View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1623_2D_high_16 (Length: 519)

Name: NF1623_2D_high_16
Description: NF1623_2D
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1623_2D_high_16
NF1623_2D_high_16
[»] chr2 (22 HSPs)
chr2 (1-404)||(21396055-21396456)
chr2 (1-404)||(28665330-28665730)
chr2 (1-408)||(35610333-35610738)
chr2 (1-404)||(37824164-37824564)
chr2 (1-404)||(24246508-24246909)
chr2 (1-404)||(24268205-24268605)
chr2 (1-398)||(41919331-41919725)
chr2 (1-404)||(27510059-27510459)
chr2 (1-399)||(27193178-27193557)
chr2 (1-399)||(27842992-27843371)
chr2 (402-516)||(41919789-41919903)
chr2 (400-516)||(24268660-24268776)
chr2 (402-516)||(21395883-21395997)
chr2 (402-516)||(28665788-28665902)
chr2 (402-516)||(37824622-37824736)
chr2 (402-516)||(27509887-27510001)
chr2 (404-516)||(27193002-27193114)
chr2 (404-516)||(27842816-27842928)
chr2 (402-516)||(35610166-35610279)
chr2 (402-516)||(24246338-24246450)
chr2 (402-491)||(17683505-17683594)
chr2 (282-392)||(17683325-17683435)
[»] chr7 (17 HSPs)
chr7 (1-404)||(12780282-12780682)
chr7 (1-404)||(9000278-9000679)
chr7 (1-404)||(12785136-12785536)
chr7 (1-404)||(7037405-7037805)
chr7 (5-404)||(42232684-42233080)
chr7 (1-380)||(21069208-21069583)
chr7 (1-307)||(22844565-22844869)
chr7 (4-325)||(18939182-18939499)
chr7 (402-516)||(9000737-9000851)
chr7 (402-516)||(42232513-42232627)
chr7 (402-516)||(12785594-12785708)
chr7 (403-516)||(22844316-22844429)
chr7 (402-516)||(12780740-12780854)
chr7 (402-516)||(7037233-7037347)
chr7 (431-516)||(5828176-5828261)
chr7 (402-516)||(21069654-21069768)
chr7 (359-404)||(22844488-22844533)
[»] scaffold0073 (4 HSPs)
scaffold0073 (1-407)||(32614-33018)
scaffold0073 (1-404)||(436-836)
scaffold0073 (402-508)||(32453-32559)
scaffold0073 (402-516)||(264-378)
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (1-355)||(15334030-15334381)
chr6 (1-404)||(2200031-2200432)
chr6 (1-395)||(18857227-18857621)
chr6 (68-404)||(12517959-12518293)
chr6 (1-307)||(30882087-30882391)
chr6 (408-519)||(12517784-12517895)
chr6 (403-516)||(30881839-30881951)
chr6 (402-491)||(10188560-10188649)
chr6 (403-473)||(2200491-2200561)
chr6 (282-392)||(10188719-10188829)
chr6 (469-513)||(2201838-2201882)
chr6 (359-404)||(30882010-30882055)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (1-403)||(14191945-14192345)
chr5 (1-393)||(37373632-37374019)
chr5 (1-404)||(8427719-8428119)
chr5 (1-404)||(27881769-27882169)
chr5 (1-404)||(30345764-30346164)
chr5 (1-395)||(10025671-10026062)
chr5 (57-401)||(39883863-39884205)
chr5 (1-404)||(3690662-3691063)
chr5 (1-404)||(3875724-3876125)
chr5 (1-404)||(24629095-24629488)
chr5 (1-401)||(25541937-25542325)
chr5 (1-307)||(17870791-17871096)
chr5 (402-516)||(8428177-8428291)
chr5 (402-516)||(37373449-37373563)
chr5 (405-516)||(27881597-27881708)
chr5 (402-516)||(10025491-10025605)
chr5 (402-516)||(14192404-14192517)
chr5 (403-516)||(24629546-24629659)
chr5 (402-516)||(3690490-3690604)
chr5 (402-516)||(25542385-25542499)
chr5 (402-516)||(30346221-30346335)
chr5 (400-517)||(37261815-37261932)
chr5 (402-516)||(3876183-3876297)
chr5 (402-487)||(39883717-39883802)
chr5 (421-516)||(17871250-17871344)
chr5 (286-404)||(37261988-37262105)
chr5 (359-404)||(17871128-17871173)
[»] chr4 (13 HSPs)
chr4 (1-404)||(49710857-49711256)
chr4 (1-404)||(35856592-35856992)
chr4 (1-404)||(49785986-49786386)
chr4 (1-386)||(13344638-13345020)
chr4 (5-404)||(55558262-55558658)
chr4 (1-348)||(5337032-5337377)
chr4 (402-516)||(35856420-35856534)
chr4 (402-516)||(13337748-13337862)
chr4 (402-516)||(13344448-13344562)
chr4 (402-516)||(49710685-49710799)
chr4 (402-516)||(49786444-49786558)
chr4 (402-516)||(55558715-55558829)
chr4 (1-91)||(14146684-14146774)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (1-404)||(42660-43061)
scaffold0107 (408-516)||(42488-42596)
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (1-404)||(25217699-25218099)
chr8 (1-385)||(7822536-7822916)
chr8 (1-398)||(30326166-30326550)
chr8 (1-404)||(25208181-25208581)
chr8 (1-404)||(21112879-21113279)
chr8 (402-516)||(25218157-25218271)
chr8 (402-516)||(30325988-30326102)
chr8 (400-516)||(21113334-21113450)
chr8 (402-516)||(7822351-7822465)
chr8 (402-516)||(25208639-25208753)
chr8 (434-504)||(17887124-17887194)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (1-404)||(48094-48494)
scaffold0090 (402-516)||(48552-48666)
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (1-516)||(48774518-48775041)
chr1 (1-404)||(6310128-6310528)
chr1 (3-404)||(36207900-36208300)
chr1 (1-395)||(2329860-2330252)
chr1 (1-404)||(52501261-52501655)
chr1 (57-404)||(16042708-16043053)
chr1 (402-516)||(6310586-6310700)
chr1 (403-516)||(52501090-52501203)
chr1 (402-513)||(2452709-2452820)
chr1 (402-516)||(16042538-16042652)
chr1 (402-516)||(37389744-37389858)
chr1 (403-516)||(36207728-36207841)
chr1 (402-516)||(2329679-2329793)
[»] scaffold0118 (2 HSPs)
scaffold0118 (1-404)||(27854-28254)
scaffold0118 (402-516)||(28311-28425)
[»] chr3 (22 HSPs)
chr3 (1-404)||(33456-33856)
chr3 (1-404)||(52918711-52919112)
chr3 (1-404)||(10244969-10245369)
chr3 (1-404)||(10967916-10968316)
chr3 (1-404)||(11369323-11369724)
chr3 (1-404)||(10111284-10111684)
chr3 (5-404)||(27275086-27275476)
chr3 (1-404)||(10001091-10001491)
chr3 (4-310)||(46913258-46913561)
chr3 (403-516)||(52918539-52918652)
chr3 (402-516)||(10968374-10968488)
chr3 (402-516)||(33284-33398)
chr3 (402-516)||(50410681-50410795)
chr3 (184-401)||(13530727-13530943)
chr3 (402-516)||(11369152-11369266)
chr3 (402-514)||(10000922-10001034)
chr3 (402-514)||(10111115-10111227)
chr3 (402-514)||(10238069-10238181)
chr3 (402-516)||(13530552-13530666)
chr3 (250-396)||(50410861-50411007)
chr3 (286-404)||(10039304-10039421)
chr3 (402-516)||(10039143-10039246)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (1-399)||(183501-183897)
scaffold0003 (402-516)||(183324-183438)
scaffold0003 (464-515)||(166047-166098)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (1-404)||(187236-187627)
scaffold0017 (405-516)||(187067-187178)
[»] scaffold1800 (1 HSPs)
scaffold1800 (1-292)||(1059-1348)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (39-404)||(4433-4795)
scaffold0134 (402-516)||(4852-4966)
[»] scaffold0262 (2 HSPs)
scaffold0262 (1-396)||(19697-20088)
scaffold0262 (402-516)||(19518-19632)
[»] scaffold1139 (2 HSPs)
scaffold1139 (1-396)||(1710-2103)
scaffold1139 (402-516)||(1530-1644)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (1-404)||(13431-13812)
scaffold0225 (402-516)||(13869-13983)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (1-404)||(318866-319250)
scaffold0002 (80-310)||(320567-320796)
scaffold0002 (403-516)||(320929-321042)
scaffold0002 (1-42)||(320522-320563)
[»] scaffold0356 (5 HSPs)
scaffold0356 (80-233)||(17147-17297)
scaffold0356 (407-516)||(17474-17583)
scaffold0356 (1-95)||(16184-16277)
scaffold0356 (1-42)||(17102-17143)
scaffold0356 (372-404)||(17379-17411)
[»] scaffold0550 (2 HSPs)
scaffold0550 (402-501)||(160-259)
scaffold0550 (303-404)||(1-102)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-95)||(141399-141493)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 21396456 - 21396055
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||    
T  21396456 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaacggacggtcgcttactggcttcaaatctatgcccaggccaaacgcagcagacatgccaactttc---ac 21396360  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21396359 aaacaagcttatcgttgatgagctgagttacaacaaagatgaactgaaaaagacacacgctgatatgttactgatgctgactgatgaacaaagatgtgtg 21396260  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21396259 catgacaagataatggagtcagttggttctgacgacggtggtttttttttcttatatggttacggtggtacgggaaaaacctttatatggaaaacattgt 21396160  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||| |||||| ||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21396159 cggctgctgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgctgcatccagcggtatagcggctcttctattaccaggtggaagaaccgcgcactcggcgct 21396060  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  21396059 gacag 21396055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 28665330 - 28665730
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||   ||    
T  28665330 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggacg-tcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacgcggcagacatgccaactttc---ac 28665425  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  28665426 aaacaagcttatcattgatgagctaaattacaacaaagttgaactggaaaagacacacgttgatatgttactgatgctgactgatgaacaaagatgtgtg 28665525  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  28665526 catgacaagatcatggagtctgttggttctgacgacaatggtttctttttcttatatggttacggtggtacgggaaaaacctttatatggaaaaaattgt 28665625  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||| |||||| | | |||||   |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  28665626 cggctgctgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgctgcatccaacggtatagcggctcttctattatcaggtggaagaaccgcgcactccacgct 28665725  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  28665726 gacag 28665730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 35610738 - 35610333
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||||||   ||    
T  35610738 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggacgatcgcttactgacttcaaatctatgtccaggccaaacgcaacagacatgccaactttc---ac 35610642  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  35610641 aaacaaacttatcgttgatgagctaaattacaacaaagatgaaatggaaaagacacacgctgatatgctactgatgctgactgatgaacaaagatgtgtg 35610542  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  35610541 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtggtttatttttcttatatggttatggtggtactggaaaaatctttatatgaaaaacattgt 35610442  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    ||| ||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||||   |||| |||||||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  35610441 cggttgctgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgttgtatccagcggtataacggctcttctattaccaggtgaaacaaccgcgcagtcgacgct 35610342  T
Q  400 gacagacct 408  Q
    |||| ||||    
T  35610341 gacatacct 35610333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 37824164 - 37824564
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||   ||    
T  37824164 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggacg-tcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacgcggcagacatgccaactttc---ac 37824259  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  37824260 aaacaagcttatcattgatgagctaaattacaacaaagttgaactggaaaagacacacgttgatatgttactgatgctgactgatgaacaaagatgtgtg 37824359  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  37824360 catgacaagatcatggagtctgttggttctgacgacaatggtttctttttcttatatggttacggtggtacgggaaaaacctttatatggaaaaaattgt 37824459  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||| |||||| | | |||||   |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37824460 cggctgctgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgctgcatccaacggtatagcggctcttctattatcaggtggaagaaccgcgcactccacgct 37824559  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  37824560 gacag 37824564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 24246909 - 24246508
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||   ||    
T  24246909 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggacagttgcttactaacttcaaatctatgcccatgccaaacgcagcagacatgccaactttc---ac 24246813  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||||||    
T  24246812 aaacaagcttattgttgatgagctaaattacaacaaagatgaactgtaaaagacacacgctgatatgttactgatgctgattgatgaacaaatatgtgtg 24246713  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||         |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  24246712 catgacaagatcatggagtccgttggtcctgacgacgatggtttctttttcttatatggttacggtggtactcgaaaaacctttatatgaaaaacattgt 24246613  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    | |||  |||| ||  |||||||||||||  |||||||| |||||| ||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24246612 cagctaatgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgctgcatccagcggtatagcggctcttctattaccaggtggaagaaccgcacactcgacgct 24246513  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  24246512 gacag 24246508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 24268205 - 24268605
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||    
T  24268205 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggagagtcgcttactgacttcaaatctatacccaggccaaacgcagcagacatgccaactttc---ac 24268301  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| | | | |||||||||||| | ||    
T  24268302 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattacaacaaagatgaactgtaaaagacacatgctgatatgttactgatgttgattgatgaacaaagatatttg 24268401  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||         ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24268402 catgaaaagatcatggagtccgttggttctgacgacgatggtttctttttcttatatggttacagtggtattggaaaaacctttatat-gaaaacattgt 24268500  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    ||||||||||| ||  ||| | |||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24268501 cggctgctgttagatcgaatgagttaattgtattgaatgttgcatctagcggtataatgactcttctattaccaggaggaagaaccgcacactcgacgct 24268600  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  24268601 gacag 24268605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 41919331 - 41919725
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | | ||||||||||||||||   ||    
T  41919331 tgattgaaattgaaatgctgcttcaagaaaacggacg-tcgcttactgacttcaaatctatgtccaggccaaacgcggcagacatgccaactttc---ac 41919426  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  41919427 aaacaagcttatcattgatgagctaaattacaacaaagttgaactggaaaagacacatgttgatatgttactgatgctgactgatgaacaaagatgtgtg 41919526  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41919527 catgacaagatcatggagtctgttggttctgacgacaatggtttctttttcttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaagattgt 41919626  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgc 398  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||| |||||| |   |||||   |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  41919627 cggctgctgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgctgcatccaatggtatagcggctcttctattatcaggtggaagaaccgcgcactccacgc 41919725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 27510459 - 27510059
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||||||   ||    
T  27510459 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacgggcggtcgcttactgacttcaaatctatgcccaggccaaatgcagcaaacatgccaactttc---ac 27510363  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  27510362 aaacaagcttatcgatgatgatctaaattacaacaaagatgaattggaaaagacacacgctgatatgttactgatgctgactgatgaacaaagatgcgtg 27510263  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||         |||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27510262 catgacaagatcatggagtctgtttgttctgacgacggtggtttctttttcttaaatgg-tacgatggtactagaaaaacctttatatggaaaacattgt 27510164  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    || ||| |||| ||  | |||||||||||  ||||||| |||||||| |  |||||   |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  27510163 cgactgttgttagatcggaggggttaattgtattgaattttgcatctggtggtatagcggctcttctattaccaggtggaagaacctcgcactcgacact 27510064  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  27510063 gacag 27510059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27193557 - 27193178
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||   ||    
T  27193557 tgattgaaattgaaatgctacttcaggaaaatggacggtcgcttattgacttcaaatctaagcctagaccaaacaaagcagacatgccaactttc---ac 27193461  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||           ||||| | ||| ||||||||      |||    
T  27193460 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattacaacaaagattaactggaaaagacacacgc-----------tgatgttgactgatgaacaa------gtg 27193378  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27193377 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtggtttctttttcttatatgcttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaacattgt 27193278  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    ||| || |||| ||  |||||||||||||  |||||||| |||||| ||| |||||  ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27193277 cggatgttgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgctgcatcaagcggtatagcagctcttcaattaccaggtggaagaaccgcacactcaacgct 27193178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27843371 - 27842992
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||   ||    
T  27843371 tgattgaaattgaaatgctacttcaggaaaatggacggtcgcttattgacttcaaatctaagcctagaccaaacaaagcagacatgccaactttc---ac 27843275  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||           ||||| | ||| ||||||||      |||    
T  27843274 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattacaacaaagattaactggaaaagacacacgc-----------tgatgttgactgatgaacaa------gtg 27843192  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27843191 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtggtttctttttcttatatgcttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaacattgt 27843092  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    ||| || |||| ||  |||||||||||||  |||||||| |||||| ||| |||||  ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27843091 cggatgttgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgctgcatcaagcggtatagcagctcttcaattaccaggtggaagaaccgcacactcaacgct 27842992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Original strand, 41919789 - 41919903
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  41919789 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcattgcttgatatcat 41919888  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  41919889 gtccaagaatgatcc 41919903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 400 - 516
Target Start/End: Original strand, 24268660 - 24268776
Alignment:
Q  400 gacagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatc 499  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24268660 gacagacctggtgcatgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccactgatgcactgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgtgatatc 24268759  T
Q  500 atgtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||||    
T  24268760 atgtccaagaatgatcc 24268776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 21395997 - 21395883
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  21395997 cagacttggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggctgttgaccgatcattgcgtgatatcat 21395898  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  21395897 gtccaagaatgatcc 21395883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Original strand, 28665788 - 28665902
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  28665788 cagacctggtgtgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcattgcttgatatcat 28665887  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  28665888 gtccaagaatgatcc 28665902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Original strand, 37824622 - 37824736
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  37824622 cagacctggtgtgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcattgcttgatatcat 37824721  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  37824722 gtccaagaatgatcc 37824736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 27510001 - 27509887
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27510001 cagatctggtgcatgctgcaaagttgataatttaggatgaggcttcaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgtgatatcat 27509902  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  27509901 gtccaagaatgatcc 27509887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 404 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 27193114 - 27193002
Alignment:
Q  404 gacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcatgt 503  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27193114 gacctggtgcgtgctgcaaaattgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgctttgaggcagttgaccgatcaatgcgttatatcatgt 27193015  T
Q  504 ccaagaatgatcc 516  Q
     ||||||||||||    
T  27193014 acaagaatgatcc 27193002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 404 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 27842928 - 27842816
Alignment:
Q  404 gacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcatgt 503  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27842928 gacctggtgcgtgctgcaaaattgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgctttgaggcagttgaccgatcaatgcgttatatcatgt 27842829  T
Q  504 ccaagaatgatcc 516  Q
     ||||||||||||    
T  27842828 acaagaatgatcc 27842816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 35610279 - 35610166
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  35610279 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatg-tgcaccgatggtgttttgaagcaattgaccgatcaatacgtgatatcat 35610181  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  35610180 gtccaagaatgatcc 35610166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 24246450 - 24246338
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24246450 cagacttggtgcgtgctgcaaagttgataatttg--atgaggctccaatgatgcactgatggtattttgaggcagttgaccgatcaatacgtgatatcat 24246353  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  24246352 gtccaagaatgatcc 24246338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 402 - 491
Target Start/End: Original strand, 17683505 - 17683594
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgc 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17683505 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttggaatgaggctctaatgatgcaccaatggtgttttgaggcagttgactcatcaatgc 17683594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 392
Target Start/End: Original strand, 17683325 - 17683435
Alignment:
Q  282 ttatatggaaaatattgtcggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaag 381  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||| ||  |||||||| ||||  ||||||||||||| | ||| |||||   |||| ||||||| || |||||||    
T  17683325 ttatatggaaaacattgtcggcttatgttagattgaaggggtgaattgtattgaatgttgcagccagcggtataacggctcttctattatcatgtggaag 17683424  T
Q  382 aaccgctcact 392  Q
    |||||| ||||    
T  17683425 aaccgcacact 17683435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 17)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 12780282 - 12780682
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||   ||    
T  12780282 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggacg-tcgcttactgacttcaaatctatgcccaggccaaacgcggcagacatgccaactttc---ac 12780377  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12780378 aaacaagcttatcattgatgagctaaattacaacaaagttgaactggaaaagacacacgctgatatgttactgatgctgactgatgaacaaagatgtgtg 12780477  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12780478 catgacaagatcatggagtctgttggttctgacgacagtggtttctttttcttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaagattgt 12780577  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    |||||| |||| ||  |||||||||||||  ||||||||||||||| | | |||||   |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  12780578 cggctgttgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgttgcatccaacggtatagcggctcttctattaccaggtggaagaaccgcgcactcgacgcc 12780677  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  12780678 gacag 12780682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 9000278 - 9000679
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||    
T  9000278 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaacggacggtcgcttactgacttcaaatctatgcccaggccaaacgcagcagacatgccaactttc---ac 9000374  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9000375 aaacaagattatcgttgatgagctaagttacaacaaagatgaactgaaaaagacacacgctgatatgttactgatgctgactgatgaacaaagatgtgtg 9000474  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtg-gnnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||| |    
T  9000475 catgacaagataatggagtccgttggttctgacgacggtgttttttttttcttatatggttacggtggtacgggaaaaacctttatacgaaaaacattat 9000574  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    | ||||||||| ||  ||| |||||||||  |||||||| |||||| ||| ||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  9000575 cagctgctgttagatcgaatgggttaattgtattgaatgctgcatccagcggtatatcggctcttctattaccaggtggtagaactgcgcactcgacgct 9000674  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  9000675 gacag 9000679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 12785136 - 12785536
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||   ||    
T  12785136 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggacg-tcgcttactgacttcaaatctatgcccaggccaaacgcggcagacatgccaactttc---ac 12785231  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12785232 aaacaagcttatcattgatgagctaaattacaacaaagttgaactggaaaagacacacgttgatatgttactgatgctgactgatgaacaaagatgtgtg 12785331  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12785332 catgacaagatcatggagtctgttggttctgacgacaatggtttctttttcttatatggttacggtggtacgggaaaaacctttatatggaaaaaattgt 12785431  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||| |||||| | | |||||   |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12785432 cggctgctgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgctgcatccaacggtatagcggctcttctattatcaggtggaagaaccgcgcactccacgct 12785531  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  12785532 gacag 12785536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 7037805 - 7037405
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||   ||    
T  7037805 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaacggacg-tcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacgcggcagacatgccaactttc---ac 7037710  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||  |||||| |||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  7037709 aaacagacttatcattgatgagctaaattacagcaaagttgaattggaaaagacacacgctgatatgttactgatgctgacagatgaacaaagatgtgtg 7037610  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7037609 catgacaagatcatggagtctgttggttctgacgatagtggtttctttttcttatatggttacggcggtactggaaaaacctttatatggaaaagattgt 7037510  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    |||||| |||| ||  |||||||||||||  ||||||||||||||| | | |||||   |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  7037509 cggctgttgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgttgcatcaaacggtataacggctcttctattaccaggtggaagaaccgcacactccacgcc 7037410  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  7037409 gacag 7037405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 42233080 - 42232684
Alignment:
Q  5 tgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcacaaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||    
T  42233080 tgaaattgaaatgttgcttcaggaaaacggagagtcgcttactgacttcaaatctatactcaggccaaacgcagcagacatgccaactttc---acaaac 42232984  T
Q  105 aagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtgcatg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| | | ||||||||| || ||||||||    
T  42232983 aagcttatcgttgatgagctaaattacaacaaagatgaactgtaaaagacacatgctgatatgttactgatgctgattgatgaacaaatatatgtgcatg 42232884  T
Q  205 acaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgtcggc 303  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||         ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  42232883 aaaagatcatggagtccgttggttctgacgacgatggtttctttttcttatatggttacagtggtattggaaaaacctttatat-gaaaacattgtcggc 42232785  T
Q  304 tgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgctgaca 403  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  42232784 tgctgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgctgcatctagcggtataatgactcttctattaccagaaggaagaaccgcacactcgacgctgaca 42232685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Original strand, 21069208 - 21069583
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  || ||||||||||||||||||| ||  | |||||||  || ||||||||||||||||   ||    
T  21069208 tgattgaaattgaaatgttgcttcaagaaaacagacagtcacttactgacttcaaatcta-gcacatgccaaacgaagcagacatgccaactttc---ac 21069303  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  21069304 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattacaacaaagatgaactgaaaaagacacacgctgatatgttactgatgctgattgatgaacaaagatgtgtg 21069403  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21069404 catgaaaagatcatggagtccgttggttctgacgactatggtttctttttcttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatat-gaaaacattgt 21069502  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaa 380  Q
    ||  ||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| |   || |||||||||||||||||    
T  21069503 cgattgctgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgttgcatccagcggtatagtgaatcttctattaccaggtggaa 21069583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 22844869 - 22844565
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||  ||| |||| |||||||   ||    
T  22844869 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggacggtcgattactgacttaaaatctatgcccaggctaaacgcaacagatatgctaactttc---ac 22844773  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  22844772 aaacaagcttatcattgatgagctaaattacaacaaagatgaactgaaaaagacacacgctgatatgttactaatgctgattaatgaacaaagatgtgtg 22844673  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||| ||||| || ||||||   |||||||||||| |||||    
T  22844672 tatgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtggtttctttttcttatatggttacagtggtcctcgaaaaaaaattatatggaaaacattgt 22844573  T
Q  300 cggctgct 307  Q
    ||||||||    
T  22844572 cggctgct 22844565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18939499 - 18939182
Alignment:
Q  4 ttgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcacaaa 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||||   |||||||||    
T  18939499 ttgaaattgaaatgt-gcttcagaaaaacagacgttcgcttactgatttcaaatctatgcccaagccaaacgcagcaaacatgccaac---cttcacaaa 18939404  T
Q  104 caagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtgcat 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  18939403 caagcttatcgtcgatgagctaaattacaacaaggatgaactggaaaagacacgcgctgatatgttactgatgttgactgatgaacaaagatgcgtgcat 18939304  T
Q  204 gacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgtcgg 302  Q
    |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18939303 gacaagatcaaggaatctgatggttctgacgacggtggtttctttttcttatatggttacggtggtactgg-aaaacctttatatcgaaaacattgtcgg 18939205  T
Q  303 ctgctgttcgacagaaggggtta 325  Q
     || |||| ||  ||||||||||    
T  18939204 ttgttgttagatcgaaggggtta 18939182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Original strand, 9000737 - 9000851
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  9000737 cagacctgatgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcat 9000836  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  9000837 gtccaagaatgatcc 9000851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 42232627 - 42232513
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42232627 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccattgatgcactgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgtgatatcat 42232528  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  42232527 gtccaagaatgatcc 42232513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Original strand, 12785594 - 12785708
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  12785594 cagacctggtgtgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcattgcttgatatcat 12785693  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  12785694 gtccaagaatgatcc 12785708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 403 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 22844429 - 22844316
Alignment:
Q  403 agacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcatg 502  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22844429 agacctggtgcatgtagcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatg 22844330  T
Q  503 tccaagaatgatcc 516  Q
    ||||||||||||||    
T  22844329 tccaagaatgatcc 22844316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Original strand, 12780740 - 12780854
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||    
T  12780740 cagacctggtgcgtgctacaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgtccgatcattgtttgatatcat 12780839  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  12780840 gtccaagaatgatcc 12780854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 7037347 - 7037233
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||    
T  7037347 cagacctaatgcatgctgcaaagttgataatttggggtgaggctccaatgatgcaccaatggtgttttgaggtagttgaccgatcattacgtgatatcat 7037248  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    || ||||||||||||    
T  7037247 gttcaagaatgatcc 7037233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 431 - 516
Target Start/End: Original strand, 5828176 - 5828261
Alignment:
Q  431 atttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcatgtccaagaatgatcc 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  5828176 atttgggatgaggctccaatgatgcactgatggtgttttgaggcagttgatcgatcaatgtgtgatatcatgtccaagaatgatcc 5828261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Original strand, 21069654 - 21069768
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| | | ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || | || |||||||| ||||||||    
T  21069654 cagacctggtgcgtgctgcaaacttgataatttcgaacgaggctccaatgatgtattgatggtgttttgaggcatttcatcggtcaatgcgtgatatcat 21069753  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  21069754 gtccaagaatgatcc 21069768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 22844533 - 22844488
Alignment:
Q  359 gctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgctgacag 404  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22844533 gctcttctcttactaggtggaagaaccgcgcactcgacgctgacag 22844488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 4)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 33018 - 32614
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||    
T  33018 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaacggacggtcgcttactgacttcaaatctatatccaggccaaacgcagcagacatgccaactttc---ac 32922  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  32921 aaacaagcttatcgtttatgagctaatttacaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatatgttactgatgctcactgatgaacaaagatgtgtg 32822  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||         ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32821 catgacaagatcatggagtccgttggttctaacgacgatggtttctttttcttatatggttaccgtggtactggaaaaacctttatatggaaaacattgt 32722  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    |||||||| || ||  |||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  32721 cggctgctattagatcgaaggggttaattgtattgaatgctgcatccagcagtataacggctcttctattaccaggtggaagaaccgtgtactcgacgct 32622  T
Q  400 gacagacc 407  Q
    || |||||    
T  32621 gatagacc 32614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 836 - 436
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||   ||    
T  836 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaacggacg-tcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacgcggcagacatgccaactttc---ac 741  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  740 aaacaaacttatcattgatgagctaaattacagcaaagttgaattggaaaagacacacgctgatatgttactgatgctgacagatgaacaaagatgtgtg 641  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  640 catgacaagatcatggagtctgttggttctgacgattgtggtttctttttcttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 541  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    || ||| |||| ||  |||||||||||||  ||||||||||||||| | | |||||   |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  540 cgtctgttgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgttgcatcaaacggtataacggctcttctattaccaggtggaagaaccgcacactccacgcc 441  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  440 gacag 436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 402 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 32559 - 32453
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  32559 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagctgaccgatcattgcgtgatatcat 32460  T
Q  502 gtccaag 508  Q
    |||||||    
T  32459 gtccaag 32453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 378 - 264
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||    
T  378 cagacctaatgcatgctgcaaagttgataatttggggtgaggctccaatgatgcaccaatggtgttttgaggtagttgaccgatcattacgtgatatcat 279  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    || ||||||||||||    
T  278 gttcaagaatgatcc 264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15334381 - 15334030
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||    
T  15334381 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaatggacg-tcgcttactgacttcaaatctatgcccaggccaaacgcagcagacatgccaactttc---ac 15334286  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15334285 aaacaagcttatcgttgatgagctaagttacaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatatgttactgatgctgactgatgaacaaagatgtgtg 15334186  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15334185 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtggtttctctttcttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatagaaaacattgt 15334086  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtata 355  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  15334085 cggctgctgttagatcgaaggggttaattttattgaatgttgcatccagcggtata 15334030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 2200031 - 2200432
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||||||| |||| || |||||| ||| |||| |||||||||||   ||    
T  2200031 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaacggacagtctcttactgaattcaaatctctgcccagaccaaacgcagcagacgtgccaactttc---ac 2200127  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| | ||| |||||||||||||||||    
T  2200128 aaacaaacttatcgtttatgagctaaattacaacaaagatgaactggaaaagacatacactgatatgttacagatgttgactgatgaacaaagatgtgtg 2200227  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  2200228 cacgacaagatcatggagtccgttggttttgacgacggtggtttatttttcttatatggttacggtggtactggacaaacatttatatggaaaacattgt 2200327  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||| | |||| | | |||||    |||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  2200328 cggctgctgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgctacatccaacggtataacgtctctactattaccaggttgaagaaccgcgcactcgacgct 2200427  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  2200428 gacag 2200432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 18857621 - 18857227
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||   |     
T  18857621 tgattgaaattgaaatgttgcttaaggaaaacgggttgtcgcttattgatttcaaatctatgcctaggccaaacgcagcagacatgccaaatttc---aa 18857525  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  18857524 aaacaagcttatcgttgatgatctaaattacaacaaagatgaactggaaaaggcacacgctgatatgttactgatgctgacggatgaacaaagatgtgtg 18857425  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18857424 catgacaagatcatggagtccgtttgttctgacgacggtggtttctttttcttatatgg-tacgatggtactggaaaaacctttatatggaaaacattgt 18857326  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaa---ggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcga 395  Q
    | |||| |||| ||  |||   ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||   |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  18857325 cagctgttgttagatcgaagggggggttaattgtattgaatgttgcatctagcggtataacggctcttctattaccaagtggaagaacctcgcactcga 18857227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 68 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 12518293 - 12517959
Alignment:
Q  68 gccaaacacagtagacatgccaactttcttcacaaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatatt 167  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||     
T  12518293 gccaaacgcagcagacatgccaactttc---acaaacaagcttatcgttgatgagctaagttacaacaaagatgagctggaaaagacacacgttgatatg 12518197  T
Q  168 ttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtgcatgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtg 266  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||    
T  12518196 ttactgatgttgactgatgaacaaagatgcgtgcatgacaagatcatggagtccgttggttctgacgactgtggtttctttttcttatatggttacggtg 12518097  T
Q  267 gtactggaaaaacctttatatggaaaatattgtcggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatct 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||  ||||||||||||||| |||  ||||   |||| |||    
T  12518096 gtactggaaaaacctttatatggaaaacattgtcggctgttgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgttgcatccagcgatatagcggctcttct 12517997  T
Q  367 attaccaggtggaagaaccgctcactcgacgctgacag 404  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12517996 attaccaggtggaagaaccgtacactcgacgctgacag 12517959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 30882391 - 30882087
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||  | | |||| ||||   |||||    
T  30882391 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggacggtcgattactgacttaaaatctatgcccaggctaaacgcaacaaatatgctaact---ttcac 30882295  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  30882294 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattacaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatatgttactaatgctgactgatgaacaaagatgtgtg 30882195  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||         ||||||||||||| ||||| || ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  30882194 catgacaagatcatggagttcgttggttctgacgacggtggtttctttttcttatatggttacagtggtcctcgaaaaaaatttatatggaaaacattgt 30882095  T
Q  300 cggctgct 307  Q
    ||||||||    
T  30882094 cggctgct 30882087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 408 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 12517895 - 12517784
Alignment:
Q  408 tggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcatgtccaa 507  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  12517895 tggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagctgaccgatcattgtgtgatatcatgtccaa 12517796  T
Q  508 gaatgatcctct 519  Q
    ||||||||||||    
T  12517795 gaatgatcctct 12517784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 403 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 30881951 - 30881839
Alignment:
Q  403 agacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcatg 502  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  30881951 agacctggtgcatgtagaaaagttgataatatggaatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgatcgatcaatgcg-tatatcatg 30881853  T
Q  503 tccaagaatgatcc 516  Q
    ||||||||||||||    
T  30881852 tccaagaatgatcc 30881839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 402 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 10188649 - 10188560
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgc 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10188649 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttggaatgaggctctaatgatgcaccaatggtgttttgaggcagttgactcatcaatgc 10188560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 403 - 473
Target Start/End: Original strand, 2200491 - 2200561
Alignment:
Q  403 agacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgagg 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2200491 agacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttggaatgaggctccaatgatgcaccgatagtgttttgagg 2200561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10188829 - 10188719
Alignment:
Q  282 ttatatggaaaatattgtcggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaag 381  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||| ||  |||||||| ||||  ||||||||||||| | ||| |||||   |||| ||||||||||||||||||    
T  10188829 ttatatggaaaacattgtcggcttatgttagattgaaggggtgaattgtattgaatgttgcagccagcggtatagcggctcttctattaccaggtggaag 10188730  T
Q  382 aaccgctcact 392  Q
    |||||| ||||    
T  10188729 aaccgcacact 10188719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 469 - 513
Target Start/End: Original strand, 2201838 - 2201882
Alignment:
Q  469 tgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcatgtccaagaatga 513  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2201838 tgaggcagttgaccgatcaaagcgtgatatcatgtccaagaatga 2201882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 30882055 - 30882010
Alignment:
Q  359 gctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgctgacag 404  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30882055 gctcttctcttacctggtggaagaaccgcgcactcgacgctgacag 30882010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Original strand, 14191945 - 14192345
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||   ||    
T  14191945 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaacggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcccaggccaaacgcaacagacatgccaactttc---ac 14192041  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  14192042 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattacaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatatgctactgatgctgactgatgaacaaagatgtgtg 14192141  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||         |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  14192142 catgacaagatcatggagttcgttggttctgacgacggtggtttatttttcttatatggttatggtggtactggaaaaacctttatatgaaaaacattgt 14192241  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    ||| ||||||| ||  |||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||| |||||   |||| |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||    
T  14192242 cggttgctgttagatcgaaggggttaattgtattaaatgttgtatccagcggtataacggctcttctattaccaggtgaaacaaccgcgcactcgacact 14192341  T
Q  400 gaca 403  Q
    ||||    
T  14192342 gaca 14192345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 37374019 - 37373632
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | | ||||||||||||||||   ||    
T  37374019 tgattgaaattgaaatgcagcttcaggaaaatggacg-tcgcttactgacttcaaatctatgcccaggccaaatgcggcagacatgccaactttc---ac 37373924  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  37373923 aaacaagcttatcattgatgagctaaattacaacaaagttgaactggaaaagacac--gctgatatgttactgatgctgactgatgaacaaagatgtgtg 37373826  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37373825 catgacaagatcatggagtctgttggttctgacgacagtggtttctttttcttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaagattgt 37373726  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactc 393  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||||||| | | |||||   |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37373725 cggctgctgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgttgcatccaacggtatagcggctcttctattaccaggtggaagaaccgcgcactc 37373632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 8427719 - 8428119
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||   ||    
T  8427719 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggacg-tcgcttactgacttcaaatctatgcccaggccaaacgcggcagacatgccaactttc---ac 8427814  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8427815 aaacaagcttatcattgatgagctaaattacaacaaagttgaattgaaaaagacacacgttgatatgttactgatgctgactgatgaacaaagatgtgtg 8427914  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8427915 catgacaagatcatggagtctgttggttatgacgacaatggtttctttttcttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaagattgt 8428014  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||| |||||| | | |||||   |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  8428015 cggctgctgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgctgcatccaacggtataacggctcttctattaccaggtggaagaaccgcgcactccacgcc 8428114  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  8428115 gacag 8428119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 27882169 - 27881769
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||    ||    
T  27882169 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggacg-tcgcttactgacttcaaatctatgctcaggccaaacgcagcagacatgccaacttta---ac 27882074  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  27882073 aaacaagcttatcattgatgagctaaattacaacaaagttgaactggaaaagacacacgctgatatgttactgatgctgactgatgaacaaagatgtgtg 27881974  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27881973 catgacaagatcatggagtctgttggttctgatgacagtggtttctttttcttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaagattgt 27881874  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||| |||     |||||   |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  27881873 cggctgctgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgttgtatccgatggtatagcggcttttctattaccaggtggaagaaccgcgcactccacgcc 27881774  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  27881773 gacag 27881769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 30345764 - 30346164
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||    
T  30345764 tgattgaaattgaaatgttgtttcaggaaaacggagagtcgcttactgacttcaaatctatacccaggccaaacgcagcagacatgccaactttc---ac 30345860  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||| ||||    
T  30345861 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattacaacaaagatgaactgtaaaagacacatgctgatatgttactgatgctgattgatgaacaaagatatgtg 30345960  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||         ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  30345961 catgaaaagatcatggagtctgttggttctgacgacgatggtttctttttcttatatggttacagtggtattggaaaaacctttatat-gaaaacatagt 30346059  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30346060 cggctgctgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgctgcatctagcggtataatgactcttctattaccaggaggaagaaccgcacactcgacgct 30346159  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  30346160 gacag 30346164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 10026062 - 10025671
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||    
T  10026062 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggagagtcgcttactgacttcaaatctatacccaggccaaacgcagcagacatgccaactttc---ac 10025966  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||| ||||    
T  10025965 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattacaacaaagatgaactgtaaaagacacatgctgatatgttactgatgctgattgatgaacaaagatatgtg 10025866  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||         ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10025865 catgaaaagatcatggagtccgttggttctgacgacgatggtttctttttcttatatggttacagtggtattggaaaaacctttatat-gaaaacattgt 10025767  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcga 395  Q
    |||||||| || ||  |||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  10025766 cggctgctattagatcgaaggggttaattgtattgaatgctgcatctagcggtataatgactcttctattaccagaaggaagaaccgcacactcga 10025671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 57 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 39884205 - 39883863
Alignment:
Q  57 tctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcacaaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacac 156  Q
    |||||||| ||| ||||| |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  39884205 tctatgcccaggtcaaacgcagctgacatgccaactttc---acaaataagcttatcgttgatgagctaagttacaactaagatgaactggaaaagacac 39884109  T
Q  157 acgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtgcatgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttata 255  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||         ||||||    
T  39884108 acgctgatatgttactgatgctgactgatgaacaaagatgtgtgcttgacaagatcatggagttcgttggttctgacgacggtggtttctttttcttata 39884009  T
Q  256 tggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgtcggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtata 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| | |||||||  |||||||  |||||| ||| |||||    
T  39884008 tggttacggtggtacttgaaaaacctttatatggaaaacattgtcggctgctgttagatcgaatgagttaattgtattgaatactgcatccagcggtata 39883909  T
Q  356 ttagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgctga 401  Q
       |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39883908 gcggctcttctattaccaggtggaagaaccgcgcactcgacgctga 39883863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 3691063 - 3690662
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||| |||||||||||| |||   ||    
T  3691063 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaatggacggtcgcttactgacttcaaatctatgcccatggcaaacgcagcagacatgccaacgttc---ac 3690967  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  3690966 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattacaacaaagataaacgggaaaagacacacgctgatatgttactgatgctggatgatgaacaaagatgtgtg 3690867  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| || |||| |||         | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3690866 catgacaagatcatggagtctgttgattcggatgacgatggtttctttttcatatatggttacagtggtactggaaaaatctttatatggaaaacattgt 3690767  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    | | || |||| ||  ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||   ||||    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  3690766 cagttgttgttagatcgaaagggttaattgtattgaatgttgcatccagagatataacgactcttctattaccaggtggaagaaccgcgcactcgatgct 3690667  T
Q  400 gacag 404  Q
     ||||    
T  3690666 aacag 3690662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 3875724 - 3876125
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||| |||||||||||| |||   ||    
T  3875724 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaatggacggtcgcttactgacttcaaatctatgcccatggcaaacgcagcagacatgccaacgttc---ac 3875820  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  3875821 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattacaacaaagataaacgggaaaagacacacgctgatatgttactgatgctggatgatgaacaaagatgtgtg 3875920  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| || |||| |||         | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3875921 catgacaagatcatggagtctgttgattcggatgacgatggtttctttttcatatatggttacagtggtactggaaaaatctttatatggaaaacattgt 3876020  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    | | || |||| ||  ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||   ||||    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  3876021 cagttgttgttagatcgaaagggttaattgtattgaatgttgcatccagagatataacgactcttctattaccaggtggaagaaccgcgcactcgatgct 3876120  T
Q  400 gacag 404  Q
     ||||    
T  3876121 aacag 3876125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 24629095 - 24629488
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||    
T  24629095 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggagagtcgcttactgacttcaaatctatacccaggccaaacgcagcagacatgccaactttc---ac 24629191  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||| | | ||||| |||||| ||||    
T  24629192 aaacaagcttattgttgatgagctaaattacaacaaagatgaactgtaaaagacacatgctgatacgttactgatgctgattgatgaataaagatatgtg 24629291  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||         |||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  24629292 catgaaaaaatcatggagtccgttggttctgacgacgatggtttctttttcttatacggttacagtggtattgg-aaaacctttatat-gaaaacattgt 24629389  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||      ||||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24629390 cggctgctgttagatctaaggggtt------attgaatgttgcatctagcggtataatgactcttctattaccaggaggaagaaccgcacactcgacgct 24629483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 401
Target Start/End: Original strand, 25541937 - 25542325
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||||   ||    
T  25541937 tgattgaaactgaa-tgctgcttcaggaaaacggacagtcgcttactgacttcaaatctatgctcaggtcaaacgcagcagacatgccaactttc---ac 25542032  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||| ||||    
T  25542033 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattacaacaaagatgaactggaaaagacacatgctgatatgttactgatgctgattgatgaacaaagatatgtg 25542132  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    ||||| |||||| |||||||||       |||||||| |||         ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  25542133 catgaaaagatcctggagtccg-------tgacgacgatggtttctttttcttatatggttacggtggtac-ggaaaaacctttatat-gaaaacattgt 25542223  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||| ||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25542224 cggctgttgttagaccgaaggggttaattgtattgaatgatgcatccagcggtatagtgactcttctattaccaggtggaagaaccgcatactcgacgct 25542323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 17870791 - 17871096
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||  ||| |||| |||||||   ||    
T  17870791 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggacggtcgattactgacttaaaatctatgcccaggctaaacgcaacagatatgctaactttc---ac 17870887  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  17870888 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattacaacaaagatgaactgaaaaggacacacgctgatatgttactaatgttgactgatgaacaaagatgtgtg 17870987  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtact-ggaaaaacctttatatggaaaatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||         ||||||||||||| ||||| || | |||||  ||||||||||||| ||||    
T  17870988 catgacaagatcatggagtctgttggttctaacgacggtggtttctttttcttatatggttacagtggtcctcgaaaaaaaatttatatggaaaacattg 17871087  T
Q  299 tcggctgct 307  Q
    |||||||||    
T  17871088 tcggctgct 17871096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Original strand, 8428177 - 8428291
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  8428177 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcattgcttgatatcat 8428276  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  8428277 gtccaagaatgatcc 8428291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 37373563 - 37373449
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  37373563 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgagactccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcat 37373464  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  37373463 gtccaagaatgatcc 37373449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 405 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 27881708 - 27881597
Alignment:
Q  405 acctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcatgtc 504  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27881708 acctgatgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtc 27881609  T
Q  505 caagaatgatcc 516  Q
    ||||||||||||    
T  27881608 caagaatgatcc 27881597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 10025605 - 10025491
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10025605 cagacctagtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccattgatgcactgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgtgatatcat 10025506  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  10025505 gtccaagaatgatcc 10025491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Original strand, 14192404 - 14192517
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14192404 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatg-tgcaccgatggtgttttgaagcaattgaccgatcaatgcgtgatatcat 14192502  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  14192503 gtccaagaatgatcc 14192517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 403 - 516
Target Start/End: Original strand, 24629546 - 24629659
Alignment:
Q  403 agacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcatg 502  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24629546 agacctgatgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccattgatgcactgatggtgttttgaggcagttggccgatcaatgcgtgatatcatg 24629645  T
Q  503 tccaagaatgatcc 516  Q
    ||||||||||||||    
T  24629646 tccaagaatgatcc 24629659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 3690604 - 3690490
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  3690604 cagacctggtgcctgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgaaccgatggtgttttgaggcagttgaccaatcaatgcatgatatcat 3690505  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
     ||||||||||||||    
T  3690504 atccaagaatgatcc 3690490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Original strand, 25542385 - 25542499
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  25542385 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttaagatgaggctccaatgatgcactgatggtgttttgaggaagttgaccgattaatgcgtgatatcat 25542484  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  25542485 gtccaagaatgatcc 25542499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Original strand, 30346221 - 30346335
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30346221 cagacctgatgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgagactccattgatgcactgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgtgatatcat 30346320  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||| ||||||    
T  30346321 gtccaagattgatcc 30346335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 400 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 37261932 - 37261815
Alignment:
Q  400 gacagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatc 499  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  37261932 gacagacctggtgcgtgctgtaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcattgatggtgttttgaggaagttgactgatcaatgcgcgatatc 37261833  T
Q  500 atgtccaagaatgatcct 517  Q
    ||||| | ||||||||||    
T  37261832 atgtctaggaatgatcct 37261815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Original strand, 3876183 - 3876297
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  3876183 cagacctggtgcctgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgaaccgatgatgttttgaggcagttgaccaatcaatgcatgatatcat 3876282  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
     ||||||||||||||    
T  3876283 atccaagaatgatcc 3876297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 402 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 39883802 - 39883717
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatca 487  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39883802 cagacctggtgcgtgctgcaaagctgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagctgaccgatca 39883717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 421 - 516
Target Start/End: Original strand, 17871250 - 17871344
Alignment:
Q  421 aaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcatgtccaagaatgatcc 516  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17871250 aaagttgataatatggaatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgatcgatcaatgcg-tatatcatgtccaagaatgatcc 17871344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 286 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 37262105 - 37261988
Alignment:
Q  286 atggaaaatattgtcggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaacc 385  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||   || |||||||||  ||| |||| |||||| ||| |||||   |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  37262105 atggaaaacattgtcggctgttgttagatcaaaagggttaattgtattaaatgctgcatccagcggtataacggctcttctattaccag-tggaagaacc 37262007  T
Q  386 gctcactcgacgctgacag 404  Q
    || ||||||||||||||||    
T  37262006 gcgcactcgacgctgacag 37261988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 404
Target Start/End: Original strand, 17871128 - 17871173
Alignment:
Q  359 gctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgctgacag 404  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17871128 gctcttctcttacctggtggaagaaccgcgcactcgacgctgacag 17871173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 13)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 49711256 - 49710857
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||   ||    
T  49711256 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaacggacggtcgcttactgacttcaaatctatgcccaggccaaatgcagcagacatgccaactttc---ac 49711160  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  49711159 aaacaagcttatcgttgatgagctgagttacaacaaagatgaactgggaaagacacacgctgatatgttactgatgctgactgatgaacaaagatgtgtg 49711060  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtggnnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgtc 300  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |        ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49711059 catgacaagataatggagtcagttggttctgacgacagt-gttttttttcttatatggttgcggtggtacgggaaaaacctttatatggaaaacattgtc 49710961  T
Q  301 ggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgctg 400  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||| |||||| ||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49710960 ggctgctgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgctgcatccagcggtatagcggctcttctattaccaggtggaagaaccgcgcactcgacgctg 49710861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 35856992 - 35856592
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||   ||    
T  35856992 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggacg-tcgcttactgacttcaaatctatgcccaggccaaacgcggcagacatgccaactttc---ac 35856897  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  35856896 aaacaagcttatcattgatgagctaaattacaacaaagttgaactggaaaagacacacgctgatatgttactgatgctgactgatgaacaaagatgtgtg 35856797  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35856796 catgacaagatcatggagtctgttggttctgacgacagtggtttctttttcttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaagattgt 35856697  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||| |||||| | | |||||   |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  35856696 cggctgctgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgctgcatccaacggtatagcggctcttctattaccaggtggaagaaccgcgcactccacgcc 35856597  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  35856596 gacag 35856592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 49785986 - 49786386
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||   ||    
T  49785986 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggacg-tcgcttactgacttcaaatctatgcccaggccaaacgcggcagacatgccaactttc---ac 49786081  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49786082 aaacaagcttatcattgatgagctaaattacaacaaagttgaactggaaaagacacacgttgatatgttactgatgctaactgatgaacaaagatgtgtg 49786181  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  49786182 catgacaagatcatggagtctgttggttctgacgacaatggtttctttttcttatatggttacggtggtacgggaaaaacctttatatggaaaagattgt 49786281  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    |||||| |||| ||  |||||||||||||  |||||||| |||||| | | |||||   |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||     
T  49786282 cggctgttgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgctgcatccaacggtatagcggctcttctattatcaggtggaagaaccgcgcactccacgcc 49786381  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  49786382 gacag 49786386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 13345020 - 13344638
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||||| |||||||   ||    
T  13345020 tgattgaaatataaatgttgcttcaggaaaacggacg-tcgcttactgacttcaaatctatgcccaggccaaacgcgacagacatgctaactttc---ac 13344925  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13344924 aaacaagcttatcattgatgagctaaattacaacaaagttgaactggaaaagacacacgctgatatgttactgatgctgactgatgaacaaagatgtgtg 13344825  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggt-ggnnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13344824 catgacaagatcatggagtctgttggttctgacgacagtgggttctttttcttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaagattgt 13344725  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccg 386  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||| |||||| | | |||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13344724 cggctgctgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgctgcatccaacggtatagcggctcttctattaccaggtggaagaaccg 13344638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 404
Target Start/End: Original strand, 55558262 - 55558658
Alignment:
Q  5 tgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcacaaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||    
T  55558262 tgaaattgaaatgttgcttcaggaaaacggagagtcgcttactgacttcaaatctatacccaggccaaacgcagcagacatgccaactttc---acaaac 55558358  T
Q  105 aagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtgcatg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| | | ||||||||| || ||||||||    
T  55558359 aagcttatcgttgatgagctaaattacaacaaagatgaactgtaaaagacacatgctgatatgttactgatgctgattgatgaacaaatatatgtgcatg 55558458  T
Q  205 acaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgtcggc 303  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||         |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  55558459 aaaagatcatggagtctgttggttctgacgacgatggtttctttttcttatatggttacggtggtattggaaaaacctttatat-gaaaacattgtccgc 55558557  T
Q  304 tgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgctgaca 403  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  55558558 tgctgttagatcgaaggggttaattctattgaatgatgcatctagcggtataatgactcttctattaccagaaggaagaaccgcacactcgacgctgaca 55558657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5337377 - 5337032
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | | ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   ||||||    
T  5337377 tgattgaaattgaaatgttgctttaggaaaacgaatgttcgcttactaatttcaaatctatgcccaggccaaacacaatagacatgccaac---cttcac 5337281  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5337280 aaacaagcttattgtggatgagctaaattacaacaaggatgaactgacaaagacacagactgatatgttactgatgctgactgatgaacaaagatgtgtg 5337181  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    ||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||||         |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  5337180 catgacaagatcatggactccaaaggttttgacgacggtggtttctttttcttatatggttatggtggtaccggaaaaacctttatatggaaaacatcgt 5337081  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctag 348  Q
     ||||| |||| ||  |||||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  5337080 tggctgttgttagatcgaaggggttaattgttttgaatgctgcatctag 5337032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 35856534 - 35856420
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  35856534 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcat 35856435  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  35856434 gtccaagaatgatcc 35856420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 13337862 - 13337748
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13337862 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtggtttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcat 13337763  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  13337762 gtccaagaatgatcc 13337748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 13344562 - 13344448
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13344562 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtggtttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcat 13344463  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  13344462 gtccaagaatgatcc 13344448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 49710799 - 49710685
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  49710799 cagaccttgtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcatcgatggtgttttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcat 49710700  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  49710699 gtccaagaatgatcc 49710685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Original strand, 49786444 - 49786558
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  49786444 cagacctggtgtgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcattgcttgatatcat 49786543  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  49786544 gtccaagaatgatcc 49786558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Original strand, 55558715 - 55558829
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55558715 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccattgatgcactgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgtgatatcat 55558814  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||| ||||||||    
T  55558815 gtccaaaaatgatcc 55558829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 14146684 - 14146774
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaac 91  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  14146684 tgattgaaattgaaatgctgcttctagaaaatggacggtcgcttactgacttcaaatctatgcccaggtcaaacgcagcagacatgccaac 14146774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 43061 - 42660
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||    
T  43061 tgattgaaattgaaatgttgctttaggaaaactgacggtcgcttactgacttcaaatctatgcccaggccaaacgcagcagacatgccaactttc---ac 42965  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42964 aaacaagcttatcgttgatgagctaagttacagcaaagatgaactggaaaagacacacgctgatatgttactgatgctgactaatgaacaaagatgtgtg 42865  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||    
T  42864 catgacaagataatggagtccgttggttctgacgacggtggtttttttttcttatatggttacggtggtatgggaaaaacctttatatgaaaagcattgt 42765  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||  | |||||| |||||| ||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  42764 cggctgctgttagatcgaaggggttaattgtaatgaatgctgcatccagcggtataacggctcttctattaccaggtggaagaaccgcgcactcgacgcc 42665  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  42664 gacag 42660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 408 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 42596 - 42488
Alignment:
Q  408 tggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcatgtccaa 507  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  42596 tggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcactgatggtgttttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaa 42497  T
Q  508 gaatgatcc 516  Q
    |||||||||    
T  42496 gaatgatcc 42488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 25217699 - 25218099
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||   ||    
T  25217699 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggacg-tcgcttactgacttcaaatctatgcccaggccaaacgcggcagacatgccaactttc---ac 25217794  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25217795 aaacaagcttatcattgatgagctaaattacaacaaagttgaactggaaaagacacacgctgatatgttactgatgctgactgatgaacaaagatgtgtg 25217894  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25217895 catgacaagatcatggagtctgttggttctgacgacaatggtttctttttcttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaagattgt 25217994  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||| |||||| | | |||||   |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  25217995 cggctgctgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgctgcatccaacggtatagcggctcttctattaccaggtggaagaaccgcgcactccacgcc 25218094  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  25218095 gacag 25218099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 7822916 - 7822536
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||   ||    
T  7822916 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggacg-tcgcttactgacttcaaatctatgcccaggccaaacgcggaagacatgccaactttc---ac 7822821  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7822820 aaacaagcttatcattgatgagctaaattacaacaaagttgaactggaaaagacacacgccgatatgttactgatgctgactgatgaacaaagatgtgtg 7822721  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtggnnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgtc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  7822720 catgacaagatcatggagtccgttggttctgatgacggtgggtttttttcttatatggttacggtggtacgggaaaaacctttatacggaaaacattgtc 7822621  T
Q  301 ggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaacc 385  Q
    || ||||||| ||  ||| |||||||||  |||||||| |||||| |||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||    
T  7822620 ggttgctgttagatcgaatgggttaattgtattgaatgctgcatccagcagtataacggctcttctattaccaggtggaagaacc 7822536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 30326550 - 30326166
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||| |||||||   ||    
T  30326550 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggacg-tcgcttactgacttcaaatctatgcccaggccaaacgcggcagacatgctaactttc---ac 30326455  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||          |||||||||||||||||    
T  30326454 aaacaagcttatcattgatgagctaaattacaacaaagttgaactggaaaagacacacgctgatatgttactg----------atgaacaaagatgtgtg 30326365  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30326364 catgacaagattatggagtctgttggttctgacgacagtggtttctttttcttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaagattgt 30326265  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgc 398  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||   |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  30326264 cggctgctgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgctgcatctaacggtatagcggctcttctattaccaggtggaagaaccgcgcactccacgc 30326166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 25208181 - 25208581
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| || || | ||||||||||||||||||   ||    
T  25208181 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggacg-tcgcttactgacttcaaatctatgcacagggcagacgcggtagacatgccaactttc---ac 25208276  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||||||    
T  25208277 aaacaagcttatcattgatgagctaaattacaacaaagttgaactggaaaagacacacgctgatatgttactgatattgactgatgaacaaagatgtgtg 25208376  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||         || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  25208377 catgacaagatcatggagtctgttggttctgacgacagtggtttctttttctcatatggttacggtggtactggataaacctttatatagaaaagattgt 25208476  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    ||||| ||||| ||  || ||||||||||  ||||||||||||||| | | |||||   |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||     
T  25208477 cggctactgttagatcgatggggttaattgtattgaatgttgcatccaacggtatagcggctcttctattaccaggtggaagaaccgcgcgctccacgcc 25208576  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  25208577 gacag 25208581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 21112879 - 21113279
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  21112879 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacgaagagtcgcttactgacttcaaatctatacccaggccaaacacagcagacatgccaactttc---ac 21112975  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| | | | |||||||||||| | ||    
T  21112976 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattacaacaaagatgaactgtaaaagacacatgctgatatgttactgatgttgattgatgaacaaagatatttg 21113075  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||         ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21113076 catgaaaagatcatggagttcgttggttctgacgacgatggtttctttttcttatatggttacagtggtattggaaaaacctttatat-gaaaacattgt 21113174  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    ||||||||||| ||  ||| | |||||||  |||||||| |||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  21113175 cggctgctgttagatcgaatgcgttaattgtattgaatgctgcatctagcggtataatgactcttctattaccaggaggaagaaccgcacactcgacgtt 21113274  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  21113275 gacag 21113279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Original strand, 25218157 - 25218271
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  25218157 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcat 25218256  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  25218257 gtccaagaatgatcc 25218271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 30326102 - 30325988
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  30326102 cagacctggtgcatgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcat 30326003  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  30326002 gtccaagaatgatcc 30325988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 400 - 516
Target Start/End: Original strand, 21113334 - 21113450
Alignment:
Q  400 gacagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatc 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21113334 gacagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccattgatgcactgatggtgttttgcggcagttgaccgatcaatgcgtgatatc 21113433  T
Q  500 atgtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||||    
T  21113434 atgtccaagaatgatcc 21113450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 7822465 - 7822351
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  7822465 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcattgcatgatatcat 7822366  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||| ||||||||    
T  7822365 gtccaaaaatgatcc 7822351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Original strand, 25208639 - 25208753
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  25208639 cagacctgatgcgtgctccaaagttgataatttgggatgagactccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcattgtgtgatatcat 25208738  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  25208739 gtccaagaatgatcc 25208753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 17887194 - 17887124
Alignment:
Q  434 tgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcatgtc 504  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||    
T  17887194 tgggatgaggcaccaataatgcatcgttattgttttgaggcatttgaccgaaccatgcgcgatataatgtc 17887124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 48094 - 48494
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||   ||    
T  48094 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggacg-tcgcttactgacttcaaatctatgcccaggccaaacgcggcagacatgccaactttc---ac 48189  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  48190 aaacaagcttatcattgatgagctaaattacaacaaagttgaactggaaaagacacacgttgatatgttactgatgctgactgatgaacaaagatgtgtg 48289  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  48290 catgacaagatcatggagtctgttggttctgacgacaatggtttctttttcttatatggttacggtggtacgggaaaaacctttatatggaaaaaattgt 48389  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||| |||||| | | |||||   |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||     
T  48390 cggctgctgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgctgcatccaacggtatagcggctcttctattatcaggtggaagaaccgcgcactccacgcc 48489  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  48490 gacag 48494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Original strand, 48552 - 48666
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  48552 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcattgcttgatatcat 48651  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  48652 gtccaagaatgatcc 48666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 516
Target Start/End: Original strand, 48774518 - 48775041
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||| ||||||||||||    |||||    
T  48774518 tgattgaaattgaaacgctgcttcaggaaaatggacggttgcttactgacttcaaatctatgcccatggcaaacgcagcagacatgccaac---gttcac 48774614  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||  || ||||||||||| |||||    
T  48774615 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattacaacaaagataaacgggaaaagacaca--ctgatatgttactgatgctggctgatgaacaaagaagtgtg 48774712  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||         | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  48774713 catgacaagatcatggagtctgttgattctgacgacgatggtttctttttcatatatggttacagtggtactggaaaaatctttatatggaaaacattgt 48774812  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgc- 398  Q
      | || |||| ||  |||| ||||||||  ||||||||||||||| |||  ||||  | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||     
T  48774813 tagttgttgttagatcgaagaggttaattgtattgaatgttgcatccagcgatatagcaactcttctattaccaggtggaagaaccgtgcactcgacgca 48774912  T
Q  399 -----------tgacagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatca 487  Q
                | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  48774913 aacagtccctagggcagacctggtgcgtgcttcaaagttgataatttgtgatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaagcagttgaccaatca 48775012  T
Q  488 atgcgcgatatcatgtccaagaatgatcc 516  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  48775013 atgcatgatatcatatccaagaatgatcc 48775041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 6310128 - 6310528
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||   ||    
T  6310128 tgattgaaattgaaatgttgcttcaagaaaacggacg-tcgcttactgacttcaaatctatgcccaggccaaacgcggcagacatgccaactttc---ac 6310223  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||  |||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  6310224 aaacagacttatcattgatgagctaaatttcaacaaagttgaactggaaaagacacacgctgatatattactgatgctgactgatgaacaaagatgtgtg 6310323  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6310324 catgacaagatcatggagtctgttggttctgacgataatggtttcttttacttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaagattgt 6310423  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    ||| ||||||| ||  |||||||||||||  |||||||| |||||| | | |||||   |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  6310424 cggttgctgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgctgcatccaacggtatagcggctcttctattaccaggtggaagaaccgcgcactccacgcc 6310523  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  6310524 gacag 6310528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 36208300 - 36207900
Alignment:
Q  3 attgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcacaa 102  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||  || | |  |||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||    
T  36208300 attgaaattgaaatgctgcttccggaaaacagaaggttacttggtgacttcaaatctatgcccaggccaaacgcagcagacatgccaactttc---acaa 36208204  T
Q  103 acaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtgca 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  36208203 acaagtttatcgttgatgagctaaattacaacaaaggtgaactggaaaagacacacactgatatgttactgatgctgactaatgagcaaagatgtgtgca 36208104  T
Q  203 tgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactg-gaaaaacctttatatggaaaatattgtc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||         |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  36208103 tgacaagatcatggagtccgttggttctaacgacggtggtttctttttcttatatggttacggtggtactgaaaaaaacctttatatggaaaacattgtc 36208004  T
Q  301 ggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgctg 400  Q
    ||||| |||| ||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||||| |   |||||||||| |    
T  36208003 ggctgttgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgttgcatctagcagtataacggcttttctattaccaggtggaagaatcatgcactcgacgccg 36207904  T
Q  401 acag 404  Q
    ||||    
T  36207903 acag 36207900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 2330252 - 2329860
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||| |||||   ||    
T  2330252 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggacggtcgcttactgacttcaaatctatgcccaggccaaacgtagcagacatgccatctttc---ac 2330156  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  2330155 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattacaacgaagatgaactggaaaagactcacgctgatatgttactgatgttgactgattaacaaagatgtgtg 2330056  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtg-gnnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||| |||| |||  ||||||| |||| || |||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2330055 catgacaagaacatgtagtttgttggttttgacaacagtgttttctttttcttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaacattgt 2329956  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcga 395  Q
    |  ||||| || ||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2329955 caactgctattagatcgaaagggttaattgtattgaatgttgcatctagcggtatagagactcttctattaccaggtggaagaaccgcacactcga 2329860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 52501655 - 52501261
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||    
T  52501655 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggagagtcgcttactgacttcaaatctatacccaggccaaacgcagcagacatgccaactttc---ac 52501559  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||| | | ||||| |||||| ||||    
T  52501558 aaacaagcttattgttgatgagctaaattacaacaaagatgaactgtaaaagacacatgctgatacgttactgatgctgattgatgaataaagatatgtg 52501459  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||         |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  52501458 catgaaaaaatcatggagtccgttggttctgacgacgatggtttctttttcttatacggttacagtggtattggaaaaacctttatat-gaaaacattgt 52501360  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||      ||||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  52501359 cggctgctgttagatctaaggggtt------attgaatgttgcatctagcggtataatgactcttctattaccaggaggaagaaccgcacactcgacgct 52501266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 57 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 16043053 - 16042708
Alignment:
Q  57 tctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcacaaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacac 156  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  16043053 tctatgcctaggccaaacgcagcagacatgccaactttc---acaaacaagcttatcgttgatgagctaagttacaactaagatgaactgaaaaagacac 16042957  T
Q  157 acgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtgcatgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttata 255  Q
    ||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||         ||||||    
T  16042956 acgttgatatgttactgatgctgactgatgaacaaagatgtgtgcttgacaagatcatggagttcgttggttctaacgacggtggtttctttttcttata 16042857  T
Q  256 tggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgtcggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtata 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||  |||||||  |||||| | | |||||    
T  16042856 tggttacggtggtactggaaaaaccattatatggaaaacattgtcggctgctgttagatcgaatgggttaattgtattgaatactgcatccaacggtata 16042757  T
Q  356 ttagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgctgacag 404  Q
       |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16042756 gccgctcttctattaccaggtggaagaaccgtgcactcgacgctgacag 16042708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Original strand, 6310586 - 6310700
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  6310586 cagacctgatgcatgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcat 6310685  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  6310686 gtccaagaatgatcc 6310700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 403 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 52501203 - 52501090
Alignment:
Q  403 agacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcatg 502  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  52501203 agacctgatgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccattgatgcactgatggtgttttgaggcagttggccgatcaatgcgtgatatcatg 52501104  T
Q  503 tccaagaatgatcc 516  Q
    ||||||||||||||    
T  52501103 tccaagaatgatcc 52501090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 402 - 513
Target Start/End: Original strand, 2452709 - 2452820
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  2452709 cagacctggtgcgtgctgtaatgttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgatcgatcaatgtgtgatatcat 2452808  T
Q  502 gtccaagaatga 513  Q
    ||||||||||||    
T  2452809 gtccaagaatga 2452820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 16042652 - 16042538
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | ||||||||    
T  16042652 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctcaaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagctgactgatcattgtgtgatatcat 16042553  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  16042552 gtccaagaatgatcc 16042538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Original strand, 37389744 - 37389858
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  37389744 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgagactccaatgatacaatgatggtgttttgaggcagttgaccaatcattgcgtgatatcat 37389843  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    | |||||||||||||    
T  37389844 ggccaagaatgatcc 37389858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 403 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 36207841 - 36207728
Alignment:
Q  403 agacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcatg 502  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||    
T  36207841 agacctggtgcgtgctgcaacgttgataatttgggatgaggctccaatcatgcactaatggtgttttgaggcagttgactgatcaatgtgtgataccatg 36207742  T
Q  503 tccaagaatgatcc 516  Q
    ||||||||||||||    
T  36207741 tccaagaatgatcc 36207728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 2329793 - 2329679
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||| | ||||||||    
T  2329793 cagacctggtgtgtgctgcaaagttgataattttttatgagtctccaatgatgcaccaatggtgttttgagaaagtttaccgatcaatgtgtgatatcat 2329694  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  2329693 gtccaagaatgatcc 2329679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 27854 - 28254
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||    
T  27854 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggagagtcgcttactgacttcaaatctatacccaggccaaacgcagcagacatgccaactttc---ac 27950  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||| ||||    
T  27951 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattacaacaaagatgaactgtaaaagacacatgctgatatgttactgatgctgattgatgaacaaagatatgtg 28050  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||         ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  28051 catgaaaagatcatggagtccgttggttctgacgacgatggtttctttttcttatatggttacagtggtattggaaaaacctttatat-gaaaacattgt 28149  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  28150 cggctgctgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgctgcatctagcggtataatgactcttctattaccagaaggaagaaccgcacactcgacgct 28249  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  28250 gacag 28254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Original strand, 28311 - 28425
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28311 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccattgatgcactgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgtgatatcat 28410  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  28411 gtccaagaatgatcc 28425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 22)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 33856 - 33456
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||   ||    
T  33856 tgattgaaattgaaatactgcttcaggaaaaccgacg-tcgcttactgacttcaaatctatgcccaggccaaacgcggcagacatgccaactttc---ac 33761  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  33760 aaacaagctaatcattgatgagctaaattacaacaaagttgaactggaaaagacacacgctgatatgttactgatgctgactgatgaacaaagatgtgtg 33661  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33660 catgacaagatcatggagtctgttggttctgacgacagtggtttcttttttttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaagattgt 33561  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    ||||| ||||| ||  ||| |||||||||  ||||||||||||||| | | |||||   |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  33560 cggctactgttagatcgaatgggttaattgtattgaatgttgcatccaaccgtatagcggctcttctattaccaggtggaagaaccgcgcactccacgcc 33461  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  33460 gacag 33456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 52919112 - 52918711
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||   ||    
T  52919112 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggacggtcgcttaatgacttcaaatctatgctcaggccaaacgcagcagacatgccaacattc---ac 52919016  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || | |||    
T  52919015 aaacaagattatcattgatgagctaaattacaacaaagatgaattggaaaagacacatgctgatatgttactgatgctgactgatgaacaaggaagcgtg 52918916  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||         |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||    
T  52918915 caagacaagatcatggagtccgttggttctgacgacaatggtttctttttcttatatggttacggtggtactggaaaatcctttatttggaaaagtttgt 52918816  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    |||||| |||| ||  |||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52918815 cggctgttgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgttgcatccagcggtatatcggctcttctattaccaggtggaagaaccgcgcactcgacgct 52918716  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  52918715 gacag 52918711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 10245369 - 10244969
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||| || || |  | |||| ||| ||||||||||||||||   ||    
T  10245369 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacgaacagtcgcttactgacttcaaatccatacccatacaaaacgcagcagacatgccaactttc---ac 10245273  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||| ||||    
T  10245272 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattacaacaaagatgaactggaaaagacacatgctgatatgttactgatgctgattgatgaacaaagatatgtg 10245173  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||         ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10245172 catgaaaagatcatggagtccgttggttctaacgacgatggtttctttttcttatatggttacagtggtattggaaaaacctttatat-gaaaacattgt 10245074  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10245073 cggctgctgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgttgcatctagcagtatagtgactcttctattagcaggaggaagaaccgcacactcgacgct 10244974  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  10244973 gacag 10244969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 10967916 - 10968316
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||    ||    
T  10967916 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggacc-tcacttactgacttcaaatctatgcccaggccaaacgcggcagacatgccaactttt---ac 10968011  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  10968012 aaacaagcttatcattgatgagctaaattacaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatatgttactgatgttgactgatgaacaaagatgtgtg 10968111  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||         |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10968112 catgacaagatcatggagtctgttggttctgacgacagtggtttctttttcttatatggttatggtggtactggaaaaacctttatatgaaaaagattgt 10968211  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    |||||| | || ||  |||||||||||||  |||||||| |||||| | | |||||    ||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  10968212 cggctgatattagatcgaaggggttaattgtattgaatgctgcatccaacggtatagcgactattctattaccaggtggaagaactgcgcactcgacgcc 10968311  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  10968312 gacag 10968316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 11369724 - 11369323
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||| |||   |     
T  11369724 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaatggacggtcgcttactgacttcaaatctatgcccatggcaaacacagaagacatgccaacgttc---aa 11369628  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  11369627 aaaaaagattatcgttgatgagctaaattacaacaaagataaacgggaaaagacacacgctgatatgttactgatgatagctgatgaacaaagatgtgtg 11369528  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||         | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  11369527 catgacaagatcatggagtctgttgattttgacgacgatggtttctttttcatatatggttacagtggtactggaaaaatctttatatggaaaacattgt 11369428  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    | | ||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11369427 cagttgctgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgttgcatccagcggtatatcgactcttctattaccaggtggaagaaccgtgcactcgacgct 11369328  T
Q  400 gacag 404  Q
     ||||    
T  11369327 aacag 11369323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 10111684 - 10111284
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||| ||||||| || || |  | |||| ||| ||||||||||||||||   ||    
T  10111684 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaacgaacagtcgcttactgacatcaaatccatacccatacaaaacgcagcagacatgccaactttc---ac 10111588  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||| ||||    
T  10111587 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattacaacaaagatgaactggaaaagacacatgctgatatgttactgatgctgattgatgaacaaagatatgtg 10111488  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||         ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10111487 catgaaaagatcatggagtccgttggttctaacgacgatggtttctttttcttatatggttacagtggtattggaaaaacctttatat-gaaaacattgt 10111389  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    || |||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||    
T  10111388 cgactgctgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgttgcatctagcggtatagtgactcttctattagcaggaggaagaaccgcacacctgacgct 10111289  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  10111288 gacag 10111284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 27275476 - 27275086
Alignment:
Q  5 tgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcacaaac 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||    
T  27275476 tgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggagagtcgcttactgacttcaaatctatacccaggccaaacgcagcagacatgccaactttc---acaaac 27275380  T
Q  105 aagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtgcatg 204  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||| | | ||||| |||||| ||||||||    
T  27275379 aagcttattgttgatgagctaaattacaacaaagatgaactgtaaaagacacatgctgatacgttactgatgctgattgatgaataaagatatgtgcatg 27275280  T
Q  205 acaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgtcggc 303  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||| |||         |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27275279 aaaaaatcatggagtccgttggttctgacgacgatggtttctttttcttatacggttacagtggtattggaaaaacctttatat-gaaaacattgtcggc 27275181  T
Q  304 tgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgctgaca 403  Q
    ||||||| ||   ||||||||      ||||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27275180 tgctgttagatctaaggggtt------attgaatgttgcatctagcggtataatgactcttctattaccaggaggaagaaccgcacactcgacgctgaca 27275087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 10001491 - 10001091
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||  ||||||| |||| ||||||| || || |  | |||| ||| ||||||||||||||||   ||    
T  10001491 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacgaacagtcgcttattgacatcaaatccatacccatacaaaacgcagcagacatgccaactttc---ac 10001395  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||| ||||    
T  10001394 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattacaacaaagatgaattggaaaagacacatgctgatatgttactgatgctgattgatgaacaaagatatgtg 10001295  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||         ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10001294 catgaaaagatcatggagtccgttggttcgaacgacgatggtttctttttcttatatggttacagtggtattggaaaaacctttatat-gaaaacattgt 10001196  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    || ||| |||| ||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10001195 cgactgttgttagatcgaaggggttaattatattgaatgttgcatctagcggtatagtgactcttctattagcaggaggaagaaccgcacactcgacgct 10001096  T
Q  400 gacag 404  Q
    |||||    
T  10001095 gacag 10001091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 46913561 - 46913258
Alignment:
Q  4 ttgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcacaaa 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||  | ||||||||||   |||||||||    
T  46913561 ttgaaattgaaatgt-gcttcaggaaaacggacgttcgcttactgatttcaaatctatgcccaagccaaacgcaacaaacatgccaac---cttcacaaa 46913466  T
Q  104 caagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtgcat 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  46913465 caagcttatcgtcgatgagctaaattacaacaaggatgaactggcaaagacacgtgctgatatgttactgatgctgactgatgaacagagatgtgtgcat 46913366  T
Q  204 gacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgtcgg 302  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||| |||| |||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  46913365 gacaagatcaaggaatctgttggttctaacgatggtggtttctttttcttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaacactgtcgg 46913266  T
Q  303 ctgctgtt 310  Q
    ||| ||||    
T  46913265 ctgttgtt 46913258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 403 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 52918652 - 52918539
Alignment:
Q  403 agacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcatg 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  52918652 agacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatg 52918553  T
Q  503 tccaagaatgatcc 516  Q
    ||||||||||||||    
T  52918552 tccaagaatgatcc 52918539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Original strand, 10968374 - 10968488
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  10968374 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcatgatatcag 10968473  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  10968474 gtccaagaatgatcc 10968488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 33398 - 33284
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  33398 cagacctggtgcgtgctgcatagttgataatttgggatgaggctccgatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcat 33299  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  33298 gtccaagaatgatcc 33284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 50410795 - 50410681
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  50410795 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgtgatgaggctccaatgatgcaccaatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgtgtgatatcat 50410696  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  50410695 gtccaagaatgatcc 50410681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 184 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 13530943 - 13530727
Alignment:
Q  184 atgaacaaagatgtgtgcatgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtggnnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaaccttt 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13530943 atgaacaaagatgtgtgcatgacaagttcatggagtcc-ttggttctgtcgacggtgtttctttttcttatatggttacggtggtactggaaaaacattt 13530845  T
Q  284 atatggaaaatattgtcggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaa 383  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||| |   |||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||| |  ||| |||||||||||||| |||||    
T  13530844 atatggaaaacattgtcggctattgttagctcgaaggggttaattgtattgaatgctgcatccagcagtatagtgactcttctattaccaggtgaaagaa 13530745  T
Q  384 ccgctcactcgacgctga 401  Q
    |||  |||||||| ||||    
T  13530744 ccgtgcactcgacactga 13530727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 11369266 - 11369152
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  11369266 cagacctggtgcatgcttcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccaatcaatgcatgatatcat 11369167  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
     ||||||||||||||    
T  11369166 atccaagaatgatcc 11369152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 402 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 10001034 - 10000922
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  10001034 cagacttggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctctaatgatgcactgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgtgtggtatcat 10000935  T
Q  502 gtccaagaatgat 514  Q
    |||||||||||||    
T  10000934 gtccaagaatgat 10000922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 402 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 10111227 - 10111115
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  10111227 cagacttggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctctaatgatgcactgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgtgtggtatcat 10111128  T
Q  502 gtccaagaatgat 514  Q
    |||||||||||||    
T  10111127 gtccaagaatgat 10111115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 402 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 10238181 - 10238069
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  10238181 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctctaatgatgcactgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgtgtggtatcat 10238082  T
Q  502 gtccaagaatgat 514  Q
    ||||| |||||||    
T  10238081 gtccaggaatgat 10238069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 13530666 - 13530552
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  13530666 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggataaggctccgatgatacaccaatggtgttttgagacagttgaccgatcaatgcgtcatatcat 13530567  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  13530566 gtccaagaatgatcc 13530552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 250 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 50411007 - 50410861
Alignment:
Q  250 cttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgtcggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagc 349  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||  ||| |||||||||  |||||||| |||||| |||    
T  50411007 cttatatggttacggtgttactggaaaaacctttatatggaaaacattgtcgactgctgttagatcgaaagggttaattgtattgaatgctgcatccagc 50410908  T
Q  350 agtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgac 396  Q
     |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50410907 ggtatagcagctcttctattaccaggtggaagaaccgcgcactcgac 50410861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 286 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 10039421 - 10039304
Alignment:
Q  286 atggaaaatattgtcggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaacc 385  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||   ||  ||||||||  ||| |||| |||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10039421 atggaaaacattgtcggctgttgttagatgaaaaaggttaattgtattaaatgctgcatccagcggtataacagctcttctattaccag-tggaagaacc 10039323  T
Q  386 gctcactcgacgctgacag 404  Q
    || ||||||||||||||||    
T  10039322 gcgcactcgacgctgacag 10039304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 10039246 - 10039143
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||| |||||||           ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  10039246 cagacctggtgcgtactgtaaaattgataatttgggatggggctcca-----------atggtcttttgaggaagttgactgatcaatgcgtgatatcat 10039158  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    ||| | |||||||||    
T  10039157 gtctaggaatgatcc 10039143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 178; Significance: 9e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 183897 - 183501
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||| |||||||||||| |||   ||    
T  183897 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaatggacggtcgcttactgacttcaaatctatgcccatggcaaacgcagcagacatgccaacgttc---ac 183801  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |   | |||||||||||||||||    
T  183800 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattacaacaaagataaacgggaaaagacacacgctgatatgttactgatgttggttgatgaacaaagatgtgtg 183701  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||         | || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  183700 catgacaagatcatggagtctgttgattctgacgacgatggtttctttttcatacatggctacagtggtactggaaaaatctttatatggaaaacattgt 183601  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
      | ||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||||||| |||  ||||    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  183600 tagttgctgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgttgcatccagcgatatagcgactcttctattaccaggtggaagaaccgcgcactcgacgct 183501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 183438 - 183324
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  183438 cagacctggtgcgtgctgcaaagttaataatttgggattaggctccaatgatgtaccgatggtgttttgaggcagttgaccaatcaatgcatgatatcat 183339  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
     ||||||||||||||    
T  183338 atccaagaatgatcc 183324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 464 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 166098 - 166047
Alignment:
Q  464 tgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcatgtccaagaatgatc 515  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  166098 tgttttgaggcagttgaccaatcaatgcatgatatcatatccaagaatgatc 166047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 187627 - 187236
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||   ||    
T  187627 tgattgaaatt-aaatgctgcttcaggaaaacggacagtcgcttactgacttcaaatctatgcccatgccaaacgcagtagacatgccaactttc---ac 187532  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | | |||||||||||| ||||    
T  187531 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattacaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatatgttactaatgctgattgatgaacaaagatatgtg 187432  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    ||||| ||||||||||||||||       |||||||| |||         ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  187431 catgaaaagatcatggagtccg-------tgacgacgatggtttctttttcttatatggttacggtggtac-ggaaaaacctttatat-gaaaacattgt 187341  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    |||||| |||| ||  |||| ||||||||  |||||||| |||||| ||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  187340 cggctgttgttagatcgaagaggttaattgtattgaatgatgcatccagcggtataatgactcttctattaccaggtggaagaactgcacactcgacgct 187241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 405 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 187178 - 187067
Alignment:
Q  405 acctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcatgtc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  187178 acctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgagatgaggctccaatgatgcactcatggtgttttgaggtagttgaacgatcaatgcgtgatatcatgtc 187079  T
Q  505 caagaatgatcc 516  Q
    ||||||||||||    
T  187078 caagaatgatcc 187067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1800 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold1800
Description:

Target: scaffold1800; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 1059 - 1348
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||    
T  1059 tgattgaaattgaaatgatgcttcaggaaaacggacggtcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagcagacatgtcaactttc---ac 1155  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | | |||||||||||||||||    
T  1156 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattacaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatatgttagttatgctgaatgatgaacaaagatgtgtg 1255  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtg-gnnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaa 292  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1256 catggcaagatcatggagtctgttgcttctgacgacggtgctttctttttcttatatggttacggtggtactggaaaaacatttatgtggaaa 1348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 39 - 404
Target Start/End: Original strand, 4433 - 4795
Alignment:
Q  39 tcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcacaaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaag 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  4433 tcgcttactgacttcaaatctatgcccaggccaaacgcagcggacatgccaactttc---acaaacaagcttattgttgatgagctaaattacaacaaag 4529  T
Q  139 atgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtgcatgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacgg 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | | | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  4530 atgaactggaaaagacacatgctgatatgttactgatgttgattgatgaacaaagatatgtgcatgaaaagatcatgtagtccgttggttctgacgacga 4629  T
Q  239 tgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgtcggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaat 337  Q
    |||         ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||    
T  4630 tggtttctttttcttatatggttacagtggtattggaaaaacctttatat-gaaaacattgtcggctgctgttagatcgaaggggttaattgtattgaat 4728  T
Q  338 gttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgctgacag 404  Q
      | | ||| || ||||| |  ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  4729 acttcttctggcggtatagtgactcttctattaccaggaggaagaaccgcacactcgaccctgacag 4795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Original strand, 4852 - 4966
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4852 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggatccaatgatgcactgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcatgatatcat 4951  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  4952 gtccaagaatgatcc 4966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 20088 - 19697
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||| |       
T  20088 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacagacagtcgcttactgacttcaaatctatacccag-ccaaacacagcagacatgccaactttcat--- 19993  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  || |||| ||||||||||| | | |||||||||||| ||||    
T  19992 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattacaacaaagatgaactgtaaatgacacattcttatatgttactgatgctgattgatgaacaaagatatgtg 19893  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||         ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19892 catgaaaagatcatggagtctgttggttctgacaacgatggtttctttttcttatatggttacagtggtattggaaaaacctttatat-gaaaacattgt 19794  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgac 396  Q
    ||||||  ||| ||  |||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19793 cggctgtagttagatcgaaggggttaattgtactgaatgctgcatctagcggtataatgactcttctattaccaggaggaagaaccgcacactcgac 19697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 19632 - 19518
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19632 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcactgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgtgatatcat 19533  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  19532 gtccaagaatgatcc 19518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1139 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold1139
Description:

Target: scaffold1139; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1710
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||   ||    
T  2103 tgattgaaattggaatgctgctccaggaaaacggacgatcgcttattgacttcaaatctatgcccaggccaaacgcatcagacatgccaactttc---ac 2007  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  2006 aaacgagcttatcgttgttgagctaaattacaacaaagatgaactggaaaagacacacactgatatgttactaatgctgactaatgaaaaaagatatgtg 1907  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtggnnnnnnnnct-tatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||         | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||  |||||    
T  1906 catgacaatatcatggagtccgttgggcctgacgacggtggttacttttttatatatggttgaggtggtactggaaaaacctttatattaaaatcattgt 1807  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgac 396  Q
    ||| || |||| ||  ||| ||| |||||  |||||||| | |||| ||| |||||   |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  1806 cggttgttgttagatcgaatgggctaattgtattgaatgctacatccagcggtataacggctcttctattaccaggtcgaagaaccgggcactcgac 1710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1139; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 1644 - 1530
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1644 cagacctggtgcgtgctgcaaagttaataattttggttgaggctcaaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgtgatatcat 1545  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||| ||||||||    
T  1544 gtccaataatgatcc 1530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 13431 - 13812
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||   |||||    
T  13431 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggacaatcgcttactgacttcaaatctatacccaggccaaacgcagtaaacatgccaact---ttcac 13527  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||                 | |||||||||||| ||||    
T  13528 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattacaacaaagatgaactggaaaagacacatgctgat-----------------tgatgaacaaagatatgtg 13610  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||         |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||    
T  13611 catgaaaagatcatggagtccattggttctgacgacgatggtttctttttcttatatggttacggtggtattgcaaaaa-ctttatatg--aaacattgt 13707  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    |||||| |||| ||  |||||||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  13708 cggctgttgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgttgcatccagtggtatagtgactcttctattaccaggtggaagaatcgcacactcgacact 13807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 402 - 516
Target Start/End: Original strand, 13869 - 13983
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  13869 cagacctggtgcgtgctgcaaagatgataatttgggatgaggctccaatgatgcactaatggtgttttgaggcagttgacagatcaatgagtgatatcat 13968  T
Q  502 gtccaagaatgatcc 516  Q
    |||||||||||||||    
T  13969 gtccaagaatgatcc 13983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 318866 - 319250
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttcttcac 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||    
T  318866 tgattgaaattaaaatgctgctttaggaaaatggacagtcgcttactaacttcaaatctatacccaggccaaacgcagcagacatgccaactttc---ac 318962  T
Q  101 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgctaactaatgaacaaagatgtgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||                 | |||||||||||| ||||    
T  318963 aaacaagcttatcgttgatgagctaaattacaacgaagatgaactggaaaagacacatgatgat-----------------tgatgaacaaagatatgtg 319045  T
Q  201 catgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg-nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaaacctttatatggaaaatattgt 299  Q
    ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||         |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |    
T  319046 catcaaaagatcatagagtccattggttctgacgacgatggtttctttttcttatatggttacggtggtattggaaaaacctttataatgaaaacatttt 319145  T
Q  300 cggctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgct 399  Q
    |||||| |||| ||   ||||||||||||  |||||||| |||||| ||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  319146 cggctgttgttagatcaaaggggttaattgtattgaatgctgcatccagcggtatagtgactcttctattaccaggtggaagaactgcacacttgacgct 319245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 80 - 310
Target Start/End: Original strand, 320567 - 320796
Alignment:
Q  80 agacatgccaactttcttcacaaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgcta 179  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  320567 agacatgccaactttc---acaaacaagcttatcattgatgagctaaattacaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatatgttactgatgatg 320663  T
Q  180 actaatgaacaaagatgtgtgcatgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacggtgg--nnnnnnnncttatatggttacggtggtactggaaaa 277  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||          |||||||||||||||||||  | |||||    
T  320664 actgatgaagaaagatgtgtgtatgacaagatcatggagtccgttggttctgacgacgatggtttcttttttcttatatggttacggtggtcttcgaaaa 320763  T
Q  278 acctttatatggaaaatattgtcggctgctgtt 310  Q
    || ||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  320764 acttttatatggaaaacattgttggctgttgtt 320796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 403 - 516
Target Start/End: Original strand, 320929 - 321042
Alignment:
Q  403 agacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcatg 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||    
T  320929 agacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatacatcgatggtgttttgaggcatttgatcgatcaatgggtgatatcatg 321028  T
Q  503 tccaagaatgatcc 516  Q
    ||||||||||||||    
T  321029 tccaagaatgatcc 321042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 320522 - 320563
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgc 42  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  320522 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggacggtcgc 320563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 5)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Original strand, 17147 - 17297
Alignment:
Q  80 agacatgccaactttcttcacaaacaagcttatcgttgatgagctaaattaaaacaaagatgaactggaaaagacacacgctgatattttactgatgcta 179  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |     
T  17147 agacatgccaactttc---acaaacaagcttatcgttgatgagctaaattacaacaaagatgaactggaaaagacacaagttgatatgttactgatgttg 17243  T
Q  180 actaatgaacaaagatgtgtgcatgacaagatcatggagtccgttggttctgac 233  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17244 actgatgaacaaagatgtgtgcatgacaagatcatggagtccgttggttctgac 17297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 407 - 516
Target Start/End: Original strand, 17474 - 17583
Alignment:
Q  407 ctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcatgtcca 506  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  17474 ctggtgcgtgctgcaaagttaatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtcca 17573  T
Q  507 agaatgatcc 516  Q
    ||||||||||    
T  17574 agaatgatcc 17583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 16184 - 16277
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttc 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16184 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggacggtcgcttaatgatttcaaatctatgccca-gccaaacgcagtagacatgccaactttc 16277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 17102 - 17143
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgc 42  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  17102 tgattgaaattgaaatgctgcttcaggaaaacggacggtcgc 17143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 372 - 404
Target Start/End: Original strand, 17379 - 17411
Alignment:
Q  372 caggtggaagaaccgctcactcgacgctgacag 404  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17379 caggtggaagaaccgcacactcgacgctgacag 17411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 402 - 501
Target Start/End: Original strand, 160 - 259
Alignment:
Q  402 cagacctggtgcgtgctgcaaagttgatgatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaatgcgcgatatcat 501  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  160 cagaccaggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggttaaggctccaatgatgcactaatggtgttttgaggcagctgaccgatcattgcgtgatatcat 259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 303 - 404
Target Start/End: Original strand, 1 - 102
Alignment:
Q  303 ctgctgttcgacagaaggggttaatttcattgaatgttgcatctagcagtatattagctcatctattaccaggtggaagaaccgctcactcgacgctgac 402  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1 ctgctgttagatcgaaggggttaattgtattgaatgttgcatccagcggtatagcggctcttctattaccaggtggaagaaccgcgcactcgacgctgac 100  T
Q  403 ag 404  Q
    ||    
T  101 ag 102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 141399 - 141493
Alignment:
Q  1 tgattgaaattgaaatgttgcttcaggaaaaaggacgatcgcttactgacttcaaatctatgcctaggccaaacacagtagacatgccaactttc 95  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  141399 tgattgaaattaaaatgctgctttaggaaaatggacagtcgcttactaacttcaaatctatacccaggccaaacgcagcagacatgccaactttc 141493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University