View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16244_high_2 (Length: 631)

Name: NF16244_high_2
Description: NF16244
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16244_high_2
NF16244_high_2
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (1-439)||(188938-189364)
chr5 (52-438)||(3886908-3887294)
chr5 (53-438)||(2474315-2474700)
chr5 (53-438)||(3886452-3886837)
chr5 (53-438)||(22556446-22556832)
chr5 (68-438)||(22556894-22557265)
chr5 (53-437)||(2473869-2474243)
chr5 (141-438)||(8641886-8642182)
chr5 (142-439)||(17445305-17445602)
chr5 (142-438)||(34371611-34371907)
chr5 (54-438)||(1821817-1822201)
chr5 (142-438)||(42788497-42788793)
chr5 (142-438)||(34372067-34372363)
chr5 (142-438)||(2193815-2194099)
chr5 (142-438)||(15512863-15513160)
chr5 (137-408)||(8391203-8391473)
chr5 (142-413)||(10927279-10927550)
chr5 (142-369)||(21886066-21886293)
chr5 (142-438)||(34867789-34868073)
chr5 (142-438)||(27646685-27646982)
chr5 (137-438)||(20039327-20039626)
chr5 (153-438)||(29679959-29680236)
chr5 (142-365)||(10926870-10927093)
chr5 (138-438)||(39146934-39147227)
chr5 (157-438)||(18750047-18750328)
chr5 (53-438)||(30684407-30684792)
chr5 (143-405)||(18304431-18304693)
chr5 (53-438)||(30719656-30720041)
chr5 (143-422)||(24182113-24182391)
chr5 (197-439)||(20858392-20858633)
chr5 (223-413)||(11757157-11757347)
chr5 (75-223)||(22975076-22975224)
chr5 (143-428)||(1880081-1880361)
chr5 (145-382)||(16370618-16370852)
chr5 (273-438)||(30720111-30720276)
chr5 (142-322)||(42429145-42429324)
chr5 (273-438)||(30684862-30685027)
chr5 (127-438)||(2058508-2058819)
chr5 (137-327)||(4657956-4658144)
chr5 (142-308)||(5066872-5067038)
chr5 (317-438)||(38063680-38063800)
chr5 (192-294)||(4673466-4673568)
chr5 (181-315)||(32574632-32574765)
chr5 (148-276)||(11160694-11160822)
chr5 (364-436)||(21883938-21884010)
chr5 (335-395)||(187750-187810)
chr5 (142-329)||(4102811-4102982)
chr5 (272-397)||(8366595-8366719)
chr5 (145-258)||(43356651-43356762)
chr5 (256-397)||(5785958-5786099)
chr5 (243-296)||(5785901-5785954)
chr5 (348-406)||(21041410-21041468)
chr5 (143-257)||(32136274-32136387)
chr5 (220-253)||(39801498-39801531)
chr5 (352-396)||(5066781-5066825)
chr5 (68-112)||(34371969-34372013)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (53-438)||(107314-107699)
[»] chr2 (53 HSPs)
chr2 (53-438)||(30966600-30966985)
chr2 (53-436)||(30966144-30966527)
chr2 (53-439)||(24818236-24818621)
chr2 (53-405)||(29259504-29259856)
chr2 (53-438)||(5399668-5400053)
chr2 (138-438)||(25337848-25338148)
chr2 (138-438)||(33771005-33771296)
chr2 (142-439)||(33174957-33175252)
chr2 (142-438)||(16379392-16379688)
chr2 (144-438)||(16378938-16379232)
chr2 (138-375)||(41754284-41754521)
chr2 (138-438)||(1912520-1912819)
chr2 (151-393)||(8256534-8256776)
chr2 (142-439)||(25433906-25434203)
chr2 (142-435)||(33174504-33174794)
chr2 (142-439)||(1707041-1707337)
chr2 (145-438)||(30963114-30963407)
chr2 (142-436)||(15619897-15620195)
chr2 (75-439)||(82952-83313)
chr2 (142-331)||(29804681-29804870)
chr2 (142-438)||(27882781-27883073)
chr2 (68-427)||(30961745-30962111)
chr2 (142-342)||(11388188-11388386)
chr2 (190-438)||(15639781-15640029)
chr2 (249-430)||(32377575-32377756)
chr2 (275-438)||(32377758-32377921)
chr2 (152-411)||(30963598-30963857)
chr2 (162-342)||(11394554-11394732)
chr2 (53-413)||(1953067-1953424)
chr2 (142-293)||(18098874-18099025)
chr2 (187-438)||(13191018-13191269)
chr2 (143-334)||(38898867-38899058)
chr2 (153-436)||(8073902-8074185)
chr2 (154-438)||(8181212-8181486)
chr2 (145-297)||(20502023-20502176)
chr2 (142-253)||(18447954-18448065)
chr2 (192-342)||(16542034-16542185)
chr2 (153-408)||(37552578-37552830)
chr2 (352-437)||(20502173-20502258)
chr2 (367-438)||(29804871-29804942)
chr2 (267-408)||(18875866-18876007)
chr2 (335-438)||(36924333-36924435)
chr2 (194-258)||(36924453-36924519)
chr2 (337-431)||(11389677-11389771)
chr2 (337-431)||(11406338-11406432)
chr2 (153-265)||(9909102-9909214)
chr2 (363-434)||(1952921-1952992)
chr2 (348-409)||(26865133-26865194)
chr2 (200-315)||(26864791-26864905)
chr2 (358-397)||(38898817-38898856)
chr2 (350-404)||(9909272-9909326)
chr2 (356-413)||(3804261-3804318)
chr2 (68-112)||(33174859-33174903)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (53-439)||(10210-10595)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (53-438)||(105630-106015)
[»] chr7 (70 HSPs)
chr7 (53-438)||(9124869-9125254)
chr7 (52-430)||(13124994-13125373)
chr7 (77-438)||(2941608-2941969)
chr7 (52-438)||(18833195-18833581)
chr7 (53-438)||(42515002-42515387)
chr7 (142-438)||(36422251-36422546)
chr7 (142-438)||(2193255-2193551)
chr7 (142-438)||(28495853-28496149)
chr7 (142-440)||(34405440-34405738)
chr7 (142-437)||(2189143-2189438)
chr7 (142-413)||(42515543-42515814)
chr7 (142-438)||(6718926-6719221)
chr7 (181-440)||(2465962-2466220)
chr7 (53-292)||(11517386-11517624)
chr7 (142-439)||(28495469-28495755)
chr7 (239-438)||(7646329-7646528)
chr7 (137-438)||(29038871-29039172)
chr7 (142-438)||(35473972-35474268)
chr7 (138-438)||(679812-680111)
chr7 (227-430)||(13122363-13122567)
chr7 (53-398)||(5406478-5406823)
chr7 (183-363)||(2465773-2465953)
chr7 (142-440)||(22529084-22529382)
chr7 (140-438)||(6747457-6747747)
chr7 (242-438)||(7646514-7646710)
chr7 (138-439)||(2611509-2611803)
chr7 (101-438)||(25182320-25182656)
chr7 (142-353)||(46425740-46425950)
chr7 (67-233)||(13124757-13124923)
chr7 (138-404)||(29357341-29357606)
chr7 (167-438)||(26421611-26421882)
chr7 (257-401)||(43776178-43776322)
chr7 (142-340)||(35527070-35527268)
chr7 (260-438)||(3305199-3305377)
chr7 (137-395)||(9623202-9623459)
chr7 (86-436)||(31406440-31406787)
chr7 (193-419)||(11372501-11372719)
chr7 (146-343)||(1628719-1628913)
chr7 (147-327)||(20966055-20966235)
chr7 (323-438)||(43233137-43233252)
chr7 (143-296)||(36015404-36015557)
chr7 (131-279)||(31743834-31743982)
chr7 (334-438)||(36422573-36422677)
chr7 (145-307)||(26421287-26421449)
chr7 (344-438)||(6747927-6748021)
chr7 (142-264)||(43233412-43233534)
chr7 (142-243)||(26957603-26957704)
chr7 (187-402)||(37672204-37672419)
chr7 (145-438)||(37671614-37671900)
chr7 (192-296)||(16192368-16192472)
chr7 (142-227)||(3305374-3305459)
chr7 (352-438)||(31743740-31743826)
chr7 (356-420)||(26419104-26419168)
chr7 (379-438)||(43776321-43776380)
chr7 (215-296)||(7461344-7461424)
chr7 (145-322)||(11372901-11373074)
chr7 (137-305)||(33316721-33316885)
chr7 (346-414)||(7461257-7461325)
chr7 (181-240)||(2490077-2490136)
chr7 (190-321)||(6585655-6585787)
chr7 (439-539)||(29758267-29758367)
chr7 (181-235)||(16811900-16811954)
chr7 (387-436)||(26957545-26957594)
chr7 (356-413)||(36015345-36015402)
chr7 (439-505)||(22377419-22377484)
chr7 (460-522)||(28754744-28754806)
chr7 (393-438)||(18833633-18833678)
chr7 (352-413)||(33316910-33316971)
chr7 (68-112)||(2189501-2189545)
chr7 (68-112)||(34405792-34405836)
[»] chr4 (96 HSPs)
chr4 (53-421)||(35871538-35871905)
chr4 (51-438)||(23350128-23350515)
chr4 (52-438)||(49998545-49998931)
chr4 (53-438)||(44471170-44471555)
chr4 (77-438)||(44470720-44471080)
chr4 (159-439)||(7678466-7678746)
chr4 (142-438)||(50398383-50398679)
chr4 (142-438)||(24629281-24629574)
chr4 (142-375)||(12691907-12692140)
chr4 (142-438)||(1645594-1645890)
chr4 (76-430)||(14572007-14572357)
chr4 (142-438)||(50398839-50399134)
chr4 (142-438)||(4127739-4128030)
chr4 (192-438)||(23943087-23943333)
chr4 (142-438)||(4127263-4127578)
chr4 (142-442)||(9423699-9423999)
chr4 (142-438)||(51331128-51331422)
chr4 (142-438)||(21067281-21067577)
chr4 (142-438)||(3169205-3169501)
chr4 (142-438)||(23942634-23942930)
chr4 (53-438)||(13266002-13266381)
chr4 (53-421)||(27578319-27578683)
chr4 (53-322)||(15306052-15306326)
chr4 (142-350)||(24628910-24629121)
chr4 (209-378)||(50814730-50814899)
chr4 (164-439)||(21067755-21068027)
chr4 (142-429)||(31817707-31817993)
chr4 (137-438)||(14351789-14352090)
chr4 (142-436)||(1464146-1464439)
chr4 (76-302)||(14571702-14571928)
chr4 (117-406)||(8467690-8467963)
chr4 (54-438)||(27578754-27579137)
chr4 (142-439)||(29628498-29628808)
chr4 (192-420)||(17628560-17628788)
chr4 (137-406)||(27026498-27026765)
chr4 (126-438)||(17028858-17029169)
chr4 (142-344)||(21220271-21220472)
chr4 (53-409)||(41869830-41870184)
chr4 (136-383)||(17029323-17029570)
chr4 (142-435)||(53995978-53996256)
chr4 (271-426)||(14571545-14571700)
chr4 (137-395)||(13613786-13614043)
chr4 (148-422)||(33764865-33765139)
chr4 (145-438)||(4185717-4186008)
chr4 (255-438)||(27578134-27578314)
chr4 (318-438)||(15268018-15268138)
chr4 (142-305)||(31817376-31817539)
chr4 (281-438)||(40607069-40607226)
chr4 (137-413)||(52048547-52048813)
chr4 (203-382)||(20306063-20306241)
chr4 (204-434)||(23091358-23091590)
chr4 (197-300)||(27029331-27029434)
chr4 (325-438)||(7381449-7381562)
chr4 (154-320)||(43928927-43929092)
chr4 (145-407)||(23976094-23976357)
chr4 (338-438)||(35477855-35477955)
chr4 (259-372)||(11828396-11828509)
chr4 (271-428)||(53854702-53854859)
chr4 (126-321)||(17628951-17629145)
chr4 (126-371)||(26200205-26200444)
chr4 (338-432)||(4414238-4414332)
chr4 (460-550)||(18418452-18418542)
chr4 (147-411)||(42838628-42838894)
chr4 (145-329)||(24271505-24271690)
chr4 (317-438)||(31816983-31817104)
chr4 (152-291)||(4186176-4186315)
chr4 (149-258)||(45682209-45682318)
chr4 (239-422)||(33294753-33294936)
chr4 (192-292)||(44831046-44831146)
chr4 (197-319)||(34554483-34554605)
chr4 (373-439)||(50399334-50399400)
chr4 (142-232)||(53854858-53854948)
chr4 (366-438)||(13265859-13265931)
chr4 (356-438)||(5810047-5810129)
chr4 (181-277)||(53391925-53392021)
chr4 (147-242)||(17506389-17506484)
chr4 (134-206)||(2682707-2682779)
chr4 (218-266)||(39902470-39902518)
chr4 (359-440)||(2499345-2499426)
chr4 (142-214)||(10165953-10166025)
chr4 (76-207)||(20309594-20309722)
chr4 (141-195)||(35477801-35477855)
chr4 (126-171)||(33987183-33987227)
chr4 (150-230)||(2499647-2499727)
chr4 (381-433)||(8861929-8861981)
chr4 (381-433)||(8864802-8864854)
chr4 (290-350)||(50399270-50399330)
chr4 (309-436)||(24194555-24194682)
chr4 (393-438)||(10668381-10668426)
chr4 (393-438)||(10668887-10668932)
chr4 (393-438)||(10882526-10882571)
chr4 (71-112)||(27029182-27029223)
chr4 (187-223)||(33987103-33987139)
chr4 (357-413)||(39102832-39102888)
chr4 (68-112)||(50398733-50398777)
chr4 (248-324)||(52299826-52299902)
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (53-438)||(34308330-34308715)
chr8 (53-438)||(34308786-34309175)
chr8 (53-438)||(25147446-25147830)
chr8 (53-435)||(12100602-12100982)
chr8 (143-438)||(22548400-22548695)
chr8 (142-438)||(22026378-22026675)
chr8 (142-438)||(27925898-27926193)
chr8 (148-438)||(17103086-17103377)
chr8 (142-438)||(22548846-22549142)
chr8 (142-421)||(41658973-41659252)
chr8 (68-438)||(25147892-25148261)
chr8 (53-438)||(21315961-21316345)
chr8 (142-438)||(12827105-12827401)
chr8 (146-438)||(10844466-10844758)
chr8 (142-438)||(27022190-27022485)
chr8 (142-439)||(2044057-2044354)
chr8 (138-438)||(8080194-8080493)
chr8 (142-438)||(32292396-32292699)
chr8 (53-328)||(25144682-25144957)
chr8 (221-438)||(31283503-31283719)
chr8 (138-438)||(33852109-33852409)
chr8 (50-432)||(27819105-27819484)
chr8 (142-303)||(10844882-10845043)
chr8 (139-433)||(28453334-28453628)
chr8 (181-439)||(41913008-41913266)
chr8 (142-327)||(6464872-6465057)
chr8 (192-429)||(15818876-15819112)
chr8 (52-392)||(22705089-22705424)
chr8 (138-422)||(30527349-30527630)
chr8 (294-438)||(32292092-32292236)
chr8 (154-301)||(28375042-28375189)
chr8 (138-333)||(22840486-22840680)
chr8 (146-404)||(3745104-3745362)
chr8 (181-401)||(3744676-3744896)
chr8 (141-436)||(6466255-6466549)
chr8 (155-438)||(15567860-15568139)
chr8 (143-438)||(6466711-6467000)
chr8 (153-264)||(27021904-27022015)
chr8 (137-329)||(15567516-15567708)
chr8 (232-413)||(25307855-25308034)
chr8 (142-305)||(30334892-30335055)
chr8 (181-378)||(1297045-1297242)
chr8 (323-438)||(6463394-6463510)
chr8 (242-438)||(10729722-10729918)
chr8 (143-254)||(17429501-17429611)
chr8 (239-372)||(10729603-10729736)
chr8 (449-539)||(8119225-8119315)
chr8 (356-438)||(9251098-9251180)
chr8 (138-240)||(29971450-29971552)
chr8 (352-436)||(29117445-29117529)
chr8 (53-129)||(31283356-31283432)
chr8 (53-199)||(9250913-9251057)
chr8 (295-422)||(28373990-28374116)
chr8 (233-328)||(34687920-34688015)
chr8 (188-250)||(36968434-36968496)
chr8 (188-313)||(28912826-28912951)
chr8 (361-413)||(22840425-22840477)
chr8 (375-438)||(27021840-27021903)
chr8 (353-402)||(12119224-12119273)
chr8 (352-397)||(34688045-34688090)
chr8 (268-320)||(29117361-29117413)
chr8 (266-393)||(29971323-29971448)
chr8 (137-207)||(25307759-25307829)
chr8 (200-237)||(3508790-3508827)
chr8 (356-413)||(28912730-28912787)
chr8 (68-112)||(10844784-10844828)
chr8 (249-305)||(44041986-44042042)
[»] chr3 (70 HSPs)
chr3 (53-438)||(31284127-31284512)
chr3 (79-439)||(8067216-8067576)
chr3 (77-430)||(27187188-27187542)
chr3 (138-438)||(39653159-39653459)
chr3 (138-438)||(28561741-28562040)
chr3 (151-436)||(11179887-11180172)
chr3 (142-438)||(50347745-50348041)
chr3 (142-438)||(16811380-16811674)
chr3 (187-438)||(13150405-13150656)
chr3 (142-435)||(13149953-13150246)
chr3 (142-438)||(32227072-32227368)
chr3 (142-439)||(32227500-32227796)
chr3 (142-438)||(14813948-14814244)
chr3 (53-438)||(25248021-25248407)
chr3 (142-438)||(14820153-14820449)
chr3 (142-438)||(16810924-16811220)
chr3 (56-352)||(41472214-41472508)
chr3 (181-428)||(32386595-32386842)
chr3 (143-438)||(20884968-20885263)
chr3 (53-438)||(7477102-7477486)
chr3 (138-438)||(30529682-30529981)
chr3 (142-439)||(37045034-37045328)
chr3 (53-438)||(7493792-7494176)
chr3 (143-438)||(25230099-25230394)
chr3 (143-438)||(25237686-25237981)
chr3 (143-438)||(25230556-25230851)
chr3 (143-438)||(25238143-25238438)
chr3 (53-395)||(41473907-41474249)
chr3 (195-438)||(4067212-4067454)
chr3 (187-438)||(25238535-25238786)
chr3 (142-440)||(2911094-2911381)
chr3 (142-438)||(39640936-39641219)
chr3 (152-438)||(25802399-25802685)
chr3 (145-329)||(29224326-29224510)
chr3 (53-209)||(12820554-12820710)
chr3 (142-296)||(25239070-25239224)
chr3 (211-438)||(3899868-3900095)
chr3 (52-172)||(32388848-32388968)
chr3 (232-425)||(53150676-53150869)
chr3 (142-329)||(25802964-25803151)
chr3 (142-288)||(32796936-32797082)
chr3 (203-397)||(15392570-15392764)
chr3 (203-397)||(15405606-15405800)
chr3 (190-438)||(26309840-26310088)
chr3 (203-397)||(15388203-15388397)
chr3 (203-397)||(15417431-15417625)
chr3 (203-397)||(15411015-15411209)
chr3 (203-395)||(15377344-15377536)
chr3 (154-402)||(31103845-31104095)
chr3 (203-397)||(15376056-15376250)
chr3 (346-438)||(25238978-25239070)
chr3 (346-438)||(41473744-41473836)
chr3 (356-438)||(25230948-25231030)
chr3 (352-438)||(18318864-18318950)
chr3 (176-316)||(47518295-47518432)
chr3 (271-413)||(15410629-15410771)
chr3 (381-440)||(18547416-18547475)
chr3 (271-413)||(15381258-15381400)
chr3 (271-404)||(15396493-15396626)
chr3 (211-259)||(3890046-3890094)
chr3 (271-439)||(15373696-15373864)
chr3 (271-413)||(15417045-15417186)
chr3 (359-421)||(26436264-26436325)
chr3 (233-295)||(43736715-43736777)
chr3 (240-325)||(12762939-12763023)
chr3 (68-109)||(13150302-13150343)
chr3 (201-230)||(25238816-25238845)
chr3 (359-412)||(36763824-36763877)
chr3 (271-315)||(15392183-15392227)
chr3 (68-112)||(25238872-25238916)
[»] chr6 (64 HSPs)
chr6 (53-438)||(13492699-13493085)
chr6 (52-438)||(9351972-9352357)
chr6 (77-438)||(7911812-7912173)
chr6 (135-438)||(17027382-17027685)
chr6 (68-435)||(7912235-7912602)
chr6 (48-439)||(13191363-13191754)
chr6 (142-438)||(20850320-20850616)
chr6 (67-438)||(17730960-17731335)
chr6 (142-438)||(20896538-20896835)
chr6 (53-345)||(16519879-16520170)
chr6 (142-442)||(23986164-23986464)
chr6 (138-438)||(23776436-23776735)
chr6 (142-441)||(2681068-2681363)
chr6 (142-438)||(21311514-21311810)
chr6 (204-438)||(13492393-13492628)
chr6 (138-438)||(21311966-21312266)
chr6 (140-438)||(20126033-20126331)
chr6 (142-413)||(2890715-2890985)
chr6 (242-438)||(28780209-28780405)
chr6 (151-439)||(2720414-2720702)
chr6 (106-438)||(9440708-9441037)
chr6 (142-438)||(17850917-17851213)
chr6 (126-438)||(9440160-9440472)
chr6 (142-413)||(11062285-11062555)
chr6 (142-391)||(6330811-6331059)
chr6 (142-407)||(17851373-17851638)
chr6 (142-414)||(14771594-14771866)
chr6 (142-329)||(15929581-15929768)
chr6 (460-613)||(8070537-8070690)
chr6 (142-291)||(3652485-3652634)
chr6 (138-283)||(27334156-27334301)
chr6 (138-283)||(27394896-27395041)
chr6 (142-440)||(33774866-33775151)
chr6 (144-421)||(20735696-20735973)
chr6 (278-438)||(3652658-3652818)
chr6 (242-422)||(2891161-2891340)
chr6 (145-438)||(28065687-28065982)
chr6 (137-409)||(12194324-12194593)
chr6 (137-277)||(31821704-31821844)
chr6 (181-407)||(1991591-1991817)
chr6 (142-436)||(17205338-17205631)
chr6 (181-438)||(20732616-20732872)
chr6 (126-232)||(9440485-9440591)
chr6 (193-413)||(28583013-28583234)
chr6 (117-315)||(32292860-32293055)
chr6 (289-436)||(3653048-3653191)
chr6 (162-282)||(15929218-15929338)
chr6 (182-404)||(3884977-3885194)
chr6 (77-201)||(13490055-13490179)
chr6 (270-427)||(31415951-31416107)
chr6 (181-321)||(30729807-30729947)
chr6 (145-215)||(3652981-3653051)
chr6 (356-438)||(15929352-15929434)
chr6 (355-413)||(27334305-27334363)
chr6 (355-413)||(27395045-27395103)
chr6 (363-438)||(6331219-6331294)
chr6 (343-409)||(11062029-11062095)
chr6 (357-438)||(21312453-21312533)
chr6 (187-325)||(33470882-33471019)
chr6 (181-286)||(10964342-10964447)
chr6 (212-329)||(34660468-34660585)
chr6 (379-438)||(31821643-31821702)
chr6 (154-228)||(9441061-9441135)
chr6 (67-112)||(21311871-21311916)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (53-438)||(2061-2446)
scaffold0040 (51-104)||(2555-2608)
[»] chr1 (66 HSPs)
chr1 (53-438)||(35759459-35759844)
chr1 (142-438)||(20054387-20054683)
chr1 (142-438)||(20054843-20055139)
chr1 (142-438)||(20055299-20055595)
chr1 (142-438)||(20055755-20056051)
chr1 (142-438)||(20056211-20056507)
chr1 (142-438)||(20057114-20057410)
chr1 (138-438)||(20057570-20057870)
chr1 (142-438)||(20053931-20054227)
chr1 (76-438)||(46693586-46693950)
chr1 (142-439)||(38340905-38341202)
chr1 (142-438)||(20845512-20845808)
chr1 (142-438)||(52250205-52250501)
chr1 (181-438)||(20056667-20056924)
chr1 (142-438)||(50002558-50002854)
chr1 (142-438)||(50002926-50003222)
chr1 (142-438)||(16451784-16452080)
chr1 (142-438)||(16460937-16461233)
chr1 (55-358)||(35760845-35761148)
chr1 (198-441)||(20060188-20060431)
chr1 (153-431)||(51372732-51373010)
chr1 (241-438)||(52250641-52250838)
chr1 (241-438)||(52250978-52251175)
chr1 (67-292)||(20061188-20061413)
chr1 (142-438)||(43056916-43057211)
chr1 (142-422)||(43057390-43057670)
chr1 (53-291)||(2328225-2328463)
chr1 (142-328)||(50002246-50002432)
chr1 (61-408)||(23180649-23180995)
chr1 (142-436)||(12883523-12883815)
chr1 (127-328)||(2634909-2635109)
chr1 (143-372)||(31822577-31822809)
chr1 (142-408)||(30872828-30873097)
chr1 (117-438)||(16907210-16907530)
chr1 (137-344)||(7548085-7548292)
chr1 (142-308)||(12727990-12728157)
chr1 (126-407)||(2634449-2634730)
chr1 (142-307)||(10820591-10820758)
chr1 (315-438)||(31822970-31823093)
chr1 (267-438)||(35009859-35010018)
chr1 (181-438)||(16440430-16440687)
chr1 (352-438)||(35759915-35760001)
chr1 (225-438)||(7229794-7230007)
chr1 (181-438)||(16410574-16410831)
chr1 (297-416)||(7547791-7547910)
chr1 (355-438)||(39582553-39582636)
chr1 (356-438)||(49996531-49996613)
chr1 (154-317)||(842905-843068)
chr1 (251-329)||(8278065-8278143)
chr1 (212-276)||(31823097-31823161)
chr1 (181-329)||(2739560-2739708)
chr1 (364-432)||(28181350-28181418)
chr1 (439-550)||(30420163-30420274)
chr1 (179-315)||(42066117-42066253)
chr1 (181-406)||(35168549-35168768)
chr1 (68-111)||(43057266-43057309)
chr1 (212-250)||(46411173-46411211)
chr1 (68-112)||(20054281-20054325)
chr1 (68-112)||(20054737-20054781)
chr1 (68-112)||(20055193-20055237)
chr1 (68-112)||(20055649-20055693)
chr1 (68-112)||(20056105-20056149)
chr1 (68-112)||(20056561-20056605)
chr1 (68-112)||(20057008-20057052)
chr1 (68-112)||(20057464-20057508)
chr1 (179-227)||(42317661-42317709)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (53-435)||(162531-162914)
scaffold0022 (242-438)||(162985-163181)
scaffold0022 (239-438)||(163167-163366)
scaffold0022 (126-438)||(69666-69978)
scaffold0022 (387-438)||(162483-162534)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (135-438)||(18958-19261)
scaffold0322 (71-207)||(18203-18339)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (142-438)||(2741-3037)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (142-438)||(1219-1515)
[»] scaffold0499 (1 HSPs)
scaffold0499 (142-438)||(1902-2198)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (142-435)||(154756-155049)
scaffold0002 (344-438)||(154503-154597)
scaffold0002 (68-109)||(154659-154700)
[»] scaffold0333 (3 HSPs)
scaffold0333 (142-438)||(4560-4855)
scaffold0333 (142-438)||(5015-5315)
scaffold0333 (341-438)||(5320-5418)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (76-430)||(245019-245369)
scaffold0005 (76-302)||(245448-245674)
scaffold0005 (271-426)||(245676-245831)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (229-438)||(13384-13593)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (242-438)||(14553-14749)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (142-438)||(17449-17745)
scaffold0047 (138-438)||(17987-18285)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (52-258)||(142305-142511)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (254-438)||(421-605)
[»] scaffold0557 (2 HSPs)
scaffold0557 (192-438)||(2154-2391)
scaffold0557 (142-174)||(749-781)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (284-438)||(1552-1706)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (142-422)||(14740-15019)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (141-270)||(4001-4130)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (142-255)||(23672-23785)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (147-413)||(26074-26338)
scaffold0036 (147-413)||(16038-16314)
[»] scaffold0071 (2 HSPs)
scaffold0071 (203-397)||(44613-44807)
scaffold0071 (271-413)||(45052-45193)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (211-438)||(7009-7236)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (143-254)||(45387-45497)
[»] scaffold0065 (2 HSPs)
scaffold0065 (366-428)||(62968-63030)
scaffold0065 (366-438)||(67214-67286)
[»] scaffold0442 (2 HSPs)
scaffold0442 (369-436)||(1-68)
scaffold0442 (142-174)||(2504-2536)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (261-354)||(246700-246793)
scaffold0012 (375-438)||(246638-246701)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (352-397)||(37205-37250)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Original strand, 188938 - 189364
Alignment:
Q  1 tccactttatgagttcgagagacaagaattaatgtagcaaaggcctagttagtgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  188938 tccactttatgagttcgagagacaagaattaatgtagcaaaggcctagttagtgtaacgcctccgcttggtgggcatataacacccgaggctgatgagga 189037  T
Q  101 cgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttga 200  Q
    ||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189038 cgggaagtggtccggttc------------taggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttga 189125  T
Q  201 aggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  189126 aggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgtatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcatgcttg 189225  T
Q  301 acttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189226 acttggagcaattttgggatgggtgacctaccggaaagtttcccggtaaacgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggg 189325  T
Q  401 gtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacag 439  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  189326 atcagtccgcaatcctgaaagtagtctgggatgttacag 189364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 52 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 3887294 - 3886908
Alignment:
Q  52 gtgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 151  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3887294 gtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccagctcctggcatgcttttaggcaaaactgaatcacatc 3887195  T
Q  152 ggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 251  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3887194 ggaatgagagtgatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatc 3887095  T
Q  252 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagt 351  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  3887094 ttcttttcggtaactcattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcccagtaagc 3886995  T
Q  352 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3886994 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgacaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 3886908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Original strand, 2474315 - 2474700
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2474315 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccgactcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcg 2474414  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2474415 gaatgagagagatcctaaggtcgtacagatatgggactgcatggttgaaggaagacttaaaagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 2474514  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  2474515 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgagatgggtgacctaccggaaagtttcccggtaagca 2474614  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||    
T  2474615 tgcgagtgaggaaaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctaaaagcagtctgggacgttaca 2474700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 3886837 - 3886452
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  3886837 tgtaacacctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggaatggtccggctcctagcatgcttctaggaaaaattgaatcacatcg 3886738  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3886737 gaatgagagggatcctgaggtcgtacaagtatgggactgcatggtagaaggaatgcttatatgaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 3886638  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  3886637 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacgtggagcaatttttggatgggtgacctaccgggaagtttcccagtaagcg 3886538  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  3886537 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcattctgggatgttaca 3886452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Original strand, 22556446 - 22556832
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22556446 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctaatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 22556545  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22556546 gaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 22556645  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  22556646 tcttttcggtagctcattctttaagaacttcacagttaagcgtggctgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccaggaagtttctcggtaagcg 22556745  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctg-aaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || || || |||||||||||||||    
T  22556746 tgcgagtgaggacaaaacacgctgtaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatccttaatgtcgtctgggatgttaca 22556832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 68 - 438
Target Start/End: Original strand, 22556894 - 22557265
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcc 167  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  22556894 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttcttggcaaaactgaatcacatcggaatgagagagttca 22556993  T
Q  168 tgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctc 267  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22556994 tgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtactaccaatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctc 22557093  T
Q  268 attccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaa 367  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22557094 attctttaagaacttcacagttaagcgtgcctgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaa 22557193  T
Q  368 aacacgctg-aaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||    
T  22557194 aacacgctgtaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatcctgaatgtcgtctgggatgttaca 22557265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 53 - 437
Target Start/End: Original strand, 2473869 - 2474243
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2473869 tgtaacacctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaagctgatgagggcggggagtggtccgactcctggcatgcttttaggaaaaactgaatcacatcg 2473968  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2473969 gaatgagagggatcctaaggtcgtacaggcatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 2474068  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||| |    
T  2474069 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccta----------tcccggtaagcg 2474158  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttac 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||    
T  2474159 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctaaaagcagtatgggatgttac 2474243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 141 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 8642182 - 8641886
Alignment:
Q  141 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaa 240  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8642182 tgaatcacatcagaatgagagggatcctaaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaa 8642083  T
Q  241 caagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  8642082 caagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttaagatgggtgaccta-cgggaagtt 8641984  T
Q  341 tcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  8641983 tctcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 8641886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 142 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 17445602 - 17445305
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17445602 gaatcacatcgaaatgagagggatcctgaggccgtgtaggcatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 17445503  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17445502 aagatgcatcttcttatcggtagctcattccataagaaatccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 17445403  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacag 439  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||||||||||    
T  17445402 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagtcgcctgggatgttacag 17445305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 34371611 - 34371907
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34371611 gaatcacaccggaatgagagggttcccaaggccgtacaggtgtgggactgcatggttgaaggaatgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaac 34371710  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34371711 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaacaccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactgggaagttt 34371810  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  34371811 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 34371907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 54 - 438
Target Start/End: Original strand, 1821817 - 1822201
Alignment:
Q  54 gtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcgg 153  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||  | |||||||| ||||  ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  1821817 gtaatgcctctgcttggtgggcatgtaacgtctgaggctgacgagggtggggagtggtccggctcatggcatgcttctaggcaaagttgaattacatcgg 1821916  T
Q  154 aatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 253  Q
    |||||||| |||| | ||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1821917 aatgagagagatcttaaggtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 1822016  T
Q  254 cttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgt 353  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1822017 ctttttggtagcccattccataagaactccacatttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgt 1822116  T
Q  354 gcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  1822117 gtgaatgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcggtcaacaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 1822201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 42788793 - 42788497
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42788793 gaatcacaacggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggattgggactacatggttgaaagaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 42788694  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42788693 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccacaagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggataggtgacctaccgggaagttt 42788594  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  42788593 ctcggtaagcttgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagacccgtgttggtttgtggagtcagtcgacaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 42788497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 34372067 - 34372363
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34372067 gaatcacaccagaatgagagggttcccaaggccgtacaagtatgggactacatggttgaaggaatgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaac 34372166  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34372167 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggattggtgacctaccgggaagttt 34372266  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
     ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  34372267 tccgataagcgtgcgagtgaggaaaaaacacgctgaaaatactcgtgttggtttatggcgtcagtcggcaatcctgaaagcagtctggaatgttaca 34372363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 2193815 - 2194099
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2193815 gaatcacgccggaatgagagggatcatgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 2193914  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  2193915 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccta----------- 2194003  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2194004 -ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagacccgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 2194099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 15513160 - 15512863
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaag--gcttataagaattgtttggtactacctatatca 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||  | |||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15513160 gaatcacatcggaatgagagggatcattaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaatatgcttataagaattgtt-ggtactaccaatatca 15513062  T
Q  240 acaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagt 339  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15513061 acaagatgcatcttctttttggtatctcattccataagaactccacaattaaacgtgcttgacttgaagcaattttgggatggatgacctaccgggaagt 15512962  T
Q  340 ttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  15512961 ttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaatacgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatattaca 15512863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 137 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 8391473 - 8391203
Alignment:
Q  137 aaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 236  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | | ||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  8391473 aaaccgaatcacatcggaatgagagggattctgaggccgtgtaggcatgagactacatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtact-cctgta 8391375  T
Q  237 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggga 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8391374 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctaattccataagaactccatagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggga 8391275  T
Q  337 agtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcg 408  Q
    |||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8391274 agtttctcgataaacgtgcgagtgaggacaaaacacgctgagaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcg 8391203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 142 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 10927550 - 10927279
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10927550 gaatcacatcggaatgagagggatcttgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 10927451  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||    
T  10927450 aagatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccacagttaaacgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgaccgaccgggaagttt 10927351  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 413  Q
      ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  10927350 ttcggtaagcgtgtgaatgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcggtcgacaat 10927279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 142 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21886293 - 21886066
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21886293 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggttgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacatatatcaac 21886194  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21886193 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccaaagttaagtgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactgggaagttt 21886094  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaa 369  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21886093 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaa 21886066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 34867789 - 34868073
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867789 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 34867888  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||            ||    
T  34867889 aagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccatagttaagcgtgcttaactttgagcaattttgggataggtgac------------tt 34867976  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
     |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  34867977 accggtaagcgtgcaagtaaggacaaaacacgctaaaaagactcgtgttgatttgtgggatccgtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 34868073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 27646982 - 27646685
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27646982 gaatcacatcggaatgagagggatcctagggccgtgtaggtatggggctacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctataacaac 27646883  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || | |||||||||||||||||||||||    
T  27646882 aagatgcatcttctttttggtagcccatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgtcttggagtagtctttgcatgggtgacctaccgggaagttt 27646783  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgg-caatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||  |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27646782 cccaataaacgtgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcatgttggtttgtatggtcagtcggaaaatgcttaaagttgtctgggatgttaca 27646685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 137 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20039626 - 20039327
Alignment:
Q  137 aaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 236  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20039626 aaaccgaatcacatcggaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtataggactacatagttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 20039527  T
Q  237 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggga 336  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | | || |||| |||||||||  ||||    
T  20039526 tcaacaagatgcattttctttt-ggtagcccattccataagaactctacagttaagtgtgcttgacttagagtagtctttggattggtgacctattggga 20039428  T
Q  337 agtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgtta 436  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  20039427 agtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcatgttggtttgt-tgatcagttggcaatgcttaaagtcgtctaggatgtta 20039329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 153 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 29680236 - 29679959
Alignment:
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||| |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29680236 gaatgagagagatcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataag-------tggtaatacctatatcaacaagatgcatct 29680144  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |    
T  29680143 tctttttggtagcccattacataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagtagtctttggatgggtgaccttccgagaagtttcccgataagcg 29680044  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  29680043 tgcaaatgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtct-ggatgttaca 29679959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 142 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10927093 - 10926870
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10927093 gaatcacatcagaatgagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 10926994  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||    
T  10926993 aagatgcatcttccttttggtagtccattccataagaactccacagttaaacgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgggaagttt 10926894  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggac 365  Q
    || |||||| ||| ||||||||||    
T  10926893 cctggtaagcgtgtgagtgaggac 10926870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 138 - 438
Target Start/End: Original strand, 39146934 - 39147227
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 237  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  39146934 aactgaatcacatcgaaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggtagacttataagaattgtttgatactacttatat 39147033  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 337  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |  |||||||||||||| |||||    
T  39147034 taacaagatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtcgtatgatgggtgacctactgggaa 39147133  T
Q  338 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttac 437  Q
            ||||| ||||||| |||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  39147134 -------agtaagcgtgcgagagaggacaaaaaacgctagaaagactcatgttggtttgtagggtcaatcggcaatgcttaaagtcgtctgggatgttac 39147226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 157 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 18750328 - 18750047
Alignment:
Q  157 gagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 256  Q
    ||||| |||||||| | ||| || || ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18750328 gagagagatcctgaagtcgtgcaggtttggaactgcatggttgaaggaaggattataacaattgtttggtactacctataccaaaaagatgcatcttctt 18750229  T
Q  257 ttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||    | |||||||||    
T  18750228 ttcggtagcttattccataagaactccataattaatcgtacttgacttggagcaattttaggatgggtgaccttctaggaagttttttagaaagtgtgcg 18750129  T
Q  357 agtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||| || ||||||||||||    
T  18750128 agtgaggacaaaacacactgaaaagactcgagttggtttgtggggtcagtcaacaatacttaaagtcgtatgggatgttaca 18750047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 30684792 - 30684407
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||| ||||| | ||||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| | || |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  30684792 tgtaatgcctctgcttggtggtcatgtaacgtccgagactgacaagggcaggtagtggtccgactcctggcatgcttataggcaaaaccaaatcacatcg 30684693  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||| ||||||||||||  || || |||||| ||  ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  30684692 gaatgagggggatcctgaggttgtgcaagtatggaacatcattgttgaagggaggcttatatgaattgtttggtactatctataaaaacaagatgcatct 30684593  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| ||  ||| |    
T  30684592 tcttttcggtaggtcaaaccataagaactccacagttaagcgtgctcaacttggagcaattttgggatgggtgaccttctgaaaagtttctcgaaaagcg 30684493  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||| ||||||||| |  || ||||||||| | ||| |||||||||||| ||| |||| || |||  ||| || |||||||||    
T  30684492 tgcgagtaaggacaaaatatactaaaaagactcatattgatttgtggggtcaatcgtcaatcctaaaaacagtatgagatgttaca 30684407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 143 - 405
Target Start/End: Original strand, 18304431 - 18304693
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||| ||||| ||| | || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18304431 aatcacaacggaatgagaaggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggatgatgaaaagcttatataaattgtttggtactacctatatcaaca 18304530  T
Q  243 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||||    
T  18304531 agatgcatattcttttcggtagctcattccataagaattccacagttaagcatgtttgacttggagcaattttgtgatgggtgaccttttgagaagtttc 18304630  T
Q  343 ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcag 405  Q
     | | || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||    
T  18304631 acagaaattgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaacaaactcgtgttgatttctggggtcag 18304693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 30720041 - 30719656
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||  ||| |  | |||||||||  ||||| || |||| | |||||||| ||||||||||     
T  30720041 tgtaacgcctccacttggtgggcatgtaacgtccgagactgacaagggcatgtagtggtccgactcctgacacgcttattggcaaaaccgaatcacatca 30719942  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||||||||||||||  || || |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  30719941 gaatgagagggatcctgaggttgtgcaagtatgggacatcattgttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtactacctataaaaacaagatgcatct 30719842  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| | |    |||||||  |  ||| |    
T  30719841 tcttttcggtaggtcaaaccataagaactccacaattaagcgtgctcaacttggagcaattttgggacgggtgacattctaaaaagtttcttgaaaagcg 30719742  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||| ||| ||||||||  || ||||||||||| ||  |||||||||||| ||| |||| || |||  |||||  |||||||||    
T  30719741 tgcgagagagaacaaaacatactaaaaagactcgtattaatttgtggggtcaatcgccaatcctaaaaacagtcttagatgttaca 30719656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 143 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 24182391 - 24182113
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||  ||| || ||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  24182391 aatcacattagaatgagagggatcttgagaacgtgcaagtatgagacgaaatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactatctataccaaca 24182292  T
Q  243 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 342  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||  |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||    
T  24182291 agatgcatcttc-tttcggtaccccaaaccataataacttaacagttaagcgtggttgacttggagcaattttgggatgggtgaccttctaaaaagtttc 24182193  T
Q  343 ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagt 422  Q
     ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  24182192 tcggaaagtgtgcgagtgaggataaaacacgttgaaaagattcgtgttggtttgtggggttagtcgacaatcctgaaagt 24182113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 197 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 20858633 - 20858392
Alignment:
Q  197 ttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtg 296  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  20858633 ttgaagaaaggcttataagaattgtttggtattttctatatcaacaagatgcttcttcttttctgtagctcattccataagaactccatagttaaggttg 20858534  T
Q  297 cttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttg 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| | |  |||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20858533 cttgacttggagcaactttgggat-ggtgaccttctgggaagttttctgaaaagcatgctagtgaggacaaaacacgctgaaaatactcgtgttgatttg 20858435  T
Q  397 tggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacag 439  Q
    |  ||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  20858434 ttaggtcagtcgacaatcctgaaagaagtttgggatgttacag 20858392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 223 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 11757347 - 11757157
Alignment:
Q  223 tggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgg 322  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||    
T  11757347 tggtactacttatatcaacaaaatgcatcttcttttcggtagttcaatccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttacagcaatttcgagatgg 11757248  T
Q  323 gtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 413  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||| ||| |||||||||| |||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  11757247 gtgacctaccgggaaatttttcggtaagcgtgtgagtgaggacgaaatccgcttaaaagactcttgttggtttgcggggtcagtcggcaat 11757157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 75 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22975224 - 22975076
Alignment:
Q  75 catgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggcc 174  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || | |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22975224 catgtaacgcccgaggctgatgagggcgaggagtggtccagctcttggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggcc 22975125  T
Q  175 gtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttt 223  Q
    || || ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22975124 gtgcaggtatgtgactgcatggttgaagaaaagcttataagaattgttt 22975076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 143 - 428
Target Start/End: Original strand, 1880081 - 1880361
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||||| | ||||||||||||||  ||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||     ||||||||||   ||||| ||||||| ||||    
T  1880081 aatcacaccagaatgagagggatctcgagaccgtgcagttatgtgactgcatggttgaaggaagt----taagaattgtccagtacttcctatattaaca 1880176  T
Q  243 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 342  Q
    | |||||| ||||||| |||||   |||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||| | ||| || |||| | |||| |||  ||||||||     
T  1880177 a-atgcatattctttttggtagtctattccacaagaactctacagttaagcgtgcatgagttggtgtaatatttggatagatgacttactaggaagtttt 1880275  T
Q  343 ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctg 428  Q
      |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||| |||||    
T  1880276 atggtaagcgagcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtaaggtccgtcgacaatgcttaaagtcgtctg 1880361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 16370852 - 16370618
Alignment:
Q  145 tcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaag 244  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||| |  | ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16370852 tcacatcgaaatgagagggttcctgatgccatgtaggtataagactgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacttatatcaacaag 16370753  T
Q  245 atgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttccc 344  Q
    | | |||||||||| ||||||    |  || ||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | | |  ||||||| |    
T  16370752 acgtatcttctttttggtagc---ctaaatcagaaccccgcagttaagcatgtttgacttggagcaattttgggatgggtgacattctgaaaagtttctc 16370656  T
Q  345 ggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaaga 382  Q
       ||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  16370655 ataaagcgtgcgaatgaggaaaaaacacactgaaaaga 16370618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 273 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 30720276 - 30720111
Alignment:
Q  273 ataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacac 372  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |  | ||| || |||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  30720276 ataagaactctacagttaatcgtgcttgacttggaacaattttgggatggatgactttcttgaaagctttccgaaaagcgtgcgagcgaggacaaaacac 30720177  T
Q  373 gctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  30720176 gctgaaaagactcctgttggtttgtggagtcaatcgacaatcttgaaagcagtctgggatgttaca 30720111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 322
Target Start/End: Original strand, 42429145 - 42429324
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  | ||||| ||   ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42429145 gaatcacatcggaataagagg-atcctgagaccgtgtaggtatgtgaacacatggttgaaggaggacttataagaattgtttggtactacctttatcaac 42429243  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgg 322  Q
    || |||||| |||||||| ||||| | || |||||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  42429244 aatatgcatattcttttccgtagcccgttacataagaacttcatagttaagggtgcttgacttaaagcaattttggaatgg 42429324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 30685027 - 30684862
Alignment:
Q  273 ataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacac 372  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| | |  | |||||| |||  ||| |||| || |||||||||||||    
T  30685027 ataagaactctacggttaagtgtgcttgacttggaacaattttgagatggatgactttcttgaaagttttccgaaaagcgtgcaagcgaggacaaaacac 30684928  T
Q  373 gctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| || |||||||||    
T  30684927 gctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcaatcggcaatcttgaaagcagtttgagatgttaca 30684862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 2058819 - 2058508
Alignment:
Q  127 cttctaggcaaaa-ctgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgg 225  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||| | | | ||  |||| ||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  2058819 cttctaggcaaaaaccgaatcacatcggattgagagagatcctgaagtcatgcagctatgagactggatgattgaaggaagacttatatgaattgtttgg 2058720  T
Q  226 tactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac-tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||   |||| |||||||||||||| |  | | |   |  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2058719 tactacctatatcaacaagatgcaaattctgttaaatagcacattccataagaactttgagact---ggatgcttgacttggagcaattttgggatgagt 2058623  T
Q  325 gacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt-ggggtcagtcggcaatgctgaaagta 423  Q
    ||||| |   ||||| |||||  ||  ||| ||||||| |||||| ||  |||||| ||||||||| |||||| ||||||| | | |||| ||||||| |    
T  2058622 gaccttctaagaagtctcccgaaaaacgtgtgagtgagtacaaaatacattgaaaaaactcgtgttagtttgtgggggtcaatagacaatcctgaaagca 2058523  T
Q  424 gtctgggatgttaca 438  Q
    || || |||||||||    
T  2058522 gtttgagatgttaca 2058508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 137 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4658144 - 4657956
Alignment:
Q  137 aaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 236  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||  |||| || ||||| |||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4658144 aaactgaatcacatcgaaataagagggatcttgaaaccgtgcaggtatgagacttcatggttgaacgaaga-ttataagacttgtttgatactacctata 4658046  T
Q  237 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgac 327  Q
     |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||| ||   ||||||| |||||||||    
T  4658045 acaacaacatgcatcttctttttggtagtccattccataagaacttcacagtt-atcatgcttgacttagatatattttggaatgggtgac 4657956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5067038 - 5066872
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| || ||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5067038 gaatcacaccagaatgagagagatcccgaggccgtgcatgtatgagactgtatgattaaaggaaaacttataagaattgtttggtattatctatatcaac 5066939  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggag 308  Q
    ||||||||| ||||||| |||||   ||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||| |||||||    
T  5066938 aagatgcattttctttttggtagtctatttcataaaaactccacaattaaacgtgtttgccttggag 5066872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 317 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 38063800 - 38063680
Alignment:
Q  317 ggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgct 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||    
T  38063800 ggatgggtgacctactgggaagttttccggtaagcgtgcgaatgaggacaaaatacgctgaaaa-actcgtgttggtgtgtagggtcattcgacaatgct 38063702  T
Q  417 gaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
     | ||| |||||||||||||||    
T  38063701 tagagtcgtctgggatgttaca 38063680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 192 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4673568 - 4673466
Alignment:
Q  192 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaa 291  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4673568 catgattgaaggaagtcttataagaattatttggtagcacctgtatcaacaagatgcatattctttttggtatttcattccataagaactccacagttaa 4673469  T
Q  292 gcg 294  Q
    |||    
T  4673468 gcg 4673466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 32574765 - 32574632
Alignment:
Q  181 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 280  Q
    ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  ||| |||||| ||  | |||| |||    
T  32574765 gtatgagactgcacggttaaag-aaggcttataggaattgtttggtactacctatacaaacaaaatgcatctttcttttggtagcccaaactataataac 32574667  T
Q  281 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttt 315  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32574666 ttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttt 32574632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 11160822 - 11160694
Alignment:
Q  148 catcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatg 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||  | |||||  ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  11160822 catcggaatgagagggatcatgaagtcgtgtaggtatgacactacatagttgaaggaaggcttataataattgtttggtactatctatgtcaacaagatg 11160723  T
Q  248 catcttcttttcggtagctcattccataa 276  Q
    ||| ||||||   |||| |||||||||||    
T  11160722 catattctttcacgtagttcattccataa 11160694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 364 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 21884010 - 21883938
Alignment:
Q  364 acaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgtta 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||    
T  21884010 acaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcttgaaagcagtctgggatgtta 21883938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 335 - 395
Target Start/End: Original strand, 187750 - 187810
Alignment:
Q  335 gaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggttt 395  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  187750 gaagttttccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggttt 187810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 329
Target Start/End: Original strand, 4102811 - 4102982
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| || ||||| |||||     ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||      
T  4102811 gaatcacatctgaatgagagggattctgataccgtgcaggtatgagactg-----ttgaaagaatgcttataagaattgtttggtactacatacacca-- 4102903  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacct 329  Q
             ||| ||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  4102904 ---------ctttttttcggtagcccaaaccataagaacttcacagttaaacgtgcttgacttggagcaattttgagatgagtgacct 4102982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 272 - 397
Target Start/End: Original strand, 8366595 - 8366719
Alignment:
Q  272 cataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaaca 371  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||| ||| || | | || ||||||||||||||| ||||||||| ||  |||| | | |||||| |||||||||    
T  8366595 cataagaactctatagttaagcgtgtttgatttgaagtagtatttggatgggtgacctactgggaagttttccaataagcg-gtgagtgacgacaaaaca 8366693  T
Q  372 cgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  8366694 cgttgaaaagactcgtgttggtttgt 8366719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 43356762 - 43356651
Alignment:
Q  145 tcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaag 244  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  | | || ||||| ||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||     
T  43356762 tcacatcggaatgagaggg-tcctgagatcatgcaggtatgagactgcatgattga-ggatgacttataagaattgtttggtacaacctaaaccaacaat 43356665  T
Q  245 atgcatcttctttt 258  Q
    ||||||||||||||    
T  43356664 atgcatcttctttt 43356651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 397
Target Start/End: Original strand, 5785958 - 5786099
Alignment:
Q  256 tttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgc 355  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| || | || ||||||      || | | |    
T  5785958 tttcgatagcccattccataagaactctacgcttaagcgtgtttgacttggagcaattttaggatgagtgatcttctggaaagtttttaaaaaattatac 5786057  T
Q  356 gagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  5786058 gaatgaggacaaaacacattgaaaagactcgtattggtttgt 5786099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5785954 - 5785901
Alignment:
Q  243 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtg 296  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  5785954 agatgcatcatctttttggtagctcgttccgtaagaactccacagttaagcgtg 5785901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 21041468 - 21041410
Alignment:
Q  348 aagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagt 406  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  21041468 aagtgtgtgagttaggacaaaacatgctgaaaagactcgagttggtgtgtgtggtcagt 21041410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 32136387 - 32136274
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 242  Q
    |||||||||| ||| |||| |||| | || ||||||| |||||| |||||| |||| || |||  ||||||| |||||||||||  ||  | ||||||||    
T  32136387 aatcacatcgaaataagagagatcttaagaccgtacaagtatgg-actgcaaggttaaatgaatacttataaaaattgtttggtgttatttgtatcaaca 32136289  T
Q  243 agatgcatcttcttt 257  Q
    |||||||||||||||    
T  32136288 agatgcatcttcttt 32136274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 220 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 39801531 - 39801498
Alignment:
Q  220 gtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39801531 gtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 39801498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 5066825 - 5066781
Alignment:
Q  352 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttg 396  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5066825 gtgcgagtgaagacaaaacacgctgaaaagattcatgttggtttg 5066781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Original strand, 34371969 - 34372013
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||    
T  34371969 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 34372013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 107699 - 107314
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  107699 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacggggagtggtccggttcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcg 107600  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  107599 gaatgagagggattctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgatactaccaatatcaacaagatgcatct 107500  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  107499 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacgtaccgggaagtttcccggtaagcg 107400  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  107399 tgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggctattctgaaagcagtctgggatgttaca 107314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Original strand, 30966600 - 30966985
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30966600 tgtaacacctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcgcatcg 30966699  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30966700 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggattataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 30966799  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  30966800 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttaacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttctcggtaagcg 30966899  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  30966900 tgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtggagtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 30966985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 53 - 436
Target Start/End: Original strand, 30966144 - 30966527
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30966144 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggtggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcgcatcg 30966243  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30966244 gaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 30966343  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  30966344 tcttttcggtatctcattccataagaactccatagttaagcgtgcttgacttggaccaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttctcggtaagca 30966443  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgtta 436  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  30966444 tgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgtta 30966527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 53 - 439
Target Start/End: Original strand, 24818236 - 24818621
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24818236 tgtaacgcctgcgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggtggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggtaaaactgaatcacatcg 24818335  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24818336 gaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgggactgcatggttcaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatatcaacaagatgcatct 24818435  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  24818436 ttttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttt-ggatgggtgacctaccgggaagtttcctggtaagcg 24818534  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacag 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24818535 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagtagtcggggatgttacag 24818621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 53 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 29259856 - 29259504
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  29259856 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgctcgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggtaagactgaatcacatcg 29259757  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29259756 gaatgagagggatcctgagaccgtacaagtatgggactgcatggttgaaggaaggcttattaaaattgtttggtactacatatatcaacaagatgcatct 29259657  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  29259656 tcttttcggtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgactttgagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagca 29259557  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcag 405  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29259556 tgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcag 29259504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 5400053 - 5399668
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||  || ||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5400053 tgtaacgcctccgcttggtgagcatgtaatgcctgaggctgatgagggcagggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaattgaatcacatcg 5399954  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5399953 gaatgagagggatcttgaggtcgtgcaagtatgggagtgtatggtttaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 5399854  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  5399853 tcttttcggtagctcattccataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagaaattttgggatgggtgacctaccaggaagttttccggtaagcg 5399754  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||    
T  5399753 tgcgagtgagaacaaaacacgctggaaagacttgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagcagtctgggatgttaca 5399668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 138 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25338148 - 25337848
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25338148 aactgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatat 25338049  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25338048 caacaagatgcatcttcttttcgatagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 25337949  T
Q  338 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttac 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  25337948 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgagatgttac 25337849  T
Q  438 a 438  Q
    |    
T  25337848 a 25337848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 138 - 438
Target Start/End: Original strand, 33771005 - 33771296
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||         |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33771005 aactgaatcacaccggaatgagagggttcctgagg---------tatgggactgcagggttgaagaaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 33771095  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33771096 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcatgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 33771195  T
Q  338 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttac 437  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  33771196 gtttcccggtaagcatgcgagtgaggacaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagccggcaattctgaaagcaatctgggatgttac 33771295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 142 - 439
Target Start/End: Original strand, 33174957 - 33175252
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33174957 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 33175056  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||  ||||||||||||||||||||  ||    
T  33175057 aagatgcatcttctttttggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtg-ttgacttggagtattcttatgatgggtgacctaccgggaa-att 33175154  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacag 439  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  33175155 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctggaaagactcgtgttagtttgtagggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacag 33175252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 16379392 - 16379688
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||| || |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16379392 gaatcaaattggaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttatacgaattgtttggtactacctatatcaac 16379491  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16379492 aagatgcatcttctttttggtagcacattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagtaatctttggatgggtgacctaccgggaagttt 16379591  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||| | ||||||||    
T  16379592 cactgtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcattcgacaatgcttaaagttgtctcgaatgttaca 16379688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 144 - 438
Target Start/End: Original strand, 16378938 - 16379232
Alignment:
Q  144 atcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaa 243  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16378938 atcacaccggaatgagagggattccgaggccgtgcaagtatgagactgcatggttgaaggaagtcttatacgaattgtttgatactacctatatcaacaa 16379037  T
Q  244 gatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcc 343  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16379038 gatgcatcttctttttggtagcacattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctatcgggaagtttcc 16379137  T
Q  344 cggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||    
T  16379138 gggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagttgtttggaatgttaca 16379232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 138 - 375
Target Start/End: Original strand, 41754284 - 41754521
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41754284 aactgaatcacaccggaatgagagggttcttgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctatat 41754383  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  41754384 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatggatgacctaccggaaa 41754483  T
Q  338 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgct 375  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41754484 gtttcccggtaaacgtgcgagtgaggacaaaacacgct 41754521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 138 - 438
Target Start/End: Original strand, 1912520 - 1912819
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  | ||||| |||| |||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1912520 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggttatgtaggtatgagactacatggttgaaagtagatttataagaattgtttggtactacctatat 1912619  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | || |||||||| ||||||||||||    
T  1912620 caacaagatgcatcttctttt-ggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgattgacttggagtactctttggatgggttacctaccgggaa 1912718  T
Q  338 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttac 437  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1912719 gtttctcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtagagtcagtcggcaatgcttaaagtcgtctgggatgttac 1912818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 151 - 393
Target Start/End: Original strand, 8256534 - 8256776
Alignment:
Q  151 cggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 250  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8256534 cggaatgagagggatcttgaagccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 8256633  T
Q  251 cttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaag 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||    
T  8256634 cttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctgctgggaagttttccgataag 8256733  T
Q  351 tgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggt 393  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  8256734 cgtgcgagtgaggacaaaatacgctgaaaagactcatgttggt 8256776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 142 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 25434203 - 25433906
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  25434203 gaatcacaccggaatgagagggatcctgaggccgtgctggtatgggacttcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgatacaacctttatcaac 25434104  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | || |||||||||||| || |||||||||    
T  25434103 aagatgcatctcctttctggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtggtctttggatgggtgaccaacagggaagttt 25434004  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacag 439  Q
     | |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  25434003 tctggtaagcgtgtgagtaaggacaaaacacgctgaaaagattcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcatctgggatgttacag 25433906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 142 - 435
Target Start/End: Original strand, 33174504 - 33174794
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33174504 gaatcacatcggaatgagagggatcctgatgccgtgtaggtatgggactaca--gttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 33174601  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||  |||||||||| |||||||||  ||    
T  33174602 aagatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccgcagttaagcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgacataccgggaa-att 33174700  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgtt 435  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||| |||  |||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||| || || ||||||    
T  33174701 cccggtaagcgtgcgagttaggaaaaaacatgctagaaagacccgtgtttgtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtatgtgatgtt 33174794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 142 - 439
Target Start/End: Original strand, 1707041 - 1707337
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||  | ||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1707041 gaatcacatcggaatgagagg-atcctgagactgtgtaggtatgagactacatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 1707139  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || | | || |||||||||||||||| ||||||||    
T  1707140 aagatgcatcttctttttggtagcccatctcataagaactccacagttaagagtgtttgacttgaagtagtctttggatgggtgacctaccaggaagttt 1707239  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacag 439  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||| |||| ||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1707240 cccggtaagcgtgcgagtgaatacaaaacacgctaaaaagattcgcgttgatttatagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtctgggatgttacag 1707337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 145 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 30963407 - 30963114
Alignment:
Q  145 tcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaag 244  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30963407 tcacatcagaatgagagggatcatgaagccgcacatgtatatgaatgcatgattgaaggaaggcttataagaattgttaggtactacctatatcaacaag 30963308  T
Q  245 atgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttccc 344  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||   |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| |    
T  30963307 atgcatcttatttttggtagcccaaatcataagaattcaacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgagtgaccttcttggaagtttctc 30963208  T
Q  345 ggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    || ||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| ||| | ||||||||||    
T  30963207 ggaaagcgtgcgagtgaggataaaatacgttgaaaagactcgtgttggtttgtgaggtcaatcggcaatcatgaaagcagttttggatgttaca 30963114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 142 - 436
Target Start/End: Original strand, 15619897 - 15620195
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15619897 gaattacatcagaatgagagggatcccgatgccgtgcaagtatgagactgcatagttgaaggcaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 15619996  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||| ||||||||||| || | | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | || ||||||||||||||| |||||||||    
T  15619997 aagatacatcttctttttggaaacccaatccataagaactccacaattaagcgtgcttgactttgagtagtctttggatgggtgacctactgggaagttt 15620096  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggttt----gtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgtta 436  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     || ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||    
T  15620097 ctcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaactcgctgaaaagactcgtgttggttaattggtagggtcagtcggaaatgcttaaagtcgtctgagatgtta 15620195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 75 - 439
Target Start/End: Original strand, 82952 - 83313
Alignment:
Q  75 catgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggcc 174  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||| |||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||       
T  82952 catgtaacgcccgaagctgacgagggcggagagtggtctggctcctggca-gcttctaggcaa--ctgaatcacgtcgaaatgagagggatcctgagatt 83048  T
Q  175 gtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccat 274  Q
    || || ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  83049 gtgcaggtatgagactacatggttgaaggtatgcttataagaatcgtttggtactacctataccaacaagatgaatcttttttttggtagctcattccat 83148  T
Q  275 aagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgc 374  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||  |||||||   ||| | |||  | | ||||||||||||||||||||||||||     
T  83149 aagaactctacagttaagcgtgtttgatttggaacaattttgtgatatgtgacctttagggtaatttttcagaaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgt 83248  T
Q  375 tgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacag 439  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  83249 tgataagacttatgttggtttgtggggttattcggcaatcatgaaagtagtctgagatgttacag 83313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 142 - 331
Target Start/End: Original strand, 29804681 - 29804870
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29804681 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggcaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 29804780  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctac 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  29804781 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttgggatgtttgacctac 29804870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 27883073 - 27882781
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  27883073 gaatcacaccgaaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgagactgcattgttgaaggaatgcttataagaattgtttggtattatctatatcaat 27882974  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||  ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||||| | |||||||    
T  27882973 aagatgcatcttcttttttgtaggccgttccataagaactccacaattaagcgtgtttgacttggagtagtctttggataggtgacctactgagaagttt 27882874  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
      |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  27882873 ttcggtaagtgtgcaagtcaggacaaaacacgctgaaaagaatcttgttggtttgt----tcagtcagcaatgctcaaagtcgtctgagatgttaca 27882781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 68 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 30962111 - 30961745
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcc 167  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   |||  ||| |||||| | | |||||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||| |||||    
T  30962111 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgtcaagggtggggagtggttcagctcctggca-gcttctaggaaaaatcgaatcacatcagaatgagagagatcc 30962013  T
Q  168 tgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaagga--------aggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 259  Q
    ||| |||||  | |||||||| |||||||||||||||        || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  30962012 tgaagccgtgtaggtatgggattgcatggttgaaggatttaaggaagtcttataagatttgattggtactacctatatcaacaagatgcatatttttttc 30961913  T
Q  260 ggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagt 359  Q
    ||||||  |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | | ||| ||||||||    
T  30961912 ggtagccgaaaccataagaactccacagttaaacgtgcttgacttagagcaattttgggatgggtgaccttctgggtagtttctcagaaagcgtgcgagt 30961813  T
Q  360 gaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtct 427  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  30961812 gaggacaaaacacagtgaaaagacttgtgttagtttgtggggtcaatcggcaatcatgaaaggagtct 30961745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 142 - 342
Target Start/End: Original strand, 11388188 - 11388386
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  11388188 gaatcacatcggaatgagagg-atcctgatgccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttaaaa-aattgtttggtactacctatatcaac 11388285  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11388286 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactaggaagttt 11388385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 190 - 438
Target Start/End: Original strand, 15639781 - 15640029
Alignment:
Q  190 tgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagtt 289  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | || |||| |||||||||||| ||    
T  15639781 tgcatagttgaaggcacgcttataggaattgtttggtactacctatatcaacaacatacatcttctttttggaaacccaatccacaagaactccacaatt 15639880  T
Q  290 aagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgt 389  Q
    ||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15639881 aagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctactgggaagtttctcgataagcgtgcgagtgaggacaaaacacgcagaaaagactcgtgt 15639980  T
Q  390 tggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15639981 tggttggtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 15640029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 249 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 32377756 - 32377575
Alignment:
Q  249 atcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggta 348  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  32377756 atcttgttttcggtagctcattccaaaagaactccacagttaagcatgcttgacttggagcaattttgggataggtgacctaccggaaagttttccggta 32377657  T
Q  349 agtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctggg 430  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  32377656 agcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaaaactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctaaaagcagtctggg 32377575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 275 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 32377921 - 32377758
Alignment:
Q  275 aagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgc 374  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32377921 aagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgggatgggtgatctactgggaagttttccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgc 32377822  T
Q  375 tgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32377821 tgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 32377758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 152 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 30963857 - 30963598
Alignment:
Q  152 ggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 251  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| || ||| | || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30963857 ggaatgagagggatcatgaagccgtgcaggtaagagaatgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtatggttctacctatatcaacaagatgcatc 30963758  T
Q  252 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagt 351  Q
    ||||||  |||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||| |  ||||||||  ||| ||      
T  30963757 ttctttctggtagcccaaaccataataactccacagttaagcgtgcttgacttggcggagttttgggataggtgaccttctaggaagtttgtcggaaacc 30963658  T
Q  352 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggca 411  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  30963657 gtgcgagtgaggacaaaacacagtgaaaagactcgttttggtttgtgggatcagtcggca 30963598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 162 - 342
Target Start/End: Original strand, 11394554 - 11394732
Alignment:
Q  162 ggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcgg 261  Q
    ||||||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11394554 ggatcctgatgccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttaaaa-aattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcgg 11394652  T
Q  262 tagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 342  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  11394653 tagct-attccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactaggaagtttc 11394732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 53 - 413
Target Start/End: Original strand, 1953067 - 1953424
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |  | |||||||||| | ||| || |||| | |||||||| |||||||||||    
T  1953067 tgtaacgtccccgcttggtgggcatgtagcactcgaggatgatgagggcaaggagtggtccggcttctgaca-gctttt-ggcaaaaccgaatcacatcg 1953164  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1953165 gaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaagacctataagaattgtttggtactacctatatcaactagatgcatct 1953264  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    |||||| |||||  ||  ||||||  ||| ||  ||||||| ||||| |||| | || |||||||||||||| ||||    |||||| || | | ||||     
T  1953265 tctttttggtagtccaaaccataattacttcatggttaagcatgcttaactttgcgctattttgggatgggttaccttttaggaagtatctcagaaagta 1953364  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 413  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||| | |||| ||| |||||||||    
T  1953365 tgcgagtgaggacaaaatacg-tgaaaaaactcatgttggatggtggagtcggtcggcaat 1953424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 142 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18099025 - 18098874
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099025 gaatcacatcggaatgagaggaatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaagggatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 18098926  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagc 293  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18098925 aagatgcatcttctttttggtagctcattccataagaactccatagttaagc 18098874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 187 - 438
Target Start/End: Original strand, 13191018 - 13191269
Alignment:
Q  187 gactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccaca 286  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||  |||||||||||| |    
T  13191018 gactgcatggttcaaggaagacttataagaattgtttggtactacatataccaacaagatgcatcttctttttggtagtccattttataagaactccata 13191117  T
Q  287 gttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcg 386  Q
    |||| | |||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | || ||||||| |   ||| ||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  13191118 gttatgtgtgcttgacttgaagaaattttgagataggtgaccttctggaaagtttctcaaaaagcgtgtgaatgcggacaaaacacgctaaaaagactag 13191217  T
Q  387 tgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||  |||||||  | ||||||||||||    
T  13191218 tgttggtttatggagtcagtcgacaatcttgaaagtcatatgggatgttaca 13191269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 143 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 38899058 - 38898867
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  | ||||  |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38899058 aatcacatcggaaggagagtgatcttgaggccgtgtaggtatcagactacatggttgaaggagagcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 38898959  T
Q  243 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgg 334  Q
    |||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || |||| |||||||||||||    
T  38898958 agatgcattttctttttggtaacacatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttagagtagtctttggataggtgacctaccgg 38898867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 153 - 436
Target Start/End: Original strand, 8073902 - 8074185
Alignment:
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    |||||||||||||| ||||   || || ||||||| ||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8073902 gaatgagagggatcatgagattgtgcaggtatgggtctataaggttgaagggagacttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatgcatct 8074001  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    |||||   ||||| |||| ||||||||||||| || ||||| | ||||||||||   |||||||||||| ||||||| || | ||||||| ||  |||||    
T  8074002 tctttcttgtagcccatttcataagaactccatagataagccttcttgacttggttaaattttgggatgagtgaccttccagaaagtttctcgaaaagtg 8074101  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgtta 436  Q
    || || |||| |||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||||  |||||| |||||    
T  8074102 tgtgattgagaacaaaacacgatgaaaaaacttgtgtttgtttgtgggatcagtcgacaatcttgaaagttatctgggctgtta 8074185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 154 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 8181486 - 8181212
Alignment:
Q  154 aatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 253  Q
    |||||||||||||| ||| || || | ||||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  8181486 aatgagagggatcccgagaccttataggtatgggactttgtggttgaaggaagacttttaagaattgtttggtactacctatatcaacaagat------- 8181394  T
Q  254 cttttcggtagctcat----tccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaa 349  Q
        | ||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||| |    ||||| | |  | ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  8181393 ----ttggtagctcatatattccataaaaactccacagttaagcgtgcatc---tggagtagtcgttggatgggtgacctactgggaagttttccgataa 8181301  T
Q  350 gtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgc-tgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  8181300 acgtgcaagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttg-caggtcagtcgacaatgcttaaaagtcgtctgggatgttaca 8181212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 297
Target Start/End: Original strand, 20502023 - 20502176
Alignment:
Q  145 tcacatcggaatgagagggatcctga--ggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |  || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20502023 tcacaccggaatgagagggatcccaaaaggtcgtgcaagtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactttctatatcaaca 20502122  T
Q  243 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgc 297  Q
    |||||| |||| |||| |||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  20502123 agatgcttctt-tttttggtagcccatttcataagaacttcacaattaaacgtgc 20502176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18448065 - 18447954
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18448065 gaatcacatcggaatgatagggatcctgaggccgtgtaggtatgtgactacatggttgaagtaagacttataagaattgtttggtactacttgtatcaac 18447966  T
Q  242 aagatgcatctt 253  Q
    ||||||||||||    
T  18447965 aagatgcatctt 18447954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 342
Target Start/End: Original strand, 16542034 - 16542185
Alignment:
Q  192 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcgg-tagctcattccataagaactccacagtta 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16542034 catggttgaaggaagacttataataattgttttgtactacctatatcaacaagatgtatcttttttttttatagctcattccataaaaactctacagtta 16542133  T
Q  291 agcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 342  Q
    |  ||| |||||||||||||||||| ||||| |||  ||||  |||||||||    
T  16542134 aatgtgtttgacttggagcaattttaggatgagtgctctactaggaagtttc 16542185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 153 - 408
Target Start/End: Original strand, 37552578 - 37552830
Alignment:
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||||  ||||||| || | || |||||||||||||||||  || || | |||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||| |||    
T  37552578 gaatgagaggattcctgagaccatgcaagtatgggactgcatggtcaaacga-gacttataagaattgtttggtactacatata-caaaatgatgc-tct 37552674  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    |||||| || ||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  | ||||| ||||| |||  |||| | |  ||||||||||  ||       
T  37552675 tctttttggcagcgcattccgtaagaattccacagttaagcatgcttgactttaatcaattctgggacgggaaaccttctgaaaagtttcccgaaaatca 37552774  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcg 408  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  37552775 tgcgattgaggaaaaaacacgcttaaaatacccgtgttggtttgtagggtcagtcg 37552830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 352 - 437
Target Start/End: Original strand, 20502173 - 20502258
Alignment:
Q  352 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttac 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  20502173 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttagtttgtagggtcagtcggcaatttttaaagttgtctgggatgttac 20502258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 367 - 438
Target Start/End: Original strand, 29804871 - 29804942
Alignment:
Q  367 aaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29804871 aaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 29804942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 267 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 18876007 - 18875866
Alignment:
Q  267 cattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggaca 366  Q
    |||||||||| ||||| |||  | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | |  |||||||  |  ||  |||||||||||||||    
T  18876007 cattccataaaaactcaacaacttagcgtgcttgattttgagcaattttgggatgggtgatcttctgaaaagtttcttgaaaatcgtgcgagtgaggaca 18875908  T
Q  367 aaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcg 408  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18875907 aaacacactgtaaagacacgtgttggtttgtggggacagtcg 18875866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 36924435 - 36924333
Alignment:
Q  335 gaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgt 434  Q
    ||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||| ||| | ||||| |||||| ||||    
T  36924435 gaagttttctggttagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctggaaagactcgtgttggtttgtagagttagtcggc-atgtttaaagtcgtctggaatgt 36924337  T
Q  435 taca 438  Q
    ||||    
T  36924336 taca 36924333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 36924519 - 36924453
Alignment:
Q  194 tggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactac--ctatatcaacaagatgcatcttctttt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  36924519 tggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtattacttatatatcaacaagatgcatcttctttt 36924453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 337 - 431
Target Start/End: Original strand, 11389677 - 11389771
Alignment:
Q  337 agtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctggga 431  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||| | |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||  |||||||    
T  11389677 agtttcctggtaagcatgcgagtgagaataaaacatgctgaaaaaactcatgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagtcatctggga 11389771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 337 - 431
Target Start/End: Original strand, 11406338 - 11406432
Alignment:
Q  337 agtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctggga 431  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||| | |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||  |||||||    
T  11406338 agtttcctggtaagcatgcgagtgagaataaaacatgctgaaaaaactcatgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagtcatctggga 11406432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 265
Target Start/End: Original strand, 9909102 - 9909214
Alignment:
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||||||||||||   |||| | ||||| ||||  |||||||||||| || ||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  9909102 gaatgagagggatcctgaaatcgtataagtatgagactatatggttgaaggagggtttataatgattaattggtactacctataccaacaagattcaact 9909201  T
Q  253 tcttttcggtagc 265  Q
    |||||| ||||||    
T  9909202 tctttttggtagc 9909214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 434
Target Start/End: Original strand, 1952921 - 1952992
Alignment:
Q  363 gacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgt 434  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||| |||||    
T  1952921 gacagaacacgctaaaaagacccgtgttggtttgtggggtcagtcggcactcctaaaaatagtctgagatgt 1952992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 348 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 26865194 - 26865133
Alignment:
Q  348 aagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgg 409  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  26865194 aagtatgcgagtgaggacaaagcatgctgaaaagatccgtgttggtttgtggggtcattcgg 26865133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 26864905 - 26864791
Alignment:
Q  200 aaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgctt 299  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  || ||||| ||| |   |||||||| ||  |||||||||| ||    
T  26864905 aaggaaggcttgtaagaactctttggtactacctacatcgacaagatgcatcttccatttggtaggtcaat-gttaagaacttcatcgttaagcgtgatt 26864807  T
Q  300 gacttggagcaatttt 315  Q
    ||||| || |||||||    
T  26864806 gacttagaacaatttt 26864791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 38898856 - 38898817
Alignment:
Q  358 gtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38898856 gtgaggacaaaacacgctgaaaagactcaagttggtttgt 38898817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 350 - 404
Target Start/End: Original strand, 9909272 - 9909326
Alignment:
Q  350 gtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtca 404  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||| ||| ||||||||    
T  9909272 gtgtgcgagtgagtacaaaacatgctgaaaagacttgtattgatttatggggtca 9909326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 3804318 - 3804261
Alignment:
Q  356 gagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 413  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3804318 gagtaaggacaaagcacactgaaatgactcttgttggtttgtggggtcaatcgacaat 3804261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Original strand, 33174859 - 33174903
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||    
T  33174859 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 33174903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 53 - 439
Target Start/End: Original strand, 10210 - 10595
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10210 tgtaacgcctgcgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggtggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggtaaaactgaatcacatcg 10309  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10310 gaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgggactgcatggttcaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatatcaacaagatgcatct 10409  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  10410 ttttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttt-ggatgggtgacctaccgggaagtttcctggtaagcg 10508  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacag 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10509 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagtagtcggggatgttacag 10595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Original strand, 105630 - 106015
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  105630 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacacccaaggctgatgagggcggggagtggtctggttcctggcatgcttctaggcaaaactaaatcacatcg 105729  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  105730 gaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatggaactgcagggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaaaatgcatct 105829  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  105830 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgtgtgacctaccgagaagtttcctggtaagcg 105929  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  105930 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttatagggtcagtcggcaattctgaaagcagtctgagatgttaca 106015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 302; Significance: 1e-169; HSPs: 70)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Original strand, 9124869 - 9125254
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9124869 tgtaacgccttcgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 9124968  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9124969 gaatgagagagatcttgaggccgtgcaggtatgagactgtatggttaaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 9125068  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  9125069 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgactcggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttttccggtaagcg 9125168  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  9125169 tgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctggggtgttaca 9125254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 52 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 13125373 - 13124994
Alignment:
Q  52 gtgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 151  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13125373 gtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggcggatgagggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcatatc 13125274  T
Q  152 ggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 251  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13125273 ggaatgagagggatcttgaggccctgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatc 13125174  T
Q  252 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagt 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  13125173 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccagtaagc 13125074  T
Q  352 gtgcgagtgaggac-aaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctggg 430  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13125073 gtgcgagtgaggacaaaaacacgctgaaaggactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctggg 13124994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 2941969 - 2941608
Alignment:
Q  77 tgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgt 176  Q
    |||||| ||| |||||||||||| || | ||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2941969 tgtaacgcccaaggctgatgagggcgaggagtggcccggctcccgccatgcttctaggcaaaactgaatcacatcagaatgagagggatcctgaggccgt 2941870  T
Q  177 acatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataa 276  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2941869 acaggtatgggactgcatggttgaaggaaggctgataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataa 2941770  T
Q  277 gaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2941769 gaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggagaaaacacgctg 2941670  T
Q  377 aaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||    
T  2941669 aaaagactcgtgttggtttgtgcggtcagtcggcaatcacgaaagcagtctgggatgttaca 2941608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 52 - 438
Target Start/End: Original strand, 18833195 - 18833581
Alignment:
Q  52 gtgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 151  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| | |  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18833195 gtgtaacgcccccgcttggtgggcatgtaacgctcagggctgatgagggcggggagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 18833294  T
Q  152 ggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18833295 ggaatgagagggttcctgaggccgtacaggtatggaactgcatggttgagggaaagcttatatgaattgtttagtactacctatatcaacaagatgcatc 18833394  T
Q  252 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagt 351  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  18833395 ttcttttcggtagctaattacataagaactccacagttaagcgtgtttgactttgagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaaac 18833494  T
Q  352 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  18833495 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtgggataagtcggcaatcctgaaagcagtctggggtgttaca 18833581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Original strand, 42515002 - 42515387
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42515002 tgtaacgtctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggtggagagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaattgaatcacatcg 42515101  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42515102 gaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcattt 42515201  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||| |||| |||| |||  ||||||| |    
T  42515202 tctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacataccaggaactttttcggtaagcg 42515301  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  42515302 tgcgggtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtctgtgatgttaca 42515387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 36422251 - 36422546
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36422251 gaatcacgccggaatgagagggatcctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 36422350  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36422351 aagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaa-tttgggatgggtgacctaccgggaagttt 36422449  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36422450 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 36422546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 2193255 - 2193551
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2193255 gaatcacaccggaatgagagggttcctgagaccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 2193354  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2193355 aagatgcatcttctattcggtagctcatttcataggaactccacagttaagcgtgcttgatttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 2193454  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  2193455 cccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgagatgttaca 2193551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 28495853 - 28496149
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  28495853 gaatcacatcggaatgagagggatcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaactgttgggtactacctatatcaac 28495952  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  28495953 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctattgggaagttt 28496052  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||||||    
T  28496053 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaaacagtttggaatgttaca 28496149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 142 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 34405738 - 34405440
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34405738 gaatcacaccggaatgagagggatcctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 34405639  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34405638 aggatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 34405539  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacaga 440  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||    
T  34405538 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagacccgtgttgatttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagttgtctaggatgttacaga 34405440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 142 - 437
Target Start/End: Original strand, 2189143 - 2189438
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2189143 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggctgtgcaggtgtgggactgcatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggcactacctatatcaac 2189242  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2189243 aagatgcatcttcttttcgatagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgagtgacctaccgggaagttt 2189342  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttac 437  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2189343 cccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgagaagactcgtgttgatttgtggggacagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttac 2189438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 142 - 413
Target Start/End: Original strand, 42515543 - 42515814
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42515543 gaatcacatcagaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaagtgtttggtactacctatatcaac 42515642  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  42515643 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctacatggaaattt 42515742  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 413  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42515743 tccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 42515814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 6719221 - 6718926
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6719221 gaatcacattggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 6719122  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||| |||    
T  6719121 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccagagttaagcgtgcttgacttggagtaa-tttgggatgggtgacatatcgggaacttt 6719023  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  6719022 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacactgaaaagaatcgtgttggtttgtggggtcagtcagcaatcctaaaagtcgtctgggatgttaca 6718926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 181 - 440
Target Start/End: Original strand, 2465962 - 2466220
Alignment:
Q  181 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 280  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2465962 gtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatatcaacaagttgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 2466061  T
Q  281 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaa 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2466062 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttcgggatgggtgacctaccgggaaatttcccggtaagcatgcaagtgaggacaaaacacgctgaaaa 2466161  T
Q  381 gactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacaga 440  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2466162 gactcgtgttagtttgt-aggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttacaga 2466220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 53 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11517624 - 11517386
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11517624 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggttgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 11517525  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11517524 gaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatgg-tgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 11517426  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaag 292  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11517425 acttttcggtagctcattccataagaactccgcagttaag 11517386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 142 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 28495755 - 28495469
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  28495755 gaatcccatcggaatgagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaattgttgagttttacctatatcaac 28495656  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  28495655 aagatgcatcttcttttaggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggga----- 28495561  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacag 439  Q
          ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  28495560 ------aagcgtgcgagtgaggacaaaacccgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcgatgttacag 28495469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 239 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 7646528 - 7646329
Alignment:
Q  239 aacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaag 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7646528 aacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaag 7646429  T
Q  339 tttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7646428 tttctcggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 7646329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 137 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 29039172 - 29038871
Alignment:
Q  137 aaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 236  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||| |||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29039172 aaaccgaatcacatcggaatgagaggcatcctgaggccgtgtagatatgtgactacatggttgaatggaggcttacaagaattgtttggtactacctata 29039073  T
Q  237 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggga 336  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | || |||||| ||||||||||| |    
T  29039072 tcaacaacatgcatcttctttttgataatccattccataagaactctacatttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatggatgacctaccggta 29038973  T
Q  337 agtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgtta 436  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  29038972 agtttcccggtaagcgtgtgactgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtctgggatgtta 29038873  T
Q  437 ca 438  Q
    ||    
T  29038872 ca 29038871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 35474268 - 35473972
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  | ||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  35474268 gaatcacaccggaatgagagggatccttaggtcgtgtaggtatgagactacatggttgaagaaagacttataagaattgtttagtactacttatatcaac 35474169  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | || ||||||||||| ||||||||| |||    
T  35474168 aagatgcatcttctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagtagtctttggatgggtgacgtaccgggaatttt 35474069  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||  ||||||| | ||||| |||| ||||||||||    
T  35474068 ctcggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaatgacttgtgttggtttgtagggttagagggcaatgtttaaagtcgtctaggatgttaca 35473972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 138 - 438
Target Start/End: Original strand, 679812 - 680111
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  | |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  679812 aactgaatcacatcagaatgagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggagtacatggctgaaggaaggcttataagaattgtt-ggtactacctatat 679910  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 337  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||| |||||||    
T  679911 caacaagatgcatattctttttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctgccgggaa 680010  T
Q  338 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggac-aaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgtta 436  Q
    ||||| ||||||   |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  680011 gtttcgcggtaaacatgcgagtgagaacaaaaacacgctgaaaagactcatgttggtttgt-aggtcagtctacaatgcttaaagtcgtctgggatgtta 680109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 227 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 13122567 - 13122363
Alignment:
Q  227 actacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtga 326  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13122567 actacatatattaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgatttggagcaattttgggatgggtga 13122468  T
Q  327 cctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggac-aaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagt 425  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  13122467 cctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcaatcggcaatcctgaaagcagt 13122368  T
Q  426 ctggg 430  Q
    |||||    
T  13122367 ctggg 13122363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 53 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 5406823 - 5406478
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||  |||||||||| || || || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  5406823 tgtaacgcctccgcttcgtgggcatgtaacgctcgaggctgatgagggtggagagtggtccggctcatgaca-gcttctaagcaaaactgaatcacatcg 5406725  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    |||||| ||||||||| | | ||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5406724 gaatgatagggatcctaaagtcgtgccggtatgggactgcatggttgaaggaagatttataagaattgtttggtattacctatatcaacaagatgcatct 5406625  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccg-gtaagt 351  Q
    | |||| ||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | | || |||||| |||   ||      
T  5406624 tatttttggttgcccaaaccataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaattttgggatggatgactttctggaaagttttccgaaaaaac 5406525  T
Q  352 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtg 398  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  5406524 gtgcgagtgaggacaaaacacactgaaaacactcgtgttggtctgtg 5406478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 183 - 363
Target Start/End: Original strand, 2465773 - 2465953
Alignment:
Q  183 atgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactc 282  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2465773 atgggactacatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactc 2465872  T
Q  283 cacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgagg 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  2465873 cacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaaatttcccggtaagcatgcgagtgagg 2465953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 142 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22529382 - 22529084
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| | |  | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  22529382 gaatcatatccgaatgagagggatcctgaggtcatgtaagtatgggcctacatggttgaaggaaggcttataagaaatgtttggtactatctatataaac 22529283  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | | || ||||||||||||||| | |||||||    
T  22529282 aagatgcatcttcttttcagtaactcattacaaaagaacttcacagttaagcgtgtttgacttggagtagtctttggatgggtgacctactgagaagttt 22529183  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacaga 440  Q
    | ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| | |||||||||||    
T  22529182 ctcggtaagcgtgtgagtgaggacaaaatacgctgaaaagactcatgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtccgagatgttacaga 22529084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 140 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 6747747 - 6747457
Alignment:
Q  140 ctgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatca 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747747 ctgaatcacattggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgatactacatggttgaaggaaggattataagaattgtttggtactacctatatca 6747648  T
Q  240 acaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagt 339  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   | | | || |||||||||||||| ||||||||    
T  6747647 acaagatgcatcttctttttggtagcctattccataaaaactccacagttaagcgtgcttgacttatcgtagtctttggatgggtgacctatcgggaagt 6747548  T
Q  340 ttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||        |  ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  6747547 tt--------gcttgcgagtgaggacaaaacaagttgaaaagacttgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagcagtctgggatgttaca 6747457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 242 - 438
Target Start/End: Original strand, 7646514 - 7646710
Alignment:
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7646514 aagatgcatcttgttttcggtaactcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggaaagttt 7646613  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
     ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||| |||||||||||||||    
T  7646614 tccgataagcgtgcgagtgaggacaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtggggttagtcgacaatcctaaaagtcgtctgggatgttaca 7646710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 138 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 2611803 - 2611509
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  | ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  2611803 aactgaatcacatcggaatgagaggggtcctgaggtcatgtaggtatgagactatatggtggaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctataa 2611704  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | || ||||||||||||||||||| |    
T  2611703 caacaagatgcatcttctttttggtagcccattctataagaactccatagttaagcgtgctttacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgggta 2611604  T
Q  338 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttac 437  Q
             |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| || ||| |||||||    
T  2611603 -------actaagcgtgcgagtgaggacaaaacactctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtatggaatgttac 2611511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 101 - 438
Target Start/End: Original strand, 25182320 - 25182656
Alignment:
Q  101 cgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttga 200  Q
    |||| ||||||| || |||| ||| |||||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||| ||||||||||||||    
T  25182320 cggggagtggtcaggctcctagca-gcttctaggcaaagacgagtcacatcggaatgagagagatcctgagactgtgcaagtatgagactgcatggttga 25182418  T
Q  201 aggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttg 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  25182419 aggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatacatcttattttcggtaactcattccataagaacttcacagttaagtgtgtttg 25182518  T
Q  301 acttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggg 400  Q
    |||||||| | | || ||||||  ||||| | |||||||||| |   ||| || ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||    
T  25182519 acttggagtagtctttggatggaggaccttctgggaagtttctcaaaaagcgttcgagtgagggcaaaacacgctaaaaaaactcgtattgggttgtggg 25182618  T
Q  401 gtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||| |||  ||| || |||| | || |||||||||||    
T  25182619 gtcaatcgaaaatcctaaaagcactcagggatgttaca 25182656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 142 - 353
Target Start/End: Original strand, 46425740 - 46425950
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |  | |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46425740 gaatcacatcggaatgagagggatcctgagaccatgtaggtatgggactacatggttgaaataaggcttataagaattgtttggtattacctatatcaac 46425839  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||  ||||||||||||| || |||||||    
T  46425840 aagatgcatcttcttttcggtatcttattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgaccta-cgagaagttt 46425938  T
Q  342 cccggtaagtgt 353  Q
    ||  ||||||||    
T  46425939 cctcgtaagtgt 46425950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13124923 - 13124757
Alignment:
Q  67 ttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatc 166  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13124923 ttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcatattggaatgagagggatc 13124824  T
Q  167 ctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacct 233  Q
     ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13124823 ttgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtgtggtactacct 13124757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 138 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 29357606 - 29357341
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29357606 aactgaatcacaccg-aatgagaggtatcccgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaatgtttataagaattgtttggtactaactatat 29357508  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||| | | ||  ||||| |||||| |||| ||    
T  29357507 caacaagatgcatcttcttttcgatagcccgtttcataagaactacacagttaaccgtgtttgacttagagtagtcttaagatggatgaccttccggtaa 29357408  T
Q  338 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtca 404  Q
    ||| | ||  ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29357407 gttcctcgaaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcgtgttggtttgtagggtca 29357341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 167 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 26421882 - 26421611
Alignment:
Q  167 ctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagct 266  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  26421882 ctgaggccgtgcatgtatgagactgcatggttgaagtaaggctcataagaattgttaggtactccctataccaacaagatgaatcttcttttcggtagcc 26421783  T
Q  267 cattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggaca 366  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||| | | || |||| ||||||||   ||||||||||  || ||   || |||||||||||    
T  26421782 cattccataagaactacacagttaagcgtgtttggcttcgagtagtctttggattggtgaccttatgggaagtttcttggaaaacatgtgagtgaggaca 26421683  T
Q  367 aaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||  | || ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||    
T  26421682 aagaatgccgaaaatactcgtgttggtatgtagggtcagtcgtcattgcttaaagttgtctgggatgttaca 26421611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 257 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 43776322 - 43776178
Alignment:
Q  257 ttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcg 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||    
T  43776322 ttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttggaatgggtgacctgcggggaagttttccagtaagcgtgcg 43776223  T
Q  357 agtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggg 401  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43776222 aatgaagacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggg 43776178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 35527268 - 35527070
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||| ||| ||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35527268 gaatcacaccgaaatgagagggatcccgaggtcgtgcaaatatgggactggttggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtgctacctatatcaac 35527169  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtt 340  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | || | ||||||||||||| | ||||||    
T  35527168 aagatgcatattcttttcagtagtccattccataggaactccacagttaagcatgcttgacttggagtagtctttgcatgggtgacctactgagaagtt 35527070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 260 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 3305377 - 3305199
Alignment:
Q  260 ggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagt 359  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| | | || |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  3305377 ggtagctcattacataaaaacttcacagttaagcgtgcttgatttggagtagtctttggatgggtgacctaccggaaagtttcctggtaagagtgcgagt 3305278  T
Q  360 gaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||    
T  3305277 gagaacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtaggatcagtcagcaatacttaaagtcgtctggaatgttaca 3305199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 137 - 395
Target Start/End: Original strand, 9623202 - 9623459
Alignment:
Q  137 aaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 236  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||  || |||| ||| |||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9623202 aaaccgaatcacaatggaatgagagggatccagaggttgtgcatgcatgagactccatggtagaaggagtacttataagaattgtttgataccacctata 9623301  T
Q  237 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggga 336  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | | || ||||||||||| | | | ||    
T  9623302 tcaacaagatgcatcttcttt-cggtagttcattctataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggactagtctttggatgggtgacgttctgaga 9623400  T
Q  337 agtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggttt 395  Q
    ||||| | |  |||  | |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  9623401 agttttctgaaaagccttcgagtgaggacaaagcacgctgtaaagactcatgttggttt 9623459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 86 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 31406787 - 31406440
Alignment:
Q  86 cgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaact-gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtat 184  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| | | || ||| | |||||||  ||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||  | |    
T  31406787 cgaggctgatgagggcggggagtggttcagctcttggaa-gcttctaaacaaaaatcgaatcacatcaaaatgagagggatcctgaagccgtgcagatct 31406689  T
Q  185 gggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactcca 284  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  31406688 gggactgaatggttgaaagatgacttattagaattgtttggtgttacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcccgtttcataagaactcca 31406589  T
Q  285 cagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagact 384  Q
    ||||||||||||||    |||||| | | || ||||||||| |||  |  || |||||   | ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  31406588 cagttaagcgtgct----ttggagtagtctttggatgggtggcct-tctagacgtttcttagaaagcgtgtgagtgaggacaaaacatgctgaaaagaca 31406494  T
Q  385 cgtgttggtttgt--ggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgtta 436  Q
     ||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||| || ||| |||||||    
T  31406493 tgtgttggtttgtagggtgtcagtcggtaatcctgaaagcagactgagatgtta 31406440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 193 - 419
Target Start/End: Original strand, 11372501 - 11372719
Alignment:
Q  193 atggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaag 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  11372501 atggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctgtaccaacatgatgcatgttatttttggtagctcaaaccataagaactccaaagttaag 11372600  T
Q  293 cgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgg 392  Q
    |  | |||||||  ||||||||||||||| |||||   ||| ||||||| |||| ||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11372601 cacgtttgacttatagcaattttgggatgagtgac---ccgagaagttttccggaaa-----tcagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttgg 11372692  T
Q  393 tttgtggggtcagtcggcaatgctgaa 419  Q
    ||||| |||||| || ||||| |||||    
T  11372693 tttgtagggtcactcagcaatcctgaa 11372719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 146 - 343
Target Start/End: Original strand, 1628719 - 1628913
Alignment:
Q  146 cacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaaga 245  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||| ||||| ||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1628719 cacattggaatgagagggatgttgaagccgtgcagatatgggattgcatggttgaagaaaggcttataa---ttgtttggtactatcgatatcaacaaga 1628815  T
Q  246 tgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcc 343  Q
    |||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  1628816 tgcatcttcttttttgaagcccataccataagaactccatagttaagtgtatttggcttggagcaattttgggatgggtgacctcctgcgaagtttcc 1628913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 147 - 327
Target Start/End: Original strand, 20966055 - 20966235
Alignment:
Q  147 acatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagat 246  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||| |  | ||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||    
T  20966055 acatcggaatgagagtggtcttgaggccatctaggtatgagactgcatgattgaaggatgacttataagaattattttgtaatacctataccaacaagat 20966154  T
Q  247 gcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgac 327  Q
    | || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20966155 gtatattattttcggtagctcattccataagaacttcacagttaaacatgcatgacttgtatcaattttgggatgggtgac 20966235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 323 - 438
Target Start/End: Original strand, 43233137 - 43233252
Alignment:
Q  323 gtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagt 422  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  43233137 gtgacctaccgagaagttttccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagc 43233236  T
Q  423 agtctgggatgttaca 438  Q
    ||  ||||||| ||||    
T  43233237 agattgggatgctaca 43233252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 143 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 36015557 - 36015404
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36015557 aatcacaccggaatgagagggatcccaaggcagtgcaagtatgagactccatggttgaaggaaagcttaaaagaattgtttggtactacatatatcaaca 36015458  T
Q  243 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtg 296  Q
    |||||| |||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  36015457 agatgcctcttcttttaaatagcccattccataagaacttcacagttaaacgtg 36015404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 131 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 31743982 - 31743834
Alignment:
Q  131 taggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtacta 230  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||   ||| || | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  31743982 taggaaaaactgaatcatatcgaaatgagatggatcttgaaatcgtgcaagcatgagactgcatggttgaaggaatgcttataagaatggtttggtgcta 31743883  T
Q  231 cctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaa 279  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31743882 tctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaa 31743834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 334 - 438
Target Start/End: Original strand, 36422573 - 36422677
Alignment:
Q  334 ggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatg 433  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  36422573 ggaagtttcccggcaagtgtgcgagtgaggacaaaacacactgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcgacaatgctaaaagtaatctgggatg 36422672  T
Q  434 ttaca 438  Q
    |||||    
T  36422673 ttaca 36422677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 145 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26421449 - 26421287
Alignment:
Q  145 tcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaag 244  Q
    ||||||| |||||| |||| || ||||||| |  | ||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26421449 tcacatcagaatgatagggttcttgaggccatgtaggtatgggtcagtatggttgaaggaagacttataagaattgcttgatactacctatatcaacaag 26421350  T
Q  245 atgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgga 307  Q
    |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  26421349 atgcatatttttttcggtagtccattccataagaactccacagttaaacgtgtttgaattgga 26421287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 344 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 6748021 - 6747927
Alignment:
Q  344 cggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  6748021 cggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtctgagaggttaca 6747927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 142 - 264
Target Start/End: Original strand, 43233412 - 43233534
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||||  | ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43233412 gaatcacaccgaaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgtgactgtatggttaaaggaagacttataagaattgtttggtactatctatatcaac 43233511  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtag 264  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  43233512 aagatgcatctttttttcggtag 43233534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26957704 - 26957603
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26957704 gaatcacatcggaatgagagggatcttgaggctgtgtaggtatggaactacatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 26957605  T
Q  242 aa 243  Q
    ||    
T  26957604 aa 26957603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 187 - 402
Target Start/End: Original strand, 37672204 - 37672419
Alignment:
Q  187 gactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccaca 286  Q
    ||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||| | ||| | ||| |||||||| | ||||    
T  37672204 gactgcatggttgcaaaaaggtttataataattgtttggtactacttgtaccaacaagatgcaacttctttttgttagttgatttcataagaaatacaca 37672303  T
Q  287 gttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcg 386  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||   ||||| ||||| | ||||| |||| ||| || | || ||||||||| |||| ||| |||||| || ||    
T  37672304 gttaagcgtgtttgactttgaacaattttataatgggcgaccttctgggaaatttctcggaaaatatgtgagtgaggataaaatacgttgaaaatacccg 37672403  T
Q  387 tgttggtttgtggggt 402  Q
    ||||||||| ||||||    
T  37672404 tgttggtttatggggt 37672419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 37671900 - 37671614
Alignment:
Q  145 tcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaag 244  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  ||||   |||||| |||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  37671900 tcacaccggaatgagagggatcttgataccgtgtgtgtatgtgactgcattgtggaatgaagatttataaaaattgtt-ggtactacctatgccaacaag 37671802  T
Q  245 atgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttccc 344  Q
    || |||    |||| || | |||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||   |  ||||||| |    
T  37671801 atacat----tttttggcaactcatttcatatgaaatccacatttaagcgtgcttgaattggagcaattttgtgatgggtcaccttttgaaaagtttctc 37671706  T
Q  345 ggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
       ||| ||| |||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  37671705 ataaagcgtgtgagtgaggaccaaacacactaaaaagtctcgtgttggtttg-ggggtcagt-tgcaatacttaaagtcgtctgagatgttaca 37671614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 192 - 296
Target Start/End: Original strand, 16192368 - 16192472
Alignment:
Q  192 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaa 291  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||  ||||| ||    
T  16192368 catgattgaatgaaggattataagaattgtttggtattacctacatcaacaagatgcatcttcgttttggtagcccattccataagaactatacagtgaa 16192467  T
Q  292 gcgtg 296  Q
    |||||    
T  16192468 gcgtg 16192472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3305459 - 3305374
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggta 227  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3305459 gaatcacatcgaaatgagggggatcctgaggccgtgtaagtatgggactacatggttgaatgaaggcttatgagaattgtttggta 3305374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 352 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31743826 - 31743740
Alignment:
Q  352 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  31743826 gtgcgagtgaggtcaacgcacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggttagtcgacaatgcttaaagtcgtttgggatgttaca 31743740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 356 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 26419168 - 26419104
Alignment:
Q  356 gagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaa 420  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26419168 gagtgaggacaaaacatgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaa 26419104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 379 - 438
Target Start/End: Original strand, 43776321 - 43776380
Alignment:
Q  379 aagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  43776321 aagactcgtgttggtttgtggggttagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 43776380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 215 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 7461424 - 7461344
Alignment:
Q  215 gaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtg 296  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7461424 gaattgtttgatactaactatataaacaagatacatcttctttttggtagttcatt-cataagaactctacagttaagcgtg 7461344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 322
Target Start/End: Original strand, 11372901 - 11373074
Alignment:
Q  145 tcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaag 244  Q
    |||||||  |||||||||| |||| ||||| |  | ||||| || |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || || ||||| |||||||    
T  11372901 tcacatcaaaatgagagggttcctaaggccatgtaggtatgagattgcatggttgaatgaagacttgtaagaattgtttcatagtatctataccaacaag 11373000  T
Q  245 atgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgg 322  Q
    |||  |||||||||  |||||  |  ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    ||||||||||||||    
T  11373001 atgagtcttctttttcgtagcctaaaccataagaactacacaattaagtgtgcttgactt----caattttgggatgg 11373074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 305
Target Start/End: Original strand, 33316721 - 33316885
Alignment:
Q  137 aaactgaatc-acatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctat 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||  ||| | ||| || ||||| |||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||  | ||| |||    
T  33316721 aaactgaatccacatcggaatgagataaattttgatgtcgtgcaggtatgagactacatggttgaaggaaaaattataagaattgtttgacaatacttat 33316820  T
Q  236 atcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttg 305  Q
    ||||||||||||     ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  33316821 atcaacaagatg-----tcttttcggtagcccaaactataagaactccacaattaaacgtgtttgacttg 33316885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 7461325 - 7461257
Alignment:
Q  346 gtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatg 414  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||    
T  7461325 gtaaatgtgcgagtgaagataaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtgggatcaatcgacaatg 7461257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Original strand, 2490077 - 2490136
Alignment:
Q  181 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaa 240  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  2490077 gtatgtgactgcatgattgaaggaatgcttataagaagtgtttgttactacctatatcaa 2490136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 321
Target Start/End: Original strand, 6585655 - 6585787
Alignment:
Q  190 tgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac--aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacag 287  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||  ||   ||||| ||||  | ||    
T  6585655 tgcatgattgaaagaagacttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaaaagatacatcttccttttggtag-gcaaaacataaaaactttatag 6585753  T
Q  288 ttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatg 321  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  6585754 ttaagtgtgcttgacttgaagcaaatttaggatg 6585787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 439 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 29758367 - 29758267
Alignment:
Q  439 gaattgacctccaacacaaataagattcatgtcccaacagcccctgcgacaaatcacaacaagcattttaagccctttcgagcccaatagaacccgcaca 538  Q
    |||| |||| |||||||  | |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  29758367 gaatcgaccaccaacacggacaagattcacgtaccaacagcccctgcgacaattcacagcgcgcattttcagccctttcgagtccaacggaccccgcaca 29758268  T
Q  539 c 539  Q
    |    
T  29758267 c 29758267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16811954 - 16811900
Alignment:
Q  181 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctat 235  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16811954 gtatgagactacatggttgaaggaatgcttataagaattgttttgtactatctat 16811900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 387 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 26957594 - 26957545
Alignment:
Q  387 tgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgtta 436  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26957594 tgttggtttgtagggccagtcggcaatgcttaaagtcgtctgggatgtta 26957545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 356 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 36015402 - 36015345
Alignment:
Q  356 gagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 413  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | || ||||||||||    
T  36015402 gagtgaggacaaaatacgctaaaaagactcgtgttagtttgtagagttagtcggcaat 36015345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 439 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 22377484 - 22377419
Alignment:
Q  439 gaattgacctccaacacaaataagattcatgtcccaacagcccctgcgacaaatcacaacaagcatt 505  Q
    ||||||||| | |||||  | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22377484 gaattgaccgctaacacggacaagattcatgtaccaacagccc-tgcgacaaatcacagcaagcatt 22377419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 460 - 522
Target Start/End: Original strand, 28754744 - 28754806
Alignment:
Q  460 aagattcatgtcccaacagcccctgcgacaaatcacaacaagcattttaagccctttcgagcc 522  Q
    |||||||| || |||||| ||| |||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||    
T  28754744 aagattcacgtaccaacaacccttgcgacaaatcacagcaggcattatcagccctttcgagcc 28754806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 438
Target Start/End: Original strand, 18833633 - 18833678
Alignment:
Q  393 tttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  18833633 tttgtgggatcagtcggcaatcctgaaagcagtctggggtgttaca 18833678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 413
Target Start/End: Original strand, 33316910 - 33316971
Alignment:
Q  352 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 413  Q
    |||||||| | ||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33316910 gtgcgagtaatgacaaaatacgttgaaaagacccatgttggtttgtgaggtcagtcgacaat 33316971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Original strand, 2189501 - 2189545
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||    
T  2189501 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 2189545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 34405836 - 34405792
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||    
T  34405836 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 34405792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 96)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 53 - 421
Target Start/End: Original strand, 35871538 - 35871905
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35871538 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 35871637  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  35871638 gaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggacttcatggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtaccacctatatcaacaagatgcat-t 35871736  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |    
T  35871737 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctatcggaaagtttcccggtaaacg 35871836  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  35871837 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagtcggcaatcctgaaag 35871905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 51 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23350515 - 23350128
Alignment:
Q  51 agtgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacat 150  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23350515 agtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgctcgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacat 23350416  T
Q  151 cggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 250  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23350415 cggaatgagagagatcttgaggccgtacaggtaggggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtacttcctatatcaacaagatgcat 23350316  T
Q  251 cttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaag 350  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||    
T  23350315 cttcttttcggtagctccttccataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatggatgacctaccgagaagtttctctgtaag 23350216  T
Q  351 tgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
     ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  23350215 cgtgtgagtgaggacaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaattctgaaagcagtctggggtgttaca 23350128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 52 - 438
Target Start/End: Original strand, 49998545 - 49998931
Alignment:
Q  52 gtgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 151  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||  | | |||||||||||| |||| |||||||| | || |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  49998545 gtgtaacgcctccccttggtgggcatgtaaagctcaaggctgatgagggcggggagtggtccagctcttggcatgcttctagacaaaactaaatcacatc 49998644  T
Q  152 ggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 251  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49998645 ggaatgagagggatcctaaggctgtgtaggcatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 49998744  T
Q  252 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagt 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49998745 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagt 49998844  T
Q  352 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||    
T  49998845 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggacagtcggcaattctgaaagcagtttggggtgttaca 49998931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 44471555 - 44471170
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44471555 tgtaacacctctgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctagcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcg 44471456  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44471455 gaatgagagagatcttgaggccgtacaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 44471356  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  44471355 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgatttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaaatttcccggtaagcg 44471256  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||| || |||| |||||||    
T  44471255 ggcgagtgaggacaaaacatgctggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaattcttaaagtcgtttggggtgttaca 44471170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 44471080 - 44470720
Alignment:
Q  77 tgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgt 176  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||    
T  44471080 tgtaacgcccgaggctaatgagggcggggagtggtccggctcctagcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagagatcatgacgctgt 44470981  T
Q  177 acatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataa 276  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  44470980 acaagtatgtgactgtatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctgttcg-taactcattccataa 44470882  T
Q  277 gaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44470881 gaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatggttgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctg 44470782  T
Q  377 aaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| || ||||| ||||||| |||||||    
T  44470781 gaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcaacaattcttaaagtcgtctggggtgttaca 44470720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 159 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 7678746 - 7678466
Alignment:
Q  159 gagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttt 258  Q
    |||||||| ||||||| |  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7678746 gagggatcttgaggccttgtaggtatggggctacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttt 7678647  T
Q  259 cggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgag 358  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7678646 cggtagcttattccataagaactccacagttaagtgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgag 7678547  T
Q  359 tgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacag 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7678546 tgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgtaggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttacag 7678466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 50398679 - 50398383
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50398679 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtataggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 50398580  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  50398579 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccatagttaagcgtgcttgacttggagtattcttatgatgggtgacctaccgggaagttt 50398480  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  50398479 accggtaagcgtgcgagtgaggacaaaatacactggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgagatgttaca 50398383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 24629574 - 24629281
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24629574 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggtcgtgtaggtatgggactgcatggttaaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 24629475  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  24629474 aagatgcatcttcttttcggtacctcgttccataagaattccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa---a 24629378  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  24629377 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttagtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgtgatgttaca 24629281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 142 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12692140 - 12691907
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12692140 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 12692041  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12692040 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactgggaagttt 12691941  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgct 375  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12691940 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgct 12691907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 1645890 - 1645594
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1645890 gaatcacatcggaatgagaggaatcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtattacctatatcaac 1645791  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||| ||||||||    
T  1645790 aagatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccaggaagttt 1645691  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |   ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  1645690 ctttgtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagttggcaatgcttaaagtcgtatgggatgttaca 1645594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 76 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 14572357 - 14572007
Alignment:
Q  76 atgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccg 175  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||| |||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14572357 atgtaacgcccaaggctgatgagggcggggagtggtccggctcttggcatgcatctagaaaaatatgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggcca 14572258  T
Q  176 tacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccata 275  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||||    
T  14572257 tgtaggtatgggactacatggttgaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc-tttcggtagcctaaaccata 14572159  T
Q  276 agaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgct 375  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  14572158 agaactccaca---aagcgtgcttgacttagagcaattttgagatgggtgaccttctgggaagtttctcggaaagcgtgtgagtgaggacaaaacacggt 14572062  T
Q  376 gaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctggg 430  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  14572061 gaaaagactcgtgttggtttgcggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatggg 14572007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 50399134 - 50398839
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50399134 gaatcacatcggaatgagagggatcctgagaccgtgtaggtatgagattacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 50399035  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||| |  ||    
T  50399034 acgatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagtattcttatgatgggtgacctaccgggga-att 50398936  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  50398935 cccggtaaacgtgcaagtgaggacaaaacacgttggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 50398839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 4128030 - 4127739
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | | ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4128030 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggcatgagactatatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 4127931  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  4127930 aagatgcatcttcttttcggtagccaattccataagaacttcagagttaagcgtgcttggcttagagcaattttgggatgggtgacctaccgaaaagttt 4127831  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  4127830 tccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgg-----gtcggcaatcttgaaagcagtctgggatgttaca 4127739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 192 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23943333 - 23943087
Alignment:
Q  192 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaa 291  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23943333 catggttgaaggaagacttataaaaaatatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagcacattccataagaactccacagttaa 23943234  T
Q  292 gcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttg 391  Q
    ||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23943233 gcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgaccaaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttg 23943134  T
Q  392 gtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  23943133 gtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 23943087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 4127578 - 4127263
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4127578 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgggactacatagttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 4127479  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagtt-------------------aagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgg 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   |||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  4127478 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttccataagaactccacagttaagcatgattggcttggagcaattttgggatgg 4127379  T
Q  323 gtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagt 422  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  4127378 gtgagctatcgggaagtttcccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagc 4127279  T
Q  423 agtctgggatgttaca 438  Q
    ||| | | ||||||||    
T  4127278 agtttagaatgttaca 4127263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 142 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 9423999 - 9423699
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9423999 gaatcacaccggaatgagagggatcctgaggtcgtgcatgtatgggactgcatggttgaaagaaggcttataataattgtttggtactacctatatcaac 9423900  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||| | | || ||||||||||||||||||||| |||    
T  9423899 aagatgcatcttctttctagtagcccattccataagaatttcacaattaagtgtgcttgaattggagtagtcttaggatgggtgacctaccgggaaattt 9423800  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacagaa 441  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| || ||||||||| |||||  | |||||||||||||||    
T  9423799 cccgttaagcatgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtgtgtacggtccgttggcaatgcttaaagtcatttgggatgttacagaa 9423700  T
Q  442 t 442  Q
    |    
T  9423699 t 9423699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 51331422 - 51331128
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51331422 gaatcacatcggaatgagaggaatcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctatatcaac 51331323  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||| |||    
T  51331322 aagatacatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtattcttatgatgggtgacctaccgggaaattt 51331223  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
      || |||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  51331222 -tcgataagcgtgcgaatgaggacaaaacacactg-aaagactcgtattagtttgtagggtcagtcggcaatcctaaaagtagtctaggatgttaca 51331128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 21067281 - 21067577
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  21067281 gaatcacaccggaatgagagggatcccgaggtcgtgcatgtatgagactgcatggttgaaggaagactaataataattatttggtactacatatatcaac 21067380  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | | || ||| |||||||||||||| ||||||    
T  21067381 aagatgcatcttctttccggtagctcattctaaaagtactccacaattaagcgtgcttgacttggagtagtctttggaggggtgacctaccggaaagttt 21067480  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21067481 ctcggtaagcgtgcgagtggggacaaaacacactgaaaagactcgtgttagtttgttgggtcagtccacaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 21067577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 3169205 - 3169501
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3169205 gaatcacatcggaatgagaggaatcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataaaaattgtttggtactacctatatcaac 3169304  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||||||| | ||||||    
T  3169305 aagatgcatcttctttttggtaacccaatccataagaactccacacttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgagtgacctaccagaaagttt 3169404  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| |||| ||||| ||||    
T  3169405 cttggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaatactcgtgttggtttgtagggtcagttggcaatacttaaagtcgtctaggatgctaca 3169501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23942930 - 23942634
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23942930 gaatcacatcggaatgagagggatcctggggccgtgtaggtatggaactacatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 23942831  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||| ||||||||||| ||||||    
T  23942830 aagatgcatcttcttttttgtagcacattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatggatgacctaccggaaagttt 23942731  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||   |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||   ||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  23942730 ccaaataagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaggacccgtgttggtttgtaggaatagtcaacaatgcttaaagttgtatgggatgttaca 23942634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Original strand, 13266002 - 13266381
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||      |||||||||  | ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||      
T  13266002 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgctcgaggctggtgaggg-----agtggtccgacttctggcaa-cttctgggcaaaattgaatcacatta 13266095  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    |||||||||||||| | | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13266096 gaatgagagggatcttaaagccgtgcaggtatgggaatgcatggttgaaggaaggcttataataattttttagtactccctatatcaataagatgcatct 13266195  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    | ||||||||||| ||   || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||   ||||||||| |||  |||||    
T  13266196 tattttcggtagcccaaatcacaagaaccccacagttaagcgtgcttgactttgagaaattttaggatgggtgaccttttgggaagttttccgaaaagtg 13266295  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  13266296 tgcgagtgaggagaaaacatgttgaaaagacttgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaagcagtatgggatgttaca 13266381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 53 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 27578683 - 27578319
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||     
T  27578683 tgtaacacctccgcttggtgggcatgtaacactcgaggctgatgagggcggggagcggtccggctcctggca-gcttctaggcaaaaccgaatcatatca 27578585  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    |||||||| ||   |||| | |||  | || || |||||  |||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27578584 gaatgagatgg---ctgaagtcgtggaggtgtgagactgtgtggttgaatgatggtttataagaattatttggtgctacctatatcaacaagatgcatct 27578488  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| | ||||||||| |||  ||| |    
T  27578487 tcttttcggtatcccaaaccataagaactccatagttaagcgtgcttgacttcgaacaattttgggatgagcgaccttctgggaagttttccgacaagcg 27578388  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaag 421  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||||    
T  27578387 tgcgagtgaggacaaaacacgcagaaaagactcgtgatggtttgtgggatcagtcaacaatcctgaaag 27578319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 53 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 15306326 - 15306052
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||     
T  15306326 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcgaggagtggtctggctcctggca-gcttctaggcaaaacagaaccacatca 15306228  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattg------tttggtactacctatatcaacaagat 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||| |||      ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15306227 gaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactacatggtcgaaagaagacttataagatttgagcaattttggtactacctatataaacaagat 15306128  T
Q  247 gcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgg 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15306127 gcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaatcttgggatgg 15306052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 142 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24629121 - 24628910
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaa---ggcttataagaattgtttggtactacctatatc 238  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24629121 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgtaggtatgggactgcatggttaaaggaattaggcttataagaattgtttggtactacctatatc 24629022  T
Q  239 aacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaag 338  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24629021 aacaagatgcatcttcttttcagtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgcgaaa 24628922  T
Q  339 tttcccggtaag 350  Q
    |||| |||||||    
T  24628921 tttctcggtaag 24628910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 209 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 50814899 - 50814730
Alignment:
Q  209 ttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggag 308  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50814899 ttataagaattgtttggtactatctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggag 50814800  T
Q  309 caattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 378  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  50814799 caattttgggatggatgacctaccgggaagtttcccggtaaacgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 50814730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 164 - 439
Target Start/End: Original strand, 21067755 - 21068027
Alignment:
Q  164 atcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggta 263  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||   ||||    
T  21067755 atcccgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaagatacattttttt---ggta 21067851  T
Q  264 gctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgagg 363  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  21067852 gtccattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttgaagtagtctttggatgggtgacctaccgggaagtttaccggtaaacgtgcgagtgagg 21067951  T
Q  364 acaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacag 439  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  21067952 acaaaacacactgaaaaaattcgtgttggtttgtaggcttagtcggcaatgcttaaagtcatctgggatgttacag 21068027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 142 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 31817993 - 31817707
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  31817993 gaatcacatcggaataagagggattatgaggtcatgcatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttcggtactacctataccaac 31817894  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||| ||||| | | |||||||    
T  31817893 aagatgcatcttcttttcggtagtccatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttgtagtagttttaggatgggcgaccttcggtgaagttt 31817794  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgg 429  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||||| || | || || |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  31817793 cgcggaaagcgtgcgagtgaggacaaatcatgttg-aatgactcgtgttggtttgagggatcagtcagcaatcctgaaagcagtctgg 31817707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 137 - 438
Target Start/End: Original strand, 14351789 - 14352090
Alignment:
Q  137 aaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 236  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||    
T  14351789 aaaccgaatcacaccagaatgagagggatcctgaggtcgtgcatgtatgagtctgcatggttgaaggaaggcttgtaagagttttttggtactatctata 14351888  T
Q  237 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggga 336  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | | || |||||| |||||||| |  |    
T  14351889 tcaacaagatgcatcttctttttggtatcctattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttcgagtagtctttggatggatgacctactgcaa 14351988  T
Q  337 agtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgtta 436  Q
    ||||| || ||||| |||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  14351989 agttttccagtaagcgtgcaagtgaagacaaaatatgctgaaaagactcatgttggtttgtatggtcagtcagcaatgcttaaagtcgtatgggatgtta 14352088  T
Q  437 ca 438  Q
    ||    
T  14352089 ca 14352090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 142 - 436
Target Start/End: Original strand, 1464146 - 1464439
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || | ||||  | ||||| || | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1464146 gaatcacatcagaatgagagggatcatgcgaccgtgtaggtatgagaatacatagttgaaagaaaacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 1464245  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  1464246 aagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaacttcacaatttagcgtgcttaacttggagcaattttgggatgggtgaccttctgagaagttt 1464345  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgtta 436  Q
     ||   ||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||  ||| || |||| ||||||||||||||    
T  1464346 tccaaaaaacgtgcgagttaggacacaacacgctgaaaa-actcgtgttgatttgtggggtcggtcgataatcctaaaagcagtctgggatgtta 1464439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 76 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 14571928 - 14571702
Alignment:
Q  76 atgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccg 175  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||    
T  14571928 atgtaacacccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcttggttctaggaaaaactgaatcacatcataatgaaagggatcttgagtccg 14571829  T
Q  176 tacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccata 275  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||    
T  14571828 tgtaggtatgggacttcatggttgaagggatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagcctaaaccata 14571729  T
Q  276 agaactccacagttaagcgtgcttgac 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  14571728 agaactccacagttaagcgtgcttgac 14571702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 117 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 8467963 - 8467690
Alignment:
Q  117 tcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataaga 216  Q
    |||||||| ||||||||||||  | ||| |||||| |||||| |||||||||||| | || || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8467963 tcctggca-gcttctaggcaa--ccgaaccacatcagaatgaaagggatcctgagactgtgcaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataaga 8467867  T
Q  217 attgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttg 316  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  8467866 attgtttggtactacctataccaacaagatgcatcttcttttcggtagccc--------agaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt-- 8467777  T
Q  317 ggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagt 406  Q
       ||||||||||   |||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8467776 ---tgggtgaccttatgggaagtttctcggaaagcatgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagt 8467690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 54 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 27579137 - 27578754
Alignment:
Q  54 gtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcgg 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||| |||||  ||| |||||||||  || || || ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27579137 gtaacgccttcgtttggtgggcatgtaatgctcgaggctggtgagggtggggagtggtccgactcttgaca-gcttctaggtaaaaccgaatcacatcgg 27579039  T
Q  154 aatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 253  Q
    ||| ||||||||| | | | |||  | |||||  ||| | |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||    
T  27579038 aataagagggatcttaaagtcgtgtaggtatgacactacttggttgactgaagacttataagaattgtttggtactacatatatcaattagacacatctt 27578939  T
Q  254 cttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgt 353  Q
    |||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||| ||    
T  27578938 cttttcagtagccctatccataagaactacacagttaagcgtgcttaacttggagcgattttgggatgcgtgaccttctgggaagtttcccagaaagcgt 27578839  T
Q  354 gcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||  ||| || || || ||||| |||||||||    
T  27578838 gcgagtgaggacaaatcatgctgaaaagacttgtgttgatttgtagggtcaatcgagaatacttaatgtcgtctgagatgttaca 27578754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 142 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 29628808 - 29628498
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29628808 gaatcacatcgaaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 29628709  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa---- 337  Q
    ||||||  |||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | || ||||||||||| |||||||||        
T  29628708 aagatgtgtctt-tgtttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagtagtctttggatgggtgacttaccgggaaactc 29628610  T
Q  338 ----------gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtct 427  Q
              ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||  |||| ||||    
T  29628609 cagaaagtttgtttcccagtaagtgtacgagtgaggataaaatacgctgaaaaaactcgtgttgatttgtaggatcagtcggcaatgctttaagtcgtct 29628510  T
Q  428 gggatgttacag 439  Q
    || |||||||||    
T  29628509 ggaatgttacag 29628498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 192 - 420
Target Start/End: Original strand, 17628560 - 17628788
Alignment:
Q  192 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaa 291  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| ||||||||| |    
T  17628560 catggttgaaggtaggcttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatgcatcttcttttcgatagcccaacccataagaattccacagttga 17628659  T
Q  292 gcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttg 391  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| |||||   ||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  17628660 gcgtgcctgacttggagcaattttgagatgggtgaccttctaggaagattcccataaagcgtgtgagtgaggacaaaacacactggaaagacttgtgttg 17628759  T
Q  392 gtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaa 420  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17628760 gtatgtggagtcagtcggcaatcctgaaa 17628788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 137 - 406
Target Start/End: Original strand, 27026498 - 27026765
Alignment:
Q  137 aaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 236  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||  || | | || || |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27026498 aaaccgaatcacatcagaatgagagggatattg-gacggtgcaggtatgggactacacgattgaaggaaggcttataagaattgtttgatactacctata 27026596  T
Q  237 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggga 336  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  |||    
T  27026597 tcaacaagatgcatcttttttt-ggtagcccattccataagaactacgtagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttgggaagggtgaccttctagga 27026695  T
Q  337 agtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagt 406  Q
    ||||| ||   ||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27026696 agtttaccaaaaagcgtgtgactgaggaaaaaacacgctgaaaagactcgtgtttgtttgtggggccagt 27026765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 126 - 438
Target Start/End: Original strand, 17028858 - 17029169
Alignment:
Q  126 gcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgg 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||| ||    
T  17028858 gcttctaggcaaa-ctgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagccttgcatgtatgggactgcatagttgaaggaggatttgtaagaattgttagg 17028956  T
Q  226 tactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtg 325  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  17028957 tgctacctatatcaacaagatgcgtcttattttacctagcttattccataagaacttcatagttaagagtgcttgacttggagcaatttcgggatgggta 17029056  T
Q  326 acctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagt 425  Q
    | ||   |||||||||| ||  |||||||| | |||||| |||||| | ||||||||||  |||||||||    ||||| ||||||||  | |||||  |    
T  17029057 aacttatgggaagtttctcgaaaagtgtgctaatgaggagaaaacatgttgaaaagacttctgttggtttacatggtcaatcggcaataattaaagtcat 17029156  T
Q  426 ctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||||    
T  17029157 ctgggatgttaca 17029169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 142 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21220472 - 21220271
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |  | |||||  |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21220472 gaatcacatcagaatgagagggatcatgaggccatgtaggtatgaaactatatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 21220373  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  21220372 aagatgcatcttctttttggtaactcattctataagaactacacagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgggacgggtgaccta-ctggaagttt 21220274  T
Q  342 ccc 344  Q
    |||    
T  21220273 ccc 21220271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 53 - 409
Target Start/End: Original strand, 41869830 - 41870184
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| | | |||||| ||| |  |||| ||||| ||  |||||  | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  41869830 tgtaacgcctccgcttggtggacatgtaacgctcaaggctggtgacgggggga-gtggtacgtctcctgtaa-gcttctaggcaaaactaaatcacatcg 41869927  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    || |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  41869928 gagtgagagggatcctgagactgtacatatatgggactgcatgattgaaggaagacttataagaattgtatgatactacctatatcaacaagacgcatct 41870027  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    ||||||| ||| | ||   |||||||||| |||| ||| || || ||||| | |||||||||||||||||  ||||| | |  ||||||  ||  ||| |    
T  41870028 tcttttcagtaacccaaatcataagaacttcacaattatgcatgtttgacatagagcaattttgggatggaagaccttctgaaaagtttttcgaaaagcg 41870127  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgg 409  Q
    ||  || || |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  41870128 tgtaagggatgacagaacacgctgaaaagactcgtgtttatttgtggggttagtcgg 41870184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 136 - 383
Target Start/End: Original strand, 17029323 - 17029570
Alignment:
Q  136 aaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctat 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| || |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  17029323 aaaactgaattacatcggaatgagagggatctagaggtcgtgcaagtatgggactgcatagttgaatgaagacttgtaataattgtttagtactacctat 17029422  T
Q  236 atcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggg 335  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| | |||    
T  17029423 atcaacaagatgcatattacttttggtaccttattccataagaactccacagttaagagtgcttaacttggagcatttttgggttgggtgaccttctggg 17029522  T
Q  336 aagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagac 383  Q
    ||||||||| | ||| | || | ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  17029523 aagtttcccagaaagcgggcaaatgacgacaaaacatgctaaaaagac 17029570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 142 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 53996256 - 53995978
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  |  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53996256 gaatcacatcggaatgagaaggatcctgaggctatgtagatatgggactacatggttgaaggaatgcttataaaaattgtttggtactacctatatcaac 53996157  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||  |||  | ||||           ||    
T  53996156 aagattcatcttctttttggtatctcattccataagaactccacagttaagtgtgcttgacttggagtagtctttagatatgcgacc-----------tt 53996068  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgtt 435  Q
    |||| |||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| | ||||| |||| |||||||    
T  53996067 cccgataagtgtgc----gaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtggacaatgtttaaagtcgtctcggatgtt 53995978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 271 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 14571700 - 14571545
Alignment:
Q  271 ccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaac 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14571700 ccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttcgagatgggtgatcttttgggaagtttctcggaaagtgtgtgagtgaggacaaaac 14571601  T
Q  371 acgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtc 426  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  14571600 acgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgggaatcctgaaagcagtc 14571545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 137 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13614043 - 13613786
Alignment:
Q  137 aaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 236  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||  || |||| ||| |||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  13614043 aaaccgaatcacaatggaatgagagggatccagaggttgtgcatgcatgagactccatggtagaaggagtacttataagaattgtttgataccacctata 13613944  T
Q  237 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggga 336  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | | || ||||||||||| | | | ||    
T  13613943 tcaacaagatgcatcttc-tttcggtagttcattctataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggactagtctttggatgggtgacgttctgaga 13613845  T
Q  337 agtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggttt 395  Q
    ||||| | |  |||  | |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  13613844 agttttctgaaaagccttcgagtgaggacaaagcacgctgtaaagactcatgttggttt 13613786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 148 - 422
Target Start/End: Original strand, 33764865 - 33765139
Alignment:
Q  148 catcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatg 247  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | |||| | |||||  |||| |||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33764865 catcagaatgtgagggatcctgggaccgtgcgtgtataagactacatggttggatgaagacttttaagaattgtttggtgctacctataccaacaagatg 33764964  T
Q  248 catcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggt 347  Q
    |||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |  |||  |||  |       
T  33764965 catcttcttttttgtagctcattttataagaacttcacacttaagcgtgcttgatttggatcaattttgggatgggtgactttctaggagttttttcaaa 33765064  T
Q  348 aagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagt 422  Q
    |||  || ||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||    
T  33765065 aagcatgtgagcgaggtcaaaacacactaaaaagactcgtgttggtttgtgaggtcaatcgacaatgcttaaagt 33765139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 145 - 438
Target Start/End: Original strand, 4185717 - 4186008
Alignment:
Q  145 tcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaag 244  Q
    |||||||  |||||||||| || ||||||| | || ||||| ||| |||||||| ||||||  | ||||||||||||||| ||| || |||| |||||||    
T  4185717 tcacatcaaaatgagagggttcatgaggccatgcaggtatgagacggcatggttaaaggaatacatataagaattgtttgataccacatataccaacaag 4185816  T
Q  245 atgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttccc 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||| |||| |    
T  4185817 atgcatcttctttttggtagctcattctacaagaactctacagttaagtatgcttgacttggagcaattttgggataggtgaccttatgcgaaatttctc 4185916  T
Q  345 ggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |  ||| ||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||| |||||||||  |||| || |||||  | ||||||||||||    
T  4185917 gaaaagcgtgtgaatgaggacaaaacacactaaaaagact-gtgttaatttgt-gggtcagtcaacaatacttaaagtcatttgggatgttaca 4186008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 255 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 27578314 - 27578134
Alignment:
Q  255 ttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtg 354  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||| | ||  |||    
T  27578314 ttttcggtagcccaaactataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcagttttgggatgagtgaccttatgggaagtttccctgaaaacgtg 27578215  T
Q  355 cgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27578214 cgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgggttgtagg---agtcggtaatcctgaaaggagtctgggatgttaca 27578134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 318 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 15268138 - 15268018
Alignment:
Q  318 gatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctg 417  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15268138 gatgggtgagctaccgggaaatttctcggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctg 15268039  T
Q  418 aaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||| ||||| || |||||||    
T  15268038 aaagcagtctcggctgttaca 15268018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 142 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 31817539 - 31817376
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31817539 gaatcacatcgaaataagagggatcatgaggtcgtgcatgtatgagacttcatggttgaaggaacgtttataataattgtttggtactacctataccaac 31817440  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttg 305  Q
    || ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  31817439 aaaatgcatcttcttttccgcagcccattccttaagaactctacaattaagcgtgtttgacttg 31817376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 281 - 438
Target Start/End: Original strand, 40607069 - 40607226
Alignment:
Q  281 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaa 380  Q
    |||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  40607069 tccatagttaaacgtgtttgatttggagcaaatttgggatgggtgacctaccggaaagtttatcggtaagcgttcgagtgaggacaaaatacgctgaaaa 40607168  T
Q  381 gactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
     |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  40607169 aactcgtgttgatttgtggaatcagtcggcaatgcttaaggtcgtctgggatgttaca 40607226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 137 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 52048813 - 52048547
Alignment:
Q  137 aaactgaat-cacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctat 235  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||    
T  52048813 aaactgaattcacgtcggaatgagagggttcctaaggccgtacaggtatgaaactgcatagctgaaggaaaatttataagaattgtttgatactacgtat 52048714  T
Q  236 atcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggg 335  Q
    |  |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||  ||||| |||||| |  ||    
T  52048713 actaacaagatgcatcttcattt-tgtaagtcattccataagaactccacagttaa---------acttggagcaatttt-agatggatgaccttctagg 52048625  T
Q  336 aagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 413  Q
    ||||||| ||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||| ||||    
T  52048624 aagtttctcgaaaagagtgcaagtgaggacaaaacacgctgaaaagattcatgttggtttgtgagatcagtcgacaat 52048547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 203 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 20306241 - 20306063
Alignment:
Q  203 gaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgac 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||| |||| | |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20306241 gaaggcttataagaattgtttggtactatctatatcaacaagatgca---tctttttggtatcccatttcataagaactacacggttaagcgtgcttgac 20306145  T
Q  303 ttggagcaattttgggatgggtgacctac--cgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaaga 382  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||    ||||||||||||  ||  |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  20306144 ttggagcaatttttagatgggtgccctactataggaagtttcccgaaaaacgtgcaagtgaggacaaaacactctgaaaaga 20306063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 204 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 23091590 - 23091358
Alignment:
Q  204 aaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgact 303  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23091590 aaggcgtataaaaattgtttggtactacatatattaacaagatgcatcttctttctggtagcttattctataaaaactccacagttaagcatgcttgact 23091491  T
Q  304 tggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaag-tttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt-gggg 401  Q
    || ||||||||||||||||||||  |   |||||| |||||||  ||  | || |||||||| |||||||||| |||| ||| ||||| |||| | ||||    
T  23091490 tgtagcaattttgggatgggtgatattttgggaagttttcccgaaaaacgggcaagtgaggataaaacacgctaaaaaaactagtgttagtttatggggg 23091391  T
Q  402 tcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgt 434  Q
    |||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||    
T  23091390 tcagtcggcaaccctgaaagcagtttggtatgt 23091358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 197 - 300
Target Start/End: Original strand, 27029331 - 27029434
Alignment:
Q  197 ttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtg 296  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27029331 ttgaaggaagacttataagaattatttggtactacttatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccacagttaagtgtg 27029430  T
Q  297 cttg 300  Q
    ||||    
T  27029431 cttg 27029434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 325 - 438
Target Start/End: Original strand, 7381449 - 7381562
Alignment:
Q  325 gacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtag 424  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |    
T  7381449 gacctaccgagaagttttccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagacccgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcg 7381548  T
Q  425 tctgggatgttaca 438  Q
    | ||||||||||||    
T  7381549 tatgggatgttaca 7381562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 154 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 43929092 - 43928927
Alignment:
Q  154 aatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 253  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||   |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43929092 aatgagagggttcctgaagccgtgcaggtatgagactatttggtcgaaggaaagcttacaagaattgtttggtactacatataccaacaagatgcatctt 43928993  T
Q  254 cttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggat 320  Q
    ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  43928992 ctttttggtag-ttatttcataagaaatccacaattaaacgtgcttgactttgagcaattttgggat 43928927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 23976357 - 23976094
Alignment:
Q  145 tcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaag 244  Q
    |||||||| |||||||||  ||||| |||| |  | ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  23976357 tcacatcgaaatgagaggtttcctggggccatgtaggtatgggtctgcatgattgaaggaagagttataagaattgtttggtactacctatactaacaag 23976258  T
Q  245 atgcatcttc-ttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcc 343  Q
    |||||||||| ||||   ||||  |   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||   | || ||||||    
T  23976257 atgcatcttcttttttcatagccaaaatcataaaaactccacagttaaacgtgcttgacttggaataattttgggatgagtgagcttatgtgatgtttcc 23976158  T
Q  344 cggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtc 407  Q
    |   ||   ||||  |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  23976157 caaaaaacatgcggctgaggaaaaaacacgctgaaaagactaatgttggtttatggggtcagtc 23976094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 338 - 438
Target Start/End: Original strand, 35477855 - 35477955
Alignment:
Q  338 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttac 437  Q
    ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  35477855 gtttctcggtaaacgtgcgagagaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatgggatgttac 35477954  T
Q  438 a 438  Q
    |    
T  35477955 a 35477955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 259 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 11828509 - 11828396
Alignment:
Q  259 cggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgag 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | || || ||||||   || ||||||||    
T  11828509 cggtagctccttccataagaactccacagttaagcgtgctttacttggagcatttttgggatgggtgaccttctggaaaatttcccaaaaaatgtgcgag 11828410  T
Q  359 tgaggacaaaacac 372  Q
    ||||| ||||||||    
T  11828409 tgagggcaaaacac 11828396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 271 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 53854859 - 53854702
Alignment:
Q  271 ccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaac 370  Q
    |||||||||||||| |||||||| || | |||||| || | |||| ||||| ||||||||||   |||||| |||||||  |||||||||| |||||||     
T  53854859 ccataagaactccatagttaagcatgttagacttgaagtagtttttggatgtgtgacctaccaaaaagtttaccggtaaacgtgcgagtgatgacaaaat 53854760  T
Q  371 acgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctg 428  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  53854759 acgttgaaaagactcgtgttgatttgtagggttagtcggcaatgcttaaagtcgtctg 53854702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 321
Target Start/End: Original strand, 17628951 - 17629145
Alignment:
Q  126 gcttctaggcaaaactgaatc-acatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttg 224  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| ||| || ||||| || || |||||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  17628951 gcttctaggcaaatc-gaatccacatcagaatgagtgggatcctaaggtcgtgcaggtatgtgaatgtatggttgaataaaaacttataagaattgtttg 17629049  T
Q  225 gtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatg 321  Q
    ||||||||||||  || ||||||| |||||||||  | ||| || |||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17629050 gtactacctatactaataagatgcctcttctttttagaagcccaatccaaaagaattccaca-ttaagcatgcttgacttggagcaattttgagatg 17629145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26200444 - 26200205
Alignment:
Q  126 gcttctaggcaaaactgaat-cacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaag--gcttataagaattgtt 222  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    ||  | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  26200444 gcttctaggcaaa-ctgaattcacatcagaatgagagggatcctgatattgtgtaggtatgggacatcatggttgaaggaagaggcttataacaattgtt 26200346  T
Q  223 tggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgg 322  Q
    || ||||| |||||  |||||||||||| ||||||  ||||||  |  |||||||||||  |||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26200345 tgatactaactatacaaacaagatgcatattctttgtggtagccgaaaccataagaacttaaca--------tgcttgacttggagcaattttgggatgg 26200254  T
Q  323 gtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaaca 371  Q
    ||||||| | | |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||    
T  26200253 gtgaccttcagcgaagtttcacgaaaagcgtgtgagtgaggacaaaaca 26200205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 338 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4414332 - 4414238
Alignment:
Q  338 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggat 432  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  4414332 gtttcctggtaagcgtgcgagtcaggacaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtatgggat 4414238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 460 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 18418542 - 18418452
Alignment:
Q  460 aagattcatgtcccaacagcccctgcgacaaatcacaacaagcattttaagccctttcgagcccaatagaacccgcacaccgcgaaccaca 550  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  18418542 aagattcatgtaccaaaagcccatgcgacaaatcacaacaagtattttcagccctttcgagcccaacagaccccgcacaccgcgaaccaca 18418452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 411
Target Start/End: Original strand, 42838628 - 42838894
Alignment:
Q  147 acatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagat 246  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| | ||  | ||||| |||| ||| ||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42838628 acatcagaatgagagg-atcctgagactgtgtaagtatgagactacatagttcaaggaagacgtataaaaattgtttggtactacctatatcaacaaaat 42838726  T
Q  247 gcatctt--cttttcggtagctcattccataagaac-tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcc 343  Q
    |||||||   |||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| || ||||  ||| |||| |||||| |    ||||||||    
T  42838727 gcatctttctttttcgatagttcattccataagaactttcacagttaagcgtgtttgacttagaacaataatggaatggatgaccttctaaaaagtttcc 42838826  T
Q  344 cggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggca 411  Q
    | | |    ||  ||||  |||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  42838827 cagaagacatgtaagtgtagacaaaacacgctgaaaagatttgtgttgatttatggggtcggtcggca 42838894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 24271690 - 24271505
Alignment:
Q  145 tcacatcggaatgagagggatcctgaggccgta--catgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||||| |||| ||||||| ||| ||| | |||||||||| |||| |||||||||||  ||||    
T  24271690 tcacatcggaatgagagggttcctgaggtcgtgtgcaggtatgagactacatggttaaagtaagacatataagaattatttgatactacctatacgaaca 24271591  T
Q  243 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacct 329  Q
    |||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||  ||  ||| | ||||||| || || ||||||||||||| |||||||    
T  24271590 agatgcatatt-ttttgggtagcccattccataagaactctgcaaataaacatgcttgagttagaacaattttgggatgcgtgacct 24271505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 317 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31817104 - 31816983
Alignment:
Q  317 ggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgct 416  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||| ||    
T  31817104 ggatgggtgacattctgggaagtttcccagaaagcgtacgagtgaggacaaaacatgttgaaaagactcgtgctggtttgtggggccaatcgacaatcct 31817005  T
Q  417 gaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    || |||||| ||||||||||||    
T  31817004 gatagtagtatgggatgttaca 31816983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 291
Target Start/End: Original strand, 4186176 - 4186315
Alignment:
Q  152 ggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 251  Q
    |||||||||||| || | ||||| | || ||||| ||||  ||| || |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  4186176 ggaatgagagggttcgtaaggccatgcacgtatgagactaaatgtttaaaggaatgcttataagaatgatttggtactacctacatgaacaagattcatc 4186275  T
Q  252 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaa 291  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  4186276 ttctttttggtagcccattgcataagaactacacagttaa 4186315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 149 - 258
Target Start/End: Original strand, 45682209 - 45682318
Alignment:
Q  149 atcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgc 248  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| | ||| ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  45682209 atcggaatgagagagatcttgaggccatgcatatatgggactacatgattgaatgaaggtttataagaattatttggtattatctataccaacaagatgc 45682308  T
Q  249 atcttctttt 258  Q
    || |||||||    
T  45682309 attttctttt 45682318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 239 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 33294936 - 33294753
Alignment:
Q  239 aacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgac-ttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 337  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| || | |   || ||    
T  33294936 aacaaaatgcatcttcttttttgtagttcactccataagaactccacagtaaagcgtgctcgactttggaacaattttggaatggatgccattatggaaa 33294837  T
Q  338 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagt 422  Q
     |||| |   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||  |||| ||||||||    
T  33294836 atttctc-aaaagtgtgcaagtgagaacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgggttgtagcgtcaatctacaatcctgaaagt 33294753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 292
Target Start/End: Original strand, 44831046 - 44831146
Alignment:
Q  192 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaa 291  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||| || |||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||    
T  44831046 catggttgaagggaagcttataaaaattgtttggtactacctaaactaacaagatgtatattcttttcggtagcccatttcatatgaacttcacagttaa 44831145  T
Q  292 g 292  Q
    |    
T  44831146 g 44831146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 197 - 319
Target Start/End: Original strand, 34554483 - 34554605
Alignment:
Q  197 ttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtg 296  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||||| || |||||| | ||    
T  34554483 ttgaaagaatgcttataagaattgtttgacactacctataccagcaagatgcattttatttttggtagaccattccataagaacttcatagttaaacatg 34554582  T
Q  297 cttgacttggagcaattttggga 319  Q
     ||||||| ||| ||||||||||    
T  34554583 tttgacttagagaaattttggga 34554605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 373 - 439
Target Start/End: Original strand, 50399334 - 50399400
Alignment:
Q  373 gctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacag 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  50399334 gctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcgatgttacag 50399400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 53854948 - 53854858
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacc 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||  | ||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53854948 gaatcacatcggaatgagagggatcatgaagcagtgtaggtatgagactatatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacc 53854858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 366 - 438
Target Start/End: Original strand, 13265859 - 13265931
Alignment:
Q  366 aaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  13265859 aaaacacgctgaaaagactcgtgttagtttgtgcggtcagtcggtaatcctgaaagcagtctgagatgttaca 13265931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 356 - 438
Target Start/End: Original strand, 5810047 - 5810129
Alignment:
Q  356 gagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| || |||| ||| || |||||||||    
T  5810047 gagtgaggataaaacacgctgaaaagactcatgttgatttgtggggttagtcggcaatcctaaaagaagtatgagatgttaca 5810129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 277
Target Start/End: Original strand, 53391925 - 53392021
Alignment:
Q  181 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataag 277  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||  |||||||    
T  53391925 gtatgagactgcatggttgaagaaatgcttataaaaattgtttgataccatctatatcaacaagatacatatttttttcggtagttcagaccataag 53392021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 242
Target Start/End: Original strand, 17506389 - 17506484
Alignment:
Q  147 acatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| | | |||||||| || |||||| || || |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17506389 acatcagaatgagagggatcatgaggtcatgcatgtatgagagtgcatgattaaaagaagacttataagaattgtatagtactacctatatcaaca 17506484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2682779 - 2682707
Alignment:
Q  134 gcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaag 206  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| || |||||| ||||||||||    
T  2682779 gcaaaattgaatcacatcgaaatgagagggatcctgaaaccgtgcatgtatgtgattgcatgattgaaggaag 2682707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 218 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39902518 - 39902470
Alignment:
Q  218 ttgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagct 266  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39902518 ttgtttggtactatctatatcaacaagatgcatcttcttttcgatagct 39902470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 359 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 2499426 - 2499345
Alignment:
Q  359 tgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacaga 440  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||| | |||||||| || | ||| ||| |||||||||||||    
T  2499426 tgaggacaaaacacgttgaaaagacgcgtgttggtttgtacggttaatcggcaatacttagagttgtcagggatgttacaga 2499345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 214
Target Start/End: Original strand, 10165953 - 10166025
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataa 214  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||  | || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10165953 gaatcacatcggaatgagaaagatcatgaggcattgcaggtatgggactgcattgttgaatgaaggcttataa 10166025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20309722 - 20309594
Alignment:
Q  76 atgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccg 175  Q
    ||||||||||  ||||||| |||| |||| | ||||| || || || || |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |      
T  20309722 atgtaacaccaaaggctgacgagggcggggattggtctggctcatgaca-gcttctagg--aaaccgaatcacatcggaatgagagggatcatgagactt 20309626  T
Q  176 tacatgtatgggactgcatggttgaaggaagg 207  Q
    | || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20309625 tgcaggtatgtgactacatggttgaaggaagg 20309594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 195
Target Start/End: Original strand, 35477801 - 35477855
Alignment:
Q  141 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatg 195  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||    
T  35477801 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaggccgtgcaagtacgagactgcatg 35477855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 33987227 - 33987183
Alignment:
Q  126 gcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgag 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33987227 gcttctaggcaaa-ctgaatcacatcggaatgagagggatcatgag 33987183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2499727 - 2499647
Alignment:
Q  150 tcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtacta 230  Q
    |||||||||||||||| || |  |||| || ||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  2499727 tcggaatgagagggattctaaaaccgtgcaggtatgagacttcatggttgaagcaacacttataaaaattgtttggtacta 2499647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 381 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 8861981 - 8861929
Alignment:
Q  381 gactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatg 433  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  8861981 gactcatgtttgtttgtggggtcagtcggcaattatgaaagcagtctgggatg 8861929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 381 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 8864854 - 8864802
Alignment:
Q  381 gactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatg 433  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  8864854 gactcatgtttgtttgtggggtcagtcggcaattatgaaagcagtctgggatg 8864802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 350
Target Start/End: Original strand, 50399270 - 50399330
Alignment:
Q  290 aagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaag 350  Q
    |||||||| |||||||||| | | ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50399270 aagcgtgcctgacttggagtattcttatgatgggtgacctactgggaagtttcccggtaag 50399330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 436
Target Start/End: Original strand, 24194555 - 24194682
Alignment:
Q  309 caattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcg 408  Q
    |||||||||||| ||| || | |  ||||||||| ||| |||  ||||||| | ||||||| |||||||||| | |||||||  |||||||||| ||| |    
T  24194555 caattttgggattggtaactttcttggaagtttcgcggaaagaatgcgagttaagacaaaatacgctgaaaaaattcgtgttaatttgtggggttagttg 24194654  T
Q  409 gcaatgctgaaagtagtctgggatgtta 436  Q
     |||| ||||||||  ||||| ||||||    
T  24194655 ccaatactgaaagtcatctggaatgtta 24194682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 438
Target Start/End: Original strand, 10668381 - 10668426
Alignment:
Q  393 tttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  10668381 tttgtggggtcagtgggcaatcctgaaagcagtctggggtgttaca 10668426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 438
Target Start/End: Original strand, 10668887 - 10668932
Alignment:
Q  393 tttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  10668887 tttgtggggtcagttggcaatcctgaaagcagtctggggtgttaca 10668932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 438
Target Start/End: Original strand, 10882526 - 10882571
Alignment:
Q  393 tttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  10882526 tttgtggggtcagtgggcaatcctgaaagcagtctggggtgttaca 10882571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 112
Target Start/End: Original strand, 27029182 - 27029223
Alignment:
Q  71 tgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  27029182 tgggcatgtaacacccgaggctgacgagggcggggagtggtc 27029223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33987139 - 33987103
Alignment:
Q  187 gactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttt 223  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33987139 gactgcattgtttaaggaaggcttataagaattgttt 33987103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 357 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 39102888 - 39102832
Alignment:
Q  357 agtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 413  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  39102888 agtgaggacaaaacatgcgcaaaagattagtgttggtttgtgggctcagtcagcaat 39102832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 50398777 - 50398733
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||    
T  50398777 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 50398733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 248 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 52299902 - 52299826
Alignment:
Q  248 catcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggt 324  Q
    |||||||||||  |||||  |||| ||||||||| || |||||| | ||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  52299902 catcttcttttttgtagcctattcaataagaacttcatagttaaacatgcttgattttgagcaattttaggatgggt 52299826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 34308715 - 34308330
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34308715 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgataagggcggggagtggtccggctcctggcgtgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 34308616  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34308615 gaatgaaagggatcctgaggccgtacaagtatgagactgtatggttgaaggaaggcttataagaactgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 34308516  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  34308515 tcttttcggtagcctattccataagaactccacacttaagcgtgcttggcttggagcaattttgagatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagca 34308416  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  34308415 tgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgctggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 34308330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 34309175 - 34308786
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34309175 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcgaggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 34309076  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat----caacaagatgc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  34309075 gaatgagagggatcctgaggccgtacaagtatgagactgtatggttgaaggaaggcttataagaactgtttggtactacctatatatatcaacaagatgc 34308976  T
Q  249 atcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggta 348  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34308975 atcttcttttcggtagcctattccataagaactccacagttaagcgtgcttggcttggagcaattttgagatgggtgacctaccgggaagtttcccggta 34308876  T
Q  349 agtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  34308875 agcatgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcagcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 34308786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Original strand, 25147446 - 25147830
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25147446 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacactcgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcttggcatgcttctaggcaaaactaaatcacatcg 25147545  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||||| || | ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25147546 gaatgagagagatcctaagactgtgtaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaagatgcatct 25147645  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |    
T  25147646 tcttttcggtagctcattccataagaactccatagttaatcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcctgataagcg 25147745  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||    
T  25147746 tgcgagtgagtacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt-gggtcagtcggcaatcctgaaagcagtcttgggtgttaca 25147830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 53 - 435
Target Start/End: Original strand, 12100602 - 12100982
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12100602 tgtaacgcctccgctcggtgtgcatgtaacacccgaggctgatgagggcggggagtggtccgactcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcg 12100701  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
     ||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12100702 aaatgagaag-atcctgaggccgtacaggtatgagactgcatggttgaaggcaagcttataagatttgtttggtactacctatatcaataagatgcatct 12100800  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  12100801 tcttttcggtagctcatttcataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttt-ggatgggtgacctaccgggaagtttcctcgtaagcg 12100899  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgtt 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  12100900 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagtcgtatgggatgtt 12100982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 143 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22548695 - 22548400
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22548695 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggctgtgcaggtatgtgactgcatggttgaaggaagttttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 22548596  T
Q  243 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22548595 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataataactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 22548496  T
Q  343 ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  22548495 ccagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatgggatgttaca 22548400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 22026378 - 22026675
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22026378 gaatcacaccggaatgagagggttcgtgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaatgaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 22026477  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22026478 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatattgggatgggtaacctatcgggaagttt 22026577  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggac-aaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22026578 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 22026675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 27925898 - 27926193
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27925898 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggattataagaattgtttggtactacctatatcaac 27925997  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27925998 aagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaa-tttgggatgggtgaggtaccgggaagttt 27926096  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27926097 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 27926193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 148 - 438
Target Start/End: Original strand, 17103086 - 17103377
Alignment:
Q  148 catcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatg 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  17103086 catcggaatgagagagatcctgaggccgtacaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagctg 17103185  T
Q  248 catcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatggg-tgacctaccgggaagtttcccgg 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17103186 catcttcttttcggtagctcattccataagaactccacggttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggttgacctaccgggaagtttcccgg 17103285  T
Q  347 taagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||    
T  17103286 taagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagtcgtctgggatgttaca 17103377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22549142 - 22548846
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22549142 gaatcacaccggaatgagaggcttcctgaggctgtgcaggtatgtgactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 22549043  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22549042 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataaaaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 22548943  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  22548942 cccagtaagcgtgcgagtgaggataaaacacgctgaacagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatgggatgttaca 22548846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 142 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 41659252 - 41658973
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41659252 gaatcacaccggaatgagagggttcctgatgtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 41659153  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41659152 aagatgcatcttcttttcgatagctcattacataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgggataggtgacctaccgggaagttt 41659053  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaag 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41659052 ccctgtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaag 41658973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 68 - 438
Target Start/End: Original strand, 25147892 - 25148261
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcc 167  Q
    ||||||||||||||| | ||||  |||||||| |||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25147892 tggtgggcatgtaacgctcgagtatgatgagggcggggagtggtttggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacataagaatgagagggatcc 25147991  T
Q  168 tgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctc 267  Q
     |||| |||  | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25147992 cgaggtcgtgtaggtatgggactgtgtcgttgaaggaaggcttataagaattgtttggtcttacctatatcaacaagatgcatattcttttcggtagctc 25148091  T
Q  268 attccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| |||    
T  25148092 attccataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt-ccgataaacgtgcgagtgaggtcaa 25148190  T
Q  368 aacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||| || |||||||||    
T  25148191 aacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagcagtatgagatgttaca 25148261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 21316345 - 21315961
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| || |||||| |||| ||||||||||||    
T  21316345 tgtaacacctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggcttctggcaagcatctaggaaaaattgaatcacatcg 21316246  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
      |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||| || ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21316245 cgatgagagggatcctaaggccgtgcaggtatgagactgtatggttaaatgagcgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcg 21316146  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  21316145 tcttttcagtagctcatttcataagaactccacagttaagtgtgcttgacttggagtaattttggtaagggtgacctaccgcgaagttt-ccggtaagcg 21316047  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||    
T  21316046 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcaatcgacaatcctaaaagcagtctgggatgttaca 21315961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 12827401 - 12827105
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12827401 gaatcacgccggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtatgggactacttggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 12827302  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12827301 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 12827202  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  12827201 cccggtaagtgtgcgagtgaggttaaaacacttttaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 12827105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 146 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 10844758 - 10844466
Alignment:
Q  146 cacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaaga 245  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  10844758 cacaccggaatgagagggttcctgaggccttgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatattaacaaga 10844659  T
Q  246 tgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccg 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10844658 tgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttctcg 10844559  T
Q  346 gtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||    
T  10844558 gtaagcatgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgtttgtttgtagggtcagtcgacaatcctaaaagtcgtctgggatgttaca 10844466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 27022485 - 27022190
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27022485 gaatcacatcggaatgagagggatcttgaggccatgtaggtatgggactacatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 27022386  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  27022385 aacatgcatcttattttcggcagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactggaaagttt 27022286  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
       |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||    
T  27022285 -ttggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctaaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagcagtctgggatgttaca 27022190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 142 - 439
Target Start/End: Original strand, 2044057 - 2044354
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2044057 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgatactacctatatcaac 2044156  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||  |||||||||    
T  2044157 aagatgcattttctttttggtagcccattccataataactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaatgggaagttt 2044256  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacag 439  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  2044257 tccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtattggtttgtagggtcagtcaccaatgcttaaagtcgtttgggatgttacag 2044354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 138 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 8080493 - 8080194
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8080493 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaagctgataagaattgtttggtactacctatat 8080394  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 337  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| ||||||  ||||    
T  8080393 caacaagatgcattttctttttggtagcccattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtaacctactaggaa 8080294  T
Q  338 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttac 437  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  8080293 gtttctcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggccagtcgacaatgcttaaagtcgtct-ggatgttac 8080195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 32292396 - 32292699
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32292396 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaagtatgggactgcatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactatctatatcaac 32292495  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||| ||||||||||||||    
T  32292496 aagttgcatcttctttttgctagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgatctaccgggaagttt 32292595  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgg-------tttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgt 434  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  32292596 tccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtactttgtagggtcagtcggcaatcctaaaagcagtctgggatgt 32292695  T
Q  435 taca 438  Q
    ||||    
T  32292696 taca 32292699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 53 - 328
Target Start/End: Original strand, 25144682 - 25144957
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||| || ||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25144682 tgtaacacccccgcttggtaggcatgtaacgttcgaggctgatgagggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatca 25144781  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| ||||  |||| ||| || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25144782 gaatgagagagatctcgaggtcgtgcaggtatgggattgcatgattgaaggcaggcttataagaattgtttggtactacctatatcagcaagatgcatct 25144881  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25144882 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 25144957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 221 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31283719 - 31283503
Alignment:
Q  221 tttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggat 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  31283719 tttggtactacctatattaacaagatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccacagttaagtgtgcttgactttgagcaattttgg-at 31283621  T
Q  321 gggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaa 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31283620 gggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacgcgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgttgaaa 31283521  T
Q  421 gtagtctgggatgttaca 438  Q
    || |||||||||||||||    
T  31283520 gtcgtctgggatgttaca 31283503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 138 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 33852409 - 33852109
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33852409 aactgaatcacaccagaatgagagggatcccgagaccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacctatat 33852310  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 337  Q
     ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||| ||| ||    
T  33852309 taacaagatgtatcttctttttggtagcccattccataagaacttcacaattaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctatcggaaa 33852210  T
Q  338 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttac 437  Q
    |||||  | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||  |||||| | |||||||| ||||| |||  |||||||||    
T  33852209 gtttcatgataagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctaaaaagactcatgttgatttgtcaggtcagacagcaatgcttaaagttgtcacggatgttac 33852110  T
Q  438 a 438  Q
    |    
T  33852109 a 33852109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 50 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27819484 - 27819105
Alignment:
Q  50 tagtgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcaca 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||||||||   ||||||||||||  |||||| | |||| |||||||||| ||||||||    
T  27819484 tagtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaaggctcgaggttgatgagggtaggaagtggtccgactcctggaa-gcttttaggcaaaaccgaatcaca 27819386  T
Q  150 tcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgca 249  Q
    || |||||||||||||| ||| | | | || ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27819385 tcagaatgagagggatcatgaagtcatgcaagtatgagacttcatggttgaaggaaggctaataagaattgtttggtactacctatatcaacaaaatgca 27819286  T
Q  250 tcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaa 349  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| | | || ||||||||||||| | |  |||||| || | ||    
T  27819285 tcttcttttcaatagctcattccataaaaactccacagttaagtgtgtttgactttgagtagtatttggatgggtgaccttctgataagttttccagaaa 27819186  T
Q  350 gtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggat 432  Q
    | ||| |||||||||| || ||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| || |||| ||||| ||||    
T  27819185 gcgtgtgagtgaggac-aagcacactgaaaagacccgtgtt-gattgtggggtcagtcgacaatcctaaaagcagtctaggat 27819105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 142 - 303
Target Start/End: Original strand, 10844882 - 10845043
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10844882 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 10844981  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgact 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10844982 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgact 10845043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 139 - 433
Target Start/End: Original strand, 28453334 - 28453628
Alignment:
Q  139 actgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatc 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  28453334 actgaatcacaccggaatgagagggatcccgaggtcgtgcaggtatgagacttcatggttgaaagaaaacttataagaattgttttatactacctatatt 28453433  T
Q  239 aacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaag 338  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||| ||||||||  |||||    
T  28453434 aacaagatgcatcttctttatggtagcccattccataagaactctacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatggatgacctactcggaag 28453533  T
Q  339 tttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatg 433  Q
    |||||   ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||||||||    
T  28453534 tttcctaataagactgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagagtcgtgtttgtttgtaagatcagtcgacaatcctaaaagcagtctgggatg 28453628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 181 - 439
Target Start/End: Original strand, 41913008 - 41913266
Alignment:
Q  181 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 280  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  41913008 gtatgggactgcatgtttgaaagaaggcttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaagatgcgtcttctttttggtagcccattccataagaac 41913107  T
Q  281 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaa 380  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || | | || ||||| |||||||||  | |||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  41913108 tccgcagttaagcgtgcttgacttgaagtagtctttggatgagtgacctactagaaagtttcttggtaagcgtgcaagtgaggacaaaacacgttgaaaa 41913207  T
Q  381 gactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacag 439  Q
     ||||||||| |||| | |||||||||| ||||| | ||||| || ||  |||||||||    
T  41913208 aactcgtgttagtttatagggtcagtcgacaatgtttaaagtcgtttgcaatgttacag 41913266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 142 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 6465057 - 6464872
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6465057 gaatcacattggaatgagaggaatcatgaggccgtgtaggtatggaactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 6464958  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgac 327  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||    
T  6464957 aagatgcattttctttttggtagctcattccataacaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgac 6464872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 192 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15819112 - 15818876
Alignment:
Q  192 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaa 291  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15819112 catggttgaaggaatgcttagaaaaattgtttggtactacatatatcaacatgatgcatcttcttttcggtagcacattccataagaact-cacagttaa 15819014  T
Q  292 gcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttg 391  Q
       |||||||||||||| |   || ||||||| ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  15819013 atttgcttgacttggagtaggctttggatgggcgaccttctgggaagtttcccgaaaagtgtgcgagtgaggacaaagcacactgaaaagacttgtgttg 15818914  T
Q  392 gtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgg 429  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  15818913 gtttgtggggccagtcggcaatacttaaagtcgtctgg 15818876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 52 - 392
Target Start/End: Original strand, 22705089 - 22705424
Alignment:
Q  52 gtgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 151  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||           
T  22705089 gtgtaacgcctccgctcggtgggcatgtaacgctcgaggctgatgaggacggggagtggtcaggctcctggca-gcttcaaggcaaaaccgaa------- 22705180  T
Q  152 ggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 251  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  22705181 ggaatgagagggatcctgaagccgtgtaggtatgggactggatgattgaaggaagggttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgca-- 22705278  T
Q  252 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaat-tttg-------------ggatgggtgacctaccgggaa 337  Q
     |||||| |||| | |||||||||        ||||||||||||||||||||||||| | | ||||             ||| |||||||||||||||||    
T  22705279 -tctttttggtaacccattccata--------acagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttgaatgagtagctttggacgggtgacctaccgggaa 22705369  T
Q  338 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgg 392  Q
    |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22705370 gttttccagtaagcgtgccagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgg 22705424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 138 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 30527630 - 30527349
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 237  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||  | | ||||||||||||||||||||| || || ||    
T  30527630 aactgaatcacactggaatgagagggattccgaggccgtac--gtatgagactgcatgtttgaacca-gacttataagaattgtttggtaccacttacat 30527534  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 337  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| ||| || |||||||||| ||||| | ||    
T  30527533 caataagatacatcttcttttgggtagcccatttcataagaactccacagttaagattgtttgactttgagtaatctttggatgggtgatctacctgaaa 30527434  T
Q  338 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagt 422  Q
      ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||| |||||    
T  30527433 acttcccggtaagcgtgcgagtgaggataaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtaggatcagtcgacaatgcttaaagt 30527349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 294 - 438
Target Start/End: Original strand, 32292092 - 32292236
Alignment:
Q  294 gtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggt 393  Q
    ||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32292092 gtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggt 32292191  T
Q  394 ttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32292192 ttgtagggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 32292236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 154 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 28375189 - 28375042
Alignment:
Q  154 aatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28375189 aatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatgattgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctacatcaacaagatgcatctt 28375090  T
Q  254 cttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttga 301  Q
    |||||||||||||| |||||||| | || || ||||||||||||||||    
T  28375089 cttttcggtagctctttccataacagcttcatagttaagcgtgcttga 28375042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 138 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22840680 - 22840486
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |  | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22840680 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaggctttgtaggtatgagactacatggtcgaatgaagacttataagaattgtttggtactatctatat 22840581  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccg 333  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||  | | || |||||||||||||||||    
T  22840580 caacaagatgcatcttctttttgttagctcattccataagaactccacag-taatcatgcttgacttagattagtctttggatgggtgacctaccg 22840486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 146 - 404
Target Start/End: Original strand, 3745104 - 3745362
Alignment:
Q  146 cacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaaga 245  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| || |    ||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |    
T  3745104 cacatcgaaatgagagggatcctaaggtcgtgcaggctaaggactacatggttgaaggaaaacttataagaactgtttagtactacctataccaacaata 3745203  T
Q  246 tgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccg 345  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | | |||||||| |     
T  3745204 tgcatcttctttttggtagcccattccataataactccacagtcaagcgtgcttgacttagagcaattttgggatggctgaccatctgagaagtttctca 3745303  T
Q  346 gtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtca 404  Q
      ||| ||| || |||  | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  3745304 aaaagcgtgtgaatgataataaaacatgctgaaaagactcatgttgatttgttgggtca 3745362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Original strand, 3744676 - 3744896
Alignment:
Q  181 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  3744676 gtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttgacactacctataccaacaatatgcaccttctttttggtagcacatttcataagaac 3744775  T
Q  281 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaa 380  Q
    || ||| |||||| |  || |||| ||||||||||||||| ||||||     | |||||||| | | |||||||  | |||| ||||||||| |||||||    
T  3744776 tctacaattaagctttattaactttgagcaattttgggattggtgactatttgagaagtttctcagaaagtgtgttaatgagaacaaaacacactgaaaa 3744875  T
Q  381 gactcgtgttggtttgtgggg 401  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3744876 gactcgtgttggtttgtgggg 3744896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 141 - 436
Target Start/End: Original strand, 6466255 - 6466549
Alignment:
Q  141 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaa 240  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||   || ||||||||||||| |||| || || | |  || ||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  6466255 tgaatcacatcagaatgagaggaattctgagagagtgcatgtatgggactacatgtttaaaagtatactaatatgaattgtttggtactacttataccaa 6466354  T
Q  241 caagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtt 340  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||||  |||| | |||||||||||| |||||||||| |||  ||| |||   ||||||||    
T  6466355 caagttgcatcttccttttggtag-tcatttcataagaaatccattgttaggtgtgcttgacttgaagcaattttgagataagtggccttttgggaagtt 6466453  T
Q  341 tcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgtta 436  Q
    || |   |||  | |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  6466454 tctcaaaaagcatacgagtgaggacaaagcacgctaaaaagacttgtgttggtttgtggggccagtcggcaatactgaaagtcgtctgggatgtta 6466549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 155 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 15568139 - 15567860
Alignment:
Q  155 atgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc 254  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||  |||| |||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  15568139 atgagagagatcctgagaccgtacaaatatgtgacttcttggttgaaggaagacttataacaattgtttggtatgacctatatcaacaagatgcatcttt 15568040  T
Q  255 ttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtg 354  Q
    ||||   |   | |    |||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  | |  ||||||||| ||| || ||||    
T  15568039 ttttttttttttta----ataagaactccacaattaagcgtacttgactcagagcaattttgggatgggtgaatttctaggaagtttctcggaaaatgtg 15567944  T
Q  355 cgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  15567943 agagtgaggacaaaacacgttaaaaagacccgtgttagtatgtggggccagtcggcaatacttaaagtcgtctgagatattaca 15567860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 143 - 438
Target Start/End: Original strand, 6466711 - 6467000
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||| | || |  |||||| ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6466711 aatcatatcagaatgagagggattctgagactgtgcgggtatggaactgcatggttaaagga-gacttataaaaattgtttggtactacctataccaaca 6466809  T
Q  243 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 342  Q
    |||||||||||  ||||  |||| |||| |||||||||| || | ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||     
T  6466810 agatgcatctt--tttca-tagc-catttcataagaactacaaatttaagtgtacttgacttggagcaattttggtatgggtgaccttcttggaagtttt 6466905  T
Q  343 ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |  | |||  | |||||||  ||||| ||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  6466906 ctagaaagcatacgagtgaaaacaaagcacactaaaaaaactcatgttggtttgtggggtcagtcggcaatgct-taagtcgtcagggatgttaca 6467000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 153 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27022015 - 27021904
Alignment:
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    |||||||||||||||||||||| |  | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27022015 gaatgagagggatcctgaggccatgtaggtataagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacttatatcaacaagatgcatct 27021916  T
Q  253 tcttttcggtag 264  Q
    ||||||||||||    
T  27021915 tcttttcggtag 27021904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 137 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15567708 - 15567516
Alignment:
Q  137 aaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||  || ||||  |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  15567708 aaactgaatcacatcggaatgagagagatcttgacatcgcgcaagtattagacatcatggtggaaggaaggcttataagaattgtttgacactacatata 15567609  T
Q  237 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacct 329  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| | |||||| |||| ||||||    
T  15567608 ccaacaagatacatcttctttttggtagttcatttcataagaactccgcagttaatcgtgtttgacttggagtagttttggaatggatgacct 15567516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 232 - 413
Target Start/End: Original strand, 25307855 - 25308034
Alignment:
Q  232 ctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctac 331  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||  |||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | || ||||||||||| |||    
T  25307855 ctatatcaacaagatacatctttttt--ggtagcccattctgtaagaactccacagttaagcttgcttgacttggtgtagtctttggatgggtgacgtac 25307952  T
Q  332 cgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 413  Q
      | ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  25307953 ttgaaagtttttcggcaagcgtgcgagtgaggacaaagtacgctgaaaagactcgtgttgatttatgggatcagtcggcaat 25308034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 30335055 - 30334892
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| | || || ||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30335055 gaatcacatcggaattagatggatcctgagactgtgcaggtatgcgactgcaaggttgaaagaagacttataaaaattgtttgatactacctataccaac 30334956  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttg 305  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| || ||||||  ||| ||||||||    
T  30334955 aagatacatcttcttttcgatagctcaattcataataacttcatagttaaatgtgtttgacttg 30334892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 181 - 378
Target Start/End: Original strand, 1297045 - 1297242
Alignment:
Q  181 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 280  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  1297045 gtatgagactgcatggttgaagtaaaacttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatttatattcttttcggtatcccattatataagaac 1297144  T
Q  281 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 378  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| || ||| || ||||| ||||||| | |  |||||| |  | |||||||| | |||||||||| |||| ||||    
T  1297145 tccatagttaagtgtgtttgacttgaagtaatctttggatgagtgaccttctgaaaagttttcaagaaagtgtgcaaatgaggacaaagcacgttgaa 1297242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 323 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 6463510 - 6463394
Alignment:
Q  323 gtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgg-tttgtggggtcagtcggcaatgctgaaag 421  Q
    |||||||||| | ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||| ||||    
T  6463510 gtgacctaccagaaaacttctcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggttttttagggtcagtcgacaatgcttaaag 6463411  T
Q  422 tagtctgggatgttaca 438  Q
    | |||| ||||||||||    
T  6463410 tcgtctaggatgttaca 6463394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 242 - 438
Target Start/End: Original strand, 10729722 - 10729918
Alignment:
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | | ||  ||||||||||||   ||||| | |    
T  10729722 aagatgcatcttgttttctgttacccattccataagaactccacaattaagcgtgatagacttggagtagtcttttgatgggtgaccttatgggaaatat 10729821  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||  | ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  | || ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  10729822 cctagaaagcgtgcgagtgtggacaaagcacgctgaaaagactcgtgttattttgaagagttagttggcaatactgaaagtcgtctaggatgttaca 10729918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 254
Target Start/End: Original strand, 17429501 - 17429611
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 242  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17429501 aatcacatcggaatgagagg-atcttgagaccgtgcatatatgtgactgcattgttgaaggaagacttatgagtattatttggtactacctatatcaaca 17429599  T
Q  243 agatgcatcttc 254  Q
    ||||| ||||||    
T  17429600 agatgtatcttc 17429611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 239 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 10729736 - 10729603
Alignment:
Q  239 aacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaag 338  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||   || |||    
T  10729736 aacaagatgcatcttctttttggtagcctattccataaggactccacaattaagggtgcttggcttgaagcaattttgggatgactgaccttatggaaag 10729637  T
Q  339 tttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacac 372  Q
    ||||  |  ||| |||||||||| ||||||||||    
T  10729636 tttcatgaaaagcgtgcgagtgaagacaaaacac 10729603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 449 - 539
Target Start/End: Original strand, 8119225 - 8119315
Alignment:
Q  449 ccaacacaaataagattcatgtcccaacagcccctgcgacaaatcacaacaagcattttaagccctttcgagcccaatagaacccgcacac 539  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  8119225 ccaacacgaacaagattcatgtaccaacagcccctgcaacatatcacagcaagcattatcagccctttcgagcccaacagaccccgcacac 8119315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 356 - 438
Target Start/End: Original strand, 9251098 - 9251180
Alignment:
Q  356 gagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||  |||||||||    
T  9251098 gagtgaggacaaaacacgctgaaaaaacttgtgttggtttgtggggtcaatcgacaatcctgaaagcagtctatgatgttaca 9251180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29971552 - 29971450
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29971552 aactgaatcacatcagaattggaaggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagatttataagaattgtttgatactatctatat 29971453  T
Q  238 caa 240  Q
    |||    
T  29971452 caa 29971450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 352 - 436
Target Start/End: Original strand, 29117445 - 29117529
Alignment:
Q  352 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgtta 436  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||  || |||||||||    
T  29117445 gtgcgagtgaggacaaatcatcctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcggtcggtaatcctgaaagtcatccgggatgtta 29117529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 31283432 - 31283356
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgctt 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||  |||||||||| |||| ||||||||    
T  31283432 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggtggagagtggtccggctcctagcatgctt 31283356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 199
Target Start/End: Original strand, 9250913 - 9251057
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||| |||||| |||||||  |||||||   |||||||||||| | || | ||||||| |  |||| |||  ||| |||||||||| ||||||||||     
T  9250913 tgtaacacctccgcttggtggatatgtaacgttcgaggctgatgaaggcgaggagtggtctgcctcctagcaa-cttttaggcaaaaccgaatcacatca 9251011  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttg 199  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||    
T  9251012 gaatgagagggatcctgaagcc-tagaggtatgggactgcatggttg 9251057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28374116 - 28373990
Alignment:
Q  295 tgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | | | ||||| |  | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||    
T  28374116 tgcttgacttggagcaattttgg-atgagcgaccttctgagtagttttctagaaagtgtgtgagtgaggataaaacacgctgaaaaaacttgtattgatt 28374018  T
Q  395 tgtggggtcagtcggcaatgctgaaagt 422  Q
    |||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  28374017 tgtgagatcaatcggcaatgcttaaagt 28373990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 328
Target Start/End: Original strand, 34687920 - 34688015
Alignment:
Q  233 tatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 328  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| ||||||  |||  ||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  34687920 tataccaaaaagatgcatcttctttttggtaggttattccataagaattccatagttaaatgtgtctgacttggagcaattatggtatggatgacc 34688015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 36968496 - 36968434
Alignment:
Q  188 actgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 250  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36968496 actgtatggttgaaggatgacttataagaattgattggtgctacttatatcaacaagatgcat 36968434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 28912951 - 28912826
Alignment:
Q  188 actgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacag 287  Q
    |||||||| ||||| |||| | |||||||||||| || || || || |||| |||||||||||||| |||| | || | ||||| |||| ||||||||||    
T  28912951 actgcatgattgaaagaagtcatataagaattgtctgatattatctgtatcgacaagatgcatcttatttttgatatcccattctataataactccacag 28912852  T
Q  288 ttaagcgtgcttgacttggagcaatt 313  Q
    |||||  || | ||||| ||||||||    
T  28912851 ttaagtatgttcgactttgagcaatt 28912826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 22840477 - 22840425
Alignment:
Q  361 aggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 413  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  22840477 aggacaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtatggtcagtcgacaat 22840425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 27021903 - 27021840
Alignment:
Q  375 tgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||| || |||||||||    
T  27021903 tgaaaagactcgtgttggtttgtgaagtcagtcggcaatcctgaaaacagtatgagatgttaca 27021840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 353 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 12119273 - 12119224
Alignment:
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggt 402  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12119273 tgcgagtgaggacaaagcacattgaaaatactcgtgttggtttgtggggt 12119224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 352 - 397
Target Start/End: Original strand, 34688045 - 34688090
Alignment:
Q  352 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34688045 gtgcgaatgaggacaaaacacgttgaaaagactcatgttggtttgt 34688090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Original strand, 29117361 - 29117413
Alignment:
Q  268 attccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggat 320  Q
    ||||||| ||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29117361 attccatgagaactctacacttcaacgtgcttgacttggagcaattttgggat 29117413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 29971448 - 29971323
Alignment:
Q  266 tcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggac 365  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||  | | || | ||||||||||||| |  || |||| |  |||   ||| |||||||||    
T  29971448 tcattccataaaaacttcacagttaaacgtgtttgacttggaatagtctttgtatgggtgacctactg--aaatttctcaataaacatgcaagtgaggac 29971351  T
Q  366 aaaacacgctgaaaagactcgtgttggt 393  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29971350 aaaacatgctgaaaaaactcgtgttggt 29971323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 207
Target Start/End: Original strand, 25307759 - 25307829
Alignment:
Q  137 aaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaagg 207  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||| |  ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25307759 aaactgaatcacactggaatgagagcgattccaaggccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaagg 25307829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 237
Target Start/End: Original strand, 3508790 - 3508827
Alignment:
Q  200 aaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 237  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3508790 aaggaaggtttataagaattatttggtactacctatat 3508827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 28912787 - 28912730
Alignment:
Q  356 gagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 413  Q
    ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  28912787 gagtgaggacaaaacatactaaaaggactcgtgttgatttgtttggtcagtcggcaat 28912730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Original strand, 10844784 - 10844828
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||    
T  10844784 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 10844828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 249 - 305
Target Start/End: Original strand, 44041986 - 44042042
Alignment:
Q  249 atcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttg 305  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  44041986 atcttcttttcagtaacacattccacaagaacttcattgttaagcgtgcttgacttg 44042042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 70)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31284512 - 31284127
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31284512 tgtaacgcctccgcttagtgggcatgtatcgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccgactcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 31284413  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31284412 gaatgagagggatcttgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 31284313  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| |    
T  31284312 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctgccgggaagttttccgacaagcg 31284213  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  31284212 tgcgagtggggacaaaacacgccgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcatgaaagcaatctgggatgttaca 31284127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 79 - 439
Target Start/End: Original strand, 8067216 - 8067576
Alignment:
Q  79 taacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtac 178  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  8067216 taacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaagcaaaattgaatcacatcggaatgagagggaccctgaggccgtgc 8067315  T
Q  179 atgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataaga 278  Q
    | |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8067316 aggtatgggattgcatggttgaaggccggcttataagaattgtttagtactacctatatcaacaagatgcatctttttttcggtagctcattccataaga 8067415  T
Q  279 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 378  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8067416 actccatagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccgataagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 8067515  T
Q  379 aagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacag 439  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  8067516 aagactcgtgttggtttgtgaggtcaatcggcaatcctaaaagcagtctgggatgttacag 8067576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 77 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 27187542 - 27187188
Alignment:
Q  77 tgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgt 176  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  27187542 tgtaacgcccgaggctgatgagggcggcaagtggtccggctcctagcaagcttctaggaaaaattgaatcacattggaatgagagggatcctgaggctgt 27187443  T
Q  177 acatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataa 276  Q
     ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27187442 gcatgtatgggactgcatggttaaatgaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcactaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataa 27187343  T
Q  277 gaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggac-aaaacacgct 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27187342 gaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccgataagcgtgcgagtgaggacaaaaacacgct 27187243  T
Q  376 gaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctggg 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  27187242 gaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaattctgaaaacagtctggg 27187188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 138 - 438
Target Start/End: Original strand, 39653159 - 39653459
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  39653159 aactgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgttggatactacctatat 39653258  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39653259 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccatgagaactccacagttaagtgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 39653358  T
Q  338 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttac 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  39653359 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctaaaagcagtctgggatgttac 39653458  T
Q  438 a 438  Q
    |    
T  39653459 a 39653459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 138 - 438
Target Start/End: Original strand, 28561741 - 28562040
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28561741 aactgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 28561840  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  28561841 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggat-ggtgacctacggggaa 28561939  T
Q  338 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttac 437  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||| || ||||||||    
T  28561940 gtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggtaatcttgaaagcagtatgagatgttac 28562039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 151 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 11180172 - 11179887
Alignment:
Q  151 cggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11180172 cggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 11180073  T
Q  251 cttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaag 350  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11180072 cttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggatgtttcccggtaag 11179973  T
Q  351 tgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgtta 436  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11179972 tgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgtta 11179887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 50347745 - 50348041
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50347745 gaatcacgccggaatgagagggatcctgaggccttgtatgtatgagactacttggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 50347844  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50347845 aagatgcatcttctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgagaagttt 50347944  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50347945 cccgataagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 50348041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 16811380 - 16811674
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16811380 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtttgggactccatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatttcaac 16811479  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16811480 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaattccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 16811579  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16811580 cccgataagcatgcgagtgaggacaaa--acgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 16811674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 187 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 13150656 - 13150405
Alignment:
Q  187 gactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccaca 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13150656 gactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccaca 13150557  T
Q  287 gttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcg 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13150556 gttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcg 13150457  T
Q  387 tgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13150456 tgttgatttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 13150405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 142 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 13150246 - 13149953
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13150246 gaatcacgccggaatgagagggctcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctgtatcaac 13150147  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13150146 aagatgcatcttcttttcagtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttggaatgggtgacctaccgggaagttt 13150047  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgtt 435  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  13150046 ctcggtaagtgtgcaagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgtt 13149953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 32227368 - 32227072
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  32227368 gaatcacgccggaatgagagggatcctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatattaac 32227269  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32227268 aagatgcatcttctttttggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 32227169  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32227168 cccggtaagtgtgcgagtgaggaaaaaacacattgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 32227072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 142 - 439
Target Start/End: Original strand, 32227500 - 32227796
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  32227500 gaatcacgccggaatgagagggatc-tgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatattaac 32227598  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32227599 aagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 32227698  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacag 439  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32227699 cccgataagtgtgcgagtgaggaaaaaacacattgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttacag 32227796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 14813948 - 14814244
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  14813948 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgtaggtatgagactgcatggttaaaggaaggcttataataattgtttggtactacctatatcaat 14814047  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||    
T  14814048 aagatgcatcttcttttcggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgtgatgggtgacctaccgaaaggttt 14814147  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14814148 cccggtaagcgtgcgagtgaagacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggttagtcggcaatactgaaagcagtctgggatgttaca 14814244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Original strand, 25248021 - 25248407
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||| ||| ||||   ||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25248021 tgtaacgcctccgcttgatgggttagtaacgcccgaggctaatgagggtggggagtggtcaggctcctggcatgcttataggcaaaactgaatcacatcg 25248120  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248121 gaatgagagggattctaaggccgtgcaggtatgggactgcatggttaaaggaatgtttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 25248220  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| | | ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  25248221 tctttttggtagcccattccataataactccacggttcagcgtgcttgacttggagtagtcttatgatggatgacctaccgggaagtttcacggtaagcg 25248320  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctg-aaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||| || |||| ||||||||||||||||    
T  25248321 tgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaaagactcgtgttgatttgtgaggttagtcgacaatcctaaaagcagtctgggatgttaca 25248407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 14820153 - 14820449
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||| ||||  | ||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14820153 gaatcacaccgcaatgagagggttcctgagcccgtgtaggtatggggctgcacggctaaaggaaggcttataagaattgtttggtactacttatatcaac 14820252  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14820253 aagatgcatcttattttcggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggaacaattttgggatgggtgacctatcggaaagttt 14820352  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14820353 cccggtaagcatgcaagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 14820449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 16810924 - 16811220
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||    
T  16810924 gaatcacatcggaatgagagggatcttgaggccgtgtagatatgggactgcatggttgatggaaggcttataagaattgttgcgtactaactatatctac 16811023  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16811024 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaacttcacatttaagtgtgcttgacttgtagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 16811123  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  16811124 ccccgtaagcgtgcgagtgaggacaaaatacgctgaaaagattcgtgttggtttgtggggtcggtcggcaatcctgaaagcaatctgggatgttaca 16811220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 56 - 352
Target Start/End: Original strand, 41472214 - 41472508
Alignment:
Q  56 aacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaa 155  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  41472214 aacgcctctgattggtgggcatgtaacgcccaaggctgaagagggtggtgagtggtccggctcctggcatgcatctaggcaagactgaatcacatcggaa 41472313  T
Q  156 tgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttct 255  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41472314 tgagagggatcctgaggtcgtacaggtatgagactgcatggttgaaggaag-cttataagaattgtttggtactacatatatcaacaagatgcatcttct 41472412  T
Q  256 tttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  41472413 tttcggtagatcattccataagaactccacggttaaacgtgcttgacttgaaacaattttgggatgggtgacctaccggaaagttt-ccggtaagtg 41472508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 181 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 32386842 - 32386595
Alignment:
Q  181 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 280  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  32386842 gtatgggactgtatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatcttcttttcagtagctaattccataagaac 32386743  T
Q  281 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaa 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  32386742 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacccaccggaaagtttcttggtaagcgtccgagtgaggacaaaacacgctaaaaa 32386643  T
Q  381 gactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctg 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  32386642 gactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcttgaaagcagtctg 32386595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 143 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20885263 - 20884968
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 242  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  | ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20885263 aatcacatcgcaatgagagggatcttgaggtcgtgtaggtatgtgactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttgatactacctatatcaaca 20885164  T
Q  243 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 342  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20885163 agatgcatcttctttttagtagcacattccataagaactccacaattaagcgtgcttgacttggagtagtatttggatgggtgacctaccgggaaatttc 20885064  T
Q  343 ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  20885063 ccgttaagcgtgcaagttaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtctgcaatgcttaaagtcgtttgggatgttaca 20884968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Original strand, 7477102 - 7477486
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||    
T  7477102 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 7477200  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    |||||||||||||||| | | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  7477201 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 7477300  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| ||| |    
T  7477301 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttagagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 7477400  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||    
T  7477401 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagtcgtctaggatgttaca 7477486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 138 - 438
Target Start/End: Original strand, 30529682 - 30529981
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30529682 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaagtaaggcttataagaattttttggtactacctatat 30529781  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||| | ||||    
T  30529782 caacaagatgcatcttctttttggtagcccattccataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgaccta-ctggaa 30529880  T
Q  338 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttac 437  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  30529881 gtttcccagtaagcatgcgagtgaggacaaaacacgctaaaaagacttgtgttggtttgcagggttagtcggcaatgcttaaagttgtctaggatgttac 30529980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 142 - 439
Target Start/End: Original strand, 37045034 - 37045328
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37045034 gaatcacatctgaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtgtgggactacatgaatgaaggaatgcttataagaattgtttggtaatacctatatcaac 37045133  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||   ||    
T  37045134 aaggtgcatcttctttttggtaccctattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccggga---tt 37045230  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacag 439  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  37045231 cccgataagcatgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttacag 37045328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Original strand, 7493792 - 7494176
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||  |||||||||||||||  ||||||||||    
T  7493792 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccggcttctggcg-gcttctaggcaaaacataatcacatcg 7493890  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||| |||||| | | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7493891 gaatgagagagatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatgcatct 7493990  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   | || | |||| |||||| |  |||| |||||||  ||| |    
T  7493991 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagttgtcttagcatggctgaccttctaggaaatttcccgtaaagcg 7494090  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||    
T  7494091 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagtcgtctaggatgttaca 7494176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 143 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25230394 - 25230099
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25230394 aatcacatcggaaggagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaaca 25230295  T
Q  243 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 342  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||  ||||||||||||| | ||||||||     
T  25230294 agatacatcttctttttggtagcccattcaataagaactccacagttatgcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgacctatcaggaagtttt 25230195  T
Q  343 ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| || || |||||||||    
T  25230194 ccggtaagcgagcgagtgaggacaaaacacgttggaaagactagtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtttgagatgttaca 25230099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 143 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25237981 - 25237686
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25237981 aatcacatcggaaggagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaaca 25237882  T
Q  243 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 342  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||  ||||||||||||| | ||||||||     
T  25237881 agatacatcttctttttggtagcccattcaataagaactccacagttatgcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgacctatcaggaagtttt 25237782  T
Q  343 ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| || || |||||||||    
T  25237781 ccggtaagcgagcgagtgaggacaaaacacgttggaaagactagtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtttgagatgttaca 25237686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 143 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25230851 - 25230556
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 242  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  | ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25230851 aatcacattggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggtttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 25230752  T
Q  243 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 342  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | ||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  25230751 agatgcattttctttttggtagcccattccataagaactcaacaattaagcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgccctactgggaagtttc 25230652  T
Q  343 ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  ||||| || | ||||||||||    
T  25230651 ccggtaagcgtgcgagtgagatcaaaacacgctggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtctacaatgcataaagtcgtttaggatgttaca 25230556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 143 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25238438 - 25238143
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 242  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  | ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25238438 aatcacattggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggtttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 25238339  T
Q  243 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 342  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | ||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  25238338 agatgcattttctttttggtagcccattccataagaactcaacaattaagcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgccctactgggaagtttc 25238239  T
Q  343 ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  ||||| || | ||||||||||    
T  25238238 ccggtaagcgtgcgagtgagatcaaaacacgctggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtctacaatgcataaagtcgtttaggatgttaca 25238143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 53 - 395
Target Start/End: Original strand, 41473907 - 41474249
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41473907 tgtaacgcctccgcttgatgggcatgtaacgcctgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctagcatgcttctcggcaagactgaatcacatcg 41474006  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
     ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  || |    
T  41474007 aaatgagagggatcttgaggtcgttcaggtatgtgactggatggttaaaggaagacttataagaattgtttgatacttcctatatcaacaagattgatat 41474106  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    |||||| ||| | |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||  |    
T  41474107 tctttttggtggatcattctataaaaactccacagtcaagcgtgcttgacttggaacaattttgggatgggtgacataccagaaagtttcccagtaatcg 41474206  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggttt 395  Q
    |||| ||||  |||||||| | ||||||||||| |||| ||||    
T  41474207 tgcgggtgaatacaaaacatgttgaaaagactcatgttagttt 41474249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 195 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 4067454 - 4067212
Alignment:
Q  195 ggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcg 294  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4067454 ggttgaaggaagacttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcattacataagaactccacagttaagcg 4067355  T
Q  295 tgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtt 394  Q
    |||||||||||||| | | || |||||| ||||||||||| |||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4067354 tgcttgacttggagtagtctttggatggatgacctaccggaaagttttctggtaagcgtgcaagtgaggacaaaacacgctgaaaagaccagtgttggtt 4067255  T
Q  395 tgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  4067254 tgtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtct-ggatgttaca 4067212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 187 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25238786 - 25238535
Alignment:
Q  187 gactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccaca 286  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25238786 gactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactatctttatcaacaagatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccaca 25238687  T
Q  287 gttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcg 386  Q
    |||||||||||||||||||||| | | || |||| ||||||||| ||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25238686 gttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggattggtgacctatcgggaagttttttggtaagcatgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcg 25238587  T
Q  387 tgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  25238586 tgttggtttgtatggtcggtcggcaatggttaaagtcgtctgggatgttaca 25238535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 142 - 440
Target Start/End: Original strand, 2911094 - 2911381
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  |||||||||| ||| | |||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  2911094 gaatcacacctgaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggaccacatggttgaaagaatggttataaaaattgtttgatattacctatatcaac 2911193  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||| ||||||           ||    
T  2911194 aagatgcatattctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgagtgacc-----------tt 2911282  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacaga 440  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  2911283 ctcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtaggatcaatcgacaatgcttaaagtcgtgtgggatgttacaga 2911381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 39640936 - 39641219
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  39640936 gaatcacatcagaatgagagagatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagagttgtttggtactacctatatcaat 39641035  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||||||               
T  39641036 aagatgcatcttctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagcagtctttggattggtgaccta----------- 39641124  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
      || |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||  ||||| ||||| |||| ||||||||||| | ||| | |||||||||||||||    
T  39641125 --cgataagtgtgcgagtgaggacaaaatgcactgaaaagacttatgttgatttgtagggtaagtcggcaatgtttaaaatcgtctgggatgttaca 39641219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 152 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25802685 - 25802399
Alignment:
Q  152 ggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 251  Q
    ||||||||||||||| || |||| |  | ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25802685 ggaatgagagggatcatgtggccatgtaggtatgagactgcatggttaacggaaggctgataagaatggtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 25802586  T
Q  252 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagt 351  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | | || ||| ||||||||| |  ||||||||| ||  |||     
T  25802585 ttcttttcgatagcccattccataagaaatccacagttaagcgtgtttgacttggagtagtcttaggacgggtgaccttctaggaagtttctcgaaaaga 25802486  T
Q  352 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| || || |||||||||    
T  25802485 gtgcgagtaaggtcaaaacacgctgaaaagacgtgtgttggtttgtagggtcagtcaacaatgcttaaagtcgtttgagatgttaca 25802399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 145 - 329
Target Start/End: Original strand, 29224326 - 29224510
Alignment:
Q  145 tcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaag 244  Q
    ||||||| |||||| |||| || ||||||| |  |  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  29224326 tcacatcagaatgaaagggttcatgaggccatgtagatatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatactaacaag 29224425  T
Q  245 atgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacct 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29224426 atgcatcttcttttcggtagcccaaaccataagaacttcacaattaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacct 29224510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 53 - 209
Target Start/End: Original strand, 12820554 - 12820710
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12820554 tgtaacgctcccgcttggtgggcatgtaacgctcgaggctgatgagggcggggagtggtccggctccttgcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 12820653  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggct 209  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12820654 gaatgagagggattctaaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaagaaaggct 12820710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25239224 - 25239070
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||  | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25239224 gaatcacaccggtatgagagggattctgaggtcgtgtaggtatgggactatatggttgaaggaacgcttataagaattttttggtactacctatatcaac 25239125  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtg 296  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25239124 aagatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtg 25239070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 211 - 438
Target Start/End: Original strand, 3899868 - 3900095
Alignment:
Q  211 ataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagca 310  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  | | ||   ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  3899868 ataagaattgtttggtactacatataccaacaagatgcatctttttttcgacaacacaaatcataagaactccacaataaagcatgcttgacttggagca 3899967  T
Q  311 attttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggc 410  Q
    ||||||| ||||||||||| | || |||||||||   ||| ||| ||||  |||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  3899968 attttggtatgggtgaccttctggaaagtttcccaaaaagcgtgtgagtatggacaaaacaaggtgaaaagactcgtgttgatctgtggggtcagtcagc 3900067  T
Q  411 aatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||| |||||| | || ||||||||||||    
T  3900068 aattctgaaaatggtatgggatgttaca 3900095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 32388968 - 32388848
Alignment:
Q  52 gtgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 151  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32388968 gtgtaacgcctccgcttagtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaattgaatcacatc 32388869  T
Q  152 ggaatgagagggatcctgagg 172  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  32388868 ggaatgagagggatcctgagg 32388848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 232 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 53150869 - 53150676
Alignment:
Q  232 ctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctac 331  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  53150869 ctatattaacaagatgcatatttttttcggtagccaatttcataagaacttcacagttaaccgtgcttaacttggagcaattttgggatgggtgacctta 53150770  T
Q  332 cgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagt 425  Q
     | ||||||||||   ||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||| |||| ||||||    
T  53150769 tgagaagtttcccaaaaagcgggcgagtgaggacaaaacatgttgaaaagactcatgttagtttgtggggtcagtcaacaatcctgacagtagt 53150676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 142 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 25803151 - 25802964
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||| | | |||  | |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  25803151 gaatcatatcggaataagagggttcctaatgtcgtgtaggtatgggactgcatggttgaagtaagacttgtaagaattgtttggtactacctataaaaac 25803052  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacct 329  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | | || |||||||||||||    
T  25803051 aagatgtatcttcttttcggtatcccatttcataagaactccgtagttaagcgtgcttgacttggactagtcttaggatgggtgacct 25802964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 32797082 - 32796936
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |  | |||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32797082 gaatcacatcgaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgaaactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 32796983  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 288  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32796982 aagatgcatcttcttttttgtagcacattccataagaactccacagt 32796936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 203 - 397
Target Start/End: Original strand, 15392570 - 15392764
Alignment:
Q  203 gaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgac 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||  ||||||||| |||||     |||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  15392570 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccatcagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15392669  T
Q  303 ttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||   |||||||| |||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15392670 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttttcctaaaagtgtgcaagtgaggacatagcacgctgaaagaactcgtgttggtttgt 15392764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 203 - 397
Target Start/End: Original strand, 15405606 - 15405800
Alignment:
Q  203 gaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgac 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||  ||||||||| |||||     |||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  15405606 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccattagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15405705  T
Q  303 ttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||    
T  15405706 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttttcctaaaagtgtgcaagtgaggacaaagcacgctgaaagaacccgtgttggtttgt 15405800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 190 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 26310088 - 26309840
Alignment:
Q  190 tgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagtt 289  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26310088 tgcatggttgaaggacgatttataagaattttttgttactacatataccaaaaagatgcatcttctttatggtagctcattccattagaactcgacagtt 26309989  T
Q  290 aagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgt 389  Q
    ||  ||  |||||||  | |||||||||||||||||| ||  | ||| |||||| ||  || |||| ||||| ||||||| || || ||||||||| |||    
T  26309988 aaatgtatttgacttaaaacaattttgggatgggtgatctttcaggatgtttcctggatagcgtgcaagtgaagacaaaatacactcaaaagactcatgt 26309889  T
Q  390 tggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||| |||   ||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  26309888 tggtttgtggggttagttaacaataattaaagtcgtctgggatgttaca 26309840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 203 - 397
Target Start/End: Original strand, 15388203 - 15388397
Alignment:
Q  203 gaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgac 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||  || |||||||||||  ||||||||| |||||     |||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  15388203 gaaggcttataagaattgtttcgtattaccagtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccatcagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15388302  T
Q  303 ttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||   |||||||| |||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15388303 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttttcctaaaagtgtgcaagtgaggacatagcacgctgaaagaactcgtgttggtttgt 15388397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 203 - 397
Target Start/End: Original strand, 15417431 - 15417625
Alignment:
Q  203 gaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgac 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||  ||||||||| |||||     |||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  15417431 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccattagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15417530  T
Q  303 ttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||    
T  15417531 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttttcctaaaagtgtgcaagtgaggacaaagcacgctgaaagaacccgtattggtttgt 15417625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 203 - 397
Target Start/End: Original strand, 15411015 - 15411209
Alignment:
Q  203 gaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgac 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||  ||||||||| |||||     |||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  15411015 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccattagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15411114  T
Q  303 ttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||   |||||||| |||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||||    
T  15411115 ttggatcaattttgggatgggtgaccttttgggaagttttcctaaaagtgtgcaagtgaggacaaagcacggtgaaagaacccgtgttggtttgt 15411209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 203 - 395
Target Start/End: Original strand, 15377344 - 15377536
Alignment:
Q  203 gaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgac 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||   || |||||||||||  ||||||||| ||| |     |||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  15377344 gaaggcttataagaattgtttggtattactggtaccaacaagatgccacttcttttcagtacccaggaccattagaactccacagttaaatgtgcttgac 15377443  T
Q  303 ttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggttt 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||   |||||||| |||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||    
T  15377444 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttttcctaaaagtgtgcaagtgaggacaaagcacgttgaaagaacccgtgttggttt 15377536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 154 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 31104095 - 31103845
Alignment:
Q  154 aatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 253  Q
    ||||| ||||||| | |||  ||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||    
T  31104095 aatgatagggatcttaaggttgtacaggtatgagattgcatggttcaaggaagacttataagaattgtttgatactatctataccaactagatgcatttt 31103996  T
Q  254 cttttcggtag--ctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagt 351  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||| ||||| | | ||  |||| |   | ||||||||||   ||      
T  31103995 ctttttggtagctctcattccataagaacttcacatttaagtgtctttgactttgagtaatttggagttgaatgactttatgagaagtttcccaaaaaac 31103896  T
Q  352 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggt 402  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  31103895 gcgcgagtgagaacaaaacatgctgaaacgactcgtgttgatttgtagggt 31103845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 203 - 397
Target Start/End: Original strand, 15376056 - 15376250
Alignment:
Q  203 gaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgac 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||   || |||||||||||  ||||||||| ||| |     |||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  15376056 gaaggcttataagaattgtttggtattacaggtaccaacaagatgccacttcttttcagtacccaggaccattagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15376155  T
Q  303 ttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||| ||||||||||  || |||||||||||||    
T  15376156 ttggatcaattttgggatgggtgaacttttgggaagttttcctaaaagtgtgcaagtgatgacaaagcacgctgaaagaacccgtgttggtttgt 15376250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 346 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25239070 - 25238978
Alignment:
Q  346 gtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| || || |||||||||    
T  25239070 gtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtatgagatgttaca 25238978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 346 - 438
Target Start/End: Original strand, 41473744 - 41473836
Alignment:
Q  346 gtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||| || |||||||||    
T  41473744 gtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagacccgtgttggtttgtggggtcagtcgccaatcgtgaaagcagtatgagatgttaca 41473836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 356 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25231030 - 25230948
Alignment:
Q  356 gagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  25231030 gagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtatggtcggtcggcaatggttaaagtcgtctgggatgttaca 25230948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 352 - 438
Target Start/End: Original strand, 18318864 - 18318950
Alignment:
Q  352 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| || |||||||| | |||||| ||||| |||||||||    
T  18318864 gtgcgagtgagaacaaaacacgctgaaaagattcgggttggtttgttgggacaatcggcaatccagaaagtcgtctgtgatgttaca 18318950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 47518432 - 47518295
Alignment:
Q  176 tacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccata 275  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||| || || ||||||||||||| || ||    |||||||||||||||    
T  47518432 tacaggtatggaattgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtttgaaactatctctaccaacaagatgcattttttta---gtagctcattccata 47518336  T
Q  276 agaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttg 316  Q
    | ||||  ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  47518335 ataactttacaattaagtgagcttgatttggagcaattttg 47518295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 413
Target Start/End: Original strand, 15410629 - 15410771
Alignment:
Q  271 ccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaac 370  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  |||| | ||||||||  ||   ||||||  || ||| |||||| |    
T  15410629 ccataagaactccacatttaagtgtgcttgacttggatcaattttgagatgggaaaccttctgggaagttctccaaaaagtgtatgactgaagacaaagc 15410728  T
Q  371 acgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 413  Q
    | |||||||  || | ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15410729 atgctgaaagaacccatgttgatttgtggggtcagttggcaat 15410771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18547475 - 18547416
Alignment:
Q  381 gactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacaga 440  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  18547475 gactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgattgggatgttacaga 18547416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 413
Target Start/End: Original strand, 15381258 - 15381400
Alignment:
Q  271 ccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaac 370  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  |||| | || |||||   |   ||||||  || ||| |||||| |    
T  15381258 ccataagaactccacatttaagtgtgcttgacttggatcaattttgagatgggaaaccttctggaaagttctacaaaaagtgtatgactgaagacaaagc 15381357  T
Q  371 acgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 413  Q
    | |||||||  || ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15381358 atgctgaaagaacccgtgttgatttgtggggtcagttggcaat 15381400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 404
Target Start/End: Original strand, 15396493 - 15396626
Alignment:
Q  271 ccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaac 370  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  |||| | ||||| ||  ||   ||||||  || ||| |||||| |    
T  15396493 ccataagaactccacatttaagtgtgcttgacttggatcaattttgagatgggaaaccttctgggaaattgtccaaaaagtgtatgactgaagacaaatc 15396592  T
Q  371 acgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtca 404  Q
    | |||||||  || ||||||| ||||||||||||    
T  15396593 atgctgaaagaacccgtgttgatttgtggggtca 15396626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 259
Target Start/End: Original strand, 3890046 - 3890094
Alignment:
Q  211 ataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 259  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  3890046 ataagaattgtttgctactacatatatcaacaagatgcatctttttttc 3890094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 439
Target Start/End: Original strand, 15373696 - 15373864
Alignment:
Q  271 ccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaac 370  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||  |||| |  ||||||||  |   ||||||  || ||| |||||| |    
T  15373696 ccataagaactccacatttaggtgtgcttgacttggatcaattttgagatgggaaaccttctaggaagttttgcaaaaagtgtatgactgaagacaaagc 15373795  T
Q  371 acgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacag 439  Q
    | |||||||  || ||||||| |||||||||||||| || |||  | ||||| |||| |||| ||||||    
T  15373796 atgctgaaagaacccgtgttgatttgtggggtcagttggaaataattaaagtcgtcttggatattacag 15373864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 413
Target Start/End: Original strand, 15417045 - 15417186
Alignment:
Q  271 ccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaac 370  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||  |||| |  |||||||  ||   ||||||  || ||| |||||| |    
T  15417045 ccataagaactccacatttaagtgtgcttgactt-gatcaattttgagatgggaaaccttctcggaagttctccaaaaagtgtatgactgaagacaaagc 15417143  T
Q  371 acgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 413  Q
    | |||||||  || ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15417144 atgctgaaagaacccgtgttgatttgtggggtcagttggcaat 15417186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 421
Target Start/End: Original strand, 26436264 - 26436325
Alignment:
Q  359 tgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaag 421  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||    
T  26436264 tgagaacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttttgggg-cagtcggcaaagttgaaag 26436325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 43736777 - 43736715
Alignment:
Q  233 tatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgt 295  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||    
T  43736777 tatatcaacaatatgcatcttcttgttggtagctcatttcataagaatttcactgttaagcgt 43736715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 325
Target Start/End: Original strand, 12762939 - 12763023
Alignment:
Q  240 acaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtg 325  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  |  ||||| |||||| |||| |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12762939 acaagatgcatcgtcttttaggtagcctaaaccataggaactcaacaggtaattgtacttgacttggag-aattttgggatgggtg 12763023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 13150343 - 13150302
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  13150343 tggtgggcatgtaacacccaaggctgatgagggcggggagtg 13150302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25238845 - 25238816
Alignment:
Q  201 aggaaggcttataagaattgtttggtacta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25238845 aggaaggcttataagaattgtttggtacta 25238816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 36763877 - 36763824
Alignment:
Q  359 tgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaa 412  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| |||||    
T  36763877 tgaggaaaaaacacgctgataagactcatgttggtttgtggagacagttggcaa 36763824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 315
Target Start/End: Original strand, 15392183 - 15392227
Alignment:
Q  271 ccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttt 315  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  15392183 ccataagaactccacatttaagtgtgcttgacatggatcaatttt 15392227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 25238916 - 25238872
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||    
T  25238916 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 25238872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 287; Significance: 1e-160; HSPs: 64)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Original strand, 13492699 - 13493085
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13492699 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcatatcg 13492798  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    |||||||| |||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13492799 gaatgagaaggatcctgaggctgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataataattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 13492898  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  13492899 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttagagcaattttgggatgggtgacctaccggaaagttacccggtaagcg 13492998  T
Q  353 tgcgagtgaggac-aaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  13492999 tgcgagtgaggacaaaaacatgctgaaaagactcgtgttgatttgtagggtcagtcagcaatcctgaaagcagtctggggtgttaca 13493085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 52 - 438
Target Start/End: Original strand, 9351972 - 9352357
Alignment:
Q  52 gtgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 151  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  9351972 gtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggca-gcttctaggcaaaacataatcacatc 9352070  T
Q  152 ggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 251  Q
    | |||||||||||||||||||| ||  | ||||| |||| |||||| ||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9352071 gaaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggtcgaagggagacttataatatttgtttggtactacctatataaacaagatgcatc 9352170  T
Q  252 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagt 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  9352171 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctacctggaagtttctcggtaagc 9352270  T
Q  352 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  9352271 gtgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggacgttaca 9352357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 7911812 - 7912173
Alignment:
Q  77 tgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7911812 tgtaacacccgaggctgatgagagcggggagtggtccgactcctggcatgtttctaggaaaaactgaatcacatcggaatgagagggatctcgaggccgt 7911911  T
Q  177 acatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataa 276  Q
     || |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7911912 gcaggtataggactgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataa 7912011  T
Q  277 gaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctg 376  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7912012 gaactccacagttatgcttgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagattctcggtaagcatgcgagtgaggacaaaacacgctg 7912111  T
Q  377 aaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  7912112 aaaagacttgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 7912173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 135 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 17027685 - 17027382
Alignment:
Q  135 caaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactaccta 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17027685 caaaactaaatcacatcggaatgagagggatccagaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactaccta 17027586  T
Q  235 tatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgg 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17027585 tatcaacaagattcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgg 17027486  T
Q  335 gaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgt 434  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  17027485 gaagtttcccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgt 17027386  T
Q  435 taca 438  Q
    ||||    
T  17027385 taca 17027382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 68 - 435
Target Start/End: Original strand, 7912235 - 7912602
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcc 167  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7912235 tggtgggcatgtaacgcccgacgcagatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcggaatgagagggatct 7912334  T
Q  168 tgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctc 267  Q
     |||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7912335 cgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaaacttatatgaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcattttcttttcggtagctc 7912434  T
Q  268 attccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaa 367  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  7912435 attccataagaactccatagttaaacgtgcttgacttggagcaattttggaatgggtgacctgctgggaagtttcccgttaagcgtacgagtgaggacaa 7912534  T
Q  368 aacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgtt 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  7912535 aacacgctgaaaagactcatgttggtttgtggggttagtcggcaatcctgaaagcaatctgggatgtt 7912602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 48 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 13191754 - 13191363
Alignment:
Q  48 gttagtgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatca 147  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||| |||||| || ||| ||||||| ||| |||||| |||||    
T  13191754 gttactgtaatgcctccgcttggtgggcatgtaacgcctgaggctgatgagggcggcgagtagtccggctcttggtatgcttcgaggaaaaactaaatca 13191655  T
Q  148 catcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13191654 catcggaatgagagggatcctaagactatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatg 13191555  T
Q  248 catcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggt 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  13191554 catcttcttttcggtagctcgttccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgagatgggtgaccaaccgggaagtttcccgat 13191455  T
Q  348 aagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacag 439  Q
    ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||    
T  13191454 aagcgtgcgagtgaggacaaaatacactgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcttgaaagcagtctggggtgttacag 13191363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 20850320 - 20850616
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20850320 gaatcacaccggaatgagagggttcatgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttttgtactacctatatcaac 20850419  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20850420 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactctacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 20850519  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||    
T  20850520 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatggggtgttaca 20850616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 67 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 17731335 - 17730960
Alignment:
Q  67 ttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatc 166  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17731335 ttggtgggcatgtaacgcctgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctagcatgcttctaggcaaaattgaatcacatcggaatgagagggatc 17731236  T
Q  167 ctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca----agatgcatcttcttttcggt 262  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  17731235 ctgaggccgttcaggtatgggactgcatggttaaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatagatgcatcttcttttcggt 17731136  T
Q  263 agctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgag 362  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||||    
T  17731135 agctcattctttaagaactccacatttaagcgtgcttgacttggagcaattttgagataggtgacctaccggaaagtttatcggtaagcgtgcaagtgag 17731036  T
Q  363 gacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||| |||| ||||||||||    
T  17731035 gacaaaacacgctaaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatcctgagagtcgtctaggatgttaca 17730960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20896835 - 20896538
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20896835 gaatcacatcggaatgagagggatccttaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 20896736  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20896735 aagatgcatcttcttttcagtagctcattccataagaactccacggttaagcgtgcttggcttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaaattt 20896636  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgagga-caaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  20896635 cccggtaagtgtgcgagtgaggagaaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagccggcaatcttgaaagcagtctgggatgttaca 20896538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 53 - 345
Target Start/End: Original strand, 16519879 - 16520170
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16519879 tgtaacgcctccacttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggca-gcttctaggcaaaacagaatcacatcg 16519977  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16519978 gaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggtcgaaggaaggcttatgagatttgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 16520077  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccg 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16520078 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgagatgggtgacctgccgggaagtttcccg 16520170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 142 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23986464 - 23986164
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23986464 gaatcacatcggaatgagagggatccggaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggtaggcttataagaattgtttggtactacctatatgaac 23986365  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23986364 aagatgcatcttcttttcggtagctcaaaccataagaacttcacagttaagtgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttt 23986265  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacagaa 441  Q
    | ||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  23986264 cacggaaagcgtgcgagtgaggagaagacacgctgaaaagacttgtgttggtttgtggggtcagtcggcaattctgaaagcagtatgggatgttacagaa 23986165  T
Q  442 t 442  Q
    |    
T  23986164 t 23986164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 138 - 438
Target Start/End: Original strand, 23776436 - 23776735
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23776436 aactgaatcacgccggaatgagaggtatcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaatcgtctggtactacctatat 23776535  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  23776536 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaacttcaca-ttaagcgtacttgacttggagcaattttgggatggatgacctactgggaa 23776634  T
Q  338 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttac 437  Q
    ||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23776635 gtttcctagtaaacgtgcgagtgacgacaaaacacgctgaaaagattcgtgttggtttgtggagtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttac 23776734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 142 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 2681363 - 2681068
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  | || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2681363 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgtaggtttgggactgcatggttgaatgaagacttataagaattgtttggtactacccatatcaac 2681264  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||    
T  2681263 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacaattaagcgtgcttaatttggaacaattttgggatgggt----tactgggaagttt 2681168  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacagaa 441  Q
    ||  ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  2681167 cctagtaagcgtgcaagtgaggacaaaacacgttgagaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagctgtctgggatgttacagaa 2681068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 21311514 - 21311810
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  21311514 gaatcacatcggaatgagagggttcatgaggccgtacaagtatgggactgcatggttgaaggaagccttataagaattgtttggtattacctagataaac 21311613  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  21311614 aagatccatcttctttttggaagctcattccataagaactccgcagttaagcgtgcttgactttgagtagtcttatgatgggtgacctaccgggatgttt 21311713  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21311714 tccggtaagtgtgcgagtgaagacaaaacacgctgtaaggactcgtgttggtttgtagggtcaatcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 21311810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 204 - 438
Target Start/End: Original strand, 13492393 - 13492628
Alignment:
Q  204 aaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgact 303  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13492393 aaggcttataagaattgtttgatattacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctaattccataagaactccacagttaagcgtgcttgact 13492492  T
Q  304 tggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgagg-acaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggt 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13492493 tggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccagtaagcgtgcgagtgaggaaaaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggt 13492592  T
Q  403 cagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| || |||||||    
T  13492593 cagtcggcaatcttgaaagcagtctagggtgttaca 13492628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 138 - 438
Target Start/End: Original strand, 21311966 - 21312266
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| || |||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21311966 aactgaatcacaccagaatgagagggttcatgaggctgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttaggtactacctatat 21312065  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||    
T  21312066 caacaagatgcatcttctttttggtagcccatttcataagaaatccatagttaaacgtgcttgacttggagcagtcttatgatgagtgacctaccgggaa 21312165  T
Q  338 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttac 437  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21312166 gtttcccggtaagtgtgtaagtgaagacaaaacacattgaaaagactggtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttac 21312265  T
Q  438 a 438  Q
    |    
T  21312266 a 21312266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 140 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20126331 - 20126033
Alignment:
Q  140 ctgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatca 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20126331 ctgaatcacatcggaatgagagggatcctaaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaatggtttgatactacctatatca 20126232  T
Q  240 acaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagt 339  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | | || | ||||| ||||||||  |||||    
T  20126231 acaagatgcatcttctttttggtagcacattccataagaattccacaattaagcgtgcttgacttggagtagtctttgaatgggcgacctacctagaagt 20126132  T
Q  340 ttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  20126131 ttcccagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtagggtccgtcgacaatgcttaaagtcgtctgggacgttaca 20126033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 142 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 2890985 - 2890715
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||  |||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  2890985 gaatcacattagaatgagagg-atcccgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttataagaattgttagggactacctatatcaaa 2890887  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |  | ||||||||||||||| | |||||||    
T  2890886 aagatgcttcttcttttcagtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgaaatagtactaggatgggtgacctactgagaagttt 2890787  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 413  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  2890786 cccgataagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctaaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaat 2890715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 242 - 438
Target Start/End: Original strand, 28780209 - 28780405
Alignment:
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28780209 aagatgcatcttgttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 28780308  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
     | |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28780309 tctggtaagtgtgcgagtgaggataaaacattttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagccgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 28780405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 151 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 2720702 - 2720414
Alignment:
Q  151 cggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 250  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  2720702 cggaatgagagggatcccaaggtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatattaacaagacacat 2720603  T
Q  251 cttcttttc-ggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaa 349  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | || ||||||||||| ||  ||||||||||||| |||    
T  2720602 ctttttttttggtagctcattccataagaactccacagttaagtgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacatattgggaagtttcccgataa 2720503  T
Q  350 gtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacag 439  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||    
T  2720502 gcgtgcgagtgagaacaaaacacgctgagaagactcgtgtcggtttgcagggtcagtcggcaatgct-taagtagtctaggatgtgacag 2720414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 106 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 9441037 - 9440708
Alignment:
Q  106 agtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaa 205  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||||| |   ||| || | |||| ||| ||||||||||||||    
T  9441037 agtggtccggctcctggca-gcttctaggcaaaactgaatcacatcaaaatagaagggatcctaat--cgtgcaggcatggaactacatggttgaaggaa 9440941  T
Q  206 ggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttg 305  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||     
T  9440940 tgcttataagaattctttggtactacttttatcaacaagatgcattttcttttcagtagcccaaaccataagaacttcacagttaagtgtgtttgacttt 9440841  T
Q  306 gagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  9440840 gagcaattttgggatgggtgaccttcttggaagtttcccgaaaaatgtgcaagtgatgacaaaatacgctgaaaaaactcgtgctggtttgtggggtcag 9440741  T
Q  406 tcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  9440740 tcggcaatcttgaaagcagtctgggatgttaca 9440708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 17850917 - 17851213
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  17850917 gaatcacaccggaatgagagggatcctgaggtcgtgcaagtatgggactgcatggttaaaagaatgctgataagatatgtttggtactacctttatcaac 17851016  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  17851017 aagatgcatcttctttctggtagcccattctataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtcttcggatgggagacctactgggaagttt 17851116  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||  ||| | |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || || || ||||| | |||||||    
T  17851117 cctagtacgcgtgcgagttaggacaaaacaagtcgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcaatcggcaatacttaatgtcgtctgagttgttaca 17851213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 126 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 9440472 - 9440160
Alignment:
Q  126 gcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgg 225  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  9440472 gcttctagggaagaccgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatggaactgcatggttgaatgaaagcttataagaattgttcgg 9440373  T
Q  226 tactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtg 325  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  9440372 tactacttatatcaacaagatgcattttcttttcggtagctcactccataagaacttcacagttaagtgtgcttgatttggagcaatttttggatgggtg 9440273  T
Q  326 acctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagt 425  Q
    ||||   ||||||||||     ||  ||| || ||| ||||||| |  || |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||  | ||||||||    
T  9440272 accttatgggaagtttctaaaaaaacgtgtgaatgatgacaaaatatactaaaaaaactcgtgttgatttgtgggatcagtcgacaattttaaaagtagt 9440173  T
Q  426 ctgggatgttaca 438  Q
     |||| |||||||    
T  9440172 ttggggtgttaca 9440160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 142 - 413
Target Start/End: Original strand, 11062285 - 11062555
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||| ||  | |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11062285 gaatcacatcgacatgagagg-atcctgaggctgtgtaggtatgaaactacatggttgaaggaaggcttataagaagtgttttgtactacctatatcaac 11062383  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||| ||| ||||||    
T  11062384 aagatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctatcggaaagttt 11062483  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 413  Q
    |||| |||    | ||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||| | | |||||||||||||    
T  11062484 cccgataaacccgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaaaatttgtgttgatttatagagtcagtcggcaat 11062555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 142 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 6331059 - 6330811
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6331059 gaatcacatcggaatgagatggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 6330960  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||  ||| ||||||||||||  || ||     
T  6330959 aatatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagtattcttatgattggtgacctaccgaaaaatt- 6330861  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttg 391  Q
    | | ||||| |||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||    
T  6330860 ctcagtaagcgtgcaagtgatgacaaaacacgcgagaaagactcgtgttg 6330811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 142 - 407
Target Start/End: Original strand, 17851373 - 17851638
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  17851373 gaatcacaccggaatgagagggatcccgaggccgtgcaagtatgggactgcatggttaaaagaaggcttataagatatgtttggtactacctttatcaac 17851472  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | || |||||||||| |||  |||| ||||    
T  17851473 aagatgcatcttctttttggtagcccattctataagaactccacaattaagcgtgcttgacttggagtagtcttcggatgggtgatctattgggaggttt 17851572  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtc 407  Q
     || || || ||||||| |||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||||  ||||||||    
T  17851573 tcccgttagcgtgcgagcgagggcaaaacacggtaaaaagaatcgtattggtttgtaaggtcagtc 17851638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 142 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 14771866 - 14771594
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| || |||||  | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14771866 gaatcacgccggaatgagagggatcccgaagccgtgtaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 14771767  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| | | || ||||| |||||||||  ||||||||    
T  14771766 aagatccatattctttttggtaatctattccataagaactccacagttaagtgtgctagacgtggagtagtctttggatgagtgacctactcggaagttt 14771667  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatg 414  Q
     || ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||    
T  14771666 accagtaaacgtacgagcgaggacaaaacacgctgataagactcatgttggtttgtagagtcagtcgacaatg 14771594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 142 - 329
Target Start/End: Original strand, 15929581 - 15929768
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||| | ||| |  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15929581 gaatcacatcagaataagagagatcctaatgccttgtatgtattggactacatggttgaatgaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaac 15929680  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacct 329  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  15929681 aaaatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttaacatgaagcaattttgggatgggtgacct 15929768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 460 - 613
Target Start/End: Original strand, 8070537 - 8070690
Alignment:
Q  460 aagattcatgtcccaacagcccctgcgacaaatcacaacaagcattttaagccctttcgagcccaatagaacccgcacaccgcgaaccacactagcacaa 559  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  8070537 aagattcatgtcccaacaacctctgcgacaaatcacaacaagcattttaagcccttttgagcccaacagaactcgcacactgcaaaccacactagcacaa 8070636  T
Q  560 caacgacgagtttctaaactagaaccacgacccccgacgacggcgaaggcagac 613  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8070637 cagcgatgagtttctaaactagaaccacgacccccgacgacggcgaaggcagac 8070690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 142 - 291
Target Start/End: Original strand, 3652485 - 3652634
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3652485 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtctgatactacctatatcaac 3652584  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaa 291  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3652585 aagatgcatcttctttttggtagttcattccataagaactccacagttaa 3652634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 283
Target Start/End: Original strand, 27334156 - 27334301
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27334156 aactgaatcacaccggaacgagagggttcctgaggtcgtgcaggtatggaactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatat 27334255  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactcc 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27334256 caacaagatgaatcttcttttcggtagctcattccataagaactcc 27334301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 283
Target Start/End: Original strand, 27394896 - 27395041
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394896 aactgaatcacaccggaacgagagggttcctgaggtcgtgcaggtatggaactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatat 27394995  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactcc 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394996 caacaagatgaatcttcttttcggtagctcattccataagaactcc 27395041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 142 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 33775151 - 33774866
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||  |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  33775151 gaatcacactggaatgagagtgatcgcgaggccgtgcaagtatgtgaccgcatggttgaaggaaggattataagaattgtctggtgctacctatatcaac 33775052  T
Q  242 aaga--tgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagt 339  Q
    ||||  ||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || | | || ||||||||||||||| | |||||    
T  33775051 aagagatgcatcttctttttgatagtccattccataagaactccacagttaagtgtgtttgacttgcagtagtctttggatgggtgacctactgagaagt 33774952  T
Q  340 ttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacag 439  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||| |||||||               |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  33774951 ttttcggtaagcgtgcgagtgaggaaaaaacac---------------gttggtttgtagggtcagtcggcaatgtttaaagtcgtctgggatgttacag 33774867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 144 - 421
Target Start/End: Original strand, 20735696 - 20735973
Alignment:
Q  144 atcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaa 243  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||| | ||  | ||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20735696 atcacatcataatgagagggatcttgagactgtgtaggtatgtgactacatgattgtaggaaggcttataagaattgtttgatactacttatatcaacaa 20735795  T
Q  244 gatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcc 343  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||| |   || |||||||| |||| |  ||||||||||    
T  20735796 gatgcatcttcttttcggtagtccattctataaaaactccatagttaagtgtggttggcttggagtagcctttggatgggtaaccttcaaggaagtttcc 20735895  T
Q  344 cggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaag 421  Q
     || |||  ||| | ||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  20735896 aggaaagcatgcaattgaggacaaaacacgctaaaaagacttgcgtcggtttgtggggtcagttgacaatcctgaaag 20735973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 278 - 438
Target Start/End: Original strand, 3652658 - 3652818
Alignment:
Q  278 aactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctga 377  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  3652658 aactccacagttaagcttgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgggaagcttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaaaaagctga 3652757  T
Q  378 aaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  3652758 aaagactcttgttggtttgtagggtcagttgacaatgcttaaagttgtctgagatgttaca 3652818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 242 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 2891340 - 2891161
Alignment:
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||| | | || |||||||||||||||   || ||||    
T  2891340 aagatgcatctttgttttggtagcccattccataaaaactccacagttaaatgtgcttgatttggagtagtctttggatgggtgacctactacgatgttt 2891241  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagt 422  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  2891240 cc-ggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagattcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagt 2891161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 145 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 28065982 - 28065687
Alignment:
Q  145 tcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaag 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||  |   ||| ||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  28065982 tcacatcggaatgagagggatcctaaggtcgtgtagaaatgagactgtatgattgaatgaaagcttataagaattgtttggtactatctctatcaacaag 28065883  T
Q  245 atgcatc---ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||   || |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||  || |||||||    
T  28065882 atgcatctttttttttttggtagcttattccataagaactccacaattaagcatgtttgactttgagcagttttgtgatgggtaacctttcgagaagttt 28065783  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
     |||  ||| ||| || ||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||| ||  ||||||| ||| |||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  28065782 -ccgaaaagcgtgtgaatgatgacaaaacacgctaaaaaatctcatgttggattacggggtcaatcgacaatacttaaagttgtctgcgatgttaca 28065687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 137 - 409
Target Start/End: Original strand, 12194324 - 12194593
Alignment:
Q  137 aaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||  |||||||| |||||| ||| ||||||| | || ||||| |||| |||||    
T  12194324 aaaccgaatcacattggaatgagaggaatcctgagaccgtgcagatatga-actgcatgattgaagaaagacttataa-atttttttggcactatctata 12194421  T
Q  237 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggga 336  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||||||    | |    
T  12194422 tcaacaagatgcatcttcttttttataattcattccataagaactccacagttaagcatgtttgacatggagcaattttaggatggatgaccttttagaa 12194521  T
Q  337 agtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgg 409  Q
    ||||| || | ||  ||| ||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12194522 agttttccagaaaacgtgtgagtttggacaaaacacactgaaaagactcatgttggttt-tggggtcagtcgg 12194593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 137 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31821844 - 31821704
Alignment:
Q  137 aaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 236  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  31821844 aaaccgaatcacatcggaatgagagggatcatgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttataagaattatttggtactaactata 31821745  T
Q  237 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataag 277  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  31821744 tcaacaagatgcatcttttttttggtagctcattccataag 31821704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 181 - 407
Target Start/End: Original strand, 1991591 - 1991817
Alignment:
Q  181 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 280  Q
    ||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1991591 gtatgagactacatggttggaagaaggcttacaagaattgtttggtattacatatctaaacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaac 1991690  T
Q  281 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaa 380  Q
    | ||||||||| | |  |||| |||||| | |||| ||||||||||||| | |  |||||| |||  |||  || |||||| ||||||  ||||||||||    
T  1991691 ttcacagttaaacattattgatttggagtagtttttggatgggtgaccttctgaaaagttttccgaaaagcatgtgagtgaagacaaagtacgctgaaaa 1991790  T
Q  381 gactcgtgttggtttgtggggtcagtc 407  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||    
T  1991791 aactcgtgttgatttgtgggatcagtc 1991817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 142 - 436
Target Start/End: Original strand, 17205338 - 17205631
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||| || |    |||||  |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  17205338 gaatcacatcggaattagagggattttgagaccatggtggtatgaaactgcatgattgaatgaagaattataagaattgtttggtactacctttaccaac 17205437  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    | ||||||    
T  17205438 aagattcatcttgtttt-ggtagcccattccataagaactccattgttaaacatgcttgatttggagtaattttgggatgggagacctttatgaaagttt 17205536  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgtta 436  Q
      ||| ||   |||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| || ||||| || ||| ||||||    
T  17205537 ttcggaaaacatgcgagtgagaacaaaacacaccgaaaagactcgcgttgatttgcgggattagtcggcaattctcaaagttgtttggaatgtta 17205631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 181 - 438
Target Start/End: Original strand, 20732616 - 20732872
Alignment:
Q  181 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 280  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  20732616 gtatgtgactacatggttgtaggaaggcttataagaattatttggtactacctatattaataatatgcatattcttttcggtagcccattcaataaaaac 20732715  T
Q  281 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaa 380  Q
    || || |||||| ||||||||||||||| | | ||    |||||||| |   | |||||||||  | |||  |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20732716 tctacggttaagagtgcttgacttggagtagtcttttattgggtgacattgtgagaagtttcctagaaagcttgcgagtgaggaaaaaacacactgaaaa 20732815  T
Q  381 gactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |  | ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| | | || |||||||||    
T  20732816 g-tttgtgttggtttgtggggtcattcagcaatcctgaaagcattatgtgatgttaca 20732872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9440591 - 9440485
Alignment:
Q  126 gcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgg 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9440591 gcttctagggaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatgggacttcatggttgaatgaaggcttataagaattgtttgg 9440492  T
Q  226 tactacc 232  Q
    |||||||    
T  9440491 tactacc 9440485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 193 - 413
Target Start/End: Original strand, 28583013 - 28583234
Alignment:
Q  193 atggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaag 292  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28583013 atggttgaatgaaggcttataagaattatttgatacgatctatatcaacaagatgcatcatctttccggtagttcattccataagaaatccacagctaag 28583112  T
Q  293 cgtgcttgacttgg-agcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttg 391  Q
     || |||||| ||| |  | | || | ||| || || | | || ||||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||     
T  28583113 tgtccttgacatggaattagtctttgtatgagttactttctggaaagtttcccagaaagcgtgtgagtggggacaaaacatactgaaaagactcatgtta 28583212  T
Q  392 gtttgtggggtcagtcggcaat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28583213 gtttgtggggtcagtcggcaat 28583234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 117 - 315
Target Start/End: Original strand, 32292860 - 32293055
Alignment:
Q  117 tcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataaga 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| |  | |||||| ||||||||||  ||||| ||  ||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32292860 tcctggcat-cttctaggcaaaccaaattcacattggaatgagagaaatccttagatcgtgcaggtatgagactgcatggttgaatgaaggcttataaga 32292958  T
Q  217 attgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttt 315  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||  ||| | ||||  |||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  32292959 attgtttggtactacctataccaacaaaatacatcttgtttttagtaacacatt--ataagaactccatagttaagcgaacttgactttgagcaatttt 32293055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 289 - 436
Target Start/End: Original strand, 3653048 - 3653191
Alignment:
Q  289 taagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtg 388  Q
    |||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||     
T  3653048 taagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctatcgagaagtttcccgataagcgtgcgag----gacaaaacacgctgaaaagactcgta 3653143  T
Q  389 ttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgtta 436  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  3653144 ttggtttgtagggtcaatcggcaatgcttaaaatcgtctgggatgtta 3653191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 162 - 282
Target Start/End: Original strand, 15929218 - 15929338
Alignment:
Q  162 ggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcgg 261  Q
    |||||||||||||||  | ||||| |||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15929218 ggatcctgaggccgtttaggtatgagactacaaggttgaagaaaagcttataagaattgtttggtaatgcctatatcaataagatgcatattcttttcgg 15929317  T
Q  262 tagctcattccataagaactc 282  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15929318 tagctcattccataagaactc 15929338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 182 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 3885194 - 3884977
Alignment:
Q  182 tatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaact 281  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| || |||||| ||   ||||||| ||||||||||||||    
T  3885194 tatgagactgcatagttgaaggaatgcttaaaagaattgtttggtactacatatactaacaaaatacatcttttt---ggtagcttattccataagaact 3885098  T
Q  282 ccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaag 381  Q
     || |||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |  |  |||  |||||   |||  || |||||||||||||||||| || ||||    
T  3885097 tcaaagttgaacgtgcttgacttggagcaattttgagataggtgacatttc--gaaagttcccaagaagcatgtgagtgaggacaaaacacgatgtaaag 3885000  T
Q  382 actcgtgttggtttgtggggtca 404  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  3884999 acttgtgttggtttgtagggtca 3884977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 201
Target Start/End: Original strand, 13490055 - 13490179
Alignment:
Q  77 tgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgt 176  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||| ||    
T  13490055 tgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtccggctcctgacatgcttctaggaaaaacttaatcacatcgaaatgagagagatcatgaggctgt 13490154  T
Q  177 acatgtatgggactgcatggttgaa 201  Q
     || |||| ||||||||||||||||    
T  13490155 gcaggtataggactgcatggttgaa 13490179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 270 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 31416107 - 31415951
Alignment:
Q  270 tccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaa 369  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||  || ||   || ||||||| ||  ||  ||| ||||||||||||||    
T  31416107 tccataagaactccacaattaagcgtgtttgacttagattagttttgggatggacgatcttatggaaagtttctcgaaaaacgtgtgagtgaggacaaaa 31416008  T
Q  370 cacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||    
T  31416007 cacgctgaaaaga-tcgtgttggtttgtgggatcagtcggcaatacttaaagttgtct 31415951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 30729947 - 30729807
Alignment:
Q  181 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 280  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||  |||||||||| |||||   |||| ||||||||    
T  30729947 gtatgagacagcatggttgaaggaggactcataaaaattgtttggtactacgtatataaacatgattgatcttcttttgggtagtcaattctataagaac 30729848  T
Q  281 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatg 321  Q
    |  | |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  30729847 tttatagttaagcgttcttgaatttgagcaattttgggatg 30729807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 215
Target Start/End: Original strand, 3652981 - 3653051
Alignment:
Q  145 tcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3652981 tcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactgcatggttgaacgaaggcttataag 3653051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 356 - 438
Target Start/End: Original strand, 15929352 - 15929434
Alignment:
Q  356 gagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  15929352 gagtgaggacaaaatacgctaaaaagacttgtgttgatttgtggggtcactcggcaatccttaaagcagtctgggatgttaca 15929434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 355 - 413
Target Start/End: Original strand, 27334305 - 27334363
Alignment:
Q  355 cgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27334305 cgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcgacaat 27334363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 355 - 413
Target Start/End: Original strand, 27395045 - 27395103
Alignment:
Q  355 cgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27395045 cgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcgacaat 27395103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 363 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 6331294 - 6331219
Alignment:
Q  363 gacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||    
T  6331294 gacaaaacatgctggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatcttgaaagcagtctgagatgttaca 6331219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 343 - 409
Target Start/End: Original strand, 11062029 - 11062095
Alignment:
Q  343 ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgg 409  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  11062029 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctaaaaaaactcgtgttggtttgtagggttagtcgg 11062095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 357 - 438
Target Start/End: Original strand, 21312453 - 21312533
Alignment:
Q  357 agtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  21312453 agtgaagacaaaaca-gctgaaaagactggtgttggtttgtagggtcagtcgacaatggttaaagtcgtctgggatgttaca 21312533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 325
Target Start/End: Original strand, 33470882 - 33471019
Alignment:
Q  187 gactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccaca 286  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||| ||| ||  |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  33470882 gacttcatggttaaaggaagacttattaga-ttacttggtattacctatactaacaagatgcatattcttttttgtagttcattacataagaattccaca 33470980  T
Q  287 gttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtg 325  Q
    |||| ||||| ||||||| ||    ||||||||||||||    
T  33470981 gttatgcgtgtttgactttgaaattttttgggatgggtg 33471019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 286
Target Start/End: Original strand, 10964342 - 10964447
Alignment:
Q  181 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 280  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||  || ||||||| ||||||| | ||||||| |||    
T  10964342 gtatgagactgtatggtagaagaaagacttacaagaattgtttggtactacatatatcaataaaataaatattctttttggtagcttaatccataaaaac 10964441  T
Q  281 tccaca 286  Q
    ||||||    
T  10964442 tccaca 10964447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 34660585 - 34660468
Alignment:
Q  212 taagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaa 311  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||| |||| |||||||||| ||  |||||||||   |||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||    
T  34660585 taagagttgtttggtattatctatatcgacaatatgcatcttccttctggtagctcaaatcatacgaactccatagttaagcatacttgacttgaagcaa 34660486  T
Q  312 ttttgggatgggtgacct 329  Q
     |||  ||||||||||||    
T  34660485 gttttagatgggtgacct 34660468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 379 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31821702 - 31821643
Alignment:
Q  379 aagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||    
T  31821702 aagactcgtgttggtttgtatggtcagtcggcaatgcttaaagtcatatgggatgttaca 31821643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 228
Target Start/End: Original strand, 9441061 - 9441135
Alignment:
Q  154 aatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtac 228  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| ||  |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9441061 aatgagaggaatcctaaagccgtgcagatatgtgactacatgattgaaggaaagcttataagaattgtttggtac 9441135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 21311871 - 21311916
Alignment:
Q  67 ttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtc 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  21311871 ttggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcgggaagtggtc 21311916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 2446 - 2061
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| | | || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2446 tgtaatgcctccgcttggtgggtatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccagcttctagcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcg 2347  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2346 gaatgagaaggatcctaaggccgtgcaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 2247  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  2246 tcttttcggtagcttattccataagaactcaatagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttttccggtaagcg 2147  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||    
T  2146 tgcgagtgaggacaaaacacattgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagttgtctgggatgttaca 2061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 2608 - 2555
Alignment:
Q  51 agtgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacggg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2608 agtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggg 2555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 66)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 53 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 35759844 - 35759459
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  35759844 tgtaacgcctccacttggtgggtatgtaacgcccgaggctgatgacggcggggagtggtctggctcctagcatgcttctaggaaaaattgaatcacatcg 35759745  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35759744 gaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 35759645  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  35759644 tcttttcggtagctcattccataagaacttcatagttaaacgtgcttgacttggagctattttgggattggtgacctaccgggaagtttttcggtaagcg 35759545  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  35759544 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttttggggtcagtcggcaatcatgaaagtagtctggggtgttaca 35759459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20054683 - 20054387
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20054683 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 20054584  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20054583 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 20054484  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20054483 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 20054387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20055139 - 20054843
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20055139 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 20055040  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20055039 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 20054940  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20054939 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 20054843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20055595 - 20055299
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20055595 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 20055496  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20055495 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 20055396  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20055395 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 20055299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20056051 - 20055755
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20056051 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 20055952  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20055951 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 20055852  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20055851 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 20055755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20056507 - 20056211
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20056507 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 20056408  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20056407 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 20056308  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20056307 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 20056211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20057410 - 20057114
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20057410 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 20057311  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20057310 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 20057211  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20057210 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 20057114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 138 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20057870 - 20057570
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20057870 aactgaatcacaccgaaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 20057771  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20057770 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 20057671  T
Q  338 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttac 437  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20057670 gtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttac 20057571  T
Q  438 a 438  Q
    |    
T  20057570 a 20057570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20054227 - 20053931
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20054227 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 20054128  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20054127 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgactaggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 20054028  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
     | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20054027 tctggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 20053931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 76 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 46693950 - 46693586
Alignment:
Q  76 atgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaact-gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggcc 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||  || || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  46693950 atgtaacacccgaggctgatgagggctaggagtggtccgactcttgtcatgcttctaggcaaaagttgaatcacatcggaatgagagggatcctaaggtc 46693851  T
Q  175 gtacatgtatgggactgc-atggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattcca 273  Q
    || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  46693850 gtgcatgtatgggactgtgatggttgaaggaaggcttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtatctcatttca 46693751  T
Q  274 taagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacg 373  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  46693750 taataactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggaaagtttcccggtatgcgtgcgagtgaggacaaaacacg 46693651  T
Q  374 ctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  46693650 ctgaaaagacccgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaagcagtttgggatgttaca 46693586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 142 - 439
Target Start/End: Original strand, 38340905 - 38341202
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38340905 gaatcacaccggaatgagatggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 38341004  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38341005 aagatgcatcttcatttcggtagctcattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactgggaagttt 38341104  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacag 439  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  38341105 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgcggaaaagactcgtgttggtttatggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacag 38341202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20845808 - 20845512
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20845808 gaatcacaccggaatgagacggttcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgttactacctatatcaac 20845709  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20845708 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagaaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 20845609  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||    
T  20845608 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcttgaaagcagtctgagatgttaca 20845512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 52250205 - 52250501
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52250205 gaatcacaccggaatgagagggatcatgaggccttgtaggtatgggactacatggtcgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 52250304  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52250305 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttggaatgggtgacctaccgggaagttt 52250404  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52250405 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 52250501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 181 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20056924 - 20056667
Alignment:
Q  181 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20056924 gtatgggactgcagggttgaaggaaggcttatgagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 20056825  T
Q  281 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaa 380  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20056824 tccacagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaa 20056725  T
Q  381 gactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20056724 gactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 20056667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 50002854 - 50002558
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50002854 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaggccgtgtaggcatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 50002755  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  50002754 aagatgcatcttcttttcggtagctcattctttaagaactccatagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgggatggatgacctaccgggaagttc 50002655  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  50002654 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaagtcgtctaggatgttaca 50002558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 50003222 - 50002926
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  50003222 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgcaggtataggactgcatggttaaagggagacttataataattgttgggtactacctatatcaac 50003123  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50003122 aagatgcatcttcttttcagtagctcattccaaaagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctaccgggaagttt 50003023  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  50003022 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcagcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 50002926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16452080 - 16451784
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16452080 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtaggggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 16451981  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16451980 aagatgcatcttcttttcggtagttcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggaaagttt 16451881  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
     ||  |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16451880 tccaataagcgtgcgcgtgatgacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 16451784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16461233 - 16460937
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16461233 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtaggggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 16461134  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16461133 aagatgcatcttcttttcggtagttcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggaaagttt 16461034  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
     ||  |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16461033 tccaataagcgtgcgcgtgatgacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 16460937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 55 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 35761148 - 35760845
Alignment:
Q  55 taacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcgga 154  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||  ||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  35761148 taacgcctccgcttggtgggtatgtaacgtccgaggctgatgagggtggcgagtggtctggctcctggcatgcttctaggaaaaattgaatcacatcgga 35761049  T
Q  155 atgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc 254  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35761048 atgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc 35760949  T
Q  255 ttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtg 354  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  35760948 tttttggtagctcattccatgagaactccgtagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtaacctatcgggaagtttcccggtaagcgtg 35760849  T
Q  355 cgag 358  Q
    ||||    
T  35760848 cgag 35760845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 198 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 20060431 - 20060188
Alignment:
Q  198 tgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgc 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20060431 tgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagtgtgc 20060332  T
Q  298 ttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20060331 ttgacttggatcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttttccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgatggaaagactcgtgttggtttgt 20060232  T
Q  398 ggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttacagaa 441  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20060231 ggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctggggtgttacagaa 20060188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 153 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 51373010 - 51372732
Alignment:
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  51373010 gaatgagagggatcccgaggccatacaggtatgtgactgtatggttgaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatatcgacaagatgcatct 51372911  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| |    
T  51372910 tattttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaattttgggatgggtgacctatcaggaagtttttcggtaagcg 51372811  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctggga 431  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| |||||    
T  51372810 tgcgagtgaggacaaaatccgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcaatcggcaatcttgaaagcagtatggga 51372732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 241 - 438
Target Start/End: Original strand, 52250641 - 52250838
Alignment:
Q  241 caagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52250641 caagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtt 52250740  T
Q  341 tcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52250741 tcccggtaagtgtgcgagtgaagacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 52250838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 241 - 438
Target Start/End: Original strand, 52250978 - 52251175
Alignment:
Q  241 caagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52250978 caagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtt 52251077  T
Q  341 tcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52251078 tcccggtaagtgtgcgagtgaagacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 52251175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 67 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20061413 - 20061188
Alignment:
Q  67 ttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatc 166  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20061413 ttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcttggcaatcttctaggctaaactgaatcacatcagaatgagagggatc 20061314  T
Q  167 ctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagct 266  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20061313 ctgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagct 20061214  T
Q  267 cattccataagaactccacagttaag 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  20061213 cattccataagaactccacagttaag 20061188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 43057211 - 43056916
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43057211 gaatcacatcagaatgag-gggatcctaaggccgtgtaggtatgtgactacatggttgaaggaaggcttagaagaattgtttgatactacctatatcaac 43057113  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   | || ||||||||||||||| |||||||||    
T  43057112 aagatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgattgacttagagtggtctttggatgggtgacctactgggaagttt 43057013  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||    
T  43057012 cccggtaagcatgcgagtgaggacaaaacacactgaaaaaacttgtgttggtttgtagggtcagtcggcaattattaaagtcgtcggggatgttaca 43056916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 142 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 43057670 - 43057390
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43057670 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaac 43057571  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | || |||| |||||||||| |||||||||    
T  43057570 aagatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgattgacttggagtggtctttggatcggtgacctactgggaagttt 43057471  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagt 422  Q
    |||||||||  || ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||| || |||||    
T  43057470 cccggtaagcatgtgagtgagaacaaaacacgctaaaaagacttgtgttggtttgtattgtcagtcagcaattcttaaagt 43057390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 53 - 291
Target Start/End: Original strand, 2328225 - 2328463
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  2328225 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacacccaaggctgatgagggcggagagtggtctggctcctggcatgcttttaggcaaaactgaatcacattg 2328324  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2328325 gaatgagagaaattatgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatct 2328424  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaa 291  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2328425 tctttttggtagcacattccataagaactccacagttaa 2328463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 142 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 50002432 - 50002246
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50002432 gaatcacatcggaatgagagggatcatgaggccgtgtaggcatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctttatcaac 50002333  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50002332 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttgagtgtgcttgacttggagcaattttgggattggtgacc 50002246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 61 - 408
Target Start/End: Original strand, 23180649 - 23180995
Alignment:
Q  61 ctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgaga 160  Q
    ||||| |||||||||||||||| | || ||||||||| | |||| |||||||||  |||| | | |||| |||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  23180649 ctccgcttggtgggcatgtaacgctcgtggctgatgaaggcggggagtggtccgactcctagta-gcttataggaaaaattgaatcacattggaatgaga 23180747  T
Q  161 gggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcg 260  Q
    |||||| ||| |||||  | | |||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23180748 gggatcttgaagccgtgtaggaatgggactacgtggttgaaggaatgattataagaattgcttggtactacctatatcaacaagatgtatcttctattcg 23180847  T
Q  261 gtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtg 360  Q
     |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | || ||||||  |   || ||||||||||    
T  23180848 ctagcccattccataagaattccacaattaagcgtgcttgacttggagaaattttgggatgggttaccttctggaaagtttttcaaaaaatgtgcgagtg 23180947  T
Q  361 aggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcg 408  Q
    | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||    
T  23180948 acgacaaaacatgctgaaaagactaatgttggtttgtcgggttagtcg 23180995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 142 - 436
Target Start/End: Original strand, 12883523 - 12883815
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||| || || ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12883523 gaatcacaccggaatgagatggatcccgaggctgtgcaggtatgggactgcatgattgaaggaatacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 12883622  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| || | |||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  12883623 aagatgcattttctttttggtagctcattccataaaaactccacagttaagtgtgtttgacttgaagtagtttttggatggatgacctactgggaagttt 12883722  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgtta 436  Q
    ||| |||||  ||    || |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||| ||||||| |||||  |||| |||||||    
T  12883723 cccagtaagcatg-ttttgtggacaaaacatgctgaaaa-actcgtgttgatttgtaaggtcaatcgacaatgcttaaagtcatctgagatgtta 12883815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 127 - 328
Target Start/End: Original strand, 2634909 - 2635109
Alignment:
Q  127 cttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggt 226  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||  || || ||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||    
T  2634909 cttctaggcaaatc-gaatcacatcggaatgagagggatcatgaggttgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggataactcataagaattgtttggt 2635007  T
Q  227 actacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtga 326  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||| ||||    
T  2635008 actacctataccaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattcaataagaactccacagttaagcgtgtttggcttggagtaatctttggatgagtga 2635107  T
Q  327 cc 328  Q
    ||    
T  2635108 cc 2635109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 143 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 31822809 - 31822577
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 242  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31822809 aatcacatcagaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagatttataagaattatttggtactacatatatcaaca 31822710  T
Q  243 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtt-- 340  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||  |||||||      
T  31822709 atatgcatcttcttttcggtagctcaatccaaaagaactccacagttaagcgtttttgacttggaacaattttgggatggacgacctactcggaagttat 31822610  T
Q  341 -tcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacac 372  Q
     |||| |||   |||||||||||||||||||||    
T  31822609 ttccctgtagacgtgcgagtgaggacaaaacac 31822577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 142 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 30873097 - 30872828
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30873097 gaatcacaccggaatgagagggattctgaggccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaagacttttaagaattgtttgatactacctatatcaac 30872998  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| || | | || ||||||||||||||| |  ||||||    
T  30872997 aagatgcatcttctttttggtagtccattctataagaactccacaattaagcatgcttgacttgcagtagtctttggatgggtgacctactgaaaagttt 30872898  T
Q  342 cccggtaagtgtg---cgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcg 408  Q
    | ||  || | ||   ||||||||||||||||| | |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||    
T  30872897 cacgaaaaatatgtgacgagtgaggacaaaacatgttgaaaagattcatgttaatttgtagggtcagtcg 30872828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 117 - 438
Target Start/End: Original strand, 16907210 - 16907530
Alignment:
Q  117 tcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataaga 216  Q
    |||||||| ||||||||||||| |  ||||| |||  ||||||||||||  |||| | || || |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16907210 tcctggca-gcttctaggcaaacca-aatcatatcaaaatgagagggattttgagactgtgcaggtatgaaactgcatggttgaaagaaggcttataaga 16907307  T
Q  217 attgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttg 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  ||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16907308 attgtttggtactacctatatcaacaagatacatcttcttttcagtggtccattctacaagaactccatagttaagcgtgtttgacttggagcaattttg 16907407  T
Q  317 ggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagt-gaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgc 415  Q
     ||||||||||||   | ||||||||  |  |||  ||| |||  ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  16907408 agatgggtgaccttttgagaagtttcttgaaaagcatgcaagtaaaggacaaaatacactggaaagactcgtgttggtttgtggggtcagccaacaatcc 16907507  T
Q  416 tgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    | |||| ||  ||||||||||||    
T  16907508 ttaaagcagcatgggatgttaca 16907530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 137 - 344
Target Start/End: Original strand, 7548085 - 7548292
Alignment:
Q  137 aaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 236  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||| |||| || ||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||    
T  7548085 aaactgaatcacattgcaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgagactacatgattaaaggaagacttataaaaattgtttggtattaactata 7548184  T
Q  237 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggga 336  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | | || ||||||||||||||||| ||    
T  7548185 tcaacaagatgcatattctttttggtagcccatttgataagaactccacaattaagcgtacttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgaga 7548284  T
Q  337 agtttccc 344  Q
    ||||||||    
T  7548285 agtttccc 7548292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 142 - 308
Target Start/End: Original strand, 12727990 - 12728157
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggt-actacctatatcaa 240  Q
    ||||||||| | ||||| |||||| ||||| | ||  | |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12727990 gaatcacattgaaatgaaagggattctgagactgtgtaggtatgggacaacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggttactgcctatatcaa 12728089  T
Q  241 caagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggag 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12728090 caagatgcatcttcttttcggtagcacattccataagaactccacagttaagcatgcttgacttggag 12728157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 407
Target Start/End: Original strand, 2634449 - 2634730
Alignment:
Q  126 gcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagaggg-atcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttg 224  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||  ||||||| || |||||| || |||||||||||  ||||||||||||    
T  2634449 gcttctagg-aaaaccgaatcacatcgaaatgagaggggatcctgaggttgtgtatgtatgagattgcatgattaaaggaaggcttgcaagaattgtttg 2634547  T
Q  225 gtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggt 324  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| | | || |||||| |    
T  2634548 gtactagctatacaaacaagatgcatcttcttttcgatagtctattcaataagaacttcactgttaaacgtgcttgacttggagtagtctttggatggat 2634647  T
Q  325 gacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtc 407  Q
    ||| | | ||||||||| ||   |||  ||||| ||||||  || |||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  2634648 gacattctgggaagttttccaaaaagcatgcgaatgaggatgaagcacgctgaaaagactcttgtttgtttgtaaggtcagtc 2634730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 142 - 307
Target Start/End: Original strand, 10820591 - 10820758
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10820591 gaatcacatcggagtgagagggattatgaggcggtgtatgtattggactacatggttgaaggaagatttataagaattgtttggtactacctatatcaat 10820690  T
Q  242 aagatgcatc--ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgga 307  Q
    ||||| ||||  || |||||| |  |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  10820691 aagatacatctttttttttcgatgactcatttcataagaaattcacagttaagcgtgcttgacttgga 10820758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 315 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31823093 - 31822970
Alignment:
Q  315 tgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatg 414  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  31823093 tgggatgggtgacctactgggaagtttctcggtaagcatgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcagcaatc 31822994  T
Q  415 ctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    | ||||| | ||||||||||||||    
T  31822993 cagaaagcattctgggatgttaca 31822970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 267 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 35010018 - 35009859
Alignment:
Q  267 cattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggaca 366  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||| ||| |||||||||            |||||||    
T  35010018 cattccataagaactccacggttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgagaattttcccggt------------gaggaca 35009931  T
Q  367 aaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  35009930 aaacacactgaaaaaactcatgttcgtttgtagggtcagtcggcaatgctcaaagtcgtctgggatgttaca 35009859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 181 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16440687 - 16440430
Alignment:
Q  181 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 280  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  16440687 gtatgggaatacatggttgaagaaagacttataagaactgtttgctactaccgataacaacaagatgcatattctttttggtagctcattctataataac 16440588  T
Q  281 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaa 380  Q
    | || ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| || |  | |   |||  ||||  | ||| || ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  16440587 ttcaaagttaagtgtgattgactcgaagcaattttgggatgagtaaggttctaagaaacttcctagaaagcgtacgagtgaggattaaacacgctaaaaa 16440488  T
Q  381 gactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
     ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||| |||||| ||||||||    
T  16440487 aacatgtgttggtttgtgtggtcaatcggcaatatttaaagttgtctggaatgttaca 16440430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 352 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 35760001 - 35759915
Alignment:
Q  352 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  35760001 gtgcgagcgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcatgaaagcagtctgggatgttaca 35759915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 225 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 7230007 - 7229794
Alignment:
Q  225 gtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggt 324  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||| |||| |||    
T  7230007 gtactaactatatcaacacgaagcatcttcatttcggtagttcattacataagaactccatagataagcatgtttgacttggagcaattttaggattggt 7229908  T
Q  325 gacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtag 424  Q
    |||||      ||||||  ||  ||| |||  |||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||   ||||  ||    
T  7229907 gaccttatataaagtttttcgaaaagcgtgaaagtgaggataaaacatgctgaaaaaactcgtgttgctttgtggggtgagtcgtcaatcaagaaaacag 7229808  T
Q  425 tctgggatgttaca 438  Q
    ||| ||||||||||    
T  7229807 tctaggatgttaca 7229794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 181 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16410831 - 16410574
Alignment:
Q  181 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 280  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||  |||| | ||||||    
T  16410831 gtatgggaatgcattgttgaaggaaagcttataagaattatttactactaccaataccaacaagatgcatcttgtttttggtagcctattctagaagaac 16410732  T
Q  281 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaa 380  Q
    | || |||||| | || |||||||||||||| |||||||||  | || | | | |||||||||  | ||| || ||||||| || |||||| | ||||||    
T  16410731 ttcaaagttaaacatgtttgacttggagcaagtttgggatgtttaacattctgagaagtttccaagaaagcgtacgagtgatgataaaacatgttgaaaa 16410632  T
Q  381 gactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
     ||| ||||| |||||||||   ||||| ||||  | ||||| || ||||||||||||    
T  16410631 aacttgtgttagtttgtgggacaagtcgacaatatttaaagtcgtatgggatgttaca 16410574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 297 - 416
Target Start/End: Original strand, 7547791 - 7547910
Alignment:
Q  297 cttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttg 396  Q
    |||||||||||| | | || |||||||||||||||||| ||||||  || |||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  7547791 cttgacttggagtagtgtttggatgggtgacctaccggaaagtttttcgataagcgtgcgagtaaggacaaaacacactgaaaagtctcgtgttgatttg 7547890  T
Q  397 tggggtcagtcggcaatgct 416  Q
    | |||||||||| |||||||    
T  7547891 tagggtcagtcgacaatgct 7547910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 355 - 438
Target Start/End: Original strand, 39582553 - 39582636
Alignment:
Q  355 cgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  39582553 cgagtgaggacaaaacacgctgagaagactcgttttggtttgtaggatcagtcggcaatgcttaaagtagtttgggatgttaca 39582636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 356 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 49996613 - 49996531
Alignment:
Q  356 gagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||    
T  49996613 gagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcttgttagtttgtggggtcagtcggcaatcctaaaagcagtctgagatgttaca 49996531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 843068 - 842905
Alignment:
Q  154 aatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 253  Q
    ||||||||||||| ||||  |||  | ||||| | ||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||    
T  843068 aatgagagggatcatgagatcgtgtaggtatgtgtctgcatgattgaaggaagtcgtgtaagaattgtttggtactatccattccaacaagatgcatgtt 842969  T
Q  254 cttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgg 317  Q
    ||||| | ||| || |  ||||||||||| |||||| | |||||||||||| || |||||||||    
T  842968 ctttttgatagatcgtcacataagaactcaacagttgaacgtgcttgactttgaacaattttgg 842905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 251 - 329
Target Start/End: Original strand, 8278065 - 8278143
Alignment:
Q  251 cttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacct 329  Q
    |||||||| |||||  |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8278065 cttctttttggtagtccatttcataaagactccacagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttgggatgggtgacct 8278143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 31823161 - 31823097
Alignment:
Q  212 taagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataa 276  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31823161 taagaattatttggtactacctatatcaataaaatgcatcttctttttggtagctcattccataa 31823097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 329
Target Start/End: Original strand, 2739560 - 2739708
Alignment:
Q  181 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 280  Q
    ||||| ||||| |||||| | | ||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||   |||   |||||||||||||    
T  2739560 gtatgagactgtatggttaaggaaagacttataagaattgtttagcactacatatatcaacaatatgtatcttcttttttatagtctattccataagaac 2739659  T
Q  281 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacct 329  Q
    | ||  |||||| ||| ||||||| |||||||||||  |||| ||||||    
T  2739660 ttcatggttaagtgtgtttgactttgagcaattttgatatggatgacct 2739708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 28181418 - 28181350
Alignment:
Q  364 acaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggat 432  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||| ||||||| ||| ||||||    
T  28181418 acaaaacactctgaaaagactcgtgttggtttgtggaggcagttgacaatcctgaaagcagtatgggat 28181350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 439 - 550
Target Start/End: Original strand, 30420163 - 30420274
Alignment:
Q  439 gaattgacctccaacacaaataagattcatgtcccaacagcccctgcgacaaatcacaacaagcattttaagccctttcgagcccaatagaacccgcaca 538  Q
    |||| |||| |||||||  | |||||||| || |||||| ||||||| |||||||||  | |||||||| | |||||||||||||||   | ||||||||    
T  30420163 gaatcgaccgccaacacggacaagattcacgtaccaacaacccctgcaacaaatcactgcgagcattttcaaccctttcgagcccaacgaaccccgcaca 30420262  T
Q  539 ccgcgaaccaca 550  Q
    ||| ||||||||    
T  30420263 ccgtgaaccaca 30420274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 315
Target Start/End: Original strand, 42066117 - 42066253
Alignment:
Q  179 atgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataaga 278  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||  || |||||||||||| |  |||||  ||||| ||| |||||||||| ||||||  |  |||||| |    
T  42066117 atgtatgtgactccatggttgaagaaagacttgaaataattgtttggtattttctatactaacaaaatgtatcttctttttggtagcctaaaccataaaa 42066216  T
Q  279 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttt 315  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  42066217 acttcacggttaaacgtgcttgatttgaaacaatttt 42066253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 406
Target Start/End: Original strand, 35168549 - 35168768
Alignment:
Q  181 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 280  Q
    ||||| |||| ||||||| |||| || |||| ||||||| ||| ||||||  |||| ||||||||||||| || ||   | ||  ||||||||| ||| |    
T  35168549 gtatgcgactccatggttaaagggagactta-aagaattattttgtactagatataccaacaagatgcattttttt---gataattcattccattagagc 35168644  T
Q  281 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaa 380  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||| || ||||| || || | | | || ||||  |  ||| ||  |||||||||||||| |||| | |||    
T  35168645 tccacagttaagcgtgtttaacttggagtaattgtgtgatgg-tggcc-atctgaaaatttcttgaaaagagtatgagtgaggacaaaatacgcgggaaa 35168742  T
Q  381 gactcgtgttggtttgtggggtcagt 406  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  35168743 gactcgtattgatttgtggggtcagt 35168768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 43057309 - 43057266
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggt 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  43057309 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgaggacggggagtggt 43057266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 46411211 - 46411173
Alignment:
Q  212 taagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 250  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46411211 taagaattatttggtactacctatatcaataagatgcat 46411173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20054325 - 20054281
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||    
T  20054325 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 20054281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20054781 - 20054737
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||    
T  20054781 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 20054737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20055237 - 20055193
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||    
T  20055237 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 20055193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20055693 - 20055649
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||    
T  20055693 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 20055649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20056149 - 20056105
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||    
T  20056149 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 20056105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20056605 - 20056561
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||    
T  20056605 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 20056561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20057052 - 20057008
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||    
T  20057052 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 20057008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20057508 - 20057464
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtc 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||    
T  20057508 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 20057464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 42317661 - 42317709
Alignment:
Q  179 atgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggta 227  Q
    ||||||| || |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  42317661 atgtatgagattgcacggttaaaggaatgcttataagaattgtttggta 42317709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 53 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 162914 - 162531
Alignment:
Q  53 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 152  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  162914 tgtaacgcctcctcttggtggacatgtaatgcccgaggctgatgagggtggggagtggtctggctcctgacatgcttctaggcaaaactgaattacatcg 162815  T
Q  153 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  162814 gaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgtgactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatct 162715  T
Q  253 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||| |    
T  162714 tcttttcggtagctcattccataagaactccgcagttaagcgtgcttgacttggagcaactttgggatgagtgacctacctggaagtttcgcgataagcg 162615  T
Q  353 tgcgagtgaggacaaaacacgctg-aaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgtt 435  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  162614 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatgggatgtt 162531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 242 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 163181 - 162985
Alignment:
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  163181 aagatgcatcttgttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctatcgggaagttt 163082  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  163081 ctcggtaagcgttcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggccagtcggcaatcctgaaaacagtctgggatgttaca 162985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 239 - 438
Target Start/End: Original strand, 163167 - 163366
Alignment:
Q  239 aacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaag 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  163167 aacaagatgcatcttcttttcggtagctcattctttaagaattccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgagaag 163266  T
Q  339 tttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  163267 tttcccagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtctgtcgacaatcctgaaagtcgtctgggatgttaca 163366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 126 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 69978 - 69666
Alignment:
Q  126 gcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgg 225  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||  ||||||||||||||| || |  | || ||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  69978 gcttctaggtaaagccgattcacatcataatgagagggatcctaagactatgcaggtatgagactgcatcgttgaaggaatgcttataataattgtttgg 69879  T
Q  226 tactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtg 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| | | || |||||||||    
T  69878 tactacctatatcaacatgatgcatctttttttcattagctcattccataagaactccacagttatgcgggcttgactaggagtagtctttggatgggtg 69779  T
Q  326 acctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagt 425  Q
    |||| | |||||||||   || ||| ||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||    
T  69778 accttcagggaagtttatgggaaagcgtgtgagtgatgacaaaccacgctaaaaagactcgtgttggtttgttggttcagtcggcaatcctgaaagcagt 69679  T
Q  426 ctgggatgttaca 438  Q
     ||||||||||||    
T  69678 ttgggatgttaca 69666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 162534 - 162483
Alignment:
Q  387 tgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||| |||||||||    
T  162534 tgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctaaaagcaatctgagatgttaca 162483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 135 - 438
Target Start/End: Original strand, 18958 - 19261
Alignment:
Q  135 caaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactaccta 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18958 caaaactaaatcacatcggaatgagagggatccagaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactaccta 19057  T
Q  235 tatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgg 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19058 tatcaacaagattcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgg 19157  T
Q  335 gaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgt 434  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  19158 gaagtttcccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgt 19257  T
Q  435 taca 438  Q
    ||||    
T  19258 taca 19261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 71 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18339 - 18203
Alignment:
Q  71 tgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctga 170  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18339 tgggcatgtaacgctcgaggcggatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaacactgaatcacatcggaatgagagggatccaga 18240  T
Q  171 ggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaagg 207  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18239 ggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagg 18203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 2741 - 3037
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2741 gaatcacatcgaaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 2840  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2841 aagatgcatattcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggagacctaccgggaagttt 2940  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2941 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagcagtctcggatgttaca 3037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 1219 - 1515
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1219 gaatcacaccggaatgagacggttcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatataaac 1318  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1319 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 1418  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1419 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggcgtcagtcgacaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 1515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0499 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0499
Description:

Target: scaffold0499; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 2198 - 1902
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| | |||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2198 gaatcacaccagaatgaaagggttcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 2099  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2098 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 1999  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || ||||||||||||    
T  1998 cccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaatacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagtcgtttgggatgttaca 1902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 142 - 435
Target Start/End: Original strand, 154756 - 155049
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  154756 gaatcacgccggaatgagagggctcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctgtatcaac 154855  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  154856 aagatgcatcttcttttcagtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttggaatgggtgacctaccgggaagttt 154955  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgtt 435  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  154956 ctcggtaagtgtgctagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgtt 155049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 344 - 438
Target Start/End: Original strand, 154503 - 154597
Alignment:
Q  344 cggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  154503 cggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 154597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 109
Target Start/End: Original strand, 154659 - 154700
Alignment:
Q  68 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  154659 tggtgggcatgtaacacccaaggctgatgagggcggggagtg 154700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 3)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 4560 - 4855
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4560 gaatcacatcggaaggagagggttcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttagaagaattgtttggtactacctatatcaac 4659  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4660 aagatgcatcttcttttcggtagctcattttataagaactccacagttaagtgtgcttaacttggagcaa-tttgggatgggtgacctaccgggaagttt 4758  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  4759 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgactgggatgttaca 4855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 5015 - 5315
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggctt-----ataagaattgtttggtactacctata 236  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||||||||||    
T  5015 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttaaaagagaagaattgtttggtactacctata 5114  T
Q  237 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggga 336  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  5115 ttaacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttaacttggagcaa-tttgggatgggtgacctacctgga 5213  T
Q  337 agtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgtta 436  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5214 aatttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgtta 5313  T
Q  437 ca 438  Q
    ||    
T  5314 ca 5315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 341 - 438
Target Start/End: Original strand, 5320 - 5418
Alignment:
Q  341 tcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaa-cacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  5320 tcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtaagtcgacaatgcttaaagtcgtctaggatgttaca 5418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 76 - 430
Target Start/End: Original strand, 245019 - 245369
Alignment:
Q  76 atgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccg 175  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||| |||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  245019 atgtaacgcccaaggctgatgagggcggggagtggtccggctcttggcatgcatctagaaaaatatgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggcca 245118  T
Q  176 tacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccata 275  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||||    
T  245119 tgtaggtatgggactacatggttgaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc-tttcggtagcctaaaccata 245217  T
Q  276 agaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgct 375  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  245218 agaactccaca---aagcgtgcttgacttagagcaattttgagatgggtgaccttctgggaagtttctcggaaagcgtgtgagtgaggacaaaacacggt 245314  T
Q  376 gaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctggg 430  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  245315 gaaaagactcgtgttggtttgcggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatggg 245369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 76 - 302
Target Start/End: Original strand, 245448 - 245674
Alignment:
Q  76 atgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccg 175  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||    
T  245448 atgtaacacccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcttggttctaggaaaaactgaatcacatcataatgaaagggatcttgagtccg 245547  T
Q  176 tacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccata 275  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||    
T  245548 tgtaggtatgggacttcatggttgaagggatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagcctaaaccata 245647  T
Q  276 agaactccacagttaagcgtgcttgac 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  245648 agaactccacagttaagcgtgcttgac 245674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 271 - 426
Target Start/End: Original strand, 245676 - 245831
Alignment:
Q  271 ccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaac 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  245676 ccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttcgagatgggtgatcttttgggaagtttctcggaaagtgtgtgagtgaggacaaaac 245775  T
Q  371 acgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtc 426  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  245776 acgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgggaatcctgaaagcagtc 245831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 229 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 13593 - 13384
Alignment:
Q  229 tacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13593 tacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaattttgggatgggtgacc 13494  T
Q  329 taccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctg 428  Q
    ||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  13493 taccgggaagtttctttgtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtccg 13394  T
Q  429 ggatgttaca 438  Q
    ||||||||||    
T  13393 ggatgttaca 13384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 242 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14749 - 14553
Alignment:
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14749 aagatgcatcttgttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 14650  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14649 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagccgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 14553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 17745 - 17449
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17745 gaatgacatcagaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 17646  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    | |||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||  | ||||||    
T  17645 aggatgtatcttctttttggtagctcaattcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtactctttggatgggtgacctactcgaaagttt 17546  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| || ||| | |||||| ||||||||    
T  17545 ttcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggttcatagggtcagtcggcaatacttaaaatcgtctggaatgttaca 17449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 138 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 18285 - 17987
Alignment:
Q  138 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18285 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgtgactacatagttgaaggaagacttataagaattgtttgatactacctatat 18186  T
Q  238 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 337  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||  || ||    
T  18185 caacaagatgcatcttttttt-ggtagctaattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctattggaaa 18087  T
Q  338 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttac 437  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  18086 gtttttcggtaaacgtgcgagtgaggacacaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtagggtcaatcgacaatgcttaaagtcgtct-ggatgttac 17988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 52 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 142511 - 142305
Alignment:
Q  52 gtgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 151  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  142511 gtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaggacggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatc 142412  T
Q  152 ggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  142411 ggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgggacttcatggttgaaggaatgtttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 142312  T
Q  252 ttctttt 258  Q
    |||||||    
T  142311 ttctttt 142305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Original strand, 421 - 605
Alignment:
Q  254 cttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgt 353  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  421 cttttcggtagctcattccataaaatctccatagttaagcgtgcttgacatggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccgataagcat 520  T
Q  354 gcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  521 gtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctaaaagtagtctcggatgttaca 605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0557
Description:

Target: scaffold0557; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 192 - 438
Target Start/End: Original strand, 2154 - 2391
Alignment:
Q  192 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaa 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  2154 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactccctatataaacaagatgcatcttctttttggtagcccattccttaagaactccacagttaa 2253  T
Q  292 gcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttg 391  Q
    || |||||||| ||||| | | ||  |||||||||||||||         | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2254 gcatgcttgacatggagtagtcttatgatgggtgacctacc---------ctcggtaagcgtgcgagtgaggagaaaacacgctgaaaagactcgtgttg 2344  T
Q  392 gtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||| || ||||||| |||| || |||| |||||||||| |||||    
T  2345 gtttgtaggatcagtcgacaatcctaaaagcagtctgggattttaca 2391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 174
Target Start/End: Original strand, 749 - 781
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggcc 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  749 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggcc 781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 123; Significance: 7e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 284 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 1706 - 1552
Alignment:
Q  284 acagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagac 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  1706 acagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcatgtgagtgaggacaaaacacgctaaaaagac 1607  T
Q  384 tcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1606 tcgtgttggtttgtggggtcagtcgataatcctgaaagcagtctgggatgttaca 1552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 142 - 422
Target Start/End: Original strand, 14740 - 15019
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |   ||| ||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  14740 gaatcacatcggaacaagagggatcctaatatcgtgcatgtataggactgcagtgttgaaggaatgcttataagaattgtttggtaatacctatatcaat 14839  T
Q  242 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 341  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||   | || ||||||||||||    |||||||||    
T  14840 aagatgcatcgtcttttcggtaattcattgaataagaacttcacagttaagcatgtttgacttggagtggtctttggatgggtgaccatatgggaagttt 14939  T
Q  342 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagt 422  Q
     |||  ||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||  |||||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  14940 tccgaaaaacgtgcgagtgatgacaaaacacgctaaaaagacacgagtatgtttgtgggg-cagtcagcaatcttgaaagt 15019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 141 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 4130 - 4001
Alignment:
Q  141 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaa 240  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4130 tgaatcacaccagaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggactgcattgttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctgtatcaa 4031  T
Q  241 caagatgcatcttcttttcggtagctcatt 270  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4030 caagatgcatcttctttttggtagcccatt 4001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 142 - 255
Target Start/End: Original strand, 23672 - 23785
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 241  Q
    |||||||| || |||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23672 gaatcacaccgaaatgagagggttcttgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 23771  T
Q  242 aagatgcatcttct 255  Q
    ||||||||||||||    
T  23772 aagatgcatcttct 23785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 147 - 413
Target Start/End: Original strand, 26074 - 26338
Alignment:
Q  147 acatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagat 246  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||| || || || |||| |||||||| |  | ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  26074 acatcagaaagagagggatcctaaggccgtgcaggtgtgagacttcatggttgcataatggcttatacaaattttttggtactacatatatcaacatgat 26173  T
Q  247 gcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccgg 346  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| |||| ||    | ||||||| ||     
T  26174 gcatcttctttttggtagctcattttataagaactc--cagttaagtgtgcttgacttggagtatttttaggatgagtgagcttatagaaagtttctcga 26271  T
Q  347 taagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 413  Q
     |||  |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||    
T  26272 aaagcttgcgagggagaacataacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtaggatcaatcggcaat 26338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 413
Target Start/End: Original strand, 16038 - 16314
Alignment:
Q  147 acatcggaatgagagggatcctgaggccgtacat--gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaag 244  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   ||| |||  ||||| || ||||| |||||| || | ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  16038 acatcagaatgagagggatcctgatatcgtgcataggtatgagattgcatagttgaatgatgacttgtaagaattgtttggtgctatctatatcaacatg 16137  T
Q  245 atgcatc---------ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggg 335  Q
    |||| ||         || ||||  ||||| ||||  |||| |||| || |||||| ||||||||||||| | || |||| ||||| |||||||          
T  16138 atgcctcttttttttttttttttttgtagcccattttataaaaacttcatagttaaacgtgcttgacttgaaacagttttaggatgagtgaccttatata 16237  T
Q  336 aagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 413  Q
    |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16238 aagttttccggaaagcttgcaagtgatgacaaaacatgctg-aaaggctcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaat 16314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 203 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 44807 - 44613
Alignment:
Q  203 gaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgac 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||  ||||||||| |||||     |||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  44807 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccattagaactccaaagttaaatgtgcttgac 44708  T
Q  303 ttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||    
T  44707 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttttcctaaaagtgtgcaagtgaggacaaagcacgctgaaagaacccgtattggtttgt 44613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 45193 - 45052
Alignment:
Q  271 ccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaac 370  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||  |||| |  |||||||  ||   ||||||  || ||| |||||| |    
T  45193 ccataagaactccacatttaagtgtgcttgactt-gatcaattttgagatgggaaaccttctcggaagttctccaaaaagtgtatgactgaagacaaagc 45095  T
Q  371 acgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 413  Q
    | |||||||  || ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45094 atgctgaaagaacccgtgttgatttgtggggtcagttggcaat 45052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 211 - 438
Target Start/End: Original strand, 7009 - 7236
Alignment:
Q  211 ataagaattgtttggtactacctat-atcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagc 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||| |||| |  |   ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7009 ataagaattgtttggtactacatattaccaacaagatgcaccttttttttgacaatccaaaccataagaactccacagttaagcatgcttgacttggagc 7108  T
Q  310 aattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgg 409  Q
    |||||||| |||||||||||   || ||||||||||  |||  || ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| |||     
T  7109 aattttggtatgggtgaccttttggaaagtttcccgaaaagcatgtgagtggggac-aaacaaggtgaaaagactcgtgttggcctgtggggtcaatcga 7207  T
Q  410 caatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||| |||||| | |||||| ||||||||    
T  7208 caattctgaaaatcgtctggaatgttaca 7236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 254
Target Start/End: Original strand, 45387 - 45497
Alignment:
Q  143 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 242  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||| |||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45387 aatcacatcggaatgagagg-atcttgagaccgtgcatatatgtgactacattgttgaaggaagacttatgagaattatttggtactacctatatcaaca 45485  T
Q  243 agatgcatcttc 254  Q
    ||||| ||||||    
T  45486 agatgtatcttc 45497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 366 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 63030 - 62968
Alignment:
Q  366 aaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctg 428  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  63030 aaaacacgctgaaaagactcgtattggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagtagtctg 62968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 366 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 67286 - 67214
Alignment:
Q  366 aaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  67286 aaaagacgctaaaaacacttgtgttggtttgtggggtcaatcggcaatcctgaaagcagtctgtgatgttaca 67214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0442 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0442
Description:

Target: scaffold0442; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 436
Target Start/End: Original strand, 1 - 68
Alignment:
Q  369 acacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgtta 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| ||| ||||||||||    
T  1 acacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtaggcaatcctaaaagcagtttgggatgtta 68  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0442; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 142 - 174
Target Start/End: Original strand, 2504 - 2536
Alignment:
Q  142 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggcc 174  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2504 gaatcacatcagaatgagagggatcctgaggcc 2536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 246793 - 246700
Alignment:
Q  261 gtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtg 354  Q
    ||||| || ||||||||||||| | | |||| ||||||| | |||||| | | || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  246793 gtagcccaatccataagaactctataattaatcgtgcttaatttggagtagtctttggatgggtgacctactggtaagtttcccggtaagtgtg 246700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 246701 - 246638
Alignment:
Q  375 tgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagtagtctgggatgttaca 438  Q
    |||||||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  246701 tgaaaagattggtgttggtttgtagtgtctgtcggcaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 246638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 352 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 37250 - 37205
Alignment:
Q  352 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 397  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37250 gtgcgagtgagggaaaaacacgctgaaaagattcgtgttggtttgt 37205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University