View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16275_low_26 (Length: 248)

Name: NF16275_low_26
Description: NF16275
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16275_low_26
NF16275_low_26
[»] chr4 (105 HSPs)
chr4 (20-248)||(16934242-16934470)
chr4 (20-248)||(9176573-9176801)
chr4 (20-248)||(16931888-16932116)
chr4 (20-248)||(44599937-44600165)
chr4 (20-248)||(9174245-9174473)
chr4 (20-248)||(18847159-18847387)
chr4 (20-248)||(40637080-40637307)
chr4 (52-248)||(22782837-22783033)
chr4 (52-248)||(22780472-22780668)
chr4 (20-248)||(24878995-24879222)
chr4 (20-248)||(48486325-48486552)
chr4 (20-248)||(11434961-11435188)
chr4 (20-248)||(51015252-51015479)
chr4 (20-248)||(8631519-8631750)
chr4 (52-248)||(11006336-11006532)
chr4 (52-248)||(11008665-11008861)
chr4 (20-248)||(22044490-22044717)
chr4 (20-248)||(22046785-22047012)
chr4 (20-248)||(22800962-22801189)
chr4 (20-248)||(22802834-22803061)
chr4 (20-248)||(40091515-40091742)
chr4 (20-248)||(5198426-5198653)
chr4 (20-248)||(24880457-24880684)
chr4 (20-248)||(24888802-24889029)
chr4 (20-248)||(14633326-14633551)
chr4 (20-248)||(47868407-47868634)
chr4 (52-248)||(7941359-7941556)
chr4 (20-248)||(2484972-2485200)
chr4 (52-248)||(18709263-18709458)
chr4 (20-248)||(9148257-9148486)
chr4 (20-248)||(38409205-38409438)
chr4 (20-248)||(47274733-47274959)
chr4 (20-248)||(5637565-5637796)
chr4 (20-248)||(24348220-24348451)
chr4 (22-248)||(31849698-31849924)
chr4 (22-248)||(33415588-33415812)
chr4 (20-248)||(38928277-38928505)
chr4 (20-248)||(12395945-12396172)
chr4 (20-248)||(56030450-56030677)
chr4 (20-248)||(14787531-14787760)
chr4 (20-248)||(6764845-6765077)
chr4 (20-244)||(619551-619774)
chr4 (20-248)||(12400907-12401134)
chr4 (20-248)||(16453315-16453542)
chr4 (20-248)||(36378298-36378525)
chr4 (20-248)||(36919684-36919914)
chr4 (20-248)||(36921593-36921822)
chr4 (52-248)||(37089471-37089666)
chr4 (20-248)||(37313166-37313393)
chr4 (20-248)||(19095888-19096116)
chr4 (52-248)||(3824670-3824863)
chr4 (52-248)||(22132491-22132684)
chr4 (80-248)||(26086076-26086243)
chr4 (20-243)||(3937314-3937535)
chr4 (20-248)||(19322703-19322926)
chr4 (20-248)||(41997498-41997725)
chr4 (52-248)||(13543997-13544192)
chr4 (20-248)||(17662345-17662565)
chr4 (52-248)||(22134716-22134909)
chr4 (63-248)||(18409447-18409631)
chr4 (20-248)||(18537575-18537798)
chr4 (20-233)||(6132879-6133090)
chr4 (90-248)||(36380425-36380582)
chr4 (52-248)||(47210852-47211035)
chr4 (45-248)||(52942559-52942747)
chr4 (20-248)||(18534933-18535156)
chr4 (20-244)||(53405133-53405358)
chr4 (130-248)||(16455357-16455474)
chr4 (20-248)||(8756352-8756577)
chr4 (97-248)||(27499128-27499278)
chr4 (20-175)||(38270158-38270313)
chr4 (20-175)||(24446756-24446906)
chr4 (94-248)||(38890326-38890476)
chr4 (156-248)||(2891433-2891524)
chr4 (20-150)||(5101003-5101133)
chr4 (162-248)||(13547302-13547387)
chr4 (130-246)||(30136667-30136780)
chr4 (53-124)||(2891356-2891427)
chr4 (150-248)||(47150994-47151092)
chr4 (150-248)||(28453818-28453915)
chr4 (20-226)||(9863714-9863917)
chr4 (20-248)||(12102096-12102320)
chr4 (149-228)||(31983649-31983727)
chr4 (20-248)||(15032649-15032863)
chr4 (150-228)||(40999071-40999148)
chr4 (20-217)||(25357643-25357838)
chr4 (192-248)||(4215483-4215539)
chr4 (210-248)||(5635576-5635614)
chr4 (150-227)||(10113003-10113080)
chr4 (210-248)||(11437558-11437596)
chr4 (200-238)||(38270120-38270158)
chr4 (68-228)||(9022362-9022516)
chr4 (153-226)||(3982300-3982374)
chr4 (20-228)||(16185956-16186164)
chr4 (165-224)||(16638827-16638884)
chr4 (168-228)||(47566496-47566554)
chr4 (150-228)||(54906722-54906801)
chr4 (165-228)||(5336903-5336964)
chr4 (165-228)||(55822265-55822326)
chr4 (130-210)||(10114445-10114522)
chr4 (23-83)||(16455296-16455356)
chr4 (168-228)||(16489352-16489410)
chr4 (168-228)||(16689061-16689119)
chr4 (168-228)||(25699752-25699810)
chr4 (164-228)||(29609591-29609654)
[»] chr6 (64 HSPs)
chr6 (20-248)||(12195614-12195842)
chr6 (20-248)||(19704668-19704902)
chr6 (20-248)||(26932661-26932897)
chr6 (20-248)||(14507275-14507502)
chr6 (20-248)||(28241421-28241648)
chr6 (20-242)||(19227514-19227735)
chr6 (20-248)||(1230349-1230576)
chr6 (20-248)||(11983129-11983356)
chr6 (20-248)||(13057181-13057408)
chr6 (52-248)||(20915455-20915651)
chr6 (21-248)||(25477262-25477488)
chr6 (20-248)||(14458867-14459092)
chr6 (52-248)||(4816331-4816526)
chr6 (20-248)||(9019913-9020140)
chr6 (20-248)||(15530222-15530449)
chr6 (20-248)||(3390366-3390593)
chr6 (52-248)||(30967220-30967415)
chr6 (20-248)||(3629964-3630191)
chr6 (20-248)||(15541240-15541467)
chr6 (20-248)||(3233830-3234057)
chr6 (20-248)||(15532781-15533008)
chr6 (20-248)||(30728928-30729155)
chr6 (24-248)||(32279988-32280210)
chr6 (20-248)||(3632038-3632265)
chr6 (20-248)||(13039741-13039968)
chr6 (52-248)||(26065005-26065197)
chr6 (52-248)||(26084974-26085166)
chr6 (20-248)||(2628985-2629217)
chr6 (52-248)||(30034703-30034898)
chr6 (20-248)||(24338547-24338775)
chr6 (132-248)||(5273315-5273431)
chr6 (21-248)||(12161657-12161880)
chr6 (45-248)||(22490651-22490854)
chr6 (20-248)||(3027954-3028177)
chr6 (45-248)||(15719666-15719856)
chr6 (153-248)||(1069819-1069913)
chr6 (20-157)||(1072067-1072204)
chr6 (20-248)||(17012031-17012254)
chr6 (20-161)||(13870608-13870748)
chr6 (20-160)||(32447502-32447643)
chr6 (164-248)||(26066223-26066307)
chr6 (45-248)||(14466345-14466537)
chr6 (20-141)||(17852529-17852650)
chr6 (68-248)||(16455526-16455701)
chr6 (164-248)||(33308988-33309071)
chr6 (164-248)||(33311257-33311340)
chr6 (20-124)||(8995466-8995570)
chr6 (164-248)||(26068494-26068578)
chr6 (164-248)||(29754808-29754892)
chr6 (149-248)||(12186172-12186271)
chr6 (130-248)||(15367131-15367245)
chr6 (148-228)||(26945258-26945337)
chr6 (68-248)||(19696479-19696654)
chr6 (150-228)||(20526922-20526999)
chr6 (150-228)||(22858075-22858152)
chr6 (151-228)||(28037851-28037927)
chr6 (20-178)||(15346378-15346524)
chr6 (67-124)||(10584155-10584212)
chr6 (150-226)||(11138423-11138499)
chr6 (20-56)||(26066319-26066355)
chr6 (20-56)||(26068590-26068626)
chr6 (173-228)||(11262596-11262649)
chr6 (168-228)||(22351973-22352031)
chr6 (20-60)||(29754983-29755023)
[»] chr5 (93 HSPs)
chr5 (20-248)||(31179470-31179698)
chr5 (20-243)||(31542687-31542910)
chr5 (20-248)||(31545032-31545260)
chr5 (52-248)||(15552229-15552425)
chr5 (20-248)||(25921573-25921800)
chr5 (20-248)||(10529199-10529426)
chr5 (22-248)||(16776112-16776337)
chr5 (20-248)||(2174871-2175098)
chr5 (20-248)||(4236581-4236808)
chr5 (20-248)||(18511312-18511541)
chr5 (52-248)||(34479517-34479714)
chr5 (20-248)||(38882057-38882285)
chr5 (20-248)||(39854436-39854662)
chr5 (20-248)||(21947979-21948205)
chr5 (23-248)||(6756449-6756673)
chr5 (20-248)||(18509418-18509646)
chr5 (52-248)||(34477152-34477349)
chr5 (52-248)||(1189709-1189904)
chr5 (20-248)||(25904055-25904282)
chr5 (20-248)||(40221474-40221701)
chr5 (52-248)||(16092300-16092495)
chr5 (20-248)||(17072835-17073062)
chr5 (52-248)||(25804009-25804204)
chr5 (20-227)||(20043002-20043208)
chr5 (20-248)||(2818435-2818663)
chr5 (52-248)||(6745053-6745247)
chr5 (52-248)||(18468995-18469190)
chr5 (20-231)||(20044962-20045172)
chr5 (21-248)||(34530766-34530992)
chr5 (52-248)||(6747290-6747484)
chr5 (20-248)||(10474423-10474650)
chr5 (52-248)||(18466668-18466863)
chr5 (52-248)||(27912520-27912715)
chr5 (20-248)||(18596599-18596824)
chr5 (20-248)||(12556024-12556250)
chr5 (52-248)||(21684551-21684746)
chr5 (45-233)||(31472728-31472915)
chr5 (20-248)||(26097685-26097911)
chr5 (52-248)||(27910435-27910629)
chr5 (20-248)||(31466079-31466305)
chr5 (20-248)||(36402428-36402655)
chr5 (20-248)||(17818590-17818816)
chr5 (20-248)||(24126808-24127035)
chr5 (45-248)||(39398093-39398294)
chr5 (20-248)||(2954368-2954596)
chr5 (20-248)||(37705880-37706107)
chr5 (45-248)||(695866-696056)
chr5 (90-248)||(658453-658610)
chr5 (20-248)||(6661286-6661509)
chr5 (20-208)||(26098391-26098578)
chr5 (20-248)||(21288716-21288948)
chr5 (135-248)||(4410090-4410202)
chr5 (147-248)||(20505941-20506041)
chr5 (144-248)||(39798123-39798226)
chr5 (20-244)||(10586791-10587007)
chr5 (164-248)||(10749796-10749880)
chr5 (135-248)||(41585844-41585956)
chr5 (164-248)||(10757273-10757356)
chr5 (20-144)||(20507665-20507789)
chr5 (20-248)||(36208532-36208755)
chr5 (164-248)||(3373236-3373320)
chr5 (164-248)||(38960231-38960314)
chr5 (55-248)||(20053834-20054017)
chr5 (164-248)||(15354674-15354757)
chr5 (164-248)||(15356950-15357033)
chr5 (164-248)||(23665140-23665223)
chr5 (164-248)||(23793364-23793447)
chr5 (126-208)||(2723960-2724041)
chr5 (20-106)||(4410009-4410099)
chr5 (149-248)||(9020299-9020397)
chr5 (130-228)||(17413288-17413383)
chr5 (171-248)||(23741958-23742034)
chr5 (45-237)||(42770750-42770934)
chr5 (20-106)||(41585947-41586033)
chr5 (198-248)||(42770939-42770989)
chr5 (150-248)||(15143547-15143645)
chr5 (150-228)||(4754235-4754312)
chr5 (164-230)||(23667415-23667481)
chr5 (150-228)||(2144684-2144763)
chr5 (20-55)||(23742057-23742092)
chr5 (168-229)||(4897828-4897888)
chr5 (20-56)||(3373332-3373368)
chr5 (165-228)||(2298122-2298183)
chr5 (165-228)||(10627364-10627425)
chr5 (20-55)||(23665090-23665125)
chr5 (20-55)||(23667365-23667400)
chr5 (20-55)||(23793462-23793497)
chr5 (173-228)||(26406594-26406647)
chr5 (165-226)||(13295835-13295896)
chr5 (150-226)||(34033691-34033768)
chr5 (164-228)||(32520533-32520597)
chr5 (20-52)||(15354777-15354809)
chr5 (20-52)||(15357053-15357085)
[»] chr3 (119 HSPs)
chr3 (20-248)||(35777353-35777581)
chr3 (20-248)||(6063543-6063773)
chr3 (20-248)||(6065893-6066122)
chr3 (20-248)||(50493931-50494159)
chr3 (52-248)||(746721-746917)
chr3 (52-248)||(455871-456067)
chr3 (52-248)||(458248-458444)
chr3 (20-248)||(3859460-3859687)
chr3 (20-248)||(4308379-4308606)
chr3 (52-248)||(10621627-10621823)
chr3 (52-248)||(38210334-38210530)
chr3 (20-248)||(5191585-5191812)
chr3 (20-248)||(6561742-6561969)
chr3 (20-248)||(24979639-24979866)
chr3 (20-248)||(11170336-11170563)
chr3 (20-248)||(38889971-38890199)
chr3 (20-248)||(22114403-22114630)
chr3 (20-248)||(43228223-43228450)
chr3 (20-248)||(45882871-45883098)
chr3 (20-248)||(51727105-51727331)
chr3 (20-248)||(43226018-43226244)
chr3 (20-248)||(43423561-43423788)
chr3 (20-248)||(53917762-53917989)
chr3 (23-248)||(18099268-18099493)
chr3 (50-248)||(28102100-28102297)
chr3 (20-248)||(18096998-18097226)
chr3 (20-248)||(1313342-1313568)
chr3 (20-248)||(3314616-3314843)
chr3 (52-248)||(4103993-4104188)
chr3 (20-248)||(10956125-10956352)
chr3 (64-248)||(25388882-25389065)
chr3 (20-248)||(27101279-27101510)
chr3 (20-248)||(12268062-12268291)
chr3 (20-248)||(1626781-1627008)
chr3 (20-248)||(10958421-10958648)
chr3 (52-248)||(25533406-25533601)
chr3 (20-248)||(10084487-10084718)
chr3 (50-244)||(28100143-28100336)
chr3 (78-248)||(28413129-28413299)
chr3 (20-248)||(5926862-5927089)
chr3 (52-248)||(30005805-30006000)
chr3 (52-248)||(42990268-42990463)
chr3 (20-248)||(53915594-53915821)
chr3 (20-248)||(10191408-10191638)
chr3 (20-248)||(18162596-18162822)
chr3 (20-244)||(26720480-26720702)
chr3 (20-248)||(48361769-48361995)
chr3 (20-248)||(28761527-28761753)
chr3 (20-248)||(51943303-51943529)
chr3 (20-248)||(32264137-32264368)
chr3 (20-248)||(5522724-5522940)
chr3 (20-245)||(39715402-39715625)
chr3 (52-248)||(9604705-9604899)
chr3 (52-248)||(29956650-29956845)
chr3 (20-248)||(43421513-43421740)
chr3 (20-248)||(35918041-35918274)
chr3 (20-248)||(15780792-15781030)
chr3 (20-248)||(880549-880777)
chr3 (20-244)||(28180956-28181177)
chr3 (52-248)||(47148993-47149188)
chr3 (92-248)||(1321483-1321638)
chr3 (20-248)||(36011759-36011986)
chr3 (20-248)||(53468554-53468780)
chr3 (20-248)||(51674864-51675080)
chr3 (20-156)||(11163082-11163218)
chr3 (20-248)||(31151279-31151504)
chr3 (53-180)||(41849117-41849244)
chr3 (20-247)||(54691673-54691898)
chr3 (20-248)||(32219027-32219243)
chr3 (52-221)||(42992250-42992417)
chr3 (20-237)||(28137415-28137620)
chr3 (110-248)||(7606685-7606822)
chr3 (20-248)||(23633392-23633613)
chr3 (20-248)||(13420284-13420497)
chr3 (20-248)||(889871-890096)
chr3 (20-248)||(23636959-23637182)
chr3 (45-241)||(54884114-54884307)
chr3 (20-244)||(53591127-53591339)
chr3 (51-248)||(4666488-4666675)
chr3 (20-248)||(53597173-53597395)
chr3 (95-248)||(561875-562024)
chr3 (95-248)||(25635391-25635540)
chr3 (139-248)||(25688259-25688367)
chr3 (136-248)||(6231849-6231959)
chr3 (101-248)||(6484372-6484519)
chr3 (130-248)||(17795303-17795417)
chr3 (130-248)||(19103743-19103857)
chr3 (22-142)||(27635830-27635950)
chr3 (149-248)||(5886261-5886358)
chr3 (20-142)||(47701798-47701920)
chr3 (88-248)||(1673975-1674131)
chr3 (149-248)||(5899734-5899831)
chr3 (20-193)||(24177211-24177380)
chr3 (20-141)||(6231381-6231502)
chr3 (152-248)||(11168165-11168260)
chr3 (132-229)||(4560401-4560497)
chr3 (60-228)||(36871420-36871583)
chr3 (20-124)||(3306731-3306835)
chr3 (20-84)||(1321373-1321437)
chr3 (150-228)||(1620580-1620657)
chr3 (166-248)||(3306839-3306920)
chr3 (150-228)||(14634561-14634638)
chr3 (182-228)||(11007633-11007679)
chr3 (20-66)||(53896475-53896521)
chr3 (87-225)||(13419883-13420015)
chr3 (198-248)||(24181489-24181539)
chr3 (95-193)||(25633930-25634024)
chr3 (20-101)||(4560509-4560590)
chr3 (132-177)||(7606828-7606873)
chr3 (150-228)||(11066652-11066731)
chr3 (216-248)||(47701769-47701801)
chr3 (130-207)||(31021284-31021359)
chr3 (20-109)||(1618893-1618983)
chr3 (150-191)||(7768632-7768672)
chr3 (20-76)||(6484317-6484373)
chr3 (52-84)||(6719358-6719390)
chr3 (20-60)||(6719396-6719436)
chr3 (212-248)||(27635756-27635792)
chr3 (168-228)||(27762107-27762165)
[»] chr1 (96 HSPs)
chr1 (20-248)||(16226119-16226347)
chr1 (20-248)||(47179661-47179893)
chr1 (20-248)||(47177310-47177542)
chr1 (20-248)||(51749991-51750218)
chr1 (52-248)||(9459518-9459714)
chr1 (52-248)||(9463345-9463541)
chr1 (20-248)||(13215033-13215260)
chr1 (24-248)||(6822971-6823193)
chr1 (20-248)||(10399930-10400157)
chr1 (20-248)||(15823498-15823725)
chr1 (20-248)||(20302411-20302638)
chr1 (20-248)||(38925580-38925807)
chr1 (20-248)||(2617468-2617695)
chr1 (20-248)||(28842445-28842674)
chr1 (20-248)||(28840630-28840859)
chr1 (20-248)||(13761789-13762016)
chr1 (20-248)||(28998355-28998582)
chr1 (20-248)||(29004071-29004298)
chr1 (20-248)||(39462471-39462698)
chr1 (20-248)||(41646872-41647099)
chr1 (20-248)||(50248674-50248901)
chr1 (20-246)||(18307061-18307286)
chr1 (52-244)||(12302611-12302802)
chr1 (20-248)||(17186230-17186457)
chr1 (20-248)||(20291409-20291636)
chr1 (52-248)||(27337041-27337235)
chr1 (45-248)||(31422975-31423178)
chr1 (20-248)||(50076774-50077001)
chr1 (20-248)||(21948290-21948520)
chr1 (20-248)||(24325608-24325842)
chr1 (20-248)||(39932023-39932252)
chr1 (51-248)||(31735623-31735819)
chr1 (20-248)||(25251377-25251604)
chr1 (60-248)||(46431809-46431996)
chr1 (20-248)||(50078923-50079150)
chr1 (20-248)||(51752317-51752543)
chr1 (24-248)||(6823840-6824071)
chr1 (51-248)||(18839570-18839766)
chr1 (20-248)||(50307648-50307876)
chr1 (20-248)||(6995802-6996029)
chr1 (20-248)||(17324738-17324965)
chr1 (52-248)||(25127856-25128051)
chr1 (52-248)||(27339232-27339427)
chr1 (20-248)||(28207168-28207395)
chr1 (52-248)||(47906254-47906449)
chr1 (53-248)||(16428638-16428832)
chr1 (20-248)||(14098072-14098299)
chr1 (52-248)||(15294936-15295131)
chr1 (58-248)||(48665167-48665357)
chr1 (52-248)||(4131482-4131676)
chr1 (20-248)||(11457577-11457804)
chr1 (45-248)||(2949333-2949535)
chr1 (20-248)||(31489867-31490092)
chr1 (21-248)||(3579718-3579946)
chr1 (20-248)||(6756479-6756705)
chr1 (45-248)||(31425117-31425323)
chr1 (20-248)||(9241188-9241415)
chr1 (52-248)||(2510427-2510621)
chr1 (20-248)||(17318845-17319066)
chr1 (61-248)||(40133937-40134123)
chr1 (20-248)||(17324017-17324242)
chr1 (135-248)||(16231630-16231743)
chr1 (20-248)||(47451600-47451821)
chr1 (20-248)||(42922186-42922409)
chr1 (92-248)||(15669496-15669648)
chr1 (45-248)||(8347375-8347573)
chr1 (135-248)||(25248654-25248766)
chr1 (20-245)||(14183697-14183915)
chr1 (43-248)||(8349154-8349354)
chr1 (20-247)||(18800676-18800898)
chr1 (59-248)||(16432396-16432573)
chr1 (164-248)||(23785935-23786019)
chr1 (148-248)||(6115205-6115304)
chr1 (20-106)||(16231553-16231639)
chr1 (160-248)||(51757623-51757710)
chr1 (20-248)||(49495313-49495528)
chr1 (153-248)||(16429042-16429136)
chr1 (20-248)||(26520215-26520447)
chr1 (20-248)||(26613342-26613569)
chr1 (22-106)||(25248757-25248841)
chr1 (20-248)||(30790503-30790723)
chr1 (20-248)||(13125560-13125785)
chr1 (150-248)||(30738732-30738830)
chr1 (150-228)||(155788-155865)
chr1 (146-248)||(16561544-16561646)
chr1 (150-228)||(27916576-27916653)
chr1 (150-226)||(26332613-26332688)
chr1 (154-228)||(43104245-43104318)
chr1 (150-228)||(14353047-14353126)
chr1 (165-228)||(14997040-14997101)
chr1 (210-248)||(23816027-23816065)
chr1 (130-228)||(28279328-28279424)
chr1 (45-84)||(6115344-6115383)
chr1 (165-228)||(4144804-4144865)
chr1 (20-169)||(13127813-13127957)
chr1 (182-214)||(3091240-3091272)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (20-248)||(6160-6388)
[»] chr7 (90 HSPs)
chr7 (20-248)||(31156010-31156238)
chr7 (52-248)||(7349372-7349568)
chr7 (52-248)||(7351751-7351947)
chr7 (20-248)||(42331097-42331326)
chr7 (20-248)||(1049395-1049622)
chr7 (20-248)||(40836842-40837069)
chr7 (20-248)||(35591-35818)
chr7 (23-248)||(3878540-3878766)
chr7 (20-248)||(11355220-11355447)
chr7 (20-245)||(27306333-27306556)
chr7 (52-248)||(1047024-1047219)
chr7 (52-248)||(38393980-38394175)
chr7 (20-248)||(7470122-7470353)
chr7 (20-248)||(37412227-37412455)
chr7 (20-248)||(44526-44753)
chr7 (45-248)||(4296034-4296237)
chr7 (20-248)||(13099576-13099803)
chr7 (20-248)||(25276103-25276330)
chr7 (20-248)||(25542493-25542718)
chr7 (20-248)||(26804535-26804761)
chr7 (20-248)||(7472080-7472311)
chr7 (20-248)||(20137209-20137436)
chr7 (20-248)||(21679989-21680216)
chr7 (20-248)||(24748556-24748783)
chr7 (20-248)||(31435147-31435374)
chr7 (20-248)||(44724541-44724768)
chr7 (20-248)||(443557-443784)
chr7 (20-248)||(21678028-21678255)
chr7 (52-248)||(48457647-48457842)
chr7 (20-248)||(40946286-40946517)
chr7 (52-248)||(3035715-3035913)
chr7 (52-248)||(28487547-28487742)
chr7 (20-248)||(39146087-39146314)
chr7 (52-248)||(11757222-11757419)
chr7 (52-248)||(20299452-20299649)
chr7 (52-248)||(9680813-9681009)
chr7 (52-248)||(1849975-1850170)
chr7 (52-248)||(18345535-18345730)
chr7 (52-248)||(20297356-20297551)
chr7 (52-248)||(20626032-20626227)
chr7 (52-248)||(20629923-20630118)
chr7 (52-248)||(20642342-20642537)
chr7 (20-248)||(21990113-21990339)
chr7 (45-248)||(21592243-21592445)
chr7 (20-248)||(24258425-24258652)
chr7 (42-248)||(27832733-27832939)
chr7 (52-248)||(9679053-9679248)
chr7 (52-248)||(28485560-28485755)
chr7 (20-248)||(22251650-22251869)
chr7 (62-248)||(43253617-43253801)
chr7 (20-248)||(22828733-22828960)
chr7 (20-245)||(42223118-42223344)
chr7 (20-176)||(18567575-18567731)
chr7 (20-248)||(24817454-24817676)
chr7 (20-241)||(7188505-7188721)
chr7 (130-248)||(7092312-7092429)
chr7 (20-248)||(20091645-20091868)
chr7 (87-248)||(24813599-24813755)
chr7 (137-248)||(7094560-7094670)
chr7 (164-248)||(2935374-2935458)
chr7 (164-248)||(9027293-9027376)
chr7 (45-244)||(24465536-24465722)
chr7 (136-248)||(38396713-38396824)
chr7 (20-206)||(22392435-22392608)
chr7 (164-248)||(1606486-1606569)
chr7 (164-248)||(22108173-22108256)
chr7 (164-248)||(40549933-40550016)
chr7 (164-248)||(22137184-22137267)
chr7 (164-248)||(40552211-40552294)
chr7 (150-227)||(16297146-16297222)
chr7 (150-248)||(6332311-6332409)
chr7 (20-106)||(7092415-7092506)
chr7 (20-106)||(7094663-7094753)
chr7 (58-119)||(38396316-38396377)
chr7 (192-248)||(26295580-26295636)
chr7 (189-248)||(6348912-6348971)
chr7 (153-248)||(40281477-40281572)
chr7 (68-228)||(6048885-6049039)
chr7 (68-228)||(11081522-11081675)
chr7 (150-228)||(11084467-11084544)
chr7 (20-60)||(1606432-1606472)
chr7 (213-248)||(22393876-22393911)
chr7 (165-228)||(21369642-21369703)
chr7 (20-55)||(22108123-22108158)
chr7 (20-55)||(22137134-22137169)
chr7 (20-55)||(40549883-40549918)
chr7 (20-55)||(40552161-40552196)
chr7 (149-228)||(2120881-2120960)
chr7 (20-80)||(3677242-3677301)
chr7 (20-135)||(30906264-30906377)
[»] chr2 (68 HSPs)
chr2 (52-248)||(35218062-35218258)
chr2 (52-248)||(35215685-35215881)
chr2 (20-248)||(40032158-40032385)
chr2 (20-248)||(42064443-42064670)
chr2 (20-248)||(13910144-13910371)
chr2 (20-248)||(19502111-19502338)
chr2 (20-248)||(19504446-19504672)
chr2 (20-248)||(45280084-45280312)
chr2 (20-248)||(27104727-27104953)
chr2 (20-248)||(42452711-42452936)
chr2 (20-248)||(15539575-15539802)
chr2 (20-248)||(24162322-24162539)
chr2 (20-248)||(22287436-22287663)
chr2 (20-245)||(11739663-11739887)
chr2 (20-248)||(19007568-19007795)
chr2 (52-248)||(23452337-23452532)
chr2 (20-248)||(21520793-21521022)
chr2 (20-248)||(42923609-42923838)
chr2 (19-248)||(34979679-34979907)
chr2 (20-248)||(3022091-3022318)
chr2 (20-248)||(17849045-17849272)
chr2 (20-248)||(28196565-28196792)
chr2 (20-248)||(6258917-6259142)
chr2 (50-248)||(17848401-17848596)
chr2 (21-248)||(14837202-14837422)
chr2 (20-248)||(6264249-6264472)
chr2 (20-248)||(44289168-44289395)
chr2 (52-248)||(45239077-45239271)
chr2 (20-248)||(43623680-43623895)
chr2 (20-248)||(31732877-31733092)
chr2 (20-248)||(11578209-11578431)
chr2 (20-177)||(22163117-22163274)
chr2 (20-165)||(22407591-22407736)
chr2 (20-248)||(18800414-18800629)
chr2 (52-193)||(38020162-38020302)
chr2 (68-248)||(20146709-20146884)
chr2 (20-248)||(22874070-22874285)
chr2 (164-248)||(36558963-36559047)
chr2 (164-248)||(36561240-36561324)
chr2 (20-145)||(5377631-5377760)
chr2 (69-248)||(17897346-17897519)
chr2 (164-248)||(45332280-45332364)
chr2 (142-248)||(5375446-5375550)
chr2 (102-248)||(28459290-28459435)
chr2 (135-235)||(38414194-38414291)
chr2 (148-228)||(40699429-40699508)
chr2 (87-227)||(35107294-35107427)
chr2 (20-248)||(37963039-37963254)
chr2 (150-228)||(17921754-17921833)
chr2 (102-248)||(27136225-27136368)
chr2 (150-228)||(43139432-43139509)
chr2 (165-244)||(20589763-20589842)
chr2 (149-226)||(26345661-26345738)
chr2 (151-210)||(27583477-27583535)
chr2 (52-106)||(38020103-38020157)
chr2 (149-228)||(15693958-15694038)
chr2 (165-228)||(28458949-28459011)
chr2 (150-226)||(7502975-7503052)
chr2 (20-83)||(12342673-12342737)
chr2 (150-228)||(34575230-34575308)
chr2 (150-226)||(35028632-35028707)
chr2 (212-248)||(38020311-38020347)
chr2 (165-228)||(2740941-2741002)
chr2 (210-248)||(22407554-22407592)
chr2 (219-248)||(7463048-7463077)
chr2 (151-226)||(13828466-13828542)
chr2 (150-228)||(30720732-30720811)
chr2 (183-226)||(41303155-41303199)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (52-248)||(34-230)
[»] chr8 (57 HSPs)
chr8 (20-248)||(14807759-14807986)
chr8 (20-248)||(27826994-27827221)
chr8 (52-248)||(24873280-24873476)
chr8 (20-248)||(27829305-27829532)
chr8 (60-248)||(43079650-43079838)
chr8 (52-248)||(43082013-43082209)
chr8 (20-248)||(44720851-44721079)
chr8 (20-248)||(14477284-14477511)
chr8 (20-248)||(18810716-18810943)
chr8 (20-248)||(27106997-27107224)
chr8 (20-248)||(4424026-4424253)
chr8 (20-248)||(14419291-14419518)
chr8 (52-248)||(32339349-32339544)
chr8 (20-248)||(1225174-1225401)
chr8 (20-248)||(27911023-27911249)
chr8 (20-248)||(27957442-27957668)
chr8 (20-244)||(28251671-28251894)
chr8 (20-248)||(15067989-15068216)
chr8 (20-245)||(13858587-13858811)
chr8 (20-248)||(15072718-15072946)
chr8 (52-248)||(3874050-3874245)
chr8 (52-248)||(22684756-22684951)
chr8 (20-248)||(30480603-30480830)
chr8 (52-248)||(608774-608969)
chr8 (20-229)||(33541507-33541715)
chr8 (52-248)||(15809259-15809453)
chr8 (20-248)||(36865545-36865770)
chr8 (50-248)||(5372278-5372474)
chr8 (20-248)||(18812901-18813117)
chr8 (52-245)||(28283322-28283514)
chr8 (20-248)||(41384753-41384979)
chr8 (20-248)||(25952529-25952755)
chr8 (45-208)||(5622878-5623040)
chr8 (20-248)||(43530132-43530350)
chr8 (20-190)||(26775209-26775378)
chr8 (20-248)||(41382681-41382897)
chr8 (20-248)||(15185815-15186037)
chr8 (45-248)||(3005732-3005929)
chr8 (20-248)||(31162221-31162444)
chr8 (20-248)||(21482330-21482545)
chr8 (20-175)||(35872555-35872705)
chr8 (102-248)||(15956051-15956192)
chr8 (45-248)||(21480547-21480737)
chr8 (20-112)||(3886153-3886245)
chr8 (24-123)||(12517248-12517349)
chr8 (45-231)||(37214317-37214512)
chr8 (150-228)||(31573847-31573924)
chr8 (135-248)||(181622-181737)
chr8 (147-248)||(31035252-31035353)
chr8 (20-193)||(2468261-2468425)
chr8 (20-106)||(181545-181631)
chr8 (150-228)||(31578399-31578476)
chr8 (87-181)||(31035144-31035235)
chr8 (150-228)||(17847661-17847740)
chr8 (165-228)||(13985199-13985262)
chr8 (150-228)||(33839043-33839120)
chr8 (165-228)||(6376141-6376203)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (20-248)||(41583-41810)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (20-248)||(2841-3068)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (20-248)||(69391-69622)
scaffold0025 (20-163)||(73207-73354)
scaffold0025 (131-174)||(73160-73203)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (20-248)||(14980-15207)
scaffold0131 (24-248)||(14482-14707)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (20-248)||(183741-183966)
scaffold0005 (20-248)||(51970-52199)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (20-248)||(79146-79373)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (20-248)||(3958-4184)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (20-248)||(11573-11800)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (20-248)||(1997-2229)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (52-248)||(29164-29359)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (45-248)||(79845-80047)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (64-240)||(35644-35819)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (20-248)||(85192-85418)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (20-248)||(16751-16974)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (20-248)||(15922-16145)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (130-248)||(1552-1669)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (21-248)||(1743-1958)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (20-180)||(993-1158)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (20-248)||(4775-4998)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (164-248)||(22221-22304)
scaffold0140 (164-248)||(24496-24579)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 105)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16934470 - 16934242
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16934470 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 16934371  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16934370 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggt 16934271  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16934270 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 16934242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9176801 - 9176573
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9176801 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgt 9176702  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9176701 ctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggt 9176602  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176601 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 9176573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16932116 - 16931888
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  16932116 ataaatataaaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgt 16932017  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16932016 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggt 16931917  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16931916 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 16931888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 44600165 - 44599937
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44600165 ataaatatagaccttgtattaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 44600066  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44600065 ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggt 44599966  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44599965 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 44599937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9174473 - 9174245
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9174473 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 9174374  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9174373 ctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggt 9174274  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9174273 agaattaggtgggagacttattcttgtaa 9174245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 18847159 - 18847387
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18847159 ataaatatagaccttgtatcaaaacaaactttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 18847258  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18847259 ctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggt 18847358  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847359 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 18847387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 40637080 - 40637307
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40637080 ataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 40637179  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40637180 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagga-tcgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggt 40637278  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637279 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 40637307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22783033 - 22782837
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22783033 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22782934  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782933 gattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 22782837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22780668 - 22780472
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780668 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22780569  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780568 gattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 22780472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 24878995 - 24879222
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||  || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24878995 ataaatatagaccttgtatccgagtaaacttggagatagagggggctgaaactagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 24879094  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24879095 ctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggt 24879193  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879194 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 24879222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 48486325 - 48486552
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  48486325 ataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttat 48486424  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  48486425 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggt 48486523  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48486524 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 48486552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 11434961 - 11435188
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11434961 ataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 11435060  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  |  ||||||||||    
T  11435061 ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcctggttaccggaagagtctaggactttgggt 11435159  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435160 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 11435188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 51015252 - 51015479
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  51015252 ataaatatagactttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 51015351  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  51015352 ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 51015450  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015451 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 51015479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8631750 - 8631519
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagt 115  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8631750 ataaatatagactttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 8631651  T
Q  116 ttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagacttt 215  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||    
T  8631650 ttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggacttt 8631552  T
Q  216 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631551 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 8631519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11006532 - 11006336
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  11006532 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 11006433  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006432 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 11006336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11008861 - 11008665
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  11008861 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 11008762  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11008761 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 11008665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22044717 - 22044490
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22044717 ataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 22044618  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  22044617 ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 22044519  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22044518 agaattaggcgggagacttatttttgtaa 22044490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22047012 - 22046785
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22047012 ataaatataggccttgtatcggagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 22046913  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  22046912 cttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 22046814  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046813 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 22046785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22801189 - 22800962
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22801189 ataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgt 22801090  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||    
T  22801089 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttgattacgggaagaggctgagactttgggt 22800991  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22800990 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 22800962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22803061 - 22802834
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22803061 ataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 22802962  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  22802961 ctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 22802863  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802862 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 22802834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 40091742 - 40091515
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  40091742 ataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtttagagtttgt 40091643  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  40091642 ctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 40091544  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40091543 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 40091515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 5198426 - 5198653
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5198426 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgt 5198525  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| | ||||| ||    
T  5198526 ctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggttacgggaagagattggggctttgtgt 5198624  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5198625 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 5198653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 24880457 - 24880684
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24880457 ataaatatagaccttgtatcggagtaaacttggagatagagggggcgtaaactagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 24880556  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24880557 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggt 24880655  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880656 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 24880684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 24888802 - 24889029
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24888802 ataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggattgtatagagtttgt 24888901  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||    
T  24888902 ctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagactaggactttgggt 24889000  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24889001 agaattaggcgggagacttattcatgtaa 24889029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 14633326 - 14633551
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14633326 ataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgt 14633424  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14633425 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttac-ggaagagattgggactttgggt 14633522  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14633523 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 14633551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 47868407 - 47868634
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47868407 ataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 47868506  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||| | ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  47868507 ctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggt 47868605  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47868606 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 47868634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 7941359 - 7941556
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaa--cactagggtttgtggg 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  7941359 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtggg 7941458  T
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941459 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 7941556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2485200 - 2484972
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagataga-gggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2485200 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagctagaagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 2485101  T
Q  119 tctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||    
T  2485100 tctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 2485002  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2485001 tagagataggcgggagacttattcttgtaa 2484972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18709458 - 18709263
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  18709458 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagtt 18709359  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18709358 gattcaccttgggaaacactattagggtt-gagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaa 18709263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 9148257 - 9148486
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagttt 117  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9148257 ataaatataggccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaagcaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagttt 9148356  T
Q  118 gtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgg 217  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||| |    
T  9148357 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttag 9148455  T
Q  218 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148456 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 9148486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 38409205 - 38409438
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatataga 113  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  38409205 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaatggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 38409304  T
Q  114 gtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagact 213  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||    
T  38409305 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggact 38409403  T
Q  214 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38409404 ttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaa 38409438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 47274733 - 47274959
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  47274733 ataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgt 47274831  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||    
T  47274832 ctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggt 47274930  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47274931 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 47274959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5637796 - 5637565
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagt 115  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5637796 ataaatatagaccttgtataagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 5637697  T
Q  116 ttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagacttt 215  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||    
T  5637696 ttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggacttt 5637598  T
Q  216 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5637597 gggtagaattaggcaggagacttattcttgtaa 5637565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 24348220 - 24348451
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagt 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||   |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24348220 ataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagt 24348319  T
Q  116 ttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagacttt 215  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||    
T  24348320 ttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggacttt 24348418  T
Q  216 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24348419 gggtagaattaggcggtagacttattcttgtaa 24348451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 22 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31849924 - 31849698
Alignment:
Q  22 aaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtct 121  Q
    ||||||||  ||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31849924 aaatataggtcttgtatcagagcaaactaggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 31849825  T
Q  122 cttaggagcaaacact-agggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggta 220  Q
    ||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  31849824 cttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggta 31849726  T
Q  221 gaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  31849725 gaattaagcgggagacttattcttgtaa 31849698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 33415812 - 33415588
Alignment:
Q  22 aaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtct 121  Q
    |||||||| | |||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33415812 aaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 33415713  T
Q  122 cttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtag 221  Q
    ||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  33415712 ctt-ggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaaga-tcgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtag 33415615  T
Q  222 aattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  33415614 aattaggcgggagacttattcttgtaa 33415588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38928505 - 38928277
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||| | |||| | | || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38928505 ataaatataggctttgtattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 38928406  T
Q  120 ctcttagg-agcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
    ||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||    
T  38928405 ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaaaagattggggctttggg 38928307  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928306 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 38928277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12396172 - 12395945
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| | || | |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12396172 ataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 12396073  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12396072 ctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggt 12395974  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12395973 agaattaggcgggagacttattgttgtaa 12395945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 56030450 - 56030677
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||| | |||| ||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  56030450 ataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgt 56030549  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||   ||||||||    
T  56030550 ctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggttacgggaagagattggagctttgggt 56030648  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  56030649 agaattaggcgggagactttttcttgtaa 56030677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 14787760 - 14787531
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagttt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14787760 ataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 14787661  T
Q  118 gtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgg 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14787660 gtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgg 14787562  T
Q  218 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
     |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14787561 atagaattaggtgggagactttttcttgtaa 14787531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 6764845 - 6765077
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6764845 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 6764944  T
Q  120 ctc-----ttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactt 214  Q
    |||     || ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||  || |||||    
T  6764945 ctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgggactt 6765043  T
Q  215 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6765044 tgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaa 6765077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 619774 - 619551
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  619774 ataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggtttgcatagagtttgt 619675  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  619674 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gactgtcttggttaagggaagagattgggtctttgggt 619576  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattctt 244  Q
    |||||||||||||| | ||||||||    
T  619575 agaattaggcgggaaaattattctt 619551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12401134 - 12400907
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| | || | |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12401134 ataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 12401035  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12401034 ctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggt 12400936  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12400935 agaattaggcgggagacttattgttgtaa 12400907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 16453315 - 16453542
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||| | |||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  16453315 ataaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtacaaagtttgt 16453414  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  16453415 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagattgggactttgggt 16453513  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16453514 agtattaggcgggagacttattcttgtaa 16453542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 36378298 - 36378525
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| ||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36378298 ataaatatagactttgtatcagaataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 36378397  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36378398 ctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-aagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggt 36378496  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36378497 agaattaagcgggagacttattcttgtaa 36378525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36919914 - 36919684
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttga--gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagttt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  36919914 ataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgatagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggataaagttt 36919815  T
Q  118 gtctcttagg-agcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttg 216  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||     
T  36919814 gtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttt 36919716  T
Q  217 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919715 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 36919684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36921822 - 36921593
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagttt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36921822 ataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagagatagaggggg-tgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagttt 36921724  T
Q  118 gtctcttagg-agcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttg 216  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||    
T  36921723 gtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttg 36921625  T
Q  217 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36921624 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 36921593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37089666 - 37089471
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||    
T  37089666 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggtt 37089567  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089566 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttgattacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 37089471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37313393 - 37313166
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||   |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  37313393 ataaatataggttttgtatcaaagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgt 37313294  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  37313293 ctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggaaagagattgggattttgggt 37313195  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37313194 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 37313166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 19095888 - 19096116
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19095888 ataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgt 19095987  T
Q  120 ctcttagg-agcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagatt-gagactttgg 217  Q
    ||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  19095988 ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattagag-ctttgg 19096085  T
Q  218 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19096086 gtagaattaggcgggagactaattcttgtaa 19096116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3824863 - 3824670
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||    
T  3824863 gagatagagggggctgaaaca--ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggtt 3824766  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824765 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctattggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 3824670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22132684 - 22132491
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  22132684 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttcgaa-caaacactagggtttgtgggtt 22132587  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132586 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 22132491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 80 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26086243 - 26086076
Alignment:
Q  80 agaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26086243 agaaaaacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 26086144  T
Q  180 tggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26086143 t-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 26086076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3937535 - 3937314
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  3937535 ataaatatagacttt-tatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtatagagtttgt 3937437  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
     |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3937436 ttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt-ggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggctttgggt 3937338  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattct 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  3937337 agaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 19322703 - 19322926
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  19322703 ataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg- 19322800  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  19322801 ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggt 19322897  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19322898 agaattaggcgggagacttatttttgtaa 19322926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 41997498 - 41997725
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  41997498 ataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgt 41997597  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  41997598 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttagttacgggaaaagattgagattttgggt 41997696  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41997697 agaattaggtgggagacttattcttgtaa 41997725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 13543997 - 13544192
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttagg-agcaaacactagggtttgtgggt 150  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| || |    
T  13543997 gagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggat 13544095  T
Q  151 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544096 tgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 13544192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17662565 - 17662345
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagt 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||             
T  17662565 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt--------- 17662475  T
Q  116 ttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagacttt 215  Q
      ||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  17662474 --gtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagagactgggacttt 17662378  T
Q  216 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662377 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 17662345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22134909 - 22134716
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  22134909 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcaaa-caaacactagggtttgtgggtt 22134812  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134811 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 22134716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 63 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18409631 - 18409447
Alignment:
Q  63 ggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttg 162  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  18409631 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttc 18409532  T
Q  163 ggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18409531 gggaacactattaggatt-gagtctcttagttataggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaa 18409447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18537798 - 18537575
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttg 118  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  18537798 ataaatatagatcttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtatagagtttg 18537701  T
Q  119 tctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
     ||||| | | ||| |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||    
T  18537700 -ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagacttttgg 18537605  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537604 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 18537575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 6132879 - 6133090
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| ||   | |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  6132879 ataaatatagacattgtatcggtgtaaacattgagatagaggaggctgaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgt 6132977  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    || || | | |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6132978 ctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggt 6133076  T
Q  220 agaattaggcggga 233  Q
    ||||||||||||||    
T  6133077 agaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 90 - 248
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380582
Alignment:
Q  90 caacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctct 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |  || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtatct 36380523  T
Q  190 tggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36380524 tggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 36380582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 47211035 - 47210852
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||        
T  47211035 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg---- 47210940  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
            ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47210939 --------ttgggaaacactattaggatt-gagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 47210852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 45 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 52942747 - 52942559
Alignment:
Q  45 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttt 144  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  52942747 aaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggttt 52942649  T
Q  145 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 244  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||             ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942648 gaggattgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggg-------------tttgggtagaattaggcgggagacttattctt 52942563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18535156 - 18534933
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttg 118  Q
    |||||||||||||| |  ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  18535156 ataaatatagacctcgattcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagtgtttaaaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtatagagtttg 18535059  T
Q  119 tctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
     ||||| | | |||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  18535058 -ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgagaagagattgagactttggg 18534963  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18534962 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 18534933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Original strand, 53405133 - 53405358
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagataga---gggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtt 116  Q
    ||||||||||||||||| |||    ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53405133 ataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 53405232  T
Q  117 tgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttg 216  Q
    ||||||||  || |||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||  |||||||||     
T  53405233 tgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagatt-gagtctcttggttacggaaagaggctgagacttta 53405330  T
Q  217 ggtagaattaggcgggagacttattctt 244  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  53405331 ggtagaattaagcgggagacttattctt 53405358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 130 - 248
Target Start/End: Original strand, 16455357 - 16455474
Alignment:
Q  130 caaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggc 229  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16455357 caaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggc 16455455  T
Q  230 gggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16455456 gggagacttattcttgtaa 16455474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8756577 - 8756352
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||||| |||| |||| ||| |||||||||||    
T  8756577 ataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaattaggatttgtatagagtttg 8756479  T
Q  119 tctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt-ggttacaggaagagattgagactttgg 217  Q
     ||||| | | |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||     
T  8756478 -ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattg-agtctctttggtcacgggaagagattgagactttga 8756383  T
Q  218 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8756382 gtagaattagacgggagacttattcttgtaa 8756352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 248
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499278
Alignment:
Q  97 actagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttac 196  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggatt-gagtctattggttac 27499226  T
Q  197 aggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
       ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  27499227 gataagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaa 27499278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 38270313 - 38270158
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  38270313 ataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaagaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgt 38270214  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 175  Q
    || || | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38270213 cttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24446906 - 24446756
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     ||||||||||| ||||||||||||    
T  24446906 ataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac-----aactagggtttgtatagagtttgt 24446812  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 175  Q
    ||||| | | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446811 ctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890326
Alignment:
Q  94 aaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | | |||||| ||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattg-agtctcttgat 38890381  T
Q  194 tacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  38890380 cacgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaa 38890326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 156 - 248
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891524
Alignment:
Q  156 caccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaa 2891524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 150
Target Start/End: Original strand, 5101003 - 5101133
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||  |||  | |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5101003 ataaatatagaccttgaatcagggtaaaccttgagatagaggggactgaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 5101102  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggt 150  Q
    | ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  5101103 cactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 162 - 248
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547387
Alignment:
Q  162 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13547302 gggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaa 13547387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 130 - 246
Target Start/End: Original strand, 30136667 - 30136780
Alignment:
Q  130 caaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggc 229  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  30136667 caaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgg-gtctcttggtcacgagaagaaattgtgactttgggtagaattaggc 30136763  T
Q  230 gggagacttattcttgt 246  Q
    || ||||||||||||||    
T  30136764 ggaagacttattcttgt 30136780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 124
Target Start/End: Original strand, 2891356 - 2891427
Alignment:
Q  53 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2891356 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt 2891427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 150 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 47151092 - 47150994
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  47151092 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattg-agtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 47150994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 150 - 248
Target Start/End: Original strand, 28453818 - 28453915
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  28453818 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattg-agtctcttggttacgggaagagatttggaccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaa 28453915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 226
Target Start/End: Original strand, 9863714 - 9863917
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatag-agggggctgaaa--caagggtttagaaaaacaacaacaaaa-ctagggtttatatagagt 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  |||| ||||||||| || | |||||||  |||||||||||||   ||| ||||||| ||||||||| ||  ||||    
T  9863714 ataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagatagtagagagctgaaaaacaagggtttagaagc-caaaaacaaaaactagggtttgta--gagt 9863810  T
Q  116 ttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagacttt 215  Q
    |||| |||| | | ||||||||| |||| |  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  9863811 ttgt-tcttggcaacaaacactaaggttgg--gtttgattcaccttgggaaaccctattaggattg-agtcttttggtcacgggaagagattgagacttt 9863906  T
Q  216 gggtagaatta 226  Q
    |||||||||||    
T  9863907 gggtagaatta 9863917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 12102096 - 12102320
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagaggggg-ctgaaa-caagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagttt 117  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |  |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| || |||| ||    
T  12102096 ataaatatagatcttgtatcagataaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggttt-tagagagatt 12102192  T
Q  118 gtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgg 217  Q
     ||||| ||  | | | |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||| ||||||  |||||||    
T  12102193 -tctctaagcgggagaaactagggttgttg--ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgg 12102288  T
Q  218 gtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12102289 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 12102320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 149 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983649
Alignment:
Q  149 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagatta-agtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattagg 31983649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15032863 - 15032649
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| | ||  || || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  15032863 ataaatatagacttggtaccagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg- 15032766  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | ||||          || || ||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||| |||||  |||||| |||    
T  15032765 ctctttgcaacaaa----------tgagg-ttgattcatatttggaaacactattaggattg-agtctcttggacacgagaaaagatttggacttttggt 15032678  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15032677 agaattaggcgggagatttattcttgtaa 15032649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40999148 - 40999071
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40999148 ttgattcacctaggaaaacattattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattagg 40999071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 217
Target Start/End: Original strand, 25357643 - 25357838
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagag-----ggggctgaaa-caagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatataga 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||     |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | |||    
T  25357643 ataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgagagagagtgagaggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggtttagagaga 25357740  T
Q  114 gtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagact 213  Q
     ||   |||| ||  | | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| ||||    
T  25357741 ttt---ctctaagtgggagacactagggtt-gtga-ttgattcaccttgggaaatactattaggatt-gagtctcttggtcatgggaagagattgggact 25357834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 248
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215539
Alignment:
Q  192 gttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 4215539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635576
Alignment:
Q  210 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 5635576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 227
Target Start/End: Original strand, 10113003 - 10113080
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttac-aggaagagattgagactttgggtagaattag 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10113003 ttgattcaccttaggaaacactattatgatt-gagtctcttggtcacggggaagagattaggactttgggtagaattag 10113080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 248
Target Start/End: Original strand, 11437558 - 11437596
Alignment:
Q  210 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11437558 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 11437596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38270158 - 38270120
Alignment:
Q  200 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270158 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactt 38270120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 228
Target Start/End: Original strand, 9022362 - 9022516
Alignment:
Q  68 aaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaa 166  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| || ||| ||   ||||| | | ||||||||| |||| |  | |||||||||||||| |||    
T  9022362 aaacaagggtttagaagt-caacatcaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttggagaa 9022455  T
Q  167 acactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    ||| ||||||||| | | | ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9022456 acagtattaggatagaatt-tcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattagg 9022516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3982374 - 3982300
Alignment:
Q  153 attcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagaga-ttgagactttgggtagaatta 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3982374 attcaccttggagaaacactattaggatt-gagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaatta 3982300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16186164 - 16185956
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttg 118  Q
    ||||||||| ||||||| ||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| | |||   |     
T  16186164 ataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagagagagggggctaaaaacaagggtttagaaaca-aacaac-aaactagggtttagagaga---tt 16186070  T
Q  119 tctcttaggagcaaacactagggtttg---tgggttgattcaccttg--ggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagact 213  Q
    ||||| ||  | | |||||| |||| |   ||  |||||||||||||    ||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||  |||    
T  16186069 tctctaagcgggagacactaaggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactgttaggatt-gagtctcttggtcacgggaagagattggaact 16185971  T
Q  214 ttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||||||    
T  16185970 ttgggtagaattagg 16185956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 224
Target Start/End: Original strand, 16638827 - 16638884
Alignment:
Q  165 aaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaat 224  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16638827 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacaggaagagattgagac-ttgggtagaat 16638884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Original strand, 47566496 - 47566554
Alignment:
Q  168 cactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  47566496 cactattaggattg-agtctcttggtcacaggaagagactg-gaatttgggtagaattagg 47566554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Original strand, 54906722 - 54906801
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagatt-gagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  54906722 ttgattcaccatggagaaacactattagaattg-agtctcttggtcactggaagagattcaagactttaggtagaattagg 54906801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336903
Alignment:
Q  165 aaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5336964 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattagg 5336903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822326
Alignment:
Q  165 aaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  55822265 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 55822326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 130 - 210
Target Start/End: Original strand, 10114445 - 10114522
Alignment:
Q  130 caaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgag 210  Q
    |||||||||||||| |  | ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||   |||||||||||    
T  10114445 caaacactagggttgg--gattgattcactttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgataagagattgag 10114522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 83
Target Start/End: Original strand, 16455296 - 16455356
Alignment:
Q  23 aatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 83  Q
    ||||||| | |||| ||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16455296 aatataggctttgtatcagagcaaaccgagagataaagggggctgaaacaagggtttagaa 16455356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Original strand, 16489352 - 16489410
Alignment:
Q  168 cactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  16489352 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 16489410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16689119 - 16689061
Alignment:
Q  168 cactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  16689119 cactattaggattg-agtctcttggtcacaggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16689061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Original strand, 25699752 - 25699810
Alignment:
Q  168 cactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  25699752 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagactgggacttt-ggtagaattagg 25699810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29609654 - 29609591
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| | || | ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29609654 gaaacactattagaattg-agtctcttgatcacggcaagagattgagacttcgagtagaattagg 29609591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 64)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12195842 - 12195614
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12195842 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 12195743  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  12195742 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagt 12195643  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12195642 agaattaatcgggagacttattcttgtaa 12195614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19704902 - 19704668
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagag------ggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatataga 113  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||      ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  19704902 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagatggagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 19704803  T
Q  114 gtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagact 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19704802 gtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggact 19704703  T
Q  214 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704702 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 19704668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26932897 - 26932661
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatata 111  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  26932897 ataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagagagatagagggggttgaaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagggtttgtata 26932798  T
Q  112 gagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgaga 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26932797 gagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgaga 26932698  T
Q  212 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26932697 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 26932661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 14507502 - 14507275
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14507502 ataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 14507403  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  14507402 ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 14507304  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14507303 agaattaggcggaagacttattcttgtaa 14507275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28241648 - 28241421
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28241648 ataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 28241549  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||| |||    
T  28241548 ctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggt 28241450  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28241449 agaattagacgggagacttattcttgtaa 28241421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19227735 - 19227514
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19227735 ataaatatagatcttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 19227636  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  19227635 ctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggt 19227537  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19227536 agaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1230576 - 1230349
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1230576 ataaatatagaccttgtatcatagcaaactttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 1230477  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||  || ||||||||||    
T  1230476 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gactctcttggttattggaagaggctgggactttgggt 1230378  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230377 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 1230349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11983356 - 11983129
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11983356 ataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaaaggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 11983257  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  11983256 ctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 11983158  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983157 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 11983129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 13057181 - 13057408
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13057181 ataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 13057280  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13057281 ctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-aagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggt 13057379  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13057380 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 13057408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20915651 - 20915455
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20915651 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 20915552  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915551 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 20915455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 25477262 - 25477488
Alignment:
Q  21 taaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtc 120  Q
    ||||||||||| |||| |||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25477262 taaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtc 25477361  T
Q  121 tcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggta 220  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||    
T  25477362 tcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacggaaagagattggggctttgggta 25477460  T
Q  221 gaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25477461 gaattaggcgggagacttattcttgtaa 25477488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 14459092 - 14458867
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14459092 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 14458993  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  14458992 ctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgatt--ccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 14458896  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14458895 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 14458867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4816526 - 4816331
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4816526 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 4816427  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816426 gattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 4816331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 9019913 - 9020140
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9019913 ataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 9020012  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  9020013 ctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttataggaagagattgggactttgggt 9020111  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9020112 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 9020140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15530449 - 15530222
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15530449 ataaatatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagagggggctgaagcaagggcttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 15530350  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15530349 ctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggt 15530251  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15530250 tgaattaggcgggagacttattcttgtaa 15530222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 3390366 - 3390593
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  3390366 ataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttttt 3390465  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  3390466 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacagaaagagattggggctttgggt 3390564  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390565 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 3390593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 30967220 - 30967415
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30967220 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 30967319  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30967320 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaa 30967415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3630191 - 3629964
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||| | |||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3630191 ataaatatagacattgtatcaatgtaaaacttgagatagagggggctgaaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 3630092  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  3630091 ctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggt 3629993  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3629992 agaattaggagggagacttattcttgtaa 3629964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15541467 - 15541240
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15541467 ataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 15541368  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  15541367 ctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaatt-gagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggt 15541269  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||    
T  15541268 aggattaggcgggagacgtattcttgtaa 15541240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3234057 - 3233830
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  3234057 ataaatatagac-ttgtatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtatatagtttgt 3233959  T
Q  120 ctcttagg-agcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
    ||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3233958 ctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgaggctttggg 3233860  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3233859 tagaattatgcgggagacttattcttgtaa 3233830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15533008 - 15532781
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  15533008 ataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgt 15532909  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
     |||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| |||||| |||    
T  15532908 ttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggtcatgggaagagattgggacttttggt 15532810  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15532809 agaattaggcgagagacttattcttgtaa 15532781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 30729155 - 30728928
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30729155 ataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtatcgaaagacaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgt 30729056  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||  || | ||||||||    
T  30729055 ctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gactctcttggttacgggaagaggctggggctttgggt 30728957  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30728956 agaattaggcgggagacttatttttgtaa 30728928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Original strand, 32279988 - 32280210
Alignment:
Q  24 atatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctct 123  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32279988 atatagaccttgtatcatagtaaacttggagatagagggg-ctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctct 32280086  T
Q  124 taggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaa 223  Q
    | | | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  32280087 tggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggacttcaggtagaa 32280185  T
Q  224 ttaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  32280186 ttaggcgggagacttattcttgtaa 32280210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3632265 - 3632038
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3632265 ataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 3632166  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  3632165 ctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggatt-gagtctctttgttacggaaagagattgggactttgggt 3632067  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3632066 agaattaggcaggagacttattcttgtaa 3632038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 13039741 - 13039968
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||  |||| |||  | |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  13039741 ataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtatagagtttgt 13039840  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  13039841 ctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-aagtctcttggttacgggaagagattgagactttgcgt 13039939  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13039940 agaattaggcggaagacttattcttgtaa 13039968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 26065005 - 26065197
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||    
T  26065005 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttgg---aaacactagggtttgagggtt 26065101  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065102 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 26065197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 26084974 - 26085166
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||    
T  26084974 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttgg---aaacactagggtttgagggtt 26085070  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085071 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 26085166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2629217 - 2628985
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagag-----ggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagag 114  Q
    ||||||||||||||||| |||    ||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2629217 ataaatatagaccttgtatcatgttaaactttgagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 2629118  T
Q  115 tttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactt 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  2629117 tttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactt 2629019  T
Q  215 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||   | ||||||||||||    
T  2629018 tgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaa 2628985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 30034898 - 30034703
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30034898 gagatagagggagctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 30034799  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034798 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcaattggttaagggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 30034703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24338775 - 24338547
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  24338775 ataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcataaagtttgt 24338676  T
Q  120 ctcttaggagcaaacacta-gggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
     |||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||  | |||||||| ||||||||||    
T  24338675 gtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagatt-gagtcttttggttatggaaagagattaagactttggg 24338577  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  24338576 tagaattagtcagaagacttattcttgtaa 24338547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 132 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273315
Alignment:
Q  132 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  232 gagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaa 5273315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12161880 - 12161657
Alignment:
Q  21 taaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtc 120  Q
    ||||||||||| |||| |||  | |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12161880 taaatatagacattgtatcattgtaaaccttgagataaagggg-ctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 12161782  T
Q  121 tcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggta 220  Q
    |||  ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12161781 tct--ggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaaga-tcgagtctattggttacgggaagagattgagactttaggta 12161685  T
Q  221 gaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
     ||||| | |||||| ||||||||||||    
T  12161684 taattaagtgggagatttattcttgtaa 12161657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 248
Target Start/End: Original strand, 22490651 - 22490854
Alignment:
Q  45 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggttta-gaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtt 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  22490651 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgcctctttggaacaaacactagggtt 22490750  T
Q  144 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattct 243  Q
    || ||    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22490751 tgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattg-agtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattatgcgagagacttattct 22490849  T
Q  244 tgtaa 248  Q
    |||||    
T  22490850 tgtaa 22490854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3028177 - 3027954
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttg 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| | ||||||| |||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3028177 ataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccatgagataaaaggggctgaaaacaagggttt-ggaaggcaac-acaaaactagggtttgtatagagtttg 3028080  T
Q  119 tctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
     ||||| | | ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |    
T  3028079 -ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgag 3027984  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  3027983 tagaattaggctggagatttatttttgtaa 3027954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 248
Target Start/End: Original strand, 15719666 - 15719856
Alignment:
Q  45 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttt 144  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||| ||||||||||| || || | | ||||||||||||||     
T  15719666 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt- 15719755  T
Q  145 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 244  Q
      | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15719756 --gagttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 15719852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 153 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069819
Alignment:
Q  153 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 1069819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 1072204 - 1072067
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1072204 ataaatatagacattgtatcagagtaaactttgagatagaaggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgt 1072105  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattca 157  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1072104 ctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 17012031 - 17012254
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaa-acaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||  || |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  | ||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  17012031 ataaatatagaccttgtatcggagtaaaccttgagatagaggggtctgaataaaagggtttagaagta-aacaacaaa-ctagggtttgtataaagtttg 17012128  T
Q  119 tctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
     ||||| | | ||||||||||||||    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||  |||| ||    
T  17012129 -ctcttggcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttctgaaacaatattaggattg-agtctcttggtcacgagaagagattgatgcttttgg 17012224  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17012225 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 17012254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 13870748 - 13870608
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||| | |||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13870748 ataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttgt 13870650  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 161  Q
    ||||| | | |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13870649 ctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacctt 13870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 32447643 - 32447502
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||| | |||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32447643 ataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 32447544  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactag-ggtttgtgggttgattcacct 160  Q
    ||||| | | |||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  32447543 ctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcacct 32447502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066223
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 26066223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 248
Target Start/End: Original strand, 14466345 - 14466537
Alignment:
Q  45 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttt 144  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||           ||||||||| || | | |||||||||||||||    
T  14466345 aaaccttgagatagagagggttgaaacaagagtttagaaagacaacagcaaaactag-----------agtttgtctattggcaacaaacactagggttt 14466433  T
Q  145 -gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattct 243  Q
     | || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14466434 tgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacggaaagagattgggagtttgagtagaattaggcgagagacatattct 14466532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 141
Target Start/End: Original strand, 17852529 - 17852650
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  17852529 ataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgt 17852628  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactaggg 141  Q
    |||||  || ||||||||||||    
T  17852629 ctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16455701 - 16455526
Alignment:
Q  68 aaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 167  Q
    ||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||| || ||||||| |||||| | | | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16455701 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt-gtgg-ttgattcaccttgggaaa 16455606  T
Q  168 cactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||| ||||||||  ||||||||| | || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16455605 cactgttaggatta-agtctcttgctcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaa 16455526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 248
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309071
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaa 33309071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 248
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311340
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaa 33311340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 124
Target Start/End: Original strand, 8995466 - 8995570
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8995466 ataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 8995565  T
Q  120 ctctt 124  Q
    |||||    
T  8995566 ctctt 8995570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068494
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaa 26068494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754808
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaa 29754808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 149 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186172
Alignment:
Q  149 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgta 12186173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 130 - 248
Target Start/End: Original strand, 15367131 - 15367245
Alignment:
Q  130 caaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggc 229  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||| |||||||||| |||||  |    
T  15367131 caaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattg-agtctcttcgtcgcgggaagagattgaaactttgggtaaaattaatc 15367226  T
Q  230 gggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15367227 gggagacttattcttgtaa 15367245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 228
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945337
Alignment:
Q  148 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 26945337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 248
Target Start/End: Original strand, 19696479 - 19696654
Alignment:
Q  68 aaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 167  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| | | ||| ||||||||||      ||||||||||||||||||    
T  19696479 aaacaagggtttagaaaca-aacaacaaat-tagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaatcactagggttcaaa--ttgattcaccttgggaaa 19696573  T
Q  168 cactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||| |||||||| ||||||||| || || | |||||||||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  19696574 cactgttaggatt-gagtctctttgtcactgaaagagattgagactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 19696654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Original strand, 20526922 - 20526999
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  20526922 ttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattagg 20526999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22858152 - 22858075
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22858152 ttgattcaccttgggaaacactattatgattg-agtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagatttagg 22858075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037851
Alignment:
Q  151 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| | || | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggatt-gagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattagg 28037851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 178
Target Start/End: Original strand, 15346378 - 15346524
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||        |   |||||||||||| |||| | ||||     
T  15346378 ataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaccaagggtttaga--------attcaaactagggtttgtataaaatttg- 15346468  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga 178  Q
    ||||| | | |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15346469 ctcttggcaacaaacactagggt---tgggttgattcaccttgggaaacactcttagga 15346524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 124
Target Start/End: Original strand, 10584155 - 10584212
Alignment:
Q  67 gaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctt 124  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  10584155 gaaacaaaggtttataaaagcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctt 10584212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138499
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaatta 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggatt-gagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaatta 11138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 26066355 - 26066319
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagat 56  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26066355 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 26066319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 26068626 - 26068590
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagat 56  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26068626 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 26068590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 228
Target Start/End: Original strand, 11262596 - 11262649
Alignment:
Q  173 ttaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  11262596 ttaggattg-agtctcttggtcacaggaagagattgaga-tttaggtagaattagg 11262649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351973
Alignment:
Q  168 cactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  22352031 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgaga-tttgggtagaattagg 22351973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 29755023 - 29754983
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagag 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  29755023 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactctgagagagag 29754983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 93)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31179698 - 31179470
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31179698 ataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 31179599  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31179598 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggt 31179499  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31179498 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 31179470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 20 - 243
Target Start/End: Original strand, 31542687 - 31542910
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31542687 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 31542786  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31542787 ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggt 31542886  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattct 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  31542887 agaattaggcgggagacttattct 31542910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 31545032 - 31545260
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31545032 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 31545131  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  31545132 ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattagagtctcttggttacgggaagaaattgggactttgggt 31545231  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31545232 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 31545260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 15552229 - 15552425
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552229 gagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 15552328  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552329 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 15552425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25921800 - 25921573
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25921800 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 25921701  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||| |||||    
T  25921700 ctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactctgggt 25921602  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25921601 agaattaggcggaagacttattcttgtaa 25921573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10529426 - 10529199
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10529426 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttttatagagtttgt 10529327  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  10529326 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggt 10529228  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10529227 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 10529199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 248
Target Start/End: Original strand, 16776112 - 16776337
Alignment:
Q  22 aaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtct 121  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16776112 aaatatagaccttgtatctgagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttacaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 16776211  T
Q  122 cttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtag 221  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  16776212 ctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 16776310  T
Q  222 aattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16776311 aattaggcgggagacttattcttgtaa 16776337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 2174871 - 2175098
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||| || |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2174871 ataaatacaggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 2174970  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  2174971 ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 2175069  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2175070 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 2175098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 4236581 - 4236808
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4236581 ataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 4236680  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  4236681 ctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 4236779  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4236780 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 4236808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18511541 - 18511312
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagttt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18511541 ataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 18511442  T
Q  118 gtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgg 217  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18511441 gtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgg 18511343  T
Q  218 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511342 atagaattaggcgggagacttattcttgtaa 18511312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 34479714 - 34479517
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  34479714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34479615  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  34479614 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 34479517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 38882057 - 38882285
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggg-gctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38882057 ataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 38882156  T
Q  119 tctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||    
T  38882157 tctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 38882255  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38882256 tagaattaggcaggagacttattcttgtaa 38882285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 39854436 - 39854662
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39854436 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 39854534  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  39854535 ctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcatggttacgggaagagactggaactttgggt 39854633  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854634 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 39854662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 21947979 - 21948205
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21947979 ataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 21948077  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||    
T  21948078 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggt 21948176  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948177 ggaattaggcgggagacttattcttgtaa 21948205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 248
Target Start/End: Original strand, 6756449 - 6756673
Alignment:
Q  23 aatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctc 122  Q
    |||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6756449 aatatagatcttgtatcatattaaactttgagatagagggagctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctc 6756548  T
Q  123 ttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtaga 222  Q
    || ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6756549 tttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactattaggatt-gagtatcttggttacgggaagagattgagactttgggtaga 6756647  T
Q  223 attaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  6756648 attaggcgggagacttattcttgtaa 6756673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18509646 - 18509418
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagag-ggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18509646 ataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 18509547  T
Q  119 tctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  18509546 tctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagaatgggactttggg 18509448  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18509447 tagaattaagcgggagacttattcttgtaa 18509418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 34477349 - 34477152
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  34477349 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34477250  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  34477249 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 34477152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1189904 - 1189709
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  1189904 gagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 1189805  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1189804 gattcactttgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 1189709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 25904055 - 25904282
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25904055 ataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtatagagtttgt 25904154  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| ||    
T  25904155 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattagggctttgagt 25904253  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  25904254 ataattaggcgggagacttattcttgtaa 25904282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 40221474 - 40221701
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40221474 ataaatatagacattgactcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 40221573  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  40221574 ctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagattgggacttttggt 40221672  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40221673 agaattaggcggaagacttattcttgtaa 40221701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16092495 - 16092300
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  16092495 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggtt 16092396  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092395 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 16092300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 17072835 - 17073062
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17072835 ataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 17072934  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| | |||| | |    
T  17072935 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttaggggaagagattggggctttcgat 17073033  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17073034 agaattaggcggaagacttattcttgtaa 17073062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 25804009 - 25804204
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  25804009 gagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 25804108  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804109 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 25804204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 227
Target Start/End: Original strand, 20043002 - 20043208
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||| | |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20043002 ataaatataggctttgtatcatagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 20043101  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  20043102 ctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttggat 20043200  T
Q  220 agaattag 227  Q
    ||||||||    
T  20043201 agaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2818663 - 2818435
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2818663 ataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgt 2818564  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtggg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||  || |||||||||    
T  2818563 ctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgatt-gagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttggg 2818465  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2818464 tagaattaggcgggagactttttcttgtaa 2818435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 6745053 - 6745247
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||    
T  6745053 gagataaagggggctgaaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacacta-ggtttgagggtt 6745151  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745152 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 6745247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 18468995 - 18469190
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||    
T  18468995 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 18469094  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18469095 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaa 18469190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Original strand, 20044962 - 20045172
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||| | |||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20044962 ataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagacagagggggctgaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 20045061  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  20045062 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggt 20045160  T
Q  220 agaattaggcgg 231  Q
    ||||||||||||    
T  20045161 agaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 34530992 - 34530766
Alignment:
Q  21 taaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtc 120  Q
    ||||||||||| |||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34530992 taaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 34530893  T
Q  121 tcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggta 220  Q
    |||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||| |||    
T  34530892 tcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggctacgggaagagattaggactttgagta 34530794  T
Q  221 gaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34530793 gaattaggcgggagatttattcttgtaa 34530766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 6747290 - 6747484
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| | | ||||||||| |||||| |||||    
T  6747290 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttgtataaaatttgtctctttgaaacaaacacta-ggtttgagggtt 6747388  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747389 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 6747484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10474650 - 10474423
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  10474650 ataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgaaatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgt 10474551  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10474550 ctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagatt-gaatctcttggttacaggaagagattgggactttgagt 10474452  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10474451 agaattaggcgggagacttatttttgtaa 10474423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 18466668 - 18466863
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | | ||||||||||| |||| |||||    
T  18466668 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggtt 18466767  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466768 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggaaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 18466863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 27912520 - 27912715
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| | |||| |||| |||||    
T  27912520 gagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggtt 27912619  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912620 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 27912715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 18596599 - 18596824
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||  ||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18596599 ataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgggatagagggggctgaaacaagggtata--aagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 18596696  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  18596697 ctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagt 18596795  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18596796 agaattaggcgggagacttatttttgtaa 18596824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12556250 - 12556024
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  12556250 ataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgt 12556151  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||| || ||| |||    
T  12556150 ctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gtgtctcttggctacgggaagagattg-gagttttggt 12556053  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||| |  ||||||| |||||||||    
T  12556052 agaattagacaagagactttttcttgtaa 12556024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21684746 - 21684551
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21684746 gagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggtt 21684647  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21684646 gattcgccttgggatacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaa 21684551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31472915 - 31472728
Alignment:
Q  45 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttt 144  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  31472915 aaaccttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggttt 31472816  T
Q  145 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  31472815 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcggga 31472728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 26097685 - 26097911
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26097685 ataaatatagaccttgaatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgt 26097784  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |   || ||||||||||    
T  26097785 ctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcacctt-ggaaacactattaggaat-gagtctcttggttacgggaaaatgctgggactttgggt 26097882  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26097883 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 26097911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 27910435 - 27910629
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||    
T  27910435 gagatagcgggggctgaaacaagg-tttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 27910533  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910534 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 27910629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31466305 - 31466079
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31466305 ataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataaaaggggctgaaacaaaggtttaaaaaagtaacgacaaaactagggtttgtatagagtttgt 31466206  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  31466205 ctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggt 31466107  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31466106 agaattaggcgggagac-tattcttgtaa 31466079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36402655 - 36402428
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| ||||||||||||    
T  36402655 ataaatatagaccttatatcagagtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaatcacgaaactagggtttgtatagagtttgt 36402556  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||    
T  36402555 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggatt-gaatctcttggttacgggaggagattggaactttgggt 36402457  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  36402456 aaaattaggctggagacttattattgtaa 36402428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17818816 - 17818590
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  17818816 ataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagaaagagggg-ctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcgt 17818718  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  17818717 ctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagact-gagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggt 17818619  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17818618 agaattatgcgggagacttattcttgtaa 17818590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 24126808 - 24127035
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| || | |||  | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24126808 ataaatatagacattatatcagtgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 24126907  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    |||||   | |||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24126908 ctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggatt-aagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggt 24127006  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24127007 agaattaggcgatagacttattcttgtaa 24127035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 39398294 - 39398093
Alignment:
Q  45 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttagg-agcaaacactagggtt 143  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||    
T  39398294 aaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtt 39398197  T
Q  144 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattct 243  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  39398196 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggaaagagattggaactttgggtagaattaggcagtagacttattct 39398098  T
Q  244 tgtaa 248  Q
    |||||    
T  39398097 tgtaa 39398093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 2954368 - 2954596
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||| | |||| |||  | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | || | |||||    
T  2954368 ataaatataggctttgtatcagtgtaaactttgagatagaggagtatgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgt 2954467  T
Q  120 ctcttagg-agcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
    ||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  2954468 ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattg-agtctcttagttacgagaagagattgagactttggg 2954566  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2954567 tagaattaggcgggagacgtattcttgtaa 2954596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37706107 - 37705880
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||| ||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  37706107 ataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgtatagactttgt 37706008  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  |  ||||| |    
T  37706007 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggat 37705909  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37705908 agaattaggtgggagacttattcttgtaa 37705880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 45 - 248
Target Start/End: Original strand, 695866 - 696056
Alignment:
Q  45 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttt 144  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||           ||| ||| |||||||||||||||    
T  695866 aaaccttgagataaagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat-----------ctttggaacaaacactagggttt 695954  T
Q  145 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 244  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  695955 gagggttgattcaccttgg-aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 696052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 90 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658453
Alignment:
Q  90 caacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctct 189  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagga-tcgagtctct 658512  T
Q  190 tggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  658511 tggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 658453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6661509 - 6661286
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||   |||||| |||| |||||| | ||||||||||||    
T  6661509 ataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaattagggtatgtatagagtttgt 6661411  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
     |||| | | |||||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||    
T  6661410 -tcttggcaacaaacactagagttgg--ggttgattcaccatgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaaattgagattttgggt 6661315  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  6661314 acaattaggcaggagacttattcttgtaa 6661286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26098578 - 26098391
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||  ||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  26098578 ataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgtatagagtttgt 26098479  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattg 208  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  26098478 ctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaaacactattatgatt-gagtctcttggttacggaaagagattg 26098391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 21288716 - 21288948
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||  | | || |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  21288716 ataaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggttgaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttgt 21288815  T
Q  120 ctcttaggagcaaacac------tagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagact 213  Q
    ||||| ||| |||||||      ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||  ||||    
T  21288816 ctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcacctt-gaaaacactattaggatt-gagtatcttggttacgggaagagattaggact 21288913  T
Q  214 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||| |||||||| |||||||| || |||||||||    
T  21288914 ttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaa 21288948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 135 - 248
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410202
Alignment:
Q  135 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggag 4410188  T
Q  235 acttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||    
T  4410189 acttattcttgtaa 4410202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 147 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20506041 - 20505941
Alignment:
Q  147 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20506041 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  247 aa 248  Q
    ||    
T  20505942 aa 20505941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 144 - 248
Target Start/End: Original strand, 39798123 - 39798226
Alignment:
Q  144 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattct 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798123 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattct 39798221  T
Q  244 tgtaa 248  Q
    |||||    
T  39798222 tgtaa 39798226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Original strand, 10586791 - 10587007
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagag---ggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtt 116  Q
    ||||||||||||||||| |||    ||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||           ||||    
T  10586791 ataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactag-----------agtt 10586879  T
Q  117 tgtctcttagg-agcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagacttt 215  Q
    |||||||| || | |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  10586880 tgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattc-agtctcttgcttacggaaagagattgagacttt 10586978  T
Q  216 gggtagaattaggcgggagacttattctt 244  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10586979 gggtagaattaggcaggagacttattctt 10587007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 248
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10749880
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 10749880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 135 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585844
Alignment:
Q  135 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggag 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattg-agtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggag 41585858  T
Q  235 acttattcttgtaa 248  Q
    ||||||| ||||||    
T  41585857 acttatttttgtaa 41585844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 248
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757356
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttac-ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 10757356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20507789 - 20507665
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| || ||||| ||||||||||||    
T  20507789 ataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtttgtatagagtttgt 20507690  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggttt 144  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||    
T  20507689 ctctttggaacaaacacaagggttt 20507665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 36208532 - 36208755
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| || |||| ||     
T  36208532 ataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggttt-tagagagatt- 36208627  T
Q  119 tctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
    ||||| ||  | | | |||||||||  ||  |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  36208628 tctctaagcgggagaaactagggttgttg--ttgattcaccttgggaaacattactaagattg-agtctcttggtaacgggaagagattgagactttggg 36208724  T
Q  219 tagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  36208725 tagaattaggtttgtagacttattcttgtaa 36208755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3373236
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 3373236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38960231
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagac-tattcttgtaa 38960231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 248
Target Start/End: Original strand, 20053834 - 20054017
Alignment:
Q  55 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgat 154  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||  |||||||| ||||||||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||    |||||||    
T  20053834 atagagggcgctgaaacaagggtttagaagg-caacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--ggttgat 20053929  T
Q  155 tcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20053930 tcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtt-----tggagattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaa 20054017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354674
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaa 15354674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356950
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaa 15356950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 248
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665223
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaa 23665223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793364
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaa 23793364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 208
Target Start/End: Original strand, 2723960 - 2724041
Alignment:
Q  126 ggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattg 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2723960 ggagcaaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattg 2724041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 106
Target Start/End: Original strand, 4410009 - 4410099
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggttt 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4410009 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 4410099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 149 - 248
Target Start/End: Original strand, 9020299 - 9020397
Alignment:
Q  149 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9020299 gttgattcaccttggaaaacactattaagattg-agtttcttggtcacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaa 9020397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 130 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17413383 - 17413288
Alignment:
Q  130 caaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17413383 caaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattagg 17413288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 23742034 - 23741958
Alignment:
Q  171 tattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  23742034 tattaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaa 23741958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 237
Target Start/End: Original strand, 42770750 - 42770934
Alignment:
Q  45 aaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtt 143  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||   ||||| ||||| |||| |||||||||| |||| ||||| | | ||||||||| ||||    
T  42770750 aaaccttgagatagaggggactgaaaacaagggtttggaagg-caaca-caaaattagg-tttatatagaatttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt 42770845  T
Q  144 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact 237  Q
     |  |||| ||||||| ||||||||  |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  42770846 gg--ggttcattcaccatgggaaac--tattaggactg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 41586033 - 41585947
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggttt 106  Q
    ||||||||||   |||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41586033 ataaatataggttttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaataacaagaacaaaactagggttt 41585947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 198 - 248
Target Start/End: Original strand, 42770939 - 42770989
Alignment:
Q  198 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42770939 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaa 42770989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 248
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143645
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 15143645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Original strand, 4754235 - 4754312
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4754235 ttgattcaccttgaaaaacactattagaattg-agcctcttggtcactggaagagattgtgactttggatagaattagg 4754312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 230
Target Start/End: Original strand, 23667415 - 23667481
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcg 230  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  23667415 gaaacactataaggattggactctcttgcttacagaaagagattgggactttggaaagaattaggcg 23667481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2144763 - 2144684
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattga-gactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  2144763 ttgattcaccttggagaaacactattaggat-ggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattagg 2144684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 23742092 - 23742057
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23742092 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga 23742057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 229
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4897888
Alignment:
Q  168 cactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggc 229  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4897828 cactgttaggattg-agtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggc 4897888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 3373368 - 3373332
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagat 56  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3373368 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 3373332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2298183 - 2298122
Alignment:
Q  165 aaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  2298183 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 2298122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 10627364 - 10627425
Alignment:
Q  165 aaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10627364 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagac-tagggtagaattagg 10627425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 55
Target Start/End: Original strand, 23665090 - 23665125
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga 55  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23665090 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23665125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 55
Target Start/End: Original strand, 23667365 - 23667400
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga 55  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23667365 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23667400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 23793497 - 23793462
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga 55  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23793497 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23793462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26406647 - 26406594
Alignment:
Q  173 ttaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  26406647 ttaggattg-agtctcttggtcacaggaagagattgagac-ttgagtagaattagg 26406594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 13295835 - 13295896
Alignment:
Q  165 aaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagatt-gagactttgggtagaatta 226  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13295835 aaacacttttaggattg-agtctcttgatcacatgaagagattcgagactttgggtagaatta 13295896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34033768 - 34033691
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattga-gactttgggtagaatta 226  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||| | || ||||||||||||||    
T  34033768 ttgatttaccttggagaaacactattaggatt-gagtctcttggtcgcgggaagagattcaggattttgggtagaatta 34033691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 164 - 228
Target Start/End: Original strand, 32520533 - 32520597
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattga-gactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| | |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32520533 gaaacactattaagattg-agtctctcgattacgggaagagattcatgactttgggtagaattagg 32520597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 15354809 - 15354777
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttg 52  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15354809 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 15354777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 15357085 - 15357053
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttg 52  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15357085 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 15357053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 119)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 35777353 - 35777581
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35777353 ataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 35777452  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35777453 ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggt 35777552  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777553 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 35777581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6063773 - 6063543
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagttt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6063773 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 6063674  T
Q  118 gtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgg 217  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6063673 gtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgg 6063574  T
Q  218 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6063573 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 6063543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6066122 - 6065893
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagaggggg-ctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  6066122 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttg 6066023  T
Q  119 tctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6066022 tctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 6065923  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6065922 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 6065893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 50493931 - 50494159
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50493931 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 50494030  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  50494031 ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagggattgggactttgggt 50494130  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50494131 agaattaggcggaagacttattcttgtaa 50494159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 746721 - 746917
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746721 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 746820  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746821 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 746917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 455871 - 456067
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455871 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 455970  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455971 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 456067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 458248 - 458444
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458248 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 458347  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458348 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 458444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 3859460 - 3859687
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3859460 ataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 3859559  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  3859560 ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggt 3859658  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859659 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 3859687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4308606 - 4308379
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4308606 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 4308507  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  4308506 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggt 4308408  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308407 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 4308379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10621823 - 10621627
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621823 gagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 10621724  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621723 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 10621627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 38210334 - 38210530
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  38210334 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 38210433  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38210434 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 38210530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 5191585 - 5191812
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5191585 ataaatatagaccttgtatctaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 5191684  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  5191685 ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 5191783  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5191784 agaattaggcgggagactcattcttgtaa 5191812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 6561742 - 6561969
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6561742 ataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 6561841  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6561842 ctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggt 6561940  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561941 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 6561969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 24979639 - 24979866
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24979639 ataaatatataccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 24979738  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24979739 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggatt-gagtctcttggttacggaaagagattgagactttgggt 24979837  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24979838 agaattaggcaggagacttattcttgtaa 24979866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 11170336 - 11170563
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11170336 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 11170435  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||  || |||||| |||    
T  11170436 ctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtgtcttggttacgggaagaggctgggactttaggt 11170534  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170535 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 11170563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 38889971 - 38890199
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagt 115  Q
    |||||||||||||||||   | ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  38889971 ataaatatagaccttgt---atagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagt 38890067  T
Q  116 ttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagacttt 215  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  38890068 ttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggacttt 38890166  T
Q  216 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890167 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 38890199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22114630 - 22114403
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22114630 ataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 22114531  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || || |||||||    
T  22114530 ctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggattttgggt 22114432  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114431 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 22114403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 43228223 - 43228450
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  43228223 ataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgtatagagtttgt 43228322  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  43228323 ctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 43228421  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43228422 agaattaggcaggagacttattcttgtaa 43228450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 45882871 - 45883098
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  45882871 ataaatatagaccttgtatcatagtaaactatgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgt 45882970  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  45882971 ctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggt 45883069  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45883070 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 45883098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 51727331 - 51727105
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  51727331 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgtatagagtttgt 51727232  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||    
T  51727231 ctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggtaagaggctgagactttgggt 51727134  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51727133 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 51727105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 43226018 - 43226244
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  43226018 ataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactacg-tttgtatagagtttgt 43226116  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  43226117 ctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 43226215  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226216 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 43226244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 43423788 - 43423561
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43423788 ataaatatagacattgtatcactgtaaaccttgagaaagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 43423689  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  43423688 ctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggt 43423590  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43423589 agaattaggcggtagacttattcttgtaa 43423561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 53917989 - 53917762
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||  ||| |  |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53917989 ataaatatagaccttgaatcagattaaaccttgagatggagggggctgaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 53917890  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  53917889 ctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggt 53917791  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917790 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 53917762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18099493 - 18099268
Alignment:
Q  23 aatatagaccttgtgtcaaagcaaacttt-gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtct 121  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18099493 aatatagaccttgtatcagagtaaacttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 18099394  T
Q  122 cttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtag 221  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  18099393 ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 18099295  T
Q  222 aattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  18099294 aattaggcgggagacttattcttgtaa 18099268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 50 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28102297 - 28102100
Alignment:
Q  50 ttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtggg 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  28102297 ttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggg 28102198  T
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28102197 ttgattcaccttgggaaacgctattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 28102100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18097226 - 18096998
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaacttt-gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18097226 ataaatatagaccttgtatcatagtaaacttgagagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 18097127  T
Q  119 tctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||    
T  18097126 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 18097028  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18097027 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 18096998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 1313342 - 1313568
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1313342 ataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagg-tttacaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 1313440  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1313441 ctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggt 1313539  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1313540 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 1313568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 3314616 - 3314843
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||  |||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3314616 ataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 3314715  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3314716 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggt 3314814  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  3314815 aaaattaggcgggagacttattcttgtaa 3314843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4104188 - 4103993
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4104188 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 4104089  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104088 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 4103993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10956352 - 10956125
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10956352 ataaatatagaccttgtatcagagtaaacatgaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 10956253  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  10956252 ctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggt 10956154  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956153 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 10956125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 64 - 248
Target Start/End: Original strand, 25388882 - 25389065
Alignment:
Q  64 gctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 163  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25388882 gctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-g 25388980  T
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25388981 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaa 25389065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27101510 - 27101279
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaact----ttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagt 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27101510 ataaatatagaccttgtatcagagcaaattgagatagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 27101411  T
Q  116 ttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagacttt 215  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  27101410 ttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagaatgggacttt 27101312  T
Q  216 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27101311 gggtagaattaggtgggagacttattcttgtaa 27101279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12268291 - 12268062
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaa-ctagggtttatatagagtttg 118  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  12268291 ataaatatagaacttgtatcagagtaaactttgagatagagggagctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaaactagggtttgtatagagtttg 12268192  T
Q  119 tctcttagg-agcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgg 217  Q
    |||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  12268191 tctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggggctttgg 12268093  T
Q  218 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12268092 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 12268062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1627008 - 1626781
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  1627008 ataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttat 1626909  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  1626908 ctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggggagagattgggactttgggt 1626810  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1626809 agaattaagcgggagacttattcttgtaa 1626781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10958648 - 10958421
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10958648 ataaatatagaccttgtatcagagtaaacataaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 10958549  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||    
T  10958548 ctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgacactttgggt 10958450  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10958449 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 10958421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 25533406 - 25533601
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||    
T  25533406 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 25533505  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533506 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 25533601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10084718 - 10084487
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagt 115  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  10084718 ataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagatagagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagt 10084619  T
Q  116 ttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagacttt 215  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  || ||||||    
T  10084618 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga-tcgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttt 10084520  T
Q  216 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10084519 gggtagaattaggagggagacttattcttgtaa 10084487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 50 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28100336 - 28100143
Alignment:
Q  50 ttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtggg 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  28100336 ttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggg 28100237  T
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 244  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28100236 ttgattcaccttggaaaacgctattaggatt-gagtcttttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 78 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28413299 - 28413129
Alignment:
Q  78 ttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 177  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28413299 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 28413200  T
Q  178 attggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28413199 attgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 28413129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5927089 - 5926862
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| ||   | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  5927089 ataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgt 5926990  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    || || ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  5926989 ctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggt 5926891  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5926890 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 5926862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 30005805 - 30006000
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  30005805 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 30005904  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30005905 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 30006000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 42990268 - 42990463
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| |||||    
T  42990268 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 42990367  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990368 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 42990463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 53915821 - 53915594
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||  ||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  53915821 ataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgtatagattttgt 53915722  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  53915721 ctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggt 53915623  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53915622 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 53915594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10191638 - 10191408
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagt 115  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||    |||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  10191638 ataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagataaagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttttatagagt 10191539  T
Q  116 ttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagacttt 215  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  10191538 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga-tcgagtctcttggttacaggaagaggctg-gacttt 10191441  T
Q  216 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10191440 gggtagaattaggagggagacttattcttgtaa 10191408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 18162596 - 18162822
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaa-agcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttg 118  Q
    ||||||||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18162596 ataaatatagaccttgtatcatgagtaaacttggagatagaggga--tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 18162693  T
Q  119 tctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
    ||||||  || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18162694 tctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 18162792  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18162793 tagaattaggtgggagacttattcttgtaa 18162822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Original strand, 26720480 - 26720702
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26720480 ataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 26720579  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    || || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  26720580 ctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggatt-gagtttcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 26720677  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattctt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26720678 agaattaggcgggagacttattctt 26720702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 48361995 - 48361769
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48361995 ataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatacagggggctgaaacaagg-tttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 48361897  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  48361896 ctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggatt-gagtctcttagttacgggaagagattggggcttttggt 48361798  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  48361797 agaattaggcggaagactttttcttgtaa 48361769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28761753 - 28761527
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||  ||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  28761753 ataaatatagactttgcatcagagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatatagtttg- 28761655  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  28761654 ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagatattgagactttaggt 28761556  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28761555 agaattaggcgggatacttattcttgtaa 28761527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 51943303 - 51943529
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||  ||| || |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51943303 ataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggtgctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 51943402  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    |||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||    
T  51943403 ctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggt 51943501  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51943502 agaattaggcgggagactt-ttcttgtaa 51943529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 32264368 - 32264137
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagca----aactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagt 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  32264368 ataaatatagaccttgtatcagagtaaattaactttgagatagagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagt 32264269  T
Q  116 ttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagacttt 215  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  ||  |||||    
T  32264268 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctggaacttt 32264170  T
Q  216 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32264169 gggtagaattatgcgggagacttattcttgtaa 32264137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5522940 - 5522724
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||           ||    
T  5522940 ataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-----------gt 5522852  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  5522851 ctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 5522753  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522752 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 5522724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 245
Target Start/End: Original strand, 39715402 - 39715625
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  39715402 ataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgtatagagtttgt 39715500  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    || || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39715501 ctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggt 39715599  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  39715600 agaattaggcgggagacttattcttg 39715625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9604899 - 9604705
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||| |||||    
T  9604899 gagatagagggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggtt 9604801  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9604800 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 9604705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 29956650 - 29956845
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| |||||    
T  29956650 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 29956749  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29956750 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 29956845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 43421740 - 43421513
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  43421740 ataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 43421641  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||| |  |||||||    
T  43421640 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaatt-gagtctcttggttacgggaaaagattggggatttgggt 43421542  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43421541 agaattagacgggagacttattcttgtaa 43421513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 35918274 - 35918041
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35918274 ataaatatagaccttgtatcatagcaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 35918175  T
Q  120 ctcttagga------gcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagact 213  Q
    ||||| |||       |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||| || || |    
T  35918174 ctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaatt-gagtctcttggttacgagaagagactgggaat 35918076  T
Q  214 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  35918075 ttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaa 35918041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 15780792 - 15781030
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtt--- 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||       
T  15780792 ataaatatagaccttgtatcagagtaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 15780891  T
Q  117 --------tgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattg 208  Q
            |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  ||    
T  15780892 ataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattacgatt-gagtctcttggttacgggaagaggctg 15780990  T
Q  209 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15780991 agactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaa 15781030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 880777 - 880549
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  880777 ataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggtctgaaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttcgt 880678  T
Q  120 ctcttagg-agcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
    ||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||    
T  880677 ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcatt-gagtctcttggttacggaaagagattggggctttggg 880579  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  880578 tagaattagacgggagagttattcttgtaa 880549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Original strand, 28180956 - 28181177
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28180956 ataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaata--ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 28181053  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  28181054 ctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggatt-gagtctattggttacgggaagagattgggactttggat 28181152  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattctt 244  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  28181153 agaattaggcgggagacgtattctt 28181177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 47149188 - 47148993
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttagg-agcaaacactagggtttgtgggt 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||| || ||||  |||    
T  47149188 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggt 47149089  T
Q  151 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149088 tgattcacctt-ggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 47148993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 92 - 248
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321638
Alignment:
Q  92 acaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 191  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttg 1321581  T
Q  192 gttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321582 gttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 1321638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 36011759 - 36011986
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| | |  | |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  36011759 ataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtatagagtttgt 36011858  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    |||||  || ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36011859 ctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggatt-gaatatcttggttacgggaagagattgtgactttgggt 36011957  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  36011958 agaattagttgggagacttattcttgtaa 36011986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 53468780 - 53468554
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  53468780 ataaatatagacattgtatcagtgtaaacctttagataaagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaaccagg-tttgtatagagtttgt 53468682  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  53468681 ctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacggggagagattgggactttgggt 53468583  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  53468582 aaaattaggcgggagacttattcttgtaa 53468554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 51675080 - 51674864
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||           ||    
T  51675080 ataaatatagacgttgtatcaatgtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaggttt-----------gt 51674992  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    | ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| || ||||| |    
T  51674991 ccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagattgggattttggat 51674893  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51674892 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 51674864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 156
Target Start/End: Original strand, 11163082 - 11163218
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11163082 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 11163181  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattc 156  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11163182 ctctttggaacaaacactagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 31151279 - 31151504
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagttt 117  Q
    |||||||||||| |||| ||| | | |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  31151279 ataaatatagactttgtatcagatgtaaacctcgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaat-caacaagaaaactagggtttgtatagagttt 31151377  T
Q  118 gtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgg 217  Q
    | ||||| | | ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  31151378 g-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaaaagattgggactttgg 31151473  T
Q  218 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31151474 gtagaattaggcgggtgacttattcttgtaa 31151504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 53 - 180
Target Start/End: Original strand, 41849117 - 41849244
Alignment:
Q  53 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttg 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41849117 agatagagggggctgaaacaagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttg 41849216  T
Q  153 attcaccttgggaaacactattaggatt 180  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41849217 attcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 54691898 - 54691673
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||| | |||| ||| || |||| || |||||||||||| | |||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54691898 ataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggg-taaaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 54691800  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||  ||||||||||  | ||||| ||    
T  54691799 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gaattttttggttatgggaagagattagggctttgagt 54691701  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgta 247  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  54691700 tgaattaggcgggagacttattcttgta 54691673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 32219027 - 32219243
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||           |||||||    
T  32219027 ataaatatagaccttgtatctgactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactag-----------agtttgt 32219115  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||     
T  32219116 ctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggatt-gagtctcttggttgcgggaagagattgggactttgggc 32219214  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  32219215 agaattaggcggaagacttatttttgtaa 32219243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 221
Target Start/End: Original strand, 42992250 - 42992417
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||| |||||    
T  42992250 gagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggtt 42992349  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtag 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||    
T  42992350 gattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagagagtg-gactttgggtag 42992417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28137620 - 28137415
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||  | |||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||           |||||||    
T  28137620 ataaatatatgcgttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag-----------agtttgt 28137532  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  28137531 ctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattagga-tgaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggt 28137433  T
Q  220 agaattaggcgggagact 237  Q
    |||||||||||| |||||    
T  28137432 agaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606685
Alignment:
Q  110 tagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattga 209  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||     
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgg 7606724  T
Q  210 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606723 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 7606685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 23633392 - 23633613
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| ||| || |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||   |||||| ||||||||||||| ||||| |||||     
T  23633392 ataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaaggatttagaagc-caacaagaaaactagggtttgtatagtgtttg- 23633489  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | |||||||||||||| |  |||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23633490 ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttacc--gggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggt 23633584  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23633585 agaattaggcggaagacttattcttgtaa 23633613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13420497 - 13420284
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||          ||  |||||||||||| |||||||||| |    
T  13420497 ataaatataggttttgtatcaaagcaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggttta----------aatcaaactagggtttgtatagagttt-t 13420409  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||  | | ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13420408 ctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggt 13420313  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13420312 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 13420284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 890096 - 889871
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||  |||| |||  | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||   ||||||  || ||||||||| ||||||||||||    
T  890096 ataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggaagctgaaacaagggtttagaatggcaacaa--aacctagggtttgtatagagtttgt 889999  T
Q  120 ctcttagg-agcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
    || || || | |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  889998 ctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag-ttggggctttggg 889901  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  889900 tagaattaggcaggagagttattcttgtaa 889871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 23636959 - 23637182
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||| || |||| ||| || |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| |||||||| ||     
T  23636959 ataaatatatactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctaaaacaagggtttagaagc-caacaagaaaactagggtttgtatagagtctg- 23637056  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | ||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |  |||||| |||  ||||||||||    
T  23637057 ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttgttcatgggaagatattaggactttgggt 23637153  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23637154 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 23637182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 241
Target Start/End: Original strand, 54884114 - 54884307
Alignment:
Q  45 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttt 144  Q
    |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||| ||  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  54884114 aaaccttgagatagagggagctcgaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttgta--gagtttgtttctttggaacaaacactagggttt 54884211  T
Q  145 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatt 241  Q
    |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  54884212 gatggttgattcatcttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacagaaagagattgaaactttgaatagaattaggagggagacttatt 54884307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Original strand, 53591127 - 53591339
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| | |  | |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||           ||    
T  53591127 ataaatatagacattgtataagtgtaaaccttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggttt-----------gt 53591215  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    |||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||| |||||  || |||||||    
T  53591216 ctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaatt-gagtctcttggttacgagaatagatttggattttgggt 53591314  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattctt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  53591315 agaattaggcgggagacttattctt 53591339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 51 - 248
Target Start/End: Original strand, 4666488 - 4666675
Alignment:
Q  51 tgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggt 150  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||| ||||||||           |||||||   | || ||||||||||||| ||||    
T  4666488 tgagatagagggggctgaaagaagggtctagtaagacaacaacaaaaatagggttt-----------gtctcttgacaacagacactagggtttgagggt 4666576  T
Q  151 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaga--cttattcttgtaa 248  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4666577 tgattcatcttgggaaacactattatgattg-agtctctaggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaa 4666675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 53597173 - 53597395
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| || |||||||||| |    
T  53597173 ataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggga-tgaaacaagggtttataagt-caacaagaaaactaggggttgtatagagttt-t 53597269  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | ||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   ||| ||||||||| |||| ||    
T  53597270 ctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcatgagaatagattgagattttgagt 53597366  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  53597367 agaattaggcaagagacttattcttgtaa 53597395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 95 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 562024 - 561875
Alignment:
Q  95 aaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 194  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| | | ||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  562024 aaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttca--ggttgattcacattgggaaacactattaggattt-agtctcttggtc 561929  T
Q  195 acaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  561928 acgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaa 561875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 95 - 248
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635540
Alignment:
Q  95 aaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 194  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||| | | |||||||||||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggattt-agtctcttggtc 25635486  T
Q  195 acaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25635487 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaa 25635540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 139 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688259
Alignment:
Q  139 gggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactt 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactt 25688269  T
Q  239 attcttgtaa 248  Q
    ||||||||||    
T  25688268 attcttgtaa 25688259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 136 - 248
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6231959
Alignment:
Q  136 ctagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaga 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgtt-gagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggaga 6231946  T
Q  236 cttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||    
T  6231947 cttattcttgtaa 6231959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 101 - 248
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484519
Alignment:
Q  101 gggtttatatagagtttgtctcttagg-agcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacagg 199  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || | |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttg-agtctcttggttacggg 6484470  T
Q  200 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6484471 aagagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaa 6484519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 248
Target Start/End: Original strand, 17795303 - 17795417
Alignment:
Q  130 caaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggc 229  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17795303 caaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattg-agtctcttggtcacggaaagagattgaggctttgggtagaattaggc 17795398  T
Q  230 gggagacttattcttgtaa 248  Q
    || ||||||||||||||||    
T  17795399 ggaagacttattcttgtaa 17795417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 248
Target Start/End: Original strand, 19103743 - 19103857
Alignment:
Q  130 caaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggc 229  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19103743 caaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattg-agtctcttggtcacggaaagagattgaggctttgggtagaattaggc 19103838  T
Q  230 gggagacttattcttgtaa 248  Q
    || ||||||||||||||||    
T  19103839 ggaagacttattcttgtaa 19103857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 27635950 - 27635830
Alignment:
Q  22 aaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtct 121  Q
    ||||||||||||||  | | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27635950 aaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 27635851  T
Q  122 cttaggagcaaacactagggt 142  Q
    ||| ||| |||||||||||||    
T  27635850 cttgggaacaaacactagggt 27635830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 149 - 248
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886358
Alignment:
Q  149 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttg-agtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 5886358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 47701920 - 47701798
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47701920 ataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 47701821  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggt 142  Q
    || || ||| ||||||| |||||    
T  47701820 ctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 88 - 248
Target Start/End: Original strand, 1673975 - 1674131
Alignment:
Q  88 aacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtct 187  Q
    ||||| |||||||| |||| |||| |||||| ||||| | | |||||||||||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1673975 aacaagaaaactagtgtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttag--gattgattcaccatgggaaacactattaggattg-agtct 1674070  T
Q  188 cttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||| | || ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  1674071 cttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaa 1674131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 149 - 248
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899831
Alignment:
Q  149 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttg-agtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 5899831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 24177211 - 24177380
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  24177211 ataaatatagaccttgtatcatagtaaacattgagctagagggggctgaaaacaagagtttagatgt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg 24177309  T
Q  119 tctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 193  Q
     ||||| | | ||||||||| |||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24177310 -ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 141
Target Start/End: Original strand, 6231381 - 6231502
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6231381 ataaatatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagcgggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 6231480  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactaggg 141  Q
    ||||| | | ||||||||||||    
T  6231481 ctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 248
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168260
Alignment:
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaa 11168260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4560497 - 4560401
Alignment:
Q  132 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggc 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  4560497 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggc 4560401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36871583 - 36871420
Alignment:
Q  60 gggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacc 159  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| | | ||||||| |||||| |  | ||||||||||    
T  36871583 gggggctgaaacaagggtttacaagc-caacaagaaaactagggcttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttag--gattgattcacc 36871488  T
Q  160 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36871487 ttggaaaacactgttaagattg-agtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattagg 36871420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 124
Target Start/End: Original strand, 3306731 - 3306835
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  3306731 ataaatatagacattgtatcagtgtaaacctagagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatagagtttgt 3306830  T
Q  120 ctctt 124  Q
    |||||    
T  3306831 ctctt 3306835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 84
Target Start/End: Original strand, 1321373 - 1321437
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 84  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321373 ataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 1321437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620580
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattag-gtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 1620580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 248
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3306920
Alignment:
Q  166 aacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3306839 aacactattaggattg-agtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaa 3306920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14634638 - 14634561
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14634638 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattagg 14634561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11007679 - 11007633
Alignment:
Q  182 gagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11007679 gagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 11007633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 53896521 - 53896475
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggct 66  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53896521 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct 53896475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 225
Target Start/End: Original strand, 13419883 - 13420015
Alignment:
Q  87 caacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 186  Q
    |||||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||| | | |||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  13419883 caacaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattagga-tcaagtc 13419976  T
Q  187 tcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaatt 225  Q
    ||||||| || | |||||||| | | |||||||||||||    
T  13419977 tcttggtcacggaaagagattcaaattttgggtagaatt 13420015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 248
Target Start/End: Original strand, 24181489 - 24181539
Alignment:
Q  198 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24181489 ggaaaagattgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaa 24181539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 193
Target Start/End: Original strand, 25633930 - 25634024
Alignment:
Q  95 aaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 193  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| | | |||||||||||| | |  | |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25633930 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggctgg--gattgattcaccttgggagacattattaggatt-gagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 4560590 - 4560509
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactag 101  Q
    |||| |||||||  ||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||   ||||||||||||||    
T  4560590 ataagtatagactatgtatcatagtaaacattgagatagagggggctgaaacaatggtttataaaggtaacaacaaaactag 4560509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7606873 - 7606828
Alignment:
Q  132 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 177  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606873 aacagtaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 7606828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066731
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagatt-gagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||| | || |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaa-tcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattagg 11066731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701769
Alignment:
Q  216 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 47701769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 31021359 - 31021284
Alignment:
Q  130 caaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagatt 207  Q
    |||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||    
T  31021359 caaacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggatt-gagtctcttgatcacatgaagagatt 31021284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 1618983 - 1618893
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagata--gagggggctgaaa-caagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttata 109  Q
    |||||||||||||||||  || || |||| |||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  1618983 ataaatatagaccttgtaccatagtaaaccttgagagacagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaac-aaactagggtttata 1618893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 191
Target Start/End: Original strand, 7768632 - 7768672
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 191  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7768632 ttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttg 7768672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 76
Target Start/End: Original strand, 6484317 - 6484373
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggg 76  Q
    |||||||||| | |||| |||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6484317 ataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaggg 6484373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 6719390 - 6719358
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 84  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6719390 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaa 6719358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 6719436 - 6719396
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagag 60  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  6719436 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagag 6719396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27635792 - 27635756
Alignment:
Q  212 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27635792 ctttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaa 27635756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27762107
Alignment:
Q  168 cactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  27762165 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 27762107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 96)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 16226119 - 16226347
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16226119 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggtctaaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 16226218  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16226219 ctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggt 16226318  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16226319 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 16226347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 47179661 - 47179893
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagt 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47179661 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 47179760  T
Q  116 ttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagacttt 215  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  47179761 ttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttt 47179860  T
Q  216 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47179861 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 47179893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 47177310 - 47177542
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagt 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47177310 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 47177409  T
Q  116 ttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagacttt 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  47177410 ttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatgggagtctcttggttacgggaagagattgggacttt 47177509  T
Q  216 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47177510 gggtagaattaggcaggagacttattcttgtaa 47177542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 51749991 - 51750218
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51749991 ataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 51750090  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  51750091 ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 51750189  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750190 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 51750218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9459714 - 9459518
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9459714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggtt 9459615  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9459614 gattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaa 9459518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9463541 - 9463345
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9463541 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggtt 9463442  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9463441 gattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaa 9463345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 13215033 - 13215260
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13215033 ataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 13215132  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13215133 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggt 13215231  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13215232 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 13215260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Original strand, 6822971 - 6823193
Alignment:
Q  24 atatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctct 123  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6822971 atatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 6823070  T
Q  124 taggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaa 223  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||    
T  6823071 taggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaa 6823168  T
Q  224 ttaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  6823169 ttaggcgggagacttattcttgtaa 6823193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10400157 - 10399930
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10400157 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactgggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 10400058  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  10400057 ctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttcggt 10399959  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399958 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 10399930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 15823498 - 15823725
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15823498 ataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 15823597  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  15823598 ctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggt 15823696  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15823697 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 15823725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 20302411 - 20302638
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20302411 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 20302510  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |  ||||||||||    
T  20302511 ctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagagactaggactttgggt 20302609  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302610 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 20302638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38925807 - 38925580
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38925807 ataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 38925708  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38925707 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggt 38925609  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38925608 agaattaggctggagacttattcttgtaa 38925580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 2617468 - 2617695
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2617468 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 2617567  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  2617568 ctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 2617666  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2617667 agaattaggatggagacttattcttgtaa 2617695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 28842445 - 28842674
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagttt 117  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28842445 ataaatataaaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 28842544  T
Q  118 gtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgg 217  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||    
T  28842545 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggatt-gagtctattggttacgggaagaggctgagactttgg 28842643  T
Q  218 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28842644 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 28842674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 28840630 - 28840859
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagttt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28840630 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatacagggggatgaaacaagggtttagaaaggaaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 28840729  T
Q  118 gtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgg 217  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||    
T  28840730 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgg 28840828  T
Q  218 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840829 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 28840859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 13761789 - 13762016
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13761789 ataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacataactagggtttgtatagagtttgt 13761888  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  13761889 ctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagtctgtgactttgggt 13761987  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13761988 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 13762016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28998582 - 28998355
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||  ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28998582 ataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 28998483  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    || ||  ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  28998482 cttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggt 28998384  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28998383 agaattaggcgggagactttttcttgtaa 28998355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 29004298 - 29004071
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||  ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29004298 ataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 29004199  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    || ||  ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  29004198 cttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggt 29004100  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29004099 agaattaggcgggagactttttcttgtaa 29004071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 39462471 - 39462698
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39462471 ataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagaaggctgaaacaaaggtttagaaatgcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 39462570  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39462571 ctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggt 39462669  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39462670 agaattaggcgggagaattattcttgtaa 39462698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 41646872 - 41647099
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41646872 ataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 41646971  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41646972 ctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcacttggttacgggaagagattgcgactttgggt 41647070  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41647071 agaattaggctggagacttattcttgtaa 41647099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 50248901 - 50248674
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  50248901 ataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatatagagtttgt 50248802  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50248801 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagatcgagactttgggt 50248703  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50248702 agaattaggcgagagacttattcttgtaa 50248674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 246
Target Start/End: Original strand, 18307061 - 18307286
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18307061 ataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgt 18307160  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  18307161 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggt 18307259  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgt 246  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18307260 agaattaggcgagagacttattcttgt 18307286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 52 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12302802 - 12302611
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  12302802 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggtt 12302703  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302702 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattctt 12302611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17186457 - 17186230
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||  |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17186457 ataaatatagattttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 17186358  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||    
T  17186357 ctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggatt-gagtctcttggttacgggaagagatttgaactttgggt 17186259  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17186258 agaattagaagggagacttattcttgtaa 17186230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 20291409 - 20291636
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20291409 ataaatatagaccttgtattagagcaaattttgagatagagggagatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 20291508  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |  ||||||||||    
T  20291509 ctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagagactaggactttgggt 20291607  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291608 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 20291636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27337235 - 27337041
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27337235 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 27337137  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27337136 gattcaccttgggaaacactattaggattgg-gtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaa 27337041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 45 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31423178 - 31422975
Alignment:
Q  45 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttagg-agcaaacactagggtt 143  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||    
T  31423178 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggcattaaacactagggtt 31423079  T
Q  144 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattct 243  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31423078 tgaaagttgattcaccttgggaaacactattagaatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattct 31422980  T
Q  244 tgtaa 248  Q
    |||||    
T  31422979 tgtaa 31422975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 50077001 - 50076774
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  50077001 ataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaagggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgt 50076902  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  50076901 ctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggaatttgggt 50076803  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50076802 agaattaggcgggaaacttattcttgtaa 50076774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21948520 - 21948290
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagt 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21948520 ataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 21948421  T
Q  116 ttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagacttt 215  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   || ||||||    
T  21948420 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-ggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagacgctgggacttt 21948323  T
Q  216 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948322 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 21948290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 24325608 - 24325842
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatata 111  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  24325608 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtt-agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 24325706  T
Q  112 gagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgaga 211  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||    
T  24325707 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgtga 24325805  T
Q  212 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325806 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 24325842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 39932023 - 39932252
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagttt 117  Q
    ||||||||||||||||| | | |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39932023 ataaatatagaccttgtatgagacaaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 39932122  T
Q  118 gtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgg 217  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  39932123 gtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgggaagagactgagactttgg 39932221  T
Q  218 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39932222 gtagaattaggcgggagactaattcttgtaa 39932252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 51 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31735819 - 31735623
Alignment:
Q  51 tgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggt 150  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  31735819 tgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 31735720  T
Q  151 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735719 tgattcaccttgggaaacactattaaggtt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 31735623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25251604 - 25251377
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  25251604 ataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataacgtttgt 25251505  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25251504 ctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctctcggttacgggaagagattgggactttgggt 25251406  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25251405 agaattaggcggaaaacttattcttgtaa 25251377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 60 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 46431996 - 46431809
Alignment:
Q  60 gggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacc 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431996 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 46431897  T
Q  160 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431896 ttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 46431809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 50079150 - 50078923
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| | |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  50079150 ataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcatagagtttgt 50079051  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  50079050 ctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-aagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggt 50078952  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50078951 agaattaggagggagacttattcttgtaa 50078923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 51752317 - 51752543
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  51752317 ataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggtaacaacaaaattagggcttgtatagagtttgt 51752416  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  51752417 ctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactatta-gatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggt 51752514  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51752515 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 51752543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Original strand, 6823840 - 6824071
Alignment:
Q  24 atatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggg-gctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctc 122  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6823840 atatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc 6823939  T
Q  123 ttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt-------ggttacaggaagagattgagacttt 215  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||       |||||| ||||||||||| | ||||    
T  6823940 ttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgatt-gaatctcttggttacgggttacgggaagagattggggcttt 6824038  T
Q  216 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6824039 gggtagaattaggcggcagacttattcttgtaa 6824071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 51 - 248
Target Start/End: Original strand, 18839570 - 18839766
Alignment:
Q  51 tgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggt 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||  ||||    
T  18839570 tgagatagagggggctgaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggt 18839669  T
Q  151 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839670 tgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagaatgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 18839766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 50307876 - 50307648
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||  | |||| |||||| |||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50307876 ataaatataagctttgtatcaaagtaaaccttgagatatatggggctgaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgt 50307777  T
Q  120 ctcttagg-agcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
    ||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  50307776 ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggggctttggg 50307678  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50307677 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 50307648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6996029 - 6995802
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||  ||| || |||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6996029 ataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggggccgaaacaacggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 6995930  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  6995929 ctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggt 6995831  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  6995830 agaattaggcgggatactttttcttgtaa 6995802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17324965 - 17324738
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||   || || |||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  17324965 ataaatatagaccttgaaccagagtaaacctgaagatacagggggctaaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtatagagtttgt 17324866  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17324865 ctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggt 17324767  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324766 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 17324738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 25127856 - 25128051
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  25127856 gagatagaggggcctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 25127955  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25127956 gattcaccttgtgaaacactatttggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 25128051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27339427 - 27339232
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27339427 gagatagagggggctgaaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 27339328  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27339327 gattcaccttgggaaatactattacgatt-gagtctcttagttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaa 27339232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28207395 - 28207168
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  28207395 ataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtaaagtttgt 28207296  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||  |    
T  28207295 ctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggatt-gtgtctcttggttacaggaagagattggggctttgaat 28207197  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28207196 ataattacgcgggagactttttcttgtaa 28207168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 47906254 - 47906449
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||    
T  47906254 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 47906353  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906354 gattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 47906449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 53 - 248
Target Start/End: Original strand, 16428638 - 16428832
Alignment:
Q  53 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttg 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||| |||||| ||||||    
T  16428638 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttg 16428737  T
Q  153 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16428738 attcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaa 16428832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 14098299 - 14098072
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14098299 ataaatatagaccttgtatcaaactaaactttgagatagaggggactgaaacaatggtttaaaaaggcaactacaaaactagggtttgtatagagtttgt 14098200  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagatt-gagactttggg 218  Q
    |||||  || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  14098199 ctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattagag-ctttggg 14098102  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14098101 tagaattagacgggagacttattcttgtaa 14098072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15295131 - 15294936
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||| |||||    
T  15295131 gagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggtt 15295032  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15295031 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaa 15294936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 58 - 248
Target Start/End: Original strand, 48665167 - 48665357
Alignment:
Q  58 gagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattca 157  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  48665167 gagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattca 48665266  T
Q  158 ccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtta-caggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48665267 ccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttaccgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 48665357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4131676 - 4131482
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  4131676 gagatagagggggctgaaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 4131577  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4131576 gatttaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaa 4131482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11457804 - 11457577
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  11457804 ataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttga 11457705  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
     |||| | | |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||    
T  11457704 ttcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgcgaagagattgggggtttgggt 11457606  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11457605 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 11457577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2949535 - 2949333
Alignment:
Q  45 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttt 144  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  2949535 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggtt 2949436  T
Q  145 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 244  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2949435 gatggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttgtttacgagaatagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttctt 2949337  T
Q  245 gtaa 248  Q
    ||||    
T  2949336 gtaa 2949333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 31489867 - 31490092
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| | |  | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  31489867 ataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag--tttgt 31489964  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  31489965 ctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatttcttggttacgggaagagattgagactttggat 31490063  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31490064 agaattaggcggaagacttattcttgtaa 31490092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3579946 - 3579718
Alignment:
Q  21 taaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagaggggg--ctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttg 118  Q
    |||||||||||||||| |||  | ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3579946 taaatatagaccttgtatcagcgtaaaatttgagatagagggggggctgaaacaagggttcagaaaggcagcaacaaaactagggtttgtatagagtttg 3579847  T
Q  119 tctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
    |||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||| | |||||||    
T  3579846 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggatt-gagtctcttgattacggaaagagattggggctttggg 3579748  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  3579747 taaaattaggcgggagacttattcttgtaa 3579718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 6756479 - 6756705
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| ||   | |||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6756479 ataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaaatagaggggactgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 6756578  T
Q  120 ctcttagg-agcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
    ||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||  |||||||||| |||||||||    
T  6756579 ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag--tcttgattacgagaagagattgggactttggg 6756675  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6756676 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 6756705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 45 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31425323 - 31425117
Alignment:
Q  45 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttagg-agcaaacactagggtt 143  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||    
T  31425323 aaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaacaaacactagggtt 31425224  T
Q  144 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-gag-tctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatt 241  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31425223 tgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaggcttatt 31425124  T
Q  242 cttgtaa 248  Q
    |||||||    
T  31425123 cttgtaa 31425117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9241415 - 9241188
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagaggggg-ctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttg 118  Q
    |||||||||| | |||| ||| || |||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9241415 ataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 9241317  T
Q  119 tctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
    |||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||    
T  9241316 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagattggggctttggg 9241218  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9241217 tagaattagacgggagacttattcttgtaa 9241188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2510621 - 2510427
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||    
T  2510621 gagatagagggggctgaaacaagggtttataaaggcaaccacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 2510522  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2510521 gattcacctttggaaacactattaggatt-gagtcttttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaa 2510427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 17318845 - 17319066
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||   |||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17318845 ataaatataggttttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttagagtttgt 17318944  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||      |||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  17318945 ctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaac------aggatt-gagtctcttggttacgggaacagattgggactttgggt 17319037  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17319038 agaattaggcggaagacttattcttgtaa 17319066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 61 - 248
Target Start/End: Original strand, 40133937 - 40134123
Alignment:
Q  61 ggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacct 160  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40133937 ggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 40134036  T
Q  161 tgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40134037 tgggaaatactactaggatt-gagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaa 40134123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 17324017 - 17324242
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| | | || |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  | |||||||||||  | ||| ||||||||||||    
T  17324017 ataaatatagactttgtattagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttatagagtttgt 17324114  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||  |||||||||    
T  17324115 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttgaatatgggaagagattggaactttgggt 17324213  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17324214 aaaattaggcgggagacttattcttgtaa 17324242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 135 - 248
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231743
Alignment:
Q  135 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  235 acttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||    
T  16231730 acttattcttgtaa 16231743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 47451600 - 47451821
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47451600 ataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggcttaaacaagggtttggaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 47451699  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |         |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  47451700 ctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattag------tgtttaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggt 47451792  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    | |||||||||||| |||| |||||||||    
T  47451793 aaaattaggcgggaaactttttcttgtaa 47451821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 42922186 - 42922409
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||  |||| ||| || |||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  42922186 ataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg- 42922283  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  42922284 ctcctagcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggt 42922380  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42922381 agaattaggcgagagacttattcttgtaa 42922409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 92 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15669648 - 15669496
Alignment:
Q  92 acaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 191  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||| ||||| | | |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15669648 acaaaagtagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttg 15669553  T
Q  192 gttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15669552 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 15669496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8347573 - 8347375
Alignment:
Q  45 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttt 144  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| | | ||||||| | ||||     
T  8347573 aaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggtta 8347476  T
Q  145 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 244  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8347475 g--ggttgattcaccttaggaaacactattatgattg-agtctcttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattctt 8347379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 135 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248654
Alignment:
Q  135 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggag 234  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatta-agtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggag 25248668  T
Q  235 acttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||    
T  25248667 acttattcttgtaa 25248654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14183915 - 14183697
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||| ||| ||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||   |||||||||||| ||||||| |||     
T  14183915 ataaatatagaccatgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaatg-caacac--aaactagggtttgtatagaggttg- 14183820  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | |||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||   | |||||||    
T  14183819 ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattataattg-agtctcttggttacgggaagagattagaattttgggt 14183723  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttg 245  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  14183722 agaattaggcggaagacttattcttg 14183697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8349354 - 8349154
Alignment:
Q  43 gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggt 142  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| | | |||||||||||||    
T  8349354 gcaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaattaaggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggt 8349257  T
Q  143 ttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 242  Q
    | |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  8349256 tgg--ggtttattcaccttgggaaacactattaggattg-agtttgatggtcacgggaagagattaggactttaggtagaattaggcgggtgacttattc 8349160  T
Q  243 ttgtaa 248  Q
    ||||||    
T  8349159 ttgtaa 8349154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18800898 - 18800676
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  18800898 ataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatacaaggggctgaaacaaaggtttag-aagtcaacaagaaaactacggtttgtatagagtttg- 18800801  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| |   |||| |||||||||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||| || || |||||||   |||||||||    
T  18800800 ctcttggccacaaatactagggtt--ggggttgattcaccctgagaaacactattaggatt-gagtctctaggtcacgggtagagatttgaactttgggt 18800704  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgta 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18800703 agaattaggcgggacacttattcttgta 18800676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 59 - 248
Target Start/End: Original strand, 16432396 - 16432573
Alignment:
Q  59 agggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcac 158  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||           ||||||| |   |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16432396 agggggcagaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-----------gtctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcac 16432484  T
Q  159 cttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  16432485 cttgggaaacattattaggatt-gaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaa 16432573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 248
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786019
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 23786019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 148 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115205
Alignment:
Q  148 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 247  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattg-agtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgta 6115206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 106
Target Start/End: Original strand, 16231553 - 16231639
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggttt 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  16231553 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtctagaaaagcaacaagaaaactagggttt 16231639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 160 - 248
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757710
Alignment:
Q  160 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 51757710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 49495528 - 49495313
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||          ||||||||||||  ||| ||||||     
T  49495528 ataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaatc--------aaactagggtttgcatatagtttg- 49495438  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | ||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||| || | ||||||||| | ||||||||    
T  49495437 ctcttggcaacaaacactatggtt---gagttgattcaccttgggaaacactaataaaattg-agtcttttggtcacggtaagagattggggctttgggt 49495342  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49495341 agaattaggcgggagactcattcttgtaa 49495313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 248
Target Start/End: Original strand, 16429042 - 16429136
Alignment:
Q  153 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16429042 attcaacttgggaaacactattaggattg-agtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaa 16429136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26520447 - 26520215
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagag-ggggctg-aaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagttt 117  Q
    |||||||||||| |||| ||| || |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26520447 ataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 26520349  T
Q  118 gtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttaca------ggaagagattgaga 211  Q
    | ||||| | | ||||||||| | ||    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||      ||||||||||| ||    
T  26520348 g-ctcttggcaacaaacactaagatt--gaggttgattcaccttgggaaacactattatgatt-gagtctcttggtcacagtcacgggaagagattggga 26520253  T
Q  212 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||    
T  26520252 ctttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaa 26520215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26613569 - 26613342
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaa-caagggtttagaaaaacaacaaca-aaactagggtttatatagagt 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  |||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| || || || | ||| ||||||||| | ||| |    
T  26613569 ataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagagatagagggggctgaaaacaagggtttagaagaaaaaaaaaacaaattagggtttagagagatt 26613470  T
Q  116 ttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagacttt 215  Q
    |   |||| ||  | | ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26613469 t---ctctaagcgggagacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattcggattg-agtcacttggtcacaggaagagattgaggcttt 26613376  T
Q  216 gggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  26613375 gggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 26613342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 25248841 - 25248757
Alignment:
Q  22 aaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggttt 106  Q
    |||||||||| |||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25248841 aaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 25248757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 30790723 - 30790503
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttg 118  Q
    |||||||||||| |||| ||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||||   ||||| ||     
T  30790723 ataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca-aacaataaa-ctagggttt---tagagatt- 30790630  T
Q  119 tctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
    ||||| ||  | | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| |    
T  30790629 tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtg 30790534  T
Q  219 tagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  30790533 tagaattaggtttggagacttattcttgtaa 30790503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13125785 - 13125560
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggttta-tatagagtttg 118  Q
    ||||||| | ||||||| ||| || |||  |||||| | |||||||||||||||||||| ||||   ||||||  ||||||||||||  |||||||||||    
T  13125785 ataaatagaaaccttgtatcagagtaaaacttgagagaaagggggctgaaacaagggttaagaagc-caacaaggaaactagggtttggtatagagtttg 13125687  T
Q  119 tctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
     ||||| |   ||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||| |  ||||||||||| |||||||||    
T  13125686 -ctcttggcgacaaacactagggttga--ggttgattcacattgggaaacgctgttaggattg-aggctcttggtcaagggaagagattgggactttggg 13125591  T
Q  219 tagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  13125590 tagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 13125560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738732
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 30738732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155865
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattagg 155865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 146 - 248
Target Start/End: Original strand, 16561544 - 16561646
Alignment:
Q  146 tgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattctt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || | || ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||    
T  16561544 tgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-aagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattctt 16561642  T
Q  245 gtaa 248  Q
    ||||    
T  16561643 gtaa 16561646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Original strand, 27916576 - 27916653
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  27916576 ttgattcaccttggaaaacactattagaattg-agtctcttggtcacatgaagagattgtgactttgggtggaattagg 27916653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332613
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaatta 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggattt-agtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 228
Target Start/End: Original strand, 43104245 - 43104318
Alignment:
Q  154 ttcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  43104245 ttcaccttggaaaacactattagaattg-agtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattagg 43104318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353126
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagatt-gagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggattt-agtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattagg 14353126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 14997040 - 14997101
Alignment:
Q  165 aaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14997040 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagagattgagac-ttgggtagaattagg 14997101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 248
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816065
Alignment:
Q  210 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 23816065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 228
Target Start/End: Original strand, 28279328 - 28279424
Alignment:
Q  130 caaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||||| |  | ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  28279328 caaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattg-agcttcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattagg 28279424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 6115383 - 6115344
Alignment:
Q  45 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 84  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115383 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 6115344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144804
Alignment:
Q  165 aaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  4144865 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 4144804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13127957 - 13127813
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||| ||||||| ||  || |||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||||||      
T  13127957 ataaatataaaccttgtatcggagtaaacctttagagagaggggt-tgaaacaagggtttagaagc-caacaagaaaagtagggtttatatagagttt-c 13127861  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaca 169  Q
    || || | | ||||||||||||||   || | ||||||||||||||||||    
T  13127860 cttttggcaacaaacactagggtt--gggatagattcaccttgggaaaca 13127813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3091272 - 3091240
Alignment:
Q  182 gagtctcttggttacaggaagagattgagactt 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3091272 gagtctcttggtaacaggaagagattgagactt 3091240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 6160 - 6388
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  6160 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgt 6259  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6260 ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggt 6359  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6360 agaattaggcgggagatttattcttgtaa 6388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 90)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31156238 - 31156010
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31156238 ataaatatagagcttgtatcaaggcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 31156139  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31156138 ctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgggtacgggaagagattgggactttgggt 31156039  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31156038 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 31156010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7349568 - 7349372
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349568 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 7349469  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349468 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 7349372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7351947 - 7351751
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7351947 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 7351848  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7351847 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 7351751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 42331326 - 42331097
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  42331326 ataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgt 42331227  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttaca--ggaagagattgagactttgg 217  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  42331226 ctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacacgggaagagattgagactttgg 42331128  T
Q  218 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331127 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 42331097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1049622 - 1049395
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1049622 ataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 1049523  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  1049522 ctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 1049424  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049423 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 1049395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 40837069 - 40836842
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40837069 ataaatatagaccttgtatcagagcaaatttggagattgagggggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 40836970  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  40836969 ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggt 40836871  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836870 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 40836842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 35591 - 35818
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  35591 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgt 35690  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  35691 ctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 35789  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35790 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 35818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 248
Target Start/End: Original strand, 3878540 - 3878766
Alignment:
Q  23 aatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtc 120  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3878540 aatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 3878639  T
Q  121 tcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggta 220  Q
    |||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  3878640 tctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggta 3878738  T
Q  221 gaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878739 gaattaggcgggagacttattcttgtaa 3878766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 11355220 - 11355447
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||| | |||| |||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11355220 ataaatataggctttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 11355319  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355320 ctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 11355418  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355419 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 11355447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27306556 - 27306333
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27306556 ataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-tatagagtttgt 27306458  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  27306457 ctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 27306359  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttg 245  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  27306358 aaaattaggcgggagacttattcttg 27306333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1047219 - 1047024
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1047219 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 1047120  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047119 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 1047024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 38393980 - 38394175
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  38393980 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 38394079  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394080 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 38394175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7470353 - 7470122
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagt 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||     
T  7470353 ataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaga 7470254  T
Q  116 ttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagacttt 215  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  7470253 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagacttt 7470155  T
Q  216 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470154 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 7470122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37412455 - 37412227
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||  ||| || |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37412455 ataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 37412356  T
Q  120 ctc-ttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
    ||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  37412355 ctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagactgggactttggg 37412257  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412256 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 37412227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 44526 - 44753
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44526 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgt 44625  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  44626 ctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgatt-gagtcttttggttacgggaagaggttgggactttgggt 44724  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  44725 agaattatgtgggagacttattcttgtaa 44753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 45 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4296237 - 4296034
Alignment:
Q  45 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttagg-agcaaacactagggtt 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  4296237 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtt 4296138  T
Q  144 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattct 243  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4296137 tgatggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 4296039  T
Q  244 tgtaa 248  Q
    |||||    
T  4296038 tgtaa 4296034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13099803 - 13099576
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13099803 ataaatatagaccttgaatcaaagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 13099704  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  13099703 ctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggt 13099605  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13099604 agaattaggcgggagatttattcttgtaa 13099576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 25276103 - 25276330
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||  | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25276103 ataaatatatgctttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaataatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 25276202  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25276203 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggt 25276301  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25276302 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 25276330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 25542493 - 25542718
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25542493 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 25542591  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  25542592 ctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-ggaaagactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggt 25542689  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25542690 agaattatgcgggagacttattcttgtaa 25542718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 26804535 - 26804761
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26804535 ataaatatagaccttgtg----agtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 26804630  T
Q  120 ctcttaggagcaaacac---tagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttg 216  Q
    ||||| ||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  26804631 ctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-tagtctcttggttacgggaagaggctgagactttg 26804729  T
Q  217 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804730 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 26804761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7472311 - 7472080
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagt 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  7472311 ataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaga 7472212  T
Q  116 ttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagacttt 215  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||  |||||    
T  7472211 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctggaacttt 7472113  T
Q  216 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7472112 gggtagaattaggcgggacacttattcttgtaa 7472080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20137436 - 20137209
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||| | | |||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  20137436 ataaatattggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgt 20137337  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20137336 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggt 20137238  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137237 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 20137209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 21679989 - 21680216
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| | |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21679989 ataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 21680088  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21680089 ctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttaccggaagagattgggactttgggt 21680187  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21680188 agaattagacgggagatttattcttgtaa 21680216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 24748556 - 24748783
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  24748556 ataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgacttagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttgt 24748655  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  24748656 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgatt-gagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggt 24748754  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24748755 agaattaggcaggagacttattcttgtaa 24748783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31435374 - 31435147
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31435374 ataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 31435275  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||  |||||||||    
T  31435274 ctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggt 31435176  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31435175 agaattaggtggaagacttattcttgtaa 31435147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 44724541 - 44724768
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44724541 ataaatatagacattgtatcagtgtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 44724640  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  || ||||||||||    
T  44724641 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggt 44724739  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724740 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 44724768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 443557 - 443784
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||  ||| || |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  443557 ataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggagctaaaacaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 443656  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  443657 ctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggt 443755  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  443756 agaattaggcgagagacttattcttgtaa 443784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 21678028 - 21678255
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||  |||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21678028 ataaatatagatattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtatagagtttgt 21678127  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  21678128 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagatattgggactttgggt 21678226  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||    
T  21678227 agcattaggcgggagacgtattcttgtaa 21678255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 48457647 - 48457842
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  48457647 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 48457746  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457747 cattcacctagggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 48457842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 40946286 - 40946517
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagat----agagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagt 115  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40946286 ataaatataaaccttgtttcatagcaaactttgagagggacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 40946385  T
Q  116 ttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagacttt 215  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||  || ||||||    
T  40946386 ttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttactttggaaaacactattaggatt-gagtctcttagttacgggaagaggctgggacttt 40946484  T
Q  216 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40946485 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 40946517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 3035715 - 3035913
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3035715 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 3035814  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaaga---gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||   |  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3035815 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaa 3035913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 28487547 - 28487742
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | | | |||||||||||| |||||||    
T  28487547 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggtt 28487646  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28487647 gattcacctttggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 28487742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 39146314 - 39146087
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||  ||| |||  | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39146314 ataaatatagacactgtatcagtgtaaaccttgagatggagggggctgaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 39146215  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  39146214 ctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattggaactttgggt 39146116  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39146115 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 39146087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 11757222 - 11757419
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaaggg-tttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggg-tttgtggg 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||    
T  11757222 gagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgaggg 11757321  T
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757322 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 11757419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 20299452 - 20299649
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaaggg-tttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggg-tttgtggg 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||    
T  20299452 gagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgaggg 20299551  T
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299552 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 20299649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 9680813 - 9681009
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttagg-agcaaacactagggtttgtgggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||    
T  9680813 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaagggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggt 9680912  T
Q  151 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9680913 tgattcacctcgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaa 9681009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 1849975 - 1850170
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1849975 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggtt 1850074  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850075 gattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 1850170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 18345535 - 18345730
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||| |||||| |||| |||||    
T  18345535 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggtt 18345634  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345635 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 18345730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 20297356 - 20297551
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||    
T  20297356 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggtt 20297455  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20297456 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaa 20297551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 20626032 - 20626227
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| |||||    
T  20626032 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggtt 20626131  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20626132 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaa 20626227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 20629923 - 20630118
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| |||||    
T  20629923 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggtt 20630022  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20630023 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaa 20630118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 20642342 - 20642537
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| |||||    
T  20642342 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggtt 20642441  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20642442 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaa 20642537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 21990113 - 21990339
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||  ||| || |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  21990113 ataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatagagtttgt 21990211  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  21990212 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagaatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgagt 21990310  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21990311 agaattaggcgggagactttttcttgtaa 21990339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21592445 - 21592243
Alignment:
Q  45 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  21592445 aaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt 21592346  T
Q  145 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 244  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21592345 gagggttgattcaccttggcaagcactattaggatt-tagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattctt 21592247  T
Q  245 gtaa 248  Q
    ||||    
T  21592246 gtaa 21592243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 24258425 - 24258652
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||   |||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24258425 ataaatataggttttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgt 24258524  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |    
T  24258525 ctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttggat 24258623  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24258624 agaattaggcggaaaacttattcttgtaa 24258652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27832939 - 27832733
Alignment:
Q  42 agcaaactttgagatagagggg-gctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagg 140  Q
    ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| | | || ||||||||    
T  27832939 agcaaaccttgtgatagagtggagctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtatagagtttgtctcttggcaacatacactagg 27832840  T
Q  141 gtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 240  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27832839 gtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtaaaattaggcgggagacttat 27832741  T
Q  241 tcttgtaa 248  Q
    ||||||||    
T  27832740 tcttgtaa 27832733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 9679053 - 9679248
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttagg-agcaaacactagggtttgtgggt 150  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| || |    
T  9679053 gagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggat 9679151  T
Q  151 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9679152 tgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 9679248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 28485560 - 28485755
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  28485560 gagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggtt 28485659  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28485660 gattcacctttggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagattggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaa 28485755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22251869 - 22251650
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||| ||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22251869 ataaatataaaccttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgt 22251770  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    || || ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22251769 ctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggt 22251679  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251678 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 22251650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 62 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 43253801 - 43253617
Alignment:
Q  62 gggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 161  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  43253801 gggctgaaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacta-ggtttgagggttgattcacctt 43253703  T
Q  162 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43253702 gggaaacactattaggatt-gagtctcttgattacggaaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaa 43253617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22828960 - 22828733
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||| | |||| ||  || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  22828960 ataaatataggctttgtatccgagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttat 22828861  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    |||||   | |||||||||| |||||  ||||||||||  || | |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22828860 ctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagagattgagactttgggt 22828762  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22828761 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 22828733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 245
Target Start/End: Original strand, 42223118 - 42223344
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagg-gggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttg 118  Q
    |||||||||| | |||| ||| || |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42223118 ataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagatgtgggatgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 42223217  T
Q  119 tctcttagg-agcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgg 217  Q
    |||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||    
T  42223218 tctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggagctttgg 42223316  T
Q  218 gtagaattaggcgggagacttattcttg 245  Q
     ||||||||||||| | |||||||||||    
T  42223317 atagaattaggcggaaaacttattcttg 42223344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Original strand, 18567575 - 18567731
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18567575 ataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 18567674  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattag 176  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567675 ctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24817676 - 24817454
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  24817676 ataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaagt-caacaagagaactagggtttgtatagagtttg 24817579  T
Q  119 tctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
     ||||| | | ||||||||||||||   ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24817578 -ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttggg 24817484  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24817483 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 24817454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 7188505 - 7188721
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||| |||||||| ||||| |||||     
T  7188505 ataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttag-aagtcaacaataaaaatagggtttgtatagggtttg- 7188602  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  7188603 ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaatagattgagactttgggt 7188699  T
Q  220 agaattaggcgggagacttatt 241  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  7188700 agaattaagcgggagacttatt 7188721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 130 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7092429 - 7092312
Alignment:
Q  130 caaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggc 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  7092429 caaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggc 7092331  T
Q  230 gggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7092330 gggagacttattcttgtaa 7092312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20091868 - 20091645
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttg 118  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |   ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  20091868 ataaatatagactttttatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttcggagg-caaca-caaaactagggtttgtatagagtttg 20091771  T
Q  119 tctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
     || || | | |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20091770 -ctattggcaacaaagattagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaa-tctcttggtcacgggaagagattgagactttggg 20091675  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20091674 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 20091645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813599
Alignment:
Q  87 caacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 186  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |  |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattg-agtc 24813661  T
Q  187 tcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24813660 tcttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 24813599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7094670 - 7094560
Alignment:
Q  137 tagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagac 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  7094670 tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagac 7094572  T
Q  237 ttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||    
T  7094571 ttattcttgtaa 7094560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 248
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935458
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 2935458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027293
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaa 9027293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 244
Target Start/End: Original strand, 24465536 - 24465722
Alignment:
Q  45 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttt 144  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||| ||||| ||||| ||||| | | ||||||||||||||     
T  24465536 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatagcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt- 24465625  T
Q  145 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 244  Q
      |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  24465626 --gaattgattcaccttgggaaacaatattaggattg-agtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagatttattctt 24465722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 136 - 248
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396824
Alignment:
Q  136 ctagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaga 235  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 38396811  T
Q  236 cttattcttgtaa 248  Q
    |||||| ||||||    
T  38396812 cttatttttgtaa 38396824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 206
Target Start/End: Original strand, 22392435 - 22392608
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||          |||||||||||| |||||| ||||     
T  22392435 ataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaatc--------aaactagggtttgtatagaatttg- 22392525  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagat 206  Q
    || || | | ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  22392526 ctattggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagagat 22392608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 248
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606569
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaa 1606569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 248
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108256
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaa 22108256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 248
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550016
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaa 40550016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 248
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137267
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaa 22137267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 248
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552294
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaa 40552294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297146
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattag 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattag 16297146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 248
Target Start/End: Original strand, 6332311 - 6332409
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  6332311 ttgattcagtttggaaaacactattaagattg-agtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaa 6332409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 7092506 - 7092415
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaa-actagggttt 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  7092506 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatggagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaacactagggttt 7092415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 7094753 - 7094663
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggttt 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||    
T  7094753 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaacatagggttt 7094663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 119
Target Start/End: Original strand, 38396316 - 38396377
Alignment:
Q  58 gagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  38396316 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 248
Target Start/End: Original strand, 26295580 - 26295636
Alignment:
Q  192 gttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26295580 gttacaggaagcgattgtgactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaa 26295636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 248
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6348971
Alignment:
Q  189 ttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaa 6348971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281477
Alignment:
Q  153 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||   | ||||||||||||||||    
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattg-agtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaa 40281477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 228
Target Start/End: Original strand, 6048885 - 6049039
Alignment:
Q  68 aaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaa 166  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| || ||| ||   ||||| | | ||||||||||| |||| || |||||||||||||  |||    
T  6048885 aaacaagggtttagaagc-caacatcaaaactagggtttgtaaagaatt---ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggattgattcaccttgaagaa 6048978  T
Q  167 acactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6048979 acactattaggattgaa-tctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattagg 6049039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 228
Target Start/End: Original strand, 11081522 - 11081675
Alignment:
Q  68 aaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 167  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || ||| ||   ||||| | | ||||||||||||||    | ||||||||| ||||||||    
T  11081522 aaacaagggtttagaagc-caacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcactttgggaaa 11081615  T
Q  168 cactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||  || |||| ||| |||||||    
T  11081616 cactattaggatt-gagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattagg 11081675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Original strand, 11084467 - 11084544
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||   |||||||||| |||||||    
T  11084467 ttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgagaagagattcgaactttgggtaaaattagg 11084544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Original strand, 1606432 - 1606472
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagag 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1606432 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 1606472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 248
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22393911
Alignment:
Q  213 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 22393911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369703
Alignment:
Q  165 aaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  21369642 aaacactattaggattg-agtctcttggttacggaaagagattgggac-ttgggtaaaattagg 21369703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 55
Target Start/End: Original strand, 22108123 - 22108158
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga 55  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22108123 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 22108158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 55
Target Start/End: Original strand, 22137134 - 22137169
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga 55  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22137134 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 22137169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 55
Target Start/End: Original strand, 40549883 - 40549918
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga 55  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40549883 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 40549918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 55
Target Start/End: Original strand, 40552161 - 40552196
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga 55  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40552161 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 40552196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 228
Target Start/End: Original strand, 2120881 - 2120960
Alignment:
Q  149 gttgattcaccttggg--aaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  2120881 gttgattcaccttggacaaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2120960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 80
Target Start/End: Original strand, 3677242 - 3677301
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttta 80  Q
    ||||||||||| ||||  ||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3677242 ataaatatagatcttgaatcagagtaaacttggagataga-ggggctgaaacaagggttta 3677301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 30906377 - 30906264
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | | || |||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||| | || ||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  30906377 ataaatatagaccttgtataagagtaaatcttgagatagagggggctgaaaacaagaatttagaaaca-aataac-aaactagagtttgtatagagtttg 30906280  T
Q  119 tctcttaggagcaaaca 135  Q
     ||||||| | ||||||    
T  30906279 -ctcttagcaacaaaca 30906264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 181; Significance: 7e-98; HSPs: 68)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 35218258 - 35218062
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35218258 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 35218159  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35218158 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaa 35218062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 35215881 - 35215685
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35215881 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 35215782  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35215781 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaa 35215685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 40032385 - 40032158
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40032385 ataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 40032286  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  40032285 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagaggttaggactttgggt 40032187  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40032186 agaattaggcgtgagacttattcttgtaa 40032158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 42064443 - 42064670
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42064443 ataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 42064542  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |    
T  42064543 ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttggat 42064641  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064642 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 42064670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13910371 - 13910144
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13910371 ataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 13910272  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  13910271 ctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagactggaactttgggt 13910173  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910172 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 13910144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19502338 - 19502111
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19502338 ataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgt 19502239  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  19502238 ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggt 19502140  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502139 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 19502111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19504672 - 19504446
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19504672 ataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 19504573  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  19504572 ctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttac-ggaagaggctgggactttgggt 19504475  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504474 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 19504446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 45280312 - 45280084
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaa-caacaacaaaactagggtttatatagagtttg 118  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45280312 ataaatatataccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 45280213  T
Q  119 tctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
    |||||| ||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||    
T  45280212 tctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 45280114  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45280113 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 45280084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 27104727 - 27104953
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27104727 ataaatatagaccttgtatcagagaaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 27104826  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  27104827 ctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 27104924  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104925 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 27104953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 42452711 - 42452936
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  42452711 ataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtataaagtttgt 42452810  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||  | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  42452811 ctct--gtaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggt 42452907  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452908 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 42452936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15539802 - 15539575
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15539802 ataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatatagggggttgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgt 15539703  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15539702 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gattctcttggttacgggaagagattgagactttgggt 15539604  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539603 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 15539575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24162539 - 24162322
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24162539 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 24162440  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |          || ||||||||||    
T  24162439 ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttggttgc----------tgggactttgggt 24162351  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24162350 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 24162322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22287663 - 22287436
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  22287663 ataaatatagaccttgtattaaagtaaactttgagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgt 22287564  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  22287563 ctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggatt-gagtctcttagttacgggaagagattgacacttcgggt 22287465  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22287464 agaattgggcgggagacttattcttgtaa 22287436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11739887 - 11739663
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| | |  | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  11739887 ataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctggaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatggagtttgt 11739788  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11739787 ctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gattctcttggttataggaagagattgggactttgggt 11739689  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttg 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  11739688 agaattaggcgggagaattattcttg 11739663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 19007568 - 19007795
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||| | |||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  19007568 ataaatataggctttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtatagagtttgt 19007667  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  19007668 ctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaatt-gagtttcttggttatgggaagagattggggctttgggt 19007766  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19007767 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 19007795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 23452532 - 23452337
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23452532 gagacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 23452433  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23452432 gattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaa 23452337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21521022 - 21520793
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagttt 117  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21521022 ataaatataaaccttgtatcagactaaactttgagagatagatggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagttt 21520923  T
Q  118 gtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgg 217  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  ||||||||    
T  21520922 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagaggctaggactttgg 21520824  T
Q  218 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21520823 gtagaattaggcgggagactaattcttgtaa 21520793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 42923838 - 42923609
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagttt 117  Q
    ||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  42923838 ataaatatagaccttgaatcatagtaaaccttgagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttgtatagagttt 42923739  T
Q  118 gtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgg 217  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||    
T  42923738 gtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagagattggggctttgg 42923640  T
Q  218 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42923639 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 42923609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 34979907 - 34979679
Alignment:
Q  19 cataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttg 118  Q
    ||||||||||||| |||| | |  | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  34979907 cataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttg 34979808  T
Q  119 tctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||    
T  34979807 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttggttacgggaagagattcggactttcgg 34979709  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34979708 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 34979679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 3022091 - 3022318
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| ||| || |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  3022091 ataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgt 3022190  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||    
T  3022191 ctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttaccggaagagattgaggttttaggt 3022289  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3022290 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 3022318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 17849045 - 17849272
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||| || |||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||  |||||||||||     
T  17849045 ataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtatagagtttgc 17849144  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17849145 ctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagatt-gagtctcttggttacggtaagagattgagactttgggt 17849243  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17849244 agaattaggcgggagacttatttttgtaa 17849272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 28196565 - 28196792
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||  | |||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28196565 ataaatatatgctttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 28196664  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  28196665 ctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagagattgaggctttgggt 28196763  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28196764 agaattaggcggaagatttattcttgtaa 28196792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6259142 - 6258917
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| | | |  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  6259142 ataaatatagaccttgtattagactaaactttgagatagaggaggatgaaacaagagtttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgt 6259043  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    || || |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| | ||||||||    
T  6259042 ctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggga--agattggggctttgggt 6258946  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6258945 agaattaggtgggagacttattcttgtaa 6258917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 50 - 248
Target Start/End: Original strand, 17848401 - 17848596
Alignment:
Q  50 ttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttagg-agcaaacactagggtttgtgg 148  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||| ||    
T  17848401 ttgagatagagggggctcaaacgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagg 17848500  T
Q  149 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  17848501 gttgattcactttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtaga---aggcgggagacttattcttgtaa 17848596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 14837202 - 14837422
Alignment:
Q  21 taaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtc 120  Q
    ||||||||||| |||| |||  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  14837202 taaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtacatagtttgtc 14837301  T
Q  121 tcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggta 220  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||  |||    
T  14837302 tctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttg------ggaagagattgagactttaagta 14837394  T
Q  221 gaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  14837395 gaattaggcgggggacttattcttgtaa 14837422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6264472 - 6264249
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    |||||| ||||||||||||    
T  6264472 ataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgt 6264377  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   || |||||| | |||||| |    
T  6264376 ctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-aagtctcttggttacgataaaagattggggctttggat 6264278  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6264277 agaattagacgggagacttattcttgtaa 6264249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 44289395 - 44289168
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||   |||| ||| ||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  44289395 ataaatataggttttgtatcatagcaaaccttgatatagaggggactaaaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtctgt 44289296  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  44289295 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcacttggttacgggaagagattgggacttagggt 44289197  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||| | || | ||||||||||||||    
T  44289196 agaattaagtggaaaacttattcttgtaa 44289168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 45239271 - 45239077
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||| || | | |||||||||||||||| |||||    
T  45239271 gagatagagggggctgaaacaatgatttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagactttctct-ttggcaacaaacactagggtttgagggtt 45239173  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  45239172 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaa 45239077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 43623895 - 43623680
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || |||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43623895 ataaaaatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagaggggggtgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 43623796  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    |||            |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  43623795 ctc------------actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 43623709  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623708 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 43623680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31733092 - 31732877
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| ||||  || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  31733092 ataaatatagactttgtaacagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgt 31732993  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||            ||| ||||||||||    
T  31732992 ctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggatt-gagtctcttggt------------ttgggactttgggt 31732906  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31732905 agaattaggtgggagacttattcttgtaa 31732877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11578431 - 11578209
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||| | |||  | |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||| |||||| ||| |    
T  11578431 ataaatatagaccttatatcagggtaaatcttgagatagagtgggctgaaacaagggtttag-aagtcaacaaaaaaactagggtttgtatagaattttt 11578333  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | |||  |||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  11578332 ctcttggcaacaa--actagggtt--ggggttgattcacctcgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggt 11578238  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11578237 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 11578209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22163274 - 22163117
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22163274 ataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtatagagtttgt 22163175  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 177  Q
    |||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22163174 ctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg 22163117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22407736 - 22407591
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22407736 ataaatatagaccttgtatcagagtaaactgtgagatatagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 22407637  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggga 165  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22407636 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 22407591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18800629 - 18800414
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| |||  | |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||          || ||||||||| ||||||| |||     
T  18800629 ataaatatagaccttgtatcagggtaaacatggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aagctagggtttgtatagaggttg- 18800539  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  18800538 ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacaggaagagattggggctttgggt 18800443  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18800442 agaattaggagggagacttattcttgtaa 18800414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 193
Target Start/End: Original strand, 38020162 - 38020302
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  38020162 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 38020261  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 193  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38020262 gattcaccatggtaaacactattaggatt-gagtctcttggt 38020302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20146884 - 20146709
Alignment:
Q  68 aaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 167  Q
    ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||| | | ||||||||| |||| |  | ||||||||||||||||||    
T  20146884 aaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaa 20146789  T
Q  168 cactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    || || |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20146788 caatagtaggattg-agtctcttggtcacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 20146709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 22874070 - 22874285
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||| || | |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||| |||||||||||     
T  22874070 ataaatacaggctttgtatcagagcaaacctggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatagagtttg- 22874160  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | ||||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||| |||| |||    
T  22874161 ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattg-agtctcttagtcacgggaagagattgaggctttcggt 22874256  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22874257 agaattaggtgggagacttatttttgtaa 22874285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558963
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 36558963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561240
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 36561240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 5377760 - 5377631
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagt 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5377760 ataaatatagaccttgtttcagagcaaactttgagagagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagt 5377661  T
Q  116 ttgtctcttaggagcaaacactagggtttg 145  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  5377660 ttgtctctttggaacaaacactaggttttg 5377631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 69 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17897519 - 17897346
Alignment:
Q  69 aacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaac 168  Q
    |||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | | |||||||||||  ||| |  |||||||||||||||||||    
T  17897519 aacaagggtttagaagt-caacaataaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaac 17897425  T
Q  169 actattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |   ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17897424 actattaggattg-agtctcttggtcatgagaaaagattgagattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 17897346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332280
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaa 45332280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375446
Alignment:
Q  142 tttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatt 241  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-ggagacttatt 5375453  T
Q  242 cttgtaa 248  Q
    |||||||    
T  5375452 cttgtaa 5375446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459290
Alignment:
Q  102 ggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaa 201  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| | | |||| |||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaa 28459337  T
Q  202 gagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||| ||| | |||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28459336 gagtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaa 28459290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  135 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggag 234  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcac-ggaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggag 38414195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 228
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699508
Alignment:
Q  148 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattagg 40699508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 227
Target Start/End: Original strand, 35107294 - 35107427
Alignment:
Q  87 caacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 186  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||    || ||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  35107294 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaaca----gggttg-ggattgattcaccttgagaaacattattaggattg-agtc 35107386  T
Q  187 tcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattag 227  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35107387 tcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattag 35107427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37963254 - 37963039
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| | | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||| | || ||||||     
T  37963254 ataaatatagactttgtataagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtgtatagtttg- 37963164  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    |||||   | ||||||| | ||||   | |||||||| |||| | ||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||    
T  37963163 ctcttgacaacaaacaccatggtt---gtgttgattccccttagaaaacattattgagattg-agtctcttggtcacctgaagagattgaggctttgggt 37963068  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  37963067 agaattagacgagagacttattcttgtaa 37963039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921833
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagatt-gagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattagg 17921833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27136368 - 27136225
Alignment:
Q  102 ggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaa 201  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| | | |||||||||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||| || | ||    
T  27136368 ggtttatatagagcttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggatt-gaatctcttggtcacggaaa 27136273  T
Q  202 gagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 248  Q
    || |||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  27136272 gaaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 27136225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Original strand, 43139432 - 43139509
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  43139432 ttgattcatcttgggaaacattattaggattg-agtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattagg 43139509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 244
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589842
Alignment:
Q  165 aaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattctt 244  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  20589763 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattctt 20589842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 226
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345738
Alignment:
Q  149 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagatt-gagactttgggtagaatta 226  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaatta 26345738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27583535 - 27583477
Alignment:
Q  151 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgag 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  27583535 tgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagagattgag 27583477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 106
Target Start/End: Original strand, 38020103 - 38020157
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggttt 106  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  38020103 gagatagagggggttggaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 228
Target Start/End: Original strand, 15693958 - 15694038
Alignment:
Q  149 gttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagaga-ttgagactttgggtagaattagg 228  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15693958 gttgattcaccgtggagaaacactattaggataa-agtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattagg 15694038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458949
Alignment:
Q  165 aaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  28459011 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 7502975 - 7503052
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagatt-gagactttgggtagaatta 226  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7502975 ttgatccaccttggagaaacactattaggattg-agtatcttggtcaagggaagagatttgagactttgggtagaatta 7503052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 12342737 - 12342673
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaac-aagggtttagaa 83  Q
    ||||||||| || |||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12342737 ataaatatacacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaagggtttagaa 12342673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34575308 - 34575230
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagatt-gagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  34575308 ttgattcaccttggagaaacactattaggat-ggagtctcttggtctcgggaa-agattcgggactttgggtagaattagg 34575230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 35028632 - 35028707
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaatta 226  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35028632 ttgattcgcattggaaaacactattatgattg-agtctcttgatcacgagaagagattgacactttgggtagaatta 35028707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Original strand, 38020311 - 38020347
Alignment:
Q  212 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38020311 ctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaa 38020347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741002
Alignment:
Q  165 aaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  2740941 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 2741002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22407592 - 22407554
Alignment:
Q  210 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22407592 gacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaa 22407554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 219 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7463048
Alignment:
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 7463048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13828542 - 13828466
Alignment:
Q  151 tgattcaccttgggaaacactattaggatt-ggagtctctt--ggttacaggaagagattgagactttgggtagaatta 226  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||  ||| ||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13828542 tgattcaccttaggaaacactgtta--attaggagtctcttttggtcacgggaagagattcagactttgggtagaatta 13828466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30720811 - 30720732
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagatt-gagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  30720811 ttgattcatcttggagaaacactattaggattg-agtctctttggcacgagaagagattcgtgactttgggtagaattagg 30720732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41303199 - 41303155
Alignment:
Q  183 agtctcttggttacaggaagagatt-gagactttgggtagaatta 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  41303199 agtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaatta 41303155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 34 - 230
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 133  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  134 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaa 230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 57)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 14807759 - 14807986
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14807759 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 14807858  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  14807859 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 14807957  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807958 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 14807986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 27826994 - 27827221
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27826994 ataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 27827093  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||    
T  27827094 ctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagaggctgggaccttgggt 27827192  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827193 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 27827221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24873476 - 24873280
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24873476 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggtt 24873377  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24873376 gattcacctttggaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 24873280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 27829305 - 27829532
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27829305 ataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 27829404  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||    
T  27829405 ctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggaccttgggt 27829503  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829504 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 27829532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 60 - 248
Target Start/End: Original strand, 43079650 - 43079838
Alignment:
Q  60 gggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacc 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079650 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 43079749  T
Q  160 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079750 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 43079838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 43082013 - 43082209
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  43082013 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 43082112  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43082113 gattcaccttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaa 43082209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 44720851 - 44721079
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||| |||    
T  44720851 ataaatatagaccttatatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatgttttgtatagagtctgt 44720950  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||    
T  44720951 ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 44721049  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44721050 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 44721079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 14477284 - 14477511
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||| | |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14477284 ataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgt 14477383  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14477384 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggt 14477482  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14477483 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 14477511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 18810716 - 18810943
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18810716 ataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 18810815  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||  || |||||| |||    
T  18810816 ctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaataggctgggactttaggt 18810914  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810915 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 18810943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27107224 - 27106997
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27107224 ataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 27107125  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27107124 ctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggt 27107026  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27107025 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 27106997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 4424026 - 4424253
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4424026 ataaatacagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 4424125  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   |||||| |    
T  4424126 cgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggagctttggat 4424224  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4424225 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 4424253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 14419518 - 14419291
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  14419518 ataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgt 14419419  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14419418 ctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggt 14419320  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14419319 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 14419291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 32339349 - 32339544
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  32339349 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 32339448  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339449 gattcaccttggtaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 32339544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 1225174 - 1225401
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||| | |||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1225174 ataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgt 1225273  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  1225274 ctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggt 1225372  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1225373 agaattagacgggagacttattcttgtaa 1225401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 27911023 - 27911249
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||| ||| |||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27911023 ataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaagg-caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 27911121  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27911122 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggt 27911220  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27911221 agaattaggcgggagagttattcttgtaa 27911249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 27957442 - 27957668
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||| ||| |||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27957442 ataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaagg-caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 27957540  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27957541 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggt 27957639  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27957640 agaattaggcgggagagttattcttgtaa 27957668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28251894 - 28251671
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28251894 ataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 28251795  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  28251794 ctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 28251696  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattctt 244  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  28251695 aaaattaggcgggagacttattctt 28251671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 15067989 - 15068216
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15067989 ataaatataaaccttgtatcaacctaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaaccagggtttgtatagagtttgt 15068088  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  15068089 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggatt-gagtcttttggttacggaaagaggttgagactttgggt 15068187  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15068188 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 15068216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13858811 - 13858587
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| ||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13858811 ataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 13858712  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    |||||   | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  13858711 ctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggttacgggaagagattggggctttgggt 13858613  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttg 245  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  13858612 agaattaagcgggagacttattcttg 13858587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 15072718 - 15072946
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15072718 ataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgt 15072817  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaaga-gattgagactttggg 218  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | ||| |||||||||    
T  15072818 ctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagggttgggactttggg 15072916  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15072917 tagaattaggcgggagatttattcttgtaa 15072946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 3874050 - 3874245
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3874050 gagatagcgggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 3874149  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874150 gattcaccttgggaaacactattaggatt-tagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 3874245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22684951 - 22684756
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||  ||||    
T  22684951 gagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggtt 22684852  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22684851 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 22684756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 30480830 - 30480603
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| | |  | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  30480830 ataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgt 30480731  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  30480730 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagagattgaggctttgggt 30480632  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30480631 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 30480603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 608774 - 608969
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  608774 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 608873  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608874 gattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 608969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33541715 - 33541507
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33541715 ataaatatagacattgtatcagtgtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 33541616  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  33541615 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggatt-gagtatcttggttacgggaagagattgggacttttggt 33541517  T
Q  220 agaattaggc 229  Q
    ||||||||||    
T  33541516 agaattaggc 33541507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 15809259 - 15809453
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15809259 gagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct-tttggaacaaacactagggtttgtgggtt 15809357  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809358 gattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaaactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 15809453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 36865545 - 36865770
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttg 118  Q
    |||||||||||| |||| ||| | | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36865545 ataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 36865644  T
Q  119 tctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
    |||||| | | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | || |||||||||||  ||||||||    
T  36865645 tctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctct---tcacgggaagagattggaactttggg 36865740  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36865741 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 36865770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 50 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5372474 - 5372278
Alignment:
Q  50 ttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtggg 149  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||    
T  5372474 ttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgaggg 5372376  T
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  5372375 ttaattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagagattgggactttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaa 5372278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 18812901 - 18813117
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||           |||||||    
T  18812901 ataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag-----------agtttgt 18812989  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  || ||||||||||    
T  18812990 ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttgggtacgggaagaggctgtgactttgggt 18813088  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813089 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 18813117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 52 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28283514 - 28283322
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  28283514 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggtt 28283415  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 245  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28283414 gattcacattgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttg 28283322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 41384753 - 41384979
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  41384753 ataaatatagaccttgaatcaaagtaaaaattgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgt 41384851  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   |||| |||    
T  41384852 ctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacaccattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggagctttaggt 41384950  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||    
T  41384951 agaattaggtgggagaatttttcttgtaa 41384979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 25952529 - 25952755
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||  | |||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||  |||| |||||||    
T  25952529 ataaatataagctttgtatcagaggaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattagggttg-tatatagtttgt 25952627  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||    
T  25952628 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatattaggatt-gagtctcttggttacgagaagaaattgagacattgggt 25952726  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  25952727 agaattaggcagaagacttattcttgtaa 25952755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 5623040 - 5622878
Alignment:
Q  45 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttt 144  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  5623040 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctattgggaacaaacactagggttt 5622941  T
Q  145 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattg 208  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  5622940 gagggttgattcatctttggaaacattatttggatt-gagtctcttgattacgggaagagattg 5622878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 43530132 - 43530350
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagt 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||              | ||||||    
T  43530132 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacg-------------tgtagagt 43530218  T
Q  116 ttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagacttt 215  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  || ||||||    
T  43530219 ttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctctcggttacgggaagaggctgggacttt 43530317  T
Q  216 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43530318 gggtagaattaggcgggagacttattcctgtaa 43530350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 190
Target Start/End: Original strand, 26775209 - 26775378
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||| | |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  26775209 ataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaatactagggtttgtatatagtttgt 26775308  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt 190  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  26775309 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacactattagaatt-gagtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 41382681 - 41382897
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||  ||| || |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  41382681 ataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagatggggctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagaatttgt 41382780  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||           |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  41382781 ctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcac-----------ctattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggt 41382868  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41382869 agaattaggcgggagactttttcttgtaa 41382897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15186037 - 15185815
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||| || |||| ||| || |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15186037 ataaatataaactttgtatcagagtaaaccttgagataaaggtgactgaaacaagggtttagaaagaaaataacaaaactatggtttatataaagtttgt 15185938  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-gagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
    ||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |  |||||||||||| ||||||||       ||||||    
T  15185937 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattgagtctctcttggttacgggaagaga-------tttggg 15185845  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15185844 tagaattaggcgagagacctattcttgtaa 15185815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3005929 - 3005732
Alignment:
Q  45 aaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtt 143  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||  | |||||| |||||||    
T  3005929 aaaccttgagatagagggggctggaaacaagggtttagaaaca-aataacaaa-ctagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaatagggtt 3005833  T
Q  144 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattct 243  Q
       || ||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3005832 ---ggattgattcactttggaaaacactattagcattg-agtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 3005737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 31162221 - 31162444
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| | | |||||||  ||| |||| |||| ||||||    
T  31162221 ataaatatagaccttgtatcatagtaaaccttgagaaagagggggctaaaaacaaaggtttagaaaca-agcaacaaat-tagtgtttgtataaagtttg 31162318  T
Q  119 tctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
     ||||| | | |||||||||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  31162319 -ctcttggcaacaaacactaacgttag--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcaccggaagagattgggactttggg 31162414  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31162415 tagaattaggtggaagacttattcttgtaa 31162444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 21482330 - 21482545
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||  |||| ||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||          |||||||||||| |||| ||||||     
T  21482330 ataaatatagaatttgtatcagagtaaactttgagatagagtggactgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtataaagtttg- 21482420  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| | | ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  21482421 ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttatgggaagagattggggctttgggt 21482516  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21482517 agaattaggcgagtgacttattcttgtaa 21482545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 35872705 - 35872555
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     ||||||||||| ||||||||||||    
T  35872705 ataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac-----aactagggtttgtatagagtttgt 35872611  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 175  Q
    ||||| | | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35872610 ctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 248
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956192
Alignment:
Q  102 ggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaa 201  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| || ||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaa-tcttttggtcacgggaa 15956145  T
Q  202 gagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15956146 gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 15956192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 248
Target Start/End: Original strand, 21480547 - 21480737
Alignment:
Q  45 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttt 144  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||| ||| ||||||| ||||| | | ||||||||||| ||     
T  21480547 aaaccttgagatagatggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggttt- 21480636  T
Q  145 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 244  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21480637 --gggttgattcaccttgggaaacactattagaattg-agtctcttggttacgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattctt 21480733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 3886245 - 3886153
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatag 112  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  3886245 ataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12517349 - 12517248
Alignment:
Q  24 atatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtct 121  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12517349 atatataccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 12517250  T
Q  122 ct 123  Q
    ||    
T  12517249 ct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37214512 - 37214317
Alignment:
Q  45 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaact-------------------agggtttatatagagtttgtctctta 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||                   ||||||| |||||||||||||||||     
T  37214512 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttggttacgggaagagattgagggtttgtatagagtttgtctcttt 37214413  T
Q  126 ggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaatt 225  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||          | ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||    
T  37214412 ggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca----------ttgagtctcttggttacgggaagcgattggaactttgggtagaatt 37214323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31573924 - 31573847
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31573924 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 31573847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 248
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181737
Alignment:
Q  135 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt-aggattggagtctcttggttaca--ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgg 231  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||   |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggatta-agtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgg 181720  T
Q  232 gagacttattcttgtaa 248  Q
     ||||||||||||||||    
T  181721 aagacttattcttgtaa 181737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 248
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035353
Alignment:
Q  147 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   | |||||||||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattg-agtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttg 31035350  T
Q  246 taa 248  Q
    |||    
T  31035351 taa 31035353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2468425 - 2468261
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtt----tatatagagt 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||        ||  |||||| ||||    ||||||||||    
T  2468425 ataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggagctgaaacaaggatttaga--------aatcaaactacggtttgtatatatagagt 2468334  T
Q  116 ttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 193  Q
    ||| ||||| | | |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2468333 ttg-ctcttggcaacaaatactagggt---tgggttgattcaccttgggaaacactattagaatt-gagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 106
Target Start/End: Original strand, 181545 - 181631
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggttt 106  Q
    |||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||| |||||||||||||    
T  181545 ataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggcttagaatggcaacaataaaactagggttt 181631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578399
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattg-agtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 31578399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 181
Target Start/End: Original strand, 31035144 - 31035235
Alignment:
Q  87 caacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 181  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | | |||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31035144 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacaccattaggattg 31035235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Original strand, 17847661 - 17847740
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgg--gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17847661 ttgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaa-tctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 17847740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13985262 - 13985199
Alignment:
Q  165 aaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagatt-gagactttgggtagaattagg 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  13985262 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattagg 13985199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33839120 - 33839043
Alignment:
Q  150 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattga-gactttgggtagaattagg 228  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33839120 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattg-agtctcttggt--caggaagagattcaagactttgggtagaattagg 33839043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 6376141 - 6376203
Alignment:
Q  165 aaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 228  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6376141 aaacactgttaagattg-agtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattagg 6376203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 41810 - 41583
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41810 ataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 41711  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||| |||    
T  41710 ctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggt 41612  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41611 agaattagacgggagacttattcttgtaa 41583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 2841 - 3068
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2841 ataaatatagaacttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 2940  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  |  ||||||||||    
T  2941 ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggcttggactttgggt 3039  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3040 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 3068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 69622 - 69391
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagt 115  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  69622 ataaatatagaccttatatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 69523  T
Q  116 ttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagacttt 215  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  69522 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggttgggacttt 69424  T
Q  216 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69423 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 69391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 73354 - 73207
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagt 115  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  73354 ataaatatagaccgtgtatcaaaggaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagt 73255  T
Q  116 ttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 163  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  73254 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 73207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 73203 - 73160
Alignment:
Q  131 aaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 174  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  73203 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 14980 - 15207
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14980 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaatgatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataaagtttgt 15079  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  15080 ctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggaaagagattcagactttgggt 15178  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15179 agaattatgcgggagacttattcttgtaa 15207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 14707 - 14482
Alignment:
Q  24 atatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtct 121  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14707 atatagaccttgttttagagcaaactttgagagatagagggggatgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 14608  T
Q  122 cttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtag 221  Q
    ||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  14607 ctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-tagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtag 14509  T
Q  222 aattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  14508 aattaggcgggagacttattcttgtaa 14482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 183966 - 183741
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  183966 ataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgt 183868  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  183867 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttac-ggaagagattgggactttgggt 183770  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  183769 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 183741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 51970 - 52199
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagttt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51970 ataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 52069  T
Q  118 gtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgg 217  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  52070 gtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgg 52168  T
Q  218 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
     |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  52169 atagaattaggtgggagactttttcttgtaa 52199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 79146 - 79373
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||  ||| || |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  79146 ataaatatagaccttgaatcagagtaaaacttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 79245  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||    
T  79246 ctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagaatttgggt 79344  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  79345 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 79373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 3958 - 4184
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  3958 ataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgt 4056  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||    
T  4057 ctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggt 4155  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4156 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 4184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11800 - 11573
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||  ||| || |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11800 ataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 11701  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    |||||  || |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11700 ctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggt 11602  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11601 agaattaggcgggatacttattcttgtaa 11573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 1997 - 2229
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatataga 113  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||      || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||    
T  1997 ataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagaaagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtacaga 2096  T
Q  114 gtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagact 213  Q
    ||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||  || ||||    
T  2097 gtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaaaaggctgggact 2194  T
Q  214 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2195 ttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaa 2229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 29164 - 29359
Alignment:
Q  52 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29164 gagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggtt 29263  T
Q  152 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29264 gattcgccttgggatacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaa 29359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 248
Target Start/End: Original strand, 79845 - 80047
Alignment:
Q  45 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttagg-agcaaacactagggtt 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||| | |||||||    
T  79845 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtt 79944  T
Q  144 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattct 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  79945 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-aagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtag-attaggcaggagacttattcc 80042  T
Q  244 tgtaa 248  Q
    |||||    
T  80043 tgtaa 80047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 240
Target Start/End: Original strand, 35644 - 35819
Alignment:
Q  64 gctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 163  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  35644 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagg 35743  T
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 240  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35744 gaaacactattaggatt-aagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 85192 - 85418
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||| | |||| |||||| |||| |||||||||| | ||  ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  85192 ataaatataggctttgtatcaaagtaaaccttgagatagaagagga-gaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 85290  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||||||| | |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| ||    
T  85291 ctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggatt-gagtcttttggttacgagaagagattgtgactttgagt 85389  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  85390 agaatcagacgggagacttattcttgtaa 85418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16974 - 16751
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttg 118  Q
    ||||||||| ||||||| ||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16974 ataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctgaaaacaagggttt-gaaagacaaca-caaaactagggtttgtatagagtttg 16877  T
Q  119 tctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
     ||||| | | |||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16876 -ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtcacttggtgacgggaagagattgagactttggg 16781  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16780 tagaattaggccagagacttattcttgtaa 16751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16145 - 15922
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||  |||| ||| || |||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  16145 ataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg- 16048  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  16047 ctcctagcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggt 15951  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15950 agaattaggcgagagacttattcttgtaa 15922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1669 - 1552
Alignment:
Q  130 caaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  1669 caaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc 1571  T
Q  230 gggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1570 gggagacttattcttgtaa 1552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1958 - 1743
Alignment:
Q  21 taaatatagaccttgtgtcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    |||||||||||||||| ||| | | |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||      
T  1958 taaatatagaccttgtatcagatgtaaacctagagatagaggtggctgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttc- 1861  T
Q  120 ctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggt 219  Q
            | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  1860 --------aacaaacactagggtt-gtgg-ttgattcaccttgggaaacacaattaggattg-agtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggt 1772  T
Q  220 agaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1771 agaattaggcgggagagttattcttgtaa 1743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 993
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1158 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 1059  T
Q  120 ctc-----ttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 180  Q
    |||     || ||| ||||||||| | || | |||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  1058 ctctttagtttggaacaaacactacgtttggagggttgatccaccttgcgaaatacttttaggatt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 4775 - 4998
Alignment:
Q  20 ataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggg-tttagaaaaacaacaacaaaactagggtttatatagagtttg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||| |||||| || || |||||||  | | ||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  4775 ataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggtctgaaaaaaaggatttagaagta-agcaacaaa-ctagggtttatatagcgttt- 4871  T
Q  119 tctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 218  Q
    ||||| || | |||||||||| |||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |   |||||||||||  |||| ||    
T  4872 tctctcagcaacaaacactagagttga--gtttgattcatgttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttgg 4968  T
Q  219 tagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4969 tagaattaggcgggagacttatttttgtaa 4998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 248
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22304
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaa 22304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 248
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24579
Alignment:
Q  164 gaaacactattaggattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaa 24579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University