View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1627_low_8 (Length: 612)

Name: NF1627_low_8
Description: NF1627
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1627_low_8
NF1627_low_8
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (1-612)||(5689905-5690516)
chr6 (1-612)||(5176463-5177077)
chr6 (1-612)||(5278290-5278904)
chr6 (12-612)||(5344596-5345196)
chr6 (1-602)||(5128173-5128774)
chr6 (19-608)||(5157378-5157967)
chr6 (32-608)||(5073658-5074234)
chr6 (19-608)||(5096450-5097039)
chr6 (1-542)||(5354430-5354971)
chr6 (19-608)||(5066444-5067033)
chr6 (30-576)||(5425663-5426209)
chr6 (19-608)||(5102364-5102953)
chr6 (19-475)||(5447329-5447785)
chr6 (19-608)||(5370313-5370902)
chr6 (8-608)||(5383057-5383657)
chr6 (8-602)||(5396681-5397275)
chr6 (30-576)||(5350149-5350687)
chr6 (1-478)||(5433759-5434236)
chr6 (19-507)||(5181778-5182266)
chr6 (8-478)||(5284269-5284739)
chr6 (8-395)||(5257297-5257684)
chr6 (19-361)||(5446899-5447241)
chr6 (357-612)||(5243659-5243914)
chr6 (19-315)||(5243910-5244206)
chr6 (19-250)||(5147004-5147235)
chr6 (257-467)||(5281280-5281490)
chr6 (257-467)||(5179521-5179731)
chr6 (457-608)||(5137416-5137567)
chr6 (548-611)||(5434459-5434522)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (19-534)||(4344388-4344903)
chr4 (30-534)||(4360830-4361334)
chr4 (1-475)||(4320502-4320976)
chr4 (1-478)||(4123819-4124296)
chr4 (19-478)||(4335087-4335546)
chr4 (19-410)||(4133373-4133762)
chr4 (19-474)||(6498410-6498865)
chr4 (82-474)||(6650872-6651264)
chr4 (13-474)||(6621391-6621852)
chr4 (45-474)||(6532116-6532545)
chr4 (43-467)||(6752726-6753150)
chr4 (82-474)||(6545332-6545724)
chr4 (82-326)||(6815275-6815519)
chr4 (43-470)||(6728172-6728599)
chr4 (36-427)||(7885322-7885713)
chr4 (43-197)||(6837040-6837194)
chr4 (106-323)||(6796616-6796833)
chr4 (19-474)||(6675445-6675900)
chr4 (85-198)||(6715575-6715688)
chr4 (226-470)||(6588084-6588328)
chr4 (387-478)||(6758834-6758925)
chr4 (34-140)||(6772861-6772967)
chr4 (223-324)||(6837220-6837321)
chr4 (388-467)||(6822802-6822881)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (8-608)||(8650-9250)
[»] chr5 (7 HSPs)
chr5 (12-602)||(8877344-8877934)
chr5 (364-476)||(20838719-20838831)
chr5 (388-476)||(12599054-12599142)
chr5 (364-476)||(20812364-20812476)
chr5 (385-474)||(15803019-15803108)
chr5 (388-478)||(30417931-30418021)
chr5 (235-323)||(12599207-12599295)
[»] chr7 (3 HSPs)
chr7 (19-575)||(36213612-36214168)
chr7 (47-478)||(18935156-18935587)
chr7 (38-318)||(34724626-34724906)
[»] chr3 (10 HSPs)
chr3 (19-368)||(47986842-47987191)
chr3 (19-368)||(47996129-47996478)
chr3 (19-368)||(48005416-48005765)
chr3 (19-368)||(48014701-48015050)
chr3 (367-478)||(6905806-6905917)
chr3 (409-478)||(47986752-47986821)
chr3 (409-478)||(47996039-47996108)
chr3 (409-478)||(48005326-48005395)
chr3 (409-478)||(48014611-48014680)
chr3 (364-478)||(32411083-32411197)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (47-488)||(22584084-22584525)
chr2 (235-302)||(14767123-14767190)
chr2 (14-65)||(14767360-14767411)
[»] scaffold0813 (1 HSPs)
scaffold0813 (82-474)||(4710-5102)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (82-474)||(6464-6856)
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (244-476)||(3262629-3262860)
chr8 (245-477)||(3286516-3286748)
chr8 (385-478)||(3391536-3391629)
chr8 (401-478)||(3407323-3407400)
chr8 (364-476)||(31175934-31176046)
chr8 (385-475)||(3314966-3315056)
chr8 (385-478)||(3364277-3364370)
chr8 (387-475)||(3325003-3325091)
chr8 (385-476)||(3398522-3398613)
chr8 (254-302)||(3375055-3375103)
chr8 (254-302)||(31175824-31175872)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (82-326)||(8317-8561)
[»] scaffold0373 (2 HSPs)
scaffold0373 (43-197)||(9456-9610)
scaffold0373 (223-324)||(9636-9737)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (385-478)||(6146-6239)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 596; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 596; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 5690516 - 5689905
Alignment:
Q  1 ttctctttaatatttatattcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5690516 ttctctttaatatttatattcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatca 5690417  T
Q  101 tgcctaatcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttgga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5690416 tgcctaatcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttgga 5690317  T
Q  201 agattgtattagcctttctaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5690316 agattgtattagcctttctaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaa 5690217  T
Q  301 gaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5690216 gaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaattgtaaggtcaaaaagcattgggt 5690117  T
Q  401 atatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaagtgctctttcatccccctttga 500  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5690116 atatttctctgtgcggacatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaagtgctctttcatccccctttga 5690017  T
Q  501 aacatctgctgccatgtcatctcttgtttctttagatataccacatagtagttctcaggaactgtcatctatttccaaccacctttcaaggcttcgaagt 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5690016 aacatctgctgccatgtcatctcttgtttctttagatataccatgtagtagttctcaggaactgtcatctatttccaaccacctttcaaggcttcgaagt 5689917  T
Q  601 ctatgggtagag 612  Q
    ||||||||||||    
T  5689916 ctatgggtagag 5689905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 612
Target Start/End: Original strand, 5176463 - 5177077
Alignment:
Q  1 ttctctttaatatttatattcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatca 100  Q
    |||| |||||||||| | |||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  5176463 ttctatttaatatttttgttcttgcagaggatggagaagctgaaaattcttaatcttagtcattctcattatctgacagagaccccagacttttcaaaca 5176562  T
Q  101 tgcctaatcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttgga 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5176563 tgcctaatcttgaaaagcttatactcatagattgcccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgataaaattcttctgataaacttgga 5176662  T
Q  201 agattgtattagcctttctaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaa 300  Q
    ||||||||||||||||   |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  5176663 agattgtattagccttcagagtcttccaagaagtatctataagttgaaatctttgaaaacactcattctttctgggtgttcgatgattgacaagttggaa 5176762  T
Q  301 gaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |    
T  5176763 gaggacttggaacaaatggaatctttaactactctgcttgcaaataacactgcaataacaagagtgcccttgtcaatagtaaggtcaaaaagcattggat 5176862  T
Q  401 atatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaagtgctctttcatccccctttga 500  Q
    | || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  5176863 acatctctttgtgcggctatgaaggattctcacgtgatatatttccatcaatcatttggtcttggatgtcaccaacaagttctctttcatccccctttca 5176962  T
Q  501 aacatctgctgcc---atgtcatctcttgtttctttagatataccacatagtagttctcaggaactgtcatctatttccaaccacctttcaaggcttcga 597  Q
    ||||||| |||||   || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5176963 aacatcttctgccaatatttcatctctcgtttctttagatataccacatagtagttctcaggaactgtcatctatttccgaccacctttcaaggcttcga 5177062  T
Q  598 agtctatgggtagag 612  Q
    |||||||||||||||    
T  5177063 agtctatgggtagag 5177077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 612
Target Start/End: Original strand, 5278290 - 5278904
Alignment:
Q  1 ttctctttaatatttatattcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatca 100  Q
    |||| |||||||||| | |||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  5278290 ttctatttaatatttttgttcttgcagaggatggagaagctgaaaattcttaatcttagtcattctcattatctgacagagaccccagacttttcaaaca 5278389  T
Q  101 tgcctaatcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttgga 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5278390 tgcctaatcttgaaaagcttatactcatagattgcccaaggttgtgtgaggtttctcatagcattggatatctcgataaaattcttctgataaacttgga 5278489  T
Q  201 agattgtattagcctttctaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaa 300  Q
    ||||||||||||||||   |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  5278490 agattgtattagccttcagagtcttccaagaagtatctataagttgaaatctttgaaaacactcattctttctgggtgttcgatgattgacaagttggaa 5278589  T
Q  301 gaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||||| |    
T  5278590 gaggacttggaacaaatggaatctttaactactctgcttgcaaataacactgcaataacaagagtgcccttgtctatagtaaggtcaaaaagcattggat 5278689  T
Q  401 atatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaagtgctctttcatccccctttga 500  Q
    | || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  5278690 acatctctttgtgcggctatgaaggattctcacgtgatatatttccatcaatcatttggtcttggatgtcaccaacaagttctctttcatccccctttca 5278789  T
Q  501 aacatctgctgcc---atgtcatctcttgtttctttagatataccacatagtagttctcaggaactgtcatctatttccaaccacctttcaaggcttcga 597  Q
    ||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5278790 aacatcttctgccaatatttcatctcttgtttctttagatataccacatagtagttctcaggaactgtcatctatttccgaccacctttcaaggcttcga 5278889  T
Q  598 agtctatgggtagag 612  Q
    |||||||||||||||    
T  5278890 agtctatgggtagag 5278904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 12 - 612
Target Start/End: Original strand, 5344596 - 5345196
Alignment:
Q  12 atttatattcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatctt 111  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||   | | |||||||||    
T  5344596 atttatgttcttacagatgatggagaagctgaaaattctcaatcttagtcattctcattacctgatacaaaccccggacttttcttacttacctaatctt 5344695  T
Q  112 gaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtatta 211  Q
    |||||| || |||||   ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  5344696 gaaaagttagtactcgtggattgtccaagtttgtgtgagatttctcatagcattggagatctcaagaaaattcttctcattaatttggaagactgtatta 5344795  T
Q  212 gcctttctaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttgga 311  Q
    |||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| || |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  5344796 gcctatgtagcctgccaagaagcatctataagttgaattctctaaaaactctcattctttcgggttgtttaaagattgacaagttggaagaggacttaga 5344895  T
Q  312 acaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctg 411  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||||  || ||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5344896 acaaatgaaatctttaaccattctgatcgcaaataacactgcaataacaaaagttccctttttagtagtaaggtcaaaaagcattggatatatttctctg 5344995  T
Q  412 tgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaagtgctctttcatccccctttgaaacatctgctg 511  Q
    || || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    || ||| |||| |||    
T  5344996 tgtggctatgaaggattctcacgcgatgtatttccatctatcatctggtcttggatgtcaccaacaagttctctttcattcgaagttcaaatatctcctg 5345095  T
Q  512 ccatgtcatctcttgtttctttagatataccacatagtagttctcaggaactgtcatctatttccaaccacctttcaaggcttcgaagtctatgggtaga 611  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5345096 cgatgtcatctctggtttctttagatataccacatagtagctcccaagatctgtcaactatttccaaccacctttcaaggcttcgaagtctatgggtaga 5345195  T
Q  612 g 612  Q
    |    
T  5345196 g 5345196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 5128774 - 5128173
Alignment:
Q  1 ttctctttaatatttatattcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatca 100  Q
    ||||||| ||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||        
T  5128774 ttctcttcaattttcatgttcttgcagatgatggagaagctgaaaattctcaatcatagtcattctcattgtctgacacacaccccagacttttcatatt 5128675  T
Q  101 tgcctaatcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttgga 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||  |||||||||   |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  5128674 tacctaatcttgaaaagctagtactcaaagattgttcaatgttgtctgaggtttctactagcatcggacatctcaataaaattcttctgataaatttgga 5128575  T
Q  201 agattgtattagcctttctaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaa 300  Q
    |||||| |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||||    
T  5128574 agattgcattagcctatgtagcctcccaagaagcatctataagttgaaatctttgaaaactctcattctttctggttgtataatgattgacaagttggaa 5128475  T
Q  301 gaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| || |||||||||   |||||||||||||||||||| |    
T  5128474 gaggacttggaacaaatggaatcattaacaactctgcttgcaaataacactgcaataaaaagagtacccttttcagtagtaaggtcaaaaagcattggat 5128375  T
Q  401 atatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaagtgctctttcatccccctttga 500  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || |||  ||| |    
T  5128374 atatctctctgtgcggccatgaaggattttcaagtgatgtgtttccatctatcatctggtcttggatgtcaccaacaaatgatctcccacccctatttca 5128275  T
Q  501 aacatctgctgccatgtcatctcttgtttctttagatataccacatagtagttctcaggaactgtcatctatttccaaccacctttcaaggcttcgaagt 600  Q
    |||||||  |  |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| || ||||| || || || ||| |  ||||| |||| |||||||||    
T  5128274 aacatctaatatcatgtcatctcttgttcctctagatgtaccacatagtagttcccacgaactatcgtcgatgtcccagtaccttccaagtcttcgaagt 5128175  T
Q  601 ct 602  Q
    ||    
T  5128174 ct 5128173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 19 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 5157967 - 5157378
Alignment:
Q  19 ttcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagc 118  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  5157967 ttcttgcagatgatggaaaagctaaaaattctaaatcttagtcattctcattgtctgacgcacaccccagacttttcatacatgcctaatcttgagaagc 5157868  T
Q  119 taatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttc 218  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||||||| |||||    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||      
T  5157867 tggtactcaaagattgtccaatgttgtctgaggtttctcctagcattggaaatctcagtgaaattcttctaatagatttggaagattgtgttagccttcg 5157768  T
Q  219 taaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatg 318  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  5157767 aagccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaattttaattctttcagggtgtataatgattgacaagttggaagaggacatagaacagatg 5157668  T
Q  319 gaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| || |||||||||   |||||||||||||||||||| || || ||| || |||| |    
T  5157667 gaatctttaaccactctgcttgcacacgacactgcaataaaaagagtacccttttcagtagtaaggtcaaaaagcattggatacatctctttgggcggct 5157568  T
Q  419 atgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaagtgctctttcatccccctttgaaacatctgctgccatgtc 518  Q
    |||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||  |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  5157567 atgaaggattttctcgtgatgtgtttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaaataatctcccatctccatttcaaacatctgctgccatgtc 5157468  T
Q  519 atctcttgtttctttagatataccacatagtagttctcaggaactgtcatctatttccaaccacctttcaaggcttcgaagtctatgggt 608  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| |    ||| |||| |||||||||||||||||    
T  5157467 atctcttgttcctttagatgtaccacatagtaattcccaggaactatcatcgatttcccagtgtcttccaagtcttcgaagtctatgggt 5157378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 32 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 5074234 - 5073658
Alignment:
Q  32 tggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagctaatactcaaaga 131  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| |||    
T  5074234 tggagaagctgaaaatactcaatcttagtcattctcattatctgacgcaaactccagatttttcaaacttgcctaatcttgaacaactagtactcacaga 5074135  T
Q  132 ttgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttctaaccttccaaga 231  Q
    |||||||||||||   |||||||| ||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   | ||||||||||    
T  5074134 ttgtccaaggttgtcagaggtttctcatagtattgaacatctcaataaaattcttctgataaatttggaagattgtattggtcttcagagccttccaaga 5074035  T
Q  232 agcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaacca 331  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||    
T  5074034 agtatctataagttgaaatctctaaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattgacaagttggaagaggacttagaacagatgacatctttaacca 5073935  T
Q  332 ctctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctc 431  Q
    ||||| | |||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5073934 ctctgatagcaaataacaccgcaataacaagagtgcccttttcagtagtaaggtcgaaaagcattggatatatttctttgtgcggctatgaaggattctc 5073835  T
Q  432 acgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaagtgctctttcatccccctttgaaacatctgctgccatgtcatctcttgtttct 531  Q
    ||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||  | ||||| ||| | ||   |||||| |||||||| | |||| ||    
T  5073834 acgtgatgtgttcccatcgatcatttggtcttggatgtcaccgacaaataatctcacttccccatttcagacggttgctgcaatgtcatcccatgttcct 5073735  T
Q  532 ttagatataccacatagtagttctcaggaactgtcatctatttccaaccacctttcaaggcttcgaagtctatgggt 608  Q
    |||||| ||| | |||||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||| || |||||||| |||| |||||    
T  5073734 ttagatgtactaaatagtagttcccatgaactatcatctatttccaattaccttccatggcttcgatgtctttgggt 5073658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 19 - 608
Target Start/End: Original strand, 5096450 - 5097039
Alignment:
Q  19 ttcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagc 118  Q
    |||||| ||| |||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  5096450 ttcttgcagaggatggaaaaactgaaaattctaaatcttagtcattctcattgtctgacacacaccccagacttttcatacatgcctaatcttgagaagc 5096549  T
Q  119 taatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttc 218  Q
    |  |||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||||||| |||||    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||      
T  5096550 tggtacttaaagattgtccaatgttgtctgaggtttctcctagcattggaaatctcagtgaaattcttctaatagatttggaagattgtgttagccttcg 5096649  T
Q  219 taaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatg 318  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||| | |||||||||    
T  5096650 tagccttccaggaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttctgggtgtataatgattgacgagttggaagaggacatagaacaaatg 5096749  T
Q  319 gaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggat 418  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||   |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||      
T  5096750 gaatcattaaccattctgcttgcaaataacactggaataaaaagagtacccttttcagtagtaaggtcaaaaagcattggatacatttctctatgtggcc 5096849  T
Q  419 atgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaagtgctctttcatccccctttgaaacatctgctgccatgtc 518  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |  ||| |||||||   || ||||||||  || ||||||    
T  5096850 atgaaggattttcacgtgatgtgtttccgtctatcatctggtcttggttgtcaccaacaaataatctctcatccctagttcaaacatctaatgtcatgtc 5096949  T
Q  519 atctcttgtttctttagatataccacatagtagttctcaggaactgtcatctatttccaaccacctttcaaggcttcgaagtctatgggt 608  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| || ||||| | ||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  5096950 atcccttgtttctgtagatgtaccaaatagtagttcccatgaactattatcgatttccaagtaccttccaagtcttcgaagtctttgggt 5097039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 5354971 - 5354430
Alignment:
Q  1 ttctctttaatatttatattcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatca 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||  |||||| | || |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||   ||    
T  5354971 ttctctttaatatgtatgttcttgcagagaatggagcatctgaaaattctcaatcttagtcattcacattgtctgacacatacccctgacttttcttaca 5354872  T
Q  101 tgcctaatcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttgga 200  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||   ||| ||||| |  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |    
T  5354871 tgcctaatcttgaaaagcttgtactcaaagattgtccaatgttatctgaagtttctccaagcattggacatctcaataaaattcttctgataaatttcaa 5354772  T
Q  201 agattgtattagcctttctaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaa 300  Q
    ||| || |||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||  || | |  |||||||||||    
T  5354771 agactgcattaacctttctagcctcccaagaagcatctacaagttgaaatctttgaaaactctcattctttctggttgtaaaaagttagacaagttggaa 5354672  T
Q  301 gaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggt 400  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||  || || || ||||||||||| |    
T  5354671 gaggacttggaacaattggaatctttaaccaccctgcttgcaaatgacactgcaataacaagagtacccttctcaatagttagttccaaaagcattggat 5354572  T
Q  401 atatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaagtgctctttcatccccctttga 500  Q
    |||||||| | || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||   ||| || ||| |    
T  5354571 atatttctttatgtggctatgaaggattctcacgtgatgtgtttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaaataatctccgatctccatttca 5354472  T
Q  501 aacatctgctgccatgtcatctcttgtttctttagatatacc 542  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  5354471 aacatctgctgccatgtcatctcttgtttcttttgatgtacc 5354430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 19 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 5067033 - 5066444
Alignment:
Q  19 ttcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagc 118  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||| |||||  || ||||| |||||||||   |||||||||||||||||||    
T  5067033 ttcttgcagaggatggaaaagctgaaaattctaaatcttagccattctcattgtctgatgcacacccctgacttttcatatatgcctaatcttgaaaagc 5066934  T
Q  119 taatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttc 218  Q
    || ||||||||||||||||||  |||   |||||||| | ||  || ||| | |||    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||      
T  5066933 tagtactcaaagattgtccaatattgtccgaggtttctcctacaataggaaaactcagtgaaattcttctaatagatttggaagattgtgttagccttcg 5066834  T
Q  219 taaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatg 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  5066833 taaccttccaagaagcatctataagttgaaatctcttaaaactctcattctttctgggtgtataatgattgacaagttagaagaggacatagaacaaatg 5066734  T
Q  319 gaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||| |||  | |||||||||   |||||||||||||||||||| || || ||| ||||||| |    
T  5066733 gaatctttaaccactctgcttgcacataaaactgcaataaaaagaatacccttttcagtagtaaggtcaaaaagcattggatacatctctttgtgcggct 5066634  T
Q  419 atgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaagtgctctttcatccccctttgaaacatctgctgccatgtc 518  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||  ||||||  ||| |||||||| ||  |||| |    
T  5066633 atgaaggattctcgcgtgatgtgtttccatctatcattttgtcttggatgtcaccaacaaataatctcccatccctatttcaaacatctactatcatgcc 5066534  T
Q  519 atctcttgtttctttagatataccacatagtagttctcaggaactgtcatctatttccaaccacctttcaaggcttcgaagtctatgggt 608  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  5066533 atctcttgttcctttagatgtaccacatagtagctcccatgaactatcatcaatttccaagtaccttccaagtcttcgaagtctttgggt 5066444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 30 - 576
Target Start/End: Original strand, 5425663 - 5426209
Alignment:
Q  30 gatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagctaatactcaaa 129  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |  ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  5425663 gatggaaaagctgaaaattctaaatcttagtcattctcattgtctgacgcgcacccctgactttacattcatgcctaatcttgaaaagctggtgctcaaa 5425762  T
Q  130 gattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttctaaccttccaa 229  Q
    |||||||||| ||||  |||| |||| | |||||||||| |||||    |||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||   | ||||||||    
T  5425763 gattgtccaatgttgtctgagatttctcctagcattggaaatctcagagaaattcttctaataaatttagaagattgtgttcgccttcaaagccttccaa 5425862  T
Q  230 gaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaac 329  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5425863 gaaacatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttctgggtgtgtaatgattgacaagttggaagaggacatagaacaaatggaatctttaac 5425962  T
Q  330 cactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattc 429  Q
    ||||||| ||||| || | |||| ||||| ||| || |||||||||   |||| |||| |||||||||| || || ||| ||||||| |||||||||||     
T  5425963 cactctgattgcacataaaactgcaataaaaagagtacccttttcagtggtaatgtcacaaagcattggatacatctctttgtgcggctatgaaggattt 5426062  T
Q  430 tcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaagtgctctttcatccccctttgaaacatctgctgccatgtcatctcttgttt 529  Q
    ||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  |||  ||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||||||     
T  5426063 tcacgtgatgtgtttccagcgatcatttggtcttggatgtcaccaacaaataatctcccatccccatttcaaacatctgatatcatgtcatctcttgttc 5426162  T
Q  530 ctttagatataccacatagtagttctcaggaactgtcatctatttcc 576  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||    
T  5426163 ctttagatgtaccacatagtaattcccaggaactatcatcgatttcc 5426209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 5102953 - 5102364
Alignment:
Q  19 ttcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagc 118  Q
    |||||| ||| | |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  5102953 ttcttgcagaggttggaaaagctgaaaattctaaatcttagtcattctcattgtctgacgcacacccctgacttttcatacttgcctaatcttgagaagc 5102854  T
Q  119 taatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttc 218  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||  ||||||||  | || ||||||| |||||    |||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||      
T  5102853 tggtactcaaagattgtccaatgttgtctgaggtttgtcctaccattggagatctcactgaaatacttctaatagatttggaagattgtgttagccttcg 5102754  T
Q  219 taaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatg 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5102753 tagccttccaagaagcatctataagttgaaatctttgaaaatactcattctttctgggtgtttaatgattgacaagttggaagacgacttggaacaaatg 5102654  T
Q  319 gaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggat 418  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||  |||||| ||||||||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |    
T  5102653 gaatcattaaccactcttctagcaaacaacactgcaataacaacagtgcccttttcagtagtaaggtcaaaaagcattggatatatctctctatgtggct 5102554  T
Q  419 atgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaagtgctctttcatccccctttgaaacatctgctgccatgtc 518  Q
    |||||||| | |||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||| || |||  ||| ||||||||  |  ||||||    
T  5102553 atgaaggactttcacatgatgtgtttccatctatcatctggtcttggatgtcaccaacaaataatcttccacccctatttcaaacatctaatatcatgtc 5102454  T
Q  519 atctcttgtttctttagatataccacatagtagttctcaggaactgtcatctatttccaaccacctttcaaggcttcgaagtctatgggt 608  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||   ||||| |||  ||||||||||| |||||    
T  5102453 atctcttgttcctctagatgtaccacatagtagttcccacgaactatcatcgatttccatgtaccttccaaatcttcgaagtctttgggt 5102364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 475
Target Start/End: Original strand, 5447329 - 5447785
Alignment:
Q  19 ttcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagc 118  Q
    |||||| ||| |||||| || || |||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| | | ||| |||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  5447329 ttcttgcagaggatggaaaatctgaaaaatctcaatcttagtcattctcatcgtctgacaaacatcccggacttttcatgcttgcctaatcttgaaaagc 5447428  T
Q  119 taatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttc 218  Q
    || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  5447429 tagtactcaaagattgtccaatgttgtctgaggtttctcctagcattggacatctcaataaaattcttctgataaatttggaagattgtattggcctagg 5447528  T
Q  219 taaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatg 318  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  5447529 taacctcccaagaagcatctataagttgaaatctttgaaaactctcattctttctggttgtttaaagattgacaagctggaagaggacttggaacagatg 5447628  T
Q  319 gaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||  |||||||||||    || ||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5447629 gaatctttaaccactctgcttgcaaataatacttcaataacaacagtgcccttttcggtagttaggtcgaagagcattggatatatttctttgtgcggat 5447728  T
Q  419 atgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaa 475  Q
     |||||||| ||| | |||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  5447729 ttgaaggatcctcgcatgatgtgtttccatctattattcggtcttggatgtcaccaa 5447785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 608
Target Start/End: Original strand, 5370313 - 5370902
Alignment:
Q  19 ttcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagc 118  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||     
T  5370313 ttcttgcagatgatggaaaagctaaaaattctaaatcttagtcattctcattgtctgacgcacaccccagacttttcatacttgcctaagcttgaaaagt 5370412  T
Q  119 taatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttc 218  Q
    || |||||||||||||| ||| | ||  ||||||||| | |||||||||  |||||| | |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||      
T  5370413 tagtactcaaagattgttcaatgctgtctgaggtttctcctagcattgggaatctcggcgaaattcttctaatagattttgaagattgtgttagccttcg 5370512  T
Q  219 taaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatg 318  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||||||||||||||  | ||||| |||    
T  5370513 taaccttccaagaagcatttataagttgaaatctctaaagactcttattctttcagggtgtgtaatgattgagaagttggaagaggatatagaacagatg 5370612  T
Q  319 gaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggat 418  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| || |||||||||   ||| |||||||||||||||| || |||||  |||| ||      
T  5370613 gaatcattaaccactctgcttgcaaataacactgcaataaaaagggtacccttttcagtagtacggtcaaaaagcattggatacatttcattgtgtggcc 5370712  T
Q  419 atgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaagtgctctttcatccccctttgaaacatctgctgccatgtc 518  Q
    ||| |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||  || |||  ||| |||||| |  |   |||||    
T  5370713 atgtaggattttcacatgatgtttttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaaattatctcccacccctatttcaaacatgtaatatgatgtc 5370812  T
Q  519 atctcttgtttctttagatataccacatagtagttctcaggaactgtcatctatttccaaccacctttcaaggcttcgaagtctatgggt 608  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||| |||  ||||| |||  ||||||||||| |||||    
T  5370813 atctcttgttcctttagatgtaccacatagtagttcccatgaactatcatcaattttcaagtaccttccaattcttcgaagtctttgggt 5370902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 8 - 608
Target Start/End: Original strand, 5383057 - 5383657
Alignment:
Q  8 taatatttatattcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaa 107  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||  || ||||| || || |||||||| |||||||| |||   |||||||||||||| ||||   |||||||    
T  5383057 taatatttatgttcttgcagaggatggagatactgaaaatcctaaaccttagtcattctcattacctggtgcagaccccagacttctcaaatttgcctaa 5383156  T
Q  108 tcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgt 207  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||   |||||||| | |||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  5383157 tcttgaaaagctagtactcgcagattgtccgaggttgtccgaggtttctcctagcattggagatctcaagaaaattcttctgattaatttggaagactgt 5383256  T
Q  208 attagcctttctaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggact 307  Q
     ||||||| | || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| ||||||||||||||||     
T  5383257 gttagcctatgtagcctcccaagaagcatttataagttgaaatctctgaaaactctcattctttctggttgtttaaagattaccaagttggaagaggaca 5383356  T
Q  308 tggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttc 407  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||| ||||||||| || ||| |||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  5383357 tagaacaaatggaatctttaactactttgcttgcagataacactgcaataacaagagttcccctttcaattttaaggtcaaaaagtattgtatatatttc 5383456  T
Q  408 tctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaagtgctctttcatccccctttgaaacatct 507  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||  ||||||||||||  |||||| |  |||  ||| ||  ||| |||||||     
T  5383457 tttgtgcggccatgaaggattctcacgtgatgtgtttccatccatcattaagtcttggatgtcctcaacaaataatctcccattccattttcaaacatca 5383556  T
Q  508 gctgccatgtcatctcttgtttctttagatataccacatagtagttctcaggaactgtcatctatttccaaccacctttcaaggcttcgaagtctatggg 607  Q
    |||  ||||||||||| |||| |||| ||| |||||| ||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||| ||||  |||| ||||| ||||    
T  5383557 gctatcatgtcatctcatgttcctttcgatgtaccacgtagtagttcccatgacctatcatcaatttccaagtaccttccaagtattcgcagtctttggg 5383656  T
Q  608 t 608  Q
    |    
T  5383657 t 5383657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 602
Target Start/End: Original strand, 5396681 - 5397275
Alignment:
Q  8 taatatttatattcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaa 107  Q
    |||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5396681 taatatttatgttcttgcagaggctggagaagctgaaaattctcaatcttagtcattctcattatttgacacagaccccagacttttcaaacatgcctaa 5396780  T
Q  108 tcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgt 207  Q
    ||||||| | ||| || |||  |||||||||| ||||   || ||||||||||  |||||| ||||  | ||||| ||||| |||||||||||  |||||    
T  5396781 tcttgaacaactagtagtcactgattgtccaaagttgtcagaagtttcccataatattggagatctgaaaaaaatacttctaataaatttggagaattgt 5396880  T
Q  208 attagcctttctaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggact 307  Q
    ||||  |||   | |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||  ||||||| ||||||| | ||||| |||| |||||||| || |    
T  5396881 attaagcttcaaagccttccaagaagtatttataagttgaaatcactacaaactcttcttctttctgggtgtttactgattgacaaattggaagaagatt 5396980  T
Q  308 tggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttc 407  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  || |||||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| | |||||| |||||||||||| | ||| ||    
T  5396981 tggaacagatggaatctttaaccaccttggttgcaaataacactgcaataaaaagagtgccgttttcaattttaaggttaaaaagcattggatttatctc 5397080  T
Q  408 tctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaagtgctctttcatccccctttgaaacatct 507  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| ||||  | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |   ||  |||  || ||| ||||||||    
T  5397081 tttgtgcggatatgaaggattttcatgtgaagtgtttccagctatcatttcgtcttggatgtcaccaacaattaacctcccatttccatttcaaacatct 5397180  T
Q  508 gctgccatgtcatctcttgtttctttagatataccacatagtagttctcaggaactgtcatctatttccaaccacctttcaaggcttcgaagtct 602  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |  || ||  ||||||||| || ||||| |||||| |||| || || ||| ||||||||||||||||    
T  5397181 gctgccatgtcatctcttatttctttacacgtaacaagtagtagttcgcacgaactatcatctttttcgaaacaacttccaaggcttcgaagtct 5397275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 30 - 576
Target Start/End: Original strand, 5350149 - 5350687
Alignment:
Q  30 gatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagctaatactcaaa 129  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||  || ||||||||| ||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5350149 gatggaaaagctgaaaattctaaatcttagtcattcttgttgtctgacacacaccc--gacttttcatacatgcctaatcttgaaaagctagtactcaaa 5350246  T
Q  130 gattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttctaaccttccaa 229  Q
    |||||||||| ||||   |||||||| | |||||||||| |||||    |||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||   | ||||||||    
T  5350247 gattgtccaatgttgtccgaggtttctcctagcattggagatctcagtgaaattcttctaatagatttggaggattgtgttagccttcaaagccttccaa 5350346  T
Q  230 gaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaac 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5350347 gaagcatctttaagttgaaatctctcaaaactctcattctttcagggtgtataatgattgacaagttggaagaggacatagaacaaatggaatctttaac 5350446  T
Q  330 cactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattc 429  Q
    ||||||||||||| || | |||| ||||| |||  | |||||||||   |||||||||||||||||||| || || ||| ||||||| |||||||||||     
T  5350447 cactctgcttgcacataaaactgcaataaaaagaatacccttttcagtagtaaggtcaaaaagcattggatacatctctttgtgcggctatgaaggattt 5350546  T
Q  430 tcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaagtgctctttcatccccctttgaaacatctgctgccatgtcatctcttgttt 529  Q
    ||||||||| | ||      |||||||   ||||||||||||||||||| |  ||   ||||||| ||| |||||||||    ||||||||||||||||     
T  5350547 tcacgtgatgtgtt------tatcattcattcttggatgtcaccaacaaataatcacccatccccatttcaaacatctgacatcatgtcatctcttgttc 5350640  T
Q  530 ctttagatataccacatagtagttctcaggaactgtcatctatttcc 576  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  5350641 ctttagatgtaccacatagtagttcccaggaactatcatcgatttcc 5350687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 478
Target Start/End: Original strand, 5433759 - 5434236
Alignment:
Q  1 ttctctttaatatttatattcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatca 100  Q
    |||||||| || ||| | |||||| |||  ||||||||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||       
T  5433759 ttctcttttatttttgtgttcttgcagagaatggagaagctgaaaattcttaaccttagtcattgtcattatctgacacaaacaccagacttttcaaatt 5433858  T
Q  101 tgcctaatcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttgga 200  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  |   |||| |||| | ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  5433859 tgcctaatcttgaaaagttagtactcacagattgtccaagtctttctgagatttctcctagcattggccatctcaatgaaattcttctgataaatttgga 5433958  T
Q  201 agattgtattagcctttctaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaa 300  Q
    |||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || |||| || |||| |||| ||||||    
T  5433959 agattgtattggcctatgtaacctcccaagaagcatatataagttgaaatctttgaaaactctcatccttactggctgtttaaagattgacaatttggaa 5434058  T
Q  301 gaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggt 400  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||  |||||    | || |||||||||||||| |    
T  5434059 gatgacttggaacatatggaatctttaaccactctgcttgcaaataacactgcaataaaaagagtgcctctttcagtactgagatcaaaaagcattggat 5434158  T
Q  401 atatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaa 478  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5434159 atatctctttgtgcggttatgaaggattctcacacgatttatttccatttatcattcagtcttggatgtcaccaacaa 5434236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 5182266 - 5181778
Alignment:
Q  19 ttcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagc 118  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||| ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||     
T  5182266 ttcttgcagaggctggagaagctgaaaattctcaatcttagtcattctcattttctgtcaaagactccagacttttcaaacttgcctaaccttgaacagt 5182167  T
Q  119 taatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttc 218  Q
    || |||||| ||||||||| | ||||  ||| |||||||| || |||||| ||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||      
T  5182166 tagtactcacagattgtccgaagttgtctgaagtttcccaaagtattggagatctcaataaaatacttttgataaatttggaagattgcattagccttca 5182067  T
Q  219 taaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatg 318  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5182066 aagccttccaagaagcatctataatttgaaatcattaaacactctcattctttctgggtgtttaatgattgacaagttggaagaggatttggaacaaatg 5181967  T
Q  319 gaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggat 418  Q
     |||||||||||||  || |||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||   |||| ||| ||||||||||  ||||||||  |||| ||||    
T  5181966 aaatctttaaccacattgattgcaaataacactgcaataacaagagtgccgttttcagtagtaaagtccaaaagcattgcatatatttccttgtgtggat 5181867  T
Q  419 atgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaagtgctctttcatccccctttgaaacatct 507  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||  ||||||| ||| ||||||||    
T  5181866 atgaaggattctcacatgatgtgtttccagcgatcatttggtcttggatgtcaccgacaaataatctcccatccccatttcaaacatct 5181778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 5284739 - 5284269
Alignment:
Q  8 taatatttatattcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaa 107  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  | ||| |||||||| | |||||||||    
T  5284739 taatatttatgttcttgcagaggatggagaagctgaaaattctcaatcttagtcattcccattatctcacacgaagccctgacttttcgaacatgcctaa 5284640  T
Q  108 tcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgt 207  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |   ||||||||| | |||||||||| ||||| | ||||||  | |||||||||| |||| ||||    
T  5284639 tcttgaaaagctagtgctcaaagattgtccaaggctatctgaggtttcacctagcattggaaatctcaataaaattgctttgataaattttgaaggttgt 5284540  T
Q  208 attagcctttctaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggact 307  Q
    |||||| | | || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5284539 attagcttatgtagcctcccacgaagcatctataagttgaaatctctaaaaactttcattctttttgggtgttcaatgattgacaagttggaagaggact 5284440  T
Q  308 tggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttc 407  Q
    | ||||| |||  |||||||||||||||| | || ||| |||| | ||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  5284439 tagaacagatgacatctttaaccactctgatagctaataacaccgcaataacaagagtgcccttttcagtagtaaggtcgaaaagcattggatatattgc 5284340  T
Q  408 tctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaa 478  Q
    | ||||||| ||||| ||| | ||| | ||| | |||||||  || |||| ||| ||||||||| ||||||    
T  5284339 tttgtgcggttatgagggactttcaagcgatgtgtttccattaataattttgtcatggatgtcagcaacaa 5284269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 5257684 - 5257297
Alignment:
Q  8 taatatttatattcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaa 107  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || | || ||| |||   | ||| |||||||| | |||||||||    
T  5257684 taatatttatgttcttgcagaggatggagaagctgaaaattctcaatcttagtcattcccgttgtctcacaagaagccctgacttttccaacatgcctaa 5257585  T
Q  108 tcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgt 207  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| | |   |  ||||||    ||||||||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  5257584 tcttgaaaagttagtactcaaagattgtccaatgctatctagggtttcttcaagcattggaaatctcaagaaaattgttttgataaatttggaagattgt 5257485  T
Q  208 attagcctttctaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggact 307  Q
    |||||| | |   | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5257484 attagcttatgcgaactcccaagaagcatctataagttgaaatctctaaaaactttcattctttctgggtgttcaatgattgacaagttggaagaggact 5257385  T
Q  308 tggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcat 395  Q
    | ||||| |||  |||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||| ||||| || |||  | |||| |||||||||||    
T  5257384 tagaacagatgacatctttaaccactctaattgcaaataacactgcaataacaagagtgccattatcagttttaagatcaaaaagcat 5257297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 361
Target Start/End: Original strand, 5446899 - 5447241
Alignment:
Q  19 ttcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagc 118  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| | ||| |||||||||| || |||||||||| |||| |    
T  5446899 ttcttgcagaggatggagaagctaaaaattctcaatcttagccattcgcactatctcacacaaagccctgacttttcaaacacgcctaatcttcaaaaac 5446998  T
Q  119 taatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttc 218  Q
    || ||||||||||||| |||  ||||  ||||||||| | ||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |     
T  5446999 tagtactcaaagattgcccactgttgtctgaggtttcacctagcatcagacatctcaataaaattcttctgataaacttggaagactgcattagcctatg 5447098  T
Q  219 taaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatg 318  Q
    || ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||| || |||| ||||| ||||||||||||| ||  |||||    
T  5447099 tagcctcccaaaaagcatctataagttgaaatctttgaaaactctcgttctttctggttgtttaaagattgacaaggtggaagaggacttcgagaaaatg 5447198  T
Q  319 gaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaa 361  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||    
T  5447199 gaatctttaaccactcttcttgcaaataacacttcaataacaa 5447241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 357 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 5243914 - 5243659
Alignment:
Q  357 aacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatt 456  Q
    |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||     
T  5243914 aacaagagtgcccttttcagtagtaaggtcaaaaagcatcggatatatttctttgtgtggctatgaaggattttcacgcgatgtatttccatctatcatc 5243815  T
Q  457 tggtcttggatgtcaccaacaagtgctctttcatccccctttgaaacatctgctgccatgtcatctcttgtttctttagatataccacatagtagttctc 556  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  5243814 tggtcttggatgtcaccaacaagttctctttcatcccaagttcaaacatctcctgcgatgtcatctctggtttctttagatataccgcatagtagctccc 5243715  T
Q  557 aggaactgtcatctatttccaaccacctttcaaggcttcgaagtctatgggtagag 612  Q
    | || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  5243714 aagagctgtcaactatttccatccacctttcaaggcttcgaagcctattggtagag 5243659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5244206 - 5243910
Alignment:
Q  19 ttcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagc 118  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||  |||| | |||||||||||||    
T  5244206 ttcttgtggatgatggaaaagctaaaaattctaaatcttagtcattctcattgtctgacgcacaccccagacttttcatacatgtcaaatcttgaaaagc 5244107  T
Q  119 taatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttc 218  Q
    || |||||||||||||| ||  ||||   ||| |||| | |||||||||  |||||    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||      
T  5244106 tagtactcaaagattgttcagtgttgtccgagatttctcctagcattgggaatctcagtgaaattcttctaatagatttggaagattgtgttagccttcg 5244007  T
Q  219 taaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaa 315  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  5244006 aagccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactttcattctctcagggtgtataatgattgagaagttggaagaggacttggaacaa 5243910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5147235 - 5147004
Alignment:
Q  19 ttcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagc 118  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||| | |    
T  5147235 ttcttgcagaggatggagaagctaaaaattctcaagcttagtcactctcattatttgacacagaccccaaactttttaaacttgcctaatcttgaacaac 5147136  T
Q  119 taatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttc 218  Q
    || |||||   |||||||||| ||||  ||| ||||| ||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  5147135 tagtactctctgattgtccaatgttgtctgaagtttctcatagtattggatatctcaataaaattcttctgataaatttggaagattgtactagccttcg 5147036  T
Q  219 taaccttccaagaagcatctataagttgaaat 250  Q
     |  ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  5147035 aagtcttccaagaagtatatataggttgaaat 5147004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 257 - 467
Target Start/End: Original strand, 5281280 - 5281490
Alignment:
Q  257 aaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaat 356  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| |||||||||| |||    
T  5281280 aaactctgattctttctgggtgttcaatgattaacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatccttaacgaccctgattgctaatgacactgcaat 5281379  T
Q  357 aacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatt 456  Q
    |||||| || |||||| ||   | |||||  |||| |||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  5281380 aacaagagttccctttgcagtaggaaggttgaaaaacattggatatatttctttctgcggctataaaggattctcacgtgatgtagttccatatatcatt 5281479  T
Q  457 tggtcttggat 467  Q
     ||||||||||    
T  5281480 cggtcttggat 5281490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 257 - 467
Target Start/End: Original strand, 5179521 - 5179731
Alignment:
Q  257 aaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaat 356  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||| |||| |||||||||| |||    
T  5179521 aaactctgattctttctgggtgttcaaagattaacaagttggaagaggacttggaagaaatggaatccttaacgaccctgattgctaatgacactgcaat 5179620  T
Q  357 aacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatt 456  Q
    ||| || || |||||| ||   | |||||  |||| |||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  5179621 aactagagttccctttgcagtaggaaggttgaaaaacattggatatatttctttctgcggctataaaggattctcacgtgatgtagttccatatatcatt 5179720  T
Q  457 tggtcttggat 467  Q
     ||||||||||    
T  5179721 cggtcttggat 5179731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 457 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 5137567 - 5137416
Alignment:
Q  457 tggtcttggatgtcaccaacaagtgctctttcatccccctttgaaacatctgctgccatgtcatctcttgtttctttagatataccacatagtagttctc 556  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||  || |||  ||| ||||||||  |  |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |    
T  5137567 tggtcttggatgtcaccaacaaataatctcccacccctatttcaaacatctaatatcatgtcatctcttgttcctctagatgtaccacatagtagttccc 5137468  T
Q  557 aggaactgtcatctatttccaaccacctttcaaggcttcgaagtctatgggt 608  Q
    | ||||| ||||| |||| |    ||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  5137467 acgaactatcatcgattttcgtgtaccttccaagtcttcgaagtctttgggt 5137416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 548 - 611
Target Start/End: Original strand, 5434459 - 5434522
Alignment:
Q  548 gtagttctcaggaactgtcatctatttccaaccacctttcaaggcttcgaagtctatgggtaga 611  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  5434459 gtagttcacatgaactgtcgtctatttccaaccagctttcagggcttcaaagtctatggataga 5434522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 534
Target Start/End: Original strand, 4344388 - 4344903
Alignment:
Q  19 ttcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagc 118  Q
    |||||| ||| ||||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  4344388 ttcttgcagaggatggatcagctgaaaattctcaatctcagtcattctcattgtctgacacagacgcctgacttttcatacttgcctaatcttgaaaagc 4344487  T
Q  119 taatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttc 218  Q
    || |||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||     
T  4344488 tagtactcaaagattgtccaaggctgtctgagatttcccaaagtattggacatctcaacaaaattcttttgataaatttgaaaaattgtattagcctttg 4344587  T
Q  219 taaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatg 318  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4344588 taaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaatgattgacaagttggaagaggacttggaacaaatg 4344687  T
Q  319 gaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggat 418  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||  || |||||||||   |||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| ||||    
T  4344688 gaatctttaaccactctgattgcaaataacactgctataacaaaagtacccttttcagtagtaaggtcaaaacgcattggatttatttctttgtgtggat 4344787  T
Q  419 atgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaagtgctctttcatccccctttgaaacatctgctgccatgtc 518  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  || | ||| ||||| ||||||  |||||    
T  4344788 atgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttggtcttggatgtcaccaacaaatggtctctcgcccacttttcaaacaactgctgggatgtc 4344887  T
Q  519 atctcttgtttcttta 534  Q
    ||| ||||||||||||    
T  4344888 atcgcttgtttcttta 4344903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 534
Target Start/End: Original strand, 4360830 - 4361334
Alignment:
Q  30 gatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagctaatactcaaa 129  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  4360830 gatggagcagctgaaaattctcaatcttagtcattctcaatatctgacacagacgcctgacttttcatacttgcctaatcttgaaaagctagtacttaaa 4360929  T
Q  130 gattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttctaaccttccaa 229  Q
    |||||||||||| ||  |||| ||||||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4360930 gattgtccaaggctgtctgagatttcccaaagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgcattagcctttgtaaccttccaa 4361029  T
Q  230 gaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaac 329  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4361030 gaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttcaatgattgacacgttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaac 4361129  T
Q  330 cactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattc 429  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||  || |||||||||| |||||| |||||| ||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  4361130 cactctgattgcaaataacactggtataacaaaagtacccttttcaattgtaagatcaaaacgcattggatttatttctttgtgtggatatgaaggattc 4361229  T
Q  430 tcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaagtgctctttcatccccctttgaaacatctgctgccatgtcatctcttgttt 529  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||  || | ||| ||||| ||||||  |||||||| |||||||    
T  4361230 tcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgtcaccaacaaatggtctctcgcccacttttcaaacaactgctgggatgtcatcccttgttt 4361329  T
Q  530 cttta 534  Q
     ||||    
T  4361330 tttta 4361334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 4320976 - 4320502
Alignment:
Q  1 ttctctttaatatttatattcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatca 100  Q
    |||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||  |     
T  4320976 ttctctataatatttttatttttgcagaggatggagcagctgaagattctaaatcttagtcattctcatcatttgacacagacccctgacttttcatact 4320877  T
Q  101 tgcctaatcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttgga 200  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||||||||||| |    
T  4320876 tgcctaatcttgaaaagctagtgctcgaagattgcccaaggctgtctcaggtttcccatagcattggacatctcaaaaaagttgttttgataaatttgaa 4320777  T
Q  201 agattgtattagcctttctaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaa 300  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||| ||||||| |||||||||||    
T  4320776 agattgtattagcctttgtagccttccaagaaacatctatacgttgaaaactctgaatactctcattctatcgggatgtttaatgattgacaagttggaa 4320677  T
Q  301 gaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||| |||||||  || |||||||||   |||||||||||||||||||| |    
T  4320676 gaggacttggaacaaatggaatctttaaccaccctgattgcaaataatactggtataacaaaagttcccttttcattagtaaggtcaaaaagcattggat 4320577  T
Q  401 atatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaa 475  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4320576 ttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttggtcttggatgtcaccaa 4320502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 4124296 - 4123819
Alignment:
Q  1 ttctctttaatatttatattcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatca 100  Q
    |||||| |||||||| | |||||| |||  |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |     
T  4124296 ttctctataatatttctgttcttgcagagaatggagcagctgaaaattctcaatcttagtcattctcattatctgacacagacccctgacttttcatact 4124197  T
Q  101 tgcctaatcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttgga 200  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||  |||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||| |    
T  4124196 tgcctaaccttgaaaagctggtactcaaagattgtccaaggctgtctgaggtatcccatacaattggacatcttaagaaagttcttttgataaatttgaa 4124097  T
Q  201 agattgtattagcctttctaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaa 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| |||||||||||    
T  4124096 agattgtactagcctttctaaccttccaagaaacatttattcgttgaaatctctgaaaactctcattctatcgggatgtttaatgattgacaagttggaa 4123997  T
Q  301 gaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggt 400  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||  |||||||  |||||||||||    |||||||||||||||||||| |    
T  4123996 gaggagttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaataatactgctataacaaaagtgcccttttcggtagtaaggtcaaaaagcattggat 4123897  T
Q  401 atatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaa 478  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4123896 ttatttctctgtgtggatatgaaggattctctcgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaa 4123819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 478
Target Start/End: Original strand, 4335087 - 4335546
Alignment:
Q  19 ttcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagc 118  Q
    |||||| ||| ||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||  | |||||||||||||||| |    
T  4335087 ttcttgcagaggatggagcagttgaaaattctcaatcttagtcattctcattatctaacacagacccctgatttttcatacttgcctaatcttgaaaacc 4335186  T
Q  119 taatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttc 218  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||  |||||| |||||||  |||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  4335187 tagtactcaaagattgtccgaggctgtctgaggtatcccatacaattggacatcttaagaaagttcttttgataaatttgaaagattgcattagcctttg 4335286  T
Q  219 taaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatg 318  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4335287 taaccttccaagaaacatctatacgttgaagtctctgaaaactctcattctatcaggatgtttaaagattgacaagttggaagaggacttggaacaaatg 4335386  T
Q  319 gaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggat 418  Q
    |||||||||||||||||  | ||| || ||||||| |||||||  ||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||| || |    
T  4335387 gaatctttaaccactctcatggcagataacactggtataacaaaagtgcccttttcagtagtaaagtcaaaaagcattggctatatctctttgtgtgggt 4335486  T
Q  419 atgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaa 478  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  4335487 atgaaggattctcccgtgatgtgtttccttctataatttggtcttggatggtaccaacaa 4335546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 4133762 - 4133373
Alignment:
Q  19 ttcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagc 118  Q
    |||||| ||| | ||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| |    
T  4133762 ttcttgcagaggctggagaatctaaaatttctcaatcttagtcattctcattgtctagtacagaccccagatttttcacacatgcctaatctagaaaaac 4133663  T
Q  119 taatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||| |||||| | ||| ||||  | ||||||||| |||| |||| |||||||      
T  4133662 taatactcaaagattgtccaaggctgtctgaggtttcccataccattggtcatctccataaagttctcattataaatttgaaagactgtactagccttcg 4133563  T
Q  219 taaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatg 318  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||| |||| |||||  |||||||||||||||||    
T  4133562 taaccttccaagaaccatctattcgttgaaatctctgaaaactcttattctttctggctgtttaattattgacaaattgga--aggacttggaacaaatg 4133465  T
Q  319 gaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctct 410  Q
    || ||||||||||||||| |||   || |||||| ||||||||  ||||||||||||   | |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4133464 gagtctttaaccactctgattgtggataacactgcaataacaaaagtgcccttttcagtcgcaaggtcaaaaagcattgaatatatttctct 4133373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 6498865 - 6498410
Alignment:
Q  19 ttcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagc 118  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  || |||   | |||||||||||| |   | |||||||| |||||||||    
T  6498865 ttcttgcagatgctagagaatcttaaaattcttaatcttagtcattctcagaatttgattgaaaccccagactttacgtacttgcctaatattgaaaagc 6498766  T
Q  119 taatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttc 218  Q
    || |||||||||| |||||||| |||  |  ||| |||||||||||||||  ||||   ||| ||||  |||| ||||||   || || | | | |||      
T  6498765 tagtactcaaagactgtccaagtttgtctacggtctcccatagcattggatctctctgtaaacttctaatgattaatttgacggactgcactggtcttca 6498666  T
Q  219 taaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatg 318  Q
     |||||||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||| | |||||||| || ||||| | |||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||    
T  6498665 aaaccttccgagaagcatctataaattaaaatctctagaaactttgattctttctggatgttccaagattgacaaattggaggaggacgtggaacagatg 6498566  T
Q  319 gaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggat 418  Q
    ||||| || || ||  || ||||  || | ||||  |||||||  || ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || |||||| |  | ||||    
T  6498565 gaatcattgacaaccttgattgcggataagactgctataacaaaagttcccttttcaatagtaagatcaaaaagcattggatacatttctttaggtggat 6498466  T
Q  419 atgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcacca 474  Q
     | ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6498465 ttaaaggattttcacgtgatgtatttccttctctcattcggtcttggatgtcacca 6498410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 474
Target Start/End: Original strand, 6650872 - 6651264
Alignment:
Q  82 accccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaa 181  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||   || ||| |||| ||||||||||  |||  | |||     
T  6650872 accccagacttttcattcatgcctaatcttgaaaagctagtactcaaagactgtccaagattaactgcggtctcccgtagcattggatctctgcataaac 6650971  T
Q  182 ttcttctgataaatttggaagattgtattagcctttctaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttc 281  Q
    ||||||| |||||||||  ||| || |  || |||   || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  ||||| | |||||||| || |||||    
T  6650972 ttcttctaataaatttgacagactgcacaagtcttcagaaacttcctagaagcatatataaattaaaatctctagaaactttgattctttctggatgttc 6651071  T
Q  282 aatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgta 381  Q
     | |||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||  || ||||  || | ||||  |||||||  ||||| |||||||  |||    
T  6651072 caagattgacaaattggaggaggacttggaacagatggaatcattgaaaaccttgattgcggataagactgctataacaaaagtgccgttttcaatagta 6651171  T
Q  382 aggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcacca 474  Q
    || | || || |||||| ||||||||||| || || | ||||||||| ||||| ||| ||||||| | | || || |||||||||||||||||    
T  6651172 agattaagaaacattggatatatttctctatgtggctttgaaggattttcacgagatgtatttccttttctcgttcggtcttggatgtcacca 6651264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 6621852 - 6621391
Alignment:
Q  13 tttatattcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttg 112  Q
    ||||| |||||| ||||| |  |||| || |||||||| ||||||||||| |||    || ||||  | |||||||| ||||||  |||||||||||| |    
T  6621852 tttattttcttgcagatgctaaagaatctaaaaattcttaatcttagtcattctttggatttgactgaaaccccagatttttcatacatgcctaatctcg 6621753  T
Q  113 aaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattag 212  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| |||  |   || |||||||||||||||  |||| | ||| |||| || |||||||||  ||| || ||  |    
T  6621752 aaaagctagtgctcaaagactgtccaagtttgtctacagtctcccatagcattggatctctccataaacttctccttataaatttgacagactgcatacg 6621653  T
Q  213 cctttctaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaa 312  Q
     |||  ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||| | |||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  6621652 tcttcgtaaacttccaagaagcatctataaattaaaatctctagaaactttaattctttcaggatgttccatgattgacaaattggaggaggacttggaa 6621553  T
Q  313 caaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgt 412  Q
    || |||||||| || || ||  || ||||  || | ||||  |||||||  || ||||||||||  ||| | || |||| |||||| ||||||||| | |    
T  6621552 cagatggaatcattgacaaccttgattgcggataagactgctataacaaaagttcccttttcaatagtacgatctaaaaacattggatatatttctttat 6621453  T
Q  413 gcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcacca 474  Q
    | |||| ||||||||| ||||| ||| | ||||| ||  | ||| | |||||||||||||||    
T  6621452 gtggatttgaaggattttcacgggatgtgtttccttcacttattcgctcttggatgtcacca 6621391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 6532545 - 6532116
Alignment:
Q  45 aattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttg 144  Q
    |||||| ||||||||||| ||||   || ||||  | |||||| ||||||||   |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||    
T  6532545 aattcttaatcttagtcattctctacatttgactgaaaccccaaacttttcatatatgcctaatcttgaaaagttagtactcaaagactgtccaagtttg 6532446  T
Q  145 cgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttctaaccttccaagaagcatctataagt 244  Q
      || ||| |||||||||||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||  ||| || |   | |||   ||  |||||||||| || ||||| |    
T  6532445 tctgcggtctcccatagcattggatctctccaaaaacttcttctgataaatttgacagactgcacaggtcttcaaaaaattccaagaagtatttataaat 6532346  T
Q  245 tgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaa 344  Q
    | ||||||||  ||||  | |||||||| || ||||| | ||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||||||| || || ||  || ||||  |    
T  6532345 taaaatctctagaaaccttgattctttcaggatgttccaagattaacaaattggaggaggacatagaacagatggaatcgttgacaaccttgattgcgga 6532246  T
Q  345 tgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatattt 444  Q
    | | ||||  ||| ||   || ||||||||||  |||||  |||||| |||||  ||||||||| | ||||| | ||||||||| |||  |||| |||||    
T  6532245 taagactgctatagcagaagtccccttttcaatagtaagaccaaaaaacattgaatatatttctatttgcggctttgaaggattttcaaatgatgtattt 6532146  T
Q  445 ccatctatcatttggtcttggatgtcacca 474  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6532145 ccttctatcattcggtcttggatgtcacca 6532116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 467
Target Start/End: Original strand, 6752726 - 6753150
Alignment:
Q  43 aaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggt 142  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  || ||||  | || ||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |    
T  6752726 aaaattcttaatcttagtcattctcaggatttgaccgaaactccagacttttcatatatgcctaatcttgaaaagcttgtactcaaagactgtccaagtt 6752825  T
Q  143 tgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttctaaccttccaagaagcatctataa 242  Q
    ||  |   || |||||||||||||||  |||  | ||  ||||||||||| |||||  ||| || |  || |||   || ||||| ||| |||| |||||    
T  6752826 tgtctacagtctcccatagcattggatctctacataatcttcttctgatagatttgacagactgcacgagtcttcagaaacttcctagatgcatatataa 6752925  T
Q  243 gttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgca 342  Q
     || ||||||||  ||||| | |||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||  || ||||     
T  6752926 attaaaatctctagaaactttgattctttctggatgttccatgattgacaaattggaggaggacttggaacagatggaatcattgattaccttgattgcg 6753025  T
Q  343 aatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatat 442  Q
     || | ||||  |||||||  |||||||||||||  ||||| |  ||||||||||| ||||||||| |  | || | ||||||||| ||||||||| |||    
T  6753026 gataagactgctataacaaaagtgcccttttcaatagtaagattgaaaagcattggatatatttcttttcgtggctttgaaggattttcacgtgatgtat 6753125  T
Q  443 ttccatctatcatttggtcttggat 467  Q
    | || ||| ||||| ||||||||||    
T  6753126 tcccttctctcattcggtcttggat 6753150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 6545724 - 6545332
Alignment:
Q  82 accccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaa 181  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||| |||  |   || |||||||||||||||  |||  | |||     
T  6545724 accccagacttttcatatatgcctaatcttgaaaagatagtactcaaaggctgtccaagtttgtctacagtctcccatagcattggatctctacataaac 6545625  T
Q  182 ttcttctgataaatttggaagattgtattagcctttctaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttc 281  Q
    ||||||| |||||||||  ||| || |   | |||   || ||||| | |||||||||||| || ||||||||  ||||| | |||||||| || |||||    
T  6545624 ttcttctaataaatttgacagactgcacaggtcttcgaaaacttccgaaaagcatctataaattaaaatctctagaaactttgattctttcgggatgttc 6545525  T
Q  282 aatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgta 381  Q
     | ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||  || ||||  || | ||||  |||||||  |||||||||||||  ||     
T  6545524 caagattaacaaattggaggaggacttggaacagatggaatcgttgaaaaccttgattgcggataagactgctataacaaaagtgcccttttcaatagtt 6545425  T
Q  382 aggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcacca 474  Q
    || |  ||||||||||| ||||||||| |  | || | ||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  6545424 agattgaaaagcattggatatatttcttttcgtggctttgaaggattttcacgtgatgtattcccttctctcattcggtcttggctgtcacca 6545332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 326
Target Start/End: Original strand, 6815275 - 6815519
Alignment:
Q  82 accccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaa 181  Q
    |||||||||||| ||  | |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||  |   || |||||||| ||||||  |||  | ||||    
T  6815275 accccagactttacatacttgccaaatcttgaaaagctagtactcaaaaattgtccaagtttgtctacagtctcccatagtattggatctctacataaaa 6815374  T
Q  182 ttcttctgataaatttggaagattgtattagcctttctaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttc 281  Q
    ||||||| |||||||||  ||| || |   | |||   || ||||||||||||| |||||| || ||||||||  ||||| | |||||||| || |||||    
T  6815375 ttcttctcataaatttgacagactgcacaggtcttcggaaacttccaagaagcaactataaattaaaatctctagaaactttgattctttctggatgttc 6815474  T
Q  282 aatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatcttt 326  Q
     |||||| | || ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  6815475 catgattgaaaaattggaggaggacttggaacagatggaatcttt 6815519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 470
Target Start/End: Original strand, 6728172 - 6728599
Alignment:
Q  43 aaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggt 142  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||   || ||||  | ||||||||||||||   | | |||||||||||||||||  | |||||| | |||||||| |    
T  6728172 aaaattcttaatcttagtcattctctggatttgactgaaaccccagacttttcctacttacctaatcttgaaaagctcgtgctcaaaaactgtccaagtt 6728271  T
Q  143 tgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttctaaccttccaagaagcatctataa 242  Q
    ||  |  ||| ||||| |||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||  ||| ||     | |||   || |||||||||| |||||| ||    
T  6728272 tgtctacggtctcccaaagcattggatctctacaaaaaattcttctgataaatttgagagactgcgcaggtcttcggaaacttccaagaaacatctacaa 6728371  T
Q  243 gttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgca 342  Q
    ||| ||||||||  ||||| | |||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || || ||  || ||||     
T  6728372 gttaaaatctctagaaactttgattctttcaggatgttccatgattgacaaattggaggaggacgtggaacagatggaatcattgacaaccttgattgcg 6728471  T
Q  343 aatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatat 442  Q
     || | ||||  |||||||  ||||| |||||||  ||||| |  ||||| ||||| ||||||||| |  | || | ||||||||| ||||||||| |||    
T  6728472 gataagactgctataacaaaagtgccattttcaatagtaagattgaaaagtattggatatatttcttttcgtggctttgaaggattttcacgtgatgtat 6728571  T
Q  443 ttccatctatcatttggtcttggatgtc 470  Q
    | || ||| |  ||||||||||||||||    
T  6728572 tcccttctcttgtttggtcttggatgtc 6728599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 7885713 - 7885322
Alignment:
Q  36 gaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagctaatactcaaagattgt 135  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||| |||||  |  ||| ||| ||||| ||||||||||   |||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  7885713 gaagctgaaaattcttaatttgagtcattctcacaacttgagacatacccccgacttttcaaaattgccaaatcttgaaaagttaatacttaaggattgt 7885614  T
Q  136 ccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttctaaccttccaagaagca 235  Q
    || || |||  |  ||||||   ||  || ||||||||| | || |||||| | ||||||||| |||||||||   |||||    | |||||||| ||||    
T  7885613 cccagtttgtcttcggtttcttctaatataggacatctcaaaaagattcttttaataaatttgaaagattgtacaggccttcgagaacttccaaggagca 7885514  T
Q  236 tctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactct 335  Q
    | ||||||||  | || |||||||| |||||||| || || ||| |||  ||| ||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||||||  |    
T  7885513 tatataagttagactcgctgaaaacactcattctgtctggatgtacaaaaattgacaagttagaagaggatatagaacaaatgaaatctttaaccacctt 7885414  T
Q  336 gcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggat 427  Q
    | ||||  |||||||||  || ||||| ||||||||| ||   ||||| |||||||||||||  | ||||||||| || || ||| ||||||    
T  7885413 ggttgcggatgacactgctatcacaagagtgccctttgcagtagtaagatcaaaaagcattgcatttatttctctatgtggttataaaggat 7885322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 197
Target Start/End: Original strand, 6837040 - 6837194
Alignment:
Q  43 aaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggt 142  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  || ||||  | || |||||||| |||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  6837040 aaaattcttaatcttagtcattctcaggatttgactgaaactccagacttctcatatatgccgaatcttgaaaagctagtactcaaagactgtccaagtt 6837139  T
Q  143 tgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaattt 197  Q
    ||  || ||| |||||||||||||||  |||| | ||| ||||||||||||||||    
T  6837140 tgtctgcggtctcccatagcattggatctctccataaacttcttctgataaattt 6837194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 323
Target Start/End: Original strand, 6796616 - 6796833
Alignment:
Q  106 aatcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagatt 205  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||  |  ||| |||||||||||||||  |||  | ||||||||||| |||||||||  ||| |    
T  6796616 aatcttgaaaagctagtactaaaaaattgtccaagtttgtctacggtctcccatagcattggatctctacataaaattcttctcataaatttgacagact 6796715  T
Q  206 gtattagcctttctaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagagga 305  Q
    | ||  | |||   || |||||||||||||||||||  || ||||||||  ||||| | |||||||| || ||| | |||||| | || ||||| |||||    
T  6796716 gcataggtcttcggaaacttccaagaagcatctatacattaaaatctctagaaactttgattctttctggatgtaccatgattgaaaaattggaggagga 6796815  T
Q  306 cttggaacaaatggaatc 323  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  6796816 cttggaacagatggaatc 6796833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 474
Target Start/End: Original strand, 6675445 - 6675900
Alignment:
Q  19 ttcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagc 118  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||  || || |  | |||||||||||||||  | |||| ||| |||||||||    
T  6675445 ttcttgtagatgattgagaatctaaaaattcttaatcttagtcattctcaaaatttggctgaaaccccagacttttcatacttgcccaatattgaaaagc 6675544  T
Q  119 taatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttc 218  Q
    |  | |||||||| |||||||| |||  |  ||| |||||||||||||||  |||| | ||  ||||| |||||||||||   || || | | | |||      
T  6675545 tggtgctcaaagactgtccaagtttgtctacggtctcccatagcattggatctctccataagcttcttatgataaatttgacggactgcactggtcttca 6675644  T
Q  219 taaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatg 318  Q
     || ||||| |||||||| |  || || ||||||||  ||||| | |||||||| || ||||| | |||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||    
T  6675645 aaaacttccgagaagcatttgcaaattaaaatctctagaaactttgattctttctggatgttccaagattgacaaattggaggaggacgtggaacagatg 6675744  T
Q  319 gaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggat 418  Q
    |||||  | || ||  || ||||| || | || |  |||| ||  || ||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |  || ||| | || || |    
T  6675745 gaatcaatgacaaccttgattgcagataaaacagctataataaaagttcccttttcaatagtaagatcaaagagcattggattcatctctttatgtggct 6675844  T
Q  419 atgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcacca 474  Q
     ||||||||| |||| |||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  6675845 ttgaaggattttcacttgatgtatttccttctctcattaagtcttggatgtcacca 6675900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 85 - 198
Target Start/End: Original strand, 6715575 - 6715688
Alignment:
Q  85 ccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattc 184  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||  |  ||| |||||||||||||||  |||  | |||||||    
T  6715575 ccagacttttcatacatgccaaatcttgaaaagcttatactcgaagactgtccaagtttgtctacggtctcccatagcattggatctctgcataaaattc 6715674  T
Q  185 ttctgataaatttg 198  Q
    ||||||||||||||    
T  6715675 ttctgataaatttg 6715688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 6588328 - 6588084
Alignment:
Q  226 ccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatctt 325  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  |  ||||| | |||||||| || ||||| |||||| | ||  |||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  6588328 ccaagaagcatctataaattaaaatcgttagaaactttgattctttctggatgttctatgattgaaaaactggaggaggacttggaacagatggaatcgt 6588229  T
Q  326 taaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaagg 425  Q
    | |  ||  || ||||  || | ||||  || ||||  ||||| |||||||  ||||||   ||||||||||| ||||||||| | || || | ||||||    
T  6588228 tgattaccttgattgccgataagactgccatcacaaaagtgccattttcaatagtaaggatgaaaagcattggatatatttctttttgtggctttgaagg 6588129  T
Q  426 attctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtc 470  Q
    ||| ||||||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||    
T  6588128 attttcacgtgatgtattcccttctctcattcggtcttggatgtc 6588084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 478
Target Start/End: Original strand, 6758834 - 6758925
Alignment:
Q  387 aaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaa 478  Q
    |||||||||| | | |||||||||||| || | |||||||||  |||||||||||||||| | | ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6758834 aaaaagcattagatttatttctctgtgtggctttgaaggatttgcacgtgatatatttccttttgtcattcggtctaggatgtcaccaacaa 6758925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 140
Target Start/End: Original strand, 6772861 - 6772967
Alignment:
Q  34 gagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagctaatactcaaagatt 133  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||| || ||||  | |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||| |||||||  |||    
T  6772861 gagaatctaaaaattcttaatcttagtcattcccatgatttgaccgaaaccccagacttttcatacttgccgaatcttgaaaagctagtactcaagaatt 6772960  T
Q  134 gtccaag 140  Q
    |||||||    
T  6772961 gtccaag 6772967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 223 - 324
Target Start/End: Original strand, 6837220 - 6837321
Alignment:
Q  223 cttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatggaat 322  Q
    ||||| |||||||||||||  || ||||||||  ||||| | |||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  6837220 cttccgagaagcatctatacattaaaatctctacaaactttgattctttctggatgttccatgattgacaaattggaggaggatttggtacagatggaat 6837319  T
Q  323 ct 324  Q
    ||    
T  6837320 ct 6837321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 467
Target Start/End: Original strand, 6822802 - 6822881
Alignment:
Q  388 aaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggat 467  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||||| | ||||||||    
T  6822802 aaaagcattggatatatttctttatgcggctttgaaggattttcacgtgatgtattcccttctctcattcgctcttggat 6822881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 8 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 9250 - 8650
Alignment:
Q  8 taatatttatattcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaa 107  Q
    ||||||||||  ||||| ||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || |||||||||||||||    |||||||    
T  9250 taatatttatggtcttgcagaggctggcgaagctgaaaattctcaatcttagtcattctcattatttgatgcataccccagacttttcatatttgcctaa 9151  T
Q  108 tcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgt 207  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||| ||||||| ||||||   |||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  9150 tcttgaaaagctagtactcaaagattgtccaatgttgaccgaggtttctcataccattggagatctcggtgaaatacttctaatagatttggaagattgt 9051  T
Q  208 attagcctttctaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggact 307  Q
     ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||     
T  9050 gttagccttcgtagccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttctgggtgtataatgattgacaagttggaagaggaca 8951  T
Q  308 tggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttc 407  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  8950 tagaacagatggaatctttaaccactctgcttgcagataacactgcattaacaagagtgcccttttcaatagtaaggtcaaaaagtattgtatatatttc 8851  T
Q  408 tctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaagtgctctttcatccccctttgaaacatct 507  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |  |||  ||||   |||| ||||||||    
T  8850 tttgtgcggccatgaaggattctcacgtgatgtgtttccatctatcattaagtcttggatgtctccaacaaataatctcccatcttactttcaaacatct 8751  T
Q  508 gctgccatgtcatctcttgtttctttagatataccacatagtagttctcaggaactgtcatctatttccaaccacctttcaaggcttcgaagtctatggg 607  Q
     ||  ||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||| ||||  |||||||||| ||||    
T  8750 actatcatgtcatctcatgttcctttagatgtaccacgtagtagttcccaggaactatcatcaatttccaagtaccttccaagtattcgaagtctttggg 8651  T
Q  608 t 608  Q
    |    
T  8650 t 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 240; Significance: 1e-132; HSPs: 7)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 12 - 602
Target Start/End: Original strand, 8877344 - 8877934
Alignment:
Q  12 atttatattcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatctt 111  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||| || | |||||||||||    
T  8877344 atttatgttcttgcagaggatggagaagctaaaaattctcaatcttagccactctcatcatctgacacaaactccagactttttaaacttgcctaatctt 8877443  T
Q  112 gaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtatta 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||| |||| ||||  || |||| |||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8877444 gaaaagctagtactcaaagattgtccgaggttgatagagatttcgcatactataggacttctgaataaagttcttttgataaatttggaagattgtatta 8877543  T
Q  212 gcctttctaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttgga 311  Q
    |||||   | |||||||||||| || || |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  8877544 gccttcggagccttccaagaagtatatacaagttgaaatctctaaaatctctcattctttctgggtgttcaatgattgacaagttggaggaggacttaga 8877643  T
Q  312 acaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctg 411  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| || || ||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  8877644 acagatgaaatctttaaccactctgcttgcaaataacactgcaataaaaagagtaccattttcattagtaaggtcaaaaagcattggatatatttctttg 8877743  T
Q  412 tgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaagtgctctttcatccccc-tttgaaacatctgct 510  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |  || ||||| ||| |||||||| |     
T  8877744 tgcggctatgaaggattttcgcgtgatgtgtttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaaataat-taacagcccccatttcaaacatctacc 8877842  T
Q  511 gccatgtcatctcttgtttctttagatataccacatagtagttctcaggaactgtcatctatttccaaccacctttcaaggcttcgaagtct 602  Q
     | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||  ||||  |||| || || || |||||| || | |||||||||||    
T  8877843 actatgtcatctctagtttctttagatgtaccatatagtagttcccacaaactagcatcaatatcaaagcaccttccaggtcttcgaagtct 8877934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 364 - 476
Target Start/End: Original strand, 20838719 - 20838831
Alignment:
Q  364 gtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtctt 463  Q
    ||||||| |||||  | ||| |||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| |||| |||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  20838719 gtgccctattcaatagcaagatcaaaaagcattggatatatatcactatgtggatatgaaggattatcacatgatgtttttccttctctcatttggtctt 20838818  T
Q  464 ggatgtcaccaac 476  Q
    |||||||||||||    
T  20838819 ggatgtcaccaac 20838831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 388 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 12599142 - 12599054
Alignment:
Q  388 aaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaac 476  Q
    ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  12599142 aaaagcattggatatatatccttgtgtggatatgaaggattatcacgtgatgtttttccttctctcaattggtcttggatgtcaccaac 12599054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 364 - 476
Target Start/End: Original strand, 20812364 - 20812476
Alignment:
Q  364 gtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtctt 463  Q
    ||||||| |||||  | ||| |||||||||||||  ||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  20812364 gtgccctattcaatagcaagatcaaaaagcattgcatatatatcactatgtggatacgaaggattatcacgtgatgtttttccttctctcatttggtctt 20812463  T
Q  464 ggatgtcaccaac 476  Q
    |||||||||||||    
T  20812464 ggatgtcaccaac 20812476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 385 - 474
Target Start/End: Original strand, 15803019 - 15803108
Alignment:
Q  385 tcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcacca 474  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||| |||| |||| | ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  15803019 tcaaaaagcattggatatatatctctatgtggatataaaggattatcacatgatgtttttccttctctcattaggtcttggatatcacca 15803108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 388 - 478
Target Start/End: Original strand, 30417931 - 30418021
Alignment:
Q  388 aaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaa 478  Q
    ||||||||||  ||||| || ||||| |||| |||||||||  |||||||| | ||||| | | ||||  |||||||||||||||||||||    
T  30417931 aaaagcattgtttatatatccctgtgtggatttgaaggatttgcacgtgatgtttttccttgtctcatacggtcttggatgtcaccaacaa 30418021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 235 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 12599295 - 12599207
Alignment:
Q  235 atctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatc 323  Q
    |||||| | |||||| || |||||||||| || ||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| ||| | | ||| ||||||||    
T  12599295 atctatcaattgaaaactttgaaaactcttatactttctggttgttcaaagattagcaagttggaagaagacatagtacagatggaatc 12599207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 3)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 36214168 - 36213612
Alignment:
Q  19 ttcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagc 118  Q
    |||||| ||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  36214168 ttcttgcagaggctggaaaagctgaaaattctcaatcttagtcattctcattatctgacaaagactccagatttttcaaacatgcctaaccttgaaaaac 36214069  T
Q  119 taatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttc 218  Q
    || |||||| |||||||||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  36214068 tagtactcacagattgtccaagattgtctgaggtttcccacagtattggacatctcaataaagttcttctaataaatttggaagattgtattagccttca 36213969  T
Q  219 taaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatg 318  Q
     | |||||| | | | ||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  36213968 aagccttcctaaaggtatctataagttaaaattacttaaaactctcattctttctggatgttcaaagattgacaaattggaagaggacatggaacagatg 36213869  T
Q  319 gaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggat 418  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||   ||||| || |||||||| |  ||||| ||| ||||||| |    
T  36213868 gaatctttaaccaccttgattgcaaataacactgcaataacaagagtgccattttcagtagtaagatctaaaagcatcgcttatatatctttgtgcggct 36213769  T
Q  419 atgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaagtgctctttcatccccctttgaaacatctgctgccatgtc 518  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | | ||  ||| |||||||| ||  ||||||    
T  36213768 atgaaggattctcacatgatgtgtttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaaatgttctcccgttccgatttcaaacatctactatcatgtc 36213669  T
Q  519 atctcttgtttctttagatataccacatagtagttctcaggaactgtcatctatttc 575  Q
    |||||||||| || ||||| || |||| || | ||| || | ||||||||| |||||    
T  36213668 atctcttgttcctctagatgtatcacacagcaattcccatgcactgtcatcaatttc 36213612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 478
Target Start/End: Original strand, 18935156 - 18935587
Alignment:
Q  47 ttctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcg 146  Q
    |||| ||||||||||| |||||| | |||| ||| |||||  ||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||      
T  18935156 ttcttaatcttagtcattctcataacctgagacaaaccccgaacttttcaaacttgccgaatcttgaaaagttaatactcaaagattgcccaagtttgtc 18935255  T
Q  147 tgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttctaaccttccaagaagcatctataagttg 246  Q
       |||||| ||||| || |||| |||| | ||||||||| | ||||||||| |||| ||||   |||||| | | |||||||||||||||||||| ||     
T  18935256 ctcggtttctcatagtataggacttctcaagaaaattcttttaataaatttgaaagactgtacaggcctttgtgaacttccaagaagcatctataaatta 18935355  T
Q  247 aaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatg 346  Q
     | ||  | ||| |||||||| | || || ||| |||  ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||  |||||| ||||| ||| ||||  ||     
T  18935356 gagtcggtcaaagctctcattttatctggatgtacaaaaattgacaagttggaagaggacatagaacagatgacatctttgaccaccctggttgcggata 18935455  T
Q  347 acactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttcc 446  Q
    | ||||   ||||||| ||||||||| ||   ||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||  ||||| || | |||||    
T  18935456 agactgctgtaacaagagtgccctttgcagtagtaagatcaaaaagcattggatttatttcactgtgtggatttgaaggattagcacgtaatgtgtttcc 18935555  T
Q  447 atctatcatttggtcttggatgtcaccaacaa 478  Q
     || || |||  |||||||||||| |||||||    
T  18935556 ttcaattattcagtcttggatgtctccaacaa 18935587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 34724906 - 34724626
Alignment:
Q  38 agcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagctaatactcaaagattgtcc 137  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||| |||||| |  ||| ||| || ||||||||||||  | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34724906 agctgaaatttcttaatcttagtcattctcataacttgaaacaaacaccagacttttcatacttgccaaatcttgaaaagttaatactcaaagattgtcc 34724807  T
Q  138 aaggttg-cgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttctaaccttccaagaagcat 236  Q
    ||  ||| | | | ||||| | ||  || ||| ||||| | ||||||||  ||||||||||| |||| ||||   |||||| | | ||||||||||||||    
T  34724806 aaatttgtcctca-gtttctcctaatataggaaatctcaagaaaattctattgataaatttgaaagactgtacaggcctttgtgagcttccaagaagcat 34724708  T
Q  237 ctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatg 318  Q
    |||||| ||||| ||  | |||||||||||| | || || ||| |||  ||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  34724707 ctataaattgaagtcagtaaaaactctcattgtgtctggatgtacaaaaattgacaagttggaagaggacatagaacaaatg 34724626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 162; Significance: 4e-86; HSPs: 10)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 47987191 - 47986842
Alignment:
Q  19 ttcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagc 118  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  | ||  |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  47987191 ttcttgcagaagatggaaaagctaaaaattctcaatcttagtcattctcattatctcacacgaagccttgacttttcaaacatgcctaatctcgaaaagc 47987092  T
Q  119 taatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttc 218  Q
    || ||||||||||||| |||| |||   |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  47987091 tagtactcaaagattgcccaatgttatctgagatttctcctagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagactgtattagcctatg 47986992  T
Q  219 taaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatg 318  Q
    || ||| ||||||||||  || || || |||||||| ||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  47986991 tagcctcccaagaagcacatacaaattaaaatctctaaaaactctcattctttctggctgtttaaagattaacaagttggaagaggacatggaataaatg 47986892  T
Q  319 gaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcc 368  Q
     |||||||||| ||| || |||||||| ||||||  |||||||| |||||    
T  47986891 aaatctttaactactttggttgcaaataacactgcgataacaagagtgcc 47986842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 47996478 - 47996129
Alignment:
Q  19 ttcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagc 118  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  | ||  |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  47996478 ttcttgcagaagatggaaaagctaaaaattctcaatcttagtcattctcattatctcacacgaagccttgacttttcaaacatgcctaatctcgaaaagc 47996379  T
Q  119 taatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttc 218  Q
    || ||||||||||||| |||| |||   |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  47996378 tagtactcaaagattgcccaatgttatctgagatttctcctagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagactgtattagcctatg 47996279  T
Q  219 taaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatg 318  Q
    || ||| ||||||||||  || || || |||||||| ||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  47996278 tagcctcccaagaagcacatacaaattaaaatctctaaaaactctcattctttctggctgtttaaagattaacaagttggaagaggacatggaataaatg 47996179  T
Q  319 gaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcc 368  Q
     |||||||||| ||| || |||||||| ||||||  |||||||| |||||    
T  47996178 aaatctttaactactttggttgcaaataacactgcgataacaagagtgcc 47996129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 48005765 - 48005416
Alignment:
Q  19 ttcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagc 118  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  | ||  |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  48005765 ttcttgcagaagatggaaaagctaaaaattctcaatcttagtcattctcattatctcacacgaagccttgacttttcaaacatgcctaatctcgaaaagc 48005666  T
Q  119 taatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttc 218  Q
    || ||||||||||||| |||| |||   |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  48005665 tagtactcaaagattgcccaatgttatctgagatttctcctagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagactgtattagcctatg 48005566  T
Q  219 taaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatg 318  Q
    || ||| ||||||||||  || || || |||||||| ||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  48005565 tagcctcccaagaagcacatacaaattaaaatctctaaaaactctcattctttctggctgtttaaagattaacaagttggaagaggacatggaataaatg 48005466  T
Q  319 gaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcc 368  Q
     |||||||||| ||| || |||||||| ||||||  |||||||| |||||    
T  48005465 aaatctttaactactttggttgcaaataacactgcgataacaagagtgcc 48005416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 48015050 - 48014701
Alignment:
Q  19 ttcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagc 118  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  | ||  |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  48015050 ttcttgcagaagatggaaaagctaaaaattctcaatcttagtcattctcattatctcacacgaagccttgacttttcaaacatgcctaatctcgaaaagc 48014951  T
Q  119 taatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttc 218  Q
    || ||||||||||||| |||| |||   |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  48014950 tagtactcaaagattgcccaatgttatctgagatttctcctagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagactgtattagcctatg 48014851  T
Q  219 taaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatg 318  Q
    || ||| ||||||||||  || || || |||||||| ||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  48014850 tagcctcccaagaagcacatacaaattaaaatctctaaaaactctcattctttctggctgtttaaagattaacaagttggaagaggacatggaataaatg 48014751  T
Q  319 gaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcc 368  Q
     |||||||||| ||| || |||||||| ||||||  |||||||| |||||    
T  48014750 aaatctttaactactttggttgcaaataacactgcgataacaagagtgcc 48014701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 367 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 6905917 - 6905806
Alignment:
Q  367 cccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttgga 466  Q
    |||||||| | ||| || ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  6905917 cccttttccattgttagatcaaaaagcattgtgtatatatccctatgcggatatgaaggattatcacgtgatatttttccttctctcatttggtcttgga 6905818  T
Q  467 tgtcaccaacaa 478  Q
    ||||||||||||    
T  6905817 tgtcaccaacaa 6905806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 409 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 47986821 - 47986752
Alignment:
Q  409 ctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaa 478  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47986821 ctgtgcggctatgaaggattttcacgtgatgtgtttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaa 47986752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 409 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 47996108 - 47996039
Alignment:
Q  409 ctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaa 478  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47996108 ctgtgcggctatgaaggattttcacgtgatgtgtttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaa 47996039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 409 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 48005395 - 48005326
Alignment:
Q  409 ctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaa 478  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48005395 ctgtgcggctatgaaggattttcacgtgatgtgtttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaa 48005326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 409 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 48014680 - 48014611
Alignment:
Q  409 ctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaa 478  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48014680 ctgtgcggctatgaaggattttcacgtgatgtgtttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaa 48014611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 32411197 - 32411083
Alignment:
Q  364 gtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtctt 463  Q
    ||||||| |||||  ||||| || |||||||| |  ||||| ||||| || |||||||||||||| |||| |||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  32411197 gtgccctgttcaatagtaagatcgaaaagcatcgcatatatatctctatgtggatatgaaggattatcacatgaagtatttccctctctcatttggtctt 32411098  T
Q  464 ggatgtcaccaacaa 478  Q
     ||||||||||||||    
T  32411097 agatgtcaccaacaa 32411083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 47 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 22584525 - 22584084
Alignment:
Q  47 ttctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcg 146  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||| ||| | | ||  |||||||  ||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |  |||      
T  22584525 ttctcaatcttagtcattctcacaatctcacagaaagccttgacttttttatgctgcctaatcttgaaaagatagtactcaaagattgtcggaacttgac 22584426  T
Q  147 tgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagcctttctaaccttccaagaagcatctataagttg 246  Q
    |  ||||||  ||||||| | |  |||| ||| | ||||||| ||||||||| |||| ||| | ||||||| || ||| ||||||| |||||| ||||||    
T  22584425 tatggtttcttatagcatcgtatttctcaacagagttcttctaataaatttgcaagactgtttaagcctttgtagcctcccaagaaacatctacaagttg 22584326  T
Q  247 aaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatg 346  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||   || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22584325 aaatctttgaaaactctcattctttctggctgttaaaaactttataagttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatg 22584226  T
Q  347 acactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttcc 446  Q
    | |||| ||||| ||  ||||| |||||||   | ||||||||||  ||| |||| |||||| |||| || ||||||||| ||| | | ||| || ||||    
T  22584225 aaactgcaataaaaaaagtgccattttcaatatttaggtcaaaaactatttggtacatttctttgtgtggctatgaaggactcttaagcgatgtagttcc 22584126  T
Q  447 atctatcatttggtcttggatgtcaccaacaagtgctctttc 488  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22584125 atctatgatttggtcttggatgtcatcaacaagtgcactttc 22584084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 235 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 14767190 - 14767123
Alignment:
Q  235 atctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaaga 302  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||    
T  14767190 atctatcaattgaaatctttgaaaactctcatcctttccggctgttcaaagattgacaaattggaaga 14767123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 14767411 - 14767360
Alignment:
Q  14 ttatattcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactc 65  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14767411 ttatcttcatgtagttgatggagaagctaaaaattctcaatctcagtcactc 14767360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0813 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0813
Description:

Target: scaffold0813; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 5102 - 4710
Alignment:
Q  82 accccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaa 181  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||   || ||| |||| ||||||||||  |||  | |||     
T  5102 accccagacttttcattcatgcctaatcttgaaaagctagtactcaaagactgtccaagattaactgcggtctcccgtagcattggatctctgcataaac 5003  T
Q  182 ttcttctgataaatttggaagattgtattagcctttctaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttc 281  Q
    ||||||| |||||||||  ||| || |  || |||   || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  ||||| | |||||||| || |||||    
T  5002 ttcttctaataaatttgacagactgcacaagtcttcagaaacttcctagaagcatatataaattaaaatctctagaaactttgattctttctggatgttc 4903  T
Q  282 aatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgta 381  Q
     | |||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||  || ||||  || | ||||  |||||||  ||||| |||||||  |||    
T  4902 caagattgacaaattggaggaggacttggaacagatggaatcattgaaaaccttgattgcggataagactgctataacaaaagtgccgttttcaatagta 4803  T
Q  382 aggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcacca 474  Q
    || | || || |||||| ||||||||||| || || | ||||||||| ||||| ||| ||||||| | | || || |||||||||||||||||    
T  4802 agattaagaaacattggatatatttctctatgtggctttgaaggattttcacgagatgtatttccttttctcgttcggtcttggatgtcacca 4710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 474
Target Start/End: Original strand, 6464 - 6856
Alignment:
Q  82 accccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaa 181  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||   || ||| |||| ||||||||||  |||  | |||     
T  6464 accccagacttttcattcatgcctaatcttgaaaagctagtactcaaagactgtccaagattaactgcggtctcccgtagcattggatctctgcataaac 6563  T
Q  182 ttcttctgataaatttggaagattgtattagcctttctaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttc 281  Q
    ||||||| |||||||||  ||| || |  || |||   || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  ||||| | |||||||| || |||||    
T  6564 ttcttctaataaatttgacagactgcacaagtcttcagaaacttcctagaagcatatataaattaaaatctctagaaactttgattctttctggatgttc 6663  T
Q  282 aatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgta 381  Q
     | |||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||  || ||||  || | ||||  |||||||  || ||||||||||  |||    
T  6664 caagattgacaaattggaggaggacttggaacagatggaatcattgaaaaccttgattgcggataagactgctataacaaaagttcccttttcaatagta 6763  T
Q  382 aggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcacca 474  Q
     | || |||| |||||| ||||||||| | || |||| ||||||||| ||||| ||| | ||||| ||  | ||| | |||||||||||||||    
T  6764 cgatctaaaaacattggatatatttctttatgtggatttgaaggattttcacgggatgtgtttccttcacttattcgctcttggatgtcacca 6856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 244 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 3262860 - 3262629
Alignment:
Q  244 ttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaa 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| || || |||| |||| |||| |||||||| ||| | |  || |||||||| || || || ||| ||||||    
T  3262860 ttgaaatctttgaaaactctcatactttctggttgctcaaagattgacaaattggaagaagacatagtgcagatggaatccttgacaacactgattgcaa 3262761  T
Q  344 atgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatt 443  Q
    | || || ||  | | |   ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||| ||||| || || || |||||||| ||||| ||||||||| | ||    
T  3262760 aggatacaggtgtgaaagaggtgccctattcaatagtaagatcaaaaagcattggatatatatccctatgtggatatga-ggattttcacgtgatgtttt 3262662  T
Q  444 tccatctatcatttggtcttggatgtcaccaac 476  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3262661 tccctctatcatttggtcttggatgtcaccaac 3262629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 3286748 - 3286516
Alignment:
Q  245 tgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaa 344  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||||| |||| ||||||||||||| ||| | |  || |||||||| || || || ||| |||||||    
T  3286748 tgaaatctttgaacactctcatcctttctggttgttcaaagattgacaagttggaagaagacatagtgcagatggaatccttgacaacactgattgcaaa 3286649  T
Q  345 tgacactggaataacaagtgtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatattt 444  Q
    | | || |   | | |   ||||||||||||| |||||| |||||||||||  | ||||| || || || |||||||||||||| |||| |||| | |||    
T  3286648 taatacagctgttaaagaagtgcccttttcaattgtaagatcaaaaagcatcagatatatatccctatgtggatatgaaggattatcacatgatgttttt 3286549  T
Q  445 ccatctatcatttggtcttggatgtcaccaaca 477  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3286548 caatctctcattaggtcttggatgtcaccaaca 3286516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 385 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 3391629 - 3391536
Alignment:
Q  385 tcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaa 478  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||| | || | ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3391629 tcaaaaagcattggatatatatctctatgtggatatgaaggattatcacatcatgtttttccttctctcattaggtcttggatgtcaccaacaa 3391536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 401 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 3407400 - 3407323
Alignment:
Q  401 atatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaa 478  Q
    |||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3407400 atatatctctatgtggatatcaaggattatcacgtgatgtttttccttctatcatttggtcttggatgtcaccaacaa 3407323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 364 - 476
Target Start/End: Original strand, 31175934 - 31176046
Alignment:
Q  364 gtgcccttttcaactgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtctt 463  Q
    ||||||| |||||  | ||| |||||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||| ||| ||||  | ||||| ||| ||||||||||||    
T  31175934 gtgccctattcaatagcaagatcaaaaagcattgcatatatatctctatgtggatatgaaggattatcatgtgacgtttttccttctctcatttggtctt 31176033  T
Q  464 ggatgtcaccaac 476  Q
    |||||||||||||    
T  31176034 ggatgtcaccaac 31176046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 385 - 475
Target Start/End: Original strand, 3314966 - 3315056
Alignment:
Q  385 tcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaa 475  Q
    ||||||| |||||| ||||| || || || | ||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3314966 tcaaaaaacattggatatatatccctatgtgaatatgaaggtttatcacgtgatgtttttccttctatcatttggtcttggatgtcaccaa 3315056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 478
Target Start/End: Original strand, 3364277 - 3364370
Alignment:
Q  385 tcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaa 478  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||| | || | ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3364277 tcaaaaagcattggatatatatctctatgtggatatgaaggattatcacatcatgtttttccttctctcattaggtcttggatatcaccaacaa 3364370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 387 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 3325091 - 3325003
Alignment:
Q  387 aaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaa 475  Q
    |||||||||||| ||||| || || || |||||||||||| | ||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3325091 aaaaagcattggatatatatccctctgtggatatgaaggactatcacacgatgtttttccttctatcatttggtcttggatgtcaccaa 3325003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 3398613 - 3398522
Alignment:
Q  385 tcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaac 476  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| || |||||| ||||||| ||   |||| | ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3398613 tcaaaaagcattgcatatatatctctatgtggatataaaggattatcgtctgatgtttttccttctctcatttggtcatggatgtcaccaac 3398522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 254 - 302
Target Start/End: Original strand, 3375055 - 3375103
Alignment:
Q  254 tgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaaga 302  Q
    |||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3375055 tgaaaactcttatactttctggttgttcaaagattaacaagttggaaga 3375103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 254 - 302
Target Start/End: Original strand, 31175824 - 31175872
Alignment:
Q  254 tgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaaga 302  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  31175824 tgaaaagtctcattctttctggttgttcaatgattgacaaattggaaga 31175872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 8561 - 8317
Alignment:
Q  82 accccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaa 181  Q
    |||||||||||| ||  | |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||  |   || |||||||| ||||||  |||  | ||||    
T  8561 accccagactttacatacttgccaaatcttgaaaagctagtactcaaaaattgtccaagtttgtctacagtctcccatagtattggatctctacataaaa 8462  T
Q  182 ttcttctgataaatttggaagattgtattagcctttctaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttc 281  Q
    ||||||| |||||||||  ||| || |   | |||   || ||||||||||||| |||||| || ||||||||  ||||| | |||||||| || |||||    
T  8461 ttcttctcataaatttgacagactgcacaggtcttcggaaacttccaagaagcaactataaattaaaatctctagaaactttgattctttctggatgttc 8362  T
Q  282 aatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatcttt 326  Q
     |||||| | || ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  8361 catgattgaaaaattggaggaggacttggaacagatggaatcttt 8317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0373 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0373
Description:

Target: scaffold0373; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 197
Target Start/End: Original strand, 9456 - 9610
Alignment:
Q  43 aaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggt 142  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  || ||||  | || |||||||| |||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  9456 aaaattcttaatcttagtcattctcaggatttgactgaaactccagacttctcatatatgccgaatcttgaaaagctagtactcaaagactgtccaagtt 9555  T
Q  143 tgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaattt 197  Q
    ||  || ||| |||||||||||||||  |||| | ||| ||||||||||||||||    
T  9556 tgtctgcggtctcccatagcattggatctctccataaacttcttctgataaattt 9610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0373; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 223 - 324
Target Start/End: Original strand, 9636 - 9737
Alignment:
Q  223 cttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatggaat 322  Q
    ||||| |||||||||||||  || ||||||||  ||||| | |||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  9636 cttccgagaagcatctatacattaaaatctctacaaactttgattctttctggatgttccatgattgacaaattggaggaggatttggtacagatggaat 9735  T
Q  323 ct 324  Q
    ||    
T  9736 ct 9737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 385 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 6239 - 6146
Alignment:
Q  385 tcaaaaagcattgggtatatttctctgtgcggatatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaa 478  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  6239 tcaaaaagcattgtgtatatatccctatgcggatatgaaggattatcacgtgatgtttttccttcccttatttggtcttggatgtcaccaacaa 6146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University