View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1623_1D_low_18 (Length: 276)

Name: NF1623_1D_low_18
Description: NF1623_1D
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1623_1D_low_18
NF1623_1D_low_18
[»] chr6 (55 HSPs)
chr6 (20-267)||(25470664-25470912)
chr6 (20-267)||(34647625-34647873)
chr6 (20-267)||(34640951-34641199)
chr6 (19-267)||(12167192-12167442)
chr6 (19-267)||(19286101-19286351)
chr6 (40-267)||(19877306-19877535)
chr6 (40-267)||(19883082-19883311)
chr6 (19-267)||(19786844-19787095)
chr6 (20-267)||(23837536-23837785)
chr6 (21-267)||(29615172-29615417)
chr6 (44-267)||(24562262-24562486)
chr6 (38-267)||(21566160-21566390)
chr6 (137-267)||(11289575-11289705)
chr6 (39-267)||(12941775-12942003)
chr6 (39-223)||(28290226-28290409)
chr6 (64-240)||(23835057-23835233)
chr6 (64-223)||(14033142-14033300)
chr6 (64-240)||(33682204-33682380)
chr6 (144-267)||(18788439-18788563)
chr6 (144-267)||(18799419-18799543)
chr6 (20-102)||(11283984-11284066)
chr6 (64-220)||(27562560-27562715)
chr6 (64-223)||(28359874-28360032)
chr6 (64-267)||(19726606-19726810)
chr6 (68-267)||(22906969-22907170)
chr6 (143-267)||(19439782-19439907)
chr6 (136-267)||(19588553-19588686)
chr6 (39-267)||(24513798-24514029)
chr6 (63-267)||(1592758-1592963)
chr6 (64-237)||(29416468-29416643)
chr6 (64-267)||(937655-937859)
chr6 (136-267)||(14375281-14375415)
chr6 (44-125)||(5290259-5290339)
chr6 (107-219)||(8760448-8760562)
chr6 (154-267)||(8768146-8768260)
chr6 (107-220)||(2708411-2708527)
chr6 (38-205)||(15457439-15457607)
chr6 (38-205)||(15464034-15464202)
chr6 (38-105)||(18799359-18799425)
chr6 (136-205)||(14616306-14616376)
chr6 (136-205)||(14724438-14724507)
chr6 (64-205)||(14581891-14582034)
chr6 (38-105)||(18788379-18788445)
chr6 (109-210)||(19818944-19819047)
chr6 (48-150)||(26418758-26418860)
chr6 (44-78)||(94630-94664)
chr6 (99-204)||(19300705-19300813)
chr6 (153-205)||(14995985-14996038)
chr6 (153-205)||(31251458-31251511)
chr6 (99-267)||(21724733-21724903)
chr6 (39-78)||(27767334-27767373)
chr6 (39-81)||(20011099-20011141)
chr6 (38-80)||(21365628-21365670)
chr6 (38-80)||(23969610-23969652)
chr6 (180-267)||(23234898-23234986)
[»] chr7 (62 HSPs)
chr7 (19-267)||(12591608-12591857)
chr7 (20-267)||(13123944-13124191)
chr7 (20-267)||(12710873-12711120)
chr7 (19-267)||(13006261-13006511)
chr7 (39-267)||(14421329-14421559)
chr7 (41-267)||(13742483-13742709)
chr7 (44-267)||(4279943-4280167)
chr7 (44-267)||(19616275-19616499)
chr7 (38-267)||(16676166-16676396)
chr7 (38-267)||(17650403-17650632)
chr7 (54-267)||(20328221-20328435)
chr7 (39-267)||(11302827-11303055)
chr7 (39-267)||(11383811-11384040)
chr7 (39-267)||(11390299-11390528)
chr7 (39-223)||(23665846-23666029)
chr7 (38-267)||(18606840-18607070)
chr7 (39-223)||(29795705-29795888)
chr7 (39-223)||(29799524-29799707)
chr7 (64-223)||(20579960-20580118)
chr7 (38-267)||(21232006-21232236)
chr7 (64-240)||(806998-807174)
chr7 (64-240)||(11631941-11632117)
chr7 (64-240)||(18049231-18049407)
chr7 (64-240)||(18055710-18055886)
chr7 (64-240)||(23201503-23201679)
chr7 (64-240)||(23507630-23507806)
chr7 (64-267)||(6411821-6412026)
chr7 (64-267)||(14281617-14281822)
chr7 (64-267)||(35962709-35962914)
chr7 (64-267)||(11220083-11220290)
chr7 (64-267)||(1612623-1612828)
chr7 (64-267)||(15338826-15339030)
chr7 (64-267)||(15723188-15723392)
chr7 (66-267)||(19599844-19600046)
chr7 (64-224)||(16109083-16109243)
chr7 (64-266)||(14431989-14432192)
chr7 (64-267)||(15710964-15711168)
chr7 (178-266)||(36306032-36306121)
chr7 (136-266)||(14128244-14128374)
chr7 (39-205)||(147042-147210)
chr7 (136-267)||(3289751-3289884)
chr7 (44-150)||(3327780-3327885)
chr7 (44-148)||(37244400-37244504)
chr7 (39-205)||(14320600-14320767)
chr7 (44-125)||(32771475-32771556)
chr7 (153-205)||(14565798-14565851)
chr7 (48-150)||(15086013-15086114)
chr7 (48-125)||(18958543-18958621)
chr7 (154-205)||(31154457-31154509)
chr7 (44-125)||(46174305-46174383)
chr7 (171-205)||(16187758-16187792)
chr7 (38-126)||(31154341-31154427)
chr7 (38-90)||(13678256-13678307)
chr7 (38-80)||(2464287-2464329)
chr7 (39-81)||(2965906-2965948)
chr7 (38-80)||(3858516-3858558)
chr7 (39-80)||(14565683-14565724)
chr7 (39-80)||(15166749-15166790)
chr7 (39-80)||(18871841-18871882)
chr7 (39-80)||(20907521-20907562)
chr7 (44-166)||(36306109-36306233)
chr7 (180-220)||(18958444-18958484)
[»] chr2 (50 HSPs)
chr2 (20-267)||(5706987-5707235)
chr2 (39-267)||(6482296-6482526)
chr2 (39-267)||(6485763-6485993)
chr2 (19-267)||(26582630-26582879)
chr2 (44-267)||(200621-200845)
chr2 (44-267)||(23169271-23169495)
chr2 (44-267)||(23580528-23580752)
chr2 (44-267)||(43693381-43693605)
chr2 (45-267)||(27367556-27367779)
chr2 (46-267)||(6744297-6744519)
chr2 (38-267)||(23090003-23090233)
chr2 (38-267)||(23102431-23102661)
chr2 (39-267)||(9241308-9241537)
chr2 (57-267)||(23877831-23878043)
chr2 (39-267)||(20260799-20261027)
chr2 (39-223)||(10685643-10685826)
chr2 (64-240)||(12572311-12572487)
chr2 (64-240)||(12578793-12578969)
chr2 (64-240)||(27296004-27296181)
chr2 (64-223)||(27785695-27785853)
chr2 (64-223)||(27790916-27791074)
chr2 (64-267)||(2105577-2105782)
chr2 (64-267)||(22809882-22810087)
chr2 (38-267)||(23263957-23264188)
chr2 (38-267)||(21907222-21907455)
chr2 (38-220)||(21074000-21074183)
chr2 (109-267)||(19703453-19703615)
chr2 (44-220)||(19649562-19649741)
chr2 (64-267)||(20724032-20724239)
chr2 (64-267)||(23290925-23291132)
chr2 (39-205)||(6261581-6261748)
chr2 (64-224)||(24943376-24943538)
chr2 (136-267)||(23752863-23752997)
chr2 (39-205)||(26884128-26884295)
chr2 (64-220)||(24658773-24658931)
chr2 (44-125)||(28971395-28971476)
chr2 (39-202)||(27211017-27211181)
chr2 (44-150)||(21133345-21133451)
chr2 (136-205)||(24652402-24652472)
chr2 (153-202)||(27208682-27208732)
chr2 (39-78)||(13101297-13101336)
chr2 (39-78)||(15643412-15643451)
chr2 (39-81)||(9497-9539)
chr2 (44-78)||(17592658-17592692)
chr2 (44-78)||(28292700-28292734)
chr2 (39-80)||(19662985-19663026)
chr2 (57-126)||(23269192-23269260)
chr2 (57-126)||(23276061-23276129)
chr2 (39-80)||(29280916-29280957)
chr2 (38-90)||(23062475-23062526)
[»] chr3 (74 HSPs)
chr3 (20-267)||(41456120-41456369)
chr3 (40-267)||(9532825-9533054)
chr3 (44-267)||(14084511-14084735)
chr3 (44-267)||(14089912-14090136)
chr3 (44-267)||(49399453-49399677)
chr3 (45-267)||(13968806-13969029)
chr3 (45-267)||(13974281-13974504)
chr3 (44-267)||(24123176-24123400)
chr3 (44-267)||(8583267-8583491)
chr3 (38-267)||(17157035-17157265)
chr3 (38-267)||(24191736-24191966)
chr3 (38-267)||(16802422-16802652)
chr3 (38-220)||(17190810-17190992)
chr3 (39-267)||(12304724-12304952)
chr3 (38-267)||(23174133-23174361)
chr3 (64-240)||(8742910-8743086)
chr3 (64-240)||(8761080-8761256)
chr3 (64-223)||(4677164-4677322)
chr3 (64-223)||(41175477-41175635)
chr3 (64-223)||(41180615-41180773)
chr3 (64-223)||(13909529-13909687)
chr3 (64-223)||(13939988-13940146)
chr3 (64-223)||(44775201-44775359)
chr3 (64-223)||(44780385-44780543)
chr3 (44-267)||(31690567-31690794)
chr3 (64-264)||(12200203-12200403)
chr3 (64-223)||(13946474-13946632)
chr3 (64-267)||(14544163-14544368)
chr3 (38-267)||(17243651-17243883)
chr3 (38-220)||(18888940-18889124)
chr3 (64-267)||(14652688-14652892)
chr3 (107-220)||(17199061-17199175)
chr3 (38-267)||(18899979-18900212)
chr3 (67-224)||(14292706-14292865)
chr3 (64-237)||(34852211-34852386)
chr3 (64-267)||(13203511-13203715)
chr3 (64-267)||(16382852-16383056)
chr3 (64-214)||(12961428-12961580)
chr3 (64-266)||(16838475-16838677)
chr3 (48-267)||(31943425-31943648)
chr3 (171-267)||(12255233-12255329)
chr3 (64-267)||(18719106-18719312)
chr3 (44-125)||(11850780-11850860)
chr3 (154-266)||(16829952-16830065)
chr3 (64-214)||(19443469-19443621)
chr3 (178-267)||(23173876-23173966)
chr3 (64-220)||(11964922-11965080)
chr3 (154-205)||(12479740-12479791)
chr3 (39-205)||(38312183-38312352)
chr3 (39-82)||(12034506-12034549)
chr3 (154-201)||(12356009-12356056)
chr3 (154-201)||(12362558-12362605)
chr3 (44-82)||(10597893-10597931)
chr3 (136-205)||(18129837-18129907)
chr3 (48-82)||(18757123-18757157)
chr3 (44-78)||(20187673-20187707)
chr3 (138-214)||(13303287-13303364)
chr3 (172-267)||(13313908-13314005)
chr3 (38-78)||(8374077-8374117)
chr3 (64-189)||(12363445-12363572)
chr3 (39-78)||(15374655-15374694)
chr3 (39-78)||(30597011-30597050)
chr3 (172-214)||(13324875-13324917)
chr3 (39-81)||(14864763-14864805)
chr3 (39-81)||(17130672-17130714)
chr3 (136-205)||(18136351-18136421)
chr3 (44-78)||(48774771-48774805)
chr3 (39-80)||(10553848-10553889)
chr3 (39-80)||(14764291-14764332)
chr3 (180-267)||(17496239-17496328)
chr3 (39-80)||(23372037-23372078)
chr3 (39-80)||(51300077-51300118)
chr3 (180-267)||(10597703-10597791)
chr3 (180-220)||(18756980-18757020)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (20-267)||(20045852-20046100)
chr1 (39-267)||(20438504-20438734)
chr1 (19-267)||(41110769-41111019)
chr1 (44-267)||(21542036-21542260)
chr1 (44-267)||(42095876-42096100)
chr1 (38-267)||(19664102-19664332)
chr1 (64-267)||(32650102-32650307)
chr1 (64-240)||(27280192-27280369)
chr1 (64-266)||(3706736-3706939)
chr1 (136-267)||(20242606-20242738)
chr1 (101-267)||(23066673-23066842)
chr1 (64-267)||(19778431-19778639)
chr1 (109-267)||(29554416-29554578)
chr1 (155-267)||(21732569-21732682)
chr1 (154-267)||(20824330-20824445)
chr1 (64-205)||(20941891-20942034)
chr1 (44-150)||(23195568-23195673)
chr1 (64-217)||(22448296-22448440)
chr1 (138-266)||(20838140-20838270)
chr1 (47-150)||(36614918-36615018)
chr1 (138-205)||(19961210-19961277)
chr1 (109-205)||(16883575-16883674)
chr1 (178-224)||(955082-955128)
chr1 (44-78)||(9269912-9269946)
chr1 (55-150)||(24079542-24079637)
chr1 (55-150)||(24109117-24109212)
chr1 (154-205)||(29535019-29535071)
chr1 (39-78)||(43088366-43088405)
chr1 (44-78)||(4231167-4231201)
chr1 (39-81)||(16669432-16669474)
chr1 (39-81)||(20852225-20852267)
chr1 (39-81)||(20858851-20858893)
chr1 (39-81)||(21705197-21705239)
chr1 (180-267)||(21734442-21734531)
chr1 (44-78)||(24850079-24850113)
chr1 (180-267)||(21745634-21745722)
[»] chr8 (44 HSPs)
chr8 (20-267)||(19902901-19903149)
chr8 (20-267)||(23865391-23865638)
chr8 (19-267)||(17053552-17053802)
chr8 (39-267)||(44476211-44476441)
chr8 (39-267)||(44479473-44479703)
chr8 (44-267)||(23825104-23825328)
chr8 (21-252)||(25409512-25409743)
chr8 (45-267)||(30766922-30767145)
chr8 (38-267)||(14057580-14057810)
chr8 (64-267)||(22025556-22025762)
chr8 (64-240)||(1804492-1804668)
chr8 (64-240)||(36799376-36799552)
chr8 (64-240)||(9273183-9273360)
chr8 (64-223)||(18681545-18681703)
chr8 (64-223)||(31567854-31568012)
chr8 (64-223)||(31573075-31573233)
chr8 (38-220)||(18609767-18609949)
chr8 (44-267)||(21282038-21282264)
chr8 (136-267)||(25110914-25111046)
chr8 (99-267)||(22063559-22063731)
chr8 (64-267)||(41009430-41009637)
chr8 (109-220)||(21668901-21669014)
chr8 (64-240)||(21326847-21327027)
chr8 (64-267)||(21322231-21322439)
chr8 (64-267)||(22177586-22177790)
chr8 (64-267)||(22050201-22050405)
chr8 (64-267)||(22055719-22055923)
chr8 (64-267)||(10606931-10607139)
chr8 (154-267)||(21300114-21300229)
chr8 (44-125)||(31412626-31412708)
chr8 (44-125)||(31418808-31418890)
chr8 (109-205)||(19988224-19988322)
chr8 (64-190)||(20974073-20974201)
chr8 (48-82)||(5240064-5240098)
chr8 (39-78)||(11392721-11392760)
chr8 (39-90)||(23653139-23653189)
chr8 (38-80)||(8596251-8596293)
chr8 (44-90)||(23653819-23653864)
chr8 (39-81)||(24321762-24321804)
chr8 (44-78)||(27345697-27345731)
chr8 (39-80)||(8729173-8729214)
chr8 (190-267)||(22176031-22176107)
chr8 (39-80)||(27942334-27942375)
chr8 (153-192)||(27942221-27942261)
[»] scaffold0029 (4 HSPs)
scaffold0029 (19-267)||(110714-110962)
scaffold0029 (19-126)||(116749-116855)
scaffold0029 (38-80)||(92294-92336)
scaffold0029 (38-80)||(98020-98062)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (20-267)||(9605-9852)
[»] chr5 (46 HSPs)
chr5 (39-267)||(19510974-19511204)
chr5 (44-267)||(23527428-23527654)
chr5 (52-267)||(21675444-21675660)
chr5 (52-267)||(1857476-1857692)
chr5 (38-267)||(22439698-22439928)
chr5 (39-267)||(37805289-37805517)
chr5 (39-223)||(9775442-9775625)
chr5 (39-205)||(23112773-23112939)
chr5 (64-240)||(17264794-17264971)
chr5 (64-240)||(21678267-21678443)
chr5 (64-240)||(17271276-17271453)
chr5 (64-223)||(22175014-22175173)
chr5 (64-267)||(758224-758427)
chr5 (64-267)||(22312801-22313005)
chr5 (64-267)||(20937594-20937799)
chr5 (64-237)||(10816774-10816949)
chr5 (135-267)||(22007893-22008028)
chr5 (64-237)||(23538801-23538976)
chr5 (99-267)||(22509142-22509312)
chr5 (44-125)||(24751647-24751727)
chr5 (44-125)||(24669109-24669189)
chr5 (44-125)||(24738878-24738958)
chr5 (136-267)||(6404466-6404600)
chr5 (39-205)||(34829003-34829171)
chr5 (44-150)||(27635969-27636074)
chr5 (136-219)||(6728280-6728364)
chr5 (153-205)||(28371459-28371512)
chr5 (153-205)||(38145787-38145840)
chr5 (64-267)||(22232606-22232813)
chr5 (153-205)||(42960171-42960224)
chr5 (39-81)||(19235822-19235864)
chr5 (44-78)||(19800486-19800520)
chr5 (39-81)||(22460077-22460119)
chr5 (39-81)||(28890518-28890560)
chr5 (39-81)||(28897222-28897264)
chr5 (39-81)||(28910422-28910464)
chr5 (39-81)||(28925690-28925732)
chr5 (39-81)||(28932113-28932155)
chr5 (39-81)||(28933617-28933659)
chr5 (39-81)||(28946817-28946859)
chr5 (44-78)||(29746695-29746729)
chr5 (39-80)||(22336082-22336123)
chr5 (39-80)||(22749728-22749769)
chr5 (39-80)||(28371586-28371627)
chr5 (39-80)||(38145913-38145954)
chr5 (39-80)||(42960057-42960098)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (39-267)||(8046870-8047098)
chr4 (39-267)||(11847028-11847257)
chr4 (36-267)||(18212111-18212342)
chr4 (39-267)||(15533761-15533989)
chr4 (64-240)||(635763-635940)
chr4 (64-223)||(53748769-53748927)
chr4 (64-223)||(41799970-41800128)
chr4 (64-223)||(42701226-42701384)
chr4 (64-223)||(51602091-51602249)
chr4 (64-223)||(51607972-51608130)
chr4 (109-267)||(15406955-15407116)
chr4 (64-237)||(4831090-4831265)
chr4 (64-237)||(4834385-4834560)
chr4 (64-267)||(23121599-23121804)
chr4 (67-267)||(14484432-14484634)
chr4 (64-267)||(16156630-16156839)
chr4 (64-239)||(16152484-16152665)
chr4 (94-267)||(14048228-14048407)
chr4 (64-205)||(14062908-14063052)
chr4 (107-267)||(14485552-14485716)
chr4 (136-267)||(17000139-17000271)
chr4 (107-220)||(26077731-26077847)
chr4 (64-205)||(14556115-14556260)
chr4 (64-267)||(43284868-43285072)
chr4 (64-223)||(20940260-20940419)
chr4 (64-264)||(11171233-11171435)
chr4 (109-267)||(15324919-15325080)
chr4 (64-201)||(41529123-41529263)
chr4 (138-212)||(14048152-14048227)
chr4 (39-205)||(14910560-14910727)
chr4 (136-205)||(2585204-2585274)
chr4 (44-125)||(13452206-13452287)
chr4 (44-78)||(42956141-42956175)
chr4 (44-78)||(54845067-54845101)
chr4 (99-214)||(1651084-1651203)
chr4 (99-202)||(27905244-27905350)
chr4 (154-205)||(30146857-30146909)
chr4 (39-78)||(19128461-19128500)
chr4 (39-78)||(33097019-33097058)
chr4 (39-78)||(42220357-42220396)
chr4 (44-78)||(45959861-45959895)
chr4 (44-78)||(47872541-47872575)
chr4 (39-80)||(10977182-10977223)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (21-266)||(174535-174781)
scaffold0001 (40-242)||(489104-489306)
scaffold0001 (136-267)||(95920-96054)
scaffold0001 (39-205)||(493992-494159)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (39-267)||(2541-2770)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (44-267)||(38381-38605)
scaffold0106 (136-209)||(46789-46863)
scaffold0106 (136-209)||(51062-51136)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (44-267)||(35519-35743)
scaffold0076 (44-267)||(30118-30342)
scaffold0076 (70-267)||(51673-51872)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (44-267)||(46952-47176)
scaffold0028 (44-267)||(52357-52581)
scaffold0028 (178-267)||(92634-92724)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (44-267)||(174534-174758)
scaffold0011 (64-267)||(152361-152565)
scaffold0011 (64-267)||(258491-258699)
scaffold0011 (64-224)||(197455-197618)
[»] scaffold0026 (4 HSPs)
scaffold0026 (21-267)||(12849-13095)
scaffold0026 (64-265)||(63168-63370)
scaffold0026 (64-267)||(124443-124649)
scaffold0026 (39-80)||(110168-110209)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (38-267)||(4272-4502)
[»] scaffold0077 (3 HSPs)
scaffold0077 (38-267)||(4591-4821)
scaffold0077 (64-205)||(23832-23975)
scaffold0077 (64-205)||(18201-18344)
[»] scaffold0124 (5 HSPs)
scaffold0124 (39-267)||(36790-37019)
scaffold0124 (154-220)||(44013-44080)
scaffold0124 (38-190)||(44068-44221)
scaffold0124 (113-223)||(40549-40658)
scaffold0124 (64-109)||(8493-8538)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (36-267)||(10231-10462)
[»] scaffold0811 (1 HSPs)
scaffold0811 (20-193)||(1-174)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (38-267)||(29722-29951)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (38-267)||(15429-15659)
scaffold0025 (136-267)||(71162-71294)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (38-267)||(140-370)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (38-224)||(10174-10359)
[»] scaffold1773 (1 HSPs)
scaffold1773 (83-267)||(1-176)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (64-267)||(5148-5353)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (38-267)||(41589-41819)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (38-267)||(102900-103131)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (64-267)||(17477-17682)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (44-267)||(17373-17600)
scaffold0034 (44-267)||(10077-10304)
scaffold0034 (99-205)||(72262-72371)
scaffold0034 (38-80)||(35886-35928)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (64-267)||(6003-6208)
[»] scaffold0239 (2 HSPs)
scaffold0239 (64-267)||(14469-14673)
scaffold0239 (99-267)||(7186-7356)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (64-267)||(56418-56623)
scaffold0067 (64-267)||(47384-47589)
scaffold0067 (64-267)||(62804-63009)
[»] scaffold1615 (1 HSPs)
scaffold1615 (54-264)||(392-603)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (38-264)||(16914-17141)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (64-267)||(141326-141529)
scaffold0021 (109-237)||(146611-146742)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (38-267)||(115710-115941)
scaffold0004 (64-221)||(321062-321221)
scaffold0004 (109-224)||(326816-326933)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (64-267)||(10341-10546)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (64-267)||(41931-42135)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (64-268)||(4977-5184)
[»] scaffold1584 (1 HSPs)
scaffold1584 (44-267)||(300-527)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (44-267)||(2899-3126)
scaffold0348 (64-205)||(1761-1904)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (64-267)||(27861-28068)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (136-267)||(20490-20622)
scaffold0023 (107-211)||(156797-156901)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (64-267)||(8410-8618)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (64-219)||(16068-16225)
scaffold0243 (107-220)||(8047-8162)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (64-263)||(50948-51148)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (64-264)||(265100-265300)
scaffold0005 (64-264)||(258674-258874)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (64-267)||(27739-27945)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (136-267)||(7322-7454)
[»] scaffold0249 (2 HSPs)
scaffold0249 (38-205)||(7843-8012)
scaffold0249 (38-205)||(14832-15000)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (154-267)||(5638-5753)
[»] scaffold0461 (4 HSPs)
scaffold0461 (38-190)||(1130-1284)
scaffold0461 (38-190)||(8066-8220)
scaffold0461 (154-220)||(1075-1142)
scaffold0461 (154-220)||(8011-8078)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (153-267)||(14097-14212)
scaffold0063 (64-267)||(24209-24413)
[»] scaffold0430 (1 HSPs)
scaffold0430 (102-223)||(14589-14710)
[»] scaffold0693 (1 HSPs)
scaffold0693 (38-190)||(2012-2167)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (44-205)||(52670-52834)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (136-220)||(34850-34935)
[»] scaffold1913 (1 HSPs)
scaffold1913 (159-240)||(4-86)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (136-202)||(2376-2442)
scaffold0203 (154-205)||(17139-17190)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (109-220)||(171831-171945)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (64-205)||(16927-17071)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (44-125)||(509-589)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (153-265)||(16983-17096)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (141-267)||(55939-56068)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (136-220)||(5923-6006)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (138-205)||(11977-12044)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (48-150)||(31666-31768)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (44-125)||(26071-26152)
scaffold0104 (44-125)||(27453-27534)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (153-205)||(927-980)
[»] scaffold0720 (1 HSPs)
scaffold0720 (39-126)||(4285-4370)
[»] scaffold1726 (1 HSPs)
scaffold1726 (48-150)||(208-310)
[»] scaffold0377 (1 HSPs)
scaffold0377 (178-220)||(7344-7386)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (136-205)||(7011-7081)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (64-190)||(13465-13593)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (153-205)||(24537-24590)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (154-214)||(44282-44343)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (154-267)||(3299-3415)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (38-90)||(149-200)
[»] scaffold0214 (1 HSPs)
scaffold0214 (44-76)||(15346-15378)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (38-90)||(16198-16249)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (38-90)||(1869-1920)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (180-268)||(26353-26443)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (178-267)||(38637-38728)
scaffold0022 (178-267)||(136697-136788)
[»] scaffold0609 (1 HSPs)
scaffold0609 (38-80)||(10-52)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (44-78)||(1164-1198)
[»] scaffold0320 (1 HSPs)
scaffold0320 (44-78)||(872-906)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (44-78)||(15082-15116)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (171-205)||(370495-370529)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (39-80)||(3010-3051)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 55)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 25470912 - 25470664
Alignment:
Q  20 tatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25470912 tatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 25470813  T
Q  120 gcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctc 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25470812 gcattctcagcaggacctaagtcctcacctctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctc 25470713  T
Q  219 ccacttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25470712 ccacttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatacctacatacaac 25470664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 34647873 - 34647625
Alignment:
Q  20 tatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  34647873 tatgacacgacatccccatctagaactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccgtaattcagggccgtgacccactccgctgtcgaatggttaaa 34647774  T
Q  120 gcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctc 218  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34647773 gcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctc 34647674  T
Q  219 ccacttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34647673 ccacttgatgtttatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 34647625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 34641199 - 34640951
Alignment:
Q  20 tatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  34641199 tatgacacgacatccccatctagaactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccgtaattcagggccgtgacccactccgctgtcgaatggttaaa 34641100  T
Q  120 gcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctc 218  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34641099 gcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacggcgaggcgttccagagccgaagctctc 34641000  T
Q  219 ccacttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34640999 ccacttgatgtttatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 34640951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 267
Target Start/End: Original strand, 12167192 - 12167442
Alignment:
Q  19 atatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaa 118  Q
    |||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12167192 atatgacatgacacccccctttaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaa 12167291  T
Q  119 agcattctcagcagga-ctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctct 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12167292 agcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 12167391  T
Q  218 cccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12167392 cccactttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctacatacaac 12167442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 267
Target Start/End: Original strand, 19286101 - 19286351
Alignment:
Q  19 atatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaa 118  Q
    |||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19286101 atatgacatgacacccccctttaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaa 19286200  T
Q  119 agcattctcagcagga-ctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctct 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19286201 agcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 19286300  T
Q  218 cccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19286301 cccactttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctacatacaac 19286351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 40 - 267
Target Start/End: Original strand, 19877306 - 19877535
Alignment:
Q  40 taatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcagga-ctaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19877306 taatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaa 19877405  T
Q  139 gtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19877406 gtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaa 19877505  T
Q  238 ctacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19877506 ctaccccacctgtgtatatctacatacaac 19877535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 40 - 267
Target Start/End: Original strand, 19883082 - 19883311
Alignment:
Q  40 taatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcagga-ctaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19883082 taatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaa 19883181  T
Q  139 gtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19883182 gtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaa 19883281  T
Q  238 ctacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19883282 ctaccccacctgtgtatatctacatacaac 19883311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19787095 - 19786844
Alignment:
Q  19 atatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaa 118  Q
    |||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19787095 atatgacatgacacccccctttaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccattacccacaccactgtcgaatggttaa 19786996  T
Q  119 agcattctcagcagga-ctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctct 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19786995 agcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 19786896  T
Q  218 cccac-ttgatgatt-atgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19786895 cccactttgatgtttaatgcaactaccccacctgtgtatatctacatacaac 19786844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 267
Target Start/End: Original strand, 23837536 - 23837785
Alignment:
Q  20 tatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23837536 tatgacacgacatccctatctaatattcctcaataaatgtaattatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 23837635  T
Q  120 gcattctcagcagga-ctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctc 218  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23837636 gcattctcaacaggacctaagttctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgttttgaacgacaaggtgttccagagccgaagctctc 23837735  T
Q  219 ccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23837736 ccactttgatgtttatggaactacccaacctgtgtatctctacatacaac 23837785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 29615417 - 29615172
Alignment:
Q  21 atgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaag 120  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29615417 atgacatgacatccccct-taatactccccaataa-tgcaactatgcatgtggtaccataac-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaag 29615321  T
Q  121 cattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcc 219  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29615320 cattctcatcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcc 29615221  T
Q  220 cac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29615220 cactttgatgtttatgcaactacccaacctgtgtatatctacatacaac 29615172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 24562262 - 24562486
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcc 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24562262 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcc 24562360  T
Q  143 tcaccgctccacaccgcttt-gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaacta 240  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  24562361 tcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 24562459  T
Q  241 cccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  24562460 cccaacctgtgtatatctacatacaac 24562486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21566390 - 21566160
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-t 136  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  21566390 tctaagactcctcgataaatgcaactatgcacgtggtaccata-ttcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcatgacat 21566292  T
Q  137 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgc 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  21566291 aagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgc 21566192  T
Q  236 aactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  21566191 aactaacccacttgtgtatatctacatacaac 21566160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 137 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11289705 - 11289575
Alignment:
Q  137 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccacttgatgattatgca 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11289705 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccacttgatgtttatgca 11289606  T
Q  237 actacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11289605 actacccaacctgtgtatatctacatacaac 11289575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 39 - 267
Target Start/End: Original strand, 12941775 - 12942003
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-ta 137  Q
    |||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  12941775 ctaagactcctcaacaaatgaaactatgcatgtggtaccaaaat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacata 12941873  T
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgca 236  Q
    |||||||||| ||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12941874 agtcctcaccacta-acaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgca 12941972  T
Q  237 actacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||  || ||| |||||||||||||||||||    
T  12941973 actgacccacctgtgtatatctacatacaac 12942003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28290409 - 28290226
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-ta 137  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  28290409 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacata 28290311  T
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    |||||||||| ||  ||| | |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28290310 agtcctcaccact-aacatcactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccact 28290226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 240
Target Start/End: Original strand, 23835057 - 23835233
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  23835057 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 23835154  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 240  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  23835155 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 23835233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Original strand, 14033142 - 14033300
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  14033142 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 14033239  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  14033240 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 14033300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 33682380 - 33682204
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  33682380 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 33682283  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 240  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  33682282 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccaaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 33682204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 144 - 267
Target Start/End: Original strand, 18788439 - 18788563
Alignment:
Q  144 caccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacc 242  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |    
T  18788439 caccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaac 18788538  T
Q  243 caaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    | ||  |||||||||||||||||||    
T  18788539 ccacttgtgtatatctacatacaac 18788563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 144 - 267
Target Start/End: Original strand, 18799419 - 18799543
Alignment:
Q  144 caccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacc 242  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |    
T  18799419 caccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaac 18799518  T
Q  243 caaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    | ||  |||||||||||||||||||    
T  18799519 ccacttgtgtatatctacatacaac 18799543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 11284066 - 11283984
Alignment:
Q  20 tatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacacc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11284066 tatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacacc 11283984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27562715 - 27562560
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    |||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  27562715 atgcatgtggtaccaagaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 27562618  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctccc 220  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  27562617 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccc 27562560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28360032 - 28359874
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  28360032 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacacctttgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 28359935  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  28359934 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 28359874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 19726606 - 19726810
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  19726606 atgcatgtggtaccataat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccacta-acaccactt 19726703  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  || ||  ||||||||||||    
T  19726704 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctac 19726803  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  19726804 atacaac 19726810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 68 - 267
Target Start/End: Original strand, 22906969 - 22907170
Alignment:
Q  68 atgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaa 165  Q
    ||||||||||||||| |||| || |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||     
T  22906969 atgtggtaccataat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgag 22907067  T
Q  166 caattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatac 264  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||  || ||  ||||||||||||||||    
T  22907068 caactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcagctgacccacttgtgtatatctacatac 22907167  T
Q  265 aac 267  Q
    |||    
T  22907168 aac 22907170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 143 - 267
Target Start/End: Original strand, 19439782 - 19439907
Alignment:
Q  143 tcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactac 241  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||| ||||      
T  19439782 tcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccgcttttatgcttatgtaactga 19439881  T
Q  242 ccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    || ||  |||||||||||||||||||    
T  19439882 cccacttgtgtatatctacatacaac 19439907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 136 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19588686 - 19588553
Alignment:
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatg 234  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| | || ||| |||||    
T  19588686 taagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgataaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatg 19588587  T
Q  235 caact-acccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||| || | ||  |||||||||||||||||||    
T  19588586 caactaactccactggtgtatatctacatacaac 19588553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24514029 - 24513798
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctcagcaggac-t 136  Q
    |||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    ||| ||||||| | |||||||||||||||||||   |||||| |    
T  24514029 ctaagactcctcgacaaatgcaa-tatgcatgtggtaccata-ttcagggccggagccctcaccgctattcgaatggttaaagcattcttttcaggacat 24513932  T
Q  137 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatg 234  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| | ||||| | || ||| |||||    
T  24513931 aagtcatcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttaaacgacaaggcgttccagggccgaaaccctcccgcttttatgcttatg 24513832  T
Q  235 caa-ctacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||| | || | ||  |||||||||||||||||||    
T  24513831 caaccgactccacttgtgtatatctacatacaac 24513798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 63 - 267
Target Start/End: Original strand, 1592758 - 1592963
Alignment:
Q  63 tatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgct 160  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||    
T  1592758 tatgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtcgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccacta-acaccact 1592855  T
Q  161 ttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatcta 259  Q
    |||| ||| ||||  |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||  || ||  ||||||| |||    
T  1592856 ttgagcaactagtactccaccactttgaacgagaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttttgcaactgacccacttgtgtataccta 1592955  T
Q  260 catacaac 267  Q
    ||||||||    
T  1592956 catacaac 1592963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29416643 - 29416468
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||| |||| || | |  ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  29416643 atgcatgtggtaccata-ttcaaggtcgtagccctcacagctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactt 29416545  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaa 237  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  29416544 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggtgctccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaa 29416468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 937859 - 937655
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| || | || |  ||| |||| |||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  937859 atgcatgtggtaccataat-catgaccttagccctcacctctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcacctcta-acaccactt 937762  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccactt-gatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| |||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||| |  || ||  ||||||||||||    
T  937761 tgagcaacgagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccacttctatgcttatgcaattgacccactcgtgtatatctac 937662  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  937661 atacaac 937655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 136 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14375415 - 14375281
Alignment:
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattat 233  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | || | | ||||    
T  14375415 taagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttaagcttat 14375316  T
Q  234 gcaact-acccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||| | || | || ||||||||||||||||||||    
T  14375315 gcaaataactccactagtgtatatctacatacaac 14375281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 5290339 - 5290259
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5290339 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccat-attcagggacgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattc 5290259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8760562 - 8760448
Alignment:
Q  107 tcgaatggttaaagcattctcag-caggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttcca 204  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||| | |||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  8760562 tcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacgactagtgttccaccactttgaacaacaaggcgttcca 8760463  T
Q  205 gagccgaagctctcc 219  Q
    | || ||||| ||||    
T  8760462 gggcagaagccctcc 8760448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 8768260 - 8768146
Alignment:
Q  154 caccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgt 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||  | || ||| ||||||||||  || ||  ||||    
T  8768260 caccgctttgaacaactagtgttccaccattttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctccagcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgt 8768161  T
Q  253 atatctacatacaac 267  Q
    |||||||||||||||    
T  8768160 atatctacatacaac 8768146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 220
Target Start/End: Original strand, 2708411 - 2708527
Alignment:
Q  107 tcgaatggttaaagcattctcag-caggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  2708411 tcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagttctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgataaggcgttcc 2708510  T
Q  204 agagccgaagctctccc 220  Q
    || |||| ||| |||||    
T  2708511 agggccggagccctccc 2708527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 205
Target Start/End: Original strand, 15457439 - 15457607
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc---agcagga 134  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    ||| ||||| | | ||||||||||||||||||    | |||||    
T  15457439 tctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata--tcagggccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattctttatatcagga 15457536  T
Q  135 c-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaat-tagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    | | ||||||| |   |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15457537 catgagtcctccca--ttaacaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 15457607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 205
Target Start/End: Original strand, 15464034 - 15464202
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc---agcagga 134  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    ||| ||||| | | ||||||||||||||||||    | |||||    
T  15464034 tctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata--tcagggccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattctttatatcagga 15464131  T
Q  135 c-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaat-tagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    | | ||||||| |   |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15464132 catgagtcctccca--ttaacaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 15464202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 105
Target Start/End: Original strand, 18799359 - 18799425
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgct 105  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18799359 tctaagactcctcgaaaaatgcaactatgcatgtggtaccat-attcagggccgtgacccacaccgct 18799425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14616376 - 14616306
Alignment:
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14616376 taagtcatcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 14616306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 205
Target Start/End: Original strand, 14724438 - 14724507
Alignment:
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    ||||| |||||||||   |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  14724438 taagttctcaccgctaatcaccgctttgaacaacaagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccag 14724507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14582034 - 14581891
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgct 160  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||  | ||| ||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||| | ||||||||||| |  ||||||||    
T  14582034 atgcatgtggtaccataa--cagggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattctttcatcaggacatgagtcctcaccgttaaacaccgct 14581937  T
Q  161 ttgaacaa-ttagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    ||||||||  | ||||||| || ||||||| ||| |||| ||||||    
T  14581936 ttgaacaacattgtgttcctccactttgaatgacaaggcattccag 14581891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 105
Target Start/End: Original strand, 18788379 - 18788445
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgct 105  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18788379 tctaagactcctcgaaaaatgcaactatacatgtggtaccat-attcagggccgtgacccacaccgct 18788445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 210
Target Start/End: Original strand, 19818944 - 19819047
Alignment:
Q  109 gaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccaga 206  Q
    |||||||||||||||||    |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||     
T  19818944 gaatggttaaagcattcatttcaggacataagtcatcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccacctctttgaacgacaaggcattccagg 19819043  T
Q  207 gccg 210  Q
    ||||    
T  19819044 gccg 19819047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 26418860 - 26418758
Alignment:
Q  48 ctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg--tcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctc 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    ||| ||||||||  | |||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  26418860 ctcaataaatgcaaatatgcatgtggtatcataa-tcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagtcctc 26418764  T
Q  145 accgct 150  Q
    ||||||    
T  26418763 accgct 26418758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 94664 - 94630
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94664 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 94630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19300813 - 19300705
Alignment:
Q  99 caccgctgtcgaatggttaaagcattctc--agcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaat-tagtgttccaccgctttgaacgacg 194  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||   | |||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||     
T  19300813 caccgctatagaatggttaaagcattcttttatcaggacatgagtcctcaccgcta-acaccgctttgaacaacatagtgttccaccactttgaacgaca 19300715  T
Q  195 aggcgttcca 204  Q
    | ||||||||    
T  19300714 aagcgttcca 19300705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14996038 - 14995985
Alignment:
Q  153 acaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14996038 acaccgctttgaacaacaatgtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 14995985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Original strand, 31251458 - 31251511
Alignment:
Q  153 acaccgctttgaacaat-tagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  31251458 acaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaatgacaaggcgttccag 31251511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21724903 - 21724733
Alignment:
Q  99 caccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgag 196  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  | ||| |||||| ||| ||||  |||||| |||||| | |  ||    
T  21724903 caccgctatagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccacta-ataccactttgagcaactagtactccaccactttgatctattag 21724805  T
Q  197 gcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||  || ||  ||||||| |||||||||||    
T  21724804 gcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttttgcaactgacccacttgtgtatacctacatacaac 21724733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 78
Target Start/End: Original strand, 27767334 - 27767373
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27767334 ctaagactcctcaataaatgcatatatgcatgtggtacca 27767373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 20011141 - 20011099
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataa 81  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20011141 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataa 20011099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 21365670 - 21365628
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21365670 tctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccata 21365628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 23969652 - 23969610
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  23969652 tctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccata 23969610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23234986 - 23234898
Alignment:
Q  180 ccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| | || ||| ||||||||||  |  ||  |||||||||||||||||||    
T  23234986 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactcacttgtgtatatctacatacaac 23234898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 62)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12591857 - 12591608
Alignment:
Q  19 atatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaa 118  Q
    |||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12591857 atatgacatgacacccccctttaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaa 12591758  T
Q  119 agcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctct 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12591757 agcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgctccaccgctttgaacgacgaagcgttccagagccgaagctct 12591658  T
Q  218 cccacttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12591657 cccacttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 12591608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 20 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13124191 - 13123944
Alignment:
Q  20 tatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 119  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13124191 tatgacacgacatccccc-ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 13124093  T
Q  120 gcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctc 218  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13124092 gcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctc 13123993  T
Q  219 ccacttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13123992 ccacttgatgtttatgcaactacccaacctgtgtatatctacatacaac 13123944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12711120 - 12710873
Alignment:
Q  20 tatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 119  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12711120 tatgacacgacatccccc-ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 12711022  T
Q  120 gcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctc 218  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  12711021 gcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagtcgaagctctc 12710922  T
Q  219 ccacttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12710921 ccacttgatatttatgcaactacccaacctgtgtatatctacatacaac 12710873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 267
Target Start/End: Original strand, 13006261 - 13006511
Alignment:
Q  19 atatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaa 118  Q
    |||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13006261 atatgacatgacacccccctttaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaa 13006360  T
Q  119 agcattctcagcagga-ctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctct 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13006361 agcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 13006460  T
Q  218 cccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13006461 cccactttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctacatacaac 13006511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 39 - 267
Target Start/End: Original strand, 14421329 - 14421559
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcagga-cta 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14421329 ctaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaccta 14421428  T
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgca 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14421429 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagcgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgca 14421528  T
Q  237 actacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  14421529 actacccaacctgtgtatctctatatacaac 14421559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 41 - 267
Target Start/End: Original strand, 13742483 - 13742709
Alignment:
Q  41 aatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taag 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13742483 aatactcctcaataa-tgcaattatgcatgtggtaccataatttagggccgttacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaag 13742581  T
Q  140 tcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccacttgatgattatgcaact 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13742582 tcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccacttgatgtttatgcaact 13742681  T
Q  240 acccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  13742682 acccaacctgtgtatatcaacatacaac 13742709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 4279943 - 4280167
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcc 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4279943 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcc 4280041  T
Q  143 tcaccgctccacaccgcttt-gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaacta 240  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  4280042 tcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 4280140  T
Q  241 cccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  4280141 cccaacctgtgtatatctacatacaac 4280167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 19616275 - 19616499
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcc 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19616275 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcc 19616373  T
Q  143 tcaccgctccacaccgcttt-gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaacta 240  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19616374 tcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 19616472  T
Q  241 cccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19616473 cccaacctgtgtatatctacatacaac 19616499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Original strand, 16676166 - 16676396
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-t 136  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  16676166 tctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttaaggaccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacat 16676264  T
Q  137 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgc 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  16676265 aagtcctcaccgctcgacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgc 16676364  T
Q  236 aactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||| | || ||   ||||||||||||||||||    
T  16676365 aaccaacccacttatgtatatctacatacaac 16676396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Original strand, 17650403 - 17650632
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-t 136  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  17650403 tctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattt-aggaccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacat 17650501  T
Q  137 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgc 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  17650502 aagtcctcaccgctcgacaccgctttgaacaactagtgttccaccgc-ttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgc 17650600  T
Q  236 aactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||| | || ||   ||||||||||||||||||    
T  17650601 aaccaacccacttatgtatatctacatacaac 17650632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 54 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20328435 - 20328221
Alignment:
Q  54 aaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctcc 152  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| | |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||      
T  20328435 aaatgctactatgcatgtggtaccata-tacaggaccgtagcccacaccgctgtcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaa 20328337  T
Q  153 acaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtg 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  || ||  |||    
T  20328336 acaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgtcccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaactgacccacttgtg 20328237  T
Q  252 tatatctacatacaac 267  Q
    ||||||||||||||||    
T  20328236 tatatctacatacaac 20328221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 39 - 267
Target Start/End: Original strand, 11302827 - 11303055
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-ta 137  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  11302827 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaat-cagggccgtgacccacacctttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacata 11302925  T
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgca 236  Q
    |||||||||| ||  ||||| |||||| ||| ||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  11302926 agtcctcaccacta-acaccactttgagcaactagtactccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgca 11303024  T
Q  237 actacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||  || ||| |||||||||||||||||||    
T  11303025 actgacccacctgtgtatatctacatacaac 11303055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 39 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11384040 - 11383811
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggact-a 137  Q
    |||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||  |||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |    
T  11384040 ctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatg-ttcaggaccgtagcccactccgctgtcgaatggttaaagcattcttttcaggactta 11383942  T
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgca 236  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  11383941 agtcctcaccgctaaacaccgctttgaaccactagtgttccaccgctttgaacaacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgattatgca 11383842  T
Q  237 actacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||  || ||  |||||||||||||||||||    
T  11383841 actgacccacttgtgtatatctacatacaac 11383811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 39 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11390528 - 11390299
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-ta 137  Q
    |||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||  |||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||    
T  11390528 ctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatg-ttcaggaccgtagcccactccgctgtcgaatggttaaagcattcttttcaggacata 11390430  T
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgca 236  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  11390429 agtcctcaccactaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccacttttatgattatgca 11390330  T
Q  237 actacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||  || ||  |||||||||||||||||||    
T  11390329 actgacccacttgtgtatatctacatacaac 11390299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23666029 - 23665846
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-ta 137  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  23666029 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaat-cagggccgtgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacata 23665931  T
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    |||||||||| ||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23665930 agtcctcaccacta-acaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 23665846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Original strand, 18606840 - 18607070
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-t 136  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| || |    
T  18606840 tctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatg-ttcaggaccgtagcccacaccgctgtcgaatggttaaagcattcttttcagaacat 18606938  T
Q  137 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgc 235  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||| || ||| ||||||    
T  18606939 aagtcctcaccgctaaacaccgctttgaaccactagtgttccaccgctttgaaccacaaggcgttccagagtcgaagctctctcacttttatgcttatgc 18607038  T
Q  236 aactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||  || ||  |||||||||||||||||||    
T  18607039 aactgacccacttgtgtatatctacatacaac 18607070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 39 - 223
Target Start/End: Original strand, 29795705 - 29795888
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-ta 137  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  29795705 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaac-cagggccgtgacccataccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacata 29795803  T
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    |||||||||| ||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29795804 agtcctcaccacta-acaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 29795888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 39 - 223
Target Start/End: Original strand, 29799524 - 29799707
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-ta 137  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  29799524 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaac-cagggccgtgacccataccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacata 29799622  T
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    |||||||||| ||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29799623 agtcctcaccacta-acaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 29799707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20580118 - 20579960
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  20580118 atgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 20580021  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  20580020 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 20579960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21232236 - 21232006
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac- 135  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    ||| | |||||   ||||||||||||||||| |   ||||||     
T  21232236 tctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagcattcattttcaggaca 21232139  T
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatg 234  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  21232138 taagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatg 21232039  T
Q  235 caactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||  || ||  || ||||||||||||||||    
T  21232038 caactgacccacttgtatatatctacatacaac 21232006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 807174 - 806998
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  807174 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 807077  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 240  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  807076 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 806998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11632117 - 11631941
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  11632117 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 11632020  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 240  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  11632019 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 11631941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18049407 - 18049231
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  18049407 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 18049310  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 240  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  18049309 gagtaactagtactccacctctttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 18049231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18055886 - 18055710
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  18055886 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 18055789  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 240  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  18055788 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 18055710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23201679 - 23201503
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  23201679 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 23201582  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaacta 240  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||    
T  23201581 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctctcacttttatgtttatgcaacta 23201503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23507806 - 23507630
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  23507806 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 23507709  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaacta 240  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||    
T  23507708 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctctcacttttatgtttatgcaacta 23507630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 6411821 - 6412026
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||  |||| ||||    
T  6411821 atgcatgtggtaccataat-cagggccgaagccctcaccgctgtagaattgttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctatacactgctt 6411919  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| ||  |  ||||||||||||    
T  6411920 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaatgcgttccagagccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaactaaccctcttgtgtatatctac 6412019  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  6412020 atacaac 6412026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14281822 - 14281617
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||| ||||| ||  ||||| |||    
T  14281822 atgcatgtggtaccataat-cagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcatcaccactaaacaccactt 14281724  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  || ||  ||||||||||||    
T  14281723 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctac 14281624  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  14281623 atacaac 14281617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 35962914 - 35962709
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  35962914 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactt 35962816  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  || ||  ||||||||||||    
T  35962815 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctac 35962716  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  35962715 atacaac 35962709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11220290 - 11220083
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtc-gaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgct 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    ||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  11220290 atgcatgtggtaccataat-cagggccgaagccctcaccgctatttgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgcttaacaccgct 11220192  T
Q  161 ttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaact-acccaaccagtgtatatct 258  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || ||||||| || | ||  ||||||||||    
T  11220191 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccacttttatgcttctgcaactaactccactggtgtatatct 11220092  T
Q  259 acatacaac 267  Q
    |||||||||    
T  11220091 acatacaac 11220083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 1612623 - 1612828
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  1612623 atgcatgtggtaccataat-caggaccgtagcccccaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccacta-acaccactt 1612720  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaact-acccaaccagtgtatatcta 259  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| || | ||  |||||||||||    
T  1612721 tgagcaaatagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatccaactgactccacttgtgtatatcta 1612820  T
Q  260 catacaac 267  Q
    ||||||||    
T  1612821 catacaac 1612828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 15338826 - 15339030
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  15338826 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccacta-acaccactt 15338923  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  || ||  ||||||||||||    
T  15338924 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctac 15339023  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  15339024 atacaac 15339030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15723392 - 15723188
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  15723392 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccacta-acaccactt 15723295  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  || ||  ||||||||||||    
T  15723294 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctac 15723195  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  15723194 atacaac 15723188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 267
Target Start/End: Original strand, 19599844 - 19600046
Alignment:
Q  66 gcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttg 163  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||  |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||    
T  19599844 gcatgtggtaccataat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcatttattttcaggacataagtcctcaccacta-acaccactttg 19599941  T
Q  164 aacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacat 262  Q
    | ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||  || ||  ||||||||||||||    
T  19599942 agcaactagtgatccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactattatgcttatacaactgacccacttgtgtatatctacat 19600041  T
Q  263 acaac 267  Q
    |||||    
T  19600042 acaac 19600046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16109243 - 16109083
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  16109243 atgcatgtggtaccataat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccacta-acaccactt 16109146  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccactt 224  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16109145 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccactt 16109083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Original strand, 14431989 - 14432192
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  14431989 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacctaagtcctcaccacta-acaccactt 14432086  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||  || ||  | ||||||||||    
T  14432087 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgagtatatctac 14432186  T
Q  261 atacaa 266  Q
    ||||||    
T  14432187 atacaa 14432192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15711168 - 15710964
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  15711168 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaatcattcattttcaggacataagtcctcaccacta-acaccactt 15711071  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| ||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||  || ||  ||||||||||||    
T  15711070 tgagcaactagtactccaccactttgaacgacaaggcgttccagatccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctac 15710971  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  15710970 atacaac 15710964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36306121 - 36306032
Alignment:
Q  178 caccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaa 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  36306121 caccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcacacttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctacatacaa 36306032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 266
Target Start/End: Original strand, 14128244 - 14128374
Alignment:
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatg 234  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||    
T  14128244 taagtcctcaccacta-acaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccactgttatgcttatg 14128342  T
Q  235 caactacccaaccagtgtatatctacatacaa 266  Q
    |||||  || ||  | ||||||||||||||||    
T  14128343 caactgacccacttgagtatatctacatacaa 14128374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 205
Target Start/End: Original strand, 147042 - 147210
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc---agcaggac 135  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||    ||| ||||| | | ||||||||||||||||||    | ||||||    
T  147042 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata--tcagagccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattctttttatcaggac 147139  T
Q  136 -taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaat-tagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
     | ||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  147140 atgagtcctcaccgtta-acaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 147210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3289884 - 3289751
Alignment:
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatg 234  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||   || ||||| | || |||||||||    
T  3289884 taagtcctcaccgctaatcaccgctttgaacaacaagtgttctaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagggccctcccgcttttatgattatg 3289785  T
Q  235 caact-acccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||| || | ||  |||||||||||||||||||    
T  3289784 caactgactccacttgtgtatatctacatacaac 3289751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 150
Target Start/End: Original strand, 3327780 - 3327885
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgc-tgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtc 141  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| |||||| | | |||||||||||||||  ||| |||||| ||||||    
T  3327780 actcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccat-attcagggccaaagccctcaccgctttttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagtc 3327876  T
Q  142 ctcaccgct 150  Q
    |||||||||    
T  3327877 ctcaccgct 3327885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 37244504 - 37244400
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg--tcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||| ||||||||  | |||||||||||||||  ||| |||||| |||||    
T  37244504 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagt 37244408  T
Q  141 cctcaccg 148  Q
    ||||||||    
T  37244407 cctcaccg 37244400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14320767 - 14320600
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct---cagcaggac 135  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    ||| ||||| | | ||||||||||||||||||   || ||||||    
T  14320767 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata--tcagggccggagccctcaccgttatagaatggttaaagcattcttttcatcaggac 14320670  T
Q  136 -taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaat-tagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
     | ||||||| |   |  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  14320669 atgagtcctccca--ttaacaccgctttgaacaacatagtgttccatcgctttgaacgacaaggcgttccag 14320600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 125
Target Start/End: Original strand, 32771475 - 32771556
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  32771475 actcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccat-attcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattc 32771556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Original strand, 14565798 - 14565851
Alignment:
Q  153 acaccgctttgaacaat-tagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14565798 acaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 14565851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15086114 - 15086013
Alignment:
Q  48 ctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctca 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     ||| |||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  15086114 ctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccat-attcagggctgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagtcctca 15086018  T
Q  146 ccgct 150  Q
    |||||    
T  15086017 ccgct 15086013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 18958621 - 18958543
Alignment:
Q  48 ctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg--tcgaatggttaaagcattc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  18958621 ctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattc 18958543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Original strand, 31154457 - 31154509
Alignment:
Q  154 caccgctttgaacaat-tagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31154457 caccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 31154509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 125
Target Start/End: Original strand, 46174305 - 46174383
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||| ||   |||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  46174305 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa---caggaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 46174383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16187792 - 16187758
Alignment:
Q  171 agtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16187792 agtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 16187758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 126
Target Start/End: Original strand, 31154341 - 31154427
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 126  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  | ||| ||||| | | ||||||||||||||||||    
T  31154341 tctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccata--tcagggccgaggccctcaccgttatagaatggttaaagcattct 31154427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 90
Target Start/End: Original strand, 13678256 - 13678307
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggcc 90  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13678256 tctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccat-attcagggcc 13678307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 80
Target Start/End: Original strand, 2464287 - 2464329
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  2464287 tctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccata 2464329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 81
Target Start/End: Original strand, 2965906 - 2965948
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataa 81  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  2965906 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataa 2965948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 3858558 - 3858516
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  3858558 tctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccata 3858516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 80
Target Start/End: Original strand, 14565683 - 14565724
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  14565683 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata 14565724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 80
Target Start/End: Original strand, 15166749 - 15166790
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15166749 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata 15166790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 80
Target Start/End: Original strand, 18871841 - 18871882
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18871841 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata 18871882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 20907562 - 20907521
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20907562 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata 20907521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 36306233 - 36306109
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagt 140  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    ||| |||| || |||||||||||||||||||| |   |||||| | |||    
T  36306233 actcctcaaataatgcaaatatgcatgtggtaccat-attcaagaccgaagccctcaccactagtcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagt 36306135  T
Q  141 cctcaccgctccacaccgctttgaac 166  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||    
T  36306134 cctcaccgctaaacaccgctttgaac 36306109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18958484 - 18958444
Alignment:
Q  180 ccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctccc 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  18958484 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagctctccc 18958444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 50)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5707235 - 5706987
Alignment:
Q  20 tatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707235 tatgacacgacatccccatctagaactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccgtaattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 5707136  T
Q  120 gcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctc 218  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5707135 gcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgctccaccgctttgaacgacgaagcgttccagagccgaagctctc 5707036  T
Q  219 ccacttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707035 ccacttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 5706987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 39 - 267
Target Start/End: Original strand, 6482296 - 6482526
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcagga-cta 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  6482296 ctaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaccta 6482395  T
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgca 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  6482396 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgca 6482495  T
Q  237 actacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  6482496 actacccaacctgtgtatctctacatacaac 6482526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 39 - 267
Target Start/End: Original strand, 6485763 - 6485993
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcagga-cta 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  6485763 ctaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaccta 6485862  T
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgca 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  6485863 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgca 6485962  T
Q  237 actacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  6485963 actacccaacctgtgtatctctacatacaac 6485993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 267
Target Start/End: Original strand, 26582630 - 26582879
Alignment:
Q  19 atatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaa 118  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26582630 atatgacacgacttccccccctaatactcttcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataac-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaa 26582728  T
Q  119 agcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctct 217  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26582729 agcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 26582828  T
Q  218 cccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26582829 cccactttgatgtttatgcaactacccaacctgtgtatatctacatacaac 26582879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 200621 - 200845
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcc 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  200621 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcc 200719  T
Q  143 tcaccgctccacaccgcttt-gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaacta 240  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  200720 tcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 200818  T
Q  241 cccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  200819 cccaacctgtgtatatctacatacaac 200845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23169495 - 23169271
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcc 142  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23169495 actcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcc 23169397  T
Q  143 tcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactac 241  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23169396 tcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccactttgatgcttatgcaactac 23169297  T
Q  242 ccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||    
T  23169296 ccaacccgtgtatatccacatacaac 23169271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23580752 - 23580528
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcc 142  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23580752 actcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcc 23580654  T
Q  143 tcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactac 241  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23580653 tcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccactttgatgcttatgcaactac 23580554  T
Q  242 ccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||    
T  23580553 ccaacccgtgtatatccacatacaac 23580528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 43693381 - 43693605
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcc 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  43693381 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcc 43693479  T
Q  143 tcaccgctccacaccgcttt-gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaacta 240  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  43693480 tcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 43693578  T
Q  241 cccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  43693579 cccaacctgtggatatctacatacaac 43693605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 45 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27367779 - 27367556
Alignment:
Q  45 ctcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcct 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27367779 ctcctcgataaatgcaaatatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcct 27367681  T
Q  144 caccgctccacaccgcttt-gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactac 241  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  27367680 caccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ctatgcaactac 27367582  T
Q  242 ccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  27367581 ccaacctgtgtatatctacatacaac 27367556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6744519 - 6744297
Alignment:
Q  46 tcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctc 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  6744519 tcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaaacattctcatcaggacctaagtcctc 6744421  T
Q  145 accgctccacaccgcttt-gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacc 242  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  6744420 accgctcaacaccgcttttgaacaaccagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaactacc 6744322  T
Q  243 caaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  6744321 caacctgtgtatatctacatacaac 6744297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23090233 - 23090003
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-t 136  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  23090233 tctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacat 23090135  T
Q  137 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgc 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  23090134 aagtcctcaccgctcaacaccgctttgaataactagtgttccaccgcttttaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgc 23090035  T
Q  236 aactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  23090034 aactaacccacttgtgtatatctacatacaac 23090003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23102661 - 23102431
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-t 136  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  23102661 tctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacat 23102563  T
Q  137 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgc 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || | | ||||||    
T  23102562 aagtcctcaccgctcaacaccgctttgaaaaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggagttccagagccgaagctctcccacttttaggcttatgc 23102463  T
Q  236 aactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  23102462 aactaacccacttgtgtatatctacatacaac 23102431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 39 - 267
Target Start/End: Original strand, 9241308 - 9241537
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-ta 137  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  9241308 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataat-cagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacata 9241406  T
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgca 236  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||| |||||||    
T  9241407 agtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactaatgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagttcttccacttttatgcttatgca 9241506  T
Q  237 actacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||  || ||  |||||||||||||||||||    
T  9241507 actgacccacttgtgtatatctacatacaac 9241537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 57 - 267
Target Start/End: Original strand, 23877831 - 23878043
Alignment:
Q  57 tgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccaca 155  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||| |||    
T  23877831 tgcaactatgcatgtggtaccatatttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattatcatcaggacataagtcttcaccgctcaaca 23877930  T
Q  156 ccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtat 254  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||| |||| || ||  ||||||    
T  23877931 ccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaactacaaggcgttccaaagccgaagctctcccacttttatgcttatgcgactaacccacttgtgtat 23878030  T
Q  255 atctacatacaac 267  Q
    |||||||||||||    
T  23878031 atctacatacaac 23878043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 267
Target Start/End: Original strand, 20260799 - 20261027
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-ta 137  Q
    |||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20260799 ctaagactcctcaacaaaagcaactatgcatgtggtaccaaaat-cagggccgtgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacata 20260897  T
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgca 236  Q
    |||||||||| ||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  20260898 agtcctcaccacta-acaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgca 20260996  T
Q  237 actacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||  || ||| |||||||||||||||||||    
T  20260997 actgacccacctgtgtatatctacatacaac 20261027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10685826 - 10685643
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-ta 137  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  10685826 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacata 10685728  T
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    |||||||||| ||  ||||| ||||||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  10685727 agtcctcaccact-aacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 10685643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 240
Target Start/End: Original strand, 12572311 - 12572487
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  12572311 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 12572408  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 240  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  12572409 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 12572487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 240
Target Start/End: Original strand, 12578793 - 12578969
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  12578793 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 12578890  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 240  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  12578891 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 12578969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27296181 - 27296004
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  27296181 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 27296083  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 240  Q
    ||  || ||||  |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  27296082 gagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 27296004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Original strand, 27785695 - 27785853
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  27785695 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 27785792  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  27785793 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 27785853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Original strand, 27790916 - 27791074
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  27790916 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 27791013  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  27791014 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 27791074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 2105577 - 2105782
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  2105577 atgcatgtggtaccataattcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccacta-acaccactt 2105675  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  || ||  ||||||||||||    
T  2105676 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctac 2105775  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  2105776 atacaac 2105782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 22809882 - 22810087
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||  | ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  |||||||||    
T  22809882 atgcatgtggtaccata-tccagggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgctt 22809980  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | || ||| ||||||||||  || ||  ||||||||||||    
T  22809981 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcctgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctac 22810080  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  22810081 atacaac 22810087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Original strand, 23263957 - 23264188
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-t 136  Q
    ||||| ||||||| | || ||||| || ||||||||||||||| |||||||||    ||| |||| || ||||||| ||||||||||||   |||||| |    
T  23263957 tctaagactcctcgacaattgcaactaagcatgtggtaccata-ttcagggccggagccctcaccactatcgaatgattaaagcattcttttcaggacat 23264055  T
Q  137 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgc 235  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | || ||| ||||||    
T  23264056 aagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgc 23264155  T
Q  236 aac-tacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||  || | ||  |||||||||||||||||||    
T  23264156 aacagactccactggtgtatatctacatacaac 23264188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Original strand, 21907222 - 21907455
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcagcaggac- 135  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||   ||||||     
T  21907222 tctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaaacattcttttcaggaca 21907320  T
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattat 233  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| ||||    
T  21907321 taagtcctcaccgcaaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccacttttatgcttat 21907420  T
Q  234 gcaact-acccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||| || | ||  |||||||||||||||||||    
T  21907421 gcaactgactccacttgtgtatatctacatacaac 21907455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21074183 - 21074000
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcagcaggac- 135  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||   ||||||     
T  21074183 tctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattcttttcaggaca 21074085  T
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctccc 220  Q
    |  ||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  21074084 tgggtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacaagacgttccagggccgaagccctccc 21074000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19703615 - 19703453
Alignment:
Q  109 gaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccaga 206  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  19703615 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgataaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacaacaaggcgttccagg 19703516  T
Q  207 gccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaact-acccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||| ||||| | || ||| |||||||||| || | ||  |||||||||||||||||||    
T  19703515 gccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactaactccactggtgtatatctacatacaac 19703453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19649741 - 19649562
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcag-caggac-taagt 140  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||  | ||||||||||||||||||    |||||| | |||    
T  19649741 actcctcaacaaatgcagatatgcatgtggtaccata-ttcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagt 19649643  T
Q  141 cctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctccc 220  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||    
T  19649642 cctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccaaagccctccc 19649562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 20724032 - 20724239
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgct 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    ||| |||||||  | ||||||||||||||||| |   |||||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  20724032 atgcatgtggtaccataat-cagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgct 20724130  T
Q  161 ttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaact-acccaaccagtgtatatct 258  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| | ||  || |||||||||| || | ||  ||||||||||    
T  20724131 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagggccgaagccctcccgcttttttgcttatgcaactaactccactggtgtatatct 20724230  T
Q  259 acatacaac 267  Q
    |||||||||    
T  20724231 acatacaac 20724239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 23290925 - 23291132
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||  |||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  23290925 atgcatgtggtaccata-ttcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattcgtttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 23291023  T
Q  162 tgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaact-acccaaccagtgtatatct 258  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||| ||  || |||||||||| || | ||  ||||||||||    
T  23291024 tgaacaacaaagtgtttcaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccggagccctcccacttttgtgcttatgcaactaactccacttgtgtatatct 23291123  T
Q  259 acatacaac 267  Q
    |||||||||    
T  23291124 acatacaac 23291132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6261748 - 6261581
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct---cagcaggac 135  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||   |||| ||||| | | ||||||||||||||||||   || ||||||    
T  6261748 ctaaaactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata--tcagagccgaaaccctcaccgttatagaatggttaaagcattcttttcatcaggac 6261651  T
Q  136 -taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaa-ttagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
     | ||||||| |   |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6261650 atgagtcctccca--ttaacaccgctttgaacaacttagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 6261581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 224
Target Start/End: Original strand, 24943376 - 24943538
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||   |||||||||    
T  24943376 atgcatgtggtaccata-ttcagggccgcagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgcgaaacaccgctt 24943474  T
Q  162 tgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccactt 224  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||  ||| |||||||||    
T  24943475 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggtgttctagggccagagccctcccactt 24943538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 267
Target Start/End: Original strand, 23752863 - 23752997
Alignment:
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattat 233  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||  || ||||    
T  23752863 taagtcctcaccgctaatcaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagggccagagccctcccacttttgtgcttat 23752962  T
Q  234 gcaact-acccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||| || | ||  |||||||||||||||||||    
T  23752963 gcaactaactccacttgtgtatatctacatacaac 23752997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 205
Target Start/End: Original strand, 26884128 - 26884295
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc---agcaggac 135  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  | ||| ||||| | | ||||||||||||||||||    | ||||||    
T  26884128 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata--tcagggccggggccctcaccgttatagaatggttaaagcattctttttatcaggac 26884225  T
Q  136 -taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaat-tagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
     | ||||||| |   |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26884226 atgagtcctccca--ttaacaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 26884295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 220
Target Start/End: Original strand, 24658773 - 24658931
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||  | |||||||||||||||||    |||||| ||||| ||||| |||  ||||| |||    
T  24658773 atgcatgtggtaccata-ttcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcatttcaggacataagttctcactgctaaacaccactt 24658871  T
Q  162 tgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctccc 220  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||    
T  24658872 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccaaagccctccc 24658931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 28971476 - 28971395
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    ||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  28971476 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccat-attcaggaccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattc 28971395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27211181 - 27211017
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct---cagcaggac 135  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    ||| ||||| | | ||||||||||| ||||||   || ||||||    
T  27211181 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata--tcagggccggagccctcaccgttatagaatggttaaaacattcttttcatcaggac 27211084  T
Q  136 -taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaat-tagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttc 202  Q
     | ||||||| |   |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27211083 atgagtcctccca--ttaacaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttc 27211017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 21133451 - 21133345
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg--tcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagt 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    ||| ||||||||  | |||||||||||||||  ||| |||||| |||||    
T  21133451 actcctcaacaaatgcaaatatgcatgtagtaccat-attcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagt 21133355  T
Q  141 cctcaccgct 150  Q
    ||||||||||    
T  21133354 cctcaccgct 21133345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 205
Target Start/End: Original strand, 24652402 - 24652472
Alignment:
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24652402 taagtcctcaccgctaaacactgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaagacgttccag 24652472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27208732 - 27208682
Alignment:
Q  153 acaccgctttgaacaat-tagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttc 202  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27208732 acaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttc 27208682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 13101336 - 13101297
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13101336 ctaagactcctcaataaatgcatatatgcatgtggtacca 13101297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 15643451 - 15643412
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15643451 ctaagactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 15643412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 81
Target Start/End: Original strand, 9497 - 9539
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataa 81  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  9497 ctaagactcctcaaaaaatgcaactatgcatgtggtaccataa 9539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 17592692 - 17592658
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17592692 actcctcaataaatgcagatatgcatgtggtacca 17592658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 78
Target Start/End: Original strand, 28292700 - 28292734
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28292700 actcctccataaatgcaaatatgcatgtggtacca 28292734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 19663026 - 19662985
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19663026 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata 19662985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Original strand, 23269192 - 23269260
Alignment:
Q  57 tgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 126  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||||    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23269192 tgcaactaagcatgtggtaccata-ttcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagcattct 23269260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Original strand, 23276061 - 23276129
Alignment:
Q  57 tgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 126  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||||    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23276061 tgcaactaagcatgtggtaccata-ttcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagcattct 23276129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 80
Target Start/End: Original strand, 29280916 - 29280957
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  29280916 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata 29280957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 90
Target Start/End: Original strand, 23062475 - 23062526
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggcc 90  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23062475 tctaagactcctcaacaagtgcaactatgcatgtggtaccat-attcagggcc 23062526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 74)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 41456369 - 41456120
Alignment:
Q  20 tatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41456369 tatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 41456270  T
Q  120 gcattctcagcagga-ctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctc 218  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41456269 gcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctc 41456170  T
Q  219 ccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  41456169 ccactttgatgtttatgcaactatcccacctgtgtatatctacatacaac 41456120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 40 - 267
Target Start/End: Original strand, 9532825 - 9533054
Alignment:
Q  40 taatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcagga-ctaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9532825 taatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaa 9532924  T
Q  139 gtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaa 237  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9532925 gtcctcaccgctccacaccactttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaa 9533024  T
Q  238 ctacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  9533025 ctacccaacctgtgtatctctacatacaac 9533054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 14084511 - 14084735
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcc 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14084511 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcc 14084609  T
Q  143 tcaccgctccacaccgcttt-gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaacta 240  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14084610 tcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 14084708  T
Q  241 cccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14084709 cccaacctgtgtatatctacatacaac 14084735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 14089912 - 14090136
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcc 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14089912 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcc 14090010  T
Q  143 tcaccgctccacaccgcttt-gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaacta 240  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14090011 tcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 14090109  T
Q  241 cccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14090110 cccaacctgtgtatatctacatacaac 14090136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 49399453 - 49399677
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcc 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  49399453 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaccaggacctaagtcc 49399551  T
Q  143 tcaccgctccacaccgcttt-gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaacta 240  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  49399552 tcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 49399650  T
Q  241 cccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  49399651 cccaacctgtgtatatctacatacaac 49399677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 45 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13969029 - 13968806
Alignment:
Q  45 ctcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcct 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  13969029 ctcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcct 13968931  T
Q  144 caccgctccacaccgcttt-gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactac 241  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  13968930 caccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ctatgcaactac 13968832  T
Q  242 ccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  13968831 ccaacctgtgtatatctacatacaac 13968806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 45 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13974504 - 13974281
Alignment:
Q  45 ctcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcct 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  13974504 ctcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcct 13974406  T
Q  144 caccgctccacaccgcttt-gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactac 241  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  13974405 caccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ctatgcaactac 13974307  T
Q  242 ccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  13974306 ccaacctgtgtatatctacatacaac 13974281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24123400 - 24123176
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcc 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24123400 actcctcaataaatgcaaatatgcacgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcc 24123302  T
Q  143 tcaccgctccacaccgcttt-gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaacta 240  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  24123301 tcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 24123203  T
Q  241 cccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  24123202 cccaacctgtgtatatctacatacaac 24123176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 8583491 - 8583267
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcc 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  8583491 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcc 8583393  T
Q  143 tcaccgctccacaccgcttt-gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaacta 240  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  8583392 tcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 8583294  T
Q  241 cccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||  || |||||||||||||||    
T  8583293 cccaacctatggatatctacatacaac 8583267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Original strand, 17157035 - 17157265
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-t 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  17157035 tctaagactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccgta-ttcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacat 17157133  T
Q  137 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgc 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  17157134 aagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgc 17157233  T
Q  236 aactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||| ||  |  |||||||||||||||||||    
T  17157234 aactaacccccttgtgtatatctacatacaac 17157265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Original strand, 24191736 - 24191966
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-t 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  24191736 tctaagactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccgta-ttcggggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacat 24191834  T
Q  137 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgc 235  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  24191835 aagttctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgc 24191934  T
Q  236 aactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||| ||  |  |||||||||||||||||||    
T  24191935 aactaacccccttgtgtatatctacatacaac 24191966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16802652 - 16802422
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-t 136  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  16802652 tctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaaacattctcatcaggacat 16802554  T
Q  137 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgc 235  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  16802553 aagtcatcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttctaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgc 16802454  T
Q  236 aactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
     |||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  16802453 gactaacccacttgtgtatatctacatacaac 16802422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Original strand, 17190810 - 17190992
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-t 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  17190810 tctaagactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtacca-aattcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacat 17190908  T
Q  137 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctccc 220  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17190909 aagtcctcaccgatcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaaagacaaggcgttccagagccgaagctctccc 17190992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 267
Target Start/End: Original strand, 12304724 - 12304952
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-ta 137  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| || ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  12304724 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgtatgtggtatcaaaat-cagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacata 12304822  T
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgca 236  Q
    |||||||||| ||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12304823 agtcctcaccacta-acaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgca 12304921  T
Q  237 actacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||  |  ||| |||||||||||||||||||    
T  12304922 actgactcacctgtgtatatctacatacaac 12304952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Original strand, 23174133 - 23174361
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-t 136  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||  |||| | || |  |||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| |    
T  23174133 tctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatg-ttcaagaccgtagcccacaccgctgtcgaatggttaaagcatttttt-caggacat 23174230  T
Q  137 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgc 235  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| || |||    
T  23174231 aagtcctcaccgcta-acaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttcaagagccgaagctctcccacttttatgcttttgc 23174329  T
Q  236 aactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||  || ||  |||||||||||||||||||    
T  23174330 aactgacccacttgtgtatatctacatacaac 23174361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8743086 - 8742910
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  8743086 atgcatgtggtaccaaaattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 8742989  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 240  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  8742988 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 8742910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8761256 - 8761080
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  8761256 atgcatgtggtaccaaaattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 8761159  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 240  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  8761158 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 8761080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Original strand, 4677164 - 4677322
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  4677164 atgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 4677261  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  4677262 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 4677322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Original strand, 41175477 - 41175635
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  41175477 atgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 41175574  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  41175575 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 41175635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Original strand, 41180615 - 41180773
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  41180615 atgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 41180712  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  41180713 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 41180773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Original strand, 13909529 - 13909687
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  13909529 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 13909626  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  13909627 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 13909687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Original strand, 13939988 - 13940146
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  13939988 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 13940085  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  13940086 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 13940146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Original strand, 44775201 - 44775359
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  44775201 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 44775298  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  44775299 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 44775359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Original strand, 44780385 - 44780543
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  44780385 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 44780482  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  44780483 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 44780543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 31690794 - 31690567
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcag-caggac-taagt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||    |||||| | |||    
T  31690794 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata-ttcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagt 31690696  T
Q  141 cctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaac 238  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | || ||| |||||||||    
T  31690695 cctcaccgctaaacaccgctttaaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagccctcccgcttttatgtttatgcaac 31690596  T
Q  239 tacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |  || ||  |||||||||||||||||||    
T  31690595 tgacccacttgtgtatatctacatacaac 31690567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 264
Target Start/End: Original strand, 12200203 - 12200403
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||  ||||| ||||    
T  12200203 atgcatgtggtaccaaaat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagttctcaccact-aacaccacttt 12200300  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctaca 261  Q
    || ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||  || ||  | |||||||||||    
T  12200301 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaagttgttccagagctgaagctctcccactgttatgcttatgcaacttacccacttgagtatatctaca 12200400  T
Q  262 tac 264  Q
    |||    
T  12200401 tac 12200403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Original strand, 13946474 - 13946632
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  13946474 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 13946571  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||    
T  13946572 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaaactctcccact 13946632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14544368 - 14544163
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcag-caggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||| ||  |||||||||    
T  14544368 atgcatgtggtaccataat-caggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgctt 14544270  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  ||  |  ||||||||||||    
T  14544269 tgagcaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccgcttgtgtatatctac 14544170  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  14544169 atacaac 14544163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17243883 - 17243651
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcattctcagcaggac- 135  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||     
T  17243883 tctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcggagccctcaccgctagtcgaatggttaaagcattcttttcaggaca 17243785  T
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatg 234  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| | || ||| |||||    
T  17243784 taagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacaagacgttctagggccgaagccctcccgcttttatgcttatg 17243685  T
Q  235 caact-acccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||| || | ||   ||||||||||||||||||    
T  17243684 caactgactccactgatgtatatctacatacaac 17243651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Original strand, 18888940 - 18889124
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcagcaggac- 135  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||   ||||||     
T  18888940 tctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattcttttcaggaca 18889038  T
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctccc 220  Q
    |||||||||| | ||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  18889039 taagtcctcatcactgaacaccgctttgaacaataaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctccc 18889124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14652892 - 14652688
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  14652892 atgcatgtggtaccataat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccacta-acaccactt 14652795  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  || ||  ||||||||||||    
T  14652794 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactattatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctac 14652695  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  14652694 atacaac 14652688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17199175 - 17199061
Alignment:
Q  107 tcgaatggttaaagcattctcag-caggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttcca 204  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17199175 tcgaatggttaaagcattcttttacaggacctaagtcctcaccgcta-acaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttcca 17199077  T
Q  205 gagccgaagctctccc 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  17199076 gagccgaagctctccc 17199061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Original strand, 18899979 - 18900212
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcagcaggac- 135  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||  |||||||||||||||||| |   ||||||     
T  18899979 tctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggccagagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcatttttttcaggaca 18900077  T
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattat 233  Q
    |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | || ||| ||||    
T  18900078 taagtcctcacctctaaacatcgctttgaacaacaaagtgttccaccgatttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttat 18900177  T
Q  234 gcaa-ctacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||| | || | ||  |||||||||||||||||||    
T  18900178 gcaaccgactccacttgtgtatatctacatacaac 18900212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 224
Target Start/End: Original strand, 14292706 - 14292865
Alignment:
Q  67 catgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttg 163  Q
    |||||||||||||||| |||||||    ||| ||||||||| |||||||||||||||||  |    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  14292706 catgtggtaccataat-cagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttttaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttg 14292804  T
Q  164 aacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccactt 224  Q
    | ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14292805 agcaactagtgctccaacgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactt 14292865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34852386 - 34852211
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  34852386 atgcatgtggtaccata-ttcagggccgtagccctcaccgttgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactt 34852288  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaa 237  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  34852287 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctctcacttttatgattatgcaa 34852211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13203715 - 13203511
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || |  ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  13203715 atgcatgtggtaccataaa-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatagttaaagcattcattttcaggacctaagtcctcaccacta-acaccactt 13203618  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || ||  | ||||||||||    
T  13203617 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactaacccacttgagtatatctac 13203518  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  13203517 atacaac 13203511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16383056 - 16382852
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  16383056 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccacta-acaccactt 16382959  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  || ||  ||||||||||||    
T  16382958 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgtaatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctac 16382859  T
Q  261 atacaac 267  Q
    | |||||    
T  16382858 acacaac 16382852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12961580 - 12961428
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgct 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||  | ||||||||||||||||| |   |||||| |||||| ||||||||  ||||||||    
T  12961580 atgcatgtggtaccataat-cagggccgaaaccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcatcaccgctaaacaccgct 12961482  T
Q  161 ttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagc 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12961481 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagc 12961428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16838677 - 16838475
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || | | || ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  16838677 atgcatgtggtaccataat-caggaccgt-agcctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttccaggacataagtcctcaccacta-acaccactt 16838581  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  || ||  | ||||||||||    
T  16838580 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgagtatatctac 16838481  T
Q  261 atacaa 266  Q
    ||||||    
T  16838480 atacaa 16838475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 267
Target Start/End: Original strand, 31943425 - 31943648
Alignment:
Q  48 ctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcag-caggac-taagtcctc 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||| ||||||   ||||||||||||| ||||||    |||||  | |||||||    
T  31943425 ctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata-ttcagggccgaagccctcaccgcaaatcgaatggttaaaacattctttttcaggaaatgagtcctc 31943523  T
Q  145 accgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacc 242  Q
    ||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| | | || ||| ||||||||||  |    
T  31943524 accgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacaacaaggcgttccagagccgaagccctctcgctttcatgcttatgcaactgac 31943623  T
Q  243 caaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    | ||  |||||||||||||||||||    
T  31943624 ccacttgtgtatatctacatacaac 31943648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 171 - 267
Target Start/End: Original strand, 12255233 - 12255329
Alignment:
Q  171 agtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccacttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  ||||||||||  || ||  |||||||||||||||||||    
T  12255233 agtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagccctcccgctttatacttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 12255329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18719312 - 18719106
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcag-caggac-taagtcctcaccgctccacaccgct 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||    |||||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  18719312 atgcatgtggtaccataat-cagggccgaagccctcaccgcttatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgct 18719214  T
Q  161 ttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccacttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatcta 259  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | ||| | ||| ||  ||||||||||  || ||  |||||||||||    
T  18719213 ttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgagaaggcgttccagggccgaaaccctcacgctttatacttatgcaactgacccacttgtgtatatcta 18719114  T
Q  260 catacaac 267  Q
    ||||||||    
T  18719113 catacaac 18719106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 11850860 - 11850780
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  11850860 actcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccat-attcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattc 11850780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16830065 - 16829952
Alignment:
Q  154 caccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaactacccaaccagtgt 252  Q
    |||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  || ||  | ||    
T  16830065 caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgagt 16829966  T
Q  253 atatctacatacaa 266  Q
    ||||||||||||||    
T  16829965 atatctacatacaa 16829952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 214
Target Start/End: Original strand, 19443469 - 19443621
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc--agcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgct 160  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||    ||| ||||||| | ||||||||||||||||||   | |||||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  19443469 atgcatgtggtaccataa--cagggccggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattcttttatcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgct 19443566  T
Q  161 ttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagc 214  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  19443567 ttgaacaacaatgtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagc 19443621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 267
Target Start/End: Original strand, 23173876 - 23173966
Alignment:
Q  178 caccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||  || ||  |||||||||||||||||||    
T  23173876 caccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcacacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 23173966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11965080 - 11964922
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||  | |||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  11965080 atgcatgtggtaccata-ttcagggccggagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattcatttcaggacctaagtcctcaccgctaaacaccgctt 11964982  T
Q  162 tgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctccc 220  Q
    |||||||  | |||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||| ||| |||||    
T  11964981 tgaacaacaaagtgttccaccactttgaacgacatggcgttccagggccggagccctccc 11964922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12479791 - 12479740
Alignment:
Q  154 caccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12479791 caccgctttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 12479740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 38312352 - 38312183
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc---agcaggac 135  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    ||| ||||| | | ||||||||||| ||||||    | ||||||    
T  38312352 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata--tcagggccggagccctcaccgttatagaatggttaaaacattctttttatcaggac 38312255  T
Q  136 -taagtcctcaccgctccacaccgctttgaa-caat-tagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
     | |||||||||||||  ||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38312254 atgagtcctcaccgcta-acaccgctttgaaacaacatggtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 38312183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 12034549 - 12034506
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataat 82  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12034549 ctaagactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccataat 12034506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12356056 - 12356009
Alignment:
Q  154 caccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgtt 201  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12356056 caccgctttgaacaacaagtgttccactgctttgaacgacgaggcgtt 12356009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12362605 - 12362558
Alignment:
Q  154 caccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgtt 201  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12362605 caccgctttgaacaacaagtgttccactgctttgaacgacgaggcgtt 12362558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 10597931 - 10597893
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataat 82  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10597931 actcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccataat 10597893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18129907 - 18129837
Alignment:
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18129907 taagtcctcaccactaatcaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 18129837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 18757157 - 18757123
Alignment:
Q  48 ctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataat 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18757157 ctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataat 18757123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 78
Target Start/End: Original strand, 20187673 - 20187707
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20187673 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 20187707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13303364 - 13303287
Alignment:
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagc 214  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  13303364 agtcctcaccgctaatcaccgttttgaacaacaatgtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagc 13303287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13314005 - 13313908
Alignment:
Q  172 gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctc-ccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| || | || ||| ||||||||||  || ||  |||||||||||||||||||    
T  13314005 gtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctcaccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 13313908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 8374117 - 8374077
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8374117 tctaagacccctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 8374077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 189
Target Start/End: Original strand, 12363445 - 12363572
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||  | |||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  12363445 atgcatgtggtaccata-ttcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcatttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 12363543  T
Q  162 tgaacaa-ttagtgttccaccgctttgaa 189  Q
     ||||||   |||||||||||||||||||    
T  12363544 cgaacaacaaagtgttccaccgctttgaa 12363572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 78
Target Start/End: Original strand, 15374655 - 15374694
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15374655 ctaagactcctcaataaatgcagatatgcatgtggtacca 15374694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 30597050 - 30597011
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30597050 ctaagactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 30597011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13324917 - 13324875
Alignment:
Q  172 gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagc 214  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  13324917 gtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagc 13324875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 81
Target Start/End: Original strand, 14864763 - 14864805
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataa 81  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14864763 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataa 14864805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 81
Target Start/End: Original strand, 17130672 - 17130714
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataa 81  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17130672 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataa 17130714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18136421 - 18136351
Alignment:
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18136421 taagtcctcaccactaatcaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacaacaaggcgttccag 18136351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 48774805 - 48774771
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48774805 actcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtacca 48774771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 80
Target Start/End: Original strand, 10553848 - 10553889
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  10553848 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata 10553889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 14764332 - 14764291
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  14764332 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata 14764291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 267
Target Start/End: Original strand, 17496239 - 17496328
Alignment:
Q  180 ccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaact-acccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| | || ||| |||||||||| || | ||  |||||||||||||||||||    
T  17496239 ccgctttgaacgacgaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaac 17496328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 23372078 - 23372037
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  23372078 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata 23372037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 80
Target Start/End: Original strand, 51300077 - 51300118
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  51300077 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata 51300118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 10597791 - 10597703
Alignment:
Q  180 ccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| | || ||| |||||| |||| |  ||  |||||||||||||||||||    
T  10597791 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctcccgcttttatgcttatgcgactaactcacttgtgtatatctacatacaac 10597703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18757020 - 18756980
Alignment:
Q  180 ccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctccc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  18757020 ccgctttgaacgacgaggcgttccagggcagaagccctccc 18756980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 20 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20046100 - 20045852
Alignment:
Q  20 tatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20046100 tatgacacgacatccccatctaatactcctcaaaaaatgaaattatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtagaatggttaaa 20046001  T
Q  120 gcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctc 218  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046000 gcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctc 20045901  T
Q  219 ccacttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20045900 ccgcttgatgtttatgaaactacccaacctgtgtatatctacatacaac 20045852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 39 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20438734 - 20438504
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-ta 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20438734 ctaatactcctaaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaccta 20438635  T
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgca 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20438634 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgca 20438535  T
Q  237 actacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20438534 actacccaacctgtgtatctctacatacaac 20438504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 267
Target Start/End: Original strand, 41110769 - 41111019
Alignment:
Q  19 atatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaa 118  Q
    |||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41110769 atatgacatgacacccccctttaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtgataccataattcagggtcatgacccacaccattgtcgaatggttaa 41110868  T
Q  119 agcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctct 217  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41110869 agcattctcagcatgacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacgactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 41110968  T
Q  218 cccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41110969 cccactttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctacatacaac 41111019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 21542036 - 21542260
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcc 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21542036 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcc 21542134  T
Q  143 tcaccgctccacaccgcttt-gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaacta 240  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21542135 tcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 21542233  T
Q  241 cccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21542234 cccaacctgtgtatatctacatacaac 21542260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 42096100 - 42095876
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcc 142  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  42096100 actcctcagtaaatgcaaatatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcc 42096002  T
Q  143 tcaccgctccacaccgcttt-gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaacta 240  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  42096001 tcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 42095903  T
Q  241 cccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  42095902 cccaacctgtgtatatctacatacaac 42095876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19664332 - 19664102
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-t 136  Q
    ||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  19664332 tctaagactcctcaacaaatgcagctatgcatgtggtaccata-ttcagggccggagccctcactgctatcgaatggttaaagcattcttatcaggacat 19664234  T
Q  137 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgc 235  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  19664233 aagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttaatgcttatgc 19664134  T
Q  236 aactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  19664133 aactaacccacttgtgtatatctacatacaac 19664102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 32650102 - 32650307
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||    
T  32650102 atgcatgtggtaccata-ttcaggaccgtagcccacaccgttgtcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcatcaccgctaaacaccgcttt 32650200  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaact-acccaaccagtgtatatctac 260  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||  ||||||||||||    
T  32650201 gaacaactaatgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaactgactccacttgtgtatatctac 32650300  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  32650301 atacaac 32650307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 240
Target Start/End: Original strand, 27280192 - 27280369
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  27280192 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 27280290  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 240  Q
    ||  || ||||  |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  27280291 gagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 27280369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 3706939 - 3706736
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  3706939 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccacta-acaccactt 3706842  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  || ||  | ||||||||||    
T  3706841 tgagcaattagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgagtatatctac 3706742  T
Q  261 atacaa 266  Q
    ||||||    
T  3706741 atacaa 3706736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 136 - 267
Target Start/End: Original strand, 20242606 - 20242738
Alignment:
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatg 234  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  20242606 taagtcctcaccgctaaacaccgctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatg 20242705  T
Q  235 caactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||| |  || ||  |||||||||||||||||||    
T  20242706 caaatgacccacttgtgtatatctacatacaac 20242738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23066842 - 23066673
Alignment:
Q  101 ccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggc 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||| ||||| ||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  23066842 ccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcatcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggc 23066743  T
Q  199 gttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  || ||  |||||||||||||||||||    
T  23066742 gttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 23066673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19778639 - 19778431
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctcag--caggac-taagtcctcaccgctccacaccgc 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||     |||||| |||||||||||||||  |||| ||    
T  19778639 atgcatgtggtaccataat-cagggtcgcagccctcaccgctgttcgaatggttaaagcattctttttccaggacataagtcctcaccgctaaacacagc 19778541  T
Q  160 tttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaact-acccaaccagtgtatatc 257  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||| | || ||| |||||||||| || | ||  |||||||||    
T  19778540 tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagggccgaggccctcccgctttcatgtttatgcaactaactccacttgtgtatatc 19778441  T
Q  258 tacatacaac 267  Q
    ||||||||||    
T  19778440 tacatacaac 19778431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 29554578 - 29554416
Alignment:
Q  109 gaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccaga 206  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  29554578 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagg 29554479  T
Q  207 gccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaact-acccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||| ||| ||||| | ||  || |||||||||| || | ||  |||||||||||||||||||    
T  29554478 gccggagccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaac 29554416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 267
Target Start/End: Original strand, 21732569 - 21732682
Alignment:
Q  155 accgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccacttgatgattatgcaact-acccaaccagtgta 253  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| ||||| ||| ||| |||||||||| || | ||  |||||    
T  21732569 accgctttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttctagggccagagccctcccgctttatgcttatgcaactgactccacttgtgta 21732668  T
Q  254 tatctacatacaac 267  Q
    ||||||||||||||    
T  21732669 tatctacatacaac 21732682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20824445 - 20824330
Alignment:
Q  154 caccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact--tgatgattatgcaactacccaaccagtg 251  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||| ||||||||||| || ||  |||    
T  20824445 caccgctttgaacaacaagtgttccacctctttgaacgacaaggcgttctagagcagaagccctcccgcttattatgcttatgcaactaacctacttgtg 20824346  T
Q  252 tatatctacatacaac 267  Q
    ||||||||||||||||    
T  20824345 tatatctacatacaac 20824330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20942034 - 20941891
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtc-gaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    ||| ||||||| |  |||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||   ||||||||    
T  20942034 atgcatgtggtaccata-ttcagggccggagccctcaccgctatttgaatggttaaagcattcatttcaggacataagtcctcaccgctaatcaccgctt 20941936  T
Q  162 tgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20941935 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 20941891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 23195673 - 23195568
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtc 141  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||| |||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||| ||||||    
T  23195673 actcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccat-attcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagtc 23195577  T
Q  142 ctcaccgct 150  Q
    |||||||||    
T  23195576 ctcaccgct 23195568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22448440 - 22448296
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||          |    
T  22448440 atgcatgtggtaccataat-cagggccgtagccctcaccgctgttgaatggttaaagcattcatttacaggacataagtcctcaccact----------t 22448352  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctct 217  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22448351 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 22448296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20838270 - 20838140
Alignment:
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact--tgatgattatgc 235  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||| | ||||| ||  | ||| ||||||    
T  20838270 agtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaatgttccaccactttgaacgacaaggcattccagggcagaatccctcccgcttattatgcttatgc 20838171  T
Q  236 aactacccaaccagtgtatatctacatacaa 266  Q
    ||||| || ||  ||||||||| ||||||||    
T  20838170 aactaacccacttgtgtatatccacatacaa 20838140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 150
Target Start/End: Original strand, 36614918 - 36615018
Alignment:
Q  47 cctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctca 145  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||   |||| ||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  36614918 cctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaa--cagggccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagtcctca 36615013  T
Q  146 ccgct 150  Q
    |||||    
T  36615014 ccgct 36615018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 205
Target Start/End: Original strand, 19961210 - 19961277
Alignment:
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaat-tagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19961210 agtcctcaccgcta-acaccgcttcgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 19961277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16883674 - 16883575
Alignment:
Q  109 gaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaa-ttagtgttccaccgc-tttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    |||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16883674 gaatggttaaagcattcatttcaggacataagtcctcaccgctaatcaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgcttttgaacgacaaggcgttccag 16883575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 955128 - 955082
Alignment:
Q  178 caccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccactt 224  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  955128 caccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctcttccactt 955082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 78
Target Start/End: Original strand, 9269912 - 9269946
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9269912 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 9269946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 150
Target Start/End: Original strand, 24079542 - 24079637
Alignment:
Q  55 aatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg--tcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgct 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||| ||||||||  | |||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||    
T  24079542 aatgcaaatatgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagtcctcaccgct 24079637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 24109212 - 24109117
Alignment:
Q  55 aatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg--tcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgct 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||| ||||||||  | |||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||    
T  24109212 aatgcaaatatgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagtcctcaccgct 24109117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Original strand, 29535019 - 29535071
Alignment:
Q  154 caccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29535019 caccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 29535071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 78
Target Start/End: Original strand, 43088366 - 43088405
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43088366 ctaagactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 43088405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 78
Target Start/End: Original strand, 4231167 - 4231201
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4231167 actcctccataaatgcaaatatgcatgtggtacca 4231201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 16669474 - 16669432
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataa 81  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16669474 ctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataa 16669432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 20852267 - 20852225
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataa 81  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20852267 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataa 20852225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 20858893 - 20858851
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataa 81  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20858893 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataa 20858851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 81
Target Start/End: Original strand, 21705197 - 21705239
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataa 81  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21705197 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataa 21705239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21734531 - 21734442
Alignment:
Q  180 ccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccacttgat--gattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||   ||| ||||||||| ||  ||||||||||  || | ||| |||||||||||||||||||    
T  21734531 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcccactttatatgattatgcaatgactccacctgtgtatatctacatacaac 21734442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 78
Target Start/End: Original strand, 24850079 - 24850113
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24850079 actcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtacca 24850113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21745722 - 21745634
Alignment:
Q  180 ccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccacttg-atgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||   ||| |||||| ||  ||||||||||||  || | ||| |||||||||||||||||||    
T  21745722 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcccatttatatgattatgcaatgactccacctgtgtatatctacatacaac 21745634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 44)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19903149 - 19902901
Alignment:
Q  20 tatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 119  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19903149 tatgacacgacatccccccctaatactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 19903050  T
Q  120 gcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctc 218  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19903049 gcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctc 19902950  T
Q  219 ccacttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19902949 ccacttgatatttatgcaactacccaacctgtgtatatctacatacaac 19902901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 267
Target Start/End: Original strand, 23865391 - 23865638
Alignment:
Q  20 tatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 119  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23865391 tatgatacgacatccccc-ctaatactcctcaataaatgcaagtatgcatgtggtaccataatccagggccatgacccacaccgctgtcaaatggttaaa 23865489  T
Q  120 gcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctc 218  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23865490 gcattctcaacaggacataagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctc 23865589  T
Q  219 ccacttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23865590 ccacttgatgtttatgcaactacccaacctgtgtatatctacatacaac 23865638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 267
Target Start/End: Original strand, 17053552 - 17053802
Alignment:
Q  19 atatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaa 118  Q
    |||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17053552 atatgacatgacacccccctttaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgccgaatggttaa 17053651  T
Q  119 agcattctcagcagga-ctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctct 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17053652 agcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagttttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagctgaagctct 17053751  T
Q  218 cccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17053752 cccactttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctacatacaac 17053802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 39 - 267
Target Start/End: Original strand, 44476211 - 44476441
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcagga-cta 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  44476211 ctaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaccta 44476310  T
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgca 236  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  44476311 agtcctcaccgctccacaccgttttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgca 44476410  T
Q  237 actacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  44476411 actacccaacctgtgtatctctacatacaac 44476441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 39 - 267
Target Start/End: Original strand, 44479473 - 44479703
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcagga-cta 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  44479473 ctaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaccta 44479572  T
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgca 236  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  44479573 agtcctcaccgctccacaccgttttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgca 44479672  T
Q  237 actacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  44479673 actacccaacctgtgtatctctacatacaac 44479703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 23825104 - 23825328
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcc 142  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23825104 actcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcc 23825202  T
Q  143 tcaccgctccacaccgcttt-gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaacta 240  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  23825203 tcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 23825301  T
Q  241 cccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23825302 cccaacctgtgtatatctacatacaac 23825328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 252
Target Start/End: Original strand, 25409512 - 25409743
Alignment:
Q  21 atgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaag 120  Q
    |||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25409512 atgacatgacatccccc-ctaattctcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataac-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaag 25409609  T
Q  121 cattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcc 219  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25409610 cattctcatcaggacctaagtcatcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgatccagagccgaagctctcc 25409709  T
Q  220 cac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgt 252  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  25409710 cactttgatgtttatgcaactacccaacctgtgt 25409743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 30767145 - 30766922
Alignment:
Q  45 ctcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcct 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  30767145 ctcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcataaggacctaagtcct 30767047  T
Q  144 caccgctccacaccgcttt-gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactac 241  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  30767046 caccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ctatgcaactac 30766948  T
Q  242 ccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
     ||||| |||||||||||||||||||    
T  30766947 tcaacctgtgtatatctacatacaac 30766922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14057810 - 14057580
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-t 136  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    ||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  14057810 tctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagcattcttatcaggacat 14057712  T
Q  137 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgc 235  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  14057711 aagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgc 14057612  T
Q  236 aactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||| || ||  |||||||| ||||||||||    
T  14057611 aactaacccacttgtgtatatttacatacaac 14057580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22025762 - 22025556
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgct 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    ||| ||||||||| |||||||||||||||||  |   |||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  22025762 atgcatgtggtaccataat-cagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgct 22025664  T
Q  161 ttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatcta 259  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  || ||  || ||||||||    
T  22025663 ttgagcaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtctatatcta 22025564  T
Q  260 catacaac 267  Q
    ||||||||    
T  22025563 catacaac 22025556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1804668 - 1804492
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  1804668 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 1804571  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 240  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  1804570 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 1804492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 240
Target Start/End: Original strand, 36799376 - 36799552
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  36799376 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 36799473  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 240  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  36799474 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 36799552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9273360 - 9273183
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  9273360 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcagaacataagtcctcaccact-aacaccacttt 9273262  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 240  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  9273261 gagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 9273183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18681703 - 18681545
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  18681703 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 18681606  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  18681605 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 18681545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31568012 - 31567854
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  31568012 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 31567915  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  31567914 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 31567854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31573233 - 31573075
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  31573233 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 31573136  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  31573135 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 31573075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Original strand, 18609767 - 18609949
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-t 136  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||   |||||| |    
T  18609767 tctaagactcctcgataattgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggccggagccctcactgctatcgaatggttaaagcattcttttcaggacat 18609865  T
Q  137 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctccc 220  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||| |||||    
T  18609866 aagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttcaacgacaaggcattccagggccgaagccctccc 18609949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 21282038 - 21282264
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcag-caggac-taagt 140  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||    |||||| | |||    
T  21282038 actcctcaaataatgcaaatatgcatgtggtaccata-ttcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagt 21282136  T
Q  141 cctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaact 239  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||    
T  21282137 cgtcaccgctatacaccgctttgaacaacaagtgttccaccgttttgaacgacaaggtgttccagagccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaact 21282236  T
Q  240 acccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    | || ||  |||||||||||||||||||    
T  21282237 aacccacttgtgtatatctacatacaac 21282264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 136 - 267
Target Start/End: Original strand, 25110914 - 25111046
Alignment:
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatg 234  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  25110914 taagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaagacattccagagccgaagctctcccacttttatgcttatg 25111013  T
Q  235 caactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  25111014 caactaacccacttgtgtatatctacatacaac 25111046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22063731 - 22063559
Alignment:
Q  99 caccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacga 195  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |   |||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  22063731 caccgctgtagaatggttaaagcattcatttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgagcaactagtgctccaccgctttgaacgacaa 22063632  T
Q  196 ggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  || ||  |||||||||||||||||||    
T  22063631 ggcgttccggagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 22063559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 41009637 - 41009430
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgct 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||  | ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  41009637 atgcatgtggtaccataat-cagggccgaaaccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgct 41009539  T
Q  161 ttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaact-acccaaccagtgtatatct 258  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | || ||| |||||||||| || | ||  ||||||||||    
T  41009538 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactaactccactggtgtatatct 41009439  T
Q  259 acatacaac 267  Q
    |||||||||    
T  41009438 acatacaac 41009430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 220
Target Start/End: Original strand, 21668901 - 21669014
Alignment:
Q  109 gaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccaga 206  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21668901 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaga 21669000  T
Q  207 gccgaagctctccc 220  Q
    ||||||||||||||    
T  21669001 gccgaagctctccc 21669014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21327027 - 21326847
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcag--caggac-taagtcctcaccgctccacaccgc 159  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||     |||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  21327027 atgcatgtggtaccataat-cagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttccaggacataagtcctcaccgctaaacaccgc 21326929  T
Q  160 tttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaacta 240  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| | || ||| |||||||||||    
T  21326928 tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaggccctcccgctttcatgtttatgcaacta 21326847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21322439 - 21322231
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcag--caggac-taagtcctcaccgctccacaccgc 159  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||     |||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  21322439 atgcatgtggtaccataat-cagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattcttttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgc 21322341  T
Q  160 tttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaact-acccaaccagtgtatatc 257  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||  | ||||| | || ||| |||||||||| || | ||  |||||||||    
T  21322340 tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagggccgagaccctcccgctttcatgtttatgcaactaactccacttgtgtatatc 21322241  T
Q  258 tacatacaac 267  Q
    ||||||||||    
T  21322240 tacatacaac 21322231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 22177586 - 22177790
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||| ||||| ||  ||||| |||    
T  22177586 atgcatgtggtaccataat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcttcaccacta-acaccactt 22177683  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| | ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||  || ||  ||||||||||||    
T  22177684 tgagcaacttgtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttttgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctac 22177783  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  22177784 atacaac 22177790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 22050201 - 22050405
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  22050201 atgcatgtggtaccataat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacctaagtcctcaccacta-acaccactt 22050298  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    | | ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||| |  || ||  | ||||||||||    
T  22050299 taagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaaatgacccacttgagtatatctac 22050398  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  22050399 atacaac 22050405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 22055719 - 22055923
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| ||| |||||||| ||  ||||| |||    
T  22055719 atgcatgtggtaccataat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacctaaatcctcaccacta-acaccactt 22055816  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    | | ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |  || ||  | ||||||||||    
T  22055817 taagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaaatgacccacttgagtatatctac 22055916  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  22055917 atacaac 22055923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 10606931 - 10607139
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcag-caggac-taagtcctcaccgctccacaccgct 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    ||| |||||||  | ||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||  |||||||     
T  10606931 atgcatgtggtaccataat-cagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcg 10607029  T
Q  161 ttgaacaattag-tgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaact-acccaaccagtgtatatc 257  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| ||||| | || ||| |||||||||| || | ||  |||||||||    
T  10607030 ttgaacaacaaggtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatc 10607129  T
Q  258 tacatacaac 267  Q
    ||||||||||    
T  10607130 tacatacaac 10607139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21300229 - 21300114
Alignment:
Q  154 caccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaact-acccaaccagtg 251  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||| | || ||| |||||||||| || | ||  |||    
T  21300229 caccgctttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccaaggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtg 21300130  T
Q  252 tatatctacatacaac 267  Q
    ||||||||||||||||    
T  21300129 tatatctacatacaac 21300114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 31412708 - 31412626
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg--tcgaatggttaaagcattc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  31412708 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattc 31412626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 31418890 - 31418808
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg--tcgaatggttaaagcattc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  31418890 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattc 31418808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19988322 - 19988224
Alignment:
Q  109 gaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattag-tgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    |||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19988322 gaatggttaaagcattcatttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttcaacaacaaaatgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 19988224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20974201 - 20974073
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcag-caggac-taagtcctcaccgctccacaccgct 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    ||| |||||||  | ||||||||||||||||||    |||||| |||||||||| ||||  ||||||||    
T  20974201 atgcatgtggtaccataat-cagggccgaagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcatcgctaaacaccgct 20974103  T
Q  161 ttgaacaattagtgttccaccgctttgaac 190  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20974102 ttgaacaacttgtgttccaccgctttgaac 20974073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 82
Target Start/End: Original strand, 5240064 - 5240098
Alignment:
Q  48 ctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataat 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5240064 ctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataat 5240098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 11392760 - 11392721
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11392760 ctaagactcctcaataaatgcagatatgcatgtggtacca 11392721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 23653189 - 23653139
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggcc 90  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23653189 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccat-attcagggcc 23653139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 8596293 - 8596251
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8596293 tctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccata 8596251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 90
Target Start/End: Original strand, 23653819 - 23653864
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggcc 90  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23653819 actcctcaagaaatgcaactatgcatgtggtaccat-attcagggcc 23653864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 24321804 - 24321762
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataa 81  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24321804 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataa 24321762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 78
Target Start/End: Original strand, 27345697 - 27345731
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27345697 actcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtacca 27345731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 8729214 - 8729173
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8729214 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata 8729173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22176107 - 22176031
Alignment:
Q  190 cgacgaggcgttccagagccgaagctctcccacttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||||  || ||  |||||||||||||||||||    
T  22176107 cgacaaggcgttccagagccgaatctctccc-ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 22176031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 27942375 - 27942334
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27942375 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata 27942334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27942261 - 27942221
Alignment:
Q  153 acaccgctttgaacaat-tagtgttccaccgctttgaacga 192  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27942261 acaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacga 27942221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 4)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 267
Target Start/End: Original strand, 110714 - 110962
Alignment:
Q  19 atatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaa 118  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  110714 atatgacacgacacccccccttaatactcctcaataa-tgcaattatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaa 110812  T
Q  119 agcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctct 217  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  110813 agcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcattgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 110912  T
Q  218 cccacttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  110913 cccacttgatgtttatgcaactacccaacctgtgtatatctacatacaac 110962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 126
Target Start/End: Original strand, 116749 - 116855
Alignment:
Q  19 atatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaa 118  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  116749 atatgacacgacacccccccttaatactcctcaataa-tgcaattatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaa 116847  T
Q  119 agcattct 126  Q
    ||||||||    
T  116848 agcattct 116855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 92336 - 92294
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  92336 tctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccata 92294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 98062 - 98020
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  98062 tctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccata 98020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 9852 - 9605
Alignment:
Q  20 tatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 119  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9852 tatgacacaacatccccc-ctaatactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 9754  T
Q  120 gcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctc 218  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9753 gcattctcaataggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctc 9654  T
Q  219 ccacttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9653 ccacttgttttttatgcaactacccaacctgtgtatatctacatacaac 9605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 46)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 39 - 267
Target Start/End: Original strand, 19510974 - 19511204
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcagga-cta 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  19510974 ctaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaccta 19511073  T
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgca 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19511074 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgca 19511173  T
Q  237 actacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19511174 actacccaacctgtgtatctctacatacaac 19511204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 23527428 - 23527654
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcagga-ctaagtcc 142  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23527428 actcctcaatgaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcc 23527527  T
Q  143 tcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgatt-atgcaacta 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  23527528 tcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttaatgcaacta 23527627  T
Q  241 cccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23527628 ccccacctgtgtatatctacatacaac 23527654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 52 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21675660 - 21675444
Alignment:
Q  52 ataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgct 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  21675660 ataaatgcaaatatgcatgtggtaccata-ttcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 21675562  T
Q  151 ccacaccgcttt-gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaacca 248  Q
    | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  21675561 caacaccgcttttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaactacccaacct 21675463  T
Q  249 gtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21675462 gtgtatatctacatacaac 21675444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 52 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1857692 - 1857476
Alignment:
Q  52 ataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgct 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1857692 ataaatgcaaatatgcatgtggtaccata-ttcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 1857594  T
Q  151 ccacaccgcttt-gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaacca 248  Q
    | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||     
T  1857593 caacaccgcttttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ctatgcaactacccaacct 1857495  T
Q  249 gtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1857494 gtgtatatctacatacaac 1857476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22439928 - 22439698
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-t 136  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  22439928 tctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaaacattctcatcaggacat 22439830  T
Q  137 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgc 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || ||| ||||||    
T  22439829 aagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgtttcaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccggagctctcccacttttatgcttatgc 22439730  T
Q  236 aactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||| || ||   ||||||||||||||||||    
T  22439729 aactaacccacttatgtatatctacatacaac 22439698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 37805517 - 37805289
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-ta 137  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  37805517 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaat-cagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacata 37805419  T
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgca 236  Q
    |||||||||| ||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  37805418 agtcctcaccacta-acaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttacagagccgaagctctcccacttttatgcttatgca 37805320  T
Q  237 actacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||  || ||| |||||||||||||||||||    
T  37805319 actgacccacctgtgtatatctacatacaac 37805289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 223
Target Start/End: Original strand, 9775442 - 9775625
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-ta 137  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  9775442 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaat-cagggccgtgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacata 9775540  T
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    |||||||||| ||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9775541 agtcctcaccacta-acaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 9775625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23112939 - 23112773
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-ta 137  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  23112939 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgaccctcaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacata 23112841  T
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaa-ttagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23112840 agtcctcaccact-aacaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggtgttccag 23112773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17264971 - 17264794
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  17264971 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 17264873  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 240  Q
    ||  || ||||  |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17264872 gagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaagctctcccactgtgatgtttatgcaacta 17264794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21678443 - 21678267
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  21678443 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 21678346  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 240  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  21678345 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 21678267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17271453 - 17271276
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  17271453 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgttgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 17271355  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 240  Q
    ||  || ||||  |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17271354 gagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaagctctcccactgtgatgtttatgcaacta 17271276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Original strand, 22175014 - 22175173
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||  ||||| ||||    
T  22175014 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctaaccact-aacaccacttt 22175112  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22175113 gagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcgttccagagccgaagctctcccact 22175173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 758427 - 758224
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  758427 atgcatgtggtaccataat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttcaggacgtaagtcctcaccacta-acaccacttt 758330  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctaca 261  Q
    || ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  || ||  |||||||||||||    
T  758329 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 758230  T
Q  262 tacaac 267  Q
    ||||||    
T  758229 tacaac 758224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22313005 - 22312801
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  22313005 atgcatgtggtaccataat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactg-acaccactt 22312908  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||  || ||  ||||||||||||    
T  22312907 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctac 22312808  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  22312807 atacaac 22312801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 20937594 - 20937799
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |  ||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |   || ||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  20937594 atgcatgtggtaccataat-caggaccgtagccctcaccgatgtagaatggttaaagcattcattttcaagacataagtcctcaccactaaacaccactt 20937692  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  || ||  ||||||||||||    
T  20937693 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccacagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctac 20937792  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  20937793 atacaac 20937799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Original strand, 10816774 - 10816949
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | | |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  10816774 atgcatgtggtaccata-ttcagtgtcgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactt 10816872  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaa 237  Q
    ||| ||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  10816873 tgagcaactagtgctccaccaatttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaa 10816949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22008028 - 22007893
Alignment:
Q  135 ctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact--tgatgatt 231  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||||    
T  22008028 ctaagtcctcaccgctaaacatcgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccacttattatgatt 22007929  T
Q  232 atgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||||  || ||  |||||||||||||||||||    
T  22007928 atgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 22007893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Original strand, 23538801 - 23538976
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  23538801 atgcatgtggtaccata-ttcagggccgtagccctcaccgctgtagtatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactt 23538899  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaa 237  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  23538900 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaagtcgttccagagccgaagctctctcacttttatgattatgcaa 23538976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22509312 - 22509142
Alignment:
Q  99 caccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgag 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||| ||| ||||  |||||| ||||||||||| ||    
T  22509312 caccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccacta-acaccactttgagcaactagtactccaccactttgaacgacaag 22509214  T
Q  197 gcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||  || ||  |||||||||||||||||||    
T  22509213 gcgttccagatccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 22509142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 24751727 - 24751647
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24751727 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccat-attcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattc 24751647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 24669189 - 24669109
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24669189 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccat-attcagggtcgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattc 24669109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 24738958 - 24738878
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24738958 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccat-attcagggtcgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattc 24738878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6404600 - 6404466
Alignment:
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatt-agtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattat 233  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||| | ||  || ||||    
T  6404600 taagtcctcaccgctaatcaccgctttgaacaacagagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagctctcccgcttttgtgcttat 6404501  T
Q  234 gcaact-acccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||| || | ||  |||||||||||||||||||    
T  6404500 gcaactgactccacttgtgtatatctacatacaac 6404466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 205
Target Start/End: Original strand, 34829003 - 34829171
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc---agcaggac 135  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||    ||| ||||| | | ||||||||||||||||||    | ||||||    
T  34829003 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata--tcagagccggagccctcaccgttatagaatggttaaagcattctttttatcaggac 34829100  T
Q  136 -taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaat-tagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
     | ||||||||||  |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34829101 atgagtcctcaccatta-acaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 34829171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 27636074 - 27635969
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtc 141  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||| |||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||| ||||||    
T  27636074 actcctcaataagtgcaaatatgcatgtggtaccat-attcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagtc 27635978  T
Q  142 ctcaccgct 150  Q
    |||||||||    
T  27635977 ctcaccgct 27635969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6728364 - 6728280
Alignment:
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcc 219  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||    
T  6728364 taagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgtttcagggccggagccctcc 6728280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28371512 - 28371459
Alignment:
Q  153 acaccgctttgaacaat-tagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28371512 acaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 28371459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 38145840 - 38145787
Alignment:
Q  153 acaccgctttgaacaat-tagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38145840 acaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 38145787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22232813 - 22232606
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||  | ||||||||| |||||||    |||||| |||||| | ||||||  |||||||||    
T  22232813 atgcatgtggtaccata-ttcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttatagcattcatttcaggacataagtctttaccgctaaacaccgctt 22232715  T
Q  162 tgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccactt--gatgattatgcaactacccaaccagtgtatatct 258  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||   ||| ||||| |||   ||| ||||||||||  || ||  ||||||||||    
T  22232714 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggtgttccagggcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatct 22232615  T
Q  259 acatacaac 267  Q
    |||||||||    
T  22232614 acatacaac 22232606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Original strand, 42960171 - 42960224
Alignment:
Q  153 acaccgctttgaacaat-tagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  42960171 acaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccag 42960224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 81
Target Start/End: Original strand, 19235822 - 19235864
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataa 81  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19235822 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataa 19235864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 19800520 - 19800486
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19800520 actcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtacca 19800486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 81
Target Start/End: Original strand, 22460077 - 22460119
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataa 81  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22460077 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataa 22460119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 28890560 - 28890518
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataa 81  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  28890560 ctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataa 28890518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 28897264 - 28897222
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataa 81  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  28897264 ctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataa 28897222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 28910464 - 28910422
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataa 81  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  28910464 ctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataa 28910422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 28925732 - 28925690
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataa 81  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  28925732 ctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataa 28925690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 28932155 - 28932113
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataa 81  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  28932155 ctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataa 28932113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 28933659 - 28933617
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataa 81  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  28933659 ctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataa 28933617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 28946859 - 28946817
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataa 81  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  28946859 ctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataa 28946817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 29746729 - 29746695
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29746729 actcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtacca 29746695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 80
Target Start/End: Original strand, 22336082 - 22336123
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22336082 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata 22336123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 80
Target Start/End: Original strand, 22749728 - 22749769
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22749728 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata 22749769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 28371627 - 28371586
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28371627 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata 28371586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 38145954 - 38145913
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  38145954 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata 38145913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 80
Target Start/End: Original strand, 42960057 - 42960098
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  42960057 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata 42960098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 39 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 8047098 - 8046870
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-ta 137  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8047098 ctaatactcctcaataa-tgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaccta 8047000  T
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccacttgatgattatgcaa 237  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  8046999 agtcctcactgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttgatgtttatgcca 8046900  T
Q  238 ctacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8046899 ctacccaacctgtgtatatctacatacaac 8046870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 39 - 267
Target Start/End: Original strand, 11847028 - 11847257
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-ta 137  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  11847028 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccataaa-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaccta 11847126  T
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgca 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11847127 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgca 11847226  T
Q  237 actacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  11847227 actacccaacctgtgtatatcttcatacaac 11847257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 36 - 267
Target Start/End: Original strand, 18212111 - 18212342
Alignment:
Q  36 catctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac 135  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18212111 catctaagactcctcac-aaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggac 18212208  T
Q  136 -taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattat 233  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  18212209 ataagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttat 18212308  T
Q  234 gcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||  || ||  |||||||||||||||||||    
T  18212309 gcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 18212342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 267
Target Start/End: Original strand, 15533761 - 15533989
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-ta 137  Q
    |||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15533761 ctaagactcctcaacaaaagcaactatgcatgtggtaccaaaat-cagggccgtgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacata 15533859  T
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgca 236  Q
    |||||||||| ||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  15533860 agtcctcaccacta-acaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgca 15533958  T
Q  237 actacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||  || ||| |||||||||||||||||||    
T  15533959 actgacccacctgtgtatatctacatacaac 15533989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 635940 - 635763
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  635940 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 635842  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 240  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  635841 gagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 635763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 53748927 - 53748769
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  53748927 atgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 53748830  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  53748829 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 53748769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41800128 - 41799970
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  41800128 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 41800031  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  41800030 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 41799970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Original strand, 42701226 - 42701384
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  42701226 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 42701323  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  42701324 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 42701384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 51602249 - 51602091
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  51602249 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 51602152  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  51602151 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 51602091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 51608130 - 51607972
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  51608130 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 51608033  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    ||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  51608032 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 51607972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 109 - 267
Target Start/End: Original strand, 15406955 - 15407116
Alignment:
Q  109 gaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccaga 206  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15406955 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccaga 15407054  T
Q  207 gccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||||||| | | || ||| ||||||||||  || ||  |||||||||||||||||||    
T  15407055 gccgaagctctctcgctttcatgtttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 15407116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4831265 - 4831090
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  4831265 atgcatgtggtaccata-ttcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactt 4831167  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaa 237  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  4831166 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaa 4831090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4834560 - 4834385
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  4834560 atgcatgtggtaccata-ttcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactt 4834462  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaa 237  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  4834461 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaa 4834385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 23121599 - 23121804
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  23121599 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactt 23121697  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  || ||  ||||||||||||    
T  23121698 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacgaggcattccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctac 23121797  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  23121798 atacaac 23121804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 267
Target Start/End: Original strand, 14484432 - 14484634
Alignment:
Q  67 catgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttga 164  Q
    |||||||||||||||| |||| || |  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||    
T  14484432 catgtggtaccataat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttga 14484530  T
Q  165 acaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacata 263  Q
     ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  || ||  |||| ||||||||||    
T  14484531 gcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtgtatctacata 14484630  T
Q  264 caac 267  Q
    ||||    
T  14484631 caac 14484634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 16156630 - 16156839
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc--tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgc 159  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||  | |||||||||||||||||  |   |||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  16156630 atgcatgtggtaccata-ttcagggccggagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattcatttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgc 16156728  T
Q  160 tttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact--tgatgattatgcaactacccaaccagtgtatat 256  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||  || ||  ||||||||    
T  16156729 tttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaaggccgaagccctcccacttattatgattatgcaactgacccactcgtgtatat 16156828  T
Q  257 ctacatacaac 267  Q
    |||||||||||    
T  16156829 ctacatacaac 16156839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 239
Target Start/End: Original strand, 16152484 - 16152665
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc--tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgc 159  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||  | |||||||||||||||||  |   |||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  16152484 atgcatgtggtaccata-ttcagggccggagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattcatttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgc 16152582  T
Q  160 tttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact--tgatgattatgcaact 239  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  16152583 tttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccacttattatgattatgcaact 16152665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 267
Target Start/End: Original strand, 14048228 - 14048407
Alignment:
Q  94 acccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcag-caggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaa 189  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    |||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  14048228 accctcaccgctgatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaa 14048327  T
Q  190 cgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaact-acccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||| ||||| | || |||||||||||||| || | ||  |||||||||||||||||||    
T  14048328 cgacaaggcgttccagggccaaagccctcccgcttttatgattatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaac 14048407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 205
Target Start/End: Original strand, 14062908 - 14063052
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcag-caggac-taagtcctcaccgctccacaccgct 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  14062908 atgcatgtggtaccataat-cagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgct 14063006  T
Q  161 ttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14063007 ttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 14063052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 267
Target Start/End: Original strand, 14485552 - 14485716
Alignment:
Q  107 tcgaatggttaaagcattctcag-caggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||| | |||||||||||||   |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14485552 tcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaatcaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggtgttcc 14485651  T
Q  204 agagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    || |||||||| ||||| | || ||| ||||||||||  || ||  |||||||||||||||||||    
T  14485652 agggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 14485716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17000271 - 17000139
Alignment:
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatg 234  Q
    ||||| |||||| ||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  17000271 taagttctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggtgttccagagccgaagctctctcacttttatgcttatg 17000172  T
Q  235 caactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||  || ||  |||||||||||||||||||    
T  17000171 caactgacccacttgtgtatatctacatacaac 17000139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26077847 - 26077731
Alignment:
Q  107 tcgaatggttaaagcattctcag-caggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  26077847 tcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgtttc 26077748  T
Q  204 agagccgaagctctccc 220  Q
    ||||||||||| |||||    
T  26077747 agagccgaagccctccc 26077731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14556260 - 14556115
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcag--caggac-taagtcctcaccgctccacaccgc 159  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||     |||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  14556260 atgcatgtggtaccata-ttcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattcttttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgc 14556162  T
Q  160 tttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14556161 tttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 14556115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 43285072 - 43284868
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |  ||| | || |||| ||||||||||| ||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  43285072 atgcatgtggtaccataat-caggaccgtagccctctcctctgtagaatggttaaatcattcattttcaggacataagtcctcaccacta-acaccactt 43284975  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| ||||| |||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  || ||   |||||||||||    
T  43284974 tgagcaactagtgctccaccactttgaacaacaaggcgtcccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccactcttgtatatctac 43284875  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  43284874 atacaac 43284868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Original strand, 20940260 - 20940419
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |  ||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  20940260 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgttgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccacta-acaccactt 20940357  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 223  Q
    ||| ||| ||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20940358 tgagcaactagtgctccaccactttgaacaacaaggcgttccagagctgaagctctcccact 20940419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11171435 - 11171233
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | |  ||| |||||| || ||||||||||||||||| |   |||||| |||||| ||||| ||  ||||| |||    
T  11171435 atgcatgtagtaccataat-cagggtcgtagccctcaccgccgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcatcaccactaaacaccactt 11171337  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| ||||| |||||| |||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  || ||  |||||||| |||    
T  11171336 tgagcaactagtgctccaccactttaaacgataaggcgttccaaagccgaagctctcccacttttatgtttatgcaactgacccacttgtgtatatatac 11171237  T
Q  261 atac 264  Q
    ||||    
T  11171236 atac 11171233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 267
Target Start/End: Original strand, 15324919 - 15325080
Alignment:
Q  109 gaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccaga 206  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  15324919 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaa-accgctttgaacatcaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagg 15325017  T
Q  207 gccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaact-acccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    || ||||| ||||| | || ||| ||||| |||| || | ||  |||||||||||||||||||    
T  15325018 gcagaagccctcccgcttttatgcttatgtaactaactccactggtgtatatctacatacaac 15325080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41529263 - 41529123
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcag-caggac-taagtcctcaccgctccacaccgct 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  41529263 atgcatgtggtaccata-ttcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgct 41529165  T
Q  161 ttgaacaa-ttagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgtt 201  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  41529164 ttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgataaggcgtt 41529123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 212
Target Start/End: Original strand, 14048152 - 14048227
Alignment:
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaa 212  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14048152 agtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgttttgaacgacaaggcgttccagggccgaa 14048227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 205
Target Start/End: Original strand, 14910560 - 14910727
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcagcaggac- 135  Q
    |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    ||| ||||||| | |||||||||||||||||  | |  |||||     
T  14910560 ctaagactactcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataa-tcagggccggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattcttttataaggaca 14910658  T
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaa-ttagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    | |||||||||| ||  ||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  14910659 tgagtcctcacc-ct-aacatcgctttgaacaacatagtgttccatcgctttgaacgacaaggcgttccag 14910727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 2585274 - 2585204
Alignment:
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2585274 taagtcctcaccgctaatcaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 2585204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 125
Target Start/End: Original strand, 13452206 - 13452287
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  13452206 actcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccat-attcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattc 13452287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 42956175 - 42956141
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42956175 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 42956141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 54845101 - 54845067
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54845101 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 54845067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1651203 - 1651084
Alignment:
Q  99 caccgctgtcgaatggttaaagcattctc--agcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacg 194  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||   | |||||| | |||||||||||    || |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||     
T  1651203 caccgctatagaatggttaaagcattcttttatcaggacatgagtcctcaccgtcaaactccgctttgaacaacaatgtgttccaccgctttgaacgaca 1651104  T
Q  195 aggcgttccagagccgaagc 214  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  1651103 aggcgttccagggcagaagc 1651084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 202
Target Start/End: Original strand, 27905244 - 27905350
Alignment:
Q  99 caccgctgtcgaatggttaaagcattctc--agcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaat-tagtgttccaccgctttgaacgacg 194  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||   | |||||| | ||||||| |||||  ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||     
T  27905244 caccgctatagaatggttaaagcattcttttatcaggacatgagtcctctccgcta-acaccgctttgaacaacatagtgttccatcgctttgaacgaca 27905342  T
Q  195 aggcgttc 202  Q
    ||||||||    
T  27905343 aggcgttc 27905350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Original strand, 30146857 - 30146909
Alignment:
Q  154 caccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30146857 caccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 30146909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 19128500 - 19128461
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19128500 ctaagactcctcaataaatgcagatatgcatgtggtacca 19128461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 78
Target Start/End: Original strand, 33097019 - 33097058
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33097019 ctaagactcctcaataaatgcagatatgcatgtggtacca 33097058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 78
Target Start/End: Original strand, 42220357 - 42220396
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42220357 ctaagactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 42220396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 45959895 - 45959861
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45959895 actcctccataaatgcaaatatgcatgtggtacca 45959861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 47872575 - 47872541
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47872575 actcctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 47872541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 10977223 - 10977182
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  10977223 ctaagactcctcaataaatgcgactatgcatgtggtaccata 10977182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 174781 - 174535
Alignment:
Q  21 atgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaag 120  Q
    |||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  174781 atgacatgacatccccc-ctaattctcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcttggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaag 174683  T
Q  121 cattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcc 219  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  174682 cattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttttaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcc 174583  T
Q  220 cac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaa 266  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  174582 cactttgatgtttatgcaactacccaacctttgtatctctacatacaa 174535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 40 - 242
Target Start/End: Original strand, 489104 - 489306
Alignment:
Q  40 taatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taa 138  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  489104 taatactcctcaataa-tgtaattatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaacactgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaa 489202  T
Q  139 gtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccacttgatgattatgcaac 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  489203 gtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttgatgtttatgcaac 489302  T
Q  239 tacc 242  Q
    ||||    
T  489303 tacc 489306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 267
Target Start/End: Original strand, 95920 - 96054
Alignment:
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattat 233  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||| || ||| ||||    
T  95920 taagtcctcaccgctaatcaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttcaagggccaaagccctcccacttttatgcttat 96019  T
Q  234 gcaact-acccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||| || | ||  |||||||||||||||||||    
T  96020 gcaactgactccacttgtgtatatctacatacaac 96054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 494159 - 493992
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc---agcaggac 135  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  | ||| ||||| | | ||||||||||||||||||    | ||||||    
T  494159 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata--tcagggccggggccctcaccgttatagaatggttaaagcattctttttatcaggac 494062  T
Q  136 -taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaat-tagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
     | ||||||| |   |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  494061 atgagtcctccca--ttaacaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 493992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 39 - 267
Target Start/End: Original strand, 2541 - 2770
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-ta 137  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  2541 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggaccta 2639  T
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgca 236  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2640 agtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactggtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccactttgatgcttatgca 2739  T
Q  237 actacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2740 actacccaacctgtgtatatctacatacaac 2770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 38381 - 38605
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcc 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  38381 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcc 38479  T
Q  143 tcaccgctccacaccgcttt-gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaacta 240  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  38480 tcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 38578  T
Q  241 cccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  38579 cccaacctgtgtatatctacatacaac 38605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 46863 - 46789
Alignment:
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagcc 209  Q
    |||||||||||||||   ||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  46863 taagtcctcaccgctaatcaccgatttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagcc 46789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 51136 - 51062
Alignment:
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagcc 209  Q
    |||||||||||||||   ||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  51136 taagtcctcaccgctaatcaccgatttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagcc 51062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 35743 - 35519
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcc 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  35743 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcc 35645  T
Q  143 tcaccgctccacaccgcttt-gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaacta 240  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  35644 tcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 35546  T
Q  241 cccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  35545 cccaacctgtgtatatctacatacaac 35519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 30342 - 30118
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcc 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  30342 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcc 30244  T
Q  143 tcaccgctccacaccgcttt-gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaacta 240  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  30243 tcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ctatgcaacta 30145  T
Q  241 cccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  30144 cccaacctgtgtatatctacatacaac 30118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 51872 - 51673
Alignment:
Q  70 gtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaaca 167  Q
    |||||||||||||| ||||||  | ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |   |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  51872 gtggtaccataatt-agggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattcattttcaggacataagccctcaccgctaaacaccgctttgaaca 51774  T
Q  168 attagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaa 266  Q
    | || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | || ||| ||||||||||  || ||  ||||||||||||||||||    
T  51773 actactgttccaccgctttgaatgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaa 51674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 47176 - 46952
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcc 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  47176 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcc 47078  T
Q  143 tcaccgctccacaccgcttt-gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaacta 240  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  47077 tcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 46979  T
Q  241 cccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  46978 cccaacctgtgtatatctacatacaac 46952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 52581 - 52357
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcc 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  52581 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcc 52483  T
Q  143 tcaccgctccacaccgcttt-gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaacta 240  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  52482 tcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 52384  T
Q  241 cccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  52383 cccaacctgtgtatatctacatacaac 52357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 92724 - 92634
Alignment:
Q  178 caccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctc-ccacttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||   ||| ||| |||||| ||||||||||||  || | ||| |||||||||||||||||||    
T  92724 caccgctttgaacgacaaggcgttctagggcatgagccctctccactttatgattatgcaaagactccacctgtgtatatctacatacaac 92634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 174758 - 174534
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcc 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  174758 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataat-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcc 174660  T
Q  143 tcaccgctccacaccgcttt-gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaacta 240  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  174659 tcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 174561  T
Q  241 cccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  174560 cccaacctgtgtatatctacatacaac 174534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 152361 - 152565
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |  ||| || | |||| |||||||||||||| || |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  152361 atgcatgtggtaccataat-caggaccgtagccctcaacactgtagaatggttaaagcaatcattttcaggacataagtcctcaccacta-acaccactt 152458  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| || ||  ||||||||||||    
T  152459 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctac 152558  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  152559 atacaac 152565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 258491 - 258699
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcag-caggac-taagtcctcaccgctccacaccgct 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  258491 atgcatgtggtaccata-ttcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgct 258589  T
Q  161 ttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaact-acccaaccagtgtatatc 257  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||| ||  || |||||||||| || | ||  |||||||||    
T  258590 ttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcaggagccctcccacttttgtgcttatgcaactaactccacttgtgtatatc 258689  T
Q  258 tacatacaac 267  Q
    ||||||||||    
T  258690 tacatacaac 258699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 197618 - 197455
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgct 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||  | ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  197618 atgcatgtggtaccata-ttcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgct 197520  T
Q  161 ttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccactt 224  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||| |||||||||    
T  197519 ttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggtgttccagggccagagccctcccactt 197455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 4)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13095 - 12849
Alignment:
Q  21 atgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaag 120  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13095 atgacatgacatcccc--ctaatactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccataat-caggtccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaag 12999  T
Q  121 cattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcc 219  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  12998 cattcttatcaggacctaagtcctcaccgctctacaccgctttgaacaacttgtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccgaaactctcc 12899  T
Q  220 cac-ttgatgattatgcaact-acccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12898 cactttgatgcttatgcaactaacccaacctgtgtatatctacatacaac 12849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 63370 - 63168
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  63370 atgcatgtggtaccataat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccacta-acaccactt 63273  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  || ||  ||||||||||||    
T  63272 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgataaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctac 63173  T
Q  261 ataca 265  Q
    |||||    
T  63172 ataca 63168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 124649 - 124443
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcag-caggac-taagtcctcaccgctccacaccgct 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||    |||||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  124649 atgcatgtggtaccataat-cagggccgaagccctcaccgcttatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgct 124551  T
Q  161 ttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatcta 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||| ||||| | || ||| ||||||||||  || ||  || ||||||||    
T  124550 ttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccaggtcagaagccctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtttatatcta 124451  T
Q  260 catacaac 267  Q
    ||||||||    
T  124450 catacaac 124443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 80
Target Start/End: Original strand, 110168 - 110209
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  110168 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata 110209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 4502 - 4272
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-t 136  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  4502 tctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgcggtaccata-ttcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacat 4404  T
Q  137 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgc 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  4403 aagtcctcaccgctcaacaccgctgtgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgc 4304  T
Q  236 aactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||  | ||  |||||||||||||||||||    
T  4303 aactaatccacttgtgtatatctacatacaac 4272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 4821 - 4591
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-t 136  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  4821 tctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggccgtgacccacaccgctgtcgaattgttaaagcattctcatcaggacat 4723  T
Q  137 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgc 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  4722 aagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgc 4623  T
Q  236 aactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||| || ||   ||||||||||||||||||    
T  4622 aactaacccacttatgtatatctacatacaac 4591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23975 - 23832
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||  | |||||||||||||||||    |||||| || ||||||||||||   ||||||||    
T  23975 atgcatgtggtaccata-ttcagggccggagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattcatttcaggacataggtcctcaccgctaatcaccgctt 23877  T
Q  162 tgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23876 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 23832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18344 - 18201
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||  | |||||| ||||||||||    |||||| || ||||||||||||   ||||||||    
T  18344 atgcatgtggtaccata-ttcagggccggagccctcaccgctaatagaatggctaaagcattcatttcaggacataggtcctcaccgctaatcaccgctt 18246  T
Q  162 tgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18245 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 18201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 5)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 39 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 37019 - 36790
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-ta 137  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  37019 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataat-cagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattcttatcaggacata 36921  T
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgca 236  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||    
T  36920 agtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctctcacttttatgcttatgca 36821  T
Q  237 actacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||  || ||  |||||||||||||||||||    
T  36820 actgacccacttgtgtatatctacatacaac 36790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 44080 - 44013
Alignment:
Q  154 caccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctccc 220  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  44080 caccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagccctccc 44013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 44221 - 44068
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcattctcagcaggac- 135  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||    |||||     
T  44221 tctaagactcctcgacaaatgcaactatccatgtggtaccat-attcagggccagagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttaggaca 44123  T
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaac 190  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||    
T  44122 taagtcatcaccgctaaacaccgctttgacaacaaagtgttccaccgctttgaac 44068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 40549 - 40658
Alignment:
Q  113 ggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccga 211  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||  || ||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||    
T  40549 ggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcattccagagccga 40646  T
Q  212 agctctcccact 223  Q
    |||||| |||||    
T  40647 agctcttccact 40658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 8538 - 8493
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcg 109  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8538 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcg 8493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 36 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 10462 - 10231
Alignment:
Q  36 catctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac 135  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10462 catctaagactcctcac-aaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggac 10365  T
Q  136 -taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattat 233  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||    
T  10364 ataagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagctgaagctctcccacttttatgcttat 10265  T
Q  234 gcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||  || ||   ||||||||||||||||||    
T  10264 gcaactgacccacttatgtatatctacatacaac 10231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0811
Description:

Target: scaffold0811; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 174 - 1
Alignment:
Q  20 tatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 119  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  174 tatgacacgacatccccc-ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatccagggccgtgatccacaccgctgtcgaatggttaaa 76  T
Q  120 gcattctcagcagga-ctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgac 193  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  75 gcattatcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgac 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Original strand, 29722 - 29951
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-t 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  29722 tctaagactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataat-cagggccgtaacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacat 29820  T
Q  137 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgc 235  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||  |    
T  29821 aagtcctcaccgctcaacaccactttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccaaagctctcccacttttatgcttagac 29920  T
Q  236 aactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  29921 aactaccc-acttgtgtatatctacatacaac 29951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15659 - 15429
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-t 136  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  15659 tctaagactcctctataaatgcaactatgcatgtggtacctta-ttcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacat 15561  T
Q  137 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgc 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||| || |||    
T  15560 aagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaatgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccacttttatgcttgtgc 15461  T
Q  236 aactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||| ||  |  |||||||||||||||||||    
T  15460 aactaacccccttgtgtatatctacatacaac 15429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 136 - 267
Target Start/End: Original strand, 71162 - 71294
Alignment:
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatg 234  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||    
T  71162 taagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccgcttttatgcttatg 71261  T
Q  235 caactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||  |  ||  |||||||||||||||||||    
T  71262 caactgacacacttgtgtatatctacatacaac 71294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 370 - 140
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-t 136  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||  |||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |    
T  370 tctaagactcctcgacaaatgcaattatgcatgtggtaccatg-ttcaggaccgtagcccacaccgctgtcgaatggttaaagcattcttttcaggacat 272  T
Q  137 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgc 235  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  271 aagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgc 172  T
Q  236 aactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||  || ||  |||||||||||||||||||    
T  171 aactgacccacttgtgtatatctacatacaac 140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Original strand, 10174 - 10359
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-t 136  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  10174 tctaagactcctcgataa-tgcaactatgcttgtggtaccata-ttcagggccgtgacccactccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacat 10271  T
Q  137 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccactt 224  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10272 aagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttctaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcacactt 10359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1773 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1773
Description:

Target: scaffold1773; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 83 - 267
Target Start/End: Original strand, 1 - 176
Alignment:
Q  83 tcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccacc 181  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||          ||||||||||| ||||||||||||    
T  1 tcaggaccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcacc----------gctttgaacaactagtgttccacc 90  T
Q  182 gctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccacttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  91 actttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttaaaaattatgcaactacccaacctgtgtatatctacatacaac 176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 5148 - 5353
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  5148 atgcatgtggtaccataatt-agggccaaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctatacaccgctt 5246  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| ||  |  ||||||||||||    
T  5247 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaactaaccctcttgtgtatatctac 5346  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  5347 atacaac 5353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 41819 - 41589
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac- 135  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    ||| | |||||   ||||||||||||||||| |   ||||||     
T  41819 tctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagcattcattttcaggaca 41722  T
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatg 234  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  41721 taagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgcttttaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatg 41622  T
Q  235 caactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||  || ||  |||||||||||||||||||    
T  41621 caactgacccacttgtgtatatctacatacaac 41589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 103131 - 102900
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-t 136  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    ||| |||  || ||||||||||||||||||||   |||||| |    
T  103131 tctaagactcctcgataattgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggccggagccctcacttctttcgaatggttaaagcattcttttcaggacat 103033  T
Q  137 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgc 235  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| | || ||| ||||||    
T  103032 aagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaactcgttccagggccgaagctctcccgcttttatgcttatgc 102933  T
Q  236 aac-tacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||  |||| ||  ||||||| |||||||||||    
T  102932 aacagaccccactggtgtatacctacatacaac 102900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 17477 - 17682
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||    ||| || |||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  17477 atgcatgtggtaccataat-cggggccgaagccctcatcgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 17575  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | || ||| ||||||||||  || ||  ||||||||||||    
T  17576 tgaacaactagtgctccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctttcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctac 17675  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  17676 atacaac 17682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17600 - 17373
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |   |||||| | |||    
T  17600 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccat-attcagggccgaaaccctcaccgctgatcgaatggttaaaacattctttttcaggacatgagt 17502  T
Q  141 cctcaccgctccacaccgctttgaacaa-ttagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaac 238  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||   | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | || ||| ||||| |||    
T  17501 cctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaaatgttccacagctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgtaac 17402  T
Q  239 tacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |  || ||  |||||||||||||||||||    
T  17401 tgacccacttgtgtatatctacatacaac 17373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 10304 - 10077
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||| |||||||  ||||||||||||||||||| |   |||||| | |||    
T  10304 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccat-attcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagt 10206  T
Q  141 cctcaccgctccacaccgctttgaacaa-ttagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaac 238  Q
    | ||||||||  |||||||||| |||||   ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| | || ||| |||||||||    
T  10205 cttcaccgctaaacaccgcttttaacaacaaagtgttccacatctttgaacgacaaggcgttccagggctgaagccctcccgcttttatgcttatgcaac 10106  T
Q  239 tacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |  || ||  |||||||||||||||||||    
T  10105 tgacccacttgtgtatatctacatacaac 10077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 205
Target Start/End: Original strand, 72262 - 72371
Alignment:
Q  99 caccgctgtcgaatggttaaagcattctc--agcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaat-tagtgttccaccgctttgaacgacg 194  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||   | |||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||     
T  72262 caccgctatagaatggttaaagcattcttttatcaggacatgagtcctcaccgcta-ataccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttaaacgaca 72360  T
Q  195 aggcgttccag 205  Q
    |||||||||||    
T  72361 aggcgttccag 72371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 35928 - 35886
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  35928 tctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata 35886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6208 - 6003
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  6208 atgcatgtggtaccataat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactt 6110  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| || ||   |||||||||||    
T  6109 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgtaactaacccacttatgtatatctac 6010  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  6009 atacaac 6003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14673 - 14469
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  14673 atgcatgtggtaccataat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccacta-acaccactt 14576  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  || ||  ||||||||||||    
T  14575 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctac 14476  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  14475 atacaac 14469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 7356 - 7186
Alignment:
Q  99 caccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgag 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  | ||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  7356 caccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccacta-ataccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaag 7258  T
Q  197 gcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||  || ||  |||||||||||||||||||    
T  7257 gcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatccaactgtcccacttgtgtatatctacatacaac 7186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 56623 - 56418
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcag-caggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||| ||  |||||||||    
T  56623 atgcatgtggtaccataat-caggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgctt 56525  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||  ||  |  ||||||||||||    
T  56524 tgagcaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaatctctcccacttttatgcttatgcaactgaccctcttgtgtatatctac 56425  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  56424 atacaac 56418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 47589 - 47384
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcag-caggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||| ||  |||||||||    
T  47589 atgcatgtggtaccataat-caggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgctt 47491  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||  ||  |  ||||||||||||    
T  47490 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaaactctcccacttttatgcttatgcaactgacccgcttgtgtatatctac 47391  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  47390 atacaac 47384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 63009 - 62804
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcag-caggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||| ||  |||||||||    
T  63009 atgcatgtggtaccataat-caggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgctt 62911  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||  ||  |  ||||||||||||    
T  62910 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaaactctcccacttttatgcttatgcaactgacccgcttgtgtatatctac 62811  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  62810 atacaac 62804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1615 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1615
Description:

Target: scaffold1615; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 603 - 392
Alignment:
Q  54 aaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctc 151  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    ||| | |||||   ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||     
T  603 aaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcatcgcta 506  T
Q  152 cacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagt 250  Q
     || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  || ||  ||    
T  505 aactccgctttgaacaactagtgttccaccgatttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttaatgcttatgcaactgacccacttgt 406  T
Q  251 gtatatctacatac 264  Q
    ||||||||||||||    
T  405 gtatatctacatac 392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17141 - 16914
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac- 135  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    ||| | |||||   ||||||||||||||||| |   ||||||     
T  17141 tctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagcattcattttcaggaca 17044  T
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatg 234  Q
    |||| ||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  17043 taaggcctcaccgctaaactccgttttgaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatg 16944  T
Q  235 caactacccaaccagtgtatatctacatac 264  Q
    |||||  || ||  ||||||||||||||||    
T  16943 caactgacccacttgtgtatatctacatac 16914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 141326 - 141529
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||    ||| ||||||||| |||||||||||||||||    |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  141326 atgcatgtggtaccataat-caggaccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttcaggacgtaagtcctcaccacta-acaccacttt 141423  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctaca 261  Q
    || ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  || ||  |||||||||||||    
T  141424 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 141523  T
Q  262 tacaac 267  Q
    ||||||    
T  141524 tacaac 141529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 237
Target Start/End: Original strand, 146611 - 146742
Alignment:
Q  109 gaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccaga 206  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  | ||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  146611 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaaaaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccaga 146710  T
Q  207 gccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaa 237  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  146711 gacgaagctctcccacttttatgattatgcaa 146742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Original strand, 115710 - 115941
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-t 136  Q
    ||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||||||||| || ||||||    ||| |||| || ||||||||||||||||||||   |||||| |    
T  115710 tctaagactcctcgacaattgcaactatgcatgtggtaccatattt-agggccggagccctcaccactatcgaatggttaaagcattcttttcaggacat 115808  T
Q  137 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgc 235  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| | || ||| ||||||    
T  115809 aagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacgggtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggtcgaagccctcccgcttttatgcttatgc 115908  T
Q  236 aac-tacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||  || | ||  |||||||||||||||||||    
T  115909 aacagactccactggtgtatatctacatacaac 115941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 321062 - 321221
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgct 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    ||| |||||||  | ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  321062 atgcatgtggtaccataat-cagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgct 321160  T
Q  161 ttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctccca 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  321161 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctccca 321221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 109 - 224
Target Start/End: Original strand, 326816 - 326933
Alignment:
Q  109 gaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccaga 206  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  326816 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagg 326915  T
Q  207 gccgaagctctcccactt 224  Q
    |||||||| |||||||||    
T  326916 gccgaagccctcccactt 326933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 10341 - 10546
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||| | ||  ||| | |||    
T  10341 atgcatgtggtaccataat-cagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcatcactaaacatcactt 10439  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| |||  |||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  || ||  ||||||||||||    
T  10440 tgagcaaccagtgctccaccactttgaacgacaaggcgtcccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaactgaccgactcgtgtatatctac 10539  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  10540 atacaac 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 41931 - 42135
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  41931 atgcatgtggtaccataat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccacta-acaccactt 42028  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||  || ||  ||||||||||||    
T  42029 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctac 42128  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  42129 atacaac 42135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5184 - 4977
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| | |||||||||||||  |||||||||    
T  5184 atgcatgtggtaccataat-cagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctt 5086  T
Q  162 tgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatcta 259  Q
    |||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||| | || ||| ||||||||||| || ||  |||||||||||    
T  5085 tgaacaacaaagtgctccaccgctttgaacgacaaggcattccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatcta 4986  T
Q  260 catacaaca 268  Q
    |||||||||    
T  4985 catacaaca 4977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1584 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1584
Description:

Target: scaffold1584; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 300 - 527
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcag-caggac-taagt 140  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||  | ||||||||||||||||||    |||||| | |||    
T  300 actcctcaacaaatgcagatatgcatgtggtaccata-ttcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagt 398  T
Q  141 cctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaac 238  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| | || ||  |||||||||    
T  399 cctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccaaagccctcccgcttttatacttatgcaac 498  T
Q  239 tacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |  || ||  |||||||||||||||||||    
T  499 tgacccacttgtgtatatctacatacaac 527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 2899 - 3126
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcag-caggac-taagt 140  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||||  |||||||||    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||    |||||| | |||    
T  2899 actcctcaacaattacaaatatgcatgtggtaccatg-ttcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagt 2997  T
Q  141 cctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaac 238  Q
    | ||||||||  ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | || ||| |||||||||    
T  2998 catcaccgctaaacacctctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgataaggcgttccagagccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaac 3097  T
Q  239 tacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    || || ||  |||||||||||||||||||    
T  3098 taacccacttgtgtatatctacatacaac 3126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1904 - 1761
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||  | |||||||||||||||||    || ||| |||||||||||||||  | | |||||    
T  1904 atgcatgtggtaccata-ttcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcatttcaagacataagtcctcaccgctaaaaagcgctt 1806  T
Q  162 tgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  1805 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggtgttccag 1761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 27861 - 28068
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgct 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    ||| |||||||  | ||||||||||||||||| |   |||||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  27861 atgcatgtggtaccataat-cagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgct 27959  T
Q  161 ttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaact-acccaaccagtgtatatct 258  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| | || ||| |||||||||| || | ||  ||||||||||    
T  27960 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactaactccactggtgtatatct 28059  T
Q  259 acatacaac 267  Q
    |||||||||    
T  28060 acatacaac 28068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20622 - 20490
Alignment:
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatg 234  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  20622 taagtcctcaccactaaacaccgcgttgagcaactagtactccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatg 20523  T
Q  235 caactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||  || ||  |||||||||||||||||||    
T  20522 caactgacccacttgtgtatatctacatacaac 20490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 156901 - 156797
Alignment:
Q  107 tcgaatggttaaagcattctcag-caggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttcca 204  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||| | |||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  156901 tcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacacctctttgaacaac--gtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttcca 156804  T
Q  205 gagccga 211  Q
    | |||||    
T  156803 gggccga 156797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 8410 - 8618
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctcag--caggac-taagtcctcaccgctccacaccgc 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||     |||||| |||||||||||||||  |||| ||    
T  8410 atgcatgtggtaccataat-cagggtcgcagccctcaccgctgttcgaatggttaaagcattctttttccaggacataagtcctcaccgctaaacacagc 8508  T
Q  160 tttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaact-acccaaccagtgtatatc 257  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||| | || ||| |||||||||| || | ||  |||||||||    
T  8509 tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagggccgaggccctcccgctttcatgtttatgcaactaactccacttgtgtatatc 8608  T
Q  258 tacatacaac 267  Q
    ||||||||||    
T  8609 tacatacaac 8618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16225 - 16068
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| ||||||| | |||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  16225 atgcatgtggtaccata-ttcagggccgtagccctcaccgctattcgaatgcttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 16127  T
Q  162 tgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcc 219  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||    
T  16126 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccggagccctcc 16068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8162 - 8047
Alignment:
Q  107 tcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttcca 204  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8162 tcgaatggttaaagcattctttttaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggagttcca 8063  T
Q  205 gagccgaagctctccc 220  Q
    | |||| ||| |||||    
T  8062 gggccggagccctccc 8047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 51148 - 50948
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||    
T  51148 atgcatgtggtaccataat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcgttttcaggacataagtcctcaccacta-acaccactt 51051  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  || ||  ||||||||||||    
T  51050 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgataaggcgttctagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacctacttgtgtatatctac 50951  T
Q  261 ata 263  Q
    |||    
T  50950 ata 50948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 264
Target Start/End: Original strand, 265100 - 265300
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |  ||  ||||||||| |||||||||||||||||    || ||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  265100 atgcatgtggtaccataat-caggaccgtagccttcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttcatgacataagtcctcaccacta-acaccacttt 265197  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctaca 261  Q
    || ||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  || ||  |||||||||||||    
T  265198 gagcaactagtgccccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 265297  T
Q  262 tac 264  Q
    |||    
T  265298 tac 265300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 264
Target Start/End: Original strand, 258674 - 258874
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt 162  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |  ||  ||||||||| |||||||||||||||||    || ||| || ||||||||| ||  ||||| ||||    
T  258674 atgcatgtggtaccataat-caggaccgtagccttcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttcatgacatatgtcctcaccacta-acaccacttt 258771  T
Q  163 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctaca 261  Q
    || ||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  || ||  |||||||||||||    
T  258772 gagcaactagtgccccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 258871  T
Q  262 tac 264  Q
    |||    
T  258872 tac 258874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27945 - 27739
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctcagc-aggac-taagtcctcaccgctccacaccgct 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    ||| ||||||| | |||||||||||||||||||     ||||| |||||||||| ||||  ||||||||    
T  27945 atgcatgtggtaccataat-cagggccggagccctcaccgctattcgaatggttaaagcattcttttataggacataagtcctcatcgcta-acaccgct 27848  T
Q  161 ttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac--ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatct 258  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||| | || |||  |||||||||    
T  27847 ttgaacaactcgtgttccaccactttgaacgacaagccgttccagagccgaagctctcccgctgttaatgactatgcaaccaacccacccttgtatatct 27748  T
Q  259 acatacaac 267  Q
    |||||||||    
T  27747 acatacaac 27739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 267
Target Start/End: Original strand, 7322 - 7454
Alignment:
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatg 234  Q
    |||||||| ||| ||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||    
T  7322 taagtccttaccactaaacaccgctttgaatatctagtgttccaccgctatgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccgcttttatgcttatg 7421  T
Q  235 caactacccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||  || ||  |||||||||||||||||||    
T  7422 caactgacccacttgtgtatatctacatacaac 7454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8012 - 7843
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcagcaggac- 135  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||    ||| ||| |||  | |||||||||||||||||    ||||||     
T  8012 tctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatatggtaccata-ttctgggccggagccctcactgctaattgaatggttaaagcattcatttcaggaca 7914  T
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7913 taagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 7843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15000 - 14832
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc---agcagga 134  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    ||| ||||| | | ||||||||||||||||||    | |||||    
T  15000 tctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata--tcagggccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattctttatatcagga 14903  T
Q  135 c-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaat-tagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    | | ||||||| |   |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14902 catgagtcctccca--ttaacaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 14832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 267
Target Start/End: Original strand, 5638 - 5753
Alignment:
Q  154 caccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaact-acccaaccagtg 251  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| | || ||| |||||||||| || | ||  |||    
T  5638 caccgctttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtg 5737  T
Q  252 tatatctacatacaac 267  Q
    ||||||||||||||||    
T  5738 tatatctacatacaac 5753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 1284 - 1130
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcattctcagcaggac- 135  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||    |||||     
T  1284 tctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccat-attcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttaggaca 1186  T
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaa-ttagtgttccaccgctttgaac 190  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  1185 taagtcctcaccgctaaacaccactttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaac 1130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8220 - 8066
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcattctcagcaggac- 135  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||    |||||     
T  8220 tctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccat-attcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttaggaca 8122  T
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaa-ttagtgttccaccgctttgaac 190  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  8121 taagtcctcaccgctaaacaccactttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaac 8066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1142 - 1075
Alignment:
Q  154 caccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctccc 220  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  1142 caccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctccc 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8078 - 8011
Alignment:
Q  154 caccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctccc 220  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  8078 caccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctccc 8011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 267
Target Start/End: Original strand, 14097 - 14212
Alignment:
Q  153 acaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccactt-gatgattatgcaactacccaaccagtg 251  Q
    ||||| |||||| |||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||  |  |||    
T  14097 acaccactttgagcaacgagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccacttctatgtttatgcaactaacccccttgtg 14196  T
Q  252 tatatctacatacaac 267  Q
    ||||||||||||||||    
T  14197 tatatctacatacaac 14212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 24209 - 24413
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctt 161  Q
    |||||| |||||||||||| |||| || |  ||| |||| |||| ||||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| || ||  ||||| |||    
T  24209 atgcatctggtaccataat-caggaccgtagccctcacctctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcgccacta-acaccactt 24306  T
Q  162 tgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccactt-gatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctac 260  Q
    |||  ||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| ||  |  ||||||||| ||    
T  24307 tgaggaatgagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctcttccacttctatgcttatgcaactaaccgccttgtgtatatccac 24406  T
Q  261 atacaac 267  Q
    |||||||    
T  24407 atacaac 24413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0430 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0430
Description:

Target: scaffold0430; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14710 - 14589
Alignment:
Q  102 cgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgt 200  Q
    |||||| ||||||||||| |||||    |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  14710 cgctgtagaatggttaaaacattcatttcaggacataagtcctcaccacta-acaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgt 14612  T
Q  201 tccagagccgaagctctcccact 223  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  14611 tctagagccgaagctctcccact 14589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Original strand, 2012 - 2167
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcattctcagcaggac- 135  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||    |||||     
T  2012 tctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccat-attcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttaggaca 2110  T
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaaca--attagtgttccaccgctttgaac 190  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||  | ||||||||||||||| |||||    
T  2111 taagtcctcaccgctaaacaccactttgaacaacaatagtgttccaccgctgtgaac 2167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 52834 - 52670
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcag-caggac-taagt 140  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||    |||||| |  ||    
T  52834 actcctcaacaaatgctgatatgcatgtggtaccataat-cagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgggt 52736  T
Q  141 cctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  52735 cctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaagacgttccag 52670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 220
Target Start/End: Original strand, 34850 - 34935
Alignment:
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctccc 220  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||    
T  34850 taagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccggagccctccc 34935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1913 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1913
Description:

Target: scaffold1913; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 4 - 86
Alignment:
Q  159 ctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaacta 240  Q
    |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  4 ctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaagcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaacta 86  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 2442 - 2376
Alignment:
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttc 202  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2442 taagtcctcaccgctaatcaccgctttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttc 2376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 17190 - 17139
Alignment:
Q  154 caccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17190 caccgctttgaacaacaagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccag 17139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 171945 - 171831
Alignment:
Q  109 gaatggttaaagcattc-tcagcaggac-taagtcctcaccgctccacaccgcttt-gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  171945 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgataaggcgttccag 171846  T
Q  206 agccgaagctctccc 220  Q
     |||| ||| |||||    
T  171845 ggccggagccctccc 171831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 17071 - 16927
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcag-caggac-taagtcctcaccgctccacaccgct 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||    |||||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  17071 atgcatgtggtaccata-ttcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaaacattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgct 16973  T
Q  161 ttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16972 ttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 16927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 589 - 509
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 125  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| |||| |||| ||||| |||||||||||    
T  589 actcctcaataaatacaaatatgcatgtggtaccat-attcagggccgtagccctcaccactgtagaatgattaaagcattc 509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 265
Target Start/End: Original strand, 16983 - 17096
Alignment:
Q  153 acaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtg 251  Q
    |||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | || ||| ||||||||||  || ||  ||     
T  16983 acactgctttgaacaacatgtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagcgccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgta 17082  T
Q  252 tatatctacataca 265  Q
    ||||||||||||||    
T  17083 tatatctacataca 17096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 267
Target Start/End: Original strand, 55939 - 56068
Alignment:
Q  141 cctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaac 238  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| | ||  || |||||||||    
T  55939 cctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccggagccctcccgcttttgtgtttatgcaac 56038  T
Q  239 t-acccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    | || | ||  |||||||||||||||||||    
T  56039 taactccacttgtgtatatctacatacaac 56068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6006 - 5923
Alignment:
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctccc 220  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||| |||||    
T  6006 taagtcctcatcgcta-acaccgctttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacggcaaggcgttccagggccggagccctccc 5923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12044 - 11977
Alignment:
Q  138 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaat-tagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12044 agtcctcaccgcta-acaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 11977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 31768 - 31666
Alignment:
Q  48 ctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg--tcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctc 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | | ||||||||  | |||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  31768 ctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataa-tcagggccaaagcactcaccgctgttttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagtcctc 31672  T
Q  145 accgct 150  Q
    ||||||    
T  31671 accgct 31666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 125
Target Start/End: Original strand, 26071 - 26152
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  26071 actcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccat-attcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattc 26152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 125
Target Start/End: Original strand, 27453 - 27534
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  27453 actcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccat-attcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattc 27534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Original strand, 927 - 980
Alignment:
Q  153 acaccgctttgaacaat-tagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  927 acaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0720 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0720
Description:

Target: scaffold0720; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 4370 - 4285
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 126  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |  ||| ||||| | | ||||||||||||||||||    
T  4370 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata--tcagggccgttgccctcaccgttatagaatggttaaagcattct 4285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1726 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1726
Description:

Target: scaffold1726; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 150
Target Start/End: Original strand, 208 - 310
Alignment:
Q  48 ctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg--tcgaatggttaaagcattctcagcaggac-taagtcctc 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    ||| ||||||||  | |||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  208 ctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataa-tcaaggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagtcctc 304  T
Q  145 accgct 150  Q
    ||||||    
T  305 accgct 310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0377 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0377
Description:

Target: scaffold0377; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 220
Target Start/End: Original strand, 7344 - 7386
Alignment:
Q  178 caccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctccc 220  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  7344 caccgctttgaacgacagggcgttccagagccgaagctctccc 7386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 205
Target Start/End: Original strand, 7011 - 7081
Alignment:
Q  136 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7011 taagtcctcaccgctaatcaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaagacgttccag 7081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13593 - 13465
Alignment:
Q  64 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcag-caggac-taagtcctcaccgctccacaccgct 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    ||| |||||||  | ||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||| ||  ||||||||    
T  13593 atgcatgtggtaccataat-cagggccgaagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgct 13495  T
Q  161 ttgaacaattagtgttccaccgctttgaac 190  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  13494 ttgaacaacatgtgttccaccgctttgaac 13465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24590 - 24537
Alignment:
Q  153 acaccgctttgaacaat-tagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24590 acaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaagtcgttccag 24537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Original strand, 44282 - 44343
Alignment:
Q  154 caccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagc 214  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  44282 caccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaggaccgaagc 44343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3415 - 3299
Alignment:
Q  154 caccgctttgaacaatta-gtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaact-acccaaccagt 250  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||| | ||  || |||||||||| || | ||  ||    
T  3415 caccgctttgaacaacaacgtgttccaccgctttgaacgacaaggtgttccagggccggagccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgt 3316  T
Q  251 gtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||||||||||||    
T  3315 gtatatctacatacaac 3299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 90
Target Start/End: Original strand, 149 - 200
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggcc 90  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  149 tctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccat-attcagggcc 200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 15378 - 15346
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtac 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15378 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtac 15346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 16249 - 16198
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggcc 90  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16249 tctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccat-attcagggcc 16198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 90
Target Start/End: Original strand, 1869 - 1920
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggcc 90  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1869 tctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccat-attcagggcc 1920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 268
Target Start/End: Original strand, 26353 - 26443
Alignment:
Q  180 ccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccactt--gatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaaca 268  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |   ||| |||||||||   ||||||||||||  || | ||| ||||||||||||||||||||    
T  26353 ccgctttgaacgacaaggcgttccagatcatgagccctcccactttatatgattatgcaatgactccacctgtgtatatctacatacaaca 26443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 38728 - 38637
Alignment:
Q  178 caccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaact-acccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| | || ||| |||||||||| || | ||  |||||||||||||||||||    
T  38728 caccgctttgaacgacgaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccactcgtgtatatctacatacaac 38637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 136788 - 136697
Alignment:
Q  178 caccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaact-acccaaccagtgtatatctacatacaac 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| | || ||| |||||||||| || | ||  |||||||||||||||||||    
T  136788 caccgctttgaacgacgaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccactcgtgtatatctacatacaac 136697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0609
Description:

Target: scaffold0609; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 52 - 10
Alignment:
Q  38 tctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  52 tctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata 10  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 1198 - 1164
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1198 actcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtacca 1164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 78
Target Start/End: Original strand, 872 - 906
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  872 actcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtacca 906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 78
Target Start/End: Original strand, 15082 - 15116
Alignment:
Q  44 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 78  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15082 actcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtacca 15116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 205
Target Start/End: Original strand, 370495 - 370529
Alignment:
Q  171 agtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccag 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  370495 agtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 370529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 3051 - 3010
Alignment:
Q  39 ctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccata 80  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  3051 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata 3010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University