View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16249_low_15 (Length: 254)

Name: NF16249_low_15
Description: NF16249
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16249_low_15
NF16249_low_15
[»] chr1 (61 HSPs)
chr1 (1-240)||(17697036-17697275)
chr1 (25-240)||(42571777-42571992)
chr1 (1-238)||(5765198-5765435)
chr1 (1-238)||(13283697-13283934)
chr1 (24-240)||(35586929-35587145)
chr1 (21-240)||(14173755-14173974)
chr1 (21-239)||(36909552-36909770)
chr1 (12-240)||(18170015-18170243)
chr1 (21-240)||(17686358-17686577)
chr1 (14-240)||(6435762-6435988)
chr1 (1-227)||(24363777-24364003)
chr1 (14-240)||(38046424-38046650)
chr1 (32-240)||(24270371-24270579)
chr1 (18-238)||(35576331-35576551)
chr1 (18-237)||(48568398-48568617)
chr1 (14-240)||(13972914-13973140)
chr1 (19-240)||(12791268-12791489)
chr1 (17-238)||(18842431-18842652)
chr1 (24-232)||(47488037-47488245)
chr1 (18-228)||(3658475-3658685)
chr1 (18-240)||(39224191-39224413)
chr1 (18-240)||(44337313-44337535)
chr1 (14-240)||(49926370-49926595)
chr1 (18-238)||(39856900-39857120)
chr1 (24-240)||(50068259-50068475)
chr1 (18-237)||(13635291-13635510)
chr1 (18-240)||(29435963-29436185)
chr1 (19-240)||(27035313-27035534)
chr1 (18-239)||(29762215-29762436)
chr1 (14-237)||(49396697-49396920)
chr1 (18-240)||(44597691-44597913)
chr1 (18-240)||(49427377-49427599)
chr1 (18-240)||(51269792-51270014)
chr1 (21-237)||(23342634-23342850)
chr1 (22-237)||(35184963-35185179)
chr1 (18-237)||(21484637-21484856)
chr1 (18-240)||(27486684-27486906)
chr1 (18-237)||(45689114-45689331)
chr1 (18-237)||(41874878-41875097)
chr1 (18-240)||(19160307-19160529)
chr1 (19-237)||(48215191-48215409)
chr1 (18-208)||(46180274-46180465)
chr1 (1-240)||(17372717-17372957)
chr1 (21-200)||(37778109-37778288)
chr1 (14-240)||(41780683-41780909)
chr1 (70-240)||(49598921-49599090)
chr1 (53-238)||(49263017-49263202)
chr1 (36-238)||(35526189-35526391)
chr1 (1-238)||(16532067-16532304)
chr1 (18-237)||(30309826-30310039)
chr1 (5-221)||(16081294-16081510)
chr1 (99-184)||(13148365-13148450)
chr1 (21-114)||(40533283-40533376)
chr1 (1-84)||(14772509-14772592)
chr1 (170-238)||(16098078-16098146)
chr1 (20-128)||(19262409-19262517)
chr1 (30-104)||(29707547-29707621)
chr1 (145-238)||(14772662-14772755)
chr1 (36-238)||(15471510-15471721)
chr1 (196-238)||(48707090-48707132)
chr1 (203-240)||(46181731-46181768)
[»] chr2 (52 HSPs)
chr2 (1-237)||(33404012-33404248)
chr2 (14-240)||(35491629-35491855)
chr2 (18-240)||(12968292-12968514)
chr2 (5-240)||(10364611-10364849)
chr2 (14-240)||(19471620-19471846)
chr2 (18-232)||(42120014-42120228)
chr2 (14-240)||(41499080-41499306)
chr2 (18-235)||(10360189-10360406)
chr2 (21-238)||(27130502-27130719)
chr2 (21-238)||(37312488-37312705)
chr2 (32-232)||(29906584-29906784)
chr2 (14-240)||(2919351-2919577)
chr2 (18-240)||(22493265-22493487)
chr2 (17-238)||(6901962-6902183)
chr2 (18-240)||(3941731-3941953)
chr2 (18-237)||(29111155-29111374)
chr2 (21-240)||(34521677-34521896)
chr2 (17-238)||(20148114-20148335)
chr2 (18-238)||(5420465-5420685)
chr2 (21-240)||(6976832-6977049)
chr2 (24-240)||(32734641-32734857)
chr2 (18-240)||(42241089-42241311)
chr2 (18-240)||(3937054-3937276)
chr2 (18-240)||(43982850-43983072)
chr2 (18-239)||(17424784-17425005)
chr2 (19-240)||(39393885-39394106)
chr2 (18-237)||(29067726-29067945)
chr2 (16-238)||(17796095-17796314)
chr2 (18-240)||(16581816-16582040)
chr2 (24-240)||(22001828-22002044)
chr2 (88-237)||(39799902-39800051)
chr2 (92-235)||(18392032-18392179)
chr2 (14-180)||(40677361-40677527)
chr2 (1-128)||(27650400-27650527)
chr2 (106-240)||(34638960-34639093)
chr2 (1-86)||(31991909-31991994)
chr2 (1-89)||(16253600-16253688)
chr2 (1-86)||(15891620-15891705)
chr2 (116-236)||(16253474-16253594)
chr2 (1-86)||(18036135-18036220)
chr2 (1-84)||(43491600-43491687)
chr2 (170-237)||(31770360-31770427)
chr2 (176-240)||(40678763-40678827)
chr2 (24-97)||(18393486-18393559)
chr2 (24-238)||(11679084-11679308)
chr2 (44-238)||(11718741-11718945)
chr2 (195-240)||(26617652-26617697)
chr2 (79-131)||(17112399-17112451)
chr2 (36-119)||(26617485-26617568)
chr2 (20-86)||(18878652-18878718)
chr2 (1-35)||(20148334-20148368)
chr2 (1-30)||(6902187-6902216)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (1-238)||(14115033-14115270)
chr6 (18-240)||(801160-801381)
chr6 (14-240)||(13402527-13402753)
chr6 (14-240)||(32027617-32027843)
chr6 (15-240)||(32037677-32037902)
chr6 (18-240)||(29066547-29066769)
chr6 (18-240)||(29075560-29075782)
chr6 (18-240)||(29108134-29108356)
chr6 (14-240)||(34802885-34803111)
chr6 (18-239)||(11692446-11692667)
chr6 (18-222)||(35058728-35058932)
chr6 (18-240)||(29110531-29110754)
chr6 (21-240)||(12396770-12396989)
chr6 (18-240)||(6205478-6205700)
chr6 (18-240)||(27640174-27640396)
chr6 (55-237)||(22305793-22305975)
chr6 (21-175)||(30257575-30257729)
chr6 (1-105)||(17465311-17465415)
chr6 (1-84)||(34134801-34134884)
chr6 (1-86)||(20192466-20192551)
chr6 (1-86)||(20242103-20242188)
chr6 (1-86)||(22136087-22136172)
chr6 (1-86)||(22143440-22143525)
chr6 (1-238)||(28051354-28051601)
chr6 (18-104)||(3765780-3765867)
chr6 (1-77)||(14482798-14482874)
chr6 (51-128)||(2402306-2402383)
chr6 (18-96)||(24021090-24021168)
chr6 (14-72)||(35021226-35021284)
chr6 (33-121)||(18743985-18744073)
chr6 (18-96)||(2192535-2192613)
chr6 (184-238)||(18744144-18744198)
[»] chr5 (47 HSPs)
chr5 (17-238)||(33370645-33370866)
chr5 (21-238)||(1400301-1400518)
chr5 (18-239)||(40009518-40009739)
chr5 (21-240)||(4724073-4724292)
chr5 (18-240)||(7225-7447)
chr5 (36-238)||(1971356-1971558)
chr5 (18-240)||(8537943-8538165)
chr5 (14-240)||(18308249-18308475)
chr5 (18-240)||(541631-541853)
chr5 (18-240)||(8576137-8576359)
chr5 (18-240)||(11346698-11346920)
chr5 (18-240)||(19400352-19400574)
chr5 (18-240)||(19036670-19036892)
chr5 (22-240)||(35565261-35565478)
chr5 (24-240)||(3601330-3601546)
chr5 (18-237)||(11027769-11027988)
chr5 (18-240)||(28880980-28881202)
chr5 (18-233)||(30709594-30709809)
chr5 (19-237)||(38854150-38854368)
chr5 (18-240)||(27661373-27661595)
chr5 (21-240)||(36350313-36350523)
chr5 (21-240)||(6793385-6793604)
chr5 (24-237)||(17366738-17366950)
chr5 (55-238)||(35927470-35927653)
chr5 (66-240)||(3169593-3169766)
chr5 (52-238)||(2599210-2599396)
chr5 (21-158)||(1694860-1694997)
chr5 (124-237)||(3458828-3458941)
chr5 (1-128)||(18920835-18920962)
chr5 (1-86)||(17195338-17195423)
chr5 (24-114)||(7082336-7082426)
chr5 (1-128)||(25360562-25360690)
chr5 (17-83)||(12742818-12742884)
chr5 (155-228)||(1693382-1693455)
chr5 (1-86)||(36311924-36312009)
chr5 (186-240)||(7082281-7082335)
chr5 (124-238)||(12742706-12742820)
chr5 (124-238)||(12805524-12805638)
chr5 (17-83)||(12805636-12805702)
chr5 (20-237)||(19748051-19748276)
chr5 (1-86)||(13131057-13131142)
chr5 (1-58)||(2599426-2599483)
chr5 (20-128)||(15798078-15798186)
chr5 (20-128)||(23228668-23228776)
chr5 (1-35)||(12742883-12742917)
chr5 (2-35)||(12805701-12805734)
chr5 (33-121)||(16418111-16418199)
[»] chr4 (60 HSPs)
chr4 (1-238)||(3393296-3393533)
chr4 (21-240)||(43889497-43889716)
chr4 (14-240)||(22436901-22437127)
chr4 (1-238)||(17211258-17211496)
chr4 (24-240)||(242417-242633)
chr4 (18-238)||(25762590-25762810)
chr4 (24-239)||(14330695-14330910)
chr4 (18-232)||(31824624-31824838)
chr4 (18-240)||(33163539-33163761)
chr4 (18-240)||(51027762-51027984)
chr4 (18-240)||(51428187-51428409)
chr4 (1-238)||(18412587-18412824)
chr4 (14-239)||(49817635-49817860)
chr4 (16-240)||(26591678-26591902)
chr4 (14-240)||(34153277-34153503)
chr4 (1-237)||(11288288-11288523)
chr4 (21-240)||(4785420-4785639)
chr4 (18-240)||(1226150-1226371)
chr4 (18-240)||(21017172-21017394)
chr4 (14-240)||(34529787-34530013)
chr4 (18-240)||(40353768-40353990)
chr4 (14-240)||(49791927-49792153)
chr4 (14-239)||(2773000-2773225)
chr4 (1-238)||(10312264-10312501)
chr4 (18-235)||(20778864-20779081)
chr4 (14-238)||(957446-957670)
chr4 (14-237)||(6282314-6282537)
chr4 (19-238)||(24606744-24606963)
chr4 (21-240)||(47657353-47657572)
chr4 (18-240)||(49063969-49064191)
chr4 (18-235)||(55796738-55796955)
chr4 (18-237)||(32937897-32938116)
chr4 (18-240)||(46816520-46816740)
chr4 (18-240)||(41794557-41794779)
chr4 (18-237)||(1042744-1042961)
chr4 (1-240)||(13850739-13850978)
chr4 (18-240)||(37866396-37866619)
chr4 (18-240)||(6177310-6177532)
chr4 (18-240)||(56138900-56139122)
chr4 (1-240)||(13866253-13866492)
chr4 (1-240)||(21169441-21169684)
chr4 (21-238)||(42886255-42886475)
chr4 (18-240)||(49094735-49094957)
chr4 (18-211)||(21711549-21711742)
chr4 (18-237)||(20901663-20901882)
chr4 (18-237)||(45939518-45939737)
chr4 (14-240)||(44560171-44560397)
chr4 (18-183)||(27759374-27759539)
chr4 (24-237)||(39588922-39589135)
chr4 (21-237)||(36776517-36776733)
chr4 (14-237)||(49423749-49423972)
chr4 (18-240)||(28082228-28082450)
chr4 (18-238)||(9489671-9489890)
chr4 (1-237)||(31324167-31324403)
chr4 (1-109)||(49817175-49817283)
chr4 (1-86)||(17292106-17292191)
chr4 (1-128)||(23124503-23124630)
chr4 (145-238)||(21412647-21412740)
chr4 (20-128)||(20759132-20759240)
chr4 (20-128)||(20765523-20765631)
[»] chr3 (71 HSPs)
chr3 (21-237)||(51015284-51015500)
chr3 (18-237)||(39416941-39417160)
chr3 (1-238)||(6754210-6754448)
chr3 (1-236)||(6464320-6464556)
chr3 (18-238)||(44927469-44927689)
chr3 (14-240)||(46414323-46414549)
chr3 (18-240)||(47065691-47065913)
chr3 (14-240)||(51013267-51013493)
chr3 (21-237)||(34472072-34472288)
chr3 (24-240)||(42382275-42382491)
chr3 (21-237)||(45100461-45100677)
chr3 (25-237)||(48087552-48087764)
chr3 (1-240)||(30192542-30192785)
chr3 (14-232)||(41577918-41578136)
chr3 (18-240)||(53826689-53826911)
chr3 (14-240)||(55206873-55207099)
chr3 (24-240)||(42383055-42383271)
chr3 (21-240)||(2428491-2428710)
chr3 (24-239)||(13895869-13896084)
chr3 (25-240)||(25576592-25576806)
chr3 (14-240)||(41803906-41804132)
chr3 (18-240)||(42950013-42950235)
chr3 (21-238)||(34647263-34647480)
chr3 (2-238)||(774315-774551)
chr3 (10-238)||(8633344-8633572)
chr3 (30-240)||(43569914-43570124)
chr3 (18-239)||(49218729-49218950)
chr3 (18-238)||(34693283-34693503)
chr3 (18-237)||(24702265-24702483)
chr3 (1-237)||(33449127-33449351)
chr3 (21-240)||(47759887-47760106)
chr3 (18-240)||(2646869-2647091)
chr3 (14-240)||(27186952-27187178)
chr3 (21-239)||(10053271-10053485)
chr3 (21-237)||(37281459-37281675)
chr3 (25-240)||(43477061-43477276)
chr3 (18-240)||(3495022-3495244)
chr3 (18-240)||(19453222-19453444)
chr3 (18-240)||(49610493-49610715)
chr3 (21-240)||(14631449-14631668)
chr3 (18-240)||(46403007-46403229)
chr3 (18-240)||(49140047-49140269)
chr3 (18-240)||(51695599-51695821)
chr3 (22-240)||(52569406-52569623)
chr3 (18-240)||(54390446-54390668)
chr3 (14-238)||(7954209-7954434)
chr3 (18-237)||(2268487-2268706)
chr3 (15-237)||(7246101-7246323)
chr3 (18-240)||(34049731-34049953)
chr3 (18-239)||(44835480-44835701)
chr3 (22-239)||(49273404-49273621)
chr3 (24-240)||(4004086-4004302)
chr3 (24-239)||(36135013-36135227)
chr3 (1-233)||(20375858-20376090)
chr3 (21-237)||(36721385-36721601)
chr3 (21-240)||(50458687-50458906)
chr3 (1-240)||(14265412-14265648)
chr3 (21-201)||(42323385-42323565)
chr3 (18-179)||(50997453-50997614)
chr3 (1-116)||(18440873-18440988)
chr3 (1-116)||(19485947-19486062)
chr3 (1-211)||(25887584-25887796)
chr3 (14-145)||(46346601-46346732)
chr3 (150-237)||(15637031-15637118)
chr3 (17-109)||(7954774-7954866)
chr3 (187-238)||(11378906-11378957)
chr3 (190-239)||(46346745-46346794)
chr3 (1-80)||(15637155-15637234)
chr3 (197-240)||(42328288-42328331)
chr3 (36-128)||(17267306-17267398)
chr3 (1-35)||(7954865-7954899)
[»] chr7 (48 HSPs)
chr7 (1-238)||(1642563-1642800)
chr7 (18-240)||(18237556-18237778)
chr7 (18-237)||(41217609-41217828)
chr7 (14-240)||(15337894-15338120)
chr7 (14-240)||(48270640-48270866)
chr7 (21-239)||(41048776-41048994)
chr7 (25-240)||(47268891-47269105)
chr7 (1-238)||(21614735-21614973)
chr7 (21-240)||(21187295-21187514)
chr7 (14-240)||(46862183-46862409)
chr7 (32-240)||(20378710-20378918)
chr7 (21-237)||(36393820-36394036)
chr7 (24-239)||(40588542-40588757)
chr7 (21-240)||(43351096-43351314)
chr7 (18-240)||(39477233-39477455)
chr7 (14-240)||(48315169-48315395)
chr7 (18-239)||(34140858-34141079)
chr7 (18-237)||(30360512-30360730)
chr7 (32-238)||(21650518-21650724)
chr7 (32-239)||(17183205-17183412)
chr7 (18-232)||(48220737-48220949)
chr7 (18-240)||(20564751-20564973)
chr7 (1-239)||(2356282-2356521)
chr7 (21-240)||(42735255-42735473)
chr7 (14-222)||(30354804-30355012)
chr7 (18-240)||(17839315-17839538)
chr7 (63-237)||(28979060-28979234)
chr7 (21-240)||(28114389-28114608)
chr7 (88-240)||(26603268-26603420)
chr7 (18-239)||(10523061-10523283)
chr7 (18-240)||(45363245-45363458)
chr7 (19-132)||(2206031-2206144)
chr7 (18-148)||(9367113-9367243)
chr7 (116-240)||(13916825-13916949)
chr7 (137-240)||(42682948-42683051)
chr7 (1-128)||(150192-150319)
chr7 (3-78)||(3380652-3380727)
chr7 (21-128)||(28066359-28066466)
chr7 (13-86)||(11824839-11824912)
chr7 (1-121)||(18149638-18149758)
chr7 (20-128)||(7414196-7414304)
chr7 (18-86)||(26601771-26601839)
chr7 (18-107)||(13920431-13920520)
chr7 (188-237)||(8726381-8726430)
chr7 (20-121)||(12083042-12083143)
chr7 (22-121)||(31267188-31267286)
chr7 (199-239)||(3924805-3924845)
chr7 (195-238)||(18146953-18146996)
[»] chr8 (33 HSPs)
chr8 (18-232)||(33799543-33799757)
chr8 (14-240)||(44943069-44943295)
chr8 (21-240)||(41856969-41857188)
chr8 (18-232)||(43638669-43638883)
chr8 (18-245)||(40415252-40415479)
chr8 (18-240)||(15032316-15032538)
chr8 (18-240)||(26452325-26452547)
chr8 (18-240)||(43693137-43693359)
chr8 (18-238)||(34614955-34615175)
chr8 (18-238)||(41363658-41363878)
chr8 (18-237)||(38033917-38034136)
chr8 (19-238)||(42168953-42169172)
chr8 (14-240)||(18440283-18440509)
chr8 (18-240)||(28706134-28706356)
chr8 (1-238)||(3589241-3589478)
chr8 (18-240)||(41275394-41275616)
chr8 (24-240)||(40414610-40414826)
chr8 (14-240)||(42603454-42603680)
chr8 (1-238)||(31171791-31172028)
chr8 (21-239)||(19242157-19242375)
chr8 (21-239)||(19315341-19315559)
chr8 (60-237)||(26484580-26484757)
chr8 (18-240)||(2416915-2417137)
chr8 (18-239)||(24861344-24861565)
chr8 (18-240)||(485250-485472)
chr8 (14-240)||(40702360-40702587)
chr8 (81-237)||(16575695-16575851)
chr8 (123-240)||(22548263-22548380)
chr8 (18-86)||(22549236-22549301)
chr8 (1-53)||(16575867-16575920)
chr8 (198-240)||(12504896-12504938)
chr8 (145-235)||(22843442-22843532)
chr8 (14-66)||(26486847-26486899)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (18-238)||(2261-2481)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (18-232)||(17910-18123)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (18-239)||(1783-2004)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (17-238)||(24899-25119)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (112-240)||(63968-64095)
scaffold0004 (18-83)||(64098-64163)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (20-128)||(5453-5561)
[»] scaffold0027 (2 HSPs)
scaffold0027 (36-121)||(36775-36860)
scaffold0027 (145-238)||(36649-36742)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 61)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17697275 - 17697036
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17697275 tagttggaaggtgcattccttacctaatcacgatcttctggcggaatcagactcttgataatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcga 17697176  T
Q  101 tccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttgg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  17697175 tccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtactttaactccacccaagtgaatgataccctacccttgtcgagcattgg 17697076  T
Q  201 acgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  17697075 acgtttataccaaacgtgttccaccctccttatgtctctg 17697036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 25 - 240
Target Start/End: Original strand, 42571777 - 42571992
Alignment:
Q  25 taatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctccc 124  Q
    |||| ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42571777 taatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctccc 42571876  T
Q  125 aaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccac 224  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42571877 aaaacatgctcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcattggacgtttataccgaacgtgttccac 42571976  T
Q  225 cctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||||||||    
T  42571977 cctccttgtgtctctg 42571992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5765435 - 5765198
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5765435 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcagacggttgataatatcttcatttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 5765336  T
Q  101 tccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttgg 200  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||| || | ||||||||||||    
T  5765335 tccactagaacatgttctgctcccaaaacatgctcatcaagtttttgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatattcttccatcgtcgagcgttgg 5765236  T
Q  201 acgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5765235 acgtttataccgaacgtattccaccctccttgtatctc 5765198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13283934 - 13283697
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13283934 tagttggaaggtgcattctctacctaatcacgatcttctggcggaatcagactgttgataatatattcagttgatctcagcaacgttacctgcatatcga 13283835  T
Q  101 tccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttgg 200  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||| |||||| |||||| |||| | ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13283834 tccactagaacatgctgcgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcatcgttcgttaatttcacccaactaaatgatactctcccctcgtcgagcgttgg 13283735  T
Q  201 acgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13283734 acgtttataccgaacgtattccaccctcctcgtgtctc 13283697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 35586929 - 35587145
Alignment:
Q  24 ctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35586929 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaaggtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 35587028  T
Q  124 caaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattcca 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35587029 caaaacatgttcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 35587128  T
Q  224 ccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||||||||||||||||    
T  35587129 ccctccttgtgtctctg 35587145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 14173755 - 14173974
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14173755 tacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtcc 14173854  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14173855 tcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattctcccctcatcgagcgttggacgtttataccgaacgtgtt 14173954  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14173955 ccaccctccttgtgtctctg 14173974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 36909770 - 36909552
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36909770 tacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 36909671  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36909670 tcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatgctcttccctcgtcgagcgttggacgtttacaccgaacgtatt 36909571  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctct 239  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  36909570 ccaccctccttatgtctct 36909552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18170243 - 18170015
Alignment:
Q  12 tgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaac 111  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  18170243 tgcattcggtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacctttgatgatatcttcagttgagctcagcaatgtcacccgcatatcgatctactggaac 18170144  T
Q  112 atgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttatacc 211  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18170143 atgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgaacgtttatacc 18170044  T
Q  212 gaacgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18170043 gaacgtgttccaccctccttgtgtctctg 18170015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 17686358 - 17686577
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17686358 tacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagctacgtcacccgcatatcgatccactggaagatgttgtgc 17686457  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17686458 tcccaaaacatgctcttcacgttttcgtcattcgttaattcaacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgtt 17686557  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  17686558 ctaccctccttgtgtctctg 17686577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6435988 - 6435762
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  6435988 cattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcacttgatctcaacaacgtcactcacatatcgatccactggaacat 6435889  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6435888 gttgtgctcccaaaacttgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccga 6435789  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  6435788 acgttttccaccctccttgtgtctctg 6435762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 24363777 - 24364003
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24363777 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctaacggaatcaaactcttgataatatcttcagttgctctcaacaacgttaaccgcatatcga 24363876  T
Q  101 tccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttgg 200  Q
    |||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24363877 tccactagaacatactgtgcccccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttcattaattctacccaagtgattgatattctcccctcgtcgagcgttgg 24363976  T
Q  201 acgtttataccgaacgtattccaccct 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24363977 acgtttataccgaacgtattccaccct 24364003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 38046424 - 38046650
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||    
T  38046424 cattccgtacctaatgacgatcttctggtggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcaccggcatattgatcgactggaacat 38046523  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38046524 gttgtgctcccaaaacatgcttgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccga 38046623  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  38046624 acgtgttccaccctccttgtgtctctg 38046650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 240
Target Start/End: Original strand, 24270371 - 24270579
Alignment:
Q  32 gatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacat 131  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24270371 gatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcctaaaacat 24270470  T
Q  132 gttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctcctt 231  Q
    | || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24270471 gctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcatcgagtgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 24270570  T
Q  232 gtgtctctg 240  Q
    |||||||||    
T  24270571 gtgtctctg 24270579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35576551 - 35576331
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  35576551 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccaccggaacatgctg 35576452  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35576451 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattctcccctcatcgagcgttggacgtttataccgaacgt 35576352  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctc 238  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  35576351 gttccaccctccttgtgtctc 35576331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 48568398 - 48568617
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48568398 ccctaactaatgacaatcttctggcgaaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 48568497  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  48568498 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcatcattctttaactccacccaagtgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacta 48568597  T
Q  218 attccaccctccttgtgtct 237  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  48568598 attccaccctccttgtgtct 48568617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13973140 - 13972914
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  13973140 cattccgtacctaatgacgatcttatggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaatgtcacccgcatattgatccactggaacat 13973041  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  13973040 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctagtcgagtgttggacgtttatactga 13972941  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  13972940 acgtattccaccctccttgcgtctctg 13972914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 240
Target Start/End: Original strand, 12791268 - 12791489
Alignment:
Q  19 cctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgt 118  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12791268 cctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcaaaaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgt 12791367  T
Q  119 gctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgta 218  Q
    ||||| |||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  12791368 gctccaaaaaaatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtg 12791467  T
Q  219 ttccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  12791468 ttccaccctacttgtgtctctg 12791489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18842652 - 18842431
Alignment:
Q  17 tccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgtt 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  18842652 tccctacctaatcccgatcttctggcgggatcagactcttgacaatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgcc 18842553  T
Q  117 gtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacg 216  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18842552 gtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactaaatgatattcttccctcatcgagcgttggacgtttataccgaacg 18842453  T
Q  217 tattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18842452 tattccaccctccttgtgtctc 18842431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 24 - 232
Target Start/End: Original strand, 47488037 - 47488245
Alignment:
Q  24 ctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 123  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||    
T  47488037 ctaatgacgatcttctggcgaaatcaagctgttgatgacatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatcaactagaaaatattgtgctcc 47488136  T
Q  124 caaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattcca 223  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47488137 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattcca 47488236  T
Q  224 ccctccttg 232  Q
    |||||||||    
T  47488237 ccctccttg 47488245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3658685 - 3658475
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3658685 ccctacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacttgcatatcgatccactagaacatgttg 3658586  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3658585 tgctcccaaaacacgttcgtcacgtttttgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctctcctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 3658486  T
Q  218 attccaccctc 228  Q
     ||||||||||    
T  3658485 gttccaccctc 3658475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 39224191 - 39224413
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39224191 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatatttagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttg 39224290  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  39224291 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcattctttaattccacccaagtgaatgataccctcccctcgttgagcgttagacgtttataccgaacgt 39224390  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  39224391 gttccaccctccttgtgtctctg 39224413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 44337313 - 44337535
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44337313 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcatattgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatgttg 44337412  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44337413 tgcacccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgtgaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggt 44337512  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  44337513 gttccaccatccttgtgtctctg 44337535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 49926370 - 49926595
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  49926370 cattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacctgcatatcgatccactggaacat 49926469  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49926470 gttgtgctcccaaaacatgctcctcacgttttcgtcgttcgttaattccgcacaagtgaatgacactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccga 49926569  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  49926570 acgtgttccaccc-ccttctgtctctg 49926595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Original strand, 39856900 - 39857120
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39856900 ccctaactaatgacgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgtcg 39856999  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  39857000 tgctcccaaaacatgatcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtggatgatactctcccctcgtcgagcattggacgtttataccgaacat 39857099  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctc 238  Q
     ||||||||| ||||||||||    
T  39857100 gttccacccttcttgtgtctc 39857120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 50068259 - 50068475
Alignment:
Q  24 ctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50068259 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgacgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcc 50068358  T
Q  124 caaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattcca 223  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||    
T  50068359 caaaacatgttcgtcacatttttgtcgttctttaaatccacccaagtgaatgatactctccactcgtcgagtgttggaccttcataccgaacatattcca 50068458  T
Q  224 ccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||| |||||||    
T  50068459 ccctccttgcgtctctg 50068475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 13635291 - 13635510
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13635291 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaaccaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttg 13635390  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13635391 tgctcccaaaacatggtcgtgacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgt 13635490  T
Q  218 attccaccctccttgtgtct 237  Q
     ||||||| |||||||||||    
T  13635491 gttccaccatccttgtgtct 13635510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29436185 - 29435963
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||  |||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  29436185 ccctaactaatgacgatcttctggcttaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcgtatcgatccactggaacatgctg 29436086  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    | ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29436085 tactcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccatcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 29435986  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  29435985 gttccaccctccttgtgtctctg 29435963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 240
Target Start/End: Original strand, 27035313 - 27035534
Alignment:
Q  19 cctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgt 118  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  27035313 cctaactaatgacgatcttctggtggaatcaagttgttgatgatatcttaagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaatatggtgt 27035412  T
Q  119 gctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgta 218  Q
     ||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27035413 tctcccaaaacatactcgtcacgttttcgtcattctttaactccacccaagtgaatgatacccttccctcgtcgagcgttggacgtttataccggacgta 27035512  T
Q  219 ttccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27035513 ttccaccctccttgtgtctctg 27035534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 29762215 - 29762436
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||   ||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29762215 ccctaactaatgatgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatattttcagttgatctcatcaacgtcacccgtatatcgatccactggaacatgttg 29762314  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29762315 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggt 29762414  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctct 239  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  29762415 gttccaccctccttgtgtctct 29762436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 49396920 - 49396697
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  49396920 cattccatacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgttgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcaatccactggaacat 49396821  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  49396820 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgttgttcgttaattccactcaagtgaatgatactctcccctcgtaaatcgttggacgtttataccga 49396721  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtct 237  Q
    |||| ||||||||||||| |||||    
T  49396720 acgtgttccaccctccttatgtct 49396697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 44597913 - 44597691
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  44597913 ccctaactaatgacgatcttccggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcatcaacgtcacccacatatcgatccactggaacatgctg 44597814  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44597813 tgctcccaaaacatactcatcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggt 44597714  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  44597713 gttccaccctccttgtgtctctg 44597691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 49427599 - 49427377
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49427599 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttg 49427500  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49427499 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccgcccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacatttataccgaacgt 49427400  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     |  |||| ||||||| ||||||    
T  49427399 gtaacaccatccttgtatctctg 49427377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 51270014 - 51269792
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51270014 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatcccagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 51269915  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  51269914 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaactgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacagaaggt 51269815  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  51269814 gttccaccctccttgtgtctctg 51269792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23342850 - 23342634
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  23342850 tacctaatgacgatcttctggaggaatcaaacttttgatgatatcttcagtttatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactcgaacataatgtgc 23342751  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23342750 tccaaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattcaacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgtt 23342651  T
Q  221 ccaccctccttgtgtct 237  Q
     |||| |||||||||||    
T  23342650 tcaccttccttgtgtct 23342634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35185179 - 35184963
Alignment:
Q  22 acctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgct 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  35185179 acctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatttcagcaacgtcacctgcatatcgatccactggaacatgccgtgct 35185080  T
Q  122 ccc-aaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35185079 ccccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccatcaaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgtt 35184980  T
Q  221 ccaccctccttgtgtct 237  Q
    |||||||||||||||||    
T  35184979 ccaccctccttgtgtct 35184963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 21484637 - 21484856
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21484637 ccctacctaatgacgatcttctggtgaaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcactcgcatatcgatccactggaacatgttg 21484736  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    |||||| |||||||| || |||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  21484737 tgctccaaaaacatgctcgtcacattttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacaa 21484836  T
Q  218 attccaccctccttgtgtct 237  Q
     || ||||||||||||||||    
T  21484837 gtttcaccctccttgtgtct 21484856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 27486684 - 27486906
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27486684 ccctaactaatgacgatcttcaggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccaatggaacatgttg 27486783  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27486784 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaattaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggt 27486883  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
      || ||||||||||||||||||    
T  27486884 gatctaccctccttgtgtctctg 27486906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 45689331 - 45689114
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45689331 ccctaactaatgacgatcttatggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatccatccactggaacatgttg 45689232  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||   ||| ||| |    
T  45689231 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattctccccccgtcgagcgttggacgtt--aaccaaacat 45689134  T
Q  218 attccaccctccttgtgtct 237  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  45689133 attccaccctccttgtgtct 45689114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 41874878 - 41875097
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||   || | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41874878 ccctaactaataacgatcttctggcggaatcaagttgctaatgatatctttagttgatctcagcaacattacccgcatatcgatccactagaacatgttg 41874977  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||      
T  41874978 tgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgttatttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcttcgagcattggacgttgataccgaacta 41875077  T
Q  218 attccaccctccttgtgtct 237  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  41875078 attccaccctccttgtgtct 41875097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19160529 - 19160307
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19160529 ccctaactaatgacaatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 19160430  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    || |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19160429 tgttcccaaaacatagtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctccccttgtcaagcgttggacgtttataccaaacgt 19160330  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| |||| |||||||||    
T  19160329 gttccaccatcctcgtgtctctg 19160307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 48215409 - 48215191
Alignment:
Q  19 cctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgt 118  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48215409 cctaactaatgactatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgt 48215310  T
Q  119 gctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgta 218  Q
    ||||| |||| ||| || ||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  48215309 gctccaaaaatatgctcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccactcaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtg 48215210  T
Q  219 ttccaccctccttgtgtct 237  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  48215209 ttccaccatccttgtgtct 48215191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 208
Target Start/End: Original strand, 46180274 - 46180465
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  46180274 ccctaactaatgacgatcttctggcagaatcaagctgttgatgatatcttcaattgatctcaacaacgttacccacatatcgatccactggaacatgctg 46180373  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccaccca-agtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttat 208  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46180374 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccagagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttat 46180465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17372957 - 17372717
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccc-tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcg 99  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||| | ||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  17372957 tagttggaaggtgcatttccatacctaatgacgatcttctggcgaaattaaactttcgatgatatcttcagttgatctcatcaacgttacacgtatatcg 17372858  T
Q  100 atccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttg 199  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||||    
T  17372857 atccactggaatatggtgtgctcccaaaacatgttcttcacattttcgtcgttcgctaattccacctaagtggattatattctcccctcgtcgagcgttg 17372758  T
Q  200 gacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||    
T  17372757 gacgtttataccgaacatatttcaccctctttgcgtctctg 17372717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37778288 - 37778109
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  37778288 tacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatcaactggaacatgttgttc 37778189  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttgg 200  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  37778188 tcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtcctttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcaagcgttgg 37778109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 41780909 - 41780683
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  41780909 cattccgtacctaatgacgaacttctggcgaaatcaaacttttgatgatatattcagttgatcttagcaacgtcacctgcatatctatctactggaacat 41780810  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    | ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  41780809 gctgtgctcccaaaatatattcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattatcctctcgtcgagcgttggacgtttataccga 41780710  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  41780709 acgtgttccacccttcttgtgtctctg 41780683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 240
Target Start/End: Original strand, 49598921 - 49599090
Alignment:
Q  70 gttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaag 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  49598921 gttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgcttgtcacgttt-cgtcattctttaactccactcaag 49599019  T
Q  170 tgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49599020 tgaatgatactctcccctcgtcgagtgttgaacgtttataccgaacgtattccaccctccttgcgtctctg 49599090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 53 - 238
Target Start/End: Original strand, 49263017 - 49263202
Alignment:
Q  53 tgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgtt 152  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  49263017 tgttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgttaccagcatatagatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcttt 49263116  T
Q  153 ctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
      |||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  49263117 tgttaattccactcaagtgaatgatactctcccctcgttgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctacttgtgtctc 49263202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 36 - 238
Target Start/End: Original strand, 35526189 - 35526391
Alignment:
Q  36 ttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttc 135  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||    
T  35526189 ttctagcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgcaacattctgtgctcccaaaacatggtc 35526288  T
Q  136 ttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgt 235  Q
     || |||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  35526289 gtctcgttttcgacgttcgttaattccacccaggtgaatgatactctctcctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgcgttccaccctccctgtgt 35526388  T
Q  236 ctc 238  Q
    |||    
T  35526389 ctc 35526391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 16532067 - 16532304
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  16532067 tagttggaagatgcattccatacctaatcacgatcttctagcgaaatcagactattgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacacgcatatcaa 16532166  T
Q  101 tccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttgg 200  Q
    |||| | || |||| | |||||||| || ||| || |||| |||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||| |||  ||||||||||     
T  16532167 tccattagagcatgctctgctcccataatatgctcatcacattttcgtcgttcgttaattccacccaacttaatgatattctctcctcatcgagcgttgt 16532266  T
Q  201 acgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16532267 acgtttatatcgaacgtattccatcctccttgtgtctc 16532304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 30309826 - 30310039
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||      || |||||||||||||||||||| ||| |  ||    
T  30309826 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatattcagttgatctc------gtcacccgcatatcgatccactgaaacgtcctg 30309919  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30309920 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaatgataccctccccccgtcgagtgttggacgtttataccgaacgt 30310019  T
Q  218 attccaccctccttgtgtct 237  Q
     ||||||||||||| |||||    
T  30310020 gttccaccctccttatgtct 30310039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16081510 - 16081294
Alignment:
Q  5 tggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatcca 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| || |  ||||  |||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |    
T  16081510 tggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttccggcagaattaaactcttcagtatattctcagttgattgcagcaacgttacacgcatatcgatcaa 16081411  T
Q  105 ctggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgt 204  Q
    || |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  16081410 ctagaacatgttgtgctccaaaaacatgctcctcatgttatcgtcgttcgttaattccacctaactgaatgatatcctcccctcgtcgagcgttgaacgt 16081311  T
Q  205 ttataccgaacgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||    
T  16081310 ttataccgaacgtattc 16081294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13148450 - 13148365
Alignment:
Q  99 gatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcc 184  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13148450 gatccactggaacatgttgtgctctcaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcc 13148365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 114
Target Start/End: Original strand, 40533283 - 40533376
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40533283 tacctaatgacgatcttctggcggaattaaacttttgatgatatcttcagttgatctcggcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatg 40533376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 14772509 - 14772592
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaac 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||| |||||||| |||||    
T  14772509 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcagaatcaaactgttgagaacatcttcaattgatctctgcaac 14772592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 170 - 238
Target Start/End: Original strand, 16098078 - 16098146
Alignment:
Q  170 tgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16098078 tgaatgatattctcccatcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 16098146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 128
Target Start/End: Original strand, 19262409 - 19262517
Alignment:
Q  20 ctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtg 119  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| ||||| | |||||||| ||||    
T  19262409 ctacctaatcataatcttcaggcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatctcagcaacgtgacaaacatattgatcctcgggaacatgatgtg 19262508  T
Q  120 ctcccaaaa 128  Q
    || ||||||    
T  19262509 ctgccaaaa 19262517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 104
Target Start/End: Original strand, 29707547 - 29707621
Alignment:
Q  30 acgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatcca 104  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29707547 acgatcttctagcggaatcaaacttttgatgatatctttagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatcca 29707621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 238
Target Start/End: Original strand, 14772662 - 14772755
Alignment:
Q  145 tcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    |||||||||||||| || | || | |||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  14772662 tcgtcgttctttaattctagccgactgaacgatattctcccgttgtccaacgttggacgttcataccaaatgtatttcaccctccttgtgtctc 14772755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15471721 - 15471510
Alignment:
Q  36 ttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaa------- 128  Q
    |||||||  ||||| ||| |||| |||||||||||  |||||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||||||||||  |||||           
T  15471721 ttctggcataatcaaactcttgagaatatcttcaggcgatctcagcaacgtgacaaacacatcaatccacgggaacatgttgtgctgacaaaaaatcaag 15471622  T
Q  129 --catgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccc 226  Q
      ||||||| |||| |  |||| |||| ||||||||  |  | |||| | || |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||| |    
T  15471621 aacatgttcctcacatcgtcgttgttcgttaactccggctgactgaacgttattctcccctcgtcgaacgttggatgttcataccaaacgtattccacac 15471522  T
Q  227 tccttgtgtctc 238  Q
    ||||||||||||    
T  15471521 tccttgtgtctc 15471510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 196 - 238
Target Start/End: Original strand, 48707090 - 48707132
Alignment:
Q  196 gttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48707090 gttggacgttcataccaaacgtattccaccctccttgtgtctc 48707132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 240
Target Start/End: Original strand, 46181731 - 46181768
Alignment:
Q  203 gtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  46181731 gtttataccgaacgtattccaccttccttgcgtctctg 46181768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 181; Significance: 7e-98; HSPs: 52)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33404248 - 33404012
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33404248 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcgacatcagactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 33404149  T
Q  101 tccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttgg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  33404148 tccactggaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacacaactgaatgatactattccctcgtcgagcgttgg 33404049  T
Q  201 acgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33404048 acgtttataccgaacgtattccaccctctttgtgtct 33404012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 35491855 - 35491629
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35491855 cattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacat 35491756  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35491755 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccga 35491656  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  35491655 acgtgttccaccctccttgtgtctctg 35491629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 12968292 - 12968514
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12968292 ccctaactaatgacgatcttctggaggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccaatggaacatgttg 12968391  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12968392 tgctcccaaaacatgctcgtaacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcattggacgtttataccgaacgt 12968491  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12968492 attccaccctccttgtgtctctg 12968514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 240
Target Start/End: Original strand, 10364611 - 10364849
Alignment:
Q  5 tggaaggtgcattc---cctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgat 101  Q
    ||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  10364611 tggaaggtgcattcattcctacgtaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacatcacccgcatatcgat 10364710  T
Q  102 ccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttgga 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10364711 ccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgga 10364810  T
Q  202 cgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10364811 cgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtgtctctg 10364849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 19471620 - 19471846
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19471620 cattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatcttagcaacgtcacccgcatatcgatacactggaacat 19471719  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19471720 gctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccga 19471819  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19471820 acgtgttccaccctccttgtgtctctg 19471846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42120228 - 42120014
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  42120228 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccacatatcaatccactggaacatgttg 42120129  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42120128 tgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgttctttaactccgcccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacatttataccgaacgt 42120029  T
Q  218 attccaccctccttg 232  Q
    |||||||||||||||    
T  42120028 attccaccctccttg 42120014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 41499080 - 41499306
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  41499080 cattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcaccctcatatcgatccactggaacat 41499179  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41499180 gctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaggttaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccga 41499279  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  41499280 acgtgttccaccctccttctgtctctg 41499306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 10360189 - 10360406
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10360189 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgaaatcttcagttgatctcagcaacattacccgcatatcgatccactggaacatgttg 10360288  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10360289 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcatcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacagaacgt 10360388  T
Q  218 attccaccctccttgtgt 235  Q
     |||||||||||||||||    
T  10360389 gttccaccctccttgtgt 10360406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 238
Target Start/End: Original strand, 27130502 - 27130719
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27130502 tacctaatgactatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 27130601  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  27130602 tcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattctcccctcgttgagcgttggacgtttataccgaatgtgtt 27130701  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctc 238  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27130702 ccaccctccttgtgtctc 27130719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 238
Target Start/End: Original strand, 37312488 - 37312705
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37312488 tacctaatgacgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 37312587  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37312588 tcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgataatctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgtt 37312687  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctc 238  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  37312688 ccatcctccttgtgtctc 37312705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29906784 - 29906584
Alignment:
Q  32 gatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacat 131  Q
    ||||||||||| ||||||   ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29906784 gatcttctggcagaatcaagttgttgatgatattttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacat 29906685  T
Q  132 gttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctcctt 231  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29906684 gtttgtcacgttttcgtcgttctttaacttcacccaagtgaatgatactctccccacgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctcctt 29906585  T
Q  232 g 232  Q
    |    
T  29906584 g 29906584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 2919351 - 2919577
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  2919351 cattccgtacctaatgacgatcttttggcggaatcaaacttttaatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatctactgtaacat 2919450  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  2919451 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcatcgagcgttggacgtttatacaga 2919550  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  2919551 acgtgttccaccctccttgtgtctctg 2919577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22493487 - 22493265
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  22493487 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatctttagttgatctcaggaacgttacccgcatatcaatccactggaacattctg 22493388  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    | ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22493387 tactcccaaaacatgctcgtcacgttttcgccgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 22493288  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  22493287 attccaccctccttgcgtctctg 22493265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6902183 - 6901962
Alignment:
Q  17 tccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgtt 116  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6902183 tccctacctaatcatgatcttctcgcggaatcagactgttgataatatcttcagttgatctcaacaacgttactcgcatatcgattcactggaacatgtt 6902084  T
Q  117 gtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacg 216  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  6902083 gtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttatgccgaatg 6901984  T
Q  217 tattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    | ||| ||||||||||||||||    
T  6901983 tgttcaaccctccttgtgtctc 6901962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3941953 - 3941731
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3941953 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcatcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgatg 3941854  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  3941853 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatactgaaggt 3941754  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  3941753 gttccaccctccttgtgtctctg 3941731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29111374 - 29111155
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29111374 ccctacctagtgacgttattctggcggaattaaatttttgatgatatcttcggttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 29111275  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29111274 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatactgaacgt 29111175  T
Q  218 attccaccctccttgtgtct 237  Q
     |||||||||||||||||||    
T  29111174 gttccaccctccttgtgtct 29111155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 34521677 - 34521896
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||| ||  ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34521677 tacctaatgacgatcttatgagggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 34521776  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  34521777 tcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgttgagcgtttgacgtttataccgaacgtgtt 34521876  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     |||||||||||||||||||    
T  34521877 tcaccctccttgtgtctctg 34521896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20148335 - 20148114
Alignment:
Q  17 tccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgtt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20148335 tccctacctaatcacgatcttctggcggaatcagactgttgaaaatatcttcagctaatctcagcaacgttacccgcatatcgatctactggaacatgtt 20148236  T
Q  117 gtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacg 216  Q
    ||||||| |||||||| |  ||| |||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||     
T  20148235 gtgctcctaaaacatgctagtcatgttttcgtcgttctttaattccccccaactaaatgatattctcccctcgttgagcgttggacgtttataccgaaca 20148136  T
Q  217 tattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  20148135 tatttcaccctccttgtgtctc 20148114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5420685 - 5420465
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  5420685 ccctaactaatgacgatcttcaggtggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatatcagcaacgtcacccgcatatcgatccattggaacatgctg 5420586  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5420585 tgctcacaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccactcaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatatcgaacgt 5420486  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctc 238  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  5420485 gttccaccctccttgtgtctc 5420465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6977049 - 6976832
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6977049 tacctaatgacgatcttctcgcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgc 6976950  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  6976949 tcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaatttcacccaagtgaatgatacact--cctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacatgtt 6976852  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6976851 ccaccctccttgtgtctctg 6976832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 32734857 - 32734641
Alignment:
Q  24 ctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 123  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32734857 ctaatgactatcttttggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatatcaacaacgttacccgcatatcgatccactgtaacatgttgtgctcc 32734758  T
Q  124 caaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattcca 223  Q
    ||||||||| |  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  32734757 caaaacatgcttgtcacattttcgtagttctttaactccacccaagtgaatgataccctcccctcgtcgagcgttgaacgtttataccaaacgtattcca 32734658  T
Q  224 ccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||||||||||||||||    
T  32734657 ccctccttgtgtctctg 32734641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 42241089 - 42241311
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||| |||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  42241089 ccctaactaatgacgatcttatggcagaatcaaacttttggtgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatcaactgaaacatgttg 42241188  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42241189 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgttgttctttaattccacccaagtgaatgataccctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaatgt 42241288  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     || |||||||||||||||||||    
T  42241289 gtttcaccctccttgtgtctctg 42241311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 3937054 - 3937276
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3937054 ccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 3937153  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||    
T  3937154 tgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgt 3937253  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  3937254 gttccaccatccttgtgtctctg 3937276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 43983072 - 43982850
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43983072 ccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 43982973  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||    
T  43982972 tgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgt 43982873  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  43982872 gttccaccatccttgtgtctctg 43982850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17425005 - 17424784
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17425005 ccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactagaacatgttg 17424906  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||    
T  17424905 tgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgt 17424806  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctct 239  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  17424805 gttccaccatccttgtgtctct 17424784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 39394106 - 39393885
Alignment:
Q  19 cctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgt 118  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39394106 cctaactaatgacgatcttctgacggaatcaagttgttaatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactagaacatgttgt 39394007  T
Q  119 gctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgta 218  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  39394006 gctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttgattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtg 39393907  T
Q  219 ttccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  39393906 ttacaccctccttgtgtctctg 39393885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29067945 - 29067726
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29067945 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 29067846  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29067845 tgctcccaaaacatggtcgtcacattttcgtcattcgttaattgcacccaagtgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgt 29067746  T
Q  218 attccaccctccttgtgtct 237  Q
     ||||||| |||||||||||    
T  29067745 gttccaccatccttgtgtct 29067726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 238
Target Start/End: Original strand, 17796095 - 17796314
Alignment:
Q  16 ttccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgt 115  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17796095 ttccctacctaatgacgagcttctgacggaaccaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactagaacatgt 17796194  T
Q  116 tgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaac 215  Q
       |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  |||    
T  17796195 ---gctcccaaaacatgctcttcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctccactcgtcgagcgttggatgtttatacttaac 17796291  T
Q  216 gtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    || ||||||||||| ||||||||    
T  17796292 gtgttccaccctccctgtgtctc 17796314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16582040 - 16581816
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatc--gatccactggaacatgt 115  Q
    ||||| ||||| | |||||||| |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||     
T  16582040 ccctaactaatgaagatcttctagcggaatcaagcttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatctcgatccaatggaacatga 16581941  T
Q  116 tgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaac 215  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16581940 tgtgctcccaaaacatgctcgacacattttcgtcgctcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcattggacgtttataccgaac 16581841  T
Q  216 gtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  16581840 gtgttccaccctccttgtgtctctg 16581816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22002044 - 22001828
Alignment:
Q  24 ctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 123  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  22002044 ctaatgacaatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttaagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccattggaacatgctgagctcc 22001945  T
Q  124 caaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattcca 223  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  22001944 caaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattcctcccaagtgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttcta 22001845  T
Q  224 ccctccttgtgtctctg 240  Q
    || ||||||||||||||    
T  22001844 ccatccttgtgtctctg 22001828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 88 - 237
Target Start/End: Original strand, 39799902 - 39800051
Alignment:
Q  88 acccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccct 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39799902 acccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtgacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccct 39800001  T
Q  188 tgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  39800002 tgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatccttgtgtct 39800051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 92 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18392179 - 18392032
Alignment:
Q  92 gcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  18392179 gcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtaaatgatactctcccctcgtc 18392080  T
Q  192 gagcgttggacgtttataccg----aacgtattccaccctccttgtgt 235  Q
     ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  18392079 aagcgttggacgtttataccgaacgaacgtattccaccctccttgtgt 18392032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 180
Target Start/End: Original strand, 40677361 - 40677527
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  40677361 cattccgtacctaatgacgatcttctagcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactagaacat 40677460  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatact 180  Q
    || ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  40677461 gtcgtgctcccagaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtggatgatact 40677527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 27650400 - 27650527
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||    
T  27650400 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatctcagcaacgtgacaaacatatcga 27650499  T
Q  101 tccactggaacatgttgtgctcccaaaa 128  Q
    ||||| | ||||||||||| | ||||||    
T  27650500 tccacggtaacatgttgtgttgccaaaa 27650527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34639093 - 34638960
Alignment:
Q  106 tggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtt 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  34639093 tggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgttgagcgttggacgtt 34638994  T
Q  206 tataccgaacgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  34638993 tataccgaaggtgttcca-cctccttgtgtctctg 34638960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 31991909 - 31991994
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgt 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  31991909 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcaaattgttgagaatatcttcagttgatctctgcaacgt 31991994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 16253688 - 16253600
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttac 89  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16253688 tagttggaaggtgtattccctacctaatcacgatcttctggtggaatcaaactgtcgataatatctttagttgatctcagcaacgttac 16253600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 15891620 - 15891705
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgt 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  15891620 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatattctagcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatctccgcaacgt 15891705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16253594 - 16253474
Alignment:
Q  116 tgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaac 215  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| | ||  || ||||| ||||||||||||||    
T  16253594 tgtgctcccaaaacatgctgctcacgttatcgtcgttctttaattccacccaacttaatgatattctcccatcgttaagtgttgggcgtttataccgaac 16253495  T
Q  216 gtattccaccctccttgtgtc 236  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16253494 gtattccaccctccttgtgtc 16253474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 18036135 - 18036220
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgt 86  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || |||||||||| |||||||    
T  18036135 tagttggaaggtgcatttcctacctaatcacgatcttctggcggaatcaaattgttgagaatatttttagttgatctctgcaacgt 18036220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 43491687 - 43491600
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattc----cctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaac 84  Q
    ||||||||||||||||||    | |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43491687 tagttggaaggtgcattctttccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaac 43491600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31770427 - 31770360
Alignment:
Q  170 tgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtct 237  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  31770427 tgaatgatactctcccctcgtcgaacgttggacgtttataccgaacatattacatcctccttgtgtct 31770360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Original strand, 40678763 - 40678827
Alignment:
Q  176 atactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40678763 atactctcccttcgtcgagtgttggacgtttataccgaacgcgttccaccctccttgtgtctctg 40678827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 18393559 - 18393486
Alignment:
Q  24 ctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatat 97  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18393559 ctaatgacgatcttctggcagaatcaagttgtttatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacacgcatat 18393486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 238
Target Start/End: Original strand, 11679084 - 11679308
Alignment:
Q  24 ctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 123  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |    ||||||||||||| |||||||| |||| | |    
T  11679084 ctaatcataatcttatggcagaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatctaagtaacgtgagaaacatatcgatccacgggaacatgatgtggtgc 11679183  T
Q  124 caa----------aacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
     ||          ||||||||| ||||||  |||||||||||||| || | |  | | || | || |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |    
T  11679184 aaaaaaaatcgagaacatgttcatcacgtcgtcgtcgttctttaattctagctgattaaacgttattctcccatcgtccaacgttggacgttcataccaa 11679283  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  11679284 atgtattccaccctccttgtgtctc 11679308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11718945 - 11718741
Alignment:
Q  44 gaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaa----------aacatgt 133  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    ||||||||||||| |||||||| |||| | | ||          |||||||    
T  11718945 gaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatctcagtaacgtgagaaacatatcgatccacgggaacatgatgtggtgcaaaaaaaatcgagaacatgt 11718846  T
Q  134 tcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgt 233  Q
    || ||||||  |||||||||||||| || | || | | || | || |||||| | ||| | || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  11718845 tcatcacgtcgtcgtcgttctttaattctagccgattaaacgttattctcccatcgtccaacgctggacgttcataccaaatgtattccaccctccttgt 11718746  T
Q  234 gtctc 238  Q
    |||||    
T  11718745 gtctc 11718741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 240
Target Start/End: Original strand, 26617652 - 26617697
Alignment:
Q  195 cgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26617652 cgttggacgttcataccaaacgtattccaccctccttgtgtctctg 26617697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17112451 - 17112399
Alignment:
Q  79 agcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacat 131  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  17112451 agcaacgtcacccgcatatcaatccattagaacatattgtgctcccaaaacat 17112399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 119
Target Start/End: Original strand, 26617485 - 26617568
Alignment:
Q  36 ttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtg 119  Q
    |||| ||||||||| ||| || | |||||||||||  |||||||||||||| ||   ||||||||||||| || ||||||||||    
T  26617485 ttctagcggaatcaaactcttaagaatatcttcaggcgatctcagcaacgtgacaaacatatcgatccacggggacatgttgtg 26617568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 18878718 - 18878652
Alignment:
Q  20 ctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgt 86  Q
    ||||||||| |  |||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  18878718 ctacctaatgataatcttctgtcggaatcaaattgttgagaatatcttcaggcgatctcagcaacgt 18878652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 20148368 - 20148334
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatc 35  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20148368 tagttggaaggagcattccctacctaatcacgatc 20148334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Complemental strand, 6902216 - 6902187
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatca 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6902216 tagttggaaggtgcattccctacctaatca 6902187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14115270 - 14115033
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  14115270 tagttggaaggtgcattccctacctaatcactatcttctggcagaatcagactcttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgttacccgcatattga 14115171  T
Q  101 tccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14115170 tccactggaacatgttgtgctcccagaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttacttccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgg 14115071  T
Q  201 acgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  14115070 acgtttatactgaacgttttgcaccctccttgtgtctc 14115033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 801381 - 801160
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  801381 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 801282  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  801281 tgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttctttaactctacccaagtgaatgacac-ctcccctcgtcgagctttggacgtttataccaaacgt 801183  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  801182 attccaccctccttgtgtctctg 801160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13402753 - 13402527
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13402753 cattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaatttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacat 13402654  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  13402653 gttgggctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccactcaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacatttatacaga 13402554  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  13402553 acgtgttccaccctccttgtgtctctg 13402527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 32027617 - 32027843
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  32027617 cattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcaatccactagaacat 32027716  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  32027717 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcattcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgaatgttggacgtttataccga 32027816  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  32027817 acgtgttcaaccctccttgtgtctctg 32027843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 240
Target Start/End: Original strand, 32037677 - 32037902
Alignment:
Q  15 attccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatg 114  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  32037677 attccttacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcaatccactagaacatg 32037776  T
Q  115 ttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaa 214  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  32037777 ttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcattcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgaatgttggacgtttataccgaa 32037876  T
Q  215 cgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  32037877 cgtgttcaaccctccttgtgtctctg 32037902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29066769 - 29066547
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29066769 ccctaactaatgacgatctactggcggaatcaagttgttgatcatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 29066670  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29066669 tgctcccaaaacatgctcttcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggt 29066570  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  29066569 gttccaccctccttgtgtctctg 29066547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29075782 - 29075560
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29075782 ccctaactaatgacgatctgctggcggaatcaagttgttgatcatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 29075683  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29075682 tgctcccaaaacatgctcttcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggt 29075583  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  29075582 gttccaccctccttgtgtctctg 29075560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29108356 - 29108134
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29108356 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatcatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 29108257  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  29108256 tgctcccaaaacatgctcttcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccacaggt 29108157  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  29108156 gttccaccctccttgtgtctctg 29108134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 34802885 - 34803111
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  34802885 cattccttacctaatgacgatcttttggcgaaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatttactggaacat 34802984  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    |||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34802985 gttgtgctccctgaacatgctcatcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtcaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccga 34803084  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  34803085 acgtgttccaccctccttgtgtctctg 34803111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11692667 - 11692446
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11692667 ccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttg 11692568  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  11692567 tgcttccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctccccttgtcgagtgttggacgtttataccaaatgt 11692468  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctct 239  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  11692467 gttccaccatccttgtgtctct 11692446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 222
Target Start/End: Original strand, 35058728 - 35058932
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | ||||| |   ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35058728 ccctaactaatgacgatcttcttgtggaattaagatgttgatgatatctttagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 35058827  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35058828 tgctcccaaaacatgctcgtaacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataacgaacgt 35058927  T
Q  218 attcc 222  Q
    |||||    
T  35058928 attcc 35058932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29110754 - 29110531
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29110754 ccctaactaatgacgatctgctggcggaatcaagttgttgatcatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 29110655  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29110654 tgctcccaaaacatgctcttcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggt 29110555  T
Q  218 attccaccc-tccttgtgtctctg 240  Q
     |||||||| ||||||||||||||    
T  29110554 gttccacccatccttgtgtctctg 29110531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12396989 - 12396770
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12396989 tacctaatgacgatcttttggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagtagatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgc 12396890  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  |    
T  12396889 tcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaattgaatgatactctcccctcgtcgagtgttagacgtttataccgaacgtgct 12396790  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  12396789 ccaccctccttatgtctctg 12396770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6205700 - 6205478
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6205700 ccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 6205601  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||    
T  6205600 tgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgt 6205501  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  6205500 gttccaccatccttgtgtctctg 6205478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27640396 - 27640174
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27640396 ccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 27640297  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  27640296 tgcttccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaatgt 27640197  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  27640196 gttccaccatccttgtgtctctg 27640174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 55 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22305975 - 22305793
Alignment:
Q  55 ttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttct 154  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||     
T  22305975 ttgatgatatcttcagttgatctaaccaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatggtcgtgacgttttcgtcgttcg 22305876  T
Q  155 ttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtct 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  22305875 ttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatccttgtgtct 22305793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 175
Target Start/End: Original strand, 30257575 - 30257729
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30257575 tacctaatgacgatcttctagcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgtcacccacatatcgatccactagaacatgatgtgc 30257674  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatg 175  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  30257675 tcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaactgaatg 30257729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 17465311 - 17465415
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||    
T  17465311 tagttggaaggtgtattctctacctaatcacgatcttttggcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatctctgcaacgtgacaaacatatcga 17465410  T
Q  101 tccac 105  Q
    |||||    
T  17465411 tccac 17465415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 34134884 - 34134801
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaac 84  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  34134884 tagttgaaaggtgcattccctacctaatcacgatcttttagcggaatcaaactgttgagaatttcttcagttgatctctgcaac 34134801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 20192551 - 20192466
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgt 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20192551 tagttggaaggtgcattcccttcctaatcacattcttctgccagaaccacactgttgagaatatcttcagttgatctctgcaacgt 20192466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 20242103 - 20242188
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgt 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20242103 tagttggaaggtgcattcccttcctaatcacattcttctgccagaaccacactgttgagaatatcttcagttgatctctgcaacgt 20242188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 22136087 - 22136172
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgt 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  22136087 tagttggaaggtgcattcccttcctaatcacattcttctgccagaaccacactgttgagaatatcttcagttgatctctgcaacgt 22136172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 22143440 - 22143525
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgt 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  22143440 tagttggaaggtgcattcccttcctaatcacattcttctgccagaaccacactgttgagaatatcttcagttgatctctgcaacgt 22143525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 28051601 - 28051354
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttga-taatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcg 99  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| ||   |||||||    
T  28051601 tagttgaaaggtgcattctctacgtaatcacgatcttctagcggaatcaaactattgagaaatatctccagttgatctctgcaacgtgacaaacatatcg 28051502  T
Q  100 atccactggaacatgttgtgctcccaa---------aacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgt 190  Q
    |||  | | | |||| |||||| ||||         |||||| || | ||||| |||||||||||||| || | || | |||| | || |||||| | ||    
T  28051501 atcaccagaaccatgctgtgctgccaaaaaatcgagaacatgctcctgacgttgtcgtcgttctttaattctagccgactgaacgttattctcccgtcgt 28051402  T
Q  191 cgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    | | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  28051401 ccaacgttggacgttcataccaaatgtatttcaccctccttgtgtctc 28051354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 104
Target Start/End: Original strand, 3765780 - 3765867
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatc-atactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatcca 104  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| |||||  | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3765780 ccctaactaatgatgatcttctggtggaatttaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatcca 3765867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 14482798 - 14482874
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatct 77  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |  |||||||||    
T  14482798 tagtgggaaggtgcattccctacctaatcattatcttctagcggaatcaaactgttgacaatatgtctagttgatct 14482874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 2402383 - 2402306
Alignment:
Q  51 actgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaa 128  Q
    |||||||| | |||||||||  |||||||||||||| ||   ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2402383 actgttgagattatcttcaggcgatctcagcaacgtgacaaacatatcgatccacaggaacatgttgtgctgccaaaa 2402306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 96
Target Start/End: Original strand, 24021090 - 24021168
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcata 96  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||    
T  24021090 ccctaactaatgacgattttatggcggaatcaaacttttgatgatatcttaagttgatctaagcaacttcacccgcata 24021168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 72
Target Start/End: Original strand, 35021226 - 35021284
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagtt 72  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  35021226 cattccgtacttaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 35021284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 121
Target Start/End: Original strand, 18743985 - 18744073
Alignment:
Q  33 atcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgct 121  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||||| | ||   |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18743985 atcttatggaggaatcaaactgtcgagaatatcttcagacgatctcagcaacatgacaaacatatcgatccacgagaacatgttgtgct 18744073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 2192613 - 2192535
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcata 96  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| | | ||||| ||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||    
T  2192613 ccctaactaatgacgattttatggcggaatcaaaattttgatgatatcttaagttgatctaagcaacttcacccgcata 2192535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 238
Target Start/End: Original strand, 18744144 - 18744198
Alignment:
Q  184 cccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    |||||||||| | |||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18744144 cccttgtcgaactttggacgttcgtaccaaatgtattccaccctccttgtgtctc 18744198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33370866 - 33370645
Alignment:
Q  17 tccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgtt 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370866 tccctacctaatcatgatcttctggcggaatcagactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgtt 33370767  T
Q  117 gtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacg 216  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  33370766 gtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactaaatgatattctcccctcgtcgagcgttgaacgtttatatcgaacg 33370667  T
Q  217 tattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  33370666 tattccaccctccttgtgtctc 33370645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 238
Target Start/End: Original strand, 1400301 - 1400518
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1400301 tacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatggatccactggaacatgatgtgc 1400400  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1400401 tcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgtt 1400500  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctc 238  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1400501 ccaccctccttgtgtctc 1400518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 40009739 - 40009518
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | |||||||  |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  40009739 ccctaactaatgacgatcttcttgtggaatcaagctgttgatgatgtcttcagttgatctcaacaacgttacccacatatcgatccactgtaacatgttg 40009640  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40009639 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 40009540  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctct 239  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  40009539 attccaccctccttgcgtctct 40009518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 4724073 - 4724292
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4724073 tacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 4724172  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  4724173 tcccaaaacatgctcgtcacgtttttgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcatcgagcgttggacgtttataccgaatgtgtt 4724272  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  4724273 ccactttccttgtgtctctg 4724292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 7225 - 7447
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7225 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 7324  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7325 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgt 7424  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  7425 gttccaccatccttgtgtctctg 7447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 36 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1971558 - 1971356
Alignment:
Q  36 ttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttc 135  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1971558 ttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatattgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctc 1971459  T
Q  136 ttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgt 235  Q
     ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1971458 gtcacgttttcgtcgttcgttaattccaccgaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccctccttgtgt 1971359  T
Q  236 ctc 238  Q
    |||    
T  1971358 ctc 1971356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8538165 - 8537943
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8538165 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttg 8538066  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8538065 tgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgaacgtttataccgaacgt 8537966  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  8537965 gttccaccatccttgtgtctctg 8537943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18308475 - 18308249
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| ||||||||  | |||| |||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18308475 cattccatacctaatgtcaatctactggcggaatcaaatttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacat 18308376  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18308375 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccga 18308276  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18308275 acgtgttccaccctccttgtgtctctg 18308249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 541631 - 541853
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||   ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  541631 ccctaactaatgacgatcttctggcgaaatcaagttgttgatgatatctccagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgatg 541730  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  541731 tgctcccaaaacatgctcgtcccgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggt 541830  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  541831 gttccaccctccttgtgtctctg 541853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 8576137 - 8576359
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8576137 ccctaactaatgacaatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccaccggaacatgttg 8576236  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8576237 tgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcttcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgt 8576336  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  8576337 gttccaccatccttgtgtctctg 8576359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11346920 - 11346698
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  11346920 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcactcgcatatcgatccactggaacatgctg 11346821  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11346820 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcattaatttcacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgt 11346721  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  11346720 gttccaccatccttgtgtctctg 11346698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19400574 - 19400352
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19400574 ccctaactaatgacgatattctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcaccaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 19400475  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19400474 tgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgacactctcccctcatcgagcgttggacgtttataccgaacgt 19400375  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  19400374 attccaccatccttgtgtctctg 19400352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 19036670 - 19036892
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19036670 ccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttg 19036769  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||    
T  19036770 tgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgt 19036869  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  19036870 gttccaccatccttgtgtctctg 19036892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 35565478 - 35565261
Alignment:
Q  22 acctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgct 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35565478 acctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttctgatgatatctttagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgct 35565379  T
Q  122 cccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattc 221  Q
    ||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  35565378 cccaaaacatgctcgtcacg-tttcatcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttagacgtttataccgaacgtgttc 35565280  T
Q  222 caccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  35565279 caccctccttatgtctctg 35565261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3601546 - 3601330
Alignment:
Q  24 ctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 123  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  3601546 ctaatgacgatcttctgacggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgaaacactggaacatgttgtgctct 3601447  T
Q  124 caaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattcca 223  Q
     |||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||| |    
T  3601446 taaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaatatgttcta 3601347  T
Q  224 ccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||||||||||||||||    
T  3601346 ccctccttgtgtctctg 3601330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11027988 - 11027769
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11027988 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaactttcgatgatatcttcagttgatctaaccaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 11027889  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11027888 tgctcccaaaacatggtcgtgacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgt 11027789  T
Q  218 attccaccctccttgtgtct 237  Q
     ||||||| |||||||||||    
T  11027788 gttccaccatccttgtgtct 11027769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28881202 - 28880980
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28881202 ccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 28881103  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||    
T  28881102 tgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttgtaccaaatgt 28881003  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  28881002 tttccaccatccttgtgtctctg 28880980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30709809 - 30709594
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30709809 ccctaactaatgacgatcttccggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaaccaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 30709710  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30709709 tgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcattcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgt 30709610  T
Q  218 attccaccctccttgt 233  Q
     ||||||| |||||||    
T  30709609 gttccaccatccttgt 30709594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 38854368 - 38854150
Alignment:
Q  19 cctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgt 118  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38854368 cctaactaatgacggtcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaaccaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgatgt 38854269  T
Q  119 gctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgta 218  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  38854268 gctcccaaaacatggtcgtgacgttttcgtcgttcgttaattccacccaattgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtg 38854169  T
Q  219 ttccaccctccttgtgtct 237  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  38854168 ttccaccatccttgtgtct 38854150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 27661373 - 27661595
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27661373 ccctaactaatgacaatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatctttagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttg 27661472  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||  |||||    
T  27661473 tgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtaaatgatactctcccctcgtcgagcaatggaagtttatactaaacgt 27661572  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  27661573 gttccaccatccttgtgtctctg 27661595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 36350313 - 36350523
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36350313 tacctaatgacgatcttctggtggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacctacatatcgatccactggaacatgttgtgc 36350412  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
             ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  36350413 ---------atgctcgtcacgttttcgtcgttcattaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgaacgtttataccgaacgtgtt 36350503  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36350504 ccaccctccttgtgtctctg 36350523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 6793385 - 6793604
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  6793385 tacctaatgacgatcttctggctgaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacctcatccgcatatcgattcactagaacatgttgtgc 6793484  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||| | ||||||||||||| || ||    
T  6793485 tcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgttcgttaattccactcaagtgaatgatactcactcctcgtcgagcgttaggcgtttataccgaatgtgtt 6793584  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  6793585 ccatcctccttgtgtctctg 6793604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 237
Target Start/End: Original strand, 17366738 - 17366950
Alignment:
Q  24 ctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 123  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17366738 ctaatcacgatattctggcagaatcagactcttgataatatctttagttgatctcaacaacggtacccgcatatcaatccactagaacatgttgtgctcc 17366837  T
Q  124 caaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattcca 223  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17366838 caaaacatgtttgtcacattttcgtcgttcgttaattccacccaactaaatgatattcttccctcatcgagggttggacgtttatatcgaac-tattcca 17366936  T
Q  224 ccctccttgtgtct 237  Q
    ||||||||||||||    
T  17366937 ccctccttgtgtct 17366950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 55 - 238
Target Start/End: Original strand, 35927470 - 35927653
Alignment:
Q  55 ttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttct 154  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  35927470 ttgatgatatctttagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaagatgatgtgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcg 35927569  T
Q  155 ttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||  |||||||||    
T  35927570 ttaattccacccaactaaatgatactcttccctcgtcgagcattggacgtttataacgaacgtgttacaccctaattgtgtctc 35927653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 66 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3169766 - 3169593
Alignment:
Q  66 ttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacc 165  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3169766 ttcagctgatctcagcaacgtcacccgcataccgatccactggaacatgttgtgctcttaaaatatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacc 3169667  T
Q  166 caagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  3169666 caagtgaatgatactct-ccctcgtcgagcgttagacgtttataccgaacgtgttccaccctctttatgtctctg 3169593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2599396 - 2599210
Alignment:
Q  52 ctgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgt 151  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||    
T  2599396 ctgttgagaatatcatcagttaatctcagcaacgttacacacatatcgatccacggtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcttcatgtcgccgttgt 2599297  T
Q  152 tctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    ||  ||| ||||||||| ||||||||| |||| | | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2599296 tcgctaattccacccaactgaatgatattctctcatcgtcgaatgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 2599210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 1694997 - 1694860
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  1694997 tacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgtcacccgcatatcgttccagtgaaacatgctgtgc 1694898  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaa 158  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  1694897 tcccaaaacatgctcgtcacgttttcgttgttcgttaa 1694860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 124 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3458941 - 3458828
Alignment:
Q  124 caaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattcca 223  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3458941 caaaacatactcgtcacgttttcgtcgttctttaactcaacccaagtgaatgatactctcccctcgtcaagcgttggacatttataccgaacgtattcca 3458842  T
Q  224 ccctccttgtgtct 237  Q
    ||||||||| ||||    
T  3458841 ccctccttgcgtct 3458828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18920962 - 18920835
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||    
T  18920962 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatctctgcaacgtgacaaacatatcga 18920863  T
Q  101 tccactggaacatgttgtgctcccaaaa 128  Q
    ||  | | | ||||||||||| ||||||    
T  18920862 tcatcggaaccatgttgtgctgccaaaa 18920835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 17195338 - 17195423
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgt 86  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17195338 tagttggaagatgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcaaattgttgataatatctttagttgatctcagcaacgt 17195423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 7082426 - 7082336
Alignment:
Q  24 ctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatg 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7082426 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatg 7082336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 25360562 - 25360690
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagc-aacgttacccgcatatcg 99  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||| ||||| ||   |||||||    
T  25360562 tagttgaaaggtgcattctctacctaatcacgatcttctgacggaatcaaactgttgaaaacatcttcaggcgatctcagcaaacgtgacaaacatatcg 25360661  T
Q  100 atccactggaacatgttgtgctcccaaaa 128  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  25360662 atccacgagaacatgttgtgctgccaaaa 25360690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 12742884 - 12742818
Alignment:
Q  17 tccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaa 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12742884 tccctacctaatcacgatcttctggcggaatcagactgttgatgatatcttcagttgatctcagcaa 12742818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1693455 - 1693382
Alignment:
Q  155 ttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctc 228  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1693455 ttaattccacccaagtgagtgatactctcctctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctc 1693382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 36311924 - 36312009
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgt 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||    
T  36311924 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcagaattaaactattgagaagatcttcaggcgatctcagcaacgt 36312009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 186 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7082335 - 7082281
Alignment:
Q  186 cttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7082335 cttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtgtctctg 7082281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12742820 - 12742706
Alignment:
Q  124 caaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattcca 223  Q
    ||||||||||||  |  ||| ||||||||| |||| |||||| || ||||||||| | || | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742820 caaaacatgttccacctgttatcgtcgttcgttaattccacctaactgaatgatattatctcatcgttgagcgttggacgtttataccgaacgtattcca 12742721  T
Q  224 ccctccttgtgtctc 238  Q
    |||| ||||||||||    
T  12742720 cccttcttgtgtctc 12742706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12805638 - 12805524
Alignment:
Q  124 caaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattcca 223  Q
    ||||||||||||  | |||| ||||||||| |||| |||||| || ||||||||| | || | |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12805638 caaaacatgttccacccgttatcgtcgttcgttaattccacctaactgaatgatattatctcatcattgagcgttggacgtttataccgaacgtattcca 12805539  T
Q  224 ccctccttgtgtctc 238  Q
    |||| ||||||||||    
T  12805538 cccttcttgtgtctc 12805524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 12805702 - 12805636
Alignment:
Q  17 tccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaa 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12805702 tccctacctaatcacgatcttctggcataatcagactgttgatgatatcttcagttgatctcagcaa 12805636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19748276 - 19748051
Alignment:
Q  20 ctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtg 119  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||   ||||||||||||| | |||||||||||    
T  19748276 ctacctaatcataatcttatggcggaatcaaattgttgagaatatcttcaggcgatctcagcaacg-tacaaacatatcgatccacggaaacatgttgtg 19748178  T
Q  120 ctcccaa---------aacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttatac 210  Q
    || ||||         ||||||||||||||||  ||||||||| |||| || | |  | |||| | || |||||| ||||| | ||||||||||| |||     
T  19748177 ctgccaaaaaatggagaacatgttcttcacgtcgtcgtcgttcgttaattctagctgactgaacgttattctcccgttgtccaacgttggacgttcatat 19748078  T
Q  211 cgaacgtattccaccctccttgtgtct 237  Q
    | || |||||||||||| |||||||||    
T  19748077 caaatgtattccacccttcttgtgtct 19748051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 13131057 - 13131142
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgt 86  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  13131057 tagttggaaggtgcattctctagctaatcacgatcttctagcaaaatcaaaatgttgagaatatcttcagttgatctctgcaacgt 13131142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 2599483 - 2599426
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttga 58  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2599483 tagttgaaaggtgcattctctacctaatcacgatcttctgacggaatcaaactgttga 2599426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 128
Target Start/End: Original strand, 15798078 - 15798186
Alignment:
Q  20 ctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtg 119  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||| |||||| ||   |||||| |||||| | |||||||||||    
T  15798078 ctacctaatcataatcttttggcggaatcaaactgttgagaatatcttcaggcaatctcatcaacgtgacaaacatatcaatccacggaaacatgttgtg 15798177  T
Q  120 ctcccaaaa 128  Q
    || ||||||    
T  15798178 ctgccaaaa 15798186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 128
Target Start/End: Original strand, 23228668 - 23228776
Alignment:
Q  20 ctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtg 119  Q
    |||||||||||  || |||| ||||||||| |||||| | ||||||||||  |||||||| |||||| ||   ||||||||| ||| ||||||||  |||    
T  23228668 ctacctaatcataattttctagcggaatcaaactgttcagaatatcttcaagtgatctcaacaacgtgacaaacatatcgattcacgggaacatgcggtg 23228767  T
Q  120 ctcccaaaa 128  Q
    || ||||||    
T  23228768 ctgccaaaa 23228776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 12742917 - 12742883
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatc 35  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12742917 tagttggaagatgcattccctacctaatcacgatc 12742883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 12805734 - 12805701
Alignment:
Q  2 agttggaaggtgcattccctacctaatcacgatc 35  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12805734 agttggaagatgcattccctacctaatcacgatc 12805701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 121
Target Start/End: Original strand, 16418111 - 16418199
Alignment:
Q  33 atcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgct 121  Q
    |||||||||| || ||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||   ||| || |||| | |||||||||||||||    
T  16418111 atcttctggcagagtcaaactcttgagaatatcttcaggtgatctcagcaatgtaacatccatctcaatcctcgggaacatgttgtgct 16418199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 60)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3393533 - 3393296
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3393533 tagttggaaggtgcattccctacctaatcatgatcttctggcggaatcagactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacatgcatatcga 3393434  T
Q  101 tccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttgg 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||||| |  |||||||||||    
T  3393433 tccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcctcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactaaatgataatctcccatcctcgagcgttgg 3393334  T
Q  201 acgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3393333 acgtttatatcgaacgtattccaccctccttgtgtctc 3393296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 43889497 - 43889716
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43889497 tacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgattatatcttcagttgatctcaacaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgc 43889596  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43889597 tcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgtt 43889696  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  43889697 ccaccctccttgtgtctctg 43889716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22437127 - 22436901
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22437127 cattccgtacctaatgacgatcttccggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacat 22437028  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22437027 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcatcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccga 22436928  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22436927 acgtgttccaccctccttgtgtctctg 22436901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17211496 - 17211258
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcg 99  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17211496 tagttggaagatgcatttccctacctaatcacgatcttctggcggaatcagactgttgataatatctttagttgatctcagcaacgttacccgcatatcg 17211397  T
Q  100 atccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||| |||| || || ||| ||||||||| ||| |||| ||||| |||||    
T  17211396 atccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgtttttatcgttcgttaattcgactcaaatgaatgatattcttccctcgtcgaacgttg 17211297  T
Q  200 gacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17211296 gacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 17211258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 242417 - 242633
Alignment:
Q  24 ctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  242417 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcc 242516  T
Q  124 caaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattcca 223  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  242517 caaaacatgctcgtcacgttttcatcgttctttaactccacctaagtgaatgatgctctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccgaacgtgttcca 242616  T
Q  224 ccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||||||||||||||||    
T  242617 ccctccttgtgtctctg 242633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25762810 - 25762590
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25762810 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccaccagaacatgttg 25762711  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25762710 tgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaatgt 25762611  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctc 238  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  25762610 gttccaccctccttgtgtctc 25762590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 239
Target Start/End: Original strand, 14330695 - 14330910
Alignment:
Q  24 ctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14330695 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccattggaacatgttgtgctcc 14330794  T
Q  124 caaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattcca 223  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  14330795 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaatgataccctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccgaaagtgttcca 14330894  T
Q  224 ccctccttgtgtctct 239  Q
    ||||||||||||||||    
T  14330895 ccctccttgtgtctct 14330910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 232
Target Start/End: Original strand, 31824624 - 31824838
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  31824624 ccctaactaatgacgatcttctagcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctaagcaacgttacccgcatattgatccactagaacatgttg 31824723  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31824724 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 31824823  T
Q  218 attccaccctccttg 232  Q
    |||||||||||||||    
T  31824824 attccaccctccttg 31824838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 33163539 - 33163761
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33163539 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgttacccacatatcgatccactggaacatgttg 33163638  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  33163639 tgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgttactctcccctcgttgagcgttggacgtttataccgaacgt 33163738  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||| ||| |||||||    
T  33163739 attccaccctcattgcgtctctg 33163761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 51027762 - 51027984
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51027762 ccctaactaatgacgatcttatggtggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 51027861  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51027862 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 51027961  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     |||||| |||||||||||||||    
T  51027962 gttccactctccttgtgtctctg 51027984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 51428187 - 51428409
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51428187 ccctaactaatgacgatcttcttgcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 51428286  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  51428287 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaactccacacaagtgaatgatactctcccctcgttgagcgttgaacgtttataccgaacgt 51428386  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  51428387 gttccaccctccttgtgtctctg 51428409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18412824 - 18412587
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18412824 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcagaatcaaattgttgataatatattcagttgatctcagcaacgttacacgcatatcga 18412725  T
Q  101 tccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttgg 200  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||| |||||| || ||||||||| ||| || | ||||||||||||    
T  18412724 tccactgaaacatggtgtgctcccaaaacatgctcctcacgttatcgtcgttcattaattccaccgaactgaatgatattcttccatcgtcgagcgttgg 18412625  T
Q  201 acgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18412624 acgtttataccgaacgtattccacccttcttgtgtctc 18412587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 49817635 - 49817860
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49817635 cattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcagactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactagaacat 49817734  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    | ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  49817735 gatgtgctcccaaaacatgctcgtaacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgttactctcccctcgtagagcgttggacgtttatactga 49817834  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctct 239  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  49817835 acgtgttccaccctccttgtgtctct 49817860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 240
Target Start/End: Original strand, 26591678 - 26591902
Alignment:
Q  16 ttccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgt 115  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26591678 ttccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatcttagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgt 26591777  T
Q  116 tgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaac 215  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26591778 tgtgctcccaaaatatgttcgtcacgtttttgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatatcgaac 26591877  T
Q  216 gtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  26591878 gtgttccaccctccttgtgtctctg 26591902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 34153277 - 34153503
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  34153277 cattccgtacataatgacgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcaccaacgtcatccgcatattgatccactggaacat 34153376  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34153377 gttgtgctcccaaaacatgatcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccga 34153476  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  34153477 acgtgttccaccctccttgtgtctctg 34153503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11288523 - 11288288
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11288523 tagttggaaggtgcattccctacttaatcacgatcttctaacagaatcaaattgt-gataatatcttcagttgatctcagcaacgttactcgcatatcga 11288425  T
Q  101 tccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttgg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  11288424 tccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactaaatgatattctcccctcgtcgaccgttgg 11288325  T
Q  201 acgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtct 237  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11288324 acgtttatacggaacgtattccaccctccttgtgtct 11288288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 4785420 - 4785639
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4785420 tacctaatgacgatcttgtggcggaatcaaactgttgataatatcttcagttgatatcagcaacgttccccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 4785519  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||| || ||    
T  4785520 tcccaaaacatgttcttcacgtttttgtcgttcgttaattccaccaaagtgaatgatgctctcccctcgtcaagggtttgacgtttataccgaatgtgtt 4785619  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4785620 ccaccctccttgtgtctctg 4785639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1226371 - 1226150
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1226371 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactagaacatgttg 1226272  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  1226271 tgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgttctttaattccacacaagtgaatgataccctcccctcgtcgagcgttggacgtttatagcaaacgt 1226172  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  1226171 attccaccctcc-tgtgtctctg 1226150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 21017172 - 21017394
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21017172 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 21017271  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21017272 tgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgt 21017371  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  21017372 gttccaccatccttgtgtctctg 21017394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 34529787 - 34530013
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  34529787 cattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacctgcatatcgatccactggaacat 34529886  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34529887 gttgtgctcccaaaaaatgctcgtcacattttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 34529986  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    | || ||||||||| ||||||||||||    
T  34529987 aggtgttccacccttcttgtgtctctg 34530013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 40353768 - 40353990
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40353768 ccctaactaatgacaatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttg 40353867  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40353868 tgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgt 40353967  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  40353968 gttccaccatccttgtgtctctg 40353990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 49791927 - 49792153
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| | |||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49791927 cattccgtacctaatgatgatcttttggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacctgcatatcgatccactggaacat 49792026  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  49792027 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcattcgttaattccacccaagtgaataatactctcccatcgtcgagcgttggacgtttataccga 49792126  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  49792127 acgtgttccaccctccttgtgtctctg 49792153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2773225 - 2773000
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2773225 cattccgtacctgatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatggtatcttcagttgatctcaataacgttacccgcatatcgatccactggaacat 2773126  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||    
T  2773125 gttgtgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtagagcgttggacgtttataacga 2773026  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctct 239  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||    
T  2773025 acgtgttccaccatccttgtgtctct 2773000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10312501 - 10312264
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10312501 tagttggaaggtgaattccctacctaatcacgatcttccagcggaattagattgttgataatatcttcagttgatcttaacaacgttacccgcatatcga 10312402  T
Q  101 tccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttgg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||||| | |||||| ||||     
T  10312401 tccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactaaatgatattctcccatcgtcgagtgttgt 10312302  T
Q  201 acgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10312301 atgtttataccgaacatattccacactccttgtgtctc 10312264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 20778864 - 20779081
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20778864 ccctacctaatgacgatcttttggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgaaacccgcatatcgatccattggaacatgttg 20778963  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20778964 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaaatgaatgatactctcccctcgtagagcgttggacgtttataccgaacgt 20779063  T
Q  218 attccaccctccttgtgt 235  Q
     ||||||||| |||||||    
T  20779064 gttccacccttcttgtgt 20779081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Original strand, 957446 - 957670
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  957446 cattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatctttagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacat 957545  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  957546 gctgtgctcctaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatacgctcccctcgtcgagcgttggacatttatacaga 957645  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    || ||||||||||||||| ||||||    
T  957646 acatattccaccctccttatgtctc 957670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 6282314 - 6282537
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  6282314 cattccgtaactaatgacgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatcttagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacat 6282413  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6282414 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcattcgttaattccacccaagtgaatgatactctctccttgtcgagtgttggacgtttataccga 6282513  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtct 237  Q
    |||| ||||||||||||| |||||    
T  6282514 acgtgttccaccctccttctgtct 6282537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24606963 - 24606744
Alignment:
Q  19 cctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||    
T  24606963 cctacctaatcacgatcttctggcggaatcagactcttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccacatatcaatccacgggaacatgatgt 24606864  T
Q  119 gctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgta 218  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  24606863 gctcccaatacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattctacccaactgaataatactctccgcttgtcgagcgttggacatttatatcgaacgtg 24606764  T
Q  219 ttccaccctccttgtgtctc 238  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24606763 ttccaccctccttgtgtctc 24606744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 47657353 - 47657572
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47657353 tacctaatgacgatcttctggtggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 47657452  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||||||| ||| || ||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  47657453 tcccaaaatatgctcgtcacgttttggtcgttcgttaattccatccaagtgaatgatactctcccatcgtcgagcgttggatgtttataccgaacgtgtt 47657552  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  47657553 ccacccaccttgtgtctctg 47657572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 49064191 - 49063969
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  49064191 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacgtcacccgcatatcgatccacggaaacatgttg 49064092  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49064091 tgctccaaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaatgacaccctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccgaacgt 49063992  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     |||||| |||||||||||||||    
T  49063991 gttccactctccttgtgtctctg 49063969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 55796955 - 55796738
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  55796955 ccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 55796856  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55796855 tgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgt 55796756  T
Q  218 attccaccctccttgtgt 235  Q
     ||||||| |||||||||    
T  55796755 gttccaccatccttgtgt 55796738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 32937897 - 32938116
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32937897 ccctatctaatgacgatcttctggcggaatcaaatttttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgctg 32937996  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32937997 tgctcccgaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatattctcccttcgtcgagtgttggacgtttataccgaacgt 32938096  T
Q  218 attccaccctccttgtgtct 237  Q
     |||||||||||||||||||    
T  32938097 gttccaccctccttgtgtct 32938116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 46816520 - 46816740
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46816520 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctattgatgatatcttca--tgatctcaacaacgttacctgcatatcgatccactggaacatgttg 46816617  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  46816618 tgctcccaaaacatgctcgtcacgtttttgtcgttctttaactccacccaagtgaatgataccctcccctcgtcgagcattggacgtgtatactgaacgt 46816717  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  46816718 attccaccctccttgcgtctctg 46816740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 41794557 - 41794779
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41794557 ccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttg 41794656  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||    
T  41794657 tgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgt 41794756  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  41794757 gttccaccatccttgtgtctctg 41794779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1042961 - 1042744
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1042961 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgattatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 1042862  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  || |     
T  1042861 tgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtctagcgttggacgtttatac--aaggc 1042764  T
Q  218 attccaccctccttgtgtct 237  Q
     |||||||||||||||||||    
T  1042763 gttccaccctccttgtgtct 1042744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13850978 - 13850739
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||   ||||||||    
T  13850978 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacggtcttctggcggaatcaaactgttgagaatatctttagttgatctcagcaatgttacatacatatcga 13850879  T
Q  101 tccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttgg 200  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  |||| | || |||| ||||||||| |||||| | ||| | ||||||    
T  13850878 tccacggtaacatgttgtgctcccaaaacatgttcgtcacgtcgtcgtcgtttgttaatttcatccaactgaatgatattctcccatcgtcaaacgttgg 13850779  T
Q  201 acgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13850778 acgtttataccaaacgtattccaccctccttgtgtctctg 13850739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37866619 - 37866396
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37866619 ccctaactaatgacgatcttctagcggaatcaagatattgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttg 37866520  T
Q  118 tgctccc-aaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacg 216  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  37866519 tgctcccgaaaacatgctcatcacgttttcgtcgctcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggatgtttataccgaatg 37866420  T
Q  217 tattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    | ||||||||| ||||||||||||    
T  37866419 tgttccacccttcttgtgtctctg 37866396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 6177310 - 6177532
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6177310 ccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 6177409  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||    
T  6177410 tgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgt 6177509  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  6177510 gttccaccatccttgtgtctctg 6177532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 56139122 - 56138900
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  56139122 ccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 56139023  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||    
T  56139022 tgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgt 56138923  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  56138922 gttccaccatccttgtgtctctg 56138900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13866492 - 13866253
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |    
T  13866492 tagttgaaaggtgcattccctacctaatcacggtcttctggcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatctcagcaacgttacatacatatcaa 13866393  T
Q  101 tccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttgg 200  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| |||||| | ||| |  |||||    
T  13866392 tccacggtaacatgttgtgctcccaaaacatgttcgtcacgtcgtcgtcgtttgttaattccatccaactgaatgatattctcccatcgtcaaatgttgg 13866293  T
Q  201 acgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13866292 acgtttataccaaacgcattccaccctccttgtgtctctg 13866253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21169684 - 21169441
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgc----attccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcata 96  Q
    ||||||||||||||    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21169684 tagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaatttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacctgcata 21169585  T
Q  97 tcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcg 196  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||| ||| |||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21169584 tcgatccactggtacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcgcgtattcatcgtccgttaattcgacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcg 21169485  T
Q  197 ttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21169484 ttggatgtttatatcgaacgtgttccaccctccttgtgtctctg 21169441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 42886475 - 42886255
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  42886475 tacctaatgatgatcttctggcggaatcagactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcgtatcgatccactagaaaatgttgtgc 42886376  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatga---tactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    || |||| |||| || ||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  42886375 tctcaaagcatgctcgtcatgttttcgtcgttggttaattccacccaagtgaatgatagtactctcccctcgtcgagcgttggaagtttataacgaacgt 42886276  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctc 238  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  42886275 gttccaccctccttgtgtctc 42886255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 49094957 - 49094735
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49094957 ccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgacgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttg 49094858  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||    
T  49094857 tgctcccaaaacatggtcgtcacgtttttgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgt 49094758  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  49094757 gttccaccatccttgtgtctctg 49094735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21711742 - 21711549
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711742 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatctttagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttg 21711643  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttatacc 211  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  21711642 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaatgataccctcccctcgtcgagcgttagatgtttatacc 21711549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 20901663 - 20901882
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||| || |||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20901663 ccctaactaatgacgatcttcaggtggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcagtgttacccgcatatcgatccactagaacatgctg 20901762  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20901763 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattctccactcgtcgaacgttggacgtttataccgaacgt 20901862  T
Q  218 attccaccctccttgtgtct 237  Q
     ||| |||||||||||||||    
T  20901863 gttctaccctccttgtgtct 20901882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 45939737 - 45939518
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||  ||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45939737 ccctaactaatgacgatcttatggaagaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttactcgcatatcgatccactggaacatgttg 45939638  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || |||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  45939637 tgctcccaaaacatgctcgtcacattatcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgataatctcctctcgtcgagcgttgaacgtttatatcgaacgt 45939538  T
Q  218 attccaccctccttgtgtct 237  Q
     |||||||||||||||||||    
T  45939537 gttccaccctccttgtgtct 45939518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 44560171 - 44560397
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||||  || | ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  44560171 cattccgtacctaatgacgatcttaaggagaaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcaatacactggaacat 44560270  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    | | ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  44560271 gctttgctcccaaaacatgcttgtcacgttttcgtcgttcgttaattccatccaagtgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttatactga 44560370  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  44560371 acgtgttccaccctccttgtgtctctg 44560397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 27759539 - 27759374
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  27759539 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttactcgcatatcgatccactggaacatgctg 27759440  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctc 183  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27759439 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctc 27759374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39589135 - 39588922
Alignment:
Q  24 ctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 123  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39589135 ctaatgacgatcttctagcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcatccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcc 39589036  T
Q  124 caaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattcca 223  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  39589035 caaaacatgctcgtcacattttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctccccccgtcgagcgttggacgtttatactgaaggtgttcca 39588936  T
Q  224 ccctccttgtgtct 237  Q
    ||||||||||||||    
T  39588935 ccctccttgtgtct 39588922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Original strand, 36776517 - 36776733
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| ||||||||   ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  36776517 tacctaatgacgatctttcagcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgccgtgc 36776616  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  36776617 tcccaaaccatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattctacccaagtgaataatactctcccctcgtcgagcgttggacatttatacctaacgtgtt 36776716  T
Q  221 ccaccctccttgtgtct 237  Q
    |||||||||||||||||    
T  36776717 ccaccctccttgtgtct 36776733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 49423749 - 49423972
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  49423749 cattccgtacctaatgacgatcttatggcagaatcaaacttttgatgatttcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccacttgaacat 49423848  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    |  ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  49423849 gccgtgctcccagaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccatccaagtgaatgataatctcccctcgtcgagcgctggacatttataccga 49423948  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtct 237  Q
    || | |||||||||||||||||||    
T  49423949 acatgttccaccctccttgtgtct 49423972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28082450 - 28082228
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| || ||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||    
T  28082450 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaatttttgatgatatcttcagttgatctaagtaacttcacctgcatattgatccactgaaacatgatg 28082351  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  28082350 tgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcatcgagcgttggacgtttataccaaacgt 28082251  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  28082250 gttccaccatccttgtgtctctg 28082228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9489890 - 9489671
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  9489890 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcaataacgtcacccgcatatcaatccactggaacatgctg 9489791  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    |||||| |||||||| || |||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  9489790 tgctcc-aaaacatgctcgtcacattttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatactgaaggt 9489692  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctc 238  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  9489691 gttccaccctccttgtgtctc 9489671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31324403 - 31324167
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  31324403 tagttggaaggtgcattccctacctaatcatgatcttctagcggaatcaaactgttgagaatgtcttcagttgatctcagcaactttacacacatatcga 31324304  T
Q  101 tccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttgg 200  Q
    ||||| | ||||||||||||||| |||||||| || ||||||  | ||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||| ||||||    
T  31324303 tccacggtaacatgttgtgctccaaaaacatgctcgtcacgtcattgtcgttcgttaattccacccaactgaataatattctcccatcgtcgaacgttgg 31324204  T
Q  201 acgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtct 237  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||    
T  31324203 acgtttatactgaacctattccatcctcattgtgtct 31324167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 49817175 - 49817283
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  49817175 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttttggcagaatcagactgttgataatatcttcatttgatctcatcaacgttacacgcatatcga 49817274  T
Q  101 tccactgga 109  Q
    |||||||||    
T  49817275 tccactgga 49817283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 17292191 - 17292106
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgt 86  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  17292191 tagttggaaggtgcattccctacataatcacgatcttctggcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatctctgcaacgt 17292106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 23124503 - 23124630
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||| |   |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  23124503 tagttgaaaggtgcattccctacctaatcacaatcttctggcgaaatcaaattgttgagaatatctttaagcgatctcagcaacgtgacaaacatatcga 23124602  T
Q  101 tccactggaacatgttgtgctcccaaaa 128  Q
    |||||  |||||||||||||| ||||||    
T  23124603 tccacgagaacatgttgtgctaccaaaa 23124630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 238
Target Start/End: Original strand, 21412647 - 21412740
Alignment:
Q  145 tcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    ||||||||| |||| |||| |||| | ||||||| |||||||| || || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21412647 tcgtcgttcgttaattccatccaactaaatgatattctcccctcgttgaacattggacgtttataccggacgtattccaccctccttgtgtctc 21412740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 128
Target Start/End: Original strand, 20759132 - 20759240
Alignment:
Q  20 ctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtg 119  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||  ||| |||||||||| ||   |||||||||||||  ||||||||| ||    
T  20759132 ctacctaatcataatcttctggtggaatcaaattgttgagaatatcttcaggcgatatcagcaacgtgacaaacatatcgatccacgcgaacatgttatg 20759231  T
Q  120 ctcccaaaa 128  Q
    || ||||||    
T  20759232 ctgccaaaa 20759240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 128
Target Start/End: Original strand, 20765523 - 20765631
Alignment:
Q  20 ctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtg 119  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||  ||| |||||||||| ||   |||||||||||||  ||||||||| ||    
T  20765523 ctacctaatcataatcttctggtggaatcaaattgttgagaatatcttcaggcgatatcagcaacgtgacaaacatatcgatccacgcgaacatgttatg 20765622  T
Q  120 ctcccaaaa 128  Q
    || ||||||    
T  20765623 ctgccaaaa 20765631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 71)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 51015500 - 51015284
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015500 tacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtttcccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 51015401  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51015400 tcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatacactcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgtt 51015301  T
Q  221 ccaccctccttgtgtct 237  Q
    |||||||||||||||||    
T  51015300 ccaccctccttgtgtct 51015284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 39416941 - 39417160
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39416941 ccctaactaatgacgatcttctggcgaaatcaagctattgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 39417040  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  39417041 tgctcccaaaacatgctcatcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacta 39417140  T
Q  218 attccaccctccttgtgtct 237  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39417141 attccaccctccttgtgtct 39417160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6754448 - 6754210
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcg 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6754448 tagttggaaggtgcatttccctacataatcacgatcttctagcagaatcagactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcg 6754349  T
Q  100 atccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttg 199  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6754348 atcaactagaacatgttgtactcccaaaacatgatcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaacttaatgatattctcccctcgtcgagcgttg 6754249  T
Q  200 gacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6754248 gacgtttataccgaacgtattccaccctctttgtgtctc 6754210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 6464320 - 6464556
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcg 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6464320 tagttggaaggtgcatttccctatataatcacgatcttcttgcagaatcagactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccacatatcg 6464419  T
Q  100 atccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6464420 atccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgattgtcacgttttcgtcgttcattaattccacccaactgaatgatattctcccctcgtcgagcgttg 6464519  T
Q  200 gacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtc 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6464520 gacgtttataccaaacgtattccaccctctttgtgtc 6464556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44927689 - 44927469
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44927689 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttg 44927590  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44927589 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 44927490  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctc 238  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  44927489 gttccaccctccttgtgtctc 44927469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 46414323 - 46414549
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  46414323 cattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttaagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactagaacat 46414422  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  46414423 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctccactcgtcgagcgttggatgtttataccga 46414522  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  46414523 acgtgttccaccctccttgtgtctctg 46414549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 47065913 - 47065691
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47065913 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttaatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactagaacatgttg 47065814  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  47065813 tgctcccaaaacatgctcgtcacattttcctcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcaagcgttggacgtttatactgaacgt 47065714  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  47065713 attccaccctccttgtgtctctg 47065691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 51013267 - 51013493
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  51013267 cattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatcttagcaacgtcacccgcatatcgatacactggaacat 51013366  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  51013367 gttgtgttcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgttgagcgttggacgtttataccga 51013466  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  51013467 acgtgttccaccctccttgtgtctctg 51013493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Original strand, 34472072 - 34472288
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34472072 tacctaatgacgatcttctggcggaataaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 34472171  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  34472172 tcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtagagcgttggacgtttataccgaatgtgtt 34472271  T
Q  221 ccaccctccttgtgtct 237  Q
    |||||||||||||||||    
T  34472272 ccaccctccttgtgtct 34472288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 42382491 - 42382275
Alignment:
Q  24 ctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42382491 ctaatgacgatcttctggcggaatcaacttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcc 42382392  T
Q  124 caaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattcca 223  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  42382391 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttatactgaacgtagtcca 42382292  T
Q  224 ccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||  |||||||    
T  42382291 ccctccttacgtctctg 42382275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Original strand, 45100461 - 45100677
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45100461 tacctaatgacgatattatggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 45100560  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45100561 tcccaaaacatgctcgtcacatttttgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccttcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgtt 45100660  T
Q  221 ccaccctccttgtgtct 237  Q
    |||||||||||||||||    
T  45100661 ccaccctccttgtgtct 45100677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Original strand, 48087552 - 48087764
Alignment:
Q  25 taatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctccc 124  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48087552 taatgacgatcttctggtggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaatatgttgtgctccc 48087651  T
Q  125 aaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccac 224  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  48087652 aaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaggtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaactaattccac 48087751  T
Q  225 cctccttgtgtct 237  Q
    | |||||||||||    
T  48087752 catccttgtgtct 48087764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30192785 - 30192542
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgc----attccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcata 96  Q
    ||||||||||||||    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30192785 tagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcata 30192686  T
Q  97 tcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcg 196  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30192685 tcgatccactagaacatgatgtactcccaaaacatgctagacacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcg 30192586  T
Q  197 ttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30192585 ttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtgtctctg 30192542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41578136 - 41577918
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  41578136 cattccgtacctaatgatgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcactcgcatattgatccactggaacat 41578037  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41578036 gctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccga 41577937  T
Q  214 acgtattccaccctccttg 232  Q
    |||||||||||||||||||    
T  41577936 acgtattccaccctccttg 41577918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 53826689 - 53826911
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  53826689 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacatgcatatcgatccattggaacatgttg 53826788  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53826789 tgctcccaaaacatgctcatcacattttcgtcgttctttaactctacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcattggacgtttataccgaacgt 53826888  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  53826889 attccaccctccttgcgtctctg 53826911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 55206873 - 55207099
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55206873 cattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacat 55206972  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  55206973 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcacctcgtcgagcattggacgtttataccga 55207072  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| || |||||||||| ||||||||    
T  55207073 acgtgtttcaccctccttctgtctctg 55207099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 42383271 - 42383055
Alignment:
Q  24 ctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42383271 ctaatgacgatcttctggcggaatcaacttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcc 42383172  T
Q  124 caaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattcca 223  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  42383171 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggaagtttatactgaacgtagtcca 42383072  T
Q  224 ccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||  |||||||    
T  42383071 ccctccttacgtctctg 42383055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2428710 - 2428491
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2428710 tacctaatgacgatcttctagcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactagaaaatgttgtgc 2428611  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2428610 tcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattatcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgtt 2428511  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  2428510 ccaccctccttctgtctctg 2428491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 239
Target Start/End: Original strand, 13895869 - 13896084
Alignment:
Q  24 ctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 123  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13895869 ctaatgacgatcttctagcggaatcaagcttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcc 13895968  T
Q  124 caaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattcca 223  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13895969 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgctcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 13896068  T
Q  224 ccctccttgtgtctct 239  Q
    ||||||||||||||||    
T  13896069 ccctccttgtgtctct 13896084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 25 - 240
Target Start/End: Original strand, 25576592 - 25576806
Alignment:
Q  25 taatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctccc 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  25576592 taatgacgatcttctgacggaatcaagctattgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatcca-tggaacatgctgtgctccc 25576690  T
Q  125 aaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccac 224  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25576691 aaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgataatctcccctcgtcgagcgttggatgtttataccgaacgtattccac 25576790  T
Q  225 cctccttgtgtctctg 240  Q
    |||||||| |||||||    
T  25576791 cctccttgcgtctctg 25576806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 41804132 - 41803906
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  41804132 cattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgattatatcttcatttgatctcatcaacgtcactctcatatcgatccactggaacat 41804033  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  41804032 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgaacgtttataccga 41803933  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  41803932 acgtgttccaccctccttttgtctctg 41803906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 42950013 - 42950235
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42950013 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtaaaccgcatatcgatccactggaacatgttg 42950112  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42950113 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcattctttaactccatccaagtgaatgatactcttccctcgtcgagcgttggacatttataccgaacgt 42950212  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||||||||| |||| |||||||    
T  42950213 attccacccttcttgcgtctctg 42950235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 238
Target Start/End: Original strand, 34647263 - 34647480
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34647263 tacctaatgacgatcttctagcgtaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcaatccactggaacatgttgtgc 34647362  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  34647363 tcccgaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatactgaacgtgtt 34647462  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctc 238  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34647463 ccaccctccttgtgtctc 34647480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 238
Target Start/End: Original strand, 774315 - 774551
Alignment:
Q  2 agttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  774315 agttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggtggaatcagactcttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgat 774414  T
Q  102 ccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttgga 201  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  774415 ccactggaacatgcagtgctccgaaaacatgttcttcacgttttcatcgttcgttaattccatccaactgaatgatattctcccgtcgtcgagcgttgga 774514  T
Q  202 cgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    |||||||| | |||  ||||||| ||||| |||||||    
T  774515 cgtttatagcaaacacattccactctcctcgtgtctc 774551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 238
Target Start/End: Original strand, 8633344 - 8633572
Alignment:
Q  10 ggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactgga 109  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8633344 ggtgcattcggtacctaatgacgatcttctggcggaatcagactgttgataatatcttcagatgatcgcaacaacgttacccgcatatcgatccactgga 8633443  T
Q  110 acatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttata 209  Q
    ||| |||||  |||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8633444 acacgttgtcatcccaaaaaatattcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggatgtttata 8633543  T
Q  210 ccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  8633544 ccaaacgtattccaccctccttgtgtctc 8633572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 43570124 - 43569914
Alignment:
Q  30 acgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaac 129  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43570124 acgatcttctggcgaaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaac 43570025  T
Q  130 atgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctcc 229  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43570024 atgctcgtcacgttttcgtcgttcgttagttccacccaagtaaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcc 43569925  T
Q  230 ttgtgtctctg 240  Q
    || ||||||||    
T  43569924 ttctgtctctg 43569914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 49218729 - 49218950
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  49218729 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgtcactcgcatatcgatccactggaacatgttg 49218828  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  49218829 cgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgccgtttgttaattccacccaagtgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaaggt 49218928  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctct 239  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  49218929 gttccaccctccttgtgtctct 49218950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Original strand, 34693283 - 34693503
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34693283 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaagttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttg 34693382  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  34693383 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgatactcaaccctcgtcgagcgttggacgtttatactgaaggt 34693482  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctc 238  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  34693483 gttccaccctccttgtgtctc 34693503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 24702265 - 24702483
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24702265 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagcttttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgtcacctgcatatcgatccactggaacatgttg 24702364  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702365 tgctcccaaaacatgtccgtcacgttttcgtcgttc-gtaattccacccaagtgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 24702463  T
Q  218 attccaccctccttgtgtct 237  Q
     |||||||||||||||||||    
T  24702464 gttccaccctccttgtgtct 24702483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 33449127 - 33449351
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||            ||||||    
T  33449127 tagttggaaggtgcattccctacctaattacgatcttctggcggaatcaaactttggatgatatcttcagttgatctcagca------------tatcga 33449214  T
Q  101 tccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttgg 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  33449215 tccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgtttg 33449314  T
Q  201 acgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtct 237  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  33449315 acgtttatatcgaacgtatttcaccctccttgtgtct 33449351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 47759887 - 47760106
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||     
T  47759887 tacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatctttagttgatctcagcaacgtcacccgtacatcgatccactggaacatgctgtgt 47759986  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  47759987 tcccaaaacatgtttgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaggtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacggaacgtgtt 47760086  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  47760087 ccaccctccttgtgtctctg 47760106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 2646869 - 2647091
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2646869 ccctaactaatgacgatcttctagcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 2646968  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2646969 tgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccatcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgt 2647068  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  2647069 gttccaccatccttgtgtctctg 2647091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27187178 - 27186952
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27187178 cattccctacctaatcacgatattatggcggaatcagattgttgataatatctttagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccaatggaacat 27187079  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| ||||||||   ||||| |||||| |||||||  |    
T  27187078 gttgtgctcccaaaacatgttcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaactaaatgatattctcccctctacgagcattggacatttatactaa 27186979  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  27186978 acgtattccaccctccttgtgtctctg 27186952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Original strand, 10053271 - 10053485
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  10053271 tacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatat-ttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgt---gc 10053366  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  10053367 tcccaaaacatgctcatcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaattgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacatttataccgaatgtatt 10053466  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctct 239  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10053467 ccaccctccttgtgtctct 10053485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 37281675 - 37281459
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37281675 tacctaatgacgatcttctggcggaattaaacttttgatgatatcttccgttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatgttgtgc 37281576  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  37281575 tcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaatgataccctaccctcgtcgagtgttggacgtttataccgaacgtgtt 37281476  T
Q  221 ccaccctccttgtgtct 237  Q
    ||| | |||||||||||    
T  37281475 ccatcatccttgtgtct 37281459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 43477276 - 43477061
Alignment:
Q  25 taatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctccc 124  Q
    |||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43477276 taatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcggttgatctcatcaacgtcacctgcatatcgatccactggaacatgctgtgctccc 43477177  T
Q  125 aaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccac 224  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  43477176 aaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaaggtgttccac 43477077  T
Q  225 cctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||||||||    
T  43477076 cctccttgtgtctctg 43477061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 3495022 - 3495244
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3495022 ccctaactaatgacgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatcttaagttgatctaaacaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttg 3495121  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  3495122 tgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatatcaaacgt 3495221  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  3495222 gttccaccatccttgtgtctctg 3495244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 19453222 - 19453444
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19453222 ccctaactaatgatgatcttctggtggaatcaaacttttgatgatatctttagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccattggaacatgttg 19453321  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19453322 tgctcccataacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcattggacgtttatatcgaacgt 19453421  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||||||||| | ||||||    
T  19453422 gttccaccctccttctatctctg 19453444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 49610715 - 49610493
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  49610715 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgacccactggaacatactg 49610616  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  49610615 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatatcgaaggt 49610516  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  49610515 gttccaccctccttgtgtctctg 49610493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14631668 - 14631449
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  14631668 tacctaatgacgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatctttagttgatctcaacaacgtcacccgcatatcaatccactggaacatgttttgc 14631569  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14631568 tcccaaaacatgctcgtcacgttttcgttgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctttactcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgtt 14631469  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14631468 ccaccctccttgtgtctctg 14631449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 46403229 - 46403007
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46403229 ccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 46403130  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||    
T  46403129 tgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgt 46403030  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  46403029 gttccaccatccttgtgtctctg 46403007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 49140047 - 49140269
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49140047 ccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 49140146  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||    
T  49140147 tgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgt 49140246  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  49140247 gttccaccatccttgtgtctctg 49140269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 51695599 - 51695821
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51695599 ccctaactaatgatgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgatg 51695698  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51695699 tgctcccaaaacatgctcgtcacgtattcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaacttttccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggt 51695798  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  51695799 gttccaccctccttgtgtctctg 51695821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 52569406 - 52569623
Alignment:
Q  22 acctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgct 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  52569406 acctaatgacgatcttctggcggaatcaaactcttgatgatatcttcagttgatctcagcaatgtcacccgcatatcgattcaccggaacatgttgtgct 52569505  T
Q  122 cccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattc 221  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  52569506 cccaaaacatgctcgtcac-ttttcgtcgttcgttaattccacccaagcgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaatgtgttc 52569604  T
Q  222 caccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  52569605 caccatccttttgtctctg 52569623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 54390668 - 54390446
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  54390668 ccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 54390569  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||    
T  54390568 tgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgt 54390469  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  54390468 gttccaccatccttgtgtctctg 54390446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7954434 - 7954209
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7954434 cattccgtacctaatgacgatcttctagcggaatcagattgttgataatatcttcagttgatcttagcaactttacccgcatatcgatccactggaacat 7954335  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactct-ccccttgtcgagcgttggacgtttataccg 212  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||  |||| ||||||||| | |||||||| || |||||  ||||| ||||||||||||| |||    
T  7954334 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgtttgttaattccacccaactaaatgataccctccccctcatcgagtgttggacgtttatgccg 7954235  T
Q  213 aacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  7954234 aacgtattccaccctccttgtgtctc 7954209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 2268487 - 2268706
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  2268487 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatctactggaacatgatg 2268586  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  2268587 tgctcccaaaacatgcccgtcacgttttcgtcgttcgttaattccatccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaactt 2268686  T
Q  218 attccaccctccttgtgtct 237  Q
     ||||||| |||||||||||    
T  2268687 gttccaccatccttgtgtct 2268706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7246323 - 7246101
Alignment:
Q  15 attccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatg 114  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  7246323 attccatacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacgtcacccgcatatcgatacactggaacatg 7246224  T
Q  115 ttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaa 214  Q
    || |  |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7246223 ttataatcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtcaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaa 7246124  T
Q  215 cgtattccaccctccttgtgtct 237  Q
     || |||||| || |||||||||    
T  7246123 tgtgttccactcttcttgtgtct 7246101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34049953 - 34049731
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34049953 ccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 34049854  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || ||    
T  34049853 tgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttgaacgtttataccaaatgt 34049754  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  34049753 gttccaccatccttgtgtctctg 34049731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 44835480 - 44835701
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |     
T  44835480 ccctaactaatgacgatcttctgacggaatcaagctgttgatgatattttcagttgatctcaacaaccttacccgcatatccatccactggaacattcta 44835579  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||| |||||||    
T  44835580 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaaatgaatgatactctcccctcgtcgaacgttgaatgtttatatcgaacgt 44835679  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctct 239  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  44835680 attccaccctccttgcgtctct 44835701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 49273621 - 49273404
Alignment:
Q  22 acctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgct 121  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  49273621 acctaatgacgatattctggaagaatcaaacttttgatgatatattcagttgatctcagcaacgtcacccacatattgatcaactggaacatgttgtgct 49273522  T
Q  122 cccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattc 221  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  49273521 cccagaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcattaattccacccaagtgaatgatactctgccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaatgtgttc 49273422  T
Q  222 caccctccttgtgtctct 239  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49273421 caccctccttgtgtctct 49273404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 4004086 - 4004302
Alignment:
Q  24 ctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 123  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4004086 ctaatgacgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcc 4004185  T
Q  124 caaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattcca 223  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||    
T  4004186 caaaacatgctcgtcacgtttttgtcgttcgttaattccacccacgtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgaatgtttataccaaacgtgttcca 4004285  T
Q  224 ccctccttgtgtctctg 240  Q
    || ||||||||||||||    
T  4004286 ccatccttgtgtctctg 4004302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 36135227 - 36135013
Alignment:
Q  24 ctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 123  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  36135227 ctaatgacaatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatctactgaaacatgatgtgctcc 36135128  T
Q  124 caaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattcca 223  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  36135127 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatact-tcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttcca 36135029  T
Q  224 ccctccttgtgtctct 239  Q
    || |||||||||||||    
T  36135028 ccatccttgtgtctct 36135013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 20375858 - 20376090
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||| || |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20375858 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatattttggcggaatcaaacagttgttattatcttaaattgatctcagcaacgttacacgcatatcga 20375957  T
Q  101 tccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttgg 200  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| || |    
T  20375958 tctacttgaacatgttgtgctctcaaaacatactcctcacgttatcgtcgttctttaattccacccaactgaatgatattctcccatcgtcgagcattag 20376057  T
Q  201 acgtttataccgaacgtattccaccctccttgt 233  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  20376058 acgtttataccgaacatattccatcttccttgt 20376090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Original strand, 36721385 - 36721601
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36721385 taccaaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcaccagcatatcgatccactagaacatgttgtgc 36721484  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||||||   || || ||||||||||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  36721485 tcccaaacattgctcgtcacgttttcgtcgttcgtttattccaatcaagtgaatgatactctcctctcgtcgagcgttggacatttataccgaacgtgtt 36721584  T
Q  221 ccaccctccttgtgtct 237  Q
    |||||||||||||||||    
T  36721585 ccaccctccttgtgtct 36721601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 50458687 - 50458906
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50458687 tacctaatgacgatcttcaggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtttatctcaacaacgtcacccgcatatctatccactggaacatgttgtgc 50458786  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||| |  | ||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| ||| |     
T  50458787 tcccaaaacatgctcgtcaagttttcgtcgttcgtagattccacccaattaaacgatactctcccctcgtcgagcgttggacacttatatcgaccgtgtc 50458886  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  50458887 ccaccctccttgtgtctctg 50458906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14265648 - 14265412
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | || |||||||| |||| ||||||| |||||||| | || |||||    
T  14265648 tagttggaaagtgcaatccctacctaatcacgatcttcaggcggaatcaaactctggagaatatctttagttaatctcagtaacgttacacacaaatcga 14265549  T
Q  101 tccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttgg 200  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||   ||||||||| |||| | || |||| ||||||||| || ||| | ||||| ||||||    
T  14265548 tccacggtaacatgttgtggtcccaaaacatgttcgtcacg---tcgtcgttccttaatttcatccaactgaatgatattcacccatcgtcgaacgttgg 14265452  T
Q  201 acgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14265451 atgtttataccgaacgtattccaccttccttgtgtctctg 14265412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Original strand, 42323385 - 42323565
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||||  | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  42323385 tacctaatgacgatcttccagtggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcaccagcatatcgatccactgaaacattttgagc 42323484  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttgga 201  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  42323485 tcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcaagcgttgga 42323565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 50997614 - 50997453
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50997614 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatcaactggaacatgttg 50997515  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatac 179  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  50997514 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccactcaagtgaatgatac 50997453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 18440988 - 18440873
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18440988 tagttggaaggtgcattctctacctaatcacgatcttctggtggaatcaaactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacacacatatcga 18440889  T
Q  101 tccactggaacatgtt 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  18440888 tccactggaacatgtt 18440873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 19486062 - 19485947
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  19486062 tagttggaaggtgcattctctacctaatcacgatcttctggtggaatcaaactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacacacatatcga 19485963  T
Q  101 tccactggaacatgtt 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  19485962 tccactggaacatgtt 19485947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 25887584 - 25887796
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaat---cacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||    
T  25887584 tagttggaaggtgcattccctacctaataatcacgatattctagcggaatcaaactgtggagaatatcttcagttgatctcaacaacgttccacacatat 25887683  T
Q  98 cgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgt 197  Q
     |||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||| |  ||||||||  |||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||| |||    
T  25887684 -gatccacgagaacatgttgtgctcccaaaacatggtcctcacatcctcgtcgtttgttaattccacccaactgagtgatattctcccatcgtcgaacgt 25887782  T
Q  198 tggacgtttatacc 211  Q
    ||||||||||||||    
T  25887783 tggacgtttatacc 25887796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 145
Target Start/End: Original strand, 46346601 - 46346732
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46346601 cattccgtacataatgacaatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacat 46346700  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgtttt 145  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  46346701 gttgtgctcccagaacatgctcgtcacgtttt 46346732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15637118 - 15637031
Alignment:
Q  150 gttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtct 237  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15637118 gttcattaattccacccaactgaatgatattctcccatcgtcgagtgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtct 15637031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 7954866 - 7954774
Alignment:
Q  17 tccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactgga 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||    
T  7954866 tccctacttaatcacgatcttctggcgaaataagactgttgataaaatctttagttgatctcatcaaagttacacgtatatcgatcaactgga 7954774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 187 - 238
Target Start/End: Original strand, 11378906 - 11378957
Alignment:
Q  187 ttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11378906 ttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtgtctc 11378957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 239
Target Start/End: Original strand, 46346745 - 46346794
Alignment:
Q  190 tcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctct 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  46346745 tcgagcgttggacgtttatacggaacgtgttccaccctccttgtgtctct 46346794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 15637234 - 15637155
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcag 80  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  ||  ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15637234 tagttggaaggtgaattccctaccgaattacgatcttccagcaaaatcaaaatattgataatatcttcagttgatctcag 15637155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 240
Target Start/End: Original strand, 42328288 - 42328331
Alignment:
Q  197 ttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42328288 ttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtgtctctg 42328331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 128
Target Start/End: Original strand, 17267306 - 17267398
Alignment:
Q  36 ttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaa 128  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| |||||||| ||   ||||||||||||| ||   ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  17267306 ttctggcagaatcaaactcttgagaatatctttaggcaatctcagcaacgtaacttacatatcgatccacgggaacatgatgtgctgccaaaa 17267398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 7954899 - 7954865
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatc 35  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7954899 tagttggaaggtgcattccctacctgatcacgatc 7954865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 48)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 1642563 - 1642800
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1642563 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcaaactgttgataatatcttcagttgatctcaacaacgttacacgcatatcga 1642662  T
Q  101 tccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttgg 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| ||||     
T  1642663 tccacttgaacatgttgtgctcccaaaacatgctcctcacgttttcatcgttcgttaattccacccaactaaatgatattctcccctcgtcgagtgttga 1642762  T
Q  201 acgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  1642763 acgtttatatcaaacgtattccaccctccttgtgtctc 1642800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18237778 - 18237556
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18237778 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaactgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcataccgatccactggaacatgatg 18237679  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18237678 tgctcccaaaatatgctcgtcatgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatcctctccccttgtcgagcgttagacgtttataccgaacgt 18237579  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||||||| |||||| |||||||    
T  18237578 attccaccatccttgcgtctctg 18237556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41217828 - 41217609
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41217828 ccctaactaatgacgatcttctggtggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 41217729  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||      
T  41217728 tgctcccaaaacatgttcttcactttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgaatttttataccgaacta 41217629  T
Q  218 attccaccctccttgtgtct 237  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  41217628 attccaccctccttgtgtct 41217609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 15337894 - 15338120
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15337894 cattccatacctaatgacgatcttctggcggaatcagactgtttataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactgaaacat 15337993  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||    
T  15337994 gttgtgctcccaaaacatgctcatcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgttgagcgttgaacatttataccga 15338093  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15338094 acgtgttccaccctccttgtgtctctg 15338120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 48270866 - 48270640
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48270866 cattccgtacctaacgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacat 48270767  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  48270766 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccactcaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtctataccga 48270667  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  48270666 acgtgttccaccctccttttgtctctg 48270640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 41048994 - 41048776
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41048994 tacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 41048895  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41048894 tcccaaaacatgctcgtcgcgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcacctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgtt 41048795  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctct 239  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  41048794 ccatcctccttctgtctct 41048776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 25 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 47269105 - 47268891
Alignment:
Q  25 taatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctccc 124  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| | ||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47269105 taatgacgatcttttggcggaatcaaattgttgatgatatttttagttaatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctccc 47269006  T
Q  125 aaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccac 224  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  47269005 aaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgctggacgtttata-cgaacgtattccac 47268907  T
Q  225 cctccttgtgtctctg 240  Q
    |||||||| |||||||    
T  47268906 cctccttgcgtctctg 47268891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 21614735 - 21614973
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcg 99  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21614735 tagttgaaaggtgcatttccctacctaatcacgaacttctggcggaatcaaaattttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcg 21614834  T
Q  100 atccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttg 199  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21614835 atccactagaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcgcgttttcgtcgttcgttaattccacccaaatgaatgatactcttccctcgtcgagcgttg 21614934  T
Q  200 gacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
     ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21614935 aacgtttatatcgaacgtgttccaccctccttgtgtctc 21614973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 21187295 - 21187514
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21187295 tacctaatgacgatcttctgacggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgc 21187394  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  || |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21187395 tcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcaatcgttaattctacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgtt 21187494  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     |||||||||||||||||||    
T  21187495 tcaccctccttgtgtctctg 21187514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 46862183 - 46862409
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  46862183 cattccgtaccttatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatcatatcttcagttaatctcagcaacgtcactcgcatatcgatccactggaacat 46862282  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46862283 gctgtgctcccaaaacaagctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccatccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccga 46862382  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  46862383 acgtgttccaccctccttctgtctctg 46862409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 32 - 240
Target Start/End: Original strand, 20378710 - 20378918
Alignment:
Q  32 gatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacat 131  Q
    ||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20378710 gatcttctggcggaatcaagttgttaattatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatctgtccactggaacatgttgtgctcccaaaacat 20378809  T
Q  132 gttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctcctt 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20378810 gttcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgataccctcccctcgttgtgcattggacgtttataccgaacgtattccaccctcctt 20378909  T
Q  232 gtgtctctg 240  Q
    |||||||||    
T  20378910 gtgtctctg 20378918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Original strand, 36393820 - 36394036
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36393820 tacctaatgaagatcttatggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatattgtgc 36393919  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  36393920 tcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacacaagtgaatgatattctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccgaacgtgtt 36394019  T
Q  221 ccaccctccttgtgtct 237  Q
    |||||||||||||||||    
T  36394020 ccaccctccttgtgtct 36394036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 40588757 - 40588542
Alignment:
Q  24 ctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 123  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40588757 ctaatgacgatcttctggccgaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 40588658  T
Q  124 caaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattcca 223  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  40588657 caaaacatgctcatcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaagcgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgttcca 40588558  T
Q  224 ccctccttgtgtctct 239  Q
    ||||||||||||||||    
T  40588557 ccctccttgtgtctct 40588542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 43351096 - 43351314
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43351096 tacctaatgacgatcttctggtggaatcagacatttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcaccc-catatcgatccactggaacatgttgtgc 43351194  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43351195 tcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcatcgagcgttggacgtttatactgaacgtgtt 43351294  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  43351295 ccaccctccttgtgtctctg 43351314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 39477233 - 39477455
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||   |||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39477233 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttaatgatatctttagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttg 39477332  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39477333 tgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaatgatatcctcccctcgtcgagcgttggacgtttatactgaacgt 39477432  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||||||||||||| ||||    
T  39477433 gttccaccctccttgtgtatctg 39477455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 48315169 - 48315395
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  48315169 cattccgtacctaatgacgatcttatggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatctactggaacat 48315268  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  48315269 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatgctctcctctcgttgagcgttggacgtttataccaa 48315368  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||    
T  48315369 acgtgttccaccctccttctatctctg 48315395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 34141079 - 34140858
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34141079 ccctaactaatgacgatcttatggcgaaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttg 34140980  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  34140979 tgctcccaaaacatgtccgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaaatgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggatgtttataccgaaatt 34140880  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctct 239  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  34140879 gttccaccctccttgtgtctct 34140858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30360730 - 30360512
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30360730 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaactttttatgatatcttcagttgatctcagcaacgc-acccgcatatcaatccactagaacatgttg 30360632  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  30360631 tgctcccaaaacatgctcgttacgttttcgtcgttttttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgtacatttataccgaacgt 30360532  T
Q  218 attccaccctccttgtgtct 237  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30360531 attccaccctccttgtgtct 30360512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21650724 - 21650518
Alignment:
Q  32 gatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacat 131  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21650724 gatcttatggcggaatcagactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccacatatcgatccactggaacatgttgtgatcccataacat 21650625  T
Q  132 gttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctcctt 231  Q
    | || |||| |||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  21650624 gctcgtcacattttcgtcgttcgttaattcctcccaactgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataatgaacgtgttccaccctcctt 21650525  T
Q  232 gtgtctc 238  Q
    |||||||    
T  21650524 gtgtctc 21650518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 32 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17183412 - 17183205
Alignment:
Q  32 gatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacat 131  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17183412 gatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgcttccaaaacat 17183313  T
Q  132 gttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctcctt 231  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  17183312 gttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattcttccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaacgtgttacaccctcctt 17183213  T
Q  232 gtgtctct 239  Q
    ||||||||    
T  17183212 gtgtctct 17183205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 232
Target Start/End: Original strand, 48220737 - 48220949
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||    
T  48220737 ccctaactaatgacgatcttatggtggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaccgtcacctgcatattgatccactggaacatgctg 48220836  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    |||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48220837 tgctcccaa--catgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccaccaaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 48220934  T
Q  218 attccaccctccttg 232  Q
    |||||||||||||||    
T  48220935 attccaccctccttg 48220949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20564973 - 20564751
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20564973 ccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 20564874  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||    
T  20564873 tgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgt 20564774  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  20564773 gttccaccatccttgtgtctctg 20564751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2356521 - 2356282
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcg 99  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  2356521 tagttggaagatgcatttccctacctaatcacggtcttatagcggaatcaaatttttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgttactcgcatatcg 2356422  T
Q  100 atccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttg 199  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| || |||| |||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2356421 atccattggaacatgctgttctcccaaaacatgctcgtcacatttttgtcgttcgttaattccatccaagtgaatgatactctcccctcttcgagcgttg 2356322  T
Q  200 gacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctct 239  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2356321 gatgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtgtctct 2356282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 42735473 - 42735255
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  42735473 tacctaatgacgatcttcttgcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgattcactagaatatgttgtgc 42735374  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42735373 tcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgataatcttccc-catcgagcgttggacgtttataccgaacgtgtt 42735275  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  42735274 ccaccctccttctgtctctg 42735255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Original strand, 30354804 - 30355012
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  30354804 cattccgtacctaatgacgatcttttggcagaatcaaacttttgatgatatcttcagctgatctcagcaacgtcatccacatatcgatccactggaacat 30354903  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30354904 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatacgctcccctcgtcgaacgttggacgtttataccga 30355003  T
Q  214 acgtattcc 222  Q
    |||| ||||    
T  30355004 acgtgttcc 30355012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17839538 - 17839315
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttct-ggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgtt 116  Q
    ||||| ||||| |||||||| | |||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17839538 ccctaactaatgacgatctttttggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgct 17839439  T
Q  117 gtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacg 216  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||    
T  17839438 gtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcatcgagcgttggacgtttattccaaacg 17839339  T
Q  217 tattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    | ||||||| ||||||||||||||    
T  17839338 tcttccaccatccttgtgtctctg 17839315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Original strand, 28979060 - 28979234
Alignment:
Q  63 atcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactcc 162  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| || |||| | |    
T  28979060 atcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgtttttgtcgctcgttaatttc 28979159  T
Q  163 acccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtct 237  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28979160 acccaagtgaatgatactctcctctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtgtct 28979234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 28114389 - 28114608
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| || ||||| || | |||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28114389 tacctaatgacaatcttttgacagaatcaaatttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccacatttcgatccattggaacatgttgtgc 28114488  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    ||| |||||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  28114489 tcctaaaacatgctcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgggcgttggacgtttataccgaacgtgtt 28114588  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  28114589 ccaccctccttgtttctctg 28114608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 88 - 240
Target Start/End: Original strand, 26603268 - 26603420
Alignment:
Q  88 acccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccct 187  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  26603268 acccacatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgctctttaattccacccaagtgaatgataccctccctt 26603367  T
Q  188 tgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26603368 cgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctctg 26603420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10523283 - 10523061
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaa-catgtt 116  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||     
T  10523283 ccctaactaatgacgattttcaggcggaatcaaacttttgatgatatattcagttgatctaagaaacttcacccgcatatcgatccacaagaaacatgtg 10523184  T
Q  117 gtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacg 216  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10523183 gtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccaacaaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacg 10523084  T
Q  217 tattccaccctccttgtgtctct 239  Q
    | ||||||| |||||||||||||    
T  10523083 tgttccaccatccttgtgtctct 10523061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 45363245 - 45363458
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||| ||    
T  45363245 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgt---------atcgatccactggaacatgatg 45363335  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  45363336 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcatttgttaattccacccaagtgaatgaaactctctgctcgtcgagcgttggacgtttatactgaaggt 45363435  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  45363436 gttccaccctccttgtgtctctg 45363458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 132
Target Start/End: Original strand, 2206031 - 2206144
Alignment:
Q  19 cctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgt 118  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2206031 cctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatattgt 2206130  T
Q  119 gctcccaaaacatg 132  Q
    ||||||||||||||    
T  2206131 gctcccaaaacatg 2206144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Original strand, 9367113 - 9367243
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9367113 ccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctg 9367212  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgt 148  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  9367213 tgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgt 9367243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13916949 - 13916825
Alignment:
Q  116 tgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaac 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  13916949 tgtgctcccaaaacatggtcatcacatttttgtcattcgttaattcaacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaat 13916850  T
Q  216 gtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    || ||||||| ||||||||||||||    
T  13916849 gtgttccaccatccttgtgtctctg 13916825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 42683051 - 42682948
Alignment:
Q  137 tcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtc 236  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42683051 tcacgttttcgttgttcgttaattccaccaaagtgaatgatattctcccctcgtcgttcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtgtc 42682952  T
Q  237 tctg 240  Q
    ||||    
T  42682951 tctg 42682948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 150319 - 150192
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||| |||||||||||  ||||||| |||||| ||    |||||||    
T  150319 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctagcagaatcaaattgttgagaatatcttcaggcgatctcaacaacgtgacaaatatatcga 150220  T
Q  101 tccactggaacatgttgtgctcccaaaa 128  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  150219 tccacgggaacatgatgtgctgccaaaa 150192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 78
Target Start/End: Original strand, 3380652 - 3380727
Alignment:
Q  3 gttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctc 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  3380652 gttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcagaatcaaattgttgagaatatcttcagttgatctc 3380727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 28066466 - 28066359
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  |||||||||||||| ||   ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28066466 tacctaatcacgatgttctggcggaatcaaacttttgagaatatcttcagacgatctcagcaacgtgacaaacatatcgatccacaggaacatgttgtgc 28066367  T
Q  121 tcccaaaa 128  Q
    | ||||||    
T  28066366 tgccaaaa 28066359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 11824912 - 11824839
Alignment:
Q  13 gcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgt 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11824912 gcattccctacctaatcacgatcttctagcggaatcaaactgttgaaaatatcttcagttgatctctgcaacgt 11824839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 18149758 - 18149638
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |    || |||||    
T  18149758 tagttgaaaagtgcattccctacctaaatacgatcttctggcgcaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatctctgcaacttgaaaaacaaatcga 18149659  T
Q  101 tccactggaacatgttgtgct 121  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  18149658 tccacgggaacatgttgtgct 18149638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 128
Target Start/End: Original strand, 7414196 - 7414304
Alignment:
Q  20 ctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtg 119  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| ||   ||||| |||||||  ||||||||||||    
T  7414196 ctacctaatcataatcttctggcgaaatcaaactgttgagaatattttcaggcgatctcagcaacgtgacaaacatatagatccacgagaacatgttgtg 7414295  T
Q  120 ctcccaaaa 128  Q
    || ||||||    
T  7414296 ctgccaaaa 7414304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 86
Target Start/End: Original strand, 26601771 - 26601839
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgt 86  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26601771 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaactattgatgatatcttcagttgatctcaacaacgt 26601839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 13920520 - 13920431
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactg 107  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | | ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  13920520 ccctaactaatgacgatcttatggcgaaatcaaatttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacctgcatatcgatccactg 13920431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 237
Target Start/End: Original strand, 8726381 - 8726430
Alignment:
Q  188 tgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtct 237  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8726381 tgtcgaacgatggacgtttataccgaacttattccaccctccttgtgtct 8726430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 12083143 - 12083042
Alignment:
Q  20 ctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtg 119  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||||||| || ||   |||||| |||||  |||||||||||||    
T  12083143 ctacctaatcataatcttcaggcggaaccaaactgttgagaatatcttcaggcgatctcagcaatgtgacaaacatatccatccatgggaacatgttgtg 12083044  T
Q  120 ct 121  Q
    ||    
T  12083043 ct 12083042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 31267286 - 31267188
Alignment:
Q  22 acctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgct 121  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||| |||||| | |||||||||||  ||||| |||||||| ||   ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31267286 acctaatcataatcttctagctgaatcaaactgtt-agaatatcttcaggcgatcttagcaacgtgacaaacatatcgatccacgggaacatgttgtgct 31267188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3924845 - 3924805
Alignment:
Q  199 ggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctct 239  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  3924845 ggacgtttatatcaaacgtattccaccctccttgtgtctct 3924805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18146996 - 18146953
Alignment:
Q  195 cgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18146996 cgttggacgttcataccaaaagtattccaccctccttgtgtctc 18146953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 33)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 232
Target Start/End: Original strand, 33799543 - 33799757
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33799543 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttatccgcatatcgatccactggaacatgttg 33799642  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  33799643 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataacgaacat 33799742  T
Q  218 attccaccctccttg 232  Q
    |||||||||||||||    
T  33799743 attccaccctccttg 33799757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 44943069 - 44943295
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44943069 cattccgtacctaatgacaatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacat 44943168  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  44943169 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatatcga 44943268  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| || |||| ||||||||||||||    
T  44943269 acgtgttacaccatccttgtgtctctg 44943295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 41856969 - 41857188
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41856969 tacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 41857068  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||||||| ||| || |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41857069 tcccaaaatatgctcgtcacattttcgtcgttcgttaattccacccaagttaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgtt 41857168  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  41857169 ccaccctccttctgtctctg 41857188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 232
Target Start/End: Original strand, 43638669 - 43638883
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  43638669 ccctaactaatgacgatcttctggcgaaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacgcgcatatcgatgcactggaacatgttg 43638768  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43638769 tgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgttctttaactccacccaagtgaaggatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 43638868  T
Q  218 attccaccctccttg 232  Q
    |||||||||||||||    
T  43638869 attccaccctccttg 43638883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 40415479 - 40415252
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  40415479 ccctaactaatgacgatcttctgacggaatcaagctgttgatgatatcttaagttgatctcaacaacgtcacctgcatatcgatccacgggaacatgttg 40415380  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40415379 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaatgataccctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 40415280  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctgctgct 245  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||    
T  40415279 gttccaccctccttgtgtctctggtgct 40415252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 15032316 - 15032538
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15032316 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttg 15032415  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15032416 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgt 15032515  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| | ||||||||||||    
T  15032516 gttccaccatacttgtgtctctg 15032538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26452547 - 26452325
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26452547 ccctaactaatgacgatcttctagcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttg 26452448  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26452447 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggt 26452348  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  26452347 gttccaccctccttgtgtctctg 26452325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 43693359 - 43693137
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43693359 ccctaactaatgacgatcttctggaggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttg 43693260  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  43693259 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaaatgaatgatatcctcccctcgccgagcgttggacgtttataccgaacgt 43693160  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  43693159 gttccaccctccttgtgtctctg 43693137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34615175 - 34614955
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  34615175 ccctaactaattactatcttctggtggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcaatccactggatcatgttg 34615076  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34615075 tgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaatttcacccaagtgaatgatactttcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 34614976  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctc 238  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  34614975 gttccaccctccttgtgtctc 34614955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 41363878 - 41363658
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41363878 ccctaactaatgacgatcttctggaggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtaacccgcatatcgatccactggaacatgttg 41363779  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  41363778 tgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttagacgtgtataccgaacgt 41363679  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctc 238  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  41363678 gttccaccctccttgtgtctc 41363658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 38033917 - 38034136
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38033917 ccctaactaatgacgatcttccggcggaatcaagctattgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactagaacatgttg 38034016  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  38034017 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaggtgaatgatactctcccctcgtagagcgttgaacgtttataccgaacgt 38034116  T
Q  218 attccaccctccttgtgtct 237  Q
     |||||||||||||||||||    
T  38034117 gttccaccctccttgtgtct 38034136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Original strand, 42168953 - 42169172
Alignment:
Q  19 cctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgt 118  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42168953 cctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctctgcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgt 42169052  T
Q  119 gctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgta 218  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  42169053 gctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgttgttcgttaattccacccaagggaatgatactttcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgcg 42169152  T
Q  219 ttccaccctccttgtgtctc 238  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  42169153 ttccaccctcctcgtgtctc 42169172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 18440283 - 18440509
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18440283 cattccgtacctaatgacgatcttctcgcgtaatcaaacttttgatgatatcttcagtttatctcagcaacgtcaccctcatatcgatccactggaacat 18440382  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18440383 gttgtgctcctaaaacatgctcgtcacgttttcatcgttcgttaattctacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccga 18440482  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18440483 acgtgttccaccctccttgtgtctctg 18440509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 28706134 - 28706356
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  28706134 ccctaactaatgacaatcttctggcggaatcaagcggttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgttacacgcatatcgatccactaaaacatgttg 28706233  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28706234 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgttgttctttaactccactcaagtgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 28706333  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  28706334 attccaccctccttgcgtctctg 28706356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 3589241 - 3589478
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  3589241 tagtttgaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcaaactgttgataatgtcttcagttgatctcaacaatgttacacgcatatcga 3589340  T
Q  101 tccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttgg 200  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||| | | | | |||| |    
T  3589341 tccactggaacatcctgtgctcccaaaacatgcccatcacgttatcgtcgttcattaattccacccaactgaatgatattctcccatagacaatcgtttg 3589440  T
Q  201 acgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3589441 acgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 3589478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 41275616 - 41275394
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41275616 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccattggaacatgttg 41275517  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  41275516 tgctctcaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgtttgacgtttataccgaaggt 41275417  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  41275416 gttccaccctccttgtgtctctg 41275394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40414826 - 40414610
Alignment:
Q  24 ctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 123  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  40414826 ctaatgacgatcttctggtggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcaatcaactgaaacatgttgtgctcc 40414727  T
Q  124 caaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattcca 223  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  40414726 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaatgataccctcccctcgtcgagtgttagacgtttataccgaacgtgttcca 40414627  T
Q  224 ccctccttgtgtctctg 240  Q
    || ||||||||||||||    
T  40414626 ccttccttgtgtctctg 40414610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 42603680 - 42603454
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42603680 cattccgtacctaatgacgatcttttggcggaatcaaacttttgatgatatattcggttgatttcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacat 42603581  T
Q  114 gttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 213  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  42603580 gatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgataccctcccctcgtcgagcattggacgtttataccga 42603481  T
Q  214 acgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||    
T  42603480 acgtgttccgccctccttctgtctctg 42603454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 31171791 - 31172028
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  31171791 tagttggaaggtgcattccatacctaatcacgatcttctggcggaatcaaactgttgataatattttcagttgatctcagcaacgtcacccacatatcga 31171890  T
Q  101 tccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttgg 200  Q
    ||||| | |||||| |||||| |  ||| |||||  ||| ||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||| | ||||| ||||||    
T  31171891 tccacggtaacatgctgtgcttctgaaaaatgtttgtcatgtcgtcgtcgttcattaattccacccaactgaatgatattctcccatcgtcgaacgttgg 31171990  T
Q  201 acgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31171991 acgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 31172028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Original strand, 19242157 - 19242375
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| || ||||||| |  |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  19242157 tacctaatgacaatcttctcgtagaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatcttagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtat 19242256  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19242257 tcccaaaacatgctcgtcacgtttttgtcgttccttaattacacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgtt 19242356  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctct 239  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19242357 ccaccctccttgtgtctct 19242375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Original strand, 19315341 - 19315559
Alignment:
Q  21 tacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 120  Q
    |||||||| || ||||||| |  |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  19315341 tacctaatgacaatcttctcgtagaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatcttagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtat 19315440  T
Q  121 tcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtatt 220  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19315441 tcccaaaacatgctcgtcacgtttttgtcgttccttaattacacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgtt 19315540  T
Q  221 ccaccctccttgtgtctct 239  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19315541 ccaccctccttgtgtctct 19315559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26484757 - 26484580
Alignment:
Q  60 aatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaac 159  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||     
T  26484757 aatatcttcagttgatctcagcaatgttatgcgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaat 26484658  T
Q  160 tccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26484657 tccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtgtct 26484580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2417137 - 2416915
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||   ||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2417137 ccctaactaatgacgatcttctggtggaatcaagttgttgatgatatcttcggttgatctcatcaacgtcacctgcatatcgatcaactggaacatgttg 2417038  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  2417037 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgaaactctccccttgtcgaatgttggacgtttataccgaaggt 2416938  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||||||||||||| ||||    
T  2416937 gttccaccctccttgtgtttctg 2416915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24861565 - 24861344
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  24861565 ccctaactaatgacgatcttctggcagaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcaatccaattgaacatgttg 24861466  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24861465 tgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgatactctccccccgtcgagcgttggacgtttataccgaaggt 24861366  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctct 239  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  24861365 gttccaccctccttgtgtctct 24861344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 485250 - 485472
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  485250 ccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcatccgcatatcgatccactagaacatgctg 485349  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||    
T  485350 tgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgt 485449  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctctg 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  485450 gttccaccatccttgtgtctctg 485472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40702587 - 40702360
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcac-gatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaaca 112  Q
    |||||| |||||||| || |||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  40702587 cattccgtacctaatgaccgatcttttggcggaatcaaacttttgatgatatattcagttgatctcagcaacgtcatccgcatatcgatccactggaaca 40702488  T
Q  113 tgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccg 212  Q
    |||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  40702487 tgttttgttcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattctcccttcgtcgaacgttggacgtttatactg 40702388  T
Q  213 aacgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  40702387 aacgtgttccactctccttctgtctctg 40702360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 81 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16575851 - 16575695
Alignment:
Q  81 caacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatact 180  Q
    |||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| |||    
T  16575851 caacattacgcgcgtatcgatgcactggaacatgttgtggtcccaaaacatgctcatcccgttttcgttgttcgttaattccacccaactgaatgaaact 16575752  T
Q  181 ctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtct 237  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16575751 ctcctctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtct 16575695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22548380 - 22548263
Alignment:
Q  123 ccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattcc 222  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  22548380 ccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcatttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatatcgaatgtgttcc 22548281  T
Q  223 accctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22548280 accctccttgtgtctctg 22548263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22549301 - 22549236
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgt 86  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22549301 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaa---gttgatgatatcttcagttgatgtcagcaacgt 22549236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 16575920 - 16575867
Alignment:
Q  1 tagttggaaggtgcatt-ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatact 53  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  16575920 tagttggaaggtgcatttccctgcctaatcacgaacttctggcggaatcaaact 16575867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 240
Target Start/End: Original strand, 12504896 - 12504938
Alignment:
Q  198 tggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12504896 tggacattcataccaaacgtattccaccctccttgtgtctctg 12504938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 235
Target Start/End: Original strand, 22843442 - 22843532
Alignment:
Q  145 tcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgt 235  Q
    ||||| ||| |||||||||  ||| |||| | || |||||| | ||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22843442 tcgtccttcgttaactccaatcaactgaacgttattctcccatcgtcaaacgatggacgttcataccaaacgtattccaccctccttgtgt 22843532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 26486899 - 26486847
Alignment:
Q  14 cattccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatct 66  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||    
T  26486899 cattccgtacctaatgacgatcttctgacggaatcaagctgttgatgatatct 26486847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2481 - 2261
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2481 ccctaactaatgacgatcttttggcggaatcaagctgttgatgatatcttcaattgatctcatcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 2382  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  2381 tgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgttgagcgttggacgtttataccgaacgt 2282  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctc 238  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  2281 gttccaccctccttgtgtctc 2261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 232
Target Start/End: Original strand, 17910 - 18123
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17910 ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactataacatgttg 18009  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18010 tgctcccaaaacatgctcatcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactct-ccctcgtcgagtgttggacgtttataccgaacgt 18108  T
Q  218 attccaccctccttg 232  Q
     ||||||||||||||    
T  18109 gttccaccctccttg 18123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2004 - 1783
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttg 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2004 ccctaactaatgacgatcttatggcgaaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttg 1905  T
Q  118 tgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 217  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  1904 tgctcccaaaacatgtccgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaaatgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggatgtttataccgaaatt 1805  T
Q  218 attccaccctccttgtgtctct 239  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  1804 gttccaccctccttgtgtctct 1783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25119 - 24899
Alignment:
Q  17 tccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgtt 116  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  25119 tccctacctaatcacgatctattggcgcaatcagactcttg-taatatcttcagttgatcttagcaatgttatccgcaaatagatccactagaacatgtt 25021  T
Q  117 gtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacg 216  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||    
T  25020 gtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttcgttaattccacccaactgaatgctactctcccctcctcgagcgttgtacgtctataccgaacg 24921  T
Q  217 tattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24920 tattccaccctccttgtgtctc 24899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 112 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 64095 - 63968
Alignment:
Q  112 atgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttatacc 211  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  64095 atgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcattgattccactcaactgaatgatactct-cccttgtcgagcgttggacatttatacc 63997  T
Q  212 gaacgtattccaccctccttgtgtctctg 240  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  63996 gaacgtgctccaccctccttgtgtctctg 63968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 64163 - 64098
Alignment:
Q  18 ccctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaa 83  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  64163 ccctacctaatgacgatcttctggtggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaa 64098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5561 - 5453
Alignment:
Q  20 ctacctaatcacgatcttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtg 119  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||| ||   ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  5561 ctacctaatctcgatcttctggcgaaatcaaactgttgagaatatcttcaggcgatctcaacaacgtgacaaacatattgatccatgggaacatgttgtg 5462  T
Q  120 ctcccaaaa 128  Q
    || ||||||    
T  5461 ctgccaaaa 5453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 36860 - 36775
Alignment:
Q  36 ttctggcggaatcatactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgct 121  Q
    |||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||| ||  |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  36860 ttctagcggaattaaactcttgagaatatcttcaggcgatctcaacaacgtgacaagcatatcgatccacgggaacatgatgtgct 36775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 145 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 36742 - 36649
Alignment:
Q  145 tcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtgtctc 238  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| |||||| || ||||||||  || | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||    
T  36742 tcgtcgttcgttaactccggccaactgaatgttattctcccctcatcaaacgtgggacgttcataccaaacgtattccacgttccatgtgtctc 36649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University