View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16306_low_5 (Length: 444)

Name: NF16306_low_5
Description: NF16306
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16306_low_5
NF16306_low_5
[»] chr6 (106 HSPs)
chr6 (111-444)||(19773474-19773807)
chr6 (111-444)||(22805779-22806120)
chr6 (1-403)||(15817345-15817744)
chr6 (108-365)||(23414819-23415076)
chr6 (1-252)||(4476872-4477123)
chr6 (111-403)||(15705375-15705668)
chr6 (108-365)||(27556577-27556834)
chr6 (30-250)||(23838224-23838444)
chr6 (112-399)||(28103831-28104119)
chr6 (1-335)||(14979209-14979543)
chr6 (181-365)||(31477893-31478077)
chr6 (181-365)||(16760134-16760318)
chr6 (188-362)||(18955853-18956027)
chr6 (181-362)||(22948950-22949131)
chr6 (38-250)||(18453232-18453444)
chr6 (181-365)||(18917349-18917533)
chr6 (181-362)||(22952906-22953087)
chr6 (181-362)||(23871394-23871575)
chr6 (181-362)||(23875350-23875531)
chr6 (187-365)||(1644547-1644725)
chr6 (214-400)||(17743276-17743463)
chr6 (181-362)||(14472113-14472294)
chr6 (181-343)||(11566723-11566885)
chr6 (181-343)||(19870451-19870613)
chr6 (181-343)||(23394929-23395091)
chr6 (185-403)||(15875279-15875498)
chr6 (181-343)||(8243722-8243884)
chr6 (181-343)||(23989781-23989943)
chr6 (181-339)||(22862811-22862969)
chr6 (200-403)||(17377818-17378022)
chr6 (2-227)||(25619545-25619770)
chr6 (38-248)||(20136722-20136931)
chr6 (38-248)||(22195938-22196147)
chr6 (234-365)||(27415994-27416125)
chr6 (181-343)||(12618927-12619087)
chr6 (245-422)||(18913813-18914000)
chr6 (245-422)||(18937071-18937258)
chr6 (38-307)||(18696480-18696749)
chr6 (1-214)||(20556680-20556893)
chr6 (1-214)||(25754972-25755185)
chr6 (245-422)||(15174163-15174350)
chr6 (38-304)||(18706301-18706568)
chr6 (38-250)||(16493196-16493409)
chr6 (38-226)||(33443122-33443307)
chr6 (38-225)||(20224018-20224205)
chr6 (38-225)||(22118002-22118189)
chr6 (39-226)||(18177531-18177719)
chr6 (39-226)||(18199275-18199463)
chr6 (39-226)||(18204152-18204340)
chr6 (1-178)||(25752838-25753015)
chr6 (109-249)||(23539020-23539160)
chr6 (116-219)||(18896252-18896354)
chr6 (38-224)||(25738457-25738641)
chr6 (114-226)||(23076806-23076918)
chr6 (43-225)||(23527970-23528150)
chr6 (245-403)||(19656076-19656237)
chr6 (114-382)||(23538745-23538996)
chr6 (114-219)||(19362507-19362611)
chr6 (129-245)||(20182848-20182962)
chr6 (129-245)||(22153029-22153143)
chr6 (114-226)||(35008224-35008336)
chr6 (120-224)||(29416845-29416949)
chr6 (1-101)||(16133257-16133357)
chr6 (1-101)||(19443867-19443967)
chr6 (1-75)||(20734033-20734107)
chr6 (1-75)||(27851394-27851468)
chr6 (1-75)||(18658598-18658671)
chr6 (1-68)||(611139-611205)
chr6 (44-91)||(17229780-17229827)
chr6 (245-303)||(23956148-23956206)
chr6 (318-382)||(17105771-17105835)
chr6 (39-183)||(17105849-17105993)
chr6 (38-104)||(20078033-20078099)
chr6 (1-51)||(29848092-29848142)
chr6 (151-224)||(14594210-14594282)
chr6 (1-46)||(18455658-18455703)
chr6 (1-46)||(18702984-18703029)
chr6 (1-46)||(25921150-25921195)
chr6 (1-68)||(13764751-13764818)
chr6 (122-185)||(15896051-15896114)
chr6 (1-68)||(19826076-19826142)
chr6 (1-68)||(34296856-34296923)
chr6 (1-63)||(15174042-15174104)
chr6 (151-224)||(7429918-7429990)
chr6 (1-46)||(17318709-17318754)
chr6 (1-46)||(19655816-19655861)
chr6 (10-63)||(23956265-23956318)
chr6 (1-46)||(28947764-28947809)
chr6 (1-46)||(32259268-32259313)
chr6 (2-46)||(19234617-19234661)
chr6 (263-311)||(20078134-20078182)
chr6 (122-185)||(19656075-19656138)
chr6 (3-46)||(29044682-29044725)
chr6 (1-39)||(8760103-8760141)
chr6 (1-39)||(8767850-8767888)
chr6 (1-46)||(7827392-7827437)
chr6 (1-46)||(13285129-13285174)
chr6 (1-46)||(18398339-18398384)
chr6 (1-46)||(18708919-18708964)
chr6 (1-42)||(20411258-20411299)
chr6 (2-39)||(25347553-25347590)
chr6 (1-46)||(27126064-27126109)
chr6 (114-158)||(8227445-8227489)
chr6 (114-170)||(19847929-19847984)
chr6 (4-63)||(20177151-20177208)
chr6 (148-224)||(23956108-23956183)
[»] chr7 (153 HSPs)
chr7 (2-403)||(16998488-16998890)
chr7 (4-403)||(46580500-46580900)
chr7 (1-444)||(14273361-14273813)
chr7 (111-444)||(14258297-14258639)
chr7 (111-444)||(16460697-16461039)
chr7 (111-444)||(16579605-16579947)
chr7 (111-444)||(16585716-16586058)
chr7 (1-252)||(16008592-16008843)
chr7 (1-252)||(18872374-18872625)
chr7 (1-250)||(11661322-11661570)
chr7 (1-250)||(18607503-18607752)
chr7 (111-403)||(32301183-32301476)
chr7 (1-252)||(14566216-14566467)
chr7 (108-365)||(1858760-1859017)
chr7 (1-250)||(14422000-14422250)
chr7 (108-365)||(25927180-25927434)
chr7 (108-365)||(13918454-13918711)
chr7 (155-444)||(15719842-15720140)
chr7 (166-403)||(8940145-8940383)
chr7 (44-250)||(42461999-42462205)
chr7 (38-391)||(17060282-17060635)
chr7 (181-362)||(45170089-45170270)
chr7 (181-365)||(39722105-39722289)
chr7 (1-180)||(147704-147883)
chr7 (184-403)||(8468613-8468833)
chr7 (181-343)||(18283227-18283389)
chr7 (181-343)||(32968-33130)
chr7 (181-343)||(12704742-12704904)
chr7 (181-343)||(12714725-12714887)
chr7 (181-343)||(12718529-12718691)
chr7 (181-343)||(16907284-16907446)
chr7 (44-250)||(16996272-16996477)
chr7 (181-343)||(18279264-18279426)
chr7 (38-250)||(9033204-9033417)
chr7 (111-308)||(20487533-20487730)
chr7 (197-403)||(15112839-15113046)
chr7 (181-343)||(12723440-12723602)
chr7 (181-342)||(70848-71009)
chr7 (181-342)||(74957-75118)
chr7 (44-250)||(130680-130888)
chr7 (38-223)||(11768777-11768964)
chr7 (197-403)||(16323947-16324153)
chr7 (181-343)||(16114102-16114264)
chr7 (181-343)||(16117255-16117417)
chr7 (181-343)||(26292256-26292418)
chr7 (56-250)||(11525440-11525635)
chr7 (200-422)||(15116352-15116580)
chr7 (106-250)||(38519422-38519566)
chr7 (234-364)||(2530191-2530320)
chr7 (1-224)||(38828304-38828526)
chr7 (1-214)||(13647492-13647707)
chr7 (245-403)||(32160910-32161068)
chr7 (111-249)||(10501355-10501493)
chr7 (245-391)||(16550712-16550858)
chr7 (260-365)||(15084035-15084140)
chr7 (111-250)||(20619430-20619570)
chr7 (111-249)||(14157036-14157174)
chr7 (46-190)||(9725526-9725670)
chr7 (245-403)||(17232814-17232973)
chr7 (245-370)||(16614825-16614950)
chr7 (38-225)||(17017326-17017513)
chr7 (1-224)||(34957416-34957636)
chr7 (287-403)||(14981543-14981660)
chr7 (287-403)||(15411019-15411136)
chr7 (38-214)||(9177524-9177700)
chr7 (1-227)||(29004063-29004287)
chr7 (111-216)||(14929152-14929257)
chr7 (111-216)||(15352618-15352723)
chr7 (319-444)||(1490194-1490328)
chr7 (1-74)||(18456235-18456308)
chr7 (185-284)||(14270032-14270131)
chr7 (119-224)||(16109453-16109558)
chr7 (1-68)||(30820843-30820910)
chr7 (140-224)||(837317-837401)
chr7 (140-224)||(1202497-1202581)
chr7 (156-217)||(10896687-10896748)
chr7 (156-217)||(15167285-15167346)
chr7 (38-214)||(16091844-16092019)
chr7 (108-216)||(48991266-48991372)
chr7 (1-68)||(36685836-36685904)
chr7 (108-215)||(15008427-15008533)
chr7 (147-226)||(18203887-18203965)
chr7 (1-75)||(8756983-8757056)
chr7 (140-224)||(833321-833405)
chr7 (140-224)||(1198501-1198585)
chr7 (114-226)||(1867929-1868040)
chr7 (166-226)||(38898181-38898241)
chr7 (114-215)||(20220124-20220222)
chr7 (1-75)||(4325448-4325521)
chr7 (1-51)||(13408187-13408237)
chr7 (5-185)||(709146-709325)
chr7 (1-65)||(17505591-17505655)
chr7 (1-65)||(17547559-17547623)
chr7 (1-68)||(832610-832676)
chr7 (1-68)||(1197790-1197856)
chr7 (1-68)||(12755293-12755359)
chr7 (108-178)||(2529982-2530052)
chr7 (1-51)||(13699476-13699526)
chr7 (345-422)||(14157153-14157231)
chr7 (5-63)||(14188883-14188941)
chr7 (5-63)||(14191677-14191735)
chr7 (1-63)||(32160789-32160851)
chr7 (1-63)||(47975498-47975560)
chr7 (151-224)||(13892670-13892742)
chr7 (1-68)||(59005-59071)
chr7 (356-422)||(10501483-10501550)
chr7 (4-63)||(48812241-48812300)
chr7 (1-63)||(16550591-16550653)
chr7 (1-63)||(16615009-16615071)
chr7 (1-51)||(17070880-17070930)
chr7 (1-51)||(40555330-40555380)
chr7 (1-51)||(47094495-47094545)
chr7 (1-46)||(13745787-13745832)
chr7 (1-46)||(13894515-13894560)
chr7 (1-46)||(21675495-21675540)
chr7 (1-46)||(25941858-25941903)
chr7 (1-46)||(39292323-39292368)
chr7 (166-214)||(15081900-15081948)
chr7 (3-46)||(24270570-24270613)
chr7 (1-68)||(37727514-37727580)
chr7 (1-43)||(14416071-14416113)
chr7 (1-63)||(16462439-16462501)
chr7 (1-46)||(4691482-4691527)
chr7 (1-46)||(13745363-13745408)
chr7 (1-42)||(14153558-14153599)
chr7 (1-46)||(20252928-20252973)
chr7 (5-46)||(21538779-21538820)
chr7 (1-46)||(33001334-33001379)
chr7 (1-46)||(48213531-48213576)
chr7 (108-215)||(2280047-2280155)
chr7 (1-44)||(8564177-8564220)
chr7 (150-189)||(14416246-14416285)
chr7 (1-36)||(15167405-15167440)
chr7 (1-68)||(15213897-15213964)
chr7 (387-422)||(16461046-16461081)
chr7 (1-44)||(19282514-19282557)
chr7 (387-422)||(32301102-32301137)
chr7 (1-35)||(8514332-8514366)
chr7 (119-215)||(12255730-12255827)
chr7 (38-75)||(14036423-14036460)
chr7 (38-75)||(14044973-14045010)
chr7 (1-42)||(14161441-14161482)
chr7 (38-75)||(14346453-14346490)
chr7 (38-75)||(14355003-14355040)
chr7 (1-46)||(15576417-15576462)
chr7 (395-444)||(16185935-16185984)
chr7 (1-34)||(32771760-32771793)
chr7 (1-46)||(44374366-44374411)
chr7 (1-46)||(44383231-44383276)
chr7 (1-46)||(46386674-46386719)
chr7 (122-178)||(1490117-1490173)
chr7 (387-419)||(16579566-16579598)
chr7 (387-419)||(16586065-16586097)
[»] chr3 (156 HSPs)
chr3 (111-422)||(16796362-16796674)
chr3 (4-403)||(52989548-52989947)
chr3 (42-403)||(324130-324492)
chr3 (4-403)||(14966064-14966464)
chr3 (111-403)||(43889558-43889851)
chr3 (1-252)||(23371294-23371545)
chr3 (1-252)||(14763548-14763799)
chr3 (111-365)||(12339640-12339894)
chr3 (1-250)||(51300611-51300860)
chr3 (1-227)||(10833926-10834151)
chr3 (111-403)||(12469796-12470089)
chr3 (139-444)||(18700267-18700581)
chr3 (108-365)||(5223238-5223495)
chr3 (114-444)||(17691644-17691982)
chr3 (38-444)||(21837271-21837685)
chr3 (1-336)||(16643135-16643470)
chr3 (114-444)||(54876322-54876664)
chr3 (1-179)||(9533416-9533594)
chr3 (200-365)||(11300532-11300697)
chr3 (181-365)||(37439719-37439903)
chr3 (181-362)||(15964814-15964995)
chr3 (181-362)||(15968738-15968919)
chr3 (181-362)||(15972662-15972843)
chr3 (181-365)||(19775607-19775791)
chr3 (166-403)||(11914003-11914241)
chr3 (187-365)||(4588862-4589040)
chr3 (111-308)||(14670914-14671111)
chr3 (108-306)||(15465068-15465266)
chr3 (111-308)||(14682413-14682610)
chr3 (181-365)||(11854575-11854759)
chr3 (181-343)||(4111332-4111494)
chr3 (181-343)||(7109562-7109724)
chr3 (181-343)||(7113497-7113659)
chr3 (181-343)||(11165612-11165774)
chr3 (181-343)||(22321528-22321690)
chr3 (181-343)||(22336583-22336745)
chr3 (181-343)||(27409727-27409889)
chr3 (181-343)||(28949588-28949750)
chr3 (181-343)||(55022731-55022893)
chr3 (1-224)||(8928252-8928474)
chr3 (181-343)||(4107480-4107642)
chr3 (181-343)||(11069932-11070094)
chr3 (46-250)||(9577674-9577876)
chr3 (181-342)||(30065811-30065972)
chr3 (181-342)||(15617239-15617400)
chr3 (1-214)||(43550264-43550477)
chr3 (38-250)||(15246068-15246281)
chr3 (46-250)||(15265189-15265394)
chr3 (38-207)||(15207029-15207199)
chr3 (38-250)||(37427764-37427976)
chr3 (1-214)||(50242985-50243198)
chr3 (181-343)||(14499189-14499351)
chr3 (245-422)||(35961596-35961783)
chr3 (111-243)||(14179427-14179559)
chr3 (245-384)||(22652036-22652174)
chr3 (38-250)||(32402819-32403030)
chr3 (114-248)||(28194743-28194878)
chr3 (119-382)||(14568899-14569163)
chr3 (1-95)||(18892961-18893055)
chr3 (111-227)||(10542364-10542480)
chr3 (1-95)||(18889735-18889829)
chr3 (117-212)||(44494893-44494988)
chr3 (44-158)||(29172492-29172606)
chr3 (318-422)||(16979092-16979206)
chr3 (114-219)||(23318650-23318754)
chr3 (164-249)||(36527794-36527879)
chr3 (38-222)||(13919408-13919591)
chr3 (1-112)||(2248557-2248668)
chr3 (119-224)||(34852596-34852701)
chr3 (164-249)||(3265000-3265085)
chr3 (319-403)||(17046206-17046291)
chr3 (1-81)||(24153031-24153111)
chr3 (110-216)||(316202-316309)
chr3 (156-217)||(38311759-38311820)
chr3 (108-220)||(12378003-12378114)
chr3 (1-75)||(13522998-13523071)
chr3 (156-217)||(20248741-20248803)
chr3 (356-422)||(36527737-36527804)
chr3 (245-303)||(41813-41871)
chr3 (1-75)||(3394589-3394662)
chr3 (1-75)||(6158789-6158862)
chr3 (1-75)||(12275941-12276014)
chr3 (1-63)||(16979313-16979375)
chr3 (1-51)||(18367345-18367395)
chr3 (1-63)||(35961474-35961536)
chr3 (1-51)||(42324808-42324858)
chr3 (1-62)||(22652236-22652297)
chr3 (1-65)||(10554668-10554732)
chr3 (1-68)||(31224540-31224608)
chr3 (1-75)||(179294-179367)
chr3 (1-51)||(10563124-10563174)
chr3 (1-51)||(10989390-10989440)
chr3 (1-51)||(14642137-14642187)
chr3 (245-303)||(16325249-16325307)
chr3 (83-209)||(16839575-16839699)
chr3 (1-65)||(55292228-55292292)
chr3 (1-68)||(1988819-1988885)
chr3 (4-63)||(13026274-13026333)
chr3 (4-63)||(13029866-13029925)
chr3 (112-215)||(37251100-37251202)
chr3 (1-63)||(6805548-6805610)
chr3 (6-63)||(41930-41987)
chr3 (119-215)||(2051138-2051235)
chr3 (1-46)||(6156126-6156171)
chr3 (1-46)||(11192501-11192546)
chr3 (1-46)||(14519683-14519728)
chr3 (151-224)||(14647688-14647760)
chr3 (328-365)||(15465039-15465076)
chr3 (395-444)||(17685744-17685793)
chr3 (1-46)||(19568955-19569000)
chr3 (1-46)||(24546257-24546302)
chr3 (1-46)||(44273894-44273939)
chr3 (1-46)||(50755968-50756013)
chr3 (1-46)||(54330892-54330937)
chr3 (1-69)||(6819507-6819574)
chr3 (1-45)||(15565935-15565979)
chr3 (356-422)||(3265075-3265142)
chr3 (1-68)||(11913119-11913186)
chr3 (182-249)||(14568804-14568871)
chr3 (350-403)||(24513836-24513890)
chr3 (1-51)||(37038233-37038283)
chr3 (1-46)||(12952462-12952507)
chr3 (155-224)||(13436357-13436425)
chr3 (1-46)||(14441588-14441633)
chr3 (119-215)||(52523666-52523763)
chr3 (1-46)||(54876070-54876115)
chr3 (146-226)||(43926034-43926114)
chr3 (387-422)||(324049-324084)
chr3 (122-185)||(17046305-17046368)
chr3 (387-422)||(18700588-18700623)
chr3 (1-36)||(38311591-38311626)
chr3 (1-43)||(3803258-3803300)
chr3 (122-196)||(14441300-14441374)
chr3 (1-39)||(17513007-17513045)
chr3 (113-215)||(22110285-22110386)
chr3 (1-46)||(2842049-2842094)
chr3 (1-46)||(5206241-5206286)
chr3 (387-420)||(10542484-10542517)
chr3 (1-46)||(11258887-11258932)
chr3 (319-372)||(13026468-13026521)
chr3 (319-372)||(13030060-13030113)
chr3 (1-46)||(14508268-14508313)
chr3 (5-46)||(17046582-17046623)
chr3 (1-42)||(17207766-17207807)
chr3 (1-46)||(17519460-17519505)
chr3 (1-46)||(17534322-17534367)
chr3 (1-46)||(17538527-17538572)
chr3 (1-46)||(17693488-17693533)
chr3 (1-46)||(35065167-35065212)
chr3 (1-46)||(40807416-40807461)
chr3 (185-222)||(54520977-54521014)
chr3 (245-281)||(16979218-16979254)
chr3 (114-170)||(17248221-17248276)
chr3 (114-158)||(24340657-24340701)
chr3 (5-45)||(25104792-25104832)
chr3 (114-158)||(37642199-37642243)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (111-444)||(125802-126144)
scaffold0011 (1-42)||(32878-32919)
scaffold0011 (387-422)||(125760-125795)
[»] chr8 (129 HSPs)
chr8 (1-444)||(17460874-17461326)
chr8 (4-403)||(19808187-19808587)
chr8 (20-403)||(22237860-22238243)
chr8 (46-402)||(37515602-37515959)
chr8 (111-403)||(18833458-18833751)
chr8 (108-365)||(14397791-14398040)
chr8 (181-365)||(21410789-21410973)
chr8 (181-365)||(21805281-21805465)
chr8 (181-365)||(21828097-21828281)
chr8 (165-403)||(23409691-23409930)
chr8 (1-180)||(27941476-27941655)
chr8 (181-362)||(18862728-18862909)
chr8 (108-336)||(23659371-23659599)
chr8 (181-343)||(21976753-21976915)
chr8 (38-224)||(22253024-22253210)
chr8 (38-250)||(17086012-17086224)
chr8 (181-343)||(19278366-19278528)
chr8 (44-250)||(20501966-20502172)
chr8 (181-343)||(43251674-43251836)
chr8 (38-250)||(23667859-23668071)
chr8 (1-214)||(25484061-25484274)
chr8 (181-343)||(21972668-21972826)
chr8 (155-308)||(23914029-23914183)
chr8 (166-313)||(16401983-16402136)
chr8 (245-391)||(26453908-26454054)
chr8 (44-250)||(22995893-22996100)
chr8 (245-391)||(19880026-19880172)
chr8 (230-343)||(22111792-22111905)
chr8 (111-232)||(25363134-25363255)
chr8 (111-250)||(17438148-17438288)
chr8 (247-391)||(23478278-23478422)
chr8 (38-250)||(22963278-22963484)
chr8 (111-243)||(5083085-5083218)
chr8 (245-422)||(19929556-19929736)
chr8 (55-225)||(16799561-16799732)
chr8 (62-246)||(23943876-23944060)
chr8 (44-214)||(28397635-28397805)
chr8 (318-403)||(22352932-22353018)
chr8 (276-403)||(5760577-5760705)
chr8 (38-226)||(20533267-20533455)
chr8 (44-215)||(17439370-17439541)
chr8 (108-226)||(19154814-19154932)
chr8 (331-403)||(44384821-44384894)
chr8 (185-284)||(1327013-1327112)
chr8 (108-217)||(14103152-14103262)
chr8 (1-75)||(41680721-41680795)
chr8 (114-222)||(35026797-35026903)
chr8 (114-215)||(37116434-37116535)
chr8 (156-217)||(44476753-44476814)
chr8 (156-217)||(44480015-44480076)
chr8 (42-214)||(2418737-2418906)
chr8 (38-157)||(22525659-22525778)
chr8 (1-75)||(15635767-15635840)
chr8 (112-215)||(17266925-17267028)
chr8 (1-68)||(20454638-20454704)
chr8 (245-303)||(8414418-8414476)
chr8 (156-217)||(8728620-8728682)
chr8 (245-303)||(11775008-11775066)
chr8 (83-224)||(21329104-21329243)
chr8 (114-222)||(22419349-22419455)
chr8 (38-215)||(40492711-40492887)
chr8 (1-68)||(364186-364253)
chr8 (1-68)||(20455395-20455461)
chr8 (1-68)||(20460373-20460439)
chr8 (111-185)||(21346164-21346239)
chr8 (112-215)||(22364748-22364850)
chr8 (1-68)||(44432259-44432326)
chr8 (1-75)||(39695115-39695188)
chr8 (166-214)||(19936956-19937004)
chr8 (1-60)||(19880234-19880293)
chr8 (1-44)||(21861207-21861250)
chr8 (1-60)||(26454117-26454176)
chr8 (1-68)||(42560114-42560181)
chr8 (1-68)||(44523013-44523080)
chr8 (1-51)||(21579794-21579844)
chr8 (86-224)||(21967476-21967612)
chr8 (1-46)||(4381379-4381424)
chr8 (1-46)||(18817048-18817093)
chr8 (151-224)||(34950622-34950694)
chr8 (6-62)||(8414302-8414358)
chr8 (1-68)||(17795630-17795697)
chr8 (3-46)||(22344462-22344505)
chr8 (3-46)||(22356122-22356165)
chr8 (112-215)||(24353107-24353209)
chr8 (1-44)||(38185673-38185716)
chr8 (1-43)||(18024282-18024324)
chr8 (1-63)||(19882371-19882433)
chr8 (1-43)||(20517704-20517746)
chr8 (151-209)||(21980265-21980322)
chr8 (151-209)||(21985248-21985305)
chr8 (151-209)||(22000284-22000341)
chr8 (151-209)||(22005262-22005319)
chr8 (1-75)||(42266179-42266252)
chr8 (1-46)||(361799-361844)
chr8 (10-63)||(11775125-11775178)
chr8 (1-46)||(17979003-17979048)
chr8 (148-189)||(18024465-18024506)
chr8 (1-46)||(18815409-18815454)
chr8 (1-46)||(22474172-22474217)
chr8 (1-46)||(22483167-22483212)
chr8 (1-42)||(23670073-23670114)
chr8 (2-46)||(5760953-5760997)
chr8 (152-224)||(11251625-11251696)
chr8 (112-215)||(20498647-20498751)
chr8 (1-45)||(21321927-21321971)
chr8 (3-46)||(5080429-5080472)
chr8 (1-36)||(8728524-8728559)
chr8 (122-185)||(13665189-13665252)
chr8 (122-185)||(13724464-13724527)
chr8 (345-399)||(18302800-18302855)
chr8 (53-104)||(22381608-22381659)
chr8 (268-311)||(22381703-22381746)
chr8 (1-68)||(23478478-23478545)
chr8 (155-222)||(25658189-25658255)
chr8 (4-46)||(18118754-18118796)
chr8 (1-35)||(21513752-21513786)
chr8 (1-46)||(6102340-6102385)
chr8 (155-224)||(16197952-16198020)
chr8 (1-46)||(20179108-20179153)
chr8 (159-200)||(21346241-21346282)
chr8 (1-34)||(22258890-22258923)
chr8 (197-226)||(22525633-22525662)
chr8 (1-46)||(36305079-36305124)
chr8 (5-42)||(38988890-38988927)
chr8 (5-42)||(39019987-39020024)
chr8 (148-224)||(11774968-11775043)
chr8 (114-158)||(13508019-13508063)
chr8 (114-158)||(13597551-13597595)
chr8 (4-36)||(18122329-18122361)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (111-444)||(699-1041)
[»] chr2 (89 HSPs)
chr2 (4-403)||(34874037-34874437)
chr2 (111-444)||(23069215-23069557)
chr2 (1-403)||(21081558-21081961)
chr2 (1-403)||(27472315-27472718)
chr2 (1-252)||(19662242-19662493)
chr2 (1-444)||(18358556-18359001)
chr2 (1-250)||(21073314-21073563)
chr2 (1-250)||(9241976-9242225)
chr2 (10-252)||(6260974-6261217)
chr2 (1-252)||(30643868-30644119)
chr2 (108-365)||(31345051-31345308)
chr2 (181-365)||(1283228-1283412)
chr2 (166-403)||(24918006-24918244)
chr2 (181-365)||(30345074-30345258)
chr2 (166-403)||(23707275-23707513)
chr2 (166-403)||(24670891-24671129)
chr2 (181-365)||(41531087-41531271)
chr2 (166-403)||(24681312-24681548)
chr2 (44-250)||(34136990-34137196)
chr2 (181-343)||(24628562-24628724)
chr2 (181-343)||(27601657-27601819)
chr2 (196-403)||(22459579-22459787)
chr2 (181-343)||(12901595-12901757)
chr2 (181-343)||(27379516-27379678)
chr2 (181-343)||(27383562-27383724)
chr2 (181-343)||(24649218-24649380)
chr2 (111-308)||(9784673-9784869)
chr2 (181-342)||(10101728-10101889)
chr2 (1-214)||(22173615-22173828)
chr2 (38-250)||(18546803-18547016)
chr2 (75-227)||(21237825-21237978)
chr2 (245-422)||(34492200-34492387)
chr2 (111-250)||(19201906-19202046)
chr2 (245-422)||(21914779-21914966)
chr2 (38-251)||(23287412-23287625)
chr2 (44-216)||(43947236-43947408)
chr2 (38-251)||(26392431-26392643)
chr2 (287-442)||(24316193-24316356)
chr2 (1-109)||(41301560-41301668)
chr2 (119-224)||(22703174-22703279)
chr2 (318-403)||(20320737-20320823)
chr2 (156-217)||(6482838-6482899)
chr2 (156-217)||(6486305-6486366)
chr2 (38-215)||(23004835-23005012)
chr2 (4-81)||(34858975-34859052)
chr2 (120-224)||(13101577-13101682)
chr2 (108-215)||(20520121-20520227)
chr2 (1-63)||(21915025-21915087)
chr2 (1-75)||(22501260-22501333)
chr2 (1-75)||(22509194-22509267)
chr2 (1-65)||(2524316-2524380)
chr2 (112-215)||(23791360-23791463)
chr2 (1-68)||(24883785-24883851)
chr2 (1-63)||(20590909-20590971)
chr2 (1-75)||(31520509-31520582)
chr2 (1-50)||(25183603-25183652)
chr2 (1-68)||(23338987-23339054)
chr2 (108-215)||(24697534-24697641)
chr2 (112-215)||(25108974-25109077)
chr2 (1-68)||(28349306-28349373)
chr2 (1-51)||(10039721-10039771)
chr2 (1-46)||(21316248-21316293)
chr2 (1-46)||(22686260-22686305)
chr2 (257-422)||(39827952-39828120)
chr2 (245-399)||(20915226-20915386)
chr2 (166-214)||(24642807-24642855)
chr2 (11-63)||(34492089-34492141)
chr2 (1-44)||(24841375-24841418)
chr2 (4-63)||(26903561-26903620)
chr2 (1-51)||(18388884-18388934)
chr2 (3-45)||(23609898-23609940)
chr2 (122-200)||(24834804-24834882)
chr2 (1-46)||(22332138-22332183)
chr2 (108-226)||(22413064-22413183)
chr2 (1-46)||(24273846-24273891)
chr2 (1-46)||(24515606-24515651)
chr2 (5-46)||(29113782-29113823)
chr2 (2-46)||(43707872-43707916)
chr2 (112-215)||(23207364-23207466)
chr2 (388-422)||(13101739-13101773)
chr2 (1-43)||(21336039-21336081)
chr2 (1-46)||(9975349-9975394)
chr2 (1-42)||(22690105-22690146)
chr2 (1-42)||(22694701-22694742)
chr2 (1-46)||(23969210-23969255)
chr2 (114-171)||(24529508-24529564)
chr2 (1-46)||(36839591-36839636)
chr2 (112-215)||(7665-7769)
chr2 (122-178)||(26903427-26903483)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (1-403)||(1697-2099)
scaffold0125 (1-46)||(27720-27765)
[»] chr4 (101 HSPs)
chr4 (46-402)||(13591793-13592149)
chr4 (111-403)||(17048066-17048359)
chr4 (1-248)||(18212784-18213031)
chr4 (1-250)||(24047121-24047370)
chr4 (4-285)||(10056653-10056934)
chr4 (187-365)||(10712695-10712873)
chr4 (187-365)||(10926465-10926643)
chr4 (166-403)||(14746570-14746808)
chr4 (181-365)||(12487550-12487734)
chr4 (181-362)||(14954250-14954431)
chr4 (181-362)||(27533868-27534049)
chr4 (181-362)||(25689712-25689893)
chr4 (181-343)||(9556391-9556553)
chr4 (38-227)||(32306854-32307043)
chr4 (181-343)||(14757505-14757667)
chr4 (181-340)||(4561417-4561576)
chr4 (181-343)||(5757021-5757183)
chr4 (46-227)||(14852742-14852924)
chr4 (185-391)||(15497041-15497247)
chr4 (44-250)||(26050340-26050545)
chr4 (181-342)||(17810134-17810295)
chr4 (1-204)||(630490-630693)
chr4 (181-343)||(33742241-33742401)
chr4 (1-214)||(51463654-51463867)
chr4 (38-249)||(40907122-40907333)
chr4 (234-365)||(43256213-43256344)
chr4 (1-214)||(23803051-23803264)
chr4 (185-404)||(19857416-19857636)
chr4 (245-391)||(10694955-10695101)
chr4 (245-391)||(10908721-10908867)
chr4 (247-422)||(40619694-40619872)
chr4 (245-391)||(15008163-15008309)
chr4 (245-391)||(15884123-15884269)
chr4 (1-214)||(12611106-12611316)
chr4 (44-216)||(15791857-15792030)
chr4 (109-225)||(16043087-16043203)
chr4 (38-226)||(17333352-17333542)
chr4 (44-196)||(26789441-26789594)
chr4 (111-250)||(15041893-15042033)
chr4 (111-250)||(15112391-15112531)
chr4 (119-227)||(40906987-40907094)
chr4 (38-216)||(14825551-14825730)
chr4 (245-403)||(53631320-53631481)
chr4 (257-422)||(14650697-14650866)
chr4 (119-224)||(4831475-4831580)
chr4 (119-224)||(4834770-4834875)
chr4 (153-250)||(26045268-26045364)
chr4 (167-250)||(14185029-14185112)
chr4 (119-224)||(14047715-14047820)
chr4 (287-403)||(26013377-26013496)
chr4 (185-277)||(52873148-52873240)
chr4 (119-224)||(30146462-30146567)
chr4 (1-75)||(10704890-10704963)
chr4 (1-75)||(10918660-10918733)
chr4 (108-215)||(52243122-52243230)
chr4 (245-303)||(28385529-28385587)
chr4 (1-61)||(15884002-15884062)
chr4 (1-65)||(16277914-16277978)
chr4 (1-65)||(53387524-53387588)
chr4 (1-68)||(56115423-56115490)
chr4 (1-75)||(9638399-9638472)
chr4 (1-75)||(9871153-9871226)
chr4 (1-63)||(10694834-10694896)
chr4 (1-63)||(10908600-10908662)
chr4 (1-51)||(15448003-15448053)
chr4 (6-63)||(28385646-28385703)
chr4 (356-422)||(14184973-14185040)
chr4 (1-60)||(15008372-15008431)
chr4 (1-68)||(33849140-33849207)
chr4 (1-51)||(43251149-43251200)
chr4 (112-215)||(46640388-46640490)
chr4 (112-215)||(53082084-53082186)
chr4 (4-66)||(15990439-15990501)
chr4 (1-51)||(33186316-33186366)
chr4 (1-46)||(2425207-2425252)
chr4 (1-46)||(3337519-3337564)
chr4 (1-46)||(14508182-14508227)
chr4 (1-46)||(19566505-19566550)
chr4 (1-46)||(26922258-26922303)
chr4 (1-63)||(40619933-40619995)
chr4 (1-42)||(15344301-15344342)
chr4 (319-372)||(15990254-15990307)
chr4 (1-46)||(16026515-16026559)
chr4 (1-46)||(26445305-26445350)
chr4 (1-42)||(40229727-40229768)
chr4 (1-42)||(44024190-44024231)
chr4 (1-42)||(45314923-45314964)
chr4 (185-222)||(49547744-49547781)
chr4 (1-46)||(53631060-53631105)
chr4 (1-36)||(12622802-12622837)
chr4 (122-185)||(15365185-15365248)
chr4 (122-185)||(27996027-27996090)
chr4 (1-46)||(10357023-10357068)
chr4 (5-46)||(11425375-11425416)
chr4 (185-222)||(14048732-14048769)
chr4 (1-46)||(14630246-14630291)
chr4 (1-46)||(25091073-25091118)
chr4 (185-222)||(36038025-36038062)
chr4 (1-42)||(46740623-46740664)
chr4 (1-46)||(55582624-55582669)
chr4 (148-224)||(28385489-28385564)
[»] chr5 (85 HSPs)
chr5 (1-403)||(6765724-6766126)
chr5 (1-252)||(37598704-37598955)
chr5 (1-252)||(42960590-42960842)
chr5 (1-252)||(28370843-28371094)
chr5 (139-403)||(22107394-22107659)
chr5 (173-365)||(18356131-18356323)
chr5 (173-365)||(20910910-20911102)
chr5 (111-403)||(33895587-33895870)
chr5 (181-365)||(40723670-40723854)
chr5 (181-365)||(10753203-10753387)
chr5 (38-250)||(23469853-23470064)
chr5 (1-403)||(29447899-29448303)
chr5 (4-168)||(38145328-38145492)
chr5 (181-343)||(20295708-20295870)
chr5 (1-230)||(30138750-30138979)
chr5 (181-343)||(19472803-19472965)
chr5 (187-343)||(15236924-15237080)
chr5 (44-227)||(25574334-25574516)
chr5 (44-227)||(25575527-25575709)
chr5 (44-227)||(25576720-25576902)
chr5 (245-391)||(17010923-17011069)
chr5 (245-403)||(263042-263201)
chr5 (38-250)||(21731319-21731532)
chr5 (38-250)||(21809439-21809652)
chr5 (38-246)||(21328073-21328282)
chr5 (38-251)||(26732692-26732904)
chr5 (38-227)||(26740505-26740693)
chr5 (156-252)||(22336615-22336711)
chr5 (156-252)||(22340153-22340249)
chr5 (39-248)||(15796471-15796682)
chr5 (1-81)||(18418797-18418877)
chr5 (120-249)||(10816453-10816582)
chr5 (156-217)||(22750264-22750325)
chr5 (38-161)||(20572025-20572149)
chr5 (234-308)||(18356308-18356381)
chr5 (156-217)||(19511516-19511577)
chr5 (120-224)||(23538504-23538608)
chr5 (309-365)||(11230985-11231041)
chr5 (236-308)||(20910854-20910925)
chr5 (1-81)||(22412392-22412471)
chr5 (109-226)||(27988857-27988978)
chr5 (1-68)||(31456196-31456263)
chr5 (181-243)||(15236863-15236925)
chr5 (1-75)||(24277193-24277266)
chr5 (1-75)||(24384947-24385020)
chr5 (309-365)||(11220587-11220643)
chr5 (309-365)||(11225173-11225229)
chr5 (309-365)||(11228996-11229052)
chr5 (1-63)||(263260-263322)
chr5 (112-226)||(22178152-22178266)
chr5 (245-303)||(33473272-33473330)
chr5 (1-60)||(17011132-17011191)
chr5 (1-68)||(17812795-17812861)
chr5 (4-68)||(21554968-21555033)
chr5 (5-68)||(21557635-21557699)
chr5 (1-68)||(12122109-12122175)
chr5 (1-68)||(36460368-36460435)
chr5 (1-51)||(17875414-17875464)
chr5 (1-51)||(22758478-22758528)
chr5 (1-46)||(16062906-16062951)
chr5 (1-46)||(18744070-18744115)
chr5 (175-248)||(41861449-41861523)
chr5 (1-46)||(1627967-1628012)
chr5 (310-363)||(11227008-11227061)
chr5 (1-46)||(20565974-20566019)
chr5 (1-46)||(21399590-21399635)
chr5 (1-42)||(26749538-26749579)
chr5 (1-46)||(30611973-30612018)
chr5 (1-46)||(30613933-30613978)
chr5 (10-63)||(33473160-33473213)
chr5 (151-224)||(43243243-43243315)
chr5 (108-215)||(22144134-22144242)
chr5 (1-44)||(14026394-14026437)
chr5 (3-46)||(16605192-16605235)
chr5 (3-46)||(22111020-22111063)
chr5 (1-36)||(22750374-22750409)
chr5 (2-45)||(27869163-27869206)
chr5 (1-43)||(41876180-41876222)
chr5 (148-188)||(27869281-27869322)
chr5 (5-46)||(32607916-32607957)
chr5 (114-170)||(2154593-2154648)
chr5 (114-170)||(20901988-20902043)
chr5 (109-215)||(25743807-25743913)
chr5 (148-224)||(33473295-33473370)
chr5 (114-158)||(40725996-40726040)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (5-444)||(15588-16034)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (1-403)||(49-458)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (111-444)||(119855-120197)
[»] chr1 (81 HSPs)
chr1 (111-444)||(48603299-48603641)
chr1 (1-339)||(13881203-13881541)
chr1 (1-250)||(28312564-28312813)
chr1 (38-444)||(27653081-27653496)
chr1 (1-250)||(20437814-20438064)
chr1 (44-250)||(21043146-21043352)
chr1 (181-365)||(1925212-1925396)
chr1 (181-365)||(20924226-20924410)
chr1 (112-403)||(48520407-48520699)
chr1 (181-365)||(20228892-20229076)
chr1 (44-247)||(22124338-22124541)
chr1 (39-250)||(20958158-20958369)
chr1 (197-403)||(12271450-12271657)
chr1 (186-444)||(51326638-51326906)
chr1 (181-343)||(21407216-21407378)
chr1 (181-343)||(1010584-1010746)
chr1 (53-246)||(14800583-14800781)
chr1 (53-246)||(14809457-14809655)
chr1 (181-343)||(16375541-16375704)
chr1 (181-343)||(52639402-52639564)
chr1 (38-250)||(52940736-52940947)
chr1 (245-401)||(46198433-46198590)
chr1 (245-422)||(29764346-29764533)
chr1 (237-365)||(33797456-33797584)
chr1 (112-308)||(41781522-41781718)
chr1 (1-214)||(45574628-45574841)
chr1 (1-224)||(2332797-2333019)
chr1 (245-403)||(50000658-50000817)
chr1 (234-444)||(22130961-22131169)
chr1 (46-216)||(47190684-47190855)
chr1 (1-204)||(22130652-22130854)
chr1 (156-252)||(16372045-16372141)
chr1 (111-250)||(635914-636053)
chr1 (181-257)||(23819381-23819457)
chr1 (44-215)||(21533739-21533908)
chr1 (185-284)||(43543144-43543243)
chr1 (1-224)||(20031477-20031698)
chr1 (119-224)||(32649787-32649892)
chr1 (330-403)||(20316532-20316606)
chr1 (139-226)||(16381256-16381346)
chr1 (1-75)||(24815439-24815512)
chr1 (119-224)||(29534624-29534729)
chr1 (112-215)||(41049968-41050070)
chr1 (112-215)||(50614048-50614151)
chr1 (112-215)||(50621876-50621979)
chr1 (1-51)||(21180912-21180962)
chr1 (1-63)||(29764225-29764287)
chr1 (1-68)||(294434-294501)
chr1 (1-75)||(16401060-16401133)
chr1 (1-63)||(46198312-46198374)
chr1 (395-444)||(636090-636139)
chr1 (1-50)||(50000889-50000938)
chr1 (3-75)||(7792441-7792512)
chr1 (129-191)||(20329118-20329181)
chr1 (112-215)||(50686698-50686801)
chr1 (2-68)||(296753-296819)
chr1 (130-192)||(11945564-11945626)
chr1 (1-51)||(44822709-44822759)
chr1 (6-75)||(8276584-8276652)
chr1 (1-46)||(12710308-12710353)
chr1 (1-46)||(17902348-17902393)
chr1 (175-251)||(20454548-20454625)
chr1 (46-95)||(48520773-48520822)
chr1 (1-46)||(50544272-50544317)
chr1 (1-49)||(38057238-38057286)
chr1 (4-75)||(22349980-22350050)
chr1 (108-215)||(35261009-35261114)
chr1 (1-42)||(1643020-1643061)
chr1 (1-42)||(14793148-14793189)
chr1 (1-46)||(18121025-18121070)
chr1 (1-46)||(20588099-20588144)
chr1 (1-46)||(20592637-20592682)
chr1 (1-46)||(22823993-22824038)
chr1 (1-46)||(39060516-39060561)
chr1 (1-46)||(51323695-51323740)
chr1 (112-215)||(16368219-16368320)
chr1 (108-171)||(16758780-16758843)
chr1 (113-215)||(21896189-21896292)
chr1 (1-43)||(24720280-24720322)
chr1 (1-46)||(21239882-21239927)
chr1 (2-39)||(23195139-23195176)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (1-403)||(313-714)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (1-252)||(110701-110952)
scaffold0026 (1-63)||(21484-21546)
scaffold0026 (1-39)||(124147-124185)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (111-401)||(21064-21355)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (1-250)||(9543-9791)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (20-403)||(169590-169974)
scaffold0020 (111-250)||(142631-142771)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (38-403)||(24456-24820)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (108-365)||(31058-31315)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (108-347)||(39205-39444)
[»] scaffold0107 (3 HSPs)
scaffold0107 (38-436)||(9943-10350)
scaffold0107 (60-250)||(36230-36420)
scaffold0107 (234-325)||(15469-15560)
[»] scaffold0019 (4 HSPs)
scaffold0019 (1-227)||(132989-133215)
scaffold0019 (1-142)||(133751-133892)
scaffold0019 (111-225)||(29285-29390)
scaffold0019 (357-403)||(21847-21894)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (38-403)||(3186-3552)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (108-365)||(20139-20396)
scaffold0293 (38-250)||(17552-17764)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (7-399)||(67161-67553)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (1-180)||(2314-2493)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (166-403)||(53825-54063)
scaffold0022 (114-215)||(128904-129005)
scaffold0022 (112-215)||(78409-78510)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (1-302)||(105078-105377)
scaffold0023 (1-68)||(162682-162749)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (181-365)||(234-418)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (181-365)||(11584-11768)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (181-365)||(36169-36353)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (181-365)||(189460-189644)
scaffold0012 (44-248)||(221072-221275)
scaffold0012 (114-215)||(225492-225593)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (108-310)||(17563-17765)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (181-365)||(32743-32927)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (170-403)||(6932-7166)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (139-403)||(7731-7995)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (38-250)||(18026-18238)
[»] scaffold0123 (4 HSPs)
scaffold0123 (44-444)||(384-793)
scaffold0123 (1-162)||(6331-6490)
scaffold0123 (39-226)||(25182-25367)
scaffold0123 (1-46)||(16358-16403)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (181-365)||(14170-14354)
[»] scaffold0599 (2 HSPs)
scaffold0599 (166-403)||(1279-1517)
scaffold0599 (3-68)||(395-460)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (181-366)||(36025-36208)
scaffold0109 (4-68)||(2737-2801)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (107-403)||(85441-85739)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (166-391)||(468-693)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (181-365)||(80554-80738)
scaffold0029 (181-343)||(65611-65773)
scaffold0029 (181-343)||(61695-61857)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (187-365)||(207591-207769)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (44-250)||(697-902)
scaffold0010 (108-226)||(60643-60761)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (111-310)||(6091-6290)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (166-403)||(6889-7127)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (181-343)||(58802-58964)
[»] scaffold0077 (4 HSPs)
scaffold0077 (38-227)||(55543-55733)
scaffold0077 (1-68)||(22967-23034)
scaffold0077 (1-39)||(17844-17882)
scaffold0077 (1-39)||(23477-23515)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (217-444)||(2751-2987)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (87-250)||(1944-2107)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (181-343)||(5184-5346)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (181-343)||(12283-12445)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (111-281)||(20769-20939)
scaffold0018 (328-441)||(20652-20774)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (181-343)||(311-473)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (181-342)||(3958-4119)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (44-250)||(625-831)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (38-250)||(29282-29494)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (187-327)||(80424-80564)
scaffold0037 (1-214)||(82235-82451)
scaffold0037 (318-365)||(80574-80621)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (97-250)||(3917-4071)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (38-248)||(75687-75897)
scaffold0054 (1-42)||(65567-65608)
[»] scaffold0061 (3 HSPs)
scaffold0061 (193-343)||(67397-67546)
scaffold0061 (1-46)||(15173-15218)
scaffold0061 (1-46)||(24231-24276)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (234-365)||(71236-71367)
scaffold0003 (1-68)||(138173-138240)
[»] scaffold0306 (3 HSPs)
scaffold0306 (166-391)||(14906-15131)
scaffold0306 (245-403)||(4215-4374)
scaffold0306 (1-63)||(4433-4495)
[»] scaffold0138 (3 HSPs)
scaffold0138 (245-422)||(33074-33261)
scaffold0138 (112-226)||(18170-18284)
scaffold0138 (1-50)||(33334-33383)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (241-384)||(1227-1370)
scaffold0017 (241-384)||(7978-8121)
scaffold0017 (1-46)||(25936-25981)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (1-214)||(269-481)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (1-214)||(12221-12434)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (245-422)||(5615-5802)
scaffold0058 (6-63)||(5861-5918)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (38-226)||(19505-19693)
scaffold0106 (166-251)||(15225-15310)
scaffold0106 (1-46)||(21153-21198)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (111-250)||(988-1128)
[»] scaffold0515 (2 HSPs)
scaffold0515 (245-403)||(4215-4374)
scaffold0515 (1-63)||(4433-4495)
[»] scaffold0436 (2 HSPs)
scaffold0436 (111-249)||(8082-8220)
scaffold0436 (356-419)||(8028-8092)
[»] scaffold0462 (2 HSPs)
scaffold0462 (245-422)||(10378-10564)
scaffold0462 (1-50)||(10636-10685)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (245-422)||(22477-22664)
scaffold0046 (122-219)||(16861-16957)
scaffold0046 (117-219)||(26016-26117)
scaffold0046 (1-63)||(22356-22418)
[»] scaffold0741 (2 HSPs)
scaffold0741 (166-293)||(4256-4383)
scaffold0741 (278-403)||(6851-6977)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (38-250)||(11196-11407)
scaffold0040 (38-250)||(22296-22507)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (111-250)||(3006-3146)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (245-403)||(70536-70689)
scaffold0057 (5-63)||(70419-70477)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (119-250)||(10213-10344)
[»] scaffold0452 (2 HSPs)
scaffold0452 (293-444)||(13490-13650)
scaffold0452 (111-185)||(13430-13502)
[»] scaffold0111 (4 HSPs)
scaffold0111 (111-250)||(7481-7619)
scaffold0111 (111-250)||(14600-14738)
scaffold0111 (1-46)||(13123-13168)
scaffold0111 (1-46)||(19390-19435)
[»] scaffold1419 (2 HSPs)
scaffold1419 (39-222)||(101-283)
scaffold1419 (114-154)||(1-41)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (257-422)||(56842-57011)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (1-222)||(28978-29197)
scaffold0080 (1-222)||(34443-34662)
scaffold0080 (1-46)||(22378-22423)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (114-250)||(30381-30518)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (259-422)||(7544-7711)
[»] scaffold0914 (1 HSPs)
scaffold0914 (44-216)||(1785-1960)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (111-227)||(2602-2719)
scaffold0507 (112-220)||(7991-8100)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (111-250)||(7420-7560)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (111-227)||(6684-6800)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (38-209)||(3687-3857)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (38-251)||(206383-206596)
scaffold0014 (374-422)||(126896-126945)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (144-231)||(15030-15117)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (38-216)||(22361-22540)
scaffold0047 (1-46)||(78484-78529)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (38-216)||(13979-14158)
scaffold0005 (257-422)||(166426-166595)
scaffold0005 (112-215)||(267747-267849)
scaffold0005 (1-46)||(187092-187137)
[»] scaffold1283 (2 HSPs)
scaffold1283 (245-403)||(1314-1475)
scaffold1283 (1-46)||(1054-1099)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (257-408)||(15470-15625)
[»] scaffold0001 (11 HSPs)
scaffold0001 (1-224)||(152797-153018)
scaffold0001 (83-224)||(163004-163143)
scaffold0001 (245-303)||(176078-176136)
scaffold0001 (245-303)||(168724-168782)
scaffold0001 (2-51)||(77102-77151)
scaffold0001 (6-63)||(176195-176252)
scaffold0001 (122-185)||(446608-446671)
scaffold0001 (257-307)||(497538-497588)
scaffold0001 (6-59)||(168846-168899)
scaffold0001 (148-224)||(168684-168759)
scaffold0001 (148-224)||(176038-176113)
[»] scaffold0561 (2 HSPs)
scaffold0561 (108-249)||(10524-10666)
scaffold0561 (356-422)||(10467-10534)
[»] scaffold0347 (2 HSPs)
scaffold0347 (108-204)||(123-219)
scaffold0347 (257-341)||(8967-9051)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (287-365)||(6854-6932)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (38-207)||(2285-2454)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (38-250)||(4555-4767)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (318-403)||(78299-78385)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (119-224)||(146261-146366)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (122-225)||(29747-29851)
[»] scaffold0790 (1 HSPs)
scaffold0790 (125-219)||(6116-6210)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (108-217)||(589-699)
[»] scaffold0108 (4 HSPs)
scaffold0108 (172-250)||(3307-3385)
scaffold0108 (38-91)||(3385-3438)
scaffold0108 (1-51)||(5832-5882)
scaffold0108 (1-46)||(7368-7413)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (117-219)||(57898-57999)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (119-224)||(48403-48508)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (114-215)||(97092-97193)
scaffold0006 (114-215)||(106370-106471)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (185-284)||(36036-36135)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (186-284)||(10858-10956)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (112-226)||(6215-6329)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (1-75)||(19231-19304)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (108-225)||(332391-332507)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (1-63)||(11100-11162)
[»] scaffold0338 (2 HSPs)
scaffold0338 (1-63)||(3529-3591)
scaffold0338 (323-399)||(11613-11692)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (108-215)||(16028-16136)
scaffold0357 (164-226)||(2737-2799)
scaffold0357 (108-215)||(13213-13322)
[»] scaffold0825 (1 HSPs)
scaffold0825 (1-68)||(1402-1468)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (1-44)||(21677-21720)
[»] scaffold0737 (2 HSPs)
scaffold0737 (1-66)||(6264-6330)
scaffold0737 (112-215)||(1730-1832)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (112-226)||(38392-38506)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (1-75)||(6191-6264)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (395-444)||(3550-3599)
scaffold0165 (395-444)||(7614-7663)
scaffold0165 (108-215)||(27677-27785)
[»] scaffold0635 (1 HSPs)
scaffold0635 (1-51)||(7299-7349)
[»] scaffold0630 (1 HSPs)
scaffold0630 (1-51)||(8479-8529)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (1-51)||(3121-3171)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (1-51)||(13361-13411)
scaffold0220 (1-51)||(16179-16229)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (1-51)||(8472-8522)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-63)||(12094-12156)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (114-215)||(91-192)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (1-46)||(1505-1550)
[»] scaffold0301 (3 HSPs)
scaffold0301 (151-224)||(16541-16613)
scaffold0301 (86-224)||(12077-12213)
scaffold0301 (86-224)||(15229-15365)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-46)||(34685-34730)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (151-224)||(209001-209073)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (1-49)||(21058-21106)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (1-44)||(2362-2405)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (1-51)||(12749-12799)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (42-104)||(8376-8438)
[»] scaffold1160 (1 HSPs)
scaffold1160 (1-42)||(110-151)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (1-46)||(3108-3153)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (1-46)||(5137-5182)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (1-42)||(18240-18281)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (1-46)||(18585-18630)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (1-46)||(28955-29000)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (1-42)||(24590-24631)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (1-42)||(56401-56442)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (1-70)||(51355-51423)
[»] scaffold0672 (1 HSPs)
scaffold0672 (1-44)||(8143-8186)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (1-68)||(36158-36224)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (1-44)||(26348-26391)
scaffold0104 (1-44)||(27730-27773)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (1-68)||(159537-159603)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (114-200)||(14547-14633)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (1-46)||(18712-18758)
[»] scaffold0098 (2 HSPs)
scaffold0098 (154-224)||(24289-24358)
scaffold0098 (154-224)||(35159-35228)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (4-46)||(36106-36148)
[»] scaffold1662 (1 HSPs)
scaffold1662 (1-46)||(8-53)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (185-222)||(1583-1620)
[»] scaffold1186 (1 HSPs)
scaffold1186 (1-46)||(1131-1176)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (1-46)||(7937-7982)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (185-222)||(3178-3215)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (1-42)||(11933-11974)
[»] scaffold0401 (1 HSPs)
scaffold0401 (1-42)||(8244-8285)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (1-46)||(7972-8017)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (1-46)||(7553-7598)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (1-42)||(62143-62184)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (114-158)||(11607-11651)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (114-158)||(17961-18005)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (10-46)||(20670-20706)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (114-158)||(38190-38234)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 106)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 111 - 444
Target Start/End: Original strand, 19773474 - 19773807
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19773474 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttcttgattatcatttgatattgtt 19773573  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 310  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19773574 atatcttgagatgtttacgtgctgcatatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgat 19773673  T
Q  311 acttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttgtctaagttgtaagttgtcg 410  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19773674 gcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgtaggtgttgtctaagttgtaagttatcg 19773773  T
Q  411 ttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 444  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19773774 ttccaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 19773807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 111 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22806120 - 22805779
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22806120 aatatgatttaatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttta-gttgttgttgattatcatttgatattgtt 22806022  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 310  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22806021 atatcttgtgatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatattcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgat 22805922  T
Q  311 acttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgt 401  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||    
T  22805921 gcttctcattaatattgttatgttgtgaattgctcgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt 22805822  T
Q  402 aagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 444  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22805821 aagttgtcattccaaagtatcccaaagtattggagtcttaagt 22805779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Original strand, 15817345 - 15817744
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  || |  ||||| |  |||    
T  15817345 tatgaggtcaattaagttgtttaagattatttaacccatgttgtgagttgatc-ttggggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctgtg 15817443  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |  | | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  15817444 aagctg-tataatatgatttgatgttgttagtaatgtggtatatttgaatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttaattatcatt 15817542  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15817543 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcatatgttgttgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgttta 15817642  T
Q  301 agttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagtt 399  Q
    ||| |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15817643 agtagttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttttg-tgtttct-atgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagtt 15817740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23415076 - 23414819
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatatt 207  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23415076 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatatt 23414977  T
Q  208 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23414976 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 23414877  T
Q  308 gatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23414876 gatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 23414819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 4477123 - 4476872
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4477123 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtaccgttgatgttgagtg 4477024  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4477023 agtcagttataatataatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatt 4476924  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  4476923 tgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 4476872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 111 - 403
Target Start/End: Original strand, 15705375 - 15705668
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15705375 aatatggtttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtttatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 15705474  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 310  Q
    |||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  15705475 atatcttgagatgtttacttgttttctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtataagttgatgat 15705574  T
Q  311 acttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15705575 gcttctcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtttaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 15705668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27556834 - 27556577
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatatt 207  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  27556834 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgatcatcatttgatgtt 27556735  T
Q  208 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 307  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27556734 gttatatattgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 27556635  T
Q  308 gatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27556634 gatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 27556577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23838444 - 23838224
Alignment:
Q  30 tttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgtt 129  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23838444 tttaacccattttgtgagttgacccttgaggtaggaatggaggttgattatagtactgttgaggttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgtt 23838345  T
Q  130 agtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23838344 agtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatg 23838245  T
Q  230 tgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    ||  |||||||||||||||||    
T  23838244 tgctgcctatgttgctgttgt 23838224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 112 - 399
Target Start/End: Original strand, 28103831 - 28104119
Alignment:
Q  112 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28103831 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattatgtgaattatataagttgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgtta 28103930  T
Q  212 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 311  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  28103931 taccttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatg 28104030  T
Q  312 cttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagtt 399  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28104031 ctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagtttcaggtgttggtctaagtt 28104119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 14979209 - 14979543
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||  | |  ||| | |  |||    
T  14979209 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcattggggtagggatggaggttgaatataacattactgaggatctgtg 14979308  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |  | | ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14979309 aagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 14979408  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 300  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14979409 tgatgttgttatatctcaagatgtttaagtgatgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttta 14979508  T
Q  301 agttgttgatacttcatattaatattgttatgttg 335  Q
    |||||||| |  ||   ||||||||||||||||||    
T  14979509 agttgttggtgattttcattaatattgttatgttg 14979543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 31477893 - 31478077
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31477893 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatg 31477992  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31477993 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 31478077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16760318 - 16760134
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16760318 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatg 16760219  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16760218 tggaagatatatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 16760134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 188 - 362
Target Start/End: Original strand, 18955853 - 18956027
Alignment:
Q  188 gttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaga 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18955853 gttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaga 18955952  T
Q  288 tgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18955953 tgtatgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgcatgcgctgtttctgttgct 18956027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 181 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22949131 - 22948950
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22949131 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatg 22949032  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22949031 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 22948950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 38 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18453444 - 18453232
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  18453444 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattatactactgttgatgttcagtgagtctgatattatatgatttgatgttgttagtaatgt 18453345  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 237  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  18453344 gatatagttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgattttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcct 18453245  T
Q  238 atgttgctgttgt 250  Q
    |||||||||||||    
T  18453244 atgttgctgttgt 18453232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 18917349 - 18917533
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18917349 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 18917448  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18917449 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 18917533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 181 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22953087 - 22952906
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22953087 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatg 22952988  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22952987 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgagaattgcttgtgctgtttctgttgct 22952906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 181 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23871575 - 23871394
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  23871575 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatg 23871476  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  23871475 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgagaattgcttgtgctgtttctgttgct 23871394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 181 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23875531 - 23875350
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  23875531 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatg 23875432  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  23875431 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgagaattgcttgtgctgtttctgttgct 23875350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 1644725 - 1644547
Alignment:
Q  187 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1644725 tgttgattatcatttgatattgttatattctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaag 1644626  T
Q  287 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1644625 atgtttgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 1644547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 214 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 17743463 - 17743276
Alignment:
Q  214 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 313  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17743463 tcttgagatgtttacgtgctacctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatact 17743364  T
Q  314 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttg 400  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17743363 tctcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctattgctgttgaagattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttg 17743276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 181 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14472294 - 14472113
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14472294 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 14472195  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 362  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  14472194 tggaagatgtataatgttgaagttattgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgcatgtgctgtttctgttgct 14472113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11566885 - 11566723
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11566885 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 11566786  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11566785 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 11566723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19870613 - 19870451
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19870613 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 19870514  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19870513 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 19870451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23395091 - 23394929
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23395091 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 23394992  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23394991 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 23394929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 185 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15875498 - 15875279
Alignment:
Q  185 gatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 284  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15875498 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcatatgttgctgatgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtgga 15875399  T
Q  285 agatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgca 384  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15875398 aaatgtatgatgtttaagttgttgataattttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttacatattgatcaagttgca 15875299  T
Q  385 ggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
     ||||| ||||| |||||||    
T  15875298 agtgttggtctatgttgtaa 15875279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 8243884 - 8243722
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8243884 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcacctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 8243785  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8243784 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 8243722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23989943 - 23989781
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23989943 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttaggtgaaatatttatatgccttatg 23989844  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23989843 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 23989781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 181 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 22862969 - 22862811
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22862969 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 22862870  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaa 339  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22862869 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 22862811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 200 - 403
Target Start/End: Original strand, 17377818 - 17378022
Alignment:
Q  200 ttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttt 299  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  17377818 ttgatgttgtcatatcttgagatgtttacgtgctgcatatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgttt 17377917  T
Q  300 aagttgttgatacttcat-attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaag 397  Q
    |||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17377918 aagttgtttat-gttcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtattgtttctgttgttgttgtatattgatcaagttgcaggtgttggtctaag 17378016  T
Q  398 ttgtaa 403  Q
    ||||||    
T  17378017 ttgtaa 17378022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Original strand, 25619545 - 25619770
Alignment:
Q  2 atgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtga 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||  | |  ||||| |  ||||    
T  25619545 atgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcattggggtaggaatggaggttgaatataacattactgatgatctgtga 25619644  T
Q  102 gtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcattt 201  Q
        | ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25619645 tgttgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatttttaagttgatgttgattatcattt 25619744  T
Q  202 gatattgttatatcttgagatgttta 227  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||    
T  25619745 gatgttgttatatctcaagatgttta 25619770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20136931 - 20136722
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |  |||| || ||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||     
T  20136931 atgttatgagttgatccttagggtaggaatgaaggttggttataatactgctattgttcagagagtctgatacaagatgatttgatgttgttagttatgt 20136832  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 237  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  20136831 gatataattgtatat-cattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcct 20136733  T
Q  238 atgttgctgtt 248  Q
    |||||||||||    
T  20136732 atgttgctgtt 20136722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 248
Target Start/End: Original strand, 22195938 - 22196147
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |  |||| || ||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||     
T  22195938 atgttatgagttgatccttagggtaggaatgaaggttggttataatactgctattgttcagagagtctgatacaagatgatttgatgttgttagttatgt 22196037  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 237  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  22196038 gatataattgtatat-cattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcct 22196136  T
Q  238 atgttgctgtt 248  Q
    |||||||||||    
T  22196137 atgttgctgtt 22196147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 234 - 365
Target Start/End: Original strand, 27415994 - 27416125
Alignment:
Q  234 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27415994 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 27416093  T
Q  334 tgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27416094 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 27416125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Original strand, 12618927 - 12619087
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  12618927 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtctcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatt--tatgtcttatg 12619024  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12619025 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgctgtgaattgc 12619087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 245 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 18914000 - 18913813
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  18914000 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgagaattgct 18913901  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18913900 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 18913813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 245 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 18937258 - 18937071
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  18937258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgagaattgct 18937159  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18937158 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 18937071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18696749 - 18696480
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||| ||||||||| ||||||||| |||||     
T  18696749 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttatcatatgatttaatgttgttaataatgt 18696650  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt-acgtgtcgcc 236  Q
    ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||  || || | ||||||  | ||||||||||||||||| |||  ||||| | || | |||    
T  18696649 gatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttggagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgtattgcc 18696551  T
Q  237 tatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18696550 tatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 18696480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 20556680 - 20556893
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||| |||| || |  ||||| |  | |    
T  20556680 tatgagttaaattaaggtgttaaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttcgggtaggaatgagggttgaatataatattactgatgatatgag 20556779  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20556780 aagctattataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatt 20556879  T
Q  201 tgatattgttatat 214  Q
    |||| |||||||||    
T  20556880 tgatgttgttatat 20556893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25755185 - 25754972
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| || |  ||||| |   ||    
T  25755185 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttagaccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctttg 25755086  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25755085 aagctattataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattttataagatgtttaagttgatgttgattatgatt 25754986  T
Q  201 tgatattgttatat 214  Q
    |||| |||||||||    
T  25754985 tgatgttgttatat 25754972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 245 - 422
Target Start/End: Original strand, 15174163 - 15174350
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15174163 tgttgttggttatgtgaaataattatatgacttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgagaattact 15174262  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15174263 tgtgctatttatgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 15174350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 18706568 - 18706301
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggg-gtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatg 136  Q
    ||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18706568 atgttatgagttgatccttggttgtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgatgttgttaataatg 18706469  T
Q  137 agatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt-acgtgtcgc 235  Q
      |||||  |||||||||||||  || |||||||| |||||||||| || | ||||||  | ||||||||||||||||| |||  ||||| |  | | ||    
T  18706468 tcatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatatattgc 18706370  T
Q  236 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagtt 304  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18706369 ctatgttgctgtttttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtt 18706301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16493409 - 16493196
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataat-atgatttgatgttgttagtaatg 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||   | ||| | |||| |||| |||||||||||||    
T  16493409 atgttatgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattatagtactgttaatgtccagtgagtttaaaatatttatgaattgaggttgttagtaatg 16493310  T
Q  137 agatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgc 235  Q
     |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||   ||    
T  16493309 tgatatatt-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgttctatcttgagatgtttatgttctgc 16493211  T
Q  236 ctatgttgctgttgt 250  Q
    |||||||||||||||    
T  16493210 ctatgttgctgttgt 16493196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33443307 - 33443122
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| || | |||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  33443307 atgttatgagttgatccttagggtaggaatggaggttgaatataatattattgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgt 33443208  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 226  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33443207 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagt---tgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 33443122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20224205 - 20224018
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||  |||| || | ||||| ||||||| |||||| ||||||||     
T  20224205 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattgctgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttgatagtaatgt 20224106  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 225  Q
     |||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  20224105 aatatatttgtgtatgaattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgtt 20224018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22118189 - 22118002
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||  |||| || | ||||| ||||||| |||||| ||||||||     
T  22118189 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattgctgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttgatagtaatgt 22118090  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 225  Q
     |||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  22118089 aatatatttgtgtatgaattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgtt 22118002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 226
Target Start/End: Original strand, 18177531 - 18177719
Alignment:
Q  39 tgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttg-agtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| | |||||| ||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  18177531 tgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatataa-atgatttgatgttgttaataatgt 18177629  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-ttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 226  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18177630 gatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 18177719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 226
Target Start/End: Original strand, 18199275 - 18199463
Alignment:
Q  39 tgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttg-agtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| | |||||| ||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  18199275 tgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatataa-atgatttgatgttgttaataatgt 18199373  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-ttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 226  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18199374 gatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 18199463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18204340 - 18204152
Alignment:
Q  39 tgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttg-agtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| | |||||| ||||  ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||     
T  18204340 tgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatgtaa-atgatttgatgttgttaataatgt 18204242  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-ttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 226  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18204241 gatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 18204152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25753015 - 25752838
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| || |  ||||| |   ||    
T  25753015 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttagaccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattactgatgatctatg 25752916  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 178  Q
    |  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25752915 aagctattataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 25752838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 109 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23539160 - 23539020
Alignment:
Q  109 ataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattg 208  Q
    |||| ||||||| |||||  || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  23539160 ataagatgatttaatgttaataataaggtgatatatttgtaaatgcattatgtggattatatatgatgtttatgttgatgttaattatcatttgatattg 23539061  T
Q  209 ttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttg 249  Q
    |||||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||    
T  23539060 ttatatcttgagatgtatatgtgctgcctgtgttgctgttg 23539020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 219
Target Start/End: Original strand, 18896252 - 18896354
Alignment:
Q  116 gatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatc 215  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18896252 gatttaatgttgttagtaatgggatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttatatc 18896350  T
Q  216 ttga 219  Q
    ||||    
T  18896351 ttga 18896354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25738641 - 25738457
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||| || || |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |  |      
T  25738641 atgttatgagttgatccttgggttaggaatgaagatttattaaaatactgttgatgttcagtgagtctgatataagatga-ttgatgttgttaatgctat 25738543  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  25738542 ggtatatttgcaaatgcattatgtggattatgaatgatgtttaagttga-gttgattattaattgatattgtcatatcttgagatgt 25738457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 114 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23076918 - 23076806
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttata 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  23076918 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattata 23076819  T
Q  214 tcttgagatgttt 226  Q
    ||| || ||||||    
T  23076818 tctggatatgttt 23076806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 225
Target Start/End: Original strand, 23527970 - 23528150
Alignment:
Q  43 gtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatat 142  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||||  |||||||| || | || ||| | || |||| |||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  23527970 gtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgtttatgttactgttgttgctcagagagcctgaaataagatgatttgatgttgatagtaatgtgatgt 23528069  T
Q  143 atttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 225  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  || ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  23528070 agttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagtcgatgttgatcgtcctttg--attgttacatcttgagatgtt 23528150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Original strand, 19656076 - 19656237
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttata--tgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattg 342  Q
    ||||||| || |||||| ||| |||||  ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | |  ||    |||||||||||||| |||||||||    
T  19656076 tgttgttagtaatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattg 19656175  T
Q  343 cttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  19656176 catgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaagtgttggtcaaagttgtaa 19656237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 23538996 - 23538745
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttata 213  Q
    |||| |||||||||||  ||||| |||||| |||||||||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23538996 atgaattgatgttgttgttaatgtgatatagttgtatatgcgttatgtgaatgatatatgatgtttaggttgatgttgattgtcatttgatattgttata 23538897  T
Q  214 tcttgagatgttt--acgtgtcgcctatgttgctgttgttggttat-gtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 310  Q
    || |||| |||||     ||| | ||    ||||| ||| |||||| || |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||     
T  23538896 tcatgagctgttttatattgttgtct---ctgctggtgtgggttatggtaaaatatttatataccttatgtgaaaaatgtatgatg-ttaaggtgttga- 23538802  T
Q  311 acttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 382  Q
                   || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23538801 ---------------tgatatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 23538745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19362611 - 19362507
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttata 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19362611 atgatttaatgttgttagtaatgtgatataattttatatgcattatgtgaattatttaagatgttcaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttata 19362513  T
Q  214 tcttga 219  Q
    ||||||    
T  19362512 tcttga 19362507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 129 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20182962 - 20182848
Alignment:
Q  129 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttac 228  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20182962 tagtaatgtgatatagttgtatatgcatt--gtgaattatgtatgatgtttaagttgttgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttat 20182865  T
Q  229 gtgtcgcctatgttgct 245  Q
    |||  |||||| |||||    
T  20182864 gtgctgcctatattgct 20182848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 129 - 245
Target Start/End: Original strand, 22153029 - 22153143
Alignment:
Q  129 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttac 228  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22153029 tagtaatgtgatatagttgtatatgcatt--gtgaattatgtatgatgtttaagttgttgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttat 22153126  T
Q  229 gtgtcgcctatgttgct 245  Q
    |||  |||||| |||||    
T  22153127 gtgctgcctatattgct 22153143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35008336 - 35008224
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttata 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||    
T  35008336 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatattcattacatgaattatatatgatgtttaagttgtttttgattatcacttgatattattata 35008237  T
Q  214 tcttgagatgttt 226  Q
    ||| || ||||||    
T  35008236 tctggatatgttt 35008224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 224
Target Start/End: Original strand, 29416845 - 29416949
Alignment:
Q  120 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttg 218  Q
    ||||||||||| | ||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29416845 tgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttaattatcatttgatattgttatatcttg 29416943  T
Q  219 agatgt 224  Q
    ||||||    
T  29416944 agatgt 29416949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 16133257 - 16133357
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |  || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  16133257 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcctcgggttatgtgtgaaggtttattataatactgttgatgttcagtg 16133356  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  16133357 a 16133357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 19443867 - 19443967
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |  || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  19443867 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcctcgggttatgcgtgaaggtttattataatactgttgatgttcagtg 19443966  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  19443967 a 19443967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 20734033 - 20734107
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  20734033 tatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatgaaggttg 20734107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 27851468 - 27851394
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  27851468 tatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 27851394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 18658671 - 18658598
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  18658671 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 18658598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 611205 - 611139
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  611205 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatg 611139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 91
Target Start/End: Original strand, 17229780 - 17229827
Alignment:
Q  44 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17229780 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 17229827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23956206 - 23956148
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 303  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23956206 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 23956148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 318 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 17105835 - 17105771
Alignment:
Q  318 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 382  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17105835 attattattgatatgttgagaattgcctgtgttgtttctgttgctgttgaacattgatcaagttg 17105771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 17105993 - 17105849
Alignment:
Q  39 tgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgag 138  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |  || |||| ||||| |||||||| |||| ||| |  | || |||| |||| |||||||||||| ||| | |    
T  17105993 tgttgtgagttgatccttggggtagggaatgaagttgtttatattactgttgttgttcagtaaccctgacataaaatgaattgatgttgttaataacgtg 17105894  T
Q  139 atatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagt 183  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |||||| ||||    
T  17105893 atatagttgtatatgaattatgtgaattatgtatgatgttaaagt 17105849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Original strand, 20078033 - 20078099
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtc 104  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||    
T  20078033 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatactatcgatgttcagtgagtc 20078099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 29848092 - 29848142
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29848092 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttga 29848142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 224
Target Start/End: Original strand, 14594210 - 14594282
Alignment:
Q  151 atgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||    
T  14594210 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 14594282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 18455658 - 18455703
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18455658 tatgagttcaattaaggtctttaagagtatttaacctatgttgtga 18455703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 18703029 - 18702984
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18703029 tatgagttcaattagggtttttaagagtatttaacctatgttgtga 18702984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 25921195 - 25921150
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25921195 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 25921150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 13764818 - 13764751
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| ||||    
T  13764818 tatgagttaaattaaggtgttttagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttagggtagaaatg 13764751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15896114 - 15896051
Alignment:
Q  122 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttg 185  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||    
T  15896114 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgtggaaaatgtaagatgttcaagttg 15896051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 19826076 - 19826142
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  19826076 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaattatgttgtgagttga-tcttgggataggaatg 19826142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 34296856 - 34296923
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  34296856 tatgagtttaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagtcgacccttggggttggaatg 34296923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 15174042 - 15174104
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  15174042 tatgagttcaattaaattgtttaagggtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 15174104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7429990 - 7429918
Alignment:
Q  151 atgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||    
T  7429990 atgcattatgtgaattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 7429918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 17318709 - 17318754
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17318709 tatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 17318754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 19655816 - 19655861
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19655816 tatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 19655861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 23956318 - 23956265
Alignment:
Q  10 aattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||    
T  23956318 aattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtag 23956265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 28947809 - 28947764
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28947809 tatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 28947764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 32259313 - 32259268
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  32259313 tatgagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttgtga 32259268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 19234661 - 19234617
Alignment:
Q  2 atgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19234661 atgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacctatgttgtga 19234617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 311
Target Start/End: Original strand, 20078134 - 20078182
Alignment:
Q  263 atatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 311  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20078134 atatatatatgcgttatgtgtaagatgtatgatgttgaagttgttgata 20078182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 185
Target Start/End: Original strand, 19656075 - 19656138
Alignment:
Q  122 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttg 185  Q
    ||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| ||| || |||||| ||||||    
T  19656075 atgttgttagtaatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttg 19656138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 29044725 - 29044682
Alignment:
Q  3 tgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29044725 tgagttcaattaaggtgtttaagagtatataacctatgttgtga 29044682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 8760103 - 8760141
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  8760103 tatgagttcaattaaggtgtttaagaatatttaacccat 8760141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 8767850 - 8767888
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  8767850 tatgagttcaattaaggtgtttaagaatatttaacccat 8767888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 7827437 - 7827392
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  7827437 tatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 7827392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 13285174 - 13285129
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  13285174 tatgagttcatttaaggtgtttaagagtatttaacctatattgtga 13285129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 18398384 - 18398339
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  18398384 tatgagctcaattaaggtgtttaagagtatttaacttatgttgtga 18398339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 18708964 - 18708919
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18708964 tatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 18708919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 20411258 - 20411299
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 42  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  20411258 tatgagttcaattaagttgtttaagagtatttaacctatgtt 20411299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 25347590 - 25347553
Alignment:
Q  2 atgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccat 39  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25347590 atgagttcaattaaggtgtttgagagtatttaacccat 25347553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 27126064 - 27126109
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27126064 tatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 27126109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 158
Target Start/End: Original strand, 8227445 - 8227489
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 158  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  8227445 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcatta 8227489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 170
Target Start/End: Original strand, 19847929 - 19847984
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatat 170  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  19847929 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 19847984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 20177208 - 20177151
Alignment:
Q  4 gagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||||||    
T  20177208 gagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacctatgttatga--tgaaccttggggtag 20177151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23956183 - 23956108
Alignment:
Q  148 tatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    ||||||| |||||||||  || || ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||    
T  23956183 tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 23956108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 153)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 16998890 - 16998488
Alignment:
Q  2 atgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtga 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| || |  ||||| |  ||||    
T  16998890 atgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggagattgaatataatattactgatgatctgtga 16998791  T
Q  102 gtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcattt 201  Q
      ||| ||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998790 agcagttataatatgatttaatgttgataataatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcattt 16998691  T
Q  202 gatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaa 301  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  16998690 gatgttgttatatcttgagatgtttaagtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgttgaaaatatatgatgtttaa 16998591  T
Q  302 gttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttg 400  Q
    ||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16998590 gttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtaatgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttg 16998491  T
Q  401 taa 403  Q
    |||    
T  16998490 taa 16998488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 4 - 403
Target Start/End: Original strand, 46580500 - 46580900
Alignment:
Q  4 gagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagt 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||      
T  46580500 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaag 46580599  T
Q  104 cagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttga 203  Q
    | | ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46580600 ctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttga 46580699  T
Q  204 tattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 303  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46580700 tgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 46580799  T
Q  304 tgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgta 402  Q
    ||||||| ||    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46580800 tgttgatgctcttcattaatattgttatgctgtgaattgcttgtactgtttttgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgta 46580899  T
Q  403 a 403  Q
    |    
T  46580900 a 46580900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14273813 - 14273361
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| || |  ||||| |  |||    
T  14273813 tatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtg 14273714  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |  | | ||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14273713 aagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 14273614  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14273613 tgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatgtggaaaatgtatgatgttta 14273514  T
Q  301 agttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtg-ttgtct----- 394  Q
    |||||||| |  ||   |||||||||||||||||| ||||   ||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||         
T  14273513 agttgttggtgtttttcattaatattgttatgttgcgaatattttgtactatttctgttgctattgcatattgatcaagttgcaggtgtttgtctaagtt 14273414  T
Q  395 ---aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 444  Q
       ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14273413 gtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaagt 14273361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 111 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14258639 - 14258297
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14258639 aatatgatttgatattgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 14258540  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 310  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14258539 atatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttgagttgttgat 14258440  T
Q  311 acttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgt 401  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||    
T  14258439 gcttctcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtaatgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt 14258340  T
Q  402 aagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 444  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14258339 aagttgtcattccaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 14258297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 111 - 444
Target Start/End: Original strand, 16460697 - 16461039
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16460697 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgtt 16460796  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 310  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16460797 atatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgttagttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgat 16460896  T
Q  311 acttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtg-ttgtct--------aagttgt 401  Q
     ||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||||    
T  16460897 gcttctcatcaatattgttatgttgtgaattgcttttgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtttgtctaagttgtaaagttgt 16460996  T
Q  402 aagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 444  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16460997 aagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 16461039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 111 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16579947 - 16579605
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  16579947 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgtttttgattatcatttgatgttgtt 16579848  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 310  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  16579847 atatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtgtaaaatgtattatgtttaagttgttgat 16579748  T
Q  311 acttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgt 401  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||    
T  16579747 gcttctcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctattgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt 16579648  T
Q  402 aagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 444  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16579647 aagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 16579605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 111 - 444
Target Start/End: Original strand, 16585716 - 16586058
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  16585716 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgtttttgattatcatttgatgttgtt 16585815  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 310  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  16585816 atatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtgtaaaatgtattatgtttaagttgttgat 16585915  T
Q  311 acttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgt 401  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||    
T  16585916 gcttctcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctattgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt 16586015  T
Q  402 aagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 444  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16586016 aagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 16586058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16008843 - 16008592
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16008843 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 16008744  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16008743 agtcagatataatataatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatt 16008644  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  16008643 tgatattgttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgccgttgttg 16008592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18872625 - 18872374
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18872625 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 18872526  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18872525 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatt 18872426  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  18872425 tgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 18872374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11661570 - 11661322
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11661570 tatgagttcaattaatgtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgaccct-ggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 11661472  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11661471 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 11661372  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  11661371 tgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 11661322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18607752 - 18607503
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607752 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 18607653  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607652 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 18607553  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  18607552 tgatatttttatatattgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 18607503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 111 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 32301476 - 32301183
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32301476 aatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatctttaagttgatgttgattatcatttgatgttgtt 32301377  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 310  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  32301376 atatcttgagatgtttacgtgttgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaaattgttgat 32301277  T
Q  311 acttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt-gttgtctaagttgtaa 403  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  32301276 acttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtggtggtctaagttgtaa 32301183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14566467 - 14566216
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14566467 tatgagtgtaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 14566368  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14566367 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatt 14566268  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  14566267 tgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 14566216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Original strand, 1858760 - 1859017
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatatt 207  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1858760 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatatt 1858859  T
Q  208 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1858860 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 1858959  T
Q  308 gatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1858960 gatgcttcacattaatattgatatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 1859017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14422250 - 14422000
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422250 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagcatttaacccatgttgtgaggttacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 14422151  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14422150 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggatcatataagatgttttaagttgatgttgattatcat 14422051  T
Q  200 ttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||| |||||||    
T  14422050 ttgatattgttatatcttgaggtgtttatgtgctgcctatgttactgttgt 14422000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Original strand, 25927180 - 25927434
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatatt 207  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  25927180 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttg---ttgattatcatttgatatt 25927276  T
Q  208 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25927277 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 25927376  T
Q  308 gatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25927377 gatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgatgtt 25927434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Original strand, 13918454 - 13918711
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatatt 207  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  13918454 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttaattatcatttgatatc 13918553  T
Q  208 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13918554 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatatggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 13918653  T
Q  308 gatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13918654 gatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 13918711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 155 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15720140 - 15719842
Alignment:
Q  155 attatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggt 254  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||    
T  15720140 attaagtgaattagataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcatatgtttctgttgttggt 15720041  T
Q  255 tatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgttt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  15720040 tatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgttt 15719941  T
Q  355 ctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 444  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  15719940 ctgttgctgatgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcctaagt 15719842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 166 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 8940383 - 8940145
Alignment:
Q  166 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaata 265  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940383 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaata 8940284  T
Q  266 tttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  8940283 tttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttatgttgctgtt 8940184  T
Q  366 gaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8940183 gcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 8940145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 44 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 42462205 - 42461999
Alignment:
Q  44 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  42462205 tgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattatagtactgttgatgttcaatgagtctgatataatataatttgatgttgttagtaatgtgatata 42462106  T
Q  144 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttg 243  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  42462105 gttgtatattcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttg 42462006  T
Q  244 ctgttgt 250  Q
    |||||||    
T  42462005 ctgttgt 42461999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 38 - 391
Target Start/End: Original strand, 17060282 - 17060635
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||| || |  |||||||   ||| || | ||||| ||||||| |||||| ||||||||     
T  17060282 atgttatgagttgatccttggggtagaaacggaggttgaatataatattactgatgttctatgaatctgttataacatgatttaatgttgatagtaatgt 17060381  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt-aagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcc 236  Q
     | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||     
T  17060382 caaatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgaagttgattatcgtttgatattgttatattttgagatgtttatgtgctgca 17060481  T
Q  237 tatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgt 336  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||| ||| | | ||||    
T  17060482 tatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatattccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatgttggtct-ttgt 17060580  T
Q  337 gaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 391  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  17060581 gaattgcttgtactgtttctattgctgttgaatattgatcaaattacaagtgttg 17060635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 181 - 362
Target Start/End: Original strand, 45170089 - 45170270
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45170089 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatg 45170188  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  45170189 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgtttgtactgtttctgttgct 45170270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 39722289 - 39722105
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39722289 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatg 39722190  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39722189 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttatgttgctgtt 39722105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 147883 - 147704
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  147883 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgaattgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 147784  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttta 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  147783 agtcagatataatatgatttgatgttgtgagtaatgagatatatttgtataagcattatgtggattatatgagatgttta 147704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 184 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 8468833 - 8468613
Alignment:
Q  184 tgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgg 283  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8468833 tgatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtgg 8468734  T
Q  284 aagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgc 383  Q
    |  || ||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  8468733 agaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtattgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgc 8468634  T
Q  384 aggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  8468633 aggtgttggtctaagttgtaa 8468613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18283389 - 18283227
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18283389 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 18283290  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18283289 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 18283227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 33130 - 32968
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33130 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 33031  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33030 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 32968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Original strand, 12704742 - 12704904
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12704742 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 12704841  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12704842 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 12704904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12714887 - 12714725
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12714887 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 12714788  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12714787 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 12714725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12718691 - 12718529
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12718691 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 12718592  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12718591 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 12718529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Original strand, 16907284 - 16907446
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16907284 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 16907383  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16907384 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 16907446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 44 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16996477 - 16996272
Alignment:
Q  44 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 143  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16996477 tgagttgacccttaggttaggaatggaggttgattataatattattgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatata 16996378  T
Q  144 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||    
T  16996377 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaa-atgttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctacgttg 16996279  T
Q  244 ctgttgt 250  Q
    |||||||    
T  16996278 ctgttgt 16996272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18279426 - 18279264
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18279426 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 18279327  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18279326 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttttgaattgc 18279264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 38 - 250
Target Start/End: Original strand, 9033204 - 9033417
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  9033204 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttggttatagtactgttaatgttcagtgagtctaatataatgtgatttgatgttgttaataatgt 9033303  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcc 236  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||    
T  9033304 gatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgcattattatttgatattgttatatcctgagatatttatgtgttgcc 9033403  T
Q  237 tatgttgctgttgt 250  Q
    ||||||| ||||||    
T  9033404 tatgttgttgttgt 9033417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 111 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20487730 - 20487533
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20487730 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgtt 20487631  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttg 308  Q
    || ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20487630 atgtcttgagatatttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatggcttatgtggaaaatgtacgatgtttaagttgttg 20487533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 197 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15113046 - 15112839
Alignment:
Q  197 catttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatg 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15113046 catttgatattgttatatcttgagatgtttaagtgttgcctatgttgatgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtagaaaatgtatgatg 15112947  T
Q  297 tttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtcta 395  Q
    |||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15112946 tttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaatttcttgtactgtttctgttgctgttgcacattgatcaagttgcaggtgttggtcta 15112847  T
Q  396 agttgtaa 403  Q
    ||||||||    
T  15112846 agttgtaa 15112839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12723602 - 12723440
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12723602 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 12723503  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12723502 tggaagatgtttgatgtttaagctgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 12723440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 181 - 342
Target Start/End: Original strand, 70848 - 71009
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70848 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 70947  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattg 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  70948 tggaagatgtttgatgtttaagttgtcgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 71009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 181 - 342
Target Start/End: Original strand, 74957 - 75118
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74957 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 75056  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattg 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  75057 tggaagatgtttgatgtttaagttgtcgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 75118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 44 - 250
Target Start/End: Original strand, 130680 - 130888
Alignment:
Q  44 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcag-atataatatgatttgatgttgttagtaatgagatat 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  130680 tgagttgatccttggggtaggaatggtggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtttgtatataatatgatttgatgttattagtaatgtgatat 130779  T
Q  143 atttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgt 241  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||    
T  130780 agttgtatatgcattatgtggattatataaggtgtttaagttgatgattgattattatttgatattgttatatcttgagatgtttctgtgctgcctatgt 130879  T
Q  242 tgctgttgt 250  Q
    || ||||||    
T  130880 tgatgttgt 130888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 38 - 223
Target Start/End: Original strand, 11768777 - 11768964
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||     
T  11768777 atgttatgagtcgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgtttatgttcagtgagtctaatataatatgatttgaggttgttagtaatgt 11768876  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg--attatcatttgatattgttatatcttgagatg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11768877 gatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaaatattatttgatattgttatatcttgagatg 11768964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 197 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 16324153 - 16323947
Alignment:
Q  197 catttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatg 296  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  16324153 cattcgatattgttatatcttgagatgtttaagtgttgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgtt-atatgccttttgtggaaaatgcatgatg 16324055  T
Q  297 tttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtcta 395  Q
    |||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16324054 tttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcgggtgttggtcta 16323955  T
Q  396 agttgtaa 403  Q
    ||||||||    
T  16323954 agttgtaa 16323947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16114264 - 16114102
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16114264 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgttcatgtgtcgcctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 16114165  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16114164 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 16114102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16117417 - 16117255
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16117417 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgttcatgtgtcgcctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 16117318  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16117317 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 16117255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26292418 - 26292256
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26292418 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgtcaatgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 26292319  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26292318 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 26292256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 56 - 250
Target Start/End: Original strand, 11525440 - 11525635
Alignment:
Q  56 tggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgca 155  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||    
T  11525440 tggggtaggaatgaaggtggattataataatgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatatgatgttattagtaatttgatatattggtatatgca 11525539  T
Q  156 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  11525540 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgattgattattatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgctgcctatgttgttgttgt 11525635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 200 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 15116580 - 15116352
Alignment:
Q  200 ttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15116580 ttgatattgttatatcttgagatgtttaagtgctgcctatgttgctgttgtttgttatgtgaaatgtgcatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttt 15116481  T
Q  300 aagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct---- 394  Q
    | |||||||||  ||   |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||        
T  15116480 acgttgttgatgtttttcattaatattgttattttgtgaatttcttgtattgtttctgttgctgttgcacattgatcaagttgcaagtgttggtctttgt 15116381  T
Q  395 -aagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
     ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15116380 aaagttgtaagttgtctttccaaagtatt 15116352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 106 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 38519566 - 38519422
Alignment:
Q  106 gatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgata 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38519566 gatataatatgatttgatgttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattgtataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgata 38519467  T
Q  206 ttgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  38519466 ttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgttgttgt 38519422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 234 - 364
Target Start/End: Original strand, 2530191 - 2530320
Alignment:
Q  234 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2530191 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatt-atatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 2530289  T
Q  334 tgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgt 364  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2530290 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgt 2530320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 38828526 - 38828304
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || || | ||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  38828526 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccacgttgtgagttgatcctcgggttatgagtgaatgtttattataatactgttgatgttcagtg 38828427  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcat 199  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||| | | | | || ||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  38828426 agtctgatataagatga-ttgatgttgttaatgacgtggtagatttgcaaatgcattatgtggacttatataggatgtttaagttg-tgttgattatcat 38828329  T
Q  200 ttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  38828328 ttgatattattatatcttgagatgt 38828304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13647707 - 13647492
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || |  ||||| |  | |    
T  13647707 tatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgcg 13647608  T
Q  101 agtcagatataatat--gatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatca 198  Q
    |  |   ||||||||  ||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  13647607 aagctattataatatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttgattatga 13647508  T
Q  199 tttgatattgttatat 214  Q
    |||||| |||||||||    
T  13647507 tttgatgttgttatat 13647492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Original strand, 32160910 - 32161068
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  32160910 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaat-tgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 32161008  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  32161009 tgtgctgtttctgttgctgttgcatattgattaagttacaggtgttggtctaagttgtaa 32161068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 111 - 249
Target Start/End: Original strand, 10501355 - 10501493
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10501355 aatatgatttgattttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgtt 10501454  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttg 249  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  10501455 atatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgttgttg 10501493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 245 - 391
Target Start/End: Original strand, 16550712 - 16550858
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16550712 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaacgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttttgaattgct 16550811  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 391  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16550812 tgtgttgtttctattgatgttgaataatgatcaagttgcagatgttg 16550858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 260 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15084140 - 15084035
Alignment:
Q  260 gaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgtt 359  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15084140 gaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgtt 15084041  T
Q  360 gctgtt 365  Q
    ||||||    
T  15084040 gctgtt 15084035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 111 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20619570 - 20619430
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  20619570 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 20619471  T
Q  210 tatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  20619470 tatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgttgttgt 20619430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 111 - 249
Target Start/End: Original strand, 14157036 - 14157174
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14157036 aatatgatttgatatcattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgtt 14157135  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttg 249  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  14157136 atatcttgagatgtttatgtgttgtctatgttgctgttg 14157174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 190
Target Start/End: Original strand, 9725526 - 9725670
Alignment:
Q  46 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 145  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |  | ||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  9725526 agttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttcagtgagtctgatataatgtgatttaatgttgttagtaatgtgatatagt 9725625  T
Q  146 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgtt 190  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  9725626 tgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatgtt 9725670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 17232973 - 17232814
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  ||   ||||||||||| ||||| | |||||||    
T  17232973 tgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggagaatatatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgtcatgttataaattgct 17232874  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  17232873 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcaggtgttggtctaagttgtaa 17232814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 245 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16614950 - 16614825
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16614950 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaacgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttttgaattgct 16614851  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaata 370  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||    
T  16614850 tgtgttgtttctattgatgttaaata 16614825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 225
Target Start/End: Original strand, 17017326 - 17017513
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  | |||||  ||||  | | ||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  17017326 atgttatgagttgatccttggggtagggatggaggttgaatatagtattactaatgttctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgt 17017425  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 225  Q
     ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||    
T  17017426 aatatatttgtatatgcattatatgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatgttattatatctggatatgtt 17017513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34957636 - 34957416
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| ||||    
T  34957636 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttatgagttgatcctt-ggttaggaatgaaggtttattaaaatactgttgatgttcagtg 34957538  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |||| |||| || |||  |||| ||||||| |  |  | || ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||| |||||||    
T  34957537 agtctgataaaagatg-gttgaggttgttaatgttatggtaaatttgcaaatgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-ggttgactatcatt 34957440  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    ||||||||| |||| |||||||||    
T  34957439 tgatattgtcatattttgagatgt 34957416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 287 - 403
Target Start/End: Original strand, 14981543 - 14981660
Alignment:
Q  287 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagg 386  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14981543 atgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcagg 14981642  T
Q  387 tgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    |||| |||||||||||||    
T  14981643 tgttggtctaagttgtaa 14981660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 287 - 403
Target Start/End: Original strand, 15411019 - 15411136
Alignment:
Q  287 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagg 386  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15411019 atgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgtatattgatcaagttgcagg 15411118  T
Q  387 tgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    |||| |||||||||||||    
T  15411119 tgttggtctaagttgtaa 15411136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 214
Target Start/End: Original strand, 9177524 - 9177700
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| || |  ||||| |  ||||  | | | ||| ||||||| |||||| ||||||||     
T  9177524 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatatgtgaagctgttttaacatgatttaatgttgatagtaatgt 9177623  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatat 214  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9177624 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattattatat 9177700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29004287 - 29004063
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||| | |  |||||||||| ||||    
T  29004287 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcctttggttaggaatgaaggtttattaaaatgttgttgatgttcagtg 29004188  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |||| |||| || |||  |||| ||||||| |  |    || ||||| | |||  ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||||    
T  29004187 agtctgataaaagatg-gttgaggttgttaatgttatagtaaatttgcaaatgtcttatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgactatcatt 29004090  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgttta 227  Q
    || |||||| |||| ||||||||||||    
T  29004089 tggtattgtcatattttgagatgttta 29004063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 216
Target Start/End: Original strand, 14929152 - 14929257
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14929152 aatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttggatatgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 14929251  T
Q  211 atatct 216  Q
     |||||    
T  14929252 gtatct 14929257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 216
Target Start/End: Original strand, 15352618 - 15352723
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15352618 aatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttggatatgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 15352717  T
Q  211 atatct 216  Q
     |||||    
T  15352718 gtatct 15352723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 319 - 444
Target Start/End: Original strand, 1490194 - 1490328
Alignment:
Q  319 ttaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtc 409  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||||||||||    
T  1490194 ttaatattgttatgatgtgaattgcttgtactttttctgttgttgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtc 1490293  T
Q  410 gttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 444  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1490294 tttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaagt 1490328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 18456235 - 18456308
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggtt 74  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18456235 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggtt 18456308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 185 - 284
Target Start/End: Original strand, 14270032 - 14270131
Alignment:
Q  185 gatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 284  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  14270032 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatgttcatatgctttatgtgga 14270131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 224
Target Start/End: Original strand, 16109453 - 16109558
Alignment:
Q  119 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctt 217  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16109453 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgtaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgctatatctt 16109551  T
Q  218 gagatgt 224  Q
    |||||||    
T  16109552 gagatgt 16109558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 30820843 - 30820910
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30820843 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatg 30820910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 140 - 224
Target Start/End: Original strand, 837317 - 837401
Alignment:
Q  140 tatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  837317 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 837401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 140 - 224
Target Start/End: Original strand, 1202497 - 1202581
Alignment:
Q  140 tatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1202497 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 1202581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 217
Target Start/End: Original strand, 10896687 - 10896748
Alignment:
Q  156 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10896687 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 10896748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15167346 - 15167285
Alignment:
Q  156 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15167346 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 15167285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16092019 - 16091844
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| || |  ||||| |  ||||  | | |||| ||||| ||  |||||||| |||||     
T  16092019 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatatgtgaagctgttatactatgaattattgttgttaataatgt 16091920  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatat 214  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16091919 tacatatttgtatacgcattatgtggattatatatgatgattaag-tgttgttgattatcatttgatattattatat 16091844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 48991372 - 48991266
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatatt 207  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  48991372 tataatatgatttaatgttgatagtaatt-gatatatt-gtatatgcattatctgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatatt 48991275  T
Q  208 gttatatct 216  Q
     ||||||||    
T  48991274 attatatct 48991266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 36685836 - 36685904
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggt-ttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36685836 tatgagttcaattaagatgttttaagagtatttaacccatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatg 36685904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 215
Target Start/End: Original strand, 15008427 - 15008533
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatatt 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || ||||||||  || ||||||||    
T  15008427 tataagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgaggtgttgttgatttgca-ttgatatt 15008525  T
Q  208 gttatatc 215  Q
    ||||||||    
T  15008526 gttatatc 15008533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18203965 - 18203887
Alignment:
Q  147 gtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18203965 gtatatgcattgtgtggattatatatgatgattaagt-gttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 18203887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 8756983 - 8757056
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  8756983 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 8757056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 224
Target Start/End: Original strand, 833321 - 833405
Alignment:
Q  140 tatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    |||||||| | |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  833321 tatatttgcaaatgcattatgtgaaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgt 833405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 224
Target Start/End: Original strand, 1198501 - 1198585
Alignment:
Q  140 tatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    |||||||| | |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1198501 tatatttgcaaatgcattatgtgaaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgt 1198585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 226
Target Start/End: Original strand, 1867929 - 1868040
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttata 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || |||| |||  || ||||||||||||||    
T  1867929 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttcatttgca-ttgatattgttata 1868027  T
Q  214 tcttgagatgttt 226  Q
    || |||| |||||    
T  1868028 tcatgagctgttt 1868040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 226
Target Start/End: Original strand, 38898181 - 38898241
Alignment:
Q  166 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 226  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38898181 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctagagatgttt 38898241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Original strand, 20220124 - 20220222
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttata 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  || |||||||| ||||||| |   ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20220124 atgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttga---gatgttgatttgcatttgatattgttata 20220220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 4325521 - 4325448
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  4325521 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 4325448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 13408237 - 13408187
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13408237 tatgagttcaattaagttttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 13408187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 185
Target Start/End: Original strand, 709146 - 709325
Alignment:
Q  5 agttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtc 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||  || |||| ||||| || |  || |||| || |||||    
T  709146 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggta-gaaacgaagttgtttataatattaatgttgttcagagagtc 709244  T
Q  105 agata-taatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttg 185  Q
     || | ||| |||| || ||||||||||| ||| |||||| || | ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||    
T  709245 tgaaattaagatga-ttaatgttgttagtgatgtgatatagttatttatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttg 709325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 17505591 - 17505655
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtagga 65  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  17505591 tatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 17505655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 17547623 - 17547559
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtagga 65  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  17547623 tatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 17547559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 832610 - 832676
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  832610 tatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatg 832676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 1197790 - 1197856
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  1197790 tatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatg 1197856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 12755293 - 12755359
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  12755293 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttgacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatg 12755359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 178
Target Start/End: Original strand, 2529982 - 2530052
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 178  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2529982 tataatatgatttaatgttgatagtgatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtt 2530052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 13699476 - 13699526
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13699476 tatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 13699526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 422
Target Start/End: Original strand, 14157153 - 14157231
Alignment:
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  14157153 tgtgttgtctatgttgctgttgcatattgatcaagttccaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttgcaaagtatt 14157231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 63
Target Start/End: Original strand, 14188883 - 14188941
Alignment:
Q  5 agttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  14188883 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 14188941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 63
Target Start/End: Original strand, 14191677 - 14191735
Alignment:
Q  5 agttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  14191677 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 14191735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 32160789 - 32160851
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||    
T  32160789 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttagggtag 32160851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 47975498 - 47975560
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||    
T  47975498 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttcgtccttggggtag 47975560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13892742 - 13892670
Alignment:
Q  151 atgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  13892742 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgagatgt 13892670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 59005 - 59071
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  59005 tatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttga-tcttgggataggaatg 59071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 422
Target Start/End: Original strand, 10501483 - 10501550
Alignment:
Q  356 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10501483 tgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctgagttgtaagttgtctttccaaagtatt 10501550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 48812300 - 48812241
Alignment:
Q  4 gagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  48812300 gagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 48812241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 16550591 - 16550653
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  16550591 tatgagtttaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgttccttggggtag 16550653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 16615071 - 16615009
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  16615071 tatgagtttaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgttccttggggtag 16615009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 17070880 - 17070930
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  17070880 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttga 17070930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 40555330 - 40555380
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  40555330 tatgagttcaattaaggtgtttaagtgtatttaacccatattgtgagttga 40555380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 47094545 - 47094495
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47094545 tatgatttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttga 47094495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 13745787 - 13745832
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13745787 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13745832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 13894560 - 13894515
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13894560 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13894515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 21675495 - 21675540
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21675495 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 21675540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 25941903 - 25941858
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25941903 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 25941858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 39292323 - 39292368
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  39292323 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 39292368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 214
Target Start/End: Original strand, 15081900 - 15081948
Alignment:
Q  166 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatat 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15081900 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 15081948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 46
Target Start/End: Original strand, 24270570 - 24270613
Alignment:
Q  3 tgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24270570 tgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 24270613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 37727514 - 37727580
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  37727514 tatgagttcaatcaaggtgtttaagagtttttaacctatgttgtgagttga-tcttgggataggaatg 37727580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 14416071 - 14416113
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttg 43  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14416071 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttg 14416113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 16462501 - 16462439
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  16462501 tatgagttaaattaaggtgattaacagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 16462439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 4691482 - 4691527
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4691482 tatgagttaaattaaggtgtttaagagtatttaaccaatgttgtga 4691527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 13745363 - 13745408
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13745363 tatgagttcaattaaggtgtttcagagtatttaacctatgttgtga 13745408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 14153558 - 14153599
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 42  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14153558 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14153599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 20252928 - 20252973
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20252928 tatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 20252973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 46
Target Start/End: Original strand, 21538779 - 21538820
Alignment:
Q  5 agttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21538779 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 21538820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 33001379 - 33001334
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  33001379 tatgagttcaattaaggtgtttaagagaatttaacctatgttgtga 33001334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 48213531 - 48213576
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  48213531 tatgagttcaattaaggtgtttaagaatatttaacctatgttgtga 48213576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 215
Target Start/End: Original strand, 2280047 - 2280155
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatat 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| || |||||| ||||| || |||||||| | || ||| || || ||||||||  ||||||||||    
T  2280047 tataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatat 2280146  T
Q  207 tgttatatc 215  Q
    | |||||||    
T  2280147 tattatatc 2280155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 8564177 - 8564220
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgt 44  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  8564177 tatgatttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 8564220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 189
Target Start/End: Original strand, 14416246 - 14416285
Alignment:
Q  150 tatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgt 189  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14416246 tatgcattatatggattatacaagatgtttaagttgatgt 14416285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 15167440 - 15167405
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacc 36  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15167440 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 15167405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 15213964 - 15213897
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||   ||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  15213964 tatgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaatttatgttgtgagtcgacccttgggtttggaatg 15213897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 422
Target Start/End: Original strand, 16461046 - 16461081
Alignment:
Q  387 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16461046 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 16461081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 19282557 - 19282514
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgt 44  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  19282557 tatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 19282514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 32301137 - 32301102
Alignment:
Q  387 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32301137 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 32301102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 8514332 - 8514366
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaac 35  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8514332 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 8514366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 215
Target Start/End: Original strand, 12255730 - 12255827
Alignment:
Q  119 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatc 215  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||||  || |||||||| | |||||| || || ||| || | ||||||||||||||||||||    
T  12255730 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatc 12255827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 14036460 - 14036423
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14036460 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttg 14036423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 14045010 - 14044973
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14045010 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttg 14044973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 14161441 - 14161482
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 42  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  14161441 tatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 14161482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 14346490 - 14346453
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14346490 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttg 14346453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 14355040 - 14355003
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14355040 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttg 14355003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 15576417 - 15576462
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||    
T  15576417 tatgagttcaattaaggtgtttaagggtatttaacttatgttgtga 15576462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16185984 - 16185935
Alignment:
Q  395 aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 444  Q
    |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16185984 aagttgtaagttatctttccaaagtgttccaaagtattggagtcctaagt 16185935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 32771793 - 32771760
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaa 34  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32771793 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 32771760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 44374411 - 44374366
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  44374411 tatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 44374366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 44383276 - 44383231
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  44383276 tatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 44383231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 46386674 - 46386719
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  46386674 tatgagttcaactatggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 46386719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 178
Target Start/End: Original strand, 1490117 - 1490173
Alignment:
Q  122 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 178  Q
    ||||||||| ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1490117 atgttgttaataatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatatatgatgtt 1490173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 387 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 16579598 - 16579566
Alignment:
Q  387 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16579598 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 16579566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 387 - 419
Target Start/End: Original strand, 16586065 - 16586097
Alignment:
Q  387 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16586065 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 16586097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 156)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 111 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 16796674 - 16796362
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16796674 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 16796575  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 310  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16796574 atatcttgaaatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 16796475  T
Q  311 acttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtc 409  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16796474 gcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtc 16796375  T
Q  410 gttctaaagtatt 422  Q
    |||| ||||||||    
T  16796374 gttccaaagtatt 16796362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 4 - 403
Target Start/End: Original strand, 52989548 - 52989947
Alignment:
Q  4 gagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagt 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||| || |  ||||| |  ||||      
T  52989548 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggg-taggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtgaag 52989646  T
Q  104 cagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttga 203  Q
    | | ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52989647 ctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttga 52989746  T
Q  204 tattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 303  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52989747 tgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 52989846  T
Q  304 tgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgta 402  Q
    ||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52989847 tgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgta 52989946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 42 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 324492 - 324130
Alignment:
Q  42 tgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagata 141  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |  | ||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||    
T  324492 tgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactaatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaata 324393  T
Q  142 tatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  324392 tatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgt 324293  T
Q  242 tgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaatt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  324292 tgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaatt 324193  T
Q  342 gcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  324192 gcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 324130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 4 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14966464 - 14966064
Alignment:
Q  4 gagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagt 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||      
T  14966464 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatcattggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaag 14966365  T
Q  104 cagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttga 203  Q
    | | ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14966364 ctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaattgatgttgattatcatttga 14966265  T
Q  204 tattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 303  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14966264 tgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagt 14966165  T
Q  304 tgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgta 402  Q
    ||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14966164 tgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgtttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgta 14966065  T
Q  403 a 403  Q
    |    
T  14966064 a 14966064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 111 - 403
Target Start/End: Original strand, 43889558 - 43889851
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43889558 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 43889657  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 310  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43889658 atatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtagaaaatgtatgatgtttaagttgttgat 43889757  T
Q  311 acttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
       ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43889758 gtctctcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 43889851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 23371294 - 23371545
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23371294 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 23371393  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23371394 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatt 23371493  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  23371494 tgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 23371545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 14763548 - 14763799
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14763548 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 14763647  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14763648 agtcagatataatataatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatt 14763747  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  14763748 tgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 14763799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 111 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 12339894 - 12339640
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12339894 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 12339795  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12339794 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 12339695  T
Q  311 acttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12339694 gcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 12339640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 51300860 - 51300611
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51300860 tatgagtgtaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 51300761  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51300760 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatt 51300661  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||    
T  51300660 tgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgt 51300611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 10833926 - 10834151
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10833926 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggtttattatagtactgttgatgttgagtg 10834025  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10834026 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata-ttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 10834124  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgttta 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  10834125 tgatattgttatatcttgagatgttta 10834151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 111 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 12470089 - 12469796
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12470089 aatatgatgtgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 12469990  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 310  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  12469989 atatcttgagatgttcacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtgtgatgtttaagttgttgat 12469890  T
Q  311 acttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12469889 gcttctcattaatattgttatgttgtgaattggttgtgttgtttttgttgctgttgaatatttataaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 12469796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 139 - 444
Target Start/End: Original strand, 18700267 - 18700581
Alignment:
Q  139 atatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgccta 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  18700267 atatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgccta 18700366  T
Q  239 tgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtga 338  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||  |||||||||||||||||||||    
T  18700367 tgttgttgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgggaaatgtatgatgtttaagtttttgatgtttctcattaatattgttatgttgtga 18700466  T
Q  339 attgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg-tct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagt 429  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||        ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18700467 attgctagtgctgtttctgttgctgttgaatatagatcaagttgcaggtgttgatctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaagtattccaaagt 18700566  T
Q  430 attggagtcttaagt 444  Q
    |||||||||||||||    
T  18700567 attggagtcttaagt 18700581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 5223495 - 5223238
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatatt 207  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5223495 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatatt 5223396  T
Q  208 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5223395 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgctgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 5223296  T
Q  308 gatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  5223295 gatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgtttgtgctgtttttgttgctgtt 5223238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 114 - 444
Target Start/End: Original strand, 17691644 - 17691982
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttata 213  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  17691644 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgataatcatttgatgttattata 17691743  T
Q  214 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 313  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |     
T  17691744 tct-gagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgacgca 17691842  T
Q  314 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg-tct--------aagttgtaag 404  Q
    |    |||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||        ||||||||||    
T  17691843 tttcgttaatattgttatgtgttgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcataatgatcaagttgcaggtgttgatctaagttgtaaagttgtaag 17691942  T
Q  405 ttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 444  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17691943 ttgtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaagt 17691982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 38 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21837685 - 21837271
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |  ||||| | |||||  | | || |||||||||| ||| || ||||||||     
T  21837685 atgttatgagttgatccttcgggtaggaattgaggttgaatataatattactgatgatcagtgaagctgttacaatatgatttaatgatgatagtaatgt 21837586  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 237  Q
     ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  21837585 aataaatttgtatatgcatt-tgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcct 21837487  T
Q  238 atgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtg 337  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||   || |||||| ||||||||||    
T  21837486 atgttgttgatgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttatgttgttgatgcttttcatgaatattattatgttgtg 21837387  T
Q  338 aattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaag 428  Q
    |||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||    
T  21837386 aatgacttgtactgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgttgatgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaaatgttccaaag 21837287  T
Q  429 tattggagtcttaagt 444  Q
    ||||||||||||||||    
T  21837286 tattggagtcttaagt 21837271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16643470 - 16643135
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||  | |  ||||| |  |||    
T  16643470 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggagattgaagataacattactgatgatctgtg 16643371  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |  | | ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16643370 aagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataggatgtttaagttgatgttgattatcatt 16643271  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 300  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||| |||  | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16643270 tgatgttgttatatctcaagatgtttatgtgatgtctaagttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttta 16643171  T
Q  301 agttgttgatacttcatattaatattgttatgttgt 336  Q
    |||||||| | |||   | |||||||||||||||||    
T  16643170 agttgttggtgcttttcagtaatattgttatgttgt 16643135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 114 - 444
Target Start/End: Original strand, 54876322 - 54876664
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttata 213  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54876322 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttata 54876421  T
Q  214 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg---gttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 310  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  54876422 tcttgagatgtttacgtgctgtctatgttgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgac 54876521  T
Q  311 acttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg-tctaagt--------tgt 401  Q
     | |    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||        |||    
T  54876522 gcatttccttaatattgttatgttgtaaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcataatgatcaagttgcaggtgttgatctaagttgtaaagttgt 54876621  T
Q  402 aagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 444  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  54876622 aagttgtctttccaaagtgttccaaaatattgaagtcttaagt 54876664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9533594 - 9533416
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9533594 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 9533495  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 179  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9533494 agtcggatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 9533416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 200 - 365
Target Start/End: Original strand, 11300532 - 11300697
Alignment:
Q  200 ttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11300532 ttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttt 11300631  T
Q  300 aagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11300632 aagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 11300697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 37439719 - 37439903
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37439719 agttgttgttgattattatttgatatggttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatg 37439818  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  37439819 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttatgttgctgtt 37439903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 181 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15964995 - 15964814
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15964995 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatg 15964896  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15964895 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttttgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 15964814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 181 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15968919 - 15968738
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15968919 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatg 15968820  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15968819 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttttgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 15968738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 181 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15972843 - 15972662
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15972843 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatg 15972744  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15972743 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttttgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 15972662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19775791 - 19775607
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19775791 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacatgtcgcctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgacttatg 19775692  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19775691 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgctatgttgtgaattgtttgtgctgtttctgttgctgtt 19775607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 166 - 403
Target Start/End: Original strand, 11914003 - 11914241
Alignment:
Q  166 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaata 265  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11914003 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctggctatgttgttgttgttggctatgtgaaata 11914102  T
Q  266 tttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  11914103 tttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttttgttgctgtt 11914202  T
Q  366 gaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11914203 gcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 11914241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 4588862 - 4589040
Alignment:
Q  187 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 286  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4588862 tgttgattatcatttgaaattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 4588961  T
Q  287 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4588962 atgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 4589040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 111 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 14671111 - 14670914
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  14671111 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgtt 14671012  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttg 308  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14671011 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgtttaagttgttg 14670914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 108 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15465266 - 15465068
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatatt 207  Q
    |||||||| ||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15465266 tataatataatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgcttaagttgttgttgattatcatttgatatt 15465167  T
Q  208 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15465166 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttatgttgt 15465068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 111 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 14682610 - 14682413
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  14682610 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatcttgtt 14682511  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttg 308  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||    
T  14682510 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaattgacgatgtttaagttgttg 14682413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 11854759 - 11854575
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11854759 agttgttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgtttatatgtcttatg 11854660  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  11854659 aggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctccgtattaatattgttatgttgtgaattgcttgagctgtttatgttgctgtt 11854575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Original strand, 4111332 - 4111494
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4111332 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 4111431  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4111432 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 4111494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7109724 - 7109562
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7109724 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 7109625  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7109624 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 7109562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7113659 - 7113497
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7113659 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 7113560  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7113559 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 7113497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Original strand, 11165612 - 11165774
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11165612 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 11165711  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11165712 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 11165774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22321690 - 22321528
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321690 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 22321591  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22321590 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 22321528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22336745 - 22336583
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22336745 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 22336646  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22336645 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 22336583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Original strand, 27409727 - 27409889
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27409727 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 27409826  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27409827 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 27409889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28949750 - 28949588
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28949750 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 28949651  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28949650 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 28949588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 55022893 - 55022731
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55022893 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 55022794  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55022793 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 55022731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 8928252 - 8928474
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  8928252 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtttattataatactgttgatgttcagtg 8928351  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgg-attatataagatgtttaagttgatgttgattatcat 199  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||| | |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8928352 agtctgatataagatga-ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcat 8928449  T
Q  200 ttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  8928450 ttgatattgttatatcttgagatgt 8928474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Original strand, 4107480 - 4107642
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4107480 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 4107579  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4107580 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgtttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 4107642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11070094 - 11069932
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11070094 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 11069995  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11069994 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 11069932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9577876 - 9577674
Alignment:
Q  46 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 145  Q
    |||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  9577876 agttgatccttggggtgggaacgaaggttgattataatattgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgacatatt 9577777  T
Q  146 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgct 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  9577776 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaggtgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgaga--tttatgtgttgcctatgttgct 9577679  T
Q  246 gttgt 250  Q
    |||||    
T  9577678 gttgt 9577674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 181 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30065972 - 30065811
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30065972 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgctgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 30065873  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattg 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30065872 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 30065811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 181 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15617400 - 15617239
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15617400 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgctgctgctgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 15617301  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattg 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15617300 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 15617239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 43550264 - 43550477
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || |  ||||| |  |||    
T  43550264 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtg 43550363  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  43550364 aagctattataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttgattatgatt 43550463  T
Q  201 tgatattgttatat 214  Q
    |||| |||||||||    
T  43550464 tgatgttgttatat 43550477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15246281 - 15246068
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  15246281 atgttatgagttgatccttgtggtaggaatggaggttgaccttagtactgttgatgttctgtgagtctgatataatgtgatttgatgttgttattaatgt 15246182  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggatt-atataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcc 236  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||   |||  |||    
T  15246181 gatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttgattatcctttgatattgttatgtctggatatgttattgtgctgcc 15246082  T
Q  237 tatgttgctgttgt 250  Q
    ||||||||||||||    
T  15246081 tatgttgctgttgt 15246068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15265394 - 15265189
Alignment:
Q  46 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 145  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  15265394 agttgatccttggggtaggaatggaggttgaccttagtactgttgatgtacagtgagtctgatataatgtgatttgatgttgttattaatgtgatataat 15265295  T
Q  146 tgtatatgcattatgtggatt-atataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgc 244  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||   |||  |||||||||||    
T  15265294 tgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttgattatcctttgatattgttatgtctggatatgttattgtgctgcctatgttgc 15265195  T
Q  245 tgttgt 250  Q
    ||||||    
T  15265194 tgttgt 15265189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 38 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15207199 - 15207029
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  15207199 atgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaccttagtactgttgatgttctgtgagtctgatataatgtgatttgatgttgttattaatgt 15207100  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggatt-atataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatatt 207  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15207099 gatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttgattatcctttgatatt 15207029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 37427976 - 37427764
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagata-taatatgatttgatgttgttagtaatg 136  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| || ||||| || | ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  37427976 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttggttataatactgttgttgttcagagagtctgaaaataagatgatt-gatgttgttagtaatg 37427878  T
Q  137 agatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcc 236  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  37427877 tgatatagttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgatgattatcatttgatactgttatatcttgagatgtttatgtgctgcc 37427778  T
Q  237 tatgttgctgttgt 250  Q
    | || |||||||||    
T  37427777 tgtgctgctgttgt 37427764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 50243198 - 50242985
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||| | |||| || |  ||||| |  |||    
T  50243198 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtatgaatgagggttaaatataatattactgatgatctgtg 50243099  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50243098 aagctattataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatt 50242999  T
Q  201 tgatattgttatat 214  Q
    |||| |||||||||    
T  50242998 tgatgttgttatat 50242985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14499351 - 14499189
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  14499351 agttgttgttaattatcattggatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgccaatgtggctgttgtgggttatgtaaaatattaatatgccttatg 14499252  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14499251 tggaagatgtttgatgtttaagtggttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 14499189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 245 - 422
Target Start/End: Original strand, 35961596 - 35961783
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  35961596 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatatttttatgttgagaattgct 35961695  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35961696 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 35961783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 111 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14179559 - 14179427
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14179559 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 14179460  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttg 243  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14179459 atatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttg 14179427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 245 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22652174 - 22652036
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22652174 tgttgttggttatgtgaaataattatatgcattatgtggaa-atgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatactgttatgttgtgaattgct 22652076  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgca 384  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22652075 tgtgttgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttgca 22652036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 250
Target Start/End: Original strand, 32402819 - 32403030
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||| |||||  |||||||     
T  32402819 atgttatgagttgatctttagggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgctcagtgagtctgatat-atatgatttgttgttgcgagtaatgt 32402917  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt-aagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcc 236  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  | |    
T  32402918 gatatagttttatatgcattatgtgaattatctaagatgtttaaagttgctattgattattatttgatattgttatatcttgagacg-ttatgtgctgtc 32403016  T
Q  237 tatgttgctgttgt 250  Q
    ||||||||||||||    
T  32403017 tatgttgctgttgt 32403030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 114 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28194878 - 28194743
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  28194878 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 28194779  T
Q  213 atcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgtt 248  Q
    ||||||||||||||| |||  | |||||||||||||    
T  28194778 atcttgagatgtttatgtgctgtctatgttgctgtt 28194743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 119 - 382
Target Start/End: Original strand, 14568899 - 14569163
Alignment:
Q  119 ttgatgttgttagtaatgagatatat--ttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatct 216  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||     
T  14568899 ttgatgttgttgttaatgtgatatataattgtatatgcgttatgtgaattatatatgatgtttaggttgatgttgactgtcacttgatattgttatatca 14568998  T
Q  217 tgagatgtt-tacg-tgtcgcctatgttgctgttgttggttat-gtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 313  Q
    |||| |||| || | ||| | ||    |||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||  |    
T  14568999 tgagctgttgtatgttgttgtct---ctgctgttgttggttatggtaaaatatgtatataccttatgtggaaaatgtatgatgttaaag-agttgatgtt 14569094  T
Q  314 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 382  Q
    |   |||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569095 tgtcattattattcatatgttgtgaattacttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 14569163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 18893055 - 18892961
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgtt 95  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18893055 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagatgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgtt 18892961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 111 - 227
Target Start/End: Original strand, 10542364 - 10542480
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  10542364 aatatgatttgatgtcgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgtt 10542463  T
Q  211 atatcttgagatgttta 227  Q
    |||||||||||||||||    
T  10542464 atatcttgagatgttta 10542480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 18889829 - 18889735
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgtt 95  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18889829 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagatgacccttgggacaggaatggaggttgattatagtactgttgatgtt 18889735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 117 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 44494988 - 44494893
Alignment:
Q  117 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttat 212  Q
    |||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44494988 atttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattattat 44494893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 158
Target Start/End: Original strand, 29172492 - 29172606
Alignment:
Q  44 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  29172492 tgagttgatccttggggtaggaatggaggtcggttatagtattgttgatgttcagtgagtctgatataatataatttgatgttgatagtattgtgatata 29172591  T
Q  144 tttgtatatgcatta 158  Q
     ||||||||||||||    
T  29172592 attgtatatgcatta 29172606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 318 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 16979206 - 16979092
Alignment:
Q  318 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          ||||||||||||||||||||    
T  16979206 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttg 16979107  T
Q  408 tcgttctaaagtatt 422  Q
    |||||| ||||||||    
T  16979106 tcgttccaaagtatt 16979092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 219
Target Start/End: Original strand, 23318650 - 23318754
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttata 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23318650 atgatttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagttgttcaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttata 23318748  T
Q  214 tcttga 219  Q
    ||||||    
T  23318749 tcttga 23318754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36527879 - 36527794
Alignment:
Q  164 attatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttg 249  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  36527879 attatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatatttatgtgttgcctatgttgctgttg 36527794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13919591 - 13919408
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  | |||||  ||||  | | ||||||||||||| |||||  |||  |||     
T  13919591 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattactaatgttatgtgaagctgttataatatgatttaatgtttatagcgatgt 13919492  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagat 222  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  13919491 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaag-tgttgttgattattatgtgataatgttatatcttgagat 13919408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 2248557 - 2248668
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||| | || |||||||||| |||     
T  2248557 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaagtttattaaaatattgttgatgttcagta 2248656  T
Q  101 agtcagatataa 112  Q
    |||| |||||||    
T  2248657 agtctgatataa 2248668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 224
Target Start/End: Original strand, 34852596 - 34852701
Alignment:
Q  119 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctt 217  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34852596 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatctt 34852694  T
Q  218 gagatgt 224  Q
    |||||||    
T  34852695 gagatgt 34852701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 249
Target Start/End: Original strand, 3265000 - 3265085
Alignment:
Q  164 attatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttg 249  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  3265000 attatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcatgagatgtttatgtgttgcctatgttgttgttg 3265085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 319 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 17046291 - 17046206
Alignment:
Q  319 ttaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17046291 ttaatattgttatgatgtgaattgattgtactgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 17046206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 24153031 - 24153111
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 81  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24153031 tatgagttcaattaaggtgtctaagagtacttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatata 24153111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 316309 - 316202
Alignment:
Q  110 taatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatattg 208  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  316309 taatgtgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattg 316210  T
Q  209 ttatatct 216  Q
    ||||||||    
T  316209 ttatatct 316202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 217
Target Start/End: Original strand, 38311759 - 38311820
Alignment:
Q  156 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38311759 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 38311820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12378114 - 12378003
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatatt 207  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  12378114 tataatatgatttaatgttgatagtaatttaatatatt-gtatatgtattatttgaattatttaagatgtttaagttgttgttgatttgcatttgatatt 12378016  T
Q  208 gttatatcttgag 220  Q
    |||||||| ||||    
T  12378015 gttatatcatgag 12378003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 13522998 - 13523071
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  13522998 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 13523071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 217
Target Start/End: Original strand, 20248741 - 20248803
Alignment:
Q  156 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatctt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  20248741 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgaattatcatttgatactgttatatctt 20248803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 356 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 36527804 - 36527737
Alignment:
Q  356 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  36527804 tgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagtatt 36527737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 41871 - 41813
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 303  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41871 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 41813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 3394589 - 3394662
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  3394589 tatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 3394662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 6158862 - 6158789
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  6158862 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 6158789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 12276014 - 12275941
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  12276014 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 12275941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 16979375 - 16979313
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  16979375 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 16979313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 18367345 - 18367395
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18367345 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 18367395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 35961474 - 35961536
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  35961474 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 35961536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 42324808 - 42324858
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42324808 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 42324858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 22652297 - 22652236
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggta 62  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  22652297 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggta 22652236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 10554732 - 10554668
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtagga 65  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  10554732 tatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 10554668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 31224540 - 31224608
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggt-ttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  31224540 tatgagttcaattagggtgttttaagagtatttaacccatgctgtgagtcgacccttggggtcggaatg 31224608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 179294 - 179367
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  179294 tatgagttgaattaaggtgtttaacagtatttaatccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaggttg 179367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 10563174 - 10563124
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10563174 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttga 10563124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 10989390 - 10989440
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10989390 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttga 10989440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 14642137 - 14642187
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14642137 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttga 14642187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 303
Target Start/End: Original strand, 16325249 - 16325307
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 303  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16325249 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttacgtggaaaatgtatgatgtttaagt 16325307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Original strand, 16839575 - 16839699
Alignment:
Q  83 tactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag 182  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || || ||||||| || |  | || ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16839575 tactgttgatgttcagtgagtctgatataagatggtt-gaggttgttaatattttggtaaatttgcaaatgcattatgtggattatgtatgatgtttaag 16839673  T
Q  183 ttgatgttgattatcatttgatattgt 209  Q
     | ||||||||||||||||| ||||||    
T  16839674 -taatgttgattatcatttggtattgt 16839699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 55292228 - 55292292
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtagga 65  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  55292228 tatgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacccatgttatgagtagacctttgaggtagga 55292292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 1988819 - 1988885
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  1988819 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaaccaatgttgtgagttga-tcttgggataggaatg 1988885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Original strand, 13026274 - 13026333
Alignment:
Q  4 gagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  13026274 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtcattggggtag 13026333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Original strand, 13029866 - 13029925
Alignment:
Q  4 gagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  13029866 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtcattggggtag 13029925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Original strand, 37251100 - 37251202
Alignment:
Q  112 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || ||||| || |||| || || || ||||||||  |||||||||||||||    
T  37251100 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatg-ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtta 37251198  T
Q  212 tatc 215  Q
    ||||    
T  37251199 tatc 37251202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 6805548 - 6805610
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||    
T  6805548 tatgagttcaattaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggttcttggggtag 6805610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 41987 - 41930
Alignment:
Q  6 gttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||    
T  41987 gttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtag 41930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 215
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051235
Alignment:
Q  119 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatc 215  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||  || |||||||| | |||||| || || ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 2051235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 6156171 - 6156126
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  6156171 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 6156126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 11192546 - 11192501
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  11192546 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 11192501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 14519728 - 14519683
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14519728 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 14519683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 224
Target Start/End: Original strand, 14647688 - 14647760
Alignment:
Q  151 atgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||    
T  14647688 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 14647760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15465076 - 15465039
Alignment:
Q  328 ttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15465076 ttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 15465039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 395 - 444
Target Start/End: Original strand, 17685744 - 17685793
Alignment:
Q  395 aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 444  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17685744 aagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaagt 17685793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 19568955 - 19569000
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19568955 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 19569000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 24546302 - 24546257
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24546302 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 24546257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 44273939 - 44273894
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44273939 tatgagttcaattagggtttttaagagtatttaacctatgttgtga 44273894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 50755968 - 50756013
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  50755968 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 50756013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 54330892 - 54330937
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  54330892 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 54330937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 6819574 - 6819507
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatgg 69  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||  |||||| |||||||||    
T  6819574 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgtgggttga-tcttgggataggaatgg 6819507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 15565979 - 15565935
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtg 45  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15565979 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtg 15565935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 422
Target Start/End: Original strand, 3265075 - 3265142
Alignment:
Q  356 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg-tctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3265075 tgttgttgttgcatattgatcaattcgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagtatt 3265142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 11913186 - 11913119
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  11913186 tatgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttttgattcgacccttggggtaggaatg 11913119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 249
Target Start/End: Original strand, 14568804 - 14568871
Alignment:
Q  182 gttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttg 249  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||    
T  14568804 gttggtgttaattatcatttgatattcttatatcttgagatgtatatgtgctgcctgtgttgctgttg 14568871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24513890 - 24513836
Alignment:
Q  350 tgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24513890 tgttgctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagtggtaa 24513836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 37038283 - 37038233
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37038283 tatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttttgagttga 37038233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 12952507 - 12952462
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12952507 tatgagctcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 12952462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13436425 - 13436357
Alignment:
Q  155 attatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  13436425 attatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgactatcatttggtattgtcatattttgagatgt 13436357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 14441633 - 14441588
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14441633 tatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 14441588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 215
Target Start/End: Original strand, 52523666 - 52523763
Alignment:
Q  119 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatc 215  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||  || |||||||| | |||||| || || ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  52523666 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatc 52523763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 54876070 - 54876115
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  54876070 tatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 54876115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 43926114 - 43926034
Alignment:
Q  146 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 226  Q
    |||||||||||||  || ||| |||| ||||||| || || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  43926114 tgtatatgcattacatgaattgtatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttt 43926034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 324084 - 324049
Alignment:
Q  387 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  324084 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 324049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17046368 - 17046305
Alignment:
Q  122 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttg 185  Q
    |||||||||||| || |||||| || || |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  17046368 atgttgttagtattgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatatatgatgttgaagttg 17046305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 422
Target Start/End: Original strand, 18700588 - 18700623
Alignment:
Q  387 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18700588 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 18700623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 38311591 - 38311626
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacc 36  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38311591 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 38311626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 3803300 - 3803258
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttg 43  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3803300 tatgagttaaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttg 3803258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 14441374 - 14441300
Alignment:
Q  122 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattat 196  Q
    |||||||| |||||| |||||| || || |||||||||||||| ||| || |||||| |||||| ||||| ||||    
T  14441374 atgttgtttgtaatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgttgttgtttat 14441300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 17513045 - 17513007
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17513045 tatgagttcaattaaggtgtttgagagtatttaacccat 17513007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 215
Target Start/End: Original strand, 22110285 - 22110386
Alignment:
Q  113 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttat 212  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||  |||||| ||||||  || ||| |||| |||||| | | || ||||||||  ||||||||||||||||    
T  22110285 tatgatttgaagttgttaataatgtgatataaatgtatacgcattacatgaattctatatgatgttga-gatgctgttgatttgcatttgatattgttat 22110383  T
Q  213 atc 215  Q
    |||    
T  22110384 atc 22110386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 2842049 - 2842094
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2842049 tatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 2842094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 5206241 - 5206286
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5206241 tatgagttcaattatggtgtttaagattatttaacctatgttgtga 5206286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 420
Target Start/End: Original strand, 10542484 - 10542517
Alignment:
Q  387 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagta 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10542484 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagta 10542517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 11258932 - 11258887
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  11258932 tatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 11258887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 372
Target Start/End: Original strand, 13026468 - 13026521
Alignment:
Q  319 ttaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatatt 372  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||    
T  13026468 ttaatattgttattatgtgaattgcttgtgctgtttctgctgttgttgattatt 13026521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 372
Target Start/End: Original strand, 13030060 - 13030113
Alignment:
Q  319 ttaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatatt 372  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||    
T  13030060 ttaatattgttattatgtgaattgcttgtgctgtttctgctgttgttgattatt 13030113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 14508313 - 14508268
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14508313 tatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 14508268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 17046623 - 17046582
Alignment:
Q  5 agttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17046623 agttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 17046582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 17207807 - 17207766
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 42  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17207807 tatgagttcaaataaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 17207766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 17519460 - 17519505
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  17519460 tatgagttcaactaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgtga 17519505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 17534322 - 17534367
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  17534322 tatgagttcaactaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgtga 17534367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 17538572 - 17538527
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17538572 tatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 17538527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 17693533 - 17693488
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17693533 tatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 17693488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 35065167 - 35065212
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  35065167 tatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 35065212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 40807461 - 40807416
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  40807461 tatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 40807416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 54521014 - 54520977
Alignment:
Q  185 gatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagat 222  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  54521014 gatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 54520977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 16979254 - 16979218
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgt 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16979254 tgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgt 16979218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 170
Target Start/End: Original strand, 17248221 - 17248276
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatat 170  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  17248221 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 17248276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 158
Target Start/End: Original strand, 24340657 - 24340701
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 158  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24340657 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcatta 24340701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 45
Target Start/End: Original strand, 25104792 - 25104832
Alignment:
Q  5 agttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtg 45  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  25104792 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacttatgttgtg 25104832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 158
Target Start/End: Original strand, 37642199 - 37642243
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 158  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  37642199 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcatta 37642243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 111 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 126144 - 125802
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  126144 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 126045  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 310  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  126044 atatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgat 125945  T
Q  311 acttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgt 401  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||    
T  125944 gcttctcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt 125845  T
Q  402 aagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 444  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  125844 aagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 125802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 32919 - 32878
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 42  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  32919 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 32878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 125795 - 125760
Alignment:
Q  387 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  125795 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 125760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 129)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 17460874 - 17461326
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  |||    
T  17460874 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtg 17460973  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |    | ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17460974 aagttgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 17461073  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 300  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17461074 tgatgttgttatatctctagatgtttatgtgtttcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtaagatgttta 17461173  T
Q  301 agttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtg-ttgtct----- 394  Q
    |||||||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||         
T  17461174 agttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgtttgtctaagtt 17461273  T
Q  395 ---aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 444  Q
       ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17461274 gtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaagt 17461326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 4 - 403
Target Start/End: Original strand, 19808187 - 19808587
Alignment:
Q  4 gagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagt 103  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||      
T  19808187 gagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaaa 19808286  T
Q  104 cagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttga 203  Q
    | | ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19808287 ctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttatgttgatgttgattatcatttga 19808386  T
Q  204 tattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 303  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  19808387 tgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgtctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 19808486  T
Q  304 tgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgta 402  Q
    ||||||| ||    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19808487 tgttgatgctcttcattaatatttttatgttgtgaattgcttgtaatggttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgta 19808586  T
Q  403 a 403  Q
    |    
T  19808587 a 19808587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 403
Target Start/End: Original strand, 22237860 - 22238243
Alignment:
Q  20 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||    
T  22237860 tttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatt 22237959  T
Q  120 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttga 219  Q
    | |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22237960 taatgttgatagtaatgtattatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 22238059  T
Q  220 gatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatat 319  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    ||    
T  22238060 gatgtttacgtgtttcttatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaa-atgtatgatgtttaagttgttgatcctcttcat 22238158  T
Q  320 taatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22238159 taatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 22238243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 46 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 37515959 - 37515602
Alignment:
Q  46 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 145  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |  | |||||   |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  37515959 agttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttttatgagtctgatataatgtgatttaatgttgttagtaatgtgatataat 37515860  T
Q  146 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgct 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||    
T  37515859 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgctgcctatgttgct 37515760  T
Q  246 gttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgctt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  37515759 gttgttggttatgtgaaatatttatgtgccttatgtggaaaaagtacgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgatatgttgtgaattgctt 37515660  T
Q  346 gtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgta 402  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37515659 gtgatgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgta 37515602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 111 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 18833751 - 18833458
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt-aagttgatgttgattatcatttgatattgt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18833751 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatgtgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgatgttgtttattatttgatattgt 18833652  T
Q  210 tatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttga 309  Q
    ||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  18833651 tatatct-gagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtttttta 18833553  T
Q  310 tacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    | ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  18833552 tgcttctcattaatattgatatgttgtgaattgcttgtgctgtttatgttgttgttgaatattgatcaagttgtaggagttggtctaagttgtaa 18833458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Original strand, 14397791 - 14398040
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatatt 207  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14397791 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgctgttgattatcaattgatatt 14397890  T
Q  208 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  14397891 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgc--------gaagatgtatgatgtttaagttgtt 14397982  T
Q  308 gatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14397983 gttgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgtttgtgctgtttctgttgctgtt 14398040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 21410973 - 21410789
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  21410973 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatg 21410874  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21410873 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 21410789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 21805465 - 21805281
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  21805465 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatg 21805366  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21805365 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 21805281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 21828097 - 21828281
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21828097 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatg 21828196  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21828197 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 21828281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 165 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 23409930 - 23409691
Alignment:
Q  165 ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23409930 ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaat 23409831  T
Q  265 atttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcat-attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctg 363  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23409830 atttatataccttatgtggaaaatgaatgatatttaagttgttgat-gttcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctg 23409732  T
Q  364 ttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23409731 ttgcatattgatcaaattgcaggtgttggtctaagttgtaa 23409691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 27941476 - 27941655
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27941476 tatgagtgcaattaaggtgtttaatagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 27941575  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttta 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27941576 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatatgagatgttta 27941655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 181 - 362
Target Start/End: Original strand, 18862728 - 18862909
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18862728 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatg 18862827  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18862828 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 18862909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 108 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 23659599 - 23659371
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatatt 207  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23659599 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgtt 23659500  T
Q  208 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 307  Q
    |||||||||  ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23659499 gttatatctcaagatgtttatgtgatgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 23659400  T
Q  308 gatacttcatattaatattgttatgttgt 336  Q
    | |  ||   |||||||||||||||||||    
T  23659399 ggtgtttttcattaatattgttatgttgt 23659371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Original strand, 21976753 - 21976915
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21976753 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 21976852  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21976853 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 21976915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Original strand, 22253024 - 22253210
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  22253024 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtaagtctgatataatatgatttgatgttcttagtaatgt 22253123  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    |||| | || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22253124 gataaagttatatatgcattatgtggatcacataagatgtttaagttgatgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 22253210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 38 - 250
Target Start/End: Original strand, 17086012 - 17086224
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  17086012 atgttatgagttgacccttagggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcaatgagtccaatataatatgatttgatgttgatagtaatgt 17086111  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 237  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  17086112 gatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatatttaagttgatgttgattattatttggtattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcct 17086211  T
Q  238 atgttgctgttgt 250  Q
    || ||||| ||||    
T  17086212 attttgcttttgt 17086224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Original strand, 19278366 - 19278528
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19278366 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 19278465  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19278466 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttctgaattgc 19278528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 250
Target Start/End: Original strand, 20501966 - 20502172
Alignment:
Q  44 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 143  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  20501966 tgagatgacccttggggtaggaatggaggttgattatataattgttgatgttcagtgaatctgatataatatgatttgatgttgttagtaatatgacata 20502065  T
Q  144 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||    
T  20502066 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttatgttgttgttggttatcatttgatattgttatatcttgagatatttatgtgctgcctatgttg 20502165  T
Q  244 ctgttgt 250  Q
    |||||||    
T  20502166 ctgttgt 20502172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 43251836 - 43251674
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43251836 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 43251737  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43251736 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 43251674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 38 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23668071 - 23667859
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  23668071 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattataatactgttaatgttcagtgagtctaatatgatatgatttgaggttgttagtaatgt 23667972  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgtt-gattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcc 236  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||    
T  23667971 gatatatttgtatatgcattatatgaattatataagatgtttaagttgatgttaaaatattatttgatattgttatatcttgagatggttatgtgctgcc 23667872  T
Q  237 tatgttgctgttgt 250  Q
     |||||||||||||    
T  23667871 -atgttgctgttgt 23667859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 25484061 - 25484274
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || |  ||||| |  |||    
T  25484061 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtg 25484160  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25484161 aagctattataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatt 25484260  T
Q  201 tgatattgttatat 214  Q
    |||| || ||||||    
T  25484261 tgatgttattatat 25484274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Original strand, 21972668 - 21972826
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21972668 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 21972767  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||    || || ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21972768 tggaagatgtttgatgtttaa----ttaatgcttcacataaatattgttatgttgtgaattgc 21972826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 155 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 23914183 - 23914029
Alignment:
Q  155 attatgtggatta-tataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttgg 253  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  23914183 attatgtgaattaatataagatgtttaagttgttgctgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatgttgctgttgttgg 23914084  T
Q  254 ttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttg 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23914083 ttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgtttaagttgttg 23914029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 166 - 313
Target Start/End: Original strand, 16401983 - 16402136
Alignment:
Q  166 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttga------tattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgt 259  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16401983 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgaatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgt 16402082  T
Q  260 gaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16402083 gaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatact 16402136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 26454054 - 26453908
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  26454054 tgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 26453955  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 391  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26453954 tgtgttgtttctgttgcagttgaatattgatcaagttgcagatgttg 26453908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22996100 - 22995893
Alignment:
Q  44 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatata-atatgatttgatgttgttagtaatgagatat 142  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| | |||| | |||||||||||||   | ||||| |||||    
T  22996100 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattttagtactgttgatgttctgtgagtctgctatatacatgatttgatgttaaaaataatgtgatat 22996001  T
Q  143 atttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgtt 242  Q
    | ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||   |||  |||||||||    
T  22996000 agttgtatatgcattatgtgatttatgtaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctgaatatgttattgtgctgcctatgtt 22995901  T
Q  243 gctgttgt 250  Q
    ||||||||    
T  22995900 gctgttgt 22995893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 19880172 - 19880026
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19880172 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatatttttatgttgagaattgct 19880073  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 391  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19880072 tgtgttgtttctgttgatgttgaatattgaccaagttgcagatgttg 19880026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 230 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22111905 - 22111792
Alignment:
Q  230 tgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgtt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22111905 tgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 22111806  T
Q  330 atgttgtgaattgc 343  Q
    ||||||||||||||    
T  22111805 atgttgtgaattgc 22111792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 111 - 232
Target Start/End: Original strand, 25363134 - 25363255
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25363134 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 25363233  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25363234 atatcttgagatgtttacgtgt 25363255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 111 - 250
Target Start/End: Original strand, 17438148 - 17438288
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  17438148 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 17438247  T
Q  210 tatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  17438248 tatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgtttctgttgt 17438288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 247 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 23478422 - 23478278
Alignment:
Q  247 ttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttg 346  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23478422 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtttatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttg 23478323  T
Q  347 tgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 391  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23478322 tgctgtttcttttgatgttgaatattgatcaagttggagatgttg 23478278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 250
Target Start/End: Original strand, 22963278 - 22963484
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |  |||||     ||||||  |||||||||||| ||||||     
T  22963278 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaagttgattatagtactgctaatgttcatagagtc-----taatat--tttgatgttgttggtaatgt 22963370  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcc 236  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||    
T  22963371 gatataattgtatatgcattgtgtgaattataaaatatgttaaagttgatgttgaattattatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtactgcc 22963470  T
Q  237 tatgttgctgttgt 250  Q
    ||||||||||||||    
T  22963471 tatgttgctgttgt 22963484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 111 - 243
Target Start/End: Original strand, 5083085 - 5083218
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  5083085 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatcatataagatccttaagttgatgattgattattatttgacattgt 5083184  T
Q  210 tatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttg 243  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  5083185 tatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttg 5083218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 245 - 422
Target Start/End: Original strand, 19929556 - 19929736
Alignment:
Q  245 tgttgttggttat-gtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19929556 tgttgttgattattgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattaatattgttatgctgtgaattgc 19929655  T
Q  344 ttgtgttg-tttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  19929656 ttgtgctgttttatgttgctgttgaatattaattaagttgcaagtgttggtccaagttgtaagttgttgttccaaaatatt 19929736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16799732 - 16799561
Alignment:
Q  55 ttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgc 154  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||  |||| || | ||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  16799732 ttggggtatgaatggaggatgattataatattactgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgc 16799633  T
Q  155 attatgtggattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 225  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16799632 attatgtgaaatatataagatgttttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctggatatgtt 16799561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 246
Target Start/End: Original strand, 23943876 - 23944060
Alignment:
Q  62 aggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgt 161  Q
    ||||||||||||||| |||| || |  |||||||  ||||  | | |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23943876 aggaatggaggttgaatataatattactgatgttctgtgaagctgttataatatgatttgatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgt 23943975  T
Q  162 ggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctg 246  Q
    | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| | |||  || ||||||||||    
T  23943976 gaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttaatgtgctgcatatgttgctg 23944060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28397805 - 28397635
Alignment:
Q  44 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga-tgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatat 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| | || || ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  28397805 tgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattataatattgttgatttttcagagagtctgatataa-atgatttaatgttgttaataatgtgatat 28397707  T
Q  143 atttgtatatgcattatgtggattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatat 214  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  28397706 a-ttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatat 28397635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 318 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22353018 - 22352932
Alignment:
Q  318 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22353018 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 22352932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 276 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 5760705 - 5760577
Alignment:
Q  276 ttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgat 375  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| | |  ||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5760705 ttatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtagttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgcttgtgttgtttctgttgttgttgaatattgat 5760606  T
Q  376 caagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5760605 caagttgcaagtgttggtctaagttgtaa 5760577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 226
Target Start/End: Original strand, 20533267 - 20533455
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  | |  |||||||  ||||  | | |||||| ||||||  ||||| ||||||||     
T  20533267 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataacattactgatgttctgtgaagctgttataatgtgatttattgttgatagtaatgt 20533366  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 226  Q
     ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  20533367 aatataattgtatatgcattttgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgatcatcacttgatattattatatctggatatgttt 20533455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 215
Target Start/End: Original strand, 17439370 - 17439541
Alignment:
Q  44 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 143  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||    
T  17439370 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatacagtattaatgatgatatgtgaagctgttataatatgatttaatgttgataataatgtgatata 17439469  T
Q  144 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatc 215  Q
    |||||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17439470 tttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 17439541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Original strand, 19154814 - 19154932
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatatt 207  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  19154814 tataatatgatttaatgttgatactaatgtaatatatttgtatatgcattatctgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattagcacttgatatt 19154913  T
Q  208 gttatatcttgagatgttt 226  Q
     |||||||| || ||||||    
T  19154914 attatatctggatatgttt 19154932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 331 - 403
Target Start/End: Original strand, 44384821 - 44384894
Alignment:
Q  331 tgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44384821 tgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 44384894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 185 - 284
Target Start/End: Original strand, 1327013 - 1327112
Alignment:
Q  185 gatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 284  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1327013 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcctaagttgctgttgtaggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtgga 1327112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Original strand, 14103152 - 14103262
Alignment:
Q  108 tataatatgatttga-tgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatat 206  Q
    ||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14103152 tataatatgattttaatgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 14103251  T
Q  207 tgttatatctt 217  Q
    |||||||||||    
T  14103252 tgttatatctt 14103262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 41680721 - 41680795
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41680721 tatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatggaggttg 41680795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 222
Target Start/End: Original strand, 35026797 - 35026903
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttata 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |   ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35026797 atgatttgatgttgttaataatgtgatatgattttatatgcattatgtgaattatatatgatgtttta--agatgttgattatcgtttgatattgttata 35026894  T
Q  214 tcttgagat 222  Q
    |||||||||    
T  35026895 tcttgagat 35026903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 37116535 - 37116434
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttata 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  37116535 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttata 37116436  T
Q  214 tc 215  Q
    ||    
T  37116435 tc 37116434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 44476814 - 44476753
Alignment:
Q  156 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44476814 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 44476753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 44480076 - 44480015
Alignment:
Q  156 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44480076 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 44480015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 2418737 - 2418906
Alignment:
Q  42 tgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagata 141  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||  || |||| ||||| |||||||| |||| |||  | | ||  ||| |||||||||||||||||  |||| ||||    
T  2418737 tgtgagttgatccttgggttaggaaatgaagttgtttatattactgttgttgttcagtatgcctgac-taagatgatttgatgttgttaacaatgtgata 2418835  T
Q  142 tatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatat 214  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2418836 tgattgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttca--agatgttgattatcgtttgatattgttatat 2418906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22525778 - 22525659
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||  |||| || | ||||| ||||||| |||||||| ||||||     
T  22525778 atgttatgagttgatcattggggtaggaatggaggttaattataatactcctgatgttttgtgaatctgttataacatgatttaatgttgttggtaatgt 22525679  T
Q  138 gatatatttgtatatgcatt 157  Q
     |||||||||||||||||||    
T  22525678 catatatttgtatatgcatt 22525659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 15635767 - 15635840
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  15635767 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 15635840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Original strand, 17266925 - 17267028
Alignment:
Q  112 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||   | |||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||||||||||    
T  17266925 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtta 17267024  T
Q  212 tatc 215  Q
    ||||    
T  17267025 tatc 17267028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 20454704 - 20454638
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  20454704 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatg 20454638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 303
Target Start/End: Original strand, 8414418 - 8414476
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 303  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8414418 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 8414476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 217
Target Start/End: Original strand, 8728620 - 8728682
Alignment:
Q  156 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatctt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  8728620 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgaattaccatttgatactgttatatctt 8728682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11775066 - 11775008
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 303  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11775066 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 11775008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21329243 - 21329104
Alignment:
Q  83 tactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag 182  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || || ||||||| || |  | || ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  21329243 tactgttgatgttcagtgagtctgatataagatggtt-gaggttgttaatattatggtaaatttgcaaatgcattatgtggataatgtatgatgtttaag 21329145  T
Q  183 ttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    | | |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  21329144 tag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgagatgt 21329104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 222
Target Start/End: Original strand, 22419349 - 22419455
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttata 213  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |   ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22419349 atgatttaatgttgtcaataatgtgatatgattgtatatgcattatgtgaattatttatgatgtttta--agatgttgattatcgtttgaaattgttata 22419446  T
Q  214 tcttgagat 222  Q
    |||||||||    
T  22419447 tcttgagat 22419455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 215
Target Start/End: Original strand, 40492711 - 40492887
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| |||| |||     
T  40492711 atgttgtgagttgatccttgtggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtgatgt 40492810  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatc 215  Q
     ||||||||||||||||| |   || ||||| || ||||||| || || ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  40492811 aatatatttgtatatgcaat-catgaattatttatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 40492887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 364253 - 364186
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  364253 tatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaatccatgttgtgagttgaaccttgggatagcaatg 364186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 20455461 - 20455395
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  20455461 tatgaggtcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatg 20455395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 20460439 - 20460373
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  20460439 tatgaggtcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatg 20460373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 185
Target Start/End: Original strand, 21346164 - 21346239
Alignment:
Q  111 aatatgatttgat-gttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttg 185  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  21346164 aatatgatttgattgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatatttaagttg 21346239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22364850 - 22364748
Alignment:
Q  112 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || |||||||| || |||||||||||||    
T  22364850 atatgatttgatgttgttaataaagtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgattttc-tttgatattgtta 22364752  T
Q  212 tatc 215  Q
    ||||    
T  22364751 tatc 22364748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 44432326 - 44432259
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  44432326 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatg 44432259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 39695115 - 39695188
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  39695115 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 39695188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 214
Target Start/End: Original strand, 19936956 - 19937004
Alignment:
Q  166 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatat 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19936956 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 19937004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 19880293 - 19880234
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttgggg 60  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||    
T  19880293 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttggtccttgggg 19880234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 21861207 - 21861250
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgt 44  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21861207 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgt 21861250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 26454176 - 26454117
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttgggg 60  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||    
T  26454176 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttggtccttgggg 26454117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 42560114 - 42560181
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  42560114 tatgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagtcgacccttggggttggaatg 42560181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 44523013 - 44523080
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  44523013 tatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatg 44523080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 21579794 - 21579844
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21579794 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttga 21579844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Original strand, 21967476 - 21967612
Alignment:
Q  86 tgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttg 185  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||| ||||| || |  | || ||| ||  |||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  21967476 tgttgatgttcagtgagtctgatataagatggtt-gatgatgttaatattatggtaaattcgtcaatgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag 21967574  T
Q  186 atgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
     |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||    
T  21967575 -tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 21967612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 4381379 - 4381424
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4381379 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 4381424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 18817048 - 18817093
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18817048 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 18817093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34950694 - 34950622
Alignment:
Q  151 atgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  34950694 atgcattatgtggattaagtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgttatattttgggatgt 34950622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Original strand, 8414302 - 8414358
Alignment:
Q  6 gttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggta 62  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||    
T  8414302 gttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggta 8414358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 17795697 - 17795630
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  17795697 tatgagttcaattaaggtgtttacaagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatg 17795630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 22344505 - 22344462
Alignment:
Q  3 tgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22344505 tgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 22344462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 22356165 - 22356122
Alignment:
Q  3 tgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22356165 tgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 22356122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24353209 - 24353107
Alignment:
Q  112 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||||||  || ||| |||| ||||||| || || ||||||||  || ||||||||||||    
T  24353209 atatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatacgatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgtta 24353111  T
Q  212 tatc 215  Q
    ||||    
T  24353110 tatc 24353107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 38185673 - 38185716
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgt 44  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  38185673 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgt 38185716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 18024282 - 18024324
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttg 43  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18024282 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttg 18024324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 19882433 - 19882371
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||    
T  19882433 tatgagttaaattaaggtgtttaagggtatttaacctatgttgtgagttggtccttagggtag 19882371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 20517704 - 20517746
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttg 43  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20517704 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttg 20517746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 209
Target Start/End: Original strand, 21980265 - 21980322
Alignment:
Q  151 atgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgt 209  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  21980265 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgt 21980322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 209
Target Start/End: Original strand, 21985248 - 21985305
Alignment:
Q  151 atgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgt 209  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  21985248 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgt 21985305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 209
Target Start/End: Original strand, 22000284 - 22000341
Alignment:
Q  151 atgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgt 209  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  22000284 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgt 22000341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 209
Target Start/End: Original strand, 22005262 - 22005319
Alignment:
Q  151 atgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgt 209  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  22005262 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgt 22005319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 42266179 - 42266252
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| |  |||||| |||||||||| ||||    
T  42266179 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtattcaactcatgttgagagtt-aatcttgggataggaatggaagttg 42266252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 361799 - 361844
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  361799 tatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 361844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 11775178 - 11775125
Alignment:
Q  10 aattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||    
T  11775178 aattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtag 11775125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 17979003 - 17979048
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17979003 tatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtga 17979048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Original strand, 18024465 - 18024506
Alignment:
Q  148 tatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgt 189  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18024465 tatatgcattatatggattatacaagatgtttaagttgatgt 18024506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 18815409 - 18815454
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18815409 tatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 18815454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 22474217 - 22474172
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  22474217 tatgagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttgtga 22474172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 22483212 - 22483167
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  22483212 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacttatgttgtga 22483167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 23670114 - 23670073
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 42  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23670114 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 23670073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 5760997 - 5760953
Alignment:
Q  2 atgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5760997 atgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 5760953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Original strand, 11251625 - 11251696
Alignment:
Q  152 tgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| |||| ||| |||||    
T  11251625 tgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgtcgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 11251696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20498751 - 20498647
Alignment:
Q  112 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||| |||||  || |||||||| | |||||| || || || ||| |  ||||||||||||||    
T  20498751 atatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgtt 20498652  T
Q  211 atatc 215  Q
    |||||    
T  20498651 atatc 20498647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 21321927 - 21321971
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtg 45  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21321927 tatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtg 21321971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 5080472 - 5080429
Alignment:
Q  3 tgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5080472 tgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacctatgttgtga 5080429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 8728524 - 8728559
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacc 36  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8728524 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 8728559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 185
Target Start/End: Original strand, 13665189 - 13665252
Alignment:
Q  122 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttg 185  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||||||    
T  13665189 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgcggaatatgtatgatgttgaagttg 13665252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 185
Target Start/End: Original strand, 13724464 - 13724527
Alignment:
Q  122 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttg 185  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||||||    
T  13724464 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgcggaatatgtatgatgttgaagttg 13724527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 18302800 - 18302855
Alignment:
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagtt 399  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18302800 tgtgttgtctctgttgttgttgaatattaatcaagttgcaagtgttggtctaagtt 18302855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 104
Target Start/End: Original strand, 22381608 - 22381659
Alignment:
Q  53 ccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtc 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||    
T  22381608 ccttggggtaggaatcgaggttgattataatattgtcgatgttcagtgagtc 22381659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 311
Target Start/End: Original strand, 22381703 - 22381746
Alignment:
Q  268 tatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 311  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22381703 tatatgcgttatgtgtaagatgtatgatgttgaagttgttgata 22381746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 23478545 - 23478478
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    ||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  23478545 tatgagttcaactaaggtgtttcatagtatttaacatatgttgtgagttggtccttggggtagaaatg 23478478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 222
Target Start/End: Original strand, 25658189 - 25658255
Alignment:
Q  155 attatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagat 222  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  25658189 attatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgactatcatttggtattgtcatattttgagat 25658255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 46
Target Start/End: Original strand, 18118754 - 18118796
Alignment:
Q  4 gagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18118754 gagttcaattaaggtgttttagagtatttaacctatgttgtga 18118796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 21513786 - 21513752
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaac 35  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21513786 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 21513752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 6102340 - 6102385
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  6102340 tatgagttcaattaggatatttaagagtatttaacctatgttgtga 6102385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16198020 - 16197952
Alignment:
Q  155 attatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| || |||||| |||||| |||| |||||||||    
T  16198020 attatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgactagcatttggtattgtcatattttgagatgt 16197952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 20179108 - 20179153
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20179108 tatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 20179153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 21346241 - 21346282
Alignment:
Q  159 tgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21346241 tgtgaattatataagatatttaagttgttgttgattatcatt 21346282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Original strand, 22258890 - 22258923
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaa 34  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22258890 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 22258923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22525662 - 22525633
Alignment:
Q  197 catttgatattgttatatcttgagatgttt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22525662 catttgatattgttatatcttgagatgttt 22525633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 36305124 - 36305079
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  36305124 tatgagtccaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 36305079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 38988927 - 38988890
Alignment:
Q  5 agttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 42  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38988927 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 38988890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 39020024 - 39019987
Alignment:
Q  5 agttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 42  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  39020024 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 39019987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11775043 - 11774968
Alignment:
Q  148 tatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    ||||||| |||||||||  || || ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||    
T  11775043 tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 11774968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 158
Target Start/End: Original strand, 13508019 - 13508063
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 158  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  13508019 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcatta 13508063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 158
Target Start/End: Original strand, 13597551 - 13597595
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 158  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  13597551 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcatta 13597595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 36
Target Start/End: Original strand, 18122329 - 18122361
Alignment:
Q  4 gagttcaattaaggtttttaagagtatttaacc 36  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18122329 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 18122361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 111 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 1041 - 699
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1041 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttatatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 942  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 310  Q
    ||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  941 atatcttgagatgtttatgtgctgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 842  T
Q  311 acttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgt 401  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||    
T  841 gcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt 742  T
Q  402 aagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 444  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  741 aagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 89)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 4 - 403
Target Start/End: Original strand, 34874037 - 34874437
Alignment:
Q  4 gagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagt 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||      
T  34874037 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttgggataggaatggaggttgaatataatattactgatgatatgtgaag 34874136  T
Q  104 cagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttga 203  Q
    | | ||||||||||||| ||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34874137 ctgttataatatgatttaatgttgaaagtattgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttga 34874236  T
Q  204 tattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 303  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  34874237 tgttgttatatcttgagatgtttaagtgccgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagt 34874336  T
Q  304 tgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgta 402  Q
    ||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34874337 tgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgta 34874436  T
Q  403 a 403  Q
    |    
T  34874437 a 34874437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 111 - 444
Target Start/End: Original strand, 23069215 - 23069557
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23069215 aatatgatttgatgttgatggcaatgtaatatatttttatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 23069314  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 310  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23069315 atatcttgagatgtttacgtgctacctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgat 23069414  T
Q  311 acttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgt 401  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||    
T  23069415 gcttctcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt 23069514  T
Q  402 aagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 444  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23069515 aagctgtcgttccaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 23069557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Original strand, 21081558 - 21081961
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| || |  ||||| |  |||    
T  21081558 tatgagttcaattaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtaggaatggaggatgaatataatattactgatgatatgtg 21081657  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |  | | ||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21081658 aagctgttataatatgatttaatgttgatactaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 21081757  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 300  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  21081758 tgatgtttttatatctttagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatgtgaaaaatgtatgatgttta 21081857  T
Q  301 agttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagtt 399  Q
    |||| ||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21081858 agttattgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagtt 21081957  T
Q  400 gtaa 403  Q
    ||||    
T  21081958 gtaa 21081961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 27472718 - 27472315
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| || |  | ||| |  |||    
T  27472718 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacttatgttatgagttgatccttggggtaggactggaggttgaatataatattactaatgatctgtg 27472619  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |  | | || |||||||||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27472618 aagctgttaaaatatgatttaatgttgatagtaatataatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgtttaagttgatgttgattatcatt 27472519  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27472518 tgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttta 27472419  T
Q  301 agttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagtt 399  Q
    |||||||||| ||    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27472418 agttgttgatgctcttcattaatattattatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagtt 27472319  T
Q  400 gtaa 403  Q
    ||||    
T  27472318 gtaa 27472315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 19662242 - 19662493
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19662242 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 19662341  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19662342 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatt 19662441  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  19662442 tgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 19662493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 18358556 - 18359001
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |   |||| |  | |    
T  18358556 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattaccgatgatctgcg 18358655  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |  | | |||| |||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  18358656 aagctgttata-tatgatttaatgttgatagtaatgtattatatttgtatatgcaatatgtgaattatataagatgcttaagttgatgttgattattatt 18358754  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18358755 tgatgttgttatatcttgagatgtttaagtaccgcctatgttgctgttgttggttttgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgttta 18358854  T
Q  301 agttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagtt 399  Q
    |||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  18358855 agttgttgatgcttttcattaatattattatgttgtgaatttcttgtgctgtttctgttgctattgaatattgatcaagttgcagatgttggtctaagtt 18358954  T
Q  400 gt-aagttgtcgttctaaagt-attccaaagtattggagtcttaagt 444  Q
    || |||||||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  18358955 gtaaagttgtctttccaaagtgtttccgaagtattggagtcttaagt 18359001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 21073314 - 21073563
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073314 tatgagttcaattaaggtatttcagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 21073413  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21073414 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatattcattatgtggattatataagatatttaagttgatgttgattatcatt 21073513  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||    
T  21073514 tgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcatatgttgctgttgt 21073563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9242225 - 9241976
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9242225 tatgagtgcaactaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattatagtactgttgatgttgaatg 9242126  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9242125 agtaagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 9242026  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  9242025 tgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 9241976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Original strand, 6260974 - 6261217
Alignment:
Q  10 aattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagata 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6260974 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttagggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagata 6261073  T
Q  110 taatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtata-tgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattg 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6261074 taatataatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatattgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattg 6261173  T
Q  209 ttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 252  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  6261174 ttatatcttgagacgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 6261217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 30643868 - 30644119
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30643868 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgaccattagggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 30643967  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  30643968 agtcagatataatacaatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagtagatattgattatcatt 30644067  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 252  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  30644068 tgatattgttatatcttgagacgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 30644119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31345308 - 31345051
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatatt 207  Q
    |||||||||| ||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31345308 tataatatgaattagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatatt 31345209  T
Q  208 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31345208 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 31345109  T
Q  308 gatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31345108 aatgcttcacactaatattgttatgttgtgaattacttgtgctgtttctgttgctgtt 31345051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 1283412 - 1283228
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1283412 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatg 1283313  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1283312 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 1283228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 166 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24918244 - 24918006
Alignment:
Q  166 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaata 265  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918244 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaata 24918145  T
Q  266 tttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24918144 tttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgtt 24918045  T
Q  366 gaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24918044 gcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 24918006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 30345074 - 30345258
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30345074 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatg 30345173  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30345174 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 30345258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 166 - 403
Target Start/End: Original strand, 23707275 - 23707513
Alignment:
Q  166 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaata 265  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707275 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaata 23707374  T
Q  266 tttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  23707375 tttatatgcattatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactatttctgttgctgtt 23707474  T
Q  366 gaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23707475 gcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 23707513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 166 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24671129 - 24670891
Alignment:
Q  166 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaata 265  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24671129 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtactgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaata 24671030  T
Q  266 tttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24671029 tttatatgggttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgtt 24670930  T
Q  366 gaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24670929 gtatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 24670891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 41531087 - 41531271
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41531087 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttactgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatg 41531186  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  41531187 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttatgttgctgtt 41531271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 166 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24681548 - 24681312
Alignment:
Q  166 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaata 265  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681548 tatatatgatgtttaagttgatgttgatcatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaata 24681449  T
Q  266 tttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24681448 tttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcgtcattagtattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgtt 24681349  T
Q  366 gaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24681348 g--tattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 24681312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 44 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34137196 - 34136990
Alignment:
Q  44 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 143  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||    
T  34137196 tgagatgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtattgttaatgttcagtgagtctgatataatatgatgtgatgttactagtaatgtgatata 34137097  T
Q  144 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttg 243  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  34137096 attgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatctcttgagatgtttatgtgttgcctatgttg 34136997  T
Q  244 ctgttgt 250  Q
    |||||||    
T  34136996 ctgttgt 34136990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Original strand, 24628562 - 24628724
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24628562 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 24628661  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24628662 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 24628724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27601819 - 27601657
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27601819 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 27601720  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27601719 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 27601657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 196 - 403
Target Start/End: Original strand, 22459579 - 22459787
Alignment:
Q  196 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 295  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22459579 tcatttgatgttgttatatctttagatgtttatgtgttgcctatgttgctgttgtcggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtataat 22459678  T
Q  296 gtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct 394  Q
    ||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22459679 gttgaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttcggttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtct 22459778  T
Q  395 aagttgtaa 403  Q
    |||||||||    
T  22459779 aagttgtaa 22459787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Original strand, 12901595 - 12901757
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12901595 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 12901694  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12901695 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 12901757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Original strand, 27379516 - 27379678
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27379516 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 27379615  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  27379616 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgcgaattgc 27379678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Original strand, 27383562 - 27383724
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27383562 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 27383661  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  27383662 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgcgaattgc 27383724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24649380 - 24649218
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24649380 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctaggttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 24649281  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24649280 tggaagatgtttgatgcttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 24649218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 111 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9784869 - 9784673
Alignment:
Q  111 aatatgatttgat-gttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgt 209  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| ||||    
T  9784869 aatatgatttgattgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaggt--tgttgattatcattggatgttgt 9784772  T
Q  210 tatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttg 308  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  9784771 tatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgtttaaattgttg 9784673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 181 - 342
Target Start/End: Original strand, 10101728 - 10101889
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10101728 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgttcatgtgtcgcctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 10101827  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattg 342  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10101828 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgtttcacattaatattgttatgttgtgaattg 10101889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 22173615 - 22173828
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || |  ||||| |  |||    
T  22173615 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtg 22173714  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22173715 aagctattataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattaagtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatt 22173814  T
Q  201 tgatattgttatat 214  Q
    |||| |||||||||    
T  22173815 tgatgttgttatat 22173828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 250
Target Start/End: Original strand, 18546803 - 18547016
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  18546803 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattttagtactgttgatgttctgtgagtttgatataatatattttgatgttgttagtaatgt 18546902  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggatt-atataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcc 236  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||   |||  |||    
T  18546903 gatacatttgtatatgcattatgtaaattaatgtaagatgtctaagttgatgttgattatcctttgatattgttatgtctggatatgttattgtgatgcc 18547002  T
Q  237 tatgttgctgttgt 250  Q
     |||||||||||||    
T  18547003 catgttgctgttgt 18547016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 75 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21237978 - 21237825
Alignment:
Q  75 gattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataaga 174  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21237978 gattatagtactgttaatgttcagtgagtctgatatactataatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataaga 21237879  T
Q  175 tgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 227  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21237878 tgtttaagttgatgatgaattattatttgatattgttatatcttgagatgttta 21237825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 245 - 422
Target Start/End: Original strand, 34492200 - 34492387
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34492200 tgttgttggttatgtgaaataattatataccttatgtggaaaatgtataatgtttaagttgttgatgctttttattaatattgttatgttgagaattgct 34492299  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt----------gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||          ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34492300 tctgatgtttctgttgttgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagtcgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 34492387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 111 - 250
Target Start/End: Original strand, 19201906 - 19202046
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgt 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  19201906 aatatgatttgaagttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatatgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 19202005  T
Q  210 tatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19202006 tatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgctgttgt 19202046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 245 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21914966 - 21914779
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21914966 tgttgtaggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttatttaatattgttatgttgagaattgct 21914867  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21914866 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 21914779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23287625 - 23287412
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||  |||  || | ||||| || |||| | | || ||||||||     
T  23287625 atgttgtgagttgatccttagggtaggaatggaggttgattataatattactgatgttctgtggatctgttataacattatttaacgatgatagtaatgt 23287526  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt-acgtgtcgcc 236  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||    
T  23287525 gatatatttgtatatgcaatatgtggattatatatgatgattaagt-gttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttttatgtactgcc 23287427  T
Q  237 tatgttgctgttgtt 251  Q
    |||||||||||||||    
T  23287426 tatgttgctgttgtt 23287412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 216
Target Start/End: Original strand, 43947236 - 43947408
Alignment:
Q  44 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatg-ttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatat 142  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  43947236 tgagttgacccttagggtaggaatggaggttgattataatactgttgatgtttcagagagtttgatataa-atgatttaatgttgttaataatgtgatat 43947334  T
Q  143 atttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt-taagttgatgttgattatcatttgatattgttatatct 216  Q
    | ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  43947335 a-ttgtatatgcactatgtgaattatatgagatgttgtaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct 43947408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26392643 - 26392431
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |  |||||||  |||| |  | ||| | ||||| | |||||| ||| || |     
T  26392643 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgttctgtgaatttgttattacatgatctaatgttgatagaaaggt 26392544  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |    ||||    
T  26392543 gatatatttgtatatgcattatgtggattagataagatgtttaag-tattgttgattattatttgatattgttatatcctgagatgtttatgcactgcct 26392445  T
Q  238 atgttgctgttgtt 251  Q
    ||||||||||||||    
T  26392444 atgttgctgttgtt 26392431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 287 - 442
Target Start/End: Original strand, 24316193 - 24316356
Alignment:
Q  287 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagg 386  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24316193 atgtatgatgtttaagttgt-gatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactatttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcagg 24316291  T
Q  387 tgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaa 442  Q
    |||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24316292 tgttggtctaagttacaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaa 24316356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 41301560 - 41301668
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| ||||    
T  41301560 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtttattaaaatactgttgatgttcagtg 41301659  T
Q  101 agtcagata 109  Q
    |||| ||||    
T  41301660 agtctgata 41301668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22703279 - 22703174
Alignment:
Q  119 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctt 217  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22703279 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaaattg-tgttgattatcatttgatattgttatatctt 22703181  T
Q  218 gagatgt 224  Q
    |||||||    
T  22703180 gagatgt 22703174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 403
Target Start/End: Original strand, 20320737 - 20320823
Alignment:
Q  318 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20320737 attaatattgtcatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgaatactgatcaagttgcaggtgttggtctaaattgtaa 20320823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6482899 - 6482838
Alignment:
Q  156 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  6482899 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttaattaccatttgatattgttatatctt 6482838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6486366 - 6486305
Alignment:
Q  156 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  6486366 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttaattaccatttgatattgttatatctt 6486305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23005012 - 23004835
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| || |  ||||| |  ||||  | | |||| |||||||| | ||||||| | |||     
T  23005012 atgttatgagttgatcctttgggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatatgtgaagctgttatactatgatttaacgttgttaatgatgt 23004913  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatc 215  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  23004912 taaatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatc 23004835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 81
Target Start/End: Original strand, 34858975 - 34859052
Alignment:
Q  4 gagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 81  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  34858975 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttgggataggaatggaggttgaatata 34859052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 224
Target Start/End: Original strand, 13101577 - 13101682
Alignment:
Q  120 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgg-attatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat-attgttatatctt 217  Q
    ||||||||||| | ||| | |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13101577 tgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgataatttttatatctt 13101675  T
Q  218 gagatgt 224  Q
    |||||||    
T  13101676 gagatgt 13101682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 215
Target Start/End: Original strand, 20520121 - 20520227
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatatt 207  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || ||||||||  || ||||||||    
T  20520121 tataagatgatttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatatt 20520219  T
Q  208 gttatatc 215  Q
    ||||||||    
T  20520220 gttatatc 20520227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 21915087 - 21915025
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  21915087 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 21915025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 22501333 - 22501260
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  22501333 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtcgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 22501260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 22509267 - 22509194
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  22509267 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtcgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 22509194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 2524316 - 2524380
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtagga 65  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  2524316 tatgagttcaatcaaggtatttaagagtatttaacctatgttgtgagttgacctttagggtagga 2524380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23791463 - 23791360
Alignment:
Q  112 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || ||||||||  |||||| || || ||||||||  ||||||||||| |||    
T  23791463 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatataatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattttta 23791364  T
Q  212 tatc 215  Q
    ||||    
T  23791363 tatc 23791360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 24883851 - 24883785
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  24883851 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtagtgagttga-tcttgggataggaatg 24883785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 20590909 - 20590971
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  20590909 tatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtag 20590971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 31520582 - 31520509
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||| |||||||||| ||||    
T  31520582 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaactcatgttgtgagttta-tcttgggataggaatggaagttg 31520509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 25183652 - 25183603
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 50  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25183652 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 25183603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 23338987 - 23339054
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  23338987 tatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatg 23339054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 215
Target Start/End: Original strand, 24697534 - 24697641
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatatt 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || ||| |||| || |||| || || |||||| |  |||||||||||    
T  24697534 tataatatgattttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagtttgagatgttgttgaattgcatttgatatt 24697633  T
Q  208 gttatatc 215  Q
    ||||||||    
T  24697634 gttatatc 24697641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25109077 - 25108974
Alignment:
Q  112 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || |  |||||||| |  |||||||||||||    
T  25109077 atatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatattgttgattttgctttgatattgtta 25108978  T
Q  212 tatc 215  Q
    ||||    
T  25108977 tatc 25108974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 28349373 - 28349306
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||| ||||    
T  28349373 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgatttgaactttgggatagcaatg 28349306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 10039721 - 10039771
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10039721 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgatgtgagttga 10039771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 21316248 - 21316293
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21316248 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 21316293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 22686305 - 22686260
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22686305 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 22686260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 422
Target Start/End: Original strand, 39827952 - 39828120
Alignment:
Q  257 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc--ttgtgttgttt 354  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||   ||| |||| |||||| |||||||| |   |||||||  |    
T  39827952 tgtgaaatatttatataccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttaattcttatcattgatatggttatgctgtgaattacctatgtgttgcct 39828051  T
Q  355 ctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgt-tgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
     ||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||  || |||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  39828052 atgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtttaagatgaaagatgtcgttccaaagtatt 39828120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 20915386 - 20915226
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttat--atgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcat--attaatattgttatgttgtgaat 340  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||  |||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||  || ||  ||| || |||||||||||||| |    
T  20915386 tgttgttagttatgtgatatagttatttatgcattatgtggaatatgtatgatgttgtagttgtt-attgtttattcatttatgttgttatgttgtgagt 20915288  T
Q  341 tgctt--gtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagtt 399  Q
    || ||  |||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  20915287 tgtttatgtgttgcttctgttgttgttgaatattaattaagttgcaagtgttggtctaagtt 20915226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 214
Target Start/End: Original strand, 24642807 - 24642855
Alignment:
Q  166 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatat 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24642807 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 24642855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Original strand, 34492089 - 34492141
Alignment:
Q  11 attaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  34492089 attaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 34492141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 24841418 - 24841375
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgt 44  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24841418 tatgagttcaattaaggtatttaagagtatttaacctatgttgt 24841375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 26903620 - 26903561
Alignment:
Q  4 gagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  | |||||||||    
T  26903620 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatattgtgagttggtcattggggtag 26903561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 18388884 - 18388934
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  18388884 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtattttactcatgttgagagttga 18388934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 23609940 - 23609898
Alignment:
Q  3 tgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtg 45  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23609940 tgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtg 23609898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 200
Target Start/End: Original strand, 24834804 - 24834882
Alignment:
Q  122 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||| || |||||| || ||| | ||| ||||||||    
T  24834804 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaaattgttattgtttatcatt 24834882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 22332183 - 22332138
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  22332183 tatgagttcaattaaggtgttcaagagtatttaacctatgttgtga 22332138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Original strand, 22413064 - 22413183
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttg--ata 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || ||||| || |||| || || || ||||||||  ||||||  |||    
T  22413064 tataagatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatg-ttgagatgttgttgatttgcatttgatata 22413162  T
Q  206 ttgttatatcttgagatgttt 226  Q
    |||||||||| |||| |||||    
T  22413163 ttgttatatcatgagctgttt 22413183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 24273846 - 24273891
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  24273846 tatgagttcaattaaggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtga 24273891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 24515651 - 24515606
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  24515651 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgtga 24515606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 29113823 - 29113782
Alignment:
Q  5 agttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  29113823 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 29113782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Original strand, 43707872 - 43707916
Alignment:
Q  2 atgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  43707872 atgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtga 43707916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23207466 - 23207364
Alignment:
Q  112 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || ||||| ||  ||| || || ||  |||||||  |||||||||||||||    
T  23207466 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttataatg-ttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgtta 23207368  T
Q  212 tatc 215  Q
    ||||    
T  23207367 tatc 23207364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 388 - 422
Target Start/End: Original strand, 13101739 - 13101773
Alignment:
Q  388 gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13101739 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 13101773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 21336039 - 21336081
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttg 43  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  21336039 tatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttg 21336081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 9975394 - 9975349
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  9975394 tatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 9975349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 22690146 - 22690105
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 42  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  22690146 tatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgtt 22690105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 22694742 - 22694701
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 42  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  22694742 tatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgtt 22694701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 23969210 - 23969255
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23969210 tatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 23969255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 171
Target Start/End: Original strand, 24529508 - 24529564
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatata 171  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  24529508 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatata 24529564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 36839636 - 36839591
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  36839636 tatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 36839591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Original strand, 7665 - 7769
Alignment:
Q  112 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataaga-tgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| |||||| |||||||| |||||  || |||||||| || ||||| || || || ||| |  ||||||||||||||    
T  7665 atatgatttaatgttgttgttaatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgtt 7764  T
Q  211 atatc 215  Q
    |||||    
T  7765 atatc 7769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26903483 - 26903427
Alignment:
Q  122 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 178  Q
    ||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| ||| || ||||||    
T  26903483 atgttgttagtaatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgtt 26903427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Original strand, 1697 - 2099
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  |||    
T  1697 tatgagttcaattaaggtttt-aagattatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtg 1795  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |    | ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1796 aaaatgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 1895  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 300  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1896 tgatgatgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctttgttgctgttattggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgttta 1995  T
Q  301 agttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagtt 399  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  1996 agttgttgatacttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttacaggtgttggtctaagtt 2095  T
Q  400 gtaa 403  Q
    ||||    
T  2096 gtaa 2099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 27765 - 27720
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  27765 tatgagtacaattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgtga 27720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 101)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 46 - 402
Target Start/End: Original strand, 13591793 - 13592149
Alignment:
Q  46 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 145  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |  | ||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  13591793 agttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttcagtgagtctgatataatgtgatttaatgttgttagtaatgtgatatagt 13591892  T
Q  146 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgct 245  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  13591893 tgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatattttgagatgtttatgtgctgcctatgttgct 13591992  T
Q  246 gttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgctt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13591993 gttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaa-atgtatgatgtttaagttgatgatgcttttcattaatattgatatgttgtgaattgctt 13592091  T
Q  346 gtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgta 402  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13592092 gtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgaaggtgttggtctaagttgta 13592149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 111 - 403
Target Start/End: Original strand, 17048066 - 17048359
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17048066 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtacatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 17048165  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 310  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17048166 atatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 17048265  T
Q  311 acttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17048266 gcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgttgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 17048359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18213031 - 18212784
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18213031 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 18212932  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18212931 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 18212832  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgtt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  18212831 tgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgtt 18212784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 24047121 - 24047370
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24047121 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgaccattagggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 24047220  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24047221 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 24047320  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  24047321 tgatattgttatatcttaagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 24047370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 10056934 - 10056653
Alignment:
Q  4 gagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagt 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||      
T  10056934 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttatgagttgatcctttgggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaag 10056835  T
Q  104 cagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttga 203  Q
    | | ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056834 ctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttga 10056735  T
Q  204 tattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaa 285  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056734 tgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaa 10056653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10712873 - 10712695
Alignment:
Q  187 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10712873 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaag 10712774  T
Q  287 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10712773 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttgtgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 10712695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10926643 - 10926465
Alignment:
Q  187 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10926643 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaag 10926544  T
Q  287 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10926543 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttgtgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 10926465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 166 - 403
Target Start/End: Original strand, 14746570 - 14746808
Alignment:
Q  166 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaata 265  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746570 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctacctatgttgctgttgttggttatgtgaaata 14746669  T
Q  266 tttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  14746670 tttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgtt 14746769  T
Q  366 gaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14746770 gcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 14746808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 12487734 - 12487550
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12487734 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatg 12487635  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12487634 tgaaagatgtatgatgtttaaattgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 12487550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 181 - 362
Target Start/End: Original strand, 14954250 - 14954431
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14954250 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatg 14954349  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14954350 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 14954431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 181 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27534049 - 27533868
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27534049 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatg 27533950  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27533949 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgcatgtgctgtttctgttgct 27533868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 181 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25689893 - 25689712
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  25689893 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatg 25689794  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25689793 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 25689712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9556553 - 9556391
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9556553 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 9556454  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9556453 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 9556391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 38 - 227
Target Start/End: Original strand, 32306854 - 32307043
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  32306854 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtattattgatgttcagtaagtctgatataatatggtttgatgttgatagtaatgt 32306953  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32306954 gatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttaatattgttatatcttgagatgttta 32307043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Original strand, 14757505 - 14757667
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14757505 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 14757604  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14757605 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 14757667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 181 - 340
Target Start/End: Original strand, 4561417 - 4561576
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4561417 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 4561516  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaat 340  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4561517 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaataatgttatgttgtgaat 4561576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Original strand, 5757021 - 5757183
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757021 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 5757120  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  5757121 tggaagatgtttgatgtttaagttgttggtgcttcacattaatattgttatgttgtggattgc 5757183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 46 - 227
Target Start/End: Original strand, 14852742 - 14852924
Alignment:
Q  46 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14852742 agttgacccttggggtgggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcagtgagtctaatataatatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatt 14852841  T
Q  146 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 227  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14852842 tgcatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttta 14852924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 185 - 391
Target Start/End: Original strand, 15497041 - 15497247
Alignment:
Q  185 gatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 284  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15497041 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcctatgttgatgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtgga 15497140  T
Q  285 agatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgca 384  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15497141 aaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgagaattgattgtgatgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgca 15497240  T
Q  385 ggtgttg 391  Q
    | |||||    
T  15497241 gatgttg 15497247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 250
Target Start/End: Original strand, 26050340 - 26050545
Alignment:
Q  44 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 143  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26050340 tgagttgatccttgggttaggaatggaggttgattataatattattgatgttcaatgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatata 26050439  T
Q  144 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||| |||    
T  26050440 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-tgttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgtttttgtgctgcctattttg 26050538  T
Q  244 ctgttgt 250  Q
    |||||||    
T  26050539 ctgttgt 26050545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 181 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17810295 - 17810134
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17810295 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgttcatgtgtcgcctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 17810196  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattg 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17810195 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 17810134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 630490 - 630693
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| || |  ||||| |  |||    
T  630490 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtatgaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtg 630589  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  630590 aagctattataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttaaagttgatgttgattatgatt 630689  T
Q  201 tgat 204  Q
    ||||    
T  630690 tgat 630693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 33742401 - 33742241
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  33742401 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtctcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatt--tatgtcttatg 33742304  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33742303 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgctgtgaattgc 33742241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 51463654 - 51463867
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| || | |||||| |  |||    
T  51463654 tatgagtttaattaaggcgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattattgatgatctgtg 51463753  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51463754 aagctattataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatt 51463853  T
Q  201 tgatattgttatat 214  Q
    |||| |||||||||    
T  51463854 tgatgttgttatat 51463867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 38 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40907333 - 40907122
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| ||||| | |||||||| | ||| |||||| |||||||||||||   |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| | |||     
T  40907333 atgttatgagttgatccttgtgctaggaatgaaagtttattataatactgttgatgttcgatgagtctgatataagatgttttgatgttgttaatgatgt 40907234  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 237  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  40907233 gaaatatttgtaaatgcattatgtggattatatatgatgtttatgttgatgttgattatcatttgatatttttatatcttgagatgtttatgtgttgcct 40907134  T
Q  238 atgttgctgttg 249  Q
     |||||||||||    
T  40907133 gtgttgctgttg 40907122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 234 - 365
Target Start/End: Original strand, 43256213 - 43256344
Alignment:
Q  234 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  43256213 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgatatgt 43256312  T
Q  334 tgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43256313 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 43256344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 23803051 - 23803264
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| || |  ||||| |  |||    
T  23803051 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttatgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattactgatgatctgtg 23803150  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23803151 aagctattataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatt 23803250  T
Q  201 tgatattgttatat 214  Q
    | || |||||||||    
T  23803251 ttatgttgttatat 23803264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 185 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19857636 - 19857416
Alignment:
Q  185 gatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 284  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  19857636 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcataagccttatgtgga 19857537  T
Q  285 agatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgca 384  Q
      || |||||| ||||||||||||||  ||   ||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  19857536 gaatatatgatatttaagttgttgatgtttttcattaatattgtcatgttgtgaattacttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaggatgca 19857437  T
Q  385 ggtgtt-gtctaagttgtaag 404  Q
    |||||| || |||||||||||    
T  19857436 ggtgttggtttaagttgtaag 19857416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 391
Target Start/End: Original strand, 10694955 - 10695101
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  10694955 tgttgttggttatgtaaaataattatattccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatatttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 10695054  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 391  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10695055 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttg 10695101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 391
Target Start/End: Original strand, 10908721 - 10908867
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  10908721 tgttgttggttatgtaaaataattatattccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatatttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 10908820  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 391  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10908821 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttg 10908867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 247 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 40619872 - 40619694
Alignment:
Q  247 ttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttg 346  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40619872 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtaagatgtttaggttgttgatgcttttcattaatatttttatgttgtgaattgcttg 40619773  T
Q  347 tgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttg--taagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  40619772 tgctgtttctgttactgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtcgttccaaagtatt 40619694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 15008309 - 15008163
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15008309 tgttgttggttatgtgaaataattatatatcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgatatgttgtgaattgct 15008210  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 391  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15008209 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttg 15008163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 391
Target Start/End: Original strand, 15884123 - 15884269
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15884123 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgttatgttgagaattgct 15884222  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 391  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15884223 tgtgttgtttctgttgatgttgaatattgatcaagttgcagatgttg 15884269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12611316 - 12611106
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| || |  ||||| |   ||    
T  12611316 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattactgatgatctatg 12611217  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12611216 aagctattataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcatt---tgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatt 12611120  T
Q  201 tgatattgttatat 214  Q
    |||| |||||||||    
T  12611119 tgatgttgttatat 12611106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15792030 - 15791857
Alignment:
Q  44 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttg-agtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatat 142  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15792030 tgagttgatcattgaggtaggaatggaggttgattataatactgttgatgtttcagagagtctgatataa-atgatttgatgttgttaataatgtgatat 15791932  T
Q  143 atttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatct 216  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15791931 agttgtatatgcattatgtgaattatacaagatgtttaagttgatgttgaattatcctttgatattgttatatct 15791857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 109 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16043203 - 16043087
Alignment:
Q  109 ataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattg 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16043203 ataagatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttg 16043104  T
Q  209 ttatatcttgagatgtt 225  Q
    |||||||||||||||||    
T  16043103 ttatatcttgagatgtt 16043087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17333542 - 17333352
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |  |||||||  ||||  | | ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  17333542 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataataatactgatgttctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgttagtaatgt 17333443  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaa--gttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 226  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17333442 aatatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatgattaagtgttgttgattattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 17333352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 26789594 - 26789441
Alignment:
Q  44 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttg-agtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatat 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||  || ||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  26789594 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatgttgtagatgtttcagagagtctgatataa-ataatttgatgttgttaataatgtgatat 26789496  T
Q  143 atttgtatatgcattatgtggatt-atataagatgtttaagttgatgttgattat 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26789495 atttgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttgattat 26789441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 111 - 250
Target Start/End: Original strand, 15041893 - 15042033
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgt 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||     
T  15041893 aatatgatttgatgttcttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgattaagttgatgattgattattatttgacattga 15041992  T
Q  210 tatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    |||||||| ||||||||| |||  || ||||||| ||||||    
T  15041993 tatatcttaagatgtttatgtgctgcatatgttgttgttgt 15042033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 111 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15112531 - 15112391
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgt 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||     
T  15112531 aatatgatttgatgtttttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgattaagttgatgattgattattatttgacattga 15112432  T
Q  210 tatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    |||||||| ||||||||| |||  || ||||||| ||||||    
T  15112431 tatatcttaagatgtttatgtgctgcatatgttgttgttgt 15112391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40907094 - 40906987
Alignment:
Q  119 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttg 218  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40907094 ttgatgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcatgatgtggattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttg 40906996  T
Q  219 agatgttta 227  Q
    |||||||||    
T  40906995 agatgttta 40906987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14825730 - 14825551
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  || |  |||||||  |||| || | | |||| |||||| |||||| ||||||||     
T  14825730 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttgatagtaatgt 14825631  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatct 216  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  14825630 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct 14825551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Original strand, 53631320 - 53631481
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttata--tgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattg 342  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||  ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | |  ||    |||||||||||||| |||||||||    
T  53631320 tgttgttggtaatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattg 53631419  T
Q  343 cttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  53631420 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaagtgttggtctaagttgtaa 53631481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 257 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 14650866 - 14650697
Alignment:
Q  257 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct--tgtgttgttt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||   ||| ||||||||||| |||||||||||  |||| | |||    
T  14650866 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaatatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgcttatgtgctattt 14650767  T
Q  355 -ctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
     |||||| |||||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14650766 cctgttgttgttgaatattagtcaagctgcaagtgttggtctaagttgtaacttgtcgttccaaagtatt 14650697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 224
Target Start/End: Original strand, 4831475 - 4831580
Alignment:
Q  119 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctt 217  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4831475 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatctt 4831573  T
Q  218 gagatgt 224  Q
    |||||||    
T  4831574 gagatgt 4831580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 224
Target Start/End: Original strand, 4834770 - 4834875
Alignment:
Q  119 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctt 217  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4834770 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatctt 4834868  T
Q  218 gagatgt 224  Q
    |||||||    
T  4834869 gagatgt 4834875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 153 - 250
Target Start/End: Original strand, 26045268 - 26045364
Alignment:
Q  153 gcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||    
T  26045268 gcattatgtggattatataagatgtttaagt-gttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgtttttgtgctgcctattttgctgttgt 26045364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 167 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14185112 - 14185029
Alignment:
Q  167 atataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14185112 atatgagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgatgttatatcttgagacgtttatgtgttgcctatgttgctgttgt 14185029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14047820 - 14047715
Alignment:
Q  119 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctt 217  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14047820 ttgatattgttaatgatgtggtatattcgtaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatctt 14047722  T
Q  218 gagatgt 224  Q
    |||||||    
T  14047721 gagatgt 14047715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 287 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 26013496 - 26013377
Alignment:
Q  287 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct--gttgaatattgatcaagttgca 384  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  26013496 atgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgggttgcatattgatcaagttgca 26013397  T
Q  385 ggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    | |||| || ||||||||||    
T  26013396 gatgttggtttaagttgtaa 26013377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 185 - 277
Target Start/End: Original strand, 52873148 - 52873240
Alignment:
Q  185 gatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcctt 277  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  52873148 gatgttgattattatttgatgttgttataccttgaggtgtttaagtgttggctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgcctt 52873240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30146567 - 30146462
Alignment:
Q  119 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctt 217  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||| | |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30146567 ttgatattgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattaagtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatctt 30146469  T
Q  218 gagatgt 224  Q
    |||||||    
T  30146468 gagatgt 30146462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 10704963 - 10704890
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  10704963 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 10704890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 10918733 - 10918660
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  10918733 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 10918660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 215
Target Start/End: Original strand, 52243122 - 52243230
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatat 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| || || |||||| | |||||||||||    
T  52243122 tataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatat 52243221  T
Q  207 tgttatatc 215  Q
    |||||||||    
T  52243222 tgttatatc 52243230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28385587 - 28385529
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 303  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28385587 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 28385529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 15884002 - 15884062
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggt 61  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  15884002 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggt 15884062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 16277914 - 16277978
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtagga 65  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  16277914 tatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 16277978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 53387524 - 53387588
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtagga 65  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  53387524 tatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 53387588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 56115423 - 56115490
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  56115423 tatgagttctattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaaccttgggatagcaatg 56115490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 9638472 - 9638399
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  9638472 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 9638399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 9871153 - 9871226
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||| ||||    
T  9871153 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttta-tcttgggataggaatggaagttg 9871226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 10694834 - 10694896
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  10694834 tatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 10694896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 10908600 - 10908662
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  10908600 tatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 10908662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 15448003 - 15448053
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15448003 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttctgagttga 15448053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 28385703 - 28385646
Alignment:
Q  6 gttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  28385703 gttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccaagttgtgagttggtccttggggtag 28385646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 14185040 - 14184973
Alignment:
Q  356 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  14185040 tgttgctgttgtatattgatcaaattgcaggtgttggtctaagttgtaagttatctttccaaagtatt 14184973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 15008431 - 15008372
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttgggg 60  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||    
T  15008431 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttggtccttgggg 15008372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 33849207 - 33849140
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  33849207 tatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatg 33849140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 43251149 - 43251200
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggt-ttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43251149 tatgagttcaattaaggtgttttaagagtatttaatccatgttgtgagttga 43251200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Original strand, 46640388 - 46640490
Alignment:
Q  112 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| |||| || || || | |||||| ||||||||||||||||    
T  46640388 atatgatttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg-ttgagatgttattgattttcatttgatattgtta 46640486  T
Q  212 tatc 215  Q
    ||||    
T  46640487 tatc 46640490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Original strand, 53082084 - 53082186
Alignment:
Q  112 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || | |||||| |  |||||||||||||    
T  53082084 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 53082182  T
Q  212 tatc 215  Q
    ||||    
T  53082183 tatc 53082186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 15990501 - 15990439
Alignment:
Q  4 gagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaa 66  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  15990501 gagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttggtcattggggtaggaa 15990439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 33186366 - 33186316
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  33186366 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttga 33186316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 2425207 - 2425252
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2425207 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 2425252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 3337564 - 3337519
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3337564 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 3337519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 14508227 - 14508182
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14508227 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 14508182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 19566505 - 19566550
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19566505 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 19566550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 26922258 - 26922303
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26922258 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 26922303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 40619995 - 40619933
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  40619995 tatgagttaaattaaggtgtttaagagtattatacctatgttgtgagttggtccttggggtag 40619933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 15344342 - 15344301
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 42  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15344342 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 15344301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 319 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15990307 - 15990254
Alignment:
Q  319 ttaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatatt 372  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  15990307 ttaatattgttataatgtgaattgcttgtgttgtttctgctgttgttgattatt 15990254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 16026515 - 16026559
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16026515 tatgagttcaattaaggtgtttaagagta-ttaacccatgttgtga 16026559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 26445350 - 26445305
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26445350 tatgatttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 26445305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 40229768 - 40229727
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 42  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  40229768 tatgagttcaattaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 40229727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 44024190 - 44024231
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 42  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  44024190 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 44024231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 45314923 - 45314964
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 42  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  45314923 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 45314964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 222
Target Start/End: Original strand, 49547744 - 49547781
Alignment:
Q  185 gatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagat 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49547744 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 49547781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 53631060 - 53631105
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  53631060 tatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 53631105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 12622837 - 12622802
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacc 36  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12622837 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 12622802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15365248 - 15365185
Alignment:
Q  122 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttg 185  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||| ||| || |||||| ||||||    
T  15365248 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgaattatgtggaatatgtatgatgttgaagttg 15365185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27996090 - 27996027
Alignment:
Q  122 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttg 185  Q
    ||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||    
T  27996090 atgttgttagtaatgtgatacaattatatatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttg 27996027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 10357023 - 10357068
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10357023 tatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 10357068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 11425416 - 11425375
Alignment:
Q  5 agttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  11425416 agttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 11425375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14048769 - 14048732
Alignment:
Q  185 gatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagat 222  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  14048769 gatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 14048732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 14630291 - 14630246
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  14630291 tatgagttcaattagggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtga 14630246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 25091118 - 25091073
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25091118 tatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaaccaatgttgtga 25091073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 36038062 - 36038025
Alignment:
Q  185 gatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagat 222  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  36038062 gatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 36038025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 46740664 - 46740623
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 42  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  46740664 tatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgtt 46740623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 55582669 - 55582624
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||    
T  55582669 tatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaatctatgttgtga 55582624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28385564 - 28385489
Alignment:
Q  148 tatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    ||||||| |||||||||  || || ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||    
T  28385564 tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 28385489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 85)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 6766126 - 6765724
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| || || || || |  |||    
T  6766126 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggtggaatataatattgctgttgatctgtg 6766027  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |  | | |||| |||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  6766026 aagctgttata-tatgatttaatgttgatagtaatgtattatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgttgattattatt 6765928  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6765927 tgatgttgttatatcttgagatgtttaagtgccgcctatgttgctgttgttggttgtgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttta 6765828  T
Q  301 agttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagtt 399  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  6765827 agttgttgatacttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcatgtgttggtctaagtt 6765728  T
Q  400 gtaa 403  Q
    ||||    
T  6765727 gtaa 6765724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 37598704 - 37598955
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37598704 tatgagtgcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 37598803  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37598804 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatt 37598903  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  37598904 tgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 37598955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 42960842 - 42960590
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttgggg-taggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagt 99  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42960842 tatgagtgcaattaaggtgcttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagt 42960743  T
Q  100 gagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42960742 gagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcat 42960643  T
Q  200 ttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  42960642 ttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgccgttgttg 42960590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 28370843 - 28371094
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28370843 tatgagtgtaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 28370942  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28370943 agtcagatataatatgatctgatgttgttagtaatgagatatatttgcatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatt 28371042  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  28371043 tgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 28371094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 139 - 403
Target Start/End: Original strand, 22107394 - 22107659
Alignment:
Q  139 atatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgccta 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  22107394 atatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttaggtgctgccta 22107493  T
Q  239 tgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtga 338  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  22107494 tgttgctgttgttggttatgtcaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtga 22107593  T
Q  339 attgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22107594 attgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 22107659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 173 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 18356323 - 18356131
Alignment:
Q  173 gatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatat 272  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18356323 gatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatat 18356224  T
Q  273 gccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18356223 gccttatgtggaagatgtatgatgtttgagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgtttgtgatgtttctgttgctgtt 18356131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 173 - 365
Target Start/End: Original strand, 20910910 - 20911102
Alignment:
Q  173 gatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatat 272  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20910910 gatgtataagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatat 20911009  T
Q  273 gccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20911010 gtcttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgtttgtgttgtttctgttgctgtt 20911102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 111 - 403
Target Start/End: Original strand, 33895587 - 33895870
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||          ||||||||||    
T  33895587 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgtt----------tgatattgtt 33895676  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 310  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33895677 gtatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgtgggttttgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgat 33895776  T
Q  311 acttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
     ||    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  33895777 gctcttcattaatattgttatgttgtgaactgcttgtgctgtttatgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtattggtctaagttgtaa 33895870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 40723670 - 40723854
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40723670 agttgttgttgattatcatttaatattgatatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 40723769  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40723770 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataatagtattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 40723854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10753387 - 10753203
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10753387 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacatgttgcctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgacttatg 10753288  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10753287 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgctatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgttgtt 10753203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 38 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23470064 - 23469853
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||     
T  23470064 atgttatgagttgatcattggggtaggaatggaggttgattatagtaatgttgatgttcagtgagtctgttataatatgatttgatgttgttagtaatgt 23469965  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||  ||||    
T  23469964 gatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgata-tggtatatcttgagatgtttatgtgctgcct 23469866  T
Q  238 atgttgctgttgt 250  Q
    |||||||||||||    
T  23469865 atgttgctgttgt 23469853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 29448303 - 29447899
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||   || |  ||||| |  |||    
T  29448303 tatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggatgaatactatattaatgatgatttgtg 29448204  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |    | |||||||||||||||||||| || ||| | ||| |||||||||||||||||  || ||||  || ||||||| || || ||||||||  ||||    
T  29448203 aagttgttataatatgatttgatgttgataataaggtgatgtatttgtatatgcattacatgaattacgtatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt 29448104  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgttt-acgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttt 299  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |  |   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  29448103 tgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaa-atgtataatgttt 29448005  T
Q  300 aagttg-ttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaag 397  Q
    || ||| ||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  29448004 aaattgattgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgctcctgttgatgttgagtattgattaagttgcaggtgttggtctaag 29447905  T
Q  398 ttgtaa 403  Q
    ||||||    
T  29447904 ttgtaa 29447899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Original strand, 38145328 - 38145492
Alignment:
Q  4 gagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagt 103  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38145328 gagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgactgagt 38145427  T
Q  104 cagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattat 168  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38145428 cagatataatataatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattat 38145492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20295870 - 20295708
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20295870 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 20295771  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20295770 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 20295708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 30138750 - 30138979
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  |||    
T  30138750 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtg 30138849  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |  |   ||||||||||||| |||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30138850 aagctattataatatgatttaatgttcgtagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatt 30138949  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgt 230  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30138950 tgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 30138979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Original strand, 19472803 - 19472965
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19472803 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 19472902  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19472903 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 19472965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 187 - 343
Target Start/End: Original strand, 15236924 - 15237080
Alignment:
Q  187 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15236924 tgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 15237023  T
Q  287 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15237024 atgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 15237080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 227
Target Start/End: Original strand, 25574334 - 25574516
Alignment:
Q  44 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25574334 tgagttgatccttggggtaggaatagaggttgattataatactacagatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatata 25574433  T
Q  144 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 227  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||    
T  25574434 gttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatta-ttgaaatagttatatcttgagatgttta 25574516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 227
Target Start/End: Original strand, 25575527 - 25575709
Alignment:
Q  44 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25575527 tgagttgatccttggggtaggaatagaggttgattataatactacagatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatata 25575626  T
Q  144 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 227  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||    
T  25575627 gttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatta-ttgaaatagttatatcttgagatgttta 25575709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 227
Target Start/End: Original strand, 25576720 - 25576902
Alignment:
Q  44 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  25576720 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatattacagatgttcagtgagtctgatataatatgattttatgttgatagtaatgtgatata 25576819  T
Q  144 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 227  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25576820 gttgtatatgcatgatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatta-ttgatattgttatatcttgagatgttta 25576902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 17011069 - 17010923
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  17011069 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 17010970  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 391  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17010969 tgtgctgcttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttg 17010923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 263201 - 263042
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  263201 tgttgttggttatgtgaaataattatgtgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 263102  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgt-tgtctaagttgtaa 403  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  263101 tgtgctgtttctgttgttgttgcatatagatcaagttgcaggtataggtctaagttgtaa 263042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 250
Target Start/End: Original strand, 21731319 - 21731532
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataat-atgatttgatgttgttagtaatg 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||   | ||| | |||| |||| |||||||||||||    
T  21731319 atgttatgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattatagtactgttaatgtccagtgagtttaaaatatttatgaattgaggttgttagtaatg 21731418  T
Q  137 agatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgc 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||   ||    
T  21731419 agatatatt-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgttctatcttgagatgtttatgttctgc 21731517  T
Q  236 ctatgttgctgttgt 250  Q
    |||||||||||||||    
T  21731518 ctatgttgctgttgt 21731532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 250
Target Start/End: Original strand, 21809439 - 21809652
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataat-atgatttgatgttgttagtaatg 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||   | ||| | |||| |||| |||||||||||||    
T  21809439 atgttatgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattatagtactgttaatgtccagtgagtttaaaatatttatgaattgaggttgttagtaatg 21809538  T
Q  137 agatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgc 235  Q
     |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||   ||    
T  21809539 tgatatatt-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgttctatcttgagatgtttatgttctgc 21809637  T
Q  236 ctatgttgctgttgt 250  Q
    |||||||||||||||    
T  21809638 ctatgttgctgttgt 21809652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 246
Target Start/End: Original strand, 21328073 - 21328282
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatata-atatgatttgatgttgttagtaatg 136  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||  | |||| | ||||||||||||| | | |||||    
T  21328073 atgttatgagttgatccatgggggaggaatggaggtttattatagtattgttgatgttctgtgagtttgctatatacatgatttgatgttataaataatg 21328172  T
Q  137 agatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcc 236  Q
     |||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||  |||  |||    
T  21328173 tgatatagttgtatatgcattatgtgatttatgtaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgctatatctgaatatgtttttgtgctgcc 21328272  T
Q  237 tatgttgctg 246  Q
    ||||||||||    
T  21328273 tatgttgctg 21328282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 251
Target Start/End: Original strand, 26732692 - 26732904
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |  |  |||||||  |||| |  | ||| | ||||||| |||||| ||| ||||     
T  26732692 atgtagtgagttgatccttggggtaagaatggaggttgattataatgttactgatgttctgtgaatatgttattacatgatttaatgttgatagaaatgt 26732791  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |    ||||    
T  26732792 gatatatttgtatatgcattatgtggattaaataagatgtttaag-tgtcgttgattattatttgatattgttatatcctgagatgtttatgcactgcct 26732890  T
Q  238 atgttgctgttgtt 251  Q
    ||||||||||||||    
T  26732891 atgttgctgttgtt 26732904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 227
Target Start/End: Original strand, 26740505 - 26740693
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |  |  |||||||  |||| |  | ||| | ||||||| |||||| ||| ||||     
T  26740505 atgttgtgagttgatccttggggtaggagtggaggttgattataatgttactgatgttctgtgaatttgttattacatgatttaatgttgatagaaatgt 26740604  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  26740605 gatatatttgtatatgcattatgtggattaaataagatgtttaag-tgttgttgattattatttgatattgttatatccttagatgttta 26740693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 156 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22336711 - 22336615
Alignment:
Q  156 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  |||||||    
T  22336711 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgtcgttgttg 22336615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 156 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22340249 - 22340153
Alignment:
Q  156 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  |||||||    
T  22340249 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgtcgttgttg 22340153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15796682 - 15796471
Alignment:
Q  39 tgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttg-agtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||| || ||||  ||| || | ||||||| |||||||||||||| || |||||     
T  15796682 tgttgtgagatgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactactgctgctgtttcagtaagcctgatataa-atgatttgatgttgctaataatgt 15796584  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-ttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatg-tttacgtgtcgc 235  Q
    |||||| |||||||| || |||| | ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||| |||  ||    
T  15796583 gatataattgtatatacagtatgcgaattataagagatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgctatatcatgagctgttttatgtgctgc 15796484  T
Q  236 ctatgttgctgtt 248  Q
    |||||||||||||    
T  15796483 ctatgttgctgtt 15796471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 18418877 - 18418797
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 81  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18418877 tatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatata 18418797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10816582 - 10816453
Alignment:
Q  120 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttg 218  Q
    ||||||||||| | ||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10816582 tgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggagttatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttg 10816484  T
Q  219 agatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttg 249  Q
    |||||| || |||   |||||| ||||||||    
T  10816483 agatgtctatgtgctacctatgatgctgttg 10816453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22750325 - 22750264
Alignment:
Q  156 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22750325 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 22750264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20572149 - 20572025
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatata-atatgatttgatgttgttagtaatg 136  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||  ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||    
T  20572149 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgattttactattgttgatgttctgtgagtctgctaaatacatgatttgatgttgttagtaatg 20572050  T
Q  137 agatatatttgtatatgcattatgt 161  Q
      ||||| |||||||||||||||||    
T  20572049 taatatagttgtatatgcattatgt 20572025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 234 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18356381 - 18356308
Alignment:
Q  234 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttg 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18356381 gcctatgttgctgttgttggttatctgaaatatttatatgctttat-tggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 18356308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19511577 - 19511516
Alignment:
Q  156 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19511577 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatatcgttatatctt 19511516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23538608 - 23538504
Alignment:
Q  120 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgg-attatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttg 218  Q
    |||||||||||   ||| | |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23538608 tgatgttgttaacgatgtggtatatttgaaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatgatttgatattgttatatcttg 23538510  T
Q  219 agatgt 224  Q
    ||||||    
T  23538509 agatgt 23538504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 309 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 11231041 - 11230985
Alignment:
Q  309 atacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11231041 atactttatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 11230985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 236 - 308
Target Start/End: Original strand, 20910854 - 20910925
Alignment:
Q  236 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttg 308  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20910854 ctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttat-tggaaaatgtatgatgtataagttgttg 20910925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22412471 - 22412392
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 81  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22412471 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttga-tcttggggtaggaatggaggttgaatata 22412392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 226
Target Start/End: Original strand, 27988857 - 27988978
Alignment:
Q  109 ataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata--tttgtatatgcatt-atgtggattatataagatgtttaa--gttgatgttgattatcatttga 203  Q
    |||| ||||||| |||||||||  |||| ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27988857 ataagatgattt-atgttgttaagaatgtgatataaatttgtatatgcattgatgtgaattatacaagatgtttaaatgttgatgttgattatcatttga 27988955  T
Q  204 tattgttatatcttgagatgttt 226  Q
    |||||||||||| |||| |||||    
T  27988956 tattgttatatcatgagctgttt 27988978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 31456263 - 31456196
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  31456263 tatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacccatattgtgagtcgacccttggggtaggaatg 31456196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 243
Target Start/End: Original strand, 15236863 - 15236925
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttg 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15236863 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttg 15236925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 24277193 - 24277266
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  24277193 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 24277266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 24385020 - 24384947
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  24385020 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 24384947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 309 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 11220643 - 11220587
Alignment:
Q  309 atacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11220643 atactttatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 11220587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 309 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 11225229 - 11225173
Alignment:
Q  309 atacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11225229 atactttatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 11225173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 309 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 11229052 - 11228996
Alignment:
Q  309 atacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11229052 atactttatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 11228996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 263322 - 263260
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  263322 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 263260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 226
Target Start/End: Original strand, 22178152 - 22178266
Alignment:
Q  112 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 211  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || ||||||||  ||||||||||||| |    
T  22178152 atatgattggatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtca 22178251  T
Q  212 tatcttgagatgttt 226  Q
    |||| |||| |||||    
T  22178252 tatcatgagctgttt 22178266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 303
Target Start/End: Original strand, 33473272 - 33473330
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 303  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33473272 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 33473330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 17011191 - 17011132
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttgggg 60  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  17011191 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttgggg 17011132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 17812861 - 17812795
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  17812861 tatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatg 17812795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 21554968 - 21555033
Alignment:
Q  4 gagttcaattaaggtttttaa-gagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  21554968 gagttcaattaaggtgtttaaagagtatttaacccatgttgtgagtcgacccttgagttaggaatg 21555033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Original strand, 21557635 - 21557699
Alignment:
Q  5 agttcaattaaggtttttaa-gagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21557635 agttcaattaaggtgtttaaagagtatttaaactatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatg 21557699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 12122109 - 12122175
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  12122109 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttga-tcttgggataggaatg 12122175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 36460435 - 36460368
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  36460435 tatgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagtcgacccttggggttggaatg 36460368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 17875464 - 17875414
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  17875464 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccctattgtgagttga 17875414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 22758478 - 22758528
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22758478 tatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttga 22758528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 16062951 - 16062906
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16062951 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 16062906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 18744115 - 18744070
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18744115 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 18744070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 248
Target Start/End: Original strand, 41861449 - 41861523
Alignment:
Q  175 tgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatg-tttacgtgtcgcctatgttgctgtt 248  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||| |||  |||||||||||||||    
T  41861449 tgttgaagttgatggtgattgtcatttgatattgttatatcatgagctgttttatgtgctgcctatgttgctgtt 41861523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 1627967 - 1628012
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1627967 tatgagttcaattaacgtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 1628012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 310 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 11227061 - 11227008
Alignment:
Q  310 tacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctg 363  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  11227061 tactttatattaatattgttatgttgtgaatttcatgtgctgtatctgttgctg 11227008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 20566019 - 20565974
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20566019 tatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 20565974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 21399590 - 21399635
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  21399590 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctattttgtga 21399635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 26749579 - 26749538
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 42  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26749579 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 26749538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 30612018 - 30611973
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  30612018 tatgagttgaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 30611973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 30613978 - 30613933
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  30613978 tatgagttgaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 30613933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 63
Target Start/End: Original strand, 33473160 - 33473213
Alignment:
Q  10 aattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||    
T  33473160 aattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtag 33473213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 224
Target Start/End: Original strand, 43243243 - 43243315
Alignment:
Q  151 atgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||    
T  43243243 atgcattatgtggattacgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 43243315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22144242 - 22144134
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatat 206  Q
    ||||| |||| |||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||  || |||||||| | |||||| || || ||||||||  || |||||||    
T  22144242 tataagatgaattgatgttgtttacaatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatat 22144143  T
Q  207 tgttatatc 215  Q
    |||||||||    
T  22144142 tgttatatc 22144134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 14026394 - 14026437
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgt 44  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14026394 tatgagttgaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 14026437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 46
Target Start/End: Original strand, 16605192 - 16605235
Alignment:
Q  3 tgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16605192 tgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 16605235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 22111063 - 22111020
Alignment:
Q  3 tgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22111063 tgagttctattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 22111020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 22750409 - 22750374
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacc 36  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22750409 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 22750374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 45
Target Start/End: Original strand, 27869163 - 27869206
Alignment:
Q  2 atgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtg 45  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27869163 atgagttcaattaaggtgtttgagagtatttaacctatgttgtg 27869206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 41876180 - 41876222
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttg 43  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  41876180 tatgagttaaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttg 41876222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 188
Target Start/End: Original strand, 27869281 - 27869322
Alignment:
Q  148 tatatgcattatgtggattatataagatg-tttaagttgatg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  27869281 tatatgcattatgtggattatataacatgatttaagttgatg 27869322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 46
Target Start/End: Original strand, 32607916 - 32607957
Alignment:
Q  5 agttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  32607916 agttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 32607957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 170
Target Start/End: Original strand, 2154593 - 2154648
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatat 170  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  2154593 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 2154648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 170
Target Start/End: Original strand, 20901988 - 20902043
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatat 170  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  20901988 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 20902043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25743913 - 25743807
Alignment:
Q  109 ataatatgatttgatgttgttagtaatgaga--tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgata 205  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||   |||||||||  | ||||||    
T  25743913 ataagatgatttggtgttgttattaatgtgacatatatttatatatgcattatgtgaattatttgtgatgttttaagt---tgttgattactacttgata 25743817  T
Q  206 ttgttatatc 215  Q
    ||||||||||    
T  25743816 ttgttatatc 25743807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 224
Target Start/End: Original strand, 33473295 - 33473370
Alignment:
Q  148 tatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    ||||||| |||||||||  || || ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||    
T  33473295 tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 33473370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 40726040 - 40725996
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 158  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  40726040 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcatta 40725996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 5 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16034 - 15588
Alignment:
Q  5 agttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtc 104  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||| |  ||||  |    
T  16034 agttcaattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgagtttatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattggtgatgatctgtgaagc 15935  T
Q  105 agatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat 204  Q
     | ||||| ||    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15934 tgttataacata---taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat 15838  T
Q  205 attgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatat-ttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15837 gttgttatatcttgagatgtttacgtgttacctatgttgctgttgttggttatgtgaaaaatattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 15738  T
Q  304 tgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtc--------t 394  Q
    ||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||             
T  15737 tgttggtgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtattgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaagtgttggtcgaatttgta 15638  T
Q  395 aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 444  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15637 aagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaagt 15588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 458 - 49
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  |||    
T  458 tatgagttcaattaaggtgtttaagagcatttaacccgtgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtg 359  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |  | | ||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  358 aagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatttgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 259  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 300  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  258 tgatgttgttatatcttgatatgtttacgtgttgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttaggtggaaaatgtatgatgttta 159  T
Q  301 agttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttg---tgt---tgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtc 393  Q
    |||||||| | |||   ||||||||||||||||||||||||| |||   |||   ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||    
T  158 agttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtttgtactgtttctgtttctgttgctgttgcatattaagcaagttgcaggtgttggtc 59  T
Q  394 taagttgtaa 403  Q
    ||| ||||||    
T  58 taatttgtaa 49  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 111 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 120197 - 119855
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  120197 aatacgatttgatgttgatgataatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaactatatcagatgtttaagttattgttgattatcatttgatattgtt 120098  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 310  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  120097 atatcttgagatgtttacgtgttgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgat 119998  T
Q  311 acttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtg-ttgtcta--------agttgt 401  Q
     ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        ||||||    
T  119997 gcttctcattaatattattatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtttgtctaagttgtatagttgt 119898  T
Q  402 aagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 444  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119897 aagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 119855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 81)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 111 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 48603641 - 48603299
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48603641 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatacattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 48603542  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 310  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48603541 agatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggctatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 48603442  T
Q  311 acttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtc--------taagttgt 401  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||        ||||||||    
T  48603441 gcttcacattaatattgttatgatggaaattgcttgtgctgtttctgttgctattgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgttaagttgt 48603342  T
Q  402 aagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 444  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48603341 aagttgtcgttccaaagtattcaaaagtattggagtcttaagt 48603299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 13881203 - 13881541
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  | |  ||||| |  |||    
T  13881203 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataacattactgatgatctgtg 13881302  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |  | | ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13881303 aagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 13881402  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 300  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13881403 tgatgttgttatatctcaagatgtttatgtgatgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttta 13881502  T
Q  301 agttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaa 339  Q
    |||||||| | |||   ||||||||||||||||||||||    
T  13881503 agttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgtgaa 13881541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 28312813 - 28312564
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312813 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 28312714  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312713 agccagatataatatgatttgatgtttttagtaatgagatatatttgtatatacattatgtggattttataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 28312614  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||| ||||||    
T  28312613 tgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgtctatgttgatgttgt 28312564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 38 - 444
Target Start/End: Original strand, 27653081 - 27653496
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  | ||  ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  27653081 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgagaagcagttataatatgatttaatgttgatagtaatgt 27653180  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 237  Q
      ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  27653181 attatatttgtatatgcattatgagaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttaagtgctgcct 27653280  T
Q  238 atgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||    
T  27653281 atgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtagaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtg 27653380  T
Q  338 aattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaag 428  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||| || |||||    
T  27653381 aattgtttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagatgcagatgttggtctaagttataaagttgtaagttgtctttccaaagtgtttcaaag 27653480  T
Q  429 tattggagtcttaagt 444  Q
    ||||||||||||||||    
T  27653481 tattggagtcttaagt 27653496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 20437814 - 20438064
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20437814 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgaggttacccttggggtaggaatggaggttgactatagtactgttgatgttgagtg 20437913  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20437914 agtcagatataatatgatttgatgctgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgatgttgattatcat 20438013  T
Q  200 ttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||    
T  20438014 ttgatattgttatatcttgaggtgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 20438064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 44 - 250
Target Start/End: Original strand, 21043146 - 21043352
Alignment:
Q  44 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21043146 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 21043245  T
Q  144 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  21043246 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatttttattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttg 21043345  T
Q  244 ctgttgt 250  Q
     ||||||    
T  21043346 ttgttgt 21043352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 1925212 - 1925396
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1925212 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatg 1925311  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1925312 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 1925396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 20924226 - 20924410
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20924226 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatg 20924325  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20924326 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 20924410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 112 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 48520699 - 48520407
Alignment:
Q  112 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt-aagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    |||||| |||||||| | | ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  48520699 atatgaattgatgttataaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgatgttgtttattatttgatattgtt 48520600  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 310  Q
    |||||| |||||||| | ||    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  48520599 atatct-gagatgttcatgttctacctatgttgctgctgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtataatgtttaagttgttgat 48520501  T
Q  311 acttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
     ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  48520500 gcttctcattaatattgatatgttgtgaattgcttgtgctgtttctattgccgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaaattgtaa 48520407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 20228892 - 20229076
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20228892 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 20228991  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20228992 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 20229076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 44 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22124541 - 22124338
Alignment:
Q  44 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 143  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22124541 tgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgactatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatata 22124442  T
Q  144 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttg 243  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  22124441 gttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttg 22124342  T
Q  244 ctgt 247  Q
    ||||    
T  22124341 ctgt 22124338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 39 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20958369 - 20958158
Alignment:
Q  39 tgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgag 138  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  20958369 tgttatgagttgatccttggtgtaagaatgaaggttgattgtagtattgttgatgttcagtgagtctgatataatatgttttgatgttgttagtaatgtg 20958270  T
Q  139 atatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgccta 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||    
T  20958269 atatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtcatatcttgagatgtttatgtgctgccta 20958170  T
Q  239 tgttgctgttgt 250  Q
    ||||||||||||    
T  20958169 tgttgctgttgt 20958158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 197 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 12271657 - 12271450
Alignment:
Q  197 catttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatg 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12271657 catttgatattgttatatcttgagatgtttaagtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggaaaatgtatgatg 12271558  T
Q  297 tttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtcta 395  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12271557 tttaagttgttgatacttttcattaattttgttatgctgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtcta 12271458  T
Q  396 agttgtaa 403  Q
    ||||||||    
T  12271457 agttgtaa 12271450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 186 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 51326906 - 51326638
Alignment:
Q  186 atgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaa 285  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51326906 atgttgattattatttgatgttgttatatcttgagatgtttaggtgctgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgtttatatgccttatgtggaa 51326807  T
Q  286 gatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcag 385  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  51326806 aatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcag 51326707  T
Q  386 gtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagt-attccaaagtattggagtcttaagt 444  Q
    ||||| || |        ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  51326706 gtgttggtataagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgtttccaaagtattggagtcttaagt 51326638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21407378 - 21407216
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21407378 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 21407279  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21407278 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 21407216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1010746 - 1010584
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1010746 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 1010647  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1010646 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 1010584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 53 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14800781 - 14800583
Alignment:
Q  53 ccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgtta-gtaatgagatatat----ttg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    |||    
T  14800781 ccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttaagtaacgtgatatatatagttg 14800682  T
Q  148 tatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||||||||||    
T  14800681 tatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgctgcatatgttgctg 14800583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 53 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14809655 - 14809457
Alignment:
Q  53 ccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgtta-gtaatgagatatat----ttg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    |||    
T  14809655 ccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttaagtaacgtgatatatatagttg 14809556  T
Q  148 tatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||||||||||    
T  14809555 tatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgctgcatatgttgctg 14809457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Original strand, 16375541 - 16375704
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttga-tattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttat 279  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16375541 agttgttgttgattatcatttgaatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttat 16375640  T
Q  280 gtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16375641 gtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 16375704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 52639564 - 52639402
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52639564 agttgttgttgattatcattcgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatg 52639465  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52639464 tggaagatgtttgatgtctaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 52639402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 250
Target Start/End: Original strand, 52940736 - 52940947
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |  ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52940736 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattataatattactgatgttcagtgactctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgt 52940835  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 237  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  ||||    
T  52940836 gatgtagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttggtattgttatatcttgagatg-ttatgtgctgcct 52940934  T
Q  238 atgttgctgttgt 250  Q
    |||||| ||||||    
T  52940935 atgttgttgttgt 52940947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 401
Target Start/End: Original strand, 46198433 - 46198590
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  46198433 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgaggcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 46198532  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt 401  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46198533 tgtgttgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt 46198590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 245 - 422
Target Start/End: Original strand, 29764346 - 29764533
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  29764346 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgttttcaattaatattgttatgttgtgaattgct 29764445  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29764446 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 29764533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 237 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 33797584 - 33797456
Alignment:
Q  237 tatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgt 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33797584 tatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttcacattaatattgttatgttgt 33797485  T
Q  337 gaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33797484 gaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 33797456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 112 - 308
Target Start/End: Original strand, 41781522 - 41781718
Alignment:
Q  112 atatgatttgat-gttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||    
T  41781522 atatgatttgattgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaggt--tgttgattatcatttgatgttgtt 41781619  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgg-aagatgtatgatgtttaagttgttg 308  Q
    ||||||||| ||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  41781620 atatcttgaaatgtttatgtgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaaatgtacgatgtttaagttgttg 41781718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 45574628 - 45574841
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| || |  ||||| |  |||    
T  45574628 tatgagttcaattaaggtgtttaagcgtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtg 45574727  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  45574728 aagctattataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttgattatgatt 45574827  T
Q  201 tgatattgttatat 214  Q
    |||| || ||||||    
T  45574828 tgatgttcttatat 45574841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 2332797 - 2333019
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |  || || ||||| |||||| |||||| |||||| ||||    
T  2332797 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcctcgggttttgagtgaaggtttattataatactgtcgatgttcagtg 2332896  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcat 199  Q
    |||| ||||||| || | |||||||||||| | | | | || ||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2332897 agtctgatataagat-aattgatgttgttaatgacgtggtagatttgcaaatgcattatgtggacttatataggatgtttaagttg-tgttgattatcat 2332994  T
Q  200 ttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2332995 ttgatattgttatatcttgagatgt 2333019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 50000817 - 50000658
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  50000817 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgttatgttgtgaattgct 50000718  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  50000717 tgtgctatttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagtggtaa 50000658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 234 - 444
Target Start/End: Original strand, 22130961 - 22131169
Alignment:
Q  234 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatg-tttaagttgttgatacttcatattaatattgttatg 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||            | |||    
T  22130961 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttttaagttgttgatgcttc------------tcatg 22131048  T
Q  333 ttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattc 423  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22131049 ttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttctcgttccaaagtattc 22131148  T
Q  424 caaagtattggagtcttaagt 444  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  22131149 caaagtactggagtcttaagt 22131169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 47190855 - 47190684
Alignment:
Q  46 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttg-agtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatat 144  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  47190855 agttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatactgttgatgtttcagagagtctgatataa-atgatttgatgttgttagtaatgtgatatag 47190757  T
Q  145 ttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatc-atttgatattgttatatct 216  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  47190756 ttgtatatgcattatgtaaattatataagatgtttaagttgatgttgatttcctctttgatattgttatatct 47190684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 22130652 - 22130854
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||| || |  ||||| |  |||    
T  22130652 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtttatccttggggtaggaatggaagttgaatataatattactgatgatctgtg 22130751  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  22130752 aagctactataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatg-tgattatgatt 22130850  T
Q  201 tgat 204  Q
    ||||    
T  22130851 tgat 22130854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 156 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16372141 - 16372045
Alignment:
Q  156 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  16372141 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 16372045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 250
Target Start/End: Original strand, 635914 - 636053
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgt 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| |||||| |||||    
T  635914 aatatgatttgatgttgttagcaatgtgat-tatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgcttaagttgatgattgaatattatttgacattgt 636012  T
Q  210 tatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    |||||||||| || |||| |||  |||||||||||||||||    
T  636013 tatatcttgaaatatttatgtgctgcctatgttgctgttgt 636053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 23819381 - 23819457
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttat 257  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23819381 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttat 23819457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 215
Target Start/End: Original strand, 21533739 - 21533908
Alignment:
Q  44 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 143  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |  | |||||  |||| |    ||| | ||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  21533739 tgagttgatccttggg-taggaatggaggttgattataatattactaatgttctgtgaatttattattacatgatttaatgttgatagaaatgtgatata 21533837  T
Q  144 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21533838 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-tgttgttgattattatttgatattgttatatc 21533908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 185 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 43543243 - 43543144
Alignment:
Q  185 gatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 284  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  43543243 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtgga 43543144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 20031477 - 20031698
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| |||| | |  |||||||||| ||||    
T  20031477 tatgagttcaattaaggtgtttaggagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaattaaggtttattaaaatgttgttgatgttcagtg 20031576  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |||| |||| || |||  |||| ||||||| |  |    || ||||| | |||| ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||||    
T  20031577 agtctgataaaagatg-gttgaggttgttaatcttatagtaaatttgcaaatgccttatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgactatcatt 20031674  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    || |||||| |||| ||| |||||    
T  20031675 tggtattgtcatattttgggatgt 20031698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32649892 - 32649787
Alignment:
Q  119 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctt 217  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32649892 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatctt 32649794  T
Q  218 gagatgt 224  Q
    |||||||    
T  32649793 gagatgt 32649787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 330 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 20316606 - 20316532
Alignment:
Q  330 atgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  20316606 atgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagtttcaggtgttggtctaaattgtaa 20316532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16381346 - 16381256
Alignment:
Q  139 atatatttgtatatgcatt-atgtggattatataagatgtttaa--gttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16381346 atatatttgtatatgcattgatgtgaattatacaatatgtttaaatgttgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 16381256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 24815439 - 24815512
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  24815439 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 24815512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29534729 - 29534624
Alignment:
Q  119 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctt 217  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||||  | |||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29534729 ttgatgttgttaatgatgtggtatattttcaaatgcattatgtggaattttatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatatcgttatatctt 29534631  T
Q  218 gagatgt 224  Q
    |||||||    
T  29534630 gagatgt 29534624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Original strand, 41049968 - 41050070
Alignment:
Q  112 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 211  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||| || || || ||||||||  |||||||||||||||    
T  41049968 atatgatttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatg-ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtta 41050066  T
Q  212 tatc 215  Q
    ||||    
T  41050067 tatc 41050070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Original strand, 50614048 - 50614151
Alignment:
Q  112 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 211  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||| ||||||||| || || ||||||||  |||||||||||||||    
T  50614048 atatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtta 50614147  T
Q  212 tatc 215  Q
    ||||    
T  50614148 tatc 50614151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Original strand, 50621876 - 50621979
Alignment:
Q  112 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 211  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||| ||||||||| || || ||||||||  |||||||||||||||    
T  50621876 atatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtta 50621975  T
Q  212 tatc 215  Q
    ||||    
T  50621976 tatc 50621979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 21180912 - 21180962
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21180912 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 21180962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 29764225 - 29764287
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  29764225 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 29764287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 294501 - 294434
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  294501 tatgagttcaattaatgtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaaccttgggatagcaatg 294434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 16401133 - 16401060
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  16401133 tatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacccatgttttgagttga-tcttgggacaggaatggaggttg 16401060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 46198312 - 46198374
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||    
T  46198312 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatattgtgagttggtccttggggtag 46198374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 395 - 444
Target Start/End: Original strand, 636090 - 636139
Alignment:
Q  395 aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 444  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  636090 aagttgtaagttgtctttctaaagtattccaaagtattggattcttaagt 636139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 50000938 - 50000889
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 50  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50000938 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 50000889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Original strand, 7792441 - 7792512
Alignment:
Q  3 tgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  7792441 tgagttcaattaaggtgtttaagagcatttaacccatgttgtgatttga-tcttgggataggaatggaagttg 7792512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20329181 - 20329118
Alignment:
Q  129 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg-tttaagttgatgttg 191  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20329181 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgttaattatataagatgttttaagttgatgttg 20329118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 50686801 - 50686698
Alignment:
Q  112 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 211  Q
    |||||||  |||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || ||||||||  ||||||| |||||||    
T  50686801 atatgatccgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgtta 50686702  T
Q  212 tatc 215  Q
    ||||    
T  50686701 tatc 50686698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 296819 - 296753
Alignment:
Q  2 atgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  296819 atgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatg 296753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11945626 - 11945564
Alignment:
Q  130 agtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttga 192  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11945626 agtaatgtaatatatttgtatatacattctgtgaattatataagatgtttaagttgctgttga 11945564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 44822709 - 44822759
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44822709 tatgagttcaattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtgagttga 44822759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 75
Target Start/End: Original strand, 8276584 - 8276652
Alignment:
Q  6 gttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  8276584 gttcaattaaggcgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 8276652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 12710353 - 12710308
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12710353 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 12710308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 17902348 - 17902393
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17902348 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 17902393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 251
Target Start/End: Original strand, 20454548 - 20454625
Alignment:
Q  175 tgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatg-tttacgtgtcgcctatgttgctgttgtt 251  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| || |||| |||  ||||||||||||||||||    
T  20454548 tgttgaagttgatgttgattgtcatttgatattgttataccatgagctgttttatgtgctgcctatgttgctgttgtt 20454625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 48520822 - 48520773
Alignment:
Q  46 agttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgtt 95  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48520822 agttgatcattggggtaggaatggaggttgattatagtactgctgatgtt 48520773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 50544317 - 50544272
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  50544317 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 50544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 38057238 - 38057286
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagtt 49  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38057238 tatgagtacaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtt 38057286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 22350050 - 22349980
Alignment:
Q  4 gagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  22350050 gagttcaattaaggtgtttaagagtattcaactcatgttgagagttga-tcttgggataggaatggaagttg 22349980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 215
Target Start/End: Original strand, 35261009 - 35261114
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatat 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||  || ||||| || | |||||| |   ||||||||||  ||||||||||    
T  35261009 tataagatgatttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttga---gatgttgatttgcatttgatat 35261105  T
Q  207 tgttatatc 215  Q
    |||||||||    
T  35261106 tgttatatc 35261114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 1643061 - 1643020
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 42  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1643061 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 1643020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 14793148 - 14793189
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 42  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14793148 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14793189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 18121070 - 18121025
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18121070 tatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 18121025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 20588144 - 20588099
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20588144 tatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 20588099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 20592682 - 20592637
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20592682 tatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 20592637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 22823993 - 22824038
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22823993 tatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtga 22824038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 39060561 - 39060516
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  39060561 tatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 39060516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 51323740 - 51323695
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  51323740 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgtga 51323695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Original strand, 16368219 - 16368320
Alignment:
Q  112 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||| | |||| || || || ||||||||  || ||||||||||||    
T  16368219 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgatg-ttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgtta 16368316  T
Q  212 tatc 215  Q
    ||||    
T  16368317 tatc 16368320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 16758843 - 16758780
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatata 171  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||  || ||||||||    
T  16758843 tataatatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 16758780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 215
Target Start/End: Original strand, 21896189 - 21896292
Alignment:
Q  113 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 211  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||| |||||  || |||||||| | |||||| || || || ||| |  |||||||||||||||    
T  21896189 tatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgtta 21896288  T
Q  212 tatc 215  Q
    ||||    
T  21896289 tatc 21896292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 24720280 - 24720322
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttg 43  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24720280 tatgagttcagttaaggtgtttaagagtatttaacctatgttg 24720322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 21239882 - 21239927
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||    
T  21239882 tatgagttcaattaaggtgtttaagaatttttaacctatgttgtga 21239927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Original strand, 23195139 - 23195176
Alignment:
Q  2 atgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccat 39  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23195139 atgagttcaattaaggtgtttgagagtatttaacccat 23195176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 714 - 313
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||  || |  ||||| |   ||    
T  714 tatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacccatgttatgagttgatc-ttggagtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctatg 616  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |  | | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  615 aagctg-tataatataatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttaatgttaattatcatt 517  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  516 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctccctatgttgttgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatatatgatgttta 417  T
Q  301 agttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagtt 399  Q
    |||||||||| |||   ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  416 agttgttgatgcttttcattaatattgttacgtcgtgaatttcttgtgctgtttctattgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagtt 317  T
Q  400 gtaa 403  Q
    ||||    
T  316 gtaa 313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 110952 - 110701
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110952 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 110853  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  110852 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatt 110753  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  110752 tgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 110701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 21546 - 21484
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  21546 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttcacctatgttgtgagttggtccttggggtag 21484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 124147 - 124185
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  124147 tatgagttcaattaaggtgtttaagaatatttaacccat 124185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 111 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 21355 - 21064
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21355 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgttaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 21256  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 310  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21255 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgat 21156  T
Q  311 acttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt 401  Q
     ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21155 gcttctcagtaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctatttttgttgctgttgaatattaatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt 21064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 9543 - 9791
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9543 tatgagtacaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 9642  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9643 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattgtatggattatataagatgtttaag-tgatgttgattatcatt 9741  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||| ||||||    
T  9742 tgatattgttatatcttgagatgtctatgtgctgcctatgttgttgttgt 9791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 403
Target Start/End: Original strand, 169590 - 169974
Alignment:
Q  20 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 119  Q
    ||||||| ||||||||| || || | |||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||| || |  ||||| |  || |  | | ||||||||||||    
T  169590 tttaagaatatttaacctatattataagttgatccttgggataggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtaaagctgttataatatgatt 169689  T
Q  120 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttga 219  Q
    | || ||  || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  169690 taatatttataataatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 169789  T
Q  220 gatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatat 319  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    ||    
T  169790 gatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcat 169889  T
Q  320 taatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  169890 taatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttactgttacatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 169974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 111 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 142771 - 142631
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  142771 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 142672  T
Q  210 tatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  142671 tatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 142631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 38 - 403
Target Start/End: Original strand, 24456 - 24820
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  || |  ||||| |  |  |  | | ||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  24456 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctgcaaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgt 24555  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 237  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  24556 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgaaatgtttaagtgttgcct 24655  T
Q  238 atgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtg 337  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||    
T  24656 atgttgatgttgatggttatgtgaaatatttatatgccttatctggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctt-tcattaatattgttatgttctg 24754  T
Q  338 aattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttgtctaagttgtaa 403  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24755 aattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttgtttaagttgtaa 24820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31315 - 31058
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatatt 207  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31315 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgtttattatcatttgatatt 31216  T
Q  208 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31215 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttagttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 31116  T
Q  308 gatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31115 gatgcttcacattaatattgttatgttttgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 31058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 108 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 39444 - 39205
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatatt 207  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39444 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatatt 39345  T
Q  208 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39344 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 39245  T
Q  308 gatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgt 347  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39244 gatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgt 39205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 38 - 436
Target Start/End: Original strand, 9943 - 10350
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  9943 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgt 10042  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 237  Q
     |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  10043 aatatatttgtatatacattctgtgaattatataagatgtttaagatgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcct 10142  T
Q  238 atgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtg 337  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||| ||||||| |||||    
T  10143 atgtttctgctattggttatgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaattttgttattttgtg 10242  T
Q  338 aattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaag 428  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  10243 aattgcttgtactgtttttgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgcaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaag 10342  T
Q  429 tattggag 436  Q
    ||||||||    
T  10343 tattggag 10350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 60 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 36420 - 36230
Alignment:
Q  60 gtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattat 159  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36420 gtaggaatggaggttgattataatactattgatgttcagtgagtctaatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattat 36321  T
Q  160 gtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  36320 gtggattatataagatgtttaagttgtcgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgttgttgt 36230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 234 - 325
Target Start/End: Original strand, 15469 - 15560
Alignment:
Q  234 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatat 325  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  15469 gcctatgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcgcattaatat 15560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 4)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 133215 - 132989
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    ||||||||||||||||   |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  133215 tatgagttcaattaagaggtttaagtgtatttaactcatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattataatactattgatgttgagtg 133116  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  133115 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaataagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 133016  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgttta 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  133015 tgatattgttatatcttgaaatgttta 132989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 133751 - 133892
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  133751 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 133850  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatat 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  133851 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatat 133892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29390 - 29285
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||         |||||||||||||||||||||||||    
T  29390 aatatgatttactgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaagtatttaagatg---------atgttgattatcatttgatattgtt 29300  T
Q  211 atatcttgagatgtt 225  Q
    ||||||||| |||||    
T  29299 atatcttgatatgtt 29285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 21894 - 21847
Alignment:
Q  357 gttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21894 gttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 21847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 38 - 403
Target Start/End: Original strand, 3186 - 3552
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  || |  ||||| |  ||||  | | |||||||| |||| |||||| ||||||||     
T  3186 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatattactgatgatctgtgaagctgttataatatcatttaatgttgatagtaatgt 3285  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 237  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||  | |||| |||| |||  ||||    
T  3286 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttaatgttgattatcatttaatgttgttatataataagatatttaagtgctgcct 3385  T
Q  238 atgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||    
T  3386 atgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgaattatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtg 3485  T
Q  338 aattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3486 aattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcagatgttggtctaagttgtaa 3552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Original strand, 20139 - 20396
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatatt 207  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20139 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttttatatgcactatgtgaattatatataatgtttaagttgttgttgattagcatttgatatt 20238  T
Q  208 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 307  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20239 gttaaatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 20338  T
Q  308 gatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20339 gatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 20396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 38 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17764 - 17552
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||     
T  17764 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattatagtaatgttgatgttcagtgagactgatataatatgatttgaagttgttggtaatgt 17665  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 237  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||    
T  17664 gatatagttgtatatgccttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtactgcct 17565  T
Q  238 atgttgctgttgt 250  Q
    | |||||||||||    
T  17564 aagttgctgttgt 17552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 67553 - 67161
Alignment:
Q  7 ttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcag 106  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||| || |  | ||| |  ||||    |    
T  67553 ttcaattaaggtgtttaagaatatttaacctatgttaagagttgatcattggggtaggaatggatgttgaatataatattacttatgatctgtgaagttg 67454  T
Q  107 atataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatat 206  Q
     ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  67453 ttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttttatatgcattatgtgaattgtataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 67354  T
Q  207 tgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgt 306  Q
    |||||||||||| | ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  67353 tgttatatcttg-ggtgtttacgtgctgcttatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgaataatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgt 67255  T
Q  307 tgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagtt 399  Q
    |||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  67254 tgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatccagttgcaggtgttggtctaagtt 67161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 2314 - 2493
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2314 tatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 2413  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttta 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2414 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttta 2493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 166 - 403
Target Start/End: Original strand, 53825 - 54063
Alignment:
Q  166 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaata 265  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53825 tatatatgatgtttaagtagatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaata 53924  T
Q  266 tttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  53925 tttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgtt 54024  T
Q  366 gaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54025 gcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 54063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Original strand, 128904 - 129005
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttata 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  128904 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttata 129003  T
Q  214 tc 215  Q
    ||    
T  129004 tc 129005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 78510 - 78409
Alignment:
Q  112 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||| | |||| || || || ||||||||  || ||||||||||||    
T  78510 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgatg-ttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgtta 78413  T
Q  212 tatc 215  Q
    ||||    
T  78412 tatc 78409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 105377 - 105078
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  || |  ||||| |   ||    
T  105377 tatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttggggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctatg 105279  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |  | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  105278 aagctg-tataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattttttgaattatataagatgtttaatttgatgttaattatcatt 105180  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  105179 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgtcggttatgcgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttta 105080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 162749 - 162682
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  162749 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaattcatgttgtgagttgaactttgggatagcaatg 162682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 418 - 234
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  418 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatg 319  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  318 tgaaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 11584 - 11768
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11584 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatg 11683  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11684 tgaaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 11768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 36169 - 36353
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36169 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatg 36268  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36269 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 36353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 189460 - 189644
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  189460 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatg 189559  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  189560 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 189644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 44 - 248
Target Start/End: Original strand, 221072 - 221275
Alignment:
Q  44 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 143  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  221072 tgagttgacccttcgggtaggaatagaggttgattatagtagtgttgatgttcagtgagtctgatataatttgatttgatgttgttagtaatgtgatata 221171  T
Q  144 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttg 243  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |    
T  221172 gttgtatatgcattatgtggattatataaga-ctttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgtag 221270  T
Q  244 ctgtt 248  Q
    |||||    
T  221271 ctgtt 221275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 225593 - 225492
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttat 212  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||  || |||||||| | |||||| || || ||||||||  ||||||||||| ||||    
T  225593 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatt-gcatttgatattattat 225495  T
Q  213 atc 215  Q
    |||    
T  225494 atc 225492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 108 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17765 - 17563
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatatt 207  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17765 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgaattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatatt 17666  T
Q  208 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17665 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 17566  T
Q  308 gat 310  Q
    |||    
T  17565 gat 17563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 32743 - 32927
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32743 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatg 32842  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32843 tgaaagatgtatgatgtttaaattgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 32927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 170 - 403
Target Start/End: Original strand, 6932 - 7166
Alignment:
Q  170 taagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatattta 269  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6932 taagttgtttaagttgatgttgattatcatttaatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgactatgttgctgttgttggttatgtgaaatatgta 7031  T
Q  270 tatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaat 369  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||    
T  7032 tatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtttgtactgtttctgttgctgttgcat 7131  T
Q  370 attgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7132 attgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 7166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 139 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 7995 - 7731
Alignment:
Q  139 atatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt-aagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 237  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  7995 atatatttgtgtatggattatgtgaattatataagatgttttaagttgatgttgcttattatttgatattgttatatct-gagatgtttatgtgttgcct 7897  T
Q  238 atgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtg 337  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||  ||||||||||  ||||||||    
T  7896 atgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgaagtt-aagtggttgatgcttctcattaatattgacatgttgtg 7798  T
Q  338 aattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg-tctaagttgtaa 403  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7797 aattgtttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttgctctaaattgtaa 7731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 38 - 250
Target Start/End: Original strand, 18026 - 18238
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  18026 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatattgttagtaatgt 18125  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 237  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||    
T  18126 gatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgtttattatcatttgatattgttatatcttgagatatttatgtgctgcct 18225  T
Q  238 atgttgctgttgt 250  Q
    |||||| ||||||    
T  18226 atgttgttgttgt 18238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 4)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 44 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 793 - 384
Alignment:
Q  44 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 143  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  793 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgatgttgttaataatgtgatata 694  T
Q  144 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt-acgtgtcgcctatgtt 242  Q
      |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || | ||||||  | ||||||||||||||||| |||  ||||| | || | | |||||||    
T  693 aatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgtattgtctatgtt 595  T
Q  243 gctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattg 342  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  594 gttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtacgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 495  T
Q  343 cttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattg 433  Q
     ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||    
T  494 tttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagctgtaaagttgtaagttgtctttcaaaagtgttccaaactattg 395  T
Q  434 gagtcttaagt 444  Q
    |||||||||||    
T  394 gagtcttaagt 384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 6490 - 6331
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| || |||| |||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||  |||    
T  6490 tatgagttcaattagggtgtttaagagtgtttaacctatgttatgagtagatccttagggtagaaatgcaagttgattataatactgttgatgttcggtg 6391  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtg 162  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6390 agtctgatat-atatgatttggtgttgttaataatgtgatata-ttgtatatgcattatgtg 6331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25367 - 25182
Alignment:
Q  39 tgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgag 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||| | ||||||||||||| | ||||| |    
T  25367 tgttgtgagttgatccttggggtagaaatgaaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataagacgatttgatgttgtaa-taatgtg 25269  T
Q  139 atatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 226  Q
    |||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||||| || || ||||||||  || ||||||| |||||||| |||| |||||    
T  25268 atatatttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatatcgttatatcatgagctgttt 25182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 16403 - 16358
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16403 tatgagttcaattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 16358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 14170 - 14354
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14170 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgtttacgtgtcgcctatgttcctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatg 14269  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14270 tggaagatatatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 14354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 166 - 403
Target Start/End: Original strand, 1279 - 1517
Alignment:
Q  166 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaata 265  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1279 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctggctatgttgttgttgttggctatgtgaaata 1378  T
Q  266 tttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  1379 tttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttttgttgctgtt 1478  T
Q  366 gaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1479 gcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 1517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 460 - 395
Alignment:
Q  3 tgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  460 tgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttttgattcgacccttggggtaggaatg 395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 181 - 366
Target Start/End: Original strand, 36025 - 36208
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36025 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatg 36124  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttg 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||    
T  36125 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgcatgtgctgtt--tgttgctgttg 36208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 2801 - 2737
Alignment:
Q  4 gagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  2801 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatg 2737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 107 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 85739 - 85441
Alignment:
Q  107 atataatatgatttga-tgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgata 205  Q
    |||||||||||||| | ||| | || ||||| |||||| | ||||| ||||||  || |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||     
T  85739 atataatatgattttaatgtcgatattaatgtgatataatcgtatacgcattacatgaattatatatgatgcttaagttgatgttgattattatttgatg 85640  T
Q  206 ttgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttg 305  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  85639 ttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcagatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttg 85540  T
Q  306 ttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    ||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  85539 ttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcaggtgttggtctaagttgtaa 85441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 166 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 693 - 468
Alignment:
Q  166 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaata 265  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  693 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctttctatgttgttgttgttggttatgtgaaata 594  T
Q  266 tttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  593 tttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattattatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgtt 494  T
Q  366 gaatattgatcaagttgcaggtgttg 391  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  493 gcatattgatcaagttgcaggtgttg 468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 80738 - 80554
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80738 agttgttgttgattatcatttaatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 80639  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  80638 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgattgtgctatttctgttgctgtt 80554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Original strand, 65611 - 65773
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65611 agttgttgttgattatcgtttgatattgttatatcctgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 65710  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  65711 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 65773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Original strand, 61695 - 61857
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  61695 agttgttgttgattatcattagatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgaatatgtgaaatatttatatgccttatg 61794  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  61795 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 61857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 207591 - 207769
Alignment:
Q  187 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  207591 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgtcgcctatgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 207690  T
Q  287 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  207691 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatcttgtgaattgcttgtgctgtttttgttgctgtt 207769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 902 - 697
Alignment:
Q  44 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 143  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  902 tgagatgacccttggggtagga-tggaggttgattataatactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatata 804  T
Q  144 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttg 243  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  803 gttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttcatgatgtgatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttg 704  T
Q  244 ctgttgt 250  Q
    |||||||    
T  703 ctgttgt 697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Original strand, 60643 - 60761
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatat 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| | |||||| || || ||||||||  || |||||||    
T  60643 tataaaatgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatat 60741  T
Q  207 tgttatatcttgagatgttt 226  Q
    || |||||| |||| |||||    
T  60742 tggtatatcatgagctgttt 60761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 111 - 310
Target Start/End: Original strand, 6091 - 6290
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  6091 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgtt 6190  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 310  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  6191 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatggcttatgtggaaaatatacgatgtttaagttgttgat 6290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 166 - 403
Target Start/End: Original strand, 6889 - 7127
Alignment:
Q  166 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaata 265  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  6889 tatatatgatgtttaagttgatgttgagtatcatttaatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttactgttgttggttatgtgaaatt 6988  T
Q  266 tttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||| ||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  6989 tttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatactgttacgatgtgtattgcttgtactgtttctgttgctgtt 7088  T
Q  366 gaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7089 gcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 7127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Original strand, 58802 - 58964
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58802 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 58901  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  58902 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 58964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 4)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 38 - 227
Target Start/End: Original strand, 55543 - 55733
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||     
T  55543 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcagtgagtctaatataatatgatttgaggttgttagtaatgt 55642  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 227  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55643 gatatatttgcatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttta 55733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 23034 - 22967
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  23034 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatg 22967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 17844 - 17882
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  17844 tatgagttcaattaaggtgtttaagaatatttaacccat 17882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 23477 - 23515
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23477 tatgagttcaattaaggtgtttaagaatatttaacccat 23515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 217 - 444
Target Start/End: Original strand, 2751 - 2987
Alignment:
Q  217 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttca 316  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||      
T  2751 tgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgctttt 2850  T
Q  317 tattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttg 407  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||||||||    
T  2851 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctcttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttg 2950  T
Q  408 tcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 444  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  2951 tctttccaaagtgttccaaagtattggattcttaagt 2987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 87 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 2107 - 1944
Alignment:
Q  87 gttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttga 186  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2107 gttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttga 2008  T
Q  187 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  2007 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 1944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Original strand, 5184 - 5346
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5184 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgatgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 5283  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5284 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 5346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12445 - 12283
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12445 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 12346  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12345 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 12283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 111 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 20939 - 20769
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20939 aatatgatttgatgttaatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 20840  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgt 281  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20839 atatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgt 20769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 328 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 20774 - 20652
Alignment:
Q  328 ttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaag 418  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||| ||||    
T  20774 ttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaag 20675  T
Q  419 tattccaaagtattggagtctta 441  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20674 tattccaaagtattggagtctta 20652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 473 - 311
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  473 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 374  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    || ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  373 tgaaagatgtttgatgtttaagttattgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 181 - 342
Target Start/End: Original strand, 3958 - 4119
Alignment:
Q  181 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3958 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 4057  T
Q  281 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattg 342  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  4058 tggaagatgtttaatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttatgaattg 4119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 250
Target Start/End: Original strand, 625 - 831
Alignment:
Q  44 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||| || | |||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  625 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatattattgatgttcagtaagcctgatataatgtgatctgatgttgatagtaatgtgatata 724  T
Q  144 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttg 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  725 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcttttgatattgttatatcttgagatgtttatatgctgcctatgttg 824  T
Q  244 ctgttgt 250  Q
     ||||||    
T  825 ttgttgt 831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 38 - 250
Target Start/End: Original strand, 29282 - 29494
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  29282 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtattgttaatgttaagtgagtctaatatgatatgatttgaggttgttagtaatgt 29381  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcc 236  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||    
T  29382 gatatatttgcatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagaagtttatgtgctgcc 29481  T
Q  237 tatgttgctgttgt 250  Q
     |||||||||||||    
T  29482 -atgttgctgttgt 29494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 187 - 327
Target Start/End: Original strand, 80424 - 80564
Alignment:
Q  187 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  80424 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatatgaaatatttatatgccttatgtggaag 80523  T
Q  287 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  80524 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattg 80564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 82451 - 82235
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||| || |  ||||| |  |||    
T  82451 tatgagttcaattaaggtgtt-aagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggttggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtg 82353  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcat----tatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattat 196  Q
    |  |   | ||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82352 aagctattgtaatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattat 82253  T
Q  197 catttgatattgttatat 214  Q
     ||||||| |||||||||    
T  82252 gatttgatgttgttatat 82235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 318 - 365
Target Start/End: Original strand, 80574 - 80621
Alignment:
Q  318 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  80574 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 80621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4071 - 3917
Alignment:
Q  97 agtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg-tttaagttgatgttgatta 195  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4071 agtgagtcatatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgatgttgatta 3972  T
Q  196 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  3971 tcatttggtaatgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 3917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 38 - 248
Target Start/End: Original strand, 75687 - 75897
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | || || |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||     
T  75687 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttggttataatactgttgttatttagagagtctaatacaagatgatttgatgttgttagtaatgt 75786  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 237  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  75787 gataaaattgtatttgcattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcct 75886  T
Q  238 atgttgctgtt 248  Q
    | |||||||||    
T  75887 acgttgctgtt 75897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 65567 - 65608
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 42  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  65567 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 65608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 343
Target Start/End: Original strand, 67397 - 67546
Alignment:
Q  193 ttatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  67397 ttatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgt-aaatatttatatgccttatgtggaagatgttt 67495  T
Q  293 gatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  67496 gatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 67546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 15173 - 15218
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15173 tatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 15218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 24231 - 24276
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24231 tatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 24276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 234 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 71367 - 71236
Alignment:
Q  234 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  71367 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 71268  T
Q  334 tgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  71267 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 71236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 138240 - 138173
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  138240 tatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatg 138173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 166 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 15131 - 14906
Alignment:
Q  166 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaata 265  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15131 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacatgtggcctatgttggtgttgttggttatgtgaaata 15032  T
Q  266 tttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    ||||||||| ||||| | || |||||||||||| ||||||| ||  ||    || ||||||| |||| ||  |||||||||   ||||||||||||||||    
T  15031 tttatatgcgttatgggaaaaatgtatgatgttaaagttgtagacgctctccataaatattgatatgatgaaaattgcttgcactgtttctgttgctgtt 14932  T
Q  366 gaatattgatcaagttgcaggtgttg 391  Q
    | ||||||||||||| ||| ||||||    
T  14931 gcatattgatcaagtcgcacgtgttg 14906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 4374 - 4215
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  4374 tgttgttggttatatgaaattattatatgtcttatgtggaaaatgtctgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 4275  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4274 tgtgttgtttctgttgctgttgcatattgatcaaattgcaggtgttggtctaagttgtaa 4215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 4495 - 4433
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  4495 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 4433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 33261 - 33074
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  33261 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgcttttaattaatattgttatgttgagaattgct 33162  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33161 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 33074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 226
Target Start/End: Original strand, 18170 - 18284
Alignment:
Q  112 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 211  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || ||||||||  ||||||||||||| |    
T  18170 atatgttttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtca 18269  T
Q  212 tatcttgagatgttt 226  Q
    |||| |||| |||||    
T  18270 tatcatgagctgttt 18284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 33383 - 33334
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 50  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33383 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 33334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 241 - 384
Target Start/End: Original strand, 1227 - 1370
Alignment:
Q  241 ttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaat 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||| |||||||||    
T  1227 ttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatgcttttcattaatattgttaagttgtgaat 1326  T
Q  341 tgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgca 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1327 tgcttgtgttgtttctgttgctgttcaatattgatcaagttgca 1370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 241 - 384
Target Start/End: Original strand, 7978 - 8121
Alignment:
Q  241 ttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaat 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||| |||||||||    
T  7978 ttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatgcttttcattaatattgttaagttgtgaat 8077  T
Q  341 tgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgca 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8078 tgcttgtgttgtttctgttgctgttcaatattgatcaagttgca 8121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 25981 - 25936
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25981 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 25936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 481 - 269
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  |||    
T  481 tatgagttcaattaaggtgtt-aagagtatttaacccatgttgtgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtg 383  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |  |   ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  382 aagcttttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagctgatgttgattatgatt 283  T
Q  201 tgatattgttatat 214  Q
    |||| |||||||||    
T  282 tgatgttgttatat 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12434 - 12221
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || |  ||||| |  |||    
T  12434 tatgagttcaattaatgtgtttaagagtatttaacccattttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtg 12335  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    | ||   ||||||||| ||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  12334 aatctattataatatggtttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttcaagttgatgttgattatgatt 12235  T
Q  201 tgatattgttatat 214  Q
    |||| |||||||||    
T  12234 tgatgttgttatat 12221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5802 - 5615
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5802 tgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatatagttatgttgtgaattgct 5703  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5702 tgtgatgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 5615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 5918 - 5861
Alignment:
Q  6 gttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  5918 gttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgtgagttggtccttggggtag 5861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 226
Target Start/End: Original strand, 19505 - 19693
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| || |||||     
T  19505 atgttatgagttaatcattggggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcagtgagtctgatattatgtgatttgatgttgataataatgt 19604  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataaga-tgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  19605 gatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagattttttaagttgatgttgattattgtttgacattgttatat-ttgagatgttt 19693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 166 - 251
Target Start/End: Original strand, 15225 - 15310
Alignment:
Q  166 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgtt 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  15225 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctattgtt 15310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 21198 - 21153
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21198 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 21153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 111 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 1128 - 988
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |    
T  1128 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattct 1029  T
Q  210 tatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  1028 tatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgctgttgt 988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 4374 - 4215
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  4374 tgttgttggttatatgaaattattatatgtcttatgtggaaaatgtctgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 4275  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4274 tgtgttgtttctgttgctgttgcatattgatcaaattgcaggtgttggtctaagttgtaa 4215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 4495 - 4433
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  4495 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 4433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 111 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8220 - 8082
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8220 aatatgatttgatgtcattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgtt 8121  T
Q  211 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttg 249  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  8120 atatcttgagatgtttatgtgttgcatatgttgctgttg 8082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 8092 - 8028
Alignment:
Q  356 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagt 419  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  8092 tgttgctgttgcatattgataaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagt 8028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 245 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10564 - 10378
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  10564 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttta-gtttttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 10466  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10465 tgtgctatttctgttgctgttgaatattcatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 10378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 10685 - 10636
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttg 50  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10685 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 10636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 245 - 422
Target Start/End: Original strand, 22477 - 22664
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| |    
T  22477 tgttgttgattatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtt 22576  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22577 tgtgctgtttttgttgctgttgaatatttatcaagttgcagatgtttgtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 22664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 219
Target Start/End: Original strand, 16861 - 16957
Alignment:
Q  122 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttga 219  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16861 atgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgttcaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttatatcttga 16957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Original strand, 26016 - 26117
Alignment:
Q  117 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatct 216  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  26016 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgttcaagttgttgttgattgtc-cttgatattgttatatct 26114  T
Q  217 tga 219  Q
    |||    
T  26115 tga 26117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 22356 - 22418
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  22356 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 22418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 166 - 293
Target Start/End: Original strand, 4256 - 4383
Alignment:
Q  166 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaata 265  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4256 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgatatgtttacgtgttgcctattttgctgttgttggttatgtgaaata 4355  T
Q  266 tttatatgccttatgtggaagatgtatg 293  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  4356 tttatatacgttatgtggaaaatgtatg 4383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 278 - 403
Target Start/End: Original strand, 6851 - 6977
Alignment:
Q  278 atgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatca 377  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6851 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgatgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatca 6950  T
Q  378 agttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6951 agttgcaggtgttggtctaagttgtaa 6977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11407 - 11196
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatag-tactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatg 136  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |||| || ||||| || |||| | ||||  ||||| |||||||||    
T  11407 atgttatgagctgatccttggggtaggaatgaaggttggttataaatactgttgttgttcagagagtctgaaataagaagatta-atgttattagtaatg 11309  T
Q  137 agatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcc 236  Q
     |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||    
T  11308 tgatatagttgtatatgcattatttggattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgctgcc 11210  T
Q  237 tatgttgctgttgt 250  Q
    | ||||||||||||    
T  11209 tgtgttgctgttgt 11196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22507 - 22296
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatag-tactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatg 136  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |||| || ||||| || |||| | ||||  ||||| |||||||||    
T  22507 atgttatgagctgatccttggggtaggaatgaaggttggttataaatactgttgttgttcagagagtctgaaataagaagatta-atgttattagtaatg 22409  T
Q  137 agatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcc 236  Q
     |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||    
T  22408 tgatatagttgtatatgcattatatggattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgctgcc 22310  T
Q  237 tatgttgctgttgt 250  Q
    | ||||||||||||    
T  22309 tgtgttgctgttgt 22296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 111 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3146 - 3006
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  3146 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 3047  T
Q  210 tatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    |||||||||||||||||| |||   ||||||||| ||||||    
T  3046 tatatcttgagatgtttatgtgctacctatgttgttgttgt 3006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Original strand, 70536 - 70689
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 344  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| |    
T  70536 tgttcttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtt 70635  T
Q  345 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    |||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  70636 tgtgttgtttctgttgc------atattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 70689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 63
Target Start/End: Original strand, 70419 - 70477
Alignment:
Q  5 agttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
T  70419 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttggtccttggggtag 70477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 119 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10344 - 10213
Alignment:
Q  119 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttg 218  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10344 ttgatgttgttagtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgatgattattatttgatattgttacatcttg 10245  T
Q  219 agatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    ||||||||| |||  || ||||||||||||||    
T  10244 agatgtttatgtgctgcttatgttgctgttgt 10213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 293 - 444
Target Start/End: Original strand, 13490 - 13650
Alignment:
Q  293 gatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-g 391  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  13490 gatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctattgaatattgatcaagttgcatgtgttgg 13589  T
Q  392 tct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 444  Q
    |||        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13590 tctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggagtctaaagt 13650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 185
Target Start/End: Original strand, 13430 - 13502
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttg 185  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13430 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtat--gcattatctgaattatataagatgtttaagttg 13502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 111 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 7619 - 7481
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  7619 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 7520  T
Q  210 tatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    ||||||||  |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  7519 tatatctt--gatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 7481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 111 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14738 - 14600
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  14738 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 14639  T
Q  210 tatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    ||||||||  |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  14638 tatatctt--gatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 14600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 13123 - 13168
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13123 tatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 19390 - 19435
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19390 tatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 19435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 283 - 101
Alignment:
Q  39 tgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgag 138  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  || |||| ||||| |||| ||| |||| ||| || | ||||||  ||||||||||||||||| ||||| |    
T  283 tgttgtgagtcgatccttggggtaggaaatgaagttgtttatattactattgttgttcagtaagcctgatatag-atgatttgatgttgttaataatgtg 185  T
Q  139 atatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagat 222  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  184 atataattgtatatgcattatgtgaattttatatgatgtttaagttgatgatgtttatcatttgatattgttatatcttgagat 101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 41 - 1
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgc 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  41 atgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 257 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 57011 - 56842
Alignment:
Q  257 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct--tgtgttgttt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| |||   ||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||    
T  57011 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgtcgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgtttatgtgttgttt 56912  T
Q  355 -ctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  56911 cctgttgctgttgaatattaatcaagttgcaagtgttggtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 56842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29197 - 28978
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||| | | ||||||||||||||||    
T  29197 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaagccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtttattaaaatgctgttgatgttgagtg 29098  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |||| |||| || |||  |||| ||||||| |  |  | || ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||||    
T  29097 agtctgataaaagatg-gttgaggttgttaatgttacggtaaatttgcaaatgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgactatcatt 29000  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagat 222  Q
    || |||||| |||| |||||||    
T  28999 tggtattgtcatattttgagat 28978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34662 - 34443
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||| | | ||||||||||||||||    
T  34662 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaagccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtttattaaaatgctgttgatgttgagtg 34563  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |||| |||| || |||  |||| ||||||| |  |  | || ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||||    
T  34562 agtctgataaaagatg-gttgaggttgttaatgttacggtaaatttgcaaatgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgactatcatt 34465  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagat 222  Q
    || |||||| |||| |||||||    
T  34464 tggtattgtcatattttgagat 34443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 22378 - 22423
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22378 tatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 22423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 114 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30518 - 30381
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  30518 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgcttaagttgttgattgattattatttgacattgttat 30419  T
Q  213 atcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
     |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  30418 gtcttgagatgtttatgtgatgcctatgttgctgttgt 30381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 259 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 7711 - 7544
Alignment:
Q  259 tgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct--tgtgttgttt-c 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||   ||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |    
T  7711 tgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgcttatgtgttgtttcc 7612  T
Q  356 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  7611 tattgctgttgaatattaatcaagttgcaagtgttggtctgagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 7544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1960 - 1785
Alignment:
Q  44 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttg-agtgagtcagat-ataatatgatttgatgttgttagtaatgagata 141  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||  |||||  || ||||| ||| |||||||  ||||||||||||| | ||| ||||    
T  1960 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattttaatgctgtaaatgtttcagagagtctgattataatatagtttgatgttgttaatgatgtgata 1861  T
Q  142 tatttgtatatgcattatgtggattat-ataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatct 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1860 tatttgtatatgcattatgtgaattattataaggagtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatct 1785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 111 - 227
Target Start/End: Original strand, 2602 - 2719
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || |     
T  2602 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacatgga 2701  T
Q  210 tatatcttgagatgttta 227  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2702 tatatcttgagatgttta 2719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 220
Target Start/End: Original strand, 7991 - 8100
Alignment:
Q  112 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||| || ||||| |||||  || |||||||| | ||||||||| || |||||| | |||||||||||| ||    
T  7991 atatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattatt 8090  T
Q  211 atatcttgag 220  Q
    ||||| ||||    
T  8091 atatcatgag 8100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 111 - 250
Target Start/End: Original strand, 7420 - 7560
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgt 209  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||     
T  7420 aatatgattatatgctgttagtaatgtgatatatttgtgtatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattga 7519  T
Q  210 tatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  7520 tatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 7560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 111 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6800 - 6684
Alignment:
Q  111 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 210  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6800 aatatgatttgaggttgatggtaatgtaatatatttgtatatgtagtatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 6701  T
Q  211 atatcttgagatgttta 227  Q
    |||||||||||||||||    
T  6700 atatcttgagatgttta 6684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3857 - 3687
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||  |||| || | ||||| ||||||| |||||| ||||||||     
T  3857 atgttatgagttgatccttgaggtaggaatggaggttgattataatattactgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttgatagtaatgt 3758  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgt 209  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||    
T  3757 aatatatttgtatatgtattatgtggattatataagatgtttaagtgaatgttgatt-tcctttgatattgt 3687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 251
Target Start/End: Original strand, 206383 - 206596
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||| ||| |||||| |||||||  ||||||||||||| || |  |||||||   ||| |  | ||||| ||||||| || ||||||||||||     
T  206383 atgttatgaggtgatccttggtgtaggaacagaggttgattataatattactgatgttctatgaatatgttataacatgatttaatattgttagtaatgt 206482  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt-acgtgtcgcc 236  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||    
T  206483 aatatatttgtatatgcattatgtggattatacaagatgattaagt-gttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttttatgtactgcc 206581  T
Q  237 tatgttgctgttgtt 251  Q
    |||||||||||||||    
T  206582 tatgttgctgttgtt 206596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 126945 - 126896
Alignment:
Q  374 atcaagttgcaggtgttg-tctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  126945 atcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagtatt 126896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 231
Target Start/End: Original strand, 15030 - 15117
Alignment:
Q  144 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtg 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15030 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 15117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22540 - 22361
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  || |  |||||||  |||| || | | |||| |||||| |||||| ||||||||     
T  22540 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttgatagtaatgt 22441  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatct 216  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  22440 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct 22361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 78529 - 78484
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  78529 tatgagttcaactaaggtgttaaagagtatttaacctatgttgtga 78484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Original strand, 13979 - 14158
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  || |  |||||||  |||| || | | |||| |||||| |||||| ||||||||     
T  13979 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttgatagtaatgt 14078  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatct 216  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  14079 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct 14158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 257 - 422
Target Start/End: Original strand, 166426 - 166595
Alignment:
Q  257 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct--tgtgttgttt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||   ||| ||||||||||| |||||||||||  |||| | |||    
T  166426 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaatatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgcttatgtgctattt 166525  T
Q  355 -ctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
     |||||| |||||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  166526 cctgttgttgttgaatattagtcaagctgcaagtgttggtctaagttgtaacttgtcgttccaaagtatt 166595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 267849 - 267747
Alignment:
Q  112 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 211  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| |||||| | | |  ||||||||  |||||||||||||||    
T  267849 atatgatttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttga-gatattgttgatttgcatttgatattgtta 267751  T
Q  212 tatc 215  Q
    ||||    
T  267750 tatc 267747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 187092 - 187137
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  187092 tatgagttcaattagggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtga 187137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Original strand, 1314 - 1475
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttata--tgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattg 342  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||  ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | |  ||    |||||||||||||| |||||||||    
T  1314 tgttgttggtaatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattg 1413  T
Q  343 cttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1414 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaagtgttggtctaagttgtaa 1475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 1054 - 1099
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1054 tatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 1099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 257 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 15625 - 15470
Alignment:
Q  257 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgt--tgttt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||   ||| ||||||||||| |||||||||||| |||  |||||    
T  15625 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgatgtgaattgcttatgtgctgttt 15526  T
Q  355 c-tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgt 408  Q
    | |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15525 cctaatgttgttgaatattaatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgt 15470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 11)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 152797 - 153018
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||  ||||| |||| | ||||||||||||| ||||    
T  152797 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtaagttgatccttgggttaggaatcaaggtttattaaaatactgttgatgtttagtg 152896  T
Q  101 agtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    |||| |||| || || | |||| | ||||| |  |  | || ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||||    
T  152897 agtctgataaaagat-agttgaggatgttaatgttatggtaaatttgcaaatgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgagtatcatt 152994  T
Q  201 tgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    ||  ||||| |||| |||||||||    
T  152995 tggcattgtcatattttgagatgt 153018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 163004 - 163143
Alignment:
Q  83 tactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag 182  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||||| || |  | || ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  163004 tactgttgatgttcagtgagtctgatataagatggtt-gatgttgttaatattatggtaaatttgaaaatgcattatgtggattatgtatgatgtttaag 163102  T
Q  183 ttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    | | ||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  163103 tag-tgtagattatcatttggtattgtcatattttgagatgt 163143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 176136 - 176078
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 303  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  176136 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 176078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 168782 - 168724
Alignment:
Q  245 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 303  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  168782 tgttgttgcttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 168724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 77151 - 77102
Alignment:
Q  2 atgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  77151 atgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttga 77102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 176252 - 176195
Alignment:
Q  6 gttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||    
T  176252 gttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtag 176195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 446671 - 446608
Alignment:
Q  122 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttg 185  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||    
T  446671 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttg 446608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 497588 - 497538
Alignment:
Q  257 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 307  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  497588 tgtgaaatatttatataacttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgtt 497538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 168899 - 168846
Alignment:
Q  6 gttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggg 59  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||    
T  168899 gttcaattaaggagtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggg 168846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 168759 - 168684
Alignment:
Q  148 tatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    ||||||| |||||||||  || || ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||    
T  168759 tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 168684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 176113 - 176038
Alignment:
Q  148 tatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    ||||||| |||||||||  || || ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||    
T  176113 tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 176038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10666 - 10524
Alignment:
Q  108 tataatatgatttga-tgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatat 206  Q
    ||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10666 tataatatgattttaatgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 10567  T
Q  207 tgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttg 249  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  10566 tgttacatctagagatgtttatgtgttgcctatgttgttgttg 10524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 356 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10534 - 10467
Alignment:
Q  356 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 422  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10534 tgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagtatt 10467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 219 - 123
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat 204  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  219 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttgattatgatttgat 123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9051 - 8967
Alignment:
Q  257 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaatt 341  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||  || |||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  9051 tgtgaaatatttatataccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgtgaattcttatcattgatattgttatgttgtgaatt 8967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 287 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 6932 - 6854
Alignment:
Q  287 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6932 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 6854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 207
Target Start/End: Original strand, 2285 - 2454
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||||   ||||  | | ||||||||||||| |||||| |||||||      
T  2285 atgttatgagttggtccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgtcctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaattt 2384  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatatt 207  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||    
T  2385 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttgtagttgattatcgcttgatatt 2454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 250
Target Start/End: Original strand, 4555 - 4767
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 137  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | || |  ||||| |  ||||    | ||||||||||||| ||| || ||||||||     
T  4555 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatacaatattactgatgatctgtgaagttgttataatatgatttaatgatgatagtaatgt 4654  T
Q  138 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 237  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| | |||| |  |    
T  4655 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatttgaaatgtttaagttgttgatgattatcatatgatattattatatctggatatgttaatgtgttgtat 4754  T
Q  238 atgttgctgttgt 250  Q
    |||||| ||||||    
T  4755 atgttgttgttgt 4767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 318 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 78385 - 78299
Alignment:
Q  318 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 403  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  78385 attaatattgctatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 78299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 146366 - 146261
Alignment:
Q  119 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctt 217  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146366 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatctt 146268  T
Q  218 gagatgt 224  Q
    |||||||    
T  146267 gagatgt 146261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29851 - 29747
Alignment:
Q  122 atgttgttagtaatgagatatattt-gtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgag 220  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| |||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  29851 atgttgatagtaatgtaatatattttgtatgtgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctggat 29752  T
Q  221 atgtt 225  Q
    |||||    
T  29751 atgtt 29747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0790 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0790
Description:

Target: scaffold0790; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6210 - 6116
Alignment:
Q  125 ttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttga 219  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  6210 ttgttaataatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattttatatgatgtttaagttgaggatgtttatcatttgatattgttatatcttga 6116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Original strand, 589 - 699
Alignment:
Q  108 tataatatgatttga-tgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatat 206  Q
    ||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  589 tataatatgattttaatgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 688  T
Q  207 tgttatatctt 217  Q
    |||||||||||    
T  689 tgttatatctt 699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 4)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3385 - 3307
Alignment:
Q  172 agatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 250  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  3385 agatgtttcagttgatgttgattgtcatttgatattgttatatcttgagatatttatgtgttgcctatgttgctgttgt 3307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 3438 - 3385
Alignment:
Q  38 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 91  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3438 atgttatgagttgatccttagggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 3385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 5882 - 5832
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5882 tatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgagttga 5832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 7368 - 7413
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  7368 tatgagttaaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 7413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 57999 - 57898
Alignment:
Q  117 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatct 216  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  57999 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatttaaaatgttcaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttatatct 57901  T
Q  217 tga 219  Q
    |||    
T  57900 tga 57898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48508 - 48403
Alignment:
Q  119 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctt 217  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48508 ttgatattgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatctt 48410  T
Q  218 gagatgt 224  Q
    |||||||    
T  48409 gagatgt 48403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 97193 - 97092
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttata 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  97193 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttata 97094  T
Q  214 tc 215  Q
    ||    
T  97093 tc 97092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 106471 - 106370
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttata 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  106471 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttata 106372  T
Q  214 tc 215  Q
    ||    
T  106371 tc 106370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 185 - 284
Target Start/End: Original strand, 36036 - 36135
Alignment:
Q  185 gatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 284  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||||||||||| |||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  36036 gatgttgattattttttgatgttcttatatcttgaggtgtttaagtgctgcatatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtgga 36135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 186 - 284
Target Start/End: Original strand, 10858 - 10956
Alignment:
Q  186 atgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 284  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  10858 atgttgagtattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgcttatattgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgcattatgtgga 10956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 112 - 226
Target Start/End: Original strand, 6215 - 6329
Alignment:
Q  112 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || ||||||||  ||||||||||||| |    
T  6215 atatgatttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtca 6314  T
Q  212 tatcttgagatgttt 226  Q
    |||| |||| |||||    
T  6315 tatcatgagctgttt 6329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 19231 - 19304
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  19231 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 19304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 332507 - 332391
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatat 206  Q
    |||| |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||| | ||| | |||||||    
T  332507 tatattatgattttatgttgaaagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattataaattatgtttaagttgatgttgaaatatta-ttgatat 332409  T
Q  207 tgttatatcttgagatgtt 225  Q
    || ||||||||||||||||    
T  332408 tg-tatatcttgagatgtt 332391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 11162 - 11100
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  11162 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 11100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 3529 - 3591
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3529 tatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgagttggcccttggggtag 3591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 399
Target Start/End: Original strand, 11613 - 11692
Alignment:
Q  323 tattgttatgttgtgaattgctt--gtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagtt 399  Q
    ||||| |||||||||| ||||||  ||| ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  11613 tattgatatgttgtgagttgcttacgtgctgcctctgttgttgttgaatattgattaagttgcaagtgttggtctaagtt 11692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 215
Target Start/End: Original strand, 16028 - 16136
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatat 206  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||| ||||||||||||||  || |||||||||| |||||| || || ||||||||  ||||||||||    
T  16028 tataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatat 16127  T
Q  207 tgttatatc 215  Q
    |||||||||    
T  16128 tgttatatc 16136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2799 - 2737
Alignment:
Q  164 attatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 226  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  2799 attatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttt 2737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13322 - 13213
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataaga--tgtttaagttgatgttgattatcatttgata 205  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||| ||||||||||||||  || |||||||| ||   |||| || || ||||||||  |||||||||    
T  13322 tataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgata 13223  T
Q  206 ttgttatatc 215  Q
    ||||||||||    
T  13222 ttgttatatc 13213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 1402 - 1468
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  1402 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatg 1468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 21720 - 21677
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgt 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21720 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgt 21677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 6264 - 6330
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttt-taagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaa 66  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6264 tatgagttcaattagggttttttaagagtatttaacttatgttgtgagtagacccttggggtaggaa 6330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Original strand, 1730 - 1832
Alignment:
Q  112 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 211  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  |  |||||||| |||| || || || ||||||||  |||||||||||||||    
T  1730 atatgatttgacgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacataaattatatatgatg-ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtta 1828  T
Q  212 tatc 215  Q
    ||||    
T  1829 tatc 1832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38506 - 38392
Alignment:
Q  112 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 211  Q
    ||||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || |||||| |  ||||||||||||| |    
T  38506 atatgatttgatgttgagattaatgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtca 38407  T
Q  212 tatcttgagatgttt 226  Q
    |||| |||| |||||    
T  38406 tatcatgagctgttt 38392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 6264 - 6191
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 75  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  6264 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtttttaatccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatggaagttg 6191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 395 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 3599 - 3550
Alignment:
Q  395 aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 444  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3599 aagttgtaagttgtcgttccaaagtattcgaaagtattggagtcttaagt 3550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 395 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 7663 - 7614
Alignment:
Q  395 aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 444  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7663 aagttgtaagttgtctttccaaagtattctaaagtattggagtcttaagt 7614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 215
Target Start/End: Original strand, 27677 - 27785
Alignment:
Q  108 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatat 206  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||| ||||||||||||||   | |||||||  | |||||| || || ||||||||  ||||||||||    
T  27677 tataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatat 27776  T
Q  207 tgttatatc 215  Q
    |||||||||    
T  27777 tgttatatc 27785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0635
Description:

Target: scaffold0635; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 7349 - 7299
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7349 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgatgtgagttga 7299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 8529 - 8479
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8529 tatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttga 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 3171 - 3121
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3171 tatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgcgagttga 3121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 13411 - 13361
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13411 tatgagttcaattaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttga 13361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 16229 - 16179
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16229 tatgagttcaatgaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttga 16179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 8522 - 8472
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8522 tatgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaatccatgttgtgagttga 8472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 12094 - 12156
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 63  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||   |||||||||||    
T  12094 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtaattaacctatgttgtgagtttgtccttggggtag 12156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 192 - 91
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttata 213  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || | ||||||  ||| |||||||||||||    
T  192 atgatttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgcatctgatattgttata 93  T
Q  214 tc 215  Q
    ||    
T  92 tc 91  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 1550 - 1505
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1550 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 1505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 224
Target Start/End: Original strand, 16541 - 16613
Alignment:
Q  151 atgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||    
T  16541 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 16613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Original strand, 12077 - 12213
Alignment:
Q  86 tgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttg 185  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||| || || | ||||| || |  |||| |||||   |||||||| ||||||||| || ||||||||||| |    
T  12077 tgttgatgttcagtgagtctgatataagatggtt-gagggtgttaatattatgataaatttgccaatgcattacgtggattatgtatgatgtttaagtag 12175  T
Q  186 atgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
     |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||    
T  12176 -tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 12213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Original strand, 15229 - 15365
Alignment:
Q  86 tgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttg 185  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||| || || | ||||| || |  |||| |||||   |||||||| ||||||||| || ||||||||||| |    
T  15229 tgttgatgttcagtgagtctgatataagatggtt-gagggtgttaatattatgataaatttgccaatgcattacgtggattatgtatgatgtttaagtag 15327  T
Q  186 atgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
     |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||    
T  15328 -tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 15365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 34730 - 34685
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34730 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 34685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 209073 - 209001
Alignment:
Q  151 atgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||    
T  209073 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 209001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 21106 - 21058
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagtt 49  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21106 tatgagttcaattaagggttttaagagcatttaacctatgttgtgagtt 21058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 2405 - 2362
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgt 44  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  2405 tatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgt 2362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 12799 - 12749
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  12799 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtattcaactcatgttgagagttga 12749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 8438 - 8376
Alignment:
Q  42 tgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtc 104  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||| ||||||||    
T  8438 tgtgagttgatccgtggggtaggaatggaggttgcttataatattgtcgatgttcagtgagtc 8376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1160
Description:

Target: scaffold1160; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 151 - 110
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 42  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  151 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 3108 - 3153
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3108 tatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 3153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 5182 - 5137
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5182 tatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 5137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 18240 - 18281
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 42  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18240 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 18281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 18630 - 18585
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  18630 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgtga 18585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 28955 - 29000
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28955 tatgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacctatgttgtga 29000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 24590 - 24631
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 42  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24590 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 24631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 56442 - 56401
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 42  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  56442 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 56401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 51423 - 51355
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatgga 70  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  51423 tatgagttaaaataaggtgtttaagagtatttaatcaatgttgtgagttga-tcttgggataggaatgga 51355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0672 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0672
Description:

Target: scaffold0672; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 8143 - 8186
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgt 44  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  8143 tatgagttcaattaaggtgtttatgattatttaacccatgttgt 8186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 36158 - 36224
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||| |||||||  |||||| ||||||||    
T  36158 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtattcgactcatgttgagagttga-tcttgggataggaatg 36224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 26391 - 26348
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgt 44  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  26391 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatacatgttgt 26348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 27773 - 27730
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgt 44  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  27773 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatacatgttgt 27730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 159537 - 159603
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatg 68  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||| ||||||||    
T  159537 tatgagttcaattaaggtgattaagagtattcaactcatgttgagagttga-tcttgggataggaatg 159603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 200
Target Start/End: Original strand, 14547 - 14633
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 200  Q
    ||||||| | |||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||| || ||||||||| ||||    
T  14547 atgatttaaagttgttggtaatgtgatataattatatatgcattatgtggaatatgtattatgttgaagctgttgttgattaccatt 14633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 18712 - 18758
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggt-ttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18712 tatgagttcaattaaggtgtttaaagagtatttaacctatgttgtga 18758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24358 - 24289
Alignment:
Q  154 cattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  24358 cattatgtggattatgtgtgatgtttaagtag-tgttgattgtcatttggtattgtcatattttgagatgt 24289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 35228 - 35159
Alignment:
Q  154 cattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 224  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  35228 cattatgtggattatgtgtgatgtttaagtag-tgttgattgtcatttggtattgtcatattttgagatgt 35159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 46
Target Start/End: Original strand, 36106 - 36148
Alignment:
Q  4 gagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  36106 gagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 36148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1662
Description:

Target: scaffold1662; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 8 - 53
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8 tatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 53  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1620 - 1583
Alignment:
Q  185 gatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagat 222  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  1620 gatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 1583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 1176 - 1131
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  1176 tatgagttcaattagggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtga 1131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 7982 - 7937
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  7982 tatgagtttaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 7937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 3178
Alignment:
Q  185 gatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagat 222  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  3215 gatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 3178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 11933 - 11974
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 42  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  11933 tatgagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 11974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 8285 - 8244
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 42  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8285 tatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 8244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 7972 - 8017
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  7972 tatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 8017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 7598 - 7553
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||    
T  7598 tatgagttcaattaaggtgtttattagtatttaacctatgttgtga 7553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 62184 - 62143
Alignment:
Q  1 tatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 42  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  62184 tatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 62143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 11651 - 11607
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 158  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  11651 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcatta 11607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 158
Target Start/End: Original strand, 17961 - 18005
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 158  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17961 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcatta 18005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 46
Target Start/End: Original strand, 20670 - 20706
Alignment:
Q  10 aattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 46  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20670 aattaaggttttaaagagtatttaaccaatgttgtga 20706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 158
Target Start/End: Original strand, 38190 - 38234
Alignment:
Q  114 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 158  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  38190 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcatta 38234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University