View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1627_low_3 (Length: 816)

Name: NF1627_low_3
Description: NF1627
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1627_low_3
NF1627_low_3
[»] chr2 (4 HSPs)
chr2 (7-795)||(14658675-14659457)
chr2 (316-463)||(13715381-13715528)
chr2 (316-463)||(4848485-4848632)
chr2 (135-206)||(38226096-38226167)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (7-412)||(44398274-44398678)
chr4 (15-463)||(6127073-6127511)
chr4 (7-463)||(43810833-43811277)
chr4 (420-467)||(49251450-49251497)
chr4 (420-465)||(24626015-24626060)
chr4 (420-463)||(55863268-55863311)
chr4 (420-466)||(38582148-38582194)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (316-461)||(4785003-4785148)
chr8 (420-463)||(30151839-30151882)
chr8 (316-383)||(22917110-22917177)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (327-463)||(39773715-39773851)
[»] chr3 (3 HSPs)
chr3 (337-462)||(45908165-45908290)
chr3 (420-467)||(44658291-44658338)
chr3 (420-463)||(44827634-44827677)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (420-463)||(7694627-7694670)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (420-469)||(38231772-38231821)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 657; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 657; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 14659457 - 14658675
Alignment:
Q  7 gtgagatgaataatccatgagaaagaagttcctctatttaagcttgggatcaatttcaactttaaatccatcaccataataattttttgattgagttata 106  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  14659457 gtgagaagaataatccatgagaaagaaattcctctatttaagcttgggatcaatttcaactttaaatccatcaccataataattttttgatttggttata 14659358  T
Q  107 tattgctacggctaatcttgaacctacgccatttcaatggaaccagagggaattcttgaataatattgatataaaaattgccgtttcactaatttggaat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  14659357 tattgctacggctaatcttgaacctacgccatttcaatggaactagagggagttcttgaataatattgatataaaaattgccgtttcattaatttgaaat 14659258  T
Q  207 ttgaaataataacaagcaaatgaaaaaatactaaagagtgaaaggacagggaattgaaggagtcaaatgggtaattgaggaagtagagagattggattcg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14659257 ttgaaataataacaagcaaatgaaaaaatactaaagagtgaaaggacggggaattgaaggagtggaatgggtaattgaggaagtagagagattggatccg 14659158  T
Q  307 gttacgagtgagagagagaacaatgaaagagatagagttggtgatggctaagatttagtgtggatagagtatgataagatttcatggatagtctaatcta 406  Q
    |||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14659157 gtt------gagagagagaacaatgaaagagatagagttgatgatggctaagatttagtgtggatagagtatgataagatttcatggatagtctaatcta 14659064  T
Q  407 aacattnnnnnnnttggtccatcatggaccaattcttcaattggtccaagctaaatggcacgtaataagtcttacttcttaagtgaaagtcataaatttc 506  Q
    ||||||       ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14659063 aacattaaaaaaattgatccatcatggaccaattcttcaattgatccaagctaaatggcacctaataagtcatacttcttaagggaaagtcataaatttc 14658964  T
Q  507 tacttcttatgtgaaagaatccaatatatgtctcatcaattctaataaaatttgcatggcagctccttaataacaatatttcgcatttaagaatcctaga 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14658963 tacttcttatgtgaaagaatccaatatatgactcatcaattctaataaaatttgcatggcagctccttaataataatatttcgcatttaagaatcctaga 14658864  T
Q  607 cttacaagtcttacttcttatgtgaaactctccaataatgtgacccaagagtaaccagcaacaacgtaaatgtatttatactgaaatcaattttgtagaa 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14658863 cttacaagtcttacttcttatgtgaaactctccaataatgtgacccaagagtaaccagcaacaatgtaaatgtatttatactgaaatcaattttgtagaa 14658764  T
Q  707 tcaagatcatgcaaaatcaaatttataagcatacataatgatttttagctaaaaagaatatcaattaggtcaaaagtaacttggtacta 795  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14658763 tcaagatcatgcaaaatcaaatttataagcatacataatgatttttagctaaaaagaatatcaattaggtcaaaagtaacttagtacta 14658675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 316 - 463
Target Start/End: Original strand, 13715381 - 13715528
Alignment:
Q  316 gagagagagaacaatgaaagagatagagttggtgatggctaagatttagtgtggatagagtatgataagatttcatggatagtctaatctaaacattnnn 415  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||       
T  13715381 gagagaaagagcaatgaaggagatagagttggtgatggcttagatagggtgtgggtagagtatgataagatttggtggattgtctaatctaaacattaaa 13715480  T
Q  416 nnnnttggtccatcatggaccaattcttcaattggtccaagctaaatg 463  Q
        ||||| |||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||    
T  13715481 aaaattggtgcatcatggaccatttcttctactcgtccaagctaaatg 13715528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 316 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 4848632 - 4848485
Alignment:
Q  316 gagagagagaacaatgaaagagatagagttggtgatggctaagatttagtgtggatagagtatgataagatttcatggatagtctaatctaaacattnnn 415  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||       
T  4848632 gagagaaagagcaatgaaggagatagagttggtgatggcttagatagagtctgggtagagtatgataagatttgatggattgcctaatctaaacattaaa 4848533  T
Q  416 nnnnttggtccatcatggaccaattcttcaattggtccaagctaaatg 463  Q
        ||| ||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  4848532 aaaattgatccatcatacaccaattcttcaactagtccaaactaaatg 4848485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 206
Target Start/End: Original strand, 38226096 - 38226167
Alignment:
Q  135 ccatttcaatggaaccagagggaattcttgaataatattgatataaaaattgccgtttcactaatttggaat 206  Q
    ||||||||||||||| ||||| | || ||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  38226096 ccatttcaatggaactagaggaagttgttgaatagtattgatataaaaatggaagtttcactaatttggaat 38226167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 44398678 - 44398274
Alignment:
Q  7 gtgagatgaataatccatgagaaagaagttcctctatttaagcttgggatcaatttcaactttaaatccatcaccataataattttttgattgagttata 106  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  44398678 gtgagaagaataatcgatgagaaagaagttcctctatttaagcttgggatcaatttcaactttaaatccatcaccataataattttctgatttagttata 44398579  T
Q  107 tattgctacggctaatcttgaaccta-cgccatttcaatggaaccagagggaattcttgaataatattgatataaaaattgccgtttcactaatttggaa 205  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44398578 tattgctacagctaatcttgaacctaacgccatttcaatggaatcagagggagttcttgaataatattgatataaaaattgccgtttcactaatttggaa 44398479  T
Q  206 tttgaaataataacaagcaaatgaaaaaatactaaagagtgaaaggacagggaattgaaggagtcaaatgggtaattgaggaagtagagagattggattc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44398478 tttgaaataataacaagcaaatgaaaaaatactaaagagtgaaaggacagggaattgaaggagtggaatgggtaattgaggaagtagagagattggatcc 44398379  T
Q  306 ggttacgagtgagagagagaacaatgaaagagatagagttggtgatggctaagatttagtgtggatagagtatgataagatttcatggatagtctaatct 405  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44398378 ggttactagtgaga--gagaacaatgaaagagatagagttggtaatggctaagatttagtgtggatagagtatgataagatttgatggatagtctaatct 44398281  T
Q  406 aaacatt 412  Q
    |||||||    
T  44398280 aaacatt 44398274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 6127511 - 6127073
Alignment:
Q  15 aataatccatgagaaagaagttcctctatttaagcttgggatcaatttcaactttaaatccatcaccataataattttttgattgagttatatattgcta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6127511 aataatccatgagaaagaagttcctttatttaagcttgggatcaatttcaactttaaatccatcaccataataattttttgatttagttatatattgcta 6127412  T
Q  115 cggctaatcttgaacctacgccatttcaatggaaccagagggaattcttgaataatattgatataaaaattgccgtttcactaatttggaatttgaaata 214  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6127411 cggctaatcttgaacctacatcatttcaatggaaccagagggagttcttgaataatattgatataaaaattgccgtttcattaatttggaatttgaaata 6127312  T
Q  215 ataacaagcaaatgaaaaaatactaaagagtgaaaggacagggaattgaaggagtcaaatgggtaattgaggaagtagagagattggattcggttacgag 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||           ||| |||||||||| ||| | || || ||    
T  6127311 ataacaagcaaatgaaaaaatactaaagagtgaaacgacggggaattgaaggagtggaat----------agaattagagagatttgatcccgtaactag 6127222  T
Q  315 tgagagagagaacaatgaaagagatagagttggtgatggctaagatttagtgtggatagagtatgataagatttcatggatagtctaatctaaacattnn 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  6127221 tgagagagagaacaatgaaagagatagagttgatgatggctaagatttagtgtggatagaatatgataagatttgatggatagtctaatctaaacattaa 6127122  T
Q  415 nnnnnttggtccatcatggaccaattcttcaattggtccaagctaaatg 463  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6127121 aaaaattggtccatcatggaccaattcttcaattgatctaagctaaatg 6127073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 7 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 43811277 - 43810833
Alignment:
Q  7 gtgagatgaataatccatgagaaagaagttcctctatttaagcttgggatcaatttcaactttaaatccatcaccataataattttttgattgagttata 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43811277 gtgagaagaataatccatgagaaagaagttcctctatttaagtttgggatcaatttcaactttaaatccatcaccataataattttttgatttagttata 43811178  T
Q  107 tattgctacggctaatcttgaaccta-cgccatttcaatggaaccagagggaattcttgaataatattgatataaaaattgccgtttcactaatttggaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43811177 tattgctacggctaatcttgaacctaacgccatttcaatggaac---------ttcttgaataatattgatataaaaactgccgtttcactaatttggaa 43811087  T
Q  206 tttgaaataataacaagcaaatgaaaaaatactaaagagtgaaaggacagggaattgaaggagtcaaatgggtaattgaggaagtagagagattggattc 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  43811086 tttgaaataataacaagcaaatgaaaaaatactaaagagtgaaaggatggagaattgaaggagtggaatgggtaattgaggaagtagagagattgaatcc 43810987  T
Q  306 ggttacgagtgagagagagaacaatgaaagagatagagttggtgatggctaagatttagtgtggatagagtatgataagatttcatggatagtctaatct 405  Q
    |||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  43810986 ggttactagt----gagagaacaatgaaagagatagagttggtgatggctaagatttagtgtggatagagttcgataagatttgatggatagtctaatct 43810891  T
Q  406 aaacattnnnnnnnttggtccatcatggaccaattcttcaattggtccaagctaaatg 463  Q
    ||| |||       ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43810890 aaatattaaaaaaattggtccatcataaaccaattattcaattggtccaagctaaatg 43810833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 420 - 467
Target Start/End: Original strand, 49251450 - 49251497
Alignment:
Q  420 ttggtccatcatggaccaattcttcaattggtccaagctaaatggcac 467  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  49251450 ttggtccatcatggaccaaaacttcaataggtccaagctaaatggcac 49251497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 465
Target Start/End: Original strand, 24626015 - 24626060
Alignment:
Q  420 ttggtccatcatggaccaattcttcaattggtccaagctaaatggc 465  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  24626015 ttggtccatcatggaccaatacctcaatgggtccaagctaaatggc 24626060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 463
Target Start/End: Original strand, 55863268 - 55863311
Alignment:
Q  420 ttggtccatcatggaccaattcttcaattggtccaagctaaatg 463  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  55863268 ttggtccatcatggaccaatacttcaatagatccaagctaaatg 55863311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 38582194 - 38582148
Alignment:
Q  420 ttggtccatcatggaccaattcttcaattggtccaagctaaatggca 466  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||    
T  38582194 ttggtccatcatggaccaatatctcaatgggtccaagctaaatggca 38582148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 77; Significance: 3e-35; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 316 - 461
Target Start/End: Original strand, 4785003 - 4785148
Alignment:
Q  316 gagagagagaacaatgaaagagatagagttggtgatggctaagatttagtgtggatagagtatgataagatttcatggatagtctaatctaaacattnnn 415  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||       
T  4785003 gagagaaagagcaatgaaggagatagagttggtgatggcttagatagagtgtgggtagagtatgataagatttggtggattgtctaatctacacattaaa 4785102  T
Q  416 nnnnttggtccatcatggaccaattcttcaattggtccaagctaaa 461  Q
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4785103 aaaattggtccatcatggaccaattcttcaactggtccaagctaaa 4785148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 420 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 30151882 - 30151839
Alignment:
Q  420 ttggtccatcatggaccaattcttcaattggtccaagctaaatg 463  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30151882 ttggtccatcatggaccaatacttcaatgggtccaagctaaatg 30151839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22917177 - 22917110
Alignment:
Q  316 gagagagagaacaatgaaagagatagagttggtgatggctaagatttagtgtggatagagtatgataa 383  Q
    |||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||| |||||||||||||    
T  22917177 gagagaaagagcaaggaaggagatagagttggtgatggcttagatagggtgtgggtagagtatgataa 22917110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 68; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 327 - 463
Target Start/End: Original strand, 39773715 - 39773851
Alignment:
Q  327 caatgaaagagatagagttggtgatggctaagatttagtgtggatagagtatgataagatttcatggatagtctaatctaaacattnnnnnnnttggtcc 426  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||| |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||       |||| ||    
T  39773715 caatgaaggagatagagttggtgatggcttagatagggtgtgggtagagtatgatatgatttggtggattgtctaatctaaacattaaaaaaattggccc 39773814  T
Q  427 atcatggaccaattcttcaattggtccaagctaaatg 463  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39773815 atcatggaccaattcttcaactggtccaagctaaatg 39773851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 61; Significance: 9e-26; HSPs: 3)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 337 - 462
Target Start/End: Original strand, 45908165 - 45908290
Alignment:
Q  337 gatagagttggtgatggctaagatttagtgtggatagagtatgataagatttcatggatagtctaatctaaacattnnnnnnnttggtccatcatggacc 436  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||     
T  45908165 gatagagttggtgatggcttagatagggtgtgggtagagtatgataagatttggtggattgtctaatctaaacattaaaaaaattggtccatcatggaca 45908264  T
Q  437 aattcttcaattggtccaagctaaat 462  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||    
T  45908265 aatttttcaactggtccaagctaaat 45908290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 467
Target Start/End: Original strand, 44658291 - 44658338
Alignment:
Q  420 ttggtccatcatggaccaattcttcaattggtccaagctaaatggcac 467  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  44658291 ttggtccattatggaccaaaacttcaataggtccaagctaaatggcac 44658338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 463
Target Start/End: Original strand, 44827634 - 44827677
Alignment:
Q  420 ttggtccatcatggaccaattcttcaattggtccaagctaaatg 463  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  44827634 ttggtccattatggaccaattcttcaataggtccatgctaaatg 44827677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 420 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 7694670 - 7694627
Alignment:
Q  420 ttggtccatcatggaccaattcttcaattggtccaagctaaatg 463  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  7694670 ttggtccatcatggaccaatacttcaatgggtccaagctaaatg 7694627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 469
Target Start/End: Original strand, 38231772 - 38231821
Alignment:
Q  420 ttggtccatcatggaccaattcttcaattggtccaagctaaatggcacgt 469  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  38231772 ttggtccatcatggaccaatacttcaatggttccaagctaaatgacacgt 38231821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University