View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16249_low_13 (Length: 260)

Name: NF16249_low_13
Description: NF16249
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16249_low_13
NF16249_low_13
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (159-256)||(28372114-28372211)
chr5 (159-255)||(37600041-37600137)
chr5 (159-255)||(38146451-38146547)
chr5 (159-255)||(19510412-19510508)
chr5 (159-255)||(22338962-22339058)
chr5 (159-255)||(33473964-33474060)
chr5 (161-255)||(22335432-22335526)
chr5 (159-255)||(22120624-22120720)
chr5 (159-255)||(23113435-23113531)
chr5 (159-255)||(41878684-41878780)
chr5 (159-255)||(15238150-15238246)
chr5 (162-255)||(24768598-24768691)
chr5 (159-255)||(20294464-20294560)
chr5 (159-242)||(18354760-18354843)
chr5 (159-245)||(19474205-19474291)
chr5 (159-255)||(10751767-10751863)
chr5 (159-255)||(20912285-20912381)
chr5 (181-255)||(22108503-22108577)
chr5 (159-245)||(40727432-40727517)
chr5 (159-255)||(11219505-11219601)
chr5 (159-255)||(11224091-11224187)
chr5 (159-255)||(11227913-11228009)
chr5 (159-255)||(11226107-11226203)
chr5 (159-255)||(11229903-11229999)
chr5 (159-250)||(36459503-36459594)
chr5 (159-214)||(22749152-22749207)
chr5 (10-43)||(23113286-23113319)
chr5 (10-43)||(37599892-37599925)
chr5 (10-42)||(9775014-9775046)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (159-255)||(109551-109647)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (159-255)||(224175-224271)
[»] chr7 (52 HSPs)
chr7 (159-255)||(14420737-14420833)
chr7 (159-255)||(18871247-18871343)
chr7 (162-255)||(15166200-15166293)
chr7 (159-255)||(10897929-10898025)
chr7 (159-255)||(146450-146546)
chr7 (159-255)||(834078-834174)
chr7 (159-255)||(1199258-1199354)
chr7 (159-255)||(16004954-16005050)
chr7 (159-255)||(41283595-41283691)
chr7 (159-255)||(18606285-18606384)
chr7 (159-255)||(838166-838262)
chr7 (159-255)||(1203346-1203442)
chr7 (159-255)||(11660232-11660328)
chr7 (159-255)||(13891580-13891676)
chr7 (159-255)||(16110008-16110104)
chr7 (159-255)||(10607353-10607449)
chr7 (159-255)||(13891963-13892059)
chr7 (159-255)||(16582371-16582467)
chr7 (162-245)||(11302267-11302350)
chr7 (159-255)||(7520248-7520345)
chr7 (159-255)||(39268346-39268442)
chr7 (159-255)||(39721145-39721242)
chr7 (159-255)||(9752540-9752636)
chr7 (159-255)||(15083175-15083272)
chr7 (159-255)||(31675-31771)
chr7 (159-255)||(72404-72500)
chr7 (159-255)||(76513-76609)
chr7 (159-255)||(12706155-12706251)
chr7 (159-255)||(12713490-12713586)
chr7 (159-255)||(12722148-12722244)
chr7 (159-255)||(16908542-16908638)
chr7 (159-255)||(18277944-18278040)
chr7 (159-255)||(18281908-18282004)
chr7 (159-255)||(18424185-18424281)
chr7 (159-255)||(2531365-2531460)
chr7 (159-255)||(2833514-2833610)
chr7 (159-255)||(12717237-12717333)
chr7 (159-245)||(26291116-26291203)
chr7 (159-241)||(45171533-45171615)
chr7 (159-250)||(15213003-15213094)
chr7 (179-255)||(9752644-9752720)
chr7 (159-214)||(20486733-20486788)
chr7 (159-215)||(25928404-25928460)
chr7 (159-224)||(1860054-1860119)
chr7 (159-215)||(13919445-13919501)
chr7 (159-205)||(16185524-16185570)
chr7 (10-43)||(146662-146695)
chr7 (10-43)||(10897780-10897813)
chr7 (10-43)||(18871459-18871492)
chr7 (179-215)||(9752728-9752764)
chr7 (10-42)||(23666425-23666457)
chr7 (179-215)||(39268450-39268486)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (159-255)||(15533169-15533265)
chr4 (159-255)||(18211554-18211650)
chr4 (159-255)||(24048417-24048513)
chr4 (159-255)||(36036902-36036998)
chr4 (159-255)||(28384801-28384897)
chr4 (159-255)||(30145733-30145829)
chr4 (159-255)||(49549115-49549212)
chr4 (159-255)||(17052478-17052574)
chr4 (159-255)||(22634959-22635055)
chr4 (159-255)||(20158480-20158576)
chr4 (159-255)||(20163931-20164027)
chr4 (159-255)||(13813865-13813961)
chr4 (159-255)||(13818353-13818449)
chr4 (159-240)||(12422908-12422989)
chr4 (159-255)||(4562806-4562902)
chr4 (159-255)||(5758488-5758584)
chr4 (159-255)||(9555019-9555115)
chr4 (159-255)||(14759024-14759120)
chr4 (159-255)||(14955792-14955888)
chr4 (159-255)||(15223496-15223592)
chr4 (159-255)||(20161156-20161252)
chr4 (179-255)||(24048521-24048597)
chr4 (159-255)||(33740786-33740882)
chr4 (159-255)||(12486221-12486317)
chr4 (159-255)||(23996999-23997094)
chr4 (159-255)||(25688392-25688488)
chr4 (159-242)||(17807017-17807100)
chr4 (161-255)||(38106897-38106990)
chr4 (179-255)||(13818457-13818533)
chr4 (159-215)||(631780-631836)
chr4 (159-205)||(10711825-10711871)
chr4 (159-205)||(10925595-10925641)
chr4 (173-241)||(40906323-40906391)
chr4 (159-205)||(27532752-27532798)
chr4 (162-215)||(14047308-14047361)
chr4 (173-241)||(38106798-38106866)
chr4 (179-215)||(22635063-22635099)
chr4 (179-224)||(13813969-13814014)
chr4 (179-224)||(13818541-13818586)
chr4 (10-43)||(15533381-15533414)
chr4 (10-43)||(18211787-18211820)
chr4 (10-43)||(36037114-36037147)
chr4 (10-42)||(30145947-30145979)
[»] chr3 (63 HSPs)
chr3 (159-255)||(14764828-14764924)
chr3 (159-255)||(3801920-3802016)
chr3 (159-255)||(23372576-23372672)
chr3 (159-255)||(51299483-51299579)
chr3 (159-255)||(54519547-54519643)
chr3 (159-255)||(41084-41180)
chr3 (159-255)||(9532208-9532304)
chr3 (159-255)||(10834974-10835070)
chr3 (159-255)||(13435768-13435864)
chr3 (159-255)||(18899400-18899499)
chr3 (159-255)||(20249882-20249978)
chr3 (159-255)||(29545971-29546067)
chr3 (159-255)||(12853396-12853492)
chr3 (159-255)||(16795453-16795549)
chr3 (159-255)||(8928900-8928996)
chr3 (159-255)||(11301698-11301794)
chr3 (159-255)||(5219797-5219893)
chr3 (159-255)||(19774148-19774244)
chr3 (159-255)||(38312890-38312985)
chr3 (159-255)||(7108188-7108284)
chr3 (159-255)||(7112123-7112219)
chr3 (159-255)||(11068563-11068659)
chr3 (159-255)||(11167126-11167222)
chr3 (159-242)||(12304136-12304220)
chr3 (159-242)||(16326074-16326158)
chr3 (159-255)||(22320079-22320175)
chr3 (159-255)||(22335134-22335230)
chr3 (159-255)||(28948411-28948507)
chr3 (159-255)||(55021326-55021422)
chr3 (159-245)||(11853666-11853752)
chr3 (159-255)||(30064334-30064431)
chr3 (159-255)||(4108822-4108918)
chr3 (159-255)||(4112671-4112767)
chr3 (159-255)||(14664375-14664471)
chr3 (159-255)||(14667539-14667635)
chr3 (159-255)||(15616127-15616223)
chr3 (159-255)||(12337206-12337302)
chr3 (159-255)||(14497898-14497993)
chr3 (159-255)||(16751934-16752030)
chr3 (159-250)||(11912382-11912473)
chr3 (159-245)||(18933388-18933475)
chr3 (159-241)||(15963461-15963543)
chr3 (159-241)||(15967385-15967467)
chr3 (159-241)||(15971309-15971391)
chr3 (159-214)||(14670017-14670072)
chr3 (159-214)||(14681541-14681596)
chr3 (173-255)||(15564801-15564883)
chr3 (161-250)||(16840238-16840327)
chr3 (159-215)||(15463868-15463924)
chr3 (173-241)||(15555602-15555670)
chr3 (159-205)||(4590193-4590239)
chr3 (159-205)||(8491765-8491811)
chr3 (159-205)||(17318542-17318588)
chr3 (159-215)||(23173287-23173343)
chr3 (205-255)||(17348806-17348856)
chr3 (161-205)||(14068097-14068141)
chr3 (10-43)||(3802132-3802165)
chr3 (10-43)||(9532420-9532453)
chr3 (10-43)||(12304336-12304369)
chr3 (10-43)||(14764679-14764712)
chr3 (10-43)||(23372427-23372460)
chr3 (10-43)||(29545801-29545834)
chr3 (10-43)||(51299695-51299728)
[»] chr2 (22 HSPs)
chr2 (159-255)||(10686279-10686375)
chr2 (159-255)||(19663590-19663686)
chr2 (159-255)||(20260207-20260303)
chr2 (159-255)||(9240624-9240720)
chr2 (159-255)||(6481734-6481830)
chr2 (159-255)||(6485201-6485297)
chr2 (159-255)||(37378986-37379082)
chr2 (159-255)||(21074540-21074636)
chr2 (159-255)||(10103329-10103425)
chr2 (159-255)||(12902639-12902735)
chr2 (159-255)||(24630080-24630176)
chr2 (159-255)||(24645101-24645197)
chr2 (159-255)||(24647044-24647140)
chr2 (159-255)||(24647877-24647973)
chr2 (159-255)||(30346690-30346786)
chr2 (159-245)||(27381026-27381112)
chr2 (159-245)||(27384996-27385082)
chr2 (159-255)||(27600321-27600417)
chr2 (159-255)||(31343867-31343963)
chr2 (159-241)||(41532475-41532557)
chr2 (159-215)||(9783984-9784040)
chr2 (10-43)||(20260419-20260452)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (162-255)||(8729645-8729738)
chr8 (159-255)||(11774246-11774342)
chr8 (159-255)||(363218-363314)
chr8 (159-255)||(8415009-8415105)
chr8 (159-255)||(27942718-27942814)
chr8 (159-255)||(23427776-23427872)
chr8 (159-255)||(21409850-21409947)
chr8 (159-255)||(21804342-21804439)
chr8 (159-255)||(14399125-14399221)
chr8 (159-255)||(21829493-21829589)
chr8 (159-255)||(21974216-21974312)
chr8 (159-255)||(43250152-43250248)
chr8 (159-240)||(44385866-44385947)
chr8 (159-255)||(21978326-21978422)
chr8 (159-255)||(22110551-22110647)
chr8 (159-241)||(18864137-18864219)
chr8 (159-241)||(30941597-30941679)
chr8 (159-215)||(23913255-23913311)
chr8 (159-244)||(21328527-21328612)
chr8 (162-250)||(42560917-42561005)
chr8 (159-205)||(21386159-21386205)
chr8 (159-205)||(21968025-21968071)
chr8 (159-205)||(21980865-21980911)
chr8 (159-205)||(21985848-21985894)
chr8 (159-205)||(22000811-22000857)
chr8 (159-205)||(22009229-22009275)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (159-255)||(150-246)
[»] scaffold0544 (2 HSPs)
scaffold0544 (159-255)||(3549-3645)
scaffold0544 (195-255)||(1-61)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (159-255)||(4475745-4475841)
chr6 (159-255)||(12941171-12941267)
chr6 (159-255)||(23955319-23955415)
chr6 (159-255)||(27222782-27222878)
chr6 (159-255)||(28290927-28291023)
chr6 (159-255)||(22075423-22075519)
chr6 (159-255)||(14470831-14470927)
chr6 (159-255)||(23537931-23538027)
chr6 (159-255)||(27416560-27416656)
chr6 (161-255)||(31479497-31479591)
chr6 (159-255)||(8242362-8242458)
chr6 (159-255)||(11565351-11565447)
chr6 (159-255)||(11716973-11717069)
chr6 (159-255)||(12620366-12620462)
chr6 (159-255)||(23988253-23988349)
chr6 (159-255)||(27555490-27555585)
chr6 (159-255)||(23400627-23400724)
chr6 (159-255)||(16758665-16758761)
chr6 (159-255)||(22947617-22947713)
chr6 (159-255)||(22951573-22951669)
chr6 (159-255)||(23870061-23870157)
chr6 (159-255)||(23874017-23874113)
chr6 (159-241)||(23393605-23393687)
chr6 (159-241)||(23413513-23413595)
chr6 (159-255)||(22861705-22861801)
chr6 (159-232)||(19869160-19869233)
chr6 (159-250)||(1254114-1254205)
chr6 (159-250)||(34297805-34297896)
chr6 (159-245)||(16622797-16622881)
chr6 (159-255)||(25737842-25737938)
chr6 (161-215)||(2076276-2076330)
chr6 (159-205)||(18918613-18918659)
chr6 (159-205)||(18953516-18953562)
chr6 (179-215)||(23537887-23537923)
chr6 (10-43)||(4475958-4475991)
chr6 (10-43)||(12941383-12941416)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (159-255)||(32649017-32649113)
chr1 (159-255)||(16370875-16370971)
chr1 (161-255)||(29533837-29533931)
chr1 (162-255)||(20439188-20439281)
chr1 (159-255)||(22132131-22132227)
chr1 (159-255)||(33795983-33796079)
chr1 (159-255)||(1009212-1009308)
chr1 (159-255)||(1926828-1926924)
chr1 (159-255)||(16376848-16376944)
chr1 (159-255)||(20925842-20925938)
chr1 (159-245)||(20230171-20230258)
chr1 (159-255)||(41389697-41389793)
chr1 (159-255)||(39245203-39245297)
chr1 (159-255)||(39248758-39248852)
chr1 (159-255)||(52634218-52634314)
chr1 (159-215)||(41801311-41801367)
chr1 (159-205)||(21406253-21406299)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (159-250)||(10854-10945)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (162-255)||(37568-37661)
scaffold0124 (159-255)||(25600-25696)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (159-255)||(5192-5288)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (159-255)||(33887-33983)
scaffold0080 (159-209)||(28468-28518)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (162-255)||(8775-8868)
[»] scaffold1852 (1 HSPs)
scaffold1852 (159-255)||(853-949)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (159-245)||(14804-14890)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (159-255)||(5563-5659)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (159-255)||(18773-18869)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (159-255)||(70705-70801)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (162-255)||(11095-11188)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (159-255)||(11001-11097)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (159-255)||(60358-60454)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (159-255)||(11727-11823)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (159-255)||(34160-34256)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (159-255)||(68588-68684)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (159-241)||(15607-15689)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (159-255)||(5775-5871)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (159-250)||(4076-4167)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (159-242)||(8540-8623)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (159-215)||(6993-7049)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (159-255)||(6353-6448)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (159-215)||(74364-74420)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (171-255)||(115390-115473)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (159-206)||(37235-37282)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (159-207)||(10765-10813)
[»] scaffold0380 (1 HSPs)
scaffold0380 (159-205)||(3974-4020)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (159-205)||(23970-24016)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (159-205)||(62872-62918)
[»] scaffold1873 (2 HSPs)
scaffold1873 (196-255)||(641-700)
scaffold1873 (179-207)||(605-633)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (159-205)||(37230-37276)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (159-250)||(163600-163691)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (185-215)||(21390-21420)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 159 - 256
Target Start/End: Original strand, 28372114 - 28372211
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtc 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28372114 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtc 28372211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 37600041 - 37600137
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37600041 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 37600137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 38146451 - 38146547
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38146451 acttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 38146547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19510508 - 19510412
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19510508 acttgatgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgctaatggaacgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 19510412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22339058 - 22338962
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22339058 acttgatgatggttatgttacgttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaataatgatgt 22338962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 33473964 - 33474060
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33473964 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 33474060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22335526 - 22335432
Alignment:
Q  161 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22335526 ttgatgatggttatgttacgttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaataatgatgt 22335432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 22120624 - 22120720
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120624 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 22120720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 23113435 - 23113531
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23113435 acttgatgatgattgtgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 23113531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 41878684 - 41878780
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41878684 acttgatgatagttatgttaagttgataagttgtcttttatttatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 41878780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 15238150 - 15238246
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15238150 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 15238246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 162 - 255
Target Start/End: Original strand, 24768598 - 24768691
Alignment:
Q  162 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  24768598 tgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattaatattatgaattaatgatgt 24768691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20294560 - 20294464
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20294560 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 20294464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18354843 - 18354760
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattat 242  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18354843 acttgatgatgtttatgttaagttgataaattgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattat 18354760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 159 - 245
Target Start/End: Original strand, 19474205 - 19474291
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 245  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19474205 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaa 19474291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10751863 - 10751767
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  10751863 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcaagaaatgataatgagatggttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 10751767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 20912285 - 20912381
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  20912285 acttgatgatgtgtatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattgttatgaattaatgatgt 20912381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 255
Target Start/End: Original strand, 22108503 - 22108577
Alignment:
Q  181 ttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22108503 ttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 22108577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 245
Target Start/End: Original strand, 40727432 - 40727517
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40727432 acttgatgatg-ttatgttaagttgataagttatcttttattcatgaattgataaagagatgtttgatgaataattattattatgaa 40727517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11219601 - 11219505
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||    
T  11219601 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtactattacgaattaatgatgt 11219505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11224187 - 11224091
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||    
T  11224187 acttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtactattacgaattaatgatgt 11224091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11228009 - 11227913
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||    
T  11228009 acttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtactattacgaattaatgatgt 11227913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11226203 - 11226107
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||    
T  11226203 acttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgatcatgagatgtttgatgaataagtactattacgaattaatgatgt 11226107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11229999 - 11229903
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||    
T  11229999 acttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgatcatgagatgtttgatgaataagtactattacgaattaatgatgt 11229903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 36459594 - 36459503
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 250  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  36459594 acttaatgatgattatgttaagttgataagttgttccttattcatgttttgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 36459503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22749207 - 22749152
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||    
T  22749207 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcctatattcatgagttgttaat 22749152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 43
Target Start/End: Original strand, 23113286 - 23113319
Alignment:
Q  10 attattctgagaagatgtttatgatattgattac 43  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23113286 attattatgagaagatgtttatgatattgattac 23113319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 43
Target Start/End: Original strand, 37599892 - 37599925
Alignment:
Q  10 attattctgagaagatgtttatgatattgattac 43  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37599892 attattatgagaagatgtttatgatattgattac 37599925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 9775046 - 9775014
Alignment:
Q  10 attattctgagaagatgtttatgatattgatta 42  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9775046 attattatgagaagatgtttatgatattgatta 9775014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 109647 - 109551
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109647 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 109551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 224175 - 224271
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  224175 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 224271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 52)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14420833 - 14420737
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14420833 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 14420737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18871343 - 18871247
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18871343 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 18871247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 162 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15166293 - 15166200
Alignment:
Q  162 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15166293 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 15166200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 10897929 - 10898025
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10897929 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttatgaataattattattatgaaatgatgatgt 10898025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 146546 - 146450
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146546 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctactcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 146450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 834078 - 834174
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  834078 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 834174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 1199258 - 1199354
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1199258 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 1199354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16005050 - 16004954
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16005050 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttcgatgaataactattattatgaaatgatgatgt 16004954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 41283691 - 41283595
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41283691 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaaaaattattattatgaaatgatgatgt 41283595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18606384 - 18606285
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattatta---ttatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  18606384 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattattatgaaatgatgatgt 18606285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 838166 - 838262
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  838166 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaataaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 838262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 1203346 - 1203442
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1203346 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaataaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 1203442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11660328 - 11660232
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11660328 acttgatgatggttatgttaagttggtaagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaaattatgatgt 11660232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13891676 - 13891580
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13891676 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 13891580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 16110008 - 16110104
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16110008 acttgatgatggttatgttaagttgataagttatcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 16110104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 10607353 - 10607449
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10607353 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttagtcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 10607449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13892059 - 13891963
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13892059 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttttgcatgaattgctaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 13891963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16582467 - 16582371
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16582467 acttgatgatggttatgataagttgataagttgtctttttttcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 16582371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 162 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11302350 - 11302267
Alignment:
Q  162 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11302350 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgtaatgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 11302267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 7520248 - 7520345
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7520248 acttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 7520345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 39268346 - 39268442
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39268346 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgccttttattcatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 39268442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 39721242 - 39721145
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39721242 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 39721145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 9752540 - 9752636
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9752540 acttggtgatggttatgttaagttgataagttgccttttattcatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 9752636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15083272 - 15083175
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaag-ttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15083272 acttgatgatggttatgttaaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 15083175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31771 - 31675
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31771 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 31675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 72404 - 72500
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  72404 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 72500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 76513 - 76609
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  76513 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 76609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 12706155 - 12706251
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12706155 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12706251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 12713586 - 12713490
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12713586 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12713490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 12722244 - 12722148
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12722244 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12722148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 16908542 - 16908638
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16908542 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 16908638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18278040 - 18277944
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18278040 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattgatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 18277944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18282004 - 18281908
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18282004 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattgatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 18281908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18424281 - 18424185
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18424281 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatggttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 18424185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 2531365 - 2531460
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2531365 acttgatgatg-ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataaagagatgttttatgaataattattattatgaattaatgatgt 2531460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 2833514 - 2833610
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2833514 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgttcaatgaataattattattatgaattaatgatgt 2833610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 12717333 - 12717237
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12717333 acttgctgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12717237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26291203 - 26291116
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26291203 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattaataatgagatgtttgacgaataattattattatgaa 26291116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 45171533 - 45171615
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 241  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  45171533 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatta 45171615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15213094 - 15213003
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15213094 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 15213003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 179 - 255
Target Start/End: Original strand, 9752644 - 9752720
Alignment:
Q  179 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9752644 agttgataagttgtcttttatccatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 9752720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20486788 - 20486733
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20486788 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 20486733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 215
Target Start/End: Original strand, 25928404 - 25928460
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25928404 actttatgatggttatgttaagttgataagttgttttttattcatgaattgctaatg 25928460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 224
Target Start/End: Original strand, 1860054 - 1860119
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttg 224  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  1860054 acttgatgacgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttg 1860119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 215
Target Start/End: Original strand, 13919445 - 13919501
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 215  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13919445 acttgatgacgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 13919501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16185570 - 16185524
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 205  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16185570 acttgatgagggtcatgttaagttgataagtcgtcttctattcatga 16185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 146695 - 146662
Alignment:
Q  10 attattctgagaagatgtttatgatattgattac 43  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  146695 attattatgagaagatgtttatgatattgattac 146662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 43
Target Start/End: Original strand, 10897780 - 10897813
Alignment:
Q  10 attattctgagaagatgtttatgatattgattac 43  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10897780 attattatgagaagatgtttatgatattgattac 10897813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 18871492 - 18871459
Alignment:
Q  10 attattctgagaagatgtttatgatattgattac 43  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18871492 attattatgagaagatgtttatgatattgattac 18871459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 215
Target Start/End: Original strand, 9752728 - 9752764
Alignment:
Q  179 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  9752728 agttgataagttatcttttattcatgaattgataatg 9752764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 42
Target Start/End: Original strand, 23666425 - 23666457
Alignment:
Q  10 attattctgagaagatgtttatgatattgatta 42  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23666425 attattatgagaagatgtttatgatattgatta 23666457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 215
Target Start/End: Original strand, 39268450 - 39268486
Alignment:
Q  179 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 215  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  39268450 agttgataagttgtcttctattcatgagttgctaatg 39268486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15533265 - 15533169
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533265 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 15533169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18211650 - 18211554
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18211650 acttgatgatggttatgttgagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 18211554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 24048417 - 24048513
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24048417 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 24048513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 36036998 - 36036902
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36036998 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttcatgaataattattattatgaaatgatgatgt 36036902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28384897 - 28384801
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28384897 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgaggaataattattattatgaaatgatgatgt 28384801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 30145829 - 30145733
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30145829 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 30145733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 49549115 - 49549212
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataa-gttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49549115 acttgatgatggttatgttaagttgataccgttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 49549212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 17052478 - 17052574
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17052478 acttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 17052574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 22634959 - 22635055
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22634959 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 22635055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 20158480 - 20158576
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20158480 acttgatgatgcttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 20158576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 20163931 - 20164027
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20163931 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 20164027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 13813865 - 13813961
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13813865 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgccttttgttcatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 13813961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 13818353 - 13818449
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13818353 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgcattttattcatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 13818449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12422989 - 12422908
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12422989 acttgatgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattatt 12422908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 4562806 - 4562902
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4562806 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 4562902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 5758488 - 5758584
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5758488 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 5758584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9555115 - 9555019
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  9555115 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 9555019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 14759024 - 14759120
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14759024 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 14759120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 14955792 - 14955888
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14955792 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 14955888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15223592 - 15223496
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15223592 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatggttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 15223496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 20161156 - 20161252
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20161156 acttgataatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcaagaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 20161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 179 - 255
Target Start/End: Original strand, 24048521 - 24048597
Alignment:
Q  179 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24048521 agttgctaagttgtcttttattcatgaattgttaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 24048597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 33740882 - 33740786
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33740882 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 33740786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 12486317 - 12486221
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12486317 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgatgatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12486221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 23996999 - 23997094
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  23996999 acttgatgatggttatgt-aagttgataagttctcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataatcattattatgaattaatgatgt 23997094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25688488 - 25688392
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  25688488 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 25688392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17807100 - 17807017
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattat 242  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17807100 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattat 17807017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 38106990 - 38106897
Alignment:
Q  161 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  38106990 ttgatgatgtttatgttaagttgataaattgtctttcattcatgagttgctaat-gaatgtttgatgaagaattattattatgaattaatgatgt 38106897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 179 - 255
Target Start/End: Original strand, 13818457 - 13818533
Alignment:
Q  179 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13818457 agttgataagttgtcttttatccatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 13818533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 215
Target Start/End: Original strand, 631780 - 631836
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  631780 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtattctattcatgagttgctaatg 631836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10711871 - 10711825
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10711871 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 10711825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10925641 - 10925595
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10925641 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 10925595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40906391 - 40906323
Alignment:
Q  173 atgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  40906391 atgttaagttgttaagttgtcttctattcataagttgctaatgaaatgttttatgaagaattattatta 40906323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27532798 - 27532752
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27532798 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgccttctattcatga 27532752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14047361 - 14047308
Alignment:
Q  162 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  14047361 tgatgatgattatgttaagttgataagttgtattttattcatgagttgttaatg 14047308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 38106866 - 38106798
Alignment:
Q  173 atgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||    
T  38106866 atgttaagttgttaagttgtcttctatttatgagttgctaatgagatgttttatgaagaattattatta 38106798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 215
Target Start/End: Original strand, 22635063 - 22635099
Alignment:
Q  179 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22635063 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 22635099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 179 - 224
Target Start/End: Original strand, 13813969 - 13814014
Alignment:
Q  179 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttg 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||    
T  13813969 agttgataagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgtttg 13814014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 179 - 224
Target Start/End: Original strand, 13818541 - 13818586
Alignment:
Q  179 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttg 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||    
T  13818541 agttgataagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgtttg 13818586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 15533414 - 15533381
Alignment:
Q  10 attattctgagaagatgtttatgatattgattac 43  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15533414 attattatgagaagatgtttatgatattgattac 15533381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 18211820 - 18211787
Alignment:
Q  10 attattctgagaagatgtttatgatattgattac 43  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18211820 attattatgagaagatgtttatgatattgattac 18211787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 36037147 - 36037114
Alignment:
Q  10 attattctgagaagatgtttatgatattgattac 43  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36037147 attattatgagaagatgtttatgatattgattac 36037114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 30145979 - 30145947
Alignment:
Q  10 attattctgagaagatgtttatgatattgatta 42  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30145979 attattatgagaagatgtttatgatattgatta 30145947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 63)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 14764828 - 14764924
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14764828 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 14764924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3802016 - 3801920
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3802016 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 3801920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 23372576 - 23372672
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23372576 acttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 23372672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 51299579 - 51299483
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51299579 acttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 51299483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 54519643 - 54519547
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54519643 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 54519547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 41180 - 41084
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41180 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgaggaataattattattatgaaatgatgatgt 41084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9532304 - 9532208
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9532304 acttgatgatggttatgttgagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 9532208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 10834974 - 10835070
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10834974 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaatttctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 10835070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13435864 - 13435768
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13435864 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 13435768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18899499 - 18899400
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgc---taatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18899499 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaataatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 18899400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 20249882 - 20249978
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20249882 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatattcgatgaataactattattatgaaatgatgatgt 20249978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 29545971 - 29546067
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29545971 acttgatgatggttgtgttaagttgataagttgtcttttagtcatgaattgctaatggaaggtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 29546067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 12853396 - 12853492
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12853396 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 12853492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16795549 - 16795453
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16795549 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagacgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 16795453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 8928900 - 8928996
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8928900 acttgatggtggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatggactgctaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 8928996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 11301698 - 11301794
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11301698 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 11301794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 5219893 - 5219797
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5219893 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagacgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 5219797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19774244 - 19774148
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19774244 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 19774148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 38312890 - 38312985
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat-ggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38312890 acttgatgatggttatgttaagtttataagttgtcttttattcatgaa-tgctaatgggaatgttcgatgaat-attattattatgaaatgatgatgt 38312985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7108284 - 7108188
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  7108284 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 7108188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7112219 - 7112123
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  7112219 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 7112123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11068659 - 11068563
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11068659 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 11068563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 11167126 - 11167222
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11167126 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 11167222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12304220 - 12304136
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataat-tattattat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12304220 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtattttattcatgaattgctgatggaatgtttgatgaattatatattattat 12304136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 242
Target Start/End: Original strand, 16326074 - 16326158
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataat-tattattat 242  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16326074 acttgatgagggttatgtcaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaattatatattattat 16326158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22320175 - 22320079
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22320175 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 22320079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22335230 - 22335134
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22335230 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 22335134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28948507 - 28948411
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28948507 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 28948411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 55021422 - 55021326
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  55021422 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 55021326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 159 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11853752 - 11853666
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11853752 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcacgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaa 11853666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 30064431 - 30064334
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  30064431 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattaataatgagatgtttgacgaataattattattatgaattaatgatgt 30064334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 4108822 - 4108918
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4108822 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatatttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 4108918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 4112671 - 4112767
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4112671 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatatttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 4112767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14664471 - 14664375
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||    
T  14664471 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattatatttatgaattaatgatgt 14664375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14667635 - 14667539
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||    
T  14667635 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattatatttatgaattaatgatgt 14667539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15616223 - 15616127
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15616223 acttgaagatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 15616127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 12337302 - 12337206
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgga-atgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12337302 acttgatgatgtttatgttaaattgata-gttgtcttttattcatgaattgataattgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 12337206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14497993 - 14497898
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14497993 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-ttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 14497898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 16751934 - 16752030
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16751934 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttatcttttattcatcaaatgataatgagatggttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 16752030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11912473 - 11912382
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  11912473 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 11912382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 245
Target Start/End: Original strand, 18933388 - 18933475
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  18933388 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtattttattcatgaattaataatgagatgtttgacgaataattattattatgaa 18933475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15963543 - 15963461
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 241  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  15963543 acttgatgatgtttatgttaaattaataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatta 15963461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15967467 - 15967385
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 241  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  15967467 acttgatgatgtttatgttaaattaataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatta 15967385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15971391 - 15971309
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 241  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  15971391 acttgatgatgtttatgttaaattaataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatta 15971309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14670072 - 14670017
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14670072 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 14670017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14681596 - 14681541
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14681596 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 14681541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15564883 - 15564801
Alignment:
Q  173 atgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||  |||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15564883 atgttaagttgatgtgttgtcttctgttcatgagttgctaatgaaatgttttatgaagaattattattatgaattgatgatgt 15564801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 250
Target Start/End: Original strand, 16840238 - 16840327
Alignment:
Q  161 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  ||  ||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  16840238 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagattcttgctgaataattattgttatgaattgat 16840327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15463924 - 15463868
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 215  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15463924 acttgatgacgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 15463868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15555670 - 15555602
Alignment:
Q  173 atgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  15555670 atgttaagttgttaagttgtcttatattcatgagttgctaatgagatgtttgatgaagaattattatta 15555602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 205
Target Start/End: Original strand, 4590193 - 4590239
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4590193 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 4590239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 205
Target Start/End: Original strand, 8491765 - 8491811
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8491765 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 8491811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 205
Target Start/End: Original strand, 17318542 - 17318588
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17318542 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 17318588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23173343 - 23173287
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  23173343 acttgatgatagttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgagttgttaatg 23173287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 255
Target Start/End: Original strand, 17348806 - 17348856
Alignment:
Q  205 aattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17348806 aattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 17348856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 205
Target Start/End: Original strand, 14068097 - 14068141
Alignment:
Q  161 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14068097 ttgatgatggttatgttaagtcgataagttgtcttctattcatga 14068141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 3802165 - 3802132
Alignment:
Q  10 attattctgagaagatgtttatgatattgattac 43  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3802165 attattatgagaagatgtttatgatattgattac 3802132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 9532453 - 9532420
Alignment:
Q  10 attattctgagaagatgtttatgatattgattac 43  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9532453 attattatgagaagatgtttatgatattgattac 9532420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 12304369 - 12304336
Alignment:
Q  10 attattctgagaagatgtttatgatattgattac 43  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12304369 attattatgagaagatgtttatgatattgattac 12304336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 43
Target Start/End: Original strand, 14764679 - 14764712
Alignment:
Q  10 attattctgagaagatgtttatgatattgattac 43  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14764679 attattatgagaagatgtttatgatattgattac 14764712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 43
Target Start/End: Original strand, 23372427 - 23372460
Alignment:
Q  10 attattctgagaagatgtttatgatattgattac 43  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23372427 attattatgagaagatgtttatgatattgattac 23372460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 43
Target Start/End: Original strand, 29545801 - 29545834
Alignment:
Q  10 attattctgagaagatgtttatgatattgattac 43  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29545801 attattatgagaagatgtttatgatattgattac 29545834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 51299728 - 51299695
Alignment:
Q  10 attattctgagaagatgtttatgatattgattac 43  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51299728 attattatgagaagatgtttatgatattgattac 51299695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 10686279 - 10686375
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10686279 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 10686375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 19663590 - 19663686
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19663590 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 19663686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20260303 - 20260207
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20260303 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 20260207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9240720 - 9240624
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9240720 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 9240624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 6481830 - 6481734
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6481830 acttgatgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgctaatggaacgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 6481734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 6485297 - 6485201
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6485297 acttgatgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgctaatggaacgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 6485201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 37379082 - 37378986
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37379082 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaaaaattattattatgaaatgatgatgt 37378986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 21074540 - 21074636
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21074540 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaaaaaaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 21074636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 10103329 - 10103425
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  10103329 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 10103425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 12902639 - 12902735
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12902639 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12902735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 24630080 - 24630176
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24630080 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 24630176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24645197 - 24645101
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24645197 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattggtaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 24645101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24647140 - 24647044
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24647140 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattggtaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 24647044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24647973 - 24647877
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24647973 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattggtaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 24647877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 30346690 - 30346786
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  30346690 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 30346786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 159 - 245
Target Start/End: Original strand, 27381026 - 27381112
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 245  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381026 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaa 27381112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 159 - 245
Target Start/End: Original strand, 27384996 - 27385082
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 245  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27384996 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaa 27385082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27600417 - 27600321
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  27600417 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattgttatgaattaatgatgt 27600321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31343963 - 31343867
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31343963 acttgatgatgtatatgttaagttgataagctgtcttttattcatgaattgataaagagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 31343867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 41532475 - 41532557
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 241  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  41532475 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatta 41532557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9784040 - 9783984
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9784040 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 9783984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 20260452 - 20260419
Alignment:
Q  10 attattctgagaagatgtttatgatattgattac 43  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20260452 attattatgagaagatgtttatgatattgattac 20260419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 162 - 255
Target Start/End: Original strand, 8729645 - 8729738
Alignment:
Q  162 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8729645 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 8729738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11774342 - 11774246
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11774342 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 11774246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 363314 - 363218
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  363314 acttgttgatggttatgttaagatgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 363218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 8415009 - 8415105
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8415009 acttgattagggttattttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 8415105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 27942718 - 27942814
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27942718 acttgatgatggttatgataagttaataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 27942814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23427872 - 23427776
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23427872 acttaatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaaatgtttgatgaataattattattataaattgatgatgt 23427776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21409947 - 21409850
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21409947 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 21409850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21804439 - 21804342
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21804439 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 21804342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 14399125 - 14399221
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||    
T  14399125 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaattaatgatgt 14399221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 21829493 - 21829589
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21829493 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 21829589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 21974216 - 21974312
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21974216 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 21974312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 43250248 - 43250152
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43250248 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 43250152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 44385866 - 44385947
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatt 240  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  44385866 acttgatgatgattatgttaacttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattatt 44385947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 21978326 - 21978422
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21978326 acttgatgatgtttatgttatattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 21978422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22110647 - 22110551
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22110647 acttgatgatttttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 22110551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 18864137 - 18864219
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 241  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  18864137 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatta 18864219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 30941597 - 30941679
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 241  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  30941597 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcataaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatta 30941679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23913311 - 23913255
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23913311 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 23913255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21328612 - 21328527
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatga 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  21328612 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatgcttgttgaataattattgttatga 21328527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 250
Target Start/End: Original strand, 42560917 - 42561005
Alignment:
Q  162 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  42560917 tgatggtggttatgttaagttgacaagttgttccttattcatgcattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 42561005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21386205 - 21386159
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21386205 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21386159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 205
Target Start/End: Original strand, 21968025 - 21968071
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21968025 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21968071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 205
Target Start/End: Original strand, 21980865 - 21980911
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21980865 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21980911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 205
Target Start/End: Original strand, 21985848 - 21985894
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21985848 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21985894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 205
Target Start/End: Original strand, 22000811 - 22000857
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22000811 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 22000857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 205
Target Start/End: Original strand, 22009229 - 22009275
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 205  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22009229 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 22009275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 246 - 150
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  246 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgtaatgatgatgt 150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 3549 - 3645
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3549 acttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 3645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 255
Target Start/End: Original strand, 1 - 61
Alignment:
Q  195 tttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 tttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 61  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4475841 - 4475745
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4475841 acttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 4475745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 12941267 - 12941171
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12941267 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctgatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 12941171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23955415 - 23955319
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23955415 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 23955319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27222878 - 27222782
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27222878 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttcgatgaataactattattatgaaatgatgatgt 27222782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 28290927 - 28291023
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28290927 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcataaattgctaattgaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 28291023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 22075423 - 22075519
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  22075423 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 22075519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14470927 - 14470831
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14470927 acttgatgatgtttatgttaggttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 14470831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23538027 - 23537931
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23538027 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcccttattcgtgaattgttaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 23537931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 27416560 - 27416656
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27416560 acttgatgatgtttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 27416656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 255
Target Start/End: Original strand, 31479497 - 31479591
Alignment:
Q  161 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31479497 ttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 31479591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8242458 - 8242362
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  8242458 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 8242362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11565447 - 11565351
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11565447 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 11565351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 11716973 - 11717069
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11716973 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 11717069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 12620366 - 12620462
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12620366 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12620462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23988349 - 23988253
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23988349 acttgatgatgtttatattaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 23988253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27555585 - 27555490
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27555585 acttgatgatgtttatgttaagttgata-gttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 27555490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23400724 - 23400627
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  23400724 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcctttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattataaagtaatgatgt 23400627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16758761 - 16758665
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16758761 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgatagtgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 16758665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22947713 - 22947617
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22947713 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 22947617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22951669 - 22951573
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22951669 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 22951573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23870157 - 23870061
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23870157 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 23870061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23874113 - 23874017
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23874113 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 23874017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23393687 - 23393605
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 241  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  23393687 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatta 23393605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23413595 - 23413513
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 241  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  23413595 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatta 23413513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22861801 - 22861705
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  22861801 acttggtgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattatgattatgaattaatgatgt 22861705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19869233 - 19869160
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataa 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  19869233 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataa 19869160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 1254205 - 1254114
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1254205 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgttaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 1254114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 250
Target Start/End: Original strand, 34297805 - 34297896
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  34297805 acttgctgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 34297896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16622881 - 16622797
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16622881 acttgatgatgtttatgttaagttgataagtt--cttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaatgattatcattatgaa 16622797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25737938 - 25737842
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||| | ||||||| |||| ||||    
T  25737938 acttgatgatgattatgctaagttgataagttgtcccttattcatgtattgctaatgagatgcttgctgaataattactgttatgaattgataatgt 25737842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2076330 - 2076276
Alignment:
Q  161 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  2076330 ttgatgatgattatgttaagttgataagttgttttttattcatgaattgataatg 2076276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 205
Target Start/End: Original strand, 18918613 - 18918659
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18918613 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 18918659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 205
Target Start/End: Original strand, 18953516 - 18953562
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18953516 acttgatgatgattatgttaagtcgataagttgtcttctattcatga 18953562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23537923 - 23537887
Alignment:
Q  179 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23537923 agttgctaagttgtcttttattcatgaattgctaatg 23537887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 4475991 - 4475958
Alignment:
Q  10 attattctgagaagatgtttatgatattgattac 43  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4475991 attattatgagaagatgtttatgatattgattac 4475958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 12941416 - 12941383
Alignment:
Q  10 attattctgagaagatgtttatgatattgattac 43  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12941416 attattatgagaagatgtttatgatattgattac 12941383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 32649113 - 32649017
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32649113 acttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 32649017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16370971 - 16370875
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16370971 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttcgatgaataactattattatgaaatgatgatgt 16370875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 29533931 - 29533837
Alignment:
Q  161 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29533931 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 29533837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 162 - 255
Target Start/End: Original strand, 20439188 - 20439281
Alignment:
Q  162 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20439188 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgtattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 20439281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 22132131 - 22132227
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22132131 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 22132227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 33796079 - 33795983
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33796079 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgatatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 33795983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1009308 - 1009212
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1009308 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 1009212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 1926828 - 1926924
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1926828 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 1926924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 16376848 - 16376944
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16376848 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 16376944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 20925842 - 20925938
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20925842 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 20925938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 245
Target Start/End: Original strand, 20230171 - 20230258
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20230171 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattaataatgagatgtttgatgaataattattattatgaa 20230258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 41389697 - 41389793
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  41389697 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgttttttattcatgaaatgataatgagatggttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 41389793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 39245203 - 39245297
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39245203 acttgatgatgtttatgttaagttgataagtt--cttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 39245297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 39248758 - 39248852
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39248758 acttgatgatgtttatgttaagttgataagtt--cttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 39248852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 52634314 - 52634218
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  52634314 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttattttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 52634218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 215
Target Start/End: Original strand, 41801311 - 41801367
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41801311 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 41801367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21406299 - 21406253
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21406299 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21406253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 250
Target Start/End: Original strand, 10854 - 10945
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10854 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 10945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 162 - 255
Target Start/End: Original strand, 37568 - 37661
Alignment:
Q  162 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37568 tgatgatggttatgttaagttgatacgttgtcttttattcatgtattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 37661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 25600 - 25696
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25600 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgtgatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 25696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 5288 - 5192
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5288 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtctattattcatgaaatgctaatggaatgtttgatgaataattattatgatgaattgatgatgt 5192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 33983 - 33887
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33983 acttgatgatcgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 33887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28518 - 28468
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattg 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28518 acttgatgatcgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattg 28468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 162 - 255
Target Start/End: Original strand, 8775 - 8868
Alignment:
Q  162 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8775 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattataaaatgatgatgt 8868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 853 - 949
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  853 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 159 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14890 - 14804
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14890 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaa 14804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 5563 - 5659
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  5563 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattgttattatgaattaatgatgt 5659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18869 - 18773
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  18869 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcatttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattgttattataaattgatgatgt 18773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 70801 - 70705
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  70801 acttgatgatgtttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 70705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 162 - 255
Target Start/End: Original strand, 11095 - 11188
Alignment:
Q  162 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  11095 tgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattaatattatgaattaatgatgt 11188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11097 - 11001
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11097 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 11001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 60358 - 60454
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  60358 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 60454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11823 - 11727
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11823 acttgatgatgcttatgttaagttgatatgttgtcttttatacatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 11727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 34160 - 34256
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34160 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgatgatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 34256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 68588 - 68684
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  68588 acttgatggtgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 68684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 15607 - 15689
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattatta 241  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  15607 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattatta 15689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 5871 - 5775
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgga-atgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  5871 acttgatgatgtttatgttaagttgata-gttgtcttttattcatgaattgataattgagacgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 5775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4167 - 4076
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  4167 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 4076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8623 - 8540
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattat 242  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  8623 acttgatgatgtttatgttaagttaataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaatgattattattat 8540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 215
Target Start/End: Original strand, 6993 - 7049
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6993 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 7049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 6353 - 6448
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  6353 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-ttgatgaataactattattatgaattaatgatgt 6448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 215
Target Start/End: Original strand, 74364 - 74420
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  74364 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgagttgctaatg 74420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 171 - 255
Target Start/End: Original strand, 115390 - 115473
Alignment:
Q  171 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  115390 ttatgttaagttgata-gttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtatttttatgaattgatgatgt 115473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 206
Target Start/End: Original strand, 37235 - 37282
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37235 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaa 37282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10813 - 10765
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10813 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtattttattcatgaat 10765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0380 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0380
Description:

Target: scaffold0380; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4020 - 3974
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4020 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 3974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 205
Target Start/End: Original strand, 23970 - 24016
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23970 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 24016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 205
Target Start/End: Original strand, 62872 - 62918
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  62872 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 62918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold1873
Description:

Target: scaffold1873; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 700 - 641
Alignment:
Q  196 ttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 255  Q
    |||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  700 ttatccatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 633 - 605
Alignment:
Q  179 agttgataagttgtcttttattcatgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  633 agttgataagttgtcttttattcatgaat 605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 205
Target Start/End: Original strand, 37230 - 37276
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  37230 acttgatgatggttatgttaagtcgataagttgtcttctattcatga 37276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 250
Target Start/End: Original strand, 163600 - 163691
Alignment:
Q  159 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||  ||| |||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  163600 acttgatgagggttatgttaagttgataacttgttccttattcatgttttggtaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgat 163691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 215
Target Start/End: Original strand, 21390 - 21420
Alignment:
Q  185 taagttgtcttttattcatgaattgctaatg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21390 taagttgtcttttattcatgaattgctaatg 21420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University