View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16275_low_25 (Length: 249)

Name: NF16275_low_25
Description: NF16275
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16275_low_25
NF16275_low_25
[»] chr7 (105 HSPs)
chr7 (1-231)||(20137098-20137327)
chr7 (1-231)||(24748665-24748895)
chr7 (1-231)||(44724650-44724879)
chr7 (1-231)||(13099463-13099694)
chr7 (1-231)||(39145975-39146205)
chr7 (1-231)||(4295923-4296152)
chr7 (1-231)||(31435035-31435265)
chr7 (1-231)||(38394057-38394286)
chr7 (1-231)||(48457724-48457953)
chr7 (1-231)||(37412114-37412345)
chr7 (1-231)||(7092202-7092430)
chr7 (1-231)||(7470011-7470240)
chr7 (1-231)||(9680891-9681120)
chr7 (1-231)||(21592132-21592361)
chr7 (1-231)||(21990221-21990450)
chr7 (1-231)||(42330986-42331217)
chr7 (1-231)||(20299530-20299760)
chr7 (1-231)||(20297433-20297662)
chr7 (1-231)||(20626109-20626338)
chr7 (1-231)||(20630000-20630229)
chr7 (1-231)||(20642419-20642648)
chr7 (1-231)||(40836732-40836960)
chr7 (4-229)||(11355331-11355555)
chr7 (1-231)||(35700-35929)
chr7 (1-231)||(1850052-1850281)
chr7 (1-231)||(7471969-7472198)
chr7 (1-231)||(9679131-9679359)
chr7 (6-231)||(27306224-27306448)
chr7 (1-231)||(443666-443896)
chr7 (1-231)||(44635-44864)
chr7 (1-231)||(1046914-1047142)
chr7 (1-231)||(3878648-3878877)
chr7 (1-231)||(18345612-18345841)
chr7 (6-227)||(27832631-27832847)
chr7 (1-223)||(7094449-7094670)
chr7 (2-231)||(42223229-42223457)
chr7 (1-229)||(1049285-1049511)
chr7 (65-231)||(25276212-25276378)
chr7 (1-231)||(40946399-40946628)
chr7 (1-231)||(3035792-3036024)
chr7 (1-228)||(28487627-28487853)
chr7 (1-231)||(43253506-43253734)
chr7 (6-231)||(21678137-21678361)
chr7 (4-231)||(21680098-21680327)
chr7 (9-230)||(7351649-7351869)
chr7 (36-231)||(24817377-24817569)
chr7 (24-231)||(24258534-24258744)
chr7 (1-229)||(25542603-25542828)
chr7 (9-229)||(24813494-24813712)
chr7 (1-224)||(38396713-38396934)
chr7 (1-231)||(28485637-28485865)
chr7 (9-230)||(31155908-31156128)
chr7 (36-230)||(7349297-7349490)
chr7 (46-213)||(20091581-20091745)
chr7 (69-231)||(11757300-11757462)
chr7 (52-231)||(22828672-22828851)
chr7 (9-196)||(2935374-2935560)
chr7 (52-231)||(7188612-7188789)
chr7 (1-196)||(22108173-22108366)
chr7 (1-196)||(40549933-40550126)
chr7 (9-196)||(9027191-9027376)
chr7 (1-196)||(22137184-22137377)
chr7 (1-196)||(40552211-40552404)
chr7 (1-146)||(22393878-22394023)
chr7 (9-196)||(1606486-1606671)
chr7 (6-169)||(26295580-26295743)
chr7 (9-210)||(24465629-24465829)
chr7 (9-195)||(6332326-6332514)
chr7 (69-231)||(22251602-22251760)
chr7 (112-223)||(26804651-26804762)
chr7 (64-172)||(6348912-6349020)
chr7 (9-210)||(16297018-16297222)
chr7 (9-231)||(11081579-11081803)
chr7 (155-231)||(22392535-22392608)
chr7 (1-59)||(11759369-11759427)
chr7 (6-195)||(25351353-25351539)
chr7 (1-50)||(26804761-26804810)
chr7 (36-128)||(6046668-6046759)
chr7 (6-195)||(25410130-25410318)
chr7 (7-183)||(6067193-6067370)
chr7 (63-196)||(6048976-6049111)
chr7 (185-231)||(18567684-18567730)
chr7 (12-195)||(21369642-21369824)
chr7 (40-207)||(40281411-40281572)
chr7 (36-195)||(2120899-2121056)
chr7 (9-196)||(13290470-13290658)
chr7 (6-195)||(25357047-25357233)
chr7 (154-210)||(11084467-11084523)
chr7 (36-195)||(3320076-3320232)
chr7 (36-195)||(3324824-3324980)
chr7 (36-195)||(25405393-25405549)
chr7 (154-195)||(12310157-12310198)
chr7 (6-82)||(34546874-34546951)
chr7 (36-195)||(42006663-42006820)
chr7 (6-49)||(6359946-6359989)
chr7 (36-195)||(7069780-7069936)
chr7 (36-195)||(7074787-7074943)
chr7 (157-195)||(8378648-8378686)
chr7 (157-195)||(15541139-15541177)
chr7 (36-82)||(44010775-44010821)
chr7 (6-82)||(2075226-2075303)
chr7 (6-82)||(7464513-7464590)
chr7 (154-210)||(26210631-26210688)
chr7 (12-60)||(9190053-9190101)
chr7 (12-56)||(30814560-30814604)
[»] chr6 (78 HSPs)
chr6 (1-231)||(13057290-13057520)
chr6 (1-231)||(13039850-13040080)
chr6 (1-231)||(3390475-3390705)
chr6 (1-231)||(11983018-11983247)
chr6 (1-231)||(3631928-3632156)
chr6 (1-231)||(9020022-9020251)
chr6 (1-231)||(1230238-1230467)
chr6 (1-231)||(3629854-3630082)
chr6 (1-231)||(4816220-4816449)
chr6 (1-231)||(30967297-30967526)
chr6 (1-231)||(32280092-32280322)
chr6 (4-207)||(1069710-1069913)
chr6 (2-231)||(25477370-25477606)
chr6 (1-231)||(14458756-14458983)
chr6 (1-231)||(28241310-28241539)
chr6 (1-231)||(3233714-3233948)
chr6 (1-231)||(30034592-30034821)
chr6 (1-230)||(19704556-19704786)
chr6 (1-231)||(14507165-14507393)
chr6 (1-229)||(26065081-26065306)
chr6 (1-229)||(26085050-26085275)
chr6 (1-231)||(14466418-14466649)
chr6 (1-231)||(2628875-2629103)
chr6 (7-231)||(20915351-20915574)
chr6 (1-231)||(30728813-30729046)
chr6 (9-228)||(5273213-5273431)
chr6 (55-231)||(15530166-15530340)
chr6 (1-229)||(15541129-15541356)
chr6 (4-231)||(15532674-15532899)
chr6 (1-211)||(12186060-12186271)
chr6 (1-230)||(26932550-26932779)
chr6 (9-231)||(15719741-15719961)
chr6 (1-231)||(24338437-24338666)
chr6 (9-212)||(16455421-16455625)
chr6 (54-231)||(3027895-3028070)
chr6 (12-230)||(12195515-12195732)
chr6 (1-231)||(12161547-12161775)
chr6 (9-196)||(26066121-26066307)
chr6 (9-231)||(15367130-15367349)
chr6 (71-231)||(22490736-22490896)
chr6 (1-196)||(29754698-29754892)
chr6 (9-196)||(33308988-33309173)
chr6 (9-196)||(26068392-26068578)
chr6 (9-196)||(33311257-33311442)
chr6 (9-212)||(26945258-26945463)
chr6 (119-230)||(19227514-19227625)
chr6 (73-231)||(17012138-17012294)
chr6 (9-210)||(19696556-19696759)
chr6 (9-231)||(22857949-22858171)
chr6 (9-132)||(25465587-25465710)
chr6 (9-210)||(25078554-25078755)
chr6 (9-133)||(15346541-15346664)
chr6 (36-128)||(30445723-30445815)
chr6 (49-231)||(20526903-20527083)
chr6 (1-95)||(10584227-10584321)
chr6 (9-209)||(28037722-28037927)
chr6 (9-195)||(12911442-12911629)
chr6 (9-195)||(12937190-12937376)
chr6 (32-128)||(28078215-28078310)
chr6 (64-122)||(3833481-3833540)
chr6 (154-196)||(7542525-7542567)
chr6 (36-192)||(22351877-22352031)
chr6 (9-108)||(11262678-11262777)
chr6 (36-195)||(13878727-13878883)
chr6 (36-195)||(16785919-16786075)
chr6 (6-192)||(17694846-17695030)
chr6 (138-210)||(11138423-11138496)
chr6 (6-82)||(25941780-25941857)
chr6 (6-82)||(33215938-33216015)
chr6 (36-195)||(13883475-13883631)
chr6 (36-195)||(31248740-31248896)
chr6 (157-195)||(3577658-3577696)
chr6 (133-183)||(5165936-5165985)
chr6 (138-192)||(19701988-19702041)
chr6 (157-195)||(26887368-26887406)
chr6 (157-195)||(35201470-35201508)
chr6 (6-82)||(3577484-3577560)
chr6 (10-108)||(22870100-22870196)
[»] chr1 (106 HSPs)
chr1 (1-231)||(17324627-17324856)
chr1 (1-231)||(25127933-25128163)
chr1 (2-231)||(13215142-13215375)
chr1 (1-231)||(16428714-16428944)
chr1 (5-231)||(18839648-18839874)
chr1 (1-231)||(50076663-50076892)
chr1 (4-231)||(50307540-50307766)
chr1 (1-231)||(10399819-10400048)
chr1 (4-231)||(9241079-9241306)
chr1 (1-231)||(31425006-31425238)
chr1 (1-231)||(12302496-12302725)
chr1 (1-231)||(51750100-51750329)
chr1 (1-225)||(25248542-25248766)
chr1 (1-231)||(15823607-15823836)
chr1 (1-231)||(25251265-25251495)
chr1 (1-225)||(11457466-11457689)
chr1 (1-231)||(38925472-38925698)
chr1 (1-231)||(15294825-15295054)
chr1 (1-231)||(18307170-18307399)
chr1 (1-231)||(28840741-28840969)
chr1 (1-231)||(40134005-40134235)
chr1 (1-231)||(47906331-47906560)
chr1 (1-231)||(16432455-16432686)
chr1 (1-231)||(39932134-39932364)
chr1 (1-231)||(17186118-17186348)
chr1 (1-231)||(31735512-31735741)
chr1 (1-231)||(39462580-39462809)
chr1 (1-231)||(50078811-50079041)
chr1 (1-225)||(6823081-6823304)
chr1 (1-231)||(6995691-6995920)
chr1 (1-231)||(27336931-27337159)
chr1 (4-231)||(6756589-6756815)
chr1 (1-231)||(14097960-14098190)
chr1 (1-231)||(3579608-3579836)
chr1 (1-199)||(16429050-16429248)
chr1 (6-231)||(17324124-17324349)
chr1 (1-231)||(46431697-46431927)
chr1 (1-229)||(28998244-28998471)
chr1 (1-229)||(29003960-29004187)
chr1 (1-231)||(2510316-2510544)
chr1 (1-231)||(2617577-2617806)
chr1 (1-231)||(13761898-13762126)
chr1 (1-231)||(20302520-20302748)
chr1 (1-231)||(24325724-24325953)
chr1 (1-231)||(27339122-27339350)
chr1 (1-231)||(31489974-31490202)
chr1 (1-231)||(41646981-41647210)
chr1 (1-231)||(51752426-51752653)
chr1 (1-231)||(4131366-4131599)
chr1 (1-231)||(2949223-2949451)
chr1 (1-231)||(28842556-28842784)
chr1 (1-231)||(50248561-50248792)
chr1 (1-229)||(31422851-31423091)
chr1 (9-229)||(9459416-9459635)
chr1 (9-229)||(9463243-9463462)
chr1 (1-231)||(14183581-14183810)
chr1 (1-231)||(28207059-28207286)
chr1 (1-231)||(17318954-17319177)
chr1 (9-231)||(42922293-42922514)
chr1 (10-231)||(16226228-16226448)
chr1 (36-231)||(15669419-15669612)
chr1 (1-212)||(6115093-6115304)
chr1 (4-231)||(20291518-20291743)
chr1 (36-214)||(8347298-8347476)
chr1 (10-226)||(47179779-47179993)
chr1 (51-231)||(21948229-21948407)
chr1 (65-231)||(48665238-48665404)
chr1 (10-226)||(47177428-47177642)
chr1 (10-225)||(16231630-16231843)
chr1 (1-199)||(51757624-51757820)
chr1 (9-196)||(23785935-23786121)
chr1 (14-183)||(47451751-47451919)
chr1 (38-213)||(18800600-18800775)
chr1 (1-151)||(23816027-23816176)
chr1 (6-211)||(49495206-49495411)
chr1 (11-212)||(30790401-30790602)
chr1 (9-213)||(16561545-16561751)
chr1 (68-231)||(8349109-8349270)
chr1 (36-231)||(13125483-13125677)
chr1 (36-210)||(30738653-30738830)
chr1 (93-231)||(6823946-6824091)
chr1 (9-210)||(26613237-26613440)
chr1 (34-210)||(155788-155963)
chr1 (9-120)||(15916562-15916674)
chr1 (9-231)||(27916557-27916780)
chr1 (68-231)||(28279327-28279490)
chr1 (1-77)||(13358787-13358863)
chr1 (63-206)||(43104245-43104390)
chr1 (6-192)||(21353342-21353525)
chr1 (10-212)||(26520119-26520321)
chr1 (66-210)||(14353047-14353190)
chr1 (9-105)||(13127685-13127782)
chr1 (138-210)||(26332616-26332688)
chr1 (133-195)||(14997040-14997101)
chr1 (133-195)||(4144804-4144865)
chr1 (51-89)||(11693351-11693389)
chr1 (37-82)||(9521826-9521871)
chr1 (1-38)||(13447264-13447301)
chr1 (64-100)||(8213579-8213615)
chr1 (9-128)||(46783212-46783331)
chr1 (148-231)||(26332699-26332780)
chr1 (157-195)||(2232597-2232635)
chr1 (36-82)||(9526577-9526623)
chr1 (202-231)||(47451709-47451738)
chr1 (12-56)||(3156989-3157033)
chr1 (12-56)||(28223421-28223465)
[»] chr4 (131 HSPs)
chr4 (6-231)||(16455356-16455581)
chr4 (1-231)||(40637189-40637418)
chr4 (1-231)||(40091404-40091633)
chr4 (1-231)||(12395834-12396063)
chr4 (1-231)||(12400796-12401025)
chr4 (1-231)||(22800851-22801080)
chr4 (1-231)||(48486434-48486663)
chr4 (1-231)||(24880566-24880796)
chr4 (1-231)||(8631408-8631637)
chr4 (1-231)||(14633434-14633662)
chr4 (1-231)||(17662234-17662463)
chr4 (1-231)||(24348333-24348562)
chr4 (1-231)||(24888911-24889140)
chr4 (1-223)||(36380472-36380694)
chr4 (1-231)||(38928166-38928395)
chr4 (1-231)||(24879104-24879334)
chr4 (1-231)||(16453424-16453654)
chr4 (1-231)||(33415477-33415706)
chr4 (1-231)||(36921482-36921711)
chr4 (1-231)||(37089361-37089589)
chr4 (1-231)||(47868516-47868745)
chr4 (1-231)||(22802723-22802952)
chr4 (1-231)||(36378407-36378637)
chr4 (1-228)||(47274844-47275069)
chr4 (1-231)||(9148368-9148596)
chr4 (1-231)||(22046675-22046903)
chr4 (2-231)||(37313055-37313284)
chr4 (5-231)||(19322810-19323035)
chr4 (3-231)||(38409320-38409546)
chr4 (1-231)||(19095998-19096227)
chr4 (1-231)||(6764959-6765188)
chr4 (1-231)||(36919573-36919802)
chr4 (1-226)||(7941443-7941667)
chr4 (1-204)||(2891433-2891636)
chr4 (1-231)||(2484862-2485090)
chr4 (1-231)||(5198535-5198764)
chr4 (1-231)||(22044380-22044608)
chr4 (1-231)||(26085966-26086194)
chr4 (1-231)||(51015361-51015589)
chr4 (6-231)||(14787423-14787649)
chr4 (1-231)||(11435070-11435298)
chr4 (9-231)||(22132389-22132609)
chr4 (9-213)||(18537470-18537675)
chr4 (1-231)||(11006226-11006455)
chr4 (1-231)||(18847268-18847496)
chr4 (1-231)||(619437-619665)
chr4 (1-198)||(13547302-13547498)
chr4 (32-231)||(13544075-13544272)
chr4 (1-231)||(31849588-31849817)
chr4 (9-226)||(9176471-9176687)
chr4 (9-231)||(41997607-41997828)
chr4 (1-231)||(11008557-11008784)
chr4 (1-231)||(27499160-27499386)
chr4 (9-230)||(16931786-16932006)
chr4 (9-230)||(16934140-16934360)
chr4 (9-231)||(18709161-18709381)
chr4 (10-231)||(44599836-44600056)
chr4 (9-230)||(9174143-9174363)
chr4 (9-231)||(18409344-18409565)
chr4 (9-231)||(22134615-22134834)
chr4 (10-230)||(22780371-22780590)
chr4 (10-230)||(22782736-22782955)
chr4 (16-231)||(56030559-56030770)
chr4 (9-213)||(38890221-38890426)
chr4 (1-169)||(4215483-4215650)
chr4 (9-231)||(18534828-18535049)
chr4 (1-231)||(30136666-30136894)
chr4 (9-231)||(8756247-8756469)
chr4 (69-228)||(3824627-3824785)
chr4 (78-231)||(5637530-5637683)
chr4 (9-211)||(12102221-12102425)
chr4 (16-199)||(47210756-47210938)
chr4 (1-151)||(5635465-5635614)
chr4 (9-210)||(28453818-28454020)
chr4 (4-225)||(53405250-53405474)
chr4 (1-151)||(11437558-11437706)
chr4 (128-231)||(6132987-6133090)
chr4 (38-211)||(31983554-31983727)
chr4 (36-197)||(15032572-15032733)
chr4 (36-196)||(3982200-3982362)
chr4 (118-231)||(3937314-3937427)
chr4 (1-145)||(5101130-5101272)
chr4 (9-195)||(16185831-16186018)
chr4 (91-231)||(52942537-52942664)
chr4 (1-84)||(6133098-6133181)
chr4 (67-210)||(47150948-47151092)
chr4 (9-210)||(25357772-25357979)
chr4 (9-210)||(9863842-9864049)
chr4 (53-210)||(40998990-40999148)
chr4 (1-98)||(47563009-47563105)
chr4 (38-210)||(9022438-9022613)
chr4 (18-231)||(10112984-10113198)
chr4 (5-124)||(49088791-49088911)
chr4 (1-195)||(5336769-5336964)
chr4 (6-78)||(14789422-14789496)
chr4 (63-128)||(54928699-54928764)
chr4 (9-128)||(3578668-3578786)
chr4 (9-108)||(26557823-26557922)
chr4 (51-126)||(24446680-24446754)
chr4 (185-228)||(24446756-24446799)
chr4 (36-195)||(55822265-55822420)
chr4 (9-98)||(22295412-22295502)
chr4 (36-192)||(31300427-31300580)
chr4 (185-231)||(38270158-38270204)
chr4 (36-195)||(7050282-7050439)
chr4 (6-192)||(8529270-8529455)
chr4 (46-192)||(4558314-4558458)
chr4 (1-49)||(52942477-52942525)
chr4 (46-195)||(4570094-4570241)
chr4 (36-195)||(11853549-11853705)
chr4 (82-210)||(54906722-54906852)
chr4 (6-82)||(4884985-4885062)
chr4 (151-231)||(10114444-10114522)
chr4 (138-195)||(16638827-16638883)
chr4 (6-192)||(16688934-16689119)
chr4 (36-195)||(36769479-36769636)
chr4 (1-44)||(3937263-3937306)
chr4 (133-192)||(16489352-16489410)
chr4 (36-82)||(15831252-15831298)
chr4 (1-35)||(24446643-24446677)
chr4 (157-195)||(36771396-36771434)
chr4 (123-161)||(38270120-38270158)
chr4 (154-195)||(4874620-4874661)
chr4 (12-81)||(10047383-10047452)
chr4 (6-82)||(18587077-18587154)
chr4 (12-81)||(39245998-39246067)
chr4 (148-192)||(4884877-4884921)
chr4 (12-56)||(12743925-12743969)
chr4 (12-56)||(12745314-12745358)
chr4 (156-192)||(25699752-25699788)
chr4 (148-196)||(29609606-29609654)
[»] chr5 (96 HSPs)
chr5 (1-231)||(1189596-1189827)
chr5 (1-231)||(695939-696168)
chr5 (1-231)||(16092188-16092418)
chr5 (1-231)||(18511201-18511430)
chr5 (1-231)||(25804086-25804314)
chr5 (1-231)||(40221583-40221813)
chr5 (4-231)||(10529091-10529317)
chr5 (1-231)||(6745130-6745358)
chr5 (1-214)||(20505832-20506042)
chr5 (1-231)||(25921462-25921691)
chr5 (3-231)||(17072944-17073172)
chr5 (1-231)||(6756555-6756782)
chr5 (1-231)||(2174980-2175208)
chr5 (1-231)||(18596706-18596936)
chr5 (1-231)||(21948087-21948316)
chr5 (1-231)||(24126917-24127146)
chr5 (1-231)||(10474312-10474541)
chr5 (1-231)||(25904164-25904393)
chr5 (1-223)||(27912605-27912826)
chr5 (1-231)||(31472601-31472831)
chr5 (1-231)||(39854544-39854773)
chr5 (2-231)||(18466745-18466973)
chr5 (1-231)||(658345-658571)
chr5 (1-225)||(41585733-41585956)
chr5 (1-231)||(2818324-2818554)
chr5 (1-231)||(17818481-17818708)
chr5 (1-231)||(4236690-4236918)
chr5 (1-231)||(6747367-6747594)
chr5 (1-231)||(18509307-18509536)
chr5 (1-231)||(27910511-27910740)
chr5 (1-231)||(38882167-38882395)
chr5 (1-231)||(34479407-34479637)
chr5 (1-231)||(2954478-2954706)
chr5 (1-229)||(16776221-16776447)
chr5 (1-231)||(34477042-34477272)
chr5 (1-213)||(39798126-39798337)
chr5 (1-230)||(2723964-2724183)
chr5 (1-231)||(26097794-26098021)
chr5 (6-231)||(37705774-37705998)
chr5 (1-223)||(10586901-10587122)
chr5 (1-231)||(36402317-36402546)
chr5 (2-211)||(36208656-36208865)
chr5 (3-231)||(18469072-18469297)
chr5 (1-225)||(4410090-4410312)
chr5 (9-231)||(31545141-31545362)
chr5 (9-230)||(15552307-15552527)
chr5 (1-231)||(21684441-21684669)
chr5 (9-230)||(31179368-31179588)
chr5 (9-213)||(6661181-6661386)
chr5 (9-231)||(31542796-31543016)
chr5 (68-231)||(34530721-34530884)
chr5 (1-231)||(39397982-39398210)
chr5 (5-196)||(10749796-10749986)
chr5 (1-231)||(12555912-12556141)
chr5 (2-231)||(31465979-31466196)
chr5 (1-231)||(9020281-9020510)
chr5 (2-223)||(21288839-21289050)
chr5 (9-196)||(38960129-38960314)
chr5 (5-196)||(10757273-10757462)
chr5 (1-196)||(15354564-15354757)
chr5 (1-196)||(23665140-23665333)
chr5 (1-196)||(23793254-23793447)
chr5 (1-231)||(20053906-20054127)
chr5 (9-196)||(3373134-3373320)
chr5 (1-196)||(15356840-15357033)
chr5 (46-231)||(17413200-17413384)
chr5 (130-231)||(20045071-20045172)
chr5 (1-179)||(23741848-23742023)
chr5 (138-231)||(20043111-20043204)
chr5 (36-210)||(15143547-15143722)
chr5 (36-192)||(4897828-4897985)
chr5 (78-166)||(42770936-42771024)
chr5 (153-231)||(26098391-26098469)
chr5 (4-104)||(26098280-26098380)
chr5 (9-162)||(15445263-15445417)
chr5 (51-210)||(2144601-2144763)
chr5 (9-196)||(34033563-34033753)
chr5 (124-213)||(42770847-42770934)
chr5 (1-59)||(20043222-20043280)
chr5 (64-210)||(35430259-35430408)
chr5 (6-192)||(22672837-22673022)
chr5 (36-195)||(1170811-1170967)
chr5 (148-195)||(10627364-10627411)
chr5 (133-195)||(2298122-2298183)
chr5 (12-81)||(11916996-11917065)
chr5 (6-82)||(28786515-28786592)
chr5 (6-82)||(42238371-42238448)
chr5 (62-122)||(20045210-20045270)
chr5 (133-196)||(32520533-32520597)
chr5 (6-190)||(25445501-25445684)
chr5 (36-82)||(1240539-1240585)
chr5 (133-231)||(4754216-4754312)
chr5 (153-195)||(31782597-31782639)
chr5 (157-195)||(35385596-35385634)
chr5 (12-56)||(533893-533937)
chr5 (12-56)||(42428430-42428474)
[»] chr3 (133 HSPs)
chr3 (1-231)||(1313450-1313679)
chr3 (1-231)||(4308268-4308497)
chr3 (1-231)||(38890081-38890310)
chr3 (1-231)||(3314725-3314955)
chr3 (1-231)||(53917651-53917880)
chr3 (1-231)||(45882980-45883210)
chr3 (1-231)||(10956014-10956243)
chr3 (1-227)||(4666559-4666784)
chr3 (1-231)||(1321520-1321749)
chr3 (1-231)||(1626670-1626899)
chr3 (1-231)||(18099157-18099386)
chr3 (2-231)||(28761415-28761645)
chr3 (1-229)||(9604594-9604821)
chr3 (4-231)||(10958313-10958539)
chr3 (1-231)||(24979748-24979978)
chr3 (5-231)||(5926755-5926980)
chr3 (1-231)||(25533483-25533712)
chr3 (1-231)||(43228332-43228561)
chr3 (1-231)||(43423450-43423679)
chr3 (1-231)||(51726994-51727222)
chr3 (1-231)||(53915483-53915712)
chr3 (6-231)||(43226126-43226350)
chr3 (1-229)||(53468440-53468670)
chr3 (1-231)||(3859569-3859797)
chr3 (1-231)||(7606575-7606803)
chr3 (1-231)||(27101168-27101397)
chr3 (1-231)||(28101989-28102218)
chr3 (1-231)||(30005882-30006111)
chr3 (1-231)||(42990345-42990574)
chr3 (1-231)||(43421402-43421631)
chr3 (2-231)||(11170445-11170673)
chr3 (1-221)||(6484411-6484630)
chr3 (1-231)||(4103883-4104111)
chr3 (1-231)||(18096887-18097116)
chr3 (1-231)||(51674753-51674982)
chr3 (1-231)||(51943412-51943640)
chr3 (1-231)||(18162704-18162933)
chr3 (1-231)||(32264025-32264255)
chr3 (9-230)||(746799-747019)
chr3 (1-231)||(880438-880667)
chr3 (1-231)||(10084376-10084605)
chr3 (2-231)||(15780912-15781148)
chr3 (1-224)||(6231849-6232070)
chr3 (1-231)||(5522614-5522842)
chr3 (1-231)||(36011868-36012097)
chr3 (1-221)||(25688147-25688367)
chr3 (9-231)||(25388947-25389167)
chr3 (1-231)||(5191694-5191921)
chr3 (9-231)||(47148890-47149110)
chr3 (1-231)||(48361658-48361887)
chr3 (1-231)||(32219125-32219355)
chr3 (10-231)||(38210411-38210631)
chr3 (55-231)||(6561851-6562028)
chr3 (1-231)||(39715510-39715735)
chr3 (1-231)||(12267962-12268180)
chr3 (9-230)||(10621525-10621745)
chr3 (1-231)||(22114292-22114521)
chr3 (1-231)||(26720589-26720817)
chr3 (10-230)||(458326-458545)
chr3 (48-231)||(13420219-13420399)
chr3 (1-211)||(5886261-5886468)
chr3 (1-211)||(5899734-5899941)
chr3 (9-230)||(6063441-6063661)
chr3 (9-231)||(10191305-10191525)
chr3 (10-230)||(455949-456168)
chr3 (1-231)||(17795302-17795529)
chr3 (1-231)||(19103742-19103969)
chr3 (1-231)||(23633499-23633723)
chr3 (1-231)||(28413018-28413248)
chr3 (1-208)||(11168165-11168371)
chr3 (12-231)||(53591225-53591442)
chr3 (10-231)||(50494040-50494260)
chr3 (51-231)||(29956727-29956906)
chr3 (20-231)||(889779-889988)
chr3 (9-231)||(6065791-6066012)
chr3 (14-232)||(35917944-35918160)
chr3 (7-213)||(31151404-31151609)
chr3 (9-212)||(561769-561974)
chr3 (3-145)||(47701660-47701801)
chr3 (9-231)||(25635424-25635644)
chr3 (4-231)||(54691564-54691790)
chr3 (1-199)||(27635645-27635830)
chr3 (64-231)||(54884196-54884362)
chr3 (1-194)||(3306839-3307030)
chr3 (107-231)||(35777462-35777587)
chr3 (1-231)||(42992327-42992540)
chr3 (36-231)||(53597279-53597472)
chr3 (9-166)||(24181486-24181644)
chr3 (84-231)||(1674015-1674160)
chr3 (9-231)||(36871295-36871516)
chr3 (117-231)||(28100143-28100257)
chr3 (95-231)||(23637066-23637200)
chr3 (64-210)||(14634491-14634638)
chr3 (124-231)||(28137415-28137522)
chr3 (112-231)||(28181063-28181182)
chr3 (36-210)||(1620483-1620657)
chr3 (9-129)||(25634030-25634150)
chr3 (1-77)||(35919102-35919178)
chr3 (75-228)||(4560352-4560497)
chr3 (1-88)||(41849243-41849329)
chr3 (36-184)||(11007545-11007684)
chr3 (1-66)||(53894044-53894109)
chr3 (46-231)||(13419922-13420106)
chr3 (6-192)||(29913949-29914132)
chr3 (6-192)||(10595028-10595213)
chr3 (6-192)||(27761980-27762165)
chr3 (6-192)||(47878165-47878350)
chr3 (180-231)||(41849193-41849244)
chr3 (36-195)||(10094100-10094256)
chr3 (18-210)||(7768632-7768825)
chr3 (6-82)||(10612772-10612849)
chr3 (6-192)||(10897008-10897193)
chr3 (36-195)||(22626009-22626166)
chr3 (168-213)||(24177335-24177380)
chr3 (8-100)||(27420822-27420915)
chr3 (148-195)||(7418064-7418111)
chr3 (185-228)||(7606830-7606873)
chr3 (36-195)||(10100117-10100273)
chr3 (36-195)||(10200980-10201136)
chr3 (36-195)||(10208026-10208182)
chr3 (6-128)||(15823641-15823763)
chr3 (1-83)||(16996987-16997070)
chr3 (2-49)||(42992608-42992655)
chr3 (157-195)||(6303310-6303348)
chr3 (36-82)||(11079628-11079674)
chr3 (148-182)||(13893475-13893509)
chr3 (157-195)||(16462203-16462241)
chr3 (157-195)||(27544273-27544311)
chr3 (157-195)||(47883026-47883064)
chr3 (36-82)||(48390327-48390373)
chr3 (12-81)||(1736319-1736388)
chr3 (12-81)||(18552897-18552966)
chr3 (12-81)||(30709804-30709873)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (6-231)||(14376-14600)
scaffold0131 (6-231)||(15089-15313)
[»] chr8 (72 HSPs)
chr8 (1-230)||(14419179-14419408)
chr8 (1-231)||(30480492-30480721)
chr8 (1-231)||(3874127-3874356)
chr8 (1-231)||(32339426-32339655)
chr8 (1-231)||(15068098-15068327)
chr8 (1-231)||(25952637-25952867)
chr8 (1-231)||(27106886-27107115)
chr8 (1-231)||(27911131-27911359)
chr8 (1-231)||(27957550-27957778)
chr8 (1-231)||(28251556-28251785)
chr8 (4-231)||(608851-609077)
chr8 (1-231)||(22684642-22684874)
chr8 (1-231)||(4424135-4424364)
chr8 (1-231)||(15809335-15809564)
chr8 (1-231)||(14807868-14808107)
chr8 (1-231)||(1225283-1225513)
chr8 (1-231)||(15072827-15073057)
chr8 (5-231)||(13858477-13858702)
chr8 (1-231)||(27829414-27829642)
chr8 (1-231)||(43530232-43530461)
chr8 (4-231)||(41384861-41385087)
chr8 (1-231)||(28283210-28283437)
chr8 (4-231)||(5372168-5372396)
chr8 (2-231)||(15956077-15956303)
chr8 (1-231)||(18812999-18813227)
chr8 (1-231)||(27827103-27827331)
chr8 (1-231)||(36865655-36865883)
chr8 (4-231)||(15185706-15185928)
chr8 (9-231)||(21482430-21482649)
chr8 (9-231)||(43079719-43079940)
chr8 (1-231)||(18810825-18811053)
chr8 (1-190)||(41382820-41383008)
chr8 (18-213)||(21480637-21480832)
chr8 (9-231)||(44720960-44721181)
chr8 (9-231)||(43082090-43082311)
chr8 (9-214)||(31162343-31162551)
chr8 (6-210)||(3005624-3005829)
chr8 (9-230)||(24873178-24873398)
chr8 (102-231)||(14477393-14477522)
chr8 (9-210)||(31578273-31578476)
chr8 (9-213)||(31035252-31035459)
chr8 (1-231)||(33541399-33541606)
chr8 (51-225)||(181622-181795)
chr8 (9-142)||(2468126-2468259)
chr8 (81-210)||(31573794-31573924)
chr8 (36-196)||(17847677-17847830)
chr8 (9-196)||(3895972-3896162)
chr8 (153-231)||(5622878-5622956)
chr8 (36-195)||(6376141-6376300)
chr8 (130-231)||(37214317-37214409)
chr8 (1-60)||(37214253-37214312)
chr8 (11-108)||(16833789-16833886)
chr8 (171-231)||(26775318-26775378)
chr8 (36-195)||(28327908-28328064)
chr8 (51-126)||(35872479-35872553)
chr8 (185-228)||(35872555-35872598)
chr8 (51-105)||(14419732-14419786)
chr8 (1-49)||(14477548-14477597)
chr8 (6-195)||(17799418-17799606)
chr8 (36-195)||(16757293-16757449)
chr8 (67-195)||(13985135-13985262)
chr8 (168-213)||(2468261-2468306)
chr8 (12-81)||(4696620-4696689)
chr8 (6-195)||(9021101-9021289)
chr8 (6-195)||(21033870-21034057)
chr8 (157-195)||(16752666-16752704)
chr8 (157-195)||(28895502-28895540)
chr8 (1-35)||(35872442-35872476)
chr8 (12-81)||(7412345-7412414)
chr8 (6-82)||(23179555-23179632)
chr8 (12-56)||(6599096-6599140)
chr8 (12-56)||(6674549-6674593)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (1-231)||(183630-183858)
scaffold0005 (6-231)||(52081-52307)
scaffold0005 (6-78)||(50234-50308)
[»] chr2 (85 HSPs)
chr2 (1-231)||(11739548-11739778)
chr2 (1-229)||(6258806-6259031)
chr2 (1-229)||(17849156-17849383)
chr2 (1-231)||(34979566-34979797)
chr2 (1-231)||(6264137-6264367)
chr2 (1-231)||(19502000-19502229)
chr2 (1-231)||(42452818-42453046)
chr2 (1-231)||(42923498-42923727)
chr2 (1-226)||(43623569-43623793)
chr2 (1-231)||(17848481-17848706)
chr2 (1-231)||(19007677-19007906)
chr2 (1-231)||(45279973-45280202)
chr2 (1-231)||(14837310-14837534)
chr2 (1-218)||(5375335-5375550)
chr2 (1-225)||(27104841-27105063)
chr2 (2-231)||(40032043-40032276)
chr2 (1-231)||(21520682-21520911)
chr2 (1-231)||(22287325-22287554)
chr2 (1-231)||(23452226-23452455)
chr2 (1-231)||(44289056-44289286)
chr2 (1-231)||(42064552-42064781)
chr2 (1-231)||(19504335-19504563)
chr2 (1-231)||(28196674-28196901)
chr2 (1-231)||(13910034-13910262)
chr2 (35-231)||(45239000-45239195)
chr2 (40-213)||(11578136-11578309)
chr2 (1-231)||(28459179-28459408)
chr2 (1-231)||(18800302-18800529)
chr2 (1-213)||(22874185-22874397)
chr2 (10-230)||(35215584-35215803)
chr2 (10-230)||(35217961-35218180)
chr2 (91-231)||(15539553-15539693)
chr2 (1-231)||(3022200-3022438)
chr2 (9-210)||(20146604-20146806)
chr2 (8-231)||(31732772-31732983)
chr2 (1-196)||(36558853-36559047)
chr2 (1-196)||(36561130-36561324)
chr2 (1-231)||(24162212-24162430)
chr2 (9-210)||(17897242-17897443)
chr2 (1-144)||(22407443-22407585)
chr2 (10-196)||(45332179-45332364)
chr2 (36-212)||(40699429-40699606)
chr2 (1-132)||(22707740-22707872)
chr2 (63-195)||(20589763-20589896)
chr2 (9-183)||(37962938-37963109)
chr2 (1-102)||(22163011-22163111)
chr2 (64-210)||(35107351-35107498)
chr2 (15-142)||(7462950-7463077)
chr2 (3-133)||(23870951-23871080)
chr2 (83-231)||(27136195-27136342)
chr2 (36-231)||(43139413-43139606)
chr2 (63-211)||(15693958-15694109)
chr2 (36-195)||(35028647-35028807)
chr2 (168-231)||(38020239-38020302)
chr2 (126-225)||(38414194-38414291)
chr2 (46-195)||(33603994-33604143)
chr2 (36-196)||(17921769-17921927)
chr2 (146-209)||(27583472-27583535)
chr2 (67-172)||(13828397-13828503)
chr2 (171-231)||(22163106-22163165)
chr2 (36-192)||(17943540-17943692)
chr2 (36-195)||(39686983-39687139)
chr2 (138-211)||(26345661-26345735)
chr2 (36-192)||(27517664-27517818)
chr2 (36-195)||(2740941-2741097)
chr2 (36-195)||(39680045-39680201)
chr2 (133-195)||(28458949-28459011)
chr2 (36-98)||(39287262-39287324)
chr2 (6-195)||(20054759-20054947)
chr2 (195-231)||(22407591-22407627)
chr2 (36-195)||(2736205-2736361)
chr2 (138-196)||(7502990-7503049)
chr2 (1-36)||(15539518-15539553)
chr2 (36-195)||(17462436-17462592)
chr2 (36-82)||(12781246-12781292)
chr2 (69-192)||(17932637-17932756)
chr2 (157-195)||(22712660-22712698)
chr2 (157-195)||(22717369-22717407)
chr2 (157-195)||(38190997-38191035)
chr2 (157-195)||(45567409-45567447)
chr2 (12-81)||(8390174-8390243)
chr2 (12-81)||(14699031-14699100)
chr2 (67-100)||(41303088-41303121)
chr2 (12-56)||(17057369-17057413)
chr2 (12-56)||(17085352-17085396)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-231)||(79255-79484)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (1-231)||(69281-69509)
scaffold0025 (186-229)||(73160-73203)
scaffold0025 (201-231)||(73211-73241)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (1-228)||(4069-4294)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (1-231)||(1442-1670)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (1-231)||(11462-11691)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-231)||(41472-41701)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (1-223)||(79938-80158)
scaffold0004 (157-195)||(188386-188424)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (1-231)||(85300-85530)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (9-212)||(1638-1842)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (9-231)||(6269-6490)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (9-231)||(15817-16038)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (9-231)||(111-332)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (1-231)||(29241-29469)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (1-231)||(2950-3178)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (9-231)||(16646-16867)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (1-196)||(22221-22414)
scaffold0140 (1-196)||(24496-24689)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (51-225)||(2117-2290)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (36-199)||(4912-5076)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (121-231)||(35709-35819)
scaffold0011 (1-78)||(35816-35893)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (1-66)||(4668-4733)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (36-195)||(57452-57613)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (1-44)||(1440-1483)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (157-195)||(224819-224857)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (6-82)||(16980-17057)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 105)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 20137098 - 20137327
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20137098 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaaga 20137196  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||     
T  20137197 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactcaatcttaatagtgtttcccaa 20137296  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137297 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 20137327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24748895 - 24748665
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24748895 cacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctaatctggaggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaaga 24748796  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24748795 gatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccggaaccaagagactcaatcgtaatagtgtttcccag 24748696  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24748695 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 24748665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44724879 - 44724650
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44724879 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 44724781  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  44724780 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 44724681  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724680 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 44724650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 13099463 - 13099694
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa-g 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  13099463 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaaag 13099562  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13099563 agatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttccca 13099662  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13099663 aggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgt 13099694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 39145975 - 39146205
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||  | ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39145975 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttagggaaaagagcagccccccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaaga 39146074  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  39146075 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttttccaa 39146174  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39146175 ggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgt 39146205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 4295923 - 4296152
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4295923 cacaaaagaatttgttcacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagatagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 4296021  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  4296022 gatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 4296121  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4296122 ggtgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgt 4296152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 31435035 - 31435265
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31435035 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaaga 31435134  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  31435135 gatatcaatgggttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagttccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 31435234  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31435235 ggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgt 31435265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38394286 - 38394057
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38394286 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 38394188  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  38394187 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 38394088  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38394087 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 38394057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 48457953 - 48457724
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  48457953 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 48457855  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  48457854 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccta 48457755  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48457754 ggtgaatgaaccctcaaaccctagtgtttgt 48457724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 37412114 - 37412345
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa-g 99  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| | || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37412114 cacaaaagaatttattgatccagttcggtccaaattgacccagtctaggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaag 37412213  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37412214 agatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 37412313  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412314 aggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 37412345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 7092202 - 7092430
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7092202 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgattcactata-tgatgagtaacattacaaaaga 7092299  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  7092300 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaa 7092399  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7092400 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 7092430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 7470011 - 7470240
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7470011 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagggagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 7470109  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  7470110 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcacaa 7470209  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7470210 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 7470240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9681120 - 9680891
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9681120 cacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcactata-tgatgagtaactttacaaaaga 9681022  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  9681021 tatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccga 9680922  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9680921 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 9680891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 21592132 - 21592361
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21592132 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 21592230  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || |||     
T  21592231 gatgtcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcgcgtaaccaagagactaaatcctaatagtgcttgccaa 21592330  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21592331 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 21592361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21990450 - 21990221
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21990450 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctctgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 21990352  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||     
T  21990351 gatatcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctactcaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttctcaa 21990252  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21990251 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 21990221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 42330986 - 42331217
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||  || |||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  42330986 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagaatagccctccgtttcactata-taatgagtaactttacaaaaga 42331084  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttccc--gtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42331085 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 42331184  T
Q  199 agggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331185 aaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 42331217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20299760 - 20299530
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20299760 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 20299662  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  20299661 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 20299562  T
Q  201 ggtgaatcaaccctc-aaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20299561 ggtgaatcaaccctcaaaaccctagtgtttgt 20299530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20297662 - 20297433
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  20297662 cacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaaaga 20297564  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  20297563 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctatttctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 20297464  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20297463 ggtgaatcaaccctcaaaccctactgtttgt 20297433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20626338 - 20626109
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20626338 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 20626240  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  20626239 gaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 20626140  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20626139 ggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgt 20626109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20630229 - 20630000
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20630229 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 20630131  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  20630130 gaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 20630031  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20630030 ggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgt 20630000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20642648 - 20642419
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20642648 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 20642550  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  20642549 gaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 20642450  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20642449 ggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgt 20642419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 40836732 - 40836960
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||    
T  40836732 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-ga 40836829  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  40836830 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 40836929  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40836930 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 40836960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11355555 - 11355331
Alignment:
Q  4 aaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  11355555 aaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctaggggagagagcagctctctgttccactata-tgatgagaaacgttacaaaaaagat 11355457  T
Q  104 atcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggt 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  11355456 atcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 11355357  T
Q  204 gaatcaaccctcaaaccctagtgttt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  11355356 gaatcaaccctcaaaccctagtgttt 11355331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35929 - 35700
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35929 cacaaaaaaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaaagcagctctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 35831  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35830 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaa 35731  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35730 ggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgt 35700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1850281 - 1850052
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1850281 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 1850183  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||  |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||     
T  1850182 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccagcctcttcccgtaagcaagaaactcaatcctaatagtgttttccaa 1850083  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1850082 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 1850052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 7471969 - 7472198
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7471969 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 7472067  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  7472068 gaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagttccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 7472167  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7472168 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 7472198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9679359 - 9679131
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9679359 cacaaaagaatttgttgacccagtctggtccaaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaaga 9679261  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  9679260 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 9679161  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  9679160 ggtgaatcaatcctcaaa-cctagtgtttgt 9679131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 231
Target Start/End: Original strand, 27306224 - 27306448
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 105  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27306224 aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatat 27306322  T
Q  106 caatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtga 205  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27306323 caatgggttgcaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 27306422  T
Q  206 atcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  27306423 atcaaccctcaaaccctagtttttgt 27306448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 443896 - 443666
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtg-agagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  443896 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcgggggggagagagcagcccttcgtttcactata-tgatgagtaacgttataaaag 443798  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  443797 agatatcaatggattacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttccca 443698  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443697 aggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 443666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44864 - 44635
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||   |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44864 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaagcagctatccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 44766  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |     
T  44765 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacataattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaaaagactcaatcataatagtgtttcctaa 44666  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44665 ggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgt 44635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 1046914 - 1047142
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||    
T  1046914 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-ga 1047011  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  1047012 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 1047111  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1047112 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 1047142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3878877 - 3878648
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3878877 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacatagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 3878779  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  3878778 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttaccaa 3878679  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  3878678 ggtgaatcaacccacaagccctagcgtttgt 3878648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18345841 - 18345612
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  18345841 cacaaaagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaaga 18345743  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  18345742 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 18345643  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18345642 ggtgaatcaaccctcaaaacctagtatttgt 18345612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 227
Target Start/End: Original strand, 27832631 - 27832847
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 105  Q
    ||||||||||| |||||||||     ||||||||||||| |||| ||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27832631 aagaatttgtttacccagttc-----aaattgacctagtctgggggagagagaagccctccatttcactataatgatgagtaactttacagaagagatat 27832725  T
Q  106 caatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtga 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27832726 caatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 27832825  T
Q  206 atcaaccctcaaaccctagtgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27832826 atcaaccctcaaaccctagtgt 27832847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 7094449 - 7094670
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7094449 cacaaaagaatttattgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgatgagtaacattacaaaaga 7094547  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  7094548 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaattaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 7094647  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaacccta 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  7094648 ggtgaatcaaccctcaaacccta 7094670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 42223457 - 42223229
Alignment:
Q  2 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  42223457 acaaaagaatttgttgacccagttcgatcaaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccatttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagag 42223359  T
Q  102 atatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagg 201  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  42223358 atatcaataggtttcaagaataagttttccgcctaattctatccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaag 42223259  T
Q  202 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42223258 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 42223229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 1049285 - 1049511
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||    
T  1049285 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-ga 1049382  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  1049383 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctgatagtgtttcccaa 1049482  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1049483 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgttt 1049511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 65 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25276378 - 25276212
Alignment:
Q  65 ccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttccc 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25276378 ccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggtttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttccc 25276279  T
Q  165 gtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25276278 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 25276212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40946628 - 40946399
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40946628 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 40946530  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  40946529 gaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttccaa 40946430  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  40946429 agtaaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 40946399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3036024 - 3035792
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||| | || |||||||    
T  3036024 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat-atgatgagtatcgttgcaaaaga 3035926  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatc---tcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 197  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||  |   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3035925 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccagcctcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 3035826  T
Q  198 cagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3035825 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 3035792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28487853 - 28487627
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28487853 cacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctctgattcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 28487755  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  28487754 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccaaa 28487655  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 228  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  28487654 ggtgaatcaacccacgaaccctagtgtt 28487627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 43253506 - 43253734
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| || | |||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  43253506 cacaaaagaatttattgacccagttcggtctaaattgacctagtctgagggagagagcagccctctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 43253604  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||     
T  43253605 gaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctctttccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 43253704  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43253705 ggtgaatcaaccctcaaa-cctagtgtttgt 43253734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21678361 - 21678137
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 105  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | || |||||||||| || | ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21678361 aagaatttgttgtcccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagcccactgtttcactata-tgataagtaaccttacaaaagatatat 21678263  T
Q  106 caatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtga 205  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21678262 caatgggttacaagaatacgtctcccgcctaatgctacccaaagtcccaatatcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 21678163  T
Q  206 atcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21678162 atcaaccctcaaaccctagtgtttgt 21678137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21680327 - 21680098
Alignment:
Q  4 aaaagaatttgttgacccag---ttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||   |||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21680327 aaaagtatttgttgacccagcagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagctctctgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaaga 21680229  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  21680228 gatatcattgggttacaagaataaatctcccgtctaattctacccaaagtcccaatctcttccggtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 21680129  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680128 gatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 21680098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 7351649 - 7351869
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||    
T  7351649 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaa 7351746  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  7351747 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 7351846  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtttg 230  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  7351847 caacccacaaaccctagtgtttg 7351869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 36 - 231
Target Start/End: Original strand, 24817377 - 24817569
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcct 135  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24817377 tgacctagtatgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagacatcaatgagttacaagaataagtctcccgcct 24817476  T
Q  136 atttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||||   |||||||||||||||    
T  24817477 aattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatactgctttccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgt 24817569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24258744 - 24258534
Alignment:
Q  24 ttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataat---gatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaaga 120  Q
    |||| |||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24258744 ttcggtccaaattgacctagtctgaaagagagagcagccctccgttccactataataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaga 24258645  T
Q  121 ataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaacc 220  Q
    |||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24258644 ataagttttccgcctaattctatccaaagtctcaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaacc 24258545  T
Q  221 ctagtgtttgt 231  Q
     ||||||||||    
T  24258544 atagtgtttgt 24258534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25542828 - 25542603
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  25542828 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagctctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-ga 25542731  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||     
T  25542730 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtcttt-ccaa 25542632  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25542631 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgttt 25542603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Original strand, 24813494 - 24813712
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |||| |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  24813494 aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagaaagcagccatccgctccactataatgatgagtaactttacaaaggagatataa 24813593  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  24813594 atgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatcacttcccgtcaccaagagactcaatcctaatagtgcttcccaaggtgaat 24813693  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgttt 229  Q
    ||||||   |||||||||||||    
T  24813694 caaccc---aaccctagtgttt 24813712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 38396934 - 38396713
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||    
T  38396934 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagaagccctccgatccactata-tgatgagtaaagttacaaa-ga 38396837  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||     
T  38396836 gaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaacagtgtttcccaa 38396737  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctag 224  Q
    ||||||||||||| |||| |||||    
T  38396736 ggtgaatcaacccacaaaacctag 38396713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28485865 - 28485637
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||  |||| | | || |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28485865 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgag-gagagagcaaccctctgattcattata-tgatgagtaacgttacaaaaga 28485768  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || |||||||  |||||||||||| ||||||||||| || ||| || || | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  28485767 gaaatcaatggattacaagaataaatctcccgcctaattatactcaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccaaa 28485668  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28485667 ggtgaatcaacccgcaaaccctagtgtttgt 28485637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 31155908 - 31156128
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  |||||||||  |||||||| | ||||||| |||| |||||    
T  31155908 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatag-gatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaa 31156005  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  31156006 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtacccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 31156105  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtttg 230  Q
    |||||| |||| |||||||||||    
T  31156106 caacccacaaatcctagtgtttg 31156128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 230
Target Start/End: Original strand, 7349297 - 7349490
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcct 135  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7349297 tgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct 7349394  T
Q  136 atttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttg 230  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7349395 aattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttg 7349490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 213
Target Start/End: Original strand, 20091581 - 20091745
Alignment:
Q  46 tgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctaccc 145  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20091581 tgggggagagagcagccctccgttccactat---gatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccc 20091677  T
Q  146 agagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccc 213  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20091678 aaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagatttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 20091745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 69 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11757462 - 11757300
Alignment:
Q  69 tccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaa 168  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||    
T  11757462 tccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaa 11757364  T
Q  169 ccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctc-aaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11757363 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccctagtgtttgt 11757300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 22828672 - 22828851
Alignment:
Q  52 agagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtc 151  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22828672 agagagcagccctctgtttcactataataatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 22828771  T
Q  152 tcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |   |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22828772 tcaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttctaatctgaatcaaccatcaaactctagtgtttgt 22828851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 2935560 - 2935374
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  2935560 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaa 2935463  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 196  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2935462 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 2935374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7188789 - 7188612
Alignment:
Q  52 agagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtc 151  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  7188789 agagagcagccttccgttccactataatgatgaataactttacaaaagaaatatcaatgggttataaaaataagtctcccgcttaattctacccaaagtc 7188690  T
Q  152 tcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  7188689 tcaatctattcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgt 7188612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22108366 - 22108173
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  22108366 cacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-ga 22108269  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 196  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22108268 gaaatcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22108173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 40550126 - 40549933
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  40550126 cacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-ga 40550029  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 196  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40550028 gaaatcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 40549933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Original strand, 9027191 - 9027376
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  9027191 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcctatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaa 9027288  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 196  Q
    || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9027289 tgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 9027376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22137377 - 22137184
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||||    
T  22137377 cacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaaga 22137280  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 196  Q
    || ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22137279 gaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22137184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 40552404 - 40552211
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||||    
T  40552404 cacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaaga 40552307  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 196  Q
    || ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40552306 gaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 40552211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 22394023 - 22393878
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| | || |||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22394023 cacaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagaacaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaaga 22393924  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctaccca 146  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22393923 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccca 22393878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1606671 - 1606486
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  1606671 aatttgttgacccagttcggtccaatctgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaa 1606574  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 196  Q
    || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1606573 tgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 1606486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26295743 - 26295580
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 105  Q
    ||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26295743 aagaatttgtttatccagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagcagtcatctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatat 26295644  T
Q  106 caatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaac 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  26295643 caatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcacaatcgcttcctgtaac 26295580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24465829 - 24465629
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    |||||||| || ||||||| | || ||||| ||||| |||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  24465829 aatttgtttactcagttcggttcatattgatctagtctgggggagagagcagtcacccgtttcattataatgatgagta-ctttacaaaagacatatcaa 24465731  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatc 208  Q
    || |||| |||||||| |||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  24465730 tgagttaaaagaataaatctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaaggtgaatc 24465631  T
Q  209 aa 210  Q
    ||    
T  24465630 aa 24465629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6332514 - 6332326
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| | || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  6332514 aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctaggggagagaacagtcttccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatta 6332415  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    | | |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6332414 aagggttacaagaataagtcttcaagcctaattctacctaaagtctcaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttt 6332326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 231
Target Start/End: Original strand, 22251602 - 22251760
Alignment:
Q  69 tccactataatgatgagtaaccttacaaaagaga----tatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttccc 164  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  22251602 tccactataatgatgagtaactttacaaaagagaaagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttccc 22251701  T
Q  165 gtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||        ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22251702 gtaaccaagagactcaatccta--------tcccaaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgt 22251760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 112 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26804762 - 26804651
Alignment:
Q  112 gttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  26804762 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 26804663  T
Q  212 cctcaaacccta 223  Q
    ||||||||||||    
T  26804662 cctcaaacccta 26804651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 6349020 - 6348912
Alignment:
Q  64 tccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcc 163  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6349020 tccgttccactgtaatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatcttttcc 6348921  T
Q  164 cgtaaccaa 172  Q
    ||| |||||    
T  6348920 cgtgaccaa 6348912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 210
Target Start/End: Original strand, 16297018 - 16297222
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| || ||||||| ||||| | |||| |||| | || ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  16297018 aatttgtttacacagttcggtccaatactgacatagtctaggggagagagcagctctccgttctactataatgatgagtaactttgcaaaagagatatta 16297117  T
Q  108 at-gtgttacaagaataagtctcccgc-ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtga 205  Q
    |  | ||||||||||| | ||| |    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  16297118 aaagggttacaagaatcaatcttcaaatctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtga 16297217  T
Q  206 atcaa 210  Q
    |||||    
T  16297218 atcaa 16297222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11081803 - 11081579
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatc- 106  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||  | ||||||||| | ||| |||||||||| ||||| ||||||||||     
T  11081803 aatttgtttacccagttcggtccaatattgacctagtctgggggagagagcaaccatccgttccattttaaagatgagtaactttacacaagagatatca 11081704  T
Q  107 -aatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtg 204  Q
     || | ||||||||||| |||| ||   |||| || ||| || | ||  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  11081703 aaaagggttacaagaattagtcttcaaacctaattttacacaaaatcctaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaagtg 11081604  T
Q  205 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||    
T  11081603 aatcaa-tctc-aaccctagtgtttgt 11081579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22392608 - 22392535
Alignment:
Q  155 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||    
T  22392608 atctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgt 22392535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 11759427 - 11759369
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagca 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11759427 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 11759369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25351539 - 25351353
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagata 104  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| |||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||    
T  25351539 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagaacagctctccgatccactataatgatgagtttctttacaaa-gagata 25351441  T
Q  105 tcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |   || ||||||||||| ||||| |   |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25351440 t---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25351353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 26804810 - 26804761
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggt 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26804810 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggt 26804761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 6046759 - 6046668
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtct 128  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  || | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  6046759 tgacctagtctgggggagagagcagctcttcattccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaaaggtttacaagaataagtct 6046668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25410318 - 25410130
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagaga 102  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||||||    
T  25410318 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttac-aaagaga 25410220  T
Q  103 tatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||   || ||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25410219 tat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25410130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 6067193 - 6067370
Alignment:
Q  7 agaatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 105  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||  | ||   ||||||||||    
T  6067193 agaatttgtttacccagtccggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagctctccgtttcactataatgacgagttccttttacaaagagatat 6067292  T
Q  106 caatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatc 183  Q
    ||  |  |||||||||| |||| ||   |||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6067293 cagaggattacaagaattagtcttcaaacctaattcta-tcaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactaaatc 6067370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6049111 - 6048976
Alignment:
Q  63 ctccgttccactata--atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctc 159  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||| | |||| ||||||| |||| |   |||| ||||| ||| ||||||||| ||    
T  6049111 ctccgttccactatataatgatgagtaactttacaaagg-gatatcaaagggttataagaatacgtcttcaaacctaattctatccaaagtctcaatatc 6049013  T
Q  160 ttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 196  Q
    ||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  6049012 ttctcgtgaccaagagattcaatcctaatagtgtttc 6048976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18567730 - 18567684
Alignment:
Q  185 taatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18567730 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgt 18567684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21369824 - 21369642
Alignment:
Q  12 ttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat--gagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||| |||||||||| |||||   ||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||  | ||||||| |||||||       
T  21369824 ttgtttacccagttcggtccaatgatgacctactatggcggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaa-gagatat--- 21369729  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    || |||||| |||| ||||| |   |||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21369728 tgagttacatgaatcagtcttcaaacctaattttaccca-agtcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 21369642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 207
Target Start/End: Original strand, 40281411 - 40281572
Alignment:
Q  40 ctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatt 138  Q
    ||||| |||| |||||||||  ||| |||||||| | || |||||||||| |||||||       |||| | ||||||||||||||||| |   |||| |    
T  40281411 ctagtctgggggagagagcatcccttcgttccacaacaacgatgagtaactttacaaa-------tcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaat 40281503  T
Q  139 tctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    || ||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||  |||||||||| |||||||    
T  40281504 tccaccaaaagtctcaatctcttcccgtgaccaacagactcaatcctaacggtgtttcccaaggtgaat 40281572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2121056 - 2120899
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat--gagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg- 132  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||  | ||||||| |||||||   || ||||||||||| ||||| |       
T  2121056 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttacaaa-gagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaa 2120961  T
Q  133 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2120960 cctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2120899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Original strand, 13290470 - 13290658
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | ||||| ||| || | ||||| | ||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13290470 aatttgtttacccagttcggtccaatactgaccaagtctgagggagagtgtagctctctgttccgctataatgatgagtaactttac-aaagagatatca 13290568  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 196  Q
    |   ||||||||||| | || ||   |||| |||||||||||||   ||| |||||| || ||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  13290569 aaaggttacaagaattattcttcaaacctaattctacccagagttctaatatcttcctgtgaccaagagactaaattctaatagtgtttc 13290658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25357233 - 25357047
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagata 104  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| |||||| ||   || || ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||    
T  25357233 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagatcatctcttcgatccactataatgatgagtttctttacaaa-gagata 25357135  T
Q  105 tcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |   || ||||||||||| ||||| |   |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25357134 t---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25357047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11084523 - 11084467
Alignment:
Q  154 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 210  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  11084523 aatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaa 11084467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Original strand, 3320076 - 3320232
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 133  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  3320076 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 3320171  T
Q  134 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3320172 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3320232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Original strand, 3324824 - 3324980
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 133  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  3324824 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 3324919  T
Q  134 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3324920 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3324980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25405549 - 25405393
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 133  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  25405549 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 25405454  T
Q  134 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25405453 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25405393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 195
Target Start/End: Original strand, 12310157 - 12310198
Alignment:
Q  154 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12310157 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 12310198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 82
Target Start/End: Original strand, 34546874 - 34546951
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 82  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34546874 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 34546951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 42006820 - 42006663
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat--gagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg- 132  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  || |||||||||||||||||  ||||  | ||||||| |||||||   || ||||||| ||| ||||| |       
T  42006820 tgacctagtctgggagagagagcagctcttcgttccactataatgatatgagtttctttacaaa-gagatat---tgagttacaaaaatcagtcttcaaa 42006725  T
Q  133 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  42006724 cctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 42006663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 49
Target Start/End: Original strand, 6359946 - 6359989
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatggg 49  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6359946 aagaaattgttgacccagttcgatccaacttgacctaatatggg 6359989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 7069936 - 7069780
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 133  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  || || ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  7069936 tgacctagtctgggggagagagcagctcttcgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 7069841  T
Q  134 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7069840 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7069780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 7074943 - 7074787
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 133  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  7074943 tgacctagtctgggggagagtgcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 7074848  T
Q  134 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7074847 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7074787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 195
Target Start/End: Original strand, 8378648 - 8378686
Alignment:
Q  157 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8378648 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttt 8378686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 195
Target Start/End: Original strand, 15541139 - 15541177
Alignment:
Q  157 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15541139 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 15541177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 82
Target Start/End: Original strand, 44010775 - 44010821
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 82  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44010775 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 44010821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 2075303 - 2075226
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 82  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  2075303 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctttccgttccactataatgat 2075226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 82
Target Start/End: Original strand, 7464513 - 7464590
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 82  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  7464513 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctggggaagagagcagctctccgttccactataatgat 7464590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26210688 - 26210631
Alignment:
Q  154 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccagggtgaatcaa 210  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  26210688 aatctctttccgttaccaagagactcaatcctaatagtatttctccaaggtgaatcaa 26210631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 9190101 - 9190053
Alignment:
Q  12 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcag 60  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||||    
T  9190101 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcag 9190053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 30814604 - 30814560
Alignment:
Q  12 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagaga 56  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  30814604 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 30814560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 78)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13057520 - 13057290
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13057520 cacaaaagaatttgttgaccgagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagtagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaaga 13057421  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  13057420 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaa 13057321  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13057320 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 13057290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13040080 - 13039850
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13040080 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaaga 13039981  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||     
T  13039980 gatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacgcaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgttttccaa 13039881  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13039880 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 13039850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3390705 - 3390475
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3390705 cacaaaagaatttgttgacccaatttggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactgtaatgatgagtaactttacaaaaga 3390606  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  3390605 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 3390506  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390505 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 3390475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 11983018 - 11983247
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11983018 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 11983116  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  11983117 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 11983216  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11983217 ggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgt 11983247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 3631928 - 3632156
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3631928 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg--acagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaaga 3632025  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  3632026 gatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaacaaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 3632125  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3632126 gatgaatcaacccttaaaccctagtgtttgt 3632156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9020251 - 9020022
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9020251 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccccccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaaga 9020153  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  9020152 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcctataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 9020053  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9020052 ggtgaatcaaccctcaaaacctagtgattgt 9020022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 1230238 - 1230467
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1230238 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 1230336  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||     
T  1230337 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttccaataaccaagagagtcaatcctaatagtgtttcccaa 1230436  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230437 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 1230467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 3629854 - 3630082
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||| | || |||||| ||||||||||    
T  3629854 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggg-gagagagcagccctcagtttcactatatt-attagtaactttacaaaaga 3629951  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||     
T  3629952 gatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaa 3630051  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3630052 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 3630082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 4816220 - 4816449
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  4816220 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaaaga 4816318  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  4816319 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaa 4816418  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4816419 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 4816449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30967526 - 30967297
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30967526 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagctctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 30967428  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  30967427 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtttcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 30967328  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30967327 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 30967297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32280322 - 32280092
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  32280322 cacaagagaattttttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttttactataacgatgagtaactttacaaaaga 32280223  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  32280222 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctgaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 32280123  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32280122 ggtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgt 32280092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Original strand, 1069710 - 1069913
Alignment:
Q  4 aaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagat 103  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1069710 aaaagaatttgttgattcagttcggtccaaattgacctagtatggggaagagagcagccctccgtttctctataatgatgagtaaccttacaaaagagat 1069809  T
Q  104 atcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggt 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  1069810 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 1069909  T
Q  204 gaat 207  Q
    ||||    
T  1069910 gaat 1069913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25477606 - 25477370
Alignment:
Q  2 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaacc-------ttac 94  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||        ||||    
T  25477606 acaaaagaatttgttgacccatttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaacgagtaacgttac 25477507  T
Q  95 aaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtt 194  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25477506 aaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtt 25477407  T
Q  195 tcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25477406 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 25477370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 14458756 - 14458983
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14458756 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 14458854  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  14458855 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 14458954  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14458955 g--gaatcagccctcaaaccctagtgtttgt 14458983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 28241310 - 28241539
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28241310 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 28241408  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  28241409 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 28241508  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28241509 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 28241539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 3233714 - 3233948
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttc-----gatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttaca 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||     | || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||  | |||||||| |||||    
T  3233714 cacaaaagaatttgttgacccagttcagttcggtcaaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccgtttcactatacgg-tgagtaacgttaca 3233812  T
Q  96 aaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3233813 aaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3233912  T
Q  196 cccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3233913 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 3233948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 30034592 - 30034821
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30034592 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacccagtctgggggagagagcagccctccgatccgctata-tgatgagtaacgttacaaaaga 30034690  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||     
T  30034691 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccttaaccaattgactcaatcctaatagtgtttcccaa 30034790  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30034791 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 30034821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 19704556 - 19704786
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaa-ag 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||    
T  19704556 cacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaagag 19704654  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttccc 198  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19704655 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttccc 19704754  T
Q  199 agggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttg 230  Q
    | ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19704755 aaggtgaatcaacccacaaactctagtgtttg 19704786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 14507165 - 14507393
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| | ||||||| |||| |||| | ||||||| ||    
T  14507165 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgataagtatcgttacaaa-ga 14507262  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  14507263 gaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 14507362  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14507363 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 14507393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26065306 - 26065081
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| | | ||||||| ||||||| ||    
T  26065306 cacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgatccactata-taacgagtaacgttacaaa-ga 26065210  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  26065209 gaagtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 26065110  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065109 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 26065081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26085275 - 26085050
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| | | ||||||| ||||||| ||    
T  26085275 cacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgatccactata-taacgagtaacgttacaaa-ga 26085179  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  26085178 gaagtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 26085079  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085078 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 26085050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14466649 - 14466418
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14466649 cacaagagaatttgctgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaacagcagtcatccggttcactataatgatgaataaccttacaaaaga 14466550  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||| || | || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  14466549 gatatcaatgagttacaagaatatgtctctcgcctaattctactcaaactcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 14466450  T
Q  201 ggtgaatcaaccctc-aaaccctagtgtttgt 231  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14466449 gatgaatcaatcctcaaaaccctagtgtttgt 14466418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 2628875 - 2629103
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||    
T  2628875 cacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaccgttacaaa-ga 2628972  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||| |   ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  2628973 gaaatcaatgggttacaagaataaattctccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 2629072  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2629073 ggtgaatcaacccttaaaacctagtgtttgt 2629103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 231
Target Start/End: Original strand, 20915351 - 20915574
Alignment:
Q  7 agaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||    
T  20915351 agaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa-gagaaatc 20915448  T
Q  107 aatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtga 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20915449 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccgaagtcccaatctcttctcgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 20915548  T
Q  206 atcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  20915549 atcaacccacaaaccctagtgtttgt 20915574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 30728813 - 30729046
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || | |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  30728813 cacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccttccgttccactataat-atgagtaactttacaaaaga 30728911  T
Q  101 ga----tatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 196  Q
    ||    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30728912 gaaagatatcaatgagttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccagcctcttcccgtaaccaagagagtcaatcctaatagtgtttc 30729011  T
Q  197 ccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30729012 ccaaggtgaatcaaccctcaaatcctagtgtttgt 30729046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 5273213 - 5273431
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||  | ||||||| |||| |||||    
T  5273213 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactataa-gatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaa 5273310  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5273311 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 5273410  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtt 228  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  5273411 caacccacaaaccctagtgtt 5273431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 15530166 - 15530340
Alignment:
Q  55 gagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctca 154  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||    
T  15530166 gagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg-gttacaagaataagtctcccgcctaattcaacccaaagcctca 15530263  T
Q  155 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15530264 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 15530340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 15541129 - 15541356
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||  ||||||||||   || ||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  15541129 cacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattaacctagtctggaggagagagcagctttctgtttcactata-tgatgaataactttacaaaaga 15541227  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  15541228 gatatcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaatcctacccaaagtcccaatctcttctcgtgaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaa 15541327  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15541328 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 15541356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 15532674 - 15532899
Alignment:
Q  4 aaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagat 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| | || || ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15532674 aaaagaatttgttgacctagttcagtcaaaattgacctagtctagg-gatagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagat 15532771  T
Q  104 atcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggt 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  15532772 atcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggt 15532871  T
Q  204 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  15532872 gaatcaaccctcaaaccctattgtttgt 15532899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 12186060 - 12186271
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||  | |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12186060 cacaaaataatttgtttacccagttcggttcaaattgacctagtccgaggcagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaaga 12186159  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcc-cgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| || |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12186160 gatatcaatgagttacaagaataagtctccaaacctaattgtacccaaagtctcaatctcttcccgtgaacaagagactcaatcctaatagtgtttccca 12186259  T
Q  200 gggtgaatcaac 211  Q
     |||||||||||    
T  12186260 aggtgaatcaac 12186271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 26932550 - 26932779
Alignment:
Q  1 cacaaaagaa-tttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaag 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |    
T  26932550 cacaaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-g 26932647  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttccc 198  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  26932648 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttctc 26932747  T
Q  199 agggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttg 230  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26932748 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttg 26932779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15719961 - 15719741
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtg-agagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15719961 aatttgtttaccaagttcggtccaaattgacctagtatggggggaaagagcaactctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 15719862  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  15719861 atgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaat 15719762  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||| |   |||||||||||||||    
T  15719761 caactc---aaccctagtgtttgt 15719741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 24338437 - 24338666
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||  ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||| |||| |||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24338437 cacaaaaatatttgtttacctagttcggtccaaattgacatagtctgggggagag--cagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaaga 24338534  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | | ||| ||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||     
T  24338535 gatatcaatgggttacaagaataagtcttctgactaattctacccaaagtcttaatctctttccataaccaaaagactcaatcttaatagtgttttccaa 24338634  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaa-ccctagtgtttgt 231  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  24338635 ggtaaatcaaccctcaaacccctagtgtttgt 24338666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 16455421 - 16455625
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16455421 aatttgtttactcagttcggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatca 16455520  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| | ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  16455521 aagggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgagcaagagacttaatcctaacagtgtttcccaaggtgaat 16455620  T
Q  208 caacc 212  Q
    |||||    
T  16455621 caacc 16455625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 54 - 231
Target Start/End: Original strand, 3027895 - 3028070
Alignment:
Q  54 agagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctc 153  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  3027895 agagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataaatctccagcctaattctactcaaagtctc 3027994  T
Q  154 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  3027995 aatctcttcacgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgt 3028070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Original strand, 12195515 - 12195732
Alignment:
Q  12 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgt 111  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||||     
T  12195515 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgg 12195612  T
Q  112 gttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12195613 gttacaagaataagtctcccgattaattctactcaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 12195712  T
Q  211 ccctcaaaccctagtgtttg 230  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  12195713 cccacaaaccctagtgtttg 12195732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 12161547 - 12161775
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| | || |||||| ||| | ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12161547 cacaaaataatttgttgattcagttcggtccaaattaacctagtttagg-gagagaacagccatccattttactata-tgatgagtaaccttacaaaaga 12161644  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| | || || |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  12161645 gatatcaatgggttacaagaataaatctcccacttaattatacctaaagtctcaatctcttcccgtaaccaatagactcgatcttaatagtgtttcccaa 12161744  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12161745 cgtgaaacaaccctcaaaccctagtgtttgt 12161775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Original strand, 26066121 - 26066307
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| ||||||||  |||| |||||| ||||||| |||| |||||    
T  26066121 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatt-tgataagtaacgttacaaa-gagaaatcaa 26066218  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 196  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26066219 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 26066307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15367349 - 15367130
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggt-gagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||| | |||||| ||||||| |||||| |||| |||||| |||||||| |    
T  15367349 aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagagcagccttccgtttcactata-tgatgaataactttacaatagagatatta 15367251  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  || || |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  15367250 atgggttacaagaataagtctcccgattaattttacccaaagtttcaatctcttcccgcgacgaagagactcaatcctaagagtgtttcccaaggtgaat 15367151  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  15367150 caaccc---aaccctagtgtttgt 15367130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 71 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22490896 - 22490736
Alignment:
Q  71 cactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaacc 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  22490896 cactataatgatgagtaatcttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcataattctacccaaagtcccaatctctttccgtaacc 22490797  T
Q  171 aagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||    ||||||||||||||||||||    
T  22490796 aagagactcaatcctaatagtgtttcgcaaggtgtatacctcctcaaaccctagtgtttgt 22490736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 29754698 - 29754892
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  29754698 cacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-ga 29754795  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 196  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29754796 gaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacctaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 29754892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 33309173 - 33308988
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  33309173 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaa 33309076  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 196  Q
    || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33309075 tgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 33308988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Original strand, 26068392 - 26068578
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||||| |||| |||||    
T  26068392 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagcaacgttacaaa-gagaaatcaa 26068489  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 196  Q
    || |||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26068490 tgggttacaagaataagtctcccacctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaagcaagagactccaatcctaatagtgtttc 26068578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 33311442 - 33311257
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  33311442 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaaagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaa 33311345  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 196  Q
    || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33311344 tgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 33311257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26945463 - 26945258
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||  |||| || | |||| | |||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26945463 aatttgtttacccagttcggtccaaacctgacataatctgggggggagagctgcccttcgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 26945364  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaa 206  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |   |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||     
T  26945363 atgagttacaaaaataagtctacaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgac 26945264  T
Q  207 tcaacc 212  Q
    ||||||    
T  26945263 tcaacc 26945258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 230
Target Start/End: Original strand, 19227514 - 19227625
Alignment:
Q  119 gaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaa 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19227514 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaa 19227613  T
Q  219 ccctagtgtttg 230  Q
    ||||||||||||    
T  19227614 ccctagtgtttg 19227625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 73 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17012294 - 17012138
Alignment:
Q  73 ctataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaa 172  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||||||||| ||| |||||    
T  17012294 ctataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagcatcaatctcttctcgtgaccaa 17012195  T
Q  173 gagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17012194 gagactcaatcctaatattgtttcagaaggtgaatcaa-cctc-aaccctagtgtttgt 17012138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19696759 - 19696556
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||   || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19696759 aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggagagagagcagctatctgttccactataatgatgaataactttacaaaagagatatca 19696660  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaa 206  Q
    | |  ||||||||||||||| ||   |||| ||||| ||| |||||||||||||| | || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  19696659 aaggattacaagaataagtcttcaaacctaattctaaccaaagtctcaatctctttcagtgacaaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaa 19696560  T
Q  207 tcaa 210  Q
    ||||    
T  19696559 tcaa 19696556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 22857949 - 22858171
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  22857949 aatttgtttacacagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gatatatca 22858047  T
Q  108 at-gtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtga 205  Q
    |  | ||||||||||| ||||| |   ||||  |||||| | |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22858048 aaagggttacaagaattagtcttcaaacctaaatctacctaaagtctcaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtga 22858147  T
Q  206 atcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||    
T  22858148 atcaa-tctc-aaccctagtgtttgt 22858171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Original strand, 25465587 - 25465710
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25465587 aatttgtttacccagttcggtccaatactgacatagtatgggagagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatca 25465685  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtctcccg 132  Q
    | | | |||||||||||||||||||    
T  25465686 aaggggtacaagaataagtctcccg 25465710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 210
Target Start/End: Original strand, 25078554 - 25078755
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25078554 aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagactggga-agaaagcagtcctccgttccactgtaatgacgagtaactttacaaaagagatatca 25078652  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaa 206  Q
    | | |||||||||||||||| ||   |||| ||||||  | | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||  |||||| ||| ||||||    
T  25078653 aagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctactta-aatctcaatctctttccgtgaccaagagactcaatcttaacggtgtttaccaaggtgaa 25078751  T
Q  207 tcaa 210  Q
    ||||    
T  25078752 tcaa 25078755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15346664 - 15346541
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  15346664 aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctttccgtttcactat-atgatgaataactttacaatagagatatcaa 15346566  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgc 133  Q
    || ||||||||||||||||| ||||    
T  15346565 tgggttacaagaataagtcttccgc 15346541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 30445815 - 30445723
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtct 128  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  30445815 tgacctagtatggtggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaattagtct 30445723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20527083 - 20526903
Alignment:
Q  49 gtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccag 147  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||| |   |||| ||||||| |     
T  20527083 gtgagagagcagctctccgttccactataatgatgaataactttacaaa-gagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctaccaaa 20526985  T
Q  148 agtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||| |||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  20526984 agtcttaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa-tctc-aaccctagtgtttgt 20526903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 10584321 - 10584227
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttaca 95  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10584321 cacaaaaaaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttaca 10584227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 209
Target Start/End: Original strand, 28037722 - 28037927
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgt---tccactataatgatgagtaaccttacaaaagagata 104  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||  |||| |||||||||| | | |||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28037722 aatttgtttacccagctcggtccaaaactgacctagactgggggagagagcagcctttcgtccgtccactattatgatgagtaactttacaaaagagata 28037821  T
Q  105 tcaatgtgttacaagaataag-tctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggt 203  Q
    |||| | |||||||||||||| | |    |||| ||||||||| ||||||||||| || |||| | |||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  28037822 tcaaagggttacaagaataagattttaaacctaattctacccaaagtctcaatctatttccgtgaacaagggactcaatcctaacagtgtttcccaaggt 28037921  T
Q  204 gaatca 209  Q
    ||||||    
T  28037922 gaatca 28037927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Original strand, 12911442 - 12911629
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaatt-gacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||   |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  12911442 aatttgtttacccggttcgttccaaaacagacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatta 12911540  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |   ||||||||||| || | ||   ||||  |||||| | ||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  12911541 aatggttacaagaattagccttcaaacctaactctaccaaaagtctcaatctattatcgtgactaagagactcaatcttaatagtgttt 12911629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Original strand, 12937190 - 12937376
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaatt-gacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||   |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  12937190 aatttgtttacccggttcgttccaaaacagacctagtctggg-gagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatta 12937287  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |   ||||||||||| || | ||   |||| ||||||| | ||| ||||||| ||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  12937288 aatggttacaagaattagccttcaaacctaattctaccaaaagtttcaatctattctcgtgactaagagactcaatcttaatagtgttt 12937376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 128
Target Start/End: Original strand, 28078215 - 28078310
Alignment:
Q  32 aaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtct 128  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  28078215 aaattgacctagtatgagggagagagcagtcttataatccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaag-gttacaagaataagtct 28078310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 3833540 - 3833481
Alignment:
Q  64 tccgttccactataatgatgagt-aaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3833540 tccgttccactataatgatgagttaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaat 3833481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 196
Target Start/End: Original strand, 7542525 - 7542567
Alignment:
Q  154 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 196  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7542525 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc 7542567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 192
Target Start/End: Original strand, 22351877 - 22352031
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccg 132  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  | |||| ||||||||||   || |||||| |||| |||| ||       
T  22351877 tgacctagtctgggggagagagcagttctccgttccactataatgatatgagtttctttac-aaagagatat---tgagttacatgaatcagtcttcaaa 22351972  T
Q  133 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 192  Q
    |||| ||||||||| | |||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22351973 cctaattctaccca-aatctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 22352031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 11262777 - 11262678
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||  | |||| ||||||||||||    
T  11262777 aatttgtttaccccgttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagttctccgttacaatataatgatgagtttctttac-aaagagatatca 11262679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13878883 - 13878727
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 133  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  13878883 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 13878788  T
Q  134 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13878787 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13878727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16786075 - 16785919
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 133  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  16786075 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 16785980  T
Q  134 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16785979 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16785919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 192
Target Start/End: Original strand, 17694846 - 17695030
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat-gagtaaccttacaaaagagat 103  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||  | |||| ||||||||    
T  17694846 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctaggggagagagcagctctccgttccactataatgatatagtttctttac-aaagagat 17694944  T
Q  104 atcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 192  Q
    ||   || ||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17694945 at---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17695030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11138496 - 11138423
Alignment:
Q  138 ttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccagggtgaatcaa 210  Q
    ||||||| | |||| | |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11138496 ttctacctaaagtccccatctcttcccgtgaccaagtgactcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 11138423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 25941857 - 25941780
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 82  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25941857 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 25941780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 33216015 - 33215938
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 82  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   |||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33216015 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtatgggggatagagcagctctccgttccactataatgat 33215938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13883631 - 13883475
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 133  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   |||  || ||||||| ||||| |   |    
T  13883631 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgaatttcaagaatcagtcttcaaac 13883536  T
Q  134 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13883535 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13883475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Original strand, 31248740 - 31248896
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 133  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  31248740 tgacctagtataggggagagagtagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 31248835  T
Q  134 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  31248836 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 31248896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 195
Target Start/End: Original strand, 3577658 - 3577696
Alignment:
Q  157 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3577658 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3577696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 183
Target Start/End: Original strand, 5165936 - 5165985
Alignment:
Q  133 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatc 183  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5165936 cctaattctaccca-agtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatc 5165985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 192
Target Start/End: Original strand, 19701988 - 19702041
Alignment:
Q  138 ttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 192  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19701988 ttctaccca-agtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 19702041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 195
Target Start/End: Original strand, 26887368 - 26887406
Alignment:
Q  157 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26887368 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 26887406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 195
Target Start/End: Original strand, 35201470 - 35201508
Alignment:
Q  157 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  35201470 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 35201508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 82
Target Start/End: Original strand, 3577484 - 3577560
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 82  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3577484 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctggg-gagagagcagctctccgttccactataatgat 3577560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Original strand, 22870100 - 22870196
Alignment:
Q  10 atttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| |  ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||    
T  22870100 atttgttcacccagttcggtccaatactgacctact--gggagagagagaagctctccgttccactataatgatgagtttctttac-aaagagatatcaa 22870196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 106)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 17324627 - 17324856
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17324627 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 17324725  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  17324726 gatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 17324825  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324826 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 17324856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25128163 - 25127933
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  25128163 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtcctaattgacctagtatgggagagagagcagccctccgtttcaatataatgatgagtaaccttacaaaaga 25128064  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||     
T  25128063 gatatcaatgaattacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatccaaatagtgtttcacaa 25127964  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25127963 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 25127933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13215375 - 13215142
Alignment:
Q  2 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagag 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13215375 acaaaagaatttgttgacgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaaatttacaaaagag 13215276  T
Q  102 a----tatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 197  Q
    |    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13215275 aaaaatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 13215176  T
Q  198 cagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13215175 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 13215142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16428944 - 16428714
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16428944 cacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactaaaatgatgagtaaccttacaaaaga 16428845  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  16428844 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaa 16428745  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16428744 ggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgt 16428714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18839874 - 18839648
Alignment:
Q  5 aaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagata 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839874 aaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagata 18839775  T
Q  105 tcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtg 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18839774 tcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcattctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 18839675  T
Q  205 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||    
T  18839674 aatcaaccctaaaaccctactgtttgt 18839648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 50076663 - 50076892
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50076663 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctggg-gagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaaga 50076761  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  50076762 gatatcaatggattacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaattcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 50076861  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076862 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 50076892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 50307540 - 50307766
Alignment:
Q  4 aaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  50307540 aaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagat 50307638  T
Q  104 atcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggt 203  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  50307639 gtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 50307738  T
Q  204 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50307739 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 50307766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 10399819 - 10400048
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10399819 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 10399917  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  10399918 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 10400017  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10400018 ggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgt 10400048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 9241079 - 9241306
Alignment:
Q  4 aaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagat 103  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9241079 aaaagaatttgtttccccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagat 9241178  T
Q  104 atcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggt 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||    
T  9241179 atcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaataatgttttccaaggt 9241278  T
Q  204 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9241279 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 9241306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 31425006 - 31425238
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31425006 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggg-gagagagcagccttccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaaga 31425104  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagag---actcaatcataatagtgtttcc 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||| |    
T  31425105 gatatcaatgagttacaagaataagcctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagatcactcaatcctaatagtgttttc 31425204  T
Q  198 cagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31425205 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 31425238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 12302496 - 12302725
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12302496 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 12302594  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  12302595 gatgtcaatgagttataagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 12302694  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302695 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 12302725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 51750329 - 51750100
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  51750329 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 51750231  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  51750230 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 51750131  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51750130 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 51750100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 25248542 - 25248766
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25248542 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagggagcagtcctccgtttcactataattatgagtaaccttacaaaaga 25248641  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||     
T  25248642 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcctgtaaccgagagacttaatcctaatagtgttttccaa 25248741  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  25248742 ggtgaatcaaccctcaaaccctagt 25248766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15823836 - 15823607
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  15823836 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactata-tgatgagtaacgttacaataga 15823738  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  15823737 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatattaatagtgtttcccaa 15823638  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15823637 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 15823607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 25251265 - 25251495
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||  |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25251265 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtattggggagagagcaaccctctgtttcactataatgataagtaaccttacaaaaga 25251364  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |     
T  25251365 tatatcaatgggttacaagaataagttttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccgagagactcaatcctaatagtgtttcctaa 25251464  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25251465 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 25251495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 11457466 - 11457689
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11457466 cacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagacatccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaaga 11457564  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11457565 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaacccccaatctcttcgcgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaa 11457664  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11457665 ggtgaatcaaccctcaaaccctagt 11457689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 38925472 - 38925698
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||  |||||   |||||||||| ||||||||||    
T  38925472 cacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgttttactat---gatgagtaacgttacaaaaga 38925567  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  38925568 gatatcaatgggttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaa 38925667  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38925668 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 38925698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 15294825 - 15295054
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15294825 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 15294923  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  15294924 gaaatcaatgggttacaagaataaatctcccacctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 15295023  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15295024 ggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgt 15295054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18307399 - 18307170
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18307399 cacaaaagaatttgttgactccgttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccatccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaaga 18307301  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  18307300 gatatcaatgcgtcacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccga 18307201  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18307200 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 18307170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28840969 - 28840741
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  28840969 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-ga 28840872  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  28840871 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 28840772  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28840771 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 28840741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40134235 - 40134005
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40134235 cacaaaagaatttgtttacctagtccggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccatccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaaga 40134136  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||     
T  40134135 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaaacctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctagtagtatttcccaa 40134036  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40134035 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 40134005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47906560 - 47906331
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  47906560 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccaagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 47906462  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  47906461 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaa 47906362  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47906361 ggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgt 47906331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16432686 - 16432455
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtat-gggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaag 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16432686 cacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagtccgccgtttcactataatgatgagtaacattacaaaag 16432587  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  16432586 agatatcaatgggttacaagaataattgtcccgcataattctacccaaagtttcaatctcttcccataaccaagagattcaatcctaataatgtttccca 16432487  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16432486 aggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 16432455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39932364 - 39932134
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtga-gagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  39932364 cacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtatgggggaagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtatcgttacaaaag 39932266  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  39932265 agaaatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagtctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttccca 39932166  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  39932165 aggttaatcaaccctcaaaacctagtgtttgt 39932134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 17186118 - 17186348
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17186118 cacaaaagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactccgttccattataatgatgagtaactttacaaaaga 17186217  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  17186218 gatattaatgggttacaagaataagtctcccttctaattctacccaaagttcaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctgatagtgtttcccaa 17186317  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17186318 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 17186348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 31735512 - 31735741
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  31735512 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaaga 31735610  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  31735611 gaaatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaaccttaatagtgtttcccaa 31735710  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31735711 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 31735741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39462809 - 39462580
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||    
T  39462809 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactata-tgatgaataacttttcaaaaga 39462711  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  39462710 gatatcaaagggttacaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 39462611  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  39462610 ggtgaatcaaccctaaaaacctagtgtttgt 39462580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 50078811 - 50079041
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  50078811 cacaaaagaatttgtttaccaaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgttccactataatgatgaataactttacaaaaga 50078910  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||     
T  50078911 gatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgttttccaa 50079010  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50079011 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 50079041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6823304 - 6823081
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  6823304 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaaga 6823206  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  6823205 gaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaa 6823106  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagt 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  6823105 ggtgaatcaacccacaaaccctagt 6823081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 6995691 - 6995920
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  6995691 cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttataaaaga 6995789  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  6995790 gatgtcaatgagttacaagaaaaagtatcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaa 6995889  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6995890 ggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgt 6995920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 27336931 - 27337159
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  27336931 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-ga 27337028  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  27337029 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagacccaatcctaatagtgtttcccaa 27337128  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27337129 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 27337159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6756815 - 6756589
Alignment:
Q  4 aaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtg-agagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagaga 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6756815 aaaagaatttgttgatccagttcggtccaaactgacctagtctggggggagagagcagtcttccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagaga 6756716  T
Q  103 tatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaggg 202  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  6756715 tatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtaatca--agactcaatcctaatagtgtttcccaagg 6756618  T
Q  203 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6756617 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 6756589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 14097960 - 14098190
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaacctt-acaaaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  14097960 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgtgggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgtttacaaaag 14098058  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14098059 agatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaag-ctctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttcc 14098157  T
Q  199 agggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14098158 aaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgt 14098190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 3579608 - 3579836
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||| || |||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  3579608 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcaatcatccgtttcacta--atgatgagtaactttacaaaaga 3579705  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| || | ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |     
T  3579706 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagccccaatctctttccgtaatcaagagactcaatcctaattgtgtttcctaa 3579805  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3579806 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 3579836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16429248 - 16429050
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16429248 cacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcgctataatgatgagtaaccttacaaaaga 16429149  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16429148 gatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaattcccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttccca 16429050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17324349 - 17324124
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagt-atgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagata 104  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17324349 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtcatggg-gagagaccagccttccgtttcactataatgatgaataaccttacaaaagagata 17324251  T
Q  105 tcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtg 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||  |||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  17324250 tcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagttccaatctcttcccatattcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 17324151  T
Q  205 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  17324150 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 17324124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 46431697 - 46431927
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtg--agagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |  ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||     
T  46431697 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaa- 46431794  T
Q  99 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 198  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46431795 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccatcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 46431894  T
Q  199 agggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46431895 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 46431927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 28998244 - 28998471
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||  |||| ||| ||| ||| ||||||||||| || |||||||    
T  28998244 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccata-tgatgagtaacgttgcaaaaga 28998342  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  28998343 gatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 28998442  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998443 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 28998471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 29003960 - 29004187
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||  |||| ||| ||| ||| ||||||||||| || |||||||    
T  29003960 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccata-tgatgagtaacgttgcaaaaga 29004058  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  29004059 gatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 29004158  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004159 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 29004187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 2510316 - 2510544
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  2510316 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaactttacaagaga 2510414  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |     
T  2510415 gaaatcaatgggttacaagaataagtctct-gcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttccaaa 2510513  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2510514 ggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgt 2510544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2617806 - 2617577
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2617806 cacaaaataatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 2617708  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  2617707 gaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 2617608  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2617607 ggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgt 2617577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13762126 - 13761898
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  13762126 cacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagaagccctccggtccactata-tgatgagtaacgttacaaa-ga 13762029  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  13762028 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagactcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaa 13761929  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13761928 gttgaatcaacccccaaaccctagtgtttgt 13761898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20302748 - 20302520
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||| ||    
T  20302748 cacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagtagtcctccgatccactatc-tgatgagtatcgttacaaa-ga 20302651  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  20302650 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 20302551  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20302550 ggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgt 20302520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24325953 - 24325724
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||| |||||||||| | | || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24325953 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacttagtctgggggagagagcagccattcgattcactata-tgatgagtaacattacaaaaga 24325855  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  24325854 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaa 24325755  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24325754 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 24325724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 27339122 - 27339350
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  27339122 cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagatcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-ga 27339219  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  27339220 gaaatcaatgggttacaagaataagtcgcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaactaagagactcaatcgtaatagtatttcccaa 27339319  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27339320 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 27339350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31490202 - 31489974
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  31490202 cacaaaagaatttgttgatctagttcagtccaaattgacctagtctggggg-gagagcagccctccgtttcaccata-tgatgaataaccttacaaaaga 31490105  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||     
T  31490104 gatatcaatgagttacaagaataagtcttccgcctaattctatccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagaaattcaatcctaatagtgtttcccaa 31490005  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31490004 ggtgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgt 31489974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41647210 - 41646981
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||   |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41647210 cacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctgatggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 41647112  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  41647111 gatatcaatgagttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtcgcaatctcttcccgtaaccaagtgactcaatcctaatagtgtttcccaa 41647012  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||| | ||| || |||||||||    
T  41647011 ggtgaatcaaccataaaaaccaagtgtttgt 41646981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 51752653 - 51752426
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| || |||||| | ||||||| ||    
T  51752653 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tggtgagtatcgttacaaa-ga 51752556  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  51752555 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatc-taatagtgtttcacaa 51752457  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51752456 ggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgt 51752426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 4131366 - 4131599
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaag- 99  Q
    |||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  4131366 cacaaaagaatttgttgacatagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaaga 4131465  T
Q  100 ---agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 196  Q
       ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4131466 gaaagatatcaatgggttacaagaataagtttctcgcctaattctacccaaagtc-cagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 4131564  T
Q  197 ccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4131565 ccaaggtaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 4131599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 2949223 - 2949451
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2949223 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcgggg-gagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 2949320  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||     
T  2949321 gatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctattctcgtaaacaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 2949420  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2949421 ggtgaatcaaccatcaacccctagtgtttgt 2949451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28842784 - 28842556
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  28842784 cacaatagaatttgttgacctagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagattagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaa-ga 28842687  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     
T  28842686 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaatagactcaatcctaatagtgtttcccaa 28842587  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28842586 tgtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 28842556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 50248561 - 50248792
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagag--cagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| | || |||||||  ||  | || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50248561 cacaaaagaatttgttgacccaattcggaccaaattgacctagtctaggggagagagaacaaccatctgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaa 50248659  T
Q  99 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 198  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50248660 gagatgtcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtctcgatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 50248759  T
Q  199 agggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50248760 aatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 50248792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 31422851 - 31423091
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccac------------tataatgatgagtaa 88  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||| |||            |||||||||||||||    
T  31422851 cacaaaagaatttgttcacccagctcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctctgtttcaccctctctttcactataatgatgagtaa 31422950  T
Q  89 ccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataat 188  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  31422951 ccttacaaaagagatgtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaattctaat 31423050  T
Q  189 agtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31423051 agtgtttcccaaggtgaatcaactttcaaaccctagtgttt 31423091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Original strand, 9459416 - 9459635
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||    
T  9459416 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaa 9459513  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagac-tcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  9459514 tgggttacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 9459613  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgttt 229  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  9459614 caacccacaaaccctagtgttt 9459635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Original strand, 9463243 - 9463462
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||    
T  9463243 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaa 9463340  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagac-tcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  9463341 tgggttacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 9463440  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgttt 229  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  9463441 caacccacaaaccctagtgttt 9463462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 14183581 - 14183810
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaag 99  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14183581 cacaaaaaaatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaag 14183680  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  14183681 agatatcaatgggttgcaagaataagtcttccgcctaattctacccaaaattctaatctcttcccgtaaccaagagactcaattataatagtgttttcca 14183780  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     ||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  14183781 aggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgt 14183810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 28207059 - 28207286
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||    
T  28207059 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcact---atgatgagtaacgttacaaaaga 28207155  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||  || || | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  28207156 gatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcgtaattatattcaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagacacaatcctaatagtgtttcccaa 28207255  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  28207256 ggtgaataaactctcaaaccctagtgtttgt 28207286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17319177 - 17318954
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  17319177 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctagg-gagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaacttaacaaaaga 17319079  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||||||     
T  17319078 gatatcaataagttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctgttcccgtaaccaagagactcaatc------ctgtttcccaa 17318985  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17318984 ggtgaatcaaccttccaaccctagtgtttgt 17318954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 42922514 - 42922293
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42922514 aatttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtcctccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatca 42922415  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||    
T  42922414 atgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcgcaaggtgaat 42922315  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||| |||| |||||||||||||||    
T  42922314 caa-cctc-aaccctagtgtttgt 42922293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16226448 - 16226228
Alignment:
Q  10 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||||||    
T  16226448 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 16226351  T
Q  110 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatc 208  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16226350 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 16226251  T
Q  209 aaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  16226250 aacccacaaaccctagtgtttgt 16226228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 231
Target Start/End: Original strand, 15669419 - 15669612
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcct 135  Q
    ||||||||| | || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15669419 tgacctagtctcggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtagctttacgagagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct 15669518  T
Q  136 atttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  15669519 aattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgt 15669612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 6115093 - 6115304
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6115093 cacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcattccgtttcactataatgatgagtaattttacaaaaga 6115192  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||  ||     
T  6115193 gatatcaattggttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttttcaa 6115292  T
Q  201 ggtgaatcaacc 212  Q
    ||||||||||||    
T  6115293 ggtgaatcaacc 6115304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20291743 - 20291518
Alignment:
Q  4 aaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||| ||  |||||| ||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||     
T  20291743 aaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtgtgggggagagaacaaccctccgatccactata-tgatgagaatcgttacaaa-gagaa 20291646  T
Q  104 atcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggt 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  20291645 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 20291546  T
Q  204 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20291545 gaatcaaccctcaaaacttagtgtttgt 20291518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 214
Target Start/End: Original strand, 8347298 - 8347476
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcct 135  Q
    ||||||||| | || || ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8347298 tgacctagtctaggggaaagagcatccctccgttccactataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct 8347397  T
Q  136 atttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccct 214  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  8347398 aattctactcaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatcaaccct 8347476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47179993 - 47179779
Alignment:
Q  10 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||||||    
T  47179993 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggg-gagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 47179897  T
Q  110 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatc 208  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  47179896 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 47179797  T
Q  209 aaccctcaaaccctagtg 226  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  47179796 aacccacaaaccctagtg 47179779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 51 - 231
Target Start/End: Original strand, 21948229 - 21948407
Alignment:
Q  51 gagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagt 150  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  21948229 gagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 21948327  T
Q  151 ctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    | ||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21948328 cccagcgtcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt-ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 21948407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 65 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 48665404 - 48665238
Alignment:
Q  65 ccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttccc 164  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||    
T  48665404 ccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttccc 48665306  T
Q  165 -gtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48665305 ggtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 48665238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47177642 - 47177428
Alignment:
Q  10 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||||||    
T  47177642 atttgttgacccagttcgatccaatctgacctagtctggg-gagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 47177546  T
Q  110 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatc 208  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  47177545 gggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcccatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 47177446  T
Q  209 aaccctcaaaccctagtg 226  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  47177445 aacccacaaaccctagtg 47177428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16231843 - 16231630
Alignment:
Q  10 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 109  Q
    ||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||||||    
T  16231843 atttgttgacc-agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 16231747  T
Q  110 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatc 208  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16231746 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaggctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 16231647  T
Q  209 aaccctcaaaccctagt 225  Q
    ||||| |||||||||||    
T  16231646 aacccacaaaccctagt 16231630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 51757820 - 51757624
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| || |||||| | ||||||| ||    
T  51757820 cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tggtgagtatcgttacaaa-ga 51757723  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    || ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51757722 gaaatcgataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 51757624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23786121 - 23785935
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  23786121 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaa 23786024  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 196  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23786023 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23785935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 47451919 - 47451751
Alignment:
Q  14 gttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgt 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  47451919 gttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcattcgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagt 47451821  T
Q  114 tacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatc 183  Q
    |||||||| |||| ||||||||| || |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47451820 tacaagaaaaagtttcccgcctaattttacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatc 47451751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 213
Target Start/End: Original strand, 18800600 - 18800775
Alignment:
Q  38 acctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctat 137  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||     
T  18800600 acctagtttgggggagagagcagttctccgcttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggatacaagaataagtgtcccgcctaa 18800699  T
Q  138 ttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccc 213  Q
    ||||||||| |||   ||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18800700 ttctacccaaagttcaaatctctacccgtgacctagagactcaatcctaatagtgtttctcagggtgaatcaaccc 18800775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23816176 - 23816027
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23816176 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcatccctccgatccattata-tgatgagtaacgttacaaaaga 23816078  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtc 151  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23816077 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 23816027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 211
Target Start/End: Original strand, 49495206 - 49495411
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 105  Q
    |||||||| || ||| |||||| || |||||||| |||| | || ||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49495206 aagaatttctttacctagttcggtctaaattgacatagtcttggggagagataagcccttcgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatat 49495305  T
Q  106 caatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtga 205  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||| ||||| |||||||||  || |||||||||||| |||||    
T  49495306 caatgggttacaagaatgagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttaccgtgaccaaaagactcaattttattagtgtttcccaaggtga 49495405  T
Q  206 atcaac 211  Q
    ||||||    
T  49495406 atcaac 49495411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Original strand, 30790401 - 30790602
Alignment:
Q  11 tttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 109  Q
    |||||| | |||||||| ||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30790401 tttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctggga-agagagcagtcatccattccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 30790499  T
Q  110 gtgttacaagaataagtctcc-cgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatc 208  Q
    | |||||||||||||||||||   |||| |||||| || |||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  30790500 gggttacaagaataagtctccaaacctaattctacacaaagtctccatctcttcgcgtaaccaaaagactc-atcctaacagtgtttcccaaggtaaatc 30790598  T
Q  209 aacc 212  Q
    ||||    
T  30790599 aacc 30790602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16561751 - 16561545
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||| |  | |||||||||  |||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16561751 aatttgtttacacagttcggtccaatactgacctagtctatgggagagagcaaccctttgttccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatca 16561652  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaa 206  Q
    | | ||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16561651 aagggttacaagaataagtcttcaaacctatttctacccaaagtctcaatctatttccgtggccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 16561552  T
Q  207 tcaaccc 213  Q
    |||||||    
T  16561551 tcaaccc 16561545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 68 - 231
Target Start/End: Original strand, 8349109 - 8349270
Alignment:
Q  68 ttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgta 167  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||  |||||||||||||     
T  8349109 ttccactataatgatgagtaacttaacaaaagagataccaatgagttacaagaataagtcacccgcctaattctacctaaagtcctaatctcttcccgtg 8349208  T
Q  168 accaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||  | |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  | |||||||||||||||    
T  8349209 accatcaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaataaacc--ccaaccctagtgtttgt 8349270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 231
Target Start/End: Original strand, 13125483 - 13125677
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcc 134  Q
    |||||||||| ||| | |||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||   ||    
T  13125483 tgacctagtaagggggggagagcaactctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacc 13125582  T
Q  135 tatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    || ||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||| ||| || ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  13125583 taattctacccaaagtcccaatctcttcccttgaccaagagcctcaatcctaacagcgtttcccaatgtgaatcaa-cctc-aaccctagtgtttgt 13125677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 210
Target Start/End: Original strand, 30738653 - 30738830
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataat--gatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg- 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |       
T  30738653 tgacctagtatgggtgagagagcatccctccgtttcactataatatgatgagtaactttacaaaagagacatcaaagggttacaagaataagtcttcaaa 30738752  T
Q  133 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 210  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  30738753 cctaattctacccaaaatcccaatctcttcctatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 30738830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6824091 - 6823946
Alignment:
Q  93 acaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaacc-------aagagactcaatcat 185  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||       |||||| |||||| |    
T  6824091 acaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctgccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaacccgtaaccaagagattcaatcgt 6823992  T
Q  186 aatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6823991 aatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 6823946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 210
Target Start/End: Original strand, 26613237 - 26613440
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| |||||||||| || || | ||||||| | |||| ||||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  26613237 aatttgtttacccagttcggtcaaatactgacctaatctgggggagagagaagctctctgttccactataatgattagtaactttccaaaagagatatca 26613336  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaa 206  Q
    | | |||||||||||||||| ||   |||| ||||||||| || ||||||||||||| || |||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  26613337 aagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagcctcaatctcttcctgtgaccaagtgactcaatccgaatagtgtttcccaaggtgaa 26613436  T
Q  207 tcaa 210  Q
    ||||    
T  26613437 tcaa 26613440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 155963 - 155788
Alignment:
Q  34 attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg- 132  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||   ||||||||||| | ||| |       
T  155963 attgacctagtttggg-gagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagataacaaaaggttacaagaattactcttcaaa 155866  T
Q  133 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 210  Q
    |||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  155865 cctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 155788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 15916674 - 15916562
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaa-ttgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  15916674 aatttgtttacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgacgagtaactttataaaagagatatca 15916575  T
Q  108 atgtgttacaaga 120  Q
    ||| |||||||||    
T  15916574 atgggttacaaga 15916562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27916780 - 27916557
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27916780 aatttgtttacccaattcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataacgatgagtaactttac-aaagagatatca 27916682  T
Q  108 atg--tgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtg 204  Q
    | |   |||| |||||| |||| ||   |||| ||| ||||| |||| ||||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||    
T  27916681 aagaaggttaaaagaattagtcttcaaacctaattccacccaaagtcacaatctcttcatgtgaccaagagactcaattctaatagtgttttccaaggtg 27916582  T
Q  205 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||   || |||||||||||||||    
T  27916581 aatcaa--ttccaaccctagtgtttgt 27916557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 68 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28279490 - 28279327
Alignment:
Q  68 ttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgt 166  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| ||   |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  28279490 ttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatgccaatgagttacaagaattagtcttcaaacctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgt 28279391  T
Q  167 aaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     |||||||  ||||||| |||||||||||| ||| || ||||||| |  | |||||||||||||||    
T  28279390 gaccaagaagctcaatcctaatagtgtttctccaaggggaatcaatc--ccaaccctagtgtttgt 28279327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 13358863 - 13358787
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  13358863 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata 13358787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 63 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 43104390 - 43104245
Alignment:
Q  63 ctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaag-aataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctct 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || || || ||   |||| ||||||||| ||| ||||| |||    
T  43104390 ctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaaaaaaatcttcaaacctaattctacccaaagtttcaatgtct 43104291  T
Q  161 tcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaa 206  Q
    ||| || ||||| |||||||||  ||||||||||| ||| ||||||    
T  43104290 tcctgtgaccaaaagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaa 43104245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 192
Target Start/End: Original strand, 21353342 - 21353525
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagata 104  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||  ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  | |||| |||||||||    
T  21353342 aagaatttgtttacccagttcggtctaaagatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatgagtttctttac-aaagagata 21353440  T
Q  105 tcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 192  Q
    |   || ||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  21353441 t---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 21353525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 212
Target Start/End: Original strand, 26520119 - 26520321
Alignment:
Q  10 atttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||  ||||||| | |||| || ||||||  |||||||||||||||||| || || ||| ||||        ||||||    
T  26520119 atttgtttacccagtttggtccaaaactgacctaatttgggggaaagagcaaccctccgttccactataattataagcaactttac--------tatcaa 26520210  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaac------caagagactcaatcataatagtgtttcccagg 201  Q
    || ||||||||||||||| |||   |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26520211 tgggttacaagaataagtttccaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgactgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaag 26520310  T
Q  202 gtgaatcaacc 212  Q
    |||||||||||    
T  26520311 gtgaatcaacc 26520321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14353190 - 14353047
Alignment:
Q  66 cgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctc-aatctcttccc 164  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||| | |||||||||||| || ||   |||| ||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  14353190 cgttccactataatgatgaataactttacaaaaga--tttcaaagggttacaagaata-gtttcaaacctaattctacccaaagtctcgaatctctttcc 14353094  T
Q  165 gtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccagggtgaatcaa 210  Q
    || ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14353093 gtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 14353047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 105
Target Start/End: Original strand, 13127685 - 13127782
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 105  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||| | | ||||||| |||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13127685 aatttgtttacccggttcggtccaatactaacctagtctggaggagagagcagctctccgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatat 13127782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 210
Target Start/End: Original strand, 26332616 - 26332688
Alignment:
Q  138 ttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 210  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  26332616 ttctacacaaagtctcaatctcttctcgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaa 26332688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14997101 - 14997040
Alignment:
Q  133 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14997101 cctaattctaccca-agtctcaatctcttccagtaaccaagagactcaatcctaacagtgttt 14997040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 195
Target Start/End: Original strand, 4144804 - 4144865
Alignment:
Q  133 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4144804 cctaattctaccca-agtcccagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 4144865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 89
Target Start/End: Original strand, 11693351 - 11693389
Alignment:
Q  51 gagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaac 89  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11693351 gagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaac 11693389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 9521871 - 9521826
Alignment:
Q  37 gacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 82  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9521871 gacctagtatgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 9521826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 13447264 - 13447301
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattga 38  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13447264 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattga 13447301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 100
Target Start/End: Original strand, 8213579 - 8213615
Alignment:
Q  64 tccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8213579 tccgttccactataatgatgagtaactttacaaaaga 8213615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 46783331 - 46783212
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||| || | |||  |||| | |||  ||| ||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  46783331 aatttgtttatccagttcgatccaatattgacttactctggaggagataacagctctctgttccactataatgatgagtttctttacaaaa-agatatca 46783233  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtct 128  Q
    | | ||||||||||| |||||    
T  46783232 aagggttacaagaattagtct 46783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 231
Target Start/End: Original strand, 26332699 - 26332780
Alignment:
Q  148 agtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  26332699 agtctcaatctattttcgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaaacc-caaa-cctagtgtttgt 26332780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2232635 - 2232597
Alignment:
Q  157 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2232635 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2232597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 9526623 - 9526577
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 82  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9526623 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 9526577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 202 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47451738 - 47451709
Alignment:
Q  202 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47451738 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 47451709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 3157033 - 3156989
Alignment:
Q  12 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagaga 56  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  3157033 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 3156989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 56
Target Start/End: Original strand, 28223421 - 28223465
Alignment:
Q  12 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagaga 56  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  28223421 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 28223465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 131)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16455581 - 16455356
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16455581 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgtttcactataatgacgagtaaccttacaaaagagatat 16455482  T
Q  106 caatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtga 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16455481 caatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 16455382  T
Q  206 atcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16455381 atcaaccatcaaaccctagtgtttgt 16455356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40637418 - 40637189
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40637418 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 40637320  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  40637319 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttcccaa 40637220  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637219 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 40637189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 40091404 - 40091633
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40091404 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacattacaaaaga 40091502  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40091503 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaa 40091602  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40091603 ggtgaatcaaccctcaaaccatagtgtttgt 40091633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 12395834 - 12396063
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12395834 cacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaaga 12395932  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  12395933 gatatcaatgggttacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 12396032  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396033 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 12396063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 12400796 - 12401025
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12400796 cacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaaga 12400894  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  12400895 gatatcaatgggttacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaa 12400994  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12400995 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 12401025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 22800851 - 22801080
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22800851 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 22800949  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  22800950 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgttttccaa 22801049  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22801050 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 22801080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 48486663 - 48486434
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  48486663 cacaaaataatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 48486565  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  48486564 gatttcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 48486465  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48486464 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 48486434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24880796 - 24880566
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaacctt-acaaaag 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  24880796 cacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgcgtaacgtttacaaaag 24880698  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24880697 agatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 24880598  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24880597 aggtgaaccaaccctcaaaccctagtgtttgt 24880566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 8631408 - 8631637
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8631408 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 8631506  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  8631507 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 8631606  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8631607 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 8631637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14633662 - 14633434
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14633662 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacattacaaaaga 14633564  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  14633563 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctt-ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 14633465  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14633464 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 14633434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 17662234 - 17662463
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17662234 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 17662332  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  17662333 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 17662432  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17662433 ggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgt 17662463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24348562 - 24348333
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24348562 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 24348464  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  24348463 gaaatcaatgggttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 24348364  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24348363 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 24348333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24889140 - 24888911
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  24889140 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgataagtaacgttacaaaaga 24889042  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  24889041 gatatcaatgggttacatgaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 24888942  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24888941 ggtgaatcaaccctcaaagcctagtgtttgt 24888911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36380694 - 36380472
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36380694 cacaaaagaatttgtttacccagttcgctccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactcagttccactataatgatgagtaactttacaaaaga 36380595  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  36380594 tatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttccggtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaa 36380495  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaacccta 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36380494 ggtgaatcaaccctcaaacccta 36380472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 38928166 - 38928395
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38928166 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttttactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 38928264  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  38928265 gatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatcttttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 38928364  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928365 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 38928395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24879334 - 24879104
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaacctt-acaaaag 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||| | || |||||||    
T  24879334 cacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgtgtatcgtttacaaaag 24879236  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24879235 agatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 24879136  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24879135 aggtgaatcaaccctcaaaccctggtgtttgt 24879104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16453654 - 16453424
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16453654 cacaaaagaattttttggcgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaaga 16453555  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  16453554 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaatactacccaaagtcccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 16453455  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16453454 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 16453424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 33415477 - 33415706
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  || | |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33415477 cacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagcctgagggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaaga 33415575  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  33415576 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcgatcttaatagtgtttcccaa 33415675  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33415676 ggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgt 33415706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 36921482 - 36921711
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36921482 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttaactagtctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 36921580  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  36921581 gatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 36921680  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36921681 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 36921711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 37089361 - 37089589
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  37089361 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaa-ga 37089458  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||     
T  37089459 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 37089558  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089559 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 37089589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47868745 - 47868516
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  47868745 cacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtatcgttacaaaaga 47868647  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  47868646 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaa 47868547  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47868546 ggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgt 47868516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 22802723 - 22802952
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22802723 cacaaaagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagaaaccctccgttccactata-tgatgagtaacattacaaaaga 22802821  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  22802822 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 22802921  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22802922 ggtgaatcaaccctcaaaccctaatgtttgt 22802952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36378637 - 36378407
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  36378637 cacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaacttcacaagaga 36378538  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||     
T  36378537 gatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagacttaatcctaatagtgttttccaa 36378438  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36378437 ggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgt 36378407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47275069 - 47274844
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  47275069 cacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaaga 47274972  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  47274971 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 47274872  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  47274871 gatgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 47274844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9148596 - 9148368
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  9148596 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaa-ga 9148499  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  9148498 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 9148399  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148398 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 9148368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 22046675 - 22046903
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  22046675 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-ga 22046772  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  22046773 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 22046872  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22046873 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 22046903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 37313055 - 37313284
Alignment:
Q  2 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagag 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||| |||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37313055 acaaaagaatttgttgatccaatttggtccaaattgacatagtctgggggaaagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagag 37313154  T
Q  102 atatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagg 201  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  37313155 atattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaag 37313254  T
Q  202 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37313255 gtgaatcaactctcaaaccctagtgtttgt 37313284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19323035 - 19322810
Alignment:
Q  5 aaagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagat 103  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19323035 aaagaatttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcatccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagat 19322936  T
Q  104 atcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggt 203  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  19322935 atcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 19322836  T
Q  204 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||    
T  19322835 gaatcaacc--caaaccctagtgtttgt 19322810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38409546 - 38409320
Alignment:
Q  3 caaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagaga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||    
T  38409546 caaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-gaga 38409449  T
Q  103 tatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaggg 202  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  38409448 aatcaatgggttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagg 38409349  T
Q  203 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38409348 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 38409320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19096227 - 19095998
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  19096227 cacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactata-tgataagtaacgttacaaaaga 19096129  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  19096128 gatatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaag-ctctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcaca 19096030  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19096029 aggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 19095998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6765188 - 6764959
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6765188 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 6765090  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||  |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||     
T  6765089 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaa 6764990  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6764989 ggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgt 6764959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 36919573 - 36919802
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| | ||  |||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  36919573 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccatctattccactata-tgatgaataacgttacaaaaga 36919671  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  36919672 gatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 36919771  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919772 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 36919802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7941667 - 7941443
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  7941667 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaaaga 7941569  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  7941568 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 7941469  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtg 226  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  7941468 ggtgaatcaacccacaaaccctagtg 7941443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2891636 - 2891433
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||| |||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891636 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaagttgtactagtctgggggagagagcagtcatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaaga 2891537  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  2891536 gatatcaatgggttacaagaacaagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 2891437  T
Q  201 ggtg 204  Q
    ||||    
T  2891436 ggtg 2891433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 2484862 - 2485090
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  2484862 cacaaaggaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-ga 2484959  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  2484960 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctatctctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 2485059  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2485060 ggtgaatcaacccagaaaccctagtgtttgt 2485090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5198764 - 5198535
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  5198764 cacaaaagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaaaga 5198666  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     
T  5198665 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacacaaagccccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttcccaa 5198566  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5198565 agtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgt 5198535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 22044380 - 22044608
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  22044380 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-ga 22044477  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  22044478 gaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 22044577  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22044578 ggggaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 22044608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 26085966 - 26086194
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||    
T  26085966 cacaaaagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccttccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-ga 26086063  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  26086064 gaaaacaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 26086163  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26086164 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 26086194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 51015589 - 51015361
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||   ||||||| ||    
T  51015589 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagacctccgatccactata-tgatgagtattgttacaaa-ga 51015492  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  51015491 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 51015392  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51015391 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 51015361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 231
Target Start/End: Original strand, 14787423 - 14787649
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagag--cagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagat 103  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||  ||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14787423 aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagat 14787521  T
Q  104 atcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggt 203  Q
     |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  14787522 gtcaatgagttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 14787621  T
Q  204 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14787622 gaatcaatcctcaaaccctagtgtttgt 14787649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11435298 - 11435070
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  11435298 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-ga 11435201  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |  ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  11435200 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagactcttccggtaaccaggagactcaatcctaatagtgtttcccaa 11435101  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11435100 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 11435070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 22132389 - 22132609
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||    
T  22132389 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaa 22132486  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatc 208  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22132487 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 22132586  T
Q  209 aaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  22132587 aacccacaaaccctagtgtttgt 22132609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 213
Target Start/End: Original strand, 18537470 - 18537675
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| |||||||||| || |||  ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18537470 aatttgtttacccagttcggtcaaaaaatgacctattatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 18537569  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  18537570 atgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaat 18537669  T
Q  208 caaccc 213  Q
    ||||||    
T  18537670 caaccc 18537675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 11006226 - 11006455
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||    
T  11006226 cacaaaagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaccattacaaa-ga 11006323  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttccca 199  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  11006324 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttccca 11006423  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11006424 aggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 11006455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18847496 - 18847268
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||    
T  18847496 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa-ga 18847400  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttccca 199  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  18847399 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatgctaatagtgtttccca 18847300  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18847299 aggtgaatcaacccacaaactctagtgtttgt 18847268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 619437 - 619665
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  619437 cacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagttaggg-gagagagcagtcatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 619534  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||     
T  619535 gatatcaatgggttataagaataattttcccgcctaattctacccaaagacccaatctcttcccttaaccaagacagtcaatcctaatagtgtttcccaa 619634  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  619635 ggtaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 619665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13547498 - 13547302
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13547498 cacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcactata-tgatgagtaactttacaaaaga 13547400  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 198  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13547399 tatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 13547302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 32 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13544272 - 13544075
Alignment:
Q  32 aaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctccc 131  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13544272 aaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccc 13544174  T
Q  132 gcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13544173 gcctaattctacccaaagtcccaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaa-cctagtgtttgt 13544075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 31849588 - 31849817
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||    
T  31849588 cacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-ga 31849685  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||     
T  31849686 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaagcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 31849785  T
Q  201 ggtgaatcaaccctc-aaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  31849786 ggtgaatcaacccacaaaaccttagtgtttgt 31849817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Original strand, 9176471 - 9176687
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||    
T  9176471 aatttgttgactctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaa 9176568  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  9176569 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 9176668  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtg 226  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  9176669 caacccacaaaccctagtg 9176687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41997828 - 41997607
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  41997828 aatttgtttatccagttcggtccaaattaacctagtctggg-gagagagcggccctccgtttcactatgatgatgagtaactttacaaaagagatattaa 41997730  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatc 208  Q
     | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  41997729 agggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaaatctcaatcttttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatc 41997630  T
Q  209 aaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  41997629 aaccctcaaaccctagtgtttgt 41997607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 11008557 - 11008784
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||       
T  11008557 cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccattacaaa--- 11008652  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttccca 199  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  11008653 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttccca 11008752  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11008753 aggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 11008784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27499386 - 27499160
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27499386 cacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggg-gaaagagcagcccttcgtttcaatataatgatgagtaaccttacaaaaga 27499288  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||||| |    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  27499287 gatattag---gttacaaaaataagtctcccgcctaattatacccaaagcctcaatctcttatcgtaaccaatagactcaatcctaatagtgtttctcag 27499191  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27499190 gatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 27499160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 16931786 - 16932006
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||    
T  16931786 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaa 16931883  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||    
T  16931884 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttctcaaggtgaat 16931983  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtttg 230  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  16931984 caacccacaaaccctagtgtttg 16932006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 16934140 - 16934360
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||    
T  16934140 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaa 16934237  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||    
T  16934238 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttctcaaggtgaat 16934337  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtttg 230  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  16934338 caacccacaaaccctagtgtttg 16934360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 18709161 - 18709381
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||    
T  18709161 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaa 18709258  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatc 208  Q
    || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  18709259 tgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcgcaatctcttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgtttcccaaggtgaatc 18709358  T
Q  209 aaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||| | |||||||||||||||||    
T  18709359 aactcacaaaccctagtgtttgt 18709381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 231
Target Start/End: Original strand, 44599836 - 44600056
Alignment:
Q  10 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||||||    
T  44599836 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 44599933  T
Q  110 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatc 208  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  44599934 gagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 44600033  T
Q  209 aaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  44600034 aacccacaaaccctagtgtttgt 44600056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 9174143 - 9174363
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||    
T  9174143 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggcagagaacagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaa 9174240  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagac-tcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  9174241 tgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 9174340  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtttg 230  Q
    |||| | | ||||||||||||||    
T  9174341 caactcacgaaccctagtgtttg 9174363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 18409344 - 18409565
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||   ||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18409344 aatttgtttacccagttcaatccaaattgacctagtctgagggagagagcaactctctgtttcactataatgatgggtaac-ttacaaaagagatatcaa 18409442  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatc 208  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| || | ||| ||||    
T  18409443 tgggttacaagaataaatctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcctataactaagagactcaatcctaatagtgttcccgaaggttaatc 18409542  T
Q  209 aaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18409543 aaccctcaaaccctagtgtttgt 18409565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 22134615 - 22134834
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||    
T  22134615 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaa 22134711  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatc 208  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||  || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22134712 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaatgtcccagccttttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 22134811  T
Q  209 aaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  22134812 aacccacaaaccctagtgtttgt 22134834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 22780371 - 22780590
Alignment:
Q  10 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  22780371 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaat 22780468  T
Q  110 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatc 208  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  22780469 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatc 22780568  T
Q  209 aaccctcaaaccctagtgtttg 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  22780569 aacccacaaaccctagtgtttg 22780590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 22782736 - 22782955
Alignment:
Q  10 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 109  Q
    ||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  22782736 atttgttgatccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaat 22782833  T
Q  110 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatc 208  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  22782834 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatc 22782933  T
Q  209 aaccctcaaaccctagtgtttg 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  22782934 aacccacaaaccctagtgtttg 22782955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 56030770 - 56030559
Alignment:
Q  16 tgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgtta 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||| ||     ||||||| |||| |||||||||| || |||||| ||||    
T  56030770 tgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttcat----atgatgaataacgttacaaaagaaatgtcaatgagtta 56030675  T
Q  116 caagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctc 215  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  56030674 caagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctc 56030575  T
Q  216 aaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||||    
T  56030574 aaaccctagtgtttgt 56030559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 213
Target Start/End: Original strand, 38890221 - 38890426
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| | | || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38890221 aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctaatcttggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 38890320  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||   |||||    
T  38890321 atgggttacaagaataagtctcccttctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaatatgaat 38890420  T
Q  208 caaccc 213  Q
    ||||||    
T  38890421 caaccc 38890426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4215650 - 4215483
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4215650 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 4215552  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaac 169  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||| |||||||||||||    
T  4215551 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcacaacctcttcccgtaac 4215483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 18534828 - 18535049
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||  | ||||||| |||| | |||||||  |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  18534828 aatttgtttaccctgttcggtccaaaacttacctagtctgggggggagagcacccctccgttccactataattatgagtagttttacaaaagagatatca 18534927  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  18534928 atgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaat 18535027  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||  | |||||||||||||||    
T  18535028 caacc--ccaaccctagtgtttgt 18535049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30136894 - 30136666
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||| |  |||||||||| | || ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30136894 cacaaaagaatttgtttatccaattcggtccaaattgacctagtattgaggagagagcagccatctgtttcactataatgatgattaactttacaaaaga 30136795  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||     
T  30136794 gatatcgatgagtcacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcacaatttcttctcgtgaccaagagacccaatcatagtagtgtttcccaa 30136695  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  30136694 ggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgt 30136666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 8756247 - 8756469
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaatt-gacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||   |||||||| |||  |||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  8756247 aatttgtttacccagttcgctccaaaaccgacctagtctggaggagagagcaaccatccgttccactataatgattagtaactttacaaaagagatatca 8756346  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaacc-aagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaa 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  8756347 atgagttacaagaataagtctcccgtctaattctactcaaagtctcaatctcttcccgtgaccaaagagactcaatcctagtagtgtttcccaaggtgaa 8756446  T
Q  207 tcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||  | |||||||||||||||    
T  8756447 tcaacc--ccaaccctagtgtttgt 8756469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 69 - 228
Target Start/End: Original strand, 3824627 - 3824785
Alignment:
Q  69 tccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaa 168  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||    
T  3824627 tccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaa 3824725  T
Q  169 ccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 228  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824726 ccaatagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 3824785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 78 - 231
Target Start/End: Original strand, 5637530 - 5637683
Alignment:
Q  78 atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagac 177  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  5637530 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 5637629  T
Q  178 tcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5637630 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgt 5637683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12102425 - 12102221
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12102425 aatttgtttacctagttcggtccaaaactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 12102326  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtctcc-cgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaa 206  Q
     || |||||||||||||||||||   |||| ||||||||| |||  |||||| ||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12102325 gtgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagttccaatcttttcccatgaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 12102226  T
Q  207 tcaac 211  Q
    |||||    
T  12102225 tcaac 12102221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 199
Target Start/End: Original strand, 47210756 - 47210938
Alignment:
Q  16 tgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgtta 115  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||    
T  47210756 tgactcagttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggtta 47210854  T
Q  116 caagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47210855 caagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttccca 47210938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 5635465 - 5635614
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5635465 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaaga 5635563  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtc 151  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5635564 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 5635614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 28454020 - 28453818
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | | ||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28454020 aatttgtttacccagttcggtccaatactaacctagtctgggggagagagtagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 28453921  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    |    |||||||||| ||||| |  |||| |||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  28453920 aaagtttacaagaattagtcttcaacctaattctacccaaggtccaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaat 28453821  T
Q  208 caa 210  Q
    |||    
T  28453820 caa 28453818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 53405474 - 53405250
Alignment:
Q  4 aaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagat 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||  |||  ||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||     
T  53405474 aaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagag--cagctctctgttccactata-tgatgagtatcgtttcaaaagagaa 53405378  T
Q  104 atcaatgtgttacaagaataag------tctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||      |||||||| || ||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  53405377 atcaatgggttacaagaataagaataagtctcccgcttaattctacctaaagtctcagcctctttccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttct 53405278  T
Q  198 cagggtgaatcaaccctcaaaccctagt 225  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||    
T  53405277 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagt 53405250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 11437706 - 11437558
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  11437706 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttac-aaaga 11437609  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtc 151  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11437608 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 11437558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 128 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6133090 - 6132987
Alignment:
Q  128 tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgt 227  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6133090 tcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccagggtgactcaaccctcaaaccctagtgt 6132991  T
Q  228 ttgt 231  Q
    ||||    
T  6132990 ttgt 6132987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 211
Target Start/End: Original strand, 31983554 - 31983727
Alignment:
Q  38 acctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-ccta 136  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||| |   ||||    
T  31983554 acctagtattgg-gagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaaaagatatcaaagggttacaaaaataagtcttcaaaccta 31983652  T
Q  137 tttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaac 211  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31983653 attctacccaaagtctcaatctcttcccatgaccaagagacttaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 31983727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 197
Target Start/End: Original strand, 15032572 - 15032733
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcct 135  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15032572 tgacctagtttgggggagagagcagctcttcgttccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcct 15032671  T
Q  136 atttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 197  Q
    | ||||||| | ||||  ||||| ||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15032672 aattctaccaaaagtccaaatcttttctcgtgtccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 15032733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 196
Target Start/End: Original strand, 3982200 - 3982362
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcc 134  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||   |     
T  3982200 tgacctagtatgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagtgttacaagaatcagtcttcaaact 3982299  T
Q  135 tatttctacccagagtctc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 196  Q
    || ||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3982300 taattctacccaaagtcccaaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcctaatagtgtttc 3982362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 118 - 231
Target Start/End: Original strand, 3937314 - 3937427
Alignment:
Q  118 agaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaa 217  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3937314 agaataagtctcccacctaattctacccaaagcctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaattccaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaa 3937413  T
Q  218 accctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||    
T  3937414 accctagtgtttgt 3937427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 5101272 - 5101130
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  5101272 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagatagcagccctccgttttactat-atgatgagtaaatttacaaaaga 5101175  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctaccc 145  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  5101174 catatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaagtctaccc 5101130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Original strand, 16185831 - 16186018
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  16185831 aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaactttac-aaagatatatca 16185929  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    | | ||| |||||||||||| ||   |||| ||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16185930 aagggttgcaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 16186018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 91 - 231
Target Start/End: Original strand, 52942537 - 52942664
Alignment:
Q  91 ttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatag 190  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |             |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52942537 ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa-------------cccgtaaccaagagactcaatcctaatag 52942623  T
Q  191 tgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52942624 tgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgt 52942664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 6133181 - 6133098
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatga 84  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6133181 cacaaaagaatttgttgacccaattcgatccaaattgacctagtctgggtgagagagcagtcatccgttccactataatgatga 6133098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 210
Target Start/End: Original strand, 47150948 - 47151092
Alignment:
Q  67 gttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccg 165  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||   |||| ||||||||| | |||||||||||||  |    
T  47150948 gttccactataatgatgagcaactttagaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaattctcaatctcttcatg 47151047  T
Q  166 taaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 210  Q
    | |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  47151048 tgaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaa 47151092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25357979 - 25357772
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| |||||||| | ||||| | ||||||||| | || ||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25357979 aatttgtttacccagttaggtccaatactgacctagtctaggggagagagcagctatccgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 25357880  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtctcccgcct--att---tctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaggg 202  Q
    | | ||||||||||||||||| |   ||  |||   | || ||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  25357879 aagggttacaagaataagtcttcaaacttaattctatatatccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaagg 25357780  T
Q  203 tgaatcaa 210  Q
    ||||||||    
T  25357779 tgaatcaa 25357772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9864049 - 9863842
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtg--agagagcagtcctccgttccactataatgatga---gtaaccttacaaaagaga 102  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | |||| |||| |||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||| ||||    
T  9864049 aatttgtttacccagttcggtccaatactgacttagtctgggggggagagagcagctctccgttccactataatgatgatgagtaactttacaaa-gaga 9863951  T
Q  103 tatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcct-atttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagg 201  Q
    ||||||   ||||||||||| ||||| |   || | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||| |    
T  9863950 tatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacttaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaaaagactcaatcctaatagggtttcccaag 9863851  T
Q  202 gtgaatcaa 210  Q
    |||||||||    
T  9863850 gtgaatcaa 9863842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 53 - 210
Target Start/End: Original strand, 40998990 - 40999148
Alignment:
Q  53 gagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtc 151  Q
    |||||||  |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |   |||||||   |||| ||||||||| ||||    
T  40998990 gagagcatccctctgttccactataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaaaacacagtctccaaacctaattctacccaaagtc 40999089  T
Q  152 tcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 210  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  40999090 tcgatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgttttcctaggtgaatcaa 40999148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 47563105 - 47563009
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  47563105 cacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcaaggggagagagcagccctccgtttcactataa-gatgagtaaccttacaaaa 47563009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9022613 - 9022438
Alignment:
Q  38 acctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat--gtgttacaagaataagtc-tcccgcc 134  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    ||||||||||| |||| ||   ||    
T  9022613 acctaatatgggggagagagcagccctttgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaatagaggttacaagaattagtcttcaaacc 9022515  T
Q  135 tatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccagggtgaatcaa 210  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | || ||| ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  9022514 taattcaacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagaaattctatcctaatactgtttctccaaggtgaatcaa 9022438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10113198 - 10112984
Alignment:
Q  18 acccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtg-tta 115  Q
    |||||||||| ||||| | | ||||||| | || ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||   | |||    
T  10113198 acccagttcggtccaatactaacctagtcttggggagagagcagctctccattccactataatgattagtaacattacaaa-gagatatcaaaaaggtta 10113100  T
Q  116 caagaataagtctcccgc-ctatttctacccagagtctcaatctcttccc-gtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccc 213  Q
    ||||||| ||||| |    ||| ||||||||| ||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |    
T  10113099 caagaattagtcttcaaatctaattctacccaaagtcctaatctcttccccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatcaa-tc 10113001  T
Q  214 tcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    || |||||||||||||||    
T  10113000 tc-aaccctagtgtttgt 10112984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 49088911 - 49088791
Alignment:
Q  5 aaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtat-gggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaag-aga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||| ||| ||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| |||    
T  49088911 aaagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctggggggagagagtagttctctgtttcactat-atgatgactaacattacaaaagaaga 49088813  T
Q  103 tatcaatgtgttacaagaataa 124  Q
    | |||||| |||||||||||||    
T  49088812 tgtcaatgagttacaagaataa 49088791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 5336769 - 5336964
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaag 99  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||  ||||| ||||||||| ||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  | ||   ||||    
T  5336769 cacaaaagaatttgtttaatcagttcagtccaatattgacctactataggggagagagcagctctccgttccactataatgatgaatttcttttacaaag 5336868  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||||| |  |  |||||||||| |||| ||   |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  5336869 agatataagaggattacaagaattagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 5336964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 78
Target Start/End: Original strand, 14789422 - 14789496
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtat--gggtgagagagcagtcctccgttccactataa 78  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14789422 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactataa 14789496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 128
Target Start/End: Original strand, 54928699 - 54928764
Alignment:
Q  63 ctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtct 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||    
T  54928699 ctccgttccactatagtgatgagtaactttacaaaagagatattaaaatgttacaagaatcagtct 54928764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Original strand, 3578668 - 3578786
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| |||||||||| || || | || |||||| |||| |||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  3578668 aatttgtttacccagttcggtctaatactggcctagtctgggggagaga-cagctctccattccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatca 3578765  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtct 128  Q
    |  |||||||||||| |||||    
T  3578766 aaatgttacaagaattagtct 3578786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 26557922 - 26557823
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||| | |||| |||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26557922 aatttgtttacctagttcggtccaatactgacttagtctgggggagagagcagctctccgttccactataacgatgagtaactttac-aaagagatatca 26557824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 126
Target Start/End: Original strand, 24446680 - 24446754
Alignment:
Q  51 gagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagt 126  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  24446680 gagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggcttacaaaaataagt 24446754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 228
Target Start/End: Original strand, 24446756 - 24446799
Alignment:
Q  185 taatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446756 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 24446799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 55822420 - 55822265
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 133  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  55822420 tgacctagtatggg-gagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 55822326  T
Q  134 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||| ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  55822325 ctaattctaccca-agtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 55822265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 22295502 - 22295412
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 98  Q
    |||||||| |||||||||  ||||| | || |||||| |||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22295502 aatttgtttacccagttcagtccaatactgccctagtgtgggggagagagcaattctccattccactataatgatgagtaactttacaaaa 22295412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31300580 - 31300427
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccg 132  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||  | |||| ||||||||||   || ||||||||||| |||| ||       
T  31300580 tgacctagtctggg-gagagagcagccctccgttccactataatgatatgagtttctttac-aaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaa 31300486  T
Q  133 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 192  Q
    |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  31300485 cctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 31300427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 231
Target Start/End: Original strand, 38270158 - 38270204
Alignment:
Q  185 taatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270158 taatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 38270204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Original strand, 7050282 - 7050439
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat--gagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg- 132  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||  ||||  | ||||||| |||||||   || ||||||||||| ||||| |       
T  7050282 tgacctagtctgggggagagagcagctctctgttccactataatgatatgagtttctttacaaa-gagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaa 7050377  T
Q  133 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7050378 cctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7050439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8529455 - 8529270
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagaga 102  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||||||    
T  8529455 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttac-aaagaga 8529357  T
Q  103 tatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 192  Q
    |||   || ||| ||||||| |||| ||   |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  8529356 tat---tgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 8529270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4558458 - 4558314
Alignment:
Q  46 tgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttcta 142  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  | |||| ||||||||||   || ||||||||||| |||| ||   |||| |||||    
T  4558458 tgggggagagagcagttctccgttccactataatgatatgagtttctttac-aaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattcta 4558363  T
Q  143 cccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 192  Q
    |||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4558362 ccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 4558314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 52942477 - 52942525
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatggg 49  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  52942477 cacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctggg 52942525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 4570241 - 4570094
Alignment:
Q  46 tgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat--gagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttcta 142  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||  | ||||||| |||||||   || ||||||||||| ||||| |   |||| |||||    
T  4570241 tgggggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaa-gagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattcta 4570146  T
Q  143 cccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4570145 ccca-agtcccaacctcttcccgtgaccaagagactcgatcctaatagtgttt 4570094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 11853705 - 11853549
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 133  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  11853705 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 11853610  T
Q  134 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11853609 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 11853549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 54906852 - 54906722
Alignment:
Q  82 tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctc-aatctcttcccgtaaccaagagactc 179  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||| |   |||| ||||||| | |||||  |||||||||| || ||||||||||||    
T  54906852 tgagtaactttacaaa-gagatatcaaagagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctacctaaagtcttgaatctcttccagtgaccaagagactc 54906754  T
Q  180 aatcataatagtgtttc-ccagggtgaatcaa 210  Q
    |||  |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  54906753 aattctaatagtgtttctccatggtgaatcaa 54906722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 4885062 - 4884985
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 82  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4885062 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 4884985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10114522 - 10114444
Alignment:
Q  151 ctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  10114522 ctcaatctcttatcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaagtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgt 10114444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16638883 - 16638827
Alignment:
Q  138 ttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16638883 ttctaccca-agtctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 16638827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 192
Target Start/End: Original strand, 16688934 - 16689119
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagaga 102  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| || | ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||||||    
T  16688934 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtttgtgggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttac-aaagaga 16689032  T
Q  103 tatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 192  Q
    |||   || ||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||| |||| ||  ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  16689033 tat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 16689119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 36769636 - 36769479
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccg 132  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||  | |||| ||||||||||   || ||||||||||| |||| ||       
T  36769636 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttac-aaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaa 36769541  T
Q  133 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||| || |||||| |||||||  |||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  36769540 cctaattttaccca-agtctcagcctcttcccgtgaccaagaaactcgatcctaatagtgttt 36769479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 3937263 - 3937306
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagt 44  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  3937263 cacaaatgaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagt 3937306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16489410 - 16489352
Alignment:
Q  133 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 192  Q
    |||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16489410 cctaattctaccca-agtcccagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 16489352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 15831298 - 15831252
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 82  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15831298 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 15831252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 24446643 - 24446677
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaat 35  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24446643 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat 24446677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 36771434 - 36771396
Alignment:
Q  157 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36771434 ctcttcccatgaccaagagactcaatcataatagtgttt 36771396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 161
Target Start/End: Original strand, 38270120 - 38270158
Alignment:
Q  123 aagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctctt 161  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  38270120 aagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctctt 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 195
Target Start/End: Original strand, 4874620 - 4874661
Alignment:
Q  154 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4874620 aatctcttcccgtgaccaagagactctatcttaatagtgttt 4874661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Original strand, 10047383 - 10047452
Alignment:
Q  12 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga 81  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||| |||||||||| |||||  |||||||| ||||    
T  10047383 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatga 10047452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 18587154 - 18587077
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 82  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18587154 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgat 18587077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Original strand, 39245998 - 39246067
Alignment:
Q  12 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga 81  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||| |||||||||| |||||  |||||||| ||||    
T  39245998 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatga 39246067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4884921 - 4884877
Alignment:
Q  148 agtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 192  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4884921 agtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 4884877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 56
Target Start/End: Original strand, 12743925 - 12743969
Alignment:
Q  12 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagaga 56  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  12743925 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 12743969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 56
Target Start/End: Original strand, 12745314 - 12745358
Alignment:
Q  12 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagaga 56  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  12745314 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 12745358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 25699788 - 25699752
Alignment:
Q  156 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 192  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  25699788 tctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25699752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 196
Target Start/End: Original strand, 29609606 - 29609654
Alignment:
Q  148 agtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 196  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||    
T  29609606 agtctcaatctcttgccgtgatcaagagactcaattctaatagtgtttc 29609654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 96)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 1189596 - 1189827
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtg-agagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1189596 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggaggagagagcatccctccgttccactataattatgagtaaccttacaaaag 1189695  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1189696 agatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 1189795  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1189796 aagtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 1189827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 696168 - 695939
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  696168 cacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgaataactttacaaaaga 696069  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  696068 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt-ccaa 695970  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  695969 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 695939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 16092188 - 16092418
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| | |  |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092188 cacaaaagaatttgttgatccagttcagtctaaattgacctagtctagaggagagagcaaccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaaga 16092287  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  16092288 gatctcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 16092387  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092388 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 16092418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18511201 - 18511430
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18511201 cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaaga 18511299  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  18511300 gatatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 18511399  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511400 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 18511430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25804314 - 25804086
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25804314 cacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 25804217  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  25804216 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 25804117  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804116 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 25804086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40221813 - 40221583
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40221813 cacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaaga 40221714  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  40221713 gatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaa 40221614  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40221613 ggtgaatcaaccctcaaatcctagtgtttgt 40221583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 10529091 - 10529317
Alignment:
Q  4 aaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  10529091 aaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgattcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaa 10529189  T
Q  104 atcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggt 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  10529190 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 10529289  T
Q  204 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10529290 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 10529317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6745358 - 6745130
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6745358 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 6745260  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  6745259 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 6745160  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6745159 ggtgaatcaaccctcaaa-cctagtgtttgt 6745130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 20505832 - 20506042
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||  ||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20505832 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagag--cagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 20505928  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  20505929 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 20506028  T
Q  201 ggtgaatcaaccct 214  Q
    ||||||||||||||    
T  20506029 ggtgaatcaaccct 20506042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 25921462 - 25921691
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25921462 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 25921560  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  25921561 gaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccagagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcacaa 25921660  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25921661 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 25921691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17073172 - 17072944
Alignment:
Q  3 caaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagaga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17073172 caaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccgagtctgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaaccttacaaaagaga 17073073  T
Q  103 tatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaggg 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | | || | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  17073072 tatcaatgagttacaagaataagtcttccgcctaattctatcgaaagccccaatctcttcccctaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagg 17072973  T
Q  203 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17072972 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 17072944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6756782 - 6756555
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  6756782 cacaaaagattttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctc-gtttcactataatgatgtgtaaccttacaaaaaa 6756684  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  6756683 gatatcaatgt--tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaa 6756586  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6756585 ggagaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 6756555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2175208 - 2174980
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| ||    
T  2175208 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgataagtaacgttacaaa-ga 2175111  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2175110 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaa 2175011  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2175010 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 2174980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18596936 - 18596706
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18596936 cacaaaagaatctgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaaga 18596837  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||     
T  18596836 gatatcaatgagttacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaacagtgttttccaa 18596737  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  18596736 ggtgaatcaaccctcaaaccatattgtttgt 18596706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21948316 - 21948087
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21948316 cacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 21948218  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  21948217 gatatcaaggggttacaagaataagtctcccgcctaattccacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 21948118  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948117 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 21948087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24127146 - 24126917
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24127146 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaaga 24127048  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  24127047 gatatcaatgagttacaagaataagtctatcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaa 24126948  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||| |||||| | |||||||||||| |||||    
T  24126947 ggtcaatcaatcttcaaaccctagtatttgt 24126917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 10474312 - 10474541
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  10474312 cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaaccttagaaaaga 10474410  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||     
T  10474411 gatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccaatctcttcctgtaaccaagagattcaatcttaatagtgtttcccaa 10474510  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  10474511 ggtgtatcaaccctcaaaccccagtgtttgt 10474541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25904393 - 25904164
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||    
T  25904393 cacaaaataatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgtttcactata-tgataagtaacgttacaataga 25904295  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  25904294 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattatactcaaagccctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 25904195  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25904194 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 25904164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27912826 - 27912605
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  27912826 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagttctctgttccactata-tgatgagtatcgttacaaaaga 27912728  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  27912727 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 27912628  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaacccta 223  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  27912627 ggtgaatcaaccctcaaaaccta 27912605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 31472601 - 31472831
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31472601 cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaaga 31472700  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  ||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  31472701 gatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 31472800  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31472801 ggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgt 31472831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39854773 - 39854544
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  39854773 cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtagcgttacaaaaga 39854675  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  39854674 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccagtctcttcccgtaaccatgagactcaatcctaatagtgtttcccaa 39854575  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39854574 ggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgt 39854544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18466973 - 18466745
Alignment:
Q  2 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagag 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
T  18466973 acaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccattata-tgatgagtatcgttacaaaagag 18466875  T
Q  102 atatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagg 201  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18466874 aaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 18466775  T
Q  202 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18466774 gtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgt 18466745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 658345 - 658571
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||   |||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  658345 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg---gagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 658440  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||     
T  658441 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttctcaa 658540  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  658541 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 658571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 41585733 - 41585956
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41585733 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacattacaaaaga 41585831  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||     
T  41585832 gatatcaatgacttacaaaaataagtctcctgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtagccaagagactcaatcctactagtgtttcccaa 41585931  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  41585932 ggtgaatcaaccctcaaaccctagt 41585956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 2818324 - 2818554
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2818324 cacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 2818422  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  2818423 gatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagccttttcccgtaaccaagagactcaatcgtaatagtgttttccaa 2818522  T
Q  201 ggtgaatc-aaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2818523 ggtgaatcaaaccctcaaaccctagtgtttgt 2818554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 17818481 - 17818708
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  || |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  17818481 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagaga--agccctctgttccactgta-tgatgagtaactttacaaaaga 17818577  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||     
T  17818578 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcagtcttaatagtgtttcccaa 17818677  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  17818678 ggtaaatcaaccatcaaaccctagtgtttgt 17818708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4236918 - 4236690
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4236918 cacaaaagaatttattgacc-agttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 4236821  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  4236820 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaa 4236721  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4236720 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 4236690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6747594 - 6747367
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |    
T  6747594 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagagagagagcagccctccgatccactata-tgacgagtaacgttacaaaa-a 6747497  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  6747496 gaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 6747397  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6747396 ggtgaatcaaccctcaaa-cctagtgtttgt 6747367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18509307 - 18509536
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| | || |||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  18509307 cacaaaagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagcccaccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaata 18509405  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  18509406 gatatcaacgagttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccattctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 18509505  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18509506 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 18509536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27910740 - 27910511
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||    
T  27910740 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctctccgttccattata-tgatgagtatcgttacaaaaga 27910642  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||     
T  27910641 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaa 27910542  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27910541 ggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgt 27910511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38882395 - 38882167
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  38882395 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-ga 38882298  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  38882297 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 38882198  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38882197 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 38882167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 34479407 - 34479637
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  34479407 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttac-aaaga 34479504  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcc-cgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttccc 198  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34479505 gaaatcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactccaatcataatagtgtttccc 34479604  T
Q  199 agggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34479605 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 34479637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2954706 - 2954478
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  2954706 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacctagtttgggggagagagcatccctccgcttcactata-tgatgagtaactttacaaa-ga 2954609  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  2954608 gatatcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttctcgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttccaa 2954509  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2954508 agtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 2954478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16776447 - 16776221
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||| |||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  16776447 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggggagatagcagccctccgatccactata-tgataagtaacgttacaaaaga 16776349  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  16776348 gaaatcaatg-gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 16776250  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16776249 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgttt 16776221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 34477042 - 34477272
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  34477042 cacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttac-aaaga 34477139  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcc-cgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttccc 198  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34477140 gaaatcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcataatagtgtttccc 34477239  T
Q  199 agggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34477240 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 34477272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39798337 - 39798126
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||  |||||||| | ||| ||||||    
T  39798337 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactatac-gatgagtatcattataaaaga 39798239  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  39798238 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 39798139  T
Q  201 ggtgaatcaaccc 213  Q
    |||||||||||||    
T  39798138 ggtgaatcaaccc 39798126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2724183 - 2723964
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2724183 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactat-atgatgagtaatcttacaaaaga 2724085  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  2724084 gatatcaatgggttacaagaataaatcacccgcctaattctac---------caatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatggtgtttcccaa 2723994  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttg 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2723993 ggtgaatcatccctcaaaccctagtgtttg 2723964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26098021 - 26097794
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26098021 cacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggaggagagagcag-cctctgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 26097924  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||   | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||     
T  26097923 gatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcattttcccgtaaccaagagactcattcctaatagtgttt-ccaa 26097825  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26097824 ggtgaatcaaccctctaaccctagtgtttgt 26097794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 231
Target Start/End: Original strand, 37705774 - 37705998
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 105  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  || | | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37705774 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaatagccattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatat 37705872  T
Q  106 caatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |  |  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  37705873 caatgggttacaagaataagtctcccacctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 37705972  T
Q  206 atcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  37705973 atcaaccctcaaaccctagtgtttgt 37705998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10587122 - 10586901
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtg-agagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaag 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  10587122 cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-g 10587025  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10587024 agaaatcaatgggttaaaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctctttccgtaagcaagagactgaatcctaatagtgtttccca 10586925  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaacccta 223  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  10586924 aggtgaatcaaccctcaaacccta 10586901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 36402317 - 36402546
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| | || ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36402317 cacaaaagaatttgttgacctagttcgatctaaattgacctagtctgggggagagagcagacatctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 36402415  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||     
T  36402416 gatatcaatggattacaataataagtctccagcctaattttacccaaagttccaatctcctcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtattttccaa 36402515  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36402516 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 36402546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 36208865 - 36208656
Alignment:
Q  2 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagag 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36208865 acaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtatggg-gaaagagcagcccgccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagag 36208767  T
Q  102 atatcaatgtgttacaagaataagtct-cccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||     
T  36208766 atatcaatgggttacaagaataagtctacaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgttaccaagagactcaatcttagtaatgtttcccaa 36208667  T
Q  201 ggtgaatcaac 211  Q
    |||||||||||    
T  36208666 ggtgaatcaac 36208656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18469297 - 18469072
Alignment:
Q  3 caaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagaga 102  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||  || |||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||    
T  18469297 caaaagaatttgttaatccagttcggtccaaattgacctagtctggg--agagagcagctcttcgttccactaga-tgatgagtatcgttacaaaagaga 18469201  T
Q  103 tatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaggg 202  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18469200 aatcaatgggttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagg 18469101  T
Q  203 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18469100 tgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgt 18469072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4410312 - 4410090
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||    
T  4410312 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-ga 4410215  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  4410214 gaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 4410115  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagt 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  4410114 ggtgaatcaacccacaaaccctagt 4410090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31545362 - 31545141
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||   ||||||| |||| |||||    
T  31545362 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtactgttacaaa-gagaaatcaa 31545265  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  31545264 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatttcttcccgtaaccaagagactctaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 31545165  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  31545164 caacccacaaaccctagtgtttgt 31545141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15552527 - 15552307
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||    
T  15552527 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaa 15552430  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15552429 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 15552330  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtttg 230  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  15552329 caacccacaaaccctagtgtttg 15552307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 21684441 - 21684669
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||   ||||||| ||    
T  21684441 cacaaacgaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtattgttacaaa-ga 21684538  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  21684539 gaaatcaatgagttacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaagccccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatcccaa 21684638  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21684639 ggcgaatcaacccataaaccctagtgtttgt 21684669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 31179368 - 31179588
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| || ||    
T  31179368 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatgaa 31179465  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  31179466 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 31179565  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtttg 230  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  31179566 caacccacaaaccctagtgtttg 31179588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 213
Target Start/End: Original strand, 6661181 - 6661386
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  6661181 aatttgtttatccagttcggtccaaatctgacctagtctgagggagagagcagtcatccgttccactataattatgagcaactttacaaaagagatatca 6661280  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6661281 atgggttacaagaataagtctcctgcctaattgtacccaaaatctcaatttcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccatggtgaat 6661380  T
Q  208 caaccc 213  Q
    ||||||    
T  6661381 caaccc 6661386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31543016 - 31542796
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||   ||||||| |||| |||||    
T  31543016 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtactgttacaaa-gagaaatcaa 31542919  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  31542918 tgggtt-cgagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 31542820  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  31542819 caacccacaaaccctagtgtttgt 31542796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 68 - 231
Target Start/End: Original strand, 34530721 - 34530884
Alignment:
Q  68 ttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgta 167  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||  ||||||||||||||    
T  34530721 ttccactataatgatgagcaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataaatctcccgcctaattctactcaaagtcctaatctcttcccgta 34530820  T
Q  168 accaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34530821 gccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgt 34530884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 39397982 - 39398210
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| | ||||||  |||||| | ||  ||||| | ||||||||    
T  39397982 cacaaaagaatgttttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagcagccatccgttttactata-taattggtaacgtcacaaaaga 39398080  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  39398081 gatatcaatgggttacaagaataagtctactgcctaattctacccaaagttccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 39398180  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39398181 ggtgaatcaaccctcaaa-cctagtgtttgt 39398210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 10749986 - 10749796
Alignment:
Q  5 aaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagata 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |    
T  10749986 aaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaa 10749889  T
Q  105 tcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 196  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10749888 tcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 10749796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 12555912 - 12556141
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa-g 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| | || ||| |||||||||| |||||||| |    
T  12555912 cacaaaagaatttattgacccagttcagtccaaattgaactagtatgggggagatagcagccctccgtttcgctttaa-gatgagtaacgttacaaaaag 12556010  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||  | ||| ||||||| | | || ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  12556011 agatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcttgtctaattctaccaaaactc-caatctcttcccgtagccaagagacacaatcctaatagtgtttccca 12556109  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12556110 aggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgt 12556141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 31465979 - 31466196
Alignment:
Q  2 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagag 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||| | |||||||| |||          ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  31465979 acaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgaactagtctgggggtgagagcagccct----------ata-tgatgagtaactttacaaaatag 31466067  T
Q  102 atatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |    
T  31466068 atatcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatactgtttctcaag 31466166  T
Q  202 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  31466167 gtgaatcaaccgtcaaaccctggtgtttgt 31466196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9020510 - 9020281
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaatt-gacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaag 99  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| ||||||   |||||| | |||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9020510 cacaaaagaattggtttatccagttcggtccaaaacagacctaatttggaggagagagcagccatccgatccactataatgatgagtaattttacaaaag 9020411  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  9020410 agatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagctccaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcttaatagtgttttcca 9020311  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     ||||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  9020310 aggtgaatcaa--cttcaaccctagtgtttgt 9020281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21289050 - 21288839
Alignment:
Q  2 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagag 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||      
T  21289050 acaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataa-gatgagtaacgttacaaaag-- 21288954  T
Q  102 atatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagg 201  Q
          ||| |||||||||| || |||||||| || ||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  || |    
T  21288953 ------atgagttacaagaaaaaatctcccgcttaattctatccaaagtcctaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgttt-tcaag 21288861  T
Q  202 gtgaatcaaccctcaaacccta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21288860 gtgaatcaaccctcaaacccta 21288839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Original strand, 38960129 - 38960314
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  38960129 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaa 38960226  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 196  Q
    || |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  38960227 tgggttacaagaata-gtctcccgtctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 38960314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 10757462 - 10757273
Alignment:
Q  5 aaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagata 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| || | |    
T  10757462 aaagaatttgttgacccagttcggtctaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-gaaaaa 10757365  T
Q  105 tcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 196  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10757364 tcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctt-ccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 10757273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 15354564 - 15354757
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||||| |||| |||||    
T  15354564 cacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttaatgagtaacgttac-aaaga 15354661  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 196  Q
    || ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15354662 gaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 15354757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23665333 - 23665140
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  23665333 cacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-ga 23665236  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 196  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23665235 gaaatcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23665140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 23793254 - 23793447
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||||    
T  23793254 cacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaaga 23793351  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 196  Q
    || ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23793352 gaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23793447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20054127 - 20053906
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaag 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||  |||||||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  20054127 cacaaaagaatttgtttacgcagttcggtccaaaactgacctagtatggaggagagagcagccttccgttctactataatgatgagtaactttacaaaag 20054028  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    |||||||   | |||||||||||||||||||| |||| ||||||  | |||| ||||||     |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20054027 agatatc---gggttacaagaataagtctcccacctaattctacttaaagtcccaatct-----ccaaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 20053936  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  20053935 aggtgaatcaa-cctc-aaccctagtgtttgt 20053906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Original strand, 3373134 - 3373320
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||    
T  3373134 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaa 3373231  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagac-tcaatcataatagtgtttc 196  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  3373232 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagacttcaatcctaatagtgtttc 3373320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 15356840 - 15357033
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||||| |||| |||||    
T  15356840 cacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtccgggggagagagcagccctccgatccactat-ttaatgagtaacgttac-aaaga 15356937  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 196  Q
    || ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15356938 gaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 15357033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 46 - 231
Target Start/End: Original strand, 17413200 - 17413384
Alignment:
Q  46 tgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataag-tctcccgcctatttctacc 144  Q
    |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||   |||| |||||||    
T  17413200 tgggggagagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagttttcaaacctaattctacc 17413299  T
Q  145 cagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  17413300 taaagtctcaatctcttcccttgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgt 17413384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20045172 - 20045071
Alignment:
Q  130 ccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 229  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20045172 ccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccggaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 20045073  T
Q  230 gt 231  Q
    ||    
T  20045072 gt 20045071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 23741848 - 23742023
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||||    
T  23741848 cacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaaga 23741945  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactc 179  Q
    || ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23741946 gaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtaatcaagagactc 23742023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 138 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20043204 - 20043111
Alignment:
Q  138 ttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20043204 ttctatccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 20043111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15143722 - 15143547
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcc 134  Q
    ||||||||| | || |||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||   ||    
T  15143722 tgacctagtctaggggagaaagcagctccccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacc 15143623  T
Q  135 tatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 210  Q
    || ||||||||| | ||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||| | ||||||||||    
T  15143622 taattctacccaaaatccaaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgcttccaaaggtgaatcaa 15143547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 36 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4897985 - 4897828
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcc 134  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||||||||||| |||| ||  |||    
T  4897985 tgacctagtatgggggagaaagcagcccactgttccgctataatgatgagtaactttacaatagagatatcaaatggttacaagaatcagtcttcaagcc 4897886  T
Q  135 tatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 192  Q
    || ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||    
T  4897885 taattctacccaaagtcacaatctcttcccgtgaccaagatactcaatcctaacagtg 4897828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 42771024 - 42770936
Alignment:
Q  78 atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgt 166  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42771024 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaataggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgt 42770936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 153 - 231
Target Start/End: Original strand, 26098391 - 26098469
Alignment:
Q  153 caatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26098391 caatctctttccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttgtcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 26098469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 104
Target Start/End: Original strand, 26098280 - 26098380
Alignment:
Q  4 aaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtat-gggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagaga 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  26098280 aaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtatggggggagagagcagccctccgtttcaccat-atgatgagtaacgttacaaaagaga 26098378  T
Q  103 ta 104  Q
    ||    
T  26098379 ta 26098380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Original strand, 15445263 - 15445417
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| |||||||||  ||||| | ||||||||| ||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15445263 aatttgtttacccagttcagtccaatactgacctagtctggga-agagagcagcccttcgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 15445361  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttc 162  Q
    | | ||||||||||| | || ||   |||| |||||| || |||||||||||||||    
T  15445362 aagggttacaagaatcattcttcaaacctaattctactcaaagtctcaatctcttc 15445417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 210
Target Start/End: Original strand, 2144601 - 2144763
Alignment:
Q  51 gagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat-caatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccaga 148  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||   ||||||||||| |||| ||   |||| ||| ||||| |    
T  2144601 gagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatataaaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattccacccaaa 2144699  T
Q  149 gt-ctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccagggtgaatcaa 210  Q
    || || ||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2144700 gtcctgaatctcttcccgcgaccaagagactccatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 2144763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Original strand, 34033563 - 34033753
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatc- 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  34033563 aatttgtttacccagttcgatccaatactgacctagtcaggg-gagagagcagttctatgttccacagtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcg 34033661  T
Q  107 aatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagt-ctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 196  Q
    || | ||||| | || ||||| ||   | || ||||||||| | | || ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34033662 aaggggttaccataacaagtcttcaaacttaattctacccaaaatcctgaatctcttcccgcgaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 34033753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42770934 - 42770847
Alignment:
Q  124 agtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccc 213  Q
    |||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||  |||||||| ||||||| |||||    
T  42770934 agtctctcgtctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcagtcctaata--gtttcccatggtgaatgaaccc 42770847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 20043280 - 20043222
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagca 59  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||    
T  20043280 cacaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagca 20043222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35430408 - 35430259
Alignment:
Q  64 tccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatc-aatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctc-aatctct 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |  |||||||||| |||| ||   |||| ||||||||| || | | |||||||    
T  35430408 tccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaaaagaattacaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaaagacccgaatctct 35430310  T
Q  161 tcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccagggtgaatcaa 210  Q
    ||||   |||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  35430309 tccctagaccaagagactcaattgtaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 35430259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22673022 - 22672837
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagaga 102  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||  | |||| |||||||    
T  22673022 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttac-aaagaga 22672924  T
Q  103 tatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 192  Q
    |||   || ||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22672923 tat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtctcagcctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 22672837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 1170967 - 1170811
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 133  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  1170967 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 1170872  T
Q  134 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1170871 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 1170811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 10627411 - 10627364
Alignment:
Q  148 agtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  10627411 agtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 10627364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 195
Target Start/End: Original strand, 2298122 - 2298183
Alignment:
Q  133 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||| ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2298122 cctaattctaccca-agtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2298183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 11917065 - 11916996
Alignment:
Q  12 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga 81  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  11917065 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactataatga 11916996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 28786592 - 28786515
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 82  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  28786592 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagttctccgttccattataatgat 28786515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 42238448 - 42238371
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 82  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  42238448 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 42238371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 20045270 - 20045210
Alignment:
Q  62 cctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaat 122  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  20045270 cctccgtttctctataatgataagtaactttacaaaaaagatatcaatgggttaaaagaat 20045210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 32520597 - 32520533
Alignment:
Q  133 cctatttctacccagagtc-tcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 196  Q
    |||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  32520597 cctaattctacccaaagtcatgaatctcttcccgtaatcgagagactcaatcttaatagtgtttc 32520533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25445684 - 25445501
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagaga 102  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||  | |||| |||||||    
T  25445684 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttac-aaagaga 25445586  T
Q  103 tatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatag 190  Q
    |||   || || |||||||| |||| ||   |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25445585 tat---tgagtaacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatag 25445501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 1240585 - 1240539
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 82  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1240585 tgacctagtttgggagagagagcagctctccgttccactataatgat 1240539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4754312 - 4754216
Alignment:
Q  133 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||| ||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||  |||||||||||  || ||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  4754312 cctaattctatccaaagtcacaatctcttccagtgaccaagaggctcaattctaatagtgtttttcaaggtgaatcaa-tctc-aaccctagtgtttgt 4754216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 195
Target Start/End: Original strand, 31782597 - 31782639
Alignment:
Q  153 caatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  31782597 caatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 31782639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 195
Target Start/End: Original strand, 35385596 - 35385634
Alignment:
Q  157 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  35385596 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 35385634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 533937 - 533893
Alignment:
Q  12 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagaga 56  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  533937 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 533893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 56
Target Start/End: Original strand, 42428430 - 42428474
Alignment:
Q  12 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagaga 56  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  42428430 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 42428474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 133)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1313679 - 1313450
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1313679 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 1313581  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  1313580 gatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 1313481  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1313480 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 1313450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 4308268 - 4308497
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4308268 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 4308366  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  4308367 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 4308466  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308467 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 4308497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38890310 - 38890081
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38890310 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 38890212  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  38890211 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 38890112  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38890111 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 38890081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3314955 - 3314725
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  3314955 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgaataattttacaaaaga 3314856  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  3314855 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 3314756  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3314755 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 3314725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 53917651 - 53917880
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  53917651 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaaga 53917749  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  53917750 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 53917849  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917850 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 53917880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45883210 - 45882980
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtat-gggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  45883210 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctagggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaag 45883112  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45883111 agatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 45883012  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  45883011 aggtgaatcaaccctcaaaccttattgtttgt 45882980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 10956014 - 10956243
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10956014 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggtggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 10956112  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||     
T  10956113 gaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaataatgtttcccaa 10956212  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10956213 ggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgt 10956243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4666784 - 4666559
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4666784 cacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctggg---gagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaaga 4666688  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataag--tctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4666687 gatatcaatggattacaagaataaggatctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaacctagagactcaatcataatagtgtttccc 4666588  T
Q  199 agggtgaatcaaccctcaaaccctagtgt 227  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||    
T  4666587 aagatgaatcaaccctcaaaccctagtgt 4666559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1321749 - 1321520
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1321749 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 1321651  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  1321650 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 1321551  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1321550 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 1321520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 1626670 - 1626899
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1626670 cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatcgacctagtctgggcgagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaaga 1626768  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  1626769 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccaatctctccccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaa 1626868  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1626869 ggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgt 1626899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18099157 - 18099386
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  18099157 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccatattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaatgttacaaaaga 18099255  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  18099256 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 18099355  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099356 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 18099386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 28761415 - 28761645
Alignment:
Q  2 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaa-ttgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28761415 acaaaagaatttgtttacccagttcgatccaaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaaga 28761514  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  28761515 gatatcaatgggttacaagaataagtatcccgcctaattctacctaaagtctcaatatcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaa 28761614  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  28761615 ggtgaatcaactctcaaacccttgtgtttgt 28761645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 9604594 - 9604821
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9604594 cacaaaagaatttgttgacctagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 9604692  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  9604693 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaacctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 9604792  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9604793 ggtgaatcaaccctcaaaacctagtgttt 9604821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 10958313 - 10958539
Alignment:
Q  4 aaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||     
T  10958313 aaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgaagagtaacgttacaaaagagaa 10958411  T
Q  104 atcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggt 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  10958412 atcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtgtcagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 10958511  T
Q  204 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10958512 gaatcaaccttcaaaccctagtgtttgt 10958539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24979978 - 24979748
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaacctt-acaaaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||     
T  24979978 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacgtttacaaaaa 24979880  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  24979879 agatattaatttgttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtatttccca 24979780  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24979779 aggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 24979748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 5926755 - 5926980
Alignment:
Q  5 aaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagata 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  5926755 aaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagtcatccgtttcattata-tgatgagtaaccttacaaaagatata 5926853  T
Q  105 tcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtg 204  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  5926854 taaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggcg 5926953  T
Q  205 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  5926954 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 5926980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25533712 - 25533483
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25533712 cacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 25533614  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     
T  25533613 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttcccaa 25533514  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25533513 ggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgt 25533483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43228561 - 43228332
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  43228561 cacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 43228463  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  43228462 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 43228363  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43228362 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 43228332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 43423450 - 43423679
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  | ||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  43423450 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctcagggagagagcagctctcagtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 43423548  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  43423549 gatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 43423648  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423649 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 43423679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 51726994 - 51727222
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  51726994 cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 51727092  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  51727093 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttaccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 51727192  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51727193 ggtgaatcaaccctcaaaccc-agtgtttgt 51727222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 53915483 - 53915712
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  53915483 cacaaaagaatttgttgacccagttcagtcaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcacta-aatgatgagtaacattacaaaaga 53915581  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||     
T  53915582 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaataatgtttcacaa 53915681  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  53915682 ggtaaatcaaccatcaaaccctagtgtttgt 53915712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43226350 - 43226126
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  43226350 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaat 43226252  T
Q  106 caatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtga 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  43226251 caatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 43226152  T
Q  206 atcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  43226151 atcaacccacaaaccctagtgtttgt 43226126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 53468440 - 53468670
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtat--gggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53468440 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtctggggggtagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaa 53468539  T
Q  99 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  53468540 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccaatctctccccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttccc 53468639  T
Q  199 agggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 229  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  53468640 aaggtgaatcaatgctcaaaccctagtgttt 53468670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3859797 - 3859569
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||   ||||||| ||    
T  3859797 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctacgatccactata-tgatgagtattgttacaaa-ga 3859700  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  3859699 gaaatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 3859600  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3859599 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 3859569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 7606575 - 7606803
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||  |    
T  7606575 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgacgagtaacgttacaaat-a 7606672  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  7606673 gaaatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 7606772  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7606773 ggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgt 7606803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 27101168 - 27101397
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  27101168 cacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctattctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaacgttgcaaaaga 27101266  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  27101267 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccattctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 27101366  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27101367 ggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgt 27101397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 28101989 - 28102218
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||  | || |||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  28101989 cacaaaagaatttgttgacctagtttggtccaaattgacctagctttggggagagagcagccatccgttccactata-tgataagtaactttacaaaaga 28102087  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  28102088 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagcgtttcccaa 28102187  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28102188 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 28102218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30006111 - 30005882
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | | || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30006111 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctaatctaggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 30006013  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||     
T  30006012 gaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaa 30005913  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30005912 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 30005882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 42990574 - 42990345
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  42990574 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcaccata-tgatgagtaacgttacaaaaga 42990476  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  42990475 gaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 42990376  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  42990375 ggtgaatcaaccctcaaaacctaatgtttgt 42990345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 43421402 - 43421631
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | || ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  43421402 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 43421500  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |  | |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  43421501 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaatccccaatcttttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaa 43421600  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43421601 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 43421631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11170673 - 11170445
Alignment:
Q  2 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11170673 acaaaagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagag 11170575  T
Q  102 atatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagg 201  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  11170574 aaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagacactcaatcctaatagtgtttcccaag 11170475  T
Q  202 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11170474 gtgaatcaatccgcaaaccctagtgtttgt 11170445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6484630 - 6484411
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  6484630 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaaaa 6484532  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  6484531 gatatcaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaaaccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaaacctaatagtgtttcccaa 6484432  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccc 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6484431 ggtgaatcaaccctcaaaccc 6484411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 4103883 - 4104111
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||    
T  4103883 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-ga 4103980  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  4103981 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 4104080  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4104081 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 4104111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18096887 - 18097116
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  18096887 cacaaaagaattcgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagctctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagg 18096985  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  18096986 gaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 18097085  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18097086 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 18097116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 51674753 - 51674982
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || || |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  51674753 cacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctggtatgggggagagagcagccctccatttcagtata-tgatgagtaacattacaaaaga 51674851  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  51674852 gatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaatcccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaa 51674951  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51674952 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 51674982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 51943640 - 51943412
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  51943640 cacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 51943542  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| | || | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  51943541 gacgtcaatgagttacaagaa-aagtctcccgcctaattctacctaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 51943443  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943442 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 51943412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18162933 - 18162704
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaacctt-acaaaag 99  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||     
T  18162933 cacaaaaaaatttgttgacacagttcg-tccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgtttacaaaat 18162836  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18162835 aaatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 18162736  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18162735 aggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgt 18162704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 32264025 - 32264255
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa-g 99  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  32264025 cacaaaagaatt-gttgatccagtttggtccaaatagacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaaag 32264123  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||  ||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32264124 agatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagttccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 32264223  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32264224 aggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 32264255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 747019 - 746799
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  747019 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaa 746922  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  746921 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 746822  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtttg 230  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  746821 caacccacaaaccctagtgtttg 746799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 880438 - 880667
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | || |||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  880438 cacaaaagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccattttactata-tgatgagtaactttacaaaaga 880536  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  880537 gatatcaatgggttacaagaataactctcccgtctaattctacccaaagccccaatctctttccgtaaccaagagactcaatgctaatagtgtttcccaa 880636  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  880637 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 880667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 10084376 - 10084605
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10084376 cacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 10084474  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  10084475 gaaatcaacgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttcccaa 10084574  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10084575 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 10084605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15781148 - 15780912
Alignment:
Q  2 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtc---ctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |   || ||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  15781148 acaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcaggcgcccttcgttccactataatgataaataactttacaaaa 15781049  T
Q  99 gaga----tatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtt 194  Q
    ||||    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15781048 gagaaatatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctaccgaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcgtaatagtgtt 15780949  T
Q  195 tcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15780948 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 15780912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6232070 - 6231849
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| |||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  6232070 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatcggggggagacagcagccctccgttc-actgtaatgatgagtagctttacaaaaga 6231972  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||     
T  6231971 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa-tcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaacactaatagtgtttcccaa 6231873  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctag 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6231872 ggtgaatcaaccctcaaaccctag 6231849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 5522614 - 5522842
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||    
T  5522614 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-ga 5522711  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  5522712 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 5522811  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5522812 ggtaaatcaacccacaaacccgagtgtttgt 5522842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36012097 - 36011868
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36012097 cacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgaagaagagagcagccctctgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 36011999  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||     
T  36011998 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccaactaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagatattcaatcctaatagtgtttcccaa 36011899  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36011898 cgtgaatcaaccctcaaaccatagtgtttgt 36011868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 25688147 - 25688367
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaacctt-acaaaag 99  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  25688147 cacaaaagaactttttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgcgtaacgtttacaaaag 25688245  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25688246 agatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 25688345  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccc 221  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  25688346 aggtgaatcaaccctcaaaccc 25688367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25389167 - 25388947
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  25389167 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaa 25389070  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  25389069 tgggttacaagaatatgtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgttt-ccaaggtgaat 25388971  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  25388970 caacccacaaaccctagtgtttgt 25388947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5191921 - 5191694
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||| | ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||    
T  5191921 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagaacagccctctgatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-ga 5191825  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  5191824 gaaatcaatgggttacaagaatgagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 5191725  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5191724 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 5191694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 47148890 - 47149110
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  47148890 aatttgttgacctagttcgggccaaattgacatagtctgggggagagagcagtcctctgtttcactata-tgatgagtaacgatacaaaagagatatcaa 47148988  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatc 208  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  47148989 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagacccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt-ccaaggtgaatc 47149087  T
Q  209 aaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||| ||||| || |||||||||    
T  47149088 aaccatcaaatcccagtgtttgt 47149110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 48361658 - 48361887
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||  |||||| | ||||||||| || |||||||    
T  48361658 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttttactatatt-atgagtaacgttgcaaaaga 48361756  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| | || | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  48361757 gatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagccccaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 48361856  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48361857 tgtgaatcaaccctcaaaccctagtttttgt 48361887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32219355 - 32219125
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaacctt-acaaaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||     
T  32219355 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggagagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacgtttacaaaaa 32219257  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  32219256 agatatcaatgggttacaaaaataagtcttccgcctaattctgcccaaagtcccaatctcttcccgcaaccaagagactcaatcctgatagtgtttccca 32219157  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32219156 aggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgt 32219125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38210631 - 38210411
Alignment:
Q  10 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||||||    
T  38210631 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 38210534  T
Q  110 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatc 208  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  38210533 gagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 38210434  T
Q  209 aaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  38210433 aacccacaaaccctagtgtttgt 38210411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6562028 - 6561851
Alignment:
Q  55 gagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa-gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctc 153  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  6562028 gagcagccctccgctccactataatgatgagttaccttacaaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc 6561929  T
Q  154 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6561928 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccccagtgtttgt 6561851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39715735 - 39715510
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||| |||||||||| |||||  ||  | || ||| ||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  39715735 cacaaaagaatttgttgacctagtttggtccaaaatgatctagtatgggggagag--caaccatctgtttcactat---gatgagtaactttacaaaaga 39715641  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  39715640 gatatcaatgggttgcaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaa 39715541  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39715540 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 39715510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 12267962 - 12268180
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12267962 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 12268060  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |           |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  12268061 g-----------ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccgaa 12268149  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12268150 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 12268180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 10621525 - 10621745
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||    
T  10621525 aatttgttgacccagttcggtccaatctgagctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaa 10621622  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  10621623 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 10621722  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtttg 230  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  10621723 caacccacaaaccctagtgtttg 10621745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 22114292 - 22114521
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | || |||| |||||| ||  |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22114292 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttactttgtttgggggagagatcatccctccgattcattata-tgatgagtaacgttacaaaaga 22114390  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  22114391 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 22114490  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22114491 ggtgaatcaacccacaaaacctagtgtttgt 22114521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26720817 - 26720589
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  26720817 cacaaaagaatttggtgacccagttcggtccaaattgacctaatctaggggagagagcagtcatccgttccactata-tgatgagtatcgttacaaaaga 26720719  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |  ||||     
T  26720718 gaaatcaaagggttaaaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagt-taacccaa 26720620  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26720619 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 26720589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 458545 - 458326
Alignment:
Q  10 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||||||    
T  458545 atttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 458448  T
Q  110 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatc 208  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  458447 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 458348  T
Q  209 aaccctcaaaccctagtgtttg 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  458347 aacccacaaaccctagtgtttg 458326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 13420219 - 13420399
Alignment:
Q  48 ggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccag 147  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  13420219 ggtgagagagcagctctccgttccattataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaa 13420318  T
Q  148 agtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  13420319 agtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaactc---aaccctagtgtttgt 13420399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5886468 - 5886261
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| || |||| ||    
T  5886468 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgtttcaaa-ga 5886371  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||     
T  5886370 caaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgttt-ccaa 5886272  T
Q  201 ggtgaatcaac 211  Q
    |||||||||||    
T  5886271 ggtgaatcaac 5886261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5899941 - 5899734
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| || |||| ||    
T  5899941 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttgcaaa-ga 5899844  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||     
T  5899843 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatcacttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgttt-ccaa 5899745  T
Q  201 ggtgaatcaac 211  Q
    |||||||||||    
T  5899744 ggtgaatcaac 5899734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 6063441 - 6063661
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||    
T  6063441 aatttgtggacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaa 6063538  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6063539 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 6063638  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtttg 230  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  6063639 caacccacaaaccctagtgtttg 6063661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 10191305 - 10191525
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  10191305 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttagggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatgaa 10191403  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatc 208  Q
     | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  10191404 cgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtc-cagcctcttcctgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 10191502  T
Q  209 aaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  10191503 aacccacaaaccctagtgtttgt 10191525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 456168 - 455949
Alignment:
Q  10 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||   |||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||||||    
T  456168 atttgttgacccagttcggtccaacccgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 456071  T
Q  110 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatc 208  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  456070 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 455971  T
Q  209 aaccctcaaaccctagtgtttg 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  455970 aacccacaaaccctagtgtttg 455949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17795529 - 17795302
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||| |||||||||| ||| | |||| | |||||||||||||| | || |||||||||| | |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17795529 cacaagagaatttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagccttccgtttcattataatgatgagtaactttacaaaaga 17795430  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  17795429 gatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcccaa 17795330  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     ||||||||||||   |||||||||||||||    
T  17795329 agtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgt 17795302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19103969 - 19103742
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||| |||||||||| ||| | |||| | |||||||||||||| | || |||||||||| | |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19103969 cacaagagaatttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagccttccgtttcattataatgatgagtaactttacaaaaga 19103870  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  19103869 gatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcccaa 19103770  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     ||||||||||||   |||||||||||||||    
T  19103769 agtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgt 19103742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23633723 - 23633499
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  23633723 cacaaaagaatttgtttacccatttcggtctaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccttttcactataatgatgagtaactttacaaa-ga 23633626  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  23633625 gatatcatcgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc-- 23633528  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||| ||||||||  | |||||||||||||||    
T  23633527 ggtaaatcaacc--ccaaccctagtgtttgt 23633499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 28413018 - 28413248
Alignment:
Q  1 cacaaaagaa-tttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaag 99  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |    
T  28413018 cacaaaagaaatttgttgacctaattcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-g 28413115  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagac-tcaatcataatagtgtttccc 198  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  28413116 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttccc 28413215  T
Q  199 agggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28413216 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 28413248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11168371 - 11168165
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||    
T  11168371 cacaaaagaatttgttgaccaagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccaatata-tgataagtaacgttacaaaaga 11168273  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  11168272 gaaatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaattcccagcctcttcccgtaaccaagacactcaatcctaatagtgtttcccaa 11168173  T
Q  201 ggtgaatc 208  Q
    ||||||||    
T  11168172 ggtgaatc 11168165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 53591442 - 53591225
Alignment:
Q  12 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgt 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  53591442 ttgttgacctagttcgatccaaattgacctagtctggg-gagagagcatcccttcgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaatgagatatcaatgg 53591345  T
Q  112 gttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaac 211  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||    
T  53591344 attagaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatccaaatctattctcgtaaccaagagactcaattcgaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 53591245  T
Q  212 cctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  53591244 cctcaaaccctagtgtttgt 53591225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 50494260 - 50494040
Alignment:
Q  10 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||||||    
T  50494260 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 50494163  T
Q  110 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatc 208  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  50494162 gggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatcccttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 50494063  T
Q  209 aaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  50494062 aacccacaaaccctagtgtttgt 50494040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 51 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29956906 - 29956727
Alignment:
Q  51 gagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagt 150  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  29956906 gagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 29956808  T
Q  151 ctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    | ||  |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  29956807 cccagcctcttctcgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctaatgtttgt 29956727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Original strand, 889779 - 889988
Alignment:
Q  20 ccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaag 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || | |||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  889779 ccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagaaatcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcagtgggttacaag 889877  T
Q  120 aataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaac 219  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  889878 aataactctcctgcctaattctacccaaagccccaa-ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaaac 889976  T
Q  220 cctagtgtttgt 231  Q
    || |||||||||    
T  889977 cccagtgtttgt 889988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 6065791 - 6066012
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| | || |||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||    
T  6065791 aatttgttgacccagttctgtccaatctgacctagtctaggggagagagcagccatccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaa 6065888  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6065889 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 6065988  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  6065989 caacccacaaaccctagtgtttgt 6066012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 35917944 - 35918160
Alignment:
Q  14 gttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgt 113  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||| ||| || | ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  35917944 gttgatccagttcggtctaaattgacc-agtctgagggagagagcagctctccgttccactata-taatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 35918041  T
Q  114 tacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccc 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | || || ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  35918042 tacaagaataagtctccctcctatttctacccaaattcccagtctcttctcgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcgcaaggtgaatcaaccc 35918141  T
Q  214 tcaaaccctagtgtttgtg 232  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  35918142 tcaaactctagtgtttgtg 35918160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31151609 - 31151404
Alignment:
Q  7 agaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 105  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  31151609 agaatttgtttacccagttcagcccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataacaatgagtaactttacaaaagagatat 31151510  T
Q  106 caatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtga 205  Q
    ||  | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  31151509 ca--gggttacaagaataagtcacccgcctaattctacccaaagtcccaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 31151412  T
Q  206 atcaaccc 213  Q
    ||||||||    
T  31151411 atcaaccc 31151404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 561769 - 561974
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgg-gtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatc 106  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||  ||||||||| ||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  561769 aatttgtttacccggttcggtccaaaactgacctagtctggagggagagagcagcccttcgttccactataatgatgagtaactttacaaaaaagatatc 561868  T
Q  107 aatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaa 206  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||    
T  561869 aatgacttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtctcaatctcttcacgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaatgtgaa 561968  T
Q  207 tcaacc 212  Q
    ||||||    
T  561969 tcaacc 561974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Original strand, 47701660 - 47701801
Alignment:
Q  3 caaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagaga 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47701660 caaaagaatttgttgatccagttcgatccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagaga 47701758  T
Q  103 tatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctaccc 145  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47701759 tatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccc 47701801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25635644 - 25635424
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    |||||||| || ||||| | ||||||||| |||||    || |||||||||  |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  25635644 aatttgtttacgcagtttggtccaaattggcctagccgaggggagagagcaaccctctgtttcaccataatgatgagtaactttacaaaatagatatcaa 25635545  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatc 208  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  25635544 tgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaacc 25635445  T
Q  209 aaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    || |  | |||||||||||||||    
T  25635444 aatc--ccaaccctagtgtttgt 25635424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 54691564 - 54691790
Alignment:
Q  4 aaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagat 103  Q
    |||||||||||| |||| |||||  | ||||||||| |||| | || |||||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  54691564 aaaagaatttgtcgacctagttcagttcaaattgacatagtctaggggagagagcagccctccgtttaactata-tgatgggtaacgttacaaaagagat 54691662  T
Q  104 atcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggt 203  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| || || || |  ||||||||||| ||||||| | | |||||| ||||||||||||||| |||    
T  54691663 atcaatgaaatacaagaataagtctcccgcctaattcaactcaaagccctaatctcttcccataaccaaaaaattcaatcctaatagtgtttcccaaggt 54691762  T
Q  204 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54691763 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 54691790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 27635645 - 27635830
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27635645 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 27635743  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||            |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27635744 gatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattttacccaaag------------cccgtaaccaagagactcaatcttaatattgtttccca 27635830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 54884362 - 54884196
Alignment:
Q  64 tccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcc 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||| |||| |||||  || ||| |||||||||| |    
T  54884362 tccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatagattacaa-aataagtctccctcctaattctattcaaagtttcaatctctttc 54884264  T
Q  164 cgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54884263 tgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaagatgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgt 54884196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 3307030 - 3306839
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||  | ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3307030 cacaaaagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtctagg--agagagcaaccatccttttcactataatgatgagtaactttacaaaaga 3306933  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtt 194  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    |||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3306932 gatatcaatgggttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaaactccaatatctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 3306839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 107 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35777587 - 35777462
Alignment:
Q  107 aatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtga 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  35777587 aatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 35777488  T
Q  206 atcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  35777487 atcaacccacaaaccctagtgtttgt 35777462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 42992540 - 42992327
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||| | |||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  42992540 cacaaaaaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgattcactat-atgatgactaacgttacaaaaga 42992442  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||               ||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  42992441 gaaatcaatgagttacaagaataa---------------ctacccaaagtc-cactctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaa 42992358  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42992357 ggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgt 42992327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 53597472 - 53597279
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcct 135  Q
    ||||||||| || | |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||  ||||    
T  53597472 tgacctagtttgtgggagagagcaaccctccattccactataatgatgagtaactttacaaaagaaatatcaacgggttacaagaataagtctcttgcct 53597373  T
Q  136 atttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    | |||||| || | ||||||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  53597372 aattctactcaaaatctcaatctattctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa--cttcaaccctagtgtttgt 53597279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 24181644 - 24181486
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||  ||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24181644 aatttgtttacccaattcggtccaaaactgacctagtttggaggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagaaatatca 24181545  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgt 166  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  24181544 atgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccaatcttttcccgt 24181486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1674160 - 1674015
Alignment:
Q  84 agtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatc 183  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1674160 agtaactttacaaaagacatatcaaagggttacacgaataagtctcccgtctatttctacccaaagtcccaatctcttcccgtgatcaagagactcaatc 1674061  T
Q  184 ataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  1674060 ctaatagtgtttcccatggtgaatcaatcct--aaccctagtgtttgt 1674015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 36871295 - 36871516
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||    
T  36871295 aattcgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgattaactttac-aaagagataaca 36871393  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaa 206  Q
    | | ||| |||||||||||| ||   |||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||    
T  36871394 aagggttgcaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgaccaagagactcaatcttaacagtgttttccaaggtgaa 36871493  T
Q  207 tcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||| |||  |||||| ||||||||    
T  36871494 tcaatcct--aaccctggtgtttgt 36871516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Original strand, 28100143 - 28100257
Alignment:
Q  117 aagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctca 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  28100143 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagcgttttccaaggtgaatcaaccctca 28100242  T
Q  217 aaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||    
T  28100243 aaccctagtgtttgt 28100257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23637200 - 23637066
Alignment:
Q  95 aaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtt 194  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||    
T  23637200 aaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctaatatcttcccatgaacaagagactcaatcctaatagtgtt 23637101  T
Q  195 tcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    || || ||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  23637100 tctcaaggtaaatcaacc--caaaccctagtgtttgt 23637066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 210
Target Start/End: Original strand, 14634491 - 14634638
Alignment:
Q  64 tccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttc 162  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| |   |||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  14634491 tccgttccactattatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaggtttacaagaatcagtcttcaaacctaatgctacccaaagtctcaatctcttc 14634590  T
Q  163 ccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 210  Q
     ||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14634591 tcgtgactaagagacacaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 14634638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Original strand, 28137415 - 28137522
Alignment:
Q  124 agtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaacccta 223  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  28137415 agtcttccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagacttcatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaacccta 28137514  T
Q  224 gtgtttgt 231  Q
    ||||||||    
T  28137515 gtgtttgt 28137522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28181182 - 28181063
Alignment:
Q  112 gttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaac 211  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||    
T  28181182 gttataagaatacgtctcccgcctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaatagactcaatcctaatggtgtttcccaaagtgaatcaac 28181083  T
Q  212 cctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||| || |||||||||    
T  28181082 cctcaaatcccagtgtttgt 28181063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 210
Target Start/End: Original strand, 1620483 - 1620657
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcc 134  Q
    ||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||||||||  || | ||   ||    
T  1620483 tgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaagtttac-aaagagatatcaaagggttacaagaactagccttcaaacc 1620581  T
Q  135 tatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 210  Q
    || ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1620582 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaaaagacctaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 1620657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 25634150 - 25634030
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    |||||||| ||| |||||| | ||||||| |||||| |||  |||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25634150 aatttgtttacctagttcggtgcaaattgtcctagtctggtggagagagcagccattcgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 25634051  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctc 129  Q
    ||  |||||||||||||||||    
T  25634050 tggattacaagaataagtctc 25634030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 35919102 - 35919178
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  35919102 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata 35919178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 75 - 228
Target Start/End: Original strand, 4560352 - 4560497
Alignment:
Q  75 ataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaaga 174  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||    |||    | ||||| ||||||||| ||   ||||||||||| |||||||| |    
T  4560352 ataatgatgagtaactttgcaaaagagatattaatgggttacaa----aag----ctgcctaattctacccaaagctccaatctcttccggtaaccaaca 4560443  T
Q  175 gactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 228  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4560444 ggctcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 4560497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 41849329 - 41849243
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||    
T  41849329 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactat-atgatgagtaa 41849243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Original strand, 11007545 - 11007684
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcct 135  Q
    ||||||||| | || ||||||| || || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||| |         |||    
T  11007545 tgacctagtctaggggagagaggagccccccattccactataatgatgagtaactttacaaaagagatgtcaaagagttacaagaaaa---------cct 11007635  T
Q  136 atttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatca 184  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11007636 aattctacccaaagtctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatca 11007684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 53894044 - 53894109
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctcc 66  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  53894044 cacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 53894109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13420106 - 13419922
Alignment:
Q  46 tgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg-tgttacaagaataagtctcccg-cctatttctac 143  Q
    |||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||||| ||| | ||| ||  || | ||||||    
T  13420106 tgggggagagaggagtccactattccactataatgatgagtaactttacaaa-gagatatcaaaaatgttacaaaaattattcttccaaccaaattctac 13420008  T
Q  144 ccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||| | | | |||||||| |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  13420007 ccaaaatttgaatctctttccgtgaccaagagacttgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgt 13419922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 192
Target Start/End: Original strand, 29913949 - 29914132
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagata 104  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  || || ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||    
T  29913949 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctcttcgatccactataatgatgagtttctttacaaa-gagata 29914047  T
Q  105 tcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 192  Q
    |   || ||||||||||| ||||| |   |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  29914048 t---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 29914132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 192
Target Start/End: Original strand, 10595028 - 10595213
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagaga 102  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||||||    
T  10595028 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtatgggggagagagcagctctccgttccactataatgacatgagtttctttac-aaagaga 10595126  T
Q  103 tatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 192  Q
    |||   || |||| |||||| |||| ||   |||| ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  10595127 tat---tgagttataagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtctcagcctcttcccgtgaccaagagacttaatcctaatagtg 10595213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 192
Target Start/End: Original strand, 27761980 - 27762165
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat--gagtaaccttacaaaagaga 102  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||  | ||||||| ||||    
T  27761980 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtttgggggatagagcggttctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaa-gaga 27762078  T
Q  103 tatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 192  Q
    |||   || ||||||||||| ||||| |   |||| ||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  27762079 tat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccaacctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 27762165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 192
Target Start/End: Original strand, 47878165 - 47878350
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagaga 102  Q
    ||||||||||| |||||||||| || || | ||||||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||||||    
T  47878165 aagaatttgtttacccagttcggtctaataatgacctagtctggaggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttac-aaagaga 47878263  T
Q  103 tatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 192  Q
    |||   || ||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  47878264 tat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 47878350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41849244 - 41849193
Alignment:
Q  180 aatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41849244 aatcctaatagagtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 41849193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Original strand, 10094100 - 10094256
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 133  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  10094100 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 10094195  T
Q  134 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10094196 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10094256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7768825 - 7768632
Alignment:
Q  18 acccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttac 116  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |  ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||   |||||    
T  7768825 acccaattcgatccaatactgacctagtatgggggagggagtaacccttcgttccactataataatgagtaactttac-aaaggtatattaaaaggttac 7768727  T
Q  117 aagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 210  Q
    |||||| |||| ||   |||| |||||| || |||  |||| |   ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7768726 aagaattagtcttcaaacctaattctactcaaagttccaattttagcccgtgagcaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 7768632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 82
Target Start/End: Original strand, 10612772 - 10612849
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 82  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10612772 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 10612849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10897193 - 10897008
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagaga 102  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||  | |||| |||||||    
T  10897193 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttac-aaagaga 10897095  T
Q  103 tatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 192  Q
    |||   || ||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  10897094 tat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagaatcaatcctaatagtg 10897008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Original strand, 22626009 - 22626166
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataag-tctcccg 132  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||  | |||| ||||||||   |||| ||| ||||||| || | ||       
T  22626009 tgacctagtctgggggagagagcagttctccgatccactataatgatatgagtttctttac-aaagagat---aatgagtttcaagaatcagttttcaaa 22626104  T
Q  133 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22626105 cctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22626166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24177380 - 24177335
Alignment:
Q  168 accaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccc 213  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  24177380 accaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccc 24177335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 27420915 - 27420822
Alignment:
Q  8 gaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||  ||||||| |||||| |||||||||   ||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27420915 gaatttgtttacctagttcggtccaaaactgacctactatgggggagagagcaactctatgttccattataatgatgagtaactttacaaaaga 27420822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 7418111 - 7418064
Alignment:
Q  148 agtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  7418111 agtcccaatctcttcccgtgaccaatagactcaatcataatggtgttt 7418064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 228
Target Start/End: Original strand, 7606830 - 7606873
Alignment:
Q  185 taatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7606830 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctactgtt 7606873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Original strand, 10100117 - 10100273
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 133  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  10100117 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 10100212  T
Q  134 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||| || |||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10100213 ctaattttaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10100273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Original strand, 10200980 - 10201136
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 133  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | || |||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  10200980 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttccaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 10201075  T
Q  134 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10201076 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10201136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Original strand, 10208026 - 10208182
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 133  Q
    ||||||||| || | ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  10208026 tgacctagtctgcgggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 10208121  T
Q  134 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10208122 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcgtaatagtgttt 10208182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 128
Target Start/End: Original strand, 15823641 - 15823763
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagata 104  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| || | | || ||||||||||  || |||||||||||||||| ||||  | |||| ||||||||     
T  15823641 aagaatttgtttacccaattcggtccaatattgacttactcttggagagagagcagctctacgttccactataatgaagagtttctttac-aaagagatg 15823739  T
Q  105 tcaatgtgttacaagaataagtct 128  Q
    |||| | ||||||||||| |||||    
T  15823740 tcaaagggttacaagaattagtct 15823763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 16997070 - 16996987
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatg 83  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||  ||| | | | ||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16997070 cacaagagaatttgtttacccagttcagtcccatacttacctagtctgggggagtgagcagttctccgttccactataatgatg 16996987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 42992655 - 42992608
Alignment:
Q  2 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatggg 49  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  42992655 acaaaagaattttttgactcagttcggtccaaattgacctagtctggg 42992608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6303348 - 6303310
Alignment:
Q  157 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6303348 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 6303310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 11079674 - 11079628
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 82  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11079674 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 11079628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13893509 - 13893475
Alignment:
Q  148 agtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaat 182  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13893509 agtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaat 13893475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16462241 - 16462203
Alignment:
Q  157 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16462241 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16462203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 27544311 - 27544273
Alignment:
Q  157 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27544311 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 27544273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 195
Target Start/End: Original strand, 47883026 - 47883064
Alignment:
Q  157 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  47883026 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 47883064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 82
Target Start/End: Original strand, 48390327 - 48390373
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 82  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  48390327 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 48390373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 1736388 - 1736319
Alignment:
Q  12 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga 81  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||| |||||||||| |||||  |||||||| ||||    
T  1736388 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatga 1736319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 18552966 - 18552897
Alignment:
Q  12 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga 81  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||| |||||||||| |||||  |||||||| ||||    
T  18552966 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatga 18552897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 30709873 - 30709804
Alignment:
Q  12 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga 81  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||| |||||||||| |||||  |||||||| ||||    
T  30709873 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatga 30709804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 231
Target Start/End: Original strand, 14376 - 14600
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14376 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatat 14474  T
Q  106 caatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtga 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  14475 caatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtga 14574  T
Q  206 atcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  14575 atcaaccctcaaaccctagtgtttgt 14600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15313 - 15089
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 105  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15313 aagaatttgttgagtcagttcggtccaaattgacctagcatgggggagacagcagccttccgttccactata-tgatgagtaactttacaaaagagatat 15215  T
Q  106 caatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtga 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15214 caatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagtctgaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 15115  T
Q  206 atcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  15114 atcaaccctcaaactctagtgtttgt 15089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 72)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 14419179 - 14419408
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14419179 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaaga 14419278  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
     |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  14419279 catattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaa 14419378  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14419379 ggtgaatcaaccctcaaaccccaatgtttg 14419408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 30480492 - 30480721
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||| || ||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  30480492 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccatttcactata-tgatgactaacgttacaaaaga 30480590  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  30480591 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 30480690  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30480691 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 30480721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3874356 - 3874127
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3874356 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 3874258  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  3874257 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaa 3874158  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3874157 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 3874127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32339655 - 32339426
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  32339655 cacaaaagaatttgttaacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaaga 32339557  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  32339556 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttaccaa 32339457  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32339456 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 32339426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15068327 - 15068098
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15068327 cacaaaagaatttgttggcccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccattata-tgatgagtaacgttacaaaaga 15068229  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||     
T  15068228 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaacctctttccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtatttcccaa 15068129  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15068128 ggtgaattaaccctcaaaccctagtgtttgt 15068098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25952867 - 25952637
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25952867 cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatttacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaaga 25952768  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||     
T  25952767 gatatcaatgagttacaagaataagtcttctgcctaattctacccaatgtctcaatttcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatattgttttccaa 25952668  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25952667 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 25952637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 27106886 - 27107115
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||  |||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27106886 cacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggaggagatagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaaccctacaaaaga 27106984  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  27106985 gatatctatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 27107084  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27107085 ggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgt 27107115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27911359 - 27911131
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  27911359 cacaaaagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtctggg-gagagagcaaccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaataga 27911262  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  27911261 gatatcaatgagttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 27911162  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911161 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 27911131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27957778 - 27957550
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  27957778 cacaaaagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtctggg-gagagagcaaccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaataga 27957681  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  27957680 gatatcaatgagttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 27957581  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27957580 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 27957550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 28251556 - 28251785
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28251556 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacattacaaaaga 28251654  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  28251655 gaaatcaatgggttataagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 28251754  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  28251755 ggtgaatcaacccacaaaacctagtgtttgt 28251785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 609077 - 608851
Alignment:
Q  4 aaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  609077 aaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaa 608979  T
Q  104 atcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggt 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  608978 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggt 608879  T
Q  204 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  608878 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 608851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 22684642 - 22684874
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  22684642 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaataga 22684740  T
Q  101 gatatcaatgt---gttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 197  Q
    || |||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22684741 gaaatcaatattgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 22684840  T
Q  198 cagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22684841 caaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgt 22684874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4424364 - 4424135
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  4424364 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccactata-tgatgagtaatgttacaaaaga 4424266  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  4424265 taaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccac 4424166  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4424165 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 4424135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15809564 - 15809335
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15809564 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 15809466  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  15809465 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaa 15809366  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15809365 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 15809335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14808107 - 14807868
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagag----------cagtcctccgttccactataatgatgagtaacc 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||          ||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  14808107 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacg 14808009  T
Q  91 ttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatag 190  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14808008 ttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatag 14807909  T
Q  191 tgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807908 tgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 14807868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1225513 - 1225283
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa-g 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| | | |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  1225513 cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcggccatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaag 1225415  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1225414 agatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 1225315  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1225314 aggtgaatcaaccctcaaaccgtagtgtttgt 1225283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15073057 - 15072827
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  15073057 cacaaaataatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactgta-tgatgagtaacgttacaaaaga 15072959  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatc-tcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  15072958 gatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaaccctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttcca 15072859  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15072858 aggtgaatcaaccctaaaaccctagtgtttgt 15072827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 13858477 - 13858702
Alignment:
Q  5 aaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagata 104  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13858477 aaagaatttgtttacccagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagata 13858576  T
Q  105 tcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtg 204  Q
    | |||| | | |||||||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  13858577 t-aatgggctgcaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 13858675  T
Q  205 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  13858676 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 13858702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27829642 - 27829414
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||   ||||||| ||    
T  27829642 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtattgttacaaa-ga 27829545  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  27829544 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaggtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 27829445  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27829444 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 27829414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43530461 - 43530232
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  43530461 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggagagacagcagccctccgatccactata-tgatgagtagcgttacaaaaga 43530363  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||     
T  43530362 gaaatcaatgggttacaggaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccgagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 43530263  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  43530262 ggtgaatcaaccttcaaaacctagtgtttgt 43530232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41385087 - 41384861
Alignment:
Q  4 aaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  41385087 aaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagat 41384989  T
Q  104 atcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggt 203  Q
     |||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  41384988 gtcaatgagttacaagaaaaattctcccacctaattctacctaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatggtgtttcccaaggt 41384889  T
Q  204 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41384888 gaatcaaccttcaaaccctagtgtttgt 41384861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 28283210 - 28283437
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  28283210 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-ga 28283306  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||     
T  28283307 gaaatcaatgggttgcaagaataagtctaccacctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaa 28283406  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283407 tgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 28283437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 5372168 - 5372396
Alignment:
Q  4 aaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtg-agagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagaga 102  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5372168 aaaataatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagtaaccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaaaaga 5372267  T
Q  103 tatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaggg 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5372268 tatcaatgagttacaagaataagtctgccgcctaattatactcaaagtcccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagg 5372367  T
Q  203 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5372368 tgaattaaccctcaaaccctagtgtttgt 5372396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15956303 - 15956077
Alignment:
Q  2 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagag 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | || | ||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15956303 acaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctaatctgagggagagagaaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagag 15956204  T
Q  102 atatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| |    
T  15956203 atatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaaaagattcaatcctaacagtgtttcccaag 15956104  T
Q  202 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||    
T  15956103 gtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgt 15956077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18813227 - 18812999
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||   ||||||| ||    
T  18813227 cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctaatatgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtattgttacaaa-ga 18813130  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  18813129 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtacccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 18813030  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18813029 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 18812999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27827331 - 27827103
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||   ||||||| ||    
T  27827331 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtattgttacaaa-ga 27827234  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  27827233 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaggtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 27827134  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27827133 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 27827103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36865883 - 36865655
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtat-gggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaag 99  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36865883 cacaagagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagcattccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaag 36865784  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36865783 agatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccaatctcttcccgt---gaagagactcaatcctaatagtgtttccca 36865687  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36865686 aggtgaatcaaccctcaaaccctaatgtttgt 36865655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 15185706 - 15185928
Alignment:
Q  4 aaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15185706 aaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagaacagtcctccgtttcactataatgatgagtaaccttaaaaaagagat 15185805  T
Q  104 atcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaacca--agagactcaatcataatagtgtttcccagg 201  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||       ||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||  || |    
T  15185806 atcaatgggttacaagaataggtctctcgcctaattctaccca-------aatctcttcccgtaaccaagagagactcaattctaatagtgttttacaag 15185898  T
Q  202 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15185899 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 15185928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21482649 - 21482430
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21482649 aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttctttataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 21482550  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatc 208  Q
    || |||||||||||||||| | |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  21482549 tgggttacaagaataagtcactcgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgactc 21482450  T
Q  209 aaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||   |||||||||||||||    
T  21482449 aaccc---aaccctagtgtttgt 21482430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43079940 - 43079719
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||    
T  43079940 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaa 43079843  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  43079842 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 43079743  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  43079742 caacccacaaaccctagtgtttgt 43079719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18811053 - 18810825
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||   ||||||| ||    
T  18811053 cacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtattgttacaaa-ga 18810956  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  18810955 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctattcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 18810856  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18810855 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 18810825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 41383008 - 41382820
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41383008 cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 41382910  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatag 190  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41382909 gatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatag 41382820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21480832 - 21480637
Alignment:
Q  18 acccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttaca 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21480832 acccagttcgttccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttaca 21480733  T
Q  118 agaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccc 213  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| | |  | |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21480732 agaataagtcacccgcctaattctaccaaaaaccccaatatcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 21480637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44721181 - 44720960
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||    
T  44721181 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagctctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaa 44721084  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg-tttcccagggtgaat 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  44721083 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttcccaaggtgaat 44720984  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  44720983 caacccacaaaccctagtgtttgt 44720960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43082311 - 43082090
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||    
T  43082311 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaa 43082214  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  43082213 tgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctgatagtgtttcccaaggtgaat 43082114  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  43082113 caacccacaaaccctagtgtttgt 43082090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31162551 - 31162343
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtg--agagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 105  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31162551 aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatat 31162452  T
Q  106 caatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtga 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  31162451 caatgagttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagtcccaatctcttccggtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 31162352  T
Q  206 atcaaccct 214  Q
    |||||||||    
T  31162351 atcaaccct 31162343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 210
Target Start/End: Original strand, 3005624 - 3005829
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagata 104  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3005624 aagaatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagagcacccctccgttccactataatgatgagcaactttacaaaagagata 3005723  T
Q  105 tcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtg 204  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||    
T  3005724 tcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgaccaagagactcaatgctaatagtgttttccaaagtg 3005823  T
Q  205 aatcaa 210  Q
    ||||||    
T  3005824 aatcaa 3005829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 24873178 - 24873398
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||| || |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||    
T  24873178 aatttgttgactcaattcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaa 24873275  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24873276 tcggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttccaaaggtgaat 24873375  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtttg 230  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  24873376 caacccacaaaccctagtgtttg 24873398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14477522 - 14477393
Alignment:
Q  102 atatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagg 201  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  14477522 atatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagcgtttcccaag 14477423  T
Q  202 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14477422 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 14477393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 210
Target Start/End: Original strand, 31578273 - 31578476
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||| | | ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31578273 aatttgtttacccagttcggtcctatactgacctagtctaggggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 31578372  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaa 206  Q
    |   ||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31578373 aaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcataacagtgtttcccaaggtgaa 31578472  T
Q  207 tcaa 210  Q
    ||||    
T  31578473 tcaa 31578476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31035459 - 31035252
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgaccta--gtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 105  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | |||||||  || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  31035459 aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctatagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagatat 31035361  T
Q  106 caatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtg 204  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |   |||| ||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  31035360 caaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacctaaagtctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcataacggtgtttcccaaggtg 31035261  T
Q  205 aatcaaccc 213  Q
    |||||||||    
T  31035260 aatcaaccc 31035252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 33541399 - 33541606
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33541399 cacaaaagaaatttttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaaga 33541497  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||||||||||                      |||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  33541498 gatatcaatg----------------------cctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaa 33541575  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33541576 tgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 33541606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 51 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 181795 - 181622
Alignment:
Q  51 gagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagt 150  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  181795 gagagagcagtcatctgtttcactat---gatgagtaactttacaaa-gagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagt 181700  T
Q  151 ctcaatctcttcc--cgtaaccaagagactcaatcat-aatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagt 225  Q
    | || ||||||||  |||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  181699 cccattctcttcccgcgtaactaagagacttaatcctaaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagt 181622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 2468126 - 2468259
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2468126 aatttgtttacctagttctgtccaaattgacctaatctgggagagagagcagccctctatttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 2468225  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttcta 142  Q
    || | ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  2468226 tgggctacaagaataagtctcccgtctaattcta 2468259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 210
Target Start/End: Original strand, 31573794 - 31573924
Alignment:
Q  81 atgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactc 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| |   |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31573794 atgagtaactttacaaaagagatatcaaagaattacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc 31573893  T
Q  180 aatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 210  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31573894 aatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaa 31573924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17847830 - 17847677
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cc 134  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||        |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |   ||    
T  17847830 tgacctagtctgggggagagagcagccctccattccactataatgatt-------ttacaaaagagatatcaaag-gttacaagaattagtcttcaaacc 17847739  T
Q  135 tatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 196  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  17847738 taattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagattcaatcctaatagtgtttc 17847677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 3896162 - 3895972
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| || || |||||||||| | ||| ||| |||||| |||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3896162 aatttgtttactcaattcgatccaatactgatctactatgggggagagagcagccatccgttctactttaatgatgagtaactttacaaaagagatatca 3896063  T
Q  108 -atgtgttacaagaa-taagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 196  Q
     | | |||||||||| ||| | ||   |||| || ||| || |||| |||| ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||    
T  3896062 taagagttacaagaattaattttcaaacctaattatactcaaagtcccaatttcttcccgtgacgaagagactcaatcgcaatagtgtttc 3895972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 231
Target Start/End: Original strand, 5622878 - 5622956
Alignment:
Q  153 caatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5622878 caatctcttcccgtaatcaagagactcaatccaaataatgtttccaaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 5622956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6376300 - 6376141
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcc 134  Q
    ||||||||| || | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   || |||||||| |||| ||   ||    
T  6376300 tgacctagtctgagggagagagcagccttctgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaaaaggtaacaagaattagtcttcaaacc 6376202  T
Q  135 tatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    || ||||||  | |||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6376201 taattctacataaagtctcaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcttaacagtgttt 6376141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 231
Target Start/End: Original strand, 37214317 - 37214409
Alignment:
Q  130 ccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 229  Q
    ||||||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||         |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37214317 ccgcctaattctacccaaagttccaatcgcttcccgtaaccaagagactcaat---------gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 37214407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 37214253 - 37214312
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcag 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  37214253 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcag 37214312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 16833886 - 16833789
Alignment:
Q  11 tttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    |||||| ||||||||||  | ||| |||| |||| || | |||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16833886 tttgtttacccagttcgtccaaaagtgacttagtctgtgggagagagcagcctttcgttccactataatgttgagtaactttacaaaagagatatcaa 16833789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26775378 - 26775318
Alignment:
Q  171 aagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26775378 aagagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaattaaccctcaaaccctagtgtttgt 26775318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 28328064 - 28327908
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 133  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  28328064 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 28327969  T
Q  134 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28327968 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28327908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 126
Target Start/End: Original strand, 35872479 - 35872553
Alignment:
Q  51 gagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagt 126  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  35872479 gagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggcttacaaaaataagt 35872553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 228
Target Start/End: Original strand, 35872555 - 35872598
Alignment:
Q  185 taatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35872555 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 35872598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 14419786 - 14419732
Alignment:
Q  51 gagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 105  Q
    |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14419786 gagagagcagccatccgttttactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 14419732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 14477597 - 14477548
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacc-cagttcgatccaaattgacctagtatggg 49  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14477597 cacaaaagaatttgttgaccgcagttcgatccaaattgacctagtctggg 14477548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Original strand, 17799418 - 17799606
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagaga 102  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||||||    
T  17799418 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggagagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttac-aaagaga 17799516  T
Q  103 tatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||   || |||| |||||| |||| ||   |||| || ||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17799517 tat---tgagttataagaatcagtcttcaaacctaattatactca-agtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 17799606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Original strand, 16757293 - 16757449
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 133  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  16757293 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 16757388  T
Q  134 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16757389 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16757449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 195
Target Start/End: Original strand, 13985135 - 13985262
Alignment:
Q  67 gttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctc-aatctcttcccg 165  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| ||  |||||  ||| | ||||||||||| ||| ||   |||| ||||||||| |||| | |||||||||| |    
T  13985135 gttccactataatgaggggtaactttataa--gagattccaaagggttacaagaatcagtttcaaacctaattctacccaaagtcccgaatctcttcctg 13985232  T
Q  166 taaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13985233 tgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13985262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 213
Target Start/End: Original strand, 2468261 - 2468306
Alignment:
Q  168 accaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccc 213  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2468261 accaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 2468306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 4696689 - 4696620
Alignment:
Q  12 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga 81  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||| |||||||||| |||||  |||||||| ||||    
T  4696689 ttgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatga 4696620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Original strand, 9021101 - 9021289
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat--gagtaaccttacaaaagaga 102  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||  ||||||||||  ||||| || |||||||||||  ||||  | ||||||| ||||    
T  9021101 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctggtggagagagcagctctccgatctactataatgatatgagtttctttacaaa-gaga 9021199  T
Q  103 tatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||   || ||||||||||| ||||| |   |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9021200 tat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 9021289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21034057 - 21033870
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagaga 102  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||||||    
T  21034057 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtatggggaaaagagcagatctccgttccactataatgatatgagtttctttac-aaagaga 21033959  T
Q  103 tatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||   || ||||||||||| |||| ||   |||||||||||||| |||| | | | ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21033958 tat---tgagttacaagaattagtcttcaaacctatttctaccca-agtc-ccagcccttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 21033870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 195
Target Start/End: Original strand, 16752666 - 16752704
Alignment:
Q  157 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16752666 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16752704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 28895540 - 28895502
Alignment:
Q  157 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28895540 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28895502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 35872442 - 35872476
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaat 35  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35872442 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat 35872476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Original strand, 7412345 - 7412414
Alignment:
Q  12 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga 81  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||| ||||||||||  ||||  |||||||| ||||    
T  7412345 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 7412414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 82
Target Start/End: Original strand, 23179555 - 23179632
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 82  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  23179555 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctatccgttccactataatgat 23179632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 6599140 - 6599096
Alignment:
Q  12 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagaga 56  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  6599140 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 6599096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 6674593 - 6674549
Alignment:
Q  12 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagaga 56  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  6674593 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 6674549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 183630 - 183858
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  183630 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacattacaaaaga 183728  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  183729 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctt-ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 183827  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183828 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 183858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 52307 - 52081
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagag--cagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagat 103  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||  ||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  52307 aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagat 52209  T
Q  104 atcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggt 203  Q
     |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  52208 gtcaatgagttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 52109  T
Q  204 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52108 gaatcaatcctcaaaccctagtgtttgt 52081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 50308 - 50234
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtat--gggtgagagagcagtcctccgttccactataa 78  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  50308 aagaatttgttgacccagttaggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactataa 50234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 85)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 11739548 - 11739778
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11739548 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaacctttcaaaaga 11739647  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||||||||||  || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||     
T  11739648 gatatcaatggattccaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcctataaccaagagaatcaatcctaatagtgtttcccaa 11739747  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11739748 ggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgt 11739778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 6258806 - 6259031
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6258806 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggg-gagagagcagccctccgtttcactataataatgagtaactttacaaaaga 6258904  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || | |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  6258905 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagccccaa--tcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 6259002  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6259003 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 6259031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17849383 - 17849156
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17849383 cacaaaagaatttgttgacccagtcttgtccaaattgacctagtatgtgggagagagcagccc-ccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaaga 17849285  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  17849284 gatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttaccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttctcaa 17849185  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17849184 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 17849156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 34979566 - 34979797
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgag-agagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34979566 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttggggggggagagtagcccttcgttccactataatgatgaggaaccttacaaaag 34979665  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34979666 agatataaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaagtccgaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttccca 34979765  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34979766 aggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 34979797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 6264137 - 6264367
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6264137 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaaga 6264236  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| || | |||||| ||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  6264237 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctatccaaagccccaatcttttatcgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaa 6264336  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6264337 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 6264367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 19502000 - 19502229
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  19502000 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaaga 19502098  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  19502099 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 19502198  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19502199 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 19502229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 42453046 - 42452818
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  42453046 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 42452949  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  42452948 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 42452849  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  42452848 ggtgaatcaacccacaaactctagtgtttgt 42452818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 42923498 - 42923727
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  42923498 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgtttcactata-tgacgagtaactttacaaaaga 42923596  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  42923597 gatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaa 42923696  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42923697 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 42923727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 43623569 - 43623793
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  43623569 cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 43623667  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||     
T  43623668 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaa 43623767  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtg 226  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  43623768 ggtgaatcaaccctcaaaacctagtg 43623793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17848706 - 17848481
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17848706 cacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 17848608  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  17848607 gatatcaatg-gttacaagaataagtctcccgcct---tctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 17848512  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17848511 agtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgt 17848481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19007906 - 19007677
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19007906 cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 19007808  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||     
T  19007807 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagaaactcaattctaatagtgtttcccaa 19007708  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19007707 ggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgt 19007677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 45279973 - 45280202
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45279973 cacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 45280071  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  45280072 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatcccaa 45280171  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  45280172 ggtgaatcaaccctctaaacctagtgtttgt 45280202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14837534 - 14837310
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14837534 cacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcatccatccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaaga 14837435  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  14837434 gatatcaatgagttacaagaataagtcccccgcctaattctacttaaagtctcaatctcttc------ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 14837341  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14837340 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 14837310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 5375335 - 5375550
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  5375335 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat-atgatgagtaatgttacaaaaga 5375433  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  5375434 gatatcaatgggttacaagaataagtct-ccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaa 5375532  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaa 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5375533 ggtgaatcaaccctcaaa 5375550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27105063 - 27104841
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||    
T  27105063 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaatgttacaaa-ga 27104966  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  27104965 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 27104866  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagt 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  27104865 ggtgaatcaacccacaaaccctagt 27104841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 40032043 - 40032276
Alignment:
Q  2 acaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagag 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  40032043 acaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcggccctccgtttcactataatgatgagtaactttgcaaaagag 40032142  T
Q  102 a----tatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 197  Q
    |    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40032143 aaagatatcaatgggttacaagaataagtctcacgcctaattctacccaaagtcctaacctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 40032242  T
Q  198 cagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032243 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 40032276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 21520682 - 21520911
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21520682 cacaaaagaatttgttgacaaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 21520780  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  |  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  21520781 gatatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaa 21520880  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21520881 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 21520911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 22287325 - 22287554
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22287325 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 22287423  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||     
T  22287424 gatatcaacgggttacaagaataagtctcccgcccaattctacccgaagtgtcaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaataccgtttcccaa 22287523  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22287524 ggtgaatcaaccctcaaaccctaatgtttgt 22287554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 23452226 - 23452455
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  23452226 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaaaga 23452324  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  23452325 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctatccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaa 23452424  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23452425 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 23452455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 44289056 - 44289286
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||  | || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44289056 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggaaagagcaaccatctgtttcactataatgatgagtaatcttacaaaaga 44289155  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| | || | || ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  44289156 gatatcaacgggttacaagaataagttttccacttaattctaccctaagtcccaatctcttcccgtaaccaagtgactcaatcctaatagtgtttcccaa 44289255  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44289256 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 44289286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 42064781 - 42064552
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaatt-gacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||   ||||||| |    
T  42064781 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtattgttacaaa-g 42064684  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42064683 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 42064584  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42064583 aggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 42064552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 19504335 - 19504563
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  19504335 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactat-atgatgagtatcgttacaaaaga 19504433  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  19504434 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctt-ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 19504532  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  19504533 ggtgaatcaaccaacaaacccttgtgtttgt 19504563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28196901 - 28196674
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| |||||||||| | | |||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  28196901 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtc--aattgacctagtctgggggagagagcagccattcgtttcactata-tgatgagtaatgttacaaaaga 28196805  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  28196804 gatatcaatgggttacaagaataaatcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 28196705  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28196704 ggtgaatcaacccttaaaccctaatgtttgt 28196674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 13910034 - 13910262
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | || | ||||||||| |||||||||   ||||||| ||    
T  13910034 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgatccactata-tgatgagtattgttacaaa-ga 13910131  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||     
T  13910132 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaa 13910231  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13910232 ggtgaatcaacccataaaccctagtgtttgt 13910262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 231
Target Start/End: Original strand, 45239000 - 45239195
Alignment:
Q  35 ttgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcc 134  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  45239000 ttgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtatcccgct 45239098  T
Q  135 tatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    || ||||||| | |  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45239099 taattctaccaaaaaccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 45239195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 213
Target Start/End: Original strand, 11578136 - 11578309
Alignment:
Q  40 ctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctattt 139  Q
    ||||| |||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11578136 ctagtctgggggaaagagcagccctccgttcgactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaatt 11578235  T
Q  140 ctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccc 213  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11578236 ctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccgaggtgaatcaaccc 11578309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 28459179 - 28459408
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28459179 cacaaaagaatttgtttatctagttcgatccaaattgacctagtctaggt-agagagaagccctccgtttcactataatgatgagtaactttaaaaaaga 28459277  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||   || | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  28459278 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattatacctgaagccccaaactcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttgccaa 28459377  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  28459378 ggtgaatccaccctcaaatcctagtttttgt 28459408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18800302 - 18800529
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaag 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||| || |||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  18800302 cacaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaaactgacctggtctggg-gagagagtagccctccgtttcactataatgacgagtaactttacaaaag 18800400  T
Q  100 agatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || | ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18800401 agatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 18800500  T
Q  200 gggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
     |||||||||||||   |||||||||||||||    
T  18800501 aggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgt 18800529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22874397 - 22874185
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22874397 cacaagagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcagctctcagtttcactataatgatgagtaactttacaaaaga 22874298  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| | || |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||| |||     
T  22874297 gatatcaatgggttacaaaaataagtctcccacctaattctaccgaaagcctcaatctcttcccgtgactaagagactcaatcctaatactgttttccaa 22874198  T
Q  201 ggtgaatcaaccc 213  Q
    |||||||||||||    
T  22874197 ggtgaatcaaccc 22874185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 35215584 - 35215803
Alignment:
Q  10 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||||||    
T  35215584 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 35215681  T
Q  110 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatc 208  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  35215682 gagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaaactcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 35215781  T
Q  209 aaccctcaaaccctagtgtttg 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  35215782 aacccacaaaccctagtgtttg 35215803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 35217961 - 35218180
Alignment:
Q  10 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||     
T  35217961 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaac 35218058  T
Q  110 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaatc 208  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  35218059 gggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 35218158  T
Q  209 aaccctcaaaccctagtgtttg 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  35218159 aacccacaaaccctagtgtttg 35218180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 91 - 231
Target Start/End: Original strand, 15539553 - 15539693
Alignment:
Q  91 ttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatag 190  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15539553 ttacaaaagatatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagaatcaatcctaatag 15539652  T
Q  191 tgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539653 tgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 15539693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3022438 - 3022200
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataa---------tgatgagtaacct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | || ||| || |||||         ||||||||||| |    
T  3022438 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcattataacgatgataatgatgagtaactt 3022339  T
Q  92 tacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagt 191  Q
    || ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  3022338 tataaa-gagatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaaacctcaatctcttccggtaaccaagagactcaatcctaatagt 3022240  T
Q  192 gtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3022239 gtttcctaaggtgaatcaaccctcaaaccgtagtgtttgt 3022200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 210
Target Start/End: Original strand, 20146604 - 20146806
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||| | |||| |||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20146604 aattcgtttacccagttcggtccaatactgacttagtctgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 20146703  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||    
T  20146704 aagagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatctcaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctactattgtttcccaaggtgaat 20146803  T
Q  208 caa 210  Q
    |||    
T  20146804 caa 20146806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 231
Target Start/End: Original strand, 31732772 - 31732983
Alignment:
Q  8 gaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31732772 gaatttgtttacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcacaataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 31732871  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||            ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||    
T  31732872 atgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtccca------------aaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaacgtgaat 31732959  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  31732960 caaccctcaaaccttagtgtttgt 31732983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 36558853 - 36559047
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  36558853 cacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-ga 36558950  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 196  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  36558951 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 36559047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 36561130 - 36561324
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  36561130 cacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-ga 36561227  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 196  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  36561228 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 36561324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 24162212 - 24162430
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||  |||||||| |||||||||| | |||| |||||    
T  24162212 cacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtccgggggagagagcagccatccaatccactat-atgatgagtagcattac-aaaga 24162309  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||          || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  24162310 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc----------ccagcaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaa 24162399  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24162400 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 24162430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 210
Target Start/End: Original strand, 17897242 - 17897443
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17897242 aatttgtttacccagttcggaccaatactgacctagtctggg-gagagagcagccatccgttctactataatgatgagtaactttacaaaatagatatca 17897340  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17897341 aagggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaaatctcaatcttttctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 17897440  T
Q  208 caa 210  Q
    |||    
T  17897441 caa 17897443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 22407443 - 22407585
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22407443 cacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactat-atgatgagtaacgttacaaaaga 22407541  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacc 144  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  22407542 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccccctaattctacc 22407585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 196
Target Start/End: Original strand, 45332179 - 45332364
Alignment:
Q  10 atttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  | ||||||| ||||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  45332179 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaattcactata-tgatgagtacctttacaaa-gagaaatcaat 45332276  T
Q  110 gtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 196  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  45332277 gggttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 45332364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40699606 - 40699429
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cc 134  Q
    ||||||||| |||| || ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| |   ||    
T  40699606 tgacctagtctgggggaaagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaggattacaaaaataagtcttcaaacc 40699507  T
Q  135 tatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaacc 212  Q
    || ||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40699506 taattctacccaaagtcccaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 40699429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 22707740 - 22707872
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgg--gtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||  | |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22707740 cacaaaagaatttgttgacctagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaa 22707838  T
Q  99 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg 132  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22707839 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccg 22707872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 63 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20589896 - 20589763
Alignment:
Q  63 ctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcc-cgcctatttctacccagagtctcaatctctt 161  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||   |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20589896 ctccgttacactataatgatgagtaacttcacaaaagagatatcaatgggttaaaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctcaatctctt 20589797  T
Q  162 cccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20589796 cccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 20589763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 183
Target Start/End: Original strand, 37962938 - 37963109
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||||||||   | |||||    
T  37962938 aatttgtttacccagttcggtccaaattaacctagtgtgggagagagatcagtccactgtttcactataatgatgaataactttacaaaa---aaatcaa 37963034  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatc 183  Q
    ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||| || ||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  37963035 tggattacaagaataagtctctcgtctaattctacccaaagcctcaatctcttcaggtgaccaagagactcaatc 37963109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 22163011 - 22163111
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22163011 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactat-atgatgagtaacgttacaaaaga 22163109  T
Q  101 ga 102  Q
    ||    
T  22163110 ga 22163111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35107498 - 35107351
Alignment:
Q  64 tccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgc--ctatttctacccagagtctcaatctctt 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |     ||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  35107498 tccgttccactataatgatgagtaacattacaaaagagataacaaag-gttacaagaataagtcttcaaaatctaattctacccaaagtcacaatctctt 35107400  T
Q  162 cccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaa 210  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||    
T  35107399 cccgtgaccaagagactcaatcctaataatgtttctcaaggtgaatcaa 35107351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 142
Target Start/End: Original strand, 7462950 - 7463077
Alignment:
Q  15 ttgacccagttcgatccaaa-ttgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgt 113  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  7462950 ttgacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-taatgggtaacgttacaaaagagaaatcaatgagt 7463048  T
Q  114 tacaagaataagtctcccgcctatttcta 142  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7463049 tacaagaataagtctcccgcctaattcta 7463077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23871080 - 23870951
Alignment:
Q  3 caaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagaga 102  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |  | |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23871080 caaaagaatttgttgacctagtttgatccaaattgacctaatctaagggagagagcaaccctccgtttcactata-tgatgagtaaccttactaaagaga 23870982  T
Q  103 tatcaatgtgttacaagaataagtctcccgc 133  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23870981 tattaatgggttacaagaataagtctgccgc 23870951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 83 - 231
Target Start/End: Original strand, 27136195 - 27136342
Alignment:
Q  83 gagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcc-cgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaa 181  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||| || |||| |||| |||| |||| ||||||||| ||||    
T  27136195 gagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctccaaacctaattctactcaaagtcccaatttctttccgtgaccaagagattcaa 27136294  T
Q  182 tcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    || ||||||||||| ||| | ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  27136295 tcctaatagtgttttccaagatgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgt 27136342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43139606 - 43139413
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cc 134  Q
    ||||||||||| ||  | ||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||   ||||||| ||| |||||   | ||    
T  43139606 tgacctagtatagggaaaagaacagtcctctgtaccactataatgatgagtaactttacaaa-gagaaatcaaaaggttacaataattagtctttagacc 43139508  T
Q  135 tatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    || ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  43139507 taattctacctaaagtctcaatatcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgtttcccaagatgaatcaa-tctc-aaccctagtgtttgt 43139413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 63 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15694109 - 15693958
Alignment:
Q  63 ctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctc-aatctct 160  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||| |||| | |||||||    
T  15694109 ctccgttccactaaaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaaatctct 15694010  T
Q  161 tcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccagggtgaatcaac 211  Q
    ||| || |||||||||||  ||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15694009 tcctgtgaccaagagactttatcctaatagtgtttctccacggtgaatcaac 15693958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 35028807 - 35028647
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcc- 134  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||   ||||||||||| ||| | |   |     
T  35028807 tgacctagtaagggggagagagcagctctccgttccactgcaatgatgagtaattttagaaaagagatattaaaaggttacaagaattagtattcaaaca 35028708  T
Q  135 tatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  35028707 taattctacccaaagtgtcaatctcttctcgtgatcaagagactcaatcataatagtgttt 35028647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 168 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38020302 - 38020239
Alignment:
Q  168 accaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38020302 accaagagactcaatcctaatagtgtttaccatggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 38020239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 225
Target Start/End: Original strand, 38414194 - 38414291
Alignment:
Q  126 tctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagt 225  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||| |||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  38414194 tctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatcttttcc-gtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa-cctcaaaccctagt 38414291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33604143 - 33603994
Alignment:
Q  46 tgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacc 144  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||   |||| |||||| |||| ||   |||| |||| ||    
T  33604143 tgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagatatatcaaaaggttagaagaattagtcttcaaacctaattcttcc 33604045  T
Q  145 cagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
     | |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  33604044 taaagtctcaatcacttcccatgaccaaaagactcaattataatagtgttt 33603994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17921927 - 17921769
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cc 134  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||   ||||| | ||| ||||||| ||| |     ||    
T  17921927 tgacctagtctgggt-agagagcagccctccgttccactataatgatgactaactttatgaaaga---atcaaagggttgcaagaatcagttttaaaacc 17921832  T
Q  135 tatttctacccagagtctc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 196  Q
    || ||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17921831 taattctacccaaagtcccgaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 17921769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 146 - 209
Target Start/End: Original strand, 27583472 - 27583535
Alignment:
Q  146 agagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatca 209  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  27583472 agagactcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatca 27583535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 172
Target Start/End: Original strand, 13828397 - 13828503
Alignment:
Q  67 gttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccg 165  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||   | || ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13828397 gttccactataattatgagtaattttacaaaagagatatcaaagggctacaagaataagtcttcaaacataattctacccaaagtctgaatctcttcccg 13828496  T
Q  166 taaccaa 172  Q
    | |||||    
T  13828497 tgaccaa 13828503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 231
Target Start/End: Original strand, 22163106 - 22163165
Alignment:
Q  171 aagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22163106 aagagactcaacc-taatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 22163165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17943692 - 17943540
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cc 134  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||   || ||||||||||| ||||| |   ||    
T  17943692 tgacctagtctgggggagagagcagctctctgatccactataatgatgagtttctttacaaa-gagatat---tgagttacaagaattagtcttcaaacc 17943597  T
Q  135 tatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 192  Q
    || ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17943596 taattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17943540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39687139 - 39686983
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 133  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  39687139 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 39687044  T
Q  134 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  39687043 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 39686983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 26345735 - 26345661
Alignment:
Q  138 ttctacccagagtctc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaac 211  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||    
T  26345735 ttctacccaaagtctcgaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttgctaaggtgaatcaac 26345661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 192
Target Start/End: Original strand, 27517664 - 27517818
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatg--atgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccg 132  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||  | |||| ||||||||||   || ||||||||||| |||| ||       
T  27517664 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttac-aaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaa 27517759  T
Q  133 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtg 192  Q
    |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  27517760 cctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 27517818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2741097 - 2740941
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 133  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| |||||     |    
T  2741097 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtctttaaac 2741002  T
Q  134 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||| ||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2741001 ctaattctaccca-agtcccaacctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2740941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39680201 - 39680045
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 133  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| | ||| |   |    
T  39680201 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcaatcttcaaac 39680106  T
Q  134 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||| ||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  39680105 ctaattctaccca-agtctcagcctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 39680045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 195
Target Start/End: Original strand, 28458949 - 28459011
Alignment:
Q  133 cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||| ||||||||| |||| |||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28458949 cctaattctacccaaagtcccaatatctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28459011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 39287324 - 39287262
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa 98  Q
    |||||||||||| | ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  39287324 tgacctagtatgagggagagagcagctcttcgttccactataatgatgagtaattttacaaaa 39287262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Original strand, 20054759 - 20054947
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat--gagtaaccttacaaaagaga 102  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||  ||||||||||  ||||| || |||||||||||  ||||  | ||||||| ||||    
T  20054759 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctggtggagagagcagctctccgatctactataatgatatgagtttctttacaaa-gaga 20054857  T
Q  103 tatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||   || ||||||||||| ||||| |   |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20054858 tat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 20054947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 231
Target Start/End: Original strand, 22407591 - 22407627
Alignment:
Q  195 tcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407591 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 22407627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2736361 - 2736205
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 133  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |   |    
T  2736361 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaac 2736266  T
Q  134 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||| ||||||| | |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2736265 ctaattctaccaa-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2736205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 7503049 - 7502990
Alignment:
Q  138 ttctacccagagtctcaa-tctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 196  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  7503049 ttctacccaaagtctcaaatctcttcccttgaccaagatactcaatcctaatagtgtttc 7502990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 15539518 - 15539553
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaatt 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15539518 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatt 15539553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17462592 - 17462436
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga-tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-c 133  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||   | | ||| ||||||| ||||| |   |    
T  17462592 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa-gagata---aggagtttcaagaatcagtcttcaaac 17462497  T
Q  134 ctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17462496 ctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 17462436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 82
Target Start/End: Original strand, 12781246 - 12781292
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 82  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12781246 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 12781292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17932756 - 17932637
Alignment:
Q  69 tccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccg-cctatttctacccagagtctcaatctcttcccgta 167  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||   || ||||||||||| ||||| |   |||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||     
T  17932756 tccactataatgatgagtttctttacaaa-gagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccca-agtcccagcctcttcccgtg 17932662  T
Q  168 accaagagactcaatcataatagtg 192  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  17932661 accaagagactcaatcctaatagtg 17932637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 195
Target Start/End: Original strand, 22712660 - 22712698
Alignment:
Q  157 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22712660 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22712698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 195
Target Start/End: Original strand, 22717369 - 22717407
Alignment:
Q  157 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22717369 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22717407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 38191035 - 38190997
Alignment:
Q  157 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38191035 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttt 38190997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 45567447 - 45567409
Alignment:
Q  157 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  45567447 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 45567409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 8390243 - 8390174
Alignment:
Q  12 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga 81  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||| ||||||||||  ||||  |||||||| ||||    
T  8390243 ttgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatga 8390174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 14699100 - 14699031
Alignment:
Q  12 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatga 81  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||| |||||||||| |||||  |||||||| ||||    
T  14699100 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatga 14699031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 100
Target Start/End: Original strand, 41303088 - 41303121
Alignment:
Q  67 gttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41303088 gttccactataatgatgagtaactttacaaaaga 41303121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 56
Target Start/End: Original strand, 17057369 - 17057413
Alignment:
Q  12 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagaga 56  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  17057369 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagaga 17057413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 56
Target Start/End: Original strand, 17085352 - 17085396
Alignment:
Q  12 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagaga 56  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  17085352 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagaga 17085396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 79484 - 79255
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  79484 cacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 79386  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  79385 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaattctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 79286  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  79285 ggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgt 79255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 69281 - 69509
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  69281 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-ga 69378  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  69379 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 69478  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69479 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 69509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Original strand, 73160 - 73203
Alignment:
Q  186 aatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 229  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  73160 aatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 73203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 231
Target Start/End: Original strand, 73211 - 73241
Alignment:
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73211 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 73241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4294 - 4069
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4294 cacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaaga 4197  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  4196 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 4097  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  4096 gatgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 4069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 1442 - 1670
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||    
T  1442 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-ga 1539  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  1540 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 1639  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1640 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 1670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 11462 - 11691
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11462 cacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 11560  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  11561 gaaatcaatgggttacaagaataagtatcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 11660  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  11661 ggaaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 11691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 41472 - 41701
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41472 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 41570  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  41571 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 41670  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41671 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 41701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 80158 - 79938
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  80158 cacaaaagaatttgttgacccagttcaatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 80060  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    ||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  80059 gatgtcaatgagttacaggaataagtctcctgcctaat-ctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaa 79961  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaacccta 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  79960 ggtgaatcaaccctcaaacccta 79938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 195
Target Start/End: Original strand, 188386 - 188424
Alignment:
Q  157 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  188386 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 188424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 85530 - 85300
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||  | |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  85530 cacaaaagaatttgtttacctggttcagttcaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacgaaaga 85431  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||| || |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||| |||     
T  85430 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctgattctactcaaagtcacaatctcttctcgtaaccaaaagactcaatcctagtagtgttttccaa 85331  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  85330 ggtgaatcaaccctcaaactttagtgtttgt 85300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 1638 - 1842
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| |||||||||| || |||  |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1638 aatttgtttacccagttcggtcaaaaactgacctagtatgggggagagagcagccctacgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 1737  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  1738 atgggttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcctaattgtgtttcccaaggtgaat 1837  T
Q  208 caacc 212  Q
    |||||    
T  1838 caacc 1842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6490 - 6269
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  6490 aatttgttgactcagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaa 6393  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagac-tcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6392 tgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 6293  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  6292 caacccacaaaccctagtgtttgt 6269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 15817 - 16038
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaa-attgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15817 aatttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtcctccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatca 15916  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||    
T  15917 atgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcgcaaggtgaat 16016  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||| |||| |||||||||||||||    
T  16017 caa-cctc-aaccctagtgtttgt 16038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 332 - 111
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||    
T  332 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaa 235  T
Q  109 tgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  234 tgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcacgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 135  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  134 caacccacaaaccctagtgtttgt 111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29469 - 29241
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||   ||||||| ||    
T  29469 cacaaacgaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtattgttacaaa-ga 29372  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  29371 gaaatcaatgagttacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaagccccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatcccaa 29272  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29271 ggcgaatcaacccataaaccctagtgtttgt 29241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3178 - 2950
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| ||    
T  3178 cacaaaatattttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctcggggagatagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-ga 3081  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccag 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  3080 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccaagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaa 2981  T
Q  201 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2980 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 2950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 16646 - 16867
Alignment:
Q  9 aatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||  |||||| || |||| ||||||  |  |||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16646 aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagataaaccctttgtcccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 16745  T
Q  108 atgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaat 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  16746 atgggttacaagaataagtctctggcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtcaccaagtgactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaat 16845  T
Q  208 caaccctcaaaccctagtgtttgt 231  Q
    ||| |  | |||||||||||||||    
T  16846 caatc--ccaaccctagtgtttgt 16867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22414 - 22221
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||||    
T  22414 cacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaaga 22317  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 196  Q
    || ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22316 gaaatcaatgagttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 24689 - 24496
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||||    
T  24689 cacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaaga 24592  T
Q  101 gatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcataatagtgtttc 196  Q
    || ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24591 gaaatcaatgagttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 24496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 51 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2290 - 2117
Alignment:
Q  51 gagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctatttctacccagagt 150  Q
    ||||||| || |||||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  2290 gagagagtagccctccgattcactata-tgatgaggaacgttacaaaagagaaattaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaagt 2192  T
Q  151 ctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagt 225  Q
    | ||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2191 cccagccttttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt 2117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5076 - 4912
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaa-gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcc 134  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5076 tgacctagtctggggcagagagcagttctatgttccactataatgatgagtatctttacaaaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcc 4977  T
Q  135 tatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttccca 199  Q
    || ||||||| | ||  ||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4976 taattctaccaaaagcttcaatctcttctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 4912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35819 - 35709
Alignment:
Q  121 ataagtctcccgcctatttctacccagagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaacc 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  35819 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttccctaggtgaattaaccctcaaacc 35720  T
Q  221 ctagtgtttgt 231  Q
    |||||||||||    
T  35719 ctagtgtttgt 35709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 35893 - 35816
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataa 78  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |  |  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  35893 cacaaaataatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctaaggaagagagcagccctccgttccactataa 35816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 4668 - 4733
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtatgggtgagagagcagtcctcc 66  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  4668 cacaaaggaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 4733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Original strand, 57452 - 57613
Alignment:
Q  36 tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtc-tcccgcc 134  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||| |||||| |||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||  || ||   ||    
T  57452 tgacctagtctgggggagagagcagctctctgttccattatattaatgagtaactttacaaaatagatatcaaagggttacaagaatagatcttcaaacc 57551  T
Q  135 tatttctacccagagtctc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    || ||| ||||| |||| | ||||||||||  | ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  57552 taattccacccaaagtcccgaatctcttccaatgaccaagagattcaatcctaatagtgttt 57613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 1440 - 1483
Alignment:
Q  1 cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagt 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1440 cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagt 1483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 224857 - 224819
Alignment:
Q  157 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  224857 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 224819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 82
Target Start/End: Original strand, 16980 - 17057
Alignment:
Q  6 aagaatttgttgacccagttcgatccaaat-tgacctagtatgggtgagagagcagtcctccgttccactataatgat 82  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16980 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgat 17057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University