View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16306_low_11 (Length: 336)

Name: NF16306_low_11
Description: NF16306
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16306_low_11
NF16306_low_11
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (2-330)||(20536208-20536535)
chr8 (2-330)||(18818203-18818530)
chr8 (2-330)||(21918794-21919121)
chr8 (2-330)||(18879031-18879352)
chr8 (2-330)||(21923722-21924049)
chr8 (2-330)||(22626736-22627063)
chr8 (11-330)||(7372778-7373088)
chr8 (2-330)||(23406379-23406708)
chr8 (2-329)||(23648554-23648881)
chr8 (7-330)||(31971257-31971577)
chr8 (3-330)||(45130793-45131117)
chr8 (2-329)||(28648837-28649164)
chr8 (2-330)||(16199440-16199765)
chr8 (2-333)||(6759255-6759584)
chr8 (2-330)||(16092134-16092463)
chr8 (2-330)||(22875065-22875393)
chr8 (2-207)||(25362934-25363138)
chr8 (155-330)||(21389399-21389571)
chr8 (155-330)||(21395929-21396101)
chr8 (155-330)||(21778725-21778897)
chr8 (155-330)||(21790422-21790594)
chr8 (164-327)||(14409444-14409606)
chr8 (164-327)||(1484402-1484564)
chr8 (164-327)||(5853292-5853454)
chr8 (164-323)||(16413316-16413474)
chr8 (164-327)||(20403227-20403389)
chr8 (164-327)||(22001753-22001915)
chr8 (164-327)||(41598188-41598350)
chr8 (164-327)||(4483281-4483442)
chr8 (164-327)||(4542373-4542535)
chr8 (164-327)||(15203231-15203393)
chr8 (164-327)||(20046195-20046357)
chr8 (147-328)||(18678039-18678221)
chr8 (147-328)||(32121734-32121916)
chr8 (164-327)||(19896265-19896430)
chr8 (164-327)||(14823774-14823935)
chr8 (231-323)||(45290762-45290853)
chr8 (231-333)||(19937073-19937174)
chr8 (164-327)||(25484275-25484430)
chr8 (254-326)||(26355742-26355815)
chr8 (207-330)||(6520368-6520491)
chr8 (231-314)||(15070571-15070653)
chr8 (232-330)||(17140916-17141014)
chr8 (204-327)||(26219717-26219838)
chr8 (204-330)||(38855246-38855372)
chr8 (233-330)||(21490995-21491092)
chr8 (158-330)||(17612059-17612231)
chr8 (164-329)||(26223917-26224081)
chr8 (211-326)||(21285601-21285716)
chr8 (232-330)||(5866297-5866395)
chr8 (204-327)||(26225288-26225409)
chr8 (283-330)||(21249384-21249431)
chr8 (283-330)||(21255222-21255269)
chr8 (181-311)||(19801399-19801527)
chr8 (158-311)||(20498581-20498734)
chr8 (259-326)||(23760893-23760961)
chr8 (254-315)||(983450-983512)
chr8 (158-323)||(13508034-13508199)
chr8 (204-318)||(21673716-21673830)
chr8 (158-323)||(13597566-13597731)
chr8 (260-309)||(22525579-22525628)
chr8 (260-311)||(17267044-17267096)
chr8 (159-303)||(23776785-23776929)
chr8 (260-311)||(17439557-17439609)
chr8 (260-311)||(24353039-24353091)
chr8 (263-311)||(28397569-28397617)
chr8 (260-311)||(37116366-37116418)
[»] chr2 (62 HSPs)
chr2 (2-330)||(22737974-22738300)
chr2 (2-330)||(23285865-23286188)
chr2 (2-330)||(22731027-22731355)
chr2 (10-330)||(23654188-23654507)
chr2 (2-330)||(23076442-23076769)
chr2 (2-327)||(298608-298933)
chr2 (25-330)||(23060513-23060815)
chr2 (2-330)||(37910-38235)
chr2 (2-330)||(22337115-22337443)
chr2 (2-330)||(23660023-23660350)
chr2 (2-330)||(20309108-20309432)
chr2 (164-327)||(22105412-22105575)
chr2 (2-175)||(27753730-27753902)
chr2 (164-329)||(32214921-32215085)
chr2 (164-324)||(21155060-21155219)
chr2 (164-327)||(18808943-18809105)
chr2 (164-327)||(23130862-23131024)
chr2 (164-327)||(23133329-23133491)
chr2 (164-327)||(23709532-23709694)
chr2 (164-327)||(23712013-23712175)
chr2 (164-327)||(26505379-26505541)
chr2 (164-327)||(26507857-26508019)
chr2 (164-327)||(32039498-32039660)
chr2 (164-327)||(34402522-34402684)
chr2 (164-327)||(39682313-39682475)
chr2 (181-327)||(23135590-23135735)
chr2 (2-103)||(32451723-32451824)
chr2 (164-327)||(571397-571559)
chr2 (164-327)||(6725995-6726157)
chr2 (164-327)||(24367774-24367936)
chr2 (181-327)||(45029871-45030016)
chr2 (164-327)||(24898195-24898358)
chr2 (164-327)||(24900678-24900841)
chr2 (164-327)||(24903155-24903318)
chr2 (164-327)||(24905632-24905795)
chr2 (164-327)||(24908107-24908270)
chr2 (127-330)||(23708537-23708738)
chr2 (211-330)||(23103399-23103516)
chr2 (231-327)||(24529596-24529691)
chr2 (164-327)||(28577099-28577261)
chr2 (164-325)||(43137301-43137461)
chr2 (253-330)||(8946657-8946734)
chr2 (147-323)||(25616192-25616369)
chr2 (164-327)||(38967374-38967537)
chr2 (275-330)||(23040255-23040310)
chr2 (232-330)||(23071972-23072070)
chr2 (204-325)||(28405981-28406103)
chr2 (248-324)||(24643034-24643109)
chr2 (254-329)||(22134251-22134326)
chr2 (183-311)||(7707-7835)
chr2 (254-326)||(7679589-7679662)
chr2 (158-330)||(19671830-19672001)
chr2 (231-311)||(32451950-32452031)
chr2 (204-326)||(25175854-25175976)
chr2 (254-315)||(18786947-18787009)
chr2 (159-303)||(22799076-22799220)
chr2 (260-309)||(23287384-23287433)
chr2 (159-326)||(23019656-23019823)
chr2 (261-309)||(26392403-26392451)
chr2 (253-311)||(22413181-22413240)
chr2 (253-311)||(23207296-23207355)
chr2 (260-311)||(25108906-25108958)
[»] chr5 (64 HSPs)
chr5 (2-330)||(8286636-8286964)
chr5 (2-330)||(25421532-25421860)
chr5 (4-330)||(23390292-23390617)
chr5 (2-330)||(22075018-22075346)
chr5 (2-330)||(25431395-25431722)
chr5 (4-330)||(24493569-24493894)
chr5 (3-330)||(13025311-13025637)
chr5 (3-330)||(13095495-13095821)
chr5 (2-327)||(24529223-24529548)
chr5 (2-330)||(9077952-9078280)
chr5 (2-330)||(21292764-21293090)
chr5 (163-330)||(21808343-21808510)
chr5 (163-330)||(21729018-21729185)
chr5 (2-330)||(1096467-1096795)
chr5 (231-330)||(21997556-21997655)
chr5 (2-193)||(22107167-22107357)
chr5 (3-192)||(21985941-21986130)
chr5 (127-316)||(18418594-18418780)
chr5 (164-327)||(264768-264930)
chr5 (164-327)||(39363384-39363546)
chr5 (181-327)||(10732957-10733102)
chr5 (164-327)||(36154783-36154942)
chr5 (164-327)||(20909012-20909174)
chr5 (204-327)||(22412187-22412309)
chr5 (164-327)||(29329934-29330096)
chr5 (164-327)||(42245365-42245527)
chr5 (164-327)||(29345980-29346142)
chr5 (164-327)||(32027393-32027555)
chr5 (181-327)||(39245136-39245281)
chr5 (155-282)||(18356363-18356488)
chr5 (231-327)||(38619434-38619529)
chr5 (164-327)||(29348453-29348615)
chr5 (164-327)||(29350926-29351088)
chr5 (164-324)||(18319033-18319193)
chr5 (231-327)||(20902076-20902172)
chr5 (231-327)||(2154681-2154776)
chr5 (231-327)||(11581266-11581361)
chr5 (231-326)||(23064512-23064606)
chr5 (147-328)||(17517138-17517320)
chr5 (233-327)||(20918017-20918110)
chr5 (155-282)||(20910745-20910870)
chr5 (164-327)||(10775675-10775838)
chr5 (231-327)||(31061068-31061163)
chr5 (163-311)||(22144068-22144216)
chr5 (254-330)||(19660879-19660956)
chr5 (254-330)||(21329541-21329618)
chr5 (207-330)||(21502154-21502277)
chr5 (159-323)||(37723910-37724073)
chr5 (254-326)||(22959576-22959649)
chr5 (212-311)||(20026942-20027043)
chr5 (204-326)||(21565546-21565668)
chr5 (232-330)||(36314577-36314675)
chr5 (254-330)||(19668898-19668975)
chr5 (231-324)||(24067110-24067202)
chr5 (254-330)||(26012079-26012154)
chr5 (241-326)||(26704075-26704160)
chr5 (241-326)||(26973808-26973893)
chr5 (275-327)||(20806852-20806904)
chr5 (261-314)||(26732884-26732937)
chr5 (204-264)||(20766115-20766174)
chr5 (253-311)||(22178264-22178323)
chr5 (155-226)||(23572182-23572252)
chr5 (261-311)||(26740697-26740747)
chr5 (285-330)||(40725853-40725898)
[»] chr7 (71 HSPs)
chr7 (2-330)||(9509189-9509516)
chr7 (2-330)||(12698831-12699159)
chr7 (2-330)||(26211995-26212323)
chr7 (2-330)||(16386041-16386369)
chr7 (2-330)||(10589039-10589365)
chr7 (2-330)||(38227481-38227808)
chr7 (2-327)||(3564157-3564482)
chr7 (2-328)||(40443393-40443716)
chr7 (127-327)||(18456332-18456530)
chr7 (2-330)||(27847627-27847951)
chr7 (2-315)||(15143830-15144143)
chr7 (164-330)||(13647325-13647491)
chr7 (158-327)||(16213684-16213852)
chr7 (211-327)||(48273392-48273508)
chr7 (164-327)||(456321-456483)
chr7 (164-327)||(11972496-11972658)
chr7 (164-327)||(14949122-14949284)
chr7 (164-327)||(15376713-15376875)
chr7 (164-327)||(16232520-16232682)
chr7 (164-327)||(18640272-18640434)
chr7 (164-327)||(20385123-20385285)
chr7 (164-327)||(21189595-21189757)
chr7 (164-327)||(32125491-32125653)
chr7 (164-327)||(41522917-41523079)
chr7 (164-327)||(41525379-41525541)
chr7 (164-326)||(11393287-11393448)
chr7 (164-330)||(18430709-18430874)
chr7 (181-323)||(24275175-24275316)
chr7 (184-327)||(16410059-16410201)
chr7 (164-327)||(24702238-24702400)
chr7 (164-327)||(27216860-27217022)
chr7 (158-330)||(2280068-2280238)
chr7 (161-326)||(14932685-14932851)
chr7 (161-326)||(15356120-15356286)
chr7 (161-326)||(15360234-15360400)
chr7 (164-327)||(44116509-44116671)
chr7 (164-327)||(3386333-3386495)
chr7 (199-327)||(13869346-13869474)
chr7 (164-323)||(38898376-38898535)
chr7 (233-327)||(13831373-13831466)
chr7 (164-327)||(24704688-24704847)
chr7 (164-327)||(17061915-17062077)
chr7 (164-327)||(20110556-20110708)
chr7 (231-330)||(22072913-22073013)
chr7 (232-330)||(16495402-16495500)
chr7 (232-330)||(28505321-28505419)
chr7 (232-330)||(34200786-34200884)
chr7 (254-330)||(67745-67822)
chr7 (254-326)||(44014182-44014255)
chr7 (207-326)||(16219715-16219834)
chr7 (259-330)||(47831807-47831879)
chr7 (233-330)||(11996051-11996148)
chr7 (277-326)||(811199-811248)
chr7 (277-330)||(15754955-15755008)
chr7 (277-326)||(18005650-18005699)
chr7 (164-264)||(26355983-26356083)
chr7 (164-264)||(26358435-26358535)
chr7 (253-315)||(1868038-1868101)
chr7 (253-315)||(12901338-12901401)
chr7 (241-324)||(18154873-18154956)
chr7 (197-282)||(2530126-2530209)
chr7 (155-303)||(15211484-15211632)
chr7 (164-311)||(12756671-12756817)
chr7 (260-315)||(14044761-14044817)
chr7 (260-315)||(14354791-14354847)
chr7 (260-311)||(18203831-18203882)
chr7 (269-327)||(26356098-26356156)
chr7 (269-327)||(26358550-26358608)
chr7 (285-330)||(19486820-19486865)
chr7 (260-311)||(20220238-20220290)
chr7 (253-304)||(48991206-48991258)
[»] chr6 (70 HSPs)
chr6 (2-330)||(20360754-20361081)
chr6 (2-330)||(20638077-20638404)
chr6 (8-330)||(17287596-17287917)
chr6 (2-330)||(22780021-22780348)
chr6 (2-330)||(29060540-29060868)
chr6 (2-330)||(25629148-25629476)
chr6 (2-329)||(18409620-18409947)
chr6 (2-330)||(19303334-19303661)
chr6 (2-330)||(20593773-20594101)
chr6 (163-330)||(16496244-16496411)
chr6 (2-330)||(16920427-16920751)
chr6 (163-330)||(20076700-20076863)
chr6 (155-330)||(35245586-35245758)
chr6 (2-330)||(22831503-22831829)
chr6 (164-327)||(12742317-12742479)
chr6 (164-327)||(18334592-18334754)
chr6 (164-327)||(19005046-19005208)
chr6 (164-327)||(19858919-19859081)
chr6 (164-327)||(22782227-22782389)
chr6 (164-327)||(24422547-24422709)
chr6 (164-327)||(25754809-25754971)
chr6 (164-327)||(33861794-33861956)
chr6 (164-327)||(33864278-33864440)
chr6 (2-103)||(18821613-18821714)
chr6 (164-329)||(30676710-30676874)
chr6 (183-327)||(1595549-1595692)
chr6 (231-327)||(25656629-25656724)
chr6 (164-327)||(2291180-2291342)
chr6 (164-327)||(8055029-8055191)
chr6 (3-311)||(11185524-11185828)
chr6 (164-327)||(26924640-26924802)
chr6 (164-329)||(34963371-34963535)
chr6 (184-327)||(25688502-25688644)
chr6 (181-327)||(1540928-1541073)
chr6 (161-315)||(25644335-25644490)
chr6 (164-324)||(16448526-16448686)
chr6 (164-327)||(3852017-3852179)
chr6 (164-311)||(18456735-18456881)
chr6 (181-311)||(18461895-18462024)
chr6 (183-330)||(20109140-20109285)
chr6 (231-327)||(20556959-20557054)
chr6 (64-303)||(25603241-25603478)
chr6 (254-326)||(19652199-19652272)
chr6 (155-282)||(27415887-27416012)
chr6 (147-328)||(23992429-23992608)
chr6 (203-328)||(19847989-19848114)
chr6 (254-330)||(27333262-27333339)
chr6 (254-330)||(27394002-27394079)
chr6 (275-330)||(25714417-25714472)
chr6 (130-303)||(15041473-15041644)
chr6 (231-311)||(18821867-18821946)
chr6 (232-330)||(28496494-28496592)
chr6 (232-330)||(29808905-29809003)
chr6 (77-303)||(25611592-25611816)
chr6 (277-330)||(1561303-1561356)
chr6 (281-330)||(22080797-22080846)
chr6 (259-318)||(4185870-4185930)
chr6 (253-309)||(33443068-33443124)
chr6 (253-315)||(9098557-9098620)
chr6 (285-330)||(8227587-8227632)
chr6 (211-330)||(23019408-23019525)
chr6 (278-318)||(4186379-4186419)
chr6 (278-318)||(4738626-4738666)
chr6 (260-311)||(23076749-23076801)
chr6 (260-311)||(35008167-35008219)
chr6 (284-315)||(19668386-19668417)
chr6 (241-326)||(19873120-19873205)
chr6 (241-326)||(22432249-22432334)
chr6 (241-326)||(22438799-22438884)
chr6 (289-333)||(19008799-19008843)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (2-328)||(22636437-22636761)
chr4 (5-330)||(12902757-12903081)
chr4 (2-330)||(44052829-44053156)
chr4 (2-330)||(7088877-7089204)
chr4 (2-323)||(23374153-23374473)
chr4 (3-330)||(16239764-16240090)
chr4 (2-330)||(7893703-7894028)
chr4 (2-330)||(14053096-14053422)
chr4 (2-325)||(14038653-14038976)
chr4 (2-327)||(16377315-16377639)
chr4 (155-330)||(7798774-7798949)
chr4 (127-330)||(16270155-16270356)
chr4 (2-215)||(3096759-3096970)
chr4 (2-207)||(17047866-17048070)
chr4 (158-330)||(6899891-6900062)
chr4 (205-330)||(52873363-52873488)
chr4 (164-327)||(18215274-18215436)
chr4 (164-327)||(44102214-44102376)
chr4 (164-327)||(44928879-44929042)
chr4 (164-327)||(12307-12469)
chr4 (164-327)||(3515007-3515169)
chr4 (164-327)||(15118352-15118514)
chr4 (164-327)||(23803265-23803427)
chr4 (164-327)||(52312510-52312672)
chr4 (204-327)||(54798749-54798872)
chr4 (158-327)||(1837503-1837671)
chr4 (164-333)||(19242693-19242861)
chr4 (204-327)||(14280316-14280438)
chr4 (164-327)||(44615288-44615450)
chr4 (164-327)||(44773087-44773249)
chr4 (164-327)||(50222339-50222501)
chr4 (164-327)||(51463868-51464030)
chr4 (244-330)||(3096293-3096379)
chr4 (181-327)||(18239436-18239581)
chr4 (164-329)||(19618172-19618336)
chr4 (155-330)||(17046487-17046659)
chr4 (164-323)||(15355324-15355483)
chr4 (164-327)||(12610950-12611105)
chr4 (164-329)||(14970707-14970871)
chr4 (9-311)||(6190481-6190782)
chr4 (158-311)||(13800-13953)
chr4 (2-122)||(15091103-15091224)
chr4 (254-330)||(39706332-39706409)
chr4 (2-73)||(7798953-7799024)
chr4 (204-327)||(8574864-8574985)
chr4 (231-330)||(15367690-15367788)
chr4 (231-330)||(15370018-15370116)
chr4 (231-330)||(15371202-15371300)
chr4 (231-330)||(15373483-15373581)
chr4 (231-330)||(15402703-15402801)
chr4 (232-330)||(16223532-16223629)
chr4 (155-282)||(43256106-43256231)
chr4 (259-330)||(15551817-15551889)
chr4 (164-328)||(22353835-22353999)
chr4 (181-311)||(21815602-21815731)
chr4 (164-327)||(7641192-7641344)
chr4 (254-326)||(12774011-12774084)
chr4 (158-315)||(52243143-52243302)
chr4 (212-315)||(12288211-12288316)
chr4 (158-315)||(43198502-43198661)
chr4 (254-326)||(8846360-8846433)
chr4 (231-324)||(20149832-20149924)
chr4 (155-226)||(15121749-15121819)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (2-330)||(3470-3797)
scaffold0292 (2-330)||(343-670)
[»] chr3 (80 HSPs)
chr3 (2-330)||(13442274-13442601)
chr3 (2-330)||(20698230-20698556)
chr3 (2-330)||(17487856-17488184)
chr3 (24-330)||(17499338-17499643)
chr3 (2-330)||(26686887-26687214)
chr3 (2-330)||(23083155-23083482)
chr3 (3-330)||(43840932-43841258)
chr3 (2-330)||(12399209-12399533)
chr3 (2-326)||(14576626-14576949)
chr3 (2-330)||(25476178-25476506)
chr3 (2-330)||(18438534-18438862)
chr3 (2-317)||(14572602-14572916)
chr3 (2-330)||(14972854-14973182)
chr3 (2-327)||(40213514-40213838)
chr3 (2-330)||(11424556-11424880)
chr3 (25-315)||(30029855-30030143)
chr3 (127-327)||(24153128-24153326)
chr3 (44-312)||(42386428-42386696)
chr3 (2-207)||(16796670-16796874)
chr3 (164-327)||(17672626-17672788)
chr3 (164-327)||(29172583-29172745)
chr3 (164-327)||(7781347-7781509)
chr3 (164-327)||(9707607-9707769)
chr3 (164-327)||(17463178-17463340)
chr3 (164-327)||(34159326-34159488)
chr3 (164-327)||(45606907-45607069)
chr3 (164-327)||(55476491-55476653)
chr3 (181-327)||(28848628-28848773)
chr3 (164-327)||(8899094-8899256)
chr3 (164-327)||(16454281-16454443)
chr3 (164-327)||(38961891-38962053)
chr3 (164-327)||(13151790-13151953)
chr3 (164-327)||(13154255-13154418)
chr3 (164-328)||(13544024-13544187)
chr3 (164-325)||(41123892-41124049)
chr3 (164-327)||(6469134-6469296)
chr3 (164-327)||(10247723-10247885)
chr3 (164-323)||(12567564-12567722)
chr3 (164-327)||(17446655-17446816)
chr3 (164-327)||(50242822-50242984)
chr3 (213-327)||(55500942-55501055)
chr3 (164-325)||(16282811-16282971)
chr3 (204-327)||(36166598-36166719)
chr3 (183-330)||(43550497-43550644)
chr3 (147-328)||(46822267-46822449)
chr3 (231-327)||(12119792-12119887)
chr3 (231-327)||(15412429-15412524)
chr3 (196-327)||(15977515-15977645)
chr3 (164-311)||(53070653-53070799)
chr3 (231-327)||(8499518-8499613)
chr3 (231-327)||(44494809-44494904)
chr3 (231-327)||(10556985-10557080)
chr3 (204-316)||(21618460-21618570)
chr3 (162-328)||(12511059-12511226)
chr3 (254-326)||(16103784-16103857)
chr3 (231-327)||(17737236-17737334)
chr3 (158-311)||(52523676-52523831)
chr3 (196-327)||(27165250-27165381)
chr3 (232-330)||(13210350-13210448)
chr3 (204-326)||(16097332-16097454)
chr3 (254-326)||(9512924-9512997)
chr3 (254-326)||(9520899-9520972)
chr3 (254-326)||(12174303-12174376)
chr3 (127-207)||(14179555-14179634)
chr3 (207-330)||(14234487-14234610)
chr3 (211-326)||(15470928-15471043)
chr3 (275-327)||(45577948-45578000)
chr3 (186-327)||(53301527-53301669)
chr3 (277-327)||(28194693-28194743)
chr3 (254-323)||(32307684-32307754)
chr3 (158-330)||(24340672-24340844)
chr3 (254-326)||(49668120-49668193)
chr3 (254-323)||(1644718-1644787)
chr3 (158-330)||(37642214-37642386)
chr3 (185-312)||(23274705-23274832)
chr3 (55-92)||(12339988-12340025)
chr3 (260-309)||(13919350-13919399)
chr3 (260-311)||(22110402-22110454)
chr3 (211-311)||(37251168-37251270)
chr3 (260-311)||(43925977-43926029)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (2-330)||(843-1169)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (2-330)||(167773-168099)
scaffold0011 (2-330)||(51913-52239)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (2-330)||(13211-13538)
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (2-330)||(27250523-27250850)
chr1 (2-330)||(21026680-21027007)
chr1 (2-330)||(22532269-22532597)
chr1 (2-329)||(50210006-50210333)
chr1 (2-253)||(22354366-22354616)
chr1 (2-327)||(34509783-34510108)
chr1 (2-329)||(20135188-20135515)
chr1 (4-219)||(22355969-22356185)
chr1 (4-219)||(22357655-22357871)
chr1 (2-330)||(38801185-38801508)
chr1 (127-329)||(22468616-22468816)
chr1 (6-116)||(20847017-20847127)
chr1 (164-327)||(13988866-13989028)
chr1 (164-327)||(21923291-21923453)
chr1 (164-327)||(23593735-23593897)
chr1 (164-330)||(45574842-45575008)
chr1 (164-327)||(16275363-16275526)
chr1 (164-327)||(21475087-21475249)
chr1 (164-327)||(31612313-31612475)
chr1 (164-327)||(433012-433172)
chr1 (164-328)||(21840766-21840929)
chr1 (239-330)||(20847184-20847275)
chr1 (164-327)||(29298137-29298298)
chr1 (164-327)||(29776688-29776850)
chr1 (231-333)||(21342090-21342191)
chr1 (231-327)||(21346961-21347056)
chr1 (196-327)||(21707167-21707297)
chr1 (196-327)||(21711709-21711839)
chr1 (164-329)||(16361915-16362079)
chr1 (155-282)||(33797569-33797694)
chr1 (233-333)||(15860078-15860177)
chr1 (231-330)||(13212929-13213027)
chr1 (158-311)||(21861519-21861672)
chr1 (158-311)||(21896205-21896358)
chr1 (164-327)||(22123067-22123230)
chr1 (262-329)||(20454606-20454673)
chr1 (204-326)||(22921864-22921986)
chr1 (254-323)||(21754052-21754122)
chr1 (254-326)||(20248283-20248356)
chr1 (127-207)||(48603637-48603716)
chr1 (241-326)||(21714546-21714631)
chr1 (181-311)||(35261053-35261180)
chr1 (231-324)||(40389157-40389249)
chr1 (232-330)||(14295574-14295672)
chr1 (204-326)||(33681011-33681133)
chr1 (254-315)||(52928014-52928076)
chr1 (155-303)||(21787988-21788136)
chr1 (232-314)||(20918620-20918702)
chr1 (204-326)||(22237631-22237753)
chr1 (254-315)||(16758664-16758726)
chr1 (277-326)||(21161720-21161769)
chr1 (260-311)||(21533923-21533974)
chr1 (260-311)||(50614167-50614219)
chr1 (260-311)||(50621995-50622047)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (2-330)||(5915-6245)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (4-330)||(1851-2176)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (2-330)||(38761-39088)
scaffold0145 (127-330)||(32942-33143)
scaffold0145 (231-332)||(9744-9844)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (3-327)||(22886-23209)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (2-312)||(24095-24406)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (2-330)||(8326-8650)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (2-330)||(20910-21238)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (6-330)||(4849-5171)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (2-330)||(8479-8802)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (2-330)||(39913-40240)
scaffold0080 (211-311)||(19885-19987)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (2-330)||(1952-2279)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (2-330)||(10220-10544)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (2-272)||(13150-13419)
scaffold0175 (255-330)||(34123-34199)
scaffold0175 (275-330)||(273-328)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (2-330)||(15259-15584)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (2-323)||(25858-26179)
scaffold0122 (204-327)||(44702-44825)
scaffold0122 (2-177)||(33288-33463)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (2-330)||(13497-13822)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (2-328)||(39479-39804)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (2-328)||(75008-75333)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (12-330)||(25896-26213)
scaffold0026 (2-330)||(39858-40184)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (2-330)||(32067-32391)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (2-329)||(17008-17337)
scaffold0056 (181-311)||(79301-79430)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (44-330)||(2987-3271)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (2-240)||(124675-124912)
scaffold0021 (261-330)||(121766-121835)
scaffold0021 (159-329)||(174767-174936)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (2-330)||(4712-5039)
scaffold0358 (2-265)||(1-263)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (2-327)||(339744-340065)
scaffold0003 (164-327)||(158450-158612)
scaffold0003 (155-282)||(71349-71474)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (2-271)||(6669-6937)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (2-330)||(4508-4835)
scaffold0228 (2-330)||(12090-12417)
scaffold0228 (2-330)||(22042-22369)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (2-330)||(16393-16721)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (2-330)||(846-1170)
[»] scaffold0120 (5 HSPs)
scaffold0120 (5-330)||(32755-33077)
scaffold0120 (5-330)||(45928-46250)
scaffold0120 (231-330)||(16113-16212)
scaffold0120 (7-85)||(16331-16410)
scaffold0120 (275-330)||(17395-17450)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (2-330)||(46995-47313)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (2-330)||(16282-16606)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (2-330)||(7266-7590)
scaffold0106 (2-330)||(1289-1613)
scaffold0106 (262-327)||(15291-15356)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (2-330)||(51582-51906)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (192-330)||(28414-28552)
scaffold0046 (232-330)||(1997-2095)
scaffold0046 (232-330)||(11292-11390)
scaffold0046 (277-330)||(4552-4605)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (127-329)||(3105-3306)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (2-309)||(4545-4851)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (2-327)||(4925-5246)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (11-150)||(17790-17929)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (2-207)||(1037-1241)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (5-271)||(759-1021)
scaffold0395 (264-330)||(4888-4954)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (2-249)||(27911-28158)
scaffold0130 (294-329)||(27878-27913)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (208-330)||(11442-11564)
scaffold0235 (2-145)||(11307-11450)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (2-171)||(3640-3808)
scaffold0165 (2-171)||(7704-7872)
scaffold0165 (158-315)||(27698-27855)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (2-311)||(51678-51985)
scaffold0034 (231-330)||(32538-32635)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (164-327)||(20747-20909)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (164-327)||(37821-37983)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (164-327)||(94411-94573)
scaffold0023 (164-323)||(17440-17598)
scaffold0023 (181-327)||(44454-44600)
scaffold0023 (203-326)||(100378-100501)
scaffold0023 (254-326)||(101503-101576)
scaffold0023 (259-330)||(119875-119947)
scaffold0023 (283-326)||(40248-40291)
scaffold0023 (159-326)||(38429-38596)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (181-327)||(13392-13537)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (164-327)||(4694-4856)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (164-327)||(13947-14109)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (164-327)||(82072-82234)
scaffold0037 (204-315)||(22665-22776)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (164-327)||(136680-136842)
scaffold0028 (164-327)||(139149-139311)
scaffold0028 (164-327)||(144087-144249)
scaffold0028 (164-327)||(134211-134373)
scaffold0028 (164-327)||(141618-141780)
scaffold0028 (232-328)||(62200-62296)
scaffold0028 (277-326)||(132662-132711)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (183-315)||(8481-8613)
scaffold0621 (204-330)||(6535-6661)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (164-329)||(11286-11450)
scaffold0029 (155-226)||(12861-12931)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (164-324)||(4300-4459)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (164-328)||(10772-10935)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (2-137)||(20595-20730)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (164-327)||(16784-16946)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (163-330)||(128751-128917)
scaffold0031 (164-311)||(20379-20524)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (164-323)||(501088-501246)
scaffold0001 (231-327)||(85647-85742)
scaffold0001 (254-326)||(160688-160761)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (155-282)||(15362-15487)
scaffold0107 (262-311)||(36199-36248)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (231-324)||(1348-1440)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (164-327)||(12064-12220)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (164-327)||(106-268)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (164-327)||(40400-40562)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (164-329)||(12249-12413)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (164-328)||(9241-9404)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (165-326)||(29558-29720)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (5-170)||(10323-10488)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (103-267)||(3424-3588)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (164-327)||(4214-4377)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (204-327)||(116430-116551)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (231-313)||(29946-30027)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (254-330)||(6611-6688)
scaffold0333 (254-330)||(13991-14068)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (254-330)||(6167-6244)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (254-330)||(15821-15898)
scaffold0020 (277-326)||(178898-178947)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (164-327)||(161089-161252)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (204-326)||(133-255)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (158-311)||(13147-13301)
scaffold0357 (158-315)||(16049-16206)
scaffold0357 (260-311)||(2680-2732)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (232-330)||(1092-1190)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (259-330)||(1083-1155)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (232-327)||(15664-15759)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (231-327)||(2196-2291)
scaffold0247 (158-330)||(17976-18148)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (254-326)||(28813-28887)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (204-326)||(19268-19390)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (158-311)||(53498-53651)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (186-327)||(38679-38820)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (161-303)||(29117-29262)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (254-326)||(1086-1159)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (204-311)||(1051-1158)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (207-330)||(12766-12889)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (259-326)||(2694-2762)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (207-326)||(12943-13062)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (204-326)||(2801-2923)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (205-311)||(12587-12693)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (204-318)||(129917-130031)
scaffold0010 (181-311)||(60687-60818)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (204-326)||(14692-14814)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (158-330)||(11464-11636)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (155-326)||(26828-26996)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (241-326)||(23843-23928)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (277-326)||(45860-45909)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (158-330)||(38205-38377)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (204-315)||(10536-10647)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (204-318)||(5655-5769)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (232-326)||(32102-32197)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (263-326)||(36454-36517)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (254-315)||(8118-8180)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (254-326)||(23927-24000)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (211-315)||(10542-10646)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (158-309)||(8008-8161)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (253-315)||(25121-25184)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (159-326)||(1881-2045)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (254-318)||(6824-6889)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (241-326)||(19980-20065)
scaffold0139 (211-307)||(38339-38437)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (275-311)||(11982-12018)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (2-51)||(182-232)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (158-272)||(225466-225578)
scaffold0012 (44-92)||(225644-225692)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (260-309)||(206575-206624)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (241-326)||(69794-69879)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (159-326)||(4754-4921)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20536535 - 20536208
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||||||    
T  20536535 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttattaggttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagtgttgaaccttggggtagtattaagac 20536436  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||  | |||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20536435 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtc-gattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatattt 20536337  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20536336 gaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgag 20536237  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536236 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 18818203 - 18818530
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || |||||| ||||||||    
T  18818203 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaatttagggtagtattaagac 18818302  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  18818303 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatt 18818401  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    |||||||||||||| || ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18818402 gaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 18818501  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818502 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 21918794 - 21919121
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||  ||||||||    
T  21918794 tctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacccttgggtaagattaagac 21918893  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaat-att 200  Q
    |||| || || |||| |||    | ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  21918894 ttaacgatgaggttaattacgatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctg-ctgattatgatgtgatataatgttta-tgcattacttgaagaattatt 21918991  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21918992 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 21919091  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21919092 gtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 18879031 - 18879352
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||||    
T  18879031 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcggcctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcatcaagac 18879130  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| |||||||  ||||  | ||||||||| | |||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18879131 ttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgat-aagatgtgctgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatattt 18879228  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18879229 gaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 18879323  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18879324 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 21923722 - 21924049
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||    
T  21923722 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcccgagtagttgagagttgaaccttgaggtagtattaagac 21923821  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||  | |||| ||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  21923822 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgt-tgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaagtataatt 21923920  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21923921 gaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 21924020  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21924021 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22627063 - 22626736
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggtttt-gcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  22627063 tctcgcctcgcgagtgatctagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgaga 22626964  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |   |||||||||||| ||| |    
T  22626963 cttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatga-tgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataat 22626865  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22626864 tgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 22626766  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626765 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 7373088 - 7372778
Alignment:
Q  11 gcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaag 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| | | | ||||||||||| |    
T  7373088 gcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtggtagtgagacttaatgagg 7372989  T
Q  111 atgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatattta 210  Q
    |||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||        ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  7372988 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgttgtgatataa--------gcattacttgaagtataattgaatattta 7372898  T
Q  211 agatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaa 310  Q
    ||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372897 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 7372798  T
Q  311 gttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7372797 gttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23406708 - 23406379
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| || || ||  |||  |||    
T  23406708 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggttttgtgacctttgttgcacgagttattgagagttgaactttgggataatattgggac 23406609  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||    |||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  23406608 ttaatgaggatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatgt-tgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatt 23406510  T
Q  202 gaatatttaagatgtt--gatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatg 299  Q
    |||||||||||||| |  | ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  23406509 gaatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 23406410  T
Q  300 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406409 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 23648881 - 23648554
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttt-tgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  23648881 tctcgcctcgtgagtaacccagaaacagagtgacttgttaggtttatgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaaga 23648782  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    | |||||| ||||||| |||||  | || |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  |    
T  23648781 cctaatgatgatgttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttat 23648683  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||  | |||||  ||||||||| |||||||    
T  23648682 tgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatga 23648583  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 329  Q
    ||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  23648582 gtcagtctaagttgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 31971577 - 31971257
Alignment:
Q  7 cctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaat 106  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  31971577 cctcgcgagcgacccagaaatagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagctgaacctttgggtaggattaagacttaac 31971478  T
Q  107 gaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaata 206  Q
     | || |||| |||||  | |||||| ||| |||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  31971477 aatgaggttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttg-ttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtata 31971380  T
Q  207 tttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggt 306  Q
      |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31971379 cataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 31971281  T
Q  307 ctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  31971280 ctaagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 330
Target Start/End: Original strand, 45130793 - 45131117
Alignment:
Q  3 ctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagact 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| |||||||||    
T  45130793 ctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttattagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagact 45130892  T
Q  103 taatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttg 202  Q
    |||| | || |||| |||||  | |||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  45130893 taataatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttga-tgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttgaagaataattg 45130990  T
Q  203 aatatttaagatgttgatgaa-ttgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
     |||  ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  45130991 tatacctaagatgttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 45131088  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||    
T  45131089 tcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 329
Target Start/End: Original strand, 28648837 - 28649164
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  28648837 tctcgccttgcgcatgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgaga 28648936  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||  ||       
T  28648937 cttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaa 28649035  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || ||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  28649036 tgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatga 28649135  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649136 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 16199440 - 16199765
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  16199440 tctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgacttattggattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagac 16199539  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||  | || |||| |||||  | |||||||||| |||||| | ||| ||  |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  16199540 ttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttg-ttgattatgatgtaatataatg-tttatgcattacttgaagaatattt 16199637  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    | |||  |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||  |||| |||||| |||||||  || ||||| ||||||||||||||||||    
T  16199638 gtatacctaagatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 16199735  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16199736 gtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6759584 - 6759255
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||| |||| ||||| | ||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  6759584 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggattttgcaatctgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgaga 6759485  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgttt-aagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatat 199  Q
    |||||||| ||||||| |||||  | |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||  ||      
T  6759484 cttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattgaattatga 6759386  T
Q  200 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatg 299  Q
     || ||| || |||||||||    |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  6759385 gtgtataattgagatgttgac---ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 6759289  T
Q  300 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759288 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 16092134 - 16092463
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||| |  |||  ||| ||||||| ||| ||||||||| |||||  ||| |||    
T  16092134 tctcgcctcccgagtgacccagaaacagagtgccctgttaggattttgcgatctgtgtcacacaagttgttaagagttgaaccttggggtaatattgaga 16092233  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctg-tttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatat 199  Q
    ||||| || ||||||| |||||    | |||| || |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||  ||      
T  16092234 cttaaggatgatgttaattataatatgcgaagttgttttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattatga 16092332  T
Q  200 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatg 299  Q
     || |||||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  16092333 atgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 16092432  T
Q  300 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092433 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22875393 - 22875065
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggt-tttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||| |||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  22875393 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagggctttgcgatctatgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgaga 22875294  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgttt-aagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatat 199  Q
      |||||  ||||||| |||||  | |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||      
T  22875293 tgtaatggtgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatga 22875195  T
Q  200 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatg 299  Q
     || |||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  || || | |||||||||||||||||    
T  22875194 atgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatg 22875096  T
Q  300 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22875095 agtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 25362934 - 25363138
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||| ||  ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  25362934 tctcgcctcgagagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgcgacctttcttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagac 25363033  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    |||||||||| | || |||||  | ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  | |||||    
T  25363034 ttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttg-ttgattatgatgtggtataatgttttatgcattacttgagaattattt 25363132  T
Q  202 gaatat 207  Q
    ||||||    
T  25363133 gaatat 25363138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 155 - 330
Target Start/End: Original strand, 21389399 - 21389571
Alignment:
Q  155 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgttt 254  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||     
T  21389399 tgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt- 21389496  T
Q  255 ttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
      ||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21389497 --gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 155 - 330
Target Start/End: Original strand, 21395929 - 21396101
Alignment:
Q  155 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgttt 254  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||||||||||     
T  21395929 tgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt- 21396026  T
Q  255 ttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21396027 --gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 155 - 330
Target Start/End: Original strand, 21778725 - 21778897
Alignment:
Q  155 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgttt 254  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||     
T  21778725 tgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt- 21778822  T
Q  255 ttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
      ||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21778823 --gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 155 - 330
Target Start/End: Original strand, 21790422 - 21790594
Alignment:
Q  155 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgttt 254  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||||||||||     
T  21790422 tgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt- 21790519  T
Q  255 ttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21790520 --gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 14409444 - 14409606
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409444 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14409543  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    | || ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14409544 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 1484564 - 1484402
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484564 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 1484465  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1484464 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 5853292 - 5853454
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853292 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 5853391  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5853392 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 323
Target Start/End: Original strand, 16413316 - 16413474
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413316 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16413415  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 323  Q
    | || ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16413416 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20403389 - 20403227
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20403290  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20403289 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22001915 - 22001753
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001915 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22001816  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22001815 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 41598350 - 41598188
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598350 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41598251  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
      || ||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41598250 -actgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4483442 - 4483281
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483442 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 4483343  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4483342 g-ttgtgttgctgttgtt-attaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 4542373 - 4542535
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  4542373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatctt 4542472  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4542473 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 15203231 - 15203393
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203231 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15203330  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15203331 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 20046195 - 20046357
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20046195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 20046294  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20046295 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 147 - 328
Target Start/End: Original strand, 18678039 - 18678221
Alignment:
Q  147 ttgatgactgattatgatgtgatataatgttt-tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtc 245  Q
    ||||||| ||| || ||||||||| | ||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  18678039 ttgatgattgaataagatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtc 18678138  T
Q  246 atgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 328  Q
     |||||||  ||||  ||||||||| |  | ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  18678139 ttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 147 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 32121916 - 32121734
Alignment:
Q  147 ttgatgactgattatgatgtgatataatgttt-tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtc 245  Q
    ||||||| ||| || ||||||||| | ||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  32121916 ttgatgattgaataagatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtc 32121817  T
Q  246 atgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 328  Q
     |||||||  ||||  ||||||||| |  | ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  32121816 ttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 19896430 - 19896265
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattat---gtcatgctgtttttgtat 260  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  19896430 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtat 19896331  T
Q  261 actgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    || |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19896330 accgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 14823935 - 14823774
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14823935 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14823836  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | |||| |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  14823835 g-ttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatgatga 14823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 323
Target Start/End: Original strand, 45290762 - 45290853
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45290762 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 333
Target Start/End: Original strand, 19937073 - 19937174
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  19937073 tgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagt 19937171  T
Q  331 cca 333  Q
    |||    
T  19937172 cca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 25484275 - 25484430
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25484275 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25484374  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
      |        ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25484375 agc--------tgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 254 - 326
Target Start/End: Original strand, 26355742 - 26355815
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26355742 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 207 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6520491 - 6520368
Alignment:
Q  207 tttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcgg 305  Q
    |||| ||||||||||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  6520491 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 6520393  T
Q  306 tctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  6520392 tctaagttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15070653 - 15070571
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070653 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 232 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 17141014 - 17140916
Alignment:
Q  232 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17141014 gatattattatgtcatgatggatt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 204 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 26219838 - 26219717
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtc 303  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| | |||   ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26219838 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 26219741  T
Q  304 ggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||| | ||||||||    
T  26219740 ggtctaagttgattatgatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 204 - 330
Target Start/End: Original strand, 38855246 - 38855372
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagt 302  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  38855246 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 38855344  T
Q  303 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  38855345 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21491092 - 21490995
Alignment:
Q  233 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21491092 atattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 330
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612231
Alignment:
Q  158 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||| | | || |  | ||||||||||| ||||| |||||| |    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-g 17612157  T
Q  258 tatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
     |||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  17612158 catactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 26224081 - 26223917
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | ||||||| || ||  |||| |||||| || |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  26224081 tgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatatt 26223982  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 329  Q
    | || | ||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  26223981 g-ctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatg 26223917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285601
Alignment:
Q  211 agatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtcta 309  Q
    |||||||| ||| |||||  ||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtcta 21285618  T
Q  310 agttgatgaagatgatg 326  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  21285617 agttgattaagaagatg 21285601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 232 - 330
Target Start/End: Original strand, 5866297 - 5866395
Alignment:
Q  232 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5866297 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 204 - 327
Target Start/End: Original strand, 26225288 - 26225409
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtc 303  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | |||   ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26225288 atatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 26225385  T
Q  304 ggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  26225386 ggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 283 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21249431 - 21249384
Alignment:
Q  283 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21249431 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 283 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21255269 - 21255222
Alignment:
Q  283 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21255269 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 311
Target Start/End: Original strand, 19801399 - 19801527
Alignment:
Q  181 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgt 280  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||  | ||||    
T  19801399 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ttgtgttgctattgt 19801496  T
Q  281 tgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801497 tatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20498734 - 20498581
Alignment:
Q  158 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    |||| ||||||||||||  | | | |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||  ||||     
T  20498734 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct-atttta 20498636  T
Q  258 tatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
     ||||||||||||||  || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20498635 catactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 326
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760961
Alignment:
Q  259 atactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 23760961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 315
Target Start/End: Original strand, 983450 - 983512
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 315  Q
    |||| ||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983450 tttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 323
Target Start/End: Original strand, 13508034 - 13508199
Alignment:
Q  158 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| | | ||||    ||||||||||| ||||| |||| | |    
T  13508034 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgt-g 13508132  T
Q  258 tatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 323  Q
     ||| ||||||||||  || |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  13508133 catattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21673830 - 21673716
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagt 302  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||||||    
T  21673830 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagt 21673732  T
Q  303 cggtctaagttgatga 318  Q
    ||||||||||||||||    
T  21673731 cggtctaagttgatga 21673716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 323
Target Start/End: Original strand, 13597566 - 13597731
Alignment:
Q  158 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||| | | ||||    ||||||||||| ||||| |||||| |    
T  13597566 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgtttt-g 13597664  T
Q  258 tatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 323  Q
     || |||| ||||||  || |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  13597665 cattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525579
Alignment:
Q  260 tactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtcta 309  Q
    ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 22525579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 311
Target Start/End: Original strand, 17267044 - 17267096
Alignment:
Q  260 tactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267044 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 303
Target Start/End: Original strand, 23776785 - 23776929
Alignment:
Q  159 tatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| |||| || || ||||||||  | ||||||||| | |||    
T  23776785 tatgatgttatataatgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtcatgctgatgttg 23776883  T
Q  258 tatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtc 303  Q
    |   ||||||||| |  | | ||| |||||||||| ||||||||||    
T  23776884 tgatctgcctatgctgctatagttatttaactaagttgcatgagtc 23776929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 311
Target Start/End: Original strand, 17439557 - 17439609
Alignment:
Q  260 tactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17439557 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24353091 - 24353039
Alignment:
Q  260 tactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    |||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353091 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28397617 - 28397569
Alignment:
Q  263 tgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28397617 tgcctatgttgttgttgtctattaattaagctgcatgagtcggtctaag 28397569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 37116418 - 37116366
Alignment:
Q  260 tactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    |||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116418 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 62)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 22737974 - 22738300
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22737974 tctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggggtagtattaagac 22738073  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22738074 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatattt 22738172  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22738173 gaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatgttgttatttaactaagctgcatgag 22738271  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22738272 tcggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23286188 - 23285865
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  23286188 tctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcatgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagac 23286089  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  23286088 ttaatgaagatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttg-ttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacattt 23285990  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23285989 gaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt----ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 23285894  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285893 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 22731027 - 22731355
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttggg-tagcattaaga 100  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  22731027 tctcgcctcacgagtcacccagaaacagagtgccttgttaggttttgcgatctttgttgcacgagctgttgataattgaaccttgggggtagtattaaga 22731126  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22731127 cttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatt 22731225  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22731226 tgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 22731325  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22731326 gtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Original strand, 23654188 - 23654507
Alignment:
Q  10 cgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654188 cgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaa 23654287  T
Q  110 gatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatattt 209  Q
    || |||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  23654288 gaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgt-taattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatattt 23654386  T
Q  210 aagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtcta 309  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23654387 aagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23654486  T
Q  310 agttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  23654487 agttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23076769 - 23076442
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  ||     
T  23076769 tctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggat 23076670  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    || |||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  23076669 tttatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatt 23076571  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23076570 gaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 23076471  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23076470 tcggtctaagtggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 327
Target Start/End: Original strand, 298608 - 298933
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  298608 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagac 298707  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    |||||||||| ||||  ||||    |||||||||| |||||||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||    
T  298708 ttaatgaagaggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttg-ttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattattt 298806  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||    
T  298807 gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 298906  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  298907 gtcggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 25 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23060815 - 23060513
Alignment:
Q  25 aacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttatata 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||| |    
T  23060815 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgtt-cacgagttgttgagaattgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattata-a 23060718  T
Q  125 ccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaat 224  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| |    
T  23060717 ttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 23060619  T
Q  225 tgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 324  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060618 tgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 23060519  T
Q  325 tgatgt 330  Q
    ||||||    
T  23060518 tgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 37910 - 38235
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  37910 tctcgcctcgcgagcgacccagaaacatagtgacttgttagactttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagac 38009  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||  | || |||| |||||  |  ||||||||| |||||  | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  38010 ttaacaatgaggttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgt-tgattatgatgtgatataatgttta-tgcattacttgaagaatgttt 38107  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    | |||  ||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  38108 gtatacataagatgatgatgaatcgaaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 38206  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38207 tcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22337443 - 22337115
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggtttt-gcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||    
T  22337443 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtagtattaaga 22337344  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||    |||||| |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||       
T  22337343 cttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaa 22337245  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || |||||| |||||||| ||  |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22337244 tgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 22337145  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337144 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23660350 - 23660023
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggtttt-gcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  23660350 tctcgcctcgtgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggtttttgtgacctttattgcacgagttattgagagttgaaccttggggtagtattgaga 23660251  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||| ||| ||||||| |||||    || |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||   ||  |    
T  23660250 cttattgatgatgttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgat 23660152  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||    
T  23660151 tgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttc-gtatactgcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatga 23660053  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23660052 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20309432 - 20309108
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  20309432 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgacttgttagattttgcgacccttgttgcacgatttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagac 20309333  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||  | || ||||  ||||  | |||||||||  |||||| | ||| ||  ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20309332 ttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgt-tgattatgatgtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatattt 20309235  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt-attgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    | |||  |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  20309234 gtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatga 20309138  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20309137 gtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22105575 - 22105412
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22105575 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 22105476  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22105475 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 27753902 - 27753730
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||| ||| || ||||||||||||    
T  27753902 tctcgcctcgcaagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgaccttcgttgcacgagttgtcgagagttgaagcttgggatagcattaagac 27753803  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatg 175  Q
    ||||||| ||||||| |||||    ||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27753802 ttaatgatgatgttaattataatatgtgaaactgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatg 27753730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 164 - 329
Target Start/End: Original strand, 32214921 - 32215085
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214921 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32215020  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 329  Q
    | || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32215021 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 324
Target Start/End: Original strand, 21155060 - 21155219
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155060 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21155159  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 324  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21155160 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18809105 - 18808943
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809105 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18809006  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18809005 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23131024 - 23130862
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131024 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23130925  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23130924 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23133491 - 23133329
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23133392  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23133391 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 23709532 - 23709694
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709532 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23709631  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23709632 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 23712013 - 23712175
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712013 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23712112  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23712113 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 26505541 - 26505379
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26505541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26505442  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    || | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26505441 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 26508019 - 26507857
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26508019 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26507920  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    || | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26507919 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 32039498 - 32039660
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039498 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32039597  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  32039598 g-ttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 34402522 - 34402684
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402522 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34402621  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34402622 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 39682475 - 39682313
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39682376  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39682375 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 181 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23135735 - 23135590
Alignment:
Q  181 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgt 280  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||    
T  23135735 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgt 23135637  T
Q  281 tgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23135636 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 103
Target Start/End: Original strand, 32451723 - 32451824
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  32451723 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagatgaaccttggggtagcattaagac 32451822  T
Q  102 tt 103  Q
    ||    
T  32451823 tt 32451824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 571559 - 571397
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||| | || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571559 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 571460  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  571459 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 6726157 - 6725995
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726157 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6726058  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6726057 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24367936 - 24367774
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367936 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24367837  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24367836 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 181 - 327
Target Start/End: Original strand, 45029871 - 45030016
Alignment:
Q  181 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgt 280  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  | |||| |||||||    
T  45029871 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgt-tgtgttgttgttgt 45029969  T
Q  281 tgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45029970 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 24898195 - 24898358
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24898294  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24898295 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 24900678 - 24900841
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900678 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24900777  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24900778 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 24903155 - 24903318
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903155 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24903254  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24903255 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 24905632 - 24905795
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905632 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24905731  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24905732 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 24908107 - 24908270
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908107 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24908206  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24908207 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 127 - 330
Target Start/End: Original strand, 23708537 - 23708738
Alignment:
Q  127 gtgaagctgtt-taagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 225  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||  || |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||||||||| ||| |||||| ||||| ||    
T  23708537 gtgaagctgttataagatgaattgatgt-tgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgattt 23708635  T
Q  226 gcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgt-tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 324  Q
    |||| ||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||  | | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  23708636 gcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga--aagatga 23708732  T
Q  325 tgatgt 330  Q
    ||||||    
T  23708733 tgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 330
Target Start/End: Original strand, 23103399 - 23103516
Alignment:
Q  211 agatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaa 310  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103399 agatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23103496  T
Q  311 gttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    | || |||||||||||||||    
T  23103497 gatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 231 - 327
Target Start/End: Original strand, 24529596 - 24529691
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24529596 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28577261 - 28577099
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||  |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28577261 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 28577162  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  |  |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28577161 gt-tgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 164 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 43137461 - 43137301
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||| | || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  43137461 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 43137362  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 325  Q
     | | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43137361 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 253 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946657
Alignment:
Q  253 ttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 25616369 - 25616192
Alignment:
Q  147 ttgatgactgattatgatgtgatataatgttt-tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtc 245  Q
    ||||||| ||| || ||||||||| | || || ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  25616369 ttgatgattgaataagatgtgatacattgattatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtc 25616270  T
Q  246 atgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 323  Q
     |||||||  ||||  ||||||||| |  | ||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  25616269 ttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 25616192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 38967537 - 38967374
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 262  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || |||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  38967537 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatat 38967438  T
Q  263 tgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||  | |||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38967437 tgt-tgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 330
Target Start/End: Original strand, 23040255 - 23040310
Alignment:
Q  275 tgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040255 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 232 - 330
Target Start/End: Original strand, 23071972 - 23072070
Alignment:
Q  232 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23071972 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 204 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28406103 - 28405981
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagt 302  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  28406103 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagt 28406004  T
Q  303 cggtctaagttgatgaagatgat 325  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  28406003 cggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 324
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643109
Alignment:
Q  248 gctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 324  Q
    |||||||||||||||||  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactga-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 254 - 329
Target Start/End: Original strand, 22134251 - 22134326
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 329  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  22134251 tttgcatactgcctatgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 311
Target Start/End: Original strand, 7707 - 7835
Alignment:
Q  183 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattg-ttgtt 281  Q
    |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||  || |||||    
T  7707 cattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtt 7805  T
Q  282 gtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
      ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7806 tattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 254 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 7679662 - 7679589
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  7679662 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 19672001 - 19671830
Alignment:
Q  158 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||||| | ||||||| | | ||||    ||||||||||| ||||| |||||| |    
T  19672001 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattga-gatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgtttt-g 19671904  T
Q  258 tatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
     ||||||||||||||  || |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  19671903 catactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 311
Target Start/End: Original strand, 32451950 - 32452031
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||  |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32451950 tgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 25175976 - 25175854
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagt 302  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  25175976 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaat 25175878  T
Q  303 cggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  25175877 ctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 315
Target Start/End: Original strand, 18786947 - 18787009
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 315  Q
    |||| ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786947 tttgcatactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 303
Target Start/End: Original strand, 22799076 - 22799220
Alignment:
Q  159 tatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| |||| || || ||||||||| | |||||| |||| |||    
T  22799076 tatgatgtgatataatgttatgtgccttactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgatgttgttg 22799174  T
Q  258 tatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtc 303  Q
    |   ||||||||| |  | ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22799175 tgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 22799220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  260 tactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtcta 309  Q
    |||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 326
Target Start/End: Original strand, 23019656 - 23019823
Alignment:
Q  159 tatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| |||| || || ||||||||| | |||||| |||| |||    
T  23019656 tatgatgtgatataacgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgttgttgttg 23019754  T
Q  258 tatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |   ||||||||| |  | ||||| |||||||||| |  |||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  23019755 tgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttttatgagtcaatataagatgattaagatgatg 23019823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  261 actgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtcta 309  Q
    ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 253 - 311
Target Start/End: Original strand, 22413181 - 22413240
Alignment:
Q  253 ttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22413181 ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 253 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23207355 - 23207296
Alignment:
Q  253 ttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    |||| |||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207355 ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25108958 - 25108906
Alignment:
Q  260 tactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25108958 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 25108906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 64)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 8286636 - 8286964
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  8286636 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcttgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagac 8286735  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  8286736 ttaatgaagatgttaattatattatgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgttt 8286834  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctg-tttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  8286835 gattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 8286934  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286935 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25421860 - 25421532
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  25421860 tctcgcctcgcgagtgacctagaaaccgagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagcattgaga 25421761  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  25421760 cttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataat 25421662  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  25421661 tgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 25421562  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421561 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 330
Target Start/End: Original strand, 23390292 - 23390617
Alignment:
Q  4 tcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagactt 103  Q
    ||||||| |||||||| |  |||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| ||||||||||    
T  23390292 tcgcctcacgagtgaccctaaaacagagtgccttgttagattttgtgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagtattaagactt 23390391  T
Q  104 aatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttga 203  Q
    ||||| ||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23390392 aatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttga 23390490  T
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23390491 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 23390590  T
Q  304 ggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  23390591 ggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22075346 - 22075018
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaa-cagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22075346 tctcgcctcgcgagtgacccagaaaacagagtgacttgttag-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaaga 22075248  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||    ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||    
T  22075247 cttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgt-tgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatt 22075149  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22075148 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatga 22075049  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaag-atgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22075048 gtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25431722 - 25431395
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||    
T  25431722 tctcacctcgcgagtgacccagaaatcgagtgccttgttaggattttgcgacctttgttacacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagcattgaga 25431623  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  25431622 cttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataat 25431524  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  25431523 tgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatga 25431424  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25431423 gtcggtctaa-tttatgaagatgatgatgt 25431395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 24493894 - 24493569
Alignment:
Q  4 tcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggtttt-gcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagact 102  Q
    |||||||| |||| || || |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  24493894 tcgcctcgtgagtaacccataaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagact 24493795  T
Q  103 taatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttg 202  Q
    |||| | ||||||| |||||  | |||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||    
T  24493794 taataatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattg 24493696  T
Q  203 aatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagt 302  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||  ||||| |||||||||||||    
T  24493695 aatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagt 24493597  T
Q  303 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24493596 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13025637 - 13025311
Alignment:
Q  3 ctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggtttt-gcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  13025637 ctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagac 13025538  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||    |||||| |||||||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||| ||    
T  13025537 ttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgt-tgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataatt 13025439  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||  |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||    
T  13025438 gaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgag 13025340  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13025339 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13095821 - 13095495
Alignment:
Q  3 ctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggtttt-gcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  13095821 ctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagtattaagac 13095722  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||    |||||| |||||||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||| ||    
T  13095721 ttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgt-tgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataatt 13095623  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||  |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||    
T  13095622 gaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgag 13095524  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13095523 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24529548 - 24529223
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggtttt-gcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| | |    
T  24529548 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcactagtagttgagagttgaaccttggggtagtattgaaa 24529449  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| |||||||  ||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||   ||       
T  24529448 cttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaa 24529350  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || ||| ||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24529349 tgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 24529250  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24529249 gtcggtctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 9078280 - 9077952
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |  ||| |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||| ||| |||    
T  9078280 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgaga 9078181  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||   ||       
T  9078180 cttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaa 9078082  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || ||| || |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||     
T  9078081 tgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgg 9077982  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9077981 gtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 21292764 - 21293090
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | || ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  21292764 tctcgcctcgcgagtgacccagaaatagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgggagttggacccttgggtaggattaagac 21292863  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||| | || |||| |||||  | |||||| ||| |||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  21292864 ttaataatgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttga-tgattatgatgtgatataatgttta-tgcattacttgaagaataatt 21292961  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaag--tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatg 299  Q
    | |||  |||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  21292962 gtatacctaagatgttgatgaatttgaatattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 21293059  T
Q  300 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||||    
T  21293060 aatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 163 - 330
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808510
Alignment:
Q  163 atgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 262  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21808442  T
Q  263 tgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21808443 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 163 - 330
Target Start/End: Original strand, 21729018 - 21729185
Alignment:
Q  163 atgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 262  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21729018 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21729117  T
Q  263 tgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21729118 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 1096795 - 1096467
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||  |||||||| |  ||| |||| ||||||| | | ||| ||||| |||||| ||| |||    
T  1096795 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagaatgcctttttagaattttgcgatctctgtcgcacaagttgttaaaagttggaccttggggtagtattgaga 1096696  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||  |  |||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||       
T  1096695 cttaatgaggatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaa 1096597  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || |||| | |||||||| ||| |||||  |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1096596 tgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 1096497  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1096496 gtcggtctaagttgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 231 - 330
Target Start/End: Original strand, 21997556 - 21997655
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997556 tgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 193
Target Start/End: Original strand, 22107167 - 22107357
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||| |   ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||    
T  22107167 tctcgcctcgcgagtgacccggaaatagagtgccttgtgatactttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagatgaacctttgagtagtattaagac 22107266  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaa 193  Q
    |||||||||| |||| |||||  | ||||||||||||||| ||| ||| ||  |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  22107267 ttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttg-ttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 192
Target Start/End: Original strand, 21985941 - 21986130
Alignment:
Q  3 ctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggtttt-gcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  21985941 ctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattcagac 21986040  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttga 192  Q
    || |||| |||||||  ||||    |||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||||    
T  21986041 ttgatgatgatgttaactataatttgtgaagttgtttaagatgtgttgatg-ttgaatatgaggtgataaaatgttatatgcattacttga 21986130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 127 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18418780 - 18418594
Alignment:
Q  127 gtgaagctgttt-aagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 225  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18418780 gtgaagctgttttaagatgttttgac-attgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaata-ttaagatgttg-tgaatt 18418684  T
Q  226 gcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgtt-gtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 316  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  18418683 gcaaatgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgat 18418594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 264768 - 264930
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264768 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 264867  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  264868 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 39363546 - 39363384
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363546 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39363447  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39363446 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 181 - 327
Target Start/End: Original strand, 10732957 - 10733102
Alignment:
Q  181 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgt 280  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||    
T  10732957 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgt 10733055  T
Q  281 tgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10733056 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 36154783 - 36154942
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154783 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 36154882  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||   || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36154883 gc---tg-tgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20909174 - 20909012
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909174 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20909075  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20909074 g-ttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 204 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22412309 - 22412187
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtc 303  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  22412309 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtc 22412211  T
Q  304 ggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  22412210 ggtctaagttgattaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 29330096 - 29329934
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29330096 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 29329997  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29329996 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 42245365 - 42245527
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245365 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 42245464  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42245465 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 29346142 - 29345980
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346142 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29346043  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | || |  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29346042 g-ttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 32027555 - 32027393
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027555 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32027456  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | |||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32027455 g-ttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 181 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 39245281 - 39245136
Alignment:
Q  181 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgt 280  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| ||  || |||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||    
T  39245281 tgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgt 39245183  T
Q  281 tgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39245182 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 155 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356363
Alignment:
Q  155 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgttt 254  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||  |    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctg--t 18356391  T
Q  255 ttgtatactgcctatgttattgttgttg 282  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||    
T  18356390 ttgtatgctgcctatgttgctgttgttg 18356363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 231 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 38619529 - 38619434
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38619529 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 29348615 - 29348453
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348615 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29348516  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | || |  |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29348515 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 29351088 - 29350926
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29351088 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29350989  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | || |  |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29350988 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 164 - 324
Target Start/End: Original strand, 18319033 - 18319193
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 262  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18319033 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 18319132  T
Q  263 tgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 324  Q
    ||| | |||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  18319133 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 231 - 327
Target Start/End: Original strand, 20902076 - 20902172
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-atgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20902076 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaagatgatga 20902172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 231 - 327
Target Start/End: Original strand, 2154681 - 2154776
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2154681 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 231 - 327
Target Start/End: Original strand, 11581266 - 11581361
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11581266 tgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 231 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23064606 - 23064512
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23064606 tgatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 328
Target Start/End: Original strand, 17517138 - 17517320
Alignment:
Q  147 ttgatgactgattatgatgtgatataatgttt-tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtc 245  Q
    ||||||| ||| || ||||||||| | ||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||    
T  17517138 ttgatgattgaataagatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtc 17517237  T
Q  246 atgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 328  Q
     |||||||  ||||  ||||||||| |  | ||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  17517238 ttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 17517320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 233 - 327
Target Start/End: Original strand, 20918017 - 20918110
Alignment:
Q  233 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20918017 atattattttgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 155 - 282
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910870
Alignment:
Q  155 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaa-tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||      
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatgttcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-- 20910841  T
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgttgttg 282  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||||||||    
T  20910842 tttgtatgctgtctatgttgctgttgttg 20910870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 10775675 - 10775838
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 262  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10775675 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatac 10775774  T
Q  263 tgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||| | |||   ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10775775 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 31061163 - 31061068
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31061163 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22144216 - 22144068
Alignment:
Q  163 atgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 262  Q
    ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||| |||| ||||| || ||||| ||||    
T  22144216 atgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatac 22144118  T
Q  263 tgcctatgttattgt-tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    | ||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144117 tacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 254 - 330
Target Start/End: Original strand, 19660879 - 19660956
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19660879 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 254 - 330
Target Start/End: Original strand, 21329541 - 21329618
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21329541 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 330
Target Start/End: Original strand, 21502154 - 21502277
Alignment:
Q  207 tttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcgg 305  Q
    ||||||||| |||||| |||||   |||||| |||| |||||||| |||   ||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  21502154 tttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 21502252  T
Q  306 tctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  21502253 tctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 37724073 - 37723910
Alignment:
Q  159 tatgatgtgatataatgttttgt-gcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||  ||   |||||  || |||||||||||||||  |  |||||| || |||||||||||||   |    
T  37724073 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---g 37723977  T
Q  258 tatactgcctatgttattgt-tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 323  Q
    |||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  37723976 tatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 254 - 326
Target Start/End: Original strand, 22959576 - 22959649
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22959576 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 311
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027043
Alignment:
Q  212 gatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtct 308  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttgg-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 20027040  T
Q  309 aag 311  Q
    |||    
T  20027041 aag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21565668 - 21565546
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagt 302  Q
    |||||| | |||||||||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  | || ||| ||||||||||||||||||||    
T  21565668 atatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagt 21565570  T
Q  303 cggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  21565569 cggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 232 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 36314675 - 36314577
Alignment:
Q  232 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36314675 gatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 254 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 19668975 - 19668898
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19668975 tttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24067202 - 24067110
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 324  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||   ||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  24067202 tgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatga 24067110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 330
Target Start/End: Original strand, 26012079 - 26012154
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26012079 tttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 26704160 - 26704075
Alignment:
Q  241 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |  | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26704160 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 26973893 - 26973808
Alignment:
Q  241 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |  | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26973893 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 275 - 327
Target Start/End: Original strand, 20806852 - 20806904
Alignment:
Q  275 tgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20806852 tgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 314
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  261 actgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 314  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Original strand, 20766115 - 20766174
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 264  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20766115 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg 20766174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 253 - 311
Target Start/End: Original strand, 22178264 - 22178323
Alignment:
Q  253 ttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22178264 ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23572252 - 23572182
Alignment:
Q  155 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 226  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  23572252 tgattatgatgtattataatgttta-tgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg 23572182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 311
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  261 actgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    |||| |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 40725898 - 40725853
Alignment:
Q  285 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  40725898 taactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 71)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 9509516 - 9509189
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  9509516 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcaagagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagac 9509417  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  9509416 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatattt 9509318  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  9509317 gaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgag 9509218  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509217 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12699159 - 12698831
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||| |||||||     
T  12699159 tctcacctcgtgagtgacccagaaacaaagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgatagttgaaccttggggtagtattaagag 12699060  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12699059 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatattt 12698961  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  12698960 gaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 12698861  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698860 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 26212323 - 26211995
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaa-cagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  26212323 tctcgcctcgcgagtgacccagaaaacagagtgatttgttag-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaaga 26212225  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||    
T  26212224 cttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgt-tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatt 26212126  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| || ||||    
T  26212125 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatga 26212026  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaag-atgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26212025 gtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 16386041 - 16386369
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16386041 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtccagagttgaacctttgggtaacattaagac 16386140  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    |||||||||| ||||  ||||  | ||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  | | |||    
T  16386141 ttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttg-ttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattgttt 16386239  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16386240 gaatatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatga 16386339  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16386340 gtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 10589365 - 10589039
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  10589365 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttttttgcacgagttgtctagagttggacctttgggtaggattaagac 10589266  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| || |||| |||||  | |||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  10589265 ttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttg-ctgattatgatgtgatataatgttta-tgcattgcttgaagaatattt 10589168  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  10589167 gaacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 10589068  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  10589067 tcgatctaagttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 38227808 - 38227481
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggtttt-gcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  38227808 tctcgcctcgcgagtgacccataaacagagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggggtagtattaaga 38227709  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||    |||||| | |||||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||| ||| |    
T  38227708 cttaatgatgatgttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttgatgt-tgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataat 38227610  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  38227609 tgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatga 38227511  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38227510 gtcggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 327
Target Start/End: Original strand, 3564157 - 3564482
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||| ||| |||    
T  3564157 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagtttaaccttggggtagtattgaga 3564256  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||  |  ||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||  ||       
T  3564257 cttaatgatgatgttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaa 3564355  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || ||| || |||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3564356 tgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 3564455  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  3564456 gtcggtctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 40443716 - 40443393
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||| ||||||||    
T  40443716 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttattggattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagatgaacccttgggtaggattaagac 40443617  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||  | || |||| |||||  | |||||||||| |||||| | | | ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  40443616 ttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgt-tgattatgatgtgatataatgttta-tgcattacttgaagaatattt 40443519  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    | |||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||  || ||||| ||||||||||||||| ||    
T  40443518 gtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacga 40443421  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgat 328  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||    
T  40443420 gtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 127 - 327
Target Start/End: Original strand, 18456332 - 18456530
Alignment:
Q  127 gtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  18456332 gtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttg 18456430  T
Q  227 caagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18456431 catttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18456529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 27847627 - 27847951
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  27847627 tctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagac 27847726  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||| | ||  |||  ||||  | |||||||||  |||||| | ||| ||  |||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  27847727 ttaataatgagattaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttg-ttgattatgatgtgtgataatg-tttatgcattacttgaagaatgttt 27847824  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    | |||  |||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||| |||   ||||| ||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||    
T  27847825 gtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactg---ttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatga 27847921  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
     |||||||||| || |||||||||||||||    
T  27847922 atcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 315
Target Start/End: Original strand, 15143830 - 15144143
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||| | |||||    
T  15143830 tctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagttgaacctcggggtagtactaaga 15143929  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctg-tttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatat 199  Q
    |||||||| ||||||   ||||  | || |||||| |||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||  ||      
T  15143930 cttaatgatgatgtttaatataatctgtcaagctgttttaagatgttttga-cattgattatgatgtgatatgatgttatacgcattacttaaattatga 15144028  T
Q  200 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatg 299  Q
     || ||| || |||||||| ||  |||||  ||||||||| || || ||||||| ||| ||||||   |||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  15144029 atgtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactg-agatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 15144127  T
Q  300 agtcggtctaagttga 315  Q
    ||||||||||||||||    
T  15144128 agtcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13647491 - 13647325
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13647491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 13647392  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  13647391 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 158 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16213852 - 16213684
Alignment:
Q  158 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    ||||| |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||| ||| ||| |  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16213852 ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttg 16213753  T
Q  258 tatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |||||||| | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16213752 tatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 211 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273392
Alignment:
Q  211 agatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaa 310  Q
    |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa 48273409  T
Q  311 gttgatgaagatgatga 327  Q
    |||||| ||||||||||    
T  48273408 gttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 456483 - 456321
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456483 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 456384  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  456383 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11972658 - 11972496
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972658 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11972559  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11972558 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 14949122 - 14949284
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949122 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14949221  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14949222 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 15376713 - 15376875
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376713 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15376812  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15376813 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16232682 - 16232520
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232682 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16232583  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16232582 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18640434 - 18640272
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640434 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18640335  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18640334 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 20385123 - 20385285
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385123 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20385222  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20385223 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 21189595 - 21189757
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189595 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21189694  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21189695 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 32125653 - 32125491
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32125554  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32125553 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 41523079 - 41522917
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523079 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41522980  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41522979 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 41525541 - 41525379
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41525442  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41525441 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 164 - 326
Target Start/End: Original strand, 11393287 - 11393448
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393287 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11393386  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11393387 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 18430874 - 18430709
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18430874 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 18430775  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18430774 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 181 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 24275316 - 24275175
Alignment:
Q  181 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgt 280  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||    
T  24275316 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgt 24275218  T
Q  281 tgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 323  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24275217 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 184 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16410201 - 16410059
Alignment:
Q  184 attacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||| |    
T  16410201 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttat 16410103  T
Q  284 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16410102 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24702400 - 24702238
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24702400 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 24702301  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24702300 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 27217022 - 27216860
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217022 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27216923  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27216922 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 158 - 330
Target Start/End: Original strand, 2280068 - 2280238
Alignment:
Q  158 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    |||| |||||||||||| || | || |||| |||||  |||| ||||||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  2280068 ttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctg-ttttg 2280166  T
Q  258 tatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
     |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2280167 catactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 326
Target Start/End: Original strand, 14932685 - 14932851
Alignment:
Q  161 tgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgta 259  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  14932685 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 14932784  T
Q  260 tactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
      || |||||| || | ||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  14932785 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 326
Target Start/End: Original strand, 15356120 - 15356286
Alignment:
Q  161 tgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgta 259  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  15356120 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15356219  T
Q  260 tactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
      || |||||| || | ||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15356220 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 326
Target Start/End: Original strand, 15360234 - 15360400
Alignment:
Q  161 tgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgta 259  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  15360234 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15360333  T
Q  260 tactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
      || |||||| || | ||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15360334 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 44116671 - 44116509
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||| ||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44116671 tgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 44116572  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    || | ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44116571 gc-tgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 3386495 - 3386333
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | || ||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3386495 tgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3386396  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
       | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3386395 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 199 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13869474 - 13869346
Alignment:
Q  199 tttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgca 297  Q
    |||||||| || ||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||   ||||||| |||||||||||||||    
T  13869474 tttgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgca 13869376  T
Q  298 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13869375 tgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 323
Target Start/End: Original strand, 38898376 - 38898535
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 262  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  || | |||||| || |||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38898376 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatac 38898475  T
Q  263 tgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 323  Q
    ||| | |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38898476 tgc-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 233 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13831466 - 13831373
Alignment:
Q  233 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13831466 atattattatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24704847 - 24704688
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  24704847 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttg---tttttgtatact 24704751  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24704750 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 17061915 - 17062077
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17061915 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttt-gtatact 17062013  T
Q  264 gcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||  | |||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17062014 gctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20110708 - 20110556
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  20110708 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtata-- 20110611  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||         ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20110610 gc---------tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22073013 - 22072913
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22073013 tgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaagatgatgatg 22072914  T
Q  330 t 330  Q
    |    
T  22072913 t 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 232 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16495500 - 16495402
Alignment:
Q  232 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16495500 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 232 - 330
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505419
Alignment:
Q  232 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 232 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 34200884 - 34200786
Alignment:
Q  232 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34200884 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 254 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 67822 - 67745
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  67822 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 254 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 44014255 - 44014182
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44014255 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 326
Target Start/End: Original strand, 16219715 - 16219834
Alignment:
Q  207 tttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcgg 305  Q
    |||||||||||||||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16219715 tttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcgg 16219813  T
Q  306 tctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  16219814 tctaagttgaagatgatgatg 16219834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 47831879 - 47831807
Alignment:
Q  259 atactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47831879 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 330
Target Start/End: Original strand, 11996051 - 11996148
Alignment:
Q  233 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11996051 atattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 326
Target Start/End: Original strand, 811199 - 811248
Alignment:
Q  277 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  811199 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 330
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15755008
Alignment:
Q  277 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 18005699 - 18005650
Alignment:
Q  277 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18005699 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 264
Target Start/End: Original strand, 26355983 - 26356083
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26355983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26356082  T
Q  264 g 264  Q
    |    
T  26356083 g 26356083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 264
Target Start/End: Original strand, 26358435 - 26358535
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26358435 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26358534  T
Q  264 g 264  Q
    |    
T  26358535 g 26358535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 315
Target Start/End: Original strand, 1868038 - 1868101
Alignment:
Q  253 ttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 315  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868038 ttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12901401 - 12901338
Alignment:
Q  253 ttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 315  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12901401 ttttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 324
Target Start/End: Original strand, 18154873 - 18154956
Alignment:
Q  241 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 324  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18154873 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatga 18154956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Original strand, 2530126 - 2530209
Alignment:
Q  197 tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttg 282  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||  ||||||||    
T  2530126 tatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgtatgttgcctatgttgctgttgttg 2530209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15211632 - 15211484
Alignment:
Q  155 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgttt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||  |||||||  |  ||||||| || |||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||| ||||     
T  15211632 tgattatgatgtgatataatgttgtatacatcgcttgaagttttattgaataattgagatgttg-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttg 15211534  T
Q  255 ttgt-atactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtc 303  Q
    |||| || ||||||||| |  |||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  15211533 ttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 15211484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 311
Target Start/End: Original strand, 12756671 - 12756817
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||   ||| |||||| || ||| |||| | | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12756671 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 12756770  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    |  | ||||  ||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12756771 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044761
Alignment:
Q  260 tactgcctatgtta-ttgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 315  Q
    |||||||||||||  || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354791
Alignment:
Q  260 tactgcctatgtta-ttgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 315  Q
    |||||||||||||  || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 260 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18203882 - 18203831
Alignment:
Q  260 tactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    ||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18203882 tactgtctatgttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatctaag 18203831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 327
Target Start/End: Original strand, 26356098 - 26356156
Alignment:
Q  269 tgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |||| |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  26356098 tgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26356156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 327
Target Start/End: Original strand, 26358550 - 26358608
Alignment:
Q  269 tgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |||| |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  26358550 tgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26358608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 330
Target Start/End: Original strand, 19486820 - 19486865
Alignment:
Q  285 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  19486820 taactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 311
Target Start/End: Original strand, 20220238 - 20220290
Alignment:
Q  260 tactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20220238 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 48991258 - 48991206
Alignment:
Q  253 ttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcg 304  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  48991258 ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 48991206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 70)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 20360754 - 20361081
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20360754 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattgaacctttgggtagtattaagac 20360853  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| || |||| |||||    ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20360854 ttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgt-tgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatattt 20360952  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20360953 gaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 20361052  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  20361053 tcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 20638077 - 20638404
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| || || |||||||||    
T  20638077 tctcacctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggataacattaagac 20638176  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  20638177 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaagaatgttt 20638275  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20638276 gaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgag 20638375  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20638376 ttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 330
Target Start/End: Original strand, 17287596 - 17287917
Alignment:
Q  8 ctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatg 107  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17287596 ctcgtgagtgacccagaaacagagtgtcttgttagggtttgctatctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatg 17287695  T
Q  108 aagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatat 207  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17287696 aggatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggt-tgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatat 17287794  T
Q  208 ttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtc 307  Q
    |||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17287795 ttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 17287894  T
Q  308 taagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  17287895 taagttgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 22780021 - 22780348
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||| |||||  |||| ||||||||| |||||| || |||||    
T  22780021 tctcgcctcgcgagtaacctagaaacagagtgtcctgttaggttttgtgacctttgttgcacaagttgccgagagttgaaccttggggtagtataaagac 22780120  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| ||||||| | |||  | ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||    
T  22780121 ttaatgatgatgttaatcataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataatt 22780219  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22780220 gaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgcatgag 22780319  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22780320 tcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 29060868 - 29060540
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||  |||||||| |||||| ||| |||    
T  29060868 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagctgaaccttggggtagtattgaga 29060769  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||| ||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||       
T  29060768 cttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatgaa 29060670  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || ||| || |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29060669 tgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 29060570  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29060569 gtcggtctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 25629148 - 25629476
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  25629148 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacttttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgaga 25629247  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| | ||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||       
T  25629248 cttaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaa 25629346  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || ||| || |||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  25629347 tgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatga 25629446  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629447 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 329
Target Start/End: Original strand, 18409620 - 18409947
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  18409620 tctcgcctctctagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttacgacctttgttgcacgagttattgagagttgaaccttagggtagtattgaga 18409719  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||  ||       
T  18409720 cttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaa 18409818  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || ||  || |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18409819 tggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatga 18409918  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18409919 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 19303334 - 19303661
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |  ||| |||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||| | |||    
T  19303334 tctcgcctcgagagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctatgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagcactgaga 19303433  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
     ||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||       
T  19303434 attaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaa 19303532  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || ||| || |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19303533 tgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 19303631  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19303632 gtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20594101 - 20593773
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||| |  ||| |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||| ||| |||    
T  20594101 tctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgaga 20594002  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    ||||||||  ||| || |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||   ||  |    
T  20594001 cttaatgataatgataattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgat 20593903  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || ||| || |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||  |||| || ||||||| ||||||||||    
T  20593902 tgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatga 20593803  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20593802 ttcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 163 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16496411 - 16496244
Alignment:
Q  163 atgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 262  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16496411 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 16496312  T
Q  263 tgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16496311 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 16920427 - 16920751
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || | |||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  16920427 tctcgccttgcgagtgacccagaaacaaagtgacttgttggattttgcgacctttgttgcacgatttctcgagagttgaacccttgggtagaattaagac 16920526  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||  | || ||||  ||||  |  ||||||||  ||||||   ||| ||  ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16920527 ttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagataagttgttgt-tgattatgatgtggtataatgttta-tgcattacttgaagaatattt 16920624  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    | |||  |||||||||||||||| | |  ||||||  |||||||||| ||||   |||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16920625 gtatacataagatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatga 16920721  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  16920722 gtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 163 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076700
Alignment:
Q  163 atgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 262  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttac 20076768  T
Q  263 tgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076767 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 155 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  155 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgttt 254  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||   ||||     
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgatta-tgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttg 35245663  T
Q  255 ttgtatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  35245662 ttgtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22831829 - 22831503
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| | || |||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  22831829 tctcgcctcgcgagtgaccgagaaacagagtgacttgttggattttgcgacctttgtcgcacgattcgtcgagagttgaacccttgggtagaattaagac 22831730  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    || |  | || ||||  ||||  | |||||||||  |||||| | ||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  22831729 ttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttg-ttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgttt 22831632  T
Q  202 gaat--atttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcat 298  Q
    | ||  || |||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||   |||  ||| | | ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||    
T  22831631 gtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 22831535  T
Q  299 gagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||    
T  22831534 gagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12742479 - 12742317
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742479 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12742380  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12742379 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 18334592 - 18334754
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334592 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18334691  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18334692 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 19005208 - 19005046
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005208 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19005109  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19005108 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 19858919 - 19859081
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858919 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19859018  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19859019 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22782389 - 22782227
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  || | |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22782290  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    || | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22782289 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24422709 - 24422547
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422709 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24422610  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24422609 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 25754971 - 25754809
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754971 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25754872  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
     | | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25754871 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 33861956 - 33861794
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861956 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33861857  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33861856 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 33864440 - 33864278
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864440 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33864341  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33864340 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 103
Target Start/End: Original strand, 18821613 - 18821714
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  18821613 tctcgcctcgcgagcgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggggtagcattaagac 18821712  T
Q  102 tt 103  Q
    ||    
T  18821713 tt 18821714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 164 - 329
Target Start/End: Original strand, 30676710 - 30676874
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30676710 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 30676809  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 329  Q
    || | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30676810 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 1595692 - 1595549
Alignment:
Q  183 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttg 282  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||     
T  1595692 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttatgttgctgttgtta 1595594  T
Q  283 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1595593 tttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 231 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 25656724 - 25656629
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25656724 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 2291180 - 2291342
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2291180 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 2291279  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2291280 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 8055191 - 8055029
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055191 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8055092  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
       | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8055091 tt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11185828 - 11185524
Alignment:
Q  3 ctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagact 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| ||| || | ||| |||||||| |||||||||    
T  11185828 ctcgcctcgtgagtgacccagaaacatagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcatgggttgtcgaggatcggacccttgggtaggattaagact 11185729  T
Q  103 taatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttg 202  Q
    ||||   || ||||    ||  | |||||| ||  |||||| | ||| || |||||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  11185728 taatagtgaggttaaccgtaatctgtgaagatgaataagatatgttgttg-ctgattatgaagtgttataaag-tttatgcattacttgaagaatgtttg 11185631  T
Q  203 aatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
     |||   |||||| |||||||||| |  |||||| |||||||||   |||| ||||| |||||  ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11185630 tatacaaaagatgctgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 11185534  T
Q  302 tcggtctaag 311  Q
    ||||||||||    
T  11185533 tcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 26924640 - 26924802
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924640 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26924739  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
       | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26924740 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 34963535 - 34963371
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963535 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34963436  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 329  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  34963435 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 184 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 25688644 - 25688502
Alignment:
Q  184 attacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| |    
T  25688644 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttatgttgctgttgttat 25688546  T
Q  284 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  25688545 ttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagataatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 181 - 327
Target Start/End: Original strand, 1540928 - 1541073
Alignment:
Q  181 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgt 280  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||  ||||||    
T  1540928 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgt 1541026  T
Q  281 tgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1541027 tatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 25644490 - 25644335
Alignment:
Q  161 tgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtat 260  Q
    ||||||||||||||  | |  ||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| || ||  ||||||| |||| ||| |||||||||| ||    
T  25644490 tgatgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcat 25644391  T
Q  261 actgcctatgttattgt-tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 315  Q
    ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644390 actgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 164 - 324
Target Start/End: Original strand, 16448526 - 16448686
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 262  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448526 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16448625  T
Q  263 tgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 324  Q
    ||| | |||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16448626 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 3852017 - 3852179
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3852017 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3852116  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
       | ||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3852117 at-tgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18456881 - 18456735
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456881 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18456782  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
       | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456781 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18462024 - 18461895
Alignment:
Q  181 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgt 280  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||  ||||||    
T  18462024 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgt 18461926  T
Q  281 tgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461925 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20109285 - 20109140
Alignment:
Q  183 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gtt 281  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||| |||| | ||| |||||| | ||||||||||||||  |||| |||    
T  20109285 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtt 20109187  T
Q  282 gtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20109186 tattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 327
Target Start/End: Original strand, 20556959 - 20557054
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20556959 tgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 303
Target Start/End: Original strand, 25603241 - 25603478
Alignment:
Q  64 gagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatga 163  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||   || |  | ||||||||||||||||||| | | | | |||||||||    
T  25603241 gagttgcttagagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgacgatgtttaatagaatctgtgaagctgtttaagatgtttag-tcattgattatga 25603339  T
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||| ||||| | | ||||||||||||  |  ||||||| || |||||| | ||||||  || ||||||| |||||||||| |||| |||||  ||    
T  25603340 tgtgatatgatgttgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatct 25603438  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtc 303  Q
    ||||||| |  |||||||  |||||||||  |||||||||    
T  25603439 gcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25603478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 254 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19652272 - 19652199
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19652272 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 155 - 282
Target Start/End: Original strand, 27415887 - 27416012
Alignment:
Q  155 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaat-atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||      
T  27415887 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg-- 27415983  T
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgttgttg 282  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  27415984 tttgtatgctgcctatgttgctgttgttg 27416012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 23992608 - 23992429
Alignment:
Q  147 ttgatgactgattatgatgtgatataatgttt-tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtc 245  Q
    ||||||| ||| || ||||||||| | ||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||    
T  23992608 ttgatgattgaataagatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttga---attgcaattgatatttttatgtc 23992512  T
Q  246 atgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 328  Q
     |||||||  ||||  ||||||||| |  | ||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  23992511 ttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 23992429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 203 - 328
Target Start/End: Original strand, 19847989 - 19848114
Alignment:
Q  203 aatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagt 302  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||  |||||||  ||||  ||||||||| |  | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  19847989 aatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 19848088  T
Q  303 cggtctaagttgatgaagatgatgat 328  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||    
T  19848089 cagtctaagttgattaagatgttgat 19848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 254 - 330
Target Start/End: Original strand, 27333262 - 27333339
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27333262 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 254 - 330
Target Start/End: Original strand, 27394002 - 27394079
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27394002 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25714472 - 25714417
Alignment:
Q  275 tgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25714472 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 303
Target Start/End: Original strand, 15041473 - 15041644
Alignment:
Q  130 aagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatat-ttgaatatttaagatgttgatgaattgca 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||| ||| || | |||||| | ||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  15041473 aagctgtttaagatgtgttgatga-taattaagatttggtttaatgtat-gtgcattacttga-gattttattgaatacttaagatgttattgaattgca 15041569  T
Q  229 agtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtc 303  Q
      ||||||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| || | ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15041570 tttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatgagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 311
Target Start/End: Original strand, 18821867 - 18821946
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821867 tgatattgttatggcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 232 - 330
Target Start/End: Original strand, 28496494 - 28496592
Alignment:
Q  232 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28496494 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 232 - 330
Target Start/End: Original strand, 29808905 - 29809003
Alignment:
Q  232 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29808905 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 303
Target Start/End: Original strand, 25611592 - 25611816
Alignment:
Q  77 ttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgt 176  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    | |  |  |||||||||||||||||| | | | | ||||||||||||||||| ||||    
T  25611592 ttgaacctttgggtagctttaggacttaatgacgatgtttaacagaatctatgaagctgtttaagatgtttag-tcattgattatgatgtgatatgatgt 25611690  T
Q  177 tttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattg 276  Q
    | | | ||||||||||||  |  ||||||| || |||||| | ||||||  || ||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||| |  ||    
T  25611691 tgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctg 25611789  T
Q  277 ttgttgtttaactaagctgcatgagtc 303  Q
    |||||  |||||||||  |||||||||    
T  25611790 ttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25611816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561303
Alignment:
Q  277 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 281 - 330
Target Start/End: Original strand, 22080797 - 22080846
Alignment:
Q  281 tgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22080797 tgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 259 - 318
Target Start/End: Original strand, 4185870 - 4185930
Alignment:
Q  259 atactgcctatgttattgt-tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 318  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4185870 atactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatga 4185930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 33443124 - 33443068
Alignment:
Q  253 ttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtcta 309  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33443124 ttttatatactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 315
Target Start/End: Original strand, 9098557 - 9098620
Alignment:
Q  253 ttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 315  Q
    ||||| ||||||||| ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098557 ttttgcatactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 330
Target Start/End: Original strand, 8227587 - 8227632
Alignment:
Q  285 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  8227587 taactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23019525 - 23019408
Alignment:
Q  211 agatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtcta 309  Q
    |||||||| ||| |||||  ||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| ||||||  |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23019525 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtcta 23019427  T
Q  310 agttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    || |||  |||||||||||||    
T  23019426 agatga--aagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 4186419 - 4186379
Alignment:
Q  278 tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4186419 tgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatga 4186379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 318
Target Start/End: Original strand, 4738626 - 4738666
Alignment:
Q  278 tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4738626 tgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatga 4738666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076749
Alignment:
Q  260 tactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008167
Alignment:
Q  260 tactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 284 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19668417 - 19668386
Alignment:
Q  284 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668417 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19873205 - 19873120
Alignment:
Q  241 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |  | ||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19873205 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22432334 - 22432249
Alignment:
Q  241 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |  | |||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22432334 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22432249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22438884 - 22438799
Alignment:
Q  241 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |  | |||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22438884 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19008843 - 19008799
Alignment:
Q  289 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 333  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  19008843 taagctgcatgagttggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19008799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 2 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22636761 - 22636437
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22636761 tctcgcctcacgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggggtagtattaagac 22636662  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    |||| || ||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22636661 ttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgtt-aagatgtgttgatgtc-gattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatattt 22636564  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22636563 gaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgag 22636464  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgat 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  22636463 tcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12903081 - 12902757
Alignment:
Q  5 cgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagactta 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12903081 cgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaacctttgggtaggattaagactta 12902982  T
Q  105 atgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaa 204  Q
    ||||||| |||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  12902981 atgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgt-tgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaa 12902883  T
Q  205 tatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcg 304  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12902882 tatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 12902783  T
Q  305 gtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  12902782 gtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 44053156 - 44052829
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  44053156 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagac 44053057  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  44053056 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatattt 44052958  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44052957 gaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgag 44052858  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44052857 tcggcctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 7089204 - 7088877
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7089204 tctcgcctcgcgagtgacccggaaacagagtgtcttgttagattttgcgacctttgttgcaagagttgtcgagagttgaacctttgagtagcattaagac 7089105  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    |||||||||| |||| |||||  | |||||| |||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7089104 ttaatgaagaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttg-ctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatattt 7089006  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7089005 gaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 7088906  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088905 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 323
Target Start/End: Original strand, 23374153 - 23374473
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23374153 tctcgcctcgcgggtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcaacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagac 23374252  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    |||||||||| ||||  ||||  |  ||||||| |||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||    
T  23374253 ttaatgaagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgt-tgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattattt 23374351  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23374352 gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 23374451  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatg 323  Q
    ||| ||||||||| ||||||||    
T  23374452 tcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 330
Target Start/End: Original strand, 16239764 - 16240090
Alignment:
Q  3 ctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggtttt-gcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||    
T  16239764 ctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattaagac 16239863  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||  | | ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| ||| ||    
T  16239864 ttaatgatgatgttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataatt 16239962  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||| |||| ||||||||    
T  16239963 gaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctattttgctattgttatttaattaagttgcatgag 16240061  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16240062 ttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 7894028 - 7893703
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggtttt-gcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||  |||||||    
T  7894028 tctcgcctcacgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcatgagttgccgagagttgaaccttggggtaatattaaga 7893929  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    ||||| || ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| |    
T  7893928 cttaacgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg----ctgattatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataat 7893833  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  7893832 tgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatga 7893733  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893732 atcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 14053096 - 14053422
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  14053096 tctcgccttgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagac 14053195  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||  | || |||| |||||  | ||||||| || |||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14053196 ttaacaatgaggttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttg-ttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttgaagaatattt 14053293  T
Q  202 gaatatttaag-atgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatg 299  Q
    | ||   |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  14053294 gtatgcataagaatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatg 14053391  T
Q  300 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  14053392 agtcgatctaagatgttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14038976 - 14038653
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |  ||| |||| ||||| | ||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  14038976 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgaga 14038877  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||| ||| |||||  | |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||       
T  14038876 cttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaa 14038778  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || ||| || |||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14038777 tgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 14038678  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgat 325  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  14038677 gtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 327
Target Start/End: Original strand, 16377315 - 16377639
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgt-tgagaattgaacctttgggtagcattaag 99  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||| ||| ||    
T  16377315 tctcgcctcacgagtgacccagaaacatagtgccttgttaggattttgctacctttgttgcacgagttttatgagagttgaaccttggggtagtattgag 16377414  T
Q  100 acttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatat 199  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  | ||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||      
T  16377415 acttaatgatgatgttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatga 16377513  T
Q  200 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatg 299  Q
     || ||| || |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  16377514 atgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 16377611  T
Q  300 agtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16377612 agtcggtctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 155 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 7798949 - 7798774
Alignment:
Q  155 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgttt 254  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7798949 tgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttt 7798850  T
Q  255 ttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798849 ttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 127 - 330
Target Start/End: Original strand, 16270155 - 16270356
Alignment:
Q  127 gtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | |||    
T  16270155 gtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttg 16270253  T
Q  227 caagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16270254 catttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatg 16270352  T
Q  327 atgt 330  Q
    ||||    
T  16270353 atgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3096970 - 3096759
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || || ||    
T  3096970 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggataaatac 3096871  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| || |||| |||||    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3096870 ttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttg-ctgattatgatgagatacaatg-tttatgcattacttgaagaatattt 3096773  T
Q  202 gaatatttaagatg 215  Q
    ||||||||| ||||    
T  3096772 gaatatttatgatg 3096759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 17047866 - 17048070
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17047866 tctcgcctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagac 17047965  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||||||   || ||| |  | ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||    
T  17047966 ttaatgaagagactaattacaacctgtgaagctgtttaagatgtgttgttg-ttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattattt 17048064  T
Q  202 gaatat 207  Q
    ||||||    
T  17048065 gaatat 17048070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 158 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899891
Alignment:
Q  158 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||  ||| |||||| |    
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-g 6899964  T
Q  258 tatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||  | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 205 - 330
Target Start/End: Original strand, 52873363 - 52873488
Alignment:
Q  205 tatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcg 304  Q
    ||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52873363 tatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 52873462  T
Q  305 gtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  52873463 gtctaagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 18215274 - 18215436
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215274 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18215373  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    | || ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18215374 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 44102376 - 44102214
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| | | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102376 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44102277  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
     | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44102276 ac-tgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 44928879 - 44929042
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||  ||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928879 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 44928978  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    || | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44928979 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 12307 - 12469
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12307 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12406  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12407 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 3515169 - 3515007
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3515169 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatact 3515070  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    || | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3515069 gc-tgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 15118352 - 15118514
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118352 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15118451  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15118452 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 23803265 - 23803427
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803265 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23803364  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
     | | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23803365 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 52312672 - 52312510
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312672 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 52312573  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52312572 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 204 - 327
Target Start/End: Original strand, 54798749 - 54798872
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtc 303  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  54798749 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtc 54798848  T
Q  304 ggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  54798849 ggtctaagttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 158 - 327
Target Start/End: Original strand, 1837503 - 1837671
Alignment:
Q  158 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  1837503 ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttg 1837602  T
Q  258 tatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |||||||  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1837603 tatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 164 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19242861 - 19242693
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242861 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19242762  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 333  Q
    |  | |||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19242761 gt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 204 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 14280438 - 14280316
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtc 303  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14280438 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 14280340  T
Q  304 ggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  14280339 ggtctaagttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 44615450 - 44615288
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44615450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 44615351  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44615350 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 44773087 - 44773249
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  || | |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44773186  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44773187 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 50222339 - 50222501
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50222339 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataat 50222438  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50222439 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 51463868 - 51464030
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463868 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 51463967  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
     | | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51463968 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 244 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096293
Alignment:
Q  244 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 181 - 327
Target Start/End: Original strand, 18239436 - 18239581
Alignment:
Q  181 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgt 280  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |  ||||||    
T  18239436 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgttgt 18239534  T
Q  281 tgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18239535 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 329
Target Start/End: Original strand, 19618172 - 19618336
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19618172 tgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 19618271  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 329  Q
    || | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19618272 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 155 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 17046659 - 17046487
Alignment:
Q  155 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgttt 254  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||     
T  17046659 tgattaagatgtgttataatgttta-tacattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttc 17046561  T
Q  255 ttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |   ||||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17046560 t---atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 323
Target Start/End: Original strand, 15355324 - 15355483
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 262  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355324 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15355423  T
Q  263 tgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 323  Q
    ||| | |||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15355424 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12611105 - 12610950
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||         
T  12611105 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgt----- 12611011  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
       | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12611010 ---tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 329
Target Start/End: Original strand, 14970707 - 14970871
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | || ||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14970707 tgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatatt 14970806  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 329  Q
    | || | ||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||    
T  14970807 g-ctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaatgttgatg 14970871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6190782 - 6190481
Alignment:
Q  9 tcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatga 108  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||| |  |    
T  6190782 tcgcgagtgacccaaaaatagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagctgtcgagagttgaaccttggcgtagcattaagacttgaata 6190683  T
Q  109 agatgttatttatataccgtgaagctgtt-taagatg-tattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaata 206  Q
     ||| ||| ||| |   |||||||||||| | ||||| || || ||| ||  ||||||||||| ||||| | |  |||||||||||||  ||  ||||||    
T  6190682 tgatattaattacaattcgtgaagctgttatgagatgttaatgttga-tg--tatgatgtgatctaatg-tatacgcattacttgaagtttaaatgaata 6190587  T
Q  207 tttaagatg-ttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatgagtcg 304  Q
     || ||||| ||| |   || | | ||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6190586 attgagatgattgttcgcttac-attgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcg 6190488  T
Q  305 gtctaag 311  Q
    |||||||    
T  6190487 gtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 311
Target Start/End: Original strand, 13800 - 13953
Alignment:
Q  158 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    |||| ||||||||||||  | | | |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||| || |||||    
T  13800 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttg 13898  T
Q  258 tatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
     ||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13899 catactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15091224 - 15091103
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |  ||| |||| ||||  | ||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  15091224 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagtttctaagagttgaaccttggggtagtattgaga 15091125  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttata 122  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  15091124 cttaatgaagatgttaattata 15091103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 254 - 330
Target Start/End: Original strand, 39706332 - 39706409
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39706332 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 7799024 - 7798953
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttga 73  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  7799024 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgtcttgttaggttttgcgacctttgtttcacgagttgttga 7798953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 204 - 327
Target Start/End: Original strand, 8574864 - 8574985
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtc 303  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | |||   ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8574864 atatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 8574961  T
Q  304 ggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |||||||||| || ||||||||||    
T  8574962 ggtctaagttaattaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15367788 - 15367690
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15367788 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15370116 - 15370018
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15370116 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15371300 - 15371202
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15371300 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15373581 - 15373483
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15373581 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15402801 - 15402703
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15402801 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 232 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16223629 - 16223532
Alignment:
Q  232 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  16223629 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 282
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256231
Alignment:
Q  155 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaa-tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtt 253  Q
    ||||||| |||||||||||| || | |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||      
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-- 43256202  T
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgttgttg 282  Q
    || |||| |||||||||||  ||||||||    
T  43256203 ttggtatgctgcctatgttgctgttgttg 43256231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15551889 - 15551817
Alignment:
Q  259 atactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15551889 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22353999 - 22353835
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||||||| || ||||||| |||||||||| ||||  |  |  ||    
T  22353999 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatct 22353900  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 328  Q
    ||||||| |  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  22353899 gcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 181 - 311
Target Start/End: Original strand, 21815602 - 21815731
Alignment:
Q  181 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgt 280  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||  ||| ||    
T  21815602 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacag-ttgtgttgctgtcgt 21815700  T
Q  281 tgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21815701 tatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 7641192 - 7641344
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||         
T  7641192 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgt----- 7641286  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
          |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7641287 ------gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 254 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 12774084 - 12774011
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12774084 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 315
Target Start/End: Original strand, 52243143 - 52243302
Alignment:
Q  158 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatg--ctgtttt 255  Q
    |||| ||||||||||||  | | ||||||||||| |  |||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||  ||||||| |||| |||||  |||  ||    
T  52243143 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactg-att 52243241  T
Q  256 tgtatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 315  Q
    || ||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243242 tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 315
Target Start/End: Original strand, 12288211 - 12288316
Alignment:
Q  212 gatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtct 308  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||| |||| |||||  ||| ||| | ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12288211 gatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 12288309  T
Q  309 aagttga 315  Q
    |||||||    
T  12288310 aagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 315
Target Start/End: Original strand, 43198502 - 43198661
Alignment:
Q  158 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgt-tttt 256  Q
    |||| ||||||||||||  | | | |||||||||||  |||| ||||||||| |||| ||||||| |||||  ||||||  |||| |||||   | ||||    
T  43198502 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaattgtttt 43198601  T
Q  257 gtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 315  Q
    | ||| || |||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198602 gcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 8846433 - 8846360
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  8846433 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 20149924 - 20149832
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||   ||||||| ||| |  ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20149924 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-atgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatga 20149832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 226
Target Start/End: Original strand, 15121749 - 15121819
Alignment:
Q  155 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 226  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  15121749 tgattatgatgtattataatgttta-tgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg 15121819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 3797 - 3470
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  3797 tctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgagttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaactttggggtagtattaagac 3698  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||  |  |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3697 ttaatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatattt 3599  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||| |||||||||||| ||||||    
T  3598 gaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgag 3499  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3498 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 670 - 343
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggtttt-gcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  670 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcaacctttgttgcatgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgaga 571  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||     |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  570 cttaatgaggatgttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataat 472  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
     ||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  471 cgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctatttt-gtatactgcctatgttattgttgttatttaactaagctgcatga 373  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  372 gtcggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 80)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13442601 - 13442274
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| || |  |||||||||    
T  13442601 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatgacattaagac 13442502  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13442501 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatattt 13442403  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  13442402 gaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgag 13442303  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 20698230 - 20698556
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  20698230 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgtggcacgagttgtcgagagttgaacctttggatagaattaagac 20698329  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20698330 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagt-tgattatgatgtgatataatgttta-tgcattacttgaagaatattt 20698427  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20698428 gaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 20698527  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698528 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 17488184 - 17487856
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaa-cagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||    
T  17488184 tctcgcctcgcgagtgacctagaaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaaga 17488085  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17488084 cttaatgatgatgttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatt 17487986  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  17487985 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatga 17487886  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17487885 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 24 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 17499643 - 17499338
Alignment:
Q  24 aaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttatat 123  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  17499643 aaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataa 17499544  T
Q  124 accgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaa 223  Q
       ||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499543 tttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgt-tgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaa 17499445  T
Q  224 ttgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 323  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499444 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 17499345  T
Q  324 atgatgt 330  Q
    |||||||    
T  17499344 atgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 26687214 - 26686887
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||| |||||| || |||||| |||  |||    
T  26687214 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttacgacctttgttgcacgaatcgttgagagttgaactttggggtagtattgggac 26687115  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |     
T  26687114 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatg 26687016  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26687015 gaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgag 26686916  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26686915 tcggtctaagttgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 23083155 - 23083482
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||||    
T  23083155 tctcgcctcgcgaatgacccagaaacatagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttcagagttgaaccttgaggtagtattaagac 23083254  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||| ||| ||||||| ||| |  | ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | | ||    
T  23083255 ttagtgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgat-attgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaatt 23083353  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||    
T  23083354 gaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgag 23083453  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083454 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 43841258 - 43840932
Alignment:
Q  3 ctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagact 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  || || |||||| |||  ||||    
T  43841258 ctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttacacgagttgttgagagtttgactttggggtagtattgggact 43841159  T
Q  103 taatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttg 202  Q
    ||| || ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  43841158 taacgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 43841060  T
Q  203 aatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagt 302  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43841059 aatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 43840960  T
Q  303 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  43840959 cggtttaagttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12399533 - 12399209
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  12399533 tctcgcctcacgagtgacccagaaacag--tgacttgttag-ttttccgacctttgttgcacgagttgttggggattaagcctttgggtagcattaagac 12399437  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
     ||||||||| ||||  ||||  | |||||||| |||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | |||||    
T  12399436 ataatgaagaggttaactataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgt-tgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaattattt 12399338  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  12399337 gaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 12399238  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12399237 tcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 14576626 - 14576949
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  14576626 tctcgcctcgcgagtgacctagaaacaaagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaaga 14576725  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
     ||||||| ||||||| |||||  | |||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |    
T  14576726 tttaatgatgatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataat 14576824  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||  ||||||| |||||||||| || ||||    
T  14576825 tgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatga 14576923  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||||||||||||||||  |||||||    
T  14576924 gtcggtctaagttgatgttgatgatg 14576949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 25476178 - 25476506
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||| |||    
T  25476178 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagtattgaga 25476277  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| ||| |  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||       
T  25476278 cttaatgaggatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatga-tgataatgatgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaa 25476376  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || ||| || |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||    
T  25476377 tgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatga 25476476  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476477 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 18438862 - 18438534
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggtttt-gcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||| |||    
T  18438862 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagtgttgaaccttggggtagtattgaga 18438763  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| |||||||  ||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||   ||       
T  18438762 cttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaa 18438664  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || |||   ||||||||| ||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||    
T  18438663 tgtataaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatga 18438564  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18438563 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14572916 - 14572602
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggtttt-gcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  14572916 tctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtaccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaaga 14572817  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||    |||||| |||||||||| | || |||  || |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| |    
T  14572816 cttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatttgtttatgt-tgtttatgatgtgatataatgtttttttcattatttgaagtataat 14572718  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    |||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14572717 tgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 14572619  T
Q  301 gtcggtctaagttgatg 317  Q
    |||||||||||||||||    
T  14572618 gtcggtctaagttgatg 14572602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 14973182 - 14972854
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    ||| |||| ||||| | ||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  14973182 tctcgcctcgcaagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgaga 14973083  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||  |  |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||       
T  14973082 cttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaa 14972984  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || |||| | |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14972983 tgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 14972884  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972883 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 327
Target Start/End: Original strand, 40213514 - 40213838
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||| |||    
T  40213514 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagtttaaccttggggtagtattgaga 40213613  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||  | || |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |  ||       
T  40213614 cttaatgatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaa 40213712  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || ||| || |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| |||||    
T  40213713 tgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatga 40213811  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40213812 gtcggtctaagttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 11424556 - 11424880
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggtttt-gcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||| |||    
T  11424556 tctcgcctcgcgagcgacctagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgaga 11424655  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||  ||||||| || ||  | ||||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||       
T  11424656 cttaatgttgatgttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaag-ttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaa 11424754  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || ||| || ||||||||||   |||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11424755 tgcataattgagatgttgat---ttgctattgatattgttatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 11424850  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11424851 gtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 30030143 - 30029855
Alignment:
Q  25 aacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttatata 124  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||      
T  30030143 aacagaatgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgatgatgtttaatataat 30030044  T
Q  125 ccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaat 224  Q
      ||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |  |||||||||||||| |||| |||||    
T  30030043 atgtgaagctgtttaagatgttttgac-attgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatatttaagacgttg-tgaat 30029946  T
Q  225 tgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 315  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| ||||| |  | ||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  30029945 tgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 30029855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 127 - 327
Target Start/End: Original strand, 24153128 - 24153326
Alignment:
Q  127 gtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  24153128 gtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttg 24153226  T
Q  227 caagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24153227 catttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactacctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24153325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 44 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 42386696 - 42386428
Alignment:
Q  44 ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgttt-aaga 142  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||  |||||  | | ||||||| | |||  | |||||||||||| ||||    
T  42386696 ttttgcgaactttgtcgcacgagttgttgtgagttgaaccttggggtagtattgggacttgtttatgatgttaatgataatctgtgaagctgttttaaga 42386597  T
Q  143 tgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattat 242  Q
    ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||   ||||||||| |||||||| ||| |||||  ||||||| ||||    
T  42386596 tgttttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttat 42386498  T
Q  243 gtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42386497 gtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16796874 - 16796670
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16796874 tctcgcctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgcgacctttgttgcacgaattgttaagagttgaacctttgggtagcattaagac 16796775  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    |||||||||| | || |||||    |||||| |||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||    
T  16796774 ttaatgaagaggctaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttg-tttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattattt 16796676  T
Q  202 gaatat 207  Q
    ||||||    
T  16796675 gaatat 16796670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 17672788 - 17672626
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672788 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17672689  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17672688 gc-tatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 29172583 - 29172745
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172583 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29172682  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    | || ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29172683 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 7781347 - 7781509
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781347 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7781446  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7781447 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 9707607 - 9707769
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707607 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 9707706  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    || | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9707707 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 17463340 - 17463178
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463340 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17463241  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17463240 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 34159488 - 34159326
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159488 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34159389  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34159388 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 45606907 - 45607069
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606907 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 45607006  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45607007 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 55476653 - 55476491
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 55476554  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55476553 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 181 - 327
Target Start/End: Original strand, 28848628 - 28848773
Alignment:
Q  181 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgt 280  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||    
T  28848628 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgt 28848726  T
Q  281 tgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28848727 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 8899256 - 8899094
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899256 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8899157  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8899156 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 16454281 - 16454443
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454281 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16454380  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16454381 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 38961891 - 38962053
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961891 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 38961990  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  38961991 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 13151790 - 13151953
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151790 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13151889  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13151890 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 13154255 - 13154418
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154255 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13154354  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13154355 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13544187 - 13544024
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  13544187 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 13544088  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 328  Q
    || | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13544087 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 41124049 - 41123892
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124049 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41123950  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 325  Q
    |    |  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41123949 g----ttgtgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 6469134 - 6469296
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||| ||  |||| ||| || || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469134 tgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6469233  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6469234 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 10247723 - 10247885
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247723 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 10247822  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | || |  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10247823 g-ttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 12567722 - 12567564
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12567722 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 12567623  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 323  Q
    || | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12567622 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 17446655 - 17446816
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446655 tgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17446754  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17446755 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 50242984 - 50242822
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50242984 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50242885  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
     | | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  50242884 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  213 atgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 312  Q
    |||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 55500957  T
Q  313 tgatgaagatgatga 327  Q
    |||| ||||||||||    
T  55500956 tgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 325
Target Start/End: Original strand, 16282811 - 16282971
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282811 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16282910  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 325  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16282911 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 204 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 36166719 - 36166598
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtc 303  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||   ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36166719 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 36166622  T
Q  304 ggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  36166621 ggtctaagttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 183 - 330
Target Start/End: Original strand, 43550497 - 43550644
Alignment:
Q  183 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttg 282  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||  |||  ||     
T  43550497 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtcatta 43550596  T
Q  283 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  43550597 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 147 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 46822449 - 46822267
Alignment:
Q  147 ttgatgactgattatgatgtgatataatgttt-tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtc 245  Q
    ||||||| ||| || ||||||||| | ||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  46822449 ttgatgattgaataagatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtc 46822350  T
Q  246 atgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 328  Q
     || ||||  ||||  ||||||||| |  | ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  46822349 ttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 231 - 327
Target Start/End: Original strand, 12119792 - 12119887
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12119792 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 231 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15412524 - 15412429
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15412524 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 196 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15977645 - 15977515
Alignment:
Q  196 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctg 295  Q
    |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  15977645 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgttatttaactaagctg 15977547  T
Q  296 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15977546 catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 311
Target Start/End: Original strand, 53070653 - 53070799
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  53070653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatact 53070752  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    |  ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070753 g-ttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 8499613 - 8499518
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8499613 tgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 44494904 - 44494809
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||   ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44494904 tgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 10557080 - 10556985
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | |||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10557080 tgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctga-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 204 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21618570 - 21618460
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtc 303  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||   ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21618570 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 21618473  T
Q  304 ggtctaagttgat 316  Q
    |||||||||||||    
T  21618472 ggtctaagttgat 21618460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 12511226 - 12511059
Alignment:
Q  162 gatgtgatataatgttt-tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtat 260  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||  ||||     
T  12511226 gatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattattgaatattgaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaa 12511127  T
Q  261 actgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 328  Q
     ||||||||| |  | ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  12511126 tctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 254 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16103857 - 16103784
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16103857 tttgcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 17737334 - 17737236
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgta---tactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||   || ||| | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17737334 tgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 311
Target Start/End: Original strand, 52523676 - 52523831
Alignment:
Q  158 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatg--ctgtttt 255  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| |||||   |||||| |||| |||||  |||||||    
T  52523676 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaactgtttt 52523775  T
Q  256 tgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
     | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523776 -gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 27165381 - 27165250
Alignment:
Q  196 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagct 294  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||| |||||  |||||||  ||| ||||| |||||| | |||||| |||| ||  |||| ||| ||||||||||||    
T  27165381 atatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgtttt-gcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagct 27165283  T
Q  295 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27165282 gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 232 - 330
Target Start/End: Original strand, 13210350 - 13210448
Alignment:
Q  232 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13210350 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 204 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16097454 - 16097332
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagt 302  Q
    |||||| |||||||||||| |||||   |||||| |||| | ||| || ||| | ||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16097454 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 16097356  T
Q  303 cggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  16097355 cggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 254 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 9512997 - 9512924
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  9512997 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 254 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 9520972 - 9520899
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  9520972 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 254 - 326
Target Start/End: Original strand, 12174303 - 12174376
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12174303 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14179634 - 14179555
Alignment:
Q  127 gtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatat 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||    
T  14179634 gtgaagctgtttaagatgtgttgttgt-tgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 14179555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 14234610 - 14234487
Alignment:
Q  207 tttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatgagtcgg 305  Q
    |||| ||||||||||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||| || |    
T  14234610 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcag 14234512  T
Q  306 tctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  14234511 tctaagttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15471043 - 15470928
Alignment:
Q  211 agatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgt-tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtcta 309  Q
    |||||||||||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15471043 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 15470945  T
Q  310 agttgatgaagatgatg 326  Q
    |||||| || |||||||    
T  15470944 agttgaagatgatgatg 15470928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 327
Target Start/End: Original strand, 45577948 - 45578000
Alignment:
Q  275 tgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45577948 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 327
Target Start/End: Original strand, 53301527 - 53301669
Alignment:
Q  186 tacttgaagaatatttgaatatttaagatgttga-tgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgt 283  Q
    ||||||||  |||| ||||||||| |||| |||| ||| |||||  ||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||  |||| ||| |    
T  53301527 tacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttat 53301625  T
Q  284 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53301626 ttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28194743 - 28194693
Alignment:
Q  277 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28194743 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 32307754 - 32307684
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 323  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32307754 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 330
Target Start/End: Original strand, 24340672 - 24340844
Alignment:
Q  158 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| | | ||||    ||||||||||| ||||| |||| | |    
T  24340672 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgt-g 24340770  T
Q  258 tatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
     ||||||| ||||||  || |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  24340771 catactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 254 - 326
Target Start/End: Original strand, 49668120 - 49668193
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  49668120 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 323
Target Start/End: Original strand, 1644718 - 1644787
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 323  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  1644718 tttgcatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatgacgatg 1644787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 330
Target Start/End: Original strand, 37642214 - 37642386
Alignment:
Q  158 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||| | | || |  | ||||||||||| ||||| |||||| |    
T  37642214 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-g 37642312  T
Q  258 tatactgcctatgttattgttg-ttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
     ||||||||||||||  || |  ||   ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  37642313 catactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 23274832 - 23274705
Alignment:
Q  185 ttacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattg-ttgttgt 283  Q
    |||||||||  |||| ||||||||| |||||||| | | ||||    ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||  || |||||      
T  23274832 ttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaa 23274734  T
Q  284 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 312  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23274733 ttaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 12340025 - 12339988
Alignment:
Q  55 ttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtag 92  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12340025 ttgtcgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtag 12339988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919350
Alignment:
Q  260 tactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtcta 309  Q
    |||| ||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 311
Target Start/End: Original strand, 22110402 - 22110454
Alignment:
Q  260 tactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    |||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110402 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 311
Target Start/End: Original strand, 37251168 - 37251270
Alignment:
Q  211 agatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtc 307  Q
    |||||||| ||| |||||  ||||||| |||| |||||  |||||||  |||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  37251168 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtc 37251266  T
Q  308 taag 311  Q
    ||||    
T  37251267 taag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 43926029 - 43925977
Alignment:
Q  260 tactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    |||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926029 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 843 - 1169
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  843 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgaattgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagac 942  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    |||||||||| |||| |||||  |  |||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  943 ttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttt-tggttgattatgatgtgatataatgttta-tgcattacttgaataatattt 1040  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1041 gaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgag 1140  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1141 tcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 167773 - 168099
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  167773 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgaattgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagac 167872  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    |||||||||| |||| |||||  |  |||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  167873 ttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttt-tggttgattatgatgtgatataatgttta-tgcattacttgaataatattt 167970  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  167971 gaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgag 168070  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  168071 tcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 52239 - 51913
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  52239 tctcgcctcgcgagtgacccagaaactgagtgtcttgttaggttttgcgacc-ttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagac 52141  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  52140 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgta-gattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatt 52042  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  52041 gaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 51942  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51941 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13538 - 13211
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| || ||||||||||||    
T  13538 tctcgcctcgcgagtgacctagaatcagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaaccttgggatagcattaagac 13439  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13438 ttaatgatgatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatattt 13340  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  13339 gaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 13240  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  13239 tcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 27250523 - 27250850
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  27250523 tctcgcctcgcgagtgacacagaaacagagtcccttgttatattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagcattgatac 27250622  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    |||||||||| |||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27250623 ttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgt-tgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatattt 27250721  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||    
T  27250722 gaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgag 27250821  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27250822 tcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21027007 - 21026680
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21027007 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagac 21026908  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    |||||||||| |||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||    
T  21026907 ttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgt-tgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattattt 21026809  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21026808 gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgag 21026709  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21026708 tcggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22532597 - 22532269
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| |||    
T  22532597 tctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgacttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaaccttgaggtagtattgaga 22532498  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||       
T  22532497 cttaatgatgatgttatttatgaactgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaa 22532399  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||||    
T  22532398 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatga 22532299  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22532298 gttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 329
Target Start/End: Original strand, 50210006 - 50210333
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  50210006 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattgaga 50210105  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||       
T  50210106 cttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaa 50210204  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || ||| || |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  50210205 tgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 50210304  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210305 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 22354366 - 22354616
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22354366 tctcgcctcgcaagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttaggtagtattaagac 22354465  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  22354466 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaatattt 22354564  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22354565 gaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 34510108 - 34509783
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggtttt-gcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||| |||    
T  34510108 tctcgcctcacgagtgacccagaaacagagtgtcatgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagggttgaaccttggggtagtattgaga 34510009  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||  |  |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||   ||       
T  34510008 cttaatgatgatgttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaa 34509910  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || ||| ||||||||||| ||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  34509909 tgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 34509810  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  34509809 gtcggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20135515 - 20135188
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttt-tgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||    
T  20135515 tctcacctcgcgagtaacccagaaacagagtgacttgttaggtttatgcgacctttgttgtacgagttgttgagagttgaaccttagggtagtagtaaga 20135416  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    | |||||| | ||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||  |  |    
T  20135415 cctaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttat 20135317  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |  | |||||||||||||||| |||||||    
T  20135316 tgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatga 20135217  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 329  Q
    ||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  20135216 gtcagtctaagttgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 219
Target Start/End: Original strand, 22355969 - 22356185
Alignment:
Q  4 tcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgac-ttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagact 102  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  22355969 tcgcatcgcgagtgacctagaaacagagtgacattgttagattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagact 22356068  T
Q  103 taatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttg 202  Q
    |||||| ||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22356069 taatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttg 22356168  T
Q  203 aatatttaagatgttga 219  Q
    |||||||| ||||||||    
T  22356169 aatatttatgatgttga 22356185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 219
Target Start/End: Original strand, 22357655 - 22357871
Alignment:
Q  4 tcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgac-ttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagact 102  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  22357655 tcgcatcgcgagtgacctagaaacagagtgacattgttagattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagact 22357754  T
Q  103 taatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttg 202  Q
    |||||| ||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22357755 taatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttg 22357854  T
Q  203 aatatttaagatgttga 219  Q
    |||||||| ||||||||    
T  22357855 aatatttatgatgttga 22357871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 38801185 - 38801508
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |  | ||||||| |||||||| ||||||||    
T  38801185 tctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgtacgagttgtcggaagttgaacccttgggtaggattaagac 38801284  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||| | ||  |||  ||||    |||||||||  |||||| | ||| ||  |||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  38801285 ttaataatgagattaactataatttgtgaagctgaataagatatgttgttgt-tgattacgatgtgttataatgttta-tgcattacttgaagaataatt 38801382  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    | |||| ||| |||||||||||||| |  |||||| |||||||| |||||   ||| | ||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||    
T  38801383 gtatatataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcttgctg---ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 38801479  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  38801480 gtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 127 - 329
Target Start/End: Original strand, 22468616 - 22468816
Alignment:
Q  127 gtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||  ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22468616 gtgaagctgtttaagatgtgctgatg--taattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatgttgttgaattg 22468713  T
Q  227 caagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||  | ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  22468714 caattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttg 22468813  T
Q  327 atg 329  Q
    |||    
T  22468814 atg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 116
Target Start/End: Original strand, 20847017 - 20847127
Alignment:
Q  6 gcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaa 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20847017 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaa 20847116  T
Q  106 tgaagatgtta 116  Q
    |||||| ||||    
T  20847117 tgaagaggtta 20847127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13989028 - 13988866
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989028 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13988929  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13988928 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 21923291 - 21923453
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923291 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21923390  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21923391 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 23593735 - 23593897
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593735 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23593834  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23593835 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 45574842 - 45575008
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| |||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45574842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatact 45574941  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  45574942 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 16275363 - 16275526
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 262  Q
    |||||||||||| | | ||||||| |||||   ||| |||||| || ||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275363 tgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16275462  T
Q  263 tgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    || ||||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16275463 tg-ctatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 21475087 - 21475249
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21475186  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21475187 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 31612475 - 31612313
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||||||  | |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 31612376  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
       | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31612375 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 433172 - 433012
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  433172 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatact 433073  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |||| ||||   |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  433072 gcctgtgtt---gccgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21840929 - 21840766
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21840929 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 21840830  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 328  Q
    || | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21840829 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 239 - 330
Target Start/End: Original strand, 20847184 - 20847275
Alignment:
Q  239 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20847184 ttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 29298298 - 29298137
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29298298 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatact 29298200  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29298199 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 29776850 - 29776688
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  29776850 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatact 29776751  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29776750 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 231 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21342191 - 21342090
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  21342191 tgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagt 21342093  T
Q  331 cca 333  Q
    |||    
T  21342092 cca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 231 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21347056 - 21346961
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21347056 tgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 196 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21707297 - 21707167
Alignment:
Q  196 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctg 295  Q
    |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||   | |||| |||||||| |||||||||||||    
T  21707297 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactat-tgtgttgttgttgttatttaactaagctg 21707199  T
Q  296 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21707198 catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 196 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21711839 - 21711709
Alignment:
Q  196 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctg 295  Q
    |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||   | |||| |||||||| |||||||||||||    
T  21711839 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactat-tgtgttgttgttgttatttaactaagctg 21711741  T
Q  296 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21711740 catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16362079 - 16361915
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  || | |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16362079 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatact 16361980  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 329  Q
    |  | ||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16361979 gt-tgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 155 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797569
Alignment:
Q  155 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaat-atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||      
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-- 33797598  T
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgttgttg 282  Q
    ||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  33797597 tttgtatgctgcatatgttgctgttgttg 33797569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 233 - 333
Target Start/End: Original strand, 15860078 - 15860177
Alignment:
Q  233 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcc 332  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  15860078 atattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcc 15860176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 231 - 330
Target Start/End: Original strand, 13212929 - 13213027
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |  ||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13212929 tgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 311
Target Start/End: Original strand, 21861519 - 21861672
Alignment:
Q  158 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    |||| ||||||||||||  | | | |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||| |||||    
T  21861519 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttg 21861617  T
Q  258 tatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
     ||||||||||||||  || |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21861618 catactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 311
Target Start/End: Original strand, 21896205 - 21896358
Alignment:
Q  158 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    |||| ||||||||||||  | | | |||||| ||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||| |||||    
T  21896205 ttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttg 21896303  T
Q  258 tatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    |||||||||||||||  || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21896304 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 22123067 - 22123230
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  | || |||||| || |||  ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22123067 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 22123166  T
Q  264 gcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22123167 gt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 262 - 329
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  262 ctgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 329  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 204 - 326
Target Start/End: Original strand, 22921864 - 22921986
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagt 302  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22921864 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22921962  T
Q  303 cggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||||||||| |||||| |||||||    
T  22921963 cggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 254 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21754122 - 21754052
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 323  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21754122 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 254 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 20248356 - 20248283
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20248356 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 48603716 - 48603637
Alignment:
Q  127 gtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatat 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||    
T  48603716 gtgaagctgtttaagatgtgttgttgt-tgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 48603637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 241 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21714631 - 21714546
Alignment:
Q  241 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |  | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21714631 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 311
Target Start/End: Original strand, 35261053 - 35261180
Alignment:
Q  181 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-g 279  Q
    |||||||||||||  || | ||||| ||| ||||||||||   |||||  ||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||  |||| |    
T  35261053 tgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttg 35261148  T
Q  280 ttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261149 tttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 40389249 - 40389157
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||   ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  40389249 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-atgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatga 40389157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 330
Target Start/End: Original strand, 14295574 - 14295672
Alignment:
Q  232 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  14295574 gatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 33681133 - 33681011
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagt 302  Q
    |||||| ||||||||| || |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  33681133 atatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagt 33681035  T
Q  303 cggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||||||||||||| || |||||||    
T  33681034 cggtctaagttgaagatgatgatg 33681011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 315
Target Start/End: Original strand, 52928014 - 52928076
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 315  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928014 tttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 303
Target Start/End: Original strand, 21787988 - 21788136
Alignment:
Q  155 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtt 253  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| |||| || || ||||||||  | |||||||||||    
T  21787988 tgattatgatgttatataatgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattacgaagtcatgctgtt 21788086  T
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtc 303  Q
     ||||   ||||||||| |  | | ||| |||||||||| ||||||||||    
T  21788087 gttgtgatctgcctatgctgctatggttatttaactaagttgcatgagtc 21788136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20918702 - 20918620
Alignment:
Q  232 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 314  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918702 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22237753 - 22237631
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagt 302  Q
    |||||| |||||||||||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | ||| |||||||||   |||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  22237753 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagt 22237655  T
Q  303 cggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||||||||||||| || |||||||    
T  22237654 cggtctaagttgaagatgatgatg 22237631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16758726 - 16758664
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 315  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16758726 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21161769 - 21161720
Alignment:
Q  277 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  21161769 ttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgatgatgatgatg 21161720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 260 - 311
Target Start/End: Original strand, 21533923 - 21533974
Alignment:
Q  260 tactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    |||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  21533923 tactgcgtatgttgttgttgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 21533974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 311
Target Start/End: Original strand, 50614167 - 50614219
Alignment:
Q  260 tactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    |||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614167 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 311
Target Start/End: Original strand, 50621995 - 50622047
Alignment:
Q  260 tactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    |||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621995 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 5915 - 6245
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| | ||||||| || ||||||||||||    
T  5915 tctcgcctcgttagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttatcgagagtggaaccttgggatagcattaagac 6014  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6015 ttaatgatgatgttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatattt 6113  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttg---tttaactaagctgcat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||   ||||||||||||||||    
T  6114 gaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcat 6213  T
Q  299 gagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6214 gagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 2176 - 1851
Alignment:
Q  4 tcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagactt 103  Q
    ||||||| |||||||| |  |||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| ||||||||||    
T  2176 tcgcctcacgagtgaccctaaaacagagtgccttgttagattttgtgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagtattaagactt 2077  T
Q  104 aatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttga 203  Q
    ||||| ||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2076 aatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttga 1978  T
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1977 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 1878  T
Q  304 ggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  1877 ggtctaagttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 39088 - 38761
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggtttt-gcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  39088 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacatagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaaga 38989  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  38988 cttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataat 38890  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  38889 tgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatga 38791  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38790 ctcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 127 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 33143 - 32942
Alignment:
Q  127 gtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | |||    
T  33143 gtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttg 33045  T
Q  227 caagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33044 catttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatg 32946  T
Q  327 atgt 330  Q
    ||||    
T  32945 atgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 231 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 9844 - 9744
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  9844 tgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagt 9746  T
Q  331 cc 332  Q
    ||    
T  9745 cc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23209 - 22886
Alignment:
Q  3 ctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggtttt-gcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  23209 ctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagac 23110  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  23109 ttaatgatgatgttatttataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatt 23011  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23010 gaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 22912  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22911 tcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 312
Target Start/End: Original strand, 24095 - 24406
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| || || ||| ||||||||    
T  24095 tctcgcctcgcgagtgacctagaaacaaagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaactttgggatagtattaagac 24194  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||| ||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24195 ttattgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatattt 24294  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24295 gaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 24394  T
Q  301 gtcggtctaagt 312  Q
    ||||||||||||    
T  24395 gtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 8326 - 8650
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttggg-tagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||| |||  ||    
T  8326 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgaccttcgttgcacgagttgttgagagttgaacgttgggggtagtattggga 8425  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  8426 cttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataat 8524  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  8525 tgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgcctatg---ttgctgttatttaactaagctgcatga 8620  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8621 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21238 - 20910
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  21238 tctcgcctcgtgagtgacccaaaaacagagtgacttgttgagttttgcgacctttgttgcacgagttgatcagagttgaacctttgggtagtattaagac 21139  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  21138 ttaatgaagatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacattt 21040  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||  || |||||  |||||||||||  ||||    
T  21039 gaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatga 20940  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  20939 gtcggtctaagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 5171 - 4849
Alignment:
Q  6 gcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaa 105  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5171 gcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttag-ttttgccacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttggctagcaataagacttaa 5073  T
Q  106 tgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaat 205  Q
    |||||  ||||  ||||  | ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||    
T  5072 tgaaggggttagctataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgt-tgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaat 4974  T
Q  206 atttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcgg 305  Q
    | ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4973 acttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcgg 4874  T
Q  306 tctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  4873 tctaagttgttgaagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8802 - 8479
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||    
T  8802 tctcgcctcgcgaatgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtagtattaagac 8703  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| ||||||| ||| |  | ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||| | | ||    
T  8702 ttaatgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgt-tgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagtacactt 8608  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||||    
T  8607 gaatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgag 8508  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8507 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 40240 - 39913
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggt-tttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  40240 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtaccttgttaggtgtttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgaga 40141  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||  | |||||||| |||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  40140 cttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataat 40042  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
      |||||||||||||||  |||  ||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  40041 caaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatga 39943  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  39942 gttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 311
Target Start/End: Original strand, 19885 - 19987
Alignment:
Q  211 agatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtc 307  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||| |||| |||||  |||||||  |||||||||||||||  |||| |||  |||| |||||||||||||||||||    
T  19885 agatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtc 19983  T
Q  308 taag 311  Q
    ||||    
T  19984 taag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 2279 - 1952
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  2279 tctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacatgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagac 2180  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    |||||||  | |||||| |||    || ||||||| || ||| | ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  2179 ttaatgataaggttattaataatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgt-tgattatgatgagatataatgttttatgcattacttgaataatgttt 2081  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||    
T  2080 gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgttgttaattaactaagctgcatgag 1981  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||    
T  1980 tcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 10220 - 10544
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  10220 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtagaattaagac 10319  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||| |  | |||| |||||  | |||||||||| |||||| | | | ||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  10320 ttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttga-tgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatattt 10417  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  || |||||  ||||||| |||||||||    
T  10418 gtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatga 10514  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10515 gtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13419 - 13150
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  |||    
T  13419 tctcgcctcgcgagtgacccagaaactgagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggac 13320  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  13319 ttaatgaagatgttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatt 13221  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 272  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13220 gaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 13150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 255 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 34199 - 34123
Alignment:
Q  255 ttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34199 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 328 - 273
Alignment:
Q  275 tgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  328 tgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 15259 - 15584
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  | |||||||| ||||||||    
T  15259 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgactcgttgggtaggattaagac 15358  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||| |  | |||| |||||  | |||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  15359 ttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttga-tgattatgatgtgatataat-atttatgcattacttgaagaatattt 15456  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
      |||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||    
T  15457 ttatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgag 15555  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||    
T  15556 tcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 323
Target Start/End: Original strand, 25858 - 26179
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||  |||||||| |||||| ||| |||    
T  25858 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagctgaaccttggggtagtattgaga 25957  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||  |  |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||       
T  25958 cttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaa 26056  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || ||| || ||| |||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26057 tgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 26156  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatg 323  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26157 gtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 204 - 327
Target Start/End: Original strand, 44702 - 44825
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtc 303  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44702 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 44801  T
Q  304 ggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
     |||||||||||| ||||||||||    
T  44802 agtctaagttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Original strand, 33288 - 33463
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  |||   || ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  33288 tctcgcctcgcgtgtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcatacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgaga 33387  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgtt 177  Q
    |||||||| ||||||| |||||  |  |||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  33388 cttaatgatgatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgtt 33463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13822 - 13497
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  13822 tctcgcctcgcgagcgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacttttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttcggtaggattaagac 13723  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||  | || |||| |||||  | |||||||||| |||||| | | | ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  13722 ttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgt-tgattatgatgtgatataatgttta-tgcattacttgaagaatgttt 13625  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    | |||  |||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  13624 gtatacataagatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 13526  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13525 tcggtctaagttgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 39804 - 39479
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||| |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||| ||| |||    
T  39804 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgaga 39705  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||| | ||||||| |||||  |  |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||       
T  39704 cttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaa 39606  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || |||||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  39605 tgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 39507  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgat 328  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39506 gtcggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 328
Target Start/End: Original strand, 75008 - 75333
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||| |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||| ||| |||    
T  75008 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgaga 75107  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||| | ||||||| |||||  |  |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||       
T  75108 cttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaa 75206  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || |||||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  75207 tgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 75305  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgat 328  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  75306 gtcggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 26213 - 25896
Alignment:
Q  12 cgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaag 110  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  26213 cgagtgacccagaaaccaagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgagg 26114  T
Q  111 atgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatattta 210  Q
    |||||| |||||  | ||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  26113 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttg 26015  T
Q  211 agatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaa 310  Q
    |||||||| | | |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  26014 agatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaa 25916  T
Q  311 gttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  25915 gttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 40184 - 39858
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  40184 tctcgcctcgcgggtgacctagaaaccgagtgccttgttatgattttgcgacctttgttgcacaatttgttgagagttgaacctt-gggtagcattgaga 40086  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||    ||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| |    
T  40085 cttaatgaggatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataat 39987  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    ||||||||| |||||||| | | |||||  |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||| |||||    
T  39986 tgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatatttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatga 39888  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  39887 gttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 32391 - 32067
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  32391 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagttacttttttgattttgcgacctttgttgctctagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagac 32292  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||  | || |||| |||||  | |||||||||| |||||| | | | ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32291 ttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgt-tgattatgatgtgatataatgttta-tgcattacttgaagaatattt 32194  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    | |||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  32193 gtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 32096  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32095 tcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 329
Target Start/End: Original strand, 17008 - 17337
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||| |||    
T  17008 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtaccttattaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttaaaccttggggtagtattgaga 17107  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||| | ||||||| |||||  | || ||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||       
T  17108 cttaatcatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaa 17206  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttt--tgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcat 298  Q
    || ||| || |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  17207 tgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcat 17306  T
Q  299 gagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17307 gagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 311
Target Start/End: Original strand, 79301 - 79430
Alignment:
Q  181 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgt 280  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||    
T  79301 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactgtc-gtgttgctgttgt 79399  T
Q  281 tgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  79400 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 330
Target Start/End: Original strand, 2987 - 3271
Alignment:
Q  44 ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagat 143  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||    
T  2987 ttttgcgacctgtgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagctgtttaagat 3086  T
Q  144 gtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatg 243  Q
    |  ||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  3087 gcgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 3185  T
Q  244 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3186 tcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 124912 - 124675
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  124912 tctcgcctcgcgagtgacccagaaaaagagtgtcttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagac 124813  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  124812 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatattt 124714  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattatt 240  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  124713 gaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 261 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  261 actgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 174936 - 174767
Alignment:
Q  159 tatgatgtgatataatgttttgt-gcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||   |||||  || |||||||| ||||||| |  |||||| || |||||||||||||   |    
T  174936 tatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtt---g 174840  T
Q  258 tatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 329  Q
    |||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  174839 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 5039 - 4712
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggtttt-gcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    ||||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||    
T  5039 tctcgcctcgcaagtgacccataataagagtgacttgttagatttttgcaacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaacctttgggtaggattaaga 4940  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||  | || ||||  ||||  | |||||| ||| |||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  4939 cttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgt-tgattatgatgtgatataatgttta-tgccttacttgaagaatatt 4842  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || |||  |||||| |||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  4841 tgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 4742  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4741 gtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 263 - 1
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggtttt-gcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    ||||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||    
T  263 tctcgcctcgcaagtgacccataataagagtgacttgttagatttttgcaacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaacctttgggtaggattaaga 164  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||  | || ||||  ||||  | |||||| ||| |||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  163 cttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgt-tgattatgatgtgatataatgttta-tgccttacttgaagaatatt 66  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 265  Q
    || |||  |||||| |||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  65 tgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 327
Target Start/End: Original strand, 339744 - 340065
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  339744 tctcgcctcgcgagtgacccagaaatagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagtcgttaagggttgaaccttggggtagtattgagac 339843  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||||| || |||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||  ||   |    
T  339844 ttaatgatgacgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaat 339942  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    | ||| || |||||||| ||| ||| |  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  339943 gtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgttg-tgttatttaactaagctgcatgag 340039  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  340040 tcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 158450 - 158612
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 158549  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  158550 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 155 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 71474 - 71349
Alignment:
Q  155 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaat-atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||      
T  71474 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg-- 71378  T
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgttgttg 282  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  71377 tttgtatgctgcctatgttgctgttgttg 71349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6937 - 6669
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||     
T  6937 tctcgcctcgcgagtgacccataaacagagtgacatgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagat 6838  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    |||||||  | ||||||||||  | || ||||||| || ||| | ||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  6837 ttaatgataaggttatttataatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgt-tgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataatgttt 6739  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 271  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6738 gaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 4835 - 4508
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||  || |||||| |||||||| || ||| |||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  4835 tctcgcttcgcgagtgacccagaaacagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgaga 4736  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||       
T  4735 cttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaa 4637  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || |||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4636 tgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatga 4538  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4537 gtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12417 - 12090
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||  || |||||| |||||||| || ||| |||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  12417 tctcgcttcgcgagtgacccagaaacagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgaga 12318  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||       
T  12317 cttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaa 12219  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || |||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12218 tgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatga 12120  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12119 gtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22369 - 22042
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||  || |||||| |||||||| || ||| |||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  22369 tctcgcttcgcgagtgacccagaaacagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgaga 22270  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||       
T  22269 cttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaa 22171  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || |||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22170 tgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatga 22072  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22071 gtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 16393 - 16721
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| || |||||||| |  ||| |||| |||||||  || ||||||||| |||||| ||| |||    
T  16393 tctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgccttgttgggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaggagttgaaccttggggtagtattgaga 16492  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||       
T  16493 cttaatgatgatgttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattttgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaa 16591  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    || ||| || ||||| || ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16592 tgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 16691  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16692 gtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 846 - 1170
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||| |||||| |    
T  846 tctcgcctcgcgagtaacccagaaacagagtgacttgttagattttgcaacctttgttgcacgatttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagtc 945  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||  | || ||||  ||||  | |||||||||| ||| || | ||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  946 ttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgtataaaatatgttgttg-ttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatattt 1043  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt-attgttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    | |||  |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||  || ||  |||||||||||||||||    
T  1044 gtatacataagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatg---ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatga 1140  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1141 gtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 5)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 330
Target Start/End: Original strand, 32755 - 33077
Alignment:
Q  5 cgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagactt 103  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||| |||||||| |  ||| |||| | ||||| ||| ||||||||| |||||| ||| | ||||    
T  32755 cgcctcgcgagtgacccataaacagaatgtcttgttaggattttgcgatctgtgtcgcaccaattgttaagagttgaaccttggggtagtattgaaactt 32854  T
Q  104 aatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaa-gatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttg 202  Q
    | ||||| ||||| |||||  | |||||||| ||| | ||||   |||||  |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||| | |    
T  32855 attgaaggtgttagttataatctgtgaagctattttatgatgc--tgatgt-tgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-g 32950  T
Q  203 aatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagt 302  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||||||    
T  32951 aatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagt 33049  T
Q  303 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33050 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 46250 - 45928
Alignment:
Q  5 cgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagactt 103  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||| |||||||| |  ||| |||| | ||||| ||| ||||||||| |||||| ||| | ||||    
T  46250 cgcctcgcgagtgacccataaacagaatgtcttgttaggattttgcgatctgtgtcgcaccaattgttaagagttgaaccttggggtagtattgaaactt 46151  T
Q  104 aatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaa-gatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttg 202  Q
    | ||||| ||||| |||||  | |||||||| ||| | ||||   |||||  |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||| | |    
T  46150 attgaaggtgttagttataatctgtgaagctattttatgatgc--tgatgt-tgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-g 46055  T
Q  203 aatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagt 302  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||||||    
T  46054 aatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagt 45956  T
Q  303 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45955 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 231 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16212 - 16113
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16212 tgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 16410 - 16331
Alignment:
Q  7 cctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggtttt-gcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctt 85  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16410 cctcgcaagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctt 16331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 330
Target Start/End: Original strand, 17395 - 17450
Alignment:
Q  275 tgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17395 tgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 47313 - 46995
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  47313 tctcgcctcgcgagtgacccaaaaccagagtgacttgttagaaatggcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagac 47214  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||  | ||       ||||  | |||||||||| |||||| | ||| ||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  47213 ttaacaatgag------tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttga-tgtttatgatgtgatataatgttta-tgcattacttggagaatattt 47122  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    | |||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    |||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  47121 gtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ctgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatga 47025  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  47024 gtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16606 - 16282
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||| || | |||| ||||||  |||||||| ||||||||    
T  16606 tctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttggattttgtgacctttgttgcacgatttctcgagagttgaacgcttgggtaggattaagac 16507  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||| | || ||||  ||||  | |||||||||  |||||| | ||| ||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  16506 ttaataatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgt-tgattatgatgtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgttt 16409  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttg-ttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    | |||  ||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||||||||||    
T  16408 gtatacataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatga 16312  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16311 gtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 7590 - 7266
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  7590 tctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttggagtttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagac 7491  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||  | || ||||  ||||  |  ||||||||  |||||| | ||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  7490 ttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgt-tgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgttt 7393  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    | |||  |||||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||||| ||||   |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7392 gtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatga 7296  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7295 gtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 1613 - 1289
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  1613 tctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttggagtttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagac 1514  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||  | || ||||  ||||  |  ||||||||  |||||| | ||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  1513 ttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgt-tgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgttt 1416  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    | |||  |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||   ||| ||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  1415 gtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 1319  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1318 gtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 262 - 327
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  262 ctgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 51906 - 51582
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  51906 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacttttgttgcacgagttgtcgagaattggacccttgggtaggattaagac 51807  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||    || ||||  ||||  | |||||||||  |||||| | ||| ||  ||| ||||| ||| ||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||    
T  51806 ttaagagtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttg-ttgaatatgaagtgttataatg-tttatgcatttcttgaaggatattt 51709  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    | |||  |||||||||||||||||| |  || ||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||    
T  51708 gtatacataagatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 51612  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  51611 gtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 192 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 28552 - 28414
Alignment:
Q  192 aagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaa 291  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28552 aagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaa 28453  T
Q  292 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28452 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 232 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 2095 - 1997
Alignment:
Q  232 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2095 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 232 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11390 - 11292
Alignment:
Q  232 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11390 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 277 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4552
Alignment:
Q  277 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 127 - 329
Target Start/End: Original strand, 3105 - 3306
Alignment:
Q  127 gtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||||||     
T  3105 gtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatta 3203  T
Q  227 caagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3204 catttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 3303  T
Q  327 atg 329  Q
    |||    
T  3304 atg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4851 - 4545
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    ||||||||||| ||  || |||||||||| || | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| ||| |||    
T  4851 tctcgcctcgcaagctacccagaaacagaatgccatgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttgaggtagtattgaga 4752  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgttt-aagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatat 199  Q
    |||| ||||||||||| |||||    |||| ||||||| |||||||  |||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||     
T  4751 cttattgaagatgttaattataatttgtgaggctgttttaagatgt--tgatgt-tgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataa 4655  T
Q  200 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatg 299  Q
     |||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||| || || ||||| | ||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  4654 atgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgttgttatttaactaagttgcatg 4555  T
Q  300 agtcggtcta 309  Q
    ||||||||||    
T  4554 agtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 327
Target Start/End: Original strand, 4925 - 5246
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||     
T  4925 tctcgcctcgcgagtgacacagaaacagagtgacttattggattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagat 5024  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    ||||| |  | |||| |||||    ||||| |||  ||| || | ||| ||  |||||| |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| |||    
T  5025 ttaataataaggttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgt-tgattaagatgtgttataatgttta-tacattacttgaagaatgttt 5122  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatga 300  Q
    | |||  |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||   ||||| | ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  5123 gtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatga 5219  T
Q  301 gtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||    
T  5220 gtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 150
Target Start/End: Original strand, 17790 - 17929
Alignment:
Q  11 gcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaag 110  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  17790 gcgagtcacccagaaatagagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagtattaagacttaatgagg 17889  T
Q  111 atgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattga 150  Q
    |||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||    
T  17890 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttga 17929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1241 - 1037
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||| |||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  1241 tctcgcctcacgagtgacccggaaacaaagtgccttgtgagactttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacttttgggtagtattaagac 1142  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    |||||||||| | || |||||  | |||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||    
T  1141 ttaatgaagaggctaattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttg-ttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattattt 1043  T
Q  202 gaatat 207  Q
    ||||||    
T  1042 gaatat 1037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 271
Target Start/End: Original strand, 759 - 1021
Alignment:
Q  5 cgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagactt 103  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||    
T  759 cgcctcgtgagtgacctagaaacagagagtcttgttaggatttttcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagactt 858  T
Q  104 aatgaagatgttatttat-ataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttg 202  Q
    ||||  |||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||  |||    
T  859 aatggtgatgctatttatgata-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtc-gattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattg 956  T
Q  203 aatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 271  Q
    ||||||| |||| ||| ||| |||| | ||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  957 aatatttgagattttgttgacttgc-attgatattattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 264 - 330
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28158 - 27911
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| | |  ||| |||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  28158 tctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcaatctgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgaga 28059  T
Q  101 cttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||  | |||||| |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||       
T  28058 cttaatgatgatgttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaa 27960  T
Q  201 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgc 249  Q
    || |||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  27959 tgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 294 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27913 - 27878
Alignment:
Q  294 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27913 tgcatgagtcggtctaagtttatgaagatgatgatg 27878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 208 - 330
Target Start/End: Original strand, 11442 - 11564
Alignment:
Q  208 ttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtc 307  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  11442 ttaacatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtt 11541  T
Q  308 taagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  11542 taagttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Original strand, 11307 - 11450
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  11307 tctcacctcgcgagtgacacagaaacaaagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtagagagttgaacctttgggtagaattaagac 11406  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgt 145  Q
    ||||||| || |||| |||||  | ||||||||| |||| ||||    
T  11407 ttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctgattaacatgt 11450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 3808 - 3640
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  3808 tctcgtctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagac 3709  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatat 171  Q
    |||||||||| | || |||||  | ||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||    
T  3708 ttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttg-ttgattatgatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 7872 - 7704
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  7872 tctcgtctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagac 7773  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatat 171  Q
    |||||||||| | || |||||  | ||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||    
T  7772 ttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttg-ttgattatgatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 315
Target Start/End: Original strand, 27698 - 27855
Alignment:
Q  158 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    |||| ||||||||||||  | | ||||||||| |||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| || ||  ||||||| |||| |||||||||||| |    
T  27698 ttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctgtttt-g 27796  T
Q  258 tatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 315  Q
     ||||| |||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27797 catactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 311
Target Start/End: Original strand, 51678 - 51985
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  51678 tctcacctcgctagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggggtagcattaagac 51777  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactga-ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 200  Q
    || |  | ||| ||| ||| |    ||||||||| ||| ||  |||| |||  ||| |||||||||||||||||| | |  |||||||||||||  ||      
T  51778 ttgaatatgatattaattacaatttgtgaagctg-ttatgagatattaatg-ttgatttatgatgtgatataatg-tatacgcattacttgaagtttaaa 51874  T
Q  201 tgaatatttaagatg-ttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatg 299  Q
    |||||| || ||||| ||| ||  |||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||  |  ||| |||||||||||||||||||    
T  51875 tgaataattgagatgattgttggcttgc-attgatattattatgtcttgctatttttgaatgctgcctatgtgctgtttgatgtttaactaagctgcatg 51973  T
Q  300 agtcggtctaag 311  Q
    ||||||||||||    
T  51974 agtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 32635 - 32538
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 329  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  32635 tgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatg 32539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20909 - 20747
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20810  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20809 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 37983 - 37821
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 37884  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37883 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 94573 - 94411
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94573 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 94474  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  94473 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 323
Target Start/End: Original strand, 17440 - 17598
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17440 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17539  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 323  Q
    | || ||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17540 g-ctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 181 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 44600 - 44454
Alignment:
Q  181 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgttttt-gtatactgcctatgttattgttg 279  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||  |||||    
T  44600 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgttg 44502  T
Q  280 ttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44501 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 203 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 100501 - 100378
Alignment:
Q  203 aatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgag 301  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||   ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  100501 aatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 100403  T
Q  302 tcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  100402 tcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 254 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101503
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119875
Alignment:
Q  259 atactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 283 - 326
Target Start/End: Original strand, 40248 - 40291
Alignment:
Q  283 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  40248 tttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 326
Target Start/End: Original strand, 38429 - 38596
Alignment:
Q  159 tatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| |||| || || ||||||||  | |||||| |||| |||    
T  38429 tatgatgtgatataacgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtcatgttgttgttg 38527  T
Q  258 tatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |   ||| ||||| |  | ||||| |||||||||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  38528 tgatctgtctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 38596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 181 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13537 - 13392
Alignment:
Q  181 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgt 280  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||    
T  13537 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgt 13439  T
Q  281 tgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13438 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4856 - 4694
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4856 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4757  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    | || ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4756 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 14109 - 13947
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14109 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14010  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14009 g-ttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 82234 - 82072
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82234 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 82135  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
      || ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  82134 -actgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 315
Target Start/End: Original strand, 22665 - 22776
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagt 302  Q
    |||||| |||||||||||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||||||   |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22665 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22763  T
Q  303 cggtctaagttga 315  Q
    |||||||||||||    
T  22764 cggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 136842 - 136680
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  136842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 136743  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  136742 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 139311 - 139149
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  139311 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 139212  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  139211 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 144249 - 144087
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  144249 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 144150  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  144149 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 134373 - 134211
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  134373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 134274  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  134273 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 141780 - 141618
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  141780 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 141681  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  141680 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 62296 - 62200
Alignment:
Q  232 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 328  Q
    |||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||    
T  62296 gatattattataccatgatgtttttc-atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagtcgaagatgatgatgat 62200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 132711 - 132662
Alignment:
Q  277 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  132711 ttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8613 - 8481
Alignment:
Q  183 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattg-ttgtt 281  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  8613 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtt 8515  T
Q  282 gtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 315  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8514 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 204 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6661 - 6535
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagt 302  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  6661 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 6563  T
Q  303 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6562 cggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11286
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11450 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11351  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 329  Q
    | || ||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  11350 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatg 11286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12931 - 12861
Alignment:
Q  155 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 226  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  12931 tgattatgatgtattataatgttta-tgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg 12861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 4459 - 4300
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||| || || ||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4459 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4360  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 324  Q
     | | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4359 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 10935 - 10772
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10935 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 10836  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 328  Q
    || | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10835 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 20730 - 20595
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttaggttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagac 101  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |  ||||||||||||    
T  20730 tctcgcctcgcgagcgacctagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggaatagcattaagac 20631  T
Q  102 ttaatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtt 137  Q
    ||||||| |||||||  ||||  | |||||||||||    
T  20630 ttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtt 20595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16946 - 16784
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16946 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 16847  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
     | | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16846 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128751
Alignment:
Q  163 atgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 262  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| | |      
T  128917 atgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt-ttttt 128819  T
Q  263 tgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |   | ||||  | ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  128818 tttttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 311
Target Start/End: Original strand, 20379 - 20524
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20379 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 20477  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20478 ga-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 501246 - 501088
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  501246 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 501147  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 323  Q
    || | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  501146 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 327
Target Start/End: Original strand, 85647 - 85742
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  85647 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 254 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 160761 - 160688
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||| ||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  160761 tttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 155 - 282
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15487
Alignment:
Q  155 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaa-tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||      
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-- 15458  T
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgttgttg 282  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  15459 tttgtatgctgcctatgttgatgttgttg 15487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 36248 - 36199
Alignment:
Q  262 ctgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    ||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36248 ctgcctatgttgttgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaag 36199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 231 - 324
Target Start/End: Original strand, 1348 - 1440
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1348 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-catgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12220 - 12064
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12220 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatact 12121  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||   |||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12120 gc---tgt----gttgctgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 106
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  268 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 169  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
       | ||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  168 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 40562 - 40400
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||   ||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40562 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatact 40463  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |  | ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40462 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 164 - 329
Target Start/End: Original strand, 12249 - 12413
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  | || |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  12249 tgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattct 12348  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 329  Q
    || | ||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12349 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 9404 - 9241
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    |||||||||||  | | |||||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9404 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 9305  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 328  Q
    |  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9304 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 29720 - 29558
Alignment:
Q  165 gtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||    
T  29720 gtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtcttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatct 29621  T
Q  264 gcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
     |||||| || | ||||| ||||||||||   |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  29620 acctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 10488 - 10323
Alignment:
Q  5 cgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagactt 103  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| |||||||| |  ||| |||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  10488 cgcctcgcgagtgacctagaaacaaagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagactt 10389  T
Q  104 aatgaagatgttatttatataccgtgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgata 170  Q
    ||| | ||||||| | |||  | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  10388 aataatgatgttaataataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 103 - 267
Target Start/End: Original strand, 3424 - 3588
Alignment:
Q  103 taatgaagatgttatttatataccgtgaagctgttt-aagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 201  Q
    |||||| ||||||| |||||  |  ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||   |    
T  3424 taatgatgatgttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagt 3522  T
Q  202 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 267  Q
    | ||| || |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3523 gtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4377 - 4214
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 262  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4377 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatac 4278  T
Q  263 tgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||| | |||   ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4277 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 204 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 116551 - 116430
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtc 303  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||   ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  116551 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 116454  T
Q  304 ggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  116453 ggtctaagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 30027 - 29946
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30027 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 254 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6688 - 6611
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6688 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 254 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 14068 - 13991
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14068 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 254 - 330
Target Start/End: Original strand, 6167 - 6244
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6167 tttgcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 254 - 330
Target Start/End: Original strand, 15821 - 15898
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15821 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178898
Alignment:
Q  277 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 161089 - 161252
Alignment:
Q  164 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 262  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  || | |||||| || |||||||||| || |||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  161089 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatac 161188  T
Q  263 tgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||| | |||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  161189 tgc-tgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 204 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 255 - 133
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagt 302  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  255 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaat 157  T
Q  303 cggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  156 cggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13301 - 13147
Alignment:
Q  158 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaata-tttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgttttt 256  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||  ||| |||||||| ||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||||     
T  13301 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt- 13203  T
Q  257 gtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13202 gcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 315
Target Start/End: Original strand, 16049 - 16206
Alignment:
Q  158 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  ||||  |||| ||| |||||||| ||| || ||  ||||||| |||| ||||| |||||| |    
T  16049 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgttgtttt-g 16147  T
Q  258 tatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 315  Q
     ||||| |||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16148 catactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2680
Alignment:
Q  260 tactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 232 - 330
Target Start/End: Original strand, 1092 - 1190
Alignment:
Q  232 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1092 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 330
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1155
Alignment:
Q  259 atactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 232 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15759 - 15664
Alignment:
Q  232 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15759 gatattattatatcatgatggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 327
Target Start/End: Original strand, 2196 - 2291
Alignment:
Q  231 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  2196 tgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaaaatgatga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 330
Target Start/End: Original strand, 17976 - 18148
Alignment:
Q  158 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| | | ||||    ||||||||||| ||||| |||| | |    
T  17976 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgt-g 18074  T
Q  258 tatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
     ||| ||| ||||||  || |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  18075 cataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 254 - 326
Target Start/End: Original strand, 28813 - 28887
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgt--tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||| ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28813 tttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 204 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19390 - 19268
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagt 302  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19390 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 19292  T
Q  303 cggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  19291 cggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 311
Target Start/End: Original strand, 53498 - 53651
Alignment:
Q  158 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    |||| ||||||||||||  | | | |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||| || |||||    
T  53498 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttg 53596  T
Q  258 tatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
     ||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  53597 catactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 186 - 327
Target Start/End: Original strand, 38679 - 38820
Alignment:
Q  186 tacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtt 284  Q
    ||||||||  |||| | ||||||| |||| ||||||| |||||  ||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||  |||| ||| ||    
T  38679 tacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttatt 38777  T
Q  285 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 327  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38778 taactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 29262 - 29117
Alignment:
Q  161 tgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttga--atatttaagatgttgat-gaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |  ||||  ||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  29262 tgatgtgatataatgttgtgtgtattacttgaagttttattgaatatatttaaggtgttgttaaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttg 29163  T
Q  258 tatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtc 303  Q
    ||  || |||||| || | ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29162 taatctacctatgctactattgttatttaactaagatgcatgagtc 29117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 254 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 1159 - 1086
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1159 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagatg 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1051
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagt 302  Q
    |||||| |||||||||||| | | |  ||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1158 atatttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 1060  T
Q  303 cggtctaag 311  Q
    |||||||||    
T  1059 cggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12889 - 12766
Alignment:
Q  207 tttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcgg 305  Q
    |||| ||||||||||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | ||| |||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  12889 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcgg 12791  T
Q  306 tctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  12790 tctaagttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 326
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2762
Alignment:
Q  259 atactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13062 - 12943
Alignment:
Q  207 tttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcgg 305  Q
    |||| ||||||||||| |||||   |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  13062 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 12964  T
Q  306 tctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  12963 tctaagttgaagatgatgatg 12943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 326
Target Start/End: Original strand, 2801 - 2923
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagt 302  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||  ||||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2801 atatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 2899  T
Q  303 cggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||||||||| |||||| |||||||    
T  2900 cggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12693 - 12587
Alignment:
Q  205 tatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatgagtc 303  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  || |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  12693 tatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtc 12595  T
Q  304 ggtctaag 311  Q
    ||||||||    
T  12594 ggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 130031 - 129917
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgt-tgttgtttaactaagctgcatgagt 302  Q
    |||||| |||||||||||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  ||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  130031 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagt 129933  T
Q  303 cggtctaagttgatga 318  Q
    ||||||||||||||||    
T  129932 cggtctaagttgatga 129917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 311
Target Start/End: Original strand, 60687 - 60818
Alignment:
Q  181 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcat--gctgtttttgtatactgcctatgttattg-t 277  Q
    |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| |||| | |||||||  ||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||  || |    
T  60687 tgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgc-attgatattggtatatcatgagctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtt 60784  T
Q  278 tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  60785 tgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 326
Target Start/End: Original strand, 14692 - 14814
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagt 302  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||   ||||||| ||| ||||| || |||| | |||||||||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||    
T  14692 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagt 14790  T
Q  303 cggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  14791 cggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11636 - 11464
Alignment:
Q  158 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||| | | || |  | ||||||||||| ||||| |||||| |    
T  11636 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-g 11538  T
Q  258 tatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
     ||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||    
T  11537 catactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 26996 - 26828
Alignment:
Q  155 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatg-ctgtt 253  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||||| ||||  |||||  ||||    
T  26996 tgattatgatgtattataatgttta-tgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataatta--tcatgattgtt 26901  T
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
     |||||  ||||||||| |  | ||||| |||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| || ||||||    
T  26900 gttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagatgcatgagtcgatataagatgattaaaatgatg 26828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 241 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23928 - 23843
Alignment:
Q  241 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |  | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23928 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatggtgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 326
Target Start/End: Original strand, 45860 - 45909
Alignment:
Q  277 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45860 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 330
Target Start/End: Original strand, 38205 - 38377
Alignment:
Q  158 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||| | | || |  | ||||||||||| ||||| |||||| |    
T  38205 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-g 38303  T
Q  258 tatactgcctatgttattg-ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 330  Q
     ||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||    
T  38304 catactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 315
Target Start/End: Original strand, 10536 - 10647
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagt 302  Q
    |||||| |||||||||||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  10536 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagt 10634  T
Q  303 cggtctaagttga 315  Q
    |||||||||||||    
T  10635 cggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 5769 - 5655
Alignment:
Q  204 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagt 302  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||||||||  |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  5769 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagt 5671  T
Q  303 cggtctaagttgatga 318  Q
    ||||||||||||||||    
T  5670 cggtctaagttgatga 5655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 32197 - 32102
Alignment:
Q  232 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32197 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 36517 - 36454
Alignment:
Q  263 tgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36517 tgcctatgctactattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 315
Target Start/End: Original strand, 8118 - 8180
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 315  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8118 tttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 326
Target Start/End: Original strand, 23927 - 24000
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23927 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 24000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10646 - 10542
Alignment:
Q  211 agatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtcta 309  Q
    |||||||||||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  10646 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtcta 10548  T
Q  310 agttga 315  Q
    ||||||    
T  10547 agttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 309
Target Start/End: Original strand, 8008 - 8161
Alignment:
Q  158 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcat--gctgtttt 255  Q
    |||| |||||||||||| || | | |||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||| ||  |||||||||||| ||||  ||||  ||    
T  8008 ttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctg-att 8106  T
Q  256 tgtatactgcctatg-ttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtcta 309  Q
    || |||||||||||| |  |  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8107 tgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 25184 - 25121
Alignment:
Q  253 ttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 315  Q
    |||| |||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25184 ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2045 - 1881
Alignment:
Q  159 tatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatg-ctgtttttg 257  Q
    ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||| || || ||| ||||  |||||  |||| |||    
T  2045 tatgatgtattataatgttta-tgcattacttgaagaataattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattgttgttg 1950  T
Q  258 tatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||  |||||||||||  | ||||| || ||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  1949 taatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 6889 - 6824
Alignment:
Q  254 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 318  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6889 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgatga 6824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 20065 - 19980
Alignment:
Q  241 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| || | ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20065 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctactattgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 38437 - 38339
Alignment:
Q  211 agatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttattgtt-gttgtttaactaagctgcatgagtcggtc 307  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||| | || |||||  |||||||  |||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38437 agatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12018 - 11982
Alignment:
Q  275 tgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12018 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 232 - 182
Alignment:
Q  2 tctcgcctcgcgagtgactcagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcga 51  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  232 tctcgccacgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcga 182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 225578 - 225466
Alignment:
Q  158 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| || ||||||  |||||||||||| ||| |||| |||||    
T  225578 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttg-attgcatttgatattattatatcacgctg-ttttg 225481  T
Q  258 tatactgcctatgtt 272  Q
     |||||| |||||||    
T  225480 catactgactatgtt 225466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 225692 - 225644
Alignment:
Q  44 ttttgcgaccattgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtag 92  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  225692 ttttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtag 225644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 309
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  260 tactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtcta 309  Q
    |||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 69879 - 69794
Alignment:
Q  241 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |  | ||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  69879 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 326
Target Start/End: Original strand, 4754 - 4921
Alignment:
Q  159 tatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 257  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| |||| || || ||||||||| | |||| |||||| |||    
T  4754 tatgatgtgatataacgttatgtatattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcaagctgttgttg 4852  T
Q  258 tatactgcctatgttattgttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 326  Q
    |   ||||||||| |  | || || |||||||||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  4853 tgatctgcctatgctgctattattatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 4921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University