View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1623_2D_low_4 (Length: 1743)

Name: NF1623_2D_low_4
Description: NF1623_2D
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1623_2D_low_4
NF1623_2D_low_4
[»] chr7 (24 HSPs)
chr7 (4-1724)||(21069749-21071476)
chr7 (289-1724)||(5828242-5829682)
chr7 (640-1724)||(9000832-9001918)
chr7 (478-1724)||(7036001-7037252)
chr7 (289-1649)||(12785751-12787112)
chr7 (1038-1724)||(12780835-12781523)
chr7 (749-1319)||(42231639-42232210)
chr7 (1181-1724)||(22843792-22844335)
chr7 (1404-1724)||(42232210-42232532)
chr7 (20-456)||(22843347-22843793)
chr7 (16-257)||(45122516-45122758)
chr7 (6-240)||(5829713-5829963)
chr7 (37-257)||(12787146-12787368)
chr7 (37-257)||(42230989-42231211)
chr7 (37-257)||(9002285-9002509)
chr7 (37-257)||(7035539-7035761)
chr7 (289-582)||(42231241-42231534)
chr7 (289-582)||(9001966-9002255)
chr7 (289-459)||(7035792-7035964)
chr7 (289-396)||(45122377-45122485)
chr7 (1322-1367)||(18939139-18939184)
chr7 (840-874)||(12983007-12983041)
chr7 (840-874)||(18292589-18292623)
chr7 (840-874)||(26368005-26368039)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (4-1724)||(185359-187086)
[»] chr3 (56 HSPs)
chr3 (4-1724)||(50408959-50410700)
chr3 (4-1724)||(11367445-11369171)
chr3 (4-1724)||(10037442-10039162)
chr3 (289-1724)||(10109696-10111132)
chr3 (511-1724)||(13529352-13530571)
chr3 (343-1724)||(10968469-10969859)
chr3 (469-1724)||(9999675-10000939)
chr3 (289-1608)||(11361346-11362676)
chr3 (409-1367)||(46912281-46913245)
chr3 (960-1724)||(10237324-10238086)
chr3 (1084-1724)||(32662-33303)
chr3 (289-1152)||(41763622-41764497)
chr3 (289-1032)||(31898-32649)
chr3 (289-1099)||(15328876-15329700)
chr3 (289-957)||(10234521-10235186)
chr3 (16-567)||(37802606-37803160)
chr3 (289-917)||(10230923-10231547)
chr3 (947-1339)||(47692723-47693115)
chr3 (1121-1458)||(52917994-52918330)
chr3 (651-891)||(37801945-37802188)
chr3 (6-241)||(9999219-9999460)
chr3 (19-257)||(47691853-47692091)
chr3 (6-241)||(10234230-10234472)
chr3 (1499-1724)||(52918332-52918558)
chr3 (16-396)||(41221010-41221391)
chr3 (16-241)||(10230650-10230879)
chr3 (4-255)||(10970066-10970328)
chr3 (4-257)||(11361056-11361313)
chr3 (473-747)||(41221455-41221735)
chr3 (4-257)||(15329730-15329986)
chr3 (6-241)||(10109399-10109650)
chr3 (4-257)||(41764529-41764788)
chr3 (37-257)||(10108813-10109035)
chr3 (37-257)||(10230052-10230276)
chr3 (16-257)||(23092356-23092599)
chr3 (309-627)||(47692139-47692454)
chr3 (80-396)||(52917633-52917946)
chr3 (37-257)||(31646-31867)
chr3 (37-257)||(27273239-27273461)
chr3 (37-257)||(10233647-10233869)
chr3 (19-205)||(10040888-10041078)
chr3 (289-550)||(10109070-10109333)
chr3 (297-395)||(9999514-9999612)
chr3 (289-550)||(10233899-10234164)
chr3 (299-550)||(10230319-10230572)
chr3 (289-396)||(10041148-10041255)
chr3 (4-76)||(46912158-46912232)
chr3 (4-74)||(52916764-52916836)
chr3 (289-396)||(23092632-23092739)
chr3 (289-351)||(10969971-10970033)
chr3 (417-550)||(9999015-9999153)
chr3 (479-574)||(10041312-10041407)
chr3 (840-874)||(20777761-20777795)
chr3 (840-874)||(35685133-35685167)
chr3 (840-874)||(38356474-38356508)
chr3 (840-874)||(55368943-55368977)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (289-1724)||(27508466-27509906)
chr2 (303-1643)||(17683597-17684934)
chr2 (289-1724)||(21394454-21395902)
chr2 (651-1724)||(27191946-27193021)
chr2 (651-1724)||(27841760-27842835)
chr2 (749-1724)||(24268757-24269734)
chr2 (37-1649)||(28665945-28667563)
chr2 (37-1649)||(37824779-37826397)
chr2 (55-1649)||(41919946-41921543)
chr2 (435-1370)||(35608920-35609862)
chr2 (4-1125)||(24244666-24245784)
chr2 (1180-1724)||(24245812-24246357)
chr2 (16-821)||(40488282-40489107)
chr2 (16-562)||(2881333-2881888)
chr2 (16-567)||(3641873-3642436)
chr2 (1407-1724)||(35609867-35610185)
chr2 (126-562)||(2868225-2868661)
chr2 (4-257)||(17687514-17687772)
chr2 (651-891)||(2867578-2867821)
chr2 (4-257)||(27508173-27508436)
chr2 (37-257)||(39441834-39442055)
chr2 (37-257)||(36047858-36048080)
chr2 (1523-1671)||(3642922-3643071)
chr2 (16-257)||(21394178-21394421)
chr2 (16-184)||(24270188-24270357)
chr2 (4-144)||(35608697-35608839)
chr2 (37-180)||(26955164-26955308)
chr2 (289-582)||(24269842-24270138)
chr2 (651-730)||(3642841-3642920)
chr2 (289-459)||(39441632-39441802)
chr2 (594-675)||(24269737-24269822)
chr2 (190-250)||(35608837-35608897)
chr2 (1660-1724)||(41919884-41919948)
chr2 (841-874)||(3571845-3571878)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (4-1633)||(10186349-10187985)
chr6 (495-1724)||(2201866-2203102)
chr6 (651-1679)||(18343582-18344612)
chr6 (16-1327)||(12516200-12517522)
chr6 (525-1569)||(15332969-15334019)
chr6 (289-1153)||(12518700-12519567)
chr6 (1181-1724)||(30881315-30881858)
chr6 (289-1091)||(29641668-29642484)
chr6 (525-1091)||(31511832-31512403)
chr6 (289-891)||(24195989-24196597)
chr6 (1086-1493)||(29639947-29640355)
chr6 (4-567)||(4220868-4221435)
chr6 (1086-1493)||(31510118-31510525)
chr6 (20-456)||(30880871-30881316)
chr6 (651-891)||(4220227-4220470)
chr6 (4-257)||(12518414-12518670)
chr6 (1439-1724)||(12517520-12517806)
chr6 (4-257)||(15330339-15330595)
chr6 (37-257)||(31512655-31512877)
chr6 (16-257)||(24195715-24195958)
chr6 (37-257)||(29642517-29642739)
chr6 (4-231)||(14906298-14906527)
chr6 (1501-1649)||(18814054-18814203)
chr6 (289-529)||(15330628-15330869)
chr6 (289-459)||(31512454-31512624)
chr6 (1650-1714)||(18857163-18857227)
chr6 (840-874)||(15877026-15877060)
chr6 (841-874)||(29965978-29966011)
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (339-1724)||(14192498-14193891)
chr5 (360-1724)||(25542480-25543849)
chr5 (37-1724)||(27879920-27881616)
chr5 (289-1722)||(39882270-39883713)
chr5 (37-1724)||(8428272-8429961)
chr5 (290-1724)||(37260406-37261835)
chr5 (592-1724)||(3689372-3690509)
chr5 (592-1724)||(3876278-3877415)
chr5 (478-1724)||(37372216-37373468)
chr5 (4-1215)||(6088017-6089232)
chr5 (4-1153)||(15032840-15033999)
chr5 (4-1153)||(4050606-4051766)
chr5 (4-902)||(2261499-2262419)
chr5 (744-1319)||(24629954-24630530)
chr5 (749-1319)||(10024618-10025189)
chr5 (749-1319)||(30346637-30347208)
chr5 (1181-1724)||(17871325-17871868)
chr5 (289-917)||(26831720-26832344)
chr5 (289-884)||(43448566-43449166)
chr5 (1404-1724)||(30346316-30346637)
chr5 (642-984)||(43524258-43524603)
chr5 (1404-1724)||(24629640-24629954)
chr5 (1404-1724)||(10025189-10025510)
chr5 (804-1153)||(30313813-30314157)
chr5 (37-580)||(24630641-24631186)
chr5 (4-458)||(43524845-43525299)
chr5 (4-458)||(18115607-18116063)
chr5 (37-579)||(30347322-30347866)
chr5 (4-250)||(14194043-14194303)
chr5 (20-257)||(17872064-17872311)
chr5 (4-229)||(25543935-25544164)
chr5 (21-257)||(30313201-30313439)
chr5 (16-257)||(43448294-43448537)
chr5 (37-257)||(10023966-10024188)
chr5 (67-241)||(26831498-26831676)
chr5 (932-1155)||(2261271-2261495)
chr5 (37-257)||(26792645-26792867)
chr5 (642-806)||(18116307-18116471)
chr5 (78-257)||(3688820-3689002)
chr5 (78-257)||(3877783-3877965)
chr5 (72-257)||(37260185-37260374)
chr5 (289-456)||(17871867-17872034)
chr5 (289-582)||(10024219-10024511)
chr5 (37-256)||(37371747-37371984)
chr5 (289-396)||(14193897-14194004)
chr5 (92-257)||(39882072-39882240)
chr5 (289-459)||(37372014-37372184)
chr5 (289-459)||(3689075-3689246)
chr5 (289-459)||(3877541-3877712)
chr5 (289-550)||(26792896-26793160)
chr5 (479-581)||(43524713-43524815)
chr5 (479-575)||(18116095-18116191)
chr5 (592-707)||(30313668-30313787)
chr5 (594-678)||(10024531-10024619)
chr5 (665-724)||(10692495-10692554)
chr5 (417-459)||(30313547-30313589)
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (289-1722)||(36206304-36207745)
chr1 (289-1724)||(16041114-16042557)
chr1 (491-1724)||(2328462-2329698)
chr1 (289-1724)||(48775022-48776465)
chr1 (289-1724)||(6310681-6312122)
chr1 (289-1724)||(37389839-37391277)
chr1 (291-1571)||(18147775-18149066)
chr1 (982-1724)||(2452804-2453545)
chr1 (4-961)||(28960873-28961842)
chr1 (651-1370)||(48238519-48239240)
chr1 (4-1153)||(25074114-25075275)
chr1 (749-1319)||(52500224-52500795)
chr1 (27-630)||(2453541-2454147)
chr1 (1313-1679)||(48233498-48233865)
chr1 (16-562)||(48239649-48240195)
chr1 (289-820)||(16748262-16748798)
chr1 (1404-1724)||(52500795-52501109)
chr1 (19-257)||(7101787-7102025)
chr1 (37-582)||(52499566-52500113)
chr1 (16-249)||(16043177-16043411)
chr1 (16-257)||(36206032-36206273)
chr1 (16-257)||(48776490-48776733)
chr1 (4-257)||(16040825-16041081)
chr1 (16-257)||(16748828-16749071)
chr1 (37-257)||(37391308-37391529)
chr1 (37-257)||(36518773-36518995)
chr1 (37-253)||(18147523-18147741)
chr1 (289-581)||(7102059-7102348)
chr1 (37-257)||(6312155-6312377)
chr1 (4-184)||(12450767-12450949)
chr1 (289-459)||(36519024-36519194)
chr1 (421-459)||(12451018-12451056)
chr1 (840-874)||(42032105-42032139)
[»] scaffold0262 (2 HSPs)
scaffold0262 (318-1724)||(18117-19537)
scaffold0262 (6-241)||(17812-18052)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (316-1724)||(4947-6362)
scaffold0134 (6-241)||(6410-6659)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (289-1703)||(1859764-1861188)
chr4 (289-1724)||(35854994-35856439)
chr4 (289-1724)||(49709263-49710704)
chr4 (37-1649)||(49786601-49788215)
chr4 (677-1669)||(38517579-38518573)
chr4 (4-961)||(37531856-37532834)
chr4 (289-1152)||(31920561-31921432)
chr4 (411-1153)||(787088-787840)
chr4 (749-1319)||(55559131-55559702)
chr4 (1278-1724)||(13337320-13337767)
chr4 (16-459)||(618279-618720)
chr4 (1404-1724)||(55558810-55559131)
chr4 (1366-1679)||(617956-618270)
chr4 (16-257)||(31920283-31920526)
chr4 (4-257)||(786717-786972)
chr4 (16-257)||(49708990-49709233)
chr4 (37-257)||(35854742-35854963)
chr4 (37-257)||(55560131-55560353)
chr4 (289-582)||(55559808-55560102)
chr4 (92-257)||(1859565-1859733)
chr4 (144-257)||(9281828-9281941)
chr4 (85-184)||(38517436-38517537)
chr4 (37-128)||(6244756-6244846)
chr4 (290-368)||(9281977-9282055)
chr4 (603-678)||(55559701-55559780)
chr4 (16-50)||(42328860-42328894)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (289-1724)||(25218252-25219701)
chr8 (289-1724)||(7820925-7822370)
chr8 (137-1591)||(30306105-30307575)
chr8 (749-1724)||(21113431-21114408)
chr8 (289-1406)||(31978533-31979657)
chr8 (811-1724)||(25208734-25209635)
chr8 (289-1152)||(33861640-33862515)
chr8 (4-819)||(13424422-13425242)
chr8 (289-1046)||(7780835-7781601)
chr8 (289-902)||(14713366-14713999)
chr8 (640-1099)||(14767005-14767469)
chr8 (4-257)||(14713071-14713336)
chr8 (4-257)||(31979687-31979944)
chr8 (4-257)||(14764430-14764683)
chr8 (16-257)||(21114838-21115082)
chr8 (37-257)||(25219731-25219954)
chr8 (58-257)||(7780599-7780801)
chr8 (58-257)||(7820689-7820891)
chr8 (478-739)||(25209652-25209917)
chr8 (932-1155)||(14714003-14714227)
chr8 (4-183)||(37915275-37915458)
chr8 (289-582)||(14764713-14765006)
chr8 (289-675)||(21114411-21114813)
chr8 (84-257)||(33862547-33862724)
chr8 (37-144)||(30305978-30306085)
chr8 (1598-1724)||(30325880-30326007)
chr8 (4-85)||(33863079-33863162)
chr8 (840-874)||(17886246-17886280)
chr8 (840-874)||(25089468-25089502)
chr8 (594-631)||(14765020-14765057)
[»] scaffold1139 (1 HSPs)
scaffold1139 (409-1724)||(206-1549)
[»] scaffold0003 (5 HSPs)
scaffold0003 (289-1724)||(164617-166065)
scaffold0003 (640-1724)||(182257-183343)
scaffold0003 (4-257)||(164326-164584)
scaffold0003 (4-257)||(172441-172699)
scaffold0003 (289-700)||(172732-173151)
[»] scaffold0073 (6 HSPs)
scaffold0073 (478-1724)||(31210-32464)
scaffold0073 (289-1406)||(18545-19670)
scaffold0073 (4-257)||(23393-23650)
scaffold0073 (4-257)||(18258-18515)
scaffold0073 (1445-1724)||(3-283)
scaffold0073 (289-459)||(31003-31173)
[»] scaffold0550 (3 HSPs)
scaffold0550 (592-1723)||(260-1397)
scaffold0550 (289-771)||(4168-4661)
scaffold0550 (37-257)||(4692-4914)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (37-1649)||(48709-50325)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (741-1398)||(16231-16889)
scaffold0025 (289-739)||(13581-14034)
scaffold0025 (4-257)||(13295-13548)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (289-1151)||(125312-126187)
scaffold0022 (4-253)||(125017-125277)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (1018-1724)||(17564-18263)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (969-1724)||(321023-321779)
scaffold0002 (478-1032)||(310072-310624)
scaffold0002 (19-459)||(310656-311098)
scaffold0002 (4-82)||(331413-331492)
[»] scaffold0888 (2 HSPs)
scaffold0888 (483-1290)||(24-837)
scaffold0888 (4-257)||(889-1144)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (289-1155)||(97080-97953)
scaffold0012 (4-257)||(97984-98247)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (19-1032)||(132255-133270)
[»] scaffold1424 (3 HSPs)
scaffold1424 (289-1087)||(773-1575)
scaffold1424 (4-241)||(471-729)
scaffold1424 (1117-1248)||(1572-1703)
[»] scaffold0118 (4 HSPs)
scaffold0118 (749-1319)||(28727-29298)
scaffold0118 (1404-1724)||(28406-28727)
scaffold0118 (37-257)||(29729-29954)
scaffold0118 (289-579)||(29409-29700)
[»] scaffold0196 (3 HSPs)
scaffold0196 (289-828)||(23432-23977)
scaffold0196 (140-257)||(23283-23401)
scaffold0196 (4-76)||(23192-23265)
[»] scaffold0107 (4 HSPs)
scaffold0107 (1374-1608)||(39937-40171)
scaffold0107 (4-214)||(44807-45020)
scaffold0107 (491-721)||(34258-34492)
scaffold0107 (1626-1724)||(42409-42507)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (1531-1724)||(13964-14158)
[»] scaffold0499 (2 HSPs)
scaffold0499 (56-257)||(9998-10202)
scaffold0499 (289-396)||(10233-10340)
[»] scaffold0532 (1 HSPs)
scaffold0532 (4-215)||(3522-3744)
[»] scaffold1370 (3 HSPs)
scaffold1370 (4-214)||(1375-1588)
scaffold1370 (289-438)||(1167-1316)
scaffold1370 (479-556)||(1075-1152)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (37-214)||(13298-13477)
[»] scaffold0636 (1 HSPs)
scaffold0636 (37-182)||(1-147)
[»] scaffold0582 (1 HSPs)
scaffold0582 (55-161)||(10271-10379)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 984; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 984; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 21071476 - 21069749
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaa-tatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacat 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21071476 attatgttatcttaaagttataagtgttgttataatttaaatttgatatggaaaaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacat 21071377  T
Q  101 tgcacataacaattaaaatatttggatttat---acttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttg 196  Q
    || ||| ||| |||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21071376 tgtacacaacgattaaagtatttggatttattatacttatactaattatttgtagtataatatgtactcattgttaaacttagcatatgtaatatttttg 21071277  T
Q  197 caaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtc 296  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||              |||||         || |||||||     
T  21071276 caaaaatacgccgacgtactgtatattattatttgttgacataatgtat---attaatcataaaaactaaaaaatttgtatttctttt-atataatagtg 21071181  T
Q  297 agtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttg 396  Q
    ||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21071180 agtgttagatttatacacctagtatgtgaatacaaaagataaaatttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgattgttatttg 21071081  T
Q  397 nnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngttccgcgtattgttatacttgaaaagt 496  Q
                |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21071080 tttttattttttacaaaaccaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaatgatgtaaaaaaaa-gttccgcgtattgttatacctgaaaagt 21070982  T
Q  497 gcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnncgact 596  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||           |||    
T  21070981 gcatcagttaaaagtcaaaggcaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtcctgtaatgaccaatacgccttacaaagaaattaaaaaaaaaa-act 21070883  T
Q  597 tccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaaca 692  Q
    | ||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||  |    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21070882 ttcaatcaatacacaactctagttttctaaattatagcaacaacgattctaaaacataactaatgatcatactttttgaaaaacttcacgatgcacaaca 21070783  T
Q  693 tttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccat 792  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  21070782 tttgtggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagcttcaaaccttttctagaagtaactcgagagacagcgacatagagttgcccat 21070683  T
Q  793 tcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaattt 892  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||     
T  21070682 gcgtgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaagattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaataaagcgacaatggaaattg 21070583  T
Q  893 catgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatc-ttggaatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggta 991  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  21070582 tttgcgcctgaatttgaagggtagtcctgaatcactcggaataagattcatccttggaatgaataccctggtagctgccctttttcatgtaattacggta 21070483  T
Q  992 gcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatc 1091  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21070482 gcaactatcgtgctcttccctagatgtgtaactttcagcctcgcaacagtacacagtccattggcctgatcgatgtttctcatcagcataactggacatc 21070383  T
Q  1092 ctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcc 1191  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||    
T  21070382 ccacccttagtttcaaccggtgatttggaatttcagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcactttggacatctaaattttcacc 21070283  T
Q  1192 cgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggt 1291  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21070282 cgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcaccaggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggt 21070183  T
Q  1292 gcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgt 1391  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21070182 gcgagtattcccctttcttggaaaaatagcaggttaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgt 21070083  T
Q  1392 tcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaatt 1491  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  21070082 ctgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaaacgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgtcaaaatt 21069983  T
Q  1492 agcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattg 1591  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  21069982 agcaatttctttctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcgatacattacaataaacccatatctttaatgaattg 21069883  T
Q  1592 attgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtc 1690  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21069882 attgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctacctgaaatcaccacctaaaactactgtgattccaccaaatggtc 21069783  T
Q  1691 taaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21069782 taaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 21069749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 870; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 5829682 - 5828242
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5829682 taatagtgagtgtcaaatgtatacatctagtccgtgaatgcaaacgttaaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgatt 5829583  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngttccgcgtattgttatact 488  Q
    |||||||             |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||     
T  5829582 gttatttatttttattttttacaaaaccaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaagttccgcgtattgttatacc 5829483  T
Q  489 tgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnn 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||          
T  5829482 tgaaaagtgcatcaattaaaagtcaaaggtaagaggatctgcttatatagaaattgcatgtcctgtaatgactagtacgccttacaaagaaatt-aaaaa 5829384  T
Q  589 nnncgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgat 684  Q
       | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5829383 aaacaactttcaatcaatacgcaactttagttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttaaaaaacttcacgat 5829284  T
Q  685 acacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagag 784  Q
    ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  5829283 acacaacatatatggtatccttgaaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaaccttttctagaagtaacttgagagacagcgaaatagag 5829184  T
Q  785 ttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaat 884  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5829183 ttgcccatgcgtgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagatagagattgacccggacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaat 5829084  T
Q  885 gaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaa 983  Q
    | |||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  5829083 ggaaattgtctgcgcatgaatttgaagggtagttctggattactcagaataagattcatcttgggaatgaataccttggtacctgcccttttttctgtaa 5828984  T
Q  984 ttacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataat 1083  Q
    ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  5828983 ttacggtagcagctgtcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagcctcgtaccattacgcagtccattggcctgatcgatgtttctcatcagcataac 5828884  T
Q  1084 tggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaa 1183  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  5828883 tggacatcccacctctagtttcaaccggtgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattacaatgtgaaccactcgctttggacatcataa 5828784  T
Q  1184 ttttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaa 1283  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  5828783 ttttcacccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgagtcaa 5828684  T
Q  1284 gcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatt 1383  Q
    | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  5828683 gtgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctataagtgacatcaaaagatt 5828584  T
Q  1384 tgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcg 1483  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  5828583 tgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgttgttgccgtctccaattcagagtatccacttg 5828484  T
Q  1484 ccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttg 1583  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||    
T  5828483 ccaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtaccgaagatgcactcaatctcatattaatagtaagcctcaacacattaaaataaacccatatctttg 5828384  T
Q  1584 atgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccacc 1682  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  5828383 atgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactaatatcattccacc 5828284  T
Q  1683 aaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5828283 aaatggtttaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 5828242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 659; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 640 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 9001918 - 9000832
Alignment:
Q  640 tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcag 739  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  9001918 tctaaaacataaccaatggtcatactttttgaaaatcttcacgatacacaacatttgtggtctccttacaaacattattatcttcatccaggataagcaa 9001819  T
Q  740 tttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatat 839  Q
     |||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  9001818 cttcagaccttttcttgaagttactcgagagacaacgacataaagttgtccatgcgtgaacacaagcttaggaagataaacccccactcgagataaagat 9001719  T
Q  840 tgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagat 939  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9001718 tgaccctggcttttatttattgtcattgcaaaataaagcgtcaatggaaatttcctgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagat 9001619  T
Q  940 tcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatc 1038  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||| |    
T  9001618 tcatcctgggaatgaataccctagtacctgccctttttcctgtaattccggtagcagctatcgtgctcttccctagatgtgtaattgtcagcctagtacc 9001519  T
Q  1039 attacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaata 1138  Q
    ||||| || | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  9001518 attacgcagtccattggcctgatcgatgtttctcatcagcataactggatatcccacctttagtttcaacctgtgatttggaatttcagagctcttaata 9001419  T
Q  1139 ccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctg 1238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9001418 ccattaagaaattccggtgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcaccta 9001319  T
Q  1239 gaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatc 1338  Q
    ||||| | || || ||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9001318 gaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttagtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatc 9001219  T
Q  1339 attcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattc 1438  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9001218 aatcagatcgggataaacaaagtctataagagacatcaacggatttgttgtgtccgatatcaacaaatcttcaagaatttctaccttcatttcaccattc 9001119  T
Q  1439 tcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctca 1538  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  9001118 tcatccgaagcatcgttgccgtatccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctatgcaggtaccgaagatgcacccaatctca 9001019  T
Q  1539 tattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatg 1637  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||| ||||  |||||||| | |    
T  9001018 tattaacagtaagcctcaacacattacaataagcccatatctttgacgaattgactgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaatagg 9000919  T
Q  1638 caatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9000918 caatatctgcctaaaatcacaacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtttaagcgcgtttaggggatcattcttggacatgat 9000832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 657; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 478 - 1724
Target Start/End: Original strand, 7036001 - 7037252
Alignment:
Q  478 attgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaag 577  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||| |||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  7036001 attgttaaacctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatgacaggaggatctacttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaag 7036099  T
Q  578 aaatttnnnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaa 672  Q
    |||||          |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7036100 aaattaaaaataaaacgacttccaaacaataggcaactttagttttataaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaa 7036199  T
Q  673 aaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagac 772  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| |||||||    
T  7036200 aaacttcacgatacacaacatttgtggtctccttacaaacattattatcttcatccatgatgagcagcttcagaccttttcttgaagttacttgagagac 7036299  T
Q  773 aacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaa 872  Q
    | ||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7036300 agcgacataaagttgtccatgcgtgagcacaggcttaggaagataacc-cccactcgagataaagattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaa 7036398  T
Q  873 caaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccc 971  Q
    |||||||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||| |||    
T  7036399 caaagcgtcagtggaaattgcctgcgcctgaatttgaacggtagttctggatcactcggaataagattcatcctgggaatgaatactctagtacctgccc 7036498  T
Q  972 tttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttct 1071  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| | ||||||| ||| ||||||||| | |||||   ||||||||||||||    
T  7036499 tttttcatgtaattacggtagcagctatcgtgctcttccctagacgtgtaattgtcagcctagtaccattacacagtccattgccttgatcgatgtttct 7036598  T
Q  1072 cataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctc 1171  Q
    ||| |||||||  |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  7036599 catcagcataaccggacatcccacctttagtttcaacctgtgatttggaattccaaagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactcgctt 7036698  T
Q  1172 tggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgct 1271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| |||||    
T  7036699 tggacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 7036798  T
Q  1272 caactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgg 1371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  7036799 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaagtagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtga 7036898  T
Q  1372 catcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaag 1471  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  7036899 catcaacggatttgttgtgtctgatatcagcgaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 7036998  T
Q  1472 agtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataag 1571  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7036999 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcttgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 7037098  T
Q  1572 cacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactat 1670  Q
    |  |||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||| |||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  7037099 cctatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactac 7037198  T
Q  1671 tgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    ||||||||||||||||||| |||   | ||||  |||||||||||| |||||||    
T  7037199 tgtcattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaagggatcattcttgaacatgat 7037252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1649
Target Start/End: Complemental strand, 12787112 - 12785751
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12787112 taatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaatttttt-cgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgatt 12787014  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn------gttccgcgtattgt 482  Q
    ||||||||            ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 ||| | || |||||    
T  12787013 gttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgataaaaaaaaaaaaaaaaggtttcacggattgt 12786914  T
Q  483 tatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatt 582  Q
    || || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  12786913 taaacctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatgacaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccggtacgccttacaaagaaatt 12786815  T
Q  583 tnnnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaact 677  Q
              |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12786814 aaaaataaaacgacttccaaacaataggcaactttagttttatatattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaact 12786715  T
Q  678 tcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacga 777  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  12786714 tcacgatacacaacatttgtggtctccttacaaacattattatcttcatccaggatgagcagcttcagaccttttcatgaagttactcgagagacaacga 12786615  T
Q  778 catagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaag 877  Q
    |||| ||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12786614 cataaagttgtctatgcgtgaacacaggcttaggaagataaacccccacccgagataaagattgacc-tagcttttatttattgtcattgcaaaacaaag 12786516  T
Q  878 cgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttcccttttt 976  Q
    |||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12786515 cgtcaatggaaattgtctgcgtctgaatttgaagggtagtcctggatcattcggaataagattcatcctgggaatgaataccctagtacctgcccttttt 12786416  T
Q  977 cct-gtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcata 1075  Q
    ||| |||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||      
T  12786415 ccttgtaattacggtagcagttatcgtgctcttccctagatgtataactgtcagcctagtaccattacacagtccattggcctgatcgatgtttctcaac 12786316  T
Q  1076 agcataattggacatcctaccctt-agtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctgg 1174  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  12786315 agcataactggacatcccaccttttagtttcaacctgtgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactcgctttgg 12786216  T
Q  1175 acatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaa 1274  Q
    |||||||||||||| || |||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || || ||| || |||||| ||||||||    
T  12786215 acatcagaattttcacctgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaa 12786116  T
Q  1275 ctgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcat 1374  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  12786115 ttgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacagagtctataagtgacat 12786016  T
Q  1375 caacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagt 1474  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  12786015 caacggatttgttgtgtttgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagt 12785916  T
Q  1475 atgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcac 1574  Q
    || |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||  ||||           || ||||||||| | |||||||||||  |    
T  12785915 atccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgtaggtaccgaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaataagtcc 12785827  T
Q  1575 atatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcct 1649  Q
    |||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||  || ||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  12785826 atatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatctggcatcgttcctcctcagacaacatgcaatatctgcct 12785751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1038 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 12781523 - 12780835
Alignment:
Q  1038 cattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaat 1137  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  12781523 cattacacagtccattggcctgatcgatgtttctcatcagcataactggacatcccaccattagtttcaacctgtgatttggaattccatagctcttaat 12781424  T
Q  1138 accattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcg-acaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacc 1236  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12781423 accattaagaaattctggtgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatctcaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacc 12781324  T
Q  1237 tggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggtta 1336  Q
    ||||||| | || || ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12781323 tggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggtta 12781224  T
Q  1337 tcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccat 1436  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12781223 tcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtcttatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccat 12781124  T
Q  1437 tctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatct 1536  Q
    | ||| | ||||| || ||| ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| ||||||    
T  12781123 tgtcacccgaagcatcattgtcgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcttgctctacaggtaccgaagatgcacccaatct 12781024  T
Q  1537 catattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaaca 1635  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||| |||||| ||||  | |||| |||    
T  12781023 catattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctccttggactaca 12780924  T
Q  1636 tgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
     |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12780923 ggcaacatctgcctaaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgat 12780835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 749 - 1319
Target Start/End: Original strand, 42231639 - 42232210
Alignment:
Q  749 ttttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgaccctta 848  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  42231639 ttttctagaagtaactcgagagacagcgacatagagttgcccatgcgtgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaagattgaccctga 42231738  T
Q  849 cttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg 948  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42231739 cttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaattatatgcgcatgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcctgg 42231838  T
Q  949 -aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaa 1047  Q
     |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||     
T  42231839 gaatgaataccttggtacctgccctttttcctgtaattacggtagcagctatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagccttgtaccattacacag 42231938  T
Q  1048 ttcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaaga 1147  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  42231939 tccattggcctgatcgatgtttctcatcagcataactggacatcccacctttagtttcaaccggtgatttggaattccagagctctaaataccattaagg 42232038  T
Q  1148 aattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtg 1247  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42232039 aattcagttgtgaaccactcactttggacatcagaattttcacccgagcgacaaacaaaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagtg 42232138  T
Q  1248 aaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaata 1319  Q
    | || |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  42232139 acatcatatattcgttaacatgttcaactgaatcaagcgttggtgagagtattcccctttcttggaaaaata 42232210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1181 - 1724
Target Start/End: Original strand, 22843792 - 22844335
Alignment:
Q  1181 gaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaat 1280  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  22843792 gaattttcacccgatcgacaaacagaaacagaacttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaacagaat 22843891  T
Q  1281 caagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacgg 1380  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  22843892 caagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcaggtcaccaaggttatcatttaaatcgagatacacaatgtctataagtgacatcaacag 22843991  T
Q  1381 atttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcac 1480  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||     
T  22843992 atttgttgtgtcagatatgagcaaatcttcaagaatttctaccttcatttcacca-tctcatccgaagcgacgttgccttctctaattaagagtatccaa 22844090  T
Q  1481 tcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatct 1580  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  22844091 ttgccaaaattagcaatttattcctgctctacaggtaccaaagatgcacccaatcccatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatct 22844190  T
Q  1581 ttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattcc 1679  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22844191 ttgatgaactgattgaggcatcaacaatatcatgcctcgttccttttcggatgacatgcaatatctgcatgaaatcaccacctaaaacttttgtctttcc 22844290  T
Q  1680 accaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22844291 accaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 22844335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1404 - 1724
Target Start/End: Original strand, 42232210 - 42232532
Alignment:
Q  1404 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttc 1503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  42232210 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaaccgttgttgccgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttt 42232309  T
Q  1504 ctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 1603  Q
    || ||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42232310 ctactctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagtctcaacacattaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 42232409  T
Q  1604 acaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacct-aaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcattt 1701  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  42232410 acaatatactgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgatatcaccacctaaaaactattgtcattccaccaaatggtttaaactcgttt 42232509  T
Q  1702 agaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  42232510 aggggatcattcttggacatgat 42232532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 456
Target Start/End: Original strand, 22843347 - 22843793
Alignment:
Q  20 tataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaa---------ttttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||         ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22843347 tataagtatggttataatttaaatttgatatggaaaaaagtatcatcttaattttgttaattttgtatatatttaaaaatatctaaacattgcacataac 22843446  T
Q  111 aattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccg 209  Q
     | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  22843447 gactaaagtatttggatttatatttatactaattatttgtagtataagatgtaatcattgttaaacttagcatatgtaatatttttgcaaaaatacgcgg 22843546  T
Q  210 acgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtgtcagatgta 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||              |||||         || ||||||||||||||| |||||    
T  22843547 acgtactgtatattattatttgttgacataatgtattatattaatcataaaaactaaaaaaattgtatttttttttatataatagtcagtgtcaaatgta 22843646  T
Q  310 tacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnnnnna 409  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||            |    
T  22843647 tacacctagtctgtgaatacaaatgttaaattttttactggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaactccgattgttatttgtttttatttttta 22843746  T
Q  410 caaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacga 456  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22843747 caaaaccaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacga 22843793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 45122758 - 45122516
Alignment:
Q  16 aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaatta 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  45122758 aagttataattgtggttataatttaaattcgatatgaa--aaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataa 45122661  T
Q  116 aaatatttggat--ttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacg 212  Q
    || |||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45122660 aagtatttgaattattatacttgtactaattatttgtaatataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaatatttttgcaaaaatacgccgacg 45122561  T
Q  213 tactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  45122560 tactgtataataatatttgttgacaaaatgtattttattaatcat 45122516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5829963 - 5829713
Alignment:
Q  6 tatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaa-tatcatcttaattttgt---------atatattttgaaatatc 93  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||         | |||||||||||||||    
T  5829963 tatgttatcttaaagttataagtgttgttataatttaaatttgatatggaaaaaaaatatcatcttaattttgttaattttgtaaatattttgaaatatc 5829864  T
Q  94 taaacattgcacataacaattaaaatatttggatt---tatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaat 189  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5829863 taaacattgcacataacgattaaagtattttgatttactatacttatactaattatttgtcgtataagacgtactcattattaaacttagcatatgtaat 5829764  T
Q  190 atttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataa 240  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5829763 atttttgcaaaaatacgccaacgtactgtatattattatttgttgacataa 5829713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12787368 - 12787146
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatact 134  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  12787368 tttaaatttgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatttggattattatact 12787270  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgtt 233  Q
    | || | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||| |||||| || || ||||||||    
T  12787269 tgtatttattatttgtagtataagattcactcattgttaaacttagcatatgtaattttcttgcaaaaatacgccgacttactgtgtaataatatttgtt 12787170  T
Q  234 aacataatatattttattaatcat 257  Q
     ||| ||| |||||||||||||||    
T  12787169 gacaaaatgtattttattaatcat 12787146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 257
Target Start/End: Original strand, 42230989 - 42231211
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatact 134  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||  |||||||    
T  42230989 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaagtatttggattattatact 42231087  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgtt 233  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||    
T  42231088 tgtactaattatttttagtataagatgcattcattgttaaacttagcatatgtaattttcttgcaaaaatacgccgacgtactgtgtaataatatttgtt 42231187  T
Q  234 aacataatatattttattaatcat 257  Q
     ||| ||| |||||||||||||||    
T  42231188 gacaaaatgtattttattaatcat 42231211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 9002509 - 9002285
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaa-atatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatac 133  Q
    |||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||  ||||||    
T  9002509 tttaaattcgatatgaaaaaaatatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatttgaattattatac 9002410  T
Q  134 ttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgt 232  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||| || || |||||||    
T  9002409 ttgtactaattttttgtagtataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaatattattgcaaaaataagacgacgtactgtgtaataatatttgt 9002310  T
Q  233 taacataatatattttattaatcat 257  Q
    | ||| ||| |||||||||||||||    
T  9002309 tgacaaaatgtattttattaatcat 9002285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 257
Target Start/End: Original strand, 7035539 - 7035761
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatact 134  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  7035539 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatttcatataacgataaaaatatttggattattatact 7035637  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgtt 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||    
T  7035638 tgtactaattatttgtagtataagatgcattcattgttaaaattagcatatgtaattttcttgcaaaaatacgccgacgtactgtgtaataatatttgtt 7035737  T
Q  234 aacataatatattttattaatcat 257  Q
      || ||| |||||||||||||||    
T  7035738 ggcaaaatgtattttattaatcat 7035761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 289 - 582
Target Start/End: Original strand, 42231241 - 42231534
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||| || |||||  | |||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  42231241 taatagtcattgtcacatgcatatacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaattttt-acgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacaccgatt 42231339  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttaggg-taacaacgatgtnnnnnnnnng-ttccgcgtattgttata 486  Q
    ||||||||            ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         | ||||||| ||||||| |    
T  42231340 gttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttaggggtaacaacgatgtaaaaaaaaaggttccgcggattgttaaa 42231439  T
Q  487 cttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatt 582  Q
    | |||||| ||||| |||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42231440 cctgaaaaatgcatgaattaatagtcaatggcagaaagatctgcttatatagaaattgcatgt-ctataatgaccagtacgccttacaaagaaatt 42231534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 289 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 9002255 - 9001966
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  9002255 taatagtaagtgtcagatgtatacacctagtctgtgaatgcaaacgtt-------ttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgtcgatt 9002163  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnn---acaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnng-ttccgcgtattgtta 484  Q
    |||||||                ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         | |||| || |||||||    
T  9002162 gttattttttttttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttaggataacaacgatgtaaaaaaaaaggttccacggattgtta 9002063  T
Q  485 tacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatt 582  Q
     || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  9002062 aacctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatggcaggaggatctgcttatatagaaattgcatgt-ctataatgatcagtacgccttataaagaaatt 9001966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 289 - 459
Target Start/End: Original strand, 7035792 - 7035964
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaatttttt--acggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccga 386  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| ||||   | |||||||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7035792 taatagtcattgtcacatgcatacacgtagtaggtaaatgcaaacgtttaattttttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccga 7035891  T
Q  387 ttgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt 459  Q
    ||||||||||            ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7035892 ttgttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt 7035964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 289 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 45122485 - 45122377
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaatttttt-acggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgat 387  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||  | ||||||||| || |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  45122485 taatagtcagtgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacatttaatttttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgtcgat 45122386  T
Q  388 tgttatttg 396  Q
    |||||||||    
T  45122385 tgttatttg 45122377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1322 - 1367
Target Start/End: Original strand, 18939139 - 18939184
Alignment:
Q  1322 gggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataa 1367  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18939139 gggttaccaaagttatcattcaaatcgggatacacaaagtttataa 18939184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 840 - 874
Target Start/End: Original strand, 12983007 - 12983041
Alignment:
Q  840 tgacccttacttttatttattgtcattgcaaaaca 874  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12983007 tgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaaca 12983041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 840 - 874
Target Start/End: Complemental strand, 18292623 - 18292589
Alignment:
Q  840 tgacccttacttttatttattgtcattgcaaaaca 874  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18292623 tgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaaca 18292589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 840 - 874
Target Start/End: Complemental strand, 26368039 - 26368005
Alignment:
Q  840 tgacccttacttttatttattgtcattgcaaaaca 874  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26368039 tgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaaca 26368005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 904; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 904; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 1724
Target Start/End: Original strand, 185359 - 187086
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatctt---------aattttgtatatattttgaaatat 92  Q
    ||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||||    
T  185359 attatgttatcttaaaattataagtgttgttataatttaaatttgatatgaa-aaaaatatcatctttattttgttaattttgtatatattttaaaatat 185457  T
Q  93 ctaaacattgcacataacaattaaaatatttggatttat---acttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaa 188  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  185458 ctaaacattgcacataacgattaaagtatttgtatttattatacttatactaattatttgtagtataagatgtattcattgttaaacttagcatatgtaa 185557  T
Q  189 tatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattatta---tttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnn 285  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||| ||||||| |||   |||||||||              |||||             
T  185558 tatttttgcaaaaataagccgacgtactgtatattattattatttgttgacataatgtat---attaatcataaaaactaaaaaatttgtatttttttt- 185653  T
Q  286 atgtaatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccg 385  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  185654 atataatagtgagtgtcagatgtatacacctagtatgtgaatgcaaacgttaaatttttgacgggtgtgtataaatatagtttggggtacaagaacgccg 185753  T
Q  386 attgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngttccgcgtattgttat 485  Q
    |||||||||||            |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||     ||||||||||         |||||||||||||||||    
T  185754 attgttatttgtttatattttttacaaaa-caatggtctaatgtaattcttgtatttta-----acaacgatgtaaaaaaaaagttccgcgtattgttat 185847  T
Q  486 acttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnn 585  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||       
T  185848 acctgaaaagtgcatcaattaaaagtcaaaggcagaaggatctgcttgtatacaaattgcatgtcttgtgatgaccagtacgccttacaaagaaatt-aa 185946  T
Q  586 nnnnnncgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcac 681  Q
          | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  185947 aaaaaacaacttccaatcaatatgcaactttagttttttaaattatagcaacaccaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcac 186046  T
Q  682 gatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacata 781  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  186047 gatacacaacatttgtggtctccttgcaaacattattattttcatccaagatgagcagcttcaaaccttttctagaagtaactcgagagacagcgacata 186146  T
Q  782 gagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtc 881  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  186147 gagttgcccatgcgtgaacacgggcttaggtagataaactcccacttgagataaagattgaccct--cttttatttattgtcattgtaaaacaaagcatc 186244  T
Q  882 aatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctg 980  Q
    |||| |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  186245 aatggaaattgtctgcgcatgaatttgaaggatagtcctggatcactcggaataagattcatcctgggaatgaataccctggtacctgccctttttcctg 186344  T
Q  981 taattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcat 1080  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||| | || ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  186345 taattacggtagcagctatcgtcctcttccctagatgttaaactgtcagcctcgtaccattacacagtccactggcctgatcgatgtttctcatcagcat 186444  T
Q  1081 aattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatca 1180  Q
    || | ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  186445 aactagacatcccacctttagtttcaaccggtgatttggaa--ccagagctcttaataccattaaggaattccgttgagaaccactcgctttggacatca 186542  T
Q  1181 gaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaat 1280  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  186543 gaattt-cacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcagctgaat 186641  T
Q  1281 caagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacgg 1380  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  186642 caagcgttggtgcgagtattcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacag 186741  T
Q  1381 atttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcac 1480  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  186742 atttgttgtgtacgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgccgtctccaattgagagtatccac 186841  T
Q  1481 tcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatct 1580  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||    
T  186842 ttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcaagtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaggccttaaaacattacaataagcccatatct 186941  T
Q  1581 ttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattcc 1679  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  186942 ttgatgaattgattggtgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcttgaaatcaccacctaaaactactgtcattcc 187041  T
Q  1680 accaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  187042 accaaatggtttaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 187086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 901; Significance: 0; HSPs: 56)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 901; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 1724
Target Start/End: Original strand, 50408959 - 50410700
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgt---------atatattttgaaatat 92  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||    
T  50408959 attatgttatcttaaagttataagtgtggttataatttaaatttgatatgaaaaaaaatatcatcttaattttgttaatattgtatatattttgaaatat 50409058  T
Q  93 ctaaacattgcacataacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatat 191  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50409059 ataaacattgcacataacgattaaagtatttgaatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcatatgtaatat 50409158  T
Q  192 ttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaa 291  Q
    ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||              |||||         || |||    
T  50409159 ttttgaaaaaatacgccaacgtactatatattattattagttgacataatgtattttatttatcataaaaactaaaaaatttgtattttttt--atataa 50409256  T
Q  292 tagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaatttttt-acggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgt 390  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50409257 tagtcagtgtcagatgtatatacctagtctgtgaatgcaaacgttaaatttttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgattgt 50409356  T
Q  391 tatttgnnnnnnnnnnnn-acaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn-gttccgcgtattgttatact 488  Q
    ||||||             |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||          |||  || |||| ||||||     
T  50409357 tatttgttttcatttttttacaaaaccaatggtctaatgtaaatattgtattttaaggtaacaacgatgtaaaaaaaaaagttttgcatatttttatacc 50409456  T
Q  489 tgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnn 588  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||          
T  50409457 tgaaaagtgcaccagttaaaagtcaatggcaggaagatatgcttatatataaattgaatgtcctgtaatgaccagtacgccttacaaagaaattaaaaaa 50409556  T
Q  589 nnncga-------cttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaact 677  Q
        ||       ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  |    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50409557 aaaagaaaaaagacttccaaacaatatgcaactttagttttctaaattataacaacaacaattctaaaa-ataaccaatgatcatactttttgaaaaact 50409655  T
Q  678 tcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacga 777  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  50409656 tcacaatacacaacatttgtggtctccttgcaaacattattatatttatccaagatgagcagcttcaaaccttttctagaagtaactcgattgacaacga 50409755  T
Q  778 catagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaag 877  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50409756 catagagttgtccatgcgtgaacacgggcttaggaagataatctcccactcgagataaagattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaacaaag 50409855  T
Q  878 cgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttcccttttt 976  Q
    |||||||| |||||   ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50409856 cgtcaatggaaattgtttgcgcctaaatttgaagggtagtcctagatcactcggaataagattcatcttgggaatgaataccctggtacctgcccttttt 50409955  T
Q  977 cctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataa 1076  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  50409956 cctgtaattatggtagcagctatcgtgctcttccctagatgtgtaacggtcagcctcgtaccattactcagtccattggtctgatcgatgtttctcatca 50410055  T
Q  1077 gcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggac 1176  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |  |||||    
T  50410056 gcataactggacatctcacccttagtttcaaccagcgatttggaattccagagctcttaataccatttagaaattccgctgtgaaccactctcattggac 50410155  T
Q  1177 atcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaact 1276  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||  ||||| |||||| |||    
T  50410156 atcagaattttcacccgatcgacaaagagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatatttgttaacatgctcgact 50410255  T
Q  1277 gaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatca 1376  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50410256 gaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttgaaaaaatagtgggtcgccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatca 50410355  T
Q  1377 acggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtat 1476  Q
     |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  50410356 gcggatttgttgtgtccgatatgagaaaatcttcaggaattt----cttcatttcaccattctcatccaaagcgtcgttaccgtctctaattgagagtat 50410451  T
Q  1477 gcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacat 1576  Q
     |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||    
T  50410452 ccacttgccaaaattagcaatttattcctgctctacaggtaccgaagatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacacattagaataagccaat 50410551  T
Q  1577 atctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtca 1675  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50410552 atctttgatgaattgattgaggcatcaaaaatatcgtgcctcgttgctttacggacaacaggcagtatctgcctgaaatcaccacctaaaactactgtca 50410651  T
Q  1676 ttccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  50410652 ttccacgaaaaggtataaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 50410700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 824; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 1724
Target Start/End: Original strand, 11367445 - 11369171
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 101  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11367445 attatgttatcttaaagttataattgtcgttataatttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacttt 11367543  T
Q  102 gcacataacaattaaaatatttggatt--tatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgca 198  Q
    ||| ||| | |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  11367544 gcatatatcgattaaattatttggattattatacttgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttatacttagcatatgtaatatttttgca 11367643  T
Q  199 aaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcag 298  Q
    ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||               ||||         || ||||||||||    
T  11367644 aaaatatgccgacgtactgtataataatatttgttgacaaaatgtattttattaatcataaaaactaaaaaatatgtatttttttatatataatagtcag 11367743  T
Q  299 tgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaatttttt-acggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgn 397  Q
    | ||| ||| |||||| |||||    |||||||| ||| |||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  11367744 tatcatatgcatacacgtagtcggcaaatgcaaatgtttaatttttttacgggtgtgcataaatatagtttgggctacagaaacgccgattgttatttgt 11367843  T
Q  398 nnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn--gttccgcgtattgttatacttgaaaag 495  Q
               ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||           |||||||| ||||||| |||||||||     
T  11367844 ttttcatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttagcgtaacaacgatgtaaaaaaaaaaggttccgcggattgttaaacttgaaaaa 11367943  T
Q  496 tgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnn-cga 594  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||          |||    
T  11367944 tgcatgaattaatagtcaatggcaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgacttgtacgccttacaaagaaattaaaaataaaacga 11368042  T
Q  595 cttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaa 690  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11368043 cttccaaataataggcaactttagttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcacgatacacaa 11368142  T
Q  691 catttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtcc 790  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11368143 catttttggtctccttacaaacattattatcttcatccaggatgagcagcttcagaccttttcttgaagttactcgagagacagcgacataaagttgtcc 11368242  T
Q  791 attcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaat 890  Q
    || | ||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11368243 atgcgtgaacacagacttaagaagataaacccccactcgagataaagattgactctggcttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaat 11368342  T
Q  891 ttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatctt-ggaatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacgg 989  Q
    | | ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  11368343 tgcttgcgcctgaattttaagggtagtcctggatcattcagaataagattcatcttgggaatgaataccctggtgccttccctttttcctgtaattacag 11368442  T
Q  990 tagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggaca 1089  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  11368443 tagcagctatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagcctcgtaccattacacagtccattgacctgatcgatgtttctcatcaacataactggaca 11368542  T
Q  1090 tcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcaga-attttc 1188  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  11368543 tcccacccttagtttcaaccggtgatttggaattctagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagactttttc 11368642  T
Q  1189 gcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgtt 1288  Q
     ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11368643 acccaatcgacaaattgaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctcaaccgaatcaagcgtt 11368742  T
Q  1289 ggtgcgagtatgcccctttattgg-aaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgtt 1387  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11368743 ggtgcgagtattcccttttcttggaaaaaagagcgggtcaccaatgttatcattcaaatcgggatatacaaagtctatgagtgacatcaacggatttgtt 11368842  T
Q  1388 gtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaa 1487  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||         |||||| | ||||||||| || |||| |||| |||||    
T  11368843 gtgtcggatatgagcaaatcttcgggaatttctacattcatttcaccattctca---------tcgttgtcctctccaattgagggtatccacttgccaa 11368933  T
Q  1488 aattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatga 1587  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  11368934 aattatcagtttcttccttctctgcaggtcccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttgatga 11369033  T
Q  1588 attgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaa 1686  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  11369034 attgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatatgcctgaaatcaccacttaaaactactgtcattccaccaaaa 11369133  T
Q  1687 ggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||    
T  11369134 ggtctaaactcgtataggggatcattcttggatatgat 11369171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 819; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 1724
Target Start/End: Original strand, 10037442 - 10039162
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 101  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10037442 attatgttatcttaaagttataattgtggttataatttaaattcgatattaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatccaaacatt 10037540  T
Q  102 gcacataacaattaaaatatttggatt--tatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgca 198  Q
    ||| ||||| || ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  10037541 gcatataacgataaaagtatttggattactatacttgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacatagcatatgtaatatttttgca 10037640  T
Q  199 aaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcag 298  Q
    ||||||  | ||||||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||               ||||         ||  |||||||||    
T  10037641 aaaatatgctgacgtactgtataataatatttgttgacaaaatgtattttattaatcataaaaactaaaaaaaatgtatttttttttataaaatagtcag 10037740  T
Q  299 tgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnn 398  Q
    ||||  ||| |||||| |||||  | |||||||||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  10037741 tgtcgcatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaattttttacgtgtgtatataaatatagtttgggctacagaaacgccgattgttatttgtt 10037840  T
Q  399 nnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngttccgcgtattgttatacttgaaaagtgc 498  Q
              ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  10037841 tttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaggtttcgcggattgttaaacgtgaaaagtgc 10037940  T
Q  499 atcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnn-cgactt 597  Q
    || |||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||          ||||||    
T  10037941 atgaattaatagtcaatggcatgaggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaagaaattaaaaataaaacgactt 10038039  T
Q  598 ccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacat 693  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10038040 ccaaataataggaaactttagttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcacgatacacaacat 10038139  T
Q  694 ttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccatt 793  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | || || ||| ||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||     
T  10038140 ttgtggtctccttacaaacattattatcttcatccatgatgagcagctttagaccttctcttgaagttacttgagagacagcgacataaagttgtccatg 10038239  T
Q  794 catgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttc 893  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  10038240 cgtgaacacaggcttaggaagataaacccccactcgagataaagattgaccctgacttttatctattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaattgc 10038339  T
Q  894 atgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtag 992  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10038340 ctgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcagaataagattcatcctgggaatgaataccctggtacttgccctttttcctgtaattacggtag 10038439  T
Q  993 caactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcc 1092  Q
    || ||||  ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| || |||||| | |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10038440 cagctattgtgctcttccctagatgtgtaattgccagcctcgtaccactacacagtccattggcctgatcaatgtttctcatcagcataactggacatcc 10038539  T
Q  1093 tacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgccc 1192  Q
     | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  10038540 caaccttagtttcaaccggtgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattcctttgtgaaccattcgctttgggcatcagaattttcaccc 10038639  T
Q  1193 gatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtg 1292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| || |||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  10038640 gatcgacaaacagaatgagagcttaaataatatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaattgaatcaagtgttggcg 10038739  T
Q  1293 cgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgtt 1392  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||          | ||||||| ||||||||||||     
T  10038740 cgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaattgggatacacaaa----------gacatcaacagatttgttgtgtc 10038829  T
Q  1393 cgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaatta 1492  Q
     ||||| |||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  10038830 tgatataagcaaatcttcgaaaatttataccttcgtttcaccattctcatctaaagcgtcgttgccgtcttcaattgagagtatccacttgccaaaatta 10038929  T
Q  1493 gcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattga 1592  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10038930 gcaatttcttcttgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacaataagcctcaacacattacaataagcccatatctttgatgaattga 10039029  T
Q  1593 ttgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtct 1691  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10039030 ttgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcagacaacatgcaatatcttcttgaaatcaccacataaaactattgtcattccaccaaaaggtct 10039129  T
Q  1692 aaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    |||||| ||||  ||||||||| | ||||||||    
T  10039130 aaactcgtttaagggatcattcctagacatgat 10039162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 795; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1724
Target Start/End: Original strand, 10109696 - 10111132
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaatttttt-acggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgat 387  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10109696 taatagtgagtgtcagatgtatacatctagtctgtgaatgcaaacgttaaatttttttacgggtgtatataaatatagtttgggctacataaacgtcgat 10109795  T
Q  388 tgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngttccgcgtattgttatac 487  Q
    ||||||||             |||||| |||||||||||  |||||||||||||          ||||||||         |||||||||||||||||||    
T  10109796 tgttatttatttttatattttacaaaaccaatggtctaagttaaatattgtatt----------aacgatgtaaaaaaaaagttccgcgtattgttatac 10109885  T
Q  488 ttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnn 587  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||         
T  10109886 ctgaaaagtgcatcaattaaaagtcaaaagcaagaagatctgcttatatagaatttgcatgtcctgtaatgaccagtacgtcttacaaagaaattaaaaa 10109985  T
Q  588 nnnncga----cttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttc 679  Q
          |    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10109986 aaaaaaaaaaactttcaatcaatacgcaactttagttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttaaaaaacttc 10110085  T
Q  680 acgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgaca 779  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10110086 acgatacacaacatttgtggtctccttgaaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaaccttttctagaagtaactcgagagacaacgaca 10110185  T
Q  780 tagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcg 879  Q
    ||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  10110186 tagagttgctcatgcgtgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaagattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaataaaacg 10110285  T
Q  880 tcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcc 978  Q
    |||||| |||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  10110286 tcaatggaaattgtctgcgcatgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcctgggaatgaatacgttggtacctgccctttttcc 10110385  T
Q  979 tgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagc 1078  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| | |||||| | |||||||||||||||| |||    
T  10110386 tgtaattacggtagcagctatcatgctcttccctagatgtgtaactgtcagcctcataccattacacagtccattggcccgatcgatgtttctcatcagc 10110485  T
Q  1079 ataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacat 1178  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  10110486 ataactggacatcccacctttagtttcaaccggtgatttggaattccagagctcttaatatcattaaggaattccgttgtgaaccacttgatttggacat 10110585  T
Q  1179 cagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactga 1278  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||||||||||||    
T  10110586 cagaattttcacccgatcaacaaacataatcaaagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactga 10110685  T
Q  1279 atcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaac 1378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  10110686 atcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctgtaagtgacatcaac 10110785  T
Q  1379 ggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgc 1478  Q
     ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| | ||||| |    
T  10110786 agatttgttgcgtctgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcctccgaagcgttgttgccgtctccaattcatagtatcc 10110885  T
Q  1479 actcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatat 1578  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||| |||||    
T  10110886 acttgccaaaattagcaatttctttctgctctgtaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcattaacacattaaaataagctcatat 10110985  T
Q  1579 ctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcatt 1677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10110986 ctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcatt 10111085  T
Q  1678 ccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    ||| |||| ||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  10111086 ccatcaaatggtttaaactcgtttagggaatcattcttggacatgat 10111132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 772; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 511 - 1724
Target Start/End: Original strand, 13529352 - 13530571
Alignment:
Q  511 tcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnn-cgacttccaaacaatacg 609  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||          ||||||||||||||||||    
T  13529352 tcaatgggaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtcatgtaatgaccaatacgccttacaaagaaattaaacaaaaaacgacttccaaacaatacg 13529451  T
Q  610 caactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctcct 705  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  13529452 caactttagttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaatacttcacgatacacaatatttgtggtctcgt 13529551  T
Q  706 tgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacggg 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13529552 tgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagcttcaaaccttttctagaagtaacttgagagacagcgacatagagttgtccatgcatgaacacggg 13529651  T
Q  806 cttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaat 905  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  13529652 cttaggaagataaactcccagtcgagataaagattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaatttcctgcgcctggat 13529751  T
Q  906 ttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatctt-ggaatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgc 1004  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |    
T  13529752 ttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcctaggaatgaataccctggtacctgccctttttcctgtaattacgatagcagctatcgttc 13529851  T
Q  1005 tctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagttt 1104  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| | | |||||| |||||||||||    
T  13529852 tcttccctagatgtgtgactgtcagcctcataccattacacaatccattggcctgatcgatgtttctcatgagcatactag-acatcccacccttagttt 13529950  T
Q  1105 caaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaaca 1204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| || ||||||||| ||    
T  13529951 caaccggtgatttggaattccagagctcttaataccactaagaaattccgttgtgaaccactcgctttggacaccaaaattttcacctgatcgacaagca 13530050  T
Q  1205 gaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccc 1304  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  13530051 gaaccagagcttaaatactctttctcttcacctggactcagtgacatcatatattcgttaaaatgctcaactgaatgaagtgttggtgcgagtattcccc 13530150  T
Q  1305 tttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaa 1404  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  13530151 tttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgatatgaccaa 13530250  T
Q  1405 atcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcc 1504  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13530251 atcttctagaatttctaccttcatttcaccattctcacctgatgcgtcgttgccgtctccaattgagagtatatacttgccaaaattagcaatttattcc 13530350  T
Q  1505 tgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaa 1604  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  13530351 tgctctacaggtaccgaagatgcactcaatctcatattaacagtaagcctctacacattacaataagcccatatctgtgatgaattgattgaggcatcaa 13530450  T
Q  1605 caat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttag 1703  Q
    |||| || ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  13530451 caatatcgtgcctcgttcctttttggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccagctaaaactactgtcattccatcgaaaggtctaaactcgtttag 13530550  T
Q  1704 aggatcattcttggacatgat 1724  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  13530551 gggatcattcttggacatgat 13530571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 760; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 343 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 10969859 - 10968469
Alignment:
Q  343 tttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattt 442  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||            |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10969859 tttacgggtgtgtataaatatagtttggtctacagaaatgttgattgttatttgtttttattttttacaaaaccaatggtctagtgtaaatattgtattt 10969760  T
Q  443 tagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaat 542  Q
    || ||||| |||||| |         ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  10969759 tacggtaataacgatataagaaaaaggttccgcgtattgttatacctgaaaagtgcatcaattaaaagtaaactgcaggaggatctgcttatatagaaat 10969660  T
Q  543 ttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaa----gaaatt-tnnnnnnnncgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaat 637  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||| |        |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  10969659 tgcatgtcctgtaatgaccagtacgccttacaaattaagaaattataaataaaacgacttccaaacaatacgcaactttatttttctaaattatagcaac 10969560  T
Q  638 ga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagat 733  Q
     |    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  10969559 aacaattctaaaacataaccaatgatcatacttttcgaaaaacttcacgatacacaacattgt-ggtctccttgcaaacattatcatcttcattcaagat 10969461  T
Q  734 gagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagat 833  Q
    |||||| |||| || |||||| |||||||||||||||| | | ||| |||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10969460 gagcagcttcagaccttttcttgaagtaactcgagagaaagcaacacagagttatccatgcgtgaacacaggcttaggaagataaactcccactcgagat 10969361  T
Q  834 aaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaa 933  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  10969360 aaagattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaattgcatgcgcctgaatttgaagggtactcccggatcactcggaa 10969261  T
Q  934 taagattcatcttgga-atgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcct 1032  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  10969260 taagattcatcctggggatgaataccctggtacctgtcctttttcttgtaattacggtagcagctatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtgagcct 10969161  T
Q  1033 cgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctc 1132  Q
    |||| ||||| ||| | |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| | |||  || ||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  10969160 cgtaccattatacagtccattggcctgattgatgtttctcatcagcataactcgactccccaccattagtttcaaccggtgatttgaaattctagagctc 10969061  T
Q  1133 ttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctctt 1232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  10969060 ttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatcgacaaacaaaataagagcttaaatactctttctctt 10968961  T
Q  1233 cacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaag 1332  Q
    ||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||| |||||| |||    
T  10968960 cacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctaaactgaatcaagcgttggtgcgagtattccccttgcttagaaaaatagcaggtcacgaag 10968861  T
Q  1333 gttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttca 1432  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  10968860 tttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgtccgatatcagcaaatc-tcagaaatttctaccttcatttca 10968762  T
Q  1433 ccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactca 1532  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||    
T  10968761 ccattctcatctgaagcgtcgttgccatctccaattgagagtgtccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctataggtactgaagatgcaccca 10968662  T
Q  1533 atctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggac 1631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  10968661 atctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataaacccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctccctcgatccgtttcggac 10968562  T
Q  1632 aacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
     |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  10968561 tacagacaatatctgcctgaaatcaccatctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaaatcgtttaggggatcattcttggacctgat 10968469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 730; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 469 - 1724
Target Start/End: Original strand, 9999675 - 10000939
Alignment:
Q  469 gttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgc 568  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  9999675 gttccgcgtattgttatacctgaaaagtgcatcaattaaaagtcaaaagcaagaagatctgcttatatagaaattgcatgtcctgtaatgaccagaacgc 9999774  T
Q  569 tttacaaagaaatttnnnnnnnncga---cttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatca 661  Q
     |||||||||||||           |   ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |    ||||||||||||||||||||||    
T  9999775 cttacaaagaaattaaaaaaaaaaaaaaactttcaatcaatacgcaactttagttttctagattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatca 9999874  T
Q  662 tattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagta 761  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  9999875 tactttttaaaaaacttcacgatacacaacatttgtggtctccttgaaaacattattattttcatccaagatgagtagtttcaaaccttttctagaagta 9999974  T
Q  762 actcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattg 861  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  9999975 acttgagagacaacgacatagagttgctcatgcgtgaacacgggtttaggaagataaactcacactcgagataaagattgaccctgacttttatttattg 10000074  T
Q  862 tcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccct 960  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |    
T  10000075 tcattgcaaaataaaacgtcaatggaaattgtctgcgcatgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcctgggaatgaatacgtt 10000174  T
Q  961 ggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctga 1060  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||| | ||    
T  10000175 ggtacctgccctttttcctgtaattacggtagcagctatcatgctcttccctagatgtgtaactgtcagcctcgtaccattacacagtccattggcccga 10000274  T
Q  1061 tcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtga 1160  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  10000275 tcgatgtttctcatcagcataactggacatcccacctttagtttcaaccggtgatttggaattccagagctcttaatatcattagggaattccgttgtga 10000374  T
Q  1161 accactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgc 1260  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |    
T  10000375 accacttgatttggacatcagaattttcacccgatcaacaaacataatcaaagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattc 10000474  T
Q  1261 gttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaag 1360  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10000475 gttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcctctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaag 10000574  T
Q  1361 tctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgt 1460  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  10000575 tctgtaagtgatatcaacagatttgttgcatctgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcctccgaagcgttgttgccgt 10000674  T
Q  1461 ctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacat 1560  Q
    |||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  10000675 ctccaattcatagtatccacttgccaaaattaacaatttctttctactctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagccttaacac 10000774  T
Q  1561 attacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcacca 1659  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  10000775 attaaaataagcccatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaacatctgcctgaaatcccca 10000874  T
Q  1660 cctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  10000875 cctaaaactattgtcattccatcaaatggtttaaactcgtttagggaatcattcttggacatgat 10000939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 675; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1608
Target Start/End: Original strand, 11361346 - 11362676
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||  | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11361346 taatagtcagtttcacatgcatacacgtaatcggtaaatgcaaacgtttaattttttacggatgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgatt 11361445  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnng---ttccgcgtattgttat 485  Q
    ||||||||            ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||             || | || ||| |||     
T  11361446 gttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacaatgtaaaaaaaaaaagctttcacggattattaa 11361545  T
Q  486 acttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnn 585  Q
    || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||       
T  11361546 acctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatggcaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgtcttacaaagaaattaaa 11361644  T
Q  586 nnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttca 680  Q
           |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11361645 aataaaacgacttccaaacaataggcaactttggttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttca 11361744  T
Q  681 cgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacat 780  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  11361745 cgatacacaacatttgtggtctccttacaaacattattatcttcatccaggatgagcagcttcaaaccttttcttgaagttactcgagagacagcgacat 11361844  T
Q  781 agagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgt 880  Q
    | ||||| |||| | ||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11361845 aaagttgcccatgcgtgaacataggcttaggaagataaacccccacttgagataaagattgaccttgacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgt 11361944  T
Q  881 caatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatctt-ggaatgaataccctggtaccttccctttttcct 979  Q
    ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  11361945 caatggaaattgcctgcgcttgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgggaatgaataccctggtaccttctttttttcat 11362044  T
Q  980 gtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagca 1079  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  11362045 gtaattacagtagcagctatcatgctcttccctagatgtgtaactatcagcctcgtaccattacacaatccattgacctgatcgatgtttctcatcagca 11362144  T
Q  1080 taattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatc 1179  Q
    | | ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11362145 tgactggacatcccaccattagtttcaaccggtgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctagacatc 11362244  T
Q  1180 agaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagctt-aaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactga 1278  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||| ||||||||| ||    
T  11362245 agacttttcgcccgatcgacaaactgaatcagagcttaaaaaaatctttctcttcacctggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctcaaccga 11362344  T
Q  1279 atcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaac 1378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  11362345 atcaagcgttggtgcgagtattcccttttcttggaaaaatagtgggtcaccaatgttatcatttaaatcgggatatacaaagtctattagtgacatcaac 11362444  T
Q  1379 ggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagag--tat 1476  Q
    | ||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||    
T  11362445 gaatttgttgtatcggatatgagtaaatcttcgggaatttcccccttcatttcaccattctcattcgaagcgtcgttgtcgtctccaattgagagtatat 11362544  T
Q  1477 gcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacat 1576  Q
     |||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  11362545 ccacttgccaaaattagcagtttattcttgctctgcaggtcccgaagatgcacccaatctcatattaactgtaagcctcaacacattacaataagcccat 11362644  T
Q  1577 atctttgatgaattgattgatgcatcaacaat 1608  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11362645 atctttgatgaattgattgaggcatcaacaat 11362676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 579; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 409 - 1367
Target Start/End: Original strand, 46912281 - 46913245
Alignment:
Q  409 acaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaa 508  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  46912281 acaaaaccaatgatctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtataaaaaaagttccgcgtattgttatacctaaaaagtgcatcgattaaa 46912380  T
Q  509 agtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnn--cgacttccaaacaat 606  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||           |||||| ||||||||    
T  46912381 agtcaatggcaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtcatgtaatgaccaatacgccttacaaagaaattaaaaaaaaaaacgactttcaaacaat 46912480  T
Q  607 acgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtct 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46912481 acgcaactttagttttctaaattatagcaataacaattctaaaatataatcaatgatcatactttttgaaaaacttcacgatacacaacatttgtggtct 46912580  T
Q  703 ccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacac 802  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  46912581 ccttgtaaacattattatcttcatccaagatgagcagcttcaaaccttttctagaagtaactcgagagacaatgacatagagttgtccatgcgtgaacac 46912680  T
Q  803 gggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctg 902  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| | ||||||||    
T  46912681 gggcttaggaagataa-ctcccactcgagataaagattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaacaaactgtcgatggaaattgcttgcgcctg 46912779  T
Q  903 aatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatct 1001  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||     
T  46912780 aatttgaagggtagtcctggatcactcagaataagattcatcgtgggaatgaataccctcatacctgccctttatcctgtaattacgatagcagctatca 46912879  T
Q  1002 tgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttag 1101  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  46912880 tgctcttccctagatgggtaactgtcagcctcgtaccattacacaatccattggcctgatcgatatttctcatcagcataactggacatcccacccttag 46912979  T
Q  1102 tttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaa 1201  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  46912980 tttcaaccggtgattttgaattccatagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctttggacatcagaatttccccccgatcgacaa 46913079  T
Q  1202 acagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgc 1301  Q
    ||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46913080 acataatcaaagcttaaatactatttttcttcacctggaattggtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattc 46913179  T
Q  1302 ccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataa 1367  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46913180 tcctttcttggaaaaatagcgggtcgccaaagttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataa 46913245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 960 - 1724
Target Start/End: Original strand, 10237324 - 10238086
Alignment:
Q  960 tggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctg 1059  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||| | |    
T  10237324 tggtacctgccctttttcctgtaattacggtagcagctatcatgctcttccctagatgtgtaactgtcagcctcgtaccattacacagtccattggcccg 10237423  T
Q  1060 atcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtg 1159  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  10237424 atcgatgtttctcatcagcataac-ggacatcccacctttagtttcaaccggtgatttggaattccagagctcttaatatcattaaggaattccgttgtg 10237522  T
Q  1160 aaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatg 1259  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | || ||||||     
T  10237523 aaccacttgatttggacatcagaattttcacccgatcaacaaacataatcaaagcttaa-tactctttctcttcacctggaatcagtaacatcatatatt 10237621  T
Q  1260 cgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaa 1359  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10237622 cgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttgaaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaa 10237721  T
Q  1360 gtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccg 1459  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  10237722 gtctgtaagtgacatcaacagatttgttgcgtctgatatgagcaattcttcaggaatttctaccgttatttcaccattc-cctccgaagcgttgttgccg 10237820  T
Q  1460 tctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaaca 1559  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10237821 tctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctcagcaggtaccaaagatgcatccaatcttatattaacagtaagccttaaca 10237920  T
Q  1560 tattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcacc 1658  Q
     |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10237921 cattaaaataagcccatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaagcaatatctgcctgaaatcacc 10238020  T
Q  1659 acctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||    
T  10238021 acctaaaactattgtcattccatcaaatggtttaaactcgtttagggaatcattcctggacatgat 10238086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1084 - 1724
Target Start/End: Original strand, 32662 - 33303
Alignment:
Q  1084 tggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaa 1183  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32662 tggacatctcacctttagtttcaacctgtgatttggatttccagagctcttaataccattaagaaattatggtgtgaaccactcgctttggacatcagaa 32761  T
Q  1184 ttttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaa 1283  Q
    ||||| ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || || ||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  32762 ttttcacccgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacttggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaa 32861  T
Q  1284 gcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatt 1383  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  32862 gcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtccataagtgacatcaacggatt 32961  T
Q  1384 tgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcg 1483  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||||||| |||| ||||||| |||| |    
T  32962 tgttgtgtttgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcattgttgccgtctctaattgagagtatccacttg 33061  T
Q  1484 ccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttg 1583  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33062 caaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagcccatatctttg 33161  T
Q  1584 atgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccacc 1682  Q
    | |||||||  || ||||||||||| ||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33162 acgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcgtcgttcctcctcggacaacatgcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactattgtcattccacc 33261  T
Q  1683 aaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    ||||||| |||   | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33262 aaaaggtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgat 33303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1152
Target Start/End: Complemental strand, 41764497 - 41763622
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaatttttt-acggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgat 387  Q
    |||||||||||| || ||| |||||| |||||  | |||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  41764497 taatagtcagtgccacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaatttttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacaaaaatgtcgat 41764398  T
Q  388 tgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn-----gttccgcgtattgt 482  Q
    |||||||||            ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||  |||||    
T  41764397 tgttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtttaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaaaaaaggttccgcagattgt 41764298  T
Q  483 tatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatt 582  Q
    || || |||||||||||| |||||| |||||||| |||| | ||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41764297 taaacctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatgacagggggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaagaaatt 41764199  T
Q  583 tnnnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcata-ttttttgaaaaac 676  Q
              |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  41764198 aaaaataaaacgacttccaaacaataggcaactttagttttcgaaattatagcaataacaattctaaaacataaccaatgatcatacttttttgaaaaat 41764099  T
Q  677 ttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacg 776  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| || |||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  41764098 ttcacgatacacaacatttgtggtctccttacaaacattattatcttcatccaggatgaccaacttcagaccttttcttgaagttactcgagagacagcg 41763999  T
Q  777 acatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaa 876  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  41763998 acataaagttgtccatgcgtgaacacaggcttaagaagataaacccccacttgagataaagattgaccctcacttttatgtattgtcattgcaaaacaac 41763899  T
Q  877 gcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcat-cttggaatgaataccctggtaccttccctttt 975  Q
     |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  41763898 acgtcaatggaaattgcctgcgcctgaatttgaaggatagtcctggatcactcggaataagattcatcctgggaatgaatacactggtaccttccccttt 41763799  T
Q  976 tcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcata 1075  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||| |  |||||||||||||||||     
T  41763798 tcctgtaattacagtatcaactatcgtgctcttccctagatgtgtaactatcagcctcgtaccattacacagtccattagcatgatcgatgtttctcatc 41763699  T
Q  1076 agcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattc 1152  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  41763698 agcataactggacatctcacccttagtttcaaccggtgatttggaattctagagctcttaataccattaaaaaattc 41763622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1032
Target Start/End: Original strand, 31898 - 32649
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31898 taatagtcattgtcacatgcatacacatagtcggtaaatgcaaacgtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgatt 31997  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn---gttccgcgtattgttat 485  Q
    ||||||||            ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| | || |||||||     
T  31998 gttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaaaaggtttcacggattgttaa 32097  T
Q  486 acttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnn 585  Q
    || |||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||       
T  32098 acctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatgacagaaggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaagaaattaaa 32196  T
Q  586 nnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttca 680  Q
           |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32197 aataaaacgacttccaaacaataggcaactttagttttataaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttca 32296  T
Q  681 cgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacat 780  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  32297 cgatacacaacatttgtggtctccttacaaacattattatcttcatccaggatgagcagcttcagaccttttcttgaagttactcgagagacagcgacat 32396  T
Q  781 agagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgt 880  Q
    | ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32397 aaagttgtccatgtgtgaacacaggcttaggaagataaacccccactcgagataaagattgaccctggcttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgt 32496  T
Q  881 caatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcat-cttggaatgaataccctggtaccttccctttttcct 979  Q
    ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  32497 caatggaaattgcccgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcctgggaatgaataccctagtacctgccctttttcct 32596  T
Q  980 gtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcct 1032  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  32597 gtaattacgatagcagctatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagcct 32649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1099
Target Start/End: Complemental strand, 15329700 - 15328876
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||||  |||||||| |||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  15329700 taatagtcaggttcagatgtttacagccagtttgtgaatgcaaacgttaaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacggaaacgtcgatt 15329601  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaa-tcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngttccgcgtattgttatac 487  Q
    |||||||             |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||         ||||   ||||||||||||    
T  15329600 gttatttatttttattttttacaaaaatcaacggtctaatgtaaatattgtattttagg-taacaacaatgtaaaaaaaaagttcaaagtattgttatac 15329502  T
Q  488 ttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnn 587  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   | |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||         
T  15329501 ctgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggaggatctgtttaatattcaattgcatgtcgtgtaatgaccaatacgccttacaaagaaattaaaaa 15329402  T
Q  588 nnnncga-----cttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaactt 678  Q
          |     ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||  |    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15329401 aaaaaaaaaacacttccaaacaatacgtaactttagttttcttaattatagcaacaacaattctaaaatataaccaatgaacatactttttgaaaaactt 15329302  T
Q  679 cacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgac 778  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15329301 cacgatacacaacatttgtggtctccttgcaaacattattatcttcattcaaaatgagcagcttcaaaccttttatagaagtaactcgagagacagcgac 15329202  T
Q  779 atagagttgtccattcatg----aacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaaca 874  Q
    ||||||||||||||  |||    || |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  15329201 atagagttgtccatatatgcgtgaatacgggcttaggaagatcaactcctactcaagataaagattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaacaa 15329102  T
Q  875 aagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctt 973  Q
    ||| ||||||| ||||  | || || |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||    
T  15329101 aagtgtcaatggaaatcacctgtgcttgaatttgaatggtagtccttgatcgctcggaatacgattcatcttgggaatgaatactctggtacctgtcctt 15329002  T
Q  974 tttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctca 1073  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||    
T  15329001 tttcctgtaattacggtagcagctatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagcctcgcaccattacacagtccattggcatgatcgatgtttctca 15328902  T
Q  1074 taagcataattggacatcctaccctt 1099  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||    
T  15328901 tcagcataactggacatcccaccctt 15328876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 306; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 289 - 957
Target Start/End: Original strand, 10234521 - 10235186
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  10234521 taatagtgagtgtcagatgtatacatctagtttgtgaatgcaaacgttaaattttttacgggtgtatataaatatagtttgggttacagaaacgccgatt 10234620  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngttccgcgtattgttatact 488  Q
    |||||||             |||||| |||||||||||  |||||||||||||          ||||||||         |||||||||||||||||||     
T  10234621 gttatttatttttcttttttacaaaaccaatggtctaagttaaatattgtatt----------aacgatgtaaaaaaaaagttccgcgtattgttatacc 10234710  T
Q  489 tgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnn 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||          
T  10234711 tgaaaagtgcatcaattaaaagtcaaaagcaagaagatctgcttatatagaaattgcatgtcctgtaatgaccagtacgccttacaaagaaattaaaaaa 10234810  T
Q  589 nnncg--acttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacg 682  Q
           |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10234811 aaaaataactttcaatcaatacgcaactttagttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttaaaaaacttcacg 10234910  T
Q  683 atacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatag 782  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10234911 atacacaacatttatggtctccttgaaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaaccttttctagaagtaactcaagagacaacgacatag 10235010  T
Q  783 agttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtca 882  Q
    |||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  10235011 agttgctcatgcgtgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaagattgaccttgacttttatttattgtcattgcaaaataaaacgtaa 10235110  T
Q  883 atgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatctt-ggaatgaatac 957  Q
    ||| |||||   ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10235111 atggaaattgtctgcgcatgaatttgaagggtagtccgggatcactcggaataagattcatcttgggaatgaatac 10235186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 279; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 16 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 37803160 - 37802606
Alignment:
Q  16 aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaatta 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  37803160 aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggaaaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgagatatctaaacattgcacataacgatta 37803061  T
Q  116 aaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgta 214  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  37803060 aagtatttggatttatacttatactaattatttgtagtataaaatgtactcattgttaaacttagcatatgtaatatttttgcaaaaatactccgacata 37802961  T
Q  215 ctgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgta-nnnnnnnnnatgtaatagtcagtgtcagatgtataca 313  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||              |||||          || ||||||| |||||||||||||||||    
T  37802960 ctgtatattattatttgttgacataatgtattttattaatcataaaaactaaaaaatttgtattttttttttatataatagtaagtgtcagatgtataca 37802861  T
Q  314 cctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaa 413  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||    
T  37802860 cctagtctgtgaatgcaaacgttaaattttttacgggtgtatataaatatagtttgggctacaaaaacgtcgattgttatttgtttttattttttacaaa 37802761  T
Q  414 atcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt-nnnnnnnnngttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtc 512  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||          |||  ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  37802760 accaatggtctaatgtaaatattgtattttggggtaacaatgatgtaaaaaaaaaagttttgcgtactgttatacctaaaaagtgcatcaattaaaagtc 37802661  T
Q  513 aatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacg 567  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  37802660 aatggcaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtcttgtaatgaccaatacg 37802606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 289 - 917
Target Start/End: Original strand, 10230923 - 10231547
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10230923 taatagtgagtgtcagatgtatacatctagtctgtcaatgcaaacgttaaattttttatgggtgtatataaatatagtttgggctacagaaacgccgatt 10231022  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngttccgcgtattgttatact 488  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||  |||||||||||||          ||||||||         |||||||||||||||||||     
T  10231023 gttatttgtttttattttttacaaaatcaatggtctaagttaaatattgtatt----------aacgatgtaaaaaaaaagttccgcgtattgttatacc 10231112  T
Q  489 tgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnn 588  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||  ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||          
T  10231113 tgaaaagtgcatcaattaaaattcaaaagcaagaacatctgcttatatagaaattgcatgtcctgtaatgaccagtacaccttacaaagaaattaaaaaa 10231212  T
Q  589 nnncg--acttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacg 682  Q
           |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||   |    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  10231213 agatataactttcaatcaatacgcaactttagttttctaaattatagcatcaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttctaaaaaacttcacg 10231312  T
Q  683 atacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatag 782  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10231313 atacacaacatttgtggtctccttgaaaacattattatcttcatccaagatgagtagtttcaaaccttttctagaagtaactcgagagacaacgacatag 10231412  T
Q  783 agttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtca 882  Q
    |||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  10231413 agttgctcatgcgtgaacacgggcttaggaagataaactgccactcgagataaagattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaataaaacgtca 10231512  T
Q  883 atgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagt 917  Q
    ||| |||||   ||||| |||||||||||||||||    
T  10231513 atggaaattgtctgcgcatgaatttgaagggtagt 10231547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 947 - 1339
Target Start/End: Original strand, 47692723 - 47693115
Alignment:
Q  947 ggaatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacaca 1046  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  47692723 ggaatgaataccctggtacctgccattttttctgtaattacggtagcaactatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagcctcataccattacaca 47692822  T
Q  1047 attcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaag 1146  Q
     | |||||  |||||||||| ||||||| ||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47692823 gtccattgacctgatcgatgcttctcatcagcataactggaaaacctacccctagtttcaaccggtgatttggaattccagagctcttaataccattaag 47692922  T
Q  1147 aaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggt 1246  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  47692923 aaatttcgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgtccgatcgacaaacagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaattagt 47693022  T
Q  1247 gaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatca 1339  Q
    || || || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  47693023 gacatcatgtattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgaggattcccctttcttgggaaaattgtgggtcaccaaggttatca 47693115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1121 - 1458
Target Start/End: Original strand, 52917994 - 52918330
Alignment:
Q  1121 attccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaat 1220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52917994 attccagagctcttagtaccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatcgacaaacaaaatcagagcttaaat 52918093  T
Q  1221 actctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatag 1320  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  52918094 actctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgggtattcccctttcttggaaaaatag 52918193  T
Q  1321 cgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttct 1420  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||   ||||||| ||||||||||||    
T  52918194 cgagtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacgaagtctataagtggcatcaacagatttgttgtgtccggtaacggcaaatc-tcaggaatttct 52918292  T
Q  1421 accttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgcc 1458  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  52918293 accttcatttcaccattcccatccgaagcgtcgttgcc 52918330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 651 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 37802188 - 37801945
Alignment:
Q  651 accaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattat---cttcatccaagatgagcagtttcaaac 747  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||    
T  37802188 accaatgatcatactttttgaaaaacttcacgatacacaacatttatggtctacttgcaaacattattattatcttcatccaagatgagcagcttcaaac 37802089  T
Q  748 attttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgaccctt 847  Q
     |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||     
T  37802088 cttttataggagtaactcgagagacagcgacatagagttgtccatgcgtgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaagatttacccta 37801989  T
Q  848 acttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatt 891  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37801988 acttttttttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatt 37801945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Original strand, 9999219 - 9999460
Alignment:
Q  6 tatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgc 103  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9999219 tatgttatcttaaagttataagtgttgttataatttacatttgatatggaaaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgc 9999318  T
Q  104 acataacaattaaaatatttggat---ttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaa 199  Q
    ||||| | |||||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9999319 acatagcgattaaagtatttggatttattatatttatactaattatttgtagtataagatgtactcatcgttaaacttagcatatgtaatatttttgcaa 9999418  T
Q  200 aaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataat 241  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9999419 aaatacgccgacgtactgtatattattatttgttgacataat 9999460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 168; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 257
Target Start/End: Original strand, 47691853 - 47692091
Alignment:
Q  19 ttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaa 118  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  47691853 ttataagtgtgattacaatttaaattttacatgga-aaagatatcatcttaattttgtatataatttgaaatatctaaacattgcacataacgattaaag 47691951  T
Q  119 tatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactg 217  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47691952 tatttgaatttatacttatattaattatttgtagtataagacgtactcattgttaaacttagcatatgtaatatttttgcaaaaatacgccgacgtactg 47692051  T
Q  218 tatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  47692052 tatattattatttgttgacataatgtattttattaatcat 47692091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Original strand, 10234230 - 10234472
Alignment:
Q  6 tatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaa-atatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattg 102  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10234230 tatgttatcttaaagttataagtgttgttataatttacatttgatatggaaaaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattg 10234329  T
Q  103 cacataacaattaaaatatttggat---ttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgca 198  Q
    |||||| | |||||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10234330 cacatagcgattaaagtatttggatttattatatttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcatatgtaatatttttgca 10234429  T
Q  199 aaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataat 241  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10234430 aaaatacgccgacgtactgtatattattatttgttgacataat 10234472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 1499 - 1724
Target Start/End: Original strand, 52918332 - 52918558
Alignment:
Q  1499 tcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatg 1598  Q
    ||||||| |||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  52918332 tcttcctactctacaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcgtatctttgatgaattgattgagg 52918431  T
Q  1599 catcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactc 1697  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  52918432 catcaacaatatcctccctcgatccttttcggactacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactt 52918531  T
Q  1698 atttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||    
T  52918532 gtttaggggatcattcttggacatgat 52918558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 396
Target Start/End: Original strand, 41221010 - 41221391
Alignment:
Q  16 aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaa---------ttttgtatatattttgaaatatctaaacattgcaca 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41221010 aagttataagtgcggttataatttaaatttgatatggaaaaaaatatcatcttaattttattaattttgtatatattttgaaatacctaaacattgcaca 41221109  T
Q  107 taacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatac 205  Q
    |||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  41221110 taaatattaaagtatttggatttatactta-actaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaatttaacatatgtaatatttttgcaaaaatac 41221208  T
Q  206 accgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtgtcaga 305  Q
     |  ||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||              |||||         || ||||||||| |||||||    
T  41221209 gcgaacgtactatatattattattttttgacataatgtattttattaatcataaaaactaaaaaaattgta--tttttttatataatagtcaatgtcaga 41221306  T
Q  306 tgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttg 396  Q
    ||||||||| ||||     |||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41221307 tgtatacacatagt-----aatgcaaacgttaaatatttta-gggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgattgttatttg 41221391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 241
Target Start/End: Original strand, 10230650 - 10230879
Alignment:
Q  16 aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaa-tatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaatt 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  10230650 aagttataagtgttgttataatttacatttgatatggaaaaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaac-ttgcacatagcgatt 10230748  T
Q  115 aaaatatttggatttat---acttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccga 210  Q
    ||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10230749 aaagtatttggatttattatatttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacatagcatatgtaatatttttgcaaaaatacgccga 10230848  T
Q  211 cgtactgtatattattatttgttaacataat 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10230849 cgtactgtatattataatttgttgacataat 10230879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10970328 - 10970066
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgt---------atatattttgaaatat 92  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||    
T  10970328 attatgttatcttaaagttataagtatggttataatttaaatttgatatgga-aaaaatatcatcttaattttgtttattttgtatatattttgaaatat 10970230  T
Q  93 ctaaacattgcacataacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatat 191  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10970229 ctaaacattgcacacaacgattaaagtatttggagttatagttatactaattatttgtagtataagatgtagtcattcttaaacttagcatatgtaatat 10970130  T
Q  192 ttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatc 255  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  10970129 ttttgcaaaaatacgtcgacatactgtatattattacttgttgacataatgtattttattaatc 10970066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 11361056 - 11361313
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 101  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11361056 attatgttatcttaaagttataattgtggttataatttaaatttgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatataatttgaaatatctaaacatt 11361154  T
Q  102 gcacataacaattaaaatatttggat--ttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgca 198  Q
    ||| ||||| || ||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  11361155 gcatataaccataaaagtatttggattattatatttgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacttaacatacgtaatatttttgca 11361254  T
Q  199 aaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    |||||||  |||||||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  11361255 aaaatacgtcgacgtactgtataataatatttgttgacaaaatgtattttattaatcat 11361313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 473 - 747
Target Start/End: Original strand, 41221455 - 41221735
Alignment:
Q  473 cgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgcttta 572  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  41221455 cgcgtattgttatacctgaaaagtgcatcaactaaaagtcaatggcaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtcctgtaatgaccagtacacctta 41221554  T
Q  573 caaagaaatttnnnnnnnn--cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattt 666  Q
    ||||||||||           |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| ||    
T  41221555 caaagaaattaaaaaaaaaaacgacttccaaacaatacgcaactttgattttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactt 41221654  T
Q  667 tttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaac 747  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  41221655 tttgaaaaacttcacgatacacaacatatgtggtctccttgcaaacattattatcttcatcgaagatgagcaacttcaaac 41221735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15329986 - 15329730
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 101  Q
    ||||||||||||  || |||||| |||| |||||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15329986 attatgttatcttaaaattataattgtg-ttataatttaaattcgatgtgaa-aaaaatataatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 15329889  T
Q  102 gcacataacaattaaaatatttggatt--tatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgca 198  Q
    ||| ||||| || ||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15329888 gcatataacgataaaagtatttggattgttatacttgtactaattatttgtagtataagatgtactccttgtcaaacttagcatatgtaatatttttgca 15329789  T
Q  199 aaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15329788 aaaatacgccgaggtactgtatattattatttgttgacataatgtattttattaatcat 15329730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Original strand, 10109399 - 10109650
Alignment:
Q  6 tatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaa-tatcatcttaa---------ttttgtatatattttgaaatatc 93  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||         |||||||||||||||||||||||    
T  10109399 tatgttatcttaaagttataagtgttgttataatttacatttgatatggaaaaaaaatatcatcttaattttgttaattttgtatatattttgaaatatc 10109498  T
Q  94 taaacattgcacataacaattaaaatatttggat---ttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaat 189  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10109499 taaacattgcacatagcgattaaagtatttggatttattatatttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcatatgtaat 10109598  T
Q  190 atttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataat 241  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10109599 atttttgcaaaaatacgccgatgtactgtatattattatttgttgacataat 10109650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 41764788 - 41764529
Alignment:
Q  4 attatgttatct---aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacat 100  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41764788 attatgttatcttaaaagttataattgtggttataatttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacat 41764690  T
Q  101 tgcacataacaattaaaatatttggat--ttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgc 197  Q
    || | ||||| || ||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41764689 tgtatataacgataaaagtatttggattattatacttgtactaattatttgttgtataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaatatttttgc 41764590  T
Q  198 -aaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
     |||||||| | ||| || |||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  41764589 aaaaaatacgctgacttaatgtataataatatttgttgacaaaatgtattttattaatcat 41764529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 257
Target Start/End: Original strand, 10108813 - 10109035
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatact 134  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  10108813 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatttggattattatact 10108911  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgtt 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||||||||| || || ||||||||    
T  10108912 tgtactaattatttgtagtataagatgcactcatttttaaacttagcatatgtaattttattgcaaaaatacgtcgacgtactgtgtaataatatttgtt 10109011  T
Q  234 aacataatatattttattaatcat 257  Q
     ||| ||| |||||||||||||||    
T  10109012 gacaaaatgtattttattaatcat 10109035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 257
Target Start/End: Original strand, 10230052 - 10230276
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatact 134  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  10230052 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatttggattattatact 10230150  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatattt--ttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttg 231  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||| || || ||||||    
T  10230151 tgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaattttttcttgcaaaaatacgtcgacgtactgtgtaataatatttg 10230250  T
Q  232 ttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    || ||| ||| |||||||||||||||    
T  10230251 ttgacaaaatgtattttattaatcat 10230276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 257
Target Start/End: Original strand, 23092356 - 23092599
Alignment:
Q  16 aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaatta 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |    
T  23092356 aagttataattgtggttataatttaaattcgatatgaa-aaatatataatcttatttttgtatatattttgaaatatctaaacactgcatataacgataa 23092454  T
Q  116 aaatatttggat--ttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacg 212  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  23092455 aaatatttggattattatacttgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaatcttagcatatgtaattttcttgcaaaaatacgccgacg 23092554  T
Q  213 tactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    |||||| || || |||||||| ||| ||  |||||| ||||||||    
T  23092555 tactgtgtaataatatttgttgacaaaacctattttcttaatcat 23092599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 309 - 627
Target Start/End: Original strand, 47692139 - 47692454
Alignment:
Q  309 atacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnnnnn 408  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||                 
T  47692139 atacacctagtctgtgaatgcaaacattaatttttttacaggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgctgattgttatttatttttatttttt 47692238  T
Q  409 acaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaa 508  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  47692239 acaaaaccaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaaccatgtaaaaaaaaagttccg--tattgttatacctaaaaagtgcatcaattaaa 47692336  T
Q  509 agtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnncgacttccaaacaatac 608  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||         ||||||||||||||||    
T  47692337 actcaatggcaggaggatctgcttatatagaaattacatgtcctgtaaggaccagtacgccttacaaagaaa-ttaaaaaaaaagacttccaaacaatac 47692435  T
Q  609 gcaactttagttttctaaa 627  Q
    | ||| |||||||||||||    
T  47692436 gtaacattagttttctaaa 47692454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 80 - 396
Target Start/End: Original strand, 52917633 - 52917946
Alignment:
Q  80 tattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaactta 179  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  52917633 tattttaaaatatctaaacattggacataacgattaaagtatttggagttatacttatactaattatttgtagtataagatttagtcattcttaaactta 52917732  T
Q  180 gcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtann 278  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||              |||||      
T  52917733 gcatatgtaatatttttgcaaaaaaacgtttacgtactgt-tattattacttgttgacataatgtattttattaatcataaaaactaaaaaatttgta-- 52917829  T
Q  279 nnnnnnnatgtaatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaa 378  Q
           || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||   |    
T  52917830 -ttttttatataatagtcaatgtcagatgtatacacctagtctgtgaatgcaaacgttaatttttttacgggtgtgtataaatatagtttgggttaatga 52917928  T
Q  379 aacgccgattgttatttg 396  Q
    || |||||||||||||||    
T  52917929 aatgccgattgttatttg 52917946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 257
Target Start/End: Original strand, 31646 - 31867
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatact 134  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  31646 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatct-aattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatttggattattatact 31743  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgtt 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||| || || ||||||||    
T  31744 tgtactaattatttgtagtataagatgcacttattgttaaacttagcatatgtaattttctttcaaaaatacgccgacgtactgtgtaataatatttgtt 31843  T
Q  234 aacataatatattttattaatcat 257  Q
     ||| ||| |||||||||||||||    
T  31844 gacaaaatgtattttattaatcat 31867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 257
Target Start/End: Original strand, 27273239 - 27273461
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatact 134  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  27273239 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttatatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatttggattattatact 27273337  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgtt 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||    
T  27273338 tgtactaattatttgtagtataagatacattcattgttaaacttagtatatgtaattttcttgcaaaaatacgccgacgtactgtgtaataatatttgtt 27273437  T
Q  234 aacataatatattttattaatcat 257  Q
     ||| ||| |||||||||||||||    
T  27273438 gacaaaatgtattttattaatcat 27273461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 257
Target Start/End: Original strand, 10233647 - 10233869
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatact 134  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  10233647 tttaaattcgatatgaa-aaaaatattatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatttggattattatact 10233745  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgtt 233  Q
    | || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||    
T  10233746 tgtaataattatttgtagtataagatgcaatcattgttaaacttagcatatgcaattttcttgcaaaaatacgtcgacggactgtgtaataatatttgtt 10233845  T
Q  234 aacataatatattttattaatcat 257  Q
     ||| ||| |||||||||||||||    
T  10233846 gacaaaatgtattttattaatcat 10233869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Original strand, 10040888 - 10041078
Alignment:
Q  19 ttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaa-tatcatcttaattttgtatatattttgaaatat--ctaaacattgcacataacaatta 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||    
T  10040888 ttataagtgtggttataatttaaatttcacatgaaaaaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatgtctaaacattgcacataaggatta 10040987  T
Q  116 aaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatac 205  Q
    || ||||||||||||||||||||  |  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10040988 aagtatttggatttatacttataaaatatatctgtagtataagatgtacttattgttaaacttagcatatgtaatattttggcaaaaatac 10041078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 289 - 550
Target Start/End: Original strand, 10109070 - 10109333
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10109070 taatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacaccgatt 10109169  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt--nnnnnnnnngttccgcgtattgttata 486  Q
    ||||||||            ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||           |||||||| ||||||| |    
T  10109170 gttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtgtaatgtaaataatgtattttagggtaacaatgatgtaaaaaaaaaatgttccgcggattgttaaa 10109269  T
Q  487 cttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtc 550  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  10109270 cctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatgacaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtc 10109333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 297 - 395
Target Start/End: Original strand, 9999514 - 9999612
Alignment:
Q  297 agtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttattt 395  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9999514 agtgtcagatgtatacatctagtctgtgaatgcaaacgttaaattttttacgggtgtatataaatatagtttgggctacagaaacgccgattgttattt 9999612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 289 - 550
Target Start/End: Original strand, 10233899 - 10234164
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaatttttt-acggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgat 387  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | |||  ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10233899 taatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatataaacgtttaatttttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacaccgat 10233998  T
Q  388 tgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt---nnnnnnnnngttccgcgtattgtta 484  Q
    |||||||||            ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||            |||||||| |||||||    
T  10233999 tgttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaatgatgtaaaaaaaaaaaggttccgcggattgtta 10234098  T
Q  485 tacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtc 550  Q
     || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  10234099 aacctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatgacaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtc 10234164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 299 - 550
Target Start/End: Original strand, 10230319 - 10230572
Alignment:
Q  299 tgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnn 398  Q
    ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||      
T  10230319 tgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacaccgattgttatttgtt 10230418  T
Q  399 nnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt--nnnnnnnnngttccgcgtattgttatacttgaaaagt 496  Q
              ||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||           |||||||| ||||||| || ||||||||    
T  10230419 tttaatttttacagaacaaatggtctaatgtaaatattgctttttagggtaacaatgatgtaaaaaaaaaaggttccgcggattgttaaacctgaaaagt 10230518  T
Q  497 gcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtc 550  Q
    |||| |||||| ||| |||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  10230519 gcatgaattaatagttaatgacaggaggatctgcttatatagaaattacatgtc 10230572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 289 - 396
Target Start/End: Original strand, 10041148 - 10041255
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10041148 taatagtcggtgtcaaatgtagacacttagtcggtgaatgcaaacgttaaattttttacatgtgtgtgtaaatatagtttgggctacagaaacgctgatt 10041247  T
Q  389 gttatttg 396  Q
    ||| ||||    
T  10041248 gttctttg 10041255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 76
Target Start/End: Original strand, 46912158 - 46912232
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgt 76  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  46912158 attatgttatcttaaagttataagtgtggttataatttaaatttgatatgggaaaaaatatcatcttaattttgt 46912232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 74
Target Start/End: Original strand, 52916764 - 52916836
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaatttt 74  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52916764 attatgttatcttaaatttataagtgtggttataatttaaatttgatatggaaaaaaatatcatcttaatttt 52916836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 289 - 396
Target Start/End: Original strand, 23092632 - 23092739
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||    ||||||||| || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23092632 taatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggcaaatgcaaacctttaattttctacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgatt 23092731  T
Q  389 gttatttg 396  Q
    ||||||||    
T  23092732 gttatttg 23092739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 289 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 10970033 - 10969971
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10970033 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtatgtgaatgcaaacgttaatttttttacggat 10969971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 417 - 550
Target Start/End: Original strand, 9999015 - 9999153
Alignment:
Q  417 aatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn-----gttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagt 511  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||              |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||    
T  9999015 aatggtgtaatgtaaatattgtattttagggtaacaatgatgtaaaaaaaaaaaaaggttccgcggattgttaaacctgaaaagtgcatgaattaatagt 9999114  T
Q  512 caatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtc 550  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  9999115 caatgacaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtc 9999153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 479 - 574
Target Start/End: Original strand, 10041312 - 10041407
Alignment:
Q  479 ttgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttaca 574  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || || ||||| ||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||| || |||||    
T  10041312 ttgttatacctgaaaagttcatcaattaaaagtcaattgtagaaggatctgtttatataaaaattgcatgtcatgtaatgaccagtaagccttaca 10041407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 840 - 874
Target Start/End: Original strand, 20777761 - 20777795
Alignment:
Q  840 tgacccttacttttatttattgtcattgcaaaaca 874  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20777761 tgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaaca 20777795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 840 - 874
Target Start/End: Original strand, 35685133 - 35685167
Alignment:
Q  840 tgacccttacttttatttattgtcattgcaaaaca 874  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35685133 tgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaaca 35685167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 840 - 874
Target Start/End: Complemental strand, 38356508 - 38356474
Alignment:
Q  840 tgacccttacttttatttattgtcattgcaaaaca 874  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38356508 tgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaaca 38356474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 840 - 874
Target Start/End: Original strand, 55368943 - 55368977
Alignment:
Q  840 tgacccttacttttatttattgtcattgcaaaaca 874  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55368943 tgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaaca 55368977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 895; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 895; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1724
Target Start/End: Original strand, 27508466 - 27509906
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27508466 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtttgtgaatgcaaacgttaaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgatt 27508565  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn-gttccgcgtattgttatac 487  Q
    ||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||     
T  27508566 gttatttgtttttattttttacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaaagttccgcgtattgttatag 27508665  T
Q  488 ttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnn 587  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||         
T  27508666 ctgaaaagtgcatca-ttaaaagtcaatggcaagaggatctgcttatatagaaattgcatgtcctataatgaccattacgtcttacaaagaaatt-aaaa 27508763  T
Q  588 nnnncgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacga 683  Q
        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27508764 aaaacaacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcacga 27508863  T
Q  684 tacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacataga 783  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27508864 tacacaacatttgtggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgggtagcttcaaaccttttctaaaagtaactcgagagacagcgacataga 27508963  T
Q  784 gttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaa 883  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27508964 gttgtccatgcgtgaacacgggcttaggaatataaactcccactcgagataaagattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaa 27509063  T
Q  884 tgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctgta 982  Q
    || ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27509064 tggaaattgcatgttcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcagaataagattcatcctgggaatgaataccctcgtacctgccctttttcctgta 27509163  T
Q  983 attacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataa 1082  Q
    | || ||||||| ||||| ||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  27509164 actatggtagcagctatcgtgctcttccctagatgagtgactatcagcctcgtaccattacacagtccattggcctgatcgatgtttctcatcaacataa 27509263  T
Q  1083 ttggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcaga 1182  Q
     ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  27509264 ctggacatcccacccttattttcaaccggtgatttgaaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctttggacattaga 27509363  T
Q  1183 attttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatca 1282  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27509364 attttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatca 27509463  T
Q  1283 agcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggat 1382  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  27509464 agcgttgatgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcaggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgatatcaacgaat 27509563  T
Q  1383 ttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactc 1482  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||     
T  27509564 ttgttgtgtccgacatgagcaaatctttaggaatttctaccttcatctcaccattctcatctgaagcgtcgttgctgtctccaattgagagtatctactt 27509663  T
Q  1483 gccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatcttt 1582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  27509664 gccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtagcaaagatgcacccaatcttatattaacagtaagcctcaatacattacaataagcccatatcttt 27509763  T
Q  1583 gatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccac 1681  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27509764 gatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgtctcgttcctttttggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactgtcattccac 27509863  T
Q  1682 caaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27509864 caaaatgtctaaactcatttaggggatcattcttggacatgat 27509906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 787; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 303 - 1643
Target Start/End: Complemental strand, 17684934 - 17683597
Alignment:
Q  303 agatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnn 402  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||     |||||||||||  |||||||||||||||||||          
T  17684934 agatgtatacacctaatttgtgaatgcaaacgttaaattttttacgggtgtgtataa-----gtttgggctactgaaacgccgattgttatttgttttat 17684840  T
Q  403 nnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn---gttccgcgtattgttatacttgaaaagtgca 499  Q
          |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||            ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  17684839 t-----acaaaatcaatggtctaatgcaaatattgtattttaggttaacaacgatgtaaaaaaaaaatagtttcgcgtattgttatacctgaaaagtgca 17684745  T
Q  500 tcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnncgacttcc 599  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||          |||||||    
T  17684744 tcatttaaaagtcaatggcaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtcctgtaatgaccagtacgccttacaaagaaattaaaaaaat--gacttcc 17684647  T
Q  600 aaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacattt 695  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  17684646 aaacaatgcacaactttagttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcacgacacacaacatat 17684547  T
Q  696 ttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattca 795  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |     
T  17684546 gtggtctccttgcaaacattattatattcatccaagatgagcagcttcaaaccttttctagaagtaactcgagagacaatgacatagagttgtccatgcg 17684447  T
Q  796 tgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcat 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  17684446 tgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaagattgaccctgacttttatttatcgtcattgcaaaacaaaacgtcaatggaaattgcat 17684347  T
Q  896 gcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatctt-ggaatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagca 994  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  17684346 gcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcagaataagattcatccaaggaatgaacaccctggtactttccctttttcatgtaattacgttagca 17684247  T
Q  995 actatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatccta 1094  Q
     | ||| || |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  17684246 gcaatcgtggtcttccctagatgtgtaactgttagcctcgtaccattacacagtccattgacctgatcgatgtttctcatcagcataactggacatccca 17684147  T
Q  1095 cccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccga 1194  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||    
T  17684146 cccttagtttcaaccggtgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcactttggacatcaaaattttcacccga 17684047  T
Q  1195 tcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcg 1294  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  17684046 tcgacaaacaaaatcatagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaattgaatcaagcgttggagcg 17683947  T
Q  1295 agtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcg 1394  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |     
T  17683946 agtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtcca 17683847  T
Q  1395 atatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagc 1494  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  17683846 atatgagcgaatattcaggaatttctaccttcattttaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagc 17683747  T
Q  1495 aatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgatt 1594  Q
    |||||||||||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17683746 aatttcttcctgctctacaggtatcgaagatgcacccaatctcatattaacaataagccttaacacattacaataagctcatatctttgatgaattgatt 17683647  T
Q  1595 gatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatat 1643  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17683646 gaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaagcaatat 17683597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 751; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1724
Target Start/End: Original strand, 21394454 - 21395902
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||    ||||||||| || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  21394454 taatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggcaaatgcaaacctttaattttctacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccaatt 21394553  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn---gttccgcgtattgttat 485  Q
    ||||||||            ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||  || ||||     
T  21394554 gttatttgttgttaatttttacagaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaaaaggttccgcagatagttaa 21394653  T
Q  486 acttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnn 585  Q
    || |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||||||| |||| || ||||||||||       
T  21394654 acctgaaaagtgcattaattaatagtaaatggcaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagcacgccttgcaaagaaattaaa 21394752  T
Q  586 nnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataa----ccaatgatcatattttttgaaaaac 676  Q
           ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||  |    ||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||    
T  21394753 aataaaacgacttccaaacaatagccaactttggttttataaattatagcaacaacaattctaaaacataattaaccaatgatcatactttttgaaaaac 21394852  T
Q  677 ttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacg 776  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  21394853 ttcacgatacacaacatttgtggtctccttgcaaacattattatcttcatccaggatgagcagcttcagaccttttcttgaagttactcgagagacagcg 21394952  T
Q  777 acatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaa 876  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21394953 acatagagttgtccatgcgtgaacacaggcttaggaagataaacccccactcgagataaagattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaacaaa 21395052  T
Q  877 gcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttt 975  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  21395053 gcgtcaatggaaattgcctgcgcttgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcctgggaatgaatacgctggtacctgccctttt 21395152  T
Q  976 tcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcata 1075  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||     
T  21395153 tcctgtaattacggtagcagctatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagcctagtaccattacacagtccattggcctgatctatgtttctcatc 21395252  T
Q  1076 agcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctgga 1175  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  21395253 agcataactggacatcccacctttagcttcaacctgtgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccggcgtgaaccactcgctttgga 21395352  T
Q  1176 catcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaac 1275  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| |||||||||    
T  21395353 catcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaac 21395452  T
Q  1276 tgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatc 1375  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  21395453 tgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatatacaaagtctataagcgacatc 21395552  T
Q  1376 aacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagta 1475  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  21395553 aacggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagta 21395652  T
Q  1476 tgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcaca 1575  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  21395653 tccacttgccgaaattagcaatttcttcctgatctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagccca 21395752  T
Q  1576 tatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtc 1674  Q
    || |||||| |||||||  || ||||||||||| ||| |||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  21395753 taactttgacgaattgacggaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactacggtc 21395852  T
Q  1675 attccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    ||||||||||||||| ||| | | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21395853 attccaccaaaaggtttaagcgcgtttaggggatcattcttggacatgat 21395902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 712; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 651 - 1724
Target Start/End: Original strand, 27191946 - 27193021
Alignment:
Q  651 accaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacatt 750  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27191946 accaatgatcatactttctgaaaaacttcacgatacacaacatttgtggtctccttgcaaacattattatattcatccaagatgagcagcttcaaacctt 27192045  T
Q  751 ttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttact 850  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  27192046 ttctagaagtaactcgagagacagcgacatagagttgtccatgcgtgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaagattgaccctaact 27192145  T
Q  851 tttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttg-ga 949  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  27192146 ttttttcattgtcattgcaaaacaaagcgtcgatggaaattgcatgcacctgaatttcaagtgtagtcctggatcactcggaataagattcatcatgtga 27192245  T
Q  950 atgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaatt 1049  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |     
T  27192246 atgaataccatggtacctgccctttctcctgtaattacggtagcagttatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagcctcgtaccattacacagtc 27192345  T
Q  1050 cattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaa 1149  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27192346 cattggcctgatcgatgtttctcatcagcatagccggacatcccacccttggtttcaaccggtgatttggaatttcagagctcttaataccattaagaaa 27192445  T
Q  1150 ttccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaa 1249  Q
    |||  |||||||  ||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||     
T  27192446 ttctattgtgaaatactcgctttggacatcaaaaatttcacccgatcgacaaatagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgac 27192545  T
Q  1250 attatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgg 1349  Q
    || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27192546 atcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagagggtcaccaaggttatcattcaaatcgg 27192645  T
Q  1350 gatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagc 1449  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27192646 gatacacaaagtctataagtgacatcaacagatttgttgtgtccgatatgagcaaatctttaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagc 27192745  T
Q  1450 gtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagta 1549  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||| |||| | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||||||| |     
T  27192746 gtcgttgccgtcaccagttgagagtatccacttgtcaaaattatgaatttcttcctgctctacaggtatcaaagatgcacccaatctcatattaacaatc 27192845  T
Q  1550 agcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcc 1648  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27192846 agcctcaacaaattacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcc 27192945  T
Q  1649 tgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  27192946 tgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttgtacatgat 27193021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 712; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 651 - 1724
Target Start/End: Original strand, 27841760 - 27842835
Alignment:
Q  651 accaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacatt 750  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27841760 accaatgatcatactttctgaaaaacttcacgatacacaacatttgtggtctccttgcaaacattattatattcatccaagatgagcagcttcaaacctt 27841859  T
Q  751 ttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttact 850  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  27841860 ttctagaagtaactcgagagacagcgacatagagttgtccatgcgtgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaagattgaccctaact 27841959  T
Q  851 tttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttg-ga 949  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  27841960 ttttttcattgtcattgcaaaacaaagcgtcgatggaaattgcatgcacctgaatttcaagtgtagtcctggatcactcggaataagattcatcatgtga 27842059  T
Q  950 atgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaatt 1049  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |     
T  27842060 atgaataccatggtacctgccctttctcctgtaattacggtagcagatatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagcctcgtaccattacacagtc 27842159  T
Q  1050 cattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaa 1149  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27842160 cattggcctgatcgatgtttctcatcagcatagccggacatcccacccttggtttcaaccggtgatttggaatttcagagctcttaataccattaagaaa 27842259  T
Q  1150 ttccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaa 1249  Q
    |||  |||||||  ||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||     
T  27842260 ttctattgtgaaatactcgctttggacatcaaaaatttcacccgatcgacaaatagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgac 27842359  T
Q  1250 attatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgg 1349  Q
    || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27842360 atcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagagggtcaccaaggttatcattcaaatcgg 27842459  T
Q  1350 gatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagc 1449  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27842460 gatacacaaagtctataagtgacatcaacagatttgttgtgtccgatatgagcaaatctttaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagc 27842559  T
Q  1450 gtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagta 1549  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||| |||| | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||||||| |     
T  27842560 gtcgttgccgtcaccagttgagagtatccacttgtcaaaattatgaatttcttcctgctctacaggtatcaaagatgcacccaatctcatattaacaatc 27842659  T
Q  1550 agcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcc 1648  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27842660 agcctcaacaaattacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcc 27842759  T
Q  1649 tgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  27842760 tgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttgtacatgat 27842835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 670; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 749 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 24269734 - 24268757
Alignment:
Q  749 ttttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgaccctta 848  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  24269734 ttttctagaagtaactcgagagacagcgacatagagttgcccatgcgtgaacacatgcttaggaagataaactcccactcgagataaagattgaccctga 24269635  T
Q  849 cttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatctt-g 947  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  24269634 cttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaattatctgcgcatgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcctag 24269535  T
Q  948 gaatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaa 1047  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  24269534 gaatgaataccttagtacctgccctttttcctgtaattacggtagcagctatcgtggtcttccctagatgtgtaactgtcagcctcgtaccattacacag 24269435  T
Q  1048 ttcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaaga 1147  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24269434 tccattggcctgatcgatgtttctcatcagcataactggacatcccacctttagtttcaaccggtgatttggaattccagagctcttaataccattaagg 24269335  T
Q  1148 aattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtg 1247  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24269334 aattccgttgtgaaccactcactttggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagtg 24269235  T
Q  1248 aaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatc 1347  Q
    | || |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24269234 acatcatatattcgttaacatgttcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatc 24269135  T
Q  1348 gggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaa 1447  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24269134 gagatacacaaagtctataagtgacatcaacagatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaa 24269035  T
Q  1448 gcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacag 1547  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||     
T  24269034 gcgttgttgccgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatcgcatattaacaa 24268935  T
Q  1548 taagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctg 1646  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24268934 taagcgtcaacacattaaaataagcacatatctgtgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctg 24268835  T
Q  1647 cctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24268834 cctgatatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaatggtttaaacttgtttaggggatcattcttggacatgat 24268757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 637; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 1649
Target Start/End: Complemental strand, 28667563 - 28665945
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaa-tatttggatt--tatac 133  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||    
T  28667563 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttcattttgtatatattttaaaatatctaaacattgcatataacgataaaaaatatttggattattatac 28667465  T
Q  134 ttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgt 232  Q
    || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||| || || |||||||    
T  28667464 ttgtactgattatttgtagcataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaattttcttgcaaaaatacgccgacgtactgtgtaataatatttgt 28667365  T
Q  233 taacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaa 332  Q
    | ||| ||| |||||||||||||||               ||||         || ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | ||||||||    
T  28667364 tgacaaaatgtattttattaatcataaaaactaaaaaatatgtatttttttttatataatagtcattgtcaaatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaa 28667265  T
Q  333 cgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaa 432  Q
    |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||            ||||||  |||||| |||||||||    
T  28667264 cgtttaattttttacgggtgtgtatagatatagtttgggctacagaaatgccgattgttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtgtaatgtaaa 28667165  T
Q  433 tattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn-------gttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagta 525  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||                ||| | || ||||||| || | |||||||||| |||||| |||||||| |||||| |    
T  28667164 tattgtgttttggggtaacaacgatgtaaaaaaaaaaaaaaaggtttcacggattgttaaacctaaaaagtgcatgaattaatagtcaatgacaggagga 28667065  T
Q  526 tctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttct 624  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||          |||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28667064 tctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccggtacgccttacaaagaaattaaaaataaaacgacttccaaacaataggcaactttagttttat 28666966  T
Q  625 aaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattat 720  Q
    | ||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  28666965 atattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcacgatacacaacatttgtggtctccttacaaacattattat 28666866  T
Q  721 cttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaac 820  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || |||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||    
T  28666865 cttcatccaggatgagcagcttcagaccttttcatgaagttactcgagagacaacgacataaagttgtctatgcgtgaacacaggcttaggaagataaac 28666766  T
Q  821 tcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcct 920  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  28666765 ccccacccgagataaagattgacc-tagcttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaattgtctgcgtctgaatttgaagggtagtcct 28666667  T
Q  921 ggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcct-gtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgt 1018  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||    
T  28666666 ggatcattcggaataagattcatcctgggaatgaataccctagtacctgccctttttccttgtaattacggtagcagttatcgtgctcttccctagatgt 28666567  T
Q  1019 gtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctaccctt-agtttcaaccggtcattt 1117  Q
     ||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| || |||||||||| || ||||    
T  28666566 ataactgtcagcctagtaccattacacagtccattggcctgatcgatgtttctcaacagcataactggacatcccaccttttagtttcaacctgtgattt 28666467  T
Q  1118 ggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagctta 1217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | ||| |||||||||| |||    
T  28666466 ggaattccagagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacctgatctaaaaatagaatcagaggtta 28666367  T
Q  1218 aatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaa 1317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | || || ||| || |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28666366 aatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaattgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaaaaa 28666267  T
Q  1318 tagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatt 1417  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  28666266 tagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacagagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtttgatatcagcaaatcttcaggaatt 28666167  T
Q  1418 tctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggta 1517  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28666166 tctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgtaggta 28666067  T
Q  1518 ctgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcct 1616  Q
    | || ||||||  ||||           || ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||  || |    
T  28666066 ccgaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaataagtccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatctggcat 28665978  T
Q  1617 cgatccttttcggacaacatgcaatatctgcct 1649  Q
    || ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  28665977 cgttcctcctcagacaacatgcaatatctgcct 28665945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 637; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 1649
Target Start/End: Complemental strand, 37826397 - 37824779
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaa-tatttggatt--tatac 133  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||    
T  37826397 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttcattttgtatatattttaaaatatctaaacattgcatataacgataaaaaatatttggattattatac 37826299  T
Q  134 ttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgt 232  Q
    || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||| || || |||||||    
T  37826298 ttgtactgattatttgtagcataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaattttcttgcaaaaatacgccgacgtactgtgtaataatatttgt 37826199  T
Q  233 taacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaa 332  Q
    | ||| ||| |||||||||||||||               ||||         || ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | ||||||||    
T  37826198 tgacaaaatgtattttattaatcataaaaacgaaaaaatatgtatttttttttatataatagtcattgtcaaatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaa 37826099  T
Q  333 cgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaa 432  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||            ||||||  |||||| |||||||||    
T  37826098 cgtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaatgccgattgttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtgtaatgtaaa 37825999  T
Q  433 tattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn-------gttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagta 525  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||                ||| | || ||||||| || | |||||||||| |||||| |||||||| |||||| |    
T  37825998 tattgtgttttggggtaacaacgatgtaaaaaaaaaaaaaaaggtttcacggattgttaaacctaaaaagtgcatgaattaatagtcaatgacaggagga 37825899  T
Q  526 tctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttct 624  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||          |||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  37825898 tctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccggtacgccttacaaagaaattaaaaataaaacgacttccaaacaataggcaactttagttttat 37825800  T
Q  625 aaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattat 720  Q
    | ||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  37825799 atattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcacgatacacaacatttgtggtctccttacaaacattattat 37825700  T
Q  721 cttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaac 820  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || |||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||    
T  37825699 cttcatccaggatgagcagcttcagaccttttcatgaagttactcgagagacaacgacataaagttgtctatgcgtgaacacaggcttaggaagataaac 37825600  T
Q  821 tcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcct 920  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  37825599 ccccacccgagataaagattgacc-tagcttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaattgtctgcgtctgaatttgaagggtagtcct 37825501  T
Q  921 ggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcct-gtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgt 1018  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||    
T  37825500 ggatcattcggaataagattcatcctgggaatgaataccctagtacctgccctttttccttgtaattacggtagcagttatcgtgctcttccctagatgt 37825401  T
Q  1019 gtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctaccctt-agtttcaaccggtcattt 1117  Q
     ||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| || |||||||||| || ||||    
T  37825400 ataactgtcagcctagtaccattacacagtccattggcctgatcgatgtttctcaacagcataactggacatcccaccttttagtttcaacctgtgattt 37825301  T
Q  1118 ggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagctta 1217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | ||| |||||||||| |||    
T  37825300 ggaattccagagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacctgatctaaaaatagaatcagaggtta 37825201  T
Q  1218 aatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaa 1317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | || || ||| || |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  37825200 aatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaattgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaaaaa 37825101  T
Q  1318 tagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatt 1417  Q
    |||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  37825100 tagttggtcaccaaggttatcatttagatcgggatacacagagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtttgatatcagcaaatcttcaggaatt 37825001  T
Q  1418 tctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggta 1517  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37825000 tctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgtaggta 37824901  T
Q  1518 ctgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcct 1616  Q
    | || ||||||  ||||           || ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||  || |    
T  37824900 ccgaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaataagtccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatctggcat 37824812  T
Q  1617 cgatccttttcggacaacatgcaatatctgcct 1649  Q
    || ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  37824811 cgttcctcctcagacaacatgcaatatctgcct 37824779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 636; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 1649
Target Start/End: Complemental strand, 41921543 - 41919946
Alignment:
Q  55 aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaa-tatttggatt--tatacttatactaattatttgta 151  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  41921543 aaaaatatcatcttcattttgtatatattttaaaatatctaaacattgcatataacgataaaaaatatttggattattatacttgtactaattatttgta 41921444  T
Q  152 gtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttat 250  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||| | | ||| ||||||||    
T  41921443 gcataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaattttcttgtaaaaatacgccgacgtactgtgtaataatatttgttgatagaatgtattttat 41921344  T
Q  251 taatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacgga 350  Q
    |||||||               ||||         || ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||| ||||||| ||||     
T  41921343 taatcataaaaactaaaaaatatgtatttttttttatataatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaattttt-acggg 41921245  T
Q  351 tgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaa 450  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||            ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41921244 tgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgattgttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaa 41921145  T
Q  451 caacgatgtnnnnnnnnn----gttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttca 546  Q
    |||||||||             ||| | || ||||||| || |||||||||||| || ||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||    
T  41921144 caacgatgtaaaaaaaaaaaaggtttcacggattgttaaacctgaaaagtgcatgaactaatagtcaatgacaggaggatctgcttatatagaaattgca 41921045  T
Q  547 tgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tc 641  Q
    |||| | |||||||| |||||| |||||||||||||          |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  |    ||    
T  41921044 tgtc-tataatgaccggtacgccttacaaagaaattaaaaataaaacgacttccaaacaataggcaactttagttttatatattatagcaacaacaattc 41920946  T
Q  642 taaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtt 741  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  41920945 taaaacataaccgatgatcatactttttaaaaaacttcacgatacacaacatttgtggtctccttacaaacattattatcttcatccaggatgagtagct 41920846  T
Q  742 tcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattg 841  Q
    ||| || |||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  41920845 tcagaccttttcatgaagttactcgagagacagcgacataaagttgtctatgcgtgaacacaggcttaggaagataaacccccacccgagataaagattg 41920746  T
Q  842 acccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattc 941  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41920745 accctggcttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaattgtctgcgtctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattc 41920646  T
Q  942 at-cttggaatgaataccctggtaccttccctttttcc-tgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatca 1039  Q
    || || |||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| ||    
T  41920645 atcctgggaacgaataccctagtacctgccctttttccttgtaattacggtagcagttatcgtgctcttccctagatgtataactgtcagcctagtacca 41920546  T
Q  1040 ttacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaatac 1139  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  41920545 ttacacagtccattggcctgatcgatgtttctcaacagcataactggacatcccacctttagtttcaacctgtgatttggaattccagagctcttaatac 41920446  T
Q  1140 cattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctgg 1239  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  41920445 cattaagaaattctggtgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttatcttcacctgg 41920346  T
Q  1240 aatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatca 1339  Q
    ||||   || || ||| || |||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  41920345 aatcaacgacatcataaattcgttaacatgcttaattgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatca 41920246  T
Q  1340 ttcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattct 1439  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41920245 ttcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgt 41920146  T
Q  1440 catctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcat 1539  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  | ||||||  ||||         
T  41920145 cacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattatcaatttcttcctgctctacaggtaccaaagatgcatccaat----- 41920051  T
Q  1540 attaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgc 1638  Q
          || ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| |   |||||| ||||  |||||||||| ||    
T  41920050 ------agcaagcctcaaaacattacaataagtccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatatggcctcgttcctcctcggacaacaggc 41919957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 435 - 1370
Target Start/End: Original strand, 35608920 - 35609862
Alignment:
Q  435 ttgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaa 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||         ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  35608920 ttgtattttagggtaacaacgatgtaagaaaaa-gtttcgcgtattgttatacctgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggaggatctgcttat 35609018  T
Q  535 atataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnnc-gacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatgg 633  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||            |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  35609019 atagaaattgcatgtcatgtaatgaccagtacgccttacaaagaaataaaaaaaaaaaagacttccaaacaatacacaactttagttttctaaattatag 35609118  T
Q  634 caatga-----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacga-tacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatc 727  Q
    |||| |     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  35609119 caataacaaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcatgaatacacaacatttgtggtctccttgcaaaagttattatcttcatc 35609218  T
Q  728 caagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccact 827  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35609219 caagatgagcagcttcaaaccttttctagaagtaactcgagagacagcaacatagagttgtccatgcgtgaacacgggcttaggaagataaactcccact 35609318  T
Q  828 cgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcac 927  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  35609319 cgagataaacattgaccttgacttttatttattgtcattgcaaaacaaaatgtcaatggaaattgcaagcgtctgaatttgaagggtagtcatagatcac 35609418  T
Q  928 tcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaacttt 1026  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| |    
T  35609419 tcggaataagattcatcttgggaatgaataccctggtacctgccctttttcttgtaattacggtagcagctatcgtgctcttccctagacgtgtaactgt 35609518  T
Q  1027 cagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattcca 1126  Q
    |||||||||| || |||||| | |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  35609519 cagcctcgtaccactacacagtccattggcctgatcaatgtttctcatcagcataactggacatccaacccttagtttcaaccagtgatttggaattcca 35609618  T
Q  1127 gagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctt 1226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35609619 gagctcttaataccattaagaaattctgttgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcactcgatcgacaaacataatcagagcttaaatactctt 35609718  T
Q  1227 tctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtc 1326  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  35609719 tctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatactcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtc 35609818  T
Q  1327 accaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtg 1370  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35609819 accaatgttatcattcaaatcggaatacacaaagtctataagtg 35609862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 531; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 1125
Target Start/End: Original strand, 24244666 - 24245784
Alignment:
Q  4 attatgttatct-aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaatttt---------gtatatattttgaaatatc 93  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||         |||||||||||||||||||    
T  24244666 attatgttatcttaaattataagtgtggttataatttaaatttgatatgga----aatatcatcttaattttattaattttgtatatattttgaaatatc 24244761  T
Q  94 taaacattgcacataacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatt 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24244762 taaacattgcacataacgattaaagtatttggatttatacttatactaattatttgtagtataaaatatactcattgttaaacttagcatatgtaatatt 24244861  T
Q  193 tttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaat 292  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||              |||||         |||  ||    
T  24244862 tttgcaaaaatacgccgaggtactgtgtattattatttgttgacataatgtat---attaatcataaaacctaaaaaatttgtatttttttatatg--at 24244956  T
Q  293 agtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgtta 392  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24244957 agtcagtgttagatgtatacacctaatctgtgaatgcaaacgttaaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacaaaaatgccgattgtta 24245056  T
Q  393 tttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnng---ttccgcgtattgttatactt 489  Q
    |||             |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||      
T  24245057 ttt------attttttacaaaaccattggtctaatgtaaatatcgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaataaaattccgcgtattgttataccc 24245150  T
Q  490 gaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnn 589  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||| |||| ||||||| || |||||||| |||||||||||             
T  24245151 tgaaagtgcatcaattaaaagtcaaaggcagaaggatctgcttatatagaaattgcatgccctgtaacgatcagtacgccttacaaagaaa--------a 24245242  T
Q  590 nncgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgata 685  Q
        |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24245243 aaaaacttccaatcaatacacaactttagttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcacgata 24245342  T
Q  686 cacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagt 785  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24245343 cacaacatttgtggtctccttgcaaacattattatcttcatcctagatgagcagcttcataccttttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagt 24245442  T
Q  786 tgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactc-gagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaat 884  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24245443 tgcccatgcatgaacacgggcttaggaagataaattcccactcggaaacaaagattgaccctaacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaat 24245542  T
Q  885 gaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcat-cttggaatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaa 983  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | || |||||||| |||    
T  24245543 ggaaattgcatgcgcctgaatttgaagggcagtcctggatcactcggaataagattcatcctgggaatgaataccctggtacatgccttttttcctataa 24245642  T
Q  984 ttacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataat 1083  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  24245643 ttacggtagcagctatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagcctcgtaccattacacagtccattggcctgatcgatgtttctcatcagcataac 24245742  T
Q  1084 tggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattcc 1125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24245743 tggacatcccacccttagtttcaaccggtgatttggaattcc 24245784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1180 - 1724
Target Start/End: Original strand, 24245812 - 24246357
Alignment:
Q  1180 agaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaa 1279  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||||||||    
T  24245812 agaattttcacccgatcgacaaacagaatcagatcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaa 24245911  T
Q  1280 tcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacg 1379  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  24245912 tcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttgaaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaggtctataagtgacatccacg 24246011  T
Q  1380 gatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgca 1479  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| || ||    
T  24246012 gatttgttgtgtccgttatgagcaaatctttaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccaaagcgtcgttgccgtctccaattgagagaatcca 24246111  T
Q  1480 ctcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatc 1579  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24246112 catgccaacattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagattcac-caatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagcccatatc 24246210  T
Q  1580 tttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatcc-ttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcatt 1677  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||    
T  24246211 tttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcatcattcctttttcggacaacatgcaatatctgccttaaatcaccacctaaaactactatgatt 24246310  T
Q  1678 ccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24246311 ccaccaaaaggtctaaactcatttaggggatcattcttggacatgat 24246357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 40489107 - 40488282
Alignment:
Q  16 aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgt---------atatattttgaaatatctaaacattgcaca 106  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40489107 aagttataagtgttattataatttaaatttgatatggaaaaacatatcatcttaattttgttaattttgtatatatttttaaatatctaaacattgcaca 40489008  T
Q  107 taacaattaaaatatttggatttat---acttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaa 202  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  40489007 taacgattaaagtatttagatttattatacttatactaattatttgtagtataagatatactcattgttaaacttaacatatgtaatatttttgcaaaaa 40488908  T
Q  203 tacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtgtc 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||              |||||         || ||||||| ||||||    
T  40488907 tacgccgacgtactgtatattattatttgttgacataatgtat---attaatcataaaaattaaaaaatttgtatttttttt-atataatagtgagtgtc 40488812  T
Q  303 agatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnn 402  Q
    ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||           
T  40488811 agatgtaaacatctattctgtgaatgcaaacgttaaattttttacgggtgtgtacaaatatagtttgggctacagaaacgttgattgttatttattttta 40488712  T
Q  403 nnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatca 502  Q
          |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40488711 ttttttacaaaaccaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaagttccgcgtattgttatacttgaaaagcgcatca 40488612  T
Q  503 attaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnn-------cgac 595  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| |||  || ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||                | ||    
T  40488611 attaaaagtcaaaggcagaaggatctgtttatgtagaaattgcatgtcatgtaatgaccagtacgccttacaaagaaattaaaaaataaaaaaaaacaac 40488512  T
Q  596 ttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaac 691  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  40488511 tttcaatcaatacacaactttagttttctaaattatagcaacaacagttctaaaacataatcaatgatcatactttttgaaaaacttcacaatacacaac 40488412  T
Q  692 atttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtcca 791  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  40488411 atttatggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgaacagcttcaaaccttttctagaagtaactcgagagacagcgacatagagttgccca 40488312  T
Q  792 ttcatgaacacgggcttaggaagataaact 821  Q
    | | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  40488311 tgcgtgaacacgggcttaggaagattaact 40488282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 16 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 2881888 - 2881333
Alignment:
Q  16 aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgt---------atatattttgaaatatctaaacattgcaca 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2881888 aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggaaaaaaatatcatcttaattttgttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcaca 2881789  T
Q  107 taacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatac 205  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2881788 taacaattaaagtatttgaatttatacttatactaattatttgtagtataaaatgtactcattgttaaacttagcatatgtaatatttttgcaaaaatac 2881689  T
Q  206 accgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtgtcaga 305  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||              |||||         || ||||||| |||||||||    
T  2881688 tccgacatactgtatattattatttgttgacataatgtattttattaatcataaaaactaaaaaatttgta--ttttttcatataatagtaagtgtcaga 2881591  T
Q  306 tgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnn 405  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||             
T  2881590 tgtatacacctagtctgtgaatgcaaacgttaaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgtcgattgttatttgtttttattt 2881491  T
Q  406 nnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt-nnnnnnnnngttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaat 504  Q
       |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||          ||| ||| || |||||||| | ||||||||||||||    
T  2881490 tttacaaaaccaatggtctaatgtaaatattgtattttggggtaacaatgatgtaaaaaaaaaagtttcgcttactgttatacctaaaaagtgcatcaat 2881391  T
Q  505 taaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgacca 562  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  2881390 taaaagtcaatggcaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtcttgtaatgacca 2881333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 567
Target Start/End: Original strand, 3641873 - 3642436
Alignment:
Q  16 aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaa---------ttttgtatatattttgaaatatctaaacattgcaca 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3641873 aagttataagtgtggttataatttaaatatgataagga-aaaaatatcatcttaattttgttaattttgtatatattttgaaatatccaaacattgcaca 3641971  T
Q  107 taacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatac 205  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3641972 taacgattaaagtatttagatttattcttatattaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcatatgtaatatttttgcaaaaatac 3642071  T
Q  206 accgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtgtcaga 305  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||              |||||         || ||||||  |||||||||    
T  3642072 tccgacgtactgtatattattatttgttaacataatgtattttattaatcataaaaactaaaaaatttgta--tttttttatataatagaaagtgtcaga 3642169  T
Q  306 --tgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnn 403  Q
      |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||           
T  3642170 tgtgtatacacctagtttgtgaatgcaaacgttaaattttttacgggtgtgtataaatataatttcggctacagaaacgtcgattgttatttgtttttat 3642269  T
Q  404 nnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt-nnnnnnnnngttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatca 502  Q
         |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||          ||| |||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  3642270 tttttacaaaaccaatggtctaatgtaaatattgtattttggggtaacaacgatgtaaaaaaaaaagtttcgcgtactgttatacctaaaaagtgcatca 3642369  T
Q  503 attaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatt--tcatgtcctgtaatgaccagtacg 567  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||   |||||| ||||||||||| ||||    
T  3642370 attaaaagtcaatggcaggaggatctgcttatatagaaattgcacatgtcttgtaatgaccaatacg 3642436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1407 - 1724
Target Start/End: Original strand, 35609867 - 35610185
Alignment:
Q  1407 cttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctg 1506  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35609867 cttcagaaatttctaccttcatttcaccattctgatccgaaacttcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctg 35609966  T
Q  1507 ctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaaca 1606  Q
    ||||  |||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  35609967 ctctaaaggtaccgaagatgcacccaatgtcatattaacagtaagcctcaacacattataataagtccatatctttaatgaattgattggggcatcaaca 35610066  T
Q  1607 at-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttagag 1705  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |    
T  35610067 atatcctgcctcgttccttttcgggcaacaggcaatatatgcctgaaatcaccacctaaaacaactgtcattctaccaaaaggtctaaactcgtttaggg 35610166  T
Q  1706 gatcattcttggacatgat 1724  Q
    |||||||||||||||||||    
T  35610167 gatcattcttggacatgat 35610185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 126 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 2868661 - 2868225
Alignment:
Q  126 atttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatatta 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2868661 atttatacttatactaattatttgtagtataaaatgtactcattgttaaacttagcatatgtaatatttttgcaaaaatactccgacatactgtatatta 2868562  T
Q  225 ttatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatg 324  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||              |||||         || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2868561 ttatttgttgacataatgtattttattaatcataaaaactaaaaaatttgta--ttttttcatataatagtaagtgtcagatgtatacacctagtctgtg 2868464  T
Q  325 aatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtct 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||            |||||| |||||||||    
T  2868463 aatgcaaacgttaaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgtcgattgttatttgtttttattttttacaaaaccaatggtct 2868364  T
Q  425 aatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt-nnnnnnnnngttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggag 523  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||          ||| ||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2868363 aatgtaaatattgtattttggggtaacaatgatgtaaaaaaaaaagtttcgcttactgttatacctaaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggag 2868264  T
Q  524 tatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgacca 562  Q
     ||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  2868263 gatctgcttatatagaaattgcatgtcttgtaatgacca 2868225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17687772 - 17687514
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatctt---aattttgtatatattttgaaatatctaaac 98  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17687772 attatgttatcttaaagttataactgtggttataatttaaatttgatatggaaaaaaatatcatcttgttaattttgtatatattttgaaatatctaaac 17687673  T
Q  99 attgcacataacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgc 197  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17687672 attgcacataacgattaaagtatt-ggatttatacttatactaattatttgtactataagatgtactcattgttaaacttaacatatgtaatatttttgc 17687574  T
Q  198 aaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  17687573 aaaaatacgccgaagtactgtatattattatttgttgatataatgtattttattaatcat 17687514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 651 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 2867821 - 2867578
Alignment:
Q  651 accaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattat---cttcatccaagatgagcagtttcaaac 747  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||    
T  2867821 accaatgatcatactttttgaaaaacttcaggatacacaacatttatggtctacttgcaaacattattattatcttcatccaagatgagcagcttcaaac 2867722  T
Q  748 attttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgaccctt 847  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||      
T  2867721 cttttctagaagtaactcgagagacagcgacatagagttgtccatgcgtgaacacgggcttaggaagataaactcccacttgagataaagattgacccga 2867622  T
Q  848 acttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatt 891  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2867621 acttttttttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaatt 2867578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 27508173 - 27508436
Alignment:
Q  4 attatgttatctaa-gttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaa--------ttttgtatatattttgaaatatct 94  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||        ||||||||||||||| ||||||||    
T  27508173 attatgttatttaaagttataattgtggttataatttaaatttgatatgaaaaaaaatatcatcttaattttttaattttgtatatattttaaaatatct 27508272  T
Q  95 aaacattgcacataacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatattt 193  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27508273 aaacattgcacataacgattaaagtatttgaatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttaacatatgtaatattt 27508372  T
Q  194 ttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27508373 ttgcaaaaatatgccgacgtattgtatattattatttgttgacataatgtattttattaatcat 27508436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 39442055 - 39441834
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatact 134  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  39442055 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatttggatcattatact 39441957  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgtt 233  Q
    | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||    
T  39441956 tgtactaattatatgtagtataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaat-tttttgcaaaaatacgccgacgtactgtgtaataatatttgtt 39441858  T
Q  234 aacataatatattttattaatcat 257  Q
     ||| ||| |||||||||||||||    
T  39441857 gacaaaatgtattttattaatcat 39441834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 36048080 - 36047858
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatact 134  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  36048080 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatttggattattatact 36047982  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgtt 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||| || || ||||||||    
T  36047981 tgtactaattatttgtagtataagagtcactcattgttaaacttagcatatgtaattttcttgcaaaaatacgccaacgtactgtgtaataatatttgtt 36047882  T
Q  234 aacataatatattttattaatcat 257  Q
     ||| |||||||||||||||||||    
T  36047881 gacaaaatatattttattaatcat 36047858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1523 - 1671
Target Start/End: Original strand, 3642922 - 3643071
Alignment:
Q  1523 gatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatc 1621  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  3642922 gatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacaaattacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttc 3643021  T
Q  1622 cttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactatt 1671  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3643022 cttttcgggcaacaggcaatatctacctgaaatcaccacctaaaactatt 3643071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 257
Target Start/End: Original strand, 21394178 - 21394421
Alignment:
Q  16 aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaatta 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| || |    
T  21394178 aagttataattgtggttataatttaaattcgatatgaa-aaatatataatcttatttttgtatatattttaaaatatctaaacactgcatataacgataa 21394276  T
Q  116 aaatatttggatt--tatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacg 212  Q
    |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |    
T  21394277 aaatatttagattattatacttgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaatcttagcatatgtaattttcttgcaaaaatacgccgatg 21394376  T
Q  213 tactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    |||||| || || |||||||| ||| |   |||||||||||||||    
T  21394377 tactgtgtaataatatttgttgacaaagcgtattttattaatcat 21394421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24270357 - 24270188
Alignment:
Q  16 aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaatta 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  24270357 aagttataattgtggttataatttaaattcgatatgaa-aaatatataatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataa 24270259  T
Q  116 aaatatttggat--ttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata 184  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24270258 aaatatttggattattatacctgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacttagcata 24270188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 144
Target Start/End: Original strand, 35608697 - 35608839
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 101  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35608697 attatgttatcttaaagttataagtgtggttataatttaaatttcatatgaaaaaaaagatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 35608796  T
Q  102 gcacataacaattaaaatatttggatttatacttatactaatt 144  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  35608797 gcacataacgattaaagtatctggatttatacttatactaatt 35608839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 26955308 - 26955164
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatact 134  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||  |||||||    
T  26955308 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatttagattattatact 26955210  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttag 180  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26955209 tgtactaattatttgtagtataagatgcattcattgttaaacttag 26955164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 289 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 24270138 - 24269842
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaatttttt-acggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgat 387  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24270138 taatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaatttttttacgggtgtgtataaatatagtttgggttacagaaacgccgat 24270039  T
Q  388 tgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtatttta-gggtaacaacgatgt--nnnnnnnnngttccgcgtattgtta 484  Q
    |||||||||            ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||           ||||||||  ||||||    
T  24270038 tgttatttgttattaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttaggggtaacaacgatgtaaaaaataacggttccgcgggttgtta 24269939  T
Q  485 tacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatt 582  Q
     || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24269938 aacctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatggcaggaagatctgctaatataaaaattgcatgt-ctataatgaccagtacgccttacaaagaaatt 24269842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 651 - 730
Target Start/End: Original strand, 3642841 - 3642920
Alignment:
Q  651 accaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaa 730  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3642841 accaatgatcatactttttgaaaaacttcacgatacacaacatttgtggtctccttgcaaacattattatcttcatccaa 3642920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 289 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 39441802 - 39441632
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  39441802 taatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaatgtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgtcgatt 39441703  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt 459  Q
    ||||||||            ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39441702 gttatttgtttttaatttttacagaataaatggtctaatgtaaatattgtattttagagtaacaacgatgt 39441632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 594 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 24269822 - 24269737
Alignment:
Q  594 acttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaa 675  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24269822 actttcaatcaatgcgcaactttagttttctaaattatagcaacgacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttaaaaaa 24269737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 250
Target Start/End: Original strand, 35608837 - 35608897
Alignment:
Q  190 atttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttat 250  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||    
T  35608837 atttttgcaaaaatacgccgacgtactgtatatcattatttgttgaaataatgtattttat 35608897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1660 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 41919948 - 41919884
Alignment:
Q  1660 cctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |||   | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  41919948 cctaaaactactgccattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgat 41919884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 841 - 874
Target Start/End: Complemental strand, 3571878 - 3571845
Alignment:
Q  841 gacccttacttttatttattgtcattgcaaaaca 874  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3571878 gaccctgacttttatttattgtcattgcaaaaca 3571845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 873; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 873; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 1633
Target Start/End: Original strand, 10186349 - 10187985
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatctt---aattttgtatatattttgaaatatctaaac 98  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10186349 attatgttatcttaaagttataactgtggttataatttaaatttgatatggaaaaaaatatcatcttgttaattttgtatatattttgaaatatctaaac 10186448  T
Q  99 attgcacataacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgc 197  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  10186449 attgcacataacgattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttaacatatgtaatatttttgc 10186548  T
Q  198 aaaaa-tacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtc 296  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||              |||||         || ||||||||    
T  10186549 aaaaaatacgccgaagtactgtatattattatttgttgacataatgtattctattaatcataaaaacaaaaaaaattgtatttgtttttatataatagtc 10186648  T
Q  297 agtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttg 396  Q
    |   ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  10186649 aacttcagatgtatacacctaatttgtgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtataa-----gtttgggctactgaaacgccgattgttatttg 10186743  T
Q  397 nnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn-----gttccgcgtattgttatacttga 491  Q
                |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||              ||| ||||||||||||||| |||    
T  10186744 ttttatt-----acaaaatcaatggtctaatgcaaatattgtattttaggttaacaacaatgtaaaaaaaaaaaatagtttcgcgtattgttatacctga 10186838  T
Q  492 aaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnn 591  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||             
T  10186839 aaagtgcatcatttaaaagtcaatgacaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtcatgtaatgaccagtacgccttacaaagaaattaaaaaaaat 10186938  T
Q  592 cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgataca 687  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||  |    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10186939 -gacttccaaacaatgcacaactttagttttctaaattatagcaacaacaattctaaaccataaccaatgatcatactttttgaaaaagttcacgataca 10187037  T
Q  688 caacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttg 787  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  10187038 caacatatgtggtctccttgcaaacattattatattcatccaagatgagcaacttcaaaccttttctagaagtaagtcgagagacaatgacatagagttg 10187137  T
Q  788 tccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaa 887  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  10187138 tccatgcgtgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaagattgaccttgacttttatttatcgtcattgcaaaacaaaacgtcaatgga 10187237  T
Q  888 aatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaatta 986  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  10187238 aattatatgcgcctgaatttgaaaggtagtcctggatcactcagaataagattcatccagggaatgaacaccctggtactttccctttttaatgtaatta 10187337  T
Q  987 cggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattgg 1086  Q
    |||||||||| ||| || |||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  10187338 cggtagcaacaatcgtggtcttccctagatgtgtaattgtcagcctcgtaccattacacagtccattgacctgatcgatgtttctcatcagcataactgg 10187437  T
Q  1087 acatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattt 1186  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  10187438 acatcccacccttagtttcaaccggtgatttggaattcaagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcactttggacatcaaaattt 10187537  T
Q  1187 tcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcg 1286  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||| ||||||||| |    
T  10187538 tcacccgatcgacaaacagaatcatagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaattgaatcaagtg 10187637  T
Q  1287 ttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgt 1386  Q
    |||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  10187638 ttggagcgagtattcccttttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggattttt 10187737  T
Q  1387 tgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgcca 1486  Q
    ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||  || |    
T  10187738 tgtgtccaatatgagcaaatattcaggaatttctaccttcattttaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagcatccacgtgcga 10187837  T
Q  1487 aaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatg 1586  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  10187838 aaattagcaatttcttcctgctctacaggtatcgaagatgcacccaatctcatattaacaataagcctcaacacattacaataagctcatatctttgatg 10187937  T
Q  1587 aattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaa 1633  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  10187938 aattgattgaggcatcaacaatatcctgtctcgttccttttcggacaa 10187985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 776; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 495 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 2203102 - 2201866
Alignment:
Q  495 gtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnncga 594  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||           ||    
T  2203102 gtgcatcaattaaaattcaatggcaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtcctataatgaccagtacgccttacaaagaaataaaaaaaaaatga 2203003  T
Q  595 cttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaa 690  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2203002 cttctaaacaatacgcaactttagttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaatttcacgatacacaa 2202903  T
Q  691 catttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtcc 790  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  2202902 catttgtggtctcctttcaaacattattatcttcatccaagatgagcagcttcaaaccttttctagaagtaactcgagagacaacaacataaagttttcc 2202803  T
Q  791 attcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcatt-gcaaaacaaagcgtcaatgaaaa 889  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  2202802 atgcgtgaacacgggcttagaaagataaactcccatttgagataaagattgaccctgacttttatttattgtcatttgcaaaacaaagcgtcaatggaaa 2202703  T
Q  890 tttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacg 988  Q
     |   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2202702 ctgtctgcacctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgggaatgaataccctgatacctgccctttttcctgtaattacg 2202603  T
Q  989 gtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggac 1088  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  2202602 gtagcaactatcgtgctcttccttagatgtgtaactgtcagcctcgtaccattacacagtccatttgcctgatcgatgtttctcatcggcataactggac 2202503  T
Q  1089 atcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttc 1188  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  2202502 atcccacccttagtttcaaccagtgatttggaattccagagctctaaataccattaaggaattcagttgtgaaccactcactttggacatcagaattttc 2202403  T
Q  1189 gcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgtt 1288  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||| || ||||||| |||||||    
T  2202402 acccgatcgacaaatagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgttctactgaattaagcgtt 2202303  T
Q  1289 ggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttg 1388  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  2202302 ggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttattg 2202203  T
Q  1389 tgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaa 1488  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  2202202 tgttcgatatgagcaaatcttcgggaatttctacattcatttcaccattctcatttgaagcgtcgttgccttctccaattgagagtatccacttgccaaa 2202103  T
Q  1489 attagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaa 1588  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  2202102 attagcaatttcttcatgctctgcaagtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcgacacattacaatatgcctatatctttgatgaa 2202003  T
Q  1589 ttgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaag 1687  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2202002 ttgatcgaggcatcaacaatatcctgcctcgatccttttcggacaatgggcaatatctgcctgaagtcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaag 2201903  T
Q  1688 gtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  2201902 gtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgat 2201866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 655; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 651 - 1679
Target Start/End: Original strand, 18343582 - 18344612
Alignment:
Q  651 accaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacatt 750  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18343582 accaatgatcatactttttgaaaaacttcacgatacacaacagttgtggtttccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagcttcaaacctt 18343681  T
Q  751 ttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttact 850  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  18343682 ttctagaagtaactcaagagacagcgacatagagttgtccatgcgtgaagatgggcttaggaagataaactcccacttgagataaagattgaccctaact 18343781  T
Q  851 tttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttg-ga 949  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  18343782 tttttttattgtaattgcaaaacaaagtgtcaatggaaattgcatgcacctgaatttcaagtgtagtcctggatcactcggaataagattcatcctgtga 18343881  T
Q  950 atgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaatt 1049  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||| |     
T  18343882 atgaataccctggtacctgccctttctcctgtaattacggtagcagttatcgtgctcttccctagatgtgtaactgttagccttgtaccattacacagtc 18343981  T
Q  1050 cattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaa 1149  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18343982 cattggcctgatcgatgtttctcatcagcatagccggacatcccacccttggtttcaactggtgatttggaattttagagctcttaataccattaagaaa 18344081  T
Q  1150 ttccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaa 1249  Q
    |||  |||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||     
T  18344082 ttctattgtgaaatactcgctttggacatcaaaattttcacccgatcgacaaatagaatcaaagcttaaatactctttctcttcgcctggaatcagcgac 18344181  T
Q  1250 attatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgg 1349  Q
    || |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18344182 atcatatattcgtcaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcaagtattcccctttcttggaaaaatagatggtcaccaaggttatcattcaaatcgg 18344281  T
Q  1350 gatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagc 1449  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18344282 gatacacaaagtctataagtgacatgaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcactattctcatctgaagc 18344381  T
Q  1450 gtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagta 1549  Q
     |||||| ||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || |||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18344382 ttcgttgtcgtctccaattgagagtattcacttgtcaaaattaggaatttcttcctgctctgtagataccaaagatgcactcaatctcatattaacagta 18344481  T
Q  1550 agcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcc 1648  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18344482 agcctcaacaaattacaataagcccatatctttgataaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcc 18344581  T
Q  1649 tgaaatcaccacctaaaactattgtcattcc 1679  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18344582 tgaaatcaccacctaaaactattgtcattcc 18344612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 586; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 1327
Target Start/End: Original strand, 12516200 - 12517522
Alignment:
Q  16 aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaatta 115  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  12516200 aagttataattgtgtttataatttaaattcgatatgaaaaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataa 12516299  T
Q  116 aaatatttggatt--tatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacg 212  Q
    || ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  12516300 aagtatttggattattatacttgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaatatttttgcagaaatacgccgacg 12516399  T
Q  213 tactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtgtcagatgtatac 312  Q
    ||||||| | || |||||||| ||| ||| ||||||||||| |||               ||||         || ||||||||||||||| ||| ||||    
T  12516400 tactgtaaaataatatttgttgacaaaatgtattttattaaccataaaaactaaaaaatatgtatttttttatatataatagtcagtgtcacatgcatac 12516499  T
Q  313 acctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnnnnnacaa 412  Q
    || |||||  | |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||            ||||    
T  12516500 acgtagtcggtaaatgcaaacgtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaatgccgattgttatttgtttttaatttttacaa 12516599  T
Q  413 aatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn---gttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaa 509  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||            |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |    
T  12516600 aacaaatggtctaatgtaaatattttattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaaaaggttccgcggattgttaaacatgaaaagtgcatgaattaata 12516699  T
Q  510 gtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnn-cgacttccaaacaatac 608  Q
    ||||||| || ||| ||||| ||| |||  |||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||          ||||||| ||| ||||     
T  12516700 gtcaatgacaagaggatctgattatataggaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaagaaattaaaaataaaacgacttcaaaaaaatag 12516798  T
Q  609 gcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctcc 704  Q
    | |||| |||||||||||||||| ||||  |    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12516799 gaaactatagttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataagcaatgatcatactttttgaaaaacttcacgatacacaacatttgtggtctcc 12516898  T
Q  705 ttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgg 804  Q
    || |||||||||| ||||||||||| |||||| || |||| || |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||  |    
T  12516899 ttacaaacattatcatcttcatccaggatgagtagcttcagaccttttcttgaagttacttgagagacagcgacataaagttgtccatgcgtgaacatag 12516998  T
Q  805 gcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaa 904  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||    
T  12516999 gcttaggaagataaacccccactcgagataaagattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaattgtctgcgcctgaa 12517098  T
Q  905 tttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttg 1003  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  12517099 tttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcctgggaatgaataccctggtacctgccctttttcctgtaattacggtagcagctatcgtg 12517198  T
Q  1004 ctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtt 1103  Q
    ||||| |||||| |||||| | |||| || ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||||||| ||| ||||||    
T  12517199 ctcttccctagaagtgtaaatgtcagactagtaccattacacagtccattggcctgatcgatgtttctcatcaacataaccggacatcccacctttagtt 12517298  T
Q  1104 tcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaac 1203  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||  |||||    
T  12517299 tcaacctgtgatttggaattccaaagctcttaataccattaagaaattccgatgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcaccccatcatcaaac 12517398  T
Q  1204 agaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgccc 1303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||    
T  12517399 agaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcaaatattccc 12517498  T
Q  1304 ctttattggaaaaatagcgggtca 1327  Q
    |||| ||||||||||||| |||||    
T  12517499 ctttcttggaaaaatagctggtca 12517522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 556; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 525 - 1569
Target Start/End: Original strand, 15332969 - 15334019
Alignment:
Q  525 atctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttc 623  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||         |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15332969 atctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaagaaatttagaataaaacgacttccaaacaataggcaactttagttttc 15333067  T
Q  624 taaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattatta 719  Q
    |||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  15333068 taaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcaggatatacaacatttgtggtctccttacaaacattatta 15333167  T
Q  720 tcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaa 819  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  15333168 tcttcatccaggatgagcagcttcagaccttttcttgaagttactcgagagacagcgacataaagttgtccatgcgtgaacacaggcttaggaagataaa 15333267  T
Q  820 ctcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcc 919  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15333268 c-cccactcgagataaagattgaccctggcttttatttattgttatttcaaaacaaagcgtcaatggaaattgcatgcgcctgaatctgaagggtagtcc 15333366  T
Q  920 tggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctgg-taccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatg 1017  Q
    || |||||||| ||||||||||||| ||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  15333367 tgaatcactcgaaataagattcatcctgggaatgtattccctgggtacctgccctttttcctgtaattacggtagcagctattgtgctcttccctagatg 15333466  T
Q  1018 tgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctc-ataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatt 1116  Q
     |||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||| |||||| || || | ||||| ||||||||| ||| ||||||| |||| || |||    
T  15333467 agtaactgtcagcctagtaccattacacagtccattggcctgatcaatgtttttccatcaccataactggacatcccacctttagttttaacctgtgatt 15333566  T
Q  1117 tggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagctt 1216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |    
T  15333567 tggaattccagagctcttaataccattaagaaatttcgatatgaacctctcgctttggacatcagaattttcacctgatctacaaacagaatcagagcct 15333666  T
Q  1217 aaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaa 1316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  15333667 aaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagtgttggtgcgagtattcccatttgttggaaaa 15333766  T
Q  1317 atagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaat 1416  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||||||||    
T  15333767 atagctggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctattagtgacatcaacggatttgttacgtacgatatcaacaaatcttcaggaat 15333866  T
Q  1417 ttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggt 1516  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15333867 ttctaccttcatttcactattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcttgctctgcaggt 15333966  T
Q  1517 actgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaata 1569  Q
    |  || |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15333967 atcgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcttcaacacattacaata 15334019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1153
Target Start/End: Original strand, 12518700 - 12519567
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||| | ||| | |||    
T  12518700 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagcctgtgaatgcaaaagttcaattttttacgggtgtgtataaatatggtttgagctacagacacggcaatt 12518799  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngttccgcgtattgttatact 488  Q
    ||||||||            | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||             || ||||||||||||     
T  12518800 gttatttgtttttattttttagaaaaccaatggtctaatgtaaatattatattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaat---cgtgtattgttatacc 12518896  T
Q  489 tgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnn 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||          
T  12518897 tgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggaggatctacttatatagaaattgcatgtcacgtaatgaccagtacgccttacaaataaattaaaaaa 12518996  T
Q  589 nnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacga 683  Q
        | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || ||||    
T  12518997 aaaacaacttccaaacaatatgcaactttagttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataacctaagatcatactttttgaaaaaatttacga 12519096  T
Q  684 tacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacataga 783  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| | |||||||    
T  12519097 tagacaacatttgtgatctccttgcaaacattattatcttcatccaatatgagcagcttcaaaccttttctatatgtaactcgagagacagcaacataga 12519196  T
Q  784 gttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaa 883  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12519197 gttgtccatgcgtgaacacgtgcttaggaatataaactcccactcgagataaagattgaccttgacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaa 12519296  T
Q  884 tgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcat-cttggaatgaataccctggtaccttccctttttcctgta 982  Q
    || |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  12519297 tggaaattgtttgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcacttggaataagattcatcctgggaatgaataccctggtacctgcccttttttttgta 12519396  T
Q  983 attacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataa 1082  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||| | ||| ||||||| ||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  12519397 attacggtagcaactatcgtgctcttccctagacgtataattgtcaacctcgtaccattacacggtccattggcctgatcgatgcttctcatcagcataa 12519496  T
Q  1083 ttggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattcc 1153  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12519497 ttggacatcccacccttagtttcaaccggtgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattcc 12519567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1181 - 1724
Target Start/End: Original strand, 30881315 - 30881858
Alignment:
Q  1181 gaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaat 1280  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  30881315 gaattttcacccgatcgacaaacagaaccagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaacagaat 30881414  T
Q  1281 caagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacgg 1380  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30881415 caagcgttggtgcgagtatttccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcatttaaatcgagatacacaatgtctataagtgacatcaacgg 30881514  T
Q  1381 atttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcac 1480  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||     
T  30881515 atttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcacca-tctcatccgaagcgccgttgccttctctaattgagagtatccat 30881613  T
Q  1481 tcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatct 1580  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  30881614 ttgccaaaattagcaatttattcctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatcccatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatct 30881713  T
Q  1581 ttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattcc 1679  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  30881714 ttgatgaactgattgaggcatcaacaatatcatgcctcgttccttttcggatgacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaacttttgtctttcc 30881813  T
Q  1680 accaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30881814 accaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 30881858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1091
Target Start/End: Complemental strand, 29642484 - 29641668
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacgga-tgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgat 387  Q
    ||||||||| || |||||| |||||| |||||  | |||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29642484 taatagtcattgccagatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaatttttaacggggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgat 29642385  T
Q  388 tgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngt--------tccgcgtat 479  Q
    |||||||||            ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||                   | | || ||    
T  29642384 tgttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctgatgtaaatattgtattttaggataacaacgatgtaaaaaaaaaaaaaaaaaaattcacggat 29642285  T
Q  480 tgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaa 579  Q
    ||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  29642284 tgttaaacctgaaaaatgcatgaattaatagtcaatgataggaggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaagaa 29642186  T
Q  580 atttnnnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaa 674  Q
    |||          |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29642185 attaaaaataaaacgacttccaaacaataggcaactttagttttataaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaa 29642086  T
Q  675 acttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaa 774  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||| ||||||||||||     
T  29642085 acttcacgatacacaacatttatggtctccttacaaacattattatcttcatccaggatgagcagcttcagaccttttcttgaagttactcgagagacag 29641986  T
Q  775 cgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaaca 874  Q
    ||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29641985 cgacataaagttgtccaagcgtgaacacaggcttaggaagataaacccccactcgaaataaagattgaccctggcttttatttattgtcattgcaaaaca 29641886  T
Q  875 aagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcat-cttggaatgaataccctggtaccttccctt 973  Q
    ||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| |||||| |||||    
T  29641885 aagcgtcaatggaaattgtctgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcgtaataatattcatcctgggaatgaataccctagtacctgccctt 29641786  T
Q  974 tttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctca 1073  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  29641785 tttcttgtaataacggtagcagctatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagcctagtaccattacacagtccattggcctgatcgatgtttctca 29641686  T
Q  1074 taagcataattggacatc 1091  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  29641685 tcagcataactggacatc 29641668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 525 - 1091
Target Start/End: Complemental strand, 31512403 - 31511832
Alignment:
Q  525 atctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttc 623  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||          |||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  31512403 atctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaagaaattaaaaataaaacgacttccaaacaataggcaactttagtttta 31512305  T
Q  624 taaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattatta 719  Q
    ||||||||  |||  |    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31512304 taaattataacaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcacgatacacaacatttgtggtctccttacaaacattatta 31512205  T
Q  720 tcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaa 819  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||    
T  31512204 tcttcatccaggatgagcagcttcagaccttttcttgaagttactcgagagacagcgacataaagttgtccaagcgtgaacacaggcttaggaagataaa 31512105  T
Q  820 ctcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcc 919  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  31512104 cccccactcgaaataaagattgaccctggcttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaattgtctgcgcctgaatttgaagggtagtcc 31512005  T
Q  920 tggatcactcggaataagattcat-cttggaatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgt 1018  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  31512004 tggatcactcgtaataacattcatcctgggaatgaataccctagtacctgccctttttcttgtaattacggtagcagctatcgtgctcttccctagatgt 31511905  T
Q  1019 gtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatc 1091  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||| | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  31511904 gtaactgtcagcctagtaccattacatagtccattggcctgatcgatgtttctcatcagcataactggacatc 31511832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 289 - 891
Target Start/End: Original strand, 24195989 - 24196597
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24195989 taatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgctgatt 24196088  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn--gttccgcgtattgttata 486  Q
    ||||||||            ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||           |||| ||| ||||||| |    
T  24196089 gttatttgttgttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaatgatgtaaaaaaaaaaggttcagcggattgttaaa 24196188  T
Q  487 cttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnn 586  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||        
T  24196189 cctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatggcaggaggatctacttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaagaaattaaaa 24196287  T
Q  587 nnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcac 681  Q
          |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24196288 ataaaacgacttccaaacaataggcaactttggttttataaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcac 24196387  T
Q  682 gatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacata 781  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| |||||||| |||||||    
T  24196388 gatacacaacatttgtggtctccttgcaaacattattatcttcatctaggatgagcagcttcagaccttttcttgaagttacttgagagacagcgacata 24196487  T
Q  782 gagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtc 881  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24196488 gagttgtccatgcgtgaacacaggcttaggaagataaacccccactcgagataaagattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtc 24196587  T
Q  882 aatgaaaatt 891  Q
    |||| |||||    
T  24196588 aatggaaatt 24196597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1086 - 1493
Target Start/End: Complemental strand, 29640355 - 29639947
Alignment:
Q  1086 gacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattcc-gttgtgaaccactcgctctggacatcagaat 1184  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29640355 gacatcccacctttagtttcaacctgtgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattcttggtgtgaaccactcgctttagacatcagaat 29640256  T
Q  1185 tttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaag 1284  Q
    |||| ||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  29640255 tttcacccgatctaaaaatagaattagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaag 29640156  T
Q  1285 cgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggattt 1384  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29640155 cgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcaggatacacaaagtctataagtgacatcaacagattt 29640056  T
Q  1385 gttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgc 1484  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  29640055 gttgtggttgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgc 29639956  T
Q  1485 caaaattag 1493  Q
     ||||||||    
T  29639955 aaaaattag 29639947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 4 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 4221435 - 4220868
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatctta---------attttgtatatattttgaaatat 92  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||    
T  4221435 attatgttatcttaaagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggaaaaaaatatcatcttagttttgttaattttgtatatattttgaaatat 4221336  T
Q  93 ctaaacattgcacataacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatat 191  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4221335 ctaaacattgcacataacgattaaagtatttgtatttatacttatactaattatttgtagtataaaatgtactcattgttaaacttagcatatgtaatat 4221236  T
Q  192 ttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaa 291  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||              |||||         || |||    
T  4221235 ttttgcaaaaatactccgacatactgtatattattatttgttgacataatgtattttattaatcataaaaactaaaaattttgta--tttttttatataa 4221138  T
Q  292 tagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgtt 391  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||       |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4221137 tagtaagtgtcagatgtatacacctagtctgtgaatgcaaacg-------ttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgtcgattgtt 4221045  T
Q  392 atttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt-nnnnnnnnngttccgcgtattgttatacttg 490  Q
    |||||            |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||          ||| |||||| |||||||| |     
T  4221044 atttgtttttattttttacaaaaccaatggtctaatgtaaatattgtattttggggtaacaatgatgtaaaaaaaaaagtttcgcgtactgttataccta 4220945  T
Q  491 aaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacg 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  4220944 aaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtcttgtaatgaccaatacg 4220868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1086 - 1493
Target Start/End: Complemental strand, 31510525 - 31510118
Alignment:
Q  1086 gacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaatt 1185  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  31510525 gacatcccacctttagtttcaacctgtgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactcgctttagacatcagaatt 31510426  T
Q  1186 ttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagc 1285  Q
    ||| ||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  31510425 ttcacccgatctaaaaatagaattagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagc 31510326  T
Q  1286 gttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttg 1385  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31510325 gttggtgcgagtattcccctttcttgaaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagattaggatacacaaagtctataagtgacatcaacagatttg 31510226  T
Q  1386 ttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgcc 1485  Q
    ||||| | ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||     
T  31510225 ttgtggttgatatcagcaaatcttaagaaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaaacatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgca 31510126  T
Q  1486 aaaattag 1493  Q
    ||||||||    
T  31510125 aaaattag 31510118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 456
Target Start/End: Original strand, 30880871 - 30881316
Alignment:
Q  20 tataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaa---------ttttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataac 110  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||         ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  30880871 tataagtatggttataatttgaatttgatatggaaaaaagtatcatcttaattttgttaattttgtatatatttaaaaatatctaaacattgcatataac 30880970  T
Q  111 aattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccg 209  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |    
T  30880971 gattaaagtatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtaattattgttaaacttagcatatgcaatatttttgcaaaaatacgcgg 30881070  T
Q  210 acgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtgtcagatgta 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||              |||||         || ||||||||| ||||||| |||    
T  30881071 acgtactgtatattattatttgttgacataatgtattatattaatcat-aaaaactaaaaaattgtatttttttttatataatagtcactgtcagacgta 30881169  T
Q  310 tacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnnnnna 409  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||            |    
T  30881170 tacacctagtctgtgaatgcaaatgttaaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgattgttatttgtttttatttttta 30881269  T
Q  410 caaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacga 456  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30881270 caaaaccaacggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacga 30881316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 651 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 4220470 - 4220227
Alignment:
Q  651 accaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattat---tatcttcatccaagatgagcagtttcaaac 747  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4220470 accaatgatcatactttttgaaaaacttcacgatacacaacatttatggtctacttgcaaacattatcattatcttcatccaagatgagcagcttcaaac 4220371  T
Q  748 attttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgaccctt 847  Q
     |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  4220370 cttttatagaagtaactcgagagacagcgacatagagttgtccatgcgtgaacacgagcttaggaagataaactcccactcgagataaagattgacccta 4220271  T
Q  848 acttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatt 891  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4220270 acttttttttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaatt 4220227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 12518414 - 12518670
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 101  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12518414 attatgttatcttaaagttaaaagtgtgattataatttaaatttaatatagaaaaaaatatcatcctaattttgtataaattttgaaatatctaaacatt 12518513  T
Q  102 gcacataacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaa 200  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12518514 gcacataacgatcaaagtatttggatttatacttatattaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcatatgtaatatttttgcaaa 12518613  T
Q  201 aatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||    
T  12518614 aatacgccgacgtactgtatattattatttgttgacataacgaattttattaatcat 12518670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 1439 - 1724
Target Start/End: Original strand, 12517520 - 12517806
Alignment:
Q  1439 tcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctca 1538  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||    
T  12517520 tcatccgaagtgtcgttgtcgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggaacagaagatgcacccaatctca 12517619  T
Q  1539 tattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatg 1637  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||| |||||| ||||  |||||||||| |    
T  12517620 tattaacagtaagcttcaacacattacaataagcccatatctttgacgaattaactgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacagg 12517719  T
Q  1638 caatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12517720 caatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtttaagcgcgtttagaggatcattcttggacatgat 12517806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 15330339 - 15330595
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 101  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15330339 attatgttatcttaaagttataattgtggttataatttaaattggatatgaa--aaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatttaaacatt 15330436  T
Q  102 gcacataacaattaaaatatttggat--ttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgca 198  Q
    ||| ||||| || ||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15330437 gcatataacgataaaagtatttggattattatacttgtactaattatttgtagtataaaatgcactcattgttaaacttagtatatgtaatatttttgca 15330536  T
Q  199 aaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  15330537 aaaatacgccgacgtactgtataataatatttgttgacaaaatgtattttattaatcat 15330595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 31512877 - 31512655
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatact 134  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  31512877 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacgttgcatataacgataaaaatatttggattattatact 31512779  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgtt 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||    
T  31512778 tgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaattttcttgcaaaaatacgccgacgtactgtgtaataatatttgtt 31512679  T
Q  234 aacataatatattttattaatcat 257  Q
     ||| ||| |||||||||||||||    
T  31512678 gacaaaatgtattttattaatcat 31512655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 257
Target Start/End: Original strand, 24195715 - 24195958
Alignment:
Q  16 aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaatta 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  24195715 aagttataattgtggttataatttaaattcgatatgaa-aacaatataatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataa 24195813  T
Q  116 aaatatttggat--ttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacg 212  Q
    |||||||| |||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  24195814 aaatattttgattattatacttgtattaattttttgtagtataagatgcactcattgtaaaacttagcatatgtaattttcttgcaaaaatacgccgacg 24195913  T
Q  213 tactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    |||||| || || |||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  24195914 tactgtgtaataatatttgttgacaaaacgtattttattaatcat 24195958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29642739 - 29642517
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatact 134  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| || |||||||||||||  |||||||    
T  29642739 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatgatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacgttgcatacaacgataaaaatatttggattattatact 29642641  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgtt 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||    
T  29642640 tgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaattttcttgcaaaaatacgccgacgtactgtgtaataatatttgtt 29642541  T
Q  234 aacataatatattttattaatcat 257  Q
     ||| ||| |||||||||||||||    
T  29642540 gacaaaatgtattttattaatcat 29642517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 14906298 - 14906527
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 101  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||  | ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  14906298 attatgttatcttaaagttataaatgtgattgtaatttaaattcgatattaa-aaaaatatcttcttaattctgtaaatattttgaaatatctaaatatt 14906396  T
Q  102 gcacataacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaa 200  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||||||   |||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||    
T  14906397 gcacataatgattaaagtatttggatctatacttataatgtatatttgtagtatgtaatgtactcattgttcaactcagtatatgtaatatttttgcaaa 14906496  T
Q  201 aatacaccgacgtactgtatattattatttg 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14906497 aatacgccgacgtactgtatattattatttg 14906527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1501 - 1649
Target Start/End: Original strand, 18814054 - 18814203
Alignment:
Q  1501 ttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgca 1600  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |    
T  18814054 ttcctgctctacaggtaccaacgatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatctttgatgaattgattaaggga 18814153  T
Q  1601 tcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcct 1649  Q
    |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18814154 tcaacaatatcatgtctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcct 18814203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 289 - 529
Target Start/End: Original strand, 15330628 - 15330869
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||||||| ||    
T  15330628 taatagtcaatgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttcggcttcagaaacgccgctt 15330727  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt-nnnnnnnnngttccgcgtattgttatac 487  Q
    ||||||||            ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||          |||||||| ||||||| ||    
T  15330728 gttatttgtttttaatttttacaaaataaatggtctaatgtaaatattgtattttacggtaacaacgatgtaaaaaaaaaggttccgcggattgttaaac 15330827  T
Q  488 ttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctg 529  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15330828 ttgaaaagtgcatgaattaatagtcaatggcaggaggatctg 15330869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 289 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 31512624 - 31512454
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||  |||||  | |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31512624 taatagtcattgtcacatgcatacatgtagtcggtaaatgcaaacgtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctaccgaaacgccgatt 31512525  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt 459  Q
    ||||||||            ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31512524 gttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctgatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt 31512454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1650 - 1714
Target Start/End: Original strand, 18857163 - 18857227
Alignment:
Q  1650 gaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattct 1714  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  18857163 gaaattaccacctaaaacggatgtcattccaccgaaatgtctaaactcattttggggatcattct 18857227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 840 - 874
Target Start/End: Original strand, 15877026 - 15877060
Alignment:
Q  840 tgacccttacttttatttattgtcattgcaaaaca 874  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15877026 tgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaaca 15877060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 841 - 874
Target Start/End: Original strand, 29965978 - 29966011
Alignment:
Q  841 gacccttacttttatttattgtcattgcaaaaca 874  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29965978 gaccctgacttttatttattgtcattgcaaaaca 29966011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 847; Significance: 0; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 847; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 339 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 14193891 - 14192498
Alignment:
Q  339 attttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgt 438  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14193891 attttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacataaacgccgattgttatttatttttattttttacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgt 14193792  T
Q  439 attttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatat 538  Q
    |||||||||||||||||||||         ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  14193791 attttagggtaacaacgatgtaaaaaaaa-gtttcgcgtattgttatacctgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggaggatctgcttatatag 14193693  T
Q  539 aaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnncgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatg 638  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  14193692 aaattgcatgtcatgtaatgaccagtacgccttacaaagaaataaaaaaaaaaagacttccaaacaatacacaactttagttttctaaattatagcaata 14193593  T
Q  639 a-----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacga-tacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaaga 732  Q
    |     ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14193592 acaaattctaaaacataactaacgatcatactttttgaaaaacttcacgaatacacaacatttgtggtctccttgcaaacgttattatcttcatccaaga 14193493  T
Q  733 tgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgaga 832  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14193492 tgagcagcttcaaaccttttctagaagtaactcgagagacagcaacatagagttgttcatgcttgaacacgggcttaggaagataaactcccactcaaga 14193393  T
Q  833 taaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcgga 932  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14193392 taaacattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaacaaaatgtcaatggaaattgcaagcgtctgaatttgaagggtagtcttggatcactcgga 14193293  T
Q  933 ataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcc 1031  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  14193292 ataagattcatcttgggaatgaataccctggtacctgccctttttcctgtaattacggtagcagctatcgtgctcttccctagacgtgtaactgtcagcc 14193193  T
Q  1032 tcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagct 1131  Q
    | ||| || |||||| | |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14193192 ttgtaccactacacagtccattggcctgatcaatgtttctcatcagcataactggacatccaacccttagtttcaaccggtgatttggaattccagagct 14193093  T
Q  1132 cttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctct 1231  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14193092 cttaataccattacgaaattccgtcgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctct 14192993  T
Q  1232 tcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaa 1331  Q
    |||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14192992 tcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaattaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcggatcaccaa 14192893  T
Q  1332 ggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttc 1431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14192892 ggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacagatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcagaaatttctaccttcatttc 14192793  T
Q  1432 accattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactc 1531  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||| |    
T  14192792 accattctgatccgaaacttcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgtcaaaattagcaatttcttcctactctacaggtaccgaagatgcaccc 14192693  T
Q  1532 aatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcgga 1630  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  14192692 aatctcatattaacagtaagcctcaacacattataataagcccatatctttaatgaattaattggggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggg 14192593  T
Q  1631 caacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcattta-gaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  14192592 caacatgcaatatatgcctgaaatcaccacctaaaacaactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggatcattcttggacatgat 14192498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 833; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 360 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 25543849 - 25542480
Alignment:
Q  360 atatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnnnnn-acaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatg 458  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||             |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25543849 atatagtttgggctacagaaacgccgattgttatttgtttttatttttttacaaaaccaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacaatg 25543750  T
Q  459 tnnnnnnnnngttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatg 558  Q
    |         ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  25543749 taaaaaaaa-gttccgcgtattgttatacctgaaaagtgcatcaattaaaagacaaaggcaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtcctgtaatg 25543651  T
Q  559 accagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnncga-cttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataacc 653  Q
    |||||||||| |||||||||||||           | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    |||||||||||| |    
T  25543650 accagtacgccttacaaagaaattaaaaaaaaaataacttccaatcaatacgcaactttagttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataatc 25543551  T
Q  654 aatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttc 753  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  25543550 aatgatcatactttttgaaaaacttcacgatacacaacatttgtggtctccttgcaaacattattattttcatccaagatgagcagcttcaaaccttttc 25543451  T
Q  754 tagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttactttt 853  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  25543450 tagaagtaactcgagagacagcgacatacagttgcccatgcgtgaacacgggcttagggatataaactcccactcgagataaagattgaccct--ctttt 25543353  T
Q  854 atttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatg 952  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| | | ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25543352 atttattgtcaccgcaaaacaaagcgtcaatggaaattgccttcgcatgaatttgaaagatagtcctggatcactcggaataagattcatcatgggaatg 25543253  T
Q  953 aataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcat 1052  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||    
T  25543252 aataccctggtacctgccctttttcctgtagttacggtagcagctatcgtgctcttccttagatgtgtaactgtcagcctcgtaccattacacagtccat 25543153  T
Q  1053 tggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattc 1152  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  25543152 tggcctgatcgatgtttctcatcagcataactggacatcccacccttagtttcaaccggtgatttggaattccagagctcttaataccattaaggaattt 25543053  T
Q  1153 cgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaatt 1252  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  25543052 cgttgtgaaccactcgctttggacatcataattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatc 25542953  T
Q  1253 atatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggat 1352  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25542952 atatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggat 25542853  T
Q  1353 acacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtc 1452  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  25542852 acacaaagtctataagtgacatcaacatatttgttgtgtccgatatgagaaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgtt 25542753  T
Q  1453 gttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagc 1552  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25542752 gttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaagttagcaatttctttctgctttgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagc 25542653  T
Q  1553 ctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctga 1651  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25542652 ctcaacacattacaataagcccatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatattctgccacgttccttttcggacaacagacaatatctgcctga 25542553  T
Q  1652 aatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25542552 aatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaatggtttaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 25542480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 832; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 1724
Target Start/End: Original strand, 27879920 - 27881616
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatattt-ggatt--tatac 133  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||||||| |||||  |||||    
T  27879920 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaaaattccatataacgataaaaatattttggattattatac 27880018  T
Q  134 ttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgt 232  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||| |||||||||||| || || |||||||    
T  27880019 ttgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaactttcttgcaaaaatacgccgacgtactgtgtaataatatttgt 27880118  T
Q  233 taacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaa 332  Q
    | | | |||||||||||||||||||               ||||         || ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | ||||||||    
T  27880119 tgataaaatatattttattaatcataaaaactaaaaaatatgtatttttttttatataatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaa 27880218  T
Q  333 cgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaa 432  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||            ||||||  ||||||||||||||||    
T  27880219 cgtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacaccgattgttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaa 27880318  T
Q  433 tattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnng-ttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgct 531  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||         | || |||| ||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27880319 tattgtattttagggtatcaacgatgtaaaaaaaaaggtttcgcggattgttaaacatgaaaagtgcatgaattaatagtcaatggcaggaggatctgct 27880418  T
Q  532 taaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaatta 630  Q
    || ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||          ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  27880419 tatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaagaaattaaaaataaaacgacttccaaataataggcaactttagttttataaatta 27880517  T
Q  631 tggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcat 726  Q
    | ||||  |    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27880518 tagcaacaacaattctaaaacataagcaatgatcatactttttgaaaaacttcacgatacacaacatttgtggtctccttacaaacattattatcttcat 27880617  T
Q  727 ccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccac 826  Q
    ||| ||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  27880618 ccaggatgagcagcttcagaccttttcttgaagttactcgagagacagcgacata-agttgtccatgcgtaaacacaggcttaggaagataaaaccccac 27880716  T
Q  827 tcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatca 926  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27880717 tcgagataaagattgacgctgacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaattgcatgcgcctaaatttgaagggtagtcctggatca 27880816  T
Q  927 ctcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactt 1025  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  27880817 ctcggaataagattcatcctgggaatgaataccctagtatctgccctttttcctgtaattacggtagcaactatcgtgctcttccctagatgtgtaactg 27880916  T
Q  1026 tcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattcc 1125  Q
    ||||||| ||| ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  27880917 tcagcctagtaccattacacagtccattagcctgatcgatgtttctcatcagcataactggacatcccacctttagtttcaacctgtgatttggaattcc 27881016  T
Q  1126 agagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactct 1225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27881017 agagctcttaataccattaagaaattccagtgtgaaccactcgctttggacatcataattttcacccgatctacaaatagaatcagagcttaaatactct 27881116  T
Q  1226 ttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggt 1325  Q
    |||||||||| ||||||| | || || ||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||    
T  27881117 ttctcttcacttggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcagctgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggt 27881216  T
Q  1326 caccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctacctt 1425  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27881217 caccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgggtccgatatcagcaaatcttcaggagtttctacctt 27881316  T
Q  1426 catttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgat 1525  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||    
T  27881317 tatttcaccattgtcatccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttctacctgctctgcatgtaccgaagat 27881416  T
Q  1526 gcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatcctt 1624  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| |||| | ||||     
T  27881417 gcacccaatctcatattaacggtaagcctcaacacattacaataagcccatatctttgatgaattgaccgaggcatcaacaatatccggccttgttcctc 27881516  T
Q  1625 ttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27881517 ctcggacaacatgcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtttaagcgcgtttaggggatcattcttggacatgat 27881616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 760; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1722
Target Start/End: Original strand, 39882270 - 39883713
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39882270 taatagttattgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgatt 39882369  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn----gttccgcgtattgtta 484  Q
    ||||||||            ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||| |||||||    
T  39882370 gttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaaacaggttccgcggattgtta 39882469  T
Q  485 tacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttn 584  Q
     || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||| | | ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||      
T  39882470 aacctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatgtcaggaggatctgcttataaagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaagaaattaa 39882568  T
Q  585 nnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttc 679  Q
            |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39882569 aaataaaacgacttccaaacaataggcaactttagttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttc 39882668  T
Q  680 acgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgaca 779  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| || |||||| ||||| |||||||||| | |||||    
T  39882669 acgatacacaacatttgtggtctccttacaaacattattattttcatccaggatgagcaacttcagaccttttcttgaagttactcgagagatagcgaca 39882768  T
Q  780 tagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcg 879  Q
    || |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39882769 taaagttgtccatgcgtgaacacaggcttatgaagataaacccccactcgagataaagattgaccctggcttttatttattgtcattgcaaaacaaagcg 39882868  T
Q  880 tcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcc 978  Q
    |||||| |||||   ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39882869 tcaatggaaattgtctgcgcctgaatttgaagggtagttcttgatcactcggaataagattcatcctgggaatgaataccctggtacctgccctttttcc 39882968  T
Q  979 tgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagc 1078  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||    
T  39882969 tgtaattacggtagcagctatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagcctagtaccattacacagtccattggcctgatcgatgtttctcatcagc 39883068  T
Q  1079 ataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacat 1178  Q
    |||| ||||||||| ||| ||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  39883069 ataactggacatcccacctttaatttcaacatgtgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgatgtgaaccactcgctttggacat 39883168  T
Q  1179 cagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactga 1278  Q
    || |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   || || ||| || |||||| ||||||||||||    
T  39883169 cataattgtcacccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacttggaatcaacgacatcataaattcgttaacatgctcaactga 39883268  T
Q  1279 atcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaac 1378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39883269 atcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggcaaaatagctgggcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaac 39883368  T
Q  1379 ggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgc 1478  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  39883369 ggatttgttgtgtccgatatcagcaaatctttaggaatatctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatcc 39883468  T
Q  1479 actcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatat 1578  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  39883469 acttgccaaaattagcaatttcttcatgctctgcatgtaccgaagctgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagccaatat 39883568  T
Q  1579 ctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcatt 1677  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||| ||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  39883569 ctttgacgaattgactgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctaggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacgtaaaactactgtcatt 39883668  T
Q  1678 ccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatg 1722  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  39883669 ccaccaaaaggtttaagcgcgtttaggggatcattcttggacatg 39883713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 748; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 8429961 - 8428272
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggatt--tatact 134  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||    
T  8429961 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttcattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatttggattattatact 8429863  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgtt 233  Q
    | |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||||||||| || || ||||||||    
T  8429862 tgtactaattatttgtagcataaaatgcactcattgttaaacttagcatatgtaattttcttgcaaaaatacgtcgacgtactgtgtaataatatttgtt 8429763  T
Q  234 aacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaac 333  Q
     ||| ||| |||||||||||||||               ||||         || ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||    
T  8429762 gacaaaatgtattttattaatcataaaaactaaaaaatatgtatttttttttatataatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaac 8429663  T
Q  334 gttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaat 433  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||            ||||||  |||||||||||||||||    
T  8429662 gtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgattgttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaat 8429563  T
Q  434 attgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnng----ttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctg 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||              || | || ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||    
T  8429562 attgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaaaaagatttcacgaattgttaaacctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatgacaggaggatctg 8429463  T
Q  530 cttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaat 628  Q
    |||| ||| ||||| |||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||          |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  8429462 cttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccggtacgccttacaaagaaattaaaaataaaacgacttccaaacaataggcaactttagttttatatat 8429364  T
Q  629 tatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttc 724  Q
    ||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  8429363 tatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcacgatacacaacatttgtggtctccttacaaacattattatcttc 8429264  T
Q  725 atccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactccc 824  Q
    ||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| || | |||||||  |||||||||||||||| |||    
T  8429263 atccaggatgagcagcttcagaccttttcttgaagttactcgagagacatcgacataaagttgtctatgcgtgaacacatgcttaggaagataaaccccc 8429164  T
Q  825 actcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggat 924  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8429163 actcgagataaagattgaccctgtcttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaattgcctgcgtctgaatttgaagggtagtcctggat 8429064  T
Q  925 cactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcct-gtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaa 1022  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||    
T  8429063 cactcggaataagattcatcctgggaatgaataccctagtacctgccctttttccttgtaattacggtagcagttatcgtgctcttccctagatgtataa 8428964  T
Q  1023 ctttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaat 1122  Q
    || ||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||    
T  8428963 ctgtcagcctagtaccattacacagtccattggcctgatcgatgtttctcaacagcataactggacatcccacctttagtttcaacctgtgatttggaat 8428864  T
Q  1123 tccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatac 1222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||    
T  8428863 tccagagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactcgctttggacatcagaatattcacccgatctaaaaatagaatcagaggttaaatac 8428764  T
Q  1223 tctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcg 1322  Q
    ||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||      
T  8428763 tctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaattgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagtt 8428664  T
Q  1323 ggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctac 1422  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8428663 ggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcaggaatttctac 8428564  T
Q  1423 cttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgat 1522  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  8428563 cttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaa 8428464  T
Q  1523 gatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatc 1621  Q
    ||||||  ||||           || ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||  |||||| ||    
T  8428463 gatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaataagcccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatctggcctcgttc 8428375  T
Q  1622 cttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacat 1721  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||   | ||||| |||||||||||||||||    
T  8428374 ctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgccattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacat 8428275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 709; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 290 - 1724
Target Start/End: Original strand, 37260406 - 37261835
Alignment:
Q  290 aatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattg 389  Q
    |||||||||||||  ||| |||||| |||||  | |||||||||||| ||||||||||   ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  37260406 aatagtcagtgtcgtatgaatacacgtagtccgtaaatgcaaacgtttaattttttacatgtgtatataaatatagtttgggttacagaaacgccgattg 37260505  T
Q  390 ttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnng-ttccgcgtattgttatact 488  Q
    |||||||            ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | ||||||| ||||||| ||     
T  37260506 ttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaaggttccgcgaattgttaaacg 37260605  T
Q  489 tgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnn 588  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||          
T  37260606 tgaaaagtacatgaattaatagtcaatggcaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaagaaattaaaaat 37260704  T
Q  589 nnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacga 683  Q
        ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37260705 aaaacgacttccaaacaataaacaactttaattttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcacga 37260804  T
Q  684 tacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacataga 783  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  37260805 tacacaaaatttgtggtctccttacaaacattattatcttcatccatgatgagcagcttcagaccttttcttgaagttactcgagagacagcgacataaa 37260904  T
Q  784 gttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaa 883  Q
    ||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37260905 gttgtccatgcgtgaacgcaggcttaggaagataaacccccactcgagataaagattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcga 37261004  T
Q  884 tgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttg-gaatgaataccctggtaccttccctttttcctgta 982  Q
    || ||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37261005 tggaaattgcctgcgcttgaatttgaagggtagttctgcatcactcggaataagatccatcctgagaatgaataccctggtacctgccctttttcctgta 37261104  T
Q  983 attacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataa 1082  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||| || |||| | | |||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  37261105 gttatggtagcaactatcgtgctcttccctagatgtgtaatttccagcctcgtaccactacatagtccattggcctgatcaatgtttctcatcagcataa 37261204  T
Q  1083 ttggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcaga 1182  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  37261205 ctggacatcccacccttagtttcaaccggtgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattcctttgtgaaccattcgctttggacatcaaa 37261304  T
Q  1183 attttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatca 1282  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  37261305 attttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatca 37261404  T
Q  1283 agcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggat 1382  Q
    || ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||          | |||||||||      
T  37261405 agtgttggcgcaagtattcccctttcttgaaaaaataacgggtcattaaggttatcattcaaattgggatacacaaa----------gacatcaacgg-- 37261492  T
Q  1383 ttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactc 1482  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  37261493 ttgttgtgtccaatataagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccactt 37261592  T
Q  1483 gccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatcttt 1582  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  37261593 gccaaaattagcaatttcttcttgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatcttt 37261692  T
Q  1583 gatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccac 1681  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37261693 gatgaattgatcgagacatcaacaatatcctgcctcgttccttttcagacaacaggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattccac 37261792  T
Q  1682 caaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||    
T  37261793 cgaaaggtctaaactcgtttaaaggatcattcctagacatgat 37261835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 690; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 592 - 1724
Target Start/End: Original strand, 3689372 - 3690509
Alignment:
Q  592 cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgataca 687  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||   |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3689372 cgacttccaaacaataggcaactttggttttctaaattatagcagcaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcacgataca 3689471  T
Q  688 caacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttg 787  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  3689472 caatatttgtggtctccttacaaacattattatcttcatccaggacgagcagcttcaaaccttttcttgaagttactcgagagacagcgacataaagttg 3689571  T
Q  788 tccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaa 887  Q
     |||| | |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3689572 cccatgcgtgaacacaagcttaggaagataaacccccactcgagataaagattgaccttgacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgga 3689671  T
Q  888 aatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaatta 986  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  3689672 aattgcttgcgc-tgaatttgaagggtattcctgggtcactcggaataagattcatcttgggaatgaataccctggtaccttccctttttcatgtattta 3689770  T
Q  987 cggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattgg 1086  Q
    | |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  3689771 cagtagcatctatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagcctcgtaccattacacagtccattgacctgatcgatgtttctcatcagcataactgg 3689870  T
Q  1087 acatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattt 1186  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3689871 acatcccaccattagtttcaaccggtgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctagagatcagaattt 3689970  T
Q  1187 tcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcg 1286  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3689971 tcgcccgatcgacaaactgaatcagagcttaaatactctttctctccacttggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctcaaccgaatcaagcg 3690070  T
Q  1287 ttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgt 1386  Q
    ||||||||||||| | | ||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||| ||||||    
T  3690071 ttggtgcgagtattcacttttcttgaaaaaagagtgggtcaccaatgttatcattcaaatcgggatatacaaagtccattagtgacatcaacgaatttgt 3690170  T
Q  1387 tgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgcca 1486  Q
    ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  3690171 tgtatcggatatgagcaaatctttgggaatttctaccttcatttcaccattctcattcgaagtgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcca 3690270  T
Q  1487 aaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatg 1586  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  3690271 aaattagcagtttcttcctgctctgcaggtcccgaagatgcacccaatctcatattaactgtaagcctcaacacattacaataagcccatatctttgatg 3690370  T
Q  1587 aattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaa 1685  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  3690371 aattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactatcattccaccaaa 3690470  T
Q  1686 aggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  3690471 aggtctaaactcgtttaggggatcattcttggatatgat 3690509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 690; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 592 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 3877415 - 3876278
Alignment:
Q  592 cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgataca 687  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||   |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3877415 cgacttccaaacaataggcaactttggttttctaaattatagcagcaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcacgataca 3877316  T
Q  688 caacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttg 787  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  3877315 caatatttgtggtctccttacaaacattattatcttcatccaggacgagcagcttcaaaccttttcttgaagttactcgagagacagcgacataaagttg 3877216  T
Q  788 tccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaa 887  Q
     |||| | |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3877215 cccatgcgtgaacacaagcttaggaagataaacccccactcgagataaagattgaccttgacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgga 3877116  T
Q  888 aatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaatta 986  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  3877115 aattgcttgcgc-tgaatttgaagggtattcctgggtcactcggaataagattcatcttgggaatgaataccctggtaccttccctttttcatgtattta 3877017  T
Q  987 cggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattgg 1086  Q
    | |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  3877016 cagtagcatctatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagcctcgtaccattacacagtccattgacctgatcgatgtttctcatcagcataactgg 3876917  T
Q  1087 acatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattt 1186  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3876916 acatcccaccattagtttcaaccggtgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctagagatcagaattt 3876817  T
Q  1187 tcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcg 1286  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3876816 tcgcccgatcgacaaactgaatcagagcttaaatactctttctctccacttggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctcaaccgaatcaagcg 3876717  T
Q  1287 ttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgt 1386  Q
    ||||||||||||| | | ||| ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||| ||||||    
T  3876716 ttggtgcgagtattcacttttcttgaaaaaagagtgggtccccaatgttatcattcaaatcgggatatacaaagtccattagtgacatcaacgaatttgt 3876617  T
Q  1387 tgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgcca 1486  Q
    ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  3876616 tgtatcggatatgagcaaatctttgggaatttctaccttcatttcaccattctcattcgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcca 3876517  T
Q  1487 aaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatg 1586  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  3876516 aaattagcagtttcttcctgctctgcaggtcccgaagatgcacccaatctcatattaactgtaagcctcaacacattacaataagcccatatctttgatg 3876417  T
Q  1587 aattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaa 1685  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  3876416 aattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactatcattccaccaaa 3876317  T
Q  1686 aggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  3876316 aggtctaaactcgtttaggggatcattcttggatatgat 3876278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 681; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 478 - 1724
Target Start/End: Original strand, 37372216 - 37373468
Alignment:
Q  478 attgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaag 577  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  37372216 attgttaaacctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatgacaggaggatctgcttatatagaaattgcatgta-tataatgaccaatacgccttacaaag 37372314  T
Q  578 aaatttnnnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaa 672  Q
    |||||          |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  |    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  37372315 aaattaaaaataaaacgacttccaaacaataggcaactttagttttataaattatagcaacaacaattctaaaacataatcaatgatcatactttttgaa 37372414  T
Q  673 aaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagac 772  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  37372415 aaacttcacgatacacaacatttgtggtctccttacaaacattatcatcttcatccaggatgagcagcttcagaccttttcttgaagttactcgagagac 37372514  T
Q  773 aacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaa 872  Q
    | ||||||| |||||||||| | |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37372515 agcgacataaagttgtccatgcgtgaatacaggcttaggaagataaacccccactcgagataaagattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaa 37372614  T
Q  873 caaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccc 971  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||     
T  37372615 caaagcgtcaatggaaattgcctgcgcttgaatttgaagggtagttctggatcactcggaataagattcatcctgggaatgaataccctagtacctgcca 37372714  T
Q  972 tttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttct 1071  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  37372715 tttttcctgtaattacggtagcagctatcgtgctcttccctagatgtgtaattgtcagcctagtaccattacacagtccattggcctaatcgatgtttct 37372814  T
Q  1072 cataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctc 1171  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  37372815 catcagcataactggacatcccacctttagtttcaacctgtgatttggaattccaaagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactcgctt 37372914  T
Q  1172 tggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgct 1271  Q
    |||||||||||||| || ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||  ||||| |||||    
T  37372915 tggacatcagaattatcacccgatctaaaaatagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcataaattggttaacatgct 37373014  T
Q  1272 caactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgg 1371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  37373015 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttcgaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtga 37373114  T
Q  1372 catcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaag 1471  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  37373115 catcaacggatttgttatgtctgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 37373214  T
Q  1472 agtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataag 1571  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37373215 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 37373314  T
Q  1572 cacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactat 1670  Q
    | ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||| |||||| ||||  || ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  37373315 cccatatctttgacgaattgaccgacgcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcagacaacaggcaatatctgcttaaaatcaccacctaaaactac 37373414  T
Q  1671 tgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    ||| ||||||||||||||| |||   | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  37373415 tgtgattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgat 37373468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 646; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 1215
Target Start/End: Original strand, 6088017 - 6089232
Alignment:
Q  4 attatgttatctaa-gttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaa-tatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 101  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6088017 attatgttatttaaagttataaatgtggttataatttaaatttaatatggaaaaaaaatatcatcttaattttgtatatagtttgaaatatctaaacatt 6088116  T
Q  102 gcacataacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaa 200  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  6088117 gcacataacgattaaagtatttgaatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcatatgtaatatttta-caaa 6088215  T
Q  201 aatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtg 300  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||              |||||         || ||||||||||||    
T  6088216 aatacgccgacgtattgtatattattatttgttgacataatgtattttattaatcatataaactaaaaaatttgtatttttta--atataatagtcagtg 6088313  T
Q  301 tcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnn 400  Q
    | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||        
T  6088314 ttagatgtatacacctagtatgtgaatgcaaacgttaatttttttacgggtgtgtatagatatagtttgggctacagaaacaccgattgttatttgttta 6088413  T
Q  401 nnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcat 500  Q
            |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||         |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6088414 tatattttacaaaaccaatggtctaatgtaaacattgtattttagggtaacaatgatgtaaaaaaaaagttctgcgtattgttatacctgaaaagtgcat 6088513  T
Q  501 caattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnncgacttcca 600  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||         |||||||||    
T  6088514 caattaaaagtcaatggcaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtcctgtaatgaccagtacgtcttacaaagaaatt-aaaaaaaacgacttcca 6088612  T
Q  601 aacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttt 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||     
T  6088613 aacaatacgcaactttagttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataacaaatgatcatactttttgaaaaacttaacgatgcacaacatttg 6088712  T
Q  697 tggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcat 796  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  6088713 tggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcaacttcaaaccttttctagaagtaactcgagagacagcgacatagagttgtccatgcgt 6088812  T
Q  797 gaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatg 896  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  6088813 gaacacgggcttaggaatataaactcccactcgagataaaggttgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaattgaatg 6088912  T
Q  897 cgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcat-cttggaatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaa 995  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6088913 cacctgaatttgaagggtagtcctagatcactcagaataagattcatcctgggaatgaataccctcgtacctgccctttttcctgtaactacagtagcaa 6089012  T
Q  996 ctatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctac 1095  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  6089013 ctatcgtgctcttccctagatgtgtgactggcagcttcgtaccattacacagttcattggcctgatcgatgtttctcatcagcataactggacatcccac 6089112  T
Q  1096 ccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgat 1195  Q
    |||||||||||||  || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| || | ||||||| ||||||    
T  6089113 ccttagtttcaactagtgatttgaaatcccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcaccttggatattaaaattttcacccgat 6089212  T
Q  1196 cgacaaacagaatcagagct 1215  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6089213 cgacaaacagaatcagagct 6089232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 575; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 1153
Target Start/End: Complemental strand, 15033999 - 15032840
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 101  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15033999 attatgttatcttaaagttaaaagtgtgattataatttaaatttgatattgaaaaaaatttcatcttaattttgaatatattttgaaatatctaaacatt 15033900  T
Q  102 gcacataacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaa 200  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15033899 gcacataacgatcaaagtatttggatttatacttatattaattatttgtattataagatgtactcattgttaaacttagcatatgtaatatttttgcaaa 15033800  T
Q  201 aatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtg 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||              |||||         || ||||||||||||    
T  15033799 aatacgccgacgtactgtatattattatttgttgacataacaaattttattaatcataaaaactaaaaaaattgtatttttttt-atataatagtcagtg 15033701  T
Q  301 tcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnn 400  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| | ||| | |||||||||||        
T  15033700 tcagatgtatacacctagcctatgaatacaaaagttaaattttttacaggtgtgtataaatatggtttgggctacagatacgacaattgttatttgtttt 15033601  T
Q  401 nnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngt--tccgcgtattgttatacttgaaaagtgc 498  Q
            | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |  | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  15033600 tattttttagaaaaccaatgatctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaaatatttcgcgtattgttatacctaaaaagtgc 15033501  T
Q  499 atcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnn------c 592  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||     ||||| ||||||| |||||||||||||               |    
T  15033500 atcaattaaaagtcaatgacaggaggatctacttacatagaaattgcatgtc-----atgacaagtacgccttacaaagaaattaaacaagaaaaaaaac 15033406  T
Q  593 gacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacac 688  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15033405 gacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataacctaagatcatactttttgaaaaacttcacgatacac 15033306  T
Q  689 aacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgt 788  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15033305 aacatttgtggtctccttgcaaatattattatcttcatccaagatgagcaacttcaaacattttctataagtaactcgagagacagcgacatagagttgt 15033206  T
Q  789 ccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaa 888  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15033205 ccatgcgtgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaagattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcctcaatggaa 15033106  T
Q  889 atttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcat-cttggaatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattac 987  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15033105 attgcctgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcaaaataagattcatcctgggaatgaataccctggtacctgccctttttcctgttattac 15033006  T
Q  988 ggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattgga 1087  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||  | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15033005 ggtagcaactatcgtgctcttccctagatgtgtaattgtcagcctcgtaccattacacggtccattggcctgatcgatgtttctcatcagcataattgga 15032906  T
Q  1088 catcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattcc 1153  Q
    ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15032905 catcacacccttagtttcaaccgatgatttggaattctagagctcttaataccattaagaaattcc 15032840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 1153
Target Start/End: Original strand, 4050606 - 4051766
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 101  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4050606 attatgttatcttaaagttataattgtgtttataatttaaattcgataagaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 4050704  T
Q  102 gcacataacaattaaaatatttggatt--tatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgca 198  Q
    ||| ||||| || ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4050705 gcatataacgataaaagtatttggattattatacttgtactaattatt-gtagtataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaatatttttgca 4050803  T
Q  199 aaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcag 298  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||               ||||         || ||||||| ||    
T  4050804 aaaatacgccgacgtactgtataataatatttgttgacaaaatgtattttattaatcataaaaactaaaaaatgtgtatttttttttatataatagttag 4050903  T
Q  299 tgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnn 398  Q
    ||||| ||| |||||| |||||  | |||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  4050904 tgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgaaaacgtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgattgttatttgtt 4051003  T
Q  399 nnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn--------gttccgcgtattgttatacttg 490  Q
              ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||                 | ||| ||  |||||| || ||    
T  4051004 tttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtactttaggataacaacgatgtaaaaaaaaaaaaaaaaggatccacgatttgttaaacctg 4051103  T
Q  491 aaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnn 590  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||            
T  4051104 aaaagtgcatgaattaatagtcaatgacaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaacagtacgccttacaaagaaattaaaaataa 4051202  T
Q  591 n-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgata 685  Q
      |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||  |    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4051203 aacgacttccaaacaataggcaactttagatttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataacaaataatcatactttttgaaaaacttcacgata 4051302  T
Q  686 cacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagt 785  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| || |||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  4051303 tacaacatttctggtctccttacaaacattattatcttcatccacaatgagcaccttcagaccttttcttgaagttactcgagagacagcaacataaagt 4051402  T
Q  786 tgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatg 885  Q
    |||||||   ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||   |||||||||||||| ||||||    
T  4051403 tgtccatgtgtgaacacaggcttaggaagataaacccccactcgagataaagattgaccctgacttttatatattg---ttgcaaaacaaagcatcaatg 4051499  T
Q  886 aaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatc-ttggaatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaat 984  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||     
T  4051500 gaaattgcatgcgcctgaatttgaagggtagtcatggatcactcggaataagattcatcatgggaatgaataccctagtaccagccctttttcctgtaac 4051599  T
Q  985 tacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataatt 1084  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| |||||  ||||||||  |||||| |||  |||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4051600 tacggtaggagctatcgtgctcttccctag--gtgtaactgacagcctagtactattacacagtccatttgtctgatcgatgtttctcatcagcataatt 4051697  T
Q  1085 ggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattcc 1153  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4051698 ggacatcccacccttagtttcaaccggtgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattcc 4051766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 902
Target Start/End: Complemental strand, 2262419 - 2261499
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgt---------atatattttgaaatat 92  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||    
T  2262419 attatgttatcttaaagttataagtatggttataatttaaatttgatatgga-aaaaatatcatcttaattttgttaattttatatatattttgaaatat 2262321  T
Q  93 ctaaacattgcacataacaattaaaatatttggatttatacttatactaa-ttatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaata 190  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2262320 ctaaacattgcagataacgattaaagtatttgaatttatactta-actaaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttaacatatgtaata 2262222  T
Q  191 tttttgcaaaaatacaccgacgt---actgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnat 287  Q
    ||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||              |||||         ||    
T  2262221 tttttgcaaaaatactccgacgtcgtactgtatattattatttgttgacataatgtattttattaatcataaaaactaaaaaaattgtatttttta--at 2262124  T
Q  288 gtaatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgat 387  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2262123 ataatagttagtgtcagatgtatacacctagtctgtgaatgcaaacgttaaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaatgccgat 2262024  T
Q  388 tgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn--------gttccgcgtat 479  Q
    |||||||||            ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||                 ||||| |||||    
T  2262023 tgttatttgtttttattttttacaaaatcaatggtctaatataaatattatattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaaaaaaaaaagttccacgtat 2261924  T
Q  480 tgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaa 579  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2261923 tgttatacctgaaaaatgcatcaattaaaagtcaatggcaggacgacatgcttatatagaaattgcatgtcttgtaatgaccaatacgccttacaaagaa 2261824  T
Q  580 atttnnnnnnnncgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaa 675  Q
    ||          ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2261823 at--aaaaaaaacgacttccaaacaatacgcaacttttgttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaa 2261726  T
Q  676 cttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaac 775  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  2261725 cttcacgatacacaacattcgtggtctccttgcaaacattattatctccatccaatatgagcaacttcaaaccttttctagaagtaactcgagagacagc 2261626  T
Q  776 gacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaa 875  Q
    |||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2261625 gacataaagttgttcatacgtgaacacgggcttaggaagataaactcccacttgagataaagattgaccctgacttttatttattgtcgttgcaaaacaa 2261526  T
Q  876 agcgtcaatgaaaatttcatgcgcctg 902  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  2261525 agcatcaatggaaattgcatgcgcctg 2261499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 744 - 1319
Target Start/End: Complemental strand, 24630530 - 24629954
Alignment:
Q  744 aaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgac 843  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24630530 aaacttttactagaagtaactcgagagacagcgacatagagttgcccatgcgtgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaagattgac 24630431  T
Q  844 ccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcat 943  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24630430 cctgacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaattatatgcgcatgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcat 24630331  T
Q  944 cttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcatta 1042  Q
    | ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  24630330 cctgggaatgaataccttggtatctgccctttttcctgtaattacggtagcatctattgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagccttgtaccatta 24630231  T
Q  1043 cacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccat 1142  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24630230 cacagtccattggcctgatcgatgtttctcatcagcacaactggacatcccacctttagtttcaaccggtgatttggaattccaaagctcttaataccat 24630131  T
Q  1143 taagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaat 1242  Q
    |||| |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24630130 taaggaattccgttgtgaaccgctcattttggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaat 24630031  T
Q  1243 cggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaata 1319  Q
    | |||| || |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24630030 cagtgacatcatatattcgttaacatgttcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaata 24629954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 749 - 1319
Target Start/End: Original strand, 10024618 - 10025189
Alignment:
Q  749 ttttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgaccctta 848  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  10024618 ttttctagaagtaactcgagagacagcgacatagagttgcccatgtgtgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaagattgaacctga 10024717  T
Q  849 cttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg 948  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10024718 cttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatagaaattatttgcgcatgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcctgg 10024817  T
Q  949 -aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaa 1047  Q
     |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||     
T  10024818 gaatgaataccttggtacttgccctttttcctgtaattacggtggcagctatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagccttgtaccattacacag 10024917  T
Q  1048 ttcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaaga 1147  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  10024918 ttcattggcctgatccatgtttctcatcagcataactggacatcccacctttagtttcaaccggtgatttggaataccagagctcttaataccattaagg 10025017  T
Q  1148 aattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtg 1247  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  10025018 aattccgttgtgaaccactcactttggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacttggaatcaatg 10025117  T
Q  1248 aaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaata 1319  Q
    | || |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  10025118 acatcatatattcgttaacatgttcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaata 10025189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 749 - 1319
Target Start/End: Complemental strand, 30347208 - 30346637
Alignment:
Q  749 ttttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgaccctta 848  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  30347208 ttttctagaagtaactcgagagacagcgacatagagttgcccatgcgtgaacacgggtttaggaagataaactcccactcgagataaagattgaccctga 30347109  T
Q  849 cttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg 948  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  30347108 cttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaattatctgcgcatgaatttgaaggatagtcctggatcactcggaataaaattcatcctgg 30347009  T
Q  949 -aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaa 1047  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||     
T  30347008 gaatgaataccttggtacctgccctttttcctgtaattacagtagcagctattgtgctcttccctagatgtgtaactgtcaaccttgtaccattacacag 30346909  T
Q  1048 ttcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaaga 1147  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30346908 tccattggcctgatcgatgtttctcatcagcataactggacatcccacctttagtttcaaccggtgatttggaattccagagctcttaataccattaagg 30346809  T
Q  1148 aattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtg 1247  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30346808 aattccgttgtgaaccactcactttggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagtg 30346709  T
Q  1248 aaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaata 1319  Q
    | || |||||| |||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  30346708 acatcatatattcgttaacatgttcaacttaatcaagtgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaata 30346637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1181 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 17871868 - 17871325
Alignment:
Q  1181 gaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaat 1280  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  17871868 gaattttcacccgatcgacaaacagaaccagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaacagaat 17871769  T
Q  1281 caagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacgg 1380  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17871768 caagcgttggtgcgagtatttccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcatttaaatcgagatacacaatgtctataagtgacatcaacgg 17871669  T
Q  1381 atttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcac 1480  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||     
T  17871668 atttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcacca-tctcatccgaagcgccgttgccttctctaattgagagtatccat 17871570  T
Q  1481 tcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatct 1580  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17871569 ttgccaaaattagcaatttattcctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatcccatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatct 17871470  T
Q  1581 ttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattcc 1679  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17871469 ttgatgaactgattgaggcatcaacaatatcatgcctcgttccttttcggatgacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaacttttgtctttcc 17871370  T
Q  1680 accaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17871369 accaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 17871325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 289 - 917
Target Start/End: Original strand, 26831720 - 26832344
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26831720 taatagtgagtgtcagatgtatacatctagtctgtcaatgcaaacgttaaattttttatgggtgtatataaatatagtttgggctacagaaacgccgatt 26831819  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngttccgcgtattgttatact 488  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||  |||||||||||||          ||||||||         |||||||||||||||||||     
T  26831820 gttatttgtttttattttttacaaaatcaatggtctaagttaaatattgtatt----------aacgatgtaaaaaaaaagttccgcgtattgttatacc 26831909  T
Q  489 tgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnn 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||          
T  26831910 tgaaaagtgcatcaattaaaagtcaaaagcaagaagatctgcttatatagaaattgcatgtcctgtaatgaccagtacaccttacaaagaaattaaaaaa 26832009  T
Q  589 nnncg--acttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacg 682  Q
           |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||   |    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26832010 agatataactttcaatcaatacgcaactttagttttctaaattatagcatcaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttaaaaaacttcacg 26832109  T
Q  683 atacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatag 782  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26832110 atacacaacatttgtggtctccttgaaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaaccttttctagaagtaactcgagagacaacgacatag 26832209  T
Q  783 agttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtca 882  Q
    |||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26832210 agttgctcatgcgtgaacacgggcttaggaagataaactgccactcgagataaagattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaataaaacgtca 26832309  T
Q  883 atgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagt 917  Q
    ||| |||||   ||||| |||||||||||||||||    
T  26832310 atggaaattgtctgcgcatgaatttgaagggtagt 26832344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 289 - 884
Target Start/End: Original strand, 43448566 - 43449166
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| |||||    
T  43448566 taatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaactttttacgggtgtgtataaatatagttcgggccacagaaacgtcgatt 43448665  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngtt-ccgcgtattgttatac 487  Q
    ||||||||            ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | | ||||| ||||||| ||    
T  43448666 gttatttgttgttaatttttacaaaactaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaaggtaccgcggattgttaaac 43448765  T
Q  488 ttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnn 587  Q
     |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||         
T  43448766 ctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatggcaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacagagaaattaaaaa 43448864  T
Q  588 nnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacg 682  Q
         ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43448865 taaaacgacttccaaacaatagacaactttggttttataaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcacg 43448964  T
Q  683 atacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatag 782  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  43448965 atacacaacatttgtggtctccttgcaaacattattatcttcatccaggatgagcagcttcagaccttttcttgaagttactcgagagacagcgacatag 43449064  T
Q  783 agttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtca 882  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43449065 agttgtccatgcgtgaacacaggcttaggaagataaacccccactcgagataaagattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtca 43449164  T
Q  883 at 884  Q
    ||    
T  43449165 at 43449166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1404 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 30346637 - 30346316
Alignment:
Q  1404 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttc 1503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  30346637 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgccgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttt 30346538  T
Q  1504 ctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 1603  Q
    |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30346537 ctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagtcttaacacattaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 30346438  T
Q  1604 acaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcattta 1702  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||    
T  30346437 acaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgacatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaatagtttaaactcgttta 30346338  T
Q  1703 gaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    | |||||| |||||||||||||    
T  30346337 ggggatcaatcttggacatgat 30346316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 642 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 43524603 - 43524258
Alignment:
Q  642 taaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtt 741  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  43524603 taaaacataatcaattatcatactttttgaaaaacttcacgatacacaacatttgtggtctccttgcacatattattatcttcatccaatatgagcagct 43524504  T
Q  742 tcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaag--ataaactcccactcgagataaatat 839  Q
     ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||| ||    
T  43524503 acaaacctcttctagaagtaactcgagagacagcgacatagagttgtccatgcgtgaacacgggcctaggaagatataaactcccactcgggataaagat 43524404  T
Q  840 tgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagat 939  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  43524403 tgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgttaagggaaattgcatgcgcctgaatttgaagggtagtcttggatcacttagaataagat 43524304  T
Q  940 tcat-cttggaatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaat 984  Q
    |||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  43524303 tcatcctaggaatgaatatcatggtaccttccctttttcctgtaat 43524258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1404 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 24629954 - 24629640
Alignment:
Q  1404 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttc 1503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||       ||||     
T  24629954 aatcttcaggaatttctaccttcatttaaccattctcatccgaagcgttgttgtcgtctccaattcagagtatccacttgccgaaatt-------tcttt 24629862  T
Q  1504 ctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 1603  Q
    |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24629861 ctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagtctcaacacattaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 24629762  T
Q  1604 acaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcattta 1702  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  24629761 acaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgatatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaatggtttaaactcgttta 24629662  T
Q  1703 gaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  24629661 ggggatcattcttggacatgat 24629640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1404 - 1724
Target Start/End: Original strand, 10025189 - 10025510
Alignment:
Q  1404 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttc 1503  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  10025189 aatctttaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttaccgtctctaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttt 10025288  T
Q  1504 ctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 1603  Q
    |||||||||||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10025289 ctgctctgcaggtaccaaagatgcacccagtctcatattaacagtaagtctcaacacatcaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 10025388  T
Q  1604 acaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcattta 1702  Q
    ||||| |  ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  10025389 acaatatattgcctcgttccttttcggacagcaggcaatatctgcctaatatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaatggtttaaactcgttta 10025488  T
Q  1703 gaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  10025489 ggggatcattcttggacatgat 10025510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 804 - 1153
Target Start/End: Original strand, 30313813 - 30314157
Alignment:
Q  804 ggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctga 903  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30313813 ggcttaggaagataaacccccactcgagataaagattgaccctggcttttatttattgtta---caaaacaaagcgtcaatgaaaattgcatgcgcctga 30313909  T
Q  904 atttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatctt 1002  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||| |  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  30313910 atttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcatggaaatgaataccatagta-cagctctttttcctgtaattacggtagcagctatcgt 30314008  T
Q  1003 gctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagt 1102  Q
    |||||| |||||  ||||||||  || ||| |||  |||||||| | |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  30314009 gctcttccctag--gtgtaactgacaacctagtactattacacagtccatttgtttgatcgatgtttctcatcagcataattggacatcccacccttagt 30314106  T
Q  1103 ttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattcc 1153  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  30314107 ttcaatcggtgatttggaattccagaggtcttaataccatgaagaaattcc 30314157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 37 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 24631186 - 24630641
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatact 134  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  24631186 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatttggattattatact 24631088  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgtt 233  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||    
T  24631087 tgtactaattatttatagtataagatgcattcattgttaaacttagcatatgtaattttcttgcaaaaatacgccgacgtactgtgtaataatatttgtt 24630988  T
Q  234 aacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaac 333  Q
     ||| ||| |||||||||||||||               ||||         || |||||||||  |||| ||| |||||| |||||  | |||||||||    
T  24630987 gacaaaatgtattttattaatcataaaaactaaaaaatatgtatttttttttatataatagtcatcgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaac 24630888  T
Q  334 gttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaat 433  Q
    ||| || ||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||            ||||||  |||||||||||||||||    
T  24630887 gtttaa-tttttacgagtgtgtataaatgtagtttgggctacagaaacaccgattgttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaat 24630789  T
Q  434 attgtatttta-gggtaacaacgatgtnnnnnnnnngtt-ccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgct 531  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||         ||| ||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  24630788 attgtattttaggggtaacaacgatgtaaaaaaaaggttaccgcggattgttaaacctgaaaaatgcatgaattaatagtcaatggcaggaagatctgct 24630689  T
Q  532 taaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaa 580  Q
    || ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24630688 tatatagaaattgcatgt-ctataatgaccagtacgccttacaaagaaa 24630641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 43525299 - 43524845
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 101  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43525299 attatgttatcttaaagttataagtgtggttttaatttaaatttgtcatgga-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 43525201  T
Q  102 gcacataacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaa 200  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| | |||  |  |||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43525200 gcacataatgattaaagtatttggatttataatcataaaatatatttgtagtataacagttgctcattgttaaacttagcatatgtaatatttttgcaaa 43525101  T
Q  201 aatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtg 300  Q
    |||    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||              |||||         ||  |||||||||||    
T  43525100 aatgtgtcgacgtactctatattattatttgttgacataatgtattatattaatcataaaaaataaaatatttgta--tttttttataaaatagtcagtg 43525003  T
Q  301 tcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnn 400  Q
      ||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||        
T  43525002 caagatgtagacacccattctgtgaatgcaaatgttagattttttacgggtgtgtataaatatagtttgtgctacacaaacgctgaatgttctttgtttt 43524903  T
Q  401 nnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatg 458  Q
            |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43524902 tattttttacaaaatcaatgatctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatg 43524845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 458
Target Start/End: Original strand, 18115607 - 18116063
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 101  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18115607 attatgttatcttaaagttataagtgtggttttaatttaaatttgacatgga-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 18115705  T
Q  102 gcacataacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaa 200  Q
    |||| |||  |||||| |||||||||||||| | |||  |  ||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18115706 gcacttaatgattaaagtatttggatttataatcataaaatatatttgtagtataacggttgctcattgttaaacttagcatatgtaatatttttgcaaa 18115805  T
Q  201 aatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtg 300  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||              |||||         ||  |||||||||||    
T  18115806 aatatgccgacgtactgtatattattatttgttgacataatgtattatactaatcataaaaaataaaatatttgtatttttttttataaaatagtcagtg 18115905  T
Q  301 tcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnn 400  Q
      ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  || |||| ||||        
T  18115906 caagatgtagacacccagtctgtgaatgcaaatgttagatcttttacgggtgtgtataaatatagtttgtgctacacaaacgttgaatgttctttgtttt 18116005  T
Q  401 nnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatg 458  Q
            |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18116006 tattttttacaaaaccaatgatctaatgtaaataatgtattttagggtaacaacgatg 18116063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 37 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 30347866 - 30347322
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatact 134  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||  |||||||    
T  30347866 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataatgataaaaatatttggattattatact 30347768  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgtt 233  Q
    | |||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||    
T  30347767 tgtactaattatttatagtataaggtgcattcattgttaaacttcgcatatgtaattttcttgcaaaaatacgccgacgtactgtgtaataatatttgtt 30347668  T
Q  234 aacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaac 333  Q
     ||| ||| |||||||||||||||               ||||         || ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||    
T  30347667 gacaaaatgtattttattaatcataaaaactaaaaaatatgtatttttttatatataatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaac 30347568  T
Q  334 gttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaat 433  Q
    ||| || ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||            ||||||  |||||||||||||||||    
T  30347567 gtttaa-tttttacgggtgtgtataaatgtagtttgggctacagaaacaccgattgttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaat 30347469  T
Q  434 attgtatttta-gggtaacaacgatgt-nnnnnnnnngttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgct 531  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||          |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |  ||| |||    
T  30347468 attgtattttaggggtaacaacgatgtaaaaaaaaaggttccgcggattgttaaacttgaaaactgcatgaattaatagtcaatggcagtaagatccgct 30347369  T
Q  532 taaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaa 579  Q
    || ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30347368 tatatagaaattgcatgt-ctataatgaccagtacgccttacaaagaa 30347322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14194303 - 14194043
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaata--tcatcttaattttgt---------atatattttgaaat 90  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |  |||||||||||||||         ||||||||||||||    
T  14194303 attatgttatcttaaagttataagtgtagttataatttaaatttgatatgaaaaaaaaaagatcatcttaattttgttaattttgtatatattttgaaat 14194204  T
Q  91 atctaaacattgcacataacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaat 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  14194203 atctaaacattgcacataacgattaaagtatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtacccattgataaacttagcatatgtaat 14194104  T
Q  190 atttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttat 250  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||    
T  14194103 atttttgtaaaaatacgccgacgtactgtatatcattatttgttgaaataatgtattttat 14194043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17872311 - 17872064
Alignment:
Q  20 tataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgt---------atatattttgaaatatctaaacattgcacataac 110  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||         ||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  17872311 tataagtatggttataatttgaatttgatatggaaaaaagtatcatcttaattttgttaattttgtatatatttaaaaatatctaaacattgcatataac 17872212  T
Q  111 aattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccg 209  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |    
T  17872211 gattaaagtatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtaattattgttaaacttagcatatgcaatatttttgcaaaaatacgcgg 17872112  T
Q  210 acgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  17872111 acgtactgtatattattatttgttgacataatgtattatattaatcat 17872064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25544164 - 25543935
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 101  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25544164 attatgttatcttaaagttataattgtggttataatttaaattcgttatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatc 25544066  T
Q  102 gcacataacaattaaaatatttggat--ttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgca 198  Q
    ||| ||||| || ||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25544065 gcatataacgataaaagtatttggattattatacttgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaatatttttgca 25543966  T
Q  199 aaaatacaccgacgtactgtatattattatt 229  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  25543965 aaaataagccgatgtactgtatattattatt 25543935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 257
Target Start/End: Original strand, 30313201 - 30313439
Alignment:
Q  21 ataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaata 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||    
T  30313201 ataattgtggttataatttaaatttgataagaa-aaaaacatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaagta 30313299  T
Q  121 tttggat--ttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactg 217  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  30313300 tttggattattatacttgtactaattatttgtcgcataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaatatttttgcaaaaatacgccgatgtactg 30313399  T
Q  218 tatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    |||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  30313400 tataataatatttgttgacaaaatgtattttattaatcat 30313439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 257
Target Start/End: Original strand, 43448294 - 43448537
Alignment:
Q  16 aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaatta 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |    
T  43448294 aagttataattgtggttataatttaaattcgatatgaa-aacaatataatcttaattttgtatatattttgaaaaatttaaacattgcatataacgataa 43448392  T
Q  116 aaatatttggatt--tatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacg 212  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  43448393 aaatatttggattattatacttgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaattttcttgcaaaaatacaccgacg 43448492  T
Q  213 tactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    |||||| || || |||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  43448493 tactgtgtaataatatttgttgacaaaacgtattttattaatcat 43448537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 257
Target Start/End: Original strand, 10023966 - 10024188
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatact 134  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  10023966 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatttggattattatact 10024064  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgtt 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||    
T  10024065 tgtactaattatttgtagtataagatgcattcattgttaaacttagcatatgtaattttcttgcaaaaatacgccgacgtactgtgtaataatatttgtt 10024164  T
Q  234 aacataatatattttattaatcat 257  Q
     ||| ||| |||||||||||||||    
T  10024165 gacaaaatgtattttattaatcat 10024188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 67 - 241
Target Start/End: Original strand, 26831498 - 26831676
Alignment:
Q  67 ttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat---ttatacttatactaattatttgtagtataagatgta 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26831498 ttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacatagcgattaaagtatttggatttattatatttatactaattatttgtagtataagatgta 26831597  T
Q  164 ctcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataat 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  26831598 ctcattgttaaacttagcatatgtaatatttttgcaaaaatacgccgacgtactgtatattataatttgttgacataat 26831676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 932 - 1155
Target Start/End: Complemental strand, 2261495 - 2261271
Alignment:
Q  932 aataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagc 1030  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2261495 aataagattcatcctgggaatgaataccctggtaccagccctttttcccgtaattacggttgcaactatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagc 2261396  T
Q  1031 ctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagc 1130  Q
    |||||| |||||||||   |||||  || ||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||    
T  2261395 ctcgtaccattacacagaccattgacctcatcaatgtttctcatcagcctaactggacatcccacccttagtttcaacctgtgatttggaatgccaaagc 2261296  T
Q  1131 tcttaataccattaagaaattccgt 1155  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2261295 tcttaataccattaagaaattccgt 2261271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 117; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 257
Target Start/End: Original strand, 26792645 - 26792867
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatact 134  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  26792645 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatttggattattatact 26792743  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgtt 233  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||||||  ||||||||||| || || ||||||||    
T  26792744 tgtactaattatttgttgtataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaattttcttttaaaaatacgtcgacgtactgtgtaataatatttgtt 26792843  T
Q  234 aacataatatattttattaatcat 257  Q
     ||| ||| |||||||||||||||    
T  26792844 gacaaaatgtattttattaatcat 26792867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 642 - 806
Target Start/End: Original strand, 18116307 - 18116471
Alignment:
Q  642 taaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtt 741  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  18116307 taaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcacgatacacaacatttgtggtctccttgcacatattattatcttcatccaatatgagcagct 18116406  T
Q  742 tcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggc 806  Q
     ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  18116407 acaaacctcttctagaagtaactcgagagacagcgacataaagttgtccatgcgtgaacaagggc 18116471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 78 - 257
Target Start/End: Original strand, 3688820 - 3689002
Alignment:
Q  78 tatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggatt--tatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaa 175  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3688820 tataatttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaagtatttggattattatacttgtactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaa 3688919  T
Q  176 cttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  3688920 cttaacatacgtaatatttttgcaaaaatacgtcgacgtactgtataataatatttgttgacaaaaggtattttattaatcat 3689002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 78 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 3877965 - 3877783
Alignment:
Q  78 tatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggatt--tatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaa 175  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3877965 tataatttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaagtatttggattattatacttgtactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaa 3877866  T
Q  176 cttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  3877865 cttaacatacgtaatatttttgcaaaaatacgtcgacgtactgtataataatatttgttgacaaaaggtattttattaatcat 3877783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 257
Target Start/End: Original strand, 37260185 - 37260374
Alignment:
Q  72 tttgtatatattttgaa-atatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggatt--tatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcat 168  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||  || ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37260185 tttgtatatattttgtatatatctaaacattgcatataatgataaaagtatttggattattatacttgtactaattatttgtagtataagatgcactcat 37260284  T
Q  169 tgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  37260285 tgttaaacttagcatatgtaatatttttgcaaaaatatgccgacgtactgtataataatatttgttgacaaaatgtattttattaatcat 37260374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 289 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 17872034 - 17871867
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17872034 taatagtcactgtcagatgtatacacctagtctgtgaatgcaaatgttaaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgatt 17871935  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacga 456  Q
    ||||||||            |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17871934 gttatttgtttttattttttacaaaaccaacggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacga 17871867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 289 - 582
Target Start/End: Original strand, 10024219 - 10024511
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||| ||||||| |  | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10024219 taatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaatttttaaatg-tgtgtataaatatagtttgggctacaaaaacaccgatt 10024317  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttaggg-taacaacgatgtnnnnnnnnngttccgcgtattgttatac 487  Q
    ||||||||            ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         |||| ||| ||||||| ||    
T  10024318 gttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttaggggtaacaacgatgtaaaaaaaaggttctgcggattgttaaac 10024417  T
Q  488 ttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatt 582  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10024418 ctgaaaaatgcatgaattaatagtcaatggcaggaagatctgcttatatagaaattgcatgt-ctataatgaccagtacgccttacaaagaaatt 10024511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 256
Target Start/End: Original strand, 37371747 - 37371984
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataa-------caat--taaaata----ttt 123  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||  |||| ||    |||    
T  37371747 tttaaattcgatatgaaaaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataatgatatgcaatgttaaactaattattt 37371846  T
Q  124 ggatt--tatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtat 220  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||| |    
T  37371847 ggattattatacttgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaattttcttgcaaaaatacgccgacgtactgtgt 37371946  T
Q  221 attatta--tttgttaacataatatattttattaatca 256  Q
    | || ||  |||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  37371947 aataatatttttgttgacaaaatgtattttattaatca 37371984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 289 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 14194004 - 14193897
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14194004 taatagtcggtgttagatgtatacacctagtctgtgaatgcaaacgttaaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 14193905  T
Q  389 gttatttg 396  Q
    ||||||||    
T  14193904 gttatttg 14193897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 92 - 257
Target Start/End: Original strand, 39882072 - 39882240
Alignment:
Q  92 tctaaacattgcacataacaattaaaatatttggatt--tatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaa 188  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  39882072 tctaaacattgcatataacgataaaaatatatggattattatacttgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaaattagcatatgtaa 39882171  T
Q  189 tatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  39882172 tttttttgcaaaaatacgtcgacgtactgtgtaataatatttgttgacaaaatgtattttattaatcat 39882240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 289 - 459
Target Start/End: Original strand, 37372014 - 37372184
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| ||||   | |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37372014 taatagtcattgtcacatgcatacacgtagttggtaaatgcaaacgtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgatt 37372113  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt 459  Q
    ||||||||            ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37372114 gttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt 37372184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 289 - 459
Target Start/End: Original strand, 3689075 - 3689246
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaatttttt-acggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgat 387  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3689075 taatagtcagtgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaatttttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgat 3689174  T
Q  388 tgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt 459  Q
    |||||||||            ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3689175 tgttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacaatgt 3689246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 289 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 3877712 - 3877541
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaatttttt-acggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgat 387  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3877712 taatagtcagtgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaatttttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgat 3877613  T
Q  388 tgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt 459  Q
    |||||||||            ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3877612 tgttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacaatgt 3877541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 289 - 550
Target Start/End: Original strand, 26792896 - 26793160
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26792896 taatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaactttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacaccgatt 26792995  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt---nnnnnnnnngttccgcgtattgttat 485  Q
    ||||||||            ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||            |||| ||| |||||||     
T  26792996 gttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtgtaatgtaaatattgtattttagggtaacaatgatgtaaaaaaaaaaatgttctgcggattgttaa 26793095  T
Q  486 acttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtc 550  Q
    || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  26793096 acctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatgacaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtc 26793160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 479 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 43524815 - 43524713
Alignment:
Q  479 ttgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaaga 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43524815 ttgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaattgcaggaggatttgcttatatagaaattgcatgtcctgtaatgaccagtacgccttacaacga 43524716  T
Q  579 aat 581  Q
    |||    
T  43524715 aat 43524713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 479 - 575
Target Start/End: Original strand, 18116095 - 18116191
Alignment:
Q  479 ttgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaa 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18116095 ttgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaattgcaggaggatttgcttatatagaaattgcatgtcatgtaatgaccagtacgccttacaa 18116191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 592 - 707
Target Start/End: Original strand, 30313668 - 30313787
Alignment:
Q  592 cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgataca 687  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||  |    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  30313668 cgacttccaaacaataggcaactttagatttctaaattataacaacaagaattctaaaacataacaaatgatcatactttttgaaaaacttcatgatata 30313767  T
Q  688 caacatttttggtctccttg 707  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  30313768 caacatttgtggtctccttg 30313787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 594 - 678
Target Start/End: Original strand, 10024531 - 10024619
Alignment:
Q  594 acttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaactt 678  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10024531 actttcaatcaatgcgcaactttagttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttaaaaaactt 10024619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 665 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 10692554 - 10692495
Alignment:
Q  665 tttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttc 724  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10692554 tttttgaaagacctcacgatacacaatatttatggtctccttgcaaatattattatcttc 10692495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 417 - 459
Target Start/End: Original strand, 30313547 - 30313589
Alignment:
Q  417 aatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30313547 aatggtctaatgtaaatattgtattttaggataacaacgatgt 30313589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 824; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 824; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1722
Target Start/End: Original strand, 36206304 - 36207745
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36206304 taatagtaagtgtcagatgtatacacctagtctgtgaatgcaaatgttaaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 36206403  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn-gttccgcgtattgttatac 487  Q
    ||||||||            ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||          |||| || ||||||||||     
T  36206404 gttatttgtttttattttttacaaaatcaatagtctaatgtgaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaaagttctgcatattgttatat 36206503  T
Q  488 ttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnn 587  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| ||| ||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||         
T  36206504 ctgaaaagtgcatcaattaaaagtcaacgacaagaggatctgcttatatagaaattgcatgccatgtaatgaccagtacgccttacacagaaattaaaaa 36206603  T
Q  588 nnnn--cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcac 681  Q
          ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |    | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  36206604 aaaaaacgacttccaaacaatacacaactttagttttctaaattatagcaacaacaattttaaaacataaccaatgatcatactttttaaaaaacttcac 36206703  T
Q  682 gatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacata 781  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36206704 gatacacaacatttgtggtctccttgcaaacattatgatcttcatccaagatgagcagcttcaaaccttttctagaagtaactcgagagacagcgacata 36206803  T
Q  782 gagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtc 881  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36206804 gagttgtccatgcgtgatcacgggcttaggaagataaa-tctcactcgagataaagattgaccctaacttttatttattgtcgttgcaaaacaaagcgtc 36206902  T
Q  882 aatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcat-cttggaatgaataccctggtaccttccctttttcctg 980  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  36206903 aatgaaaattgcatgcacctgaatttgaagggtagtcctggatcattcgcaataagattcatactgggaatgaataccctggtacctgcccttttttctg 36207002  T
Q  981 taattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcat 1080  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| | | ||||||  |||| |||||||||||| | |||    
T  36207003 taattacggtagcagctatcgtgctcttccctagatgtgtaactgccagcctcgtaccattacatagtccattggcttgattgatgtttctcatcaacat 36207102  T
Q  1081 aattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatca 1180  Q
    || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  36207103 aactggacatctcatccttagtttcaaccggtgatttggagtttcagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaacaactcactttggacatca 36207202  T
Q  1181 gaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaat 1280  Q
     ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  36207203 taattttcacccgatcgacaaacataatcaaagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaat 36207302  T
Q  1281 caagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacgg 1380  Q
    |||  ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36207303 caattgttggggcgagtattcccctttcttgaaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacgg 36207402  T
Q  1381 atttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcac 1480  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  36207403 atttgttgtgtcggatatgagaaaatcatcaggaatttctaccttcaattcaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtcttcaattgagagtatccac 36207502  T
Q  1481 tcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatct 1580  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  36207503 ttgccaaaattatcaatttcttcctgctttgcaggtaccgaagatgaacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataaactcatatct 36207602  T
Q  1581 ttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattcc 1679  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36207603 ttgatgaattgattgaggcatcaataatatcctgcctctttccttttcagacaacaggcaatatctgtctgaaatcaccacctaaaactactgtcattcc 36207702  T
Q  1680 accaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatg 1722  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  36207703 accaaaaggtctaaactcatttaagggatcattcttggacatg 36207745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 774; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1724
Target Start/End: Original strand, 16041114 - 16042557
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||| ||| || ||| |||||  | |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16041114 taatagtcattgtcacatgcattcacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgatt 16041213  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn--gttccgcgtattgttata 486  Q
    ||||||||            ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||           |||| ||| ||||||| |    
T  16041214 gttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaataacgatgtaaaaaaaaaaggttcggcggattgttaaa 16041313  T
Q  487 cttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnn 586  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||| | | ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||        
T  16041314 cctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatgccaggaggatctgcttataaagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaagaaattaaaa 16041412  T
Q  587 nnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcac 681  Q
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16041413 ataaaacgacttccaaacaataggcaactttagttttctaaattatatcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcac 16041512  T
Q  682 gatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacata 781  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16041513 gatacacaacatttgtggtctccttacaaacattattatcttcatccaggatgagcaacttcagaccttttcttgaagttactcgagagacaacgacata 16041612  T
Q  782 gagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtc 881  Q
     |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041613 aagttgtccatgcgtgaacacaggcttatgaagataaacccccactcgagataaagattgaccatggcttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtc 16041712  T
Q  882 aatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctg 980  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16041713 aatggaaattgcatgcgcctgaatttgaagagtagtcctggatcactcggaataagattcatccagggaatgaataccctggtacctgccatttttcctg 16041812  T
Q  981 taattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcat 1080  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  16041813 taattacggtagcagctatcgtgctcttccctaaatgtgtaactgtcagcctagtaccattacacagtttattggcctaatcgatgtttctcatcagcat 16041912  T
Q  1081 aattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatca 1180  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16041913 aactggacatcccacctttagtttcaacctgtgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgatgtgaaccactcgctttggacatca 16042012  T
Q  1181 gaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaat 1280  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || || ||| || |||||| ||||||||||||||    
T  16042013 gaattttcacccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacttggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaat 16042112  T
Q  1281 caagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacgg 1380  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16042113 caagcgttggtgcgagtattcccctttcttggcaaaatagctgggcaccaaggttatcattcagattgggatacacaaagtctataagcgacatcaacgg 16042212  T
Q  1381 atttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcac 1480  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16042213 atttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccac 16042312  T
Q  1481 tcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatct 1580  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  16042313 ttgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcatgtaccgaagctgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagccaatatct 16042412  T
Q  1581 ttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattcc 1679  Q
    |||| ||||| | ||| ||||||||||| ||| |||||| ||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16042413 ttgacgaattaactgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctaggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacgtaaaactactgtcattcc 16042512  T
Q  1680 accaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    |||||||||| ||| | | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16042513 accaaaaggtttaagcgcgtttaggggatcattcttggacatgat 16042557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 748; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 491 - 1724
Target Start/End: Original strand, 2328462 - 2329698
Alignment:
Q  491 aaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnn 590  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||            
T  2328462 aaaagtgcaccagttaaaagtcaatggcaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtcctctaatgaccagtacgccttacaaaaaaattaaaaaaaa 2328561  T
Q  591 n--cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgat 684  Q
       |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  2328562 aaacgactttcaaacaatatgcaactttagttttctaaattatagcaacaacaattctaaaa-ataaccaatgatcatactttttgaaaaagttcacaat 2328660  T
Q  685 acacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagag 784  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2328661 acacaacatttgtggtctccttgcaaacattattatctttatccaagatgagcaacttcaaaccttttctagaagtaactcgagagacagcgacatagag 2328760  T
Q  785 ttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaat 884  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2328761 ttgtccatgcgtgaacacgggcttaggaagataaa-tcccactcgaggtaaagattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaat 2328859  T
Q  885 gaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatc-ttggaatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaa 983  Q
    | |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2328860 ggaaattgtttgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatccttggaatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaa 2328959  T
Q  984 ttacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataat 1083  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||  ||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  2328960 ttatggtagcagctatcgtgctcttccctatatgtgtaacggtcagcctcgtaccattactcagtccattggtctgatcgatgtttctcatcagcataac 2329059  T
Q  1084 tggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaa 1183  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  2329060 tggacatcccgcccttagtttcaaccggtgatttggaattccatagctcttaataccatttagaaattccgttgtgaaccactctctttggacatcagaa 2329159  T
Q  1184 ttttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaa 1283  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  2329160 ttttcacccgatcgacaaagagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcgactgaatcaa 2329259  T
Q  1284 gcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatt 1383  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  2329260 gcgttggtgcgagtattcccctttcttgaaaaaatagtggatcaccaaggttatcattcaaatcgggatacac---gtctataagtgacatcaacggatt 2329356  T
Q  1384 tgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcg 1483  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |    
T  2329357 tgttgtgtccgatatgagaaaatcttcaggaatttctaccttcattttaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtctctaattgagagtatccacttg 2329456  T
Q  1484 ccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttg 1583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2329457 ccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaacgaagaggcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcccatatctttg 2329556  T
Q  1584 atgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccacc 1682  Q
    ||||||||||| | |||| |||||| || ||||||| | |||  ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||     
T  2329557 atgaattgattaaggcattaacaatatcgtgcctcgttgcttcacggacaacaggtagtatctgcctgaaatcaccacctaaaaccactatcattccacg 2329656  T
Q  1683 aaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2329657 aaaaggtctaaacttgtttaggggatcattcttggacatgat 2329698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 708; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 48776465 - 48775022
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||| |||||  | ||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  48776465 taatagtcggtgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaagcgtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacac-gatt 48776367  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn---gttccgcgtattgttat 485  Q
    ||||||||            ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||            ||| |||| |||||||     
T  48776366 gttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtatattaggttaacaatgatgtaaaaaaaaaaaggtttcgcggattgttaa 48776267  T
Q  486 acttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnn 585  Q
    || |||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||       
T  48776266 acctgaaaagtgcatgaattaataatcaatggcaagaggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgacctgtacgccttacaaagaaattaaa 48776168  T
Q  586 nnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttca 680  Q
           |||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||| ||||  |    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  48776167 aataaaacgacttccaaacaataggcagctttagttttatatattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgttcatactttttgaaaaacttca 48776068  T
Q  681 cgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacat 780  Q
     |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||  |||| |||||||||| |  |||||    
T  48776067 tgatacacaacatttgtggtctccttacaaacattattatcttcatccaggatgagcaacttcagaccttttcttcaagttactcgagagatagtgacat 48775968  T
Q  781 agagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgt 880  Q
    | ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48775967 aaagttgtccatgtgtgaacacaggcttaggaagataaacccccactcgagataaagattgactctcgcttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgt 48775868  T
Q  881 caatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcct 979  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48775867 caatggaaattgcctgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgggaatgaataccctggtaccttccctttttcct 48775768  T
Q  980 gtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagca 1079  Q
    |||||||   |||||  |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  48775767 gtaattataatagcagttatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagcctcgtaccattacacagtccaatgacctgatcgatgtttctcatcagca 48775668  T
Q  1080 taattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatc 1179  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48775667 taattggacatcccaccctcagtttcaactggtgatttggaattccatagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatc 48775568  T
Q  1180 agaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaa 1279  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | || |||||| |||||| ||||||||| |||    
T  48775567 agactttttgcccgatcgacaaactgaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcatttacatcatatattcgttaacatgctcaaccgaa 48775468  T
Q  1280 tcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacg 1379  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |    
T  48775467 tcaagcgttggtgcgagtattcccttttcttggaaaaagagcaggtcaccaatgttatcattctaatcgggatatacaaagtgtattagtgacatcaaag 48775368  T
Q  1380 gatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgca 1479  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  48775367 aatttgttgtgtcggatatgagcaaatcttcgggaatttctaccttcatttcaccattctcattcgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatcca 48775268  T
Q  1480 ctcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatc 1579  Q
    || ||||||||||||| |||||| |||||||| |||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  48775267 cttgccaaaattagcagtttctttctgctctgtaggtcccgaagatgcacccaatctgatattaacagtaagcctcaacacattacaataagcccatata 48775168  T
Q  1580 tttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattc 1678  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  48775167 tttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatacaatatttgtctgaaatcaccacctaaaactaccgtcattc 48775068  T
Q  1679 caccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    | ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||    
T  48775067 ctccaaaaggtctaaactcgtttaagggatcattcttggatatgat 48775022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 704; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 6312122 - 6310681
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||| ||| | |||| |||||  | |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6312122 taatagtcattgtcacatgcacacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgatt 6312023  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn--gttccgcgtattgttata 486  Q
    |||||| |            ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |  | ||||||| |    
T  6312022 gttattagtttttaatttttacaaaataaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaatgatgtaaaaaaaaaaggtttcatggattgttaaa 6311923  T
Q  487 cttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnn 586  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||| |||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||        
T  6311922 cctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatgacaggaggatctacttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaagaaattaaaa 6311824  T
Q  587 nnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcac 681  Q
          |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6311823 ataaaacgacttccaaacaataggcaactttagttttataaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcac 6311724  T
Q  682 gatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacata 781  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||| || ||||    
T  6311723 gatacacaacatttgtggtctccttacaaacattattatattcatccaggatgagcagcttcagaccttttcttgaagttactcgagagacagcggcata 6311624  T
Q  782 gagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtc 881  Q
     |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6311623 aagttgtccatgcgtgaacacgggcttaggaagataacc-cccactcgagataaagattgaccctgacttttatttattttcattgcaaaacaaagcgtc 6311525  T
Q  882 aatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctg 980  Q
    |||| ||||| | |||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  6311524 aatggaaattgcctgc--ctggattttaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcctgggaatgaataccctagtacctgccctttttcatg 6311427  T
Q  981 taattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcat 1080  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  6311426 taattacggtagcagctatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcaacctagtaccattacacagtccattggcctgatcgatgtttctcatcagcat 6311327  T
Q  1081 aattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatca 1180  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  6311326 aactggacatcccacctttagtttcaacctatgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactcgctttggacatca 6311227  T
Q  1181 gaattttcgcccgatcg-acaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaa 1279  Q
    |||||||| |||||||  | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| |||||||||||||    
T  6311226 gaattttcacccgatctcaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaa 6311127  T
Q  1280 tcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacg 1379  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6311126 tcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacg 6311027  T
Q  1380 gatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgca 1479  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||    
T  6311026 gatttgttgtgtctgatatcagcgaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaatggagactatcca 6310927  T
Q  1480 ctcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatc 1579  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  6310926 cttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagcccatatc 6310827  T
Q  1580 tttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattc 1678  Q
    ||||| |||||||  || ||||||||||| ||  |||||  ||||  ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  6310826 tttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatcaggcctcattcctcctcggacaacagacaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactattgtcgttc 6310727  T
Q  1679 caccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    ||||||||||| |||   | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6310726 caccaaaaggtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgat 6310681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 692; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 37391277 - 37389839
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  37391277 taatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaattttttacggatgtgtataaatatagttttggctacagaaacgccgatt 37391178  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn----gttccgcgtattgtta 484  Q
    ||||||||            ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||| | || |||||||    
T  37391177 gttatttgtttttaatttttacaaaacaaatagtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaaatacaaaaaggtttcacggattgtta 37391078  T
Q  485 tacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttn 584  Q
     || |||||||||||| |||||| ||| |||| || ||  || |||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||      
T  37391077 aacctgaaaagtgcatgaattaatagttaatgacatgaagatatgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaagaaattaa 37390979  T
Q  585 nnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttc 679  Q
            ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37390978 aaataaaacgacttccaaacaatagacaactttagttttataaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttc 37390879  T
Q  680 acgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgaca 779  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||| | |||    
T  37390878 acgatacaaaacatttgtggtcttcttacaaacattattatcttcatccaggatgagcagcttcagaccttttcttgaagttactcgagagacagctaca 37390779  T
Q  780 tagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcg 879  Q
    || |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37390778 taaagttgtccatgcgtgaacacaggcttaggaagataaacccccactcgagataaagattgaccctggcttttatttattgtcattgcaaaacaaagcg 37390679  T
Q  880 tcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcc 978  Q
    |||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||      
T  37390678 tcaatggaaattgcctgtgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcctgggaatgaataccctagtacctgccctttttat 37390579  T
Q  979 tgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagc 1078  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| || ||| ||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  37390578 tgtaattacggtagcagctatcgtgctcttccctagatgtgtgactgtcagtctagtaccattacacagtccattggcctgatcgatatttctcatcagc 37390479  T
Q  1079 ataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacat 1178  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||       ||||    
T  37390478 ataactggacatcccacctttagtttcaacctgtgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactc-------acat 37390386  T
Q  1179 cagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactga 1278  Q
    |||||||||| ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| ||||||||||||    
T  37390385 cagaattttcacccgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactga 37390286  T
Q  1279 atcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaac 1378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37390285 atcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaac 37390186  T
Q  1379 ggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgc 1478  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||| ||| ||| |    
T  37390185 ggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatctttgccgtctccaattgagaatatcc 37390086  T
Q  1479 actcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatat 1578  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  37390085 acttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaatagtaagcctcaacacattacaataagcccatat 37389986  T
Q  1579 ctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcatt 1677  Q
    |||||| |||||||  || ||||||||||| ||| |||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37389985 ctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccagcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactattgtcatt 37389886  T
Q  1678 ccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    |||||||||||| |||   | ||||  ||||||||||||| ||||||    
T  37389885 ccaccaaaaggtttaagtgcgtttaagggatcattcttggccatgat 37389839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 681; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 291 - 1571
Target Start/End: Original strand, 18147775 - 18149066
Alignment:
Q  291 atagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgt 390  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18147775 atagtgagtgtcagatgtatacatctagtctctgaatgcaaacgtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaatgccgattgt 18147874  T
Q  391 tatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn-gttccgcgtattgttatactt 489  Q
    |||||             |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||          ||||||||||||||||||| |    
T  18147875 tattt-attttattttttacaaaaccaatggtctaagttaaatattgtattttagggtaacaatgatgtaaaaaaaaaagttccgcgtattgttatacct 18147973  T
Q  490 gaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnn 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| | | ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||           
T  18147974 gaaaagtgcatcaattaaaagtcaaaagcaagaagatctgcttatacagaaattgcatgtcatgtaatgaccagtacgccttacaaagaaattaaaaaaa 18148073  T
Q  590 nncga------cttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggc---aatgat-ctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttc 679  Q
        |      ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  18148074 aaaaaaaaaaactgtcaatcaatacgcaactttagttttctaaattatagcgacaataatactaaaacataaccaatgatcatactttttaaaaaacttg 18148173  T
Q  680 acgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgaca 779  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18148174 acgatacacaacatttgtggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagcttcaaaccttttatagaagtaactcgagagacaacgaca 18148273  T
Q  780 tagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcg 879  Q
    ||||||||  | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18148274 tagagttgctcgtgcgtgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaagattgacactgacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcg 18148373  T
Q  880 tcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcc 978  Q
    |||||| |||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18148374 tcaatggaaattgtctgcgcatgaatttgaagggtagtcctggatcattcggaataagattcatcttgggaatgaataccttggtacctgccctttttcc 18148473  T
Q  979 tgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagc 1078  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||| || |||    
T  18148474 tgtaattacggtagcagctatcatgatcttccctagatgtgtaactgtcagcctcgtaccattacacactccattggccttatcgatgtttctaatcagc 18148573  T
Q  1079 ataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacat 1178  Q
    |||| ||||||||  | | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18148574 ataactggacatctcatctttagtttcaaccggtgatttagaattccagagctcttaataccattaaggaattccgttgtgaaccacttgctttggacat 18148673  T
Q  1179 cagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactga 1278  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||| |||    
T  18148674 aagaattttcatccgatcgacaaacagaataagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaaatga 18148773  T
Q  1279 atcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaac 1378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18148774 atcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaattgagatacacaaagtcgataagtgacatcaac 18148873  T
Q  1379 ggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgc 1478  Q
     |||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||| ||||||| |    
T  18148874 agatttgttgtgtccgatatgagaaaatcttcataaatttctaccttcatttcaccattctccttcgaagcgttattgccgtctccaattcagagtatcc 18148973  T
Q  1479 actcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataag 1571  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  18148974 acttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagccttaacacattaaaataag 18149066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 485; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 982 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 2453545 - 2452804
Alignment:
Q  982 aattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcata 1081  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  2453545 aattacggtagcaactatcttgctcttccatagatgtgtaactgtcaacctcgtaccattacacaatccatttgcatgatcgatgtttctcatcagcata 2453446  T
Q  1082 attggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcag 1181  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| | ||||||||||    
T  2453445 actggacatcccaccgttagtttcaatcggtgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccattgtgaatc--tcgttttggacatcag 2453348  T
Q  1182 aattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatc 1281  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||| |||||| |||||||||| |||     
T  2453347 aattttcacccgatcgacaaatagaatcagagcctaaatactctttctcttcacctggaattagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactcaata 2453248  T
Q  1282 aagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacgga 1381  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2453247 aagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcggaattcacaaagtctataagtgacatcaacgga 2453148  T
Q  1382 tttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcact 1481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2453147 tttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatttgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccact 2453048  T
Q  1482 cgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctt 1581  Q
     | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||    
T  2453047 tgtcaaaattagcaatttcttcatgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcgacacattacaatatgcctatatctt 2452948  T
Q  1582 tgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattcca 1680  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2452947 tgatgaattgattgaagcatcaacaatatcctgcctcgatccttttcggacaatgggcaatatcttcctgaaatcaccacctaaaactactgtcattcca 2452848  T
Q  1681 ccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    ||||||| ||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  2452847 ccaaaagttctaaactcgtttaaggggtcattcttggacatgat 2452804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 485; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 961
Target Start/End: Original strand, 28960873 - 28961842
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 101  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28960873 attatgttatcttaaagttataagtgtacttataattgaaatttgatatgga-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 28960971  T
Q  102 gcacataacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaa 200  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  28960972 gcaaataacgattaaagtatttggatttatactta-actaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttaatatatgtaatatttttgcaaa 28961070  T
Q  201 aatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtg 300  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||              |||||         || ||||||||||||    
T  28961071 aatacgctgacgtactgtatattattatttgttgacataatgtattttattaatcataaaaactaaaaaaattgtatttttttt-atataatagtcagtg 28961169  T
Q  301 tcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnn 400  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||        
T  28961170 tcagatgtatacacctagtctgtgaatgcaaacgttaaattttttacgggtgtgtataaatatagtttggactacataaacgccgattgttatttgtttt 28961269  T
Q  401 nnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn-gttccgcgtattgttatacttgaaaagtgca 499  Q
            |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28961270 tattttttacaaaaccaatggtctaatgtaaatattatattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaaagttccgcgtattgttatacctgaaaaatgca 28961369  T
Q  500 tcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnnc----gac 595  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||             |||    
T  28961370 tcaattaaaagtcaatggcaggaggacctgcttatatagaaattgcatgtcctgtaatgaccagtacgtcttacaaagaaatttaaaaaaaaaaaatgac 28961469  T
Q  596 ttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatat----tttttgaaaaacttcacgataca 687  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||| |||||    
T  28961470 ttccaaacaatacgcaacttttgttttctaaattatagcaacaacaactctaaaacataaccaatggtcatatatactttttgaaaaacttcaccataca 28961569  T
Q  688 caacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttg 787  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  28961570 caacattcgtggtctccttgcaaacattattatcttcattcaagatgagcagcttcaaactttttctagaagtaactcgagagacagcgacatagagtt- 28961668  T
Q  788 tccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaa 887  Q
     |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  28961669 -ccatgcgtgaacacgggcttaggaagataaacttccactcgagataaagattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaacaaagtgtcaatgga 28961767  T
Q  888 aatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttg-gaatgaataccctg 961  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28961768 aattgcatgcgtctgaatttgaagggtagtcctggatcatgcggaataagattcatcctgagaatgaataccctg 28961842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 651 - 1370
Target Start/End: Complemental strand, 48239240 - 48238519
Alignment:
Q  651 accaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacatt 750  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  48239240 accaatgatcatactttttgaaaaacttcacgatacacaacatttgtggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagcttcaaacctt 48239141  T
Q  751 ttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttact 850  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  48239140 ttctagaagtaattcgagatacatcgacatagagttgtccatgcgtgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaagattgaccctaact 48239041  T
Q  851 tttattt-attgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttg-g 948  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48239040 ttttttttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatcgaaattgcatgcacctgaatttcaagtgtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgtg 48238941  T
Q  949 aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaat 1048  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | |||| ||| ||||||||| |    
T  48238940 aatgaataccctggtacctgccatttctcctgtaattacggtagcaactatcgtgctcttccctagatgtgtaactgccggccttgtaccattacacagt 48238841  T
Q  1049 tcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaa 1148  Q
     |||||| ||||||||||||||| || ||||||   | |||||| |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48238840 ccattggcctgatcgatgtttcttatgagcatagccgcacatcccacccttggtttcaaccggtgaattggaatttcagagctcttaataccattaagaa 48238741  T
Q  1149 attccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtga 1248  Q
    ||||  |||||||  ||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  48238740 attctattgtgaaatactcgctttggacatcaaagttttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcgcctggaatcagcga 48238641  T
Q  1249 aattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcg 1348  Q
     || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  48238640 catcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcctctttcttggaaaaatagagggtcgccaaggttatcattcaaatcg 48238541  T
Q  1349 ggatacacaaagtctataagtg 1370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  48238540 ggatacacaaagtctataagtg 48238519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 1153
Target Start/End: Complemental strand, 25075275 - 25074114
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 101  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25075275 attatgttatcttaaagttataattgtgattataatttaaattcgataagaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 25075177  T
Q  102 gcacataacaattaaaatatttggatt--tatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgca 198  Q
    ||| ||||| || ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25075176 gcatataacgataaaagtatttggattattatacttgtactaattatt-gtagtataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaatatttttgca 25075078  T
Q  199 aaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcag 298  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||               ||||         || ||||||| ||    
T  25075077 aaaatacgccgacgtactgtataataatatttgttgacaaaatgtattttattaatcataaaaactaaaaaatgtgtatttttttttatataatagttag 25074978  T
Q  299 tgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnn 398  Q
    ||||| ||| |||||| |||||  | |||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  25074977 tgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgaaaacgtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgattgttatttgtt 25074878  T
Q  399 nnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn---------gttccgcgtattgttatactt 489  Q
              ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||                  | ||| ||  |||||| || |    
T  25074877 tttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtactttaggataacaacgatgtaaaaaaaaaaaaaaaaaggatccacgatttgttaaacct 25074778  T
Q  490 gaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnn 589  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||           
T  25074777 gaaaagtgcatgaattaatagtcaatgacaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaacagtacgccttacaaagaaattaaaaata 25074679  T
Q  590 nn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgat 684  Q
       |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||  |    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25074678 aaacgacttccaaacaataggcaactttagatttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataacaaataatcatactttttgaaaaacttcacgat 25074579  T
Q  685 acacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagag 784  Q
    | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| || |||||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||    
T  25074578 atacaacatttctggtctccttacaaacattattatcttcatccacaatgagcaccttcagaccttttcttgaagttactcgagagacagcaacataaag 25074479  T
Q  785 ttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaat 884  Q
    ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||   |||||||||||||| |||||    
T  25074478 ttgtccatgtgtgaacacaggcttaggaagataaacccccactcgagataaagattgaccctgacttttatatattg---ttgcaaaacaaagcatcaat 25074382  T
Q  885 gaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatc-ttggaatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaa 983  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  25074381 ggaaattgcatgcgcctgaatttgaagggtagtcatggatcactcggaataagattcatcatgggaatgaataccctagtaccagccctttttcctgtaa 25074282  T
Q  984 ttacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataat 1083  Q
     |||||||| | ||||| ||||||| |||||  ||||||||  |||||| |||  |||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25074281 ctacggtaggagctatcgtgctcttccctag--gtgtaactgacagcctagtactattacacagtccatttgtctgatcgatgtttctcatcagcataat 25074184  T
Q  1084 tggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattcc 1153  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25074183 tggacatcccacccttagtttcaaccggtgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattcc 25074114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 749 - 1319
Target Start/End: Original strand, 52500224 - 52500795
Alignment:
Q  749 ttttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgaccctta 848  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  52500224 ttttctagaagtaactcgagagacagcgacatagagttgcccatgcgtgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaagattgaccctga 52500323  T
Q  849 cttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg 948  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52500324 cttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaattatatgcgcatgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcctgg 52500423  T
Q  949 -aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaa 1047  Q
     |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||     
T  52500424 gaatgaataccttggtatctgccctttttcctgtaattacggtagcatctattgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagccttgtaccattacacag 52500523  T
Q  1048 ttcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaaga 1147  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  52500524 tccattggcctgatcgatgtttctcatcagcacaactggacatcccacctttagtttcaaccggtgatttggaattccaaagctcttaataccattaagg 52500623  T
Q  1148 aattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtg 1247  Q
    |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52500624 aattccgttgtgaaccgctcattttggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagtg 52500723  T
Q  1248 aaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaata 1319  Q
    | || |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  52500724 acatcatatattcgttaacatgttcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaata 52500795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 27 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 2454147 - 2453541
Alignment:
Q  27 gtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttgga 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  2454147 gtggttataatttaaatttgatatggaaaaaaacatcatcttaattttgtatatattttgaaatatttaaacattgcacataacgattaaagtatttgga 2454048  T
Q  127 tttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2454047 tttatacttatactaattatttgtagtataagatgcactcattgataaacttagcatatgtaatatttttgcaaaaatacgccgacgtactgtatattat 2453948  T
Q  226 tatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtgtcagatg--tatacacctagtctat 323  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||              |||||         || ||||||||| |||||||||  |||||| ||||| | |    
T  2453947 tatttgttgacataatgtattttattaatcataaaaactaaaaaatttgta--ttaatttatataatagtcaatgtcagatgtatatacatctagtttgt 2453850  T
Q  324 gaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtc 423  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||            | |||| |||||||     
T  2453849 gaatgcaaacgttaaaatttttaccggtgtgtataaatatagtttgggctaaagaaacgtcgattgttatttgtttttattttttataaaaccaatggtt 2453750  T
Q  424 taatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt-nnnnnnnnngttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcagga 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2453749 taatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaaagttccacgtattgttatacctgaaaaatgcatcaattaaaagtcaatggcagga 2453650  T
Q  523 gtatctgcttaaatataaatttcatgtcct-gtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnncgacttccaaacaatacgcaactttagttt 621  Q
    | ||||||||| ||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2453649 ggatctgcttatatagaaattgcatgtcctactaatgaccggtacgccttacaaagaaattaaaaaaaaacgacttccaaacaatacgcaactttagctt 2453550  T
Q  622 tctaaatta 630  Q
    |||||||||    
T  2453549 tctaaatta 2453541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1313 - 1679
Target Start/End: Original strand, 48233498 - 48233865
Alignment:
Q  1313 aaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcag 1412  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48233498 aaaaatagagggtcgccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcagcggatttgttgtgttcgatatgagtaaatcttcag 48233597  T
Q  1413 gaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgc 1512  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48233598 gaatttctaccttcatttccccattctcatctgaagcgtcgttgtcgtctcaagttgagagtattcacttgtcaaaattaggaatttcttcctgctctgc 48233697  T
Q  1513 aggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcc 1611  Q
    ||||||  | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  48233698 aggtaccaaagatgcacccaatctcatatcaacagtaagcctcaacaaattacaataaacacatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcc 48233797  T
Q  1612 tgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattcc 1679  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48233798 tgtctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattcc 48233865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 16 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 48240195 - 48239649
Alignment:
Q  16 aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaatta 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  48240195 aagttataagtgtgattataatttaaattttatatggaaaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatataaacattgcacataacgatta 48240096  T
Q  116 aaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgta 214  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48240095 aactatttggatttatacttatattaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcatatgtaatatttttgcaaaaatactccgacgta 48239996  T
Q  215 ctgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtgtcagatgtatacac 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||              |||||         || ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  48239995 ctgtatattattatttgttgacataatgtattttattaatcataaaaactaaaaaaattgta--tttttttatataacagtaagtgtcagatgtatacac 48239898  T
Q  315 ctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaa 414  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||            ||||||    
T  48239897 ctagtctgtgaatgcaaacgttaaattttttacgggtgtgtataaagatagtttgggctacagaaacgtcgattgttatttgtttttattttttacaaaa 48239798  T
Q  415 tcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt-nnnnnnnnngttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtca 513  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||          ||| ||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  48239797 ccaatggtctaatgtaaatattatattttggggtaacaaagatgtaaaaaaaaaagtttcgcatactgttatacctaaaaagtgcatcaattaaaagtca 48239698  T
Q  514 atggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgacca 562  Q
    |||||||||| || |||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  48239697 atggcaggaggatatgcttatatagaaattgcatgtcttgtaatgacca 48239649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 289 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 16748798 - 16748262
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||  |||||  | |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16748798 taatagtcattgtcacatgcatacatgtagtcggtaaatgcaaacgtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgatt 16748699  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnng-ttccgcgtattgttatac 487  Q
    ||| ||||            ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | ||||||| ||||||| ||    
T  16748698 gttgtttgttcttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaaggttccgcggattgttaaac 16748599  T
Q  488 ttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnn 587  Q
     | |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||         
T  16748598 ctaaaaagtgcatgaattaatagtcaatggcaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtataccttacaaagaaattaaaaa 16748500  T
Q  588 nnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacg 682  Q
         |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  |    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16748499 taaaacgacttccaaacaataggcaactttggttttataaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaaggatcatactttttgaaaaacttcacg 16748400  T
Q  683 atacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatag 782  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16748399 atacacaacatttgcggtctccttgcaaacattattatcttcatccaggatgagcagcttcagaccttttcttgaagttactcgagagacagcgacatag 16748300  T
Q  783 agttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaac 820  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  16748299 agttgtccatgcgtgaacacaggcttaggaagataaac 16748262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1404 - 1724
Target Start/End: Original strand, 52500795 - 52501109
Alignment:
Q  1404 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttc 1503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||       ||||     
T  52500795 aatcttcaggaatttctaccttcatttaaccattctcatccgaagcgttgttgtcgtctccaattcagagtatccacttgccgaaatt-------tcttt 52500887  T
Q  1504 ctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 1603  Q
    |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52500888 ctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagtctcaacacattaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 52500987  T
Q  1604 acaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcattta 1702  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  52500988 acaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgatatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaatggtttaaactcgttta 52501087  T
Q  1703 gaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  52501088 ggggatcattcttggacatgat 52501109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 257
Target Start/End: Original strand, 7101787 - 7102025
Alignment:
Q  19 ttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  7101787 ttataagtgtggttataatttaaatttgacatgga-aaaaatatcatcttaattttgtatataatttgaaatatctaaacattgcacataacgattaaag 7101885  T
Q  119 tatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  7101886 tatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagacgtactcattgttaaacttagcatatgtaatatttttgcaaaaatacgccgacgtattg 7101985  T
Q  218 tatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  7101986 tatattattatttgttgacataatgtattttattaatcat 7102025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 582
Target Start/End: Original strand, 52499566 - 52500113
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatact 134  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  52499566 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatttggattattatact 52499664  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgtt 233  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||    
T  52499665 tgtactaattatttatagtataagatgcattcattgttaaacttagcatatgtaattttcttgcaaaaatacgccgacgtactgtgtaataatatttgtt 52499764  T
Q  234 aacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaac 333  Q
     ||| ||| |||||||||||||||               ||||         || |||||||||  |||| ||| |||||| |||||  | |||||||||    
T  52499765 gacaaaatgtattttattaatcataaaaactaaaaaatatgtatttttttttatataatagtcatcgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaac 52499864  T
Q  334 gttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaat 433  Q
    ||| || ||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||            ||||||  |||||||||||||||||    
T  52499865 gtttaa-tttttacgagtgtgtataaatgtagtttgggctacagaaacaccgattgttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaat 52499963  T
Q  434 attgtatttta-gggtaacaacgatgt-nnnnnnnnngttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgct 531  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||          |||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  52499964 attgtattttaggggtaacaacgatgtaaaaaaaaaggttccgcggattgttaaacctgaaaaatgcatgaattaatagtcaatggcaggaagatctgct 52500063  T
Q  532 taaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatt 582  Q
    || ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52500064 tatatagaaattgcatgt-ctataatgaccagtacgccttacaaagaaatt 52500113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 249
Target Start/End: Original strand, 16043177 - 16043411
Alignment:
Q  16 aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaatta 115  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |    
T  16043177 aagttaaaagtgtgattataatttcaatttgatatagaaaaaaatatcatcttaattttgtctatattttgaaatatgtaaccattgcacataacgatca 16043276  T
Q  116 aaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgta 214  Q
    || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16043277 aagtatttggatttaaacttatattaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttaacatatgtaatatttttgcaaaaatacgccgacgta 16043376  T
Q  215 ctgtatattattatttgttaacataatatatttta 249  Q
     |||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  16043377 ttgtatattattatttgttgacataacaaatttta 16043411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 257
Target Start/End: Original strand, 36206032 - 36206273
Alignment:
Q  16 aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaatta 115  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  36206032 aagttataaatgtagctataatttaaatttgatatgaa-aaaaatatcattttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataatgatta 36206130  T
Q  116 aaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgta 214  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  36206131 aagtatttagatttatacttatactaattatttgtcatatatgatgtacctattgttaaacttagcatatgtaatatttttgcaaaaatactctgacgta 36206230  T
Q  215 ctgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36206231 ttgtatattattatttgttaacataatgtattttattaatcat 36206273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 48776733 - 48776490
Alignment:
Q  16 aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaatta 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  48776733 aagttataattgtggttataatttaaattcgatatgaa-aaaaatatcattttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatatatcgatta 48776635  T
Q  116 aaatatttggat--ttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacg 212  Q
    || ||||||  |  |||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48776634 aagtatttgttttattatacttgtattaattatttgtattataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaatatttttgcaaaaatacgccgacg 48776535  T
Q  213 tactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  48776534 tactgtataataatatttgttgacaaaatgtattttattaatcat 48776490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 16040825 - 16041081
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 101  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16040825 attatgttatcttaaagttataactgtggttataatttaaatc-gatatgaa-aaaaatatcatcttaattttatatatattttgaaatatctaaacatt 16040922  T
Q  102 gcacataacaattaaaatatttggat--ttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgca 198  Q
    ||| ||||| || ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16040923 gcatataacgataaaaatatatggattattatacttgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaatttttttgca 16041022  T
Q  199 aaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    ||| ||| |||||||||||| || || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  16041023 aaattacgccgacgtactgtgtaataatatttgttgacaaaatgtattttattaatcat 16041081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16749071 - 16748828
Alignment:
Q  16 aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaatta 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |    
T  16749071 aagttataattgtggttataatttaaattcgatatgaa-aaaaatataattttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgaatataacgataa 16748973  T
Q  116 aaatatttggat--ttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacg 212  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  16748972 aaatatttggattattatacttgtactaattatttgtagtataagatgcactcattattaaacttagcatatgtaattttcttgcaaaaatacgccgacg 16748873  T
Q  213 tactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    |||||  || || |||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  16748872 tactgcgtaataatatttgttgacaaaacgtattttattaatcat 16748828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 37391529 - 37391308
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggatt--tatact 134  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||    
T  37391529 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaatttt-tatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatttggattattatact 37391432  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgtt 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||    
T  37391431 tgtactaattatttgtagtataagatgcattcattgttaaacttagcatatgtaatttttttgcaaaaatacgccgacgtactgtgtaataatatttgtt 37391332  T
Q  234 aacataatatattttattaatcat 257  Q
     ||| ||| |||||||||||||||    
T  37391331 gacaaaatgtattttattaatcat 37391308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 257
Target Start/End: Original strand, 36518773 - 36518995
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatact 134  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  36518773 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcattttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatttggattattatact 36518871  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgtt 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||    
T  36518872 tgtactaattatttgtagtataagatgcattcatggttaaacttagcatatgtaattttcttgcaaaaatacgccgacgtactgtgtaataatatttgtt 36518971  T
Q  234 aacataatatattttattaatcat 257  Q
     ||| ||| |||||||||||||||    
T  36518972 gacaaaatgtattttattaatcat 36518995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 253
Target Start/End: Original strand, 18147523 - 18147741
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatact 134  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||  |||||||    
T  18147523 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaagcattgcacatagcgataaaaatatttggattattatact 18147621  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgtt 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||||| || || ||||||||    
T  18147622 tgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaattttcttgcaaaaatatgccgacgtactgtgtaataatatttgtt 18147721  T
Q  234 aacataatatattttattaa 253  Q
     ||| |||  ||||||||||    
T  18147722 gacaaaatgcattttattaa 18147741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 289 - 581
Target Start/End: Original strand, 7102059 - 7102348
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||| |  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7102059 taatagtcagtatcagatgtatacacctaatctgcgaatgcaaacgttaatttttttacag--gtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgatt 7102156  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngttccgcgtattgttatact 488  Q
    ||||||||            |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |          | ||||||||||||||||     
T  7102157 gttatttgtttttattttttacaaaaccaatgatctaatgtaaatattgtattttggggtaacaaccatataaaaaaaaaat-ccgcgtattgttatacc 7102255  T
Q  489 tgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  7102256 tgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcagaaggatctgcttatatagaaattacatgtctcgtaaggaccagtacgccttacaaagaaat 7102348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6312377 - 6312155
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatact 134  Q
    |||||||| |||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||| |    
T  6312377 tttaaattcgatatgaaaaaaaa-atcatcataattttgtatatattttaaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatttggattattatatt 6312279  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgtt 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  ||||||||| || || || ||||||||    
T  6312278 tgtactaattatttgtagtataagatgcacgcattgttaaacttagcatatgtaattttcttgcaaaaatatgccgacgtaccgtgtaataatatttgtt 6312179  T
Q  234 aacataatatattttattaatcat 257  Q
     ||| ||| |||||||||||||||    
T  6312178 gacaaaatgtattttattaatcat 6312155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Original strand, 12450767 - 12450949
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgt---------atatattttgaaatat 92  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||         ||||||||||||||||    
T  12450767 attatgttatcttaaagttataagtgtggctataatttaaatttgatatggaaaaaaaaaatatcttaattttgttaattttgtatatattttgaaatat 12450866  T
Q  93 ctaaacattgcacataacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata 184  Q
    ||||||||| ||| |||| |||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12450867 ctaaacattccacgtaacgatt---------ggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtattcatttttaaacttagcata 12450949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 289 - 459
Target Start/End: Original strand, 36519024 - 36519194
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  36519024 taatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaattttt-acgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacaccgatt 36519122  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtatttta-gggtaacaacgatgt 459  Q
    ||||||||            ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36519123 gttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttaggggtaacaacgatgt 36519194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 421 - 459
Target Start/End: Original strand, 12451018 - 12451056
Alignment:
Q  421 gtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt 459  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12451018 gtctaatataaatattgtattttagggtaacaacgatgt 12451056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 840 - 874
Target Start/End: Original strand, 42032105 - 42032139
Alignment:
Q  840 tgacccttacttttatttattgtcattgcaaaaca 874  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42032105 tgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaaca 42032139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 813; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 813; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 318 - 1724
Target Start/End: Original strand, 18117 - 19537
Alignment:
Q  318 gtctatgaatgcaaacgttaaatttttt-acggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatc 416  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||             |||||| |    
T  18117 gtctgtgaatgcaaacattaaatttttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgattgttatttatttttattttttacaaaacc 18216  T
Q  417 aatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatg 516  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  18217 tatggtctaatgtaaatattgtattttagcgtaacaacgatgtaaaaaaaaagttccgcgtattgttatacctgaaaagtgcatcaattaaaagtcaaag 18316  T
Q  517 gcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnncga--------cttccaaacaatac 608  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||           |        ||| ||| ||||||    
T  18317 gcaggaggatctgcttatatagaaattacatgtcctgtaatgaccagtacgccttacaaagaaattaaaaaaaaaaaaaaaaaaaactttcaatcaatac 18416  T
Q  609 gcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctcc 704  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18417 gcaactttagttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttaaaaaacttcacgatacacaacatatgtggtctcc 18516  T
Q  705 ttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgg 804  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||      
T  18517 ttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagcttcaaaccttttctagaagtaactcgagagacagcgacatagagttgcccatgcgtgaacacaa 18616  T
Q  805 gcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaa 904  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||| | ||||    
T  18617 gcttaggaagataaactcccactcgagataaagattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaattgtctgcacatgaa 18716  T
Q  905 tttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatctt-ggaatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttg 1003  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||| |||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |     
T  18717 tttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcctaggaatgaatatcttggcacctaccttttttccagtaattacggtagcagctatcgta 18816  T
Q  1004 ctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtt 1103  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  18817 ctcttccctagatgtgtagctgtcagcctcgtaccattacacagtccattggcctgatcgatgtttctcatcagcataactggacatcccacctttagtt 18916  T
Q  1104 tcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaac 1203  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18917 tcaaccggtgatttggaattccagagctcttaataccattaaggaattccgttgtgaaccactcgctttgcacatcagaattttcactcgatcgacaaac 19016  T
Q  1204 agaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgccc 1303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19017 agaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattccc 19116  T
Q  1304 ctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagca 1403  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  19117 cttttttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcaagatacacaaagtctataagtgacatcaacatatttgttgtgtccgatatgagca 19216  T
Q  1404 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttc 1503  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||| | || ||| ||||||||||||||||     
T  19217 aatcttcagaaatttctaccttcatttcatcattctcatccgaagcgttgttgccgtctccaattcaaagtatccccttgcc-aaattagcaatttcttt 19315  T
Q  1504 ctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 1603  Q
    ||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19316 ctgctctgcaggtatcaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattaaaataagcccatatctttgatgaattgattgatgcatca 19415  T
Q  1604 acaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcattta 1702  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||    
T  19416 acaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaattaccacctaaaactattgtcattccaccaaatgatttaaactcgttta 19515  T
Q  1703 gaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  19516 ggggatcattcttggacatgat 19537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Original strand, 17812 - 18052
Alignment:
Q  6 tatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgc 103  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17812 tatgttatcttaaagttataagtgttgttataattttaatttgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatttaaacattgc 17910  T
Q  104 acataacaattaaaatatttggat---ttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaa 199  Q
    ||||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17911 acataacgattaaagtatttggatttattatacttatactaattatttgtagtataagatgtattcattgttaaacttagcatatgtaatatttttgcaa 18010  T
Q  200 aaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataat 241  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  18011 aaatacgccgacgtactgtatattattatttattgacataat 18052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 813; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 813; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 316 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 6362 - 4947
Alignment:
Q  316 tagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaat 415  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||             ||||||     
T  6362 tagtctgtgaatgtaaacgttaaattttttacgggtgt-tataaatatagtctgggctacagaaacgccgattgttatttatttttattttttacaaaac 6264  T
Q  416 caatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaat 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6263 caatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaa-gttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaaa 6165  T
Q  516 ggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnncga----cttccaaacaatacgca 611  Q
    |||| ||  ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||           |    | | ||| ||||||| |    
T  6164 ggcatgaaaatctgcttatatagaaattgcatgtcctataatgaccagtacgccttacaaagaaattaaaaaaaaaaaaaaaacattcaatcaatacgta 6065  T
Q  612 actttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttg 707  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  |    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||    
T  6064 actttagttttctaaattataggaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttaaaaaacttcacaatacaaaacatctgtggtctccttg 5965  T
Q  708 caaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggct 807  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||| | ||||||||||||    
T  5964 caaacattattatcttcatccaagatgagcagcttcaaaccttttctagaagtaactcgagagacagcgacatggagtttcccatgcgtgaacacgggct 5865  T
Q  808 taggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaattt 907  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||    
T  5864 taggaagataaactctcactcgagataaagtttgagcctaacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaattgtgtgcgcatgaattt 5765  T
Q  908 gaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctc 1006  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5764 gaagggtaatcctggatcactcggaataagattcatcttgggaatgaataccttggtacctgccctttttcctgtaattacggtagcagctatcgtgctc 5665  T
Q  1007 tttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttca 1106  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||| |||    
T  5664 ttccctagatgtgtaactgtcagcctcgtaccattacacagtccattggtctgatcgatgtttctcatcagcataactggacatcccacctttagtatca 5565  T
Q  1107 accggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacaga 1206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5564 accggtgatttggaattccagagctcttaataccattaaggaattctgttgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatcgacaaacaga 5465  T
Q  1207 atcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctt 1306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5464 atcagagcttaaatactctttctcttcacctgaaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctt 5365  T
Q  1307 tattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaat 1406  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5364 tcttgg-aaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctataagtgacatcaatagatttgttgtgtccgatatgagcaaat 5266  T
Q  1407 cttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctg 1506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  5265 cttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgctgttgtcgtctccaagtcagagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctg 5166  T
Q  1507 ctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaaca 1606  Q
    || ||||||||   | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5165 ctttgcaggtatcaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattaaaataagcacatatcttttatgaattgattgatgcatcaaca 5066  T
Q  1607 at-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttagag 1705  Q
    || |||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |    
T  5065 atatcctgcctcgttccttttcgaacaataggcaatatctgcctaaaatcaccatctaaaactattgtcattccaccaaatggtttaaactcgtttaggg 4966  T
Q  1706 gatcattcttggacatgat 1724  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4965 gatcattcttggacatgat 4947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6659 - 6410
Alignment:
Q  6 tatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgt---------atatattttgaaatatct 94  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||    
T  6659 tatgttatcttaaagttataagtgttgttataatttaaatttgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgttaattttatatatattttgaaatatct 6561  T
Q  95 aaacattgcacataacaattaaaatatttggatttat---acttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaata 190  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6560 aaacattgcacataacgattaaagtatttggatttattatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcatatgtaata 6461  T
Q  191 tttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataat 241  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6460 tttttgcaaaaatacgccgatgtactgtatattattatttgttgacataat 6410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 812; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 812; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1703
Target Start/End: Original strand, 1859764 - 1861188
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaatttttt-acggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgat 387  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1859764 taatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaatttttttacggatgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgat 1859863  T
Q  388 tgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn---gttccgcgtattgtta 484  Q
    |||||||||            ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||  |||||||    
T  1859864 tgttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaaaaggttccgcagattgtta 1859963  T
Q  485 tacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttn 584  Q
     || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||      
T  1859964 aacctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatggcaggaggatctatttatatagaaattgcatgtc-tgtaatgaccagtacgccttataaagaaattaa 1860062  T
Q  585 nnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttc 679  Q
            |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1860063 aaataaaacgacttccaaacaataggcaactttagttttataaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttc 1860162  T
Q  680 acgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgaca 779  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||| || |||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  1860163 acgatacacaacatttgtagtctccttacaaacattattatcttcatccacgatgagtagcttcagaccttttcttgaagttactcgagagacagcgaca 1860262  T
Q  780 tagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcg 879  Q
    || |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1860263 taaagttgtccatgcgtgaacacaggcttaggaagataaacccccacttgagataaagattgaccctagcttttatttattgtcattgcaaaacaaagcg 1860362  T
Q  880 tcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcc 978  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  1860363 tcaatggaaattgcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcctgggaatgaataccttggtacctgccctttttac 1860462  T
Q  979 tgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagc 1078  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| || |||    
T  1860463 tgtaattacggtagcaactatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagcctcgtaccattacacaatccattggcatgatcgatgtttcttatcagc 1860562  T
Q  1079 ataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacat 1178  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1860563 ataactggacatcccacctttagtttcaaccggtgatttggaattccatagctcttaataccattaaggaattccgttgtgaaccactcgctttggacat 1860662  T
Q  1179 cagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactga 1278  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| || |||||| |||||| ||||||||||||    
T  1860663 cagaattttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacccagaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactga 1860762  T
Q  1279 atcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaac 1378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1860763 atcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctataagtgacatcaac 1860862  T
Q  1379 ggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgc 1478  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |    
T  1860863 agatttgttgtgtccgatatgagcaaatctttaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgtcgtctccaattcagagtatcc 1860962  T
Q  1479 actcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatat 1578  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  1860963 acttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattaaaataagcccatat 1861062  T
Q  1579 ctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcatt 1677  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1861063 ctttaatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatttgcctgaaatcaccaccttacactattgtcatt 1861162  T
Q  1678 ccaccaaaaggtctaaactcatttag 1703  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||    
T  1861163 ccaccaaatggtttaaactcgtttag 1861188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 794; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1724
Target Start/End: Original strand, 35854994 - 35856439
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35854994 taatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaattttttacggatgtgtataaatatagttttggctacagaaacgccgatt 35855093  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn----gttccgcgtattgtta 484  Q
    ||||||||            ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||| | || |||||||    
T  35855094 gttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaaaaaagtttcacggattgtta 35855193  T
Q  485 tacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttn 584  Q
     || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||      
T  35855194 aacctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatgacaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaagaaattaa 35855292  T
Q  585 nnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttc 679  Q
            |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35855293 aaataaaacgacttccaaacaataggcaactttagttttataaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttc 35855392  T
Q  680 acgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgaca 779  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  35855393 acgatacacaacatttgtggtctccttacaaacattattatcttcatccaggatgagcagcttcagaccttttcttgaagttactcgagagacagcgaca 35855492  T
Q  780 tagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcg 879  Q
    || |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35855493 taaagttgtccatgcgtgaacacaggcttaggaagataaacccccactcgagataaagattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcg 35855592  T
Q  880 tcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcc 978  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  35855593 tcaatggaaattgcctgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcctgggaatgaataccctagtacctgccctttttcc 35855692  T
Q  979 tgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagc 1078  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||    
T  35855693 tgtaattacggtagcagctatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagcctagtaccattacacagtccattggcctgatcgatgtttctcatcagc 35855792  T
Q  1079 ataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacat 1178  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  35855793 ataactggacatcccacctttagtttcaacctgtgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactcgctttggacat 35855892  T
Q  1179 cagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactga 1278  Q
    |||||||||| ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| ||||||||||||    
T  35855893 cagaattttcacccgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactga 35855992  T
Q  1279 atcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaac 1378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35855993 atcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaac 35856092  T
Q  1379 ggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgc 1478  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  35856093 ggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatcc 35856192  T
Q  1479 actcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatat 1578  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  35856193 acttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagcccatat 35856292  T
Q  1579 ctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcatt 1677  Q
    |||||| |||||||  || ||||||||||| ||| |||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  35856293 ctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcatt 35856392  T
Q  1678 ccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    |||||||||||| |||   | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  35856393 ccaccaaaaggtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgat 35856439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 772; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1724
Target Start/End: Original strand, 49709263 - 49710704
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||  |||||  | |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49709263 taatagtcattgtcacatgcatacatgtagtcggtaaatgcaaacgtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgatt 49709362  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnng-ttccgcgtattgttatac 487  Q
    ||| ||||            ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||| ||||||| ||    
T  49709363 gttgtttgttgttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattatattttagggtaacaacgatgtaataaaaaaggttccgcggattgttaaac 49709462  T
Q  488 ttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnn 587  Q
     |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||         
T  49709463 ctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatggcaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaagaaattaaaaa 49709561  T
Q  588 nnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacg 682  Q
         |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  |    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  49709562 taaaacgacttccaaacaataggcaactttggttttataaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaaggatcatactttttgaaaaacttcacg 49709661  T
Q  683 atacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatag 782  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  49709662 atacacaacatttgtggtctccttgcaaacattattatcttcatccaggatgagcagcttcagaccttttcttgaagttactcgagagacagcgacatag 49709761  T
Q  783 agttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtca 882  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49709762 agttgtccatgcgtgaacacaggcttaggaagataaacccccactcgagataaagattgaccttgacttttatttattgacattgcaaaacaaagcgtca 49709861  T
Q  883 atgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctgt 981  Q
    ||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| || ||||||||| |||    
T  49709862 atggaaattgtctgcacctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcctgggaatgaatacgctggtaactgccctttttcatgt 49709961  T
Q  982 aattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcata 1081  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | || ||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  49709962 aattacggtagcagctatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagcctagtaccattacacagtccaatggcctgatctatgtttctcatcagcata 49710061  T
Q  1082 attggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcag 1181  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  49710062 actggacatcccacctttagtttcaacctgtgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccggtgtgaaccactcgctttggacatcag 49710161  T
Q  1182 aattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatc 1281  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| |||||||||||||||    
T  49710162 aattttcacccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatc 49710261  T
Q  1282 aagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacgga 1381  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  49710262 aagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagctggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaa-gga 49710360  T
Q  1382 tttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcact 1481  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  49710361 tttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattttcatccgaagcatcgttgccgtgtccaattgagagtatccact 49710460  T
Q  1482 cgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctt 1581  Q
     |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  49710461 tgccaaaattagcaatttctttctgttctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatctt 49710560  T
Q  1582 tgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattcca 1680  Q
    | | |||||||  || ||||||||||| ||  |||||| ||||  ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49710561 taacgaattgacggaggcatcaacaatatctggcctcgttcctcctcgaacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactattgtcattcca 49710660  T
Q  1681 ccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    || |||||| ||| | | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  49710661 ccgaaaggtttaagcgcgtttaggggatcattcttggacatgat 49710704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 654; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 1649
Target Start/End: Complemental strand, 49788215 - 49786601
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaa-tatttggatt--tatac 133  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||    
T  49788215 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttcattttgtatatattttaaaatatctaaacattgcatataacgataaaaaatatttggattattatac 49788117  T
Q  134 ttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgt 232  Q
    || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||| |||||| || || |||||||    
T  49788116 ttgtactaattatttgtagcataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaattttcttgcaaaaatacgccgacatactgtgtaataatatttgt 49788017  T
Q  233 taacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaa 332  Q
    | ||| ||| |||||||||||||||               ||||         || ||||||||| | ||| ||| |||||| |||||  | ||| ||||    
T  49788016 tgacaaaatgtattttattaatcataaaaactaaaaaatatgtatttttttttatataatagtcattatcaaatgcatacacgtagtcggtaaatacaaa 49787917  T
Q  333 cgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaa 432  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||            ||||||  ||||||||||||||||    
T  49787916 cgtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgattgttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaa 49787817  T
Q  433 tattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn----gttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatct 528  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||             ||| | || ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||    
T  49787816 tattgtgttttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaaaaaggtttcacggattgttaaacctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatgacaggaggatct 49787717  T
Q  529 gcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaa 627  Q
    ||||| ||| ||||| |||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||          |||||||||||||||| ||| |||||||||| || |    
T  49787716 gcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccggtacgccttacaaagaaattaaaaataaaacgacttccaaacaataggcagctttagttttatata 49787618  T
Q  628 ttatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatctt 723  Q
    |||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  49787617 ttatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcacgatacacaacatttgtggtctccttacaaacattattatctt 49787518  T
Q  724 catccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcc 823  Q
    |||||| ||||||||| |||  || |||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  49787517 catccaggatgagcagcttcggaccttttcatgaagttactcgagagacaacgacataaagttgtctatgcgtgaacacaggcttaggaagataaacccc 49787418  T
Q  824 cactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctgga 923  Q
    ||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49787417 cacccgagataaagattgacc-tggcttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaattgtctgcgtctgaatttgaagggtagtcctgga 49787319  T
Q  924 tcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcct-gtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgta 1021  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| ||    
T  49787318 tcattcggaataagattcatcctgggaatgaataccctagtacctgccctttttccttgtaattacggtagcagttatcgtgctcttccctagatgtata 49787219  T
Q  1022 actttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaa 1121  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||    
T  49787218 actgtcagcctagtaccattacacaatccattggcctgatcgatgtttctcaacagcataactggacatcccacctttagtttcaatctgtgatttggaa 49787119  T
Q  1122 ttccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaata 1221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | ||| |||||||||| |||||||    
T  49787118 ttccagagctcttaataccattaagaaattctggtgttaaccactcgctttggacatcagaattttcacctgatctaaaaatagaatcagaggttaaata 49787019  T
Q  1222 ctctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagc 1321  Q
    |||||||||||||||||||||| | || || ||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  49787018 ctctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaatatgctcaattgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagt 49786919  T
Q  1322 gggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttcta 1421  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49786918 tggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacagagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcaggaatttcta 49786819  T
Q  1422 ccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactga 1521  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  49786818 ccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgtaggtaccga 49786719  T
Q  1522 tgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgat 1620  Q
     ||||||  ||||           || ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||  || ||| |    
T  49786718 agatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaataagtccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatctggcatcgtt 49786630  T
Q  1621 ccttttcggacaacatgcaatatctgcct 1649  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||    
T  49786629 cctcctcagacaacatgcaatatctgcct 49786601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 551; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 677 - 1669
Target Start/End: Original strand, 38517579 - 38518573
Alignment:
Q  677 ttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacg 776  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| || | || |||||| ||||| || ||||||||| ||    
T  38517579 ttcacgatacacaacatctgtggtctccttacaaacattattatcgtcatccaggatgagcagctttagaccttttcttgaagttacccgagagacagcg 38517678  T
Q  777 acatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaa 876  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||   ||| || ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38517679 acataaagttgtccatgcgtgaacacaggcttatgaagctaaaactccattcaagataaagattgaccttggcttttatttattgtcattgcaaaacaaa 38517778  T
Q  877 gcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttt 975  Q
    ||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  38517779 gcgtcaaaggaaattgcctgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcattcagaataaaattcatcctgggaatgaataccctagtacctgccctttt 38517878  T
Q  976 tcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcata 1075  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||     
T  38517879 tcctgtaattacggtagcaactatcgtgctcttccctagatgtgtaactttcagcctagtaccattacacagtccattgacctgatcgatgtttctcatc 38517978  T
Q  1076 agcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctgga 1175  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||    
T  38517979 agcataactggacatcccacctttagtttcaacctgtgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattttggtgtgaaccactcgctttgga 38518078  T
Q  1176 catcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaac 1275  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| ||||||||     
T  38518079 catcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaat 38518178  T
Q  1276 tgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatc 1375  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38518179 tgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcatttagatcgggatacacaaagtctataagtgacatc 38518278  T
Q  1376 aacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagta 1475  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  38518279 aacggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccaaagcatcgttgccgtctccaattgagagta 38518378  T
Q  1476 tgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcaca 1575  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  38518379 tccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagccca 38518478  T
Q  1576 tatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaacta 1669  Q
    ||||||||| |||||||  || |||| |||||| ||| | |||| ||||  || |||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38518479 tatctttgacgaattgaccgaggcattaacaatatccggtctcgttcctcctcagacaacagttaatatctgcctaaaatcaccacctaaaacta 38518573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 483; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 961
Target Start/End: Complemental strand, 37532834 - 37531856
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgt---------atatattttgaaatat 92  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||    
T  37532834 attatgttatcttaaagttataagtatggttataatttaaatttgatatgga-aaaaatatcatcttaattttgttaattttgtatatattttgaaatat 37532736  T
Q  93 ctaaacattgcacataacaattaaaatatttggatttatacttatactaa-ttatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaata 190  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37532735 ctaaacattgcacataacgattaaagtatttggatttatactta-actaaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcatatgtaata 37532637  T
Q  191 tttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgta 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||              |||||         || ||    
T  37532636 tttttgcaaaaatactccgacgtactgtatattattatttgttgacataatgtattttattaatcataaaaactaaaaaaattgtattttttt--atata 37532539  T
Q  291 atagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgt 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37532538 atagtcagtgtcagatgtatacacctagtctgtgaatgcaaacgttaaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgattgt 37532439  T
Q  391 tatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn-gttccgcgtattgttatactt 489  Q
    ||||||            |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||| ||||||||||||||| |    
T  37532438 tatttgtttttattttttacaaaaccaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaaagtttcgcgtattgttatacct 37532339  T
Q  490 gaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnn 589  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||          
T  37532338 gaaaaatgcatcaattaaaagtcaatggcaggaggacctgcttatatagaaattgcatgtcctgtaatgaccagtacgtcttacaaagaaatttaaaaaa 37532239  T
Q  590 nnc----gacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatat----tttttgaaaaact 677  Q
           |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||    
T  37532238 aaaaaatgacttccaaacaatacgcaacttttgttttctaaattatagcaacaacaactctaaaacataaccaatggtcatatatactttttgaaaaact 37532139  T
Q  678 tcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacga 777  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37532138 tcaccatacacaacattcgtggtctccttgcaaacattattatcttcattcaagatgagcagcttcaaactttttctagaagtaactcgagagacagcga 37532039  T
Q  778 catagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaag 877  Q
    |||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37532038 catagagtt--ccatgcgtgaacacgggcttaggaagataaacttccactcgagataaagattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaacaaag 37531941  T
Q  878 cgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttg-gaatgaataccctg 961  Q
     ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  37531940 tgtcaatggaaattgcatgcgtctgaatttgaagggtagtcctggatcatgcggaataagattcatcctgagaatgaataccctg 37531856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1152
Target Start/End: Original strand, 31920561 - 31921432
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31920561 taatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacaccgatt 31920660  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn--gttccgcgtattgttata 486  Q
    ||||||||            ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||            |||||||| ||||||| |    
T  31920661 gttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtgtaatgtaaataatgtattttagggtaacaatgatgaaaaaaaaaaaggttccgcggattgttaaa 31920760  T
Q  487 cttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnn 586  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||        
T  31920761 cctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatgacaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaagaaattaaaa 31920859  T
Q  587 nnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcata-ttttttgaaaaacttca 680  Q
          |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31920860 ataaaacgacttccaaacaataggcaactttagttttcgaaattatagcaataacaattctaaaacataaccaatgatcatacttttttgaaaaatttca 31920959  T
Q  681 cgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacat 780  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| || |||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  31920960 cgatacacaacatttgtggtctccttacaaacattattatcttcatccaggatgaccaacttcagaccttttcttgaagttactcgagagacagcgacat 31921059  T
Q  781 agagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgt 880  Q
    | |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  31921060 aaagttgtccatgcgtgaacacaggcttaagaagataaacccccacttgagataaagattgaccctcacttttatgtattgtcattgcaaaacaacacgt 31921159  T
Q  881 caatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcat-cttggaatgaataccctggtaccttccctttttcct 979  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  31921160 caatggaaattgcctgcgcctgaatttgaaggatagtcctggatcactcggaataagattcatcctgggaatgaatacactggtaccttccccttttcct 31921259  T
Q  980 gtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagca 1079  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||| |  ||||||||||||||||| ||||    
T  31921260 gtaattacagtatcaactatcgtgctcttccctagatgtgtaactatcagcctcgtaccattacacagtccattagcatgatcgatgtttctcatcagca 31921359  T
Q  1080 taattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattc 1152  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31921360 taactggacatctcacccttagtttcaaccggtgatttggaattctagagctcttaataccattaaaaaattc 31921432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 411 - 1153
Target Start/End: Original strand, 787088 - 787840
Alignment:
Q  411 aaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaag 510  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||          ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  787088 aaaaccaatggtctaatgtaaatattctattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaaattc-gcgtattgttatacctgaaaagtgcatcaattaaaag 787186  T
Q  511 tcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnn-------cgacttccaaac 603  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||               ||||||||||||    
T  787187 tcaatggcaggagaatctacttatatagaaattgcatgtcacgtaatgaccagtaagccttacaaagaaattttaaaaaaaaaaaaaacgacttccaaac 787286  T
Q  604 aatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttgg 699  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |    |||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  787287 aatacgcaactttagttttcttaattatagcaacaacaattctaaaacataatctaagatcatactttttgaaaaacttcaggatatacaacatttgtgg 787386  T
Q  700 tctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaa 799  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||   ||||    
T  787387 tctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagcttcacaccttttctatatgtaactcgagagacaacaacatagagttgttcatgtgtgaa 787486  T
Q  800 cacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgc 899  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||    
T  787487 cacgggcttaggaagataaactcccacttgagataaagattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaacaaagtgtcaatggaaattgtctgcgc 787586  T
Q  900 ctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttggaatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactat 999  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  787587 ctgaatttgaagggtagttctggatcacttggaataagattcatccgggaatgaataccctgatacctgccctttttcccgtaattacgttagcagctat 787686  T
Q  1000 cttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctaccctt 1099  Q
    | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||  | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||| ||    
T  787687 cgtgctcttccctagatgtgtaattgtcagcctcgtaccattacacgttccattggcctgatcgatgtttctcatcagcataactgaacatctcaccttt 787786  T
Q  1100 agtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattcc 1153  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  787787 agtttcaacctgtgatttggaattccatagctcttaataccattaagaaattcc 787840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 749 - 1319
Target Start/End: Complemental strand, 55559702 - 55559131
Alignment:
Q  749 ttttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgaccctta 848  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  55559702 ttttctagaagtaactcgagagacagcgacatagagttgcccatgcgtgaacacaggcttaggaaaataaactcccactcgagataaagattgaccctga 55559603  T
Q  849 cttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg 948  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  55559602 cttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaattatctgcgcatgaatttgaagggtagtcctggaccactcggaataagattcatcctgg 55559503  T
Q  949 -aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaa 1047  Q
     |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||     
T  55559502 gaatgaataccttggtacctgccctttttcctgtaattacggtagcagctatcgtgatcttccctagatgtgtaactgtcagccttgtaccattacacag 55559403  T
Q  1048 ttcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaaga 1147  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  55559402 tccattggcctgatcgatgtttctcatcaacataactggacatcccacctttagtttcaaccggtgatttgaaattccagagctctaaataccattaagg 55559303  T
Q  1148 aattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtg 1247  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  55559302 aattcagttgtgaaccactcactttggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagtg 55559203  T
Q  1248 aaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaata 1319  Q
    | || |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  55559202 acatcatatattcgttaacatgttcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaata 55559131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1278 - 1724
Target Start/End: Original strand, 13337320 - 13337767
Alignment:
Q  1278 aatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaa 1377  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  13337320 aatcaagcgttgatgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctataagtgacataaa 13337419  T
Q  1378 cggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatg 1477  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||||| |||||||     
T  13337420 cggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcatgaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgtcgtctccaattgagagtatc 13337519  T
Q  1478 cactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacata 1577  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||    
T  13337520 cacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaaacctcaacacattacaataatatcata 13337619  T
Q  1578 tctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcat 1676  Q
    ||||||| |||||||  || ||||||||||| ||| |||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  13337620 tctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcat 13337719  T
Q  1677 tccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    ||||||||||||| |||     ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13337720 tccaccaaaaggtttaagtgtgtttaggggatcattcttggacatgat 13337767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 16 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 618720 - 618279
Alignment:
Q  16 aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaatta 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  618720 aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggaaaaaaatatcatcttaattttgtatatattttaaaatatctaaacattgcacataacgatta 618621  T
Q  116 aaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgta 214  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  618620 aagtatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcatatgtaatatttttgcaaaaatactccgacgta 618521  T
Q  215 ctgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtgtcagatgtatacac 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||              |||||         || ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  618520 ctgtatattattatttgttgacataatgtattttattaatcataaaaactaaaaaaattgta--tttttttatataacagtaagtgtcagatgtatacac 618423  T
Q  315 ctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaa 414  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||            ||||||    
T  618422 ctagtctgtgaatgcaaacattaaattttttacgggtgtgtatagatatagtttgggctacaaaaacgtcgattgttatttgtttttattttttacaaaa 618323  T
Q  415 tcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt 459  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  618322 tcaatggtctaatgtaaatattata-tttggggtaacaacgatgt 618279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1404 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 55559131 - 55558810
Alignment:
Q  1404 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttc 1503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  55559131 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgttgttgccgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttt 55559032  T
Q  1504 ctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 1603  Q
    |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55559031 ctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagtctcaacacattaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 55558932  T
Q  1604 acaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcattta 1702  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  55558931 acaatatactgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgatatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaatggtttaaactcgttta 55558832  T
Q  1703 gaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    | |||||||| |||||||||||    
T  55558831 ggggatcatttttggacatgat 55558810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1366 - 1679
Target Start/End: Complemental strand, 618270 - 617956
Alignment:
Q  1366 aagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctcca 1465  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  618270 aagtgacatgaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcttcgttgtcgtctcca 618171  T
Q  1466 attaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattac 1565  Q
    ||| ||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  618170 attgagagtattcacttgttaaaattaggaatttcttcctgctctgcagataccaaagatgcactcaatctcatattaacagttagcctcaacaaattac 618071  T
Q  1566 aataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaa 1664  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  618070 aataagcctatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcatgcctcgttccttttcagacaacatgcaatatctgcttgaaatcaccacctaa 617971  T
Q  1665 aactattgtcattcc 1679  Q
    | |||||||||||||    
T  617970 agctattgtcattcc 617956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 257
Target Start/End: Original strand, 31920283 - 31920526
Alignment:
Q  16 aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaatta 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  31920283 aagttataattgtggttataatttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataa 31920381  T
Q  116 aaatatttggat--ttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacg 212  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  31920382 aaatatttggattattatacttgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaattttcttgcaaaaatacgccgacg 31920481  T
Q  213 tactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    |||||| || || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  31920482 tactgtgtaataatatttgttgacaaaatgtattttattaatcat 31920526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 786717 - 786972
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 101  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  786717 attatgttatcttaaagttataattgtggttataatttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaactttgtatatattttgaaatatctaaacatt 786815  T
Q  102 gcacataacaattaaaatatttggatt--tatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgca 198  Q
    |||  |||| || ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  786816 gca--taacgataaaagtatttggattattatacttgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacttagcatacgtaatatttttgca 786913  T
Q  199 aaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    ||||||| | ||||||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  786914 aaaatacgctgacgtactgtataataatatttgttgacaaaatgtattttattaatcat 786972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 257
Target Start/End: Original strand, 49708990 - 49709233
Alignment:
Q  16 aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaatta 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |    
T  49708990 aagttataattgtggttataatttaaatttgatatgaa-aaaaatataattttaattttgtatatattttaaaatatctaaacattgcatataacgataa 49709088  T
Q  116 aaatatttggat--ttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacg 212  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  49709089 aaatatttggattattatacctgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaattttcttgcaaaaatacgccgacg 49709188  T
Q  213 tactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    |||||| || || |||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  49709189 tactgtgtaataatatttgttgacaaaacgtattttattaatcat 49709233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 257
Target Start/End: Original strand, 35854742 - 35854963
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggatt--tatact 134  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||    
T  35854742 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaatttt-tatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatttggattattatact 35854839  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgtt 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||    
T  35854840 tgtactaattatttgtagtataagatgcattcattgttaaacttagcatatgtaatttttttgcaaaaatacgccgacgtactgtgtaataatatttgtt 35854939  T
Q  234 aacataatatattttattaatcat 257  Q
     ||| ||| |||||||||||||||    
T  35854940 gacaaaatgtattttattaatcat 35854963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 55560353 - 55560131
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatact 134  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  55560353 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatttggattattatact 55560255  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgtt 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||    
T  55560254 tgtactaattatttgtagtataagatgcattcattgttaaacttagcatatgtaatttacttgcaaaaatacgccgacgtactgtgtaataatatttgtt 55560155  T
Q  234 aacataatatattttattaatcat 257  Q
     ||| ||| |||||||||||||||    
T  55560154 gacaaaatgtattttattaatcat 55560131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 289 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 55560102 - 55559808
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||    
T  55560102 taatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaattttt-acgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacaccaatt 55560004  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttaggg-taacaacgatgtnnnnnnnnn--gttccgcgtattgttat 485  Q
    ||||||||            ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||           |||||||| |||||||     
T  55560003 gttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttaggggtaacaacgatgtaaaaaaaaaaggttccgcggattgttaa 55559904  T
Q  486 acttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatt 582  Q
    || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  55559903 acctgaaaaatgcatgaattaatagtcaatggcaggaagatctgcttatatagaaattgcatgt-ctataatgaccggtacgccttacaaagaaatt 55559808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 92 - 257
Target Start/End: Original strand, 1859565 - 1859733
Alignment:
Q  92 tctaaacattgcacataacaattaaaatatttggatt--tatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaa 188  Q
    |||||| |||| | ||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1859565 tctaaatattgtatataacgataaaaatatttggattattatacttgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaa 1859664  T
Q  189 tatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  1859665 ttttcttgcaaaaatacgccgacgtactgtgtaataatatttgttgacaaaacgtattttattaatcat 1859733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 257
Target Start/End: Original strand, 9281828 - 9281941
Alignment:
Q  144 tatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcatagtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatat 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  9281828 tatttgtagtataagatgtactcattattaaatttaatataataatattttagtaaaaatacactgacgtactgtatattattatttgttgacataatgt 9281927  T
Q  244 attttattaatcat 257  Q
    ||| ||||||||||    
T  9281928 attatattaatcat 9281941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 184
Target Start/End: Original strand, 38517436 - 38517537
Alignment:
Q  85 tgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggatt--tatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagca 182  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  38517436 tgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatctggattattatacttgtactaattatttgtagtataagattcactcattgttaaacttagca 38517535  T
Q  183 ta 184  Q
    ||    
T  38517536 ta 38517537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Original strand, 6244756 - 6244846
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggatt 128  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  6244756 tttaaattcgatatgaa-aaaaatataatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatacaacgataaaaatatttggatt 6244846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 368
Target Start/End: Original strand, 9281977 - 9282055
Alignment:
Q  290 aatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagttt 368  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |  |||| |||||||||| |||| || |||||||||||| | ||||||||||||    
T  9281977 aatagtcaatgtcagatgtagacatccggtctgtgaatgcaaatgttagatattttacggatgtatataaatatagttt 9282055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 603 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 55559780 - 55559701
Alignment:
Q  603 caatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaactt 678  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||   |    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  55559780 caatgcgcaactttagttttctaaattatagcagcaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttaaaaaactt 55559701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 42328894 - 42328860
Alignment:
Q  16 aagttataagtgtggttataatttaaatttgatat 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42328894 aagttataagtgtagttataatttaaatttgatat 42328860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 802; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 802; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 25219701 - 25218252
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25219701 taatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaatgtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgatt 25219602  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn--------gttccgcgtatt 480  Q
    ||||||||            ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 ||| | || |||    
T  25219601 gttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaaaaaaaaaggtttcacggatt 25219502  T
Q  481 gttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaa 580  Q
    |||| || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  25219501 gttaaacctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatgacaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaagaaa 25219403  T
Q  581 tttnnnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaa 675  Q
    ||          |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25219402 ttaaaaataaaacgacttccaaacaataggcaactttagttttataaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaa 25219303  T
Q  676 cttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaac 775  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||| |    
T  25219302 cttcacgatacacaacatttgtggtctccttacaaacattattatcttcatccaggatgagcagcttcagaccttttcttgaagttactcgagagacagc 25219203  T
Q  776 gacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaa 875  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25219202 gacataaagttgtccatgcgtgaacacaggcttaggaagataaacccccactcgagataaagattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaacaa 25219103  T
Q  876 agcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttcccttt 974  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25219102 agcgtcaatggaaattgcctgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcctgggaatgaataccctggtacctgcccttt 25219003  T
Q  975 ttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcat 1074  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  25219002 ttcctgtaattacggtagcagctatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagcctagtaccattacacagtccattggcctgatcgatgtttctcat 25218903  T
Q  1075 aagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctgg 1174  Q
     ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  25218902 cagcataactggacatcccacctttagtttcaacctgtgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccggtgtgaaccactcgctttgg 25218803  T
Q  1175 acatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaa 1274  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| ||||||||    
T  25218802 acatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaa 25218703  T
Q  1275 ctgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcat 1374  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25218702 ctgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacat 25218603  T
Q  1375 caacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagt 1474  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  25218602 caacggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagt 25218503  T
Q  1475 atgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcac 1574  Q
    || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  25218502 atccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagccc 25218403  T
Q  1575 atatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgt 1673  Q
    |||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||| |||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  25218402 atatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgt 25218303  T
Q  1674 cattccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    |||||||||||||||| |||   | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25218302 cattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgat 25218252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 692; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1724
Target Start/End: Original strand, 7820925 - 7822370
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  7820925 taatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaatgtttatttttttacgggtgtgtataaataaagtttgggctacagaaacgtcgatt 7821024  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn-----gttccgcgtattgtt 483  Q
    ||||||||            ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||| |||| ||||||    
T  7821025 gttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaaaaaaggtttcgcggattgtt 7821124  T
Q  484 atacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaattt 583  Q
    | || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  7821125 aaacctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatgacaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaagaaatta 7821223  T
Q  584 nnnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaactt 678  Q
             |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7821224 aaaataaaacgacttccaaacaataggcaactttagttttataaattatagcgacaacaattctaaaacttaaccaatgatcatactttttgaaaaactt 7821323  T
Q  679 cacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgac 778  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| || | || |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  7821324 cacgatacacaacatttgtggtctccttataaacattattatcttcatccaggatgagcagctttagaccttttcttgaagttactcgagagacagcgac 7821423  T
Q  779 atagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagc 878  Q
    ||| |||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7821424 ataaagttgtccatgcgtgaacacagacttaggaagataaacccccactcgagataaagattgaccctagcttttatttattgtcattgcaaaacaaagc 7821523  T
Q  879 gtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttc 977  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |    
T  7821524 gtcaatggaaattgcctgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagatacatcctgggaatgaataccctaatacctgccctttt-c 7821622  T
Q  978 ctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataag 1077  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||    
T  7821623 ctgtaattacggtagcagctatcgtgctcttccctagatgtgtaactatcagcctagtaccattacacagtccattggcctgatcgatgtttctcatcag 7821722  T
Q  1078 cataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggaca 1177  Q
    ||||| |||| || | ||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  7821723 cataactggaaattccacctttagtttcaacatgtgatttggaattccagagctcttaatacaattaagaaattctggtgtgaaccactcgctttggaca 7821822  T
Q  1178 tcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactg 1277  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || || ||| || |||||| |||||||||||    
T  7821823 tcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctgaaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactg 7821922  T
Q  1278 aatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaa 1377  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  7821923 aatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcggaatacacaaagtctataagtgacatcaa 7822022  T
Q  1378 cggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatg 1477  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||||| |||||||     
T  7822023 cggatttgttgtgtttgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgtcgtctccaattgagagtatc 7822122  T
Q  1478 cactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacata 1577  Q
    ||||  | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  7822123 cacttacaaaaattcgcaatttcttcctgctctacaggtaccgaagatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcata 7822222  T
Q  1578 tctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcat 1676  Q
    ||||||| |||||||  || |||||||||||   | |||||| ||||  |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  7822223 tctttgacgaattgaccgaggcatcaacaataatcggcctcgttcctcctcggacaataggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcat 7822322  T
Q  1677 tccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    ||||||||||||| |||     ||||| |||||||| |||||||||||    
T  7822323 tccaccaaaaggtttaagtgtgtttaggggatcatttttggacatgat 7822370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 675; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 137 - 1591
Target Start/End: Original strand, 30306105 - 30307575
Alignment:
Q  137 tactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| | |||||||||| || || |||||||| |    
T  30306105 tactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaattttcttgcaaaaatacgctgacgtactgtgtaataatatttgttga 30306204  T
Q  236 cataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnt-tgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacg 334  Q
    || ||| |||||||||||||||              | ||||         || ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | ||||||||||    
T  30306205 caaaatgtattttattaatcataaaaactaaaaaaatatgtatttttttttatataatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacg 30306304  T
Q  335 ttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaata 434  Q
    || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||            ||||||  ||||||||||||||||||    
T  30306305 tttaattttatacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgattgttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaata 30306404  T
Q  435 ttgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn---------gttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagta 525  Q
    ||||||||||||||| |||||||||                  ||| | || ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |    
T  30306405 ttgtattttagggtatcaacgatgtaaaaaaaaaaagaaaaaggtttcacggattgttaaacatgaaaagtgcatgaattaatagtcaatgacaggagga 30306504  T
Q  526 tctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnnc-gacttccaaacaatacgcaactttagttttct 624  Q
    ||| |||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||           ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  30306505 tcttcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaagaaattaaaaataaaatgacttccaaacaataggcaactttagttttat 30306603  T
Q  625 aaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattat 720  Q
    ||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  30306604 aaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcacgatacacaacatttgtggtctccttacaaacattattat 30306703  T
Q  721 cttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaac 820  Q
    |||||||||  |||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||    
T  30306704 cttcatccagaatgagcagcttcagaccttttcttgaagttactcgagagacagcgacataaagttgtccatgcgtgaacataggcttaggaagataaac 30306803  T
Q  821 tcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcct 920  Q
     ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  30306804 ccccactcgagataaagattgaccctggcttttatttattgtcattgcaaaacaaagtgtcaatggaaattgcctgcgcctgaatttgaagggtagtcct 30306903  T
Q  921 ggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtg 1019  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  30306904 ggatcactcagaataagattcatcctgggaatgaataccctagtacctgccctttttcctgtaattacggtagcagctatcgtgctcttccctagatgtg 30307003  T
Q  1020 taactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttgg 1119  Q
    ||||| | ||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||  || ||||||    
T  30307004 taactgttagcctagtaccattacacagtccattggcctgatcgatgtttctcatcagcataactggacatcccacctttagtttcaacttgtgatttgg 30307103  T
Q  1120 aattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaa 1219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||    
T  30307104 aattgcagagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcggagcttaaa 30307203  T
Q  1220 tactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaata 1319  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  30307204 tactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaata 30307303  T
Q  1320 gcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttc 1419  Q
    |  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  30307304 gttggtcaccaaggttatcgttcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcaggaatttc 30307403  T
Q  1420 taccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtact 1519  Q
    ||| |||||||||||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  30307404 tacattcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgtcgtctccaattgagagtatctacttgcaaaaattagcaatttcttcccactctgcaggtacc 30307503  T
Q  1520 gatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattg 1591  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  30307504 gaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagcccatatctttgacgaattg 30307575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 658; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 749 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 21114408 - 21113431
Alignment:
Q  749 ttttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgaccctta 848  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  21114408 ttttctagaagtaactcgagagacagcgacatagagttgctcatgcgtgaacacagacttaggaagataaactcccactcgagataaagattgaccctga 21114309  T
Q  849 cttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatctt-g 947  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  21114308 cttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaattatctgcgcatgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcctag 21114209  T
Q  948 gaatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaa 1047  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  21114208 gaatgaataccttggtacctgccctttttcctgtaattacggtagcagctatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagcctcgtaccattacacag 21114109  T
Q  1048 ttcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaaga 1147  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21114108 tccattggcttgatcgatgtttctcatcagcataactggacatcccacctttagtttcaaccggtgatttggaattccagagctcttaataccattaagg 21114009  T
Q  1148 aattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtg 1247  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21114008 aatttcgttgtgaaccactcactttggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagtg 21113909  T
Q  1248 aaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatc 1347  Q
    | || |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21113908 acatcatatattcgttaacatgttcaactgaatcaagcgttggtgcaagtattccccttttttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatc 21113809  T
Q  1348 gggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaa 1447  Q
      ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21113808 aagatacacaaagtctataagtgacatcaacagatttgttgtgtccgatataagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaa 21113709  T
Q  1448 gcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacag 1547  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| ||||| |||||||||||    
T  21113708 gcgttgttgccgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatcgcatattaacag 21113609  T
Q  1548 taagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctg 1646  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21113608 taagcgtcaacacattaaaataagcacatatctgtgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctg 21113509  T
Q  1647 cctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21113508 cctgatatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaatggtttaaacttgtttaggggatcattcttggacatgat 21113431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1406
Target Start/End: Complemental strand, 31979657 - 31978533
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||  | |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31979657 taatagtcagtatcacatgcatacacgtactcggtaaatgcaaacgtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgctgatt 31979558  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn--gttccgcgtattgttata 486  Q
    ||||||||            ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||| ||||||| |    
T  31979557 gttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaagaaaaaaggttccgcggattgttaaa 31979458  T
Q  487 cttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnn 586  Q
    || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||        
T  31979457 ctagaaaagtgcatgaattaatagtcaatggcaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaagaaattaaaa 31979359  T
Q  587 nnnnnc-gacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcac 681  Q
           ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31979358 ataaaatgacttccaaacaataggcaactttagttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcgtactttttgaaaaacttcac 31979259  T
Q  682 gatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacata 781  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  31979258 gatacacaacatttgtggtctccttactaacattattatcttcatccaggatgagcagcttcagaccttttcttcaagttactcgagagacaccgaaata 31979159  T
Q  782 gagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtc 881  Q
     |||||| ||| | ||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31979158 aagttgttcatgcgtgaacacagacttaagaagataaacccccactcgagataaagattgaccctggtttttatttattgtcattgtaaaacaaagcgtc 31979059  T
Q  882 aatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatctt-ggaatgaataccctggtaccttccctttttcctg 980  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  31979058 aatggaaattgcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcctcggaatgaataccctggtacctgccatttttcttg 31978959  T
Q  981 taattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcat 1080  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  31978958 taattacggtagcagctatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagcctagtaccattacacagtccattggcttgatcgatgtttctcatcagcat 31978859  T
Q  1081 aattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatca 1180  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  31978858 aactggacatcccacctttagtttcaacctgtgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgatgtgaaccactcgctttggacatct 31978759  T
Q  1181 gaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaat 1280  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| ||  ||| | ||||||||||||||    
T  31978758 gaattttcccccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaatttgttgacatgctcaactgaat 31978659  T
Q  1281 caagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacgg 1380  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  31978658 caagcgttgatgcgagtattcccctttcttggaaaaatagctggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtttataagtgacatcaacag 31978559  T
Q  1381 atttgttgtgttcgatatgagcaaat 1406  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||    
T  31978558 atttgttgtgcccgatatcagcaaat 31978533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 811 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 25209635 - 25208734
Alignment:
Q  811 gaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaa 910  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  25209635 gaagataaacccccactcgagataaagactgaccctggcttttatttattatcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaattgtctgcgcctgaatttgaa 25209536  T
Q  911 gggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttcccttttt-cctgtaattacggtagcaactatcttgctctt 1008  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25209535 gggtagtcctggatcactcggaataagattcatcctgggaatgaataccctagtacctgcccttttttcctgtaattacggtagcagctatcgtgctctt 25209436  T
Q  1009 tcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaac 1108  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  25209435 ccctagatgtgtaactgtcagcctagtaccattacacagtccattggcctgatcgatgtttctcatcagcataactggacatcccacctttagtttcaac 25209336  T
Q  1109 cggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaat 1208  Q
    | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  25209335 ctgtgatttggaataccagagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactagctttggacatcagaattttcgcccgatctaaaaatagaat 25209236  T
Q  1209 cagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgccccttta 1308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  25209235 cagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttc 25209136  T
Q  1309 ttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatct 1408  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||               |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  25209135 ttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcatt---------------aaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgacatcagcaaatct 25209051  T
Q  1409 tcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgct 1508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||| |||||| |||||||    
T  25209050 tcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgtcgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagtaatttcgtcctgct 25208951  T
Q  1509 ctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat 1608  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||||||    
T  25208950 ctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacattaagcctcaacacattacaataagctcatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaat 25208851  T
Q  1609 -tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttagagga 1707  Q
     ||| |||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     ||||| |||    
T  25208850 atccggcctcgttcctcctcggaaaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtttaagtgtctttagggga 25208751  T
Q  1708 tcattcttggacatgat 1724  Q
    |||||||||||||||||    
T  25208750 tcattcttggacatgat 25208734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1152
Target Start/End: Complemental strand, 33862515 - 33861640
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaatttttt-acggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgat 387  Q
    |||||||||||| || ||| |||||| |||||  | |||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  33862515 taatagtcagtgccacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaatttttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacaaaaatgtcgat 33862416  T
Q  388 tgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn-----gttccgcgtattgt 482  Q
    |||||||||            ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||  |||||    
T  33862415 tgttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtttaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaaaaaaggttccgcagattgt 33862316  T
Q  483 tatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatt 582  Q
    || || |||||||||||| |||||| |||||||| |||| | ||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33862315 taaacctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatgacagggggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaagaaatt 33862217  T
Q  583 tnnnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcata-ttttttgaaaaac 676  Q
              |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  33862216 aaaaataaaacgacttccaaacaataggcaactttagttttcgaaattatagcaataacaattctaaaacataaccaatgatcatacttttttgaaaaat 33862117  T
Q  677 ttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacg 776  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| || |||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  33862116 ttcacgatacacaacatttgtggtctccttacaaacattattatcttcatccaggatgaccaacttcagaccttttcttgaagttactcgagagacagcg 33862017  T
Q  777 acatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaa 876  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  33862016 acataaagttgtccatgcgtgaacacaggcttaagaagataaacccccacttgagataaagattgaccctcacttttatgtattgtcattgcaaaacaac 33861917  T
Q  877 gcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcat-cttggaatgaataccctggtaccttccctttt 975  Q
     |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  33861916 acgtcaatggaaattgcctgcgcctgaatttgaaggatagtcctggatcactcggaataagattcatcctgggaatgaatacactggtaccttccccttt 33861817  T
Q  976 tcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcata 1075  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||| |  |||||||||||||||||     
T  33861816 tcctgtaattacagtatcaactatcgtgctcttccctagatgtgtaactatcagcctcgtaccattacacagtccattagcatgatcgatgtttctcatc 33861717  T
Q  1076 agcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattc 1152  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  33861716 agcataactggacatctcacccttagtttcaaccggtgatttggaattctagagctcttaataccattaaaaaattc 33861640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 819
Target Start/End: Original strand, 13424422 - 13425242
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaa---------ttttgtatatattttgaaatat 92  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||         ||||||||||||||||||||||    
T  13424422 attatgttatcttaaagttaaaagtgtggttataatttaaatttgatatggaaaaaagcatcatcttaattttgttaattttgtatatattttgaaatat 13424521  T
Q  93 ctaaacattgcacataacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatat 191  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  13424522 ctaaacattgcacataacgattaaagtatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgaactcattgataaacttagcatatgtaatat 13424621  T
Q  192 ttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaa 291  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||              |||||         || |||    
T  13424622 ttttgcaaaaatacgccgacgtactgtatattattatttgttgacataatgtattttattaatcataaaaactaaaaattttgta--tttttttatataa 13424719  T
Q  292 tagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgtt 391  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||        || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13424720 tagtcaatgtcagatttatacacctagtatctgaatgc--------aactttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctaaagaaacgccgattgtt 13424811  T
Q  392 atttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngttccgcgtattgttatacttga 491  Q
    |||||            | |||| |||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||         ||||| ||||||||||||| |||    
T  13424812 atttgtttttattttttataaaaccaattgtttaatgtaaatattgtactttaggttaacaacgatgttaaaaaaaagttccacgtattgttatacctga 13424911  T
Q  492 aaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnn 591  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||             
T  13424912 aaagtgcatcaattaaaattcaatggcaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtcctataatgactagtacgtcttacaaagaaatt--aaaaaaa 13425009  T
Q  592 cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga-----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatac 686  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  |     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13425010 agacttccaaacaattcgcaactttagctttctaaattatagcaaaaaaaaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcacgatac 13425109  T
Q  687 acaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagtt 786  Q
    | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13425110 ataacatttgtgatctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagcttcaaaccttttctagaagtaactcgagagacagtgacatagagtt 13425209  T
Q  787 gtccattcatgaacacgggcttaggaagataaa 819  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  13425210 gtccatgcgtgaacacggacttaggaagataaa 13425242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 289 - 1046
Target Start/End: Original strand, 7780835 - 7781601
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  7780835 taatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaatgtttatttttttacgggtgtgtataaataaagtttgggctacagaaacgtcgatt 7780934  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn-----gttccgcgtattgtt 483  Q
    ||||||||            ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||| |||| ||||||    
T  7780935 gttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaaaaaaggtttcgcggattgtt 7781034  T
Q  484 atacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaattt 583  Q
    | || |||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  7781035 aaacctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatgacagaaggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaagaaatta 7781133  T
Q  584 nnnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaactt 678  Q
             |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7781134 aaaataaaacgacttccaaacaataggcaactttagttttataaattatagcgacaacaattctaaaacttaaccaatgatcatactttttgaaaaactt 7781233  T
Q  679 cacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgac 778  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| || | || |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  7781234 cacgatacacaacatttgtggtctccttataaacattattatcttcatccaggatgagcagcttaagaccttttcttgaagttactcgagagacagcgac 7781333  T
Q  779 atagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagc 878  Q
    ||| |||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781334 ataaagttgtccatgcgtgaacacagacttaggaagataaacccccactcgagataaagattgaccctagcttttatttattgtcattgcaaaacaaagc 7781433  T
Q  879 gtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcat-cttggaatgaataccctggtaccttccctttttc 977  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  7781434 gtcaatggaaattgcctgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagatacatcctgggaatgaataccctaatacctgccc-ttttc 7781532  T
Q  978 ctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacaca 1046  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  7781533 ctgtaattacggtagcagctatcgtgctcttccctagatgtgtaactatcagcctagtaccattacaca 7781601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 274; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 289 - 902
Target Start/End: Original strand, 14713366 - 14713999
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||||    
T  14713366 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctgtgaatgcaaacgttaaattttttacgggtgtgtataaatatagtttggactacagaaatgtcgatt 14713465  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn--------gttccgcgtatt 480  Q
    ||||||||            |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||                 ||| ||||||||    
T  14713466 gttatttgtttttattttttacaaaatcaatggtctaatgtaaatattatattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaaaaaaaaaagtttcgcgtatt 14713565  T
Q  481 gttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaa 580  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||| |||||||    
T  14713566 gttatacctgaaaaatgcatcaattaaaagtcaatggcaggaggacatgcttatatagaaattgcatgtcttgtaatgaccaatacgtcttataaagaaa 14713665  T
Q  581 tttnnnnnnnnc---------gacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatatttt 667  Q
    | |                  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  |    |||||||||||||||||||||||| |||    
T  14713666 tatataaaaaaaaaaaaaaaagacttccaaacaatacgcaactttggttttctaaattacagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatacttt 14713765  T
Q  668 ttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcga 767  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14713766 ttgaaaaacttcacgataaacaacattcgtggtctccttgcaaacattattatctccattcaagatgagcagcttcaaaccttttctagaagtaactcga 14713865  T
Q  768 gagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattg 867  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  14713866 gagacagcgacataaagttgttcatacgtgaacacgggcttaggaagataaa-tcccactcgagataaagattgaccctgaattttatttattgtcattg 14713964  T
Q  868 caaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctg 902  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14713965 caaaacaaagcgtcaatggaaattgcatgcgcctg 14713999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 640 - 1099
Target Start/End: Original strand, 14767005 - 14767469
Alignment:
Q  640 tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcag 739  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14767005 tctaaaatataaccaatgaacatactttttgaaaaacttcacgatacacaacatttgtggtctccttgcaaacattattatcttcattcaaaatgagcag 14767104  T
Q  740 tttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatg----aacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataa 835  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    || |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  14767105 cttcaaaccttttatagaagtaactcgagagacagcgacatagagttgtccatatatgcgtgaatacgggcttaggaagatcaactcctactcaagataa 14767204  T
Q  836 atattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaata 935  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||  | || || |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  14767205 agattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaacaaaagtgtcaatggaaatcacctgtgcttgaatttgaatggtagtccttgatcgctcggaata 14767304  T
Q  936 agattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcg 1034  Q
     |||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  14767305 cgattcatcttgggaatgaatactctggtacctgtcctttttcctgtaattacggtagcagctatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagcctcg 14767404  T
Q  1035 tatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctaccctt 1099  Q
     | ||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  14767405 caccattacacagtccattggcatgatcgatgtttctcatcagcataactggacatcccaccctt 14767469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 14713071 - 14713336
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaa---------ttttgtatatattttgaaatat 92  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||    
T  14713071 attatgttatcttaaagttataagtatggttataatttaaatttgatatggaaaaaaatatcatcttaattttgttaattttgtatatattttgaaatat 14713170  T
Q  93 ctaaacattgcacataacaattaaaatatttggatttatacttatact-aattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaata 190  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  14713171 ctaaacattgcacataacgattaaagtatttggatttatattta-actaaattatttgtagtataagatgtacttattgttaaacttagcatatgtaata 14713269  T
Q  191 tttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  14713270 tttttgcaaaaatactccgacgtactgtatattattatttgttgacataatgtattttactaatcat 14713336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 31979944 - 31979687
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 101  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  31979944 attatgttatcttaaagttataattgtggttataatttaaatttgaaatgaa-aaaaatataatcttaattttgtatatatttcaaaatagctaaacatt 31979846  T
Q  102 gcacataacaattaaaatatttggatt--tatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgca 198  Q
    ||| ||||| || ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  31979845 gcatataacgatcaaagtatttggattattatacttgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacttagcatatgttatatttttgca 31979746  T
Q  199 aaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  31979745 aaaatacgccgacttactgtataataatatttgttgacaaaatgtattttattaatcat 31979687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 14764430 - 14764683
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 101  Q
    ||||||||||||  || |||||| |||| |||||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14764430 attatgttatcttaaaattataattgtg-ttataatttaaattcgatgtgaa-aaaaatataatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 14764527  T
Q  102 gcacataacaattaaaatatttggatt--tatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgca 198  Q
    ||| ||||| || ||| ||||||||||  ||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14764528 gcatataacgataaaagtatttggattgttatacttgta---attatttgtagtataagatgtactccttgtcaaacttagcatatgtaatatttttgca 14764624  T
Q  199 aaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14764625 aaaatacgccgaggtactgtatattattatttgttgacataatgtattttattaatcat 14764683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21115082 - 21114838
Alignment:
Q  16 aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaatttt-gtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaatt 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  21115082 aagttataattgtggttataatttaaattcgatatgaa-aaatatataatcttaatttttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgata 21114984  T
Q  115 aaaatatttggatt--tatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgac 211  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||    
T  21114983 aaaatatttggattattatacctatactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaattttcttgcaaaaatacgccgac 21114884  T
Q  212 gtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    ||| ||| || || |||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  21114883 gtattgtgtaataatatttgttgacaaaacgtattttattaatcat 21114838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25219954 - 25219731
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatact 134  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  25219954 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatttggattattatact 25219856  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattatta-tttgt 232  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | || || || |||||    
T  25219855 tgtactaattatttgtagtataagattcactcattgttaaacttagcatatgtaatttttttgcaaaaatacgccgacgtactatgtaataatattttgt 25219756  T
Q  233 taacataatatattttattaatcat 257  Q
    | ||| ||| |||||||||||||||    
T  25219755 tgacaaaatgtattttattaatcat 25219731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Original strand, 7780599 - 7780801
Alignment:
Q  58 aatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatacttatactaattatttgtagtat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  7780599 aatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatttggattattatacttttactaattatttgtagtat 7780698  T
Q  156 aagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaat 254  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||| || || ||||| || ||| ||| ||||||||||||    
T  7780699 aagatgcactcattgttaaacttagtatatgtaattttcttgcaaaaatacgccgacgtactgtgtaataatatttattgacaaaatgtattttattaat 7780798  T
Q  255 cat 257  Q
    |||    
T  7780799 cat 7780801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Original strand, 7820689 - 7820891
Alignment:
Q  58 aatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatacttatactaattatttgtagtat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  7820689 aatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatttggattattatacttttactaattatttgtagtat 7820788  T
Q  156 aagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaat 254  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||| || || ||||| || ||| ||| ||||||||||||    
T  7820789 aagatgcactcattgttaaacttagtatatgtaattttcttgcaaaaatacgccgacgtactgtgtaataatatttattgacaaaatgtattttattaat 7820888  T
Q  255 cat 257  Q
    |||    
T  7820889 cat 7820891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 478 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 25209917 - 25209652
Alignment:
Q  478 attgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaag 577  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  25209917 attgttaaacctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatgacaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaag 25209819  T
Q  578 aaatttnnnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatgat----ctaaaacataaccaatgatcatattttttgaa 672  Q
    |||||          |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25209818 aaattaaaaataaaacgacttccaaacaataggcaactttagttttataaattatagcaacaataattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaa 25209719  T
Q  673 aaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcag 739  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  25209718 aaacttcacgatacacaacatttgtggtctccttacaaacattattatctttatccaggataagcag 25209652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 932 - 1155
Target Start/End: Original strand, 14714003 - 14714227
Alignment:
Q  932 aataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagc 1030  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  | |||||||  |||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14714003 aataagattcatcctgggaatgaataccctggtaccagctctttttctcgtaattacagttgcaactatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagc 14714102  T
Q  1031 ctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagc 1130  Q
    |||||| |||||||||   |||||  || ||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  14714103 ctcgtaccattacacagaccattgacctcatcaatgtttctcatcagcctaactagacatcccacccttagtttcaacctgtgatttggaatgccagagc 14714202  T
Q  1131 tcttaataccattaagaaattccgt 1155  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14714203 tcttaataccattaagaaattccgt 14714227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 37915458 - 37915275
Alignment:
Q  4 attatgttatct---aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacat 100  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37915458 attatgttatcttaaaagttataattgtggttataatttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacat 37915360  T
Q  101 tgcacataacaattaaaatatttggat--ttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcat 183  Q
    || | ||||| || ||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37915359 tgtatataacgataaaagtatttggattattatacttgtactaattatttgttgtataagatgcactcattgttaaacttagcat 37915275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 289 - 582
Target Start/End: Original strand, 14764713 - 14765006
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||||  |||||||| |||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||||    
T  14764713 taatagtcaggttcagatgtttacagccagtttgtgaatgcaaacgttaaattttttacgggtgtgtataaatatagtttaggctacggaaacgtcgatt 14764812  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatc-aatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngttccgcgtattgttatac 487  Q
    |||||||             |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||         |||| | ||||||||||||    
T  14764813 gttatttatttttattttttacaaaaaccaacggtctaatgtaaatattgtattttagg-taacaacaatgtaaaaaaaaagttcagagtattgttatac 14764911  T
Q  488 ttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatt 582  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   | |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14764912 ctgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggaggatctgtttaatattcaattgcatgtcgtgtaatgaccaatacgccttacaaagaaatt 14765006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 289 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 21114813 - 21114411
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaatttttt-acggat-gtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccga 386  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21114813 taatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaatttttttacgggttgtgtataaatatagtttgggttacagaaacgccga 21114714  T
Q  387 ttgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttaggg-taacaacgatgtnnnnnnnnn----gttccgcgtattg 481  Q
    ||||||||||            ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||             |||||||| ||||    
T  21114713 ttgttatttgttattaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttaggggtaacaacgatgtaaaaaaaaaaacggttccgcggattg 21114614  T
Q  482 ttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaat 581  Q
    ||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21114613 ttaaacctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatggcaggaagatctgcttatataaaaattgcatgt-ctataatgaccagtacgccttacaaagaaat 21114515  T
Q  582 t------tnnnnnnnncgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttga 671  Q
    |               | |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||    |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  21114514 taaaagaaaaaaaaaacaactttcaatcaatgcgcaactttagttttctaaattatagcaacgacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttaa 21114415  T
Q  672 aaaa 675  Q
    ||||    
T  21114414 aaaa 21114411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 33862724 - 33862547
Alignment:
Q  84 ttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggatt--tatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagc 181  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33862724 ttgaaatatctaaacattgtatataacgataaaagtatttggattattatacttgtactaattatttgttgtataagatgcactcattgttaaacttagc 33862625  T
Q  182 ata-gtaatatttttgc-aaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  33862624 atatgtaatatttttgcaaaaaatacgctgacttaatgtataataatatttgttgacaaaatgtattttattaatcat 33862547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 144
Target Start/End: Original strand, 30305978 - 30306085
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttgga-tttatactt 135  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  30305978 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatttggattttatactt 30306076  T
Q  136 atactaatt 144  Q
     ||||||||    
T  30306077 gtactaatt 30306085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 1598 - 1724
Target Start/End: Original strand, 30325880 - 30326007
Alignment:
Q  1598 gcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaact 1696  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||  |||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||       
T  30325880 gcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaataggcaatatctgcctaaaatcacaacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtttaagtg 30325979  T
Q  1697 catttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30325980 cgtttaggggatcattcttggacatgat 30326007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 33863162 - 33863079
Alignment:
Q  4 attatgttatct---aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatatttt 85  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33863162 attatgttatcttaaaagttataattgtggttataatttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatatttt 33863079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 840 - 874
Target Start/End: Original strand, 17886246 - 17886280
Alignment:
Q  840 tgacccttacttttatttattgtcattgcaaaaca 874  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17886246 tgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaaca 17886280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 840 - 874
Target Start/End: Complemental strand, 25089502 - 25089468
Alignment:
Q  840 tgacccttacttttatttattgtcattgcaaaaca 874  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25089502 tgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaaca 25089468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 631
Target Start/End: Original strand, 14765020 - 14765057
Alignment:
Q  594 acttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattat 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14765020 acttccaaacaatacgtaactttagttttcttaattat 14765057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1139 (Bit Score: 767; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1139
Description:

Target: scaffold1139; HSP #1
Raw Score: 767; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 409 - 1724
Target Start/End: Original strand, 206 - 1549
Alignment:
Q  409 acaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngttc-cgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaa 507  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  206 acaaaaccgatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaaagtctcgcgtattgttatacctgaaaagtgcatcaattaa 305  T
Q  508 aagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnn-cgacttccaaacaat 606  Q
    | |||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||           |||||| |||| |||    
T  306 atgtcaatggcgtgaggatctgcttatatagaaattgcatgtccagtaatgatcagtacgccttacaaagaaataaaaaaaagaacgacttacaaaaaat 405  T
Q  607 acgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtct 702  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  406 acgcaaatttagttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcacgatacacgacatttgtggtct 505  T
Q  703 ccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacac 802  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  506 ccttgcgaacattattatcttcatccaagatgagcagcttcaaaccttttctagaagtaactcgagagacagcgacatagagttgtccatgcgtgaacac 605  T
Q  803 gggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctg 902  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  606 gggcttaggaagataaactcccactcgagataaagattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaattgcttgcgcctg 705  T
Q  903 aatttgaagg---gtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaacta 998  Q
    ||||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  706 aatttgaaggcgggtagtcctagatcactcagaataagattcatcctgggaatgaataccctggtaccttccctttttcctataattacggtagtagcta 805  T
Q  999 tcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctaccct 1098  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||| |  |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  806 ttgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagccttgtaccattacacaatccattggcctgatcaacatttctcatcagcataactggacatcctaccct 905  T
Q  1099 tagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcga 1198  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  906 tagcttcaaccggtgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggtcatcagaattttcgcccgattga 1005  T
Q  1199 caaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagta 1298  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1006 caaacaaaatcagagcttaaatactctttctcttcacttggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcgactgaattaagcgttggtgcgagta 1105  T
Q  1299 tgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatat 1398  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  1106 ttcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtccgatat 1205  T
Q  1399 gagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatt 1498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  1206 gagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagagtcgttgtcgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagaaatt 1305  T
Q  1499 tcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatg 1598  Q
    |||||||||| | || ||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1306 tcttcctgctatacatgtacctaagatgcacccaatcccatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatctttgatgaattgattgatg 1405  T
Q  1599 catcaacaa------------------ttcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattcca 1680  Q
    ||| || ||                  ||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  1406 cataaataatatcatgcctcaatctttttcctacctcgatctttttcgggcaacaggcaatatctacttgaaatcaccacctaaaactactatcattcca 1505  T
Q  1681 ccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  1506 ccaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattattggacatgat 1549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 753; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 753; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1724
Target Start/End: Original strand, 164617 - 166065
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaatttttt-acggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgat 387  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  164617 taatagtcagtgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaatttttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgat 164716  T
Q  388 tgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn---gttccgcgtattgtta 484  Q
    ||||||||             ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||            |||||||| ||| |||    
T  164717 tgttatttatttttaatttttacaaaacaaatggtataatgtaaatattgtattttagggtaacaacaatgtaaaaaataaaaggttccgcggattatta 164816  T
Q  485 tacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttn 584  Q
     || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||      
T  164817 aacctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatggcaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgtcttacaaagaaattaa 164915  T
Q  585 nnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttc 679  Q
            |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  164916 aaataaaacgacttccaaacaataggcaactttggttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttc 165015  T
Q  680 acgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgaca 779  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  165016 acgatacacaacatttgtggtctccttacaaacattattatcttcatccaggatgagcagcttcaaaccttttcttgaagttactcgagagacagcgaca 165115  T
Q  780 tagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcg 879  Q
    || ||||| |||| | ||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  165116 taaagttgcccatgcgtgaacataggcttaggaagataaacccccacttgagataaagattgaccttgacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcg 165215  T
Q  880 tcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatctt-ggaatgaataccctggtaccttccctttttcc 978  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  165216 tcaatggaaattgcctgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgggaatgaataccctggtaccttctttttttca 165315  T
Q  979 tgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagc 1078  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||    
T  165316 tgtaattacagtagcagctatcatgctcttccctagatgtgtaactatcagcctcgtaccattacacaatccattgacctgatcgatgtttctcatcagc 165415  T
Q  1079 ataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacat 1178  Q
    || | ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  165416 atgactggacatcccaccattagtttcaaccggtgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctagacat 165515  T
Q  1179 cagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagctt-aaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactg 1277  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||| ||||||||| |    
T  165516 cagacttttcgcccgatcgacaaactgaatcagagcttaaaaaaatctttctcttcacctggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctcaaccg 165615  T
Q  1278 aatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaa 1377  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  165616 aatcaagcgttggtgcgagtattcccttttcttggaaaaatagtgggtcaccaatgttatcatttaaatcgggatatacaaagtctattagtgacatcaa 165715  T
Q  1378 cggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagag--ta 1475  Q
    || ||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||    
T  165716 cgaatttgttgtatcggatatgagtaaatcttcgggaatttcccccttcatttcaccattctcattcgaagcgtcgttgtcgtctccaattgagagtata 165815  T
Q  1476 tgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcaca 1575  Q
    | |||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  165816 tccacttgccaaaattagcagtttattcttgctctgcaggtcccgaagatgcacccaatctcatattaactgtaagcctcaacacattacaataagccca 165915  T
Q  1576 tatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtc 1674  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  165916 tatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactatc 166015  T
Q  1675 attccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||    
T  166016 attccaccaaaaggtctaaactcgtttaggtgatcattcttggatatgat 166065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 683; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 640 - 1724
Target Start/End: Original strand, 182257 - 183343
Alignment:
Q  640 tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcag 739  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  182257 tctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcacgatacacaacatttgtggtttccttacaaacattattatcttcatccaagatgagcag 182356  T
Q  740 tttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatat 839  Q
     ||||||| |||||| ||||| | |||||||||| ||||||| ||||| |||| | ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  182357 cttcaaaccttttcttgaagttaatcgagagacagcgacataaagttgcccatgcgtgaacacaggtttaggaagataaacccccactcgagataaagat 182456  T
Q  840 tgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagat 939  Q
    ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  182457 tgaccttgacttttatttattatcattgcaaaacaaagcgtcaatgcaaattgcttgcgcctgaatttgaagggtagtcttggatcactcggaataagat 182556  T
Q  940 tcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatc 1038  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  182557 tcatcttgggaatgaataccctgttaccttccctttttcatataattacagtagcagctatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagcctcgtacc 182656  T
Q  1039 attacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaata 1138  Q
    |||||||| | |||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  182657 attacacagtccattgacctgattgatgtttctcatcagcataactggacatcccaccattagtttcaaccggtgatttgaaattccagagctcttaata 182756  T
Q  1139 ccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctg 1238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  182757 ccattaagaaattccgttgtgaaccactcactctagccatcagatttttcgcccgatcgacaaactgaatcagagcttaaatactctttctcttcacttg 182856  T
Q  1239 gaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatc 1338  Q
    |||||  ||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  182857 gaatcactgacatcatatattcgttaacatgctcaaccgaatcaagcgttggtgcgagtattcccttttcttggaaaaagagtgggtcaccaatgatatc 182956  T
Q  1339 attcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattc 1438  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  182957 attcaaatcgggatatacaaagtctattagtgacatcaacgaatttgttgtatcggatatgagcaaatcttcgggaatttctaccttcatttcaccattc 183056  T
Q  1439 tcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctca 1538  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||| |||| |||    
T  183057 tcattcgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcagtttcttcctgctctgcaggtcccgaagatgcacccaatatca 183156  T
Q  1539 tattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatg 1637  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||      
T  183157 tattaactgtaagcctcaacacattacaataaggccatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcattccttttcggacaacaga 183256  T
Q  1638 caatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  183257 caatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactatcattccaccaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggatatgat 183343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 164326 - 164584
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 101  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  164326 attatgttatcttaaagttataattgtggttataatttaaatttgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatataatttaaaatatctaaacatt 164424  T
Q  102 gcacataacaattaaaatatttggat--ttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaata-tttttgc 197  Q
    ||| ||||| || ||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  164425 gcatataacgataaaagtatttggattattatacttgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacttaacatacgtaatattttttgc 164524  T
Q  198 aaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    ||||||||  |||||||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  164525 aaaaatacgtcgacgtactgtataataatatttgttgacaaaatgtattttattaatcat 164584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 172441 - 172699
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 101  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  172441 attatgttatcttaaagttataattgtggttataatttaaatttgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatataatttaaaatatctaaacatt 172539  T
Q  102 gcacataacaattaaaatatttggat--ttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaata-tttttgc 197  Q
    ||| ||||| || ||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  172540 gcatataacgataaaagtatttggattattatacttgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacttaacatacgtaatattttttgc 172639  T
Q  198 aaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    ||||||||  |||||||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  172640 aaaaatacgtcgacgtactgtataataatatttgttgacaaaatgtattttattaatcat 172699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 289 - 700
Target Start/End: Original strand, 172732 - 173151
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaatttttt-acggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgat 387  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  172732 taatagtcagtgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaatttttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgat 172831  T
Q  388 tgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt---nnnnnnnnngttccgcgtattgtta 484  Q
    ||||||||             ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||            |||||||| ||| |||    
T  172832 tgttatttatttttaatttttacaaaacaaatggtataatgtaaatattgtattttagggtaacaacaatgtaaaaaataaaaggttccgcggattatta 172931  T
Q  485 tacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatt-t 583  Q
     || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||      
T  172932 aacctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatggcaggaggatctgcttatatagaaattgcatgt-ctataatgaccagtacgtcttacaaagaaattaa 173030  T
Q  584 nnnnnnnncgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttc 679  Q
            |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  173031 aaataaaacgacttccaaacaataggcaactttggttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttc 173130  T
Q  680 acgatacacaacatttttggt 700  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  173131 acgatacacaacatttgtggt 173151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 700; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 700; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 478 - 1724
Target Start/End: Original strand, 31210 - 32464
Alignment:
Q  478 attgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatata----aatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttac 573  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    |||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  31210 attgttaaacctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatggcaggaggatctgcttaattatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttac 31308  T
Q  574 aaagaaatttnnnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttt 668  Q
    |||||||||          |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |    ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31309 aaagaaattaaaaataaaacgacttccaaacaataggcaactttagttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaattatcatactttt 31408  T
Q  669 tgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgag 768  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||    
T  31409 tgaaaaatttcaggatacacaacatttgtggtctccttacaaacattattatcttcatccaggatgagcagcttcagaccttttcttgaagttactcgag 31508  T
Q  769 agacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgc 868  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31509 agacagcgacataaagttgttcatgcgtgaacacaggcttaggaagataaaccgccactcgagataaagattgaccctggcttttatttattgtcattgc 31608  T
Q  869 aaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatctt-ggaatgaataccctggtacct 967  Q
    ||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||    
T  31609 aaaacaaagcgtcaatggaaattgtctgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcattataggaatgaatatcctggtacct 31708  T
Q  968 tccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgt 1067  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  31709 gcattttttcctgtaattacggtagcagctatcgtgctctc-cctagatgtgtaactgtcagcctagtaccattacacagtccattggcctgatcgatgt 31807  T
Q  1068 ttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactc 1167  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| || |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31808 ttctcatcagcataactggacatcccacctttagtttcaacctgtgatttgggattccaaagatcttaataccattaagaaattccgatgtgaaccactc 31907  T
Q  1168 gctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaata 1267  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  | || ||| || |||||| |    
T  31908 gctttggacatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagcaacatcataaattcgttaaca 32007  T
Q  1268 tgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataa 1367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32008 tgctcaactgaatcaagcgttggtgcaagtat-cccctttcttggaaaaatagctggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataa 32106  T
Q  1368 gtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaat 1467  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  32107 gtgacatcaacggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcatcgttgccgtatccaat 32206  T
Q  1468 taagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaa 1567  Q
    | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32207 tgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaa 32306  T
Q  1568 taagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaa 1666  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||  |||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307 taagcacatatctttgacgaattgactgaggcatcaacaatatctggcctcgttcctcgtcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaa 32406  T
Q  1667 ctattgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| | | ||||  ||||| | ||||||||||||    
T  32407 ctactgtcattccaccaaaaggtttaagcgcgtttacgggatcgtgcttggacatgat 32464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1406
Target Start/End: Original strand, 18545 - 19670
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||  | |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18545 taatagtcagtatcacatgcatacacgtactcggtaaatgcaaacgtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgctgatt 18644  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn--gttccgcgtattgttata 486  Q
    ||||||||            ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||| ||||||| |    
T  18645 gttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaagaaaaaaggttccgcggattgttaaa 18744  T
Q  487 cttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnn 586  Q
    || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||        
T  18745 ctagaaaagtgcatgaattaatagtcaatggcaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaagaaattaaaa 18843  T
Q  587 nnnnnc-gacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcata-ttttttgaaaaacttca 680  Q
           ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18844 ataaaatgacttccaaacaataggcaactttagttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatacttttttgaaaaacttca 18943  T
Q  681 cgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacat 780  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||    
T  18944 cgatacacaacatttgtggtctccttactaacattattatcttcatccaggatgagcagcttcagaccttttcttcaagttactcgagagacaccgaaat 19043  T
Q  781 agagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgt 880  Q
    | |||||| ||| | ||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19044 aaagttgttcatgcgtgaacacagacttaagaagataaacccccactcgagataaagattgaccctggtttttatttattgtcattgtaaaacaaagcgt 19143  T
Q  881 caatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcat-cttggaatgaataccctggtaccttccctttttcct 979  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  19144 caatggaaattgcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcctcggaatgaataccctggtacctgccatttttctt 19243  T
Q  980 gtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagca 1079  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||| |   |||||||||||||||| ||||    
T  19244 gtaattacggtagcagctatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagcctagtaccattacacagtccattagcaagatcgatgtttctcatcagca 19343  T
Q  1080 taattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatc 1179  Q
    ||| ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  19344 taactggacatcccacctttagtttcaacctgtgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgatgtgaaccactcgctttggacatc 19443  T
Q  1180 agaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaa 1279  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| ||  ||| | |||||||||||||    
T  19444 agaattttcacccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaatttgttgacatgctcaactgaa 19543  T
Q  1280 tcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacg 1379  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  19544 tcaagcgttgatgcgagtattcccctttcttggaaaaatagctggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtttataagtgacatcaaca 19643  T
Q  1380 gatttgttgtgttcgatatgagcaaat 1406  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||    
T  19644 gatttgttgtgtccgatatcagcaaat 19670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 23393 - 23650
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 101  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23393 attatgttatcttaaagttataattgtggttataatttaaactcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatataaacatt 23491  T
Q  102 gcacataacaattaaaatatttggat--ttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgca 198  Q
    ||| ||||| || ||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23492 gcatataacgataaaagtatttggattattatacttgtactaattatttgtaatataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaatatttttgca 23591  T
Q  199 aaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  23592 aaaatacgccgacgtactgtataataatatttgttgacaaaatgtattttattaatcat 23650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 18258 - 18515
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 101  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  18258 attatgttatcttaaagttataattgtggttataatttaaatttgaaatgaa-aaaaatataatcttaattttgtatatatttcaaaatagctaaacatt 18356  T
Q  102 gcacataacaattaaaatatttggatt--tatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgca 198  Q
    ||| ||||| || ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18357 gcatataacgatcaaagtatttggattattatacttgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacttagcatatgttatatttttgca 18456  T
Q  199 aaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  18457 aaaatacgccgacttactgtataataatatttgttgacaaaatgtattttattaatcat 18515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1445 - 1724
Target Start/End: Original strand, 3 - 283
Alignment:
Q  1445 gaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaa 1544  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  3 gaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcttgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaa 102  T
Q  1545 cagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatat 1643  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||||| |||||||  ||  |||||||||| ||| |||||| ||||  ||||| || | |||||||    
T  103 cagtaagcctcaaaacattacaataagccaatatatttgacgaattgaccgagacatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggaaaaaaggcaatat 202  T
Q  1644 ctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||   | ||||  |||||||||||| |||||||    
T  203 ctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaagggatcattcttgaacatgat 283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 289 - 459
Target Start/End: Original strand, 31003 - 31173
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31003 taatagtcagtgtcacatgcatacacgtagtcgttaaatgcaaacgtttaattttttacgggtgtgtataaatatagttggggctacagaaacgccgatt 31102  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt 459  Q
    ||| ||||            ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31103 gttttttgtttttaatttttacaaaacaaatagtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt 31173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 673; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 673; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 592 - 1723
Target Start/End: Complemental strand, 1397 - 260
Alignment:
Q  592 cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgataca 687  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1397 cgacttccaaacaataggcaactttagttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcacgataca 1298  T
Q  688 caacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttg 787  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||     
T  1297 caacatttgtggtctccttacaaacattattatcttcatccaggatgagcagcttcagaccttttcttgaagttactcgagagacagcgagataaagtta 1198  T
Q  788 tccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaa 887  Q
    ||||| | |||||||   |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  1197 tccatgcgtgaacacaaacttaagaagataaacccccactcgagataaagattgaccctgacttttatttattgtcattgtaaaacaaagtgtcaatgga 1098  T
Q  888 aatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaatta 986  Q
    |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1097 aattgcctgcgcctcaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcataatgggaatgaataccctggtacctgccatttttcctgtaatta 998  T
Q  987 cggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattgg 1086  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  997 cggtagcagctatcgtgctcttccctagatttgtaactgtcagcctagtaccattacacagtccattggcctgatcgatgtttctcatcagcataattgg 898  T
Q  1087 acatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattt 1186  Q
    |||||| ||  |||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  897 acatcccacttttagcttcaacctgtgatttggaattccatagctcttaataccattaagaaattccgatgtgaaccactcgctttggacatcagaattt 798  T
Q  1187 tcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcg 1286  Q
    || ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | || || ||| || | |||| ||||||||||||||||||||    
T  797 tcacccaatctacaaacagaatcagaggttaaatactctttcttttcacctggaatcagcgacatcataaattcattaacatgctcaactgaatcaagcg 698  T
Q  1287 ttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgt 1386  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  697 ttggtgcgagtattcccctttattggaaaaatagctggtcaccaaggttatcatttagatcgggatacacaaagtttataagtgacatcaacgggtttgt 598  T
Q  1387 tgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgcca 1486  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  597 tgtgtctgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcatcattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcca 498  T
Q  1487 aaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatg 1586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  497 aaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaatagtaagcctcaacacattacaataagcccatatctttgacg 398  T
Q  1587 aattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaa 1685  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  397 aattgattgaggcatcaacaatatccggccttgttcctcctcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactaccttcattccaccaaa 298  T
Q  1686 aggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatga 1723  Q
    |||| ||| | | ||||| ||||||| |||||||||||    
T  297 aggtttaagcgcgtttaggggatcatgcttggacatga 260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 289 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 4661 - 4168
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatata----gtttgggctacaaaaacgcc 384  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    |||||||||||| |||||||    
T  4661 taatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggtcaatgcaaacgtttaattttttacgggtgtgtataaatatatatagtttgggctacagaaacgcc 4562  T
Q  385 gattgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn---gttccgcgtattg 481  Q
    ||||||||||||            ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||| ||||    
T  4561 gattgttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaagaaggttccgcggattg 4462  T
Q  482 ttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaat 581  Q
    ||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4461 ttaaacctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatggcaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaagaaat 4363  T
Q  582 ttnnnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaac 676  Q
    |          |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4362 taaaaataaaacgacttccaaacaataggcaactttagttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaac 4263  T
Q  677 ttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagaga 771  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  4262 ttcacgatacacaacatttgtggtctccttacaaacattattatcttcatccaggatgagcagcttcagaccttttcttgaagttactcgagaga 4168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4914 - 4692
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatact 134  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  4914 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatcaaaacattgcatataacgataaaaatatttggattattatact 4816  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgtt 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| | || || ||||||||    
T  4815 tgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaattttcttgcaaaaatacgccgacgtactatgtaataatatttgtt 4716  T
Q  234 aacataatatattttattaatcat 257  Q
     ||| ||| |||||||||||||||    
T  4715 gacaaaatgtattttattaatcat 4692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 666; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 666; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 1649
Target Start/End: Complemental strand, 50325 - 48709
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggatt--tatact 134  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||    
T  50325 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatctttattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatttggattattatact 50227  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgtt 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||    
T  50226 tgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaattttcttgcaaaaatacgccgacgtactgcgtaataatatttgtt 50127  T
Q  234 aacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaac 333  Q
     ||| ||| |||||||||||||||               |||          || ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||    
T  50126 gacaaaatgtattttattaatcataaaaactaaaaaatatgtttttttttttatataatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaac 50027  T
Q  334 gttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaat 433  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||            ||||||  |||||||||||||||||    
T  50026 gtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgattgttatttgtttttaatttttacaaaacaaatggtctaatgtaaat 49927  T
Q  434 attgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn------gttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatc 527  Q
    ||||||||||||||||||||||||                 ||| | || ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||    
T  49926 attgtattttagggtaacaacgataaaaaaaaaaaaaaaaggtttcacggattgttaaacctgaaaagtgcatgaattaatagtcaatgacaggaggatc 49827  T
Q  528 tgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaa 626  Q
    |||||| ||| ||||| |||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||          |||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  49826 tgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccggtacgccttacaaagaaattaaaaataaaacgacttccaaacaataggcaactttagttttatat 49728  T
Q  627 attatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatct 722  Q
    ||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  49727 attatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcacgatacacaacatttgtggtctccttacaaacattattatct 49628  T
Q  723 tcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactc 822  Q
    ||||||| ||||||||| |||| || |||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  49627 tcatccaggatgagcagcttcagaccttttcatgaagttactcgagagacaacgacataaagttgtctatgcgtgaacacaggcttaggaagataaaccc 49528  T
Q  823 ccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctgg 922  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  49527 ccacccgagataaagattgacc-tagcttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaattgtctgcgtctgaatttgaagggtagtcctgg 49429  T
Q  923 atcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcct-gtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgt 1020  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| |    
T  49428 atcattcggaataagattcatcctgggaatgaataccctagtacctgccctttttccttgtaattacggtagcagttatcgtgctcttccctagatgtat 49329  T
Q  1021 aactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctaccctt-agtttcaaccggtcatttgg 1119  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| || |||||||||| || ||||||    
T  49328 aactgtcagcctagtaccattacacagtccattggcctgatcgatgtttctcaacagcataactggacatcccaccttttagtttcaacctgtgatttgg 49229  T
Q  1120 aattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaa 1219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | ||| |||||||||| |||||    
T  49228 aattccagagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacctgatctaaaaatagaatcagaggttaaa 49129  T
Q  1220 tactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaata 1319  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | || || ||| || |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  49128 tactctttctcttcacctagaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaattgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaaaaata 49029  T
Q  1320 gcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttc 1419  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  49028 gttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacagagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtttgatatcagcaaatcttcaggaatttc 48929  T
Q  1420 taccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtact 1519  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  48928 taccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgtaggtacc 48829  T
Q  1520 gatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcg 1618  Q
    || ||||||  ||||           || ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||  || |||    
T  48828 gaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaataagtccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatctggcatcg 48740  T
Q  1619 atccttttcggacaacatgcaatatctgcct 1649  Q
     ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  48739 ttcctcctcagacaacatgcaatatctgcct 48709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 472; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 741 - 1398
Target Start/End: Original strand, 16231 - 16889
Alignment:
Q  741 ttcaaacattttcta-gaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatat 839  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231 ttcaaaccttttctatgaaataactcgagagacaacgacatagagttgtccatgcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatat 16330  T
Q  840 tgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagat 939  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16331 tgaccctgacttttattcattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaattgcctgcgcctgaatttgaagggtagtcttgaatcactcggaataagat 16430  T
Q  940 tcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatc 1038  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16431 tcatcctgggaatgaataccttggtacttgccctttttcctgtaattacggtagcaactatcgtgctctttcctagatgtgtaactttcagccttgtacc 16530  T
Q  1039 attacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaata 1138  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16531 attgcacaattcattggcctgatcgatgtttctcagaagcataagtggacatcctacc-ttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaata 16629  T
Q  1139 ccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctg 1238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  16630 ccattaagaaattctgttgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcgctcgattgaaaaacagaatcatagcttaaaaactctttctcttcaccta 16729  T
Q  1239 gaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatc 1338  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16730 gaatcagtgaaatcatatatgcgttaacatactccactaaattaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaagttatc 16829  T
Q  1339 attcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatat 1398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16830 attcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtccgatat 16889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 289 - 739
Target Start/End: Original strand, 13581 - 14034
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13581 taatagtcagtgtcagatatatacacctagtatgtgaatgcaaacgttaaattttttatgggtgtgtataaatatagtttaggctacagaaacgccgatt 13680  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnn--acaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngttccgcgtattgttata 486  Q
    |||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||    
T  13681 gttatttatttttattttttttacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacaatgtaaaaaaaaagttccgcgtattgttata 13780  T
Q  487 cttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnn 586  Q
      | |||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        
T  13781 gctaaaaattgcataaattaaaagtcaatggtaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtcctgtaatgaccagtacgccttacaaagaaattgaaa 13880  T
Q  587 nnnnncgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatgatctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaac-ttcacgata 685  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13881 aaaaacgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatagcaacgatcaaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaactttcacgata 13980  T
Q  686 cacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcag 739  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13981 cacaacatttgtggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcag 14034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 13295 - 13548
Alignment:
Q  4 attatgttatctaagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13295 attatgttatctaagttataagtgtcgttataatttaaatttgatatggaaaacaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgc 13394  T
Q  104 acataacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcatagtaatatttttgcaaaaat 203  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13395 acgtaacgattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcatagtaatatttttgcaaaaat 13494  T
Q  204 acaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13495 aagccgacgtactgtatattattatttgttaacataatgtattttattaatcat 13548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 467; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1151
Target Start/End: Original strand, 125312 - 126187
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  125312 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctgtgaatgcaaacgttaaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgatt 125411  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnngttccgcgtattgttatact 488  Q
    ||||||||            |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |     
T  125412 gttatttgtttttattttttacaaaaccaatggtctaatgtaagtattgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaagttccgcgtattgttattca 125511  T
Q  489 tgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnn 588  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||           
T  125512 tgaaaagtgtatcaattaaaagtcaatagatggaggacctgcttatatagaaattgcatgtcctgtaatgaccattacactttacaaagaaataaaaaaa 125611  T
Q  589 nnn--------cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaac 676  Q
               |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  125612 taaaaaaaaaacgacttccgaacaacacgcaactttggttttctaaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatacttattgaaaaac 125711  T
Q  677 ttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacg 776  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||     
T  125712 ttcacgatacacaacatttgtggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagcttcaaaccttttctagaagtaaatcgagaaacaaca 125811  T
Q  777 acatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaa 876  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  125812 acatagagttgtccatgcgtgaacacgggcttaggaagataaactcccactcaagataaagattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaacaaa 125911  T
Q  877 gcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcat-cttggaatgaataccctggtaccttccctttt 975  Q
    |||| |||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  125912 gcgttaatgaaaattgcttgcgcttgaatttgaaaggtagtcctggatcactcgaaataagattcatcctgggaatgaataccctggtaccaaccctttt 126011  T
Q  976 tcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcata 1075  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||     
T  126012 tcccgtaattacggtagcaactatcgtgctctttcctagatgtgtaactgtcagcctcgtaccattacacagtccattggtctgatcgatgtttctcatc 126111  T
Q  1076 agcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaatt 1151  Q
    | ||||| |||| |||| ||||||| |||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||    
T  126112 aacataactggaaatcccacccttattttcaacctgtgatttggaacgtcagagctcttaataccattaaaaaatt 126187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 253
Target Start/End: Original strand, 125017 - 125277
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaat---------tttgtatatattttgaaatat 92  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||    
T  125017 attatgttatcttaaagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggaaaaaaatatcatcttaatcttgttaattttgtatatattttgcaatat 125116  T
Q  93 ctaaacattgcacataacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatat 191  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  125117 ctaaacattgcacatagcgattaaagtatttggatttatactta-actaattatttgtagtataagatgtactcattgttaagcttaacatatgtaatat 125215  T
Q  192 ttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  125216 ttttgcaaaaatacgccgacgtactgtatattattatttgttgacataatgtattttattaa 125277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 466; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1018 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 18263 - 17564
Alignment:
Q  1018 tgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcattt 1117  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18263 tgtaactgtcagcctcgtaccattacacagtccattagcctgatcgatgtttctcatcagcataactggacatcccacccttagtttcaaccggtgattt 18164  T
Q  1118 ggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagctta 1217  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18163 ggaattctagagctcttaataccattaagaaattctgttgtgaaccactcgctttggacatcataattttcacccgatcggcaaacagaatcaaagctta 18064  T
Q  1218 aatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaa 1317  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||          
T  18063 aatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactaaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttg------ 17970  T
Q  1318 tagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatt 1417  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  17969 -agcggatcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaact 17871  T
Q  1418 tctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggta 1517  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17870 tctaccttcatttcaccattctcatccgaagcttcgttgctgtctccaattgagagtatccacttgctaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggta 17771  T
Q  1518 ctgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcct 1616  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17770 ccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaa-aagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcct 17672  T
Q  1617 cgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttg 1716  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17671 cgttccttttcggacaacatgcaatagctgcctgaaatcaccacataaaactcttgtcattccacggaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttg 17572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 465; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 969 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 321779 - 321023
Alignment:
Q  969 ccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtt 1068  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||    
T  321779 ccctttttcctgtaattacggtagcagctatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagcctagtaccattacacagtccattggcctgatcgaggtt 321680  T
Q  1069 tctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcg 1168  Q
    ||| || ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  321679 tcttatcagcataactggacatcccacctttagtttcaacctgtgatttggaattccagagctctgaataccattaagaaattctgatgtgaaccactcg 321580  T
Q  1169 ctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatat 1268  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || || ||| || |||||| ||    
T  321579 ctttggacatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctgaaatcagcgatatcataaattcgttaacat 321480  T
Q  1269 gctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataag 1368  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  321479 gctcaactgaatcaagcattggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacaaaaagtctataag 321380  T
Q  1369 tggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaatt 1468  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |  |||||||||| ||||    
T  321379 tgacatcaacggatttgttttgtccgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattatcaaccgaagcataattgccgtctcaaatt 321280  T
Q  1469 aagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaat 1568  Q
     ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  321279 gagaatatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaaaagtaagcctcaacacattacaat 321180  T
Q  1569 aagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaac 1667  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  321179 aagcccatatcgttgatgaattgattaaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaac 321080  T
Q  1668 tattgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  321079 tcttgtcattccaccaaaaggtctaaagttgtttaggggatcattcttggacatgat 321023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 478 - 1032
Target Start/End: Complemental strand, 310624 - 310072
Alignment:
Q  478 attgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaag 577  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||| |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||||||| |||| ||||||||    
T  310624 attgttaaacctgaaaagtgcatgaattaatagtaaatgacaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagcacgccttacaaag 310526  T
Q  578 aaatttnnnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaa 672  Q
    |||||          |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  |    ||||||||||||||||| ||       ||||||    
T  310525 aaattaaaaataaaacgacttccaaacaataggcaactttggttttataaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaataat-------tttgaa 310433  T
Q  673 aaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagac 772  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  310432 aaacttcacgatacacaacatttgtggtctccttgcaaacattattatcttcatccaggatgagcagcttcagacattttcttgaagttactcgagagac 310333  T
Q  773 aacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaa 872  Q
    |  ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  310332 agtgacatagagttgtccatgcgtgaacacaggcttaggaagataaacccccactcgagataaagattgatcctgacttttatttattgtcattgcaaaa 310233  T
Q  873 caaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcat-cttggaatgaataccctggtaccttccc 971  Q
    ||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  310232 caaagcgtcaatggaaattgcctgtgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcagaataagattcatcctgggaatgaataccctggtacctgccc 310133  T
Q  972 tttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcct 1032  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  310132 tttttcctgtaattacggtagcagctatcgtgctcttccctatatgtgtaactgtcagcct 310072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 311098 - 310656
Alignment:
Q  19 ttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaa 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  311098 ttataattgtggttataatttaaattccatatgaa-aaatatataatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaa 311000  T
Q  119 tatttggat--ttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtac 215  Q
    |||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||| |||||||||    
T  310999 tatttggattattatacatgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacttagcatacgtaagtttcttgcaaaaatacgccgacgtac 310900  T
Q  216 tgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtgtcagatgtatacacc 315  Q
    ||| || || |||||||| | | || ||||||||||||||||               ||||         || ||||||||| ||||| ||| ||||||     
T  310899 tgtgtaataatatttgttgaaaaaaaatattttattaatcataaaaactaaaaaatatgtatttttttttatataatagtcattgtcacatgcatacacg 310800  T
Q  316 tagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaat 415  Q
    |||||    ||||||||| || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||            ||||||     
T  310799 tagtcggcaaatgcaaacctttaattttatacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgattgttatttgttgttaatttttacaaaac 310700  T
Q  416 caatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt 459  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  310699 aaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgt 310656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 331492 - 331413
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatat 82  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  331492 attatgttatcttaaagttataattgtggttataatttaaatttgatat-gaaaaaaatatcatcttaattttgtatatat 331413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0888 (Bit Score: 451; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0888
Description:

Target: scaffold0888; HSP #1
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1290
Target Start/End: Complemental strand, 837 - 24
Alignment:
Q  483 tatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatt 582  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  837 tatacctgaaaagtgtatcaattaaaagtcaatggcaggaggatctgcatatatagaaattgcatgtcctgtaatgaccagtacgacttacaaagaaatt 738  T
Q  583 tnnnnnnnncgacttccaaacaatacgcaactttagtttt-ctaaattatggcaatga-----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaac 676  Q
              ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |     |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  737 aaaaaaaat-gacttcacaacaatacgcaactttagtttttctaaattatagcaacaacaaattctaaaacataaccaacgatcattctttttgaaaaac 639  T
Q  677 ttcacgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacg 776  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||    
T  638 ttcacgatacacaacatttgtggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgaacaacttcaaaccttttctagtagtaactcgagagatagcg 539  T
Q  777 acatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaa 876  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  538 acatagagttgtccatgcgtgaacacgggtttaggaagataaactcccacttgagataaagattgactctgacttttatttattgtcattgcaaaaaaaa 439  T
Q  877 gcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg-aatgaataccctggtaccttccctttt 975  Q
    ||||||| | |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  438 gcgtcaaaggaaattctctgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcgttatgggaatgaataccctggtacctgccctttt 339  T
Q  976 tcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcata 1075  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||     
T  338 tccagtaattacggtagcaactatcgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagcctcgtaccattacacagtccattggcctgatcgatgtttctcatc 239  T
Q  1076 agcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctgga 1175  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  238 agcataaccggacatcccacccttagtttcaactggtgatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccattgtgaaccactcgttttgga 139  T
Q  1176 catcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaac 1275  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||| ||  ||||| |||||| |||||||||    
T  138 aatcagaattttcacccgatcgacatacaaaatcagagcttaaatactctttctcgccacctgaaatcagtgacatcgtatattcgttaacatgctcaac 39  T
Q  1276 tgaatcaagcgttgg 1290  Q
    |||||||||| ||||    
T  38 tgaatcaagccttgg 24  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0888; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1144 - 889
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 101  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1144 attatgttatcttaaagttataagtgtggttataatttaaatttgatatgga-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacatt 1046  T
Q  102 gcacataacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaa 200  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  1045 gcacataacgattaaagtatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgtgaaacttagcatatgtaatacatttgcaaa 946  T
Q  201 aatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  945 aatacgccgacgtactgtatattattatttgttgacataatgtattttattaatcat 889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 444; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1155
Target Start/End: Complemental strand, 97953 - 97080
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  97953 taatagttagtgtgagatgtatacacctagtctgtgaatgcaaacattaaattttttatgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgtcgatt 97854  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn--gttccgcgtattgttata 486  Q
    ||||||||            | |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |           ||| ||||||||||||||    
T  97853 gttatttgtttttattttttaaaaaaccaatggtctaatataaatattatattttagggtaacaacgatttaaaaaaaaaaagtttcgcgtattgttata 97754  T
Q  487 cttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnn 586  Q
    | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||         
T  97753 cctgaaaaatgcatcagttaaaagtcaatggcaggaggacctgcttatatagaaattgtatgtcctgtaatgaccagtacgtcttacaaagaaata-aaa 97655  T
Q  587 nnnnncgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacg 682  Q
         | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  97654 aaaaactacatccaaacaatacgcaactttggttttctaaattatagcaacaacaactctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacttcacg 97555  T
Q  683 atacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatag 782  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  97554 atacacaacattcgtggtctccttgcaaacgttattatcttcatccaagatgagcagcttcaaaccttttctagaagtaactcgagagacagcgacatag 97455  T
Q  783 agttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtca 882  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  97454 agttgtccatgcgtgaacacgggcttaggaagataaaatcccactcgagataaaaattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtca 97355  T
Q  883 atgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttg-gaatgaataccctggtaccttcccttttt-cctg 980  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| || |    
T  97354 atggaaattgcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcatgcggaataagattcatcctgagaatgaataccctggtaccaaccctttttccccg 97255  T
Q  981 taattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcat 1080  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||  |||||| ||||||||||| ||| |    
T  97254 taattacgatagcaactatcgtgctcttccctagatgtgtaactatcagcctcgtaccattacacagtccattgacctgatcaatgtttctcatcagcct 97155  T
Q  1081 aattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgt 1155  Q
    || ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  97154 aactggacatcccacccttaatttcaacctgtgatttggaatgctggagctcttaataccattaagaaattccgt 97080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 98247 - 97984
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgt---------atatattttgaaatat 92  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||    
T  98247 attatgttatcttaaagttataagtgtggttataatttaaatttgatatgga-aaaaatatcatcttaattttgttaattttgtatatattttgaaatat 98149  T
Q  93 ctaaacattgcacataacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatat 191  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  98148 ctaaacattgcacataacgattaaagtatttggatttatactta-actaattatttgtagtataagacgtactcattgttaaacttagcatatgtaatat 98050  T
Q  192 ttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  98049 ttttgcaaaaatacgccgacgtactgtatattattatttgttgacataatgtattttattaatcat 97984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 1032
Target Start/End: Complemental strand, 133270 - 132255
Alignment:
Q  19 ttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaa 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  133270 ttataattgtggttataatttaaattccatatgaa-aaatatataatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaa 133172  T
Q  119 tatttggatt--tatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtac 215  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||| |||||||||    
T  133171 tatttggattattatacttgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacttagcatacgtaagtttcttgcaaaaatacgccgacgtac 133072  T
Q  216 tgtatattattatttgttaacataatatattttattaatcatnnnnnnnnnnnnnnttgtannnnnnnnnatgtaatagtcagtgtcagatgtatacacc 315  Q
    ||| || || |||||||| ||| ||  |||||||||||||||               ||||         || ||||||||| ||||| ||| ||||||     
T  133071 tgtgtaataatatttgttgacaaaacgtattttattaatcataaaaactaaaaaatatgtatttttttttatataatagtcattgtcacatgcatacacg 132972  T
Q  316 tagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgattgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaat 415  Q
    |||||    ||||||||| || |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||            ||||||     
T  132971 tagtcggcaaatgcaaacctttaattttttacgggtgtgtataactatagtttgggctacagaaacgccgattgttatttgttgttaatttttacaaaac 132872  T
Q  416 caatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn--gttccgcgtattgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtca 513  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||| | ||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |    
T  132871 aaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaaaaggttccgtggattgttaaacctgaaaagtgcatgaattaatagtaa 132772  T
Q  514 atggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnnn-cgacttccaaacaatacgcaa 612  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||          |||||||||||||||| ||||    
T  132771 atgacaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagcacgccttacaaagaaattaaaaataaaacgacttccaaacaataggcaa 132673  T
Q  613 ctttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgatacacaacatttttggtctccttgc 708  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||  |    ||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  132672 ctttggttttataaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaataat-------tttgaaaaacttcacgatacacaacatttgtggtctccttgc 132580  T
Q  709 aaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggctt 808  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  132579 aaacattattatcttcatccaggatgagcagcttcagacattttcttgaagttactcgagagacagtgacatagagttgtccatgcgtgaacacaggctt 132480  T
Q  809 aggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttg 908  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||    
T  132479 aggaagataaacccccactcgagataaagattgatcctgacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatggaaattgcctgtgcctgaatttg 132380  T
Q  909 aagggtagtcctggatcactcggaataagattcat-cttggaatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctct 1007  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  132379 aagggtagtcctggatcactcagaataagattcatcctgggaatgaataccctggtacctgccctttttcctgtaattacggtagcagctatcgtgctct 132280  T
Q  1008 ttcctagatgtgtaactttcagcct 1032  Q
    | |||| |||||||||| |||||||    
T  132279 tccctatatgtgtaactgtcagcct 132255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1424 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold1424
Description:

Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 1087
Target Start/End: Original strand, 773 - 1575
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  773 taatagtgagtgtcagatgtatacatctagtctgtgaatgcaaacgttaaattttttacgggtgtgtacaaatataatttgggcaacagaaacgccgatt 872  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn--gttccgcgtattgttata 486  Q
    |||||||             |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  873 gttatttatttttattttttacaaaaccaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtaaaaaaaagaagttccgcgtattgttata 972  T
Q  487 cttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnn 586  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||        
T  973 cctgcaaagtgcatcaattaaaagtcaaaggcaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtcctgtaatgatcagtacgccttacaaagaaattaaaa 1072  T
Q  587 nnnnncgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacg 682  Q
         | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||      || ||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  1073 aaaaccaactttcaatcaatacgcaactttagttttctaaattatagcaatagcaattcaaaaacataatcaataatcatactttctgaaaaacttcacg 1172  T
Q  683 atacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacatag 782  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1173 atacacaacatttgtggtctcgttgcaaacattattatcttcatccaagatgaatagcttcaaaccttttatagaagtaactcgagagacagcgacatag 1272  T
Q  783 agttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgacccttacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtca 882  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1273 agttgcccatgcgtgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaaaattgaccctgacttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcg 1372  T
Q  883 atgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcat-cttggaatgaataccctggtaccttccctttttcctgt 981  Q
    ||| |||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  1373 atggaaattgtctgtgcatgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcctgggaatgaataccttggtacctgccgtttttcctgt 1472  T
Q  982 aattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaattcattggtctgatcgatgtttctcataagcata 1081  Q
    |||||||||||   ||||| |||| || |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  1473 aattacggtag---ctatcgtgctattccctacatgtgtaactgtcagccttgtaccattacacagtccattggcctgatcgatgtttctcatcagcata 1569  T
Q  1082 attgga 1087  Q
    | ||||    
T  1570 actgga 1575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1424; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 471 - 729
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaattt------gatatggagaaaaatatcatcttaattttgt---------atatattttg 86  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||      |||||||| ||| ||||||||||||||||||         ||||||||||    
T  471 attatgttatcttaaagttataagtgttgttataatttaaatttaaatttgatatggaaaaacatatcatcttaattttgttaattttgtatatattttg 570  T
Q  87 aaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggatttat---acttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcat 183  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  571 aaatatctaaacattgcacataacgattgaagtatttgaatttattatacttatactaattatttgtagtataagatatactcattgttaaacttagcat 670  T
Q  184 a-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataat 241  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  671 atgtaatatttttgcaaaaatacgccgacgtactgtatattattatttgttgacataat 729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1424; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 1117 - 1248
Target Start/End: Original strand, 1572 - 1703
Alignment:
Q  1117 tggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagctt 1216  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  1572 tggaattctagtgctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctttggacatcaaaattttcacccgatcgataaacataatcagagttt 1671  T
Q  1217 aaatactctttctcttcacctggaatcggtga 1248  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  1672 aaatacgctttctcttcacctggaatcagtga 1703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 749 - 1319
Target Start/End: Complemental strand, 29298 - 28727
Alignment:
Q  749 ttttctagaagtaactcgagagacaacgacatagagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactcgagataaatattgaccctta 848  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  29298 ttttctagaagtaactcgagagacagcgacatagagttgcccatgcgtgaacacgggcttaggaagataaactcacactcgagataaatattgaccctga 29199  T
Q  849 cttttatttattgtcattgcaaaacaaagcgtcaatgaaaatttcatgcgcctgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcttgg 948  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29198 cttttatttattgtcattgcaaaacaaaacgtcaatggaaattatctgcgcatgaatttgaagggtagtcctggatcactcggaataagattcatcctgg 29099  T
Q  949 -aatgaataccctggtaccttccctttttcctgtaattacggtagcaactatcttgctctttcctagatgtgtaactttcagcctcgtatcattacacaa 1047  Q
     |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||    
T  29098 gaatgaataccttggtacctgccttttttcctgtaattacggtagcagctattgtgctcttccctagatgtgtaactgtcagtcttgtaccattacacaa 28999  T
Q  1048 ttcattggtctgatcgatgtttctcataagcataattggacatcctacccttagtttcaaccggtcatttggaattccagagctcttaataccattaaga 1147  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998 tccattggcctgatcgatgtttctcatcagcataactggacatcccacctttagtttcaaccggtgatttggaattccagagctcttaataccattaaga 28899  T
Q  1148 aattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtg 1247  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  28898 aattccgttgtgaaccactcactttggacatcaaaattttcacccaagcgacaaacagaatcagagtttaaatactttttctcttcacctggaatcagtg 28799  T
Q  1248 aaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaata 1319  Q
    | || |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28798 acatcatatattcgttaacatgttcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaata 28727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1404 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 28727 - 28406
Alignment:
Q  1404 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttc 1503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  28727 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgctgtcttcaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttt 28628  T
Q  1504 ctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 1603  Q
    |||||||||||||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28627 ctgctctgcaggtaccaaagatgcatccaatctcatattaacagtaagtctcaactcattaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 28528  T
Q  1604 acaat-tcctgcctcgatccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcattta 1702  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  28527 acaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgatatcaccaccttaaactattgtcattccaccaaatggtttaaactcgttta 28428  T
Q  1703 gaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  28427 ggggatcattcttggacatgat 28406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29954 - 29729
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataaca---attaaaatatttggat--ttat 131  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |   || |||||||||||||  ||||    
T  29954 tttaaattcgatatgaa-aaaaatattatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataataatgataaaaatatttggattattat 29856  T
Q  132 acttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattattt 230  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| | ||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||| || || |||||    
T  29855 acttgtactaattatttgtagtataagattcattcattgttaaactttgtatatgtaattttcttgcaaaaatacgccgacgtactgtgtaataatattt 29756  T
Q  231 gttaacataatatattttattaatcat 257  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  29755 gttgacaaaatgtattttattaatcat 29729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 289 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 29700 - 29409
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  29700 taatagtcattgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaattttt-acgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacaccgatt 29602  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatc-aatggtctaatgtaaatattgtatttta-gggtaacaacgatgt-nnnnnnnnngttccgcgtattgttat 485  Q
    ||||||||            |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||          |||| ||| |||||||     
T  29601 gttatttgtttttaatttttacaaaaacaaatggtctaatgtaaatcttgtattttaggggtaacaacgatgtaaaaaaaaaggttctgcggattgttaa 29502  T
Q  486 acttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaa 579  Q
    || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||| |||||||| ||||||||||    
T  29501 acctgaaaaatgcatgaattaatagtcaatggcaggaagatctgcttatatagaaattgcatgt-ctataatgaacagtacgccttacaaagaa 29409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0196 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 3)
Name: scaffold0196
Description:

Target: scaffold0196; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 289 - 828
Target Start/End: Original strand, 23432 - 23977
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaatttttt-acggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgat 387  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  23432 taatagtcagtttcagatgtatacacctagtttgtgaatgcagacgttcaatttttttacgggtatgtataaatatagtttgggcttcaaaaacgttgat 23531  T
Q  388 tgttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacgatgtnnnnnnnnn--gttccgcgtattgttat 485  Q
    |||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           |||||| ||||||||||    
T  23532 tgttatttgtttttattttttacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgtattttagggtaacaacaatgtaaaaaaaaaaagttccgtgtattgttat 23631  T
Q  486 acttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnn 585  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||        
T  23632 acctgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaagaggatctgcttatatagaaattgcatgtcctgtaatgaccagtacaccttacaaagaaata-aa 23730  T
Q  586 nnnnnncgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatgat----ctaaaacataaccaatgatcata-ttttttgaaaaacttca 680  Q
          ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23731 aaaaaacgacttccaaacaatac-caactttagttttctaaattatagcaacaataattctaaaacataaccaatgatcatacttttttgaaaaacttca 23829  T
Q  681 cgatacacaacatttttggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagtttcaaacattttctagaagtaactcgagagacaacgacat 780  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  23830 cgatacacaacatttgtggtctccttgcaaacattattatcttcatccaagatgagcagcttcaaaccttttctagaagtaactcgagagatagtgacat 23929  T
Q  781 agagttgtccattcatgaacacgggcttaggaagataaactcccactc 828  Q
    |||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23930 agagttgtccatgcgtgaacatggacttaggaagataaactcccactc 23977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0196; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 140 - 257
Target Start/End: Original strand, 23283 - 23401
Alignment:
Q  140 taattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacat 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  23283 taattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcatatgtaatatttttgcaaaaataaggcgacgtactgtatattattatttgctgacat 23382  T
Q  239 aatatattttattaatcat 257  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  23383 aatgtattttattaatcat 23401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0196; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 76
Target Start/End: Original strand, 23192 - 23265
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgt 76  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23192 attatgttatcttaaagttataagtgtggttataatttaaatttcatat-gaaaaaaatatcatcttaattttgt 23265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 155; Significance: 2e-81; HSPs: 4)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1374 - 1608
Target Start/End: Original strand, 39937 - 40171
Alignment:
Q  1374 tcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagag 1473  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  39937 tcaacggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcaagaatttctacctttatttcaccattctcatccgaagcatcgttgccatctccaattgagag 40036  T
Q  1474 tatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtactgatgatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagca 1573  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  40037 tattcacttgccaaagttagcaatttcttcctgctctgtaggtaccgaagatgcacacaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagcc 40136  T
Q  1574 catatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat 1608  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  40137 catatctttgacgaattgactgaggcatcaacaat 40171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Original strand, 44807 - 45020
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatat--ctaaaca 99  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  44807 attatgttatcttaaagttataagtctgattataatttaaatttgacat--aaaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatatctaaaca 44904  T
Q  100 ttgcacataacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgca 198  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  44905 ttgcacataaagattaaagtatttggatttatacttataaaatatatttgtagtataagatgtacttattgttaaacttagcatatgtaatattttggca 45004  T
Q  199 aaaatacaccgacgta 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  45005 aaaatacaccgacgta 45020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 491 - 721
Target Start/End: Original strand, 34258 - 34492
Alignment:
Q  491 aaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaatgaccagtacgctttacaaagaaatttnnnnnnn 590  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||            
T  34258 aaaagtgcatgaattaatagtcaatggcaggaggatctgcttatatagaaattgcatgtc-tataatgaccagtacgccttacaaagaaattaaaaataa 34356  T
Q  591 n-cgacttccaaacaatacgcaactttagttttctaaattatggcaatga----tctaaaacataaccaatgatcatattttttgaaaaacttcacgata 685  Q
      ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  34357 aacgacttccaaacaatagacaactttagttttataaattatagcaacaacaattctaaaacataaccaatgatcatactttttgaaaaacatcacgata 34456  T
Q  686 cacaacatttttggtctccttgcaaacattattatc 721  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  34457 cacaacatttgtggtctccttacaaacattattatc 34492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1626 - 1724
Target Start/End: Original strand, 42409 - 42507
Alignment:
Q  1626 tcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    |||| ||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  42409 tcgggcaacaggaaatatctgcataaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtttaagcacgtttaggggatcattcttggacatgat 42507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 139; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 1531 - 1724
Target Start/End: Complemental strand, 14158 - 13964
Alignment:
Q  1531 caatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaat-tcctgcctcgatccttttcgg 1629  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  14158 caatctcatattaatagtaagcctcaacatattaaaataagcccatatatttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcttgcctcgttccttttcgg 14059  T
Q  1630 acaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttagaggatcattcttggacatgat 1724  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14058 acaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattatcattccaccaaatggtttaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 13964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0499 (Bit Score: 134; Significance: 5e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0499
Description:

Target: scaffold0499; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 56 - 257
Target Start/End: Original strand, 9998 - 10202
Alignment:
Q  56 aaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatacttatactaattatttgtagt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  9998 aaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgatgaaagtatttggattattatacttgtactaattatttgtagt 10097  T
Q  154 ataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgtactgtatattattatttgttaacataatatattttatta 252  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  10098 ataagatgcactcattgttatacttagcatatgtaatatttttgcaaaaatacgccgacgtactgtataataatatttgttgacaaaatgtattttatta 10197  T
Q  253 atcat 257  Q
    |||||    
T  10198 atcat 10202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0499; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 289 - 396
Target Start/End: Original strand, 10233 - 10340
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10233 taatagtcagtgtcacatgcatacacgtagtcggtaaatgcaaacgtttaattttttacgggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgccgatt 10332  T
Q  389 gttatttg 396  Q
    ||||||||    
T  10333 gttatttg 10340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0532 (Bit Score: 129; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0532
Description:

Target: scaffold0532; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3744 - 3522
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaatt---------ttgtatatattttgaaatat 92  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||    
T  3744 attatgttatcttaaagttataagtgtggttataatttaaatttgatatgaa-aaaaatattatcttaattctgttaattttgtatatattttgaaatat 3646  T
Q  93 ctaaacattgcacataacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatat 191  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3645 ctaaacattgcacataacgattaaagtctttggatttatacttataataattatttgtagtataagatgtattcattgttaaacttagcatatgtaatat 3546  T
Q  192 ttttgcaaaaatacaccgacgtac 215  Q
    ||||||||||||||  ||||||||    
T  3545 ttttgcaaaaatacggcgacgtac 3522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1370 (Bit Score: 127; Significance: 8e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold1370
Description:

Target: scaffold1370; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1588 - 1375
Alignment:
Q  4 attatgttatct--aagttataagtgtggttataatttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatat--ctaaaca 99  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1588 attatgttatcttaaagttataagtgtggttataatttaaatttgacatgaa--aaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatatctaaaca 1491  T
Q  100 ttgcacataacaattaaaatatttggatttatacttatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgca 198  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  1490 ttgcacataaagattaaagtatttggatttatacttataaaatatatttgtagtataagatgtacttattgttaaacttagcatatgtaatattttggca 1391  T
Q  199 aaaatacaccgacgta 214  Q
    ||||||| ||||||||    
T  1390 aaaatacgccgacgta 1375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1370; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 289 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 1316 - 1167
Alignment:
Q  289 taatagtcagtgtcagatgtatacacctagtctatgaatgcaaacgttaaattttttacggatgtgtgtaaatatagtttgggctacaaaaacgccgatt 388  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1316 taatagtcggtgtcagatgtagacacccagtcggtgaatgcaaacattaaattttttacaggtgtgtataaatatagtttgggctacagaaacgctgatt 1217  T
Q  389 gttatttgnnnnnnnnnnnnacaaaatcaatggtctaatgtaaatattgt 438  Q
    ||| ||||            |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1216 gttctttgtttttattttttacaaaaccaatggtctaatgtaaatattgt 1167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1370; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 479 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 1152 - 1075
Alignment:
Q  479 ttgttatacttgaaaagtgcatcaattaaaagtcaatggcaggagtatctgcttaaatataaatttcatgtcctgtaa 556  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || || ||||| ||| ||  ||||| |||||| |||||    
T  1152 ttgttatacctgaaaagttcatcaattaaaagtcaattgtagaaggatctgtttatatgaaaattgcatgtcatgtaa 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 102; Significance: 7e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 214
Target Start/End: Original strand, 13298 - 13477
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatact 134  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||  ||  |||||||    
T  13298 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatttaaattattatact 13396  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagcata-gtaatatttttgcaaaaatacaccgacgta 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  |||||||    
T  13397 tgtactaattatttgtagtataagatgcactcattgttaaacttagcatatgtaattttcttgcaaaaatacgtcgacgta 13477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0636 (Bit Score: 97; Significance: 7e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0636
Description:

Target: scaffold0636; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 147 - 1
Alignment:
Q  37 tttaaatttgatatggagaaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatact 134  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  147 tttaaattcgatatgaa-aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcatataacgataaaaatatttggattattatact 49  T
Q  135 tatactaattatttgtagtataagatgtactcattgttaaacttagca 182  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  48 tgtactaattatttgtagtataagatgcattcattgttaaacttagca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0582 (Bit Score: 78; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0582
Description:

Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 161
Target Start/End: Original strand, 10271 - 10379
Alignment:
Q  55 aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacattgcacataacaattaaaatatttggat--ttatacttatactaattatttgtag 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  10271 aaaaatatcatcttaattttgtatatattttgaaatatctaaacgttgcatataacgataaaaatatttggattattatacttgtactaattatttgtag 10370  T
Q  153 tataagatg 161  Q
    |||||||||    
T  10371 tataagatg 10379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University