View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16308_low_11 (Length: 209)

Name: NF16308_low_11
Description: NF16308
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16308_low_11
NF16308_low_11
[»] chr8 (63 HSPs)
chr8 (5-209)||(21918915-21919119)
chr8 (1-209)||(20536210-20536418)
chr8 (1-209)||(18818320-18818528)
chr8 (1-209)||(31971259-31971465)
chr8 (1-209)||(7372780-7372980)
chr8 (1-209)||(21923839-21924047)
chr8 (1-209)||(45130909-45131115)
chr8 (1-209)||(18879148-18879350)
chr8 (1-209)||(22626738-22626945)
chr8 (1-209)||(23406381-23406591)
chr8 (1-209)||(16199557-16199763)
chr8 (1-209)||(28648955-28649163)
chr8 (18-209)||(16092270-16092461)
chr8 (3-209)||(21389366-21389569)
chr8 (3-209)||(21395896-21396099)
chr8 (3-209)||(21790389-21790592)
chr8 (1-209)||(23648555-23648763)
chr8 (8-209)||(21778697-21778895)
chr8 (1-209)||(22875067-22875275)
chr8 (1-209)||(6759260-6759466)
chr8 (45-208)||(14409444-14409606)
chr8 (45-208)||(1484402-1484564)
chr8 (45-208)||(5853292-5853454)
chr8 (45-208)||(20403227-20403389)
chr8 (45-208)||(22001753-22001915)
chr8 (59-204)||(16413331-16413474)
chr8 (45-208)||(41598188-41598350)
chr8 (45-208)||(4483281-4483442)
chr8 (45-208)||(4542373-4542535)
chr8 (45-208)||(15203231-15203393)
chr8 (45-208)||(20046195-20046357)
chr8 (45-208)||(19896265-19896430)
chr8 (80-209)||(18678093-18678221)
chr8 (1-87)||(25363051-25363138)
chr8 (80-209)||(32121734-32121862)
chr8 (45-208)||(14823774-14823935)
chr8 (134-209)||(21490997-21491072)
chr8 (139-209)||(17140918-17140988)
chr8 (45-208)||(25484275-25484430)
chr8 (45-209)||(26223918-26224081)
chr8 (134-209)||(5866318-5866393)
chr8 (99-195)||(15070571-15070665)
chr8 (84-208)||(26219717-26219838)
chr8 (39-204)||(13508034-13508199)
chr8 (84-209)||(38855246-38855370)
chr8 (110-204)||(45290761-45290853)
chr8 (59-192)||(19801397-19801527)
chr8 (99-208)||(19937061-19937168)
chr8 (134-209)||(6520370-6520445)
chr8 (84-208)||(26225288-26225409)
chr8 (39-204)||(13597566-13597731)
chr8 (39-209)||(17612059-17612229)
chr8 (134-195)||(983450-983511)
chr8 (160-209)||(21249386-21249434)
chr8 (160-209)||(21255224-21255272)
chr8 (91-195)||(21285613-21285716)
chr8 (139-195)||(23760893-23760949)
chr8 (39-192)||(20498581-20498734)
chr8 (134-207)||(26355742-26355815)
chr8 (140-192)||(24353039-24353091)
chr8 (140-192)||(37116366-37116418)
chr8 (133-192)||(19154930-19154989)
chr8 (84-195)||(21673720-21673830)
[»] chr4 (64 HSPs)
chr4 (1-209)||(12902759-12902967)
chr4 (1-209)||(7088879-7089087)
chr4 (1-209)||(22636437-22636644)
chr4 (1-209)||(44052831-44053039)
chr4 (1-204)||(23374270-23374473)
chr4 (1-209)||(7893705-7893910)
chr4 (1-209)||(16270147-16270354)
chr4 (27-209)||(7798776-7798958)
chr4 (1-209)||(16239881-16240088)
chr4 (1-208)||(16377434-16377639)
chr4 (1-209)||(14053213-14053420)
chr4 (1-209)||(17046489-17046694)
chr4 (1-206)||(14038653-14038858)
chr4 (85-209)||(52873363-52873486)
chr4 (39-209)||(6899893-6900062)
chr4 (45-208)||(18215274-18215436)
chr4 (45-208)||(44928879-44929042)
chr4 (45-208)||(12307-12469)
chr4 (45-208)||(15118352-15118514)
chr4 (45-208)||(52312510-52312672)
chr4 (39-208)||(1837503-1837671)
chr4 (1-95)||(3096759-3096853)
chr4 (59-208)||(23803280-23803427)
chr4 (45-208)||(44615288-44615450)
chr4 (45-208)||(44773087-44773249)
chr4 (45-208)||(50222339-50222501)
chr4 (84-208)||(54798749-54798872)
chr4 (128-209)||(3096295-3096375)
chr4 (59-208)||(3515007-3515154)
chr4 (59-208)||(18239434-18239581)
chr4 (59-208)||(19242699-19242846)
chr4 (59-208)||(51463883-51464030)
chr4 (84-208)||(14280316-14280438)
chr4 (59-209)||(19618187-19618335)
chr4 (45-208)||(44102214-44102376)
chr4 (45-204)||(15355324-15355483)
chr4 (45-209)||(22353835-22353999)
chr4 (59-208)||(12610950-12611090)
chr4 (59-195)||(14970722-14970856)
chr4 (5-195)||(52243108-52243301)
chr4 (45-209)||(15367692-15367856)
chr4 (45-209)||(15402705-15402869)
chr4 (7-87)||(17047989-17048070)
chr4 (36-161)||(43256106-43256230)
chr4 (139-209)||(15551819-15551889)
chr4 (99-209)||(15370020-15370128)
chr4 (99-209)||(15371204-15371312)
chr4 (99-209)||(15373485-15373593)
chr4 (47-192)||(21815587-21815731)
chr4 (84-208)||(8574864-8574985)
chr4 (39-192)||(13800-13953)
chr4 (45-208)||(7641192-7641344)
chr4 (99-209)||(16223534-16223642)
chr4 (39-195)||(43198502-43198660)
chr4 (134-207)||(12774011-12774084)
chr4 (134-209)||(39706332-39706407)
chr4 (92-195)||(12288211-12288315)
chr4 (36-122)||(15121749-15121834)
chr4 (40-192)||(6190481-6190633)
chr4 (134-207)||(8846360-8846433)
chr4 (45-205)||(20149832-20149992)
chr4 (2-51)||(14280462-14280512)
chr4 (2-47)||(54798675-54798721)
chr4 (133-192)||(46640499-46640558)
[»] chr1 (53 HSPs)
chr1 (1-209)||(27250640-27250848)
chr1 (1-209)||(21026682-21026890)
chr1 (7-209)||(22532271-22532473)
chr1 (1-209)||(50210124-50210332)
chr1 (1-208)||(34509783-34509990)
chr1 (1-133)||(22354483-22354616)
chr1 (1-209)||(22468608-22468815)
chr1 (1-209)||(20135189-20135397)
chr1 (1-209)||(38801302-38801506)
chr1 (45-209)||(45574842-45575006)
chr1 (45-208)||(13988866-13989028)
chr1 (45-208)||(21923291-21923453)
chr1 (59-208)||(23593750-23593897)
chr1 (45-208)||(21475087-21475249)
chr1 (45-208)||(31612313-31612475)
chr1 (45-208)||(29298137-29298298)
chr1 (45-208)||(29776688-29776850)
chr1 (110-209)||(20847175-20847273)
chr1 (45-208)||(433012-433172)
chr1 (59-209)||(21840766-21840914)
chr1 (1-87)||(48603637-48603724)
chr1 (45-208)||(16275363-16275526)
chr1 (36-161)||(33797570-33797694)
chr1 (1-98)||(22356085-22356184)
chr1 (1-98)||(22357771-22357870)
chr1 (59-209)||(16361916-16362064)
chr1 (45-209)||(13212861-13213025)
chr1 (45-208)||(21346961-21347124)
chr1 (45-208)||(22123067-22123230)
chr1 (76-208)||(21707167-21707297)
chr1 (76-208)||(21711709-21711839)
chr1 (59-208)||(21342096-21342244)
chr1 (99-208)||(15860064-15860171)
chr1 (142-209)||(20454606-20454672)
chr1 (39-192)||(21861519-21861672)
chr1 (39-192)||(21896205-21896358)
chr1 (134-209)||(14295595-14295670)
chr1 (5-195)||(16758665-16758857)
chr1 (45-205)||(40389157-40389317)
chr1 (84-207)||(22921864-22921986)
chr1 (134-204)||(21754052-21754122)
chr1 (134-195)||(20918620-20918681)
chr1 (129-207)||(21714546-21714623)
chr1 (134-195)||(33681023-33681084)
chr1 (97-192)||(35261086-35261180)
chr1 (27-172)||(21787979-21788125)
chr1 (134-207)||(20248283-20248356)
chr1 (134-195)||(52928014-52928075)
chr1 (134-195)||(22237643-22237704)
chr1 (140-192)||(50614167-50614219)
chr1 (140-192)||(50621995-50622047)
chr1 (133-192)||(16368329-16368388)
chr1 (133-192)||(41050079-41050138)
[»] chr7 (70 HSPs)
chr7 (1-209)||(10589041-10589248)
chr7 (1-209)||(12698833-12699042)
chr7 (1-209)||(9509191-9509399)
chr7 (1-202)||(26212005-26212206)
chr7 (1-208)||(18456324-18456530)
chr7 (1-209)||(16386158-16386367)
chr7 (1-209)||(40443393-40443599)
chr7 (1-209)||(38227483-38227690)
chr7 (1-208)||(3564275-3564482)
chr7 (1-209)||(27847744-27847949)
chr7 (45-209)||(13647327-13647491)
chr7 (45-208)||(456321-456483)
chr7 (45-208)||(11972496-11972658)
chr7 (45-208)||(14949122-14949284)
chr7 (45-208)||(15376713-15376875)
chr7 (45-208)||(16232520-16232682)
chr7 (45-208)||(18640272-18640434)
chr7 (45-208)||(20385123-20385285)
chr7 (45-208)||(21189595-21189757)
chr7 (45-208)||(32125491-32125653)
chr7 (45-208)||(41522917-41523079)
chr7 (45-208)||(41525379-41525541)
chr7 (45-207)||(11393287-11393448)
chr7 (39-208)||(16213684-16213852)
chr7 (45-209)||(18430711-18430874)
chr7 (59-204)||(24275175-24275318)
chr7 (91-208)||(48273392-48273508)
chr7 (45-208)||(24702238-24702400)
chr7 (45-208)||(27216860-27217022)
chr7 (47-208)||(16410059-16410219)
chr7 (45-208)||(44116509-44116671)
chr7 (45-208)||(3386333-3386495)
chr7 (45-208)||(24704688-24704847)
chr7 (5-195)||(2280033-2280224)
chr7 (42-207)||(14932685-14932851)
chr7 (42-207)||(15356120-15356286)
chr7 (42-207)||(15360234-15360400)
chr7 (79-208)||(13869346-13869474)
chr7 (134-209)||(34200788-34200863)
chr7 (45-208)||(20110556-20110708)
chr7 (45-208)||(17061915-17062077)
chr7 (45-204)||(38898376-38898535)
chr7 (81-208)||(13831373-13831498)
chr7 (134-209)||(67747-67822)
chr7 (1-195)||(15143948-15144142)
chr7 (134-209)||(16495404-16495479)
chr7 (134-209)||(28505342-28505417)
chr7 (77-161)||(2530126-2530208)
chr7 (134-209)||(11996071-11996146)
chr7 (45-192)||(12756671-12756817)
chr7 (45-144)||(26355983-26356083)
chr7 (45-144)||(26358435-26358535)
chr7 (91-209)||(22072915-22073033)
chr7 (134-207)||(811175-811248)
chr7 (134-207)||(44014182-44014255)
chr7 (139-207)||(18005650-18005718)
chr7 (157-209)||(15754955-15755006)
chr7 (139-209)||(47831809-47831879)
chr7 (40-207)||(17138013-17138177)
chr7 (129-193)||(18154881-18154944)
chr7 (5-195)||(1867910-1868100)
chr7 (5-209)||(19486658-19486863)
chr7 (40-106)||(12187117-12187183)
chr7 (36-172)||(15211495-15211632)
chr7 (134-195)||(16219761-16219822)
chr7 (133-195)||(12901339-12901401)
chr7 (91-195)||(16056344-16056446)
chr7 (2-51)||(48273538-48273588)
chr7 (140-195)||(14044762-14044817)
chr7 (140-195)||(14354792-14354847)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-209)||(13213-13421)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (1-209)||(960-1167)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-209)||(167890-168097)
scaffold0011 (1-209)||(51915-52123)
[»] chr3 (81 HSPs)
chr3 (1-209)||(20698347-20698554)
chr3 (1-209)||(12399211-12399419)
chr3 (1-209)||(13442276-13442484)
chr3 (1-209)||(17487858-17488066)
chr3 (1-209)||(17499340-17499548)
chr3 (1-209)||(26686889-26687097)
chr3 (4-209)||(23083275-23083480)
chr3 (1-209)||(43840934-43841142)
chr3 (1-209)||(14972856-14973064)
chr3 (1-195)||(14576744-14576937)
chr3 (1-208)||(24153120-24153326)
chr3 (1-209)||(18438536-18438744)
chr3 (2-193)||(42386428-42386620)
chr3 (4-209)||(25476299-25476504)
chr3 (1-195)||(14572605-14572798)
chr3 (3-209)||(11424676-11424878)
chr3 (1-208)||(40213632-40213838)
chr3 (45-208)||(29172583-29172745)
chr3 (45-208)||(7781347-7781509)
chr3 (45-208)||(9707607-9707769)
chr3 (45-208)||(17463178-17463340)
chr3 (45-208)||(34159326-34159488)
chr3 (45-208)||(45606907-45607069)
chr3 (45-208)||(55476491-55476653)
chr3 (59-208)||(17672626-17672773)
chr3 (59-208)||(28848626-28848773)
chr3 (45-208)||(8899094-8899256)
chr3 (45-208)||(16454281-16454443)
chr3 (45-208)||(38961891-38962053)
chr3 (45-208)||(13151790-13151953)
chr3 (45-208)||(13154255-13154418)
chr3 (45-209)||(43550478-43550642)
chr3 (45-208)||(6469134-6469296)
chr3 (45-208)||(10247723-10247885)
chr3 (45-208)||(17446655-17446816)
chr3 (59-209)||(13544024-13544172)
chr3 (45-206)||(16282811-16282971)
chr3 (59-204)||(12567564-12567707)
chr3 (59-208)||(50242822-50242969)
chr3 (45-192)||(53070653-53070799)
chr3 (1-195)||(30029856-30030049)
chr3 (93-208)||(55500942-55501055)
chr3 (45-206)||(41123892-41124049)
chr3 (84-208)||(36166598-36166719)
chr3 (1-87)||(14179555-14179642)
chr3 (76-208)||(15977515-15977645)
chr3 (99-208)||(12119780-12119887)
chr3 (99-208)||(15412429-15412536)
chr3 (80-209)||(46822267-46822395)
chr3 (84-195)||(21618462-21618570)
chr3 (5-209)||(24340637-24340842)
chr3 (99-208)||(8499518-8499625)
chr3 (134-209)||(13210371-13210446)
chr3 (1-87)||(16796670-16796757)
chr3 (110-208)||(44494809-44494905)
chr3 (39-192)||(52523676-52523831)
chr3 (80-209)||(12511059-12511187)
chr3 (104-208)||(10556985-10557087)
chr3 (134-207)||(12174303-12174376)
chr3 (149-208)||(17737236-17737294)
chr3 (134-204)||(32307684-32307754)
chr3 (134-195)||(15470940-15471001)
chr3 (134-207)||(16103784-16103857)
chr3 (134-207)||(49668120-49668193)
chr3 (40-207)||(856140-856304)
chr3 (76-208)||(27165250-27165381)
chr3 (134-209)||(14234489-14234564)
chr3 (146-208)||(28194693-28194755)
chr3 (5-209)||(37642179-37642384)
chr3 (134-207)||(9512924-9512997)
chr3 (134-207)||(9520899-9520972)
chr3 (134-207)||(16097332-16097405)
chr3 (154-208)||(45577947-45578000)
chr3 (65-193)||(23274705-23274832)
chr3 (133-208)||(53301594-53301669)
chr3 (39-116)||(2051148-2051226)
chr3 (91-192)||(43925977-43926079)
chr3 (134-173)||(1644718-1644757)
chr3 (140-190)||(13919350-13919399)
chr3 (140-192)||(22110402-22110454)
chr3 (91-192)||(37251168-37251270)
[»] chr6 (60 HSPs)
chr6 (1-209)||(20360871-20361079)
chr6 (1-209)||(20638194-20638402)
chr6 (2-209)||(22780139-22780346)
chr6 (44-209)||(16496246-16496411)
chr6 (1-209)||(17287707-17287915)
chr6 (1-209)||(29060542-29060750)
chr6 (1-209)||(25629266-25629474)
chr6 (1-209)||(18409738-18409946)
chr6 (1-209)||(20593775-20593983)
chr6 (36-209)||(35245588-35245758)
chr6 (1-209)||(16920544-16920749)
chr6 (1-209)||(22831505-22831712)
chr6 (1-209)||(19303452-19303659)
chr6 (44-209)||(20076702-20076863)
chr6 (45-208)||(12742317-12742479)
chr6 (45-208)||(18334592-18334754)
chr6 (45-208)||(19005046-19005208)
chr6 (45-208)||(19858919-19859081)
chr6 (45-208)||(22782227-22782389)
chr6 (45-208)||(24422547-24422709)
chr6 (45-208)||(33861794-33861956)
chr6 (45-208)||(33864278-33864440)
chr6 (59-208)||(25754809-25754956)
chr6 (45-208)||(1595549-1595711)
chr6 (45-208)||(2291180-2291342)
chr6 (45-208)||(8055029-8055191)
chr6 (45-208)||(26924640-26924802)
chr6 (3-199)||(11185517-11185710)
chr6 (59-209)||(30676725-30676873)
chr6 (59-209)||(34963372-34963520)
chr6 (59-208)||(1540926-1541073)
chr6 (59-208)||(25656629-25656776)
chr6 (59-208)||(25688502-25688649)
chr6 (45-192)||(18456735-18456881)
chr6 (42-195)||(25644336-25644490)
chr6 (59-192)||(18461895-18462026)
chr6 (45-208)||(3852017-3852179)
chr6 (45-205)||(16448526-16448686)
chr6 (45-208)||(20556894-20557054)
chr6 (36-161)||(27415887-27416011)
chr6 (39-192)||(18821795-18821946)
chr6 (45-209)||(19847949-19848114)
chr6 (4-172)||(15041465-15041633)
chr6 (4-172)||(25603299-25603467)
chr6 (134-209)||(27333262-27333337)
chr6 (134-209)||(27394002-27394077)
chr6 (134-209)||(28496515-28496590)
chr6 (134-209)||(29808926-29809001)
chr6 (39-195)||(20109154-20109312)
chr6 (4-172)||(25611637-25611805)
chr6 (149-209)||(25714419-25714478)
chr6 (80-209)||(23992429-23992554)
chr6 (157-209)||(1561305-1561356)
chr6 (5-209)||(8227425-8227630)
chr6 (133-195)||(9098557-9098619)
chr6 (134-207)||(19652199-19652272)
chr6 (133-190)||(33443068-33443124)
chr6 (133-195)||(19668387-19668449)
chr6 (91-192)||(23019425-23019525)
chr6 (139-195)||(4185870-4185926)
[»] chr2 (61 HSPs)
chr2 (1-209)||(23285867-23286071)
chr2 (1-209)||(22731145-22731353)
chr2 (1-209)||(23076444-23076652)
chr2 (8-209)||(23060515-23060716)
chr2 (1-209)||(22738091-22738298)
chr2 (1-209)||(23654297-23654505)
chr2 (1-209)||(38027-38233)
chr2 (1-208)||(298725-298933)
chr2 (1-209)||(20309110-20309315)
chr2 (1-209)||(22337117-22337325)
chr2 (1-209)||(23660025-23660232)
chr2 (45-208)||(22105412-22105575)
chr2 (45-205)||(21155060-21155219)
chr2 (45-208)||(18808943-18809105)
chr2 (45-208)||(23130862-23131024)
chr2 (45-208)||(23133329-23133491)
chr2 (45-208)||(23709532-23709694)
chr2 (45-208)||(23712013-23712175)
chr2 (45-208)||(26505379-26505541)
chr2 (45-208)||(26507857-26508019)
chr2 (45-208)||(34402522-34402684)
chr2 (45-208)||(39682313-39682475)
chr2 (59-208)||(23135590-23135737)
chr2 (45-208)||(571397-571559)
chr2 (45-208)||(6725995-6726157)
chr2 (45-208)||(24367774-24367936)
chr2 (59-209)||(32214936-32215084)
chr2 (45-208)||(24898195-24898358)
chr2 (45-208)||(24900678-24900841)
chr2 (45-208)||(24903155-24903318)
chr2 (45-208)||(24905632-24905795)
chr2 (45-208)||(24908107-24908270)
chr2 (45-208)||(32039498-32039660)
chr2 (42-209)||(23103348-23103514)
chr2 (45-208)||(28577099-28577261)
chr2 (45-208)||(45029854-45030016)
chr2 (45-206)||(43137301-43137461)
chr2 (5-195)||(23708533-23708724)
chr2 (45-208)||(24529528-24529691)
chr2 (133-209)||(8946659-8946734)
chr2 (80-204)||(25616192-25616315)
chr2 (45-208)||(38967374-38967537)
chr2 (39-209)||(19671832-19672001)
chr2 (84-206)||(28405981-28406103)
chr2 (147-209)||(23040247-23040308)
chr2 (134-209)||(23071993-23072068)
chr2 (128-205)||(24643034-24643109)
chr2 (134-209)||(22134251-22134325)
chr2 (39-192)||(32451878-32452031)
chr2 (134-207)||(7679589-7679662)
chr2 (84-207)||(25175854-25175976)
chr2 (1-56)||(27753730-27753785)
chr2 (4-82)||(40622123-40622200)
chr2 (44-192)||(7687-7835)
chr2 (134-195)||(18786947-18787008)
chr2 (40-172)||(22799076-22799209)
chr2 (40-172)||(23019656-23019789)
chr2 (140-190)||(23287384-23287433)
chr2 (141-190)||(26392403-26392451)
chr2 (133-192)||(23207296-23207355)
chr2 (45-121)||(24642856-24642933)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (1-209)||(4851-5059)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-209)||(1853-2061)
[»] chr5 (66 HSPs)
chr5 (1-209)||(23390407-23390615)
chr5 (8-209)||(8286760-8286962)
chr5 (1-202)||(22075028-22075229)
chr5 (1-209)||(25421534-25421742)
chr5 (1-209)||(25431397-25431604)
chr5 (44-209)||(21808343-21808508)
chr5 (44-209)||(21729018-21729183)
chr5 (1-209)||(24493571-24493778)
chr5 (1-208)||(24529223-24529430)
chr5 (1-209)||(9077954-9078162)
chr5 (1-209)||(21292881-21293088)
chr5 (1-209)||(13025313-13025520)
chr5 (1-209)||(13095497-13095704)
chr5 (1-209)||(1096469-1096677)
chr5 (45-208)||(264768-264930)
chr5 (45-208)||(39363384-39363546)
chr5 (46-208)||(10732941-10733102)
chr5 (104-209)||(21997549-21997653)
chr5 (45-208)||(20909012-20909174)
chr5 (45-208)||(29329934-29330096)
chr5 (45-208)||(42245365-42245527)
chr5 (45-208)||(29345980-29346142)
chr5 (1-208)||(22412187-22412383)
chr5 (45-208)||(36154783-36154942)
chr5 (59-208)||(39245136-39245283)
chr5 (45-195)||(20902008-20902158)
chr5 (45-208)||(29348453-29348615)
chr5 (45-208)||(29350926-29351088)
chr5 (36-161)||(18356364-18356488)
chr5 (45-208)||(2154613-2154776)
chr5 (45-208)||(11581199-11581361)
chr5 (45-208)||(32027393-32027555)
chr5 (45-205)||(18319033-18319193)
chr5 (1-195)||(18418596-18418788)
chr5 (36-161)||(20910745-20910869)
chr5 (44-192)||(22144068-22144216)
chr5 (40-204)||(37723910-37724073)
chr5 (45-208)||(10775675-10775838)
chr5 (134-209)||(19660879-19660954)
chr5 (80-209)||(17517192-17517320)
chr5 (1-73)||(22107284-22107357)
chr5 (99-208)||(31061068-31061175)
chr5 (99-208)||(38619434-38619541)
chr5 (113-208)||(20918017-20918110)
chr5 (92-192)||(20026942-20027043)
chr5 (134-209)||(21329541-21329616)
chr5 (99-207)||(23064512-23064618)
chr5 (134-209)||(36314579-36314654)
chr5 (134-207)||(22959576-22959649)
chr5 (134-207)||(21565546-21565619)
chr5 (45-205)||(24067110-24067270)
chr5 (139-209)||(21502205-21502275)
chr5 (36-106)||(23572182-23572252)
chr5 (1-72)||(21986058-21986130)
chr5 (40-207)||(22032323-22032485)
chr5 (40-106)||(18769954-18770020)
chr5 (134-195)||(26012079-26012140)
chr5 (129-207)||(26704075-26704152)
chr5 (141-195)||(26732884-26732937)
chr5 (129-207)||(26973808-26973885)
chr5 (134-209)||(19668900-19668975)
chr5 (84-144)||(20766115-20766174)
chr5 (153-208)||(20806850-20806904)
chr5 (141-192)||(26740697-26740747)
chr5 (5-209)||(40725855-40726060)
chr5 (91-161)||(29448052-29448123)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (1-209)||(3472-3680)
scaffold0292 (1-209)||(345-552)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (1-209)||(4714-4921)
scaffold0358 (1-145)||(1-145)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-209)||(32069-32274)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (8-209)||(6039-6243)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (1-193)||(24212-24406)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (1-209)||(15376-15582)
scaffold0114 (40-106)||(7393-7459)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (1-209)||(10337-10542)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (1-209)||(32944-33151)
scaffold0145 (1-209)||(38763-38970)
scaffold0145 (45-208)||(9749-9912)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (2-209)||(1954-2161)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-209)||(13499-13705)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (1-208)||(22886-23092)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (1-209)||(8444-8648)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (1-209)||(20912-21121)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-209)||(3062-3269)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (7-209)||(3103-3305)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-209)||(39479-39686)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-209)||(75126-75333)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-209)||(25898-26105)
scaffold0026 (1-209)||(39860-40067)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (1-204)||(25976-26179)
scaffold0122 (84-208)||(44702-44825)
scaffold0122 (1-58)||(33406-33463)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (1-209)||(963-1168)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (1-209)||(16284-16489)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (1-206)||(4513-4717)
scaffold0228 (1-206)||(12095-12299)
scaffold0228 (1-206)||(22047-22251)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (1-209)||(46997-47202)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (4-209)||(8481-8682)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (1-209)||(17126-17336)
scaffold0056 (59-192)||(79299-79430)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (1-158)||(13144-13302)
scaffold0175 (135-209)||(34125-34199)
scaffold0175 (154-209)||(275-329)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (1-209)||(39915-40122)
scaffold0080 (91-192)||(19885-19987)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (1-209)||(1291-1496)
scaffold0106 (1-209)||(7268-7473)
scaffold0106 (142-208)||(15291-15356)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (36-209)||(32904-33075)
scaffold0120 (36-209)||(45930-46101)
scaffold0120 (1-209)||(16115-16322)
scaffold0120 (149-209)||(17389-17448)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (72-209)||(28416-28552)
scaffold0046 (134-209)||(11294-11369)
scaffold0046 (134-209)||(1999-2074)
scaffold0046 (157-209)||(4554-4605)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (1-209)||(16511-16719)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-209)||(51584-51789)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-151)||(6669-6820)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (1-116)||(124679-124795)
scaffold0021 (40-209)||(174768-174936)
scaffold0021 (141-209)||(121768-121835)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (1-208)||(339861-340065)
scaffold0003 (45-208)||(158450-158612)
scaffold0003 (36-161)||(71350-71474)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (1-208)||(5042-5246)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (45-208)||(20747-20909)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (45-208)||(37821-37983)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (45-208)||(94411-94573)
scaffold0023 (59-208)||(44454-44602)
scaffold0023 (59-204)||(17455-17598)
scaffold0023 (139-209)||(119877-119947)
scaffold0023 (83-207)||(100378-100501)
scaffold0023 (140-207)||(40224-40291)
scaffold0023 (134-207)||(101503-101576)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (59-208)||(13392-13539)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (45-208)||(13947-14109)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (45-208)||(136680-136842)
scaffold0028 (45-208)||(139149-139311)
scaffold0028 (45-208)||(144087-144249)
scaffold0028 (45-208)||(134211-134373)
scaffold0028 (45-208)||(141618-141780)
scaffold0028 (139-193)||(62216-62270)
scaffold0028 (133-207)||(132662-132736)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (59-208)||(4694-4841)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (88-205)||(11442-11558)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (59-208)||(82072-82219)
scaffold0037 (134-195)||(22714-22775)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (45-208)||(16784-16946)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (59-205)||(4300-4444)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (59-209)||(10772-10920)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (59-209)||(11287-11435)
scaffold0029 (36-106)||(12861-12931)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (59-204)||(501088-501231)
scaffold0001 (45-208)||(85579-85742)
scaffold0001 (134-207)||(160688-160761)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (1-147)||(3440-3588)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (27-190)||(4545-4708)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (45-208)||(40400-40562)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (59-208)||(106-253)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (36-161)||(15362-15486)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (84-208)||(116430-116551)
scaffold0022 (140-192)||(129021-129072)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (59-209)||(12264-12412)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (59-209)||(9241-9389)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (45-194)||(29946-30094)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (45-192)||(20379-20524)
scaffold0031 (44-209)||(128753-128917)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (1-87)||(1037-1124)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (39-195)||(8482-8640)
scaffold0621 (84-209)||(6537-6661)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (1-126)||(27914-28040)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (45-208)||(4214-4377)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (45-208)||(12064-12220)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (45-208)||(161089-161252)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (5-192)||(13147-13336)
scaffold0357 (5-195)||(16014-16205)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (8-151)||(881-1021)
scaffold0395 (144-209)||(4888-4952)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (5-195)||(27663-27854)
scaffold0165 (1-52)||(3640-3691)
scaffold0165 (1-52)||(7704-7755)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (4-185)||(26850-27027)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (5-209)||(17941-18146)
scaffold0247 (99-208)||(2184-2291)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (45-205)||(1280-1440)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (134-209)||(1113-1188)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (84-207)||(19268-19390)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (134-208)||(15664-15738)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (46-207)||(29558-29720)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (84-207)||(2801-2923)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (39-190)||(8008-8161)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (39-209)||(11466-11636)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (134-209)||(6613-6688)
scaffold0333 (134-209)||(13993-14068)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (134-209)||(6167-6242)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (39-209)||(38205-38375)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (134-209)||(15821-15896)
scaffold0020 (143-207)||(178898-178961)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (2-192)||(60626-60818)
scaffold0010 (134-195)||(129921-129982)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (84-207)||(14692-14814)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (39-192)||(53498-53651)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (39-192)||(51833-51985)
scaffold0034 (91-195)||(32552-32654)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (84-192)||(1051-1158)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (40-207)||(1881-2045)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (139-207)||(2694-2762)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (2-51)||(10323-10372)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (45-208)||(38657-38820)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (84-195)||(5659-5769)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (134-207)||(28813-28887)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (139-209)||(1083-1153)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (39-153)||(225465-225578)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (134-195)||(1098-1159)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (134-195)||(10585-10646)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (134-195)||(8118-8179)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (4-207)||(21721-21920)
scaffold0210 (4-207)||(29613-29812)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (129-207)||(23843-23920)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (134-207)||(45836-45909)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (134-195)||(23927-23988)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (44-188)||(38339-38484)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (84-207)||(133-255)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (85-192)||(12587-12693)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (91-195)||(25122-25226)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (88-172)||(4803-4887)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (134-192)||(6831-6889)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (149-192)||(11982-12024)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (42-172)||(29128-29262)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (44-192)||(6237-6386)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (134-209)||(12768-12843)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (143-207)||(36454-36517)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (1-31)||(17898-17928)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (134-195)||(12955-13016)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (134-195)||(10543-10604)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (140-190)||(206575-206624)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (133-192)||(569-628)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (36-172)||(192921-193059)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 178; Significance: 3e-96; HSPs: 63)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 21918915 - 21919119
Alignment:
Q  5 atctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaat-atttgaatatttaagatgttgttgaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21918915 atctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 21919014  T
Q  104 ttgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagat 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21919015 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgttgaagat 21919113  T
Q  204 gatgat 209  Q
    ||||||    
T  21919114 gatgat 21919119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20536418 - 20536210
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20536418 tataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttga 20536319  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20536318 tgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 20536220  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  20536219 agatgatgat 20536210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 18818320 - 18818528
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  18818320 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgt 18818419  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18818420 tgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 18818518  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  18818519 agatgatgat 18818528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31971465 - 31971259
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |    
T  31971465 tataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgat 31971366  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaa 200  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31971365 gaattggaattgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgttgaa 31971268  T
Q  201 gatgatgat 209  Q
    |||||||||    
T  31971267 gatgatgat 31971259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7372980 - 7372780
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||       ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  7372980 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa-------gcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgtt 7372888  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaa 200  Q
    || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  7372887 gacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatgaa 7372789  T
Q  201 gatgatgat 209  Q
    |||||||||    
T  7372788 gatgatgat 7372780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 21923839 - 21924047
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||| ||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21923839 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 21923938  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||||||||||| || |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21923939 tgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 21924037  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  21924038 agatgatgat 21924047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 45130909 - 45131115
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |    
T  45130909 tataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgat 45131008  T
Q  101 gaa-ttgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  45131009 gaatttgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagatgttga 45131105  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  45131106 agatgatgat 45131115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 18879148 - 18879350
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18879148 tataatctgtgaagctgat-aagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttga 18879246  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18879247 tgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 18879340  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  18879341 agatgatgat 18879350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22626945 - 22626738
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22626945 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 22626846  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||| | ||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22626845 tgatttgtatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 22626748  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  22626747 agatgatgat 22626738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23406591 - 23406381
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgtt-- 97  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |      
T  23406591 tataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatat 23406492  T
Q  98 gttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgtt 197  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  23406491 gttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgat 23406393  T
Q  198 gaagatgatgat 209  Q
    ||||||||||||    
T  23406392 gaagatgatgat 23406381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 16199557 - 16199763
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| | |    
T  16199557 tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgtagat 16199656  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| | ||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16199657 gaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagatgttga 16199753  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  16199754 agatgatgat 16199763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 28648955 - 28649163
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||   || ||| ||||||||||||    
T  28648955 tataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgt 28649054  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  28649055 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 28649153  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  28649154 agatgatgat 28649163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Original strand, 16092270 - 16092461
Alignment:
Q  18 tttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatat 116  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||   || |||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  16092270 tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatat 16092369  T
Q  117 gattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16092370 tattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 16092461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 21389366 - 21389569
Alignment:
Q  3 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttga 102  Q
    |||| ||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| |||    
T  21389366 taatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 21389465  T
Q  103 attgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaag 201  Q
    |||| | ||||||| ||||||||| ||||   ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21389466 attgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagatgttgaag 21389561  T
Q  202 atgatgat 209  Q
    ||||||||    
T  21389562 atgatgat 21389569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 21395896 - 21396099
Alignment:
Q  3 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttga 102  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| |||    
T  21395896 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 21395995  T
Q  103 attgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaag 201  Q
    |||| | ||||||| ||||| ||| ||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21395996 attgaatttgatataattatctcatgctg---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagatgttgaag 21396091  T
Q  202 atgatgat 209  Q
    ||||||||    
T  21396092 atgatgat 21396099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 21790389 - 21790592
Alignment:
Q  3 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttga 102  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| |||    
T  21790389 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 21790488  T
Q  103 attgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaag 201  Q
    |||| | ||||||| ||||| ||| ||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21790489 attgaatttgatataattatctcatgctg---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagatgttgaag 21790584  T
Q  202 atgatgat 209  Q
    ||||||||    
T  21790585 atgatgat 21790592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23648763 - 23648555
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  23648763 tataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaagatgttgt 23648664  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    || ||||||| |||||| ||||||||| | |||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||| | |    
T  23648663 tgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaag-ttgcatgagtcagtctaagttgatta 23648565  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||| ||||    
T  23648564 agatgttgat 23648555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778895
Alignment:
Q  8 tgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgc 107  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| |||||||     
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattga 21778796  T
Q  108 aattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 206  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||   ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21778797 atttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 21778892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22875275 - 22875067
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||   || |||||| ||||||||    
T  22875275 tataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg 22875176  T
Q  99 ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttg 198  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  22875175 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctgtgttgctgctgctatttaactaagct-gcatgagtcggtctaaattgatg 22875078  T
Q  199 aagatgatgat 209  Q
    |||||||||||    
T  22875077 aagatgatgat 22875067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6759466 - 6759260
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||   || ||| || ||||||||    
T  6759466 tataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgagatgttg 6759367  T
Q  99 ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttg 198  Q
       | ||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  6759366 ---acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatg 6759271  T
Q  199 aagatgatgat 209  Q
    |||||||||||    
T  6759270 aagatgatgat 6759260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 14409444 - 14409606
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  14409444 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14409543  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14409544 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1484564 - 1484402
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1484564 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 1484465  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1484464 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 5853292 - 5853454
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  5853292 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 5853391  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  5853392 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20403389 - 20403227
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20403389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20403290  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20403289 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22001915 - 22001753
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22001915 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22001816  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22001815 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 204
Target Start/End: Original strand, 16413331 - 16413474
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16413331 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 16413429  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16413430 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 41598350 - 41598188
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41598350 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41598251  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
      || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41598250 -actgtgttgctgttgttattcaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 4483442 - 4483281
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  4483442 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 4483343  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4483342 g-ttgtgttgctgttgtta-ttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 4542373 - 4542535
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  4542373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat-ct 4542471  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
       | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4542472 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 15203231 - 15203393
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| || || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15203231 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15203330  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  15203331 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 20046195 - 20046357
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  20046195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 20046294  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20046295 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19896430 - 19896265
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattga---tatgattatgtcaagctgtttttgtat 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||   ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  19896430 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtat 19896331  T
Q  141 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    || |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19896330 accg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 209
Target Start/End: Original strand, 18678093 - 18678221
Alignment:
Q  80 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcat 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||    
T  18678093 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaag-ttgcat 18678191  T
Q  180 gagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  18678192 gagtcagtctaagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 25363051 - 25363138
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgaatat 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  25363051 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 25363138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32121862 - 32121734
Alignment:
Q  80 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcat 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||    
T  32121862 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaag-ttgcat 32121764  T
Q  180 gagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||  ||||||||| | |||||| ||||    
T  32121763 gagtcattctaagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14823935 - 14823774
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  14823935 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14823836  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||    
T  14823835 g-ttgtgttgttgttgttatttaactttgct-gcatgagt-ggtctaaattgattaagatgatga 14823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21491072 - 21490997
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21491072 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 21490997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17140988 - 17140918
Alignment:
Q  139 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17140988 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 17140918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 25484275 - 25484430
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  25484275 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac- 25484373  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
           | |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  25484374 -------tagctgttgttatttaactaagct-gcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26224081 - 26223918
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || ||||||||| || ||  |||| |||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |    
T  26224081 tgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatatt 26223982  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    | || | ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||| ||||    
T  26223981 g-ctttattgctgttgttatttaattaagct-gcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgat 26223918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Original strand, 5866318 - 5866393
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5866318 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 5866393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15070665 - 15070571
Alignment:
Q  99 ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15070665 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgtcgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26219838 - 26219717
Alignment:
Q  84 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagt 183  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26219838 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatact-attttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagct-gcatgagt 26219742  T
Q  184 cggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||| | | ||||||||    
T  26219741 cggtctaagttgattatgatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 204
Target Start/End: Original strand, 13508034 - 13508199
Alignment:
Q  39 ttatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttg 137  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| | ||||  | ||||| ||||| ||| | || || ||    
T  13508034 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtg 13508132  T
Q  138 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 204  Q
     ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13508133 catattgcctatgttgctgattgttaattaactaagct-gcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Original strand, 38855246 - 38855370
Alignment:
Q  84 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgag 182  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||  |||| ||| | || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  38855246 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgag 38855343  T
Q  183 tcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||    
T  38855344 tcggtctaagttgattaagatgatgat 38855370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 45290761 - 45290853
Alignment:
Q  110 ttgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 204  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  45290761 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 59 - 192
Target Start/End: Original strand, 19801397 - 19801527
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||||| ||    
T  19801397 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ttgtgttgctatt 19801494  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19801495 gttatttaactaagct-gcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 208
Target Start/End: Original strand, 19937061 - 19937168
Alignment:
Q  99 ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttg 198  Q
    |||| ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |     
T  19937061 ttgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtccaagttgatt 19937158  T
Q  199 aagatgatga 208  Q
    ||||||||||    
T  19937159 aagatgatga 19937168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6520445 - 6520370
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  6520445 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 6520370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 208
Target Start/End: Original strand, 26225288 - 26225409
Alignment:
Q  84 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagt 183  Q
    |||||| |||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26225288 atatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctg-catgagt 26225384  T
Q  184 cggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||| | ||||||||||    
T  26225385 cggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 204
Target Start/End: Original strand, 13597566 - 13597731
Alignment:
Q  39 ttatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttg 137  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||||| | ||||  | ||||| ||||| ||| | || |||||    
T  13597566 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttg 13597664  T
Q  138 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 204  Q
     || |||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13597665 cattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagct-gcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612229
Alignment:
Q  39 ttatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttg 137  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||||| | || |    ||||| ||||| ||| | |||||| |    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-g 17612157  T
Q  138 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
     ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  17612158 catactgcctatgttgttgattgttaattaactaagct-gcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 17612229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 195
Target Start/End: Original strand, 983450 - 983511
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  983450 tttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttg 983511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249386
Alignment:
Q  160 ttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249434 ttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 21249386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255224
Alignment:
Q  160 ttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255272 ttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 21255224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285613
Alignment:
Q  91 agatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtct 189  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||| | |||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctg-catgagtcggtct 21285619  T
Q  190 aagttg 195  Q
    ||||||    
T  21285618 aagttg 21285613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 195
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760949
Alignment:
Q  139 atactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttg 23760949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 20498734 - 20498581
Alignment:
Q  39 ttatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttg 137  Q
    |||| |||||||||||| || ||| |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||| |||||||  |||| ||| |||  ||||     
T  20498734 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct-atttta 20498636  T
Q  138 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
     |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  20498635 catactgcctatgttgctgtttgtttattaactaag-ttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Original strand, 26355742 - 26355815
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  26355742 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 24353091 - 24353039
Alignment:
Q  140 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24353091 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct-gcatgagtcggtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 37116418 - 37116366
Alignment:
Q  140 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37116418 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct-gcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 192
Target Start/End: Original strand, 19154930 - 19154989
Alignment:
Q  133 ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19154930 ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct-gcatgagtcggtttaag 19154989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21673830 - 21673720
Alignment:
Q  84 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgag 182  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||  |||| ||| | || ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | || ||||||    
T  21673830 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatg-catgag 21673733  T
Q  183 tcggtctaagttg 195  Q
    |||||||||||||    
T  21673732 tcggtctaagttg 21673720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 64)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12902967 - 12902759
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  12902967 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttga 12902868  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12902867 tgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgttga 12902769  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  12902768 agatgatgat 12902759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7089087 - 7088879
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  7089087 tataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttga 7088988  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  7088987 tgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 7088889  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  7088888 agatgatgat 7088879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22636644 - 22636437
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22636644 tataatctgtgaagctgtt-aagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttga 22636546  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22636545 tgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 22636447  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  22636446 agatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 44053039 - 44052831
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44053039 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttga 44052940  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  44052939 tgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttgttatttaactgagct-gcatgagtcggcctaagttgatga 44052841  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  44052840 agatgatgat 44052831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 23374270 - 23374473
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  23374270 tataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgt 23374369  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  23374370 tgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcgttctaagttgttga 23374468  T
Q  200 agatg 204  Q
    |||||    
T  23374469 agatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7893910 - 7893705
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  7893910 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg---ctgattatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgt 7893814  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  7893813 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagct-gcatgaatcggtctaagttgatga 7893715  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  7893714 agatgatgat 7893705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 16270147 - 16270354
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16270147 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 16270246  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    | | ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  16270247 taacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagct-gcatgagtcggtctaacttgatga 16270344  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  16270345 agatgatgat 16270354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798776
Alignment:
Q  27 tgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtc 125  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  126 aagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 7798776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 16239881 - 16240088
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16239881 tataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgt 16239980  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||| |||    
T  16239981 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctattttgctattgttatttaattaag-ttgcatgagttggtctaagttgatga 16240078  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  16240079 agatgatgat 16240088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 16377434 - 16377639
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||   || ||| || |||||||||    
T  16377434 tataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgt 16377533  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16377534 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 16377630  T
Q  200 agatgatga 208  Q
    |||| ||||    
T  16377631 agataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 14053213 - 14053420
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaag-atgttgt 99  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||||     
T  14053213 tataatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatgcataagaatgttga 14053312  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttg 198  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||    
T  14053313 tgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaag-ttgcatgagtcgatctaagatgttg 14053409  T
Q  199 aagatgatgat 209  Q
    |||||||||||    
T  14053410 aagatgatgat 14053420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17046694 - 17046489
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| |    
T  17046694 tataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgat 17046595  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||   |||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17046594 gaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttctatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagatgttga 17046499  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  17046498 agatgatgat 17046489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14038858 - 14038653
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||   || ||| || |||||||||    
T  14038858 tataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgt 14038759  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  14038758 tgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcagtctaagttgatga 14038660  T
Q  200 agatgat 206  Q
    |||||||    
T  14038659 agatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 85 - 209
Target Start/End: Original strand, 52873363 - 52873486
Alignment:
Q  85 tatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtc 184  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52873363 tatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtc 52873461  T
Q  185 ggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  52873462 ggtctaagttgatgaagatgatgat 52873486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899893
Alignment:
Q  39 ttatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttg 137  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  | | || |||||    
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttg-ttttg 6899964  T
Q  138 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgctattgttatttaactaagat-gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 6899893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 18215274 - 18215436
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18215274 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18215373  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18215374 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 44928879 - 44929042
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||||||| |||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  44928879 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 44928978  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44928979 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 12307 - 12469
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  12307 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12406  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12407 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 15118352 - 15118514
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15118352 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15118451  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15118452 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 52312672 - 52312510
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  52312672 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 52312573  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  52312572 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 208
Target Start/End: Original strand, 1837503 - 1837671
Alignment:
Q  39 ttatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttg 137  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  1837503 ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttg 1837602  T
Q  138 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1837603 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 3096853 - 3096759
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatg 95  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3096853 tataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttatgatg 3096759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Original strand, 23803280 - 23803427
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  23803280 tatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttgctgtt 23803378  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23803379 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 44615450 - 44615288
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  44615450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 44615351  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44615350 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 44773087 - 44773249
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  || | |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  44773087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44773186  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44773187 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 50222339 - 50222501
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  50222339 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataat 50222438  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  50222439 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 208
Target Start/End: Original strand, 54798749 - 54798872
Alignment:
Q  84 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagt 183  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  54798749 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattcaactaagct-gcatgagt 54798847  T
Q  184 cggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||| | ||||||||||    
T  54798848 cggtctaagttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 128 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3096375 - 3096295
Alignment:
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3096375 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 3096295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3515154 - 3515007
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3515154 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 3515056  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3515055 gttttttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Original strand, 18239434 - 18239581
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||    
T  18239434 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgctgctgtt 18239532  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18239533 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19242846 - 19242699
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||| ||||||    
T  19242846 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgtt 19242748  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19242747 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19242699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Original strand, 51463883 - 51464030
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    ||||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  51463883 tatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttgctgtt 51463981  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  51463982 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14280438 - 14280316
Alignment:
Q  84 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagt 183  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14280438 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc-gtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagt 14280341  T
Q  184 cggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||| | ||||||||||    
T  14280340 cggtctaagttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 209
Target Start/End: Original strand, 19618187 - 19618335
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19618187 tatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 19618285  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  19618286 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 19618335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 44102376 - 44102214
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  44102376 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44102277  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
      || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44102276 -actgtgttattgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 204
Target Start/End: Original strand, 15355324 - 15355483
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  15355324 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15355423  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 204  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15355424 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22353999 - 22353835
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||||||| |||||||||  |||||||| | ||||  |  |  ||    
T  22353999 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatct 22353900  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22353899 gcctatgctgctgttgttatttacctaagctg-catgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12611090 - 12610950
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||        | ||||||||||    
T  12611090 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgt--------tgtgttgctgtt 12610999  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12610998 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 59 - 195
Target Start/End: Original strand, 14970722 - 14970856
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||| ||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| || || | ||||||||    
T  14970722 tatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattg-ctgttttgctgtt 14970820  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  14970821 gttatttaactaagct-gcatgagttggtctaagttg 14970856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 195
Target Start/End: Original strand, 52243108 - 52243301
Alignment:
Q  5 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttga 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||| || || |||| |||||||||||| || ||||||||||||| |  |||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  52243108 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttga 52243207  T
Q  103 attgcaattgatatgattatgtcaag--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    ||| || |||||||  |||| ||| |  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52243208 atttcatttgatattgttatatcatgaactgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttg 52243301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15367856 - 15367692
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| |||||  |||| |||||| || ||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  15367856 tgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15367757  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  15367756 tg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15367692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15402869 - 15402705
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| |||||  |||| |||||| || ||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  15402869 tgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15402770  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  15402769 tg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15402705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 87
Target Start/End: Original strand, 17047989 - 17048070
Alignment:
Q  7 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgaatat 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  17047989 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 17048070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 161
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256230
Alignment:
Q  36 tgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaa-tatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtt 133  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||      
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-- 43256202  T
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 161  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||    
T  43256203 ttggtatgctgcctatgttgctgttgtt 43256230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15551889 - 15551819
Alignment:
Q  139 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551889 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 15551819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15370128 - 15370020
Alignment:
Q  99 ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttg 198  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  15370128 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcagtctaagtcgttg 15370031  T
Q  199 aagatgatgat 209  Q
    |||||| ||||    
T  15370030 aagatgttgat 15370020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15371312 - 15371204
Alignment:
Q  99 ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttg 198  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  15371312 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcagtctaagtcgttg 15371215  T
Q  199 aagatgatgat 209  Q
    |||||| ||||    
T  15371214 aagatgttgat 15371204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15373593 - 15373485
Alignment:
Q  99 ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttg 198  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  15373593 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcagtctaagtcgttg 15373496  T
Q  199 aagatgatgat 209  Q
    |||||| ||||    
T  15373495 aagatgttgat 15373485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 192
Target Start/End: Original strand, 21815587 - 21815731
Alignment:
Q  47 tgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgc 145  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||| |     
T  21815587 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacag- 21815685  T
Q  146 ctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21815686 ttgtgttgctgtcgttatttaactaagct-gcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 208
Target Start/End: Original strand, 8574864 - 8574985
Alignment:
Q  84 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagt 183  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | || ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8574864 atatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagct-gcatgagt 8574960  T
Q  184 cggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||  | ||||||||||    
T  8574961 cggtctaagttaattaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 13800 - 13953
Alignment:
Q  39 ttatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttg 137  Q
    |||| |||||||||||| || ||| |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||  |||| ||| | || |||||    
T  13800 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttg 13898  T
Q  138 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
     |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13899 catactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct-gcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 7641192 - 7641344
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||         
T  7641192 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgt----- 7641286  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
          ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7641287 ------gttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16223642 - 16223534
Alignment:
Q  99 ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttg 198  Q
    |||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  16223642 ttgacttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcagtctaagtcgttg 16223545  T
Q  199 aagatgatgat 209  Q
    |||||| ||||    
T  16223544 aagatgttgat 16223534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 195
Target Start/End: Original strand, 43198502 - 43198660
Alignment:
Q  39 ttatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgt-tttt 136  Q
    |||| |||||||||||| || ||| |||||||||||  |||| ||||||||| |||| ||| ||| ||||| |||||||| |||| ||| |   | ||||    
T  43198502 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaattgtttt 43198601  T
Q  137 gtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    | ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43198602 gcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttg 43198660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12774084 - 12774011
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  12774084 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Original strand, 39706332 - 39706407
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  39706332 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 39706407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 195
Target Start/End: Original strand, 12288211 - 12288315
Alignment:
Q  92 gatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaag--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtc 188  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||| ||| |  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12288211 gatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtc 12288308  T
Q  189 taagttg 195  Q
    |||||||    
T  12288309 taagttg 12288315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Original strand, 15121749 - 15121834
Alignment:
Q  36 tgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattat 122  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  15121749 tgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataattat 15121834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 6190633 - 6190481
Alignment:
Q  40 tatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatg-ttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgt 138  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||||||  ||  |||||| || ||||| |||||   || || |||||||  |||||||| ||| ||||||     
T  6190633 tatgatgtgatctaatgtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttcgcttaca-ttgatattgttatgtcatgctatttttga 6190535  T
Q  139 atactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    || ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6190534 atgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagct-gcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8846433 - 8846360
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  8846433 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct-gaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20149992 - 20149832
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||||| || ||| | || |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  20149992 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 20149893  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 205  Q
    ||  | ||| ||||||||||||| |  ||| | ||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  20149892 tg-atgtgtcgctgttgttattttatcaag-ttgcatgagtcagtctaagttgattaagatga 20149832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 14280512 - 14280462
Alignment:
Q  2 ataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgctgattatgatgtgata 51  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  14280512 ataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata 14280462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 47
Target Start/End: Original strand, 54798675 - 54798721
Alignment:
Q  2 ataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgctgattatgatgt 47  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  54798675 ataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgt 54798721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 192
Target Start/End: Original strand, 46640499 - 46640558
Alignment:
Q  133 ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46640499 ttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagct-gcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 53)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 27250640 - 27250848
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  27250640 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttga 27250739  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27250740 tgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgttga 27250838  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  27250839 agatgatgat 27250848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21026890 - 21026682
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  21026890 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgt 21026791  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21026790 tgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgttga 21026692  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
     |||||||||    
T  21026691 cgatgatgat 21026682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22532473 - 22532271
Alignment:
Q  7 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaatt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  22532473 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaatt 22532374  T
Q  106 gcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 205  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22532373 gcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa-attgcatgagttggtctaagttgatgaagatga 22532275  T
Q  206 tgat 209  Q
    ||||    
T  22532274 tgat 22532271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 50210124 - 50210332
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttat-gcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||   || ||| || |||||||||    
T  50210124 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgt 50210223  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  50210224 tgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 50210322  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  50210323 agatgatgat 50210332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 34509990 - 34509783
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||   || ||| ||||||||||||    
T  34509990 tataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgt 34509891  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  34509890 tgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 34509792  T
Q  200 agatgatga 208  Q
    |||||||||    
T  34509791 agatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 22354483 - 22354616
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22354483 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttga 22354582  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtt 133  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  22354583 tgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 22468608 - 22468815
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   ||  ||||||| ||||||||||||    
T  22468608 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatg-taattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatgttgt 22468706  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | |    
T  22468707 tgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaag-ttgcatgagtcagtctaagttgatta 22468805  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||| ||||    
T  22468806 agatgttgat 22468815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20135397 - 20135189
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||||    
T  20135397 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattgaatacttaagatgttgt 20135298  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||| | |||| |||||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||| | |    
T  20135297 tgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaag-ttgcatgagtcagtctaagttgatta 20135199  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||| ||||    
T  20135198 agatgttgat 20135189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 38801302 - 38801506
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||| |    
T  38801302 tataatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatatataatatgttgat 38801401  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||  ||||   ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  38801402 gaattgaatttgatataattatgtcttgctg---ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct-gcatgagtc-gtctaagatgttga 38801496  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  38801497 agatgatgat 38801506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Original strand, 45574842 - 45575006
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  45574842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatact 45574941  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  45574942 gcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 45575006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13989028 - 13988866
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13989028 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13988929  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13988928 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 21923291 - 21923453
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  21923291 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21923390  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21923391 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Original strand, 23593750 - 23593897
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  23593750 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 23593848  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23593849 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 21475087 - 21475249
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  21475087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21475186  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  21475187 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 31612475 - 31612313
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  31612475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 31612376  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
       | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31612375 -attgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29298298 - 29298137
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  29298298 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatact 29298200  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29298199 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29776850 - 29776688
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | | ||||||||||||    
T  29776850 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatact 29776751  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29776750 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 209
Target Start/End: Original strand, 20847175 - 20847273
Alignment:
Q  110 ttgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||||  |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20847175 ttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 20847273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 433172 - 433012
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  433172 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatact 433073  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||| ||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  433072 gcctgtgttgc---cgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21840914 - 21840766
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21840914 tatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 21840816  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  21840815 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 48603724 - 48603637
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgaatat 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  48603724 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 48603637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 16275363 - 16275526
Alignment:
Q  45 tgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||   ||| |||||| || ||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  16275363 tgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16275462  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    || |||||| | |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16275463 tg-ctatgtcgttgttgttatttaactaag-ttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797570
Alignment:
Q  36 tgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaat-atttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtt 133  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||      
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-- 33797598  T
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 161  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  33797597 tttgtatgctgcatatgttgctgttgtt 33797570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 22356085 - 22356184
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgct-gattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  22356085 tataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatgatgttg 22356184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 22357771 - 22357870
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgct-gattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  22357771 tataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatgatgttg 22357870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 59 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16362064 - 16361916
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  || | |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||  | |||||||||     
T  16362064 tatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactg-ttgtgttgctgtc 16361966  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  16361965 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 16361916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Original strand, 13212861 - 13213025
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  13212861 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 13212960  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||  |  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  13212961 tgt-tgcgtcgctgttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 13213025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21347124 - 21346961
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  21347124 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 21347025  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    || || |||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21347024 tg-ctgtgtctttgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 22123067 - 22123230
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  | || |||||| || |||  ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22123067 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 22123166  T
Q  144 gcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  22123167 g-ttgtgttgctgtttgctatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagtagattaagatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21707297 - 21707167
Alignment:
Q  76 atatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 175  Q
    |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||     
T  21707297 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatact-attgtgttgttgttgttatttaactaagct- 21707200  T
Q  176 gcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21707199 gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21711839 - 21711709
Alignment:
Q  76 atatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 175  Q
    |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||     
T  21711839 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatact-attgtgttgttgttgttatttaactaagct- 21711742  T
Q  176 gcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21711741 gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21342244 - 21342096
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgt 157  Q
    ||||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || |||   |||    
T  21342244 tatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtctttgt 21342146  T
Q  158 tgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21342145 tgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21342096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 208
Target Start/End: Original strand, 15860064 - 15860171
Alignment:
Q  99 ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttg 198  Q
    |||| ||||| || |||| ||||||||| | ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |     
T  15860064 ttgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtccaagttgatt 15860161  T
Q  199 aagatgatga 208  Q
    ||||||||||    
T  15860162 aagatgatga 15860171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 209
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454672
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 20454672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 21861519 - 21861672
Alignment:
Q  39 ttatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttg 137  Q
    |||| |||||||||||| || ||| |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||| |||||||  |||| ||| |||| |||||    
T  21861519 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttg 21861617  T
Q  138 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
     |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21861618 catactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagct-gcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 21896205 - 21896358
Alignment:
Q  39 ttatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttg 137  Q
    |||| |||||||||||| || ||| |||||| ||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||| |||||||  |||| ||| |||||||| |    
T  21896205 ttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-g 21896303  T
Q  138 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21896304 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaag-ttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Original strand, 14295595 - 14295670
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14295595 tttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgat 14295670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16758857 - 16758665
Alignment:
Q  5 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttga 102  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  |||||| || |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||| ||   ||||||||||     
T  16758857 atctgtgaagctgttataatatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgttgt-gatgttgttgt 16758759  T
Q  103 attgcaattgatatgattatgtcaag--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    |||| | |||||||  |||| ||| |  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16758758 attgtatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag-ttgcatgagtcggtctaagttg 16758665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 40389317 - 40389157
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||||| || ||| | || |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  40389317 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 40389218  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 205  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  40389217 tg-atgtgtcgctgttgttatttaaccaag-ttgcatgagtcagtctaggttgattaagatga 40389157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 207
Target Start/End: Original strand, 22921864 - 22921986
Alignment:
Q  84 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgag 182  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||  |||| ||| | || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22921864 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg-catgag 22921961  T
Q  183 tcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |||||||||| || ||| |||||||    
T  22921962 tcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21754122 - 21754052
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 204  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21754122 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgatgatgatg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20918681 - 20918620
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20918681 tttgcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21714623 - 21714546
Alignment:
Q  129 ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21714623 ctgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctg-catgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33681084 - 33681023
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33681084 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag-ttgcatgagtcggtctaagttg 33681023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 192
Target Start/End: Original strand, 35261086 - 35261180
Alignment:
Q  97 tgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    |||||| ||||| |||||||  |||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35261086 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct-gcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 172
Target Start/End: Original strand, 21787979 - 21788125
Alignment:
Q  27 tgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgt 124  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||| ||  ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||| |  | ||    
T  21787979 tgttgatgttgattatgatgttatataatgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattacgaagt 21788077  T
Q  125 caagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 172  Q
    || |||||| ||||   ||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  21788078 catgctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggttatttaactaag 21788125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20248356 - 20248283
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20248356 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttg-catgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 195
Target Start/End: Original strand, 52928014 - 52928075
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52928014 tttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttg 52928075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22237704 - 22237643
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22237704 tttgcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagctt-catgagtcggtctaagttg 22237643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 50614167 - 50614219
Alignment:
Q  140 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50614167 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct-gcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 50621995 - 50622047
Alignment:
Q  140 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50621995 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct-gcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 192
Target Start/End: Original strand, 16368329 - 16368388
Alignment:
Q  133 ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16368329 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct-gcatgagtcggtctaag 16368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 192
Target Start/End: Original strand, 41050079 - 41050138
Alignment:
Q  133 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  41050079 ttttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagct-gcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 70)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10589248 - 10589041
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  10589248 tataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattgcttgaagaatatttgaacattgaagatgttgtt 10589149  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  10589148 gaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcgatctaagttgtcgaa 10589050  T
Q  201 gatgatgat 209  Q
    |||||||||    
T  10589049 gatgatgat 10589041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12699042 - 12698833
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12699042 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttga 12698943  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttg 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  12698942 tgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatg 12698844  T
Q  199 aagatgatgat 209  Q
    |||||||||||    
T  12698843 aagatgatgat 12698833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9509399 - 9509191
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9509399 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttga 9509300  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  9509299 tgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 9509201  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  9509200 agatgatgat 9509191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 26212206 - 26212005
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  26212206 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgt 26212107  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  26212106 tgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag-ttgtatgagtcggtctaagttgttga 26212008  T
Q  200 aga 202  Q
    |||    
T  26212007 aga 26212005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 18456324 - 18456530
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  18456324 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 18456423  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  18456424 tgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatcgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatta 18456521  T
Q  200 agatgatga 208  Q
    |||||||||    
T  18456522 agatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 16386158 - 16386367
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||     
T  16386158 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattgtttgaatatttaagatgttga 16386257  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttg 198  Q
    |||| | ||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16386258 tgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgttg 16386356  T
Q  199 aagatgatgat 209  Q
    |||||||||||    
T  16386357 aagatgatgat 16386367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40443599 - 40443393
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |    
T  40443599 tataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgat 40443500  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  40443499 gaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagct-gcacgagtcggtctaagatgttga 40443403  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  40443402 agatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38227690 - 38227483
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||| ||||||| | |||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| | | | ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  38227690 tataatatgtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgt 38227591  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  38227590 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagtagatga 38227493  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  38227492 agatgatgat 38227483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 3564275 - 3564482
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||  ||   || ||| || |||||||||    
T  3564275 tataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgt 3564374  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| || || ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  3564375 tgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 3564473  T
Q  200 agatgatga 208  Q
    |||||||||    
T  3564474 agatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 27847744 - 27847949
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| |    
T  27847744 tataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgat 27847843  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||  |||   ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  27847844 gaattgaatttgatataattatgtcatactg---ttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagct-gcatgaatcggtctaagatgttga 27847939  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  27847940 agatgatgat 27847949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13647491 - 13647327
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  13647491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 13647392  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13647391 gcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 13647327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 456483 - 456321
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  456483 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 456384  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  456383 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11972658 - 11972496
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11972658 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11972559  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11972558 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 14949122 - 14949284
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  14949122 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14949221  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14949222 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 15376713 - 15376875
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15376713 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15376812  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15376813 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16232682 - 16232520
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16232682 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16232583  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16232582 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18640434 - 18640272
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18640434 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18640335  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18640334 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 20385123 - 20385285
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20385123 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20385222  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20385223 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 21189595 - 21189757
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  21189595 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21189694  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21189695 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 32125653 - 32125491
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32125653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32125554  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  32125553 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 41523079 - 41522917
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41523079 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41522980  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41522979 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 41525541 - 41525379
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41525541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41525442  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41525441 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 207
Target Start/End: Original strand, 11393287 - 11393448
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11393287 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11393386  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  11393387 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16213852 - 16213684
Alignment:
Q  39 ttatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttg 137  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  16213852 ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttg 16213753  T
Q  138 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16213752 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18430874 - 18430711
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||    
T  18430874 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 18430775  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18430774 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 18430711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24275318 - 24275175
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24275318 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 24275220  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24275219 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 91 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273392
Alignment:
Q  91 agatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtcta 190  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcataagtcggtcta 48273410  T
Q  191 agttgttgaagatgatga 208  Q
    ||||| | ||||||||||    
T  48273409 agttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24702400 - 24702238
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  24702400 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 24702301  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24702300 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 27217022 - 27216860
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  27217022 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27216923  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  27216922 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16410219 - 16410059
Alignment:
Q  47 tgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgc 145  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  16410219 tgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg- 16410121  T
Q  146 ctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16410120 ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 44116671 - 44116509
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  44116671 tgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 44116572  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44116571 g-ctgtgttgctgttgttatttaaccaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3386495 - 3386333
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  3386495 tgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3386396  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
       | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3386395 -attgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24704847 - 24704688
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||    ||||||||||||||    
T  24704847 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc---ttgtttttgtatact 24704751  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24704750 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 195
Target Start/End: Original strand, 2280033 - 2280224
Alignment:
Q  5 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttga 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||| || || |||| |||||||||||| || |||| |||| |||||  |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2280033 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttga 2280132  T
Q  103 attgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
     ||||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2280133 tttgcatttgatattattatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagct-gcatgagtcggtctaagttg 2280224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 207
Target Start/End: Original strand, 14932685 - 14932851
Alignment:
Q  42 tgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaa-ttgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgta 139  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |  ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||    
T  14932685 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 14932784  T
Q  140 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
      || |||||| | || |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  14932785 atctacctatgctactattgttatttaactaag-tcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 207
Target Start/End: Original strand, 15356120 - 15356286
Alignment:
Q  42 tgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaa-ttgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgta 139  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |  ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||    
T  15356120 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15356219  T
Q  140 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
      || |||||| | || |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  15356220 atctacctatgctactattgttatttaactaag-tcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 207
Target Start/End: Original strand, 15360234 - 15360400
Alignment:
Q  42 tgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaa-ttgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgta 139  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |  ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||    
T  15360234 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15360333  T
Q  140 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
      || |||||| | || |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  15360334 atctacctatgctactattgttatttaactaag-tcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13869474 - 13869346
Alignment:
Q  79 tttgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggc 177  Q
    |||||||| || ||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  13869474 tttgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgtcgctgttgttatttaactaagct-gc 13869377  T
Q  178 atgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13869376 atgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34200863 - 34200788
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34200863 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 34200788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20110708 - 20110556
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| ||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||      
T  20110708 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtata-- 20110611  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
             |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20110610 ---------gctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 17061915 - 17062077
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||  |||||||||||    
T  17061915 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgct-attttgtatact 17062013  T
Q  144 gcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    | ||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17062014 g-ctgagttgctgattgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 204
Target Start/End: Original strand, 38898376 - 38898535
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  || | |||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  38898376 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatac 38898475  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 204  Q
    ||| | ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  38898476 tgc-tgtgtcgttgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13831498 - 13831373
Alignment:
Q  81 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatg 180  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  13831498 tgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactacc-gtgttgttgttgttatttaactaagct-gcatg 13831401  T
Q  181 agtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  13831400 agtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 67822 - 67747
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  67822 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 67747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 15143948 - 15144142
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg 98  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||  ||   || ||| || ||||||||    
T  15143948 tataatctgtcaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatatgatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatacttgagatgttg 15144047  T
Q  99 ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    |||  ||||| ||||||| || || ||  |||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15144048 ttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgag-atgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttg 15144142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16495479 - 16495404
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16495479 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 16495404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Original strand, 28505342 - 28505417
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28505342 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagatgatgaagatgatgat 28505417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 161
Target Start/End: Original strand, 2530126 - 2530208
Alignment:
Q  77 tatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 161  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||  |||||||  |||||||||||||||||||    
T  2530126 tatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgtatgttgcctatgttgctgttgtt 2530208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Original strand, 11996071 - 11996146
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11996071 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatg-catgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 11996146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 192
Target Start/End: Original strand, 12756671 - 12756817
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||| |||||| || ||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |    
T  12756671 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 12756770  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  12756771 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaact-gctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Original strand, 26355983 - 26356083
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  26355983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26356082  T
Q  144 g 144  Q
    |    
T  26356083 g 26356083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Original strand, 26358435 - 26358535
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  26358435 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26358534  T
Q  144 g 144  Q
    |    
T  26358535 g 26358535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22073033 - 22072915
Alignment:
Q  91 agatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtct 189  Q
    |||||||||||| || || |||||||  |||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  22073033 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagct-gcatgggtcagtct 22072935  T
Q  190 aagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||| | |||||||||||    
T  22072934 aagttgattaagatgatgat 22072915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Original strand, 811175 - 811248
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  811175 tttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 44014255 - 44014182
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  44014255 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18005718 - 18005650
Alignment:
Q  139 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18005718 atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15755006
Alignment:
Q  157 ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctg-catgagtcagtctaagttgttgaagatgatgat 15755006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 47831879 - 47831809
Alignment:
Q  139 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  47831879 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 47831809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 207
Target Start/End: Original strand, 17138013 - 17138177
Alignment:
Q  40 tatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaag-ctgtttttgt 138  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||  ||| |  |||| ||||    
T  17138013 tatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattgttgttgt 17138109  T
Q  139 atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| | |||||||||| | |||| || | |||||||||    
T  17138110 aatctgcctatgttgctattgttattcaaccaag-ttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 193
Target Start/End: Original strand, 18154881 - 18154944
Alignment:
Q  129 ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagt 193  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18154881 ctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaaccaagct-gcatgagtcggtctaagt 18154944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 195
Target Start/End: Original strand, 1867910 - 1868100
Alignment:
Q  5 atctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaa 103  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||| || || | || |||||||||| | || |||||||||| ||||  |||| ||| | ||| |||||||||| |     
T  1867910 atctgtgaagctttttaagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttcat 1868008  T
Q  104 ttgcaattgatatgattatgtca--agctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    ||||| |||||||  |||| |||  |||||||||  |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1868009 ttgca-ttgatattgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctg-catgagtcggtctaagttg 1868100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 19486658 - 19486863
Alignment:
Q  5 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttga 102  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||| || || |||| |||||||||||| || ||||||| |||||||  |||| ||| ||||| |||||||||| |    
T  19486658 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgttta 19486757  T
Q  103 attgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaag 201  Q
     || |    ||||| ||||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  19486758 cttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctg-catgagtcggtccaagtcgttgaag 19486855  T
Q  202 atgatgat 209  Q
    ||| ||||    
T  19486856 atgttgat 19486863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 40 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 12187183 - 12187117
Alignment:
Q  40 tatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattg 106  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||| |||||||    
T  12187183 tatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg 12187117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15211632 - 15211495
Alignment:
Q  36 tgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgttt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||  |  ||||||| || ||||||||| |||||  || ||||||  |||||||| | ||||     
T  15211632 tgattatgatgtgatataatgttgtatacatcgcttgaagttttattgaataattgagatgttgt-gaattataaatgatattgttatgtcatgatgttg 15211534  T
Q  135 ttgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 172  Q
    |||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15211533 ttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaag 15211495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 195
Target Start/End: Original strand, 16219761 - 16219822
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16219761 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagcta-catgagtcggtctaagttg 16219822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 12901401 - 12901339
Alignment:
Q  133 ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  12901401 ttttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagct-gcatgagtcggtttaagttg 12901339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16056446 - 16056344
Alignment:
Q  91 agatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtct 189  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||| | ||  |||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  16056446 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttg--tttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggt-gcatcagtcggtct 16056350  T
Q  190 aagttg 195  Q
    ||||||    
T  16056349 aagttg 16056344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 48273588 - 48273538
Alignment:
Q  2 ataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgctgattatgatgtgata 51  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  48273588 ataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata 48273538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044762
Alignment:
Q  140 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    |||||||||||||||| || |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctg-catgagtcggtctaagttg 14044762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354792
Alignment:
Q  140 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    |||||||||||||||| || |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctg-catgagtcggtctaagttg 14354792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13421 - 13213
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13421 tataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttga 13322  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  13321 tgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcagtctaagttgatga 13223  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  13222 agatgatgat 13213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 960 - 1167
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  960 tataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat 1059  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaa 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1060 gaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgttgaa 1158  T
Q  201 gatgatgat 209  Q
    |||||||||    
T  1159 gatgatgat 1167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 167890 - 168097
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  167890 tataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat 167989  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaa 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  167990 gaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgttgaa 168088  T
Q  201 gatgatgat 209  Q
    |||||||||    
T  168089 gatgatgat 168097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 52123 - 51915
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  52123 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgt 52024  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  52023 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 51925  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  51924 agatgatgat 51915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 81)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 20698347 - 20698554
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  20698347 tataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgat 20698446  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaa 200  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  20698447 gaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatgaa 20698545  T
Q  201 gatgatgat 209  Q
    |||||||||    
T  20698546 gatgatgat 20698554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12399419 - 12399211
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  12399419 tataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgt 12399320  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12399319 tgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgttga 12399221  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  12399220 agatgatgat 12399211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13442484 - 13442276
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13442484 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttga 13442385  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13442384 tgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 13442286  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  13442285 agatgatgat 13442276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17488066 - 17487858
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17488066 tataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttga 17487967  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17487966 tgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 17487868  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  17487867 agatgatgat 17487858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17499548 - 17499340
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17499548 tataatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttga 17499449  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17499448 tgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 17499350  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  17499349 agatgatgat 17499340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26687097 - 26686889
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||    
T  26687097 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgt 26686998  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  26686997 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgaaga 26686899  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  26686898 agatgatgat 26686889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Original strand, 23083275 - 23083480
Alignment:
Q  4 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  23083275 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttga 23083374  T
Q  103 attgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaaga 202  Q
     ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23083375 cttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatgaaga 23083473  T
Q  203 tgatgat 209  Q
    |||||||    
T  23083474 tgatgat 23083480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 43841142 - 43840934
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  43841142 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgt 43841043  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  43841042 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtttaagttgatga 43840944  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    |||| |||||    
T  43840943 agataatgat 43840934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14973064 - 14972856
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||   || |||| | |||||||||    
T  14973064 tataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgt 14972965  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14972964 tgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 14972866  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  14972865 agatgatgat 14972856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 14576744 - 14576937
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14576744 tataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 14576843  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  14576844 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatactgtctatgttgctgttgttatttaactaag-ttgaatgagtcggtctaagttg 14576937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 24153120 - 24153326
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24153120 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 24153219  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  24153220 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactacctatgttgctatcgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatta 24153317  T
Q  200 agatgatga 208  Q
    |||||||||    
T  24153318 agatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18438744 - 18438536
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||   || |||   ||||||||||    
T  18438744 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgt 18438645  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  18438644 tgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-acatgagtcggtctaagttgatga 18438546  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  18438545 agatgatgat 18438536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 42386620 - 42386428
Alignment:
Q  2 ataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||   ||||||||| |||||||||    
T  42386620 ataatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgt 42386521  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagt 193  Q
    ||| ||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  42386520 tgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaact-gcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Original strand, 25476299 - 25476504
Alignment:
Q  4 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||   || ||| || ||||||||||||    
T  25476299 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttga 25476398  T
Q  103 attgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaaga 202  Q
     ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25476399 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttttttaactaagct-acatgagtcggtctaagttgatgaaga 25476497  T
Q  203 tgatgat 209  Q
    |||||||    
T  25476498 tgatgat 25476504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14572798 - 14572605
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatg-cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||  || || ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14572798 tataatttgtgaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatataatgtttttttcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 14572699  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    ||| |  |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14572698 tgactctcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttg 14572605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 11424676 - 11424878
Alignment:
Q  3 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||   || ||| || |||||||| |     
T  11424676 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgagatgttgat- 11424774  T
Q  102 aattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaag 201  Q
      |||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  11424775 --ttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcagtctaagttgatgaag 11424870  T
Q  202 atgatgat 209  Q
    ||||||||    
T  11424871 atgatgat 11424878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 40213632 - 40213838
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  ||   || ||| || |||||||||    
T  40213632 tataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgt 40213731  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |    
T  40213732 tgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatgttgttatttaactaagct-acatgagtcggtctaagttgatta 40213829  T
Q  200 agatgatga 208  Q
    |||||||||    
T  40213830 agatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 29172583 - 29172745
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  29172583 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29172682  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29172683 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 7781347 - 7781509
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  7781347 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7781446  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7781447 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 9707607 - 9707769
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9707607 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 9707706  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  9707707 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17463340 - 17463178
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17463340 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17463241  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17463240 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 34159488 - 34159326
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  34159488 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34159389  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  34159388 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 45606907 - 45607069
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  45606907 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 45607006  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  45607007 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 55476653 - 55476491
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  55476653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 55476554  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  55476553 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17672773 - 17672626
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    ||||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  17672773 tatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctatgttgttgtt 17672675  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17672674 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Original strand, 28848626 - 28848773
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  28848626 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 28848724  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28848725 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8899256 - 8899094
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8899256 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8899157  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  8899156 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 16454281 - 16454443
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16454281 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16454380  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16454381 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaag-ttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 38961891 - 38962053
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  38961891 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 38961990  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  38961991 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 13151790 - 13151953
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13151790 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13151889  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13151890 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 13154255 - 13154418
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13154255 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13154354  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13154355 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Original strand, 43550478 - 43550642
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| |||||    
T  43550478 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatact 43550577  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  43550578 gcatatgttgctgtcattatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 43550642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 6469134 - 6469296
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||| ||| || || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6469134 tgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6469233  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6469234 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 10247723 - 10247885
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10247723 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 10247822  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10247823 g-ttgtgctgctgttgttatttaactaagct-gtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 17446655 - 17446816
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17446655 tgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17446754  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  17446755 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13544172 - 13544024
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||    
T  13544172 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattg-ctgtgttgctgtt 13544074  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  13544073 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 206
Target Start/End: Original strand, 16282811 - 16282971
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16282811 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16282910  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 206  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16282911 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12567707 - 12567564
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||    
T  12567707 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattg-ctgtgttgctgtt 12567609  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12567608 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 50242969 - 50242822
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||    
T  50242969 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact-actgtgttgctgtt 50242871  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  50242870 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 192
Target Start/End: Original strand, 53070653 - 53070799
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  53070653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatact 53070752  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53070753 g-ttatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 30030049 - 30029856
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||  |  |||||||||||||| ||||     
T  30030049 tataatatgtgaagctgtttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatatttaagacgttg- 30029951  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||| |||||| |||||  ||| ||||| |||| |||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  30029950 tgaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaag-ttgcatgagtcagtctaagttg 30029856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  93 atgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaag 55500958  T
Q  193 ttgttgaagatgatga 208  Q
    ||| | ||||||||||    
T  55500957 ttgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 41124049 - 41123892
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41124049 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41123950  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 206  Q
    |    |  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  41123949 g----ttgtgttgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 36166719 - 36166598
Alignment:
Q  84 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagt 183  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36166719 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagct-gcatgagt 36166623  T
Q  184 cggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||| | ||||||||||    
T  36166622 cggtctaagttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 14179642 - 14179555
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgaatat 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  14179642 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 14179555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15977645 - 15977515
Alignment:
Q  76 atatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 175  Q
    |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||     
T  15977645 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagct- 15977548  T
Q  176 gcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15977547 gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 208
Target Start/End: Original strand, 12119780 - 12119887
Alignment:
Q  99 ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttg 198  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |     
T  12119780 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaacaaagct-gcatgagtcggtctaagttgatt 12119877  T
Q  199 aagatgatga 208  Q
    ||||||||||    
T  12119878 aagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15412536 - 15412429
Alignment:
Q  99 ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttg 198  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |     
T  15412536 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgtcgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatt 15412439  T
Q  199 aagatgatga 208  Q
    ||||||||||    
T  15412438 aagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 46822395 - 46822267
Alignment:
Q  80 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcat 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  | ||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||    
T  46822395 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaag-ttgcat 46822297  T
Q  180 gagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  46822296 gagtcagtctaagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21618570 - 21618462
Alignment:
Q  84 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagt 183  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21618570 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagct-gcatgagt 21618474  T
Q  184 cggtctaagttg 195  Q
    ||||||||||||    
T  21618473 cggtctaagttg 21618462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 24340637 - 24340842
Alignment:
Q  5 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttga 102  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||| || || |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| |    
T  24340637 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgttta 24340736  T
Q  103 attgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaag 201  Q
     ||||  | ||||| ||||| ||| | || || || ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  24340737 cttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagct-gcatgagtcagtctaagtcgttgaag 24340834  T
Q  202 atgatgat 209  Q
    ||| ||||    
T  24340835 atgttgat 24340842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8499625 - 8499518
Alignment:
Q  99 ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttg 198  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |     
T  8499625 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgatt 8499528  T
Q  199 aagatgatga 208  Q
    ||||||||||    
T  8499527 aagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Original strand, 13210371 - 13210446
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210371 tttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 13210446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 16796757 - 16796670
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgaatat 87  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  16796757 tataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 16796670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 44494905 - 44494809
Alignment:
Q  110 ttgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  44494905 ttgatattattatgttatgctgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 52523676 - 52523831
Alignment:
Q  39 ttatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtca--agctgtttt 135  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| | |||||  |||| |||  | ||| |||    
T  52523676 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaactg-ttt 52523774  T
Q  136 tgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52523775 tgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12511187 - 12511059
Alignment:
Q  80 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcat 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||  | ||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||    
T  12511187 ttgaatattgaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaag-ttgcat 12511089  T
Q  180 gagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||  ||||||||| | |||||| ||||    
T  12511088 gagtcattctaagttgattaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 10557087 - 10556985
Alignment:
Q  104 ttgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagat 203  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| |||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  10557087 ttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctga-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgattaagat 10556990  T
Q  204 gatga 208  Q
    |||||    
T  10556989 gatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Original strand, 12174303 - 12174376
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  12174303 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 149 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737236
Alignment:
Q  149 tgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17737294 tgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32307754 - 32307684
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  32307754 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15471001 - 15470940
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15471001 tttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttg 15470940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16103857 - 16103784
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16103857 tttgcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Original strand, 49668120 - 49668193
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  49668120 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 856304 - 856140
Alignment:
Q  40 tatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaag-ctgtttttgt 138  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||| |  |||| ||||    
T  856304 tatgatgtattataatgtttatgtattacttgaagattaattgtatacataagatgttgttgaattg-aattggtataatta--tcatgattgttgttgt 856208  T
Q  139 atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |  |||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||| | |||| || | |||||||||    
T  856207 aatctgcctatgttgctattgttattcaactaag-ttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 27165381 - 27165250
Alignment:
Q  76 atatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagct 174  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| ||| ||||| |||||||   ||| ||| | |||||| | |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27165381 atatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgtttt-gcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagct 27165283  T
Q  175 ggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  27165282 g-catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14234564 - 14234489
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  14234564 tttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagct-gcatgaatcagtctaagttgattaagatgatgat 14234489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  146 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 37642179 - 37642384
Alignment:
Q  5 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttga 102  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||| || || |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||||| |    
T  37642179 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgttta 37642278  T
Q  103 attgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaag 201  Q
     || |    ||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||| |  |||  |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  37642279 cttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagct-gcatgagtcggtccaagtcgttgaag 37642376  T
Q  202 atgatgat 209  Q
    ||| ||||    
T  37642377 atgttgat 37642384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9512997 - 9512924
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  9512997 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagct-gcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9520972 - 9520899
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  9520972 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagct-gcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16097405 - 16097332
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16097405 tttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 208
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45578000
Alignment:
Q  154 ctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23274832 - 23274705
Alignment:
Q  65 ttacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttat 163  Q
    |||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| | ||||  | ||||| ||||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||| ||||||     
T  23274832 ttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaa 23274734  T
Q  164 ttaactaagctggcatgagtcggtctaagt 193  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  23274733 ttaactaag-ttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 208
Target Start/End: Original strand, 53301594 - 53301669
Alignment:
Q  133 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  53301594 ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgt-atgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 116
Target Start/End: Original strand, 2051148 - 2051226
Alignment:
Q  39 ttatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatat 116  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  2051148 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatat 2051226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 43926079 - 43925977
Alignment:
Q  91 agatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtca--agctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggt 187  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||  |||||||||  | ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  43926079 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct-gcatgagtcggt 43925982  T
Q  188 ctaag 192  Q
    |||||    
T  43925981 ctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 173
Target Start/End: Original strand, 1644718 - 1644757
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagc 173  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1644718 tttgcatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagc 1644757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919350
Alignment:
Q  140 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtcta 190  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttattaactaagct-gcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 22110402 - 22110454
Alignment:
Q  140 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22110402 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct-gcatgagtcggtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 192
Target Start/End: Original strand, 37251168 - 37251270
Alignment:
Q  91 agatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaag--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggt 187  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||| |  |||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||||    
T  37251168 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct-gcatgactcggt 37251265  T
Q  188 ctaag 192  Q
    |||||    
T  37251266 ctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 60)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 20360871 - 20361079
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20360871 tataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttga 20360970  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  20360971 tgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcgatctaagttgatga 20361069  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    | ||||||||    
T  20361070 aaatgatgat 20361079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 20638194 - 20638402
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  20638194 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaagatgttga 20638293  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  20638294 taaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagct-gcatgagttggtctaagttgatga 20638392  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  20638393 agatgatgat 20638402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Original strand, 22780139 - 22780346
Alignment:
Q  2 ataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgttta-tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  22780139 ataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgtt 22780238  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaa 200  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  22780239 gacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagct-gcatgagtcagtctaagttgatgaa 22780337  T
Q  201 gatgatgat 209  Q
    |||||||||    
T  22780338 gatgatgat 22780346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16496411 - 16496246
Alignment:
Q  44 atgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  16496411 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 16496312  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496311 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 16496246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 17287707 - 17287915
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||| | ||| |||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  17287707 tataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgt 17287806  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  17287807 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatta 17287905  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  17287906 agatgatgat 17287915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29060750 - 29060542
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||  ||   || ||| || |||||||||    
T  29060750 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgt 29060651  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  29060650 tgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagctgatga 29060552  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  29060551 agatgatgat 29060542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 25629266 - 25629474
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||   || ||| || |||||||||    
T  25629266 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgt 25629365  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| |||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  25629366 tgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgttgtaatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 25629464  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  25629465 agatgatgat 25629474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 18409738 - 18409946
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||  ||   || ||  || |||||||||    
T  18409738 tataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgt 18409837  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18409838 tgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactgagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 18409936  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  18409937 agatgatgat 18409946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20593983 - 20593775
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||   ||  ||| ||| || |||||||||    
T  20593983 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatgttgt 20593884  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  20593883 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagct-gcatgattcggtctaagttgatga 20593785  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  20593784 agatgatgat 20593775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245588
Alignment:
Q  36 tgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||   |||| |    
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgt 35245662  T
Q  136 tgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35245661 tgtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagct-gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 35245588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 16920544 - 16920749
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |    
T  16920544 tataatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgat 16920643  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    |||| | | |||||||  ||||||||   || | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  16920644 gaatggaatttgatatacttatgtca---tgatgttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtcaaagatgttga 16920739  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  16920740 agatgatgat 16920749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22831712 - 22831505
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaat--atttaagatgttg 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  || ||||||||||    
T  22831712 tataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttg 22831613  T
Q  99 ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgtt 197  Q
     ||||||| | |||||||||||||||||   |||  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||    
T  22831612 atgaattgaatttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctactatgtt 22831517  T
Q  198 gaagatgatgat 209  Q
    ||||||||||||    
T  22831516 gaagatgatgat 22831505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 19303452 - 19303659
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||  ||   || ||| || |||||||||    
T  19303452 tataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgt 19303551  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  19303552 tgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagatgatga 19303649  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  19303650 agatgatgat 19303659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076702
Alignment:
Q  44 atgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |   ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || |||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttac 20076768  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20076767 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 20076702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12742479 - 12742317
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  12742479 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12742380  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12742379 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 18334592 - 18334754
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18334592 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18334691  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18334692 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19005208 - 19005046
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  19005208 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19005109  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19005108 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 19858919 - 19859081
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  19858919 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19859018  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19859019 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22782389 - 22782227
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  || | |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22782389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22782290  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22782289 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24422709 - 24422547
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  24422709 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24422610  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24422609 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33861956 - 33861794
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  33861956 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33861857  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  33861856 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33864440 - 33864278
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  33864440 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33864341  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  33864340 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25754956 - 25754809
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  25754956 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttgctgtt 25754858  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  25754857 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1595711 - 1595549
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  1595711 tgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1595612  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  1595611 g-ttatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 2291180 - 2291342
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  2291180 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 2291279  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2291280 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8055191 - 8055029
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8055191 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8055092  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
       | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  8055091 -tttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 26924640 - 26924802
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26924640 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26924739  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
       | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26924740 -attgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11185710 - 11185517
Alignment:
Q  3 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttga 102  Q
    |||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||   |||||| || |||    
T  11185710 taatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatga 11185611  T
Q  103 attgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    |||| | ||||||| |||||||||   |||| ||||| |||||  |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11185610 attgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagatgttga 11185517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 209
Target Start/End: Original strand, 30676725 - 30676873
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30676725 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 30676823  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  30676824 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 30676873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34963520 - 34963372
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  34963520 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 34963422  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  34963421 gttatttaactaag-ttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 34963372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Original strand, 1540926 - 1541073
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  1540926 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 1541024  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  1541025 gttatttaactaagct-gcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25656776 - 25656629
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||| |||| |||||  |||| |||||| || ||| ||| || | ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25656776 tatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctatgttgctgtt 25656678  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  25656677 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25688649 - 25688502
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||| ||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25688649 tatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttatgttgctgtt 25688551  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| ||||    
T  25688550 gttatttaactaagct-gcatgagtcgatctaagttgattaagataatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18456881 - 18456735
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18456881 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18456782  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
       | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18456781 -attgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25644490 - 25644336
Alignment:
Q  42 tgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtat 140  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| || || |||||||  |||| ||| |||||||||| ||    
T  25644490 tgatgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcat 25644391  T
Q  141 actgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25644390 actgcctatgttgctgtctgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttg 25644336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 59 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18462026 - 18461895
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||    
T  18462026 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctgtt 18461928  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18461927 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 3852017 - 3852179
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| || |||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  3852017 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3852116  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
       | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3852117 -attgtgttgctgttgttattaaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 205
Target Start/End: Original strand, 16448526 - 16448686
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  16448526 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16448625  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 205  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  16448626 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 20556894 - 20557054
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||   || ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  20556894 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaaa--ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 20556991  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  20556992 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 161
Target Start/End: Original strand, 27415887 - 27416011
Alignment:
Q  36 tgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaat-atttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtt 133  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||      
T  27415887 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg-- 27415983  T
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 161  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27415984 tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 27416011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 18821795 - 18821946
Alignment:
Q  39 ttatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatg-ttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttg 137  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||  |||||| || ||||| ||||||  ||||  |||||||  ||||| || ||||||||||    
T  18821795 ttatgatgtgatataatgtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcg-ttgatattgttatggcatgctgtttttg 18821893  T
Q  138 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18821894 tatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Original strand, 19847949 - 19848114
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaa-tatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||   ||||||  ||||  |    
T  19847949 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttgatgtaatc 19848048  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  19848049 tgcctatgctgctattgttatttaactaag-ttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 19848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 172
Target Start/End: Original strand, 15041465 - 15041633
Alignment:
Q  4 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatat-ttgaatatttaagatgttgttga 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || | |||| ||| || | |||||| | |||||||||||| || | | ||||||| |||||||||| ||||    
T  15041465 aatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgataattaagatttggtttaatgtatgtgcattacttga-gattttattgaatacttaagatgttattga 15041563  T
Q  103 attgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 172  Q
    |||||| ||||||| || |||||| |||||| ||||   ||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  15041564 attgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaag 15041633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 172
Target Start/End: Original strand, 25603299 - 25603467
Alignment:
Q  4 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |  ||||||| || |||||| || ||    
T  25603299 aatctgtgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtagt-ga 25603397  T
Q  103 attgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 172  Q
    |||  || ||||||  |||||||| | |||| |||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25603398 attataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaag 25603467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Original strand, 27333262 - 27333337
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27333262 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 27333337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Original strand, 27394002 - 27394077
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27394002 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 27394077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Original strand, 28496515 - 28496590
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28496515 tttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagtttttgaagatgatgat 28496590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Original strand, 29808926 - 29809001
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29808926 tttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagtttttgaagatgatgat 29809001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20109312 - 20109154
Alignment:
Q  39 ttatgatgtgatataatgtt---tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttt 135  Q
    |||| |||||||||||| ||   ||| |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||  |||| | | | || |||    
T  20109312 ttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttg-ttt 20109214  T
Q  136 tgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    || |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20109213 tgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct-gcatgagtcggtctaagttg 20109154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 172
Target Start/End: Original strand, 25611637 - 25611805
Alignment:
Q  4 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttga 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |  ||||||| || |||||| || ||    
T  25611637 aatctatgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtagt-ga 25611735  T
Q  103 attgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 172  Q
    |||  || ||||||  |||||||| | |||| |||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25611736 attataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaag 25611805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714419
Alignment:
Q  149 tgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 25714419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23992554 - 23992429
Alignment:
Q  80 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcat 179  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||||  ||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||||| | ||||    
T  23992554 ttgaatatttaagatgttg---aattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaag-ttgcat 23992459  T
Q  180 gagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  23992458 gagtcagtctaagttgattaagatgttgat 23992429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561305
Alignment:
Q  157 ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctg-catgagtcagtctaagttgttgaagatgatgat 1561305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 8227425 - 8227630
Alignment:
Q  5 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttga 102  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||| || || |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||||| |    
T  8227425 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgttta 8227524  T
Q  103 attgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaag 201  Q
     || |    ||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||||| ||||||| |  |||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8227525 cttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagct-gcatgagtcggtccaagttgttgaag 8227622  T
Q  202 atgatgat 209  Q
    ||| ||||    
T  8227623 atgttgat 8227630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 195
Target Start/End: Original strand, 9098557 - 9098619
Alignment:
Q  133 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9098557 ttttgcatactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttg 9098619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19652272 - 19652199
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19652272 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 33443124 - 33443068
Alignment:
Q  133 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtcta 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  33443124 ttttatatactgcctatgttgctgttgtttattaactaagct-gcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19668449 - 19668387
Alignment:
Q  133 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19668449 ttttgcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctg-catgagtcggtctaagttg 19668387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23019525 - 23019425
Alignment:
Q  91 agatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtct 189  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||| | |||||| | ||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||| |||| |||||||||    
T  23019525 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagct-gcataagtcggtct 23019428  T
Q  190 aag 192  Q
    |||    
T  23019427 aag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 195
Target Start/End: Original strand, 4185870 - 4185926
Alignment:
Q  139 atactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  4185870 atactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgct-gcatgagtcggtccaagttg 4185926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 61)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23286071 - 23285867
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  23286071 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttga 23285972  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23285971 tgaattgcaattgatattattatgt----ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 23285877  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  23285876 agatgatgat 23285867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 22731145 - 22731353
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  22731145 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttga 22731244  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  22731245 tgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaacttgatga 22731343  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  22731344 agatgatgat 22731353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23076652 - 23076444
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  23076652 tataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgt 23076553  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  23076552 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagtggatga 23076454  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  23076453 agatgatgat 23076444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23060716 - 23060515
Alignment:
Q  8 tgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  23060716 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttg 23060617  T
Q  107 caattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 206  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23060616 caattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 23060518  T
Q  207 gat 209  Q
    |||    
T  23060517 gat 23060515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 22738091 - 22738298
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22738091 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttga 22738190  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  22738191 tgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatca 22738288  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  22738289 agatgatgat 22738298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 23654297 - 23654505
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||     
T  23654297 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttga 23654396  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23654397 tgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgttga 23654495  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  23654496 agatgatgat 23654505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 38027 - 38233
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||| || |    
T  38027 tataatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgatgat 38126  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaa 200  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38127 gaatcgaaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgttgaa 38224  T
Q  201 gatgatgat 209  Q
    |||||||||    
T  38225 gatgatgat 38233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 298725 - 298933
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  298725 tataatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgt 298824  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttg 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |     
T  298825 tgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatt 298923  T
Q  199 aagatgatga 208  Q
    ||||||||||    
T  298924 aagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20309315 - 20309110
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |    
T  20309315 tataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgat 20309216  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgct-gttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20309215 gaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagatgttga 20309120  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  20309119 agatgatgat 20309110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22337325 - 22337117
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||   || |||||| |||||||||    
T  22337325 tataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgt 22337226  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22337225 tgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 22337127  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  22337126 agatgatgat 22337117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23660232 - 23660025
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||    
T  23660232 tataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgt 23660133  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||    
T  23660132 tgatttgcatttgatattattatgtcatcctg-tttcgtatactgcctatgttgctgttgttgtttaactaagat-acatgagtcggtctaagttgatga 23660035  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  23660034 agatgatgat 23660025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22105575 - 22105412
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  22105575 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 22105476  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22105475 gcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 205
Target Start/End: Original strand, 21155060 - 21155219
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  21155060 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21155159  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 205  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21155160 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18809105 - 18808943
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18809105 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18809006  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18809005 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23131024 - 23130862
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23131024 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23130925  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23130924 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23133491 - 23133329
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23133491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23133392  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23133391 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 23709532 - 23709694
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23709532 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23709631  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23709632 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 23712013 - 23712175
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23712013 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23712112  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23712113 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26505541 - 26505379
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26505541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26505442  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26505441 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26508019 - 26507857
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26508019 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26507920  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26507919 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 34402522 - 34402684
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  34402522 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34402621  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  34402622 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 39682475 - 39682313
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  39682475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39682376  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  39682375 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23135737 - 23135590
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  23135737 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 23135639  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23135638 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 571559 - 571397
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||| | || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  571559 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 571460  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  571459 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6726157 - 6725995
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| || || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6726157 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6726058  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6726057 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24367936 - 24367774
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  24367936 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24367837  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  24367836 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 209
Target Start/End: Original strand, 32214936 - 32215084
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  32214936 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgtt 32215034  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  32215035 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 32215084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 24898195 - 24898358
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  24898195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24898294  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24898295 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 24900678 - 24900841
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  24900678 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24900777  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24900778 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 24903155 - 24903318
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  24903155 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24903254  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24903255 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 24905632 - 24905795
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  24905632 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24905731  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24905732 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 24908107 - 24908270
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  24908107 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24908206  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24908207 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 32039498 - 32039660
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32039498 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32039597  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  32039598 g-ttgtgttactgttgttatttaactaagct-gcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 42 - 209
Target Start/End: Original strand, 23103348 - 23103514
Alignment:
Q  42 tgatgtgatataatgttta--tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgta 139  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||  ||   |||||  || |||||||| ||||||| | ||||||| || |||||| |||||||  |||    
T  23103348 tgatgtgatataatgtttaattgcatgacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gta 23103445  T
Q  140 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23103446 tactgcctatgttgctgtttttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 23103514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 28577261 - 28577099
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28577261 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 28577162  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28577161 g-ttgcgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 45029854 - 45030016
Alignment:
Q  45 tgtgatataa-tgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |    
T  45029854 tgtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 45029953  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  45029954 g-ttgtgttgttgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 43137461 - 43137301
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||| | || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |    
T  43137461 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtata-t 43137363  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 206  Q
      || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  43137362 tactgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 195
Target Start/End: Original strand, 23708533 - 23708724
Alignment:
Q  5 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttga 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||| || || |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||| | |||    
T  23708533 atctgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatga 23708632  T
Q  103 attgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
     |||||||||||||  |||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23708633 tttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagct-gcttgagtcggtctaagttg 23708724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 24529528 - 24529691
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaa-tatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||| || || ||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  24529528 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 24529627  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    ||  | ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24529628 tg-atgtgttgttgttgttatttaactatgct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 133 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946659
Alignment:
Q  133 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 8946659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25616315 - 25616192
Alignment:
Q  80 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcat 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||  ||||  ||||||||| |||| |||| ||||||||||| | ||||    
T  25616315 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaag-ttgcat 25616217  T
Q  180 gagtcggtctaagttgttgaagatg 204  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||    
T  25616216 gagtcagtctaagttgattaagatg 25616192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 38967537 - 38967374
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||     
T  38967537 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatat 38967438  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    ||  | ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  38967437 tgt-tgtgtcgatgttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19672001 - 19671832
Alignment:
Q  39 ttatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttg 137  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||||| | ||||||||| | ||||  | ||||| ||||| ||| | |||||| |    
T  19672001 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattga-gatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgtttt-g 19671904  T
Q  138 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
     |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  19671903 catactgcctatgttgctgattgttaattaactaagct-gcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 19671832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28406103 - 28405981
Alignment:
Q  84 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgag 182  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||  |||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  28406103 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag-ttgcatgag 28406005  T
Q  183 tcggtctaagttgttgaagatgat 206  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||    
T  28406004 tcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 209
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040308
Alignment:
Q  147 tatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 23040308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Original strand, 23071993 - 23072068
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23071993 tttgcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctg-catgagtcggactaagttgttgaagatgatgat 23072068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 205
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643109
Alignment:
Q  128 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 205  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactga-tgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Original strand, 22134251 - 22134325
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| |||||||||    
T  22134251 tttgcatactgcctatgttgctgttgatatttaactaagct-gcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgat 22134325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 32451878 - 32452031
Alignment:
Q  39 ttatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatg-ttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttg 137  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||  ||  |||||| || ||||| ||||||  ||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||    
T  32451878 ttatgatgtgatattatgtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgca-ttgatattgttatgtcatgctatttttg 32451976  T
Q  138 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
     || ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  32451977 aatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagct-gcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7679662 - 7679589
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  7679662 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct-gcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25175976 - 25175854
Alignment:
Q  84 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgag 182  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||  |||| ||| | || ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||     
T  25175976 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct-gcatgaa 25175879  T
Q  183 tcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    || |||||||||| ||| |||||||    
T  25175878 tctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 27753785 - 27753730
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatg 56  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27753785 tataatatgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 27753730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 82
Target Start/End: Original strand, 40622123 - 40622200
Alignment:
Q  4 aatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttg 82  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40622123 aatctgtgaagctgttatgagatgt-ttgt-gttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttg 40622200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 192
Target Start/End: Original strand, 7687 - 7835
Alignment:
Q  44 atgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||| |||||||  |||| ||| | || ||||| ||||    
T  7687 atgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatac 7785  T
Q  143 tgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| || |||||||    
T  7786 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct-gcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 195
Target Start/End: Original strand, 18786947 - 18787008
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18786947 tttgcatactacctatgttactgattgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttg 18787008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 40 - 172
Target Start/End: Original strand, 22799076 - 22799209
Alignment:
Q  40 tatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttg 137  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||  ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||| || | |||| | |||| |||    
T  22799076 tatgatgtgatataatgttatgtgccttactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgatgttgttg 22799174  T
Q  138 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 172  Q
    |   ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22799175 tgatctgcctatgctgctattgttatttaactaag 22799209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 40 - 172
Target Start/End: Original strand, 23019656 - 23019789
Alignment:
Q  40 tatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttg 137  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||| ||  ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||| || | |||| | |||| |||    
T  23019656 tatgatgtgatataacgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgttgttgttg 23019754  T
Q  138 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 172  Q
    |   ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23019755 tgatctgcctatgctgctattgttatttaactaag 23019789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  140 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtcta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagct-gcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  141 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtcta 190  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagct-gcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23207355 - 23207296
Alignment:
Q  133 ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23207355 ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct-gcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 121
Target Start/End: Original strand, 24642856 - 24642933
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgatta 121  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  24642856 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 154; Significance: 7e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5059 - 4851
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||    
T  5059 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgt 4960  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  4959 tgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaatct-gcatgagtcggtctaagttgttga 4861  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  4860 agatgatgat 4851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 154; Significance: 7e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2061 - 1853
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2061 tataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttga 1962  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  1961 tgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 1863  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  1862 agatgatgat 1853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 154; Significance: 7e-82; HSPs: 66)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 23390407 - 23390615
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23390407 tataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttga 23390506  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23390507 tgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 23390605  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  23390606 agatgatgat 23390615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 8286760 - 8286962
Alignment:
Q  8 tgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  8286760 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattg 8286859  T
Q  107 caattgatatgattatgtcaagctg-tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 205  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8286860 caattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 8286958  T
Q  206 tgat 209  Q
    ||||    
T  8286959 tgat 8286962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22075229 - 22075028
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  22075229 tataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgt 22075130  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22075129 tgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gaatgagtcggtctaagttgttga 22075031  T
Q  200 aga 202  Q
    |||    
T  22075030 aga 22075028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25421742 - 25421534
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  25421742 tataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgt 25421643  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  25421642 tgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 25421544  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  25421543 agatgatgat 25421534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25431604 - 25431397
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  25431604 tataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgt 25431505  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  |||    
T  25431504 tgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagat-gcatgagtcggtctaa-tttatga 25431407  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  25431406 agatgatgat 25431397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808508
Alignment:
Q  44 atgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21808442  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808443 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 21808508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Original strand, 21729018 - 21729183
Alignment:
Q  44 atgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  21729018 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21729117  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729118 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 21729183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24493778 - 24493571
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24493778 tataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 24493679  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24493678 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttacttaaccaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 24493581  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  24493580 agatgatgat 24493571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24529430 - 24529223
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||   || ||| ||||||||||||    
T  24529430 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgt 24529331  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24529330 tgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 24529232  T
Q  200 agatgatga 208  Q
    |||||||||    
T  24529231 agatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9078162 - 9077954
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||   || ||| || |||||||||    
T  9078162 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgt 9078063  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||    
T  9078062 tgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgggtcagtctaagttgatga 9077964  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  9077963 agatgatgat 9077954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 21292881 - 21293088
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |    
T  21292881 tataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgat 21292980  T
Q  101 gaattgca--attgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttg 198  Q
    |||||  |  |||||||| |||||||||  |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  21292981 gaatttgaatattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgaatcggtctaagatgttg 21293077  T
Q  199 aagatgatgat 209  Q
    |||||||||||    
T  21293078 aagatgatgat 21293088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13025520 - 13025313
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  13025520 tataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 13025421  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13025420 tgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgct-gcatgagtcggtctaagttgatga 13025323  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  13025322 agatgatgat 13025313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13095704 - 13095497
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  13095704 tataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 13095605  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13095604 tgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgct-gcatgagtcggtctaagttgatga 13095507  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  13095506 agatgatgat 13095497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1096677 - 1096469
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||   || |||| | |||||||||    
T  1096677 tataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgt 1096578  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||| | | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  1096577 tgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 1096479  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||| ||||    
T  1096478 agatgttgat 1096469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 264768 - 264930
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  264768 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 264867  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  264868 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 39363546 - 39363384
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  39363546 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39363447  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  39363446 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 208
Target Start/End: Original strand, 10732941 - 10733102
Alignment:
Q  46 gtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactg 144  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10732941 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 10733040  T
Q  145 cctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
      | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10733041 -ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 209
Target Start/End: Original strand, 21997549 - 21997653
Alignment:
Q  104 ttgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagat 203  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21997549 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatgaagat 21997647  T
Q  204 gatgat 209  Q
    ||||||    
T  21997648 gatgat 21997653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20909174 - 20909012
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20909174 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20909075  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20909074 g-ttgtgttgcttttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29330096 - 29329934
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  29330096 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 29329997  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29329996 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 42245365 - 42245527
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  42245365 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 42245464  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  42245465 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaag-ttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29346142 - 29345980
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  29346142 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29346043  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29346042 g-ttgtgatgctgttgttatttaactaagct-gtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22412383 - 22412187
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||      ||||    ||||||||  ||   || |||||| ||||||||||    
T  22412383 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac-----ttat----tacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgtt 22412293  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaa 200  Q
    || ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||    
T  22412292 gacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagct-acatgagtcggtctaagttgattaa 22412195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 36154783 - 36154942
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  36154783 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 36154882  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    ||   || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36154883 gc---tg-tgttgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 39245283 - 39245136
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| ||  || ||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  39245283 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 39245185  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  39245184 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 20902008 - 20902158
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaa-tatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||| || || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  20902008 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 20902107  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20902108 tg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttg 20902158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29348615 - 29348453
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  29348615 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29348516  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | || ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29348515 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagct-gtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29351088 - 29350926
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  29351088 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29350989  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | || ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29350988 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagct-gtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356364
Alignment:
Q  36 tgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgttt 134  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||  |    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctg--t 18356391  T
Q  135 ttgtatactgcctatgttgctgttgtt 161  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18356390 ttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 18356364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 2154613 - 2154776
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaa-tatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||| || || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  2154613 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 2154712  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    ||  | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2154713 tg-ttgtgttgctattgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 11581199 - 11581361
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||  |||  |||||| || ||| ||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  11581199 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 11581298  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11581299 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 32027555 - 32027393
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32027555 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32027456  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  32027455 g-ttgtgttgttgttgttatttaactaag-ttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 205
Target Start/End: Original strand, 18319033 - 18319193
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  18319033 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 18319132  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 205  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  18319133 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18418788 - 18418596
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg 98  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||    
T  18418788 tataacctgtgaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatatt-aagatgttg 18418690  T
Q  99 ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-tttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    | ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||    
T  18418689 t-gaattgcaaatgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaag-ttgcacgagtcagtctaagttg 18418596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 161
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910869
Alignment:
Q  36 tgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaa-tatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtt 133  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||      
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatgttcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-- 20910841  T
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 161  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20910842 tttgtatgctgtctatgttgctgttgtt 20910869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22144216 - 22144068
Alignment:
Q  44 atgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| | || ||||| ||||    
T  22144216 atgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatac 22144118  T
Q  143 tgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    | ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22144117 tacctatgttgatgtctgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 37724073 - 37723910
Alignment:
Q  40 tatgatgtgatataatgttta--tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttg 137  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||   |||||  || |||||||| ||||||  | ||||||| || |||||| ||||||   |    
T  37724073 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---g 37723977  T
Q  138 tatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  37723976 tatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagct-gcatgagtcagtctaagatgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 10775675 - 10775838
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  10775675 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatac 10775774  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10775775 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Original strand, 19660879 - 19660954
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19660879 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 19660954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 209
Target Start/End: Original strand, 17517192 - 17517320
Alignment:
Q  80 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcat 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||  ||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||| ||||||| | ||||    
T  17517192 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattaaactaag-ttgcat 17517290  T
Q  180 gagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  17517291 gagtcagtctaagttgattaagatgttgat 17517320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 22107284 - 22107357
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattacttgaa 73  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22107284 tataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 31061175 - 31061068
Alignment:
Q  99 ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttg 198  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |     
T  31061175 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgttttgctgttgttatttaactaag-ttgcatgagtcggtctaagttgatt 31061078  T
Q  199 aagatgatga 208  Q
    ||||||||||    
T  31061077 aagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 38619541 - 38619434
Alignment:
Q  99 ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttg 198  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |     
T  38619541 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgtcgttgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatt 38619444  T
Q  199 aagatgatga 208  Q
    ||||||||||    
T  38619443 aagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 208
Target Start/End: Original strand, 20918017 - 20918110
Alignment:
Q  113 atatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20918017 atattattttgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 192
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027043
Alignment:
Q  92 gatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtca--agctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtc 188  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  | ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactg-ttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtc 20027039  T
Q  189 taag 192  Q
    ||||    
T  20027040 taag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Original strand, 21329541 - 21329616
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  21329541 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 21329616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23064618 - 23064512
Alignment:
Q  99 ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttg 198  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||  || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |     
T  23064618 ttgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatact-actgtgtcgttgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatt 23064521  T
Q  199 aagatgatg 207  Q
    |||||||||    
T  23064520 aagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 36314654 - 36314579
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36314654 tttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 36314579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Original strand, 22959576 - 22959649
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22959576 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21565619 - 21565546
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21565619 tttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24067270 - 24067110
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||||| || ||| | || |||| ||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  24067270 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 24067171  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 205  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| | |||||||    
T  24067170 tg-ttgtgtcgctgttgttatttaaccaagct-gcattggtcggtctaagttgattaagatga 24067110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 209
Target Start/End: Original strand, 21502205 - 21502275
Alignment:
Q  139 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  21502205 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctg-catgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 21502275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 23572252 - 23572182
Alignment:
Q  36 tgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattg 106  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||| |||||||    
T  23572252 tgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg 23572182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 21986058 - 21986130
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttga 72  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  21986058 tataatttgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgaatatgaggtgataaaatgttatatgcattacttga 21986130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22032485 - 22032323
Alignment:
Q  40 tatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgta 139  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||  ||| | | | ||||||    
T  22032485 tatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgat-tgtttgta 22032390  T
Q  140 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
      |||||||||||||| |||||||| ||| ||| | |||||||||| | |||| || | |||||||||    
T  22032389 atctgcctatgttgctattgttattcaaccaag-ttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 40 - 106
Target Start/End: Original strand, 18769954 - 18770020
Alignment:
Q  40 tatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattg 106  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||| |||||||    
T  18769954 tatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg 18770020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 195
Target Start/End: Original strand, 26012079 - 26012140
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26012079 tttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct-gcatgagtcggtctaagttg 26012140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26704152 - 26704075
Alignment:
Q  129 ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  26704152 ctgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagct-gcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 141 - 195
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  141 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagct-gcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26973885 - 26973808
Alignment:
Q  129 ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  26973885 ctgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagct-gcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19668975 - 19668900
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19668975 tttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctg-caagagtcggtctaagttgatgatgatgatgat 19668900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 144
Target Start/End: Original strand, 20766115 - 20766174
Alignment:
Q  84 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactg 144  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  20766115 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg 20766174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 208
Target Start/End: Original strand, 20806850 - 20806904
Alignment:
Q  153 gctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  20806850 gctgttgttatttaattaagctg-catgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 192
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  141 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttattaactaagct-gcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40726060 - 40725855
Alignment:
Q  5 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttga 102  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||| || || |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||||| |    
T  40726060 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgttta 40725961  T
Q  103 attgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaag 201  Q
     || |    ||||| ||||| ||| | ||  |||| |||||||||| ||||||| |  |||  |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  40725960 cttacgtgcgatattattatatcatgatg-ctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagct-gcatgagtcggtccaagtcgttgaag 40725863  T
Q  202 atgatgat 209  Q
    ||| ||||    
T  40725862 atgttgat 40725855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 29448123 - 29448052
Alignment:
Q  91 agatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtca--agctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 161  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29448123 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgttgtt 29448052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3680 - 3472
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3680 tataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttga 3581  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  3580 tgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctttagttatttaactaagct-acatgagtcggtctaagttgatga 3482  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  3481 agatgatgat 3472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 552 - 345
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  552 tataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgt 453  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| || |||||||||| |||| |||| |||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |    
T  452 tgacttccaattgatattattacgtcatgct-attttgtatactgcctatgttattgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagtcgataa 355  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  354 agatgatgat 345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4921 - 4714
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||| ||| |    
T  4921 tataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgat 4822  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaa 200  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4821 gaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgttgaa 4723  T
Q  201 gatgatgat 209  Q
    |||||||||    
T  4722 gatgatgat 4714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 145 - 1
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||| ||| |    
T  145 tataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgat 46  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgc 145  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  45 gaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 138; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32274 - 32069
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |    
T  32274 tataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgat 32175  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaa 200  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32174 gaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgttgaa 32078  T
Q  201 gatgatgat 209  Q
    |||||||||    
T  32077 gatgatgat 32069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 6039 - 6243
Alignment:
Q  8 tgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6039 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 6138  T
Q  107 caattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgccta---tgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagat 203  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  6139 caattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatgaagat 6237  T
Q  204 gatgat 209  Q
    ||||||    
T  6238 gatgat 6243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 24212 - 24406
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctga-ttatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24212 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg 24311  T
Q  99 ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagt 193  Q
     |||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24312 atgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 133; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 15376 - 15582
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| |    
T  15376 tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatttatgcattacttgaagaatatttttatacataagatgttgat 15475  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaa 200  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  15476 gaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagct-gcatgagtcagtctaagttgttgaa 15573  T
Q  201 gatgatgat 209  Q
    |||||||||    
T  15574 gatgatgat 15582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 40 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 7459 - 7393
Alignment:
Q  40 tatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattg 106  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||| |||||||    
T  7459 tatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg 7393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 132; Significance: 9e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 10337 - 10542
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  10337 tataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgtt 10436  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10437 gaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgct-gcatgagtcggtctaagttgttga 10532  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  10533 agatgatgat 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 130; Significance: 1e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33151 - 32944
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  33151 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 33052  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    | | ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  33051 taacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagct-gcatgagtcggtctaacttgatga 32954  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  32953 agatgatgat 32944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38970 - 38763
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  38970 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 38871  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    | | ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  38870 ttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagct-gcatgactcggtctaagttgatga 38773  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  38772 agatgatgat 38763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 9912 - 9749
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaa-tatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||| || || ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  9912 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatac 9813  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  9812 tg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2161 - 1954
Alignment:
Q  2 ataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    ||||| ||| ||||||| || ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2161 ataatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgtt 2062  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaa 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  2061 gaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgttgttaattaactaagct-gcatgagtcggtctaagatgttgaa 1963  T
Q  201 gatgatgat 209  Q
    |||||||||    
T  1962 gatgatgat 1954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13705 - 13499
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| |    
T  13705 tataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgat 13606  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaa 200  Q
    |||| | ||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13605 gaatcgaaattgatattatcatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgttgaa 13508  T
Q  201 gatgatgat 209  Q
    | |||||||    
T  13507 gttgatgat 13499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23092 - 22886
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23092 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 22993  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  22992 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatta 22895  T
Q  200 agatgatga 208  Q
    |||||||||    
T  22894 agatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 128; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 8444 - 8648
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  8444 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgt 8543  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  8544 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgcctatgttgc---tgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 8638  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  8639 agatgatgat 8648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 127; Significance: 9e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21121 - 20912
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  21121 tataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgt 21022  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttg 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||||    
T  21021 tgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagct-ttatgagtcggtctaagtcgttg 20923  T
Q  199 aagatgatgat 209  Q
    |||||| ||||    
T  20922 aagatgttgat 20912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 3062 - 3269
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||   || |||||| |||||||||    
T  3062 tataacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgt 3161  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  3162 tgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 3259  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  3260 agatgatgat 3269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 116; Significance: 3e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3305
Alignment:
Q  7 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttat-gcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaatt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||   || ||| || |||||||||||||||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  106 gcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 205  Q
     || ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 3301  T
Q  206 tgat 209  Q
    ||||    
T  3302 tgat 3305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 114; Significance: 5e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 39686 - 39479
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||   || |||||| |||||||||    
T  39686 tataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgt 39587  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  39586 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 39489  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||| ||||||    
T  39488 agacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 114; Significance: 5e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 75126 - 75333
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||   || |||||| |||||||||    
T  75126 tataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgt 75225  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  75226 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 75323  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||| ||||||    
T  75324 agacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 114; Significance: 5e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26105 - 25898
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  26105 tataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgt 26006  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    | | ||||| ||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  26005 ttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagct-tcatgagtcggtctaagttgatga 25908  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    |||| |||||    
T  25907 agataatgat 25898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40067 - 39860
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  40067 tataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgt 39968  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    | | ||||| ||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||    
T  39967 ttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagct-tcatgagttggtctaagttgatga 39870  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  39869 agatgatgat 39860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 25976 - 26179
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttat-gcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||   || ||| || ||| |||||    
T  25976 tataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgt 26075  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  26076 tgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatga 26174  T
Q  200 agatg 204  Q
    |||||    
T  26175 agatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 208
Target Start/End: Original strand, 44702 - 44825
Alignment:
Q  84 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagt 183  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44702 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagt 44800  T
Q  184 cggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    | |||||||||| | ||||||||||    
T  44801 cagtctaagttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 33406 - 33463
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt 58  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33406 tataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgtt 33463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 112; Significance: 8e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 963 - 1168
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |    
T  963 tataatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgat 1062  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||   || | ||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1063 gaattgaaattgatataattatgtca---tgatgttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagct-gcatgagtcggtctaagatgttga 1158  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  1159 agatgatgat 1168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 112; Significance: 8e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16489 - 16284
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||| |||||| |    
T  16489 tataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataatatgttgat 16390  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16389 gaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagatgttga 16294  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  16293 agatgatgat 16284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 112; Significance: 8e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4717 - 4513
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||   || |||||| |||||||||    
T  4717 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgt 4618  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  4617 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc--gcatgagtcggtctaagttgatga 4520  T
Q  200 agatgat 206  Q
    | |||||    
T  4519 aaatgat 4513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12299 - 12095
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||   || |||||| |||||||||    
T  12299 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgt 12200  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  12199 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc--gcatgagtcggtctaagttgatga 12102  T
Q  200 agatgat 206  Q
    | |||||    
T  12101 aaatgat 12095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22251 - 22047
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||   || |||||| |||||||||    
T  22251 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgt 22152  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  22151 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc--gcatgagtcggtctaagttgatga 22054  T
Q  200 agatgat 206  Q
    | |||||    
T  22053 aaatgat 22047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 112; Significance: 8e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 47202 - 46997
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||| |    
T  47202 tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtttatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttgat 47103  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||||    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  47102 gaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ctgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagct-acatgagtcggtctaagatgttga 47007  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  47006 agatgatgat 46997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8682 - 8481
Alignment:
Q  4 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttga 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    ||||||| | |||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||    
T  8682 aatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttga 8587  T
Q  103 attgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaaga 202  Q
     ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8586 cttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaaccaagct-gcatgagtcggtctaagttgatgaaga 8488  T
Q  203 tgatgat 209  Q
    |||||||    
T  8487 tgatgat 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 17126 - 17336
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttat-gcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||   || ||| || |||||||||    
T  17126 tataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgt 17225  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttt--tgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgtt 197  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  17226 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgat 17324  T
Q  198 gaagatgatgat 209  Q
    ||||||||||||    
T  17325 gaagatgatgat 17336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 59 - 192
Target Start/End: Original strand, 79299 - 79430
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||    
T  79299 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactgtc-gtgttgctgtt 79397  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  79398 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 13302 - 13144
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  13302 tataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgt 13203  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13202 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34199 - 34125
Alignment:
Q  135 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34199 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgt-atgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 34125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 275
Alignment:
Q  154 ctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctg-catgaatcggtctaagttgatgaagataatgat 275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40122 - 39915
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| |    
T  40122 tataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttat 40023  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    |||  |||| ||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  40022 tgacatgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagct-gcatgagttggtctaagttgatga 39925  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  39924 agatgatgat 39915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 192
Target Start/End: Original strand, 19885 - 19987
Alignment:
Q  91 agatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaag--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggt 187  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||| ||| |  |||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||||||||    
T  19885 agatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagct-gcatgagtcggt 19982  T
Q  188 ctaag 192  Q
    |||||    
T  19983 ctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1496 - 1291
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| |    
T  1496 tataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgat 1397  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||   || | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1396 gaattgaatttgatataattatgtca---tgatgttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagatgttga 1301  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  1300 agatgatgat 1291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7473 - 7268
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| |    
T  7473 tataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgat 7374  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    |||||| | ||||||| ||||| |||   |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  7373 gaattgaatttgatataattatttca---tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagatgttga 7278  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  7277 agatgatgat 7268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 208
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  142 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 209
Target Start/End: Original strand, 32904 - 33075
Alignment:
Q  36 tgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgttt 134  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  32904 tgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg-tt 33001  T
Q  135 ttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33002 ttgtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 33075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 46101 - 45930
Alignment:
Q  36 tgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgttt 134  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  46101 tgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg-tt 46004  T
Q  135 ttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46003 ttgtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 45930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16322 - 16115
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || || |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||   ||   || ||| || ||||| ||    
T  16322 tataatctgtgaagctgttttaagatgt--tgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatg 16225  T
Q  99 ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttg 198  Q
    |||  ||||| ||||||| || || ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16224 ttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatg 16126  T
Q  199 aagatgatgat 209  Q
    |||||||||||    
T  16125 aagatgatgat 16115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 209
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17448
Alignment:
Q  149 tgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17389 tgttgctgttgttatttaactaagcta-catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 17448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28552 - 28416
Alignment:
Q  72 aagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28552 aagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaa 28453  T
Q  172 gctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28452 gct-gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 28416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11369 - 11294
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11369 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 11294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2074 - 1999
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2074 tttgcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 1999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4554
Alignment:
Q  157 ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 4554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 16511 - 16719
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||   || ||| || ||||| |||    
T  16511 tatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgt 16610  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| || || ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  16611 tgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaaattgatga 16709  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    ||||||||||    
T  16710 agatgatgat 16719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 51789 - 51584
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||  |||||||||| |    
T  51789 tataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtttatgcatttcttgaaggatatttgtatacataagatgttgat 51690  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    |||||| | ||| ||| |||||||||   || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  51689 gaattgaatttgttataattatgtca---tgatgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagatgttga 51594  T
Q  200 agatgatgat 209  Q
    | ||||||||    
T  51593 aaatgatgat 51584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 92; Significance: 7e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 6820 - 6669
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||| ||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6820 tataatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgt 6721  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgt 151  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  6720 tgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 89; Significance: 4e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 124795 - 124679
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  124795 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttga 124696  T
Q  100 tgaattgcaattgatat 116  Q
    |||||||||||||||||    
T  124695 tgaattgcaattgatat 124679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 174936 - 174768
Alignment:
Q  40 tatgatgtgatataatgttta--tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttg 137  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  ||   |||||  || |||||||||||||||| | ||||||| || |||||| ||||||   |    
T  174936 tatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtt---g 174840  T
Q  138 tatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  174839 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagatgttgaagttgatgat 174768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121768
Alignment:
Q  141 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 121768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 89; Significance: 4e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 339861 - 340065
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||   || ||| || |||||||||    
T  339861 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgt 339960  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    ||| ||| | ||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  339961 tgacttg-atttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgttg-tgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgacga 340056  T
Q  200 agatgatga 208  Q
    |||||||||    
T  340057 agatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 158450 - 158612
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  158450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 158549  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  158550 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 71474 - 71350
Alignment:
Q  36 tgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaat-atttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtt 133  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||      
T  71474 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg-- 71378  T
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 161  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  71377 tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 71350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 5042 - 5246
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgtt 100  Q
    |||||| |||||| |||  ||| || |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| |    
T  5042 tataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgat 5141  T
Q  101 gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttga 199  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||   || | ||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  5142 gaattgaatttgatataattatgtca---tgatgttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagatgttga 5237  T
Q  200 agatgatga 208  Q
    |||||||||    
T  5238 agatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20909 - 20747
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20909 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20810  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20809 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 37983 - 37821
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  37983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 37884  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37883 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 94573 - 94411
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  94573 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 94474  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  94473 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 44602 - 44454
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctg-tttttgtatactgcctatgttgctgt 157  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  44602 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactg-ttgtgttgctgt 44504  T
Q  158 tgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44503 tgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 204
Target Start/End: Original strand, 17455 - 17598
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  17455 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctatt 17553  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17554 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119877
Alignment:
Q  139 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 119877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 100501 - 100378
Alignment:
Q  83 aatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatga 181  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||||| ||| | || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  100501 aatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catga 100404  T
Q  182 gtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||    
T  100403 gtcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 207
Target Start/End: Original strand, 40224 - 40291
Alignment:
Q  140 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  40224 tactgcctatgttgctgtttattatttaactaagct-gcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101503
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctg-catgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13539 - 13392
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  13539 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 13441  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13440 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 77; Significance: 6e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14109 - 13947
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  14109 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14010  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14009 g-ttgtgttgctgttgttatttatctaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 77; Significance: 6e-36; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 136842 - 136680
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  136842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 136743  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  136742 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 139311 - 139149
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  139311 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 139212  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  139211 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 144249 - 144087
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  144249 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 144150  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  144149 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 134373 - 134211
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  134373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 134274  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  134273 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 141780 - 141618
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  141780 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 141681  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  141680 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-acatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 62270 - 62216
Alignment:
Q  139 atactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagt 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  62270 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagct-gcatgagtcggtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 132736 - 132662
Alignment:
Q  133 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  132736 ttttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctg-catgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 4841 - 4694
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4841 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 4743  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  4742 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaggatgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 205
Target Start/End: Original strand, 11442 - 11558
Alignment:
Q  88 ttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggt 187  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11442 ttaacatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggt 11540  T
Q  188 ctaagttgttgaagatga 205  Q
     |||||||||||||||||    
T  11541 ttaagttgttgaagatga 11558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 82219 - 82072
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  82219 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttgctgtt 82121  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  82120 gttatttaactaagct-tcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 195
Target Start/End: Original strand, 22714 - 22775
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    |||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22714 tttgcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttg 22775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16946 - 16784
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  16946 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 16847  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
      || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16846 -actgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 71; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4444 - 4300
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| ||| || || ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||    
T  4444 tatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact-actgtgttgctgtt 4346  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4345 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 71; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10920 - 10772
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  10920 tatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 10822  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  10821 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 71; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11435 - 11287
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  11435 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 11337  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| | |||||| ||||    
T  11336 gttatttaactaag-ttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgat 11287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 12931 - 12861
Alignment:
Q  36 tgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattg 106  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||| |||||||    
T  12931 tgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg 12861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 70; Significance: 9e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 501231 - 501088
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||    
T  501231 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattg-ctgtgttgctgtt 501133  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  501132 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 85579 - 85742
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  85579 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 85678  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  85679 tg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 160761 - 160688
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  160761 tttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 3440 - 3588
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg 98  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||   || ||| || ||||||||    
T  3440 tataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttg 3539  T
Q  99 ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcct 147  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3540 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4708 - 4545
Alignment:
Q  27 tgttgttgctgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtc 125  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||||| || || ||    
T  4708 tgttgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatc 4609  T
Q  126 aagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtcta 190  Q
      |||| | ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4608 ttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgttgttatttaactaag-ttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 40562 - 40400
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  40562 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatact 40463  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  40462 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 253 - 106
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||   | ||||||||||    
T  253 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact-attgtgttgctgtt 155  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  154 gttatttaactaagct-gcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 36 - 161
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15486
Alignment:
Q  36 tgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaa-tatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtt 133  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||      
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-- 15458  T
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 161  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15459 tttgtatgctgcctatgttgatgttgtt 15486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 116551 - 116430
Alignment:
Q  84 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagt 183  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  116551 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagct-gcatgagt 116455  T
Q  184 cggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    |||||||||||| | ||||||||||    
T  116454 cggtctaagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 129021 - 129072
Alignment:
Q  140 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  129021 tactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagct-gcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 63; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 59 - 209
Target Start/End: Original strand, 12264 - 12412
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||  | || |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  12264 tatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctg-ctgtgttgctgtt 12362  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  12363 gttatttaactaagct-gcataagtcggtctaagttgattaagatgttgat 12412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 63; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 59 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9389 - 9241
Alignment:
Q  59 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 158  Q
    |||||||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||  | ||||||||||    
T  9389 tatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactg-ttgtgttgctgtt 9291  T
Q  159 gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  9290 gttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 63; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 30094 - 29946
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||| |||| |||||  |||| |||||| || ||| |||||||| || || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  30094 tgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29995  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagtt 194  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29994 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 192
Target Start/End: Original strand, 20379 - 20524
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | || |||||||||||    
T  20379 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 20477  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20478 g-atgtgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128753
Alignment:
Q  44 atgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| | |      
T  128917 atgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt-ttttt 128819  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |   | ||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||| | |||||||||||    
T  128818 tttttttgttgcttttgttatttaactaag-ttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgat 128753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 1124 - 1037
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgaatat 87  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  1124 tataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 1037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 59; Significance: 3e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8640 - 8482
Alignment:
Q  39 ttatgatgtgatataatgtt---tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttt 135  Q
    |||| |||||||||||| ||   ||| |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||  |||| ||| |||| |||    
T  8640 ttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttt 8542  T
Q  136 tgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8541 tgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttg 8482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6661 - 6537
Alignment:
Q  84 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgag 182  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||  |||| ||| | || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6661 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgag 6564  T
Q  183 tcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6563 tcggtctaagttgatgatgatgatgat 6537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 59; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 28040 - 27914
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||   || |||||| |||||||||    
T  28040 tataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgt 27941  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtca 126  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  27940 tgacttgcatttgatattattatgtca 27914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 4377 - 4214
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  4377 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatac 4278  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    || || ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4277 tg-ctgtgtcgctgtcgttatttaactaag-ttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12220 - 12064
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  12220 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatact 12121  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    | || ||||||||      |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12120 g-ctgtgttgctg------tttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 161089 - 161252
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  || | |||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||   |||||||||||||    
T  161089 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatac 161188  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    ||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  161189 tgc-tgtgtcgctgttgatatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13336 - 13147
Alignment:
Q  5 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaata-tttaagatgttgttg 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||| || || |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||  ||| |||||||||||    
T  13336 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttg 13237  T
Q  102 aattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    | ||||| |||||||  |||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13236 atttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagct-gcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 195
Target Start/End: Original strand, 16014 - 16205
Alignment:
Q  5 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttga 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||| || || |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  16014 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttga 16113  T
Q  103 attgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
     || || |||||||  |||| ||| | || ||||| ||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16114 tttacatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagct-gcatgagtcggtctaagttg 16205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 55; Significance: 8e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 151
Target Start/End: Original strand, 881 - 1021
Alignment:
Q  8 tgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||  ||  |||||||||| |||| ||||||| |||    
T  881 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttg 980  T
Q  107 caattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgt 151  Q
    | |||||||| |||||| || ||||   |||||||||||||||||    
T  981 c-attgatattattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4952
Alignment:
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgttgttatttaactaag-ttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgat 4952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 54; Significance: 3e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 195
Target Start/End: Original strand, 27663 - 27854
Alignment:
Q  5 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttga 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||| || || |||| |||||||||||| || ||||||||||| |||  |||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  27663 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttga 27762  T
Q  103 attgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
     || || |||||||  |||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27763 tttacatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagct-gcatgagtcggtctaagttg 27854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 3691 - 3640
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatat 52  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3691 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 7755 - 7704
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatat 52  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7755 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27027 - 26850
Alignment:
Q  4 aatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttga 102  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||    
T  27027 aatctgtgaagctgttatgagatgt-ttgt-gttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 26930  T
Q  103 attgcaattgatatgattatgtcaag-ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcg 185  Q
    |||| ||||||||| ||||  ||| |  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  26929 attg-aattgatataatta--tcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagat-gcatgagtcg 26850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 52; Significance: 5e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 17941 - 18146
Alignment:
Q  5 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttga 102  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||| || || |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| |    
T  17941 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgttta 18040  T
Q  103 attgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaag 201  Q
     ||||  | ||||| ||||| ||| | || || || ||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  18041 cttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagct-gcatgagtcagtctaagtcgttgaag 18138  T
Q  202 atgatgat 209  Q
    ||| ||||    
T  18139 atgttgat 18146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 208
Target Start/End: Original strand, 2184 - 2291
Alignment:
Q  99 ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttg 198  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |     
T  2184 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagct-gcaagagtcggtctaagttgatt 2281  T
Q  199 aagatgatga 208  Q
    || |||||||    
T  2282 aaaatgatga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 205
Target Start/End: Original strand, 1280 - 1440
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatac 142  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| |||||| || ||| | || |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1280 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 1379  T
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 205  Q
    | | | ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1380 t-catgtgttattgttgttatttaaccaagct-gcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Original strand, 1113 - 1188
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1113 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 1188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19390 - 19268
Alignment:
Q  84 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgag 182  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||  |||| ||| | || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19390 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg-catgag 19293  T
Q  183 tcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||    
T  19292 tcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15738 - 15664
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15738 tttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct-gcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29720 - 29558
Alignment:
Q  46 gtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaa-ttgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||  |  ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||  ||    
T  29720 gtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtcttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatct 29621  T
Q  144 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
     |||||| | || |||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  29620 acctatgctactattgttatttaactaag-tcacatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 207
Target Start/End: Original strand, 2801 - 2923
Alignment:
Q  84 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgag 182  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||| | ||  |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  2801 atatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagct-gcatgag 2898  T
Q  183 tcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |||||||||| || ||| |||||||    
T  2899 tcggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 190
Target Start/End: Original strand, 8008 - 8161
Alignment:
Q  39 ttatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtca--agctgtttt 135  Q
    |||| |||||||||||| || ||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||  |||||  ||    
T  8008 ttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctg-att 8106  T
Q  136 tgtatactgcctatgttgct-gttgttatttaactaagctggcatgagtcggtcta 190  Q
    || |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  8107 tgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagct-gcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11636 - 11466
Alignment:
Q  39 ttatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttg 137  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||||| | || |    ||||| ||||| ||| | |||||| |    
T  11636 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-g 11538  T
Q  138 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
     |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  11537 catactgcctatgttgctgattgttaattaactaagct-gcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgat 11466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6688 - 6613
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  6688 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 6613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14068 - 13993
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  14068 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 13993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Original strand, 6167 - 6242
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  6167 tttgcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 6242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Original strand, 38205 - 38375
Alignment:
Q  39 ttatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttg 137  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||||| | || |    ||||| ||||| ||| | |||||| |    
T  38205 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-g 38303  T
Q  138 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
     |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  38304 catactgcctatgttgctgattgttaattaactaagct-gcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgat 38375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Original strand, 15821 - 15896
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15821 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 15896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 178961 - 178898
Alignment:
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  178961 tgcctatgctgctattgttatttaaccaagct-gcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 192
Target Start/End: Original strand, 60626 - 60818
Alignment:
Q  2 ataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgt 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||  ||| || || | || |||||||||| | || |||||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||    
T  60626 ataatctgtgaagctgttataaaatgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgt 60725  T
Q  100 tgaattgcaattgatatgattatgtca--agctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    ||| |||| ||||||||   ||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  60726 tgatttgc-attgatattggtatatcatgagctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct-gcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 129982 - 129921
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  129982 tttgcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatg-catgagtcggtctaagttg 129921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 207
Target Start/End: Original strand, 14692 - 14814
Alignment:
Q  84 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgag 182  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | ||||| | ||| ||| | || |||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  14692 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctg-catgag 14789  T
Q  183 tcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||    
T  14790 tcggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 53498 - 53651
Alignment:
Q  39 ttatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttg 137  Q
    |||| |||||||||||| || ||| |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||  |||| ||| | || |||||    
T  53498 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttg 53596  T
Q  138 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
     |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| || |||||||    
T  53597 catactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct-gcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 51833 - 51985
Alignment:
Q  39 ttatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatg-ttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttg 137  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||  |||||| || ||||| ||||||  |||| |||||||| ||||||||  ||| ||||||    
T  51833 ttatgatgtgatataatgtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgc-attgatattattatgtcttgctatttttg 51931  T
Q  138 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
     || ||||||||| ||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51932 aatgctgcctatg-tgctgtttgatgtttaactaagct-gcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 32654 - 32552
Alignment:
Q  91 agatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtct 189  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  32654 agatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct-gcatgagtcggtct 32558  T
Q  190 aagttg 195  Q
    ||||||    
T  32557 aagttg 32552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1051
Alignment:
Q  84 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgag 182  Q
    |||||| |||||||| ||| | | | |||||||  |||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  1158 atatttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct-gcatgag 1061  T
Q  183 tcggtctaag 192  Q
    ||||||||||    
T  1060 tcggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2045 - 1881
Alignment:
Q  40 tatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaag-ctgtttttgt 138  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||  ||| |  |||| ||||    
T  2045 tatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattgttgttgt 1949  T
Q  139 atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| | |||||||||| | |||| || | |||||||||    
T  1948 aatctgcctatgttgctattgttattcaaccaag-ttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 207
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2762
Alignment:
Q  139 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 10372 - 10323
Alignment:
Q  2 ataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgata 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10372 ataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 38657 - 38820
Alignment:
Q  45 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatact 143  Q
    ||||||||||| || || ||| ||||||||  |||| | ||||||| |||| ||| ||| ||||| |||||||  |||| ||| | |||||| | |||||    
T  38657 tgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatact 38755  T
Q  144 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 208  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  38756 gtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtg-catgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 5769 - 5659
Alignment:
Q  84 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgag 182  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||  |||| ||| | || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  5769 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctg-catgag 5672  T
Q  183 tcggtctaagttg 195  Q
    |||||||||||||    
T  5671 tcggtctaagttg 5659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Original strand, 28813 - 28887
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgt--tgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  28813 tttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 209
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1153
Alignment:
Q  139 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 1153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 225578 - 225465
Alignment:
Q  39 ttatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttg 137  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||    
T  225578 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttg-attgcatttgatattattatatcacgctg-ttttg 225481  T
Q  138 tatactgcctatgttg 153  Q
     |||||| ||||||||    
T  225480 catactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 1159 - 1098
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1159 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttg 1098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 195
Target Start/End: Original strand, 10585 - 10646
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10585 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct-gcataagtcggtctaagttg 10646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 195
Target Start/End: Original strand, 8118 - 8179
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8118 tttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagct-gcatgagtcggtctaagttg 8179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Original strand, 21721 - 21920
Alignment:
Q  4 aatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttga 102  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||| | |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||| |||    
T  21721 aatctgtgaagctgttatgagatgt-ttgt-gttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatga 21818  T
Q  103 attgcaattgatatgattatgtcaag-ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaag 201  Q
    |||| ||||| ||| ||||  ||| |  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||||| | |||| || | |||    
T  21819 attg-aattggtataatta--tcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaag-ttgcatgagtcgatataagatgattaag 21914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Original strand, 29613 - 29812
Alignment:
Q  4 aatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttga 102  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||| | |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||| |||    
T  29613 aatctgtgaagctgttatgagatgt-ttgt-gttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatga 29710  T
Q  103 attgcaattgatatgattatgtcaag-ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaag 201  Q
    |||| ||||| ||| ||||  ||| |  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||||| | |||| || | |||    
T  29711 attg-aattggtataatta--tcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaag-ttgcatgagtcgatataagatgattaag 29806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23920 - 23843
Alignment:
Q  129 ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23920 ctgttgttgtaatctgcctatggtgctattgttatttaaccaagctg-catgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Original strand, 45836 - 45909
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  45836 tttgcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctg-catgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 195
Target Start/End: Original strand, 23927 - 23988
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  23927 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct-acatgagtcggtctaagttg 23988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 38484 - 38339
Alignment:
Q  44 atgtgatata-atgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtca--agctgtttttgtat 140  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||  |||| ||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||  | || |||  |||||||||  |||    
T  38484 atgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tat 38387  T
Q  141 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtc 188  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  38386 actgcctatgttgctgtttgttcattaactaagct-gcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 255 - 133
Alignment:
Q  84 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgag 182  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||  |||| ||| | || ||| | ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||     
T  255 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctg-catgaa 158  T
Q  183 tcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||    
T  157 tcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12693 - 12587
Alignment:
Q  85 tatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagt 183  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||||  |||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||    
T  12693 tatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct-acatgagt 12596  T
Q  184 cggtctaag 192  Q
    |||||||||    
T  12595 cggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25226 - 25122
Alignment:
Q  91 agatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtca--agctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggt 187  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||  |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  25226 agatgttgttgatttgca-ttgatatcgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct-gcatgagtcggt 25130  T
Q  188 ctaagttg 195  Q
    ||||||||    
T  25129 ctaagttg 25122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 172
Target Start/End: Original strand, 4803 - 4887
Alignment:
Q  88 ttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 172  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| || | ||||||||||| ||||   ||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  4803 ttaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcaagctgttgttgtgatctgcctatgctgctattattatttaactaag 4887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 6889 - 6831
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6889 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagct-gcatgagtcggtctaag 6831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  149 tgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgttgttatttaactaagct-gcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 29262 - 29128
Alignment:
Q  42 tgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttga--atatttaagatgttgtt-gaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtttttg 137  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||  |  ||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||    
T  29262 tgatgtgatataatgttgtgtgtattacttgaagttttattgaatatatttaaggtgttgttaaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttg 29163  T
Q  138 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 172  Q
    ||  || |||||| | || ||||||||||||||||    
T  29162 taatctacctatgctactattgttatttaactaag 29128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 192
Target Start/End: Original strand, 6237 - 6386
Alignment:
Q  44 atgtgatataa-tgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtca--agctgtttttgtat 140  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||  |||| ||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||||  | || |||  |||||||||  |||    
T  6237 atgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tat 6334  T
Q  141 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  6335 actgcctatgttgctgtttgttcattaactaag-ttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12843 - 12768
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 209  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  12843 tttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctg-catgagtcggtctaagttgatgattatgatgat 12768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 36517 - 36454
Alignment:
Q  143 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 207  Q
    |||||||| | || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  36517 tgcctatgctactattgttatttaaccaagctg-catgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 17898 - 17928
Alignment:
Q  1 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17898 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 17928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13016 - 12955
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  13016 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcag-catgagtcggtctaagttg 12955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 10604 - 10543
Alignment:
Q  134 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctggcatgagtcggtctaagttg 195  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  10604 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctg-catgagtcggtctaagttg 10543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 190
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  140 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctggcatgagtcggtcta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagct-gcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 628 - 569
Alignment:
Q  133 ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctggcatgagtcggtctaag 192  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  628 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct-gcatgagtcggtctaag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 172
Target Start/End: Original strand, 192921 - 193059
Alignment:
Q  36 tgattatgatgtgatataatgttt--atgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcaagctgtt 133  Q
    |||||||| ||||||||||||||   || ||| ||||||||  |  ||||||| || ||||||||| |||||  || ||||||  |||||||| | ||||    
T  192921 tgattatggtgtgatataatgttgtaatacatcacttgaagttttattgaataattgagatgttgt-gaattataaatgatattgttatgtcatgatgtt 193019  T
Q  134 tttgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 172  Q
     |||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  193020 gttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaag 193059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University