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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1627_low_4 (Length: 676)

Name: NF1627_low_4
Description: NF1627
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1627_low_4
NF1627_low_4
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (1-344)||(15665169-15665515)
chr2 (3-302)||(19695776-19696072)
chr2 (28-306)||(41595327-41595603)
chr2 (30-306)||(40619496-40619771)
chr2 (31-279)||(27338823-27339071)
chr2 (490-589)||(15665701-15665795)
chr2 (362-430)||(15665574-15665642)
chr2 (29-161)||(37485803-37485935)
chr2 (175-306)||(13996097-13996228)
chr2 (175-306)||(13349445-13349576)
chr2 (3-128)||(13349306-13349430)
chr2 (195-303)||(34355887-34355995)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (71-307)||(24660635-24660869)
chr6 (2-306)||(9314893-9315196)
chr6 (2-266)||(12255237-12255501)
chr6 (1-306)||(23404573-23404876)
chr6 (5-307)||(10789199-10789499)
chr6 (1-161)||(391057-391217)
chr6 (2-249)||(32329483-32329728)
chr6 (117-234)||(29979287-29979403)
chr6 (4-36)||(4889444-4889476)
[»] chr3 (10 HSPs)
chr3 (1-306)||(40700798-40701101)
chr3 (28-263)||(28457582-28457816)
chr3 (54-206)||(45852738-45852889)
chr3 (88-232)||(4384892-4385035)
chr3 (16-147)||(21748195-21748325)
chr3 (88-159)||(43462842-43462913)
chr3 (88-159)||(46663420-46663491)
chr3 (13-74)||(41864774-41864835)
chr3 (148-234)||(42490652-42490740)
chr3 (199-307)||(21748363-21748471)
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (1-306)||(40953315-40953619)
chr8 (1-267)||(27696354-27696620)
chr8 (1-306)||(16295424-16295726)
chr8 (1-306)||(16303126-16303428)
chr8 (1-306)||(37246250-37246550)
chr8 (3-306)||(43596918-43597220)
chr8 (3-306)||(11656122-11656422)
chr8 (17-167)||(8490813-8490972)
chr8 (6-193)||(16456678-16456871)
chr8 (17-161)||(15268856-15269000)
chr8 (6-168)||(42180535-42180694)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (3-306)||(45498948-45499252)
chr4 (51-307)||(5787125-5787377)
chr4 (28-306)||(37910463-37910738)
chr4 (95-306)||(28115791-28116001)
chr4 (154-306)||(17702214-17702365)
chr4 (3-306)||(34940377-34940679)
chr4 (37-306)||(3767822-3768089)
chr4 (1-303)||(34513934-34514233)
chr4 (3-161)||(36198590-36198747)
chr4 (1-158)||(44289399-44289558)
chr4 (175-306)||(34513698-34513829)
chr4 (175-306)||(44290112-44290243)
chr4 (174-231)||(11138760-11138817)
chr4 (96-156)||(3319945-3320005)
chr4 (84-128)||(34512182-34512226)
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (3-306)||(29860954-29861255)
chr5 (1-306)||(33007769-33008071)
chr5 (3-306)||(33134173-33134473)
chr5 (28-306)||(15921984-15922260)
chr5 (16-210)||(21091050-21091243)
chr5 (3-267)||(25346826-25347089)
chr5 (87-193)||(5868146-5868251)
chr5 (28-141)||(31078118-31078231)
chr5 (7-161)||(7883569-7883723)
chr5 (134-306)||(31077934-31078101)
chr5 (107-193)||(2499109-2499192)
chr5 (117-159)||(12657998-12658040)
chr5 (1-159)||(39351493-39351659)
chr5 (95-159)||(8096077-8096141)
chr5 (114-210)||(42683818-42683913)
chr5 (199-306)||(7883743-7883850)
chr5 (2-36)||(5868110-5868144)
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (55-306)||(28622738-28622988)
chr1 (1-161)||(37346130-37346290)
chr1 (3-193)||(10306582-10306770)
chr1 (3-128)||(17702919-17703044)
chr1 (175-306)||(49549600-49549730)
chr1 (199-307)||(37346980-37347088)
chr1 (1-92)||(4714392-4714483)
chr1 (199-234)||(10306759-10306794)
chr1 (117-207)||(52267876-52267963)
[»] chr7 (13 HSPs)
chr7 (28-306)||(34703121-34703401)
chr7 (28-235)||(34866242-34866448)
chr7 (3-281)||(18502843-18503127)
chr7 (88-168)||(3480603-3480683)
chr7 (114-281)||(15672847-15673010)
chr7 (3-144)||(17508541-17508682)
chr7 (3-144)||(17544532-17544673)
chr7 (181-247)||(17508667-17508733)
chr7 (181-247)||(17544481-17544547)
chr7 (88-161)||(6110329-6110401)
chr7 (95-156)||(15841589-15841650)
chr7 (94-156)||(15524604-15524666)
chr7 (107-156)||(15512618-15512667)
[»] scaffold0957 (1 HSPs)
scaffold0957 (180-234)||(1816-1870)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 15665169 - 15665515
Alignment:
Q  1 gctggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15665169 gctggatagagacatgatatgatatgggcatgataaatattaatcttatcatgtgttttatgcacacatgataataaacagggtatcattatatttaaat 15665268  T
Q  101 gaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15665269 gaataaattactatcataattaattaaatattgtaaaaatg-catgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacat 15665367  T
Q  201 tttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaaccta----tacccgtgatacaaatt 296  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||| |||||||||||    
T  15665368 tttaaaaatgacaaaaaatcatgataataaataaagaattatcttctaattctatcaggataatttccaacccaacctatacctacccatgatacaaatt 15665467  T
Q  297 acaaaggaaaacaagaatatcatagataatttatttttatctgatatg 344  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||    
T  15665468 acaaaggaagatcagaatatgatagaaattttttttttatcttatatg 15665515  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19696072 - 19695776
Alignment:
Q  3 tggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatga 102  Q
    |||||||| | |||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||  ||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  19696072 tggatagaaatatgatacgataaggacatgataaacattaatcttattatgtgtttgatgtgcacatgataataaacatgatatcattataattaaatga 19695973  T
Q  103 ataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacattt 202  Q
    | ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| | || |||| ||||||||||| || ||| ||||    
T  19695972 aaaaattgctctcataattaattaaatagtataaaaatgatatgttattaattataatagaaaata-tatgctatcattattttaaaagtgacaatattt 19695874  T
Q  203 taaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattacaaag 302  Q
    ||||||||  | || |||| |||||||||||| |  | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |  |||| |||||||||||    
T  19695873 taaaaatg--agaatatcaagataataaataagggatgatcttctaattccatcaggataatttctaactcagcttatactcaagatagaaattacaaag 19695776  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41595603 - 41595327
Alignment:
Q  28 acatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatgaataaattactatcataattaattaa 127  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||  ||||| |||| ||||| | |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  41595603 acatgataaacattaatcctattatgtgtttgatgtgcacataataacaaacatgatatcattataatcaaatgaa-aaattgctctcataattaattaa 41595505  T
Q  128 acattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacattttaaaaatgacaaaacatcatgataa 227  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||  | | |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| | || |||| |||||    
T  41595504 atattataaaaatgacatgttattaattataatagaaaatacat-gctatcattattttaaaaatgacaatattttaaaaatgaaagaatatcaagataa 41595406  T
Q  228 taaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattacaaaggaaa 306  Q
    |||||||| | | |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| |  |||| ||||||||| |||||    
T  41595405 taaataaaaaatgatcttctaatcccatcaggataatttctaactcaacttatactcaggatagaaattacaatggaaa 41595327  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 306
Target Start/End: Original strand, 40619496 - 40619771
Alignment:
Q  30 atgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatgaataaattactatcataattaattaaac 129  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||| |||| ||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||     
T  40619496 atgataaatattaatcttatcatgtgtttgatgtgcacatgataacaaacatgatatcattataattaaatgaaaaaattgctctcatagttaattaaat 40619595  T
Q  130 attgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacattttaaaaatgacaaaacatcatgataata 229  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||   || |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| | |||||    
T  40619596 attataaaaatggcaagttattaattataataaaaaata-catgctatcattattttaaaaatgacaatattttaaaaataacagaatatcaaggtaata 40619694  T
Q  230 aataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattacaaaggaaa 306  Q
    ||||| || | |||||||||| | || || |||||||| ||| |||||||||| |  |||| ||||||| |||||||    
T  40619695 aataaggaatgatcttctaatcccataagtataatttctaacccaacctatactcaggatagaaattacgaaggaaa 40619771  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 27339071 - 27338823
Alignment:
Q  31 tgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatgaataaattactatcataattaattaaaca 130  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||| |||| |||| || |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |    
T  27339071 tgataaacattaatcatatcatgtgtttgatgcgcacatgataacaaaccggatatcattataattaaatgaaaaaattgctctcataattaattaaata 27338972  T
Q  131 ttgtaaaaatgacatgtaattaatta-taataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacattttaaaaatgacaaaacatcatgataata 229  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||   || |||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  27338971 ttataaaaatgacatgttattaattattaatagaaaata-catgctatcattattttaaaaatgataatattttaaaaatgacagaatatcaagataata 27338873  T
Q  230 aataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaaccta 279  Q
    ||||| || | || || |||| | |||||||| ||||| |||||| ||||    
T  27338872 aataaggaatgatattataatcccatcaggatcatttctaactcagccta 27338823  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 490 - 589
Target Start/End: Original strand, 15665701 - 15665795
Alignment:
Q  490 cgaaacaagtgtcacaagtagagctctaaagtgggtgagaaaaacaccaaaacatccgtacaataacctgagtataataaagatagtattttagacttgg 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    | |||||||||||||||||||||||    
T  15665701 cgaaacaagtgtcacaagtagagctctaaagtaggtgacaaaaacaccaaaacatccgtac-ataacctga----attaaagatagtattttagacttgg 15665795  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 362 - 430
Target Start/End: Original strand, 15665574 - 15665642
Alignment:
Q  362 ttatccttaccatcaaactggtcctacaaggaatatggaataaactcattatcatgatttatatgtact 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  15665574 ttatccttaccatcaaactggtcctacaaggaatatggaataaactcatgctcgtgatttatatgtact 15665642  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 37485935 - 37485803
Alignment:
Q  29 catgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatgaataaattactatcataattaattaaa 128  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||  ||||| |||| |||||   || ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  37485935 catgataaacattaatcatatcatgtgtttgatgtgcacatgataacaaacataataccattataattaaatgaaaaaattgctctcataattaattaaa 37485836  T
Q  129 cattgtaaaaatgacatgtaattaattataata 161  Q
     || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37485835 gatcgtaaaaatgacatgttattaattataata 37485803  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 306
Target Start/End: Original strand, 13996097 - 13996228
Alignment:
Q  175 tatcgttattttaaaaatgtcaacattttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactca 274  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||  | || ||||  ||||||||||| || | |||||||||| | |||||||||||||| ||| ||    
T  13996097 tatcattattttaaaaatgacaatatttttaaaatggaagaatatcaaaataataaataaggaatgatcttctaatcccatcaggataatttctaaccca 13996196  T
Q  275 acctatacccgtgatacaaattacaaaggaaa 306  Q
    || ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  13996197 acttatactcaggatagaaattacaaaggaaa 13996228  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 306
Target Start/End: Original strand, 13349445 - 13349576
Alignment:
Q  175 tatcgttattttaaaaatgtcaacattttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactca 274  Q
    |||| ||||||||||||||  || |||| ||||||| || || |||| |||||||||||| || | ||||||||||   |||||||||||||| ||||||    
T  13349445 tatcattattttaaaaatgataatatttaaaaaatggcagaatatcaagataataaataaggaatgatcttctaatcgcatcaggataatttctaactca 13349544  T
Q  275 acctatacccgtgatacaaattacaaaggaaa 306  Q
     | |||||    |||| |||||||||||||||    
T  13349545 tcatatacttaggatagaaattacaaaggaaa 13349576  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 128
Target Start/End: Original strand, 13349306 - 13349430
Alignment:
Q  3 tggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatga 102  Q
    |||||||||| |  |||||||| | | |||||||| ||||||| |||  ||||||| |||| || || |||| ||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  13349306 tggatagagatagaatatgataaggatatgataaa-attaatcctatcgtgtgtttgatgcgcatatgataacaaacaggatattattataattaaatga 13349404  T
Q  103 ataaattactatcataattaattaaa 128  Q
    | ||||| || |||||||||||||||    
T  13349405 aaaaattgctctcataattaattaaa 13349430  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 34355995 - 34355887
Alignment:
Q  195 caacattttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaa 294  Q
    ||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| || | |  ||||||| ||||| || ||||||  ||  |||| ||||| || |||| |||    
T  34355995 caacatttttaaattgataaaatatcatgataataaataaggaatgaatttctaatcctatctgggtaatttataatccaacttatactcgggataaaaa 34355896  T
Q  295 ttacaaagg 303  Q
    |||||||||    
T  34355895 ttacaaagg 34355887  T

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Target: chr6 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 71 - 307
Target Start/End: Original strand, 24660635 - 24660869
Alignment:
Q  71 ataataaacagggtatcattatatttaaatgaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatatt 170  Q
    |||| ||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  24660635 ataacaaacatgatatcattataattaaatgaaaaaattactctcataattaattaaatattgtaaaaaagtcatgtaattaattttaataacaaata-t 24660733  T
Q  171 ttgatatcgttattttaaaaatgtcaacattttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaa 270  Q
     ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||| | ||| ||||||| || |||||||| || | ||    
T  24660734 atgatatcattattttaaaaatgacaacattttaaaaatgatagaatatcatgataataaat-aaggtatattttctaatcctttcaggatagttcctaa 24660832  T
Q  271 ctcaacctatacccgtgatacaaattacaaaggaaaa 307  Q
    |||| | ||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  24660833 ctcagcttatactcaggatacaaattacaaaggaaaa 24660869  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9315196 - 9314893
Alignment:
Q  2 ctggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatg 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||| |||||||    
T  9315196 ctggatagagatatgatatgataaggacatgataaacattaatcctatcatgtgtttgatgcgcacatgataacaaacaagatatcattataattaaatg 9315097  T
Q  102 aataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacatt 201  Q
    || ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||||   || |||| ||||||||||||||   | |||    
T  9315096 aaaaaattgctctcataattaattaaatattgtaaaaatggcattttattaattataatagaaaata-catgctatcattattttaaaaatgatgatatt 9314998  T
Q  202 ttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattacaaa 301  Q
    ||||||||| || || |||| |||||||||||| || | ||||||||||   | |||||||||||| || ||| ||||||| |  |||  ||||||||||    
T  9314997 ttaaaaatggcagaatatcaagataataaataaggaatgatcttctaatctcaccaggataatttctaattcagcctatactcaggattgaaattacaaa 9314898  T
Q  302 ggaaa 306  Q
    |||||    
T  9314897 ggaaa 9314893  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12255501 - 12255237
Alignment:
Q  2 ctggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatg 101  Q
    ||||||||||| | ||||| |||   |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||| |||||||    
T  12255501 ctggatagagataggatattataaagacatgataaacattaatcttatcatgtgtttgatgcgcacatgataacaaacatgatatcattataattaaatg 12255402  T
Q  102 aataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacatt 201  Q
    || |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||     || |||| ||||||||||| |  ||| |||    
T  12255401 aaaaaattactctcataattaattaaatattataaaaatgacatgttattaattacaataaaaaaatacatgctatcattattttaaaagtaacaatatt 12255302  T
Q  202 ttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataattt 266  Q
    ||||||| |||| || |||| |||||||||||| || |||||||||||| | |||| ||||||||    
T  12255301 ttaaaaaggacagaatatcaagataataaataaggaattatcttctaatcccatcatgataattt 12255237  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23404876 - 23404573
Alignment:
Q  1 gctggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaat 100  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| | |||||||||| |||||| |||| |||||||| |||  ||||| |||| ||||| | |||||||||| ||||||    
T  23404876 gctggataaagataagatatgataaggacatgataaacattaatattatcatgtgtttgatgtgcacatgataacaaacacgatatcattataattaaat 23404777  T
Q  101 gaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacat 200  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||  |||||   || |||   ||||||||||||| ||| |     
T  23404776 gaaaaaattgctatcataataaattaaatattgtaaaaatggtatgttattaattataatagaaaata-catgctataactattttaaaaatgacaata- 23404679  T
Q  201 tttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattacaa 300  Q
    |||||||||| || || |||| |||||||||| | || | ||||| ||| || |||||||||||||| |||| | ||||||| |  |||| |||||||||    
T  23404678 tttaaaaatggcagaatatcaagataataaattaggaataatcttttaagtcaatcaggataatttctaacttagcctatactcaagatataaattacaa 23404579  T
Q  301 aggaaa 306  Q
    ||||||    
T  23404578 aggaaa 23404573  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Original strand, 10789199 - 10789499
Alignment:
Q  5 gatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatgaat 104  Q
    |||||||| | ||||||||| | | || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||  |||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||     
T  10789199 gatagagataagatatgataaggatataataaacattaatcttatcatgtgtttgatgcgaacatgataacaaacaggatatcattataattaaatgaa- 10789297  T
Q  105 aaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacatttta 204  Q
    ||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||   || |||  |||||||||||||| ||| ||||||    
T  10789298 aaattgctctcataattaattaagtattataaaaatggcatgttattaattataatagaaaata-catgctattattattttaaaaatgacaatatttta 10789396  T
Q  205 aaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattacaaagga 304  Q
    |||||  || || |||| |||||||||||| || | || || |||| | ||||| |||||||  ||| |||||||||| |  |||| |||||||||||||    
T  10789397 aaaatagcagaatatcaagataataaataaggaatgatattataatcccatcagaataatttataacccaacctatactctggatagaaattacaaagga 10789496  T
Q  305 aaa 307  Q
    |||    
T  10789497 aaa 10789499  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 391057 - 391217
Alignment:
Q  1 gctggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaat 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||  ||||| |||| ||| ||| |||||||||| ||||||    
T  391057 gctggatagagataagatatgataaagacatgataaacattaatcttatcatgtgtttgatgtgcacatgataacaaataggatatcattataattaaat 391156  T
Q  101 gaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataata 161  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  391157 gaaaaaattgctctcataattaattaaatattataaaaatgacatgttattaattataata 391217  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32329728 - 32329483
Alignment:
Q  2 ctggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatg 101  Q
    ||||||||||| | ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | ||||| |||| ||| | | |||||||| ||| |||||    
T  32329728 ctggatagagataagatatgataaggacatgataaacattaatcatatcatgtgtttgatacgcacatgataacaaatatgatatcattaaatt-aaatg 32329630  T
Q  102 aataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacatt 201  Q
    || ||||| || |||||||||||| || |||||||||| |  |||| |||||||||||||  |||||   || |||| | |||||||||||| ||| |||    
T  32329629 aaaaaattgctctcataattaattcaatattgtaaaaacggtatgttattaattataatagaaaata-catgctatcatcattttaaaaatgacaatatt 32329531  T
Q  202 ttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaa 249  Q
    || ||||||  | || ||||  ||||||||||| || | |||||||||    
T  32329530 ttcaaaatggtagaatatcaacataataaataaggaatgatcttctaa 32329483  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 234
Target Start/End: Original strand, 29979287 - 29979403
Alignment:
Q  117 taattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacattttaaaaatgacaaaa 216  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||||||||| |||  |||||  | | |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||  | ||    
T  29979287 taattaattaaatgttgtaaaaattgcatgttattaattatgatagaaaatacat-gctatcattattttaaaaatgacaatattttaaaaatggtagaa 29979385  T
Q  217 catcatgataataaataa 234  Q
     |||| ||||||||||||    
T  29979386 tatcaagataataaataa 29979403  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 36
Target Start/End: Original strand, 4889444 - 4889476
Alignment:
Q  4 ggatagagacatgatatgatatgaacatgataa 36  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4889444 ggatagagacatgatatgacatgaacatgataa 4889476  T

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Target: chr3 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 10)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 40700798 - 40701101
Alignment:
Q  1 gctggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaat 100  Q
    |||||||||||| | ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| | |||||||||| ||||||    
T  40700798 gctggatagagataggatatgataaggacatgataaacattaatcctatcatgtgtttgatgcacacatgataacaaacatgatatcattataattaaat 40700897  T
Q  101 gaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacat 200  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||   || |||| ||| ||| |||||| ||| ||    
T  40700898 gaaaaaattgctctcataattaattaaatattgtaaatatgacatgttattaattataatagaaaata-catgctatcattaattt-aaaatgacaatat 40700995  T
Q  201 tttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattacaa 300  Q
    ||| |||||| || || |||| ||| |||||||| || | ||||| |||| |||||||||||||||| ||| || | ||||| |  |||| |||||||||    
T  40700996 ttttaaaatgtcataatatcaagatgataaataaggaatgatcttataatcctatcaggataatttctaacacagcttatactcaggataaaaattacaa 40701095  T
Q  301 aggaaa 306  Q
    ||||||    
T  40701096 aggaaa 40701101  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 263
Target Start/End: Original strand, 28457582 - 28457816
Alignment:
Q  28 acatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatgaataaattactatcataattaattaa 127  Q
    |||||||||| || |||| ||| || ||||| |||| ||||| |||| ||| | | |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  28457582 acatgataaacatcaatcctatcatatgtttgatgcgcacatgataacaaataagatatcattataattaaatgaaaaaattgctctcataattaattaa 28457681  T
Q  128 acattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacattttaaaaatgacaaaacatcatgataa 227  Q
    | |||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||    || |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| | |||| |||||    
T  28457682 atattgtaaaaatgacatgttagtaattataatagaaaat-gcatgctatcattattttaaaaatgacaatattttaaaaatggcaatatatcaagataa 28457780  T
Q  228 taaataaagatttatcttctaattctatcaggataa 263  Q
    ||||||| || | |||||||||| | ||||||||||    
T  28457781 taaataaggaatgatcttctaatcccatcaggataa 28457816  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 206
Target Start/End: Original strand, 45852738 - 45852889
Alignment:
Q  54 tgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatgaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaa 153  Q
    ||||| |||| || || |||||||| ||| ||| ||| ||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  45852738 tgtttgatgctcatatgataataaagaggatattattgtatttaaataaaaatattactctcataattaattaaatattgtaaaaatgacatgtaattac 45852837  T
Q  154 ttataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacattttaaa 206  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||    
T  45852838 ttataataacaaata-tatgatatcattatttaaaaaatgaaaacattttaaa 45852889  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 88 - 232
Target Start/End: Original strand, 4384892 - 4385035
Alignment:
Q  88 attatatttaaatgaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttatttta 187  Q
    |||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||| ||||||  | |||||| ||||||||    
T  4384892 attataattaaataaaacaattactctcataattatttaaatattttaaaaatggtaggtaattaattataatatcaaatacat-gatatcattatttta 4384990  T
Q  188 aaaatgtcaacattttaaaaatgacaaaacatcatgataataaat 232  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  4384991 aaaatgacaacattttaaaaataacataatatcatgataataaat 4385035  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 147
Target Start/End: Original strand, 21748195 - 21748325
Alignment:
Q  16 gatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaa-cagggtatcattatatttaaatgaataaattactat 114  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||  | |||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||  | |    
T  21748195 gatatgataaggacatgataaacattaatcatatcatgtgtttgatgcaca--tgataaaaaaacaggatatcattataattaaatgaaaaaattgttct 21748292  T
Q  115 cataattaattaaacattgtaaaaatgacatgt 147  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  21748293 cataattaattaaatattttaaaaatggcatgt 21748325  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 159
Target Start/End: Original strand, 43462842 - 43462913
Alignment:
Q  88 attatatttaaatgaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataa 159  Q
    |||||| ||||||||  || ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43462842 attataattaaatgagaaatttactctcgtaattaattaaatattttaaaaatgacatgtaattaattataa 43462913  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 46663491 - 46663420
Alignment:
Q  88 attatatttaaatgaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataa 159  Q
    |||||| ||||||||  |||||| | || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46663491 attataattaaatgagaaaattattctcgtaattaattaaatattttaaaaatgacatgtaattaattataa 46663420  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Original strand, 41864774 - 41864835
Alignment:
Q  13 catgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataa 74  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||    
T  41864774 catgatatgatatgtatatgataaacattaatcttatcatgtatttgatgcacacatgataa 41864835  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 234
Target Start/End: Original strand, 42490652 - 42490740
Alignment:
Q  148 aattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatg--tcaacattttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataa 234  Q
    ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||    || |||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  42490652 aattaattataataacaaacaccatgatatcgttattttaaaaatgataaaatatttaaaaaatgacaaggtatcatgataataaataa 42490740  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 307
Target Start/End: Original strand, 21748363 - 21748471
Alignment:
Q  199 attttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattac 298  Q
    |||||||||||| || || |||| |||||||||||| || |  |||||||||   |||||||||||||  ||| || |||||||    |||| |||||||    
T  21748363 attttaaaaatggcagaatatcaagataataaataaggaatggtcttctaatctcatcaggataatttttaacccagcctatacttaggatagaaattac 21748462  T
Q  299 aaaggaaaa 307  Q
    |||||||||    
T  21748463 aaaggaaaa 21748471  T

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Target: chr8 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 40953619 - 40953315
Alignment:
Q  1 gctggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaat 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||   |||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||| |||| ||||| | |||||| ||| ||||||    
T  40953619 gctggatagagataggatatgataacgacatgataaacattaatcatatcatgtgtttgatgcgcacatgataacaaacatgatatcatcataattaaat 40953520  T
Q  101 gaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacat 200  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||   || |||| |||||||||||||| ||| ||    
T  40953519 gaaaaaattgctctcataattaattaaatattataaaaatgacatgttattaattataataaaaaata-catgctatcattattttaaaaatgacaatat 40953421  T
Q  201 tttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattacaa 300  Q
    |||||||| | || || |||| | |||||||||| || | |||||||||| | || |  |||||||| ||| || ||||||| |  |||| |||||||||    
T  40953420 tttaaaaagggcagaatatcaaggtaataaataaggaatgatcttctaatcccattataataatttctaacccagcctatactcaggataaaaattacaa 40953321  T
Q  301 aggaaa 306  Q
    ||||||    
T  40953320 aggaaa 40953315  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27696620 - 27696354
Alignment:
Q  1 gctggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaat 100  Q
    |||||||||| | ||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||  ||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  27696620 gctggatagaaatatgatatgataaggacatgataaacattaatcctatcatgtgtttaatgtgcacatgataacaaacaggatatcattataattaaat 27696521  T
Q  101 gaataaattactatcataattaattaaacattgt-aaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaaca 199  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| | |||||||||||||  |||||   || |||| |||||||||||||  ||| |    
T  27696520 gaaaaaattgctctcataattaattaaatattataaaaaatggcatattattaattataatagaaaata-catgctatcattattttaaaaataacaata 27696422  T
Q  200 ttttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttc 267  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||||| || | |||| ||||| | |||| |||||||||    
T  27696421 ttttaaaaatgacagaatatcaagataataaataaggaatgatctcctaatcccatcaagataatttc 27696354  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16295726 - 16295424
Alignment:
Q  1 gctggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaat 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||  ||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  16295726 gctggatagagatatgatatgataaggacatgataaacattaatcttatcatgtgtttgatgtgcacatgataacaaacaggatatcattataattaaat 16295627  T
Q  101 gaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacat 200  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||  |||||   || |||   ||||||||||||| ||| |     
T  16295626 gaaaaaattgctctcataattaattaaatattgtaaaaatggtatgttattaattataatagaaaata-catgctataactattttaaaaatgacaata- 16295529  T
Q  201 tttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattacaa 300  Q
    ||||||||||  | || |||| |||||||||||| || | |||||| ||| | |||| ||||||||| |||  |  |||||| |  |||| |||||||||    
T  16295528 tttaaaaatggtagaatatcaagataataaataaggaatgatcttccaatcccatca-gataatttctaacctagtctatactcaggatataaattacaa 16295430  T
Q  301 aggaaa 306  Q
    ||||||    
T  16295429 aggaaa 16295424  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16303428 - 16303126
Alignment:
Q  1 gctggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaat 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||  ||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  16303428 gctggatagagatatgatatgataaggacatgataaacattaatcttatcatgtgtttgatgtgcacatgataacaaacaggatatcattataattaaat 16303329  T
Q  101 gaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacat 200  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||  |||||   || |||   ||||||||||||| ||| |     
T  16303328 gaaaaaattgctctcataattaattaaatattgtaaaaatggtatgttattaattataatagaaaata-catgctataactattttaaaaatgacaata- 16303231  T
Q  201 tttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattacaa 300  Q
    ||||||||||  | || |||| |||||||||||| || | |||||| ||| | |||| ||||||||| |||  |  |||||| |  |||| |||||||||    
T  16303230 tttaaaaatggtagaatatcaagataataaataaggaatgatcttccaatcccatca-gataatttctaacctagtctatactcaggatataaattacaa 16303132  T
Q  301 aggaaa 306  Q
    ||||||    
T  16303131 aggaaa 16303126  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37246550 - 37246250
Alignment:
Q  1 gctggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaat 100  Q
    |||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||| | || ||||||| |||||||||| ||||||    
T  37246550 gctggatagagataggatatgataaggacatgataaatattaatcttatcatgtgtttgatttgcacatgaaaacaaacaggatatcattataattaaat 37246451  T
Q  101 gaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacat 200  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |   |||| |||||||||||||  |||||   || |||   ||||||||||||  ||| |     
T  37246450 gaataaattgctctcataattaattaaatattgtaaaagt---atgttattaattataatagaaaata-catgttataactattttaaaaataacaata- 37246356  T
Q  201 tttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattacaa 300  Q
    |||||||||| || || |||| |||||||||||| || | |||||||||| |  ||||||||||||| |||  | ||||||| |  |||| |||||||||    
T  37246355 tttaaaaatggcagaatatcaagataataaataaggaatgatcttctaatcccctcaggataatttctaacctagcctatactcaagatataaattacaa 37246256  T
Q  301 aggaaa 306  Q
    ||||||    
T  37246255 aggaaa 37246250  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 43597220 - 43596918
Alignment:
Q  3 tggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatga 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||  ||||| |||| ||| |   |||||||||| ||||||||    
T  43597220 tggatagagatatgatatgataaggacatgataaacattaatcctatcatatgtttgatgggcacatgataacaaatataatatcattataattaaatga 43597121  T
Q  103 ataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacattt 202  Q
    | |||||  | |||||| |||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||   || |||  ||||||| |||||| ||| ||||    
T  43597120 aaaaattgttctcataactaattaaatattttaaaaatggcatgttattaattataatagaaaata-catgctatgattatttttaaaatgacaatattt 43597022  T
Q  203 taaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattacaaag 302  Q
    |||||||| || || || | ||| |||||||| || | ||||||||||   |||||||||||||  ||||||| |||||| |  |||| |||||||||||    
T  43597021 taaaaatggcagaatataaagattataaataaggagtgatcttctaatctcatcaggataatttttaactcaatctatactcaggatataaattacaaag 43596922  T
Q  303 gaaa 306  Q
    ||||    
T  43596921 gaaa 43596918  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 306
Target Start/End: Original strand, 11656122 - 11656422
Alignment:
Q  3 tggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatga 102  Q
    |||||||||| | ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||  |||| |||| ||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  11656122 tggatagagataggatatgataaggacatgataaacattaatcatatcatgtgtttgatgcgtacatgataacaaacaaggtaccattataattaaatga 11656221  T
Q  103 ataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacattt 202  Q
    | ||||| || |||||||| |||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||| | ||||    || |||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  11656222 a-aaattgctttcataattgattaaatattgtaaaaatggcatgtta-taattataat-agaaattacatgctatcattattttaaaaatgacaatattt 11656318  T
Q  203 taaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattacaaag 302  Q
    | ||||||  | || || | || ||||||||| || | ||||||||||   || ||||||||||| ||| |||||||||  |  |||| |||||||||||    
T  11656319 tcaaaatggtagaatattaagacaataaataaggaatgatcttctaatctcattaggataatttctaacccaacctatattcaggatagaaattacaaag 11656418  T
Q  303 gaaa 306  Q
    ||||    
T  11656419 gaaa 11656422  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 167
Target Start/End: Original strand, 8490813 - 8490972
Alignment:
Q  17 atatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatt--------taaatgaataaat 108  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||        ||||| || ||||    
T  8490813 atatgatatagacatgataaacattaatattatcatgtgtttgatgcacacaacataacaaacatgatatcattatcttattataattaaataaaaaaat 8490912  T
Q  109 t-actatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaat 167  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8490913 ttactctcataattaattaaatattataaaaatgacatgtaattaattataacaacaaat 8490972  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16456871 - 16456678
Alignment:
Q  6 atagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatat--------tta 97  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| | ||| |||||| |||||||| | | | | ||||| |        |||    
T  16456871 atagagtcataatatgatatgaacatgataaatattaattatattatgtgtatgatgtacacatgataataaatatgatgttattatttaattataatta 16456772  T
Q  98 aatgaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatg 193  Q
    ||| || |||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  16456771 aataaaaaaattactctcataattatttaaatattttaaaaatgacat-cgattaattataataacaaaca-tttgatatcattattttaaaaatg 16456678  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 15269000 - 15268856
Alignment:
Q  17 atatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatgaataaattactatca 116  Q
    ||||||||  |||||| |||| ||||||| ||| || |||||  ||  ||||| |||| ||||| | |||||||||| ||||||| | ||||| |  |||    
T  15269000 atatgataaaaacatgttaaacattaatcctatcatatgtttggtgtgcacatgataacaaacaagatatcattataattaaatggaaaaattgcactca 15268901  T
Q  117 taattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataata 161  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  15268900 taattaattaaatattgtagaaatggcatgtgattaattataata 15268856  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 42180694 - 42180535
Alignment:
Q  6 atagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatgaata 105  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||| ||  |||| |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||| |||||| || |    
T  42180694 atagagatatgatatgataaggacatgataac-attaatcctatcatacgtttgatgcgcacatgataacaaacatgatatcattataattaaataaaaa 42180596  T
Q  106 aattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaata 168  Q
    |||| || || |||||||||||| ||  ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||    
T  42180595 aattgctctcttaattaattaaatat--taaaaatggaatgttattaattataataaaaaata 42180535  T

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Target: chr4 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 306
Target Start/End: Original strand, 45498948 - 45499252
Alignment:
Q  3 tggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatga 102  Q
    ||||| |||| | ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||| |||||   |||||||||| ||||||||    
T  45498948 tggattgagataggatatgataaggacatgataaacattaatcatatcatgtgtttgatgcacacatgataacaaacacaatatcattataattaaatga 45499047  T
Q  103 ataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaata-ttttgatatcgttattttaaaaatgtcaacatt 201  Q
    | || || || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||  |||||  | || |||| |||||||||||||| ||| |||    
T  45499048 aaaatttgctctcataattaattaaatattgtaaaaatggtatgttattaattataatagaaaatacatatgctatcattattttaaaaatgacaatatt 45499147  T
Q  202 ttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattacaaa 301  Q
    || |||||| || || |||| ||||||||||||||| | |||||||||| | |||| |||| |||| ||| || ||||||  |  |||| ||||||||||    
T  45499148 ttcaaaatggcagaatatcaagataataaataaagaatgatcttctaatcccatcatgatagtttctaacccagcctatattcaggatataaattacaaa 45499247  T
Q  302 ggaaa 306  Q
    |||||    
T  45499248 ggaaa 45499252  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 51 - 307
Target Start/End: Original strand, 5787125 - 5787377
Alignment:
Q  51 atgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatgaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaat 150  Q
    |||||||| |||| ||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||   |    
T  5787125 atgtgtttgatgcgcacatgataacaaacaggatatcattataattaaatgaaaaaattgctctcataattaattaaatattgtaaaaatgatatg---t 5787221  T
Q  151 taattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacattttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaat 250  Q
    |||||||||||  |||||   || |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| || || |||| |||||||||||| || | ||||| ||||    
T  5787222 taattataatagaaaata-catgctatcattattttaaaaatgacaatattttaaaaatggcagaatatcaagataataaataaggaatgatcttttaat 5787320  T
Q  251 tctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattacaaaggaaaa 307  Q
     | |||||||||||||| |||||| | ||||| ||  ||| ||||||||||||||||    
T  5787321 cccatcaggataatttctaactcagcatatactcgacatagaaattacaaaggaaaa 5787377  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 306
Target Start/End: Original strand, 37910463 - 37910738
Alignment:
Q  28 acatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatgaataaattactatcataattaattaa 127  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| ||  |||||||||||||    
T  37910463 acatgataaacattaatcatatcatgtgtttgatgcacacatgataacaaacaggatatcattataattaaatgaaaatattgcttccataattaattaa 37910562  T
Q  128 acattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacattttaaaaatgacaaaacatcatgataa 227  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||   || |||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||| || || ||||  ||||    
T  37910563 atattgt-aaaatgacatgttattaattataatagaaaata-catgctatcattattttaaaaatgacaatatttt-aaaatggcagaatatcaaaataa 37910659  T
Q  228 taaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattacaaaggaaa 306  Q
    ||||||| || | |||||||||| | |||||||||||||| ||| || | ||||| | ||||| |||||||||| ||||    
T  37910660 taaataaggaatgatcttctaatcccatcaggataatttctaacccagcttatactcatgatataaattacaaacgaaa 37910738  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 95 - 306
Target Start/End: Original strand, 28115791 - 28116001
Alignment:
Q  95 ttaaatgaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgt 194  Q
    ||||||||| || || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||   | | |||| | |||| |||||||     
T  28115791 ttaaatgaaaaacttgctctcataattaattaaatattgtaaaaatgacatgttattaattataatagaaaatgcat-gctatcataatttaaaaaatga 28115889  T
Q  195 caacattttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaa 294  Q
    ||| |||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| |  |||| |||    
T  28115890 caatattttaaaaatggcaaaatctcaagataataaataaagaatgatcttctaattccatcaggataatttctaacacaacttatactcaggatagaaa 28115989  T
Q  295 ttacaaaggaaa 306  Q
    ||||||||||||    
T  28115990 ttacaaaggaaa 28116001  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 154 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17702365 - 17702214
Alignment:
Q  154 ttataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacattttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattct 253  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  17702365 ttataataacaaatacat-gatatcattattttaaaaatgacaacattttaaaaatggaagaatatcatgataataaataagaaattatcttctaattct 17702267  T
Q  254 atcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattacaaaggaaa 306  Q
    ||||||||| |||| |||||||  ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  17702266 atcaggatagtttctaactcaatttatactcaggataaaaattacaaaggaaa 17702214  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 34940679 - 34940377
Alignment:
Q  3 tggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatga 102  Q
    |||||||||| | ||| ||||| |  ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||| || | ||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  34940679 tggatagagataagatttgataagggcatgataaacattaatcatatcatgtgtttgatgcgcacatgatgacaaacagaatatcaatataattaaatga 34940580  T
Q  103 ataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacattt 202  Q
    | |||||  | |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||   || |||| ||||||||||||||  || ||||    
T  34940579 aaaaattgttctcatcattaattaaatattgtaaaaatgacatgttattaattataacagaaaata-catgttatcattattttaaaaatgataatattt 34940481  T
Q  203 taaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattacaaag 302  Q
    | |||| |  | || |||| ||||||||||||  ||| || ||||||| | |||||||||||||  || ||| | ||||| |  |||| |||||||||||    
T  34940480 ttaaaaaggaagaatatcaagataataaataagaattgattttctaatcccatcaggataatttataaatcagcatatactcaggatagaaattacaaag 34940381  T
Q  303 gaaa 306  Q
    ||||    
T  34940380 gaaa 34940377  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 3768089 - 3767822
Alignment:
Q  37 atattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatgaataaattactatcataattaattaaacattgtaa 136  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||  ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  3768089 atattaatcctatcatgtgtttgatgcgcacatgataaaaaa-aggatatcattattattaaatgaaaaaattgctctcataattaattaaatattgtaa 3767991  T
Q  137 aaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacattttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaag 236  Q
    |||||  |||| ||| |||||||||  |||||   || |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||||||| |    
T  3767990 aaatggtatgttattgattataatagaaaata-catgctatcattattttaaaaacgacaatattttaaaaataacagaatatcaagataataaataagg 3767892  T
Q  237 atttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattacaaaggaaa 306  Q
    | | || |||||||   ||| |||||||||  |||||| | |||||   ||||| |||| ||||||||||    
T  3767891 aatgatattctaatctcatctggataatttataactcagcttatacttatgatataaatgacaaaggaaa 3767822  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 34514233 - 34513934
Alignment:
Q  1 gctggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaat 100  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| | | |||||||| ||||||| | | || ||||| |||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||| ||||||    
T  34514233 gctgaatagagataagatatgataaggagatgataaacattaatcatgtcatatgtttgatgcgcacatgataacaaataggatatcattataattaaat 34514134  T
Q  101 gaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacat 200  Q
    ||| |||||  | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||   || |||| ||||||| |||||| ||| ||    
T  34514133 gaaaaaattgatctcata-ttaattaaatattgtaaaaatggcatgttattaattataatggaaaata-catgctatcattatttt-aaaatgacaatat 34514037  T
Q  201 tttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattacaa 300  Q
    |||||||||| || || |||| ||||||||||||  | | ||||||||||    || |||||||||| |||||| | ||||| |  |||| |||||||||    
T  34514036 tttaaaaatggcagaatatcaagataataaataagaaatgatcttctaatctcgtccggataatttctaactcatcttatactcaagatagaaattacaa 34513937  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 161
Target Start/End: Original strand, 36198590 - 36198747
Alignment:
Q  3 tggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatga 102  Q
    |||||||||| |  |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||  ||||| |||| ||| | | |||||||||| ||||||||    
T  36198590 tggatagagatagaatatgataagtacatgataaacattaatcttatcatgtgtttgatgtgcacatgataacaaatatgatatcattataattaaatga 36198689  T
Q  103 ataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataata 161  Q
    | ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  36198690 a-aaattgctctcataattaattaaatattgtaaaaatgctatgttattaattataata 36198747  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 44289399 - 44289558
Alignment:
Q  1 gctggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaat 100  Q
    |||||||||||| |   ||||||| | |||||||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||| |||||     
T  44289399 gctggatagagataaagtatgataaggacatgataaacattaatcttctcatgtgtttgatgcgcacatgataacaaacatgatatcattataattaaaa 44289498  T
Q  101 gaataaatta--ctatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattata 158  Q
    ||| |||  |  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44289499 gaaaaaaaaatgctctcataattaattaaatattgtaaaaatgacatgttattaattata 44289558  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 306
Target Start/End: Original strand, 34513698 - 34513829
Alignment:
Q  175 tatcgttattttaaaaatgtcaacattttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactca 274  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| || || |||| ||||||||||||  | | || ||||||| | |||||||||||||| ||| ||    
T  34513698 tatcattattttaaaaatgacaatattttaaaaatggcagaatatcaagataataaataagaaatgattttctaatcccatcaggataatttctaaccca 34513797  T
Q  275 acctatacccgtgatacaaattacaaaggaaa 306  Q
     | ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  34513798 gcttatactcaggatagaaattacaaaggaaa 34513829  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 306
Target Start/End: Original strand, 44290112 - 44290243
Alignment:
Q  175 tatcgttattttaaaaatgtcaacattttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactca 274  Q
    |||| ||||||||||||||  || |||||||||||| || || |||| ||||||||||||  | | ||||||||||   || ||||||| ||| ||||||    
T  44290112 tatcattattttaaaaatgataatattttaaaaatggcagaatatcaagataataaataattaatgatcttctaatctcattaggataacttctaactca 44290211  T
Q  275 acctatacccgtgatacaaattacaaaggaaa 306  Q
     ||||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  44290212 gcctatactcaggatataaattacaaaggaaa 44290243  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11138817 - 11138760
Alignment:
Q  174 atatcgttattttaaaaatgtcaacattttaaaaatgacaaaacatcatgataataaa 231  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  11138817 atatcattattttaaaaatgacaacattttaaaaatgaaagaatatcatgataataaa 11138760  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3320005 - 3319945
Alignment:
Q  96 taaatgaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaatta 156  Q
    ||||||| ||||||||  || |||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||    
T  3320005 taaatgagtaaattacactcgtaattaattaaatatttaaaaaaagacatgtaattaatta 3319945  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 128
Target Start/End: Original strand, 34512182 - 34512226
Alignment:
Q  84 tatcattatatttaaatgaataaattactatcataattaattaaa 128  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  34512182 tatcattataattaaatgaaaaaattgctgtcataattaattaaa 34512226  T

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Target: chr5 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29861255 - 29860954
Alignment:
Q  3 tggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatga 102  Q
    |||||||||| | |||||||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||  ||||| |||| ||||| | |||||||||| ||||||||    
T  29861255 tggatagagataagatatgataatgacatgataaacattaatcttatcatgtgtttgatgtgcacatgataacaaacacgatatcattataattaaatga 29861156  T
Q  103 ataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacattt 202  Q
    | ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||  |||||   || |||   ||||||||||||| ||| | ||    
T  29861155 aaaaattgctttcataattaattaaatattgtaaaaatggtatgttattaattataatagaaaata-catgctataactattttaaaaatgacaata-tt 29861058  T
Q  203 taaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattacaaag 302  Q
    |||||||| || || |||| |||||||||||| || | |||||||||| | |||||||||||||| |||| | ||||||| |  |||| |||||||||||    
T  29861057 taaaaatggcagaatatcaagataataaataaggaatgatcttctaatcccatcaggataatttctaacttagcctatactcaggatataaattacaaag 29860958  T
Q  303 gaaa 306  Q
    ||||    
T  29860957 gaaa 29860954  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 33007769 - 33008071
Alignment:
Q  1 gctggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaat 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||   ||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| | |||||||||| ||||||    
T  33007769 gctggatagagataagatatgataatgacatgataagtattaatcatatcatgtgtttgatgcacacatgataacaaacaagatatcattataattaaat 33007868  T
Q  101 gaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacat 200  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||  | | |   |  |||| |||||||||||||| ||| ||    
T  33007869 gaaaaaattgctctcatatttaattaaatattataaaaatggcacgttattaattataatagaataca---tcctatcattattttaaaaatgacaatat 33007965  T
Q  201 tttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattacaa 300  Q
    ||||| ||||||| || |||| |||||||||||| || | |||||||||| | |||||||||||||| ||| || | ||||| |  |||| |||||||||    
T  33007966 tttaataatgacagaatatcaagataataaataaggaatgatcttctaatcccatcaggataatttctaacccagcttatactcaggataaaaattacaa 33008065  T
Q  301 aggaaa 306  Q
    ||||||    
T  33008066 aggaaa 33008071  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 33134473 - 33134173
Alignment:
Q  3 tggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatga 102  Q
    |||||||||| | |||||||||   |||||||||  ||||||| ||| |||||||| |||| ||||| ||||   ||| | |||||||||| ||||||||    
T  33134473 tggatagagataagatatgataaagacatgataac-attaatcctatcatgtgtttgatgcgcacatgataacgcacatgatatcattataattaaatga 33134375  T
Q  103 ataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacattt 202  Q
    | ||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||||||||||||  |||||   || |||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  33134374 aaaaattgctctcataattaattaaatattataaaaattgcatgttattaattataatagaaaata-catgctatcattattttaaaaatgacaatattt 33134276  T
Q  203 taaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattacaaag 302  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||| || | |||||||||||| || ||||||||||| |||  | ||||||| | ||||| |||||||||||    
T  33134275 taaaaatgacagaatatcaagataataaataaggaatgatcttctaattccat-aggataatttctaacctagcctatactcatgatagaaattacaaag 33134177  T
Q  303 gaaa 306  Q
    ||||    
T  33134176 gaaa 33134173  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 306
Target Start/End: Original strand, 15921984 - 15922260
Alignment:
Q  28 acatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatgaataaattactatcataattaattaa 127  Q
    |||||||||| |||| || ||| |||| ||| | || ||||| |||| ||||| | |||||||||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  15921984 acatgataaacattattcctatcatgtatttgaagcgcacatgataacaaacaagatatcattataattaaataaa-aaattgctctcataattaattaa 15922082  T
Q  128 acattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacattttaaaaatgacaaaacatcatgataa 227  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  | | |||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| | || || |||| |||||    
T  15922083 atattgtaaaaatgacatattattaattataatagaaaatacat-gctatcattattttaaaaatgacaatatttaaaaaaaggcagaatatcaagataa 15922181  T
Q  228 taaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattacaaaggaaa 306  Q
    | ||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| |||| |   ||| |||||||||||||||    
T  15922182 ttaataaggattgatcttctaatcccatcaggataatttctaacccaaccgatactcaaaatagaaattacaaaggaaa 15922260  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 21091050 - 21091243
Alignment:
Q  16 gatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatgaataaattactatc 115  Q
    ||||||||| | ||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| || ||    
T  21091050 gatatgataaggacatgataaaccttaatcctatcatgtgtttgatgcgcacatgataacaaacaagatatcattataattaaatgaaaaaattgctctc 21091149  T
Q  116 ataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacattttaaaaatg 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||   || |||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  21091150 ataattaattaaatattgtaaaagtgacatgttattaattataatagaaaata-catgctatcattattttaaaaatgacaatatttcaaaaatg 21091243  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 25346826 - 25347089
Alignment:
Q  3 tggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatga 102  Q
    |||||||||  | |||||||||   |||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||| |||| ||| ||| ||||||| || ||||||||    
T  25346826 tggatagagttaggatatgataaagacatgataaacattaatcctatcatgtgtttgatgcgcacatgataacaaataggatatcattgtaattaaatga 25346925  T
Q  103 ataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacattt 202  Q
    | ||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||   |||||   || |||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  25346926 aaaaattgctctcataattatttaaatattgtaaaaatggcatgttattaattacaatggaaaata-catgctatcattattttaaaaatgacaatattt 25347024  T
Q  203 taaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttc 267  Q
    |||||||| || || |||| |||| |||||||| | | || ||||||| |  |||||||||||||    
T  25347025 taaaaatggcataatatcaagatagtaaataaaaaatgatgttctaatcccgtcaggataatttc 25347089  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 193
Target Start/End: Original strand, 5868146 - 5868251
Alignment:
Q  87 cattatatttaaatgaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttatttt 186  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||   ||||||| |||||||    
T  5868146 cattataattaaatgaaaaaattactctcataattaatgaaatattgtaaaaatggcatataattaattataatagaaaata-catgatatcattatttt 5868244  T
Q  187 aaaaatg 193  Q
    |||||||    
T  5868245 aaaaatg 5868251  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 31078231 - 31078118
Alignment:
Q  28 acatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatgaataaattactatcataattaattaa 127  Q
    |||||||||| ||||||  ||| |||||||| |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  31078231 acatgataaacattaattctatcatgtgtttgatgcgcacatgataacaaacatgatatcattataattaaatgaaaaaattgttctcataattaattaa 31078132  T
Q  128 acattgtaaaaatg 141  Q
    | ||||||||||||    
T  31078131 atattgtaaaaatg 31078118  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Original strand, 7883569 - 7883723
Alignment:
Q  7 tagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatgaataa 106  Q
    |||||| | ||||||||| | ||||| |||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||| | ||||| |||| |||||||||| ||  || || ||    
T  7883569 tagagataggatatgataaggacatgttaaacattaatcatatcatgtgtttgatgcgcacatgaaaataagcaggatatcattataattttattaaaaa 7883668  T
Q  107 attactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataata 161  Q
    ||| || |||||||| |||||| ||||||||| || |||   |||||||||||||    
T  7883669 attgctctcataattgattaaatattgtaaaattggcatcctattaattataata 7883723  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31078101 - 31077934
Alignment:
Q  134 taaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacattttaaaaatgacaaaacatcatgataataaata 233  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||  |||||  | | ||||||||||||||| |||  || ||||||| ||||| |||| |||||   ||||||||    
T  31078101 taaaaatgatatgttattaattataatagaaaatacat-gctatcgttattttaaatatgaaaatattttaagaatgataaaatatcat---aataaata 31078006  T
Q  234 aagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattacaaaggaaa 306  Q
    | || | |||||||||| | |||||||||||||| |||||| | ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  31078005 aggaatgatcttctaatcc-atcaggataatttctaactcagcttatactcaggatataaattacaaaggaaa 31077934  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2499192 - 2499109
Alignment:
Q  107 attactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatg 193  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  2499192 attactctcataattaattaaatattg-aaaaatggcatgtaattaatta-aataacaaata-catgatatcattattttaaaaatg 2499109  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12658040 - 12657998
Alignment:
Q  117 taattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataa 159  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12658040 taattaattaaacattttaaaaacgacatgtaattaattataa 12657998  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 39351659 - 39351493
Alignment:
Q  1 gctggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatc--------attat 92  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||   ||||||| ||| |||||||| |||| ||||| |||| ||| | | ||||        |||||    
T  39351659 gctggatagagacataatataatatggacatgatatgcattaatcatatcatgtgtttgatgcgcacatgataacaaatatgatatcattattttattat 39351560  T
Q  93 atttaaatgaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataa 159  Q
    | ||||||||  |||||| | |  |||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  39351559 aattaaatgagaaaattattcttgtaattaattaaatattttaaaaatggcacgtaattaattataa 39351493  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 8096141 - 8096077
Alignment:
Q  95 ttaaatgaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataa 159  Q
    ||||||||  |||||||| || | |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  8096141 ttaaatgagaaaattactctcgttattaattaaatattttaaaaacgacatgtaattaattataa 8096077  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 210
Target Start/End: Original strand, 42683818 - 42683913
Alignment:
Q  114 tcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacattttaaaaatg 210  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| | || |||  ||||||| ||| || ||| ||||||||||||    
T  42683818 tcataattaattaaatattataaaaatggcatgttattaattataatagaaaata-tatgttattattattttgaaattgacaatattttaaaaatg 42683913  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 306
Target Start/End: Original strand, 7883743 - 7883850
Alignment:
Q  199 attttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattac 298  Q
    |||||||||||| || || || | |||||||||||| || | |||||||||| | |||||||||||||| ||  || ||||||| |   ||| |||||||    
T  7883743 attttaaaaatggcagaatataaagataataaataaggaatgatcttctaatcccatcaggataatttctaatccagcctatactcagaatagaaattac 7883842  T
Q  299 aaaggaaa 306  Q
    ||||||||    
T  7883843 aaaggaaa 7883850  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 36
Target Start/End: Original strand, 5868110 - 5868144
Alignment:
Q  2 ctggatagagacatgatatgatatgaacatgataa 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5868110 ctggatagagacatgatatgatatggacatgataa 5868144  T

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Target: chr1 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 306
Target Start/End: Original strand, 28622738 - 28622988
Alignment:
Q  55 gttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatgaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaat 154  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  28622738 gtttgatgcacacatgataacaaacaggatatcattataattaaatgaaaaaattgctctcataattaattaaatattgtaaaaatggcatgttattaat 28622837  T
Q  155 tataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacattttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattcta 254  Q
    |||||||  |||||   || |||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||  || || |||| |||||||||||| || | ||||||||||   |    
T  28622838 tataatagaaaata-catgctatcattatttaaaaaatgacaatattttaaaaatcgcagaatatcaagataataaataaggaatgatcttctaatctca 28622936  T
Q  255 tcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattacaaaggaaa 306  Q
    ||||||||||||| ||| || | ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  28622937 tcaggataatttctaacacagcttatactcaggataaaaattacaaaggaaa 28622988  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 37346130 - 37346290
Alignment:
Q  1 gctggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaat 100  Q
    |||||||||||| | ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||| ||||||    
T  37346130 gctggatagagataggatatgataaggacatgataaacattaatcctatcatgtgtttgatgcgcacatgataacaaacatgatatcattataattaaat 37346229  T
Q  101 gaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataata 161  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  37346230 gaaaaaattgctctcataattaattaaatattataaaaatgacatgttattaattataata 37346290  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 193
Target Start/End: Original strand, 10306582 - 10306770
Alignment:
Q  3 tggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatca-taataaacagggtatcattatatttaaatg 101  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| | |||||| |||  ||||| | ||| |||||   |||||||| | |||||||    
T  10306582 tggataaagacaagatatgatatgtacatgataaacattaatcatatcacgtgtttgatgtgcacatgaataacaaacattatatcattaaaattaaatg 10306681  T
Q  102 aataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatg 193  Q
    || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    |||||| ||||||||||||||    
T  10306682 aa-aaattactctcataattaattaaatattgtaaaaatgacatctaattaactataatcacaaata--ccgatatcattattttaaaaatg 10306770  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 17703044 - 17702919
Alignment:
Q  3 tggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatga 102  Q
    |||||||||| | |||||||||   |||||||||  ||||||| ||| |||| ||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17703044 tggatagagataagatatgataaagacatgataagcattaatcctatcatgtttttgatgcacacatgataacaaacaggatatcattataattaaatga 17702945  T
Q  103 ataaattactatcataattaattaaa 128  Q
    | ||||| || |||||||||||||||    
T  17702944 aaaaatttctctcataattaattaaa 17702919  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 49549730 - 49549600
Alignment:
Q  175 tatcgttattttaaaaatgtcaacattttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactca 274  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| || || |||| |||||||||||| || | |||||| ||| | || ||||||| ||  ||| ||    
T  49549730 tatcattattttaaaaatgacaatattttaaaaatggcagaatatcaagataataaataaggaatgatcttcaaatcccattaggataacttttaaccca 49549631  T
Q  275 acctatacccgtgatacaaattacaaaggaaa 306  Q
    | |||||| | | ||| |||||||||||||||    
T  49549630 atctatactcat-atataaattacaaaggaaa 49549600  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 307
Target Start/End: Original strand, 37346980 - 37347088
Alignment:
Q  199 attttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattac 298  Q
    ||||| |||||| || || |||| |||||||||||| || | |||||||||| | |||| ||||||||| ||| || | ||||| |  |||| |||||||    
T  37346980 atttttaaaatggcagaatatcaggataataaataaggaatgatcttctaatcccatcatgataatttctaacccatcgtatactcaggatagaaattac 37347079  T
Q  299 aaaggaaaa 307  Q
    |||||||||    
T  37347080 aaaggaaaa 37347088  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 4714483 - 4714392
Alignment:
Q  1 gctggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattat 92  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||  ||| || |||||||||    
T  4714483 gctggataaagacatggtatgatatggataagataaacattaatcttatcatgtctttgacgcacacatgataactaaccggatatcattat 4714392  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 234
Target Start/End: Original strand, 10306759 - 10306794
Alignment:
Q  199 attttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataa 234  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10306759 attttaaaaatgacaaaatatcatgataataaataa 10306794  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 52267963 - 52267876
Alignment:
Q  117 taattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacattttaaaa 207  Q
    |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||  ||||||||||||   | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  52267963 taattaattaaatattttaaaaacggcatgtaattaat--taataacaaata-cataatatcattattttaaaaatgacaacagtttaaaa 52267876  T

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Target: chr7 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 13)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 34703401 - 34703121
Alignment:
Q  28 acatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatgaataaattactatcataattaattaa 127  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||| ||||| || ||||| |||| ||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  34703401 acatgataaacattaatcctatcatgtattttacgcgcacatgataacaaacatgatatcattataattaaatgaaaaaattgctctcataattaatgaa 34703302  T
Q  128 acattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaata-ttttgatatcgttattttaaaaatgtcaacattttaaaaatgacaaaacatc-atgat 225  Q
    | ||||||||||||  |||  |||||||||||||  |||||  | || |||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||   | || ||| | |||    
T  34703301 atattgtaaaaatggtatgctattaattataatagaaaatacatatgctatcattattttaaaaatgacaatattttcaaaatagtagaatatcaaagat 34703202  T
Q  226 aataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctatacccgtgatacaaattacaaaggaaa 306  Q
    ||||||||| || | |||||||||| | ||||||||| |||| ||| |||||||| | | ||||| |||||||||||||||    
T  34703201 aataaataaggaatgatcttctaatcccatcaggatagtttctaacccaacctatcctcatgatataaattacaaaggaaa 34703121  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 34866242 - 34866448
Alignment:
Q  28 acatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatgaataaattactatcataattaattaa 127  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||| ||||| |  ||||||||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  34866242 acatgataaacattaatcttatcatgtgtttgatgcgcacatgataacaaacaagacatcattataattaaattaaaaaattgctctcataattaattaa 34866341  T
Q  128 acattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacattttaaaaatgacaaaacatcatgataa 227  Q
    | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||   ||  ||| |||||||||||||  ||| ||| |||||||| || || ||||  ||||    
T  34866342 atattataaaaatggcatgttattaattataatagaaaata-catgcaatcattattttaaaaataacaatattataaaaatggcagaatatcaatataa 34866440  T
Q  228 taaataaa 235  Q
    ||||||||    
T  34866441 taaataaa 34866448  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 281
Target Start/End: Original strand, 18502843 - 18503127
Alignment:
Q  3 tggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaa---- 98  Q
    |||||||||| | ||||| ||| | |||||||||| ||||||  ||| |||||||| | ||  |||| |||| ||||||| |||||||||| ||||        
T  18502843 tggatagagataggatataataaggacatgataaacattaatactatcatgtgtttgaagcgtacatgataacaaacaggatatcattataattaattaa 18502942  T
Q  99 atgaataaattactatcataattaattaaaca---ttgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtc 195  Q
    ||||| ||| |  | ||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||  | | |||| |||||||||||||| |    
T  18502943 atgaaaaaaattatctcataattaattaaaaaatattgtaaaaatggcatgttattaattataatagaaaatacat-gctatcattattttaaaaatgac 18503041  T
Q  196 aacattttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctata 281  Q
    || |||| ||||||| || || |||| |||||| |||||||| | |||||||||| | ||||| |||||||| ||| || ||||||    
T  18503042 aatatttcaaaaatggcagaatatcaagataattaataaagaatgatcttctaatcccatcagcataatttctaacacagcctata 18503127  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 168
Target Start/End: Original strand, 3480603 - 3480683
Alignment:
Q  88 attatatttaaatgaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaata 168  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3480603 attataattaaatgaaaaaagtactctcataattgattaaatattttaaaaatgacatgtaattaattataataacaaata 3480683  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Original strand, 15672847 - 15673010
Alignment:
Q  114 tcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataataacaaatattttgatatcgttattttaaaaatgtcaacattttaaaaatgaca 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||   || |||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||  |    
T  15672847 tcataattaattaaatattgtaaaaatgatatgttattaattataatagaaaata-catgctatcattattttaaaaataacaatattttcaaaatgtta 15672945  T
Q  214 aaacatcatgataataaataaagatttatcttctaattctatcaggataatttccaactcaacctata 281  Q
     || |||| |||||||||||| || | |||||||||   | ||||||||||||| ||| || ||||||    
T  15672946 gaatatcaagataataaataaggaatgatcttctaa---tctcaggataatttctaacccagcctata 15673010  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 144
Target Start/End: Original strand, 17508541 - 17508682
Alignment:
Q  3 tggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatga 102  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |||| ||| ||||  |||| |||| |||||   |||||||||| ||| ||||    
T  17508541 tggatagagacagaatatgacatggacatgataagtattaatcatatcatgtatttgatgcgtacatgataacaaacataatatcattataattatatga 17508640  T
Q  103 ataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgaca 144  Q
      | |||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17508641 caatattaatttcataattaattaaatattataaaaatgaca 17508682  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17544673 - 17544532
Alignment:
Q  3 tggatagagacatgatatgatatgaacatgataaatattaatcttataatgtgttttatgcacacatcataataaacagggtatcattatatttaaatga 102  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |||| ||| ||||  |||| |||| |||||   |||||||||| ||| ||||    
T  17544673 tggatagagacagaatatgacatggacatgataagtattaatcatatcatgtatttgatgcgtacatgataacaaacataatatcattataattatatga 17544574  T
Q  103 ataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgaca 144  Q
      | |||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17544573 caatattaatttcataattaattaaatattataaaaatgaca 17544532  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 247
Target Start/End: Original strand, 17508667 - 17508733
Alignment:
Q  181 tattttaaaaatgtcaacattttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttct 247  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  17508667 tattataaaaatgacaacattttaaaaatggcagaacatcatgataataaataaggaatgatcttct 17508733  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17544547 - 17544481
Alignment:
Q  181 tattttaaaaatgtcaacattttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataaagatttatcttct 247  Q
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T  17544547 tattataaaaatgacaacattttaaaaatggcagaacatcatgataataaataaggaatgatcttct 17544481  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 6110401 - 6110329
Alignment:
Q  88 attatatttaaatgaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaattataata 161  Q
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T  6110401 attataattaaatgag-aaattgctctcataattaattaaatattgtaaaaataatatgttattaattataata 6110329  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 156
Target Start/End: Original strand, 15841589 - 15841650
Alignment:
Q  95 ttaaatgaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaatta 156  Q
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T  15841589 ttaaatgagaaaattactctcgtaattaattaaatattttataaatgacatgtaattaatta 15841650  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15524666 - 15524604
Alignment:
Q  94 tttaaatgaataaattactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaatta 156  Q
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T  15524666 tttaaatgagaaaattactctcgtaatttattaaatattttacaaatgacatgtaattaatta 15524604  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15512667 - 15512618
Alignment:
Q  107 attactatcataattaattaaacattgtaaaaatgacatgtaattaatta 156  Q
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T  15512667 attactctcgtaattaattaaatattttataaatgacatgtaattaatta 15512618  T

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Target: scaffold0957 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0957
Description:

Target: scaffold0957; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1870 - 1816
Alignment:
Q  180 ttattttaaaaatgtcaacattttaaaaatgacaaaacatcatgataataaataa 234  Q
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T  1870 ttattttaaaaatgacaaaattttaaaaatgatagaatatcatgaaaataaataa 1816  T

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