View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16308_low_3 (Length: 331)

Name: NF16308_low_3
Description: NF16308
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16308_low_3
NF16308_low_3
[»] chr4 (55 HSPs)
chr4 (1-249)||(27533868-27534116)
chr4 (1-230)||(9556391-9556620)
chr4 (4-249)||(14954188-14954431)
chr4 (44-252)||(12487550-12487758)
chr4 (68-290)||(17048136-17048359)
chr4 (1-252)||(10712695-10712941)
chr4 (1-252)||(10926465-10926711)
chr4 (4-249)||(25689712-25689955)
chr4 (1-230)||(14757438-14757667)
chr4 (1-229)||(17810134-17810362)
chr4 (4-227)||(4561353-4561576)
chr4 (1-230)||(5756954-5757183)
chr4 (1-230)||(33742241-33742468)
chr4 (68-289)||(13591928-13592149)
chr4 (68-290)||(14746585-14746808)
chr4 (74-278)||(15497043-15497247)
chr4 (121-252)||(43256213-43256344)
chr4 (132-278)||(10694955-10695101)
chr4 (132-278)||(10908721-10908867)
chr4 (74-291)||(19857416-19857634)
chr4 (134-309)||(40619694-40619872)
chr4 (132-278)||(15008163-15008309)
chr4 (132-278)||(15884123-15884269)
chr4 (68-172)||(10056653-10056757)
chr4 (132-290)||(53631320-53631481)
chr4 (144-309)||(14650697-14650866)
chr4 (174-290)||(26013377-26013496)
chr4 (74-164)||(52873150-52873240)
chr4 (68-135)||(18212784-18212851)
chr4 (68-137)||(24047301-24047370)
chr4 (69-136)||(40907122-40907189)
chr4 (1-67)||(22634438-22634504)
chr4 (132-190)||(28385529-28385587)
chr4 (68-137)||(14185029-14185098)
chr4 (1-70)||(36133978-36134047)
chr4 (71-137)||(26045298-26045364)
chr4 (71-137)||(26050479-26050545)
chr4 (74-114)||(40906987-40907027)
chr4 (243-309)||(14184973-14185040)
chr4 (74-111)||(4831543-4831580)
chr4 (74-111)||(4834838-4834875)
chr4 (74-111)||(14047715-14047752)
chr4 (74-111)||(30146462-30146499)
chr4 (68-112)||(16043087-16043131)
chr4 (32-70)||(3412820-3412858)
chr4 (68-114)||(32306997-32307043)
chr4 (206-259)||(15990254-15990307)
chr4 (26-70)||(16488126-16488170)
chr4 (69-113)||(17333352-17333396)
chr4 (19-70)||(20157501-20157552)
chr4 (74-109)||(49547746-49547781)
chr4 (1-70)||(1951778-1951845)
chr4 (32-70)||(13813073-13813111)
chr4 (1-70)||(18222395-18222462)
chr4 (85-114)||(14852895-14852924)
[»] chr6 (68 HSPs)
chr6 (68-331)||(19773544-19773807)
chr6 (1-249)||(18955779-18956027)
chr6 (1-252)||(31477828-31478077)
chr6 (1-252)||(18917282-18917533)
chr6 (1-252)||(1644547-1644795)
chr6 (1-249)||(14472113-14472360)
chr6 (1-252)||(16760134-16760383)
chr6 (4-249)||(22948950-22949193)
chr6 (1-230)||(11566723-11566952)
chr6 (1-230)||(19870451-19870680)
chr6 (1-226)||(22862811-22863036)
chr6 (1-230)||(23394929-23395158)
chr6 (68-331)||(22805779-22806051)
chr6 (4-249)||(22952906-22953149)
chr6 (4-249)||(23871394-23871637)
chr6 (4-249)||(23875350-23875593)
chr6 (1-230)||(8243722-8243951)
chr6 (1-230)||(23989781-23990010)
chr6 (68-252)||(23414819-23415003)
chr6 (68-290)||(15705445-15705668)
chr6 (68-252)||(27556577-27556761)
chr6 (1-230)||(12618860-12619087)
chr6 (101-287)||(17743276-17743463)
chr6 (68-286)||(28103900-28104119)
chr6 (68-290)||(15817523-15817744)
chr6 (74-290)||(15875279-15875496)
chr6 (87-290)||(17377818-17378022)
chr6 (121-252)||(27415994-27416125)
chr6 (132-309)||(18913813-18914000)
chr6 (132-309)||(18937071-18937258)
chr6 (68-222)||(14979389-14979543)
chr6 (132-309)||(15174163-15174350)
chr6 (86-194)||(18696480-18696589)
chr6 (132-290)||(19656076-19656237)
chr6 (121-191)||(18706301-18706371)
chr6 (68-135)||(20136722-20136789)
chr6 (68-135)||(22196080-22196147)
chr6 (68-137)||(23838224-23838293)
chr6 (1-70)||(17804218-17804287)
chr6 (68-137)||(18453232-18453301)
chr6 (216-269)||(23538745-23538798)
chr6 (76-139)||(4476872-4476935)
chr6 (132-190)||(23956148-23956206)
chr6 (1-70)||(22430046-22430115)
chr6 (1-70)||(25767184-25767253)
chr6 (205-269)||(17105771-17105835)
chr6 (68-132)||(20182848-20182912)
chr6 (68-132)||(22153079-22153143)
chr6 (69-136)||(23539020-23539087)
chr6 (72-113)||(33443122-33443163)
chr6 (74-111)||(29416912-29416949)
chr6 (26-70)||(16523432-16523476)
chr6 (150-198)||(20078134-20078182)
chr6 (74-113)||(18177680-18177719)
chr6 (74-113)||(18199424-18199463)
chr6 (74-113)||(18204152-18204191)
chr6 (1-70)||(12706711-12706778)
chr6 (16-70)||(18907135-18907189)
chr6 (1-70)||(23414667-23414734)
chr6 (68-114)||(25619724-25619770)
chr6 (1-70)||(27556425-27556492)
chr6 (68-113)||(23076806-23076851)
chr6 (17-70)||(27325650-27325703)
chr6 (32-68)||(1587777-1587813)
chr6 (26-70)||(19790828-19790872)
chr6 (68-112)||(20224018-20224062)
chr6 (68-112)||(22118002-22118046)
chr6 (69-113)||(23538884-23538928)
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (5-252)||(40723607-40723854)
chr5 (1-230)||(20295708-20295937)
chr5 (1-252)||(10753203-10753452)
chr5 (1-230)||(19472736-19472965)
chr5 (68-290)||(22107436-22107659)
chr5 (68-252)||(20910918-20911102)
chr5 (68-252)||(18356131-18356315)
chr5 (68-290)||(6765724-6765947)
chr5 (71-230)||(15236921-15237080)
chr5 (86-290)||(33895665-33895870)
chr5 (66-290)||(29447899-29448125)
chr5 (132-278)||(17010923-17011069)
chr5 (1-130)||(15236796-15236925)
chr5 (132-290)||(263042-263201)
chr5 (1-70)||(23535603-23535672)
chr5 (121-195)||(18356308-18356381)
chr5 (196-252)||(11230985-11231041)
chr5 (123-195)||(20910854-20910925)
chr5 (76-139)||(42960590-42960653)
chr5 (196-252)||(11220587-11220643)
chr5 (196-252)||(11225173-11225229)
chr5 (196-252)||(11228996-11229052)
chr5 (76-139)||(28371031-28371094)
chr5 (76-139)||(37598892-37598955)
chr5 (132-190)||(33473272-33473330)
chr5 (1-70)||(17410461-17410530)
chr5 (68-117)||(30138930-30138979)
chr5 (76-139)||(22336615-22336678)
chr5 (76-139)||(22340153-22340216)
chr5 (68-137)||(23469853-23469921)
chr5 (74-136)||(10816453-10816515)
chr5 (75-138)||(26732841-26732904)
chr5 (197-250)||(11227008-11227061)
chr5 (74-111)||(23538504-23538541)
chr5 (26-70)||(21366713-21366757)
chr5 (69-113)||(27988934-27988978)
chr5 (35-70)||(17517259-17517294)
chr5 (71-114)||(26740650-26740693)
chr5 (74-135)||(15796471-15796533)
chr5 (1-70)||(20911187-20911254)
chr5 (20-66)||(24767588-24767634)
chr5 (68-114)||(25576857-25576902)
chr5 (68-133)||(21328217-21328282)
chr5 (32-68)||(4036243-4036279)
chr5 (68-104)||(22750264-22750300)
chr5 (32-68)||(25229452-25229488)
chr5 (32-68)||(25293608-25293644)
chr5 (26-70)||(26680606-26680650)
chr5 (26-70)||(26952213-26952257)
chr5 (68-135)||(41861455-41861523)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (1-252)||(20228825-20229076)
chr1 (1-252)||(1925147-1925396)
chr1 (1-252)||(20924161-20924410)
chr1 (1-230)||(1010584-1010813)
chr1 (1-230)||(21407216-21407445)
chr1 (68-331)||(48603299-48603571)
chr1 (1-230)||(16375474-16375704)
chr1 (1-230)||(52639402-52639631)
chr1 (84-290)||(12271450-12271657)
chr1 (68-331)||(27653224-27653496)
chr1 (74-331)||(51326638-51326905)
chr1 (68-290)||(48520407-48520629)
chr1 (132-288)||(46198433-46198590)
chr1 (132-309)||(29764346-29764533)
chr1 (124-252)||(33797456-33797584)
chr1 (68-226)||(13881383-13881541)
chr1 (1-144)||(23819316-23819457)
chr1 (132-290)||(50000658-50000817)
chr1 (121-331)||(22130961-22131169)
chr1 (72-195)||(41781594-41781718)
chr1 (74-171)||(43543144-43543241)
chr1 (217-290)||(20316532-20316606)
chr1 (68-134)||(22124338-22124404)
chr1 (68-137)||(20437995-20438064)
chr1 (68-137)||(20958158-20958227)
chr1 (1-70)||(24783116-24783185)
chr1 (76-139)||(16372045-16372108)
chr1 (68-137)||(28312564-28312633)
chr1 (79-137)||(21043294-21043352)
chr1 (282-331)||(636090-636139)
chr1 (6-70)||(36819330-36819394)
chr1 (74-111)||(2332982-2333019)
chr1 (68-133)||(14800583-14800648)
chr1 (68-133)||(14809457-14809522)
chr1 (74-111)||(32649787-32649824)
chr1 (16-70)||(18182159-18182213)
chr1 (1-70)||(16080460-16080529)
chr1 (74-111)||(29534624-29534661)
chr1 (68-137)||(52940879-52940947)
chr1 (26-70)||(3472971-3473015)
chr1 (69-113)||(16381256-16381300)
chr1 (68-138)||(20454554-20454625)
chr1 (1-70)||(33797304-33797371)
chr1 (76-137)||(635992-636053)
[»] chr7 (94 HSPs)
chr7 (1-252)||(39722105-39722356)
chr7 (68-331)||(14258297-14258569)
chr7 (1-230)||(32968-33197)
chr7 (1-230)||(18283227-18283456)
chr7 (1-249)||(45170024-45170270)
chr7 (1-229)||(70781-71009)
chr7 (1-229)||(74890-75118)
chr7 (68-331)||(16460767-16461039)
chr7 (1-230)||(12714725-12714954)
chr7 (1-230)||(12718529-12718758)
chr7 (1-230)||(16907217-16907446)
chr7 (1-230)||(12704675-12704904)
chr7 (1-230)||(18279264-18279493)
chr7 (1-230)||(26292256-26292485)
chr7 (68-331)||(16579605-16579877)
chr7 (68-331)||(16585786-16586058)
chr7 (4-230)||(12723440-12723666)
chr7 (1-230)||(16114102-16114331)
chr7 (1-230)||(16117255-16117484)
chr7 (68-290)||(32301183-32301406)
chr7 (68-252)||(1858833-1859017)
chr7 (72-252)||(25927254-25927434)
chr7 (68-331)||(15719842-15720114)
chr7 (68-252)||(13918527-13918711)
chr7 (68-290)||(8940145-8940368)
chr7 (68-290)||(16998488-16998711)
chr7 (68-290)||(46580677-46580900)
chr7 (74-290)||(8468613-8468830)
chr7 (68-331)||(14273361-14273633)
chr7 (84-290)||(15112839-15113046)
chr7 (84-290)||(16323947-16324153)
chr7 (87-309)||(15116352-15116580)
chr7 (75-278)||(17060433-17060635)
chr7 (121-251)||(2530191-2530320)
chr7 (132-290)||(32160910-32161068)
chr7 (132-278)||(16550712-16550858)
chr7 (147-252)||(15084035-15084140)
chr7 (68-195)||(20487533-20487660)
chr7 (132-290)||(17232814-17232973)
chr7 (132-257)||(16614825-16614950)
chr7 (174-290)||(14981543-14981660)
chr7 (174-290)||(15411019-15411136)
chr7 (206-331)||(1490194-1490328)
chr7 (74-171)||(14270034-14270131)
chr7 (68-137)||(42461999-42462068)
chr7 (68-137)||(11661322-11661391)
chr7 (76-139)||(16008592-16008655)
chr7 (1-70)||(11312669-11312738)
chr7 (1-70)||(12318148-12318217)
chr7 (1-70)||(13635485-13635554)
chr7 (1-70)||(15580712-15580781)
chr7 (68-137)||(38519422-38519491)
chr7 (68-136)||(10501425-10501493)
chr7 (68-136)||(14157106-14157174)
chr7 (76-139)||(14566216-14566279)
chr7 (76-139)||(18872374-18872437)
chr7 (71-137)||(16996272-16996338)
chr7 (68-137)||(14422000-14422069)
chr7 (1-70)||(16583277-16583346)
chr7 (68-137)||(18607503-18607572)
chr7 (232-309)||(14157153-14157231)
chr7 (17-70)||(9751794-9751847)
chr7 (76-137)||(20619430-20619491)
chr7 (243-309)||(10501483-10501550)
chr7 (71-113)||(18203887-18203929)
chr7 (76-137)||(130827-130888)
chr7 (74-111)||(837364-837401)
chr7 (74-111)||(1202544-1202581)
chr7 (76-137)||(11525574-11525635)
chr7 (6-70)||(15605294-15605358)
chr7 (79-137)||(9033359-9033417)
chr7 (74-111)||(833368-833405)
chr7 (74-111)||(1198548-1198585)
chr7 (74-111)||(16109521-16109558)
chr7 (74-111)||(38828304-38828341)
chr7 (68-113)||(38898196-38898241)
chr7 (18-70)||(2832482-2832534)
chr7 (274-309)||(16461046-16461081)
chr7 (274-309)||(32301102-32301137)
chr7 (32-70)||(8917448-8917486)
chr7 (1-70)||(9593367-9593434)
chr7 (16-70)||(12321780-12321834)
chr7 (1-70)||(13918796-13918863)
chr7 (32-70)||(39267954-39267992)
chr7 (68-101)||(9177667-9177700)
chr7 (17-70)||(14429907-14429960)
chr7 (282-331)||(16185935-16185984)
chr7 (33-70)||(16724677-16724714)
chr7 (33-70)||(17701691-17701728)
chr7 (68-104)||(10896712-10896748)
chr7 (68-104)||(15167285-15167321)
chr7 (32-68)||(15728348-15728384)
chr7 (274-306)||(16579566-16579598)
chr7 (274-306)||(16586065-16586097)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (4-253)||(35961-36208)
[»] chr3 (96 HSPs)
chr3 (68-309)||(16796362-16796604)
chr3 (1-252)||(11854575-11854826)
chr3 (1-230)||(11165545-11165774)
chr3 (1-230)||(11069932-11070161)
chr3 (1-249)||(15964814-15965060)
chr3 (1-249)||(15968738-15968984)
chr3 (1-249)||(15972662-15972908)
chr3 (1-230)||(55022731-55022960)
chr3 (1-252)||(19775607-19775856)
chr3 (1-229)||(30065811-30066039)
chr3 (1-252)||(37439654-37439903)
chr3 (1-230)||(7109562-7109791)
chr3 (1-230)||(7113497-7113726)
chr3 (1-230)||(22336583-22336812)
chr3 (1-230)||(27409660-27409889)
chr3 (1-230)||(28949588-28949817)
chr3 (1-229)||(15617239-15617467)
chr3 (1-230)||(22321528-22321757)
chr3 (68-290)||(43889628-43889851)
chr3 (68-290)||(324130-324353)
chr3 (68-252)||(12339640-12339824)
chr3 (68-331)||(18700309-18700581)
chr3 (1-230)||(4111267-4111494)
chr3 (68-290)||(12469796-12470019)
chr3 (1-230)||(4107415-4107642)
chr3 (87-252)||(11300532-11300697)
chr3 (68-290)||(52989724-52989947)
chr3 (68-252)||(5223238-5223422)
chr3 (70-252)||(4588858-4589040)
chr3 (1-230)||(14499189-14499418)
chr3 (74-290)||(14966064-14966281)
chr3 (68-290)||(11914018-11914241)
chr3 (68-331)||(17691711-17691982)
chr3 (68-331)||(21837271-21837543)
chr3 (68-331)||(54876389-54876664)
chr3 (68-193)||(15465068-15465193)
chr3 (132-309)||(35961596-35961783)
chr3 (68-195)||(14670914-14671041)
chr3 (68-195)||(14682413-14682540)
chr3 (132-271)||(22652036-22652174)
chr3 (68-223)||(16643135-16643290)
chr3 (205-309)||(16979092-16979206)
chr3 (129-269)||(14569023-14569163)
chr3 (206-290)||(17046206-17046291)
chr3 (68-130)||(14179427-14179489)
chr3 (4-70)||(2897842-2897908)
chr3 (1-70)||(15482684-15482753)
chr3 (68-136)||(36527794-36527862)
chr3 (71-137)||(9577674-9577738)
chr3 (76-139)||(14763736-14763799)
chr3 (76-139)||(23371482-23371545)
chr3 (243-309)||(36527737-36527804)
chr3 (132-190)||(41813-41871)
chr3 (1-70)||(20461516-20461585)
chr3 (76-137)||(51300611-51300672)
chr3 (68-136)||(3265017-3265085)
chr3 (1-70)||(7793365-7793435)
chr3 (68-114)||(10542434-10542480)
chr3 (68-114)||(10834105-10834151)
chr3 (132-190)||(16325249-16325307)
chr3 (68-137)||(37427764-37427833)
chr3 (1-70)||(327180-327250)
chr3 (16-70)||(19725949-19726003)
chr3 (74-111)||(8928437-8928474)
chr3 (17-70)||(14665425-14665478)
chr3 (17-70)||(14668581-14668634)
chr3 (215-252)||(15465039-15465076)
chr3 (282-331)||(17685744-17685793)
chr3 (74-111)||(34852664-34852701)
chr3 (243-309)||(3265075-3265142)
chr3 (69-136)||(14568804-14568871)
chr3 (76-135)||(28194743-28194802)
chr3 (237-290)||(24513836-24513890)
chr3 (20-69)||(15850117-15850166)
chr3 (1-70)||(31097571-31097640)
chr3 (26-70)||(3403005-3403049)
chr3 (26-70)||(11862817-11862861)
chr3 (26-70)||(12172820-12172864)
chr3 (26-70)||(18383964-18384008)
chr3 (274-309)||(324049-324084)
chr3 (274-309)||(18700588-18700623)
chr3 (35-70)||(30029868-30029903)
chr3 (1-70)||(8489488-8489555)
chr3 (16-70)||(12496281-12496335)
chr3 (1-70)||(15464887-15464954)
chr3 (274-307)||(10542484-10542517)
chr3 (206-259)||(13026468-13026521)
chr3 (206-259)||(13030060-13030113)
chr3 (68-137)||(15246068-15246137)
chr3 (68-137)||(15265189-15265258)
chr3 (76-137)||(32402970-32403030)
chr3 (26-70)||(322616-322660)
chr3 (26-70)||(1982859-1982903)
chr3 (26-70)||(3389985-3390029)
chr3 (132-168)||(16979218-16979254)
chr3 (68-104)||(38311784-38311820)
[»] chr2 (47 HSPs)
chr2 (1-252)||(1283228-1283477)
chr2 (1-252)||(30345009-30345258)
chr2 (68-331)||(23069285-23069557)
chr2 (1-230)||(12901528-12901757)
chr2 (1-252)||(41531022-41531271)
chr2 (1-230)||(27379449-27379678)
chr2 (1-230)||(27383495-27383724)
chr2 (1-230)||(27601657-27601886)
chr2 (1-230)||(24628495-24628724)
chr2 (1-230)||(24649218-24649447)
chr2 (1-229)||(10101661-10101889)
chr2 (68-252)||(31345051-31345235)
chr2 (68-290)||(24918006-24918229)
chr2 (68-290)||(23707290-23707513)
chr2 (68-290)||(24670891-24671114)
chr2 (68-290)||(27472315-27472538)
chr2 (68-290)||(34874214-34874437)
chr2 (68-331)||(18358735-18359001)
chr2 (68-290)||(24681312-24681533)
chr2 (68-290)||(21081738-21081961)
chr2 (66-290)||(22459562-22459787)
chr2 (132-309)||(34492200-34492387)
chr2 (132-309)||(21914779-21914966)
chr2 (72-195)||(9784673-9784796)
chr2 (174-329)||(24316193-24316356)
chr2 (205-290)||(20320737-20320823)
chr2 (68-137)||(9241976-9242045)
chr2 (68-137)||(34136990-34137059)
chr2 (68-137)||(21073494-21073563)
chr2 (1-70)||(24735424-24735493)
chr2 (76-139)||(19662430-19662493)
chr2 (76-137)||(19201985-19202046)
chr2 (76-139)||(6261154-6261217)
chr2 (76-139)||(30644056-30644119)
chr2 (71-138)||(23287412-23287480)
chr2 (74-111)||(22703174-22703211)
chr2 (73-138)||(26392431-26392496)
chr2 (144-309)||(39827952-39828120)
chr2 (132-286)||(20915226-20915386)
chr2 (79-114)||(21237825-21237860)
chr2 (275-309)||(13101739-13101773)
chr2 (32-70)||(22811966-22812004)
chr2 (32-68)||(60840-60876)
chr2 (26-70)||(24869904-24869948)
chr2 (26-70)||(25961583-25961627)
chr2 (32-68)||(27263296-27263332)
chr2 (18-70)||(37524699-37524751)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (68-331)||(699-971)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (68-331)||(125802-126074)
scaffold0011 (274-309)||(125760-125795)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (1-252)||(11519-11768)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (1-252)||(36104-36353)
scaffold0031 (1-70)||(53586-53655)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (1-252)||(189395-189644)
scaffold0012 (68-135)||(221208-221275)
[»] chr8 (52 HSPs)
chr8 (1-252)||(21410789-21411038)
chr8 (1-252)||(21805281-21805530)
chr8 (1-252)||(21828032-21828281)
chr8 (1-249)||(18862663-18862909)
chr8 (1-230)||(43251674-43251903)
chr8 (1-230)||(21976686-21976915)
chr8 (1-230)||(19278299-19278528)
chr8 (1-230)||(21972601-21972826)
chr8 (68-289)||(37515602-37515824)
chr8 (68-290)||(22238021-22238243)
chr8 (68-290)||(23409691-23409914)
chr8 (68-331)||(17461054-17461326)
chr8 (69-290)||(19808365-19808587)
chr8 (68-290)||(18833458-18833680)
chr8 (68-252)||(14397864-14398040)
chr8 (132-278)||(26453908-26454054)
chr8 (132-278)||(19880026-19880172)
chr8 (117-230)||(22111792-22111905)
chr8 (68-223)||(23659371-23659526)
chr8 (68-195)||(23914029-23914156)
chr8 (134-278)||(23478278-23478422)
chr8 (85-200)||(16402021-16402136)
chr8 (132-309)||(19929556-19929736)
chr8 (205-290)||(22352932-22353018)
chr8 (163-290)||(5760577-5760705)
chr8 (218-290)||(44384821-44384894)
chr8 (74-171)||(1327015-1327112)
chr8 (68-119)||(25363204-25363255)
chr8 (69-137)||(20502104-20502172)
chr8 (132-190)||(8414418-8414476)
chr8 (132-190)||(11775008-11775066)
chr8 (76-137)||(17438227-17438288)
chr8 (79-137)||(22963426-22963484)
chr8 (68-137)||(17086155-17086224)
chr8 (68-111)||(22253167-22253210)
chr8 (76-130)||(5083164-5083218)
chr8 (68-137)||(22995893-22995962)
chr8 (68-112)||(16799561-16799605)
chr8 (26-70)||(30643340-30643384)
chr8 (232-286)||(18302800-18302855)
chr8 (155-198)||(22381703-22381746)
chr8 (74-109)||(35026868-35026903)
chr8 (16-70)||(15603055-15603109)
chr8 (1-70)||(16231492-16231559)
chr8 (1-70)||(21383675-21383742)
chr8 (1-70)||(21387095-21387162)
chr8 (84-113)||(22525633-22525662)
chr8 (68-133)||(23943995-23944060)
chr8 (68-104)||(14103226-14103262)
chr8 (85-137)||(23667859-23667910)
chr8 (68-104)||(44476753-44476789)
chr8 (68-104)||(44480015-44480051)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (1-230)||(65544-65773)
scaffold0029 (1-230)||(61628-61857)
scaffold0029 (1-252)||(80554-80803)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (68-331)||(119855-120127)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (1-230)||(12283-12512)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-230)||(58735-58964)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (1-229)||(3891-4119)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (44-252)||(32719-32927)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-252)||(14105-14354)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (1-252)||(234-485)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (1-230)||(5117-5346)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (68-288)||(21064-21285)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (68-252)||(31058-31242)
[»] scaffold0676 (2 HSPs)
scaffold0676 (1-230)||(311-539)
scaffold0676 (11-70)||(4454-4513)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (68-234)||(39205-39371)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (74-290)||(53846-54063)
scaffold0022 (26-70)||(73815-73859)
[»] scaffold0293 (3 HSPs)
scaffold0293 (68-252)||(20212-20396)
scaffold0293 (68-137)||(17552-17621)
scaffold0293 (1-68)||(20481-20546)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (68-290)||(169751-169974)
scaffold0020 (76-137)||(142631-142692)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (68-331)||(15588-15861)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (68-290)||(6943-7166)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (70-252)||(207587-207769)
scaffold0016 (17-68)||(207880-207931)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (68-290)||(1876-2099)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (68-290)||(24599-24820)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (74-290)||(313-530)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (68-290)||(1294-1517)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (68-278)||(468-678)
[»] scaffold0107 (3 HSPs)
scaffold0107 (74-323)||(10092-10350)
scaffold0107 (121-212)||(15469-15560)
scaffold0107 (68-137)||(36230-36299)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (104-331)||(2751-2987)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (68-290)||(7731-7952)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (68-290)||(85441-85664)
scaffold0009 (1-70)||(228390-228457)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (68-290)||(49-278)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (68-197)||(17563-17692)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (70-214)||(80420-80564)
scaffold0037 (205-252)||(80574-80621)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (68-290)||(6904-7127)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (74-290)||(3335-3552)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (68-286)||(67161-67379)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (86-331)||(384-639)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (80-230)||(67397-67546)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (121-252)||(71236-71367)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (132-309)||(33074-33261)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (128-271)||(1227-1370)
scaffold0017 (128-271)||(7978-8121)
scaffold0017 (26-70)||(15259-15303)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (132-309)||(5615-5802)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (132-290)||(4215-4374)
[»] scaffold0306 (2 HSPs)
scaffold0306 (132-290)||(4215-4374)
scaffold0306 (68-278)||(14906-15116)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (68-197)||(6161-6290)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (132-309)||(10378-10564)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (132-309)||(22477-22664)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (132-290)||(70536-70689)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (68-168)||(20769-20869)
scaffold0018 (215-328)||(20652-20774)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (180-331)||(13490-13650)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (144-309)||(56842-57011)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (146-309)||(7544-7711)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (74-189)||(105078-105193)
[»] scaffold0741 (2 HSPs)
scaffold0741 (68-180)||(4271-4383)
scaffold0741 (165-290)||(6851-6977)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (132-290)||(1314-1475)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (144-295)||(15470-15625)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (144-309)||(166426-166595)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (174-252)||(6854-6932)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (205-290)||(78299-78385)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (68-135)||(75830-75897)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (74-171)||(10859-10956)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (68-137)||(1944-2013)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (74-171)||(36038-36135)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (68-138)||(15240-15310)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (1-70)||(18648-18717)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (68-137)||(3307-3376)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (1-70)||(66431-66500)
[»] scaffold0436 (2 HSPs)
scaffold0436 (68-136)||(8082-8150)
scaffold0436 (243-306)||(8028-8092)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (76-139)||(110701-110764)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (68-118)||(15067-15117)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (68-114)||(6684-6730)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (132-190)||(176078-176136)
scaffold0001 (132-190)||(168724-168782)
scaffold0001 (1-70)||(173313-173380)
scaffold0001 (144-194)||(497538-497588)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (68-137)||(762-831)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (68-137)||(3917-3986)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (1-70)||(12925-12994)
scaffold0044 (1-70)||(19209-19278)
[»] scaffold0561 (2 HSPs)
scaffold0561 (243-309)||(10467-10534)
scaffold0561 (68-136)||(10524-10592)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (74-137)||(9728-9791)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (74-137)||(11196-11259)
scaffold0040 (74-137)||(22296-22359)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (76-137)||(988-1049)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (68-137)||(18169-18238)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (282-331)||(3550-3599)
scaffold0165 (282-331)||(7614-7663)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (1-70)||(2688-2757)
scaffold0013 (68-137)||(30381-30451)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (144-228)||(8967-9051)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (71-138)||(206528-206596)
scaffold0014 (261-309)||(126896-126945)
[»] scaffold0019 (3 HSPs)
scaffold0019 (68-114)||(132989-133035)
scaffold0019 (74-112)||(29285-29323)
scaffold0019 (244-290)||(21847-21894)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (76-137)||(7499-7560)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (68-137)||(10213-10282)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (74-111)||(48403-48440)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (74-111)||(146261-146298)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (68-137)||(697-766)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (18-70)||(183-235)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (1-68)||(20034-20099)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (16-70)||(17150-17204)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (16-70)||(9537-9591)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (76-137)||(3006-3067)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (26-70)||(417-461)
[»] scaffold1052 (1 HSPs)
scaffold1052 (18-66)||(2933-2981)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (26-70)||(6357-6401)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (26-70)||(2133-2177)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (26-70)||(1518-1562)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (68-112)||(29747-29791)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (26-70)||(42651-42695)
[»] scaffold0914 (1 HSPs)
scaffold0914 (68-103)||(1785-1820)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (16-70)||(5610-5664)
scaffold0476 (16-70)||(6805-6859)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (1-70)||(18377-18444)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (20-66)||(10085-10131)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (32-70)||(6046-6084)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (76-137)||(7481-7540)
scaffold0111 (76-137)||(14600-14659)
[»] scaffold1419 (1 HSPs)
scaffold1419 (80-109)||(101-130)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (68-113)||(2737-2782)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (85-114)||(55704-55733)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (68-104)||(663-699)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (26-70)||(15111-15155)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (210-286)||(11613-11692)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (26-70)||(313-357)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (85-137)||(29443-29494)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (26-70)||(30791-30835)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27534116 - 27533868
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27534116 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgctgttattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 27534017  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27534016 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 27533917  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27533916 tcataataatattgttatgttgtgaattgcatgtgctgtttctgttgct 27533868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9556620 - 9556391
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9556620 atgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 9556521  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  9556520 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 9556421  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9556420 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 9556391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Original strand, 14954188 - 14954431
Alignment:
Q  4 aattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatct 103  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954188 aattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatct 14954285  T
Q  104 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14954286 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttta 14954385  T
Q  204 tattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14954386 tattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 14954431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 44 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12487758 - 12487550
Alignment:
Q  44 attgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggtta 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12487758 attgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggtta 12487659  T
Q  144 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12487658 tgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaaattgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttct 12487559  T
Q  244 gttgctgtt 252  Q
    |||||||||    
T  12487558 gttgctgtt 12487550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Original strand, 17048136 - 17048359
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17048136 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 17048235  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17048236 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgttgttgaatattgatcaagt 17048335  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  17048336 tgcaggtgttggtctaagttgtaa 17048359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 10712941 - 10712695
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  10712941 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttg---attatcatttgatattgttata 10712847  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10712846 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 10712747  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10712746 tcatattaatattgttgtgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 10712695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 10926711 - 10926465
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  10926711 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttg---attatcatttgatattgttata 10926617  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10926616 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 10926517  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10926516 tcatattaatattgttgtgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 10926465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25689955 - 25689712
Alignment:
Q  4 aattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatct 103  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689955 aattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatct 25689858  T
Q  104 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25689857 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttta 25689758  T
Q  204 tattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25689757 tattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 25689712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 14757438 - 14757667
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14757438 atgaattgatattaagttgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 14757537  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  14757538 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 14757637  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14757638 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 14757667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17810362 - 17810134
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17810362 atgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 17810263  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  17810262 tcctgagatgttcatgtgtcgcctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 17810163  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattg 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17810162 tcacattaatattgttatgttgtgaattg 17810134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Original strand, 4561353 - 4561576
Alignment:
Q  4 aattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatct 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4561353 aattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcc 4561452  T
Q  104 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttca 203  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  4561453 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 4561552  T
Q  204 tattaatattgttatgttgtgaat 227  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  4561553 cattaataatgttatgttgtgaat 4561576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 5756954 - 5757183
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5756954 atgaattggtattaagttgttgatataatctgattatgctgttattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 5757053  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  5757054 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttggtgct 5757153  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  5757154 tcacattaatattgttatgttgtggattgc 5757183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33742468 - 33742241
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33742468 atgaattggtatcaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 33742369  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  33742368 tcctgagatgtttatgtgtctcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatt--tatgtcttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 33742271  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33742270 tcacattaatattgttatgctgtgaattgc 33742241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 68 - 289
Target Start/End: Original strand, 13591928 - 13592149
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13591928 agttgatgttgattatcatttgatattgttatattttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 13592027  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13592028 tggaa-atgtatgatgtttaagttgatgatgcttttcattaatattgatatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 13592126  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgta 289  Q
    || ||||||| ||||||||||||    
T  13592127 tgaaggtgttggtctaagttgta 13592149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Original strand, 14746585 - 14746808
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14746585 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctacctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatg 14746684  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14746685 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagt 14746784  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  14746785 tgcaggtgttggtctaagttgtaa 14746808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 74 - 278
Target Start/End: Original strand, 15497043 - 15497247
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 173  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  15497043 tgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcctatgttgatgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaa 15497142  T
Q  174 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagg 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  15497143 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgagaattgattgtgatgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgcaga 15497242  T
Q  274 tgttg 278  Q
    |||||    
T  15497243 tgttg 15497247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 121 - 252
Target Start/End: Original strand, 43256213 - 43256344
Alignment:
Q  121 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  43256213 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgatatgt 43256312  T
Q  221 tgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43256313 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 43256344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 132 - 278
Target Start/End: Original strand, 10694955 - 10695101
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  10694955 tgttgttggttatgtaaaataattatattccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatatttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 10695054  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 278  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10695055 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttg 10695101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 132 - 278
Target Start/End: Original strand, 10908721 - 10908867
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  10908721 tgttgttggttatgtaaaataattatattccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatatttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 10908820  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 278  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10908821 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttg 10908867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19857634 - 19857416
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 173  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||      
T  19857634 tgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcataagccttatgtggaga 19857535  T
Q  174 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagg 273  Q
    || |||||| ||||||||||||||  ||   ||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  19857534 atatatgatatttaagttgttgatgtttttcattaatattgtcatgttgtgaattacttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaggatgcagg 19857435  T
Q  274 tgtt-gtctaagttgtaag 291  Q
    |||| || |||||||||||    
T  19857434 tgttggtttaagttgtaag 19857416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 134 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 40619872 - 40619694
Alignment:
Q  134 ttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttg 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40619872 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtaagatgtttaggttgttgatgcttttcattaatatttttatgttgtgaattgcttg 40619773  T
Q  234 tgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttg--taagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  40619772 tgctgtttctgttactgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtcgttccaaagtatt 40619694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 132 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15008309 - 15008163
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15008309 tgttgttggttatgtgaaataattatatatcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgatatgttgtgaattgct 15008210  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 278  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15008209 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttg 15008163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 132 - 278
Target Start/End: Original strand, 15884123 - 15884269
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15884123 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgttatgttgagaattgct 15884222  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 278  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15884223 tgtgttgtttctgttgatgttgaatattgatcaagttgcagatgttg 15884269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 10056757 - 10056653
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056757 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 10056658  T
Q  168 tggaa 172  Q
    |||||    
T  10056657 tggaa 10056653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 132 - 290
Target Start/End: Original strand, 53631320 - 53631481
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttata--tgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattg 229  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||  ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | |  ||    |||||||||||||| |||||||||    
T  53631320 tgttgttggtaatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattg 53631419  T
Q  230 cttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  53631420 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaagtgttggtctaagttgtaa 53631481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 14650866 - 14650697
Alignment:
Q  144 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct--tgtgttgttt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||   ||| ||||||||||| |||||||||||  |||| | |||    
T  14650866 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaatatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgcttatgtgctattt 14650767  T
Q  242 -ctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
     |||||| |||||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14650766 cctgttgttgttgaatattagtcaagctgcaagtgttggtctaagttgtaacttgtcgttccaaagtatt 14650697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 174 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 26013496 - 26013377
Alignment:
Q  174 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct--gttgaatattgatcaagttgca 271  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  26013496 atgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgggttgcatattgatcaagttgca 26013397  T
Q  272 ggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    | |||| || ||||||||||    
T  26013396 gatgttggtttaagttgtaa 26013377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 164
Target Start/End: Original strand, 52873150 - 52873240
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcctt 164  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  52873150 tgttgattattatttgatgttgttataccttgaggtgtttaagtgttggctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgcctt 52873240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 18212851 - 18212784
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgtt 135  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  18212851 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgtt 18212784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Original strand, 24047301 - 24047370
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  24047301 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttaagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 24047370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 40907189 - 40907122
Alignment:
Q  69 gttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttg 136  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  40907189 gttgatgttgattatcatttgatatttttatatcttgagatgtttatgtgttgcctgtgttgctgttg 40907122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 22634438 - 22634504
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatg 67  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22634438 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatg 22634504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 28385587 - 28385529
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 190  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28385587 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 28385529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14185098 - 14185029
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14185098 agttgatgttgattatcatttgatgatgttatatcttgagacgtttatgtgttgcctatgttgctgttgt 14185029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 36133978 - 36134047
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  36133978 atgaatggatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 36134047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 137
Target Start/End: Original strand, 26045298 - 26045364
Alignment:
Q  71 tgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||    
T  26045298 tgttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgtttttgtgctgcctattttgctgttgt 26045364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 137
Target Start/End: Original strand, 26050479 - 26050545
Alignment:
Q  71 tgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||    
T  26050479 tgttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgtttttgtgctgcctattttgctgttgt 26050545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 40907027 - 40906987
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40907027 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 40906987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 14185040 - 14184973
Alignment:
Q  243 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  14185040 tgttgctgttgtatattgatcaaattgcaggtgttggtctaagttgtaagttatctttccaaagtatt 14184973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 111
Target Start/End: Original strand, 4831543 - 4831580
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4831543 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 4831580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 111
Target Start/End: Original strand, 4834838 - 4834875
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4834838 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 4834875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 14047752 - 14047715
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14047752 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 14047715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 30146499 - 30146462
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30146499 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 30146462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16043131 - 16043087
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16043131 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 16043087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 3412858 - 3412820
Alignment:
Q  32 gattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3412858 gattatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagt 3412820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 114
Target Start/End: Original strand, 32306997 - 32307043
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 114  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32306997 agttgatgttgattattatttaatattgttatatcttgagatgttta 32307043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15990307 - 15990254
Alignment:
Q  206 ttaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatatt 259  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  15990307 ttaatattgttataatgtgaattgcttgtgttgtttctgctgttgttgattatt 15990254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Original strand, 16488126 - 16488170
Alignment:
Q  26 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16488126 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 16488170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 17333396 - 17333352
Alignment:
Q  69 gttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 113  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17333396 gttgttgattattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 17333352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 20157501 - 20157552
Alignment:
Q  19 gttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20157501 gttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaatttgcatgagt 20157552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 109
Target Start/End: Original strand, 49547746 - 49547781
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagat 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49547746 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 49547781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 1951778 - 1951845
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1951778 atgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 1951845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 70
Target Start/End: Original strand, 13813073 - 13813111
Alignment:
Q  32 gattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13813073 gattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 13813111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 18222395 - 18222462
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18222395 atgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 18222462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 114
Target Start/End: Original strand, 14852895 - 14852924
Alignment:
Q  85 atttgatattgttatatcttgagatgttta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14852895 atttgatattgttatatcttgagatgttta 14852924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 68)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 68 - 331
Target Start/End: Original strand, 19773544 - 19773807
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19773544 agttgttcttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcatatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 19773643  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19773644 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 19773743  T
Q  268 tgcaggtgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19773744 tgtaggtgttgtctaagttgtaagttatcgttccaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 19773807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 18955779 - 18956027
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18955779 atgaattgatattaagttgttgatatgatccgattatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagttgtggttgattatcatttgatattgttata 18955878  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18955879 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 18955978  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18955979 tcataataatattgttatgttgtgaattgcatgcgctgtttctgttgct 18956027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 31477828 - 31478077
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31477828 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 31477925  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31477926 tcttgagatgtttacgtgtcgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 31478025  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31478026 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 31478077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 18917282 - 18917533
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18917282 atgaattgatattgggctgttgatatgatataattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 18917381  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18917382 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 18917481  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18917482 tcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 18917533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1644795 - 1644547
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  1644795 atgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgccattgttattaaactaagttgcatgagttgttg---attatcatttgatattgttata 1644699  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1644698 ttctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatact 1644599  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1644598 tcataataatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 1644547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14472360 - 14472113
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14472360 atgaattgatattaagctgttgatatgatctaattatgctgctattgttattaa-ctaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 14472262  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  14472261 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtataatgttgaagttattgatact 14472162  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  14472161 tcataataatattgttatgttgtgaattgcatgtgctgtttctgttgct 14472113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16760383 - 16760134
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16760383 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcacgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 16760286  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16760285 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatatatgatgtttaagttgttgatact 16760186  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16760185 ttatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 16760134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22949193 - 22948950
Alignment:
Q  4 aattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatct 103  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22949193 aattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatct 22949096  T
Q  104 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22949095 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttta 22948996  T
Q  204 tattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22948995 tattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 22948950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11566952 - 11566723
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11566952 atgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 11566853  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  11566852 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 11566753  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11566752 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 11566723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19870680 - 19870451
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19870680 atgaattgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 19870581  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  19870580 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 19870481  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19870480 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 19870451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22863036 - 22862811
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22863036 atgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 22862937  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  22862936 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 22862837  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaa 226  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  22862836 tcacattaatattgttatgttgtgaa 22862811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23395158 - 23394929
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23395158 atgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 23395059  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  23395058 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 23394959  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23394958 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 23394929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 68 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22806051 - 22805779
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  22806051 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgtgatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatattcgttatg 22805952  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22805951 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgctcgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 22805852  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    |||||||||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22805851 tgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcattccaaagtatcccaaagtattggagtcttaagt 22805779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22953149 - 22952906
Alignment:
Q  4 aattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatct 103  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22953149 aattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatct 22953052  T
Q  104 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22953051 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttta 22952952  T
Q  204 tattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22952951 tattaatattgttatgttgagaattgcttgtgctgtttctgttgct 22952906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23871637 - 23871394
Alignment:
Q  4 aattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatct 103  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23871637 aattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatct 23871540  T
Q  104 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23871539 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttta 23871440  T
Q  204 tattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  23871439 tattaatattgttatgttgagaattgcttgtgctgtttctgttgct 23871394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23875593 - 23875350
Alignment:
Q  4 aattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatct 103  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23875593 aattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatct 23875496  T
Q  104 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23875495 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttta 23875396  T
Q  204 tattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  23875395 tattaatattgttatgttgagaattgcttgtgctgtttctgttgct 23875350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8243951 - 8243722
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8243951 atgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 8243852  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  8243851 tcctgagatgtttatgtgtcacctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 8243752  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8243751 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 8243722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23990010 - 23989781
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23990010 atgaattggtaataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 23989911  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  23989910 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttaggtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 23989811  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23989810 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 23989781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 68 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23415003 - 23414819
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23415003 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 23414904  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23414903 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 23414819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Original strand, 15705445 - 15705668
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15705445 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacttgttttctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatg 15705544  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15705545 tggaaaatgtatgatgtataagttgatgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtttaatattgatcaagt 15705644  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  15705645 tgcaggtgttggtctaagttgtaa 15705668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 68 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 27556761 - 27556577
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27556761 agttgttgttgatcatcatttgatgttgttatatattgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 27556662  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27556661 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 27556577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 12618860 - 12619087
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12618860 atgaattggtatcaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 12618959  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  12618960 tcctgagatgtttatgtgtctcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatt--tatgtcttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 12619057  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12619058 tcacattaatattgttatgctgtgaattgc 12619087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 101 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17743463 - 17743276
Alignment:
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17743463 tcttgagatgtttacgtgctacctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatact 17743364  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttg 287  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17743363 tctcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctattgctgttgaagattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttg 17743276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 68 - 286
Target Start/End: Original strand, 28103900 - 28104119
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28103900 agttgatgttgattatcatttgatgttgttataccttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 28103999  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28104000 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagt 28104099  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagtt 286  Q
    | |||||||| |||||||||    
T  28104100 ttcaggtgttggtctaagtt 28104119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Original strand, 15817523 - 15817744
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15817523 agttgatgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcatatgttgttgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatg 15817622  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15817623 tggaaaatgtatgatgtttaagtagttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttttg-tgtttct-atgctgttgaatattgatcaagt 15817720  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  15817721 tgcaggtgttggtctaagttgtaa 15817744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 74 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15875496 - 15875279
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 173  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  15875496 tgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcatatgttgctgatgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaa 15875397  T
Q  174 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  15875396 atgtatgatgtttaagttgttgataattttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttacatattgatcaagttgcaag 15875297  T
Q  274 tgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||| ||||| |||||||    
T  15875296 tgttggtctatgttgtaa 15875279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 87 - 290
Target Start/End: Original strand, 17377818 - 17378022
Alignment:
Q  87 ttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttt 186  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  17377818 ttgatgttgtcatatcttgagatgtttacgtgctgcatatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgttt 17377917  T
Q  187 aagttgttgatacttcat-attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaag 284  Q
    |||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17377918 aagttgtttat-gttcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtattgtttctgttgttgttgtatattgatcaagttgcaggtgttggtctaag 17378016  T
Q  285 ttgtaa 290  Q
    ||||||    
T  17378017 ttgtaa 17378022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 121 - 252
Target Start/End: Original strand, 27415994 - 27416125
Alignment:
Q  121 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27415994 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 27416093  T
Q  221 tgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27416094 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 27416125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 132 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18914000 - 18913813
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  18914000 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgagaattgct 18913901  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18913900 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 18913813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 132 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18937258 - 18937071
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  18937258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgagaattgct 18937159  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18937158 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 18937071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 68 - 222
Target Start/End: Original strand, 14979389 - 14979543
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14979389 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgtttaagtgatgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 14979488  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttg 222  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |  ||   ||||||||||||||||||    
T  14979489 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgattttcattaatattgttatgttg 14979543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 132 - 309
Target Start/End: Original strand, 15174163 - 15174350
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15174163 tgttgttggttatgtgaaataattatatgacttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgagaattact 15174262  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15174263 tgtgctatttatgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 15174350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18696589 - 18696480
Alignment:
Q  86 tttgatattgttatatcttgagatgttt-acgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgt 184  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18696589 tttgatattgttatatcatgaactgttttatgtattgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgt 18696490  T
Q  185 ttaagttgtt 194  Q
    ||||||||||    
T  18696489 ttaagttgtt 18696480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 132 - 290
Target Start/End: Original strand, 19656076 - 19656237
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttata--tgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattg 229  Q
    ||||||| || |||||| ||| |||||  ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | |  ||    |||||||||||||| |||||||||    
T  19656076 tgttgttagtaatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattg 19656175  T
Q  230 cttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  19656176 catgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaagtgttggtcaaagttgtaa 19656237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18706371 - 18706301
Alignment:
Q  121 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagtt 191  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18706371 gcctatgttgctgtttttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtt 18706301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 68 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 20136789 - 20136722
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgtt 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20136789 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgtt 20136722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 68 - 135
Target Start/End: Original strand, 22196080 - 22196147
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgtt 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22196080 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgtt 22196147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 23838293 - 23838224
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  23838293 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 23838224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 17804287 - 17804218
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  17804287 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 17804218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18453301 - 18453232
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  18453301 agttgatgttgattatcatttgattttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 18453232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23538798 - 23538745
Alignment:
Q  216 tatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 269  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23538798 tatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 23538745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 4476935 - 4476872
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  4476935 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 4476872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23956206 - 23956148
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 190  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23956206 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 23956148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 22430046 - 22430115
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  22430046 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatagttaattaactaagttgcatgagt 22430115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 25767184 - 25767253
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  25767184 atgaattgatattaagctgttggtgtgatctgattatgctgctattgttacttaactaagttgcatgagt 25767253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 17105835 - 17105771
Alignment:
Q  205 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 269  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17105835 attattattgatatgttgagaattgcctgtgttgtttctgttgctgttgaacattgatcaagttg 17105771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20182912 - 20182848
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgct 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  20182912 agttgttgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatattgct 20182848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 132
Target Start/End: Original strand, 22153079 - 22153143
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgct 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  22153079 agttgttgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatattgct 22153143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23539087 - 23539020
Alignment:
Q  69 gttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttg 136  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||    
T  23539087 gttgatgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtatatgtgctgcctgtgttgctgttg 23539020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 33443163 - 33443122
Alignment:
Q  72 gttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 113  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33443163 gttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 33443122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 111
Target Start/End: Original strand, 29416912 - 29416949
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29416912 tgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 29416949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Original strand, 16523432 - 16523476
Alignment:
Q  26 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16523432 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 16523476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 198
Target Start/End: Original strand, 20078134 - 20078182
Alignment:
Q  150 atatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 198  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20078134 atatatatatgcgttatgtgtaagatgtatgatgttgaagttgttgata 20078182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 113
Target Start/End: Original strand, 18177680 - 18177719
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18177680 tgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 18177719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 113
Target Start/End: Original strand, 18199424 - 18199463
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18199424 tgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 18199463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 18204191 - 18204152
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18204191 tgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 18204152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 12706778 - 12706711
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12706778 atgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 12706711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 18907189 - 18907135
Alignment:
Q  16 gctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  18907189 gctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagctgcatgagt 18907135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 23414734 - 23414667
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  23414734 atgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 23414667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 114
Target Start/End: Original strand, 25619724 - 25619770
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  25619724 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgttta 25619770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 27556492 - 27556425
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27556492 atgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 27556425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 23076851 - 23076806
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  23076851 agttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttt 23076806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 70
Target Start/End: Original strand, 27325650 - 27325703
Alignment:
Q  17 ctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  27325650 ctgttgatgtgatatgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 27325703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 68
Target Start/End: Original strand, 1587777 - 1587813
Alignment:
Q  32 gattatgatgctattgttattaaactaagttgcatga 68  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1587777 gattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatga 1587813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Original strand, 19790828 - 19790872
Alignment:
Q  26 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  19790828 tgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 19790872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20224062 - 20224018
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  20224062 agttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgtt 20224018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 22118046 - 22118002
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  22118046 agttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgtt 22118002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 23538928 - 23538884
Alignment:
Q  69 gttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23538928 gttgatgttgattgtcatttgatattgttatatcatgagctgttt 23538884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 5 - 252
Target Start/End: Original strand, 40723607 - 40723854
Alignment:
Q  5 attgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatctt 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  40723607 attgatattaagttgttgatatgatccgattatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttaatattgatatatctt 40723706  T
Q  105 gagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40723707 gagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcat 40723806  T
Q  205 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40723807 aatagtattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 40723854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20295937 - 20295708
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20295937 atgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 20295838  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  20295837 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 20295738  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20295737 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 20295708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 10753452 - 10753203
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10753452 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 10753355  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10753354 tcttgagatgtttacatgttgcctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 10753255  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10753254 tcatattaatattgctatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgttgtt 10753203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 19472736 - 19472965
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19472736 atgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 19472835  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  19472836 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 19472935  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19472936 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 19472965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Original strand, 22107436 - 22107659
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22107436 agttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttaggtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtcaaatatttatatgccttatg 22107535  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22107536 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 22107635  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  22107636 tgcaggtgttggtctaagttgtaa 22107659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 68 - 252
Target Start/End: Original strand, 20910918 - 20911102
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20910918 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatg 20911017  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20911018 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgtttgtgttgtttctgttgctgtt 20911102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 68 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18356315 - 18356131
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18356315 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 18356216  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18356215 tggaagatgtatgatgtttgagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgtttgtgatgtttctgttgctgtt 18356131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 6765947 - 6765724
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  6765947 agttgatgttgattattatttgatgttgttatatcttgagatgtttaagtgccgcctatgttgctgttgttggttgtgtgaaatgtttatatgccttatg 6765848  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  6765847 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaaga 6765748  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||| ||||| |||||||||||||    
T  6765747 tgcatgtgttggtctaagttgtaa 6765724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 71 - 230
Target Start/End: Original strand, 15236921 - 15237080
Alignment:
Q  71 tgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgg 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15236921 tgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgg 15237020  T
Q  171 aagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15237021 aagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 15237080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 86 - 290
Target Start/End: Original strand, 33895665 - 33895870
Alignment:
Q  86 tttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtt 185  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33895665 tttgatattgttgtatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgtgggttttgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtt 33895764  T
Q  186 taagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaag 284  Q
    |||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  33895765 taagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaactgcttgtgctgtttatgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtattggtctaag 33895864  T
Q  285 ttgtaa 290  Q
    ||||||    
T  33895865 ttgtaa 33895870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 29448125 - 29447899
Alignment:
Q  66 tgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt-acgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcctt 164  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29448125 tgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaataattatatgcctt 29448026  T
Q  165 atgtggaagatgtatgatgtttaagttg-ttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatc 263  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||     
T  29448025 atgtggaa-atgtataatgtttaaattgattgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgctcctgttgatgttgagtattgatt 29447927  T
Q  264 aagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  29447926 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 29447899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 132 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17011069 - 17010923
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  17011069 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 17010970  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 278  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17010969 tgtgctgcttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttg 17010923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 15236796 - 15236925
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15236796 atgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 15236895  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttg 130  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15236896 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttg 15236925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 132 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 263201 - 263042
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  263201 tgttgttggttatgtgaaataattatgtgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 263102  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgt-tgtctaagttgtaa 290  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  263101 tgtgctgtttctgttgttgttgcatatagatcaagttgcaggtataggtctaagttgtaa 263042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 23535603 - 23535672
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23535603 atgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 23535672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18356381 - 18356308
Alignment:
Q  121 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18356381 gcctatgttgctgttgttggttatctgaaatatttatatgctttat-tggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 18356308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 196 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 11231041 - 11230985
Alignment:
Q  196 atacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11231041 atactttatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 11230985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 195
Target Start/End: Original strand, 20910854 - 20910925
Alignment:
Q  123 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttg 195  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20910854 ctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttat-tggaaaatgtatgatgtataagttgttg 20910925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 42960653 - 42960590
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  42960653 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgccgttgttg 42960590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 11220643 - 11220587
Alignment:
Q  196 atacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11220643 atactttatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 11220587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 11225229 - 11225173
Alignment:
Q  196 atacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11225229 atactttatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 11225173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 11229052 - 11228996
Alignment:
Q  196 atacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11229052 atactttatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 11228996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Original strand, 28371031 - 28371094
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  28371031 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 28371094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Original strand, 37598892 - 37598955
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  37598892 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 37598955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 190
Target Start/End: Original strand, 33473272 - 33473330
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 190  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33473272 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 33473330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 17410530 - 17410461
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  17410530 atgaattgatattaagttgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 17410461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 117
Target Start/End: Original strand, 30138930 - 30138979
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30138930 agttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 30138979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22336678 - 22336615
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  |||||||    
T  22336678 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgtcgttgttg 22336615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22340216 - 22340153
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  |||||||    
T  22340216 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgtcgttgttg 22340153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 23469921 - 23469853
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  23469921 agttgatgttgattatcatttgatatggt-atatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 23469853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10816515 - 10816453
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||| ||||||||    
T  10816515 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtgctacctatgatgctgttg 10816453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 138
Target Start/End: Original strand, 26732841 - 26732904
Alignment:
Q  75 gttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgtt 138  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |    ||||||||||||||||||    
T  26732841 gttgattattatttgatattgttatatcctgagatgtttatgcactgcctatgttgctgttgtt 26732904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11227061 - 11227008
Alignment:
Q  197 tacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctg 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  11227061 tactttatattaatattgttatgttgtgaatttcatgtgctgtatctgttgctg 11227008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 23538541 - 23538504
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23538541 tgttgattatgatttgatattgttatatcttgagatgt 23538504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Original strand, 21366713 - 21366757
Alignment:
Q  26 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21366713 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 21366757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 113
Target Start/End: Original strand, 27988934 - 27988978
Alignment:
Q  69 gttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  27988934 gttgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagctgttt 27988978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 70
Target Start/End: Original strand, 17517259 - 17517294
Alignment:
Q  35 tatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17517259 tatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagt 17517294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 114
Target Start/End: Original strand, 26740650 - 26740693
Alignment:
Q  71 tgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  26740650 tgttgttgattattatttgatattgttatatccttagatgttta 26740693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 15796533 - 15796471
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatg-tttacgtgtcgcctatgttgctgtt 135  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||| |||  |||||||||||||||    
T  15796533 tgttgattatcatttgatattgctatatcatgagctgttttatgtgctgcctatgttgctgtt 15796471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 20911187 - 20911254
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20911187 atgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 20911254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 66
Target Start/End: Original strand, 24767588 - 24767634
Alignment:
Q  20 ttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcat 66  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24767588 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 24767634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 114
Target Start/End: Original strand, 25576857 - 25576902
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 114  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25576857 agttgatgttgattattatt-gatattgttatatcttgagatgttta 25576902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 133
Target Start/End: Original strand, 21328217 - 21328282
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctg 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||  |||  |||||||||||||    
T  21328217 agttgatgttgattatcatttgatattgctatatctgaatatgtttttgtgctgcctatgttgctg 21328282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 4036279 - 4036243
Alignment:
Q  32 gattatgatgctattgttattaaactaagttgcatga 68  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4036279 gattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatga 4036243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 22750300 - 22750264
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatctt 104  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22750300 agttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 22750264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 68
Target Start/End: Original strand, 25229452 - 25229488
Alignment:
Q  32 gattatgatgctattgttattaaactaagttgcatga 68  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25229452 gattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatga 25229488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 68
Target Start/End: Original strand, 25293608 - 25293644
Alignment:
Q  32 gattatgatgctattgttattaaactaagttgcatga 68  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25293608 gattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatga 25293644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 26680650 - 26680606
Alignment:
Q  26 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  26680650 tgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 26680606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 26952257 - 26952213
Alignment:
Q  26 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  26952257 tgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 26952213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 135
Target Start/End: Original strand, 41861455 - 41861523
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatg-tttacgtgtcgcctatgttgctgtt 135  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||| |||  |||||||||||||||    
T  41861455 agttgatggtgattgtcatttgatattgttatatcatgagctgttttatgtgctgcctatgttgctgtt 41861523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 20228825 - 20229076
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20228825 atgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgccattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 20228924  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20228925 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatact 20229024  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20229025 tcataataatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 20229076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 1925147 - 1925396
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1925147 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 1925244  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1925245 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 1925344  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1925345 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 1925396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 20924161 - 20924410
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20924161 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 20924258  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20924259 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 20924358  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20924359 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 20924410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1010813 - 1010584
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1010813 atgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 1010714  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  1010713 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 1010614  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1010613 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 1010584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21407445 - 21407216
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21407445 atgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 21407346  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  21407345 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 21407246  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21407245 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 21407216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 68 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 48603571 - 48603299
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48603571 agttgttgttgattatcatttgatattgttagatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggctatgtgaaatatttatatgccttatg 48603472  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48603471 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgatggaaattgcttgtgctgtttctgttgctattgaatattgatcaagt 48603372  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtc--------taagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    |||||||||| |||        |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48603371 tgcaggtgttggtctaagttgttaagttgtaagttgtcgttccaaagtattcaaaagtattggagtcttaagt 48603299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 16375474 - 16375704
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga-tattgttat 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16375474 atgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgaatattgttat 16375573  T
Q  100 atcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatac 199  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16375574 atcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgc 16375673  T
Q  200 ttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16375674 ttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 16375704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 52639631 - 52639402
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52639631 atgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgttattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattcgatattgttata 52639532  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  52639531 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtggaagatgtttgatgtctaagttgttgatgct 52639432  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52639431 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 52639402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 84 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12271657 - 12271450
Alignment:
Q  84 catttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12271657 catttgatattgttatatcttgagatgtttaagtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggaaaatgtatgatg 12271558  T
Q  184 tttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtcta 282  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12271557 tttaagttgttgatacttttcattaattttgttatgctgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtcta 12271458  T
Q  283 agttgtaa 290  Q
    ||||||||    
T  12271457 agttgtaa 12271450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 68 - 331
Target Start/End: Original strand, 27653224 - 27653496
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27653224 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttaagtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 27653323  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  27653324 tagaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaaga 27653423  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    ||||| |||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27653424 tgcagatgttggtctaagttataaagttgtaagttgtctttccaaagtgtttcaaagtattggagtcttaagt 27653496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 74 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 51326905 - 51326638
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 173  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  51326905 tgttgattattatttgatgttgttatatcttgagatgtttaggtgctgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaa 51326806  T
Q  174 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagg 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  51326805 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcagg 51326706  T
Q  274 tgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagt-attccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    |||| || |        ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  51326705 tgttggtataagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgtttccaaagtattggagtcttaagt 51326638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 48520629 - 48520407
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48520629 agttgatgttgtttattatttgatattgttatatct-gagatgttcatgttctacctatgttgctgctgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 48520531  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  48520530 tggaaaatgtataatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgatatgttgtgaattgcttgtgctgtttctattgccgttgaatattgatcaagt 48520431  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||| ||||||    
T  48520430 tgcaggtgttggtctaaattgtaa 48520407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 132 - 288
Target Start/End: Original strand, 46198433 - 46198590
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  46198433 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgaggcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 46198532  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt 288  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46198533 tgtgttgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt 46198590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 132 - 309
Target Start/End: Original strand, 29764346 - 29764533
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  29764346 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgttttcaattaatattgttatgttgtgaattgct 29764445  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29764446 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 29764533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 124 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 33797584 - 33797456
Alignment:
Q  124 tatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33797584 tatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttcacattaatattgttatgttgt 33797485  T
Q  224 gaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33797484 gaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 33797456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 68 - 226
Target Start/End: Original strand, 13881383 - 13881541
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13881383 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgtttatgtgatgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 13881482  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaa 226  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||||    
T  13881483 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgtgaa 13881541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 23819316 - 23819457
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23819316 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttattaaacgaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 23819413  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttat 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23819414 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttat 23819457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 132 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 50000817 - 50000658
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  50000817 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgttatgttgtgaattgct 50000718  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  50000717 tgtgctatttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagtggtaa 50000658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 121 - 331
Target Start/End: Original strand, 22130961 - 22131169
Alignment:
Q  121 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatg-tttaagttgttgatacttcatattaatattgttatg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||            | |||    
T  22130961 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttttaagttgttgatgcttc------------tcatg 22131048  T
Q  220 ttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattc 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22131049 ttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttctcgttccaaagtattc 22131148  T
Q  311 caaagtattggagtcttaagt 331  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  22131149 caaagtactggagtcttaagt 22131169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 195
Target Start/End: Original strand, 41781594 - 41781718
Alignment:
Q  72 gttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgg- 170  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41781594 gttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgaaatgtttatgtgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 41781693  T
Q  171 aagatgtatgatgtttaagttgttg 195  Q
    || ||||| ||||||||||||||||    
T  41781694 aaaatgtacgatgtttaagttgttg 41781718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 43543241 - 43543144
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 171  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  43543241 tgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtgga 43543144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 217 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20316606 - 20316532
Alignment:
Q  217 atgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  20316606 atgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagtttcaggtgttggtctaaattgtaa 20316532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 22124404 - 22124338
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  22124404 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgt 22124338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Original strand, 20437995 - 20438064
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||    
T  20437995 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgaggtgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 20438064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 20958227 - 20958158
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  20958227 agttgatgttgattatcatttgatattgtcatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 20958158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 24783116 - 24783185
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24783116 atgaattgatattaagctgttcatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 24783185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16372108 - 16372045
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  16372108 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 16372045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 28312633 - 28312564
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||| ||||||    
T  28312633 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgtctatgttgatgttgt 28312564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 137
Target Start/End: Original strand, 21043294 - 21043352
Alignment:
Q  79 attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  21043294 attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgttgttgt 21043352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 331
Target Start/End: Original strand, 636090 - 636139
Alignment:
Q  282 aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  636090 aagttgtaagttgtctttctaaagtattccaaagtattggattcttaagt 636139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 70
Target Start/End: Original strand, 36819330 - 36819394
Alignment:
Q  6 ttgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  36819330 ttgatattaagctggtgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 36819394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 111
Target Start/End: Original strand, 2332982 - 2333019
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2332982 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 2333019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 14800648 - 14800583
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctg 133  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||||||||||    
T  14800648 agttgatgttgattattatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgctgcatatgttgctg 14800583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 14809522 - 14809457
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctg 133  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||||||||||    
T  14809522 agttgatgttgattattatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgctgcatatgttgctg 14809457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 32649824 - 32649787
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32649824 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 32649787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 70
Target Start/End: Original strand, 18182159 - 18182213
Alignment:
Q  16 gctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18182159 gctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 18182213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 16080460 - 16080529
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||||||||| |||| | ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  16080460 atgaattgataataagttattgatgtgatctgattatgctgctatttttaattaactaagttgcatgagt 16080529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 29534661 - 29534624
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29534661 tgttgattatcatttgatatcgttatatcttgagatgt 29534624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Original strand, 52940879 - 52940947
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||||    
T  52940879 agttgatgttgattattatttggtattgttatatcttgagatg-ttatgtgctgcctatgttgttgttgt 52940947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Original strand, 3472971 - 3473015
Alignment:
Q  26 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3472971 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 3473015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 16381300 - 16381256
Alignment:
Q  69 gttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16381300 gttgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 16381256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 68 - 138
Target Start/End: Original strand, 20454554 - 20454625
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatg-tttacgtgtcgcctatgttgctgttgtt 138  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||| || |||| |||  ||||||||||||||||||    
T  20454554 agttgatgttgattgtcatttgatattgttataccatgagctgttttatgtgctgcctatgttgctgttgtt 20454625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 33797371 - 33797304
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  33797371 atgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 33797304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 137
Target Start/End: Original strand, 635992 - 636053
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||| || |||| |||  |||||||||||||||||    
T  635992 ttgaatattatttgacattgttatatcttgaaatatttatgtgctgcctatgttgctgttgt 636053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 94)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 39722356 - 39722105
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39722356 atgagttgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 39722257  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39722256 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 39722157  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39722156 tcataataatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttatgttgctgtt 39722105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 68 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14258569 - 14258297
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14258569 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 14258470  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14258469 tggaaaatgtatgatgtttgagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtaatgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 14258370  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    |||||||||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14258369 tgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcattccaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 14258297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33197 - 32968
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33197 atgaattgatattaagctgttgatatgttccgattatgctgttattgttatttaactcagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 33098  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  33097 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 32998  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32997 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 32968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18283456 - 18283227
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18283456 atgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 18283357  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18283356 tcttgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 18283257  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18283256 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 18283227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 45170024 - 45170270
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45170024 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 45170121  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45170122 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 45170221  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 249  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  45170222 ttatattaatattgttatgttgtgaattgtttgtactgtttctgttgct 45170270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 70781 - 71009
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70781 atgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 70880  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  70881 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgtcgatgct 70980  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattg 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  70981 tcacattaatattgttatgttgtgaattg 71009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 74890 - 75118
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74890 atgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 74989  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  74990 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgtcgatgct 75089  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattg 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  75090 tcacattaatattgttatgttgtgaattg 75118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 68 - 331
Target Start/End: Original strand, 16460767 - 16461039
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16460767 agttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgttagttatgtgaaatatttatatgccttatg 16460866  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16460867 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcatcaatattgttatgttgtgaattgcttttgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 16460966  T
Q  268 tgcaggtg-ttgtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    |||||||| ||||||        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16460967 tgcaggtgtttgtctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 16461039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12714954 - 12714725
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12714954 atgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 12714855  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  12714854 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 12714755  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12714754 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 12714725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12718758 - 12718529
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12718758 atgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 12718659  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  12718658 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 12718559  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12718558 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 12718529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 16907217 - 16907446
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16907217 atgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 16907316  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  16907317 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 16907416  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16907417 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 16907446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 12704675 - 12704904
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12704675 atgaattggtattaagctgctgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 12704774  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  12704775 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 12704874  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12704875 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 12704904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18279493 - 18279264
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18279493 atgaattggtattaagttgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 18279394  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18279393 tcttgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 18279294  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18279293 tcacattaatattgttatgttttgaattgc 18279264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26292485 - 26292256
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26292485 atgaattgatattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 26292386  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  26292385 tcctgagatgtttatgtgtcgtcaatgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 26292286  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26292285 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 26292256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 68 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16579877 - 16579605
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16579877 agttgtttttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatg 16579778  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    || || |||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16579777 tgtaaaatgtattatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctattgctgttgaatattgatcaagt 16579678  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    |||||||||| ||||        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16579677 tgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 16579605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 68 - 331
Target Start/End: Original strand, 16585786 - 16586058
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16585786 agttgtttttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatg 16585885  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    || || |||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16585886 tgtaaaatgtattatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctattgctgttgaatattgatcaagt 16585985  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    |||||||||| ||||        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16585986 tgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 16586058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12723666 - 12723440
Alignment:
Q  4 aattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatct 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12723666 aattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgatattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcc 12723567  T
Q  104 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttca 203  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  12723566 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagctgttgatgcttca 12723467  T
Q  204 tattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  12723466 cattaatattgttatgttgtgaattgc 12723440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16114331 - 16114102
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16114331 atgaattgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 16114232  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  16114231 tcctgagatgttcatgtgtcgcctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 16114132  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16114131 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 16114102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16117484 - 16117255
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16117484 atgaattgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 16117385  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  16117384 tcctgagatgttcatgtgtcgcctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 16117285  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16117284 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 16117255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 32301406 - 32301183
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32301406 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatg 32301307  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32301306 tggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatacttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 32301207  T
Q  268 tgcaggt-gttgtctaagttgtaa 290  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  32301206 tgcaggtggtggtctaagttgtaa 32301183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 68 - 252
Target Start/End: Original strand, 1858833 - 1859017
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1858833 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 1858932  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1858933 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgatatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 1859017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 72 - 252
Target Start/End: Original strand, 25927254 - 25927434
Alignment:
Q  72 gttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25927254 gttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtgga 25927353  T
Q  172 agatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25927354 agatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgatgtt 25927434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 68 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15720114 - 15719842
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15720114 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcatatgtttctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 15720015  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15720014 tgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgatgaatattgatcaagt 15719915  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    |||||||||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  15719914 tgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcctaagt 15719842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 68 - 252
Target Start/End: Original strand, 13918527 - 13918711
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13918527 agttgttgttaattatcatttgatatcgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttata 13918626  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13918627 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 13918711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8940368 - 8940145
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8940368 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatg 8940269  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  8940268 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttatgttgctgttgcatattgatcaagt 8940169  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  8940168 tgcaggtgttggtctaagttgtaa 8940145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16998711 - 16998488
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998711 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttaagtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 16998612  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16998611 ttgaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtaatgtttctgttgctgttgcatattgatcaagt 16998512  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  16998511 tgcaggtgttggtctaagttgtaa 16998488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Original strand, 46580677 - 46580900
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46580677 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 46580776  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  46580777 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgctgtgaattgcttgtactgtttttgttgctgttgcatattgatcaagt 46580876  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  46580877 tgcaggtgttggtctaagttgtaa 46580900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 74 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8468830 - 8468613
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 173  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||      
T  8468830 tgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggaga 8468731  T
Q  174 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagg 273  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  8468730 atatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtattgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcagg 8468631  T
Q  274 tgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||| |||||||||||||    
T  8468630 tgttggtctaagttgtaa 8468613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 68 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14273633 - 14273361
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14273633 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatg 14273534  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |  ||   |||||||||||||||||| ||||   ||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  14273533 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgtttttcattaatattgttatgttgcgaatattttgtactatttctgttgctattgcatattgatcaagt 14273434  T
Q  268 tgcaggtg-ttgtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    |||||||| ||||||        ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14273433 tgcaggtgtttgtctaagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaagt 14273361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 84 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15113046 - 15112839
Alignment:
Q  84 catttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15113046 catttgatattgttatatcttgagatgtttaagtgttgcctatgttgatgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtagaaaatgtatgatg 15112947  T
Q  184 tttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtcta 282  Q
    |||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15112946 tttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaatttcttgtactgtttctgttgctgttgcacattgatcaagttgcaggtgttggtcta 15112847  T
Q  283 agttgtaa 290  Q
    ||||||||    
T  15112846 agttgtaa 15112839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 84 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16324153 - 16323947
Alignment:
Q  84 catttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatg 183  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  16324153 cattcgatattgttatatcttgagatgtttaagtgttgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgtt-atatgccttttgtggaaaatgcatgatg 16324055  T
Q  184 tttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtcta 282  Q
    |||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16324054 tttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcgggtgttggtcta 16323955  T
Q  283 agttgtaa 290  Q
    ||||||||    
T  16323954 agttgtaa 16323947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 87 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15116580 - 15116352
Alignment:
Q  87 ttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15116580 ttgatattgttatatcttgagatgtttaagtgctgcctatgttgctgttgtttgttatgtgaaatgtgcatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttt 15116481  T
Q  187 aagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct---- 281  Q
    | |||||||||  ||   |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||        
T  15116480 acgttgttgatgtttttcattaatattgttattttgtgaatttcttgtattgtttctgttgctgttgcacattgatcaagttgcaagtgttggtctttgt 15116381  T
Q  282 -aagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
     ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15116380 aaagttgtaagttgtctttccaaagtatt 15116352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 75 - 278
Target Start/End: Original strand, 17060433 - 17060635
Alignment:
Q  75 gttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaga 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  17060433 gttgattatcgtttgatattgttatattttgagatgtttatgtgctgcatatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatattccttatgtggaaaa 17060532  T
Q  175 tgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   |||||| ||| | | |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||    
T  17060533 tgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatgttggtct-ttgtgaattgcttgtactgtttctattgctgttgaatattgatcaaattacaagt 17060631  T
Q  275 gttg 278  Q
    ||||    
T  17060632 gttg 17060635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 251
Target Start/End: Original strand, 2530191 - 2530320
Alignment:
Q  121 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2530191 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatt-atatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 2530289  T
Q  221 tgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgt 251  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2530290 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgt 2530320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 132 - 290
Target Start/End: Original strand, 32160910 - 32161068
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  32160910 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaat-tgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 32161008  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  32161009 tgtgctgtttctgttgctgttgcatattgattaagttacaggtgttggtctaagttgtaa 32161068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 132 - 278
Target Start/End: Original strand, 16550712 - 16550858
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16550712 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaacgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttttgaattgct 16550811  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 278  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16550812 tgtgttgtttctattgatgttgaataatgatcaagttgcagatgttg 16550858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 147 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15084140 - 15084035
Alignment:
Q  147 gaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgtt 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15084140 gaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgtt 15084041  T
Q  247 gctgtt 252  Q
    ||||||    
T  15084040 gctgtt 15084035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 68 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20487660 - 20487533
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20487660 agttgttgttgattatcatttgatgttgttatgtcttgagatatttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatggcttatg 20487561  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttg 195  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20487560 tggaaaatgtacgatgtttaagttgttg 20487533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 17232973 - 17232814
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  ||   ||||||||||| ||||| | |||||||    
T  17232973 tgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggagaatatatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgtcatgttataaattgct 17232874  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  17232873 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcaggtgttggtctaagttgtaa 17232814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16614950 - 16614825
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16614950 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaacgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttttgaattgct 16614851  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaata 257  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||    
T  16614850 tgtgttgtttctattgatgttaaata 16614825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 174 - 290
Target Start/End: Original strand, 14981543 - 14981660
Alignment:
Q  174 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagg 273  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14981543 atgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcagg 14981642  T
Q  274 tgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||| |||||||||||||    
T  14981643 tgttggtctaagttgtaa 14981660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 174 - 290
Target Start/End: Original strand, 15411019 - 15411136
Alignment:
Q  174 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagg 273  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15411019 atgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgtatattgatcaagttgcagg 15411118  T
Q  274 tgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||| |||||||||||||    
T  15411119 tgttggtctaagttgtaa 15411136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 206 - 331
Target Start/End: Original strand, 1490194 - 1490328
Alignment:
Q  206 ttaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtc 296  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||||||||||    
T  1490194 ttaatattgttatgatgtgaattgcttgtactttttctgttgttgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtc 1490293  T
Q  297 gttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1490294 tttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaagt 1490328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 171
Target Start/End: Original strand, 14270034 - 14270131
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 171  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  14270034 tgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatgttcatatgctttatgtgga 14270131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 42462068 - 42461999
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  42462068 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgctgttgt 42461999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11661391 - 11661322
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  11661391 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 11661322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16008655 - 16008592
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  16008655 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgccgttgttg 16008592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 11312738 - 11312669
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11312738 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 11312669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 12318217 - 12318148
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  12318217 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 12318148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 13635485 - 13635554
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13635485 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 13635554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 15580781 - 15580712
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  15580781 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatcgttatttaactaagttgcatgagt 15580712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 38519491 - 38519422
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  38519491 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgttgttgt 38519422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 136
Target Start/End: Original strand, 10501425 - 10501493
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttg 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  10501425 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgttgttg 10501493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 136
Target Start/End: Original strand, 14157106 - 14157174
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttg 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  14157106 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgtgttgtctatgttgctgttg 14157174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 14566279 - 14566216
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  14566279 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 14566216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 18872437 - 18872374
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  18872437 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 18872374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16996338 - 16996272
Alignment:
Q  71 tgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||    
T  16996338 tgttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctacgttgctgttgt 16996272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14422069 - 14422000
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||| |||||||    
T  14422069 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgaggtgtttatgtgctgcctatgttactgttgt 14422000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 16583346 - 16583277
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  16583346 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactacgttgcatgagt 16583277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18607572 - 18607503
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  18607572 agttgatgttgattatcatttgatatttttatatattgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 18607503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 309
Target Start/End: Original strand, 14157153 - 14157231
Alignment:
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  14157153 tgtgttgtctatgttgctgttgcatattgatcaagttccaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttgcaaagtatt 14157231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 70
Target Start/End: Original strand, 9751794 - 9751847
Alignment:
Q  17 ctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9751794 ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 9751847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 20619491 - 20619430
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  20619491 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgttgttgt 20619430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 309
Target Start/End: Original strand, 10501483 - 10501550
Alignment:
Q  243 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10501483 tgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctgagttgtaagttgtctttccaaagtatt 10501550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 18203929 - 18203887
Alignment:
Q  71 tgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18203929 tgttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 18203887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 137
Target Start/End: Original strand, 130827 - 130888
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||    
T  130827 ttgattattatttgatattgttatatcttgagatgtttctgtgctgcctatgttgatgttgt 130888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 111
Target Start/End: Original strand, 837364 - 837401
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  837364 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 837401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 111
Target Start/End: Original strand, 1202544 - 1202581
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1202544 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 1202581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 137
Target Start/End: Original strand, 11525574 - 11525635
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  11525574 ttgattattatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgctgcctatgttgttgttgt 11525635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 70
Target Start/End: Original strand, 15605294 - 15605358
Alignment:
Q  6 ttgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||  |||||||||    
T  15605294 ttgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaaaatgcatgagt 15605358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 137
Target Start/End: Original strand, 9033359 - 9033417
Alignment:
Q  79 attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  9033359 attattatttgatattgttatatcctgagatatttatgtgttgcctatgttgttgttgt 9033417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 111
Target Start/End: Original strand, 833368 - 833405
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  833368 tgttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgt 833405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 111
Target Start/End: Original strand, 1198548 - 1198585
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1198548 tgttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgt 1198585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 111
Target Start/End: Original strand, 16109521 - 16109558
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16109521 tgttgattatcatttgatattgctatatcttgagatgt 16109558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 38828341 - 38828304
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38828341 tgttgattatcatttgatattattatatcttgagatgt 38828304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 113
Target Start/End: Original strand, 38898196 - 38898241
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38898196 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctagagatgttt 38898241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 70
Target Start/End: Original strand, 2832482 - 2832534
Alignment:
Q  18 tgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2832482 tgttgatgggatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 2832534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 309
Target Start/End: Original strand, 16461046 - 16461081
Alignment:
Q  274 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16461046 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 16461081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 32301137 - 32301102
Alignment:
Q  274 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32301137 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 32301102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 8917486 - 8917448
Alignment:
Q  32 gattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8917486 gattatgttgcaattgttattaaactaagttgcatgagt 8917448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 9593434 - 9593367
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  9593434 atgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 9593367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 70
Target Start/End: Original strand, 12321780 - 12321834
Alignment:
Q  16 gctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12321780 gctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactacgttgcatgagt 12321834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 13918796 - 13918863
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  13918796 atgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 13918863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 70
Target Start/End: Original strand, 39267954 - 39267992
Alignment:
Q  32 gattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39267954 gattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 39267992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 101
Target Start/End: Original strand, 9177667 - 9177700
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9177667 agttgttgttgattatcatttgatattattatat 9177700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 14429960 - 14429907
Alignment:
Q  17 ctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||| | ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14429960 ctgttgttgtgatctgattatgcggctattgttatttaactaagttgcatgagt 14429907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16185984 - 16185935
Alignment:
Q  282 aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16185984 aagttgtaagttatctttccaaagtgttccaaagtattggagtcctaagt 16185935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Original strand, 16724677 - 16724714
Alignment:
Q  33 attatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16724677 attatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgagt 16724714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Original strand, 17701691 - 17701728
Alignment:
Q  33 attatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17701691 attatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgagt 17701728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 104
Target Start/End: Original strand, 10896712 - 10896748
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatctt 104  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10896712 agttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 10896748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 15167321 - 15167285
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatctt 104  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15167321 agttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 15167285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 15728384 - 15728348
Alignment:
Q  32 gattatgatgctattgttattaaactaagttgcatga 68  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15728384 gattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatga 15728348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16579598 - 16579566
Alignment:
Q  274 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16579598 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 16579566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 306
Target Start/End: Original strand, 16586065 - 16586097
Alignment:
Q  274 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16586065 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 16586097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 253
Target Start/End: Original strand, 35961 - 36208
Alignment:
Q  4 aattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35961 aattgatattaagctgttgatatgatctaattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatct 36060  T
Q  104 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36061 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttca 36160  T
Q  204 tattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttg 253  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||    
T  36161 taataatattgttatgttgtgaattgcatgtgctgtt--tgttgctgttg 36208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 96)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 68 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16796604 - 16796362
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16796604 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgaaatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 16796505  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16796504 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 16796405  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16796404 tgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 16796362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 11854826 - 11854575
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11854826 atgaattgatgttaagttgttgatatgatctgattatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattattatttgatattgttata 11854727  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11854726 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgtttatatgtcttatgaggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgct 11854627  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  11854626 ccgtattaatattgttatgttgtgaattgcttgagctgtttatgttgctgtt 11854575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 11165545 - 11165774
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11165545 atgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 11165644  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  11165645 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 11165744  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11165745 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 11165774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11070161 - 11069932
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11070161 atgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 11070062  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  11070061 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 11069962  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11069961 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 11069932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15965060 - 15964814
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15965060 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 15964963  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15964962 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 15964863  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 249  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15964862 ttatattaatattgttttgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 15964814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15968984 - 15968738
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15968984 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 15968887  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15968886 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 15968787  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 249  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15968786 ttatattaatattgttttgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 15968738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15972908 - 15972662
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15972908 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 15972811  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15972810 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 15972711  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 249  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15972710 ttatattaatattgttttgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 15972662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 55022960 - 55022731
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55022960 atgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatactgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 55022861  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  55022860 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 55022761  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55022760 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 55022731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19775856 - 19775607
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775856 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 19775759  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775758 tcttgagatgtttacatgtcgcctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 19775659  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19775658 tcatattaatattgctatgttgtgaattgtttgtgctgtttctgttgctgtt 19775607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30066039 - 30065811
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30066039 atgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 30065940  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  30065939 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgctgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 30065840  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattg 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30065839 tcacattaatattgttatgttgtgaattg 30065811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 37439654 - 37439903
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  37439654 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctacaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattattatttgatatggttata 37439751  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37439752 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 37439851  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  37439852 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttatgttgctgtt 37439903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7109791 - 7109562
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7109791 atgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 7109692  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  7109691 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 7109592  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7109591 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 7109562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7113726 - 7113497
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7113726 atgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 7113627  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  7113626 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 7113527  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7113526 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 7113497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22336812 - 22336583
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22336812 atgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 22336713  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  22336712 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 22336613  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22336612 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 22336583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 27409660 - 27409889
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27409660 atgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 27409759  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  27409760 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 27409859  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27409860 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 27409889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28949817 - 28949588
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28949817 atgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 28949718  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  28949717 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 28949618  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28949617 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 28949588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15617467 - 15617239
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15617467 atgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 15617368  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  15617367 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgctgctgctgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 15617268  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattg 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15617267 tcacattaatattgttatgttgtgaattg 15617239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22321757 - 22321528
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321757 atgaattggtattaagctattgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 22321658  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  22321657 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 22321558  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22321557 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 22321528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Original strand, 43889628 - 43889851
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43889628 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 43889727  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43889728 tagaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtctctcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 43889827  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  43889828 tgcaggtgttggtctaagttgtaa 43889851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 324353 - 324130
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  324353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 324254  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  324253 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 324154  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  324153 tgcaggtgttggtctaagttgtaa 324130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 68 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12339824 - 12339640
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12339824 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 12339725  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12339724 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 12339640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 68 - 331
Target Start/End: Original strand, 18700309 - 18700581
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18700309 agttgttgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatg 18700408  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||| | |||||||||||||||||| |||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18700409 tgggaaatgtatgatgtttaagtttttgatgtttctcattaatattgttatgttgtgaattgctagtgctgtttctgttgctgttgaatatagatcaagt 18700508  T
Q  268 tgcaggtgttg-tct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    ||||||||||| |||        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18700509 tgcaggtgttgatctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 18700581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 4111267 - 4111494
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4111267 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 4111364  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  4111365 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 4111464  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4111465 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 4111494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12470019 - 12469796
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12470019 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttcacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 12469920  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  12469919 tggaaaatgtgtgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattggttgtgttgtttttgttgctgttgaatatttataaagt 12469820  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  12469819 tgcaggtgttggtctaagttgtaa 12469796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 4107415 - 4107642
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4107415 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 4107512  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  4107513 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgtt 4107612  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4107613 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 4107642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 87 - 252
Target Start/End: Original strand, 11300532 - 11300697
Alignment:
Q  87 ttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11300532 ttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttt 11300631  T
Q  187 aagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11300632 aagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 11300697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Original strand, 52989724 - 52989947
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52989724 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 52989823  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52989824 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagt 52989923  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  52989924 tgcaggtgttggtctaagttgtaa 52989947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 68 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 5223422 - 5223238
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5223422 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgctgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 5223323  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  5223322 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgtttgtgctgtttttgttgctgtt 5223238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 252
Target Start/End: Original strand, 4588858 - 4589040
Alignment:
Q  70 ttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtg 169  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4588858 ttgttgttgattatcatttgaaattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtg 4588957  T
Q  170 gaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4588958 gaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 4589040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14499418 - 14499189
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14499418 atgaattgatattaagctgttgataagatctgattatgcggttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttaattatcattggatattgttata 14499319  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  14499318 tcctgagatgtttatgtgtcgccaatgtggctgttgtgggttatgtaaaatattaatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagtggttgatgct 14499219  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14499218 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 14499189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 74 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14966281 - 14966064
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14966281 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaa 14966182  T
Q  174 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagg 273  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14966181 atatatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgtttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcagg 14966082  T
Q  274 tgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||| |||||||||||||    
T  14966081 tgttggtctaagttgtaa 14966064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Original strand, 11914018 - 11914241
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11914018 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctggctatgttgttgttgttggctatgtgaaatatttatatgcgttatg 11914117  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  11914118 tggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttttgttgctgttgcatattgatcaagt 11914217  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  11914218 tgcaggtgttggtctaagttgtaa 11914241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 68 - 331
Target Start/End: Original strand, 17691711 - 17691982
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691711 agttgatgttgataatcatttgatgttattatatct-gagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 17691809  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  | |    |||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17691810 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgacgcatttcgttaatattgttatgtgttgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcataatgatcaagt 17691909  T
Q  268 tgcaggtgttg-tct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    ||||||||||| |||        ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17691910 tgcaggtgttgatctaagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaagt 17691982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 68 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21837543 - 21837271
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21837543 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgatgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 21837444  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||   || |||||| |||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21837443 tggaaaatgtatgatgtttatgttgttgatgcttttcatgaatattattatgttgtgaatgacttgtactgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 21837344  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    ||  | |||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  21837343 tgttgatgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaaatgttccaaagtattggagtcttaagt 21837271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 68 - 331
Target Start/End: Original strand, 54876389 - 54876664
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg---gttatgtgaaatatttatatgcctt 164  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  54876389 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgtctatgttgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgcctt 54876488  T
Q  165 atgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatca 264  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  | |    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  54876489 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgacgcatttccttaatattgttatgttgtaaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcataatgatca 54876588  T
Q  265 agttgcaggtgttg-tctaagt--------tgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    |||||||||||||| |||||||        ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  54876589 agttgcaggtgttgatctaagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaaatattgaagtcttaagt 54876664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 68 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15465193 - 15465068
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15465193 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 15465094  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgt 193  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||    
T  15465093 tggaaaatgtatgatgtttatgttgt 15465068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 132 - 309
Target Start/End: Original strand, 35961596 - 35961783
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  35961596 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatatttttatgttgagaattgct 35961695  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35961696 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 35961783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 68 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14671041 - 14670914
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14671041 agttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 14670942  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttg 195  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14670941 tggaaaatgtacgatgtttaagttgttg 14670914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 68 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14682540 - 14682413
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14682540 agttgttgttgattatcatttgatcttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 14682441  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttg 195  Q
    ||||| ||  | ||||||||||||||||    
T  14682440 tggaaaattgacgatgtttaagttgttg 14682413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 132 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22652174 - 22652036
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22652174 tgttgttggttatgtgaaataattatatgcattatgtggaa-atgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatactgttatgttgtgaattgct 22652076  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgca 271  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22652075 tgtgttgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttgca 22652036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 68 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16643290 - 16643135
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||  | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16643290 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgtttatgtgatgtctaagttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 16643191  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgt 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||   | |||||||||||||||||    
T  16643190 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcagtaatattgttatgttgt 16643135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 205 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16979206 - 16979092
Alignment:
Q  205 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttg 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          ||||||||||||||||||||    
T  16979206 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttg 16979107  T
Q  295 tcgttctaaagtatt 309  Q
    |||||| ||||||||    
T  16979106 tcgttccaaagtatt 16979092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 129 - 269
Target Start/End: Original strand, 14569023 - 14569163
Alignment:
Q  129 tgctgttgttggttatg-tgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaat 227  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||  ||   |||| ||||  ||||||||||||    
T  14569023 tgctgttgttggttatggtaaaatatgtatataccttatgtggaaaatgtatgatgttaaaga-gttgatgtttgtcattattattcatatgttgtgaat 14569121  T
Q  228 tgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 269  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569122 tacttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 14569163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 206 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 17046291 - 17046206
Alignment:
Q  206 ttaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17046291 ttaatattgttatgatgtgaattgattgtactgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 17046206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 14179489 - 14179427
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttg 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14179489 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttg 14179427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 70
Target Start/End: Original strand, 2897842 - 2897908
Alignment:
Q  4 aattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2897842 aattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 2897908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 15482753 - 15482684
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15482753 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 15482684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 36527862 - 36527794
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttg 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  36527862 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatatttatgtgttgcctatgttgctgttg 36527794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 9577738 - 9577674
Alignment:
Q  71 tgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||    
T  9577738 tgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgaga--tttatgtgttgcctatgttgctgttgt 9577674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Original strand, 14763736 - 14763799
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  14763736 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 14763799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Original strand, 23371482 - 23371545
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  23371482 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 23371545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 243 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 36527804 - 36527737
Alignment:
Q  243 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  36527804 tgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagtatt 36527737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 41871 - 41813
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 190  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41871 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 41813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 20461516 - 20461585
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  20461516 atgaattgatattaagttgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 20461585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 51300672 - 51300611
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||    
T  51300672 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgt 51300611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 136
Target Start/End: Original strand, 3265017 - 3265085
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttg 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  3265017 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcatgagatgtttatgtgttgcctatgttgttgttg 3265085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 7793365 - 7793435
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccg-attatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7793365 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgaattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 7793435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 114
Target Start/End: Original strand, 10542434 - 10542480
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10542434 agttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 10542480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 114
Target Start/End: Original strand, 10834105 - 10834151
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10834105 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 10834151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 190
Target Start/End: Original strand, 16325249 - 16325307
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 190  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16325249 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttacgtggaaaatgtatgatgtttaagt 16325307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 37427833 - 37427764
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||| || |||||||||    
T  37427833 agttgttgatgattatcatttgatactgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctgtgctgctgttgt 37427764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 327180 - 327250
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccga-ttatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  327180 atgaattgatattaagctgttgatgtgatcttagttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 327250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 70
Target Start/End: Original strand, 19725949 - 19726003
Alignment:
Q  16 gctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19725949 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 19726003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 111
Target Start/End: Original strand, 8928437 - 8928474
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8928437 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 8928474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 14665478 - 14665425
Alignment:
Q  17 ctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14665478 ctgttgatgtgatctgattatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 14665425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 14668634 - 14668581
Alignment:
Q  17 ctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14668634 ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 14668581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15465076 - 15465039
Alignment:
Q  215 ttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15465076 ttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 15465039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 331
Target Start/End: Original strand, 17685744 - 17685793
Alignment:
Q  282 aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17685744 aagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaagt 17685793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 111
Target Start/End: Original strand, 34852664 - 34852701
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34852664 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 34852701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 309
Target Start/End: Original strand, 3265075 - 3265142
Alignment:
Q  243 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg-tctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3265075 tgttgttgttgcatattgatcaattcgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagtatt 3265142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 136
Target Start/End: Original strand, 14568804 - 14568871
Alignment:
Q  69 gttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttg 136  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||    
T  14568804 gttggtgttaattatcatttgatattcttatatcttgagatgtatatgtgctgcctgtgttgctgttg 14568871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 28194802 - 28194743
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgtt 135  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||    
T  28194802 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgctgtctatgttgctgtt 28194743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24513890 - 24513836
Alignment:
Q  237 tgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24513890 tgttgctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagtggtaa 24513836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 69
Target Start/End: Original strand, 15850117 - 15850166
Alignment:
Q  20 ttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgag 69  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15850117 ttgatatgatctgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgag 15850166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 31097571 - 31097640
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||| |||||||||||    
T  31097571 atgaattgttattaagctattgatgtgatctgattatgctgcaattgttaattaactatgttgcatgagt 31097640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Original strand, 3403005 - 3403049
Alignment:
Q  26 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3403005 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 3403049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 11862861 - 11862817
Alignment:
Q  26 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11862861 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 11862817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 12172864 - 12172820
Alignment:
Q  26 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12172864 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 12172820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Original strand, 18383964 - 18384008
Alignment:
Q  26 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18383964 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 18384008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 324084 - 324049
Alignment:
Q  274 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  324084 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 324049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 309
Target Start/End: Original strand, 18700588 - 18700623
Alignment:
Q  274 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18700588 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 18700623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 30029903 - 30029868
Alignment:
Q  35 tatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30029903 tatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagt 30029868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 8489488 - 8489555
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8489488 atgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 8489555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 12496335 - 12496281
Alignment:
Q  16 gctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  12496335 gctgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagt 12496281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 15464954 - 15464887
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15464954 atgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 15464887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 307
Target Start/End: Original strand, 10542484 - 10542517
Alignment:
Q  274 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagta 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10542484 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagta 10542517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 259
Target Start/End: Original strand, 13026468 - 13026521
Alignment:
Q  206 ttaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatatt 259  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||    
T  13026468 ttaatattgttattatgtgaattgcttgtgctgtttctgctgttgttgattatt 13026521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 259
Target Start/End: Original strand, 13030060 - 13030113
Alignment:
Q  206 ttaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatatt 259  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||    
T  13030060 ttaatattgttattatgtgaattgcttgtgctgtttctgctgttgttgattatt 13030113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 15246137 - 15246068
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||   |||  |||||||||||||||||    
T  15246137 agttgatgttgattatcctttgatattgttatgtctggatatgttattgtgctgcctatgttgctgttgt 15246068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 15265258 - 15265189
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||   |||  |||||||||||||||||    
T  15265258 agttgatgttgattatcctttgatattgttatgtctggatatgttattgtgctgcctatgttgctgttgt 15265189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 137
Target Start/End: Original strand, 32402970 - 32403030
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  | |||||||||||||||    
T  32402970 ttgattattatttgatattgttatatcttgagacg-ttatgtgctgtctatgttgctgttgt 32403030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 322660 - 322616
Alignment:
Q  26 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  322660 tgatctgattatgccgctattgttatttaactaagttgcatgagt 322616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Original strand, 1982859 - 1982903
Alignment:
Q  26 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  1982859 tgatctgattatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagt 1982903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Original strand, 3389985 - 3390029
Alignment:
Q  26 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  3389985 tgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 3390029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16979254 - 16979218
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgt 168  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16979254 tgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgt 16979218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 104
Target Start/End: Original strand, 38311784 - 38311820
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatctt 104  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38311784 agttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 38311820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 47)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1283477 - 1283228
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1283477 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaatctaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 1283380  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1283379 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 1283280  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1283279 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 1283228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 30345009 - 30345258
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30345009 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 30345106  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30345107 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 30345206  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30345207 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 30345258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 68 - 331
Target Start/End: Original strand, 23069285 - 23069557
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23069285 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctacctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 23069384  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23069385 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 23069484  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    |||||||||| ||||        |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23069485 tgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagctgtcgttccaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 23069557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 12901528 - 12901757
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12901528 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 12901627  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  12901628 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 12901727  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12901728 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 12901757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 41531022 - 41531271
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41531022 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 41531119  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41531120 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttactgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 41531219  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  41531220 ttatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttatgttgctgtt 41531271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 27379449 - 27379678
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27379449 atgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 27379548  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  27379549 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 27379648  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  27379649 tcacattaatattgttatgttgcgaattgc 27379678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 27383495 - 27383724
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27383495 atgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 27383594  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  27383595 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 27383694  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  27383695 tcacattaatattgttatgttgcgaattgc 27383724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27601886 - 27601657
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27601886 atgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 27601787  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  27601786 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 27601687  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27601686 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 27601657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 24628495 - 24628724
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24628495 atgaattggtattaagctgttaatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 24628594  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  24628595 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 24628694  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24628695 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 24628724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24649447 - 24649218
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24649447 atgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 24649348  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  24649347 tcctgagatgtttatgtgtcgcctaggttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgcttaagttgttgatgct 24649248  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24649247 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 24649218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 10101661 - 10101889
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10101661 atgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 10101760  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  10101761 tcctgagatgttcatgtgtcgcctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgtt 10101860  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattg 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10101861 tcacattaatattgttatgttgtgaattg 10101889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 68 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 31345235 - 31345051
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31345235 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 31345136  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31345135 tggaagatgtatgatgtttaagttgttaatgcttcacactaatattgttatgttgtgaattacttgtgctgtttctgttgctgtt 31345051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24918229 - 24918006
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24918229 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatg 24918130  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24918129 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagt 24918030  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  24918029 tgcaggtgttggtctaagttgtaa 24918006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Original strand, 23707290 - 23707513
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23707290 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcattatg 23707389  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23707390 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactatttctgttgctgttgcatattgatcaagt 23707489  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  23707490 tgcaggtgttggtctaagttgtaa 23707513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24671114 - 24670891
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  24671114 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtactgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgggttatg 24671015  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24671014 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgtatattgatcaagt 24670915  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  24670914 tgcaggtgttggtctaagttgtaa 24670891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27472538 - 27472315
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472538 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 27472439  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27472438 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattattatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagt 27472339  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  27472338 tgcaggtgttggtctaagttgtaa 27472315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Original strand, 34874214 - 34874437
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34874214 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttaagtgccgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 34874313  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34874314 tgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagt 34874413  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  34874414 tgcaggtgttggtctaagttgtaa 34874437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 68 - 331
Target Start/End: Original strand, 18358735 - 18359001
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18358735 agttgatgttgattattatttgatgttgttatatcttgagatgtttaagtaccgcctatgttgctgttgttggttttgtgaaatgtttatatgccttatg 18358834  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18358835 tggaaaatgtacgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattattatgttgtgaatttcttgtgctgtttctgttgctattgaatattgatcaagt 18358934  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgtcgttctaaagt-attccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  18358935 tgcagatgttggtctaagttgtaaagttgtctttccaaagtgtttccgaagtattggagtcttaagt 18359001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24681533 - 24681312
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24681533 agttgatgttgatcatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatg 24681434  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24681433 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcgtcattagtattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttg--tattgatcaagt 24681336  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  24681335 tgcaggtgttggtctaagttgtaa 24681312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Original strand, 21081738 - 21081961
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21081738 agttgatgttgattatcatttgatgtttttatatctttagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatg 21081837  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    || || |||||||||||||||||| ||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21081838 tgaaaaatgtatgatgtttaagttattgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagt 21081937  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  21081938 tgcaggtgttggtctaagttgtaa 21081961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 66 - 290
Target Start/End: Original strand, 22459562 - 22459787
Alignment:
Q  66 tgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcctta 165  Q
    |||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22459562 tgagatgttgatgactttcatttgatgttgttatatctttagatgtttatgtgttgcctatgttgctgttgtcggttatgtgaaatatttatatgcctta 22459661  T
Q  166 tgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaa 265  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22459662 tgtggaaaatgtataatgttgaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttcggttgctgttgcatattgatcaa 22459761  T
Q  266 gttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  22459762 gttgcaggtgttggtctaagttgtaa 22459787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 132 - 309
Target Start/End: Original strand, 34492200 - 34492387
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34492200 tgttgttggttatgtgaaataattatataccttatgtggaaaatgtataatgtttaagttgttgatgctttttattaatattgttatgttgagaattgct 34492299  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt----------gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||          ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34492300 tctgatgtttctgttgttgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagtcgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 34492387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 132 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21914966 - 21914779
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21914966 tgttgtaggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttatttaatattgttatgttgagaattgct 21914867  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21914866 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 21914779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 9784796 - 9784673
Alignment:
Q  72 gttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 171  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9784796 gttgttgattatcattggatgttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 9784697  T
Q  172 agatgtatgatgtttaagttgttg 195  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||    
T  9784696 aaatgtacgatgtttaaattgttg 9784673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 174 - 329
Target Start/End: Original strand, 24316193 - 24316356
Alignment:
Q  174 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagg 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24316193 atgtatgatgtttaagttgt-gatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactatttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcagg 24316291  T
Q  274 tgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaa 329  Q
    |||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24316292 tgttggtctaagttacaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaa 24316356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 290
Target Start/End: Original strand, 20320737 - 20320823
Alignment:
Q  205 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20320737 attaatattgtcatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgaatactgatcaagttgcaggtgttggtctaaattgtaa 20320823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 9242045 - 9241976
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  9242045 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 9241976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 34137059 - 34136990
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  34137059 agttgatgttgattatcatttgatattgttatctcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgctgttgt 34136990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Original strand, 21073494 - 21073563
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||    
T  21073494 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcatatgttgctgttgt 21073563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 24735493 - 24735424
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24735493 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 24735424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Original strand, 19662430 - 19662493
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  19662430 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 19662493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 137
Target Start/End: Original strand, 19201985 - 19202046
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19201985 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgctgttgt 19202046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Original strand, 6261154 - 6261217
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  6261154 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagacgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 6261217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Original strand, 30644056 - 30644119
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  30644056 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagacgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 30644119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 23287480 - 23287412
Alignment:
Q  71 tgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt-acgtgtcgcctatgttgctgttgtt 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||    
T  23287480 tgttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttttatgtactgcctatgttgctgttgtt 23287412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 22703211 - 22703174
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22703211 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 22703174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 26392496 - 26392431
Alignment:
Q  73 ttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgtt 138  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |    ||||||||||||||||||    
T  26392496 ttgttgattattatttgatattgttatatcctgagatgtttatgcactgcctatgttgctgttgtt 26392431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 309
Target Start/End: Original strand, 39827952 - 39828120
Alignment:
Q  144 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc--ttgtgttgttt 241  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||   ||| |||| |||||| |||||||| |   |||||||  |    
T  39827952 tgtgaaatatttatataccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttaattcttatcattgatatggttatgctgtgaattacctatgtgttgcct 39828051  T
Q  242 ctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgt-tgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
     ||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||  || |||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  39828052 atgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtttaagatgaaagatgtcgttccaaagtatt 39828120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20915386 - 20915226
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttat--atgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcat--attaatattgttatgttgtgaat 227  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||  |||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||  || ||  ||| || |||||||||||||| |    
T  20915386 tgttgttagttatgtgatatagttatttatgcattatgtggaatatgtatgatgttgtagttgtt-attgtttattcatttatgttgttatgttgtgagt 20915288  T
Q  228 tgctt--gtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagtt 286  Q
    || ||  |||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  20915287 tgtttatgtgttgcttctgttgttgttgaatattaattaagttgcaagtgttggtctaagtt 20915226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 21237860 - 21237825
Alignment:
Q  79 attatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21237860 attattatttgatattgttatatcttgagatgttta 21237825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 309
Target Start/End: Original strand, 13101739 - 13101773
Alignment:
Q  275 gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13101739 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 13101773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 70
Target Start/End: Original strand, 22811966 - 22812004
Alignment:
Q  32 gattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22811966 gattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 22812004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 60876 - 60840
Alignment:
Q  32 gattatgatgctattgttattaaactaagttgcatga 68  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  60876 gattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatga 60840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 24869948 - 24869904
Alignment:
Q  26 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24869948 tgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 24869904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Original strand, 25961583 - 25961627
Alignment:
Q  26 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  25961583 tgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 25961627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 27263332 - 27263296
Alignment:
Q  32 gattatgatgctattgttattaaactaagttgcatga 68  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27263332 gattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatga 27263296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 37524751 - 37524699
Alignment:
Q  18 tgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  37524751 tgttgatgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagt 37524699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 68 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 971 - 699
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  971 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 872  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  871 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 772  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    |||||||||| ||||        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  771 tgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 68 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 126074 - 125802
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126074 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 125975  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  125974 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 125875  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    |||||||||| ||||        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  125874 tgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 125802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 125795 - 125760
Alignment:
Q  274 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  125795 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 125760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 11519 - 11768
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11519 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 11616  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11617 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 11716  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11717 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 11768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 36104 - 36353
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36104 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 36201  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36202 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 36301  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36302 ttatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 36353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 53655 - 53586
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  53655 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 53586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 189395 - 189644
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189395 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 189492  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189493 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 189592  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  189593 ttatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 189644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 135
Target Start/End: Original strand, 221208 - 221275
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgtt 135  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||    
T  221208 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgtagctgtt 221275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 52)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21411038 - 21410789
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21411038 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 21410941  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21410940 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 21410841  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21410840 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 21410789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21805530 - 21805281
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21805530 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 21805433  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21805432 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 21805333  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21805332 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 21805281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 21828032 - 21828281
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21828032 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 21828129  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21828130 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 21828229  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21828230 ttatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 21828281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 18862663 - 18862909
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18862663 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 18862760  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18862761 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 18862860  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgct 249  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18862861 ttatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 18862909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 43251903 - 43251674
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43251903 atgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 43251804  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  43251803 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 43251704  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43251703 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 43251674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 21976686 - 21976915
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21976686 atgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 21976785  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  21976786 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 21976885  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21976886 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 21976915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 19278299 - 19278528
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19278299 atgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 19278398  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  19278399 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 19278498  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19278499 tcacattaatattgttatgttctgaattgc 19278528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 21972601 - 21972826
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21972601 atgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 21972700  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    || || ||    
T  21972701 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa----ttaatgct 21972796  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21972797 tcacataaatattgttatgttgtgaattgc 21972826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 68 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 37515824 - 37515602
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37515824 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatgtgccttatg 37515725  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37515724 tggaaaaagtacgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgatatgttgtgaattgcttgtgatgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 37515625  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgta 289  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  37515624 tgcaggtgttggtctaagttgta 37515602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Original strand, 22238021 - 22238243
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22238021 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgtttcttatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 22238120  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22238121 tggaa-atgtatgatgtttaagttgttgatcctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagt 22238219  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  22238220 tgcaggtgttggtctaagttgtaa 22238243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 23409914 - 23409691
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23409914 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatg 23409815  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcat-attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaag 266  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  23409814 tggaaaatgaatgatatttaagttgttgat-gttcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgcatattgatcaaa 23409716  T
Q  267 ttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  23409715 ttgcaggtgttggtctaagttgtaa 23409691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 68 - 331
Target Start/End: Original strand, 17461054 - 17461326
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17461054 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctctagatgtttatgtgtttcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 17461153  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  17461154 tggaaaatgtaagatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagt 17461253  T
Q  268 tgcaggtg-ttgtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    |||||||| ||||||        ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17461254 tgcaggtgtttgtctaagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaagt 17461326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Original strand, 19808365 - 19808587
Alignment:
Q  69 gttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgt 168  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19808365 gttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgtctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgcctcatgt 19808464  T
Q  169 ggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagtt 268  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19808465 ggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatatttttatgttgtgaattgcttgtaatggttctgttgctgttgcatattgatcaagtt 19808564  T
Q  269 gcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  19808565 gcaggtgttggtctaagttgtaa 19808587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18833680 - 18833458
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18833680 agttgatgttgtttattatttgatattgttatatct-gagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 18833582  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || || ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18833581 tggaaaatgtatgatgtttaagttttttatgcttctcattaatattgatatgttgtgaattgcttgtgctgtttatgttgttgttgaatattgatcaagt 18833482  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    || ||| ||| |||||||||||||    
T  18833481 tgtaggagttggtctaagttgtaa 18833458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 68 - 252
Target Start/End: Original strand, 14397864 - 14398040
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  14397864 agttgctgttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgc------ 14397957  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
      |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14397958 --gaagatgtatgatgtttaagttgttgttgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgtttgtgctgtttctgttgctgtt 14398040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 132 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26454054 - 26453908
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  26454054 tgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 26453955  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 278  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26453954 tgtgttgtttctgttgcagttgaatattgatcaagttgcagatgttg 26453908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 132 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19880172 - 19880026
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19880172 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatatttttatgttgagaattgct 19880073  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 278  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19880072 tgtgttgtttctgttgatgttgaatattgaccaagttgcagatgttg 19880026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 117 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22111905 - 22111792
Alignment:
Q  117 tgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22111905 tgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 22111806  T
Q  217 atgttgtgaattgc 230  Q
    ||||||||||||||    
T  22111805 atgttgtgaattgc 22111792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 68 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23659526 - 23659371
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23659526 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgtttatgtgatgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 23659427  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgt 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |  ||   |||||||||||||||||||    
T  23659426 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgtttttcattaatattgttatgttgt 23659371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 68 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23914156 - 23914029
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23914156 agttgttgctgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 23914057  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttg 195  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23914056 tggaaaatgtacgatgtttaagttgttg 23914029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 134 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23478422 - 23478278
Alignment:
Q  134 ttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttg 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23478422 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtttatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttg 23478323  T
Q  234 tgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 278  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23478322 tgctgtttcttttgatgttgaatattgatcaagttggagatgttg 23478278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Original strand, 16402021 - 16402136
Alignment:
Q  85 atttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgt 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16402021 atttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgt 16402120  T
Q  185 ttaagttgttgatact 200  Q
    ||||||||||||||||    
T  16402121 ttaagttgttgatact 16402136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 309
Target Start/End: Original strand, 19929556 - 19929736
Alignment:
Q  132 tgttgttggttat-gtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19929556 tgttgttgattattgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattaatattgttatgctgtgaattgc 19929655  T
Q  231 ttgtgttg-tttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  19929656 ttgtgctgttttatgttgctgttgaatattaattaagttgcaagtgttggtccaagttgtaagttgttgttccaaaatatt 19929736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 205 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22353018 - 22352932
Alignment:
Q  205 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22353018 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 22352932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 163 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5760705 - 5760577
Alignment:
Q  163 ttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgat 262  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| | |  ||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5760705 ttatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtagttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgcttgtgttgtttctgttgttgttgaatattgat 5760606  T
Q  263 caagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5760605 caagttgcaagtgttggtctaagttgtaa 5760577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 218 - 290
Target Start/End: Original strand, 44384821 - 44384894
Alignment:
Q  218 tgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44384821 tgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 44384894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 171
Target Start/End: Original strand, 1327015 - 1327112
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 171  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1327015 tgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcctaagttgctgttgtaggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtgga 1327112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 119
Target Start/End: Original strand, 25363204 - 25363255
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25363204 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 25363255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 137
Target Start/End: Original strand, 20502104 - 20502172
Alignment:
Q  69 gttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||    
T  20502104 gttgttgttggttatcatttgatattgttatatcttgagatatttatgtgctgcctatgttgctgttgt 20502172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 190
Target Start/End: Original strand, 8414418 - 8414476
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 190  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8414418 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 8414476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11775066 - 11775008
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 190  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11775066 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 11775008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 137
Target Start/End: Original strand, 17438227 - 17438288
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  17438227 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgtttctgttgt 17438288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 137
Target Start/End: Original strand, 22963426 - 22963484
Alignment:
Q  79 attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||    
T  22963426 attattatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtactgcctatgttgctgttgt 22963484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Original strand, 17086155 - 17086224
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||    
T  17086155 agttgatgttgattattatttggtattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctattttgcttttgt 17086224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 111
Target Start/End: Original strand, 22253167 - 22253210
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 111  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22253167 agttgatgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 22253210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 130
Target Start/End: Original strand, 5083164 - 5083218
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttg 130  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  5083164 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttg 5083218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 22995962 - 22995893
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||   |||  |||||||||||||||||    
T  22995962 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatctgaatatgttattgtgctgcctatgttgctgttgt 22995893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16799605 - 16799561
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16799605 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatctggatatgtt 16799561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Original strand, 30643340 - 30643384
Alignment:
Q  26 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30643340 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 30643384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 286
Target Start/End: Original strand, 18302800 - 18302855
Alignment:
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagtt 286  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18302800 tgtgttgtctctgttgttgttgaatattaatcaagttgcaagtgttggtctaagtt 18302855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 198
Target Start/End: Original strand, 22381703 - 22381746
Alignment:
Q  155 tatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 198  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22381703 tatatgcgttatgtgtaagatgtatgatgttgaagttgttgata 22381746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 109
Target Start/End: Original strand, 35026868 - 35026903
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35026868 tgttgattatcgtttgatattgttatatcttgagat 35026903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 70
Target Start/End: Original strand, 15603055 - 15603109
Alignment:
Q  16 gctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  15603055 gctgttgatgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagt 15603109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 16231492 - 16231559
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16231492 atgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 16231559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 21383742 - 21383675
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21383742 atgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 21383675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 21387162 - 21387095
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21387162 atgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 21387095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 22525662 - 22525633
Alignment:
Q  84 catttgatattgttatatcttgagatgttt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22525662 catttgatattgttatatcttgagatgttt 22525633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 133
Target Start/End: Original strand, 23943995 - 23944060
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctg 133  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| | |||  || ||||||||||    
T  23943995 agttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttaatgtgctgcatatgttgctg 23944060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 104
Target Start/End: Original strand, 14103226 - 14103262
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatctt 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14103226 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 14103262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 23667910 - 23667859
Alignment:
Q  85 atttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |||||||||||||    
T  23667910 atttgatattgttatatcttgagatggttatgtgctgcc-atgttgctgttgt 23667859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 44476789 - 44476753
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatctt 104  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44476789 agttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 44476753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 44480051 - 44480015
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatctt 104  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44480051 agttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 44480015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 65544 - 65773
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  65544 atgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcgtttgatattgttata 65643  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  65644 tcctgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 65743  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  65744 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 65773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 61628 - 61857
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  61628 atgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattagatattgttata 61727  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  61728 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgaatatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 61827  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  61828 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 61857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 80803 - 80554
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  80803 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttaatattgttata 80706  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  80705 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatact 80606  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  80605 tcataataatattgttatgttgtgaattgattgtgctatttctgttgctgtt 80554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 68 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 120127 - 119855
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  120127 agttattgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 120028  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  120027 tgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattattatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 119928  T
Q  268 tgcaggtg-ttgtcta--------agttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    |||||||| |||||||        |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119927 tgcaggtgtttgtctaagttgtatagttgtaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 119855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12512 - 12283
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12512 atgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 12413  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  12412 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 12313  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12312 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 12283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 58735 - 58964
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58735 atgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 58834  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  58835 tcttgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 58934  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  58935 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 58964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 3891 - 4119
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3891 atgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 3990  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  3991 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttaatgtttaagttgttgatgct 4090  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattg 229  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  4091 tcacattaatattgttatgttatgaattg 4119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 44 - 252
Target Start/End: Original strand, 32719 - 32927
Alignment:
Q  44 attgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggtta 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32719 attgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggtta 32818  T
Q  144 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32819 tgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaaattgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttct 32918  T
Q  244 gttgctgtt 252  Q
    |||||||||    
T  32919 gttgctgtt 32927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 14105 - 14354
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14105 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 14202  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14203 tcttgatatgtttacgtgtcgcctatgttcctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatatatgatgtttaagttgttgatact 14302  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14303 ttatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 14354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 485 - 234
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaa-ctaa-gttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 98  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  485 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaaactaaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 388  T
Q  99 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  387 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaagttgttgata 288  T
Q  199 cttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  287 cttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 5117 - 5346
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5117 atgaattgatattaagttgttgatatgagctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttata 5216  T
Q  101 tcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatact 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  5217 tcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgatgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgct 5316  T
Q  201 tcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5317 tcacattaatattgttatgttgtgaattgc 5346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 68 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21285 - 21064
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21285 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 21186  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  21185 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcagtaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctatttttgttgctgttgaatattaatcaagt 21086  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgt 288  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  21085 tgcaggtgttggtctaagttgt 21064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 68 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 31242 - 31058
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31242 agttgttgtttattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttagttatgtgaaatatttatatgccttatg 31143  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31142 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttttgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 31058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 539 - 311
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaa-gttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttat 99  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  539 atgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgctattgttatttaactaaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttat 442  T
Q  100 atcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatac 199  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  441 atcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaagatgtttgatgtttaagttattgatgc 342  T
Q  200 ttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  341 ttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 4513 - 4454
Alignment:
Q  11 attaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4513 attatgctgttgttgtgatctgattatgctgccattgttatttaactaagttgcatgagt 4454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 68 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 39371 - 39205
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39371 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 39272  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39271 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgt 39205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 74 - 290
Target Start/End: Original strand, 53846 - 54063
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  53846 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaa 53945  T
Q  174 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagg 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53946 atgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcagg 54045  T
Q  274 tgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||| |||||||||||||    
T  54046 tgttggtctaagttgtaa 54063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Original strand, 73815 - 73859
Alignment:
Q  26 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  73815 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 73859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 68 - 252
Target Start/End: Original strand, 20212 - 20396
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  20212 agttgttgttgattagcatttgatattgttaaatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatg 20311  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20312 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 20396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 17621 - 17552
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||    
T  17621 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtactgcctaagttgctgttgt 17552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 20481 - 20546
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatga 68  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  20481 atgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 20546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Original strand, 169751 - 169974
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  169751 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 169850  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  169851 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttactgttacatattgatcaagt 169950  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  169951 tgcaggtgttggtctaagttgtaa 169974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 142692 - 142631
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  142692 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 142631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 68 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15861 - 15588
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatat-ttatatgccttat 166  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  15861 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttacctatgttgctgttgttggttatgtgaaaaatattatatgtcttat 15762  T
Q  167 gtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaag 266  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15761 gtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtattgtttctgttgctgttgcatattgatcaag 15662  T
Q  267 ttgcaggtgtt-gtc--------taagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    ||||| ||||| |||         ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15661 ttgcaagtgttggtcgaatttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaagt 15588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Original strand, 6943 - 7166
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6943 agttgatgttgattatcatttaatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgactatgttgctgttgttggttatgtgaaatatgtatatgccttatg 7042  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7043 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagt 7142  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  7143 tgcaggtgttggtctaagttgtaa 7166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 252
Target Start/End: Original strand, 207587 - 207769
Alignment:
Q  70 ttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtg 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  207587 ttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgtcgcctatgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtg 207686  T
Q  170 gaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  207687 gaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatcttgtgaattgcttgtgctgtttttgttgctgtt 207769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 68
Target Start/End: Original strand, 207880 - 207931
Alignment:
Q  17 ctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatga 68  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  207880 ctgttgatatgatatgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 207931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Original strand, 1876 - 2099
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1876 agttgatgttgattatcatttgatgatgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctttgttgctgttattggttatgtgaaatatttatatgtcttatg 1975  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1976 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagt 2075  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    | |||||||| |||||||||||||    
T  2076 tacaggtgttggtctaagttgtaa 2099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Original strand, 24599 - 24820
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  24599 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgaaatgtttaagtgttgcctatgttgatgttgatggttatgtgaaatatttatatgccttatc 24698  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24699 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctt-tcattaatattgttatgttctgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagt 24797  T
Q  268 tgcaggtgttgtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  24798 tgcaggtgttgtttaagttgtaa 24820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 74 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 530 - 313
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 173  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  530 tgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctccctatgttgttgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaa 431  T
Q  174 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagg 273  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  430 atatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttacgtcgtgaatttcttgtgctgtttctattgctgttgaatattgatcaagttgcagg 331  T
Q  274 tgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||| |||||||||||||    
T  330 tgttggtctaagttgtaa 313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Original strand, 1294 - 1517
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1294 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctggctatgttgttgttgttggctatgtgaaatatttatatgcgttatg 1393  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1394 tggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttttgttgctgttgcatattgatcaagt 1493  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  1494 tgcaggtgttggtctaagttgtaa 1517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 68 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 678 - 468
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  678 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctttctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatg 579  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  578 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattattatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagt 479  T
Q  268 tgcaggtgttg 278  Q
    |||||||||||    
T  478 tgcaggtgttg 468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 74 - 323
Target Start/End: Original strand, 10092 - 10350
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  10092 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgtttctgctattggttatgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaa 10191  T
Q  174 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagg 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||   |||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10192 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaattttgttattttgtgaattgcttgtactgtttttgttgctgttgcatattgatcaagttgcagg 10291  T
Q  274 tgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggag 323  Q
    |||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10292 tgttggtctaagttgcaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaagtattggag 10350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 212
Target Start/End: Original strand, 15469 - 15560
Alignment:
Q  121 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatat 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  15469 gcctatgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcgcattaatat 15560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 36299 - 36230
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  36299 agttgtcgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgttgttgt 36230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 104 - 331
Target Start/End: Original strand, 2751 - 2987
Alignment:
Q  104 tgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttca 203  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||      
T  2751 tgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgctttt 2850  T
Q  204 tattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttg 294  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||||||||    
T  2851 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctcttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttg 2950  T
Q  295 tcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  2951 tctttccaaagtgttccaaagtattggattcttaagt 2987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 7952 - 7731
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7952 agttgatgttgcttattatttgatattgttatatct-gagatgtttatgtgttgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 7854  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7853 tggaaaatgtatgaagtt-aagtggttgatgcttctcattaatattgacatgttgtgaattgtttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 7755  T
Q  268 tgcaggtgttg-tctaagttgtaa 290  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||    
T  7754 tgcaggtgttgctctaaattgtaa 7731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 85664 - 85441
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  85664 agttgatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcagatgccttatg 85565  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  85564 tggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaaga 85465  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  85464 tgcaggtgttggtctaagttgtaa 85441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 228390 - 228457
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  228390 atgaattgttattaagct--tgatgtgatctgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 228457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 278 - 49
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  278 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgatatgtttacgtgttgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttagg 179  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttg---tgt---tgtttctgttgctgttgaatattga 261  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||||||| |||   |||   ||||||||||||||||| ||||| |    
T  178 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtttgtactgtttctgtttctgttgctgttgcatattaa 79  T
Q  262 tcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
     ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  78 gcaagttgcaggtgttggtctaatttgtaa 49  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17692 - 17563
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17692 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 17593  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17592 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 17563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 70 - 214
Target Start/End: Original strand, 80420 - 80564
Alignment:
Q  70 ttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtg 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  80420 ttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatatgaaatatttatatgccttatgtg 80519  T
Q  170 gaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  80520 gaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattg 80564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 252
Target Start/End: Original strand, 80574 - 80621
Alignment:
Q  205 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  80574 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 80621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 68 - 290
Target Start/End: Original strand, 6904 - 7127
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6904 agttgatgttgagtatcatttaatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttactgttgttggttatgtgaaatttttatatgcgttatg 7003  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||| ||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7004 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatactgttacgatgtgtattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagt 7103  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  7104 tgcaggtgttggtctaagttgtaa 7127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 74 - 290
Target Start/End: Original strand, 3335 - 3552
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 173  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||  | |||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||     
T  3335 tgttgattatcatttaatgttgttatataataagatatttaagtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgaattatgtggaaa 3434  T
Q  174 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  3435 atgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaga 3534  T
Q  274 tgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||| |||||||||||||    
T  3535 tgttggtctaagttgtaa 3552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 68 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 67379 - 67161
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  67379 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttggg-tgtttacgtgctgcttatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgaataatg 67281  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  67280 tgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatccagt 67181  T
Q  268 tgcaggtgtt-gtctaagtt 286  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  67180 tgcaggtgttggtctaagtt 67161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 639 - 384
Alignment:
Q  86 tttgatattgttatatcttgagatgttt-acgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgt 184  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||| | || | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  639 tttgatattgttatatcatgaactgttttatgtattgtctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtacgatgt 540  T
Q  185 ttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct-- 281  Q
    ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||      
T  539 ttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaa 440  T
Q  282 ------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
          ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  439 gctgtaaagttgtaagttgtctttcaaaagtgttccaaactattggagtcttaagt 384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 80 - 230
Target Start/End: Original strand, 67397 - 67546
Alignment:
Q  80 ttatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtat 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  67397 ttatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgt-aaatatttatatgccttatgtggaagatgttt 67495  T
Q  180 gatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  67496 gatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 67546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 121 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 71367 - 71236
Alignment:
Q  121 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  71367 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 71268  T
Q  221 tgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  71267 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 71236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 132 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 33261 - 33074
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  33261 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgcttttaattaatattgttatgttgagaattgct 33162  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33161 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 33074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 128 - 271
Target Start/End: Original strand, 1227 - 1370
Alignment:
Q  128 ttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||| |||||||||    
T  1227 ttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatgcttttcattaatattgttaagttgtgaat 1326  T
Q  228 tgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgca 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1327 tgcttgtgttgtttctgttgctgttcaatattgatcaagttgca 1370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 128 - 271
Target Start/End: Original strand, 7978 - 8121
Alignment:
Q  128 ttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||| |||||||||    
T  7978 ttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatgcttttcattaatattgttaagttgtgaat 8077  T
Q  228 tgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgca 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8078 tgcttgtgttgtttctgttgctgttcaatattgatcaagttgca 8121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Original strand, 15259 - 15303
Alignment:
Q  26 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15259 tgatctgaatatgatgcttttgttatttaactaagttgcatgagt 15303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 132 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 5802 - 5615
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5802 tgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatatagttatgttgtgaattgct 5703  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5702 tgtgatgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 5615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 132 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 4374 - 4215
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  4374 tgttgttggttatatgaaattattatatgtcttatgtggaaaatgtctgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 4275  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4274 tgtgttgtttctgttgctgttgcatattgatcaaattgcaggtgttggtctaagttgtaa 4215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 132 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 4374 - 4215
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  4374 tgttgttggttatatgaaattattatatgtcttatgtggaaaatgtctgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 4275  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4274 tgtgttgtttctgttgctgttgcatattgatcaaattgcaggtgttggtctaagttgtaa 4215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 68 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15116 - 14906
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15116 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacatgtggcctatgttggtgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatg 15017  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagt 267  Q
     | || |||||||||||| ||||||| ||  ||    || ||||||| |||| ||  |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15016 ggaaaaatgtatgatgttaaagttgtagacgctctccataaatattgatatgatgaaaattgcttgcactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagt 14917  T
Q  268 tgcaggtgttg 278  Q
     ||| ||||||    
T  14916 cgcacgtgttg 14906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Original strand, 6161 - 6290
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6161 agttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatggcttatg 6260  T
Q  168 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 197  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  6261 tggaaaatatacgatgtttaagttgttgat 6290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 132 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10564 - 10378
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  10564 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttta-gtttttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 10466  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10465 tgtgctatttctgttgctgttgaatattcatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 10378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 132 - 309
Target Start/End: Original strand, 22477 - 22664
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| |    
T  22477 tgttgttgattatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtt 22576  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22577 tgtgctgtttttgttgctgttgaatatttatcaagttgcagatgtttgtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 22664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 132 - 290
Target Start/End: Original strand, 70536 - 70689
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 231  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| |    
T  70536 tgttcttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtt 70635  T
Q  232 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  70636 tgtgttgtttctgttgc------atattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 70689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 68 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20869 - 20769
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20869 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 20770  T
Q  168 t 168  Q
    |    
T  20769 t 20769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 215 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 20774 - 20652
Alignment:
Q  215 ttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaag 305  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||| ||||    
T  20774 ttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaag 20675  T
Q  306 tattccaaagtattggagtctta 328  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20674 tattccaaagtattggagtctta 20652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 180 - 331
Target Start/End: Original strand, 13490 - 13650
Alignment:
Q  180 gatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-g 278  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  13490 gatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctattgaatattgatcaagttgcatgtgttgg 13589  T
Q  279 tct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    |||        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13590 tctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggagtctaaagt 13650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 144 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 57011 - 56842
Alignment:
Q  144 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct--tgtgttgttt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| |||   ||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||    
T  57011 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgtcgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgtttatgtgttgttt 56912  T
Q  242 -ctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  56911 cctgttgctgttgaatattaatcaagttgcaagtgttggtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 56842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 7711 - 7544
Alignment:
Q  146 tgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct--tgtgttgttt-c 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||   ||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |    
T  7711 tgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgcttatgtgttgtttcc 7612  T
Q  243 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  7611 tattgctgttgaatattaatcaagttgcaagtgttggtctgagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 7544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 74 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 105193 - 105078
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 173  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  105193 tgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgtcggttatgcgaaataattatatgccttatgtggaaa 105094  T
Q  174 atgtatgatgtttaag 189  Q
    ||||||||||||||||    
T  105093 atgtatgatgtttaag 105078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 68 - 180
Target Start/End: Original strand, 4271 - 4383
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  4271 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgatatgtttacgtgttgcctattttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatacgttatg 4370  T
Q  168 tggaagatgtatg 180  Q
    ||||| |||||||    
T  4371 tggaaaatgtatg 4383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 165 - 290
Target Start/End: Original strand, 6851 - 6977
Alignment:
Q  165 atgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatca 264  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6851 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgatgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatca 6950  T
Q  265 agttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6951 agttgcaggtgttggtctaagttgtaa 6977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 132 - 290
Target Start/End: Original strand, 1314 - 1475
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttata--tgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattg 229  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||  ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | |  ||    |||||||||||||| |||||||||    
T  1314 tgttgttggtaatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattg 1413  T
Q  230 cttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1414 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaagtgttggtctaagttgtaa 1475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 144 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 15625 - 15470
Alignment:
Q  144 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgt--tgttt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||   ||| ||||||||||| |||||||||||| |||  |||||    
T  15625 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgatgtgaattgcttatgtgctgttt 15526  T
Q  242 c-tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgt 295  Q
    | |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15525 cctaatgttgttgaatattaatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgt 15470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 309
Target Start/End: Original strand, 166426 - 166595
Alignment:
Q  144 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct--tgtgttgttt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||   ||| ||||||||||| |||||||||||  |||| | |||    
T  166426 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaatatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgcttatgtgctattt 166525  T
Q  242 -ctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
     |||||| |||||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  166526 cctgttgttgttgaatattagtcaagctgcaagtgttggtctaagttgtaacttgtcgttccaaagtatt 166595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 174 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 6932 - 6854
Alignment:
Q  174 atgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6932 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 6854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 205 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 78385 - 78299
Alignment:
Q  205 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  78385 attaatattgctatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 78299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 135
Target Start/End: Original strand, 75830 - 75897
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgtt 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  75830 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctacgttgctgtt 75897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 171
Target Start/End: Original strand, 10859 - 10956
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 171  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  10859 tgttgagtattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgcttatattgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgcattatgtgga 10956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 2013 - 1944
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  2013 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 1944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 171
Target Start/End: Original strand, 36038 - 36135
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 171  Q
    ||||||||||  |||||| || |||||||||||| |||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  36038 tgttgattattttttgatgttcttatatcttgaggtgtttaagtgctgcatatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtgga 36135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 138
Target Start/End: Original strand, 15240 - 15310
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgtt 138  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  15240 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctattgtt 15310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 18648 - 18717
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18648 atgaattgttattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttacctaagttgcatgagt 18717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 3376 - 3307
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  3376 agttgatgttgattgtcatttgatattgttatatcttgagatatttatgtgttgcctatgttgctgttgt 3307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 66431 - 66500
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  66431 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 66500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8150 - 8082
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttg 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  8150 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgtgttgcatatgttgctgttg 8082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8092 - 8028
Alignment:
Q  243 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagt 306  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  8092 tgttgctgttgcatattgataaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagt 8028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 110764 - 110701
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  110764 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 110701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 118
Target Start/End: Original strand, 15067 - 15117
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15067 agttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 15117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 6730 - 6684
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6730 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 6684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 176136 - 176078
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 190  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  176136 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 176078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 168782 - 168724
Alignment:
Q  132 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 190  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  168782 tgttgttgcttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 168724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 173380 - 173313
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  173380 atgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 173313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 497588 - 497538
Alignment:
Q  144 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 194  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  497588 tgtgaaatatttatataacttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgtt 497538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Original strand, 762 - 831
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| ||||||    
T  762 agttgttgttgattatcttttgatattgttatatcttgagatgtttatatgctgcctatgttgttgttgt 831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 3986 - 3917
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  3986 agttgatgttgattatcatttggtaatgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 3917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 12994 - 12925
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  12994 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctcctattgttaattaactaagttgcatgagt 12925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 19278 - 19209
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19278 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctcctattgttaattaactaagttgcatgagt 19209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 243 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10534 - 10467
Alignment:
Q  243 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10534 tgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagtatt 10467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10592 - 10524
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttg 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  10592 agttgatgttgattatcatttgatgttgttacatctagagatgtttatgtgttgcctatgttgttgttg 10524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 137
Target Start/End: Original strand, 9728 - 9791
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||| ||||||    
T  9728 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtgctgcctatgttgttgttgt 9791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11259 - 11196
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||| ||||||||||||    
T  11259 tgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgctgcctgtgttgctgttgt 11196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 22359 - 22296
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||| ||||||||||||    
T  22359 tgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgctgcctgtgttgctgttgt 22296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 1049 - 988
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  1049 ttgattattatttgacattcttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgctgttgt 988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Original strand, 18169 - 18238
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||    
T  18169 agttgatgtttattatcatttgatattgttatatcttgagatatttatgtgctgcctatgttgttgttgt 18238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3599 - 3550
Alignment:
Q  282 aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3599 aagttgtaagttgtcgttccaaagtattcgaaagtattggagtcttaagt 3550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 7663 - 7614
Alignment:
Q  282 aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 331  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7663 aagttgtaagttgtctttccaaagtattctaaagtattggagtcttaagt 7614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 2688 - 2757
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  2688 atgaattgttattaagctgttgatgtgatctgattatgctgcaattgttaattaactaagttgcatgagt 2757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 30451 - 30381
Alignment:
Q  68 agttgttg-ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  30451 agttgttgattgattattatttgacattgttatgtcttgagatgtttatgtgatgcctatgttgctgttgt 30381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9051 - 8967
Alignment:
Q  144 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaatt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||  || |||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  9051 tgtgaaatatttatataccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgtgaattcttatcattgatattgttatgttgtgaatt 8967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 138
Target Start/End: Original strand, 206528 - 206596
Alignment:
Q  71 tgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt-acgtgtcgcctatgttgctgttgtt 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||    
T  206528 tgttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttttatgtactgcctatgttgctgttgtt 206596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 126945 - 126896
Alignment:
Q  261 atcaagttgcaggtgttg-tctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 309  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  126945 atcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagtatt 126896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 133035 - 132989
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  133035 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgaaatgttta 132989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 29323 - 29285
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29323 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgtt 29285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21894 - 21847
Alignment:
Q  244 gttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 290  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21894 gttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 21847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 137
Target Start/End: Original strand, 7499 - 7560
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  7499 ttgattattatttgacattgatatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 7560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 10282 - 10213
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||    
T  10282 agttgatgatgattattatttgatattgttacatcttgagatgtttatgtgctgcttatgttgctgttgt 10213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 48440 - 48403
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48440 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 48403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 146298 - 146261
Alignment:
Q  74 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146298 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 146261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 766 - 697
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  766 agttgatgttgattattatttcatgatgtgatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgctgttgt 697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 235 - 183
Alignment:
Q  18 tgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  235 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 20034 - 20099
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatga 68  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20034 atgaattgttattaagct--tgatgtgatctgattatgttgcaattgttattaaactaagttgcatga 20099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 70
Target Start/End: Original strand, 17150 - 17204
Alignment:
Q  16 gctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  17150 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttccatgagt 17204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 9591 - 9537
Alignment:
Q  16 gctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  9591 gctgttgatgtgatctgattatgttgttattgttatttaactaagttgcatgagt 9537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 3067 - 3006
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||| ||||||    
T  3067 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgctacctatgttgttgttgt 3006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 461 - 417
Alignment:
Q  26 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  461 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1052 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1052
Description:

Target: scaffold1052; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 2981 - 2933
Alignment:
Q  18 tgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcat 66  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2981 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 2933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Original strand, 6357 - 6401
Alignment:
Q  26 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6357 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 6401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Original strand, 2133 - 2177
Alignment:
Q  26 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2133 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 2177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 1562 - 1518
Alignment:
Q  26 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1562 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 1518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 29791 - 29747
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  29791 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatctggatatgtt 29747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 42695 - 42651
Alignment:
Q  26 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42695 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 42651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 68 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 1820 - 1785
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatct 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1820 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatct 1785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 5664 - 5610
Alignment:
Q  16 gctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  5664 gctgttgttgtgatctgattatgctgctactgttatttaactaagttgcatgagt 5610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 6859 - 6805
Alignment:
Q  16 gctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  6859 gctgttgttgtgatctgattatgctgctactgttatttaactaagttgcatgagt 6805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 18377 - 18444
Alignment:
Q  1 atgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18377 atgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 18444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 66
Target Start/End: Original strand, 10085 - 10131
Alignment:
Q  20 ttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcat 66  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  10085 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 10131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 70
Target Start/End: Original strand, 6046 - 6084
Alignment:
Q  32 gattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6046 gattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgagt 6084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 7540 - 7481
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  7540 ttgattattatttgacattgttatatctt--gatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 7481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14659 - 14600
Alignment:
Q  76 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  14659 ttgattattatttgacattgttatatctt--gatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 14600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 130 - 101
Alignment:
Q  80 ttatcatttgatattgttatatcttgagat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130 ttatcatttgatattgttatatcttgagat 101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 2782 - 2737
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  2782 agttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttt 2737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 114
Target Start/End: Original strand, 55704 - 55733
Alignment:
Q  85 atttgatattgttatatcttgagatgttta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55704 atttgatattgttatatcttgagatgttta 55733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 104
Target Start/End: Original strand, 663 - 699
Alignment:
Q  68 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatctt 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  663 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 15155 - 15111
Alignment:
Q  26 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15155 tgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 15111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 286
Target Start/End: Original strand, 11613 - 11692
Alignment:
Q  210 tattgttatgttgtgaattgctt--gtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagtt 286  Q
    ||||| |||||||||| ||||||  ||| ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  11613 tattgatatgttgtgagttgcttacgtgctgcctctgttgttgttgaatattgattaagttgcaagtgttggtctaagtt 11692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 357 - 313
Alignment:
Q  26 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  357 tgatctgattatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagt 313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 137
Target Start/End: Original strand, 29443 - 29494
Alignment:
Q  85 atttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||||||||    
T  29443 atttgatattgttatatcttgagaagtttatgtgctgcc-atgttgctgttgt 29494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Original strand, 30791 - 30835
Alignment:
Q  26 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 70  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  30791 tgatccgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagt 30835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University