View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16309_high_2 (Length: 252)

Name: NF16309_high_2
Description: NF16309
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16309_high_2
NF16309_high_2
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (13-237)||(15388178-15388402)
chr4 (13-237)||(14760106-14760330)
chr4 (13-237)||(14668261-14668485)
chr4 (13-237)||(5009120-5009344)
chr4 (13-237)||(6573103-6573327)
chr4 (13-237)||(17016291-17016515)
chr4 (13-237)||(34185760-34185984)
chr4 (13-237)||(18313978-18314202)
chr4 (13-237)||(24589161-24589385)
chr4 (13-237)||(54836636-54836860)
chr4 (13-226)||(39853893-39854106)
chr4 (13-237)||(14101788-14102012)
chr4 (13-233)||(20335221-20335441)
chr4 (13-237)||(24115907-24116131)
chr4 (13-237)||(27160117-27160341)
chr4 (13-226)||(18797414-18797627)
chr4 (13-237)||(15231117-15231341)
chr4 (13-237)||(36341317-36341541)
chr4 (13-236)||(1903500-1903723)
chr4 (13-237)||(33670600-33670824)
chr4 (13-235)||(15281737-15281959)
chr4 (13-237)||(21972946-21973170)
chr4 (13-237)||(30757005-30757229)
chr4 (13-237)||(31123312-31123536)
chr4 (13-237)||(40102437-40102661)
chr4 (13-100)||(22146369-22146456)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (13-237)||(27394793-27395017)
chr2 (13-237)||(23125357-23125581)
chr2 (13-237)||(37948651-37948875)
chr2 (13-226)||(27806945-27807158)
chr2 (13-237)||(12658767-12658991)
chr2 (13-237)||(34294385-34294609)
chr2 (13-235)||(27431230-27431452)
chr2 (20-237)||(28885438-28885655)
chr2 (13-237)||(20841144-20841368)
chr2 (13-237)||(39048608-39048832)
chr2 (13-226)||(13933336-13933549)
chr2 (13-237)||(11631973-11632197)
chr2 (13-226)||(257442-257655)
chr2 (13-237)||(40236739-40236963)
chr2 (13-226)||(12590050-12590263)
chr2 (13-237)||(31879517-31879741)
chr2 (13-237)||(39893300-39893524)
chr2 (13-237)||(16826127-16826351)
chr2 (13-237)||(16895129-16895353)
chr2 (13-237)||(19413290-19413514)
chr2 (13-237)||(32053034-32053258)
chr2 (13-237)||(34864915-34865139)
chr2 (13-237)||(37380908-37381132)
chr2 (13-237)||(37682684-37682908)
chr2 (13-237)||(37697949-37698173)
chr2 (13-237)||(37928600-37928824)
chr2 (13-226)||(9346775-9346988)
chr2 (13-226)||(21673964-21674177)
chr2 (13-237)||(12713390-12713614)
chr2 (13-216)||(21699960-21700163)
chr2 (13-235)||(19453212-19453434)
chr2 (18-128)||(31890285-31890395)
chr2 (18-128)||(3785833-3785943)
chr2 (18-128)||(16164820-16164930)
chr2 (18-128)||(22924942-22925052)
chr2 (18-128)||(27779574-27779684)
chr2 (18-128)||(27819331-27819441)
chr2 (24-128)||(34158184-34158288)
chr2 (18-128)||(27119864-27119974)
chr2 (13-87)||(27827841-27827915)
chr2 (140-196)||(12383932-12383988)
chr2 (140-196)||(22949665-22949721)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (13-237)||(22077672-22077896)
chr8 (13-237)||(27605666-27605890)
chr8 (13-237)||(14560855-14561079)
chr8 (13-237)||(18793935-18794159)
chr8 (13-237)||(19691329-19691553)
chr8 (13-237)||(2134021-2134245)
chr8 (13-226)||(19205123-19205336)
chr8 (13-237)||(9357856-9358080)
chr8 (13-237)||(29832557-29832781)
chr8 (13-226)||(28358713-28358926)
chr8 (13-237)||(19677678-19677902)
chr8 (13-237)||(31357759-31357983)
chr8 (13-237)||(18712715-18712939)
chr8 (13-237)||(12089484-12089708)
chr8 (13-237)||(33261965-33262189)
chr8 (13-237)||(31486632-31486856)
chr8 (18-128)||(15770914-15771024)
chr8 (18-105)||(44564347-44564434)
chr8 (24-111)||(21344943-21345030)
chr8 (176-237)||(16286632-16286694)
chr8 (141-226)||(19844409-19844494)
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (13-237)||(5593200-5593424)
chr3 (13-237)||(18054455-18054679)
chr3 (13-237)||(18273895-18274119)
chr3 (13-237)||(18289196-18289420)
chr3 (13-237)||(18304497-18304721)
chr3 (13-236)||(4793478-4793701)
chr3 (13-235)||(8286313-8286535)
chr3 (13-242)||(18333818-18334047)
chr3 (13-237)||(6205096-6205320)
chr3 (13-237)||(8299164-8299388)
chr3 (13-237)||(15889548-15889772)
chr3 (13-237)||(21677896-21678120)
chr3 (13-242)||(35883954-35884183)
chr3 (13-237)||(4686848-4687072)
chr3 (13-237)||(4724824-4725048)
chr3 (13-237)||(15737937-15738161)
chr3 (13-237)||(22384421-22384645)
chr3 (13-237)||(29145599-29145823)
chr3 (13-237)||(29661813-29662037)
chr3 (13-226)||(20573686-20573899)
chr3 (13-226)||(32442355-32442568)
chr3 (13-237)||(8214928-8215152)
chr3 (13-237)||(20069233-20069457)
chr3 (13-237)||(48469120-48469344)
chr3 (13-237)||(7076399-7076623)
chr3 (13-237)||(28112797-28113021)
chr3 (13-237)||(47026646-47026870)
chr3 (13-237)||(5016907-5017131)
chr3 (13-237)||(5606157-5606381)
chr3 (13-237)||(10399337-10399561)
chr3 (13-237)||(28342370-28342594)
chr3 (13-226)||(18245945-18246158)
chr3 (13-237)||(4343519-4343743)
chr3 (13-237)||(4420108-4420332)
chr3 (13-237)||(5470181-5470405)
chr3 (13-237)||(6539585-6539809)
chr3 (13-237)||(7999753-7999977)
chr3 (13-237)||(10646266-10646490)
chr3 (13-233)||(19697687-19697907)
chr3 (13-237)||(22867691-22867915)
chr3 (13-237)||(22882750-22882974)
chr3 (13-237)||(28024475-28024699)
chr3 (13-235)||(16621333-16621555)
chr3 (13-237)||(24331356-24331580)
chr3 (13-237)||(31961298-31961522)
chr3 (13-237)||(51785216-51785440)
chr3 (13-237)||(17981792-17982016)
chr3 (13-237)||(18228389-18228613)
chr3 (44-237)||(11107226-11107419)
chr3 (18-128)||(17992779-17992889)
chr3 (18-128)||(31033084-31033194)
chr3 (13-128)||(4627087-4627202)
chr3 (18-128)||(32293930-32294040)
chr3 (13-128)||(5714375-5714490)
chr3 (13-128)||(5725285-5725400)
chr3 (13-128)||(5766968-5767083)
chr3 (13-100)||(6963276-6963363)
chr3 (138-198)||(15592879-15592939)
chr3 (140-198)||(15918749-15918807)
chr3 (140-198)||(20443349-20443407)
chr3 (140-198)||(41440475-41440533)
chr3 (140-196)||(5950772-5950828)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (13-237)||(10913554-10913778)
chr7 (13-237)||(2157803-2158027)
chr7 (13-237)||(26438486-26438710)
chr7 (13-237)||(26534558-26534782)
chr7 (13-237)||(2106848-2107072)
chr7 (13-237)||(11421464-11421688)
chr7 (13-237)||(45390449-45390673)
chr7 (13-235)||(16515115-16515337)
chr7 (13-226)||(26516032-26516245)
chr7 (13-237)||(5131225-5131449)
chr7 (13-237)||(5144025-5144249)
chr7 (13-237)||(22145424-22145648)
chr7 (13-237)||(26271771-26271995)
chr7 (13-237)||(26316533-26316757)
chr7 (13-235)||(10844851-10845073)
chr7 (13-226)||(31561075-31561288)
chr7 (13-237)||(3448535-3448759)
chr7 (13-237)||(4141931-4142155)
chr7 (13-237)||(4202618-4202842)
chr7 (13-237)||(11444116-11444340)
chr7 (27-235)||(16044550-16044758)
chr7 (13-235)||(10842679-10842901)
chr7 (13-226)||(16748202-16748415)
chr7 (13-237)||(26666599-26666823)
chr7 (13-237)||(24589219-24589443)
chr7 (13-216)||(16446691-16446894)
chr7 (18-128)||(2776592-2776702)
chr7 (18-128)||(26512386-26512496)
chr7 (18-128)||(26681796-26681906)
chr7 (18-128)||(31127245-31127355)
chr7 (18-128)||(39209829-39209939)
chr7 (88-237)||(9621879-9622028)
chr7 (18-121)||(45734658-45734761)
chr7 (18-128)||(31087312-31087422)
chr7 (140-196)||(9469590-9469646)
chr7 (150-198)||(16287201-16287249)
chr7 (140-196)||(16393246-16393302)
chr7 (140-196)||(30369758-30369814)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (13-237)||(27022365-27022589)
chr6 (13-237)||(27287107-27287331)
chr6 (13-237)||(29552786-29553010)
chr6 (13-237)||(13295694-13295918)
chr6 (13-237)||(15421063-15421287)
chr6 (13-237)||(22931627-22931851)
chr6 (13-237)||(23854072-23854296)
chr6 (13-237)||(24866945-24867169)
chr6 (13-233)||(27626454-27626674)
chr6 (13-237)||(16677369-16677593)
chr6 (13-237)||(27179685-27179909)
chr6 (13-237)||(27269330-27269554)
chr6 (13-237)||(34461249-34461473)
chr6 (13-237)||(3699312-3699536)
chr6 (13-237)||(4760992-4761216)
chr6 (13-233)||(17089186-17089406)
chr6 (13-237)||(27010960-27011184)
chr6 (24-237)||(26921606-26921819)
chr6 (24-237)||(16753050-16753263)
chr6 (13-237)||(27060735-27060959)
chr6 (13-237)||(29504645-29504869)
chr6 (13-237)||(4528514-4528738)
chr6 (13-237)||(4542517-4542741)
chr6 (13-237)||(4720878-4721102)
chr6 (13-237)||(27488362-27488586)
chr6 (13-237)||(29576243-29576467)
chr6 (13-237)||(30554759-30554983)
chr6 (13-216)||(20171797-20172000)
chr6 (13-216)||(22163991-22164194)
chr6 (13-237)||(16940770-16940994)
chr6 (13-237)||(26113155-26113379)
chr6 (13-237)||(28210683-28210907)
chr6 (13-237)||(4776109-4776333)
chr6 (13-128)||(22455857-22455972)
chr6 (13-165)||(26992096-26992248)
chr6 (13-128)||(26775370-26775485)
chr6 (13-128)||(27358853-27358968)
chr6 (13-128)||(27449196-27449311)
chr6 (18-128)||(14142142-14142252)
chr6 (18-128)||(26789154-26789264)
chr6 (18-128)||(27197523-27197633)
chr6 (18-128)||(27251602-27251712)
chr6 (18-121)||(8902451-8902554)
chr6 (13-121)||(28163836-28163944)
chr6 (13-112)||(33373174-33373273)
chr6 (18-128)||(13520940-13521049)
chr6 (140-196)||(9136223-9136279)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (13-237)||(15655455-15655679)
chr5 (13-237)||(41677944-41678168)
chr5 (13-237)||(11552594-11552818)
chr5 (13-237)||(33295767-33295991)
chr5 (13-237)||(33780728-33780952)
chr5 (13-226)||(40470247-40470460)
chr5 (13-237)||(22995814-22996038)
chr5 (13-237)||(23629209-23629433)
chr5 (13-237)||(24684842-24685066)
chr5 (13-237)||(24973145-24973369)
chr5 (13-237)||(18372231-18372455)
chr5 (13-237)||(31434703-31434927)
chr5 (13-237)||(37355340-37355564)
chr5 (13-235)||(23895447-23895669)
chr5 (13-237)||(3792780-3793004)
chr5 (13-237)||(9320715-9320939)
chr5 (13-237)||(12135414-12135638)
chr5 (13-237)||(18497422-18497646)
chr5 (13-237)||(26483633-26483857)
chr5 (18-237)||(43081494-43081713)
chr5 (13-237)||(13321527-13321751)
chr5 (13-237)||(28652481-28652705)
chr5 (13-237)||(30032667-30032891)
chr5 (13-237)||(37767688-37767912)
chr5 (13-237)||(6877544-6877768)
chr5 (13-237)||(8662172-8662396)
chr5 (13-237)||(24586613-24586837)
chr5 (13-237)||(30155270-30155494)
chr5 (13-237)||(30171708-30171932)
chr5 (13-237)||(30937874-30938098)
chr5 (13-237)||(31823104-31823328)
chr5 (13-237)||(33519619-33519843)
chr5 (13-237)||(34619757-34619981)
chr5 (13-237)||(37668183-37668407)
chr5 (13-237)||(37758222-37758446)
chr5 (13-232)||(22891707-22891926)
chr5 (13-235)||(25203519-25203741)
chr5 (13-235)||(25267674-25267896)
chr5 (13-226)||(15755549-15755762)
chr5 (13-237)||(24727208-24727432)
chr5 (13-237)||(32592971-32593195)
chr5 (13-237)||(5641027-5641251)
chr5 (13-237)||(28956482-28956706)
chr5 (13-237)||(2514301-2514525)
chr5 (13-128)||(18125113-18125228)
chr5 (13-127)||(13439380-13439494)
chr5 (18-128)||(9547411-9547521)
chr5 (18-128)||(11326985-11327095)
chr5 (13-128)||(13183490-13183605)
chr5 (18-128)||(29887899-29888009)
chr5 (18-128)||(33878479-33878588)
chr5 (13-100)||(351912-351999)
chr5 (140-196)||(5440049-5440105)
chr5 (140-196)||(11944246-11944302)
chr5 (140-196)||(15784549-15784605)
chr5 (140-196)||(17957376-17957432)
chr5 (150-198)||(34468900-34468948)
chr5 (140-196)||(36375786-36375842)
chr5 (140-196)||(37000440-37000496)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (13-235)||(3301-3523)
scaffold0089 (99-237)||(43877-44015)
scaffold0089 (164-235)||(32096-32167)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (13-237)||(9268-9492)
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (13-237)||(30525-30749)
scaffold0143 (13-235)||(19304-19526)
scaffold0143 (13-128)||(7301-7416)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (13-226)||(21894549-21894762)
chr1 (13-237)||(51641452-51641676)
chr1 (13-232)||(20339101-20339320)
chr1 (13-226)||(10965910-10966123)
chr1 (13-237)||(28588219-28588443)
chr1 (13-237)||(3644366-3644593)
chr1 (13-226)||(41790110-41790323)
chr1 (13-237)||(10948311-10948535)
chr1 (13-234)||(16204834-16205055)
chr1 (27-235)||(20464212-20464420)
chr1 (18-128)||(28153079-28153189)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (13-237)||(15813-16037)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (13-232)||(1424-1643)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (13-237)||(22991-23215)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (13-237)||(9254-9478)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (13-237)||(12803-13027)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (13-237)||(11728-11952)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (13-237)||(11181-11405)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (13-237)||(5979-6203)
scaffold0159 (165-237)||(23111-23183)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (13-235)||(9279-9501)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (13-235)||(5471-5693)
[»] scaffold1888 (1 HSPs)
scaffold1888 (141-237)||(1155-1251)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (24-227)||(43541-43754)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (138-198)||(35165-35225)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (162-223)||(33706-33770)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (140-196)||(29443-29499)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 15388178 - 15388402
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15388178 acataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 15388277  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
    || ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15388278 cacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 15388377  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15388378 cctcggacttgcttttcggtctgtg 15388402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 14760106 - 14760330
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14760106 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 14760205  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14760206 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 14760305  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  14760306 cctctgacttgcttctcggtctgtg 14760330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14668485 - 14668261
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14668485 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 14668386  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668385 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 14668286  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||    
T  14668285 tctctgacttgcttctcggtctgtg 14668261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5009344 - 5009120
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5009344 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5009245  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5009244 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 5009145  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  5009144 cctctgacttgcttctctgtctgtg 5009120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6573327 - 6573103
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6573327 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 6573228  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6573227 tacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 6573128  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  6573127 cctctgacttgcttctctgtctgtg 6573103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17016515 - 17016291
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17016515 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 17016416  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17016415 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 17016316  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  17016315 cctctgacttgcttctcggtctgtg 17016291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 34185760 - 34185984
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  34185760 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 34185859  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34185860 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 34185959  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  34185960 cctctgacttgcttctcggtctgtg 34185984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 18313978 - 18314202
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  18313978 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 18314077  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18314078 tacaataggctgattcttgctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18314177  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  18314178 cctctgacttgcttctctgtctgtg 18314202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 24589161 - 24589385
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  24589161 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 24589260  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589261 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 24589360  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  24589361 cctctgacttgcttctcagtctgtg 24589385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 54836860 - 54836636
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  54836860 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 54836761  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  54836760 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgtccgaggaaa 54836661  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  54836660 cctctgacttgcttctcggtctgtg 54836636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39854106 - 39853893
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  39854106 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 39854007  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| || ||| || | || |  ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854006 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaagataggcccgcaggttgtggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 39853907  T
Q  213 cctcggacttgctt 226  Q
    |||| |||||||||    
T  39853906 cctctgacttgctt 39853893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14102012 - 14101788
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14102012 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 14101913  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  14101912 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 14101813  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  14101812 cctctgacttgcttctctgtctgtg 14101788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Original strand, 20335221 - 20335441
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20335221 acataatcaaaggccttccttctacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 20335320  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20335321 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 20335420  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtc 233  Q
    |||| ||||||||| ||||||    
T  20335421 cctctgacttgcttctcggtc 20335441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24116131 - 24115907
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24116131 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24116032  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     |  | ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24116031 tacgacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 24115932  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  24115931 cctctgacttgcttctcggtctgtg 24115907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 27160117 - 27160341
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27160117 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27160216  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27160217 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27160316  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  27160317 cctctgacttgcttctctgtctgtg 27160341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 18797414 - 18797627
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18797414 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtacttcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18797513  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797514 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18797613  T
Q  213 cctcggacttgctt 226  Q
    |||| |||||||||    
T  18797614 cctctgacttgctt 18797627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15231341 - 15231117
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  15231341 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 15231242  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15231241 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 15231142  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| |||||| || ||||||||||    
T  15231141 cctctgacttgtttctcggtctgtg 15231117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 36341317 - 36341541
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  36341317 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggctttcatcattcca 36341416  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     |  ||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36341417 tacgataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 36341516  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| |||||| || || |||||||    
T  36341517 cctctgacttgtttctctgtctgtg 36341541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1903723 - 1903500
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | |||||||||   |||||    
T  1903723 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcaacgttcca 1903624  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  |||| || ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1903623 tacaataggctgattcttcctgagtaacttgaagatcggcccgcaggctgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 1903524  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgt 236  Q
    |||| |||||| || |||||||||    
T  1903523 cctctgacttgtttctcggtctgt 1903500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 33670600 - 33670824
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33670600 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33670699  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  33670700 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 33670799  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  33670800 cctctgacttgcttctctgtctgtg 33670824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 15281737 - 15281959
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  15281737 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaaatcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 15281836  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15281837 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 15281936  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctg 235  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  15281937 cctctgacttgtttctcggtctg 15281959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21973170 - 21972946
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21973170 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 21973071  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  21973070 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 21972971  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  21972970 cctctgacttgcttctctgtctgtg 21972946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30757229 - 30757005
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30757229 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30757130  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  30757129 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 30757030  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  30757029 cctctgacttgcttctctgtctgtg 30757005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 31123312 - 31123536
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31123312 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31123411  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  31123412 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31123511  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  31123512 cctctgacttgcttctctgtctgtg 31123536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 40102437 - 40102661
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  40102437 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 40102536  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| |  | || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  40102537 tacaacaggctggttcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 40102636  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  40102637 cctctgacttgcttctctgtctgtg 40102661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 100
Target Start/End: Original strand, 22146369 - 22146456
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggca 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| | || |||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22146369 acatgatcaaaggccttccttcaactggagggaccagaatcggaggttctaacaaataccctttgatgctatcaaaagctttctggca 22146456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27395017 - 27394793
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27395017 acataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 27394918  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
    || ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394917 cacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27394818  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27394817 cctcggacttgcttttcggtctgtg 27394793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 23125357 - 23125581
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  23125357 acataatcaaaggccttccttccacgggtggcacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 23125456  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23125457 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 23125556  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  23125557 cctctgacttgcttctcggtctgtg 23125581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 37948651 - 37948875
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37948651 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37948750  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| || ||| || | || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37948751 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 37948850  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  37948851 cctctgacttgcttctcggtctgtg 37948875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27807158 - 27806945
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27807158 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27807059  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| || ||| || | || |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27807058 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27806959  T
Q  213 cctcggacttgctt 226  Q
    |||| |||||||||    
T  27806958 cctctgacttgctt 27806945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12658991 - 12658767
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12658991 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12658892  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12658891 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 12658792  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  12658791 cctctgacttgcttctcggtttgtg 12658767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34294609 - 34294385
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  34294609 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 34294510  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34294509 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 34294410  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  34294409 cctctgacttgcttctcggtctgtg 34294385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 27431230 - 27431452
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27431230 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27431329  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| | |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27431330 tacaataggctaattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 27431429  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctg 235  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  27431430 cctctgacttgcttctcggtctg 27431452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28885655 - 28885438
Alignment:
Q  20 caagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataata 119  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||    
T  28885655 caagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaata 28885556  T
Q  120 ggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgga 219  Q
    ||||||||| || |||| |  ||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  28885555 ggttgattctttctgagtagcttgaagaccggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctga 28885456  T
Q  220 cttgcttttcggtctgtg 237  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  28885455 cttgcttctcggtctgtg 28885438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20841368 - 20841144
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20841368 acataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 20841269  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20841268 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 20841169  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  20841168 cctctgacttgcttctcggtctgtg 20841144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 39048608 - 39048832
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  39048608 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 39048707  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39048708 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 39048807  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    ||||  |||||||| || |||||||    
T  39048808 cctcttacttgcttctcagtctgtg 39048832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 13933336 - 13933549
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13933336 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 13933435  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13933436 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 13933535  T
Q  213 cctcggacttgctt 226  Q
    |||| |||||||||    
T  13933536 cctctgacttgctt 13933549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 11631973 - 11632197
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11631973 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11632072  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  11632073 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 11632172  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  11632173 cctctgacttgcttctctgtctgtg 11632197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 257442 - 257655
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  257442 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 257541  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  257542 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 257641  T
Q  213 cctcggacttgctt 226  Q
    |||| |||||||||    
T  257642 cctctgacttgctt 257655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40236963 - 40236739
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  40236963 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcgaaagcttcttggcattcattattcca 40236864  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40236863 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 40236764  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  40236763 cctctgacttgcttctctgtctgtg 40236739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12590263 - 12590050
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  12590263 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 12590164  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12590163 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 12590064  T
Q  213 cctcggacttgctt 226  Q
    |||| |||||||||    
T  12590063 cctctgacttgctt 12590050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31879741 - 31879517
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31879741 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31879642  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  31879641 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31879542  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  31879541 cctctgacttgcttctctgtctgtg 31879517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39893524 - 39893300
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  39893524 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 39893425  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39893424 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 39893325  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  39893324 cctctgacttgcttctctgtctgtg 39893300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 16826127 - 16826351
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16826127 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16826226  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  16826227 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 16826326  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  16826327 cctctgacttgcttctctgtctgtg 16826351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16895353 - 16895129
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16895353 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16895254  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  16895253 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 16895154  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  16895153 cctctgacttgcttctctgtctgtg 16895129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 19413290 - 19413514
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19413290 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 19413389  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  19413390 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 19413489  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  19413490 cctctgacttgcttctctgtctgtg 19413514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 32053258 - 32053034
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  32053258 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 32053159  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  32053158 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 32053059  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  32053058 cctctgacttgcttctctgtctgtg 32053034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34865139 - 34864915
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  34865139 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 34865040  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  34865039 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 34864940  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  34864939 cctctgacttgcttctctgtctgtg 34864915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 37381132 - 37380908
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37381132 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37381033  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||    
T  37381032 tacaacaggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaagtgtccgaggaaa 37380933  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| |||||| || ||||||||||    
T  37380932 cctctgacttgtttctcggtctgtg 37380908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 37682684 - 37682908
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37682684 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37682783  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  37682784 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37682883  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  37682884 cctctgacttgcttctctgtctgtg 37682908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 37697949 - 37698173
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37697949 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37698048  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  37698049 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37698148  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  37698149 cctctgacttgcttctctgtctgtg 37698173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 37928824 - 37928600
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37928824 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37928725  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  37928724 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37928625  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  37928624 cctctgacttgcttctctgtctgtg 37928600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 9346775 - 9346988
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9346775 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattcca 9346874  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  9346875 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 9346974  T
Q  213 cctcggacttgctt 226  Q
    |||| |||||||||    
T  9346975 cctctgacttgctt 9346988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 21673964 - 21674177
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21673964 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 21674063  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  21674064 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 21674163  T
Q  213 cctcggacttgctt 226  Q
    |||| |||||||||    
T  21674164 cctctgacttgctt 21674177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 12713390 - 12713614
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12713390 acatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12713489  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  12713490 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 12713589  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  12713590 cctctgacttgcttctctgtctgtg 12713614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Original strand, 21699960 - 21700163
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  21699960 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggattggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 21700059  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21700060 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 21700159  T
Q  213 cctc 216  Q
    ||||    
T  21700160 cctc 21700163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 19453212 - 19453434
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||| |||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  19453212 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgccatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 19453311  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19453312 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 19453411  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctg 235  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  19453412 cctctgacttgtttctcggtctg 19453434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 31890285 - 31890395
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  31890285 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattgttccatacaa 31890384  T
Q  118 taggttgattc 128  Q
    |||| ||||||    
T  31890385 taggctgattc 31890395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 3785943 - 3785833
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  3785943 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcagttaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 3785844  T
Q  118 taggttgattc 128  Q
    |||| ||||||    
T  3785843 taggctgattc 3785833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16164930 - 16164820
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  16164930 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 16164831  T
Q  118 taggttgattc 128  Q
    |||| ||||||    
T  16164830 taggctgattc 16164820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 22924942 - 22925052
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  22924942 atcaaaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 22925041  T
Q  118 taggttgattc 128  Q
    |||||||||||    
T  22925042 taggttgattc 22925052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27779684 - 27779574
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  27779684 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27779585  T
Q  118 taggttgattc 128  Q
    |||| ||||||    
T  27779584 taggctgattc 27779574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27819441 - 27819331
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  27819441 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27819342  T
Q  118 taggttgattc 128  Q
    |||| ||||||    
T  27819341 taggctgattc 27819331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 34158288 - 34158184
Alignment:
Q  24 ggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggtt 123  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| |    
T  34158288 ggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggct 34158189  T
Q  124 gattc 128  Q
    |||||    
T  34158188 gattc 34158184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27119974 - 27119864
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  27119974 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 27119875  T
Q  118 taggttgattc 128  Q
    |||| ||||||    
T  27119874 taggctgattc 27119864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 27827915 - 27827841
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaa 87  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||    
T  27827915 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaa 27827841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12383988 - 12383932
Alignment:
Q  140 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 196  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12383988 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 12383932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22949721 - 22949665
Alignment:
Q  140 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 196  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22949721 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 22949665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 22077672 - 22077896
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077672 acataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 22077771  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
    || ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077772 cacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatcagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 22077871  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22077872 cctcggacttgcttttcggtctgtg 22077896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 27605666 - 27605890
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27605666 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27605765  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27605766 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27605865  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  27605866 cctctgacttgcttctcggtctgtg 27605890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14561079 - 14560855
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  14561079 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 14560980  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | ||||||||||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14560979 tacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 14560880  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  14560879 cctctgacttgcttctcggtctgtg 14560855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18794159 - 18793935
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18794159 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18794060  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18794059 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatttaaacgcccgaggaaa 18793960  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  18793959 cctctgacttgcttctcggtctgtg 18793935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19691553 - 19691329
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19691553 acataatcaaaggccttccttccgcgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 19691454  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  19691453 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 19691354  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  19691353 cctctgacttgcttctcggtttgtg 19691329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 2134021 - 2134245
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  2134021 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggcattcatcattcca 2134120  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2134121 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 2134220  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  2134221 cctctgacttgcttctcggtctgtg 2134245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 19205123 - 19205336
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19205123 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 19205222  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  19205223 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 19205322  T
Q  213 cctcggacttgctt 226  Q
    |||| |||||||||    
T  19205323 cctctgacttgctt 19205336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9358080 - 9357856
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9358080 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 9357981  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  9357980 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 9357881  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  9357880 cctctgacttgcttctctgtctgtg 9357856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29832781 - 29832557
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29832781 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29832682  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  29832681 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaa 29832582  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  29832581 cctctgacttgcttctctgtctgtg 29832557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 28358713 - 28358926
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28358713 acataatcaaaggccttccttccgcggatgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28358812  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  28358813 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 28358912  T
Q  213 cctcggacttgctt 226  Q
    |||| |||||||||    
T  28358913 cctctgacttgctt 28358926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19677902 - 19677678
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19677902 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattcca 19677803  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  19677802 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 19677703  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  19677702 cctctgacttgcttctctgtctgtg 19677678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31357983 - 31357759
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31357983 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31357884  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| |||| || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  31357883 tacaacagggtggttctttttaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31357784  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  31357783 cctctgacttgcttctctgtctgtg 31357759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18712939 - 18712715
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  18712939 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 18712840  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18712839 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaa 18712740  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| |||||| || ||||||||||    
T  18712739 cctctgacttgtttctcggtctgtg 18712715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 12089484 - 12089708
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12089484 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12089583  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  12089584 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 12089683  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  12089684 cctctgacttgcttctctgtctgtg 12089708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33262189 - 33261965
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33262189 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33262090  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  33262089 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 33261990  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  33261989 cctctgacttgcttctctgtctgtg 33261965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 31486632 - 31486856
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31486632 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31486731  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||  || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31486732 tacaacaggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgcccgaggaaa 31486831  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  31486832 cctctgacttgcttctctgtctgtg 31486856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 15771024 - 15770914
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  15771024 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 15770925  T
Q  118 taggttgattc 128  Q
    |||| ||||||    
T  15770924 taggctgattc 15770914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 44564434 - 44564347
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcat 105  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44564434 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcat 44564347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 111
Target Start/End: Original strand, 21344943 - 21345030
Alignment:
Q  24 ggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcc 111  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  21344943 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcc 21345030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16286694 - 16286632
Alignment:
Q  176 tatgaatcgggagatgtaattcaaacgcc-cgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16286694 tatgaatcgggagatgtaattcaatcgtctcgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 16286632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 141 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19844494 - 19844409
Alignment:
Q  141 ttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 226  Q
    ||||||||||| || || || || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |  || || ||||||| |||||||||    
T  19844494 ttgaaaattggtccacatgtggcagtcatatgagatataaatctggagatgtagttcaatctaccaagaaaacctctgacttgctt 19844409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 5593200 - 5593424
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5593200 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 5593299  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5593300 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 5593399  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  5593400 cctctgacttgcttctctgtctgtg 5593424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18054679 - 18054455
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  18054679 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 18054580  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18054579 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18054480  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  18054479 cctctgacttgcttctcggtctgtg 18054455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 18273895 - 18274119
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18273895 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18273994  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18273995 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 18274094  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  18274095 cctctgacttgcttctcggtctgtg 18274119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 18289196 - 18289420
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18289196 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18289295  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18289296 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 18289395  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  18289396 cctctgacttgcttctcggtctgtg 18289420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 18304497 - 18304721
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18304497 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18304596  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18304597 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 18304696  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  18304697 cctctgacttgcttctcggtctgtg 18304721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Original strand, 4793478 - 4793701
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4793478 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4793577  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4793578 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 4793677  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgt 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||    
T  4793678 cctctgacttgcttctcggtctgt 4793701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 8286313 - 8286535
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8286313 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 8286412  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286413 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 8286512  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctg 235  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  8286513 cctctgacttgcttctcggtctg 8286535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18334047 - 18333818
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18334047 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18333948  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18333947 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18333848  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtgctgct 242  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  18333847 cctctgacttgcttctcggtctgtggtgct 18333818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6205320 - 6205096
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6205320 acataatcaagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 6205221  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6205220 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 6205121  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  6205120 cctctgacttgcttctcagtctgtg 6205096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8299388 - 8299164
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  8299388 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 8299289  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | ||||||||||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8299288 tacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 8299189  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  8299188 cctctgacttgcttctcggtctgtg 8299164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 15889548 - 15889772
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15889548 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15889647  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15889648 tacaataggctgattctttctgaggagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 15889747  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  15889748 cctctgacttgcttctcggtctgtg 15889772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21678120 - 21677896
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  21678120 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 21678021  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678020 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 21677921  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  21677920 cctctgacttgcttctcggtctgtg 21677896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 35884183 - 35883954
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  35884183 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 35884084  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35884083 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 35883984  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtgctgct 242  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  35883983 cctctgacttgcttctcggtctgtggtgct 35883954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4687072 - 4686848
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4687072 acataatcaagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4686973  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4686972 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 4686873  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  4686872 cctctgacttgcttctcagtctgtg 4686848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4725048 - 4724824
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4725048 acataatcaagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4724949  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4724948 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 4724849  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  4724848 cctctgacttgcttctcagtctgtg 4724824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 15737937 - 15738161
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  15737937 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 15738036  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | | |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15738037 tacagtaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 15738136  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  15738137 cctctgacttgcttctcggtctgtg 15738161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 22384421 - 22384645
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  22384421 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 22384520  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | ||||||||||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22384521 tacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgttcgaggaaa 22384620  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  22384621 cctctgacttgcttctcggtctgtg 22384645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 29145599 - 29145823
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29145599 acataatcaaaggccttccctccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29145698  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29145699 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 29145798  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||    
T  29145799 cctctaacttgcttctcggtctgtg 29145823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 29661813 - 29662037
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29661813 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29661912  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  | || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29661913 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 29662012  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  29662013 cctctgacttgcttctcggtctgtg 29662037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 20573686 - 20573899
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  20573686 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcctcattcca 20573785  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| || ||| || | || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20573786 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggtccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 20573885  T
Q  213 cctcggacttgctt 226  Q
    |||| |||||||||    
T  20573886 cctctgacttgctt 20573899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32442568 - 32442355
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  32442568 acataatcaaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 32442469  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||  |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32442468 tacaacagactgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 32442369  T
Q  213 cctcggacttgctt 226  Q
    |||| |||||||||    
T  32442368 cctctgacttgctt 32442355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8215152 - 8214928
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8215152 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 8215053  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
    || || ||| |||||  || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  8215052 cacaacaggctgattttttctgagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 8214953  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  8214952 cctctgacttgcttctctgtctgtg 8214928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20069457 - 20069233
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20069457 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 20069358  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     |  ||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20069357 tacgataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 20069258  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  20069257 cctctgacttgcttctcagtctgtg 20069233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 48469344 - 48469120
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48469344 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcattattcca 48469245  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48469244 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 48469145  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||  |||||| || || |||||||    
T  48469144 cctatgacttgtttctctgtctgtg 48469120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7076623 - 7076399
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7076623 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 7076524  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| || ||| || |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  7076523 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatgcgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 7076424  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  7076423 cctctgacttgcttctcggtctgtg 7076399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 28112797 - 28113021
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  28112797 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattcca 28112896  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  28112897 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgctgtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 28112996  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  28112997 cctctgacttgcttctctgtctgtg 28113021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 47026870 - 47026646
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  47026870 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 47026771  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  47026770 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 47026671  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  47026670 cctctgacttgcttctctgtctgtg 47026646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5017131 - 5016907
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5017131 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5017032  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  5017031 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 5016932  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  5016931 cctctgacttgcttctctgtctgtg 5016907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 5606157 - 5606381
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5606157 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5606256  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  5606257 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 5606356  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  5606357 cctctgacttgcttctctgtctgtg 5606381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10399561 - 10399337
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10399561 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 10399462  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10399461 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 10399362  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| |||||| || || |||||||    
T  10399361 cctctgacttgtttctctgtctgtg 10399337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28342594 - 28342370
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28342594 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28342495  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  28342494 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 28342395  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  28342394 cctctgacttgcttctctgtctgtg 28342370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18246158 - 18245945
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18246158 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18246059  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  18246058 tacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 18245959  T
Q  213 cctcggacttgctt 226  Q
    |||| |||||||||    
T  18245958 cctctgacttgctt 18245945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 4343519 - 4343743
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4343519 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4343618  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  4343619 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4343718  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  4343719 cctctgacttgcttctctgtctgtg 4343743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4420332 - 4420108
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4420332 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4420233  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  4420232 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4420133  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  4420132 cctctgacttgcttctctgtctgtg 4420108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5470405 - 5470181
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5470405 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5470306  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  5470305 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 5470206  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  5470205 cctctgacttgcttctctgtctgtg 5470181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 6539585 - 6539809
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6539585 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 6539684  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  6539685 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 6539784  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  6539785 cctctgacttgcttctctgtctgtg 6539809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7999977 - 7999753
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7999977 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 7999878  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  7999877 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 7999778  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  7999777 cctctgacttgcttctctgtctgtg 7999753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10646490 - 10646266
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10646490 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 10646391  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  10646390 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 10646291  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  10646290 cctctgacttgcttctctgtctgtg 10646266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19697907 - 19697687
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  19697907 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgacgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 19697808  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| | ||||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  19697807 tacaataggctgattcttcttgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaattgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 19697708  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtc 233  Q
    |||| |||||| || ||||||    
T  19697707 cctctgacttgtttctcggtc 19697687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 22867691 - 22867915
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22867691 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 22867790  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  22867791 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 22867890  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  22867891 cctctgacttgcttctctgtctgtg 22867915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 22882750 - 22882974
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22882750 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 22882849  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  22882850 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 22882949  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  22882950 cctctgacttgcttctctgtctgtg 22882974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28024699 - 28024475
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  28024699 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 28024600  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28024599 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 28024500  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  28024499 cctctgacttgcttctctgtctgtg 28024475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 16621333 - 16621555
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  16621333 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 16621432  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16621433 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 16621532  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctg 235  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  16621533 cctctgacttgtttctcggtctg 16621555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24331580 - 24331356
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  24331580 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctttttggcattcatcattcca 24331481  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  24331480 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 24331381  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  24331380 cctctgacttgcttctctgtctgtg 24331356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 31961298 - 31961522
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31961298 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaagaataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31961397  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  31961398 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31961497  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  31961498 cctctgacttgcttctctgtctgtg 31961522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 51785440 - 51785216
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  51785440 acatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 51785341  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  51785340 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 51785241  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  51785240 cctctgacttgcttctctgtctgtg 51785216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 17981792 - 17982016
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17981792 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 17981891  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  17981892 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 17981991  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  17981992 cctctgacttgcttctctgtctgtg 17982016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18228613 - 18228389
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18228613 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18228514  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  18228513 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 18228414  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  18228413 cctctgacttgcttctctgtctgtg 18228389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 237
Target Start/End: Original strand, 11107226 - 11107419
Alignment:
Q  44 gacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttgattcattttgagaaatttg 143  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| | |||||| ||| || || |||| |  |||    
T  11107226 gacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcttcattccatacaataggctgactctttctgagtagcttg 11107325  T
Q  144 aaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11107326 aagatcggcccacaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 11107419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 17992779 - 17992889
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  17992779 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 17992878  T
Q  118 taggttgattc 128  Q
    |||||||||||    
T  17992879 taggttgattc 17992889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 31033084 - 31033194
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  31033084 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatataa 31033183  T
Q  118 taggttgattc 128  Q
    |||| ||||||    
T  31033184 taggctgattc 31033194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 4627202 - 4627087
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4627202 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4627103  T
Q  113 cataataggttgattc 128  Q
     | |||||| ||||||    
T  4627102 tacaataggctgattc 4627087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 32294040 - 32293930
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  32294040 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 32293941  T
Q  118 taggttgattc 128  Q
    |||| ||||||    
T  32293940 taggctgattc 32293930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5714490 - 5714375
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  5714490 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 5714391  T
Q  113 cataataggttgattc 128  Q
     | |||||| ||||||    
T  5714390 tacaataggctgattc 5714375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5725400 - 5725285
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  5725400 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 5725301  T
Q  113 cataataggttgattc 128  Q
     | |||||| ||||||    
T  5725300 tacaataggctgattc 5725285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Original strand, 5766968 - 5767083
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  5766968 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 5767067  T
Q  113 cataataggttgattc 128  Q
     | |||||| ||||||    
T  5767068 tacaataggctgattc 5767083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 100
Target Start/End: Original strand, 6963276 - 6963363
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggca 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| | || |||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6963276 acatgatcaaaggccttccttcaactggagggacaagaatcggaggttctaacaaataccctttgatgctatcaaaagctttctggca 6963363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 198
Target Start/End: Original strand, 15592879 - 15592939
Alignment:
Q  138 aatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 198  Q
    |||||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15592879 aatttgaatatcggcctgcacgttgctgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 15592939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15918807 - 15918749
Alignment:
Q  140 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 198  Q
    |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15918807 tttgaatatcggtccgcacgttgctgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 15918749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20443407 - 20443349
Alignment:
Q  140 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 198  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20443407 tttgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagagatgaaacgggagatgtaattca 20443349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41440533 - 41440475
Alignment:
Q  140 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 198  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41440533 tttgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagagatgaaacgggagatgtaattca 41440475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 196
Target Start/End: Original strand, 5950772 - 5950828
Alignment:
Q  140 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 196  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5950772 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 5950828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 10913554 - 10913778
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  10913554 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 10913653  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10913654 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 10913753  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  10913754 cctctgacttgcttctcggtctgtg 10913778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2158027 - 2157803
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2158027 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 2157928  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2157927 tacaataggctgattcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 2157828  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  2157827 cctctgacttgcttctcggtctgtg 2157803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26438710 - 26438486
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26438710 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26438611  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| || ||| || | || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26438610 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 26438511  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| |||||| || ||||||||||    
T  26438510 cctctgacttgtttctcggtctgtg 26438486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 26534558 - 26534782
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26534558 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26534657  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26534658 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggaaatgtaattcaaacgcccgaggaaa 26534757  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  26534758 cctctgacttgcttctcggtttgtg 26534782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 2106848 - 2107072
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  2106848 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 2106947  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | ||||||||||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2106948 tacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 2107047  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  2107048 cctctgacttgcttctcggtatgtg 2107072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 11421464 - 11421688
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  11421464 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 11421563  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11421564 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaac 11421663  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  11421664 cctctgacttgcttctcggtctgtg 11421688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 45390673 - 45390449
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  45390673 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 45390574  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| |||||| || |||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  45390573 tacaacaggctgattctttctgagtagtttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 45390474  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  45390473 cctctgacttgcttctctgtctgtg 45390449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 16515115 - 16515337
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  16515115 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagattcttggcattcatcattcca 16515214  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16515215 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcagcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 16515314  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctg 235  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  16515315 cctctgacttgcttctcggtctg 16515337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26516245 - 26516032
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26516245 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26516146  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26516145 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 26516046  T
Q  213 cctcggacttgctt 226  Q
    |||| |||||||||    
T  26516045 cctctgacttgctt 26516032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5131449 - 5131225
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5131449 acataatcaaaggcctcccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5131350  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5131349 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 5131250  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  5131249 cctctgacttgcttctctgtctgtg 5131225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 5144025 - 5144249
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  5144025 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 5144124  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5144125 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcaaacgtccgaggaaa 5144224  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  5144225 cctctgacttgcttctcggtctgtg 5144249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22145648 - 22145424
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22145648 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 22145549  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22145548 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaa 22145449  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    ||||  ||||| || ||||||||||    
T  22145448 cctctaacttgtttctcggtctgtg 22145424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 26271771 - 26271995
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  26271771 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggcattcatcattcca 26271870  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26271871 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 26271970  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  26271971 cctctgacttgcttctctgtctgtg 26271995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 26316533 - 26316757
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26316533 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26316632  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  26316633 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 26316732  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  26316733 cctctgacttgcttctctgtctgtg 26316757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10845073 - 10844851
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  10845073 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttacagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 10844974  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10844973 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 10844874  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctg 235  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  10844873 cctctgacttgtttctcggtctg 10844851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 31561075 - 31561288
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31561075 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31561174  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  31561175 tacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31561274  T
Q  213 cctcggacttgctt 226  Q
    |||| |||||||||    
T  31561275 cctctgacttgctt 31561288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3448759 - 3448535
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3448759 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 3448660  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  3448659 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 3448560  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  3448559 cctctgacttgcttctctgtctgtg 3448535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 4141931 - 4142155
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4141931 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4142030  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  4142031 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4142130  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  4142131 cctctgacttgcttctctgtctgtg 4142155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4202842 - 4202618
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4202842 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4202743  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| ||  || || |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  4202742 tacaataggctggctctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 4202643  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    ||||  |||||||| || |||||||    
T  4202642 cctctaacttgcttctctgtctgtg 4202618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11444340 - 11444116
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11444340 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11444241  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  11444240 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 11444141  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  11444140 cctctgacttgcttctctgtctgtg 11444116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16044758 - 16044550
Alignment:
Q  27 cttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttgat 126  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||| | |||||| ||||    
T  16044758 cttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctattaaaagcctcttggcattcatcgttccatacaataggctgat 16044659  T
Q  127 tcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 226  Q
    || |  |||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  16044658 tcttcctgagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgttt 16044559  T
Q  227 ttcggtctg 235  Q
     ||||||||    
T  16044558 ctcggtctg 16044550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 10842679 - 10842901
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  10842679 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 10842778  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10842779 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatataaatcgggagatgtaatgcaatcgcccgaggaaa 10842878  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctg 235  Q
    ||||  ||||| || ||||||||    
T  10842879 cctctaacttgtttctcggtctg 10842901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 16748202 - 16748415
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16748202 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16748301  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || |||||||||| |  |||| |  ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  16748302 tacaacaggttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccacaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 16748401  T
Q  213 cctcggacttgctt 226  Q
    |||| |||||||||    
T  16748402 cctctgacttgctt 16748415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 26666599 - 26666823
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26666599 acataatcaaaggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26666698  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     |  | ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  26666699 tacgacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 26666798  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  26666799 cctctgacttgcttctctgtctgtg 26666823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 24589219 - 24589443
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24589219 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgattccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24589318  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  24589319 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 24589418  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  24589419 cctctgacttgcttctctgtctgtg 24589443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Original strand, 16446691 - 16446894
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||    
T  16446691 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagccccttggcattcatcgttcca 16446790  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||  |||||| |  |||| |  ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16446791 tacaatagtctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcctgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcacccgaggaaa 16446890  T
Q  213 cctc 216  Q
    ||||    
T  16446891 cctc 16446894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 2776702 - 2776592
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  2776702 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 2776603  T
Q  118 taggttgattc 128  Q
    |||| ||||||    
T  2776602 taggctgattc 2776592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 26512386 - 26512496
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  26512386 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 26512485  T
Q  118 taggttgattc 128  Q
    |||| ||||||    
T  26512486 taggctgattc 26512496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 26681796 - 26681906
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  26681796 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 26681895  T
Q  118 taggttgattc 128  Q
    |||| ||||||    
T  26681896 taggctgattc 26681906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 31127355 - 31127245
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  31127355 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 31127256  T
Q  118 taggttgattc 128  Q
    |||| ||||||    
T  31127255 taggctgattc 31127245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 39209829 - 39209939
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  39209829 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 39209928  T
Q  118 taggttgattc 128  Q
    |||||||||||    
T  39209929 taggttgattc 39209939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 88 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9622028 - 9621879
Alignment:
Q  88 aagcttcctggcattcattattccacataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcggga 187  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  9622028 aagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgaga 9621929  T
Q  188 gatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||    
T  9621928 gatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtg 9621879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 45734761 - 45734658
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  45734761 atcaaaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 45734662  T
Q  118 tagg 121  Q
    ||||    
T  45734661 tagg 45734658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 31087312 - 31087422
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||    
T  31087312 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaa 31087411  T
Q  118 taggttgattc 128  Q
    |||| ||||||    
T  31087412 taggctgattc 31087422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 9469646 - 9469590
Alignment:
Q  140 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 196  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9469646 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 9469590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 198
Target Start/End: Original strand, 16287201 - 16287249
Alignment:
Q  150 ggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 198  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16287201 ggcccacatgttgcagtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 16287249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 196
Target Start/End: Original strand, 16393246 - 16393302
Alignment:
Q  140 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 196  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16393246 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 16393302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 196
Target Start/End: Original strand, 30369758 - 30369814
Alignment:
Q  140 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 196  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30369758 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 30369814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27022589 - 27022365
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27022589 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27022490  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27022489 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatataaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27022390  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  27022389 cctctgacttgcttctcggtctgtg 27022365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 27287107 - 27287331
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27287107 acataatcaaaggccttccttccacaggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27287206  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||  || |||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27287207 tacaataggctgattatttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27287306  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  27287307 cctctgacttgcttctcggtctgtg 27287331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29553010 - 29552786
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29553010 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29552911  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29552910 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 29552811  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  29552810 cctctgacttgcttctcagtctgtg 29552786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 13295694 - 13295918
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  13295694 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttagcattcatcattcca 13295793  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13295794 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 13295893  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  13295894 cctctgacttgcttctcggtctgtg 13295918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 15421063 - 15421287
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15421063 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15421162  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15421163 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 15421262  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  15421263 cctctgacttgcttctcggtctgtg 15421287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 22931627 - 22931851
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  22931627 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 22931726  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22931727 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 22931826  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  22931827 cctctgacttgcttctcggtctgtg 22931851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 23854072 - 23854296
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  23854072 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 23854171  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23854172 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 23854271  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  23854272 cctctgacttgcttctcggtctgtg 23854296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24867169 - 24866945
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24867169 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24867070  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24867069 tacaataggctgattctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 24866970  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  24866969 cctctgacttgcttctcggtctgtg 24866945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Original strand, 27626454 - 27626674
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27626454 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27626553  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
    || |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27626554 cacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 27626653  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtc 233  Q
    |||| ||||||||| ||||||    
T  27626654 cctctgacttgcttctcggtc 27626674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16677593 - 16677369
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16677593 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16677494  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16677493 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcagattgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 16677394  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| |||||| || || |||||||    
T  16677393 cctctgacttgtttctctgtctgtg 16677369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27179909 - 27179685
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  27179909 acataatcaaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggcattcatcattcca 27179810  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27179809 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27179710  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  27179709 cctctgacttgcttctcggtctgtg 27179685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 27269330 - 27269554
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  27269330 acataatcaaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggcattcatcattcca 27269429  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27269430 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27269529  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  27269530 cctctgacttgcttctcggtctgtg 27269554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 34461249 - 34461473
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  34461249 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 34461348  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34461349 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 34461448  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  34461449 cctctgacttgcttctcagtctgtg 34461473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3699536 - 3699312
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3699536 acatgatcaaaggccttccttccacacgtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 3699437  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3699436 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 3699337  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| |||||| || || |||||||    
T  3699336 cctctgacttgtttctctgtctgtg 3699312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4761216 - 4760992
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4761216 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4761117  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| || ||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  4761116 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4761017  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  4761016 cctctgacttgcttctctgtctgtg 4760992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Original strand, 17089186 - 17089406
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  17089186 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 17089285  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
    || |||||| |||||| |  |||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17089286 cacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggtagcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 17089385  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtc 233  Q
    |||| ||||||||| ||||||    
T  17089386 cctctgacttgcttctcggtc 17089406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27011184 - 27010960
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27011184 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27011085  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| || ||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  27011084 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 27010985  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  27010984 cctctgacttgcttctctgtctgtg 27010960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26921819 - 26921606
Alignment:
Q  24 ggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggtt 123  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | || ||| |    
T  26921819 ggccttccttccacgggtgggacaaagataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcattattccaaacaacaggct 26921720  T
Q  124 gattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttg 223  Q
    ||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26921719 gattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttg 26921620  T
Q  224 cttttcggtctgtg 237  Q
    ||| ||||||||||    
T  26921619 cttctcggtctgtg 26921606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16753263 - 16753050
Alignment:
Q  24 ggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggtt 123  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||| |    
T  16753263 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggct 16753164  T
Q  124 gattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttg 223  Q
    ||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  16753163 gattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgacttg 16753064  T
Q  224 cttttcggtctgtg 237  Q
     || ||||||||||    
T  16753063 tttctcggtctgtg 16753050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27060959 - 27060735
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  27060959 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 27060860  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27060859 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgtccgaggaaa 27060760  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  27060759 cctctgacttgcttctctgtctgtg 27060735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29504869 - 29504645
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29504869 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29504770  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  29504769 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaa 29504670  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  29504669 cctctgacttgcttctctgtctgtg 29504645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4528738 - 4528514
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  4528738 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatccca 4528639  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  4528638 tacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4528539  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  4528538 cctctgacttgcttctctgtctgtg 4528514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 4542517 - 4542741
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4542517 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4542616  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  4542617 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4542716  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  4542717 cctctgacttgcttctctgtctgtg 4542741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 4720878 - 4721102
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4720878 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4720977  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  4720978 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4721077  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  4721078 cctctgacttgcttctctgtctgtg 4721102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27488586 - 27488362
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27488586 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27488487  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  27488486 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 27488387  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  27488386 cctctgacttgcttctctgtctgtg 27488362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29576467 - 29576243
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29576467 acatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29576368  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  29576367 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaa 29576268  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  29576267 cctctgacttgcttctctgtctgtg 29576243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 30554759 - 30554983
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30554759 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30554858  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  30554859 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 30554958  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  30554959 cctctgacttgcttctctgtctgtg 30554983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20172000 - 20171797
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  20172000 acataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactcttgatactatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 20171901  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
    || ||| ||||||||| |  |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20171900 cacaatgggttgattcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcggtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 20171801  T
Q  213 cctc 216  Q
    ||||    
T  20171800 cctc 20171797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Original strand, 22163991 - 22164194
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  22163991 acataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactcttgatactatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 22164090  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
    || ||| ||||||||| |  |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22164091 cacaatgggttgattcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcggtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 22164190  T
Q  213 cctc 216  Q
    ||||    
T  22164191 cctc 22164194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 16940770 - 16940994
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16940770 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16940869  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  16940870 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 16940969  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  16940970 cctctgacttgcttctctgtctgtg 16940994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 26113155 - 26113379
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26113155 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26113254  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  26113255 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 26113354  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  26113355 cctctgacttgcttctctgtctgtg 26113379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28210907 - 28210683
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28210907 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28210808  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  28210807 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 28210708  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  28210707 cctctgacttgcttctctgtctgtg 28210683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4776333 - 4776109
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4776333 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4776234  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  4776233 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4776134  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  4776133 cctctgacttgcttctctgtctgtg 4776109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Original strand, 22455857 - 22455972
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22455857 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaagaataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 22455956  T
Q  113 cataataggttgattc 128  Q
    || |||||||||||||    
T  22455957 cacaataggttgattc 22455972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 26992248 - 26992096
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  26992248 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 26992149  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcgg 165  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || ||||||||||||||||    
T  26992148 tagaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcgg 26992096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Original strand, 26775370 - 26775485
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  26775370 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 26775469  T
Q  113 cataataggttgattc 128  Q
     | |||||| ||||||    
T  26775470 tacaataggctgattc 26775485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Original strand, 27358853 - 27358968
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  27358853 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 27358952  T
Q  113 cataataggttgattc 128  Q
     | |||||| ||||||    
T  27358953 tacaataggctgattc 27358968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Original strand, 27449196 - 27449311
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  27449196 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 27449295  T
Q  113 cataataggttgattc 128  Q
     | |||||| ||||||    
T  27449296 tacaataggctgattc 27449311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 14142142 - 14142252
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  14142142 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 14142241  T
Q  118 taggttgattc 128  Q
    |||| ||||||    
T  14142242 taggctgattc 14142252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26789264 - 26789154
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  26789264 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 26789165  T
Q  118 taggttgattc 128  Q
    |||| ||||||    
T  26789164 taggctgattc 26789154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27197633 - 27197523
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  27197633 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27197534  T
Q  118 taggttgattc 128  Q
    |||| ||||||    
T  27197533 taggctgattc 27197523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 27251602 - 27251712
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  27251602 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27251701  T
Q  118 taggttgattc 128  Q
    |||| ||||||    
T  27251702 taggctgattc 27251712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 121
Target Start/End: Original strand, 8902451 - 8902554
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  8902451 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcatgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaa 8902550  T
Q  118 tagg 121  Q
    ||||    
T  8902551 tagg 8902554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 28163944 - 28163836
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28163944 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28163845  T
Q  113 cataatagg 121  Q
     | ||||||    
T  28163844 tacaatagg 28163836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 112
Target Start/End: Original strand, 33373174 - 33373273
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33373174 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33373273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 13520940 - 13521049
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | ||    
T  13520940 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcc-ggcattcatcgttccatacaa 13521038  T
Q  118 taggttgattc 128  Q
    |||| ||||||    
T  13521039 taggctgattc 13521049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 196
Target Start/End: Original strand, 9136223 - 9136279
Alignment:
Q  140 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 196  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9136223 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 9136279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 15655455 - 15655679
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15655455 acataatcaaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15655554  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | ||| || |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15655555 tacaatgggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 15655654  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  15655655 cctctgacttgcttctcggtctgtg 15655679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41678168 - 41677944
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  41678168 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 41678069  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41678068 tacaataggctgattctttctgagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 41677969  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||    
T  41677968 cctctaacttgcttctcggtctgtg 41677944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11552818 - 11552594
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11552818 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11552719  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11552718 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 11552619  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  11552618 cctctgacttgcttctcagtctgtg 11552594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33295991 - 33295767
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33295991 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33295892  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33295891 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 33295792  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  33295791 cctctgacttgcttctcggtctgtg 33295767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33780952 - 33780728
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33780952 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33780853  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33780852 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 33780753  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  33780752 cctctgacttgcttctcggtctgtg 33780728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 40470247 - 40470460
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40470247 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 40470346  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| || ||| || | || |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470347 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 40470446  T
Q  213 cctcggacttgctt 226  Q
    |||| |||||||||    
T  40470447 cctctgacttgctt 40470460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 22995814 - 22996038
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  22995814 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 22995913  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22995914 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 22996013  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  22996014 cctctgacttgcttctcagtctgtg 22996038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23629433 - 23629209
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  23629433 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 23629334  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23629333 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 23629234  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  23629233 cctctgacttgcttctcggtctgtg 23629209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 24684842 - 24685066
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24684842 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24684941  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24684942 tacaataggctgattctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 24685041  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  24685042 cctctgacttgcttctcggtctgtg 24685066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24973369 - 24973145
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24973369 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcattattcca 24973270  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  24973269 tacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatttaagcgtccgaggaaa 24973170  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  24973169 cctctgacttgcttctcggtctgtg 24973145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 18372231 - 18372455
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18372231 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 18372330  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  18372331 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 18372430  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  18372431 cctctgacttgcttctctgtctgtg 18372455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31434927 - 31434703
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31434927 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31434828  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| || ||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  31434827 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31434728  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  31434727 cctctgacttgcttctctgtctgtg 31434703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 37355340 - 37355564
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37355340 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37355439  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  37355440 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37355539  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  37355540 cctctgacttgcttctctgtctgtg 37355564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23895669 - 23895447
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||    
T  23895669 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcataagcttcttggcattcatcgttcca 23895570  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23895569 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 23895470  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctg 235  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  23895469 cctctgacttgtttctcggtctg 23895447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3793004 - 3792780
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3793004 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 3792905  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3792904 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 3792805  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  3792804 cctctgacttgcttctctgtctgtg 3792780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9320939 - 9320715
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9320939 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 9320840  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  9320839 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 9320740  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  9320739 cctctgacttgcttctctgtctgtg 9320715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12135638 - 12135414
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12135638 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12135539  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  12135538 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 12135439  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  12135438 cctctgacttgcttctctgtctgtg 12135414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 18497422 - 18497646
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18497422 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18497521  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18497522 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18497621  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| |||||| || || |||||||    
T  18497622 cctctgacttgtttctctgtctgtg 18497646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26483857 - 26483633
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26483857 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26483758  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  26483757 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 26483658  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  26483657 cctctgacttgcttctctgtctgtg 26483633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 43081713 - 43081494
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  43081713 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 43081614  T
Q  118 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 217  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  43081613 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctct 43081514  T
Q  218 gacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  43081513 gacttgcttctcggtctgtg 43081494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 13321527 - 13321751
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13321527 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 13321626  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  13321627 tacaacaggctggttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 13321726  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  13321727 cctctgacttgcttctctgtctgtg 13321751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28652705 - 28652481
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28652705 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28652606  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  28652605 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 28652506  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  28652505 cctctgacttgcttctcggtctgtg 28652481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30032891 - 30032667
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30032891 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30032792  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| || ||| || | || |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  30032791 tacaataggctggttctttctaagcagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 30032692  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  30032691 cctctgacttgcttctctgtctgtg 30032667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 37767688 - 37767912
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37767688 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37767787  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  37767788 tacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37767887  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  37767888 cctctgacttgcttctctgtctgtg 37767912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6877768 - 6877544
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  6877768 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatccca 6877669  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  6877668 tacaacaggctggttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 6877569  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  6877568 cctctgacttgcttctctgtctgtg 6877544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 8662172 - 8662396
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8662172 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 8662271  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  8662272 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 8662371  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  8662372 cctctgacttgcttctctgtctgtg 8662396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24586837 - 24586613
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24586837 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24586738  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  24586737 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 24586638  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  24586637 cctctgacttgcttctctgtctgtg 24586613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30155494 - 30155270
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30155494 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30155395  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  30155394 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 30155295  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  30155294 cctctgacttgcttctctgtctgtg 30155270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30171932 - 30171708
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  30171932 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcactcatcattcca 30171833  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| || ||  || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30171832 tacaataggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 30171733  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  30171732 cctctgacttgcttctctgtctgtg 30171708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30938098 - 30937874
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  30938098 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatatgtggttccagcaggtaactcttggtgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 30937999  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30937998 tacaataggctgattcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 30937899  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  30937898 cctctgacttgcttctcggtctgtg 30937874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 31823104 - 31823328
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31823104 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31823203  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  31823204 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31823303  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  31823304 cctctgacttgcttctctgtctgtg 31823328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33519843 - 33519619
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33519843 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33519744  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  33519743 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 33519644  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  33519643 cctctgacttgcttctctgtctgtg 33519619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34619981 - 34619757
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  34619981 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 34619882  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34619881 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 34619782  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  34619781 cctctgacttgcttctctgtctgtg 34619757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 37668183 - 37668407
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37668183 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37668282  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  37668283 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37668382  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  37668383 cctctgacttgcttctctgtctgtg 37668407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 37758446 - 37758222
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37758446 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37758347  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  37758346 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37758247  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  37758246 cctctgacttgcttctctgtctgtg 37758222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22891926 - 22891707
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  22891926 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 22891827  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22891826 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcgggccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 22891727  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggt 232  Q
    |||| |||||| || |||||    
T  22891726 cctctgacttgtttctcggt 22891707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25203741 - 25203519
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||    
T  25203741 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcagtcatcgttcca 25203642  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  25203641 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 25203542  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctg 235  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  25203541 cctctgacttgtttctcggtctg 25203519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25267896 - 25267674
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||    
T  25267896 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcagtcatcgttcca 25267797  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  25267796 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 25267697  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctg 235  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  25267696 cctctgacttgtttctcggtctg 25267674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 15755549 - 15755762
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15755549 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15755648  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  15755649 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 15755748  T
Q  213 cctcggacttgctt 226  Q
    |||| |||||||||    
T  15755749 cctctgacttgctt 15755762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24727432 - 24727208
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24727432 acatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24727333  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  24727332 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 24727233  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  24727232 cctctgacttgcttctctgtctgtg 24727208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 32592971 - 32593195
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  32592971 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 32593070  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  32593071 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgagagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 32593170  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  32593171 cctctgacttgcttctctgtctgtg 32593195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5641251 - 5641027
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5641251 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5641152  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  5641151 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 5641052  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  5641051 cctctgacttgcttctctgtctgtg 5641027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 28956482 - 28956706
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  28956482 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 28956581  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| || ||  || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28956582 tacaataggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 28956681  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  28956682 cctctgacttgcttctctgtctgtg 28956706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2514525 - 2514301
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  |||   ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  2514525 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaactcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 2514426  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  2514425 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 2514326  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  2514325 cctctgacttgcttctctgtctgtg 2514301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Original strand, 18125113 - 18125228
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  18125113 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 18125212  T
Q  113 cataataggttgattc 128  Q
     | |||||| ||||||    
T  18125213 tacaataggctgattc 18125228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 13439380 - 13439494
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  13439380 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 13439479  T
Q  113 cataataggttgatt 127  Q
     | |||||| |||||    
T  13439480 tacaataggctgatt 13439494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 9547411 - 9547521
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  9547411 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatactatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 9547510  T
Q  118 taggttgattc 128  Q
    |||| ||||||    
T  9547511 taggctgattc 9547521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 11327095 - 11326985
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  11327095 atcaaaggccttccttccatgggagggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 11326996  T
Q  118 taggttgattc 128  Q
    |||||||||||    
T  11326995 taggttgattc 11326985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Original strand, 13183490 - 13183605
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  13183490 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggaattcatcgttcca 13183589  T
Q  113 cataataggttgattc 128  Q
     | |||||| ||||||    
T  13183590 tacaataggctgattc 13183605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 29887899 - 29888009
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  29887899 atcaaaggccttccttccacggatgagacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 29887998  T
Q  118 taggttgattc 128  Q
    |||| ||||||    
T  29887999 taggctgattc 29888009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33878588 - 33878479
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | ||    
T  33878588 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcc-ggcattcatcgttccatacaa 33878490  T
Q  118 taggttgattc 128  Q
    |||| ||||||    
T  33878489 taggctgattc 33878479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 100
Target Start/End: Original strand, 351912 - 351999
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggca 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| | || |||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  351912 acatgatcaaaggccttccttcaactggagggacaagaatcggaggttctaacaaataccctttgatgctatcaaaagctttctggca 351999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 196
Target Start/End: Original strand, 5440049 - 5440105
Alignment:
Q  140 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 196  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5440049 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 5440105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 196
Target Start/End: Original strand, 11944246 - 11944302
Alignment:
Q  140 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 196  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11944246 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 11944302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 196
Target Start/End: Original strand, 15784549 - 15784605
Alignment:
Q  140 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 196  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15784549 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 15784605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17957432 - 17957376
Alignment:
Q  140 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 196  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17957432 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 17957376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 34468948 - 34468900
Alignment:
Q  150 ggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 198  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34468948 ggcccacatgttgcagtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 34468900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 196
Target Start/End: Original strand, 36375786 - 36375842
Alignment:
Q  140 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 196  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36375786 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 36375842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 196
Target Start/End: Original strand, 37000440 - 37000496
Alignment:
Q  140 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 196  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37000440 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 37000496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3523 - 3301
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  3523 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 3424  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3423 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 3324  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctg 235  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  3323 cctctgacttgcttctcggtctg 3301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 99 - 237
Target Start/End: Original strand, 43877 - 44015
Alignment:
Q  99 cattcattattccacataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 198  Q
    ||||||| |||||| | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43877 cattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 43976  T
Q  199 aacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  43977 aacgcccgaggaaacctctgacttgcttctgggtctgtg 44015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 235
Target Start/End: Original strand, 32096 - 32167
Alignment:
Q  164 ggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctg 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32096 ggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 32167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9492 - 9268
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  9492 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 9393  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9392 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 9293  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  9292 cctctgacttgcttctcggtctgtg 9268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30749 - 30525
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30749 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30650  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30649 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 30550  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  30549 cctctgacttgcttctcggtctgtg 30525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19526 - 19304
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  19526 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 19427  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19426 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 19327  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctg 235  Q
    ||||  ||||| || ||||||||    
T  19326 cctctaacttgtttctcggtctg 19304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 7416 - 7301
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7416 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 7317  T
Q  113 cataataggttgattc 128  Q
     | |||||| ||||||    
T  7316 tacaataggctgattc 7301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 21894549 - 21894762
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21894549 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 21894648  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21894649 tacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 21894748  T
Q  213 cctcggacttgctt 226  Q
    |||| |||||||||    
T  21894749 cctctgacttgctt 21894762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 51641676 - 51641452
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51641676 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 51641577  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  51641576 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 51641477  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  51641476 cctctgacttgcttctctgtctgtg 51641452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 20339101 - 20339320
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  20339101 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattcca 20339200  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20339201 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 20339300  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggt 232  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  20339301 cctctgacttgcttttcggt 20339320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10966123 - 10965910
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10966123 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 10966024  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| |||||| |  |||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10966023 tacaacaggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 10965924  T
Q  213 cctcggacttgctt 226  Q
    |||| |||||||||    
T  10965923 cctctgacttgctt 10965910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28588443 - 28588219
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28588443 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28588344  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28588343 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgcccgaggaaa 28588244  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  28588243 cctctgacttgcttctctgtctgtg 28588219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3644593 - 3644366
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataat-ctttgatgctatcaaaagcttcct-ggcattcattattc 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  3644593 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattctttgatgctatcaaaagcttctttggcattcatcattc 3644494  T
Q  111 cacataataggttgattcattt-tgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 209  Q
    || | |||||| |||||| ||| | || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3644493 catacaataggctgattcttttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 3644394  T
Q  210 aaacctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||    
T  3644393 aaacctctgacttgcttctctgtctgtg 3644366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 41790110 - 41790323
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  41790110 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 41790209  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  41790210 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 41790309  T
Q  213 cctcggacttgctt 226  Q
    |||| |||||||||    
T  41790310 cctctgacttgctt 41790323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10948535 - 10948311
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10948535 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 10948436  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  10948435 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 10948336  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  10948335 cctctgacttgcttctctgtctgtg 10948311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Original strand, 16204834 - 16205055
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||   ||||| ||||  |||||    
T  16204834 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctctttggcagtcatcgttcca 16204933  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  16204934 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtctgaggaaa 16205033  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtct 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||    
T  16205034 cctctgacttgcttctcggtct 16205055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20464420 - 20464212
Alignment:
Q  27 cttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataataggttgat 126  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| | |||||| ||||    
T  20464420 cttccttccacgggtgggacaaggataggtgtttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctgat 20464321  T
Q  127 tcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 226  Q
    || |  |||| |  ||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  20464320 tcttcctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctcagacttgttt 20464221  T
Q  227 ttcggtctg 235  Q
     ||||||||    
T  20464220 ctcggtctg 20464212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 28153189 - 28153079
Alignment:
Q  18 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacataa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  28153189 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 28153090  T
Q  118 taggttgattc 128  Q
    |||| ||||||    
T  28153089 taggctgattc 28153079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16037 - 15813
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16037 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15938  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15937 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 15838  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  15837 cctctgacttgcttctcggtctgtg 15813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 1424 - 1643
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  1424 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattcca 1523  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1524 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 1623  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggt 232  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  1624 cctctgacttgcttttcggt 1643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 22991 - 23215
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22991 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 23090  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||    
T  23091 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 23190  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  23191 cctctgacttgcttctctgtctgtg 23215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9478 - 9254
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9478 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 9379  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  9378 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 9279  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  9278 cctctgacttgcttctctgtctgtg 9254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13027 - 12803
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13027 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12928  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||  || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  12927 tacaacaggctggttttttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 12828  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  12827 cctctgacttgcttctctgtctgtg 12803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 11728 - 11952
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11728 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11827  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  11828 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 11927  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  11928 cctctgacttgcttctctgtctgtg 11952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11405 - 11181
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11405 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11306  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  11305 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 11206  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  11205 cctctgacttgcttctctgtctgtg 11181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 5979 - 6203
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  5979 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatactatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 6078  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  6079 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 6178  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  6179 cctctgacttgcttctctgtctgtg 6203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23183 - 23111
Alignment:
Q  165 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| || |||||||    
T  23183 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 23111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9501 - 9279
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||  | || |||||||  |||||    
T  9501 acataatcaaaggccttccttccacaagtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgttatcaaaagccccttgacattcatcgttcca 9402  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     | |||||| |||||| |   ||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  9401 tacaataggctgattcttccagagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaag 9302  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctg 235  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  9301 cctctgacttgtttctcggtctg 9279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 5471 - 5693
Alignment:
Q  13 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 112  Q
    |||| ||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||| || | ||| ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||    
T  5471 acatgatcaacgaccttccttccacaggtgggacaaggataggtggctctaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcatttca 5570  T
Q  113 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 212  Q
     |  | |||||||||  |  |||| |  ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  5571 taccacaggttgatttttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggtggcagtcatgtgagatatgaaccttgagatataattcaaacgcccgagaaaa 5670  T
Q  213 cctcggacttgcttttcggtctg 235  Q
    |||| ||||||||| || |||||    
T  5671 cctctgacttgcttctcagtctg 5693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1888 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1888
Description:

Target: scaffold1888; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1251 - 1155
Alignment:
Q  141 ttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1251 ttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcattcgttcgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 227
Target Start/End: Original strand, 43541 - 43754
Alignment:
Q  24 ggccttccttccactggcgggacaaggata-ggtggttccagcagataatct-ttgatgctatc--aaaagcttcctggcattcatt--attccacataa 117  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||   ||||||||| ||||||||| |  |||||| | ||    
T  43541 ggccttccttccacgggtgggacaaggataaggtggttccagcaggtaatttcttgatgctatacaaaaagcttcttggcattcaattaattccatacaa 43640  T
Q  118 taggt-tgattcattttga-gaaatttgaaaattggcccgcaggtt-gcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaa-ttcaaacgcccgaggaaac 213  Q
    ||||  |||||| || | | | |  ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||    
T  43641 taggactgattctttctaaagtagcttgaagatcggcccgcaggtttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattttaagcgtccgaggaaac 43740  T
Q  214 ctcggacttgcttt 227  Q
    ||| ||||||||||    
T  43741 ctctgacttgcttt 43754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 198
Target Start/End: Original strand, 35165 - 35225
Alignment:
Q  138 aatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 198  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35165 aatttgaatatcggcccgcacgttgccgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 35225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33770 - 33706
Alignment:
Q  162 gcggtcatatgagatat-gaa-tcgggagatgtaattcaaacg-cccgaggaaacctcggacttg 223  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33770 gcggtcatgtgagatatagaagtcgggagatgtaattcaaacgccccgaggaaacctctgacttg 33706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29499 - 29443
Alignment:
Q  140 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 196  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29499 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 29443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University