View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16275_low_15 (Length: 331)

Name: NF16275_low_15
Description: NF16275
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16275_low_15
NF16275_low_15
[»] chr3 (128 HSPs)
chr3 (14-331)||(53917506-53917822)
chr3 (14-327)||(1313512-1313822)
chr3 (13-331)||(53915337-53915654)
chr3 (14-331)||(43423308-43423621)
chr3 (14-331)||(4308122-4308439)
chr3 (14-331)||(18099010-18099328)
chr3 (14-331)||(36011926-36012243)
chr3 (14-331)||(43421260-43421573)
chr3 (14-331)||(18096740-18097058)
chr3 (26-331)||(43228390-43228693)
chr3 (14-331)||(45883038-45883357)
chr3 (14-331)||(32219183-32219503)
chr3 (20-331)||(27101028-27101339)
chr3 (14-331)||(3314783-3315100)
chr3 (14-331)||(43226184-43226495)
chr3 (13-331)||(9604446-9604765)
chr3 (20-331)||(18162762-18163074)
chr3 (14-331)||(42990403-42990717)
chr3 (30-331)||(880312-880609)
chr3 (14-306)||(27635497-27635791)
chr3 (31-331)||(1626543-1626841)
chr3 (30-331)||(6484459-6484757)
chr3 (29-331)||(25688015-25688319)
chr3 (13-331)||(47148744-47149053)
chr3 (14-331)||(51674608-51674924)
chr3 (14-331)||(1321578-1321897)
chr3 (13-331)||(24979806-24980127)
chr3 (13-331)||(12267818-12268122)
chr3 (32-331)||(38890139-38890441)
chr3 (13-331)||(10084228-10084547)
chr3 (14-331)||(10955867-10956185)
chr3 (43-331)||(51943470-51943758)
chr3 (20-331)||(5926615-5926922)
chr3 (14-331)||(53468295-53468614)
chr3 (29-331)||(5886298-5886601)
chr3 (29-331)||(5899771-5900074)
chr3 (14-330)||(25533542-25533842)
chr3 (14-331)||(28101848-28102160)
chr3 (13-331)||(32263880-32264197)
chr3 (16-303)||(47701522-47701801)
chr3 (14-331)||(25389005-25389326)
chr3 (14-331)||(11168200-11168519)
chr3 (20-328)||(4666616-4666922)
chr3 (14-331)||(5522466-5522784)
chr3 (14-331)||(10958163-10958481)
chr3 (14-331)||(746857-747177)
chr3 (14-331)||(6065633-6065953)
chr3 (14-331)||(6231900-6232208)
chr3 (14-331)||(53591283-53591597)
chr3 (13-331)||(3306860-3307177)
chr3 (14-331)||(10621366-10621687)
chr3 (14-331)||(23633553-23633862)
chr3 (14-331)||(50494099-50494417)
chr3 (14-330)||(54691417-54691731)
chr3 (16-331)||(5191752-5192066)
chr3 (120-331)||(30005940-30006151)
chr3 (14-331)||(458384-458702)
chr3 (13-331)||(17795357-17795670)
chr3 (13-331)||(19103797-19104110)
chr3 (14-247)||(41849242-41849470)
chr3 (13-331)||(10191151-10191467)
chr3 (41-327)||(48361538-48361825)
chr3 (14-331)||(456007-456325)
chr3 (14-331)||(51726847-51727165)
chr3 (14-331)||(4103736-4104053)
chr3 (14-331)||(6063283-6063603)
chr3 (13-331)||(15780970-15781294)
chr3 (52-331)||(26720646-26720928)
chr3 (14-331)||(38210470-38210789)
chr3 (14-331)||(39715568-39715883)
chr3 (14-331)||(22114143-22114463)
chr3 (29-331)||(3859627-3859914)
chr3 (14-331)||(7606443-7606745)
chr3 (14-331)||(28412870-28413189)
chr3 (156-331)||(11170503-11170678)
chr3 (14-331)||(31151444-31151754)
chr3 (14-331)||(28761287-28761587)
chr3 (106-282)||(42992418-42992594)
chr3 (31-226)||(53893910-53894110)
chr3 (31-331)||(561640-561935)
chr3 (179-331)||(889779-889930)
chr3 (173-331)||(35917944-35918101)
chr3 (14-331)||(25635480-25635788)
chr3 (30-192)||(28181242-28181401)
chr3 (209-331)||(29956785-29956907)
chr3 (253-331)||(6561909-6561987)
chr3 (14-286)||(25634031-25634294)
chr3 (17-177)||(880087-880244)
chr3 (14-205)||(42992611-42992799)
chr3 (146-324)||(24181486-24181665)
chr3 (30-331)||(36871166-36871460)
chr3 (183-331)||(13420195-13420344)
chr3 (156-235)||(35919098-35919177)
chr3 (106-330)||(1620398-1620619)
chr3 (104-324)||(1674078-1674287)
chr3 (14-316)||(53597350-53597644)
chr3 (271-331)||(35777521-35777581)
chr3 (14-135)||(11170670-11170788)
chr3 (70-193)||(8183035-8183154)
chr3 (253-322)||(23637131-23637200)
chr3 (275-330)||(28100143-28100198)
chr3 (275-330)||(28181122-28181177)
chr3 (237-331)||(54884254-54884347)
chr3 (171-236)||(1736323-1736388)
chr3 (195-279)||(11007545-11007630)
chr3 (171-236)||(18552901-18552966)
chr3 (282-331)||(28137415-28137464)
chr3 (176-233)||(28181185-28181241)
chr3 (171-236)||(30709808-30709873)
chr3 (171-236)||(33386684-33386749)
chr3 (171-236)||(8370504-8370569)
chr3 (171-236)||(27452962-27453027)
chr3 (171-236)||(27974970-27975035)
chr3 (171-236)||(27986464-27986529)
chr3 (237-320)||(14634506-14634590)
chr3 (171-223)||(47923937-47923989)
chr3 (171-226)||(1417518-1417573)
chr3 (171-226)||(3716030-3716085)
chr3 (181-236)||(48438228-48438283)
chr3 (171-236)||(16264354-16264419)
chr3 (171-220)||(21711227-21711276)
chr3 (171-236)||(32143325-32143390)
chr3 (31-84)||(36957651-36957703)
chr3 (171-224)||(40844656-40844708)
chr3 (171-215)||(29682483-29682527)
chr3 (171-215)||(40913417-40913461)
chr3 (171-215)||(44331669-44331713)
chr3 (171-215)||(46173481-46173525)
[»] chr7 (98 HSPs)
chr7 (14-331)||(13099317-13099636)
chr7 (14-331)||(27306076-27306390)
chr7 (14-331)||(44724708-44725022)
chr7 (29-331)||(443724-444027)
chr7 (14-331)||(4295781-4296094)
chr7 (14-331)||(20626167-20626481)
chr7 (14-331)||(20630058-20630372)
chr7 (14-331)||(20642477-20642791)
chr7 (13-324)||(42330845-42331150)
chr7 (14-331)||(38394115-38394434)
chr7 (13-331)||(21591988-21592303)
chr7 (14-331)||(31434892-31435207)
chr7 (14-331)||(42223287-42223600)
chr7 (14-331)||(20299589-20299908)
chr7 (14-331)||(48457782-48458100)
chr7 (39-331)||(21990279-21990570)
chr7 (15-331)||(28487682-28488000)
chr7 (14-331)||(11355387-11355705)
chr7 (26-331)||(35758-36065)
chr7 (26-331)||(9679188-9679492)
chr7 (27-331)||(9680949-9681252)
chr7 (14-331)||(37411965-37412287)
chr7 (14-331)||(20297491-20297810)
chr7 (14-331)||(7092054-7092372)
chr7 (13-331)||(21680156-21680473)
chr7 (39-331)||(39145856-39146147)
chr7 (14-326)||(7094301-7094615)
chr7 (14-331)||(21678195-21678506)
chr7 (13-330)||(44694-45013)
chr7 (14-331)||(7471821-7472140)
chr7 (14-331)||(40836583-40836902)
chr7 (14-331)||(24748723-24749035)
chr7 (14-331)||(1850110-1850429)
chr7 (14-331)||(7469864-7470182)
chr7 (14-331)||(25542658-25542976)
chr7 (36-331)||(18345670-18345967)
chr7 (14-331)||(1606510-1606827)
chr7 (20-312)||(3035872-3036166)
chr7 (13-331)||(2935398-2935717)
chr7 (14-307)||(22393875-22394161)
chr7 (16-331)||(38396764-38397084)
chr7 (14-331)||(7351491-7351811)
chr7 (14-205)||(26804765-26804955)
chr7 (14-331)||(9027034-9027352)
chr7 (134-331)||(20137073-20137269)
chr7 (14-331)||(28485695-28486013)
chr7 (14-331)||(3878706-3879027)
chr7 (33-327)||(40946461-40946759)
chr7 (13-331)||(43253357-43253677)
chr7 (14-327)||(26295580-26295885)
chr7 (14-331)||(1049129-1049455)
chr7 (14-331)||(27832488-27832793)
chr7 (14-331)||(1046757-1047084)
chr7 (14-331)||(22137208-22137527)
chr7 (14-331)||(40552235-40552554)
chr7 (14-331)||(40549957-40550277)
chr7 (14-331)||(24465666-24465975)
chr7 (14-331)||(7349117-7349432)
chr7 (14-223)||(11759364-11759575)
chr7 (156-331)||(31155896-31156070)
chr7 (49-331)||(22108197-22108483)
chr7 (31-331)||(24813364-24813659)
chr7 (36-191)||(22251452-22251605)
chr7 (30-331)||(7188668-7188962)
chr7 (13-331)||(25276270-25276567)
chr7 (207-331)||(20091583-20091705)
chr7 (150-331)||(24258592-24258778)
chr7 (106-331)||(24817292-24817514)
chr7 (211-331)||(22828672-22828793)
chr7 (230-331)||(11757359-11757460)
chr7 (237-330)||(6348912-6349005)
chr7 (168-320)||(6332359-6332514)
chr7 (258-331)||(22251637-22251710)
chr7 (166-312)||(6046641-6046789)
chr7 (134-324)||(11081642-11081836)
chr7 (171-236)||(46516338-46516403)
chr7 (271-331)||(26804701-26804761)
chr7 (14-88)||(20136991-20137066)
chr7 (104-223)||(40281319-40281435)
chr7 (75-331)||(16296934-16297185)
chr7 (171-236)||(29159807-29159872)
chr7 (171-226)||(9190046-9190101)
chr7 (171-226)||(20284093-20284148)
chr7 (14-61)||(31153691-31153737)
chr7 (171-236)||(21983288-21983353)
chr7 (31-83)||(1502832-1502883)
chr7 (171-215)||(14379861-14379905)
chr7 (171-226)||(2580394-2580449)
chr7 (174-236)||(55955-56016)
chr7 (171-236)||(2647724-2647789)
chr7 (179-224)||(4796707-4796752)
chr7 (171-212)||(30024732-30024773)
chr7 (168-235)||(6067195-6067263)
chr7 (171-215)||(14069833-14069877)
chr7 (31-67)||(25357324-25357360)
chr7 (171-215)||(27347941-27347985)
chr7 (171-215)||(41317434-41317478)
chr7 (171-215)||(47676136-47676180)
[»] chr4 (122 HSPs)
chr4 (12-331)||(22800703-22801022)
chr4 (14-331)||(22802577-22802894)
chr4 (17-331)||(36919432-36919744)
chr4 (14-331)||(38928024-38928337)
chr4 (14-331)||(36921338-36921653)
chr4 (10-331)||(40637247-40637570)
chr4 (14-331)||(24888969-24889286)
chr4 (20-331)||(48486492-48486803)
chr4 (14-331)||(40091259-40091575)
chr4 (14-331)||(33415334-33415648)
chr4 (13-331)||(17662091-17662405)
chr4 (75-331)||(24879162-24879419)
chr4 (14-331)||(14787274-14787591)
chr4 (13-331)||(37089211-37089531)
chr4 (75-331)||(24880624-24880883)
chr4 (14-331)||(2891464-2891780)
chr4 (27-331)||(12395703-12396005)
chr4 (27-331)||(12400665-12400967)
chr4 (13-331)||(6765017-6765336)
chr4 (36-331)||(47274899-47275190)
chr4 (27-331)||(13547327-13547630)
chr4 (14-331)||(16453482-16453796)
chr4 (14-327)||(4215483-4215792)
chr4 (14-331)||(8631260-8631579)
chr4 (13-331)||(14633492-14633811)
chr4 (14-331)||(37312924-37313226)
chr4 (13-306)||(5635317-5635611)
chr4 (14-331)||(24348391-24348692)
chr4 (14-331)||(18847327-18847644)
chr4 (11-331)||(22044228-22044550)
chr4 (14-331)||(16931631-16931948)
chr4 (29-331)||(22046542-22046845)
chr4 (13-331)||(2484714-2485032)
chr4 (14-331)||(47868574-47868894)
chr4 (29-331)||(51015419-51015722)
chr4 (26-329)||(11435130-11435435)
chr4 (14-327)||(36378469-36378777)
chr4 (12-331)||(7941496-7941816)
chr4 (14-331)||(9176315-9176633)
chr4 (14-306)||(11437561-11437855)
chr4 (14-331)||(619298-619607)
chr4 (14-331)||(19096056-19096370)
chr4 (14-331)||(22782577-22782897)
chr4 (14-331)||(26085818-26086136)
chr4 (14-256)||(47563009-47563248)
chr4 (14-331)||(9173987-9174305)
chr4 (9-330)||(27499219-27499541)
chr4 (14-330)||(5198594-5198895)
chr4 (14-284)||(24446502-24446754)
chr4 (14-331)||(44599680-44599997)
chr4 (12-331)||(31849438-31849758)
chr4 (14-331)||(9148426-9148727)
chr4 (31-331)||(38409378-38409679)
chr4 (14-331)||(11008408-11008725)
chr4 (14-331)||(16933988-16934302)
chr4 (14-331)||(22780212-22780532)
chr4 (14-303)||(5101130-5101404)
chr4 (14-235)||(14789273-14789494)
chr4 (21-327)||(41997669-41997968)
chr4 (13-331)||(16455414-16455715)
chr4 (14-331)||(18709003-18709323)
chr4 (14-331)||(22132229-22132551)
chr4 (31-331)||(36380522-36380818)
chr4 (14-331)||(22134457-22134776)
chr4 (14-331)||(11006094-11006396)
chr4 (14-283)||(53405356-53405626)
chr4 (30-324)||(38890090-38890379)
chr4 (14-331)||(19322866-19323177)
chr4 (14-331)||(56030617-56030945)
chr4 (14-210)||(52942329-52942527)
chr4 (30-219)||(6133122-6133309)
chr4 (21-331)||(30136722-30137026)
chr4 (35-331)||(18534703-18534993)
chr4 (35-331)||(18537345-18537635)
chr4 (14-282)||(49088791-49089044)
chr4 (14-321)||(18409192-18409497)
chr4 (191-331)||(13544132-13544272)
chr4 (180-327)||(47210761-47210908)
chr4 (29-191)||(3824464-3824630)
chr4 (31-331)||(28453855-28454151)
chr4 (14-205)||(3937126-3937308)
chr4 (14-330)||(8756103-8756411)
chr4 (30-286)||(25357859-25358107)
chr4 (230-330)||(3824629-3824729)
chr4 (230-331)||(5637524-5637625)
chr4 (14-331)||(12102259-12102566)
chr4 (31-316)||(15032410-15032694)
chr4 (106-331)||(16185774-16185996)
chr4 (14-135)||(47210637-47210755)
chr4 (14-163)||(5664576-5664722)
chr4 (241-306)||(52942528-52942594)
chr4 (208-331)||(31983564-31983689)
chr4 (36-114)||(38270016-38270091)
chr4 (182-331)||(3982186-3982339)
chr4 (146-320)||(47150868-47151044)
chr4 (171-236)||(10047383-10047448)
chr4 (171-236)||(39245998-39246063)
chr4 (155-331)||(5336764-5336942)
chr4 (172-236)||(6743443-6743507)
chr4 (288-331)||(6133045-6133088)
chr4 (14-76)||(18311215-18311278)
chr4 (171-236)||(5269219-5269284)
chr4 (28-95)||(10113272-10113337)
chr4 (140-235)||(31300541-31300636)
chr4 (172-236)||(36315257-36315321)
chr4 (172-236)||(36329466-36329530)
chr4 (171-223)||(54867188-54867239)
chr4 (276-331)||(3937314-3937369)
chr4 (179-322)||(10113050-10113196)
chr4 (171-236)||(5396699-5396764)
chr4 (207-331)||(9022476-9022603)
chr4 (171-236)||(31985662-31985726)
chr4 (171-236)||(38152467-38152532)
chr4 (140-235)||(4884991-4885087)
chr4 (171-215)||(12739550-12739594)
chr4 (156-235)||(15831258-15831337)
chr4 (104-256)||(22295412-22295560)
chr4 (171-215)||(26175636-26175680)
chr4 (171-215)||(36463389-36463433)
chr4 (168-235)||(36769596-36769664)
chr4 (171-215)||(48893638-48893682)
chr4 (171-215)||(52467354-52467398)
[»] chr8 (72 HSPs)
chr8 (14-331)||(15072885-15073202)
chr8 (14-331)||(41382837-41383154)
chr8 (14-330)||(15068157-15068472)
chr8 (31-331)||(30480365-30480663)
chr8 (14-331)||(28251410-28251727)
chr8 (14-331)||(14807926-14808252)
chr8 (14-331)||(14419035-14419351)
chr8 (14-331)||(41384919-41385233)
chr8 (14-331)||(27106747-27107057)
chr8 (13-331)||(27829472-27829791)
chr8 (14-331)||(28283062-28283379)
chr8 (14-331)||(27827161-27827479)
chr8 (14-331)||(25952695-25953010)
chr8 (14-330)||(15956133-15956443)
chr8 (13-331)||(15809393-15809712)
chr8 (14-331)||(32339484-32339803)
chr8 (14-331)||(3874185-3874487)
chr8 (14-331)||(4424193-4424512)
chr8 (14-331)||(18810883-18811202)
chr8 (31-324)||(36865717-36866012)
chr8 (14-328)||(43530293-43530609)
chr8 (13-331)||(44721019-44721338)
chr8 (13-331)||(43082149-43082468)
chr8 (12-331)||(13858332-13858644)
chr8 (14-331)||(22684491-22684816)
chr8 (13-268)||(33541254-33541507)
chr8 (14-331)||(43079778-43080096)
chr8 (14-284)||(35872301-35872553)
chr8 (14-306)||(15185564-15185850)
chr8 (13-331)||(18813057-18813377)
chr8 (14-331)||(21482485-21482798)
chr8 (33-331)||(1225341-1225626)
chr8 (14-331)||(608909-609230)
chr8 (14-221)||(37214109-37214314)
chr8 (14-300)||(2467979-2468259)
chr8 (14-331)||(21480677-21480990)
chr8 (30-331)||(5372042-5372338)
chr8 (31-331)||(31162384-31162683)
chr8 (152-331)||(27911189-27911367)
chr8 (152-331)||(27957608-27957786)
chr8 (13-331)||(24873038-24873340)
chr8 (14-235)||(14477521-14477740)
chr8 (14-331)||(3005486-3005792)
chr8 (80-323)||(181685-181901)
chr8 (14-143)||(3883436-3883562)
chr8 (104-331)||(31578219-31578439)
chr8 (260-331)||(14477451-14477522)
chr8 (14-136)||(27911447-27911567)
chr8 (14-136)||(27957866-27957986)
chr8 (30-331)||(31035292-31035587)
chr8 (14-78)||(183246-183310)
chr8 (179-324)||(17847707-17847847)
chr8 (239-331)||(31573794-31573887)
chr8 (171-226)||(19752432-19752487)
chr8 (171-236)||(4696624-4696689)
chr8 (171-236)||(26403258-26403323)
chr8 (290-331)||(33541507-33541548)
chr8 (171-235)||(9765848-9765912)
chr8 (171-215)||(12702634-12702678)
chr8 (288-331)||(37214317-37214360)
chr8 (152-225)||(4812470-4812543)
chr8 (171-236)||(7412345-7412410)
chr8 (170-286)||(16833769-16833886)
chr8 (171-236)||(23799605-23799670)
chr8 (171-236)||(31071257-31071322)
chr8 (31-67)||(2467896-2467932)
chr8 (171-215)||(10930199-10930243)
chr8 (171-215)||(15212910-15212954)
chr8 (171-215)||(27811402-27811446)
chr8 (195-235)||(33032771-33032811)
chr8 (171-215)||(33352274-33352318)
chr8 (171-215)||(40321204-40321248)
[»] chr5 (92 HSPs)
chr5 (14-331)||(18511056-18511372)
chr5 (14-331)||(36402170-36402488)
chr5 (21-331)||(40221641-40221956)
chr5 (14-331)||(6745187-6745507)
chr5 (13-329)||(39854604-39854922)
chr5 (14-302)||(2724041-2724328)
chr5 (26-331)||(2818190-2818495)
chr5 (14-331)||(24126975-24127291)
chr5 (14-331)||(41585580-41585904)
chr5 (53-331)||(18509201-18509478)
chr5 (13-331)||(658203-658513)
chr5 (14-331)||(6747424-6747743)
chr5 (18-331)||(21948145-21948464)
chr5 (14-331)||(20505687-20506001)
chr5 (14-331)||(1189454-1189769)
chr5 (14-331)||(16092045-16092360)
chr5 (28-331)||(16776277-16776580)
chr5 (31-331)||(17818352-17818650)
chr5 (26-331)||(10474180-10474483)
chr5 (14-331)||(25904222-25904536)
chr5 (14-331)||(18466803-18467123)
chr5 (14-331)||(10528937-10529259)
chr5 (14-331)||(25804144-25804463)
chr5 (33-331)||(25921333-25921633)
chr5 (14-331)||(695996-696310)
chr5 (52-331)||(26097851-26098127)
chr5 (14-331)||(37705626-37705940)
chr5 (14-331)||(18596764-18597079)
chr5 (14-331)||(36208694-36209007)
chr5 (37-331)||(17073002-17073298)
chr5 (20-331)||(21288888-21289187)
chr5 (15-331)||(6756613-6756926)
chr5 (20-331)||(27912655-27912969)
chr5 (14-331)||(18469130-18469448)
chr5 (31-331)||(4236748-4237049)
chr5 (14-331)||(31465833-31466138)
chr5 (14-331)||(34476894-34477213)
chr5 (20-327)||(2954540-2954843)
chr5 (14-331)||(31179213-31179530)
chr5 (14-331)||(34479259-34479578)
chr5 (13-331)||(38882225-38882526)
chr5 (14-331)||(39798166-39798468)
chr5 (30-331)||(2175038-2175323)
chr5 (14-331)||(27910569-27910872)
chr5 (14-331)||(31542855-31543172)
chr5 (14-327)||(3372977-3373292)
chr5 (13-331)||(21684293-21684611)
chr5 (31-331)||(10749820-10750121)
chr5 (14-262)||(26098129-26098380)
chr5 (13-331)||(38959971-38960290)
chr5 (14-331)||(31472458-31472773)
chr5 (14-331)||(15552365-15552685)
chr5 (14-331)||(10586951-10587252)
chr5 (14-331)||(4410142-4410458)
chr5 (20-331)||(31545200-31545515)
chr5 (31-331)||(10757297-10757597)
chr5 (14-331)||(15354414-15354733)
chr5 (14-331)||(23665164-23665484)
chr5 (14-331)||(23793103-23793423)
chr5 (14-331)||(15356690-15357009)
chr5 (29-331)||(12555773-12556083)
chr5 (13-331)||(23741696-23742017)
chr5 (27-218)||(20043222-20043411)
chr5 (31-331)||(6661053-6661346)
chr5 (152-331)||(39397974-39398153)
chr5 (31-331)||(9020337-9020633)
chr5 (13-317)||(20053971-20054267)
chr5 (104-331)||(15143584-15143811)
chr5 (14-134)||(34530559-34530679)
chr5 (39-156)||(20045281-20045395)
chr5 (237-324)||(42770936-42771023)
chr5 (31-320)||(15445135-15445417)
chr5 (249-331)||(34530744-34530826)
chr5 (104-331)||(4897847-4898070)
chr5 (182-331)||(17413176-17413328)
chr5 (168-319)||(23667451-23667600)
chr5 (14-134)||(39397857-39397970)
chr5 (288-331)||(20045129-20045172)
chr5 (171-221)||(24553549-24553599)
chr5 (171-236)||(9353360-9353425)
chr5 (171-236)||(36932378-36932443)
chr5 (171-226)||(28832263-28832318)
chr5 (171-236)||(10281755-10281820)
chr5 (171-220)||(14520234-14520283)
chr5 (171-236)||(15464536-15464601)
chr5 (171-220)||(17004004-17004053)
chr5 (171-236)||(19588750-19588815)
chr5 (171-215)||(538149-538193)
chr5 (171-215)||(5887434-5887478)
chr5 (171-235)||(11917001-11917065)
chr5 (171-215)||(19806487-19806531)
chr5 (171-215)||(32636948-32636992)
[»] chr1 (113 HSPs)
chr1 (14-331)||(39462638-39462956)
chr1 (14-331)||(47906389-47906704)
chr1 (14-331)||(50307389-50307708)
chr1 (14-331)||(6995540-6995862)
chr1 (29-331)||(27336799-27337101)
chr1 (19-331)||(11457327-11457637)
chr1 (20-331)||(17324484-17324798)
chr1 (20-328)||(25251127-25251434)
chr1 (14-331)||(2949079-2949393)
chr1 (14-331)||(14097815-14098132)
chr1 (14-331)||(28206912-28207228)
chr1 (14-330)||(16429077-16429387)
chr1 (12-331)||(12302347-12302667)
chr1 (14-306)||(23816030-23816323)
chr1 (29-327)||(27338990-27339288)
chr1 (14-331)||(18839706-18840022)
chr1 (14-331)||(31424862-31425177)
chr1 (14-331)||(13215200-13215518)
chr1 (14-331)||(51750158-51750476)
chr1 (30-331)||(15823665-15823968)
chr1 (14-331)||(17319006-17319321)
chr1 (14-331)||(10399669-10399990)
chr1 (14-331)||(38925328-38925640)
chr1 (13-331)||(15294677-15294996)
chr1 (14-331)||(41647039-41647355)
chr1 (12-331)||(50248415-50248734)
chr1 (14-331)||(31490032-31490345)
chr1 (14-331)||(31735365-31735683)
chr1 (14-328)||(25248398-25248711)
chr1 (14-331)||(18307228-18307543)
chr1 (13-331)||(39932192-39932515)
chr1 (20-331)||(9240940-9241248)
chr1 (14-331)||(2617635-2617955)
chr1 (14-331)||(4131221-4131541)
chr1 (14-331)||(13761956-13762275)
chr1 (14-331)||(47451761-47452065)
chr1 (55-331)||(16428772-16429043)
chr1 (14-331)||(46431548-46431869)
chr1 (13-331)||(9459276-9459578)
chr1 (13-331)||(9463103-9463405)
chr1 (14-331)||(17185979-17186290)
chr1 (49-331)||(28840799-28841083)
chr1 (13-331)||(40134063-40134379)
chr1 (77-331)||(50076583-50076834)
chr1 (14-331)||(16226287-16226607)
chr1 (14-331)||(28998094-28998415)
chr1 (14-331)||(29003810-29004131)
chr1 (14-331)||(23785959-23786278)
chr1 (31-330)||(2510202-2510485)
chr1 (14-330)||(28842615-28842931)
chr1 (27-320)||(6114966-6115254)
chr1 (14-331)||(31422706-31423035)
chr1 (27-331)||(25127991-25128294)
chr1 (13-331)||(16231683-16232003)
chr1 (38-322)||(17324191-17324484)
chr1 (14-331)||(47179833-47180152)
chr1 (14-331)||(51757650-51757973)
chr1 (14-331)||(47177482-47177801)
chr1 (14-331)||(24325782-24326101)
chr1 (14-331)||(51752483-51752805)
chr1 (104-331)||(6756645-6756870)
chr1 (14-331)||(20291576-20291894)
chr1 (30-331)||(14183470-14183754)
chr1 (26-331)||(16432513-16432809)
chr1 (14-331)||(20302578-20302879)
chr1 (146-331)||(3579594-3579778)
chr1 (158-331)||(6823133-6823306)
chr1 (127-331)||(50078779-50078983)
chr1 (14-225)||(13358798-13359011)
chr1 (13-278)||(15916562-15916822)
chr1 (14-164)||(50078635-50078787)
chr1 (52-331)||(15669281-15669556)
chr1 (14-330)||(30790250-30790563)
chr1 (14-197)||(13447117-13447301)
chr1 (31-324)||(18800439-18800728)
chr1 (14-329)||(8348905-8349212)
chr1 (207-331)||(21948226-21948350)
chr1 (146-331)||(42922349-42922535)
chr1 (31-148)||(25860270-25860383)
chr1 (181-330)||(49495222-49495372)
chr1 (14-134)||(3579431-3579550)
chr1 (182-324)||(8347284-8347428)
chr1 (230-331)||(48665296-48665398)
chr1 (12-133)||(30780361-30780484)
chr1 (14-331)||(13125310-13125621)
chr1 (251-328)||(6824014-6824091)
chr1 (104-321)||(30738564-30738783)
chr1 (31-286)||(16561631-16561878)
chr1 (145-331)||(28279384-28279574)
chr1 (146-331)||(26613216-26613403)
chr1 (171-236)||(9476265-9476330)
chr1 (171-215)||(50169210-50169254)
chr1 (107-235)||(26520061-26520186)
chr1 (171-226)||(47102879-47102934)
chr1 (171-236)||(13598402-13598467)
chr1 (14-67)||(13785107-13785159)
chr1 (171-236)||(16124544-16124609)
chr1 (171-236)||(47703964-47704029)
chr1 (193-331)||(155825-155963)
chr1 (261-324)||(26520205-26520269)
chr1 (168-235)||(27916712-27916780)
chr1 (171-226)||(19072932-19072987)
chr1 (171-226)||(19120822-19120877)
chr1 (171-226)||(26644935-26644990)
chr1 (171-226)||(32889443-32889498)
chr1 (171-226)||(47098862-47098917)
chr1 (174-236)||(29651818-29651880)
chr1 (171-215)||(834167-834211)
chr1 (174-226)||(3281715-3281767)
chr1 (171-215)||(13137976-13138020)
chr1 (171-235)||(21536598-21536662)
chr1 (171-215)||(28220226-28220270)
chr1 (171-215)||(28265554-28265598)
[»] chr6 (81 HSPs)
chr6 (14-331)||(9020080-9020398)
chr6 (14-331)||(11982872-11983189)
chr6 (14-331)||(3629711-3630024)
chr6 (14-327)||(3631784-3632094)
chr6 (12-331)||(1069561-1069879)
chr6 (14-331)||(3233567-3233890)
chr6 (13-331)||(4816070-4816391)
chr6 (14-331)||(13057348-13057659)
chr6 (14-330)||(24338295-24338606)
chr6 (12-331)||(19704401-19704728)
chr6 (18-331)||(30728673-30728988)
chr6 (34-331)||(14507037-14507335)
chr6 (29-331)||(26065137-26065440)
chr6 (29-331)||(26085106-26085409)
chr6 (14-331)||(28241163-28241481)
chr6 (14-331)||(2628727-2629045)
chr6 (14-331)||(14458607-14458927)
chr6 (14-331)||(1230090-1230409)
chr6 (14-323)||(15367193-15367498)
chr6 (14-331)||(26065961-26066283)
chr6 (21-306)||(15346526-15346806)
chr6 (14-331)||(26068235-26068554)
chr6 (14-331)||(26932403-26932721)
chr6 (13-331)||(29754548-29754868)
chr6 (14-331)||(32280150-32280463)
chr6 (14-331)||(30967355-30967673)
chr6 (14-331)||(15540990-15541300)
chr6 (14-331)||(5273055-5273375)
chr6 (134-331)||(13039908-13040106)
chr6 (14-331)||(20915197-20915515)
chr6 (14-331)||(33309012-33309329)
chr6 (20-331)||(14466477-14466785)
chr6 (13-331)||(33311281-33311599)
chr6 (14-331)||(12195354-12195674)
chr6 (14-330)||(30034447-30034762)
chr6 (109-330)||(12161498-12161716)
chr6 (152-331)||(3390533-3390713)
chr6 (163-331)||(15532674-15532841)
chr6 (31-331)||(15719796-15720089)
chr6 (151-331)||(25477428-25477616)
chr6 (104-324)||(12186008-12186226)
chr6 (26-331)||(26945297-26945598)
chr6 (14-331)||(3027703-3028014)
chr6 (180-324)||(16455433-16455579)
chr6 (214-331)||(15530166-15530282)
chr6 (134-235)||(10584246-10584348)
chr6 (20-331)||(22490794-22491073)
chr6 (14-157)||(3394695-3394837)
chr6 (31-319)||(19696605-19696887)
chr6 (14-98)||(18322483-18322566)
chr6 (30-164)||(15530022-15530156)
chr6 (14-331)||(17012194-17012502)
chr6 (14-134)||(25480227-25480346)
chr6 (14-88)||(8717195-8717268)
chr6 (14-286)||(25465444-25465706)
chr6 (14-73)||(13040173-13040232)
chr6 (141-286)||(25078528-25078673)
chr6 (104-280)||(12937131-12937302)
chr6 (50-93)||(25477614-25477657)
chr6 (171-236)||(5572269-5572334)
chr6 (30-286)||(28078063-28078310)
chr6 (177-306)||(30445702-30445834)
chr6 (134-255)||(22857917-22858038)
chr6 (14-71)||(10584355-10584413)
chr6 (277-331)||(19227514-19227568)
chr6 (171-236)||(5757506-5757571)
chr6 (171-236)||(10077193-10077258)
chr6 (152-235)||(30443538-30443622)
chr6 (171-226)||(5017507-5017562)
chr6 (31-136)||(6610378-6610478)
chr6 (171-226)||(31979517-31979572)
chr6 (144-280)||(12911419-12911555)
chr6 (179-225)||(24436010-24436056)
chr6 (237-283)||(28037796-28037842)
chr6 (152-225)||(35201309-35201382)
chr6 (171-236)||(21356040-21356105)
chr6 (171-215)||(603088-603132)
chr6 (169-220)||(4641085-4641137)
chr6 (195-235)||(17694877-17694917)
chr6 (184-236)||(18232862-18232914)
chr6 (171-215)||(33211185-33211229)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (14-331)||(79313-79631)
[»] chr2 (78 HSPs)
chr2 (13-331)||(19007735-19008052)
chr2 (14-327)||(22287181-22287492)
chr2 (14-331)||(43623423-43623740)
chr2 (36-331)||(42923373-42923669)
chr2 (14-331)||(21520534-21520853)
chr2 (26-331)||(28196732-28197033)
chr2 (17-331)||(27104893-27105209)
chr2 (12-331)||(17849212-17849530)
chr2 (42-331)||(5375218-5375505)
chr2 (14-331)||(6263993-6264309)
chr2 (13-322)||(14837371-14837680)
chr2 (63-313)||(22407348-22407596)
chr2 (20-331)||(6258668-6258975)
chr2 (16-331)||(45279844-45280144)
chr2 (31-331)||(23452094-23452397)
chr2 (30-331)||(13909902-13910204)
chr2 (13-260)||(22162868-22163111)
chr2 (9-331)||(28459033-28459350)
chr2 (14-331)||(36560981-36561300)
chr2 (34-331)||(3022258-3022562)
chr2 (14-300)||(7462789-7463077)
chr2 (14-286)||(22707595-22707868)
chr2 (14-331)||(35217810-35218122)
chr2 (14-331)||(36558721-36559023)
chr2 (49-331)||(17848539-17848814)
chr2 (14-331)||(19501843-19502171)
chr2 (14-331)||(35215433-35215745)
chr2 (85-331)||(40031968-40032218)
chr2 (14-331)||(11739421-11739720)
chr2 (14-331)||(19504178-19504505)
chr2 (14-331)||(45238842-45239137)
chr2 (14-331)||(45332020-45332340)
chr2 (84-331)||(44288982-44289228)
chr2 (13-312)||(24162062-24162363)
chr2 (156-331)||(42452876-42453050)
chr2 (27-331)||(34979447-34979739)
chr2 (49-331)||(42064610-42064878)
chr2 (52-313)||(31732666-31732919)
chr2 (13-291)||(23870951-23871230)
chr2 (14-331)||(20146459-20146769)
chr2 (14-331)||(11577957-11578269)
chr2 (35-195)||(15539396-15539553)
chr2 (134-324)||(22874232-22874423)
chr2 (150-331)||(18800292-18800474)
chr2 (20-134)||(38020370-38020484)
chr2 (41-316)||(17897125-17897391)
chr2 (14-320)||(37962791-37963088)
chr2 (99-331)||(40699468-40699698)
chr2 (249-331)||(15539553-15539635)
chr2 (14-98)||(22874435-22874519)
chr2 (134-331)||(35107388-35107588)
chr2 (14-136)||(38414028-38414149)
chr2 (168-330)||(13828338-13828503)
chr2 (14-216)||(20592288-20592484)
chr2 (237-331)||(20589785-20589880)
chr2 (14-108)||(42453798-42453890)
chr2 (171-236)||(14699035-14699100)
chr2 (171-235)||(10445473-10445537)
chr2 (249-331)||(27136203-27136286)
chr2 (171-236)||(8390178-8390243)
chr2 (171-236)||(13569332-13569397)
chr2 (171-236)||(20522224-20522289)
chr2 (237-331)||(15693997-15694093)
chr2 (171-215)||(17057369-17057413)
chr2 (171-215)||(17085352-17085396)
chr2 (179-215)||(17490156-17490192)
chr2 (171-236)||(8040064-8040129)
chr2 (171-236)||(28259205-28259270)
chr2 (171-215)||(723744-723788)
chr2 (134-217)||(8173539-8173622)
chr2 (180-236)||(33118149-33118205)
chr2 (171-215)||(33162450-33162494)
chr2 (171-215)||(34139770-34139814)
chr2 (171-235)||(34682363-34682427)
chr2 (171-215)||(36318009-36318053)
chr2 (171-215)||(39284960-39285004)
chr2 (152-235)||(39680161-39680244)
chr2 (36-68)||(42923315-42923347)
[»] scaffold0131 (3 HSPs)
scaffold0131 (14-331)||(14231-14542)
scaffold0131 (150-331)||(15147-15326)
scaffold0131 (20-67)||(15386-15433)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (14-331)||(79988-80305)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (15-331)||(11315-11633)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (14-331)||(52139-52456)
scaffold0005 (13-331)||(183481-183800)
scaffold0005 (14-235)||(50236-50457)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (36-331)||(4124-4415)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (13-331)||(69132-69451)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (14-331)||(41325-41643)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (16-235)||(35818-36037)
scaffold0011 (279-331)||(35767-35819)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (14-331)||(6328-6646)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (30-331)||(1309-1612)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (16-330)||(85359-85671)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (13-331)||(29299-29617)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (31-331)||(3008-3309)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (31-331)||(1509-1803)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (14-331)||(24520-24839)
scaffold0140 (14-331)||(22245-22564)
scaffold0140 (171-236)||(8447-8512)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (14-331)||(170-473)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (20-209)||(1298-1489)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (146-331)||(15796-15982)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (30-331)||(16516-16811)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (14-225)||(4518-4733)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (14-143)||(12715-12841)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (207-331)||(2169-2293)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (253-302)||(4967-5016)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (171-236)||(5687-5752)
scaffold0006 (171-236)||(2496-2561)
[»] scaffold1899 (1 HSPs)
scaffold1899 (26-73)||(4-50)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (171-220)||(36876-36925)
scaffold0087 (171-236)||(43989-44054)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (169-220)||(6978-7030)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (171-215)||(20415-20459)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 128)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 53917506 - 53917822
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  53917506 tgttgcgaaatcgatgaaaaatcacactaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaac 53917605  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  53917606 acaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggaga 53917704  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53917705 gagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccaa 53917804  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||    
T  53917805 tctcttcccgtaaccaag 53917822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 1313822 - 1313512
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  1313822 tgttgcgaattcgatgaaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaa 1313723  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||| ||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1313722 cacaagtcaaaagtagaaaacaac---gagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggag 1313627  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  1313626 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 1313527  T
Q  313 atctcttcccgtaac 327  Q
    |||||||||||||||    
T  1313526 atctcttcccgtaac 1313512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Original strand, 53915337 - 53915654
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  53915337 ctgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaagggatagtcaagcaaccaaaaccaagtgtatgaaacaattataaa 53915436  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  53915437 cacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtcaaaattgacctagtctgggggag 53915535  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  53915536 agagcagccctccgtttcactaaatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 53915635  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||    
T  53915636 atctcttcccgtaaccaag 53915654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 43423308 - 43423621
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  43423308 tgttgcgaattcgatgaaaaattacaccaataacaaagttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaac 43423407  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| |||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  43423408 acaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctcagggaga 43423503  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    ||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  43423504 gagcagctctcagtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagccccaa 43423603  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43423604 tctcttcccgtaaccaag 43423621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 4308122 - 4308439
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaa-atcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  4308122 tgttgcgaattcgatgaaaatatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaaggaataatccaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataat 4308220  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308221 cacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 4308320  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  4308321 agagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 4308420  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    | |||||||||||||||||    
T  4308421 acctcttcccgtaaccaag 4308439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 18099010 - 18099328
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||    
T  18099010 tgttgggaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaacaaaaatcaaagtgtatggaacaattgtaaa 18099109  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18099110 cacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagagaaagaaaagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccatattgacctagtctaggggag 18099209  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  18099210 agagcagccctccgttccactatatgatgagtaatgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 18099309  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
      |||||||||||||||||    
T  18099310 gcctcttcccgtaaccaag 18099328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 36012243 - 36011926
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  36012243 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaac 36012144  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||    
T  36012143 acaagcgaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgaagaaga 36012044  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    |||||||||||  || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| || |||    
T  36012043 gagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccaactaattctacccaaagtcacaa 36011944  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36011943 tctcttcccgtaaccaag 36011926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 43421260 - 43421573
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  43421260 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaagttgatgtgtggagcaagatatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaac 43421359  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| || ||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43421360 acaagccaaaagtataaaaca---gcgagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 43421455  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||    
T  43421456 gagcagccatctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaatccccaa 43421555  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  43421556 tcttttcccgtaaccaag 43421573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 18096740 - 18097058
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  18096740 tgttgcgaattcgatgaaaaattacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaa 18096839  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18096840 cacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagagaaagaagagagaacacaaaagaattcgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 18096939  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||| |||| || |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  18096940 agagcagctctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagggaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 18097039  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
      |||||||||||||||||    
T  18097040 gcctcttcccgtaaccaag 18097058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 26 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 43228693 - 43228390
Alignment:
Q  26 gatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaat 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  43228693 gatgagaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aaatacaagccaaaat 43228596  T
Q  126 tagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcc 225  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43228595 tagaaaacaacagcgagagtaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 43228496  T
Q  226 atttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgta 325  Q
      | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  43228495 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgta 43228396  T
Q  326 accaag 331  Q
    ||||||    
T  43228395 accaag 43228390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 45883357 - 45883038
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  45883357 tgttgcaaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagttaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatc 45883258  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaag----gaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggg 209  Q
    |||||||| || ||||||||| ||   |||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45883257 acaagccagaagtagaaaacagca---agagaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggg 45883161  T
Q  210 g-agagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    | ||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  45883160 ggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 45883061  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  45883060 cccaacctcttcccgtaaccaag 45883038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 32219503 - 32219183
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataa 111  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  32219503 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacacaaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataa 32219404  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| || ||    
T  32219403 acacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggaga 32219304  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatg-ttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  32219303 gagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaaaagatatcaatgggttacaaaaataagtcttccgcctaattctgcccaaagtcc 32219204  T
Q  311 caatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  32219203 caatctcttcccgcaaccaag 32219183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 331
Target Start/End: Original strand, 27101028 - 27101339
Alignment:
Q  20 gaatttgatgaaaa-atcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaag 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  27101028 gaattcgatgaaaatatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaatgaataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaag 27101126  T
Q  119 ccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagca 218  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  27101127 caaaaagtagaaaacaacagcaagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctattctgggggagagagca 27101226  T
Q  219 gccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctct 318  Q
    ||| ||| || |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27101227 gccatccgttccactatatgatgagtaacgttgcaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccattctct 27101326  T
Q  319 tcccgtaaccaag 331  Q
    ||| |||||||||    
T  27101327 tcctgtaaccaag 27101339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3315100 - 3314783
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  3315100 tgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaagcaaagtgtatggaacaattataaa 3315001  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
    |||||||||||  |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  3315000 cacaagccaaacgtagaaaaca---gcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttggggga 3314904  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||    
T  3314903 gagagcagccctccgtttcactataatgatgaataattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagccc 3314804  T
Q  311 caatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  3314803 caatctcttcctgtaaccaag 3314783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 43226495 - 43226184
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||     
T  43226495 tgttgcgaattcgatgagaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaa-gtgtatggaacaatta-aaat 43226399  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226398 acaagccaaaagtagaaa-caacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaga--atttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 43226302  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    ||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  43226301 gagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccag 43226202  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||||||||||||||||    
T  43226201 cctcttcccgtaaccaag 43226184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Original strand, 9604446 - 9604765
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||  || ||||||||     
T  9604446 ctgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaaggaataatcaagtaaccaaaccaaagtgtatgaaacaattataat 9604544  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaag--gaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggg 210  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9604545 cacaggccaaaaatagaaaacaacagcgagagaaaagaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtctaaattgacctagtctggggg 9604644  T
Q  211 agagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  9604645 agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtct 9604744  T
Q  311 caatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  9604745 caacctctttccgtaaccaag 9604765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 20 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18163074 - 18162762
Alignment:
Q  20 gaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaacacaag 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18163074 gaattcgatgaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggagtaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaag 18162975  T
Q  119 ccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagca 218  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18162974 ccaaaagtagaaaactgcagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaaaaatttgttgacacagttc-gtccaaattgacctagtctgggggagagagca 18162876  T
Q  219 gccctccatttcactatgtgatgagtaatg-ttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctc 317  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18162875 gccctccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaataaatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctc 18162776  T
Q  318 ttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||    
T  18162775 ttcccgtaaccaag 18162762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 42990717 - 42990403
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||   |||||||     
T  42990717 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatgtaag--ttataaat 42990621  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42990620 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaaaagga-gagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggag 42990522  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  42990521 agagcagccctccgattcaccatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 42990422  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
      |||||||||||||||||    
T  42990421 gcctcttcccgtaaccaag 42990403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 30 - 331
Target Start/End: Original strand, 880312 - 880609
Alignment:
Q  30 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattaga 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| |||||| ||||    
T  880312 aaaaatcacacccataacaaacttgatgtgtggagcaaggattaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaaaccaaaagtaga 880411  T
Q  130 aaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccattt 229  Q
    |||||   |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  880412 aaaca---gcgagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccattt 880507  T
Q  230 cactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaacca 329  Q
     ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  880508 tactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataactctcccgtctaattctacccaaagccccaatctctttccgtaacca 880607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 306
Target Start/End: Original strand, 27635497 - 27635791
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatga-aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27635497 tgttgcaaattcgatgagaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaa 27635596  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaag----gaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    |||||||||||| |||||||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27635597 cacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg 27635693  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  27635694 ggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattttacccaaa 27635791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 331
Target Start/End: Original strand, 1626543 - 1626841
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaa 130  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |  ||    
T  1626543 aaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaacaaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtgaaa 1626642  T
Q  131 aacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttc 230  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  1626643 aacaac-gagagagaaa-ggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatcgacctagtctgggcgagagagcagccctccgtttc 1626740  T
Q  231 actatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaa 330  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1626741 actatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccaatctctccccgtaaccaa 1626840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 30 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6484757 - 6484459
Alignment:
Q  30 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattag 128  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  6484757 aaaaatcacactaataacaaatttgatgtgtggagcaaggaataattaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtag 6484658  T
Q  129 aaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatt 228  Q
    ||||||   |||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  6484657 aaaaca---gcgagagagaat-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtt 6484562  T
Q  229 tcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaacc 328  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6484561 tcactatatgatgagtaactttacaaaaaagatatcaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaaaccccaatctcttcccgtaacc 6484462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 29 - 331
Target Start/End: Original strand, 25688015 - 25688319
Alignment:
Q  29 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaatta 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  25688015 gaaaactcacaccaataacaaactttatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattgtaaacacaagccaaaagta 25688114  T
Q  128 gaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccat 227  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  25688115 gaaaacatcaacgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaactttttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgt 25688214  T
Q  228 ttcactatgtgatgagtaatg-ttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaa 326  Q
    |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||    
T  25688215 ttcactatatgatgcgtaacgtttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaa 25688314  T
Q  327 ccaag 331  Q
    |||||    
T  25688315 ccaag 25688319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Original strand, 47148744 - 47149053
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  47148744 ctgttgtgaatttgatgaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtg-------ggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaa 47148836  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  47148837 cacaagtcaaaagtagaaaacaac-gagagagaaa-ggaagagagaacacagaataatttgttgacctagttcgggccaaattgacatagtctgggggag 47148934  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  47148935 agagcagtcctctgtttcactatatgatgagtaacgatacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagaccca 47149034  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||    
T  47149035 atctcttcccgtaaccaag 47149053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 51674608 - 51674924
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatga-aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||  |  | |||| ||| || ||||||    
T  51674608 tgttgtgaattcgatgagaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaagcaaccaaacaagtgggtatggaacaaatataaa 51674707  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  51674708 cacaagccaaaagtagaaaacagc-gagagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctggtatgggggag 51674805  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  51674806 agagcagccctccatttcagtatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaatccca 51674905  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  51674906 atctcttctcgtaaccaag 51674924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1321897 - 1321578
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||  ||     
T  1321897 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aat 1321801  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1321800 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg 1321701  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  1321700 ggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 1321601  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||  ||||||| |||||||||    
T  1321600 cccagcctcttcctgtaaccaag 1321578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24980127 - 24979806
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataa 111  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  24980127 ctgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataa 24980028  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaa-caacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggg 210  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  24980027 acacaagccaaaagtagaaaaacaacaacgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttggggg 24979928  T
Q  211 agagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatg-ttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatc 309  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||| |||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  24979927 agagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaaaagatattaatttgttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtc 24979828  T
Q  310 ccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||| |||||||||||    
T  24979827 tcaatctctttccgtaaccaag 24979806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Original strand, 12267818 - 12268122
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12267818 ctgttgtgaactcgatgaaaaattacaccaataacaaatttgatgtgtggagcagggaatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaa 12267917  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||   ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  12267918 cacaagccaaaagtagaaaacaa---cgagagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtttgggggag 12268014  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  12268015 agagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagag-----------ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca 12268103  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12268104 atctcttcccgtaaccaag 12268122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 32 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 38890441 - 38890139
Alignment:
Q  32 aaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaa 130  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||  || ||||||||||| |||||    
T  38890441 aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta--aatacaagccaaaagtagaa 38890345  T
Q  131 aacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcc 225  Q
    |||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38890344 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctcc 38890245  T
Q  226 atttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgta 325  Q
      | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38890244 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgta 38890145  T
Q  326 accaag 331  Q
    ||||||    
T  38890144 accaag 38890139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Original strand, 10084228 - 10084547
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||  ||    
T  10084228 ctgttgcgaatccgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgggacaatta--aa 10084323  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10084324 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttg 10084423  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  10084424 gggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaacgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaag 10084523  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||  |||||||||||||||||    
T  10084524 tcccagcctcttcccgtaaccaag 10084547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 10955867 - 10956185
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||     
T  10955867 tgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aat 10955962  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  10955963 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggt 10956062  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  10956063 ggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 10956162  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    | ||  |||||||||||||||||    
T  10956163 ctcagcctcttcccgtaaccaag 10956185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 43 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 51943758 - 51943470
Alignment:
Q  43 ataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgag 142  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||    
T  51943758 ataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtttggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag 51943662  T
Q  143 agaaaag----gaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtg 238  Q
    |||||||    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  51943661 agaaaagaagagaagagagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactatatg 51943562  T
Q  239 atgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||    
T  51943561 atgagtaacgttacaaaagagacgtcaatgagttacaagaa-aagtctcccgcctaattctacctaaagccccaatctcttctcgtaaccaag 51943470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 331
Target Start/End: Original strand, 5926615 - 5926922
Alignment:
Q  20 gaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagc 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  5926615 gaattcgatgaaaactcacaccaataacaaacttcatgtgtgaagtaaggaataatcaagtaaccaaaacaaagtgtaaggaacaattataaacacaagc 5926714  T
Q  120 caaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcag 219  Q
     |||| ||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5926715 -aaaagtagaaaacaac-gagagagaaa-ggaaaagagaacacaaag-aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcag 5926810  T
Q  220 ccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctctt 319  Q
     | ||| ||||| ||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5926811 tcatccgtttcattatatgatgagtaaccttacaaaagatatataaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctctt 5926910  T
Q  320 cccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||    
T  5926911 cccgtaaccaag 5926922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 53468295 - 53468614
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatga-aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |  |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  53468295 tgttgcaaattcgatgagaaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaatgaataatggagcagccaaaacaaagtgtatggaacaattataaa 53468394  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagt--ctaggg 209  Q
    |||||| ||||| ||||||| |   |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  53468395 cacaagtcaaaagtagaaaata---gcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtctgggg 53468491  T
Q  210 gagagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  53468492 ggtagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagt 53468591  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  53468592 cccaatctctccccgtaaccaag 53468614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 5886601 - 5886298
Alignment:
Q  29 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattag 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||    
T  5886601 gaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataaacaagcaaccaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 5886504  T
Q  129 aaaacaaca---gcgaga-gaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctc 224  Q
    |||||||||   || ||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5886503 aaaacaacaacagcaagaagaaaaagaatagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 5886404  T
Q  225 catttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgt 324  Q
    |  | |||||| |||||||||| ||| | ||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5886403 cgatccactatatgatgagtaacgtttc-aaagacaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgt 5886305  T
Q  325 aaccaag 331  Q
    |||||||    
T  5886304 aaccaag 5886298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 5900074 - 5899771
Alignment:
Q  29 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattag 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||    
T  5900074 gaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataaacaagcaaccaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 5899977  T
Q  129 aaaacaacagcg---aga-gaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctc 224  Q
    |||||||||||    ||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5899976 aaaacaacagcagcaagaagaaaaagaatagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 5899877  T
Q  225 catttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgt 324  Q
    |  | |||||| |||||||||| ||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  5899876 cgatccactatatgatgagtaacgttgc-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatcacttcccgt 5899778  T
Q  325 aaccaag 331  Q
    |||||||    
T  5899777 aaccaag 5899771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25533842 - 25533542
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||     
T  25533842 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagata-tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aat 25533747  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||            ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25533746 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgaga------------agaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctaggggaga 25533659  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    ||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||     
T  25533658 gagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcag 25533559  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaa 330  Q
     ||||||||||||||||    
T  25533558 cctcttcccgtaaccaa 25533542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 28101848 - 28102160
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||  ||    
T  28101848 tgttgtgaattcgatgaaaaattacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtggatagca--atta--aa 28101943  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
    ||||| |||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  | |||||    
T  28101944 cacaacccaaaagtagaaaaca---gcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtttggtccaaattgacctagctttgggga 28102040  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    |||||||||| ||| || |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  28102041 gagagcagccatccgttccactatatgataagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccc 28102140  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28102141 aatctcttcccgtaaccaag 28102160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Original strand, 32263880 - 32264197
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  32263880 ctgttgtgaattcgaagaaaaatcacactaataacaaatttgatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaa 32263979  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
    |||||||||||| |||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  32263980 cacaagccaaaagtagaa---aacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaa-ttgttgatccagtttggtccaaatagacctagtctggggga 32264075  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttac-aaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatc 309  Q
    |||||||||||||| || ||||||  ||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |     
T  32264076 gagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagtt 32264175  T
Q  310 ccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||  |||||||| ||||||||    
T  32264176 ccagcctcttcccataaccaag 32264197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 303
Target Start/End: Original strand, 47701522 - 47701801
Alignment:
Q  16 ttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacac 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  47701522 ttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtg---atcaagtaataatcaagcaacgaaaacaaagtgtatggaacaattatgaacac 47701618  T
Q  116 aagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||||| ||||||||||    |||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  47701619 aagccaaaagtagaaaacaat---gagagaaa-ggaa-agagaacgcaaaagaatttgttgatccagttcgatccaaattgacctaatctgggggagaga 47701713  T
Q  216 gcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctaccc 303  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47701714 gcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccc 47701801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25389326 - 25389005
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  25389326 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcataccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataatta--aa 25389230  T
Q  113 cacaagccaaaat-tagaaaacaacagcgaga-gaa----aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct 205  Q
     |||||||||||  ||||||||||| |||||| |||    || ||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25389229 tacaagccaaaaagtagaaaacaacggcgagaagaatacaaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 25389130  T
Q  206 aggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaa 305  Q
     |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25389129 gggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaatatgtctcccgcctaattctacccaa 25389031  T
Q  306 aatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  25389030 agtcccaatctcttcccgtaaccaag 25389005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11168519 - 11168200
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  ||    
T  11168519 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta--aa 11168424  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagag----aaaaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||||     |||| ||||||| |||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |    
T  11168423 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgaccaagtttggtccaaattgacctagtctgg 11168324  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    |||||||||||||||||| || || ||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  11168323 gggagagagcagccctccgttccaatatatgataagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaat 11168224  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||  |||||||||||||||||    
T  11168223 tcccagcctcttcccgtaaccaag 11168200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4666922 - 4666616
Alignment:
Q  20 gaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagc 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| |||  ||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||| |    
T  4666922 gaatttgaagaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggagtaagtgattatcatgcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataaaaacaaac 4666823  T
Q  120 caaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcag 219  Q
    ||||| || |||||| | | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||    
T  4666822 caaaagtataaaacagc-gagagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct---ggggagagcag 4666728  T
Q  220 ccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataag--tctaccgcctaattctacccaaaatcccaatct 316  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  4666727 ccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatggattacaagaataaggatctcccgcctaattctacccaaagtctcaatct 4666628  T
Q  317 cttcccgtaacc 328  Q
    ||||||||||||    
T  4666627 cttcccgtaacc 4666616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 5522466 - 5522784
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||    
T  5522466 tgttgcgaattcgttgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgta-agaa-agttataaa 5522561  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  5522562 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgc 5522661  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  5522662 gggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 5522760  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||  |||||||||||||||||    
T  5522761 tcccagcctcttcccgtaaccaag 5522784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 10958163 - 10958481
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||     
T  10958163 tgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaatta--aat 10958258  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10958259 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacataaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg 10958358  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  10958359 ggagagagcagccctccgttccactatatgaagagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 10958458  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
      ||  |||||||| ||||||||    
T  10958459 gtcagcctcttcccataaccaag 10958481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 747177 - 746857
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  747177 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtat-gaa-agttataaa 747081  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||     
T  747080 tacaagccaaaagtagaaaacaactgcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctg 746981  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    ||||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  746980 ggggagagagcagtcctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 746882  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  746881 gtcccaatctcttcccgtaaccaag 746857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 6065633 - 6065953
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  6065633 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagtgtat-gaa-agttataaa 6065729  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa----aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||    ||| | |||| |||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  6065730 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaaggagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttctgtccaatctgacctagtcta 6065829  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||   |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6065830 ggggagagagcagccatccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 6065928  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  6065929 gtcccaatctcttcccgtaaccaag 6065953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6232208 - 6231900
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| || ||    || |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  6232208 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacactaataacaaatttgatgtgtggagtaa----taatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaac 6232114  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||| ||||| || ||||||   |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  6232113 acaagtcaaaaataaaaaaca---gcgagagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatcggggggaga 6232017  T
Q  214 gagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
     |||||||||||  |||||| |  |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6232016 cagcagccctcc-gttcactgtaatgatgagtagctttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccc-aaatccca 6231919  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6231918 atctcttcccgtaaccaag 6231900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 53591597 - 53591283
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| |||||  |||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  53591597 tgttgtgaattcaatgagaaaacacatcaataacaaatttgatgtgtggaacaagggataatcaagcaaccaaaacaaaatgtatggaacaattataaac 53591498  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataat--ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
    | ||| |||||  ||||||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||   ||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  53591497 ataagtcaaaagcagaaaaca---gcgagagaaaag-aagagagaatacaaaaaaaaaattgttgacctagttcgatccaaattgacctagtct-gggga 53591403  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  53591402 gagagcatcccttcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaatgagatatcaatggattagaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcca 53591303  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||| ||| ||||||||||    
T  53591302 aatctattctcgtaaccaag 53591283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3307177 - 3306860
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaa-cttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattata 110  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  || |||||||    
T  3307177 ctgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaaacttgatgtatgaagcaagggataatcaaacaatcaaaaacaaagtgtatgaaacaattata 3307078  T
Q  111 aacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggg 209  Q
    |||||||||||||| |||||||||   |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||     
T  3307077 aacacaagccaaaagtagaaaaca---gcgaaagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtctagg- 3306982  T
Q  210 gagagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
     |||||||| || ||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  3306981 -agagagcaaccatccttttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaaac 3306883  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||| |||| | |||||||||    
T  3306882 tccaatatctttctgtaaccaag 3306860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 10621366 - 10621687
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatagaataattataa 111  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||    
T  10621366 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaaccaaagtgtat-gaa-agttataa 10621462  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct 205  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||    
T  10621463 atacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgagctagtct 10621562  T
Q  206 aggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaa 305  Q
     |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10621563 gggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaa 10621661  T
Q  306 aatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  10621662 agtcccaatctcttcccgtaaccaag 10621687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23633862 - 23633553
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  23633862 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataa-atactagatgtgtgaagcaagtgaaaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaat--ttataaac 23633766  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    |||||||| || ||||||||| |   |||||||| | |||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23633765 acaagccacaagtagaaaacatc---gagagaaa-gaaagagagaacacaaaagaatttgtttacccatttcggtctaaattgacctagtct-ggggaga 23633671  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  23633670 gagcagccctccttttcactataatgatgagtaactttacaaa-gagatatcatcgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtctca 23633572  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  23633571 atctcttcccgtgaccaag 23633553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 50494417 - 50494099
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||     
T  50494417 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataatta--aat 50494321  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  || |||||   ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  50494320 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggg 50494221  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||   |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  50494220 ggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagt 50494122  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  50494121 cccaatcccttcccgtaaccaag 50494099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 54691417 - 54691731
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||  || ||||||||||    
T  54691417 tgttgtgaattcgatgagaaaacacatcaataacaaattt-atgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaaatgtatgaaacaattataaac 54691515  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||| |||| |||| ||||||| || | ||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  54691516 acaagccaaaagtagaaaacaaccgagagagaaa-ggaagagaaaacataaaagaatttgtcgacctagttcagttcaaattgacatagtctaggggaga 54691614  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  || ||    
T  54691615 gagcagccctccgtttaactatatgatgggtaacgttacaaaagagatatcaatgaaatacaagaataagtctcccgcctaattcaactcaaagccctaa 54691714  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaa 330  Q
    ||||||||| |||||||    
T  54691715 tctcttcccataaccaa 54691731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 5192066 - 5191752
Alignment:
Q  16 ttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacac 115  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || ||    
T  5192066 ttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aatac 5191971  T
Q  116 aagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggg 210  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5191970 aagccaaaagtagaaaacaatggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-gggg 5191872  T
Q  211 agagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
    ||||| ||||||||   | |||||| |||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  5191871 agagaacagccctctgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaatgagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 5191773  T
Q  311 caatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||  |||||||||||||||||    
T  5191772 cagcctcttcccgtaaccaag 5191752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 120 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 30006151 - 30005940
Alignment:
Q  120 caaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcag 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  30006151 caaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctaatctaggggagagagcag 30006052  T
Q  220 ccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctctt 319  Q
    |||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  30006051 ccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctt 30005952  T
Q  320 cccgtaaccaag 331  Q
    | ||||||||||    
T  30005951 ctcgtaaccaag 30005940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 458702 - 458384
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||     
T  458702 tgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtat-gaa-agttataaat 458607  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || |||||   ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  458606 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgg 458507  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||   |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  458506 gggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 458408  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  458407 tcccaatctcttcccgtaaccaag 458384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17795670 - 17795357
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||   ||||||     
T  17795670 ctgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggagcaactgatagtcaagcaaccaaaataaaatgtatggaag--ttataat 17795573  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    ||||| | |||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | | | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17795572 cacaaac-aaaagtagaaaacaac---gagagaaaagaaagagagaacacaagagaatttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggag 17795477  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |    
T  17795476 agagcagccttccgtttcattataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagcctc 17795377  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||| |||| ||||||    
T  17795376 aatctctttccgtgaccaag 17795357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 19104110 - 19103797
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||   ||||||     
T  19104110 ctgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggagcaactgatagtcaagcaaccaaaataaaatgtatggaag--ttataat 19104013  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    ||||| | |||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | | | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19104012 cacaaac-aaaagtagaaaacaac---gagagaaaagaaagagagaacacaagagaatttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggag 19103917  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |    
T  19103916 agagcagccttccgtttcattataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagcctc 19103817  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||| |||| ||||||    
T  19103816 aatctctttccgtgaccaag 19103797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 41849470 - 41849242
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||     
T  41849470 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtat-gaa-agttataaat 41849375  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41849374 acaagccaaaagtagaaaacaac-gagagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 41849276  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaat 247  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  41849275 gagcagccctctgtttcactatatgatgagtaat 41849242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Original strand, 10191151 - 10191467
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||  ||    
T  10191151 ctgttgcgaatctgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgggacaatta--aa 10191246  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  10191247 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaa--taatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctta 10191344  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| || || || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  10191345 gggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatgaacgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaag 10191444  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    | |||  ||||||| |||||||||    
T  10191445 t-ccagcctcttcctgtaaccaag 10191467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 41 - 327
Target Start/End: Original strand, 48361538 - 48361825
Alignment:
Q  41 caataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcg 140  Q
    ||||||||||||| |||| || | ||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||   |    
T  48361538 caataacaaacttaatgtatggaacaatgaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagtcaaaagtagaaaacaac---g 48361634  T
Q  141 agagaaaag----gaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    |||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||     
T  48361635 agagaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttttactata 48361734  T
Q  237 tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaac 327  Q
    | |||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  48361735 ttatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagccccaatctcttcccgtaac 48361825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 456325 - 456007
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||     
T  456325 tgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtat-gaa-agttataaat 456230  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || |||||   ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||   |||||||||| |    
T  456229 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaacccgacctagtctgg 456130  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||   |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  456129 gggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 456031  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  456030 tcccaatctcttcccgtaaccaag 456007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 51726847 - 51727165
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||  ||    
T  51726847 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggggcaaga-ataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta--aa 51726941  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  51726942 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgg 51727041  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  51727042 gggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 51727141  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    || ||  ||||| |||||||||||    
T  51727142 tctcagcctcttaccgtaaccaag 51727165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 4103736 - 4104053
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||   |||||||     
T  4103736 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgcgtggagcaagg-atagtcaaacaaccgaaaaaaagtgtatggaag--ttataaat 4103831  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||| | ||||| || |||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4103832 acatgtcaaaagtaaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg 4103931  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4103932 ggagatagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 4104030  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  4104031 cccagcctcttcccgtaaccaag 4104053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 6063283 - 6063603
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||    
T  6063283 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccgataacaa-cttgatgtgtggaacaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtat-gaa-agttataaa 6063379  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa----aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||    ||| | |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||     
T  6063380 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaaggagaagaacacaaagaaatttgtggacccagttcggtccaatctgacctagtctg 6063479  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||   |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6063480 ggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 6063578  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  6063579 gtcccaatctcttcccgtaaccaag 6063603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15781294 - 15780970
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  15781294 ctgttgtgaattcgatggaaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaggcaaaataaagtgtatggaacagttataaa 15781195  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15781194 cacaagtcaaaagtagaaaacaac-gagagagaaaa-gaagagagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggag 15781097  T
Q  213 agagca---gccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagag----atatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctaccca 304  Q
    ||||||   ||||| | || ||||||  |||| | |||  |||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  15781096 agagcaggcgcccttcgttccactataatgataaataactttacaaaagagaaatatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctaccga 15780997  T
Q  305 aaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    || || ||  |||||||||||||||||    
T  15780996 aagtctcagcctcttcccgtaaccaag 15780970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 52 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26720928 - 26720646
Alignment:
Q  52 ttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---a 147  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||| ||||||| |||  ||||| |||   |    
T  26720928 ttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaatacaagccaaaagtagaaaagaacgacgagaagaacaca 26720831  T
Q  148 aggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaa 246  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||     
T  26720830 aagaagagaagaacacaaaagaatttggtgacccagttcggtccaaattgacctaatctaggggagagagcagtcatccgttccactatatgatgagtat 26720731  T
Q  247 tgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  26720730 cgttacaaaagagaaatcaaagggttaaaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaag 26720646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 38210789 - 38210470
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||| ||| |||||||||| |||| |||||||||  ||     
T  38210789 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggattatcaaacaaacaaaacaaagcgtatggaataatta--aat 38210693  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||  ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| | |    
T  38210692 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaggaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgg 38210593  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||   |||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  38210592 gggagagagcagctctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 38210494  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  38210493 tctcaatctcttcccgtaaccaag 38210470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 39715883 - 39715568
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatga-aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaaca--aagtgtatagaataattata 110  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||| |  |||||||| ||| |||||||    
T  39715883 tgttgtgaattcgatgagaaaaccgcaccaataacaaacttgatgtgtacagtaagggatagtctagtaacaaaaaaataaagtgtatggaacaattata 39715784  T
Q  111 aacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggg 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | | |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||| ||| ||||| | ||||    
T  39715783 aacacaagccaaaagtagaaaacagc-gagagagaaaggaaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtttggtccaaaatgatctagtatggggg 39715685  T
Q  211 agagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
    ||||  || || ||  ||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  39715684 agag--caaccatctgtttcactatg--atgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttgcaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 39715589  T
Q  311 caatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  39715588 caatctcttcccgtaaccaag 39715568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 22114143 - 22114463
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  22114143 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaatagcaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtat-gaa-agttataaa 22114238  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaa-cagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     ||||||||||| ||||||| || | |||||| |||   ||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || | || |     
T  22114239 tacaagccaaaagtagaaaaaaaacggcgagaagaacacaaaaaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttactttgtttg 22114338  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    ||||||||| || ||||||  |||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22114339 ggggagagatcatccctccgattcattatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 22114438  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||  |||||||||||||||||    
T  22114439 atcccagcctcttcccgtaaccaag 22114463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3859914 - 3859627
Alignment:
Q  29 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattag 128  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| ||||||||||| |||    
T  3859914 gaaaagtcacaccaataacaa-cttgatgtgtggaataagggatagttaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta-aaatacaagccaaaagtag 3859817  T
Q  129 aaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatt 228  Q
    |||||||| ||||||            ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |    
T  3859816 aaaacaacggcgaga------------agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctacgat 3859729  T
Q  229 tcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaacc 328  Q
     |||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||    
T  3859728 ccactatatgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaacc 3859630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 7606443 - 7606745
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  ||    
T  7606443 tgttgcaaattcgatgaaaaat-acaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta--aa 7606538  T
Q  113 cacaagccaaaat-tagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
     ||| |||||||  ||||||||||||||||||            ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7606539 tacaggccaaaaagtagaaaacaacagcgaga------------agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggga 7606626  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    ||||||||||||||  | |||||| ||| |||||| ||||| ||| ||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  7606627 gagagcagccctccgatccactatatgacgagtaacgttac-aaatagaaatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc 7606725  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |  |||||||||||||||||    
T  7606726 agcctcttcccgtaaccaag 7606745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 28412870 - 28413189
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||| | |||||||     
T  28412870 tgttgtgaattcgatgaaaaaacacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagtaaccaaaacaa-gtgtat-gaa-agttataaat 28412965  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagag--agaacacaaaataa-tttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||   || |||||   ||||||||||| || |||||||| | | ||||||||||  |||||||||||     
T  28412966 acaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaaagaaatttgttgacctaattcggtccaatctgacctagtctg 28413065  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||   |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28413066 ggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 28413164  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  28413165 gtcccaatctcttcccgtaaccaag 28413189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 156 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11170678 - 11170503
Alignment:
Q  156 agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaa 255  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||    
T  11170678 agaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 11170579  T
Q  256 agagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  11170578 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaag 11170503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 31151754 - 31151444
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||    
T  31151754 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataa-atacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataaac 31151658  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtcc-aaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||  || | ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| | ||||||| | || ||| ||||||||||| ||||||    
T  31151657 acaag-taagagtagaaa--aacagcgagagaaaa-gaagagagaacacatgagaatttgtttacccagttcagcccaaaactgacctagtctgggggag 31151562  T
Q  213 agagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    ||||||||||||| || ||||||    ||||||||  |||||||||||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  31151561 agagcagccctccgttccactataacaatgagtaactttacaaaagagatatca--gggttacaagaataagtcacccgcctaattctacccaaagtccc 31151464  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||| ||||||| ||||||    
T  31151463 aatcttttcccgtgaccaag 31151444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 28761287 - 28761587
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| |||  ||||||| |    
T  28761287 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataataatcttgatgtgtggagcaagtgataatcaaacaaccaaaataaagtgtatggaa--attataatc 28761384  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaa-ttgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||| |||| |||||||||||                ||||||| |||||| |||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  28761385 acaagc-aaaagtagaaaacaac----------------gagagaaaacaaaagaatttgtttacccagttcgatccaaaattgacctagtctgggggag 28761467  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    ||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| || |    
T  28761468 agagcagtcctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtatcccgcctaattctacctaaagtctc 28761567  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||| |||||| |||||||||    
T  28761568 aatatcttcctgtaaccaag 28761587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 106 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 42992594 - 42992418
Alignment:
Q  106 ttataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtc 204  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42992594 ttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaaaagga-gagagaacacaaaaaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc 42992496  T
Q  205 taggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataa 282  Q
    | |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  42992495 tgggggagagagcagccccccgattcactatatgatgactaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 42992418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 226
Target Start/End: Original strand, 53893910 - 53894110
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattag-a 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||| |    
T  53893910 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataattaaataca-aagccaaaagtagaa 53894007  T
Q  130 aaacaacagcgag-agaa---aaggaaga--gagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccct 223  Q
    ||||||| ||||| ||||   || |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53894008 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccct 53894107  T
Q  224 cca 226  Q
    |||    
T  53894108 cca 53894110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 331
Target Start/End: Original strand, 561640 - 561935
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaa 130  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| || |||  ||| ||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||| |||| |||||    
T  561640 aaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagtaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaag--ttataaacacaagc-aaaagtagaa 561735  T
Q  131 aacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctag-gggagagagcagccctccatt 228  Q
    |||| |   ||||||| || ||||||||||||   | |||||||| | || ||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||| | ||    
T  561736 aacatc---gagagaagagaaagagagaacacgtga-aatttgtttacccggttcggtccaaaactgacctagtctggagggagagagcagcccttcgtt 561831  T
Q  229 tcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaac 327  Q
     ||||||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||    
T  561832 ccactataatgatgagtaactttacaaaaaagatatcaatgacttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtctcaatctcttcacgtgac 561931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 179 - 331
Target Start/End: Original strand, 889779 - 889930
Alignment:
Q  179 ccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaaga 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  889779 ccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagaaatcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcagtgggttacaaga 889878  T
Q  279 ataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  889879 ataactctcctgcctaattctacccaaagccccaa-ctcttcccgtaaccaag 889930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 173 - 331
Target Start/End: Original strand, 35917944 - 35918101
Alignment:
Q  173 gttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggatt 272  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||| |||| || |||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  35917944 gttgatccagttcggtctaaattgacc-agtctgagggagagagcagctctccgttccactatataatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtt 35918042  T
Q  273 acaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  35918043 acaagaataagtctccctcctatttctacccaaattcccagtctcttctcgtaaccaag 35918101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25635788 - 25635480
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||| |||| |||  ||  | | ||||||||    
T  25635788 tgttgtgaattcgatgaaaa-tcacactaataa-atacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaatacaa-gtgggta--acagttataaac 25635694  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaac-agcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||| |||| ||||||||||| || || |||||  |||||||  |||| ||||   ||||| |  ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||    
T  25635693 acaagc-aaaagtagaaaacaacgagtgaaagaaa--gaagagaacacacgaaat---ttgtttacgcagtttggtccaaattggcctagccgaggggag 25635600  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    |||||| |||||  |||||| ||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  25635599 agagcaaccctctgtttcaccataatgatgagtaactttacaaaatagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtctc 25635500  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  25635499 aatctcttcccgtgaccaag 25635480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 28181401 - 28181242
Alignment:
Q  30 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattaga 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28181401 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagg-acaatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtaga 28181303  T
Q  130 aaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa 192  Q
    ||||| | |  |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||||    
T  28181302 aaacagc-gacagagaaaa-gaagagagaacacaggagaatttgttgacctagttcggtccaa 28181242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 209 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 29956907 - 29956785
Alignment:
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  29956907 ggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 29956808  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||  |||||| ||||||||||    
T  29956807 cccagcctcttctcgtaaccaag 29956785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 253 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6561987 - 6561909
Alignment:
Q  253 aaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6561987 aaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaag 6561909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25634294 - 25634031
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||| ||||| | ||||||  ||| |||||||||||| |||| |||  ||  | ||||||||||    
T  25634294 tgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataa-atacttaatgtggggagcaagtaataatcaagcaaccaatacaa-gtgggta--acaattataaac 25634200  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    |||||| |||| ||||||||||||   |||| ||   | ||||||||||| || |||||||| | | |||||||| ||||||| |||||||| | |||||    
T  25634199 acaagc-aaaagtagaaaacaaca---agagtaagaaaggagagaacacacaa-aatttgtttacctagttcggtgcaaattgtcctagtctggtggaga 25634105  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtct 286  Q
    |||||||| | | |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25634104 gagcagccattcgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtct 25634031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 880087 - 880244
Alignment:
Q  17 tgcgaatttgatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacac 115  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||  ||||||||||||||  || | |||||| |||    
T  880087 tgcgaattcgatgaaaaagtcacaccaataataaacttgatgtgtggagtaaggaataatcaagcaaagaaaacaaagtgtatgaaacagttataatcac 880186  T
Q  116 aagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttga 177  Q
    || |||||| ||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  880187 aaaccaaaagtagaaaacaa---cgagagaaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttga 880244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 42992799 - 42992611
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||  | |||||||     
T  42992799 tgttgtgaattcgatgaaaa-tcacactaataacaaacttgatgtgtagagcaagggataatcagacaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataaat 42992703  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgag-agaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct 205  Q
    | | | |||||  |||||||||  ||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  42992702 atatgtcaaaagcagaaaacaatggcgagaagaaaagg-agagagaatacaaaagaattttttgactcagttcggtccaaattgacctagtct 42992611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24181665 - 24181486
Alignment:
Q  146 aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgag 243  Q
    |||| |||||||||||||  | |||||||| | ||| |||||||||||  ||||||||| | | ||||||||||| | ||| || ||||||  |||||||    
T  24181665 aaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccaattcggtccaaaactgacctagtttggaggagagagcagtcatccgttccactataatgatgag 24181567  T
Q  244 taatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgt 324  Q
    |||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24181566 taactttacaaaagaaatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccaatcttttcccgt 24181486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 331
Target Start/End: Original strand, 36871166 - 36871460
Alignment:
Q  30 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattaga 129  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| |||  |   | | |||||||||||||| |||  ||||    
T  36871166 aaaaatcacaccgataa-atacttgatgtgtggagcaaga-ataatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaacacaagcaaaagataga 36871260  T
Q  130 aaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccatt 228  Q
    |||||   |||||||||||  |||||||||||||  | |||| ||| | |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  36871261 aaaca---gcgagagaaaataaagagagaacacacga-aattcgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgtt 36871356  T
Q  229 tcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctac-cgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaa 326  Q
     ||||||  |||||| |||  |||| ||||||||| ||| || || ||||||||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  36871357 ccactataatgatgattaactttac-aaagagataacaaagggttgcaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtga 36871455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 183 - 331
Target Start/End: Original strand, 13420195 - 13420344
Alignment:
Q  183 ttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaat 280  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||| |||| || || |||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13420195 ttcggtccaaaactgacctagtct-ggtgagagagcagctctccgttccattataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaat 13420293  T
Q  281 aagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  13420294 aagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaag 13420344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 235
Target Start/End: Original strand, 35919098 - 35919177
Alignment:
Q  156 agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat 235  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  35919098 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat 35919177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 330
Target Start/End: Original strand, 1620398 - 1620619
Alignment:
Q  106 ttataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtc 204  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||   |||| ||||| | ||||||||||| || | |||||| | | |||| ||||||| | ||||||||||    
T  1620398 ttataaacacaagc-aaaagtagaaaaccac---gagataaaagaatgagagaacacacaa-agtttgttcacctagtttggtccaatactgacctagtc 1620492  T
Q  205 taggggagagagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctac-cgcctaattctacc 302  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||  |||| ||||||||||||| || |||||||||  || || |   ||||||||||||    
T  1620493 taggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaagtttac-aaagagatatcaaagggttacaagaactagccttcaaacctaattctacc 1620591  T
Q  303 caaaatcccaatctcttcccgtaaccaa 330  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1620592 caaagtcccaatctcttcccgtgaccaa 1620619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1674287 - 1674078
Alignment:
Q  104 aattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctag 202  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |   |||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| | ||||||||||| || | ||||||||    
T  1674287 aattataaacacaagaaaaaattagaaaacatc---gagagaaaagaaagagagaatacacaa-aatttgtttacccagttcggtctaatactgacctag 1674192  T
Q  203 tctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacc 302  Q
    ||| | ||||||||||||| ||| || ||  |        ||||  |||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||    
T  1674191 tctggtggagagagcagccatccgttccaaaa--------gtaactttacaaaagacatatcaaagggttacacgaataagtctcccgtctatttctacc 1674100  T
Q  303 caaaatcccaatctcttcccgt 324  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  1674099 caaagtcccaatctcttcccgt 1674078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 53597644 - 53597350
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||| ||||||| |||||   ||| |||||||||||| | ||| |||    ||| |||||||||    
T  53597644 tgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataaaatactttatgtgtggagcaaa--ataatcaagcaaccaatatcaacgtgg---gaagaattataaa 53597551  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctagggga 211  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||   | |||||||||||  | |||| | | | ||| |||||||||| | ||||||||| |  ||||    
T  53597550 cacaagcaaaaat-agaaaacaac---gagagaaagaaaggagagaacacacga-aattagcttacccaattcggtccaatactgacctagtttgtggga 53597456  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||  |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||     
T  53597455 gagagcaaccctccattccactataatgatgagtaactttacaaaagaaatatcaacgggttacaagaataagtctcttgcctaattctactcaaaatct 53597356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 271 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 35777581 - 35777521
Alignment:
Q  271 ttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35777581 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaag 35777521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 11170788 - 11170670
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||    
T  11170788 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacattaataacaa-cttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaataat--taaa 11170693  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaa 135  Q
     ||||||||||| ||||||||||    
T  11170692 tacaagccaaaagtagaaaacaa 11170670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 193
Target Start/End: Original strand, 8183035 - 8183154
Alignment:
Q  70 gatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataa 169  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||   ||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  8183035 gatagtcaagcaaccaaaataaggtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaactgca---agagaaaaa-aagagagaacacaaaagaa 8183130  T
Q  170 tttgttgatccagttcggtccaaa 193  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||    
T  8183131 tttgttgacccaattcggcccaaa 8183154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 253 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 23637200 - 23637131
Alignment:
Q  253 aaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttccc 322  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  23637200 aaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctaatatcttccc 23637131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 330
Target Start/End: Original strand, 28100143 - 28100198
Alignment:
Q  275 aagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaa 330  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28100143 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaa 28100198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 28181177 - 28181122
Alignment:
Q  275 aagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaa 330  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28181177 aagaatacgtctcccgcctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaa 28181122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 54884347 - 54884254
Alignment:
Q  237 tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||  |||| |  ||||||||| | |||||||||    
T  54884347 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatagattacaa-aataagtctccctcctaattctattcaaagtttcaatctctttctgtaaccaag 54884254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1736388 - 1736323
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1736388 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatg 1736323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 279
Target Start/End: Original strand, 11007545 - 11007630
Alignment:
Q  195 tgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaa 279  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||| |  |||||||||    
T  11007545 tgacctagtctaggggagagaggagccccccattccactataatgatgagtaactttacaaaagagatgtcaaagagttacaagaa 11007630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18552966 - 18552901
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18552966 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatg 18552901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 331
Target Start/End: Original strand, 28137415 - 28137464
Alignment:
Q  282 agtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28137415 agtcttccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaag 28137464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28181241 - 28181185
Alignment:
Q  176 gatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcact 233  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  28181241 gatccagttcagtccaaattgacctagtcta-gggagagagcagccttccgtttcact 28181185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30709873 - 30709808
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  30709873 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatg 30709808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33386749 - 33386684
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  33386749 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatg 33386684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8370569 - 8370504
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  8370569 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatg 8370504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Original strand, 27452962 - 27453027
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  27452962 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcagctctccaatccactatg 27453027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27975035 - 27974970
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  27975035 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatg 27974970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27986529 - 27986464
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  27986529 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatg 27986464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 320
Target Start/End: Original strand, 14634506 - 14634590
Alignment:
Q  237 tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctac-cgcctaattctacccaaaatcccaatctcttc 320  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |   |||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  14634506 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaggtttacaagaatcagtcttcaaacctaatgctacccaaagtctcaatctcttc 14634590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 47923989 - 47923937
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccct 223  Q
    ||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47923989 ttgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagagagcagccct 47923937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1417573 - 1417518
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcca 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  1417573 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctcca 1417518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3716085 - 3716030
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcca 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  3716085 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagctctcca 3716030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 236
Target Start/End: Original strand, 48438228 - 48438283
Alignment:
Q  181 agttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  48438228 agttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatg 48438283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Original strand, 16264354 - 16264419
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  16264354 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatg 16264419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 220
Target Start/End: Original strand, 21711227 - 21711276
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagc 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21711227 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 21711276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Original strand, 32143325 - 32143390
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  32143325 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatg 32143390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 36957703 - 36957651
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaacc 84  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36957703 aaaatcatatcaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaacc 36957651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Original strand, 40844656 - 40844708
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctc 224  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  40844656 ttgttgattcagttcggtccaatatgacctaatct-ggggagagagcagccctc 40844708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 29682527 - 29682483
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  29682527 ttgttgacccagttcggtccaacttgatctaatctaggggagaga 29682483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 40913461 - 40913417
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  40913461 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 40913417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 44331713 - 44331669
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  44331713 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 44331669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 46173525 - 46173481
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  46173525 ttgttgatctagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 46173481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 98)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 13099317 - 13099636
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13099317 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatcgtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaac 13099416  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13099417 acaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 13099516  T
Q  214 gagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttac-aaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||    
T  13099517 gagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagcccc 13099616  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13099617 aatctcttcccgtaaccaag 13099636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 27306076 - 27306390
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  27306076 tgttgcgaattcgatgagagatcacaccaataacaaacttgatgtgtggaacaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatc 27306175  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27306176 acaagccaaaagaagaaaacaacagcgagagaaaag-aagagagaacacaaga--atttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggaga 27306272  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||     
T  27306273 gagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttgcaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccag 27306372  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||||||||||||||||    
T  27306373 cctcttcccgtaaccaag 27306390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 44725022 - 44724708
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaata-attataaa 112  Q
    ||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  44725022 tgttgcgaattcgatgggaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacatattataaa 44724923  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||   |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44724922 cacaagccaaaagtagaaaacaac---gagagaaatg-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggag 44724827  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  44724826 agagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 44724727  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
      |||||| ||||||||||    
T  44724726 gcctcttctcgtaaccaag 44724708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 29 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 444027 - 443724
Alignment:
Q  29 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattag 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  444027 gaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtattgaacaattataatcacaagccaaaagtag 443928  T
Q  129 aaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggg-agagagcagccctcca 226  Q
    |||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |     
T  443927 aaaacagc-gagagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcgggggggagagagcagcccttcg 443829  T
Q  227 tttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaa 326  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  443828 tttcactatatgatgagtaacgttataaaagagatatcaatggattacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaa 443729  T
Q  327 ccaag 331  Q
     ||||    
T  443728 tcaag 443724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 4295781 - 4296094
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  4295781 tgttgcaaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaatcatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaataataaac 4295880  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| |||||||     |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4295881 acaagccaaaagtagaaaatg---gcgagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttcacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaga 4295976  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
     ||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4295977 tagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaa 4296076  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4296077 tctcttcccgtaaccaag 4296094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20626481 - 20626167
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||     
T  20626481 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacct-gatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaag--ttataaat 20626385  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20626384 ataagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagatgagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 20626285  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    ||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||     
T  20626284 gagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccag 20626185  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||||||||||||||||    
T  20626184 cctcttcccgtaaccaag 20626167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20630372 - 20630058
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||     
T  20630372 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacct-gatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaag--ttataaat 20630276  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20630275 ataagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagatgagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 20630176  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    ||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||     
T  20630175 gagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccag 20630076  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||||||||||||||||    
T  20630075 cctcttcccgtaaccaag 20630058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20642791 - 20642477
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||     
T  20642791 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacct-gatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaag--ttataaat 20642695  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20642694 ataagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagatgagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 20642595  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    ||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||     
T  20642594 gagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccag 20642495  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||||||||||||||||    
T  20642494 cctcttcccgtaaccaag 20642477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 324
Target Start/End: Original strand, 42330845 - 42331150
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  42330845 ctgttgcgaattcgatgagaaatcacgccaataataaacttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaa 42330944  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||||||||| |||||||||   |||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  42330945 cacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagagaa---agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggag 42331038  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||  |||||||| ||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  42331039 agaatagccctccgtttcactatataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 42331138  T
Q  313 atctcttcccgt 324  Q
    ||||||||||||    
T  42331139 atctcttcccgt 42331150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 38394434 - 38394115
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||     
T  38394434 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aat 38394338  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38394337 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg 38394238  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  38394237 ggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 38394138  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  38394137 cccagcctcttcccgtaaccaag 38394115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Original strand, 21591988 - 21592303
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||  | ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  21591988 ctgttgcgaattcgatgagaaaacacggctataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaa-aaagtgtatggaacaattataaa 21592086  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21592087 cacaagccaaaagtagaaaacagc-gagagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggag 21592184  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  21592185 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtccca 21592284  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  21592285 atctcttcgcgtaaccaag 21592303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 31434892 - 31435207
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatga-aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||  ||| |||||||||    
T  31434892 tgttgcgaattcgatgagaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaatcaaaataaagtgtaaggaacaattataaa 31434991  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  31434992 cacaagccaaaagtagaaaacaa---cgagagaaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttgggggag 31435087  T
Q  213 agagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    ||||||||||||| || ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||    
T  31435088 agagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagttcc 31435187  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |  |||||||||||||||||    
T  31435188 agcctcttcccgtaaccaag 31435207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 42223600 - 42223287
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  42223600 tgttgcgaattcgataaaaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtataaaacaattataaac 42223501  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||| ||||| ||||||||||    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | |||||||    
T  42223500 acaaggcaaaagtagaaaacaat---gagagaaaag-aagagagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcgatcaaaattgacctagtatgggggaga 42223405  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||| | ||||||||||||| |||||   ||||    
T  42223404 gagcagccatccatttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaataggtttcaagaataagttttccgcctaattctatccaaagctccaa 42223305  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||    
T  42223304 tctcttcccgtaaccaag 42223287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20299908 - 20299589
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||     
T  20299908 tgttgtgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aat 20299812  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || | ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20299811 acaagccaaaagtagaaaacaactgcgagaagaacacaaaggagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg 20299712  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |||||||||| ||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  20299711 ggagagagcaaccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 20299612  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  20299611 cccagcctcttcccgtaaccaag 20299589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 48458100 - 48457782
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||     
T  48458100 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aat 48458005  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48458004 acaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg 48457905  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  48457904 ggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 48457805  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  48457804 cccagcctcttcccgtaaccaag 48457782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 39 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21990570 - 21990279
Alignment:
Q  39 accaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaaca 137  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||       
T  21990570 accaataataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagcaaaca--- 21990474  T
Q  138 gcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||     
T  21990473 gcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctctgttccactata 21990374  T
Q  237 tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  21990373 tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctactcaaagcctcaatctcttcccgtaaccaag 21990279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28488000 - 28487682
Alignment:
Q  15 gttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaaca 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || |    
T  28488000 gttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aata 28487904  T
Q  115 caagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggg 209  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || ||| |||   || ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28487903 caagtcaaaagtagaaaacaacggctagaagaacacaaagaaaagaagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 28487804  T
Q  210 gagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatc 309  Q
    ||||||||| |||||   |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  28487803 gagagagcaaccctctgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcc 28487704  T
Q  310 ccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  28487703 ccaatctcttcctgtaaccaag 28487682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11355705 - 11355387
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataa 111  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  11355705 tgttgggaattcgatgaaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaattataa 11355606  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11355605 acacaagccaaaagtagaaaacaacaa-gagagagaagtaagagagaacataaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctagggga 11355507  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    ||||||||| |||  || |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  11355506 gagagcagctctctgttccactatatgatgagaaacgttacaaaaaagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctc 11355407  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  11355406 aatctcttcctgtaaccaag 11355387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 36065 - 35758
Alignment:
Q  26 gatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaat 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || |||| ||||||     
T  36065 gatgagaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aatacaaaccaaaag 35969  T
Q  126 tagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagc 220  Q
    ||||||||||  |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35968 tagaaaacaatggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaaaaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaaagcagc 35869  T
Q  221 cctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttc 320  Q
     |||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  35868 tctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc 35769  T
Q  321 ccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||    
T  35768 ccgtaaccaag 35758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9679492 - 9679188
Alignment:
Q  26 gatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaa 124  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  9679492 gatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaa 9679393  T
Q  125 ttagaaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccct 223  Q
     |||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||    
T  9679392 gtagaaaaca---gcgagagagaaaggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagtctggtccaaattgacctagtctgggaaagagagcagtact 9679296  T
Q  224 ccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccg 323  Q
    || ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  9679295 ccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcacg 9679196  T
Q  324 taaccaag 331  Q
    ||||||||    
T  9679195 taaccaag 9679188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9681252 - 9680949
Alignment:
Q  27 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaat 125  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| | |  ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||     
T  9681252 atgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggaacaagtgataattagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaag 9681153  T
Q  126 tagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcc 225  Q
    ||||||| | | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9681152 tagaaaagatc-gagagagaaa-ggaagagagaacacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 9681055  T
Q  226 atttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgta 325  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  9681054 atttcactatatgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgta 9680955  T
Q  326 accaag 331  Q
    ||||||    
T  9680954 accaag 9680949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 37411965 - 37412287
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaa--tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataa 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  37411965 tgttgtgaatttgatgagaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtggaacaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataa 37412064  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaag----gaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37412065 tcacaagccaaaactagaaaacaa---cgagagaaaagaagagaagggagaacacaaaagaatttattgatccagttcggtccaaattgacccagtctag 37412161  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttac-aaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaa 305  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  ||||||||||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37412162 gggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaa 37412261  T
Q  306 aatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||    
T  37412262 agtcccagtctcttcctgtaaccaag 37412287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20297810 - 20297491
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||     
T  20297810 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aat 20297714  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaaaaggaagag----agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |  |||||    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20297713 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaggagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg 20297614  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||      
T  20297613 ggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctatttctacccaaagc 20297514  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20297513 cccaatctcttcccgtaaccaag 20297491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 7092054 - 7092372
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||  ||     
T  7092054 tgttgcaaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaataaagtgtgtggaacaatta--aat 7092150  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    | ||| ||||| ||||||||||  |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7092151 ataagtcaaaagtagaaaacaatggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-gg 7092249  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  7092250 ggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagc 7092349  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  7092350 cccaatctcttcccgtaaccaag 7092372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21680473 - 21680156
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21680473 ctgttgtgaattcgatgaaaacccacaccaataacaagcttgatgtgtgaagcaaggaataatcatgcaacaaaaacaaagtgtatggaacaattataaa 21680374  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccag---ttcggtccaaattgacctagtctaggg 209  Q
    |||||||||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  21680373 cacaagccaaaagtagaaaacaac---gagagaaaag-aagagagaacaaaaaagtatttgttgacccagcagttcggtccaaattcacctagtctgggg 21680278  T
Q  210 gagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatc 309  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  21680277 gagagagcagctctctgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcattgggttacaagaataaatctcccgtctaattctacccaaagtc 21680178  T
Q  310 ccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  21680177 ccaatctcttccggtaaccaag 21680156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 39 - 331
Target Start/End: Original strand, 39145856 - 39146147
Alignment:
Q  39 accaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaacag 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  39145856 accaataacaaacttgatgtgtggagtaagtgataatcaagcaaccaaaacaaattgtattaaacaattataaacacaaaccaaaagtagaaaacaac-g 39145954  T
Q  139 cgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg-t 237  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||| || |||||||||  |    
T  39145955 agagagaaa-ggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttagggaaaagagcagccccccgtttcactataat 39146053  T
Q  238 gatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  39146054 gatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtaaccaag 39146147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 326
Target Start/End: Original strand, 7094301 - 7094615
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||  ||     
T  7094301 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggcatagtcaagcaaccaaaataaagtgtgtggaacaatta--aat 7094397  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  7094398 acaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcagtccaaattgacctagtctggg 7094497  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  7094498 ggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagc 7094597  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaa 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7094598 cccaatctcttcccgtaa 7094615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21678506 - 21678195
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  21678506 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccgataacaaacttgatttgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtaaggaacaattataaac 21678407  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| |||||||||   ||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21678406 acaagccaaaagtagaaaaca---gcgggagaaaag-aagagagaacacaaga--atttgttgtcccagttcggtccaaattaacctagtctaggggaga 21678313  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    ||||||||| |  ||||||||| |||| |||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21678312 gagcagcccactgtttcactatatgataagtaaccttacaaaagatatatcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaatgctacccaaagtcccaa 21678213  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  21678212 tatcttctcgtaaccaag 21678195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 45013 - 44694
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||    
T  45013 ctgttgcgaattcgatgagaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aa 44917  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44916 tacaagcaaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 44817  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    |||||| ||||||  ||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||     
T  44816 gggagaaagcagctatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacataattctacccaaag 44717  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaa 330  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  44716 tcccaacctcttcccgtaaccaa 44694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 7471821 - 7472140
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||     
T  7471821 tgttgcgaattcaatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aat 7471917  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||   ||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7471918 acaagccaaaagtagaaaacaacggtgagaagaacacaaataagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg 7472017  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    ||||||||||||| |||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  7472018 ggagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagt 7472117  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||  |||||||||||||||||    
T  7472118 tccagcctcttcccgtaaccaag 7472140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 40836583 - 40836902
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgat-gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||    
T  40836583 tgttgcgaattcgatcgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aa 40836679  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagag----aaaaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||||     |||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40836680 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 40836779  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  40836780 gggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 40836878  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    || ||  |||||||||||||||||    
T  40836879 tctcagcctcttcccgtaaccaag 40836902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24749035 - 24748723
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatga-aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||   ||||||     
T  24749035 tgttgtgaattcgatgagaaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataat 24748938  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    ||||| | |||| |||||||||||   ||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  24748937 cacaaac-aaaagtagaaaacaac---gagagaaata-aagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctaatctggaggag 24748843  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  24748842 agagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtccc 24748743  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  24748742 aatctcttcccggaaccaag 24748723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1850429 - 1850110
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||  ||     
T  1850429 tgttgcgaattcgatttgaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta--aat 1850333  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || | |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  1850332 acaagccaaaagtagaaaacaacagtgaaaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggg 1850233  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  1850232 ggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaagt 1850133  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||  |||||||||||| ||||    
T  1850132 cccagcctcttcccgtaagcaag 1850110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 7469864 - 7470182
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||  ||     
T  7469864 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaat-ttgatgtgtggagca-gggataatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaatta--aat 7469959  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||   ||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7469960 acaagccaaaagtagaaaacaacggtgagaagaacacaaataagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg 7470059  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7470060 ggagggagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 7470159  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    | ||  |||||||||||||||||    
T  7470160 ctcagcctcttcccgtaaccaag 7470182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25542976 - 25542658
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||  ||     
T  25542976 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaaatgtatggaacaatta--aat 25542880  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagagagaa-cacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||   || ||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25542879 acaagccaaaagtagaaaacaacggtgagaagaacacaaagaagagaaaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacctagtctagg 25542780  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |||||||||||| ||||  | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  25542779 ggagagagcagctctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagt 25542681  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||| |||||||| |||||||||    
T  25542680 cccagtctcttcctgtaaccaag 25542658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 36 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18345967 - 18345670
Alignment:
Q  36 cacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaa 135  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || ||||||||||| ||||||||||    
T  18345967 cacaccaacaacaa-cttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aatacaagccaaaagtagaaaacaa 18345871  T
Q  136 cagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttc 230  Q
    | |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  | |    
T  18345870 cggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacagccctccgatcc 18345771  T
Q  231 actatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaa 330  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||||    
T  18345770 actatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcacgtaaccaa 18345671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1606827 - 1606510
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||     
T  1606827 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataatta--aat 1606731  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  || |||||   |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||| ||    
T  1606730 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaggaaatttgttgacccagttcggtccaatctgatctagtctggg 1606631  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  1606630 ggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtctcccgcctaattctacccaaagt 1606533  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1606532 cccaatctcttcccgtaaccaag 1606510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 3036166 - 3035872
Alignment:
Q  20 gaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagc 119  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || ||||||    
T  3036166 gaattcgatgagaaatcacaccaataacaat-ttgatgtttggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aatacaagc 3036070  T
Q  120 caaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagagag-aacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagag 214  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||   || |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3036069 caaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaggaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagag 3035970  T
Q  215 agcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  3035969 agcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttgcaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtccca 3035872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 2935717 - 2935398
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||| |||||  ||    
T  2935717 ctgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta--aa 2935622  T
Q  113 cacaagccaaaat-tagaaaacaacagcgaga-gaa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     |||||||||||  ||||||||||| |||||| |||  || |||||   |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||     
T  2935621 tacaagccaaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaggaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctg 2935522  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2935521 ggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 2935423  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  2935422 gtcccaatctcttcccgtaaccaag 2935398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 22394161 - 22393875
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||   |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||   |||||| |    
T  22394161 tgttgtgaattcgatgaaaaattccaccaataataaacttgatgtgg--agcaagtgatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataatc 22394066  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    |||| |||||| |||||||||||   |||||||| | |||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22394065 acaaaccaaaagtagaaaacaac---gagagaaa-gaaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggaga 22393970  T
Q  214 gagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    || || |||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22393969 gaacaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaa 22393875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 38397084 - 38396764
Alignment:
Q  16 ttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacac 115  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||    
T  38397084 ttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataataaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaatta--aatac 38396989  T
Q  116 aagccaaaattagaaaa-----caacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct 205  Q
    ||||||||| |||||||     |||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38396988 aagccaaaagtagaaaaaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 38396889  T
Q  206 aggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaa 305  Q
      ||||||||| ||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38396888 gagggagagagaagccctccgatccactatatgatgagtaaagttac-aaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaa 38396790  T
Q  306 aatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    | |||||  |||||||||||||||||    
T  38396789 agtcccagcctcttcccgtaaccaag 38396764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 7351491 - 7351811
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  7351491 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagtaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtat-gaa-agttataaa 7351587  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |     
T  7351588 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatg 7351687  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||   |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7351688 ggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 7351786  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  7351787 gtcccaatctcttcccgtaaccaag 7351811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26804955 - 26804765
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26804955 tgttgcgaatttgatgagaaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaaaggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaac 26804856  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct 205  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26804855 acaagtcaaaagtagaaaacaacatcgagagaaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtct 26804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 9027034 - 9027352
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||     
T  9027034 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtat-gaa-agttataaat 9027130  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaa-------aggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||  ||       |  |||| |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||     
T  9027131 acaagccaaaagtagaaaacaacggctagaagaacataattaataaga-agaacacatagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctg 9027229  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9027230 ggggagagagcagccctcctatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtctcccgcctaattctacccaaa 9027327  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     || |||||||||||||||||||||    
T  9027328 gtctcaatctcttcccgtaaccaag 9027352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Original strand, 20137073 - 20137269
Alignment:
Q  134 aacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcact 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20137073 aacagcgagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgtttcact 20137170  T
Q  234 atg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20137171 ataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaag 20137269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28486013 - 28485695
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  ||     
T  28486013 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatatgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaaatgtatggaacaatta--aat 28485917  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagagag-aacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||   || |||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  28485916 acaagccaaaagtagaaaacaacggatagaagaacacaaagaagagaataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ga 28485818  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |||||||||| |||||   |||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||      
T  28485817 ggagagagcaaccctctgattcattatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggattacaagaataaatctcccgcctaattatactcaaagc 28485718  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  28485717 cccaatctcttctcgtaaccaag 28485695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3879027 - 3878706
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaag-tgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||  ||    
T  3879027 tgttgcgaattcgatgagaaatcacatcaataataa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaaaatgtatggaacaatta--aa 3878931  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaa-caacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     |||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||     
T  3878930 tacaaaccaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacatagtctg 3878831  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3878830 ggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 3878731  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     || ||  |||||||||||||||||    
T  3878730 gtctcagcctcttcccgtaaccaag 3878706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 33 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 40946759 - 40946461
Alignment:
Q  33 aatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaa 132  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||  || ||||||||||| |||||||    
T  40946759 aatcacatcaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta--aatacaagccaaaaatagaaaa 40946663  T
Q  133 caaca--gcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcc 225  Q
     || |  |||||| |||   || ||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  40946662 aaaaacggcgagaagaacacaaagaaaagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttc 40946563  T
Q  226 atttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgta 325  Q
      | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  40946562 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgta 40946463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Original strand, 43253357 - 43253677
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||    
T  43253357 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaat-ttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aa 43253452  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaa-caacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     ||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||   || ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  43253453 tacaagtcaaaagtagaaaaacaacagcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtctaaattgacctagtctg 43253552  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
     |||||||||||||||||   | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  43253553 agggagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaa 43253652  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     || ||  ||||| |||||| ||||    
T  43253653 gtctcagcctctttccgtaatcaag 43253677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 26295885 - 26295580
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||| | |||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26295885 tgttgtgaaattgatgaaaaatcacaccaataa-atacttgatgtatggagcacgtgataatcaagcaatcaaaacaaagtgtat-gaa-aattataaac 26295789  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||   || ||||| | |||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  26295788 acaagccaaaagtagaaaacaac---gaaagaaa-gaaagagataacacaaga--atttgtttatccagttcagtccaaattgacctagtctggaggaga 26295695  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||| | ||  |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||    
T  26295694 gagcagtcatctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcaca 26295595  T
Q  313 atctcttcccgtaac 327  Q
    ||| ||||| |||||    
T  26295594 atcgcttcctgtaac 26295580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 1049129 - 1049455
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaat-cacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatagaataattata 110  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||| | |||||    
T  1049129 tgttgcgaattcgaagaaaaattcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtat-gaa-agttata 1049225  T
Q  111 aacacaagccaaaat--tagaaaa--caacagcgaga-gaa---aaggaagagagaa--cacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacct 200  Q
    || |||||||||||   |||||||  |||| || ||| |||   || ||||||| ||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1049226 aatacaagccaaaaaggtagaaaaaacaacggcaagaagaacacaaagaagagaaaaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacct 1049325  T
Q  201 agtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattcta 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1049326 agtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattcta 1049424  T
Q  301 cccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  1049425 cccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaag 1049455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 27832488 - 27832793
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| ||||| |||||||||||||||||| |||   |||||| |    
T  27832488 tgttgtgaattcgatgaaaaatcataccaataacaaacttaatgtgtggagcaggaaataatcaagtaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataatc 27832585  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    |||| |||||| |||||||||   | |||||||| | |||||| ||||||| |  ||||||| | |||||||     ||||||||||||||| |||||||    
T  27832586 acaaaccaaaagtagaaaaca---gtgagagaaa-gaaagagataacacaaga--atttgtttacccagttc-----aaattgacctagtctgggggaga 27832674  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||    
T  27832675 gagaagccctccatttcactataatgatgagtaactttacagaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtctca 27832774  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27832775 atctcttcccgtaaccaag 27832793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 1046757 - 1047084
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatagaataattata 110  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||  | | | |||||    
T  1046757 tgttgcgaattcgaagaaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtaatgga-agttata 1046854  T
Q  111 aacacaagccaaaat--tagaaaa--caacagcgaga-gaa---aaggaagagagaa--cacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacct 200  Q
    || |||||||||||   |||||||  |||| |||||| |||   || ||||||| ||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1046855 aatacaagccaaaaaggtagaaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaaaaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacct 1046954  T
Q  201 agtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattcta 300  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1046955 agtgtgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattcta 1047053  T
Q  301 cccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  1047054 cccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaag 1047084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22137527 - 22137208
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  ||    
T  22137527 tgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataa--aa 22137431  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaa-caacagcgaga-gaa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     || |||||||| ||||||| |||| | |||| |||  || |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||     
T  22137430 tacgagccaaaagtagaaaaacaactgtgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctg 22137331  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22137330 ggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaa 22137233  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  22137232 gtcccaatctcttcccgtaaccaag 22137208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 40552554 - 40552235
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  ||    
T  40552554 tgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataa--aa 40552458  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaa-caacagcgaga-gaa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     || |||||||| ||||||| |||| | |||| |||  || |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||     
T  40552457 tacgagccaaaagtagaaaaacaactgtgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctg 40552358  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  40552357 ggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaa 40552260  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  40552259 gtcccaatctcttcccgtaaccaag 40552235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 40550277 - 40549957
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  ||    
T  40550277 tgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataa--aa 40550181  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaa--caacagcgaga-gaa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct 205  Q
     || |||||||| |||||||  |||| | |||| |||  || |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  40550180 tacgagccaaaagtagaaaaaacaactgtgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtct 40550081  T
Q  206 aggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaa 305  Q
     |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  40550080 gggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaa 40549983  T
Q  306 aatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    | || |||||||||||||||||||||    
T  40549982 agtctcaatctcttcccgtaaccaag 40549957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24465975 - 24465666
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||| |    
T  24465975 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggaacaagtgatattcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataatc 24465878  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    |||| |||||| |||||   |||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||| |  ||||||||| || ||||| ||||||| |||||||    
T  24465877 acaaaccaaaagtagaa---aacagcgagagaaaagaaagagagaacacga---aatttgtttactcagttcggttcatattgatctagtctgggggaga 24465784  T
Q  214 gagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||| |  || ||||| |||  ||||||||| | |||||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||    
T  24465783 gagcagtcacccgtttcattataatgatgagtact-ttacaaaagacatatcaatgagttaaaagaataaatctcccacctaattctacccaaagtccca 24465685  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||| | ||||||    
T  24465684 atctcttcccatgaccaag 24465666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 7349117 - 7349432
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  7349117 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagtaagggataattaagcaaccaaaataaagtgtat-gaa-agttataaa 7349213  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     ||||||||||| || |||||||| |||||| |||   || |||||   ||||||||||  ||||||||||     ||||||||||  |||||||||||     
T  7349214 tacaagccaaaagta-aaaacaacggcgagaagaacgcaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgac----ttcggtccaatctgacctagtctg 7349308  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||   |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7349309 ggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 7349407  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     || |||||||||||||||||||||    
T  7349408 gtctcaatctcttcccgtaaccaag 7349432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11759575 - 11759364
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||     
T  11759575 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaat--taaat 11759479  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgag-agaa---aaggaagag-agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||   || | |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11759478 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaaggagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg 11759379  T
Q  209 ggagagagcagccct 223  Q
    |||||||||| ||||    
T  11759378 ggagagagcaaccct 11759364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 331
Target Start/End: Original strand, 31155896 - 31156070
Alignment:
Q  156 agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaa 255  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||  ||||||||    
T  31155896 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactataggatgagtaccgttacaaa 31155995  T
Q  256 agagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  31155996 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtacccaag 31156070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22108483 - 22108197
Alignment:
Q  49 aacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaa--caacagcgaga-g 144  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  || || |||||||| |||||||  |||| | |||| |    
T  22108483 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataa--aatacgagccaaaagtagaaaaaacaactgtgagaag 22108386  T
Q  145 aa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgat 240  Q
    ||  || |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||| ||||    
T  22108385 aacaaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgat 22108286  T
Q  241 gagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22108285 gagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaag 22108197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 331
Target Start/End: Original strand, 24813364 - 24813659
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattaga 129  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||| | ||| |||     || ||||||||||| || | |||| ||||    
T  24813364 aaaatcacatcaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaatatcaacgtggt---aacaattataaacataaac-aaaagtaga 24813459  T
Q  130 aaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagccctccatt 228  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| |||  |    
T  24813460 aaacaac---gagagaaaaggaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagaaagcagccatccgct 24813555  T
Q  229 tcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaac 327  Q
     ||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  24813556 ccactataatgatgagtaactttacaaaggagatataaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatcacttcccgtcac 24813655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 191
Target Start/End: Original strand, 22251452 - 22251605
Alignment:
Q  36 cacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaa 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  22251452 cacaccaataacaaacttgatgtgttgagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacag 22251551  T
Q  136 cagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtcca 191  Q
    ||  ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  22251552 ca-agagag-aaaggaagatagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcca 22251605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 7188962 - 7188668
Alignment:
Q  30 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattaga 129  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| |||| ||||    
T  7188962 aaaaatcacatcaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaacacaagc-aaaagtaga 7188866  T
Q  130 aaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagccctccatt 228  Q
    |||||   |||||||||||| ||||||  || ||||||   ||||| | | ||||| |||||||  |||| ||| || ||| ||||||||||| ||| ||    
T  7188865 aaaca---gcgagagaaaagaaagagaacacgcaaaat---ttgtttacctagttcagtccaaaactgacatagactggggaagagagcagccttccgtt 7188772  T
Q  229 tcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaac 327  Q
     ||||||  |||||| |||  |||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||    
T  7188771 ccactataatgatgaataactttacaaaagaaatatcaatgggttataaaaataagtctcccgcttaattctacccaaagtctcaatctattcccgtgac 7188672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25276567 - 25276270
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataa 111  Q
    |||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||   || |||||||||||| | ||||||| |||  | |||||  |    
T  25276567 ctgttgtgaattcgctaaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggatcaagt--taatcaagcaaccaatatcaaagtggata--acaatta--a 25276475  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
    |||||||  |||| |||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  25276474 acacaagtaaaaagtagaaaacaac---gagagaaaaa-aagagagaacacaaaagaatttgtttaaccagttcggtccatattgacttagtct-gggga 25276380  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
    |           || || ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  25276379 g-----------ccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggtttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtct 25276291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 207 - 331
Target Start/End: Original strand, 20091583 - 20091705
Alignment:
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20091583 ggggagagagcagccctccgttccactatg--atgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 20091680  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     || |||||||||||||| ||||||    
T  20091681 gtctcaatctcttcccgtgaccaag 20091705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 150 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24258778 - 24258592
Alignment:
Q  150 gaagagagaacacaaaataattt-gttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg----tgatgagt 244  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| || ||||||     ||||||||    
T  24258778 gaagagagaacacaaaagaattttgttcatctaattcggtccaaattgacctagtctgaaagagagagcagccctccgttccactataataatgatgagt 24258679  T
Q  245 aatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||    
T  24258678 aactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagttttccgcctaattctatccaaagtctcaatcttttcccgtgaccaag 24258592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Original strand, 24817292 - 24817514
Alignment:
Q  106 ttataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtc 204  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||| |||| ||||||||  | || | ||| | | |||||||||||||  |||||||||     
T  24817292 ttataaacacaaac-aaaattagaaaacaac---gagagaaaagaaagacagaacacacga-aactcgtttaccaagttcggtccaaaactgacctagta 24817386  T
Q  205 taggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctaccc 303  Q
    | ||||||||||||||| ||| || ||||||  ||||||||||  |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24817387 tgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagacatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctaccc 24817486  T
Q  304 aaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||    
T  24817487 aaagtctcaatctcttcccgtgaccaag 24817514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 211 - 331
Target Start/End: Original strand, 22828672 - 22828793
Alignment:
Q  211 agagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatc 309  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  22828672 agagagcagccctctgtttcactataataatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 22828771  T
Q  310 ccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||||||||||| ||||||||    
T  22828772 tcaatctcttcccataaccaag 22828793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 230 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11757460 - 11757359
Alignment:
Q  230 cactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaacca 329  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  11757460 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacca 11757361  T
Q  330 ag 331  Q
    ||    
T  11757360 ag 11757359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 237 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6349005 - 6348912
Alignment:
Q  237 tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaa 330  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||    
T  6349005 tgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatcttttcccgtgaccaa 6348912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 168 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 6332514 - 6332359
Alignment:
Q  168 aatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatca 265  Q
    |||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| | ||| || ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  6332514 aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctaggggagagaacagtcttccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatta 6332415  T
Q  266 atggattacaagaataagtctac-cgcctaattctacccaaaatcccaatctcttc 320  Q
    | || |||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  6332414 aagggttacaagaataagtcttcaagcctaattctacctaaagtctcaatctcttc 6332359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 258 - 331
Target Start/End: Original strand, 22251637 - 22251710
Alignment:
Q  258 agatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  22251637 agatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaag 22251710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 6046789 - 6046641
Alignment:
Q  166 ataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatat 263  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||    
T  6046789 ataatttgtctatccaattcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagctcttcattccactataatgatgagtaactttacaaa-gagatat 6046691  T
Q  264 caatggattacaagaataagtctac-cgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||| || |||||||||||||||| |   |||||||||||||||| |||||    
T  6046690 caaaggtttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtccca 6046641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 11081836 - 11081642
Alignment:
Q  134 aacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcac 232  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||| || ||     
T  11081836 aacagcgagaggaaaaaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaatattgacctagtctgggggagagagcaaccatccgttccat 11081738  T
Q  233 tat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatc--aatggattacaagaataagtctac-cgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgt 324  Q
    | |   |||||||||  ||||| ||||||||||  || || |||||||||| ||||| |   ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  11081737 tttaaagatgagtaactttacacaagagatatcaaaaagggttacaagaattagtcttcaaacctaattttacacaaaatcctaatctcttcccgt 11081642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 46516403 - 46516338
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  46516403 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatg 46516338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26804761 - 26804701
Alignment:
Q  271 ttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  26804761 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaag 26804701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 88
Target Start/End: Original strand, 20136991 - 20137066
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa 88  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20136991 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcatacgaataataaatttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa 20137066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 223
Target Start/End: Original strand, 40281319 - 40281435
Alignment:
Q  104 aattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctag 202  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||   |||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |  |||||| |||||| | ||| ||||    
T  40281319 aattataaatacaagcaaaaattagaa---aacagctagagaaaagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacacagttctgtccaatactgaactag 40281414  T
Q  203 tctaggggagagagcagccct 223  Q
    ||| |||||||||||| ||||    
T  40281415 tctgggggagagagcatccct 40281435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 331
Target Start/End: Original strand, 16296934 - 16297185
Alignment:
Q  75 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgt 174  Q
    |||||||||||||||||||||  |   | |||||||||||||||| |||| |||||||| ||   ||||||||    ||||||||||||    |||||||    
T  16296934 tcaagcaaccaaaacaaagtggctg--acaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacgac---gagagaaag---agagagaacacacggaaatttgt 16297024  T
Q  175 tgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagata-tcaatggat 271  Q
    | |  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||  ||||||||||  || ||||||||||| | || || |    
T  16297025 ttacacagttcggtccaatactgacatagtctaggggagagagcagctctccgttctactataatgatgagtaactttgcaaaagagatattaaaagggt 16297124  T
Q  272 tacaagaataagtctac-cgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||| | ||| |    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  16297125 tacaagaatcaatcttcaaatctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaag 16297185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Original strand, 29159807 - 29159872
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  29159807 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatg 29159872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9190101 - 9190046
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcca 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  9190101 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctcca 9190046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Original strand, 20284093 - 20284148
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcca 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20284093 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcca 20284148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 61
Target Start/End: Original strand, 31153691 - 31153737
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtg 61  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31153691 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtg 31153737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Original strand, 21983288 - 21983353
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  21983288 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatg 21983353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 83
Target Start/End: Original strand, 1502832 - 1502883
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaac 83  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  1502832 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaac 1502883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 14379861 - 14379905
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14379861 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctaggggagaga 14379905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Original strand, 2580394 - 2580449
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcca 226  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  2580394 ttgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctcca 2580449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 236
Target Start/End: Original strand, 55955 - 56016
Alignment:
Q  174 ttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  55955 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatct-ggggagagagcagccctccaatccactatg 56016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2647789 - 2647724
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2647789 ttgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgggggagagagcagccctccaatccactatg 2647724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4796752 - 4796707
Alignment:
Q  179 ccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctc 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  4796752 ccagttcggtccaaaatgacctaatctgggggagaaagcagccctc 4796707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 212
Target Start/End: Original strand, 30024732 - 30024773
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  30024732 ttgttgatccagttcggtccaacttgacctactctgggggag 30024773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 235
Target Start/End: Original strand, 6067195 - 6067263
Alignment:
Q  168 aatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat 235  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| | ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  6067195 aatttgtttacccagtccggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagctctccgtttcactat 6067263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 14069833 - 14069877
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  14069833 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatcttggggagaga 14069877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 25357360 - 25357324
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaa 67  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25357360 aaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaa 25357324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27347985 - 27347941
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  27347985 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 27347941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 41317434 - 41317478
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  41317434 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 41317478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 47676136 - 47676180
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||    
T  47676136 ttgttgatccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 47676180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 122)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Original strand, 22800703 - 22801022
Alignment:
Q  12 cctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataa 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  22800703 cctgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtggggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtatatggaacaattataa 22800802  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22800803 acacaagccaaaagtagaaagcaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggga 22800902  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  22800903 gagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctc 22801002  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |  |||||||||||| ||||    
T  22801003 agcctcttcccgtaatcaag 22801022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 22802577 - 22802894
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22802577 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaac 22802676  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22802677 acaagccaaaagtagaaagcaacagcgagagaaaaagaagatagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctgggggaga 22802776  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    ||| | |||||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  22802777 gagaaaccctccgttccactatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccag 22802876  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||||||||||||||||    
T  22802877 cctcttcccgtaaccaag 22802894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 331
Target Start/End: Original strand, 36919432 - 36919744
Alignment:
Q  17 tgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacaca 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  36919432 tgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacaca 36919531  T
Q  117 agccaaaattagaaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    || ||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919532 agtcaaaagtagaaaaca---gcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 36919628  T
Q  216 gcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatc 315  Q
    |||||| || ||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  |    
T  36919629 gcagccatctattccactatatgatgaataacgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccagcc 36919728  T
Q  316 tcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||    
T  36919729 tcttcccgtaaccaag 36919744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 38928024 - 38928337
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |    
T  38928024 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatc 38928123  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||   |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38928124 acaagccaaaagtagaaaacaac---gagataaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 38928219  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  38928220 gagcagccctccgttttactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaa 38928319  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  38928320 tcttttcccgtaaccaag 38928337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 36921338 - 36921653
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  36921338 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataaac 36921437  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  36921438 acaagccaaaagtagaaaacagcaa-gagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttaactagtctgggggaga 36921535  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    |||||||| ||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  36921536 gagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccag 36921635  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||||||||||||||||    
T  36921636 cctcttcccgtaaccaag 36921653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 40637570 - 40637247
Alignment:
Q  10 tccctgttgcgaatttgatgaaaa-atcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatagaataat 106  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||| ||| |||    
T  40637570 tccctgttgcgaattcgttgagaatatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtatggaacaat 40637472  T
Q  107 tataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  40637471 tataatcacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 40637372  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40637371 ggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 40637272  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     || |||||||||||||||||||||    
T  40637271 gtctcaatctcttcccgtaaccaag 40637247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24889286 - 24888969
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaa-atcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  24889286 tgttgcgaattcgatgaaaatatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaaggaataatctaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataat 24889188  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24889187 cacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggag 24889088  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  24889087 agagcagccctccgttccactatatgataagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacatgaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccta 24888988  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||||||||||||    
T  24888987 gtctcttcccgtaaccaag 24888969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 48486803 - 48486492
Alignment:
Q  20 gaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagc 119  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||| | |||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  48486803 gaattcgatgagaaaacacaccaataacaaatttgatgcgtggaacaagcgataatcaagcaactaaaacaaagtgaatggaacaattataaacacaagc 48486704  T
Q  120 caaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcag 219  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48486703 caaaagtagaaaacaacatcaagagaaaaggaagagaaaacacaaaataatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcag 48486604  T
Q  220 ccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctctt 319  Q
    || ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48486603 ccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatttcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctt 48486504  T
Q  320 cccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||    
T  48486503 cccgtaaccaag 48486492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 40091259 - 40091575
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaat-cacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  40091259 tgttgcgaattcgatgaaaaattcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaaagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaataattataaa 40091358  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  40091359 cacaagccaaaagtagaaaatagcaa-gagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggag 40091456  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  40091457 agagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 40091556  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
      |||||||||||||||||    
T  40091557 gcctcttcccgtaaccaag 40091575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 33415334 - 33415648
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||    
T  33415334 tgttgcgaatccgatgagaaatcacacaaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgggacaattataaa 33415433  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||||||||| |||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  33415434 cacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagcctgagggag 33415529  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||    
T  33415530 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctca 33415629  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33415630 atctcttcccgtaaccaag 33415648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Original strand, 17662091 - 17662405
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||     
T  17662091 ctgttgcgaattcgttgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaccaaagtgtatggaacaattataat 17662188  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17662189 cacatgccaaaagtagaaaacaacagcgagaaaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggag 17662286  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  17662287 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 17662386  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||||||| |||||||||    
T  17662387 gtctcttcctgtaaccaag 17662405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 75 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24879419 - 24879162
Alignment:
Q  75 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24879419 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaagagaatttgt 24879320  T
Q  175 tgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatg-ttacaaaagagatatcaatggatta 273  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||||||| |||    
T  24879319 tgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgtgtatcgtttacaaaagagatatcaatgggtta 24879220  T
Q  274 caagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24879219 caagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaag 24879162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 14787274 - 14787591
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  14787274 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaac 14787373  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagag-agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggg--g 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||  || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |    
T  14787374 acaagccaaaagtagaaaacaac-tagagagaaaaagaagagaagaacac--aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggag 14787470  T
Q  211 agagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| || |||||||||| ||||| ||     
T  14787471 agagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtca 14787570  T
Q  311 caatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14787571 caatctcttcccgtaaccaag 14787591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Original strand, 37089211 - 37089531
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||    
T  37089211 ctgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aa 37089308  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37089309 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 37089408  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  37089409 gggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 37089507  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||  |||||||||||| ||||    
T  37089508 tcccagcctcttcccgtaatcaag 37089531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 75 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24880883 - 24880624
Alignment:
Q  75 tcaagcaaccaaaaca--aagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataattt 172  Q
    ||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  24880883 tcaagcaaccaaaacacaaagtgtacggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaagagaattt 24880784  T
Q  173 gttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatg-ttacaaaagagatatcaatggat 271  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  24880783 gttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgcgtaacgtttacaaaagagatatcaatgggt 24880684  T
Q  272 tacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24880683 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaag 24880624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 2891780 - 2891464
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  2891780 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaagaataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaac 2891681  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||| |||||||    
T  2891680 acaagccaaaagtagaaaacaac-gagagag-aaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaagttgtactagtctgggggaga 2891583  T
Q  214 gagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||| | ||  |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || ||    
T  2891582 gagcagtcatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaacaagtctcctgcctaattctacccaaagtctca 2891483  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2891482 atctcttcccgtaaccaag 2891464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 331
Target Start/End: Original strand, 12395703 - 12396005
Alignment:
Q  27 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaatt 126  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  12395703 atgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagagtatcgaaaaattataaacacatgccaaaagt 12395802  T
Q  127 agaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcca 226  Q
    |||| ||||| | || ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  12395803 agaagacaac-gagacagaaa-ggaagagagaacacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccg 12395900  T
Q  227 tttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaa 326  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12395901 tttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaa 12396000  T
Q  327 ccaag 331  Q
    |||||    
T  12396001 ccaag 12396005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 331
Target Start/End: Original strand, 12400665 - 12400967
Alignment:
Q  27 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaatt 126  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  12400665 atgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagagtatcgaaaaattataaacacatgccaaaagt 12400764  T
Q  127 agaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcca 226  Q
    |||| ||||| | || ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  12400765 agaagacaac-gagacagaaa-ggaagagagaacacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccg 12400862  T
Q  227 tttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaa 326  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12400863 tttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaa 12400962  T
Q  327 ccaag 331  Q
    |||||    
T  12400963 ccaag 12400967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6765336 - 6765017
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||    
T  6765336 ctgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaat---tataaa 6765240  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaa----aggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     |||||||||| | |||||||||| ||||||  ||    | ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6765239 tacaagccaaagt-agaaaacaacggcgagaagaacaccaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 6765141  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  6765140 gggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaag 6765041  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||  |||||||| ||||||||    
T  6765040 tcccagcctcttcccataaccaag 6765017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 36 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 47275190 - 47274899
Alignment:
Q  36 cacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaa 135  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  47275190 cacatcaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaatgaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaagtagaaaaca- 47275092  T
Q  136 cagcgagagaaaaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcacta 234  Q
      ||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47275091 --gcgagagaaatc-aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgtttcacta 47274996  T
Q  235 tgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  47274995 tatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcttcttcccgtaaccaag 47274899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13547630 - 13547327
Alignment:
Q  27 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaat 125  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| | |  ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||     
T  13547630 atgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggaacaagtgataattagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaag 13547531  T
Q  126 tagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcc 225  Q
    ||||||| | | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13547530 tagaaaagatc-gagagagaaa-ggaagagagaacacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 13547433  T
Q  226 atttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgta 325  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13547432 atttcactatatgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgta 13547333  T
Q  326 accaag 331  Q
    ||||||    
T  13547332 accaag 13547327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16453796 - 16453482
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||  || | |||||| |    
T  16453796 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatgaaacagttataatc 16453697  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16453696 acaagccaaaagtagaa---aacagtgagagaaaa-gaagagagaacacaaaagaattttttggcgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 16453601  T
Q  214 gagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||| || ||  |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  16453600 gagcaaccatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaatactacccaaagtccca 16453501  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  16453500 atctcttctcgtaaccaag 16453482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4215792 - 4215483
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaa--tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataa 111  Q
    ||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||    
T  4215792 tgttgcgaattcgatgagaaaactcacacaaataacaa-cttgatgtgtgaagcaaggaataatcaagcaacaaaaacaaagtgtatgaaacaattataa 4215694  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
     |||||||||||| ||||||||    |||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4215693 tcacaagccaaaagtagaaaact---gcgagagaaaagaaagaga--acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggga 4215599  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    |||||||||| ||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |    
T  4215598 gagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcac 4215499  T
Q  312 aatctcttcccgtaac 327  Q
    || |||||||||||||    
T  4215498 aacctcttcccgtaac 4215483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 8631260 - 8631579
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||  ||     
T  8631260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaatta--aat 8631355  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaa-caacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8631356 acaagccaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 8631455  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  8631456 gggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 8631555  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||  |||||||||||||||||    
T  8631556 tcccagcctcttcccgtaaccaag 8631579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14633811 - 14633492
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||  ||    
T  14633811 ctgttccgaattcgatgagaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccgaaacaaaatgtatggaacaatta--aa 14633715  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  14633714 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctga 14633615  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  14633614 gggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 14633515  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  14633514 tcccaatctctt-ccgtaaccaag 14633492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 37312924 - 37313226
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  37312924 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataatc 37313023  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    | ||||||||| |||||||||   |||||||||||             ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  37313024 ataagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaaa-------------caaaagaatttgttgatccaatttggtccaaattgacatagtctgggggaaa 37313107  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||||||| || ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37313108 gagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatccca 37313207  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  37313208 atctctttccgtaaccaag 37313226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 5635317 - 5635611
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||    
T  5635317 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaatcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aa 5635412  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5635413 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 5635512  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5635513 gggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 5635611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24348692 - 24348391
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||  ||     
T  24348692 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaacta--aat 24348597  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||            ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24348596 acaagccaaaaatagaaaacaacggcgaga------------agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaga 24348509  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    ||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  24348508 gagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtcccag 24348409  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||||||||||||||||    
T  24348408 cctcttcccgtaaccaag 24348391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18847644 - 18847327
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||     
T  18847644 tgttgtgaatctgatcaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaataatta--aat 18847549  T
Q  114 acaagccaaaat-tagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| |||   || ||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18847548 acaagccaaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaacagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-g 18847450  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  18847449 gggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 18847351  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18847350 tcccaatctcttcccgtaaccaag 18847327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 331
Target Start/End: Original strand, 22044228 - 22044550
Alignment:
Q  11 ccctgttgcgaatttgat-gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattat 109  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||     
T  22044228 ccctgttgtgaatttgatcgaaaaataacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta- 22044325  T
Q  110 aaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagag----aaaaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtc 204  Q
     || ||||||||||| ||||||||||| ||||||     |||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22044326 -aatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc 22044424  T
Q  205 taggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctaccca 304  Q
    |  ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22044425 tgagggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctaccca 22044523  T
Q  305 aaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    || |||||  |||||||||||||||||    
T  22044524 aagtcccagcctcttcccgtaaccaag 22044550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 16931631 - 16931948
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||     
T  16931631 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttaatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataatta--aat 16931727  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa--aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggg 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  || ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  16931728 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggg 16931827  T
Q  210 gagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatc 309  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||   |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  16931828 gagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 16931926  T
Q  310 ccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  16931927 tcaatctcttcccgtaaccaag 16931948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 331
Target Start/End: Original strand, 22046542 - 22046845
Alignment:
Q  29 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattag 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || ||||| ||||| |||    
T  22046542 gaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aatacaagtcaaaagtag 22046638  T
Q  129 aaaacaacagcgagag----aaaaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccct 223  Q
    ||||||||  |||||     |||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22046639 aaaacaacgacgagaagaacaaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccct 22046738  T
Q  224 ccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccg 323  Q
    ||  | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  22046739 ccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccg 22046837  T
Q  324 taaccaag 331  Q
    ||||||||    
T  22046838 taaccaag 22046845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Original strand, 2484714 - 2485032
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||    
T  2484714 ctgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaatta--aa 2484809  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2484810 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaggaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgg 2484909  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||     
T  2484910 gggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctatctctacccaaag 2485008  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||  |||||||||||||||||    
T  2485009 tcccagcctcttcccgtaaccaag 2485032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 47868894 - 47868574
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| ||| |  ||    
T  47868894 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaataa--aa 47868798  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagagag-aacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||   || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  47868797 tacaagccaaaagtagaaaacaacggtgagaagaacacaaagaagagaataacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtatgg 47868698  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  47868697 gggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 47868598  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    || ||  |||||||||||||||||    
T  47868597 tctcagcctcttcccgtaaccaag 47868574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 51015722 - 51015419
Alignment:
Q  29 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattag 128  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || ||||||||||| |||    
T  51015722 gaaaaaacacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aatacaagccaaaagtag 51015626  T
Q  129 aaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccct 223  Q
    |||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  51015625 aaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagacct 51015526  T
Q  224 ccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccg 323  Q
    ||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  51015525 ccgatccactatatgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccg 51015427  T
Q  324 taaccaag 331  Q
    ||||||||    
T  51015426 taaccaag 51015419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 11435435 - 11435130
Alignment:
Q  26 gatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  || |||||||||||    
T  11435435 gatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaatta--aatacaagccaaaa 11435339  T
Q  125 ttagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcag 219  Q
     ||||||||||  |||||| |||   |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435338 gtagaaaacaatggcgagaagaacacaaggaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcag 11435239  T
Q  220 ccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctctt 319  Q
    ||||||  | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |  |||||    
T  11435238 ccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagactctt 11435140  T
Q  320 cccgtaacca 329  Q
    || |||||||    
T  11435139 ccggtaacca 11435130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 36378777 - 36378469
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||| |||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||    
T  36378777 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataaaatacttgatatgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatgaaacaattataaac 36378680  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    |||| | |||| ||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36378679 acaaacgaaaagtagaaaacagcag---gagaaaag-aagagagaacacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 36378584  T
Q  214 gagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||||||| || ||||||  ||||||||||  | |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  36378583 gagcagccctccgttccactataatgatgagtaacttcacaagagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtccca 36378484  T
Q  313 atctcttcccgtaac 327  Q
    |||||||||||||||    
T  36378483 atctcttcccgtaac 36378469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 7941816 - 7941496
Alignment:
Q  12 cctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataa 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||| |  |    
T  7941816 cctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaacaacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatga--a 7941721  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||   || ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  7941720 atacaaggcaaaagtagaaaacaatggcgagaagaacacaaagaagaaaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 7941621  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7941620 ggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 7941521  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||||  ||||||| |||||||||    
T  7941520 gtcccagcctcttcctgtaaccaag 7941496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 9176315 - 9176633
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||     
T  9176315 tgttgcgaattcgacgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataatta--aat 9176410  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaa-caacagcgaga-gaa---aaggaagagag-aacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||   || |||||||  ||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |    
T  9176411 acaagccaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaataacacaaagaaatttgttgactctgttcggtccaaattgacctagtctgg 9176510  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  9176511 gggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 9176609  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  9176610 tctcaatctcttcccgtaaccaag 9176633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11437855 - 11437561
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||  ||    
T  11437855 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtatggagcaagagataatcaagcagccaaaaacaaagtgtatggaacaatta--aa 11437759  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11437758 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaggaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctag 11437659  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11437658 gggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 11437561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 619298 - 619607
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||   | | |||||| |    
T  619298 tgttgcggattcgatgagaaaacacaccaataataaatttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaatacaa-gtggatc--acagttataatc 619394  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  619395 acaagc-aaaagtagaaaacaacagc---agagaagaaagagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagt-taggggaga 619489  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    |||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | | |||||||||||||||||||  |||||    
T  619490 gagcagtcatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttataagaataattttcccgcctaattctacccaaagacccaa 619589  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  619590 tctcttcccttaaccaag 619607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 19096370 - 19096056
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||  ||  | | |||||| |    
T  19096370 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacactaataataaatttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaatacaa-gtgggta--acagttataatc 19096274  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaac-agcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||| | |||| ||||||||||| || || |  |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  19096273 acaaac-aaaagtagaaaacaacgagagaaaataaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggag 19096175  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   | |    
T  19096174 agagcagctctccgtttcactatatgataagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagctcta 19096075  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19096074 atctcttcccgtaaccaag 19096056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 22782577 - 22782897
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||    
T  22782577 tgttgcgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaacaaagcgtat-gaa-agttataaa 22782673  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || |||||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  22782674 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgatccagttcggtccaatctgacctagtctg 22782773  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22782774 ggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 22782872  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  22782873 gtcccaatctcttcccgtaaccaag 22782897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 26085818 - 26086136
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  26085818 tgttgcgaattcgatgagaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtat-gaa-agttataaa 26085913  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaa----aaggaagag-agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    || |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      
T  26085914 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaaaaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctga 26086013  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    |||||||||||||| |||  | |||||| |||||||||  ||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  26086014 gggagagagcagccttccgatccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaaacaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 26086112  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  26086113 ccccaatctcttcccgtaaccaag 26086136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 47563248 - 47563009
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatga-aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  47563248 tgttgtgaatttgatgagaaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaa 47563149  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    || ||||||||| |||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47563148 cataagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa-ggaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcaaggggag 47563053  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaa 256  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||  ||||||||    
T  47563052 agagcagccctccgtttcactataagatgagtaaccttacaaaa 47563009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 9173987 - 9174305
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||     
T  9173987 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacactaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaataatta--aat 9174082  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaa-caacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9174083 acaagccaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 9174182  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    || ||||| |||||||||| | |||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  9174183 ggcagagaacagccctccaatccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaag 9174281  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  9174282 tctcaatctcttcccgtaaccaag 9174305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 27499541 - 27499219
Alignment:
Q  9 atccctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataatta 108  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||  ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  27499541 atccctgttctgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaatgaataaccaagcaaccaaaacaaagtttatggaacaatta 27499442  T
Q  109 taaacacaagccaaaattagaaaacaac-agcgagaga---aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtc 204  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  27499441 taaacacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagagagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtc 27499342  T
Q  205 taggggagagagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctaccc 303  Q
    | ||||| ||||||||||| | ||||| |||  ||||||||||  |||||||||||||||   | | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  27499341 t-ggggaaagagcagcccttcgtttcaatataatgatgagtaaccttacaaaagagatat---taggttacaaaaataagtctcccgcctaattataccc 27499246  T
Q  304 aaaatcccaatctcttcccgtaaccaa 330  Q
    |||  | |||||||||  |||||||||    
T  27499245 aaagcctcaatctcttatcgtaaccaa 27499219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 5198895 - 5198594
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||     
T  5198895 tgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataataa-cttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aat 5198800  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaa-caacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||            ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5198799 acaagccaaaagtagaaaaacaacggcgaga------------agaacacaaaagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgggggag 5198712  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||    
T  5198711 agagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacacaaagcccca 5198612  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaa 330  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5198611 atctcttcccgtaaccaa 5198594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 24446502 - 24446754
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  24446502 tgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaaaaattataaac 24446601  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||             ||||||    
T  24446602 acaagccaaaagtagaaaacaa----gagagaaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-------------gggaga 24446683  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagt 284  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24446684 gagcagccctccgtttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggcttacaaaaataagt 24446754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 44599680 - 44599997
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||     
T  44599680 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagg-ataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataatta--aat 44599775  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||  || |||||   ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  44599776 acaaggcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggg 44599875  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||   |||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  44599876 ggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 44599974  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  44599975 cccaatctcttcccgtaaccaag 44599997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Original strand, 31849438 - 31849758
Alignment:
Q  12 cctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataa 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |    
T  31849438 cctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--a 31849533  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaa-caacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct 205  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31849534 atacaagccaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtct 31849633  T
Q  206 aggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaa 305  Q
     |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  31849634 gggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaa 31849732  T
Q  306 aatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    | || ||  |||||||||||| ||||    
T  31849733 agtctcagcctcttcccgtaagcaag 31849758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9148727 - 9148426
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||     
T  9148727 tgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataacaa-cttgatgtgtggaacaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aat 9148631  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||            ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  9148630 acaagccaaaagtagaaaacaacggtgaga------------agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggaga 9148543  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||     
T  9148542 gagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccag 9148444  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||||||||||||||||    
T  9148443 cctcttcccgtaaccaag 9148426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 38409679 - 38409378
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaa 130  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||  || ||||||||||| |||||    
T  38409679 aaaaacacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaactaaaacaaattgtatggaacaatta--aatacaagccaaaagtagaa 38409583  T
Q  131 aacaacagcgagag----aaaaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcc 225  Q
    |||||| ||||||     |||| ||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  38409582 aacaacggcgagaagaacaaaaagaagagaagaactcaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 38409483  T
Q  226 atttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgta 325  Q
      | |||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  38409482 gatccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgta 38409384  T
Q  326 accaag 331  Q
    ||||||    
T  38409383 accaag 38409378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 11008408 - 11008725
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||     
T  11008408 tgttgtgaattcgatcgaaaaacacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aat 11008504  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaa-caacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
    |||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  11008505 acaagcaaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgg 11008604  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||   ||||||   ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  11008605 gggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccattacaa---agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 11008701  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||  |||||||||||||||||    
T  11008702 tcccagcctcttcccgtaaccaag 11008725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 16933988 - 16934302
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||   | ||||||||||||||| | |||| |||||||||  ||     
T  16933988 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttaatgtgtggagcaagggaa--ttaagcaaccaaaacaa-gcgtatggaataatta--aat 16934081  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa--aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggg 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  || ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  16934082 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggg 16934181  T
Q  210 gagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatc 309  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||   |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  16934182 gagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 16934280  T
Q  310 ccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  16934281 tcaatctcttcccgtaaccaag 16934302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 22780212 - 22780532
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||  ||   |||||||    
T  22780212 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaacaaagcgtatcaaag--ttataaa 22780308  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     | ||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || |||||   ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||     
T  22780309 tataagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctg 22780408  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  22780409 ggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaa 22780507  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  22780508 gtcccaatctcttcccgtaaccaag 22780532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5101404 - 5101130
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5101404 tgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggatcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaac 5101305  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||   |||||||| |               ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5101304 acaagccaaagggagaaaacaccg--------------agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggaga 5101220  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctaccc 303  Q
     ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  5101219 tagcagccctccgttttactatatgatgagtaaatttacaaaagacatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaagtctaccc 5101130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 14789273 - 14789494
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  14789273 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaac 14789372  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagag-agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggg--g 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  14789373 acaagccaaaagtagaaaacaac-tagagagaaaaagaagagaagaacac--aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggag 14789469  T
Q  211 agagagcagccctccatttcactat 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  14789470 agagagcagccctccgtttcactat 14789494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 41997968 - 41997669
Alignment:
Q  21 aatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagcc 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||| ||||| |     
T  41997968 aatttgatgaaaaaacacaccaataataaacttgatgtgtggagaaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataatcacaaac- 41997872  T
Q  121 aaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagc 220  Q
    |||| |||||||||   ||||||| |||| ||||||||||  |  | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  41997871 aaaagtagaaaaca---gcgagagcaaagaaagagagaacttatga-aatttgtttatccagttcggtccaaattaacctagtct-ggggagagagcggc 41997777  T
Q  221 cctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctctt 319  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| || || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  41997776 cctccgtttcactatgatgatgagtaactttacaaaagagatattaaagggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaaatctcaatctttt 41997677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16455715 - 16455414
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||     
T  16455715 ctgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat 16455616  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    || |||| |||| ||||||||| |                |||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16455615 cataagctaaaactagaaaacagc----------------gagagaacacaaga--atttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggag 16455534  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    ||||||| | ||| |||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  16455533 agagcagtcatccgtttcactataatgacgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctc 16455434  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  16455433 aatctcttcctgtaaccaag 16455414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 18709003 - 18709323
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatc-acaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  18709003 tgttgtgaatttgatgaaaaaaccacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaaggcataatcaagcaaccaaaacaaagtgtat-gaa-agttataaa 18709099  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     ||||||||| | ||||||||||| |||||| |||   || |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||     
T  18709100 tacaagccaatagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctg 18709199  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||   |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18709200 ggggagagagcagtcctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaa 18709298  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     || |||||||||||||||||||||    
T  18709299 gtcgcaatctcttcccgtaaccaag 18709323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 22132229 - 22132551
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| |||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  ||    
T  22132229 tgttgtgaatctgatcaataatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaatta--aa 22132325  T
Q  113 cacaagccaaaattag--aaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataa-tttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtc 204  Q
     ||||||||||| ||   |||||||| |||||| |||   || ||||||| ||| || ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  22132326 tacaagccaaaagtaagaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaagaccaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagta 22132425  T
Q  205 taggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctaccca 304  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22132426 taggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccca 22132524  T
Q  305 aaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    || |||||  |||||||||||||||||    
T  22132525 aagtcccagcctcttcccgtaaccaag 22132551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 36380818 - 36380522
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaa 130  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||| || |||  ||  |||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  36380818 aaaatcacaccaataaaatatttgatgtgtggagtaagtaatgatcaagcaatcaaa-caaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaa 36380720  T
Q  131 aacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttc 230  Q
    ||||  ||   |||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  || |    
T  36380719 aacagaag---gagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgtttacccagttcgctccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactcagttcc 36380624  T
Q  231 actatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaacca 329  Q
    |||||  ||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  36380623 actataatgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttccggtaacca 36380524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 22134457 - 22134776
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| |||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||     
T  22134457 tgttgtgaatctgatcaataatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aat 22134553  T
Q  114 acaagccaaaattag--aaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
    ||||||||||| ||   |||||||| |||||| |||   || ||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  22134554 acaagccaaaagtaagaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaagacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct- 22134652  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  22134653 ggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaat 22134751  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||||  || ||||| ||||||||    
T  22134752 gtcccagccttttcccataaccaag 22134776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 11006094 - 11006396
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||     
T  11006094 tgttgtgaattcgatcgaaaaacacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aat 11006190  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaa-caacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||| |||| ||||||| |||| ||||||            ||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11006191 acaagcaaaaagtagaaaaacaacggcgaga------------agaacacaaaagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggag 11006278  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||||||||  | |||||| |||||||||   |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  11006279 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaccattac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 11006377  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
      |||||||||||||||||    
T  11006378 gcctcttcccgtaaccaag 11006396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 53405626 - 53405356
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  | |||||||     
T  53405626 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaaatgtatgga--agttataaat 53405529  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcg-agagaa---aaggaagag-agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| | ||||   || |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  53405528 acaagccaaaagtagaaaacatcggcgaaaagaacacaaagaagagaagaacaaaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct--g 53405431  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataag 283  Q
    || ||||||||| |||  || |||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  53405430 ggggagagcagctctctgttccactatatgatgagtatcgtttcaaaagagaaatcaatgggttacaagaataag 53405356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 324
Target Start/End: Original strand, 38890090 - 38890379
Alignment:
Q  30 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattaga 129  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| |||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||||| |||   ||||||||||||| ||||||||||    
T  38890090 aaaaatcacaccaataaaatatttgatatgtggagcaaggaataatctagcaaccaaa-caaagtgtatggaag--ttataaacacaaggcaaaattaga 38890186  T
Q  130 aaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagccctccatt 228  Q
    |||||   |||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| | |||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||    
T  38890187 aaaca---gcgagagaaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctaatcttggggagagagcagccctctgtt 38890282  T
Q  229 tcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgt 324  Q
     ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  38890283 ccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccttctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgt 38890379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 19323177 - 19322866
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||| |||   ||||||||    
T  19323177 tgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaactaaaataaagtgtatggaag--ttataaac 19323081  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctaggggag 212  Q
    || ||| |||| || |||||| | |   |||||| | |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  19323080 acgagc-aaaagtataaaacacctg---gagaaa-gaaagagagaacactaaagaatttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggag 19322986  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    |||||| |||||| || ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  19322985 agagcatccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctc 19322886  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  19322885 aatctcttcccgtgaccaag 19322866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 56030945 - 56030617
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||     
T  56030945 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatatgtggagcaagagatagtcacgcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaat 56030848  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaac-agcgagagaaa--ag-gaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggt-------------ccaaattg 196  Q
    |||| | |||| ||||||||| | || || |||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||             ||||||||    
T  56030847 acaaac-aaaagtagaaaacagcgagagaaagaaagaagtgaatagagaacacgaaataatttgttgacccagttcggtgacccagttcggtccaaattg 56030749  T
Q  197 acctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | |||||| ||| ||||||||||| || ||||||  ||||||||| |||||| |||||||||    
T  56030748 acctagtctaggggagagagcagccctccgtttca---tatgatgaataacgttacaaaagaaatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaat 56030652  T
Q  297 tctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  56030651 tctacccaaagctccaatctcttcccgtaaccaag 56030617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 210
Target Start/End: Original strand, 52942329 - 52942527
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataa 111  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| || ||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  52942329 tgttgcaaattcgatgaaaaaatcacacaaataacaaatttgatgtgtggagtaagagataatcaggcaatcaaaatcaaagtgtatggaacaattataa 52942428  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggg 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52942429 acacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagaggaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggg 52942527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6133309 - 6133122
Alignment:
Q  30 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattaga 129  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6133309 aaaaattacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccgaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagtcaaaagtaga 6133210  T
Q  130 aaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcag 219  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6133209 aaacaac-gagagagaaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccaattcgatccaaattgacctagtctgggtgagagagcag 6133122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 30137026 - 30136722
Alignment:
Q  21 aatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagcc 120  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||| | | ||||| |||| | ||||  ||| |||| ||||||||  |||||||||||||   |||||||||||| ||    
T  30137026 aattcgatgtaaaatcacatcaataa-atatttgatatgtggaacaagtaataatcaaacaaccaaat-aaagtgtatagaag--ttataaacacaaacc 30136931  T
Q  121 aaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagc 220  Q
    |||| ||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  30136930 aaaagtagaaaacaaca---agagaaaagaaagagagaacacaaaagaatttgtttatccaattcggtccaaattgacctagtattgaggagagagcagc 30136834  T
Q  221 cctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctctt 319  Q
    | ||  |||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  30136833 catctgtttcactataatgatgattaactttacaaaagagatatcgatgagtcacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcacaatttctt 30136734  T
Q  320 cccgtaaccaag 331  Q
    | ||| ||||||    
T  30136733 ctcgtgaccaag 30136722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 331
Target Start/End: Original strand, 18534703 - 18534993
Alignment:
Q  35 tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaaca 134  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| | |||| ||||||| |    
T  18534703 tcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaacacaaac-aaaagtagaaaata 18534799  T
Q  135 acagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcact 233  Q
       |||||||||| | |||||||||||||  | |||||||| | || ||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||||| |||||| || ||||    
T  18534800 ---gcgagagaaa-gaaagagagaacacacga-aatttgtttaccctgttcggtccaaaacttacctagtctgggggggagagcacccctccgttccact 18534894  T
Q  234 atg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||    
T  18534895 ataattatgagtagttttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttctcgtgaccaag 18534993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 331
Target Start/End: Original strand, 18537345 - 18537635
Alignment:
Q  35 tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaaca 134  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||| ||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||| |||   |||||||||||| | |||| || ||||||    
T  18537345 tcacacctataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaag--ttataaacacaaac-aaaagtataaaaca 18537441  T
Q  135 acagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcact 233  Q
    ||   |||||||| | |||||||||| || || |||||||| | ||||||||||| |||  ||||||| | | ||||||||||||||||||| || ||||    
T  18537442 ac---gagagaaa-gaaagagagaacgcacaa-aatttgtttacccagttcggtcaaaaaatgacctattatgggggagagagcagccctccgttccact 18537536  T
Q  234 atg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||    
T  18537537 ataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcccgtgaccaag 18537635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 49089044 - 49088791
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  49089044 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgttgagtaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaac 49088945  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct-aggggag 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||                |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  49088944 acaagccaaaagtagaaaacaac----------------gagagaacgc-aaagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctggggggag 49088862  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaag-agatatcaatggattacaagaataa 282  Q
    |||| ||  |||  ||||||||| |||||| |||  ||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||    
T  49088861 agagtagttctctgtttcactatatgatgactaacattacaaaagaagatgtcaatgagttacaagaataa 49088791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 321
Target Start/End: Original strand, 18409192 - 18409497
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||     
T  18409192 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataat 18409289  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaat--aatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggg 210  Q
    |||||| ||||| ||||||| |   |||||||||||  || | | || | || |   |||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||  |||    
T  18409290 cacaagacaaaagtagaaaata---gcgagagaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacacgaaatttgtttacccagttcaatccaaattgacctagtctgaggg 18409386  T
Q  211 agagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatc 309  Q
    |||||||| | |||  |||||||||  ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  18409387 agagagcaactctctgtttcactataatgatgggtaac-ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctaccaaaagtc 18409485  T
Q  310 ccaatctcttcc 321  Q
     |||||||||||    
T  18409486 tcaatctcttcc 18409497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 191 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13544272 - 13544132
Alignment:
Q  191 aaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccg 290  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  13544272 aaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccg 13544173  T
Q  291 cctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13544172 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcacgtaaccaag 13544132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 180 - 327
Target Start/End: Original strand, 47210761 - 47210908
Alignment:
Q  180 cagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaa 279  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  47210761 cagttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 47210860  T
Q  280 taagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaac 327  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  47210861 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaac 47210908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Original strand, 3824464 - 3824630
Alignment:
Q  29 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaacacaagcc-aaaatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |    
T  3824464 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaaatgtatggaacagttataaacacaagccaaaaagt 3824563  T
Q  127 ag-aaaacaacagcgag-agaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtcca 191  Q
    || |||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  3824564 agaaaaacagcagcaagaagaaaaagaatagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcca 3824630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28454151 - 28453855
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaa 130  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||| |||| |||||    
T  28454151 aaaatcacaccaatatattacttgatgtgtgaagcaaa--ataatcaagaaaccaaaacaaagtggatg--acaattataaacacaagc-aaaagtagaa 28454057  T
Q  131 aacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccatt 228  Q
    |||||| | |||| | |||| |||||||||||||  | |||||||| | |||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||| ||  |||| ||    
T  28454056 aacaaccg-gagaaagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactaacctagtctgggggagagagtagttctccgtt 28453959  T
Q  229 tcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaac 327  Q
     ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||| |  |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  28453958 ccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaagtttacaagaattagtcttcaacctaattctacccaaggtccaaatctcttcccgtaac 28453859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 205
Target Start/End: Original strand, 3937126 - 3937308
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |  || || |    
T  3937126 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgaggagcaagggataatcaagcaacc-aaacaaagtgtatggaaga--taaaatc 3937221  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct 205  Q
    ||||  ||||| ||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  3937222 acaa-acaaaagtagaaaacaa---cgagag-aaagaaagagagaacacaaatgaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtct 3937308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 8756103 - 8756411
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| | |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| |||  |   | | ||||||||    
T  8756103 tgttgtgaattcgatgaaaa-tcacatcaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaac 8756198  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaatt-gacctagtctaggggag 212  Q
    |||||| |||| || ||||||||   |||||||| | ||||||||||||| || |||||||| | |||||||| ||||||   |||||||||| | ||||    
T  8756199 acaagc-aaaagtaaaaaacaac---gagagaaa-gaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcgctccaaaaccgacctagtctggaggag 8756292  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    |||||| || ||| || ||||||  |||| |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| || |    
T  8756293 agagcaaccatccgttccactataatgattagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctactcaaagtctc 8756392  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaa 330  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  8756393 aatctcttcccgtgaccaa 8756411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25358107 - 25357859
Alignment:
Q  30 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaa-aacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattag 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| || || | |   |||||||||||| ||||| |||    ||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  25358107 aaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggaggaaagcaa--tcaagcaaccaataacaacgtgg---gaacaattataaacacaagc-aaaagtag 25358014  T
Q  129 aaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccat 227  Q
    ||||||||   ||||||||  |||||||||||||| || |||||||| | |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  25358013 aaaacaac---gagagaaa--gaagagagaacacacaaaaatttgtttacccagttaggtccaatactgacctagtctaggggagagagcagctatccgt 25357919  T
Q  228 ttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtct 286  Q
    |  |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25357918 tctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtct 25357859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 230 - 330
Target Start/End: Original strand, 3824629 - 3824729
Alignment:
Q  230 cactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaacca 329  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  3824629 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacca 3824728  T
Q  330 a 330  Q
    |    
T  3824729 a 3824729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 230 - 331
Target Start/End: Original strand, 5637524 - 5637625
Alignment:
Q  230 cactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaacca 329  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  5637524 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacca 5637623  T
Q  330 ag 331  Q
    ||    
T  5637624 ag 5637625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12102566 - 12102259
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||    
T  12102566 tgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataaactacttgatgtgtggagcaagtaataaccgagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaac 12102470  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||| ||| |    ||| ||||| ||||||||    |||||| | || ||||   ||||| | | |||||||||||||  ||||||||| | ||||||    
T  12102469 acaagcaaaagt----aaaaaacagtgagagaaag---agagagcatacgaaat---ttgtttacctagttcggtccaaaactgacctagtatgggggag 12102380  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctac-cgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
    ||||||||||||| || ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||| | |    
T  12102379 agagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcagtgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagttc 12102280  T
Q  311 caatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||| ||||| | ||||||    
T  12102279 caatcttttcccatgaccaag 12102259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 316
Target Start/End: Original strand, 15032410 - 15032694
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaa 130  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||| |||   ||||||||| || | |||| |||||    
T  15032410 aaaatcacaccaataaaatacttgatgtgcggagcaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaag--ttataaacataaac-aaaagtagaa 15032505  T
Q  131 aacaacagcgagagaaa---aggaagagagaacacaaaataatttgttgatcc-agttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctcc 225  Q
    ||  |||||||||||||   || |||| ||||||||  | |||||||  | || |||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||| || |    
T  15032506 aa--acagcgagagaaagaaagaaagaaagaacacacga-aatttgtataccctagttcggtccaatactgacctagtttgggggagagagcagctcttc 15032602  T
Q  226 atttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatct 316  Q
     || |||| |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  15032603 gttccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctaccaaaagtccaaatct 15032694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Original strand, 16185774 - 16185996
Alignment:
Q  106 ttataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtc 204  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||   |||| | ||  |||||||||||||  | |||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||    
T  16185774 ttataaacacaagc-aaaagtagaaaacaac---gagaaacaaaaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtc 16185868  T
Q  205 taggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccg-cctaattctacc 302  Q
    | ||||||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||  ||||||| || ||||||| || || ||||||||||||| |   ||||||||||||    
T  16185869 tgggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gatatatcaaagggttgcaagaataagtcttcaaacctaattctacc 16185967  T
Q  303 caaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  16185968 caaagttccaatctcttcccgtgaccaag 16185996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 135
Target Start/End: Original strand, 47210637 - 47210755
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||     
T  47210637 tgttgcgaattcgttgtgaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataataaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaat--taaat 47210733  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaa 135  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  47210734 acaagccaaaagtagaaaacaa 47210755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 5664722 - 5664576
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||| || | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||      
T  5664722 tgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataaaatacttgatgtgtggagaaggtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataatg 5664626  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacaca 163  Q
    |||| |||||| |||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||    
T  5664625 acaaaccaaaagtagaaaacattaacgagagaaaagaaagagagaacaca 5664576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 241 - 306
Target Start/End: Original strand, 52942528 - 52942594
Alignment:
Q  241 gagtaatgtt-acaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52942528 gagtaatgtttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 52942594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 331
Target Start/End: Original strand, 31983564 - 31983689
Alignment:
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctac-cgcctaattctacccaa 305  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| |   |||||||||||||||    
T  31983564 gggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaaaagatatcaaagggttacaaaaataagtcttcaaacctaattctacccaa 31983663  T
Q  306 aatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    | || |||||||||||| | ||||||    
T  31983664 agtctcaatctcttcccatgaccaag 31983689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 114
Target Start/End: Original strand, 38270016 - 38270091
Alignment:
Q  36 cacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaaca 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||    
T  38270016 cacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaaaacaa---gtatggaacaattataaaca 38270091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 182 - 331
Target Start/End: Original strand, 3982186 - 3982339
Alignment:
Q  182 gttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaa 279  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |  |||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  3982186 gttcggtccaatagtgacctagtatgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagtgttacaagaa 3982285  T
Q  280 taagtctac-cgcctaattctacccaaaatccc-aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    | ||||| |   | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  3982286 tcagtcttcaaacttaattctacccaaagtcccaaatctcttcccgtgaccaag 3982339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 320
Target Start/End: Original strand, 47150868 - 47151044
Alignment:
Q  146 aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgag 243  Q
    |||| |||||||||||||| | |||| ||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |  ||  || ||||||  |||||||    
T  47150868 aaagaaagagagaacacaaga-aattagtttacccaattcggtccaatattgacctagtctaggggagataacatctatctgttccactataatgatgag 47150966  T
Q  244 taatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctac-cgcctaattctacccaaaatcccaatctcttc 320  Q
     ||  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  47150967 caactttagaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaattctcaatctcttc 47151044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Original strand, 10047383 - 10047448
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  10047383 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatg 10047448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Original strand, 39245998 - 39246063
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39245998 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatg 39246063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 331
Target Start/End: Original strand, 5336764 - 5336942
Alignment:
Q  155 gagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat-gtgatg-agtaatgtta 251  Q
    |||||||||||| |||||||| |  |||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||||  ||||| | |  | |||    
T  5336764 gagaacacaaaagaatttgtttaatcagttcagtccaatattgacctactataggggagagagcagctctccgttccactataatgatgaatttctttta 5336863  T
Q  252 caaaagagatatcaatggattacaagaataagtctac-cgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    | |||||||||| |  ||||||||||||| ||||| |   ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  5336864 c-aaagagatataagaggattacaagaattagtcttcaaacctaattctaccc-aagtcccaatctcttcccgtgaccaag 5336942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6743507 - 6743443
Alignment:
Q  172 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  6743507 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctccaatccactatg 6743443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6133088 - 6133045
Alignment:
Q  288 ccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  6133088 ccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaag 6133045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Original strand, 18311215 - 18311278
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaa-atcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtc 76  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18311215 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagtgatagtc 18311278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5269284 - 5269219
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5269284 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatg 5269219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 10113337 - 10113272
Alignment:
Q  28 tgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtg 95  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  10113337 tgaaaaatcacaccaataaaatatttgatgtgtggagcaa--aataatcaagcaaccaaaacaaagtg 10113272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31300636 - 31300541
Alignment:
Q  140 gagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat 235  Q
    |||| |||||||||| |||  ||| ||||||||||| | ||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  31300636 gagataaaaggaagaaagagaacacaataatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtct-ggggagagagcagccctccgttccactat 31300541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36315321 - 36315257
Alignment:
Q  172 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  36315321 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatg 36315257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36329530 - 36329466
Alignment:
Q  172 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  36329530 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatg 36329466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 223
Target Start/End: Original strand, 54867188 - 54867239
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccct 223  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54867188 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtct-ggggagagagcagccct 54867239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 276 - 331
Target Start/End: Original strand, 3937314 - 3937369
Alignment:
Q  276 agaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||    
T  3937314 agaataagtctcccacctaattctacccaaagcctcaatctcttcctgtaaccaag 3937369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 10113196 - 10113050
Alignment:
Q  179 ccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatc-aatggattaca 275  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||  |||| |||||  |||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  10113196 ccagttcggtccaatactaacctagtcttggggagagagcagctctccattccactataatgattagtaacattac-aaagagatatcaaaaaggttaca 10113098  T
Q  276 agaataagtctac-cgcctaattctacccaaaatcccaatctcttccc 322  Q
    ||||| ||||| |    ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  10113097 agaattagtcttcaaatctaattctacccaaagtcctaatctcttccc 10113050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5396764 - 5396699
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | |||||||    
T  5396764 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatg 5396699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9022603 - 9022476
Alignment:
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatgga--ttacaagaataagtctaccg-cctaattctacc 302  Q
    |||||||||||||||||   || ||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||| |   |||||||| |||    
T  9022603 ggggagagagcagccctttgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagatatcaatagaggttacaagaattagtcttcaaacctaattcaacc 9022505  T
Q  303 caaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||||    
T  9022504 caaagtctcaatctcttcccgtgaccaag 9022476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31985726 - 31985662
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  31985726 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatct-ggggagagagcagctctccaatccactatg 31985662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 38152532 - 38152467
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||| || ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  38152532 ttgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactatg 38152467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4885087 - 4884991
Alignment:
Q  140 gagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat 235  Q
    |||| |||||||||| |||  ||| || |||||||| | ||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||    
T  4885087 gagataaaaggaagaaagagaacacaagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactat 4884991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 12739550 - 12739594
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  12739550 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 12739594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15831337 - 15831258
Alignment:
Q  156 agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat 235  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||    
T  15831337 agaacacaagata-tttgtttatccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactat 15831258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22295560 - 22295412
Alignment:
Q  104 aattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctag 202  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||| | ||||||| |||||| | || |||||    
T  22295560 aattataaacacaag-caaaggtagaa---aacagcgagag-aaaggaagagagaacacatga-aatttgtttacccagttcagtccaatactgccctag 22295467  T
Q  203 tctaggggagagagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaa 256  Q
    | | ||||||||||||   ||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||    
T  22295466 tgtgggggagagagcaattctccattccactataatgatgagtaactttacaaaa 22295412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 26175636 - 26175680
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  26175636 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 26175680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 36463389 - 36463433
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  36463389 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 36463433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 36769664 - 36769596
Alignment:
Q  168 aatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat 235  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||    
T  36769664 aatttgtttatccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactat 36769596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 48893638 - 48893682
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  48893638 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 48893682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 52467354 - 52467398
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  52467354 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctcggggagaga 52467398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 72)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15073202 - 15072885
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15073202 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaattataaac 15073103  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15073102 acaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaag-aagagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggaga 15073004  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    |||||||||||| || |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15073003 gagcagccctccgttccactgtatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaa 15072904  T
Q  314 -tctcttcccgtaaccaag 331  Q
      |||||| ||||||||||    
T  15072903 ccctcttctcgtaaccaag 15072885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 41383154 - 41382837
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  41383154 tgttgcgagttcgatgaaaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaatcaaaacaaagtttatggaacaattataaac 41383055  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41383054 acaagccagaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 41382955  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  41382954 gagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaa 41382855  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41382854 tctcttcccgtaaccaag 41382837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15068472 - 15068157
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  15068472 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaacaacaaacttgatgtgtggaacaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattacaaac 15068373  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  15068372 acaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaag-aagggtgaacacaaaagaatttgttggcccagttcagtccaaattgacctagtctgggggaga 15068274  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    |||||||||||| || || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||    
T  15068273 gagcagccctccgttccattatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaa 15068174  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaa 330  Q
     ||||| ||||||||||    
T  15068173 cctctttccgtaaccaa 15068157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 331
Target Start/End: Original strand, 30480365 - 30480663
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaa 130  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30480365 aaaatgacaccaataacaaatttgatgtgtggagtaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaatacaagccaaaagtagaa 30480464  T
Q  131 aacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttc 230  Q
    |||| | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  30480465 aacagc-gagagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccatttc 30480562  T
Q  231 actatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaa 330  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  30480563 actatatgatgactaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtgaccaa 30480662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 28251410 - 28251727
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  28251410 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataat 28251508  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28251509 cacaagccacaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggag 28251608  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||||||||  | |||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  28251609 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttataagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtccca 28251708  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
      |||||||||||||||||    
T  28251709 gcctcttcccgtaaccaag 28251727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14808252 - 14807926
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  14808252 tgttgcgcattcgatgaaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaacggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaa 14808153  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct------- 205  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||           
T  14808152 cacaagccaaaagtagaaaacaac-gagagagaaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggag 14808055  T
Q  206 ---aggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacc 302  Q
        ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14808054 agagggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacc 14807955  T
Q  303 caaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||| |||||  |||||||||||||||||    
T  14807954 caaagtcccagcctcttcccgtaaccaag 14807926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 14419035 - 14419351
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14419035 tgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtatggagcaagtgataatcaggaaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaac 14419134  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14419135 acaagtcaaaagtagaaaacagc-gagagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 14419232  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||| ||  |||||||||  ||||||||||  |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  14419233 gagcagccatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagacatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 14419332  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14419333 atctcttcccgtaaccaag 14419351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 41385233 - 41384919
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaa-gtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  41385233 tgttgcgaattccatgaaaaatcacacaaataacaaacttg----gtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaaagtgtatggaacaattataaa 41385138  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  41385137 cacaagccaaaagtataaaacaacagcgagagaaatggaagagagaacagaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggag 41385038  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||| || ||| || |||||||||||| |||   |||    
T  41385037 agagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaattctcccacctaattctacctaaagctcca 41384938  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||    
T  41384937 atctcttcccgtaaccaag 41384919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 27106747 - 27107057
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    |||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||| |    
T  27106747 tgttgcaaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataatc 27106844  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||| | ||||| |||||||||||   |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  27106845 aca-gacaaaagtagaaaacaac---gagagaaa-gaaagagaaaacacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggaggaga 27106939  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||    
T  27106940 tagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccctacaaaagagatatctatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaa 27107039  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27107040 tctcttcccgtaaccaag 27107057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27829791 - 27829472
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||    
T  27829791 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aa 27829695  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     | ||| ||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27829694 tataagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 27829595  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  27829594 gggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaagg 27829496  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||  |||||||||||||||||    
T  27829495 tcccagcctcttcccgtaaccaag 27829472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 28283062 - 28283379
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||  |||||     
T  28283062 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaaaaa--ataaat 28283158  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28283159 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-gg 28283257  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  28283258 ggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttgcaagaataagtctaccacctaattctacccaaagc 28283356  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28283357 cccaatctcttcccgtaaccaag 28283379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27827479 - 27827161
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||     
T  27827479 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aat 27827383  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  27827382 acaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctggg 27827283  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  27827282 ggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaggt 27827184  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||  ||||||| |||||||||    
T  27827183 cccagcctcttcctgtaaccaag 27827161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25953010 - 25952695
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||    
T  25953010 tgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagaaagtgataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaagcaattataaac 25952911  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    |||| |||||| ||||||||    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  25952910 acaatccaaaagtagaaaacg---gcgagagaaaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatttacctagtctgggggaga 25952814  T
Q  214 gagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||||||| || ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  || ||    
T  25952813 gagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtcttctgcctaattctacccaatgtctca 25952714  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  25952713 atttcttctcgtaaccaag 25952695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15956443 - 15956133
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||| |    
T  15956443 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtat-gaa-agttataatc 15956346  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    |||| | ||| | ||||||||||   |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||    
T  15956345 acaaacgaaagt-agaaaacaac---gagagaaaag-aagagagaatacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctaatctgagggaga 15956251  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||| | |||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15956250 gagaaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 15956151  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaa 330  Q
    |||||||||||| |||||    
T  15956150 atctcttcccgtgaccaa 15956133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15809712 - 15809393
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||  ||    
T  15809712 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta--aa 15809617  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15809616 tacaaggcaaaaatagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 15809517  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    || ||||||||||||||   | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  15809516 ggaagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 15809417  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||| | | ||||||||||||||||    
T  15809416 tcctagtttcttcccgtaaccaag 15809393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 32339803 - 32339484
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  ||    
T  32339803 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggggcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta--aa 32339708  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32339707 tacaagtcaaaagtagaaaataacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttaacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 32339608  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  32339607 gggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 32339508  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  32339507 ccccaatctcttcccgtaaccaag 32339484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3874487 - 3874185
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||     
T  3874487 tgttgtgaattcgttgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataaccaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aat 3874391  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||            ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3874390 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgaga------------agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 3874303  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    ||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  3874302 gagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccag 3874203  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||||||||||||||||    
T  3874202 cctcttcccgtaaccaag 3874185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 4424512 - 4424193
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  ||    
T  4424512 tgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttggtgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaatta--aa 4424417  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4424416 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 4424317  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    |||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  4424316 gggagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaatgttacaaaagataaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaag 4424217  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
      ||||||||||||||||||||||    
T  4424216 ctccaatctcttcccgtaaccaag 4424193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18811202 - 18810883
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  ||    
T  18811202 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta--aa 18811106  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  18811105 tacaagccaaaagtagaaaacgacagcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctaatctgg 18811006  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  18811005 gggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaag 18810907  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||  || ||||||||||||||    
T  18810906 tcccagcctattcccgtaaccaag 18810883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 36866012 - 36865717
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaa 130  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36866012 aaaaccacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacaaaagccaaaagtagaa 36865913  T
Q  131 aacaac-agcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtc-taggggagagagcagccctccatt 228  Q
    |||||| || || ||||||  |||| ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||| ||    
T  36865912 aacaacgagagaaagaaaa-aaagacagaacacaagagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagcattccgtt 36865814  T
Q  229 tcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgt 324  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  36865813 tcactataatgatgagtaactttacaaaagagatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccaatctcttcccgt 36865717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 43530609 - 43530293
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||     
T  43530609 tgttgcgaattcaatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aat 43530513  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43530512 acaagccaaaagtagaaaacaatggcaagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg 43530413  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
     |||| |||||||||||  | |||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  43530412 agagacagcagccctccgatccactatatgatgagtagcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaggaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 43530313  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaacc 328  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  43530312 cccagcctcttcccgtaacc 43530293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 44721338 - 44721019
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||| |||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  44721338 ctgttgtgaatctgatcaataatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataatta--aa 44721242  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  44721241 tacaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgc 44721142  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  44721141 gggagagagcagctctccaatccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 44721043  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||  |||||||||||||||||    
T  44721042 tcccagcctcttcccgtaaccaag 44721019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 43082468 - 43082149
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  43082468 ctgttgtgaatctgatcaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtat-gaa-agttataaa 43082372  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||  || |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  43082371 tacaagccaaaagtagaaaacaacgtcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgg 43082272  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||   |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  43082271 gggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaag 43082173  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  43082172 tcccaatctcttcccgtaaccaag 43082149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Original strand, 13858332 - 13858644
Alignment:
Q  12 cctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataa 111  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||    
T  13858332 cctgttgtaaattcgatgaaaaatcacaccaataagaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataa 13858429  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
    ||||||||||||| |||||   ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  13858430 acacaagccaaaagtagaa---aacagtgagag-aaagaaagggagaacac-aaagaatttgtttacccagttctgtccaaattgacctagtctggggga 13858524  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
    |||||||||||||  |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||    
T  13858525 gagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatat-aatgggctgcaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagccc 13858623  T
Q  311 caatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13858624 caatctcttcccgtaaccaag 13858644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 22684491 - 22684816
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatg--aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattata 110  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||||      
T  22684491 tgttgcgaattcgatggaaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtttatggaacaatta-- 22684587  T
Q  111 aacacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct 205  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22684588 aatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatct 22684687  T
Q  206 aggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaa---tggattacaagaataagtctaccgcctaattctacc 302  Q
     ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22684688 gggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaatagagaaatcaatattgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacc 22684787  T
Q  303 caaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||| |||||  |||||||||||||||||    
T  22684788 caaagtcccagcctcttcccgtaaccaag 22684816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 268
Target Start/End: Original strand, 33541254 - 33541507
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  33541254 ctgttgtgaattcgatcaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaataaagtgtatggaacaattataaa 33541353  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
    |||||||||||| |||||| ||   |||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33541354 cacaagccaaaagtagaaatca---gcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaaatttttgacccaattcggtccaaattgacctagtctggggga 33541450  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatg 268  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33541451 gagagcagccttccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 33541507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 43080096 - 43079778
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||     
T  43080096 tgttgtgaatctgatcaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaatggataattaagcaaccaaaacaaagtgtat-gaa-agttataaat 43080000  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||  || |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  43079999 acaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaacaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggg 43079900  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||   |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  43079899 ggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 43079801  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  43079800 cccaatctcttcccgtaaccaag 43079778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 35872301 - 35872553
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  35872301 tgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaaaaattataaac 35872400  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||             ||||||    
T  35872401 acaagccaaaagtagaaaacaa----gagagaaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-------------gggaga 35872482  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagt 284  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  35872483 gagcagccctccgtttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggcttacaaaaataagt 35872553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 306
Target Start/End: Original strand, 15185564 - 15185850
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||| |    
T  15185564 tgttgtgaattcggtgaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataatc 15185661  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    | || | |||| |||||||||||   |||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15185662 ataaac-aaaagtagaaaacaac---gagagaaa-gaaagagagaacaaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 15185756  T
Q  214 gagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    || ||| ||||| |||||||||  ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  15185757 gaacagtcctccgtttcactataatgatgagtaaccttaaaaaagagatatcaatgggttacaagaataggtctctcgcctaattctacccaaa 15185850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18813377 - 18813057
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataa 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  |    
T  18813377 ctgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatatgtagagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta--a 18813281  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |     
T  18813280 atacaagccaaaagtagaaaacgacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctaatatg 18813181  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18813180 ggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 18813082  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     || ||  ||||||||||| |||||    
T  18813081 gtcacagcctcttcccgtacccaag 18813057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21482798 - 21482485
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaaca--aagtgtatagaataattataa 111  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||| |  |||||||| |||   ||||||    
T  21482798 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagtgataatgaagcaaccaaaaaataaagtgtatggaag--ttataa 21482701  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
     ||||| | |||| |||||||||   |||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  21482700 tcacaaac-aaaagtagaaaaca---gcgagagaaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtttggggga 21482606  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
    |||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||    
T  21482605 gagagcagccctccgtttctttataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcactcgcctaattctacccaaagccc 21482506  T
Q  311 caatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  21482505 caatctcttcccataaccaag 21482485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 33 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1225626 - 1225341
Alignment:
Q  33 aatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaa 132  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||           ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  1225626 aatcacgccaataacatacttgatgtgtggaacaaggaataatcaagcaaccaaaacaaac----------aattataaacacaagtcaaaagtagaaaa 1225537  T
Q  133 caacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcac 232  Q
    ||   |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||| ||||||    
T  1225536 ca---gcgagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcggccatccgtttcac 1225441  T
Q  233 tatgtgatgagtaatgttac-aaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1225440 tatatgatgagtaacgttacaaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaag 1225341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 609230 - 608909
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatagaataattataa 111  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||  || |||||  |    
T  609230 tgttgtgaattcgatgaaaa-tcgcaccaataacaa-cttgatgcgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtatgaaacaatta--a 609135  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaat-aatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct 205  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||   || ||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  609134 atacaagccaaaagtagaaaacaacggcaagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtct 609035  T
Q  206 aggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaa 305  Q
     |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  609034 gggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaa 608935  T
Q  306 aatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    | |||||  |||||||| ||||||||    
T  608934 agtcccagcctcttcccataaccaag 608909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Original strand, 37214109 - 37214314
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37214109 tgttgtgaatttgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtatggagtaagagataagcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaattataaac 37214208  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  37214209 acaagccaaaagtagaaaacaac-gagagag-aaaggaagagaaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggtaga 37214306  T
Q  214 gagcagcc 221  Q
    ||||||||    
T  37214307 gagcagcc 37214314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 300
Target Start/End: Original strand, 2467979 - 2468259
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||  | |||||| |    
T  2467979 tgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtaggga--agttataatc 2468075  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||  ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| | | ||||| ||||||||||||||| ||| || ||||    
T  2468076 acaaaacaaaattagaaaacaa---cgagagaaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacctagttctgtccaaattgacctaatctgggagaga 2468171  T
Q  214 gagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattcta 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2468172 gagcagccctctatttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggctacaagaataagtctcccgtctaattcta 2468259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21480990 - 21480677
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatagaataattataa 111  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||| || | |||| |||||||||  |||||||||| |||   ||||||    
T  21480990 tgttgtgaattcgatgaaaaataacaccaataataaacttgatgtgtggagtaagtgacaatcaaacaaccaaaaaacaaagtgtatggaag--ttataa 21480893  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
     ||||| | ||||  ||||||||||   |||||||||| |||||||||||||  | | ||| || | |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21480892 tcacaaac-aaaagaagaaaacaac---gagagaaaagaaagagagaacacacga-attttttttacccagttcgttccaaattgacctagtctggggga 21480798  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
    |||||||||||||  |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||    
T  21480797 gagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcacccgcctaattctaccaaaaaccc 21480698  T
Q  311 caatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  21480697 caatatcttcccgtaaccaag 21480677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 331
Target Start/End: Original strand, 5372042 - 5372338
Alignment:
Q  30 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaac-aaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattag 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||| |||    
T  5372042 aaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaatggatattcaagcaactaaaattaaaatgtatggaacagttataaactcaagccaaaagtag 5372141  T
Q  129 aaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggg-agagagcagccctccat 227  Q
    |||||||    ||||||||     || |||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||| |    
T  5372142 aaaacaat---gagagaaa-----gaaagaacagaaaataatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagtaaccctccgt 5372233  T
Q  228 ttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaa 326  Q
    ||||||||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  5372234 ttcactataatgatgagtaaccttacaaaaaagatatcaatgagttacaagaataagtctgccgcctaattatactcaaagtcccaatctcttcccataa 5372333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 31162683 - 31162384
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaa 130  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||  ||| | ||| |||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||| |||||    
T  31162683 aaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataattaagtaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaatacaagccaaaagtagaa 31162586  T
Q  131 aacaacagcgagagaaaaggaaga-gagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctagggg--agagagcagccctcca 226  Q
    ||||||   |||||||||| || | |||||||||  | |||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||||||||||      
T  31162585 aacaac---gagagaaaagaaaaaagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggggggagagagcagccctctg 31162490  T
Q  227 tttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgta 325  Q
    || ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  31162489 ttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagtcccaatctcttccggtg 31162390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 152 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27911367 - 27911189
Alignment:
Q  152 agagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgtta 251  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||  |||    
T  27911367 agagagagcacaaaagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtct-ggggagagagcaaccctccgtttcactatatgatgagtaacttta 27911269  T
Q  252 caaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27911268 caatagagatatcaatgagttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaag 27911189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 152 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27957786 - 27957608
Alignment:
Q  152 agagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgtta 251  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||  |||    
T  27957786 agagagagcacaaaagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtct-ggggagagagcaaccctccgtttcactatatgatgagtaacttta 27957688  T
Q  252 caaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27957687 caatagagatatcaatgagttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaag 27957608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Original strand, 24873038 - 24873340
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataa 111  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||    
T  24873038 ctgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaacaaagtgtat-gaa-agttataa 24873134  T
Q  112 acacaagccaaaat-tagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggg 210  Q
    | |||||||||||  ||||||||||| ||||||            |||||||| ||  |||||||||  || ||||||||||  ||||||||| | ||||    
T  24873135 atacaagccaaaaggtagaaaacaacggcgaga------------agaacacagaa--atttgttgactcaattcggtccaatctgacctagtatggggg 24873220  T
Q  211 agagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||   |||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  24873221 agagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatcggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 24873319  T
Q  311 caatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  24873320 caatctctttccgtaaccaag 24873340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14477740 - 14477521
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||  |||||||||||||||||||  || ||| ||||||    
T  14477740 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatcataaac 14477641  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatc-cagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
    |||||||||||    |||| || ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  14477640 acaagccaaaa----aaaaaaaaagcgagagagaaaagaagaaagaacacaaaagaatttgttgaccgcagttcgatccaaattgacctagtctggggta 14477545  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactat 235  Q
     |||| |||| ||| |||||||||    
T  14477544 aagagtagccatccgtttcactat 14477521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 3005486 - 3005792
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||||||||| |||   |||||||     
T  3005486 tgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaaacaaccaaa-caaagtgtatggaag--ttataaat 3005581  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||  ||||     |||||||     |||| ||| ||| |||||||||| |  ||||||| | |||||||||||||||  |||||| |||| ||||||    
T  3005582 acaag--aaaaggtacaaacaac-----gagagaagaaagggagaacacaaga--atttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggag 3005672  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    |||||| |||||| || ||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3005673 agagcacccctccgttccactataatgatgagcaactttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc 3005772  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||| |||| ||||||    
T  3005773 aatctctttccgtgaccaag 3005792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 181901 - 181685
Alignment:
Q  80 caaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatc 179  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  181901 caaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaa---cgagagaaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacc 181806  T
Q  180 cagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaa 279  Q
    |||||||                    ||||||||||||| | ||  ||||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  181805 cagttcg--------------------ggggagagagcagtcatctgtttcacta--tgatgagtaactttac-aaagagatatcaatgggttacaagaa 181729  T
Q  280 taagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccg 323  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  181728 taagtcttccgcctaattctacccaaagtcccattctcttcccg 181685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 143
Target Start/End: Original strand, 3883436 - 3883562
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||     
T  3883436 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacatcaataacaa-cttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaat--taaat 3883532  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3883533 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgaga 3883562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 331
Target Start/End: Original strand, 31578219 - 31578439
Alignment:
Q  104 aattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctag 202  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||   ||||||||    |||||| |||||||||   ||||| | |||||||||||| | | ||||||||    
T  31578219 aattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaac---gagagaaag---agagagcacacaaaat---ttgtttacccagttcggtcctatactgacctag 31578308  T
Q  203 tctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccg-cctaattcta 300  Q
    |||||||||||||||||  |||| || ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||| |   ||||||||||    
T  31578309 tctaggggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattcta 31578408  T
Q  301 cccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  31578409 cccaaagtcccaatctcttcccatgaccaag 31578439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 260 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14477522 - 14477451
Alignment:
Q  260 atatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14477522 atatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaag 14477451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 27911567 - 27911447
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |  || ||| |||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  27911567 tgttgtgaatttgttgaaaaatcacaccaataaaaaacttgatgtgtggagcaagtgataat-tagaaactaaaacaaagtgt-tggaacaattataaac 27911470  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaac 136  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  27911469 acaagccaaaagtagaaaacaac 27911447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 27957986 - 27957866
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |  || ||| |||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  27957986 tgttgtgaatttgttgaaaaatcacaccaataaaaaacttgatgtgtggagcaagtgataat-tagaaactaaaacaaagtgt-tggaacaattataaac 27957889  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaac 136  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  27957888 acaagccaaaagtagaaaacaac 27957866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 31035587 - 31035292
Alignment:
Q  30 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattag 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||    ||||||||||||||| | ||| |||    ||| ||||| |||||||||| |||| |||    
T  31035587 aaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggaggaaat--tagtcaagcaaccaatatcaacgtgg---gaacaattaaaaacacaagc-aaaactag 31035494  T
Q  129 aaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgaccta--gtctaggggagagagcagccctcc 225  Q
    ||||||   |||||||||| | |||||||||||||  | |||||||| | |||||||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  31035493 aaaaca---gcgagagaaa-gaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctatagtctgggggagagagcagccctcc 31035399  T
Q  226 atttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctac-cgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccg 323  Q
     || ||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |   |||||||||||| ||| || ||||||||||| |    
T  31035398 gttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacctaaagtctcaatctcttcctg 31035300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 183310 - 183246
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaa 78  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  183310 tgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaa 183246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 17847847 - 17847707
Alignment:
Q  179 ccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaag 277  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||      | | || |||||||||||||||||| || |||||||    
T  17847847 ccagtttggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccattccactat------aatgattttacaaaagagatatcaaagg-ttacaag 17847755  T
Q  278 aataagtctac-cgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgt 324  Q
    ||| ||||| |   |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17847754 aattagtcttcaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgt 17847707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 239 - 331
Target Start/End: Original strand, 31573794 - 31573887
Alignment:
Q  239 atgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccg-cctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |   |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  31573794 atgagtaactttacaaaagagatatcaaagaattacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaag 31573887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19752487 - 19752432
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcca 226  Q
    ||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19752487 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctcca 19752432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4696689 - 4696624
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4696689 ttgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatg 4696624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26403323 - 26403258
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  26403323 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatg 26403258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 331
Target Start/End: Original strand, 33541507 - 33541548
Alignment:
Q  290 gcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33541507 gcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaag 33541548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9765912 - 9765848
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat 235  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  9765912 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 9765848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 12702634 - 12702678
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12702634 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctaggggagaga 12702678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 331
Target Start/End: Original strand, 37214317 - 37214360
Alignment:
Q  288 ccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  37214317 ccgcctaattctacccaaagttccaatcgcttcccgtaaccaag 37214360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 225
Target Start/End: Original strand, 4812470 - 4812543
Alignment:
Q  152 agagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagccctcc 225  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4812470 agagagaacacaagata-tttgtttacccagttcggtctaattatgacctagtcttggggagagagcagctctcc 4812543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Original strand, 7412345 - 7412410
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  7412345 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatg 7412410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16833886 - 16833769
Alignment:
Q  170 tttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatg 268  Q
    |||||| | ||||||||  | ||| |||| ||||||  |||||||||||||| | | || ||||||  || |||||||  ||||||||||||||||||      
T  16833886 tttgtttacccagttcgtccaaaagtgacttagtctgtgggagagagcagcctttcgttccactataatgttgagtaactttacaaaagagatatcaaat 16833787  T
Q  269 gattacaagaataagtct 286  Q
    |||||||||| |||||||    
T  16833786 gattacaagagtaagtct 16833769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23799670 - 23799605
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | | | |||||||||||||||||| | |||||||    
T  23799670 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatccactatg 23799605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31071322 - 31071257
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  31071322 ttgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatg 31071257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 67
Target Start/End: Original strand, 2467896 - 2467932
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaa 67  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  2467896 aaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaa 2467932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 10930199 - 10930243
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  10930199 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 10930243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15212954 - 15212910
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  15212954 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 15212910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27811446 - 27811402
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  27811446 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 27811402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33032811 - 33032771
Alignment:
Q  195 tgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33032811 tgacctagtctaggagagagagcagctctccattccactat 33032771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33352318 - 33352274
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  33352318 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 33352274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 40321248 - 40321204
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  40321248 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 40321204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 92)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 18511056 - 18511372
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||    
T  18511056 tgttgcgaattcgatgataaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaactaaaacaaagtgtatgaaacaattataaac 18511155  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511156 acaagcaaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 18511254  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  18511255 gagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtcccaa 18511354  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18511355 tctcttcccgtaaccaag 18511372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 36402170 - 36402488
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  36402170 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatagaacaattataaa 36402269  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  36402270 cacaagctaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcgatctaaattgacctagtctgggggag 36402369  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||| | ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| | |||    
T  36402370 agagcagacatctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatggattacaataataagtctccagcctaattttacccaaagttcca 36402469  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  36402470 atctcctcccgtaaccaag 36402488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 40221956 - 40221641
Alignment:
Q  21 aatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagcc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  40221956 aatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaaggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 40221857  T
Q  121 aaaattagaaaacaac-agcgagaga---aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagag 216  Q
    |||| ||||||||| | || ||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40221856 aaaagtagaaaacagcgagagagagagagaaaggaagagagagcacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 40221757  T
Q  217 cagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatc 315  Q
    ||||| ||| || ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  40221756 cagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctaccaaaagtcccaatc 40221657  T
Q  316 tcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||| |||||||||    
T  40221656 tcttcctgtaaccaag 40221641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6745507 - 6745187
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa---caaagtgtatagaataattata 110  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||   |||||||||| ||| |||||||    
T  6745507 tgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagagatagtcaagcagccaaaaaaacaaagtgtatggaacaattata 6745408  T
Q  111 aacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggg 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  6745407 aacacaagccaaaagtcgaaaacaacagcgagagaaaagaataagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctggggg 6745308  T
Q  211 agagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  6745307 agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 6745208  T
Q  311 caatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  6745207 caacctcttcccgtaaccaag 6745187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 39854922 - 39854604
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaac-aaagtgtatagaataattataa 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||    
T  39854922 ctgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatatgtggagcaagggatagttaagcaaccaaaaataaagtgtatggaacaattataa 39854823  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaa-ggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggg 210  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  39854822 acacaagccaaaagtaaaaaacaacagcgagagaaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgatctagtctggggg 39854723  T
Q  211 agagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  39854722 agagagcagccctccgatccactatatgatgagtagcgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttc 39854623  T
Q  311 caatctcttcccgtaacca 329  Q
    || ||||||||||||||||    
T  39854622 cagtctcttcccgtaacca 39854604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 2724328 - 2724041
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2724328 tgttgcgaatttgatgaaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtatagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaa 2724229  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaa-ggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
    |||||||||||| |||||||||   |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2724228 cacaagccaaaagtagaaaaca---gcgaaagaaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggga 2724132  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacc 302  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  2724131 gagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaatcttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatcacccgcctaattctacc 2724041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 331
Target Start/End: Original strand, 2818190 - 2818495
Alignment:
Q  26 gatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaa 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2818190 gatgaaaaa-cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaagggataatcaggcatccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaa 2818288  T
Q  125 ttagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctc 224  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  2818289 gtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctc 2818388  T
Q  225 catttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgt 324  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||  || |||||||    
T  2818389 cgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagccttttcccgt 2818488  T
Q  325 aaccaag 331  Q
    |||||||    
T  2818489 aaccaag 2818495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24127291 - 24126975
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  |||| |||| ||||||||||  || |||||||||    
T  24127291 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacacaaataacaaacttaatgtgtggagcaagggataatcagacaacaaaaaacaaagtgtatgaaacaattataaa 24127192  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    || ||| ||||| ||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24127191 cataagtcaaaagtagaaaacaac-gagagagaaa-gaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggag 24127094  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  24127093 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctatcgcctaattctacccaaagtccca 24126994  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24126993 atctcttcccgtaaccaag 24126975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 41585580 - 41585904
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41585580 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggggcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaac 41585679  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaagga--------agagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |        ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  41585680 acaagccaaaagtagaaaacaac-gagagagaaaagaagatagaacagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagttt 41585778  T
Q  206 aggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaa 305  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  41585779 gggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgacttacaaaaataagtctcctgcctaattctacccaa 41585878  T
Q  306 aatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||    
T  41585879 agccccaatctcttcccgtagccaag 41585904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 53 - 331
Target Start/End: Original strand, 18509201 - 18509478
Alignment:
Q  53 tgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaa 152  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  18509201 tgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaag-aa 18509299  T
Q  153 gagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttac 252  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||    
T  18509300 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagcccaccgtttcactatatgatgagtaactttac 18509399  T
Q  253 aaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18509400 aaaatagatatcaacgagttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccattctcttcccgtaaccaag 18509478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Original strand, 658203 - 658513
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  658203 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaaccaaaacaaagtgtacggaacaataataaa 658301  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    || ||||||||| ||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||       
T  658302 cataagccaaaagtagaaaacagca---agagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg--- 658394  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  658395 agagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 658494  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
      |||||||||||||||||    
T  658495 gcctcttcccgtaaccaag 658513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6747743 - 6747424
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa---caaagtgtatagaataattata 110  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||   |||||||||| ||| |||||||    
T  6747743 tgttgcgaattggatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtagagcaagagataatcaagcaaccaaaaacacaaagtgtatggaacaattata 6747644  T
Q  111 aacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggg 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  6747643 aacacaagccaaaagtcgaaaacaacagcgagagaaaagaagaagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagag 6747544  T
Q  211 agagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
    |||||||||||||||  | |||||| ||| |||||| ||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  6747543 agagagcagccctccgatccactatatgacgagtaacgttacaaaa-agaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 6747445  T
Q  311 caatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  6747444 cagtctcttcccgtaaccaag 6747424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21948464 - 21948145
Alignment:
Q  18 gcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaaca--aagtgtatagaataattataaacac 115  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||||||||    
T  21948464 gcgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaaataaagtgtatggaacaattataaacac 21948365  T
Q  116 aagccaaaattagaaaacaac---agcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
    ||||||||| ||||||| | |   || ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  21948364 aagccaaaagtagaaaatagcgagagagagggagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctggggga 21948265  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  21948264 gagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaaggggttacaagaataagtctcccgcctaattccacccaaagtccc 21948165  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |  |||||||| ||||||||    
T  21948164 agcctcttcccataaccaag 21948145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 20505687 - 20506001
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa---caaagtgtatagaataattata 110  Q
    ||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||||||||   |||||||||| ||| |||||||    
T  20505687 tgttgtgaattcaatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtaataatcaggcaaccaaaaaatcaaagtgtatggaacaattata 20505786  T
Q  111 aacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggg 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20505787 aacacaagccaaaactagaaaacaac---gagagaaaat-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggg 20505882  T
Q  211 agagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
    |||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  20505883 aga--gcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtct 20505980  T
Q  311 caatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20505981 caatctcttcccgtaaccaag 20506001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 1189454 - 1189769
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  1189454 tgttgtgaattcgatgaaaa--cacaccaatatcaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagccaccaaaacaaaatgtatggaacaattataaac 1189551  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg-gga 211  Q
    ||||||||||| ||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  1189552 acaagccaaaagtagaaaact---gcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggagga 1189648  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
    ||||||| |||||| || ||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  1189649 gagagcatccctccgttccactataattatgagtaaccttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtct 1189748  T
Q  311 caatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  1189749 caatctcttcctgtaaccaag 1189769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 16092045 - 16092360
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||| |||||    
T  16092045 tgttgtgaattcgatgagaaaacgcaccaataacaaacttgatatgtggagcaatggatagtcaagcaaccaaa-caaagtatatggaacaattgtaaac 16092143  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
     |||||||||| ||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16092144 gcaagccaaaagtagaaaacagc-gagagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcagtctaaattgacctagtctagaggaga 16092241  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  16092242 gagcaaccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatctcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 16092341  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16092342 atctcttcccgtaaccaag 16092360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16776580 - 16776277
Alignment:
Q  28 tgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaatta 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||  || ||||||||  ||||||||||| ||    
T  16776580 tgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaatcaaaacaaagtgtatgaaacaattataat-acaagccaaaagta 16776482  T
Q  128 gaaaacaacagcgagagaaaaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcc 225  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||    
T  16776481 gaaaacaacagcgagagaaaaagaagagcgagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggggagatagcagccctcc 16776382  T
Q  226 atttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgta 325  Q
      | |||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  16776381 gatccactatatgataagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg-ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgta 16776283  T
Q  326 accaag 331  Q
    ||||||    
T  16776282 accaag 16776277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 31 - 331
Target Start/End: Original strand, 17818352 - 17818650
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaa 130  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17818352 aaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaa 17818451  T
Q  131 aacaac-agcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccattt 229  Q
    |||| | || ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||  ||     
T  17818452 aacagcgagagagag-aaaggaaaagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagaga--agccctctgttc 17818548  T
Q  230 cactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaacca 329  Q
    |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  17818549 cactgtatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaacca 17818648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 26 - 331
Target Start/End: Original strand, 10474180 - 10474483
Alignment:
Q  26 gatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaat 125  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||     
T  10474180 gatgaaaaattacatcaataataaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagtaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcgaaaag 10474279  T
Q  126 tagaaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctc 224  Q
    ||||||  |   |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  10474280 tagaaatta---gcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatc 10474376  T
Q  225 catttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgt 324  Q
    | ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  10474377 cgtttcactatatgatgagtaaccttagaaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccaatctcttcctgt 10474476  T
Q  325 aaccaag 331  Q
    |||||||    
T  10474477 aaccaag 10474483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25904536 - 25904222
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25904536 tgttgcgaattcgatgagaaaacacacca-taataaatttgatgtgtggtgcaagggatagtcaagcaatgaaaacaaagtgtatggaacaattataaac 25904438  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||| |||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25904437 acaaaccaaaagtagaaaaca---gcgagagagaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggag 25904341  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||| | ||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||  || |    
T  25904340 agagcagtcatccgtttcactatatgataagtaacgttacaatagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattatactcaaagcccta 25904241  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25904240 atctcttcccgtaaccaag 25904222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18467123 - 18466803
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||   |||||||     
T  18467123 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacactaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaag--ttataaat 18467026  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18467025 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg 18466926  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |||||||||||| |||| || || ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18466925 ggagagagcagctctccgttccattatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 18466826  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||  ||||| |||||||||||    
T  18466825 cccagcctctttccgtaaccaag 18466803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 10528937 - 10529259
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatga-aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataa 111  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||  |    
T  10528937 tgttgtgaattcgatgagaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta--a 10529033  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaat-aatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct 205  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10529034 atacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 10529133  T
Q  206 aggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaa 305  Q
     ||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10529134 gggggagagagcagccttccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaa 10529233  T
Q  306 aatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |  |||||||||||||||||||||||    
T  10529234 agccccaatctcttcccgtaaccaag 10529259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25804463 - 25804144
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaa-atcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||    
T  25804463 tgttgcgtattcgatgaaaatatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aa 25804367  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||| | |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25804366 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagacaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtct-g 25804268  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  25804267 gggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 25804168  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||||||||||| ||||||||||    
T  25804167 ccccaatctcttctcgtaaccaag 25804144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 33 - 331
Target Start/End: Original strand, 25921333 - 25921633
Alignment:
Q  33 aatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaa 132  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  || ||||||||||| |||||||    
T  25921333 aatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaatta--aatacaagccaaaagtagaaaa 25921429  T
Q  133 caacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccat 227  Q
    |||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  25921430 caacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgt 25921529  T
Q  228 ttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaac 327  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||    
T  25921530 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccagagtcccagcctcttcccgtaac 25921629  T
Q  328 caag 331  Q
    ||||    
T  25921630 caag 25921633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 696310 - 695996
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatga-aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaag-caaccaaaacaaagtgtatagaataattataa 111  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  696310 tgttgtgaattcgatgagaaaatcataccaataacagacttgatgtgtggagcaagagataatcaagaaaaccaaaataaagtgtatggaacagttataa 696211  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||| |     |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  696210 acacaa-acaaaagtagaaaacaacagag-----aaagaaagagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctggggga 696117  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  696116 gagagcagccctccgtttcactataatgatgaataactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtct 696017  T
Q  311 caatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  696016 caatctcttcccgtaaccaag 695996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 52 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26098127 - 26097851
Alignment:
Q  52 ttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagaga-aaagg 150  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||   |||||||||| | |||||    
T  26098127 ttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacactagccaaaagtagaa---aacagcgagatagaaagg 26098031  T
Q  151 aagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgtt 250  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||| |||    
T  26098030 aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggaggagagagcag-cctctgttccactatatgatgagtaacgtt 26097932  T
Q  251 acaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||||    
T  26097931 acaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcattttcccgtaaccaag 26097851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 37705626 - 37705940
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatga-aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  37705626 tgttgtgaattcgatgagaaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataaccaagcaaccaaaacaaagtatatggaataattaaaaa 37705725  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
    |||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37705726 cacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagagaaaggaagagagaacgcaaga--atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggga 37705820  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    ||||  |||| | | ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||     
T  37705821 gagaatagccattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctatccaaaaccct 37705920  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  37705921 aatctcttcacgtaaccaag 37705940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18597079 - 18596764
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||  || |||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  18597079 tgttgcaaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaagtgataatcagacatccaaaataaagtgtatggaacaattataaac 18596980  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagag-agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    ||||| ||||| |||||   ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  18596979 acaagtcaaaagtagaa---aacagcgagagaaaa-gaagagtcgaacacaaaagaatctgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggag 18596884  T
Q  213 agagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  18596883 agagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtccc 18596784  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18596783 aatctcttcccgtaaccaag 18596764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 36209007 - 36208694
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  36209007 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacatcaataataaacttgatgtgtagagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaattataatc 36208908  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  36208907 acaagccaaaagtagaaaacaa---cgagag-aaagaaagagagaa-acaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtat-ggggaaa 36208814  T
Q  214 gagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctac-cgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    ||||||||| || |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| || |    
T  36208813 gagcagcccgccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctacaaacctaattctacccaaagtctc 36208714  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  36208713 aatctcttcccgttaccaag 36208694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 37 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17073298 - 17073002
Alignment:
Q  37 acaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaac 136  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17073298 acaccaataataaatttgatgtgtggagcaagtgatgatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacaac 17073199  T
Q  137 agcgagag-aaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat 235  Q
    |||||||| ||||  |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  17073198 agcgagagaaaaataaagagagaaagcaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccgagtctgggggagagagcagccctccgttttactat 17073099  T
Q  236 -gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
      ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  |||||||||||||| ||||||||    
T  17073098 aatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtcttccgcctaattctatcgaaagccccaatctcttcccctaaccaag 17073002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21289187 - 21288888
Alignment:
Q  20 gaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagc 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  21289187 gaattcgatgaaaaatcacaccaatatcaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaagaataataaacacaagc 21289088  T
Q  120 caaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcag 219  Q
    ||||| |||||||||||   ||||||| |  ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21289087 caaaagtagaaaacaac---gagagaacaa-aagagagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcag 21288992  T
Q  220 ccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctctt 319  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||        |||  ||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  21288991 ccctccgtttcactataagatgagtaacgttacaaaag--------atgagttacaagaaaaaatctcccgcttaattctatccaaagtcctaatctctt 21288900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6756926 - 6756613
Alignment:
Q  15 gttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaa-cttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||  || ||||||||||    
T  6756926 gttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaatcaaaacaaagtgtatgaaacaattataaac 6756827  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  6756826 acaagccaaaagtagaaaacagc-gagagagaaaag-aagagagaacacaaaagattttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggaga 6756729  T
Q  214 gagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||||| | |||||||||  ||||| ||||  |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  6756728 gagcagccct-cgtttcactataatgatgtgtaaccttacaaaaaagatatcaatg--ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 6756632  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6756631 atctcttcccgtaaccaag 6756613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27912969 - 27912655
Alignment:
Q  20 gaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagc 119  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||    
T  27912969 gaattcgatgaaaaatcccaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaatacaagc 27912872  T
Q  120 caaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagag 214  Q
     |||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27912871 taaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagag 27912772  T
Q  215 agcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaat 314  Q
    |||||  |||  || |||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||      
T  27912771 agcagttctctgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagc 27912672  T
Q  315 ctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||| ||||||||||    
T  27912671 ctcttcacgtaaccaag 27912655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18469448 - 18469130
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||     
T  18469448 tgttgtgaattcgatgaaaaatcataccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaat 18469351  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  18469350 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacgcaaaagaatttgttaatccagttcggtccaaattgacctagtct--g 18469253  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |||||||||||| || | || |||||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  18469252 ggagagagcagctcttcgttccactagatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacctaaagt 18469153  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  18469152 cccagcctcttcccgtaaccaag 18469130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 4237049 - 4236748
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaa 130  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || ||||||||||| |||||    
T  4237049 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aatacaagccaaaagtagaa 4236953  T
Q  131 aacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcc 225  Q
    |||||| | |||| |||   ||  |||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4236952 aacaacggtgagaagaacacaaataagagaagaacacaaaagaatttattga-ccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctcc 4236854  T
Q  226 atttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgta 325  Q
      | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  4236853 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgta 4236754  T
Q  326 accaag 331  Q
    ||||||    
T  4236753 accaag 4236748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 31465833 - 31466138
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  31465833 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggaacaaggaataattaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaa 31465932  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||||||||| ||||||||| | | ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  31465933 cacaagccaaaagtagaaaacagc-gagagagaaaa-gaagagagaatacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgaactagtctgggggtg 31466030  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||||          |||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  31466031 agagcagcc----------ctatatgatgagtaactttacaaaatagatatcaatgggttacaagaat-agtctcccgcctaattctacccaaagtccaa 31466119  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31466120 atctcttcccgtaaccaag 31466138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 34476894 - 34477213
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  ||    
T  34476894 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta--aa 34476989  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34476990 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 34477089  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctac-cgcctaattctacccaaa 306  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||    
T  34477090 gggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaa 34477188  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  34477189 gtcccaatctcttcccgtaaccaag 34477213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 2954843 - 2954540
Alignment:
Q  20 gaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattata-aacacaag 118  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||    
T  2954843 gaattcgatgagaaaacacaccaataacaaatttgatgtgtggagtaagtgataatcagacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattatgtaacacaag 2954744  T
Q  119 ccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagca 218  Q
    |||||| |||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  2954743 ccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacctagtttgggggagagagca 2954648  T
Q  219 gccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctct 318  Q
     ||||||  |||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  2954647 tccctccgcttcactatatgatgagtaactttac-aaagagatatcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctct 2954549  T
Q  319 tcccgtaac 327  Q
    || ||||||    
T  2954548 tctcgtaac 2954540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 31179213 - 31179530
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  31179213 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtatggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataatta--aac 31179309  T
Q  114 acaagccaaaattagaa-aacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||   || ||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  31179310 acaagccaaaagtagaagaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacagaa--atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgg 31179407  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||   |||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  31179408 gggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatgaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 31179506  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  31179507 tcccaatctcttcccgtaaccaag 31179530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 34479259 - 34479578
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  ||    
T  34479259 tgttgcgaatttgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta--aa 34479354  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
      |||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34479355 tgcaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 34479454  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctac-cgcctaattctacccaaa 306  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||    
T  34479455 gggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaa 34479553  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     || ||||||||||| |||||||||    
T  34479554 gtctcaatctcttcctgtaaccaag 34479578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 38882526 - 38882225
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||    
T  38882526 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aa 38882431  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||||            ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  38882430 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgaga------------agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggag 38882343  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  38882342 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtccca 38882244  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
      |||||||||||||||||    
T  38882243 gcctcttcccgtaaccaag 38882225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 39798468 - 39798166
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||     
T  39798468 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaat-ttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtat-gaa-agttataaat 39798372  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||            ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  39798371 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgaga------------agaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacttagtctgggggaga 39798284  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    ||||||||||||  | ||||||  ||||||||   ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||    
T  39798283 gagcagccctccgatccactatacgatgagtatcattataaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccacaa 39798184  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||    
T  39798183 tctcttcccgtaaccaag 39798166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 30 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 2175323 - 2175038
Alignment:
Q  30 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattaga 129  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||  || ||||||||||| ||||    
T  2175323 aaaagtcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta--aatacaagccaaaagtaga 2175227  T
Q  130 aaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccattt 229  Q
    ||||||| ||||||            ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |     
T  2175226 aaacaacggcgaga------------agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatc 2175139  T
Q  230 cactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaacca 329  Q
    |||||| |||| ||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  2175138 cactatatgataagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacca 2175040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27910872 - 27910569
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||   |||||||     
T  27910872 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaagggataatcaatcaaccaaaataaagtgtatggaag--ttataaat 27910775  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    |||||| |||| || |||||||| ||||||            ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  27910774 acaagctaaaagtataaaacaacggcgaga------------agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggaga 27910687  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    ||||||| |||| || || ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||     
T  27910686 gagcagctctccgttccattatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacag 27910587  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||||||||||||||||    
T  27910586 cctcttcccgtaaccaag 27910569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 31543172 - 31542855
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| |||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||     
T  31543172 tgttgtgaatctgatcaataatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggttaatcaagcaaccaaaacaaagcgtat-gaa-agttataaat 31543076  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgag-agaa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  || |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  31543075 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgaggagaacaaaagaagaacaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggg 31542976  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  31542975 ggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtactgttac-aaagagaaatcaatgggtt-cgagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 31542878  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  31542877 cccaatctcttcccgtaaccaag 31542855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 327
Target Start/End: Original strand, 3372977 - 3373292
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||| |||||  ||    
T  3372977 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta--aa 3373073  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga---gaaaaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||||   | ||| |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  3373074 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagagcaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgg 3373173  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||   |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  3373174 gggagagagcaaccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 3373272  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaac 327  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3373273 tcccaatctcttcccgtaac 3373292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Original strand, 21684293 - 21684611
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||    
T  21684293 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaatta--aa 21684388  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     | ||||||||| ||||||||||| | |||| |||   ||  |||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21684389 taaaagccaaaagtagaaaacaacggagagaagaacacaaaaaagagaagaacacaaacgaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 21684488  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||     
T  21684489 gggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaag 21684587  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  21684588 ccccaacctcttcccgtaaccaag 21684611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 10750121 - 10749820
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattaga 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||| |||||  || ||||||||||| ||||    
T  10750121 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta--aatacaagccaaaagtaga 10750025  T
Q  130 aaacaacagcgaga-gaa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctc 224  Q
    ||||||| |||||| |||  || |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10750024 aaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaag-aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctc 10749926  T
Q  225 catttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgt 324  Q
    |  | |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10749925 cgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgt 10749827  T
Q  325 aaccaag 331  Q
    |||||||    
T  10749826 aaccaag 10749820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 262
Target Start/End: Original strand, 26098129 - 26098380
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaa--tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataa 111  Q
    ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26098129 tgttgcgaattcgatgagaaaactcacaccaatatcaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataa 26098228  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaac-agcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct-aggg 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  26098229 acacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagag-aaaggaagagagaacataaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtatggggg 26098327  T
Q  210 gagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagata 262  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  26098328 gagagagcagccctccgtttcaccatatgatgagtaacgttacaaaagagata 26098380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Original strand, 38959971 - 38960290
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  38959971 ctgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtat-gaa-agttataaa 38960067  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagag----aaaaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     ||||||||||| |||||||||||  | |||     ||||| || |   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |     
T  38960068 tacaagccaaaagtagaaaacaacgacaagaagaacaaaagaaaaaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtttg 38960167  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  38960168 ggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtctcccgtctaattctacccaaa 38960265  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     || |||||||||||||||||||||    
T  38960266 gtctcaatctcttcccgtaaccaag 38960290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 31472458 - 31472773
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaat-cacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||| |||  ||  | | ||||||     
T  31472458 tgttgcgaattcgatgaaaaatacacaccgataacaaacttgatgtgtgaagtaagagatactcaagcaaccaatacaa-gtgggta--acagttataat 31472554  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaag--gaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggg 210  Q
     |||| |||||||||||||||||    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  31472555 tacaaaccaaaattagaaaacaat---gagagaaaagaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatggggg 31472651  T
Q  211 agagagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatc 309  Q
    |||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |  | ||||||||||||||| ||| ||    
T  31472652 agagagcaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctaccaaaagtc 31472751  T
Q  310 ccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  31472752 ccaatctcttcccgtgaccaag 31472773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15552685 - 15552365
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||    
T  15552685 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgcgtgaagtaagggataatcaagcaactaaaacaaagtgtat-gaa-agttataaa 15552589  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     |||||| |||| ||||||| ||  |||||| |||   || |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||     
T  15552588 tacaagctaaaagtagaaaataatggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctg 15552489  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||   |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15552488 ggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 15552390  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||||||||||||| ||||    
T  15552389 gtcccaatctcttcccgtaatcaag 15552365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 10587252 - 10586951
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||     
T  10587252 tgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagg-ataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaat 10587157  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggg-ag 212  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||            ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  10587156 acaagtcaaaagtagaaaacaacggcgaga------------agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggggag 10587069  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||    
T  10587068 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttaaaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtctca 10586970  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||| |||||| ||||    
T  10586969 atctctttccgtaagcaag 10586951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 4410458 - 4410142
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||   |||||||     
T  4410458 tgttgcgaattcgttgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-aaggtgtatggaag--ttataaat 4410364  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcga---gagaa-aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||   ||| | || | ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  4410363 acaagccaaaagtagaaaacagcggcgaaaagagcacaaagtagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggg 4410264  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4410263 ggagagagcagctctccaatccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 4410165  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  4410164 cccagcctcttcccgtaaccaag 4410142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 31545515 - 31545200
Alignment:
Q  20 gaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagc 119  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||  |||| |||| |||| ||| | ||||||| ||||||    
T  31545515 gaatctgattaataatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagtaagggttaatcaagcaattaaaataaagcgtat-gaa-agttataaatacaagc 31545419  T
Q  120 caaaattagaaaacaacagcgagag----aaaag--gaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||     |||||  |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  31545418 caaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggga 31545319  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  31545318 gagagcagccctccaatccactatatgatgagtactgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc 31545220  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  31545219 aatttcttcccgtaaccaag 31545200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 10757597 - 10757297
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattaga 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||| |||||  || ||||||||||| ||||    
T  10757597 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta--aatacaagccaaaagtaga 10757501  T
Q  130 aaacaacagcgaga-gaa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctc 224  Q
    ||||||| |||||| |||  || |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10757500 aaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaag-aatttgttgacccagttcggtctaatctgacctagtctgggggagagagcagccctc 10757402  T
Q  225 catttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgt 324  Q
    |  | |||||| |||||||||| |||||||| || | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  10757401 cgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gaaaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctt-ccgt 10757304  T
Q  325 aaccaag 331  Q
    |||||||    
T  10757303 aaccaag 10757297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 15354414 - 15354733
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  ||    
T  15354414 tgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataa--aa 15354510  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaa-caacagcgaga-gaa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     || |||||||| ||||||| |||| | |||| |||  || |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||     
T  15354511 tacgagccaaaagtagaaaaacaactgtgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctg 15354610  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| | |||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15354611 ggggagagagcagccctccgatccactatttaatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaa 15354708  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  15354709 gtcccaatctcttcccgtaaccaag 15354733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23665484 - 23665164
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  ||    
T  23665484 tgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataa--aa 23665388  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaa--caacagcgaga-gaa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct 205  Q
     || |||||||| |||||||  |||| | |||| |||  || |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  23665387 tacgagccaaaagtagaaaaaacaactgtgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtct 23665288  T
Q  206 aggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaa 305  Q
     ||| |||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23665287 ggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaa 23665190  T
Q  306 aatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  23665189 agtcccaatctcttcccgtaaccaag 23665164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 23793103 - 23793423
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  ||    
T  23793103 tgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataa--aa 23793199  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaa--caacagcgaga-gaa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct 205  Q
     || |||||||| |||||||  |||| | |||| |||  || |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  23793200 tacgagccaaaagtagaaaaaacaactgtgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtct 23793299  T
Q  206 aggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaa 305  Q
     ||| |||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23793300 ggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaa 23793397  T
Q  306 aatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  23793398 agtcccaatctcttcccgtaaccaag 23793423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 15356690 - 15357009
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  ||    
T  15356690 tgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataa--aa 15356786  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaa-caacagcgaga-gaa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     || |||||||| ||||||| |||| | |||| |||  || |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||      
T  15356787 tacgagccaaaagtagaaaaacaactgtgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtccg 15356886  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| | |||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15356887 ggggagagagcagccctccgatccactatttaatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaa 15356984  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  15356985 gtcccaatctcttcccgtaaccaag 15357009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 331
Target Start/End: Original strand, 12555773 - 12556083
Alignment:
Q  29 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattag 128  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||||| |||||||||||| |||    
T  12555773 gaaaactcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataatcacaagccaaaagtag 12555872  T
Q  129 aaaacaacagcgagagaaaag---------gaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcag 219  Q
    |||||||| | ||||||||||         ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  12555873 aaaacaac-gagagagaaaagaagagaagagaagagagaacacaaaagaatttattgacccagttcagtccaaattgaactagtatgggggagatagcag 12555971  T
Q  220 ccctccatttcactatgtgatgagtaatgttac-aaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctct 318  Q
    |||||| |||| || |  ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||   | ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  12555972 ccctccgtttcgctttaagatgagtaacgttacaaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcttgtctaattcta-ccaaaactccaatctct 12556070  T
Q  319 tcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||| |||||    
T  12556071 tcccgtagccaag 12556083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Original strand, 23741696 - 23742017
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataa 111  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  |    
T  23741696 ctgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataa--a 23741792  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaa--caacagcgaga-gaa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtc 204  Q
    | || |||||||| |||||||  |||| | |||| |||  || |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23741793 atacgagccaaaagtagaaaaaacaactgtgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtc 23741892  T
Q  205 taggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctaccca 304  Q
    | ||| |||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23741893 tggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctaccca 23741990  T
Q  305 aaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    || ||||||||||||| ||||| ||||    
T  23741991 aagtcccaatctcttctcgtaatcaag 23742017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20043411 - 20043222
Alignment:
Q  27 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatag-tcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaat 125  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||     
T  20043411 atgagaaaacacatcaataacaaacttgatttgtggagcaagtgataaatcaagcagccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaag 20043312  T
Q  126 tagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagca 218  Q
    |||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20043311 tagaaaaca---gcgagagaaaagaaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagca 20043222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 331
Target Start/End: Original strand, 6661053 - 6661346
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaa 130  Q
    |||||||||||||| | | | |||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| |||| |||||    
T  6661053 aaaatcacaccaattaaatatttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaag--ttataaacacaagc-aaaagtagaa 6661149  T
Q  131 aacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagccctccattt 229  Q
    ||||||   |||||||||| ||||||  |||| ||||   ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| | ||| ||     
T  6661150 aacaac---gagagaaaagaaagagaacacacgaaat---ttgtttatccagttcggtccaaatctgacctagtctgagggagagagcagtcatccgttc 6661243  T
Q  230 cactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaacc 328  Q
    ||||||  | ||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  6661244 cactataattatgagcaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattgtacccaaaatctcaatttcttcccgtgacc 6661343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 331
Target Start/End: Original strand, 39397974 - 39398153
Alignment:
Q  152 agagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgtta 251  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||| ||||| | ||  |||| || |    
T  39397974 agagagaacacaaaagaatgttttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagcagccatccgttttactatataattggtaacgtca 39398073  T
Q  252 caaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  39398074 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctactgcctaattctacccaaagttccaatctctttccgtaaccaag 39398153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9020633 - 9020337
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaa 130  Q
    |||||||||| ||||| | | ||||| |||| |||||   ||| |||||||||||||  ||||||||| |||   |||||||||||||| |||| |||||    
T  9020633 aaaatcacacgaataaaatatttgatctgtggagcaattaataatcaagcaaccaaat-aaagtgtattgaag--ttataaacacaagc-aaaagtagaa 9020538  T
Q  131 aacaacagcgagagaaaagga-agagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaatt-gacctagtctaggggagagagcagccctccatt 228  Q
    || |||   || ||||||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||   |||||| | | | ||||||||||||| |||  |    
T  9020537 aataac---gatagaaaagaagagagagaacacaaaagaattggtttatccagttcggtccaaaacagacctaatttggaggagagagcagccatccgat 9020441  T
Q  229 tcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaac 327  Q
     ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||    
T  9020440 ccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagctccaatctcttcccgtgac 9020341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20054267 - 20053971
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  20054267 ctgttgtgaattcgat-aaaaatcacactaataaaatacttgatgtgtagagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtat-gaa-agttataaa 20054171  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtcc-aaattgacctagtctagggga 211  Q
    ||||| | |||| |||||||| |    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||||| | | |||    
T  20054170 cacaaac-aaaagtagaaaacgaa---gagagaaaagaaagagagaacacaaaagaatttgtttacgcagttcggtccaaaactgacctagtatggagga 20054075  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
    |||||||||| ||| ||  |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||   || |||||||||||||||| || |||||||||||  ||| |||    
T  20054074 gagagcagccttccgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatc---gggttacaagaataagtctcccacctaattctacttaaagtcc 20053978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15143811 - 15143584
Alignment:
Q  104 aattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctag 202  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||  | |||||||| | ||| ||||||| || | ||||||||    
T  15143811 aattataaacacaaacaaaaagtagaaaa-aatagcgagagaaaagta-gagagaacacacga-aatttgtttacccatttcggtcaaatactgacctag 15143715  T
Q  203 tctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctac-cgcctaattcta 300  Q
    ||||||||||| |||||| | || || ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   ||||||||||    
T  15143714 tctaggggagaaagcagctccccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattcta 15143615  T
Q  301 cccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15143614 cccaaaatccaaatctcttcccgtgaccaag 15143584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 34530559 - 34530679
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  34530559 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtcgagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaattataaac 34530658  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaaca 134  Q
    ||||| ||||| |||| ||||    
T  34530659 acaagtcaaaagtagacaaca 34530679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20045395 - 20045281
Alignment:
Q  39 accaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaacag 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||       
T  20045395 accaataacaaacttgatgtgtgaagcaaatgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtaaaaaacaa--- 20045299  T
Q  139 cgagagaaaaggaagaga 156  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  20045298 cgagagaaaagaaagaga 20045281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 237 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 42771023 - 42770936
Alignment:
Q  237 tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgt 324  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  42771023 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaataggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgt 42770936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 320
Target Start/End: Original strand, 15445135 - 15445417
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaa 130  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||   ||| |||||||| |||||||| ||| || ||| |||||||||||||||| |||  |||||    
T  15445135 aaaaacacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaaa--ataatcaagcaatcaaaacaacgtggat-gaa-aattataaacacaagcaaaagatagaa 15445230  T
Q  131 aacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccattt 229  Q
    |||| |   |||||||| | |||||| ||||||  | |||||||| | ||||||| |||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||     
T  15445231 aacatc---gagagaaa-gaaagagaaaacacacga-aatttgtttacccagttcagtccaatactgacctagtct-gggaagagagcagcccttcgttc 15445324  T
Q  230 cactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctac-cgcctaattctacccaaaatcccaatctcttc 320  Q
    ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||| |   ||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  15445325 cactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaatcattcttcaaacctaattctactcaaagtctcaatctcttc 15445417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 249 - 331
Target Start/End: Original strand, 34530744 - 34530826
Alignment:
Q  249 ttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  34530744 ttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataaatctcccgcctaattctactcaaagtcctaatctcttcccgtagccaag 34530826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 4898070 - 4897847
Alignment:
Q  104 aattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctag 202  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||   |||||||| | ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||| ||| || | ||||||||    
T  4898070 aattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaac---gagagaaa-gaaagag-gaacacaaaa-aatttgtttacccagttcagtcgaatactgacctag 4897978  T
Q  203 tctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctacc-gcctaattcta 300  Q
    | | ||||||| |||||||| |  || | ||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  4897977 tatgggggagaaagcagcccactgttccgctataatgatgagtaactttacaatagagatatcaaatggttacaagaatcagtcttcaagcctaattcta 4897878  T
Q  301 cccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  4897877 cccaaagtcacaatctcttcccgtgaccaag 4897847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 331
Target Start/End: Original strand, 17413176 - 17413328
Alignment:
Q  182 gttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaa 279  Q
    ||||||||||| | ||||| | ||| |||||||||||| |||||  || ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17413176 gttcggtccaacactgaccaactctgggggagagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaa 17413275  T
Q  280 taagtctac-cgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||| | |   |||||||||||| ||| || |||||||||||| | ||||||    
T  17413276 taagttttcaaacctaattctacctaaagtctcaatctcttcccttgaccaag 17413328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 23667600 - 23667451
Alignment:
Q  168 aatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaat 267  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  || |||||||| ||| |||||||||||||||  | || ||| |||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  23667600 aatttgttggcccagttcggtccaatctgtcctagtctggggaagagagcagccctccgatccattatttgatgagtgacgttac-aaagagaaatcaat 23667502  T
Q  268 ggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctctt 319  Q
    || || |||| || ||| |  |||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  23667501 gggttgcaagcat-agtttttcgcctaattctttccaaagtcccaatctctt 23667451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 39397857 - 39397970
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaag-ggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||        |||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  39397857 tgttgtgaattcgacgagaaatcacaccaattacaaacttgacgtgtggagcaagtgga--------caaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaa 39397948  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaaca 134  Q
    | |||||||||| |||||||||    
T  39397949 ctcaagccaaaagtagaaaaca 39397970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20045172 - 20045129
Alignment:
Q  288 ccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  20045172 ccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccggaaccaag 20045129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24553599 - 24553549
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  24553599 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctatgggagagagcagcc 24553549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9353425 - 9353360
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  9353425 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatg 9353360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36932443 - 36932378
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  36932443 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatg 36932378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Original strand, 28832263 - 28832318
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcca 226  Q
    ||||||| || |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  28832263 ttgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcca 28832318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Original strand, 10281755 - 10281820
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  10281755 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactatg 10281820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 220
Target Start/End: Original strand, 14520234 - 14520283
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagc 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||    
T  14520234 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggggagagcagc 14520283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Original strand, 15464536 - 15464601
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  15464536 ttgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatg 15464601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17004053 - 17004004
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagc 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  17004053 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 17004004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Original strand, 19588750 - 19588815
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |||  ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19588750 ttgttgacccagttcggtccaatatgaactaatcttagggagagagcagccctccaatccactatg 19588815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 538193 - 538149
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||    
T  538193 ttgttgatccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 538149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 5887434 - 5887478
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  5887434 ttgttgatccaattcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 5887478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11917065 - 11917001
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat 235  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  11917065 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 11917001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19806531 - 19806487
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  19806531 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 19806487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32636992 - 32636948
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  32636992 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 32636948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 113)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 39462956 - 39462638
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  39462956 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaatcaaaatcaaagtgtatggaacaattataaa 39462857  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39462856 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggag 39462757  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||| |||  || ||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  39462756 agagcagctctccgtttcactatatgatgaataacttttcaaaagagatatcaaagggttacaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtccca 39462657  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39462656 atctcttcccgtaaccaag 39462638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 47906704 - 47906389
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  47906704 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaccaaagtgtatggaacaattataatc 47906606  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  47906605 acaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccaagtctgggggaga 47906507  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  47906506 gagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaa 47906407  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||    
T  47906406 tctcttcccgtaaccaag 47906389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 50307389 - 50307708
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  50307389 tgttgggaattcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtctggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaa 50307488  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaat-aatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50307489 cacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaataagagagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggga 50307588  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  50307589 gagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccc 50307688  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  50307689 aatctcttcccgtaaccaag 50307708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 6995540 - 6995862
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  6995540 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaactataaac 6995639  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaag-----agagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |     
T  6995640 acaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgga 6995739  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||      
T  6995740 ggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttataaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtatcccgcctaattctacccaaagc 6995839  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6995840 cccaatctcttcccgtaaccaag 6995862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 29 - 331
Target Start/End: Original strand, 27336799 - 27337101
Alignment:
Q  29 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaatta 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  27336799 gaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagta 27336898  T
Q  128 gaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  27336899 gaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccga 27336998  T
Q  228 ttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaac 327  Q
    | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||  |||||||||||||    
T  27336999 tccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcacagcctcttcccgtaac 27337097  T
Q  328 caag 331  Q
    ||||    
T  27337098 caag 27337101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 331
Target Start/End: Original strand, 11457327 - 11457637
Alignment:
Q  19 cgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaag 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||    
T  11457327 cgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtatatggaacaattttaaacacaag 11457426  T
Q  119 ccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagca 218  Q
    |||||| ||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11457427 ccaaaagtagaaaacagc-gagagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 11457524  T
Q  219 gccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctct 318  Q
    | | ||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11457525 gacatccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaacccccaatctct 11457624  T
Q  319 tcccgtaaccaag 331  Q
    || ||||||||||    
T  11457625 tcgcgtaaccaag 11457637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 331
Target Start/End: Original strand, 17324484 - 17324798
Alignment:
Q  20 gaatttgatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaag 118  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||| || |||    
T  17324484 gaattcgatgaaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcagccataacaaagtgaatagaacaattataatcataag 17324583  T
Q  119 cca-aaattagaaaacaacagcgagagaaaag----gaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||| ||| |||||||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17324584 ccagaaagtagaaaaca---gcgagagaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 17324680  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17324681 gagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaa 17324780  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17324781 tctcttcccgtaaccaag 17324798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 328
Target Start/End: Original strand, 25251127 - 25251434
Alignment:
Q  20 gaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagc 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  25251127 gaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataatcacaagc 25251226  T
Q  120 caaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcag 219  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  25251227 caaaagtagaaaacaac-gagagag-aaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtattggggagagagcaa 25251324  T
Q  220 ccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctct 318  Q
    |||||  |||||||||  |||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25251325 ccctctgtttcactataatgataagtaaccttacaaaagatatatcaatgggttacaagaataagttttccgcctaattctacccaaagtcccaatctct 25251424  T
Q  319 tcccgtaacc 328  Q
    ||||||||||    
T  25251425 tcccgtaacc 25251434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 2949079 - 2949393
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  2949079 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaac 2949178  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    ||||||||||| |||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  2949179 acaagccaaaagtagaa---aacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc-gggggag 2949274  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  2949275 agagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagcccca 2949374  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||| ||| ||||| ||||    
T  2949375 atctattctcgtaaacaag 2949393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 14097815 - 14098132
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  14097815 tgttgcgaattcgaagaaaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaa 14097914  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  14097915 cacaagtcaaaagtagaaaacaac-gagagagaaa-ggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgtgggag 14098012  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatg-ttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||   |     
T  14098013 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagctct 14098112  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14098113 aatctcttcccgtaaccaag 14098132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 28206912 - 28207228
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  28206912 tgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaa 28207011  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28207012 cacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggag 28207111  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||| ||||| ||  ||||  ||||    
T  28207112 agagcagccctccgtttcacta--tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcgtaattatattcaaagcccca 28207209  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  28207210 atctcttcctgtaaccaag 28207228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16429387 - 16429077
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||    
T  16429387 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataaac 16429290  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    |||| |||||| | |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16429289 acaaaccaaaagt-gaa---aacagcgagagaaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggaga 16429195  T
Q  214 gagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16429194 gagcagccctccgtttcgctataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaattccca 16429095  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaa 330  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16429094 atctcttcccgtaaccaa 16429077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Original strand, 12302347 - 12302667
Alignment:
Q  12 cctgttgcgaatttgatgaaaaat--cacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataatta 108  Q
    ||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| | |||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  12302347 cctgttgcgaattcgataaaaaaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggaaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 12302446  T
Q  109 taaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  12302447 taaacacaagtcaaaagtagaaaacaac-gagagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctggg 12302544  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  12302545 ggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttataagaataagtctcccgcctaattctacctaaagt 12302644  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12302645 cccaatctcttcccgtaaccaag 12302667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23816323 - 23816030
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  23816323 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatc 23816225  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaa--gagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  23816224 acaagtcaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaaaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggggga 23816125  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    ||||||| ||||||  | || ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23816124 gagagcatccctccgatccattatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 23816030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 327
Target Start/End: Original strand, 27338990 - 27339288
Alignment:
Q  29 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaatta 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  27338990 gaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggaacaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagta 27339089  T
Q  128 gaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||      
T  27339090 gaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagatcagccctccga 27339189  T
Q  228 ttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaac 327  Q
    | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  27339190 tccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtcgcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaac 27339288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18840022 - 18839706
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| || | ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18840022 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagtaatcgaaacaaagtgtatggaacaattataaac 18839923  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| ||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  18839922 acaagccaaaactagaaaacagc-gagagagaaaa-gaagagagaacacgaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaa 18839825  T
Q  214 gagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||||||  |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  18839824 gagcagccctctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 18839725  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||| ||||||||||    
T  18839724 ttctcttctcgtaaccaag 18839706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 31424862 - 31425177
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||| | | ||||||||||    
T  31424862 tgttgcgaattcaatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaatactcaagcaaccataacaaaatgtatgggacaattataaac 31424961  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31424962 acaagtcaaaagtagaaaacagc-gagagagaaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtat-ggggaga 31425058  T
Q  214 gagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||| ||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  31425059 gagcagccttccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagcctcccgcctaattctacccaaagtccca 31425158  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  31425159 atctctttccgtaaccaag 31425177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13215518 - 13215200
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| | ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13215518 tgttgtgaattcgttgagaaaacacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaac 13215419  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    ||||||||||| |||||   |||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13215418 acaagccaaaagtagaa---aacagcgagagagaaaggaagagaga--acaaaagaatttgttgacgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggag 13215324  T
Q  213 agagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagag----atatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||| || ||||||  ||||||||||  |||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  13215323 agagcagccctccgttccactataatgatgagtaaatttacaaaagagaaaaatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 13215224  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13215223 tcccaatctcttcccgtaaccaag 13215200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 51750476 - 51750158
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||     
T  51750476 tgttgcgaattcgat-aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aat 51750381  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51750380 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg 51750281  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  51750280 ggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 51750181  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  51750180 cccagcctcttcccgtaaccaag 51750158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 30 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15823968 - 15823665
Alignment:
Q  30 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattag 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||| |||    
T  15823968 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaaggggtaatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataatcacaaggcaaaagtag 15823869  T
Q  129 aaaacaacagcgagagaaaag-gaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccat 227  Q
    ||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  15823868 aaaacaacaacaagagaaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgt 15823769  T
Q  228 ttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaac 327  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  15823768 tccactatatgatgagtaacgttacaatagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaac 15823669  T
Q  328 caag 331  Q
    ||||    
T  15823668 caag 15823665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17319321 - 17319006
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17319321 tgttgtgaattcgatgaaaaatcgcaccaataacaaatttgatgtgtggagtaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaatagttataaac 17319222  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| ||||||| | | | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17319221 acaagccaaaagtagaaaatagc-gagagagaaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcta-gggaga 17319125  T
Q  214 gagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||  | |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  17319124 gagcagccctccgttttactataatgatgagtaacttaacaaaagagatatcaataagttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtccca 17319025  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  17319024 atctgttcccgtaaccaag 17319006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 10399669 - 10399990
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaa-atcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataa 111  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  |    
T  10399669 tgttgcgaattcgatgaaaatatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta--a 10399765  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  10399766 atacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 10399865  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  10399866 ggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaa 10399965  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  10399966 gtcccaatctcttcccgtaaccaag 10399990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 38925328 - 38925640
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatagaataattataa 111  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||    
T  38925328 tgttgtgaatttgatgagaaaacacaccaataataaacttgatgtgtggagtaagtgataatcaggcaaccaaaaatcaaagtgtatggaacatttataa 38925427  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38925428 acacaagccaaaagtagaaaacaat---gagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtct-gggga 38925522  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |    
T  38925523 gagagcagccctccgttttactatg--atgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtctc 38925620  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  38925621 aatctcttcccgtaaccaag 38925640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Original strand, 15294677 - 15294996
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||    
T  15294677 ctgttgcgatttcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aa 15294772  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15294773 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 15294872  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||     
T  15294873 gggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataaatctcccacctaattctacccaaag 15294972  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  15294973 tcccaacctcttcccgtaaccaag 15294996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 41647355 - 41647039
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  41647355 tgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgcggagcaagtgataatcagacaaccaaaatcaaagtgtatgaaataattataaa 41647256  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||    
T  41647255 cacaagtcaaaagtagaaaacagcaa-gagagaaa-ggaagagagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctgatggag 41647158  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||    
T  41647157 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtcgca 41647058  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||    
T  41647057 atctcttcccgtaaccaag 41647039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Original strand, 50248415 - 50248734
Alignment:
Q  12 cctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataa 111  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  50248415 cctgttgtgaattcgatgataaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataa 50248514  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
     |||||||||||| | ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50248515 ccacaagccaaaagttgaaaacaac-gagagag-aaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggaccaaattgacctagtctagggga 50248612  T
Q  212 gagag--cagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatc 309  Q
    |||||  || || ||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  50248613 gagagaacaaccatctgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatgtcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtc 50248712  T
Q  310 ccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     | ||||||||| |||||||||    
T  50248713 tcgatctcttcctgtaaccaag 50248734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 31490345 - 31490032
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  31490345 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaata-caaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataaac 31490247  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||   | |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||    
T  31490246 acaagtcaaaagtagaaaacagg-gagagagaaaat-aagagagaacacaaaagaatttgttgatctagttcagtccaaattgacctagtctggggg-ga 31490150  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| |||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||    
T  31490149 gagcagccctccgtttcaccatatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtcttccgcctaattctatccaaagtctcaa 31490050  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31490049 tctcttcccgtaaccaag 31490032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 31735365 - 31735683
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||     
T  31735365 tgttgcgaattcgatgagaaattacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aat 31735461  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31735462 acaagccaaaat-agaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg 31735560  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  31735561 ggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 31735660  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  31735661 cccagcctcttcccgtaaccaag 31735683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 25248398 - 25248711
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  25248398 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaacaataacaaacttgatgtgtggagtaaggaatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaac 25248497  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    | ||| ||||| |||||   |||||||||||| |  |||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248498 aaaagtcaaaagtagaa---aacagcgagagacaccggaagataaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 25248594  T
Q  213 agagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
     |||||| ||||| |||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |    
T  25248595 ggagcagtcctccgtttcactataattatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctc 25248694  T
Q  312 aatctcttcccgtaacc 328  Q
    |||||||||| ||||||    
T  25248695 aatctcttcctgtaacc 25248711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18307543 - 18307228
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||| | | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18307543 tgttgcgaattcgatgagaaaatacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaaatgataattaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaac 18307444  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    ||||||||||| |||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18307443 acaagccaaaagtagaa---aacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgactccgttcggtccaaattgacctagtct-ggggag 18307348  T
Q  213 agagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    ||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||    
T  18307347 agagcagccatccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgcgtcacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagcccc 18307248  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18307247 aatctcttcccgtaaccaag 18307228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 39932515 - 39932192
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||    
T  39932515 ctgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaa 39932418  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaa-caacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     ||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |     
T  39932417 tacaagccaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtatg 39932318  T
Q  207 gggga-gagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaa 305  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39932317 ggggaagagagcagccctccgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaa 39932218  T
Q  306 aatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    | || || ||||||||||||||||||    
T  39932217 agtctcagtctcttcccgtaaccaag 39932192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 331
Target Start/End: Original strand, 9240940 - 9241248
Alignment:
Q  20 gaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagc 119  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |    
T  9240940 gaattcgataaaaaatcacaccaataacaaacttgaagtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaatacaaac 9241039  T
Q  120 caaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcag 219  Q
    ||||| |||||   ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  9241040 caaaagtagaa---aacagcgagag-aaagaaagagagaacaaaaaagaatttgtttccccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcag 9241135  T
Q  220 ccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctct 318  Q
    |||||| || ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  9241136 ccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagccccaatctct 9241235  T
Q  319 tcccgtaaccaag 331  Q
    || ||||||||||    
T  9241236 tctcgtaaccaag 9241248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 2617955 - 2617635
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  ||    
T  2617955 tgttgcgaattcgatgaaaac-cacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta--aa 2617860  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaag-----gaagagagaa-cacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||      ||||||| || ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  2617859 tacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaacacaatgaagagaaaaacacaaaataatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtctg 2617760  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
     ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  2617759 agggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaa 2617660  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||||  |||||||||||||||||    
T  2617659 gtcccagcctcttcccgtaaccaag 2617635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 4131221 - 4131541
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  4131221 tgttgcgaattcgatgaaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgcggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaa 4131320  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4131321 cacaagccaaaaatagaaaacaac-gagagagaaaa-gaacagagaacacaaaagaatttgttgacatagttcagtccaaattgacctagtctgggggag 4131418  T
Q  213 agagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaag----agatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||| || ||||||  ||||||||||  |||||||||    |||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||     
T  4131419 agagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagaaagatatcaatgggttacaagaataagtttctcgcctaattctacccaaag 4131518  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    | |||  ||||||| |||||||||    
T  4131519 t-ccagcctcttcctgtaaccaag 4131541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13762275 - 13761956
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatga-aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||    
T  13762275 tgttgcgaattcgatgagaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagaaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aa 13762179  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  13762178 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgg 13762079  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  13762078 gggagagagaagccctccggtccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 13761980  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    || ||  |||||||||||||||||    
T  13761979 tcacagactcttcccgtaaccaag 13761956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 47452065 - 47451761
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  47452065 tgttgtgaattcaatgaaaaatcacatcaataacaaatttgatgtgtcgagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaac 47451966  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||             | ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  47451965 acaagccaaaagtagaaagcaacaacgagagaaaaggaagagag-------------tggttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaga 47451879  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    |||||| | | | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||  |||||    
T  47451878 gagcagtcattcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtttcccgcctaattttacccaaagccccaa 47451779  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||    
T  47451778 tctcttcccgtaaccaag 47451761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 55 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16429043 - 16428772
Alignment:
Q  55 atgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaaga 154  Q
    ||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| ||||||||| |   |||||||||| ||||    
T  16429043 atgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatagaag--ttataaacacaaaccaaaagtagaaaacatc---gagagaaaag-aaga 16428950  T
Q  155 gagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttaca 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||  |||||    
T  16428949 gagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactaaaatgatgagtaaccttaca 16428850  T
Q  254 aaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16428849 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaag 16428772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 46431548 - 46431869
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||  ||     
T  46431548 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtttggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta--aat 46431644  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa----aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||    || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46431645 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 46431744  T
Q  208 ggg--agagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaa 305  Q
    |||  |||||||||||||||  | |||||| |||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46431745 gggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaa 46431843  T
Q  306 aatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    | |||||  |||||||||||||||||    
T  46431844 agtcccatcctcttcccgtaaccaag 46431869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Original strand, 9459276 - 9459578
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  9459276 ctgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtat-gaa-agttataaa 9459372  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||||            ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  9459373 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgaga------------agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggag 9459460  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  9459461 agagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 9459559  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9459560 atctcttcccgtaaccaag 9459578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Original strand, 9463103 - 9463405
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  9463103 ctgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtat-gaa-agttataaa 9463199  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||||            ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  9463200 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgaga------------agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggag 9463287  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  9463288 agagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 9463386  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9463387 atctcttcccgtaaccaag 9463405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 17185979 - 17186290
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||| |    
T  17185979 tgttgtgaatttgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatatgtggagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataatc 17186076  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||  ||||| |||||   ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17186077 acaa-acaaaagtagaa---aacagcgagag-aaagaaagagagaacacaaaagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggaga 17186171  T
Q  214 gagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||| |||| || || |||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | | |    
T  17186172 gagcagcactccgttccattataatgatgagtaactttacaaaagagatattaatgggttacaagaataagtctcccttctaattctacccaaagttcaa 17186271  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17186272 atctcttcccgtaaccaag 17186290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 49 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28841083 - 28840799
Alignment:
Q  49 aacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa- 146  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||     
T  28841083 aacttgatgagtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtat-gaa-agttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 28840986  T
Q  147 --aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgag 243  Q
      || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||    
T  28840985 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgag 28840886  T
Q  244 taatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  28840885 taacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaag 28840799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 40134379 - 40134063
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatag--tcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattata 110  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||   ||| |||||||||||||||||||| |||   |||||    
T  40134379 ctgttgtgaattcgatgaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgatataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttata 40134282  T
Q  111 aacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggg 210  Q
    | | |||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| | ||||    
T  40134281 atctcaagccaaaagtagaaaacaac---gagagaaaaagaatagagaacacaaaagaatttgtttacctagtccggtccaaattgacctagtttggggg 40134185  T
Q  211 agagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatc 309  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  40134184 agagagcagccatccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaaacc 40134085  T
Q  310 ccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||||||||||||| ||||||    
T  40134084 tcaatctcttcccgtgaccaag 40134063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 77 - 331
Target Start/End: Original strand, 50076583 - 50076834
Alignment:
Q  77 aagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttg 176  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  50076583 aagcaactaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagttaaaagtagaaaacaac---gagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttg 50076679  T
Q  177 atccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattaca 275  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||| || ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  50076680 acccagttcggtccaaattgacatagtct-ggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggattaca 50076778  T
Q  276 agaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50076779 agaataagtttcccgcctaattctacccaaattcccaatctcttcccgtaaccaag 50076834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16226607 - 16226287
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  16226607 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtat-gaa-agttataaa 16226511  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || |||||   ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||     
T  16226510 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctg 16226411  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||   |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16226410 ggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 16226312  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  16226311 gtcccaatctcttcccgtaaccaag 16226287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 28998094 - 28998415
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa---caaagtgtatagaataattata 110  Q
    ||||| ||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||    |||||||||| ||| |||||||    
T  28998094 tgttgtgaattcgaagagaaaacacaccaatgacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaagaatcaaagtgtatggaacaattata 28998193  T
Q  111 aacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaag----gaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||     |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  28998194 aacacaagccaaaagtagaaaacaa---cgagagaaaagaagaaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 28998290  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    ||||||||| || |||||  |||||| || |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  28998291 ggggagagaacaaccctcagtttcaccatatgatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaa 28998390  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
      ||||||||||||| |||||||||    
T  28998391 gccccaatctcttcctgtaaccaag 28998415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 29003810 - 29004131
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa---caaagtgtatagaataattata 110  Q
    ||||| ||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||    |||||||||| ||| |||||||    
T  29003810 tgttgtgaattcgaagagaaaacacaccaatgacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaagaatcaaagtgtatggaacaattata 29003909  T
Q  111 aacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaag----gaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||     |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  29003910 aacacaagccaaaagtagaaaacaa---cgagagaaaagaagaaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 29004006  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    ||||||||| || |||||  |||||| || |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  29004007 ggggagagaacaaccctcagtttcaccatatgatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaa 29004106  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
      ||||||||||||| |||||||||    
T  29004107 gccccaatctcttcctgtaaccaag 29004131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23786278 - 23785959
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||| |||||  ||     
T  23786278 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta--aat 23786182  T
Q  114 acaagccaaaat-tagaaaacaacagcgaga-gaa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| |||  || |||||   |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  23786181 acaagccaaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaggaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgg 23786082  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  23786081 gggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 23785983  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23785982 tcccaatctcttcccgtaaccaag 23785959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 330
Target Start/End: Original strand, 2510202 - 2510485
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaa 130  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||  || ||||| |||||    
T  2510202 aaaatcacaccaataacaa-cttgatatgtgaagcaagagataatcaagcaacgaaaacaaagtgtatggaacaattaaaaaca--agtcaaaaatagaa 2510298  T
Q  131 aacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttc 230  Q
    |||||| ||||||            ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  2510299 aacaacggcgaga------------agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttc 2510386  T
Q  231 actatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaa 330  Q
    ||||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2510387 actatatgatgagtaactttacaagagagaaatcaatgggttacaagaataagtct-ctgcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaa 2510485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 28842931 - 28842615
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||     
T  28842931 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacactaataacaa-cttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtat-gaa-agttataaat 28842836  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||| | |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  28842835 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaatagaatttgttgacctagttctgtccaaattgacctagtctggg 28842736  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |||||||  |||||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  28842735 ggagagattagccctccgttccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 28842637  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaa 330  Q
    | ||  ||||||||||||||||    
T  28842636 ctcagcctcttcccgtaaccaa 28842615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 320
Target Start/End: Original strand, 6114966 - 6115254
Alignment:
Q  27 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaatt 126  Q
    |||||||||||||||  ||| | |||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||| |||   ||||||| ||||| ||||| |    
T  6114966 atgaaaaatcacaccggtaatatacttgatgtgtggagaaagtgataatcaagcaaccaaaataaaatgtatggaag--ttataaatacaagtcaaaagt 6115063  T
Q  127 agaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcca 226  Q
    |||| |||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||     
T  6115064 agaagacaac---gagagaaaag-aagagagaacacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcattccg 6115159  T
Q  227 tttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttc 320  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6115160 tttcactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaattggttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttc 6115254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 31422706 - 31423035
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattat-aaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||  |||||||||| |||    
T  31422706 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaatcaactaaaataaagtgtacggaataattataaaa 31422805  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||| ||||| ||||||||| | | ||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  31422806 cacaagtcaaaagtagaaaacagc-gagagagaaaa-gaagagatatcacaaaagaatttgttcacccagctcggtccaaattgacctagtctggaggag 31422903  T
Q  213 agagcagccctc-----ca-------tttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattct 299  Q
    ||||||||||||     ||       |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31422904 agagcagccctctgtttcaccctctctttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatgtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattct 31423003  T
Q  300 acccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31423004 acccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaag 31423035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25128294 - 25127991
Alignment:
Q  27 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaat 125  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||| |||||   ||||     
T  25128294 atgaaaactcacgtcaataacaaacttgatgtgtagagcaaggaataatcaagcaaccaaaatcaaagtggatagca--attataatcacaaat-aaaag 25128198  T
Q  126 tagaaaacaacagcgagagaaa---aggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccc 222  Q
    |||||||||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||    
T  25128197 tagaaaaca---gcgagagaaagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcctaattgacctagtatgggagagagagcagccc 25128101  T
Q  223 tccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcc 321  Q
    ||| ||||| |||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  25128100 tccgtttcaatataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgaattacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcc 25128001  T
Q  322 cgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||    
T  25128000 cgtaaccaag 25127991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16232003 - 16231683
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataa 111  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||    
T  16232003 ctgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaacggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtat-gaa-agttataa 16231907  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct 205  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || |||||   ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  16231906 atacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttga-ccagttcggtccaatctgacctagtct 16231808  T
Q  206 aggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaa 305  Q
     |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||   |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16231807 gggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaa 16231709  T
Q  306 aatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |  | |||||||||||||||||||||    
T  16231708 aggctcaatctcttcccgtaaccaag 16231683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 38 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 17324484 - 17324191
Alignment:
Q  38 caccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaaca--- 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||       
T  17324484 caccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccataacaaagtgtatgaaaaaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagtg 17324385  T
Q  135 ------acagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccat 227  Q
          | || |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| |    
T  17324384 agagagagagagagagagaaaggaagagagaacacaaga--atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtcatggggagagaccagccttccgt 17324287  T
Q  228 ttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttccc 322  Q
    ||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  17324286 ttcactataatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagttccaatctcttccc 17324191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 47180152 - 47179833
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||||| |||| |||||||||  ||    
T  47180152 tgttgtgaattcgatcaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaatcaaaatcaaagcgtatggaataatta--aa 47180056  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || |||||   ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||     
T  47180055 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtct- 47179957  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||   |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47179956 ggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 47179858  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  47179857 gtcccaatctcttcccgtaaccaag 47179833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 51757973 - 51757650
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||     
T  51757973 tgttgtgaattcgatgaaaaatgacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattg--aat 51757877  T
Q  114 acaagccaaaattag-----aaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagt 203  Q
    ||||||||||| |||     |||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  51757876 acaagccaaaagtagggaaaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagt 51757777  T
Q  204 ctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctaccc 303  Q
    || |||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||  ||||| ||||||| ||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51757776 ctgggggagagagcagccctccaatccactatatggtgagtatcgttac-aaagagaaatcgataggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccc 51757678  T
Q  304 aaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  51757677 aaagtctcagcctcttcccgtaaccaag 51757650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 47177801 - 47177482
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||    
T  47177801 tgttgtgaattcgatcaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataatta--aa 47177705  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || |||||   ||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||     
T  47177704 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcgatccaatctgacctagtct- 47177606  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||   |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  47177605 ggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaa 47177507  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  47177506 gtcccaatctcttcccgtaaccaag 47177482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24326101 - 24325782
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||  ||     
T  24326101 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaagtaaagtgtatggaacaatta--aat 24326005  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||| ||||  || |||||||| | |||| |||   || ||||| | | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  24326004 acaagtcaaaggtaaaaaacaacggtgagaagaacacaaagaagaaaaggacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacttagtctggg 24325905  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    ||||||||||||| | |  |||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  24325904 ggagagagcagccattcgattcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 24325805  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    | ||  |||||||||||||||||    
T  24325804 cacagcctcttcccgtaaccaag 24325782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 51752805 - 51752483
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||   ||     
T  51752805 tgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataataa-ctt-atgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattg--aat 51752711  T
Q  114 acaagccaaaattag------aaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctag 202  Q
    ||||||||||| |||      |||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51752710 acaagccaaaagtaggaaaaaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctag 51752611  T
Q  203 tctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacc 302  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51752610 tctgggggagagagcagccctccaatccactatatggtgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacc 51752512  T
Q  303 caaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||| || ||  |||||||||||||||||    
T  51752511 caaagtctcagcctcttcccgtaaccaag 51752483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 104 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6756870 - 6756645
Alignment:
Q  104 aattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagt 203  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||   ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6756870 aattataaacacaagtcaaaagtagaaaaca---gcgagaggaaag-aagagagaacagaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaactgacctagt 6756775  T
Q  204 ctagggg-agagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctac 301  Q
    || |||| ||||||||| | ||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6756774 ctggggggagagagcagtcttccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctac 6756675  T
Q  302 ccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  6756674 ccaaagtcccaatctcttctcgtaatcaag 6756645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20291894 - 20291576
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||| |||||  ||    
T  20291894 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagtaaccaaaatcaaggtgtatggaacaatta--aa 20291799  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  20291798 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacaaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtgtgg 20291699  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    |||||||| || ||||||  | |||||| ||||||| |  |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  20291698 gggagagaacaaccctccgatccactatatgatgagaatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 20291600  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||    
T  20291599 tcctagtctcttcccgtgaccaag 20291576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 331
Target Start/End: Original strand, 14183470 - 14183754
Alignment:
Q  30 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattaga 129  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||  |||    
T  14183470 aaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtgaagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaacacaagc-aaaagaaga 14183566  T
Q  130 aaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagccctccatt 228  Q
    |||||||                |||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  14183567 aaacaac----------------gagagaccacaaaaaaatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccatccgtt 14183650  T
Q  229 tcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaac 327  Q
     ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14183651 ccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttgcaagaataagtcttccgcctaattctacccaaaattctaatctcttcccgtaac 14183750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16432809 - 16432513
Alignment:
Q  26 gatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| ||| |||| ||||||| ||||||| ||| | ||||||||| || ||||||     
T  16432809 gatgaaaaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaagtaataatcaggcaatcaaaacacagtgtat-gaa-agttataaacataaaccaaaag 16432712  T
Q  126 tagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggg-agagagcagccctc 224  Q
    |||||||        | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |    
T  16432711 tagaaaa--------acagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagtccgc 16432621  T
Q  225 catttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccg 323  Q
    | |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||     
T  16432620 cgtttcactataatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaataattgtcccgcataattctacccaaagtttcaatctcttccca 16432521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20302879 - 20302578
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||| |||||  ||    
T  20302879 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtctggagcaagagataatcaagtaaccaaaatcaaggtgtatggaacaatta--aa 20302784  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||||            ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20302783 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgaga------------agaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggag 20302696  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||| || |||||  | |||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  20302695 agagtagtcctccgatccactatctgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccta 20302597  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  20302596 gtctcttcccataaccaag 20302578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 331
Target Start/End: Original strand, 3579594 - 3579778
Alignment:
Q  146 aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagta 245  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||  |||||||||    
T  3579594 aaaggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcaatcatccgtttcacta-atgatgagta 3579692  T
Q  246 atgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  3579693 actttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagccccaatctctttccgtaatcaag 3579778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 158 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6823306 - 6823133
Alignment:
Q  158 aacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaag 257  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||  ||||||||||    
T  6823306 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaag 6823207  T
Q  258 agatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  6823206 agaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaag 6823133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 127 - 331
Target Start/End: Original strand, 50078779 - 50078983
Alignment:
Q  127 agaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcca 226  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||      
T  50078779 agaaaacaac-gagagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgtttaccaaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctg 50078877  T
Q  227 tttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgta 325  Q
    || ||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  50078878 ttccactataatgatgaataactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgta 50078977  T
Q  326 accaag 331  Q
    ||||||    
T  50078978 accaag 50078983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13359011 - 13358798
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  13359011 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtat-gaa-agttataaa 13358916  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgag-agaa---aaggaagag-agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||   || |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13358915 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 13358816  T
Q  208 gggagagagcagccctcc 225  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13358815 gggagagagcagccctcc 13358798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15916822 - 15916562
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||  | | |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||    
T  15916822 ctgttgtgaattcgatgaaaagtcacaccaataa-atacttgatgtgtggagcaagtaacaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaa 15916726  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaa-ttgacctagtctagggga 211  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15916725 cacaagccaaaagtagaaaa--acagcgaga-aaaagaaagagagaacgcacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaaattgacctagtctggggga 15916630  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaaga 278  Q
    |||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15916629 gagagcagccctccgttccactataatgacgagtaactttataaaagagatatcaatgggttacaaga 15916562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 164
Target Start/End: Original strand, 50078635 - 50078787
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatga-aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  50078635 tgttgcgaattcgatgagaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaa 50078734  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaac-agcgagagaaaaggaagagagaacacaa 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  50078735 cacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagagaaaaagaagagagaaaacaa 50078787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 331
Target Start/End: Original strand, 15669281 - 15669556
Alignment:
Q  52 ttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaagga 151  Q
    ||||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||||||||| |||   |||||||||||| | ||| |   | |||| |||||||||||||| |    
T  15669281 ttgatgtgtgaagcaaataataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatcgaag--ttataaacacaaacaaaagt---ataaca-cagcgagagaaaagaa 15669374  T
Q  152 agagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgt 249  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |  |||||| ||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||  |||||||||   |    
T  15669375 agagagaacacaacaaaatttgtttacacagttcagtctaaaactgacctagtctcggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtagctt 15669474  T
Q  250 tacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  15669475 tacgagagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaag 15669556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 30790250 - 30790563
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||    
T  30790250 tgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataaaatacctgatgtgtgaagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataaac 30790346  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtcc-aaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||| | |||||   ||||  |||||||||| |||| ||||||| |||||  | | |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||    
T  30790347 acaaacaaaaatagtaaaaagacagcgagag-aaagaaagagagcacacacga-attttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtct-gggaag 30790443  T
Q  213 agagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctac-cgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
    ||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||| |||| ||     
T  30790444 agagcagtcatccattccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacacaaagtct 30790543  T
Q  311 caatctcttcccgtaaccaa 330  Q
    | |||||||| |||||||||    
T  30790544 ccatctcttcgcgtaaccaa 30790563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Original strand, 13447117 - 13447301
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||     
T  13447117 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaat--taaat 13447212  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaa----aaggaagag-agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattga 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    || |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13447213 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaaaaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattga 13447301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 324
Target Start/End: Original strand, 18800439 - 18800728
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaa 130  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||  |||||   ||| |||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||| |||||    
T  18800439 aaaatcacaccaacaaaatacttgatgtgtagagcaaataataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaag--ttataaacacaagccaaaagtagaa 18800536  T
Q  131 aacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagccctccattt 229  Q
    ||||||   |||||||||  || ||||||||||  | |||||||| | || ||| ||||||||  | ||||||| | |||||||||||||  ||||  ||    
T  18800537 aacaac---gagagaaaacaaaaagagaacacacga-aatttgtttaccctgtttggtccaaaactaacctagtttgggggagagagcagttctccgctt 18800632  T
Q  230 cactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgt 324  Q
    ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||    
T  18800633 cactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggatacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagttcaaatctctacccgt 18800728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 329
Target Start/End: Original strand, 8348905 - 8349212
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||  ||| ||||||||||||| |||||||||| |||   ||||||||    
T  8348905 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataa-aaacttgacgtgtggaacaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaag--ttataaac 8349000  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctaggggag 212  Q
    |||| | |||| ||||||||||     ||||||| | ||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||| |||  |||| |||||| ||||||    
T  8349001 acaaac-aaaagtagaaaacaatt---agagaaa-gaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtctaaaactgacatagtcttggggag 8349094  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    ||| || ||||| ||| ||||||  ||||||||||  | |||||||||||| |||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||     
T  8349095 agaacaaccctctattccactataatgatgagtaacttaacaaaagagataccaatgagttacaagaataagtcacccgcctaattctacctaaagtcct 8349194  T
Q  312 aatctcttcccgtaacca 329  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  8349195 aatctcttcccgtgacca 8349212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 207 - 331
Target Start/End: Original strand, 21948226 - 21948350
Alignment:
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21948226 ggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 21948325  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||||   ||||||||||||||||    
T  21948326 gtcccagcgtcttcccgtaaccaag 21948350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 146 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 42922535 - 42922349
Alignment:
Q  146 aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgag 243  Q
    |||| |||||| |||||| || |||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||| ||||| || |||| |  |||||||    
T  42922535 aaagaaagagataacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtcctccgttccactctaatgatgag 42922437  T
Q  244 taatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  42922436 taactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaag 42922349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 148
Target Start/End: Original strand, 25860270 - 25860383
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaa 130  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  25860270 aaaaccacaccaatatcaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaa----ccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaa 25860365  T
Q  131 aacaacagcgagagaaaa 148  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25860366 aacaacagcgagagaaaa 25860383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 181 - 330
Target Start/End: Original strand, 49495222 - 49495372
Alignment:
Q  181 agttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaa 279  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||  |||||| | |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49495222 agttcggtctaaattgacatagtcttggggagagataagcccttcgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaa 49495321  T
Q  280 taagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaa 330  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||    
T  49495322 tgagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttaccgtgaccaa 49495372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 3579431 - 3579550
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  3579431 tgttgtgaattcgatgaaaaa-cacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaac 3579529  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaaca 134  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  3579530 acaagccaaaagtagaaaaca 3579550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 182 - 324
Target Start/End: Original strand, 8347284 - 8347428
Alignment:
Q  182 gttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaa 279  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8347284 gttcggtccaaaactgacctagtctaggggaaagagcatccctccgttccactataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaa 8347383  T
Q  280 taagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgt 324  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  8347384 taagtctcccgcctaattctactcaaagtctcaatctcttcccgt 8347428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 230 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 48665398 - 48665296
Alignment:
Q  230 cactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttccc-gtaacc 328  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  48665398 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccggtaacc 48665299  T
Q  329 aag 331  Q
    |||    
T  48665298 aag 48665296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 30780484 - 30780361
Alignment:
Q  12 cctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtga--agcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattat 109  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  30780484 cctgttgtgaattcgatgaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtgtggagtaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattat 30780385  T
Q  110 aaacacaagccaaaattagaaaac 133  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||    
T  30780384 aaacacaaatcaaaagtagaaaac 30780361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 13125310 - 13125621
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||   ||| ||||||||||||||||| |||  |   | | ||||||||    
T  13125310 tgttgcgaattcgttcaaaaatcacaccaataaattacttgatgtgtggagcaaaa-ataatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaac 13125405  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||| |||| |||||||||||   ||||||||   |||||||||||||  | |||||||| | | |||||||||| | | |||||||||   |||| |    
T  13125406 acaagc-aaaagtagaaaacaac---gagagaaagaaaagagagaacacatga-aatttgtttacctagttcggtcctatactgacctagtaaggggggg 13125500  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctac-cgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
    |||||| | |||| || ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||||||||||||||| |||    
T  13125501 agagcaactctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtcc 13125600  T
Q  311 caatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||| | ||||||    
T  13125601 caatctcttcccttgaccaag 13125621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 251 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 6824091 - 6824014
Alignment:
Q  251 acaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaacc 328  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  6824091 acaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctgccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaacc 6824014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 321
Target Start/End: Original strand, 30738564 - 30738783
Alignment:
Q  104 aattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctag 202  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||| || || ||||||||   |||||||||||||  | |||||||| | | |||| ||||||| | ||||||||    
T  30738564 aattataaacacaagc-aagagtagaaaa-aatagtgagagaaagaaaagagagaacacacga-aatttgtttaccaagtttggtccaatactgacctag 30738660  T
Q  203 tctaggggagagagcagccctccatttcactatg---tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccg-cctaattc 298  Q
    | | || ||||||||| |||||| |||||||||    ||||||||||  |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |   ||||||||    
T  30738661 tatgggtgagagagcatccctccgtttcactataatatgatgagtaactttacaaaagagacatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattc 30738760  T
Q  299 tacccaaaatcccaatctcttcc 321  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  30738761 tacccaaaatcccaatctcttcc 30738783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16561878 - 16561631
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattaga 129  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| || ||   ||| |||||||||||| | ||| |||   |||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  16561878 aaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagaaaa--ataatcaagcaaccaatatcaacgtg---agaacaattataaacacaagc-aaaagtaga 16561785  T
Q  130 aaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccatt 228  Q
    ||||    |||||||||| | |||||||||||||  | |||||||| |  ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||   ||    
T  16561784 aaacg---gcgagagaaa-gaaagagagaacacacga-aatttgtttacacagttcggtccaatactgacctagtctatgggagagagcaaccctttgtt 16561690  T
Q  229 tcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtct 286  Q
     |||| |  ||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16561689 ccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtct 16561631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28279574 - 28279384
Alignment:
Q  145 aaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctagggg-agagagcagccctccatttcactatg-tgatg 241  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||| | |||||||| || || | |||||||||||||||| | ||| || | ||| ||| ||||||  |||||    
T  28279574 aaaagggagagagaacacacaaaaatttgtttacccagttcgatctaatactgacctagtctagggggaaagaacaactctcaattccactataatgatg 28279475  T
Q  242 agtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccg-cctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||  |||||||||||||  |||||  |||||||||| ||||| |   |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28279474 agtaactttacaaaagagatgccaatgagttacaagaattagtcttcaaacctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtgaccaag 28279384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 146 - 331
Target Start/End: Original strand, 26613216 - 26613403
Alignment:
Q  146 aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgag 243  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||| || | ||||||| ||| |||||||||| ||| |||  || ||||||  |||| ||    
T  26613216 aaagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtcaaatactgacctaatctgggggagagagaagctctctgttccactataatgattag 26613314  T
Q  244 taatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctac-cgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||  || ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||||||    
T  26613315 taactttccaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagcctcaatctcttcctgtgaccaag 26613403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Original strand, 9476265 - 9476330
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  9476265 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatg 9476330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 50169210 - 50169254
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  50169210 ttgttgatccagttcggtccaacttgacctaatctaggggagaga 50169254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Original strand, 26520061 - 26520186
Alignment:
Q  107 tataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtcc-aaattgacctagtct 205  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||   |||||||||||| |||||||||||||  || ||||||| | |||||| ||||| ||| ||||||| | |    
T  26520061 tataaacacaagctaaaagtagaaaaca---gcgagagaaaagaaagagagaacacacgat-atttgtttacccagtttggtccaaaactgacctaattt 26520156  T
Q  206 aggggagagagcagccctccatttcactat 235  Q
     ||||| |||||| |||||| || ||||||    
T  26520157 gggggaaagagcaaccctccgttccactat 26520186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47102934 - 47102879
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcca 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  47102934 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccatcca 47102879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Original strand, 13598402 - 13598467
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| || | |||||||    
T  13598402 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatg 13598467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 67
Target Start/End: Original strand, 13785107 - 13785159
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaa 67  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13785107 tgttgtgaatttgttaaaaaatcacaccaataa-aaacttgatgtgtgaagcaa 13785159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16124609 - 16124544
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    |||||||  |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16124609 ttgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatg 16124544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 47704029 - 47703964
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  47704029 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatg 47703964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 155963 - 155825
Alignment:
Q  193 attgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccg- 290  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||| || ||||||  ||||||||||  ||||||| |||||| |||  | |||||||||| | ||| |       
T  155963 attgacctagttt-ggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagataacaaaaggttacaagaattactcttcaaa 155866  T
Q  291 cctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  155865 cctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaag 155825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 324
Target Start/End: Original strand, 26520205 - 26520269
Alignment:
Q  261 tatcaatggattacaagaataagtctaccg-cctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgt 324  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26520205 tatcaatgggttacaagaataagtttccaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgt 26520269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27916780 - 27916712
Alignment:
Q  168 aatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat 235  Q
    |||||||| | ||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  27916780 aatttgtttacccaattcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat 27916712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Original strand, 19072932 - 19072987
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcca 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  19072932 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 19072987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Original strand, 19120822 - 19120877
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcca 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  19120822 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 19120877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26644990 - 26644935
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcca 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  26644990 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 26644935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Original strand, 32889443 - 32889498
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcca 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  32889443 ttgttgatctagttcggtccaatatgacctagtctgggggatagagcagctctcca 32889498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47098917 - 47098862
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcca 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  47098917 ttgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctcca 47098862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 236
Target Start/End: Original strand, 29651818 - 29651880
Alignment:
Q  174 ttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  29651818 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactatg 29651880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 834167 - 834211
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  834167 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagaga 834211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 226
Target Start/End: Original strand, 3281715 - 3281767
Alignment:
Q  174 ttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcca 226  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  3281715 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 3281767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 13137976 - 13138020
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  13137976 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctactctaggggagaga 13138020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21536662 - 21536598
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat 235  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  21536662 ttgttgacccagttcggtaaaaaatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 21536598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 28220226 - 28220270
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  28220226 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 28220270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 28265554 - 28265598
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  28265554 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 28265598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 81)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9020398 - 9020080
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||     
T  9020398 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagagataatcagacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaat 9020299  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaagg-aagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9020298 acaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggag 9020199  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  9020198 agagcagccccccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 9020099  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||  ||||||||    
T  9020098 atctcttcctataaccaag 9020080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 11982872 - 11983189
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |    
T  11982872 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattacaatc 11982970  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaag-gaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11982971 acaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggag 11983070  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  11983071 agagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 11983170  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
      |||||||||||||||||    
T  11983171 gcctcttcccgtaaccaag 11983189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 3629711 - 3630024
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3629711 tgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaac 3629810  T
Q  114 acaagccaaaat-tagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||||||||  |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3629811 acaagccaaaaagtagaaaacaac---gagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtat-ggggag 3629905  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | || |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||    
T  3629906 agagcagccctcagtttcactatattattagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagcccca 3630005  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3630006 atctcttcccgtaaccaag 3630024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 327
Target Start/End: Original strand, 3631784 - 3632094
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3631784 tgttgtgaattcgatgaaaaaacacaccaataacaaacttgacgtgtggagcaagtgataattaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaac 3631883  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| ||||||||| | | |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  3631884 acaagccaaaagtagaaaacatc-gagaga-aaaaggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct--gggaca 3631979  T
Q  214 gagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  3631980 gagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtccca 3632079  T
Q  313 atctcttcccgtaac 327  Q
    ||||||| |||||||    
T  3632080 atctctttccgtaac 3632094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Original strand, 1069561 - 1069879
Alignment:
Q  12 cctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataa 111  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||  | |||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  1069561 cctgttgtgaattcgatgagaaaatataccaataacaaattcgatgtatggagcaagggatagtcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaattataa 1069660  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
    |||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  1069661 acacaagcaaaaagtagaaaacagc-gagagagaaaag-aagagagaacataaaagaatttgttgattcagttcggtccaaattgacctagtatggggaa 1069758  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  1069759 gagagcagccctccgtttctctataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtct 1069858  T
Q  311 caatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  1069859 caatctcttcctgtaaccaag 1069879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 3233567 - 3233890
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| || ||| |||| ||| |||||||||| ||||||| ||  || |||||||||    
T  3233567 tgttgcgaattcgatgagaaaacacatcaataacaaatttgatgtgtggagtaagtgataatcaggcaaccaaaatcaaagtgcatgaaacaattataaa 3233666  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttga-----tccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     | |||||||||| ||||||||||||| | |    
T  3233667 cacaaaccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagttcggtcaaaattgacctagtgtgg 3233766  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  3233767 gggagagagcagccctccgtttcactatacggtgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaag 3233866  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     | |||||||||||||||||||||    
T  3233867 cctcaatctcttcccgtaaccaag 3233890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Original strand, 4816070 - 4816391
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||    
T  4816070 ctgttgtgaatctgatcaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aa 4816166  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaa-caacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     ||||| ||||| ||||||| |||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  4816167 tacaagtcaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 4816266  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4816267 ggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 4816366  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     || ||  |||||||||||||||||    
T  4816367 gtctcagcctcttcccgtaaccaag 4816391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13057659 - 13057348
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||   |  | |||||||| |    
T  13057659 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaata-aaagtgggca--acaattataatc 13057563  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    |||| | |||| |||||||||   |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  13057562 acaaac-aaaagtagaaaaca---gatagagaaaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgaccgagttcggtccaaattgacctagtttgggggaga 13057467  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||| |||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  13057466 gagtagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 13057367  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13057366 atctcttcccgtaaccaag 13057348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 24338295 - 24338606
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24338295 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaac 24338394  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    |||| |||||| ||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||    
T  24338395 acaaaccaaaagtagaaaacaa---cgagagaaaa-gaagagataacacaaaaatatttgtttacctagttcggtccaaattgacatagtct--ggggga 24338488  T
Q  214 gagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||  |    
T  24338489 gagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttctgactaattctacccaaagtctta 24338588  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaa 330  Q
    ||||||| || |||||||    
T  24338589 atctctttccataaccaa 24338606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Original strand, 19704401 - 19704728
Alignment:
Q  12 cctgttgcgaatttgat-gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatagaataatta 108  Q
    ||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||    
T  19704401 cctgttgtgaattcgatcgagaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaatcaaagtgtatggaacaatta 19704499  T
Q  109 taaacacaagccaaaattagaaaa--caacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgaccta 201  Q
      || ||||||||||| |||||||  |||| |||||| |||   || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19704500 --aatacaagccaaaagtagaaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgaccta 19704597  T
Q  202 gtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaa-agagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattcta 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19704598 gtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaagagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattcta 19704697  T
Q  301 cccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19704698 cccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaag 19704728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 331
Target Start/End: Original strand, 30728673 - 30728988
Alignment:
Q  18 gcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaa 117  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  30728673 gcgaattcgttgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaatacaa 30728772  T
Q  118 gccaaaattagaaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagag 216  Q
    | ||||| |||||   |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  30728773 gtcaaaagtagaa---aacagcgagagagaaaggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgcgggagagag 30728869  T
Q  217 cagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaag----agatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||| ||| || ||||||   ||||||||  |||||||||    |||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  30728870 cagccttccgttccactataatatgagtaactttacaaaagagaaagatatcaatgagttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca 30728969  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
      |||||||||||||||||    
T  30728970 gcctcttcccgtaaccaag 30728988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 331
Target Start/End: Original strand, 14507037 - 14507335
Alignment:
Q  34 atcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaac 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  14507037 atcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aatacaagccaaaagtagaaaac 14507133  T
Q  134 aacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatt 228  Q
    ||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  14507134 aacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgat 14507233  T
Q  229 tcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaacc 328  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  14507234 tcactatatgataagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacc 14507332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26065440 - 26065137
Alignment:
Q  29 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaatta 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||||| ||    
T  26065440 gaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacagttataatcacatgccaaaagta 26065342  T
Q  128 gaaaacaacagcgaga-gaa--aaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctc 224  Q
    |||||||||||| ||| |||  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26065341 gaaaacaacagcaagaagaacaaaagaatagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctc 26065243  T
Q  225 catttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgt 324  Q
    |  | |||||| | | |||||| |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  26065242 cgatccactatataacgagtaacgttacaaa-gagaagtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgt 26065144  T
Q  325 aaccaag 331  Q
    |||||||    
T  26065143 aaccaag 26065137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26085409 - 26085106
Alignment:
Q  29 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaatta 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||||| ||    
T  26085409 gaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacagttataatcacatgccaaaagta 26085311  T
Q  128 gaaaacaacagcgaga-gaa--aaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctc 224  Q
    |||||||||||| ||| |||  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26085310 gaaaacaacagcaagaagaacaaaagaatagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctc 26085212  T
Q  225 catttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgt 324  Q
    |  | |||||| | | |||||| |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  26085211 cgatccactatataacgagtaacgttacaaa-gagaagtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgt 26085113  T
Q  325 aaccaag 331  Q
    |||||||    
T  26085112 aaccaag 26085106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 28241163 - 28241481
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||     
T  28241163 tgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaatta--aat 28241258  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  28241259 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgaaaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctggg 28241358  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |    
T  28241359 ggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagt 28241458  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  28241459 cccagcctcttcccgtaaccaag 28241481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 2628727 - 2629045
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||    
T  2628727 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaag--ttataaa 2628822  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  2628823 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgg 2628922  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||||||||     
T  2628923 gggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataaattctccgcctaattctacccaaag 2629021  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  2629022 tcccaatctcttcccgtaaccaag 2629045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 14458607 - 14458927
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || || ||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||  ||    
T  14458607 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataatag-cttgatgtgtggagtaatggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta--aa 14458703  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14458704 tacaagccaaaagtagaaaacaacgacgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 14458803  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    |||||||||||||||||   | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  14458804 gggagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 14458903  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||  |||||||||||||||||    
T  14458904 tcccagcctcttcccgtaaccaag 14458927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 1230090 - 1230409
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||| |||||||||  || ||||| | ||    
T  1230090 tgttgcgaattcgat-aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggatcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattaaatac 1230187  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    | ||||||||| || |||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1230188 a-aagccaaaagtataaaacaacggcgagaagaacacaatgaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg 1230286  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  1230287 ggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 1230386  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||  |||||||  ||||||||    
T  1230387 cccagcctcttccaataaccaag 1230409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 15367498 - 15367193
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15367498 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcatgtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaac 15367399  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggg-gag 212  Q
    ||||||||||| |||||||  |   |||||| |||| ||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  15367398 acaagccaaaagtagaaaaata---cgagag-aaagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagag 15367304  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||  |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| |  ||    
T  15367303 agagcagccttccgtttcactatatgatgaataactttacaatagagatattaatgggttacaagaataagtctcccgattaattttacccaaagtttca 15367204  T
Q  313 atctcttcccg 323  Q
    |||||||||||    
T  15367203 atctcttcccg 15367193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 26065961 - 26066283
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||| |||||  ||     
T  26065961 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta--aat 26066057  T
Q  114 acaagccaaaat-tagaaaacaacagcgagag----aaaag--gaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtc 204  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||     |||||  |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26066058 acaagccaaaaagtagaaaacaactgcgagaagaacaaaagaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc 26066157  T
Q  205 taggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctaccca 304  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||| |||| ||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  26066158 taggggagagagcagccctccgatccactatttgataagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccta 26066256  T
Q  305 aaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  26066257 aagtcccaatctcttcccgtaaccaag 26066283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15346806 - 15346526
Alignment:
Q  21 aatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagcc 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  15346806 aattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggaacaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacacaagcc 15346707  T
Q  121 aaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagc 220  Q
    |||| ||||||||||||   |||| |||| |||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15346706 aaaagtagaaaacaaca---agag-aaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 15346612  T
Q  221 cctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
      ||| ||||||||| |||||| |||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  15346611 tttccgtttcactatatgatgaataactttacaatagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcttaattttactcaaa 15346526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 26068235 - 26068554
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||| |||||  ||     
T  26068235 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta--aat 26068331  T
Q  114 acaagccaaaat-tagaaaacaacagcgaga-gaa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| |||  || |||||   ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068332 acaagccaaaaagtagaaaacaactgcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctag 26068431  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||     
T  26068432 gggagagagcagccctccgatccactatttgatgagcaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacctaaag 26068530  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  26068531 tcccaatctcttcccgtaagcaag 26068554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 26932403 - 26932721
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||     
T  26932403 tgttgtgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtat-gaa-agttataaat 26932499  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaa-caacagcgaga-gaa---aaggaagagagaacacaaaataa-tttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
    ||||||||||  ||||||| |||| |||||| |||   || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  26932500 acaagccaaaggtagaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaaga-agaacacaaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgg 26932598  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||   |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  26932599 gggagagagcaaccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 26932697  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  26932698 tctcaatctcttcccgtaaccaag 26932721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Original strand, 29754548 - 29754868
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||  ||    
T  29754548 ctgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta--aa 29754644  T
Q  113 cacaagccaaaat-tagaaaacaacagcgaga-gaa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     || ||||||||  ||||||||||| |||||| |||  || |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||     
T  29754645 tacgagccaaaaagtagaaaacaactgcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctg 29754744  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  29754745 ggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacctaaa 29754843  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||||||||||| |||||||||||    
T  29754844 gtcccaatctctttccgtaaccaag 29754868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 32280463 - 32280150
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |||||||||||| |||| |||  ||  | |||||||||     
T  32280463 tgttgtgaattcgataaaaaatcacacaaataacaaacttgatgtatggagtaagtgataatcaagcaaccaatacaa-gtgggta--acaattataaat 32280367  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32280366 acaagccaaaagtagaaaataacat-gagagaaa-ggaagagagaacacaagagaattttttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 32280269  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgt-gatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||||||| ||| |||||   |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||    
T  32280268 gagcagccctccgttttactataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctgaagtccca 32280169  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||    
T  32280168 atctcttcccgtaaccaag 32280150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 30967673 - 30967355
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||  ||     
T  30967673 tgttgcgaattcgttgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagtaaccaaaacaaagtgcatggaataatta--aat 30967578  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  30967577 acaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttggg 30967478  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |||||||||||| ||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  30967477 ggagagagcagctctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagt 30967378  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
      ||  |||||||||||||||||    
T  30967377 ttcagcctcttcccgtaaccaag 30967355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 15540990 - 15541300
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||     || | |||||| |    
T  15540990 tgttgcgacttcgatgaaaaatcaaaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagaaaccaaaacaagttggt---aacagttataatc 15541086  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    |||| | |||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||    
T  15541087 acaaac-aaaattagaaaacaac-gagagagaaaa--aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattaacctagtctggaggaga 15541182  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    |||||||  ||  ||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15541183 gagcagctttctgtttcactatatgatgaataactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaatcctacccaaagtcccaa 15541282  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||| ||| ||||||    
T  15541283 tctcttctcgtgaccaag 15541300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 5273055 - 5273375
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataa 111  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||  || |||    
T  5273055 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgtaat--ttttaa 5273151  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  || |||||   |||||||  |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  5273152 atacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacactgagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 5273251  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||   |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5273252 ggggagagagcagccctccaatccactataagatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 5273350  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  5273351 gtcccaatctcttcccgtaaccaag 5273375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13040106 - 13039908
Alignment:
Q  134 aacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcact 233  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13040106 aacaacgagagaaaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttcact 13040007  T
Q  234 at-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  13040006 ataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacgcaaagtctcaatctcttcccgtaaccaag 13039908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 20915197 - 20915515
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||     
T  20915197 tgttgtgaatctgatcaaaaatcacaccaataataa-cttgatgtgtggggcaaggggtaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaataatta--aat 20915293  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaa-caacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||   || ||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20915294 acaagccaaaagtagaaaaacaacgacgagaagaacacaaagaagagaagaacacagag-aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 20915392  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  20915393 gggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccgaag 20915491  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  20915492 tcccaatctcttctcgtaaccaag 20915515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 33309329 - 33309012
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||| |||||  ||    
T  33309329 tgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta--aa 33309234  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  || |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  33309233 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgg 33309134  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  33309133 gggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtctcccgcctaattctacccaaag 33309036  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  33309035 tcccaatctcttcccgtaaccaag 33309012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14466785 - 14466477
Alignment:
Q  20 gaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagc 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||| |||||      
T  14466785 gaattcgatgaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtgcagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaaatgtat-gaa-agttataatcacaa-a 14466689  T
Q  120 caaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcag 219  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||    
T  14466688 caaaagtagaaaacagcagcgagag-aaagaaagagagaacacaagagaatttgctgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaacagcag 14466590  T
Q  220 ccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctct 318  Q
     | |||  ||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  14466589 tcatccggttcactataatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaatatgtctctcgcctaattctactcaaactcccaatctct 14466490  T
Q  319 tcccgtaaccaag 331  Q
    | |||||||||||    
T  14466489 ttccgtaaccaag 14466477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 33311599 - 33311281
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataa 111  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||| |||||  |    
T  33311599 ctgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta--a 33311504  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  || |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||     
T  33311503 atacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctg 33311404  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    ||||||| |||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33311403 ggggagaaagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtctcccgcctaattctacccaaa 33311306  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  33311305 gtcccaatctcttcccgtaaccaag 33311281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 12195354 - 12195674
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||    
T  12195354 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtat-gaa-agttataaa 12195450  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || |||||   ||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||     
T  12195451 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaacttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctg 12195550  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||   |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||    
T  12195551 ggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgattaattctactcaaa 12195649  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  12195650 gtcccaatctcttcccgtaaccaag 12195674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 30034447 - 30034762
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||     
T  30034447 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtatggagcaagg-ataatcaagcaaccaaa-caaagtgtat-gaa-agttataaat 30034540  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagagag-aacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    |||||| |||| ||||||||||  |||||| |||   || ||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  30034541 acaagctaaaagtagaaaacaatggcgagaagaacacaaagaagataataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacccagtctggg 30034640  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |||||||||||||||||  | | |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  30034641 ggagagagcagccctccgatccgctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 30034740  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaa 330  Q
    ||||  |||||||| |||||||    
T  30034741 cccagcctcttcccttaaccaa 30034762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 109 - 330
Target Start/End: Original strand, 12161498 - 12161716
Alignment:
Q  109 taaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  12161498 taaacacaagacaaaagtagaaaaca---gcgagagagaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgattcagttcggtccaaattaacctagtttag 12161594  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || | ||||| |||| |||     
T  12161595 gg-agagaacagccatccattttactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccacttaattatacctaaag 12161693  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaa 330  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  12161694 tctcaatctcttcccgtaaccaa 12161716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 152 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3390713 - 3390533
Alignment:
Q  152 agagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgtt 250  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||  ||    
T  3390713 agagagatcacaaaagaatttgttgacccaatttggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactgtaatgatgagtaacttt 3390614  T
Q  251 acaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||    
T  3390613 acaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctttctgtaaccaag 3390533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 163 - 331
Target Start/End: Original strand, 15532674 - 15532841
Alignment:
Q  163 aaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagata 262  Q
    |||| |||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  15532674 aaaagaatttgttgacctagttcagtcaaaattgacctagtctaggg-atagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagata 15532772  T
Q  263 tcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  15532773 tcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccatgaccaag 15532841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15720089 - 15719796
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaa-ccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattaga 129  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||   | ||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||  | |||||| |||||  ||||| ||||    
T  15720089 aaaatcacgtcaataataaacttgatgtgt---ggaagtgatagtcaagcaatcaaaaataaagtgtatgga--agttataatcacaa-acaaaaataga 15719996  T
Q  130 aaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct-aggggagagagcagccctccatt 228  Q
    |   |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||| | |||  ||    
T  15719995 a---aacagcgagagaaaagaaagagagaacacatga-aatttgtttaccaagttcggtccaaattgacctagtatggggggaaagagcaactctctgtt 15719900  T
Q  229 tcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaac 327  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  15719899 tcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgac 15719800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 151 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25477616 - 25477428
Alignment:
Q  151 aagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat--------gtgatga 242  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||        || | ||    
T  25477616 aagagagaatacaaaagaatttgttgacccatttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaacga 25477517  T
Q  243 gtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  25477516 gtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctttccgtgaccaag 25477428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 104 - 324
Target Start/End: Original strand, 12186008 - 12186226
Alignment:
Q  104 aattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagt 203  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  12186008 aattataaacacaaggaaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa-gaaagagagaacacaaaataatttgtttacccagttcggttcaaattgacctagt 12186103  T
Q  204 ctaggggagagagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctac-cgcctaattctac 301  Q
    |   || ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |   ||||||| |||    
T  12186104 ccgaggcagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctccaaacctaattgtac 12186203  T
Q  302 ccaaaatcccaatctcttcccgt 324  Q
    ||||| || ||||||||||||||    
T  12186204 ccaaagtctcaatctcttcccgt 12186226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26945598 - 26945297
Alignment:
Q  26 gatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||  ||| ||||  || |||| |||||||||  |||   |||||||||||||||||||     
T  26945598 gatgaaaaatcacaccaataaaacacttgatatgtgaaacaagtaataatcaaagaatcaaa-caaagtgtaaggaag--ttataaacacaagccaaaag 26945502  T
Q  126 tagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagccctc 224  Q
    |||||||||   |||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||| | |||||||||||||||  |||| || ||| |||| |||||| |||||     
T  26945501 tagaaaaca---gcgagagaaaagaaagagagaagacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaacctgacataatctgggggggagagctgccctt 26945406  T
Q  225 catttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccg-cctaattctacccaaaatcccaatctcttccc 322  Q
    | ||  |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26945405 cgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaaaaataagtctacaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttccc 26945306  T
Q  323 gtaaccaag 331  Q
    || ||||||    
T  26945305 gtgaccaag 26945297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 3027703 - 3028014
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||| |||| | | |||||||||| ||||||  ||| || ||||||||||  ||||||||| |||   |||||||     
T  3027703 tgttgtgaattcaatgaaaaatcacaccgataa-atatttgatgtgtggagcaagtaataatcgagcaaccaaat-aaagtgtatggaag--ttataaat 3027798  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctagggg-a 211  Q
    ||||| ||||| |||||||||||   |||||||| | |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||| |||| |    
T  3027799 acaagtcaaaagtagaaaacaac---gagagaaa-gaaagagagaacacacga-aatttgtttatccagttcggtcaaaaactgacctagtctgggggga 3027893  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
     ||||||||||||| || ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||||||||| |||| ||     
T  3027894 aagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataaatctccagcctaattctactcaaagtct 3027993  T
Q  311 caatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||| ||| ||||||    
T  3027994 caatctcttcacgtgaccaag 3028014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 180 - 324
Target Start/End: Original strand, 16455433 - 16455579
Alignment:
Q  180 cagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaag 277  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  16455433 cagttcggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaaagggttacaag 16455532  T
Q  278 aataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgt 324  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16455533 aataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgt 16455579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 214 - 331
Target Start/End: Original strand, 15530166 - 15530282
Alignment:
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  15530166 gagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg-ttacaagaataagtctcccgcctaattcaacccaaagcctcaa 15530264  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15530265 tctcttcccgtaaccaag 15530282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10584348 - 10584246
Alignment:
Q  134 aacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcac 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  10584348 aacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaaaaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcac 10584249  T
Q  233 tat 235  Q
    |||    
T  10584248 tat 10584246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22491073 - 22490794
Alignment:
Q  20 gaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagc 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| |||  ||  | ||||||||||| | ||    
T  22491073 gaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttaatgtgtggagctaaggataatcaagcaaccaaaacaa-gtgggta--acaattataaacataggc 22490977  T
Q  120 caaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcag 219  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||| | |||||||| ||||||| |||||||                    ||||||||||| |||     |||||    
T  22490976 caaaagtagaaaacaac---gagagaaa-gaaagagagagcacaaaagaatttgt--------------------tgacctagtctgggg-----agcag 22490906  T
Q  220 ccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctct 318  Q
    ||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22490905 ccctc-attacactataatgatgagtaatcttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcataattctacccaaagtcccaatctct 22490807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3394837 - 3394695
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaacc-aaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3394837 tgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataaaaatcttgatgtgtggagaaatggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaattataaa 3394738  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagaga-aaaggaagagag 157  Q
    |||||||||||| |||||   |||||||||||| ||||||||||||    
T  3394737 cacaagccaaaagtagaa---aacagcgagagagaaaggaagagag 3394695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 19696887 - 19696605
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaa 130  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |  || |||||||||| ||||||||||  |   | | |||||||||||| | |||| |||||    
T  19696887 aaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaaag--taatcaagcaaccgaaacaaagtgggtg--acagttataaacacaaac-aaaagtagaa 19696793  T
Q  131 aacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccattt 229  Q
    ||  ||||||||||||| | |||||||||||||  | |||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||  ||  ||     
T  19696792 aa--acagcgagagaaa-gaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggagagagagcagctatctgttc 19696697  T
Q  230 cactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctac-cgcctaattctacccaaaatcccaatctctt 319  Q
    ||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||| ||||| || |||||||||    
T  19696696 cactataatgatgaataactttacaaaagagatatcaaaggattacaagaataagtcttcaaacctaattctaaccaaagtctcaatctctt 19696605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 18322566 - 18322483
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtat 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18322566 tgttgcgaattctatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtat 18322483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 164
Target Start/End: Original strand, 15530022 - 15530156
Alignment:
Q  30 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaaca-aagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattag 128  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||  ||| |||||   |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  15530022 aaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaaggaataatcagacaatcaaaatttaagtgtatggaacaattataaatacaagccaaaagtag 15530121  T
Q  129 aaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaa 164  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15530122 aaaacaacagc-agagaaaaagaagagagaacacaa 15530156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17012502 - 17012194
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||| ||||    
T  17012502 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaacaataaaatacttgatgtgtggagcaaataataatcaagcaaccaaaacaaagtgtat-gaacg-tta-aaac 17012406  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggag 212  Q
    ||||||||||| ||||||| |   | |||||||| | ||||||||| |  ||||   ||||| | | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  17012405 acaagccaaaagtagaaaata---gtgagagaaa-gaaagagagaatatgaaat---ttgtttacctagttcggtccaatactgacctagtctgggggag 17012313  T
Q  213 agagcagccctccat-ttcactatgt-gatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
    |||  | | ||  || ||| ||||   |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||        
T  17012312 agatgatctct--atgttccctataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagcat 17012215  T
Q  311 caatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||| ||| ||||||    
T  17012214 caatctcttctcgtgaccaag 17012194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25480346 - 25480227
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || |||||||| |    
T  25480346 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataa-atatttgatgtgtagagtaagggatagtcgagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataatc 25480248  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaaca 134  Q
    ||||| ||||| |||||||||    
T  25480247 acaagtcaaaagtagaaaaca 25480227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 88
Target Start/End: Original strand, 8717195 - 8717268
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa 88  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8717195 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa 8717268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 286
Target Start/End: Original strand, 25465444 - 25465706
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||| || |||||   ||| |||||||||||| | ||| |||    ||| |||||||||    
T  25465444 tgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataaaatacttgatgtatggagcaaa--ataatcaagcaaccaatatcaacgtgg---gaacaattataaa 25465537  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctagggga 211  Q
    | ||||| |||| |||||||||   |||||||||| | ||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||| | |||| |||| | || ||    
T  25465538 ctcaagc-aaaagtagaaaaca---gcgagagaaa-gaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacatagtatgggaga 25465631  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtct 286  Q
    |||||||| ||||| || ||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  25465632 gagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagatatcaaaggggtacaagaataagtct 25465706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 13040232 - 13040173
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggata 73  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  13040232 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacactaataacaaacttgatgtgtggagcaatggata 13040173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 286
Target Start/End: Original strand, 25078528 - 25078673
Alignment:
Q  141 agagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tg 238  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||| | |||||||| || ||| ||| ||||| ||||| || |||| |  ||    
T  25078528 agagaaaaagaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagact-gggaagaaagcagtcctccgttccactgtaatg 25078625  T
Q  239 atgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtct 286  Q
    | ||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25078626 acgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtct 25078673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 280
Target Start/End: Original strand, 12937131 - 12937302
Alignment:
Q  104 aattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaatt-gacctag 202  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||   |||||||||| |||| |||||||| || |||||||| | || ||||| ||||||   |||||||    
T  12937131 aattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaac---gagagaaaagaaagatagaacacacaa-aatttgtttacccggttcgttccaaaacagacctag 12937225  T
Q  203 tctaggggagagagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaat 280  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||  |||| |||||||||| ||  | ||||||||||    
T  12937226 tct-ggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatattaaatggttacaagaat 12937302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 25477657 - 25477614
Alignment:
Q  50 acttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaag 93  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25477657 acttgatgtgtgaagtaagggatagtcaagcaaccaaaacaaag 25477614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5572334 - 5572269
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5572334 ttgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatg 5572269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 286
Target Start/End: Original strand, 28078063 - 28078310
Alignment:
Q  30 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattag 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||   ||| |||||||||||| | ||| |||    ||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  28078063 aaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaaaa-ataatcaagcaaccaatatcaacgtgg---gaagaattataaacacaagc-aaaagtag 28078157  T
Q  129 aaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaa-ttgacctagtctaggggagagagcagccctccat 227  Q
    |||    |||||||||||| | || ||||||||||  | |||||||| | || |||||||| ||| |||||||||| |  |||||||||||| | |  |     
T  28078158 aaa----cagcgagagaaa-gaaaaagagaacacacga-aatttgtttaccctgttcggtctaaaattgacctagtatgagggagagagcagtcttataa 28078251  T
Q  228 ttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtct 286  Q
    | ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28078252 tccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagg-ttacaagaataagtct 28078310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30445834 - 30445702
Alignment:
Q  177 atccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattac 274  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||| | | |||||||||||  |||| || ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||    
T  30445834 atccagttcagtccaatactgacctagtatggtggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttac 30445735  T
Q  275 aagaataagtctac-cgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||| ||||| |   ||||||||||||||||    
T  30445734 aagaattagtcttcaaacctaattctacccaaa 30445702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 255
Target Start/End: Original strand, 22857917 - 22858038
Alignment:
Q  134 aacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcac 232  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||  | |||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||    
T  22857917 aacagcgagagaaa-gaaagagagaacacacga-aatttgtttacacagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccac 22858014  T
Q  233 tat-gtgatgagtaatgttacaaa 255  Q
    |||  ||||||||||  |||||||    
T  22858015 tataatgatgagtaactttacaaa 22858038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 10584413 - 10584355
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatga-aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaaggga 71  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10584413 tgttgtgaattcgatgagaaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggga 10584355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 331
Target Start/End: Original strand, 19227514 - 19227568
Alignment:
Q  277 gaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  19227514 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaag 19227568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5757571 - 5757506
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  5757571 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatg 5757506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10077258 - 10077193
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  10077258 ttgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatg 10077193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30443622 - 30443538
Alignment:
Q  152 agagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat 235  Q
    ||||| |||||| || |||||||| | |||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||    
T  30443622 agagaaaacacacaaaaatttgtttacccagttcggtccaatacttacctagtctcggggagagagcagctctccgttacactat 30443538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5017562 - 5017507
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcca 226  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  5017562 ttgttgacccagttcggtcaaatatgacctaatctaggggagagagcaaccctcca 5017507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 136
Target Start/End: Original strand, 6610378 - 6610478
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaa 130  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||| ||| ||||| || ||    
T  6610378 aaaatcacaccaataaaatacttaatgtgtggagcaa--aataatcaagcaaccaaaacaaagtggat--aacaattataaacataag-caaaagtataa 6610472  T
Q  131 aacaac 136  Q
    ||||||    
T  6610473 aacaac 6610478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Original strand, 31979517 - 31979572
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcca 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  31979517 ttgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctcca 31979572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 280
Target Start/End: Original strand, 12911419 - 12911555
Alignment:
Q  144 gaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaatt-gacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat-gtgatg 241  Q
    |||||| |||| |||||||| || |||||||| | || ||||| ||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||  |||||    
T  12911419 gaaaagaaagatagaacacacaa-aatttgtttacccggttcgttccaaaacagacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatg 12911517  T
Q  242 agtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaat 280  Q
    |||||  |||| |||||||||| ||  | ||||||||||    
T  12911518 agtaactttac-aaagagatattaaatggttacaagaat 12911555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24436056 - 24436010
Alignment:
Q  179 ccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcc 225  Q
    |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24436056 ccagttcgatccaatatgacctactctaggggagagagcagccctcc 24436010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 283
Target Start/End: Original strand, 28037796 - 28037842
Alignment:
Q  237 tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataag 283  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28037796 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataag 28037842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 225
Target Start/End: Original strand, 35201309 - 35201382
Alignment:
Q  152 agagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctcc 225  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  35201309 agagagaacacaagata-tttgtttacccagttcggtctaataatgacctagtcttggggagagagcagctctcc 35201382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Original strand, 21356040 - 21356105
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | |||||||    
T  21356040 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatg 21356105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 603088 - 603132
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  603088 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatcttggggagaga 603132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4641137 - 4641085
Alignment:
Q  169 atttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagc 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4641137 atttgtttatccagttcggtccaataatgacctactctagaggagagagcagc 4641085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 235
Target Start/End: Original strand, 17694877 - 17694917
Alignment:
Q  195 tgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  17694877 tgacctagtctaggggagagagcagctctccgttccactat 17694917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 236
Target Start/End: Original strand, 18232862 - 18232914
Alignment:
Q  184 tcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  18232862 tcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaattcactatg 18232914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 33211185 - 33211229
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  33211185 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagaga 33211229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 79631 - 79313
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||     
T  79631 tgttgcgaattcaatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataattaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataat 79532  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  79531 cacaagccaaaagtagaaaacaacagcaagagaaaaagaagagagaacacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggag 79432  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  79431 agagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaattctca 79332  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
      |||||||||||||||||    
T  79331 gcctcttcccgtaaccaag 79313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 78)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 19008052 - 19007735
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataa 111  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  19008052 ctgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataa 19007953  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19007952 acacaagccaaaagtagaaaacaac-gagagagaaatg-aatagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggga 19007855  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  19007854 gagagcagcccttcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccc 19007755  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  19007754 aatctcttcccataaccaag 19007735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 327
Target Start/End: Original strand, 22287181 - 22287492
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||     
T  22287181 tgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacatagtgtatggaacaattataaaa 22287280  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    ||||| ||||  |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22287281 acaagtcaaacgtagaaaaca---gcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 22287377  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |  ||    
T  22287378 agagcagccctccatttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaacgggttacaagaataagtctcccgcccaattctacccgaagtgtca 22287477  T
Q  313 atctcttcccgtaac 327  Q
    |||||||||||||||    
T  22287478 atctcttcccgtaac 22287492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 43623423 - 43623740
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaac-aaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||     
T  43623423 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataactaacttgatgtgtggagcaatagataatcaggcaaccaaaattaaagtgtatggaacaattataat 43623522  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  43623523 cataagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtttgggggag 43623621  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  43623622 agagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 43623721  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
      |||||||||||||||||    
T  43623722 gcctcttcccgtaaccaag 43623740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 36 - 331
Target Start/End: Original strand, 42923373 - 42923669
Alignment:
Q  36 cacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaaca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  42923373 cacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaaca 42923472  T
Q  135 ac-agcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcact 233  Q
    || || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42923473 acgagagagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgtttcact 42923571  T
Q  234 atgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    || ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  42923572 atatgacgagtaactttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaag 42923669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 21520534 - 21520853
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaac-aaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||    
T  21520534 tgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaattaaagtgtatggaacaattataaa 21520633  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21520634 cacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagagaaacgaagagagaacacaaaagaatttgttgacaaagttcggtccaaattgacctagtctggggga 21520733  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  21520734 gagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagtcct 21520833  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |  ||||||| |||||||||    
T  21520834 agcctcttcctgtaaccaag 21520853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28197033 - 28196732
Alignment:
Q  26 gatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||     
T  28197033 gatgaaaaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaagggatagtccagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaag 28196934  T
Q  126 tagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcc 225  Q
    ||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  28196933 tagaaaacagc-gagagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtc--aattgacctagtctgggggagagagcagccattc 28196838  T
Q  226 atttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgta 325  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||    
T  28196837 gtttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccata 28196738  T
Q  326 accaag 331  Q
    ||||||    
T  28196737 accaag 28196732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27105209 - 27104893
Alignment:
Q  17 tgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacaca 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||  ||    
T  27105209 tgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aatgca 27105112  T
Q  117 agccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27105111 agccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggga 27105012  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    ||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27105011 gagagcagccctccgatccactatatgatgagtaatgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc 27104913  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |  |||||||||||||||||    
T  27104912 agcctcttcccgtaaccaag 27104893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17849530 - 17849212
Alignment:
Q  12 cctgttgcgaatttgatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattata 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  17849530 cctgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatttta 17849431  T
Q  111 aacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggg 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||||||||| |  |||    
T  17849430 aacacaagccaaaagtagaaaacaac-gggagag-aaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtcttgtccaaattgacctagtatgtggg 17849333  T
Q  211 agagagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatc 309  Q
    |||||||||||| || |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  17849332 agagagcagccc-ccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 17849234  T
Q  310 ccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||| |||||||||||    
T  17849233 tcaatctcttaccgtaaccaag 17849212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 42 - 331
Target Start/End: Original strand, 5375218 - 5375505
Alignment:
Q  42 aataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcga 141  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||| |    
T  5375218 aataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaattataaatacaagtcaaaagtaaaaaa--acagcaa 5375315  T
Q  142 gaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgat 240  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  5375316 gagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgat 5375415  T
Q  241 gagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  5375416 gagtaatgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtct-ccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaag 5375505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 6263993 - 6264309
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  6263993 tgttgtgaattcgatgagaaaacacactaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgactatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattattaac 6264092  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6264093 acaagccgaaagtagaaaacaac-gagagagaaa-ggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 6264190  T
Q  214 gagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||  ||||    
T  6264191 gagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctatccaaagcccca 6264290  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||| ||  ||||||||||    
T  6264291 atcttttatcgtaaccaag 6264309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 14837680 - 14837371
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaa-acttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataa 111  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14837680 ctgttgtgaattcgatgagaaatcacatcaataacaatacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaattataa 14837581  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggg 210  Q
    ||||||||||||| || ||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14837580 acacaagccaaaagtataaaaca---gcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggg 14837484  T
Q  211 agagagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatc 309  Q
    |||||||| || ||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||  ||| ||    
T  14837483 agagagcatccatccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtcccccgcctaattctacttaaagtc 14837384  T
Q  310 ccaatctcttccc 322  Q
     ||||||||||||    
T  14837383 tcaatctcttccc 14837371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 63 - 313
Target Start/End: Original strand, 22407348 - 22407596
Alignment:
Q  63 agcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacac 162  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||    
T  22407348 agcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacatc-gagagagaaa-ggaagagagaacac 22407445  T
Q  163 aaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagata 262  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22407446 aaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagata 22407545  T
Q  263 tcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||    
T  22407546 tcaatgggttacaagaataagtctcccccctaattctaccaaaagtcccaa 22407596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 331
Target Start/End: Original strand, 6258668 - 6258975
Alignment:
Q  20 gaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagc 119  Q
    ||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  6258668 gaattcgatgagaaaacataccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtctggaacaattataaacacaagc 6258767  T
Q  120 caaaattagaaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagca 218  Q
     |||| |||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  6258768 taaaagtagaa---aacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtat-ggggagagagca 6258863  T
Q  219 gccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctc 317  Q
    ||||||| |||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  ||    
T  6258864 gccctccgtttcactataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagccccaa--tc 6258961  T
Q  318 ttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||    
T  6258962 ttcccgtaaccaag 6258975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 331
Target Start/End: Original strand, 45279844 - 45280144
Alignment:
Q  16 ttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacac 115  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || ||    
T  45279844 ttgcgaattcgatgagaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aatac 45279940  T
Q  116 aagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||            ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45279941 aagccaaaagtagaaaacaacggcgaga------------agaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagaga 45280028  T
Q  216 gcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatc 315  Q
    ||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |    
T  45280029 gcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcc 45280128  T
Q  316 tcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||    
T  45280129 tcttcccgtaaccaag 45280144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 331
Target Start/End: Original strand, 23452094 - 23452397
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattaga 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  || |||||| |||| ||||    
T  23452094 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta--aatacaagctaaaagtaga 23452190  T
Q  130 aaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctc 224  Q
    ||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23452191 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 23452290  T
Q  225 catttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgt 324  Q
    || | |||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||    
T  23452291 caatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctatccaaagtcccagcctcttcccgt 23452390  T
Q  325 aaccaag 331  Q
    |||||||    
T  23452391 aaccaag 23452397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 331
Target Start/End: Original strand, 13909902 - 13910204
Alignment:
Q  30 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattaga 129  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || ||||||||||| ||||    
T  13909902 aaaagtcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aatacaagccaaaagtaga 13909998  T
Q  130 aaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctc 224  Q
    ||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  13909999 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatc 13910098  T
Q  225 catttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgt 324  Q
       | |||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  13910099 tgatccactatatgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccagtctcttcccgt 13910197  T
Q  325 aaccaag 331  Q
    |||||||    
T  13910198 aaccaag 13910204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Original strand, 22162868 - 22163111
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||     
T  22162868 ctgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataacaattttgatgtgtgaagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaattgtatggaacagttataag 22162967  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22162968 cacaagccaaaagtagaaaacaac---gagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggag 22163063  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagaga 260  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  22163064 agagcagctctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagaga 22163111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 331
Target Start/End: Original strand, 28459033 - 28459350
Alignment:
Q  9 atccctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataatta 108  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  28459033 atccctgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataaaacacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta 28459131  T
Q  109 taaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||||||| |||||| |||||   ||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  28459132 taaacacaaaccaaaagtagaa---aacagggagag-aaagaaagagagaacacaaaagaatttgtttatctagttcgatccaaattgacctagtcta-g 28459226  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||  ||     
T  28459227 gtagagagaagccctccgtttcactataatgatgagtaactttaaaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattatacctgaag 28459326  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  28459327 ccccaaactcttcccgtaaccaag 28459350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 36560981 - 36561300
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||  ||     
T  36560981 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta--aat 36561077  T
Q  114 acaagccaaaat-tagaaaacaacagcgaga-gaa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
    || ||||||||  ||||||||||| |||||| |||  || |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  36561078 acgagccaaaaagtagaaaacaactgcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgg 36561177  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  36561178 gggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 36561276  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36561277 tcccaatctcttcccgtaaccaag 36561300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 34 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3022562 - 3022258
Alignment:
Q  34 atcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaac 133  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3022562 atcacacaaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagcagaaaac 3022463  T
Q  134 aacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcact 233  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||| |    
T  3022462 aac-gagaga-aaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcatt 3022365  T
Q  234 at----------gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccg 323  Q
    ||           ||||||||||  |||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |    
T  3022364 ataacgatgataatgatgagtaacttta-taaagagatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaaacctcaatctcttccgg 3022266  T
Q  324 taaccaag 331  Q
    ||||||||    
T  3022265 taaccaag 3022258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 300
Target Start/End: Original strand, 7462789 - 7463077
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatga-aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| | ||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  7462789 tgttgcgaattcgttgagaaaaccacatcgataacaaacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataat 7462888  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtcc-aaattgacctagtctagggga 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  7462889 cacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaagagaagagagaacacaatttttttttttgacccagttcggtccaaaattgacctagtctggggga 7462988  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattcta 300  Q
    ||||||||||||||  | |||||| | ||| |||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7462989 gagagcagccctccgatccactatataatgggtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattcta 7463077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 286
Target Start/End: Original strand, 22707595 - 22707868
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatga-aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||| | | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22707595 tgttgcgaattcgatgagaaaaccacaccaataacaaatttgatgtgtggagtaaggaacaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaa 22707694  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct--aggg 209  Q
    |||||| || || |||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||  |||     
T  22707695 cacaaggcagaagtagaa---aacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcagtccaaattgacctagtctggagga 22707791  T
Q  210 gagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtct 286  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22707792 gagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtct 22707868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 35217810 - 35218122
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||     
T  35217810 tgttgtgaatctgatcaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataatta--aat 35217906  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||  ||   |||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  35217907 acaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaaga-agaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggaga 35218005  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||   |||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  35218006 gagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaacgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaa 35218104  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35218105 tctcttcccgtaaccaag 35218122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 36558721 - 36559023
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||  ||     
T  36558721 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataataa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta--aat 36558817  T
Q  114 acaagccaaaat-tagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    || ||||||||  ||||||||||| ||||||            ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  36558818 acgagccaaaaagtagaaaacaactgcgaga------------agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggag 36558905  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  36558906 agagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 36559004  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||    
T  36559005 atctcttcccgtaaccaag 36559023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 49 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17848814 - 17848539
Alignment:
Q  49 aacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaa 147  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||  || |||||||||| ||| | |||| |||||||||   ||||||||||    
T  17848814 aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaatcgcagtgtatgaaacaattataaacgcaaacaaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa 17848718  T
Q  148 aggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaat 247  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||     
T  17848717 ag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcatccgtttcactatatgatgagtaac 17848619  T
Q  248 gttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  17848618 gttacaaaagagatatcaatgg-ttacaagaataagtctcccgcc---ttctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaag 17848539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 19501843 - 19502171
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||    
T  19501843 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaag--ttataaa 19501938  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaa---------caacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgac 198  Q
     ||||||||||| |||||||         |||| || ||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19501939 tacaagccaaaagtagaaaaaaaaaaaaacaacggcaagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgac 19502038  T
Q  199 ctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattc 298  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |  | |||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19502039 ctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattc 19502138  T
Q  299 tacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  19502139 tacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaag 19502171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 35215433 - 35215745
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||  |||  ||||||||  ||     
T  35215433 tgttgtgaatctgatcaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcatatgaaataatta--aat 35215529  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||  ||   |||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  35215530 acaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaaga-agaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggaga 35215628  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||   |||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  35215629 gagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaa 35215727  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||||||||||||||||    
T  35215728 actcttcccgtaaccaag 35215745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 331
Target Start/End: Original strand, 40031968 - 40032218
Alignment:
Q  85 aaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagtt 184  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  40031968 aaaacaaagtatatggaacaattataaacacaagc-aaatgtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaatacaaaagaatttgttgacccagtt 40032066  T
Q  185 cggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaag----agatatcaatggattacaagaa 279  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||  || ||||||    |||||||||||| |||||||||    
T  40032067 cggtccaaattgacctagtctgagggagagagcggccctccgtttcactataatgatgagtaactttgcaaaagagaaagatatcaatgggttacaagaa 40032166  T
Q  280 taagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||    
T  40032167 taagtctcacgcctaattctacccaaagtcctaacctcttcctgtaaccaag 40032218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 11739421 - 11739720
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||  || |||||||||     
T  11739421 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtagagcaagggatagtcaagaaataaaaacaaagtgtatgaaacaattataaat 11739520  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||| |||||                 | ||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11739521 acaagtcaaaa-----------------gggaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 11739601  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    |||||| | ||| || ||||||  ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  11739602 gagcagtcatccgttccactataatgatgagtaacctttcaaaagagatatcaatggattccaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtccca 11739701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 19504178 - 19504505
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||    
T  19504178 tgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaag--ttataaa 19504273  T
Q  113 cacaagccaaaattagaa---------aacaacagcgagagaaa----aggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgac 198  Q
     ||||||||||| |||||         |||||| || ||| |||    | ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19504274 tacaagccaaaagtagaagaaaaaaaaaacaacggcaagaaaaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgac 19504373  T
Q  199 ctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattc 298  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||  | |||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19504374 ctagtctgggggagatagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattc 19504473  T
Q  299 tacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  19504474 tacccaaagtcccagcctctt-ccgtaaccaag 19504505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 45238842 - 45239137
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatag-aataattataa 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||  || | ||||||    
T  45238842 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggaccaagcgatagtcaagcaaccaaaatcgaagtggatatcaacagttataa 45238941  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
     |||||||||||| |||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||                    |||||||| |||||    
T  45238942 tcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaaag-aagagagaacacaaaaaaatttgttga--------------------cctagtctggggga 45239017  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||| |||| |||    
T  45239018 gagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtatcccgcttaattctaccaaaaacccc 45239117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 45332020 - 45332340
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||| || |  || |||||  ||     
T  45332020 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggaacaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtttgtaacaatta--aat 45332116  T
Q  114 acaagccaaaat-tagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| |||   || |||||   ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||     
T  45332117 acaagccaaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctg 45332216  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||   |||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45332217 ggggagagagcagccctccaattcactatatgatgagtacctttac-aaagagaaatcaatgggttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaa 45332315  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||| ||||||||||||||||||||    
T  45332316 gtcctaatctcttcccgtaaccaag 45332340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 84 - 331
Target Start/End: Original strand, 44288982 - 44289228
Alignment:
Q  84 caaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccag 182  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  44288982 caaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaacagtagaaaaca---gcgagagagaaatgaagagagaacacaaaagaatttgttgacccag 44289078  T
Q  183 ttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaata 281  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| || ||  |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  44289079 ttcggtccaaattgacctagtttgggggaaagagcaaccatctgtttcactataatgatgagtaatcttacaaaagagatatcaacgggttacaagaata 44289178  T
Q  282 agtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||| | || | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  44289179 agttttccacttaattctaccctaagtcccaatctcttcccgtaaccaag 44289228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 312
Target Start/End: Original strand, 24162062 - 24162363
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaa-atcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataa 111  Q
    |||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| |||||||||  || |||  |||    
T  24162062 ctgttgtgaatacgatgaaaatatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagaaagagataatcaagcaaccaaaaaaaagtgtatgaaacaat--taa 24162158  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaa----aaggaagag-agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    || |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||      
T  24162159 atacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaaaaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtccg 24162258  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||   |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24162259 ggggagagagcagccatccaatccactatatgatgagtagcattac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 24162357  T
Q  307 atccca 312  Q
     |||||    
T  24162358 gtccca 24162363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 156 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 42453050 - 42452876
Alignment:
Q  156 agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaa 255  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||    
T  42453050 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 42452952  T
Q  256 agagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  42452951 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaag 42452876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 331
Target Start/End: Original strand, 34979447 - 34979739
Alignment:
Q  27 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaatt 126  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| | |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| |    
T  34979447 atgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaaggaataataaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacataagtcaaaagt 34979546  T
Q  127 agaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag-agagcagccctcc 225  Q
    ||||||||   ||||||||           |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||| | |||| |||||| |    
T  34979547 agaaaaca---gcgagaga-----------gaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttggggggggagagtagcccttc 34979632  T
Q  226 atttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgt 324  Q
     || ||||||  ||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  34979633 gttccactataatgatgaggaaccttacaaaagagatataaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaagtccgaatctcttcccgt 34979732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 42064878 - 42064610
Alignment:
Q  49 aacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaa 148  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||  || |||||| |||| ||||||||||| || |||         
T  42064878 aacttgatgtgtggagcaagggatgatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaatta--aatacaagcaaaaagtagaaaacaacggcaaga----- 42064786  T
Q  149 ggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaatt-gacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaat 247  Q
           ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| |    
T  42064785 -------agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatt 42064693  T
Q  248 gttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  42064692 gttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaag 42064610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 313
Target Start/End: Original strand, 31732666 - 31732919
Alignment:
Q  52 ttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaagga 151  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||  | |||||| ||||| |||||| |||||   ||||||||||||||||      
T  31732666 ttgatgtgtgaagcaagttataatcaagcaaccaaaacagagtgtatgga--agttataatcacaaaccaaaagtagaa---aacagcgagagaaaag-- 31732758  T
Q  152 agagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgtt 250  Q
    | |||||||||  |  |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||  ||    
T  31732759 atagagaacac--acgaatttgtttacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcacaataatgatgagtaacttt 31732856  T
Q  251 acaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  31732857 acaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaa 31732919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23871230 - 23870951
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatc-acaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtat--agaataattat 109  Q
    ||||||| |||| ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||| | | | ||  ||||||||||||||||||  | || ||||||    
T  23871230 ctgttgcaaattcgatgagaaaactacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaaggaacaattaaataaccaaaacaaagtgtatgaaaaacaattat 23871131  T
Q  110 aaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggg 209  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| | | |||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||| | |||| | |||||||||||||| |||| ||    
T  23871130 aaacacaaggcaaaagtagaaaacagcgg-gagagaaatg-aagagagaactcaaaagaatttgttgacctagtttgatccaaattgacctaatctaagg 23871033  T
Q  210 gagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgc 291  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  23871032 gagagagcaaccctccgtttcactatatgatgagtaaccttactaaagagatattaatgggttacaagaataagtctgccgc 23870951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 20146459 - 20146769
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |  || |||||||||||| | |||  ||    ||| |||||||||    
T  20146459 tgttgtgaattcgttgaaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtgaagtaaag--taatcaagcaaccaatatcaacatgg---gaacaattataaa 20146553  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctagggga 211  Q
    ||||||| |||| |||||||||||   |||||||||| |||||||| ||||  | |||| ||| | |||||||||||||| | |||| ||||||  ||||    
T  20146554 cacaagc-aaaagtagaaaacaac---gagagaaaagaaagagagatcacacga-aattcgtttacccagttcggtccaatactgacttagtctgaggga 20146648  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
    |||||||||||||| || ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  20146649 gagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatct 20146748  T
Q  311 caatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||| ||||||| ||||||    
T  20146749 caatcttttcccgtgaccaag 20146769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 11577957 - 11578269
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||| | ||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||    | ||||    
T  11577957 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacattaataa-aaacttgatgtgtggaacaagtaataatcaagcaaccaaaataaagtatatggaag---tttaaa 11578052  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctagggga 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||   ||||||||   |||||| ||||||  | |||||||| | | ||||||||| |||  ||| ||||||| |||||    
T  11578053 cacaagccaaaagtagaaaacaac---gagagaaagaaaagagaaaacacacga-aatttgtttacctagttcggtctaaaactgatctagtctggggga 11578148  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
     ||||||||||||| ||  |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  11578149 aagagcagccctccgttcgactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 11578248  T
Q  311 caatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  11578249 caatctcttcccgtgaccaag 11578269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 195
Target Start/End: Original strand, 15539396 - 15539553
Alignment:
Q  35 tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaaca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  15539396 tcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggatta-tcaagcaatcaaaacaaagtgtattgaacaattataaacacaagcaaaaagtagaaaaca 15539494  T
Q  135 acagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaatt 195  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15539495 ac-gagagag-aaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatt 15539553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 134 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 22874423 - 22874232
Alignment:
Q  134 aacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcact 233  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||  |||||||    
T  22874423 aacaacgagagaaaagaaagagagaacacaagagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcagctctcagtttcact 22874324  T
Q  234 at-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgt 324  Q
    ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||| |||  | ||||||||||||||    
T  22874323 ataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccacctaattctaccgaaagcctcaatctcttcccgt 22874232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 150 - 331
Target Start/End: Original strand, 18800292 - 18800474
Alignment:
Q  150 gaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaat 247  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||  |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||  ||| ||||||     
T  18800292 gaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaaactgacctggtct-ggggagagagtagccctccgtttcactataatgacgagtaac 18800390  T
Q  248 gttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||    
T  18800391 tttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtgaccaag 18800474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 38020484 - 38020370
Alignment:
Q  20 gaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagc 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  38020484 gaatttgatgtaaaatcacaccaataacaaatttgatgtatggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagc 38020385  T
Q  120 caaaattagaaaaca 134  Q
     |||| |||||||||    
T  38020384 taaaagtagaaaaca 38020370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 316
Target Start/End: Original strand, 17897125 - 17897391
Alignment:
Q  41 caataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcg 140  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||  ||   | | |||||||||||||| |||| |||||||||||   |    
T  17897125 caataaaatacttgatgtgtggagcaaa--ataatcaagcaaccaaaacaaagttgatg--acagttataaacacaagc-aaaagtagaaaacaac---g 17897216  T
Q  141 agagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tg 238  Q
    ||||||| | |||||||||||||  | |||||||| | ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||||  ||    
T  17897217 agagaaa-gaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggaccaatactgacctagtct-ggggagagagcagccatccgttctactataatg 17897313  T
Q  239 atgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatct 316  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  17897314 atgagtaactttacaaaatagatatcaaagggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaaatctcaatct 17897391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 320
Target Start/End: Original strand, 37962791 - 37963088
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| |||| | ||| || ||||||| |||||||||||   |||||| |    
T  37962791 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacatcaataataaacttgatgtgtggagtaagtgataattaagtaatcaaaacagagtgtatagaag--ttataatc 37962888  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggaga 213  Q
    ||||   |||| |||||||||||     |||||||| || ||||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| | || ||||    
T  37962889 acaaat-aaaagtagaaaacaactt---gagaaaagaaaaagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaattaacctagtgtgggagaga 37962983  T
Q  214 gagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    || ||| || |  |||||||||  |||||| |||  |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  | ||    
T  37962984 gatcagtccactgtttcactataatgatgaataactttacaaaaaa---atcaatggattacaagaataagtctctcgtctaattctacccaaagcctca 37963080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 40699698 - 40699468
Alignment:
Q  99 agaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attga 197  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||||||  | ||||||||||| | |||||||||||||  | |||||||| | | ||||||||| || | |||    
T  40699698 agaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaa--atagcgagagaaa-gaaagagagaacacacga-aatttgtttacctagttcggtctaatactga 40699604  T
Q  198 cctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctac-cgcctaa 295  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||  || ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |   |||||    
T  40699603 cctagtctgggggaaagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaggattacaaaaataagtcttcaaacctaa 40699504  T
Q  296 ttctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  40699503 ttctacccaaagtcccaatctcttctcgtgaccaag 40699468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 249 - 331
Target Start/End: Original strand, 15539553 - 15539635
Alignment:
Q  249 ttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15539553 ttacaaaagatatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaag 15539635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 22874519 - 22874435
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtat 98  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22874519 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagtgatagtcaagcaactaaaacaaagtgtat 22874435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 35107588 - 35107388
Alignment:
Q  134 aacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcac 232  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| | | | |||||||||| | ||||||||||| ||  ||||| || || ||| || |||    
T  35107588 aacagcgagagaaaagaaagagagaacacaaaaatatttgtttacctatttcggtccaatactgacctagtctgggaaagagaacaaccatccgttccac 35107489  T
Q  233 tat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtct--accgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaacca 329  Q
    |||  ||||||||||  |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||  |    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  35107488 tataatgatgagtaacattacaaaagagataacaaagg-ttacaagaataagtcttcaaaatctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtgacca 35107390  T
Q  330 ag 331  Q
    ||    
T  35107389 ag 35107388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Original strand, 38414028 - 38414149
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||| | |||| | | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38414028 tgttgtgaattccatgaaaaatcacaccaa-aacaaaattggtgtgtggagcacgtgataattaggcaacgaaaacaaagtgtatggaataattataaac 38414126  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaac 136  Q
    |||||  |||| |||||||||||    
T  38414127 acaaggtaaaagtagaaaacaac 38414149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 168 - 330
Target Start/End: Original strand, 13828338 - 13828503
Alignment:
Q  168 aatttgttgatccagttcggtcca-aattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat-gtgatgagtaatgttacaaaagagatatca 265  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||   |  || ||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  13828338 aatttgtttatccagttcggtccagaactgacctagtctaggggagagagtagctaactgttccactataattatgagtaattttacaaaagagatatca 13828437  T
Q  266 atggattacaagaataagtctac-cgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaa 330  Q
    | ||  ||||||||||||||| |   | |||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||    
T  13828438 aagggctacaagaataagtcttcaaacataattctacccaaagtctgaatctcttcccgtgaccaa 13828503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20592484 - 20592288
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| | || ||||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||     
T  20592484 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataaaatacgtgatgtgtagagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataat 20592387  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctagggga 211  Q
    |||||| ||||| ||||||| | ||   |||| |||| |||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  20592386 cacaag-caaaagtagaaaatatca---agag-aaagaaagagagaacacacga-aatttgtttatccaattcggtccaatactgacctagtctggggga 20592293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20589880 - 20589785
Alignment:
Q  237 tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctac-cgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |   |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  20589880 tgatgagtaacttcacaaaagagatatcaatgggttaaaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaag 20589785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 42453890 - 42453798
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataatta 108  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||    
T  42453890 tgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaaatgtatggaacaatta 42453798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14699100 - 14699035
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14699100 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatg 14699035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10445537 - 10445473
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat 235  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  10445537 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 10445473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 331
Target Start/End: Original strand, 27136203 - 27136286
Alignment:
Q  249 ttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctac-cgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |   ||||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||    
T  27136203 ttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctccaaacctaattctactcaaagtcccaatttctttccgtgaccaag 27136286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8390243 - 8390178
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  8390243 ttgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatg 8390178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Original strand, 13569332 - 13569397
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  13569332 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatg 13569397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Original strand, 20522224 - 20522289
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  20522224 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatg 20522289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15694093 - 15693997
Alignment:
Q  237 tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctac-cgcctaattctacccaaaatccc-aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||| |   |||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||    
T  15694093 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaaatctcttcctgtgaccaag 15693997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 17057369 - 17057413
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17057369 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagaga 17057413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 17085352 - 17085396
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17085352 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagaga 17085396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 215
Target Start/End: Original strand, 17490156 - 17490192
Alignment:
Q  179 ccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17490156 ccagttcggtccaaattgacctactctaggggagaga 17490192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Original strand, 8040064 - 8040129
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  8040064 ttgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatg 8040129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28259270 - 28259205
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  28259270 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatg 28259205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 723744 - 723788
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  723744 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 723788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8173622 - 8173539
Alignment:
Q  134 aacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagc 217  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||  | |||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||    
T  8173622 aacaacgagagaaaagaaagagtgaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtatgggggagagagc 8173539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 236
Target Start/End: Original strand, 33118149 - 33118205
Alignment:
Q  180 cagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    |||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33118149 cagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagccctccaatccactatg 33118205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 33162450 - 33162494
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33162450 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctaggggagaga 33162494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 34139770 - 34139814
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  34139770 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 34139814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34682427 - 34682363
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat 235  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||| || ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  34682427 ttgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactat 34682363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 36318009 - 36318053
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  36318009 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactctaagggagaga 36318053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39285004 - 39284960
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  39285004 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 39284960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39680244 - 39680161
Alignment:
Q  152 agagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat 235  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||    
T  39680244 agagagaacacaagata-tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactat 39680161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 68
Target Start/End: Original strand, 42923315 - 42923347
Alignment:
Q  36 cacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaag 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42923315 cacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaag 42923347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 14231 - 14542
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14231 tgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaac 14328  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    ||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14329 acaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagagaaaggaagagagaacacaaga--atttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 14423  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  14424 agagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca 14523  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
      |||||||||||||||||    
T  14524 gcctcttcccgtaaccaag 14542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 150 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15326 - 15147
Alignment:
Q  150 gaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgt 249  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||  |||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||| || |||||| ||||||||||  |    
T  15326 gaagagagaacacaaga--atttgttgagtcagttcggtccaaattgacctagcatgggggagacagcagccttccgttccactatatgatgagtaactt 15229  T
Q  250 tacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||    
T  15228 tacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagtctgaatctctttccgtaaccaag 15147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 15433 - 15386
Alignment:
Q  20 gaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaa 67  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15433 gaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtcaagcaa 15386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 80305 - 79988
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  80305 tgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtaataatcaggcaacgaaaatcaaagtgtatggaaaaattataaa 80206  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggag 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  80205 cacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagatcacaaaagaatttgttgacccagttcaatccaaattgacctagtctgggggag 80106  T
Q  213 agagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccca 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||  ||||    
T  80105 agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaggaataagtctcctgcctaa-tctacccaaagcccca 80007  T
Q  313 atctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||    
T  80006 atctcttcccgtaaccaag 79988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Original strand, 11315 - 11633
Alignment:
Q  15 gttgcgaatttgatgaaaa-atcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaaca--aagtgtatagaataattataa 111  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| | ||||||| |||| |  |||||||| ||| ||||||||    
T  11315 gttgcgaattcgatgaaaatatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagtaaggaataattaagcaacgaaaaaataaagtgtatggaacaattataa 11413  T
Q  112 acacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11414 tcacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctggggga 11513  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    ||||||||| ||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  11514 gagagcagctctccaatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtatcccgcctaattctacccaaagtccc 11613  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11614 aatctcttcccgtaaccaag 11633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 52456 - 52139
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  52456 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaac 52357  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagag-agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggg--g 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||  || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |    
T  52356 acaagccaaaagtagaaaacaac-tagagagaaaaagaagagaagaacac--aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggag 52260  T
Q  211 agagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcc 310  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| || |||||||||| ||||| ||     
T  52259 agagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtca 52160  T
Q  311 caatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  52159 caatctcttcccgtaaccaag 52139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Original strand, 183481 - 183800
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||  ||    
T  183481 ctgttccgaattcgatgagaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccgaaacaaaatgtatggaacaatta--aa 183577  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  183578 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctga 183677  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  183678 gggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 183777  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  183778 tcccaatctctt-ccgtaaccaag 183800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 50457 - 50236
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  50457 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaac 50358  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagag-agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggg--g 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||  || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |    
T  50357 acaagccaaaagtagaaaacaac-tagagagaaaaagaagagaagaacac--aagaatttgttgacccagttaggtccaaattgacctagtctgggggag 50261  T
Q  211 agagagcagccctccatttcactat 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  50260 agagagcagccctccgtttcactat 50236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 36 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 4415 - 4124
Alignment:
Q  36 cacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaaaacaa 135  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  4415 cacatcaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaatgaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaagtagaaaaca- 4317  T
Q  136 cagcgagagaaaaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcacta 234  Q
      ||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4316 --gcgagagaaatc-aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgtttcacta 4221  T
Q  235 tgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  4220 tatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcttcttcccgtaaccaag 4124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Original strand, 69132 - 69451
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||   |||||||    
T  69132 ctgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaacaaaatgtatggaag--ttataaa 69228  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  69229 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 69328  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||| ||||  | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  69329 gggagagagcagctctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 69427  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  69428 tcccaacctcttcccgtaaccaag 69451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 41325 - 41643
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||     
T  41325 tgttgtgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaatta--aat 41420  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  41421 acaagccaaaagtagaaaacaacggcgaaaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctggg 41520  T
Q  209 ggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaat 308  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |    
T  41521 ggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagt 41620  T
Q  309 cccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  41621 cccagcctcttcccgtaaccaag 41643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 36037 - 35818
Alignment:
Q  16 ttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaaca 114  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||    
T  36037 ttgcgaattcgatgaaaaattacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaaacaaagtgtatgaaacaattataaaca 35938  T
Q  115 caagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagag 214  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  35937 caagccaaaactcgaaaacaacagcgagagaaaag-aagagagaacacaaaataatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctaaggaagag 35839  T
Q  215 agcagccctccatttcactat 235  Q
    ||||||||||| || ||||||    
T  35838 agcagccctccgttccactat 35818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 279 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 35819 - 35767
Alignment:
Q  279 ataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  35819 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaag 35767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6646 - 6328
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||||   |||    
T  6646 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataat---aaa 6551  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  || |||||   ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |    
T  6550 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgactcagttcggtccaatctgacctagtctgg 6451  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  6450 gggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaag 6352  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6351 tcccaatctcttcccgtaaccaag 6328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 331
Target Start/End: Original strand, 1309 - 1612
Alignment:
Q  30 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattaga 129  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||  || ||||||||||| ||||    
T  1309 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgtaacaatta--aatacaagccaaaagtaga 1405  T
Q  130 aaa-caacagcgagagaa----aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccct 223  Q
    ||| |||| ||||||  |    || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1406 aaaacaacggcgagaagatcacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccct 1505  T
Q  224 ccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccg 323  Q
    ||  | |||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  1506 ccgatccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccg 1604  T
Q  324 taaccaag 331  Q
    ||||||||    
T  1605 taaccaag 1612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 85671 - 85359
Alignment:
Q  16 ttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaaca 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  85671 ttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaatcttaatgtgtggagcaagagataatcaaacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaaca 85572  T
Q  115 caagccaaaattagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagag 214  Q
    |||| ||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |  |||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  85571 caagtcaaaagtagaaaacaac---gagagaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgtttacctggttcagttcaaattgacctagtctgggggagag 85476  T
Q  215 agcagccctccatttcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaa 313  Q
    ||||| | ||| || ||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||| |||| || |||    
T  85475 agcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacgaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctgattctactcaaagtcacaa 85376  T
Q  314 tctcttcccgtaaccaa 330  Q
    ||||||| |||||||||    
T  85375 tctcttctcgtaaccaa 85359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 29617 - 29299
Alignment:
Q  13 ctgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||    
T  29617 ctgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaatta--aa 29522  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 207  Q
     | ||||||||| ||||||||||| | |||| |||   ||  |||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29521 taaaagccaaaagtagaaaacaacggagagaagaacacaaaaaagagaagaacacaaacgaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 29422  T
Q  208 gggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||     
T  29421 gggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaag 29323  T
Q  308 tcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  29322 ccccaacctcttcccgtaaccaag 29299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3309 - 3008
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaat-taga 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||| ||||| |||||  ||||    
T  3309 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaa-caaagtgtat-gaa-agttataaatacaagtcaaaaagtaga 3214  T
Q  130 aaacaacagcgaga-gaa---aaggaagaga-gaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctc 224  Q
    ||||||| |||||| |||   || ||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3213 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaatattttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctcggggagatagcagccctc 3114  T
Q  225 catttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgt 324  Q
    || | |||||| ||||||||   ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |    
T  3113 caatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccaagcctcttcccat 3015  T
Q  325 aaccaag 331  Q
    |||||||    
T  3014 aaccaag 3008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 331
Target Start/End: Original strand, 1509 - 1803
Alignment:
Q  31 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattagaa 130  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||| |||   ||||||||||||||||||| |||||    
T  1509 aaaatcacaccaataa-atatttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaag--ttataaacacaagccaaaagtagaa 1604  T
Q  131 aacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagccctccattt 229  Q
    |||||    |||||||||| |||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||||||||||||| | ||     
T  1605 aacaat---gagagaaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtcaaaaactgacctagtatgggggagagagcagccctacgttc 1700  T
Q  230 cactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaacc 328  Q
    ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  1701 cactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgacc 1800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24839 - 24520
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  ||    
T  24839 tgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataa--aa 24743  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaa-caacagcgaga-gaa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     || |||||||| ||||||| |||| | |||| |||  || |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||     
T  24742 tacgagccaaaagtagaaaaacaactgtgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctg 24643  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24642 ggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgagttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaa 24545  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  24544 gtcccaatctcttcccgtaaccaag 24520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22564 - 22245
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| | || ||||||| |  ||    
T  22564 tgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgcatggaataataa--aa 22468  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaa-caacagcgaga-gaa--aaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
     || |||||||| ||||||| |||| | |||| |||  || |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||     
T  22467 tacgagccaaaagtagaaaaacaactgtgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctg 22368  T
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22367 ggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgagttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaa 22270  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  22269 gtcccaatctcttcccgtaaccaag 22245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8512 - 8447
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  8512 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatg 8447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 473 - 170
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaataattataaa 112  Q
    ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||  ||    
T  473 tgttgtgaattcgttgagaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta--aa 377  T
Q  113 cacaagccaaaattagaaaa-caacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagggga 211  Q
     ||||||||||| ||||||| |||| ||||||            ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  376 tacaagccaaaagtagaaaaacaacggcgaga------------agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggga 289  T
Q  212 gagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatccc 311  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||   ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |    
T  288 gagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaagtctc 190  T
Q  312 aatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  189 aatctcttcacgtaaccaag 170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 1298 - 1489
Alignment:
Q  20 gaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagc 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||| ||||||    
T  1298 gaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagaaaaagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaat--taaatacaagc 1394  T
Q  120 caaaattagaaaacaacagcgag-agaa---aaggaag-agagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggg 209  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||   || |||| | || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1395 caaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaaaaggacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggg 1489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 146 - 331
Target Start/End: Original strand, 15796 - 15982
Alignment:
Q  146 aaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg-tgatgag 243  Q
    |||| |||||| |||||| || |||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||| ||||| || |||| |  |||||||    
T  15796 aaagaaagagataacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtcctccgttccactctaatgatgag 15894  T
Q  244 taatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15895 taactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaag 15982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 331
Target Start/End: Original strand, 16516 - 16811
Alignment:
Q  30 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaattaga 129  Q
    |||||| | |||||||| | |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||| || |||   ||||||| |||||| ||||| |||    
T  16516 aaaaattataccaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaactaaa-caaagtgcatggaag--ttataaatacaagcaaaaat-aga 16611  T
Q  130 aaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctaggggagagagcagccctccatt 228  Q
    |||||||   |||||||||| |||||| |||||| || |||||||| | |||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||  | ||||   |     
T  16612 aaacaac---gagagaaaagaaagagaaaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagataaaccctttgtc 16707  T
Q  229 tcactatg-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaac 327  Q
     ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  16708 ccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctggcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtcac 16807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 4518 - 4733
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||| ||||||||| ||  ||||| |||| ||| |||||  ||     
T  4518 tgttgtgaatctgatccaaaatcacaccaataacaat-ttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaacaaagtcaaagcgtatggaacaatta--aat 4614  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgagag-----aaaaggaagag--agaacacaaaataatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtcta 206  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||      |||| |||||   | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4615 acaagccaaaagtagaaaacaatggcgagaagaacaaaaaagaagaagaacaacacaaaggaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctg 4714  T
Q  207 ggggagagagcagccctcc 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4715 ggggagagagcagccctcc 4733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 143
Target Start/End: Original strand, 12715 - 12841
Alignment:
Q  14 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaataattataaac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||     
T  12715 tgttgtgaattcgatgaaaaatgacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtat-gaa-agttataaat 12811  T
Q  114 acaagccaaaattagaaaacaacagcgaga 143  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  12812 acaagccaaaagtagacaacaacggcgaga 12841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 207 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 2293 - 2169
Alignment:
Q  207 ggggagagagcagccctccatttcactatgtgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaa 306  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| || ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2293 ggggagagagtagccctccgattcactatatgatgaggaacgttacaaaagagaaattaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaa 2194  T
Q  307 atcccaatctcttcccgtaaccaag 331  Q
     |||||  || ||||||||||||||    
T  2193 gtcccagccttttcccgtaaccaag 2169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 5016 - 4967
Alignment:
Q  253 aaaagagatatcaatggattacaagaataagtctaccgcctaattctacc 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  5016 aaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacc 4967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Original strand, 5687 - 5752
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| || | |||||||    
T  5687 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatg 5752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Original strand, 2496 - 2561
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||| ||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  2496 ttgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggagacagcagccctccaatccactatg 2561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 50 - 4
Alignment:
Q  26 gatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagggata 73  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  50 gatgaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagagata 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 36925 - 36876
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagc 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  36925 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctagggaagagagcagc 36876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 44054 - 43989
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  44054 ttgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctccaatccactatg 43989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 220
Target Start/End: Original strand, 6978 - 7030
Alignment:
Q  169 atttgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctaggggagagagcagc 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6978 atttgtttatccagttcggtccaataatgacctactctagaggagagagcagc 7030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 20415 - 20459
Alignment:
Q  171 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  20415 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 20459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University