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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF1627_low_6 (Length: 676)
Name: NF1627_low_6
Description: NF1627
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF1627_low_6 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 410; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 22831517 - 22830921
Alignment:
| Q |
19 |
cttgttacattggtggcaagtaaagataaaaatttcatctataatggtttccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaaccccagatg |
118 |
Q |
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22831517 |
cttgttacatttgtagcaagtgaagacagcagtttcatctataatggtttccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaacttcagatg |
22831418 |
T |
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| Q |
119 |
gcttactaagactcaccaatgatatcgagccagatacagcagcatatgctttctatccaaatcctatagtttttaaaaacacttcgaatgaaagtgtgtc |
218 |
Q |
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| T |
22831417 |
gcttactaagactcaccaatgataccgggccagatacagca---tatgctttctatccaaatcatatagtttttaaaaacacttcgaatgcaagtgtgtc |
22831321 |
T |
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| Q |
219 |
atctttctcaactacttttgtatttgccataatacctcaatatccaactcttggtggccatggaattgtttttgttatttctccaacaaaagggctacca |
318 |
Q |
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| T |
22831320 |
atctttctcaactacttttgtatttaccataaaatccatgtatccatctattagtggccatggaattgtttttgttctttctcctacaaaagggctacca |
22831221 |
T |
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| Q |
319 |
gattcactaccaggtcaataccttggtctctttaacaattccaacaatggaaacagtagcaaccatgtttttgctgttgagtttgacactgttcaagatt |
418 |
Q |
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| T |
22831220 |
aattcactaccaaatcaatactttggtctctttaactactccaacattggaaacagtagcaaccatgtttttggtgttgagcttgacactcgtaaaaatt |
22831121 |
T |
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| Q |
419 |
ttgagtttgatgatatcaatgataaccatgttggtattgatatcaatgatttgaaatcagctaattcaactcatgcaggatattatgatgatactggtcg |
518 |
Q |
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| T |
22831120 |
ttgagtttgatgatatcaatgataatcatgttggaattgatatcaatgatttgaaatcagctaattcaactcctgcaggatattatgatgatactggtcg |
22831021 |
T |
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| Q |
519 |
attcaggaatttatcccttaccagtggacatcctatacaggtatggattgaatatgatggagtgaagaaaaagattgatgttactttagctccaattagt |
618 |
Q |
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| T |
22831020 |
attcaggaatttatcccttaccagtggacatcctatgcaggtatggattgaatatgatggagtgaagaaaaagattgatgttaccttagctccagttagt |
22830921 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 22889776 - 22889186
Alignment:
| Q |
21 |
tgttacattggtggcaagtaaagataaaaatttcatctataatggtttccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaaccccagatggc |
120 |
Q |
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| T |
22889776 |
tgttacattggttgcaagtgaagacaacagtttcatatataatggattccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaactacaaatggc |
22889677 |
T |
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| Q |
121 |
ttactaagactcaccaatgatatcgagccagatacagcagcatatgctttctatccaaatcctatagtttttaaaaacacttcgaatgaaagtgtgtcat |
220 |
Q |
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| T |
22889676 |
ttactaaaactcaccaatgatacagaa--agagacaa-aggacatggtttctatccaaatccaatagttttcaaaaacacttccagtgaaagcgtgtctt |
22889580 |
T |
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| Q |
221 |
ctttctcaactacttttgtatttgccataatacctcaatatccaactcttggtggccatggaattgtttttgttatttctccaacaaaagggctaccaga |
320 |
Q |
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| T |
22889579 |
ctttctcaactacttttttatttgccataatacctcaatatgcaaatattggtggccatggaattgtttttgttatttctccaacaaaagggctaccaga |
22889480 |
T |
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| Q |
321 |
ttcactaccaggtcaataccttggtctctttaacaattccaacaatggaaacagtagcaaccatgtttttgctgttgagtttgacactgttcaagatttt |
420 |
Q |
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| T |
22889479 |
ttcactaccaagtcaataccttggtctctttaacgattccaacagtggaaacagtagcaaccatgtttttggtgttgagcttgacactcgtcaaaatttt |
22889380 |
T |
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| Q |
421 |
gagtttgatgatatcaatgataaccatgttggtattgatatcaatgatttgaaatcagctaattcaactcatgcaggatattatgatgatactggtcgat |
520 |
Q |
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| T |
22889379 |
gagtttgatgatatcaacgataaccatgttggaattgatatcaatgatttgaaatcagctgattcaactcctgcaggatattatgatggttatggtcaat |
22889280 |
T |
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| Q |
521 |
tcaggaatttatcccttaccagtggacatcctatacaggtatggattgaatatgatggagtgaagaaaaagattgatgttactttagctccaat |
614 |
Q |
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| T |
22889279 |
tcaaggatttatccctttccagtggataccctatgcaggtatggattgaatatgatggagtgaagaaaaagattgatgttactttagcaccaat |
22889186 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 22815510 - 22814921
Alignment:
| Q |
22 |
gttacattggtggcaagtaaagataaaaatttcatctataatggtttccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaaccccagatggct |
121 |
Q |
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| T |
22815510 |
gttacattggtagcaagtgtagacaacagtttcatatataatggattccaatcatcacatttaaatcttgatggtattgctgagttaacctcaaatggct |
22815411 |
T |
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| Q |
122 |
tactaagactcaccaatgatatcgagccagatacagc---agcatatgctttctatccaaatcctatagtttttaaaaacacttcgaatgaaagtgtgtc |
218 |
Q |
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| T |
22815410 |
tactaaaactcaccaatgata------cagaaagagccaaaggatatgctttctatccaaatcctatagttttcaaaaacacttccaatgaaagtgtgtc |
22815317 |
T |
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| Q |
219 |
atctttctcaactacttttgtatttgccataatacctcaatatccaactcttggtggccatggaattgtttttgttatttctccaacaaaagggctacca |
318 |
Q |
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| T |
22815316 |
ttctttctcaactacttttgtgtttgcaataagacctcaatatccaccttttagtggccaaggaattgtttttgttctttctcctacaaaagggctacca |
22815217 |
T |
|
| Q |
319 |
gattcactaccaggtcaataccttggtctctttaacaattccaacaatggaaacagtagcaaccatgtttttgctgttgagtttgacactgttcaagatt |
418 |
Q |
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| T |
22815216 |
aattcactaccaagtcaataccttggtctctttaacgattccaacaatggaaacagtaacaaccatgtttttggtgttgagcttgacactcgtcaagatt |
22815117 |
T |
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| Q |
419 |
ttgagtttgatgatatcaatgataaccatgttggtattgatatcaatgatttgaaatcagctaattcaactcatgcaggatattatgatgatactggtcg |
518 |
Q |
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| T |
22815116 |
tgcagtttgatgatatcaatgataaccatgttggtatcgatatcaattatttgaaatcagctaattcaactcctgcaggatattataatgatcatggtca |
22815017 |
T |
|
| Q |
519 |
attcaggaatttatcccttaccagtggacatcctatacaggtatggattgaatatgatggagtgaagaaaaagattgatgttactttagctccaat |
614 |
Q |
| |
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| T |
22815016 |
attcagggagttatccctttccaatggatttcctatacaggtatggattgactatgatggagtgaagaaaaagattgatgttactttagctccaat |
22814921 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 22898747 - 22898155
Alignment:
| Q |
21 |
tgttacattggtggcaagtaaagataaaaatttcatctataatggtttccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaaccccagatggc |
120 |
Q |
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| T |
22898747 |
tgttacattggtagcaagtaaagataacagtttcatctataatggtttccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctaatttaacctccaatggc |
22898648 |
T |
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| Q |
121 |
ttactaagactcaccaatgatatcgagccagatacagcagcatatgctttctatccaaatcctatagtttttaaaaacacttcgaatgaaagtgtgtcat |
220 |
Q |
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| T |
22898647 |
ttacttagactcaccaatgataccaagcaagaaaaagcac---atgctttctatccaaatcctatagttttcaagaacacttctaatggaagtgtttctt |
22898551 |
T |
|
| Q |
221 |
ctttctcaactacttttgtatttgccataatacctcaatatccaactcttggtggccatggaattgtttttgttatttctccaacaaaagggctaccaga |
320 |
Q |
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| T |
22898550 |
ctttctcaactacttttgtgtttgccataagacctcaatatccaactcttagtggccatggaattgtttttgttgtctctcctacaaaagggctaccaaa |
22898451 |
T |
|
| Q |
321 |
ttcactaccaggtcaataccttggtctctttaacaattccaacaatggaaacagtagcaaccatgtttttgctgttgagtttgacactgttcaagatttt |
420 |
Q |
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| T |
22898450 |
ttcactacaaagtcaataccttggtctctttaacaaatccaacaatggaaatagtagcaaccatgtttttggtgttgaacttgatactattattagtagt |
22898351 |
T |
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| Q |
421 |
gagtttgatgatatcaatgataaccatgttggtattgatatcaatgatttgaaatcagctaattcaactcatgcaggatattatgatgatactggtcgat |
520 |
Q |
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| T |
22898350 |
gagtttaatgatatcaatgataaccatgttggtattgatatcaatgatttgaaatcagctaaatcaactcctgcaggatattatgatgttaatggtcaac |
22898251 |
T |
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| Q |
521 |
tcaggaatttatcccttaccagtggacatcctatacaggtatggattgaatatgatggagtgaagaaaaagattgatgttactttagctccaatta |
616 |
Q |
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| T |
22898250 |
tcaagaatttgacccttttcagtggcaatcctatgcaggtatggattgaatatgatggtgaaaagaaaaagattgatgttactttagctccaatta |
22898155 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 19 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 22876402 - 22875810
Alignment:
| Q |
19 |
cttgttacattggtggcaagtaaagataaaaatttcatctataatggtttccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaaccccagatg |
118 |
Q |
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| T |
22876402 |
cttgttacattggtagcaagtgaagaaaacagtttcatctataatggattccaatcatcaaatttatatcttgatggtattgctgagttaacctcaaatg |
22876303 |
T |
|
| Q |
119 |
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218 |
Q |
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| T |
22876302 |
gcttactaaaactcaccaatgatacaga---atatgaaaaaggacatggtttctatccaaatcctatagttttcaaaaacacttccaatggaagtgtgtc |
22876206 |
T |
|
| Q |
219 |
atctttctcaactacttttgtatttgccataatacctcaatatccaactcttggtggccatggaattgtttttgttatttctccaacaaaagggctacca |
318 |
Q |
| |
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| T |
22876205 |
ttctttctcaactacttttgtatttgccataagacctcaatatccaactattagtggtgatggaattgtttttgttgtttctcctacaaaagggctacca |
22876106 |
T |
|
| Q |
319 |
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418 |
Q |
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| T |
22876105 |
aactcactaccacgtcaataccttggtctctttaacaattcaaacaatggaaacagtagcaaccatgtttttggtgttgaacttgattctgttttgacta |
22876006 |
T |
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| Q |
419 |
ttgagtttgatgatatcaatgataaccatgttggtattgatatcaatgatttgaaatcagctaattcaactcatgcaggatattatgatgatactggtcg |
518 |
Q |
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| T |
22876005 |
atgagtttaatgatatcgatgataaccatgttggaattgatatcaatgatttgaaatcagctatttcaacttctacaggatattacgatgaatataatcg |
22875906 |
T |
|
| Q |
519 |
attcaggaatttatcccttaccagtggacatcctatacaggtatggattgaatatgatggagtgaagaaaaagattgatgttactttagctccaat |
614 |
Q |
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| T |
22875905 |
attcagggatttatcccttttcagtggatatcccatgcaggtatggattgactatgatggagtgaaaaaaaagattgatgttactttagctccaat |
22875810 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 19 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 22810130 - 22809536
Alignment:
| Q |
19 |
cttgttacattggtggcaagtaaagataaaaatttcatctataatggtttccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaaccccagatg |
118 |
Q |
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| T |
22810130 |
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22810031 |
T |
|
| Q |
119 |
gcttactaagactcaccaatgatatcgagccagatacagcagcatatgctttctatccaaatcctatagtttttaaaaacacttcgaatgaaagtgtgtc |
218 |
Q |
| |
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| T |
22810030 |
gcttactaagactcaccaatgatacagaacatgaaaaaggac---atgctttctatccaaatcctgtagttttcaaaaacactatcagtgaaagtgtatc |
22809934 |
T |
|
| Q |
219 |
atctttctcaactacttttgtatttgccataatacctcaatatccaactcttggtggccatggaattgtttttgttatttctccaacaaaagggctacca |
318 |
Q |
| |
|
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| T |
22809933 |
ttctttctcaactacttttgtatttgccataagacctcaatatccaactcttagttcccatggaattgtatttgttgtttcacctacaaaagggctgcca |
22809834 |
T |
|
| Q |
319 |
gattcactaccaggtcaataccttggtctctttaacaattccaacaatggaaacagtagcaaccatgtttttgctgttgagtttgacactgttcaagatt |
418 |
Q |
| |
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| T |
22809833 |
aattcaaaagcaagtcaatatcttggtctctttaaccaatccaacaatggaaacagtagtaaccatgttttcggtgttgaactagatactcttctaagta |
22809734 |
T |
|
| Q |
419 |
ttgagtttgatgatatcaatgataaccatgttggtattgatatcaatgatttgaaatcagctaattcaactcatgcaggatattatgatgatactggtcg |
518 |
Q |
| |
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| T |
22809733 |
gtgagtttgatgatatcaatgataaccatattggtattgatatcaatgatttgaaatcagctaattcaactcctgcaggatattatgatagtaatggtca |
22809634 |
T |
|
| Q |
519 |
attcaggaatttatcccttaccagtggacatcctatacaggtatggattgaatatgatggagtgaagaaaaagattgatgttactttagctccaatta |
616 |
Q |
| |
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| T |
22809633 |
attcaagaatatgagccttttcagtggctatcctatgcatgtatggattgaatatgatggtgaaaagaaaaagattgatgctactttagctccaatta |
22809536 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 19 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 22894430 - 22893836
Alignment:
| Q |
19 |
cttgttacattggtggcaagtaaagataaaaatttcatctataatggtttccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaaccccagatg |
118 |
Q |
| |
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| T |
22894430 |
cttgttacattggtaccaagtgaagacaaaagtttcatctataatgatttccaatcatctcatttgtatcttgatggtattgctaatttaacctccaatg |
22894331 |
T |
|
| Q |
119 |
gcttactaagactcaccaatgatatcgagccagatacagcagcatatgctttctatccaaatcctatagtttttaaaaacacttcgaatgaaagtgtgtc |
218 |
Q |
| |
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| T |
22894330 |
gcttactaagactcaccaatgacaccaaacaagaaaaagcac---atgctttctatccaaaccctatagttttgaagaacacttccaatggaagtgtttc |
22894234 |
T |
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| Q |
219 |
atctttctcaactacttttgtatttgccataatacctcaatatccaactcttggtggccatggaattgtttttgttatttctccaacaaaagggctacca |
318 |
Q |
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| T |
22894233 |
ttcattctcaactacttttgtatttgccataagacatcaaggtccaacttatagtggccatggaattgtttttgttctttctcctacaaaagggctacca |
22894134 |
T |
|
| Q |
319 |
gattcactaccaggtcaataccttggtctctttaacaattccaacaatggaaacagtagcaaccatgtttttgctgttgagtttgacactgttcaagatt |
418 |
Q |
| |
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| T |
22894133 |
aattcactccaaggttcataccttggtctctttgacgattccaacaatggaaatcctagcaaccacgtttttggtgttgaacttgatactattgaaaatc |
22894034 |
T |
|
| Q |
419 |
ttgagtttgatgatatcaatgataaccatgttggtattgatatcaatgatttgaaatcagctaattcaactcatgcaggatattatgatgatactggtcg |
518 |
Q |
| |
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| T |
22894033 |
gtgagtttgatgatatcaatgataaccatgttggtattgatatcaatgatttgaaatcagctaattcaactcctgcaggatattatgatggtaatggtca |
22893934 |
T |
|
| Q |
519 |
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616 |
Q |
| |
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| T |
22893933 |
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22893836 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 21 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 22805793 - 22805205
Alignment:
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21 |
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120 |
Q |
| |
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||||||||| || |||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |
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| T |
22805793 |
tgttacattagtagcaagtgaagataacagtttcatctataatggattccaatcatcacatttatatcttgatggttttgctgagttaacctcagatggc |
22805694 |
T |
|
| Q |
121 |
ttactaagactcaccaatgatatcgagccagatacagcagcatatgctttctatccaaatcctatagtttttaaaaacacttcgaatgaaagtgtgtcat |
220 |
Q |
| |
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|
|
| T |
22805693 |
atactaagactcaccaatgatacagaacaagtaataggtc---atgctttctatccaaatccaatagttttcaaaaacacttccagtgaaagtgtgtctt |
22805597 |
T |
|
| Q |
221 |
ctttctcaactacttttgtatttgccataatacctcaatatccaactcttggtggccatggaattgtttttgttatttctccaacaaaagggctaccaga |
320 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |
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|
| T |
22805596 |
ctttctcaactacttttgtatttgccataatacctcaatatccaccttttactggccatggaattgtttttgttctttctccaacaaaagggctaccaaa |
22805497 |
T |
|
| Q |
321 |
ttcactaccaggtcaataccttggtctctttaacaattccaacaatggaaacagtagcaaccatgtttttgctgttgagtttgacactgttcaagatttt |
420 |
Q |
| |
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| T |
22805496 |
ttcactaccaaatcaataccttggtctctttaatgattccaacaatggaaacagtggcaaccatgtttttggtgttgaacttgacacttctaaagatttt |
22805397 |
T |
|
| Q |
421 |
gagtttgatgatatcaatgataaccatgttggtattgatatcaatgatttgaaatcagctaattcaactcatgcaggatattatgatgatactggtcgat |
520 |
Q |
| |
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| T |
22805396 |
gagtttggtgatgttgacaataaccacgatggtattaatatcaatgatctgaaatcagttgtctcaactactgcagcctattacgatgatcatggtcaaa |
22805297 |
T |
|
| Q |
521 |
tcaggaatttatcccttaccagtggacatcctatacaggtatggattgaatatgatggagtgaagaaaaagattgatgttactttagctcca |
612 |
Q |
| |
|
|||| | || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tcagaacagtagacctttccagtggaaatcctatacaggtatggattgattatgatggagtgaagaaaaagattgatgttactttagctcca |
22805205 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 58 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 22840499 - 22839942
Alignment:
| Q |
58 |
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157 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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tataatggattccaatcatcaaatttatatcttgatggtaccgctgagttagcctcaactggcttactaagactcaccaatgatacaaaacaagaaaaag |
22840400 |
T |
|
| Q |
158 |
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257 |
Q |
| |
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| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| | || |
|
|
| T |
22840399 |
gacaa---gctttctatccaaatcctatagttttcaaaaacacttccagcggaagtgtttcttctttctcaactacttttgtattttccataaaatcttc |
22840303 |
T |
|
| Q |
258 |
atatccaactcttggtggccatggaattgtttttgttatttctccaacaaaagggctaccagattcactaccaggtcaataccttggtctctttaacaat |
357 |
Q |
| |
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| T |
22840302 |
atatccaactcttagtggccatggaattgttttcgttatttctcctacaaaagggctaccaaattcactaccaagtcaataccttggtctctttaaccaa |
22840203 |
T |
|
| Q |
358 |
tccaacaatggaaacagtagcaaccatgtttttgctgttgagtttgacactgttcaagattttgagtttgatgatatcaatgataaccatgttggtattg |
457 |
Q |
| |
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| T |
22840202 |
tccaacattggaaacggtggcaaccatgtttttggtgttgaacttgatactcttctaagtagtgagtttgatgatatcaatgataaccatgttggtattg |
22840103 |
T |
|
| Q |
458 |
atatcaatgatttgaaatcagctaattcaactcatgcaggatattatgatgatactggtcgattcaggaatttatcccttaccagtggacatcctataca |
557 |
Q |
| |
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| T |
22840102 |
atatcaatgatttgaaatcagctaattcaactcctgcaggatattacgatgaatataatcgattcagggatttatccctctccagtggatatcctatgca |
22840003 |
T |
|
| Q |
558 |
ggtatggattgaatatgatggagtgaagaaaaagattgatgttactttagctccaattagt |
618 |
Q |
| |
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| T |
22840002 |
agtatggattgaatatgatagagtgaagaaaaagattgatgttaccttagctccatttagt |
22839942 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 164 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 22885934 - 22885559
Alignment:
| Q |
164 |
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263 |
Q |
| |
|
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22885934 |
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22885837 |
T |
|
| Q |
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aactcttggtggccatggaattgtttttgttatttctccaacaaaagggctaccagattcactaccaggtcaataccttggtctctttaacaattccaac |
363 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
22885836 |
aactcatagtggccatggaattgtttttgttatttcacctacaaaagggctaccaaattcactacaatattaataccttggtctct--aacaattccaac |
22885739 |
T |
|
| Q |
364 |
aatggaaacagtagcaaccatgtttttgctgttgagtttgacactgttcaagattttgagtttgatgatatcaatgataaccatgttggtattgatatca |
463 |
Q |
| |
|
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|
| T |
22885738 |
aatggaaacagtagcagccatgtttttggtattgagcttgacactgatcaaaattttgagtttgatgaaatcaatgataaccatattggtattgatatca |
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T |
|
| Q |
464 |
atgatttgaaatcagctaattcaactcatgcaggatattatgatgatactggtcgattcaggaatttatcccttaccagtgga |
546 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22885638 |
atgatttgaaatcagctaattcaactcctgcaggatattatgatgattatg---gattcaggaatttatccctttccagtgga |
22885559 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 22881056 - 22880631
Alignment:
| Q |
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112 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| |||| || | |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |
|
|
| T |
22881056 |
cttgttacattgatagcaagtgaagaaaacagtttcatctataaatacaatggattccattcatcacatttatatcttgatggtattgctaaggtaaact |
22880957 |
T |
|
| Q |
113 |
cagatggcttactaagactcaccaatgatatcgagccagatacagc---agcatatgctttctatccaaatcctatagtttttaaaaacacttcgaatga |
209 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22880956 |
caaatggcttactaagactcaccaatgaca------cagaaagagccaaaggatatgctttctatccaaatcctatagttttcaaaaacacttccaatga |
22880863 |
T |
|
| Q |
210 |
aagtgtgtcatctttctcaactacttttgtatttgccataatacctcaatatccaactcttggtggccatggaattgtttttgttatttctccaacaaaa |
309 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||| || || | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |
|
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| T |
22880862 |
aagtgtgtattctttctcaactacttttgtatttgccatcaaatctaggtatacagctacttgtggccatggacttgtttttgttgtttcaccaacaaaa |
22880763 |
T |
|
| Q |
310 |
gggctaccagattcactaccaggtcaataccttggtctctttaacaattccaacaatggaaacagtagcaaccatgtttttgctgttgagtttgacactg |
409 |
Q |
| |
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||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
22880762 |
gggctaccaaattcgctaccaagtaaataccttggtctctttgacactttcaacactggaaacattagcaaccatgtttttgctgttgagtttgacactg |
22880663 |
T |
|
| Q |
410 |
ttcaagattttgagtttgatgatatcaatgat |
441 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22880662 |
ttcaagattttgagtttgacgatatcaatgat |
22880631 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 305 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 22858665 - 22858354
Alignment:
| Q |
305 |
caaaagggctaccagattcactaccaggtcaataccttggtctctttaacaattccaacaatggaaacagtagcaaccatgtttttgctgttgagtttga |
404 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22858665 |
caaaagggctaccagattcacttccaaaccaataccttggtccctttaacgattccaacattggaaacactagcaaccatgtgtttgctgttgagcttga |
22858566 |
T |
|
| Q |
405 |
cactgttcaagattttgagtttgatgatatcaatgataaccatgttggtattgatatcaatgatttgaaatcagctaattcaactcatgcaggatattat |
504 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
22858565 |
cactattcaagatcttgagtttgatgatatcaataataaccatgctggtattgacatcaataatttgaaatcagctaattcaactcctgcaggatactat |
22858466 |
T |
|
| Q |
505 |
gatgatactggtcgattcaggaatttatcccttaccagtggacatcctatacaggtatggattgaatatgatggagtgaagaaaaagattgatgttactt |
604 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||| | ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |
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|
| T |
22858465 |
aatgctattggtcgattcaacgacttatccctttctagtggatatcctatgcaggtatggatagaatatgatggagtgaagaaaaatattgatgttacat |
22858366 |
T |
|
| Q |
605 |
tagctccaatta |
616 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
22858365 |
tagctccaatta |
22858354 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22842656 - 22842264
Alignment:
| Q |
19 |
cttgttacattggtggcaagtaaagataaaaatttcatctataat------ggtttccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaaccc |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||| || | ||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22842656 |
cttgttacattggtagcaagtgaagacaacagtttcatctataataatagaggattccaatcatttcatttgtatcttgatggtattgctgagttaacct |
22842557 |
T |
|
| Q |
113 |
cagatggcttactaagactcaccaatgatatcgagccagatacagcagcatatgctttctatccaaatcctatagtttttaaaaacacttcgaatgaaag |
212 |
Q |
| |
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||| |||||||| ||||||||||||||||| | | || ||||| || ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||| |
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|
| T |
22842556 |
caggtggcttaccaagactcaccaatgata-caaaaca-atacaa-aggtcatgctttatatccaaaaccaatagttttcaaaaacacttctagtgaaag |
22842460 |
T |
|
| Q |
213 |
tgtgtcatctttctcaactacttttgtatttgccataatacctcaatatcca------actcttggtggccatggaattgtttt--tgtta----tttct |
300 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
22842459 |
tgtgtcttctttctcaactacttttttatttgccataaaatctccagatccagaactaactcttagtggccacgggattgttttgttgtttcaactttca |
22842360 |
T |
|
| Q |
301 |
ccaacaaaagggctaccagattcactaccaggtcaataccttggtctctttaacaattccaacaatggaaacagtagcaaccatgtttttgctgtt |
396 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22842359 |
cctacaaaagggcaaccaaattcactaccaggtcaataccttggtctctttaacaattccaacaatggaaatagtagcaaccatgtttttggtgtt |
22842264 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22858905 - 22858677
Alignment:
| Q |
19 |
cttgttacattggtggcaagtaaagataaaaatttcatctataatggtttccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaaccccagatg |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
22858905 |
cttgttacattggtagcaagtgaagacaacggtttcatctataaaggattccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaacttcaactg |
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T |
|
| Q |
119 |
gcttactaagactcaccaatgatatcgagccagatacagcagcatatgctttctatccaaatcctatagtttttaaaaacacttcgaatgaaagtgtgtc |
218 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||| |
|
|
| T |
22858805 |
gcttactaagactcaccaatgatatcgggcaagata---cagcacatgctttctatccaaatcctatagttttcaaaaacacttctagtgaaactgtgtc |
22858709 |
T |
|
| Q |
219 |
atctttctcaactacttttgtatttgccataa |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22858708 |
ttctttctcaactacttttttatttgccataa |
22858677 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 58 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 22914115 - 22913698
Alignment:
| Q |
58 |
tataatggtttccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaaccccagatggcttactaagactcaccaatgatatcgagccagatacag |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| ||||||||| | ||||||||| || || || ||| |
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|
| T |
22914115 |
tataatggtttcaaatcatcacatttatatcttgatggtgttgctgaattaacctcaaatggtttactaagattaaccaatgat-tcaagaca---acaa |
22914020 |
T |
|
| Q |
158 |
cagcat-atgctttctatccaaatcctatagtttttaaaaacacttcgaatgaaagtgtgtcatctttctcaactacttttgtatttgccataatacctc |
256 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||||||||| ||||||||||| || || | | | ||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||| | || |
|
|
| T |
22914019 |
aagggtcatgctttctatccaaaccctatagttttcaacaatggaagtagtagtaatgtatcttctttctctactacttttgtttttgccataaaatctg |
22913920 |
T |
|
| Q |
257 |
aatatccaactcttggtggccatggaattgtttttgttatttctccaacaaaagggctaccagattcactaccaggtcaataccttggtctctttaacaa |
356 |
Q |
| |
|
| | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || || | |
|
|
| T |
22913919 |
agtttcctaatcttagtggccatggaattgtttttgttctttctccaacaaaagggttaccaaattcactaccaagtcaataccttggtctattcaatga |
22913820 |
T |
|
| Q |
357 |
ttccaacaatggaaacagtagcaaccatgtttttgctgttgagtttgacactgttcaagattttgagtttgatgatatcaatgataaccatgttggtatt |
456 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| | ||||||||||||| | | ||| |||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |
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| T |
22913819 |
atcaaacaatggaaacaacaataaccatgtttttggtttggagcttgatactattatgaatacggagttcgatgatatcaatgacaaccatgttggaatt |
22913720 |
T |
|
| Q |
457 |
gatatcaatgatttgaaatcag |
478 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22913719 |
gatatcaatggtttgaaatcag |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 457 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 22880642 - 22880481
Alignment:
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457 |
gatatcaatgatttgaaatcagctaattcaactcatgcaggatattatgatgatactggtcgattcaggaatttatcccttaccagtggacatcctatac |
556 |
Q |
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| T |
22880642 |
gatatcaatgatttgaaatcagtaaattcaatttctgcaggatattatgatgattatgatcgattcaaggatttatccctttccagtggatatcccatgc |
22880543 |
T |
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| Q |
557 |
aggtatggattgaatatgatggagtgaagaaaaagattgatgttactttagctccaattagt |
618 |
Q |
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|
| T |
22880542 |
aggtatggattgactatgatggagtgaagaaaaagattgaggttacattagctccgattagt |
22880481 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 379 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 22922291 - 22922209
Alignment:
| Q |
379 |
aaccatgtttttgctgttgagtttgacactgttcaagattttgagtttgatgatatcaatgataaccatgttggtattgatat |
461 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22922291 |
aaccatctttttgctgttgagtttgacactgttcaagattttgagtttggtgatattaatgataaccatgttggtatagatat |
22922209 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 379 - 465
Target Start/End: Original strand, 22933300 - 22933386
Alignment:
| Q |
379 |
aaccatgtttttgctgttgagtttgacactgttcaagattttgagtttgatgatatcaatgataaccatgttggtattgatatcaat |
465 |
Q |
| |
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| T |
22933300 |
aaccatatttttgctgtcgagtttgacactgctcaagactttgagtttgatgatattaatgataaccatgttggtatagacatcaat |
22933386 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 568 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 22913605 - 22913557
Alignment:
| Q |
568 |
gaatatgatggagtgaagaaaaagattgatgttactttagctccaatta |
616 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
22913605 |
gaatatgatggagtgaagaaaaagattgatgttactttagctccaatta |
22913557 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 548 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 22826209 - 22826141
Alignment:
| Q |
548 |
atcctatacaggtatggattgaatatgatggagtgaagaaaaagattgatgttactttagctccaatta |
616 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
22826209 |
atcctatgcaggtatggatagaatatgatggtgaaaataaaaagattgatgttactttagctccaatta |
22826141 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 22885965 - 22885937
Alignment:
| Q |
67 |
ttccaatcatcacatttatatcttgatgg |
95 |
Q |
| |
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| T |
22885965 |
ttccaatcatcacatttatatcttgatgg |
22885937 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 618
Target Start/End: Original strand, 21150228 - 21150824
Alignment:
| Q |
19 |
cttgttacattggtggcaagtaaagataaaaatttcatctataatggtttccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaaccccagatg |
118 |
Q |
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| T |
21150228 |
cttgttacattggtagcaagtgaagataacagtttcatctataatggattccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaacctcaaatg |
21150327 |
T |
|
| Q |
119 |
gcttactaagactcaccaatgatatcgagccagatacagcagcatatgctttctatccaaatcctatagtttttaaaaacacttcgaatgaaagtgtgtc |
218 |
Q |
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| T |
21150328 |
gcttactaagactcactagtgatacagatcatgaaatagg-gcat--gctttctatccaaatcctatagttttcgaaaacacttccggcgaaagtgtgtt |
21150424 |
T |
|
| Q |
219 |
atctttctcaactacttttgtatttgccataatacctcaatatccaactcttggtggccatggaattgtttttgttatttctccaacaaaagggctacca |
318 |
Q |
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| T |
21150425 |
ttctttttcaactacttttgtatttgccataagacctcaatatccaactcttggtggccatggaattgtttttgttatttctcctacaaaagagctacca |
21150524 |
T |
|
| Q |
319 |
gattcactaccaggtcaataccttggtctctttaacaattccaacaatggaaacagtagcaaccatgtttttgctgttgagtttgacactgttcaagatt |
418 |
Q |
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| T |
21150525 |
aattcactaccaacacaataccttggtctctttaacaattccaacaatggaaacagtagcaaccatgtttttggtgttgagcttgacactgttcaagatt |
21150624 |
T |
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| Q |
419 |
ttgagtttgatgatatcaatgataaccatgttggtattgatatcaatgatttgaaatcagctaattcaactcatgcaggatattatgatgatactggtcg |
518 |
Q |
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| T |
21150625 |
ttgagtttgatgatatcaataataaccatgttggtattgatatcaatgatttgaaatcagctaactcaacttctgcaggctattatgatgataatgatgg |
21150724 |
T |
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| Q |
519 |
attcaggaatttatcccttaccagtggacatcctatacaggtatggattgaatatgatggagtgaagaaaaagattgatgttactttagctccaattagt |
618 |
Q |
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| T |
21150725 |
attcaatgatttatcccttttcagtggatatcctatgcatgtatggattgaatatgatggtgaaaagaagaagattaatgttactttagctccaattagt |
21150824 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 379 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 15628375 - 15628278
Alignment:
| Q |
379 |
aaccatgtttttgctgttgagtttgacactgttcaagattttgagtttgatgatatcaatgataaccatgttggtattgatatcaatgatttgaaatc |
476 |
Q |
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| T |
15628375 |
aaccatctttttgctgttgaatttgacactgtcttagactttgggtttgatgatattaatgataaccatgttggtatagacatcaatggtttgaaatc |
15628278 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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