View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16308_low_4 (Length: 325)

Name: NF16308_low_4
Description: NF16308
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16308_low_4
NF16308_low_4
[»] chr4 (102 HSPs)
chr4 (1-325)||(14970433-14970757)
chr4 (1-325)||(3515119-3515443)
chr4 (1-275)||(15534343-15534617)
chr4 (1-325)||(15118079-15118402)
chr4 (1-325)||(19242811-19243136)
chr4 (1-274)||(36038033-36038306)
chr4 (1-325)||(44615400-44615724)
chr4 (1-274)||(49547500-49547773)
chr4 (1-325)||(50222066-50222389)
chr4 (1-274)||(14048740-14049013)
chr4 (5-325)||(44772814-44773137)
chr4 (1-325)||(1837246-1837559)
chr4 (1-325)||(7640913-7641242)
chr4 (1-227)||(52872799-52873025)
chr4 (1-227)||(15495900-15496126)
chr4 (1-220)||(29267570-29267789)
chr4 (1-227)||(362390-362616)
chr4 (1-227)||(19617793-19618019)
chr4 (1-227)||(14746238-14746464)
chr4 (147-325)||(18215147-18215324)
chr4 (147-325)||(19618045-19618222)
chr4 (1-230)||(52312769-52312997)
chr4 (105-325)||(18239250-18239469)
chr4 (147-325)||(12180-12357)
chr4 (147-325)||(52312622-52312799)
chr4 (1-230)||(11981-12210)
chr4 (1-227)||(19857798-19858014)
chr4 (147-325)||(15355197-15355374)
chr4 (1-142)||(362668-362809)
chr4 (1-143)||(362860-363002)
chr4 (13-143)||(18214749-18214879)
chr4 (1-143)||(52872606-52872748)
chr4 (13-143)||(3515494-3515624)
chr4 (1-143)||(19858065-19858207)
chr4 (13-143)||(52313241-52313371)
chr4 (1-143)||(14746045-14746187)
chr4 (1-143)||(14970240-14970382)
chr4 (13-143)||(15495719-15495849)
chr4 (1-143)||(19617600-19617742)
chr4 (147-274)||(15496944-15497070)
chr4 (147-273)||(52873051-52873176)
chr4 (34-143)||(14185622-14185731)
chr4 (13-143)||(52313048-52313178)
chr4 (98-227)||(18214992-18215121)
chr4 (147-274)||(14746490-14746618)
chr4 (245-325)||(12611055-12611135)
chr4 (1-163)||(30147189-30147351)
chr4 (245-325)||(51463838-51463918)
chr4 (124-227)||(15355068-15355171)
chr4 (30-143)||(22725288-22725400)
chr4 (245-325)||(23803235-23803315)
chr4 (147-234)||(19857685-19857772)
chr4 (258-325)||(21815568-21815635)
chr4 (258-325)||(44102326-44102393)
chr4 (264-325)||(22353949-22354010)
chr4 (186-254)||(362268-362336)
chr4 (258-325)||(15367806-15367873)
chr4 (258-325)||(15371318-15371385)
chr4 (258-325)||(15373599-15373666)
chr4 (258-325)||(15402819-15402886)
chr4 (263-325)||(20149942-20150004)
chr4 (269-324)||(44928873-44928928)
chr4 (74-140)||(14745925-14745991)
chr4 (30-124)||(14951270-14951364)
chr4 (261-325)||(16223648-16223712)
chr4 (258-325)||(15370134-15370200)
chr4 (54-122)||(55377225-55377293)
chr4 (1-52)||(12778409-12778460)
chr4 (14-124)||(14995644-14995754)
chr4 (30-124)||(25120050-25120144)
chr4 (30-143)||(15117915-15118028)
chr4 (23-124)||(43281694-43281795)
chr4 (222-274)||(19857607-19857659)
chr4 (258-324)||(13788-13855)
chr4 (14-124)||(18247739-18247849)
chr4 (54-124)||(18293695-18293765)
chr4 (14-124)||(47357183-47357293)
chr4 (260-324)||(43198492-43198557)
chr4 (14-122)||(15287858-15287966)
chr4 (14-122)||(15294968-15295076)
chr4 (146-230)||(19617991-19618075)
chr4 (107-143)||(44772723-44772759)
chr4 (258-316)||(52243131-52243190)
chr4 (30-124)||(5683371-5683465)
chr4 (105-143)||(7640824-7640862)
chr4 (30-136)||(9198544-9198650)
chr4 (14-124)||(10643746-10643856)
chr4 (1-95)||(14185477-14185571)
chr4 (14-112)||(16731688-16731786)
chr4 (30-124)||(22355075-22355169)
chr4 (55-124)||(17146320-17146389)
chr4 (55-124)||(18168293-18168362)
chr4 (146-230)||(15355143-15355227)
chr4 (146-230)||(19857742-19857826)
chr4 (146-217)||(362347-362418)
chr4 (147-186)||(25513032-25513071)
chr4 (148-230)||(14746438-14746520)
chr4 (14-124)||(19020009-19020119)
chr4 (74-124)||(19698032-19698082)
chr4 (74-124)||(19708617-19708667)
chr4 (258-310)||(53082089-53082142)
chr4 (146-230)||(18215093-18215177)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-325)||(20859-21183)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (1-325)||(37933-38257)
scaffold0134 (30-143)||(38308-38421)
[»] chr7 (108 HSPs)
chr7 (1-325)||(456433-456757)
chr7 (1-325)||(27216972-27217296)
chr7 (1-325)||(16232632-16232956)
chr7 (1-325)||(41523029-41523353)
chr7 (1-325)||(41525491-41525815)
chr7 (1-325)||(15376440-15376763)
chr7 (1-325)||(20384850-20385173)
chr7 (1-325)||(14948849-14949172)
chr7 (1-325)||(16213796-16214120)
chr7 (1-325)||(32125603-32125926)
chr7 (1-275)||(11303409-11303683)
chr7 (5-325)||(21189326-21189645)
chr7 (30-325)||(11393042-11393337)
chr7 (1-325)||(16410171-16410494)
chr7 (1-325)||(13869459-13869784)
chr7 (1-325)||(18640384-18640707)
chr7 (1-274)||(23664679-23664952)
chr7 (1-274)||(16108415-16108688)
chr7 (1-325)||(24702350-24702664)
chr7 (1-325)||(24704797-24705111)
chr7 (1-324)||(18430825-18431147)
chr7 (1-274)||(29796771-29797046)
chr7 (1-274)||(29800590-29800865)
chr7 (1-325)||(26355708-26356033)
chr7 (1-325)||(26358160-26358485)
chr7 (1-286)||(18627717-18628001)
chr7 (1-227)||(14269683-14269909)
chr7 (1-227)||(15081568-15081794)
chr7 (1-227)||(8940489-8940719)
chr7 (1-225)||(45847381-45847605)
chr7 (13-227)||(8468945-8469159)
chr7 (147-325)||(11972608-11972785)
chr7 (13-230)||(11972755-11972972)
chr7 (147-325)||(15081820-15081999)
chr7 (45-217)||(13841274-13841446)
chr7 (13-143)||(38897773-38897903)
chr7 (1-143)||(14269297-14269439)
chr7 (1-143)||(25926856-25926998)
chr7 (1-143)||(14156612-14156754)
chr7 (147-274)||(14269935-14270061)
chr7 (1-143)||(8940770-8940911)
chr7 (1-143)||(10501120-10501262)
chr7 (13-143)||(16214171-16214301)
chr7 (1-143)||(14156805-14156943)
chr7 (15-143)||(21189143-21189271)
chr7 (15-138)||(15081389-15081512)
chr7 (1-143)||(1856956-1857097)
chr7 (13-143)||(8940963-8941093)
chr7 (1-143)||(14269490-14269632)
chr7 (1-143)||(13918129-13918272)
chr7 (1-111)||(10500954-10501064)
chr7 (178-292)||(13841157-13841270)
chr7 (147-254)||(45847633-45847739)
chr7 (147-274)||(38898101-38898229)
chr7 (147-274)||(8940335-8940463)
chr7 (1-143)||(17985111-17985253)
chr7 (30-143)||(45847217-45847330)
chr7 (186-274)||(8468803-8468891)
chr7 (245-325)||(13647441-13647521)
chr7 (260-325)||(20110658-20110723)
chr7 (258-325)||(12756654-12756721)
chr7 (258-325)||(17061898-17061965)
chr7 (258-325)||(44116621-44116688)
chr7 (57-143)||(11310241-11310327)
chr7 (152-227)||(38898000-38898075)
chr7 (259-325)||(3386445-3386511)
chr7 (258-324)||(38898359-38898425)
chr7 (54-124)||(11286976-11287046)
chr7 (55-124)||(125965-126034)
chr7 (30-143)||(15376276-15376389)
chr7 (30-143)||(20384686-20384799)
chr7 (258-324)||(19486681-19486748)
chr7 (105-143)||(16410545-16410583)
chr7 (105-143)||(18628052-18628090)
chr7 (105-143)||(18640758-18640796)
chr7 (105-143)||(26355619-26355657)
chr7 (105-143)||(26358071-26358109)
chr7 (288-325)||(24275283-24275320)
chr7 (258-324)||(2280056-2280123)
chr7 (14-124)||(7822013-7822123)
chr7 (14-124)||(7829324-7829434)
chr7 (105-143)||(13869834-13869872)
chr7 (58-124)||(15951637-15951703)
chr7 (14-124)||(27102511-27102621)
chr7 (14-124)||(27109859-27109969)
chr7 (14-124)||(27175705-27175815)
chr7 (105-143)||(27217347-27217385)
chr7 (14-124)||(38784603-38784713)
chr7 (260-316)||(12255730-12255787)
chr7 (258-310)||(15008436-15008489)
chr7 (55-124)||(15760779-15760848)
chr7 (258-310)||(20220127-20220180)
chr7 (146-230)||(14269881-14269965)
chr7 (146-230)||(15081766-15081850)
chr7 (146-230)||(38898047-38898131)
chr7 (146-217)||(8468902-8468973)
chr7 (146-217)||(8940446-8940517)
chr7 (147-186)||(20619575-20619614)
chr7 (105-143)||(456808-456846)
chr7 (38-112)||(16202778-16202852)
chr7 (13-47)||(23461830-23461864)
chr7 (30-124)||(32495066-32495160)
chr7 (258-310)||(1867932-1867985)
chr7 (30-106)||(10001000-10001076)
chr7 (269-317)||(15113066-15113114)
chr7 (269-317)||(15116603-15116651)
chr7 (15-47)||(20110747-20110779)
chr7 (146-230)||(45847579-45847663)
[»] chr6 (96 HSPs)
chr6 (1-325)||(30676436-30676760)
chr6 (1-325)||(34963485-34963809)
chr6 (1-325)||(12742429-12742753)
chr6 (1-325)||(1540638-1540961)
chr6 (1-325)||(8055141-8055465)
chr6 (1-325)||(24422659-24422982)
chr6 (1-325)||(33861906-33862229)
chr6 (1-325)||(33864390-33864713)
chr6 (1-325)||(18334319-18334642)
chr6 (1-325)||(26924367-26924690)
chr6 (1-325)||(2290907-2291230)
chr6 (5-325)||(25688614-25688934)
chr6 (5-325)||(22782339-22782658)
chr6 (1-325)||(19858649-19858969)
chr6 (1-274)||(28289063-28289334)
chr6 (1-275)||(12942363-12942625)
chr6 (3-241)||(17377576-17377814)
chr6 (1-315)||(19847698-19847989)
chr6 (1-228)||(1598266-1598492)
chr6 (13-253)||(23992604-23992846)
chr6 (1-203)||(25535641-25535843)
chr6 (5-227)||(18914142-18914364)
chr6 (1-227)||(31630267-31630493)
chr6 (1-227)||(19005361-19005587)
chr6 (147-325)||(19005158-19005335)
chr6 (169-325)||(25656741-25656897)
chr6 (1-143)||(1598543-1598685)
chr6 (1-143)||(1891-2033)
chr6 (1-143)||(8850-8992)
chr6 (1-143)||(19005638-19005780)
chr6 (1-143)||(19847505-19847647)
chr6 (1-143)||(23415258-23415400)
chr6 (1-143)||(27557016-27557158)
chr6 (1-140)||(18914422-18914561)
chr6 (147-254)||(31630519-31630626)
chr6 (1-143)||(25688989-25689131)
chr6 (147-274)||(15875469-15875595)
chr6 (147-270)||(18913994-18914116)
chr6 (13-140)||(18914615-18914742)
chr6 (1-140)||(26924174-26924313)
chr6 (13-143)||(1598736-1598866)
chr6 (13-143)||(25689182-25689312)
chr6 (1-143)||(30676243-30676385)
chr6 (223-325)||(1595661-1595763)
chr6 (17-139)||(31630090-31630212)
chr6 (15-143)||(113-241)
chr6 (1-97)||(15892135-15892231)
chr6 (25-143)||(25737129-25737247)
chr6 (245-325)||(25754921-25755001)
chr6 (49-143)||(22981321-22981415)
chr6 (49-143)||(23806993-23807087)
chr6 (101-227)||(15875621-15875737)
chr6 (258-325)||(18456831-18456898)
chr6 (1-82)||(17883224-17883305)
chr6 (259-325)||(3852001-3852067)
chr6 (245-315)||(20556864-20556934)
chr6 (201-270)||(18937252-18937321)
chr6 (263-325)||(16448514-16448576)
chr6 (258-324)||(8227448-8227515)
chr6 (14-124)||(16240296-16240406)
chr6 (14-124)||(16556944-16557054)
chr6 (14-124)||(16633500-16633610)
chr6 (14-124)||(16650174-16650284)
chr6 (30-124)||(19984134-19984228)
chr6 (30-143)||(18334155-18334268)
chr6 (30-143)||(24423033-24423146)
chr6 (14-124)||(25904474-25904585)
chr6 (1-51)||(25737028-25737078)
chr6 (14-124)||(27654596-27654706)
chr6 (105-143)||(33864764-33864802)
chr6 (54-124)||(35016043-35016113)
chr6 (288-325)||(18461991-18462028)
chr6 (146-230)||(15875565-15875649)
chr6 (54-124)||(22226608-22226679)
chr6 (53-124)||(22593620-22593691)
chr6 (105-143)||(2290818-2290856)
chr6 (14-124)||(10487971-10488081)
chr6 (14-124)||(16377247-16377357)
chr6 (14-124)||(16384571-16384681)
chr6 (14-124)||(16826367-16826477)
chr6 (30-124)||(21776111-21776205)
chr6 (105-143)||(22782713-22782751)
chr6 (105-143)||(26924085-26924123)
chr6 (55-124)||(1555527-1555596)
chr6 (55-124)||(33315116-33315185)
chr6 (3-43)||(9045-9085)
chr6 (30-70)||(10905420-10905460)
chr6 (146-230)||(18914086-18914170)
chr6 (14-122)||(19609582-19609690)
chr6 (147-227)||(35056707-35056787)
chr6 (105-143)||(8055516-8055554)
chr6 (258-310)||(23076862-23076915)
chr6 (275-316)||(25644446-25644487)
chr6 (146-230)||(19005305-19005389)
chr6 (260-324)||(20109255-20109322)
chr6 (146-230)||(31630465-31630549)
[»] chr8 (108 HSPs)
chr8 (1-325)||(16413042-16413366)
chr8 (1-325)||(1484514-1484837)
chr8 (5-325)||(4483392-4483712)
chr8 (1-325)||(14409171-14409494)
chr8 (1-325)||(5853019-5853342)
chr8 (1-324)||(24485770-24486093)
chr8 (1-325)||(14823885-14824210)
chr8 (1-325)||(4542100-4542423)
chr8 (1-325)||(22001865-22002188)
chr8 (1-325)||(20045922-20046245)
chr8 (1-325)||(15070671-15070996)
chr8 (1-253)||(32121912-32122164)
chr8 (1-253)||(18677791-18678043)
chr8 (1-254)||(27472143-27472395)
chr8 (1-227)||(38549731-38549957)
chr8 (1-216)||(16198115-16198330)
chr8 (1-230)||(15202905-15203134)
chr8 (14-216)||(25657892-25658094)
chr8 (1-227)||(1326658-1326884)
chr8 (147-325)||(20403339-20403516)
chr8 (1-203)||(24048845-24049046)
chr8 (1-225)||(16401651-16401875)
chr8 (18-230)||(45290385-45290597)
chr8 (1-234)||(19896524-19896757)
chr8 (150-325)||(15203107-15203281)
chr8 (1-227)||(19936634-19936850)
chr8 (1-230)||(20403486-20403715)
chr8 (147-325)||(19896380-19896558)
chr8 (147-314)||(32810054-32810220)
chr8 (147-325)||(45290567-45290744)
chr8 (1-143)||(15202712-15202854)
chr8 (1-143)||(19896808-19896950)
chr8 (1-143)||(32122215-32122357)
chr8 (1-143)||(38549538-38549680)
chr8 (1-143)||(14397467-14397609)
chr8 (1-143)||(27471950-27472092)
chr8 (1-143)||(20403766-20403908)
chr8 (1-143)||(15071047-15071189)
chr8 (13-143)||(16401278-16401407)
chr8 (13-143)||(15202531-15202661)
chr8 (1-143)||(16412849-16412991)
chr8 (1-143)||(38549346-38549487)
chr8 (147-325)||(19936876-19937055)
chr8 (1-116)||(45290274-45290389)
chr8 (1-131)||(16401458-16401588)
chr8 (13-136)||(24049104-24049227)
chr8 (147-254)||(38549983-38550090)
chr8 (15-143)||(19897001-19897129)
chr8 (13-143)||(19936453-19936583)
chr8 (147-254)||(20982599-20982710)
chr8 (147-274)||(1326910-1327042)
chr8 (147-263)||(16401903-16402020)
chr8 (147-227)||(13425331-13425411)
chr8 (245-325)||(25484245-25484325)
chr8 (15-122)||(11361024-11361131)
chr8 (258-325)||(41598300-41598367)
chr8 (152-227)||(20982498-20982573)
chr8 (260-325)||(19801367-19801432)
chr8 (258-324)||(26224032-26224098)
chr8 (13-70)||(32810263-32810320)
chr8 (163-227)||(13425241-13425305)
chr8 (258-324)||(13508022-13508089)
chr8 (14-124)||(15319988-15320098)
chr8 (14-124)||(15500357-15500467)
chr8 (30-124)||(24717726-24717820)
chr8 (55-124)||(29759429-29759498)
chr8 (258-317)||(13597554-13597614)
chr8 (30-143)||(1484888-1485001)
chr8 (55-124)||(13663129-13663198)
chr8 (30-143)||(20045758-20045871)
chr8 (55-124)||(22007126-22007195)
chr8 (269-324)||(17612059-17612114)
chr8 (105-143)||(5852930-5852968)
chr8 (105-143)||(14409082-14409120)
chr8 (54-124)||(17150655-17150725)
chr8 (14-124)||(22089372-22089482)
chr8 (146-230)||(1326856-1326940)
chr8 (258-316)||(20498687-20498746)
chr8 (37-124)||(21493050-21493137)
chr8 (146-217)||(38549929-38550000)
chr8 (14-124)||(223304-223414)
chr8 (14-124)||(272163-272273)
chr8 (14-124)||(643576-643686)
chr8 (14-124)||(688075-688185)
chr8 (14-124)||(736927-737037)
chr8 (14-124)||(829382-829492)
chr8 (14-124)||(860822-860932)
chr8 (105-143)||(4483766-4483804)
chr8 (105-143)||(14824261-14824299)
chr8 (14-124)||(22146977-22147087)
chr8 (228-274)||(35026849-35026895)
chr8 (54-124)||(39114415-39114485)
chr8 (146-230)||(13425277-13425361)
chr8 (147-227)||(18815603-18815683)
chr8 (146-230)||(19936822-19936906)
chr8 (146-230)||(20982545-20982629)
chr8 (146-217)||(13425383-13425454)
chr8 (156-227)||(21513636-21513707)
chr8 (228-274)||(2418860-2418906)
chr8 (74-124)||(18611952-18612002)
chr8 (114-143)||(16401186-16401215)
chr8 (55-124)||(18618830-18618899)
chr8 (258-310)||(37116479-37116532)
chr8 (146-186)||(6573736-6573776)
chr8 (146-230)||(16401849-16401933)
chr8 (30-82)||(19866496-19866548)
chr8 (30-86)||(24678772-24678828)
chr8 (147-227)||(36733296-36733376)
[»] chr3 (111 HSPs)
chr3 (1-325)||(45606633-45606957)
chr3 (1-325)||(13544137-13544459)
chr3 (1-325)||(7781073-7781397)
chr3 (1-325)||(12567672-12567995)
chr3 (1-325)||(17463290-17463613)
chr3 (1-274)||(54520985-54521258)
chr3 (1-325)||(34159438-34159761)
chr3 (1-325)||(13153982-13154305)
chr3 (1-324)||(27165364-27165688)
chr3 (1-324)||(53301230-53301554)
chr3 (1-325)||(55476603-55476926)
chr3 (1-325)||(16454007-16454331)
chr3 (1-325)||(6468861-6469184)
chr3 (1-325)||(8499631-8499956)
chr3 (1-325)||(15412542-15412867)
chr3 (1-325)||(10247450-10247773)
chr3 (1-272)||(29544568-29544839)
chr3 (1-325)||(13151517-13151840)
chr3 (1-253)||(46822445-46822697)
chr3 (1-325)||(28848348-28848661)
chr3 (1-274)||(15977696-15977968)
chr3 (66-267)||(12305315-12305516)
chr3 (1-254)||(10557091-10557344)
chr3 (13-227)||(12119392-12119606)
chr3 (1-216)||(13436520-13436735)
chr3 (1-230)||(41124146-41124375)
chr3 (147-325)||(8899206-8899383)
chr3 (151-325)||(9707483-9707657)
chr3 (1-230)||(38961564-38961794)
chr3 (150-325)||(16282687-16282861)
chr3 (1-203)||(16282484-16282686)
chr3 (13-203)||(24513910-24514100)
chr3 (147-325)||(41123999-41124176)
chr3 (1-217)||(20629918-20630138)
chr3 (147-325)||(38961764-38961941)
chr3 (1-230)||(17444490-17444719)
chr3 (1-217)||(25237063-25237279)
chr3 (1-217)||(25229476-25229692)
chr3 (1-143)||(15465448-15465590)
chr3 (1-143)||(55319030-55319172)
chr3 (1-149)||(10379615-10379763)
chr3 (1-143)||(10557395-10557537)
chr3 (1-143)||(27165739-27165881)
chr3 (1-143)||(26054991-26055133)
chr3 (13-143)||(38961383-38961513)
chr3 (1-143)||(41124426-41124568)
chr3 (1-141)||(8500009-8500149)
chr3 (1-143)||(5223677-5223819)
chr3 (1-143)||(53301037-53301179)
chr3 (13-143)||(55318849-55318979)
chr3 (13-143)||(13937518-13937648)
chr3 (13-143)||(14567430-14567560)
chr3 (1-143)||(46822748-46822890)
chr3 (23-143)||(36528449-36528569)
chr3 (13-143)||(20629737-20629867)
chr3 (34-143)||(16358234-16358343)
chr3 (13-143)||(16282303-16282433)
chr3 (147-274)||(11913923-11914051)
chr3 (13-143)||(17444309-17444439)
chr3 (234-325)||(17446614-17446705)
chr3 (37-143)||(3264323-3264429)
chr3 (1-143)||(17393202-17393344)
chr3 (245-325)||(50242934-50243014)
chr3 (147-232)||(17444689-17444773)
chr3 (245-325)||(43550448-43550528)
chr3 (258-325)||(17672738-17672805)
chr3 (258-325)||(53070636-53070703)
chr3 (258-321)||(17248224-17248287)
chr3 (258-325)||(29172565-29172633)
chr3 (80-143)||(15007989-15008052)
chr3 (147-219)||(25237009-25237080)
chr3 (258-325)||(12119707-12119774)
chr3 (1-68)||(15007868-15007935)
chr3 (258-324)||(24340660-24340727)
chr3 (14-136)||(25058286-25058408)
chr3 (258-324)||(37642202-37642269)
chr3 (30-124)||(16934826-16934920)
chr3 (54-124)||(51158683-51158753)
chr3 (30-143)||(34159812-34159925)
chr3 (55-124)||(49231768-49231837)
chr3 (1-65)||(16358394-16358458)
chr3 (269-324)||(22147474-22147529)
chr3 (14-124)||(14528624-14528734)
chr3 (105-143)||(17463664-17463702)
chr3 (13-59)||(36528340-36528386)
chr3 (105-143)||(55476977-55477015)
chr3 (260-316)||(2051138-2051195)
chr3 (260-316)||(52523666-52523723)
chr3 (56-124)||(30152450-30152518)
chr3 (37-128)||(21026092-21026183)
chr3 (258-324)||(23274804-23274871)
chr3 (55-122)||(54039167-54039234)
chr3 (14-124)||(1468613-1468723)
chr3 (105-143)||(6468772-6468810)
chr3 (14-124)||(8276473-8276583)
chr3 (105-143)||(15412917-15412955)
chr3 (55-124)||(17956869-17956938)
chr3 (1-45)||(10555766-10555810)
chr3 (146-230)||(11913869-11913953)
chr3 (146-217)||(12119578-12119649)
chr3 (49-124)||(14263640-14263715)
chr3 (30-124)||(2281000-2281094)
chr3 (9-59)||(3264488-3264538)
chr3 (14-124)||(8269362-8269472)
chr3 (14-124)||(12808505-12808615)
chr3 (105-143)||(13151428-13151466)
chr3 (105-143)||(13153893-13153931)
chr3 (228-265)||(15977663-15977700)
chr3 (54-134)||(8023778-8023858)
chr3 (147-187)||(20630121-20630160)
chr3 (147-227)||(25201323-25201403)
[»] chr2 (113 HSPs)
chr2 (1-325)||(23130974-23131298)
chr2 (1-325)||(23133441-23133765)
chr2 (1-325)||(34402248-34402572)
chr2 (1-325)||(39682425-39682749)
chr2 (1-275)||(20261381-20261655)
chr2 (1-325)||(18809055-18809378)
chr2 (1-325)||(23711740-23712063)
chr2 (1-325)||(28577211-28577534)
chr2 (1-325)||(571509-571833)
chr2 (1-325)||(23709259-23709582)
chr2 (1-325)||(24897922-24898245)
chr2 (1-325)||(24905359-24905682)
chr2 (1-325)||(24900405-24900728)
chr2 (1-325)||(24902882-24903205)
chr2 (1-325)||(24907834-24908157)
chr2 (1-325)||(26505491-26505814)
chr2 (1-325)||(26507969-26508292)
chr2 (1-325)||(32214657-32214971)
chr2 (1-325)||(32039225-32039548)
chr2 (1-274)||(10684489-10684764)
chr2 (1-325)||(23135702-23136015)
chr2 (1-227)||(23706943-23707169)
chr2 (1-325)||(24529273-24529579)
chr2 (1-227)||(24918350-24918576)
chr2 (1-227)||(24642475-24642701)
chr2 (5-227)||(24671235-24671457)
chr2 (37-253)||(25616365-25616581)
chr2 (1-227)||(24681654-24681880)
chr2 (1-230)||(22105672-22105901)
chr2 (1-230)||(24368033-24368262)
chr2 (147-325)||(6726107-6726284)
chr2 (1-211)||(45027631-45027840)
chr2 (147-325)||(21154933-21155110)
chr2 (1-227)||(38967689-38967915)
chr2 (1-230)||(21154734-21154963)
chr2 (147-324)||(22105526-22105702)
chr2 (1-230)||(41523799-41524028)
chr2 (147-325)||(24367886-24368063)
chr2 (1-230)||(6726254-6726483)
chr2 (147-324)||(38967488-38967663)
chr2 (147-325)||(24642727-24642906)
chr2 (1-143)||(41523606-41523748)
chr2 (13-143)||(6726534-6726664)
chr2 (15-143)||(24529094-24529222)
chr2 (1-143)||(21154541-21154683)
chr2 (1-143)||(22105952-22106094)
chr2 (13-143)||(24918627-24918757)
chr2 (17-143)||(24368313-24368439)
chr2 (1-122)||(23931775-23931896)
chr2 (15-140)||(41523427-41523552)
chr2 (1-141)||(23931949-23932089)
chr2 (1-143)||(21154348-21154490)
chr2 (206-325)||(45029785-45029904)
chr2 (1-139)||(23706751-23706889)
chr2 (1-143)||(23709066-23709208)
chr2 (13-143)||(24681931-24682061)
chr2 (1-142)||(32214463-32214604)
chr2 (13-143)||(23706571-23706701)
chr2 (13-143)||(24671512-24671642)
chr2 (13-142)||(45027450-45027579)
chr2 (147-274)||(23707195-23707323)
chr2 (147-274)||(24918196-24918324)
chr2 (147-274)||(24671081-24671209)
chr2 (147-274)||(24681500-24681628)
chr2 (245-314)||(22173799-22173868)
chr2 (79-143)||(31345490-31345554)
chr2 (259-325)||(43137411-43137477)
chr2 (260-317)||(19671953-19672010)
chr2 (55-136)||(16900803-16900884)
chr2 (55-136)||(16994194-16994275)
chr2 (32-124)||(67339-67431)
chr2 (92-143)||(24642373-24642424)
chr2 (14-124)||(24686597-24686707)
chr2 (30-143)||(18809429-18809542)
chr2 (55-124)||(34823750-34823819)
chr2 (258-298)||(29601478-29601518)
chr2 (30-124)||(12727711-12727805)
chr2 (14-124)||(19887274-19887384)
chr2 (105-143)||(23131348-23131386)
chr2 (105-143)||(23711651-23711689)
chr2 (105-143)||(26505865-26505903)
chr2 (105-143)||(26508343-26508381)
chr2 (54-124)||(27261332-27261402)
chr2 (105-143)||(27920402-27920440)
chr2 (105-143)||(32039136-32039174)
chr2 (105-143)||(34402160-34402198)
chr2 (260-316)||(23708558-23708615)
chr2 (30-143)||(28577585-28577698)
chr2 (269-324)||(22459511-22459566)
chr2 (147-186)||(41523998-41524037)
chr2 (105-143)||(571884-571922)
chr2 (14-124)||(11232212-11232322)
chr2 (14-124)||(22514059-22514169)
chr2 (105-143)||(23133815-23133853)
chr2 (14-124)||(28776661-28776771)
chr2 (105-143)||(39682800-39682838)
chr2 (1-46)||(31345570-31345615)
chr2 (37-86)||(34135070-34135119)
chr2 (147-227)||(21368365-21368445)
chr2 (56-124)||(22274022-22274090)
chr2 (146-230)||(23707141-23707225)
chr2 (146-230)||(24642673-24642757)
chr2 (146-230)||(24918294-24918378)
chr2 (108-143)||(23708980-23709015)
chr2 (275-316)||(7688-7729)
chr2 (258-310)||(20520130-20520183)
chr2 (258-310)||(23791405-23791458)
chr2 (56-124)||(22283255-22283323)
chr2 (147-227)||(23799457-23799537)
chr2 (146-230)||(24671179-24671263)
chr2 (146-230)||(24681598-24681682)
chr2 (30-70)||(24788042-24788082)
chr2 (30-70)||(44584592-44584632)
[»] chr1 (62 HSPs)
chr1 (1-325)||(21474813-21475137)
chr1 (1-325)||(13988978-13989301)
chr1 (1-325)||(16362029-16362354)
chr1 (1-325)||(21840879-21841202)
chr1 (1-325)||(21923018-21923341)
chr1 (1-325)||(23593460-23593785)
chr1 (1-325)||(15859735-15860058)
chr1 (1-227)||(16274982-16275209)
chr1 (1-217)||(27161313-27161529)
chr1 (1-230)||(29776947-29777176)
chr1 (147-325)||(29776800-29776977)
chr1 (13-230)||(22122753-22122970)
chr1 (1-230)||(31612572-31612801)
chr1 (1-217)||(29298461-29298677)
chr1 (147-325)||(29298248-29298425)
chr1 (1-167)||(13227133-13227299)
chr1 (147-325)||(16275235-16275413)
chr1 (147-325)||(22122940-22123117)
chr1 (146-324)||(31612426-31612603)
chr1 (13-230)||(22050575-22050792)
chr1 (1-167)||(29535321-29535487)
chr1 (1-143)||(31612852-31612994)
chr1 (13-143)||(29298728-29298858)
chr1 (1-143)||(15859529-15859671)
chr1 (15-143)||(31613045-31613173)
chr1 (1-137)||(9044731-9044867)
chr1 (13-143)||(22122559-22122690)
chr1 (13-143)||(16274801-16274931)
chr1 (13-143)||(27161132-27161262)
chr1 (1-143)||(29777227-29777369)
chr1 (1-143)||(16401408-16401550)
chr1 (147-252)||(22050762-22050866)
chr1 (13-134)||(40129387-40129508)
chr1 (146-241)||(27161511-27161605)
chr1 (1-69)||(43543269-43543337)
chr1 (245-325)||(45574812-45574892)
chr1 (74-143)||(10812612-10812681)
chr1 (258-324)||(433123-433190)
chr1 (258-325)||(13212844-13212911)
chr1 (258-325)||(21347074-21347141)
chr1 (263-325)||(40389267-40389329)
chr1 (258-325)||(21342209-21342276)
chr1 (258-325)||(21707279-21707346)
chr1 (258-325)||(21711821-21711888)
chr1 (221-274)||(43543214-43543267)
chr1 (147-217)||(29298408-29298478)
chr1 (30-143)||(13989352-13989465)
chr1 (54-124)||(21858592-21858662)
chr1 (56-124)||(44035860-44035928)
chr1 (269-316)||(16758775-16758822)
chr1 (14-124)||(17003909-17004019)
chr1 (105-143)||(21474724-21474762)
chr1 (30-124)||(21650885-21650979)
chr1 (55-124)||(22366527-22366596)
chr1 (146-230)||(16275181-16275265)
chr1 (261-316)||(21861510-21861566)
chr1 (17-124)||(18060577-18060684)
chr1 (258-316)||(21896193-21896252)
chr1 (258-308)||(35261018-35261069)
chr1 (26-115)||(16655942-16656031)
chr1 (258-310)||(41049973-41050026)
chr1 (258-309)||(16368224-16368276)
[»] scaffold0023 (6 HSPs)
scaffold0023 (1-325)||(94523-94846)
scaffold0023 (1-325)||(17166-17490)
scaffold0023 (1-143)||(16973-17115)
scaffold0023 (278-324)||(44568-44614)
scaffold0023 (30-143)||(94897-95010)
scaffold0023 (55-124)||(154892-154961)
[»] scaffold0230 (4 HSPs)
scaffold0230 (1-325)||(14059-14383)
scaffold0230 (5-228)||(23261-23484)
scaffold0230 (1-143)||(22904-23046)
scaffold0230 (58-143)||(23121-23206)
[»] scaffold0716 (2 HSPs)
scaffold0716 (1-325)||(4806-5130)
scaffold0716 (1-143)||(5181-5323)
[»] chr5 (77 HSPs)
chr5 (1-325)||(39363496-39363820)
chr5 (1-325)||(264495-264818)
chr5 (1-325)||(20909124-20909447)
chr5 (1-325)||(38619547-38619872)
chr5 (1-325)||(10732667-10732990)
chr5 (1-321)||(39245252-39245571)
chr5 (1-325)||(42245092-42245415)
chr5 (1-325)||(23064624-23064949)
chr5 (1-325)||(29346092-29346415)
chr5 (1-325)||(29348565-29348888)
chr5 (1-325)||(29351038-29351361)
chr5 (1-274)||(37804629-37804902)
chr5 (1-253)||(17516890-17517142)
chr5 (14-274)||(9776521-9776781)
chr5 (1-325)||(2154358-2154664)
chr5 (1-227)||(20901647-20901873)
chr5 (1-217)||(20917573-20917789)
chr5 (1-230)||(32027652-32027881)
chr5 (147-325)||(32027505-32027682)
chr5 (1-230)||(29330190-29330418)
chr5 (147-325)||(20917825-20918002)
chr5 (147-325)||(29330046-29330220)
chr5 (1-143)||(17516504-17516646)
chr5 (1-143)||(20901454-20901596)
chr5 (13-143)||(32028125-32028256)
chr5 (1-143)||(296001-296143)
chr5 (1-143)||(17516697-17516839)
chr5 (13-143)||(29330469-29330599)
chr5 (15-143)||(32028512-32028640)
chr5 (13-143)||(2154177-2154307)
chr5 (14-143)||(295821-295950)
chr5 (147-325)||(20901899-20902059)
chr5 (1-143)||(32027932-32028074)
chr5 (1-143)||(32028319-32028461)
chr5 (15-143)||(20917394-20917522)
chr5 (258-325)||(36154766-36154833)
chr5 (263-325)||(18319021-18319083)
chr5 (263-325)||(24067220-24067282)
chr5 (260-325)||(11581184-11581249)
chr5 (258-325)||(10775659-10775725)
chr5 (258-322)||(31061184-31061248)
chr5 (14-124)||(22883903-22884013)
chr5 (54-124)||(27183208-27183278)
chr5 (258-324)||(40725970-40726037)
chr5 (14-124)||(43444008-43444118)
chr5 (30-143)||(264331-264444)
chr5 (55-124)||(1220384-1220453)
chr5 (55-124)||(10778832-10778901)
chr5 (147-230)||(20917772-20917855)
chr5 (14-124)||(11903-12013)
chr5 (105-143)||(20909498-20909536)
chr5 (14-124)||(25426177-25426287)
chr5 (105-143)||(39245622-39245660)
chr5 (105-143)||(39363870-39363908)
chr5 (147-227)||(1628163-1628243)
chr5 (14-122)||(7424879-7424987)
chr5 (56-124)||(23511127-23511195)
chr5 (30-124)||(11342190-11342284)
chr5 (14-124)||(21933242-21933352)
chr5 (14-124)||(21939412-21939522)
chr5 (14-124)||(22367094-22367204)
chr5 (105-143)||(23065000-23065038)
chr5 (14-124)||(35581340-35581450)
chr5 (14-124)||(36990638-36990748)
chr5 (55-124)||(1168832-1168901)
chr5 (55-124)||(11212734-11212803)
chr5 (55-124)||(21074249-21074318)
chr5 (275-316)||(22144174-22144215)
chr5 (146-230)||(20901845-20901929)
chr5 (147-186)||(14026653-14026692)
chr5 (156-227)||(18743965-18744036)
chr5 (147-186)||(21503316-21503355)
chr5 (14-124)||(18778605-18778715)
chr5 (54-124)||(32950213-32950283)
chr5 (105-143)||(38619922-38619960)
chr5 (26-115)||(28901495-28901584)
chr5 (26-115)||(28937890-28937979)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (1-325)||(13504-13828)
scaffold0444 (104-143)||(13879-13918)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (5-325)||(9354-9673)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (1-274)||(3186-3459)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-325)||(11400-11725)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (5-314)||(6070-6378)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (1-325)||(40512-40835)
scaffold0044 (14-136)||(37848-37969)
scaffold0044 (104-143)||(40886-40925)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (1-325)||(134323-134646)
scaffold0028 (1-325)||(136792-137115)
scaffold0028 (1-325)||(139261-139584)
scaffold0028 (1-325)||(141730-142053)
scaffold0028 (1-325)||(144199-144522)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (34-274)||(1591-1831)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (13-324)||(38394-38706)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (67-325)||(10885-11142)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (1-325)||(501196-501500)
scaffold0001 (13-143)||(501551-501681)
scaffold0001 (258-325)||(85562-85629)
scaffold0001 (30-82)||(139593-139645)
[»] scaffold0741 (4 HSPs)
scaffold0741 (1-274)||(4029-4304)
scaffold0741 (1-143)||(3836-3978)
scaffold0741 (1-140)||(3643-3782)
scaffold0741 (92-143)||(3541-3592)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (1-274)||(6662-6937)
scaffold0317 (13-143)||(6481-6611)
[»] scaffold0306 (4 HSPs)
scaffold0306 (7-274)||(15083-15352)
scaffold0306 (1-186)||(11066-11251)
scaffold0306 (13-143)||(10885-11015)
scaffold0306 (13-143)||(15399-15528)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (15-274)||(53612-53873)
scaffold0022 (258-309)||(78453-78505)
[»] scaffold1792 (3 HSPs)
scaffold1792 (5-228)||(416-639)
scaffold1792 (1-143)||(854-996)
scaffold1792 (58-143)||(694-779)
[»] scaffold0494 (4 HSPs)
scaffold0494 (1-227)||(250-476)
scaffold0494 (220-325)||(12194-12299)
scaffold0494 (147-227)||(502-582)
scaffold0494 (146-230)||(448-532)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (1-227)||(30229-30455)
scaffold0149 (1-143)||(30506-30648)
scaffold0149 (154-325)||(30044-30196)
[»] scaffold0043 (5 HSPs)
scaffold0043 (1-227)||(10001-10227)
scaffold0043 (1-143)||(10278-10420)
scaffold0043 (15-143)||(10471-10599)
scaffold0043 (147-186)||(9936-9975)
scaffold0043 (146-230)||(9945-10029)
[»] scaffold0747 (5 HSPs)
scaffold0747 (1-227)||(799-1025)
scaffold0747 (1-143)||(1076-1218)
scaffold0747 (147-274)||(645-773)
scaffold0747 (13-114)||(1225-1325)
scaffold0747 (146-214)||(759-827)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (1-175)||(6713-6887)
scaffold0574 (1-143)||(6938-7080)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (30-219)||(13382-13571)
scaffold0040 (1-174)||(43002-43175)
scaffold0040 (13-143)||(43226-43356)
[»] scaffold0278 (3 HSPs)
scaffold0278 (1-180)||(7996-8175)
scaffold0278 (1-143)||(8226-8368)
scaffold0278 (1-141)||(8421-8561)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (1-167)||(68231-68397)
[»] scaffold1296 (2 HSPs)
scaffold1296 (13-143)||(1741-1871)
scaffold1296 (1-57)||(1634-1690)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (1-143)||(8312-8454)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (53-203)||(57715-57865)
[»] scaffold0711 (3 HSPs)
scaffold0711 (1-143)||(7416-7558)
scaffold0711 (1-143)||(7224-7366)
scaffold0711 (49-142)||(7079-7172)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (1-143)||(18424-18566)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (1-143)||(17947-18089)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (1-143)||(31497-31639)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (1-143)||(33465-33607)
scaffold0138 (259-310)||(18176-18228)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (1-143)||(39626-39768)
[»] scaffold0151 (2 HSPs)
scaffold0151 (18-143)||(36749-36874)
scaffold0151 (1-143)||(36925-37067)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (1-143)||(19815-19957)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (147-268)||(27958-28078)
scaffold0114 (88-230)||(28048-28190)
[»] scaffold0513 (3 HSPs)
scaffold0513 (147-274)||(10760-10886)
scaffold0513 (152-227)||(10659-10734)
scaffold0513 (146-230)||(10706-10790)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (147-274)||(15145-15273)
scaffold0106 (178-227)||(15070-15119)
scaffold0106 (146-230)||(15091-15175)
[»] scaffold0145 (2 HSPs)
scaffold0145 (147-325)||(9861-10021)
scaffold0145 (154-216)||(10005-10067)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (245-325)||(218-298)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (245-325)||(82184-82264)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (245-325)||(12170-12250)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (245-325)||(1250-1330)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (164-274)||(35955-36065)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (258-325)||(158433-158500)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (30-136)||(113317-113423)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (258-325)||(4409-4476)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (258-325)||(79267-79334)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (147-274)||(1199-1327)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (258-325)||(2111-2178)
scaffold0247 (258-324)||(17964-18031)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (258-325)||(16896-16963)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (258-325)||(20363-20429)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (258-324)||(164573-164639)
scaffold0007 (258-324)||(161072-161138)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (258-325)||(4327-4393)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (14-124)||(6195-6305)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (258-323)||(12047-12112)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (14-124)||(8566-8676)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (14-124)||(30470-30580)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (1-59)||(75631-75689)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (258-324)||(11581-11648)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (53-124)||(12519-12590)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (258-324)||(38193-38260)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (14-124)||(725-835)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (55-124)||(6970-7039)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (280-325)||(13120-13165)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (258-316)||(13254-13313)
scaffold0357 (258-310)||(16037-16090)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (258-316)||(27686-27745)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (258-324)||(53486-53553)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (258-316)||(225531-225590)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (14-124)||(1375-1485)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (56-122)||(15780-15846)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (30-124)||(32122-32216)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (30-124)||(40628-40722)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (14-124)||(110064-110174)
scaffold0035 (14-124)||(118565-118675)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (54-124)||(39965-40035)
scaffold0034 (54-124)||(45448-45518)
scaffold0034 (54-124)||(79003-79073)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (55-124)||(1296-1365)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (55-122)||(912-979)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (258-316)||(7996-8055)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (54-124)||(868-938)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (14-124)||(18205-18315)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (14-124)||(28469-28579)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (14-124)||(38375-38485)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (54-124)||(53946-54016)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (54-124)||(19939-20009)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (13-58)||(398-443)
[»] scaffold0959 (1 HSPs)
scaffold0959 (49-136)||(1219-1306)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (258-316)||(60652-60711)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (54-124)||(8122-8192)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (258-310)||(6220-6273)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (258-310)||(667-720)
scaffold0123 (258-310)||(25237-25289)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (258-310)||(97137-97190)
scaffold0006 (258-310)||(106415-106468)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (260-324)||(8583-8650)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 102)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 14970433 - 14970757
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14970433 attgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatag 14970532  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14970533 aacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 14970632  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14970633 tgttcataattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgtattact 14970732  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14970733 tgaattatatgtgaataattgagac 14970757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3515443 - 3515119
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3515443 attgatcggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatag 3515344  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3515343 aacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgtatgtatatttttgtgaatacgatat 3515244  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515243 tgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 3515144  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3515143 tgaattatatgtgaataattgagac 3515119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15534617 - 15534343
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534617 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 15534518  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15534517 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatat 15534418  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534417 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 15534343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 15118079 - 15118402
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118079 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 15118178  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  15118179 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 15118277  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15118278 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 15118377  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15118378 tgaattatatgtgaataattgagac 15118402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19243136 - 19242811
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  19243136 attgattggtacagaattagtcttaggtataaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatag 19243037  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19243036 aacttgagttatggttaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 19242937  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattac 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242936 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttggagttgtttatattgtgatataattatatatgcattac 19242837  T
Q  300 ttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19242836 ttgaattatatgtgaataattgagac 19242811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 36038306 - 36038033
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36038306 attgattggtacagaattggccttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 36038207  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36038206 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaagatatgtatgtatatatttgtgaatacgatat 36038107  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36038106 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 36038033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 44615724 - 44615400
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615724 attgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaatttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 44615625  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  44615624 aactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatat 44615525  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  44615524 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 44615425  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  44615424 tgaattatatgtgaataattgagac 44615400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 49547500 - 49547773
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49547500 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 49547599  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  49547600 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaagaattatttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatat 49547699  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49547700 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatctatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatat 49547773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 50222066 - 50222389
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222066 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagatgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 50222165  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  50222166 aactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 50222264  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  50222265 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatattgttatactgtgatataattgtatatgcattact 50222364  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  50222365 tgaattatatgtgaataattgagac 50222389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14049013 - 14048740
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14049013 attgattggtacataattggttttaggtgtaaacatgaaagttgtgggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttacag 14048914  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14048913 aacttgtgttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgataaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 14048814  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14048813 tgtcaatgattgatgaggtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 14048740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Original strand, 44772814 - 44773137
Alignment:
Q  5 attggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44772814 attggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaagatttatagaact 44772913  T
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtc 204  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  44772914 tgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtc 44773012  T
Q  205 aatgattgatgaagtgttatatg----tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
     ||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44773013 catgattgatgaagtgttatatgtatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 44773112  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  44773113 tgaattatttgtgaataattgagac 44773137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 1837246 - 1837559
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1837246 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttaaaaaggatttatag 1837345  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||           ||||||  |||||||    
T  1837346 aactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg-----------ttgtgaaaacgatat 1837434  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  1837435 tgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttataatgtgatataatcgtatatgcattact 1837534  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  1837535 tgaattatatgtgaataattgagac 1837559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 7640913 - 7641242
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7640913 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccattggtttcacttcaaaaggatttatag 7641012  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  7641013 aacttgagttatagttaaattactgcctgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 7641111  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgt------tatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgc 294  Q
    | |  ||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7641112 ttttcatgattgatgaagtgttatatatatatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgc 7641211  T
Q  295 attacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7641212 attacttgaattatatgtaaataattgagac 7641242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 52872799 - 52873025
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872799 attgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 52872898  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52872899 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 52872998  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||||    
T  52872999 tgttcatgattgatgatgtgttatatg 52873025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 15495900 - 15496126
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||    
T  15495900 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttaaattcgaaaggttttatag 15495999  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15496000 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttctgaatacgatat 15496099  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  15496100 tgttcatgattgatgaagtgttatatg 15496126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29267789 - 29267570
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29267789 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 29267690  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29267689 aatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatat 29267590  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtg 220  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  29267589 tgtccatgattgatgaagtg 29267570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 362616 - 362390
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||| || | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  362616 attgattgatacaaaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttagtttgacttcaaaacgatttatag 362517  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  362516 aacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 362417  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  362416 tgttcatgattgatgaagtgttatatg 362390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 19617793 - 19618019
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19617793 attgattggtacagagttggtcttaggtgttaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgctgttggtgtgacttcaaaaggatttatag 19617892  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19617893 aagttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatat 19617992  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  19617993 tgttcatgattgatgaagtgttatatg 19618019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 14746238 - 14746464
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14746238 attgattggtacagaattggtcttcggtgtaaggacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgactttaaaaggatttatag 14746337  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||      
T  14746338 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatatatgtatatgtttgtgaatactatta 14746437  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  14746438 tgttcatgattgatgaagtgttatatg 14746464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Original strand, 18215147 - 18215324
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215147 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 18215245  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215246 tgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 18215324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Original strand, 19618045 - 19618222
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618045 ttgtttatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 19618143  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19618144 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagac 19618222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 52312997 - 52312769
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52312997 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggttttacttcaaaaggatttatag 52312898  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |    
T  52312897 aacttgagttatagtc-aattactgcacgcaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgt 52312799  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  52312798 tgtttatgattgatgaattagtatatgtat 52312769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 105 - 325
Target Start/End: Original strand, 18239250 - 18239469
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtc 204  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18239250 tgagttattgtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaatttttgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtc 18239348  T
Q  205 aatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 304  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18239349 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaa 18239448  T
Q  305 ttatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18239449 ttatatgtgaataattgagac 18239469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Original strand, 12180 - 12357
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12180 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 12278  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12279 tgttgattattattggatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 12357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 52312799 - 52312622
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312799 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 52312701  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312700 tgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 52312622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 11981 - 12210
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11981 attgataggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatcaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatag 12080  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||  || |    
T  12081 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgtgtattatgt 12180  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  12181 tgtttatgattgatgaattagtatatgtat 12210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19858014 - 19857798
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19858014 attgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaataatttatag 19857915  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||          |||||||||||||| ||||||||    
T  19857914 aacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta----------gtatatgtttgtgaatacgatat 19857825  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  19857824 tgttcatgattgatgaagtgttatatg 19857798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Original strand, 15355197 - 15355374
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355197 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaaga 15355295  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15355296 tgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagac 15355374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 362809 - 362668
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  362809 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacatcaaaaagatttatag 362710  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  362709 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtga 362668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 363002 - 362860
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  363002 attgatttgtatagaattggtcttaggtgtaaacccgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatag 362903  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362902 aatttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 362860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 18214749 - 18214879
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18214749 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttat 18214848  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18214849 ggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaa 18214879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 52872606 - 52872748
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||    
T  52872606 attgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattctgttggtctgacgtcaaaacgatttatag 52872705  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872706 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 52872748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 3515624 - 3515494
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3515624 agaattggtcttaggcgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctcacgtcaaaacgatttatagaacttgagttat 3515525  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515524 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 3515494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19858207 - 19858065
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  19858207 attgattggtacagaattggtcttaggtgcaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatag 19858108  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19858107 aacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaa 19858065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 52313371 - 52313241
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  52313371 agaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttat 52313272  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52313271 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 52313241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 14746045 - 14746187
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  14746045 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatag 14746144  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14746145 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcatagtgaa 14746187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 14970240 - 14970382
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  14970240 attgatttgtacacaattggtcttaggtgataacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatag 14970339  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970340 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 14970382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 15495719 - 15495849
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15495719 agaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttat 15495818  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15495819 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 15495849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 19617600 - 19617742
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||||| |    
T  19617600 attgattggtacataattggtcttaggtgtagacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctaacgccaaaatgatttattg 19617699  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19617700 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 19617742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 147 - 274
Target Start/End: Original strand, 15496944 - 15497070
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15496944 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 15497042  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||    
T  15497043 tgttgattattatttgatgttgttatat 15497070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 147 - 273
Target Start/End: Original strand, 52873051 - 52873176
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873051 ttgtttatgattgatgaattaatatacgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 52873149  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttata 273  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||    
T  52873150 tgttgattattatttgatgttgttata 52873176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 14185731 - 14185622
Alignment:
Q  34 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14185731 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgaacgtagg 14185632  T
Q  134 tcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||    
T  14185631 tcacagtgaa 14185622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 52313178 - 52313048
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  52313178 agaattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgcctttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgatttat 52313079  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52313078 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 52313048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 98 - 227
Target Start/End: Original strand, 18214992 - 18215121
Alignment:
Q  98 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||    
T  18214992 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttattaatacga 18215091  T
Q  198 tattgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18215092 tattgttcatgattgatgaagtgttatatg 18215121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 147 - 274
Target Start/End: Original strand, 14746490 - 14746618
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--a 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       
T  14746490 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagtt 14746588  T
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14746589 gatgttgattatcatttgatgttgttatat 14746618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12611135 - 12611055
Alignment:
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611135 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 12611055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 30147351 - 30147189
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | |  ||   |||| | ||||| ||||  ||||| |||||||||    
T  30147351 attgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaagtatggatataaaattaaaaatgacattggtatgacaacaaaaagatttatag 30147252  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatga 163  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  30147251 aacttgagttatggtcaaattactacacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatga 30147189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 51463838 - 51463918
Alignment:
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51463838 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagac 51463918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 124 - 227
Target Start/End: Original strand, 15355068 - 15355171
Alignment:
Q  124 tgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgtta 223  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15355068 tgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgtta 15355167  T
Q  224 tatg 227  Q
    ||||    
T  15355168 tatg 15355171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Original strand, 22725288 - 22725400
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacg 129  Q
    |||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22725288 taaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctaat-ccgttggtttgacatcaaaatgatttataggacttgagttatggtcaaattactgcacg 22725386  T
Q  130 taggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||| ||||    
T  22725387 taggtcacactgaa 22725400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 23803235 - 23803315
Alignment:
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23803235 gatgttgattatgattttatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagac 23803315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19857772 - 19857685
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatat 234  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19857772 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattttatatatatat 19857685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Original strand, 21815568 - 21815635
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21815568 atttgatgttgttatattatgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 21815635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 44102393 - 44102326
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102393 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 44102326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 264 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22354010 - 22353949
Alignment:
Q  264 tgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22354010 tgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 22353949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 186 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 362336 - 362268
Alignment:
Q  186 ttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 254  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362336 ttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 362268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15367873 - 15367806
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15367873 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagac 15367806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15371385 - 15371318
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15371385 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagac 15371318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15373666 - 15373599
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15373666 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagac 15373599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15402886 - 15402819
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15402886 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagac 15402819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 263 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20150004 - 20149942
Alignment:
Q  263 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20150004 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagac 20149942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 269 - 324
Target Start/End: Original strand, 44928873 - 44928928
Alignment:
Q  269 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928873 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 44928928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 74 - 140
Target Start/End: Original strand, 14745925 - 14745991
Alignment:
Q  74 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 140  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745925 ttggtctgacgtcaaaacgatttatagcacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 14745991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14951364 - 14951270
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  14951364 taaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 14951270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16223712 - 16223648
Alignment:
Q  261 tgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16223712 tgatgttgttatattgtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagac 16223648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15370200 - 15370134
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15370200 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgc-gtagttgaattatatgtgaataattgagac 15370134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 122
Target Start/End: Original strand, 55377225 - 55377293
Alignment:
Q  54 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 122  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  55377225 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 55377293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 12778409 - 12778460
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatg 52  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12778409 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatg 12778460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14995754 - 14995644
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14995754 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatgtcgttggtttgaggtctaaatgatttttagaacttgagttatg 14995655  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  14995654 atcaaattact 14995644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 124
Target Start/End: Original strand, 25120050 - 25120144
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25120050 taaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 25120144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Original strand, 15117915 - 15118028
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacg 129  Q
    |||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||||||    
T  15117915 taaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacg 15118014  T
Q  130 taggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||    
T  15118015 taggtcacagtgaa 15118028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 124
Target Start/End: Original strand, 43281694 - 43281795
Alignment:
Q  23 ttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 122  Q
    |||||| | |||| |||| ||||||||   |||||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  43281694 ttaggtgttaacatgaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggctatggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 43281793  T
Q  123 ct 124  Q
    ||    
T  43281794 ct 43281795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19857659 - 19857607
Alignment:
Q  222 tatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19857659 tatatatatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 19857607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 324
Target Start/End: Original strand, 13788 - 13855
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  13788 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgaga 13855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 18247849 - 18247739
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  18247849 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 18247750  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     | ||||||||    
T  18247749 attaaattact 18247739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 124
Target Start/End: Original strand, 18293695 - 18293765
Alignment:
Q  54 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18293695 atgttagatttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 18293765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 47357293 - 47357183
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  47357293 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggccttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatg 47357194  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     | ||||||||    
T  47357193 attaaattact 47357183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 324
Target Start/End: Original strand, 43198492 - 43198557
Alignment:
Q  260 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  43198492 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgaga 43198557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 122
Target Start/End: Original strand, 15287858 - 15287966
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  15287858 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 15287957  T
Q  114 gtcaaatta 122  Q
     ||||||||    
T  15287958 atcaaatta 15287966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 122
Target Start/End: Original strand, 15294968 - 15295076
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  15294968 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 15295067  T
Q  114 gtcaaatta 122  Q
     ||||||||    
T  15295068 atcaaatta 15295076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Original strand, 19617991 - 19618075
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| || |||||||||    
T  19617991 attgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattggtatatgtat 19618075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 143
Target Start/End: Original strand, 44772723 - 44772759
Alignment:
Q  107 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44772723 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 44772759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 316
Target Start/End: Original strand, 52243131 - 52243190
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaat 316  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  52243131 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaat 52243190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 124
Target Start/End: Original strand, 5683371 - 5683465
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||| ||||||| ||||||    ||||||||||| ||||   |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5683371 taaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttccaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 5683465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Original strand, 7640824 - 7640862
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7640824 tgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 7640862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 9198650 - 9198544
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacg 129  Q
    |||||| ||||||| ||  |||||||||||  |||||||||   ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  9198650 taaacatgaaagttttatatatggatgttatatttctaatggatttggtcttacttcaaaatgatttctacaacttgatttatggtcaaattaatacacg 9198551  T
Q  130 taggtca 136  Q
    || ||||    
T  9198550 tatgtca 9198544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 10643856 - 10643746
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||   |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  10643856 gaattggactttggtgcaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggttttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatg 10643757  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     | ||||||||    
T  10643756 attaaattact 10643746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 14185571 - 14185477
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatt 95  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||| || |  ||||||||||| | || | ||||| |||||| |||| ||||    
T  14185571 attgattggtacagaattggtcttaggtgttaacatgaaagttgtagataagtgtgttagctttccagtggctttggtgtgacttgaaaatgatt 14185477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16731786 - 16731688
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||    
T  16731786 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctctctaatggctttggtttgacttccaaatgattttttgaacttgagttat 16731688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 124
Target Start/End: Original strand, 22355075 - 22355169
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  22355075 taaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 22355169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 124
Target Start/End: Original strand, 17146320 - 17146389
Alignment:
Q  55 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  17146320 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 17146389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 18168362 - 18168293
Alignment:
Q  55 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  18168362 tgttagctttctaatggcgttgatttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 18168293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Original strand, 15355143 - 15355227
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  15355143 attgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 15355227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19857826 - 19857742
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  19857826 attgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 19857742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 362418 - 362347
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaa 217  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  362418 attgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 362347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 25513071 - 25513032
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtt 186  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  25513071 ttgtttatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 25513032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 230
Target Start/End: Original strand, 14746438 - 14746520
Alignment:
Q  148 tgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  14746438 tgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 14746520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 19020119 - 19020009
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    ||||||||||||||||   |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  19020119 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 19020020  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     | ||||||||    
T  19020019 attaaattact 19020009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 124
Target Start/End: Original strand, 19698032 - 19698082
Alignment:
Q  74 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19698032 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 19698082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 124
Target Start/End: Original strand, 19708617 - 19708667
Alignment:
Q  74 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19708617 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 19708667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 310
Target Start/End: Original strand, 53082089 - 53082142
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 310  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  53082089 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 53082142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Original strand, 18215093 - 18215177
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  18215093 attgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagcatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 18215177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21183 - 20859
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21183 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 21084  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21083 aacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 20984  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20983 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 20884  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20883 tgaattatatgtgaataattgagac 20859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 38257 - 37933
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38257 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 38158  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38157 aatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 38058  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38057 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 37958  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  37957 tgaattatatgtgaataattgagac 37933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 38421 - 38308
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacg 129  Q
    |||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||||||    
T  38421 taaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacg 38322  T
Q  130 taggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||    
T  38321 taggtcacagtgaa 38308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 108)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 456757 - 456433
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456757 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 456658  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  456657 aatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 456558  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  456557 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 456458  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  456457 tgaattatatgtgaataattgagac 456433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27217296 - 27216972
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217296 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 27217197  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27217196 aatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 27217097  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27217096 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 27216997  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27216996 tgaattatatgtgaataattgagac 27216972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16232956 - 16232632
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16232956 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgaattcaaaaggatttatag 16232857  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16232856 aatttgagttattgtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 16232757  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16232756 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 16232657  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16232656 tgaattatatgtgaataattgagac 16232632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 41523353 - 41523029
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523353 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 41523254  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41523253 aatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 41523154  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41523153 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 41523054  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  41523053 tgaattatatgtgaataattgagac 41523029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 41525815 - 41525491
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525815 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 41525716  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41525715 aatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 41525616  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41525615 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 41525516  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  41525515 tgaattatatgtgaataattgagac 41525491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 15376440 - 15376763
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376440 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 15376539  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  15376540 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 15376638  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15376639 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 15376738  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15376739 tgaattatatgtgaataattgagac 15376763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 20384850 - 20385173
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20384850 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 20384949  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  20384950 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 20385048  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20385049 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 20385148  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20385149 tgaattatatgtgaataattgagac 20385173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 14948849 - 14949172
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14948849 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 14948948  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  14948949 aactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 14949047  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14949048 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 14949147  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14949148 tgaattatatgtgaataattgagac 14949172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16214120 - 16213796
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16214120 attgattgatacagaattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatag 16214021  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16214020 aacttgagttatggtcaaatgactgcacgtaggtcacagtgaataattgaataagattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 16213921  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16213920 tgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttcatatgttgattaccatttgatgttgttatgttgtgatataattatatatgcattact 16213821  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  16213820 tgaattatatgtgaataattaagac 16213796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 32125926 - 32125603
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125926 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 32125827  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  32125826 aactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 32125728  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32125727 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 32125628  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  32125627 tgaattatatgtgaataattgagac 32125603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11303683 - 11303409
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11303683 attgattggtacataattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 11303584  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11303583 aatttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatat 11303484  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11303483 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 11303409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Original strand, 21189326 - 21189645
Alignment:
Q  5 attggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 104  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189326 attggtacagagttggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagctttttaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 21189425  T
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtc 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21189426 tgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtata-gtttgtgaatacgatattgtc 21189524  T
Q  205 aatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 304  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21189525 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 21189624  T
Q  305 ttatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21189625 ttatatgtgaataattgagac 21189645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 30 - 325
Target Start/End: Original strand, 11393042 - 11393337
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacg 129  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  11393042 taaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacg 11393141  T
Q  130 taggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgta 229  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11393142 taggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgta 11393241  T
Q  230 tatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393242 tatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 11393337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16410494 - 16410171
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410494 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 16410395  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||||||    
T  16410394 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatcaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 16410296  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||    
T  16410295 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactatgatataattgtatatgtattact 16410196  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16410195 tgaattatatgtgaataattgagac 16410171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13869784 - 13869459
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869784 attgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 13869685  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13869684 aacttgagttatggttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 13869585  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattac 299  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |     
T  13869584 tgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaa 13869485  T
Q  300 ttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||  ||||| | ||||||||||||||    
T  13869484 ttagattatctttgaataattgagac 13869459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18640707 - 18640384
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640707 attgattggcacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttataatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 18640608  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  18640607 aacttgatttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattactatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 18640509  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18640508 tttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattattttatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 18640409  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18640408 tgaattatatgtgaataattgagac 18640384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 23664679 - 23664952
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23664679 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 23664778  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23664779 aacttgagttatggtcaaattattgcatgtaggtcacagtgaagaattgttgatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatat 23664878  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23664879 tgtcaatgattgatgaaaggttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 23664952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 16108415 - 16108688
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16108415 attgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgctgttggtttgacttcaaaatgatttatag 16108514  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  16108515 aacttgagttatggtcaaattactacacgtacgtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacaatat 16108614  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16108615 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccgtttgatgttgttatat 16108688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24702664 - 24702350
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702664 attggttggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 24702565  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||          |||||||||||||| ||||||||    
T  24702564 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaatta----------gtatatgtttgtgaatacgatat 24702475  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24702474 tgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 24702375  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24702374 tgaattatatgtgaataattgagac 24702350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24705111 - 24704797
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24705111 attggttggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 24705012  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||          |||||||||||||| ||||||||    
T  24705011 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaatta----------gtatatgtttgtgaatacgatat 24704922  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24704921 tgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 24704822  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24704821 tgaattatatgtgaataattgagac 24704797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 18431147 - 18430825
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18431147 attgattggtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatcttaggtttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 18431048  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||  || |||||| |||||  | |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  18431047 aactagagttatagtcaaattactgcacgtagaacatagtgaataattgaatctgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 18430949  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  18430948 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 18430849  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18430848 tgaattatatgtgaataattgaga 18430825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29797046 - 29796771
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29797046 attgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatag 29796947  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29796946 aacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatat 29796847  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat--atatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29796846 tgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29796771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29800865 - 29800590
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29800865 attgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatag 29800766  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29800765 aacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatat 29800666  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat--atatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29800665 tgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29800590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 26355708 - 26356033
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355708 attgattggtacagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 26355807  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  26355808 aacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaaatacgatat 26355906  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg--tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 298  Q
    |||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26355907 tgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcatta 26356006  T
Q  299 cttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  26356007 cttgaattatatgtgaataattgagac 26356033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 26358160 - 26358485
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26358160 attgattggtacagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 26358259  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  26358260 aacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaaatacgatat 26358358  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg--tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 298  Q
    |||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26358359 tgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcatta 26358458  T
Q  299 cttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  26358459 cttgaattatatgtgaataattgagac 26358485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18628001 - 18627717
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18628001 attgattggcacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 18627902  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  18627901 aacttgatttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 18627803  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 286  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18627802 tttccgtgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattagtatttgatcttgttatattgtgatataatt 18627717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 14269683 - 14269909
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14269683 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggttcgacttcaaaaggatttatag 14269782  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14269783 aaattgagttatggtcaaatttttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 14269882  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  14269883 tgttcatgattgatgaagtgttatatg 14269909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 15081568 - 15081794
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15081568 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatag 15081667  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15081668 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtctaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatat 15081767  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  15081768 tgttcatgattgatgaagtgttatatg 15081794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8940719 - 8940489
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacac----gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 96  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940719 attgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 8940620  T
Q  97 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||     
T  8940619 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatact 8940520  T
Q  197 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8940519 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 8940489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 45847381 - 45847605
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  45847381 attgattggtacaaaattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaactctgttagtttgacttcaaaatgatttatag 45847480  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  45847481 aacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtctgtgaatacgatat 45847580  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttata 225  Q
    |||  ||||||||||||||||||||    
T  45847581 tgttcatgattgatgaagtgttata 45847605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8469159 - 8468945
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8469159 agaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttagttttctaatgacgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 8469060  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattg 212  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||    
T  8469059 gatcaaattactgcatgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttttgaatacgatattgttcatgattg 8468960  T
Q  213 atgaagtgttatatg 227  Q
    ||||| |||||||||    
T  8468959 atgaaatgttatatg 8468945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 11972785 - 11972608
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11972785 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgcccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaaga 11972687  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972686 tattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 11972608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11972972 - 11972755
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11972972 agaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatctatagaacttgagttat 11972873  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattg 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||| ||| ||||  |||||||    
T  11972872 agtcaaattactgtacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgcatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattg 11972773  T
Q  213 atgaagtgttatatgtat 230  Q
    ||||| |  |||||||||    
T  11972772 atgaattagtatatgtat 11972755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Original strand, 15081820 - 15081999
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaa-- 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       
T  15081820 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagtt 15081918  T
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15081919 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagac 15081999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13841446 - 13841274
Alignment:
Q  45 taggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaag 144  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13841446 taggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 13841347  T
Q  145 aattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaa 217  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  13841346 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 13841274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 38897773 - 38897903
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  38897773 agaattggtcttaggtgtaaactcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttat 38897872  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38897873 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 38897903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 14269297 - 14269439
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  14269297 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgatgtcaaaacgatttatag 14269396  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269397 aacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 14269439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 25926856 - 25926998
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| || ||||||    
T  25926856 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaaagagttatag 25926955  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25926956 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 25926998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 14156612 - 14156754
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14156612 attgatcggtacagaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 14156711  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14156712 aacttgacttatgatcaaattaccgcatgtaggtcacagtgaa 14156754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 147 - 274
Target Start/End: Original strand, 14269935 - 14270061
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269935 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 14270033  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||    
T  14270034 tgttgattattatttgatgttgttatat 14270061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 8940911 - 8940770
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||| || | |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  8940911 attgattgatacataattggtcttaggtgtaaacaa-aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatag 8940813  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940812 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 8940770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 10501120 - 10501262
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10501120 attgattgatacagagttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtttgacttcaaatggatttatag 10501219  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  10501220 aacttgagttatggtcaaattactgcacgaaggtcatagtgaa 10501262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16214301 - 16214171
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16214301 agaattggtcttaggtgtaaacacaaaggttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttat 16214202  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16214201 ggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaa 16214171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 14156805 - 14156943
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14156805 attgattggtacaaaattggtcttaggta----cactaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatag 14156900  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14156901 aacgtgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 14156943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 143
Target Start/End: Original strand, 21189143 - 21189271
Alignment:
Q  15 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21189143 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttttaatgccgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 21189242  T
Q  115 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21189243 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaa 21189271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 138
Target Start/End: Original strand, 15081389 - 15081512
Alignment:
Q  15 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 114  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15081389 aattggtcttagaagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 15081488  T
Q  115 tcaaattactgcacgtaggtcaca 138  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  15081489 ttaaattactgcacgtaggtcaca 15081512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 1856956 - 1857097
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||     
T  1856956 attgattggtaccgaattggtcttaggtgtaaacacgaa-gttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcattggtctgacgtcaaaacgatttatat 1857054  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1857055 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 1857097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 8941093 - 8940963
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8941093 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgaagtcaaaatgatttatagaacttgagttat 8940994  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    | ||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  8940993 gctcaaactactgcacataggtcgcagtgaa 8940963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 14269490 - 14269632
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  14269490 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttggtatgacgtcaaaaaaatttatag 14269589  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  14269590 aacttgagttatcatcaaattattgcacgcaggtcagagtgaa 14269632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 13918129 - 13918272
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtctt-aggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttata 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  13918129 attgattggtacagaattggtctttaggtgtaaacacgaaaactgtaggtatgaatgttagctttctaattccattggtctgacgtcaaaacgatttata 13918228  T
Q  100 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13918229 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 13918272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 10500954 - 10501064
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10500954 attgatcggtacagaattggtcttaggtgataacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 10501053  T
Q  101 aacttgagtta 111  Q
    |||||||||||    
T  10501054 aacttgagtta 10501064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 178 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13841270 - 13841157
Alignment:
Q  178 gtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgt 277  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13841270 gtatatgttt-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgt 13841172  T
Q  278 gatataattatatat 292  Q
    ||||||||| |||||    
T  13841171 gatataattgtatat 13841157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 147 - 254
Target Start/End: Original strand, 45847633 - 45847739
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  45847633 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatatgatg-tttaaga 45847731  T
Q  247 tgttgatt 254  Q
    ||||||||    
T  45847732 tgttgatt 45847739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 147 - 274
Target Start/End: Original strand, 38898101 - 38898229
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--a 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       
T  38898101 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagtt 38898199  T
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38898200 gatgttgattatcatttgatgttgttatat 38898229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 147 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8940463 - 8940335
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--a 244  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       
T  8940463 ttgtttatgattgatgaattagtatatttatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagtt 8940365  T
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8940364 gatgttgattatcatttgatgttgttatat 8940335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 17985111 - 17985253
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||||| | ||||| ||| | |||    
T  17985111 attgatcggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtaaggatgttaaatttctaatggagttggtttgattccaaaatgatatttag 17985210  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17985211 aacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcatagtgaa 17985253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Original strand, 45847217 - 45847330
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacg 129  Q
    |||||| ||||||||||| ||    ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45847217 taaacatgaaagttgtagataattgtgttaactttctaatgtcgttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacg 45847316  T
Q  130 taggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||    
T  45847317 taggtcacagtgaa 45847330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 186 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8468891 - 8468803
Alignment:
Q  186 ttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8468891 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttatgatgttgattattatttgatgttgttatat 8468803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13647521 - 13647441
Alignment:
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647521 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 13647441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 260 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20110723 - 20110658
Alignment:
Q  260 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110723 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 20110658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Original strand, 12756654 - 12756721
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12756654 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagac 12756721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Original strand, 17061898 - 17061965
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17061898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagac 17061965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 44116688 - 44116621
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44116688 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagac 44116621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 11310327 - 11310241
Alignment:
Q  57 ttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11310327 ttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaa 11310241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 227
Target Start/End: Original strand, 38898000 - 38898075
Alignment:
Q  152 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38898000 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 38898075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 259 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3386511 - 3386445
Alignment:
Q  259 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386511 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagac 3386445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 324
Target Start/End: Original strand, 38898359 - 38898425
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  38898359 atttgacgttgttatactgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 38898425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 11287046 - 11286976
Alignment:
Q  54 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11287046 atgttagctttctaatggctttggtttgtcttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 11286976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 126034 - 125965
Alignment:
Q  55 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  126034 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgagttttagaacttgagttatgatcaaattact 125965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Original strand, 15376276 - 15376389
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacg 129  Q
    |||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||||||    
T  15376276 taaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacg 15376375  T
Q  130 taggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||    
T  15376376 taggtcacagtgaa 15376389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Original strand, 20384686 - 20384799
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacg 129  Q
    |||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||||||    
T  20384686 taaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacg 20384785  T
Q  130 taggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||    
T  20384786 taggtcacagtgaa 20384799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 324
Target Start/End: Original strand, 19486681 - 19486748
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  19486681 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgaga 19486748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16410583 - 16410545
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410583 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 16410545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18628090 - 18628052
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18628090 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 18628052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18640796 - 18640758
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640796 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 18640758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Original strand, 26355619 - 26355657
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355619 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 26355657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Original strand, 26358071 - 26358109
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26358071 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 26358109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275283
Alignment:
Q  288 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 24275283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 324
Target Start/End: Original strand, 2280056 - 2280123
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  2280056 atttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgaga 2280123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 7822123 - 7822013
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  7822123 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 7822024  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  7822023 atcaaattact 7822013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 7829434 - 7829324
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  7829434 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 7829335  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  7829334 atcaaattact 7829324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13869872 - 13869834
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13869872 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 13869834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 124
Target Start/End: Original strand, 15951637 - 15951703
Alignment:
Q  58 tagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  15951637 tagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 15951703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 27102511 - 27102621
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  27102511 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 27102610  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  27102611 atcaaattact 27102621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 27109859 - 27109969
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  27109859 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 27109958  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  27109959 atcaaattact 27109969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 27175815 - 27175705
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  27175815 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 27175716  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  27175715 atcaaattact 27175705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 27217385 - 27217347
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27217385 tgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaa 27217347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 38784603 - 38784713
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  38784603 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 38784702  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  38784703 atcaaattact 38784713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 316
Target Start/End: Original strand, 12255730 - 12255787
Alignment:
Q  260 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaat 316  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  12255730 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaat 12255787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 310
Target Start/End: Original strand, 15008436 - 15008489
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 310  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15008436 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatat 15008489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 124
Target Start/End: Original strand, 15760779 - 15760848
Alignment:
Q  55 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  15760779 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 15760848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 310
Target Start/End: Original strand, 20220127 - 20220180
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 310  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20220127 atttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 20220180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Original strand, 14269881 - 14269965
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  14269881 attgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattaatatatgtat 14269965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Original strand, 15081766 - 15081850
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  15081766 attgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 15081850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Original strand, 38898047 - 38898131
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  38898047 attgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 38898131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8468973 - 8468902
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaa 217  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  8468973 attgttcatgattgatgaaatgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 8468902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8940517 - 8940446
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaa 217  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  8940517 attgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 8940446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20619614 - 20619575
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtt 186  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20619614 ttgtttatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 20619575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 456846 - 456808
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  456846 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacattgaa 456808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 112
Target Start/End: Original strand, 16202778 - 16202852
Alignment:
Q  38 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||  | ||||| ||||| |||||||||    
T  16202778 aaagttgtaggtagtgatgttagatttctaatggctttggttttacttcatgatgatttctagaatttgagttat 16202852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 47
Target Start/End: Original strand, 23461830 - 23461864
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtag 47  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23461830 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 23461864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 124
Target Start/End: Original strand, 32495066 - 32495160
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||| ||||||| ||||||   | |||| |||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  32495066 taaacatgaaagttttaggtaattaagttatctttctaatggctttggtttgatgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcatattact 32495160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 310
Target Start/End: Original strand, 1867932 - 1867985
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 310  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  1867932 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatat 1867985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 106
Target Start/End: Original strand, 10001000 - 10001076
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttg 106  Q
    |||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||    
T  10001000 taaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttg 10001076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15113114 - 15113066
Alignment:
Q  269 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaata 317  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  15113114 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaata 15113066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15116651 - 15116603
Alignment:
Q  269 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaata 317  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  15116651 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaata 15116603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 20110779 - 20110747
Alignment:
Q  15 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtag 47  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20110779 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 20110747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Original strand, 45847579 - 45847663
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  45847579 attgttcatgattgatgaagtgttatacgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattaatatatgtat 45847663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 96)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 30676436 - 30676760
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30676436 attgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaataatttatag 30676535  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30676536 aacttgagttatggtaaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 30676635  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676636 tgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 30676735  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  30676736 tgaattatatgtgaataattgagac 30676760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34963809 - 34963485
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34963809 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatag 34963710  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34963709 aacttgagttatggtcaaattactgcacatagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 34963610  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963609 tgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 34963510  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  34963509 tgaattatatgtgaataattgagac 34963485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12742753 - 12742429
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742753 attgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 12742654  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  12742653 aacttgagttatagtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgacct 12742554  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12742553 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 12742454  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  12742453 tgaattatatgtgaataattgagac 12742429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 1540638 - 1540961
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1540638 attgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 1540737  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  1540738 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 1540836  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1540837 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattact 1540936  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  1540937 tgaattatatgtgaataattgagac 1540961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8055465 - 8055141
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055465 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 8055366  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8055365 aatttgagttatggtcaaattactgaatgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 8055266  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8055265 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 8055166  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  8055165 tgaattatatgtgaataattgagac 8055141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24422982 - 24422659
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422982 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 24422883  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  24422882 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 24422784  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24422783 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 24422684  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24422683 tgaattatatgtgaataattgagac 24422659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 33862229 - 33861906
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33862229 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 33862130  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  33862129 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 33862031  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33862030 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 33861931  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  33861930 tgaattatatgtgaataattgagac 33861906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 33864713 - 33864390
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864713 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 33864614  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  33864613 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 33864515  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33864514 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 33864415  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  33864414 tgaattatatgtgaataattgagac 33864390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 18334319 - 18334642
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334319 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 18334418  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  18334419 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 18334517  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  18334518 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 18334617  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18334618 tgaattatatgtgaataattgagac 18334642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 26924367 - 26924690
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26924367 attgattggtacagaattgttcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatag 26924466  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  26924467 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtacgtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatat 26924565  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26924566 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtacatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 26924665  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26924666 tgaattatatgtgaataattgagac 26924690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 2290907 - 2291230
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2290907 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 2291006  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  2291007 aactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 2291105  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  2291106 tgtccatgactgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 2291205  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2291206 tgaattatatgtgaataattgagac 2291230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 25688934 - 25688614
Alignment:
Q  5 attggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 104  Q
    |||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  25688934 attggtaccgaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaaat 25688835  T
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  25688834 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtgacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatttttgtgaatacgatattgtc 25688735  T
Q  205 aatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 304  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25688734 catgattgaggaagtgttatatgtataaatgatgttttaagatgttgattaccatttggtgttgttatattgtgatatgattatatatgtattacttgaa 25688635  T
Q  305 ttatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25688634 ttatatgtgaataattgagac 25688614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22782658 - 22782339
Alignment:
Q  5 attggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  22782658 attggtacagaattggtcttaggtgtaagtaggaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaatt 22782559  T
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  22782558 tgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtc 22782460  T
Q  205 aatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 304  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22782459 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 22782360  T
Q  305 ttatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  22782359 ttatgtgtgaataattgagac 22782339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 19858649 - 19858969
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858649 attgattggtacataattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgt---ctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 19858745  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||| ||||||||    
T  19858746 aacttgagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgct-gtgaatacgatat 19858844  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19858845 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattgttatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 19858944  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  19858945 tgaattatatgtgaataattgagac 19858969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 28289063 - 28289334
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28289063 attgattggtacataattggtctcaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatag 28289162  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  28289163 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgag--cgatat 28289260  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28289261 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgtcgttatat 28289334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12942625 - 12942363
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||            |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12942625 attgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta------------agctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatag 12942538  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12942537 aacttgagttatggtcgaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatat 12942438  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12942437 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 12942363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 241
Target Start/End: Original strand, 17377576 - 17377814
Alignment:
Q  3 tgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaa 102  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17377576 tgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaagtatttatagaa 17377675  T
Q  103 cttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17377676 cttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaaatagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattg 17377775  T
Q  203 tcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 241  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17377776 ttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 17377814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 19847698 - 19847989
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847698 attgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgc----tagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 19847793  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19847794 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 19847893  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19847894 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg-------------------atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatt 19847974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1598492 - 1598266
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598492 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 1598393  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1598392 aacttgagtcatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatat 1598294  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgt 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1598293 tgtccatgattgatgaagtgttatatgt 1598266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23992846 - 23992604
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23992846 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctaatgttgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttat 23992747  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  23992746 ggtcaatttactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattg 23992648  T
Q  213 atgaagtgttatatgtatat---atgatgttttaagatgttgat 253  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  23992647 atgaagtgttatatgtatatatgatgatgttttaagatgttgat 23992604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25535843 - 25535641
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25535843 attgattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatag 25535744  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25535743 aacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 25535644  T
Q  201 tgt 203  Q
    |||    
T  25535643 tgt 25535641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18914364 - 18914142
Alignment:
Q  5 attggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 104  Q
    ||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18914364 attggtacataattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgctgttggtttaacttcaaaaggatgtatagaact 18914265  T
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  18914264 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtaaatacgatattgtt 18914165  T
Q  205 aatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  18914164 catgattgatgaagtgttatatg 18914142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 31630267 - 31630493
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31630267 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatagacgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatag 31630366  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31630367 aacttgagttatggtcaaattattgcacgtatgtcacaatgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 31630466  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||    
T  31630467 tgttcatgattgataaagtgttatatg 31630493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19005587 - 19005361
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005587 attgattggtacataattagtcttaggtgtaaacacaaaaattgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatag 19005488  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  19005487 aacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattactataggtatgtatatgtttgtgaatgcgatat 19005388  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||  || ||||||||| |||||||||    
T  19005387 tgttcataattgatgaaatgttatatg 19005361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19005335 - 19005158
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005335 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaaga 19005237  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005236 tgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 19005158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 169 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 25656897 - 25656741
Alignment:
Q  169 tatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25656897 tatatgtatgtatatatttgtgactacgatattgtccaagattgatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgttt 25656798  T
Q  269 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25656797 ttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagac 25656741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1598685 - 1598543
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  1598685 attgattggtacataaatggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacatcaaaacaatttatag 1598586  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598585 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 1598543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 1891 - 2033
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  1891 attgattggtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatag 1990  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1991 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 2033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 8850 - 8992
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  8850 attgattggtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatag 8949  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8950 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 8992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19005780 - 19005638
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19005780 attgattagtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacttcaaaacgatttatag 19005681  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005680 aacttgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 19005638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 19847505 - 19847647
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||    
T  19847505 attgattggtacataattggtcctaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattagtctgacgtcaaaacgatttatag 19847604  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847605 aacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 19847647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23415400 - 23415258
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  23415400 attgattggtacagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccattggtctgacgtcaaaacaatttatag 23415301  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23415300 aacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcactgtgaa 23415258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 27557158 - 27557016
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||  ||||||||    
T  27557158 attgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgttaaaacaatttatag 27557059  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27557058 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 27557016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 18914561 - 18914422
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||| ||||    
T  18914561 attgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaataccgttggtctgaagtcaaaacgattgatag 18914462  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 140  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18914461 aacttgagttatggtcaaagtactgcacgtaggtcacagt 18914422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 147 - 254
Target Start/End: Original strand, 31630519 - 31630626
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630519 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 31630618  T
Q  247 tgttgatt 254  Q
    ||||||||    
T  31630619 tgttgatt 31630626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 25689131 - 25688989
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||||    
T  25689131 attgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtcggacgtcaaaaaaatttatag 25689032  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  25689031 aacttgcgttatggtcatattactgcacgtaggtcatagtgaa 25688989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 147 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15875595 - 15875469
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15875595 ttgtttatgattgatgaattattatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtaaatgattaatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaaga 15875497  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||    
T  15875496 tgttgattattatttgatgttgttatat 15875469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 147 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18914116 - 18913994
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914116 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtta-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 18914018  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgtt 270  Q
    |||||||||  |||||||||||||    
T  18914017 tgttgattattatttgatgttgtt 18913994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 18914742 - 18914615
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18914742 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgtcgttggtctgacatcaaaaaaatttatagaacttgagttat 18914643  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914642 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 18914615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 26924174 - 26924313
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| ||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  26924174 attgattggtacagaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatag 26924273  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924274 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 26924313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1598866 - 1598736
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||| || || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  1598866 agaattggtcataagtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgacgttaaaacgatttatagaacttgagttat 1598767  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598766 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 1598736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 25689312 - 25689182
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25689312 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtgtggatgtcagcattctaatgacgttggtctgacatcaaaacaatttatagaacttgagttat 25689213  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25689212 ggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 25689182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 30676243 - 30676385
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  30676243 attgaatggtacataattggtcttaggtgataagactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgctctgacgtcaaaacgatttatag 30676342  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676343 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 30676385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 223 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1595763 - 1595661
Alignment:
Q  223 atatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattga 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1595763 atatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattga 1595664  T
Q  323 gac 325  Q
    |||    
T  1595663 gac 1595661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 139
Target Start/End: Original strand, 31630090 - 31630212
Alignment:
Q  17 ttggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtc 116  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31630090 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtc 31630189  T
Q  117 aaattactgcacgtaggtcacag 139  Q
    |||||||| || ||| |||||||    
T  31630190 aaattactacatgtatgtcacag 31630212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 143
Target Start/End: Original strand, 113 - 241
Alignment:
Q  15 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 114  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  113 aattggtcttaggtgtatacacgaaagttgaaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatataacttgagttatgg 212  T
Q  115 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  213 tcaaagtactgcacgtaggtcatagtgaa 241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 15892135 - 15892231
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattta 97  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892135 attgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattta 15892231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 25737247 - 25737129
Alignment:
Q  25 aggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  25737247 aggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacatgagttatggtcatattact 25737148  T
Q  125 gcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  25737147 gcatgtaggtcacagtgaa 25737129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 25755001 - 25754921
Alignment:
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25755001 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 25754921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Original strand, 22981321 - 22981415
Alignment:
Q  49 tatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22981321 tatggatgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 22981415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23807087 - 23806993
Alignment:
Q  49 tatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23807087 tatggatgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 23806993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15875737 - 15875621
Alignment:
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||          |||||||||||||| ||||||||    
T  15875737 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtaaataattgaatatgattgatgaatta----------gtatatgtttgtgaatacgatat 15875648  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  15875647 tgttcatgattgatgaagtgttatatg 15875621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18456898 - 18456831
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 18456831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 17883224 - 17883305
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17883224 attgattggtacagaattggtctttggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcattctaatgtcgttggtttga 17883305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 259 - 325
Target Start/End: Original strand, 3852001 - 3852067
Alignment:
Q  259 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3852001 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 3852067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 245 - 315
Target Start/End: Original strand, 20556864 - 20556934
Alignment:
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaa 315  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20556864 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa 20556934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 201 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18937321 - 18937252
Alignment:
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt 270  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18937321 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 18937252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 263 - 325
Target Start/End: Original strand, 16448514 - 16448576
Alignment:
Q  263 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16448514 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagac 16448576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 258 - 324
Target Start/End: Original strand, 8227448 - 8227515
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8227448 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 8227515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 16240406 - 16240296
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  16240406 gaattggacttcggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaggacttgagttatg 16240307  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  16240306 atcaaattact 16240296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 16556944 - 16557054
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16556944 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 16557043  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  16557044 atcaaattact 16557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 16633500 - 16633610
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16633500 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 16633599  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  16633600 atcaaattact 16633610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 16650174 - 16650284
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || || ||||||||||||||||    
T  16650174 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgaattttagaacttgagttatg 16650273  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  16650274 atcaaattact 16650284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 124
Target Start/End: Original strand, 19984134 - 19984228
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19984134 taaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatgactttggtttgacctccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 19984228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Original strand, 18334155 - 18334268
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacg 129  Q
    |||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||||||    
T  18334155 taaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacg 18334254  T
Q  130 taggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||    
T  18334255 taggtcacagtgaa 18334268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 24423146 - 24423033
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacg 129  Q
    |||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||||||    
T  24423146 taaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacg 24423047  T
Q  130 taggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||    
T  24423046 taggtcacagtgaa 24423033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 25904585 - 25904474
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagga-tttatagaacttgagttat 112  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || ||| |||||||||||||||    
T  25904585 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttat 25904486  T
Q  113 ggtcaaattact 124  Q
    | ||||||||||    
T  25904485 gatcaaattact 25904474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 25737078 - 25737028
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtat 51  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25737078 attgattggtacagaattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 25737028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 27654596 - 27654706
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  27654596 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 27654695  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     | ||||||||    
T  27654696 attaaattact 27654706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 33864802 - 33864764
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864802 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 33864764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 124
Target Start/End: Original strand, 35016043 - 35016113
Alignment:
Q  54 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35016043 atgttagctttctaatggctttgctttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 35016113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18462028 - 18461991
Alignment:
Q  288 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18462028 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 18461991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15875649 - 15875565
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  15875649 attgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattattatatgtat 15875565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 124
Target Start/End: Original strand, 22226608 - 22226679
Alignment:
Q  54 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagga-tttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22226608 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttatgatcaaattact 22226679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 124
Target Start/End: Original strand, 22593620 - 22593691
Alignment:
Q  53 gatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  22593620 gatgttagctttctaatggatttagtttgacttccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaattact 22593691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Original strand, 2290818 - 2290856
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2290818 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 2290856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 10488081 - 10487971
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  10488081 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 10487982  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  10487981 atcaaattact 10487971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 16377247 - 16377357
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  16377247 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 16377346  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  16377347 atcaaattact 16377357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 16384571 - 16384681
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  16384571 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 16384670  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  16384671 atcaaattact 16384681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 16826367 - 16826477
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||  |    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  16826367 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagacaattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 16826466  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     | ||||||||    
T  16826467 attaaattact 16826477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 124
Target Start/End: Original strand, 21776111 - 21776205
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  21776111 taaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgccaaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21776205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22782751 - 22782713
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22782751 tgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaa 22782713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Original strand, 26924085 - 26924123
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26924085 tgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaa 26924123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 1555596 - 1555527
Alignment:
Q  55 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  1555596 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 1555527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 124
Target Start/End: Original strand, 33315116 - 33315185
Alignment:
Q  55 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  33315116 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttaaaacttgagttatgatcaaattact 33315185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 43
Target Start/End: Original strand, 9045 - 9085
Alignment:
Q  3 tgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagtt 43  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9045 tgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 9085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 70
Target Start/End: Original strand, 10905420 - 10905460
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 70  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10905420 taaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatg 10905460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18914170 - 18914086
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  18914170 attgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 18914086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 19609690 - 19609582
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || |||  |||| ||||||||||| ||||    
T  19609690 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaataatttttagaacttgagatatg 19609591  T
Q  114 gtcaaatta 122  Q
     ||||||||    
T  19609590 atcaaatta 19609582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35056787 - 35056707
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| || ||| ||||  |||||||||||| | |||||||    
T  35056787 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgattatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 35056707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 8055554 - 8055516
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8055554 tgagttaaggtcaaattactgcacataggtcacagtgaa 8055516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23076915 - 23076862
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 310  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  23076915 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatat 23076862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25644487 - 25644446
Alignment:
Q  275 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaat 316  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  25644487 tgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaat 25644446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19005389 - 19005305
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| || ||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  19005389 attgttcataattgatgaaatgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 19005305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 20109322 - 20109255
Alignment:
Q  260 ttgatgttgtt-atattgtgatataat--tatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20109322 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgaga 20109255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Original strand, 31630465 - 31630549
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| ||||||||| || |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  31630465 attgttcatgattgataaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 31630549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 108)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 16413042 - 16413366
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16413042 attgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgacagttgtaggtatggatgttagcttgctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatag 16413141  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16413142 aacttgagttatggtcaaattacttcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 16413241  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413242 tgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 16413341  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16413342 tgaattatatgtgaataattgagac 16413366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1484837 - 1484514
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484837 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 1484738  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  1484737 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 1484639  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1484638 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 1484539  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  1484538 tgaattatatgtgaataattgagac 1484514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4483712 - 4483392
Alignment:
Q  5 attggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 104  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483712 attggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 4483613  T
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtc 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  4483612 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtc 4483513  T
Q  205 aatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 304  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4483512 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 4483413  T
Q  305 ttatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4483412 ttatatgtgaataattgagac 4483392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 14409171 - 14409494
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409171 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 14409270  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  14409271 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 14409369  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14409370 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 14409469  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14409470 tgaattatatgtgaataattgagac 14409494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 5853019 - 5853342
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853019 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 5853118  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  5853119 aactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 5853217  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5853218 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 5853317  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5853318 tgaattatatgtgaataattgagac 5853342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 24485770 - 24486093
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  24485770 attgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttataa 24485869  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24485870 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 24485969  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24485970 tgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttctaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 24486069  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  24486070 tgaattatatgtgaataattgaga 24486093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14824210 - 14823885
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14824210 attgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 14824111  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  14824110 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaaatacgatat 14824012  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg--tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 298  Q
    | || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14824011 tatccatgattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcatta 14823912  T
Q  299 cttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  14823911 cttgaattatatgtgaataattgagac 14823885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 4542100 - 4542423
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  4542100 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttcgcttgacttcaaaatgatttatag 4542199  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  4542200 aactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 4542298  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  4542299 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 4542398  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  4542399 tgaactatatgtgaataattgagac 4542423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22002188 - 22001865
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22002188 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagaatttatag 22002089  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  22002088 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacattgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 22001990  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22001989 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 22001890  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22001889 tgaattatatgtgaataattgagac 22001865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 20045922 - 20046245
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20045922 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttcacttcaaaaggatttatag 20046021  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||  |||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  20046022 aacttgagttatagtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 20046120  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20046121 tttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 20046220  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  20046221 tgaattatatgtaaataattgagac 20046245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15070996 - 15070671
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||     
T  15070996 attgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttaaaaatgatttatac 15070897  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15070896 aacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 15070797  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattac 299  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |     
T  15070796 tgtccatgattgatgaagttttatatgtatttatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattcagatataattgtatatgcatcaa 15070697  T
Q  300 ttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  15070696 ttagattatctgtgaataattgagac 15070671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 32122164 - 32121912
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32122164 attgattggtacagaattgttcttaggtgtaaacacgaatgttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaatgatttatag 32122065  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  32122064 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgcatatgtttgtgaatacgatat 32121965  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 253  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32121964 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 32121912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 18677791 - 18678043
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18677791 attgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaagaatttatag 18677890  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18677891 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatgtatatgtatatgtttgtgaatacgatat 18677990  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 253  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18677991 tatccatgattgatgaagtgttatatttatgtatgatgttttaagatgttgat 18678043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 27472143 - 27472395
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472143 attgattggtacataattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatag 27472242  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27472243 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 27472342  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 254  Q
    |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27472343 tgttcatgattgatgaagttttatatgtatatatgatg-tttaagatgttgatt 27472395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 38549731 - 38549957
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38549731 attgattggtaaagaattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaagatttatag 38549830  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38549831 aacttgagttatggtcaaaatactgcacgtatgtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 38549930  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||  |||||||||||| | |||||||    
T  38549931 tgttcatgattgatgaatttttatatg 38549957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16198330 - 16198115
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  16198330 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttggtttgactttaaaaatatttatag 16198231  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16198230 aacttgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 16198131  T
Q  201 tgtcaatgattgatga 216  Q
    |||  |||||||||||    
T  16198130 tgttcatgattgatga 16198115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 15202905 - 15203134
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15202905 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatag 15203004  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |    
T  15203005 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgt 15203104  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    | |  |||||||||||| |  |||||||||    
T  15203105 tatttatgattgatgaattagtatatgtat 15203134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 25657892 - 25658094
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25657892 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgtttgtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 25657991  T
Q  114 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattga 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||    
T  25657992 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatttgatattgttcatgattga 25658091  T
Q  214 tga 216  Q
    |||    
T  25658092 tga 25658094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 1326658 - 1326884
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||     
T  1326658 attgattggtacagaattggtcttaagtgtaaaaacgaaagttgtaggtatgaatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataa 1326757  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  1326758 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtacatgtttgtaaatacgatat 1326857  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  1326858 tgtttatgattgatgaagtgttatatg 1326884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20403516 - 20403339
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403516 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 20403418  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403417 tgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 20403339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 24049046 - 24048845
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24049046 attgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaacaatttatag 24048947  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24048946 aacttgagttatggtcaaattactgca-gtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 24048848  T
Q  201 tgt 203  Q
    |||    
T  24048847 tgt 24048845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 16401651 - 16401875
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16401651 attgattgatacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataa 16401750  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  16401751 aacttgagttatagtcagattacagcaggtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatactatat 16401850  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttata 225  Q
    |||  ||||||||||||||||||||    
T  16401851 tgttcatgattgatgaagtgttata 16401875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Original strand, 45290385 - 45290597
Alignment:
Q  18 tggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290385 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 45290484  T
Q  118 aattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaa 217  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||  ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  45290485 aattactgcacgtagatcatagtgaataattgaatatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 45290584  T
Q  218 gtgttatatgtat 230  Q
     |  |||||||||    
T  45290585 ttagtatatgtat 45290597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19896757 - 19896524
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896757 attgattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaaattgtaggtatgaattttaactttctagcgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 19896658  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| ||| |    
T  19896657 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatgtgattgatgaattaggatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgt 19896558  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatat 234  Q
    |||  |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  19896557 tgtttatgattgatgaattagtatatgtatatat 19896524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 150 - 325
Target Start/End: Original strand, 15203107 - 15203281
Alignment:
Q  150 tttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgt 249  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203107 tttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaataagatattatccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgt 15203205  T
Q  250 tgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203206 tgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 15203281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 19936634 - 19936850
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  19936634 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcattggtttgacttcaaaaggatttatag 19936733  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||          |||||||||||||| ||  ||||    
T  19936734 aacttgaggtatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgtttatgattgatgaatta----------gtatatgtttgtgaatattatat 19936823  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  19936824 tgttcatgattgatgaagtgttatatg 19936850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20403715 - 20403486
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20403715 attgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttgaaaaggatttatag 20403616  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |    
T  20403615 aacttgagttattgtcatattactgcgcgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgt 20403516  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  20403515 tgtttatgattgatgaattagtatatgtat 20403486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19896558 - 19896380
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttt-aag 245  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  19896558 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatatttttaag 19896460  T
Q  246 atgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896459 atgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 19896380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 147 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 32810220 - 32810054
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32810220 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaaga 32810122  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtga 314  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32810121 tgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 32810054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Original strand, 45290567 - 45290744
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290567 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 45290665  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45290666 tgttgattattatttgacgttgttatactgtgatataattgtatctgcattaattgaattatatgtgaataattgagac 45290744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 15202712 - 15202854
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15202712 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattggtttgacttcaaaagaatttatag 15202811  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202812 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 15202854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19896950 - 19896808
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19896950 attgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatag 19896851  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19896850 aacttgagttatggtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaa 19896808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 32122357 - 32122215
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  32122357 attgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatag 32122258  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32122257 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 32122215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 38549538 - 38549680
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38549538 attgattggtacagaattgatcttaggtataaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttttaattccgttggtttgacttcaaaatgatttatag 38549637  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549638 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 38549680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 14397467 - 14397609
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14397467 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagctgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttgtag 14397566  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14397567 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 14397609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 27471950 - 27472092
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  27471950 attgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatag 27472049  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472050 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 27472092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 20403908 - 20403766
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20403908 attgattgctacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaggatttatag 20403809  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403808 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 20403766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15071189 - 15071047
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  15071189 attgatcggtaaagaattgatcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatag 15071090  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15071089 aacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaa 15071047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 16401278 - 16401407
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16401278 agaattggt-ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttat 16401376  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16401377 ggtcaaattacagcacgtaggtcacagtgaa 16401407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 15202531 - 15202661
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15202531 agaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttat 15202630  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15202631 ggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 15202661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 16412849 - 16412991
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  16412849 attgattggtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaaagatttatag 16412948  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16412949 aacttgagttatggtcaaattactatacgtaggtcacagtgaa 16412991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 38549346 - 38549487
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  38549346 attgataggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctaatgtcgttggtatgacgtcaaaacgatttatag 38549445  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38549446 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg-cacagtgaa 38549487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Original strand, 19936876 - 19937055
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaa-- 244  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       
T  19936876 ttgttcatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagtt 19936974  T
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19936975 gatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataactgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattgagac 19937055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 45290274 - 45290389
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290274 attgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 45290373  T
Q  101 aacttgagttatggtc 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  45290374 aacttgagttatggtc 45290389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 16401458 - 16401588
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16401458 attgattggtacgtaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaacgccgttggtttgacttcaaaatgatttatag 16401557  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgta 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16401558 aacttgagttatggtcaaattacagcacgta 16401588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 24049227 - 24049104
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24049227 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttat 24049128  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  24049127 ggtcaaattactgcacgtaggtca 24049104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 147 - 254
Target Start/End: Original strand, 38549983 - 38550090
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549983 ttgtttatgattgatgaattagtatacgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 38550082  T
Q  247 tgttgatt 254  Q
    ||||||||    
T  38550083 tgttgatt 38550090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19897129 - 19897001
Alignment:
Q  15 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 114  Q
    |||||||||||| | |||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19897129 aattggtcttagctgtaaatacaaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 19897030  T
Q  115 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19897029 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 19897001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 19936453 - 19936583
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| || | | |||| |||||||||||||||||||||    
T  19936453 agaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtagctatggatattagctttctaattccgttggtctggcgttaaaacgatttatagaacttgagttat 19936552  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19936553 gctcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 19936583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 147 - 254
Target Start/End: Original strand, 20982599 - 20982710
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgt----tatatgtatatatgatgtttt 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||    
T  20982599 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatatatatgatgtttt 20982698  T
Q  243 aagatgttgatt 254  Q
    ||||||||||||    
T  20982699 aagatgttgatt 20982710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 147 - 274
Target Start/End: Original strand, 1326910 - 1327042
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgt------tatatgtatatatgatgtt 240  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||      |||||||||||| ||||||    
T  1326910 ttgtttatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatgtatatacgatgtt 1327008  T
Q  241 ttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    || ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1327009 ttgagatgttgattattatttgatgttgttatat 1327042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Original strand, 16401903 - 16402020
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--a 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |       
T  16401903 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgtttaagtt 16402001  T
Q  245 gatgttgattaccatttga 263  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  16402002 gatgttgattatcatttga 16402020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 227
Target Start/End: Original strand, 13425331 - 13425411
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13425331 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 13425411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 25484245 - 25484325
Alignment:
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25484245 gatgttgattatgatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 25484325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11361131 - 11361024
Alignment:
Q  15 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 114  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  11361131 aattggtcttaggtgtaaacacaaaacttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttaagttatag 11361032  T
Q  115 tcaaatta 122  Q
    | ||||||    
T  11361031 ttaaatta 11361024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 41598367 - 41598300
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598367 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 41598300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 227
Target Start/End: Original strand, 20982498 - 20982573
Alignment:
Q  152 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20982498 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 20982573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 325
Target Start/End: Original strand, 19801367 - 19801432
Alignment:
Q  260 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19801367 ttgatgttgttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 19801432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 258 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 26224098 - 26224032
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26224098 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgaga 26224032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 32810320 - 32810263
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 70  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32810320 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatg 32810263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 227
Target Start/End: Original strand, 13425241 - 13425305
Alignment:
Q  163 aattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13425241 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 13425305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 324
Target Start/End: Original strand, 13508022 - 13508089
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13508022 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgaga 13508089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 15319988 - 15320098
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15319988 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 15320087  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  15320088 atcaaattact 15320098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 15500357 - 15500467
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15500357 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 15500456  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  15500457 atcaaattact 15500467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 124
Target Start/End: Original strand, 24717726 - 24717820
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||| ||||||| ||||||   ||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24717726 taaacatgaaagttttaggtaattatgttagatttctaatgcctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 24717820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 29759498 - 29759429
Alignment:
Q  55 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29759498 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 29759429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 258 - 317
Target Start/End: Original strand, 13597554 - 13597614
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaata 317  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13597554 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaata 13597614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1485001 - 1484888
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacg 129  Q
    |||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||||||    
T  1485001 taaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacg 1484902  T
Q  130 taggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||    
T  1484901 taggtcacagtgaa 1484888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 124
Target Start/End: Original strand, 13663129 - 13663198
Alignment:
Q  55 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13663129 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 13663198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Original strand, 20045758 - 20045871
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacg 129  Q
    |||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||||||    
T  20045758 taaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacg 20045857  T
Q  130 taggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||    
T  20045858 taggtcacagtgaa 20045871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 124
Target Start/End: Original strand, 22007126 - 22007195
Alignment:
Q  55 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22007126 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 22007195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 324
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612114
Alignment:
Q  269 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 17612114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Original strand, 5852930 - 5852968
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5852930 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 5852968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Original strand, 14409082 - 14409120
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409082 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 14409120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 124
Target Start/End: Original strand, 17150655 - 17150725
Alignment:
Q  54 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  17150655 atgttagctttctaatggctttggttggacttccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 17150725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 22089372 - 22089482
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||| |  |||||||||||||||    
T  22089372 gaattggcctttggtttaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatattaagaacttgagttatg 22089471  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  22089472 atcaaattact 22089482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Original strand, 1326856 - 1326940
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| | | ||||  |||||||||||| || |||||||||    
T  1326856 attgtttatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgcttttgtttatgattgatgaattggtatatgtat 1326940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20498746 - 20498687
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaat 316  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20498746 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaat 20498687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 124
Target Start/End: Original strand, 21493050 - 21493137
Alignment:
Q  37 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||   |||| |||||| |||||||    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21493050 gaaagttgaagatatggatgttagctttcatttgccattggttggacttcatttagatttatagaacttgagttatgatcaaaatact 21493137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 217
Target Start/End: Original strand, 38549929 - 38550000
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaa 217  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  38549929 attgttcatgattgatgaatttttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 38550000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 223304 - 223414
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  223304 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 223403  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     | ||||||||    
T  223404 attaaattact 223414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 272163 - 272273
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  272163 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 272262  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  272263 atcaaattact 272273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 643686 - 643576
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  643686 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 643587  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  643586 atcaaattact 643576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 688075 - 688185
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  688075 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 688174  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     | ||||||||    
T  688175 attaaattact 688185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 736927 - 737037
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  736927 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 737026  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     | ||||||||    
T  737027 attaaattact 737037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 829492 - 829382
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  829492 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 829393  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  829392 atcaaattact 829382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 860822 - 860932
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  860822 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 860921  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     | ||||||||    
T  860922 attaaattact 860932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 4483804 - 4483766
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4483804 tgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaa 4483766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 14824299 - 14824261
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14824299 tgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaa 14824261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22147087 - 22146977
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    ||||||||||||  || | |||||||||| || |||  |||| ||||||||||||||||    
T  22147087 gaattggactttggtataaacatgaaagttttagataattgtgttagctttcttttggctttggtttgacgtccaaataatttttagaacttgagttatg 22146988  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  22146987 atcaaattact 22146977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 274
Target Start/End: Original strand, 35026849 - 35026895
Alignment:
Q  228 tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  35026849 tatatatgatgttttaagatgttgattatcgtttgatattgttatat 35026895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 39114485 - 39114415
Alignment:
Q  54 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39114485 atgttagttttctaatggctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcagattact 39114415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Original strand, 13425277 - 13425361
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  13425277 attgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 13425361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 227
Target Start/End: Original strand, 18815603 - 18815683
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||  ||| || ||| ||||  |||||||||||||| |||||||    
T  18815603 ttgttcatgattgatgaattattatgtgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 18815683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Original strand, 19936822 - 19936906
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  19936822 attgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgttcatgattgatgaattagtatatgtat 19936906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Original strand, 20982545 - 20982629
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  20982545 attgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 20982629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 217
Target Start/End: Original strand, 13425383 - 13425454
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaa 217  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  13425383 attgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 13425454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 156 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21513707 - 21513636
Alignment:
Q  156 attgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| || ||| ||||  |||||||||||||| |||||||    
T  21513707 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 21513636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 274
Target Start/End: Original strand, 2418860 - 2418906
Alignment:
Q  228 tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  2418860 tatatatgatgtttcaagatgttgattatcgtttgatattgttatat 2418906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 18612002 - 18611952
Alignment:
Q  74 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18612002 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 18611952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 143
Target Start/End: Original strand, 16401186 - 16401215
Alignment:
Q  114 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401186 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 16401215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 18618899 - 18618830
Alignment:
Q  55 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| | || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  18618899 tgttagctttctaatggctttggtttgccgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 18618830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 37116532 - 37116479
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 310  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  37116532 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatat 37116479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 186
Target Start/End: Original strand, 6573736 - 6573776
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtt 186  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  6573736 attgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 6573776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Original strand, 16401849 - 16401933
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  16401849 attgttcatgattgatgaagtgttatacgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 16401933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 19866548 - 19866496
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttga 82  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | |||||||||    
T  19866548 taaacatgaaagttgtaggtatgaaagttagatttctaatggctttggtttga 19866496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Original strand, 24678772 - 24678828
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttc 86  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||   |||||||||||||    
T  24678772 taaacatgaaagttgtaggtatggaagttaaatttctaatgaatttggtttgacttc 24678828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 227
Target Start/End: Original strand, 36733296 - 36733376
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||  ||| || ||| || |  |||||||||||||| |||||||    
T  36733296 ttgttcatgattgatgatttattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtttttcatgattgatgaagtattatatg 36733376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 111)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 45606633 - 45606957
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606633 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 45606732  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45606733 aatttgagttatggtcaaattactgaatgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 45606832  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45606833 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 45606932  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  45606933 tgaattatatgtgaataattgagac 45606957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13544459 - 13544137
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544459 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 13544360  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13544359 aacttgagttatagtcaaat-actgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatat 13544262  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544261 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 13544162  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13544161 tgaattatatgtgaataattgagac 13544137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 7781073 - 7781397
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781073 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaacgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 7781172  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7781173 aacttgagttatggtcaaattactgaacataggtcacagtgaataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 7781272  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7781273 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 7781372  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  7781373 tgaattatatgtgaataattgagac 7781397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12567995 - 12567672
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12567995 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatag 12567896  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12567895 aacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatat 12567797  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567796 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 12567697  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  12567696 tgaattatatgtgaataattgagac 12567672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17463613 - 17463290
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463613 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 17463514  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  17463513 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 17463415  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17463414 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 17463315  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  17463314 tgaattatatgtgaataattgagac 17463290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 54521258 - 54520985
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54521258 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtgggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 54521159  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  54521158 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatat 54521059  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54521058 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 54520985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34159761 - 34159438
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159761 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 34159662  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  34159661 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 34159563  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  34159562 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 34159463  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  34159462 tgaattatatgtgaataattgagac 34159438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 13153982 - 13154305
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13153982 attgattggtacagaattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatag 13154081  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  13154082 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 13154180  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  13154181 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 13154280  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13154281 tgaattatatgtgaataattgagac 13154305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 27165688 - 27165364
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27165688 attgattggtacagaattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatcttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatag 27165589  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27165588 aacttgagttatgatcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 27165489  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  27165488 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatac 27165389  T
Q  300 ttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    || |||||||| |||||| ||||||    
T  27165388 ttaaattatatatgaatatttgaga 27165364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 53301230 - 53301554
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53301230 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 53301329  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53301330 aatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 53301429  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattac 299  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | | |||    
T  53301430 tgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccattttatgttgtttatattgtgatataattgtatacgtaatac 53301529  T
Q  300 ttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||    
T  53301530 ttgaattatatatgaatatttgaga 53301554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 55476926 - 55476603
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476926 attgactggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 55476827  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  55476826 aactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 55476728  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  55476727 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 55476628  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  55476627 tgaattatatgtgaataattgagac 55476603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 16454007 - 16454331
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaa-ggatttata 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16454007 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatggatttata 16454106  T
Q  100 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgata 199  Q
    |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  16454107 gaactatagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgata 16454205  T
Q  200 ttgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattac 299  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16454206 ttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattac 16454305  T
Q  300 ttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16454306 ttgaattatatgtgaataattgagac 16454331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 6468861 - 6469184
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6468861 attgattggtacagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttggaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatag 6468960  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  6468961 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 6469059  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6469060 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 6469159  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    | |||||||||||| ||||||||||    
T  6469160 tcaattatatgtgactaattgagac 6469184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8499956 - 8499631
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499956 attgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatatggaagttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 8499857  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8499856 aacttgagttatggtgaaattacggaacataggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 8499757  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattac 299  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  8499756 tgtccatgattaatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattaa 8499657  T
Q  300 ttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  8499656 ttagattatctgtgaataattgagac 8499631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15412867 - 15412542
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412867 attgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 15412768  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15412767 aacttgatttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgtataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 15412668  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattac 299  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |     
T  15412667 tgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaa 15412568  T
Q  300 ttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  15412567 ttagattatctgtgaataattgagac 15412542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 10247450 - 10247773
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10247450 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatag 10247549  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||| ||| || || |||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  10247550 aacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatat 10247648  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10247649 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 10247748  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10247749 tgaattatatgtgaataattgagac 10247773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Original strand, 29544568 - 29544839
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29544568 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgatttcaaaagaatttatag 29544667  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  | |||||    
T  29544668 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatctatatatttgttaaaatgatat 29544767  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttat 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29544768 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttat 29544839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 13151517 - 13151840
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13151517 attgattggaacagaattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatag 13151616  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||| ||||||||    
T  13151617 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaaggtatatg-ttgtgaatacgatat 13151715  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  13151716 tgtccatgcctgatgaagtgtgatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 13151815  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13151816 tgaattatatgtgaataattgagac 13151840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 46822697 - 46822445
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822697 attgattggtaaacaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 46822598  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46822597 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 46822498  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 253  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46822497 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 46822445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 28848348 - 28848661
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848348 attgattggtactgaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 28848447  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||           |||||| ||||||||    
T  28848448 aactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg-----------ttgtgaatacgatat 28848536  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  28848537 tttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattact 28848636  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  28848637 tgaattatatgtgaataattgagac 28848661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15977968 - 15977696
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15977968 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatag 15977869  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  15977868 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 15977770  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  15977769 tgtccatgattgataaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatat 15977696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 66 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12305516 - 12305315
Alignment:
Q  66 taatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12305516 taatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaat 12305417  T
Q  166 taatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatg 265  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12305416 taatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatg 12305317  T
Q  266 tt 267  Q
    ||    
T  12305316 tt 12305315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10557344 - 10557091
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  10557344 attgattggtaaataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttagttttacttcaaaaggatttatag 10557245  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10557244 aacttgagttatggtcagattactgcacataggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaattcgatat 10557145  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 254  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10557144 tgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttgagatgttgatt 10557091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 227
Target Start/End: Original strand, 12119392 - 12119606
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119392 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 12119491  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattg 212  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  12119492 agtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattg 12119591  T
Q  213 atgaagtgttatatg 227  Q
    ||||||| |||||||    
T  12119592 atgaagtattatatg 12119606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13436735 - 13436520
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436735 attgattggtacataattggtcttaggtataaatacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 13436636  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  13436635 aacttgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatat 13436536  T
Q  201 tgtcaatgattgatga 216  Q
    |||  |||||||||||    
T  13436535 tgttcatgattgatga 13436520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 41124375 - 41124146
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41124375 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgatttgacttcaaaaggatttatag 41124276  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||| ||| |    
T  41124275 aacttgagttatagtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaactagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgt 41124176  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  41124175 tgtttatgattgatgaattagtatatgtat 41124146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8899383 - 8899206
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899383 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 8899285  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899284 tgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 8899206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 151 - 325
Target Start/End: Original strand, 9707483 - 9707657
Alignment:
Q  151 ttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707483 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 9707582  T
Q  251 gattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707583 gattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 9707657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 38961564 - 38961794
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg-ccgttggtttgacttcaaaaggatttata 99  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961564 attgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagccttctaatggccgttggtttgacttcaaaaggatttata 38961663  T
Q  100 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgata 199  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||     
T  38961664 gaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatg 38961763  T
Q  200 ttgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  38961764 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 38961794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 325
Target Start/End: Original strand, 16282687 - 16282861
Alignment:
Q  150 tttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgt 249  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282687 tttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgt 16282785  T
Q  250 tgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282786 tgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 16282861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 16282484 - 16282686
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16282484 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatag 16282583  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |    
T  16282584 aacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgt 16282683  T
Q  201 tgt 203  Q
    |||    
T  16282684 tgt 16282686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 24514100 - 24513910
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24514100 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttat 24514001  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgt 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24514000 ggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgt 24513910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 41124176 - 41123999
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124176 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattggtgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 41124078  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124077 tgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 41123999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 20629918 - 20630138
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629918 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 20630017  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgttta----tgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    ||||||||||| |  ||| || |||||||||||| |||||| |    
T  20630018 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattgatgaagtgttatctgaatgtatatgtttatgagtatg 20630117  T
Q  197 atattgtcaatgattgatgaa 217  Q
    || ||||  ||||||||||||    
T  20630118 atgttgtttatgattgatgaa 20630138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Original strand, 38961764 - 38961941
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38961764 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaaga 38961862  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961863 tgttggttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 38961941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 17444490 - 17444719
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17444490 attgattggtacagaattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttattg 17444589  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |    
T  17444590 aacttgagttatagtcaaatttttgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgt 17444689  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  17444690 tgtttatgattgatgaattagtatatgtat 17444719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25237279 - 25237063
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  25237279 attgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaacttcaaaaggatttatag 25237180  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |    
T  25237179 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgt 25237080  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaa 217  Q
    |||  ||||||||||||    
T  25237079 tgtttatgattgatgaa 25237063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25229692 - 25229476
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  25229692 attgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaacttcaaaaggatttatag 25229593  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |    
T  25229592 aacttgagttatagtcaaattactacacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgt 25229493  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaa 217  Q
    |||  ||||||||||||    
T  25229492 tgtttatgattgatgaa 25229476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15465590 - 15465448
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||    
T  15465590 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatag 15465491  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15465490 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 15465448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 55319030 - 55319172
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  55319030 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatag 55319129  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55319130 aacttgaattatggtcaaattactgcacgtaagtcacagtgaa 55319172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 10379763 - 10379615
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  10379763 attgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatag 10379664  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattg 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10379663 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattg 10379615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10557537 - 10557395
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  10557537 attgattggtacagaattggtcttagttgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtcggacgtcaaaacgatttatag 10557438  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557437 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 10557395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 27165881 - 27165739
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  27165881 attgatcggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatag 27165782  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165781 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 27165739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 26054991 - 26055133
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||    
T  26054991 attgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttggtctgacgtcaaaacgatttatag 26055090  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26055091 aacttgagttatggtaaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 26055133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 38961383 - 38961513
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  38961383 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttat 38961482  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38961483 ggtcaaattgctgcacgtaggtcacagtgaa 38961513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 41124568 - 41124426
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  41124568 attgattggtaaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatag 41124469  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124468 aacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 41124426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 8500149 - 8500009
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  8500149 attgatcgatatagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatag 8500050  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtg 141  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8500049 aacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcacagtg 8500009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 5223819 - 5223677
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||    
T  5223819 attgattggtacagaattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatag 5223720  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5223719 aacttgagttatgatcaaattactccacgtaggtcacagtgaa 5223677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 53301037 - 53301179
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  53301037 attgatcggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatag 53301136  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53301137 aacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaa 53301179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 55318849 - 55318979
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  55318849 agaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatggtagctttctaatgccgttggtatgacatcaaaacgatttatagaacttgagttat 55318948  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55318949 ggtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaa 55318979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 13937518 - 13937648
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  13937518 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgtgttat 13937617  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  13937618 ggtcaaattactgcacgtaggccacggtgaa 13937648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 14567430 - 14567560
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14567430 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctaacatcaaaaggatttatagaacttgagttat 14567529  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14567530 agtcaaattactacacgtaggtcacagtgaa 14567560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 46822890 - 46822748
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||| || | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||     
T  46822890 attgattgctacataattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataa 46822791  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46822790 aacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 46822748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 36528569 - 36528449
Alignment:
Q  23 ttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36528569 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaatta 36528470  T
Q  123 ctgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  36528469 ctgcacgtaggtcatagtgaa 36528449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 20629737 - 20629867
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||  |||||||||||||||||||||    
T  20629737 agaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacattaaagcgatttatagaacttgagttat 20629836  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20629837 ggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 20629867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 143
Target Start/End: Original strand, 16358234 - 16358343
Alignment:
Q  34 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  16358234 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaacggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcgcatagg 16358333  T
Q  134 tcacagtgaa 143  Q
    ||||| ||||    
T  16358334 tcacattgaa 16358343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 16282303 - 16282433
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||| || |||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16282303 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttatctttttaatgttgttagtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttat 16282402  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16282403 ggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 16282433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 147 - 274
Target Start/End: Original strand, 11913923 - 11914051
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--a 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       
T  11913923 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtacatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagtt 11914021  T
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11914022 gatgttgattatcatttgatgttgttatat 11914051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 17444309 - 17444439
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| | || ||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  17444309 agaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaagtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctaacgtcaaaacaatttatacaacttgagctat 17444408  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17444409 ggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 17444439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 234 - 325
Target Start/End: Original strand, 17446614 - 17446705
Alignment:
Q  234 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17446614 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagac 17446705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 143
Target Start/End: Original strand, 3264323 - 3264429
Alignment:
Q  37 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3264323 gaaagttgtaggtatggatgttagatttctaaggccgttgatttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtca 3264422  T
Q  137 cagtgaa 143  Q
    |||||||    
T  3264423 cagtgaa 3264429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17393344 - 17393202
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  17393344 attgatcggtacagaattggtcttagatgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttccaatggcgttggtttgactccaaaatgatttttag 17393245  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||| | |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  17393244 aacattagttatagtcaaattactacacataggtcatagtgaa 17393202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 50243014 - 50242934
Alignment:
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50243014 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 50242934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 147 - 232
Target Start/End: Original strand, 17444689 - 17444773
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatat 232  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17444689 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 17444773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 43550448 - 43550528
Alignment:
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550448 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagac 43550528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17672805 - 17672738
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17672805 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagac 17672738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Original strand, 53070636 - 53070703
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070636 atttgatgttgttagattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 53070703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 258 - 321
Target Start/End: Original strand, 17248224 - 17248287
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17248224 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaataattg 17248287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Original strand, 29172565 - 29172633
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172565 atttgatgttgatagtattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 29172633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15008052 - 15007989
Alignment:
Q  80 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15008052 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 15007989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25237080 - 25237009
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagt 219  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25237080 ttgtttatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 25237009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Original strand, 12119707 - 12119774
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  12119707 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagac 12119774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 15007935 - 15007868
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaa 68  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15007935 attgattggtacaaaattggttttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaa 15007868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 324
Target Start/End: Original strand, 24340660 - 24340727
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24340660 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgaga 24340727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25058408 - 25058286
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25058408 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatg 25058309  T
Q  114 gtcaaattactgcacgtaggtca 136  Q
     |||||||||| ||| |||||||    
T  25058308 atcaaattactacacataggtca 25058286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 258 - 324
Target Start/End: Original strand, 37642202 - 37642269
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  37642202 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 37642269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 124
Target Start/End: Original strand, 16934826 - 16934920
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16934826 taaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 16934920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 124
Target Start/End: Original strand, 51158683 - 51158753
Alignment:
Q  54 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  51158683 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 51158753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 34159925 - 34159812
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacg 129  Q
    |||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||||||    
T  34159925 taaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacg 34159826  T
Q  130 taggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||    
T  34159825 taggtcacagtgaa 34159812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 49231837 - 49231768
Alignment:
Q  55 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  49231837 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 49231768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 16358394 - 16358458
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttc 65  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  16358394 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttttagatatagatgttagctttc 16358458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 324
Target Start/End: Original strand, 22147474 - 22147529
Alignment:
Q  269 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22147474 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 22147529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 14528624 - 14528734
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||    
T  14528624 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggatttggtttgacttccaaatgatttttagaactttagttatg 14528723  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     | ||||||||    
T  14528724 attaaattact 14528734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17463702 - 17463664
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463702 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 17463664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 36528386 - 36528340
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 59  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36528386 agaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 36528340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 55477015 - 55476977
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55477015 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 55476977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 316
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051195
Alignment:
Q  260 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaat 316  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaat 2051195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 316
Target Start/End: Original strand, 52523666 - 52523723
Alignment:
Q  260 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaat 316  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52523666 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaat 52523723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 30152518 - 30152450
Alignment:
Q  56 gttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  30152518 gttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaatttgagttatgatcaaattact 30152450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21026183 - 21026092
Alignment:
Q  37 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcac 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||  ||| || ||| |  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21026183 gaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatggctttgttttgaagtcataatgatgttcagatcttgagttatgatcaaaatactgcac 21026092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 23274871 - 23274804
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23274871 atttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgaga 23274804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 122
Target Start/End: Original strand, 54039167 - 54039234
Alignment:
Q  55 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 122  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  54039167 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgatcaaatta 54039234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 1468613 - 1468723
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  1468613 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 1468712  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  1468713 atcaaattact 1468723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Original strand, 6468772 - 6468810
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6468772 tgagttatggtcaaattactgcacgtatgtcacagtgaa 6468810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 8276473 - 8276583
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  8276473 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtcgaaatgatttttagaacttgagatatg 8276572  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     | ||||||||    
T  8276573 attaaattact 8276583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15412955 - 15412917
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15412955 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 15412917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 124
Target Start/End: Original strand, 17956869 - 17956938
Alignment:
Q  55 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||| || ||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17956869 tgttagctttccaatggctttggtttgacatctaaatgatatttagaacttgagttatgatcaaattact 17956938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 10555810 - 10555766
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgt 45  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10555810 attgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 10555766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Original strand, 11913869 - 11913953
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  11913869 attgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 11913953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 217
Target Start/End: Original strand, 12119578 - 12119649
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaa 217  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  12119578 attgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatatttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 12119649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 49 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14263715 - 14263640
Alignment:
Q  49 tatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    ||||||||||||||||||   |   ||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14263715 tatggatgttagctttctttggggtttggtttgactccattatgatttctagaacttgagttatggtcaaattact 14263640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 2281094 - 2281000
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||| ||| | | ||||||||||||||  |  |||| || ||||||||||||| | ||||||||    
T  2281094 taaacatgaaagttttaggtatgtatgttacctttgtaaaggctttggtttgacttcattattatttctataacttgagttatgattaaattact 2281000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 59
Target Start/End: Original strand, 3264488 - 3264538
Alignment:
Q  9 gtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 59  Q
    ||||||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||    
T  3264488 gtatagaattgatcttaggtgtcttcacgaaagttgtaggtatggatgtta 3264538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 8269362 - 8269472
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | | |||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  8269362 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggcttgggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 8269461  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     | ||||||||    
T  8269462 attaaattact 8269472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 12808615 - 12808505
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||| |||| |  || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  12808615 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttagtttcaggtccaaacgatttttagaacttgagatatg 12808516  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     | ||||||||    
T  12808515 attaaattact 12808505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Original strand, 13151428 - 13151466
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13151428 tgagttaaggtcaaattactgcacataggtcacagtgaa 13151466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Original strand, 13153893 - 13153931
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13153893 tgagttaaggtcaaattactgcacataggtcacagtgaa 13153931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15977700 - 15977663
Alignment:
Q  228 tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatg 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15977700 tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatg 15977663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 8023858 - 8023778
Alignment:
Q  54 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggt 134  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||| ||||| ||||  |||||||||| | ||| |||| || ||||||    
T  8023858 atgttagctttctaatggcttgggtttgacttaaaaatgatttctagattttgagttatgatgaaaatactacaagtaggt 8023778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 187
Target Start/End: Original strand, 20630121 - 20630160
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgttt 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20630121 ttgtttatgattgatgaattagtatatgt-tgtatatgttt 20630160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25201403 - 25201323
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||| || ||||||||  |||||| ||||| | |||||||    
T  25201403 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatattgatgaatatgatattgttcatgattaatgaattattatatg 25201323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 113)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23131298 - 23130974
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131298 attgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 23131199  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  23131198 aacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatat 23131099  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  23131098 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 23130999  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23130998 tgaattatatgtgaataattgagac 23130974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23133765 - 23133441
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133765 attgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 23133666  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  23133665 aacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatat 23133566  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  23133565 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 23133466  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23133465 tgaattatatgtgaataattgagac 23133441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 34402248 - 34402572
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402248 attgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 34402347  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  34402348 aacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatat 34402447  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  34402448 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 34402547  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  34402548 tgaattatatgtgaataattgagac 34402572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 39682749 - 39682425
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682749 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 39682650  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39682649 aatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 39682550  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39682549 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 39682450  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  39682449 tgaattatatgtgaataattgagac 39682425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20261655 - 20261381
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20261655 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 20261556  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20261555 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatat 20261456  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20261455 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 20261381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18809378 - 18809055
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809378 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 18809279  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  18809278 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 18809180  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18809179 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 18809080  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18809079 tgaattatatgtgaataattgagac 18809055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 23711740 - 23712063
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711740 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 23711839  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  23711840 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 23711938  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23711939 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 23712038  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23712039 tgaattatatgtgaataattgagac 23712063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28577534 - 28577211
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577534 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 28577435  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  28577434 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacaatat 28577336  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28577335 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 28577236  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  28577235 tgaattatatgtgaataattgagac 28577211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 571833 - 571509
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  571833 attgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacgtcaaaaggatttatag 571734  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  571733 aatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 571634  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  571633 tgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 571534  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  571533 tgaattatatgtgaacaattgagac 571509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 23709259 - 23709582
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709259 attgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgcagttggtttgacttcaaaaggatttatag 23709358  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  23709359 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 23709457  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23709458 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 23709557  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23709558 tgaattatatgtgaataattgagac 23709582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 24897922 - 24898245
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24897922 attgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatag 24898021  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  24898022 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 24898120  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24898121 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 24898220  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24898221 tgaattatatgtgaataattgagac 24898245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 24905359 - 24905682
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24905359 attgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatag 24905458  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  24905459 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 24905557  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24905558 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 24905657  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24905658 tgaattatatgtgaataattgagac 24905682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 24900405 - 24900728
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24900405 attgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatag 24900504  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||| ||||||||    
T  24900505 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatg-ttgtgaatacgatat 24900603  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24900604 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 24900703  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24900704 tgaattatatgtgaataattgagac 24900728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 24902882 - 24903205
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24902882 attgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatag 24902981  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||| ||||||||    
T  24902982 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatg-ttgtgaatacgatat 24903080  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24903081 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 24903180  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24903181 tgaattatatgtgaataattgagac 24903205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 24907834 - 24908157
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24907834 attgattggtacataattggtcataggtgtaaacatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatag 24907933  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  24907934 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 24908032  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24908033 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 24908132  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24908133 tgaattatatgtgaataattgagac 24908157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26505814 - 26505491
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26505814 attgattggtacagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatag 26505715  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  26505714 aactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 26505616  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26505615 tttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 26505516  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26505515 tgaattatatgtgaataattgagac 26505491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26508292 - 26507969
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  26508292 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaagaatttatag 26508193  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  26508192 aactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 26508094  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26508093 tttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 26507994  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26507993 tgaattatatgtgaataattgagac 26507969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 32214657 - 32214971
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  32214657 attgattggtacaaaattgttcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaatgatttatag 32214756  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||          |||||||||||||  ||||||||    
T  32214757 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta----------gtatatgtttgtgtatacgatat 32214846  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214847 tgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 32214946  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  32214947 tgaattatatgtgaataattgagac 32214971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 32039225 - 32039548
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039225 attgattggtaaaggattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaattttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 32039324  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |  |||||    
T  32039325 aatttaagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatctgatat 32039423  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32039424 tgtccatgatcgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 32039523  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  32039524 tgaattatatgtgaataattgagac 32039548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 10684489 - 10684764
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10684489 attgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 10684588  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10684589 aacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatat 10684688  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg--tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10684689 tgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 10684764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23136015 - 23135702
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23136015 attgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatcccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 23135916  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||           |||||| ||||||||    
T  23135915 aactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg-----------ttgtgaatacgatat 23135827  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  23135826 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgctgattatcatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattact 23135727  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23135726 tgaattatatgtgaataattgagac 23135702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 23706943 - 23707169
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23706943 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 23707042  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23707043 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatat 23707142  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  23707143 tgttcatgattgatgaagtgttatatg 23707169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 24529273 - 24529579
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529273 attgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 24529372  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
     ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24529373 cacttgagatatggtgaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 24529472  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||                   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  24529473 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtgtatatgatg-------------------atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatt 24529553  T
Q  301 tgaattatatgtg-aataattgagac 325  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  24529554 tgaattatatatgaaataattgagac 24529579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24918576 - 24918350
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918576 attgattggtagagaattggtcttaagtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 24918477  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24918476 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatat 24918377  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  24918376 tgttcatgattgatgaagtgttatatg 24918350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 24642475 - 24642701
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642475 attgattggtacagaattgctcttaggtgtaaacccaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatag 24642574  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24642575 aacttaagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatat 24642674  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  24642675 tgttcatgattgatgaagtgttatatg 24642701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24671457 - 24671235
Alignment:
Q  5 attggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24671457 attggtacagaattggtcttaggtgtaaaaacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgttgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 24671358  T
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtc 204  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  24671357 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgtt 24671258  T
Q  205 aatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  24671257 catgattgatgaagtgttatatg 24671235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 37 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25616581 - 25616365
Alignment:
Q  37 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25616581 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattacttcacgtaggtca 25616482  T
Q  137 cagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatga 236  Q
    || |||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25616481 caatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatga 25616382  T
Q  237 tgttttaagatgttgat 253  Q
    |||||||||||||||||    
T  25616381 tgttttaagatgttgat 25616365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24681880 - 24681654
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||    
T  24681880 attggttggtacagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttgggcttccaaaggatttatag 24681781  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24681780 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatat 24681681  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  24681680 tgttcatgattgatgaagtgttatatg 24681654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22105901 - 22105672
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22105901 attgattggtgcagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatag 22105802  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |    
T  22105801 aacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgt 22105702  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  22105701 tgtttatgattgatgaattagtatatgtat 22105672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24368262 - 24368033
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24368262 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatag 24368163  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||  || |    
T  24368162 aacttgagttatagttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatcatgt 24368063  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  24368062 tgtttatgattgatgaattagtatatgtat 24368033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6726284 - 6726107
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726284 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 6726186  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726185 tgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 6726107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 45027631 - 45027840
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45027631 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatag 45027730  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  45027731 aacttgaattatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 45027829  T
Q  201 tgtcaatgatt 211  Q
    |||| ||||||    
T  45027830 tgtccatgatt 45027840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Original strand, 21154933 - 21155110
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21154933 ttgtttataattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 21155031  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155032 tgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 21155110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38967915 - 38967689
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38967915 attgattggtacataattggtcttaggtgtaaatacgaaagttgtagatatggatgttaggtttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagtatttatag 38967816  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  38967815 aacttgagttatagtgaaattactgcacgcagctcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatat 38967716  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  38967715 tgttcatgattgttgaagtgttatatg 38967689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 21154734 - 21154963
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21154734 attgattggtacagaatttgtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatag 21154833  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |    
T  21154834 aacttgagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgt 21154933  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||  || ||||||||| |  |||||||||    
T  21154934 tgtttataattgatgaattagtatatgtat 21154963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 147 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 22105702 - 22105526
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105702 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtaaatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 22105604  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105603 tgttgattataatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 22105526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 41523799 - 41524028
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523799 attgattggtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaacgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatag 41523898  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| ||| |    
T  41523899 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatgtttatgagtatgatgt 41523998  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  41523999 tgtttatgattgatgaattagtatatgtat 41524028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24368063 - 24367886
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24368063 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattttccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaaga 24367965  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367964 tgttggttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 24367886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6726483 - 6726254
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||| || | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726483 attgattgatacataagtggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatag 6726384  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| ||| |    
T  6726383 aacttaagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgt 6726284  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  6726283 tgtttatgattgatgaattagtatatgtat 6726254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 147 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 38967663 - 38967488
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38967663 ttgtttatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaaga 38967565  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38967564 tgttgattattatttgatgttg-tatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgaga 38967488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Original strand, 24642727 - 24642906
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaa-- 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       
T  24642727 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagtt 24642825  T
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642826 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 24642906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 41523606 - 41523748
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  41523606 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtatggatgttatctttataatgcccttggtttgacttcaaaatgatttatag 41523705  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523706 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 41523748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 6726664 - 6726534
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  6726664 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttat 6726565  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6726564 ggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 6726534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 143
Target Start/End: Original strand, 24529094 - 24529222
Alignment:
Q  15 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 114  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24529094 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 24529193  T
Q  115 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24529194 tcatattactgcacgtaggtcacagtgaa 24529222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 21154541 - 21154683
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  21154541 attgattgttatagaattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatag 21154640  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21154641 aatttgagttacggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaa 21154683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22106094 - 22105952
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  22106094 attgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaatgatttatag 22105995  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22105994 aacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaa 22105952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 24918757 - 24918627
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24918757 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaataccgttggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttat 24918658  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918657 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 24918627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 24368439 - 24368313
Alignment:
Q  17 ttggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24368439 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttaagttatggtc 24368340  T
Q  117 aaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24368339 aaattactgcacgtaggtcacagtgaa 24368313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23931896 - 23931775
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23931896 attgattggtacataattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtattgatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 23931797  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaatta 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23931796 aacttgagttatggtcaaatta 23931775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 140
Target Start/End: Original strand, 41523427 - 41523552
Alignment:
Q  15 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 114  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41523427 aattggtcttacgtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 41523526  T
Q  115 tcaaattactgcacgtaggtcacagt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  41523527 tcaaattactgcacgtaggtcacagt 41523552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 23932089 - 23931949
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  23932089 attgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatttcgttggtctgacgtcaaaacgatttatag 23931990  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtg 141  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  23931989 aactttagttatggtcaatttacttcacttaggtcacagtg 23931949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 21154348 - 21154490
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  21154348 attgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaatgatttatag 21154447  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21154448 aacttgacttttagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 21154490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 206 - 325
Target Start/End: Original strand, 45029785 - 45029904
Alignment:
Q  206 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  45029785 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgatgattattatttcatgttgttatattgtgatataaatgtatatgcattacttgaat 45029884  T
Q  306 tatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  45029885 tatatgtgaataattgagac 45029904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 23706751 - 23706889
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||| || ||||||    
T  23706751 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttatagttatggatgttacctttctaatgccgtaggtctgacgtcaaaacgaattatag 23706850  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacag 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23706851 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacag 23706889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 23709066 - 23709208
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||| | |||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  23709066 attgattggcacagaattcgtcctaggtgtaaacacgtaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatag 23709165  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23709166 aacttgagttatggtctaattactgcacataggtcacagtgaa 23709208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 24682061 - 24681931
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24682061 agaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagcattctaatgccgttagtctgacatcaaaaagatttatagagcttgagttat 24681962  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681961 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 24681931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 32214463 - 32214604
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||    
T  32214463 attgattggtacaaaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgctctgacgtcaaaacaatttatag 32214562  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 142  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32214563 aacttaagttatggtcaaattacagcacgtaggtcacagtga 32214604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 23706571 - 23706701
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |  ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23706571 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatggtgttggttctatgtcaaaacaatttatagaacttgagttat 23706670  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23706671 ggtcaagttactgcacgtaggtcacagtgaa 23706701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 24671642 - 24671512
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24671642 agaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagctttctaatgccatttatttgacatcaaaaatatttatagaacttgagttat 24671543  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24671542 ggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 24671512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 142
Target Start/End: Original strand, 45027450 - 45027579
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45027450 agaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttcgaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactttagttat 45027549  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 142  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45027550 ggtcaaattactacacgtaggtcacagtga 45027579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 147 - 274
Target Start/End: Original strand, 23707195 - 23707323
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--a 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       
T  23707195 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagtt 23707293  T
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23707294 gatgttgattatcatttgatgttgttatat 23707323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 147 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24918324 - 24918196
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--a 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       
T  24918324 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgcatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagtt 24918226  T
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24918225 gatgttgattatcatttgatgttgttatat 24918196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 147 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24671209 - 24671081
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--a 244  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |       
T  24671209 ttgtttacgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgtttaagtt 24671111  T
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24671110 gatgttgattatcatttgatattgttatat 24671081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 147 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24681628 - 24681500
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--a 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |       
T  24681628 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattagatgtatatatgatgtttaagtt 24681530  T
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24681529 gatgttgatcatcatttgatgttgttatat 24681500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 245 - 314
Target Start/End: Original strand, 22173799 - 22173868
Alignment:
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtga 314  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22173799 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 22173868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31345554 - 31345490
Alignment:
Q  79 ttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31345554 ttgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31345490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 259 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 43137477 - 43137411
Alignment:
Q  259 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43137477 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagac 43137411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19672010 - 19671953
Alignment:
Q  260 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaata 317  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19672010 ttgatgttgttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaata 19671953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16900884 - 16900803
Alignment:
Q  55 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 136  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  16900884 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacgtgggtca 16900803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16994275 - 16994194
Alignment:
Q  55 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 136  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  16994275 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacgtgggtca 16994194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 67431 - 67339
Alignment:
Q  32 aacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||| |||| ||||||||   |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  67431 aacatgaaaattgtaggttaagatgttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 67339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 143
Target Start/End: Original strand, 24642373 - 24642424
Alignment:
Q  92 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  24642373 gatttatagaacttgagttatggtcaaataactacacgtaggtcacagtgaa 24642424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 24686597 - 24686707
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  24686597 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgcgttatg 24686696  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  24686697 atcaaattact 24686707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18809542 - 18809429
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacg 129  Q
    |||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||||||    
T  18809542 taaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacg 18809443  T
Q  130 taggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||    
T  18809442 taggtcacagtgaa 18809429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 34823819 - 34823750
Alignment:
Q  55 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34823819 tgttagctttctaatgacgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 34823750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 29601518 - 29601478
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29601518 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 29601478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 12727805 - 12727711
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||| | |||| ||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12727805 taaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttgggttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 12727711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 19887274 - 19887384
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  19887274 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 19887373  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     | ||||||||    
T  19887374 attaaattact 19887384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23131386 - 23131348
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131386 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 23131348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Original strand, 23711651 - 23711689
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711651 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 23711689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26505903 - 26505865
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505903 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 26505865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26508381 - 26508343
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508381 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 26508343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 27261402 - 27261332
Alignment:
Q  54 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  |||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  27261402 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaataatttttataacttgagttatgatcaaattact 27261332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Original strand, 27920402 - 27920440
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27920402 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 27920440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Original strand, 32039136 - 32039174
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039136 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 32039174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Original strand, 34402160 - 34402198
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402160 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 34402198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 316
Target Start/End: Original strand, 23708558 - 23708615
Alignment:
Q  260 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaat 316  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23708558 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaat 23708615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 28577698 - 28577585
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacg 129  Q
    |||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||||||    
T  28577698 taaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacg 28577599  T
Q  130 taggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||| ||||    
T  28577598 taggtcacaatgaa 28577585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 324
Target Start/End: Original strand, 22459511 - 22459566
Alignment:
Q  269 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22459511 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgaga 22459566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 186
Target Start/End: Original strand, 41523998 - 41524037
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtt 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41523998 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 41524037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 571922 - 571884
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571922 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 571884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 11232212 - 11232322
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  11232212 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 11232311  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  11232312 atcaaattact 11232322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 22514059 - 22514169
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  22514059 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 22514158  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  22514159 atcaaattact 22514169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23133853 - 23133815
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23133853 tgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaa 23133815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 28776661 - 28776771
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  28776661 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 28776760  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  28776761 atcaaattact 28776771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 39682838 - 39682800
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682838 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 39682800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 31345615 - 31345570
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgta 46  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  31345615 attgattggtacagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgta 31345570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 86
Target Start/End: Original strand, 34135070 - 34135119
Alignment:
Q  37 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttc 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  34135070 gaaagttgtaggtatggaagttagctttctaattgctttggtttgacttc 34135119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21368445 - 21368365
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| || ||| ||||  |||||||||||| | |||||||    
T  21368445 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 21368365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22274090 - 22274022
Alignment:
Q  56 gttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  22274090 gttagctttctaatggccttggtttgatgtctaaatgatttttaaaacttgagttatgatcaaattact 22274022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Original strand, 23707141 - 23707225
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  23707141 attgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 23707225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Original strand, 24642673 - 24642757
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  24642673 attgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 24642757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24918378 - 24918294
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  24918378 attgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 24918294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 143
Target Start/End: Original strand, 23708980 - 23709015
Alignment:
Q  108 gttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23708980 gttatggtcaaattactgcacttaggtcacagtgaa 23709015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 316
Target Start/End: Original strand, 7688 - 7729
Alignment:
Q  275 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaat 316  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7688 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaat 7729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 310
Target Start/End: Original strand, 20520130 - 20520183
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 310  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20520130 atttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatat 20520183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23791458 - 23791405
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 310  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  23791458 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 23791405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22283323 - 22283255
Alignment:
Q  56 gttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||||||    
T  22283323 gttagctttctaatggccttggtttgatgtctaaatgatttttaatacttgagttatgatcaaattact 22283255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23799537 - 23799457
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| || ||| || |  |||||||||||| | |||||||    
T  23799537 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgttgaatatgatgttattcatgattgatgaattattatatg 23799457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24671263 - 24671179
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  | |||||||||| |  |||||||||    
T  24671263 attgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttacgattgatgaattagtatatgtat 24671179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24681682 - 24681598
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  24681682 attgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatttgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 24681598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 24788082 - 24788042
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 70  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24788082 taaacatgaaagttgtaggtatggatgttatctttccaatg 24788042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 70
Target Start/End: Original strand, 44584592 - 44584632
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 70  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  44584592 taaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttccaatg 44584632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 62)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 21474813 - 21475137
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474813 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 21474912  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21474913 aatttgagttatggtcaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 21475012  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21475013 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 21475112  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21475113 tgaattatatgtgaataattgagac 21475137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13989301 - 13988978
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989301 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 13989202  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  13989201 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 13989103  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13989102 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 13989003  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13989002 tgaattatatgtgaataattgagac 13988978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16362354 - 16362029
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16362354 attgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaatgcggttggtttgacttcaaaaggatttatag 16362255  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16362254 aatttaagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgttaatacgatat 16362155  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16362154 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattac 16362055  T
Q  300 ttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16362054 ttgaattatttgtgaataattgagac 16362029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21841202 - 21840879
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21841202 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatag 21841103  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  21841102 aacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatat 21841004  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21841003 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 21840904  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  21840903 taaattatatgtgaataattgagac 21840879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 21923018 - 21923341
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923018 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 21923117  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  21923118 aactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 21923216  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21923217 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 21923316  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21923317 tgaattatatgtgaataattgagac 21923341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 23593460 - 23593785
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||  | |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  23593460 attgattggtgcataattagtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaataatttatag 23593559  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23593560 aacttgcgttatagttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 23593659  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattac 299  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593660 tgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattac 23593759  T
Q  300 ttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23593760 ttgaattatatgtgaataattgagac 23593785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 15859735 - 15860058
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  15859735 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatac 15859834  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| || ||||||||    
T  15859835 aacttgagttatggtcaaataactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-cttgcgaatacgatat 15859933  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |    
T  15859934 tgtccatggttgatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgttgattaccatctgatgttgttatattgtgatataattgtatgtgcattgat 15860033  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  15860034 tgaattatttgtgagtaattaagac 15860058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 16274982 - 16275209
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaa-tgccgttggtttgacttcaaaaggatttata 99  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16274982 attgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaatgtcattggtttcacttcaaaaggatttata 16275081  T
Q  100 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgata 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  16275082 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatacgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaattcgata 16275181  T
Q  200 ttgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16275182 ttgttcatgattgatgaagtgttatatg 16275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 27161313 - 27161529
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27161313 attgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatag 27161412  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||    
T  27161413 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttatgaataaaatat 27161512  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaa 217  Q
    ||| |||||||||||||    
T  27161513 tgttaatgattgatgaa 27161529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29777176 - 29776947
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29777176 attgattggtacataattggtcttaggtgtaatcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgggttgacttcaaaaggatttatag 29777077  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |    
T  29777076 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgt 29776977  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  29776976 tgtttatgattgatgaattagtatatgtat 29776947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 29776977 - 29776800
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776977 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 29776879  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776878 tgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 29776800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 22122753 - 22122970
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22122753 agaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgggttat 22122852  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattg 212  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||    
T  22122853 agtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattg 22122952  T
Q  213 atgaagtgttatatgtat 230  Q
    ||||| || |||||||||    
T  22122953 atgaattggtatatgtat 22122970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31612801 - 31612572
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612801 attgattggtaccgaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttcaaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatag 31612702  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |||||    
T  31612701 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcaaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatcagtatgatat 31612602  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  31612601 tgtttatgattgatgaattagtatatgtat 31612572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29298677 - 29298461
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29298677 attgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatag 29298578  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |    
T  29298577 aacttgagttatagtcaaattactgcacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgt 29298478  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaa 217  Q
    |||  ||||||||||||    
T  29298477 tgtttatgattgatgaa 29298461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 29298425 - 29298248
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298425 ttgtttatgattgatgaattagtatatatatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 29298327  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298326 tgttgattattatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 29298248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13227299 - 13227133
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13227299 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttttatgtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 13227200  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaatta 167  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  13227199 aacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta 13227133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Original strand, 16275235 - 16275413
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16275235 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttcaaga 16275334  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16275335 tattgattattatttgatgttgttatattgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagac 16275413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Original strand, 22122940 - 22123117
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22122940 ttgtttatgattgatgaattggtatatgtatgtttatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 22123038  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22123039 tattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagac 22123117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31612603 - 31612426
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaag 245  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31612603 attgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaag 31612505  T
Q  246 atgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31612504 atattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgaga 31612426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 22050575 - 22050792
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| | |  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22050575 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcaatggtctaatgtcaaaacgatttatagaacttgagttat 22050674  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||    
T  22050675 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattg 22050774  T
Q  213 atgaagtgttatatgtat 230  Q
    ||||| |  |||||||||    
T  22050775 atgaattagtatatgtat 22050792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29535487 - 29535321
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29535487 attgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgtcgttggtttgacttcaaaagaatttatag 29535388  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaatta 167  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  29535387 aacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta 29535321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31612994 - 31612852
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31612994 attgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttataggtatggatttaagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatag 31612895  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612894 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31612852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 29298858 - 29298728
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29298858 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgttctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttat 29298759  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298758 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 29298728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 15859529 - 15859671
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  15859529 attgattggtacagaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacctcaaaactatttatag 15859628  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15859629 aacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 15859671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31613173 - 31613045
Alignment:
Q  15 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 114  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31613173 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaggtttctaataccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 31613074  T
Q  115 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31613073 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 31613045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 9044731 - 9044867
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||    
T  9044731 attgatcggtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagttttctaatgccgttggtctaacgtcaaaacgatttatag 9044830  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9044831 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 9044867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 22122559 - 22122690
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaa-gttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22122559 agaattggtcttaggtgtaaacactaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttttacttcaaaacgatttgtagaacttgagtta 22122658  T
Q  112 tggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22122659 tggtcaaattactgcacatagatcacagtgaa 22122690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 16274801 - 16274931
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16274801 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcattggtctgacgtcaaaactatttatagaacttgagttat 16274900  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16274901 ggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 16274931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 27161132 - 27161262
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27161132 agaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgaattat 27161231  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27161232 ggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaa 27161262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 29777369 - 29777227
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||    
T  29777369 attgatcggtacagaattagtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgttaaaacgatttatag 29777270  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  29777269 aacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacaatgaa 29777227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16401550 - 16401408
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| | || |  ||||||||||||     
T  16401550 attgatcggtacagaattggtcttaggtgtagacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctatttccattggtctaacgtggaaaggatttatat 16401451  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401450 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 16401408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 147 - 252
Target Start/End: Original strand, 22050762 - 22050866
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050762 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 22050860  T
Q  247 tgttga 252  Q
    ||||||    
T  22050861 tgttga 22050866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 40129508 - 40129387
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  40129508 agaattgatcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcgttggtctggcatcaaaacgatttatagaacttgagttat 40129409  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggt 134  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  40129408 agtcaaattactgcacgtaggt 40129387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 241
Target Start/End: Original strand, 27161511 - 27161605
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 241  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161511 attgttaatgattgatgaattagtatatatatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 27161605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 43543337 - 43543269
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 69  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43543337 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 43543269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 45574812 - 45574892
Alignment:
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45574812 gatgttgattatgatttgatgttcttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagac 45574892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 143
Target Start/End: Original strand, 10812612 - 10812681
Alignment:
Q  74 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10812612 ttggtttgacttcaaaatgatttataaaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 10812681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 258 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 433190 - 433123
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433190 atttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 433123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Original strand, 13212844 - 13212911
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13212844 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 13212911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21347141 - 21347074
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  21347141 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 21347074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 263 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 40389329 - 40389267
Alignment:
Q  263 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40389329 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagac 40389267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21342276 - 21342209
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  21342276 atttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 21342209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21707346 - 21707279
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21707346 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagac 21707279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21711888 - 21711821
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21711888 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagac 21711821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 43543267 - 43543214
Alignment:
Q  221 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43543267 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 43543214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29298478 - 29298408
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  29298478 ttgtttatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 29298408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13989465 - 13989352
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacg 129  Q
    |||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||||||    
T  13989465 taaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacg 13989366  T
Q  130 taggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||    
T  13989365 taggtcacagtgaa 13989352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 21858662 - 21858592
Alignment:
Q  54 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21858662 atgttagctttctaacggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 21858592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 124
Target Start/End: Original strand, 44035860 - 44035928
Alignment:
Q  56 gttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  44035860 gttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaattact 44035928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16758822 - 16758775
Alignment:
Q  269 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaat 316  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16758822 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaat 16758775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 17004019 - 17003909
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  17004019 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 17003920  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  17003919 atcaaattact 17003909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Original strand, 21474724 - 21474762
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474724 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 21474762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 124
Target Start/End: Original strand, 21650885 - 21650979
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||| |||||||| ||||||||||    
T  21650885 taaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttaaaactagagttatgatcaaattact 21650979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22366596 - 22366527
Alignment:
Q  55 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  22366596 tgttagctttctaatgactttggtttgacatcgaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 22366527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Original strand, 16275181 - 16275265
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  16275181 attgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 16275265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 316
Target Start/End: Original strand, 21861510 - 21861566
Alignment:
Q  261 tgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaat 316  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21861510 tgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaat 21861566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Original strand, 18060577 - 18060684
Alignment:
Q  17 ttggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtc 116  Q
    |||| ||| ||| |||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| |||||  | |||||||| |||| |     
T  18060577 ttggcctttggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttaaaaacttgagatatgatt 18060676  T
Q  117 aaattact 124  Q
    ||||||||    
T  18060677 aaattact 18060684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 316
Target Start/End: Original strand, 21896193 - 21896252
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaat 316  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  21896193 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaat 21896252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 308
Target Start/End: Original strand, 35261018 - 35261069
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 308  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  35261018 atttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattat 35261069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 16656031 - 16655942
Alignment:
Q  26 ggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggt 115  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||    
T  16656031 ggtataaacatgaaagttttagataattttgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggt 16655942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 310
Target Start/End: Original strand, 41049973 - 41050026
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 310  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  41049973 atttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatat 41050026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 309
Target Start/End: Original strand, 16368224 - 16368276
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattata 309  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  16368224 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattata 16368276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 6)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 94846 - 94523
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94846 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 94747  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  94746 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 94648  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  94647 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 94548  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  94547 tgaattatatgtgaataattgagac 94523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 17166 - 17490
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17166 attgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatttttgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatag 17265  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17266 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatagttgaatatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatat 17365  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17366 tgttcatgattgatgaagtgtcatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatactgtgatataattatatatgcattact 17465  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  17466 tgaattatatgtgaataattgagac 17490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 16973 - 17115
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| | |||||||    
T  16973 attgattggtacagaatttgtgttaggggataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgatatcaaaaaggtttatag 17072  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17073 aacttgagttatgatcaaattaatgcacgtaggtcatagtgaa 17115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44568
Alignment:
Q  278 gatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 44568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 95010 - 94897
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacg 129  Q
    |||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||||||    
T  95010 taaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacg 94911  T
Q  130 taggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||    
T  94910 taggtcacagtgaa 94897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 124
Target Start/End: Original strand, 154892 - 154961
Alignment:
Q  55 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||  || |||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  154892 tgttagctttataatgacgttggtttgaggtccaaatcatttttagaacttgagttatgatcaaattact 154961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 4)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14383 - 14059
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14383 attgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 14284  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14283 aatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 14184  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14183 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 14084  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14083 tgaattatatgtgaataattgagac 14059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 23261 - 23484
Alignment:
Q  5 attggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 104  Q
    |||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23261 attgatatagaattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaact 23360  T
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23361 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtc 23460  T
Q  205 aatgattgatgaagtgttatatgt 228  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  23461 catgattgatgaagtgttatatgt 23484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 22904 - 23046
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  22904 attgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatag 23003  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23004 aacatgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaa 23046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 143
Target Start/End: Original strand, 23121 - 23206
Alignment:
Q  58 tagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23121 tagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaa 23206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 253; Significance: 1e-141; HSPs: 2)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 5130 - 4806
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  5130 attgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccaatggtttgacttcaaaatgatttatag 5031  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5030 aacttgagttatagtcaaattacagcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 4931  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4930 tgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgttgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 4831  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4830 tgaattatatgtgaataattgagac 4806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 5323 - 5181
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| |||||    
T  5323 attgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagttttcttatgccgttggtctgacgtcaaaacgatatatag 5224  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5223 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 5181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 253; Significance: 1e-141; HSPs: 77)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 39363820 - 39363496
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  39363820 attgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttgatttgacttcaaaatgatttatag 39363721  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  39363720 aacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatat 39363621  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  39363620 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 39363521  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  39363520 tgaattatatgtgaataattgagac 39363496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 264495 - 264818
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264495 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 264594  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  264595 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 264693  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  264694 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 264793  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  264794 tgaattatatgtgaataattgagac 264818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20909447 - 20909124
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909447 attgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 20909348  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  20909347 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 20909249  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  20909248 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 20909149  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20909148 tgaattatatgtgaataattgagac 20909124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 38619872 - 38619547
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619872 attgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 38619773  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38619772 aacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 38619673  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattac 299  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| |     
T  38619672 tgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattggaatataattgtatatgcatcaa 38619573  T
Q  300 ttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  38619572 ttagattatctgtgaataattgagac 38619547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 10732667 - 10732990
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732667 attgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 10732766  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||| |    
T  10732767 aactagagttatagtcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgattt 10732865  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  10732866 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatacggtgatataattgtatatgcattact 10732965  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10732966 tgaattatatgtgaataattgagac 10732990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 39245571 - 39245252
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245571 attgattggtacataattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 39245472  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  39245471 aacttgatttatagttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 39245373  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39245372 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattact 39245273  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattg 321  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  39245272 tgaattatatgtgaataattg 39245252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 42245092 - 42245415
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42245092 attgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaatggatttatag 42245191  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  42245192 aactatagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 42245290  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  42245291 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 42245390  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  42245391 tgaattatatgtgaataattgagac 42245415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23064949 - 23064624
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23064949 attgattggtacagaattggtcttagatataaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctagtgccgttcgtttgacttcaaaaggatttatag 23064850  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23064849 aacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 23064750  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattac 299  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |     
T  23064749 tgtccatgattgatgaagttttatatgtatatattatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaa 23064650  T
Q  300 ttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  23064649 ttagattatctgtgaataattgagac 23064624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 29346415 - 29346092
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29346415 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatag 29346316  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||| ||| || || |||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  29346315 aacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatat 29346217  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29346216 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 29346117  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  29346116 tgaattatatgtgaataattgagac 29346092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 29348888 - 29348565
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29348888 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatag 29348789  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||| ||| || || |||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  29348788 aacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatat 29348690  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29348689 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 29348590  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  29348589 tgaattatatgtgaataattgagac 29348565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 29351361 - 29351038
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29351361 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatag 29351262  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||| ||| || || |||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  29351261 aacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatat 29351163  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29351162 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 29351063  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  29351062 tgaattatatgtgaataattgagac 29351038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 37804629 - 37804902
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37804629 attgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataa 37804728  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  37804729 aacttgagttatggtcaaattaatgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatat 37804828  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  37804829 tgtcaatgattaatgaagcgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattagaatttgatgttgttatat 37804902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 17516890 - 17517142
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516890 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 17516989  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17516990 aacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 17517089  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 253  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17517090 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 17517142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9776781 - 9776521
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9776781 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatg 9776682  T
Q  114 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattga 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  9776681 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgg 9776582  T
Q  214 tgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9776581 tgaagggttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 9776521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 2154358 - 2154664
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154358 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatattagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 2154457  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  2154458 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatac 2154557  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  2154558 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg-------------------atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatt 2154638  T
Q  301 tgaattatatgtg-aataattgagac 325  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  2154639 tgaattatatgtgaaataattgagac 2154664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 20901647 - 20901873
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901647 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 20901746  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20901747 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 20901846  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  20901847 tgttcatgattgatgaagtgttatatg 20901873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 20917573 - 20917789
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917573 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 20917672  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |    
T  20917673 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaagtcacggtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgt 20917772  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaa 217  Q
    |||  ||||||||||||    
T  20917773 tgtttatgattgatgaa 20917789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32027881 - 32027652
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027881 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 32027782  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |    
T  32027781 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgt 32027682  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  32027681 tgtttatgattgatgaattagtatatgtat 32027652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 32027682 - 32027505
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027682 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 32027584  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027583 tgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 32027505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29330418 - 29330190
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  29330418 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgctgttggtttgatttcaaaaggatttatag 29330319  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||| |    
T  29330318 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaa-aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttacgagtatgatgt 29330220  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  29330219 tgtttatgattgatgaattagtatatgtat 29330190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Original strand, 20917825 - 20918002
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917825 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatcttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 20917923  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20917924 tgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgctttacttgaattagatgtgaataattgagac 20918002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 29330220 - 29330046
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330220 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 29330122  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    || | ||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330121 tgattatta---tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 29330046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 17516504 - 17516646
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  17516504 attgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatag 17516603  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17516604 aacttgagttatggtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaa 17516646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 20901454 - 20901596
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  20901454 attgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtatggatgtcagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatag 20901553  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901554 aactttagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 20901596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 32028256 - 32028125
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg-tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  32028256 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttttgacgtcaaaacgatttatagagcttgagtta 32028157  T
Q  112 tggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32028156 tggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 32028125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 296001 - 296143
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  296001 attgattggtacagaattggtcttaggtgtatacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtctgacgtcaaaacaatttatag 296100  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  296101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacactgaa 296143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 17516697 - 17516839
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  17516697 attgattggcacagaattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatag 17516796  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17516797 aacttgagttatcgtcgaattactgcacataggtcacagtgaa 17516839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 29330599 - 29330469
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29330599 agaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaggccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttat 29330500  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  29330499 ggtcaaattaatgcacgtatgtcacagtgaa 29330469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 32028640 - 32028512
Alignment:
Q  15 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 114  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  32028640 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcgttggtctgacatcaaaacgatttatagagcttgagttatgg 32028541  T
Q  115 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32028540 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 32028512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 2154177 - 2154307
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2154177 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttttaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttaagttat 2154276  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
     |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  2154277 agtcaaattactgcacgtatgtcacggtgaa 2154307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 143
Target Start/End: Original strand, 295821 - 295950
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    |||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  295821 gaataggtcttaggtgtaaccatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgatctgacatcaaaacgatttatagaacttgagttatg 295920  T
Q  114 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  295921 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 295950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Original strand, 20901899 - 20902059
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  20901899 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg-------- 20901990  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtg-aataattgagac 325  Q
               ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  20901991 -----------atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagac 20902059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 32028074 - 32027932
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| |||||||||    
T  32028074 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaaattgtatttatggatgttagctttctaatgccattggtcggacgtcaaaacgatttatag 32027975  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  32027974 agcttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacaatgaa 32027932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 32028461 - 32028319
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  32028461 attgattggtacagaattggttttaggtgaaaacacgaaagttgtaggtatatatgttagctttctagtgctgttggtctgacgtcaaaacaatttatag 32028362  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32028361 agcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 32028319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 143
Target Start/End: Original strand, 20917394 - 20917522
Alignment:
Q  15 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 114  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  20917394 aattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaaaatcatttataaaacttgagttatgg 20917493  T
Q  115 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20917494 tcaaattactacacgtaggtcacaatgaa 20917522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Original strand, 36154766 - 36154833
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154766 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 36154833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 263 - 325
Target Start/End: Original strand, 18319021 - 18319083
Alignment:
Q  263 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18319021 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagac 18319083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 263 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24067282 - 24067220
Alignment:
Q  263 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24067282 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagac 24067220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 260 - 325
Target Start/End: Original strand, 11581184 - 11581249
Alignment:
Q  260 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11581184 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagac 11581249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Original strand, 10775659 - 10775725
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10775659 atttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagac 10775725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 31061248 - 31061184
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattga 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  31061248 atttgatgttgttatattgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattga 31061184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 22883903 - 22884013
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22883903 gaattggccttgggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgttcaaatgatttttagaacttgagttatg 22884002  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  22884003 atcaaattact 22884013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 124
Target Start/End: Original strand, 27183208 - 27183278
Alignment:
Q  54 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27183208 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 27183278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 258 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 40726037 - 40725970
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  40726037 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 40725970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 43444008 - 43444118
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43444008 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 43444107  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     | ||||||||    
T  43444108 attaaattact 43444118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Original strand, 264331 - 264444
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacg 129  Q
    |||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||||||    
T  264331 taaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtgccgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacg 264430  T
Q  130 taggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||    
T  264431 taggtcacagtgaa 264444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 124
Target Start/End: Original strand, 1220384 - 1220453
Alignment:
Q  55 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1220384 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 1220453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 124
Target Start/End: Original strand, 10778832 - 10778901
Alignment:
Q  55 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10778832 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 10778901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 230
Target Start/End: Original strand, 20917772 - 20917855
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||  || ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  20917772 ttgtttatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtattatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 20917855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 12013 - 11903
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  12013 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 11914  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     | ||||||||    
T  11913 attaaattact 11903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 20909536 - 20909498
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909536 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 20909498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 25426287 - 25426177
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  25426287 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 25426188  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     | ||||||||    
T  25426187 attaaattact 25426177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 39245660 - 39245622
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245660 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 39245622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 39363908 - 39363870
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363908 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 39363870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 227
Target Start/End: Original strand, 1628163 - 1628243
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||  ||| || ||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1628163 ttgttaatgattgatgaactattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttaatgattgatgaagtattatatg 1628243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 7424987 - 7424879
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  7424987 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 7424888  T
Q  114 gtcaaatta 122  Q
     ||||||||    
T  7424887 atcaaatta 7424879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 23511195 - 23511127
Alignment:
Q  56 gttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23511195 gttagctttttaatggctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 23511127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 11342284 - 11342190
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  11342284 taaacatgaaagttgtagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 11342190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 21933242 - 21933352
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  21933242 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 21933341  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  21933342 atcaaattact 21933352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 21939412 - 21939522
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  21939412 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 21939511  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  21939512 atcaaattact 21939522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 22367094 - 22367204
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||||||| ||||    
T  22367094 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaaaacttgagatatg 22367193  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     | ||||||||    
T  22367194 attaaattact 22367204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23065038 - 23065000
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23065038 tgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacagtgaa 23065000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 35581450 - 35581340
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  35581450 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 35581351  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  35581350 atcaaattact 35581340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 36990638 - 36990748
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  36990638 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 36990737  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  36990738 atcaaattact 36990748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 124
Target Start/End: Original strand, 1168832 - 1168901
Alignment:
Q  55 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| | | |||||||||||| ||||||||||    
T  1168832 tgttagctttctaatggctttggtttggcttccaaatgattttttggacttgagttatgatcaaattact 1168901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 124
Target Start/End: Original strand, 11212734 - 11212803
Alignment:
Q  55 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11212734 tgttagctttcttatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 11212803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 124
Target Start/End: Original strand, 21074249 - 21074318
Alignment:
Q  55 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  21074249 tgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21074318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22144215 - 22144174
Alignment:
Q  275 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaat 316  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22144215 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaat 22144174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Original strand, 20901845 - 20901929
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  20901845 attgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 20901929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 186
Target Start/End: Original strand, 14026653 - 14026692
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtt 186  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14026653 ttgttcatgattgatgaattaatatatgaatgtatatgtt 14026692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 156 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18744036 - 18743965
Alignment:
Q  156 attgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| || ||| ||||  |||||||||||||| |||||||    
T  18744036 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 18743965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21503355 - 21503316
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtt 186  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21503355 ttgtttatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 21503316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 18778605 - 18778715
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||    |||||| ||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  18778605 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagatttctaatggctttggttttacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 18778704  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     | ||||||||    
T  18778705 attaaattact 18778715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 32950283 - 32950213
Alignment:
Q  54 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || |||  |||| |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  32950283 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaataatttttagaatgtgagttatgatcaaattact 32950213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 38619960 - 38619922
Alignment:
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  38619960 tgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacaatgaa 38619922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 28901584 - 28901495
Alignment:
Q  26 ggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggt 115  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||    
T  28901584 ggtataaacatgaaagttttagataattttgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggt 28901495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 28937979 - 28937890
Alignment:
Q  26 ggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggt 115  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||    
T  28937979 ggtataaacatgaaagttttagataattttgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggt 28937890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13828 - 13504
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13828 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttatctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 13729  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13728 aatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 13629  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  13628 tgtccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattact 13529  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13528 tgaattatatgtgaataattgagac 13504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13918 - 13879
Alignment:
Q  104 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13918 ttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaa 13879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9673 - 9354
Alignment:
Q  5 attggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9673 attggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctctctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaact 9574  T
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtc 204  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  9573 tgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtc 9475  T
Q  205 aatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 304  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9474 catgattgatgaagtgttatatgtatatttgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaa 9375  T
Q  305 ttatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9374 ttatatgtgaataattgagac 9354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3459 - 3186
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||| || | ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3459 attgattgttacataattgttcttagttgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 3360  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3359 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 3260  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3259 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtagatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 3186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 11725 - 11400
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11725 attgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgatacttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttgggttgacttcaaaatgatttatag 11626  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11625 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagttaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 11526  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattac 299  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11525 tgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgattttgttatattgtgatataattatatatgcattac 11426  T
Q  300 ttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  11425 ttgaatcatatgtgaataattgagac 11400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6378 - 6070
Alignment:
Q  5 attggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6378 attggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 6279  T
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtc 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  6278 tgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtc 6180  T
Q  205 aatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 304  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  6179 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatttaattgcatatgcattacttgaa 6080  T
Q  305 ttatatgtga 314  Q
    ||||||||||    
T  6079 ttatatgtga 6070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 40835 - 40512
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40835 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 40736  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  40735 aacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 40637  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  40636 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 40537  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  40536 tgaattttatgtgaataattgagac 40512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 37969 - 37848
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  37969 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttcaaatggctttggtttgacttccaaatgattt-tagaacttgagttatg 37871  T
Q  114 gtcaaattactgcacgtaggtca 136  Q
     |||||||||| ||| |||||||    
T  37870 atcaaattactacacataggtca 37848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 40925 - 40886
Alignment:
Q  104 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40925 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 40886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 134646 - 134323
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134646 attgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 134547  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  134546 aactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 134448  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  134447 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 134348  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  134347 tgaattatatgtgaataattgagac 134323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 137115 - 136792
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  137115 attgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 137016  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  137015 aactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 136917  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  136916 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 136817  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  136816 tgaattatatgtgaataattgagac 136792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 139584 - 139261
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139584 attgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 139485  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  139484 aactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 139386  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  139385 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 139286  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  139285 tgaattatatgtgaataattgagac 139261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 142053 - 141730
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  142053 attgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 141954  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  141953 aactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 141855  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  141854 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 141755  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  141754 tgaattatatgtgaataattgagac 141730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 144522 - 144199
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144522 attgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 144423  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  144422 aactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatat 144324  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  144323 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattact 144224  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  144223 tgaattatatgtgaataattgagac 144199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 34 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1591
Alignment:
Q  34 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1831 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 1732  T
Q  134 tcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatata 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1731 tcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatttatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatata 1632  T
Q  234 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1631 tgattttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 1591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 324
Target Start/End: Original strand, 38394 - 38706
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38394 agaattgatcttagggctaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaatttgagttat 38493  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattg 212  Q
    | ||||||||||| | ||  |||| | |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  38494 gttcaaattactgtatgtttgtcatattgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattg 38593  T
Q  213 atgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||     
T  38594 atgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatata 38693  T
Q  312 tgaataattgaga 324  Q
    | |||| ||||||    
T  38694 taaatatttgaga 38706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 67 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 11142 - 10885
Alignment:
Q  67 aatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaatt 166  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  11142 aatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaatt 11043  T
Q  167 aatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 266  Q
    | |||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11042 agtatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 10944  T
Q  267 tgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10943 tgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagac 10885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 501500 - 501196
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  501500 attgattgttacagaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtagg-atagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatag 501402  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||                    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  501401 aacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattga-------------------atatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 501321  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 300  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501320 tgttcatgattgatgatgtgttatatgtatatataatgttttaagatgttgattactatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 501221  T
Q  301 tgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  501220 tgaattatatgtgaataattgagac 501196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 501681 - 501551
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  501681 agaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttat 501582  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501581 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 501551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Original strand, 85562 - 85629
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  85562 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagac 85629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Original strand, 139593 - 139645
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttga 82  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||    
T  139593 taaacatgaaagtcgtaggtatgaaagttagctttctaatggctttggtttga 139645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 4)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 4029 - 4304
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4029 attgattggtacagaattggtcataggtgtaaacatgaaaggtgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatag 4128  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  4129 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtgggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatat 4228  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4229 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 4304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 3836 - 3978
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||      
T  3836 attgattggtacagaattggtcttaggtggaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaacgatttatga 3935  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3936 aacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 3978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 3643 - 3782
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||      
T  3643 attgattggtacagaattggtcttagctgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgaggtcaaaacgatttatgt 3742  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3743 aacttgagttatgctcaaattactgaacgtaggtcacagt 3782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 143
Target Start/End: Original strand, 3541 - 3592
Alignment:
Q  92 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3541 gatttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtaggtcactgtgaa 3592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 6662 - 6937
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  6662 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttggtccgacgtcaaaacgatttatag 6761  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6762 aacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatat 6861  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  6862 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgagtatcatttaatgttgttatat 6937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 6481 - 6611
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  6481 agaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttat 6580  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6581 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 4)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15352 - 15083
Alignment:
Q  7 tggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttg 106  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  15352 tggtacagatttggtcttaggtgtaaccacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttg 15253  T
Q  107 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  15252 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatttatatgtttgtgaatactatattgtcca 15153  T
Q  207 tgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15152 tgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 15083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 11066 - 11251
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  11066 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttggtccgacgtcaaaacgatttatag 11165  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtt 186  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11166 tacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 11251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 10885 - 11015
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10885 agaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttat 10984  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10985 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 11015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15528 - 15399
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15528 agaattggtcttag-tgtaaacacgaaagttgtaggtatggacgttagctttctaatgtcgttggtctgacatcaaaacaatttatagaacttgagttat 15430  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15429 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 15399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 274
Target Start/End: Original strand, 53612 - 53873
Alignment:
Q  15 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 114  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  53612 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtcaaagggatttatagaacttgagatatgg 53711  T
Q  115 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||    
T  53712 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatattgttcatgattgat 53811  T
Q  215 gaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53812 gaagtgttatatgtatatatgatgtttaagtagatgttgattatcatttgatgttgttatat 53873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 78505 - 78453
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattata 309  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  78505 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattata 78453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 639 - 416
Alignment:
Q  5 attggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 104  Q
    |||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  639 attgatatagaattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaact 540  T
Q  105 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  539 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtaagtatatgtttgtgaatacgatattgtc 440  T
Q  205 aatgattgatgaagtgttatatgt 228  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  439 catgattgatgaagtgttatatgt 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 996 - 854
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  996 attgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatag 897  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  896 aacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaa 854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 779 - 694
Alignment:
Q  58 tagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  779 tagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaa 694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 4)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 250 - 476
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  250 attgattggtacataaatggtcttaggtgtaaacaagaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaagatttatag 349  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  350 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 449  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||    
T  450 tgttcatgattgataaagtgttatatg 476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 220 - 325
Target Start/End: Original strand, 12194 - 12299
Alignment:
Q  220 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataat 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12194 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataat 12293  T
Q  320 tgagac 325  Q
    ||||||    
T  12294 tgagac 12299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 227
Target Start/End: Original strand, 502 - 582
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  502 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Original strand, 448 - 532
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| ||||||||| || |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  448 attgttcatgattgataaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30455 - 30229
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  30455 attgattggtacagaattggtcttcggtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtttcacttcaaaaggatttgtag 30356  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30355 tacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 30256  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  30255 tgttcatgattgatgaagtgttatatg 30229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 30648 - 30506
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| ||||||||     
T  30648 attgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatgccattggtgtgacgtcaaaacgatttataa 30549  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30548 aactttagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 30506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 154 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 30196 - 30044
Alignment:
Q  154 tgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 253  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||                   
T  30196 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg--------------- 30112  T
Q  254 taccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30111 ----atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagac 30044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 5)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10227 - 10001
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10227 attgattggtacagtgttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 10128  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  10127 aacttgagttatggtcaaattatttcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtgtgtatatgtttgtgaatacgatat 10028  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  10027 tgttcatgattgatgaagtgttatatg 10001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10420 - 10278
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  10420 attgattggtacataattggtcttatgtgtcaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacatcaaaacgatttatag 10321  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10320 aacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 10278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10599 - 10471
Alignment:
Q  15 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  10599 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgcgttatgg 10500  T
Q  115 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  10499 tcaaattactgcatgtaggtcacaatgaa 10471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 9975 - 9936
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtt 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9975 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 9936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10029 - 9945
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  10029 attgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 9945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 5)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1025 - 799
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1025 attgattggtacagcattcgtcttaggagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaattatttatag 926  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  925 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatttgtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatat 826  T
Q  201 tgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||  |||||||||||||| |||||||    
T  825 tgttcatgattgatgaagttttatatg 799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1218 - 1076
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  1218 attgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaaagatttatag 1119  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  1118 aacttgagttatggtcaaattactacacgcaggtcatagtgaa 1076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 147 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 773 - 645
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--a 244  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       
T  773 ttgtttatgattgattaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagtt 675  T
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  674 gatgttgattatcatttgatgttgttatat 645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 1325 - 1225
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  1325 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttct-atgccgttggtctgacgtctaaacgatttatagaacttgagttat 1227  T
Q  113 gg 114  Q
    ||    
T  1226 gg 1225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 827 - 759
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgat 214  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||    
T  827 attgttcatgattgatgaagttttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 6887 - 6713
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6887 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 6788  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgt 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  6787 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 6713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 7080 - 6938
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  7080 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaaaatgatttatag 6981  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6980 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 6938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 219
Target Start/End: Original strand, 13382 - 13571
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacg 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13382 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcttactagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactgaacg 13481  T
Q  130 taggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagt 219  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  13482 taggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 13571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 43175 - 43002
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43175 attgattggtacatttttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagggtttatag 43076  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatg 174  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  43075 aacttgagttatagtcaaattagtgcacgtaggtcacagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatg 43002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 43356 - 43226
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  43356 agaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttat 43257  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43256 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 43226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 8175 - 7996
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8175 attgattagtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 8076  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgta 180  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8075 aatttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgta 7996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 8368 - 8226
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||    
T  8368 attgattggtacataactggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatccccttggtttgacgtcaaaacgatttatag 8269  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8268 aacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaa 8226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 8561 - 8421
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||     
T  8561 attgattggtacataattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaattccattggtatgacgtcaaaaagatttatac 8462  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtg 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8461 aacttgagttatggtgaaattactgcacgtaggtcacagtg 8421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 68397 - 68231
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  68397 attgattggtacaaaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgccattggtttgacttcaaaaggatttatag 68298  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaatta 167  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  68297 aacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta 68231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1871 - 1741
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 112  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1871 agaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 1772  T
Q  113 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1771 agtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 1741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 1690 - 1634
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgt 57  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1690 attgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgt 1634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 8454 - 8312
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  8454 attgattggtatagaattgctcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattggtttgacttcaaaaggatttatag 8355  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  8354 aacttgagttatggtaaaattactgcacgttggtcacagtgaa 8312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 53 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 57865 - 57715
Alignment:
Q  53 gatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgttt 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |    
T  57865 gatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatacttgaat 57766  T
Q  153 atgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgt 203  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  57765 atgagtgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 57715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0711
Description:

Target: scaffold0711; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 7416 - 7558
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  7416 attgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacatcaaaatgatttatag 7515  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7516 aacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaa 7558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 7224 - 7366
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||     
T  7224 attgattggtaaagaatatgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttatccttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttataa 7323  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7324 aacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaa 7366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 142
Target Start/End: Original strand, 7079 - 7172
Alignment:
Q  49 tatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7079 tatggatgttagctttctaatgccgttgctctgccgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtga 7172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18566 - 18424
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||    
T  18566 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcattggtctgacgtcaaaacgatttatag 18467  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18466 aacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaa 18424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18089 - 17947
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||    
T  18089 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccattggtctgacgtcaaaatgatttatag 17990  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17989 aacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaa 17947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31639 - 31497
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||    
T  31639 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatag 31540  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31539 aacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 33607 - 33465
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||| |||||||||    
T  33607 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtctgacgtaaaaacgatttatag 33508  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33507 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacggtgaa 33465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 310
Target Start/End: Original strand, 18176 - 18228
Alignment:
Q  259 tttgatgttgttat-attgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 310  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  18176 tttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 18228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 39768 - 39626
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||||||    
T  39768 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgccattggtctaacgtcaaaacgatttatag 39669  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39668 aacttgagttatggtcaaattattacacgtaggtcacagtgaa 39626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 143
Target Start/End: Original strand, 36749 - 36874
Alignment:
Q  18 tggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36749 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgttgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtca 36848  T
Q  118 aattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  36849 aattactgcacgtaggtcacagtgaa 36874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 36925 - 37067
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    ||||||||| | | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  36925 attgattggaaaaaaattagtcatagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatag 37024  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  37025 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcatagtgaa 37067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 19815 - 19957
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| || |||||     
T  19815 attgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacgcaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgaattatat 19914  T
Q  101 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19915 aacttgagttatcgtcaaattactacacgtaggtcatagtgaa 19957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 147 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 28078 - 27958
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28078 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 27980  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttg 268  Q
    |||||||||  |||||||||||    
T  27979 tgttgattattatttgatgttg 27958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 88 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28190 - 28048
Alignment:
Q  88 aaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgttt 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  28190 aaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 28091  T
Q  188 gtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
     |||||| ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  28090 atgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 28048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 147 - 274
Target Start/End: Original strand, 10760 - 10886
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10760 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatactgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaaa 10858  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||    
T  10859 tgttgagtattatttgatgttgttatat 10886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 227
Target Start/End: Original strand, 10659 - 10734
Alignment:
Q  152 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10659 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 10734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Original strand, 10706 - 10790
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  10706 attgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 10790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 147 - 274
Target Start/End: Original strand, 15145 - 15273
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--a 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       
T  15145 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagtt 15243  T
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15244 gatgttgattatcatttgatgttgttatat 15273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 227
Target Start/End: Original strand, 15070 - 15119
Alignment:
Q  178 gtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatg 227  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  15070 gtatatgtttgtgaatactatattgttcataattgatgaagtgttatatg 15119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Original strand, 15091 - 15175
Alignment:
Q  146 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtat 230  Q
    |||||| || ||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  15091 attgttcataattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 15175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 147 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10021 - 9861
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga 246  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||               
T  10021 ttgtttatgattgatgagttagtatatgtatgtataagtttgtgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatg----------- 9933  T
Q  247 tgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtg-aataattgagac 325  Q
            || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  9932 --------acgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagac 9861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10067 - 10005
Alignment:
Q  154 tgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatga 216  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  10067 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtacgatgttgtttatgattgatga 10005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 298 - 218
Alignment:
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 82264 - 82184
Alignment:
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82264 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 82184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12250 - 12170
Alignment:
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 12170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 1250 - 1330
Alignment:
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagac 1330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 274
Target Start/End: Original strand, 35955 - 36065
Alignment:
Q  164 attaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaa-gtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttg 262  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  35955 attagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatgattgatgaaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattttttg 36053  T
Q  263 atgttgttatat 274  Q
    ||||| ||||||    
T  36054 atgttcttatat 36065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Original strand, 158433 - 158500
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158433 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 158500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 113423 - 113317
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacg 129  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  113423 taaacatggaagttgtaggtatggatgttacatttctaatgacgttggtttgactccaaaatgagttttagaacttgagttatggtcaaattactaaacg 113324  T
Q  130 taggtca 136  Q
    |||||||    
T  113323 taggtca 113317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4476 - 4409
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4476 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagac 4409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Original strand, 79267 - 79334
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79267 atttgatgttgttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 79334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 274
Target Start/End: Original strand, 1199 - 1327
Alignment:
Q  147 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgagtacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--a 244  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||| || || ||||| | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       
T  1199 ttgtttatgattaataaattagtatatgaatataaatgtt-gagaataagatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagtt 1297  T
Q  245 gatgttgattaccatttgatgttgttatat 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1298 gatgttgattatcatttgatgttgttatat 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Original strand, 2111 - 2178
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2111 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 2178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 324
Target Start/End: Original strand, 17964 - 18031
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17964 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgaga 18031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16963 - 16896
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16963 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagac 16896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Original strand, 20363 - 20429
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20363 atttgatgtt-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 20429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 258 - 324
Target Start/End: Original strand, 164573 - 164639
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  164573 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 164639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 258 - 324
Target Start/End: Original strand, 161072 - 161138
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  161072 atttgatattgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 161138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4393 - 4327
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4393 atttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagac 4327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 6195 - 6305
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6195 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttatagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctaaatgatttttagaacttgagttatg 6294  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  6295 atcaaattact 6305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 12112 - 12047
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgag 323  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12112 atttgatactgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgag 12047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 8676 - 8566
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||    
T  8676 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctagatgatttttagaacttgagttatg 8577  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  8576 atcaaattact 8566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 30580 - 30470
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30580 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 30481  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  30480 atcaaattact 30470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 75631 - 75689
Alignment:
Q  1 attgattggtatagaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 59  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75631 attgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 75689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 258 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 11648 - 11581
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11648 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 11581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 124
Target Start/End: Original strand, 12519 - 12590
Alignment:
Q  53 gatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12519 gatgttagctttctaatggctttgggttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 12590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 258 - 324
Target Start/End: Original strand, 38193 - 38260
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  38193 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 38260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 835 - 725
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||   | ||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  835 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattacgttagctttctaatggctttggtctgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 736  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  735 atcaaattact 725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 124
Target Start/End: Original strand, 6970 - 7039
Alignment:
Q  55 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6970 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 7039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 280 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13165 - 13120
Alignment:
Q  280 tataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 325  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13165 tataattatatatgcattacttcaattatatgtgaataattgagac 13120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13313 - 13254
Alignment:
Q  258 atttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaat 316  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13313 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaat 13254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 310
Target Start/End: Original strand, 16037 - 16090
Alignment:
Q  258 atttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 310  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16037 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 16090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 316
Target Start/End: Original strand, 27686 - 27745
Alignment:
Q  258 atttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaat 316  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27686 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaat 27745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 324
Target Start/End: Original strand, 53486 - 53553
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  53486 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgaga 53553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 225590 - 225531
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaat 316  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  225590 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaat 225531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1375
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || || ||||||||||||||||    
T  1485 gaattggccttcggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgagttttagaacttgagttatg 1386  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  1385 atcaaattact 1375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15846 - 15780
Alignment:
Q  56 gttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 122  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15846 gttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 15780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 124
Target Start/End: Original strand, 32122 - 32216
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32122 taaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 32216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 40722 - 40628
Alignment:
Q  30 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40722 taaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 40628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 110064 - 110174
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | ||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  110064 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatg 110163  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  110164 atcaaattact 110174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 118565 - 118675
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | ||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  118565 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatg 118664  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  118665 atcaaattact 118675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 40035 - 39965
Alignment:
Q  54 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40035 atgtcagctttctaatggctttggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 39965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 45518 - 45448
Alignment:
Q  54 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  45518 atgttagctttctaatggctttggttttacttccaaataatttttagaacttgagttatgatcaaattact 45448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 79073 - 79003
Alignment:
Q  54 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  79073 atgttagctttctaattgctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 79003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 124
Target Start/End: Original strand, 1296 - 1365
Alignment:
Q  55 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1296 tgttagctttctaatggttttggtttgatttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 1365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 979 - 912
Alignment:
Q  55 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 122  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| ||||| ||||||||    
T  979 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttataacttgaattatgatcaaatta 912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 316
Target Start/End: Original strand, 7996 - 8055
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaat 316  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7996 atttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaat 8055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 938 - 868
Alignment:
Q  54 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  938 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtgcaaatgatttttagaacctgagttatgatcaaattact 868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 18315 - 18205
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| || |||||||||||||    
T  18315 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgaggtccaaatgatttttataacttgagttatg 18216  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  18215 atcaaattact 18205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 28579 - 28469
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||    | |||| ||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||||    
T  28579 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataatttttttagttttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatg 28480  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  28479 atcaaattact 28469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 38485 - 38375
Alignment:
Q  14 gaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 113  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  38485 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 38386  T
Q  114 gtcaaattact 124  Q
     ||||||||||    
T  38385 atcaaattact 38375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 54016 - 53946
Alignment:
Q  54 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  54016 atgttaactttctaatggctttggtttgactttcaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 53946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 124
Target Start/End: Original strand, 19939 - 20009
Alignment:
Q  54 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19939 atgttagctttccaatggctttggtttgaagtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 20009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 443 - 398
Alignment:
Q  13 agaattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  443 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtcgtacgtatggatgtt 398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0959 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0959
Description:

Target: scaffold0959; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 49 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1306 - 1219
Alignment:
Q  49 tatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 136  Q
    |||||||||||  |||||||||   ||||| | ||||||||| | ||| || ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  1306 tatggatgttatatttctaatggatttggtctcacttcaaaatgttttctaaaacttgatttatggtcaaattactacacataggtca 1219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 316
Target Start/End: Original strand, 60652 - 60711
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatat-tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaat 316  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  60652 atttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaat 60711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 124
Target Start/End: Original strand, 8122 - 8192
Alignment:
Q  54 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 124  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  8122 atgttagctatctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 8192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 310
Target Start/End: Original strand, 6220 - 6273
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttat-attgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 310  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  6220 atttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 6273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 720 - 667
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 310  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  720 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25289 - 25237
Alignment:
Q  258 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 310  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||    
T  25289 atttgatgttgtaataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatat 25237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 97190 - 97137
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 310  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  97190 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatat 97137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 106468 - 106415
Alignment:
Q  258 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 310  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  106468 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatat 106415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8583
Alignment:
Q  260 ttgatgttgtt-atattgtgatataat--tatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 324  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  8650 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgaga 8583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University