View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16287_high_3 (Length: 377)

Name: NF16287_high_3
Description: NF16287
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16287_high_3
NF16287_high_3
[»] chr4 (96 HSPs)
chr4 (19-377)||(12902766-12903124)
chr4 (21-377)||(7088886-7089242)
chr4 (31-377)||(23374125-23374471)
chr4 (19-377)||(44052838-44053196)
chr4 (19-377)||(22636444-22636801)
chr4 (19-377)||(14053056-14053413)
chr4 (19-377)||(7893712-7894068)
chr4 (21-377)||(16377277-16377633)
chr4 (19-271)||(3096759-3097010)
chr4 (60-377)||(16239764-16240081)
chr4 (25-377)||(14038657-14039010)
chr4 (19-248)||(17047826-17048055)
chr4 (202-377)||(7798783-7798958)
chr4 (176-377)||(16270147-16270347)
chr4 (21-370)||(44928678-44929029)
chr4 (146-377)||(17046496-17046724)
chr4 (261-377)||(52873363-52873479)
chr4 (66-367)||(6190481-6190782)
chr4 (214-377)||(6899900-6900062)
chr4 (27-124)||(7798959-7799056)
chr4 (25-189)||(15091093-15091258)
chr4 (220-370)||(18215274-18215423)
chr4 (300-377)||(3096302-3096379)
chr4 (24-370)||(44102227-44102573)
chr4 (220-370)||(12307-12456)
chr4 (220-370)||(15118352-15118501)
chr4 (220-370)||(19618172-19618321)
chr4 (220-370)||(23803265-23803414)
chr4 (220-370)||(52312523-52312672)
chr4 (214-370)||(1837503-1837658)
chr4 (220-370)||(3515020-3515169)
chr4 (220-370)||(19242712-19242861)
chr4 (220-370)||(44615301-44615450)
chr4 (220-370)||(44773087-44773236)
chr4 (220-370)||(50222339-50222488)
chr4 (220-370)||(51463868-51464017)
chr4 (240-370)||(54798729-54798859)
chr4 (31-370)||(52242958-52243301)
chr4 (220-370)||(15355324-15355474)
chr4 (235-370)||(18239434-18239568)
chr4 (260-370)||(14280329-14280438)
chr4 (208-367)||(13794-13953)
chr4 (220-370)||(14970707-14970856)
chr4 (220-375)||(22353844-22353999)
chr4 (220-377)||(15367699-15367856)
chr4 (220-377)||(15402712-15402869)
chr4 (220-370)||(12610963-12611105)
chr4 (208-370)||(43198496-43198660)
chr4 (315-377)||(15551826-15551889)
chr4 (295-377)||(15370027-15370108)
chr4 (295-377)||(15371211-15371292)
chr4 (295-377)||(15373492-15373573)
chr4 (295-377)||(16223541-16223622)
chr4 (222-367)||(21815587-21815731)
chr4 (260-369)||(8574864-8574971)
chr4 (310-370)||(12288254-12288315)
chr4 (310-370)||(12774023-12774084)
chr4 (325-370)||(7641286-7641331)
chr4 (310-370)||(39706332-39706393)
chr4 (211-337)||(43256106-43256230)
chr4 (310-370)||(8846372-8846433)
chr4 (220-370)||(20149842-20149992)
chr4 (31-73)||(12774313-12774355)
chr4 (23-73)||(21815388-21815438)
chr4 (24-72)||(3332201-3332248)
chr4 (24-72)||(15552129-15552176)
chr4 (24-72)||(24029057-24029104)
chr4 (309-367)||(46640499-46640558)
chr4 (23-73)||(21815059-21815109)
chr4 (23-73)||(21818481-21818531)
chr4 (34-72)||(22633980-22634018)
chr4 (31-72)||(15099665-15099706)
chr4 (316-365)||(17333298-17333347)
chr4 (36-72)||(13812578-13812614)
chr4 (316-367)||(53082202-53082254)
chr4 (37-72)||(4561107-4561142)
chr4 (37-72)||(5756711-5756746)
chr4 (21-72)||(9556827-9556878)
chr4 (21-72)||(12570332-12570383)
chr4 (21-72)||(13569823-13569874)
chr4 (21-72)||(16243158-16243209)
chr4 (21-72)||(16678347-16678398)
chr4 (33-72)||(20157056-20157095)
chr4 (37-72)||(33742675-33742710)
chr4 (21-72)||(36133720-36133771)
chr4 (177-226)||(14280462-14280512)
chr4 (31-97)||(15464694-15464760)
chr4 (177-222)||(54798675-54798721)
chr4 (31-72)||(8846689-8846730)
chr4 (170-359)||(15093798-15093986)
chr4 (209-282)||(15121747-15121819)
chr4 (318-359)||(16348716-16348757)
chr4 (318-359)||(16357004-16357045)
chr4 (323-359)||(11250619-11250655)
chr4 (323-359)||(15353365-15353401)
chr4 (31-71)||(39706052-39706092)
[»] chr1 (79 HSPs)
chr1 (15-377)||(27250479-27250841)
chr1 (27-374)||(21026692-21027039)
chr1 (27-377)||(50209974-50210325)
chr1 (25-377)||(22532278-22532631)
chr1 (25-377)||(34509789-34510142)
chr1 (19-309)||(22354326-22354616)
chr1 (14-377)||(38801140-38801499)
chr1 (35-370)||(20135203-20135539)
chr1 (19-275)||(22355928-22356185)
chr1 (19-275)||(22357614-22357871)
chr1 (29-197)||(20846983-20847151)
chr1 (176-370)||(22468608-22468801)
chr1 (21-370)||(433025-433373)
chr1 (286-377)||(20847175-20847266)
chr1 (220-375)||(45574842-45574997)
chr1 (220-370)||(13988879-13989028)
chr1 (220-370)||(21923291-21923440)
chr1 (220-370)||(23593735-23593884)
chr1 (220-370)||(21475087-21475236)
chr1 (220-370)||(21840780-21840929)
chr1 (220-370)||(31612326-31612475)
chr1 (170-248)||(48603652-48603730)
chr1 (220-370)||(29298150-29298298)
chr1 (220-370)||(29776701-29776850)
chr1 (220-370)||(16275363-16275513)
chr1 (208-367)||(21861513-21861672)
chr1 (208-367)||(21896199-21896358)
chr1 (220-370)||(16361930-16362079)
chr1 (318-370)||(20454606-20454658)
chr1 (220-370)||(13212861-13213011)
chr1 (295-370)||(15860084-15860158)
chr1 (220-370)||(21346974-21347124)
chr1 (211-337)||(33797570-33797694)
chr1 (220-368)||(22123067-22123215)
chr1 (235-370)||(21342109-21342244)
chr1 (171-367)||(35260986-35261180)
chr1 (180-370)||(16758665-16758857)
chr1 (220-370)||(21707180-21707329)
chr1 (220-370)||(21711722-21711871)
chr1 (310-370)||(20918620-20918681)
chr1 (297-370)||(21714558-21714631)
chr1 (310-370)||(21754061-21754122)
chr1 (310-370)||(33681023-33681084)
chr1 (310-377)||(14295595-14295663)
chr1 (220-370)||(40389167-40389317)
chr1 (201-359)||(21787978-21788136)
chr1 (310-367)||(22921913-22921971)
chr1 (310-370)||(52928014-52928075)
chr1 (31-95)||(33681301-33681365)
chr1 (260-370)||(22237643-22237753)
chr1 (31-73)||(21754350-21754392)
chr1 (310-370)||(20248295-20248356)
chr1 (24-72)||(20918917-20918964)
chr1 (316-367)||(50614167-50614219)
chr1 (316-367)||(50621995-50622047)
chr1 (309-367)||(16368329-16368388)
chr1 (309-367)||(41050079-41050138)
chr1 (31-72)||(20637165-20637206)
chr1 (31-72)||(21162080-21162121)
chr1 (170-250)||(21714683-21714763)
chr1 (21-72)||(16080202-16080253)
chr1 (37-72)||(16375231-16375266)
chr1 (21-72)||(20091230-20091281)
chr1 (21-72)||(20138380-20138431)
chr1 (37-72)||(21407653-21407688)
chr1 (316-367)||(21533923-21533974)
chr1 (21-72)||(21714861-21714912)
chr1 (21-72)||(36819066-36819117)
chr1 (37-72)||(52639839-52639874)
chr1 (31-72)||(20248592-20248633)
chr1 (318-371)||(20958123-20958176)
chr1 (34-71)||(22921635-22921672)
chr1 (32-73)||(26065254-26065295)
chr1 (31-72)||(28194213-28194254)
chr1 (31-72)||(35981451-35981492)
chr1 (30-71)||(52927745-52927786)
chr1 (99-147)||(16758890-16758938)
chr1 (24-72)||(22831138-22831186)
chr1 (32-72)||(45310135-45310175)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (19-377)||(803-1160)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (19-377)||(167733-168090)
scaffold0011 (19-377)||(51922-52279)
scaffold0011 (318-367)||(38204-38253)
[»] chr3 (128 HSPs)
chr3 (19-377)||(20698190-20698547)
chr3 (19-377)||(13442283-13442641)
chr3 (27-377)||(17487865-17488216)
chr3 (27-377)||(17499347-17499698)
chr3 (19-370)||(26686903-26687254)
chr3 (15-370)||(14576582-14576937)
chr3 (27-377)||(12399218-12399565)
chr3 (27-377)||(18438543-18438894)
chr3 (27-377)||(43840941-43841291)
chr3 (36-377)||(23083132-23083473)
chr3 (15-370)||(14572605-14572960)
chr3 (27-377)||(14972863-14973214)
chr3 (21-370)||(40213476-40213825)
chr3 (23-377)||(25476142-25476497)
chr3 (27-377)||(11424524-11424871)
chr3 (27-370)||(30029856-30030197)
chr3 (31-368)||(42386428-42386767)
chr3 (171-370)||(24153115-24153313)
chr3 (58-248)||(16796685-16796875)
chr3 (220-370)||(29172583-29172732)
chr3 (220-370)||(7781347-7781496)
chr3 (220-370)||(9707607-9707756)
chr3 (220-370)||(17463191-17463340)
chr3 (220-370)||(17672639-17672788)
chr3 (220-370)||(34159339-34159488)
chr3 (220-370)||(38961891-38962040)
chr3 (220-370)||(45606907-45607056)
chr3 (220-370)||(55476504-55476653)
chr3 (235-370)||(28848626-28848760)
chr3 (220-366)||(8899111-8899256)
chr3 (220-370)||(12567573-12567722)
chr3 (220-370)||(13544038-13544187)
chr3 (170-248)||(14179570-14179648)
chr3 (220-370)||(16454281-16454430)
chr3 (220-370)||(17446655-17446803)
chr3 (220-370)||(50242835-50242984)
chr3 (220-370)||(13151790-13151940)
chr3 (220-370)||(13154255-13154405)
chr3 (220-375)||(43550478-43550633)
chr3 (220-367)||(53070653-53070799)
chr3 (220-370)||(6469134-6469283)
chr3 (220-370)||(10247723-10247872)
chr3 (220-370)||(16282811-16282960)
chr3 (21-147)||(17248041-17248168)
chr3 (256-370)||(46822281-46822395)
chr3 (220-370)||(41123903-41124049)
chr3 (269-370)||(55500955-55501055)
chr3 (240-370)||(36166611-36166739)
chr3 (207-370)||(12511073-12511237)
chr3 (295-370)||(12119800-12119874)
chr3 (295-370)||(15412442-15412516)
chr3 (208-367)||(52523670-52523831)
chr3 (240-370)||(21618462-21618590)
chr3 (257-370)||(15977528-15977640)
chr3 (310-377)||(13210371-13210439)
chr3 (295-370)||(8499531-8499605)
chr3 (180-377)||(24340637-24340835)
chr3 (295-370)||(44494822-44494896)
chr3 (310-370)||(12174303-12174364)
chr3 (310-370)||(15470940-15471001)
chr3 (310-370)||(32307693-32307754)
chr3 (295-370)||(10556998-10557072)
chr3 (220-370)||(27165263-27165413)
chr3 (310-367)||(49668120-49668178)
chr3 (310-370)||(16103796-16103857)
chr3 (325-370)||(17737249-17737294)
chr3 (23-149)||(53070455-53070582)
chr3 (310-367)||(9512939-9512997)
chr3 (310-367)||(9520914-9520972)
chr3 (242-370)||(53301527-53301656)
chr3 (310-370)||(14234503-14234564)
chr3 (310-370)||(16097344-16097405)
chr3 (322-370)||(28194706-28194755)
chr3 (330-370)||(45577947-45577987)
chr3 (31-73)||(1644447-1644489)
chr3 (31-73)||(32307983-32308025)
chr3 (31-73)||(49667848-49667890)
chr3 (316-365)||(13919350-13919399)
chr3 (208-368)||(23274705-23274865)
chr3 (310-370)||(1644718-1644778)
chr3 (316-367)||(22110402-22110454)
chr3 (316-367)||(43925977-43926029)
chr3 (33-72)||(12340068-12340107)
chr3 (309-367)||(37251211-37251270)
chr3 (180-377)||(37642179-37642377)
chr3 (31-73)||(12934075-12934117)
chr3 (318-359)||(23077530-23077571)
chr3 (24-72)||(14665921-14665968)
chr3 (24-72)||(14669076-14669123)
chr3 (24-72)||(14735434-14735481)
chr3 (21-72)||(326922-326973)
chr3 (37-72)||(7109999-7110034)
chr3 (37-72)||(7113934-7113969)
chr3 (21-72)||(11300269-11300320)
chr3 (309-367)||(12377940-12377999)
chr3 (33-72)||(12852130-12852169)
chr3 (21-72)||(15849843-15849894)
chr3 (21-72)||(15877585-15877636)
chr3 (21-72)||(16797812-16797863)
chr3 (19-62)||(16809724-16809767)
chr3 (21-72)||(19725669-19725720)
chr3 (37-72)||(22321965-22322000)
chr3 (37-72)||(22337020-22337055)
chr3 (21-72)||(23052834-23052885)
chr3 (37-72)||(27409417-27409452)
chr3 (31-73)||(324549-324591)
chr3 (318-367)||(606378-606428)
chr3 (318-360)||(856162-856204)
chr3 (208-290)||(2051142-2051224)
chr3 (319-365)||(9577646-9577691)
chr3 (297-367)||(15878083-15878153)
chr3 (30-72)||(16097645-16097687)
chr3 (31-69)||(49389408-49389446)
chr3 (31-72)||(1465174-1465215)
chr3 (31-68)||(9513228-9513265)
chr3 (31-68)||(9521203-9521240)
chr3 (318-359)||(11298580-11298621)
chr3 (35-72)||(13210096-13210133)
chr3 (318-359)||(14878569-14878610)
chr3 (318-367)||(15246037-15246086)
chr3 (23-72)||(15482959-15483008)
chr3 (23-72)||(20461260-20461309)
chr3 (170-250)||(23408565-23408645)
chr3 (32-73)||(37250932-37250973)
chr3 (323-359)||(3389994-3390030)
chr3 (31-71)||(12171869-12171909)
chr3 (323-359)||(14665424-14665460)
chr3 (32-72)||(22110116-22110156)
[»] chr6 (105 HSPs)
chr6 (19-375)||(20360714-20361070)
chr6 (19-377)||(20638037-20638395)
chr6 (25-377)||(29060549-29060902)
chr6 (27-377)||(16920395-16920742)
chr6 (19-377)||(22779981-22780339)
chr6 (27-377)||(18409588-18409939)
chr6 (29-377)||(25629118-25629467)
chr6 (19-370)||(17287550-17287901)
chr6 (21-365)||(22831524-22831867)
chr6 (25-377)||(20593782-20594135)
chr6 (25-377)||(19303300-19303652)
chr6 (21-374)||(11185517-11185867)
chr6 (19-160)||(18821573-18821714)
chr6 (219-377)||(16496253-16496411)
chr6 (219-377)||(20076709-20076863)
chr6 (211-377)||(35245595-35245758)
chr6 (208-370)||(25644336-25644499)
chr6 (220-370)||(12742330-12742479)
chr6 (220-370)||(18334592-18334741)
chr6 (220-370)||(19005059-19005208)
chr6 (220-370)||(19858919-19859068)
chr6 (220-370)||(22782240-22782389)
chr6 (220-370)||(24422560-24422709)
chr6 (220-370)||(25754822-25754971)
chr6 (220-370)||(30676710-30676859)
chr6 (220-370)||(33861807-33861956)
chr6 (220-370)||(33864291-33864440)
chr6 (220-370)||(1595562-1595711)
chr6 (220-370)||(2291180-2291329)
chr6 (220-370)||(8055042-8055191)
chr6 (220-370)||(26924640-26924789)
chr6 (220-370)||(34963386-34963535)
chr6 (23-367)||(18456735-18457079)
chr6 (295-370)||(25656642-25656716)
chr6 (235-370)||(25688515-25688649)
chr6 (235-367)||(18461895-18462026)
chr6 (27-359)||(25603147-25603478)
chr6 (235-370)||(1540926-1541060)
chr6 (220-370)||(16448526-16448676)
chr6 (220-370)||(19847949-19848100)
chr6 (220-370)||(3852017-3852166)
chr6 (208-370)||(20109154-20109318)
chr6 (27-359)||(25611485-25611816)
chr6 (220-370)||(20556894-20557041)
chr6 (295-367)||(18821875-18821946)
chr6 (256-370)||(23992443-23992554)
chr6 (310-370)||(27333262-27333323)
chr6 (310-370)||(27394002-27394063)
chr6 (310-377)||(28496515-28496583)
chr6 (21-73)||(29808639-29808691)
chr6 (310-377)||(29808926-29808994)
chr6 (211-337)||(27415887-27416011)
chr6 (309-370)||(9098557-9098619)
chr6 (325-370)||(25714433-25714478)
chr6 (24-73)||(28496231-28496280)
chr6 (309-365)||(33443068-33443124)
chr6 (179-359)||(15041465-15041644)
chr6 (310-370)||(19652211-19652272)
chr6 (333-377)||(1561312-1561356)
chr6 (21-72)||(25641940-25641991)
chr6 (309-370)||(19668387-19668449)
chr6 (315-370)||(4185870-4185926)
chr6 (24-72)||(21939699-21939746)
chr6 (180-377)||(8227425-8227623)
chr6 (21-72)||(15894186-15894237)
chr6 (297-367)||(19873135-19873205)
chr6 (297-367)||(22432264-22432334)
chr6 (297-367)||(22438814-22438884)
chr6 (31-72)||(4185588-4185629)
chr6 (31-72)||(4667978-4668019)
chr6 (318-359)||(21766718-21766759)
chr6 (31-72)||(22080502-22080543)
chr6 (267-367)||(23019425-23019525)
chr6 (316-367)||(23076749-23076801)
chr6 (31-71)||(27333049-27333089)
chr6 (31-71)||(27393789-27393829)
chr6 (316-367)||(35008167-35008219)
chr6 (37-72)||(8244158-8244193)
chr6 (37-72)||(11567160-11567195)
chr6 (21-72)||(17804494-17804545)
chr6 (31-70)||(19652512-19652551)
chr6 (21-72)||(19863291-19863342)
chr6 (37-72)||(19870888-19870923)
chr6 (21-72)||(22334648-22334699)
chr6 (21-72)||(22429788-22429839)
chr6 (21-72)||(22432563-22432614)
chr6 (37-72)||(22863243-22863278)
chr6 (37-72)||(23395366-23395401)
chr6 (297-367)||(19862993-19863063)
chr6 (22-72)||(19873433-19873483)
chr6 (318-363)||(16493169-16493214)
chr6 (27-72)||(16924642-16924687)
chr6 (27-72)||(16929357-16929402)
chr6 (318-367)||(18453201-18453250)
chr6 (170-250)||(22432385-22432465)
chr6 (170-250)||(22438935-22439015)
chr6 (31-72)||(31155163-31155204)
chr6 (24-68)||(1561622-1561665)
chr6 (315-370)||(4186383-4186439)
chr6 (21-69)||(15041307-15041355)
chr6 (323-359)||(18907134-18907170)
chr6 (32-72)||(19668688-19668728)
chr6 (323-359)||(19790837-19790873)
chr6 (339-367)||(22080799-22080827)
chr6 (32-72)||(23657189-23657229)
[»] chr8 (85 HSPs)
chr8 (19-377)||(21918754-21919112)
chr8 (21-377)||(20536217-20536573)
chr8 (27-377)||(31971266-31971614)
chr8 (27-377)||(18818171-18818521)
chr8 (19-377)||(18878991-18879343)
chr8 (18-377)||(16199399-16199756)
chr8 (32-377)||(21923695-21924040)
chr8 (29-377)||(28648807-28649156)
chr8 (14-377)||(22626745-22627108)
chr8 (60-377)||(45130793-45131108)
chr8 (19-377)||(23406388-23406748)
chr8 (25-377)||(6759267-6759618)
chr8 (35-370)||(23648569-23648905)
chr8 (27-377)||(16092102-16092454)
chr8 (21-377)||(22875074-22875431)
chr8 (68-377)||(7372787-7373088)
chr8 (19-248)||(25362894-25363123)
chr8 (178-377)||(21389366-21389562)
chr8 (178-377)||(21395896-21396092)
chr8 (178-377)||(21790389-21790585)
chr8 (183-377)||(21778697-21778888)
chr8 (21-370)||(41598201-41598550)
chr8 (220-370)||(14409444-14409593)
chr8 (220-370)||(16413316-16413465)
chr8 (220-370)||(1484415-1484564)
chr8 (220-370)||(5853292-5853441)
chr8 (220-370)||(20403240-20403389)
chr8 (220-370)||(22001766-22001915)
chr8 (220-370)||(4483294-4483442)
chr8 (220-370)||(15203231-15203380)
chr8 (256-370)||(18678093-18678207)
chr8 (220-370)||(20046195-20046344)
chr8 (220-370)||(4542373-4542522)
chr8 (220-370)||(19896278-19896430)
chr8 (256-370)||(32121748-32121862)
chr8 (310-377)||(21491004-21491072)
chr8 (295-370)||(15070571-15070645)
chr8 (315-377)||(17140925-17140988)
chr8 (295-370)||(45290770-45290844)
chr8 (310-377)||(5866318-5866386)
chr8 (208-367)||(20498581-20498740)
chr8 (295-370)||(19937081-19937155)
chr8 (208-377)||(13508028-13508197)
chr8 (220-358)||(14823798-14823935)
chr8 (240-370)||(26219730-26219858)
chr8 (220-370)||(26223932-26224081)
chr8 (310-370)||(983450-983511)
chr8 (310-370)||(6520384-6520445)
chr8 (220-370)||(25484275-25484417)
chr8 (310-370)||(38855295-38855356)
chr8 (235-367)||(19801397-19801527)
chr8 (315-370)||(23760893-23760949)
chr8 (208-377)||(13597560-13597729)
chr8 (267-370)||(21285613-21285716)
chr8 (260-370)||(26225288-26225396)
chr8 (309-377)||(17612153-17612222)
chr8 (336-377)||(21249393-21249434)
chr8 (336-377)||(21255231-21255272)
chr8 (310-370)||(26355742-26355803)
chr8 (24-72)||(5866035-5866082)
chr8 (24-72)||(21249697-21249744)
chr8 (316-367)||(24353039-24353091)
chr8 (316-367)||(37116366-37116418)
chr8 (309-367)||(19154930-19154989)
chr8 (35-72)||(17141229-17141266)
chr8 (318-367)||(20502154-20502203)
chr8 (310-370)||(21673720-21673781)
chr8 (316-365)||(22525579-22525628)
chr8 (31-72)||(39834147-39834188)
chr8 (316-367)||(17267044-17267096)
chr8 (24-72)||(21255535-21255582)
chr8 (21-72)||(17353694-17353745)
chr8 (21-72)||(23846773-23846824)
chr8 (21-72)||(24756032-24756083)
chr8 (37-72)||(43252110-43252145)
chr8 (24-72)||(16185039-16185087)
chr8 (316-367)||(17439557-17439609)
chr8 (323-359)||(20533467-20533503)
chr8 (21-69)||(21168478-21168526)
chr8 (31-71)||(21674021-21674061)
chr8 (32-72)||(21972353-21972393)
chr8 (32-72)||(21976438-21976478)
chr8 (319-367)||(28397569-28397617)
chr8 (32-72)||(37116664-37116704)
chr8 (31-71)||(38855015-38855055)
[»] chr2 (85 HSPs)
chr2 (29-377)||(23285874-23286218)
chr2 (19-370)||(298568-298920)
chr2 (67-377)||(23654188-23654498)
chr2 (31-377)||(37882-38226)
chr2 (19-370)||(22737934-22738284)
chr2 (19-377)||(20309117-20309472)
chr2 (27-377)||(23076451-23076801)
chr2 (19-377)||(22730987-22731346)
chr2 (27-377)||(22337124-22337475)
chr2 (23-377)||(23660032-23660386)
chr2 (82-377)||(23060522-23060815)
chr2 (19-367)||(32451683-32452031)
chr2 (19-231)||(27753730-27753942)
chr2 (220-370)||(22105425-22105575)
chr2 (31-370)||(23708383-23708724)
chr2 (170-377)||(23103302-23103507)
chr2 (220-370)||(21155060-21155209)
chr2 (220-370)||(18808956-18809105)
chr2 (220-370)||(23130875-23131024)
chr2 (220-370)||(23133342-23133491)
chr2 (220-370)||(23709532-23709681)
chr2 (220-370)||(23712013-23712162)
chr2 (220-370)||(24367787-24367936)
chr2 (220-370)||(26505392-26505541)
chr2 (220-370)||(26507870-26508019)
chr2 (220-370)||(32214921-32215070)
chr2 (220-370)||(34402522-34402671)
chr2 (220-370)||(39682326-39682475)
chr2 (235-370)||(23135603-23135737)
chr2 (220-370)||(571410-571559)
chr2 (220-370)||(6726008-6726157)
chr2 (220-370)||(24898195-24898345)
chr2 (220-370)||(24900678-24900828)
chr2 (220-370)||(24903155-24903305)
chr2 (220-370)||(24905632-24905782)
chr2 (220-370)||(24908107-24908257)
chr2 (220-370)||(32039498-32039647)
chr2 (256-370)||(25616201-25616315)
chr2 (220-370)||(28577112-28577261)
chr2 (220-370)||(43137312-43137461)
chr2 (235-370)||(45029869-45030003)
chr2 (309-377)||(8946666-8946734)
chr2 (295-370)||(24529604-24529678)
chr2 (260-370)||(28405992-28406103)
chr2 (220-370)||(38967387-38967537)
chr2 (323-377)||(23040247-23040301)
chr2 (304-370)||(24643034-24643099)
chr2 (219-367)||(7687-7835)
chr2 (214-377)||(19671839-19672001)
chr2 (310-377)||(23071993-23072061)
chr2 (310-365)||(22134251-22134306)
chr2 (310-370)||(7679601-7679662)
chr2 (310-370)||(18786947-18787008)
chr2 (170-359)||(22799032-22799220)
chr2 (316-365)||(23287384-23287433)
chr2 (310-370)||(25175866-25175927)
chr2 (317-365)||(26392403-26392451)
chr2 (21-72)||(22740717-22740768)
chr2 (309-367)||(23207296-23207355)
chr2 (297-365)||(23038048-23038116)
chr2 (24-72)||(23071721-23071768)
chr2 (28-71)||(22133977-22134020)
chr2 (183-348)||(23019625-23019789)
chr2 (170-360)||(40622114-40622305)
chr2 (316-367)||(20520243-20520295)
chr2 (37-72)||(12901286-12901321)
chr2 (21-72)||(15477901-15477952)
chr2 (309-367)||(22413181-22413240)
chr2 (21-72)||(22798883-22798934)
chr2 (37-72)||(24628252-24628287)
chr2 (37-72)||(24649654-24649689)
chr2 (37-72)||(27379206-27379241)
chr2 (37-72)||(27383252-27383287)
chr2 (37-72)||(27602094-27602129)
chr2 (37-72)||(41530783-41530818)
chr2 (22-72)||(19928261-19928311)
chr2 (31-69)||(28406297-28406335)
chr2 (318-367)||(9241945-9241994)
chr2 (30-71)||(25176158-25176199)
chr2 (316-367)||(23004767-23004819)
chr2 (323-359)||(24655396-24655432)
chr2 (323-359)||(24869903-24869939)
chr2 (316-367)||(25108906-25108958)
chr2 (323-359)||(25961592-25961628)
chr2 (36-72)||(31756232-31756268)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (27-377)||(13220-13570)
[»] chr7 (103 HSPs)
chr7 (19-377)||(16386001-16386360)
chr7 (19-377)||(9509198-9509556)
chr7 (20-377)||(12698840-12699198)
chr7 (38-377)||(10589048-10589386)
chr7 (27-377)||(26212005-26212355)
chr7 (19-377)||(40443400-40443756)
chr7 (29-377)||(27847597-27847942)
chr7 (27-377)||(38227490-38227840)
chr7 (25-377)||(3564123-3564476)
chr7 (27-370)||(15143798-15144142)
chr7 (171-370)||(18456319-18456517)
chr7 (220-375)||(13647336-13647491)
chr7 (214-370)||(16213697-16213852)
chr7 (235-370)||(24275184-24275318)
chr7 (220-370)||(456334-456483)
chr7 (220-370)||(11393287-11393436)
chr7 (220-370)||(11972509-11972658)
chr7 (220-370)||(14949122-14949271)
chr7 (220-370)||(15376713-15376862)
chr7 (220-370)||(16232533-16232682)
chr7 (220-370)||(18640285-18640434)
chr7 (220-370)||(20385123-20385272)
chr7 (220-370)||(21189595-21189744)
chr7 (220-370)||(32125504-32125653)
chr7 (220-370)||(41522930-41523079)
chr7 (220-370)||(41525392-41525541)
chr7 (21-370)||(44116522-44116871)
chr7 (267-370)||(48273405-48273508)
chr7 (220-370)||(18430725-18430874)
chr7 (220-370)||(24702251-24702400)
chr7 (220-370)||(27216873-27217022)
chr7 (180-370)||(2280033-2280224)
chr7 (222-370)||(16410072-16410219)
chr7 (220-370)||(3386346-3386495)
chr7 (24-370)||(17061718-17062064)
chr7 (220-370)||(24704701-24704847)
chr7 (310-377)||(34200795-34200863)
chr7 (295-370)||(13869359-13869433)
chr7 (220-370)||(38898376-38898526)
chr7 (217-370)||(14932685-14932839)
chr7 (217-370)||(15356120-15356274)
chr7 (217-370)||(15360234-15360388)
chr7 (310-370)||(67761-67822)
chr7 (310-377)||(16495411-16495479)
chr7 (220-370)||(20110569-20110708)
chr7 (310-377)||(28505342-28505410)
chr7 (295-366)||(13831390-13831460)
chr7 (297-368)||(18154873-18154944)
chr7 (310-370)||(811175-811236)
chr7 (310-370)||(44014194-44014255)
chr7 (310-377)||(11996071-11996139)
chr7 (263-370)||(16219715-16219822)
chr7 (315-370)||(18005662-18005718)
chr7 (220-367)||(12756671-12756817)
chr7 (210-359)||(15211484-15211633)
chr7 (333-377)||(15754955-15754999)
chr7 (295-370)||(22072929-22073005)
chr7 (315-370)||(47831823-47831879)
chr7 (309-370)||(1868038-1868100)
chr7 (309-370)||(12901339-12901401)
chr7 (23-149)||(12756473-12756600)
chr7 (31-99)||(16056616-16056684)
chr7 (170-360)||(17137969-17138155)
chr7 (220-320)||(26355983-26356083)
chr7 (220-320)||(26358435-26358535)
chr7 (24-72)||(28505059-28505106)
chr7 (316-370)||(14044762-14044817)
chr7 (316-370)||(14354792-14354847)
chr7 (33-72)||(18302494-18302533)
chr7 (31-73)||(810894-810936)
chr7 (256-337)||(2530129-2530208)
chr7 (31-138)||(12255556-12255664)
chr7 (208-364)||(12255734-12255892)
chr7 (322-370)||(16056344-16056393)
chr7 (309-377)||(19486787-19486856)
chr7 (31-80)||(22073223-22073272)
chr7 (24-72)||(2832063-2832110)
chr7 (24-72)||(11995788-11995835)
chr7 (170-360)||(12187041-12187227)
chr7 (24-72)||(34201099-34201146)
chr7 (24-68)||(39267404-39267447)
chr7 (33-72)||(9389462-9389501)
chr7 (21-72)||(9703578-9703629)
chr7 (33-72)||(9751316-9751355)
chr7 (21-72)||(12321499-12321550)
chr7 (37-72)||(12718966-12719001)
chr7 (37-72)||(12723877-12723912)
chr7 (21-72)||(13149451-13149502)
chr7 (37-72)||(16906974-16907009)
chr7 (21-72)||(18154593-18154644)
chr7 (316-367)||(18203831-18203882)
chr7 (37-72)||(18279701-18279736)
chr7 (37-72)||(18283664-18283699)
chr7 (21-72)||(48593214-48593265)
chr7 (34-72)||(68061-68099)
chr7 (177-226)||(48273538-48273588)
chr7 (170-250)||(24054602-24054682)
chr7 (31-72)||(44014489-44014530)
chr7 (323-359)||(9446216-9446252)
chr7 (24-68)||(15754646-15754689)
chr7 (316-367)||(20220238-20220290)
chr7 (323-359)||(20569654-20569690)
chr7 (309-360)||(48991206-48991258)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (19-377)||(4721-5079)
scaffold0358 (19-321)||(1-303)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (28-377)||(1961-2310)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (19-377)||(3479-3837)
scaffold0292 (23-368)||(361-706)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (19-368)||(24055-24406)
scaffold0042 (21-72)||(34667-34718)
[»] chr5 (94 HSPs)
chr5 (19-377)||(8286596-8286955)
chr5 (27-377)||(22075028-22075378)
chr5 (19-377)||(23390250-23390608)
chr5 (25-377)||(25421541-25421894)
chr5 (27-377)||(21292732-21293081)
chr5 (19-377)||(13095504-13095862)
chr5 (27-377)||(24493578-24493928)
chr5 (25-366)||(25431414-25431756)
chr5 (19-377)||(13025320-13025678)
chr5 (27-377)||(24529229-24529580)
chr5 (27-377)||(9077961-9078312)
chr5 (25-377)||(1096476-1096829)
chr5 (19-263)||(22107127-22107371)
chr5 (27-248)||(21985908-21986130)
chr5 (219-377)||(21808343-21808501)
chr5 (219-377)||(21729018-21729176)
chr5 (24-370)||(11581003-11581348)
chr5 (170-377)||(37723912-37724117)
chr5 (220-370)||(264768-264917)
chr5 (295-377)||(21997564-21997646)
chr5 (220-370)||(39363397-39363546)
chr5 (221-370)||(10732941-10733089)
chr5 (24-370)||(36154586-36154929)
chr5 (220-370)||(20909025-20909174)
chr5 (220-370)||(29329947-29330096)
chr5 (220-370)||(42245365-42245514)
chr5 (220-370)||(20902008-20902158)
chr5 (171-370)||(22412200-22412388)
chr5 (171-370)||(18418596-18418793)
chr5 (220-370)||(29345993-29346142)
chr5 (31-367)||(22144068-22144406)
chr5 (220-370)||(18319033-18319183)
chr5 (235-370)||(39245149-39245283)
chr5 (220-370)||(29348466-29348615)
chr5 (220-370)||(29350939-29351088)
chr5 (220-370)||(2154613-2154763)
chr5 (211-337)||(18356364-18356488)
chr5 (256-370)||(17517192-17517306)
chr5 (220-370)||(32027406-32027555)
chr5 (310-377)||(19660879-19660947)
chr5 (298-370)||(20918026-20918097)
chr5 (220-370)||(10775675-10775825)
chr5 (211-337)||(20910745-20910869)
chr5 (295-370)||(31061081-31061155)
chr5 (295-370)||(38619447-38619521)
chr5 (310-370)||(21329541-21329602)
chr5 (310-370)||(22959576-22959637)
chr5 (310-377)||(36314586-36314654)
chr5 (309-367)||(20026984-20027043)
chr5 (299-370)||(23064524-23064594)
chr5 (310-370)||(21565558-21565619)
chr5 (170-359)||(21873277-21873462)
chr5 (220-370)||(24067120-24067270)
chr5 (297-368)||(26704089-26704160)
chr5 (297-368)||(26973822-26973893)
chr5 (310-370)||(26012079-26012140)
chr5 (317-370)||(26732884-26732937)
chr5 (315-370)||(21502205-21502261)
chr5 (317-367)||(26740697-26740747)
chr5 (24-72)||(22119951-22119998)
chr5 (170-360)||(22032345-22032529)
chr5 (21-72)||(23201680-23201731)
chr5 (21-72)||(23535347-23535398)
chr5 (31-72)||(5888940-5888981)
chr5 (35-72)||(19660606-19660643)
chr5 (310-370)||(19668914-19668975)
chr5 (329-370)||(20806850-20806891)
chr5 (31-80)||(21501919-21501968)
chr5 (31-68)||(21565863-21565900)
chr5 (31-72)||(22959298-22959339)
chr5 (318-367)||(23469822-23469871)
chr5 (170-360)||(18769910-18770096)
chr5 (33-73)||(20026706-20026746)
chr5 (24-72)||(24767095-24767142)
chr5 (21-72)||(17410744-17410795)
chr5 (21-72)||(18356624-18356675)
chr5 (37-72)||(19472493-19472528)
chr5 (37-72)||(20296145-20296180)
chr5 (21-72)||(20910558-20910609)
chr5 (21-72)||(21887135-21887186)
chr5 (309-367)||(22178264-22178323)
chr5 (33-72)||(31342414-31342453)
chr5 (34-72)||(25744036-25744074)
chr5 (318-359)||(20805575-20805616)
chr5 (318-367)||(21328268-21328317)
chr5 (318-363)||(21731514-21731559)
chr5 (31-68)||(21741308-21741345)
chr5 (318-363)||(21809634-21809679)
chr5 (209-282)||(23572182-23572254)
chr5 (32-72)||(123074-123114)
chr5 (319-359)||(20766997-20767037)
chr5 (323-359)||(26680605-26680641)
chr5 (323-359)||(26952212-26952248)
chr5 (341-377)||(40725862-40725898)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (27-376)||(13507-13854)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (19-377)||(1860-2218)
scaffold0016 (24-72)||(207277-207324)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (19-377)||(32076-32431)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (27-377)||(15227-15575)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (27-377)||(38770-39120)
scaffold0145 (176-377)||(32951-33151)
scaffold0145 (220-370)||(9762-9912)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (19-377)||(10180-10535)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (22-377)||(5878-6236)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (27-377)||(4858-5207)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (27-377)||(814-1161)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (22-375)||(51593-51943)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (25-377)||(25824-26177)
scaffold0122 (31-250)||(33260-33480)
scaffold0122 (240-370)||(44682-44812)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (28-327)||(6669-6968)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (14-377)||(8488-8847)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (29-377)||(16291-16636)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (33-377)||(1298-1639)
scaffold0106 (33-377)||(7275-7616)
scaffold0106 (318-370)||(15291-15343)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (27-370)||(22899-23242)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (32-377)||(20919-21265)
[»] scaffold0175 (4 HSPs)
scaffold0175 (19-334)||(13144-13459)
scaffold0175 (311-377)||(34132-34199)
scaffold0175 (330-377)||(282-329)
scaffold0175 (24-71)||(34437-34483)
[»] scaffold0021 (7 HSPs)
scaffold0021 (19-290)||(124681-124952)
scaffold0021 (170-376)||(174776-174980)
scaffold0021 (317-377)||(121775-121835)
scaffold0021 (309-367)||(136412-136471)
scaffold0021 (309-367)||(145120-145179)
scaffold0021 (32-73)||(136132-136173)
scaffold0021 (32-73)||(144840-144881)
[»] scaffold0056 (3 HSPs)
scaffold0056 (27-377)||(16976-17329)
scaffold0056 (235-367)||(79299-79430)
scaffold0056 (21-72)||(13834-13885)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (25-377)||(39486-39838)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (25-377)||(39922-40274)
scaffold0080 (267-367)||(19885-19987)
scaffold0080 (318-359)||(18708-18749)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (25-377)||(74974-75326)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (27-377)||(8294-8641)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (21-370)||(339706-340052)
scaffold0003 (220-370)||(158450-158599)
scaffold0003 (211-337)||(71350-71474)
scaffold0003 (21-72)||(96903-96954)
[»] scaffold0228 (4 HSPs)
scaffold0228 (21-375)||(4519-4873)
scaffold0228 (21-375)||(12101-12455)
scaffold0228 (21-375)||(22053-22407)
scaffold0228 (21-72)||(18390-18441)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (19-377)||(47004-47353)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (31-377)||(39867-40212)
scaffold0026 (69-377)||(25905-26213)
scaffold0026 (35-72)||(59271-59308)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (21-377)||(4887-5240)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (25-377)||(16359-16712)
[»] scaffold0540 (2 HSPs)
scaffold0540 (101-377)||(2987-3262)
scaffold0540 (25-90)||(772-837)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (19-248)||(1052-1281)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (19-227)||(3640-3848)
scaffold0165 (19-227)||(7704-7912)
scaffold0165 (180-370)||(27663-27854)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (19-367)||(51638-51985)
scaffold0034 (309-370)||(32552-32614)
scaffold0034 (31-97)||(32826-32892)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (27-305)||(27911-28190)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (19-194)||(20595-20770)
[»] scaffold0120 (5 HSPs)
scaffold0120 (36-377)||(32729-33068)
scaffold0120 (36-377)||(45937-46276)
scaffold0120 (176-377)||(16122-16322)
scaffold0120 (27-142)||(16331-16447)
scaffold0120 (325-377)||(17389-17441)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (19-197)||(11267-11445)
scaffold0235 (264-377)||(11442-11555)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (38-365)||(4545-4872)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (182-377)||(3103-3298)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (25-327)||(722-1021)
scaffold0395 (320-377)||(4888-4945)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (27-226)||(10323-10523)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (256-377)||(28423-28544)
scaffold0046 (310-377)||(11301-11369)
scaffold0046 (310-377)||(2006-2074)
scaffold0046 (333-377)||(4561-4605)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (68-206)||(17790-17928)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (220-370)||(4707-4856)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (220-370)||(20760-20909)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (220-370)||(37834-37983)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (220-370)||(17440-17589)
scaffold0023 (220-370)||(94424-94573)
scaffold0023 (235-370)||(44467-44602)
scaffold0023 (315-377)||(119884-119947)
scaffold0023 (310-370)||(100390-100451)
scaffold0023 (316-370)||(40224-40279)
scaffold0023 (310-370)||(101515-101576)
scaffold0023 (29-73)||(101709-101753)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (235-370)||(13405-13539)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (220-370)||(4310-4459)
scaffold0761 (21-72)||(6066-6117)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (208-370)||(8482-8646)
scaffold0621 (310-370)||(6551-6612)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (220-370)||(10786-10935)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (170-323)||(3434-3588)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (220-370)||(13960-14109)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (220-370)||(82085-82234)
scaffold0037 (260-370)||(22665-22775)
scaffold0037 (24-72)||(80090-80137)
[»] scaffold0029 (4 HSPs)
scaffold0029 (220-366)||(11305-11450)
scaffold0029 (37-72)||(61386-61421)
scaffold0029 (209-282)||(12861-12933)
scaffold0029 (39-72)||(65304-65337)
[»] scaffold0028 (9 HSPs)
scaffold0028 (220-370)||(136693-136842)
scaffold0028 (220-370)||(139162-139311)
scaffold0028 (220-370)||(144100-144249)
scaffold0028 (220-370)||(134224-134373)
scaffold0028 (220-370)||(141631-141780)
scaffold0028 (315-368)||(62216-62270)
scaffold0028 (31-73)||(132967-133009)
scaffold0028 (300-367)||(132677-132745)
scaffold0028 (37-72)||(58492-58527)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (220-370)||(501097-501246)
scaffold0001 (220-367)||(85579-85726)
scaffold0001 (310-370)||(160700-160761)
scaffold0001 (21-72)||(173587-173638)
[»] scaffold0142 (3 HSPs)
scaffold0142 (220-370)||(16797-16946)
scaffold0142 (24-142)||(17024-17143)
scaffold0142 (33-72)||(7537-7576)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (220-370)||(119-268)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (220-370)||(12249-12398)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (220-370)||(9255-9404)
[»] scaffold0044 (4 HSPs)
scaffold0044 (220-370)||(40413-40562)
scaffold0044 (21-72)||(13201-13252)
scaffold0044 (21-72)||(19485-19536)
scaffold0044 (37-73)||(62556-62592)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (220-369)||(29946-30094)
[»] scaffold0031 (5 HSPs)
scaffold0031 (220-367)||(20379-20524)
scaffold0031 (219-366)||(128771-128917)
scaffold0031 (23-69)||(20182-20228)
scaffold0031 (21-72)||(53862-53913)
scaffold0031 (297-358)||(65830-65891)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (27-108)||(182-264)
[»] scaffold0357 (4 HSPs)
scaffold0357 (180-367)||(13147-13336)
scaffold0357 (180-370)||(16014-16205)
scaffold0357 (316-367)||(2680-2732)
scaffold0357 (34-149)||(15866-15983)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (208-367)||(53492-53651)
scaffold0075 (35-72)||(8062-8099)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (220-370)||(4227-4377)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (211-337)||(15362-15486)
scaffold0107 (318-367)||(36199-36248)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (220-370)||(161089-161239)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (240-370)||(116443-116571)
scaffold0022 (316-367)||(129021-129072)
scaffold0022 (309-363)||(78345-78400)
scaffold0022 (32-72)||(128735-128775)
[»] scaffold0839 (1 HSPs)
scaffold0839 (25-135)||(1836-1947)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (260-367)||(1051-1158)
[»] scaffold0247 (3 HSPs)
scaffold0247 (32-96)||(6561-6625)
scaffold0247 (295-370)||(2204-2278)
scaffold0247 (180-377)||(17941-18139)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (170-360)||(26850-27036)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (220-370)||(12077-12220)
[»] scaffold0101 (3 HSPs)
scaffold0101 (220-370)||(1280-1430)
scaffold0101 (21-72)||(8714-8765)
scaffold0101 (170-250)||(8863-8943)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (310-370)||(15677-15738)
scaffold0261 (24-72)||(15974-16021)
[»] scaffold0102 (3 HSPs)
scaffold0102 (310-370)||(19280-19341)
scaffold0102 (31-80)||(19573-19622)
scaffold0102 (23-72)||(48219-48268)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (208-367)||(12587-12745)
scaffold0413 (21-77)||(15370-15426)
[»] scaffold0184 (3 HSPs)
scaffold0184 (310-377)||(1113-1181)
scaffold0184 (32-72)||(3993-4033)
scaffold0184 (323-359)||(4284-4320)
[»] scaffold0555 (2 HSPs)
scaffold0555 (260-370)||(10536-10646)
scaffold0555 (31-73)||(10305-10347)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (220-370)||(38657-38807)
[»] scaffold0010 (6 HSPs)
scaffold0010 (260-370)||(129921-130031)
scaffold0010 (177-367)||(60626-60818)
scaffold0010 (31-72)||(130222-130263)
scaffold0010 (32-73)||(60479-60520)
scaffold0010 (319-367)||(666-714)
scaffold0010 (24-72)||(23513-23561)
[»] scaffold1984 (2 HSPs)
scaffold1984 (31-80)||(437-486)
scaffold1984 (310-370)||(145-206)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (310-370)||(1098-1159)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (208-365)||(8002-8161)
scaffold0507 (31-73)||(7822-7864)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (310-370)||(6627-6688)
scaffold0333 (310-370)||(14007-14068)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (310-370)||(6167-6228)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (310-370)||(8118-8179)
scaffold0218 (24-68)||(29038-29081)
[»] scaffold0198 (3 HSPs)
scaffold0198 (297-370)||(23855-23928)
scaffold0198 (170-249)||(23979-24057)
scaffold0198 (21-72)||(26712-26763)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (310-370)||(23927-23988)
scaffold0100 (27-73)||(20426-20472)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (310-370)||(15821-15882)
scaffold0020 (319-368)||(178912-178961)
[»] scaffold0628 (2 HSPs)
scaffold0628 (260-367)||(2801-2908)
scaffold0628 (31-73)||(2567-2609)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (315-370)||(5659-5715)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (315-370)||(2694-2750)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (310-370)||(28813-28875)
scaffold0211 (31-73)||(28574-28616)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (316-370)||(14747-14802)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (310-367)||(6831-6889)
scaffold0556 (31-72)||(7126-7167)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (325-367)||(11982-12024)
scaffold0503 (23-149)||(12166-12293)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (208-377)||(11473-11642)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (208-377)||(38199-38368)
scaffold0124 (33-72)||(24417-24456)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (309-370)||(25122-25184)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (310-370)||(45836-45897)
scaffold0125 (31-72)||(45555-45596)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (315-370)||(1083-1139)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (170-360)||(21712-21898)
scaffold0210 (170-360)||(29604-29790)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (263-370)||(12955-13062)
scaffold0138 (31-72)||(13255-13296)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (221-370)||(29570-29720)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (170-359)||(16255-16442)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (310-370)||(12782-12843)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (310-370)||(10543-10604)
scaffold0078 (31-73)||(10842-10884)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (316-365)||(206575-206624)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (24-72)||(344-391)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (24-72)||(10226-10273)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (24-72)||(2203-2250)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (309-367)||(569-628)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (309-367)||(6327-6386)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (309-363)||(38339-38394)
scaffold0139 (297-367)||(19995-20065)
scaffold0139 (182-250)||(20116-20184)
[»] scaffold0131 (3 HSPs)
scaffold0131 (319-370)||(36466-36517)
scaffold0131 (170-249)||(36592-36671)
scaffold0131 (21-72)||(36769-36820)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (210-359)||(192920-193070)
scaffold0017 (21-73)||(192741-192793)
scaffold0017 (21-72)||(56394-56445)
scaffold0017 (21-72)||(191038-191089)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (31-73)||(2066-2108)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (31-73)||(32397-32439)
scaffold0150 (295-367)||(32117-32190)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (217-359)||(29117-29262)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (297-367)||(69809-69879)
scaffold0004 (21-72)||(10342-10393)
scaffold0004 (21-72)||(70107-70158)
scaffold0004 (170-250)||(69929-70009)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (31-72)||(9391-9432)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (24-69)||(12567-12611)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (24-72)||(9592-9639)
[»] scaffold1461 (1 HSPs)
scaffold1461 (21-72)||(226-277)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (37-72)||(4875-4910)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (21-72)||(15712-15763)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (21-72)||(6835-6886)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (21-72)||(18651-18702)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (21-72)||(16878-16929)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (309-367)||(2694-2753)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (21-72)||(14983-15034)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (21-72)||(66173-66224)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (21-72)||(2431-2482)
scaffold0013 (319-367)||(30350-30398)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (21-72)||(24726-24777)
scaffold0012 (99-149)||(225644-225694)
scaffold0012 (208-329)||(225465-225584)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (21-72)||(228131-228182)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (318-360)||(10575-10617)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (321-359)||(4999-5037)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (309-370)||(103674-103736)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (23-72)||(2099-2148)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (318-367)||(7450-7499)
scaffold0111 (318-367)||(14569-14618)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (318-359)||(44104-44145)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (323-359)||(7328-7364)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (319-367)||(3276-3324)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (316-367)||(97024-97076)
scaffold0006 (316-367)||(106302-106354)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 96)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 12903124 - 12902766
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12903124 tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctcccgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgc 12903025  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12903024 acgagctgttgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatg 12902925  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  12902924 atgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 12902825  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902824 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 12902766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7089242 - 7088886
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcac 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  7089242 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccggaaacagagtgtcttgttagattttgcgacctttgttgcaa 7089143  T
Q  121 gagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgat 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  7089142 gagttgtcgagagttgaacctttgagtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgat 7089043  T
Q  221 gtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  7089042 gtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 7088943  T
Q  321 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7088942 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 7088886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 31 - 377
Target Start/End: Original strand, 23374125 - 23374471
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcga 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  23374125 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgggtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcaacctttgttgcacgagttgttga 23374224  T
Q  131 gagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataat 230  Q
    |  || ||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23374225 ggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataat 23374324  T
Q  231 gttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgc 330  Q
    ||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23374325 gttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgc 23374424  T
Q  331 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23374425 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaaga 23374471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 44053196 - 44052838
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44053196 tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagagactctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgc 44053097  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  44053096 acgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatg 44052997  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  44052996 atgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 44052897  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44052896 tgcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaaga 44052838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22636801 - 22636444
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22636801 tgtgggattctgacttgacctcgccacggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgc 22636702  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| || |||| ||||||||| |||||| |||||||||| | |  || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  22636701 acgagttgttgagaattgaaccttggggtagtattaagacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgtt-aagatgtgttgatgtcgattatg 22636603  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||    
T  22636602 atgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaac 22636503  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22636502 tgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 22636444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Original strand, 14053056 - 14053413
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14053056 tgtgggattctgacctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgccttgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 14053155  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  14053156 acgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatg 14053255  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaag-atgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtata 317  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||   |||| |||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||  ||||||||    
T  14053256 atgtgatataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtatgcataagaatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtata 14053352  T
Q  318 ctgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  14053353 ctgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaaga 14053413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7894068 - 7893712
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttg 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||    
T  7894068 tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttg 7893969  T
Q  118 cacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattat 217  Q
    || |||| | ||||||||||||||| |||||  |||||||||| | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||    
T  7893968 catgagttgccgagagttgaaccttggggtaatattaagacttaacgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctg---attat 7893872  T
Q  218 gatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtata 317  Q
    ||||||| |||||| | | |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  7893871 gatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtata 7893772  T
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7893771 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaaga 7893712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 16377277 - 16377633
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16377277 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacatagtgccttgttaggattttgctacctttgttgca 16377376  T
Q  120 cgagtggt-cgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||  |  |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  16377377 cgagttttatgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatg 16377476  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  |||||||||    
T  16377477 atgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatac 16377574  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16377575 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 16377633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3097010 - 3096759
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3097010 tgtgggattctgacctgaactcgccaaggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 3096911  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  3096910 acgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggataaatacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatg 3096811  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatg 271  Q
    ||| |||| |||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||    
T  3096810 atgagatacaatg-tttatgcattacttgaagaatatttgaatatttatgatg 3096759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 60 - 377
Target Start/End: Original strand, 16239764 - 16240081
Alignment:
Q  60 ctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagac 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  16239764 ctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattaagac 16239863  T
Q  159 tttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttg 258  Q
    || | | ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||  ||| |||    
T  16239864 ttaatgatgatgttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataattg 16239963  T
Q  259 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 358  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  16239964 aatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctattttgctattgttatttaattaagttgcatgagt 16240062  T
Q  359 cggtctaagttgttgaaga 377  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  16240063 tggtctaagttgatgaaga 16240081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 14039010 - 14038657
Alignment:
Q  25 aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgcacgag 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||| |||| ||    
T  14039010 aatctgaccagaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaag 14038911  T
Q  124 tggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtg 223  Q
    | |   ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | |||  |||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  14038910 ttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtg 14038811  T
Q  224 atataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcct 323  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  14038810 atataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcat 14038711  T
Q  324 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14038710 gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 14038657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 248
Target Start/End: Original strand, 17047826 - 17048055
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  17047826 tgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgcgacctttgttgc 17047925  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  |||  ||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17047926 acgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagagactaattacaacctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatg 17048025  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttga 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17048026 atgtgatataatgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 202 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798783
Alignment:
Q  202 tgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtc 301  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  302 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 7798783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 176 - 377
Target Start/End: Original strand, 16270147 - 16270347
Alignment:
Q  176 tataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||     
T  16270147 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 16270246  T
Q  276 tgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 375  Q
    | | ||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16270247 taacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaa 16270345  T
Q  376 ga 377  Q
    ||    
T  16270346 ga 16270347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 370
Target Start/End: Original strand, 44928678 - 44929029
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| ||    
T  44928678 tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgc 44928776  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagact-tta-aggtgaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatatgttgttgttgatt 215  Q
    |||||| || ||||||||||||||  |||||  ||| || | ||| |  | |  ||||  || ||||||||||||| |||| |||   ||  ||||| ||    
T  44928777 acgagtcgttgagagttgaaccttgtggtag--ttatgaatattatatataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgattttatgttgttt 44928874  T
Q  216 atgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgta 315  Q
    ||  |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || |||||||  ||| ||||| ||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  44928875 atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgta 44928974  T
Q  316 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928975 tactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 44929029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 146 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 17046724 - 17046496
Alignment:
Q  146 gtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 245  Q
    ||||||||||||||| |   | ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  17046724 gtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatg-tttatacattact 17046626  T
Q  246 tgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 344  Q
    ||||  ||  ||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||   |||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17046625 tgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttctatactacctatgttgctgtttgttatttaac 17046529  T
Q  345 taagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17046528 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 17046496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 261 - 377
Target Start/End: Original strand, 52873363 - 52873479
Alignment:
Q  261 tatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 360  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873363 tatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 52873462  T
Q  361 gtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||| ||||||    
T  52873463 gtctaagttgatgaaga 52873479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6190782 - 6190481
Alignment:
Q  66 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaagg 165  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||      
T  6190782 tcgcgagtgacccaaaaatagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagctgtcgagagttgaaccttggcgtagcattaagacttgaata 6190683  T
Q  166 tgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgat-tatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatt 264  Q
    |||  |||| || |||  ||||||||| ||| || |||||  ||||||| ||||||||||| ||||| | || ||||||||||||   ||  |||||| |    
T  6190682 tgatattaattacaattcgtgaagctg-ttatgagatgttaatgttgatgtatgatgtgatctaatg-tatacgcattacttgaagtttaaatgaataat 6190585  T
Q  265 taagatg-ttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 362  Q
    | ||||| ||| |   || | |||||| |  |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  6190584 tgagatgattgttcgcttac-attgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggt 6190486  T
Q  363 ctaag 367  Q
    |||||    
T  6190485 ctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 214 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899900
Alignment:
Q  214 ttatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttg 313  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |  |||||  ||| |||||| |    
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-g 6899964  T
Q  314 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 6899900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 7799056 - 7798959
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7799056 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgtcttgttaggttttgcgacctttgtttcacgagt 7798959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15091258 - 15091093
Alignment:
Q  25 aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgcacgag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||| |||| ||    
T  15091258 aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaag 15091159  T
Q  124 tggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaag 189  Q
    |     ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | |  || ||||| ||||||||||||||    
T  15091158 tttctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaag 15091093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 18215274 - 18215423
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  18215274 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18215373  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215374 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18215423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 300 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096302
Alignment:
Q  300 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 3096302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 44102573 - 44102227
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgcacg 121  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| | |||||||   |||||||||| |||||| |||||    
T  44102573 gaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaat-acttgtttaggattttgcgatctttgtagcacg 44102475  T
Q  122 agtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagact-tta-aggtgaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    ||| || |||||||||||||| || |||  ||| || | ||| |  | |  ||||  || ||||||||||||| |||| |||   ||| || || ||||     
T  44102474 agtcgttgagagttgaaccttgggatag--ttatgaatattatatataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgatg-ttata 44102378  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
     |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| | | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  44102377 ttgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 44102278  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    | | | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102277 tac-tgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 44102227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 12307 - 12456
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  12307 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12406  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12407 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 12456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 15118352 - 15118501
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  15118352 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15118451  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118452 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15118501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 19618172 - 19618321
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||    
T  19618172 tgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 19618271  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618272 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 19618321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 23803265 - 23803414
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  23803265 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23803364  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803365 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 23803414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 52312672 - 52312523
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  52312672 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 52312573  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312572 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 52312523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 214 - 370
Target Start/End: Original strand, 1837503 - 1837658
Alignment:
Q  214 ttatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttg 313  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||| | |  |||||||||||||||||||    
T  1837503 ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttg 1837602  T
Q  314 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837603 tatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 1837658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 3515169 - 3515020
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||||||    
T  3515169 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatact 3515070  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515069 gc-tgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 3515020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19242861 - 19242712
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  19242861 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19242762  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242761 gt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 19242712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 44615450 - 44615301
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||    
T  44615450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 44615351  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615350 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 44615301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 44773087 - 44773236
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| ||   |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  44773087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44773186  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773187 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 44773236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 50222339 - 50222488
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| |    
T  50222339 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataat 50222438  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222439 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 50222488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 51463868 - 51464017
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  51463868 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 51463967  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463968 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 51464017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 240 - 370
Target Start/End: Original strand, 54798729 - 54798859
Alignment:
Q  240 attacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 339  Q
    ||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  54798729 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttat 54798828  T
Q  340 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54798829 tcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 54798859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 370
Target Start/End: Original strand, 52242958 - 52243301
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgcacgagtggtc 128  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| |||||||| ||     
T  52242958 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgta 52243056  T
Q  129 gagagttgaacctttgggtaggatt-aagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtt-taagatatgttgttgttgattatgatgtgata 226  Q
     |||||||||| || |||||| | | |||| | ||    ||  ||||  || ||||||||||||||| ||||||   ||| ||||| |||| ||||||||    
T  52243057 aagagttgaactttggggtagtaatgaagattgtataa-gatattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgata 52243155  T
Q  227 taatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatg--ctgtttttgtatactgccta 324  Q
    ||||  | ||||||||||||| || |||  ||||| ||| |||||||| |||||| || ||||| |  |||| |||||  ||| ||| | ||||||||||    
T  52243156 taattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgattt-gcatactgccta 52243254  T
Q  325 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243255 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 52243301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 15355324 - 15355474
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |||||| |||  |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  15355324 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15355423  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355424 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15355474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 235 - 370
Target Start/End: Original strand, 18239434 - 18239568
Alignment:
Q  235 tatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 334  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||    
T  18239434 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt 18239532  T
Q  335 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239533 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18239568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 260 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14280438 - 14280329
Alignment:
Q  260 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280438 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 14280340  T
Q  360 ggtctaagttg 370  Q
    |||||||||||    
T  14280339 ggtctaagttg 14280329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 208 - 367
Target Start/End: Original strand, 13794 - 13953
Alignment:
Q  208 tgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctg 307  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |  |||| ||||| ||    
T  13794 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg 13893  T
Q  308 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13894 -ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 14970707 - 14970856
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| |    
T  14970707 tgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatatt 14970806  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    || | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14970807 gc-tgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 14970856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 220 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22353999 - 22353844
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||  |  |  ||    
T  22353999 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatct 22353900  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 375  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22353899 gcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa 22353844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 220 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15367856 - 15367699
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||||||||||  | ||||| ||| |||||| |||  |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  15367856 tgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15367757  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15367756 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 15367699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 220 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15402869 - 15402712
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||||||||||  | ||||| ||| |||||| |||  |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  15402869 tgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15402770  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15402769 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 15402712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12611105 - 12610963
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||         
T  12611105 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgt----- 12611011  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611010 ---tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 12610963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 208 - 370
Target Start/End: Original strand, 43198496 - 43198660
Alignment:
Q  208 tgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctg 307  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||| |  |||| |||||       
T  43198496 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaat 43198595  T
Q  308 t-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    | ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198596 tgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 43198660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 315 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15551889 - 15551826
Alignment:
Q  315 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551889 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 15551826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 295 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15370108 - 15370027
Alignment:
Q  295 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15370108 ttatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 15370027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 295 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15371292 - 15371211
Alignment:
Q  295 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15371292 ttatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 15371211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 295 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15373573 - 15373492
Alignment:
Q  295 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15373573 ttatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 15373492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 295 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16223622 - 16223541
Alignment:
Q  295 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16223622 ttatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 16223541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 222 - 367
Target Start/End: Original strand, 21815587 - 21815731
Alignment:
Q  222 tgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgc 321  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| || || |  |||||||||||||||||||||||| |     
T  21815587 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacagt 21815686  T
Q  322 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21815687 -tgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 369
Target Start/End: Original strand, 8574864 - 8574971
Alignment:
Q  260 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    |||||| |||||||| |||||| || ||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574864 atatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 8574961  T
Q  360 ggtctaagtt 369  Q
    ||||||||||    
T  8574962 ggtctaagtt 8574971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Original strand, 12288254 - 12288315
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288254 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 12288315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12774084 - 12774023
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774084 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 12774023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 325 - 370
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641331
Alignment:
Q  325 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641286 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 7641331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Original strand, 39706332 - 39706393
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706332 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 39706393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 337
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256230
Alignment:
Q  211 tgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgttt 310  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |    || ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |  |||||||||| ||  |    
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattacttaagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--t 43256203  T
Q  311 ttgtatactgcctatgttgctgttgtt 337  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||    
T  43256204 tggtatgctgcctatgttgctgttgtt 43256230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 8846433 - 8846372
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8846433 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttg 8846372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 20149992 - 20149842
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |||||| |||  |||||| || ||| | |||| || ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  20149992 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 20149893  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||  | ||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||||    
T  20149892 tg-atgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttg 20149842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 12774355 - 12774313
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774355 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 12774313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 73
Target Start/End: Original strand, 21815388 - 21815438
Alignment:
Q  23 ggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21815388 ggaagctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 21815438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 3332248 - 3332201
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3332248 gaatctgac-tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 3332201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15552176 - 15552129
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15552176 gaatctgacc-gaactcgccacggcgagcagaggctcgcgcctcgcgag 15552129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 24029104 - 24029057
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24029104 gaatctgac-tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 24029057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 367
Target Start/End: Original strand, 46640499 - 46640558
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640499 ttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 73
Target Start/End: Original strand, 21815059 - 21815109
Alignment:
Q  23 ggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21815059 ggaagctgacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 21815109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 73
Target Start/End: Original strand, 21818481 - 21818531
Alignment:
Q  23 ggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21818481 ggaagctgacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 21818531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 72
Target Start/End: Original strand, 22633980 - 22634018
Alignment:
Q  34 tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22633980 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 22634018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15099706 - 15099665
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15099706 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 15099665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333298
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 365  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtcta 17333298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 72
Target Start/End: Original strand, 13812578 - 13812614
Alignment:
Q  36 aactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13812578 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 13812614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 367
Target Start/End: Original strand, 53082202 - 53082254
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082202 tactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Original strand, 4561107 - 4561142
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4561107 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 4561142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Original strand, 5756711 - 5756746
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5756711 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 5756746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 9556878 - 9556827
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  9556878 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 9556827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 12570383 - 12570332
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12570383 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12570332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 13569874 - 13569823
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  13569874 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 13569823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 16243158 - 16243209
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16243158 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16243209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 16678347 - 16678398
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16678347 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16678398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 72
Target Start/End: Original strand, 20157056 - 20157095
Alignment:
Q  33 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20157056 ctgaactcgccatggcgtgcagaggctctcgcctcgcgag 20157095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 33742710 - 33742675
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33742710 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 33742675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 36133720 - 36133771
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  36133720 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 36133771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14280512 - 14280462
Alignment:
Q  177 ataatctgtgaagctgttt-aagatatgttgttgttgattatgatgtgata 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  14280512 ataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata 14280462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 97
Target Start/End: Original strand, 15464694 - 15464760
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt 97  Q
    |||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||    
T  15464694 acctgaactcaccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatgacttgtt 15464760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 222
Target Start/End: Original strand, 54798675 - 54798721
Alignment:
Q  177 ataatctgtgaagctgttt-aagatatgttgttgttgattatgatgt 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  54798675 ataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgt 54798721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 8846730 - 8846689
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8846730 accttaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 8846689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15093986 - 15093798
Alignment:
Q  170 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaaga 269  Q
    |||||||  ||||| |||||||||| | || |||||  |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |   ||  ||||||  |||| |    
T  15093986 gttaactgcaatctctgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaatatattattgaatgattaata 15093888  T
Q  270 tgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    |||||  ||| || ||||||| |  | | ||||||||||| ||||   ||  ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15093887 tgttgtagaaatgaaattgatattatgaagtcatgctgttgttgtgatctttctatgctgctattgttctttaactaagttgcatgagtc 15093798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 282
Target Start/End: Original strand, 15121747 - 15121819
Alignment:
Q  209 gttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattg 282  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||   || ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  15121747 gttgattatgatgtattataatg-tttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg 15121819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 359
Target Start/End: Original strand, 16348716 - 16348757
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16348716 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16348757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 359
Target Start/End: Original strand, 16357004 - 16357045
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16357004 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16357045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 359
Target Start/End: Original strand, 11250619 - 11250655
Alignment:
Q  323 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11250619 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 11250655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 359
Target Start/End: Original strand, 15353365 - 15353401
Alignment:
Q  323 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15353365 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 15353401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 71
Target Start/End: Original strand, 39706052 - 39706092
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 71  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  39706052 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 39706092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 79)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 15 - 377
Target Start/End: Original strand, 27250479 - 27250841
Alignment:
Q  15 aacctgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttg 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  27250479 aacctgtgggattctgacctgaactcgccacgtcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacacagaaacagagtcccttgttatattttgcgacctttg 27250578  T
Q  115 ttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgat 214  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| | |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27250579 ttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagcattgatacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgat 27250678  T
Q  215 tatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  27250679 tatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgt 27250778  T
Q  315 atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250779 atactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 27250841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 27 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21027039 - 21026692
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtgg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21027039 tctgacctaaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttg 21026940  T
Q  127 tcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgata 226  Q
    | |||  || ||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21026939 ttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgata 21026840  T
Q  227 taatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  21026839 taatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctata 21026740  T
Q  327 ttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttga 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026739 ttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttga 21026692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Original strand, 50209974 - 50210325
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  50209974 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagtt 50210073  T
Q  126 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgat 225  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  50210074 gttgagagttgaacctttgggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 50210173  T
Q  226 ataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctat 325  Q
    ||||||||  | ||||||||||||| ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50210174 ataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctat 50210273  T
Q  326 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50210274 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 50210325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 25 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22532631 - 22532278
Alignment:
Q  25 aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgag 123  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22532631 aatctgacttgaactcgccacggtgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgacttgttaggattttgcgacctttgttgcacgag 22532532  T
Q  124 tggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtg 223  Q
      || ||||||||||||||  ||||| ||| |||||| | | ||| ||||  ||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22532531 ctgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgatgatgttatttatgaactgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtg 22532432  T
Q  224 atataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcct 323  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532431 atataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 22532332  T
Q  324 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22532331 atgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaaga 22532278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 25 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 34510142 - 34509789
Alignment:
Q  25 aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgag 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  34510142 aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacagagtgtcatgttaggtttttgcgacctttgttgcacgag 34510043  T
Q  124 tggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtg 223  Q
    | || ||| |||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  34510042 ttgttgagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtg 34509943  T
Q  224 atataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcct 323  Q
    |||||||||| || |||||||||||   ||   || ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509942 atataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 34509843  T
Q  324 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34509842 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 34509789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 309
Target Start/End: Original strand, 22354326 - 22354616
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22354326 tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgc 22354425  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| || |||| |||||||||| ||||| |||||||||| | |  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22354426 acgagttgttgagaattgaacctttaggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatg 22354525  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtt 309  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22354526 atgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 377
Target Start/End: Original strand, 38801140 - 38801499
Alignment:
Q  14 gaacctgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 113  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38801140 gaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 38801239  T
Q  114 gttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttga 213  Q
    |||| |||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  38801240 gttgtacgagttgtcggaagttgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactataatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttga 38801339  T
Q  214 ttatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttg 313  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||| ||| |||||||||||||| | ||||| || ||||||| |||||   |||    
T  38801340 ttacgatgtgttataatg-tttatgcattacttgaagaataattgtatatataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcttgctg---ttg 38801435  T
Q  314 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
     | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  38801436 cacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaaga 38801499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 20135539 - 20135203
Alignment:
Q  35 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattt-tgcgacctttgttgcacgagtggtcgagag 133  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| || |||||    
T  20135539 gaactcgccatggcgagcagaagctctcacctcgcgagtaacccagaaacagagtgacttgttaggtttatgcgacctttgttgtacgagttgttgagag 20135440  T
Q  134 ttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt 233  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| | | | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  20135439 ttgaaccttagggtagtagtaagacctaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgtt 20135340  T
Q  234 ttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt 333  Q
     |||||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||| |||||||||  |||| |  |||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||| |    
T  20135339 gtatgcattacttgaagttttattgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctat 20135240  T
Q  334 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20135239 tgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 20135203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 275
Target Start/End: Original strand, 22355928 - 22356185
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgac-ttgttagattttgcgacctttgttg 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22355928 tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggct-tcgcatcgcgagtgacctagaaacagagtgacattgttagattttgagacctttgttg 22356026  T
Q  118 cacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttg-ttgatta 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||    
T  22356027 cacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgatta 22356126  T
Q  217 tgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttga 275  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||    
T  22356127 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22356185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 275
Target Start/End: Original strand, 22357614 - 22357871
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgac-ttgttagattttgcgacctttgttg 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22357614 tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggct-tcgcatcgcgagtgacctagaaacagagtgacattgttagattttgagacctttgttg 22357712  T
Q  118 cacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttg-ttgatta 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||    
T  22357713 cacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgatta 22357812  T
Q  217 tgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttga 275  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||    
T  22357813 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22357871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 197
Target Start/End: Original strand, 20846983 - 20847151
Alignment:
Q  29 tgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  20846983 tgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtt 20847082  T
Q  129 gagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaa 197  Q
    |||  || ||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  20847083 gaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaaccataatctatgaagctgtttaa 20847151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 176 - 370
Target Start/End: Original strand, 22468608 - 22468801
Alignment:
Q  176 tataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   ||  ||||||| |||||||||||     
T  22468608 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgta-attatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatgttgt 22468706  T
Q  276 tgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22468707 tgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 22468801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 433373 - 433025
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || ||||||   |||||||||| |||||| ||    
T  433373 tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttgcaaaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgc 433275  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtagg-attaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatatgttgttgttgatta 216  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||  || || | | |||  | |  ||||  || |||||| |||||| |||| |||   ||| ||||| |||    
T  433274 acgagtcgttgagagttgaaccttggggtagctatgaatattataaa-taatattaatgatgatctgtaaagctgatttatgatgatttgatgttgttta 433176  T
Q  217 tgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtat 316  Q
    |  |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||||| || |||||||||||    
T  433175 tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtat 433076  T
Q  317 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433075 actgcctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 433025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 286 - 377
Target Start/End: Original strand, 20847175 - 20847266
Alignment:
Q  286 ttgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20847175 ttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 20847266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 220 - 375
Target Start/End: Original strand, 45574842 - 45574997
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||| | |  ||||||||||||||||||| |||||    
T  45574842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatact 45574941  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45574942 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa 45574997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 13989028 - 13988879
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  13989028 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13988929  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988928 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13988879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 21923291 - 21923440
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  21923291 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21923390  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923391 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21923440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 23593735 - 23593884
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  23593735 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23593834  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593835 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 23593884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 21475087 - 21475236
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  21475087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21475186  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21475187 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 21475236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21840929 - 21840780
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| ||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||    
T  21840929 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 21840830  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840829 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21840780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 31612475 - 31612326
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  ||||||  | |||||||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  31612475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 31612376  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612375 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 31612326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 48603730 - 48603652
Alignment:
Q  170 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 248  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48603730 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 29298298 - 29298150
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||    
T  29298298 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatact 29298200  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298199 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 29298150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 29776850 - 29776701
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||    
T  29776850 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatact 29776751  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776750 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 29776701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 16275363 - 16275513
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||  |||||| || ||| |||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  16275363 tgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16275462  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16275463 tgc-tatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttg 16275513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 367
Target Start/End: Original strand, 21861513 - 21861672
Alignment:
Q  208 tgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctg 307  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||  ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||| |  |||| ||||||||    
T  21861513 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg 21861612  T
Q  308 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21861613 -ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 367
Target Start/End: Original strand, 21896199 - 21896358
Alignment:
Q  208 tgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctg 307  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | ||| |||||| ||||| |||  ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||| |  |||| ||||||||    
T  21896199 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg 21896298  T
Q  308 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21896299 -ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16362079 - 16361930
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| ||   |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| ||||||| ||||||    
T  16362079 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatact 16361980  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361979 gt-tgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16361930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 318 - 370
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454658
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20454658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 13212861 - 13213011
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |||||| ||   |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||||    
T  13212861 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 13212960  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||  |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212961 tgt-tgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13213011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 370
Target Start/End: Original strand, 15860084 - 15860158
Alignment:
Q  295 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15860084 ttatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttg 15860158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21347124 - 21346974
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |||||| ||   |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||||    
T  21347124 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 21347025  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347024 tgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21346974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 211 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797570
Alignment:
Q  211 tgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgttt 310  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    || ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |  |||||||||| ||  |    
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--t 33797597  T
Q  311 ttgtatactgcctatgttgctgttgtt 337  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||    
T  33797596 ttgtatgctgcatatgttgctgttgtt 33797570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 220 - 368
Target Start/End: Original strand, 22123067 - 22123215
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| | |  |||||| || |||  ||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||    
T  22123067 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 22123166  T
Q  320 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 368  Q
    |  | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123167 gt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22123215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 235 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21342244 - 21342109
Alignment:
Q  235 tatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt 333  Q
    ||||||||| |||||| ||   |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| | |||   |||    
T  21342244 tatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgt 21342146  T
Q  334 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342145 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21342109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 367
Target Start/End: Original strand, 35260986 - 35261180
Alignment:
Q  171 ttaactataatctgtgaagctgtt-taagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaaga 269  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| ||||||   ||| ||||| | || ||||||| ||||  | |||||||||||||||| ||   ||||| ||| |||    
T  35260986 ttaacgataatatgtgaagttgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgaga 35261085  T
Q  270 tgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||||   ||||| ||||| |  |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261086 tgttgat---ttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16758857 - 16758665
Alignment:
Q  180 atctgtgaagctgtt-taagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatga 278  Q
    ||||||||||||||| ||| ||   ||||||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| |||  ||||| ||   ||||||| ||     
T  16758857 atctgtgaagctgttataatatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgttgt-gatgttgttgt 16758759  T
Q  279 attgcaattgatgtatttatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| | ||||| |  |||| |||||  ||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16758758 attgtatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 16758665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21707329 - 21707180
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | || ||||||| ||| | |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  || ||||||||| ||||||||||||    
T  21707329 tgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatact 21707230  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
       | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707229 at-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21707180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21711871 - 21711722
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | || ||||||| ||| | |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  || ||||||||| ||||||||||||    
T  21711871 tgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatact 21711772  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
       | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711771 at-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21711722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 20918681 - 20918620
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918681 tttgcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21714631 - 21714558
Alignment:
Q  297 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21714631 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttg 21714558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21754122 - 21754061
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754122 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21754061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 33681084 - 33681023
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33681084 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 33681023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 310 - 377
Target Start/End: Original strand, 14295595 - 14295663
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14295595 tttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaaga 14295663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 40389317 - 40389167
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |||||| |||  |||||| || ||| | |||| || ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  40389317 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 40389218  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||    
T  40389217 tga-tgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttg 40389167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 359
Target Start/End: Original strand, 21787978 - 21788136
Alignment:
Q  201 atgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |   ||  ||||||  ||||||||||| |||| || ||||||| |    | ||    
T  21787978 atgttgatgttgattatgatgttatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattacgaagt 21788077  T
Q  301 catgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    ||||||||| ||||   ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  21788078 catgctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggttatttaactaagttgcatgagtc 21788136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 367
Target Start/End: Original strand, 22921913 - 22921971
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921913 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22921971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Original strand, 52928014 - 52928075
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928014 tttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 52928075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 33681365 - 33681301
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttg 95  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||| ||||    
T  33681365 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaattacccagttacagagtgccttg 33681301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22237753 - 22237643
Alignment:
Q  260 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 358  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | ||| |  |||| ||||| || ||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22237753 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagt 22237655  T
Q  359 cggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||    
T  22237654 cggtctaagttg 22237643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 21754392 - 21754350
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754392 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 21754350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 20248356 - 20248295
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20248356 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 20248295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 20918964 - 20918917
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20918964 gaatctgac-tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 20918917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 367
Target Start/End: Original strand, 50614167 - 50614219
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614167 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 367
Target Start/End: Original strand, 50621995 - 50622047
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621995 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 367
Target Start/End: Original strand, 16368329 - 16368388
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368329 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 367
Target Start/End: Original strand, 41050079 - 41050138
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  41050079 ttttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 20637206 - 20637165
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20637206 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 20637165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 21162121 - 21162080
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21162121 acctgtactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 21162080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21714763 - 21714683
Alignment:
Q  170 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttta-tgcattacttgaat 250  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | || |||||  |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21714763 gttaactgcaatctgtgaagctgtt-atgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaat 21714683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 16080202 - 16080253
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16080202 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16080253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Original strand, 16375231 - 16375266
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16375231 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16375266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 20091230 - 20091281
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||    
T  20091230 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagatgttctcacctcgcgag 20091281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 20138431 - 20138380
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  20138431 tgggaatctgacttgtactcgtcatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 20138380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 21407688 - 21407653
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21407688 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21407653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 316 - 367
Target Start/End: Original strand, 21533923 - 21533974
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  21533923 tactgcgtatgttgttgttgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 21533974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 21714912 - 21714861
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21714912 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21714861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 36819066 - 36819117
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  36819066 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 36819117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 52639874 - 52639839
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52639874 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 52639839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 20248633 - 20248592
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  20248633 acctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcgcgag 20248592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20958176 - 20958123
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 371  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20958176 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactggatgagtcggtctaagttgt 20958123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 22921635 - 22921672
Alignment:
Q  34 tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 71  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22921635 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 22921672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 26065295 - 26065254
Alignment:
Q  32 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  26065295 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 26065254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 72
Target Start/End: Original strand, 28194213 - 28194254
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  28194213 acctgaactcgccatggcaagtagaggctctcgcctcgcgag 28194254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 72
Target Start/End: Original strand, 35981451 - 35981492
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  35981451 acctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgag 35981492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 71
Target Start/End: Original strand, 52927745 - 52927786
Alignment:
Q  30 gacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 71  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  52927745 gacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 52927786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16758938 - 16758890
Alignment:
Q  99 gattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggt 147  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  16758938 gattttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggggt 16758890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Original strand, 22831138 - 22831186
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22831138 gaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22831186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Original strand, 45310135 - 45310175
Alignment:
Q  32 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  45310135 cctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 45310175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Original strand, 803 - 1160
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  803 tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 902  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  903 acgaattgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatg 1002  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||    
T  1003 atgtgatataatg-tttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatac 1101  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1102 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 1160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Original strand, 167733 - 168090
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167733 tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 167832  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  167833 acgaattgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatg 167932  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||    
T  167933 atgtgatataatg-tttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatac 168031  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  168032 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 168090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 52279 - 51922
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  52279 tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaactgagtgtcttgttaggttttgcgacctt-gttgc 52181  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  52180 acgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatg 52081  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||     
T  52080 ttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatat 51981  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51980 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 51922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 367
Target Start/End: Original strand, 38204 - 38253
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38204 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 38253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 128)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Original strand, 20698190 - 20698547
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20698190 tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgtggc 20698289  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | | ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||    
T  20698290 acgagttgtcgagagttgaacctttggatagaattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatg 20698389  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  20698390 atgtgatataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatac 20698488  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20698489 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 20698547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 13442641 - 13442283
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13442641 tgtgggattctgacctgaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgc 13442542  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |   |||||||||| | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13442541 acgagttgtcgagagttgaaccttgggatgacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatg 13442442  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||    
T  13442441 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 13442342  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13442341 tgcctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 13442283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 17488216 - 17487865
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa-cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtg 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17488216 tctgacctgaaatcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtt 17488117  T
Q  126 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgat 225  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17488116 gtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 17488017  T
Q  226 ataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctat 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17488016 ataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctat 17487917  T
Q  326 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17487916 tttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 17487865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 17499698 - 17499347
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa-cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtg 125  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17499698 tctgacctgaattcgccacggtgagcagaggctctcgcctctctagtgacctagaaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtt 17499599  T
Q  126 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgat 225  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  17499598 gtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgat 17499499  T
Q  226 ataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctat 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17499498 ataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctat 17499399  T
Q  326 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17499398 tttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 17499347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 26687254 - 26686903
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  26687254 tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttacgacctttgttgc 26687155  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||| | || ||||||||||| || |||||| |||  ||||| | |  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26687154 acgaatcgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatg 26687055  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||||  ||| | |||||||||||||| || ||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  26687054 ttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 26686955  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26686954 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 26686903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Original strand, 14576582 - 14576937
Alignment:
Q  15 aacctgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgaccttt 113  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  14576582 aacctttggaaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacaaagtgccttgttaggattttgcgaccttt 14576681  T
Q  114 gttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttga 213  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| || | | ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  14576682 gttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagatttaatgatgatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttga 14576781  T
Q  214 ttatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttg 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| ||     
T  14576782 ttatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt- 14576880  T
Q  314 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14576881 tatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttg 14576937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 12399565 - 12399218
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtgg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |    
T  12399565 tctgacctgaactcgccacggcgagtaaaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacag--tgacttgttag-ttttccgacctttgttgcacgagttg 12399469  T
Q  127 tcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgata 226  Q
    | | |  || | ||||||||||| |||||||| | | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12399468 ttggggattaagcctttgggtagcattaagacataatgaagaggttaactataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgata 12399369  T
Q  227 taatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 326  Q
    |||||| |||||||||||||||    || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12399368 taatgtcttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatg 12399269  T
Q  327 ttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399268 ttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 12399218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 18438894 - 18438543
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagtg 125  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  18438894 tctgacctgaagttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagtt 18438795  T
Q  126 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgat 225  Q
    || ||| |||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  18438794 gttgagtgttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgat 18438695  T
Q  226 ataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctat 325  Q
    |||||||| ||||||||||||||   ||   || |||   ||||||||| ||| ||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18438694 ataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctat 18438595  T
Q  326 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18438594 gttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaaga 18438543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 43841291 - 43840941
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtgg 126  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  43841291 tctgacctgaactcgccacagcgagcaaaggccctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttacacgagttg 43841192  T
Q  127 tcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgata 226  Q
    | |||||||  || || |||||| |||  ||||| | |  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  43841191 ttgagagtttgactttggggtagtattgggacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgata 43841092  T
Q  227 taatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 326  Q
    ||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43841091 taatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatg 43840992  T
Q  327 ttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  43840991 ttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaaga 43840941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 36 - 377
Target Start/End: Original strand, 23083132 - 23083473
Alignment:
Q  36 aactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagtt 135  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  23083132 aactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgaatgacccagaaacatagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttcagagtt 23083231  T
Q  136 gaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttt 235  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||   | ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  23083232 gaaccttgaggtagtattaagacttagtgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttat 23083331  T
Q  236 atgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg 335  Q
     ||||||||| |||  | | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23083332 gtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattg 23083431  T
Q  336 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23083432 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 23083473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14572960 - 14572605
Alignment:
Q  15 aacctgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgaccttt 113  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  14572960 aacctttggaaatctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtaccttgttaggtttttgcgaccttt 14572861  T
Q  114 gttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttga 213  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||  |||||     
T  14572860 gttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatttgtttatgttgt 14572761  T
Q  214 ttatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttg 313  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |  ||||||||||||| |||||    
T  14572760 ttatgatgtgatataatgtttttttcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctg-ttttg 14572662  T
Q  314 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572661 tatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 14572605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 14973214 - 14972863
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  | ||| |||| |||     
T  14973214 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagtt 14973115  T
Q  126 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgat 225  Q
    |   ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14973114 gctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 14973015  T
Q  226 ataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctat 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||   || |||| | |||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14973014 ataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgt 14972915  T
Q  326 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14972914 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 14972863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 370
Target Start/End: Original strand, 40213476 - 40213825
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgca 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40213476 tgggaatctaacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgca 40213575  T
Q  120 cgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatga 219  Q
    ||||| || ||||||| |||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40213576 cgagttgttgagagtttaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatga 40213675  T
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| || ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  40213676 tgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatact 40213775  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40213776 g-ctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 40213825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 23 - 377
Target Start/End: Original strand, 25476142 - 25476497
Alignment:
Q  23 ggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25476142 ggaatctgacctgaactcgccacgacgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacg 25476241  T
Q  122 agtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatg 221  Q
    ||| || ||||||||||||||  ||||| ||| |||||| | |  || ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  25476242 agttgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgaggatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatg 25476341  T
Q  222 tgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgc 321  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  25476342 tgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac 25476441  T
Q  322 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25476442 ctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaaga 25476497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Original strand, 11424524 - 11424871
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagtg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  11424524 tctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcgacctagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagtt 11424623  T
Q  126 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgat 225  Q
    || ||||||||||| || |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||    
T  11424624 gttgagagttgaactttggggtagtattgagacttaatgttgatgttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgat 11424723  T
Q  226 ataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctat 325  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||   || ||| || ||||||||||   |||| |||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11424724 ataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgagatgttgat---ttgctattgatattgttatgtcatgctg-ttttgtatactgcctat 11424819  T
Q  326 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11424820 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 11424871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 30030197 - 30029856
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtga-cccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtg 125  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30030197 tctgacct-aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtaatcccagaa-cagaatgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtt 30030100  T
Q  126 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||||    
T  30030099 gtcgagagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgatgatgtttaatataatatgtgaagctgtttaagatgttttgacattgattatgatgtgat 30030000  T
Q  226 ataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctat 325  Q
    |||||||| | | |||||||||||   |  |||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |  ||||||||||||||| |||||  ||| ||||    
T  30029999 ataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatatttaagacgttg-tgaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctat 30029901  T
Q  326 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    | |||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  30029900 gctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 30029856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 42386767 - 42386428
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgcacgagtggtc 128  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||   |||||  | ||||||   |||||||||| |||||| |||||||| ||     
T  42386767 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagttgcccaattacagaa-gccttgtttaggattttgcgaactttgtcgcacgagttgtt 42386669  T
Q  129 gagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgttt-aagatatgttgttgttgattatgatgtgatat 227  Q
    | |||||||||||| |||||| |||  |||||     ||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  42386668 gtgagttgaaccttggggtagtattgggacttgtttatgatgttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatat 42386569  T
Q  228 aatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 327  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||   ||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42386568 aatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 42386469  T
Q  328 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 368  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42386468 tgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 171 - 370
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153313
Alignment:
Q  171 ttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagat 270  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||  ||| |||||||||||||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  271 gttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactacctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16796875 - 16796685
Alignment:
Q  58 ctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaaga 157  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16796875 ctctcgcctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgcgacctttgttgcacgaattgttaagagttgaacctttgggtagcattaaga 16796776  T
Q  158 ctttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 248  Q
    ||| | |  |||| ||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16796775 cttaatgaagaggctaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 29172583 - 29172732
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  29172583 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29172682  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172683 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 29172732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 7781347 - 7781496
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  7781347 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7781446  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781447 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 7781496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 9707607 - 9707756
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||| | ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  9707607 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 9707706  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707707 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 9707756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 17463340 - 17463191
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  17463340 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17463241  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463240 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17463191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 17672788 - 17672639
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  17672788 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17672689  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672688 gc-tatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17672639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 34159488 - 34159339
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  34159488 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34159389  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159388 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 34159339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 38961891 - 38962040
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  38961891 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 38961990  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961991 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 38962040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 45606907 - 45607056
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  45606907 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 45607006  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45607007 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 45607056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 55476653 - 55476504
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  55476653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 55476554  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476553 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 55476504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 235 - 370
Target Start/End: Original strand, 28848626 - 28848760
Alignment:
Q  235 tatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 334  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  28848626 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 28848724  T
Q  335 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848725 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 28848760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 8899256 - 8899111
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  8899256 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8899157  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 366  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899156 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 8899111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12567722 - 12567573
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||| |    
T  12567722 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 12567623  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567622 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 12567573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 13544187 - 13544038
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||| |    
T  13544187 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 13544088  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544087 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13544038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 14179648 - 14179570
Alignment:
Q  170 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 248  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14179648 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 16454281 - 16454430
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  16454281 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16454380  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16454381 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 16454430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 17446655 - 17446803
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  17446655 tgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17446754  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17446755 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttg 17446803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 50242984 - 50242835
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||    
T  50242984 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50242885  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242884 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 50242835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 13151790 - 13151940
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  13151790 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13151889  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13151890 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttg 13151940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 13154255 - 13154405
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  13154255 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13154354  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13154355 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttg 13154405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 220 - 375
Target Start/End: Original strand, 43550478 - 43550633
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| |||||||| |||||    
T  43550478 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatact 43550577  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 375  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43550578 gcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa 43550633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 220 - 367
Target Start/End: Original strand, 53070653 - 53070799
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||||||| || ||||||||||||||    
T  53070653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatact 53070752  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070753 gt-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 6469134 - 6469283
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| ||| |||  ||| || || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  6469134 tgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6469233  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469234 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 6469283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 10247723 - 10247872
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  10247723 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 10247822  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10247823 g-ttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttg 10247872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 16282811 - 16282960
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| |  || |  |||||||||||||||||||||||||    
T  16282811 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16282910  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282911 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16282960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 17248041 - 17248168
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttg-ttag-attttgcgacctttgttgc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||| |||| ||||||||| |||||| ||    
T  17248041 tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaatg-cttgtttagaattttgcgatctttgtcgc 17248139  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggt 147  Q
    |||||| || ||||||| |||||| ||||    
T  17248140 acgagtcgttgagagttaaaccttggggt 17248168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 256 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 46822395 - 46822281
Alignment:
Q  256 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 355  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  46822395 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 46822296  T
Q  356 agtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||||||||||    
T  46822295 agtcagtctaagttg 46822281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 41124049 - 41123903
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  41124049 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41123950  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |    |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41123949 g----ttgtgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 41123903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 269 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500955
Alignment:
Q  269 atgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 368  Q
    |||||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 55500957  T
Q  369 tg 370  Q
    ||    
T  55500956 tg 55500955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 240 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 36166739 - 36166611
Alignment:
Q  240 attacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 339  Q
    ||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  36166739 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttat 36166642  T
Q  340 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166641 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 36166611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 207 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12511237 - 12511073
Alignment:
Q  207 ttgttgattatgatgtgatataatgttt-tatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgc 305  Q
    ||||||| || ||||||||| | ||||| | ||||||||||||   ||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||     
T  12511237 ttgttgaataagatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattattgaatattgaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgt 12511138  T
Q  306 tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  12511137 tgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttg 12511073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 370
Target Start/End: Original strand, 12119800 - 12119874
Alignment:
Q  295 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12119800 ttatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttg 12119874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15412516 - 15412442
Alignment:
Q  295 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412516 ttatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15412442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 208 - 367
Target Start/End: Original strand, 52523670 - 52523831
Alignment:
Q  208 tgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatg--c 305  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| |||  ||||| ||| |||||||| ||| ||||| | ||| |  |||| |||||  |    
T  52523670 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaac 52523769  T
Q  306 tgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    || ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523770 tg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 240 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21618590 - 21618462
Alignment:
Q  240 attacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 339  Q
    ||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  21618590 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttat 21618493  T
Q  340 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618492 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21618462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 257 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15977640 - 15977528
Alignment:
Q  257 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 356  Q
    |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977640 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 15977542  T
Q  357 gtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||    
T  15977541 gtcggtctaagttg 15977528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 310 - 377
Target Start/End: Original strand, 13210371 - 13210439
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210371 tttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 13210439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 8499605 - 8499531
Alignment:
Q  295 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499605 ttatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 8499531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 377
Target Start/End: Original strand, 24340637 - 24340835
Alignment:
Q  180 atctgtgaagctg-tttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatga 278  Q
    ||||||||||||| |||| |||   ||| ||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| | |    
T  24340637 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgttta 24340736  T
Q  279 attgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
     ||||  | ||| |  |||| ||||| |||| | | ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24340737 cttgcgttcgatattattatatcatgatgttgt-gcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 24340835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 44494896 - 44494822
Alignment:
Q  295 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44494896 ttatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 44494822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Original strand, 12174303 - 12174364
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174303 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 12174364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15471001 - 15470940
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471001 tttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15470940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 32307754 - 32307693
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307754 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 32307693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 295 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 10557072 - 10556998
Alignment:
Q  295 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557072 ttatgtcatgccgtttttgtatgctga-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 10556998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 27165413 - 27165263
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | || ||| ||||| ||| |||  ||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||| |   ||| ||||| |||||| | |||||    
T  27165413 tgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgtttt-gcatact 27165315  T
Q  320 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165314 gtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 27165263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 310 - 367
Target Start/End: Original strand, 49668120 - 49668178
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49668120 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 49668178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16103857 - 16103796
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103857 tttgcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16103796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 325 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737249
Alignment:
Q  325 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17737294 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17737249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 149
Target Start/End: Original strand, 53070455 - 53070582
Alignment:
Q  23 ggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt--agattttgcgacctttgttgcac 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||   |||||  | ||||||   |||||||||| |||||| ||||    
T  53070455 ggaagctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacaga-agccttgtttaggattttgcgatctttgtcgcac 53070553  T
Q  121 gagtggtcgagagttgaacctttgggtag 149  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||||    
T  53070554 gagtcgttgagagttgaaccttggggtag 53070582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9512997 - 9512939
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9512997 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 9512939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9520972 - 9520914
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9520972 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 9520914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 370
Target Start/End: Original strand, 53301527 - 53301656
Alignment:
Q  242 tacttgaatgatacttgaatatttaagatgttga-tgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttat 339  Q
    ||||||||| |||  ||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||    
T  53301527 tacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttat 53301625  T
Q  340 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  53301626 ttaactaagttgtatgagtcggtctaagttg 53301656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14234564 - 14234503
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14234564 tttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttg 14234503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16097405 - 16097344
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097405 tttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16097344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 322 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194706
Alignment:
Q  322 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 28194706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45577987
Alignment:
Q  330 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 45577987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 73
Target Start/End: Original strand, 1644447 - 1644489
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644447 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 1644489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 32308025 - 32307983
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32308025 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 32307983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 73
Target Start/End: Original strand, 49667848 - 49667890
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49667848 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 49667890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919350
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 365  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23274865 - 23274705
Alignment:
Q  208 tgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctg 307  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||  | ||| | |||||||||| |||  ||||||||| |||||||| | | ||||  | ||| |  |||| ||||| ||    
T  23274865 tgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg 23274766  T
Q  308 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 368  Q
    |||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23274765 tttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Original strand, 1644718 - 1644778
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||    
T  1644718 tttgcatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttg 1644778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 367
Target Start/End: Original strand, 22110402 - 22110454
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110402 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 43926029 - 43925977
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926029 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 12340107 - 12340068
Alignment:
Q  33 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12340107 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 12340068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 367
Target Start/End: Original strand, 37251211 - 37251270
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37251211 ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 377
Target Start/End: Original strand, 37642179 - 37642377
Alignment:
Q  180 atctgtgaagctg-tttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatga 278  Q
    ||||||||||||| |||| |||   ||| ||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| |||  ||| ||||| |||||||| | |    
T  37642179 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgttta 37642278  T
Q  279 attgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
     || |    ||| |  |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  37642279 cttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaaga 37642377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 73
Target Start/End: Original strand, 12934075 - 12934117
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12934075 acctgaactcgccatggcgagcagagactctcgcctcgcgagt 12934117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 359
Target Start/End: Original strand, 23077530 - 23077571
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23077530 ctgcctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtc 23077571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 14665968 - 14665921
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14665968 gaatctgac-tgaactcgcaatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 14665921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 14669123 - 14669076
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14669123 gaatctgac-tgaactcgccatggcgagcagaggctctcacctcgcgag 14669076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 14735481 - 14735434
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14735481 gaatctgac-tgaactcgcaatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 14735434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 326922 - 326973
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  326922 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 326973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 7110034 - 7109999
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7110034 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 7109999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 7113969 - 7113934
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7113969 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 7113934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 11300269 - 11300320
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  11300269 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 11300320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 309 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12377999 - 12377940
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12377999 ttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 72
Target Start/End: Original strand, 12852130 - 12852169
Alignment:
Q  33 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12852130 ctgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 12852169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 15849843 - 15849894
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15849843 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15849894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 15877585 - 15877636
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15877585 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15877636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 16797812 - 16797863
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16797812 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16797863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 16809767 - 16809724
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctc 62  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16809767 tgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagatgctctc 16809724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 19725669 - 19725720
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||| |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19725669 tgggattctgacttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19725720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 22322000 - 22321965
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22322000 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22321965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 22337055 - 22337020
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22337055 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22337020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 23052834 - 23052885
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23052834 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23052885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Original strand, 27409417 - 27409452
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27409417 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 27409452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 324591 - 324549
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  324591 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 324549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 367
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606428
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataag 606428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 856204 - 856162
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 360  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  856204 ctgcctatgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcg 856162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 290
Target Start/End: Original strand, 2051142 - 2051224
Alignment:
Q  208 tgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgat 290  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| |||  ||||| ||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  2051142 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgat 2051224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 9577691 - 9577646
Alignment:
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 365  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  9577691 tgcctatgttgctgttgt-atataaataagctgcatgagtcggtcta 9577646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Original strand, 15878083 - 15878153
Alignment:
Q  297 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  15878083 atgtcatattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataag 15878153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 16097687 - 16097645
Alignment:
Q  30 gacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  16097687 gacctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgag 16097645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 69
Target Start/End: Original strand, 49389408 - 49389446
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 69  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  49389408 acctgaactcgccatggcgagcagaggttctcgcctcgc 49389446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 72
Target Start/End: Original strand, 1465174 - 1465215
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1465174 acctgaacttgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 1465215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 9513265 - 9513228
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 68  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9513265 acctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcg 9513228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 9521240 - 9521203
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 68  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9521240 acctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcg 9521203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 359
Target Start/End: Original strand, 11298580 - 11298621
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11298580 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 11298621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 13210096 - 13210133
Alignment:
Q  35 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13210096 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 13210133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 359
Target Start/End: Original strand, 14878569 - 14878610
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  14878569 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 14878610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15246086 - 15246037
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15246086 ctgcctatgttgctgttgtctattaattaaactgcatgagtcggtctaag 15246037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15483008 - 15482959
Alignment:
Q  23 ggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15483008 ggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15482959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 72
Target Start/End: Original strand, 20461260 - 20461309
Alignment:
Q  23 ggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  20461260 ggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 20461309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23408645 - 23408565
Alignment:
Q  170 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttta-tgcattacttgaat 250  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | || |||||  |||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  23408645 gttaactgcaatctgtgaagctgtt-atgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattacattacttgaat 23408565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 73
Target Start/End: Original strand, 37250932 - 37250973
Alignment:
Q  32 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37250932 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 37250973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 359
Target Start/End: Original strand, 3389994 - 3390030
Alignment:
Q  323 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3389994 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 3390030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 71
Target Start/End: Original strand, 12171869 - 12171909
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 71  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12171869 acctgaactggccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 12171909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14665460 - 14665424
Alignment:
Q  323 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  14665460 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 14665424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Original strand, 22110116 - 22110156
Alignment:
Q  32 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22110116 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22110156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 105)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 19 - 375
Target Start/End: Original strand, 20360714 - 20361070
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20360714 tgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagctgaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgc 20360813  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| || |||  |||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20360814 acgagttgttgaggattgaacctttgggtagtattaagacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatg 20360913  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |    
T  20360914 atgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgc 20361013  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20361014 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaa 20361070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Original strand, 20638037 - 20638395
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20638037 tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcaaaggctctcacctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgc 20638136  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||  |||||||||| | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20638137 acgagttgtcgagagttgaaccttgggataacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatg 20638236  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||    
T  20638237 atgtgatataacgttttatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 20638336  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20638337 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaaga 20638395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 25 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 29060902 - 29060549
Alignment:
Q  25 aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgag 123  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29060902 aatctgacctgaactcgccacgacgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgag 29060803  T
Q  124 tggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtg 223  Q
    | |   |||| |||||||| |||||| ||| |||||| | | |||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  29060802 ttgctaagagctgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgag 29060703  T
Q  224 atataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcct 323  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29060702 atataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcct 29060603  T
Q  324 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  29060602 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaaga 29060549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Original strand, 16920395 - 16920742
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtgg 126  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |      
T  16920395 tctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgccttgcgagtgacccagaaacaaagtgacttgttggattttgcgacctttgttgcacgatttc 16920494  T
Q  127 tcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgata 226  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |   |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16920495 tcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggta 16920594  T
Q  227 taatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 326  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||  |||||||||||||||| | | ||||| || |||||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  16920595 taatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatg---ttgtatactgcctatg 16920690  T
Q  327 ttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16920691 ctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaaga 16920742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Original strand, 22779981 - 22780339
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||    
T  22779981 tgtgggattctgacctaaactcgccacggcaagcaaaggctctcgcctcgcgagtaacctagaaacagagtgtcctgttaggttttgtgacctttgttgc 22780080  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||||| || ||||||| | | ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22780081 acaagttgccgagagttgaaccttggggtagtataaagacttaatgatgatgttaatcataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatg 22780180  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
     ||||||||||||||   |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||     
T  22780181 ttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatat 22780280  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22780281 tgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 22780339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Original strand, 18409588 - 18409939
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  18409588 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctctctagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttacgacctttgttgcacgagtt 18409687  T
Q  126 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgat 225  Q
     | |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18409688 attgagagttgaaccttagggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 18409787  T
Q  226 ataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctat 325  Q
    |||||||| |||| |||| |||||| ||   || ||  || |||||||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  18409788 ataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgt 18409887  T
Q  326 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18409888 gttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 18409939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 29 - 377
Target Start/End: Original strand, 25629118 - 25629467
Alignment:
Q  29 tgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtggt 127  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  25629118 tgacctgtactcgccgtggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacttttgttgcacgagttgt 25629217  T
Q  128 cgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatat 227  Q
      ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25629218 taagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 25629317  T
Q  228 aatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 327  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  25629318 aatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgt 25629417  T
Q  328 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25629418 tcctgttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 25629467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 370
Target Start/End: Original strand, 17287550 - 17287901
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||    
T  17287550 tgtgggattctgacctaaactcgccacggcgattagaggctcttgtctcgtgagtgacccagaaacagagtgtcttgttagggtttgctatctttgttgc 17287649  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | |  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  17287650 acgagttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatg 17287749  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
     | ||| |||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||    
T  17287750 ttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatac 17287849  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287850 tacctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17287901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22831867 - 22831524
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcac 120  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22831867 tgggattctaacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccgagaaacagagtgacttgttggattttgcgacctttgtcgcac 22831768  T
Q  121 gagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgat 220  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22831767 gattcgtcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgat 22831668  T
Q  221 gtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaat--atttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||  ||  ||| ||  || |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||||||   |||  ||| | |     
T  22831667 gtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacag 22831572  T
Q  319 tgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831571 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22831524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20594135 - 20593782
Alignment:
Q  25 aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgag 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||| |||| ||    
T  20594135 aatctgacctgaactcgctacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaag 20594036  T
Q  124 tggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtg 223  Q
    | ||  || |||||||||| |||||| ||| |||||| | | | | | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20594035 ttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgataatgataattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtg 20593936  T
Q  224 atataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcct 323  Q
    ||||| |||| || ||||||||||| | ||  ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  20593935 atatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcat 20593836  T
Q  324 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
     |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20593835 gtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaaga 20593782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 25 - 377
Target Start/End: Original strand, 19303300 - 19303652
Alignment:
Q  25 aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgcacgag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||| |||| ||    
T  19303300 aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgagagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctatgtcgcacaag 19303399  T
Q  124 tggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtg 223  Q
    | |   ||||||||||||| |||||| | | ||| || | | ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19303400 ttgctaagagttgaaccttggggtagcactgagaattaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtg 19303499  T
Q  224 atataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcct 323  Q
    |||||||||| | | |||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| || ||||||||||| |||    
T  19303500 atataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatacttcct 19303598  T
Q  324 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19303599 gtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaaga 19303652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 11185867 - 11185517
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcac 120  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11185867 tgggattctaacctgaactcgccacggcgagcagaggccctcgcctcgtgagtgacccagaaacatagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcat 11185768  T
Q  121 gagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgat 220  Q
    | || ||||||  | | ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||     
T  11185767 gggttgtcgaggatcggacccttgggtaggattaagacttaatagtgaggttaaccgtaatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaa 11185668  T
Q  221 gtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactg 320  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||||  ||  ||| |||   |||||| |||||||||| | ||||| || ||||||||   |||| ||||| ||||    
T  11185667 gtgttataaag-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtacactg 11185572  T
Q  321 cctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttga 374  Q
    |  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11185571 cacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 11185517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 18821573 - 18821714
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821573 tgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 18821672  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactt 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18821673 acgagttgtcgagagttgaaccttggggtagcattaagactt 18821714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 219 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16496411 - 16496253
Alignment:
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  16496411 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 16496312  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496311 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 16496253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 219 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076709
Alignment:
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||   ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || |||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttac 20076768  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20076767 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 20076709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 211 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245595
Alignment:
Q  211 tgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgttt 310  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||| ||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||     
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt- 35245661  T
Q  311 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
      ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35245660 --gtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 35245595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 208 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25644499 - 25644336
Alignment:
Q  208 tgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctg 307  Q
    ||||| || ||||||||||||||  | || ||||||||||||| |||  ||||| ||| |||||||||||| || || ||||| |  |||| ||| ||||    
T  25644499 tgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctg 25644400  T
Q  308 tttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644399 tttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 25644336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12742479 - 12742330
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  12742479 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12742380  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742379 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 12742330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 18334592 - 18334741
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  18334592 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18334691  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334692 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18334741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19005208 - 19005059
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  19005208 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19005109  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005108 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 19005059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 19858919 - 19859068
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  19858919 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19859018  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859019 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 19859068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22782389 - 22782240
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| ||   |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  22782389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22782290  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782289 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 22782240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 24422709 - 24422560
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  24422709 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24422610  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422609 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24422560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25754971 - 25754822
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  25754971 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25754872  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754871 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 25754822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 30676710 - 30676859
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||    
T  30676710 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 30676809  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676810 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 30676859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 33861956 - 33861807
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  33861956 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33861857  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861856 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 33861807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 33864440 - 33864291
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  33864440 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33864341  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864340 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 33864291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1595711 - 1595562
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||||||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||    
T  1595711 tgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1595612  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1595611 gt-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 1595562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 2291180 - 2291329
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||    
T  2291180 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 2291279  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291280 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 2291329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 8055191 - 8055042
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  8055191 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8055092  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055091 tt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 8055042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 26924640 - 26924789
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  26924640 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26924739  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924740 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 26924789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 34963535 - 34963386
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  34963535 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34963436  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34963435 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 34963386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18457079 - 18456735
Alignment:
Q  23 ggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt--agattttgcgacctttgttgcac 120  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||   |||||  | ||||||   |||||||||| |||||| ||||    
T  18457079 ggaagctgacctgaactagccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacaga-agccttgttcaggattttgcgatctttgtcgcac 18456981  T
Q  121 gagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagact-tta-aggtgaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatatgttgttgttgattat 217  Q
    |||| || |||||||||||||| ||| ||  ||| || | ||| |  | |  ||||  || ||||||||||||| |||| |||   ||| ||||| ||||    
T  18456980 gagtcgttgagagttgaaccttggggcag--ttatgaatattatatataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttat 18456884  T
Q  218 gatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtata 317  Q
      |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  18456883 attgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtata 18456784  T
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456783 ct-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25656716 - 25656642
Alignment:
Q  295 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656716 ttatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 25656642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 235 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25688649 - 25688515
Alignment:
Q  235 tatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 334  Q
    |||| ||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25688649 tatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt 25688551  T
Q  335 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25688550 gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 25688515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 235 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18462026 - 18461895
Alignment:
Q  235 tatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 334  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||    
T  18462026 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 18461928  T
Q  335 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461927 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 359
Target Start/End: Original strand, 25603147 - 25603478
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtgg 126  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |  |   |||||||||  |||| ||   |||||| || ||| ||| |||| |    
T  25603147 tctgacttgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgtgagctagtctagaacagagtgcattgtgaggacttgcgatctgtgtcgcatgagttg 25603246  T
Q  127 tcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgata 226  Q
       ||||||||||||||||||||  ||||||||| | |  || ||| | || |||||||||||||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||    
T  25603247 cttagagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgacgatgtttaatagaatctgtgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgata 25603346  T
Q  227 taatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 326  Q
    | ||||| ||| |||||||||||   |  ||||||| || |||||| | ||||||  || |||| |  |||||||||| |||| |||||  |||||||||    
T  25603347 tgatgttgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatg 25603445  T
Q  327 ttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
     ||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  25603446 ctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25603478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 235 - 370
Target Start/End: Original strand, 1540926 - 1541060
Alignment:
Q  235 tatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 334  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  1540926 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 1541024  T
Q  335 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1541025 gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 1541060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 16448526 - 16448676
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |||||| |||  |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  16448526 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16448625  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16448626 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttg 16448676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 19847949 - 19848100
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |||||| |||  |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||  |||||||  ||||  |    
T  19847949 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttgatgtaatc 19848048  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19848049 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 19848100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 3852017 - 3852166
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| || || |  | |||||||||||||||||||||||    
T  3852017 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3852116  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
       | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3852117 at-tgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 3852166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 208 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 20109318 - 20109154
Alignment:
Q  208 tgttgattatgatgtgatataatgttttatg--cattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgc 305  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || |||   |||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |  |||| | |||     
T  20109318 tgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgt 20109219  T
Q  306 tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109218 tgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20109154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 359
Target Start/End: Original strand, 25611485 - 25611816
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtgg 126  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |  |   |||||||||  |||| ||   |||||| || ||| ||| ||||      
T  25611485 tctgacctgaactcgccatggagagcagaggctctcgcctcgcgagctagtctagaacagagtgcattgtgaggacttgcgatctgtgtcgcatgagtta 25611584  T
Q  127 tcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgata 226  Q
       ||||||||||||||||||||  ||| ||||| | |  || ||| |  | ||||| |||||||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||    
T  25611585 cttagagttgaacctttgggtagctttaggacttaatgacgatgtttaacagaatctatgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgata 25611684  T
Q  227 taatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 326  Q
    | ||||| ||| |||||||||||   |  ||||||| || |||||| | ||||||  || |||| |  |||||||||| |||| |||||  |||||||||    
T  25611685 tgatgttgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatg 25611783  T
Q  327 ttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
     ||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  25611784 ctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25611816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 20556894 - 20557041
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  ||||   || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  20556894 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaaa--ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 20556991  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20556992 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 20557041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 295 - 367
Target Start/End: Original strand, 18821875 - 18821946
Alignment:
Q  295 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821875 ttatggcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23992554 - 23992443
Alignment:
Q  256 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 355  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||||| |||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  23992554 ttgaatatttaagatgttga---attgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatg 23992458  T
Q  356 agtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||||||||||    
T  23992457 agtcagtctaagttg 23992443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Original strand, 27333262 - 27333323
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333262 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 27333323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Original strand, 27394002 - 27394063
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394002 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 27394063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 377
Target Start/End: Original strand, 28496515 - 28496583
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28496515 tttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaaga 28496583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 73
Target Start/End: Original strand, 29808639 - 29808691
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29808639 tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 29808691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 377
Target Start/End: Original strand, 29808926 - 29808994
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29808926 tttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaaga 29808994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 211 - 337
Target Start/End: Original strand, 27415887 - 27416011
Alignment:
Q  211 tgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgttt 310  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |    || ||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||    ||||||||||||||||    
T  27415887 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacctaagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgttt 27415986  T
Q  311 ttgtatactgcctatgttgctgttgtt 337  Q
      |||| ||||||||||||||||||||    
T  27415987 --gtatgctgcctatgttgctgttgtt 27416011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Original strand, 9098557 - 9098619
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098557 ttttgcatactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 9098619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 325 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714433
Alignment:
Q  325 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 25714433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 73
Target Start/End: Original strand, 28496231 - 28496280
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496231 gaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 28496280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 33443124 - 33443068
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 365  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33443124 ttttatatactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 179 - 359
Target Start/End: Original strand, 15041465 - 15041644
Alignment:
Q  179 aatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga-atgatacttgaatatttaagatgttgatg 277  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| || | |||| ||| || | |||||| |  |||||||||||| ||  || ||||||| ||||||||||  ||    
T  15041465 aatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgataattaagatttggtttaatgtatg-tgcattacttgagatttta-ttgaatacttaagatgttattg 15041562  T
Q  278 aattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    ||||||| ||||| |  | ||||||||||||| ||||   ||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15041563 aattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatgagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19652272 - 19652211
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19652272 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 19652211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 333 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561312
Alignment:
Q  333 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaaga 1561312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 25641940 - 25641991
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25641940 tgggaatctggcttgaactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 25641991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19668449 - 19668387
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668449 ttttgcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 19668387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 315 - 370
Target Start/End: Original strand, 4185870 - 4185926
Alignment:
Q  315 atactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4185870 atactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttg 4185926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 21939746 - 21939699
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21939746 gaatctgac-tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 21939699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 377
Target Start/End: Original strand, 8227425 - 8227623
Alignment:
Q  180 atctgtgaagctg-tttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatga 278  Q
    ||||||||||||| |||| |||   ||| ||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| |||  ||| ||||| |||||||| | |    
T  8227425 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgttta 8227524  T
Q  279 attgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
     || |    ||| |  |||| ||||| |||||| | |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8227525 cttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaaga 8227623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 15894186 - 15894237
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15894186 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagagtctctcacctcgcgag 15894237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19873205 - 19873135
Alignment:
Q  297 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  19873205 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataag 19873135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22432334 - 22432264
Alignment:
Q  297 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  22432334 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataag 22432264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22438884 - 22438814
Alignment:
Q  297 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  22438884 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataag 22438814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 72
Target Start/End: Original strand, 4185588 - 4185629
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4185588 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 4185629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 72
Target Start/End: Original strand, 4667978 - 4668019
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4667978 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 4668019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21766759 - 21766718
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21766759 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 21766718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 72
Target Start/End: Original strand, 22080502 - 22080543
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22080502 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22080543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23019525 - 23019425
Alignment:
Q  267 agatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 365  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||| |  |||| ||||| |||||| | ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23019525 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtcta 23019427  T
Q  366 ag 367  Q
    ||    
T  23019426 ag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076749
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 71
Target Start/End: Original strand, 27333049 - 27333089
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 71  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  27333049 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 27333089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 71
Target Start/End: Original strand, 27393789 - 27393829
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 71  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  27393789 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 27393829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008167
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 8244193 - 8244158
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8244193 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 8244158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 11567195 - 11567160
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11567195 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 11567160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 17804545 - 17804494
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17804545 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 17804494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 19652551 - 19652512
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcg 70  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  19652551 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcg 19652512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 19863342 - 19863291
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19863342 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19863291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 19870923 - 19870888
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19870923 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19870888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 22334648 - 22334699
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  22334648 tgggattctgacctaaactcgccatggtgagcagatgctctcgcctcgcgag 22334699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 22429788 - 22429839
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22429788 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22429839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 22432614 - 22432563
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22432614 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22432563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 22863278 - 22863243
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22863278 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22863243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 23395401 - 23395366
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23395401 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23395366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19863063 - 19862993
Alignment:
Q  297 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||||||| ||||| |||||  || |||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  19863063 atgtcatactgttgttgtaatcttcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataag 19862993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 19873483 - 19873433
Alignment:
Q  22 gggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19873483 gggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19873433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 16493214 - 16493169
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 363  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  16493214 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 16493169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 72
Target Start/End: Original strand, 16924642 - 16924687
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16924642 tctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16924687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 72
Target Start/End: Original strand, 16929357 - 16929402
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16929357 tctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16929402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18453250 - 18453201
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18453250 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcataagtcggtctaag 18453201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22432465 - 22432385
Alignment:
Q  170 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttta-tgcattacttgaat 250  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | || ||||   ||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||    
T  22432465 gttaactacaatctgtgaagctgtt-atgagatgtcagtgttgattatgatgtgatatattgtttaattacattacttgaat 22432385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22439015 - 22438935
Alignment:
Q  170 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttta-tgcattacttgaat 250  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | || |||||  |||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||    
T  22439015 gttaactgcaatctgtgaagctgtt-atgagatgttagtgttgattatgatgtgatataaagtttaattacattacttgaat 22438935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 72
Target Start/End: Original strand, 31155163 - 31155204
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31155163 acctgtactctccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 31155204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 1561665 - 1561622
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 68  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1561665 gaatctgacc-gaacttgccacggcgagcataggctctcgcctcg 1561622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 4186439 - 4186383
Alignment:
Q  315 atactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4186439 atactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttg 4186383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 69
Target Start/End: Original strand, 15041307 - 15041355
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 69  Q
    |||||||||||| || |||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  15041307 tgggaatctgacttgtactcgccatgacgagcagatgctctcgcctcgc 15041355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18907170 - 18907134
Alignment:
Q  323 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18907170 tatgctgctattgttatttaactaagctgcatgagtc 18907134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 19668728 - 19668688
Alignment:
Q  32 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19668728 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 19668688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 359
Target Start/End: Original strand, 19790837 - 19790873
Alignment:
Q  323 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19790837 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 19790873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 367
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080827
Alignment:
Q  339 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22080827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Original strand, 23657189 - 23657229
Alignment:
Q  32 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23657189 cctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23657229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 85)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Original strand, 21918754 - 21919112
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21918754 tgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 21918853  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    | |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  21918854 atgagttgtcgagagttgaacccttgggtaagattaagacttaacgatgaggttaattacgatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatg 21918953  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatga-tacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtata 317  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  21918954 atgtgatataatg-tttatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtata 21919052  T
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21919053 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 21919112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20536573 - 20536217
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcac 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  20536573 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttattaggttttgcgacctttgttgcac 20536474  T
Q  121 gagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgat 220  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| | |  || ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  20536473 gagttgtcgagtgttgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgat 20536374  T
Q  221 gtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactg 320  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20536373 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 20536274  T
Q  321 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20536273 cctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 20536217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31971614 - 31971266
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtgg 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31971614 tctgacctgaactcgccccggcgagcagaggctgtcacctcgcgagcgacccagaaatagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttg 31971515  T
Q  127 tcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgata 226  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971514 tcgagagctgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgata 31971415  T
Q  227 taatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 326  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  31971414 taatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatg 31971317  T
Q  327 ttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971316 ttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 31971266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Original strand, 18818171 - 18818521
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtgg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  18818171 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttg 18818270  T
Q  127 tcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgata 226  Q
    | ||||||||||  || |||||| |||||||||| | |  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  18818271 ttgagagttgaaatttagggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgata 18818370  T
Q  227 taatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 326  Q
    ||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818371 taatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 18818470  T
Q  327 ttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18818471 ttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 18818521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Original strand, 18878991 - 18879343
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18878991 tgtgggattctgacctgaactcgccaagacgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcggcctttgttgc 18879090  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||| || ||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| || || |||||||||||    
T  18879091 acgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcatcaagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctg-ataagatgtgctgatgttgattatg 18879189  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||     |||||||||||||    
T  18879190 atgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatac 18879284  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18879285 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 18879343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 377
Target Start/End: Original strand, 16199399 - 16199756
Alignment:
Q  18 ctgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16199399 ctgtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcagacgctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgacttattggattttgcgacctttgttg 16199498  T
Q  118 cacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattat 217  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16199499 cacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattat 16199598  T
Q  218 gatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtata 317  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||  |||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||  |||| |||    
T  16199599 gatgtaatataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgaata 16199695  T
Q  318 ctgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16199696 ctgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 16199756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 32 - 377
Target Start/End: Original strand, 21923695 - 21924040
Alignment:
Q  32 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgag 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  21923695 cctgaactcgccacggtgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcccgagtagttgag 21923794  T
Q  132 agttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatg 231  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||| | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||| |    
T  21923795 agttgaaccttgaggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataagg 21923894  T
Q  232 ttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 331  Q
    || | |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  21923895 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgct 21923994  T
Q  332 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21923995 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 21924040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 29 - 377
Target Start/End: Original strand, 28648807 - 28649156
Alignment:
Q  29 tgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28648807 tgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgccttgcgcatgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgt 28648906  T
Q  128 cgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatat 227  Q
     |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28648907 tgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 28649006  T
Q  228 aatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 327  Q
    |||||| ||  |||||||||||| ||   || ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28649007 aatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgt 28649106  T
Q  328 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28649107 tgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 28649156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22627108 - 22626745
Alignment:
Q  14 gaacctgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctt 112  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  22627108 gaacctttggaaatctgacccgaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgatctagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctt 22627009  T
Q  113 tgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttg 212  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | |  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  22627008 tgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatg 22626909  T
Q  213 attatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgttttt 312  Q
    || |||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| |  |||||||||| || ||||    
T  22626908 ataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttg-tttt 22626810  T
Q  313 gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22626809 gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 22626745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 60 - 377
Target Start/End: Original strand, 45130793 - 45131108
Alignment:
Q  60 ctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagact 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  45130793 ctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttattagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagact 45130892  T
Q  160 ttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttga 259  Q
    | |   ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||     
T  45130893 taataatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttgaagaataattgt 45130991  T
Q  260 atatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 358  Q
    |||  ||||||||||||||| ||| ||||||| |  |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45130992 atacctaagatgttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 45131089  T
Q  359 cggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  45131090 cggtctaagatgttgaaga 45131108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23406748 - 23406388
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23406748 tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggttttgtgacctttgttgc 23406649  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    ||||||  | ||||||||||| || || ||  |||  ||||| | |  || ||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  23406648 acgagttattgagagttgaactttgggataatattgggacttaatgaggatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatg 23406549  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgtt--gatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtat 316  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |  | ||| ||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  23406548 ttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtat 23406449  T
Q  317 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23406448 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 23406388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 25 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 6759618 - 6759267
Alignment:
Q  25 aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgcacgag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || ||| |||| ||    
T  6759618 aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggattttgcaatctgtgtcgcacaag 6759519  T
Q  124 tggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatatgttgttgttgattatgatgt 222  Q
    | |   ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6759518 ttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgt 6759419  T
Q  223 gatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcc 322  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||| ||   || ||| || ||||||   ||| ||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  6759418 gatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgagatgt---tgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc 6759322  T
Q  323 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6759321 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 6759267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23648905 - 23648569
Alignment:
Q  35 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattt-tgcgacctttgttgcacgagtggtcgagag 133  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23648905 gaactcgccatggcgatcagaggctctcgcctcgtgagtaacccagaaacagagtgacttgttaggtttatgcgacctttgttgcacgagttgttgagag 23648806  T
Q  134 ttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt 233  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| | | | ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23648805 ttgaaccttggggtagtattaagacctaatgatgatgttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtt 23648706  T
Q  234 ttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt 333  Q
     | |||||||||||||   |  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |  |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |    
T  23648705 gtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctat 23648606  T
Q  334 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23648605 tgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 23648569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Original strand, 16092102 - 16092454
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| || |||  ||| |||     
T  16092102 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcccgagtgacccagaaacagagtgccctgttaggattttgcgatctgtgtcacacaagtt 16092201  T
Q  126 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgttt-aagatatgttgttgttgattatgatgtga 224  Q
    ||  ||||||||||||| |||||  ||| |||||| | | ||| ||||| |||||| || |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16092202 gttaagagttgaaccttggggtaatattgagacttaaggatgatgttaattataatatgcgaagttgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtga 16092301  T
Q  225 tataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgccta 324  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  16092302 tataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctg 16092401  T
Q  325 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16092402 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 16092454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22875431 - 22875074
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||| |||    
T  22875431 tgggaatctgacctgaactcgccatgacgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagggctttgcgatctatgtcgca 22875332  T
Q  120 cgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    | ||| ||  ||||||||||||| |||||| ||| |||  | | ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  22875331 caagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagatgtaatggtgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatg 22875232  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| || ||||||||||    
T  22875231 atgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatac 22875133  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22875132 tgcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaaga 22875074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 68 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7373088 - 7372787
Alignment:
Q  68 gcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 167  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||| | | | |||||| | |  |    
T  7373088 gcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtggtagtgagacttaatgagg 7372989  T
Q  168 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaa 267  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  7372988 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa--------gcattacttgaagtataattgaatatttaa 7372897  T
Q  268 gatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||| || ||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372896 gatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 7372797  T
Q  368 ttgttgaaga 377  Q
    ||| ||||||    
T  7372796 ttgatgaaga 7372787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 248
Target Start/End: Original strand, 25362894 - 25363123
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  25362894 tgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgagagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgcgacctttcttgc 25362993  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25362994 acgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatg 25363093  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttga 248  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25363094 atgtggtataatgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 178 - 377
Target Start/End: Original strand, 21389366 - 21389562
Alignment:
Q  178 taatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatg 277  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||  ||  ||| |||  |||||||||||||    
T  21389366 taatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 21389464  T
Q  278 aattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 376  Q
    ||||| | ||||| || |||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21389465 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 21389561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 178 - 377
Target Start/End: Original strand, 21395896 - 21396092
Alignment:
Q  178 taatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatg 277  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||  ||  ||| |||  |||||||||||||    
T  21395896 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 21395994  T
Q  278 aattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 376  Q
    ||||| | ||||| || |||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21395995 aattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 21396091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 178 - 377
Target Start/End: Original strand, 21790389 - 21790585
Alignment:
Q  178 taatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatg 277  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||  ||  ||| |||  |||||||||||||    
T  21790389 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 21790487  T
Q  278 aattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 376  Q
    ||||| | ||||| || |||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21790488 aattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 21790584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 183 - 377
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778888
Alignment:
Q  183 tgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattg 282  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||  ||  ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattg 21778795  T
Q  283 caattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
     | ||||| || |||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21778796 aatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 21778888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 41598550 - 41598201
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||  ||    
T  41598550 tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgccgc 41598452  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagact-tta-aggtgaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatatgttgttgttgatt 215  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||  ||| || | ||| |  | |  ||||  || ||||||||| ||| |||| |||   ||| ||||| ||    
T  41598451 acgagtcgttgagagttgaaccttggggtag--ttatgaatattatatataatattaatgatgatctgtgaaactgatttatgatgatttgatgttg-tt 41598355  T
Q  216 atgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgta 315  Q
    ||  |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  41598354 atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgta 41598255  T
Q  316 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598254 tactac-tgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 41598201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 14409444 - 14409593
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  14409444 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14409543  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409544 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 14409593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 16413316 - 16413465
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  16413316 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16413415  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413416 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16413465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1484564 - 1484415
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  1484564 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 1484465  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484464 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 1484415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 5853292 - 5853441
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  5853292 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 5853391  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853392 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 5853441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 20403389 - 20403240
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  20403389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20403290  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403289 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20403240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22001915 - 22001766
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  22001915 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22001816  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001815 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 22001766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 4483442 - 4483294
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  4483442 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 4483343  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483342 g-ttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 4483294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 15203231 - 15203380
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| || || ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  15203231 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15203330  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15203331 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttg 15203380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 256 - 370
Target Start/End: Original strand, 18678093 - 18678207
Alignment:
Q  256 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 355  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18678093 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 18678192  T
Q  356 agtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||||||||||    
T  18678193 agtcagtctaagttg 18678207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 20046195 - 20046344
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||    
T  20046195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 20046294  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046295 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20046344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 4542373 - 4542522
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||  |    
T  4542373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatctt 4542472  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542473 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 4542522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19896430 - 19896278
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgat-gtat--ttatgtcatgctgtttttgtat 316  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||  |||  ||||||||||||||||||||||    
T  19896430 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtat 19896331  T
Q  317 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    || |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896330 accg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 19896278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 256 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 32121862 - 32121748
Alignment:
Q  256 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 355  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  32121862 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 32121763  T
Q  356 agtcggtctaagttg 370  Q
    ||||  |||||||||    
T  32121762 agtcattctaagttg 32121748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 310 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21491072 - 21491004
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21491072 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 21491004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15070645 - 15070571
Alignment:
Q  295 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070645 ttatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 315 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 17140988 - 17140925
Alignment:
Q  315 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17140988 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 17140925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 370
Target Start/End: Original strand, 45290770 - 45290844
Alignment:
Q  295 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290770 ttatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 45290844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 310 - 377
Target Start/End: Original strand, 5866318 - 5866386
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5866318 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 5866386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 20498740 - 20498581
Alignment:
Q  208 tgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctg 307  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||  ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||| |  |||| |||||||     
T  20498740 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct- 20498642  T
Q  308 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
     ||||  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20498641 attttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 370
Target Start/End: Original strand, 19937081 - 19937155
Alignment:
Q  295 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19937081 ttatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttg 19937155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 208 - 377
Target Start/End: Original strand, 13508028 - 13508197
Alignment:
Q  208 tgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctg 307  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| | | ||||  | ||| |  |||| ||||| ||    
T  13508028 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg 13508127  T
Q  308 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    || | | ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13508128 ttgt-gcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 13508197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 220 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 14823935 - 14823798
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  14823935 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14823836  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 358  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  14823835 g-ttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt 14823798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 240 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 26219858 - 26219730
Alignment:
Q  240 attacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 339  Q
    ||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||| ||  |||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  26219858 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatact-attttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttat 26219761  T
Q  340 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219760 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 26219730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 26224081 - 26223932
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | ||||||||| || ||| |||  |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||| |    
T  26224081 tgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatatt 26223982  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    || | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  26223981 gctt-tattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttg 26223932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Original strand, 983450 - 983511
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983450 tttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 983511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 6520445 - 6520384
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520445 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 6520384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 25484275 - 25484417
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||     
T  25484275 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac- 25484373  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
           | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25484374 -------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttg 25484417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Original strand, 38855295 - 38855356
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855295 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 38855356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 235 - 367
Target Start/End: Original strand, 19801397 - 19801527
Alignment:
Q  235 tatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 334  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||  ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| ||    
T  19801397 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgt-tgtgttgctatt 19801494  T
Q  335 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801495 gttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 315 - 370
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760949
Alignment:
Q  315 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 23760949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 208 - 377
Target Start/End: Original strand, 13597560 - 13597729
Alignment:
Q  208 tgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctg 307  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||||||  ||||||| | | ||||  | ||| |  |||| ||||| ||    
T  13597560 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg 13597659  T
Q  308 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||| | || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13597660 tttt-gcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 13597729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 267 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285613
Alignment:
Q  267 agatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 365  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||| |  |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtcta 21285618  T
Q  366 agttg 370  Q
    |||||    
T  21285617 agttg 21285613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 370
Target Start/End: Original strand, 26225288 - 26225396
Alignment:
Q  260 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| | ||||| |  ||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225288 atatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 26225385  T
Q  360 ggtctaagttg 370  Q
    |||||||||||    
T  26225386 ggtctaagttg 26225396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 309 - 377
Target Start/End: Original strand, 17612153 - 17612222
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17612153 ttttgcatactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 17612222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 336 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249393
Alignment:
Q  336 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 21249393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 336 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255231
Alignment:
Q  336 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 21255231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Original strand, 26355742 - 26355803
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355742 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 26355803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Original strand, 5866035 - 5866082
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5866035 gaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 5866082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 21249744 - 21249697
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21249744 gaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 21249697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24353091 - 24353039
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353091 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37116418 - 37116366
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116418 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 367
Target Start/End: Original strand, 19154930 - 19154989
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19154930 ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 19154989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 17141266 - 17141229
Alignment:
Q  35 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17141266 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 17141229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 367
Target Start/End: Original strand, 20502154 - 20502203
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20502154 ctgcctatgttgctgttgtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaag 20502203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21673781 - 21673720
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21673781 tttgcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttg 21673720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525579
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 365  Q
    ||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 22525579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 39834188 - 39834147
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39834188 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 39834147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 367
Target Start/End: Original strand, 17267044 - 17267096
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267044 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 21255582 - 21255535
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21255582 gaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagcggctctcgcctcgcgag 21255535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 17353694 - 17353745
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17353694 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 17353745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 23846773 - 23846824
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23846773 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23846824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 24756083 - 24756032
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24756083 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24756032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 43252145 - 43252110
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43252145 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 43252110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 16185087 - 16185039
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16185087 gaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16185039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 367
Target Start/End: Original strand, 17439557 - 17439609
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17439557 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 359
Target Start/End: Original strand, 20533467 - 20533503
Alignment:
Q  323 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20533467 tatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtc 20533503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 69
Target Start/End: Original strand, 21168478 - 21168526
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 69  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  21168478 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgc 21168526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 21674061 - 21674021
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 71  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  21674061 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 21674021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Original strand, 21972353 - 21972393
Alignment:
Q  32 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21972353 cctgtactcgccacggcgagcagatgctctcgccccgcgag 21972393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Original strand, 21976438 - 21976478
Alignment:
Q  32 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21976438 cctgtactcgccacggcgagcagatgctctcgccccgcgag 21976478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28397617 - 28397569
Alignment:
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28397617 tgcctatgttgttgttgtctattaattaagctgcatgagtcggtctaag 28397569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 37116704 - 37116664
Alignment:
Q  32 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  37116704 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 37116664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 71
Target Start/End: Original strand, 38855015 - 38855055
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 71  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  38855015 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 38855055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 85)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 29 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23286218 - 23285874
Alignment:
Q  29 tgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  23286218 tgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtt 23286119  T
Q  129 gagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatata 228  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23286118 gagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatata 23286019  T
Q  229 atgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 328  Q
    |||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  23286018 atgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt----ctgtttttgtatactgcctatgtt 23285923  T
Q  329 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23285922 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 23285874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 19 - 370
Target Start/End: Original strand, 298568 - 298920
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298568 tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 298667  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| || |||  || ||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||    
T  298668 acgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatg 298767  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  298768 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatac 298867  T
Q  319 tgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298868 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 67 - 377
Target Start/End: Original strand, 23654188 - 23654498
Alignment:
Q  67 cgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggt 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |      
T  23654188 cgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaa 23654287  T
Q  167 gaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatattta 266  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23654288 gaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatattta 23654387  T
Q  267 agatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 366  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654388 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23654487  T
Q  367 gttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||    
T  23654488 gttgttgaaga 23654498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 31 - 377
Target Start/End: Original strand, 37882 - 38226
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcga 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37882 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacccagaaacatagtgacttgttagactttgcgacctttgttgcacgagttgtcga 37981  T
Q  131 gagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataat 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37982 gagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataat 38081  T
Q  231 gttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgc 330  Q
    | |||||||||||||||||  ||  ||| |||  ||||||| |||||||| | ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38082 g-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgatgatgaatcgaaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgc 38179  T
Q  331 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38180 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 38226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 19 - 370
Target Start/End: Original strand, 22737934 - 22738284
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22737934 tgtgggattctgaactgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgc 22738033  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| || |||| ||||||||| |||||| |||||||||| | |  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22738034 acgagttgttgagaattgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatg 22738133  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||    
T  22738134 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaac 22738233  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738234 tgcctat-ttaatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 22738284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20309472 - 20309117
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20309472 tgtgggattctgacctgaactcgccacggtgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgacttgttagattttgcgacccttgttgc 20309373  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20309372 acgatttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatg 20309273  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||   ||||||||    
T  20309272 atgtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatac 20309177  T
Q  319 tgcctatgttgct-gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20309176 tgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 20309117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076451
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtgg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  23076801 tctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttg 23076702  T
Q  127 tcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgata 226  Q
    | ||||||||||| || |||||| |||  || |||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  23076701 ttgagagttgaactttggggtagtattgggattttatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgata 23076602  T
Q  227 taatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 326  Q
    ||||||| | |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076601 taatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 23076502  T
Q  327 ttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23076501 ttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaaga 23076451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Original strand, 22730987 - 22731346
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  22730987 tgtgggattctgacctgaactcgccacggggagcaaaggctctcgcctcacgagtcacccagaaacagagtgccttgttaggttttgcgatctttgttgc 22731086  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttggg-taggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattat 217  Q
    |||||  || || | ||||||||| ||| ||| |||||||||| | |  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22731087 acgagctgttgataattgaaccttgggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattat 22731186  T
Q  218 gatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtata 317  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |    
T  22731187 gatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaa 22731286  T
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22731287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaaga 22731346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22337475 - 22337124
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagtg 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||     
T  22337475 tctgacctgaattcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgtgacctttgttgcacgagtt 22337376  T
Q  126 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgat 225  Q
    || |||||||||||||| | |||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22337375 gttgagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgat 22337276  T
Q  226 ataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctat 325  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||  ||||| ||||| |  |||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  22337275 ataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgt 22337176  T
Q  326 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22337175 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 22337124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 23 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23660386 - 23660032
Alignment:
Q  23 ggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| |||||||    
T  23660386 ggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgtgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggtttttgtgacctttattgcacg 23660287  T
Q  122 agtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatg 221  Q
    |||  | |||||||||||||| |||||| ||| ||||||   | ||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23660286 agttattgagagttgaaccttggggtagtattgagacttattgatgatgttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatg 23660187  T
Q  222 tgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgc 321  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  23660186 tgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctg-tttcgtatactgc 23660088  T
Q  322 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23660087 ctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaaga 23660032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 82 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23060815 - 23060522
Alignment:
Q  82 aacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataat 181  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||| || |||||| |||  ||||| | | ||| ||||| ||||||    
T  23060815 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgtt-cacgagttgttgagaattgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 23060717  T
Q  182 ctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaatt 281  Q
     |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  23060716 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 23060618  T
Q  282 gcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23060617 gcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 23060522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 367
Target Start/End: Original strand, 32451683 - 32452031
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32451683 tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 32451782  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttga-ttat 217  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||  |||  |||| || ||| |||||||||| ||| |  |||||  |||||| ||||    
T  32451783 acgagttgtcgagagatgaaccttggggtagcattaagacttgaatatgatattaattacaatttgtgaagctg-ttatgggatgttaatgttgatttat 32451881  T
Q  218 gatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatg-ttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtat 316  Q
    |||||||||| ||| | || ||||||||||||   ||  |||||| || ||||| ||| ||  |||| |||||| |  |||||||||||| |||||| ||    
T  32451882 gatgtgatattatg-tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgc-attgatattgttatgtcatgctatttttgaat 32451979  T
Q  317 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
     ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32451980 gctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27753942 - 27753730
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27753942 tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgaccttcgttgc 27753843  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27753842 acgagttgtcgagagttgaagcttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatg 27753743  T
Q  219 atgtgatataatg 231  Q
    |||||||||||||    
T  27753742 atgtgatataatg 27753730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22105575 - 22105425
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||| |||||    
T  22105575 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 22105476  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105475 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 22105425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 370
Target Start/End: Original strand, 23708383 - 23708724
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgcacgagtggtc 128  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| |||||||| ||     
T  23708383 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgccttgcgagttacccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgtt 23708481  T
Q  129 gagagttgaacctttgggtaggatt-aagact-ttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtt-taagatatgttgttgttgattatgatgtgat 225  Q
    || ||||||||||| |||| | | | |||| | || |  |||  ||||  || ||||||||||||||| ||||||   ||| ||||| |||| |||||||    
T  23708482 gatagttgaaccttggggtcgtaatgaagattgttta--tgatattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtttataatgtgat 23708579  T
Q  226 ataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctat 325  Q
    |||||  | |||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |  |||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  23708580 ataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctat 23708678  T
Q  326 gttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23708679 gttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttg 23708724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 170 - 377
Target Start/End: Original strand, 23103302 - 23103507
Alignment:
Q  170 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttat-gcattacttgaatgatacttgaatatttaag 268  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | || |||||  |||||  | |||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||   |||||  || ||    
T  23103302 gttaactgcaatctgtgaagctgtt-atgagatgttagtgttggatttgatgtgatataatgtttaattgcatgacttgaattatgaatgaatgattgag 23103400  T
Q  269 atgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 368  Q
    |||||||||||||| | ||||| || | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23103401 atgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 23103498  T
Q  369 tgttgaaga 377  Q
    |||||||||    
T  23103499 tgttgaaga 23103507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 21155060 - 21155209
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  21155060 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21155159  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155160 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21155209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18809105 - 18808956
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  18809105 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18809006  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809005 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18808956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23131024 - 23130875
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  23131024 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23130925  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130924 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 23130875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23133491 - 23133342
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  23133491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23133392  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133391 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 23133342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 23709532 - 23709681
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  23709532 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23709631  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709632 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 23709681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 23712013 - 23712162
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  23712013 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23712112  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712113 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 23712162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 24367936 - 24367787
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  24367936 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24367837  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367836 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24367787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 26505541 - 26505392
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||    
T  26505541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26505442  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505441 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 26505392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 26508019 - 26507870
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||    
T  26508019 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26507920  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507919 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 26507870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 32214921 - 32215070
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  32214921 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32215020  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32215021 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 32215070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 34402522 - 34402671
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  34402522 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34402621  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402622 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 34402671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 39682475 - 39682326
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  39682475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39682376  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682375 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 39682326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 235 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23135737 - 23135603
Alignment:
Q  235 tatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 334  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  23135737 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23135639  T
Q  335 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135638 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 23135603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 571559 - 571410
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||| | || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  571559 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 571460  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571459 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 571410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 6726157 - 6726008
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| || || ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  6726157 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6726058  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726057 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 6726008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 24898195 - 24898345
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  24898195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24898294  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24898295 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttg 24898345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 24900678 - 24900828
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  24900678 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24900777  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24900778 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttg 24900828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 24903155 - 24903305
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  24903155 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24903254  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24903255 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttg 24903305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 24905632 - 24905782
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  24905632 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24905731  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24905732 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttg 24905782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 24908107 - 24908257
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  24908107 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24908206  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24908207 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttg 24908257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 32039498 - 32039647
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  32039498 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32039597  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32039598 g-ttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttg 32039647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 256 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25616315 - 25616201
Alignment:
Q  256 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 355  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||  ||||  ||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  25616315 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatg 25616216  T
Q  356 agtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||||||||||    
T  25616215 agtcagtctaagttg 25616201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 28577261 - 28577112
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||  ||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||    
T  28577261 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 28577162  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577161 gt-tgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 28577112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 43137461 - 43137312
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||| | || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||| |    
T  43137461 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 43137362  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137361 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 43137312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 235 - 370
Target Start/End: Original strand, 45029869 - 45030003
Alignment:
Q  235 tatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 334  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||  | ||||| ||||    
T  45029869 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgt-tgtgttgttgtt 45029967  T
Q  335 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45029968 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 45030003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 309 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946666
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 8946666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 370
Target Start/End: Original strand, 24529604 - 24529678
Alignment:
Q  295 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24529604 ttatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttg 24529678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 28406103 - 28405992
Alignment:
Q  260 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 358  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||| |  |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28406103 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagt 28406004  T
Q  359 cggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||    
T  28406003 cggtctaagttg 28405992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 38967537 - 38967387
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |||||| |||  |||||| || |||||||||| || ||||| ||||| |  |||| ||||||| ||||||||||     
T  38967537 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatat 38967438  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967437 tgt-tgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 38967387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 323 - 377
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040301
Alignment:
Q  323 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23040247 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 23040301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 304 - 370
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643099
Alignment:
Q  304 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactga-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24643099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 367
Target Start/End: Original strand, 7687 - 7835
Alignment:
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||  ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||| |  |||| ||||| || ||||| ||||    
T  7687 atgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatac 7785  T
Q  319 tgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7786 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 19672001 - 19671839
Alignment:
Q  214 ttatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttg 313  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||||| | ||||||| | | ||||  | ||| |  |||| ||||| |||||| |    
T  19672001 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattga-gatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgtttt-g 19671904  T
Q  314 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19671903 catactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 19671839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 377
Target Start/End: Original strand, 23071993 - 23072061
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23071993 tttgcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaaga 23072061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 310 - 365
Target Start/End: Original strand, 22134251 - 22134306
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 365  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134251 tttgcatactgcctatgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22134306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 7679662 - 7679601
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7679662 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 7679601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Original strand, 18786947 - 18787008
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786947 tttgcatactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18787008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 359
Target Start/End: Original strand, 22799032 - 22799220
Alignment:
Q  170 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaaga 269  Q
    |||||||  ||| |||||||||||| | || |||||  |||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |   ||  ||||||  ||||||    
T  22799032 gttaactgcaatttgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgccttacttaagatattattgaatgattaaga 22799130  T
Q  270 tgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    ||||| |||| || ||||||| |  | | |||||| |||| ||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22799131 tgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgatgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 22799220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 365  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25175927 - 25175866
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  25175927 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttg 25175866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  317 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 365  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 22740717 - 22740768
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22740717 tgggaatctggcttgaactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22740768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23207355 - 23207296
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207355 ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23038116 - 23038048
Alignment:
Q  297 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 365  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23038116 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtccgtcta 23038048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Original strand, 23071721 - 23071768
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23071721 gaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 23071768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 71
Target Start/End: Original strand, 22133977 - 22134020
Alignment:
Q  28 ctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 71  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22133977 ctgaactgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 22134020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 348
Target Start/End: Original strand, 23019625 - 23019789
Alignment:
Q  183 tgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattg 282  Q
    ||||||||| |||| || |||||  |||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||| |   ||  ||||||  ||||||||||| |||| ||    
T  23019625 tgtgaagct-tttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatg 23019723  T
Q  283 caattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 348  Q
     ||||||| |  | | |||||| |||| ||||   ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23019724 aaattgatattatgaagtcatgttgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaag 23019789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 360
Target Start/End: Original strand, 40622114 - 40622305
Alignment:
Q  170 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatact-----tgaatatt 264  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | || |||||  |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||| |     || |||      
T  40622114 gttaactgcaatctgtgaagctgtt-atgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtactgtataca 40622211  T
Q  265 taagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatg-ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 360  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||  |||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  40622212 taagatgttgatgaattg-aattgatataatta--tcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcg 40622305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 367
Target Start/End: Original strand, 20520243 - 20520295
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520243 tactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Original strand, 12901286 - 12901321
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12901286 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12901321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15477952 - 15477901
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15477952 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15477901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 309 - 367
Target Start/End: Original strand, 22413181 - 22413240
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22413181 ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 22798883 - 22798934
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22798883 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22798934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Original strand, 24628252 - 24628287
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24628252 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24628287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 24649689 - 24649654
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24649689 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24649654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Original strand, 27379206 - 27379241
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27379206 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 27379241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Original strand, 27383252 - 27383287
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27383252 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 27383287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 27602129 - 27602094
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27602129 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 27602094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Original strand, 41530783 - 41530818
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41530783 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 41530818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Original strand, 19928261 - 19928311
Alignment:
Q  22 gggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19928261 gggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19928311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 28406335 - 28406297
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 69  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28406335 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgc 28406297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9241994 - 9241945
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||||||||||||||||||| | || | ||||||||||| |||||||||||    
T  9241994 ctgcctatgttgctgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtctaag 9241945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 25176199 - 25176158
Alignment:
Q  30 gacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 71  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  25176199 gacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 25176158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23004819 - 23004767
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23004819 tactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 23004767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 359
Target Start/End: Original strand, 24655396 - 24655432
Alignment:
Q  323 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24655396 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 24655432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24869939 - 24869903
Alignment:
Q  323 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24869939 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 24869903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 25108958 - 25108906
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25108958 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 25108906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 359
Target Start/End: Original strand, 25961592 - 25961628
Alignment:
Q  323 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25961592 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 25961628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 31756268 - 31756232
Alignment:
Q  36 aactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31756268 aactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 31756232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 13570 - 13220
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtgg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13570 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaatcagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttg 13471  T
Q  127 tcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgata 226  Q
    |||| ||||||||||| || ||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13470 tcgacagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 13371  T
Q  227 taatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 326  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13370 taatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 13271  T
Q  327 ttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13270 ttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 13220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 103)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Original strand, 16386001 - 16386360
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16386001 tgtgggattctaacctgaactcgccacggcgagcagtggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 16386100  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16386101 atgagttgtccagagttgaacctttgggtaacattaagacttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatg 16386200  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    |  |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16386201 atgtaatataatgttttatgcattacttgagaattgtttgaatatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatac 16386300  T
Q  319 tgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16386301 tgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 16386360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 9509556 - 9509198
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9509556 tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgaggagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgc 9509457  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    | |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9509456 aagagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatg 9509357  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||    
T  9509356 atgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatac 9509257  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9509256 tgcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 9509198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 12699198 - 12698840
Alignment:
Q  20 gtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgca 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12699198 gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcacctcgtgagtgacccagaaacaaagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgca 12699099  T
Q  120 cgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatga 219  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || | |  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12699098 cgagttgtcgatagttgaaccttggggtagtattaagagttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatga 12698999  T
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgt-ttttgtatac 318  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||    
T  12698998 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatac 12698899  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12698898 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 12698840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 38 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 10589386 - 10589048
Alignment:
Q  38 ctcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||     
T  10589386 ctcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttttttgcacgagttgtctagagttgg 10589287  T
Q  138 acctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttat 237  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  10589286 acctttgggtaggattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatg-tttat 10589188  T
Q  238 gcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 337  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10589187 gcattgcttgaagaatatttgaacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgtt 10589088  T
Q  338 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10589087 atttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgtcgaaga 10589048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 26212355 - 26212005
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa-cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  26212355 tctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaacagagtgatttgttag-ttttgcgacctttgttgcacgagtt 26212257  T
Q  126 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgat 225  Q
    || |||  || ||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26212256 gttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgat 26212157  T
Q  226 ataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctat 325  Q
    |||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26212156 ataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctat 26212057  T
Q  326 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  26212056 gttgctgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgttgaaga 26212005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 40443756 - 40443400
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  40443756 tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttattggattttgcgacctttgttgc 40443657  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  40443656 acgagttgtcgagagatgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatg 40443557  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||  ||||| |||    
T  40443556 atgtgatataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtttac 40443460  T
Q  319 tgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  40443459 tgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaaga 40443400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 29 - 377
Target Start/End: Original strand, 27847597 - 27847942
Alignment:
Q  29 tgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtc 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27847597 tgacctgaactcgccacggcaagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtc 27847696  T
Q  129 gagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatata 228  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  27847697 gagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgata 27847796  T
Q  229 atgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 328  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||  ||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||| |||   ||||| ||||||||||||    
T  27847797 atg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactg---ttgtacactgcctatgtt 27847892  T
Q  329 gctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27847893 gctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaaga 27847942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 38227840 - 38227490
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagtg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  38227840 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccataaacagagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagtt 38227741  T
Q  126 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgat 225  Q
    ||  ||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  38227740 gttaagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgat 38227641  T
Q  226 ataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctat 325  Q
    |||||| | | | ||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38227640 ataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctat 38227542  T
Q  326 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  38227541 gttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaaga 38227490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 377
Target Start/End: Original strand, 3564123 - 3564476
Alignment:
Q  25 aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgag 123  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3564123 aatctgacctgaactcgccacagcgagcaaatgctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgag 3564222  T
Q  124 tggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtg 223  Q
    | ||  |||||| |||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3564223 ttgttaagagtttaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtg 3564322  T
Q  224 atataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcct 323  Q
    || ||||||| || ||||||||||||| ||   || ||| || |||||||| ||| || || ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3564323 atctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcct 3564422  T
Q  324 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3564423 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 3564476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 370
Target Start/End: Original strand, 15143798 - 15144142
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgcacgagtg 125  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  15143798 tctgacctgtactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagtt 15143897  T
Q  126 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatatgttgttgttgattatgatgtga 224  Q
    |   ||||||||||||  |||||| | |||||||| | | ||| ||| | |||||||||| |||||| |||||||| | |||   |||||||||||||||    
T  15143898 gctaagagttgaacctcggggtagtactaagacttaatgatgatgtttaatataatctgtcaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtga 15143997  T
Q  225 tataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgccta 324  Q
    ||| ||||| || ||||||||| ||| ||   || ||| || |||||||| ||  ||||| ||||| |  | || || ||||||| ||| ||||||   |    
T  15143998 tatgatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactg-aga 15144096  T
Q  325 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144097 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15144142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 171 - 370
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456517
Alignment:
Q  171 ttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagat 270  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  271 gttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 220 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13647491 - 13647336
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||| |||||    
T  13647491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 13647392  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13647391 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa 13647336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 214 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16213852 - 16213697
Alignment:
Q  214 ttatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttg 313  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||| ||| ||| | ||||| |  |||||||||| ||||||||    
T  16213852 ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttg 16213753  T
Q  314 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213752 tatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16213697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 235 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 24275318 - 24275184
Alignment:
Q  235 tatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 334  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24275318 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 24275220  T
Q  335 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275219 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24275184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 456483 - 456334
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  456483 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 456384  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456383 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 456334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 11393287 - 11393436
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  11393287 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11393386  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393387 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 11393436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 11972658 - 11972509
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  11972658 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11972559  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972558 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 11972509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 14949122 - 14949271
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  14949122 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14949221  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949222 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 14949271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 15376713 - 15376862
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  15376713 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15376812  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376813 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15376862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16232682 - 16232533
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  16232682 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16232583  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232582 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16232533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18640434 - 18640285
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  18640434 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18640335  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640334 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18640285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 20385123 - 20385272
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  20385123 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20385222  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385223 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20385272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 21189595 - 21189744
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  21189595 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21189694  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189695 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21189744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 32125653 - 32125504
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  32125653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32125554  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125553 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 32125504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 41523079 - 41522930
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  41523079 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41522980  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41522979 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 41522930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 41525541 - 41525392
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  41525541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41525442  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525441 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 41525392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 44116871 - 44116522
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||  | || |||   |||||||||| |||| ||||    
T  44116871 tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgactcagttacagaacg-ctagtttaggattttgcgatctttattgc 44116773  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtagg-attaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatatgttgttgttgatta 216  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||  || || | | ||   | |  ||||  || || |||||| ||| |||| |||   ||| ||||| |||    
T  44116772 acgagtcgttgagggttgaaccttggggtagttatgaataatatata-taatattaatgatgatatgtgaaactgatttatgatgatttgatgttg-tta 44116675  T
Q  217 tgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtat 316  Q
    |  |||||||||||  | |||||||| ||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  44116674 tattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtat 44116575  T
Q  317 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44116574 actgc-tgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttg 44116522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 267 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273405
Alignment:
Q  267 agatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 366  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa 48273409  T
Q  367 gttg 370  Q
    ||||    
T  48273408 gttg 48273405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18430874 - 18430725
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| ||||||| ||||||    
T  18430874 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 18430775  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430774 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18430725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 24702400 - 24702251
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||    
T  24702400 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 24702301  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702300 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24702251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 27217022 - 27216873
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  27217022 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27216923  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27216922 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 27216873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 180 - 370
Target Start/End: Original strand, 2280033 - 2280224
Alignment:
Q  180 atctgtgaagctgtt-taagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatga 278  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||| ||||| |||| |||||||||||| || |||| |||| |||||| |||  ||||||||| |||||||| |||    
T  2280033 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttga 2280132  T
Q  279 attgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
     ||||| ||||| |  |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2280133 tttgcatttgatattattatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 2280224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 222 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16410219 - 16410072
Alignment:
Q  222 tgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgc 321  Q
    |||||||||  | |||| ||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||     
T  16410219 tgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt 16410120  T
Q  322 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410119 -tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16410072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 3386495 - 3386346
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  | |||||||||||||||||||||||    
T  3386495 tgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3386396  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386395 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 3386346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 370
Target Start/End: Original strand, 17061718 - 17062064
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgcacg 121  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| |||||    
T  17061718 gaatctgacctgaactcgcgatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacg 17061816  T
Q  122 agtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagact-tta-aggtgaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    ||| || |||||||||||| | ||||||  ||| || | ||| |  | |  ||||  || ||||||||||||| |||| |||   ||| ||||| ||||     
T  17061817 agtcgttgagagttgaaccatggggtag--ttatgaatattacatataatattaataatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttata 17061913  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
     |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||| |||| ||||||    
T  17061914 ttgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttt-gtatac 17062012  T
Q  319 tgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17062013 tgctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17062064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 24704847 - 24704701
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||||||| ||   ||||||||||||    
T  24704847 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttg---tttttgtatact 24704751  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704750 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24704701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 310 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 34200863 - 34200795
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34200863 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 34200795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 13869433 - 13869359
Alignment:
Q  295 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869433 ttatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13869359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 38898376 - 38898526
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |||||| ||   |||||| || |||||||||| || ||||| ||||| |  |||||||||||||||||| |||||    
T  38898376 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatac 38898475  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38898476 tgc-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttg 38898526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 217 - 370
Target Start/End: Original strand, 14932685 - 14932839
Alignment:
Q  217 tgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgta 315  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||   |  ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||| || |||||    
T  14932685 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 14932784  T
Q  316 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  14932785 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttg 14932839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 217 - 370
Target Start/End: Original strand, 15356120 - 15356274
Alignment:
Q  217 tgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgta 315  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||   |  ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||| || |||||    
T  15356120 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15356219  T
Q  316 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  15356220 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttg 15356274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 217 - 370
Target Start/End: Original strand, 15360234 - 15360388
Alignment:
Q  217 tgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgta 315  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||   |  ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||| || |||||    
T  15360234 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15360333  T
Q  316 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  15360334 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttg 15360388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 67822 - 67761
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67822 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 67761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16495479 - 16495411
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16495479 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 16495411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 20110708 - 20110569
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||  ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||      
T  20110708 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtata-- 20110611  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110610 ---------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20110569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 377
Target Start/End: Original strand, 28505342 - 28505410
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  28505342 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaaga 28505410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 295 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13831460 - 13831390
Alignment:
Q  295 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 366  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13831460 ttatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 13831390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 297 - 368
Target Start/End: Original strand, 18154873 - 18154944
Alignment:
Q  297 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 368  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18154873 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 18154944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Original strand, 811175 - 811236
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811175 tttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 811236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 44014255 - 44014194
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014255 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 44014194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 310 - 377
Target Start/End: Original strand, 11996071 - 11996139
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11996071 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 11996139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 16219715 - 16219822
Alignment:
Q  263 tttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 361  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||| |  |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16219715 tttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcgg 16219813  T
Q  362 tctaagttg 370  Q
    |||||||||    
T  16219814 tctaagttg 16219822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18005718 - 18005662
Alignment:
Q  315 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005718 atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18005662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 367
Target Start/End: Original strand, 12756671 - 12756817
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||  ||  |||||| || ||| |||| | | ||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||| |    
T  12756671 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 12756770  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12756771 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15211633 - 15211484
Alignment:
Q  210 ttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||   |  ||||||| || |||||||| ||||||  || |||| |  |||||||||| ||||    
T  15211633 ttgattatgatgtgatataatgttgtatacatcgcttgaagttttattgaataattgagatgttg-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgtt 15211535  T
Q  310 tttgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
     |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15211534 gttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 15211484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 333 - 377
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15754999
Alignment:
Q  333 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaaga 15754999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22073005 - 22072929
Alignment:
Q  295 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22073005 ttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttg 22072929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 47831879 - 47831823
Alignment:
Q  315 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47831879 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 47831823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Original strand, 1868038 - 1868100
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868038 ttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 1868100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12901401 - 12901339
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12901401 ttttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttg 12901339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 149
Target Start/End: Original strand, 12756473 - 12756600
Alignment:
Q  23 ggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt--agattttgcgacctttgttgcac 120  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||   ||| |  | ||||||   |||||||||| |||||| ||||    
T  12756473 ggaagctgacctgaactcaccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattaca-aaagccttgtttaggattttgcgatctttgtcgcac 12756571  T
Q  121 gagtggtcgagagttgaacctttgggtag 149  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||||    
T  12756572 gagtcgttgagagttgaaccttggggtag 12756600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16056684 - 16056616
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag 99  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||||    
T  16056684 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagttacagaatgccttgttag 16056616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 360
Target Start/End: Original strand, 17137969 - 17138155
Alignment:
Q  170 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaaga 269  Q
    |||||||  |||||||||||||| | | || |||||  |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||   || ||| |||  |||||    
T  17137969 gttaactgcaatctgtgaagctgat-atgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgttt-atgcattacttgaagattaattgtatacataaga 17138066  T
Q  270 tgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatg-ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 360  Q
    ||||||||||||| ||||| | || |||  |||||  |||| |||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  17138067 tgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcg 17138155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 220 - 320
Target Start/End: Original strand, 26355983 - 26356083
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||||||||    
T  26355983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26356082  T
Q  320 g 320  Q
    |    
T  26356083 g 26356083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 220 - 320
Target Start/End: Original strand, 26358435 - 26358535
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||||||||    
T  26358435 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26358534  T
Q  320 g 320  Q
    |    
T  26358535 g 26358535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Original strand, 28505059 - 28505106
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28505059 gaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 28505106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044762
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 14044762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354792
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 14354792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 18302533 - 18302494
Alignment:
Q  33 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18302533 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 18302494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 73
Target Start/End: Original strand, 810894 - 810936
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  810894 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 810936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 337
Target Start/End: Original strand, 2530129 - 2530208
Alignment:
Q  256 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 337  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |  |||||||||| |||||  ||||  |||||||||||||||||||    
T  2530129 ttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gtatgttgcctatgttgctgttgtt 2530208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 138
Target Start/End: Original strand, 12255556 - 12255664
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt--agattttgcgacctttgttgcacgagtggtc 128  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||| || ||||||   |||||||||| ||||||  ||||||| ||     
T  12255556 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtttcccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcacacgagttgtt 12255654  T
Q  129 gagagttgaa 138  Q
    ||||||||||    
T  12255655 gagagttgaa 12255664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 364
Target Start/End: Original strand, 12255734 - 12255892
Alignment:
Q  208 tgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctg 307  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | |||| ||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||  ||||| || ||||| |  |||| |||||       
T  12255734 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcatgaat 12255833  T
Q  308 tt-tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 364  Q
    |  |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255834 tgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16056393 - 16056344
Alignment:
Q  322 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16056393 ctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagttg 16056344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 377
Target Start/End: Original strand, 19486787 - 19486856
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19486787 ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaaga 19486856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 22073272 - 22073223
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 80  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22073272 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagttacccag 22073223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Original strand, 2832063 - 2832110
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2832063 gaatctgac-tgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 2832110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Original strand, 11995788 - 11995835
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11995788 gaatctgac-tgaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgag 11995835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 12187227 - 12187041
Alignment:
Q  170 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaaga 269  Q
    |||||||  |||||||||||||| | |||| |||||   ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||   || ||| |||  |||||    
T  12187227 gttaactgcaatctgtgaagctgat-aagagatgtttgagttgaatatgatgtattataatgttt-atgcattacttgaagattaattgtatacataaga 12187130  T
Q  270 tgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatg-ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 360  Q
    ||||||||||||| ||||| | || |||  |||||  |||  |||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  12187129 tgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattgtaattgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcg 12187041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 34201146 - 34201099
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34201146 gaatctgac-tgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 34201099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 68
Target Start/End: Original strand, 39267404 - 39267447
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 68  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39267404 gaatctgac-tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 39267447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 72
Target Start/End: Original strand, 9389462 - 9389501
Alignment:
Q  33 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9389462 ctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 9389501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 9703629 - 9703578
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  9703629 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 9703578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 72
Target Start/End: Original strand, 9751316 - 9751355
Alignment:
Q  33 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  9751316 ctgaactcgccatggtgagcagaggctctcgcctcgcgag 9751355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 12321499 - 12321550
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12321499 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12321550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 12719001 - 12718966
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12719001 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12718966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 12723912 - 12723877
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12723912 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12723877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 13149502 - 13149451
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  13149502 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 13149451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Original strand, 16906974 - 16907009
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16906974 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16907009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 18154593 - 18154644
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18154593 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18154644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 316 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18203882 - 18203831
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18203882 tactgtctatgttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatctaag 18203831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 18279736 - 18279701
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18279736 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18279701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 18283699 - 18283664
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18283699 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18283664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 48593214 - 48593265
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  48593214 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 48593265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 68099 - 68061
Alignment:
Q  34 tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  68099 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 68061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 48273588 - 48273538
Alignment:
Q  177 ataatctgtgaagctgttt-aagatatgttgttgttgattatgatgtgata 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  48273588 ataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata 48273538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24054682 - 24054602
Alignment:
Q  170 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttt-tatgcattacttgaat 250  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | || |||||  |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||    
T  24054682 gttaactgcaatctgtgaagctgtt-atgagatgttagtgttgattatgatgtgatatgatgtttaaatacattacttgaat 24054602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 44014530 - 44014489
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  44014530 acctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgag 44014489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 359
Target Start/End: Original strand, 9446216 - 9446252
Alignment:
Q  323 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9446216 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 9446252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 68
Target Start/End: Original strand, 15754646 - 15754689
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 68  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15754646 gaatctgacc-gaacttgccacggcgagcataggctctcgcctcg 15754689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 367
Target Start/End: Original strand, 20220238 - 20220290
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20220238 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 359
Target Start/End: Original strand, 20569654 - 20569690
Alignment:
Q  323 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20569654 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 20569690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 48991258 - 48991206
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 360  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  48991258 ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 48991206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5079 - 4721
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttg 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5079 tgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccataataagagtgacttgttagatttttgcaacctttgttg 4980  T
Q  118 cacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattat 217  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  4979 cacgagttgtcgacagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattat 4880  T
Q  218 gatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtata 317  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| ||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4879 gatgtgatataatgttt-atgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtata 4781  T
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4780 ctgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 4721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 303 - 1
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttg 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  303 tgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccataataagagtgacttgttagatttttgcaacctttgttg 204  T
Q  118 cacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattat 217  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  203 cacgagttgtcgacagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattat 104  T
Q  218 gatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtata 317  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  103 gatgtgatataatg-tttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtata 5  T
Q  318 ctgc 321  Q
    ||||    
T  4 ctgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 2310 - 1961
Alignment:
Q  28 ctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2310 ctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacatgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgt 2211  T
Q  128 cgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||   ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2210 cgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgataaggttattaataatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatat 2111  T
Q  228 aatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  2110 aatgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 2011  T
Q  328 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2010 cgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 1961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 3837 - 3479
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3837 tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgagttgttaggttttgcgacctttgttgc 3738  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| || |||| |||||| || |||||| |||||||||| | |  || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3737 acgagttgttgagaattgaactttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatg 3638  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  3637 atgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 3538  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  3537 tgcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaaga 3479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 706 - 361
Alignment:
Q  23 ggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacg 121  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||| |    
T  706 ggaatctgaactgaactcgccgcggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcaacctttgttgcatg 607  T
Q  122 agtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatg 221  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | |  || ||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  606 agttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatg 507  T
Q  222 tgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgc 321  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| || |||||||| |  ||| ||||||||  |||||||||||||    
T  506 tgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgct-attttgtatactgc 408  T
Q  322 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 368  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  407 ctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 24055 - 24406
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24055 tgtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacaaagtgccttgttagattttgcgacctttgttgc 24154  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttg-attat 217  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||| ||||||||||   |  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  24155 acgagttgtcgagagttgaactttgggatagtattaagacttattgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattat 24254  T
Q  218 gatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgt-ttttgtat 316  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  24255 gatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtat 24354  T
Q  317 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24355 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 34667 - 34718
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  34667 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 34718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 94)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Original strand, 8286596 - 8286955
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286596 tgtgggattctgacctaaactagccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 8286695  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
      |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  || ||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8286696 ttgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattatattatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatg 8286795  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctg-tttttgtata 317  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||  ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  8286796 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtata 8286895  T
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8286896 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 8286955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22075378 - 22075028
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa-cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  22075378 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaacagagtgacttgttag-ttttgcgacctttgttgcacgagtt 22075280  T
Q  126 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgat 225  Q
    || |||  || ||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22075279 gttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgat 22075180  T
Q  226 ataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctat 325  Q
    |||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  22075179 ataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctat 22075080  T
Q  326 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22075079 gttgctgttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttgttgaaga 22075028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Original strand, 23390250 - 23390608
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  23390250 tgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcacgagtgaccctaaaacagagtgccttgttagattttgtgacctttgttgc 23390349  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |  || ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  23390350 acgagttgtcgagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatg 23390449  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||    
T  23390450 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 23390549  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23390550 tgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 23390608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 25 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 25421894 - 25421541
Alignment:
Q  25 aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgag 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25421894 aatctgacttgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaaccgagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgag 25421795  T
Q  124 tggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtg 223  Q
    | || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  25421794 ttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtg 25421695  T
Q  224 atataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcct 323  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25421694 atataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcct 25421595  T
Q  324 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25421594 atgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 25421541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Original strand, 21292732 - 21293081
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtgg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21292732 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaatagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcacgagttg 21292831  T
Q  127 tcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgata 226  Q
    ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21292832 tcgggagttggacccttgggtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgata 21292931  T
Q  227 taatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaat--tgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgccta 324  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |||  |||||||||||||||||  |||  |||| |  ||||||||| ||||||  || |||||||||    
T  21292932 taatgttt-atgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaatattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgccta 21293028  T
Q  325 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21293029 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaaga 21293081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 13095862 - 13095504
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttg 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13095862 tgtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcagaggccctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttg 13095763  T
Q  118 cacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattat 217  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||     
T  13095762 cacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattac 13095663  T
Q  218 gatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtata 317  Q
    |||||||||||||||| | | ||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |   |||||||||||| |||||||||    
T  13095662 gatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtata 13095564  T
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13095563 ctgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 13095504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24493928 - 24493578
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagtg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  24493928 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctttcgcctcgtgagtaacccataaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagtt 24493829  T
Q  126 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgat 225  Q
    || |||||||||||||| |||||| |||||||||| |   ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24493828 gttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaataatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgat 24493729  T
Q  226 ataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctat 325  Q
    |||||||| | ||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24493728 ataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctat 24493630  T
Q  326 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24493629 gttgctattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 24493578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 25 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 25431756 - 25431414
Alignment:
Q  25 aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgag 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25431756 aatctgacttgaactcgccacggcgagtagaggctctcacctcgcgagtgacccagaaatcgagtgccttgttaggattttgcgacctttgttacacgag 25431657  T
Q  124 tggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtg 223  Q
    | || ||||||||||||||  ||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  25431656 ttgttgagagttgaaccttgaggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtg 25431557  T
Q  224 atataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcct 323  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25431556 atataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcct 25431457  T
Q  324 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431456 atgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 13025678 - 13025320
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttg 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13025678 tgtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcaaaggccctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttg 13025579  T
Q  118 cacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattat 217  Q
    ||||| | || |||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||     
T  13025578 cacgatttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattac 13025479  T
Q  218 gatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtata 317  Q
    |||||||||||||||| | | ||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |   |||||||||||| |||||||||    
T  13025478 gatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtata 13025380  T
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13025379 ctgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 13025320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24529580 - 24529229
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagtg 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| |||     
T  24529580 tctgatctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcactagta 24529481  T
Q  126 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgat 225  Q
    || |||||||||||||| |||||| ||| | |||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  24529480 gttgagagttgaaccttggggtagtattgaaacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgat 24529381  T
Q  226 ataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctat 325  Q
    |||||||| || |||||||||||   ||   || ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24529380 ataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctat 24529281  T
Q  326 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24529280 gttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 24529229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 9078312 - 9077961
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||| |||| |||     
T  9078312 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagtt 9078213  T
Q  126 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgat 225  Q
    ||  || |||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9078212 gttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 9078113  T
Q  226 ataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctat 325  Q
    |||||||| || ||||||||||| | ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9078112 ataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctat 9078013  T
Q  326 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  9078012 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaaga 9077961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 1096829 - 1096476
Alignment:
Q  25 aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaga-ttttgcgacctttgttgcacgag 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||| || ||| |||| ||    
T  1096829 aatctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagaatgcctttttagaattttgcgatctctgtcgcacaag 1096730  T
Q  124 tggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtg 223  Q
    | ||  | ||||| ||||| |||||| ||| |||||| | |  || ||||| ||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  1096729 ttgttaaaagttggaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtg 1096630  T
Q  224 atataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcct 323  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||   || |||| | |||||||| ||| ||||| ||||| |  |||||| ||| |||||||| ||||| |||    
T  1096629 atataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacct 1096530  T
Q  324 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1096529 gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 1096476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 263
Target Start/End: Original strand, 22107127 - 22107371
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | | |||||||||||||||||    
T  22107127 tgtgggattctgacctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccggaaatagagtgccttgtgatactttgcgacctttgttgc 22107226  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| || ||||| |||||||||| |||| |||||||||| | |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22107227 acgagttgttgagagatgaacctttgagtagtattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatg 22107326  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatat 263  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22107327 atgtgatataatatattatgcattacttgaatggtacttgaatat 22107371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 248
Target Start/End: Original strand, 21985908 - 21986130
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagtg 125  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  21985908 tctgacctgaactcgccacggcaagcagaggccctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagtt 21986007  T
Q  126 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgat 225  Q
    || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||    
T  21986008 gttgagagttgaaccttggggtagtattcagacttgatgatgatgttaactataatttgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgaatatgaggtgat 21986107  T
Q  226 ataatgttttatgcattacttga 248  Q
    | |||||| ||||||||||||||    
T  21986108 aaaatgttatatgcattacttga 21986130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 219 - 377
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808501
Alignment:
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21808442  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808443 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 21808501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 219 - 377
Target Start/End: Original strand, 21729018 - 21729176
Alignment:
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  21729018 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21729117  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729118 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 21729176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 370
Target Start/End: Original strand, 11581003 - 11581348
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgcacg 121  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| | |||    
T  11581003 gaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccatttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgtacg 11581101  T
Q  122 agtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagact-tta-aggtgaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||  ||| || | ||| |  | |  ||||  ||||||||||||| || |||| |||   ||| ||||| ||||     
T  11581102 agtcgttgagagttgaaccttggggtag--ttatgaatattatatataatattaatgataatctgtgaagttgatttatgatga-ttgatgttg-ttata 11581197  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
     |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||  ||| ||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||||    
T  11581198 ttgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 11581297  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581298 tgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 11581348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 170 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 37724117 - 37723912
Alignment:
Q  170 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttat-gcattacttgaatgatacttgaatatttaag 268  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  || |||||  |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||   |||||  || ||    
T  37724117 gttaactgcaatctgtgaagctgtttt-gagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgag 37724019  T
Q  269 atgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||||||||||  | ||||| || | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37724018 atgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 37723922  T
Q  368 ttgttgaaga 377  Q
     |||||||||    
T  37723921 atgttgaaga 37723912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 264768 - 264917
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  264768 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 264867  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264868 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 264917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 295 - 377
Target Start/End: Original strand, 21997564 - 21997646
Alignment:
Q  295 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21997564 ttatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 21997646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 39363546 - 39363397
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  39363546 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39363447  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363446 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 39363397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 221 - 370
Target Start/End: Original strand, 10732941 - 10733089
Alignment:
Q  221 gtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactg 320  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10732941 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 10733040  T
Q  321 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733041 t-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 10733089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 370
Target Start/End: Original strand, 36154586 - 36154929
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgcacg 121  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| |||||    
T  36154586 gaatctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacg 36154684  T
Q  122 agtggtcgagagttgaacctttgggtagg-attaagacttta-aggtgaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||  || || | | || |  | |  ||||  || || |||||||||| |||| |||   ||| || || ||||     
T  36154685 agtcgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattatatatatta--ttaatgatgatatgtgaagctgatttatgatgatttgatgatg-ttata 36154781  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
     |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  36154782 ttgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 36154881  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154882 tgc---tg-tgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 36154929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 20909174 - 20909025
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  20909174 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20909075  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909074 gt-tgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20909025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 29330096 - 29329947
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||    
T  29330096 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 29329997  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29329996 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 29329947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 42245365 - 42245514
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  42245365 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 42245464  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42245465 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 42245514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 20902008 - 20902158
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |||||| |||  |||| || || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  20902008 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 20902107  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902108 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20902158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412200
Alignment:
Q  171 ttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagat 270  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||       ||||    ||||||||| ||   || |||||| ||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac------ttat----tacttgaattatgaatgtatatttgagat 22412299  T
Q  271 gttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22412298 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 22412200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 171 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18418793 - 18418596
Alignment:
Q  171 ttaactataatctgtgaagctgttt-aagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaaga 269  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||   |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||   |  ||||||||| ||||    
T  18418793 ttaattataacctgtgaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatatt-aaga 18418695  T
Q  270 tgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-tttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 368  Q
    ||||| |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  18418694 tgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagt 18418598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 29346142 - 29345993
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  29346142 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29346043  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29346042 g-ttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttg 29345993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22144406 - 22144068
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgcacgagtggtc 128  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| |||||||| ||     
T  22144406 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgtt 22144308  T
Q  129 gagagttgaacctttgggtaggatt-aagact-ttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtt-taagatatgttgttgttgattatgatgtgat 225  Q
    |||||||||||||| | || | | | |||| | || |  |||  ||||  || | |||||||| |||| ||||||   ||| ||||| |||  |||||||    
T  22144307 gagagttgaaccttggagtcgtaatgaagattgttta--tgatattaatgatgacctgtgaagttgttataagatgaattgatgttgtttacaatgtgat 22144210  T
Q  226 ataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctat 325  Q
    |||||  | |||||||||||||||| |||  ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||| |  |||| ||||| |||||| | ||||| |||||    
T  22144209 ataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactacctat 22144111  T
Q  326 gttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144110 gttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 18319033 - 18319183
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |||||| |||  |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  18319033 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 18319132  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18319133 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttg 18319183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 235 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 39245283 - 39245149
Alignment:
Q  235 tatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 334  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||| ||  || |||  ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  39245283 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 39245185  T
Q  335 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245184 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 39245149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 29348615 - 29348466
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  29348615 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29348516  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29348515 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttg 29348466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 29351088 - 29350939
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  29351088 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29350989  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29350988 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttg 29350939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 2154613 - 2154763
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |||||| |||  |||| || || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  2154613 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 2154712  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154713 tgt-tgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 2154763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 211 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356364
Alignment:
Q  211 tgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgttt 310  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |  |||| ||||||||  |    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctg--t 18356391  T
Q  311 ttgtatactgcctatgttgctgttgtt 337  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18356390 ttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 18356364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 256 - 370
Target Start/End: Original strand, 17517192 - 17517306
Alignment:
Q  256 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 355  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  17517192 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatg 17517291  T
Q  356 agtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||||||||||    
T  17517292 agtcagtctaagttg 17517306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 32027555 - 32027406
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||| | ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  32027555 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32027456  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  32027455 g-ttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttg 32027406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 310 - 377
Target Start/End: Original strand, 19660879 - 19660947
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19660879 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 19660947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 298 - 370
Target Start/End: Original strand, 20918026 - 20918097
Alignment:
Q  298 tgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918026 tgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 10775675 - 10775825
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |||||| |||  |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||| |  ||||||||||||| |||| |||||    
T  10775675 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatac 10775774  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775775 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 10775825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 211 - 337
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910869
Alignment:
Q  211 tgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgttt 310  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    || |||||| || ||||||||| ||||||| ||||||| |  |||||||||||||  |    
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaattatttgaatgttcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--t 20910842  T
Q  311 ttgtatactgcctatgttgctgttgtt 337  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20910843 ttgtatgctgtctatgttgctgttgtt 20910869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 31061155 - 31061081
Alignment:
Q  295 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31061155 ttatgtcatgctgtttttgtatactac-tgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 31061081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 38619521 - 38619447
Alignment:
Q  295 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619521 ttatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 38619447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Original strand, 21329541 - 21329602
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329541 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21329602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Original strand, 22959576 - 22959637
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959576 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 22959637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 36314654 - 36314586
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36314654 tttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 36314586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 309 - 367
Target Start/End: Original strand, 20026984 - 20027043
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026984 ttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 299 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23064594 - 23064524
Alignment:
Q  299 gtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064594 gtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 23064524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21565619 - 21565558
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565619 tttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21565558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21873462 - 21873277
Alignment:
Q  170 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaaga 269  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | || |||||  |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |   ||  ||||||  ||||||    
T  21873462 gttaactgcaatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatggttaaga 21873364  T
Q  270 tgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    ||||||   | ||  |||||| |  | | ||||||||| | |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21873363 tgttga---aatgagattgatattatgaagtcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 21873277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 24067270 - 24067120
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |||||| |||  |||||| || ||| | |||| || ||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||||    
T  24067270 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 24067171  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  24067170 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttg 24067120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 297 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26704160 - 26704089
Alignment:
Q  297 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 368  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26704160 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 26704089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 297 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26973893 - 26973822
Alignment:
Q  297 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 368  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26973893 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 26973822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Original strand, 26012079 - 26012140
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012079 tttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 26012140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 317 - 370
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  317 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 370
Target Start/End: Original strand, 21502205 - 21502261
Alignment:
Q  315 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21502205 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21502261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 317 - 367
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  317 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Original strand, 22119951 - 22119998
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22119951 gaatctgac-tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 22119998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22032529 - 22032345
Alignment:
Q  170 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaaga 269  Q
    |||||||  |||||||||||||| | | || |||||  |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||   || ||| |||  |||||    
T  22032529 gttaactgcaatctgtgaagctgat-acgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgttt-atgcattacttgaagattaattgtatacataaga 22032432  T
Q  270 tgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 360  Q
    ||||||||||||| ||||| | || |||  ||||| | | ||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  22032431 tgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgat-tgtttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcg 22032345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 23201731 - 23201680
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23201731 tgggaatctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23201680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 23535347 - 23535398
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23535347 tgggaatctgacttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23535398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 72
Target Start/End: Original strand, 5888940 - 5888981
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5888940 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 5888981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 19660606 - 19660643
Alignment:
Q  35 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19660606 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 19660643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19668975 - 19668914
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19668975 tttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttg 19668914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 370
Target Start/End: Original strand, 20806850 - 20806891
Alignment:
Q  329 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20806850 gctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttg 20806891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Original strand, 21501919 - 21501968
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 80  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21501919 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccag 21501968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 21565900 - 21565863
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 68  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21565900 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 21565863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 72
Target Start/End: Original strand, 22959298 - 22959339
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22959298 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22959339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23469871 - 23469822
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23469871 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaag 23469822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 360
Target Start/End: Original strand, 18769910 - 18770096
Alignment:
Q  170 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaaga 269  Q
    |||||||  |||||||||||||| | | || |||||  |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||   || ||| |||  |||||    
T  18769910 gttaactgcaatctgtgaagctgat-atgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgttt-atgcattacttgaagattaattgtatacataaga 18770007  T
Q  270 tgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatg-ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 360  Q
    ||||||||||||| ||||| | || |||  |||||  |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||  || ||| |||||||||||    
T  18770008 tgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcgaccaagttgcatgagtcg 18770096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 73
Target Start/End: Original strand, 20026706 - 20026746
Alignment:
Q  33 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20026706 ctgaactcgccacagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 20026746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Original strand, 24767095 - 24767142
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24767095 gaatctgac-tgaactcgtcatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 24767142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 17410795 - 17410744
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17410795 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 17410744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 18356675 - 18356624
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18356675 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18356624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Original strand, 19472493 - 19472528
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19472493 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19472528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 20296180 - 20296145
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20296180 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 20296145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 20910558 - 20910609
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  20910558 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 20910609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 21887186 - 21887135
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21887186 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21887135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 309 - 367
Target Start/End: Original strand, 22178264 - 22178323
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22178264 ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 31342453 - 31342414
Alignment:
Q  33 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31342453 ctgaactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 31342414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 25744074 - 25744036
Alignment:
Q  34 tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25744074 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 25744036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20805616 - 20805575
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20805616 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20805575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 367
Target Start/End: Original strand, 21328268 - 21328317
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||||||||||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21328268 ctgcctatgttgctgctgtctattaattaagctgcatgagtcggtctaag 21328317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 363
Target Start/End: Original strand, 21731514 - 21731559
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 363  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  21731514 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 21731559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 68
Target Start/End: Original strand, 21741308 - 21741345
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 68  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21741308 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcg 21741345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 363
Target Start/End: Original strand, 21809634 - 21809679
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 363  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  21809634 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 21809679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23572254 - 23572182
Alignment:
Q  209 gttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattg 282  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||   || ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  23572254 gttgattatgatgtattataatgttt-atgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg 23572182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Original strand, 123074 - 123114
Alignment:
Q  32 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  123074 cctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 123114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20767037 - 20766997
Alignment:
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20767037 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20766997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26680641 - 26680605
Alignment:
Q  323 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26680641 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26680605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26952248 - 26952212
Alignment:
Q  323 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26952248 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26952212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 341 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 40725898 - 40725862
Alignment:
Q  341 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  40725898 taactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaaga 40725862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 27 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 13854 - 13507
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtgg 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  13854 tctgagctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacttttgttgcacgagttg 13755  T
Q  127 tcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgata 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13754 tcgagagttgaacctttcggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgata 13655  T
Q  227 taatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 326  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||  ||| |||  |||||||||||||||| | ||||||| |  | |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13654 taatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatg 13557  T
Q  327 ttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13556 ttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 13507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 2218 - 1860
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2218 tgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcacgagtgaccctaaaacagagtgccttgttagattttgtgacctttgttgc 2119  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |  || ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  2118 acgagttgtcgagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatg 2019  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||    
T  2018 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 1919  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1918 tgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 1860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Original strand, 207277 - 207324
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  207277 gaatctgac-tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 207324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 32431 - 32076
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  32431 tgtgggattctgacttgaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagttacttttttgattttgcgacctttgttgc 32332  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
     | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  32331 tctagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatg 32232  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||  ||||| |||    
T  32231 atgtgatataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgtttac 32135  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32134 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 32076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Original strand, 15227 - 15575
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtgg 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15227 tctgacctgaactcgccacggagagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttg 15326  T
Q  127 tcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgata 226  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |   | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15327 tcgagagttgactcgttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgata 15426  T
Q  227 taatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 326  Q
    ||||  |||||||||||||||||  ||| ||  |||  |||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15427 taat-atttatgcattacttgaagaatatttttatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatg 15524  T
Q  327 ttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15525 ttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaaga 15575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 39120 - 38770
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagtg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  39120 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacatagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagtt 39021  T
Q  126 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgat 225  Q
    || |||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39020 gttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 38921  T
Q  226 ataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctat 325  Q
    |||||||| | |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| | | ||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38920 ataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctat 38822  T
Q  326 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  38821 gttgctattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaaga 38770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 176 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 33151 - 32951
Alignment:
Q  176 tataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||     
T  33151 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 33052  T
Q  276 tgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 375  Q
    | | ||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33051 taacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaa 32953  T
Q  376 ga 377  Q
    ||    
T  32952 ga 32951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9912 - 9762
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |||||| |||  |||| || || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||||||    
T  9912 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatac 9813  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9812 tgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 9762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Original strand, 10180 - 10535
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10180 tgtgggattctgacctgaactcgccacggggagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccattgttgc 10279  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |   | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  10280 acgagttgtcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatg 10379  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||||||||||||   ||||||||    
T  10380 atgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatac 10475  T
Q  319 tgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10476 tgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 10535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 22 - 377
Target Start/End: Original strand, 5878 - 6236
Alignment:
Q  22 gggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacg 121  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5878 gggattctgacctgaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgttagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacg 5977  T
Q  122 agtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatg 221  Q
    |||  |||||||| ||||||| || ||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5978 agttatcgagagtggaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatg 6077  T
Q  222 tgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgc 321  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||| |    
T  6078 tgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactac 6177  T
Q  322 cta---tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6178 ctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 6236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5207 - 4858
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtgg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  5207 tctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctcttgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttag-ttttgccacctttgttgcacgagttg 5109  T
Q  127 tcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgata 226  Q
    | |||  || ||||||||| ||| | |||||||| | |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5108 ttgaggattaaacctttggctagcaataagacttaatgaaggggttagctataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgata 5009  T
Q  227 taatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||    || ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5008 taatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatg 4909  T
Q  327 ttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4908 ttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 4858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Original strand, 814 - 1161
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtgg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  814 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtaacccagaaacagagtgacttgttagattttgcaacctttgttgcacgatttg 913  T
Q  127 tcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgata 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |   |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  914 tcgagagttgaacccttgggtaggattaagtcttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgtta 1013  T
Q  227 taatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 326  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  1014 taatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatg---ttgtatactgcctatg 1109  T
Q  327 ttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1110 ttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 1161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 22 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 51943 - 51593
Alignment:
Q  22 gggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacg 121  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51943 gggattctaacctgagctcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacttttgttgcacg 51844  T
Q  122 agtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatg 221  Q
    ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  51843 agttgtcgagaattggacccttgggtaggattaagacttaagagtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaag 51744  T
Q  222 tgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgc 321  Q
    || ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||  |||||||||||||||||| | ||| | || |||||||||| ||   |||||||||||    
T  51743 tgttataatg-tttatgcatttcttgaaggatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatg---ttgtatactgc 51648  T
Q  322 ctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51647 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa 51593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 25 - 377
Target Start/End: Original strand, 25824 - 26177
Alignment:
Q  25 aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25824 aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgag 25923  T
Q  124 tggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtg 223  Q
    | |   |||| |||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25924 ttgctaagagctgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtg 26023  T
Q  224 atataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcct 323  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||| ||   || ||| || ||| |||| |||||| || ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26024 atataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 26123  T
Q  324 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26124 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 26177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 33260 - 33480
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtggtcg 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| || |||   || ||| ||      
T  33260 acctgaactcgccacggcgagcaaaggctctcgcctcgcgtgtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcatacaagttgtta 33359  T
Q  130 agagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataa 229  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  33360 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataa 33459  T
Q  230 tgttttatgcattacttgaat 250  Q
    ||||  | |||||||||||||    
T  33460 tgttaaacgcattacttgaat 33480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 240 - 370
Target Start/End: Original strand, 44682 - 44812
Alignment:
Q  240 attacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 339  Q
    ||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44682 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttat 44781  T
Q  340 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44782 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 44812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 6968 - 6669
Alignment:
Q  28 ctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6968 ctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccataaacagagtgacatgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgt 6869  T
Q  128 cgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | | | ||||||  |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6868 cgagagttgaacctttgggtaggattaagatttaatgataaggttatttataatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatat 6769  T
Q  228 aatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 327  Q
    || |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |  |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6768 aacgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 8847 - 8488
Alignment:
Q  14 gaacctgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 113  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8847 gaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggccagtagaggctctcgcctcgcgaatgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgaccttt 8748  T
Q  114 gttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttga 213  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| | |||| |||||||||| | | ||| ||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  8747 gttgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttga 8648  T
Q  214 ttatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttg 313  Q
    |||||||||    ||||||| | |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||| |||||||||    
T  8647 ttatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttg 8552  T
Q  314 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8551 tatactacctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 8488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 29 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16636 - 16291
Alignment:
Q  29 tgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtc 128  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  ||    
T  16636 tgaccagaactcggcacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttggattttgtgacctttgttgcacgatttctc 16537  T
Q  129 gagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatata 228  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16536 gagagttgaacgcttgggtaggattaagacttaataatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttata 16437  T
Q  229 atgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 328  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||  ||| |||  ||| |||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  16436 atg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgtt 16341  T
Q  329 gctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16340 gctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 16291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 33 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 1639 - 1298
Alignment:
Q  33 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgaga 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1639 ctgaactcgcgacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttggagtttgcgacctttgttgcacgagttgtcgaga 1540  T
Q  133 gttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgt 232  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  1539 gttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg- 1441  T
Q  233 tttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg 332  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||   ||||| ||||||||||||||||    
T  1440 tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg---ttgtacactgcctatgttgctg 1344  T
Q  333 -ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1343 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 1298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 33 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7616 - 7275
Alignment:
Q  33 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgaga 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7616 ctgaactcgcgacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttggagtttgcgacctttgttgcacgagttgtcgaga 7517  T
Q  133 gttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgt 232  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  7516 gttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg- 7418  T
Q  233 tttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg 332  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| || |||| |||   |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  7417 tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatttca---tgttgttgtatactgcctatgttgttg 7321  T
Q  333 -ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7320 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 7275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 318 - 370
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15343
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15291 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttg 15343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 27 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23242 - 22899
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagtg 125  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  23242 tctgaactgagctcgccacagcgagcagaggccctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagtt 23143  T
Q  126 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgat 225  Q
    || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  23142 gttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttatttataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgat 23043  T
Q  226 ataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctat 325  Q
    |||||||| | |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  23042 ataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-gtgt 22944  T
Q  326 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22943 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 22899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21265 - 20919
Alignment:
Q  32 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgag 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |   ||    
T  21265 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgtgagtgacccaaaaacagagtgacttgttgagttttgcgacctttgttgcacgagttgatcag 21166  T
Q  132 agttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatg 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21165 agttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatg 21066  T
Q  232 ttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 331  Q
    |||||||||||||||| |  | | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  21065 ttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgct 20966  T
Q  332 g-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    | |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  20965 gattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtcgttgaaga 20919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 4)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13459 - 13144
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13459 tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaactgagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgc 13360  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||| |||  ||||| | |  || ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13359 acgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgaagatgttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatg 13260  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  13259 ttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 13160  T
Q  319 tgcctatgttgctgtt 334  Q
    ||||||||||||||||    
T  13159 tgcctatgttgctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 311 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 34199 - 34132
Alignment:
Q  311 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34199 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaaga 34132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 282
Alignment:
Q  330 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaaga 282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 34483 - 34437
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 71  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34483 gaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 34437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 7)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 124952 - 124681
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  124952 tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaaagagtgtcttgttagattttgcgacctttgttgc 124853  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  124852 acgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatg 124753  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgat 290  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  124752 atgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgat 124681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 174980 - 174776
Alignment:
Q  170 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttat-gcattacttgaatgatacttgaatatttaag 268  Q
    |||||||  ||||||||||||| || | || |||||  |||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||   |||||  || ||    
T  174980 gttaactgaaatctgtgaagctatt-atgagatgttagtgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgag 174882  T
Q  269 atgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||| ||||||| | ||||| || | |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174881 atgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 174785  T
Q  368 ttgttgaag 376  Q
     ||||||||    
T  174784 atgttgaag 174776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 317 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121775
Alignment:
Q  317 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 121775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 309 - 367
Target Start/End: Original strand, 136412 - 136471
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  136412 ttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 309 - 367
Target Start/End: Original strand, 145120 - 145179
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  145120 ttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 73
Target Start/End: Original strand, 136132 - 136173
Alignment:
Q  32 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  136132 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 136173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 73
Target Start/End: Original strand, 144840 - 144881
Alignment:
Q  32 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  144840 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 144881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 3)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Original strand, 16976 - 17329
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtg 125  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||     
T  16976 tctgacctgaactcgccacggagagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtaccttattaggattttgcgacctttgttgcacgagtt 17075  T
Q  126 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgat 225  Q
    || ||||||| |||||| |||||| ||| |||||| |   ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  17076 gttgagagttaaaccttggggtagtattgagacttaatcatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgat 17175  T
Q  226 ataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctg--tttttgtatactgcct 323  Q
    ||||||||  | ||||||||||||| ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17176 ataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcct 17275  T
Q  324 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17276 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 17329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 235 - 367
Target Start/End: Original strand, 79299 - 79430
Alignment:
Q  235 tatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 334  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||  |  |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||    
T  79299 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactgtcg-tgttgctgtt 79397  T
Q  335 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79398 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 13834 - 13885
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  13834 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 13885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 39838 - 39486
Alignment:
Q  25 aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| || ||| |||| ||    
T  39838 aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcgcacaag 39739  T
Q  124 tggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtg 223  Q
    | ||  || |||||||||| |||||| ||| |||||| |   ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  39738 ttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtg 39639  T
Q  224 atataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcct 323  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39638 atataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcct 39540  T
Q  324 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39539 atgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 39486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 40274 - 39922
Alignment:
Q  25 aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagat-tttgcgacctttgttgcacgag 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40274 aatctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtaccttgttaggtgtttgcgacctttgttgcacgag 40175  T
Q  124 tggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtg 223  Q
    | || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40174 ttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtg 40075  T
Q  224 atataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcct 323  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||  |||  |||| ||||| |  |||||||||| || |||||||||||||||    
T  40074 atataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcct 39976  T
Q  324 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  39975 atgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaaga 39922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 267 - 367
Target Start/End: Original strand, 19885 - 19987
Alignment:
Q  267 agatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 363  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |  |||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||    
T  19885 agatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtc 19983  T
Q  364 taag 367  Q
    ||||    
T  19984 taag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 359
Target Start/End: Original strand, 18708 - 18749
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18708 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 18749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 377
Target Start/End: Original strand, 74974 - 75326
Alignment:
Q  25 aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| || ||| |||| ||    
T  74974 aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcgcacaag 75073  T
Q  124 tggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtg 223  Q
    | ||  || |||||||||| |||||| ||| |||||| |   ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  75074 ttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtg 75173  T
Q  224 atataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcct 323  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  75174 atataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcct 75272  T
Q  324 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  75273 atgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 75326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Original strand, 8294 - 8641
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtgg 126  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  8294 tctggcctaaactcgccacggtgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgaccttcgttgcacgagttg 8393  T
Q  127 tcgagagttgaacctttggg-taggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgat 225  Q
    | ||||||||||| || ||| ||| |||  ||||| | |  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  8394 ttgagagttgaacgttgggggtagtattgggacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgat 8493  T
Q  226 ataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctat 325  Q
    |||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8494 ataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgcctat 8592  T
Q  326 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8593 gttgc---tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 8641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 370
Target Start/End: Original strand, 339706 - 340052
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcac 120  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  339706 tgggaatctgacatgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaatagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcac 339805  T
Q  121 gagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgat 220  Q
    |||| ||  || |||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  339806 gagtcgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgacgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgat 339905  T
Q  221 gtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactg 320  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||   || ||| || |||||||| ||| ||| | ||||| |  |||||||||| || ||||||||||||    
T  339906 gtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactg 340003  T
Q  321 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  340004 cctatgttgttg-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 340052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 158450 - 158599
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  158450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 158549  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158550 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 158599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 211 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 71474 - 71350
Alignment:
Q  211 tgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgttt 310  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |    || ||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||    ||||||||||||||||    
T  71474 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacctaagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgttt 71375  T
Q  311 ttgtatactgcctatgttgctgttgtt 337  Q
      |||| ||||||||||||||||||||    
T  71374 --gtatgctgcctatgttgctgttgtt 71350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 96954 - 96903
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  96954 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 96903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 4)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4873 - 4519
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||||| ||||||||| |  ||| |||    
T  4873 tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccagaaacagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgca 4774  T
Q  120 cgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatga 219  Q
    | ||| ||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4773 caagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatga 4674  T
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||| ||||||    
T  4673 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 4574  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 375  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  4573 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaa 4519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12455 - 12101
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||||| ||||||||| |  ||| |||    
T  12455 tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccagaaacagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgca 12356  T
Q  120 cgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatga 219  Q
    | ||| ||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12355 caagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatga 12256  T
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||| ||||||    
T  12255 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 12156  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 375  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12155 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaa 12101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22407 - 22053
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||||| ||||||||| |  ||| |||    
T  22407 tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccagaaacagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgca 22308  T
Q  120 cgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatga 219  Q
    | ||| ||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22307 caagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatga 22208  T
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||| ||||||    
T  22207 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 22108  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 375  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22107 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaa 22053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 18390 - 18441
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18390 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 47353 - 47004
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  47353 tgtgggattctgacctgagctcgccacggagcgcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaccagagtgacttgttagaaatggcgacctttgttgc 47254  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   ||||      |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  47253 acgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgag------tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatg 47160  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| ||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||    |||| ||    
T  47159 atgtgatataatg-tttatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ctgtaaac 47064  T
Q  319 tgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  47063 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaaga 47004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 31 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 40212 - 39867
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgcacgagtggtcg 129  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | | || |    
T  40212 acctgtactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgggtgacctagaaaccgagtgccttgttatgattttgcgacctttgttgcacaatttgttg 40113  T
Q  130 agagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataa 229  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | |  || ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  40112 agagttgaacctt-gggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataa 40014  T
Q  230 tgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 329  Q
    ||||  ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| | | ||||| ||||| |  |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  40013 tgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttg 39915  T
Q  330 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  39914 ctattgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaaga 39867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 69 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 26213 - 25905
Alignment:
Q  69 cgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 167  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | |  |    
T  26213 cgagtgacccagaaaccaagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgagg 26114  T
Q  168 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaa 267  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||| |||||||||| |    
T  26113 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttga 26014  T
Q  268 gatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||||||| | | ||||| ||||| |  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26013 gatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaag 25915  T
Q  368 ttgttgaaga 377  Q
    ||| ||||||    
T  25914 ttgatgaaga 25905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 59271 - 59308
Alignment:
Q  35 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  59271 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 59308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 4887 - 5240
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcac 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  4887 tgggattctgacctgaactcgccaaagagagcagaggatctcgcctcgcgagtgacacagaaacagagtgacttattggattttgagacctttgttgcac 4986  T
Q  121 gagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgat 220  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |   | ||||||| |||||| |||||| |||  ||| |||||||||||||||||| |||    
T  4987 gagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagatttaataataaggttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagat 5086  T
Q  221 gtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactg 320  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||||||  ||  ||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||   ||||||| |     
T  5087 gtgttataatg-tttatacattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg---ttgtataata 5182  T
Q  321 cctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5183 cctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 5240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 377
Target Start/End: Original strand, 16359 - 16712
Alignment:
Q  25 aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgag 123  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || ||| |||| ||    
T  16359 aatctaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgccttgttgggattttgcgatctgtgtcgcacaag 16458  T
Q  124 tggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtg 223  Q
    | ||   |||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  16459 ttgttaggagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtg 16558  T
Q  224 atataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcct 323  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||   || ||| || ||||| || ||| || || ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  16559 atataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgctt 16658  T
Q  324 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16659 gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaaga 16712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 101 - 377
Target Start/End: Original strand, 2987 - 3262
Alignment:
Q  101 ttttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagat 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2987 ttttgcgacctgtgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagctgtttaagat 3086  T
Q  201 atgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgt 300  Q
      |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||||    
T  3087 gcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgt 3186  T
Q  301 catgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3187 catgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 3262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 90
Target Start/End: Original strand, 772 - 837
Alignment:
Q  25 aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtg 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  772 aatctgacctgaactcgccacggtgagcggaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtg 837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1281 - 1052
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1281 tgtgggattctgaccagaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccggaaacaaagtgccttgtgagactttgcgacctttgttgc 1182  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |  |||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1181 acgagttgttgagagttgaacttttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatg 1082  T
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttga 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1081 atgtgatataatgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3848 - 3640
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  3848 tgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgtctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgtgacctttgttgc 3749  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3748 acgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatg 3649  T
Q  219 atgtgatat 227  Q
    |||||||||    
T  3648 atgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7912 - 7704
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  7912 tgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgtctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgtgacctttgttgc 7813  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatg 218  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7812 acgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatg 7713  T
Q  219 atgtgatat 227  Q
    |||||||||    
T  7712 atgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 370
Target Start/End: Original strand, 27663 - 27854
Alignment:
Q  180 atctgtgaagctgtt-taagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatga 278  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||| ||||| |||| ||||||||||||  | ||||||||||| |||| |||  ||||| ||| |||||||| |||    
T  27663 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttga 27762  T
Q  279 attgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
     || || ||||| |  |||| |||||||||||| | ||||| ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27763 tttacatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 27854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 367
Target Start/End: Original strand, 51638 - 51985
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51638 tgtgggattttgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcacctcgctagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 51737  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttga-ttat 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  |||  |||| || ||| |||||||||| ||| || || ||  |||||| ||||    
T  51738 acgagttgtcgagagttgaaccttggggtagcattaagacttgaatatgatattaattacaatttgtgaagctg-ttatgagatattaatgttgatttat 51836  T
Q  218 gatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatg-ttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtat 316  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||   ||  |||||| || ||||| ||| ||  |||| |||||| |  ||||||| |||| |||||| ||    
T  51837 gatgtgatataatg-tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgc-attgatattattatgtcttgctatttttgaat 51934  T
Q  317 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
     ||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51935 gctgcctatg-tgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 32614 - 32552
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32614 ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 32552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 32892 - 32826
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt 97  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||||    
T  32892 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagctacccagttacagaatgccttgtt 32826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 28190 - 27911
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| | || ||| |||| |||     
T  28190 tctgacctgaactcgccacggcgagcaaaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcaatctgtgtcgcacaagtt 28091  T
Q  126 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgat 225  Q
    ||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  28090 gttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgat 27991  T
Q  226 ataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgc 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  27990 ataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20770 - 20595
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20770 tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacctagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgc 20671  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtt 194  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20670 acgagttgtcgagagttgaaccttggaatagcattaagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtt 20595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 5)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 36 - 377
Target Start/End: Original strand, 32729 - 33068
Alignment:
Q  36 aactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagt 134  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||| || ||| |||| | | ||  |||||    
T  32729 aactcgccacagcgaggagaggctcccgcctcgcgagtgacccataaacagaatgtcttgttaggattttgcgatctgtgtcgcaccaattgttaagagt 32828  T
Q  135 tgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttt 234  Q
    |||||||| |||||| ||| | ||||   |  |  ||||  |||||||||||||||| ||| |   ||| || ||||||| |||||||| |||||||||     
T  32829 tgaaccttggggtagtattgaaacttattgaaggtgttagttataatctgtgaagctattttatg-atgctgatgttgatcatgatgtgttataatgtta 32927  T
Q  235 tatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 334  Q
    ||||||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32928 tatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgtt 33025  T
Q  335 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33026 gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 33068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 36 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 46276 - 45937
Alignment:
Q  36 aactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagt 134  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||| || ||| |||| | | ||  |||||    
T  46276 aactcgccacagcgaggagaggctcccgcctcgcgagtgacccataaacagaatgtcttgttaggattttgcgatctgtgtcgcaccaattgttaagagt 46177  T
Q  135 tgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttt 234  Q
    |||||||| |||||| ||| | ||||   |  |  ||||  |||||||||||||||| ||| |   ||| || ||||||| |||||||| |||||||||     
T  46176 tgaaccttggggtagtattgaaacttattgaaggtgttagttataatctgtgaagctattttatg-atgctgatgttgatcatgatgtgttataatgtta 46078  T
Q  235 tatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 334  Q
    ||||||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  46077 tatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgtt 45980  T
Q  335 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45979 gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 45937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 176 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16322 - 16122
Alignment:
Q  176 tataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttga 275  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||   || ||| || ||||| ||     
T  16322 tataatctgtgaagctgtttta-agatgttgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgt 16224  T
Q  276 tgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 375  Q
    ||  ||||| ||||| |  | || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16223 tggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 16124  T
Q  376 ga 377  Q
    ||    
T  16123 ga 16122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 16447 - 16331
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgcacgagtg 125  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||     
T  16447 tctgaactgagctcgccacggcgatcagaggccctcacctcgcaagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagtt 16348  T
Q  126 gtcgagagttgaacctt 142  Q
    || ||||||||||||||    
T  16347 gttgagagttgaacctt 16331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 325 - 377
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17441
Alignment:
Q  325 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17389 tgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaaga 17441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 197
Target Start/End: Original strand, 11267 - 11445
Alignment:
Q  19 tgtgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 118  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11267 tgtgggatactgacctgaactcgccaaggcgagaagaggctctcacctcgcgagtgacacagaaacaaagtgacttgttagattttgcgacctttgttgc 11366  T
Q  119 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaa 197  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  11367 acgagttgtagagagttgaacctttgggtagaattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctgattaa 11445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 264 - 377
Target Start/End: Original strand, 11442 - 11555
Alignment:
Q  264 ttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 363  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11442 ttaacatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtt 11541  T
Q  364 taagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||    
T  11542 taagttgttgaaga 11555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 38 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4872 - 4545
Alignment:
Q  38 ctcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttg 136  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  4872 ctcgccatggcgagcaaaggctctcgcctcgcaagctacccagaaacagaatgccatgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagttg 4773  T
Q  137 aacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttta 236  Q
    ||||||  ||||| ||| ||||||   |  || ||||| |||||| ||||| ||||||| | | |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  4772 aaccttgaggtagtattgagacttattgaagatgttaattataatttgtgaggctgtttta-agatgttgatgttgatcatgatgtgatataatgtatta 4674  T
Q  237 tgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 336  Q
    |||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| ||||||  | ||||| |  | || || ||||| | ||| |||||||||||| || ||||||    
T  4673 tgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgttgt 4574  T
Q  337 tatttaactaagctgcatgagtcggtcta 365  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4573 tatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 182 - 377
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3298
Alignment:
Q  182 ctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaatt 281  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||   || ||| || |||||||| ||||||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  282 gcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
     || ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 3298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 327
Target Start/End: Original strand, 722 - 1021
Alignment:
Q  25 aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgag 123  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  722 aatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggttcccgcctcgtgagtgacctagaaacagagagtcttgttaggatttttcgacctttgttgcacgag 821  T
Q  124 tggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtg 223  Q
      || ||||||||||||||  ||||| ||| |||||| | ||||| | ||  ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||    
T  822 ctgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatggtgatgctatttatgatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtg 921  T
Q  224 atataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcct 323  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||  |||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||| |  ||||| |||||||   |||||||||||||    
T  922 atataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgc-attgatattattatgccatgctg---ttgtatactgcct 1017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 320 - 377
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4945
Alignment:
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4888 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaaga 4945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10523 - 10323
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgcacgagtg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| || ||| |||| |||     
T  10523 tctgacctgaactcgccacggcgagcagagcttcccgcctcgcgagtgacctagaaacaaagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagtt 10424  T
Q  126 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgat 225  Q
    ||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||| |   ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10423 gttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaataataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 10324  T
Q  226 a 226  Q
    |    
T  10323 a 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 256 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 28544 - 28423
Alignment:
Q  256 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 355  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28544 ttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatg 28445  T
Q  356 agtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  28444 agtcggtctaagttgatgaaga 28423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 310 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 11369 - 11301
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11369 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 11301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 2074 - 2006
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2074 tttgcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 2006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 333 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4561
Alignment:
Q  333 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 4561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 206
Target Start/End: Original strand, 17790 - 17928
Alignment:
Q  68 gcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 167  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||| | |  |    
T  17790 gcgagtcacccagaaatagagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagtattaagacttaatgagg 17889  T
Q  168 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttg 206  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17890 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 17928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 4856 - 4707
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||    
T  4856 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4757  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4756 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 4707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 20909 - 20760
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  20909 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20810  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20809 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 37983 - 37834
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  37983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 37884  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37883 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 37834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 17440 - 17589
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  17440 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17539  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17540 g-ctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 94573 - 94424
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  94573 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 94474  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94473 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 94424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 235 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 44602 - 44467
Alignment:
Q  235 tatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgttttt-gtatactgcctatgttgctgt 333  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||    
T  44602 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgt 44504  T
Q  334 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44503 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 44467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 315 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119884
Alignment:
Q  315 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 119884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 100451 - 100390
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100451 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 100390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 370
Target Start/End: Original strand, 40224 - 40279
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40224 tactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 40279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101515
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttg 101515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 101753 - 101709
Alignment:
Q  29 tgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  101753 tgacctgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgggagt 101709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 235 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 13539 - 13405
Alignment:
Q  235 tatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 334  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  13539 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13441  T
Q  335 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13440 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 4459 - 4310
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  ||| || || ||| |||| ||| ||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||    
T  4459 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4360  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4359 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 4310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 6066 - 6117
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  6066 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 6117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 208 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 8646 - 8482
Alignment:
Q  208 tgttgattatgatgtgatataatgttttatg--cattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgc 305  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || |||   |||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |  |||| ||||||    
T  8646 tgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgc 8547  T
Q  306 tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8546 tgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 8482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 6612 - 6551
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6612 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 6551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 10935 - 10786
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| ||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||    
T  10935 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 10836  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10835 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 10786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 323
Target Start/End: Original strand, 3434 - 3588
Alignment:
Q  170 gttaactataatctgtgaagctgttt-aagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaag 268  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||   || ||| || ||    
T  3434 gttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgag 3533  T
Q  269 atgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcct 323  Q
    |||||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3534 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14109 - 13960
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  14109 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14010  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14009 gt-tgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttg 13960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 82234 - 82085
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  82234 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 82135  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  82134 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttg 82085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 370
Target Start/End: Original strand, 22665 - 22775
Alignment:
Q  260 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 358  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | ||| |  |||| ||||| || ||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22665 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22763  T
Q  359 cggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||    
T  22764 cggtctaagttg 22775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Original strand, 80090 - 80137
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  80090 gaatctgac-tgaactcgacatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 80137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 4)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11305
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  11450 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11351  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 366  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11350 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 11305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Original strand, 61386 - 61421
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  61386 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 61421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12933 - 12861
Alignment:
Q  209 gttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattg 282  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||   || ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  12933 gttgattatgatgtattataatgttt-atgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg 12861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 72
Target Start/End: Original strand, 65304 - 65337
Alignment:
Q  39 tcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  65304 tcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 65337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 9)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 136842 - 136693
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||    
T  136842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 136743  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136742 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 136693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 139311 - 139162
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||    
T  139311 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 139212  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139211 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 139162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 144249 - 144100
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||    
T  144249 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 144150  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144149 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 144100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 134373 - 134224
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||    
T  134373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 134274  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  134273 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 134224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 141780 - 141631
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||    
T  141780 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 141681  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  141680 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 141631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 62270 - 62216
Alignment:
Q  315 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 368  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  62270 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 133009 - 132967
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  133009 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 132967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 300 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 132745 - 132677
Alignment:
Q  300 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  132745 tcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaag 132677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Original strand, 58492 - 58527
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  58492 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 58527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 501246 - 501097
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||| |    
T  501246 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 501147  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501146 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 501097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 220 - 367
Target Start/End: Original strand, 85579 - 85726
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |||||| ||   |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  85579 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 85678  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85679 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 85726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 160761 - 160700
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  160761 tttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 160700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 173638 - 173587
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  173638 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 173587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16946 - 16797
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||    
T  16946 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 16847  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16846 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 17143 - 17024
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt--agattttgcgacctttgttgcacg 121  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| | |||||||   |||||||||| |||||| |||||    
T  17143 gaatatgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaat-acttgtttaggattttgcgatctttgtagcacg 17045  T
Q  122 agtggtcgagagttgaacctt 142  Q
    ||| || || |||||||||||    
T  17044 agtcgttgatagttgaacctt 17024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 72
Target Start/End: Original strand, 7537 - 7576
Alignment:
Q  33 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7537 ctgaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgag 7576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 119
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||    
T  268 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 169  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  168 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttg 119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 12249 - 12398
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| | |  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  || ||||||||||||||||||| ||    
T  12249 tgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattct 12348  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12349 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttg 12398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9404 - 9255
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| ||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| ||||||| ||||||    
T  9404 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 9305  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9304 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 9255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 4)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 40562 - 40413
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||  ||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||||||    
T  40562 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatact 40463  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40462 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttg 40413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 13252 - 13201
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  13252 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 13201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 19536 - 19485
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19536 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 62592 - 62556
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  62592 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagt 62556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 220 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 30094 - 29946
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||| |||| |||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| || || ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  30094 tgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29995  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 369  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29994 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 5)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 220 - 367
Target Start/End: Original strand, 20379 - 20524
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| |||||| |||||||    
T  20379 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 20477  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20478 ga-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128771
Alignment:
Q  219 atgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||| | |      
T  128917 atgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt-ttttt 128819  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 366  Q
    |   | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  128818 tttttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaa 128771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Original strand, 20182 - 20228
Alignment:
Q  23 ggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 69  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20182 ggaagctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgc 20228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 53913 - 53862
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  53913 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 53862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 358
Target Start/End: Original strand, 65830 - 65891
Alignment:
Q  297 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 358  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  65830 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 65891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 264 - 182
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcga 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  264 tctgacctgaactcgccacagcgagtagaggctctcgccacgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcga 182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 4)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13336 - 13147
Alignment:
Q  180 atctgtgaagctgtt-taagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaata-tttaagatgttgatg 277  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||| ||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||  ||| |||||||| ||    
T  13336 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttg 13237  T
Q  278 aattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    | ||||| ||||| |  |||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13236 atttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 370
Target Start/End: Original strand, 16014 - 16205
Alignment:
Q  180 atctgtgaagctgtt-taagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatga 278  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||| ||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| |||   |||| ||| |||||||| |||    
T  16014 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttga 16113  T
Q  279 attgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
     || || ||||| |  |||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16114 tttacatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2680
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 149
Target Start/End: Original strand, 15866 - 15983
Alignment:
Q  34 tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgag 131  Q
    |||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||||  |||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| |||| ||| ||   |    
T  15866 tgaactcgccatagcgagtataggccctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatgccttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacaagttgttatg 15965  T
Q  132 agttgaacctttgggtag 149  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15966 agttgaacctttgggtag 15983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 208 - 367
Target Start/End: Original strand, 53492 - 53651
Alignment:
Q  208 tgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctg 307  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |  |||| ||||| ||    
T  53492 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg 53591  T
Q  308 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  53592 -ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 8062 - 8099
Alignment:
Q  35 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8062 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 8099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 4377 - 4227
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |||||| |||  |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  4377 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatac 4278  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4277 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 4227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 211 - 337
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15486
Alignment:
Q  211 tgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgttt 310  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    || ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |  |||||||||||||  |    
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--t 15459  T
Q  311 ttgtatactgcctatgttgctgttgtt 337  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||    
T  15460 ttgtatgctgcctatgttgatgttgtt 15486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36248 - 36199
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36248 ctgcctatgttgttgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaag 36199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 161089 - 161239
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |||||| ||   |||||| || |||||||||| || ||||| ||||| |  |||||||||  |||||||||||||    
T  161089 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatac 161188  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  161189 tgc-tgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 161239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 240 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 116571 - 116443
Alignment:
Q  240 attacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 339  Q
    ||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  116571 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttat 116474  T
Q  340 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116473 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 116443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 367
Target Start/End: Original strand, 129021 - 129072
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  129021 tactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 309 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 78400 - 78345
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 363  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  78400 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 78345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Original strand, 128735 - 128775
Alignment:
Q  32 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  128735 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 128775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0839 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0839
Description:

Target: scaffold0839; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 135
Target Start/End: Original strand, 1836 - 1947
Alignment:
Q  25 aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt--agattttgcgacctttgttgcacga 122  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| ||||||    
T  1836 aatctgacctgaattcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacga 1934  T
Q  123 gtggtcgagagtt 135  Q
    || || |||||||    
T  1935 gtcgttgagagtt 1947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1051
Alignment:
Q  260 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 358  Q
    |||||| |||||||||||| | | | ||||| |  |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1158 atatttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 1060  T
Q  359 cggtctaag 367  Q
    |||||||||    
T  1059 cggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 96
Target Start/End: Original strand, 6561 - 6625
Alignment:
Q  32 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  6561 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaatagagtgccttgt 6625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 295 - 370
Target Start/End: Original strand, 2204 - 2278
Alignment:
Q  295 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2204 ttatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttg 2278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 377
Target Start/End: Original strand, 17941 - 18139
Alignment:
Q  180 atctgtgaagctg-tttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatga 278  Q
    ||||||||||||| |||| |||   ||| ||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| | |    
T  17941 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgttta 18040  T
Q  279 attgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
     ||||  | ||| |  |||| ||||| |||| | | ||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18041 cttgcgttcgatattattatatcatgatgttgt-gcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 18139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27036 - 26850
Alignment:
Q  170 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaaga 269  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | || |||||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |||  |||||    
T  27036 gttaactgcaatctgtgaagctgtt-atgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 26939  T
Q  270 tgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgct-gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 360  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||  |||| | ||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  26938 tgttgatgaattg-aattgatataattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagatgcatgagtcg 26850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12220 - 12077
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  12220 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatact 12121  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    | || ||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12120 g-ctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 12077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 1280 - 1430
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatac 318  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |||||| |||  |||||| || ||| | |||| || ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  1280 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 1379  T
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    | | | ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1380 t-catgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttg 1430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 8714 - 8765
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  8714 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 8765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 250
Target Start/End: Original strand, 8863 - 8943
Alignment:
Q  170 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttta-tgcattacttgaat 250  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| |||||| |||||||||| || |||||| | | ||||||||||||    
T  8863 gttaactgtaatctgtgaagctg-ttatgaaatgttgatgttgaatatgatgtgagatgatgtttgatttcattacttgaat 8943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15738 - 15677
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15738 tttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttg 15677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 16021 - 15974
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16021 gaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 15974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19341 - 19280
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19341 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 19280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 19622 - 19573
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 80  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19622 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaatgacccag 19573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 72
Target Start/End: Original strand, 48219 - 48268
Alignment:
Q  23 ggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  48219 ggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 48268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12745 - 12587
Alignment:
Q  208 tgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctg 307  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | ||| ||||||| |||| |||  | | ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |  |||| ||||||||    
T  12745 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg 12647  T
Q  308 tttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12646 tttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 77
Target Start/End: Original strand, 15370 - 15426
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370 tgggaatctgacctgaactcgccatagcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 15426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 377
Target Start/End: Original strand, 1113 - 1181
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1113 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 1181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Original strand, 3993 - 4033
Alignment:
Q  32 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3993 cctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 4033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 359
Target Start/End: Original strand, 4284 - 4320
Alignment:
Q  323 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4284 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 4320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 370
Target Start/End: Original strand, 10536 - 10646
Alignment:
Q  260 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 358  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | ||| |  |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  10536 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagt 10634  T
Q  359 cggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||    
T  10635 cggtctaagttg 10646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 73
Target Start/End: Original strand, 10305 - 10347
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10305 acctgaactcgccaaagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 10347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 38657 - 38807
Alignment:
Q  220 tgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    |||||||||||  | || ||| ||||||||| |||  | ||||||| |||| ||||||| ||||| ||||| |  |||| ||||| |||||| | |||||    
T  38657 tgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatact 38755  T
Q  320 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  38756 gtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttg 38807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 6)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 130031 - 129921
Alignment:
Q  260 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagt 358  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | ||| |  |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  130031 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagt 129933  T
Q  359 cggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||    
T  129932 cggtctaagttg 129921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 367
Target Start/End: Original strand, 60626 - 60818
Alignment:
Q  177 ataatctgtgaagctgtt-taagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttga 275  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||   ||| ||||| | || |||||||||| |  | |||||||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||     
T  60626 ataatctgtgaagctgttataaaatgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgt 60725  T
Q  276 tgaattgcaattgatgtatttatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||| ||||| ||||| |   ||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  60726 tgatttgca-ttgatattggtatatcatgagctgtttt-gtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 130263 - 130222
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  130263 acctaaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 130222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 73
Target Start/End: Original strand, 60479 - 60520
Alignment:
Q  32 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  60479 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 60520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 714 - 666
Alignment:
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  714 tgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 23561 - 23513
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23561 gaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 486 - 437
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 80  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  486 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 206 - 145
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  206 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttg 145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1159 - 1098
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1159 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 1098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 208 - 365
Target Start/End: Original strand, 8002 - 8161
Alignment:
Q  208 tgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcat--gc 305  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || ||| |||||||||||| |||  ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |  |||| ||||  ||    
T  8002 tgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagc 8101  T
Q  306 tgtttttgtatactgcctatgttgct-gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 365  Q
    ||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8102 tg-atttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 73
Target Start/End: Original strand, 7822 - 7864
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7822 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 7864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 6688 - 6627
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6688 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 6627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14068 - 14007
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14068 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 14007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Original strand, 6167 - 6228
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6167 tttgcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 6228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Original strand, 8118 - 8179
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8118 tttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 8179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 68
Target Start/End: Original strand, 29038 - 29081
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 68  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  29038 gaatctgacc-gaactagccatggcgagcagaggctctcgcctcg 29081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23928 - 23855
Alignment:
Q  297 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23928 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatggtgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttg 23855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24057 - 23979
Alignment:
Q  170 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaa 249  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||    
T  24057 gttaactgcaatctgtgaagctgtt-aagagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgttaatttcattacttgaa 23979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 26763 - 26712
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26763 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 26712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Original strand, 23927 - 23988
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23927 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 23988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 20472 - 20426
Alignment:
Q  27 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20472 tctgacctgagctcgccacgacgagcagaggctctcgcctcgcgagt 20426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Original strand, 15821 - 15882
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15821 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 178961 - 178912
Alignment:
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 368  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  178961 tgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 178912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 367
Target Start/End: Original strand, 2801 - 2908
Alignment:
Q  260 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 358  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |  |||| ||||| || ||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2801 atatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 2899  T
Q  359 cggtctaag 367  Q
    |||||||||    
T  2900 cggtctaag 2908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 73
Target Start/End: Original strand, 2567 - 2609
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2567 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 2609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 5715 - 5659
Alignment:
Q  315 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5715 atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttg 5659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 370
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2750
Alignment:
Q  315 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 2750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Original strand, 28813 - 28875
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgt--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28813 tttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 28875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 73
Target Start/End: Original strand, 28574 - 28616
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28574 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 28616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 316 - 370
Target Start/End: Original strand, 14747 - 14802
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14747 tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 14802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6889 - 6831
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6889 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaag 6831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 7167 - 7126
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  7167 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgccttgcgag 7126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  325 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 12293 - 12166
Alignment:
Q  23 ggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgcacg 121  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||   |||||    ||  ||| |||||||||| ||||||  ||||    
T  12293 ggaaactgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagttgcccaattacagaagccctgtttaggattttgcgatctttgtcacacg 12194  T
Q  122 agtggtcgagagttgaacctttgggtag 149  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||    
T  12193 agtcgttgagagttgaaccttggggtag 12166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 11642 - 11473
Alignment:
Q  208 tgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctg 307  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| |||  ||| ||||| |||||||| | | || |    ||| |  |||| ||||| ||    
T  11642 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg 11543  T
Q  308 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  11542 tttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaaga 11473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 377
Target Start/End: Original strand, 38199 - 38368
Alignment:
Q  208 tgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctg 307  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| |||  ||| ||||| |||||||| | | || |    ||| |  |||| ||||| ||    
T  38199 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg 38298  T
Q  308 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 377  Q
    |||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  38299 tttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaaga 38368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 72
Target Start/End: Original strand, 24417 - 24456
Alignment:
Q  33 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24417 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 24456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25184 - 25122
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25184 ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 25122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Original strand, 45836 - 45897
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45836 tttgcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 45897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 72
Target Start/End: Original strand, 45555 - 45596
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45555 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 45596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 370
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1139
Alignment:
Q  315 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 1139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 360
Target Start/End: Original strand, 21712 - 21898
Alignment:
Q  170 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaaga 269  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | || |||||  ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||   || ||| |||  |||||    
T  21712 gttaactgcaatctgtgaagctgtt-atgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgttt-atgcattacttgaagattaattgtatacataaga 21809  T
Q  270 tgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatg-ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 360  Q
    ||||||||||||| ||||| | || |||  |||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21810 tgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcg 21898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 360
Target Start/End: Original strand, 29604 - 29790
Alignment:
Q  170 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaaga 269  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | || |||||  ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||   || ||| |||  |||||    
T  29604 gttaactgcaatctgtgaagctgtt-atgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgttt-atgcattacttgaagattaattgtatacataaga 29701  T
Q  270 tgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatg-ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 360  Q
    ||||||||||||| ||||| | || |||  |||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  29702 tgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcg 29790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 13062 - 12955
Alignment:
Q  263 tttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 361  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | ||| |  |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13062 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 12964  T
Q  362 tctaagttg 370  Q
    |||||||||    
T  12963 tctaagttg 12955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 13296 - 13255
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  13296 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgag 13255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 29720 - 29570
Alignment:
Q  221 gtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatact 319  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||   |  ||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||| || |||||  ||    
T  29720 gtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtcttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatct 29621  T
Q  320 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
     |||||| | || ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||    
T  29620 acctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttg 29570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 359
Target Start/End: Original strand, 16255 - 16442
Alignment:
Q  170 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaaga 269  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | || |||||  |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |   ||  ||||||  ||||||    
T  16255 gttaactgcaatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaaga 16353  T
Q  270 tgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    ||||| |||| |  ||||||| |  | | |||||| |||| |||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16354 tgttgttgaaat-taattgatattatgaagtcatgatgttgttgtgata-tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12843 - 12782
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12843 tttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttg 12782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 10604 - 10543
Alignment:
Q  310 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  10604 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaagttg 10543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 10884 - 10842
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10884 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 10842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 365
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 365  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 391 - 344
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  391 gaatctgac-tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 10273 - 10226
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10273 gaatctgac-tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 10226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Original strand, 2203 - 2250
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2203 gaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 2250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 628 - 569
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  628 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 367
Target Start/End: Original strand, 6327 - 6386
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6327 ttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 38394 - 38339
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 363  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38394 ttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 20065 - 19995
Alignment:
Q  297 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  20065 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctactattgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataag 19995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20184 - 20116
Alignment:
Q  182 ctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttta-tgcattacttgaat 250  Q
    ||||||||||||| | || |||||  |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  20184 ctgtgaagctgtt-atgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaat 20116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 36517 - 36466
Alignment:
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36517 tgcctatgctactattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttg 36466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36671 - 36592
Alignment:
Q  170 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttta-tgcattacttgaa 249  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | || |||||  |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  36671 gttaactgcaatctgtgaagctgtt-atgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 36592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 36820 - 36769
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  36820 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 36769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Original strand, 192920 - 193070
Alignment:
Q  210 ttgattatgatgtgatataatgtttta-tgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgt 308  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || | ||| |||||||   |  ||||||| || |||||||| ||||||  || |||| |  |||||||||| |||    
T  192920 ttgattatggtgtgatataatgttgtaatacatcacttgaagttttattgaataattgagatgttg-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgt 193018  T
Q  309 ttttgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    | |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  193019 tgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 193070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 73
Target Start/End: Original strand, 192741 - 192793
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  192741 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagt 192793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 56445 - 56394
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  56445 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 56394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 191038 - 191089
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  191038 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 191089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 73
Target Start/End: Original strand, 2066 - 2108
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2066 acctgaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgagt 2108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 32439 - 32397
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 73  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32439 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcacctcgcgagt 32397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 32190 - 32117
Alignment:
Q  295 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32190 ttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaag 32117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 29262 - 29117
Alignment:
Q  217 tgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatat--ttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttg 313  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||   |  ||||||||  ||||| ||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||| || |||    
T  29262 tgatgtgatataatgttgtgtgtattacttgaagttttattgaatatatttaaggtgttgttaaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttg 29163  T
Q  314 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    ||  || |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29162 taatctacctatgctactattgttatttaactaagatgcatgagtc 29117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 69879 - 69809
Alignment:
Q  297 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  69879 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataag 69809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 10342 - 10393
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10342 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 10393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 70158 - 70107
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  70158 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 70107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 70009 - 69929
Alignment:
Q  170 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttta-tgcattacttgaat 250  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | || |||||  |||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  70009 gttaactgcaatctgtgaagctgtt-atgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaat 69929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 9432 - 9391
Alignment:
Q  31 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9432 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 9391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 69
Target Start/End: Original strand, 12567 - 12611
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 69  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12567 gaatctgac-tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 12611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Original strand, 9592 - 9639
Alignment:
Q  24 gaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  9592 gaatctgac-tgaactcgtcatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 9639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1461
Description:

Target: scaffold1461; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 277 - 226
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  277 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Original strand, 4875 - 4910
Alignment:
Q  37 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4875 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 4910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15763 - 15712
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15763 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 6835 - 6886
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  6835 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 6886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 18702 - 18651
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18702 tgggaatctggcttgaactcgctaaggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 16878 - 16929
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16878 tgggaatctggcatgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 309 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2753 - 2694
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  | | || |||||||||||||||||||||||||    
T  2753 ttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaag 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15034 - 14983
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15034 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 14983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 66173 - 66224
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  66173 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 66224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 2431 - 2482
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2431 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 2482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30398 - 30350
Alignment:
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  30398 tgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 30350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 24726 - 24777
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24726 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagacgctctcgcctcgcgag 24777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 225694 - 225644
Alignment:
Q  99 gattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtag 149  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  225694 gattttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtag 225644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 225584 - 225465
Alignment:
Q  208 tgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaatgatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctg 307  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| |||  ||||| ||| |||||||| || |||||| ||||| |  |||| ||| ||||    
T  225584 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttg-attgcatttgatattattatatcacgctg 225486  T
Q  308 tttttgtatactgcctatgttg 329  Q
     ||||| |||||| ||||||||    
T  225485 -ttttgcatactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 228131 - 228182
Alignment:
Q  21 tgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  228131 tgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 228182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 360
Target Start/End: Original strand, 10575 - 10617
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 360  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  10575 ctgcctatgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcg 10617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 359
Target Start/End: Original strand, 4999 - 5037
Alignment:
Q  321 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4999 cctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtc 5037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Original strand, 103674 - 103736
Alignment:
Q  309 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 370  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  103674 ttttttatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaagttg 103736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 2148 - 2099
Alignment:
Q  23 ggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 72  Q
    |||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2148 ggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 2099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7499 - 7450
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7499 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 7450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 14618 - 14569
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14618 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 14569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 44145 - 44104
Alignment:
Q  318 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  44145 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 44104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 359
Target Start/End: Original strand, 7328 - 7364
Alignment:
Q  323 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 359  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7328 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 7364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3324 - 3276
Alignment:
Q  319 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3324 tgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 3276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 97076 - 97024
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  97076 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 106354 - 106302
Alignment:
Q  316 tactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 367  Q
    |||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  106354 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University